CZ20023662A3 - Sloučeniny a způsoby léčení a prevence bakteriální infekce - Google Patents

Sloučeniny a způsoby léčení a prevence bakteriální infekce Download PDF

Info

Publication number
CZ20023662A3
CZ20023662A3 CZ20023662A CZ20023662A CZ20023662A3 CZ 20023662 A3 CZ20023662 A3 CZ 20023662A3 CZ 20023662 A CZ20023662 A CZ 20023662A CZ 20023662 A CZ20023662 A CZ 20023662A CZ 20023662 A3 CZ20023662 A3 CZ 20023662A3
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
group
mutant
pore
ser
asn
Prior art date
Application number
CZ20023662A
Other languages
English (en)
Inventor
R. John Collier
Bret R. Sellman
Original Assignee
President And Fellows Of Harvard College
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by President And Fellows Of Harvard College filed Critical President And Fellows Of Harvard College
Publication of CZ20023662A3 publication Critical patent/CZ20023662A3/cs

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/02Bacterial antigens
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/195Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
    • C07K14/32Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Bacillus (G)
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/04Antibacterial agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)

Description

Oblast techniky
Předkládaný vynález se týká sloučenin a způsobů léčení bakteriálních infekcí, jako je infekce antraxem.
Dosavadní stav techniky
Původce antraxu (Bacillus anthracis) je potenciální hrozbou jako prostředek biologické války nebo biologického terorismu, protože vystavení aerosolizovaným sporám B. anthracis je pro savce, jako je člověk, smrtelné. Hlavní faktory virulence produkované tímto organismem jsou kapsle z poly-D-glutamové kyseliny a antraxový toxin (ATx). Jak kapsle, tak toxin pomáhají bakteriím při kolonizaci a úniku imunitnímu systému. Samotný ATx dokáže způsobit smrt hostitele. Očkování proti toxinu chrání hostitele před infekcí.
Atraxový toxin je členem skupiny bakteriálních toxinů označovaných jako A-B toxiny. A-B toxiny se skládají ze dvou skupin; skupina A je enzymatická část toxinu, která katalyzuje toxický účinek na cytoplazmatický cíl v cílové buňce. Skupina B se váže na buněčný receptor a usnadňuje přestup skupiny a skrz buněčnou membránu do buněčné cytoplasmy. B skupiny z A-B toxinů tetanu, botulinu, diftérie a antraxu tvoří v membránách kanály. Předpokládá se, že tyto kanály případně slouží jako průchod pro přestup skupiny A skrz membránu. Skupiny A a B antraxového toxinu jsou v bakteriálních buňkách exprimovány jako oddělené polypeptidy. A a B podjednotky dalších A-B toxinů jsou produkovány jako polypeptidy s jedním řetězcem nebo jako oddělené řetězce, které jsou sestaveny do oligomerních toxinů ještě před uvolněním z baktérie. Existují dvě alternativní podjednotky antraxového toxinu nazývané jako edémový faktor (EF) a letální faktor (LF). Nekovalentní • · komplexy EF nebo LF a podjednotky B, ochranného antigenu (PA), se nazývají edémový toxin a letální toxin. PA usnadňuje přestup EF a LF skrz membránu.
PA je exprimován jako monomerní polypeptid o velikosti 83 kDa. Monomerní PA se váže k povrchovému receptoru savčí buňky a je proteolyticky štěpen. C-koncový fragment o velikosti (63 kDa) (PA63) zůstává vázán na buňku a N-koncový fragment o velikosti 20 kDa (PA20) se od PA63 odpojí. Toto proteolytické štěpení a následné odpojení PA20 propůjčuje PA63 dvě nové vlastnosti: (1) schopnost oligomerovat do heptamerní struktury kruhového tvaru rozpojitelné pomocí SDS, která se nazývá prepór, a (2) schopnost vázat EF a LF. Oligomery obsahující PA63-EF, PA63-LF nebo kombinaci PA63-EF a PA63-LF jsou endocytosovány a přesouvány do kyselé části, kde se PA63 prepór vkládá do membrány a vytvoří pór. Během, nebo po vytvoření póru, EF a LF přestupují skrz endosomální membránu do cytoplasmy. EF je calmodulin dependentní adenylátová cyklasa, která dokáže chránit baktérii před zničením fagocyty. LF je metaloproteasa, která dokáže ničit makrofágy, nebo, v nižších koncentracích, vyvolat nadprodukci cytokinů makrofágy, což může vést ke smrti hostitele.
Kritický krok v této intoxikační cestě je vytvoření póru pomocí PA. Nízká hodnota pH slouží jako spouštěcí impuls pro přeměnu PA63 prepóru na pór. Tato přeměna je doprovázena transformací oligomeru ze stavu podléhajícího disociaci SDS na stav odolný SDS a vytvořením transmembránového β-válce sestávajícího ze 14 řetězců. Předpokládá se, že tyto kroky jsou nutné pro přestup EF a LF přes endosomální membránu a tím jsou nutné i pro působení toxinu.
Podstata vynálezu
Shrnutí vynálezu
V prvním aspektu poskytuje předkládaný vynález skupinu B tvořící pór z binárního toxinu A-B. Skupina B obsahuje mutaci, která vede k inhibici její schopnosti tvořit pór. V jednom vhodném provedení vede tato mutace u proteinu k inhibici schopnosti tvořit pór in vivo. V dalším vhodném provedení nemá mutantní skupina B dostatečnou schopnost tvorby póru in vitro a/nebo in vivo. V dalším vhodném provedení je skupina b ochranný antigen (PA) antraxu. V ještě dalším vhodném provedení má mutantní PA aminokyselinovou sekvenci, která je přinejmenším z 80 %, 90 %, 95 % nebo 98 % identická se sekvencí přirozeného PA proteinu (jako je sekvence id. č. 21, obr. 13) a má jednu z následujících mutací: K397A, K397D,
K397C, K397Q, D425A, D425N, D425E, D425K, F427A, K397 + D425K dvojitou mutaci, K395D + K397D + D425K + D426K čtyřnásobnou mutaci, K397D + D425K + F427A trojitou mutaci, F427A + AD2L2 dvojitou mutaci, K397D + F427A + AD2L2 trojitou mutaci, F427A + AD2L2 dvojitou mutaci, K397D + D425K + F427A + AD2L2 čtyřnásobnou mutaci, F427D nebo F427K. V dalším vhodném provedení má mutantní PA stejnou sekvenci jako kterákoliv ze sekvencí id. č. 1 až 11 a 13 až 18 (tabulka 1) . Další vhodné mutantní PA zahrnují PA mutanty, ve kterých je zbytek 397 jakákoliv aminokyselina s výjimkou lysinu (sekvence id. č. 19), PA mutanty, ve kterých je zbytek 425 jakákoliv aminokyselina s výjimkou kyseliny asparagové (sekvence id. č. 20), PA mutanty, ve kterých je zbytek 427 jakákoliv aminokyselina s výjimkou fenylalaninu (sekvence id. č. 23) a mutantní PA, které mají mutaci v doméně 2 (zbytky 259 až 487). Další vhodné mutantní skupiny B zahrnují toxiny Clostridium difficile, C. perfringens, C. spiroforme, C. botulinum, Bacillus cereus nebo B. thuringiensis, které mají jednu nebo více mutací vypsaných v tabulce 6 nebo mají mutaci v oblasti, která odpovídá doméně 2 v PA. Fragmenty výše uvedených mutantních skupin B, ve kterých má fragment sníženou schopnost tvořit pór v porovnání s přirozenou skupinou B odpovídajícího toxinu, také spadají do předkládaného vynálezu. Do předkládaného vynálezu také spadají fúzní proteiny, které mají mutantní skupinu B podle předkládaného vynálezu nebo fragment takové mutantní skupiny B kovalentně vázaný k j inému polypeptidu nebo proteinu. Z prvního aspektu předkládaného vynálezu je vyloučeno vynechání aminokyselin 302 až 325 (smyčka D2L2) v PA.
V druhém aspektu poskytuje předkládaný vynález prostředek očkovací látky, který má mutantní skupinu B z prvního aspektu nebo AD2L2 PA (mutantní PA, ve kterém jsou vynechány zbytky 302 až 325) nebo jeho fragment, ve farmaceuticky přijatelném nosiči. Ve vhodném provedení lze očkovací látku deaktivovat chemickými nebo fyzikálními prostředky.
Ve třetím aspektu předkládaný vynález poskytuje způsoby prevence nebo léčení bakteriální infekce u savce jako je člověk. Tento způsob zahrnuje podávání očkovací látky z druhého aspektu savci. V jednom vhodném provedení je očkovací látka podávána s farmaceuticky přijatelným nosičem nebo adjuvans. Očkovací látku lze podávat orálně, intramuskulárně, intravenózně, subkutánně, inhalací nebo jakoukoliv jinou cestou vhodnou pro poskytnutí dávky dostatečné pro prevenci nebo léčení bakteriální infekce. V dalším žádaném provedení se očkovací látka, která obsahuje mutantní ochranný antigen antraxu, podává pro prevenci nebo léčení infekce antraxem.
Ve čtvrtém aspektu poskytuje předkládaný vynález mutantní skupinu B tvořící pór z binárního toxinu A-B. Mutantní skupina B obsahuje mutaci, která vede k inhibici její schopnosti tvořit pór. Mutantní skupina B také inhibuje schopnost tvořit pór u přirozené skupiny B u odpovídajícího toxinu in vitro a/nebo in vivo. V jednom vhodném provedení vede tato mutace k inhibici schopnosti tvořit pór u proteinu in vivo. V dalším vhodném provedení nemá mutantní skupina B dostatečnou schopnost tvořit pór in vitro a/nebo in vivo. V ještě dalším « · · • · ··· · vhodném provedení je skupina B ochranný antigen (PA) antraxu. Mutantní skupina B se případně váže ke skupině A odpovídajícího toxinu. Například mutantní PA se případně váže k A skupinám edémového faktoru nebo letálního faktoru. Mutantní skupina B případně soutěží s přirozenou skupinou B ve vazbě k receptoru na povrchu savčí buňky. Mutantní skupina B se případně také váže k přirozené skupině B odpovídajícího toxinu. Takový mutant případně oligomeruje s přirozenou skupinou B tak, že vznikne komplex, který má sníženou schopnost tvořit pór. V jednom vhodném provedení nemá komplex dostatečnou schopnost tvořit pór a tím i převést skupinu A (např. EF nebo LF) přes membránu do cytoplasmy hostitelské buňky.
V jednom vhodném provedení čtvrtého aspektu má mutantní PA aminokyselinovou sekvenci, která je přinejmenším z 80 %, 90 %, 95 % nebo 98 % identická se sekvencí přirozeného PA proteinu (jako je sekvence id. č. 21, obr. 13) a má jednu z následujících mutací: K397 + D425K dvojitou mutaci, ŮD2L2 (ve které jsou odstraněny zbytky 302 až 325 PA), K395D + K397D + D425K + D426K čtyřnásobnou mutaci, D425K, F427A, K397D + D425K + F427A trojitou mutaci, F427A + AD2L2 dvojitou mutaci, K397D + F427A + AD2L2 trojitou mutaci, K397D + D425K + F427A + AD2L2 čtyřnásobnou mutaci, F427D nebo F427K. V dalším vhodném provedení má mutantní PA stejnou sekvenci jako kterákoliv ze sekvencí id. č. 8 až 18 (tabulka 1) . V dalším provedení je v přirozeném PA změněna aminokyselina 395, 397, 425, 426 nebo jejich kombinace. V ještě dalším provedení je v PA změněn zbytek v doméně 2. V dalším vhodném provedení je v mutantu vynecháno alespoň 5, alespoň 10 nebo alespoň 20 aminokyselin v D2L2 smyčce PA nebo odpovídajícího regionu skupiny B jiného binárního toxinu A-B tvořícího pór. Mutant má případně vynechánu celou nebo část smyčky D2L2 a vynechány aminokyseliny, které jsou N- nebo C- koncové ke smyčce. Další vhodné mutantní skupiny B zahrnují toxiny Clostridium • ·
J ·· • · » ♦ * · · : · · • · · · · difficile, C. perfringens, C. spiroforme, C. botulinum, Bacillus cereus nebo B. thuringiensis, které mají jednu nebo více mutací vypsaných v tabulce 6 nebo mají mutaci v oblasti, která odpovídá doméně 2 v PA. Fragmenty výše uvedených mutantních skupin B, ve kterých má fragment sníženou schopnost tvořit pór v porovnání s přirozenou skupinou B odpovídajícího toxinu a inhibují schopnost tvořit pór u přirozené skupiny B, také spadají do předkládaného vynálezu. Do předkládaného vynálezu také spadají fúzní proteiny, které mají mutantní skupinu B podle předkládaného vynálezu nebo fragment takové mutantní skupiny B kovalentně vázaný k j inému polypeptidu nebo proteinu.
V pátém aspektu se předkládaný vynález týká způsobu prevence nebo léčení bakteriální infekce u savce jako je člověk. Tento způsob zahrnuje podávání mutantní skupiny B podle čtvrtého aspektu nebo jejího fragmentu, která inhibuje schopnost tvořit pór u přirozené skupiny B, savci. V jednom provedení se PA mutant podle čtvrtého aspektu nebo jeho fragment podává jako prevence nebo pro léčení infekce antraxem u savců, kteří byli vystaveni působení spor B. anthracis. V dalším provedení se protein podává profylakticky. V jednom vhodném provedení se mutantní skupina B podává s farmaceuticky vhodným nosičem. Mutant lze podávat orálně, intramuskulárně, intravenózně, subkutánně, inhalací nebo jakoukoliv jinou cestou vhodnou pro poskytnutí dávky dostatečné pro prevenci nebo léčení infekce antraxem. V jednom provedení tento způsob také zahrnuje podávání protilátky skupiny anti-B, jako je protilátka, která váže přirozenou skupinu B, ale ne dominantní negativní mutantní skupinu B, savci. V jednom konkrétním provedení se protilátka váže k přirozenému PA, ale ne k dominantnímu negativnímu PA mutantu.
V šestém aspektu poskytuje předkládaný vynález nukleovou kyselinu kódující mutantní skupinu B (např. mutantní PA) z prvního ze čtyř aspektů.
I* * · • ·
V sedmém aspektu se předkládaný vynález týká vektoru, který obsahuje nukleovou kyselinu podle šestého aspektu.
V osmém aspektu se předkládaný vynález týká čištěné protilátky, která se specificky váže k přirozenému PA nebo mutantnímu PA proteinu vypsanému v tabulce 1. V jednom provedeni se protilátka váže ke smyčce D2L2, K397, D425, D426 nebo F427 proteinu PA. Protilátka je případně monoklonální nebo polyklonální protilátka. V příbuzném aspektu se předkládaný vynález týká čištěné protilátky, která se specificky váže k přirozené skupině B binárního A-B toxinu tvořícího pór s větší afinitou než se váže ke skupině B podle předkládaného vynálezu z odpovídajícího toxinu. V dalším příbuzném aspektu se předkládaný vynález týká čištěné protilátky, která se specificky váže ke skupině B podle předkládaného vynálezu s vyšší afinitou než se váže k přirozené skupině B z odpovídajícího toxinu.
V jednom provedení prvního nebo čtvrtého aspektu jsou konkrétně vyloučeny takové molekuly PA jejichž jediná mutace je záměna zbytku umístěného na hydrofilní straně transmembránového póru za cystein. V dalším provedení těchto aspektů jsou konkrétně vyloučeny takové molekuly PA jejichž jediná mutace je záměna aminokyseliny umístěné na hydrofilní straně transmembránového póru. V provedení konkrétně vyloučeném z prvního nebo čtvrtého aspektu jsou takové molekuly PA, které mají jako jedinou změnu mutaci v Glu302, HÍS304, Asn306, Glu308, His310, Ser312,
Asp315, Gly317, Ser319, Ser321, Gly323 přirozeného PA. V jednom provedení těchto aspektů jsou konkrétně vyloučeny molekuly PA, které mají jako jedinou mutaci změnu aminokyselinové sekvence ve smyčce D2L2. V dalším provedení jsou konkrétně vyloučeny molekuly PA, které mají jako jedinou mutaci změnu nebo vynechání aminokyseliny, která tvoří transmembránový pór. V dalším provedení je konkrétně vyloučen AD2L2 PA. V dalším provedení jsou z jednoho z těchto
Phe313, Phe314, nebo Ser325 u • ·
aspektů konkrétně vyloučeny molekuly PA, které mají C-koncový tryptický fragment o velikosti 63 kDA (PA63) a mají jako jedinou mutaci změnu aminokyseliny, která tvoří trasmembránový pór. V různých dalších provedeních konkrétně vyloučených z jednoho z těchto aspektů jsou další pór tvořící binární toxiny A-B, které mají mutaci odpovídající konkrétně vyloučené mutaci PA. V různých provedeních těchto aspektů, váže mutantní skupina B přirozenou skupinu B z téhož toxinu A-B s vyšší rovnovážnou konstantou (tj . s vyšší afinitou) než váže přirozená skupina B jiné přirozené molekuly z téhož toxinu A-B. Ve vhodných provedeních váže mutantní protein PA přirozený PA s alespoň 2, 5, 10 nebo 20 krát vyšší afinitou než přirozený PA váže jiné přirozené molekuly PA.
Je třeba chápat, že i jiné toxiny tvořící pór, kromě toxinu antraxu, lze také použít ve sloučeninách a způsobech podle předkládaného vynálezu. Například toxiny tvořící pór, jako jsou jiné toxiny A-B, mající mutace (např. bodové mutace nebo mutace vynecháním), které inhibují schopnost toxinu tvořit pór nebo inhibují schopnost přirozeného toxinu tvořit pór spadají do předkládaného vynálezu. Toxiny tvořící pór s těmito mutacemi lze použít do prostředků očkovacích látek nebo způsobů podle předkládaného vynálezu pro prevenci nebo léčení infekce etiologickým činidlem toxinu. Lze použít i jiné binární toxiny A-B, i když tímto výčtem není vynález nijak omezen, heterooligomerní toxiny (toxiny AB5), jako je toxin cholery, nebo toxiny A-B s jediným polypeptidem, jako je toxin tetanu, botulin nebo diftérie. Další toxiny, které lze použít zahrnují α-hemolysin ze Staphylococcus aureus, aerolysin z Aeromonas hydrophila, α-toxin z Clostridium septicum a cytotoxin z Pseudomonas aeruginosa. Předkládaný vynález se také týká jakéhokoliv dalšího toxinu tvořícího pór, jako jsou cholesterol dependentní cytolysiny, hexamerní toxiny nebo heptamerní toxiny. Příklady hexamerních a heptamerních toxinů zahrnují toxiny, které jsou příbuzné k a-toxinu • · · ··
» «
Staphylococcus. V jednom provedení je konkrétně vyloučen mutant vznikly vynecháním z toxinu VacA z Helicobacter pylori.
„Mutace znamená změnu v sekvenci nukleové kyseliny tak, že aminokyselinová sekvence kódovaná sekvencí nukleové kyseliny má alespoň jednu změnu v aminokyselinové sekvenci v porovnání s přirozenou sekvencí. Mutace je případně, ale tímto výčtem není nijak omezena, mutace vložením, mutace vynecháním, mutace posunutím rámce nebo mutace s chybným smyslem.
„Toxin tvořící pór znamená toxin, který tvoří transmembránový vodný pór.
„Toxin A-B tvořící pór znamená toxin tvořící pór se dvěma funkčními skupinami; jedné skupiny (B), která tvoří pór v ochranné membráně buňky hostitele, a druhé skupiny (A) , která prochází skrz ochrannou membránu a enzymaticky modifikuje konkrétní substráty uvnitř buňky hostitele.
„Binární toxin A-B tvořící pór znamená toxin A-B tvořící pór, ve kterém skupiny A a B toxinu tvořícího pór jsou oddělené proteiny a interaguj í během intoxikace buňky hostitele. Příkladem binárního toxinu je toxin antraxu.
„Skupina B znamená složku toxinu A-B tvořícího pór, která se váže na konkrétní povrchový receptor hostitelské buňky, interaguje se skupinou A toxinu a pomáhá skupině a dostat se do buňky. Mnoho skupin B, jako je PA, také tvoří
transmembránové póry. (PA) označuje polypeptid, který má
„Ochranný antigen
alespoň 60 %, 70 %, 80 % nebo 90 % alespoň j edné z
biologických aktivit PA polypeptidu antraxu popsaného
v předkládaném vynálezu. Polypeptid je případně kódován genem
PA, který popsal Vodkin a kol. (Cell, 34: 693 až 697, 1983).
Polypeptid je případně shodný s přirozeným PA popsaným Millerem a kol. (Biochemistry 38(32): 10432 až 10441, 1999) (sekvence id. č. 21) nebo jiným přirozeným PA polypeptidem z kmenu Bacillus anthracis. PA polypeptid lze případně • ·· *» ·· * 4 » 4 » » « • · · · klonovat a exprimovat v heterologním hostiteli, jako je Escherichia coli nebo Bacillus subtilis. Rozumí se, že homology a analogy, které mají charakteristiky PA antraxu, jsou také popsané v předkládaném vynálezu a lze je použít ve způsobech podle předkládaného vynálezu.
„PA63 znamená karboxy-koncovou část, která vzniká z proteolytického odštěpením N-koncového segmentu o velikosti 2 0 kDa z PA polypeptidu. PA63 tvoří heptamerní prepór a váže dvě alternativní skupiny A, edémový faktor (EF) a letální faktor (LF). Celý komplex se přesouvá do endosomu, kde se PA63 vpravuje do membrány, tvoří transmembránový pór a přemisťuje EL a LF do cytoplasmy hostitelské buňky.
„Transmembránový pór znamená transmembránový vodný kanál. Například transmembránový pór je případně β-válcovitý kanál tvořený střídavě hydrofilními a hydrofobními zbytky PA63 tak, že hydrofobní zbytky tvoří vnější část povrchu válce přiléhajícího k membráně a hydrofilní zbytky sousedí s vodným lumenem póru, který se rozprostírá napříč membránou hostitelské buňky.
„Hydrofilní povrch transmembránového póru znamená aminokyseliny PA, které sousedí s vodným lumenem póru, který se rozprostírá napříč membránou hostitelské buňky.
„Aminokyselina, která tvoří transmembránový pór znamená aminokyselinu PA, která je umístěna v β-válcovitém kanálu transmembránového póru.
„Smyčka D2L2 znamená amfipathickou smyčku, která spojuje vlákna 2β2 a 2β3 PA polypeptidu a PA63 polypeptidu, jak je popsáno v předkládaném vynálezu.
„Inhibice schopnosti tvořit pór znamená snížení množství pórů vytvořených v membránách nebo snížení rychlosti nebo množství skupiny A (např. EF nebo LF) která se přemístí do cytoplasmy hostitelské buňky. Toto snížení vzniku póru nebo přemístění toxinu je přímo úměrné k, a lze jej předpovědět, snížení aktivity při přemisťování přes povrch buňky, LFnDTA • · toxicitě nebo testu uvolňování rubidia, který je popsaný v předkládaném vynálezu. Tato snížená aktivita je přímo úměrná snížení množství radioaktivně značeného ligandu, který se přemístí do buněk, při testu přestupu buněčným povrchem, snížení inhibice proteinové syntézy díky přemístění ligandu do buněk v testu LFnDTA toxicity nebo snížení uvolňování radioaktivně značených iontů z buněk při testu uvolňování rubidia. Navíc je tato snížená aktivita přímo úměrná snížení toxicity způsobené přemístěním toxického ligandu do buněk. V jednom vhodném provedení je snížení tvorby póru nebo přemístění skupiny A alespoň 20 %, vhodněji alespoň 40 % a nejvhodněji alespoň 80 % relativně k přirozené skupině B odpovídajícího toxinu. V dalším vhodném provedení je snížení tvorby póru nebo přemístění EF nebo LA mutantním PA alespoň 20 %, vhodněji alespoň 40 % a nejvhodněji alespoň 80 % relativně k přirozenému PA63.
„Nedostatek schopnosti tvořit pór znamená, že se netvoří významné množství pórů v membránách nebo se nepřemísťuje významné množství EF nebo LF do cytoplasmy hostitelské buňky. Tento nedostatek významné tvorby pórů nebo aktivity při přemisťování toxinu je přímo úměrný k, a lze jej předpovědět, snížení aktivity při přemisťování přes povrch buňky, LFnDTA toxicitě nebo testu uvolňování rubidia, který je popsaný v předkládaném vynálezu. V jednom vhodném provedení je množství vznikajících pórů nebo množství přemístěného toxinu méně než pětinásobek množství detekovaného v kontrolním testu provedeném bez PA. Vhodněji je množství méně než dvojnásobek množství detekovaného v kontrolním testu provedeném bez PA.
„Fragment znamená polypeptid, který má oblast po sobě jdoucích aminokyselin, které jsou stejné jako v případě odpovídající oblasti v mutantním PA. Fragment má buď sníženou schopnost tvořit póry nebo přemisťovat toxiny v porovnání s přirozeným PA. Fragment také případně inhibuje schopnost přirozeného PA tvořit pór. Toto snížení vzniku póru nebo ’
♦ ·♦ *· ·· # β » ♦ · * · · · · · • · · · · · • · · · · • · · ·** · · * ♦· 9 · přemístění toxinu je přímo úměrné k, a lze jej předpovědět, snížení aktivity při přemisťování přes povrch buňky, LFnDTA toxicitě nebo testu uvolňování rubidia, který je popsaný v předkládaném vynálezu. Tato snížená aktivita je přímo úměrná snížení množství radioaktivně značeného ligandu, který se přemístí do buněk, při testu přestupu buněčným povrchem, snížení inhibice proteinové syntézy díky přemístění ligandu do buněk v testu LFnDTA toxicity nebo snížení uvolňování radioaktivně značených iontů z buněk při testu uvolňování rubidia. V jednom vhodném provedení je snížení tvorby póru nebo přemístění EF nebo LF alespoň 20 % relativně k přirozenému PA63. Vhodněji je toto snížení alespoň 40 % relativně k přirozenému PA63 a nejvhodněji je toto snížení alespoň 80 %. Inhibice schopnosti tvořit pór v porovnání s přirozeným PA je přímo úměrná k, a lze ji předpovědět, snížení aktivity ve výše popsaném testu za použití ekvimolární směsi přirozeného PA a PA fragmentu v porovnání s použitím přirozeného PA samostatně. V jednom vhodném provedení je snížení alespoň 20 %, 40 %, 60 %, 80 % nebo 99 % v porovnání s aktivitou při použití přirozeného PA samostatně. Vhodné je, aby fragment byl imunogenní a vyvolával produkci ochranných protilátek proti přirozenému PA. V dalším vhodném provedení podávání fragmentu savci, jak je popsáno v příkladu 9, brání nebo oslabuje infekci antraxem po dobu alespoň 1 měsíce, vhodněji 3 měsíců nebo nejvhodněji 6měsíců. Příklady možných fragmentů zahrnují C-koncový tryptický fragment PA mutantu o velikosti 63 kDA nebo mutantní PA, který obsahuje vynechání aminokyselin, které tvoří transmembránový pór.
„Čištěná protilátka znamená protilátku, která je alespoň ze 60 % hmotnostních zbavena proteinů a přirozených organických molekul, se kterými je přirozeně spojena. Vhodné je když je prostředek tvořen alespoň 75 % hmotnostními, vhodněji 90 % hmotnostními a nejvhodněji alespoň 99 % hmotnostními protilátky. Čištěnou protilátku lze získat
například afinitní chromatografií za použití rekombinantně produkovaného proteinu nebo peptidů s konzervativním motivem a standardními technikami.
„Specificky váže znamená, že protilátka rozpoznává a váže se k, například, přirozenému PA nebo mutantnímu PA, ale v podstatě nerozpoznává a neváže se k jiným molekulám, které nejsou PA, ve vzorku, např. biologickém vzorku, který přirozeně obsahuje proteiny. Vhodná protilátka specificky váže jakýkoliv z mutantních PA č. 1 až 18 v Tabulce 1. Další vhodné protilátky váží PA přirozeného typu s alespoň 2, 5, 10 nebo 20 krát vyšší afinitou než váží jeden nebo více z mutantních PA z Tabulky 1.
Shodnost sekvence se typicky měří za použití software pro sekvenční analýzu se standardními parametry, které jsou v něm uvedeny (např. Sequence Analysis Software Package z Genetics Computer Group, University of Wisconsin Biotechnology Center, 1710 University Avenue, Madison, WI 53705). Tento program porovnává podobné sekvence tak, že přiřazuje určitý stupeň homologie různým nahrazením, vynecháním a dalším úpravám. Konzervativní nahrazení typicky zahrnují nahrazení v následujících skupinách: glycin, alanin, vylin, isoleucin, leucin; kyselina asparagová, kyselina glutamová, aspraragin, glutamin,· serin, threonin; lysin, arginin; a fenylalanin, tyrosin.
Další rysy a výhody předkládaného vynálezu budou zřejmé z následujícího podrobného popisu.
Stručný popis obrázků
Obr 1. je schématická ilustrace intoxikační cesty ATx toxinu. PA složka ATx se váže na receptor na povrchu savčí buňky a dodává enzymové skupiny A toxinu, edémový faktor (EF) a letální faktor (LF), do cytosolu způsobem, který již byl popsán výše.
*· ♦ * ·· ♦ · • « I ««· ··
Obr. 2A je obrázek SDS-PAGE gelů ukazující vznik PA mutantních proteinů a vznik SDS-rezistentních oligomerů přirozeného typu, K397Q a AD2L2 PA. Obr. 2B je obrázek přirozeného gelu ukazující vznik prepórů přirozeného typu, K397A a D425A PA.
Obr. 3 je sloupcový graf ukazující množství 86Rb uvolněného z buněk zatížených 86Rb po inkubaci přirozeným typem, K397A nebo D425A PA v porovnání s kontrolou bez PA.
4A je sloupcový graf ukazující množství 35S-LFn
Obr. 4A
(N-konec 1-255
buňkami, které
D425A PA. Obr.
je graf ukazující snížené přemístění 35S-LFn do buněk, které je zprostředkováno K397A nebo D425A PA v porovnání s PA přirozeného typu.
Obr. 5 je graf ukazující procenta 3H-Leu v TCA nerozpustném podílu (proteinová frakce) po inkubaci buněk přirozeného typu, K397A nebo D425A PA v testu LFnDTA toxicity. Přemístění LFnDTA, který obsahuje LFn fúzovaný s A-řetězcem toxinu diftérie, do buněk vede k ribosylaci EF-2, což vede k inhibici proteinové syntézy a zvýšení množství 3H-Leu v proteinové frakci.
Obr. 6A je sloupcový graf ukazující podobnou vazbu 35S-LFn k buňkám inkubovaným s přirozeným typem, AD2L2, dvojitým mutantem K397D + D425K, nebo směsí přirozeného typu a AD2L2 nebo K397D + D425K PA. Obr. 6B je sloupcový graf ukazující snížení přemístění 35S-LFn zprostředkovaného PA přirozeného typu pomocí AD2L2 nebo K397D + D425K PA.
Obr. 7 je graf ukazující vyšší procento 3H-Leu v TCA nerozpustné frakci po inkubaci AD2L2 nebo K397D + D425K PA a PA přirozeného typu v porovnání s přirozeným typem PA samostatně. Tento výsledek je v souladu se snížením inhibice syntézy proteinů způsobené PA přirozeného typu v testu toxicity LFnDTA.
• · ♦ ♦ ·· ·# ·
Obr. 8A je graf ukazující snížení inhibice proteinů způsobené PA přirozeného typu v testu toxicity LFnDTA. Zvýšení koncentrací mutantních PA proteinů uvolňuje inhibici absorpce 3H-Leu do TCA nerozpustné frakce zprostředkovanou PA přirozeného typu. Obr. 8B je graf ukazující, že pro uvolnění inhibice absorpce 3H-Leu jsou potřeba mnohem vyšší množství PA-SSR relativně k PA přirozeného typu v porovnání s množstvími potřebnými pro mutanty vypsané v Obr. 8A.
Obr. 9 je graf ukazující snížení inhibice syntézy proteinů zprostředkované PA přirozeného typu v testu LFnDTA toxicity díky přítomnosti rostoucích koncentrací dominantního negativního PA mutantu. Vliv dominantních negativních mutantů K397D + D425K ( ), AD2L2 (), F427A (o), D425K (Δ) a K397D (0) a kontrolního mutantu SSSR ( ) jsou uvedeny v tomto obrázku.
Obr. 10 je graf ukazující snížení inhibice syntézy proteinů zprostředkované PA přirozeného typu v testu LFnDTA toxicity díky přítomnosti rostoucích koncentrací následujících dominantních negativních PA mutantů: K397D + D425K ( ), F427A + AD2L2 (□), K397D + D425K + F427A (o) a K397D + F427A + AD2L2 ( )
Obr. 11 je sloupcový graf ukazující inhibici proteinové syntézy heteroheptamerem vytvořeným smícháním PA přirozeného typu PA s mutantním PA (K397D + D425K, AD2L2, F427A nebo D425K) a pak štěpení molekul PA trypsinem. Také byla měřena inhibice proteinové syntézy ekvivalentním množstvím směsi 1 : 1 odpovídajícího mutantu a homoheptameru přirozeného typu.
Obr. 12 je čárový graf ukazující vliv dominantních negativních mutantů K397D + D425K, AD2L2, F427A a D425K na nízkým pH hnaný přesun 35S LFN přes plasmovou membránu. Uvedené výsledky jsou průměrem tří experimentů + exponenciálně vyrovnaný průměr.
Obr. 13 je aminokyselinová sekvence proteinu PA přirozeného typu použitá pro testy popsané v předkládaném vynálezu (sekvence id. č. 21) . PA mutantní proteiny popsané ·
• ·
4 4 44
4 44 4 ·
44 4
• 4 4 4
* 4 4
• ·
aktivitu. z Clostridium difficile („cpiota), C. spiroforme
C. perfringens botulinum (cbc2).
v předkládaném vynálezu jsou založeny na této sekvenci přirozeného typu.
Obr. 14 je polynukleotidová sekvence kódující PA protein přirozeného typu použitá pro testy popsané v předkládaném vynálezu (sekvence id. č. 22).
Obr. 15 je porovnání aminokyselinové sekvence PA s jinými binárními A-B toxiny, které mají ADP ribosyltransferasovou Vypsány jsou aminokyselinové sekvence toxinů („cdADPRT), ^„csiota) a C.
Toxiny C. perfringens a C. spiroforme jsou často označovány jako iota toxiny, zatímco botulinový toxin je označován jako C2. Dále porovnání zahrnuje sekvence toxinu produkovaného Bacillus cereus („VIP1), který je často označován jako VIP pro vegetativní insekticidní protein.
Obr. 16 je porovnání aminokyselinové sekvence PA s aminokyselinovou sekvencí toxinů z Clostridium difficile („cdADPRT), C. perfringens („cpiota), C. spiroforme („csiota) a C. botulinum (cbc2). Toto porovnání zahrnuje úplné sekvence toxinů.
Podrobný popis vynálezu
Nalezli jsme prostředky, kterými lze zastavit infekci bakteriemi produkujícími A-B toxin. Předkládaný vynález tak poskytuje prostředek pro použití jako protidávka ke konkrétním bakteriálním infekcím, včetně antraxu a gangrény. Protože tento prostředek je bezpečný a imunogenní, lze jej také použít jako očkovací látku.
Bylo zkonstruováno, exprimováno, čištěno a testováno mnoho mutantů PA antraxu, zda mají sníženou aktivitu v porovnání s PA přirozeného typu. Konkrétně byly tyto mutanty testovány na schopnost vázat PA ligandy a receptory; tvořit prepóry, SDS-rezistentní oligomery a póry; a přemisťovat ligandy přes membrány. Na základě rentgenové strukturní analýzy struktury
PA jsou mutantní zbytky navrženy tak, aby byly v lumenu PA prepóru. Mutantní PA nebo jejich fragmenty se sníženou nebo nedetekovatelnou schopností tvořit póry v membránách lze použít jako očkovací látky pro vytvoření ochranných protilátek, které budou bránit infekci antraxem. Navíc jsou případně tyto mutanty účinnější při léčení infekce antraxem než PA přirozeného typu, protože mají sníženou schopnost přemisťovat EF a LF produkovaný v Bacillus anthracis u infikovaného savce.
Tyto bodové mutanty a již dříve popsané mutanty vzniklé vynecháním, ve kterých chybí zbytky 302 až 325 domnělé smyčky 2 přemosťující membránu z domény 2 (AD2L2) (Miller a kol., Biochemistry 38: 10432 až 10441, 1999), byly dále charakterizovány tak, aby se zjistilo, zda jsou schopny působit jako dominantní negativní inhibitory snížení tvorby pórů pomocí PA přirozeného typu. Tato inhibice je případně důsledkem vazby ligandů nebo receptorů mutanty tak, že je méně molekul, které může PA přirozeného typu vázat. Mutanty také případně tvoří oligomery s PA přirozeného typu tak, že má sníženou nebo nedetekovatelnou schopnost tvořit póry a přemisťovat ligandy. Dominantní negativní PA mutanty a jejich fragmenty lze použít jako očkovací látku pro vytvoření ochranných protilátek pro prevenci nebo léčení infekce antraxem, jak již bylo popsáno výše. Navíc lze mutanty nebo fragmenty s dominantní negativní aktivitou použít jako terapeutická činidla pro léčení infekce antraxem inhibicí aktivity PA vylučovaného Bacillus anthracis u infikovaného savce. Protože dominantní negativní mutanty dokáží vyvolat produkci ochranných protilátek a inhibovat produkovaného infikující baktérií, lze je kombinaci očkovací látky a terapeuticky účinné látky, což je zvláště účinné pro léčení jedinců, kteří trpí nebo existuje možnost vzniku infekce antraxem. Vedle potřeby co nej rychleji zrušit působení toxinu je také důležité očkovat jedince, kteří aktivitu PA použít jako « ·· · ·· ·· ·♦ ··«« ·· · · · r · • ·· · ♦ ♦ · * • « · · · · · · ♦ · • ·« ♦· ··· ··* '·· ··· ··*· ·· ·♦·· byly vystaveni aerosolizovaným sporám B. anthracis. Toto očkování je nezbytné pro ochranu před prodlouženým působením antraxu klíčením spór, které případně zůstávají v těle po prodlouženou dobu (alespoň měsíce).
V této studii byly identifikovány některé mutanty PA, které nemají schopnost tvořit póry v membránách a přemisťovat ligandy a tím jsou potenciálními očkovacími látkami pro prevenci nebo léčení infekce antraxem (Tabulka 1) . Mutanty číslo 1 až 12 je možno proteolyticky aktivovat tak, aby vytvořily SDS-disociovatelný stav PA63 prepóru a vázaly se na buněčný receptor, EF a LF. Některé z mutací brání přeměně prepóru na SDS-rezistentní stav (Tabulka 1) . Tyto mutanty (K397A, K397C, K397D, D425A, D425N, D425K D425E, D425K, K397 + D425K a K395D + K397D + D425K + D426K) jsou také defektní při tvorbě póru a přemisťování přes membránu. Další skupinu mutantů (AD2L2 PA, K397Q a F427A) tvoří SDS-rezistentní oligomery, které se ale nevkládají do membrány a netvoří póry. Tyto výsledky byly neočekávané.
Tabulka 1
Aktivita ochranných antigenních mutantů.
Mutant číslo Sekvence id. č. Mutace Tvoří SDS- rezistentní oligomer? Tvoří kanály Dominantně negativní?
1 1 K3 97A Ne Ne Ne
2 2 K3 97D Ne Ne Ne
3 3 K397C Ne Ne Ne
4 4 K397Q Ano Ne Ne
5 5 D425A Ne Ne Ne
6 6 D425N Ne Ne nestanoveno
7 7 D425E Ne Ne Ne
8 8 D425K Ne Ne Ano
9 9 F427A Ano Ne Ano
10 10 K397D + Ne Ne Ano
D425K
11 11 K395D + K397D + D425K + D426K Ne Ne Ano
12 12 AD2L2 Ano Ne Ano
13 13 K397D + D425K + F427A nestanoveno nestanoveno Ano
14 14 F427A + AD2L2 nestanoveno nestanoveno Ano
15 15 K397D + F427A + AD2L2 nestanoveno nestanoveno Ano
16 16 K397D + D425K + F427A + AD2L2 nestanoveno nestanoveno Ano
17 17 F427D nestanoveno nestanoveno Ano
18 18 F427K nestanoveno nestanoveno Ano
Tyto P mutanty byly připraveny postupem popsaným v příkladu 1.
Několik mutantů (AD2L2, K397D + D425K dvojitý mutant,
K395D + K397D + D425K + D426K čtyřnásobný mutant, D425K,
F427A, K397D + D425K + F427A trojitý mutant, F427A + AD2L2 dvojitý mutant, K397D + F427A + AD2L2 trojitý mutant, K397D +
D425K + F427A + AD2L2 čtyřnásobný mutant, F427D a F427K) inhibuje přemístění ligandů přes membránu zprostředkované PA přirozeného typu. 0 PA mutantech AD2L2 a K397D + D425K bylo prokázáno, že tvoří s PA přirozeného typu oligomery, které nejsou schopné přemisťovat ligandy. Tyto výsledky byly neočekávané. Přítomnost jediné molekuly z těchto mutantů
v heptamerním prepóru je případně postačující pro blokování přeměny na pór. Tato schopnost blokovat vznik póru pomocí PA přirozeného typu, spolu se schopností soutěžit s PA přirozeného typu o vazbu s buněčnými receptory a odstraňování EF a LF z oběhu, činí tyto mutanty atraktivní pro použití při léčení a prevenci infekce antraxem.
Mutace dalších zbytků v PA případně také inhibuje vznik póru nebo vyvolává dominantní negativní aktivitu. Například zbytky, které elektrostaticky interagují s nabitými postranními řetězci Lys397 nebo Asp425 jsou případně také nutné pro vytvoření póru pomocí PA a mutace jednoho nebo kombinace těchto zbytků případně inhibuje vznik póru a výsledkem je dominantní negativní aktivita. Navíc je vynechání menších částí smyčky 302 až 325 D2L2 nebo vynechání aminokyselin přiléhajících ke smyčce a části nebo celé oblasti 302 až 325 případně také vede k těmto výsledkům.
Schopnost získat mutanty PA s nedetekovatelnou schopností tvořit póry nebo přemisťovat ligandy a mutanty, které slouží jako dominantní negativní inhibitory PA přirozeného typu, vede k názoru, že podobné mutanty lze získat i u jiných toxinů, jako je cť-hemolysin z Staphylococcus aureus, aerolysin z Aeromonas hydrophila, α-toxin z Clostridium septi cum, cytotoxin z Pseudomonas aeruginosa, heterooligomerní toxiny (toxiny AB5) nebo z B skupin toxinů tetanu, botulinu nebo diftérie. Navíc tyto výsledky podtrhují možnost identifikace dominantních negativních forem množství dalších oligomerních virulentních faktorů, a to od toxinů až po adhesiny.
U toxinu antraxu a dalších oligomerních systémů, ve kterých dochází k procesu skládání v kontaktu s extracelulárním prostředím, mohou být exogenně přidané mutantní podjednotky principiálně zahrnuty do finální struktury, čímž se zvyšuje šance, že takové podjednotky lze terapeuticky použít. Systémový antrax, ačkoliv je jako přirozená nemoc velmi řídký, je obávaný jako prostředek • ·· » ** ·* ·» Λ 4 · ···· ··-»
ΟΊ · ·· · * · · · · « · « · ···· · ··· · · · · · ··· ·· ··· ···· ·♦ ·*·· biologické války a biologického terorismu, a dominantně negativní PA se zdá být cenným kandidátem na léčivo. Za předpokladu, že podávaný dominantně negativní PA se volně míchá s PA přirozeného typu produkovaného v těle B. anthacis, proteiny by se měly skládat na buňkách do formy neaktivních nefunkčních komplexů, čímž dochází k blokování působení LF i EF. Vedle zabránění zjevným příznakům, dominantně negativní mutanty případně také chrání fagocyty před destrukcí, čímž pomáhají hostiteli v likvidaci infekce. Po injikování PA přirozeného typu lidem nebyly pozorovány žádné vedlejší účinky, a proto by ani mutantní neaktivní forma proteinu neměla představovat žádné nebezpečí.
Dominantně negativní PA lze také využít jako základ pro nové očkovací látky proti antraxu. Jak také jeho jméno naznačuje, PA vyvolává produkci ochranných protilátek proti antraxu a skutečně je hlavním ímunogenem očkovací látky, která je v současnosti autorizována v USA. Mutanty AD2L2, K397D + D425K a F427A popsané v předkládaném vynálezu vykazují malý nebo žádný pokles imunogenicity v porovnání s PA přirozeného typu u krys Fisher. Také jsme nalezli mutanty, které jsou nečekaně dominantně negativní tak, že podávání mutantu v poměru 0,25 : 1 k PA přirozeného typu nevede u krysího modelu k jakýmkoliv zjistitelným příznakům infekce antraxem. Čištěný PA přirozeného typu je zvažován jako náhrada v současnosti používané očkovací látky, a pokud dominantně negativní forma PA prokáže svou terapeutickou účinnost, pak může tuto roli plnit stejně dobře, čímž se zamezí nutnosti vyvíjet dva téměř identické léky.
Následující příklady jsou ilustrací předkládaného vynálezu. Nejsou zamýšleny jako jakékoliv omezení předkládaného vynálezu. Pokud není uvedeno jinak, údaje pro PA mutanty K397A a D425A jsou reprezentativní pro data získaná pro PA mutanty číslo 1 až 12 vypsané v tabulce 1.
• 9t 9 ♦· *♦ ·· • t « · ·* · · · * ♦ • ·· · · » · ♦ • « * · · · · * · · t · * · · « · · »«· 9* ·** ·»»· ·» ··*·
Příklady provedení vynálezu
Příklad 1
Obecné postupy
Buněčná kultura, média a chemikálie
Buňky křeččích vaječníků K1 (CHO-K1) byly získány ze sbírky kultur amerického typu. Buňky byly kultivovány v HAM F-12 doplněném 10% hovězím sérem, 500 jednotkami/ml penicilinu G, 2 mM L-glutaminu a 500 jednotkami/ml streptomycinsulfátu a udržovaném při 5 % CO2 v navlhčené atmosféře. Buňky byly nasazeny na 24- nebo 96- jamkové mikrotitrační destičky (Costar, Cambridge, MA) v době 16 až 18 hodin před experimentem. Všechna média pro buněčnou kulturu byla získána od firmy Gibco BRL, pokud není výslovně uvedeno jinak. Všechny chemikálie byly získány od Sigma Chemical Co., pokud není výslovně uvedeno jinak.
Konstrukce a čištění PA proteinů
PA mutant AD2L2, který neobsahuje aminokyseliny 302 až 325 z PA byl exprimován a čištěn postupem, který již byl dříve popsán (Miller a kol., Biochemistry 38: 10432 až 10441, 1999). Bodové mutace č. 1 až 11 z tabulky 1 byly provedeny za pomocí QuickChange způsobu místně směrované mutageneze podle návodu výrobce (Stratagene, La Jolla, CA) . Plasmid z práce Miller a kol. (viz výše) kódující PA přirozeného typu byl použit jako templát. Bodové mutace byly klonovány do pET22-b(+) (Novagen) expresního vektoru a pro expresi transformovány do BL21 (DE3) (Novagen). Mutanti obsahující bodovou mutaci byly exprimovány a čištěny postupem, který již byl dříve popsán (Miller, 1999). Stručně shrnuto byly kultury kultivovány v LB při 37 °C na A60o z 1,0. Exprese rekombinantního proteinu byla vyvolána přídavkem β-D-isopropylthiogalaktopyranosidu v množství 1 mM. Po tomto přídavku byly buňky kultivovány ještě další 3 hodiny ·« · «*· *» ·* < · »· · · ♦ · · ·· · « · · · « * · · «·«· * • · · · * · * • «· ··· ·«·· *· ·*»· při 30 °C a odděleny odstředěním po dobu 10 minut při 8000 x g.
Proteiny byly uvolněny z periplasmy osmotickým šokem. Buňky byly resuspendovány ve 20 mM Tris-HCl, pH 8,0, 30% glukose, vyjádřeno v procentech hmotnostních, a 1 mM EDTA a inkubovány za laboratorní teploty po dobu 10 minut za trvalého míchání. Buňky byly odděleny odstředěním, resuspendovány v 5 mM MgSO4 obsahujícím 20 mM benzamidinu a inkubovány při 4 °C po dobu 10 minut za trvalého míchání. Po opětovném stlačení buněk odstředěním při 8000 x g, byl periplasmatický extrakt odlit. Pak byl přidán Tris-HCl o pH 8,0 tak, aby výsledná koncentrace byla 2 0 mM a celý vzorek byl nanesen na kolonu Q-sepharose HP. Nevázaný protein byl z kolony vymyt pufrem A (20 mM Tris, pH 8,0). Vázaný protein byl vymyt lineárním gradientem 0 % až 25 % objemových pufru B (20 mM Tris, pH 8,0, 1 M NaCl). Tyto frakce obsahující PA byly zahuštěny a pufr byl vyměněn pomocí kolony pd-10 (Amersham-Pharmacia) obsahující pufr A. Eluát obsahující PA byl nanesen na kolonu Mono-Q a vymyt gradientem pufru B 0 % až 25 % hmotnostních. Frakce obsahující PA byly analyzovány SDS-PAGE a skladovány při -80 °C. Koncentrace proteinů byly stanoveny za použití testovací sady na proteiny Bio-Rad podle návodu uvedeného výrobcem. Všechny kapalinové chromatografie byly provedeny na AKTA čistícím systému kapalinové chromatografie (Amersham-Pharmacia).
Ostatní mutanty (čísla 13 až 18 z tabulky 1) byly konstruovány, exprimovány a čištěny stejným způsobem.
Proteolytická aktivace PA
Pro proteolytické štěpení PA83 na štěpený PA (nPA) byl použit trypsin. PA byl zředěn na koncentraci 0,5 mg/ml v případě testu tvorby prepóru a na koncentraci 0,2 mg/ml v případě ostatních testů. Trypsin byl přidán tak, aby konečný poměr trypsinu ku PA byl 1 : 1000 (hmotnostně) , výsledná směs
♦9 99
«· > · • 9 * € n
• ·· • ·
• · · i · 4
• <e «· «« « ···« ·*
byla inkubována za laboratorní teploty po dobu 2 0 minut a pak následovala inhibice trypsinu 10 molárním přebytkem trypsinového inhibitoru ze sójových bobů.
Test přemístění přes povrch buňky
Pro změření přemístění radioaktivně značeného LFn (N-koncové aminokyseliny 1 až 255 PA vázající domény LF) zprostředkovaného PA byl proveden test přemístění přes povrch buňky postupem, který již byl dříve popsán (Wesche a kol., Biochemistry, 37: 15737, 1998). Stručně shrnuto se nPA (2 x 10'8 M) nejprve naváže na buňky CHO a pak se k PA63 na povrchu buňky naváže 35S LFn. Přebytek LFn se odstraní a buňky se promyjí a podrobí pulsu pH o hodnotě 5,0 při 37 °C. Puls nízkého pH napodobuje okyselení endosomu a vede k přemístění LFn přes plasmovou membránu do buňky, které zprostředkovává PA. Vzorky se pak upraví pronasou, která proteolyticky odbourává extracelulární 35S LFn, ale ne 35S LFn, který byl přemístěn do buněk. Pak byly buňky promyty a lýzovány. Pro stanovení celkového množství 35S LFn, které se váže k buňkám, nebyly některé buňky upraveny pronasou. Po lýzování bylo množství 35S LFn v roztoku nad usazeninou stanoveno scintilačním čítačem. Procenta přemístění byla vypočtena následujícím způsobem:
(DPM chráněný před pronasou) / (DPM vázaný k buňkám) x 100 = % přemístění
Pro stanovení toho, zda proteiny mutantního PA inhibují přemístění LFn PA přirozeného typu, byl tento test také proveden za použití ekvimolárních množství mutantního PA a PA přirozeného typu, které byly smíchány před podrobením účinku trypsinu a před přidáním k buňkám zředěny na 2 x 10'8 M PA (1 x 10’8 M každého proteinu) . Když byl PA v koncentraci 1 x 108 M použit jako kontrola, pak byla účinnost přemístění pouze mírně ovlivněna snížením množství PA v porovnání s testem provedeným s 2 x 10'8 M PA přirozeného typu, což vede ·· • · • * • * • · ·«·· • ·· ·· > » oc * ·· ·
·· e* · ···· k názoru, že jakékoliv snížení v přemístění a vazbě není pouze důsledkem snížení koncentrace PA přirozeného typu.
Inhibice syntézy proteinů
Pro změření přemístění ligandů do buněk zprostředkovaného PA byla jako další metoda použita inhibice syntézy proteinů LFnDTA (Milné a kol., Mol. Microbiol., 15: 66, 1995). Pro otestování PA mutantů číslo 1 až 12 z tabulky 1, byly buňky CH0-K1 naneseny v množství 2,5 x 104 buněk na jamku na destičku s 96 jamkami 16 hodin před přidání PA proteinu. PA83 (1 x 10'12 M až 1 x ΙΟ7 M) byl inkubován s buňkami v přítomnosti 1 x 10~8 M LFnDTA po dobu 4 hodin. Pak bylo médium odstraněno a nahrazeno médiem HAM F-12 bez leucinu doplněném 3H-Leu v množství 1 mCi/ml. Po jedné hodině inkubace byly buňky promyty ledově studeným PBS a ledově studenou kyselinou trichloroctovou (10% roztok, vyjádřeno v procentech hmotnostních), aby se vysrážely proteiny. Množství 3H-Leu zabudovaného do materiálu nerozpustného TCA bylo stanoveno pomocí scintilačního čítače a bylo použito jako míra množství nově syntetizovaných proteinů.
Mutantní PA proteiny byly v tomto testu také testovány, zda uvolňují inhibici příjmu 3H-Leu způsobenou PA přirozeného typu. PA přirozeného typu byl přidán k CHO buňkám v koncentraci 1 x ΙΟ'9 M až 1 x 10'8 M LFnDTA. Také bylo přidáno zvýšené množství jednoho z mutantů. Buňky byly s toxinem inkubovány po dobu 4 hodin a vzorky byly zpracovány postupem, který již byl výše popsán.
Podobně byly testovány PA mutanty vypsané v obrázku 9. Buňky CHO-K1 (2,5 x 104 buněk na jamku) na destičce s 96 jamkami byly inkubovány po dobu 18 hodin při teplotě 37 °C z PA přirozeného typu (100 pM) v přítomnosti LFN-DTA (100 pM) a různých množství jednotlivých PA mutantů (K397D + D425K, AD2L2, F427A, D425K, K397D nebo SSSR). Médium pak bylo odstraněno a nahrazeno HAM F-12 bez leucinu doplněném 3H-Leu
v množství 1 mCi/ml. Po jedné hodině inkubace při teplotě 37 °C byly buňky promyty ledově studeným PBS a ledově studenou 10% kyselinou trichloroctovou (TCA), vyjádřeno v procentech hmotnostních). nerozpustného zabudovaného do materiálu a vyjádřeno jako procenta bez přítomnosti PA. Při je průměr ze tří pokusů výsledky byly zjištěny i
Množství H-Leu TCA bylo měřeno množství, které se zabudovalo zvolených koncentracích PA přirozeného typu a LFnDTA byla syntéza proteinů v nepřítomnosti mutantního PA inhibována z 90 % (tečkovaná čára). Uveden + směrodatná odchylka. Podobné v případě, že výchozí inkubace trvala čtyři hodiny místo 18 hodin. Podobným způsobem byly testovány mutantní PA K397D + D425K + F427A, F427A + AD2L2 a K397D + F427A + AD2L2 vypsané na obrázku 10.
PA způsobená inhibice syntézy proteinů vyvolaná heteroheptamery přirozeného typu a mutantními PA byla porovnána s tou, která byla vyvolána odpovídajícími heptamery. Homoheptamery přirozeného typu PA63 a mutanty K397D + D425K, AD2L2, F427A, K397D a D425A byly připraveny postupem, který již byl popsán výše. Domnělé heteroheptamery byly připraveny smícháním každého mutantního PA s PA přirozeného typu v poměru 1 : 1 před podrobením účinku trypsinu a kolonovou chromatografií (obr. 11) . PA přirozeného typu (1 nM) , heteroheptamer (H) (konečná koncentrace 2 nM) nebo ekvimolární směs (Μ) (1 nM každého) odpovídajícího mutantního homoheptameru nebo heptameru přirozeného typu byly inkubovány s buňkami CHO-K1 v přítomnosti LFnDTA (100 pM) po dobu 18 hodin a inhibice syntézy proteinů byla měřena postupem popsaným pro obrázek 9. Koncentrace heptamerů jsou vyjádřeny v jednotkách monomerních podjednotek PA63. Syntéza proteinů je vyjádřena jako procento kontroly bez PA. Uveden je průměr tří experimentů + exponenciálně vyrovnaný průměr. Podobné výsledky byly zjištěny i po jedné hodině inkubace.
Vznik prepóru a SDS-rezistentního oligomeru
Vznik prepórů a SDS-rezistentních oligomerů byl měřen inkubací nPA v ekvimolárním množství LFn po dobu 30 minut za laboratorní teploty. Pro stanovení toho, zda prepóry vznikly byly vzorky podrobeny elektroforéze v 4% až 12% nativním gradientním gelu (FMC) za použití 50 mM CHES, pH 9,0, 2 mg/ml
CHAPS jako vyvíjecího pufru. Pro stanovení toho, zda nízká hodnota pH vyvolala vznik SDS-rezistentních heptamerů, byl přidán 100 mM acetát sodný o pH 4,5 v takovém množství, že výsledné pH roztoku dosáhlo 5,0 a pak byl vzorek inkubován po dobu 30 minut za laboratorní teploty. Vzorek pak byl rozpuštěn v SDS-PAGE vzorkovém pufru a podroben elektroforéze na 4% až 12% SDS-PAGE gradientovém gelu. Proteiny v gelu byly vizualizovány brilantní modří „coomassie.
Uvolňování rubidia
Buňky CHO-K1 byly naneseny v hustotě 2 x 105 buněk na jamku a inkubovány při teplotě 37 °C po dobu 24 hodin. Médium pak bylo odsáto a nahrazeno médiem obsahujícím 1 pCi/ml 86RbCl a inkubace probíhala dalších 16 hodin. Buňky pak byly chlazeny na ledu po dobu 20 minut a médium bylo odstraněno. Buňky byly promyty a byl přidán nPA (2 x 10'8 M) v médiu pufrovaném HEPES. Buňky byly inkubovány s nPA po dobu 2 hodin na ledu a pak byl přidán ledově studený pufr o hodnotě pH 5,0. Po 30 minutách byly odebrány vzorky z tekutiny nad buňkami a vyhodnoceny scintilačním čítačem, aby se stanovilo množství uvolněného 86RB.
Tento standardní test lze také použít pro stanovení vlivu jiných póry tvořících toxinů na množství uvolněného 86Rb. Tak lze tímto testem testovat i další mutantní toxiny podle předkládaného vynálezu, aby se stanovilo, zda mají sníženou schopnost tvořit transmembránové póry.
Příklad 2
• · · · · • * · · ··· ·· ···
Selhání většiny mutantů při tvorbě SDS-rezistentních oligomerů
Všechny proteiny mutantních PA č. 1 až 12 v tabulce 1 a PA přirozeného typu byly upraveny trypsinem způsobem, který již byl popsán výše, čímž byly vytvořeny štěpené PA (nPA) proteiny, které se při analýze pomocí SDS-PAGE pohybují jako nízkomolekulární látky (obrázek 2A) . Vznik
SDS-disociovatelných prepórů vyvolaný mutantními PA č. 1 až 12 v tabulce 1 byl zjišťován sníženou pohyblivostí v nativních gelech heptamerního PA63 komplexovaného s LFn v porovnání s monomerním nPA (obrázek 2B) . Vznik prepórů vyvolaný mutantními PA K3 97A a D425A byl dále podpořen vymytím prepórů z kolony MonoQ ve vyšší koncentraci soli než, ve které se vymývá monomerní PA. Mutantní nPA byly také analyzovány na vznik SDS-rezistentních oligomerů. Jako pozitivní kontrola byl PA přirozeného typu upraven LFn. Puls nízkého pH převádí PA přirozeného typu na SDS-rezistentní oligomery, které se při analýze pomocí SDS-PAGE pohybují jako komplexy s vysokou molekulovou hmotností. ŮD2L2 (PA s chybějícími zbytky 302 až 325) a K397Q (obrázek 2B). SDS-rezistentní oligomery PA přirozeného typu, K397Q, F427A a AD2L2 vzniklé působením pH o nízké hodnotě (obrázek 2A a tabulka 1).
Příklad 3
Selhání většiny mutantních PA při tvorbě pórů v membránách
Selhání většiny mutantních PA při tvorbě SDS-rezistentních oligomerů vede k názoru, že tvorba pórů v membránách bude také inhibována. tvorba pórů byla testována vázáním nPA proteinů na buňky upravené radioaktivním analogem draslíku, 86Rb, pulsem nízkého pH a měřením uvolnění 86Rb do okolního média postupem, který byl popsán v příkladu 1. Uvolňování 86Rb vyvolané nPA přirozeného typu je způsobeno tím, že nPA tvoří v membráně póry prostupné pro ionty. Naopak žádný z mutantů č. 1 až 12 v tabulce 1 nevyvolal uvolňování 86Rb (obrázek 3 a tabulka 1).
• ·
Tak byla neschopnost většiny mutantnich SDS-rezistentní oligomery (příklad 2) dána s neschopností těchto mutantů tvořit póry membránách.
PA tvořit do vztahu v buněčných
Příklad 4
Selhání mutantnich PA při přemisťování LFn přes membrány
Tvorba póru je nutným krokem pro přemisťování ligandů (tj. LF, EF nebo LFn) přes membrány zprostředkované PA. Test přemisťování přes povrch buňky byl použit přímo pro měření přemisťování PA ligandů do cytoplasmy buňky (příklad 1) . Žádný z mutantnich PA č. 1 až 12 v tabulce 1 neměl významně sníženou schopnost vázat LFn (obrázek 4A) , nicméně všechny z testovaných mutantů měly v tomto testu významně sníženou schopnost přemisťovat LFn (obrázky 4B a 12) . SSSR kontrolní mutant způsobil za těchto podmínek malou inhibici. Tato data vedou k názoru, že mutanty si udržují strukturní integritu a schopnost vázat se k buněčnému receptoru a LFn, ale nejsou schopny vytvořit póry nebo přemisťovat ligandy přes membrány.
Příklad 5
Selhání mutantnich PA při přemisťování LFnDTA přes membrány
Dalším způsobem použitým pro měření přemisťování PA ligandů přes membrány je test LFnDTA toxicity (příklad 1) . V tomto testu byly buňky CHO upraveny PA a ligandem obsahujícím LFn připojený k A-řetězci toxinu diftérie DTA (LFnDTA). Přemístěný A-řetězec toxinu diftérie ADP ribosyluje cytoplasmatický protein EF-2, což vede k inhibici syntézy proteinů a vyvolání buněčné smrti. Tento test je měřením přemisťování ligandů z endosomálního prostoru na opačnou stranu buňky, jak bylo měřeno v příkladu 4. Po inkubaci s LFnDTA a mutantním PA přirozeného typu byly buňky promyty a inkubovány v médiu bez leucinu doplněném 3H-leucinem. Pokud
není inhibována syntéza proteinů, pak bude 3H-leucin zabudován do nově syntetizovaných proteinů. Pokud je syntéza inhibována LFnDTA pak bude zabudováno jen málo 3H. Všechny testované mutanty v tomto testu neinhibovaly významným způsobem syntézu proteinů (obrázek 5) . Tento výsledek dále podporuje hypotézu, že nedostatek pórů vytvořených mutantními PA vede k sníženi přemisťování PA ligandů těmito mutanty.
Příklad 6
Inhibice tvorby pórů PA přirozeného typu pomocí mutantních PA
Protože všechny mutantní PA č. 1 až 12 v tabulce 1 byly defektní při tvorbě pórů, byly testovány, aby bylo zjištěno, zda tvoří neaktivní heterooligomery s PA přirozeného typu a tím inhibují přemisťování ligandů přes membránu způsobené PA. AD2L2, K397D + D425K a K395D + K397D + D425K + D426K PA inhibují tímto způsobem PA přirozeného typu. Po smíchání s ekvimolárním množstvím PA přirozeného typu, každý z těchto tří mutantů v testu přemisťování přes buněčný povrch významně inhiboval přemisťování 35S-LFn do buněk (obrázek 6) . Vazba 35S-LFn k buňkám nebyla inhibována (obrázek 6).
Příklad 7
Inhibice tvorby pórů PA přirozeného typu pomocí mutantních PA
Také byl měřen vliv těchto mutantních proteinů na PA zprostředkovanou LFnDTA toxicitu. Když AD2L2, K397D + D425K dvojitý mutant nebo K395D + K397D + D425K + D462K čtyřnásobný mutant PA byl smíchán s PA přirozeného typu v testu LFnDTA, došlo k snížení inhibice 3H-Leu zprostředkované PA přirozeného typu v testu LFnDTA o dva řády (obrázek 7). Tak mutanty inhibují přemisťování zprostředkované PA o 99 %. Aktivita, která zůstane v přítomnosti mutantních proteinů je pravděpodobně způsobena heptamery sestávajícími ze 7 molekul • · 4 · ·
PA přirozeného typu a 0 molekul mutantního PA (WT7Mut0) . Podle Pascalova trojúhelníku by 1 % heptamerů vytvořených z ekvimolární směsi PA přirozeného typu a mutantního PA mělo být stoprocentně přirozeného typu (WT7Mut0) (tabulka 2) . Tento vypočtený výsledek je v souladu s 1 % experimentálně naměřené zbytkové aktivity přítomné ve směsi. Inhibiční studie, ve kterých byly testovány různé poměry PA přirozeného typu ku AD2L2 nebo K397D + D425K mutantním PA byly testovány v testu LFnDTA, ukázaly, že jediná aktivní složka ve směsi je pravděpodobně WT7Mut0. Tak je většina heptamerů obsahujících jednu molekulu AD2L2 nebo K397D + D425K PA neaktivních (tabulka 2) , což dále podporuje názor o dominantní negativní povaze těchto inhibitorů.
Tabulka 2
Předpovězené a měřené složení PA oligomerů tvořených různými poměry mutantního PA k PA přirozeného typu
Předpovězená % celkové Zbytková aktivita populace heptamerů
Mutantní : přirozeného typu (mol : mol) WT7Mut0 WTgMutx WT5Mut2 ňD2L2 směs K397D + D425A směs
1 : 1 0,78 % 6 % 22 % 0,7 % + 0,2 0,9 % + 0,06
0,75 : 1 2 % 10,4% 23,5 % 3,8 % + 2 1,2 % + 0,2
0,5 : 1 5,8 % 25,8 % 56,8 % 13,5 % + 0,5 5,8 % + 3,6
0,25 : 1 21 % 57 % 85 % 14,3 % + 2 10 % + 2
Předpovězené hodnoty představují procento všech heptamerů, u kterých je očekáváno, že budou mít alespoň uvedený počet molekul přirozeného typu ve směsi obsahující různé poměry mutantních PA a PA přirozeného typu. Sloupeček WT7Mut0 představuje procento všech heptamerů, u kterých se očekává, že budou obsahovat sedm molekul PA přirozeného typu. Sloupeček • ·
WT6Muti představuje procento všech heptamerů, u kterých se očekává, že budou přirozeného typu (tj . PA přirozeného typu obsahovat alespoň šest molekul PA heptamery, které obsahují šest molekul a jednu molekulu mutantního PA nebo obsahují sedm molekul PA přirozeného typu a nula molekul mutantního PA) . Podobně sloupeček WT5Mut2 představuje procento všech heptamerů, u kterých se očekává, že budou obsahovat alespoň pět molekul PA přirozeného typu. Tyto hodnoty byly vypočteny s použitím Pascalova trojúhelníku. Hodnoty vypsané ve sloupečku „Zbytková aktivita jsou skutečné experimentální hodnoty zjištěné u těchto směsí.
Titrace mutantu pomocí PA přirozeného typu v testu LFnDTA byla provedena za účelem další charakterizace inhibice PA přirozeného typu. Zvyšující se množství jednoho z mutantů byla přidána k buňkám inkubovaným s PA přirozeného typu a LFnDTA (obrázek 8A) . Mutantní PA-SSSR, který má místo rozpoznávající furin zmutováno z 164RKKR167 na 164SSSR167 byl použit jako kontrola. Protože tento mutant nelze štěpit furinem nebo jinou proteasou podobnou furinu, a proto nemůže tvořit póry, může mutant pouze inhibovat PA soupeřením o receptor. Jak AD2L2, tak K397D + D425K silně inhibují přemisťování zprostředkované PA. Nejdůležitější je, že tyto mutanty neinhibují pouze soupeřením o receptor, protože pro vyvolání 50% inhibice je v případě těchto mutantů potřeba mnohem méně proteinu než je nutné v případě PA-SSSR (obrázek 7B) . Mutant obsahující jedinou inhibici z K397D + D425K neinhibuje tak dobře jako dvojitý mutant, ale inhibuje lépe než PA-SSSR. Tato data ukazují, že AD2L2, K397D + D425K a K395D + K397D + D425K + D426K PA jsou dominantní negativní inhibitory PA přirozeného typu.
Také byla měřena negativní inhibiční aktivita F427A, D425K, K397D + D425K + F427A, F427A + AD2L2, K397D + F427A + AD2L2 mutantních PA. V tomto testu byla zvyšující se množství ♦ · mutantních forem PA smíchána s konstantním množstvím PA přirozeného typu způsobem, který již byl popsán výše. Nejúčinnější člen této skupiny, K397D + D425K + F427A trojitý mutant prakticky úplně blokuje působení toxinu v poměru mutantu ku PA přirozeného typu 1:1. D2L2, K397D + D425K, F427A, F427A + AD2L2 a K397D + F427A + ŮD2L2 mutantní PA také měly inhibiční aktivitu. K397D + D425K + F427A + ÚD2L2, F427D a F427K mutantní PA také vykazovaly dominantní negativní aktivitu v testu toxicity LFnDTA. Naopak další mutant nezpůsobující přemisťování, K397D, nevyvolával při poměru 1 : 1 prakticky žádnou inhibici, což ukazuje, že ne všechny mutanty tohoto typu jsou silně inhibiční (obrázek 9) . SSSR kontrolní mutant nevyvolával žádnou měřitelnou inhibici působení toxinu, dokonce ani v desetinásobném přebytku oproti PA přirozeného typu, což vede k názoru, že soupeření o receptory nepřispívá významně k inhibičním aktivitám ostatních mutantů.
Hypotéza, že inhibice dominantně negativních mutantů závisí na schopnosti jejich skupin PA63 tvořit hybridní komplexy s PA63 přirozeného typu byla testována za použití čištěných homo- a hetero- heptamerů. PA v roztoku lze štěpit ve furinovém místě mírným působením trypsinu a výsledné fragmenty lze oddělit chromatografií trypsinem štěpené molekuly na aniontově výměnné koloně (Miller a kol., Biochemistry 38, 10432, 1999). Čištěný PA63 izolovaný tímto způsobem je heptamerní, což ukazuje, že rovnováha oligomerizace je silně posunuta ve prospěch této formy a je strukturně podobná nebo stejná jako prepór. Čištěné homoheptamery byly připraveny z PA přirozeného typu a každého z K397D + D425K, ŮD2L2, F427A, D425K a K397D mutantních PA se sníženou účinností přemisťování. Domnělé hetero-heptamery byly připraveny smícháním každého z mutantních PA v poměru 1 : 1 s PA přirozeného typu, následným působením trypsinu na směs a chromatografií produktů na aniontově výměnné koloně.
Byla měřena inhibice syntézy proteinů vyvolaná LFnDTA způsobená každým z heteroheptamerů a ekvivalentním množstvím směsi 1 : 1 odpovídajícího mutantu a homo-heptamerů přirozeného typu. Hetrero-heptamery obsahující K397D + D425K, AD2L2, F427A a D425K mutanty nezprostředkovaly působení LFnDTA, zatímco odpovídající směsi homo-heptamerů byly silně aktivní (obrázek 11) . Naopak domnělý hetero-heptamer vytvořený smícháním K397D s PA přirozeného typu byl aktivní jako směs homo-K397D PA a PA homo-přirozeného typu. tyto výsledky jsou v souladu s vlastnostmi těchto mutantů v experimentu na obrázku 9 a podporují dojem, že PA63 z dominantně negativních mutantů deaktivuje protein přirozeného typu tím, že se na něj váže. Nepřítomnost inhibiční aktivity K397D v hetero-heptamerním prostředku ukazuje na defekt buď ve schopnosti kooligomerizovat s proteinem přirozeného typu nebo ve schopnosti inhibovat jeho aktivitu v heptameru. Zjištění, že mutantní homo-heptamery neinhibují aktivitu přirozeného typu ukazuje, že za podmínek experimentu dochází k malému soupeření o receptory a k žádné nebo jen malé výměně mezi heptamery.
Jak již bylo popsáno výše, skutečnost, že K397D + D425K dvojitý mutant prakticky úplně blokuje aktivitu v těchto testech LFnDTA toxicity vede k názoru, že jediná molekula mutantu deaktivuje heptamer a oligomerizace je náhodná. Zdá se, že AD2L2, D425K a F427A mutanty jsou mírně méně inhibiční, což vede k názoru, že pro deaktivaci je případně potřeba více než jednu molekulu tohoto mutantu na heptamer a/nebo že jejich ko-oligomerizace s PA přirozeného typu nemusí být čistě náhodná. Na deaktivaci mají vliv také další faktory jako je pořadí přidávání B skupin k rostoucímu heptamernímu komplexu (např. B skupina, která se přidává první nebo poslední). Není úmyslem omezit předkládaný vynález na jakýkoliv mechanismus inhibice uvedený v popisu.
• ·
Příklad 8
Tvorba SDS-rezistentních oligomerů obsahujících mutantní PA a PA přirozeného typu
Pro vyzkoušení interakce AD2L2 a K397D + D425K mutantů s PA přirozeného typu byl smíchán ekvimolární poměr mutantu ku PA přirozeného typu, vše bylo štěpeno trypsinem a analyzováno pomocí SDS-PAGE na vznik SDS-rezistentního oligomerů. V případě smíchání kteréhokoliv z PA přirozeného typu vznikl nový druh SDS-rezistentního PA. Na rozdíl od samotného PA přirozeného typu, který produkoval v gelu šmouhu o difúzní vysoké molekulové hmotnosti, směs mutantu a PA přirozeného typu vedla ke vzniku ostrého pásu o vysoké molekulové hmotnosti. Tento ostrý pás se také lišil od těch, které lze vidět pro mutanty samotné: K397D + D425K samostatně netvořily SDS-rezistentní oligomer a AD2L2 PA samostatně tvořil oligomer, který se pohyboval v gelu jinde než pás vytvořený v případě, že byl přítomen také PA-přirozeného typu. Ačkoliv přesné složení nebo povaha tohoto pásu nebyla stanovena, tento pás dále vede k názoru, že mutanty interagují s PA přirozeného typu v SDS-rezistentních oligomerech, což vede ke změně pohyblivosti oligomerů v gelu.
Příklad 9
Inhibice toxinu in vivo
Vlastnosti, které prokazovaly dominantně negativní mutanty in vitro vedou k závěru, že by měly inhibovat působení toxinu i in vivo. Pro otestování této hypotézy byly změřeny tři z těchto mutantů (K397D + D425K, AD2L2 a F427A) na klasickém modelu in vivo pro působení anthraxového toxinu, krysách Fisher 344 (Ivins a kol., Appl. Environ. Microbiol. 55: 2098, 1989) . Samci krys (250 g až 300 g) , kterým byla intravenózně injikována směs 8 pg LF a 40 pg PA (přibližně desetinásobek minimální smrtelné dávky), začínají zhruba po 90 minutách umírat (tabulka 3) . Když byl PA přirozeného typu nahrazen «4 » »4 ·· ··
4 4 ·· 4 4 4 · 4
44 4 · 4 · kterýmkoliv z dominantně negativních mutantů, zvířata nevykazovala žádné příznaky intoxikace během dvou týdnů, po kterých byla zvířata usmrcena. Když byl dominantně negativní PA přidán ke směsi PA/LF přirozeného typu před injekcí, bud' v poměru 1 : 1 relativně k PA přirozeného typu (40 pg dominantně negativního PA) nebo v poměru 0,25 : 1 (10 pg dominantně negativního PA) injikovaná zvířata také přežila bez příznaků. SSSR mutant měl malý vliv na aktivitu toxinu. Tyto výsledky jsou v souladu s našimi výsledky in vitro a ukazují, že dominantně negativní mutanty dokáží zabránit působení toxinu antraxu in vivo dokonce i v poměru k PA přirozeného typu, který je nižší než stechiometrický (0,25 : 1).
Tabulka 3
Inhibice PA přirozeného typu mutantními PA in vivo
Množství proteinu (pg)
WT AD2L2 K397D + D425K F427A SSR TTM
40 90 + 11 minut
40 přežití
40 přežití
-- 40 přežití
40 40 přežití
40 40 přežití
40 40 přežití
40 40 100 +3 minuty
40 10 __ přežití
40 10 přežití
40 -- 10 -- přežití
Schopnost K397D + D425K + F427A trojitého mutantu („Trojitý) inhibovat aktivitu PA přirozeného typu in vivo byla porovnána se schopností K397D + D425K dvojitého mutantu („Dvojitý) (tabulka 4). Tento experiment byl proveden «· • « postupem popsaným výše za použití krys injikovaných směsí 40 pg Pa přirozeného typu, 10 pg LF a buď PBS nebo dominantně negativního mutantu.
Tabulka 4
Inhibice PA přirozeného typu mutantními PA in vivo
Zvířata Množství mutantního PA TTM
PBD 2 -- ~ 100 minut
Dvoj itý 2 40 pg přežití
Troj itý 2 40 pg přežití
Dvoj itý 4 4 pg přežití
Troj itý 4 4 pg přežití
Také byl měřen titr anti-PA a titr neutralizační protilátky vytvořené očkováním krys K397D + D425K, AD2L2 nebo F427A PA. Pro toto stanovení byly skupiny šesti zvířat očkovány každé třikrát v nultém, třetím a šestém týdnu 50 pg proteinu ve 200 pl Ribi Tri-Mix adjuvans (Sigma) intramuskulární injekcí do oblasti zadních končetin. Dva dny před první injekcí a 14 dnů po každé injekci byla každému zvířeti odebrána krev a sérum bylo uschováno. Šestnáct dnů po poslední injekci byla krysám podána smrtelná dávka LF (30 pg PA + 6 pg LF) intravenózní injekcí, jak je popsáno v tabulce 5. Průměr titrů protilátky anti-PA v séru byl stanoven standardním ELISA testem proti PA. Titry jsou uvedeny jako obrácená hodnota geometrického průměru zředění, při kterém reaktivita séra končí. Neutralizační protilátky byly titrovány v LFnDTA testu 1 x 10'10 M PA a 1 x 10'10 M LFnDTA. Zředěné protilátky byly inkubovány s PA při 37 °C jednu hodinu před začátkem testu. Inhibice syntézy proteinů byla měřena pomocí testu toxicity LFnDTA, který již byl popsán výše. Neutralizační titry jsou uvedeny jako obrácená hodnota geometrického průměru zředění potřebného pro inhibici aktivity • · ·«· · < · · · ··· ·· ··> *«·· ·· ···*
PA o 50 %. Jak je uvedeno v tabulce 5, K397D + D425K, AD2L2 a F427A mutantní PA vykazují malý nebo žádný pokles imunogenicity v porovnání s PA přirozeného typu u krys Fisher.
Neutralizační titr a titr anti-PA protilátky po třech injekcích byly podobné bez ohledu na použitý imunogen a všechna očkovaná zvířata přežila podání smrtelné dávky PA přirozeného typu plus LF podanou 16 dnů po poslední injekci.
Tabulka 5
Titr anti-PA a titr neutralizační protilátky vytvořené očkováním krys mutantními PA
Zvířata Anti-PA titr Neutralizační titr TTM
PBS 6 < 10 < 10 74,2 + 1,5
WT 5 43 300 2490 přežití
AD2L2 6 47 500 3350 přežití
K397D + 6 65 500 2260 přežití
D425K
F427A 6 132 000 6090 přežití
Příklad 10
Protilátky PA
Protilátky PA proteinu lze použít jako léčivo a/nebo jako diagnostické činidlo. Protilátky lze produkovat standardními postupy imunizací B-buněk obsahujících biologický systém, např. zvířat jako je myš nebo králík PA proteinem nebo jeho fragmentem tak, aby se stimulovala produkce anti-PA protilátek B-buňkami, a následně se protilátky izolují z biologického systému. Pro vytvoření monoklonálních protilátek lze ze zvířat s nejvyšší imunitní reakcí na PA protein stanovenou ELISA testem odebrat slezinu a B-buňky připojené k buňkám NS-1 myelomu tak, aby vznikly hybridomy. Hybridomy, které produkují protilátky, které váží PA lze vybrat za použití standardního testu ELISA nebo pomocí „western blott. Monoklonální buněčné ·* a ·< »» • # · « • r · · » ♦ » • ♦ · · · · · · » • « · · · »·· »«» «· κ · e> ·»·· *· «ta· linie produkující vysoký titr protilátky a specificky rozpoznávající PA protein se uchovají.
Buněčné linie lze také otestovat, aby se rozpoznaly linie, které produkují protilátky, které váží PA přirozeného typu s vyšší afinitou než mutantní PA protein. Tyto protilátky lze vytvořit podáváním fragmentů PA přirozeného typu, které obsahují zbytky jako K397, D425, D426 nebo F427, zvířatům.
Výsledné protilátky lze otestovat, aby se zjistilo, která protilátka váže PA přirozeného typu, ale neváže mutantní PA protein, ve kterém chybí nebo je změněn jeden nebo více zbytků K397, D425, D426 nebo F427. Například lze protilátky aplikovat na kolonu obsahující imobilizovaný mutantní PA protein a protilátky, které neváží mutantní PA protein, lze pak vybrat.
Lze také vyrobit takové protilátky, které reagují se zbytky smyčky D2L2, přičemž tyto protilátky, lze vyrobit podáváním fragmentu PA obsahujícího smyčku D2L2 zvířatům postupem, který již byl popsán výše. Protilátky, které reagují se zbytky ve smyčce D2L2 PA přirozeného typu lze také testovat tak, aby se vybraly protilátky, které neváží mutantní PA protein, ve kterém jeden nebo více zbytků ve smyčce D2L2 chybí. Alternativně lze produkovat takové protilátky, které váží mutantní PA s vyšší afinitou než molekulu PA přirozeného typu, podáváním fragmentu mutantního PA zvířatům postupem popsaným výše a výběrem protilátek s vyšší afinitou k mutantní formě PA. Tyto protilátky se případně váží ke zbytkům v mutantním PA, které nejsou přítomny v PA přirozeného typu.
Anti-PA protilátky lze použít pro zjištění PA proteinu v biologickém vzorku, jako je sérum, tak, že se tento vzorek uvede do kontaktu s protilátkou a pak se stanovují imunitní komplexy stejným způsobem jako se stanovuje PA protein ve vzorku. Tak lze tyto protilátky použít do sady pro stanovení toho, zda byl subjekt vystaven působení toxinu antraxu.
Protilátky PA lze také použít jako léčivo pro léčení nebo prevenci infekce antraxem. Pokud se protilátka, která váže PA
·« ·»
• · ř w · ♦ 'W v
«
* V • » »
4 · • ·
• · ·· ····
přirozeného typu, ale neváže dominantně negativní mutantní PA, podává subjektu pro pasivní imunizaci proti infekci antraxem, lze dominantně negativní mutantní PA také podávat stejnému subjektu jako lék, aby se inhibovala aktivita PA přirozeného typu. Protože podávaná protilátka anti-PA nereaguje s léčivým dominantně negativním mutantním PA, neměla by protilátka anti-PA snižovat schopnost dominantně negativního mutantního PA inhibovat PA přirozeného typu. Navíc lze protilátku anti-PA, která nereaguje s léčivým dominantně negativním mutantním PA případně použít pro stanovení množství PA přirozeného typu přítomného ve vzorku od subjektu, který byl léčen dominantně negativním mutantním PA.
Podobné protilátky lze vyprodukovat i pro další mutantní skupiny B podle předkládaného vynálezu.
Příklad 11
Podávání PA proteinů a jejich fragmentů
Není úmyslem, aby podávání PA proteinů nebo fragmentů podle předkládaného vynálezu bylo omezeno na konkrétní způsob podávání, dávkování nebo frekvenci podávání, předkládaný způsob zahrnuje všechny způsoby podávání, včetně orálního, intramuskulárního, intravenózního, subkutánního, inhalací nebo jinými cestami, které poskytnou dávku postačující pro prevenci nebo léčení infekce antraxem. Jeden nebo více mutantních PA proteinů nebo fragmentů lze podávat savci v jediné dávce nebo ve více dávkách. Kdy se podávání provádí ve více dávkách, pak lze dávky podávat jednu po druhé například po týdnu nebo po měsíci. Je třeba chápat, že pro jakýkoliv konkrétní subjekt by se režimy konkrétního dávkování měly postupem času upravovat podle individuální potřeby a profesionálního posouzení osoby provádějící podávání nebo dohlížející na podávání prostředků.
Farmaceutické prostředky obsahující jeden nebo více PA proteinů nebo fragmentů podle předkládaného vynálezu lze připravit postupem popsaným v knize Remington's Pharmaceutical
Sciences od E. W. Martina. Lze použít sloučeniny stabilizující léčivo, látky pro dopravování léčiva, nosiče léčiva nebo adjuvans. Například lze použít lidský sérum albumin nebo jiný lidský nebo zvířecí protein. Jako farmaceuticky přijatelné nosiče nebo látky dopravující léčivo jsou možné fosfolipidová vesikula nebo liposomální suspenze. Adjuvans, která lze použít v předkládaném vynálezu zahrnují sloučeniny hliníku, jako je hydroxid hlinitý, fosforečnan hlinitý a hydroxyfosforečnan hlinitý. Tyto prostředky lze připravit způsoby, které jsou odborníkům v dané problematice známy.
Podobně lze podávat i další mutantní B skupiny nebo fragmenty podle předkládaného vynálezu.
Příklad 12
Další mutanty tvořící póry
Z krystalové struktury PA byly zjištěny čtyři domény PA (Petosa a kol., Nátuře 385 (6619) : 833 až 838, 1997) . Doména 2 (zbytky 259 až 487) obsahuje velkou flexibilní smyčku, která podléhá hlavní konformační změně při přeměně prepóru na pór. Záměna, vynechání nebo vložení jedné nebo více aminokyselin v této oblasti případně vede k inhibici schopnosti proteinu tvořit pór in vivo a/nebo vede ke schopnosti mutantního PA inhibovat schopnost tvořit pór u PA přirozeného typu. Například lze změnit zbytky v doméně 2 PA, které jsou stejné jako odpovídající zbytky v jednom nebo více toxinech tvořících pór (jako jsou toxiny z Clostridium difficile, C. perfringens, C. spiroforme, C. botulinum, Bacillus cereus nebo B. thuringiensis, obrázky 15 a 16) . Tyto zbytky lze v PA změnit nebo vynechat tak, aby vznikly dominantně negativní PA mutanty. Následující zbytky z domény 2 v PA jsou invariantní mezi binárními A-B toxiny vypsanými na obrázcích 15 a 16: A259, P260, V262, V264, M266, E267, S272 E275 T298, N253,
N361, N363 R365, Y366, N368, G370, T371, Y375, V377, P389, T380, T381, V384, T393, 1394, P407, Y411, P412, A420, D425, • ·
F427, 1432, N435, Q438, L450, T452, Q454, G457, G474, W477 a 1484. Tyto zbytky lze vyměnit za jakoukoliv jinou aminokyselinu. Například lze tyto zbytky vyměnit za aminokyselinu s menším postranním řetězcem, jako je glycin nebo alanin nebo lze tyto zbytky vyměnit za aminokyseliny s větším nebo rozvětveným postranním řetězcem, jako je tryptofan, leucin nebo methionin. Dále lze nabité zbytky vyměnit za zbytky s neutrálním postranním řetězcem nebo zbytky s postranním řetězcem nesoucím opačný náboj. Další příklady takových zbytků, které lze použít pro nahrazení přirozených zbytků jsou vypsány v tabulce 1.
Kromě toxinu antraxu se předkládaný vynález týká také dalších toxinů tvořících póry. Tyto toxiny lze také změnit tak, že vzniknou toxiny se sníženou nebo neměřitelnou schopností oligomerizovat, tvořit transmembránové kanály nebo přemisťovat ligandy. Navíc lze vytvořit dominantně negativní mutanty z jiných póry tvořících mutantů. Například mutace, které odpovídají PA mutacím popsaným v předkládaném vynálezu, lze provést na jiných toxinech, které jsou homologické k PA (jako jsou toxiny z Clostridium difficile, C. perfringens, C. spiroforme, C. botulinum, Bacillus cereus nebo B. thuringiensis) (obrázky 15 a 16 a tabulka 6) . Zbytky v jiných toxinech, které odpovídají zbytkům v doméně 2 PA lze změnit postupem, který již byl popsán výše. Navíc lze u jiných pór tvořících toxinů vynechat alespoň 1, 3, 5, 8, 10, 15, 20 nebo 24 aminokyselin v oblasti odpovídající smyčce D2L2 PA. Také lze provést jednu nebo více bodových mutací zbytků odpovídajících mutovaným PA zbytkům popsaným v předkládaném vynálezu.
Jakoukoliv z těchto mutantních forem pór tvořících toxinů lze podávat savci za účelem léčení nebo prevence infekce patogeny (např. baktériemi), které produkují odpovídající toxin.
Tabulka 6
Mutace v dalších pór tvořících toxinech, které odpovídají mutacím v PA antraxu, které jsou popsány v předkládaném vynálezu. Zbytky v dalších pór tvořících toxinech, které odpovídají zbytkům, které byly změněny v PA lze také změnit na jakoukoliv jinou kyselinu.
PA Toxin C. Toxin C. Toxin C. Toxin C. Toxin B.
antraxu difficile perfringens spiroforme botulinum cereus
K3 97A Q425A Q424A Q428A Q3 98A K879A
K3 97D Q425D Q424D Q428D Q398D K879D
K397C Q425C Q424C Q428C Q398C K879C
K397Q Q425Q Q424Q Q428Q Q398Q K879Q
D425A D453A D452A D456A D426A D907A
D425N D453N D452N D456N D426N D907N
D425E D453E D452E D456E D426E D907E
D425K D453K D452K D456K D426K D907K
F427A F455A F454A F458A F428a F909A
K397D + Q425D + Q424D + Q428D + Q398D + K879D +
D425K D453K D452K D456K D426K D907K
K395D + K423D + K422D + K426D + K396D + T877D
K397D + Q425D + Q424D + Q428D + Q398D + K879D +
D425K + D453K + D452K + D456K + D426K + D907K +
D426K Q454K Q453K Q457K Q427K D908K
AD2L2 Δ340-358 Δ339-357 Δ343-361 Δ307-331 Δ797-816
K397D + Q425D + Q424D + Q428D + Q398D + K879D +
D425K + D453K + D452K + D456K + D426K + D907K +
F427A F455A F454A F458A F428A F909A
F427A + F455A + F454A + F458A + F428A + F909A +
AD2L2 Δ340-358 Δ339-357 Δ343-361 Δ307-331 Δ797-816
K397D + Q425D + Q424D + Q428D + Q398D + K879D +
F427A + F455A + F454A + F458A + F428A + F909A +
AD2L2 Δ340-358 Δ339-357 Δ343-361 Δ307-331 Δ797-816
K397D + Q425D + Q424D + Q428D + Q398D + K879D +
• * • · · · · ··· ·· ·······
D425K + D453K + D452K + D456K + D426K + D907K +
F427A + F455A + F454A + F458A + F428A + F909A +
AD2L2 Δ340-358 Δ339-357 Δ343-361 Δ307-331 Δ797-816
F427D F455D F454D F458D F428D F909D
F427K F455K F454K F458K F428K F909K
Alternativně lze za použití standardních postupů molekulární biologie provést na nukleových kyselinách kódujících pór tvořící mutanty (jako jsou cholesterol dependentní cytolysiny nebo hexamerní nebo heptamerní toxiny příbuzné k α-toxinu Staphylococcus) náhodnou mutagenezi. Kódované mutantní toxiny lze exprimovat a případně čistit za použití standardních způsobů. Test uvolňování rubidia popsaný v předkládaném vynálezu lze použít pro rozpoznání mutantních toxinů se sníženou schopností tvořit transmembránové kanály. Navíc lze pro rozpoznávání dominantně negativních mutantních toxinů, které snižují toxicitu odpovídajícího toxinu přirozeného typu v případě, že je mutantní toxin a toxin přirozeného typu podán zvířatům, použít živočišné modely.
Další provedení
Všechny publikace a patentové přihlášky zmíněné v této přihlášce jsou zde uvedeny jako reference ve stejném rozsahu jako kdyby každá nezávislá publikace nebo patentová přihláška byly konkrétně a jednotlivě označeny, že jsou zde uvedeny jako reference.
I když byl předkládaný vynález popsán na konkrétních příkladech, je třeba chápat, že jsou možné další úpravy a tato přihláška zahrnuje všechny variace, použití nebo úpravy vynálezu, které obecně sledují principy vynálezu a zahrnují takové odchylky od předkládaného vynálezu, které jsou známé nebo běžné v rámci dané problematiky, do které předkládaný vynález spadá, a lze je aplikovat na nezbytné rysy, které již byly uvedeny výše budou uvedeny dále v rámci patentových nároků.
Další provedení spadají do rámce patentových nároků.
Průmyslová využitelnost
Prostředky podle předkládaného vynálezu jsou průmyslově využitelné pro výrobu léčiv.
Seznam sekvencí <110> President and Fellows of Harvard College <120> Compounds and Methods for the Treatment and Prevention of Bacterial Infection <130> 00742/060CZ2 <150> PCT/USO1/14372 <151> 2001-05-04 <150> US 60/201,800 <151> 2000-05-04 <160> 35 <170> FastSEQ for Windows Version 4.0 <210> 1 <211> 736 <212> PRT <213> Bacillus anthracis <400> 1
Glu Val Lys Gin Glu Asn Arg Leu Leu Asn Glu Ser Glu Ser
1 5 10
Ser Ser Gin Gly Leu Leu Gly Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Asn
15 20 25
Phe Gin Ala Pro Met Val Val Thr Ser Ser Thr Thr Gly Asp
30 35 40
Leu Ser Ile Pro Ser Ser Glu Leu Glu Asn Ile Pro Ser Glu
45 50 55
Asn Gin Tyr Phe Gin Ser Ala Ile Trp Ser Gly Phe Ile Lys
60 65 70
Val Lys Lys Ser Asp Glu Tyr Thr Phe Ala Thr Ser Ala Asp
75 80
Asn His Val Thr Met Trp Val Asp Asp Gin Glu Val Ile Asn
85 90 95
Lys Ala Ser Asn Ser Asn Lys Ile Arg Leu Glu Lys Gly Arg
100 105 110
Leu Tyr Gin Ile Lys Ile Gin Tyr Gin Arg Glu Asn Pro Thr
115 120 125
Glu Lys Gly Leu Asp Phe Lys Leu Tyr Trp Thr Asp Ser Gin
130 135 140
Asn Lys Lys Glu Val Ile Ser Ser Asp Asn Leu Gin Leu Pro
145 150
Glu Leu Lys Gin Lys Ser Ser Asn Ser Arg Lys Lys Arg Ser
155 160 165
Thr Ser Ala Gly Pro Thr Val Pro Asp Arg Asp Asn Asp Gly
170 175 180
Ile Pro Asp Ser Leu Glu Val Glu Gly Tyr Thr Val Asp Val
185 190 195
Lys Asn Lys Arg Thr Phe Leu Ser Pro Trp Ile Ser Asn Ile
200 205 210
His Glu Lys Lys Gly Leu Thr Lys Tyr Lys Ser Ser Pro Glu
215 220
Lys Trp Ser Thr Ala Ser Asp Pro Tyr Ser Asp Phe Glu Lys
225 230 235
Val Thr Gly 240 Arg Ile Asp Lys Asn 245 Val Ser Pro Glu 250 Ala Arg
His Pro Leu Val Ala Ala Tyr Pro Ile Val His Val Asp Met
255 260 265
Glu Asn Ile Ile Leu Ser Lys Asn Glu Asp Gin Ser Thr Gin
270 275 280
Asn Thr Asp Ser Glu Thr Arg Thr Ile Ser Lys Asn Thr Ser
285 290
Thr Ser Arg Thr His Thr Ser Glu Val His Gly Asn Ala Glu
295 300 305
Val His Ala Ser Phe Phe Asp Ile Gly Gly Ser Val Ser Ala
310 315 320
Gly Phe Ser Asn Ser Asn Ser Ser Thr Val Ala Ile Asp His
325 330 335
Ser Leu Ser Leu Ala Gly Glu Arg Thr Trp Ala Glu Thr Met
340 345 350
Gly Leu Asn Thr Ala Asp Thr Ala Arg Leu Asn Ala Asn Ile
355 360
Arg Tyr Val Asn Thr Gly Thr Ala Pro Ile Tyr Asn Val Leu
365 370 375
Pro Thr Thr Ser Leu Val Leu Gly Lys Asn Gin Thr Leu Ala
380 385 390
Thr Ile Lys Ala Lys Glu Asn Gin Leu Ser Gin Ile Leu Ala
395 400 405
Pro Asn Asn Tyr Tyr Pro Ser Lys Asn Leu Ala Pro Ile Ala
410 415 420
Leu Asn Ala Gin Asp Asp Phe Ser Ser Thr Pro Ile Thr Met
425 430
Asn Tyr Asn Gin Phe Leu Glu Leu Glu Lys Thr Lys Gin Leu
435 440 445
Arg Leu Asp Thr Asp Gin Val Tyr Gly Asn Ile Ala Thr Tyr
450 455 460
Asn Phe Glu Asn Gly Arg Val Arg Val Asp Thr Gly Ser Asn
465 470 475
Trp
Ile
Ile
505
Pro
Phe
Ile
Asn
Tyr
575
Ile
Ile
Arg
Ile
Glu
645
Arg
Lys
Leu
Val ·· ·· * · • · • ; . · · ··· ·· ··· ···· ·· ···
Gin Glu Thr Thr Ala Arg
485 490
Asn Leu Val Glu Arg Arg 500
Pro Leu Glu Thr Thr Lys 515
Leu Lys Ile Ala Phe Gly 530
Gin Tyr Gin Gly Lys Asp 545
Asp Gin Gin Thr Ser Gin
555 560
Leu Asn Ala Thr Asn Ile
570
Leu Asn Ala Lys Met Asn 585
His Tyr Asp Arg Asn Asn 600
Val Val Lys Glu Ala His 615
Glu Gly Leu Leu Leu Asn
625 630
Leu Ser Gly Tyr Ile Val 640
Lys Glu Val Ile Asn Asp 655
Ser Leu Arg Gin Asp Gly 670
Tyr Asn Asp Lys Leu Pro 685
Lys Val Asn Val Tyr Ala
696 700
Asn Pro Ser Glu Asn Gly 710
Ser Glu Val Leu Pro Gin Ile
480
Ile Phe Asn Gly Lys Asp Leu 495
Ala Ala Val Asn Pro Ser Asp 510
Asp Met Thr Leu Lys Glu Ala 520 525
Asn Glu Pro Asn Gly Asn Leu 535 540
Thr Glu Phe Asp Phe Asn Phe 550
Ile Lys Asn Gin Leu Ala Glu 565
Thr Val Leu Asp Lys Ile Lys 580
Leu Ile Arg Asp Lys Arg Phe 590 595
Ala Val Gly Ala Asp Glu Ser 605 610
Glu Val Ile Asn Ser Ser Thr
620
Asp Lys Asp Ile Arg Lys Ile 635
Ile Glu Asp Thr Glu Gly Leu 650
Tyr Asp Met Leu Asn Ile Ser 660 665
Thr Phe Ile Asp Phe Lys Lys 675 680
Tyr Ile Ser Asn Pro Asn Tyr 690
Thr Lys Glu Asn Thr Ile Ile 705
Λ · ·· • · · ·· ·· ♦· • * · ♦ · • · · * • · · · · • · · · ···· ·· ···«
Asp Thr Ser Thr Asn Gly Ile Lys Lys Ile Leu Ile Phe Ser 715 720 725
Lys Lys Gly Tyr Glu Ile Gly Glx
730 735 <210> 2 <211> 736 <212> PRT <213> Bacillus anthracis <400> 2
Glu Val 1 Lys Gin Glu Asn Arg Leu Leu Asn Glu Ser Glu Ser
5 10
Ser Ser Gin Gly Leu Leu Gly Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Asn
15 20 25
Phe Gin Ala Pro Met Val Val Thr Ser Ser Thr Thr Gly Asp
30 35 40
Leu Ser Ile Pro Ser Ser Glu Leu Glu Asn Ile Pro Ser Glu
45 50 55
Asn Gin Tyr Phe Gin Ser Ala Ile Trp Ser Gly Phe Ile Lys
60 65 70
Val Lys Lys Ser Asp Glu Tyr Thr Phe Ala Thr Ser Ala Asp
75 80
Asn His Val Thr Met Trp Val Asp Asp Gin Glu Val Ile Asn
85 90 95
Lys Ala Ser Asn Ser Asn Lys Ile Arg Leu Glu Lys Gly Arg
100 105 110
Leu Tyr Gin Ile Lys Ile Gin Tyr Gin Arg Glu Asn Pro Thr
115 120 125
Glu Lys Gly Leu Asp Phe Lys Leu Tyr Trp Thr Asp Ser Gin
130 135 140
Asn Lys Lys Glu Val Ile Ser Ser Asp Asn Leu Gin Leu Pro
145 150
50 • · · • « · • · ·♦ · • • · • · • ·· • ♦ • « · · · • • • · • ···
Glu Leu Lys Gin Lys Ser Ser Asn Ser Arg Lys Lys Arg Ser
155 160 165
Thr Ser Ala Gly Pro Thr Val Pro Asp Arg Asp Asn Asp Gly
170 175 180
Ile Pro Asp Ser Leu Glu Val Glu Gly Tyr Thr Val Asp Val
185 190 195
Lys Asn Lys Arg Thr Phe Leu Ser Pro Trp Ile Ser Asn Ile
200 205 210
His Glu Lys Lys Gly Leu Thr Lys Tyr Lys Ser Ser Pro Glu
215 220
Lys Trp Ser Thr Ala Ser Asp Pro Tyr Ser Asp Phe Glu Lys
225 230 235
Val Thr Gly Arg Ile Asp Lys Asn Val Ser Pro Glu Ala Arg
240 245 250
His Pro Leu Val Ala Ala Tyr Pro Ile Val His Val Asp Met
255 260 265
Glu Asn Ile Ile Leu Ser Lys Asn Glu Asp Gin Ser Thr Gin
270 275 280
Asn Thr Asp Ser Glu Thr Arg Thr Ile Ser Lys Asn Thr Ser
285 290
Thr Ser Arg Thr His Thr Ser Glu Val His Gly Asn Ala Glu
295 300 305
Val His Ala Ser Phe Phe Asp Ile Gly Gly Ser Val Ser Ala
310 315 320
Gly Phe Ser Asn Ser Asn Ser Ser Thr Val Ala Ile Asp His
325 330 335
Ser Leu Ser Leu Ala Gly Glu Arg Thr Trp Ala Glu Thr Met
340 345 350
Gly Leu Asn Thr Ala Asp Thr Ala Arg Leu Asn Ala Asn Ile
355 360
Arg Tyr Val Asn Thr Gly Thr Ala Pro Ile Tyr Asn Val Leu
365 370 375
Pro Thr Thr Ser Leu Val Leu Gly Lys Asn Gin Thr Leu Ala
380 385 390
Thr Ile Lys Ala Lys Glu Asn Gin Leu Ser Gin Ile Leu 405 Ala
395 400
Pro Asn Asn Tyr Tyr Pro Ser Lys Asn Leu Ala Pro Ile Ala
410 415 420
Leu Asn Ala Gin Asp Asp Phe Ser Ser Thr Pro Ile Thr Met
425 430
Asn Tyr Asn Gin Phe Leu Glu Leu Glu Lys Thr Lys Gin Leu
435 440 445
Arg Leu Asp Thr Asp Gin Val Tyr Gly Asn Ile Ala Thr Tyr
450 455 460
Asn Phe Glu Asn Gly Arg Val Arg Val Asp Thr Gly Ser Asn
465 470 475
Trp Ser Glu Val Leu Pro Gin Ile Gin Glu Thr Thr Ala Arg
480 485 490
Ile Ile Phe Asn Gly Lys Asp Leu Asn Leu Val Glu Arg Arg
495 500
Ile Ala Ala Val Asn Pro Ser Asp Pro Leu Glu Thr Thr Lys
505 510 515
Pro Asp Met Thr Leu Lys Glu Ala Leu Lys Ile Ala Phe Gly
520 525 530
Phe Asn Glu Pro Asn Gly Asn Leu Gin Tyr Gin Gly Lys Asp
535 540 545
Ile Thr Glu Phe Asp Phe Asn Phe Asp Gin Gin Thr Ser Gin
550 555 560
Asn Ile Lys Asn Gin Leu Ala Glu Leu Asn Ala Thr Asn Ile
565 570
Tyr Thr Val Leu Asp Lys Ile Lys Leu Asn Ala Lys Met Asn
575 580 585
Ile Leu Ile Arg Asp Lys Arg Phe His Tyr Asp Arg Asn Asn
590 595 600
Ile Ala Val Gly Ala Asp Glu Ser Val Val Lys Glu Ala His
605 610 615
Arg Glu Val Ile Asn Ser Ser Thr Glu Gly Leu Leu Leu Asn
620 625 630
• ·
Ile Asp Lys Asp Ile Arg 635 Lys Ile Leu Ser 640 Gly Tyr Ile Val
Glu Ile Glu Asp Thr Glu Gly Leu Lys Glu Val Ile Asn Asp
645 650 655
Arg Tyr Asp Met Leu Asn Ile Ser Ser Leu Arg Gin Asp Gly
660 665 670
Lys Thr Phe Ile Asp Phe Lys Lys Tyr Asn Asp Lys Leu Pro
675 680 685
Leu Tyr Ile Ser Asn Pro Asn Tyr Lys Val Asn Val Tyr Ala
690 695 700
Val Thr Lys Glu Asn Thr Ile Ile Asn Pro Ser Glu Asn Gly
705 710
Asp Thr Ser Thr Asn Gly Ile Lys Lys Ile Leu Ile Phe Ser
715 720 725
Lys Lys Gly Tyr Glu Ile Gly Glx
730 735
<210> 3 <211> 736 <212> PRT <213> Bacillus anthracis <400> 3
Glu Val Lys Gin Glu Asn Arg 1 5
Ser Ser Gin Gly Leu Leu Gly 15 20
Phe Gin Ala Pro Met Val Val
35
Leu Ser Ile Pro Ser Ser Glu
Asn Gin Tyr Phe Gin Ser Ala 60
Leu Leu Asn Glu Ser Glu Ser
Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Asn 25
Thr Ser Ser Thr Thr Gly Asp 40
Leu Glu Asn Ile Pro Ser Glu
55
Ile Trp Ser Gly Phe Ile Lys 65
Val Lys Lys Ser Asp Glu Tyr Thr Phe Ala Thr Ser Ala Asp
75 80
Asn His Val Thr Met Trp Val Asp Asp Gin Glu Val Ile Asn
85 90 95
Lys Ala Ser Asn Ser Asn Lys Ile Arg Leu Glu Lys Gly Arg
100 105 110
Leu Tyr Gin Ile Lys Ile Gin Tyr Gin Arg Glu Asn Pro Thr
115 120 125
Glu Lys Gly Leu Asp Phe Lys Leu Tyr Trp Thr Asp Ser Gin
130 135 140
Asn Lys Lys Glu Val Ile Ser Ser Asp Asn Leu Gin Leu Pro
145 150
Glu Leu Lys Gin Lys Ser Ser Asn Ser Arg Lys Lys Arg Ser
155 160 165
Thr Ser Ala Gly Pro Thr Val Pro Asp Arg Asp Asn Asp Gly
170 175 180
Ile Pro Asp Ser Leu Glu Val Glu Gly Tyr Thr Val Asp Val
185 190 195
Lys Asn Lys Arg Thr Phe Leu Ser Pro Trp Ile Ser Asn Ile
200 205 210
His Glu Lys Lys Gly Leu Thr Lys Tyr Lys Ser Ser Pro Glu
215 220
Lys Trp Ser Thr Ala Ser Asp Pro Tyr Ser Asp Phe Glu Lys
225 230 235
Val Thr Gly Arg Ile Asp Lys Asn Val Ser Pro Glu Ala Arg
240 245 250
His Pro Leu Val Ala Ala Tyr Pro Ile Val His Val Asp Met
255 260 265
Glu Asn Ile Ile Leu Ser Lys Asn Glu Asp Gin Ser Thr Gin
270 275 280
Asn Thr Asp Ser Glu Thr Arg Thr Ile Ser Lys Asn Thr Ser
285 290
Thr Ser Arg Thr His Thr Ser Glu Val His Gly Asn Ala Glu
295 300 305
54 4 4 4 4 • 4 4 4 · 44 4 • 4 • 44 4 4 4 4 4 4 44 4*· 4 • 4 4 ·4 4 4 444 4444
Val His Ala Ser Phe Phe Asp Ile Gly Gly Ser Val Ser Ala
310 315 320
Gly Phe Ser Asn Ser Asn Ser Ser Thr Val Ala Ile Asp His
325 330 335
Ser Leu Ser Leu Ala Gly Glu Arg Thr Trp Ala Glu Thr Met
340 345 350
Gly Leu Asn Thr Ala Asp Thr Ala Arg Leu Asn Ala Asn Ile
355 360
Arg Tyr Val Asn Thr Gly Thr Ala Pro Ile Tyr Asn Val Leu
365 370 375
Pro Thr Thr Ser Leu Val Leu Gly Lys Asn Gin Thr Leu Ala
380 385 390
Thr Ile Lys Ala Lys Glu Asn Gin Leu Ser Gin Ile Leu Ala
395 400 405
Pro Asn Asn Tyr Tyr Pro Ser Lys Asn Leu Ala Pro Ile Ala
410 415 420
Leu Asn Ala Gin Asp Asp Phe Ser Ser Thr Pro Ile Thr Met
425 430
Asn Tyr Asn Gin Phe Leu Glu Leu Glu Lys Thr Lys Gin Leu
435 440 445
Arg Leu Asp Thr Asp Gin Val Tyr Gly Asn Ile Ala Thr Tyr
450 455 460
Asn Phe Glu Asn Gly Arg Val Arg Val Asp Thr Gly Ser Asn
465 470 475
Trp Ser Glu Val Leu Pro Gin Ile Gin Glu Thr Thr Ala Arg
480 485 490
Ile Ile Phe Asn Gly Lys Asp Leu Asn Leu Val Glu Arg Arg
495 500
Ile Ala Ala Val Asn Pro Ser Asp Pro Leu Glu Thr Thr Lys
505 510 515
Pro Asp Met Thr Leu Lys Glu Ala Leu Lys Ile Ala Phe Gly
520 525 530
Phe Asn Glu Pro Asn Gly Asn Leu Gin Tyr Gin Gly Lys Asp
535 540 545
55 ·· · • < « · • · »·· < • »· • » • »· · * • · * • · · · • » · ·»« ····
Ile Thr Glu Phe Asp Phe Asn Phe Asp Gin Gin Thr Ser Gin
550 555 560
Asn Ile Lys Asn Gin Leu Ala Glu Leu Asn Ala Thr Asn Ile
565 570
Tyr Thr Val Leu Asp Lys Ile Lys Leu Asn Ala Lys Met Asn
575 580 585
Ile Leu Ile Arg Asp Lys Arg Phe His Tyr Asp Arg Asn Asn
590 595 600
Ile Ala Val Gly Ala Asp Glu Ser Val Val Lys Glu Ala His
605 610 615
Arg Glu Val Ile Asn Ser Ser Thr Glu Gly Leu Leu Leu Asn
620 625 630
Ile Asp Lys Asp Ile Arg Lys Ile Leu Ser Gly Tyr Ile Val
635 640
Glu Ile Glu Asp Thr Glu Gly Leu Lys Glu Val Ile Asn Asp
645 650 655
Arg Tyr Asp Met Leu Asn Ile Ser Ser Leu Arg Gin Asp Gly
660 665 670
Lys Thr Phe Ile Asp Phe Lys Lys Tyr Asn Asp Lys Leu Pro
675 680 685
Leu Tyr Ile Ser Asn Pro Asn Tyr Lys Val Asn Val Tyr Ala
690 695 700
Val Thr Lys Glu Asn Thr Ile Ile Asn Pro Ser Glu Asn Gly
705 710
Asp Thr Ser Thr Asn Gly Ile Lys Lys Ile Leu Ile Phe Ser
715 720 725
Lys Lys Gly Tyr Glu Ile Gly Glx
730 735 <210> 4 <211> 736 <212> PRT <213> Bacillus anthracis <400> 4
Glu Val Lys Gin Glu Asn Arg Leu 1 5
Ser Ser Gin Gly Leu Leu Gly Tyr 15 20
Phe Gin Ala Pro Met Val Val Thr
35
Leu Ser Ile Pro Ser Ser Glu Leu
50
Asn Gin Tyr Phe Gin Ser Ala Ile
Val Lys Lys Ser Asp Glu Tyr Thr 75
Asn His Val Thr Met Trp Val Asp
90
Lys Ala Ser Asn Ser Asn Lys Ile
100 105
Leu Tyr Gin Ile Lys Ile Gin Tyr
115 120
Glu Lys Gly Leu Asp Phe Lys Leu
130
Asn Lys Lys Glu Val Ile Ser Ser 145
Glu Leu Lys Gin Lys Ser Ser Asn
155 160
Thr Ser Ala Gly Pro Thr Val Pro
170 175
Ile Pro Asp Ser Leu Glu Val Glu
185 190
Lys Asn Lys Arg Thr Phe Leu Ser
200
His Glu Lys Lys Gly Leu Thr Lys 215 fc ** ** ···· ·· · i • *· · * * * · • « · · « · * * ·· 4·*· »· ·»··
Leu Asn Glu Ser Glu Ser
Tyr Phe Ser Asp Leu Asn 25
Ser Ser Thr Thr Gly Asp 40
Glu Asn Ile Pro Ser Glu
Trp Ser Gly Phe Ile Lys
70
Phe Ala Thr Ser Ala Asp 80
Asp Gin Glu Val Ile Asn 95
Arg Leu Glu Lys Gly Arg 110
Gin Arg Glu Asn Pro Thr 125
Tyr Trp Thr Asp Ser Gin
135 140
Asp Asn Leu Gin Leu Pro 150
Ser Arg Lys Lys Arg Ser 165
Asp Arg Asp Asn Asp Gly 180
Gly Tyr Thr Val Asp Val 195
Pro Trp Ile Ser Asn Ile
205 210
Tyr Lys Ser Ser Pro Glu 220 ·4·· • · · · · ·«· *· ··· *···
Lys Trp Ser Thr Ala Ser Asp Pro Tyr Ser Asp Phe Glu Lys
225 230 235
Val Thr Gly Arg Ile Asp Lys Asn Val Ser Pro Glu Ala Arg
240 245 250
His Pro Leu Val Ala Ala Tyr Pro Ile Val His Val Asp Met
255 260 265
Glu Asn Ile Ile Leu Ser Lys Asn Glu Asp Gin Ser Thr Gin
270 275 280
Asn Thr Asp Ser Glu Thr Arg Thr Ile Ser Lys Asn Thr Ser
285 290
Thr Ser Arg Thr His Thr Ser Glu Val His Gly Asn Ala Glu
295 300 305
Val His Ala Ser Phe Phe Asp Ile Gly Gly Ser Val Ser Ala
310 315 320
Gly Phe Ser Asn Ser Asn Ser Ser Thr Val Ala Ile Asp His
325 330 335
Ser Leu Ser Leu Ala Gly Glu Arg Thr Trp Ala Glu Thr Met
340 345 350
Gly Leu Asn Thr Ala Asp Thr Ala Arg Leu Asn Ala Asn Ile
355 360
Arg Tyr Val Asn Thr Gly Thr Ala Pro Ile Tyr Asn Val Leu
365 370 375
Pro Thr Thr Ser Leu Val Leu Gly Lys Asn Gin Thr Leu Ala
380 385 390
Thr Ile Lys Ala Lys Glu Asn Gin Leu Ser Gin Ile Leu Ala
395 400 405
Pro Asn Asn Tyr Tyr Pro Ser Lys Asn Leu Ala Pro Ile Ala
410 415 420
Leu Asn Ala Gin Asp Asp Phe Ser Ser Thr Pro Ile Thr Met
425 430
Asn Tyr Asn Gin Phe Leu Glu Leu Glu Lys Thr Lys Gin Leu
435 440 445
Arg Leu Asp Thr Asp Gin Val Tyr Gly Asn Ile Ala Thr Tyr
450
455
460 • ·· · *· ·· • · Λ · · · · · · · ·
Asn Phe Glu Asn Gly Arg Val Arg Val Asp Thr Gly Ser Asn
465 470 475
Trp Ser Glu Val Leu Pro Gin Ile Gin Glu Thr Thr Ala Arg
480 485 490
Ile Ile Phe Asn Gly Lys Asp Leu Asn Leu Val Glu Arg Arg
495 500
Ile Ala Ala Val Asn Pro Ser Asp Pro Leu Glu Thr Thr Lys
505 510 515
Pro Asp Met Thr Leu Lys Glu Ala Leu Lys Ile Ala Phe Gly
520 525 530
Phe Asn Glu Pro Asn Gly Asn Leu Gin Tyr Gin Gly Lys Asp
535 540 545
Ile Thr Glu Phe Asp Phe Asn Phe Asp Gin Gin Thr Ser Gin
550 555 560
Asn Ile Lys Asn Gin Leu Ala Glu Leu Asn Ala Thr Asn Ile
565 570
Tyr Thr Val Leu Asp Lys Ile Lys Leu Asn Ala Lys Met Asn
575 580 585
Ile Leu Ile Arg Asp Lys Arg Phe His Tyr Asp Arg Asn Asn
590 595 600
Ile Ala Val Gly Ala Asp Glu Ser Val Val Lys Glu Ala His
605 610 615
Arg Glu Val Ile Asn Ser Ser Thr Glu Gly Leu Leu Leu Asn
620 625 630
Ile Asp Lys Asp Ile Arg Lys Ile Leu Ser Gly Tyr Ile Val
635 640
Glu Ile Glu Asp Thr Glu Gly Leu Lys Glu Val Ile Asn Asp
645 650 655
Arg Tyr Asp Met Leu Asn Ile Ser Ser Leu Arg Gin Asp Gly
660 665 670
Lys Thr Phe Ile Asp Phe Lys Lys Tyr Asn Asp Lys Leu Pro
675 680 685
Leu Tyr Ile Ser Asn Pro Asn Tyr Lys Val Asn Val Tyr Ala
690 695 700 ·· · ·· ·· ·· ·· ···· · · · ·· · · · · ··· · ···· · • · · · « · ·
Val Thr Lys Glu Asn 705 Thr Ile Ile Asn Pro Ser 710 Glu Asn Gly
Asp Thr Ser Thr Asn Gly Ile Lys Lys Ile Leu Ile Phe Ser
715 720 725
Lys Lys Gly Tyr Glu Ile Gly Glx
730 735
<210> 5 <211> 736 <212> PRT <213> Bacillus anthracis <400> 5
Glu Val 1 Lys Gin Glu 5 Asn Arg Leu Leu Asn Glu 10 Ser Glu Ser
Ser Ser Gin Gly Leu Leu Gly Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Asn
15 20 25
Phe Gin Ala Pro Met Val Val Thr Ser Ser Thr Thr Gly Asp
30 35 40
Leu Ser Ile Pro Ser Ser Glu Leu Glu Asn Ile Pro Ser Glu
45 50 55
Asn Gin Tyr Phe Gin Ser Ala Ile Trp Ser Gly Phe Ile Lys
60 65 70
Val Lys Lys Ser Asp Glu Tyr Thr Phe Ala Thr Ser Ala Asp
75 80
Asn His Val Thr Met Trp Val Asp Asp Gin Glu Val Ile Asn
85 90 95
Lys Ala Ser Asn Ser Asn Lys Ile Arg Leu Glu Lys Gly Arg
100 105 110
Leu Tyr Gin Ile Lys Ile Gin Tyr Gin Arg Glu Asn Pro Thr
115 120 125
Glu Lys Gly Leu Asp Phe Lys Leu Tyr Trp Thr Asp Ser Gin
130
135
140
Asn Lys Lys Glu Val 145 Ile Ser Ser Asp Asn Leu Gin Leu 150 Pro
Glu Leu Lys Gin Lys Ser Ser Asn Ser Arg Lys Lys Arg Ser
155 160 165
Thr Ser Ala Gly Pro Thr Val Pro Asp Arg Asp Asn Asp Gly
170 175 180
Ile Pro Asp Ser Leu Glu Val Glu Gly Tyr Thr Val Asp Val
185 190 195
Lys Asn Lys Arg Thr Phe Leu Ser Pro Trp Ile Ser Asn Ile
200 205 210
His Glu Lys Lys Gly Leu Thr Lys Tyr Lys Ser Ser Pro Glu
215 220
Lys Trp Ser Thr Ala Ser Asp Pro Tyr Ser Asp Phe Glu Lys
225 230 235
Val Thr Gly Arg Ile Asp Lys Asn Val Ser Pro Glu Ala Arg
240 245 250
His Pro Leu Val Ala Ala Tyr Pro Ile Val His Val Asp Met
255 260 265
Glu Asn Ile Ile Leu Ser Lys Asn Glu Asp Gin Ser Thr Gin
270 275 280
Asn Thr Asp Ser Glu Thr Arg Thr Ile Ser Lys Asn Thr Ser
285 290
Thr Ser Arg Thr His Thr Ser Glu Val His Gly Asn Ala Glu
295 300 305
Val His Ala Ser Phe Phe Asp Ile Gly Gly Ser Val Ser Ala
310 315 320
Gly Phe Ser Asn Ser Asn Ser Ser Thr Val Ala Ile Asp His
325 330 335
Ser Leu Ser Leu Ala Gly Glu Arg Thr Trp Ala Glu Thr Met
340 345 350
Gly Leu Asn Thr Ala Asp Thr Ala Arg Leu Asn Ala Asn Ile
355 360
Arg Tyr Val Asn Thr Gly Thr Ala Pro Ile Tyr Asn Val Leu
365 370 375
·· · · · • · · · · ♦ ·
Pro Thr Thr Ser Leu Val Leu Gly Lys Asn 385 Gin Thr 390 Leu Ala
380
Thr Ile Lys Ala Lys Glu Asn Gin Leu Ser Gin Ile Leu Ala
395 400 405
Pro Asn Asn Tyr Tyr Pro Ser Lys Asn Leu Ala Pro Ile Ala
410 415 420
Leu Asn Ala Gin Asp Asp Phe Ser Ser Thr Pro Ile Thr Met
425 430
Asn Tyr Asn Gin Phe Leu Glu Leu Glu Lys Thr Lys Gin Leu
435 440 445
Arg Leu Asp Thr Asp Gin Val Tyr Gly Asn Ile Ala Thr Tyr
450 455 460
Asn Phe Glu Asn Gly Arg Val Arg Val Asp Thr Gly Ser Asn
465 470 475
Trp Ser Glu Val Leu Pro Gin Ile Gin Glu Thr Thr Ala Arg
480 485 490
Ile Ile Phe Asn Gly Lys Asp Leu Asn Leu Val Glu Arg Arg
495 500
Ile Ala Ala Val Asn Pro Ser Asp Pro Leu Glu Thr Thr Lys
505 510 515
Pro Asp Met Thr Leu Lys Glu Ala Leu Lys Ile Ala Phe Gly
520 525 530
Phe Asn Glu Pro Asn Gly Asn Leu Gin Tyr Gin Gly Lys Asp
535 540 545
Ile Thr Glu Phe Asp Phe Asn Phe Asp Gin Gin Thr Ser Gin
550 555 560
Asn Ile Lys Asn Gin Leu Ala Glu Leu Asn Ala Thr Asn Ile
565 570
Tyr Thr Val Leu Asp Lys Ile Lys Leu Asn Ala Lys Met Asn
575 580 585
Ile Leu Ile Arg Asp Lys Arg Phe His Tyr Asp Arg Asn Asn
590 595 600
Ile Ala Val Gly Ala Asp Glu Ser Val Val Lys Glu Ala His
605 610 615
Arg Glu Val Ile 620 Asn Ser Ser Thr Glu Gly 625 Leu Leu Leu Asn 630
Ile Asp Lys Asp Ile Arg Lys Ile Leu Ser Gly Tyr Ile Val
635 640
Glu Ile Glu Asp Thr Glu Gly Leu Lys Glu Val Ile Asn Asp
645 650 655
Arg Tyr Asp Met Leu Asn Ile Ser Ser Leu Arg Gin Asp Gly
660 665 670
Lys Thr Phe Ile Asp Phe Lys Lys Tyr Asn Asp Lys Leu Pro
675 680 685
Leu Tyr Ile Ser Asn Pro Asn Tyr Lys Val Asn Val Tyr Ala
690 695 700
Val Thr Lys Glu Asn Thr Ile Ile Asn Pro Ser Glu Asn Gly
705 710
Asp Thr Ser Thr Asn Gly Ile Lys Lys Ile Leu Ile Phe Ser
715 720 725
Lys Lys Gly Tyr Glu Ile Gly Glx
730 735 <210> 6 <211> 736 <212> PRT <213> Bacillus anthracis <400> 6
Glu Val 1 Lys Gin Glu Asn Arg Leu Leu Asn Glu Ser Glu Ser
5 10
Ser Ser Gin Gly Leu Leu Gly Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Asn
15 20 25
Phe Gin Ala Pro Met Val Val Thr Ser Ser Thr Thr Gly Asp
30 35 40
Leu Ser Ile Pro Ser Ser Glu Leu Glu Asn Ile Pro Ser Glu
• ·
Asn Gin Tyr Phe 60 Gin Ser Ala Ile Trp Ser 65 Gly Phe Ile Lys 70
Val Lys Lys Ser Asp Glu Tyr Thr Phe Ala Thr Ser Ala Asp
75 80
Asn His Val Thr Met Trp Val Asp Asp Gin Glu Val Ile Asn
85 90 95
Lys Ala Ser Asn Ser Asn Lys Ile Arg Leu Glu Lys Gly Arg
100 105 110
Leu Tyr Gin Ile Lys Ile Gin Tyr Gin Arg Glu Asn Pro Thr
115 120 125
Glu Lys Gly Leu Asp Phe Lys Leu Tyr Trp Thr Asp Ser Gin
130 135 140
Asn Lys Lys Glu Val Ile Ser Ser Asp Asn Leu Gin Leu Pro
145 150
Glu Leu Lys Gin Lys Ser Ser Asn Ser Arg Lys Lys Arg Ser
155 160 165
Thr Ser Ala Gly Pro Thr Val Pro Asp Arg Asp Asn Asp Gly
170 175 180
Ile Pro Asp Ser Leu Glu Val Glu Gly Tyr Thr Val Asp Val
185 190 195
Lys Asn Lys Arg Thr Phe Leu Ser Pro Trp Ile Ser Asn Ile
200 205 210
His Glu Lys Lys Gly Leu Thr Lys Tyr Lys Ser Ser Pro Glu
215 220
Lys Trp Ser Thr Ala Ser Asp Pro Tyr Ser Asp Phe Glu Lys
225 230 235
Val Thr Gly Arg Ile Asp Lys Asn Val Ser Pro Glu Ala Arg
240 245 250
His Pro Leu Val Ala Ala Tyr Pro Ile Val His Val Asp Met
255 260 265
Glu Asn Ile Ile Leu Ser Lys Asn Glu Asp Gin Ser Thr Gin
270 275 280
Asn Thr Asp Ser Glu Thr Arg Thr Ile Ser Lys Asn Thr Ser
285 290 • · · · · 4
Thr 295 Ser Arg Thr His Thr 300 Ser Glu Val His Gly 305 Asn Ala Glu
Val His Ala Ser Phe Phe Asp Ile Gly Gly Ser Val Ser Ala
310 315 320
Gly Phe Ser Asn Ser Asn Ser Ser Thr Val Ala Ile Asp His
325 330 335
Ser Leu Ser Leu Ala Gly Glu Arg Thr Trp Ala Glu Thr Met
340 345 350
Gly Leu Asn Thr Ala Asp Thr Ala Arg Leu Asn Ala Asn Ile
355 360
Arg Tyr Val Asn Thr Gly Thr Ala Pro Ile Tyr Asn Val Leu
365 370 375
Pro Thr Thr Ser Leu Val Leu Gly Lys Asn Gin Thr Leu Ala
380 385 390
Thr Ile Lys Ala Lys Glu Asn Gin Leu Ser Gin Ile Leu Ala
395 400 405
Pro Asn Asn Tyr Tyr Pro Ser Lys Asn Leu Ala Pro Ile Ala
410 415 420
Leu Asn Ala Gin Asp Asp Phe Ser Ser Thr Pro Ile Thr Met
425 430
Asn Tyr Asn Gin Phe Leu Glu Leu Glu Lys Thr Lys Gin Leu
435 440 445
Arg Leu Asp Thr Asp Gin Val Tyr Gly Asn Ile Ala Thr Tyr
450 455 460
Asn Phe Glu Asn Gly Arg Val Arg Val Asp Thr Gly Ser Asn
465 470 475
Trp Ser Glu Val Leu Pro Gin Ile Gin Glu Thr Thr Ala Arg
480 485 490
Ile Ile Phe Asn Gly Lys Asp Leu Asn Leu Val Glu Arg Arg
495 500
Ile Ala Ala Val Asn Pro Ser Asp Pro Leu Glu Thr Thr Lys
505 510 515
Pro Asp Met Thr Leu Lys Glu Ala Leu Lys Ile Ala Phe Gly
520
525
530 • * » · · · > · * · · • · · » · · · · · · · • · ·
Phe Asn Glu Pro Asn Gly Asn Leu Gin Tyr Gin Gly Lys Asp
535 540 545
Ile Thr Glu Phe Asp Phe Asn Phe Asp Gin Gin Thr Ser Gin
550 555 560
Asn Ile Lys Asn Gin Leu Ala Glu Leu Asn Ala Thr Asn Ile
565 570
Tyr Thr Val Leu Asp Lys Ile Lys Leu Asn Ala Lys Met Asn
575 580 585
Ile Leu Ile Arg Asp Lys Arg Phe His Tyr Asp Arg Asn Asn
590 595 600
Ile Ala Val Gly Ala Asp Glu Ser Val Val Lys Glu Ala His
605 610 615
Arg Glu Val Ile Asn Ser Ser Thr Glu Gly Leu Leu Leu Asn
620 625 630
Ile Asp Lys Asp Ile Arg Lys Ile Leu Ser Gly Tyr Ile Val
635 640
Glu Ile Glu Asp Thr Glu Gly Leu Lys Glu Val Ile Asn Asp
645 650 655
Arg Tyr Asp Met Leu Asn Ile Ser Ser Leu Arg Gin Asp Gly
660 665 670
Lys Thr Phe Ile Asp Phe Lys Lys Tyr Asn Asp Lys Leu Pro
675 680 685
Leu Tyr Ile Ser Asn Pro Asn Tyr Lys Val Asn Val Tyr Ala
690 695 700
Val Thr Lys Glu Asn Thr Ile Ile Asn Pro Ser Glu Asn Gly
705 710
Asp Thr Ser Thr Asn Gly Ile Lys Lys Ile Leu Ile Phe Ser
715 720 725
Lys Lys Gly Tyr Glu Ile Gly Glx
<210> 7 <211> 736 ·* · ·· ·· · • · · · * · » · ·· · · · ♦ • · · · · ♦ · · • « · · · * · ·· «·· ···· ·» ·· <212> PRT <213> Bacillus anthracis <400> 7
Glu 1 Val Lys Gin Glu Asn Arg Leu Leu Asn Glu Ser Glu Ser
5 10
Ser Ser Gin Gly Leu Leu Gly Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Asn
15 20 25
Phe Gin Ala Pro Met Val Val Thr Ser Ser Thr Thr Gly Asp
30 35 40
Leu Ser Ile Pro Ser Ser Glu Leu Glu Asn Ile Pro Ser Glu
45 50 55
Asn Gin Tyr Phe Gin Ser Ala Ile Trp Ser Gly Phe Ile Lys
60 65 70
Val Lys Lys Ser Asp Glu Tyr Thr Phe Ala Thr Ser Ala Asp
75 80
Asn His Val Thr Met Trp Val Asp Asp Gin Glu Val Ile Asn
85 90 95
Lys Ala Ser Asn Ser Asn Lys Ile Arg Leu Glu Lys Gly Arg
100 105 110
Leu Tyr Gin Ile Lys Ile Gin Tyr Gin Arg Glu Asn Pro Thr
115 120 125
Glu Lys Gly Leu Asp Phe Lys Leu Tyr Trp Thr Asp Ser Gin
130 135 140
Asn Lys Lys Glu Val Ile Ser Ser Asp Asn Leu Gin Leu Pro
145 150
Glu Leu Lys Gin Lys Ser Ser Asn Ser Arg Lys Lys Arg Ser
155 160 165
Thr Ser Ala Gly Pro Thr Val Pro Asp Arg Asp Asn Asp Gly
170 175 180
Ile Pro Asp Ser Leu Glu Val Glu Gly Tyr Thr Val Asp Val
185 190 195
Lys Asn Lys Arg Thr Phe Leu Ser Pro Trp Ile Ser Asn Ile
200 205 210 • 9 • · • « • I • · ·
His Glu Lys Lys Gly Leu Thr 215 Lys Tyr Lys Ser Ser Pro 220 Glu
Lys Trp Ser Thr Ala Ser Asp Pro Tyr Ser Asp Phe Glu Lys
225 230 235
Val Thr Gly Arg Ile Asp Lys Asn Val Ser Pro Glu Ala Arg
240 245 250
His Pro Leu Val Ala Ala Tyr Pro Ile Val His Val Asp Met
255 260 265
Glu Asn Ile Ile Leu Ser Lys Asn Glu Asp Gin Ser Thr Gin
270 275 280
Asn Thr Asp Ser Glu Thr Arg Thr Ile Ser Lys Asn Thr Ser
285 290
Thr Ser Arg Thr His Thr Ser Glu Val His Gly Asn Ala Glu
295 300 305
Val His Ala Ser Phe Phe Asp Ile Gly Gly Ser Val Ser Ala
310 315 320
Gly Phe Ser Asn Ser Asn Ser Ser Thr Val Ala Ile Asp His
325 330 335
Ser Leu Ser Leu Ala Gly Glu Arg Thr Trp Ala Glu Thr Met
340 345 350
Gly Leu Asn Thr Ala Asp Thr Ala Arg Leu Asn Ala Asn Ile
355 360
Arg Tyr Val Asn Thr Gly Thr Ala Pro Ile Tyr Asn Val Leu
365 370 375
Pro Thr Thr Ser Leu Val Leu Gly Lys Asn Gin Thr Leu Ala
380 385 390
Thr Ile Lys Ala Lys Glu Asn Gin Leu Ser Gin Ile Leu Ala
395 400 405
Pro Asn Asn Tyr Tyr Pro Ser Lys Asn Leu Ala Pro Ile Ala
410 415 420
Leu Asn Ala Gin Asp Asp Phe Ser Ser Thr Pro Ile Thr Met
425 430
Asn Tyr Asn Gin Phe Leu Glu Leu Glu Lys Thr Lys Gin Leu
435 440
445 * » »· ·· ** • «19 t ·«* · · * * • ·· · · · » « · · ·· ··· ··· ·· ·»· «♦·· ·· ····
Arg
Asn
Trp
Ile
Ile
505
Pro
Phe
Ile
Asn
Tyr
575
Ile
Ile
Arg
Ile
Glu
645
Arg
Lys
Leu Asp
450
Phe Glu
465
Ser Glu
Ile Phe
Ala Ala
Asp Met 520
Asn Glu
535
Thr Glu
Ile Lys
Thr Val
Leu Ile
590
Ala Val
605
Glu Val
Asp Lys
Ile Glu
Tyr Asp 660
Thr Phe
675
Thr
Asn
Val
480
Asn
Val
Thr
Pro
Phe
550
Asn
Leu
Arg
Gly
Ile
620
Asp
Asp
Met
Ile
Asp Gin
Gly Arg
Leu Pro
Gly Lys 495
Asn Pro
510 Leu Lys
Asn Gly
Asp Phe
Gin Leu
565
Asp Lys 580
Asp Lys
Ala Asp
Asn Ser
Ile Arg 635
Thr Glu
650
Leu Asn
Asp Phe
Val Tyr Gly 455
Val Arg Val 470
Gin Ile Gin
485
Asp Leu Asn
Ser Asp Pro
Glu Ala Leu
525
Asn Leu Gin
540
Asn Phe Asp 555
Ala Glu Leu
Ile Lys Leu
Arg Phe His 595
Glu Ser Val
610
Ser Thr Glu
625
Lys Ile Leu
Gly Leu Lys
Ile Ser Ser
665
Lys Lys Tyr 680
Asn Ile Ala Thr Tyr 460
Asp Thr Gly Ser Asn 475
Glu Thr Thr Ala Arg 490
Leu Val Glu Arg Arg 500
Leu Glu Thr Thr Lys 515
Lys Ile Ala Phe Gly 530
Tyr Gin Gly Lys Asp 545
Gin Gin Thr Ser Gin
560
Asn Ala Thr Asn Ile
570
Asn Ala Lys Met Asn 585
Tyr Asp Arg Asn Asn 600
Val Lys Glu Ala His 615
Gly Leu Leu Leu Asn 630
Ser Gly Tyr Ile Val 640
Glu Val Ile Asn Asp 655
Leu Arg Gin Asp Gly 670
Asn Asp Lys Leu Pro
685
69 * H * • • ·» « 99 9 9 9 «
♦ » • · • · ·
• · • ·
»*· ·· A · MM
Leu Tyr Ile Ser Asn Pro Asn Tyr Lys Val Asn Val Tyr Ala
690 695 700
Val Thr Lys Glu Asn Thr Ile Ile Asn Pro Ser Glu Asn Gly
705 710
Asp Thr Ser Thr Asn Gly Ile Lys Lys Ile Leu Ile Phe Ser
715 720 725
Lys Lys Gly Tyr Glu Ile Gly Glx
730 735
<210> 8 <211> 736 <212> PRT <213> Bacillus anthracis <400> 8
Glu Val Lys Gin Glu Asn 1 5
Ser Ser Gin Gly Leu Leu 15 20
Phe Gin Ala Pro Met Val
Leu Ser Ile Pro Ser Ser
Asn Gin Tyr Phe Gin Ser 60
Val Lys Lys Ser Asp Glu 75
Asn His Val Thr Met Trp 85 90
Lys Ala Ser Asn Ser Asn
100
Leu Tyr Gin Ile Lys Ile 115
Arg Leu Leu Asn Glu Ser 10
Gly Tyr Tyr Phe Ser Asp 25
Val Thr Ser Ser Thr Thr 35 40
Glu Leu Glu Asn Ile Pro
Ala Ile Trp Ser Gly Phe 65
Tyr Thr Phe Ala Thr Ser 80
Val Asp Asp Gin Glu Val 95
Lys Ile Arg Leu Glu Lys
105 110
Gin Tyr Gin Arg Glu Asn 120
Glu
Leu
Gly
Ser
Ile
Ala
Ile
Gly
Pro
125
Ser
Asn
Asp
Glu
Lys
Asp
Asn
Arg
Thr
Glu Lys Gly Leu Asp 130 Phe Lys Leu Tyr Trp Thr 135 Asp Ser Gin 140
Asn Lys Lys Glu Val Ile Ser Ser Asp Asn Leu Gin Leu Pro
145 150
Glu Leu Lys Gin Lys Ser Ser Asn Ser Arg Lys Lys Arg Ser
155 160 165
Thr Ser Ala Gly Pro Thr Val Pro Asp Arg Asp Asn Asp Gly
170 175 180
Ile Pro Asp Ser Leu Glu Val Glu Gly Tyr Thr Val Asp Val
185 190 195
Lys Asn Lys Arg Thr Phe Leu Ser Pro Trp Ile Ser Asn Ile
200 205 210
His Glu Lys Lys Gly Leu Thr Lys Tyr Lys Ser Ser Pro Glu
215 220
Lys Trp Ser Thr Ala Ser Asp Pro Tyr Ser Asp Phe Glu Lys
225 230 235
Val Thr Gly Arg Ile Asp Lys Asn Val Ser Pro Glu Ala Arg
240 245 250
His Pro Leu Val Ala Ala Tyr Pro Ile Val His Val Asp Met
255 260 265
Glu Asn Ile Ile Leu Ser Lys Asn Glu Asp Gin Ser Thr Gin
270 275 280
Asn Thr Asp Ser Glu Thr Arg Thr Ile Ser Lys Asn Thr Ser
285 290
Thr Ser Arg Thr His Thr Ser Glu Val His Gly Asn Ala Glu
295 300 305
Val His Ala Ser Phe Phe Asp Ile Gly Gly Ser Val Ser Ala
310 315 320
Gly Phe Ser Asn Ser Asn Ser Ser Thr Val Ala Ile Asp His
325 330 335
Ser Leu Ser Leu Ala Gly Glu Arg Thr Trp Ala Glu Thr Met
340 345 350
Gly Leu Asn Thr Ala Asp Thr Ala Arg Leu Asn Ala Asn Ile
355
360
Arg Tyr Val Asn Thr Gly Thr Ala Pro Ile Tyr Asn Val Leu
365 370 375
Pro Thr Thr Ser Leu Val Leu Gly Lys Asn Gin Thr Leu Ala
380 385 390
Thr Ile Lys Ala Lys Glu Asn Gin Leu Ser Gin Ile Leu Ala
395 400 405
Pro Asn Asn Tyr Tyr Pro Ser Lys Asn Leu Ala Pro Ile Ala
410 415 420
Leu Asn Ala Gin Asp Asp Phe Ser Ser Thr Pro Ile Thr Met
425 430
Asn Tyr Asn Gin Phe Leu Glu Leu Glu Lys Thr Lys Gin Leu
435 440 445
Arg Leu Asp Thr Asp Gin Val Tyr Gly Asn Ile Ala Thr Tyr
450 455 460
Asn Phe Glu Asn Gly Arg Val Arg Val Asp Thr Gly Ser Asn
465 470 475
Trp Ser Glu Val Leu Pro Gin Ile Gin Glu Thr Thr Ala Arg
480 485 490
Ile Ile Phe Asn Gly Lys Asp Leu Asn Leu Val Glu Arg Arg
495 500
Ile Ala Ala Val Asn Pro Ser Asp Pro Leu Glu Thr Thr Lys
505 510 515
Pro Asp Met Thr Leu Lys Glu Ala Leu Lys Ile Ala Phe Gly
520 525 530
Phe Asn Glu Pro Asn Gly Asn Leu Gin Tyr Gin Gly Lys Asp
535 540 545
Ile Thr Glu Phe Asp Phe Asn Phe Asp Gin Gin Thr Ser Gin
550 555 560
Asn Ile Lys Asn Gin Leu Ala Glu Leu Asn Ala Thr Asn Ile
565 570
Tyr Thr Val Leu Asp Lys Ile Lys Leu Asn Ala Lys Met Asn
575 580 585
Ile Leu Ile Arg Asp Lys Arg Phe His Tyr Asp Arg Asn Asn
590 595 600
Ile Ala Val Gly Ala Asp Glu Ser 610 Val Val Lys Glu Ala 615 His
605
Arg Glu Val Ile Asn Ser Ser Thr Glu Gly Leu Leu Leu Asn
620 625 630
Ile Asp Lys Asp Ile Arg Lys Ile Leu Ser Gly Tyr Ile Val
635 640
Glu Ile Glu Asp Thr Glu Gly Leu Lys Glu Val Ile Asn Asp
645 650 655
Arg Tyr Asp Met Leu Asn Ile Ser Ser Leu Arg Gin Asp Gly
660 665 670
Lys Thr Phe Ile Asp Phe Lys Lys Tyr Asn Asp Lys Leu Pro
675 680 685
Leu Tyr Ile Ser Asn Pro Asn Tyr Lys Val Asn Val Tyr Ala
690 695 700
Val Thr Lys Glu Asn Thr Ile Ile Asn Pro Ser Glu Asn Gly
705 710
Asp Thr Ser Thr Asn Gly Ile Lys Lys Ile Leu Ile Phe Ser
715 720 725
Lys Lys Gly Tyr Glu Ile Gly Glx
730 735
<210> 9 <211> 736 <212> PRT <213> Bacillus anthracis <400> 9
Glu 1 Val Lys Gin Glu Asn Arg Leu Leu Asn Glu Ser Glu Ser
5 10
Ser Ser Gin Gly Leu Leu Gly Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Asn
15 20 25
Phe Gin Ala Pro Met Val Val Thr Ser Ser Thr Thr Gly Asp
Leu Ser Ile 45 Pro Ser Ser Glu Leu Glu Asn 50 Ile Pro Ser 55 Glu
Asn Gin Tyr Phe Gin Ser Ala Ile Trp Ser Gly Phe Ile Lys
60 65 70
Val Lys Lys Ser Asp Glu Tyr Thr Phe Ala Thr Ser Ala Asp
75 80
Asn His Val Thr Met Trp Val Asp Asp Gin Glu Val Ile Asn
85 90 95
Lys Ala Ser Asn Ser Asn Lys Ile Arg Leu Glu Lys Gly Arg
100 105 110
Leu Tyr Gin Ile Lys Ile Gin Tyr Gin Arg Glu Asn Pro Thr
115 120 125
Glu Lys Gly Leu Asp Phe Lys Leu Tyr Trp Thr Asp Ser Gin
130 135 140
Asn Lys Lys Glu Val Ile Ser Ser Asp Asn Leu Gin Leu Pro
145 150
Glu Leu Lys Gin Lys Ser Ser Asn Ser Arg Lys Lys Arg Ser
155 160 165
Thr Ser Ala Gly Pro Thr Val Pro Asp Arg Asp Asn Asp Gly
170 175 180
Ile Pro Asp Ser Leu Glu Val Glu Gly Tyr Thr Val Asp Val
185 190 195
Lys Asn Lys Arg Thr Phe Leu Ser Pro Trp Ile Ser Asn Ile
200 205 210
His Glu Lys Lys Gly Leu Thr Lys Tyr Lys Ser Ser Pro Glu
215 220
Lys Trp Ser Thr Ala Ser Asp Pro Tyr Ser Asp Phe Glu Lys
225 230 235
Val Thr Gly Arg Ile Asp Lys Asn Val Ser Pro Glu Ala Arg
240 245 250
His Pro Leu Val Ala Ala Tyr Pro Ile Val His Val Asp Met
255 260 265
Glu Asn Ile Ile Leu Ser Lys Asn Glu Asp Gin Ser Thr Gin
270 275 280
74 • · · • • · • · • · * • • · • · • • · 9 · · • • • • · · · • • • · • • · 9
Asn Thr Asp Ser Glu Thr Arg Thr Ile Ser Lys Asn Thr Ser
285 290
Thr Ser Arg Thr His Thr Ser Glu Val His Gly Asn Ala Glu
295 300 305
Val His Ala Ser Phe Phe Asp Ile Gly Gly Ser Val Ser Ala
310 315 320
Gly Phe Ser Asn Ser Asn Ser Ser Thr Val Ala Ile Asp His
325 330 335
Ser Leu Ser Leu Ala Gly Glu Arg Thr Trp Ala Glu Thr Met
340 345 350
Gly Leu Asn Thr Ala Asp Thr Ala Arg Leu Asn Ala Asn Ile
355 360
Arg Tyr Val Asn Thr Gly Thr Ala Pro Ile Tyr Asn Val Leu
365 370 375
Pro Thr Thr Ser Leu Val Leu Gly Lys Asn Gin Thr Leu Ala
380 385 390
Thr Ile Lys Ala Lys Glu Asn Gin Leu Ser Gin Ile Leu Ala
395 400 405
Pro Asn Asn Tyr Tyr Pro Ser Lys Asn Leu Ala Pro Ile Ala
410 415 420
Leu Asn Ala Gin Asp Asp Phe Ser Ser Thr Pro Ile Thr Met
425 430
Asn Tyr Asn Gin Phe Leu Glu Leu Glu Lys Thr Lys Gin Leu
435 440 445
Arg Leu Asp Thr Asp Gin Val Tyr Gly Asn Ile Ala Thr Tyr
450 455 460
Asn Phe Glu Asn Gly Arg Val Arg Val Asp Thr Gly Ser Asn
465 470 475
Trp Ser Glu Val Leu Pro Gin Ile Gin Glu Thr Thr Ala Arg
480 485 490
Ile Ile Phe Asn Gly Lys Asp Leu Asn Leu Val Glu Arg Arg
495 500
Ile Ala Ala Val Asn Pro Ser Asp Pro Leu Glu Thr Thr Lys
505 510 515
Pro Asp Met Thr Leu Lys Glu Ala Leu Lys 525 Ile Ala 530 Phe Gly
520
Phe Asn Glu Pro Asn Gly Asn Leu Gin Tyr Gin Gly Lys Asp
535 540 545
Ile Thr Glu Phe Asp Phe Asn Phe Asp Gin Gin Thr Ser Gin
550 555 560
Asn Ile Lys Asn Gin Leu Ala Glu Leu Asn Ala Thr Asn Ile
565 570
Tyr Thr Val Leu Asp Lys Ile Lys Leu Asn Ala Lys Met Asn
575 580 585
Ile Leu Ile Arg Asp Lys Arg Phe His Tyr Asp Arg Asn Asn
590 595 600
Ile Ala Val Gly Ala Asp Glu Ser Val Val Lys Glu Ala His
605 610 615
Arg Glu Val Ile Asn Ser Ser Thr Glu Gly Leu Leu Leu Asn
620 625 630
Ile Asp Lys Asp Ile Arg Lys Ile Leu Ser Gly Tyr Ile Val
635 640
Glu Ile Glu Asp Thr Glu Gly Leu Lys Glu Val Ile Asn Asp
645 650 655
Arg Tyr Asp Met Leu Asn Ile Ser Ser Leu Arg Gin Asp Gly
660 665 670
Lys Thr Phe Ile Asp Phe Lys Lys Tyr Asn Asp Lys Leu Pro
675 680 685
Leu Tyr Ile Ser Asn Pro Asn Tyr Lys Val Asn Val Tyr Ala
690 695 700
Val Thr Lys Glu Asn Thr Ile Ile Asn Pro Ser Glu Asn Gly
705 710
Asp Thr Ser Thr Asn Gly Ile Lys Lys Ile Leu Ile Phe Ser
715 720 725
Lys Lys Gly Tyr Glu Ile Gly Glx
730 735
·· ♦ ·· ·· ·· • · · » · ··· ·· · · · · · * · · · · · · · • · · · · · ·· ··· ···· ·· ···· <210> 10 <211> 736 <212> PRT <213> Bacillus anthracis <400> 10
Glu 1 Val Lys Gin Glu Asn Arg Leu Leu Asn Glu Ser Glu Ser
5 10
Ser Ser Gin Gly Leu Leu Gly Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Asn
15 20 25
Phe Gin Ala Pro Met Val Val Thr Ser Ser Thr Thr Gly Asp
30 35 40
Leu Ser Ile Pro Ser Ser Glu Leu Glu Asn Ile Pro Ser Glu
45 50 55
Asn Gin Tyr Phe Gin Ser Ala Ile Trp Ser Gly Phe Ile Lys
60 65 70
Val Lys Lys Ser Asp Glu Tyr Thr Phe Ala Thr Ser Ala Asp
75 80
Asn His Val Thr Met Trp Val Asp Asp Gin Glu Val Ile Asn
85 90 95
Lys Ala Ser Asn Ser Asn Lys Ile Arg Leu Glu Lys Gly Arg
100 105 110
Leu Tyr Gin Ile Lys Ile Gin Tyr Gin Arg Glu Asn Pro Thr
115 120 125
Glu Lys Gly Leu Asp Phe Lys Leu Tyr Trp Thr Asp Ser Gin
130 135 140
Asn Lys Lys Glu Val Ile Ser Ser Asp Asn Leu Gin Leu Pro
145 150
Glu Leu Lys Gin Lys Ser Ser Asn Ser Arg Lys Lys Arg Ser
155 160 165
Thr Ser Ala Gly Pro Thr Val Pro Asp Arg Asp Asn Asp Gly
170 175 180
Ile Pro Asp Ser Leu Glu Val Glu Gly Tyr Thr Val Asp Val
185 190 195
Lys Asn Lys Arg Thr Phe Leu Ser Pro Trp 205 Ile Ser Asn Ile 210
200
His Glu Lys Lys Gly Leu Thr Lys Tyr Lys Ser Ser Pro Glu
215 220
Lys Trp Ser Thr Ala Ser Asp Pro Tyr Ser Asp Phe Glu Lys
225 230 235
Val Thr Gly Arg Ile Asp Lys Asn Val Ser Pro Glu Ala Arg
240 245 250
His Pro Leu Val Ala Ala Tyr Pro Ile Val His Val Asp Met
255 260 265
Glu Asn Ile Ile Leu Ser Lys Asn Glu Asp Gin Ser Thr Gin
270 275 280
Asn Thr Asp Ser Glu Thr Arg Thr Ile Ser Lys Asn Thr Ser
285 290
Thr Ser Arg Thr His Thr Ser Glu Val His Gly Asn Ala Glu
295 300 305
Val His Ala Ser Phe Phe Asp Ile Gly Gly Ser Val Ser Ala
310 315 320
Gly Phe Ser Asn Ser Asn Ser Ser Thr Val Ala Ile Asp His
325 330 335
Ser Leu Ser Leu Ala Gly Glu Arg Thr Trp Ala Glu Thr Met
340 345 350
Gly Leu Asn Thr Ala Asp Thr Ala Arg Leu Asn Ala Asn Ile
355 360
Arg Tyr Val Asn Thr Gly Thr Ala Pro Ile Tyr Asn Val Leu
365 370 375
Pro Thr Thr Ser Leu Val Leu Gly Lys Asn Gin Thr Leu Ala
380 385 390
Thr Ile Lys Ala Lys Glu Asn Gin Leu Ser Gin Ile Leu Ala
395 400 405
Pro Asn Asn Tyr Tyr Pro Ser Lys Asn Leu Ala Pro Ile Ala
410 415 420
Leu Asn Ala Gin Asp Asp Phe Ser Ser Thr Pro Ile Thr Met
425
430 • 0 • · • · • · '0 ·· ·· ♦ «00 • 0 · ·
0 0 « · » 0 0· »00 0« 0000
Asn Tyr Asn Gin Phe Leu Glu Leu Glu Lys Thr Lys Gin Leu
435 440 445
Arg Leu Asp Thr Asp Gin Val Tyr Gly Asn Ile Ala Thr Tyr
450 455 460
Asn Phe Glu Asn Gly Arg Val Arg Val Asp Thr Gly Ser Asn
465 470 475
Trp Ser Glu Val Leu Pro Gin Ile Gin Glu Thr Thr Ala Arg
480 485 490
Ile Ile Phe Asn Gly Lys Asp Leu Asn Leu Val Glu Arg Arg
495 500
Ile Ala Ala Val Asn Pro Ser Asp Pro Leu Glu Thr Thr Lys
505 510 515
Pro Asp Met Thr Leu Lys Glu Ala Leu Lys Ile Ala Phe Gly
520 525 530
Phe Asn Glu Pro Asn Gly Asn Leu Gin Tyr Gin Gly Lys Asp
535 540 545
Ile Thr Glu Phe Asp Phe Asn Phe Asp Gin Gin Thr Ser Gin
550 555 560
Asn Ile Lys Asn Gin Leu Ala Glu Leu Asn Ala Thr Asn Ile
565 570
Tyr Thr Val Leu Asp Lys Ile Lys Leu Asn Ala Lys Met Asn
575 580 585
Ile Leu Ile Arg Asp Lys Arg Phe His Tyr Asp Arg Asn Asn
590 595 600
Ile Ala Val Gly Ala Asp Glu Ser Val Val Lys Glu Ala His
605 610 615
Arg Glu Val Ile Asn Ser Ser Thr Glu Gly Leu Leu Leu Asn
620 625 630
Ile Asp Lys Asp Ile Arg Lys Ile Leu Ser Gly Tyr Ile Val
635 640
Glu Ile Glu Asp Thr Glu Gly Leu Lys Glu Val Ile Asn Asp
645 650 655
Arg Tyr Asp Met Leu Asn Ile Ser Ser Leu Arg Gin Asp Gly
660 665 670 ··
Lys Thr Phe 675 Ile Asp Phe Lys Lys Tyr Asn Asp Lys Leu Pro
680 685
Leu Tyr Ile Ser Asn Pro Asn Tyr Lys Val Asn Val Tyr Ala
690 695 700
Val Thr Lys Glu Asn Thr Ile Ile Asn Pro Ser Glu Asn Gly
705 710
Asp Thr Ser Thr Asn Gly Ile Lys Lys Ile Leu Ile Phe Ser
715 720 725
Lys Lys Gly Tyr Glu Ile Gly Glx
730 735
<210> 11 <211> 736 <212> PRT <213> Bacillus anthracis <400> 11
Glu Val Lys Gin Glu Asn Arg Leu Leu Asn Glu Ser Glu Ser 15 10
Ser Ser Gin Gly Leu Leu Gly Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Asn
20 25
Phe Gin Ala Pro Met Val Val Thr Ser Ser Thr Thr Gly Asp
35 40
Leu Ser Ile Pro Ser Ser Glu Leu Glu Asn Ile Pro Ser Glu
50 55
Asn Gin Tyr Phe Gin Ser Ala Ile Trp Ser Gly Phe Ile Lys
65 70
Val Lys Lys Ser Asp Glu Tyr Thr Phe Ala Thr Ser Ala Asp
80
Asn His Val Thr Met Trp Val Asp Asp Gin Glu Val Ile Asn 85 90 95
Lys Ala Ser Asn Ser Asn Lys Ile Arg Leu Glu Lys Gly Arg 100 105
110
• ·· ·· ·· ·· · · * * · • · · · * • · · · · · • · · · · ····«·· ·· ····
Leu Tyr Gin Ile Lys Ile Gin Tyr 120 Gin Arg Glu Asn Pro 125 Thr
115
Glu Lys Gly Leu Asp Phe Lys Leu Tyr Trp Thr Asp Ser Gin
130 135 140
Asn Lys Lys Glu Val Ile Ser Ser Asp Asn Leu Gin Leu Pro
145 150
Glu Leu Lys Gin Lys Ser Ser Asn Ser Arg Lys Lys Arg Ser
155 160 165
Thr Ser Ala Gly Pro Thr Val Pro Asp Arg Asp Asn Asp Gly
170 175 180
Ile Pro Asp Ser Leu Glu Val Glu Gly Tyr Thr Val Asp Val
185 190 195
Lys Asn Lys Arg Thr Phe Leu Ser Pro Trp Ile Ser Asn Ile 210
200 205
His Glu Lys Lys Gly Leu Thr Lys Tyr Lys Ser Ser Pro Glu
215 220
Lys Trp Ser Thr Ala Ser Asp Pro Tyr Ser Asp Phe Glu Lys
225 230 235
Val Thr Gly Arg Ile Asp Lys Asn Val Ser Pro Glu Ala Arg
240 245 250
His Pro Leu Val Ala Ala Tyr Pro Ile Val His Val Asp Met
255 260 265
Glu Asn Ile Ile Leu Ser Lys Asn Glu Asp Gin Ser Thr Gin
270 275 280
Asn Thr Asp Ser Glu Thr Arg Thr Ile Ser Lys Asn Thr Ser
285 290
Thr Ser Arg Thr His Thr Ser Glu Val His Gly Asn Ala Glu
295 300 305
Val His Ala Ser Phe Phe Asp Ile Gly Gly Ser Val Ser Ala
310 315 320
Gly Phe Ser Asn Ser Asn Ser Ser Thr Val Ala Ile Asp His
325 330 335
Ser Leu Ser Leu Ala Gly Glu Arg Thr Trp Ala Glu Thr Met
340 345 350 ·· • * ·· »· · ····
Gly Leu Asn Thr Ala Asp Thr Ala Arg Leu Asn Ala Asn Ile
355 360
Arg Tyr Val Asn Thr Gly Thr Ala Pro Ile Tyr Asn Val Leu
365 370 375
Pro Thr Thr Ser Leu Val Leu Gly Lys Asn Gin Thr Leu Ala
380 385 390
Thr Ile Lys Ala Lys Glu Asn Gin Leu Ser Gin Ile Leu Ala
395 400 405
Pro Asn Asn Tyr Tyr Pro Ser Lys Asn Leu Ala Pro Ile Ala
410 415 420
Leu Asn Ala Gin Asp Asp Phe Ser Ser Thr Pro Ile Thr Met
425 430
Asn Tyr Asn Gin Phe Leu Glu Leu Glu Lys Thr Lys Gin Leu
435 440 445
Arg Leu Asp Thr Asp Gin Val Tyr Gly Asn Ile Ala Thr Tyr
450 455 460
Asn Phe Glu Asn Gly Arg Val Arg Val Asp Thr Gly Ser Asn
465 470 475
Trp Ser Glu Val Leu Pro Gin Ile Gin Glu Thr Thr Ala Arg
480 485 490
Ile Ile Phe Asn Gly Lys Asp Leu Asn Leu Val Glu Arg Arg
495 500
Ile Ala Ala Val Asn Pro Ser Asp Pro Leu Glu Thr Thr Lys
505 510 515
Pro Asp Met Thr Leu Lys Glu Ala Leu Lys Ile Ala Phe Gly
520 525 530
Phe Asn Glu Pro Asn Gly Asn Leu Gin Tyr Gin Gly Lys Asp
535 540 545
Ile Thr Glu Phe Asp Phe Asn Phe Asp Gin Gin Thr Ser Gin
550 555 560
Asn Ile Lys Asn Gin Leu Ala Glu Leu Asn Ala Thr Asn Ile
565 570
Tyr Thr Val Leu Asp Lys Ile Lys Leu Asn Ala Lys Met Asn
575
580
585
Ile Leu 590 Ile Arg Asp Lys Arg Phe His Tyr Asp Arg Asn Asn
595 600
Ile Ala Val Gly Ala Asp Glu Ser Val Val Lys Glu Ala His
605 610 615
Arg Glu Val Ile Asn Ser Ser Thr Glu Gly Leu Leu Leu Asn
620 625 630
Ile Asp Lys Asp Ile Arg Lys Ile Leu Ser Gly Tyr Ile Val
635 640
Glu Ile Glu Asp Thr Glu Gly Leu Lys Glu Val Ile Asn Asp
645 650 655
Arg Tyr Asp Met Leu Asn Ile Ser Ser Leu Arg Gin Asp Gly
660 665 670
Lys Thr Phe Ile Asp Phe Lys Lys Tyr Asn Asp Lys Leu Pro
675 680 685
Leu Tyr Ile Ser Asn Pro Asn Tyr Lys Val Asn Val Tyr Ala
690 695 700
Val Thr Lys Glu Asn Thr Ile Ile Asn Pro Ser Glu Asn Gly
705 710
Asp Thr Ser Thr Asn Gly Ile Lys Lys Ile Leu Ile Phe Ser
715 720 725
Lys Lys Gly Tyr Glu Ile Gly Glx
730 735
<210> 12 <211> 736 <212> PRT <213> Bacillus anthracis <400> 12
Glu Val Lys Gin Glu Asn Arg Leu Leu Asn Glu Ser Glu Ser 1 5 10
Ser Ser Gin Gly Leu Leu Gly Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Asn 15 20 25
00 ♦· *· 00 0 0 0 0 0
0 « 0 »
0 0 0 0 «
0 0 0 «
0000000 00 00··
Phe Gin 30 Ala Pro Met Val Val 35 Thr Ser Ser Thr Thr Gly 40 Asp
Leu Ser Ile Pro Ser Ser Glu Leu Glu Asn Ile Pro Ser Glu
45 50 55
Asn Gin Tyr Phe Gin Ser Ala Ile Trp Ser Gly Phe Ile Lys
60 65 70
Val Lys Lys Ser Asp Glu Tyr Thr Phe Ala Thr Ser Ala Asp
75 80
Asn His Val Thr Met Trp Val Asp Asp Gin Glu Val Ile Asn
85 90 95
Lys Ala Ser Asn Ser Asn Lys Ile Arg Leu Glu Lys Gly Arg
100 105 110
Leu Tyr Gin Ile Lys Ile Gin Tyr Gin Arg Glu Asn Pro Thr
115 120 125
Glu Lys Gly Leu Asp Phe Lys Leu Tyr Trp Thr Asp Ser Gin
130 135 140
Asn Lys Lys Glu Val Ile Ser Ser Asp Asn Leu Gin Leu Pro
145 150
Glu Leu Lys Gin Lys Ser Ser Asn Ser Arg Lys Lys Arg Ser
155 160 165
Thr Ser Ala Gly Pro Thr Val Pro Asp Arg Asp Asn Asp Gly
170 175 180
Ile Pro Asp Ser Leu Glu Val Glu Gly Tyr Thr Val Asp Val
185 190 195
Lys Asn Lys Arg Thr Phe Leu Ser Pro Trp Ile Ser Asn Ile
200 205 210
His Glu Lys Lys Gly Leu Thr Lys Tyr Lys Ser Ser Pro Glu
215 220
Lys Trp Ser Thr Ala Ser Asp Pro Tyr Ser Asp Phe Glu Lys
225 230 235
Val Thr Gly Arg Ile Asp Lys Asn Val Ser Pro Glu Ala Arg
240 245 250
His Pro Leu Val Ala Ala Tyr Pro Ile Val His Val Asp Met
255
260
265 ··
♦ » · ·· · ·*
Glu Asn Ile Ile 270 Leu Ser Lys Asn Glu Asp 275 Gin Ser Thr Gin 280
Asn Thr Asp Ser Glu Thr Arg Thr Ile Ser Lys Asn Thr Ser
285 290
Thr Ser Arg Thr His Thr Ser Glu Val His Gly Asn Ala Glu
295 300 305
Val His Ala Ser Phe Phe Asp Ile Gly Gly Ser Val Ser Ala
310 315 320
Gly Phe Ser Asn Ser Asn Ser Ser Thr Val Ala Ile Asp His
325 330 335
Ser Leu Ser Leu Ala Gly Glu Arg Thr Trp Ala Glu Thr Met
340 345 350
Gly Leu Asn Thr Ala Asp Thr Ala Arg Leu Asn Ala Asn Ile
355 360
Arg Tyr Val Asn Thr Gly Thr Ala Pro Ile Tyr Asn Val Leu
365 370 375
Pro Thr Thr Ser Leu Val Leu Gly Lys Asn Gin Thr Leu Ala
380 385 390
Thr Ile Lys Ala Lys Glu Asn Gin Leu Ser Gin Ile Leu Ala
395 400 405
Pro Asn Asn Tyr Tyr Pro Ser Lys Asn Leu Ala Pro Ile Ala
410 415 420
Leu Asn Ala Gin Asp Asp Phe Ser Ser Thr Pro Ile Thr Met
425 430
Asn Tyr Asn Gin Phe Leu Glu Leu Glu Lys Thr Lys Gin Leu
435 440 445
Arg Leu Asp Thr Asp Gin Val Tyr Gly Asn Ile Ala Thr Tyr
450 455 460
Asn Phe Glu Asn Gly Arg Val Arg Val Asp Thr Gly Ser Asn
465 470 475
Trp Ser Glu Val Leu Pro Gin Ile Gin Glu Thr Thr Ala Arg
480 485 490
Ile Ile Phe Asn Gly Lys Asp Leu Asn Leu Val Glu Arg Arg
495 500 ·· ·· • · ·
Ile Ala Ala Val Asn Pro Ser Asp Pro Leu Glu Thr Thr Lys
505 510 515
Pro Asp Met Thr Leu Lys Glu Ala Leu Lys Ile Ala Phe Gly
520 525 530
Phe Asn Glu Pro Asn Gly Asn Leu Gin Tyr Gin Gly Lys Asp
535 540 545
Ile Thr Glu Phe Asp Phe Asn Phe Asp Gin Gin Thr Ser Gin
550 555 560
Asn Ile Lys Asn Gin Leu Ala Glu Leu Asn Ala Thr Asn Ile
565 570
Tyr Thr Val Leu Asp Lys Ile Lys Leu Asn Ala Lys Met Asn
575 580 585
Ile Leu Ile Arg Asp Lys Arg Phe His Tyr Asp Arg Asn Asn
590 595 600
Ile Ala Val Gly Ala Asp Glu Ser Val Val Lys Glu Ala His
605 610 615
Arg Glu Val Ile Asn Ser Ser Thr Glu Gly Leu Leu Leu Asn
620 625 630
Ile Asp Lys Asp Ile Arg Lys Ile Leu Ser Gly Tyr Ile Val
635 640
Glu Ile Glu Asp Thr Glu Gly Leu Lys Glu Val Ile Asn Asp
645 650 655
Arg Tyr Asp Met Leu Asn Ile Ser Ser Leu Arg Gin Asp Gly
660 665 670
Lys Thr Phe Ile Asp Phe Lys Lys Tyr Asn Asp Lys Leu Pro
675 680 685
Leu Tyr Ile Ser Asn Pro Asn Tyr Lys Val Asn Val. Tyr Ala
690 695 700
Val Thr Lys Glu Asn Thr Ile Ile Asn Pro Ser Glu Asn Gly
705 710
Asp Thr Ser Thr Asn Gly Ile Lys Lys Ile Leu Ile Phe Ser
715 720 725
Lys Lys Gly Tyr Glu Ile Gly Glx
730 735
<210> 13 <211> 736 <212> PRT <213> Bacillus anthracis <400> 13
Glu Val Lys Gin Glu Asn Arg Leu Leu Asn Glu Ser Glu Ser
1 5 10
Ser Ser Gin Gly Leu Leu Gly Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Asn
15 20 25
Phe Gin Ala Pro Met Val Val Thr Ser Ser Thr Thr Gly Asp
30 35 40
Leu Ser Ile Pro Ser Ser Glu Leu Glu Asn Ile Pro Ser Glu
45 50 55
Asn Gin Tyr Phe Gin Ser Ala Ile Trp Ser Gly Phe Ile Lys
60 65 70
Val Lys Lys Ser Asp Glu Tyr Thr Phe Ala Thr Ser Ala Asp
75 80
Asn His Val Thr Met Trp Val Asp Asp Gin Glu Val Ile Asn
85 90 95
Lys Ala Ser Asn Ser Asn Lys Ile Arg Leu Glu Lys Gly Arg
100 105 110
Leu Tyr Gin Ile Lys Ile Gin Tyr Gin Arg Glu Asn Pro Thr
115 120 125
Glu Lys Gly Leu Asp Phe Lys Leu Tyr Trp Thr Asp Ser Gin
130 135 140
Asn Lys Lys Glu Val Ile Ser Ser Asp Asn Leu Gin Leu Pro
145 150
Glu Leu Lys Gin Lys Ser Ser Asn Ser Arg Lys Lys Arg Ser
155 160 165
Thr Ser Ala Gly Pro Thr Val Pro Asp Arg Asp Asn Asp Gly
170 175 180
Ile Pro Asp Ser Leu Glu Val Glu Gly Tyr Thr Val Asp Val
185 190 195
Lys Asn Lys Arg Thr Phe Leu Ser Pro Trp Ile Ser Asn Ile
200 205 210
His Glu Lys Lys Gly Leu Thr Lys Tyr Lys Ser Ser Pro Glu
215 220
Lys Trp Ser Thr Ala Ser Asp Pro Tyr Ser Asp Phe Glu Lys
225 230 235
Val Thr Gly Arg Ile Asp Lys Asn Val Ser Pro Glu Ala Arg
240 245 250
His Pro Leu Val Ala Ala Tyr Pro Ile Val His Val Asp Met
255 260 265
Glu Asn Ile Ile Leu Ser Lys Asn Glu Asp Gin Ser Thr Gin
270 275 280
Asn Thr Asp Ser Glu Thr Arg Thr Ile Ser Lys Asn Thr Ser
285 290
Thr Ser Arg Thr His Thr Ser Glu Val His Gly Asn Ala Glu
295 300 305
Val His Ala Ser Phe Phe Asp Ile Gly Gly Ser Val Ser Ala
310 315 320
Gly Phe Ser Asn Ser Asn Ser Ser Thr Val Ala Ile Asp His
325 330 335
Ser Leu Ser Leu Ala Gly Glu Arg Thr Trp Ala Glu Thr Met
340 345 350
Gly Leu Asn Thr Ala Asp Thr Ala Arg Leu Asn Ala Asn Ile
355 360
Arg Tyr Val Asn Thr Gly Thr Ala Pro Ile Tyr Asn Val Leu
365 370 375
Pro Thr Thr Ser Leu Val Leu Gly Lys Asn Gin Thr Leu Ala
380 385 390
Thr Ile Lys Ala Lys Glu Asn Gin Leu Ser Gin Ile Leu Ala
395 400 405
Pro Asn Asn Tyr Tyr Pro Ser Lys Asn Leu Ala Pro Ile Ala
410 415 420
Leu Asn Ala Gin Asp Asp Phe Ser Ser Thr Pro Ile Thr Met
425 430
Asn Tyr Asn Gin Phe Leu Glu Leu Glu Lys Thr 445 Lys Gin Leu
435 440
Arg Leu Asp Thr Asp Gin Val Tyr Gly Asn Ile Ala Thr Tyr
450 455 460
Asn Phe Glu Asn Gly Arg Val Arg Val Asp Thr Gly Ser Asn
465 470 475
Trp Ser Glu Val Leu Pro Gin Ile Gin Glu Thr Thr Ala Arg
480 485 490
Ile Ile Phe Asn Gly Lys Asp Leu Asn Leu Val Glu Arg Arg
495 500
Ile Ala Ala Val Asn Pro Ser Asp Pro Leu Glu Thr Thr Lys
505 510 515
Pro Asp Met Thr Leu Lys Glu Ala Leu Lys Ile Ala Phe Gly
520 525 530
Phe Asn Glu Pro Asn Gly Asn Leu Gin Tyr Gin Gly Lys Asp
535 540 545
Ile Thr Glu Phe Asp Phe Asn Phe Asp Gin Gin Thr Ser Gin
550 555 560
Asn Ile Lys Asn Gin Leu Ala Glu Leu Asn Ala Thr Asn Ile
565 570
Tyr Thr Val Leu Asp Lys Ile Lys Leu Asn Ala Lys Met Asn
575 580 585
Ile Leu Ile Arg Asp Lys Arg Phe His Tyr Asp Arg Asn Asn
590 595 600
Ile Ala Val Gly Ala Asp Glu Ser Val Val Lys Glu Ala His
605 610 615
Arg Glu Val Ile Asn Ser Ser Thr Glu Gly Leu Leu Leu Asn
620 625 630
Ile Asp Lys Asp Ile Arg Lys Ile Leu Ser Gly Tyr Ile Val
635 640
Glu Ile Glu Asp Thr Glu Gly Leu Lys Glu Val Ile Asn Asp
645 650 655
Arg Tyr Asp Met Leu Asn Ile Ser Ser Leu Arg Gin Asp Gly
660 665 670
Lys Thr Phe Ile Asp Phe Lys Lys Tyr Asn Asp Lys Leu Pro
675 680 685
Leu Tyr Ile Ser Asn Pro Asn Tyr Lys Val Asn Val Tyr Ala
690 695 700
Val Thr Lys Glu Asn Thr Ile Ile Asn Pro Ser Glu Asn Gly
705 710
Asp Thr Ser Thr Asn Gly Ile Lys Lys Ile Leu Ile Phe Ser
715 720 725
Lys Lys Gly Tyr Glu Ile Gly Glx
730 735
<210> 14 <211> 736 <212> PRT <213> Bacillus anthracis <400> 14
Glu Val Lys Gin Glu Asn Arg Leu Leu Asn Glu Ser Glu Ser 15 10
Ser Ser Gin Gly Leu Leu Gly Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Asn
20 25
Phe Gin Ala Pro Met Val Val Thr Ser Ser Thr Thr Gly Asp
35 40
Leu Ser Ile Pro Ser Ser Glu Leu Glu Asn Ile Pro Ser Glu
50 55
Asn Gin Tyr Phe Gin Ser Ala Ile Trp Ser Gly Phe Ile Lys
65 70
Val Lys Lys Ser Asp Glu Tyr Thr Phe Ala Thr Ser Ala Asp
80
Asn His Val Thr Met Trp Val Asp Asp Gin Glu Val Ile Asn
90 95
Lys Ala Ser Asn Ser Asn Lys Ile Arg Leu Glu Lys Gly Arg
100 105 110 a · · · • · · · · * • · » · · ······· ·· ···
Leu Tyr Gin 115 Ile Lys Ile Gin Tyr Gin Arg Glu Asn Pro Thr
120 125
Glu Lys Gly Leu Asp Phe Lys Leu Tyr Trp Thr Asp Ser Gin
130 135 140
Asn Lys Lys Glu Val Ile Ser Ser Asp Asn Leu Gin Leu Pro
145 150
Glu Leu Lys Gin Lys Ser Ser Asn Ser Arg Lys Lys Arg Ser
155 160 165
Thr Ser Ala Gly Pro Thr Val Pro Asp Arg Asp Asn Asp Gly
170 175 180
Ile Pro Asp Ser Leu Glu Val Glu Gly Tyr Thr Val Asp Val
185 190 195
Lys Asn Lys Arg Thr Phe Leu Ser Pro Trp Ile Ser Asn Ile
200 205 210
His Glu Lys Lys Gly Leu Thr Lys Tyr Lys Ser Ser Pro Glu
215 220
Lys Trp Ser Thr Ala Ser Asp Pro Tyr Ser Asp Phe Glu Lys
225 230 235
Val Thr Gly Arg Ile Asp Lys Asn Val Ser Pro Glu Ala Arg
240 245 250
His Pro Leu Val Ala Ala Tyr Pro Ile Val His Val Asp Met
255 260 265
Glu Asn Ile Ile Leu Ser Lys Asn Glu Asp Gin Ser Thr Gin
270 275 280
Asn Thr Asp Ser Glu Thr Arg Thr Ile Ser Lys Asn Thr Ser
285 290
Thr Ser Arg Thr His Thr Ser Glu Val His Gly Asn Ala Glu
295 300 305
Val His Ala Ser Phe Phe Asp Ile Gly Gly Ser Val Ser Ala
310 315 320
Gly Phe Ser Asn Ser Asn Ser Ser Thr Val Ala Ile Asp His
325 330 335
Ser Leu Ser Leu Ala Gly Glu Arg Thr Trp Ala Glu Thr Met
340 345 350
Gly Leu Asn Thr Ala 355 Asp Thr Ala Arg Leu Asn Ala Asn 360 Ile
Arg Tyr Val Asn Thr Gly Thr Ala Pro Ile Tyr Asn Val Leu
365 370 375
Pro Thr Thr Ser Leu Val Leu Gly Lys Asn Gin Thr Leu Ala
380 385 390
Thr Ile Lys Ala Lys Glu Asn Gin Leu Ser Gin Ile Leu Ala
395 400 405
Pro Asn Asn Tyr Tyr Pro Ser Lys Asn Leu Ala Pro Ile Ala
410 415 420
Leu Asn Ala Gin Asp Asp Phe Ser Ser Thr Pro Ile Thr Met
425 430
Asn Tyr Asn Gin Phe Leu Glu Leu Glu Lys Thr Lys Gin Leu
435 440 445
Arg Leu Asp Thr Asp Gin Val Tyr Gly Asn Ile Ala Thr Tyr
450 455 460
Asn Phe Glu Asn Gly Arg Val Arg Val Asp Thr Gly Ser Asn
465 470 475
Trp Ser Glu Val Leu Pro Gin Ile Gin Glu Thr Thr Ala Arg
480 485 490
Ile Ile Phe Asn Gly Lys Asp Leu Asn Leu Val Glu Arg Arg
495 500
Ile Ala Ala Val Asn Pro Ser Asp Pro Leu Glu Thr Thr Lys
505 510 515
Pro Asp Met Thr Leu Lys Glu Ala Leu Lys Ile Ala Phe Gly
520 525 530
Phe Asn Glu Pro Asn Gly Asn Leu Gin Tyr Gin Gly Lys Asp
535 540 545
Ile Thr Glu Phe Asp Phe Asn Phe Asp Gin Gin Thr Ser Gin
550 555 560
Asn Ile Lys Asn Gin Leu Ala Glu Leu Asn Ala Thr Asn Ile
565 570
Tyr Thr Val Leu Asp Lys Ile Lys Leu Asn Ala Lys Met Asn
575 580 585
Ile Leu 590 Ile Arg Asp Lys Arg Phe His Tyr Asp Arg Asn Asn
595 600
Ile Ala Val Gly Ala Asp Glu Ser Val Val Lys Glu Ala His
605 610 615
Arg Glu Val Ile Asn Ser Ser Thr Glu Gly Leu Leu Leu Asn
620 625 630
Ile Asp Lys Asp Ile Arg Lys Ile Leu Ser Gly Tyr Ile Val
635 640
Glu Ile Glu Asp Thr Glu Gly Leu Lys Glu Val Ile Asn Asp
645 650 655
Arg Tyr Asp Met Leu Asn Ile Ser Ser Leu Arg Gin Asp Gly
660 665 670
Lys Thr Phe Ile Asp Phe Lys Lys Tyr Asn Asp Lys Leu Pro
675 680 685
Leu Tyr Ile Ser Asn Pro Asn Tyr Lys Val Asn Val Tyr Ala
690 695 700
Val Thr Lys Glu Asn Thr Ile Ile Asn Pro Ser Glu Asn Gly
705 710
Asp Thr Ser Thr Asn Gly Ile Lys Lys Ile Leu Ile Phe Ser
715 720 725
Lys Lys Gly Tyr Glu Ile Gly Glx
730 735 <210> 15 <211> 736 <212> PRT <213> Bacillus anthracis <400> 15
Glu Val Lys Gin Glu Asn Arg Leu Leu Asn Glu Ser Glu Ser 15 10
Ser Ser Gin Gly Leu Leu Gly Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Asn 20 • · · · * ··«···· ·♦ ····
Phe Gin Ala 30 Pro Met Val Val 35 Thr Ser Ser Thr Thr 40 Gly Asp
Leu Ser Ile Pro Ser Ser Glu Leu Glu Asn Ile Pro Ser Glu
45 50 55
Asn Gin Tyr Phe Gin Ser Ala Ile Trp Ser Gly Phe Ile Lys
60 65 70
Val Lys Lys Ser Asp Glu Tyr Thr Phe Ala Thr Ser Ala Asp
75 80
Asn His Val Thr Met Trp Val Asp Asp Gin Glu Val Ile Asn
85 90 95
Lys Ala Ser Asn Ser Asn Lys Ile Arg Leu Glu Lys Gly Arg
100 105 110
Leu Tyr Gin Ile Lys Ile Gin Tyr Gin Arg Glu Asn Pro Thr
115 120 125
Glu Lys Gly Leu Asp Phe Lys Leu Tyr Trp Thr Asp Ser Gin
130 135 140
Asn Lys Lys Glu Val Ile Ser Ser Asp Asn Leu Gin Leu Pro
145 150
Glu Leu Lys Gin Lys Ser Ser Asn Ser Arg Lys Lys Arg Ser
155 160 165
Thr Ser Ala Gly Pro Thr Val Pro Asp Arg Asp Asn Asp Gly
170 175 180
Ile Pro Asp Ser Leu Glu Val Glu Gly Tyr Thr Val Asp Val
185 190 195
Lys Asn Lys Arg Thr Phe Leu Ser Pro Trp Ile Ser Asn Ile
200 205 210
His Glu Lys Lys Gly Leu Thr Lys Tyr Lys Ser Ser Pro Glu
215 220
Lys Trp Ser Thr Ala Ser Asp Pro Tyr Ser Asp Phe Glu Lys
225 230 235
Val Thr Gly Arg Ile Asp Lys Asn Val Ser Pro Glu Ala Arg
240 245 250
His Pro Leu Val Ala Ala Tyr Pro Ile Val His Val Asp Met
255 260 265
Glu Asn Ile Ile 270 Leu Ser Lys Asn Glu Asp 275 Gin Ser Thr Gin 280
Asn Thr Asp Ser Glu Thr Arg Thr Ile Ser Lys Asn Thr Ser
285 290
Thr Ser Arg Thr His Thr Ser Glu Val His Gly Asn Ala Glu
295 300 305
Val His Ala Ser Phe Phe Asp Ile Gly Gly Ser Val Ser Ala
310 315 320
Gly Phe Ser Asn Ser Asn Ser Ser Thr Val Ala Ile Asp His
325 330 335
Ser Leu Ser Leu Ala Gly Glu Arg Thr Trp Ala Glu Thr Met
340 345 350
Gly Leu Asn Thr Ala Asp Thr Ala Arg Leu Asn Ala Asn Ile
355 360
Arg Tyr Val Asn Thr Gly Thr Ala Pro Ile Tyr Asn Val Leu
365 370 375
Pro Thr Thr Ser Leu Val Leu Gly Lys Asn Gin Thr Leu Ala
380 385 390
Thr Ile Lys Ala Lys Glu Asn Gin Leu Ser Gin Ile Leu Ala
395 400 405
Pro Asn Asn Tyr Tyr Pro Ser Lys Asn Leu Ala Pro Ile Ala
410 415 420
Leu Asn Ala Gin Asp Asp Phe Ser Ser Thr Pro Ile Thr Met
425 430
Asn Tyr Asn Gin Phe Leu Glu Leu Glu Lys Thr Lys Gin Leu
435 440 445
Arg Leu Asp Thr Asp Gin Val Tyr Gly Asn Ile Ala Thr Tyr
450 455 460
Asn Phe Glu Asn Gly Arg Val Arg Val Asp Thr Gly Ser Asn
465 470 475
Trp Ser Glu Val Leu Pro Gin Ile Gin Glu Thr Thr Ala Arg
480 485 490
Ile Ile Phe Asn Gly Lys Asp Leu Asn Leu Val Glu Arg Arg
495
500
Ile Ala Ala Val Asn Pro Ser Asp Pro Leu Glu Thr Thr Lys
505 510 515
Pro Asp Met Thr Leu Lys Glu Ala Leu Lys Ile Ala Phe Gly
520 525 530
Phe Asn Glu Pro Asn Gly Asn Leu Gin Tyr Gin Gly Lys Asp
535 540 545
Ile Thr Glu Phe Asp Phe Asn Phe Asp Gin Gin Thr Ser Gin
550 555 560
Asn Ile Lys Asn Gin Leu Ala Glu Leu Asn Ala Thr Asn Ile
565 570
Tyr Thr Val Leu Asp Lys Ile Lys Leu Asn Ala Lys Met Asn
575 580 585
Ile Leu Ile Arg Asp Lys Arg Phe His Tyr Asp Arg Asn Asn
590 595 600
Ile Ala Val Gly Ala Asp Glu Ser Val Val Lys Glu Ala His
605 610 615
Arg Glu Val Ile Asn Ser Ser Thr Glu Gly Leu Leu Leu Asn
620 625 630
Ile Asp Lys Asp Ile Arg Lys Ile Leu Ser Gly Tyr Ile Val
635 640
Glu Ile Glu Asp Thr Glu Gly Leu Lys Glu Val Ile Asn Asp
645 650 655
Arg Tyr Asp Met Leu Asn Ile Ser Ser Leu Arg Gin Asp Gly
660 665 670
Lys Thr Phe Ile Asp Phe Lys Lys Tyr Asn Asp Lys Leu Pro
675 680 685
Leu Tyr Ile Ser Asn Pro Asn Tyr Lys Val Asn Val Tyr Ala
690 695 700
Val Thr Lys Glu Asn Thr Ile Ile Asn Pro Ser Glu Asn Gly
705 710
Asp Thr Ser Thr Asn Gly Ile Lys Lys Ile Leu Ile Phe Ser
715 720 725
Lys Lys Gly Tyr Glu Ile Gly Glx
730 735 <210> 16 <211> 736 <212> PRT <213> Bacillus anthracis <400> 16
Glu Val Lys Gin Glu Asn Arg Leu Leu Asn Glu Ser Glu Ser
1 5 10
Ser Ser Gin Gly Leu Leu Gly Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Asn
15 20 25
Phe Gin Ala Pro Met Val Val Thr Ser Ser Thr Thr Gly Asp
30 35 40
Leu Ser Ile Pro Ser Ser Glu Leu Glu Asn Ile Pro Ser Glu
45 50 55
Asn Gin Tyr Phe Gin Ser Ala Ile Trp Ser Gly Phe Ile Lys
60 65 70
Val Lys Lys Ser Asp Glu Tyr Thr Phe Ala Thr Ser Ala Asp
75 80
Asn His Val Thr Met Trp Val Asp Asp Gin Glu Val Ile Asn
85 90 95
Lys Ala Ser Asn Ser Asn Lys Ile Arg Leu Glu Lys Gly Arg
100 105 110
Leu Tyr Gin Ile Lys Ile Gin Tyr Gin Arg Glu Asn Pro Thr
115 120 125
Glu Lys Gly Leu Asp Phe Lys Leu Tyr Trp Thr Asp Ser Gin
130 135 140
Asn Lys Lys Glu Val Ile Ser Ser Asp Asn Leu Gin Leu Pro
145 150
Glu Leu Lys Gin Lys Ser Ser Asn Ser Arg Lys Lys Arg Ser
155 160 165
Thr Ser Ala Gly Pro Thr Val Pro Asp Arg Asp Asn Asp Gly
170 175 180
Ile Pro Asp Ser Leu Glu Val Glu Gly Tyr Thr Val Asp Val
185 190 195
Lys Asn Lys Arg Thr Phe Leu Ser Pro Trp Ile Ser Asn Ile 210
200 205
His Glu Lys Lys Gly Leu Thr Lys Tyr Lys Ser Ser Pro Glu
215 220
Lys Trp Ser Thr Ala Ser Asp Pro Tyr Ser Asp Phe Glu Lys
225 230 235
Val Thr Gly Arg Ile Asp Lys Asn Val Ser Pro Glu Ala Arg
240 245 250
His Pro Leu Val Ala Ala Tyr Pro Ile Val His Val Asp Met
255 260 265
Glu Asn Ile Ile Leu Ser Lys Asn Glu Asp Gin Ser Thr Gin
270 275 280
Asn Thr Asp Ser Glu Thr Arg Thr Ile Ser Lys Asn Thr Ser
285 290
Thr Ser Arg Thr His Thr Ser Glu Val His Gly Asn Ala Glu
295 300 305
Val His Ala Ser Phe Phe Asp Ile Gly Gly Ser Val Ser Ala
310 315 320
Gly Phe Ser Asn Ser Asn Ser Ser Thr Val Ala Ile Asp His
325 330 335
Ser Leu Ser Leu Ala Gly Glu Arg Thr Trp Ala Glu Thr Met
340 345 350
Gly Leu Asn Thr Ala Asp Thr Ala Arg Leu Asn Ala Asn Ile
355 360
Arg Tyr Val Asn Thr Gly Thr Ala Pro Ile Tyr Asn Val Leu
365 370 375
Pro Thr Thr Ser Leu Val Leu Gly Lys Asn Gin Thr Leu Ala
380 385 390
Thr Ile Lys Ala Lys Glu Asn Gin Leu Ser Gin Ile Leu Ala
395 400 405
Pro Asn Asn Tyr Tyr Pro Ser Lys Asn Leu Ala Pro Ile Ala
410 415 420
Leu Asn Ala Gin Asp Asp Phe Ser Ser Thr Pro Ile Thr Met
425 430
Asn Tyr Asn Gin Phe Leu Glu Leu Glu Lys Thr Lys Gin Leu
435 440 445
Arg Leu Asp Thr Asp Gin Val Tyr Gly Asn Ile Ala Thr Tyr
450 455 460
Asn Phe Glu Asn Gly Arg Val Arg Val Asp Thr Gly Ser Asn
465 470 475
Trp Ser Glu Val Leu Pro Gin Ile Gin Glu Thr Thr Ala Arg
480 485 490
Ile Ile Phe Asn Gly Lys Asp Leu Asn Leu Val Glu Arg Arg
495 500
Ile Ala Ala Val Asn Pro Ser Asp Pro Leu Glu Thr Thr Lys
505 510 515
Pro Asp Met Thr Leu Lys Glu Ala Leu Lys Ile Ala Phe Gly
520 525 530
Phe Asn Glu Pro Asn Gly Asn Leu Gin Tyr Gin Gly Lys Asp
535 540 545
Ile Thr Glu Phe Asp Phe Asn Phe Asp Gin Gin Thr Ser Gin
550 555 560
Asn Ile Lys Asn Gin Leu Ala Glu Leu Asn Ala Thr Asn Ile
565 570
Tyr Thr Val Leu Asp Lys Ile Lys Leu Asn Ala Lys Met Asn
575 580 585
Ile Leu Ile Arg Asp Lys Arg Phe His Tyr Asp Arg Asn Asn
590 595 600
Ile Ala Val Gly Ala Asp Glu Ser Val Val Lys Glu Ala His
605 610 615
Arg Glu Val Ile Asn Ser Ser Thr Glu Gly Leu Leu Leu Asn
620 625 630
Ile Asp Lys Asp Ile Arg Lys Ile Leu Ser Gly Tyr Ile Val
635 640
Glu Ile Glu Asp Thr Glu Gly Leu Lys Glu Val Ile Asn Asp
645 650 655
Arg Tyr Asp Met Leu Asn Ile Ser Ser Leu Arg Gin Asp Gly
• · • « ·· ♦ « • · • 99 ·· ·· * 9 · ♦ ♦ · • · ·
9 9
9999
660
665
670
Lys Thr Phe Ile Asp Phe Lys Lys Tyr Asn Asp Lys Leu Pro
675 680 685
Leu Tyr Ile Ser Asn Pro Asn Tyr Lys Val Asn Val Tyr Ala
690 695 700
Val Thr Lys Glu Asn Thr Ile Ile Asn Pro Ser Glu Asn Gly
705 710
Asp Thr Ser Thr Asn Gly Ile Lys Lys Ile Leu Ile Phe Ser
715 720 725
Lys Lys Gly Tyr Glu Ile Gly Glx
730
735 <210> 17 <211> 736 <212> PRT <213> Bacillus anthracis <400> 17
Glu Val Lys Gin Glu Asn Arg Leu Leu Asn Glu Ser Glu Ser 15 10
Ser Ser Gin Gly Leu Leu Gly Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Asn
20 25
Phe Gin Ala Pro Met Val Val Thr Ser Ser Thr Thr Gly Asp
35 40
Leu Ser Ile Pro Ser Ser Glu Leu Glu Asn Ile Pro Ser Glu
50 55
Asn Gin Tyr Phe Gin Ser Ala Ile Trp Ser Gly Phe Ile Lys
65 70
Val Lys Lys Ser Asp Glu Tyr Thr Phe Ala Thr Ser Ala Asp
80
Asn His Val Thr Met Trp Val Asp Asp Gin Glu Val Ile Asn
90 95
Lys Ala Ser Asn Ser Asn Lys Ile Arg Leu Glu Lys Gly Arg
100 105 110
100
Leu Tyr Gin 115 Ile Lys Ile Gin Tyr Gin Arg 120 Glu Asn Pro 125 Thr
Glu Lys Gly Leu Asp Phe Lys Leu Tyr Trp Thr Asp Ser Gin
130 135 140
Asn Lys Lys Glu Val Ile Ser Ser Asp Asn Leu Gin Leu Pro
145 150
Glu Leu Lys Gin Lys Ser Ser Asn Ser Arg Lys Lys Arg Ser
155 160 165
Thr Ser Ala Gly Pro Thr Val Pro Asp Arg Asp Asn Asp Gly
170 175 180
Ile Pro Asp Ser Leu Glu Val Glu Gly Tyr Thr Val Asp Val
185 190 195
Lys Asn Lys Arg Thr Phe Leu Ser Pro Trp Ile Ser Asn Ile
200 205 210
His Glu Lys Lys Gly Leu Thr Lys Tyr Lys Ser Ser Pro Glu
215 220
Lys Trp Ser Thr Ala Ser Asp Pro Tyr Ser Asp Phe Glu Lys
225 230 235
Val Thr Gly Arg Ile Asp Lys Asn Val Ser Pro Glu Ala Arg
240 245 250
His Pro Leu Val Ala Ala Tyr Pro Ile Val His Val Asp Met
255 260 265
Glu Asn Ile Ile Leu Ser Lys Asn Glu Asp Gin Ser Thr Gin
270 275 280
Asn Thr Asp Ser Glu Thr Arg Thr Ile Ser Lys Asn Thr Ser
285 290
Thr Ser Arg Thr His Thr Ser Glu Val His Gly Asn Ala Glu
295 300 305
Val His Ala Ser Phe Phe Asp Ile Gly Gly Ser Val Ser Ala
310 315 320
Gly Phe Ser Asn Ser Asn Ser Ser Thr Val Ala Ile Asp His
325 330 335
Ser Leu Ser Leu Ala Gly Glu Arg Thr Trp Ala Glu Thr Met
340 345 350
101 ·· ·· • · · • · · • · · • « · · · ·
Gly Leu Asn Thr Ala Asp Thr Ala Arg Leu Asn Ala Asn Ile
355 360
Arg Tyr Val Asn Thr Gly Thr Ala Pro Ile Tyr Asn Val Leu
365 370 375
Pro Thr Thr Ser Leu Val Leu Gly Lys Asn Gin Thr Leu Ala
380 385 390
Thr Ile Lys Ala Lys Glu Asn Gin Leu Ser Gin Ile Leu Ala
395 400 405
Pro Asn Asn Tyr Tyr Pro Ser Lys Asn Leu Ala Pro Ile Ala
410 415 420
Leu Asn Ala Gin Asp Asp Phe Ser Ser Thr Pro Ile Thr Met
425 430
Asn Tyr Asn Gin Phe Leu Glu Leu Glu Lys Thr Lys Gin Leu
435 440 445
Arg Leu Asp Thr Asp Gin Val Tyr Gly Asn Ile Ala Thr Tyr
450 455 460
Asn Phe Glu Asn Gly Arg Val Arg Val Asp Thr Gly Ser Asn
465 470 475
Trp Ser Glu Val Leu Pro Gin Ile Gin Glu Thr Thr Ala Arg
480 485 490
Ile Ile Phe Asn Gly Lys Asp Leu Asn Leu Val Glu Arg Arg
495 500
Ile Ala Ala Val Asn Pro Ser Asp Pro Leu Glu Thr Thr Lys
505 510 515
Pro Asp Met Thr Leu Lys Glu Ala Leu Lys Ile Ala Phe Gly
520 525 530
Phe Asn Glu Pro Asn Gly Asn Leu Gin Tyr Gin Gly Lys Asp
535 540 545
Ile Thr Glu Phe Asp Phe Asn Phe Asp Gin Gin Thr Ser Gin
550 555 560
Asn Ile Lys Asn Gin Leu Ala Glu Leu Asn Ala Thr Asn Ile
565 570
Tyr Thr Val Leu Asp Lys Ile Lys Leu Asn Ala Lys Met Asn
575
580
585
102
·♦ ·· » · ·
Ile Leu Ile Arg Asp Lys Arg Phe His Tyr Asp Arg Asn Asn 590 595 600
Ile Ala Val Gly Ala Asp Glu Ser Val Val Lys Glu Ala His
605 610 615
Arg Glu Val Ile Asn Ser Ser Thr Glu Gly Leu Leu Leu Asn
620 625 630
Ile Asp Lys Asp Ile Arg Lys Ile Leu Ser Gly Tyr Ile Val
635 640
Glu Ile Glu Asp Thr Glu Gly Leu Lys Glu Val Ile Asn Asp
645 650 655
Arg Tyr Asp Met Leu Asn Ile Ser Ser Leu Arg Gin Asp Gly
660 665 670
Lys Thr Phe Ile Asp Phe Lys Lys Tyr Asn Asp Lys Leu Pro
675 680 685
Leu Tyr Ile Ser Asn Pro Asn Tyr Lys Val Asn Val Tyr Ala
690 695 700
Val Thr Lys Glu Asn Thr Ile Ile Asn Pro Ser Glu Asn Gly
705 710
Asp Thr Ser Thr Asn Gly Ile Lys Lys Ile Leu Ile Phe Ser
715 720 725
Lys Lys Gly Tyr Glu Ile Gly Glx
730 735 <210> 18 <211> 736 <212> PRT <213> Bacillus anthracis <400> 18
Glu 1 Val Lys Gin Glu Asn Arg Leu Leu Asn Glu Ser Glu Ser
5 10
Ser Ser Gin Gly Leu Leu Gly Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Asn
15 20 25
Phe Gin Ala Pro Met Val Val Thr Ser Ser Thr Thr Gly Asp
103 ·♦ ** * * *
30 35 40
Leu Ser Ile Pro Ser Ser Glu Leu Glu Asn Ile Pro Ser Glu
45 50 55
Asn Gin Tyr Phe Gin Ser Ala Ile Trp Ser Gly Phe Ile Lys
60 65 70
Val Lys Lys Ser Asp Glu Tyr Thr Phe Ala Thr Ser Ala Asp
75 80
Asn His Val Thr Met Trp Val Asp Asp Gin Glu Val Ile Asn
85 90 95
Lys Ala Ser Asn Ser Asn Lys Ile Arg Leu Glu Lys Gly Arg
100 105 110
Leu Tyr Gin Ile Lys Ile Gin Tyr Gin Arg Glu Asn Pro Thr
115 120 125
Glu Lys Gly Leu Asp Phe Lys Leu Tyr Trp Thr Asp Ser Gin
130 135 140
Asn Lys Lys Glu Val Ile Ser Ser Asp Asn Leu Gin Leu Pro
145 150
Glu Leu Lys Gin Lys Ser Ser Asn Ser Arg Lys Lys Arg Ser
155 160 165
Thr Ser Ala Gly Pro Thr Val Pro Asp Arg Asp Asn Asp Gly
170 175 180
Ile Pro Asp Ser Leu Glu Val Glu Gly Tyr Thr Val Asp Val
185 190 195
Lys Asn Lys Arg Thr Phe Leu Ser Pro Trp Ile Ser Asn Ile
200 205 210
His Glu Lys Lys Gly Leu Thr Lys Tyr Lys Ser Ser Pro Glu
215 220
Lys Trp Ser Thr Ala Ser Asp Pro Tyr Ser Asp Phe Glu Lys
225 230 235
Val Thr Gly Arg Ile Asp Lys Asn Val Ser Pro Glu Ala Arg
240 245 250
His Pro Leu Val Ala Ala Tyr Pro Ile Val His Val Asp Met
255 260 265
Glu Asn Ile Ile Leu Ser Lys Asn Glu Asp Gin Ser Thr Gin
104
• *
Asn
Thr
295
Val
Gly
Ser
Gly
Arg
365
Pro
Thr
Pro
Leu
Asn
435
Arg
Asn
Trp
Ile
270
Thr Asp Ser Glu Thr 285
Ser Arg Thr His Thr 300
His Ala Ser Phe Phe
310
Phe Ser Asn Ser Asn
325
Leu Ser Leu Ala Gly 340
Leu Asn Thr Ala Asp 355
Tyr Val Asn Thr Gly 370
Thr Thr Ser Leu Val
380
Ile Lys Ala Lys Glu 395
Asn Asn Tyr Tyr Pro 410
Asn Ala Gin Asp Asp 425
Tyr Asn Gin Phe Leu 440
Leu Asp Thr Asp Gin 450
Phe Glu Asn Gly Arg 465
Ser Glu Val Leu Pro
480
Ile Phe Asn Gly Lys 495
Arg Thr
Ser Glu
Asp Ile 315
Ser Ser
330 Glu Arg
Thr Ala Arg
Thr Ala Pro
Leu Gly Lys 385
Asn Gin Leu
400
Ser Lys Asn 415
Phe Ser Ser
Glu Leu Glu
Val Tyr Gly 455
Val Arg Val 470
Gin Ile Gin
485
Asp Leu Asn
275 280
Ile Ser Lys Asn Thr Ser 290
Val His Gly Asn Ala Glu 305
Gly Gly Ser Val Ser Ala 320
Thr Val Ala Ile Asp His 335
Thr Trp Ala Glu Thr Met 345 350
Leu Asn Ala Asn Ile
360
Ile Tyr Asn Val Leu 375
Asn Gin Thr Leu Ala
390
Ser Gin Ile Leu Ala
405
Leu Ala Pro Ile Ala
420
Thr Pro Ile Thr Met
430
Lys Thr Lys Gin Leu 445
Asn Ile Ala Thr Tyr 460
Asp Thr Gly Ser Asn 475
Glu Thr Thr Ala Arg 490
Leu Val Glu Arg Arg 500
Ile Ala Ala Val Asn Pro Ser Asp Pro Leu Glu Thr Thr Lys
105
505 510 515
Pro Asp Met Thr Leu Lys Glu Ala 525 Leu Lys Ile Ala 530 Phe Gly
520
Phe Asn Glu Pro Asn Gly Asn Leu Gin Tyr Gin Gly Lys Asp
535 540 545
Ile Thr Glu Phe Asp Phe Asn Phe Asp Gin Gin Thr Ser Gin
550 555 560
Asn Ile Lys Asn Gin Leu Ala Glu Leu Asn Ala Thr Asn Ile
565 570
Tyr Thr Val Leu Asp Lys Ile Lys Leu Asn Ala Lys Met Asn
575 580 585
Ile Leu Ile Arg Asp Lys Arg Phe His Tyr Asp Arg Asn Asn
590 595 600
Ile Ala Val Gly Ala Asp Glu Ser Val Val Lys Glu Ala His
605 610 615
Arg Glu Val Ile Asn Ser Ser Thr Glu Gly Leu Leu Leu Asn
620 625 630
Ile Asp Lys Asp Ile Arg Lys Ile Leu Ser Gly Tyr Ile Val
635 640
Glu Ile Glu Asp Thr Glu Gly Leu Lys Glu Val Ile Asn Asp
645 650 655
Arg Tyr Asp Met Leu Asn Ile Ser Ser Leu Arg Gin Asp Gly
660 665 670
Lys Thr Phe Ile Asp Phe Lys Lys Tyr Asn Asp Lys Leu Pro
675 680 685
Leu Tyr Ile Ser Asn Pro Asn Tyr Lys Val Asn Val Tyr Ala
690 695 700
Val Thr Lys Glu Asn Thr Ile Ile Asn Pro Ser Glu Asn Gly
705 710
Asp Thr Ser Thr Asn Gly Ile Lys Lys Ile Leu Ile Phe Ser
715 720 725
Lys Lys Gly Tyr Glu Ile Gly Glx
730 735
106
« 4« t »» • 4 ·*
·« · ♦ ♦ »
* · • »
• · · • · • · *
• B · ···· * * • · ·
<210> 19 <211> 736 <212> PRT <213> Bacillus anthracis <400> 19
Glu Val Lys Gin Glu Asn Arg Leu 1 5
Ser Ser Gin Gly Leu Leu Gly Tyr 15 20
Phe Gin Ala Pro Met Val Val Thr
35
Leu Ser Ile Pro Ser Ser Glu Leu 45 50
Asn Gin Tyr Phe Gin Ser Ala Ile 60
Val Lys Lys Ser Asp Glu Tyr Thr 75
Asn His Val Thr Met Trp Val Asp
90
Lys Ala Ser Asn Ser Asn Lys Ile
100 105
Leu Tyr Gin Ile Lys Ile Gin Tyr
115 120
Glu Lys Gly Leu Asp Phe Lys Leu
130
Asn Lys Lys Glu Val Ile Ser Ser 145
Glu Leu Lys Gin Lys Ser Ser Asn 155 160
Thr Ser Ala Gly Pro Thr Val Pro 170 175
Ile Pro Asp Ser Leu Glu Val Glu 185
Leu Asn Glu Ser Glu Ser
Tyr Phe Ser Asp Leu Asn 25
Ser Ser Thr Thr Gly Asp 40
Glu Asn Ile Pro Ser Glu
Trp Ser Gly Phe Ile Lys
70
Phe Ala Thr Ser Ala Asp 80
Asp Gin Glu Val Ile Asn 95
Arg Leu Glu Lys Gly Arg 110
Gin Arg Glu Asn Pro Thr 125
Tyr Trp Thr Asp Ser Gin
135 140
Asp Asn Leu Gin Leu Pro 150
Ser Arg Lys Lys Arg Ser 165
Asp Arg Asp Asn Asp Gly 180
Gly Tyr Thr Val Asp Val
195
190
107 ·: «..» ·: · s : ϊ .
: . . · · · · · • · · · · ··· ··« ·· «♦» ···· ·· »**·
Lys Asn Lys Arg Thr Phe Leu Ser Pro Trp 205 Ile Ser Asn Ile 210
200
His Glu Lys Lys Gly Leu Thr Lys Tyr Lys Ser Ser Pro Glu
215 220
Lys Trp Ser Thr Ala Ser Asp Pro Tyr Ser Asp Phe Glu Lys
225 230 235
Val Thr Gly Arg Ile Asp Lys Asn Val Ser Pro Glu Ala Arg
240 245 250
His Pro Leu Val Ala Ala Tyr Pro Ile Val His Val Asp Met
255 260 265
Glu Asn Ile Ile Leu Ser Lys Asn Glu Asp Gin Ser Thr Gin
270 275 280
Asn Thr Asp Ser Glu Thr Arg Thr Ile Ser Lys Asn Thr Ser
285 290
Thr Ser Arg Thr His Thr Ser Glu Val His Gly Asn Ala Glu
295 300 305
Val His Ala Ser Phe Phe Asp Ile Gly Gly Ser Val Ser Ala
310 315 320
Gly Phe Ser Asn Ser Asn Ser Ser Thr Val Ala Ile Asp His
325 330 335
Ser Leu Ser Leu Ala Gly Glu Arg Thr Trp Ala Glu Thr Met
340 345 350
Gly Leu Asn Thr Ala Asp Thr Ala Arg Leu Asn Ala Asn Ile
355 360
Arg Tyr Val Asn Thr Gly Thr Ala Pro Ile Tyr Asn Val Leu
365 370 375
Pro Thr Thr Ser Leu Val Leu Gly Lys Asn Gin Thr Leu Ala
380 385 390
Thr Ile Lys Ala Lys Glu Asn Gin Leu Ser Gin Ile Leu Ala
395 400 405
Pro Asn Asn Tyr Tyr Pro Ser Lys Asn Leu Ala Pro Ile Ala
410 415 420
Leu Asn Ala Gin Asp Asp Phe Ser Ser Thr Pro Ile Thr Met
425 430
108 η ·» • •4 * • · * * • · · ··· ·· • ·« ·· · * ·» • · • · • · ·· • 9 9 «
*
9999 • ····
Asn Tyr Asn Gin Phe Leu Glu Leu Glu Lys Thr Lys Gin Leu
435 440 445
Arg Leu Asp Thr Asp Gin Val Tyr Gly Asn Ile Ala Thr Tyr
450 455 460
Asn Phe Glu Asn Gly Arg Val Arg Val Asp Thr Gly Ser Asn
465 470 475
Trp Ser Glu Val Leu Pro Gin Ile Gin Glu Thr Thr Ala Arg
480 485 490
Ile Ile Phe Asn Gly Lys Asp Leu Asn Leu Val Glu Arg Arg
495 500
Ile Ala Ala Val Asn Pro Ser Asp Pro Leu Glu Thr Thr Lys
505 510 515
Pro Asp Met Thr Leu Lys Glu Ala Leu Lys Ile Ala Phe Gly
520 525 530
Phe Asn Glu Pro Asn Gly Asn Leu Gin Tyr Gin Gly Lys Asp
535 540 545
Ile Thr Glu Phe Asp Phe Asn Phe Asp Gin Gin Thr Ser Gin
550 555 560
Asn Ile Lys Asn Gin Leu Ala Glu Leu Asn Ala Thr Asn Ile
565 570
Tyr Thr Val Leu Asp Lys Ile Lys Leu Asn Ala Lys Met Asn
575 580 585
Ile Leu Ile Arg Asp Lys Arg Phe His Tyr Asp Arg Asn Asn
590 595 600
Ile Ala Val Gly Ala Asp Glu Ser Val Val Lys Glu Ala His
605 610 615
Arg Glu Val Ile Asn Ser Ser Thr Glu Gly Leu Leu Leu Asn
620 625 630
Ile Asp Lys Asp Ile Arg Lys Ile Leu Ser Gly Tyr Ile Val
635 640
Glu Ile Glu Asp Thr Glu Gly Leu Lys Glu Val Ile Asn Asp
645 650 655
Arg Tyr Asp Met Leu Asn Ile Ser Ser Leu Arg Gin Asp Gly
660 665 670
109 0 « 0 · • · 0 0 0 • 0 0 0 0« • 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0«
Lys Thr Phe Ile Asp Phe Lys Lys Tyr Asn Asp Lys Leu Pro
675 680 685
Leu Tyr Ile Ser Asn Pro Asn Tyr Lys Val Asn Val Tyr Ala
690 695 700
Val Thr Lys Glu Asn Thr Ile Ile Asn Pro Ser Glu Asn Gly
705 710
Asp Thr Ser Thr Asn Gly Ile Lys Lys Ile Leu Ile Phe Ser
715 720 725
Lys Lys Gly Tyr Glu Ile Gly Glx
730 735 <210> 20 <211> 736 <212> PRT <213> Bacillus anthracis <400> 20
Glu Val Lys Gin Glu Asn Arg Leu Leu Asn Glu Ser Glu Ser
1 5 10
Ser Ser Gin Gly Leu Leu Gly Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Asn
15 20 25
Phe Gin Ala Pro Met Val Val Thr Ser Ser Thr Thr Gly Asp
30 35 40
Leu Ser Ile Pro Ser Ser Glu Leu Glu Asn Ile Pro Ser Glu
45 50 55
Asn Gin Tyr Phe Gin Ser Ala Ile Trp Ser Gly Phe Ile Lys
60 65 70
Val Lys Lys Ser Asp Glu Tyr Thr Phe Ala Thr Ser Ala Asp
75 80
Asn His Val Thr Met Trp Val Asp Asp Gin Glu Val Ile Asn
85 90 95
Lys Ala Ser Asn Ser Asn Lys Ile Arg Leu Glu Lys Gly Arg
100 105 110
Leu Tyr Gin Ile Lys Ile Gin Tyr Gin Arg Glu Asn Pro Thr
110 • · • 9 ·· » · ♦ • · * • · · »· ·«
Glu Lys Gly Leu Asp Phe Lys Leu Tyr Trp Thr Asp Ser Gin
130 135 140
Asn Lys Lys Glu Val Ile Ser Ser Asp Asn Leu Gin Leu Pro
145 150
Glu Leu Lys Gin Lys Ser Ser Asn Ser Arg Lys Lys Arg Ser
155 160 165
Thr Ser Ala Gly Pro Thr Val Pro Asp Arg Asp Asn Asp Gly
170 175 180
Ile Pro Asp Ser Leu Glu Val Glu Gly Tyr Thr Val Asp Val
185 190 195
Lys Asn Lys Arg Thr Phe Leu Ser Pro Trp Ile Ser Asn Ile
200 205 210
His Glu Lys Lys Gly Leu Thr Lys Tyr Lys Ser Ser Pro Glu
215 220
Lys Trp Ser Thr Ala Ser Asp Pro Tyr Ser Asp Phe Glu Lys
225 230 235
Val Thr Gly Arg Ile Asp Lys Asn Val Ser Pro Glu Ala Arg
240 245 250
His Pro Leu Val Ala Ala Tyr Pro Ile Val His Val Asp Met
255 260 265
Glu Asn Ile Ile Leu Ser Lys Asn Glu Asp Gin Ser Thr Gin
270 275 280
Asn Thr Asp Ser Glu Thr Arg Thr Ile Ser Lys Asn Thr Ser
285 290
Thr Ser Arg Thr His Thr Ser Glu Val His Gly Asn Ala Glu
295 300 305
Val His Ala Ser Phe Phe Asp Ile Gly Gly Ser Val Ser Ala
310 315 320
Gly Phe Ser Asn Ser Asn Ser Ser Thr Val Ala Ile Asp His
325 330 335
Ser Leu Ser Leu Ala Gly Glu Arg Thr Trp Ala Glu Thr Met
340 345 350
Gly Leu Asn Thr Ala Asp Thr Ala Arg Leu Asn Ala Asn Ile
111
355 360
Arg Tyr Val Asn Thr Gly Thr Ala Pro Ile Tyr Asn Val Leu
365 370 375
Pro Thr Thr Ser Leu Val Leu Gly Lys Asn Gin Thr Leu Ala
380 385 390
Thr Ile Lys Ala Lys Glu Asn Gin Leu Ser Gin Ile Leu Ala
395 400 405
Pro Asn Asn Tyr Tyr Pro Ser Lys Asn Leu Ala Pro Ile Ala
410 415 420
Leu Asn Ala Gin Asp Asp Phe Ser Ser Thr Pro Ile Thr Met
425 430
Asn Tyr Asn Gin Phe Leu Glu Leu Glu Lys Thr Lys Gin Leu
435 440 445
Arg Leu Asp Thr Asp Gin Val Tyr Gly Asn Ile Ala Thr Tyr
450 455 460
Asn Phe Glu Asn Gly Arg Val Arg Val Asp Thr Gly Ser Asn
465 470 475
Trp Ser Glu Val Leu Pro Gin Ile Gin Glu Thr Thr Ala Arg
480 485 490
Ile Ile Phe Asn Gly Lys Asp Leu Asn Leu Val Glu Arg Arg
495 500
Ile Ala Ala Val Asn Pro Ser Asp Pro Leu Glu Thr Thr Lys
505 510 515
Pro Asp Met Thr Leu Lys Glu Ala Leu Lys Ile Ala Phe Gly
520 525 530
Phe Asn Glu Pro Asn Gly Asn Leu Gin Tyr Gin Gly Lys Asp
535 540 545
Ile Thr Glu Phe Asp Phe Asn Phe Asp Gin Gin Thr Ser Gin
550 555 560
Asn Ile Lys Asn Gin Leu Ala Glu Leu Asn Ala Thr Asn Ile
565 570
Tyr Thr Val Leu Asp Lys Ile Lys Leu Asn Ala Lys Met Asn
575 580 585
Ile Leu Ile Arg Asp Lys Arg Phe His Tyr Asp Arg Asn Asn
• ·
112 ·· · · • · · · • · · • · ·······
590 595 600
Ile Ala Val Gly Ala Asp Glu Ser Val Val Lys Glu Ala His
605 610 615
Arg Glu Val Ile Asn Ser Ser Thr Glu Gly Leu Leu Leu Asn
620 625 630
Ile Asp Lys Asp Ile Arg Lys Ile Leu Ser Gly Tyr Ile Val
635 640
Glu Ile Glu Asp Thr Glu Gly Leu Lys Glu Val Ile Asn Asp
645 650 655
Arg Tyr Asp Met Leu Asn Ile Ser Ser Leu Arg Gin Asp Gly
660 665 670
Lys Thr Phe Ile Asp Phe Lys Lys Tyr Asn Asp Lys Leu Pro
675 680 685
Leu Tyr Ile Ser Asn Pro Asn Tyr Lys Val Asn Val Tyr Ala
690 695 700
Val Thr Lys Glu Asn Thr Ile Ile Asn Pro Ser Glu Asn Gly
705 710
Asp Thr Ser Thr Asn Gly Ile Lys Lys Ile Leu Ile Phe Ser
715 720 725
Lys Lys Gly Tyr Glu Ile Gly Glx
730 735 <210> 21 <211> 736 <212> PRT <213> Bacillus anthracis <400> 21
Glu 1 Val Lys Gin Glu Asn Arg Leu Leu Asn Glu Ser Glu Ser
5 10
Ser Ser Gin Gly Leu Leu Gly Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Asn
15 20 25
Phe Gin Ala Pro Met Val Val Thr Ser Ser Thr Thr Gly Asp
113
Leu Ser
Asn Gin
Val Lys
Asn His
Lys Ala 100
Leu Tyr
Glu Lys
Asn Lys
Glu Leu
155
Thr Ser
170
Ile Pro
Lys Asn
His Glu
Lys Trp 225
Val Thr
240
His Pro
Glu Asn
Pro Ser Ser Glu Leu Glu Asn Ile Pro Ser Glu
Ile
Tyr Phe Gin Ser 60
Lys Ser Asp Glu 75
Val Thr Met Trp 90
Ser Asn Ser Asn
Gin Ile Lys Ile 115
Gly Leu Asp Phe 130
Lys Glu Val Ile 145
Lys Gin Lys Ser 160
Ala Gly Pro Thr
Asp Ser Leu Glu 185
Lys Arg Thr Phe 200
Lys Lys Gly Leu 215
Ser Thr Ala Ser
230
Gly Arg Ile Asp
Leu Val Ala Ala
255
Ile Ile Leu Ser
270
Ala Ile Trp Ser 65
Tyr Thr Phe Ala 80
Val Asp Asp Gin
Lys Ile Arg Leu 105
Gin Tyr Gin Arg 120
Lys Leu Tyr Trp 135
Ser Ser Asp Asn 150
Ser Asn Ser Arg
Val Pro Asp Arg 175
Val Glu Gly Tyr 190
Leu Ser Pro Trp 205
Thr Lys Tyr Lys 220
Asp Pro Tyr Ser
Lys Asn Val Ser 245
Tyr Pro Ile Val 260
Lys Asn Glu Asp 275
Gly Phe Ile Lys 70
Thr Ser Ala Asp
Glu Val Ile Asn
Glu Lys Gly Arg 110
Glu Asn Pro Thr
125
Thr Asp Ser Gin 140
Leu Gin Leu Pro
Lys Lys Arg Ser 165
Asp Asn Asp Gly 180
Thr Val Asp Val 195
Ile Ser Asn Ile
210
Ser Ser Pro Glu
Asp Phe Glu Lys 235
Pro Glu Ala Arg 250
His Val Asp Met 265
Gin Ser Thr Gin
280
114
Asn Thr Asp Ser Glu Thr Arg 285 Thr Ile Ser Lys 290 Asn Thr Ser
Thr Ser Arg Thr His Thr Ser Glu Val His Gly Asn Ala Glu
295 300 305
Val His Ala Ser Phe Phe Asp Ile Gly Gly Ser Val Ser Ala
310 315 320
Gly Phe Ser Asn Ser Asn Ser Ser Thr Val Ala Ile Asp His
325 330 335
Ser Leu Ser Leu Ala Gly Glu Arg Thr Trp Ala Glu Thr Met
340 345 350
Gly Leu Asn Thr Ala Asp Thr Ala Arg Leu Asn Ala Asn Ile
355 360
Arg Tyr Val Asn Thr Gly Thr Ala Pro Ile Tyr Asn Val Leu
365 370 375
Pro Thr Thr Ser Leu Val Leu Gly Lys Asn Gin Thr Leu Ala
380 385 390
Thr Ile Lys Ala Lys Glu Asn Gin Leu Ser Gin Ile Leu Ala
395 400 405
Pro Asn Asn Tyr Tyr Pro Ser Lys Asn Leu Ala Pro Ile Ala
410 415 420
Leu Asn Ala Gin Asp Asp Phe Ser Ser Thr Pro Ile Thr Met
425 430
Asn Tyr Asn Gin Phe Leu Glu Leu Glu Lys Thr Lys Gin Leu
435 440 445
Arg Leu Asp Thr Asp Gin Val Tyr Gly Asn Ile Ala Thr Tyr
450 455 460
Asn Phe Glu Asn Gly Arg Val Arg Val Asp Thr Gly Ser Asn
465 470 475
Trp Ser Glu Val Leu Pro Gin Ile Gin Glu Thr Thr Ala Arg
480 485 490
Ile Ile Phe Asn Gly Lys Asp Leu Asn Leu Val Glu Arg Arg
495 500
Ile Ala Ala Val Asn Pro Ser Asp Pro Leu Glu Thr Thr Lys
505 510 515
115 • »
Pro Asp 520 Met Thr Leu Lys Glu Ala 525 Leu Lys Ile Ala 530 Phe Gly
Phe Asn Glu Pro Asn Gly Asn Leu Gin Tyr Gin Gly Lys Asp
535 540 545
Ile Thr Glu Phe Asp Phe Asn Phe Asp Gin Gin Thr Ser Gin
550 555 560
Asn Ile Lys Asn Gin Leu Ala Glu Leu Asn Ala Thr Asn Ile
565 570
Tyr Thr Val Leu Asp Lys Ile Lys Leu Asn Ala Lys Met Asn
575 580 585
Ile Leu Ile Arg Asp Lys Arg Phe His Tyr Asp Arg Asn Asn
590 595 600
Ile Ala Val Gly Ala Asp Glu Ser Val Val Lys Glu Ala His
605 610 615
Arg Glu Val Ile Asn Ser Ser Thr Glu Gly Leu Leu Leu Asn
620 625 630
Ile Asp Lys Asp Ile Arg Lys Ile Leu Ser Gly Tyr Ile Val
635 640
Glu Ile Glu Asp Thr Glu Gly Leu Lys Glu Val Ile Asn Asp
645 650 655
Arg Tyr Asp Met Leu Asn Ile Ser Ser Leu Arg Gin Asp Gly
660 665 670
Lys Thr Phe Ile Asp Phe Lys Lys Tyr Asn Asp Lys Leu Pro
675 680 685
Leu Tyr Ile Ser Asn Pro Asn Tyr Lys Val Asn Val Tyr Ala
690 695 700
Val Thr Lys Glu Asn Thr Ile Ile Asn Pro Ser Glu Asn Gly
705 710
Asp Thr Ser Thr Asn Gly Ile Lys Lys Ile Leu Ile Phe Ser
715 720 725
Lys Lys Gly Tyr Glu Ile Gly Glx
730 735 <210> 22
116 • · <211> 2208 <212> DNA <213> Bacillus anthracis <400> 22
gaagttaaac aggagaaccg gttattaaat gaatcagaat caagttccca 50
ggggttacta ggatactatt ttagtgattt gaattttcaa gcacccatgg 100
tggttacctc ttctactaca ggggatttat ctattcctag ttctgagtta 150
gaaaatattc catcggaaaa ccaatatttt caatctgcta tttggtcagg 200
atttatcaaa gttaagaaga gtgatgaata tacatttgct acttccgctg 250
ataatcatgt aacaatgtgg gtagatgacc aagaagtgat taataaagct 300
tctaattcta acaaaatcag attagaaaaa ggaagattat atcaaataaa 350
aattcaatat caacgagaaa atcctactga aaaaggattg gatttcaagt 400
tgtactggac cgattctcaa aataaaaaag aagtgatttc tagtgataac 450
ttacaattgc cagaattaaa acaaaaatct tcgaactcaa gaaaaaagcg 500
aagtacaagt gctggaccta cggttccaga ccgtgacaat gatggaatcc 550
ctgattcatt agaggtagaa ggatatacgg ttgatgtcaa aaataaaaga 600
acttttcttt caccatggat ttctaatatt catgaaaaga aaggattaac 650
caaatataaa tcatctcctg aaaaatggag cacggcttct gatccgtaca 700
gtgatttcga aaaggttaca ggacggattg ataagaatgt atcaccagag 750
gcaagacacc cccttgtggc agcttatccg attgtacatg tagatatgga 800
gaatattatt ctctcaaaaa atgaggatca atccacacag aatactgata 850
gtgaaacgag aacaataagt aaaaatactt ctacaagtag gacacatact 900
agtgaagtac atggaaatgc agaagtgcat gcgtcgttct ttgatattgg 950
tgggagtgta tctgcaggat ttagtaattc gaattcaagt acggtcgcaa 1000
ttgatcattc actatctcta gcaggggaaa gaacttgggc tgaaacaatg 1050
ggtttaaata ccgctgatac agcaagatta aatgccaata ttagatatgt 1100
aaatactggg acggctccaa tctacaacgt gttaccaacg acttcgttag 1150
tgttaggaaa aaatcaaaca ctcgcgacaa ttaaagctaa ggaaaaccaa 1200
ttaagtcaaa tacttgcacc taataattat tatccttcta aaaacttggc 1250
gccaatcgca ttaaatgcac aagacgattt cagttctact ccaattacaa 1300
tgaattacaa tcaatttctt gagttagaaa aaacgaaaca attaagatta 1350
gatacggatc aagtatatgg gaatatagca acatacaatt ttgaaaatgg 1400
aagagtgagg gtggatacag gctcgaactg gagtgaagtg ttaccgcaaa 1450
117
4
4
ttcaagaaac aactgcacgt atcattttta atggaaaaga tttaaatctg 1500
gtagaaaggc ggatagcggc ggttaatcct agtgatccat tagaaacgac 1550
taaaccggat atgacattaa aagaagccct taaaatagca tttggattta 1600
acgaaccgaa tggaaactta caatatcaag ggaaagacat aaccgaattt 1650
gattttaatt tcgatcaaca aacatctcaa aatatcaaga atcagttagc 1700
ggaattaaac gcaactaaca tatatactgt attagataaa atcaaattaa 1750
atgcaaaaat gaatatttta ataagagata aacgttttca ttatgataga 1800
aataacatag cagttggggc ggatgagtca gtagttaagg aggctcatag 1850
agaagtaatt aattcgtcaa cagagggatt attgttaaat attgataagg 1900
atataagaaa aatattatca ggttatattg tagaaattga agatactgaa 1950
gggcttaaag aagttataaa tgacagatat gatatgttga atatttctag 2000
tttacggcaa gatggaaaaa catttataga ttttaaaaaa tataatgata 2050
aattaccgtt atatataagt aatcccaatt ataaggtaaa tgtatatgct 2100
gttactaaag aaaacactat tattaatcct agtgagaatg gggatactag 2150
taccaacggg atcaagaaaa ttttaatctt ttctaaaaaa ggctatgaga 2200
taggataa 2208
<210> 23 <211> 736 <212> PRT <213> Bacillus anthracis <400> 23
Glu 1 Val Lys Gin Glu 5 Asn Arg Leu Leu Asn Glu 10 Ser Glu Ser
Ser Ser Gin Gly Leu Leu Gly Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Asn
15 20 25
Phe Gin Ala Pro Met Val Val Thr Ser Ser Thr Thr Gly Asp
30 35 40
Leu Ser Ile Pro Ser Ser Glu Leu Glu Asn Ile Pro Ser Glu
45 50 55
Asn Gin Tyr Phe Gin Ser Ala Ile Trp Ser Gly Phe Ile Lys
60 65 70
Val Lys Lys Ser Asp Glu Tyr Thr Phe Ala Thr Ser Ala Asp
118 ·· · · • » · • « *
·» · ·
Asn His Val Thr Met Trp Val Asp Asp Gin Glu Val Ile Asn
85 90 95
Lys Ala Ser Asn Ser Asn Lys Ile Arg Leu Glu Lys Gly Arg
100 105 110
Leu Tyr Gin Ile Lys Ile Gin Tyr Gin Arg Glu Asn Pro Thr
115 120 125
Glu Lys Gly Leu Asp Phe Lys Leu Tyr Trp Thr Asp Ser Gin
130 135 140
Asn Lys Lys Glu Val Ile Ser Ser Asp Asn Leu Gin Leu Pro
145 150
Glu Leu Lys Gin Lys Ser Ser Asn Ser Arg Lys Lys Arg Ser
155 160 165
Thr Ser Ala Gly Pro Thr Val Pro Asp Arg Asp Asn Asp Gly
170 175 180
Ile Pro Asp Ser Leu Glu Val Glu Gly Tyr Thr Val Asp Val
185 190 195
Lys Asn Lys Arg Thr Phe Leu Ser Pro Trp Ile Ser Asn Ile
200 205 210
His Glu Lys Lys Gly Leu Thr Lys Tyr Lys Ser Ser Pro Glu
215 220
Lys Trp Ser Thr Ala Ser Asp Pro Tyr Ser Asp Phe Glu Lys
225 230 235
Val Thr Gly Arg Ile Asp Lys Asn Val Ser Pro Glu Ala Arg
240 245 250
His Pro Leu Val Ala Ala Tyr Pro Ile Val His Val Asp Met
255 260 265
Glu Asn Ile Ile Leu Ser Lys Asn Glu Asp Gin Ser Thr Gin
270 275 280
Asn Thr Asp Ser Glu Thr Arg Thr Ile Ser Lys Asn Thr Ser
285 290
Thr Ser Arg Thr His Thr Ser Glu Val His Gly Asn Ala Glu
295 300 305
Val His Ala Ser Phe Phe Asp Ile Gly Gly Ser Val Ser Ala ··
119 •
· ·
310 Gly Phe
Ser Leu
Gly Leu
Arg Tyr
365
Pro Thr
380
Thr Ile
Pro Asn
Leu Asn
Asn Tyr
435
Arg Leu 450
Asn Phe
Trp Ser
Ile Ile
Ile Ala
505
Pro Asp 520
Phe Asn
Ile Thr
Ser
325
Ser
Asn
Val
Thr
Lys
395
Asn
Ala
Asn
Asp
Glu
465
Glu
Phe
Ala
Met
Glu
535
Glu
Asn Ser Asn
Leu Ala Gly 340
Thr Ala Asp 355
Asn Thr Gly 370
Ser Leu Val
Ala Lys Glu
Tyr Tyr Pro 410
Gin Asp Asp 425
Gin Phe Leu
440
Thr Asp Gin
Asn Gly Arg
Val Leu Pro
480
Asn Gly Lys 495
Val Asn Pro
510
Thr Leu Lys
Pro Asn Gly
Phe Asp Phe
315
Ser Ser Thr Val Ala
330
Glu Arg Thr Trp Ala 345
Thr Ala Arg Leu Asn 360
Thr Ala Pro Ile Tyr 375
Leu Gly Lys Asn Gin 385
Asn Gin Leu Ser Gin
400
Ser Lys Asn Leu Ala 415
Phe Ser Ser Thr Pro
430
Glu Leu Glu Lys Thr 445
Val Tyr Gly Asn Ile 455
Val Arg Val Asp Thr 470
Gin Ile Gin Glu Thr
485
Asp Leu Asn Leu Val 500
Ser Asp Pro Leu Glu 515
Glu Ala Leu Lys Ile 525
Asn Leu Gin Tyr Gin 540
Asn Phe Asp Gin Gin
320
Ile Asp His 335
Glu Thr Met
350
Ala Asn Ile
Asn Val Leu
Thr Leu Ala
390
Ile Leu Ala
405
Pro Ile Ala
420
Ile Thr Met
Lys Gin Leu
Ala Thr Tyr 460
Gly Ser Asn 475
Thr Ala Arg 490
Glu Arg Arg
Thr Thr Lys
Ala Phe Gly 530
Gly Lys Asp 545
Thr Ser Gin
Asn Ile 550 120 • « Ala • ·* • · • * · • · • · • « 9 · Thr • 9 • 0 • • Asn • ·· • * • · • · ·· *♦· 560 Ile
Glu 555 Leu Asn 570
Lys Asn Gin 565 Leu Ala
Tyr Thr Val Leu Asp Lys Ile Lys Leu Asn Ala Lys Met Asn
575 580 585
Ile Leu Ile Arg Asp Lys Arg Phe His Tyr Asp Arg Asn Asn
590 595 600
Ile Ala Val Gly Ala Asp Glu Ser Val Val Lys Glu Ala His
605 610 615
Arg Glu Val Ile Asn Ser Ser Thr Glu Gly Leu Leu Leu Asn
620 625 630
Ile Asp Lys Asp Ile Arg Lys Ile Leu Ser Gly Tyr Ile Val
635 640
Glu Ile Glu Asp Thr Glu Gly Leu Lys Glu Val Ile Asn Asp
645 650 655
Arg Tyr Asp Met Leu Asn Ile Ser Ser Leu Arg Gin Asp Gly
660 665 670
Lys Thr Phe Ile Asp Phe Lys Lys Tyr Asn Asp Lys Leu Pro
675 680 685
Leu Tyr Ile Ser Asn Pro Asn Tyr Lys Val Asn Val Tyr Ala
690 695 700
Val Thr Lys Glu Asn Thr Ile Ile Asn Pro Ser Glu Asn Gly
705 710
Asp Thr Ser Thr Asn Gly Ile Lys Lys Ile Leu Ile Phe Ser
715 720 725
Lys Lys Gly Tyr Glu Ile Gly Glx
730 735 <210> 24 <211> 599 <212> PRT <213> Bacillus anthracis <400> 24
121
Thr Asp Ser Gin Asn Lys Lys Glu Val Ile Ser Ser Asp Asn
1 5 10
Leu Gin Leu Pro Glu Leu Lys Gin Lys Ser Ser Asn Ser Arg
15 20 25
Lys Lys Arg Ser Thr Ser Ala Gly Pro Thr Val Pro Asp Arg
30 35 40
Asp Asn Asp Gly Ile Pro Asp Ser Leu Glu Val Glu Gly Tyr
45 50 55
Thr Val Asp Val Lys Asn Lys Arg Thr Phe Leu Ser Pro Trp
60 65 70
Ile Ser Asn Ile His Glu Lys Lys Gly Leu Thr Lys Tyr Lys
75 80
Ser Ser Pro Glu Lys Trp Ser Thr Ala Ser Asp Pro Tyr Ser
85 90 95
Asp Phe Glu Lys Val Thr Gly Arg Ile Asp Lys Asn Val Ser
100 105 110
Pro Glu Ala Arg His Pro Leu Val Ala Ala Tyr Pro Ile Val
115 120 125
His Val Asp Met Glu Asn Ile Ile Leu Ser Lys Asn Glu Asp
130 135 140
Gin Ser Thr Gin Asn Thr Asp Ser Gin Thr Arg Thr Ile Ser
145 150
Lys Asn Thr Ser Thr Ser Arg Thr His Thr Ser Glu Val His
155 160 165
Gly Asn Ala Glu Val His Ala Ser Phe Phe Asp Ile Gly Gly
170 175 180
Ser Val Ser Ala Gly Phe Ser Asn Ser Asn Ser Ser Thr Val
185 190 195
Ala Ile Asp His Ser Leu Ser Leu Ala Gly Glu Arg Thr Trp
200 205 210
Ala Glu Thr Met Gly Leu Asn Thr Ala Asp Thr Ala Arg Leu
215 220
Asn Ala Asn Ile Arg Tyr Val Asn Thr Gly Thr Ala Pro Ile
225 230 235
122 ·· • · ♦
Tyr Asn Val Leu Pro Thr Thr Ser Leu Val Leu Gly Lys Asn
240 245 250
Gin Thr Leu Ala Thr Ile Lys Ala Lys Glu Asn Gin Leu Ser
255 260 265
Gin Ile Leu Ala Pro Asn Asn Tyr Tyr Pro Ser Lys Asn Leu
270 275 280
Ala Pro Ile Ala Leu Asn Ala Gin Asp Asp Phe Ser Ser Thr
285 290
Pro Ile Thr Met Asn Tyr Asn Gin Phe Leu Glu Leu Glu Lys
295 300 305
Thr Lys Gin Leu Arg Leu Asp Thr Asp Gin Val Tyr Gly Asn
310 315 320
Ile Ala Thr Tyr Asn Phe Glu Asn Gly Arg Val Arg Val Asp
325 330 335
Thr Gly Ser Asn Trp Ser Glu Val Leu Pro Gin Ile Gin Glu
340 345 350
Thr Thr Ala Arg Ile Ile Phe Asn Gly Lys Asp Leu Asn Leu
355 360
Val Glu Arg Arg Ile Ala Ala Val Asn Pro Ser Asp Pro Leu
365 370 375
Glu Thr Thr Lys Pro Asp Met Thr Leu Lys Glu Ala Leu Lys
380 385 390
Ile Ala Phe Gly Phe Asn Glu Pro Asn Gly Asn Leu Gin Tyr
395 400 405
Gin Gly Lys Asp Ile Thr Glu Phe Asp Phe Asn Phe Asp Gin
410 415 420
Gin Thr Ser Gin Asn Ile Lys Asn Gin Leu Ala Glu Leu Asn
425 430
Val Thr Asn Ile Tyr Thr Val Leu Asp Lys Ile Lys Leu Asn
435 440 445
Ala Lys Met Asn Ile Leu Ile Arg Asp Lys Arg Phe His Tyr
450 455 460
Asp Arg Asn Asn Ile Ala Val Gly Ala Asp Glu Ser Val Val
475 ♦ ·
123 • · · · · ♦ ·
Lys Glu Ala His Arg Glu Val 480 Ile Asn 485 Ser Ser Thr Glu Gly 490
Leu Leu Leu Asn Ile Asp Lys Asp Ile Arg Lys Ile Leu Ser
495 500
Gly Tyr Ile Val Glu Ile Glu Asp Thr Glu Gly Leu Lys Glu
505 510 515
Val Ile Asn Asp Arg Tyr Asp Met Leu Asn Ile Ser Ser Leu
520 525 530
Arg Gin Asp Gly Lys Thr Phe Ile Asp Phe Lys Lys Tyr Asn
535 540 545
Asp Lys Leu Pro Leu Tyr Ile Ser Asn Pro Asn Tyr Lys Val
550 555 560
Asn Val Tyr Ala Val Thr Lys Glu Asn Thr Ile Ile Asn Pro
565 570
Ser Glu Asn Gly Asp Thr Ser Thr Asn Gly Ile Lys Lys Ile
575 580 585
Leu Ile Phe Ser Lys Lys Gly Tyr Glu Ile Gly
590 595 <210> 25 <211> 705 <212> PRT <213> Clostridium difficile <400> 25
Glu Leu Asp Gly Met Lys Lys Ile Ile Pro Glu Glu Asn Leu
1 5 10
Phe Leu Arg Asp Tyr Ser Asn Ile Glu Lys Asp Asp Pro Phe
15 20 25
Ile Pro Asn Asn Asn Phe Phe Asp Pro Lys Leu Met Ser Asp
30 35 40
Trp Glu Asp Glu Asp Leu Asp Thr Asp Asn Asp Asn Ile Pro
45 50 55
Asp Ser Tyr Glu Arg Asn Gly Tyr Thr Ile Lys Asp Leu Ile
124 • · > 9
9 «
9 9 9 · · ·· 9·9«
Ala Val Lys Trp Glu Asp Ser 75 Phe Ala Glu 80 Gin Gly Tyr Lys
Lys Tyr Val Ser Asn Tyr Leu Glu Ser Asn Thr Ala Gly Asp
85 90 95
Pro Tyr Thr Asp Tyr Glu Lys Ala Ser Gly Ser Phe Asp Lys
100 105 110
Ala Ile Lys Thr Glu Ala Arg Asp Pro Leu Val Ala Ala Tyr
115 120 125
Pro Ile Val Gly Val Gly Met Glu Lys Leu Ile Ile Ser Thr
130 135 140
Asn Glu His Ala Ser Thr Asp Gin Gly Lys Thr Val Ser Arg
145 150
Ala Thr Thr Asn Ser Lys Thr Glu Ser Asn Thr Ala Gly Val
155 160 165
Ser Val Asn Val Gly Tyr Gin Asn Gly Phe Thr Ala Asn Val
170 175 180
Thr Thr Asn Tyr Ser His Thr Thr Asp Asn Ser Thr Ala Val
185 190 195
Gin Asp Ser Asn Gly Glu Ser Trp Asn Thr Gly Leu Ser Ile
200 205 210
Asn Lys Gly Glu Ser Ala Tyr Ile Asn Ala Asn Val Arg Tyr
215 220
Tyr Asn Thr Gly Thr Ala Pro Met Tyr Lys Val Thr Pro Thr
225 230 235
Thr Asn Leu Val Leu Asp Gly Asp Thr Leu Ser Thr Ile Lys
240 245 250
Ala Gin Glu Asn Gin Ile Gly Asn Asn Leu Ser Pro Gly Asp
255 260 265
Thr Tyr Pro Lys Lys Gly Leu Ser Pro Leu Ala Leu Asn Thr
270 275 280
Met Asp Gin Phe Ser Ser Arg Leu Ile Pro Ile Asn Tyr Asp
285 290
Gin Leu Lys Lys Leu Asp Ala Gly Lys Gin Ile Lys Leu Glu
125 *·
295 300 305
Thr Thr Gin Val 310 Ser Gly Asn Phe Gly Thr Lys Asn Ser Ser
315 320
Gly Gin Ile Val Thr Glu Gly Asn Ser Trp Ser Asp Tyr Ile
325 330 335
Ser Gin Ile Asp Ser Ile Ser Ala Ser Ile Ile Leu Asp Thr
340 345 350
Glu Asn Glu Ser Tyr Glu Arg Arg Val Thr Ala Lys Asn Leu
355 360
Gin Asp Pro Glu Asp Lys Thr Pro Glu Leu Thr Ile Gly Glu
365 370 375
Ala Ile Glu Lys Ala Phe Gly Ala Thr Lys Lys Asp Gly Leu
380 385 390
Leu Tyr Phe Asn Asp Ile Pro Ile Asp Glu Ser Cys Val Glu
395 400 405
Leu Ile Phe Asp Asp Asn Thr Ala Asn Lys Ile Lys Asp Ser
410 415 420
Leu Lys Thr Leu Ser Asp Lys Lys Ile Tyr Asn Val Lys Leu
425 430
Glu Arg Gly Met Asn Ile Leu Ile Lys Thr Pro Thr Tyr Phe
435 440 445
Thr Asn Phe Asp Asp Tyr Asn Asn Tyr Pro Ser Thr Trp Ser
450 455 460
Asn Val Asn Thr Thr Asn Gin Asp Gly Leu Gin Gly Ser Ala
465 470 475
Asn Lys Leu Asn Gly Glu Thr Lys Ile Lys Ile Pro Met Ser
480 485 490
Glu Leu Lys Pro Tyr Lys Arg Tyr Val Phe Ser Gly Tyr Ser
495 500
Lys Asp Pro Leu Thr Ser Asn Ser Ile Ile Val Lys Ile Lys
505 510 515
Ala Lys Glu Glu Lys Thr Asp Tyr Leu Val Pro Glu Gin Gly
520 525 530
Tyr Thr Lys Phe Ser Tyr Glu Phe Glu Thr Thr Glu Lys Asp
126 • ·
535
545 ·» * · • 4k ** • · · • · · • · ♦ • » · ·» ·*··
540
Ser Ser Asn Ile 550 Glu Ile Thr Leu Ile Gly 555 Ser Gly Thr Thr 560
Tyr Leu Asp Asn Leu Ser Ile Thr Glu Leu Asn Ser Thr Pro
565 570
Glu Ile Leu Asp Glu Pro Glu Val Lys Ile Pro Thr Asp Gin
575 580 585
Glu Ile Met Asp Ala His Lys Ile Tyr Phe Ala Asp Leu Asn
590 595 600
Phe Asn Pro Ser Thr Gly Asn Thr Tyr Ile Asn Gly Met Tyr
605 610 615
Phe Ala Pro Thr Gin Thr Asn Lys Glu Ala Leu Asp Tyr Ile
620 625 630
Gin Lys Tyr Arg Val Glu Ala Thr Leu Gin Tyr Ser Gly Phe
635 640
Lys Asp Ile Gly Thr Lys Asp Lys Glu Met Arg Asn Tyr Leu
645 650 655
Gly Asp Pro Asn Gin Pro Lys Thr Asn Tyr Val Asn Leu Arg
660 665 670
Ser Tyr Phe Thr Gly Gly Glu Asn Ile Met Thr Tyr Lys Lys
675 680 685
Leu Arg Ile Tyr Ala Ile Thr Pro Asp Asp Arg Glu Leu Leu
690 695 700
Val Leu Ser Val Asp
705 <210> 26 <211> 706 <212> PRT <213> Clostridium perfringens <400> 26
Glu Leu Asn Gly Asn Lys Thr Val Ile Pro Glu Glu Asn Leu
127 ·· ·· • · ·
Phe Phe Arg Asp Tyr Ser Lys Ile Asp Glu Asn Asp Pro Phe
15 20 25
Ile Pro Asn Asn Asn Phe Phe Asp Val Arg Phe Phe Ser Ala
30 35 40
Ala Trp Glu Asp Glu Asp Leu Asp Thr Asp Asn Asp Asn Ile
45 50 55
Pro Asp Ala Tyr Glu Lys Asn Gly Tyr Thr Ile Lys Asp Ser
60 65 70
Ile Ala Val Lys Trp Asn Asp Ser Phe Ala Glu Gin Gly Tyr
75 80
Lys Lys Tyr Val Ser Ser Tyr Leu Glu Ser Asn Thr Ala Gly
85 90 95
Asp Pro Tyr Thr Asp Tyr Gin Lys Ala Ser Gly Ser Ile Asp
100 105 110
Lys Ala Ile Lys Leu Glu Ala Arg Asp Pro Leu Val Ala Ala
115 120 125
Tyr Pro Val Val Gly Val Gly Met Glu Asn Leu Ile Ile Ser
130 135 140
Thr Asn Glu His Ala Ser Ser Asp Gin Gly Lys Thr Val Ser
145 150
Arg Ala Thr Thr Asn Ser Lys Thr Asp Ala Asn Thr Val Gly
155 160 165
Val Ser Ile Ser Ala Gly Tyr Gin Asn Gly Phe Thr Gly Asn
170 175 180
Ile Thr Thr Ser Tyr Ser His Thr Thr Asp Asn Ser Thr Ala
185 190 195
Val Gin Asp Ser Asn Gly Glu Ser Trp Asn Thr Gly Leu Ser
200 205 210
Ile Asn Lys Gly Glu Ser Ala Tyr Ile Asn Ala Asn Val Arg
215 220
Tyr Tyr Asn Thr Gly Thr Ala Pro Met Tyr Lys Val Thr Pro
225 230 235
Thr Thr Asn Leu Val Leu Asp Gly Glu Thr Leu Ala Thr Ile
240 245 250
128 «v ♦* • · · • · * • · · »·
I « • «
Lys Ala Gin Asp Asn Gin Ile Gly 260 Asn Asn Leu Ser Pro 265 Asn
255
Glu Thr Tyr Pro Lys Lys Gly Leu Ser Pro Leu Ala Leu Asn
270 275 280
Thr Met Asp Gin Phe Asn Ala Arg Leu Ile Pro Ile Asn Tyr
285 290
Asp Gin Leu Lys Lys Leu Asp Ser Gly Lys Gin Ile Lys Leu
295 300 305
Glu Thr Thr Gin Val Ser Gly Asn Tyr Gly Thr Lys Asn Ser
310 315 320
Gin Gly Gin Ile Ile Thr Glu Gly Asn Ser Trp Ser Asn Tyr
325 330 335
Ile Ser Gin Ile Asp Ser Val Ser Ala Ser Ile Ile Leu Asp
340 345 350
Thr Gly Ser Gin Thr Phe Glu Arg Arg Val Ala Ala Lys Glu
355 360
Gin Gly Asn Pro Glu Asp Lys Thr Pro Glu Ile Thr Ile Gly
365 370 375
Glu Ala Ile Lys Lys Ala Phe Ser Ala Thr Lys Asn Gly Glu
380 385 390
Leu Leu Tyr Phe Asn Gly Ile Pro Ile Asp Glu Ser Cys Val
395 400 405
Glu Leu Ile Phe Asp Asp Asn Thr Ser Glu Ile Ile Lys Glu
410 415 420
Gin Leu Lys Tyr Leu Asp Asp Lys Lys Ile Tyr Asn Val Lys
425 430
Leu Glu Arg Gly Met Asn Ile Leu Ile Lys Val Pro Ser Tyr
435 440 445
Phe Thr Asn Phe Asp Glu Tyr Asn Asn Phe Pro Ala Ser Trp
450 455 460
Ser Asn Ile Asp Thr Lys Asn Gin Asp Gly Leu Gin Ser Val
465 470 475
Ala Asn Lys Leu Ser Gly Glu Thr Lys Ile Ile Ile Pro Met
480 485 490
129
Ser Lys Leu Lys Pro Tyr 495 Lys Arg Tyr Val 500 Phe Ser Gly Tyr
Ser Lys Asp Pro Ser Thr Ser Asn Ser Ile Thr Val Asn Ile
505 510 515
Lys Ser Lys Glu Gin Lys Thr Asp Tyr Leu Val Pro Glu Lys
520 525 530
Asp Tyr Thr Lys Phe Ser Tyr Glu Phe Glu Thr Thr Gly Lys
535 540 545
Asp Ser Ser Asp Ile Glu Ile Thr Leu Thr Ser Ser Gly Val
550 555 560
Ile Phe Leu Asp Asn Leu Ser Ile Thr Glu Leu Asn Ser Thr
565 570
Pro Glu Ile Leu Lys Glu Pro Glu Ile Lys Val Pro Ser Asp
575 580 585
Gin Glu Ile Leu Asp Ala His Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ile
590 595 600
Lys Leu Asp Thr Asn Thr Gly Asn Thr Tyr Ile Asp Gly Ile
605 610 615
Tyr Phe Glu Pro Thr Gin Thr Asn Lys Glu Ala Leu Asp Tyr
620 625 630
Ile Gin Lys Tyr Arg Val Glu Ala Thr Leu Gin Tyr Ser Gly
635 640
Phe Lys Asp Ile Gly Thr Lys Asp Lys Glu Ile Arg Asn Tyr
645 650 655
Leu Gly Asp Gin Asn Gin Pro Lys Thr Asn Tyr Ile Asn Phe
660 665 670
Arg Ser Tyr Phe Thr Ser Gly Glu Asn Val Met Thr Tyr Lys
675 680 685
Lys Leu Arg Ile Tyr Ala Val Thr Pro Asp Asn Arg Glu Leu
690 695 700
Leu Val Leu Ser Val Asn
705 <210> 27
130 t ·· ·· « » • ·· • · · • · ·
Ol *#* • 99 ·· • fc Φ i · • · · • « » · • « * *·· ···· ·* ♦
9999 <211> 712 <212> PRT <213> Clostridium spiroforme <400> 27
Glu Leu Asn Gly Asp Lys Thr Leu Ile Pro Glu Lys Asn Leu
1 5 10
Phe Leu Arg Asp Tyr Ser Lys Ile Asp Glu Asn Asp Pro Phe
15 20 25
Ile Pro Lys Asp Asn Phe Phe Asp Leu Lys Leu Lys Ser Arg
30 35 40
Ser Ala Arg Leu Ala Ser Gly Trp Gly Asp Glu Asp Leu Asp
45 50 55
Thr Asp Asn Asp Asn Ile Pro Asp Ala Tyr Glu Lys Asn Gly
60 65 70
Tyr Thr Ile Lys Asp Ser Ile Ala Val Lys Trp Glu Asp Ser
75 80
Phe Ala Gin Gin Gly Tyr Lys Lys Tyr Leu Ser Ser Tyr Leu
85 90 95
Glu Ser Asn Thr Ala Gly Asp Pro Tyr Thr Asp Tyr Gin Lys
100 105 110
Ala Ser Gly Ser Phe Asp Lys Ala Ile Lys Ala Glu Ala Arg
115 120 125
Asp Pro Leu Val Ala Ala Tyr Pro Val Val Gly Val Gly Met
130 135 140
Glu Lys Leu Ile Ile Ser Thr Asn Glu His Ala Ser Thr Asp
145 150
Gin Gly Lys Thr Val Ser Arg Asn Thr Thr Asn Ser Lys Thr
155 160 165
Asp Ala Asn Thr Ala Gly Val Ala Ile Asn Ile Ala Tyr Gin
170 175 180
Asn Gly Phe Thr Gly Ser Ile Thr Thr Asn Tyr Ser His Thr
185 190 195
Thr Glu Asn Ser Thr Ala Val Gin Asn Ser Asn Gly Glu Ser
131 • ·
200 205 210
Trp Asn Thr Ser Leu Ser Ile Asn Lys Gly Glu 220 Ser Ala Tyr
215
Ile Asn Ala Asn Val Arg Tyr Tyr Asn Thr Gly Thr Ala Pro
225 230 235
Met Tyr Lys Val Thr Pro Thr Thr Asn Leu Val Leu Asp Gly
240 245 250
Asp Thr Leu Thr Thr Ile Lys Ala Gin Asp Asn Gin Ile Gly
255 260 265
Asn Asn Leu Ser Pro Asn Glu Thr Tyr Pro Lys Lys Gly Leu
270 275 280
Ser Pro Leu Ala Leu Asn Thr Met Asp Gin Phe Ser Ser Arg
285 290
Leu Ile Pro Ile Asn Tyr Asp Gin Leu Lys Lys Leu Asp Ala
295 300 305
Gly Lys Gin Ile Lys Leu Glu Thr Thr Gin Val Ser Gly Asn
310 315 320
Tyr Gly Ile Lys Asn Ser Gin Gly Gin Ile Ile Thr Glu Gly
325 330 335
Asn Ser Trp Ser Asp Tyr Ile Ser Gin Ile Asp Ser Leu Ser
340 345 350
Ala Ser Ile Ile Leu Asp Thr Gly Ser Asp Val Phe Glu Arg
355 360
Arg Val Thr Ala Lys Asp Ser Ser Asn Pro Glu Asp Lys Thr
365 370 375
Pro Val Leu Thr Ile Gly Glu Ala Ile Glu Lys Ala Phe Gly
380 385 390
Ala Thr Lys Asn Gly Glu Ile Leu Tyr Phe Asn Gly Met Pro
395 400 405
Ile Asp Glu Ser Cys Val Glu Leu Ile Phe Asp Gly Asn Thr
410 415 420
Ala Asn Leu Ile Lys Glu Arg Leu Asn Ala Leu Asn Asp Lys
425 430
Lys Ile Tyr Asn Val Gin Leu Glu Arg Gly Met Lys Ile Leu
132
435 440 445
Ile Lys Thr Ser Thr Tyr Phe Asn Asn Phe Asp 455 Gly 460 Tyr Asn
450
Asn Phe Pro Ser Ser Trp Ser Asn Val Asp Ser Asn Asn Gin
465 470 475
Asp Gly Leu Gin Asn Ala Ala Asn Lys Leu Ser Gly Glu Thr
480 485 490
Lys Ile Val Ile Pro Met Ser Lys Leu Asn Pro Tyr Lys Arg
495 500
Tyr Val Phe Ser Gly Tyr Leu Lys Asn Ser Ser Thr Ser Asn
505 510 515
Pro Ile Thr Val Asn Ile Lys Ala Lys Glu Gin Lys Thr Tyr
520 525 530
Asn Leu Val Ser Glu Asn Asp Tyr Lys Lys Phe Ser Tyr Glu
535 540 545
Phe Glu Thr Ile Gly Arg Asp Ala Ser Asn Ile Glu Ile Thr
550 555 560
Leu Thr Ser Ser Gly Thr Ile Phe Leu Asp Asn Leu Ser Ile
565 570
Thr Glu Leu Asn Ser Thr Pro Glu Ile Leu Lys Glu Pro Asp
575 580 585
Ile Lys Val Pro Ser Asp Gin Glu Ile Ile Asp Ala His Lys
590 595 600
Lys Tyr Tyr Ala Asp Leu Ser Phe Asn Gin Ser Thr Ala Asn
605 610 615
Tyr Tyr Leu Asp Gly Leu Tyr Phe Glu Pro Thr Gin Thr Asn
620 625 630
Lys Glu Val Leu Asp Tyr Ile Gin Lys Tyr Lys Val Glu Ala
635 640
Thr Leu Glu Tyr Ser Gly Phe Lys Asp Ile Gly Thr Lys Asp
645 650 655
Lys Glu Leu Arg Asn Tyr Thr Gly Asp Ser Asn Gin Pro Lys
660 665 670
Thr Asn Tyr Val Asn Phe Arg Ser Tyr Phe Thr Ser Gly Glu
133 • · · ·
675 680 685
Asn Val Met Pro Tyr Lys Lys Leu Arg Ile Tyr Ala Ile Thr
690 695 700
Pro Glu Asn Lys Glu Leu Leu Val Leu Ser Ile Asn
705 710 <210> 28 <211> 582 <212> PRT <213> Clostridium botulinum <400> 28
Glu Thr Ser Asp Ile Ile Lys Glu Ile Ile Pro Ser Glu Val
1 5 10
Leu Leu Lys Pro Asn Tyr Ser Asn Thr Asn Glu Lys Ser Lys
15 20 25
Phe Ile Pro Asn Asn Thr Leu Phe Ser Asn Ala Lys Leu Lys
30 35 40
Ala Asn Ala Asn Arg Asp Thr Asp Arg Asp Gly Ile Pro Asp
45 50 55
Glu Trp Glu Ile Asn Gly Tyr Thr Val Met Asn Gin Lys Ala
60 65 70
Val Ala Trp Asp Asp Lys Phe Ala Ala Asn Gly Tyr Lys Lys
75 80
Tyr Val Ser Asn Pro Phe Lys Pro Cys Thr Ala Asn Asp Pro
85 90 95
Tyr Thr Asp Phe Glu Lys Val Ser Gly Gin Ile Asp Pro Ser
100 105 110
Val Ser Met Val Ala Arg Asp Pro Met Ile Ser Ala Tyr Pro
115 120 125
Ile Val Gly Val Gin Met Glu Arg Leu Val Val Ser Lys Ser
130 135 140
Glu Thr Ile Thr Gly Asp Ser Thr Lys Ser Met Ser Lys Ser
145
150 • · ·
134
Thr Ser His Ser Ser Thr Asn Ile Asn Thr Val Gly Ala Glu
155 160 165
Val Ser Gly Ser Leu Gin Leu Ala Gly Gly Ile Phe Pro Val
170 175 180
Phe Ser Met Ser Ala Ser Ala Asn Tyr Ser His Thr Trp Gin
185 190 195
Asn Thr Ser Thr Val Asp Asp Thr Thr Gly Glu Ser Phe Ser
200 205 210
Gin Gly Leu Ser Ile Asn Thr Gly Glu Ser Ala Tyr Ile Asn
215 220
Pro Asn Ile Arg Tyr Tyr Asn Thr Gly Thr Ala Pro Val Tyr
225 230 235
Asn Val Thr Pro Thr Thr Thr Ile Val Ile Asp Lys Gin Ser
240 245 250
Val Ala Thr Ile Lys Gly Gin Glu Ser Leu Ile Gly Asp Tyr
255 260 265
Leu Asn Pro Gly Gly Thr Tyr Pro Ile Ile Gly Glu Pro Pro
270 275 280
Met Ala Leu Asn Thr Met Asp Gin Phe Ser Ser Arg Leu Ile
285 290
Pro Ile Asn Tyr Asn Gin Leu Lys Ser Ile Asp Asn Gly Gly 295 300 305
Thr Val 310 Met Leu Ser Thr Ser Gin Phe Thr Gly Asn Phe Ala
315 320
Lys Tyr Asn Ser Asn Gly Asn Leu Val Thr Asp Gly Asn Asn
325 330 335
Trp Gly Pro Tyr Leu Gly Thr Ile Lys Ser Thr Thr Ala Ser
340 345 350
Leu Thr Leu Ser Phe Ser Gly Gin Thr Thr Gin Val Ala Val
355 360
Val Ala Pro Asn Phe Ser Asp Pro Glu Asp Lys Thr Pro Lys
365 370 375
Leu Thr Leu Glu Gin Ala Leu Val Lys Ala Phe Ala Leu Glu
380 385 390
• · • ·
135
Lys Lys Asn Gly Lys Phe Tyr Phe His Gly Leu Glu Ile 405 Ser
395 400
Lys Asn Glu Lys Ile Gin Val Phe Leu Asp Ser Asn Thr Asn
410 415 420
Asn Asp Phe Glu Asn Gin Leu Lys Asn Thr Ala Asp Lys Asp
425 430
Ile Met His Cys Ile Ile Lys Arg Asn Met Asn Ile Leu Val
435 440 445
Lys Val Ile Thr Phe Lys Glu Asn Ile Ser Ser Ile Asn Ile
450 455 460
Ile Asn Asp Thr Asn Phe Gly Val Gin Ser Met Thr Gly Leu
465 470 475
Ser Asn Arg Ser Lys Gly Gin Asp Gly Ile Tyr Arg Ala Ala
480 485 490
Thr Thr Ala Phe Ser Phe Lys Ser Lys Glu Leu Lys Tyr Pro
495 500
Glu Gly Arg Tyr Arg Met Arg Phe Val Ile Gin Ser Tyr Glu
505 510 515
Pro Phe Thr Cys Asn Phe Lys Leu Phe Asn Asn Leu Ile Tyr
520 525 530
Ser Ser Ser Phe Asp Lys Gly Tyr Tyr Asp Glu Phe Phe Tyr
535 540 545
Phe Tyr Tyr Asn Gly Ser Lys Ser Phe Phe Asn Ile Ser Cys
550 555 560
Asp Ile Ile Asn Ser Ile Asn Arg Leu Ser Gly Val Phe Leu
565 570
Ile Glu Leu Asp Lys Leu Ile Ile
575 580 <210> 29 <211> 708 <212> PRT <213> Bacillus cereus • ·
136 • · · · • · · · · • · · ·· ·· ····
<400> 29
Ile Asp Ser Gin Asn Gin Pro Gin Gin Val Gin Gin Asp Glu
1 5 10
Leu Arg Asn Pro Glu Phe Asn Lys Lys Glu Ser Gin Glu Phe
15 20 25
Leu Ala Lys Pro Ser Lys Ile Asn Leu Phe Thr Gin Gin Met
30 35 40
Lys Arg Glu Ile Asp Glu Asp Thr Asp Thr Asp Gly Asp Ser
45 50 55
Ile Pro Asp Leu Trp Glu Glu Asn Gly Tyr Thr Ile Gin Asn
60 65 70
Arg Ile Ala Val Lys Trp Asp Asp Ser Leu Ala Ser Lys Gly
75 80
Tyr Thr Lys Phe Val Ser Asn Pro Leu Glu Ser His Thr Val
85 90 95
Gly Asp Pro Tyr Thr Asp Tyr Glu Lys Ala Ala Arg Asp Leu
100 105 110
Asp Leu Ser Asn Ala Lys Glu Thr Phe Asn Pro Leu Val Ala
115 120 125
Ala Phe Pro Ser Val Asn Val Ser Met Glu Lys Val Ile Leu
130 135 140
Ser Pro Asn Glu Asn Leu Ser Asn Ser Val Glu Ser His Ser
145 150
Ser Thr Asn Trp Ser Tyr Thr Asn Thr Glu Gly Ala Ser Val
155 160 165
Glu Ala Gly Ile Gly Pro Lys Gly Ile Ser Phe Gly Val Ser
170 175 180
Val Asn Tyr Gin His Ser Glu Thr Val Ala Gin Glu Trp Gly
185 190 195
Thr Ser Thr Gly Asn Thr Ser Gin Phe Asn Thr Ala Ser Ala
200 205 210
Gly Tyr Leu Asn Ala Asn Val Arg Tyr Asn Asn Val Gly Thr
215 220
Gly Ala Ile Tyr Asp Val Lys Pro Thr Thr Ser Phe Val Leu
137 • ·
225 230 235
Asn Asn Asp Thr Ile Ala Thr Ile Thr Ala Lys Ser Asn Ser
240 245 250
Thr Ala Leu Asn Ile Ser Pro Gly Glu Ser Tyr Pro Lys Lys
255 260 265
Gly Gin Asn Gly Ile Ala Ile Thr Ser Met Asp Asp Phe Asn
270 275 280
Ser His Pro Ile Thr Leu Asn Lys Lys Gin Val Asp Asn Leu
285 290
Leu Asn Asn Lys Pro Met Met Leu Glu Thr Asn Gin Thr Asp
295 300 305
Gly Val Tyr Lys Ile Lys Asp Thr His Gly Asn Ile Val Thr
310 315 320
Gly Gly Glu Trp Asn Gly Val Ile Gin Gin Ile Lys Ala Lys
325 330 335
Thr Ala Ser Ile Ile Val Asp Asp Gly Glu Arg Val Ala Glu
340 345 350
Lys Arg Val Ala Ala Lys Asp Tyr Glu Asn Pro Glu Asp Lys
355 360
Thr Pro Ser Leu Thr Leu Lys Asp Ala Leu Lys Leu Ser Tyr
365 370 375
Pro Asp Glu Ile Lys Glu Ile Glu Gly Leu Leu Tyr Tyr Lys
380 385 390
Asn Lys Pro Ile Tyr Glu Ser Ser Val Met Thr Tyr Leu Asp
395 400 405
Glu Asn Thr Ala Lys Glu Val Thr Lys Gin Leu Asn Asp Thr
410 415 420
Thr Gly Lys Phe Lys Asp Val Ser His Leu Tyr Asp Val Lys
425 430
Leu Thr Pro Lys Met Asn Val Thr Ile Lys Leu Ser Ile Leu
435 440 445
Tyr Asp Asn Ala Glu Ser Asn Asp Asn Ser Ile Gly Lys Trp
450 455 460
Thr Asn Thr Asn Ile Val Ser Gly Gly Asn Asn Gly Lys Lys
138
465 470 475
Gin Tyr Ser Ser Asn Asn Pro Asp Ala Asn Leu Thr Leu Asn
480 485 490
Thr Asp Ala Gin Glu Lys Leu Asn Lys Asn Arg Asp Tyr Tyr
495 500
Ile Ser Leu Tyr Met Lys Ser Glu Lys Asn Thr Gin Cys Glu
505 510 515
Ile Thr Ile Asp Gly Glu Ile Tyr Pro Ile Thr Thr Lys Thr
520 525 530
Val Asn Val Asn Lys Asp Asn Tyr Lys Arg Leu Asp Ile Ile
535 540 545
Ala His Asn Ile Lys Ser Asn Pro Ile Ser Ser Leu His Ile
550 555 560
Lys Thr Asn Asp Glu Ile Thr Leu Phe Trp Asp Asp Ile Ser
565 570
Ile Thr Asp Val Ala Ser Ile Lys Pro Glu Asn Leu Thr Asp
575 580 585
Ser Glu Ile Lys Gin Ile Tyr Ser Arg Tyr Gly Ile Lys Leu
590 595 600
Glu Asp Gly Ile Leu Ile Asp Lys Lys Gly Gly Ile His Tyr
605 610 615
Gly Glu Phe Ile Asn Glu Ala Ser Phe Asn Ile Glu Pro Leu
620 625 630
Gin Asn Tyr Val Thr Lys Tyr Glu Val Thr Tyr Ser Ser Glu
635 640
Leu Gly Pro Asn Val Ser Asp Thr Leu Glu Ser Asp Lys i Ile
645 650 655
Tyr Lys Asp Gly Thr Ile Lys Phe Asp Phe Thr Lys Tyr Ser
660 665 670
Lys Asn Glu Gin Gly Leu Phe Tyr Asp Ser Gly Leu Asn Trp
675 680 685
Asp Phe Lys Ile Asn Ala Ile Thr Tyr Asp Gly Lys Glu Met
690 695 700
Asn Val Phe His Arg Tyr Asn Lys
139
705 <210> 30 <211> 735 <212> PRT <213> Bacillus anthracis <400> 30
Glu Val Lys Gin Glu Asn Arg Leu Leu Asn Glu Ser Glu Ser
1 5 10
Ser Ser Gin Gly Leu Leu Gly Tyr Tyr Phe Ser Asp Leu Asn
15 20 25
Phe Gin Ala Pro Met Val Val Thr Ser Ser Thr Thr Gly Asp
30 35 40
Leu Ser Ile Pro Ser Ser Glu Leu Glu Asn Ile Pro Ser Glu
45 50 55
Asn Gin Tyr Phe Gin Ser Ala Ile Trp Ser Gly Phe Ile Lys
60 65 70
Val Lys Lys Ser Asp Glu Tyr Thr Phe Ala Thr Ser Ala Asp
75 80
Asn His Val Thr Met Trp Val Asp Asp Gin Glu Val Ile Asn
85 90 95
Lys Ala Ser Asn Ser Asn Lys Ile Arg Leu Glu Lys Gly Arg
100 105 110
Leu Tyr Gin Ile Lys Ile Gin Tyr Gin Arg Glu Asn Pro Thr
115 120 125
Glu Lys Gly Leu Asp Phe Lys Leu Tyr Trp Thr Asp Ser Gin
130 135 140
Asn Lys Lys Glu Val Ile Ser Ser Asp Asn Leu Gin Leu Pro
145 150
Glu Leu Lys Gin Lys Ser Ser Asn Ser Arg Lys Lys Arg Ser
155 160 165
Thr Ser Ala Gly Pro Thr Val Pro Asp Arg Asp Asn Asp Gly
170 175 180 « ·
140
Ile Pro Asp Ser Leu Glu Val Glu Gly Tyr 190 Thr Val Asp 195 Val
185
Lys Asn Lys Arg Thr Phe Leu Ser Pro Trp Ile Ser Asn Ile
200 205 210
His Glu Lys Lys Gly Leu Thr Lys Tyr Lys Ser Ser Pro Glu
215 220
Lys Trp Ser Thr Ala Ser Asp Pro Tyr Ser Asp Phe Glu Lys
225 230 235
Val Thr Gly Arg Ile Asp Lys Asn Val Ser Pro Glu Ala Arg
240 245 250
His Pro Leu Val Ala Ala Tyr Pro Ile Val His Val Asp Met
255 260 265
Glu Asn Ile Ile Leu Ser Lys Asn Glu Asp Gin Ser Thr Gin
270 275 280
Asn Thr Asp Ser Gin Thr Arg Thr Ile Ser Lys Asn Thr Ser
285 290
Thr Ser Arg Thr His Thr Ser Glu Val His Gly Asn Ala Glu
295 300 305
Val His Ala Ser Phe Phe Asp Ile Gly Gly Ser Val Ser Ala
310 315 320
Gly Phe Ser Asn Ser Asn Ser Ser Thr Val Ala Ile Asp His
325 330 335
Ser Leu Ser Leu Ala Gly Glu Arg Thr Trp Ala Glu Thr Met
340 345 350
Gly Leu Asn Thr Ala Asp Thr Ala Arg Leu Asn Ala Asn Ile
355 360
Arg Tyr Val Asn Thr Gly Thr Ala Pro Ile Tyr Asn Val Leu
365 370 375
Pro Thr Thr Ser Leu Val Leu Gly Lys Asn Gin Thr Leu Ala 380 385 390
Thr Ile Lys Ala Lys Glu Asn Gin Leu Ser Gin Ile Leu Ala 395 400 405
Pro Asn Asn Tyr Tyr Pro Ser Lys Asn Leu Ala Pro Ile Ala 410 415 420
141 • · • ·· φ· ·· ♦· • « · · · • · · · • · · · · • · · ♦ ·«·· ·♦ ····
Leu Asn Ala Gin Asp Asp Phe Ser Ser 425 Thr Pro 430 Ile Thr Met
Asn Tyr Asn Gin Phe Leu Glu Leu Glu Lys Thr Lys Gin Leu
435 440 445
Arg Leu Asp Thr Asp Gin Val Tyr Gly Asn Ile Ala Thr Tyr
450 455 460
Asn Phe Glu Asn Gly Arg Val Arg Val Asp Thr Gly Ser Asn
465 470 475
Trp Ser Glu Val Leu Pro Gin Ile Gin Glu Thr Thr Ala Arg
480 485 490
Ile Ile Phe Asn Gly Lys Asp Leu Asn Leu Val Glu Arg Arg
495 500
Ile Ala Ala Val Asn Pro Ser Asp Pro Leu Glu Thr Thr Lys
505 510 515
Pro Asp Met Thr Leu Lys Glu Ala Leu Lys Ile Ala Phe Gly
520 525 530
Phe Asn Glu Pro Asn Gly Asn Leu Gin Tyr Gin Gly Lys Asp
535 540 545
Ile Thr Glu Phe Asp Phe Asn Phe Asp Gin Gin Thr Ser Gin
550 555 560
Asn Ile Lys Asn Gin Leu Ala Glu Leu Asn Val Thr Asn Ile
565 570
Tyr Thr Val Leu Asp Lys Ile Lys Leu Asn Ala Lys Met Asn
575 580 585
Ile Leu Ile Arg Asp Lys Arg Phe His Tyr Asp Arg Asn Asn
590 595 600
Ile Ala Val Gly Ala Asp Glu Ser Val Val Lys Glu Ala His
605 610 615
Arg Glu Val Ile Asn Ser Ser Thr Glu Gly Leu Leu Leu Asn
620 625 630
Ile Asp Lys Asp Ile Arg Lys Ile Leu Ser Gly Tyr Ile Val
635 640
Glu Ile Glu Asp Thr Glu Gly Leu Lys Glu Val Ile Asn Asp
645 650 655
142
Arg Tyr 660 Asp Met Leu Asn Ile Ser Ser Leu Arg Gin Asp Gly
665 670
Lys Thr Phe Ile Asp Phe Lys Lys Tyr Asn Asp Lys Leu Pro
675 680 685
Leu Tyr Ile Ser Asn Pro Asn Tyr Lys Val Asn Val Tyr Ala
690 695 700
Val Thr Lys Glu Asn Thr Ile Ile Asn Pro Ser Glu Asn Gly
705 710
Asp Thr Ser Thr Asn Gly Ile Lys Lys Ile Leu Ile Phe Ser
715 720 725
Lys Lys Gly Tyr Glu Ile Gly
730 735 <210> 31 <211> 876 <212> PRT <213> Clostridium difficile <400> 31
Met Lys Ile Gin Met Arg Asn Lys Lys Val Leu Ser Phe Leu
1 5 10
Thr Leu Thr Ala Ile Val Ser Gin Ala Leu Val Tyr Pro Val
15 20 25
Tyr Ala Gin Thr Ser Thr Ser Asn His Ser Asn Lys Lys Lys
30 35 40
Glu Ile Val Asn Glu Asp Ile Leu Pro Asn Asn Gly Leu Met
45 50 55
Gly Tyr Tyr Phe Ser Asp Glu His Phe Lys Asp Leu Lys Leu
60 65 70
Met Ala Pro Ile Lys Asp Gly Asn Leu Lys Phe Glu Glu Lys
75 80
Lys Val Asp Lys Leu Leu Asp Lys Asp Lys Ser Asp Val Lys
85 90 95
Ser Ile Arg Trp Thr Gly Arg Ile Ile Pro Ser Lys Asp Gly
143 • ·
100 105 110
Glu Tyr Thr Leu Ser Thr Asp Arg Asp Asp Val Leu Met Gin
115 120 125
Val Asn Thr Glu Ser Thr Ile Ser Asn Thr Leu Lys Val Asn
130 135 140
Met Lys Lys Gly Lys Glu Tyr Lys Val Arg Ile Glu Leu Gin
145 150
Asp Lys Asn Leu Gly Ser Ile Asp Asn Leu Ser Ser Pro Asn
155 160 165
Leu Tyr Trp Glu Leu Asp Gly Met Lys Lys Ile Ile Pro Glu
170 175 180
Glu Asn Leu Phe Leu Arg Asp Tyr Ser Asn Ile Glu Lys Asp
185 190 195
Asp Pro Phe Ile Pro Asn Asn Asn Phe Phe Asp Pro Lys Leu
200 205 210
Met Ser Asp Trp Glu Asp Glu Asp Leu Asp Thr Asp Asn Asp
215 220
Asn Ile Pro Asp Ser Tyr Glu Arg Asn Gly Tyr Thr Ile Lys
225 230 235
Asp Leu Ile Ala Val Lys Trp Glu Asp Ser Phe Ala Glu Gin
240 245 250
Gly Tyr Lys Lys Tyr Val Ser Asn Tyr Leu Glu Ser Asn Thr
255 260 265
Ala Gly Asp Pro Tyr Thr Asp Tyr Glu Lys Ala Ser Gly Ser
270 275 280
Phe Asp Lys Ala Ile Lys Thr Glu Ala Arg Asp Pro Leu Val
285 290
Ala Ala Tyr Pro Ile Val Gly Val Gly Met Glu Lys Leu Ile
295 300 305
Ile Ser Thr Asn Glu His Ala Ser Thr Asp Gin Gly Lys Thr
310 315 320
Val Ser Arg Ala Thr Thr Asn Ser Lys Thr Glu Ser Asn Thr
325 330 335
Ala Gly Val Ser Val Asn Val Gly Tyr Gin Asn Gly Phe Thr
144
340 345 350
Ala Asn Val Thr Thr Asn Tyr 355 Ser His Thr Thr Asp Asn Ser 360
Thr Ala Val Gin Asp Ser Asn Gly Glu Ser Trp Asn Thr Gly
365 370 375
Leu Ser Ile Asn Lys Gly Glu Ser Ala Tyr Ile Asn Ala Asn
380 385 390
Val Arg Tyr Tyr Asn Thr Gly Thr Ala Pro Met Tyr Lys Val
395 400 405
Thr Pro Thr Thr Asn Leu Val Leu Asp Gly Asp Thr Leu Ser
410 415 420
Thr Ile Lys Ala Gin Glu Asn Gin Ile Gly Asn Asn Leu Ser
425 430
Pro Gly Asp Thr Tyr Pro Lys Lys Giy Leu Ser Pro Leu Ala
435 440 445
Leu Asn Thr Met Asp Gin Phe Ser Ser Arg Leu Ile Pro Ile
450 455 460
Asn Tyr Asp Gin Leu Lys Lys Leu Asp Ala Gly Lys Gin Ile
465 470 475
Lys Leu Glu Thr Thr Gin Val Ser Gly Asn Phe Gly Thr Lys
480 485 490
Asn Ser Ser Gly Gin Ile Val Thr Glu Gly Asn Ser Trp Ser
495 500
Asp Tyr Ile Ser Gin Ile Asp Ser Ile Ser Ala Ser Ile Ile
505 510 515
Leu Asp Thr Glu Asn Glu Ser Tyr Glu Arg Arg Val Thr Ala
520 525 530
Lys Asn Leu Gin Asp Pro Glu Asp Lys Thr Pro Glu Leu Thr
535 540 545
Ile Gly Glu Ala Ile Glu Lys Ala Phe Gly Ala Thr Lys Lys
550 555 560
Asp Gly Leu Leu Tyr Phe Asn Asp Ile Pro Ile Asp Glu Ser
565 570
Cys Val Glu Leu Ile Phe Asp Asp Asn Thr Ala Asn Lys Ile
145
575 580 585
Lys Asp Ser Leu Lys Thr Leu Ser Asp Lys Lys Ile Tyr Asn
590 595 600
Val Lys Leu Glu Arg Gly Met Asn Ile Leu Ile Lys Thr Pro
605 610 615
Thr Tyr Phe Thr Asn Phe Asp Asp Tyr Asn Asn Tyr Pro Ser
620 625 630
Thr Trp Ser Asn Val Asn Thr Thr Asn Gin Asp Gly Leu Gin
635 640
Gly Ser Ala Asn Lys Leu Asn Gly Glu Thr Lys Ile Lys Ile
645 650 655
Pro Met Ser Glu Leu Lys Pro Tyr Lys Arg Tyr Val Phe Ser
660 665 670
Gly Tyr Ser Lys Asp Pro Leu Thr Ser Asn Ser Ile Ile Val
675 680 685
Lys Ile Lys Ala Lys Glu Glu Lys Thr Asp Tyr Leu Val Pro
690 695 700
Glu Gin Gly Tyr Thr Lys Phe Ser Tyr Glu Phe Glu Thr Thr
705 710
Glu Lys Asp Ser Ser Asn Ile Glu Ile Thr Leu Ile Gly Ser
715 720 725
Gly Thr Thr Tyr Leu Asp Asn Leu Ser Ile Thr Glu Leu Asn
730 735 740
Ser Thr Pro Glu Ile Leu Asp Glu Pro Glu Val Lys Ile Pro
745 750 755
Thr Asp Gin Glu Ile Met Asp Ala His Lys Ile Tyr Phe Ala
760 765 770
Asp Leu Asn Phe Asn Pro Ser Thr Gly Asn Thr Tyr Ile Asn
775 780
Gly Met Tyr Phe Ala Pro Thr Gin Thr Asn Lys Glu Ala Leu
785 790 795
Asp Tyr Ile Gin Lys Tyr Arg Val Glu Ala Thr Leu Gin Tyr
800 805 810
Ser Gly Phe Lys Asp Ile Gly Thr Lys Asp Lys Glu Met Arg
146
815 820 825
Asn Tyr Leu Gly Asp Pro Asn Gin Pro Lys Thr Asn Tyr Val
830 835 840
Asn Leu Arg Ser Tyr Phe Thr Gly Gly Glu Asn Ile Met Thr
845 850
Tyr Lys Lys Leu Arg Ile Tyr Ala Ile Thr Pro Asp Asp Arg
855 860 865
Glu Leu Leu Val Leu Ser Val Asp
870 875
<210> 32 <211> 875 <212> PRT <213> Clostridium perfringens
<400> 32
Met Asn Ile Gin Ile Lys Asn Val Phe Ser Phe Leu Thr Leu
1 5 10
Thr Ala Met Ile Ser Gin Thr Leu Ser Tyr Asn Val Tyr Ala
15 20 25
Gin Thr Thr Thr Gin Asn Asp Thr Asn Gin Lys Glu Glu Ile
30 35 40
Thr Asn Glu Asn Thr Leu Ser Ser Asn Gly Leu Met Gly Tyr
45 50 55
Tyr Phe Ala Asp Glu His Phe Lys Asp Leu Glu Leu Met Ala
60 65 70
Pro Ile Lys Asn Gly Asp Leu Lys Phe Glu Glu Lys Lys Val
75 80
Asp Lys Leu Leu Thr Glu Asp Asn Ser Ser Ile Lys Ser Ile
85 90 95
Arg Trp Thr Gly Arg Ile Ile Pro Ser Glu Asp Gly Glu Tyr
100 105 110
Ile Leu Ser Thr Asp Arg Asn Asp Val Leu Met Gin Ile Asn
115 120
125
147 ♦ · · 4 4 >·<···· 4 · · · * 4
Ala Lys Gly Asp 130 Ile Ala Lys Thr Leu Lys Val Asn Met 135 Lys 140
Lys Gly Gin Ala Tyr Asn Ile Arg Ile Glu Ile Gin Asp Lys
145 150
Asn Leu Gly Ser Ile Asp Asn Leu Ser Val Pro Lys Leu Tyr
155 160 165
Trp Glu Leu Asn Gly Asn Lys Thr Val Ile Pro Glu Glu Asn
170 175 180
Leu Phe Phe Arg Asp Tyr Ser Lys Ile Asp Glu Asn Asp Pro
185 190 195
Phe Ile Pro Asn Asn Asn Phe Phe Asp Val Arg Phe Phe Ser
200 205 210
Ala Ala Trp Glu Asp Glu Asp Leu Asp Thr Asp Asn Asp Asn
215 220
Ile Pro Asp Ala Tyr Glu Lys Asn Gly Tyr Thr Ile Lys Asp
225 230 235
Ser Ile Ala Val Lys Trp Asn Asp Ser Phe Ala Glu Gin Gly
240 245 250
Tyr Lys Lys Tyr Val Ser Ser Tyr Leu Glu Ser Asn Thr Ala
255 260 265
Gly Asp Pro Tyr Thr Asp Tyr Gin Lys Ala Ser Gly Ser Ile
270 275 280
Asp Lys Ala Ile Lys Leu Glu Ala Arg Asp Pro Leu Val Ala
285 290
Ala Tyr Pro Val Val Gly Val Gly Met Glu Asn Leu Ile Ile
295 300 305
Ser Thr Asn Glu His Ala Ser Ser Asp Gin Gly Lys Thr Val
310 315 320
Ser Arg Ala Thr Thr Asn Ser Lys Thr Asp Ala Asn Thr Val
325 330 335
Gly Val Ser Ile Ser Ala Gly Tyr Gin Asn Gly Phe Thr Gly
340 345 350
Asn Ile Thr Thr Ser Tyr Ser His Thr Thr Asp Asn Ser Thr
355 360
148
Ala Val Gin Asp Ser Asn Gly Glu Ser Trp Asn Thr Gly Leu
365 370 375
Ser Ile Asn Lys Gly Glu Ser Ala Tyr Ile Asn Ala Asn Val
380 385 390
Arg Tyr Tyr Asn Thr Gly Thr Ala Pro Met Tyr Lys Val Thr
395 40C ) 405
Pro Thr Thr Asn Leu Val Leu Asp Gly Glu Thr Leu Ala Thr
410 415 420
Ile Lys Ala Gin Asp Asn Gin Ile Gly Asn Asn Leu Ser Pro
425 430
Asn Glu Thr Tyr Pro Lys Lys Gly Leu Ser Pro Leu Ala Leu
435 440 445
Asn Thr Met Asp Gin Phe Asn Ala Arg Leu Ile Pro Ile Asn
450 455 460
Tyr Asp Gin Leu Lys Lys Leu Asp Ser Gly Lys Gin Ile Lys
465 470 475
Leu Glu Thr Thr Gin Val Ser Gly Asn Tyr Gly Thr Lys Asn
480 485 490
Ser Gin Gly Gin Ile Ile Thr Glu Gly Asn Ser Trp Ser Asn
495 500
Tyr Ile Ser Gin Ile Asp Ser Val Ser Ala Ser Ile Ile Leu
505 510 515
Asp Thr Gly Ser Gin Thr Phe Glu Arg Arg Val Ala Ala Lys
520 525 530
Glu Gin Giy Asn Pro Glu Asp Lys Thr Pro Glu Ile Thr Ile
535 540 545
Gly Glu Ala Ile Lys Lys Ala Phe Ser Ala Thr Lys Asn Gly
550 555 560
Glu Leu Leu Tyr Phe Asn Gly Ile Pro Ile Asp Glu Ser Cys
565 570
Val Glu Leu Ile Phe Asp Asp Asn Thr Ser Glu Ile Ile Lys
575 580 585
Glu Gin Leu Lys Tyr Leu Asp Asp Lys Lys Ile Tyr Asn Val
590 595 600
149
Lys Leu Glu 605 Arg Gly Met Asn Ile Leu 610 Ile Lys Val Pro Ser 615
Tyr Phe Thr Asn Phe Asp Glu Tyr Asn Asn Phe Pro Ala Ser
620 625 630
Trp Ser Asn Ile Asp Thr Lys Asn Gin Asp Gly Leu Gin Ser
635 640
Val Ala Asn Lys Leu Ser Gly Glu Thr Lys Ile Ile Ile Pro
645 650 655
Met Ser Lys Leu Lys Pro Tyr Lys Arg Tyr Val Phe Ser Gly
660 665 670
Tyr Ser Lys Asp Pro Ser Thr Ser Asn Ser Ile Thr Val Asn
675 680 685
Ile Lys Ser Lys Glu Gin Lys Thr Asp Tyr Leu Val Pro Glu
690 695 700
Lys Asp Tyr Thr Lys Phe Ser Tyr Glu Phe Glu Thr Thr Gly
705 710
Lys Asp Ser Ser Asp Ile Glu Ile Thr Leu Thr Ser Ser Gly
715 720 725
Val Ile Phe Leu Asp Asn Leu Ser Ile Thr Glu Leu Asn Ser
730 735 740
Thr Pro Glu Ile Leu Lys Glu Pro Glu Ile Lys Val Pro Ser
745 750 755
Asp Gin Glu Ile Leu Asp Ala His Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp
760 765 770
Ile Lys Leu Asp Thr Asn Thr Gly Asn Thr Tyr Ile Asp Gly
775 780
Ile Tyr Phe Glu Pro Thr Gin Thr Asn Lys Glu Ala Leu Asp
785 790 795
Tyr Ile Gin Lys Tyr Arg Val Glu Ala Thr Leu Gin Tyr Ser
800 805 810
Gly Phe Lys Asp Ile Gly Thr Lys Asp Lys Glu Ile Arg Asn
815 820 825
Tyr Leu Gly Asp Gin Asn Gin Pro Lys Thr Asn Tyr Ile Asn
830 835
840
150 ·* * · ** • « « • · · • · · • · · ·· ···· • * » · k «
Λ9
Phe Arg Ser Tyr Phe Thr Ser Gly Glu Asn Val Met Thr Tyr
845 850
Lys Lys Leu Arg Ile Tyr Ala Val Thr Pro Asp Asn Arg Glu
855 860 865
Leu Leu Val Leu Ser Val Asn
870 875
<210> 33 <211> 879 <212> PRT <213> Clostridium spiroforme <400> 33
Met Lys Asn Lys Lys Ile Leu Gly Leu Leu Thr Cys Thr Val
1 5 10
Leu Val Gly Gin Met Met Thr Tyr Pro Val Tyr Ala Lys Thr
15 20 25
Ile Thr Gin Asn Tyr Asp Asn Gin Glu Val Glu Thr Thr Asn
30 35 40
Glu Lys Thr Val Ser Ser Asn Gly Leu Met Gly Tyr Tyr Phe
45 50 55
Ala Asp Glu His Phe Lys Asp Leu Glu Leu Met Ala Pro Val
60 65 70
Lys Asn Gly Glu Leu Lys Phe Glu Lys Asn Lys Val Glu Lys
75 80
Leu Leu Thr Glu Glu Lys Thr Asn Ile Lys Ser Ile Arg Trp
85 90 95
Thr Gly Arg Ile Ile Pro Ser Lys Asp Gly Glu Tyr Thr Leu
100 105 110
Ser Thr Asp Lys Asp Asn Val Leu Met Gin Ile Asn Ala Glu
115 120 125
Gly Glu Ile Ala Asn Thr Leu Lys Val Asn Met Ile Lys Gly
130 135 140
Gin Glu Tyr Ser Ile Arg Ile Glu Ile Gin Asp Lys Asp Ile
151 ·· * · ♦· • a *♦ *9 · « ; · ; ·· ··· 9«· v» r·* »ο·* ·· ♦ ···
145 150
Gly Tyr Val Asp Asp Leu Ser Ser Pro Lys Leu Tyr Trp Glu
155 160 165
Leu Asn Gly Asp Lys Thr Leu Ile Pro Glu Lys Asn Leu Phe
170 175 180
Leu Arg Asp Tyr Ser Lys Ile Asp Glu Asn Asp Pro Phe Ile
185 190 195
Pro Lys Asp Asn Phe Phe Asp Leu Lys Leu Lys Ser Arg Ser
200 205 210
Ala Arg Leu Ala Ser Gly Trp Gly Asp Glu Asp Leu Asp Thr
215 220
Asp Asn Asp Asn Ile Pro Asp Ala Tyr Glu Lys Asn Gly Tyr
225 230 235
Thr Ile Lys Asp Ser Ile Ala Val Lys Trp Glu Asp Ser Phe
240 245 250
Ala Gin Gin Gly Tyr Lys Lys Tyr Leu Ser Ser Tyr Leu Glu
255 260 265
Ser Asn Thr Ala Gly Asp Pro Tyr Thr Asp Tyr Gin Lys Ala
270 275 280
Ser Gly Ser Phe Asp Lys Ala Ile Lys Ala Glu Ala Arg Asp
285 290
Pro Leu Val Ala Ala Tyr Pro Val Val Gly Val Gly Met Glu
295 300 305
Lys Leu Ile Ile Ser Thr Asn Glu His Ala Ser Thr Asp Gin
310 315 320
Gly Lys Thr Val Ser Arg Asn Thr Thr Asn Ser Lys Thr Asp
325 330 335
Ala Asn Thr Ala Gly Val Ala Ile Asn Ile Ala Tyr Gin Asn
340 345 350
Gly Phe Thr Gly Ser Ile Thr Thr Asn Tyr Ser His Thr Thr
355 360
Glu Asn Ser Thr Ala Val Gin Asn Ser Asn Gly Glu Ser Trp
365 370 375
Asn Thr Ser Leu Ser Ile Asn Lys Gly Glu Ser Ala Tyr Ile
152 ·· ···· · · · ·· · · · · • · · · ····
380 385 390
Asn Ala Asn Val Arg Tyr Tyr Asn Thr Gly Thr Ala Pro Met
395 400 405
Tyr Lys Val Thr Pro Thr Thr Asn Leu Val Leu Asp Gly Asp
410 415 420
Thr Leu Thr Thr Ile Lys Ala Gin Asp Asn Gin Ile Gly Asn
425 430
Asn Leu Ser Pro Asn Glu Thr Tyr Pro Lys Lys Gly Leu Ser
435 440 445
Pro Leu Ala Leu Asn Thr Met Asp Gin Phe Ser Ser Arg Leu
450 455 460
Ile Pro Ile Asn Tyr Asp Gin Leu Lys Lys Leu Asp Ala Gly
465 470 475
Lys Gin Ile Lys Leu Glu Thr Thr Gin Val Ser Gly Asn Tyr
480 485 490
Gly Ile Lys Asn Ser Gin Gly Gin Ile Ile Thr Glu Gly Asn
495 500
Ser Trp Ser Asp Tyr Ile Ser Gin Ile Asp Ser Leu Ser Ala
505 510 515
Ser Ile Ile Leu Asp Thr Gly Ser Asp Val Phe Glu Arg Arg
520 525 530
Val Thr Ala Lys Asp Ser Ser Asn Pro Glu Asp Lys Thr Pro
535 540 545
Val Leu Thr Ile Gly Glu Ala Ile Glu Lys Ala Phe Gly Ala
550 555 560
Thr Lys Asn Gly Glu Ile Leu Tyr Phe Asn Gly Met Pro Ile
565 570
Asp Glu Ser Cys Val Glu Leu Ile Phe Asp Gly Asn Thr Ala
575 580 585
Asn Leu Ile Lys Glu Arg Leu Asn Ala Leu Asn Asp Lys Lys
590 595 600
Ile Tyr Asn Val Gin Leu Glu Arg Gly Met Lys Ile Leu Ile
605 610 615
Lys Thr Ser Thr Tyr Phe Asn Asn Phe Asp Gly Tyr Asn Asn
153
620 625 630
Phe Pro Ser Ser Trp Ser 635 Asn Val Asp Ser Asn 640 Asn Gin Asp
Gly Leu Gin Asn Ala Ala Asn Lys Leu Ser Gly Glu Thr Lys
645 650 655
Ile Val Ile Pro Met Ser Lys Leu Asn Pro Tyr Lys Arg Tyr
660 665 670
Val Phe Ser Gly Tyr Leu Lys Asn Ser Ser Thr Ser Asn Pro
675 680 685
Ile Thr Val Asn Ile Lys Ala Lys Glu Gin Lys Thr Tyr Asn
690 695 700
Leu Val Ser Glu Asn Asp Tyr Lys Lys Phe Ser Tyr Glu Phe
705 710
Glu Thr Ile Gly Arg Asp Ala Ser Asn Ile Glu Ile Thr Leu
715 720 725
Thr Ser Ser Gly Thr Ile Phe Leu Asp Asn Leu Ser Ile Thr
730 735 740
Glu Leu Asn Ser Thr Pro Glu Ile Leu Lys Glu Pro Asp Ile
745 750 755
Lys Val Pro Ser Asp Gin Glu Ile Ile Asp Ala His Lys Lys
760 765 770
Tyr Tyr Ala Asp Leu Ser Phe Asn Gin Ser Thr Ala Asn Tyr
775 780
Tyr Leu Asp Gly Leu Tyr Phe Glu Pro Thr Gin Thr Asn Lys
785 790 795
Glu Val Leu Asp Tyr Ile Gin Lys Tyr Lys Val Glu Ala Thr
800 805 810
Leu Glu Tyr Ser Gly Phe Lys Asp Ile Gly Thr Lys Asp Lys
815 820 825
Glu Leu Arg Asn Tyr Thr Gly Asp Ser Asn Gin Pro Lys Thr
830 835 840
Asn Tyr Val Asn Phe Arg Ser Tyr Phe Thr Ser Gly Glu Asn
845 850
Val Met Pro Tyr Lys Lys Leu Arg Ile Tyr Ala Ile Thr Pro
154 • ·
855 860 865
Glu Asn Lys Glu Leu Leu Val Leu Ser Ile Asn
870 875 <210> 34 <211> 721 <212> PRT <213> Clostridium botulinum <400> 34
Met 1 Leu Val Ser Lys 5 Phe Glu Asn Ser Val 10 Lys Asn Ser Asn
Lys Asn Tyr Phe Thr Ile Asn Gly Leu Met Gly Tyr Tyr Phe
15 20 25
Glu Asn Asp Phe Phe Asn Leu Asn Ile Ile Ser Pro Thr Leu
30 35 40
Asp Gly Asn Leu Thr Phe Ser Lys Glu Asp Ile Asn Ser Ile
45 50 55
Leu Gly Asn Lys Ile Ile Lys Ser Ala Arg Trp Ile Gly Leu
60 65 70
Ile Lys Pro Ser Ile Thr Gly Glu Tyr Ile Leu Ser Thr Asn
75 80
Ser Pro Asn Cys Arg Val Glu Leu Asn Gly Glu Ile Phe Asn
85 90 95
Leu Ser Leu Asn Thr Ser Asn Thr Val Asn Leu Ile Gin Gly
100 105 110
Asn Val Tyr Asp Ile Arg Ile Glu Gin Leu Met Ser Glu Asn
115 120 125
Gin Leu Leu Lys Asn Tyr Glu Gly Ile Lys Leu Tyr Trp Glu
130 135 140
Thr Ser Asp Ile Ile Lys Glu Ile Ile Pro Ser Glu Val Leu
145 150
Leu Lys Pro Asn Tyr Ser Asn Thr Asn Glu Lys Ser Lys Phe
155
160
165
155
Ile Pro Asn 170 Asn Thr Leu Phe Ser Asn 175 Ala Lys Leu 180 Lys Ala
Asn Ala Asn Arg Asp Thr Asp Arg Asp Gly Ile Pro Asp Glu
185 190 195
Trp Glu Ile Asn Gly Tyr Thr Val Met Asn Gin Lys Ala Val
200 205 210
Ala Trp Asp Asp Lys Phe Ala Ala Asn Gly Tyr Lys Lys Tyr
215 220
Val Ser Asn Pro Phe Lys Pro Cys Thr Ala Asn Asp Pro Tyr
225 230 235
Thr Asp Phe Glu Lys Val Ser Gly Gin Ile Asp Pro Ser Val
240 245 250
Ser Met Val Ala Arg Asp Pro Met Ile Ser Ala Tyr Pro Ile
255 260 265
Val Gly Val Gin Met Glu Arg Leu Val Val Ser Lys Ser Glu
270 275 280
Thr Ile Thr Gly Asp Ser Thr Lys Ser Met Ser Lys Ser Thr
285 290
Ser His Ser Ser Thr Asn Ile Asn Thr Val Gly Ala Glu Val
295 300 305
Ser Gly Ser Leu Gin Leu Ala Gly Gly Ile Phe Pro Val Phe
310 315 320
Ser Met Ser Ala Ser Ala Asn Tyr Ser His Thr Trp Gin Asn
325 330 335
Thr Ser Thr Val Asp Asp Thr Thr Gly Glu Ser Phe Ser Gin
340 345 350
Gly Leu Ser Ile Asn Thr Gly Glu Ser Ala Tyr Ile Asn Pro
355 360
Asn Ile Arg Tyr Tyr Asn Thr Gly Thr Ala Pro Val Tyr Asn
365 370 375
Val Thr Pro Thr Thr Thr Ile Val Ile Asp Lys Gin Ser Val 380 385 390
Ala Thr Ile Lys Gly Gin Glu Ser Leu Ile Gly Asp Tyr Leu 395 400 405
156
Asn Pro Gly Gly Thr 410 Tyr Pro Ile Ile Gly Glu Pro Pro 415 Met 420
Ala Leu Asn Thr Met Asp Gin Phe Ser Ser Arg Leu Ile Pro
425 430
Ile Asn Tyr Asn Gin Leu Lys Ser Ile Asp Asn Gly Gly Thr
435 440 445
Val Met Leu Ser Thr Ser Gin Phe Thr Gly Asn Phe Ala Lys
450 455 460
Tyr Asn Ser Asn Gly Asn Leu Val Thr Asp Gly Asn Asn Trp
465 470 475
Gly Pro Tyr Leu Gly Thr Ile Lys Ser Thr Thr Ala Ser Leu
480 485 490
Thr Leu Ser Phe Ser Gly Gin Thr Thr Gin Val Ala Val Val
495 500
Ala Pro Asn Phe Ser Asp Pro Glu Asp Lys Thr Pro Lys Leu
505 510 515
Thr Leu Glu Gin Ala Leu Val Lys Ala Phe Ala Leu Glu Lys
520 525 530
Lys Asn Gly Lys Phe Tyr Phe His Gly Leu Glu Ile Ser Lys
535 540 545
Asn Glu Lys Ile Gin Val Phe Leu Asp Ser Asn Thr Asn Asn
550 555 560
Asp Phe Glu Asn Gin Leu Lys Asn Thr Ala Asp Lys Asp Ile
565 570
Met His Cys Ile Ile Lys Arg Asn Met Asn Ile Leu Val Lys
575 580 585
Val Ile Thr Phe Lys Glu Asn Ile Ser Ser Ile Asn Ile Ile
590 595 600
Asn Asp Thr Asn Phe Gly Val Gin Ser Met Thr Gly Leu Ser
605 610 615
Asn Arg Ser Lys Gly Gin Asp Gly Ile Tyr Arg Ala Ala Thr
620 625 630
Thr Ala Phe Ser Phe Lys Ser Lys Glu Leu Lys Tyr Pro Glu
635 640
157 • 44 ·· ·· • · 4 4 · · 4
4 4 4
Gly Arg Tyr Arg Met Arg Phe Val
645 650
Phe Thr Cys Asn Phe Lys Leu Phe
660 665
Ser Ser Phe Asp Lys Gly Tyr Tyr
675 680
Tyr Tyr Asn Gly Ser Lys Ser Phe
690
Ile Ile Asn Ser Ile Asn Arg Leu 705
Glu Leu Asp Lys Leu Ile Ile 715 720 <210> 35 <211> 1338 <212> PRT <213> Bacillus cereus <400> 35
Met Lys Arg Met Glu Gly Lys Leu 1 5
Leu Gin Val Val Thr Lys Thr Val 15 20
Ser Ile Ser Leu Leu Asn Asn Glu
35
Leu Asn Ile Asn Ser Gin Ser Lys
50
Leu Lys Ile Thr Asp Lys Val Glu
Glu Lys Ala Lys Glu Trp Gly Lys 75
Lys Leu Thr Ala Thr Glu Lys Gly 85
444 44 444
444 44 444 4444 4* 4444
Ile Gin Ser Tyr Glu Pro 655
Asn Asn Leu Ile Tyr Ser 670
Asp Glu Phe Phe Tyr Phe 685
Phe Asn Ile Ser Cys Asp
695 700
Ser Gly Val Phe Leu Ile 710
Phe Met Val Ser Lys Lys 10
Leu Leu Ser Thr Val Phe
Val Ile Lys Ala Glu Gin 40
Tyr Thr Asn Leu Gin Asn 55
Asp Phe Lys Glu Asp Lys
70
Glu Lys Glu Lys Glu Trp 80
Lys Met Asn Asn Phe Leu
158
Asp Asn 100 Lys Asn Asp Ile Lys Thr Asn Tyr Lys 105 Glu 110 Ile Thr
Phe Ser Ile Ala Gly Ser Phe Glu Asp Glu Ile Lys Asp Leu
115 120 125
Lys Glu Ile Asp Lys Met Phe Asp Lys Thr Asn Leu Ser Asn
130 135 140
Ser Ile Ile Thr Tyr Lys Asn Val Glu Pro Thr Thr Ile Gly
145 150
Phe Asn Lys Ser Leu Thr Glu Gly Asn Thr Ile Asn Ser Asp
155 160 165
Ala Met Ala Gin Phe Lys Glu Gin Phe Leu Asp Arg Asp Ile
170 175 180
Lys Phe Asp Ser Tyr Leu Asp Thr His Leu Thr Ala Gin Gin
185 190 195
Val Ser Ser Lys Glu Arg Val Ile Leu Lys Val Thr Val Pro
200 205 210
Ser Gly Lys Gly Ser Thr Thr Pro Thr Lys Ala Gly Val Ile
215 220
Leu Asn Asn Ser Glu Tyr Lys Met Leu Ile Asp Asn Gly Tyr
225 230 235
Met Val His Val Asp Lys Val Ser Lys Val Val Lys Lys Gly
240 245 250
Val Glu Cys Leu Gin Ile Glu Gly Thr Leu Lys Lys Ser Leu
255 260 265
Asp Phe Lys Asn Asp Ile Asn Ala Glu Ala His Ser Trp Gly
270 275 280
Met Lys Asn Tyr Glu Glu Trp Ala Lys Asp Leu Thr Asp Ser
285 290
Gin Arg Glu Ala Leu Asp Gly Tyr Ala Arg Gin Asp Tyr Lys
295 300 305
Glu Ile Asn Asn Tyr Leu Arg Asn Gin Gly Gly Ser Gly Asn 310 315 320
Glu Lys Leu Asp Ala Gin Ile Lys Asn Ile Ser Asp Ala Leu 325 330 335
159 ··· · · · · * • ·· · · • · · · · · • · · · ·
Gly Lys Lys Pro Ile 340 Pro Glu Asn Ile Thr Val 345 Tyr Arg Trp 350
Cys Gly Met Pro Glu Phe Gly Tyr Gin Ile Ser Asp Pro Leu
355 360
Pro Ser Leu Lys Asp Phe Glu Glu Gin Phe Leu Asn Thr Ile
365 370 375
Lys Glu Asp Lys Gly Tyr Met Ser Thr Ser Leu Ser Ser Glu
380 385 390
Arg Leu Ala Ala Phe Gly Ser Arg Lys Ile Ile Leu Arg Leu
395 400 405
Gin Val Pro Lys Gly Ser Thr Gly Ala Tyr Leu Ser Ala Ile
410 415 420
Gly Gly Phe Ala Ser Glu Lys Glu Ile Leu Leu Asp Lys Asp
425 430
Ser Lys Tyr His Ile Asp Lys Val Thr Glu Val Ile Ile Lys
435 440 445
Gly Val Lys Arg Tyr Val Val Asp Ala Thr Leu Leu Thr Asn
450 455 460
Ser Arg Gly Pro Ser Thr Pro Pro Thr Pro Ser Pro Ser Thr
465 470 475
Pro Pro Thr Pro Ser Asp Ile Gly Ser Thr Met Lys Thr Asn
480 485 490
Gin Ile Ser Thr Thr Gin Lys Asn Gin Gin Lys Glu Met Asp
495 500
Arg Lys Gly Leu Leu Gly Tyr Tyr Phe Lys Gly Lys Asp Phe
505 510 515
Ser Asn Leu Thr Met Phe Ala Pro Thr Arg Asp Ser Thr Leu
520 525 530
Ile Tyr Asp Gin Gin Thr Ala Asn Lys Leu Leu Asp Lys Lys
535 540 545
Gin Gin Glu Tyr Gin Ser Ile Arg Trp Ile Gly Leu Ile Gin
550 555 560
Ser Lys Glu Thr Gly Asp Phe Thr Phe Asn Leu Ser Glu Asp
565
570
160 •· · ·· ·· ·· • · · · · · ♦ ♦· · ·· ♦ · · · • · · ·· · · · ··· ·· ··· ···· ·· ····
Glu Gin Ala Ile Ile Glu Ile Asn Gly Lys Ile Ile Ser Asn
575 580 585
Lys Gly Lys Glu Lys Gin Val Val His Leu Glu Lys Gly Lys
590 595 600
Leu Val Pro 605 Ile Lys Ile Glu Tyr 610 Gin Ser Asp Thr Lys 615 Phe
Asn Ile Asp Ser Lys Thr Phe Lys Glu Leu Lys Leu Phe Lys
620 625 630
Ile Asp Ser Gin Asn Gin Pro Gin Gin Val Gin Gin Asp Glu
635 640
Leu Arg Asn Pro Glu Phe Asn Lys Lys Glu Ser Gin Glu Phe
645 650 655
Leu Ala Lys Pro Ser Lys Ile Asn Leu Phe Thr Gin Gin Met
660 665 670
Lys Arg Glu Ile Asp Glu Asp Thr Asp Thr Asp Gly Asp Ser
675 680 685
Ile Pro Asp Leu Trp Glu Glu Asn Gly Tyr Thr Ile Gin Asn
690 695 700
Arg Ile Ala Val Lys Trp Asp Asp Ser Leu Ala Ser Lys Gly
705 710
Tyr Thr Lys Phe Val Ser Asn Pro Leu Glu Ser His Thr Val
715 720 725
Gly Asp Pro Tyr Thr Asp Tyr Glu Lys Ala Ala Arg Asp Leu
730 735 740
Asp Leu Ser Asn Ala Lys Glu Thr Phe Asn Pro Leu Val Ala
745 750 755
Ala Phe Pro Ser Val Asn Val Ser Met Glu Lys Val Ile Leu
760 765 770
Ser Pro Asn Glu Asn Leu Ser Asn Ser Val Glu Ser His Ser
775 780
Ser Thr Asn Trp Ser Tyr Thr Asn Thr Glu Gly Ala Ser Val
785 790 795
Glu Ala Gly Ile Gly Pro Lys Gly Ile Ser Phe Gly Val Ser
800 805 810
161
Val Asn Tyr Gin His Ser Glu Thr Val Ala Gin 820 Glu Trp 825 Gly
815
Thr Ser Thr Gly Asn Thr Ser Gin Phe Asn Thr Ala Ser Ala
830 835 840
Gly Tyr Leu Asn Ala Asn Val Arg Tyr Asn Asn Val Gly Thr
845 850
Gly Ala Ile Tyr Asp Val Lys Pro Thr Thr Ser Phe Val Leu
855 860 865
Asn Asn Asp Thr Ile Ala Thr Ile Thr Ala Lys Ser Asn Ser
870 875 880
Thr Ala Leu Asn Ile Ser Pro Gly Glu Ser Tyr Pro Lys Lys
885 890 895
Gly Gin Asn Gly Ile Ala Ile Thr Ser Met Asp Asp Phe Asn
900 905 910
Ser His Pro Ile Thr Leu Asn Lys Lys Gin Val Asp Asn Leu
915 920
Leu Asn Asn Lys Pro Met Met Leu Glu Thr Asn Gin Thr Asp
925 930 935
Gly Val Tyr Lys Ile Lys Asp Thr His Gly Asn Ile Val Thr
940 945 950
Gly Gly Glu Trp Asn Gly Val Ile Gin Gin Ile Lys Ala Lys
955 960 965
Thr Ala Ser Ile Ile Val Asp Asp Gly Glu Arg Val Ala Glu
970 975 980
Lys Arg Val Ala Ala Lys Asp Tyr Glu Asn Pro Glu Asp Lys
985 990
Thr Pro Ser Leu Thr Leu Lys Asp Ala Leu Lys Leu Ser Tyr
995 1000 1005
Pro Asp Glu Ile Lys Glu Ile Glu Gly Leu Leu Tyr Tyr Lys
1010 1015 1020
Asn Lys Pro Ile Tyr Glu Ser Ser Val Met Thr Tyr Leu Asp
1025 1030 1035
Glu Asn Thr Ala Lys Glu Val Thr Lys Gin Leu Asn Asp Thr
1040 1045 1050
162 ·· ·· ·· • · ···· » »♦ ·« · · ♦ · • · * ♦ »♦♦·· • · · · · · · ·· ··· ··<· ·♦ ···
Thr Gly Lys Phe Lys Asp 1055 Val Ser His Leu Tyr Asp Val 1060 Lys
Leu Thr Pro Lys Met Asn Val Thr Ile Lys Leu Ser Ile Leu
1065 1070 1075
Tyr Asp Asn Ala Glu Ser Asn Asp Asn Ser Ile Gly Lys Trp
1080 1085 1090
Thr Asn Thr Asn Ile Val Ser Gly Gly Asn Asn Gly Lys Lys
1095 1100 1105
Gin Tyr Ser Ser Asn Asn Pro Asp Ala Asn Leu Thr Leu Asn
1110 1115 1120
Thr Asp Ala Gin Glu Lys Leu Asn Lys Asn Arg Asp Tyr Tyr
1125 1130
Ile Ser Leu Tyr Met Lys Ser Glu Lys Asn Thr Gin Cys Glu
1135 1140 1145
Ile Thr Ile Asp Gly Glu Ile Tyr Pro Ile Thr Thr Lys Thr
1150 1155 1160
Val Asn Val Asn Lys Asp Asn Tyr Lys Arg Leu Asp Ile Ile
1165 1170 1175
Ala His Asn Ile Lys Ser Asn Pro Ile Ser Ser Leu His Ile
1180 1185 1190
Lys Thr Asn Asp Glu Ile Thr Leu Phe Trp Asp Asp Ile Ser
1195 1200
Ile Thr Asp Val Ala Ser Ile Lys Pro Glu Asn Leu Thr Asp
1205 1210 1215
Ser Glu Ile Lys Gin Ile Tyr Ser Arg Tyr Gly Ile Lys Leu
1220 1225 1230
Glu Asp Gly Ile Leu Ile Asp Lys Lys Gly Gly Ile His Tyr
1235 1240 1245
Gly Glu Phe Ile Asn Glu Ala Ser Phe Asn Ile Glu Pro Leu
1250 1255 1260
Gin Asn Tyr Val Thr Lys Tyr Glu Val Thr Tyr Ser Ser Glu
1265 1270
Leu Gly Pro Asn Val Ser Asp Thr Leu Glu Ser Asp Lys Ile
1275
1280
1285
163
• ♦
·· • » • ·
Tyr Lys Asp Gly Thr Ile Lys Phe Asp Phe Thr Lys Tyr Ser
1290 1295 1300
Lys Asn Glu Gin Gly Leu Phe Tyr Asp Ser Gly Leu Asn Trp
1305 1310 1315
Asp Phe Lys Ile Asn Ala Ile Thr Tyr Asp Gly Lys Glu Met
1320 1325 133
Asn Val Phe His Arg Tyr Asn Lys
1335
164
3>V UtV0 00 »00 «0 ··
0 0 0 «00 · · 00
00 « 0 0 0 0
0 0 « 000 0 « 000 «0 000
000 00 000 000· 0« 00«0

Claims (27)

  1. PATENTOVÉ
    NÁROKY
    1. Skupina B z binárního, pór tvořícího toxinu A-B, přičemž tato skupina obsahuje mutaci, která inhibuje její schopnost tvořit pór, přičemž tato mutace není vynechání aminokyselin 302 až 325 ochranného antigenu antraxu - sekvence id. č. 12.
  2. 2. Skupina B podle nároku 1, kdy tato skupina B je ochranný antigen antraxu.
  3. 3. Skupina B podle nároku 1, kdy tato skupina B postrádá schopnost tvorby póru.
  4. 4. Skupina B podle nároku 1, která má aminokyselinovou sekvenci, která je alespoň z 80 % stejná jako sekvence id. č. 21, a obsahuje změnu vybranou ze skupiny sestávající z:
    a) K397A,
    b) K397D,
    c) K397C,
    d) K397Q,
    e) D425A,
    f) D425N,
    g) D425E,
    h) D425K,
    i) F427A,
    j) K397 + D425K dvojité mutace,
    k) K3 95D + K397D + D425K + D426K čtyřnásobné mutace, 1) K3 97D + D425K + F427A trojité mutace, m) F427A + AD2L2 dvojité mutace, n) K397D + F427A + ŮD2L2 trojité mutace, o) K397D + D425K + F427A + ŮD2L2 čtyřnásobné mutace, p) F427D a
    q) F427K.
    165
  5. 5. Očkovací prostředek, vyznačující se tím, že obsahuje skupinu B z binárního, pór tvořícího toxinu A-B nebo její fragment ve farmaceuticky přijatelném nosiči, přičemž skupina B obsahuje mutaci, která inhibuje její schopnost tvořit pór.
  6. 6. Očkovací vyznačuj ící antigen antraxu.
  7. 7. Očkovací vyznačuj ící prostředek podle nároku 5, se t í m, že skupina B je ochranný prostředek podle nároku 5, se tím, že skupina B je deaktivována chemickými nebo fyzikálními prostředky.
  8. 8. Způsob prevence bakteriální infekce u savce, vyznačující se tím, že zahrnuje podávání očkovací látky obsahující skupinu B z binárního, pór tvořícího toxinu A-B nebo její fragment ve farmaceuticky přijatelném nosiči, přičemž skupina B obsahuje mutaci, která inhibuje její schopnost tvořit pór, savci.
  9. 9. Způsob léčení bakteriální infekce u savce, vyznačující se tím, že zahrnuje podávání očkovací látky obsahující skupinu B z binárního, pór tvořícího toxinu A-B nebo její fragment ve farmaceuticky přijatelném nosiči, přičemž skupina B obsahuje mutaci, která inhibuje její schopnost tvořit pór, savci.
  10. 10. Způsob podle nároku 8 nebo 9, vyznačující se t í m, že se tato očkovací látka podává s adjuvans.
  11. 11. Mutantní skupina B z binárního, pór tvořícího toxinu A-B, kdy tato mutantní skupina B obsahuje mutaci, která
    166
    4· • » inhibuje její schopnost tvořit pór, a tato mutantní skupina B inhibuje schopnost tvořit pór u skupiny B přirozeného typu tohoto toxinu.
  12. 12. Mutantní skupina B podle nároku 11, kdy tato mutantní skupina B je ochranný antigen antraxu.
  13. 13. Mutantní skupina B podle nároku 12, která má schopnost vázat letální faktor nebo edémový faktor.
  14. 14. Mutantní skupina B podle nároku 11, která má schopnost soutěžit se skupinou B přirozeného typu o vazbu k receptoru na povrchu savčí buňky.
  15. 15. Mutantní skupina B podle nároku 11, která má schopnost vázat skupinu B přirozeného typu.
  16. 16. Mutantní skupina B podle nároku 11, která má schopnost oligomerizovat se skupinou B přirozeného typu tak, že vznikne komplex, který má sníženou schopnost tvořit pór.
  17. 17. Mutantní skupina B podle nároku 16, kdy tento komplex postrádá schopnost tvořit pór.
  18. 18. Mutantní skupina B podle nároku 11, která má aminokyselinovou sekvenci, která je alespoň z 80 % stejná jako sekvence id. č. 21, a obsahuje změnu vybranou ze skupiny sestávající z:
    a) K397D + D425K dvojité mutace,
    b) AD2L2,
    c) K395D + K397D + D425K + D426K čtyřnásobné mutace,
    d) D425K,
    e) F427A,
    f) K397D + D425K + F427A trojité mutace, • ·
    16Ί ·· ···· · · · ·· · · · · · ··· * · · · · · • · · 9 · · · ··· ·· ··♦··«« ·♦ ··♦·
    g) F427A + AD2L2 dvojité mutace,
    h) K397D + F427A + ÁD2L2 trojité mutace,
    i) K397D + D425K + F427A + AD2L2 čtyřnásobné mutace,
    j) F427D a
    k) F427K.
  19. 19. Mutantní skupina B podle nároku 11 obsahující vynechání alespoň 5 aminokyselin ze smyčky D2L2.
  20. 20. Způsob prevence bakteriální infekce u savce, vyznačující se tím, že zahrnuje podávání mutantní skupiny B z binárního, pór tvořícího toxinu A-B nebo jejího fragmentu, přičemž skupina B obsahuje mutaci, která inhibuje její schopnost tvořit pór, a tato mutantní skupina B inhibuje schopnost tvořit pór u skupiny B přirozeného typu tohoto toxinu, savci.
  21. 21. Způsob léčení bakteriální infekce u savce, vyznačující se tím, že zahrnuje podávání mutantní skupiny B z binárního, pór tvořícího toxinu A-B nebo jejího fragmentu, přičemž skupina B obsahuje mutaci, která inhibuje její schopnost tvořit pór, a tato mutantní skupina B inhibuje schopnost tvořit pór u skupiny B přirozeného typu tohoto toxinu, savci.
  22. 22. Způsob podle nároku 8, 9, 20 nebo 21, ve kterém skupina B nebo mutantní skupina B je ochranný antigen antraxu a bakteriální infekce je infekce antraxem.
  23. 23. Způsob podle nároku 8, 9, 20 nebo 21, který dále zahrnuje podávání protilátky, která váže skupinu B přirozeného typu, savci.
    168 • »* w *· ·· ·* ·· t · ·« · · · · · • ·· » · · · · • · · · · ···· · ··· »· e < · »*· ·· *·· ···· ·* ♦···
  24. 24. Způsob podle nároku 8, 9, 20 nebo 21, ve kterém savec je člověk.
  25. 25. Způsob podle nároku 24, ve kterém byl savec vystaven sporám B. anthracis.
  26. 26. Čištěná protilátka, která specificky váže skupinu B přirozeného typu z binárního, pór tvořícího toxinu A-B s vyšší afinitou než mutantní skupina B tohoto toxinu, přičemž tato mutantní skupina B obsahuje mutaci, která inhibuje její schopnost tvorby póru.
  27. 27. Protilátka podle nároku 26, ve které tato mutantní skupina B inhibuje schopnost tvorby póru u skupiny B přirozeného typu tohoto toxinu.
CZ20023662A 2000-05-04 2001-05-04 Sloučeniny a způsoby léčení a prevence bakteriální infekce CZ20023662A3 (cs)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US20180000P 2000-05-04 2000-05-04

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CZ20023662A3 true CZ20023662A3 (cs) 2003-04-16

Family

ID=22747352

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ20023662A CZ20023662A3 (cs) 2000-05-04 2001-05-04 Sloučeniny a způsoby léčení a prevence bakteriální infekce

Country Status (15)

Country Link
US (1) US7037503B2 (cs)
EP (1) EP1278764A4 (cs)
JP (1) JP2003531841A (cs)
KR (1) KR20030019366A (cs)
CN (1) CN1440419A (cs)
AU (1) AU2001261171A1 (cs)
CA (1) CA2407443A1 (cs)
CZ (1) CZ20023662A3 (cs)
HU (1) HUP0301658A2 (cs)
IL (1) IL152553A0 (cs)
MX (1) MXPA02010826A (cs)
NO (1) NO20025204L (cs)
PL (1) PL365453A1 (cs)
WO (1) WO2001082788A2 (cs)
ZA (1) ZA200208835B (cs)

Families Citing this family (26)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6455673B1 (en) * 1994-06-08 2002-09-24 President And Fellows Of Harvard College Multi-mutant diphtheria toxin vaccines
AU2002239229A1 (en) * 2000-12-05 2002-06-18 Wisconsin Alumni Research Foundation Receptor for b. anthracis toxin
US7763451B2 (en) 2001-11-09 2010-07-27 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Methods for preparing Bacillus anthracis protective antigen for use in vaccines
IL162381A0 (en) 2001-12-05 2005-11-20 Rakesh Bhatnagar A recombinant dna construct and a process for the preparation of a non-toxic anthrax vaccine
US20040258699A1 (en) * 2002-02-11 2004-12-23 Bowdish Katherine S. Immunotherapeutics for biodefense
US20040009178A1 (en) * 2002-02-11 2004-01-15 Bowdish Katherine S. Immunotherapeutics for biodefense
US7201912B2 (en) * 2002-04-12 2007-04-10 Emergent Biodefense Operation Lansing Inc. Recombinant immunogenic compositions and methods for protecting against lethal infections from Bacillus anthracis
AU2003256289A1 (en) 2002-06-26 2004-01-19 Human Genome Sciences, Inc. Modified shine-dalgarno sequences and methods of use thereof
US7601351B1 (en) 2002-06-26 2009-10-13 Human Genome Sciences, Inc. Antibodies against protective antigen
EP1575505A4 (en) * 2002-09-10 2007-01-24 Vical Inc CODON OPTIMIZATION-BASED POLYNUCLEOTIDE VACCINES AGAINST BACILLUS ANTHRACIS INFECTION
WO2005004791A2 (en) * 2002-11-08 2005-01-20 President And Fellows Of Harvard College Compounds and methods for the treatment and prevention of bacterial infection
US20060014248A1 (en) * 2003-01-06 2006-01-19 Xencor, Inc. TNF super family members with altered immunogenicity
US20050130892A1 (en) * 2003-03-07 2005-06-16 Xencor, Inc. BAFF variants and methods thereof
US7553930B2 (en) * 2003-01-06 2009-06-30 Xencor, Inc. BAFF variants and methods thereof
US20050221443A1 (en) * 2003-01-06 2005-10-06 Xencor, Inc. Tumor necrosis factor super family agonists
AU2004246999B2 (en) * 2003-02-06 2010-06-10 Aduro Biotech, Inc., Listeria attenuated for entry into non-phagocytic cells, vaccines comprising the listeria, and methods of use thereof
US7695725B2 (en) * 2003-02-06 2010-04-13 Aduro Biotech Modified free-living microbes, vaccine compositions and methods of use thereof
US7833775B2 (en) * 2003-02-06 2010-11-16 Aduro Biotech Modified free-living microbes, vaccine compositions and methods of use thereof
US7842289B2 (en) * 2003-12-24 2010-11-30 Aduro Biotech Recombinant nucleic acid molecules, expression cassettes, and bacteria, and methods of use thereof
US20100003276A1 (en) * 2004-12-07 2010-01-07 Hermes Jeffery D Methods for treating anthrax and inhibiting lethal factor
US20080206276A1 (en) * 2005-07-08 2008-08-28 Michael Otto Targeting Poly-Gamma-Glutamic Acid to Treat Staphylococcus Epidermidis and Related Infections
AU2007259329A1 (en) * 2006-05-12 2007-12-21 Farris, Darise Anthrax compositions and methods of use and production
WO2009126355A2 (en) * 2008-01-28 2009-10-15 Baxter International, Inc. Methods of increasing recombinant production of bacillus anthracis protective antigen
US20110110968A1 (en) * 2009-11-12 2011-05-12 Stanley Goldman Human optimized Bacillus anthracis protective antigen
PE20141029A1 (es) 2011-04-22 2014-09-04 Wyeth Llc Composiciones relacionadas con una toxina de clostridium difficile mutante y sus metodos
BR122016023101B1 (pt) 2012-10-21 2022-03-22 Pfizer Inc Polipeptídeo, composição imunogênica que o compreende, bem como célula recombinante derivada de clostridium difficile

Family Cites Families (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5792458A (en) * 1987-10-05 1998-08-11 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Mutant diphtheria toxin conjugates
US5591631A (en) 1993-02-12 1997-01-07 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Anthrax toxin fusion proteins, nucleic acid encoding same
US5677274A (en) * 1993-02-12 1997-10-14 The Government Of The United States As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services Anthrax toxin fusion proteins and related methods
US5917017A (en) * 1994-06-08 1999-06-29 President And Fellows Of Harvard College Diphtheria toxin vaccines bearing a mutated R domain
US6455673B1 (en) * 1994-06-08 2002-09-24 President And Fellows Of Harvard College Multi-mutant diphtheria toxin vaccines
AU720857B2 (en) 1995-12-13 2000-06-15 President And Fellows Of Harvard College Use of toxin peptides and/or affinity handles for delivery compounds into cells
GB9618107D0 (en) * 1996-08-30 1996-10-09 Secr Defence Vaccine production
AU2771099A (en) 1998-02-18 1999-09-06 President And Fellows Of Harvard College Inhibition of toxin translocation
US6426231B1 (en) * 1998-11-18 2002-07-30 The Texas A&M University System Analyte sensing mediated by adapter/carrier molecules
US6413768B1 (en) * 1998-12-02 2002-07-02 University Of Maryland Expression plasmids
US6329156B1 (en) * 1999-03-22 2001-12-11 The Regents Of The University Of California Method for screening inhibitors of the toxicity of Bacillus anthracis

Also Published As

Publication number Publication date
US20020039588A1 (en) 2002-04-04
US7037503B2 (en) 2006-05-02
WO2001082788A2 (en) 2001-11-08
CA2407443A1 (en) 2001-11-08
ZA200208835B (en) 2004-02-09
PL365453A1 (en) 2005-01-10
WO2001082788A3 (en) 2002-07-25
NO20025204L (no) 2002-12-16
WO2001082788A9 (en) 2002-12-19
IL152553A0 (en) 2003-05-29
EP1278764A2 (en) 2003-01-29
NO20025204D0 (no) 2002-10-30
CN1440419A (zh) 2003-09-03
HUP0301658A2 (hu) 2003-08-28
MXPA02010826A (es) 2006-03-09
EP1278764A4 (en) 2004-05-19
KR20030019366A (ko) 2003-03-06
JP2003531841A (ja) 2003-10-28
AU2001261171A1 (en) 2001-11-12

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CZ20023662A3 (cs) Sloučeniny a způsoby léčení a prevence bakteriální infekce
Barth et al. Binary bacterial toxins: biochemistry, biology, and applications of common Clostridium and Bacillus proteins
US8067015B2 (en) Methods and compositions for the treatment and prevention of Staphylococcus and other bacterial infections
KR20130093084A (ko) 단백질 A(SpA) 변이체와 관련된 조성물 및 방법
EP1037650B1 (en) Compositions for the treatment of staphylococcus aureus infections
WO2013022808A2 (en) Immunogenic protein conjugates and methods for making and using the same
ES2296694T3 (es) Diana de la proteina de activacion de arniii (trap).
US7534857B2 (en) Methods and compositions for the treatment and prevention of staphylococcal infections
US20130243779A1 (en) Peptides protective against e. faecalis, methods and uses relating thereto
US20220288183A1 (en) Vaccine constructs and uses thereof against staphylococcus infections
US20120321687A1 (en) Compositions and methods for using and identifying antimicrobial agents
WO2005004791A2 (en) Compounds and methods for the treatment and prevention of bacterial infection
WO2005023851A1 (en) Plasminogen/plasmin binding polypeptides and nucleic acids therefore
EP1980267A1 (en) S. pneumoniae transcytosis protein
KR101680052B1 (ko) 탄저병의 예방 또는 치료를 위한 약제학적 조성물
US20090123458A1 (en) Protective Antigen Having Fluorinated Histidine Residues
Himanen et al. The 20 kDa C-terminally truncated form of pertussis toxin subunit S1 secreted from Bacillus subtilis
US20170087239A1 (en) Polypeptides Derived from Enterococcus and Their Use for Vaccination and the Generation of Therapeutic Antibodies
Stiles Binary Bacterial Toxins: Biochemistry
Saliba The development and characterization of murine monoclonal antibodies raised to recombinant protective antigen toxin of Bacillus anthracis