CS273182B2 - Method of expressive vector production capable to give mature human leucocytic interferon in transformed strain of escherichia coli by means of expression - Google Patents

Method of expressive vector production capable to give mature human leucocytic interferon in transformed strain of escherichia coli by means of expression Download PDF

Info

Publication number
CS273182B2
CS273182B2 CS362787A CS362787A CS273182B2 CS 273182 B2 CS273182 B2 CS 273182B2 CS 362787 A CS362787 A CS 362787A CS 362787 A CS362787 A CS 362787A CS 273182 B2 CS273182 B2 CS 273182B2
Authority
CS
Czechoslovakia
Prior art keywords
interferon
lelf
coli
fragment
plasmid
Prior art date
Application number
CS362787A
Other languages
Czech (cs)
Other versions
CS362787A2 (en
Inventor
David Van Norman Goeddel
Sidney Pestka
Original Assignee
Hoffmann La Roche
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from US06/256,204 external-priority patent/US6610830B1/en
Priority claimed from CS503781A external-priority patent/CS273152B2/en
Application filed by Hoffmann La Roche filed Critical Hoffmann La Roche
Priority to CS362787A priority Critical patent/CS273182B2/en
Publication of CS362787A2 publication Critical patent/CS362787A2/en
Publication of CS273182B2 publication Critical patent/CS273182B2/en

Links

Landscapes

  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Abstract

A method of production of an expressive vector capable in a transformed Escherichia coli strain of producing mature human leukocytic interferon with a partial amino acid sequence Cys-Ala-Trp-Glu-Val-Val-Arg-Ala-Glu-Ile-Met-Arg-Ser with 165 to 166 amino acids and with the amino acid Asp, Glu or Val in position 114 or, if methionine is linked to the N-terminal of the first amino acid of the abovementioned interferon, with 166 to 167 amino acids and with the amino acid Asp, Glu or Val in position 115, based on the fact that a) an E. coli vector is engineered containing an E. coli trp promoter, operator and trp leader of the ribosome binding point, b) a DNA fragment is prepared coding mature human leukocytic interferon, selected from a group consisting of human leukocytic interferon (LeIF) A, B, C, D, F, H, I and J, c) the abovementioned DNA fragment human leukocytic interferon is inserted in the direction of the fibre from the E. coli trp promoter, operator and trp leader of the ribosome binding point, whereby an E. coli expressive vector is acquired able, by expression in E. coli, to mature human leukocytic interferon.

Description

Tento vynález ee týká oblasti technologie rekombinantni ONA, tj. způsobů používaných ve zmíněné technologii rekombinantni ONA a produktů získaných těmito způsoby.The present invention relates to the field of recombinant ONA technology, i.e., the methods used in said recombinant ONA technology and the products obtained by these methods.

Tento vynález ee zvláště týká způsobu přípravy replikovatelného expresního vektoru, který obsahuje ONA sekvence zahrnující sekvenci kódující zralý lidský leukocytárni interferon s částečnou aminokyselinovou sekvenci Cye-Ala-Trp-Glu-Val-Val-Arg-Glu-Ile-Met-Arg-Ser, se 165 až 166 aminokyselinami a s aminokyselinou Asp, Glu nebo Val v poloze 114 nebo, jestliže na N-konec prvé aminokyseliny shora uvedeného interferonů je napojen methionin, ee 166 až 167 aminokyselinami a s aminokyselinou Asp, Glu nebo Val v poloze 115, vyznačující se tím, že se zkonstruuje první ONA sekvence kódující shora uvedený zralý interferon a odštěpitelně napojenou shora uvedenou schopnou uskutečňovat bateriálni expresi shora uvedeného interferonů.In particular, the invention relates to a method for preparing a replicable expression vector comprising ONA sequences comprising a sequence encoding mature human leukocyte interferon with a partial amino acid sequence of Cye-Ala-Trp-Glu-Val-Val-Arg-Glu-Ile-Met-Arg-Ser, having 165 to 166 amino acids and having amino acid Asp, Glu or Val at position 114 or, if the N-terminus of the first amino acid of the above interferon is methionine, ee 166 to 167 amino acids and having amino acid Asp, Glu or Val at position 115, by constructing a first ONA sequence encoding the aforementioned mature interferon and operably linked to the aforesaid capable of effecting the battery expression of the aforementioned interferons.

Lidský leukocytárni interferon (LelF) byl poprvé objeven a připraven ve formě velmi surových sraženin Isaacsem a Lindenmannem (Proč. R. Soc. B 147. 258 až 2B7 (1957) a USA patent 3 699 222). Od té doby pokračuje snaha o vyčištěni a charakterizaci tohoto materiálu. Toto úsilí vadlo k přípravě relativně homogenních leukocytárnlch interferonů získaných z normálních nebo leukemických donorekých leukocytů (NSR patentový zveřejňovaci spis č. 2 947 134). Tyto interferony tvoří skupinu bílkovin, o kterých je známo, že mají schopnost udělovat svým cílovým buňkám reai8tanci vůči virům.Human leukocyte interferon (LelF) was first discovered and prepared in the form of very crude precipitates by Isaacs and Lindenmann (Proc. R. Soc. B 147. 258-2B7 (1957) and U.S. Pat. No. 3,699,222). Since then, efforts have been made to clean and characterize this material. These efforts have led to the preparation of relatively homogeneous leukocyte interferons derived from normal or leukemic donor leukocytes (German Patent Publication No. 2,947,134). These interferons form a family of proteins known to have the ability to confer viral reactivity on their target cells.

Interferon může dále působit inhibičně na prolifereci buněk a modulovat imunitní odpověď. Tyto vlastnosti interferonů inspirovaly jejich klinické použití jako terapeutických prostředků pro léčeni virových infekci a maligních onemocněni.Furthermore, interferon may inhibit cell proliferation and modulate the immune response. These properties of interferons have inspired their clinical use as therapeutic agents for the treatment of viral infections and malignancies.

Leukocytárni interferony byly vyčištěny až v podstatě do homogenního stavu /viz Rubinstein a spolupracovnici, Proč. Nati. Acad. Sci. USA 76, 640-644 (1979); Zeon a spolupracovníci, tamtéž, 76, 5601-5605 (1969)/, a jejich uváděné molekulární hmotnosti sa pohybuji v rozmezí od asi 17500 do asi 21000. Specifická aktivita těchto preparátů ja pozoruhodně vysoká, 2 x 10 až 1 x 10 jednotek na mg bílkoviny, ale výtěžky metod používajících buněčných kultur jeou odrazujícím způsobem nízké. Přeeto pokroky v pracovních technikách pro stanovováni bilkovinových sekvenci dovolily určení částečných sladů aminokyselin v těchto interferonech /viz Zeon a spolupracovnici. Science 207, 527 (1980); Levý a spolupracovníci, Proč. Nati. Acad. Sci. USA 77; 5102-5104 (1980)/. Objasněni glykosylace různých leukocytárních interferonů není ještě v současné době úplné, ale již nyní je zřejmé, že rozdíly v gylkosylacl mezi jednotlivými členy skupiny nevysvětluji samy o sobě spektrum pozorovaných molekulových hmotnosti. Leukocytárni interferony se mimo to zjevně liči ve složení a pořadí aminokyselin, a shodnost aminokyselin jest v některých případech nižši než 80 %.Leukocyte interferons have been purified to a substantially homogeneous state / see Rubinstein et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA 76: 640-644 (1979); Zeon et al., Ibid., 76, 5601-5605 (1969)], and their reported molecular weights ranging from about 17500 to about 21000. The specific activity of these preparations is remarkably high, 2 x 10 to 1 x 10 units per mg but the yields of cell culture methods are discouragingly low. Thus, advances in working methods for determining protein sequences have allowed the determination of partial amino acid malts in these interferons (see Zeon et al.). Science 207,527 (1980); Left and coworkers, Why. Nati. Acad. Sci. USA 77; 5102-5104 (1980)]. The clarification of the glycosylation of the various leukocyte interferons is not yet complete, but it is already clear that the differences in gylcosylac between the members of the group do not in themselves explain the spectrum of observed molecular weights. In addition, leukocyte interferons apparently differ in amino acid composition and order, and the amino acid identity is in some cases less than 80%.

Zatím co isolace interferonů z donorských leukocytů zajistila materiál postačující k částečné charakterizaci a k omezených klinickým studiím 8 homogenním leukocytárním interferonem, je tento zdroj zcela nedostatečným pro získáváni interferonů v množstvích potřebných pro jeho klinické zkoušení v širokém rozsahu a pro jeho rozsáhlé použiti k profylaktickým a/nebo terapeutickým účelům. Současné klinické výzkumy používající intarfanony získané z lidských leukocytů k testováni jejich antineoplastického a antivirového účinku se vskutku principiálně omezily jen na surové preparáty (o čistotě menší než 1%) a dlouhé doby potřebné pro výrobu dostatečných množství epolu e nereálnou výškou cen kriticky zdržely výzkum na široké frontě.While the isolation of interferons from donor leukocytes has provided material sufficient for partial characterization and limited clinical studies 8 with homogeneous leukocyte interferon, this source is totally inadequate for obtaining interferons in the amounts required for its wide-scale clinical trial and for its extensive use for prophylactic and / or therapeutic purposes. Indeed, recent clinical trials using intarfanones derived from human leukocytes to test their antineoplastic and antiviral effects have in principle been limited to raw preparations (less than 1% purity) and the long time required to produce sufficient amounts of epole at unrealistic price levels has critically delayed research front.

Nástup technologie rekombinaca ONA umožnil kontrolovanou mikrobiální produkci enormní řady užitečných polypeptidů, V současné době jsou již k dispozici bakterie modifikované touto technologií umožňující výrobu takových polypeptidických produktů jako jsou eomatostatin, A a B řetězce lidského insulinu a lidský růstový hormon /viz Itakura se spolupracovníky, Science 198, 1056-1063 (1977); Goaddal ae spolupracovníky. Nátuře 281, 544-548 (1979)/, Nověji bylo technologii rekombinace ONA použito k bakteriální produkci proinaulinu a thymoeinu alfa 1, a řada autorů referuje, ža nalezli DNA kódováni pro lidský leukocy rs, •qThe advent of ONA recombination technology has enabled controlled microbial production of an enormous range of useful polypeptides. Bacteria modified by this technology are already available to produce such polypeptide products such as eomatostatin, A and B chains of human insulin and human growth hormone / see Itakura et al. 198, 1056-1063 (1977); Goaddal ae coworkers. Nature 281, 544-548 (1979)], More recently, ONA recombination technology has been used for bacterial production of proinaulin and thymoeine alpha 1, and many authors report finding DNA coded for human leukocyte rs, q

ŘŘ

CS 273 182 B2 tárni interferon a že vzniklé bílkoviny měly účinnost leukoeytárního interferonu (Nagata a spolupracovnici, Nátuře 284, 316-320 (1980); Mantei a spolupracovnici, Gene 10,CS 273 182 B2 tare interferon and that the resulting proteins had the activity of leukoeytar interferon (Nagata et al., Nature 284, 316-320 (1980); Mantei et al., Gene 10,

1-10 (1980); Tanlguchi a spolupracovnici. Nátuře 285, 647-549 (1980)/,1-10 (1980); Tanlguchi and coworkers. Nature 285, 647-549 (1980)],

Výkonným útvarem při technologii rekombinace ONA je plasmid, chromosomO proetó smyčka dvouvláknové ONA nalezená v bakteriích a v jiných mikrobech, často v mnohonásobných kopiích v Jedné bakteriální buňce. V informaci zakódované v plasmidické DNA Jest včleněna informace potřebná k reprodukci plasmidů do dceřinných buněk (tzv. replikon) a obvykle Jedna nebo více selekčních charakteristik, jako je v ořipadě bakterii rezistence vůči antibiotikům, která dovoluje, že klony hostitelské buňky obsahující plasmid, který Je předmětem naěeho zájmu mohou být rozpoznány, vybrány a přednostně pěstovány v selektivním růstovém prostředí. Užitečnost bakteriálních plasmidů spočívá vs skutečnosti, že Js lze specificky štěpit jednou nebo druhou reetrikčni endonukleásou neboli restrikčním enzymem, přičemž každé z těchto endonukieáz rozpoznává na plasmidické DNA odlišné místo štěpeni. Po rozštěpeni lze do plasmidů vpravit cizorodé (hetarologni) gsny nebo fragmenty genů bu3 přímým připojením v místě rozštěpeni nsbo připojeni na rekonstruovaných koncích sousedících s místem rozštěpeni. Rekombinace DNA se provádí vně buněk, ale vzniklý rekomblnováný plasmid lzs zavést do bakteriálních buněk postupem známým jako transformace a kultivaci získaného transformantu lze připravit velká množstvi rskom binovaného plasmidů obsahujícího heterologni gsn. Kromě toho, podle toho kam se gen vhod ně zavede vzhledem k částem plasmidů; které řídi transkripci (přepis) a translaci (překlad) zakódovaných ONA informaci, lze získaný exprese schopný nosič použit k aktuální produkci polypeptidické sekvence, pro kterou js vestavěný gen kódován; tento postup ss v popisu vynálezu označuje jako exprese.A powerful feature in ONA recombination technology is the plasmid, the chromosome O proeto loop of double-stranded ONA found in bacteria and other microbes, often in multiple copies in a single bacterial cell. The information encoded in the plasmid DNA incorporates the information needed to reproduce the plasmids into the daughter cells (the so-called replicon) and usually one or more selection characteristics, such as antibiotic resistance bacteria, which allows the host cell clones containing the plasmid that is of interest may be recognized, selected and preferably grown in a selective growth environment. The usefulness of bacterial plasmids lies in the fact that Js can be specifically cleaved by one or the other of a reetric endonuclease or restriction enzyme, each of which recognizes a different cleavage site on the plasmid DNA. After cleavage, foreign (hetarologic) genes or gene fragments can be introduced into the plasmids either by direct attachment at the cleavage site or by attachment at the reconstructed ends adjacent to the cleavage site. DNA recombination takes place outside the cells, but the resulting recombined plasmid ls can be introduced into bacterial cells by a method known as transformation and cultivation of the resulting transformant can produce large quantities of rhombined plasmids containing heterologous gsn. In addition, depending on where the gene is suitably introduced with respect to plasmid portions; which directs the transcription and translation of the encoded ONA information, the obtained expression capable carrier can be used to actually produce the polypeptide sequence for which the built-in gene is encoded; this procedure is referred to as expression in the description of the invention.

Exprese je iniciována v oblasti známé jako promotor, která js rozpoznávána a na kterou ss připojuje RNA-polymsraza. V některých případech, jako v případu tryptofanového (trp) promotoru, kterého se s výhodou používá při praktickém prováděni způsobu podle tohoto vynálezu, jsou oblasti promotoru překryty oblastmi operátoru a vytváří es kombinovaný promotor-operátor. Operátory jeou sekvence DNA; které Jsou rozpoznávány tak zvanými reprssorovýml bílkovinami, které slouží k regulováni frekvence iniciace transkripce u specifického promotoru. Polymeróza ee pohybuje podél řetězce DNA, transkribuje informace obsažené v kódovacím· vláknu DNA a jeho 5* konce na 3'konec informační kyseliny ribonukleové (m-RNA) a tyto informace se ihned překládají do polypeptidické sekvence, která má takové pořadí aminokyselin; pro které js příslušná DNA kódována. Každá aminokyselina je zakódovaná jediným tripletem nukleotidů, neboli kodonem,’ pro který je v popisu vynálezu používán termín strukturální gen a který označuje tu část DNA, ve které je zakódované aminokyselinová sekvence exprimovaného paptldického produktu. Poté, co sa RNA polymeróza naváže na promotor, transkribujenejprve nukleotidy kódováním riboaomovóho vazebného místa, pak dojde k iniciaci translace neboli k signálu start (obyčejně kodonem ATG, který se ve vzniklé m-RNA stane AUG) a poté k translaci nuklsotidických kodonů uvnitř samotného strukturálního genu. Na konci strukturálního genu ss tranekribuji tak zvané stop-kodony a polymsráza může poté vytvářet další sekvenci m-RNA která vzhledem k přítomnosti stop-signálu zůstává nepřeložena ribosomy. Ribosomy se naváži na vazebné místo připravené na m-RNA, v bakteriích obvykle poté, co se m-RNA vytvoří, a samy produkuji zakódované polypeptidy, počínaje start signálem translace a konče shora zmíněným etop signálem. Žádaný produkt se tvoři jen tehdy, když jsou sekvence kódu jící vazebné místo ribosomů umístěny správně vzhledem k AUG iniciačnímu kodonu a když všechny zbývající kodony následuji zá iniciačním kodonem ve správné fázi. Vzniklý produkt lze získat lysou hostitelské buňky a jeho oddělením od ostatních bakteriálních bílkovin vhodnou čistící metodou.Expression is initiated in a region known as a promoter, which is recognized and to which it attaches RNA-polymase. In some cases, as in the case of the tryptophan (trp) promoter, which is preferably used in the practice of the method of the invention, the promoter regions are overlapped by the operator regions to form the ε combined promoter-operator. Operators are DNA sequences; which are recognized by so-called repressor proteins, which serve to regulate the frequency of transcription initiation at a specific promoter. Polymerose ee moves along the DNA strand, transcribes the information contained in the DNA coding strand and its 5 'end to the 3' end of the ribonucleic acid information (m-RNA), and this information is immediately translated into a polypeptide sequence having such an amino acid sequence; for which the respective DNA is encoded. Each amino acid is encoded by a single nucleotide triplet, or codon, for which the term structural gene is used in the description of the invention and which designates that part of the DNA in which the amino acid sequence of the expressed peptide product is encoded. After the RNA polymerose binds to the promoter, it first transcribes the nucleotides by encoding the riboaomal binding site, then initiates translation or the start signal (usually the ATG codon, which becomes AUG in the resulting m-RNA), and then translates the nucleoside codons within the structural itself. gene. At the end of the structural gene, they transcribe the so-called stop codons, and the polymase may then form another sequence of m-RNA which, due to the presence of the stop signal, remains untranslated by ribosomes. Ribosomes bind to the m-RNA-prepared binding site, in bacteria usually after m-RNA is formed, and produce the encoded polypeptides themselves, starting with the translation start signal and ending with the aforementioned etop signal. The desired product is only formed when the ribosome binding site coding sequences are positioned correctly relative to the AUG initiation codon and all remaining codons follow the initiation codon in the correct phase. The resulting product can be obtained by lysing the host cell and separating it from other bacterial proteins by a suitable purification method.

Autoři vynálezu si uvědomili, že aplikace technologie rekombinace DNA (to je vložení interferonovych genů do mikrobiálních exprimačnlch nosičů a jejich exprese pod kontrolou regulačních prvků mikrobiálního genu) by byla nejefektivnšjší cestou k zajištěniThe inventors realized that applying recombinant DNA technology (i.e., inserting interferon genes into microbial expression carriers and expressing them under the control of microbial gene regulatory elements) would be the most effective way to ensure

CS 273 182 B2 ,Α sCS 273 182 B2, p

Bi •v velkých množství leukocytárniho interferonu, kterého by se přes to, že by nebyl glykosylován, jak je tomu v připadá produktu z lidských leukocytú, dalo klinicky používat při léčení širokého okruhu virových a neoplastických onemocněni.Bi • in large amounts of leukocyte interferon, which despite being not glycosylated, as in the human leukocyte product, could be clinically used to treat a wide range of viral and neoplastic diseases.

Podle vynálezu ee první leukocytárni gen dá připravit následujícím sledem operací:According to the invention, the first leukocyte gene can be prepared by the following sequence of operations:

1) Za použiti parciálních aminokyselinových sekvencí lidského leukocytárniho intarferonu vyčištěných do homogenního stavu se zkonstruuji soubory zkušebních vzorků synthetických ONA, jejichž kodony v celku představují všechny možné nukleotidická kombinace schopné zakódovat zmíněné parciální aminokyselinové sekvence.1) Using homogeneous purified human leukocyte intarferon partial amino acid sequences, sets of synthetic ONA test samples are constructed whose codons in total represent all possible nucleotide combinations capable of encoding said partial amino acid sequences.

2) Připraví se banky bakteriálních kolonii obsahující komplementární ONA (cDNA) z indukované mRNA. Oinó indukované mRNA, radioaktivně značená, se hybridizují do plasmidické cDNA z táto banky. Hybridizujici mRNA se eluuje a testuje se jejich schopnost translace na interferon pomocí oocytárního testu. Plasmidické DNA z kolonii, u kterých bylo zjištěno, že při tomto způsobu indukují interferonovou aktivitu, ae dále testuji na jejich schopnost hybridizace do zkušebních vzorků připravených způsobem popsaným výše ad 1).2) Bacterial colony flasks containing complementary ONA (cDNA) from induced mRNA are prepared. Ono-induced mRNA, radiolabeled, hybridized to plasmid cDNA from this flask. Hybridizing mRNAs are eluted and tested for their ability to translate to interferon using an oocyte assay. Colony plasmid DNAs found to induce interferon activity in this method and further tested for their ability to hybridize to test samples prepared as described above under 1).

3) Souběžně 8 postupem popsaným výše v části 2) se cDNA odvozená z indukované mRNA v plasmidech použije k vytvořeni nezávislé banky transformovaných kolonii. Zkušebních vzorků z částí 1) se použije k započetí aynthssy radioaktivně značených Jednovláknových cONA, kterých se použije jako hybriďizačních zkušebních vzorků. Synthetické zkušební vzorky se hybridizují e indukovanou mRNA jakožto šablonou a prodlouží se reversní transkripci za vzniku indukované, radioaktivně značená cDNA, Klony z banky kolonii, které se hybridizují do radioaktivně značené cDNA získané shora uvsdenýnfpostupem, sa dále zkouši aby sa potvrdila přítomnost celá délky inteřferonového kódujícího genu. Sako zkušebních vzorků pro interferonový gen o plné délce lze jako takového použit kteréhokoliv domnělého genového fragmentu s částečnou délkou řetězce, získaného ve shora uvedených oddílech3) Simultaneously 8 as described above in section 2), cDNA derived from induced mRNA in plasmids was used to generate an independent colony transformed bank. The test samples of part 1) are used to initiate aynthsis of radiolabeled single stranded cONA, which is used as hybridization test samples. Synthetic assay samples hybridize to the induced mRNA template and extend reverse transcription to produce induced, radiolabeled cDNA. Colony banks clone that hybridize to the radiolabeled cDNA obtained above are further tested to confirm the presence of the entire length of the interferon coding sequence. gene. The jackets of the full length interferon gene can be used as such for any putative partial chain gene fragment obtained in the above sections.

1) a 2).1) and 2).

4) Interferonový gen o plné délce, získaný shora uvedeným postupem, se za použiti syntetické DNA uzpůsobí tak, aby ee odstranila jakákoliv vedoucí sekvence, která by mohla zabránit mikrobiální expresi zralého polypeptidu a aby se mu zajistilo vhodné umístění v nosiči schopném exprese vzhledem k iniciačním signálům pro start a kribosomovému vazebnému mletu mikrobiálního promotoru. Expresi získaný interferon se vyčisti do stupně dovolujícího potvrzeni jeho charakteru a stanoveni jeho aktivity.4) The full-length interferon gene obtained as described above is made using synthetic DNA so as to remove any leader sequence that could prevent microbial expression of the mature polypeptide and to ensure appropriate placement in an expression-capable carrier relative to the initiator. start signals and cribosome binding milling of the microbial promoter. The expression of the interferon obtained is purified to a degree allowing confirmation of its character and determination of its activity.

5) Interferonový genový fragment připravený shora popsaným způsobem ee použije jako takový ke zkoušeni, ceetou hybridizace, pro přípravu jiných částečně hooologických leukocytárnich druhů interferonu.5) The interferon gene fragment prepared as described above is used as such for screening, hybridization, for the preparation of other partially hooological leukocyte interferon species.

Shora popsanou aplikací mstod technologie rekombinace ONA bylo dosaženo mikrobiální produkce, a to ve vysokých výtěžcích a vysoké čistotě, skupiny homologických leukocytárnich interferonů (neglykolyeovaných) ve formě zralých polypeptidů, nedoprovázených v podstatě odpovídající preeekvencí nebo jakoukoliv její částí. Tyto inteřferony se dají přímo exprimovat, izolovat a čistit do stupně čistoty vhodného pro jejich použiti při léčeni virových a maligních onemocněni u živočichů a u lidi. Mikrobiální expresí zatím ziakané produkty této skupiny prokázaly účinnost při testováni in vitro, a v prvních zkouškách toho druhu rovněž při testováni in vivo, přičemž posléze uvedené testováni zahrnovalo i první zralý leukocytárni interferon vyprodukovaný mikrobiálním způsobem.The above-described application of ONA recombination technology techniques resulted in microbial production, in high yields and high purity, of a group of homologous leukocyte interferons (non-glycolised) in the form of mature polypeptides not accompanied by substantially the corresponding sequence or any part thereof. These interferons can be directly expressed, isolated and purified to a degree of purity suitable for their use in the treatment of viral and malignant diseases in animals and humans. The microbial expression of the products of this group so far demonstrated efficacy in in vitro testing, and in the first tests of this kind also in in vivo testing, including the first mature leukocyte interferon produced in a microbial fashion.

Výraz zralý leukocytárni interferon používaný v popisu tohoto vynálezu značí mikrobiálně (například bakteriálně) vyprodukovanou interferonovou molekulu, prostou glykosylových skupin. Zralý leukocytárni interferon jest při způsobu podle vynálezu bezprostředně exprimován počínaje iniciačním signálem pro tlanslacl (ATG) ještě před prvním aminokyselinovým kodonem přirozeného produktu. Zralý polypeptid tak může obsahovat jako první aminokyselinu va své sekvenci methionin (pro který kóduje ATG) bez podstatnéThe term mature leukocyte interferon used in the description of the invention refers to a microbially (for example bacterially) produced glycosyl-free interferon molecule. The mature leukocyte interferon is immediately expressed in the method of the invention starting with the tlanslacl (ATG) initiation signal before the first amino acid codon of the natural product. Thus, the mature polypeptide may contain as the first amino acid in its sequence the methionine (for which it encodes ATG) without substantial

CS 273 182 B2 změny evého charakteru. Na druhé straně může mikrobiální hostitel zpracovat produkt translace tak, žs js vynechán počáteční methionin. Zralý leukocytární interferon může být exprimován společně s konjugovanou bílkovinou jiné povahy než je běžná vedouci bílkovina, přičemž zmíněný konjugát se dá specificky rozštěpit v intra- nebo extracelulárnim prostředí (viz britský patent čislo 2 007 676 A), Posléze může být zralý interferon produkován v konjugaci 8 mikrobiálním signálním peptidsm, který transportuje konjugát do buněčné stěny, kde se signální peptid odštěpí a vyloučí se zralý polypeptid. Pojem exprese zralého leukocytárního interferonu značí bakteriální nebo jinou mikrobiální produkci interferonové molekuly neobsahující glykosylovó skupiny ani aminokyselinové preeekvence, které se bezprostředně zúčastňuji mRNA translace lidského leukocytárniho interferonového genomu. x CS 273 182 B2 changes in nature. On the other hand, the microbial host can process the translation product by omitting the initial methionine. The mature leukocyte interferon may be expressed together with a conjugate protein of a different nature than the conventional leader protein, said conjugate being specifically cleaved in an intra- or extracellular environment (see British Patent No. 2,007,676 A). Subsequently, the mature interferon may be produced in conjugation 8 microbial signal peptides that transport the conjugate to the cell wall where the signal peptide is cleaved and the mature polypeptide is secreted. The term expression of mature leukocyte interferon refers to bacterial or other microbial production of an interferon molecule lacking glycosyl groups or amino acid sequences that are directly involved in mRNA translation of the human leukocyte interferon genome. x

Specifické leukocytární interferonové bílkoviny uváděné v tomto vynálezu jsou definovány pomoci stanoveného DNA genu (viz obrázky čislo 3 a 8) a podle dedukované aminokyselinové sekvence (viz obrázky 4 a 9)· Rozumí se, že u těchto specifických interferonů, i když Je lze vskutku všechny zahrnout do skupiny leukocytámich interferonových bílkovin, existuji přirozené alelické variace,' které se vyskytuji od případu k případu· Tyto variace lze demonstrovat rozdílem (nebo rozdíly) v celkové aminokyselinové sekvenci, nebo vynecháním, substitucí, vložením, inversi nebo přidáním aminokyseliny (nebo aminokyselin) vs zmíněné sekvenci. U každé leukocytární interferonové bílkoviny uvedené v tomto vynálezu, označených symboly LelF A až LelF □ , jsou zmíněné alelické variace zahrnuty do rozsahu uvedených označení nebo terminů definujících tyto interferony.The specific leukocyte interferon proteins disclosed herein are defined by the determined DNA gene (see Figures 3 and 8) and by the deduced amino acid sequence (see Figures 4 and 9). It is understood that these specific interferons, although indeed all Include in the leukocyte interferon protein family, there are natural allelic variations that occur on a case-by-case basis. These variations can be demonstrated by a difference (or differences) in the total amino acid sequence, or by omission, substitution, insertion, inversion or addition of amino acid (or amino acids) with said sequence. For each leukocyte interferon protein of the present invention, designated LelF A to LelF symboly, said allelic variations are included within the scope of said labels or of the terms defining these interferons.

Výhodný způsob podle vynálezu jest bliže objasněn v následujícím podrobném popisu a na přiložených obrázcích 1 až 9.The preferred method of the invention is illustrated in more detail in the following detailed description and in the accompanying figures 1 to 9.

Na obrázku 1 jsou znázorněny dvě aminokyselinové sekvence, které jsou společné všem druhům interferonů isolovaným z lidských leukocytů a vyčištěných do homogenního stavu, označených T-l až T-13. Všechny možné mRNA sekvence kódující tyto peptidy jsou znázorněny jako odpovídající DNA sekvence. Plemena A,’ T, G, C a U označuji nukleotidy obsahující base adenin, thymin, guanin, cytosin a uráčil. Písmeno N označuje kterýkoliv z uvedených nukleotidů A,’ G, C a U. P0lynukleotidy jsou zobrazeny tak, aby se četly ze směru 5'(zleva) do 3'(doprava), a tam, kde je znázorněna dvouvláknová (d.v.) DNA, se naopak pročítá od spodu nebo od nekódujícího vlákna.Figure 1 shows two amino acid sequences that are common to all species of interferons isolated from human leukocytes and purified to a homogeneous state, designated T1 to T-13. All possible mRNA sequences encoding these peptides are shown as corresponding DNA sequences. Breeds A, T, G, C and U refer to nucleotides containing the base adenine, thymine, guanine, cytosine and uracil. The letter N denotes any of the indicated nucleotides A, 'G, C and U. P 0 lynucleotides are shown to be read from the 5' (left) to 3 '(right) direction and where double-stranded (dv) is shown DNA, on the other hand, is read from the bottom or from the non-coding strand.

Na obrázku 2 je uveden autoradiogram znázorňujíc! hybridizaci potenciálních LelF 32 plasmidů se synthetickými deoxyoligenukleotidy značenými P.FIG. 2 shows an autoradiogram showing FIG. hybridization of potential LelF 32 plasmids with synthetic P-labeled deoxyoligenucleotides

Na obrázku 3 jeou znázorněny nukleotidická sekvence (kódující vlákna) osmi genových fragmentů, které byly izolovány jako možní kandidáti pro použiti k expresi leukocytérnich interferonů, a které jsou označeny písmeny A až “H. Iniciační ATG kodony translace a tarminačni triplety každého LelF jsou podtrženy; Stop kodony neboli terminačni triplety jsou následovány nepřekládanými oblastmi v poloze 3'· Včleněný gan o plné délce pro LelF A má vynechaný jeden kodon, který byl nalezen u ostatních nakreslených genů,’ jak je znázorněno ve třetí A lince obrázku 3. V poloze 5' nepřekládané oblasti předcházejí vedoucím sekvencím. Ve fragmentu E schůzí po izolaci celá prasakvence vedouci bílkoviny, ale je zahrnut celý gen pro předpokládaný zralý LelF E. Ve fragmentu G schází po izolaci celá kódující sekvence.Figure 3 shows the nucleotide sequences (coding strands) of the eight gene fragments that have been isolated as possible candidates for use in the expression of leukocyte interferons, and are indicated by the letters A to H. The translation initiation ATG codons and tripletlets of each LelF are underlined; Stop codons or stop triplets are followed by non-translated regions at position 3 '. The full length incorporated gan for LelF A has omitted one codon found in the other drawn genes, as shown in the third A line of Figure 3. At position 5' the untranslated regions precede the leader sequences. In fragment E, after meeting the isolation, the entire protein-leading vaccine sequence is included, but the entire gene for the putative mature LelF E is included. In fragment G, the entire coding sequence is missing after isolation.

Na obrázku 4 jest znázorněno srovnáni osmi LelF bilkovinových sekvenci určených nukleotidickými sekvencemi. Pro aminokyseliny jsou používány Jednopismenkové zkratky, doporučené IUPAC-IUB komisi pro biochemickou nomenklaturu: A alanin; C « cystein:Figure 4 shows a comparison of eight LelF protein sequences determined by nucleotide sequences. Amino acids use the one-letter abbreviations recommended by the IUPAC-IUB Biochemical Nomenclature Commission: A alanine; C «cysteine:

a kyselina asparagová; E kyselina glutamová; F fenylalanin; G a glycin: H a histidinj I a isoleuain; K lysin; L leucin; M ; methionin; N a asparagin; P a prolin;and aspartic acid; E glutamic acid; F phenylalanine; G and glycine: H and histidin I and isoleuain; K lysine; L leucine; M; methionine; N and asparagine; P and proline;

Q a glutamin; R a arginin; S a serin; T » threonin: V a valin; W a tryptofan; a Y = » tyro9in. Čísla označuji umístěni aminokyselin (S ee vztahuje na signální paptid).Q and glutamine; R and arginine; S and serine; T-threonine: V and valine; W and tryptophan; and Y = ro tyrosine. The numbers indicate the location of the amino acids (S ee refers to the signal peptide).

CS 273 182 B2CS 273 182 B2

Pomlčka na místě 44 u sekvence 165 aminokyselin interferonu LelF A jest zavedena pro vyrovnání zmíněné LelF A sekvence se sekvenci 166 aminokyselin jiných LelF, Sekvence LelF e byla stanovena za zanedbáni axtranuklaotidu (poloha 187 na obrázku 3) v jeho kódující oblasti. Hvězdičky označují terminačni kodony, které jsou ve fázi. Aminokyseliny společné všem LelF (s výjimkou pseudogenu LelF E) jsou rovněž zřejmé. Podtržené zbytky jsou aminokyseliny, které jsou rovněž přítomné v lidském fibroblastovém interferonu.A dash at position 44 of the 165 amino acid sequence of interferon LelF A is introduced to align said LelF A sequence with the 166 amino acid sequence of other LelFs. The LelF e sequence was determined neglecting the axtranuclaotide (position 187 in Figure 3) in its coding region. Asterisks indicate the termination codons that are in phase. The amino acids common to all LelF (except for the LelF E pseudogen) are also evident. Underlined residues are amino acids that are also present in human fibroblast interferon.

Na obrázku 5 jsou zobrazeny mapy rsstrikčnich endonukleáz osmi typů (A až H) cDNA klonovaných intarferony LelF. Hybridizované plasmidy byly zkonstruovány za použití metody dC:dG koncových zbytků /Goeddel D.V. a spolupracovníci,' Nátuře 287, 411-416 (1980)/. Při této metodě se vyříznou vložky cDNA za použiti rastrikčni endonukleázy Pstl. Cáry na konci každé cDNA vložky představuji přilehlé horapolymerické dC:dG koncové zbytky. Na obrázku js rovněž označeno umístěni PvuII,’ EcoRI a BglII štěpných mist. Stínované oblasti obrázku značí kódující sekvence zralých LelF; ěrafované oblasti označuji sekvence kódující signální peptid; volné oblasti znázorňuji 3Z a 5Z nekódující sekvence.Figure 5 shows maps of restriction endonucleases of eight types (A to H) of cDNA cloned by LelF intarferons. Hybridized plasmids were constructed using the dC: dG terminal residue method (Goeddel DV and co-workers, Nature 287, 411-416 (1980)). In this method, cDNA inserts were excised using a PstI screening endonuclease. The lines at the end of each cDNA insert represent adjacent horapolymeric dC: dG terminal residues. PvuII, EcoRI and BglII cleavage sites are also indicated in the figure. Shaded regions of the figure indicate the coding sequences of mature LelF; The hatched regions indicate sequences encoding a signal peptide; the free regions represent the 3 Z and 5 Z non-coding sequences.

Na obrázku 6 je schematicky zobrazena konstrukce genu kódujícího přímou mikrobiální synthesu zralého LelF A. Osou vyznačena místa štěpeni a vzniklé zbytky (Pst I”, atd.). Zkratka b.p. označuje pár basi.Figure 6 schematically depicts the construction of the gene encoding direct microbial synthesis of mature LelF A. The cleavage sites and residues formed (Pst I ', etc.) are indicated. Abbreviation b.p. indicates a pair of bases.

Na obrázku 7 ja schematicky znázorněna rastrikčni mapa dvou genových fragmentů používaných k expresi zralého leukocytárniho interferonu LelF B. Vyznačené kodonové sekvence jsou kódující koncová vlákna získaná digesci restrikčnim enzymem Sau3a v uvedených dvou případech.Figure 7 schematically depicts a raster map of two gene fragments used to express mature leukocyte interferon LelF B. The codon sequences indicated are the coding end strands obtained by digestion with the restriction enzyme Sau3a in the two cases.

Na obrázcích B a 9 jsou uvedeny DNA a aminokyselinové sekvence (pokud se týká příslušných jednoplsmenkových zkratek aminokyselin viz shora uvedený popis k obrázku 4) pěti LelF bílkovin/ včetně typu lad. Hvězdička na obrázku 9 označuje terminačni kodon příslušné DNA sekvence a rozdělovači čárka znáči deleci nebo mezeru v sekvenci.Figures B and 9 show the DNA and amino acid sequences (with respect to the respective single-letter amino acid abbreviations as described above in Figure 4) of the five LelF proteins (including the lad species). The asterisk in Figure 9 indicates the termination codon of the respective DNA sequence and the hyphen indicating the deletion or gap in the sequence.

A, Použité mikroorganismyA, Used microorganisms

Způsob podle vynálezu zahrnuje používáni dvou mikroorganismů: bakterie E. coli x x 1776, jak ja popsáno v USA patentu čislo 4 190 495,' a bakterie E. coli K-12 kmen 294 (zakončeni A, thi”, hsr”, hsmjp; jak je popsáno v britském patentu ČÍ9I0 2 055 382 A. Každý z těchto mikroorganismů ja uložen v Americké sbírce typových kultur (ATCC) pod označením ATCC čislo 31537 a 31446. Všechny práca 8 rekombinovanými DNA byly prováděny v souhlase se závaznými směrnicemi Národního zdravotnického úřadu (NIH) v USA.The method of the invention comprises the use of two microorganisms: E. coli xx 1776 as described in U.S. Patent No. 4,190,495, and E. coli K-12 strain 294 (terminated A, thi, hsr, hsmjp; Each of these microorganisms is deposited with the American Type Culture Collection (ATCC) under the designation ATCC Nos. 31537 and 31446. All work on 8 recombinant DNAs was performed in accordance with the binding guidelines of the National Health Authority (NIH). ) in USA.

Způsob podle vynálezu ve svém nejvýhodnějšim provedeni jest popsán za použiti mikroorganismů E. coli, včetně nejen kmenů E. coli x 1776 a E. -coli K-12 kmene 294, uvedených výše, ale i jiných známých kmenů E. coli, jako E. coli B, nebo jiných mikrobiálních kmenů, z nichž četné jsou uloženy a dostupné ve známých sbírkových ústavech, jako v Americké sbírce typových kultur;'viz též NSR patentový zveřejňovací spis 2 644 432. Mezi zmíněnými ijinými mikroorganismy jsou zahrnuty například kmeny Bacilli, jako například Bacillus subsilis, a jiné snterobaktariální mikroorganismy, mezi kterými lze uvést například kmeny Salmonella typhimurium a Serrata marcescans, které využívají plasmidů a jsou schopné replikace a exprese heterologních genových sekvenci v nich obsažených.Most preferably, the method of the invention is described using E. coli microorganisms, including not only E. coli strains x 1776 and E. coli K-12 strain 294 mentioned above, but also other known E. coli strains, such as E. coli. coli B, or other microbial strains, many of which are stored and available in known collection institutes, such as the American Type Culture Collection; see also German Patent Publication 2,644,432. Other microorganisms include, for example, Bacilli strains, such as e.g. Bacillus subsilis, and other snterobacterial microorganisms including, but not limited to, Salmonella typhimurium and Serrata marcescans strains that utilize plasmids and are capable of replicating and expressing the heterologous gene sequences contained therein.

□ako hostitelského organismu pro přípravu interfaronových bílkovin expresi genů pro ně kódovaných,' za kontroly kvasinkového promotoru, lze rovněž používat s výhodou kvasinek, jako Sacharomyces carevisiae.As a host organism for the production of interfaronic proteins by expressing genes encoded therein, under the control of a yeast promoter, yeasts such as Sacharomyces carevisiae can also be used advantageously.

B. Zdroj a čištěni leukocytárni intarferonové mRNA (LelF mRNA)B. Source and Purification of Leukocyte Intarferon mRNA (LelF mRNA)

LelF mRNA lze získávat z lidských leukocytů, obvykla z 'leukocytů nemocných s chronickou myeloidní leukémií; tyto leukocyty lze indukovat k produkci interferonu virem Sendaiské nebo Newcastleské nemoci, jak ja popsáno například v NSR patentovém zveřejCS 273 182 82 novacím spisu číslo 2 947 134. Zvláště výhodným zdrojem, používaným rovněž v této práci, jeet linie buněk označená KG-1, získaná od nemocných s akutní myeloidni leukémii. Tato linie buněk, popsaná H.P. Koefflerem a D.W. Goldem v časopisu Science 200, 1153 (1978), ochotně roste v kultivačním mediu obsahujícím RPMI (Rosewsll Park Memoriál Institute) 1640 plus 10 % FCS (fetálni talsci sérum) inaktivované zahřátim, 25 mM pufru HEPES (N-2-hy.droxyethyl-piperazin-N'-2-ethansulfonová kyselina) a 50 ^ug/ml gentamicinu, a subkultivuje se na Jedno až tři rozděleni dvakrát za týden. Buňky z předcházejícího kultivačního prostřed! se zmrazí s 10 % OMSO (dimethylsulfoxidu). Buňky KG-1 jsou uloženy v Americké sbírce typových kultur pod označením ATCC číslo CRL 8031.LelF mRNA can be obtained from human leukocytes, usually from leukocytes patients with chronic myeloid leukemia; these leukocytes can be induced to produce interferon virus by the Sendai or Newcastle disease virus, as described, for example, in German Patent Publication No. 273 182 82 Novelty 2,947,134. A particularly preferred source, also used in this work, is the cell line designated KG-1 obtained from patients with acute myeloid leukemia. This cell line, described by H.P. Koeffler and D.W. Goldem in Science 200, 1153 (1978), readily grows in culture medium containing RPMI (Rosewsll Park Memorial Institute) 1640 plus 10% FCS (fetal talc serum) inactivated by heating, 25 mM HEPES buffer (N-2-hydroxyethyl- piperazine-N'-2-ethanesulfonic acid) and 50 µg / ml gentamicin, and are subcultured to one to three distributions twice a week. Cells from previous culture medium! is frozen with 10% OMSO (dimethylsulfoxide). KG-1 cells are deposited with the American Type Culture Collection under the designation ATCC No. CRL 8031.

Buňky KG-1 se indukuji k produkci leukocytárni interferonové mRNA virem Sendaiské nebo Newcastleské nemoci způsobem popsaným Rubinsteinsm a spolupracovníky /viz časopis Proč. Nati. Acad. Sci. USA 76, 650-644 (1979)/. Buňky se izoluji za 5 hodin po indukci a RNA se preparuje postupem /viz Chirgwin sa spolupracovníky, Blochemistry 18, 5294-5299 (1979)/. Stejným způsobem se izoluje RNA z neindukovaných buněk. Za použiti chromatografie na oligodeoxythymidin (dT) - celulose a ultracentrifugacs ss sacharosovým gradientem se zláká 12S frakce poly(A) mRNA, jak popisuji Grsen a spolupracovnici (Arch. Biochem. Biophys. 172, 74-89 /1976/) a Okinura a spolupracovníci /Arch. Biochsm. Biophys 188, 98-104 (1978)/. Takto získaná mRNA má interferonovou aktivitu 8000 až 10000 jednotek na mikrogram při oocytovém stanoveni za užiti žáby Xanopus Laevls /viz Cavalieri a spolupracovnici, Proč. Nati. Acad. Sci USA 74, 3287-3291 (1977)/.KG-1 cells are induced to produce leukocyte interferon mRNA by Sendai or Newcastle disease virus as described by Rubinsteins et al. (See Proc. Nati. Acad. Sci. USA 76, 650-644 (1979)]. Cells are harvested 5 hours after induction and RNA is prepared as described (Chirgwin et al., Blochemistry 18, 5294-5299 (1979)). In the same way, RNA is isolated from uninduced cells. Using oligodeoxythymidine (dT) -cellulose chromatography and sucrose gradient ultracentrifugation, the 12S fraction of poly (A) mRNA, as described by Grsen et al. (Arch. Biochem. Biophys. 172, 74-89 (1976)) and Okinura et al. /Sheet. Biochsm. Biophys 188, 98-104 (1978)]. The mRNA thus obtained has an interferon activity of 8000 to 10,000 units per microgram in an oocyte assay using the Xanopus Laevls frog (see Cavalieri et al., Proc.). Nati. Acad. Sci USA 74, 3287-3291 (1977)].

C. Připrava bank kolonii obsahujících LsIF cONA sskvsncsC. Preparation of banks for colony containing LsIF cONA sskvsncs

Za použiti 5 /tig mRNA 9s standardními postupy připrav! dvouvláknová cDNA /viz Wicksns a spolupracovnici, 3. Biol. Chsm. 253, 2483-2495 (1978) o Gosddsl a 9poluprčcovníci, Naturs 281, 544-548 (1979)/, Získaná cDNA sa frakcionuja podle velikosti elektroferesou na 6%nim polyakrylamidovém gelu (PAGE), a elektroelucí se izoluje 230 ng materiálu majícího velikost v rozmez! od 500 do 1500 b.p. U části této cDNA (100 ng) ss na konec naváži zbytky deoxycytidinu (dC) způsobem popsaným Changem a spolupracovníky v časopisu Nátuře 275, 617-624 (1978), produkt se aneluje se 470 ng plasmidů pBR322, na jehož Pst I rsstrikční misto jsou navázány zbytky dssoxyguanidinu (dG) /viz Bolivar a spolupracovníci, Gana 2, 95-113 (1977)/ a takto modifikovaného plasmidů sa použije k transformaci mikroorganismu E. coli x 1776, Získá sa asi 130 transformantů rezistentních vůči tetrycyklinu a citlivých na ampicllin, na jeden ng cONA.Using 5 µg mRNA 9 with standard procedures, prepare! double stranded cDNA / see Wicksns et al., 3. Biol. Chsm. 253, 2483-2495 (1978) by Gosddsl and 9 Colts, Naturs 281, 544-548 (1979)]. The cDNA obtained is fractionated according to size by electrophoresis on a 6% polyacrylamide gel (PAGE), and 230 ng of the sizing material is isolated by electroelution. v rozmez! from 500 to 1500 b.p. For a portion of this cDNA (100 ng) ss, the deoxycytidine (dC) residues are bound to the end by the method described by Chang and co-workers in Nature 275, 617-624 (1978), the product is annealed with 470 ng of plasmids pBR322. attached dssoxyguanidine (dG) residues (see Bolivar et al., Gana 2, 95-113 (1977)) and the plasmids thus modified are used to transform E. coli x 1776, yielding about 130 tetrycycline-resistant and ampicillin-sensitive transformants, per ng of cONA.

V druhém podobném pokusu se získá přibližně 1000 transformantů E. coli K-12 kmene 294, rezistentních vůči tetracyklinu a citlivých na ampicilin, na jeden ng cDNA, V tomto případě se frakcionaci cDNA podle velikosti molekul a elektroelucí získá materiál o velikosti v roztnszi od 600 do 1300 b.p., který se použije k navázáni koncových dC.In a second similar experiment approximately 1000 tetracycline-resistant ampicillin-sensitive strain E. coli K-12 strain 294 was obtained per ng of cDNA. In this case, cDNA fractionation by molecular size and electroelution yielded a material ranging in size from 600 up to 1300 bp, which is used to bind terminal dC.

0. Připrava synthetických oligonukleotidů a jejich použitiPreparation of synthetic oligonucleotides and their use

Znalost aminokyselinových sekvencí různých tryptických fragmentů lidského leukocytárniho interferonů dovoluje navrhnout eynthetické deeoxyoligonukleotidy komplementární k různým oblastem LelF mRNA, Byly zvoleny dva tryptické peptidy T 1 a T 13, poněvadž mají aminokyselinovou sekvenci vyžadující synthesu pouze 12, popřípadě 4 undekamerů, aby sa vysvětlily všechny možné kódující sekvence (viz obrázek 1). Synthstisuji se čtyři soubory zkušebních vzorků deoxyoligonukleotidů pro každou sekvenci, z nichž každý obsahuje buň tři (T-1A, 8, C, D) nebo jeden (T-13A, B, C, D) oligonukleotid. Uvedené komplementární. deoxyoligonukleotidy o délce 11 basi se synthatiauji chemicky za použiti fosfortrieaterové metody /viz Crea a spolupracovnici, Proč. Nati. Acad. Sci. USA 75, 5765-5769 (1978)/, V T-13 sérii se připraví čtyři jednotlivá vzorky, v sérii T-l dvanáct vzorků ve čtyřech skupinách po třech vzorcích, jak Je uvedeno na obrázku 1.Knowing the amino acid sequences of the different tryptic fragments of human leukocyte interferons allows to design eynthetic deeoxyoligonucleotides complementary to different regions of the LelF mRNA. Two tryptic peptides T1 and T13 were chosen, since they have an amino acid sequence requiring only 12 or possibly 4 undecamers to synthesize. sequence (see Figure 1). Four sets of deoxyoligonucleotide test samples for each sequence are synthesized, each containing a cell of three (T-1A, 8, C, D) or one (T-13A, B, C, D) oligonucleotide. Said complementary. 11-base deoxyoligonucleotides are synthesized chemically using the phosphfortrieater method (see Crea et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA 75, 5765-5769 (1978)] In a T-13 series, four individual samples are prepared, in a T-1 series, twelve samples in four groups of three samples each as shown in Figure 1.

Čtyři individuální zkušební vzorky v T-13 sérii a dvanáct T-l zkušabnich vzorkůFour individual test samples in the T-13 series and twelve T-1 test samples

CS 273 182 B2 připravených va čtyřech skupinách po třech primerech v každé aa použiji k informační synthese radioaktivně značené jednovléknové cDNA za účelem použiti k hybridizačním zkouškám. Oako vzorové mRNA se použije bu3 12S' RNA z KG-1 buněk indukovaných Sendaiským virem (8000 jednotek IF aktivity na jeden ^ug) nebo celkové poly(A) mRNA z neindukovaných leukocytů (aktivita menši než 10 jednotek na ^ug). Z uvedených primérů se připravi cDNA značená 32P za použiti známých reakčnich podminek /viz Noyes a spolupracovnici, Proč. Nati. Acad. Sci. USA 76, 1770-1974 (1779)/. Reakce se provedou v 60 mikrolitrových pufrech o složeni 20 mM Trie-HCl (hydrochlorid tris-hydroxymathylmethanu) o pH 8,3, 20 mM chloridu draselného, 9 mM bezvodého chloridu hořečnatého a 30 mM íb -merkaptoethanolu· Pro reakce se použije vždy Jedenoho ^ug každého primeru (tj. celkem 12 yug pro primery T-l serie a celkem 4 yug pro T-13 serie), 2 /Ug indukované 12S frakce mRNA (nebo 10 ^ug neindukované póly (A) mRNA), 0,5 mM dATP, dCTP, dTTP,CS 273 182 B2 prepared in four groups of three primers in each a and I will use radiolabeled single stranded cDNA for information synthesis for use in hybridization assays. Oako sample mRNA was used with either SendSi virus induced 12S 'RNA from KG-1 cells (8000 units IF activity per µg) or total poly (A) mRNA from uninduced leukocytes (activity less than 10 units per µg). 32 P-labeled cDNA was prepared from the primers using known reaction conditions (see Noyes et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA 76, 1770-1974 (1779)]. Reactions were performed in 60 microliter buffers of 20 mM Trie-HCl (pH 8.3 hydrochloride), 20 mM potassium chloride, 9 mM anhydrous magnesium chloride and 30 mM 1-mercaptoethanol. ug of each primer (i.e. a total of 12 ug y primers Tl series and a total of 4 ug y for T-13 series), 2 / ug induced 12S fraction mRNA (or 10 .mu.g of uninduced poly (a) mRNA), 0.5mM dATP, dCTP, dTTP

200 y.uCi (/1 32P) dCTP (dodavatel Amersham, 2000-3000 Ci/mraol) a 60 jednotek revereni transkriptásy (dodavatel Bethesda Research Laboratories). Žádaný produkt se odděli od neinkorporovaného značkovacího materiálu gelovou filtraci na sloupci 10 ml Sephadexu R G-50 a produkt sa zahřívá 30 minut na 70 °C s 0,3 N roztokem hydroxidu sodného, aby se rozložila RNA, a pak se směs zneutralizuje kyselinou chlorovodíkovou. Hydridizace se provedou způsobem popsaným Kafatosem a spolupracovníky v časopisu Nucleic Acids Res. 7, 1541-1552 (1979).200 y.uCi (/ 13 P) dCTP (Amersham supplier, 2000-3000 Ci / mole) and 60 transcriptase reverse units (Bethesda Research Laboratories supplier). The desired product was separated from the unincorporated marker gel filtration on a 10 ml Sephadex R- G-50 column and the product was heated at 70 ° C for 30 minutes with 0.3 N sodium hydroxide solution to decompose the RNA and then neutralized with hydrochloric acid. . Hydridizations are performed as described by Kafatos and co-workers in Nucleic Acids Res. 7, 1541-1552 (1979).

5. Identifikace klonů pLl až pL305. Identification of clones pL1 to pL30

K přípravě 1 /Ug plasmidické DNA z každého z 500 individuálních transformantůTo prepare 1 / µg plasmid DNA from each of the 500 individual transformants

E. coli K-12 kmene 294 (viz oddíl C) ss použije rychlého způsobu izolace plasmidu popsaného Birnboimem a spolupracovníky v časopisu Nucleic Acids Res. 7, 1513-1523 (1979). Každý získaný vzorek DNA se denaturuje a pak aplikuje trojmo na nitrocalulosový filtr podle postupu popsaného Kafatosem a spoluprůcovniky (viz výše).E. coli K-12 strain 294 (see section C) ss will use a rapid method of isolating the plasmid described by Birnboim and co-workers in Nucleic Acids Res. 7, 1513-1523 (1979). Each DNA sample obtained was denatured and then applied in triplicate to a nitrocalulose filter according to the procedure described by Kafatos and co-authors (see above).

Tři shora uvedené soubory nitrocslulosových filtrů obsahujicí 500 plasmidických vzorků se hybridizujiThe above three sets of nitrocellulose filters containing 500 plasmid samples were hybridized

a) s indukovanou cDNA obsahující T-l soubor primarůja) induced cDNA containing a T-1 set of primaris

b) s indukovanou cDNA obsahující T-13 příměry, ab) induced cDNA containing T-13 primers, and

c) s neindukovanou cDNA připravenou ze použiti obou souborů primerů.(c) uninduced cDNA prepared from the use of both sets of primers.

Klony se považují za pozitivní, když hybridizuji silněji na jednom nebo obou vzorcích indukované cONA než na celkovém neindukovaném vzorku. Z výchozích 500 vzorků plasmidů bylo vybráno třicet pozitivních klonů (pLl až pL30) k další analyse.Clones are considered positive when hybridizing more strongly on one or both of the cONA-induced samples than on the total non-induced sample. Thirty positive clones (pL1 to pL30) were selected from the initial 500 plasmid samples for further analysis.

F. Identifikace klonů pL31 až pL39. Izolace plasmidu číslo 104 obsahujícího LelF genový fragmentF. Identification of clones pL31 to pL39. Isolation of plasmid # 104 containing the LelF gene fragment

Transformanty mikroorganismů E. coli x 1776 se podrobí užšímu výběru metodou koloniové hybridizace podle Grunsteina a Hognesse /viz Proč. Nati. Acad. Sci. USA 72, 3961-3965 (1975)/ za použití P značené indukované mRNA jako zkušebního vzorku /viz Lillenhaug a spolupracovníci, Biochemistry 15, 1858-1865 (1976)/. Neznačená mRNA z neindukovaných buněk ee emieí 8e zkušebním vzorkem v poměru 200:1, aby doělo ke kompetici s neindukovanou mRNA přítomnou v preparátu značeném 32P. Hybridizace značené mRNA nastává přednostně s koloniemi obsahujícími indukované sekvence. Získají se tři druhy transformantů:Transformants of E. coli x 1776 microorganisms were short-listed by the Grunstein and Hogness colony hybridization method (see Proc. Nati. Acad. Sci. USA 72, 3961-3965 (1975) (using P-labeled induced mRNA as a test sample) (see Lillenhaug et al., Biochemistry 15, 1858-1865 (1976)). Unlabeled mRNA from uninduced cells is ee emitted with a test sample at a ratio of 200: 1 to compete with the uninduced mRNA present in the 32 P-labeled preparation. Hybridization of the labeled mRNA occurs preferably with colonies containing induced sequences. Three types of transformants are obtained:

1) 2 až 3 % kolonií hybridizovaných na 32P-mRNA velmi silně;1) 2 to 3% colonies hybridized to 32 P-mRNA very strongly;

2) 10 % kolonii hybridizovaných signifikantně méně než ve skupině 1), a2) 10% colonies hybridized significantly less than in Group 1), and

3) zbytek, který nedává detegovatelný hybridizační signál.3) a residue that does not give a detectable hybridization signal.

Positivní kolonie (skupiny 1 a 2) se testuji na přítomnost sekvenci specifických pro interferon pomoci zkoušky, která spočívá v hybridizaci inteřferonové mRNA specificky na plasmidickou DNA. Nejprve se 60 silně positivních kolonii (ze skupiny 1) kultiCS 273 182 B2 ?· •r vuje individuálně ve 100 ml živného prostředí M9, doplněného tetracyklihem (20 ^ug/ml), kyselinou diaminopimslovou (100 /ug/m ), thymidinsm (20 /ug/ml) a d-biotinam (1 /ug/ml). Živná půda M9 obsahuje v 1 litru hydrogenfosforsčnan sodný (6 g), dihydrogenfoeforečnan draselný (3 g), chlorid sodný (0,5 g) a chlorid amonný (1 g)i po vystsrilisovóni v autoklávu se přidá 1 ml sterilního 1M roztoku síranu hořečnatého (bezvodého) a 10 ml sterilního 0,01 M roztoku bezvodého chloridu vápenatého. Kultury ss spoji po deseti a zs šesti uvedených spojených skupin ss izoluje plasmidické DNA způsobem popsaným Clswellem a spolupracovníky v časopisu Biochemistry 9, 4428-4440 (1970). Deset yug plasmidické DNA z každé skupiny ss rozštěpí enzymem HindlII, směs ss dsnaturujs a kovalsntně naváže na DBM-papir (diazobenzyloxymethylovaný filtrační· papír). Deden /ug přečištěné mRNA z indukovaných buněk se hybridizuje s rozštěpenou DNA vázanou na OBM-papiru. Nezhybridiaovanó mRNA se odstraní promytím, specificky hybridizovaná mRNA ss sluujs β testuje pomoci oocytů Xsnopus lasvis. V tomto testu bylo všech šest skupin negativních. Z 59 slabě positivních kolonii (skupina 2) bylo vytvořeno pět ekupin po 10 koloniích a jedna skupina z 9 kolonii, a z těchto skupin' byly shora uvedeným způsobem připraveny plasmidy, které byly zhodnoceny Jako bylo uvedeno výše. Z šesti testovaných skupin hybridizovalá jedna (K 10) na interferonovou mRNA a vykazovala v každé době testováni hladiny signifikantně vyšší nsž byly základní hladiny. Za účelem identifikováni specifického intsrferonového cONA klonu se z 9 kolonií skupiny K 10 připraví plasmidické DNA a testuji se individuálně. Dva ze zmíněných plasmidů (číslo 101 a číslo 104) vázaly interferonovou mRNA signifikantně nad základní hladiny, Z plasmidů číslo 104 byl izolován unikátní 32Positive colonies (Groups 1 and 2) are screened for the presence of interferon-specific sequences by an assay that involves interferon mRNA hybridization specifically to plasmid DNA. First, 60 strongly positive colonies (from Group 1) were cultured individually in 100 ml of M9 broth supplemented with tetracycline (20 µg / ml), diaminopimylic acid (100 µg / m), thymidine ( 20 µg / ml) and d-biotinam (1 µg / ml). M9 broth contains 1 liter of sodium hydrogen phosphate (6 g), potassium dihydrogenphosphate (3 g), sodium chloride (0.5 g) and ammonium chloride (1 g), after sterilization in an autoclave, 1 ml of sterile 1M magnesium sulphate solution is added. (anhydrous) and 10 ml of sterile 0.01 M anhydrous calcium chloride solution. DC-link cultures of ten and six of the above-mentioned DC-link groups isolated plasmid DNA as described by Clswell et al. In Biochemistry 9, 4428-4440 (1970). Ten µg of plasmid DNA from each group is digested with HindIII, the mixture is digested and covalently bound to DBM-paper (diazobenzyloxymethyl filter paper). Deden / µg of purified mRNA from induced cells hybridizes to the cleaved DNA bound to OBM-paper. Unhybridized mRNA is removed by washing, specifically hybridized ss servujs β mRNA is tested with Xsnopus lasvis oocytes. In this test, all six groups were negative. Of the 59 weakly positive colonies (group 2), five groups of 10 colonies and one group of 9 colonies were formed, and from these groups plasmids were prepared as described above and evaluated as above. Of the six test groups, one (K 10) hybridized to interferon mRNA and exhibited levels significantly higher than baseline at each time of testing. In order to identify a specific interferon cONA clone, plasmid DNA was prepared from 9 K10 colonies and tested individually. Two of the above-mentioned plasmids (number 101 and number 104) bound interferon mRNA significantly above baseline levels.

Bgl II restrikční fragment obsahující 260 b.p., označen radioaktivním P způsobem popsaným Taylorem a spolupracovníky v časopisu Biochim. Biophys, Acta 442, 324-330 (1975) a použit jako zkušební vzorek k nezávislému výběrovému hodnoceni na 400 transformantech E. coli 294 za použiti skriningové metody na koloniích in sítu /viz Grunstein a Hogness, Proč. Nati. Sci. ZSA 72, 3961-3965 (1975)/. Bylo identifikováno devět kolonií (pL31 až pL39), které hybridizovaly v tomto testu do rozdílného stupně.Bgl II restriction fragment containing 260 b.p., labeled with radioactive P as described by Taylor and co-workers in Biochim. Biophys, Acta 442, 324-330 (1975) and used as a test sample for independent selection on 400 E. coli 294 transformants using an in situ screening method (see Grunstein and Hogness, Proc. Nati. Sci. KDA 72, 3961-3965 (1975)]. Nine colonies (pL31 to pL39) were identified that hybridized to a different degree in this assay.

Shora uvedený značený fragment o 260 b.p. byl déle použit v nezávislém skríningu na 4000 transformantech E. coli 294 stejným způsobem. Bylo identifikováno 50 kolonii, které v tomto testu hybridizovaly se zkušebním vzorkem do rozdílných stupňů. Dedna z nich obsahovala LelF G fragment, jedna LelF H fragment a jedna obsahovala fragment označený jako LelF Hl, zřejmou alelickou variantu interferonu LelF H. Hybridní plasmidy, kte ré byly uvedeným způsobem získány, byly označeny jako pLelF H, atd.The above 260 bp labeled fragment. was used in an independent screen for 4000 E. coli 294 transformants in the same manner. 50 colonies were identified that hybridized to the test sample to different degrees in this assay. One of them contained a LelF G fragment, one LelF H fragment, and one contained a fragment designated as LelF H1, an obvious allelic variant of LelF H. The hybrid plasmids obtained in this manner were designated as pLelF H, and so on.

G. Izolace a stanoveni sekvence prvého LsIF gsnu a plné délce řetězceG. Isolation and sequence determination of the first LsIF gsnu and full-length chain

Ze^všech 39 potenciálních LelF cONA klonů se připraví plasmidické DNA, které se znovu podrobí dalšímu výběru se stejným zkušebním vzorkem DNA obsahujícím 260 b.p., za použiti hybridizačniho postupu popsaného Kafatosem a spolupracovníky (viz výše). Tři plasmidy (pL 4, pL 31, pL 34) dávaly při tomto skríningu velmi silné hybridizačni signály, čtyři (pL 13, pL 30, pL 32, pL 36) hybridizovaly mírně a tři (pL 6, pL 8,,pL 14) hybridizovaly se zkušebním vzorkem slabě.From all 39 potential LelF cONA clones, plasmid DNA was prepared and re-selected with the same 260 bp DNA sample using the hybridization procedure described by Kafatos et al. (Supra). Three plasmids (pL 4, pL 31, pL 34) gave very strong hybridization signals in this screening, four (pL 13, pL 30, pL 32, pL 36) hybridized slightly and three (pL 6, pL 8,, pL 14) hybridized poorly to the test sample.

Shora uvedených 39 potenciálních LelF cDNA rekombinovaných plasmidů bylo rovněž podrobeno výběrovému testováni za použiti syntetických undekamerů značených radioaktivnímThe above 39 potential LelF cDNA recombinant plasmids were also subjected to selective screening using synthetic radiolabeled undecamers.

P (skupiny individuálních T-1 primerů nebo individuální T-13 priméry) přímo jako hybridizačnich zkušebních vzorků. Hybridizačni podmínky byly zvoleny tak, aby mohlo dojit k dokonalému párováni baeí pro detegovatelné hybridizačni signály /viz Wallace a spolupracovnici. Nucleic Acids Ree. 6, 3543-3557 (1979)/. Tak byly z 39 klonů připraveny etan dardnim lysátovým postupem (viz Clswsll a spolu., shora uvedená citace) plasmidické DNA, které byly čištěny sloupcovou chromatografií na agarose značky Biorad Agarose A-50. Vzor ky (3 /Ug) každého preparátu byly linearizovóny působením restrikčního enzymu Eco Rl, de naturovány alkálií a naneseny na 2 separátní nitrocelulosové filtry v dávce 1,5 ^ug na Jednu nanášku (dle Kafatose a spolupracovníků,· citaci viz výše). Individuální synthetic9P (groups of individual T-1 primers or individual T-13 primers) directly as hybridization assay samples. The hybridization conditions were chosen so that perfect pairing of the bait for detectable hybridization signals could be achieved (see Wallace et al.). Nucleic Acids Ree. 6, 3543-3557 (1979)]. Thus, plasmid DNA was prepared from 39 clones by the ethane-dardium lysate procedure (see Clswsll et al., Supra), which were purified by column chromatography on Biorad Agarose A-50 agarose. Samples (3 µg) of each preparation were linearized with Eco RI, de-alkaline and applied to 2 separate nitrocellulose filters at a dose of 1.5 µg per application (according to Kafatos and co-workers, cited above). Individual synthetic9

CS 273 182 B2 kó deoxyoligonukleotidické primery a skupiny spojených primářů byly fosforylovány pomoci (4^32P)-ATP následujícím způsobem: 50 pmol oligonuklaotidu a 100 pmol značeného (γ32Ρ)-ΑΤΡ (dodavatel New England Nuclaar, aktivita 2500 Ci/mmol) bylo vneseno do 30 mikrolitrů pufru složeného z 50 mM Tris-HCl, 10 mM bezvodého chloridu hořečnatého a 15 mM /3-merkaptoethanolu. Ke směsi byly přidány 2 jednotky polynukleotidické kinasy T 4 a po 30 minutách zahříváni na 37 °C byly vzniklé 32P značené primery čištěny chromatografii na sloupcích z 10 ml Sephadexu ® G-50. Poté byly provedeny hybridizace za použiti 105 cpm primeru T-13C nabo 3 χ 106 cpm spojených primarů T-10. Hybridizacs byly prováděny při 15 °C po dobu 14 hodin v prostředí 6 x SSC (1 x SSC 0,15 M chlorid sodný a 0,015 M citrát sodný, pH 7,2) a 10 x Dsnhardtova roztoku (0,2 % hovězí sarumalbumin, 0,2 % polyvinylpyrolidon. O,'2 % Ficoll), způsobem popsaným Wallacem a spolupracovníky (citaci viz výše)· Filtry byly promývány po dobu 5 minut (3krát) při O °C v 6 x SSC, vysušeny a ex32 ponovány na film citlivý na X-paprsky. Výsledky získané a P značenými spojenými,primery T-13C a s primářem T-1C j3ou uvedeny na obrázku 2.CS 273 182 B2 codon deoxyoligonucleotide primers and pooled primers were phosphorylated with (4 ^ 32 P) -ATP as follows: 50 pmol oligonuclaotide and 100 pmol labeled (γ 32 Ρ) -ΑΤΡ (supplier New England Nuclaar, activity 2500 Ci / mmol ) was added to 30 microliters of a buffer composed of 50 mM Tris-HCl, 10 mM anhydrous magnesium chloride and 15 mM / 3-mercaptoethanol. Two units of polynucleotide kinase T4 were added to the mixture and after 30 minutes heating at 37 ° C, the resulting 32 P labeled primers were purified by column chromatography from 10 ml Sephadex ® G-50. Hybridizations were then performed using 10 5 cpm of T-13C primer or 3 χ 10 6 cpm of linked T-10 primers. Hybridizations were performed at 15 ° C for 14 hours in 6 x SSC (1 x SSC 0.15 M sodium chloride and 0.015 M sodium citrate, pH 7.2) and 10 x Dsnhardt's solution (0.2% bovine sarumalbumin, 0.2% polyvinylpyrrolidone (0.2% Ficoll), as described by Wallace and coworkers (cited above) · Filters were washed for 5 minutes (3 times) at 0 ° C in 6 x SSC, dried and ex32 plated on film sensitive to X-rays. The results obtained with β-labeled fused primers T-13C and with primary T-1C are shown in Figure 2.

Bylo nalezeno, že dochází k signifikantní hybridizaci plasmidické DNA z klonu 104 se skupinou spojených primérů T-1C a s primerem T-130; ais nedochází k detegovatelné hybridizaci s jinými undskamery· Oak js znázorněno na obrázku 2, četné z uvedených 39 potenciálních LsIF plasmidů (pL 2; 4, 13, 17,’ 20, 30, 31, 34) rovněž hybridizuji s oběma těmito zkušebními vzorky. Avšak restrikční andonuklsázovou analysou bylo zjištěno, že pouze jadan z těchto plasmidů, plasmid pL 31, obsahuje rovněž interní Bglll fragment o 260 b.p. Digescí pL 31 restrikčním enzymem PstX bylo zjištěno, že velikost této cDNA vložky je přibližně 1000 b.p.Significant hybridization of plasmid DNA from clone 104 was found to be associated with a group of linked primers T-1C and primer T-130; ais not detectable hybridization with other undersamers. Oak is shown in Figure 2, many of the 39 potential LsIF plasmids (pL 2; 4, 13, 17, 20, 30, 31, 34) also hybridize to both of these test samples. However, restriction andonuclease analysis revealed that only the nucleate of these plasmids, plasmid pL31, also contained an internal BglII fragment of 260 b.p. By digestion of pL31 with the restriction enzyme PstX, the size of this cDNA insert was found to be approximately 1000 b.p.

U posléze uvedené úplné Pstl vložky plasmidu pL31 byla analysovéna nukleotidická sekvence jednak Mexamovou-Gilbertovou chemickou metodou /viz časopis Msthods Enzymol.In the latter Pst1 insert of plasmid pL31, the nucleotide sequence was analyzed by the Mexam-Gilbert chemistry (see Msthods Enzymol.).

65, 499-560 (1980)/ a jednak postupem stanovujícím zakončeni didaoxydového řetězce /viz Sm th, Msthods Enzymol. 65, 560-580 (1980)/ po subklonovátíí Sau 3a fragmentů do M13 vektoru. Sekvence DNA jest znázorněna na obrázku 3 pod označením A, Příslušná translačni pročitaci konstrukce zmíněná DNA se dá předpovědět z informaci, které jsou k dispozici o sekvenci aminokyselin interferonové bílkoviny, ze známého rozmezí molekulárních hmotnosti LelF a z relativního výskytu etop-tripletů ve třech možných pročítgcích konstrukcích, a poznaná nukleotidická sekvence dovoluje naopak předpovídat aminokyselinovou sekvenci celého LelF, včetně presekvence neboli signálního peptidu. První ATG iniciační kodon translace byl nalezen vs vzdálenosti 60 nukleotidů od 5zkoncs sekvence, a jest následován o 188 kodonů později TGA terminačnim tripletem; pak je 342 nepřekládaných nukleotidů na 3Z. konci,' následovaných póly (A) sekvenci. Domnělý eignálni peptid (pravděpodobně zahrnutý do sekrece zralého LelF z leukocytů) má délku 23 aminokyselin. Zralý LelF tvořený 165 aminokyselinami má vypočítanou molekulovou hmotnost 19390. Autoři vynálezu označili LelF zakódovaný do plasmidu Pl 31 jako LelF A, Z údajů o sekvencí (viz A“ na obrázku 4) js zřejmé, žs tryptickó psptidy TI a T13 intsrfsronu LelF B odpovídají aminokyselinám 145-149; popřípadě 57 až 61, interferonů LelF A. Skutečné DNA kódující sekvence nalezené v těchto dvou oblastech odpovídají sekvencím reprezentovanýmepojanými primery T 1-C a prxmarem T 13-C (viz obrázek 8).65, 499-560 (1980) and by the didaoxyd chain termination procedure (see Sm th, Msthods Enzymol. 65, 560-580 (1980) / after subcloning the Sau 3a fragments into the M13 vector. The DNA sequence is shown in Figure 3 under the designation A. The corresponding translational reading of the DNA construct can be predicted from the information available about the amino acid sequence of the interferon protein, the known molecular weight range of LelF and the relative occurrence of etop-triplets in three possible constructs. , and the identified nucleotide sequence allows, in turn, to predict the amino acid sequence of the entire LelF, including the presequence or signal peptide. The first ATG translation initiation codon was found at a distance of 60 nucleotides from 5 of the terminus sequence, and is followed by 188 codons later by a TGA termination triplet; then there are 342 untranslated nucleotides at 3 Z. ends, followed by the poles (A) of the sequence. The putative eignal peptide (probably involved in the secretion of mature LelF from leukocytes) is 23 amino acids in length. The mature 165 amino acid LelF has a calculated molecular weight of 19390. The inventors have designated LelF encoded by plasmid P131 as LelF A, the sequence data (see A 'in Figure 4) shows that tryptic psptides T1 and T13 of LelF B correspond to amino acids 145-149; optionally 57 to 61, LelF A interferons.

H. Přímá exprese zralého leukocytárniho interferonů A (LelF A)H. Direct expression of mature leukocyte interferon A (LelF A)

I. ObecněI. General

Následující způsob exprese interferonů LelF A přímo ve formě zralého interfaronového polypeptidů je variantou postupu použitého dřivs pro přípravu lidského růstového hormonu /Goeddsl a spolupracovnici, Nátuře 281, 544-548 (1979)/ do té míry, že zahrnuje kombinováni syntetické (N-terminálni) a komplementární DNA, □ak je znázorněno na obrázku 6, místo štěpeni restrikční endonuklsázou Sau3a jest výhodně umístěno mezi kodony 1 a 3 interferonů LelF A. Byly určeny dva syntetické deoxyCS 273 182 82 oligonukleotidy, které inkorporuji ATS iniciační kodon pro translaci, obnovuji kodon pro aminokyselinu 1 (cystein) a vytváří záchytný (lepivý“) EcoRI konec. Tyto oligomery byly navázány na fragment o 34 b.p. mezi Sau3a - Avall mlety plasmidů pL31. Získaný produkt o 45 b.p. byl navázán na dalši DNA fragmenty a tak byl zkonstruován eyntheticko-přirozený gen o 865 b.p., který kóduje interferon LelF A a který je navázán EcoRI a Pstl restrikčnimi místy. Tento gen byl včleněn do plasmidů pBR 322 mszi jeho EcoRI a Pstl rsstrikčni mista za vzniku- plasmidů pLsIF AI.The following method for expressing LelF A directly in the form of mature interfaron polypeptides is a variant of the method used previously for the preparation of human growth hormone (Goeddsl et al., Nature 281, 544-548 (1979)) to the extent that it involves a combination of synthetic (N-terminal) and complementary DNA, as shown in Figure 6, the Sau3a restriction endonuclease cleavage site is preferably located between codons 1 and 3 of LelF A interferons. Two synthetic deoxyCS 273 182 82 oligonucleotides have been identified that incorporate the ATS translation initiation codon, restoring the codon for translation. amino acid 1 (cysteine) and forms the capture (sticky) EcoRI end. These oligomers were linked to a 34 b.p. fragment. between Sau3a - Avall plasmid milling pL31. The product obtained by 45 b.p. It was ligated to other DNA fragments and thus an 865 bp eynthetic-natural gene was constructed which encodes LelF A and which is bound by EcoRI and PstI restriction sites. This gene was inserted into plasmids pBR 322 m with its EcoRI and PstI restriction sites to give plasmids pLsIF A1.

2. Zkonstruováni tryptofanovóho kontrolního prvku (obsahujícího E. coli trp promotor a operátor, a trp hlavni ribosomové vazebná mleto, ale kterému schází ATG sekvence pro iniciaci translace)2. Construction of a tryptophan control element (containing the E. coli trp promoter and operator, and a trp main ribosome binding mill, but lacking an ATG translation initiation sequence)

Plasmid pGMI nsss tryptofánový (trp) opsron bakterii E. coli, majici deleci Lsl413 /viz Miozzari a spolupracovnici, Bacteriology 133, 1457-1466 (1978)/ a proto sxprimuJs fúzovanou bílkovinu obsahující prvních 6 aminokyselin vedoucí trp sekvence a přibližně poslední třetinu trp E polypeptidů (v dalším označovaný jako LE ), a rovněž sxprimujs trp D polypsptid jako celek, vše pod kontrolou tryptofánového promotorového-operátového systému. Plasmid (20 ^ug) se digsruje restrikčnim enzymem PvuII, který rozštěpí plasmid na pšti místech. Genové fragmenty se pak zkombinuji s EcoRI spojovacími Články (sestávajícími z vlastního komplementárního oligonuklsotidu o sekvenci pCATGAATTCATG), které obsahuji EcoRI rsstrikčni mleto potřebné pro pozdější klonováni do plasmidů obsahujícího EcoRI místo. Na fragmenty DNA (20 yug) získané z pGMI se působí 10 jednotkami DNA ligásy T4 v přítomnosti 200 pmol 5*-fosforylovaného syntetického oligonuklsotidu pCATGAATTCATG a v prostředí 20 mikrolitrů T4 DNA ligásového pufru (20 mM Tris, pH 7,6, 0,5 mM ATP 10 mM bszvodého chloridu hořečnatého, 5 mM dithiothreitolu) při 4 °C přes noc. Roztok ss pak zahřívá 10 minut na 70 °C, aby sa spojováni zastavilo. Spojovací články se rozštěpí digescí endonuklsázou EcoRI, vzniklé fragmenty, nyní s EcoRI konci, ss oddělí za použiti PAGE slsktroforssy (5%ní gsl) a tři největší fragmenty ss isolují, po předchozím obarveni ethidiumbromidem a detekci v ultrafialovém světle, vyříznutím příslušné části gslové vrstvy obsahující žádaný fragment. Každý z uvedených gslových fragmentů ss umísti spolu s 300 mlkrolitry 0,1 x TBE pufru (TBE pufr obsahuje 10,8 g Tris-bass, 5,5 g kyseliny boritó a 0,09 g dvojsodnó soli kyseliny ethylsndiamintstraoctové (NagEDTA) v litru vody) do dialysačniho vaku a podrobí slaktroforsse při 100 V po dobu jedné hodiny v 0,1 x TBE pufru. Vodný roztok z dialysačniho vaku sa vyjme, extrahuje fenolem, extrahuje chloroformem, upraví na 0,2 M roztok chloridem sodným a ONA se ziská, po vysráženl sthanolsm, vs vodném prostředí. Získaný gsn s EcoRI záchytnými kenci, obsahující trp promotor-operátor, ss identifikuje dále popsaným způsobem, který spočítá vs vpraveni fragmentů do plasmidů citlivého na tetraoyklin, který se po zmíněném začleněni fragmentu stane rezistentním vůči tetracyklinu.The plasmid pGMI nsss tryptophan (trp) opsron to E. coli having Ls1413 deletion (see Miozzari et al., Bacteriology 133, 1457-1466 (1978)) and therefore expresses a fusion protein comprising the first 6 amino acids of the trp sequence leader and approximately the last third of trp E polypeptides (hereinafter referred to as LE), and also express the trp D polypeptide as a whole, all under the control of the tryptophan promoter-operat system. The plasmid (20 µg) was digested with the restriction enzyme PvuII, which cleaved the plasmid at five sites. The gene fragments are then combined with EcoRI linkers (consisting of a self-complementary oligonucleotide having the sequence pCATGAATTCATG) that contain the EcoRI restriction milling needed for later cloning into plasmids containing the EcoRI site. For DNA fragments (20 ~ g) obtained from pGMI was treated with 10 units T 4 DNA ligase in the presence of 200 pmoles of a 5 * -fosforylovaného synthetic oligonuklsotidu pCATGAATTCATG and in an environment of 20 .mu.l of T4 DNA ligase buffer (20 mM Tris, pH 7.6, 0 , 5 mM ATP, 10 mM anhydrous magnesium chloride, 5 mM dithiothreitol) at 4 ° C overnight. The solution was then heated to 70 ° C for 10 minutes to stop the coupling. The linkers were cleaved by digestion with EcoRI endonuclease, the resulting fragments, now with EcoRI ends, were separated using PAGE Sclotrophors (5% gsl) and the three largest fragments were isolated after prior staining with ethidium bromide and detection in ultraviolet light by cutting the appropriate portion of the gel layer. containing the desired fragment. Each of said gsl fragments were placed together with 300 ml of 0.1 x TBE buffer (TBE buffer containing 10.8 g Tris-bass, 5.5 g boronic acid and 0.09 g ethyl disodium diamine-stearic acid disodium salt (NagEDTA) in a liter of water ) into a dialysis bag and subjected to slaktroforsse at 100 V for one hour in 0.1 x TBE buffer. The aqueous solution was removed from the dialysis bag, extracted with phenol, extracted with chloroform, adjusted to a 0.2 M solution with sodium chloride, and the ONA was recovered after precipitation with ethanol in an aqueous medium. The resulting gsn with EcoRI capture kits containing the trp promoter-operator is identified by the method described below, which calculates the insertion of the fragments into tetraoycline-sensitive plasmids, which becomes tetracycline resistant after said fragment incorporation.

Plasmid pBRHI /viz Rodrigusz a spolupracovnici, Nuclsic Acids Res. 6, 3267-3287 (1979)/ sxprimujs ampicilinovou rezistenci a obsahuje gsn pro tetracyklinovou rezistenci, ale poněvadž nsni spojen s promotorem, posléze uvedenou rezistenci nsexprimuje. Plasmid Js proto citlivý vůči tetracyklinu. Vpravením promotorového-opsrátorového systému do EcoRI místa štěpeni plasmidů es plasmid stane'rezistentním vůči tetracyklinu.Plasmid pBRHI / see Rodrigusz et al., Nuclsic Acids Res. 6, 3267-3287 (1979) / expresses ampicillin resistance and contains gsn for tetracycline resistance, but since it is not associated with a promoter, it subsequently expresses said resistance. Plasmid Js is therefore sensitive to tetracycline. By introducing the promoter-opsator system into the EcoRI site of the plasmid cleavage site, the es plasmid becomes resistant to tetracycline.

Za tim účelem se plasmid pBRHI digeruje reetrikčni endonuklsázou EcoRI, enzym se odstraní fenolovou extrakci a následující chloroformovou extrakci a po vysráženl sthanolsm se DNA ziská vs vodném prostředí. Získané molekula DNA ee pomoci T4 DNA ligásy, v oddělených reakčnich směsish, váže shora popsaným způsobem s každým zs tři ONA fragmentů získaných shora uvedeným postupem. Vzniklé DNA, obsažená v rsakčni směsi, se použije k transformaci příslušných bakterii E. coli K-12, kmene 294, za použiti standardních pracovních technik /viz Ksrshfisld a spolupracovnici, Proč. Nati. Acad. Sci.To this end, the plasmid pBRHI was digested with EcoRI reetric endonuclease, the enzyme removed by phenol extraction followed by chloroform extraction, and after precipitation of the DNA, the DNA was recovered in an aqueous medium. The DNA molecule obtained, using separate T 4 DNA ligase, in separate reaction mixtures, binds to each of the three ONA fragments obtained as described above, as described above. The resulting DNA contained in the reaction mixture was used to transform the respective E. coli K-12 strain 294 using standard techniques (see Ksrshfisld et al., Proc. Nati. Acad. Sci.

USA 71, 3455-3459 (1974)/. Bakterie ss pak umísti na LB (Luria-Bsrtani) agarové desky obsahující 20 ^ug/mol ampicilinu a 5 yug/ml tetracyklinu.. Kolonie bakterii rezistentních na tetraoyklin se vyberou, izoluje se plasmidické DNA a přítomnost žádaného frag11USA 71, 3455-3459 (1974)]. The bacteria are then plated on LB (Luria-Bsrtani) agar plates containing 20 µg / mol ampicillin and 5 µg / ml tetracycline. Colonies of tetraoycline-resistant bacteria are selected, plasmid DNA is isolated and the presence of the desired fragments is isolated.

CS 273 182 B2 mentu ee potvrdí restrikčni enzymatickou analysou* Získaný plasmid byl označen jako pBRHtrp.CS 273 182 B2 was confirmed by restriction enzyme analysis. The plasmid obtained was designated as pBRHtrp.

Digescí virového genomu hepatitidy B enzymy EcoRI a BamHI se obvyklým způsobem získé produkt, který se začlení do EcoRI a BamHI restrikčních mlet plasmidu pGH6 /viz Goeddel a spolupracovnici, Nátuře 281, 544 (1979)/ za vzniku plasmidu pHS32. Získaný plasmid pHS32 ss rozštěpí enzymem Xbal, směs se extrahuje fenolem, pak ee extrahuje chloroformem a vysráží ethanolem. Na získaný rozštěpený plasmid ss pak působí 1 mikrolitrera E. coli DNA polymsrázy I, Klenowovým fragmentem (Boehringer-Mannheim) v prostředí 30 mikrolitrů polymerázového pufru (tj. 50 mM fosforečnanu draselného, pH 7,4, 7 mM bezvodého chloridu hořečnatóho a 1 mM /3-merkaptoethanolu), obsahující 0,1 mM dTTP a 0,1 mM dCTP, po dobu 30 minut při O °C a pak 2 hodiny při 37 °C. Při této rsakci se doplní dva zs 4 nukleotidů komplementárních k 5' vyčnívajícímu konci Xbal štěpícího místa :By digesting the hepatitis B viral genome with the EcoRI and BamHI enzymes, a product is obtained in a conventional manner, which is incorporated into EcoRI and BamHI restriction milling of plasmid pGH6 (see Goeddel et al., Nature 281, 544 (1979)) to produce plasmid pHS32. The resulting plasmid pHS32 was digested with XbaI, extracted with phenol, then extracted with chloroform and ethanol precipitated. The digested plasmid ss is then treated with 1 microliter of E. coli DNA polymase I, Klenow fragment (Boehringer-Mannheim) in an environment of 30 microliter of polymerase buffer (i.e. 50 mM potassium phosphate, pH 7.4, 7 mM anhydrous magnesium chloride and 1 mM (3-mercaptoethanol) containing 0.1 mM dTTP and 0.1 mM dCTP for 30 minutes at 0 ° C and then 2 hours at 37 ° C. In this reaction, two of the 4 nucleotides complementary to the 5 'protruding end of the XbaI cleavage site are added:

5' CTAGA- 5' CTAGA -3' T—— 3' TCT Inkorpuji se dva nukleotidy, dC a dT,' a vznikne konec se dvěma 5' vyčnívajícími nukleotidy. Tento lineární zbytek plasmidu pHS32 (izolovaný po extrakci fenolem, extrakci chloroformem a vysráženi e'thanolem ve vodném prostředí) ee rozštěpí restrikčním enzymem EcoRI. Velký plasmidický fragment se odděli od menšího EcoRI - Xbal fragmentu PAGE elektroforésou a'izoluje se elektroeluci. Tento ONA-fragment plasmidu pHS32 (0,2 ^ug) se naváže, za podmínek podobných těm, které byly popsány výše, na EcoRI - Taql fragment tryptofánového operonu (0,01 ^ug) získaného z pBRHtrp.5 'CTAGA - 5' CTAGA -3 'T - 3' TCT Two nucleotides, dC and dT, 'are inserted and the end is formed with two 5' protruding nucleotides. This linear residue of the plasmid pHS32 (isolated after phenol extraction, chloroform extraction and ethanol precipitation in aqueous medium) was cleaved with the restriction enzyme EcoRI. The large plasmid fragment was separated from the smaller EcoRI-XbaI fragment by PAGE electrophoresis and electroelution was isolated. This ONA fragment of plasmid pHS32 (0.2 µg) was ligated, under conditions similar to those described above, to an EcoRI-Taq1 fragment of the tryptophan operon (0.01 µg) obtained from pBRHtrp.

Při tomto shora popsaném postupu navazováni fragmentu z plasmidu pHS32 na EcoRI - Taql fragment se Taql vyčnívající konec naváže na Xbal zbývající vyčnívající konec, i když jeho base nejsou kompletně spárovány podle Watsona a Grickova principu:In the above procedure of binding the fragment from plasmid pHS32 to the EcoRI-Taq1 fragment, the Taq1 protruding end binds to the XbaI remaining protruding end, although its bases are not completely paired according to Watson and Grick's principle:

-T CTAGA - __TCTAGA+- CTAGA - __TCTAGA +

-AGC TCT- -AGCTCT-Část takto získané reakční směsi ligantů se transformuje do buněk bakterii E. coli 294, pak ss na buňky působí teplem a přeočkují se na LB agarové desky obsahující ampicilin. Selekci se získá 24 kolonii rezistentních vůči ampicilinu, která se kultivuji dále na 3 ml LB půdy (Lakria-Bertani) a plasmid ae izoluje, Seet z těchto plaamidů má Xbal štěpné místo regenerované pomocí bakteriemi E. coli katelysovaného přepárováni a replikace DNA:-AGC TCT -AGCTCT A portion of the ligand reaction mixture thus obtained is transformed into E. coli 294 cells, then the cells are heat treated and inoculated onto LB agar plates containing ampicillin. Selection yields 24 ampicillin resistant colonies, which are cultured further on 3 ml of LB broth (Lakria-Bertani) and plasmid and isolated, Seet from these plaamides has an XbaI cleavage site regenerated by E. coli catalysed mismatching and DNA replication:

-TCTAGA- -TCTAGA-AGCTCT—= -AGATCTBylo rovněž nalezeno, že ee tyto plasmidy štěpí jak restrikčním enzymem EcoRI, tak enzymem Hpal, a žs poskytuji očekávané štěpné fragmenty. Oeden z těchto plasmidů, oznsčený pTrpl4, byl použit pro expresi hstsrolognich polypeptidů, jak js popsáno dále.-TCTAGA- -TCTAGA-AGCTCT- = -AGATCT It has also been found that these plasmids are cleaved by both the EcoRI and Hpa I enzymes and provide the expected cleavage fragments. One of these plasmids, designated pTrp14, was used to express histologic polypeptides as described below.

Plasmid pHGH 107 /viz Goeddel a spolupracovnici, Nátuře 281, 544 (1979)/ obsahuje gen pro lidský růstový hormon, složený z 23 aminokyselinových kodonů produkovaných ze syntetických DNA fragmentů, a ze 163 aminokyselinových kodonů získaných z komplementární DNA vytvořené cestou reversní transkripce informační RNA pro lidský růstový hormon. Tento gen, i když mu schází kodony “pre -sekvence lidského růstového hormonu, obsahuje ATG kodon pro iniciaci translace. Gen se izoluje z 10 ^ug plasmidu pHGH postupem zahrnujícím nejprve působeni restrikčního enzymu EcoRI a poté připojení dTTP a dATP na získaný fragment působením Klenowova fragmentu E. coli ONA polymerazy I, jak bylo popsáno výěe. Vzniklý plasmid se izoluje extrakci fenolem, extrakci chloroformem a vyeráCS 273 182 B2 žením ethanolem, .a poté se rozštěpí enzymem BamHI.Plasmid pHGH 107 (see Goeddel et al., Nature 281, 544 (1979)) contains a human growth hormone gene consisting of 23 amino acid codons produced from synthetic DNA fragments and 163 amino acid codons obtained from complementary DNA generated by reverse transcription of information RNA for human growth hormone. This gene, although lacking the human growth hormone pre-sequence codons, contains an ATG translation initiation codon. The gene was isolated from 10 µg of plasmid pHGH by a procedure comprising first treating with the restriction enzyme EcoRI and then attaching the dTTP and dATP to the obtained fragment by treatment with the Klenow fragment of E. coli ONA polymerase I as described above. The resulting plasmid is isolated by phenol extraction, chloroform extraction, and digested with ethanol, then digested with BamHI.

Vzniklý fragment obsahující gen pro lidský růstový hormon (HGH) se izoluje PAGE elektroforesou a následující elektroelucí. Výsledný fragment DNA obsahuje rovněž prvních 350 nukleotidů strukturálního genu pro rezietenci vůči tetracyklinu, ale chybí mu tetracyklinový promotorový-operátorový systém, takže, když ee v následujícím postupu tento fragment začlení do plasmidu, který je schopný exprese, lze plasmidy obsahující tuto vložku určit podle obnoveni tetracyklinové rezistence· Protože EcoRI zakončeni fragmentu je doplněno postupem za použití Klenowovy polymerázy I, má zmíněný fragment jeden tupý a jeden lepivý“ konec, což mu zajiětuje správnou orientaci, když je pozdě ji včleněn do plasmidu schopného exprese·The resulting fragment containing the human growth hormone (HGH) gene was isolated by PAGE electrophoresis followed by electroelution. The resulting DNA fragment also contains the first 350 nucleotides of the structural gene for tetracycline resistance, but lacks the tetracycline promoter-operator system, so that when it incorporates this fragment into a plasmid capable of expression in the following procedure, plasmids containing the insert can be determined by renewal tetracycline resistance · Since the EcoRI end of the fragment is complemented by the Klenow polymerase I procedure, the fragment has one blunt and one sticky end, which ensures it is correctly oriented when it is later incorporated into a plasmid capable of expression ·

V dalším se připraví exprese schopný plasmid pTrp 14 tak, aby mohl přijmout shora uvedeným způsobem získaný fragment obsahující HGH gen. Plasmid pTrp 14 se za tim účelem digeruje restrikčním enzymem Xbal a a vzniklé lepivé konce fragmentu se doplní postupem s Klenowovou polymerázou I za použiti trifosfátů dATP, dTTP, dGTP a dCTP. Po extrakci získané směsi fenolem, extrakci chloroformem a vysráženi ethanolem se na ziska nou DNA působí enzymem BamHI a vzniklý velký fragment plasmidu se izoluje PAGE elektroforesou a elektroelucí. Uvedený fragment odvozený od pTrp 14 má jeden tupý a jeden lepivý konec, které mu zajištuji správnou orientaci při rekombinaci s výše popsaným fragmentem obsahujícím HGH gsn.Next, an expression capable plasmid pTrp 14 is prepared so that it can receive the HGH gene-containing fragment obtained as described above. For this purpose, plasmid pTrp14 was digested with the restriction enzyme XbaI, and the resulting sticky ends of the fragment were complemented by the Klenow polymerase I procedure using dATP, dTTP, dGTP and dCTP triphosphates. After extraction of the resulting mixture with phenol, extraction with chloroform and ethanol precipitation, the DNA obtained is treated with BamHI and the resulting large plasmid fragment isolated by PAGE electrophoresis and electroelution. Said fragment derived from pTrp 14 has one blunt and one sticky end which provides it with the correct orientation when recombined with the above described fragment containing HGH gsn.

Fragment obsahující HGH gsn a posléze uvedený fragment pTrp 14 AXba - BamHI se zkombinuji a navzájem naváži za podmínek podobných těm, které byly popsány výše. Doplněné Xbal a EcoRI konce se naváži spolu s tupými vazebnými konci za obnoveni obou XBal a EcoRI štěpných míst:The fragment containing HGH gsn and the latter fragment pTrp 14 AXba-BamHI were combined and ligated together under conditions similar to those described above. The added XbaI and EcoRI ends are ligated together with blunt binding ends to restore both XBaI and EcoRI cleavage sites:

doplněný Xbal konec doplněný EcoRI konec iniciace HGH genucomplemented with XbaI end complemented with EcoRI end of HGH gene initiation

-TCTAG-TCTAG

AATTCTATG—TCTAGAATTCTATG-s*AATTCTATG — TCTAGAATTCTATG-s *

-AGATC-AGATC

TTAAGATAC- -AGATCTTAAGATACTTAAGATAC -AGATCTTAAGATAC

Xbal EcoRIXbal EcoRI

Touto konstrukci se rovněž obnoví rezistence genu vůči tetracyklinu. Oelikož plasmid pHGH 107 exprimuje tetracyklinovou rezistencí z promotoru ležícího proti proudu od HGH genu (lac promotor), umožňuje tato výsledná konstrukce plasmidu, označeného jako pHGH 207, expresi genu pro tetracyklinovou rezistenci za kontroly tryptofánového promotoru-operátoru. Směs produktů ligace se transformuje do bakterií E. coli 294 a po kultivaci na LB agarových deskách s půdou obsahující 5 ^ug/ml tetracyklinu se vyberou rezistentní kolonie.This construction also restores the resistance of the gene to tetracycline. Since plasmid pHGH 107 expresses tetracycline resistance from the upstream promoter of the HGH gene (lac promoter), this resulting construction of a plasmid designated pHGH 207 allows expression of the tetracycline resistance gene under the control of the tryptophan promoter-operator. The ligation product mixture is transformed into E. coli 294 and resistant colonies are selected after cultivation on LB agar plates with soil containing 5 µg / ml tetracycline.

Plasmid pHGH se digeruje restrikčním enzymem EcoRI a PAGE elektroforesou a následu jíci elektroelucí se izoluje fragment o 300 b.p. obsahujíc! trp promotor, operátor a vazebné místo pro tryptofénový hlavni ribosom, kterému však acházi ATG sekvence pro iniciaci translace. Tento DNA fragment sa zaklonuje do EcoRI štěpného mista plasmidu pLelF A, Exprese schopné plasmidy obsahující shora uvedený modifikovaný trp regulon (trp operon bakterie E. coli, ze kterého je vynechaná útlumová sekvence, aby se kontrolovatelně zvýšily hladiny exprese) lze kultivovat do stadia předem stanovených hladin na živné půdy obsahující přídatný tryptofan v množství dostatečném k potlačení promotorového-operátorového systému, pak se tryptofan odstraní, dojde k derepresi systému a nastane exprese žádaného produktu.The pHGH plasmid was digested with the restriction enzyme EcoRI and PAGE by electrophoresis, followed by electroelution to isolate a fragment of 300 b.p. containing! the trp promoter, operator, and tryptophene main ribosome binding site, but lacking ATG translation initiation sequences. This DNA fragment is cloned into the EcoRI cleavage site of plasmid pLelF A. Expression-capable plasmids containing the aforementioned modified trp regon (the E. coli trp operon from which the attenuation sequence is omitted to control the expression levels controllable) can be cultured to predetermined stages. levels on the broth containing the additional tryptophan in an amount sufficient to suppress the promoter-operator system, then tryptophan is removed, the system is derepressed, and the desired product is expressed.

Uvedený postup je podrobněji popsán níže a znázorněn na obrázku 6. Plasmid pL 31 (250 /ug) se digeruje restrikčním enzymem Pstl a gelovou elektrofořežou na 6%nim póly13This procedure is described in more detail below and shown in Figure 6. Plasmid pL 31 (250 µg) was digested with the restriction enzyme PstI and gel electrophoresis at 6%.

CS 273 182 B2 akrylamidovém gelu sa izoluje vložený fragment o 1OOO b.p. Elektroeluci se z gelu získá asi 40 ^ug žádaného vloženého fragmentu, který se za účelem dalšího zpracováni enzymatickou digesci rozdělí na 3 alikvotní podíly:CS 273 182 B2 acrylic gel gel is used to insert the inserted fragment of 10000 b.p. About 40 µg of the desired inserted fragment is obtained from the gel by electroelution and is divided into 3 aliquots for further digestion by enzymatic digestion:

a) Asi 16 /Ug vzorek tohoto fragmentu se částečně digeruje 40 jednotkami endonukleázy BglII po dobu 45 minut při 37 °C a reakčni směs se čisti PAGE elektroforesou na 6%nim gelu, získají sa asi 2 ^ug žádaného fragmentu o 670 b.p.a) About 16 µg of this fragment was partially digested with 40 units of BglII endonuclease for 45 minutes at 37 ° C, and the reaction mixture was purified by PAGE electrophoresis on a 6% gel, yielding about 2 µg of the desired fragment of 670 b.p.

b) Druhý vzorek (8 ^ug) Pst fragmentu o 1000 b.p. se štěpí endonukleázami Avall a BglII; gelovou chromatografii (PAGE) se získá jeden ^ug uvedeného fragmentu o 150 b.p.b) Second sample (8 µg) of 1000 bp Pst fragment. cleaved with Avall and BglII endonucleases; gel chromatography (PAGE) yielded one µg of said fragment of 150 b.p.

c) Na 16 y-ug vloženého fragmentu o 1000 b.p. ee působí enzymy Sau3a a Avall; po izolaci elektroforesou na 10%nim polyakrylamidovém gelu se získá asi 0,25 ^ug (10 pmol)) fragmentu o 34 b.p.c) Per 16 µg of 1000 b.p. ee acts by the enzymes Sau3a and Avall; after electrophoresis on a 10% polyacrylamide gel, about 0.25 µg (10 pmol)) of the 34 b.p. fragment was obtained.

Fosfortriesterovou metodou se synthetisuji dva dále uvedené deoxyoligonukleotidy,The two following deoxyoligonucleotides are synthesized by the phosphoryriester method,

5'-dAATTCATGTGT (fragment 1) a 5'-dGATCACACATG (fragment 2). Fragment 2 se fosforyluje ,39 následujícím způsobem: 200 mikrolitrů (asi 40 pmol) (y P)-ATP (dodavatel Amereham, aktivita 5000 Ci/mol) sa vysuší a znovu nasuspenduje ve 30 mikrolitrech pufru složeného z 60 mM Tris-HCl (pH δ), 10 mM bezvodého chloridu hořečnatého a 15 mM/S-merkaptoethanolu, a obsahujícího 100 pmol zmíněného DNA fragmentu a 2 jednotky T4 polynukleotidkinázy. Směs ss zahřívá 15 minut na 37 °C,' pak se přidá 1 mikrolitr 10 mM roztoku ATP, reakce ee nechá probíhat dalších 15 minut při uvedené teplotě a pak se provede inaktivace zahříváním směsi po dobu 15 minut na 70 °C. K reakčni směsi se přidá 100 pmol 5'-OH fragmentu 1 a 10 pmol Sau3a - Avall fragmentu o 34 b.p. a provede se vzájemné navázání fragmentů v 50 mikrolitrech prostředí složeného z 20 mM Tris-HCl (pH 7,5), 10 mM bezvodého chloridu hořečnatého, 10 mM dithiothreitolu, 0,5 mM ATP, v přítomnosti 10 jednotek T4 DNA ligázy, při 4 °C po dobu 5 hodin. Směs ss rozdělí PAGE elektroforesou na 6%nim gelu a elektroeluci se zisků produkt o 45 b.p. Asi 30 ng (1 pmol) posléze zmíněného produktu o 45 b.p. se zkombinuje s 0,5 ^ug (5 pmol) Avall - BglII fragmentu o 150 b.p. a 1 yAig (2 pmol) BglII - Pstl fragmentu o 670 b.p. Vzájemné navázání ee provede působením 20 jednotek T4 DNA ligasy při 20 °C po dobu 16 hodin. Ligasa se Inaktivuje zahříváním na 65 °C po dobu 10 minut a směs ss za účelem odstraněni polymerů genu digeruje enzymy EcoRl a Pstl. Po přečištěni směsi elektroforesou na 6% PAGE ea získá asi 20 ng (0,04 pmol) produktu o 855 b.p. Polovina (10 ng) tohoto produktu se naváže do plasmidu pBR 322 (0/3 /Ug) mezi jeho EcoRl a Pstl štěpná místa. Po transformaci tohoto plasmidu do bakterii E. coli 234 se získá 70 transformantů rezistentních vůči tetracyklinu a citlivých na ampieilin. Plasmidická DNA izolovaná z 18 z těchto transformantů sa digeruje enzymy EcoRl a Pstl. 2 těchto 18 plasmidů obsahovalo 16 EcoRl - Pstl fragment o délce 865 b.p. Oeden ^ug jednoho z těchto fragmentů, pLelF Al, se digeruje enzymem EcoRl a naváže na shora popsaným způsobem připravený EcoRl fragment o 300 b.p. (0,1 /ug), obsahující trp promotor a trp vazsbné místo hlavního ribosomu E, coli, Transformanty obsahující trp promotor se identifikují za použití P-trp zkušebního vzorku ve spojeni se skríningovou metodou pro kolonie bakterií podle Gruneteina-Hognesse. Asymetricky umístěné Xbal štěpné místo v trp gragmentu dovoluje stanovení rekombinantů, ve kterých trp promotor je orientovaný va směru na LalF A gen.5'-dAATTCATGTGT (fragment 1) and 5'-dGATCACACATG (fragment 2). Fragment 2 is phosphorylated, 39 as follows: 200 microliters (about 40 pmol) of (γ P) -ATP (supplier Amereham, activity 5000 Ci / mol) is dried and resuspended in 30 microliters of a buffer consisting of 60 mM Tris-HCl (pH δ), 10 mM anhydrous magnesium chloride and 15 mM β-mercaptoethanol, and containing 100 pmol of said DNA fragment and 2 units of T4 polynucleotide kinase. The mixture was heated at 37 ° C for 15 minutes, then 1 microliter of a 10 mM ATP solution was added, the reaction was allowed to proceed for an additional 15 minutes at this temperature, and then inactivated by heating the mixture at 70 ° C for 15 minutes. 100 pmol of 5'-OH fragment 1 and 10 pmol of Sau3a-Avall fragment of 34 b.p. were added to the reaction mixture. and bind the fragments together in 50 microliters of medium consisting of 20 mM Tris-HCl (pH 7.5), 10 mM anhydrous magnesium chloride, 10 mM dithiothreitol, 0.5 mM ATP, in the presence of 10 units of T4 DNA ligase, at 4 ° C for 5 hours. The mixture was resolved by PAGE on 6% gel and electrophoresed to yield the product by 45 b.p. About 30 ng (1 pmol) of the latter product by 45 b.p. was combined with a 0.5 µg (5 pmol) Avall-BglII fragment of 150 b.p. and 1 µg (2 pmol) of the BglII - PstI fragment of 670 b.p. Ee binding is performed by treatment with 20 units of T4 DNA ligase at 20 ° C for 16 hours. The ligase is inactivated by heating at 65 ° C for 10 minutes and the mixture is digested with the enzymes EcoR1 and PstI to remove gene polymers. Purification of the mixture by electrophoresis on 6% PAGE e gives about 20 ng (0.04 pmol) of 855 b.p. Half (10 ng) of this product was ligated into plasmid pBR 322 (0/3 / Ug) between its EcoR1 and PstI cleavage sites. Transformation of this plasmid into E. coli 234 yields 70 tetracycline-resistant and ampieilin-sensitive transformants. Plasmid DNA isolated from 18 of these transformants was digested with EcoR1 and PstI. 2 of these 18 plasmids contained a 16 EcoR1-PstI fragment of 865 b.p. One µg of one of these fragments, pLelF A1, was digested with EcoR1 and ligated to the 300 bp EcoR1 fragment prepared as described above. (0.1 µg) containing the trp promoter and the major ribosome E binding site, coli. The trp promoter-containing transformants were identified using a P-trp assay in conjunction with the Grunetein-Hogness bacterial colony screening method. The asymmetrically located XbaI cleavage site in the trp grament allows the determination of recombinants in which the trp promoter is oriented in the direction of the LalF A gene.

I, In vitro a in vivo účinnost interferonu LelF AI, In vitro and in vivo efficacy of interferon LelF A

Pro stanoveni interferonové účinnosti sa připrav! extrakty následujícím způsobem:Prepare for determination of interferon activity. extracts as follows:

Kultury o objemu 1 ml se pěstuji na živné půdě L obsahující 5 /ug/ml tetracyklinu do hodnoty absorbance při 550 nm (Ag50) asi 1,0/ pak ss kultura zředí do 25 ml M9 živné půdy obsahující 5 /Ug/ml tetracyklinu. Když AggQ dosáhne 1,0, odeberou sa 10 ml vzorky, které se odstředí, a získané buňky se suspenduji v 1 ml roztoku obsahujícím 15 % sacharosy, 50 mM Tris-HCl (pH 8,0) as50 mM EOTA (kyseliny ethylandiamintetraoctové). K suspensi se přidé Jeden mg lysozymu a po 5 minutách stáni při O °C se buňky rozruší ultrazvukem. Vzorky se centrifuguji 10 minut (15000 otáček za minutu) a v supernatantu seCulture 1 ml was grown in L broth containing 5 / ug / ml tetracycline to the absorbance values at 550 nm (G50) of about 1.0 / SS then culture was diluted into 25 mL of M9 culture medium containing 5 / ug / ml tetracycline . When AggQ reaches 1.0, 10 ml samples are taken and centrifuged, and the obtained cells are suspended in 1 ml solution containing 15% sucrose, 50 mM Tris-HCl (pH 8.0) and 50 mM EOTA (ethylandiaminetetraacetic acid). . One mg of lysozyme is added to the suspension, and after standing for 5 minutes at 0 ° C, the cells are disrupted by ultrasound. The samples are centrifuged for 10 minutes (15,000 rpm) and the supernatant is collected

5*“^5 * “^

CS 273 182 B2 stanoví intarferonové účinnost srovnáním se standardy interferonu LelF pomocí testu inhibica cytopatické účinnosti (CPE). Ke stanoveni počtu molekul interferonu (IF) na jednu buňku se používá LelF o specifické aktivitě 4 χ 108 jednotek/mg.CS 273 182 B2 determines intarferon potency by comparison with interferon LelF standards using the cytopathic potency inhibition (CPE) assay. LelF with a specific activity of 4 x 10 8 units / mg is used to determine the number of interferon (IF) molecules per cell.

□ak je zřejmé z tabulky 1, klon pLsIF A trp 25, vs kterém je trp promotor začleněn v žádané orientaci, dává v tomto testu vysoké hladiny aktivity (va výši 2,5 x 10° jednotek v litru). Oak vyplývá z tabulky 2, interferon produkovaný bakteriemi E. coli K-k2 kmene 294/pLeIF A trp 25 se chová jako autentický lidský interferon LelF; je stálý vůči kyselému prostřed! o pH 2 a jeho účinnost je neutralizována králičími protilátkami lidských leukocytárnich interferonů. Uvedený interferon má zdánlivou molekulovou hmotnost asi 20000.As shown in Table 1, clone pLsIF A trp 25, in which the trp promoter is incorporated in the desired orientation, gives high levels of activity (at 2.5 x 10 ° units per liter) in this assay. Oak shows in Table 2, the interferon produced by E. coli K-k2 strain 294 / pLeIF A trp 25 behaves as authentic human interferon LelF; is stable to acidic environment! o pH 2 and its activity is neutralized by rabbit antibodies of human leukocyte interferons. Said interferon has an apparent molecular weight of about 20,000.

Účinnost interferonu in vivo vyžaduje přítomnost makrofágů a přirozených umrtvujících (NK) buněk, přičemž se zdá, že způsob jeho účinnosti in vivo spočívá ve stimulaci těchto buněk. 3e proto možné, že interferon produkovaný bakteriemi E. coli 294/pLeXF A 25, i když má antivirovou účinnost v testech na buněčných kulturách, by nemusel být účinný u infikovaných, živočichů. Kromě toho, in vivo antivirová účinnost bakteriálně produkovaného, neglykosylovanóho interferonu LelF A by mohla být rozdílná' od glykosylovaného LelF pocházejícího z lidských leukocytů. Proto biologická účinnost bakteriálně syntatisovaného interferonu LelF A (o čistotě 2 %) byla srovnávána s účinnosti interferonu z lidských kůži pokrytých leukocyty (LelF, čistota 8 %) u virové infekce letálni encefalomyokarditidy (EMC) hranostajů (viz tabulka 3).The in vivo efficacy of interferon requires the presence of macrophages and natural killing (NK) cells, and its mode of in vivo efficacy appears to be by stimulating these cells. It is therefore possible that the interferon produced by E. coli 294 / pLeXF A 25, although it has antiviral activity in cell culture assays, may not be effective in infected animals. In addition, the in vivo antiviral activity of bacterially produced, non-glycosylated LelF A interferon could be different from glycosylated LelF derived from human leukocytes. Therefore, the biological efficacy of bacterially synthesized interferon LelF A (2% purity) was compared to that of human leukocyte-coated interferon (LelF, purity 8%) in the lethal encephalomyocarditis (EMC) viral infection of stoat (see Table 3).

Tabulka 1. Intarferonové účinnost extraktů z E. coliTable 1. Intarferon activity of E. coli extracts

E. coli K-12 E. coli K-12 buněčná cellular IF účinnost IF efficiency počat LelF Počat LelF kmen 294 strain 294 hustota density jsdnotky/ml units / ml molekul of molecules transformovaný transformed (počet buněk (number of cells kultury culture na buňku per cell plasmidem plasmid na ml) per ml) pLalF A trp 25 pLalF A trp 25 3,5 χ 108 3.5 χ 10 8 36 000 36 000 9 000 9 000 pLelF A trp 25 pLelF A trp 25 1,8 χ 109 1.8 χ 10 9 250 000 250 000 12 000 12 000

Tabulka 2. Srovnáni Table 2. Comparison účinnosti extraktů efficiency of extracts z bakterii from bacteria E. coli 294/pLaIF A 25 E. coli 294 / pLaIF A25 ss standardním interfsronam with standard interfsronam LelF x LelF x Extrakt Extract Interferonová účinnost (jednotky/ml) Interferon efficiency (units / ml) bez úpravy without modification při pH 2 at pH 2 v přítomnosti králičích anti-lidských leukocytárnich protilátek in the presence of rabbit anti-human leukocyte antibodies extrakt z E. coli 294/pLeIF A trp 25 E. coli 294 / pLeIF A trp 25 extract 500 500 500 500 10 10 LelF standard LelF standard 500 500 500 500 10 10 x/f Extrakt z bakterií x / f Extract of bacteria E. coli 294/pLeIF A trp 25 o E. coli 294 / pLeIF A trp 25 o intarferonové intarferonové aktivitě 250 000 jed- 250 000 activity

notak na ml, popsaný v tabulce 1, byl zředěn 500krát minimální základní živnou půdou na specifickou aktivitu 500 jednotek/ml.Note per ml, as described in Table 1, was diluted 500-fold with a minimum baseline broth to a specific activity of 500 units / ml.

Standard leukocytárniho interferonu (z Wadleyova ústavu), předem otitrovaný vůči NIH leukocytárnlmu interferonovému standardu, byl rovněž zředěn na konečnou koncentraci 500 U/ml. Alikvotnl podíly o objemu 1 ml byly upraveny kyselinou chlorovodíkovou o kon—The leukocyte interferon standard (from Wadley Institute), pre-titrated against the NIH leukocyte interferon standard, was also diluted to a final concentration of 500 U / ml. Aliquots of 1 ml were treated with hydrochloric acid to make

CS 273 182 B2 centraci IN na pH 2, vzorky inkubovány 52 hodin při 4 °C, zneutralizovány přidáním roztoku hydroxidu draselného a stanovena IF aktivita pomoci standardního testu CPE inhibice. Siné alikvotní podíly o objemu 25 mikrolitrů ze vzorků o koncentraci 500 jednotek/ml (nijak neošetřené) byly inkubovány s 25 mikrolitry králičí protilátky lidského leukocytárního interferonu při 37 °C po dobu 60 minut, vzorky byly 5 minut centrifugovány při 12000 násobku g a supernatant testován.CS 273 182 B2 by concentrating IN to pH 2, samples incubated for 52 hours at 4 ° C, neutralized by addition of potassium hydroxide solution, and IF activity determined using a standard CPE inhibition assay. 25 µl aliquots of 500 units / ml (not treated) samples were incubated with 25 µl of rabbit anti-human leukocyte interferon antibody at 37 ° C for 60 minutes, centrifuged at 12000 x g for 5 minutes, and the supernatant tested.

Tabulka 3. Antivirová účinnost různých LelF preparátů vůči EMG virové infekci hranostajůTable 3. Antiviral activity of various LelF preparations against EMG viral infection of stoat

Ošetření interferonem Treatment interferon Přežiti Survival Oednotky tvořeni sérových destiček/ml Units of serum platelet formation / ml den 2 den 3 day 2 day 3 den 4 den 4 Kontrola Control A AND e E (bakteriální (bacterial 0/3 0/3 10) 10) 3x10^ 3x10 ^ 10) 10 ) bílkoviny) proteins) 0 0 3 0  3 0 104 10 4 1200()3,4x10^ 1200 () 3.4x10 ^ 0 J 0 J 0 0 v in Bakteriální Bacterial 3/3 3/3 • 0 • 0 0 0 0 0 LelF A LelF A 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Standardní LelF Standard LelF 3/3 3/3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0

K testování byli použiti samci hranostajů o průměrné hmotnosti 713 g, kteří neměli před infikováním protilátky vůči EMC viru. Zvířata byla infikována intramuskulárně dávkou 100 x LDgQ EMC viru (zjištěno u myši). V kontrolní skupině uhynuli hranostajové za 134, 158 a 164 hodin po infikováni. Ošetřeni zvířat interferonem v dávce 10® jednotek bylo prováděno intravenosní cestou v intervalech -4, +2, 23, 29, 48, 72, 168 a 240 hodin, vztaženo na dobu, kdy bylo provedeno infikování. Použitý bakteriální leukocytární interferon byla frakce ze sloupcové chromatografie lysátu bakterií E. coli 294/pLeIF A 25 o specifické aktivitě 7,4 x 10® jednotak/mg bílkoviny. Oako kontrolních bakteriálních bílkovin bylo použito bílkovin z ekvivalentní frakce sloupcové chromatografie lysátu bakterii E. coli 294 pBR 322 o dvojnásobné koncentraci celkových bílkovin. Oako standardního leukocytárního interferonu bylo použito interferonu indukovanég ho chromatograficky do specifické aktivity 32 x 10 jedhotek na mg bílkoviny.Male ostriches with an average weight of 713 g and who had no antibody to the EMC virus prior to infection were used for testing. Animals were infected intramuscularly with a dose of 100 x LDgQ EMC virus (found in mice). In the control group, the stoat died 134, 158 and 164 hours after infection. Treatment of animals with 10-unit interferon was administered by intravenous route at intervals of -4, +2, 23, 29, 48, 72, 168 and 240 hours, based on the time at which infection was performed. The bacterial leukocyte interferon used was a fraction from column chromatography of E. coli 294 / pLeIF A 25 with a specific activity of 7.4 x 10 6 units / mg protein. Oako control bacterial proteins were used from the equivalent fraction of column chromatography of E. coli 294 pBR 322 lysate at twice the total protein concentration. Oako standard leukocyte interferon was used interferon induced by chromatography to specific activity of 32 x 10 units per mg protein.

Hranostajové v kontrolní skupině vykazovali postupující lethargii, ztrátu rovnováhy, ochablost a ochrnutí zadních končetin a zalévání oči začínající asi 8 hodin před smrti. Interferonem ošetřeni hranostajové nevykazovali žádnou z těchto abnormalit; zůstávali po celý čas aktivní a nevyvinula se u nich virémie. Oeden hranostaj z kontrolní skupiny, u kterého ee nevyvinula virémie během 4 dnů, uhynul nejpozději z neléčených zvířat (za 164 hodin po infikováni), ale vykázal vysoké titry viru v srdci a v mozku post mortem. U hranostajů ošetřených interferonem se nevytvořily protilátky proti EMC viru, jak bylo stanoveno za 14 a za 21 dnů po infikováni. Tyto výsledky ukazují, že aritivirálni účinnost LelF preparátů u infikovaných zvířat lze přisoudit pouze interferonu, poněvadž kontaminující bílkoviny v bakteriálních preparátech a v preparátech z lidských leukocytů jsou zcela rozličné. Tyto výsledky dále naznačuji, že glykosylace není pro in vivo antivirovou účinnost interferonu LelF A potřebná.Stoats in the control group showed progressive lethargy, loss of balance, flaccidity and paralysis of the hind limbs, and watering of eyes beginning about 8 hours before death. Interferon-treated stoats did not show any of these abnormalities; they remained active at all times and did not develop viremia. One of the control group, who had not developed viremia within 4 days, died at least from untreated animals (164 hours after infection), but showed high virus titers in the heart and brain post mortem. Interstates treated with interferon did not develop antibodies to the EMC virus as determined at 14 and 21 days after infection. These results show that the arithiviral efficacy of LelF preparations in infected animals can only be attributed to interferon, since the contaminating proteins in bacterial preparations and in human leukocyte preparations are quite different. These results further suggest that glycosylation is not required for the in vivo antiviral activity of interferon LelF A.

CS 273 182 B2CS 273 182 B2

0. Izolace dalších cDNA pro ostatní leukocytárni interferonyIsolation of other cDNAs for other leukocyte interferons

Z plně charakterizovaného plasmidů obsahujícího interferonovou LelF A cDNA se vyřízne DNA enzymem Pstl, izoluje pomoci elekfroforézya označí radioaktivním P. Získaná radioaktivně značená DNA se použije jako zkušební vzorek k výběrovému tříděni dalších transformantů bakterii E. coli 294, získaných stojným postupem jak bylo popsáno v části C, pomoci metody skriningu kolonii in šitu podle Grunsteina a Hognesse (viz výše). Izoluji se kolonie, které hybridlzuji v rozličných množstvích ss zkušebním vzorkem. štěpením těchto kolonii a deseti hybridizujicích kolonii popsaných v části G pomoci enzymu Pstl byla izolována plaemidickó DNA, která byla charakterizována třemi rozdílnými metodami. Zmíněná Pstl fragmenty byly nejprve charakterizovány na základě vzorků získaných digesci restrikčniml sndonukleázami, enzymy Bgl II, Pvu II a Eco RI. Tato analysa umožnila charakterizovat nejméně osm rozličných typů (LsIF A, LsIF B, LsIF C, LelF D, LeiF E, LeiF F, LelF G a LeiF H), znázorněných na obrázku 5, na kterém je přibližně uvedeno umístěni různých restrikčnlch míst ve vztahu k současné znalosti o presskvenci a kódující sekvenci LelF A. Deden z těchto fragmentů, LelF D, je pravděpodobně identický 9 DNA fragmentem popsaným Nagatou a spolupracovníky v časopisu Nátuře 284, 316-320 (1980).PstI DNA was excised from fully characterized plasmids containing interferon LelF A cDNA, isolated by electrophoresis and labeled with radioactive P. The radiolabeled DNA obtained was used as a test sample for the selective screening of other E. coli 294 transformants obtained by a standard procedure as described in C, using the in situ colony screening method of Grunstein and Hogness (see above). Colonies are isolated which hybridize in varying amounts with the test sample. by digesting these colonies and the 10 hybridizing colonies described in Part G with PstI, plaemid DNA was isolated and characterized by three different methods. Said Pst1 fragments were first characterized on the basis of samples obtained by digestion with restriction snducleases, enzymes Bgl II, Pvu II and Eco RI. This analysis made it possible to characterize at least eight different types (LsIF A, LsIF B, LsIF C, LelF D, LeiF E, LeiF F, LelF G and LeiF H) shown in Figure 5, which approximately shows the location of the various restriction sites in relation to The deden of these fragments, LelF D, is probably identical to the 9 DNA fragment described by Nagata and collaborators in Nature 284, 316-320 (1980).

Za druhé byly některé ze zmíněných DNA testovány pomocí hybridizačnich selekčních testů popsaných Clevelandsm a spolupracovníky v časopisu Cell 20, 95-105 (1980), na základě schopnosti selektivně odstraňovat LalF mRNA z KG-1 buněčné RNA obsahujíc! poly-A řetězce. V tomto tastu byly LelF A, B, C,a F positivní. Za třetí, posledně zmíněné Pst fragmenty byly včleněny do express schopného plasmidů, zmíněným plasmidem byly transformovány bakterie E. coli 294 a fragmenty byly exprimovány. Všechny produkty zminěné exprese, o kterých se předpokládalo, že to jsou pre-interferony, byly positivní v CPE testu na interferonovou aktivitu, ačkoliv v případě LelF F fragmentu byla nalezena jen okrajová účinnost. Kromě uvedeného charakterizováni byla u všech popsaných LelF typů stanovena sekvence.Second, some of the DNAs were tested using the hybridization selection assays described by Clevelands and co-workers in Cell 20, 95-105 (1980), based on the ability to selectively remove LalF mRNA from KG-1 cellular RNA containing cell RNA. poly-A chains. In this paste, LelF A, B, C, and F were positive. Third, the latter Pst fragments were inserted into an expression-capable plasmid, E. coli 294 was transformed with said plasmid, and the fragments were expressed. All of the expression products thought to be pre-interferons were positive in the CPE assay for interferon activity, although only marginal efficacy was found for the LelF F fragment. In addition to this characterization, a sequence was determined for all LelF types described.

K, Přímá exprese druhého zralého leukocytárniho interferonů (LelF B)K, Direct expression of second mature leukocyte interferon (LelF B)

Bylo zjištěno, že sekvence prvních čtrnácti nukleotidů izolovaného fragmentu obsahujícího gen pro zralý interferon LelF B je stejná u typů A i B. Z plasmidů pLelF A 25 byl proto izolován fragment nesoucí trp promotor-opsrátor, ribosomové vazebné místo a iniciační signál pro LsIF A (»B) gen, a tento fragment byl zkombinován se zbývající části B-sskvencs za vzniku exprese schopného plasmidů. Mapy vyčnivajicich restrikčnlch mist Pst fragmentu plasmidů pL4 (plasmid obaahujici interferonový LelF 8 gen zakončený Pst zbytky, znázorněný na obrázku 5), a plasmidů pLelF A25 jsou uvedeny na obrázcích 7a a 7b.The sequence of the first fourteen nucleotides of the isolated fragment containing the mature interferon LelF B gene was found to be the same for both types A and B. Therefore, a fragment bearing the trp promoter-opsator, ribosome binding site and LsIF A initiation signal was isolated from pLelF A 25. The B) gene, and this fragment was combined with the remainder of the B-sskvencs to form an expression plasmid. The maps of the protruding restriction sites of the Pst fragment of plasmids pL4 (a plasmid containing the interferon LelF 8 gene terminated by the Pst residues shown in Figure 5) and plasmids pLelF A25 are shown in Figures 7a and 7b.

Aby sa zs sekvence znázorněné na obrázku 7a získal Sau3a až Pstl fragment obsahující přibližně 950 b.p., js třeba provést několik operací vzhledem k tomu, že je přítomno jedno nebo vice intervenujících Sau 3a restrikčnlch míst, to jest:In order to obtain the Sau3a to Pst1 fragment containing approximately 950 b.p. of the sequence shown in Figure 7a, several operations have to be performed since one or more of the intervening Sau 3a restriction sites are present, i.e.:

1. Po provedeném štěpeni se izoluji následující fragmenty:1. After digestion, the following fragments are isolated:

a) fragment od Sau3a štěpícího mleta po EcoRI misto obsahující 110 b.p,;(a) a fragment from Sau3a digestion ground to an EcoRI site containing 110 b.p.;

b) fragment od EcoRI mista k Xba místu obsahujici 132 b.p,;b) a fragment from the EcoRI site to the Xba site containing 132 b.p.;

c) fragment qd Xba mista k Pst místu obsahujici vica než 700 b.p.c) a qd fragment of the Xba site to the Pst site containing more than 700 b.p.

2. Fragmenty la) a lb) se vzájemně naváži a koncové skupiny Sau 3a a Xba sa odříznou působením enzymů Xba a BhlII, aby se zabránilo samopolymeraci způsobené těmito terminály (relevantní Sau3a misto js uvnitř BglII místa; enzymem BglII se štěpi, aby se odříznul Sau 3a záchytný konec). Izoluje se fragment obsahující 242 b.p.2. Fragments 1a) and 1b) are ligated together and the Sau 3a and Xba end groups are cut off with Xba and BhlII to prevent self-polymerization caused by these terminals (the relevant Sau3a site is within the BglII site; BglII is cleaved to cut) Sau 3a catch end). The 242 b.p. fragment was isolated.

3. Produkty získané postupy 2) a lc) gg navzájem naváži a za účelem zabráněni samovolné polymerisace se koncové skupiny odříznou působením enzymů Pstl a BglII. Izoluje se fragment od Sau3a až k P9tl mlatu obsahujici asi 950 b.p., znázorněný na obrázku 7a. Tento3. The products obtained by processes 2) and 1c) gg bind to each other and, in order to prevent spontaneous polymerization, the end groups are cut off with the enzymes PstI and BglII. A fragment from Sau3a to P9t1 of the threshing containing about 950 b.p., shown in Figure 7a, is isolated. This

CS 273 182 82 fragment obsahuje tu část LelF B genu, která není společná β LelF A.CS 273 182 82 fragment contains that part of the LelF B gene that is not common to β LelF A.

4. Z plasmidu pLelF A25 ss izoluje fragment obsahující přibližně 300 b.p. (od HindlXI k Sau3a), obsahující trp promotor-operátor, ribosomové vazebné místo, ATG startovací signál a cysteinový kodon pro LelF A.4. Isolate a fragment containing approximately 300 b.p. from plasmid pLelF A25 ss. (from HindIII to Sau3a), containing the trp promoter-operator, ribosome binding site, ATG start signal, and cysteine codon for LelF A.

5. Z plasmidu pBR 322 se izoluje fragment od Pěti k H nd XII obsahující přibližně 3600 b.p.j tento fragment obsahuje replikon a zakódovanou tetracyklinovou, ale nikoliv ampici línovou rezistenci.5. A fragment from Five to H nd XII containing approximately 3600 bp is isolated from plasmid pBR 322, which fragment contains a replicon and a coded tetracycline but not ampoule resistance.

6. Fragmenty získané ve stupních 3, 4 a 5 se navzájem trojitě naváži a získaný plasmid ss transformuje do bakterií E. coli K-12 kmene 294.6. The fragments obtained in steps 3, 4 and 5 are ligated in triplicate and the resulting ss plasmid is transformed into E. coli K-12 strain 294.

Provede se minimální vyhledávači třídění transformantů /postupem podle Birnboima a spolupracovníků, Nucleic Acids. Res. 7, 1513-1523 (1979)/ a vzorky plasmídů se digeruji endonukleásou EcoRI. Digesci se získají tři fragmenty, které byly identifikovány Ja· ko 1) fragment obsahující EcoRI-EcoRI trp promotor; 2) vnitřní EcoRI až EcoRI fragment plasmidu pL4, a 3) fragment plasmidu pL4 obsahující iniciační signál pro translaci bílkoviny až EcoRI.Perform minimal search engine sorting of transformants / by the procedure of Birnboim and colleagues, Nucleic Acids. Res. 7, 1513-1523 (1979)] and plasmid samples were digested with EcoRI endonuclease. Three fragments were identified by digestion which were identified as 1) a fragment containing the EcoRI-EcoRI trp promoter; 2) an internal EcoRI to EcoRI fragment of plasmid pL4, and 3) a fragment of plasmid pL4 containing an initiation signal for translation of the protein to EcoRI.

Bakteriální extrakty z klonů připravených shora uvedeným způsobem vykázaly v CPE testů typickou hodnotu asi 10 x 10® jednotek interferonové aktivity na litr při Α55θ » = 1. Deden reprezentační klon připravený tímto postupem byl označen jako E. coli 294/pLeIF B trp 7.Bacterial extracts from the clones prepared as described above showed a typical value of about 10 x 10 6 units of interferon activity per liter in CPE assays at 55 55 θ »= 1. The deden representative clone prepared by this procedure was designated E. coli 294 / pLeIF B trp 7 .

L. Přímá exprese dalších zralých leukocytárních interfaronů (LelF C, D, F, Η, I a □)L. Direct expression of other mature leukocyte interfarons (LelF C, D, F, Η, I and □)

Stejně jako v případě LelF A lze sestrojit i dalěi genové fragmenty o plné délce, obsahující jiné typy interferonů LsIF, a lze je umístit do exprimačnich nosičů určených pro jejich expresi. Pomoci úplného stanoveni sekvence obvyklými způsoby se zjisti, které restrikční místo leží dostatečně blízko prvého aminokyselinového kodonu zralého interferonového typu, aby umožnilo aplikovat postup popsaný ve shora uvedené části H pro expresi zralého interferonu LelF A, to je eliminaci presekvence restrikčním odříznutím a nahraženi kodonů pro N-terminálni aminokyseliny ztracených eliminaci presekvence navázáním synthetického DNA fragmentu. Selže-li tento způsob, lze použit následujícího postupu, který, ve stručnosti, spočívá vs štěpeni fragmentu obsahujícího preeekvenci přesně před bodem, ve kterém začíná kodon pro první aminokyselinu zralého polypeptidu. Postupuje se tak, že seAs with LelF A, other full-length gene fragments containing other types of LsIF interferons can be engineered and placed in expression carriers designed for their expression. By means of complete sequence determination by conventional methods, it is determined which restriction site lies sufficiently close to the first amino acid codon of the mature interferon type to allow the procedure described in Part H above to express mature interferon LelF A, i.e., elimination of the restriction pruning precision and codon replacement for N -terminal amino acids lost by elimination of presequence by binding of a synthetic DNA fragment. If this method fails, the following procedure can be used which, in brief, consists in cleavage of the fragment containing the sequence just before the point at which the codon for the first amino acid of the mature polypeptide begins. The procedure is that of

1. Dvouvláknová DNA převede v oblasti obklopující tento bod na jednovléknovou DNA;1. Double-stranded DNA converts into single-stranded DNA in the region surrounding this point;

2. Na jednovléknovou oblast vytvořenou podle bodu 1) se hybridizuje komplementární délka priméru jednovláknové DNA, přičemž 5' konec priméru leží na opačná straně nukleotidu soussdiciho se zamýšleným štěpícím místem:2. The complementary length of the single-stranded DNA primer is hybridized to the single-stranded region formed in (1), the 5 'end of the primer lying on the opposite side of the nucleotide adjacent to the intended cleavage site:

3. Ta část druhého vlákna odstraněná ve stupni 1), která leží v 3Z směru od příměru, ss obnoví reakci s DNA polymerázou v přítomnosti trifosfátů deoxynukleotidů obsahujících adsnin, thymin, guanin a cytosin;3. That portion of the second strand removed in step 1) that lies 3 Z away from the primer, restores the reaction with DNA polymerase in the presence of deoxynucleotides triphosphates containing adsine, thymine, guanine, and cytosine;

4. Zbývající délka jednovláknové DNA, která vyčnívá nad zamýšlené místo štěpení, se odstraní digescí.4. Remaining length of single-stranded DNA that projects above the intended cleavage site is removed by digestion.

Poté lze navázat na 3 konec kódujícího vlákna jako jeho zakončeni krátký řetězec synthetické DNA s iniciačním signálem ATG pro translaci, například tak, že se pomoci lepivých konců naváže na sestrojený gen pro zralý interferon, a takto získaný gen se včlení do plasmidu schopného exprese a uvede pod kontrolu promotoru a jeho přidruženého ribosomového vazebného místa.A short strand of synthetic DNA with an ATG translation initiation signal can then be ligated to the 3 terminus of the coding strand as its end, for example by binding to the engineered mature interferon gene using sticky ends, and inserted into a plasmid capable of expression. under the control of the promoter and its associated ribosome binding site.

Podobným způsobem, jaký byl popsán výše v části K, se příslušně pro přímou bakteriální expresi uspořádají genové fragmenty kódující interferony LelF C a LelF D. Strategie exprese pro tyto dalši leukocytárni interferony zahrnuje v každém případě použitiIn a manner similar to that described in Section K above, gene fragments encoding LelF C and LelF D are appropriately arranged for direct bacterial expression. The expression strategy for these other leukocyte interferons includes in each case the use of

CS 273 182 B2 fragmentu přibližně o 300 b.p. (HindlII až Sau3a), obsahujícího trp promotor-operátor, ribosomové vazebné místo, ATG iniciační signál a cysteinový kodon interferonu LelF A z plasmidů pLelF A25. S tímto fragmentem ee zkombinuji genové fragmenty z dalších interferonových genů kódující jejich příslušné aminokyselinové sekvence mimo počátečního cysteinu, který je společný všem. Každý takto vzniklý plasmid se použije k transformaci bakterii E. coli K-12 kmene 294. K sestrojeni příslušných genů se použije následujících ligaci.CS 273 182 B2 fragment approximately 300 b.p. (HindIII to Sau3a), containing the trp promoter-operator, ribosome binding site, ATG initiation signal, and cysteine codon of interferon LelF A from plasmids pLelF A25. With this fragment, ee will combine gene fragments from other interferon genes encoding their respective amino acid sequences outside the initial cysteine that is common to all. Each plasmid thus produced was used to transform E. coli K-12 strain 294. The following ligation was used to construct the appropriate genes.

Interferon LelF CInterferon LelF C

Z plasmidů pLelF C se izoluji následující fragmenty:The following fragments were isolated from the plasmids pLelF C:

a) fragment od Sau 3a k Sau 96 o 35 b.p.ja) fragment from Sau 3a to Sau 96 by 35 b.p.j

b) fragment od Sau 96 k Pstl o vice nsž 900 b.p.b) a fragment from Sau 96 to PstI of more than 900 b.p.

Z plasmidů pLelF A-25 se izoluje postupem popsaným výše v částí K 4)It was isolated from the plasmids pLelF A-25 as described above in section K4).

c) fragment HindlII až Sau 3a o 300 b.p.;c) 300 bp HindIII to Sau 3a fragment;

Z plasmidů pBR 322 se izoluje způsobem popsaným výše v Části K 5)It was isolated from the pBR 322 plasmids as described in Section K (5) above.

d) fragment Pstl až HindlII o přibližně 3500 b.p.d) a fragment of PstI to HindIII of about 3500 b.p.

Sestrojeni genuConstruction of the gene

1) Naváží se fragmenty a) a c), produkt se ětěpi enzymy Bgl II a Hind III a izoluje se fragment asi o 335 b.p,(1) Weigh fragments (a) and (c), digest the product with Bgl II and Hind III and isolate the fragment by about 335 b.p.

2) Provede se trojitá ligace fragmentů 1) + b) + d) a resultujicím plasmidem se transformuji bakterie E. coli.2) Fragmentation of fragments 1) + b) + d) is performed in triplicate and the resulting plasmid is transformed with E. coli.

Typický klon získaný tímto způsobem byl označen jako E. coli K-12 kmen 294/pLeIF C trp 35.A typical clone obtained by this method was designated E. coli K-12 strain 294 / pLeIF C trp 35.

Interferon LelF OInterferon LelF O

Z plasmidů pLelF 0 se izoluje následující fragmenty:The following fragments were isolated from plasmids pLelF 0:

a) fragment Sau 3a až Ava II o 35 b.p.;(a) a 35 bp Sau 3a to Ava II fragment;

b) fragment od Ava II k Bgl II o 150 b.p.jb) a fragment from Ava II to Bgl II of 150 b.p.j

c) .fragment.od BglII k Pstl o přibližně 700 b.p.c) a fragment from BglII to PstI of approximately 700 b.p.

Z plasmidů pLsIF A25 se izolujeIt was isolated from the plasmids pLsIF A25

d) fragment od HindlII až po Sau3a o 300 b.p.d) a fragment from HindIII to Sau3a of 300 b.p.

Z plasmidů pBR 322 se izolujeIt was isolated from pBR 322

e) fragment od HindlII k Pstl o přibližně 3600 b.p.e) a fragment from HindIII to PstI of approximately 3600 b.p.

Sestrojeni genuConstruction of the gene

1) Naváží se fragmenty a) + b), produkt se vyřízne enzymem BglII a po přečištěni se získá produkt o 185 b.p. (1).1) Weigh the fragments a) + b), cut the product with the enzyme BglII and after purification yield a product of 185 b.p. (1).

2) Provede ee navázáni fragmentů 1) + d), vyřízne se enzymy HindlII a BglII a vyčisti se produkt o přibližně 500 b.p. (2),(2) Binding of fragments (1) + (d), excision of the HindIII and BglII enzymes and purification of the product of approximately 500 b.p. (2),

3) Provede se navázáni fragmentů 2) + c) + a) a získaným plasmidem se transformují bakterie E. coli.3) The 2) + c) + a) fragments were ligated and the obtained plasmid transformed with E. coli.

Typický klon připravený tímto způsobem byl označen jako E. coli K-12 kmen 294/pLeIF D trp 11.A typical clone prepared in this way was designated E. coli K-12 strain 294 / pLeIF D trp 11.

Interferon LelF FInterferon LelF F

Fragment obsahující LsIF F lze pro přímou expresi sestrojit tak, že se k rekonstrukci s výhodou použije aminokyselinové sekvence 1 až 13 interferonu LelF B, která je úplně shodná s obdobnou sekvenci interferonu LelF F. Z plasmidů pHGH 207, popsaného výše, se postupem za použiti rastrikčnich enzymů Pst I a Xba I digescí a následující izolaci při19The LsIF F-containing fragment can be constructed for direct expression by preferably using the amino acid sequence 1 to 13 of interferon LelF B, which is exactly the same as that of interferon LelF F, for reconstitution. From the pHGH 207 plasmids described above, of Pst I and Xba I digestion enzymes by digestion and subsequent isolation at 19

CS 273 182 B2 praví fragment asi o 1050 b.p. (a), obsahující trp promotor a majici žádanou konfiguraci na svých koncích. Druhý fragment (b) se izoluje jako větší fragment ze směsi získaná digescí plasmidů pHKY 10 endonukleásami Pstl a BglII. Fragment a) obsahuje přibližně polovinu genu kódujícího ampicilinovou rezistenci; fragment b) obsahuje zbytek tohoto genu a celý gen pro tetracyklinovou rezistenci, kromě připojeného promotoru. Fragmenty a) a b) se naváží pomocí T4 ligasy a produkt se štěpí enzymy Xbal a BglII, aby se odstranily produkty dimerisace. Vznikne fragment c), obsahující trp promotor-operátor a geny pro tetracyklinovou a ampicilinovou rezistenci.CS 273 182 B2 right fragment about 1050 b.p. (a) containing the trp promoter and having the desired configuration at its ends. The second fragment (b) is isolated as a larger fragment from the mixture obtained by digesting the plasmids pHKY 10 with PstI and BglII endonucleases. Fragment a) comprises approximately half of the gene encoding ampicillin resistance; fragment b) contains the remainder of this gene and the entire tetracycline resistance gene except the linked promoter. Fragments a) and b) were ligated with T4 ligase and the product was digested with XbaI and BglII to remove dimerization products. This results in fragment c) containing the trp promoter-operator and genes for tetracycline and ampicillin resistance.

Digescí plasmidů pLsIF F enzymy Avall a BglII se ziská fragment d) mající přibližně 580 b.p. a obsahující kodony pro aminokyseliny 14 až 166 interferonu LelF F.By digesting the plasmids pLsIF F with the enzymes Avall and BglII, fragment d) having approximately 580 b.p. and containing codons for amino acids 14 to 166 of interferon LelF F.

□igeesci plasmidů pLelF B enzymy Xbal a Avall se ziská fragment e) o 49 b.p., který kóduje aminokyseliny 1 až 13 interferonu LelF F.The digestion of the plasmids pLelF B by the XbaI and Avall enzymes yielded a fragment of 49 b.p. which encodes amino acids 1 to 13 of interferon LelF F.

Provede se trojitá ligace fragmentů c), d) a e) v přítomnosti T4 ligasy. Kohasivni konce příslušných fragmentů jsou takové, žs ss fragmenty správně uzavřou do kruhu za vzniku kompozitního plasmidů, který nsss gen pro tetracyklinovou rezistenci pod kontrolou trp promotoru-operátoru, spolu s gsnsm pro zralý interferon LelF F. Bakteria transformované tímto plasmidem lze proto vybrat na základě zmíněné rezistence při jejich kultivaci na agarových deskách obsahujících tetraoyklin. Typický klon připravený tímto způsobem byl označen jako E. coli K-12 kmen 294/pLeIF F trp 1.Fragmentation of fragments c), d) and e) is performed in triplicate in the presence of T4 ligase. The cohesive ends of the respective fragments are such that the ss fragments correctly encircle to form a composite plasmid which the nsss gene for tetracycline resistance under the control of the trp promoter-operator, together with the gsns for the mature interferon LelF F. said resistance to their cultivation on tetraoycline-containing agar plates. A typical clone prepared in this way was designated E. coli K-12 strain 294 / pLeIF F trp 1.

Interferon LelF HInterferon LelF H

Úplný LelF H gen pro expresi zralého leukoeytárního interferonu LelF H lze zkonstruovat následujícím způsobem:The full length LelF H gene for the expression of mature leukoeytar interferon LelF H can be constructed as follows:

1) Plasmid pLsIF H se podrob! digesci enzymy Haell a Rsal a izoluje se fragment o 816 b.p. rozkládající se od signálu pro peptidickou aminokyselinu 10 až do 3' nekódují cí oblasti.1) Plasmid pLsIF H was subjected to < tb > digestion with Haell and Rsal, and a fragment of 816 b.p. extending from the signal for peptide amino acid 10 to 3 'of the non-coding region.

2) Fragment se dsnaturuje a podrobí se reparační synthese pomoci Klenowova fragmentu DNA polymerasy I /viz Klenow a spolupracovníci. Proč. Nati. Acad. Sci. USA 65, 168 (1970)/, za použiti synthetického deoxyribooligonukleotidu δ'-dATG TGT AAT CTG TCT jako priméru.2) The fragment is dsnaturated and subjected to reparative synthesis using the Klenow fragment of DNA polymerase I (see Klenow et al.). Why. Nati. Acad. Sci. USA 65, 168 (1970)], using the synthetic deoxyribooligonucleotide δ'-dATG TGT AAT CTG TCT as primer.

3) Vzniklý produkt ee štěpí enzymem Sau3a a izoluje se fragment o 452 b.p. reprezentující aminokyseliny interferonu 1 až 150.3) The resulting ee was digested with Sau3a and the 452 b.p. fragment was isolated. representing the amino acids of interferon 1 to 150.

4) Plasmid pLelF H se digsruje enzymy Sau3a a Pstl a izoluje ee vzniklý fragment o 500 b.p.; ziská se gen kódující aminokyseliny od 150 až do konce kódující sekvence.4) The plasmid pLelF H was digested with the enzymes Sau3a and PstI and the resulting fragment of 500 b.p. was isolated; obtaining a gene encoding amino acids from 150 to the end of the coding sequence.

5) Fragmenty izolované ve stupních 3) a 4) se navzájem naváží za vzniku fragmentu5) The fragments isolated in steps 3) and 4) are ligated together to form a fragment

166 met cys . aep stop166 met. aep stop

ATG TGT ... -- .... GAT TGA_..._Pst IATG TGT ... - .... GAT TGA

Sau3a zakódovajicifio 166 aminokyselin interferonu LelF H.Sau3a encoding 166 amino acids of interferon LelF H.

6) Plasmid pLelF A trp 25 se digeruje restrikčnim enzymem Xbal, zakonči záchytnými konci s DNA polymerásou I a produkt se digeruje endonukleásou Pstl. Vzniklý velký fragment ss izoluje a provede se ligace s produktem získaným ve stupni 5). Získá ss exprese schopný plasmid, který může po transformaci do E. coli K-12 kmene 294 nsbo do jiné hostující bakterie exprimovat zralý interferon LelF H.6) The plasmid pLelF A trp 25 was digested with the restriction enzyme XbaI, terminated with the capture ends with DNA polymerase I and the product digested with PstI endonuclease. The resulting large fragment of ss is isolated and ligated with the product obtained in step 5). It obtains an expression-capable plasmid which, upon transformation into E. coli K-12 strain 294 nsbo into another host bacterium, can express the mature interferon LelF H.

Interferon LelF IInterferon LelF I

Rekombinant lidského gsnomu fáze A Charonu 4A, sestrojený Lawnsm a spolupracovníky /viz časopis Cell 15, 1157 (1978)/ byl podroben skríningu na leukocytární interferonovéRecombinant human phase A gsnom of Charon 4A, constructed by Lawns and coworkers (see Cell 15, 1157 (1978)), was screened for leukocyte interferon

CS 273 182 B2 geny pomoci postupů popsaných Lawnem a spolupracovníky (viz výše) a Maniatieem a spolupracovníky /viz časopis Cell 15, 687 (1978)/. Radioaktivní LelF zkušební vzorek, získaný z cONA klonu interferonu LelF A byl použit k tříděni přibližně 500 000 pisků, z nicha bylo vybráno šest LelF genomových klonů. Po opakovaném tříděni a přečištěni plaků byl vybrán jeden z uvedených klonů, HLelF 2, pro další anelysováni.CS 273 182 B2 genes using the procedures described by Lawn and coworkers (see above) and Maniatie and coworkers (see Cell 15, 687 (1978)). A radioactive LelF assay, obtained from a cONA clone of interferon LelF A, was used to screen approximately 500,000 sand, of which six LelF genomic clones were selected. After repeated plaque sorting and purification, one of these clones, HL1F2, was selected for further analysis.

Za použití shora popsané metody lze s výhodou použít jiných zkušebních vzorků k izolováni dalších leukooytárníoh interferonových bílkovin podle tohoto vynálezu.Using the method described above, other test samples may be advantageously used to isolate the other leuco-yoyl interferon proteins of the invention.

Sestrojeni genu pro interferon LelF X:Construction of the LelF X interferon gene:

1) EcoRI fragment klonu λ HLelF 2 o 2000 b.p. se subklonuje do plasmidu pBR 325 v jeho EcoRI restrikčním místě. Ziekaný plasmid obsahujicí LelF I se štěpí enzymem EcoRI a izoluje se fragment o 2000 b.p. Na tento EcoRI fragment o 2000 b.p. se naváže deoxy.oligonukleotid dAATTCTGCAG (konvertor EcoRI—Pstl), vzniklý produkt se rozštěpí enzymem Pstl a ziská se fragment o 2000 b.p. obsahující petl konce. Tento fragment se rozštěpí enzymem Sau 96 a izoluje se fragment o 1100 b.p., který mé jeden Pstl a jeden Sau 96 konec.1) EcoRI fragment of λ HLelF 2 clone 2000 b.p. was subcloned into plasmid pBR 325 at its EcoRI restriction site. The digested plasmid containing LelF I was digested with EcoRI and the 2000 b.p. fragment isolated. For this EcoRI fragment of 2000 b.p. The dAATTCTGCAG deoxy oligonucleotide (EcoRI-PstI converter) is ligated, the resulting product is digested with PstI and a fragment of 2000 b.p. containing petl ends. This fragment was digested with the enzyme Sau 96 and a fragment of 1100 b.p. was isolated which had one PstI and one Sau 96 end.

2) Plasmid pLelF C trp 35 se digeruje enzymy Pstl a Xbal a izoluje se větší fragment.2) Plasmid pLelF C trp 35 was digested with PstI and XbaI and the larger fragment isolated.

3) Malý Xbal - Pstl fragment z plasmidu pLelF C trp 35 se digeruje enzymy Xbal a Sau96 a izoluje se Xbal - Sau 96 fragment o 40 b.p.3) Small XbaI - PstI fragment from plasmid pLelF C trp 35 was digested with XbaI and Sau96 and the XbaI - Sau 96 fragment of 40 b.p. was isolated.

4) Provede se ligace fragmentů izolovaných ve stupních 1); 2) a 3) a tak se vytvoří exprese schopný plasmid pLelF I trp 1.4) Ligate the fragments isolated in steps 1); 2) and 3) to generate an expression capable plasmid pLelF I trp 1.

Interferon LelF OInterferon LelF O

Postup k sestrojeni plasmidu schopného exprese LelF 3:To construct a plasmid capable of expressing LelF 3:

1) Plasmid pLelF 3 obsahuje HindlII fragment o 3,8 kilobaeich lidské genomové ONA. který zahrnuje LelF O genovou sekvenci. Z tohoto plasmidu se izoluje Oděl - Rsal fragment o 760 b.p.1) Plasmid pLelF 3 contains a HindIII fragment of 3.8 kilobaeich human genomic ONA. which comprises the LelF O gene sequence. From this plasmid, the .alpha.-Rsal fragment of 760 b.p.

2) Plasmid pLsIF trp 7 se rozštěpí enzymy HindlII a Ddel a izoluje ee HindlII - Ddel fragment o 340 b.p,2) The plasmid pLsIF trp 7 was digested with HindIII and DdeI and isolated the HindIII-DdeI ee fragment by 340 b.p.

3) Plasmid pBR 322 se rozštěpí enzymem Pstl, fragmenty se zakončí lepivými konci inkubaci 8 DNA polymsrasou I (Klenowův fragment) a provede se digesce enzymem HindlII. Izoluje se velký fragment přibližně ,o 3600 b.p.3) Plasmid pBR 322 was digested with PstI, the fragments were terminated with a sticky end by incubation with 8 DNA Polymerase I (Klenow fragment) and digested with HindIII. A large fragment of approximately 3600 b.p. is isolated.

4) Provede se ligace fragmentů izolovaných ve stupních 1), 2) a 3) a tak se sestrojí expre se schopný plasmid- pLelF O trp 1.(4) Ligate the fragments isolated in steps (1), (2) and (3) to ligate to produce an expression plasmid-pLelF 0 trp 1.

M. čištěniM. cleaned

Obsah leukocytárního interferonu v bakteriálnich extraktech lze zvýšit postupným čištěnim:The leukocyte interferon content of bacterial extracts can be increased by sequential purification:

1. Polyethyleniminovým 3ráženim, při kterém většina buněčných bílkovin, včetně interferonu, zůstává v supernatantu.A polyethyleneimine 3-precipitation in which most of the cellular proteins, including interferon, remain in the supernatant.

2. Amoniumsulfátovou frakcionaci, při které interferon vypadává z 55%niho nasyceného roztoku siřenu amonného.2. Ammonium sulfate fractionation in which the interferon falls out of a 55% saturated ammonium sulphate solution.

3. Suspendováním amoniumsulfátových pelet v pufru složeném z 0,06 M fosforečnanu draselného a 10 mM Tris-HCl, pH 7;2; a dialysou proti 25 mM Tris-HCl, pH 7,9 (interferonová aktivita zůstává v roztoku).3. Suspending the ammonium sulfate pellets in a buffer composed of 0.06 M potassium phosphate and 10 mM Tris-HCl, pH 7; and dialysis against 25 mM Tris-HCl, pH 7.9 (interferon activity remains in solution).

4. Chromatografii shora uvedeným způsobem získaného supernatantu, při pH upraveném na 8,5, na sloupci OEAE celulosy (lineární gradientová eluce s O až 0,2 M roztokem chloridu sodného ve 25 mM Tris-HCl, pH 8,5).4. Chromatography of the supernatant obtained above, at a pH adjusted to 8.5, on a cellulose OEAE column (linear gradient elution with 0 to 0.2 M sodium chloride solution in 25 mM Tris-HCl, pH 8.5).

5. Adsorpci na agarose (značky Cibachrome Blue Agarose) nebo na hydroxyapatltu a eluci5. Adsorption on agarose (Cibachrome Blue Agarose) or hydroxyapattle and elution

CS 273 182 B2CS 273 182 B2

1,5 M roztokem chloridu draselného, popřípadě 0,2 M roztokem fosforečnanu.1.5 M potassium chloride solution or 0.2 M phosphate solution.

OO

6. Molekulárním tříděním na koloně Saphadaxu G-75.6. Molecular sorting on a Saphadax G-75 column.

7. Kataxovou chromatografii na CM-celulose ve 25 mM roztoku octanu amonného při pH 5,0, eluce amoniumacetátovým gradientem (až na 0,2 M roztok octanu amonného}·7. Catax-chromatography on CM-cellulose in 25 mM ammonium acetate solution at pH 5.0, eluting with an ammonium acetate gradient (up to 0.2 M ammonium acetate solution) ·

Shora uvedenými čisticími postupy ss získá materiál o čistotě vyšěi než 95 %.By the above purification procedures, a material with a purity of more than 95% is obtained.

Surový materiál lzs rovněž čistit chromatografickým tříděním podle velikosti molekuly, vysokotlakou kapalinovou chromatografii s ravarani fází (RP-8) nebo afinitni chromatografii na imobilisovaných antiinterfaronových protilátkách.The crude material can also be purified by molecular size chromatography, ravarani phase high-pressure liquid chromatography (RP-8), or affinity chromatography on immobilized anti-interferon antibodies.

Alternativně lze materiál získaný va shora uvedeném stupni 4 nanést na slouec obsahujíc! monoklonálni protilátku, připravený způsobem popsaným Milstainam v časopisu Scientific American 243, 66 (1980), a interferon eluovat směsi 0,2 M kyseliny octové,Alternatively, the material obtained in step (4) above may be applied to a compound containing the same. a monoclonal antibody, prepared as described by Milstainam in Scientific American 243, 66 (1980), and interferon eluting with 0.2 M acetic acid mixtures,

0,1% roztoku Tritonu a 0,15 M roztoku chloridu sodného.0.1% Triton solution and 0.15 M sodium chloride solution.

Při alternativním výhodném provedení lze leukocytárni interferon vyprodukovaný shora popsaným způsobem čistit pomocí následujících čisticích operaci:In an alternative preferred embodiment, the leukocyte interferon produced as described above can be purified by the following purification operations:

1. Zmražené buněčné pelety obsahující exprimovaný lsukocytárni interferon ae rozbiji buď manuálně nabo ve vhodném drticím zářizaní. částečně rozmražená buňky as suspendují va 4 objemech pufru A, obsahujícího 0,1 M roztok Tris-baae upravený na pH 7,5 až 8,0 10% (m/V) roztok sacharosy, 0,2 M roztok chloridu sodného, 5 mM roztok EDTA, 0,1 mM roztok PMSF a 10 až 100 mM roztok bezvodého chloridu hořečnatého. Suspenze se udržuje na teplotě asi 4 °C.Frozen cell pellets containing expressed isocyte interferon and are broken either manually or in a suitable grinding apparatus. partially thawed cells and suspended in 4 volumes of buffer A containing 0.1 M Trisbaae solution adjusted to pH 7.5 to 8.0 10% (w / v) sucrose solution, 0.2 M sodium chloride solution, 5 mM EDTA solution, 0.1 mM PMSF solution, and 10 to 100 mM anhydrous magnesium chloride solution. The suspension is maintained at about 4 ° C.

Suspenze se pak nechá projit homogenisátorem při asi 41,4 MPa a pak znovu při tlaku menším naž 6,9 MPa. Efluant z homoganisátoru z obou pasáží sa jimá za chlazeni ledovou lázni.The slurry is then passed through a homogenizer at about 400 psig and then again at a pressure of less than about 200 psig. The homoganizer effluent from both passages is collected while cooling the ice bath.

2. K homoganátu se pomalu přidává polyethylenimin až do koncentrace asi 0,35 % a směs sa ponechá stát asi 30 minut. Pevné podíly se oddělí odstředěním nebo filtraci. Tento stupeň se provádí za stálého kontrolováni teploty nebo dostatečně rychle, tak aby teplota suparnatantu (nebo filtrátu) byla stéle nižší než 10 °C. Supernatant (filtrát) se zkoncentruje ultrafiltraci přibližně na 1/10 původního objemu. Drobné částečky nebo zákal v zadrženém zahuštěném roztoku lza odatranit filtraci přes vhodný filtr, jako například přes mikroporesni membránu.2. Polyethyleneimine is slowly added to the homogenate to a concentration of about 0.35% and allowed to stand for about 30 minutes. The solids were collected by centrifugation or filtration. This step is carried out under constant temperature control or sufficiently fast so that the temperature of the supernatant (or filtrate) is still below 10 ° C. The supernatant (filtrate) is concentrated by ultrafiltration to approximately 1/10 of the original volume. Small particles or haze in the retained thickened solution can be removed by filtration through a suitable filter, such as a microporous membrane.

3. Vyčeřený roztok se nanese přímo na sloupec obsahující monoklonálni protilátku, při rychlosti toku 5 až 8 cm/hod. (nap/íklad 25 až 40 ml/hod. na sloupci o průměru 2/6 cm). Po naneseni roztoku se sloupec .promyje přibližně desetinásobkem objemu sloupce roztoku mM Tris-HCl o pH 7,5 až 8,5, obsahujícího 0/5 M roztok chloridu sodného a roztok povrchově aktivní látky, jako 0;2 roztok Tritonu X-100 nebo ekvivalentní látky. Po promytí se sloupec vypláchne desetinásobkem objemu sloupce roztoku obsahujícího 0,15 M chlorid sodný a povrchově aktivní činidlo jako Triton X-100 (0,1% roztok) nebo jeho ekvivalent. Pak se sloupec eluuje 0,2 M roztokem kyseliny octové obsahujícím povrchově aktivní látku jako Triton X-100 (0,1% roztok) nebo jeho ekvivalent. Bilkovinovó frakce ze sloupce β monoklonálni protilátkou (stanovená pomoci UV abeorbanca nebo jinou vhodnou analytickou metodou) se shromáždí a pH sa upraví IN roztokem hydroxidu sodného nebo 1,0 M roztokem Tris-base na hodnotu přibližně 4,5.3. The clarified solution is applied directly to the monoclonal antibody-containing column at a flow rate of 5-8 cm / hr. (e.g. 25 to 40 ml / h on a 2/6 cm diameter column). After application of the solution, the column is washed with approximately ten times the volume of a column of mM Tris-HCl pH 7.5 to 8.5, containing 0/5 M sodium chloride solution and a surfactant solution such as Triton X-100 0.2; equivalent substances. After washing, the column is rinsed ten times the column volume of a solution containing 0.15 M sodium chloride and a surfactant such as Triton X-100 (0.1% solution) or equivalent. The column was then eluted with a 0.2 M acetic acid solution containing a surfactant such as Triton X-100 (0.1% solution) or equivalent. The Bilkine fraction from the β column by the monoclonal antibody (determined by UV abeorbance or other suitable analytical method) is collected and the pH is adjusted to approximately 4.5 with 1N sodium hydroxide solution or 1.0 M Tris-base solution.

4. Spojené intarferonové frakce se nanesou na sloupec katexu, jako na sloupec celulosy CM 52 (značky Whatman) nebo její ekvivalent, která byla předtím ekvilibrována vhodným pufrem, jako 50 mM roztokem octanu amonného o pH 4,5. Po naneseni interferonu se sloupec promývá pufrem použitým k ekvilibraci tak dlouho, až UV abeorbanca afluantu dosáhne takové hladiny, že ee ze sloupce sluuje trochu žádané bílkoviny. Sloupec se pak eluuje roztokem 25 mM octanu sodného obsahujícího 0,12 M chloridu sodného nebo jinou kombinaci, která optimalizuje získáni interferonu a poskytne po lyofilizaci produkt mající vyhovující vlastnosti jako vzhled a rozpustnost.4. Combine intarferon fractions are loaded onto a cation exchange column such as a CM 52 cellulose column (Whatman brand) or equivalent thereof previously equilibrated with a suitable buffer, such as a 50 mM ammonium acetate solution at pH 4.5. After interferon deposition, the column is washed with the buffer used to equilibrate until the UV abeorbance of the afluant reaches a level such that the ee from the column consumes some of the desired protein. The column is then eluted with 25 mM sodium acetate solution containing 0.12 M sodium chloride or another combination that optimizes the recovery of interferon and provides, after lyophilization, a product having satisfactory properties such as appearance and solubility.

CS 273 132 B2CS 273 132 B2

Monoklonálni protilátky používané při výhodném prováděni čištěni podle vynálezu popsaném výěe lze připravit postupy popsanými Staohalinem a spolupracovníky v časopisu Proč, Nati. Acad. Sci. USA 78, 1848-1852 (1981), Monoklonálni protilátky připravené z ascitické tekutiny ee vyčistí a kovalentně naváži na Affigel-10 způsobem popsaným níže:The monoclonal antibodies used in the preferred purification of the invention described above can be prepared by the procedures described by Staohalin and co-workers in Proc, Natl. Acad. Sci. USA 78, 1848-1852 (1981), Monoclonal antibodies prepared from ascites fluid are ee purified and covalently bound to Affigel-10 as described below:

Každá z pěti myších samic druhu Balb/c se naočkuje 5 až 10 x 10 hybridomnich buněk ze střední růstové fáze kmene. Asi 5 χ 103 životaschopných buněk získaných z myši produkční kapaliny se inokuluje intraperitoneálně další skupině deseti nebo více myší. Od každé myši z posléze uvedené skupiny se opakovaně (2x až 4x) odebírá ascitická kapalina. Mohou být provedeny až tři přenosy buněk a následující odebrání ascitické kapaliny z Jedné skupiny myši na druhou. Ascitická kapalina odebraná myším při každém přenosu buněk se shromažďuje.Each of the five Balb / c female mice is inoculated with 5-10 x 10 6 hybridoma cells from the medium growth phase of the strain. About 5 10 10 3 viable cells obtained from mouse production fluid are inoculated intraperitoneally with another group of ten or more mice. Ascites fluid was collected (2x to 4x) from each mouse of the latter group. Up to three cell transfers and subsequent removal of ascites fluid from one mouse group to another can be performed. The ascites fluid collected from the mice at each cell transfer is collected.

Z ascitické kapaliny se odstraní' buňky a jejich zbytky odstředěním při nízkých otáčkách (500 až lOOOnásobek g) po dobu 15 minut. Pak se pokračuje v odstřeďováni při 18 000 otáčkách za minutu po dobu 90 minut.'Suparnatant sa zmrazí a uloží při teplotě -20 °C.Cells and their debris are removed from the ascites fluid by centrifugation at low speed (500-100 times g) for 15 minutes. Centrifugation is then continued at 18,000 rpm for 90 minutes. The supernatant is frozen and stored at -20 ° C.

Po zmrazení se odstraní další fibrin a Jemný vyloučený materiál odstřeďovánim při 35 000 otáčkách za minutu po dobu 90 minut. Všechny šarže ascitické kapaliny z každého transferu se testuji na specifickou protilátkovou aktivitu stanovením protilátkovó vazby v pevné fázi /viz Stachelin a spolupracovnici, citace uvedená výše/ a vyhovující podíly se spo ují.After freezing, additional fibrin and fine precipitated material are removed by centrifugation at 35,000 rpm for 90 minutes. All batches of ascites fluid from each transfer are tested for specific antibody activity by determining the solid phase antibody binding (see Stachelin et al., Supra, supra) and the appropriate proportions are pooled.

Koncentrace bílkoviny ve spojených roztocích ae stanoví aproximačně na základě toho, že 1 mg bílkoviny vykazuje při 280 nm abrosbanci 1,2 v kyvetě o tlouštce 1,0 cm. Ascitické kapaliny s vysokými hladinami protilátky obsahuji 30 až 35 mg bílkoviny v jednom ml.Protein concentrations in the pooled solutions and e are determined by approximation on the basis that 1 mg of protein at 280 nm exhibits an abrosance of 1.2 in a 1.0 cm cuvette. Ascites fluids with high antibody levels contain 30 to 35 mg protein per ml.

Toto množství je ekvivalentní 4 až 7 mg specifické protilátky/ml. Ascitická kapalina o této koncentraci ss ředí PBS roztokem (roztok 0,01 M fosforečnanu sodného o pH 7,3 a 0,15 M chloridu sodného) na koncentraci 10 až 12 mg bílkoviny v ml.This amount is equivalent to 4-7 mg specific antibody / ml. The ascites fluid at this concentration was diluted with PBS (0.01 M sodium phosphate solution at pH 7.3 and 0.15 M sodium chloride) to a concentration of 10-12 mg protein per ml.

Ke každým 100 ml takto zředěného roztoku se při O °C, za intenzivního mícháni, pomalu přidá 90 ml při teplotě místnosti nasyceného roztoku síranu amonného. Suspenze ss chladí ledem po dobu 40 až 60 minut a pak se odetřeďuje 15 minut při teplotě 4 °C při 10 000 otáčkách za minutu. Suparnatant se oddekantuje a odcentrifugovapá látka se dobře vysuší. Pelety bílkoviny se rozpusti v roztoku obsahujícím 0,02 M Trie-HCl (pH 7,9) a 0,04 M chlorid sodný (pufr I). Roztok bílkoviny ss dialysuje 16 až 18 hodin při teplotě místnosti proti 100 objemům zmíněného pufru I s minimálně jednou výměnou pufru. Dialysovaný roztok ee za účelem odstraněni nerozpustného materiálu odstřsďujs 10 minut při 15 000 otáčkách za minutu. Podle stanoveni absorpce při 280 mm ss získá 30 až 35 % původního množství celkové bílkoviny přítomné v ascitické kapalině.To each 100 ml of this dilute solution, 90 ml of a saturated ammonium sulfate solution was slowly added at 0 ° C, with vigorous stirring. The slurry was cooled with ice for 40 to 60 minutes and then centrifuged for 15 minutes at 4 ° C at 10,000 rpm. The supernatant is decanted off and the centrifugate is dried well. The protein pellets were dissolved in a solution containing 0.02 M Trie-HCl (pH 7.9) and 0.04 M sodium chloride (buffer I). The DC protein solution is dialysed for 16-18 hours at room temperature against 100 volumes of said buffer I with at least one buffer change. The dialysed solution is centrifuged at 15,000 rpm for 10 minutes to remove insoluble material. By determining the absorption at 280 mm ss, 30-35% of the original amount of total protein present in the ascites fluid is recovered.

Roztok obsahující 30 až 40 mg bílkoviny na ml se poté nanese na sloupec DEAE-celulosy, ekvilibrovanó předem pufrem I, Na každý gram nanesené bílkoviny se použije vrstva sloupce o objemu alespoň 100 ml. Protilátka se ze sloupce vymývá gradientovou eluci roztokem chloridu sodného obsahujícím 0,02 M Tris-HCl o pH 7,9, s lineárním gradientem od 0,04 M do 0,5 M chloridu sodného. Spojené frakce bílkoviny sluované roztokem o koncentraci mezi 0,06 až 0,1 M chloridu sodného ss zkoncentruji tím způsobem, žs ss bílkovina vysráži stejným objemem roztoku síranu amonného nasyceného při teplotě místnosti a produkt se odcentrifuguje. Získané pelety bílkoviny se rozpusti v roztoku obsahujícím 0,2 M hydrogsnuhličitan sodný (pH asi 8,0 ) a 0,3 M chlorid sodný (pufr XX) a roztok se dialysuje při teplotě místnosti proti stejnému pufru, který se třikrát vymění, Oialysovaný roztok se za účelem odstraněni malého množství nerozpustného materiálu odetřeďuje 15 minut při 20 000 násobku g, a koncentrace bílkoviny se upraví pufrem II na hodnotu 20 až 25 mg/ml. Uvedeného roztoku protilátky se použije k přípravě imunoadsorbantu následujícím způsobem.The solution containing 30 to 40 mg protein per ml is then applied to a DEAE-cellulose column equilibrated beforehand with Buffer I. A column layer of at least 100 ml is used for each gram of protein loaded. The antibody was eluted from the column by gradient elution with sodium chloride solution containing 0.02 M Tris-HCl, pH 7.9, with a linear gradient from 0.04 M to 0.5 M sodium chloride. The pooled protein fractions salified with a solution between 0.06 to 0.1 M sodium chloride were concentrated by precipitating the protein with an equal volume of ammonium sulfate solution saturated at room temperature and centrifuging the product. The obtained protein pellets are dissolved in a solution containing 0.2 M sodium bicarbonate (pH about 8.0) and 0.3 M sodium chloride (buffer XX) and the solution is dialysed at room temperature against the same buffer, which is changed three times, is centrifuged for 15 minutes at 20,000 times g to remove a small amount of insoluble material, and the protein concentration is adjusted to 20-25 mg / ml with buffer II. Said antibody solution is used to prepare an immunoadsorbant as follows.

Affigel-10 (dodavatel BioRad Laboratories, Richmond, Kalifornie) se promyje na sin23Affigel-10 (available from BioRad Laboratories, Richmond, California) is washed on sin23

CS 273 182 B2 trovaném skleněném filtru třikrát ledem ochlazeným isopropanolem a pak třikrát ledovou destilovanou vodou. Kaša gelu (asi 50%ni v ledové vodě) se přenese do trubic z plastické hmoty a provede sa sedimentace adsorbentu krátkým odstředěnímj supernatant se odsaje.CS 273 182 B2 a triplicated glass filter three times with ice-cooled isopropanol and then three times with ice-cold distilled water. The gel slurry (about 50% ni in ice water) was transferred to plastic tubes and adsorbent sedimented by brief centrifugation and the supernatant was aspirated.

Do trubice naplněné gelem se přidá stejný objem (vzhledem ke gelu)přečištěného roztoku protilátky a trubice se nechá za účelem promíchání obsahu otáčet kolem kolmé osy 5 hodin při 4 °C. Po skončení reakce se gel odstředí a promyje dvakrát pufrem III (roztok 0,1 M hydrogenuhličitanu sodného a 0,15 M chloridu sodného), aby se odstranila nezkopulovaná protilátka. Stanoveni bílkovin ve spojených promývacich roztocích ukázalo, že vice než 90 % protilátky se navázalo na gel.An equal volume (relative to the gel) of the purified antibody solution is added to the gel-filled tube and the tube is allowed to rotate about a perpendicular axis at 4 ° C for 5 hours to mix the contents. After completion of the reaction, the gel is centrifuged and washed twice with buffer III (0.1 M sodium bicarbonate solution and 0.15 M sodium chloride solution) to remove uncoupled antibody. Protein determination in the combined wash solutions showed that more than 90% of the antibody bound to the gel.

Aby se zablokovala nezreagoovaná místa, smísí se takto upravený gel se stejným objemem 0,1 M roztoku hydrochloridu ethanolamínu (pH 8) a trubice se nechá znovu za účelem promíchání obsahu rotovat 60 minut při teplotě místnosti. Kaše gslu se promyje až do odstranění reaktantů roztokem PBS a přechovává ee v roztoku PBS v přítomnosti 0,02 % (m/V) azidu sodného při teplotě 4 °C.To block unreacted sites, the treated gel was mixed with an equal volume of 0.1 M ethanolamine hydrochloride solution (pH 8) and the tube was again rotated at room temperature for 60 minutes to mix the contents. The gslu slurry is washed until the reactants are removed with PBS and stored in PBS in the presence of 0.02% (w / v) sodium azide at 4 ° C.

N. Parsnterálni podávání interferonůN. Parenteral administration of interferons

Interfsrony LelF lze podávat parenterálnš osobám potřebujícím antitumorové nebo antivirové léčeni a těm, u kterých se projevují imunosupresivní stavy. Dávkováni a počet dávek jsou paralelní s těmi, které se běžně používají při klinickém zkoušeni interferonů θ získaných z lidských zdrojů, například asi (1 až 10) x 10 . jednotek denně, a v případě materiálů o vyšší čistotě než 1 %, účelně až do této čistoty, například 5 χ 107 jednotek denně.LelF interfsrons can be administered parenterally to persons in need of anti-tumor or antiviral therapy and those who develop immunosuppressive conditions. The dosage and number of doses are parallel to those commonly used in clinical trials of human-derived interferons, e.g. about (1 to 10) x 10. in the case of materials of a purity greater than 1%, expediently up to this purity, for example 5 χ 10 7 units per day.

□ako jeden příklad vhodné aplikační formy pro v podstatě homogenní bakteriální interferon LelF lze uvést přípravu parenterálni formy: 3 mg LsIF o specifické aktivitě naQ přiklad 2 x 10 jednotek/mg se rozpusti ve 25 ml 5N roztoku lidského serumalbuminu, roztok se zfiltruje přes bakteriologický filtr a zfiltrovaný roztok se asepticky rozdělí do 100 kusů injekčních ampulek, které pak' obsahuji po 6 x 10 jednotek čistého interferonu vhodného pro parenterálni podáváni. Ampulky se před použitím výhodně přechovávají v chladu (při -20 °C).□ as one example of a suitable dosage form for a substantially homogeneous bacterial interferon LelF, parenteral form can be mentioned: 3 mg of LsIF having specific activity per q, example 2 x 10 units / mg are dissolved in 25 ml of 5N human serumalbumin solution, filtered through a bacteriological filter and the filtered solution is aseptically dispensed into 100 vials, which then contain 6 x 10 units of pure interferon suitable for parenteral administration. The vials are preferably stored refrigerated (-20 ° C) prior to use.

Sloučeniny podle předloženého vynálezu lze formulovat známými metodami do formy farmaceuticky vhodných přípravků, přičemž' účinný polypeptid se používá ve směsi s farmaceuticky přijatelným nosným vshikulsm. Vhodná vshikula a jejich formulování jsou popsány například v příručce Remington's Pharmaceutical Sciences E.V, Martinem, na kterou zde odkazujeme. Farmaceutické přípravky podle vynálezu obsahují účinné množství interferonové bílkoviny spolu s vhodným množstvím vshikula umožňujícího účinné podáváni preparátu hostiteli. 3eden z přednostních způsobů podáváni js parentsrálni podáváni.The compounds of the present invention can be formulated by known methods into pharmaceutically acceptable compositions wherein the active polypeptide is used in admixture with a pharmaceutically acceptable carrier. Suitable formulas and their formulation are described, for example, in Remington's Pharmaceutical Sciences E.V., Martin, which is incorporated herein by reference. The pharmaceutical compositions of the present invention comprise an effective amount of an interferon protein together with a suitable amount of vshikula to permit effective administration of the preparation to the host. One of the preferred modes of administration is parental administration.

Claims (6)

1. Způsob výroby expresního vektoru schopného v transformovaném kmenu E.coli expresi poskytovat zralý lidský leukocytárni interferon LelF A, B, C, O, F, Η, I nebo □ s aminokyselinovou sekvenci od polohy 1 do 166 jak je uvedeno na obr. 4 a 9 vyznačující se tím, žeA method of producing an expression vector capable of providing mature human leukocyte interferon LelF A, B, C, O, F, Η, I, or □ with the amino acid sequence from position 1 to 166 as shown in Figure 4 in a transformed strain of E. coli. and 9, characterized in that: a) zkonstruuje se E.coli vektor, který obsahuje E.coli trp promotor, operátor a trp leader ribosomové vazebné místo,a) constructing an E.coli vector containing the E.coli trp promoter, operator, and trp leader ribosome binding site, b) připraví sa DNA fragment kódující zralý lidský leukocytárni interferon, který je vybrán ze skupiny sestávajici z lidského leukocytárniho interferonu (LsIF) A, B, C, D, F, Η, I nebo J a(b) preparing a DNA fragment encoding mature human leukocyte interferon, which is selected from the group consisting of human leukocyte interferon (LsIF) A, B, C, D, F, Η, I or J; and c) připojí se shora uvedený DNA fragment lidského leukocytárniho interferonu po směru vlákna od E.coli trp promotoru, operátoru a trp leader vazebného ribosomového místa E.coli vektoru zs stupně a) použitím T4 DNA ligásy.c) attaching the above DNA fragment of the human leukocyte interferon downstream of the E. coli trp promoter, operator and the trp leader ribosome binding site of the E. coli vector of step a) using a T 4 DNA ligase. CS 273 182 B2CS 273 182 B2 2. Způsob podle bodu 1 pro výrobu expreeniho vektoru schopného v transformovaném kmenu E.coli expresí poskytovat zralý lidský leukocytární interferon LelF A s aminokyselinovou sekvencí od polohy 1 do 166 jak je uvedeno na obr. 4, vyznačující se tim, že se ve stupni b) připraví DNA fragment kódující zralý lidský leukocytární interferon (LelF) A.2. The method of item 1 for producing an expression vector capable of expressing mature human leukocyte interferon LelF A in the transformed E.coli strain with the amino acid sequence from position 1 to 166 as shown in Figure 4, characterized in that in step b ) prepares a DNA fragment encoding mature human leukocyte interferon (LelF) A. 3. Způsob podle bodu 1 pro výrobu expresního vektoru schopného v transformovaném kmenu E.coli expresi poskytovat zralý lidský leukocytární interferon LeiF B, C, O nebo F s aminokyselinovou sekvenci od polohy 1 do 166 jak je uvedeno na obr, 4, vyznačující se tim, že se ve stupni b) připrav! DNA fragment kódující zralý lidský leukocytární interferon, který je vybrán ze skupiny sestávající z lidského leukocytárního interferonu (LelF) B, C, D nebo F,3. The method of item 1 for producing an expression vector capable of providing mature human leukocyte interferon LeiF B, C, O, or F in the transformed E.coli strain with the amino acid sequence from position 1 to 166 as shown in FIG. that in step b) prepare! A DNA fragment encoding a mature human leukocyte interferon which is selected from the group consisting of human leukocyte interferon (LelF) B, C, D or F, 4. Způsob podle bodu 1 pro výrobu expresního vektoru schopného v transformovaném kmenu E.coli expresí poskytovat zralý lidský Isukocytárni interferon LelF H s aminokyselinovou sekvenci od polohy 1 do 166 jak je uvedeno na obr. 4, vyznačující se tim, že se ve stupni b) připraví DNA fragment kódující zralý lidský leukocytární interferon (LelF)4. The method of item 1 for producing an expression vector capable of providing mature human Isukocyte interferon LelF H with the amino acid sequence from position 1 to 166 as shown in Fig. 4, characterized in that in step b ) prepares a DNA fragment encoding mature human leukocyte interferon (LelF) H.H. 5, Způsob podle bodu 1 pro výrobu expresního vektoru schopného v transofrmovanóm kmenu E.coli expresi poskytovat zralý lidský leukocytární interferon LelF I nebo 3 s ami nokyselinovou sekvenci od polohy 1 do 166 jak je uvedeno na obr. 9, vyznačujlci se tim, že se ve stupni b) připrav! DNA fragment kódující zralý lidský Isukocytárni interferon (LelF) I nebo 3.5. The method of item 1 for producing an expression vector capable of providing mature human leukocyte interferon LelF I or 3 with the amino acid sequence from position 1 to 166 as shown in FIG. 9, as shown in FIG. 9, characterized in that: in step b) prepare! DNA fragment encoding mature human Isucocyte interferon (LelF) I or 3. 6. Způsob podle bodu 1, vyznačující ss tím, že se jako kmen E.coli používá E.coli K-12 kmen 294 (ATCC 31446).6. The method of claim 1, wherein the E. coli strain is E. coli K-12 strain 294 (ATCC 31446).
CS362787A 1980-07-01 1987-05-19 Method of expressive vector production capable to give mature human leucocytic interferon in transformed strain of escherichia coli by means of expression CS273182B2 (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CS362787A CS273182B2 (en) 1980-07-01 1987-05-19 Method of expressive vector production capable to give mature human leucocytic interferon in transformed strain of escherichia coli by means of expression

Applications Claiming Priority (6)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US16498680A 1980-07-01 1980-07-01
US18490980A 1980-09-08 1980-09-08
US20557880A 1980-11-10 1980-11-10
US06/256,204 US6610830B1 (en) 1980-07-01 1981-04-21 Microbial production of mature human leukocyte interferons
CS503781A CS273152B2 (en) 1980-07-01 1981-06-30 Method of mature human leucocytic interferon production
CS362787A CS273182B2 (en) 1980-07-01 1987-05-19 Method of expressive vector production capable to give mature human leucocytic interferon in transformed strain of escherichia coli by means of expression

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CS362787A2 CS362787A2 (en) 1990-07-12
CS273182B2 true CS273182B2 (en) 1991-03-12

Family

ID=27509695

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CS362687A CS273181B2 (en) 1980-07-01 1987-05-19 Method of escherichia coli cells production that are capable to produce mature human leucocytic interferon
CS362787A CS273182B2 (en) 1980-07-01 1987-05-19 Method of expressive vector production capable to give mature human leucocytic interferon in transformed strain of escherichia coli by means of expression

Family Applications Before (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CS362687A CS273181B2 (en) 1980-07-01 1987-05-19 Method of escherichia coli cells production that are capable to produce mature human leucocytic interferon

Country Status (1)

Country Link
CS (2) CS273181B2 (en)

Also Published As

Publication number Publication date
CS362687A2 (en) 1990-07-12
CS273181B2 (en) 1991-03-12
CS362787A2 (en) 1990-07-12

Similar Documents

Publication Publication Date Title
FI82712B (en) A FRUIT REQUIREMENT FOR THE PURPOSE OF HUMAN LEUKOCYTINTERFERON.
US6482613B1 (en) Microbial production of mature human leukocyte interferons
KR920007439B1 (en) Hybrid human leukocyte interferons
HU193512B (en) Process for preparing hybride interferones from human erythrocytes
NZ202190A (en) Human immune interferon : production by recombinant dna technology
HU193507B (en) Process for producing interferen-like pelypeptides
HU202921B (en) Process for producing coding dns for human tumor necrosis factor the corresponding polypeptide with utilizing them and pharmaceutical compositions containing this polypeptide as active component
IE57053B1 (en) Human immune interferon protein and production thereof
JPH0240080B2 (en)
US4801685A (en) Microbial production of mature human leukocyte interferon K and L
EP0165654B1 (en) Purified interleukin 1
JPS6361920B2 (en)
US4810645A (en) Microbial production of mature human leukocyte interferon K and L
JPH02195888A (en) Recombinant dna body containing gene coding polypeptide having human interleukin-2 and procaryote cell transformed by the same recombinant dna body
CS273182B2 (en) Method of expressive vector production capable to give mature human leucocytic interferon in transformed strain of escherichia coli by means of expression
FI82714C (en) Process for producing a transformed strain of E. coli capable of expressing a human mature leukocyte interferon
KR870000510B1 (en) The manufacturing method of transformation microorganisms
KR870000511B1 (en) Preparing method of expression vehicles
IL63197A (en) Mature human leukocyte interferons their production and compositions containing them
Goeddel Microbial production of mature human leukocyte interferons
NO164178B (en) PLASMID CODING A COMPLETE DEVELOPED HUMAN LEUKOCYTT INTERFERON.