DE10121225A1 - Identifying animals, particularly pigs, with desirable breeding traits comprises analyzing polymorphisms in the alpha-inhibin and betaA-inhibin/activin genes - Google Patents
Identifying animals, particularly pigs, with desirable breeding traits comprises analyzing polymorphisms in the alpha-inhibin and betaA-inhibin/activin genesInfo
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Abstract
Description
Die Erfindung bezieht sich und steht im generellen Zusammenhang mit der Detektion genetischer Unterschiede für die reproduktive Effizienz, das Wachstum und die Schlachtkörperzusammensetzung bei Tieren. Spezifischer bezieht sich die Erfindung auf genetische Marker, die bei verschiedenen Genen identifiziert wurden und mit denen auf erbliche Phänotypen, die mit einer verbesserten Reproduktionsleistung, verbessertem und effizienterem Wachstum und verbesserter Schlachtkörperqualität assoziert sind, geschlossen wird. Methoden und Anwendungen zur Nutzung dieser Marker werden ebenfalls dargelegt.The invention relates and is generally related to detection genetic differences for reproductive efficiency, growth and the Carcass composition in animals. More specifically, the invention relates to genetic markers that have been identified in different genes and with which they are inherited Phenotypes with improved reproductive performance, improved and more efficient Growth and improved carcass quality are associated, is closed. methods and applications for using these markers are also set out.
Die Höhe der Reproduktionsleistung, insbesondere der Wurfgröße, ist der hauptsächliche limitierende Faktor bei der tierischen Produktion. Z. B. hängt die Erzeugung von Schweine- und anderem Fleisch von der Anzahl der erzeugten Tiere ab. Gleichzeitig spielt die Wachstumsleistung und die Effizienz des Wachstums (z. B. Futterverwertung, Magerfleischanteil), sowie die Schlachtkörperqualität von einzelnen Tieren oder Würfen eine entscheidende Rolle bei der Fleischproduktion. Genetische Variabilität existiert bei verschiedenen Reproduktionsmerkmalen, beim Lebendmassezuwachs und der Schlachtkörperqualität. Die durchschnittliche Wurfgröße bei Schweinerassen z. B. variiert von 4- 16 Ferkeln pro Wurf. Das durchschnittliche Alter bei Pubertät variiert von 3-7 Monaten. Aufgrund dieser genetischen Variabilität ist eine Verbesserung der Reproduktionsleistung grundsätzlich möglich. Allerdings ist die Heritabilität für Wurfgröße und andere Fruchtbarkeitsmerkmale niedrig (0,05-0,15%). Herkömmliche Zuchtverfahren zur Selektion von Zucht- und der Erzeugung von Produktionstieren haben deshalb beim Merkmal Wurfgröße nicht zu einer Verbesserung geführt. Es besteht deshalb der Bedarf für andere Methoden und Verfahren, die direkt auf der Ebene der Gene, welche die Fruchtbarkeitsmerkmale steuern, ansetzen.The level of reproductive performance, especially litter size, is the main one limiting factor in animal production. For example, the production of pork and other meat depends on the number of animals produced. At the same time she is playing Growth performance and the efficiency of growth (e.g. feed conversion, Lean meat content), as well as the carcass quality of individual animals or litters crucial role in meat production. Genetic variability exists in different reproductive traits, the increase in live mass and the Carcass quality. The average litter size in pig breeds z. B. varies from 4- 16 piglets per litter. The average age at puberty varies from 3-7 months. by virtue of This genetic variability is fundamentally an improvement in reproductive performance possible. However, heritability is for litter size and other fertility traits low (0.05-0.15%). Conventional breeding methods for the selection of breeding and the The production of production animals therefore does not lead to a litter size characteristic Improvement led. There is therefore a need for other methods and procedures that start directly at the level of the genes that control fertility traits.
Insbesondere Chinesische Rassen aber auch bestimmte Europäische Rassen sind bekannt für eine hohe Reproduktionsleistung. Andere Rassen sind bekannt für einen hohen Schlachtkörperwert durch einen hohen Magerfleischanteil, wieder andere für einen hohen Lebendmassezuwachs. Eine Kombination der vorteilhaften Eigenschaften verschiedener Rassen führt daher zu großen Vorteilen bei der Schweineproduktion. Obwohl die Heritabilität für Schlachtkörperzusammensetzung und Lebendmassezuwachs in einem mittleren Bereich liegen (20-50%) ist die Züchtung von Rassen oder Linien wie z. B. Schweinelinien, die hohe Fruchtbarkeit, hohen Magerfleischanteil und hohen Lebendmassezuwachs aufweisen, aufgrund von antagonistischen Beziehungen mit herkömmlichen Verfahren bisher nicht gelungen. Die Bemühungen zur Kombination verschiedener Merkmale würden durch die Entdeckung von Genen oder genetischen Markern, die mit verbesserten Reproduktionseigenschaften wie z. B. einer erhöhten Wurfgröße oder einem erhöhten Lebendmassezuwachs beim Schwein assoziert sind erheblich erleichtert.Chinese breeds in particular but also certain European breeds are known for one high reproductive performance. Other breeds are known for their high carcass value due to a high proportion of lean meat, others for a high increase in live weight. A combination of the beneficial properties of different breeds therefore leads to great ones Benefits in pig production. Although heritability for Carcass composition and live weight gain are in a medium range (20-50%) is the breeding of breeds or lines such as B. Pig lines, the high Have fertility, high lean meat content and high live weight gain, due to of antagonistic relationships with conventional methods has so far not succeeded. The Efforts to combine different characteristics would be made possible by the discovery of Genes or genetic markers that have improved reproductive properties such. B. an increased litter size or an increased live mass increase in pigs are much easier.
Beim Schwein wurden bisher nur sehr wenige genetische Marker mit Auswirkungen auf die Wurfgröße oder den Lebendmassezuwachs bzw. den Magerfleischanteil beschrieben. Nach US- Patent 5,550,024 an Rothschild et al. ist dies für Wurfgröße z. B. der Östrogenrezeptor. Diese Patentschrift wird hier als Referenz miteinbezogen. Weiterhin wurde für genetische Marker im Bereich des Prolactinrezeptors im Zusammenhang mit der Wurfgrüße bei Schweinen Patentschutz beantragt (United States Patent Application Serial No. 08/812,208). Dies wird hier ebenfalls als Referenz miteinbezogen. Patentschutz wurde auch für Marker im Retinol- Bindenden Protein 4 beantragt (PCT/US99/00866). Auch dieses Patent wird hier als Referenz miteinbezogen. Weitere Patente wurden für Marker im Bereich der Melanocortinrezeptorgene und dem Ryanodinrezeptorgen erteilt. Die bisher gefundenen Marker erklären jedoch nur zu einem geringen Teil die genetischen Unterschiede im Fruchtbarkeitsgeschehen, dem Wachstum und der Schlachtkörperzusammensetzung bei bestimmten Rassen oder Linien. Es ist deshalb dringend erforderlich, neue genetische Marker und Verfahren zu deren Nutzung zu entwickeln.So far, very few genetic markers with effects on the pig have been identified Litter size or the live weight gain or the lean meat percentage described. According to US Patent 5,550,024 to Rothschild et al. is this for litter size z. B. the estrogen receptor. This Patent specification is included here for reference. Furthermore, for genetic markers in Area of the prolactin receptor in connection with the litter greetings in pigs Patent protection pending (United States Patent Application Serial No. 08 / 812,208). This will be here also included as a reference. Patent protection was also granted for markers in retinol Binding protein 4 requested (PCT / US99 / 00866). This patent is also used here as a reference involved. Additional patents have been created for markers in the field of melanocortin receptor genes and the ryanodine receptor gene. However, the markers found so far only explain a small part of the genetic differences in fertility, growth and carcass composition for certain breeds or lines. It is therefore urgently needed to develop new genetic markers and methods of using them.
Die hier vorgestellte und beschriebene Erfindung liefert neue genetische Marker, die auf der Entdeckung von Polymorphismen im INHA- und INHBA-Gen basieren und die mit verbesserten Reproduktionsmerkmalen, wie z. B. Ovulationsrate und erhöhter Wurfgröße, sowie mit Wachstums- und Schlachtkörpermerkmalen in Beziehung stehen. Dies erlaubt die genetische Typisierung von Schweinen auf ihre reproduktiven-, wachstumsfördernden und schlachtkörperbeeinflussenden Gene und die Bestimmung der Beziehung spezifischer Gene und Marker zu Reproduktions-, Wachstums- und Schlachtkörpermerkmalen. Es wird auch zur Identifikation von männlichen und weiblichen Tieren führen, die vorteilhafte Genotypen besitzen. Bei weiblichen Individuen erlaubt dies z. B. darauf zu schließen, daß sie größere Würfe, gesündere Würfe, frühere Würfe und schwerere Würfe aufweisen als der Durchschnitt der Rasse oder, bei männlichen Individuen, daß deren weibliche Nachkommen die Vorteilhaften Merkmale aufweisen. Daneben können auch männliche Tiere selbst bei entsprechendem vorteilhaften Genotyp zu höheren Würfen beitragen, indem sie mehr Ejakulat, eine höhere Spermienzahl pro Ejakulat oder vitalere Spermien erzeugen. Bezogen auf Wachstum- und Schlachtkörperzusammensetzung weisen männliche und weibliche Tiere mit vorteilhaftem Genotyp selbst oder deren Nachkommen z. B. eine höhere Wachstumsleistung oder einen höheren Magerfleischanteil auf.The invention presented and described here provides new genetic markers based on the Discovery of polymorphisms in the INHA and INHBA genes based and with improved Reproductive characteristics, such as B. ovulation rate and increased litter size, as well as with Growth and carcass characteristics are related. This allows the genetic Typing pigs on their reproductive, growth-promoting and carcass-influencing genes and determining the relationship of specific genes and Reproductive, growth and carcass trait markers. It also becomes Identification of male and female animals result in advantageous genotypes have. For female individuals, this allows e.g. B. to conclude that they have larger litters, have healthier litters, earlier litters and heavier litters than the average of the breed or, in male individuals, that their female offspring have the beneficial characteristics exhibit. In addition, male animals can also be advantageous, if appropriate Genotype contribute to higher litters by having more ejaculate, a higher sperm count per Generate ejaculate or more vital sperm. Related to growth and Carcass composition have beneficial effects on male and female animals Genotype itself or its offspring z. B. a higher growth rate or a a higher proportion of lean meat.
Die Marker werden daher als Selektionswerkzeuge in Zuchtprogrammen zur Entwicklung von Linien und Rassen verwendet, die Würfe mit vorteilhaften reproduktiven Phänotypen, vorteilhaften Wachstums- oder Schlachtkörpermerkmalen produzieren.The markers are therefore used as selection tools in breeding programs for the development of Lines and races used, the litters with advantageous reproductive phenotypes, produce beneficial growth or carcass characteristics.
Es ist Aufgabe der Erfindung, eine Methode zum Untersuchen von Schweinen zur Verfügung zu stellen, um diejenigen zu bestimmen, die größere Würfe und/oder Würfe mit verbessertem Wachstum und/oder Schlachtkörpermerkmalen erzeugen.It is an object of the invention to provide a method for examining pigs to determine those who have larger litters and / or litters with improved Generate growth and / or carcass characteristics.
Weiterhin ist die Bereitstellung von Methoden zur Identifizierung genetischer Marker, die mit Reproduktionsmerkmalen wie z. B. der Wurfgröße beim Schwein, und mit Wachstumsmerkmalen und Schlachtkörpermerkmalen, z. B. beim Schwein, in Verbindung stehen, Aufgabe der Erfindung.Furthermore, the provision of methods for identifying genetic markers that are associated with Reproductive characteristics such as B. the litter size in the pig, and with Growth traits and carcass traits, e.g. B. in pigs, in connection stand, object of the invention.
Eine weitere Aufgabe der Erfindung ist die Bereitstellung neuer genetischer Marker für Reproduktionsmerkmale wie z. B. Wurfgröße beim Schwein, und für Wachstumsmerkmale und Schlachtkörpermerkmale, z. B. beim Schwein.Another object of the invention is to provide new genetic markers for Reproductive characteristics such as B. litter size in pigs, and for growth characteristics and Carcass characteristics, e.g. B. in pigs.
Weitere Aufgaben und Vorteile der Erfindung werden teilweise in der folgenden Beschreibung aufgelistet und sind teilweise daraus ableitbar oder können durch die Anwendung der Erfindung in Erfahrung gebracht werden. Die Aufgaben und Vorteile der Erfindung können durch die aufgelisteten und beschriebenen Instrumente und die beschriebenen Kombinationen, auf die in den Ansprüchen besonders hingewiesen wird, erreicht werden.Other objects and advantages of the invention will appear in part in the following description listed and are in part derived therefrom or can by the application of the invention to be found out. The objects and advantages of the invention can be achieved by the instruments listed and described and the combinations described, to which in the claims are particularly pointed out.
Um die Aufgaben der Erfindung zu lösen und in Übereinstimmung mit dem Zweck der Erfindung, wie hierin enthalten und ausführlich beschrieben, liefert die hier vorgestellte Erfindung eine Methode, um Schweine und andere Tiere zu untersuchen, um diejenigen zu bestimmen, die mit höherer Wahrscheinlichkeit vorteilhafte reproduktive Phänotypen, z. B. größere Würfe, und/oder eine bessere Wachstumsleistung und/oder bessere Schlachtkörperzusammensetzung besitzen oder um diejenigen zu bestimmen, die Allele aufweisen, die auf unvorteilhafte Phänotypen hinweisen. So wie hier verwendet bedeutet "größere Würfe" eine signifikante Erhöhung der Wurfgröße über das Mittel einer gegebenen Population. So wie hier verwendet bedeutet der Terminus "Reproduktionsmerkmal" jedes Merkmal, das auf eine verbesserte Reproduktionsleistung hinweist oder Bestandteil derselben ist. Dies sind z. B., aber nicht ausschließlich, Hodengröße, Ejakulatvolumen, Spermienkonzentration, Spermien- und Spermaqualität, Libido, Zuchtverhalten, Wurfgröße, Anzahl lebend geborener pro Wurf, Wurfgewicht bei Geburt und Absetzen, Anzahl abgesetzter, Alter bei Pubertät, Zuchtreife, Intervall Absetzen bis Östrus, Abferkelintervall, Ovulationsrate, Uterine Kapazität, Embryoüberlebensrate.To achieve the objects of the invention and in accordance with the purpose of Invention as contained herein and described in detail provides the presented here Invention a method to examine pigs and other animals to those too determine which reproductive phenotypes are more likely to be advantageous, e.g. B. larger litters, and / or better growth performance and / or better Carcass composition or to determine those alleles which indicate unfavorable phenotypes. As used here means "Larger litters" means a significant increase in litter size over the average of a given Population. As used here, the term "reproductive feature" means anything A feature that indicates or is part of an improved reproductive performance. These are e.g. B. but not exclusively, testicle size, ejaculate volume, sperm concentration, Sperm and sperm quality, libido, breeding behavior, litter size, number of live births per Litter, weight at birth and weaning, number of weaning, age at puberty, maturity, Intermittent weaning to oestrus, farrowing interval, ovulation rate, uterine capacity, Embryo survival rate.
So wie hier verwendet bedeutet "Wachstumsmerkmale" jedes Merkmal das auf ein verbessertes Wachstum hinweist oder Bestandteil desselben ist. Dies sind z. B., aber nicht ausschließlich, Geburtsgewicht, tägliche Zunahme bis zum Absetzen, tägl. Zunahme nach dem Absetzen, gesamte tägliche Zunahme, tägl. Zunahmen in anderen Zeit- oder Gewichtsabschnitten, Futterverwertung.As used herein, "growth traits" means any trait that is upgraded Indicates growth or is part of it. These are e.g. B. but not exclusively Birth weight, daily increase until weaning, daily increase after weaning, total daily increase, daily increases in other time or weight segments, Feed conversion.
So wie hier verwendet bedeutet "Schlachtkörpermerkmal" jedes Merkmal das auf einen verbesserten Schlachtkörper hinweist oder Bestandteil desselben ist. Dies sind z. B., aber nicht ausschließlich, Magerfleischanteil, Fleisch : Fett-Verhältnis, Rückenspeckdicke, Anteil wertbestimmender Teilstücke, Schinkenanteil, Kotelettanteil, Schulteranteil, Bauchanteil, Ausschlachtungsprozente, Knochenanteil, Leitfähigkeit, pH-Wert, Göfo-Wert, Fleischbeschaffenheitszahl und andere Fleischqualitätsparameter.As used herein, "carcass trait" means each trait in one indicates improved carcass or is part of it. These are e.g. B. but not exclusively, lean meat, meat: fat ratio, back fat, percentage value-determining sections, ham portion, cutlet portion, shoulder portion, belly portion, Percussion percentage, bone percentage, conductivity, pH value, Göfo value, Meat texture number and other meat quality parameters.
So wie hier verwendet bedeutet "Reproduktionsgen" jedes Gen, das ein Produkt kodiert, welches, wenn exprimiert, Reproduktionsmerkmale vorteilhaft oder nachteilig beeinflußt. Beispiele solcher Gene sind das Östrogen- und Prolactinrezeptorgen.As used herein, "reproductive gene" means any gene that encodes a product, which, when expressed, adversely or advantageously affects reproductive traits. Examples of such genes are the estrogen and prolactin receptor genes.
So wie hier verwendet bedeutet "Wachstumsgen" jedes Gen, das ein Produkt kodiert, welches, wenn exprimiert, Wachstumsmerkmale vorteilhaft oder nachteilig beeinflußt.As used herein, "growth gene" means any gene that encodes a product that if expressed, growth characteristics favorably or adversely affected.
Ein Beispiel hierfür sind Melanocortinrezeptorgene und das IGF1 Rezeptorgen.An example of this are melanocortin receptor genes and the IGF1 receptor gene.
So wie hier verwendet bedeutet "Schlachtkörpergen" jedes Gen, das ein Produkt kodiert, welches, wenn exprimiert, Schlachtkörpermerkmale vorteilhaft oder nachteilig beeinflußt. Ein Beispiel hierfür ist das Halothangen/Ryanodinrezeptorgen. As used herein, "carcass gene" means any gene that encodes a product, which, when expressed, advantageously or adversely affects carcase characteristics. An example of this is the halothange / ryanodine receptor gene.
Die hier beschriebene Erfindung liefert daher eine Methode zum Untersuchen von Schweinen, um diejenigen zu bestimmen, die mit größerer Wahrscheinlichkeit positive Reproduktions- und/oder, Wachstums- und/oder Schlachtkörpermerkmale wie z. B. größere Würfe, höhere tägl. Zunahme, höheren Magerfleischanteil aufweisen, wobei die Methode die folgenden Schritte beeinhaltet: 1. Gewinnung einer DNA- oder RNA-Probe von einem Schwein oder einem anderen Tier; 2. Die Untersuchung der in 1. gewonnenen DNA oder RNA um zu bestimmen, welche α- Inhibin- (INHA)- und/oder βA-inhibin/activin (INHBA)-Allele vorhanden sind. D. h. die Probe des genetischen Materials wird gewonnen und dazu benutzt, um die Anwesenheit oder das Fehlen eines Polymorphismus in einem Gen zu bestimmen, das mit einem Vorteilhaften Reproduktions- und/oder Wachstums- und/oder Schlachtkörpermerkmal korreliert ist.The invention described herein, therefore, provides a method of examining pigs to determine those who are more likely to have positive reproductive and / or growth and / or carcass characteristics such as: B. Larger litters, higher daily gain, higher percentage of lean meat, the method comprising the following steps: 1. Obtaining a DNA or RNA sample from a pig or other animal; 2. Examination of the DNA or RNA obtained in 1. in order to determine which α-inhibin (INHA) and / or β A inhibin / activin (INHBA) alleles are present. That is, the sample of the genetic material is obtained and used to determine the presence or absence of a polymorphism in a gene that is correlated with an advantageous reproductive and / or growth and / or carcass trait.
In einer bevorzugten Anwendung ist der untersuchte Polymorphismus ein Restriktionsfragmentlängenpolymorphismus und der Test beinhaltet die Identifizierung des Reproduktions- und/oder Wachstums- und/oder Schlachtkörpergens im isolierten genetischen Material, das Aussetzen des Genes oder Teilen davon gegenüber einem Restriktionsenzym, das Restriktionsfragmente des Genes mit variabler Länge erzeugt, das Auftrennen der Fragmente um ein Restriktionsmuster zu erzeugen, z. B. durch Geleelektrophorese oder HPLC; und dem Vergleich des resultierenden Restriktionsmusters mit dem Restriktionsmuster eines Reproduktions- und/oder Wachstums- und/oder Schlachtkörpergens Genes, das den gewünschten Marker aufweist oder nicht aufweist.In a preferred application, the polymorphism examined is a Restriction fragment length polymorphism and the test involves the identification of the Reproductive and / or growth and / or carcass gene in the isolated genetic Material, the exposure of the gene or parts thereof to a restriction enzyme which Restriction fragments of the gene of variable length generated, the separation of the fragments around generate a restriction pattern, e.g. B. by gel electrophoresis or HPLC; and the Comparison of the resulting restriction pattern with the restriction pattern of a Reproductive and / or growth and / or carcass gene Genes that the desired Has or does not have markers.
Wenn ein Tier für den gewünschten Marker positiv getestet wird, kann es in einem Zuchtprogramm verwendet werden. Wenn das Tier nicht positiv getestet wird kann es gemerzt und anderweitig verwandt werden.If an animal tests positive for the desired marker, it can be tested in one Breeding program can be used. If the animal is not tested positive, it can be flagged and used elsewhere.
In einer weiteren bevorzugten Anwendung wird das Reproduktions- und/oder Wachstums- und/oder Schlachtkörpergen aus dem genetischen Material mittels Oligonukleotidprimern und DNA-Polymerase isoliert und das Vorhandensein oder Fehlen des Markers mittels Massenspektrometrie, z. B. MALDI-TOF, nachgewiesen.In a further preferred application, the reproduction and / or growth and / or carcass genes from the genetic material using oligonucleotide primers and DNA polymerase isolated and the presence or absence of the marker by means of Mass spectrometry, e.g. B. MALDI-TOF.
In einer besonders bevorzugten Anwendung wird das Gen oder ein Teil davon, der die Polymorphismen enthält, mittels Oligonukleotidprimern und DNA-Polymerase isoliert.In a particularly preferred application, the gene or a part thereof, which is the Contains polymorphisms, isolated by means of oligonucleotide primers and DNA polymerase.
Nachfolgend wird die amplifizierte Region entweder direkt aufgetrennt oder sequenziert, oder sie wird mit Restriktionsenzymen behandelt und die Fragmente danach aufgetrennt. Die Sichtbarmachung der Fragmente kann durch Färben der Fragmente, durch Markierung der Primer oder der dNTPs erfolgen. Vorteilhafte oder nachteilige Allele werden durch Vergleich mit Allelen aus Referenzproben identifiziert. The amplified region is then either directly separated or sequenced, or it is treated with restriction enzymes and the fragments are then separated. The The fragments can be visualized by staining the fragments, by marking the fragments Primer or the dNTPs are done. Favorable or disadvantageous alleles are identified by comparison identified with alleles from reference samples.
In einer weiteren Anwendung kann genetisches Material, wie z. B. genomische DNA, mit Restriktionsenzymen verdaut, in einer geeigneten Matrix aufgetrennt und nach Denaturierung entweder direkt in der Matrix oder nach Transfer auf eine geeignete andere Matrix (Southern transfer) durch Hybridisierung mit homologen oder heterologen Gensonden hybridisiert und der als Marker dienende Polymorphismus dargestellt werden.In another application, genetic material, such as e.g. B. genomic DNA with Restriction enzymes digested, separated in a suitable matrix and after denaturation either directly in the matrix or after transfer to a suitable other matrix (Southern transfer) hybridized by hybridization with homologous or heterologous gene probes and the serving as a marker polymorphism.
In einer anderen Anwendung beinhaltet die Erfindung eine Methode zur Identifizierung genetischer Marker für Reproduktions- und/oder, Wachstums- und/oder Schlachtkörpermerkmale wie z. B. größere Würfe, höhere tägl. Zunahme, höheren Magerfleischanteil in einer einzelnen Population. Männliche und weibliche Tiere derselben Rasse oder einer Rassenkreuzung oder einer genetischen Linie werden angepaart und z. B. die Anzahl Nachkommen pro weiblichem Tier, die tägl. Zunahme, der Magerfleischanteil der Tiere bestimmt. Ein Polymorphismus wird im Reproduktions- und/oder Wachstums- und/oder Schlachtkörpergen identifiziert und mit dem erwünschten Reproduktions- und/oder, Wachstums- und/oder Schlachtkörpermerkmal assoziert. Um den jeweiligen Polymorphismus nachzuweisen wird ein PCR-RFLP bevorzugt (vgl. z. B. Abb. 4).In another application, the invention includes a method for identifying genetic markers for reproductive and / or growth and / or carcass traits such as. B. larger litters, higher daily increase, higher percentage of lean meat in a single population. Male and female animals of the same breed or a cross breed or a genetic line are mated and z. B. determines the number of offspring per female animal, the daily increase, the lean meat percentage of the animals. A polymorphism is identified in the reproductive and / or growth and / or carcass gene and associated with the desired reproductive and / or, growth and / or carcass characteristic. To detect the respective polymorphism, a PCR-RFLP is preferred (see e.g. Fig. 4).
Es ist möglich, genetische Kopplung zwischen bestimmten Allelen alternativer DNA-Marker und Allelen, die mit einem bestimmten Gen (z. B. den hier beschriebenen Reproduktions- und/oder Wachstums- und/oder Schlachtkörpergenen) assoziert sind und für die eine Assoziation mit einem bestimmten Merkmal nachgewiesen wurde, herzustellen. Es ist daher auch möglich mit anderen, an ein bestimmtes Reproduktions- und/oder Wachstums- und/oder Schlachtkörpergen gekoppelten Markern Tiere zu selektieren, die z. B. größere Würfe, höhere tägl. Zunahme, höheren Magerfleischanteil aufweisen, oder gegen solche Tiere zu selektieren, die diese vorteilhaften Phänotypen nicht zeigen. Marker die mit α-Inhibin- (INHA)- oder βA- inhibin/activin (INHBA) eng gekoppelt sind, sind z. B. Mikrosatellitenmarker; aber auch andere gekoppelte Marker können verwendet werden.It is possible to link genetically between certain alleles of alternative DNA markers and alleles which are associated with a certain gene (e.g. the reproductive and / or growth and / or carcass genes described here) and for which an association with a certain characteristic has been established. It is therefore also possible to use other markers coupled to a specific reproductive and / or growth and / or carcass gene to select animals which, for. B. larger litters, higher daily. Increase, higher percentage of lean meat, or to select against those animals that do not show these advantageous phenotypes. Markers that are closely linked to α-inhibin (INHA) - or β A - inhibin / activin (INHBA) are e.g. B. microsatellite markers; but other linked markers can also be used.
Weiterhin können zum Nachweis der Polymorphismen Verfahren wie z. B. TaqMan™ (Perkin Elmer), Single Strand Conformation Polymorphism (SSCP), RFLP-Analyse, Denaturing Gradient Gel Elektrophorese (DGGE), Temperature Gradient Electrophoresis, Ligase Chain Reaction, oder die Sequenzierung des Reproduktions- und/oder Wachstums- und/oder Schlachtkörpergens verwendet werden. Furthermore, to detect the polymorphisms, methods such. B. TaqMan ™ (Perkin Elmer), Single Strand Conformation Polymorphism (SSCP), RFLP analysis, denaturing Gradient gel electrophoresis (DGGE), temperature gradient electrophoresis, ligase chain Reaction, or the sequencing of the reproductive and / or growth and / or Carcass gene are used.
Primer INHA1 (5'-CACATATGTATTCCGGCC-3'), 10 pmol
Primer INHA2 (5'-CCGTCTCGTACTTAAAG-3'), 10 pmol
Reaktionsvolumen: 25 µl
DNA-Template: 50 ng
dNTPs: 200 µM (Amersham-Pharmacia)
Polymerase: 0,5 U Pwo DNA Polymerase (Hybaid)
MgSO4 Primer INHA1 (5'-CACATATGTATTCCGGCC-3 '), 10 pmol
Primer INHA2 (5'-CCGTCTCGTACTTAAAG-3 '), 10 pmol
Reaction volume: 25 µl
DNA template: 50 ng
dNTPs: 200 µM (Amersham-Pharmacia)
Polymerase: 0.5 U Pwo DNA Polymerase (Hybaid)
MgSO 4
: 1 mM
PCR-Puffer: 2,5 µl (100 mM Tris-HCl, pH 8.8, 250 mM KCl)
Zyklen, Zeiten, Temperaturen: 94°C (1.5 min), gefolgt von 35 Zyklen bei 94°C (.5 min), 52°C
(1.5 min) und 72°C (1.5 min), mit einer finalen Extension bei 72°C für 5 min
Gerät: Gene Amp PCR System 2400 (Perkin Elner).
Produkt: siehe : 1 mm
PCR buffer: 2.5 µl (100 mM Tris-HCl, pH 8.8, 250 mM KCl)
Cycles, times, temperatures: 94 ° C (1.5 min), followed by 35 cycles at 94 ° C (.5 min), 52 ° C (1.5 min) and 72 ° C (1.5 min), with a final extension at 72 ° C for 5 min
Device: Gene Amp PCR System 2400 (Perkin Elner).
Product: see
Abb.Illustration
11
Primer INHBA1 (5'-CTCCACGATCATGTTCTG-3'), 10 pmol
Primer INHBA2 (5'-AGAACCTGTTCGTGGTAC-3'), 10 pmol
Reaktionsvolumen: 25 µl
DNA-Template: 50 ng
dNTPs: 200 µM (Amersham-Pharmacia)
Polymerase: 0,5 U Taq DNA Polymerase (Hybaid)
MgCL2 Primer INHBA1 (5'-CTCCACGATCATGTTCTG-3 '), 10 pmol
Primer INHBA2 (5'-AGAACCTGTTCGTGGTAC-3 '), 10 pmol
Reaction volume: 25 µl
DNA template: 50 ng
dNTPs: 200 µM (Amersham-Pharmacia)
Polymerase: 0.5 U Taq DNA Polymerase (Hybaid)
MgCL 2
: 1 mM
PCR-Puffer: 2,5 µl (100 mM Tris-HCl, pH 8.8, 250 mM KCl)
Zyklen, Zeiten, Temperaturen: 94°C (1.5 min), gefolgt von 35 Zyklen bei 94°C (.5 min), 52°C
(1.5 min) und 72°C (1.5 min), mit einer finalen Extension bei 72°C für 5 min
Gerät: Gene Amp PCR System 2400 (Perkln Eimer).
Produkt: siehe : 1 mm
PCR buffer: 2.5 µl (100 mM Tris-HCl, pH 8.8, 250 mM KCl)
Cycles, times, temperatures: 94 ° C (1.5 min), followed by 35 cycles at 94 ° C (.5 min), 52 ° C (1.5 min) and 72 ° C (1.5 min), with a final extension at 72 ° C for 5 min
Device: Gene Amp PCR System 2400 (Perkln bucket).
Product: see
Abb.Illustration
11
Claims (36)
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE10121225A DE10121225A1 (en) | 2001-04-30 | 2001-04-30 | Identifying animals, particularly pigs, with desirable breeding traits comprises analyzing polymorphisms in the alpha-inhibin and betaA-inhibin/activin genes |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE10121225A DE10121225A1 (en) | 2001-04-30 | 2001-04-30 | Identifying animals, particularly pigs, with desirable breeding traits comprises analyzing polymorphisms in the alpha-inhibin and betaA-inhibin/activin genes |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
DE10121225A1 true DE10121225A1 (en) | 2002-10-31 |
Family
ID=7683306
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
DE10121225A Withdrawn DE10121225A1 (en) | 2001-04-30 | 2001-04-30 | Identifying animals, particularly pigs, with desirable breeding traits comprises analyzing polymorphisms in the alpha-inhibin and betaA-inhibin/activin genes |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
DE (1) | DE10121225A1 (en) |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN109207609A (en) * | 2018-10-17 | 2019-01-15 | 佛山科学技术学院 | One kind SNP relevant to the chicken meat shape of growth and its application |
CN109266760A (en) * | 2018-11-20 | 2019-01-25 | 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所 | A method of based on INHA genetic test high mountain Merino reproductive capacity |
-
2001
- 2001-04-30 DE DE10121225A patent/DE10121225A1/en not_active Withdrawn
Cited By (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN109207609A (en) * | 2018-10-17 | 2019-01-15 | 佛山科学技术学院 | One kind SNP relevant to the chicken meat shape of growth and its application |
CN109207609B (en) * | 2018-10-17 | 2022-03-22 | 佛山科学技术学院 | SNP (Single nucleotide polymorphism) related to chicken growth traits and application thereof |
CN109266760A (en) * | 2018-11-20 | 2019-01-25 | 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所 | A method of based on INHA genetic test high mountain Merino reproductive capacity |
CN109266760B (en) * | 2018-11-20 | 2020-04-21 | 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所 | Method for detecting fertility of alpine merino based on INHA gene |
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