DE19636721A1 - Antibiotic and antitumor compound, manufacturing process, agent and DSM 11 071 - Google Patents

Antibiotic and antitumor compound, manufacturing process, agent and DSM 11 071

Info

Publication number
DE19636721A1
DE19636721A1 DE19636721A DE19636721A DE19636721A1 DE 19636721 A1 DE19636721 A1 DE 19636721A1 DE 19636721 A DE19636721 A DE 19636721A DE 19636721 A DE19636721 A DE 19636721A DE 19636721 A1 DE19636721 A1 DE 19636721A1
Authority
DE
Germany
Prior art keywords
methanol
ratjadon
adsorber resin
ethyl acetate
antibiotic
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Withdrawn
Application number
DE19636721A
Other languages
German (de)
Inventor
Hans Prof Dr Reichenbach
Gerhard Prof Dr Hoefle
Klaus Dr Gerth
Peter Dr Washausen
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
GESELLSCHAFT fur BIOTECHNOLOGISCHE FORSCHUNG MBH (GBF) 38124 BRAUNSCHWEIG DE
Original Assignee
GESELLSCHAFT fur BIOTECHNOLOGISCHE FORSCHUNG MBH (GBF) 38124 BRAUNSCHWEIG DE
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by GESELLSCHAFT fur BIOTECHNOLOGISCHE FORSCHUNG MBH (GBF) 38124 BRAUNSCHWEIG DE filed Critical GESELLSCHAFT fur BIOTECHNOLOGISCHE FORSCHUNG MBH (GBF) 38124 BRAUNSCHWEIG DE
Priority to DE19636721A priority Critical patent/DE19636721A1/en
Priority to PCT/EP1997/004954 priority patent/WO1998011084A1/en
Publication of DE19636721A1 publication Critical patent/DE19636721A1/en
Withdrawn legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D309/00—Heterocyclic compounds containing six-membered rings having one oxygen atom as the only ring hetero atom, not condensed with other rings
    • C07D309/16—Heterocyclic compounds containing six-membered rings having one oxygen atom as the only ring hetero atom, not condensed with other rings having one double bond between ring members or between a ring member and a non-ring member
    • C07D309/28—Heterocyclic compounds containing six-membered rings having one oxygen atom as the only ring hetero atom, not condensed with other rings having one double bond between ring members or between a ring member and a non-ring member with hetero atoms or with carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals, directly attached to ring carbon atoms
    • C07D309/30—Oxygen atoms, e.g. delta-lactones
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
    • C12N1/205—Bacterial isolates
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P17/00—Preparation of heterocyclic carbon compounds with only O, N, S, Se or Te as ring hetero atoms
    • C12P17/02—Oxygen as only ring hetero atoms
    • C12P17/06—Oxygen as only ring hetero atoms containing a six-membered hetero ring, e.g. fluorescein
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12R—INDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
    • C12R2001/00—Microorganisms ; Processes using microorganisms
    • C12R2001/01—Bacteria or Actinomycetales ; using bacteria or Actinomycetales

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

The invention relates to a compound with antibiotic and antitumoral activity, having formula (I). Also disclosed is a process to produce an antibiotic and an antitumoral agent containing the compound. Finally, the invention concerns the Sorangium cellulosum strain DSM 11 071.

Description

Gemäß einer ersten Ausführungsform betrifft die Erfindung eine Verbindung mit antibiotischer und antitumoraler Aktivität der FormelAccording to a first embodiment, the invention relates to a Association with antibiotic and antitumoral activity of the formula

Gemäß einer weiteren Ausführungsform betrifft die Erfindung eine Verbindung (Ratjadon B) der Summenformel C₂₇H₃₈O₅ und mit den folgenden Parametern:
¹H- und ¹³C-NMR-Spektrum gemäß Tabelle 1,
UV-Spektrum (Methanol): lambdamax (lg epsilon) = 229 (4,57) und 241 (sh; 4,52) nm,
IR-Spektrum (KBr): ny = 2964 (s) 2919 (s), 2880 (s), 1720 (vs), 1382 (s), 1249 (s), 1078 (s), 1058 (s), 1036 (s), 1013 (s), 991 (s) und 968 (s) cm-1.According to a further embodiment, the invention relates to a compound (Ratjadon B) of the empirical formula C₂₇H₃₈O₅ and with the following parameters:
1 H and 13 C NMR spectrum according to Table 1,
UV spectrum (methanol): lambda max (lg epsilon) = 229 (4.57) and 241 (sh; 4.52) nm,
IR spectrum (KBr): ny = 2964 (s) 2919 (s), 2880 (s), 1720 (vs), 1382 (s), 1249 (s), 1078 (s), 1058 (s), 1036 ( s), 1013 (s), 991 (s) and 968 (s) cm -1 .

Gemäß einer weiteren Ausführungsform betrifft die Erfindung eine Verbindung mit anitbiotischer und antitumoraler Aktivität, da­ durch gewinnbar, daß manAccording to a further embodiment, the invention relates to a Association with antibiotic and antitumoral activity since by winning that one

  • (a) Sorangium cellulosum Stamm So ce477 = DSM 11 071 in einem C- und N-Quellen sowie Mineralsalze enthaltenden wäßrigen Medium gegebenenfalls in Gegenwart eines Adsorberharzes kultiviert,(a) Sorangium cellulosum strain So ce477 = DSM 11 071 in one C and N sources and aqueous salts containing mineral salts Medium optionally in the presence of an adsorber resin cultured,
  • (b) Ratjadon B,(b) Ratjadon B,
  • (b1) sofern ohne Gegenwart eines Adsorberharzes kultiviert wurde, aus den Sorangium cellulosum-Zellen und/oder dem Kulturmedium oder mit Essigsäureethylester extrahiert oder(b1) if cultivated without the presence of an adsorber resin from the Sorangium cellulosum cells and / or the Culture medium or extracted with ethyl acetate or
  • (b2) sofern in Gegenwart eines Adsorberharzes kultiviert wurde, aus dem Adsorberharz mit Methanol eluiert, das Eluat einengt und mit Essigsäureethylester extrahiert,(b2) if cultivation was carried out in the presence of an adsorber resin, eluted from the adsorber resin with methanol, the eluate concentrated and extracted with ethyl acetate,
  • (c) den Essigester abzieht und den öligen Rückstand in Methanol löst,(c) withdrawing the ethyl acetate and the oily residue in methanol solves
  • (d) die methanolische Lösung über Kieselgel filtriert und mit Methanol eluiert, (d) the methanolic solution is filtered through silica gel and with Methanol eluted,  
  • (e) das methanolische Eluat einengt und an einer C₁₈-Umkehr­ phase einer HPLC-Chromatographie mit einem Methanol/Wasser-Ge­ misch als Laufmittel unterwirft,(e) the methanolic eluate is concentrated and at a C₁₈ reversal phase of an HPLC chromatography with a methanol / water Ge subject to mixing as eluent,
  • (f) Fraktionen mit einem Gehalt an Ratjadon B (Detektion: 230 nm) sammelt und Ratjadon B isoliert.(f) Fractions containing Ratjadon B (detection: 230 nm) and Ratjadon B isolated.

Die zu isolierende Verbindung kann dadurch gewinnbar sein, daß man in Stufe (a) mit Amberlite® XAD-16 als Adsorberharz arbei­ tet. Bei Stufe (e) kann man mit Nucleosil®-100 RP 18 chromato­ graphieren.The connection to be isolated can be obtained in that in stage (a) with Amberlite® XAD-16 as adsorber resin tet. At stage (e) you can use Nucleosil®-100 RP 18 chromato graph.

Gemäß einer weiteren Ausführungsform gemäß der Erfindung wird ein Verfahren zur Gewinnung einer erfindungsgemäßen Verbindung vorgesehen, das dadurch gekennzeichnet ist, daß manAccording to a further embodiment according to the invention a method for obtaining a compound according to the invention provided, which is characterized in that

  • (a) Sorangium cellulosum Stamm So ce477 = DSM 11 071 in einem C- und N-Quellen sowie Mineralsalze enthaltenden wäßrigen Medium gegebenenfalls in Gegenwart eines Adsorberharzes kultiviert,(a) Sorangium cellulosum strain So ce477 = DSM 11 071 in one C and N sources and aqueous salts containing mineral salts Medium optionally in the presence of an adsorber resin cultured,
  • (b) Ratjadon B,(b) Ratjadon B,
  • (b1) sofern ohne Gegenwart eines Adsorberharzes kultiviert wurde, aus den Sorangium cellulosum-Zellen und/oder dem Kulturmedium mit Essigsäureethylester extrahiert oder(b1) if cultivated without the presence of an adsorber resin from the Sorangium cellulosum cells and / or the Culture medium extracted with ethyl acetate or
  • (b2) sofern in Gegenwart eines Adsorberharzes kultiviert wurde, aus dem Adsorberharz mit Methanol eluiert, das Eluat einengt und mit Essigsäureethylester extrahiert,(b2) if cultivation was carried out in the presence of an adsorber resin, eluted from the adsorber resin with methanol, the eluate concentrated and extracted with ethyl acetate,
  • (c) den Essigester abzieht und den öligen Rückstand in Methanol löst, (c) withdrawing the ethyl acetate and the oily residue in methanol solves  
  • (d) die methanolische Lösung über Kieselgel filtriert und mit Methanol eluiert,(d) the methanolic solution is filtered through silica gel and with Methanol eluted,
  • (e) das methanolische Eluat einengt und an einer C₁₈-Umkehr­ phase einer HPLC-Chromatographie mit einem Methanol/Wasser-Ge­ misch als Laufmittel unterwirft,(e) the methanolic eluate is concentrated and at a C₁₈ reversal phase of an HPLC chromatography with a methanol / water Ge subject to mixing as eluent,
  • (f) Fraktionen mit einem Gehalt an Ratjadon B (Detektion: 230 nm) sammelt und Ratjadon B isoliert.(f) Fractions containing Ratjadon B (detection: 230 nm) and Ratjadon B isolated.

Eine weitere Ausführungsform der Erfindung betrifft Sorangium cellulosum So ce477 = DSM 11 071.Another embodiment of the invention relates to sorangium cellulosum So ce477 = DSM 11 071.

Schließlich betreffen weitere Ausführungsformen der Erfindung eine antibiotisches Mittel mit einem Gehalt an einer erfindungs­ gemäßen Verbindung sowie ein antitumorales Mittel mit einem Ge­ halt an einer erfindungsgemäßen Verbindung.Finally, further embodiments relate to the invention an antibiotic containing an invention modern compound and an anti-tumor agent with a Ge stop at a compound of the invention.

Nachstehend wird die Erfindung durch experimentelle Daten näher erläutert.In the following, the invention will be made closer by experimental data explained.

Ratjadon B aus Sorangium cellulosum So ce477Ratjadon B from Sorangium cellulosum So ce477

Produktionsstamm: Sorangium cellulosum gehört zur Ordnung der Myxococcales, Unterordnung Sorangineae, Familie Polyangiaceae. Der Produktionsstamm Sorangium cellulosum So ce477 wurde 1989 aus einer Bodenprobe von den Victoria Falls, Zimbabwe, isoliert. Der Stamm ist bei der Deutschen Sammlung von Mikroorganismen (DSM) unter DSM 11 071 hinterlegt.Production strain: Sorangium cellulosum belongs to the order of the Myxococcales, subordination Sorangineae, family Polyangiaceae. The production strain Sorangium cellulosum So ce477 became 1989 isolated from a soil sample from Victoria Falls, Zimbabwe. The strain is in the German collection of microorganisms (DSM) filed under DSM 11 071.

Stammkultur und morphologische Beschreibung: Stammkulturen wer­ den gehalten auf VY/2-Agar (0,5% Bäckerhefe nach Frischgewicht; 0,1% CaCl₂ × 2H₂O; 1,5% Agar; pH 7,2) oder auf Filterpapier über ST21-Agar (0,1% KNO₂; 0,1% MgSO₄ × 7H₂O; 0,1% CaCl₂ × 2H₂O; 0,1% K₂HPO₄; 0,01% MnSO₄ × 7H₂O; 0,02% FeCl₃; 0,002% Hefeextrakt; Standard-Spurenelementlösung, z. B. nach G. Drews, Mikrobiologisches Praktikum, 2. Auflage, S. 6., Berlin, Springer Verlag (1974); 1% Agar. Die Platten werden bei 30°C bebrütet.Root culture and morphological description: Root cultures who kept on VY / 2 agar (0.5% baker's yeast by fresh weight; 0.1% CaCl₂ × 2H₂O; 1.5% agar; pH 7.2) or on filter paper over ST21 agar (0.1% KNO₂; 0.1% MgSO₄ × 7H₂O; 0.1% CaCl₂ × 2H₂O; 0.1% K₂HPO₄; 0.01% MnSO₄ × 7H₂O; 0.02% FeCl₃; 0.002%  Yeast extract; Standard trace element solution, e.g. B. after G. Drews, Microbiological internship, 2nd edition, p. 6., Berlin, Springer Verlag (1974); 1% agar. The plates are incubated at 30 ° C.

Auf Filterpapier über Mineralsalzagar oder auf Hefeagar (VY/2- Agar) bildet der Stamm große hell orange Schwarmkolonien mit vielen gelborange bis schwarzbraunen Fruchtkörpern. Letztere be­ stehen aus kleinen Sporangiolen von 15 bis 20 µm Durchmesser, die in mehr oder weniger großen Haufen dicht gepackt liegen; die Haufen messen meist zwischen 50 und 150 µm Durchmesser. Die vegetativen Stäbchen haben die für Sorangium typische Form: relativ derbe, im Phasenkontrastmikroskop dunkle, zylindrische Stäbchen mit breit abgerundeten Enden, im Mittel 3 bis 5 µm lang und um 1 µm dick.On filter paper over mineral salt agar or on yeast agar (VY / 2- Agar) the trunk forms large, bright orange swarm colonies many yellow-orange to black-brown fruiting bodies. The latter be consist of small sporangioles with a diameter of 15 to 20 µm, which are densely packed in more or less large piles; the Heap usually measure between 50 and 150 µm in diameter. The vegetative sticks have the shape typical of Sorangium: relatively coarse, cylindrical in the phase contrast microscope Chopsticks with broadly rounded ends, on average 3 to 5 µm long and around 1 µm thick.

Leistungen: Der Stamm So ce477 produziert Ratjadon B als Haupt­ komponente. Diese Substanz hemmt das Wachstum zahlreicher Pilze und Hefen, gegen alle getesteten Bakterien war der Wirkstoff un­ wirksam. Bemerkenswert ist die sehr starke Wirkung gegenüber tierischen Zellkulturen. Eine IC-50 gegen die Hela Zellinie KB3.1 von nur 40 pg/ml weist aufeine antitumorale Wirkung von Ratjadon B hin.Services: The strain So ce477 produces Ratjadon B as main component. This substance inhibits the growth of numerous fungi and yeast, against all tested bacteria the active ingredient was un effective. The very strong effect is remarkable animal cell cultures. An IC-50 against the Hela cell line KB3.1 of only 40 pg / ml has an anti-tumor effect of Ratjadon B.

Produktion der Aktivitäten: Das Produktionsmedium kann folgende Zusammensetzung haben (in g/l destilliertes Wasser):
Soyabohnenmehl 2; Glukose (Maizena) 2; Stärke (Maizena) 8; Hefe­ extrakt (Marcor) 2; CaCl₂ × 2H₂O 1; MgSO₄ × 7H₂O 1; Ethylen­ diamin-tetraessigsäure Eisen (III) -Natriumsalz 0,008; HEPES 11,9. Der pH-Wert des Mediums wird vor dem Autoklavieren auf 7,2 eingestellt. Kultiviert wird in 1 1 Erlenmeyerkolben mit 250 ml des obigen Mediums und 2% XAD-16 Adsorberharz (Rohm und Haas, Frankfurt). Die Kolben werden bei 30°C auf einem Rundschüttler bei 180 U/m für 7 Tage inkubiert. Ratjadon B wird während der logarithmischen bis hin zur stationären Wachstumsphase produ­ ziert und bindet quantitativ an das Adsorberharz. In Abwesenheit von XAD kann es sowohl aus den Zellen als auch aus dem Kul­ turüberstand isoliert werden.Production of activities: The production medium can have the following composition (in g / l distilled water):
Soybean flour 2; Glucose (Maizena) 2; Starch (Maizena) 8; Yeast extract (Marcor) 2; CaCl₂ × 2H₂O 1; MgSO₄ × 7H₂O 1; Ethylene diamine tetraacetic acid ferric sodium salt 0.008; HEPES 11.9. The pH of the medium is adjusted to 7.2 before autoclaving. It is cultivated in 1 1 Erlenmeyer flask with 250 ml of the above medium and 2% XAD-16 adsorber resin (Rohm and Haas, Frankfurt). The flasks are incubated at 30 ° C on a rotary shaker at 180 U / m for 7 days. Ratjadon B is produced during the logarithmic to the stationary growth phase and binds quantitatively to the adsorber resin. In the absence of XAD, it can be isolated from both the cells and the culture supernatant.

Hemmspektrum von Ratjadon B im Plattendiffusionstest Inhibition spectrum of Ratjadon B in the plate diffusion test

Isolierung von Ratjadon BIsolation of Ratjadon B

4,2 Liter Kulturmedium werden dreimal mit je 500 ml Essigester extrahiert. Die Essigesterphasen werden vereinigt und das Lö­ sungsmittel wird abgezogen. Der braunrote ölige Rückstand wird in 10 ml Methanol gelöst und über 200 ml Kieselgel 60 (0,063 bis 0,2 mm Korngröße; 4 cm Säulendurchmesser) filtriert. Die ersten 100 ml Methanol-Eluat enthalten Ratjadon B.4.2 liters of culture medium are three times with 500 ml of ethyl acetate extracted. The ethyl acetate phases are combined and the Lö solvent is deducted. The brownish-red oily residue becomes dissolved in 10 ml of methanol and over 200 ml of silica gel 60 (0.063 to 0.2 mm grain size; 4 cm column diameter) filtered. The first 100 ml of methanol eluate contains Ratjadon B.

Trennung der KomponentenSeparation of the components

Präparative HPLC:
Das Eluat wird auf ein Volumen von ca. 5 ml eingeengt und in mehreren Läufen durch präparative RP-HPLC getrennt (Säulenabmessungen: 250 × 20 mm; Säulenmaterial: RP 18, 100 Å, 7 µ; Laufmittel: MeoH/H₂O 70/30, Flußrate: 28 ml/min; Detektion: 230 nm).
Retentionszeit: Ratjadon B = 27 min.Preparative HPLC:
The eluate is concentrated to a volume of approx. 5 ml and separated in several runs by preparative RP-HPLC (column dimensions: 250 × 20 mm; column material: RP 18, 100 Å, 7 µ; eluent: MeoH / H₂O 70/30, Flow rate: 28 ml / min; detection: 230 nm).
Retention time: Ratjadon B = 27 min.

Analytische HPLC:
(Säule: 125 × 2 mm, Nucleosil 120-5 C18, 5 µ; Laufmittel: linearer Gradient MeoH/H₂0 60/40 in 20 min auf MeoH/H₂0 80/20; Flußrate 0,3 ml/min; Detektion 230 nm) Retentionszeit: Ratjadon B = 10,8 min.
Ausbeute an Ratjadon B: 17,3 mg.Analytical HPLC:
(Column: 125 × 2 mm, Nucleosil 120-5 C18, 5 µ; eluent: linear gradient MeoH / H₂0 60/40 in 20 min to MeoH / H₂0 80/20; flow rate 0.3 ml / min; detection 230 nm) Retention time: Ratjadon B = 10.8 min.
Yield of Ratjadon B: 17.3 mg.

Charakterisierungcharacterization

Ratjadon B: C₂₇H₃₈O₅ (442) Struktur: Abb. 1.
UV (Methanol): lambdamax (lg epsilon) = 229 nm (4,57), 241 nm (sh.; 4,52).
IR (KBr): ny = 2964 (s), 2919 (s), 2880 (s), 1720 (vs), 1382 (s), 1249 (s), 1078 (s), 1058 (s), 1036 (s), 1013 (s), 991 (s) 968 (s).
¹H und ¹³C-NMR: s. Tabelle 1.
Molmasse: (-)-FAB-MS (TEG) (negativ-Ion) [M-H] = 441,2675.Ratjadon B: C₂₇H₃₈O₅ (442) Structure: Fig. 1.
UV (methanol): lambda max (lg epsilon) = 229 nm (4.57), 241 nm (sh .; 4.52).
IR (KBr): ny = 2964 (s), 2919 (s), 2880 (s), 1720 (vs), 1382 (s), 1249 (s), 1078 (s), 1058 (s), 1036 (s ), 1013 (s), 991 (s) 968 (s).
1 H and 13 C NMR: s. Table 1.
Molar mass: (-) - FAB-MS (TEG) (negative ion) [MH] = 441.2675.

Literatur zu Ratjadon A:Literature for Ratjadon A:

  • 1) D. Schummer, K. Gerth, H. Reichenbach, G. Höfle, Liebigs Ann. Chem., (1995) 685-688.1) D. Schummer, K. Gerth, H. Reichenbach, G. Höfle, Liebigs Ann. Chem., (1995) 685-688.
  • 2) K. Gerth, D. Schummer, G. Höfle, H. Irschik, H. Reichenbach, J. Antibiot., 48 (1995) 973-976.2) K. Gerth, D. Schummer, G. Höfle, H. Irschik, H. Reichenbach, J. Antibiot., 48 (1995) 973-976.

Tabelle 1 Table 1

NMR-Daten von Ratjadon B in CDCl₃ NMR data of Ratjadon B in CDCl₃

¹H: 300 MHz; ¹³C: 150 MHz. 1 H: 300 MHz; 13 C: 150 MHz.

Claims (9)

1. Verbindung mit antibiotischer und antitumoraler Aktivität der Formel: 1. Association with antibiotic and antitumor activity of the formula: 2. Verbindung (Ratjadon B) der Summenformel C₂₇H₃₈O₅ und mit den folgenden Parametern:
¹H- und ¹³C-NMR-Spektrum gemäß Tabelle 1,
UV-Spektrum (Methanol): lambdamax (lg epsilon) = 229 (4,57) und 241 (sh; 4,52) nm,
IR-Spektrum (KBr): ny = 2964 (s), 2919 (s), 2880 (s), 1720 (vs) 1382 (s), 1249 (s), 1078 (s), 1058 (s), 1036 (s), 1013 (s), 991 (s) und 968 (s) cm-1.2. compound (Ratjadon B) of the empirical formula C₂₇H₃₈O₅ and with the following parameters:
1 H and 13 C NMR spectrum according to Table 1,
UV spectrum (methanol): lambda max (lg epsilon) = 229 (4.57) and 241 (sh; 4.52) nm,
IR spectrum (KBr): ny = 2964 (s), 2919 (s), 2880 (s), 1720 (vs) 1382 (s), 1249 (s), 1078 (s), 1058 (s), 1036 ( s), 1013 (s), 991 (s) and 968 (s) cm -1 . 3. Verbindung mit antibiotischer und antitumoraler Aktivität, dadurch gewinnbar, daß man
  • (a) Sorangium cellulosum Stamm So ce477 = DSM 11 071 in einem C- und N-Quellen sowie Mineralsalze enthaltenden wäßrigen Medium gegebenenfalls in Gegenwart eines Adsorberharzes kultiviert,
  • (b) Ratjadon B,
    • (b1) sofern ohne Gegenwart eines Adsorberharzes kultiviert wurde, aus den Sorangium cellulosum-Zellen und/oder dem Kulturmedium oder mit Essigsäureethylester extrahiert oder
    • (b2) sofern in Gegenwart eines Adsorberharzes kultiviert wurde, aus dem Adsorberharz mit Methanol eluiert, das Eluat einengt und mit Essigsäureethylester extrahiert,
  • (c) den Essigester abzieht und den öligen Rückstand in Methanol löst,
  • (d) die methanolische Lösung über Kieselgel filtriert und mit Methanol eluiert,
  • (e) das methanolische Eluat einengt und an einer C₁₈-Umkehr­ phase einer HPLC-Chromatographie mit einem Methanol/Wasser-Ge­ misch als Laufmittel unterwirft,
  • (f) Fraktionen mit einem Gehalt an Ratjadon B (Detektion: 230 nm) sammelt und Ratjadon B isoliert.
3. Connection with antibiotic and antitumoral activity, which can be obtained by
  • (a) Sorangium cellulosum strain So ce477 = DSM 11 071 in an aqueous medium containing C and N sources and mineral salts, if appropriate in the presence of an adsorber resin,
  • (b) Ratjadon B,
    • (b1) if cultivation was carried out in the absence of an adsorber resin, extracted from the Sorangium cellulosum cells and / or the culture medium or with ethyl acetate or
    • (b2) if cultivation was carried out in the presence of an adsorber resin, eluted from the adsorber resin with methanol, the eluate was concentrated and extracted with ethyl acetate,
  • (c) withdrawing the ethyl acetate and dissolving the oily residue in methanol,
  • (d) the methanolic solution is filtered through silica gel and eluted with methanol,
  • (e) the methanolic eluate is concentrated and subjected to HPLC chromatography with a methanol / water mixture as the eluent on a C₁₈ reverse phase,
  • (f) Collect fractions containing Ratjadon B (detection: 230 nm) and Ratjadon B isolated.
4. Verbindung nach Anspruch 3, dadurch gewinnbar, daß man in Stufe (a) mit Amberlite® XAD-16 als Adsorberharz arbeitet.4. A compound according to claim 3, thereby obtainable in that Step (a) works with Amberlite® XAD-16 as adsorber resin. 5. Verbindung nach Anspruch 3 oder 4, dadurch gewinnbar, daß man bei Stufe (e) mit Nucleosil®-100 RP 18 chromatographiert.5. A compound according to claim 3 or 4, obtainable in that one chromatographed at step (e) with Nucleosil®-100 RP 18. 6. Verfahren zur Gewinnung der Verbindung gemäß einem der An­ sprüche 3 bis 5, dadurch gekennzeichnet, daß man
  • (a) Sorangium cellulosum Stamm So ce477 = DSM 11 071 in einem C- und N-Quellen sowie Mineralsalze enthaltenden wäßrigen Medium gegebenenfalls in Gegenwart eines Adsorberharzes kultiviert,
  • (b) Ratjadon B,
    • (b1) sofern ohne Gegenwart eines Adsorberharzes kultiviert wurde, aus den Sorangium cellulosum-Zellen und/oder dem Kulturmedium mit Essigsäureethylester extrahiert oder
    • (b2) sofern in Gegenwart eines Adsorberharzes kultiviert wurde, aus dem Adsorberharz mit Methanol eluiert, das Eluat einengt und mit Essigsäureethylester extrahiert,
  • (c) den Essigester abzieht und den öligen Rückstand in Methanol löst,
  • (d) die methanolische Lösung über Kieselgel filtriert und mit Methanol eluiert,
  • (e) das methanolische Eluat einengt und an einer C₁₈-Umkehr­ phase einer HPLC-Chromatographie mit einem Methanol/Wasser-Ge­ misch als Laufmittel unterwirft,
  • (f) Fraktionen mit einem Gehalt an Ratjadon B (Detektion: 230 nm) sammelt und Ratjadon B isoliert.
6. A method for obtaining the compound according to one of claims 3 to 5, characterized in that
  • (a) Sorangium cellulosum strain So ce477 = DSM 11 071 in an aqueous medium containing C and N sources and mineral salts, if appropriate in the presence of an adsorber resin,
  • (b) Ratjadon B,
    • (b1) if cultivation was carried out in the absence of an adsorber resin, extracted from the Sorangium cellulosum cells and / or the culture medium with ethyl acetate or
    • (b2) if cultivation was carried out in the presence of an adsorber resin, eluted from the adsorber resin with methanol, the eluate was concentrated and extracted with ethyl acetate,
  • (c) withdrawing the ethyl acetate and dissolving the oily residue in methanol,
  • (d) the methanolic solution is filtered through silica gel and eluted with methanol,
  • (e) the methanolic eluate is concentrated and subjected to HPLC chromatography with a methanol / water mixture as the eluent on a C₁₈ reverse phase,
  • (f) Collect fractions containing Ratjadon B (detection: 230 nm) and Ratjadon B isolated.
7. Sorangium cellulosum So ce477 = DSM 11 071.7. Sorangium cellulosum So ce477 = DSM 11 071. 8. Antibiotisches Mittel mit einem Gehalt an einer Verbindung gemäß einem der Ansprüche 1 bis 5.8. Antibiotic containing a compound according to one of claims 1 to 5. 9. Antitumorales Mittel mit einem Gehalt an einer Verbindung gemäß einem der Ansprüche 1 bis 5.9. Antitumor agent containing a compound according to one of claims 1 to 5.
DE19636721A 1996-09-10 1996-09-10 Antibiotic and antitumor compound, manufacturing process, agent and DSM 11 071 Withdrawn DE19636721A1 (en)

Priority Applications (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DE19636721A DE19636721A1 (en) 1996-09-10 1996-09-10 Antibiotic and antitumor compound, manufacturing process, agent and DSM 11 071
PCT/EP1997/004954 WO1998011084A1 (en) 1996-09-10 1997-09-10 Antibiotic and antitumoral compound, process for the manufacture thereof, agent containing this compound and dsm 11 071

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DE19636721A DE19636721A1 (en) 1996-09-10 1996-09-10 Antibiotic and antitumor compound, manufacturing process, agent and DSM 11 071

Publications (1)

Publication Number Publication Date
DE19636721A1 true DE19636721A1 (en) 1998-03-12

Family

ID=7805143

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
DE19636721A Withdrawn DE19636721A1 (en) 1996-09-10 1996-09-10 Antibiotic and antitumor compound, manufacturing process, agent and DSM 11 071

Country Status (2)

Country Link
DE (1) DE19636721A1 (en)
WO (1) WO1998011084A1 (en)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE10106647A1 (en) * 2001-02-12 2002-08-22 Univ Hannover Ratjadon derivatives to inhibit cell growth

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU2018315154B2 (en) 2017-08-09 2022-11-10 Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung GmbH New targeted cytotoxic ratjadone derivatives and conjugates thereof

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE10106647A1 (en) * 2001-02-12 2002-08-22 Univ Hannover Ratjadon derivatives to inhibit cell growth

Also Published As

Publication number Publication date
WO1998011084A1 (en) 1998-03-19

Similar Documents

Publication Publication Date Title
DE4138042C2 (en) Epothilones, their production processes and agents containing these compounds
WO1998013375A1 (en) Compounds with antimycotic and cytostatic effect, preparation method, agent containing these compounds and dsm 11 092
DE3888587T2 (en) AB-006 antibiotics and process for their preparation.
DE2849696A1 (en) METHOD OF MANUFACTURING ANTIBIOTIC C-15003 P-3
DE68906825T2 (en) Glycoside antibiotics BU-3608D and BU-3608E.
DE19636721A1 (en) Antibiotic and antitumor compound, manufacturing process, agent and DSM 11 071
DE69114252T2 (en) REVEROMYCIN-A, PRODUCTION AND USE AS ANTITUARY AGENT AND AS A FUNGICIDE.
DE69222150T2 (en) PROCESS FOR THE PRODUCTION OF CYCLOSPORIN-A AND / OR C
DE19607702A1 (en) Heterocyclic compounds, manufacturing processes and agents
DE4211056C1 (en) Spiran heterocyclic deriv. for controlling fungi and bacteria uncontrollable - prepd. by fermenting Sorangium e.g. Polyangium cellulosum in medium contg. carbon and nitrogen sources and mineral salts in adsorber resin, and eluting
DE2849666A1 (en) METHOD OF PREPARATION OF ANTIBIOTIC C-15003 P 4
CH620244A5 (en) Process for the microbiological preparation of a deacylpepsidin
DE4410449C2 (en) Melithiazoles A and B, manufacturing process, agents containing Melithiazol A and / or B and Melittangium lichenicola DSM 9004 with the ability to form Melithiazole A and B.
DE2921085A1 (en) ANTIBIOTIC SUBSTANCE
EP0182208B1 (en) Urdamycines, their preparation, streptomyces for their preparation and their use
EP0296545B1 (en) Antibiotic called fumifungin, microbiological process for its preparation and its use as a medicament
WO1999047523A1 (en) A and b apicularene
DE69206858T2 (en) Connection UCA1064-B
DE3881566T2 (en) ANTITUMOR DERIVATIVES, METHOD FOR THEIR PRODUCTION AND PHARMACEUTICAL COMPOSITIONS THAT CONTAIN IT.
EP0339442A2 (en) Angucyclinones from streptomyces, process to obtain them and their use
DE3932095C1 (en) Novel nannocheline and methyl ester(s) - active against Gram positive microorganisms
DE4142951C1 (en)
DE2838542A1 (en) SUBSTANCES OF THE EMPIRICAL SUMMARY C DEEP 25 H DEEP 33 N DEEP 3 O DEEP 3 S DEEP 2
WO1991000860A1 (en) Nitrogenous ambruticines, process for obtaining them and their use
DE4244213C2 (en) Ripostatins, method of preparation and agents

Legal Events

Date Code Title Description
8141 Disposal/no request for examination