CS273181B2 - Method of escherichia coli cells production that are capable to produce mature human leucocytic interferon - Google Patents

Method of escherichia coli cells production that are capable to produce mature human leucocytic interferon Download PDF

Info

Publication number
CS273181B2
CS273181B2 CS362687A CS362687A CS273181B2 CS 273181 B2 CS273181 B2 CS 273181B2 CS 362687 A CS362687 A CS 362687A CS 362687 A CS362687 A CS 362687A CS 273181 B2 CS273181 B2 CS 273181B2
Authority
CS
Czechoslovakia
Prior art keywords
dna
plasmid
trp
interferon
fragment
Prior art date
Application number
CS362687A
Other languages
Czech (cs)
Other versions
CS362687A2 (en
Inventor
David Van Norman Goeddel
Sidney Pestka
Original Assignee
Hoffmann La Roche
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from US06/256,204 external-priority patent/US6610830B1/en
Priority claimed from CS503781A external-priority patent/CS273152B2/en
Application filed by Hoffmann La Roche filed Critical Hoffmann La Roche
Priority to CS362687A priority Critical patent/CS273181B2/en
Publication of CS362687A2 publication Critical patent/CS362687A2/en
Publication of CS273181B2 publication Critical patent/CS273181B2/en

Links

Landscapes

  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Abstract

A method of production of Escherichia coli cells capable of producing mature human leukocytic interferon with a partial amino acid sequence Cys-Ala-Trp-Glu-Val-Val-Arg-Ala-Glu-Ile-Met-Arg-Ser with 165 to 166 amino acids and with the amino acid Asp, Glu or Val in position 114 or, if methionine is linked to the N-terminal of the first amino acid of the abovementioned interferon, with 166 to 167 amino acids and with the amino acid Asp, Glu or Val in position 115, based according to the invention on the fact that a) E. coli cells are incubated and treated with calcium chloride DNA by an expressive vector selected from the group of the plasmid pLeIF A trp 25 DNA, the plasmid pLeIF B trp 7 DNA, the plasmid pLeIF F trp 1 DNA, the plasmid pLeIF C trp 35 DNA, the plasmid pLeIF D trp 11 DNA, the plasmid pLeIF H DNA, the plasmid pLeIF I trp 1 DNA and the plasmid pLeIF J trp 1 DNA in a ligating buffer solution for 30 minutes b) selection of the transformed E. coli cells occurs on a solid layer of agar containing tetracycline. Specifically, the E. coli strain K-12 No 294 ATCC 31446 is used.

Description

Vynález se týká způsobu výroby E.coli buněk schopných produkovat zralý lidský leukocytárni interferon 8 částečnou aminokyselinovou sekvenci Cys-Ala-Trp-Glu-Val-Val-Arg-Ala-Glu-Ile-Mst-Arg-Ser se 165 až 166 aminokyselinami a s aminokyselinou A9p,' Glu nebo Val v poloze 114 nebo, jestliže ja na N-konac prvé aminokyseliny shora uvedeného interferonu připojen methionin, sa 166 až 167 aminokyselinami a a aminokyselinou Aep; Glu nebo Val v poloze 115.The invention relates to a process for the production of E. coli cells capable of producing mature human leukocyte interferon 8 with a partial amino acid sequence of Cys-Ala-Trp-Glu-Val-Val-Arg-Ala-Glu-Ile-Mst-Arg-Ser of 165 to 166 amino acids and amino acid A9β, Glu or Val at position 114 or, if the methionine is attached to the N-terminus of the first amino acid of the above interferon, with 166 to 167 amino acids and a amino acid Aep; Glu or Val at position 115.

Podstata způsobu podle vynálezu spočívá v tom, žeThe essence of the process according to the invention is that

a) inkubuji se E.coli buňky ošetřená chloridem vápenatým ONA expresním vektorem vybraným za skupiny zahrnující plasmid pLelF A trp 25 DNA; plasmid pLelF B trp 7 DNA, plasmiď pLIF F trp 1 DNA,’ plasmid pLelF C trp 35 DNA^ plasmid pLelF D trp 11 DNA; plasmid pLelF H DNA; plasmid pLelf I trp 1 DNA a plasmid pLelF O trp 1 DNA v ligačnim ústojném roztoku po dobu 30 minut aa) incubating E. coli cells treated with calcium chloride with an ONA expression vector selected from the group consisting of plasmid pLelF A trp 25 DNA; pLelF B trp 7 DNA plasmid, pLIFF trp 1 DNA plasmid, pLelF C trp 35 DNA plasmid ^ pLelF D trp 11 DNA plasmid; plasmid pLelF H DNA; plasmid pLelf I trp 1 DNA and plasmid pLelF 0 trp 1 DNA in ligation buffer for 30 minutes, and

b) provede sa selekce transformovaných E-coli buněk na tuhé vrstvě agaru obaahujici tatracyklin.b) selecting transformed E-coli cells on a solid layer of tatracycline-containing agar.

Lidský leukocytárni interferon (LelF) byl poprvé objeven a připraven ve formě velmi surových sraženin Issacsem a Llndemannem (Proč. R. Soc. B 147, 258 až 267 (1957) a USA patent 3 699 222). Od té doby pokračuje snaha o vyčištění a charakterizaci tohoto materiálu. Toto úsilí vedlo k přípravě relativně homogenních leukocytárních interferonů získaných z normálních nebo leukemických donorských leukocytů (NSR patentový zveřejňovací spis č. 2 947 134). Tyto intarferony tvoři skupinu bílkovin, o kterých ja známo, že máji schopnost udělovat svým cílovým buňkám reeistanci vůči virům. Interferon můža dála působit inhibičně na proliferaci buněk a modulovat imunitní odpověď. Tyto vlastnosti interferonů inspirovaly jejich klinické použiti jako terapeutických prostředků pro léčeni virových infekci a maligních onemocněni.Human leukocyte interferon (LelF) was first discovered and prepared in the form of very crude precipitates by Issacs and Lndemann (Proc. R. Soc. B 147, 258-267 (1957) and U.S. Pat. No. 3,699,222). Since then, efforts have been made to clean and characterize this material. These efforts have led to the preparation of relatively homogeneous leukocyte interferons derived from normal or leukemic donor leukocytes (German Patent Publication No. 2,947,134). These intarferons form a group of proteins known to have the ability to confer resistance to viruses on their target cells. Interferon may also act to inhibit cell proliferation and modulate the immune response. These properties of interferons have inspired their clinical use as therapeutic agents for the treatment of viral infections and malignancies.

Leukocytárni interferony byly vyčištěny až v podstatě do homogenního stavu /viz Rubinatein a spolupracovnici,’ Proč. Nati. Acad. Sci. USA 76 , 640-644 (1979); Zaon a spolupracovnici; tamtéž; 76? 5601-5605 (1979)/; a jejich uváděné molekulární hmotnosti se pohybuji v rozmezí od asi 17 500 do asi 21 000. Specifická aktivita těchto preparátů ja 8 9 pozoruhodně vysoká; 2 x 10 až 1 x 10 jednotek na mg bílkoviny, ala výtěžky metod používajících buněčných kultur jsou odrazujícím způsobem nízká. Přesto pokroky v pracovních technikách pro stanovování bilkovinových sekvenci dovolily určeni částečných sledů aminokyselin v těchto intarfaronech /viz Zoon a spolupracovnici,’ Science 207, 527 (1980)} Lávy a spolupracovnici. Proč. Nati. Acad. Sci. USA 77, 5102-5104 (1980)/. Objasněni glykosylaca rázných leukocytárních interferonů není ještě v současné době úplné, ale již nyni je zřejmé, že rozdíly v glykosylacl mezi jednotlivými Členy skupiny nevysvětlují samy o sobě spektrum pozorovaných molekulových hmotnosti. Leukocytárni intarferony se mimo to zjevně liší ve složení a pořadí aminokyselin, a shodnost aminokyselin jest v některých případech nižší než 80 %.Leukocyte interferons have been purified to a substantially homogeneous state / see Rubinatein et al., 'Why. Nati. Acad. Sci. USA 76: 640-644 (1979); Zaon and coworkers; ibid. 76? 5601-5605 (1979)]; and their reported molecular weights range from about 17,500 to about 21,000. The specific activity of these preparations is remarkably high; 2 x 10 to 1 x 10 units per mg protein, and the yields of cell culture methods are discouragingly low. Yet advances in working methods for determining protein sequences have allowed the determination of partial amino acid sequences in these intarfarons (see Zoon et al., Science 207, 527 (1980)) Lava et al. Why. Nati. Acad. Sci. USA 77, 5102-5104 (1980)]. The clarification of glycosylation of vigorous leukocyte interferons is not yet complete, but it is now apparent that differences in glycosylation between members of the group do not in themselves explain the spectrum of observed molecular weights. In addition, leukocyte intarferons clearly differ in amino acid composition and order, and the amino acid identity is in some cases less than 80%.

Zatímco isolace interferonů z donorských leukocytů zajistila materiál postačujíc! k částečné charakterizaci a k omezeným klinickým studiím a homogenním leukacytárnlm interferonem, je tento zdroj zcela nedostatečným pro získáváni interferonu v množstvích potřebných pro jeho klinické zkoušeni v širokém rozsahu a pro jeho rozsáhlé použiti k profylaktickým a/nebo terapeutickým účelům. Současné klinické výzkumy používající intarferony získané z lidských leukocytů k testováni jejich antineoplastického a antivirového účinku se vskutku pricipiálně omezily jen na surové preparáty (o čistotě menši než 1 %) a dlouhé doby potřebné pro výrobu dostatečnách množství spolu e nereálnou výškou cen kriticky zdržely výzkum na široké frontě.While isolation of interferons from donor leukocytes provided sufficient material. For partial characterization and limited clinical trials and homogeneous leukocytic interferon, this source is completely insufficient to obtain interferon in the amounts required for its wide-ranging clinical trial and for its extensive use for prophylactic and / or therapeutic purposes. Indeed, recent clinical trials using intarferones derived from human leukocytes to test their antineoplastic and antiviral effects have in fact been limited to crude preparations (less than 1% purity) and the long time required to produce sufficient quantities together with unrealistic pricing have critically delayed research on front.

Nástup technologie rekombinace ONA umožnil kontrolovanou mikrobiální produkci enormní řady užitečných polypeptidů. V současné době jsou již k dispozici bakteria modifikované touto technologii umožňujíc! výrobu takových polypeptidických produktů jako jsou sómaCS 273 181 B2 t os ta tin,' A a B řetězce lidského insulinu a lidský růstový hormon /viz Itakura se spolupracovníky/ Science 198; 1056-1063 (1977); Goeddel se spolupracovníky,' Nátuře 281, 544548 (1979)/. Nověji bylo technologií rekombinace DNA použito k bakteriální produkci proinsulinu a thymosinu alfa 1, a řada autorů referuje, že nalezli DNA kódováni pro lidský leukocytárni interferon a že vzniklé bílkoviny měly účinnost leukocytárniho interferonu (Nagata a spolupracovnici. Nátuře 284, 316-320 (1980); Mantel a spolupracovnici. Gene 10;The advent of ONA recombination technology has enabled controlled microbial production of an enormous array of useful polypeptides. Currently, bacteria modified with this technology are already available! the production of such polypeptide products such as CS 273 181 B2 tetatin, A and B chains of human insulin and human growth hormone (see Itakura et al., Science 198; 1056-1063 (1977); Goeddel et al., Nature 281, 544548 (1979)]. More recently, recombinant DNA technology has been used for bacterial production of proinsulin and thymosin alpha 1, and many authors report that they found DNA encoded for human leukocyte interferon and that the resulting proteins had leukocyte interferon activity (Nagata et al. Nature 284, 316-320 (1980)). Mantel et al., Gene 10;

1-10 (1980); Taniguchl a spolupracovnici,' Nátuře 285,‘ 547-549 (1980)/.1-10 (1980); Taniguchl et al., Nature 285, 547-549 (1980)].

Výkonným útvarem při technologii rekombinace DNA je plasmid, chromosomů prostá smyčka dvouvláknová DNA nalezená v bakteriích a v jiných mikrobech, často v mnohonásobných kopiích v jedná bakteriální buňce. V Informaci zakódované v plasmidické DNA Jest včleněna informace potřebná k reprodukci plasmidů do dceřinných buněk (tzv. replikon) a obvykle Jedna nebo vice selekčních charakteristik, jako Je v případě bakterii rezistence vůči antibiotikům, které dovoluje,' že klony hostitelské buňky obsahující plasmid, který Je před mětem našeho zájmu mohou být rozpoznány, vybrány a přednostně pěstovány v selektivním růstovém prostředí. Užitečnost bakteriálních plasmidů spočívá ve skutečnosti, že je lze specificky štěpit Jednou nebo druhou restrikční endonukleásou neboli restrikčním ezymem, přičemž každá z těchto endonukleéz rozpoznává na plasmidické DNA odlišné misto štěpení.A powerful feature in DNA recombination technology is a plasmid, a chromosome-free loop of double-stranded DNA found in bacteria and other microbes, often in multiple copies in a single bacterial cell. The information encoded in the plasmid DNA incorporates the information needed to reproduce the plasmids into the daughter cells (the so-called replicon) and usually one or more selection characteristics, such as antibiotic resistance bacteria, which allows the host cell clones containing the plasmid that It is the object of our interest that they can be recognized, selected and preferably grown in a selective growth environment. The usefulness of bacterial plasmids lies in the fact that they can be cleaved specifically by one or other restriction endonuclease or restriction enzyme, each of which recognizes a different cleavage site on the plasmid DNA.

Po rozštěpeni lze do plasmidů vpravit cizorodé (heterologní) gsny nebo fragmenty genů bu3 přímým připojením v místě rozštěpeni nebo připojením na rekonstruovaných koncích sousedicich 8 místem rozštěpeni. Rekombinace DNA se provádí vně buněk,* ale vzniklý rekombinovaný plasmid lze zavést do bakteriálních buněk postupem známým jako transformace a kultivaci získaného transformantu lze připravit velká množství rekombinovaného plasmidů obsahujícího heterologní gen. Kromě toho, podle toho kam se gen vhodně zavede vzhledem k částem plasmidů/ které řidl transkripci (přepis) a translaci (překlad) zakódovaných DNA informaci/ lze získaný exprese schopný nosič použít k aktuální produkci polypeptidickó sekvence; pro kterou je vestavěný gen kodován; tento postup se v popisu vynálezu označuje jako exprese.After cleavage, foreign (heterologous) genes or gene fragments can be introduced into the plasmids either by direct attachment at the cleavage site or by attachment at the reconstructed ends adjacent to the 8 cleavage site. DNA recombination takes place outside the cells, but the resulting recombinant plasmid can be introduced into bacterial cells by a method known as transformation, and large quantities of recombinant plasmids containing a heterologous gene can be produced by culturing the transformant obtained. In addition, depending on where the gene is suitably introduced with respect to portions of the plasmids (which have driven the transcription and translation of the encoded DNA information), the expression obtained capable of being used for actual production of the polypeptide sequence; for which the built-in gene is encoded; this procedure is referred to in the description of the invention as expression.

Exprese je iniciována v oblasti známé Jako promotor; která je rozpoznávána a na kterou se připojuje RNA-polymeraza. V některých případech; jako v případu tryptofanového (trp) promotoru; kterého se s výhodou používá při praktickém prováděni způeobu podle tohoto vynálezu, jsou oblasti promotoru překryty oblastmi operátoru a vytváří se kombinovaný promotor-operátor. Operátory Jsou sekvence DNA, které j9ou rozpoznávány tak zvanými repreaorovými bílkovinami, které slouží k regulováni frekvence iniciace transkripce u specifického promotoru. Polymaraza ae pohybuje podél řetězce DNA; transkribuje informace obsažené v kódovacím vláknu DNA a jeho 5' konce na 3'konec informační kyseliny ribonukleová (m-RNA) a tyto informace se ihned překládají do polypeptidickó sekvence, která má takové pořadí aminokyselin, pro která je příslušná DNA kódována. Každá aminokyselina je zakódovaná jediným drlpletem nukleotidů, neboli kodenem, pro který je v popisu vynálezu používán termín strukturální gen a který označuje tu část DNA; ve které je zakódovaná aminokyselinová sekvence exprimovanáho peptldickáho produktu. Potéj co se RNA polymaraza naváže na promotor, transkribuje nejprve nukleotidy kódováním ribosomového vazebného mleta, pak dojde k iniciaci translace neboli k signálu start;(obyčejně kodonem ATG, který se ve vzniklá m-RNA stane AUG) a poté k translaci nukleotidických ksdonů uvnitř samotného strukturálního genu. Na konci strukturálního gsnu se transkribuji tak zvaná stop-kodony a polymeráza může potě vytvářet dalši sekvenci m-RNA, která vzhledem k přítomnosti stop.signálu zůstává nepřeložena riboeomy. Ribosomy se naváži na vazebné misto připravené na m-RNA, v bakteriích obvykle poté, co se m-RNA vytooři, a samy produkuji zakódované polypeptldy, počínaje start signálem translace a konče ehora zmíněným stop signálem. Žádaný produkt ee tvoři Jan tehdy, když jsou sekvence kódující vazebná misto ribosomů umístěny správně vzhledem k AUG iniciačnímu kodonu a když všechny zbývající kodony následují za iniciačním kodonem ve správné fázi. Vzniklý produkt lze získat lysou hostitelné buňky a jeho oddělením od ostatních bakteriálních bílkoviny vhodnou čisticí metodou.Expression is initiated in a region known as the promoter; which is recognized and to which RNA polymerase is attached. In some cases; as in the case of the tryptophan (trp) promoter; which is preferably used in the practice of the method of the invention, the promoter regions are overlapped by operator regions and a combined promoter-operator is formed. Operators are DNA sequences that are recognized by so-called reporter proteins that serve to regulate the frequency of transcription initiation at a specific promoter. Polymaraza ae moves along the DNA strand; transcribes the information contained in the DNA coding strand and its 5 'end to the 3' end of the ribonucleic acid information (m-RNA), and this information is immediately translated into a polypeptide sequence having the amino acid sequence for which the DNA is encoded. Each amino acid is encoded by a single nucleotide breaker, or koden, for which the term structural gene is used in the present disclosure to denote that portion of DNA; wherein the encoded amino acid sequence of the expressed peptide product is encoded. After the RNA polymarase binds to the promoter, it first transcribes the nucleotides by encoding the ribosome binding milling, then initiates translation or the start signal (usually the ATG codon, which becomes the AUG in the resulting m-RNA), and then translates the nucleotide ksdon within itself structural gene. At the end of the structural gene, so-called stop codons are transcribed, and the polymerase may be pleased to generate an additional m-RNA sequence which, due to the presence of the stop signal, remains untranslated by riboeomas. The ribosomes bind to the binding site prepared for m-RNA, in bacteria usually after the m-RNA is produced, and produce the encoded polypeptides themselves, beginning with the translation start signal and ending with ehor above the stop signal. The desired product is Jan when the ribosome binding site coding sequences are positioned correctly relative to the AUG initiation codon and all remaining codons follow the initiation codon in the correct phase. The resulting product can be obtained by lysing a host cell and separating it from other bacterial proteins by a suitable purification method.

CS 273 181 B2CS 273 181 B2

Autoři vynálezu si uvědomili, že aplikace technologie rekombinace DNA (to je vloženi interferonových genů do mikrobiálních exprimačnich nosičů a jejich exprese pod kontrolou regulačních prvků mikrobiálního genu) by byla nejefektivnějěí cestou k zajištěni velkých množství lsukocytárního interferonu, kterého by ee přesto, že by nebyl glykosylován, jak je tomu v případě produktu z lidských leukocytů,’ dalo klinicky používat při léčeni širokého okruhu virových a neoplastických onemocnění.The inventors realized that applying recombinant DNA technology (i.e., inserting interferon genes into microbial expression carriers and expressing them under the control of microbial gene regulatory elements) would be the most effective way to provide large amounts of lysucocyte interferon which, although not glycosylated as in the case of a human leukocyte product, it has been used clinically in the treatment of a wide range of viral and neoplastic diseases.

Podle vynálezu se první leukocytární gen dá připravit následujícím sledem operaci:According to the invention, the first leukocyte gene can be prepared by the following sequence of operations:

1) Za použiti parciálních aminokyselinových sekvenci lidského leukocytárního interfaronu vyčištěných do homogenního stavu se zkonstruuji soubory zkušebních vzorků synthetických DNA, jejichž kodony v celku představuji všechny možné nukleotidická kombinace schopné zakódovat zmíněné parciální aminokyselinové sekvence.1) Using homogeneous purified human leukocyte interpharon partial amino acid sequences, sets of synthetic DNA test samples are constructed whose codons in total represent all possible nucleotide combinations capable of encoding said partial amino acid sequences.

2) Připraví sa banky bakteriálních kolonií obsahující komplementární DNA (cDNA) z indukované mRNA. Oiné indukované mRNA, radioaktivně označené, se hybridizuji do plasmidické oDNA z této banky. Hybrldizujici mRNA sa eluuja a testuje se jeji schopnost transplantace na interferon pomoci oocytárniho testu. Plasmidlcké ONA z kolonii, u kterých bylo zjištěno,' žs při tomto způsobu indukuji interferonovou aktivitu, se dále testuji na jejich schopnost hybridizace do zkušebních vzorků připravených způsobem popsaným výše ad2) Bacterial colony flasks containing complementary DNA (cDNA) from induced mRNA are prepared. Other induced radiolabeled mRNAs hybridize to plasmid oDNA from this flask. Hybridizing mRNA is eluted and tested for its ability to transplant to interferon using an oocyte assay. Plasmid ONAs from colonies found to induce interferon activity in this method are further tested for their ability to hybridize to test samples prepared as described above and

1).1).

3) Souběžně s postupem popsaným výše v části 2) sa oDNA odvozená z indukované mRNA v plasmidach použije k vytvořeni nezávislé banky transformovaných kolonií. Zkušebních vzorků z části 1) se použije k započetl 3ynthesy radioaktivně značených jsdnovláknových cDNA/ kterých aa použije jako hybridizačnich zkušebních vzorků. Synthatické zkušební vzorky se hybridizuji s indukovanou mRNA jakožto Šablonou a prodlouží se reversní transkripci za vzniku indukované,' radioaktivně značené cDNA. Klony z banky kolonií, které ee hybridzuji do radioaktivně značené cDNA získané shora uvedeným postupem, se dála zkouši,' aby se potvrdila přítomnost celá délky interferonového kodujiciho genu. Dako zkušebních vzorků pro interferonový gen o plné délce lze jako takového použit kteréhokoliv domnělého genového fragmentu s částečnou délkou řetězce, získaného va shora uvedených oddílech3) In parallel to the procedure described above in section 2), oDNA derived from induced mRNA in plasmids is used to create an independent bank of transformed colonies. The test samples of part 1) were used to count 3ynthesis of radiolabeled single stranded cDNA (s) and used as hybridization test samples. Synthetic assay samples hybridize to the induced mRNA template and extend reverse transcription to produce induced, radiolabeled cDNA. Colony bank clones that hybridize to the radiolabeled cDNA obtained as described above can be tested to confirm the presence of the full length interferon coding gene. Any putative partial-length gene fragment obtained in the above sections may be used as a test sample for the full-length interferon gene.

1) a 2).1) and 2).

4) Interferonový gen o plné délce/ získaný shora uvedeným postupem, se za použiti synthatické DNA uzpůsobí tak; aby se odstranila jakékoliv vedoucí sekvence, která by mohla zabránit mikrobiální expresi zralého polypeptidu a aby se mu zajistilo vhodné umístěni v nosiči schopném exprese vzhledem k iniciačním signálům pro start a k ribosomovému vazebnému mletu mikrobiálního promotoru. Expresi získaný interferon se vyčistí do stupně dovolujícího potvrzení jeho charakteru a stanoveni jeho aktivity.4) Adjust the full-length interferon gene / obtained by the above procedure, using synthetic DNA; to remove any leader sequence that could prevent microbial expression of the mature polypeptide and to provide suitable placement in an expression-capable carrier relative to the start initiation signals and to the ribosome binding milling of the microbial promoter. The expression of the interferon obtained is purified to a degree allowing confirmation of its character and determination of its activity.

5) Interferonový genový fragment připravený ehora popsaným způsobem se použije jako takový ke zkoušeni; cestou hybridizace,* pro přípravu jiných částečně homologických leukocytámich druhů interferonu.5) The interferon gene fragment prepared by ehor as described above is used as such for testing; via hybridization, * for the preparation of other partially homologous leukocyte species of interferon.

Shora popsanou aplikaci metod technologie rekombinace ONA bylo dosaženo mikrobiální produkce, a to ve vysokých výtěžcích a vysoké čistotě, skupiny homologických laukocytérnich interferonů (neglykolysovaných) ve formě zralých polypaptidů,* nedoprovázených v podstatě odpovídající prssekvancí nabo Jakoukoliv její části. Tyto interferony se dají přímo exprimovat, isolovat a čistit do stupně čistoty vhodného pro jejich použití při léčeni virových a maligních onemocněni u živočichů a u lidi. Mikrobiální expresi zatím získané produkty této skupiny prokázaly účinnost při testování in vitro, a v prvních zkouškách toho druhu rovněž při testováni in vivo, přičemž posléze uvedené testováni zahrnovalo i prvni zralý leukocytární interferon vyprodukovaný mikrobiálním způsobem.The above-described application of ONA recombinant technology techniques has resulted in microbial production, in high yields and high purity, of a group of homologous laukocyte interferons (non-glycolysed) in the form of mature polypaptides, not accompanied by substantially corresponding sequencing or any portion thereof. These interferons can be directly expressed, isolated and purified to a degree of purity suitable for their use in the treatment of viral and malignant diseases in animals and humans. The microbial expression of the products of this group so far has been shown to be effective in in vitro testing, and in the first tests of this kind also in in vivo testing, including the first mature leukocyte interferon produced in a microbial fashion.

Výraz zralý leukocytární interferon“ používaný v popisu tohoto vynálezu znáči mikrobiálně (například bakteriálně) vyprodukovanou intarfaronovou- molekulu, prostou glykoeylových skupin. Zralý leukocytární interferon jest při způsobu podle vynálezu bezCS 273 181 B2 prostředně exprimován počínaje iniciačním signálem pro tlanslaci (ATG) Ještě před prvním aminokyselinovým kodonem přirozeného produktu. Zralý polypeptld tak může obsahovat jako první aminokyselinu ve své sekvenci methionin (pro který kóduje ATGú bez podstatné změny svého charakteru. Na druhé straně může mikrobiální hostitel zpracovat produkt translace tak; že Je vynechán počáteční methionin. Zralý leukocytární interferon může být exprimován společně s konjugovanou bílkovinou jiné povahy než je běžná vedoucí bílkovina, přičemž zmíněný konjugát se dá specificky rozštěpit v lntra- nebo extracelulárnim prostředí (viz britský patent číslo 2 007 676 A). Posléze může být zralý interferon produkován v kojugaci s mikrobiálním signálním peptidem, který transportuje konjugát do buněčné stěny, kde se signální peptid odštěpí a vyloučí se zralý polypeptid. Pojem exprese zralého leukocytárního interferonu značí bakteriální nebo jinou mikrobiální produkciinterferonové molekuly neobsahující glykosylové skupiny ani aminokyselinové presekvence, které se bezprostředně zúčastňuji mRNA translace lidského leukocytárniho interferonového genomu.The term mature leukocyte interferon, as used in the description of the present invention, refers to a microbially (e.g. bacterially) produced glycolyl-free intarfarone molecule. The mature leukocyte interferon in the method of the invention without CS 273 181 B2 is expressed directly, starting with the tlanslation initiation signal (ATG), before the first amino acid codon of the natural product. Thus, a mature polypeptide may contain as the first amino acid in its sequence methionine (for which it encodes ATGs without substantially altering its nature. On the other hand, the microbial host may process the translation product so that the initial methionine is omitted. other than the conventional leader protein, said conjugate being specifically digested in an intra- or extracellular environment (see British Patent No. 2,007,676 A.) Finally, the mature interferon can be produced in conjunction with a microbial signal peptide that transports the conjugate to the cellular the walls where the signal peptide is cleaved to exclude the mature polypeptide. The expression of mature leukocyte interferon refers to bacterial or other microbial production of interferon molecules lacking glycosyl groups or amino acid presequences, which are directly involved in mRNA translation of the human leukocyte interferon genome.

Specifické leukocytární interferonové bílkoviny uváděná v tomto vynálezu jsou definovány pomoci stanoveného DNA genu (viz obrázky Číslo 3 a 8) a padle dedukovaná aminokyselinové sekvence (viz obrázky 4 a 9). Rozumí se, že u těchto specifických interferonů, i když je lze vskutku všechny zahrnout do skupiny leukooytárních interferonových bílkovin, existuji přirozené alelickó variace, která se vyskytuji od případu k případu. Tyto variace lze demonstrovat rozdílem (nebo rozdíly) v celkové aminokyselinové sekvenci,' nebo vynecháním; subetítuci, vložením; inverzi nebo přidáním aminokyseliny (nebo aminokyselin) ve zmíněné sekvenci. U každé leukocytární interferonové bílkoviny uvedená v tomto vynálezu/ označených symboly LelP A až LelF O, jsou zmíněná alelickó variace zahrnuty do rozsahu uvedených označeni nebo terminů definujících tyto interferony.The specific leukocyte interferon proteins disclosed herein are defined by the determined DNA gene (see Figures 3 and 8) and the fallen deduced amino acid sequence (see Figures 4 and 9). It is understood that, for these specific interferons, although they can indeed all be included in the group of leucooytic interferon proteins, there are natural allelic variations that occur from case to case. These variations can be demonstrated by a difference (or differences) in the total amino acid sequence, or by omission; subtitling, by insertion; by inverting or adding an amino acid (or amino acids) in said sequence. For each leukocyte interferon protein referred to in the present invention / designated by LelP A to LelF 0, said allelic variations are included within the scope of said labels or of the terms defining these interferons.

Výhodný způsob podle vynálezu jest blíže objasněn v následujícím podrobném popisu a na přiložených obrázcích·1 až 9.The preferred method of the invention is explained in more detail in the following detailed description and in the accompanying figures 1 to 9.

Na obrázku 1 Jsou znázorněny dvě aminokyselinové sekvence; které jsou společná všem druhům interferonů izolovaných z lidských leukocytů a vyčištěných do homogenního stavu/ označených T-l až T-15. Všechny možné mRNA sekvence kódující tyto peptidy jsou znázorněny jako odpovídající DNA sekvence. Písmena A, T/ G, 0 a U označuji nukleotidy obsahující base adenin; thymin, guanin,1 cytoein a uráčil. Plemeno N označuje kterýchkoliv z uvedených nukleotidů A; G, C a U. Polynukleotidy jsou zobrazeny tak; aby se četly ze směru 5* (zleva) do 3' (doprava), a tam, kde je znázorněna dvouvláknová (d.v.) ONA, se naopak pročítá od spodu nabo od nekódujícího vlékna.In Figure 1, two amino acid sequences are shown; which are common to all species of interferons isolated from human leukocytes and purified to a homogeneous state (designated T1 to T-15). All possible mRNA sequences encoding these peptides are shown as corresponding DNA sequences. The letters A, T / G, 0 and U refer to nucleotides containing base adenine; thymine, guanine, 1 cytoein and uracin. Breed N refers to any of said nucleotides A; G, C and U. The polynucleotides are shown as follows; to read from the 5 * (left) to 3 '(right) direction, and where a double-stranded (dv) ONA is shown, it in turn reads from below or from the non-coding strand.

Na obrázku 2 Je uveden autoradiogram znázorňující hybridizaci potenciálních LelF 32 plaemidů se synthetickými deoxyoligenuklaotidy značenými P.Figure 2 An autoradiogram showing hybridization of potential LelF 32 plaemids with synthetic P-labeled deoxyoligenuclaotides is shown.

Na obrázku 3 Jsou znázorněny nukleotidické sekvence (kódující vlákna) osmi genových fragmentů; které byly izolovány Jako možní kandidáti pro použiti k axprasi leukocytárnich interferonů, a které jsou označeny písmeny Aů až H. Iniciační ATG kodony translace a terminačni triplety každého LelF Jsou podtrženy. Stop kodony neboli termiriačnl triplety Jsou následovány nepřekládanými oblastmi v poloze 3*. Včleněný gen o plné délce pro LelF A má vynechaný jeden kodon, který byl nalezen u ostatních nakreslených genů, jak je znázorněno ve třetí A lince obrázku 3. V poloze 5* nepřekládané oblasti předcházejí vedoucím sekvencím. Ve fragmentu E schází po izolaci celá presekvence vedoucí bílkoviny, ale je zahrnut celý gan pro předpokládaný zralý LwIF E. Ve fragmentu G schází po izolaci celá kódující sekvence.Figure 3: Nucleotide sequences (coding strands) of eight gene fragments; which have been isolated As possible candidates for use in axprasion of leukocyte interferons, and which are indicated by the letters A to H. The translation initiation ATG codons and termination triplets of each LelF are underlined. Stop codons or thermirectional triplets are followed by non-translated regions at the 3 * position. The full length incorporated LelF A gene has omitted one codon that was found in the other drawn genes as shown in the third A line of Figure 3. At position 5 *, the untranslated regions precede the leader sequences. Fragment E lacks the full-length leader sequence after isolation, but the entire gan for the putative mature LwIF E is included. Fragment G lacks the entire coding sequence after isolation.

Na obrázku 4 jest znázorněno srovnáni osmi LalF bilkovinových sekvenci určených nukleotidickými sekvencemi. Pro aminokyseliny Jsou používány jednopismenkové zkratky, doporučená IUPAC-IUB komisí pro biochemickou nomenklaturu: A » alanln; C » cystein: D » kyselina asparagová: E » kyselina glutamováj F fenylalanin; G glycin; H a histidin;Figure 4 shows a comparison of eight LalF protein sequences determined by nucleotide sequences. For amino acids The one-letter abbreviations used by the IUPAC-IUB Biochemical Nomenclature Committee are used: Aalanine; C »cysteine: D» aspartic acid: E »glutamic acid F phenylalanine; G glycine; H and histidine;

I isoleucln: K lysin: L lauci.; M methionin: N aeparagin: P » prolin: Q » glutamin: R arginin, S serin, T n threoninj V valin: W = tryptofan: a Y » tyrosin.I isoleucine: K lysine: L lauci .; M methionine: N aeparagine: P-proline: Q-glutamine: R-arginine, S-serine, T-threonine V-valine: W = tryptophan: and Y-tyrosine.

CS 273 181 B2CS 273 181 B2

Čísla označuji umístěni aminokyselin (S ee vztahuje na signální peptid). Pomlčka na místě 44 u sekvence 165 aminokyselin interferonu LelF A jeet zavedena pro vyrovnáni zmíněná LelF A sekvence se sekvenci 166 aminokyselin jiných LelF. Sekvence LelF E byla stanovena za zanedbáni extranukleotidu (poloha 187 na obrázku 3) v jeho kódujíc! oblasti. Hvězdičky označuji tsrminační kodony,' která jsou ve fázi. Aminokyseliny společné věem LelF (s výjimkou pseudogenu LelF E) jsou rovněž zřejmé. Podtržené zbytky jsou aminokyseliny,' které jsou rovněž přítomné v lidském fibroblastovém interferonu.The numbers indicate the location of the amino acids (S ee refers to the signal peptide). A dash at position 44 of the 165 amino acid sequence of interferon LelF A is introduced to align said LelF A sequence with a sequence of 166 amino acids of other LelF A. The LelF E sequence was determined by neglecting the extranucleotide (position 187 in Figure 3) in its coding sequence. areas. Asterisks indicate the termination codons that are in phase. Amino acids common to LelF (with the exception of LelF E pseudogen) are also evident. Underlined residues are amino acids that are also present in human fibroblast interferon.

Na obrázku 5 jsou zobrazeny mapy rsetrikčnlch endonukleáz osmi typů (A až H) cDNA klonovaných interferony LelF. Hybridizované plasmidy byly zkonstruovány za použiti metody dC:dG koncových zbytků (Goeddel D.V. a spolupracovnici/ Nátuře 287/ 411-416 (1980)/. Při této metodě se vyříznou vložky cDNA za použiti reetrikční endonukleázy Pěti. Cáry na konci každé cDNA vložky představují přilehlé homopolymsrickó dCidG koncové zbytky.Figure 5 is a map of the restriction endonucleases of eight types (A to H) of cDNA cloned by LelF interferons. Hybridized plasmids were constructed using the dC: dG end-residue method (Goeddel DV et al., Nature 287 / 411-416 (1980)), whereby cDNA inserts were excised using a rheumetric endonuclease Five. homopolymsrical dCidG terminal residues.

Na obrázku je rovněž označeno umístěni PvuII; EcoRI a BglII štěpných míst. Stínované oblasti obrázku znáči kódující sekvence zralých LelF; šrafovanó oblasti označuji sekvence kódující signální peptid; volná oblasti znázorňuji 3r a 5' nekódující sekvence.The location of PvuII is also indicated in the figure; EcoRI and BglII cleavage sites. The shaded regions of the figure indicate the coding sequences of mature LelF; shaded regions indicate sequences encoding a signal peptide; the free regions represent the 3 r and 5 'non-coding sequences.

Na obrázku 6 je schematicky zobrazena konstrukce genu kódujícího přímou mikrobiální synthesu zralého LelF A. 3aou vyznačena místa štěpeni a vzniklé zbytky (Pst I/ atd.). Zkratka b.p. označuje “pár basi.Figure 6 schematically depicts the construction of the gene encoding the direct microbial synthesis of mature LelF A. 3a and cleavage sites and residues formed (Pst I / etc.) are indicated. Abbreviation b.p. indicates “a pair of bases.

Na obrázku 7 js schematicky znázorněna reetrikční mapa dvou genových fragmentů používaných k expresi zralého leukocytárniho interferonu LsIF B. Vyznačené kodonové sekvence jeou kódující koncová vlákna získaná digescí restrikčnim enzymem Sau3a v uvedených dvou případech.Figure 7 is a schematic representation of a reetric map of two gene fragments used to express mature leukocyte interferon LsIF B. The codon sequences indicated are end-strand coding sequences obtained by digestion with the restriction enzyme Sau3a in the two cases.

Na obrázcích 8 a 9 Jeou uvedeny DNA a aminokyselinové sekvence (pokud ee týké příslušných jednopismenkových zkratek aminokyselin viz shora uvedený popis k obrázku 4) pěti LelF bílkovin/ včetně typu I a 3. Hvězdička na obrázku 9 označuje terminační kodon přialušné DNA sekvence a rozdělovači čárka značí daleci nebo mezeru v sekvenci.Figures 8 and 9 show the DNA and amino acid sequences (when referring to the corresponding one-letter amino acid abbreviations as described above for Figure 4) of the five LelF proteins / including type I and 3. The asterisk in Figure 9 indicates the termination codon of the adjacent DNA sequence and the delimiter indicates a further or gap in the sequence.

A. Použité mikroorganismyA. Used micro-organisms

Způsob podls vynálezu zahrnuje používání dvou mikroorganismů: bakterie E. coli x 1776/ jak Je popsáno v USA patentu číslo 4 190 495/ a bakteri E. coli K-12 kmen 294 (zakončení A/ thi“, har“/ hsmj£), jak je popsáno v britském patentu číslo 2 055 382 A. Každý z těchto mikroorganismů je uložen v Americké sbírce typových kultur (ATCO) pod označením ATCC číslo 31537 a 31446. Všechny práce s rekombinovanými DNA.byly prováděny v souhlase se závaznými směrnicemi Národního zdravotnického úřadu (NIH) v USA.The method of the invention comprises the use of two microorganisms: E. coli x 1776 (as described in U.S. Pat. No. 4,190,495) and E. coli K-12 strain 294 (A / thi ', har' / hsmj zakon terminus). as described in British Patent No. 2,055,382 A. Each of these microorganisms is deposited with the American Type Culture Collection (ATCO) under the designation ATCC Nos. 31537 and 31446. All work with recombinant DNA has been carried out in accordance with binding National Health Authority guidelines (NIH) in the United States.

Způsob podle vynálezu ve svém nejvýhodnějším provedení jest popsán za použiti mikroorganismů E. coli, včetně nejen kmenů E. coli x 1775 a E. coli K-12 kmene 294, uvedených výše/ ale i Jiných známých kmenů E. coli, jako E. coli B/ nebo jiných mikrobiálních kmenů, z nichž četné jsou uloženy a dostupné ve známých sbírkových ústavech/ jako v Americké sbírce typových kultur; viz též NSR patentový zveřejňovaci spis 2 644 432. Mezi zmíněnými jinými mikroorganismy jsou zahrnuty například kmeny Basilli, jako například Eacillus subtilis/ a jiné enterobakterlálni mikroorganismy, mezi kterými lze uvéet například kmeny Salmonella typhimuriura a Serrata marcescens, které využívají plasmidů a jsou schopné replikace a exprese heterolognich genových sekvenci v nich obsažených.The method of the invention in its most preferred embodiment is described using E. coli microorganisms, including not only strains of E. coli x 1775 and E. coli K-12 strain 294 mentioned above, but also other known strains of E. coli such as E. coli B / or other microbial strains, many of which are stored and available in known collection institutes / such as the American Type Culture Collection; see also German Patent Publication No. 2,644,432. Other microorganisms include, for example, Basilli strains, such as Eacillus subtilis / and other enterobacterial microorganisms, including Salmonella typhimuriura and Serrata marcescens strains which use plasmids and are capable of replication, and expressing heterologous gene sequences contained therein.

□ako hostitelského organismu pro přípravu interferonových bílkovin expresi genů pro ně kódovaných,’ za kontroly kvasinkového promotoru/ lze rovněž používat s výhodou kvasinek/ jako Sacharomyces cereviae.As a host organism for the preparation of interferon proteins, the expression of genes encoded therein, under the control of a yeast promoter (preferably yeasts) such as Sacharomyces cereviae.

B. Zdroj a čištěni leukocytárni interferonové raRNA (LsIF mRNA)B. Source and purification of leukocyte interferon raRNA (LsIF mRNA)

LelF mRNA lze získávat z lidských leukocytů/ obvykle z leukocytů nemocných e chronickou myeloidni leukémii/ tyto leukocyty lze indukovat k produkci interferonu virem Sendaiaká nebo Newcstleské nemoci/ jak je popsáno například v NSR patentovém zvařejňovaCS 273 181 B2 cim spisu číslo 2 947 134. Zvláště výhodným zdrojem,’ používaným rovněž v táto práci,' Js linie buněk označená KG-1,’ získaná od nemocných s akutní mysloidní leukémií. Tato linie buněk, popsaná H.P. Koefflerem a D.W. Goldem v časopisu Science 200, 1153 (1978), ochotně roste v kultivačním mediu obsahujícím RPMI (Rosewell Park Memoriál Institute) 1640 plus 10 % FCS (fetálni telecí sérum) inaktivované zahřátím,' 25 mM pufru HEPES (N-2-hydroxyethyl-piperazin-N/-2-ethan8ulfonovó kyselina) a 50 ^ug/rnl gentamicinu; a subkultivuje Se na Jedno až tři rozděleni dvakrát za týden. Buňky z předcházejícího kultivačního prostředí se zmrazí s 10 % OMSO (dimwthylsulfoxidu). Buňky KG-1 jsou uloženy v Americké sbírce typových kultur pod označením ATCC čislo CRL 8031.LelF mRNA can be obtained from human leukocytes (usually from leukocytes suffering from chronic myeloid leukemia), and these leukocytes can be induced to produce interferon by Sendai or Newcastle disease virus, as described, for example, in U.S. Pat. No. 2,781,118 B2 cim file 2,947,134. a source, also used in this work, is a cell line designated KG-1 obtained from patients with acute mysloid leukemia. This cell line, described by HP Koeffler and DW Gold in Science 200, 1153 (1978), readily grows in culture medium containing RPMI (Rosewell Park Memorial Institute) 1640 plus 10% FCS (fetal calf serum) inactivated by heating, 25 mM buffer HEPES (N-2-hydroxyethyl-piperazine-N - 2-ethanesulfonic acid) and 50 µg / ml gentamicin; and subculture to one to three divided twice a week. Cells from the previous culture medium are frozen with 10% OMSO (dimethylsulfoxide). KG-1 cells are deposited with the American Type Culture Collection under the designation ATCC No. CRL 8031.

Buňky KG-1 se indukují k produkci leukooytární interferonové mRNA virem Sendaiskó nebo Newcastleeké nemoci způsobem popsaným Rubinsteinem a spolupracovníky /viz časopis Proč. Nati. Acad. Sci. USA 76; 640-644 (1979)/. Buňky es izoluji za 5 hodin po indukci a RNA se preparuje postupem za použiti thiokyanátu guanidinu s hydrochloridem guanidinu /viz Chirgwin se spolupracovníky, Biochemiatry 18, 5294-5299 (1979)/. Stejným způsobem se izoluje RNA z neindukovaných buněk. Za použiti chromatografie na oligodeoxythymidin (dT) - celulose a ultracentrifugace se eacharosovým gradientem áe ziská 12S frakce poly(A) mRNA/ jak popisuji Gresn a spolupracovníci /Arch. Biochem. Biophys. 172,' 74-89, (1976)/ a Okimura a spolupracovnici /Arch. Biochem. Biophys. 188; 98-104 (1978)/. Takto získané mRNA má interferonovou aktivitu 8000 až 10 000 jednotek na mikrogram při oocytovém stanoveni za užiti žáby Xenopua Laevis /viz Cavalieri a spolupracovnici, Proč. Nati. Acad. Sci USA 74/ 3287-3291 (1977)/.KG-1 cells are induced to produce leucooytic interferon mRNA by Sendaisko virus or Newcastle disease as described by Rubinstein and coworkers / see Proc. Nati. Acad. Sci. USA 76; 640-644 (1979)]. The es cells are isolated 5 hours after induction and RNA is prepared by the procedure using guanidine thiocyanate with guanidine hydrochloride (see Chirgwin et al., Biochemiatry 18, 5294-5299 (1979)). In the same way, RNA is isolated from uninduced cells. Using oligodeoxythymidine (dT) -cellulose chromatography and ultracentrifugation with eacharose gradient to obtain a 12S poly (A) mRNA fraction (as described by Gresn et al., Arch.). Biochem. Biophys. 172, 74-89, (1976) and Okimura et al., Arch. Biochem. Biophys. 188; 98-104 (1978)]. The mRNA thus obtained has an interferon activity of 8000 to 10,000 units per microgram in an oocyte assay using a Xenopua Laevis frog / see Cavalieri et al., Proc. Nati. Acad. Sci USA 74 / 3287-3291 (1977)].

C. Příprava bank kolonii obsahujících LelF cONA sekvenceC. Preparation of colony flasks containing LelF cONA sequences

Za použiti 5 /Ug mRNA se standardními poetupy připrav! dvouvláknová cONA /viz Wickens a spolupracovnici, 0. Biol. Chem. 253/ 2483-2495 (1978) a Goeddel a spolupracovnici Nátuře 281, 544-548 (1979). Získaná cDNA ee frakcionuje podle velikosti elektroforeoou na 6%nim polyakrylamidovém gelu (PAGE); a elektroeluci sa izoluje 230 ng materiálu majícího velikost v rozmezí od 500 do 1300 b.p. U části této cONA (100 ng) se nakonec naváží zbytky deoxycytidinu (dC) způsobem popsaným Changem a spolupracovníky v časopisu Nátuře 275, 617-624 (1978)/ produkt ee analuje se 470 plasmidu pBR322,' na jehož Pet I restrikčni mleto jsou navázány zbytky desoxyguanidinu (dG) /viz Bolivar a spolupracovnici,' Gene 2, 95-113 (1977)/ a takto modifikovaného plasmidu se použije k transformaci mikroorganismu E. coli x 1776. Ziská se asi 130 transformantů rezistentních vůči tetracyklinu a citlivých na ampicilin/ na jeden ng cDNA.Using 5 / µg of mRNA with standard procedures, prepare! double-stranded cONA / see Wickens et al., 0. Biol. Chem. 253 / 2483-2495 (1978) and Goeddel et al. Nature 281, 544-548 (1979). The obtained cDNA was ee fractionated by electrophoresis on a 6% polyacrylamide gel (PAGE); and 230 ng of material having a size ranging from 500 to 1300 b.p. is isolated by electroelution. For a portion of this cONA (100 ng), deoxycytidine residues (dC) were finally ligated as described by Chang and co-workers in Nature 275, 617-624 (1978) / product ee analyzed with 470 plasmid pBR322, to which the Pet I restriction mills are bound desoxyguanidine residues (dG) (see Bolivar et al., Gene 2, 95-113 (1977)) and the plasmid thus modified is used to transform E. coli x 1776. About 130 tetracycline-resistant and ampicillin-sensitive transformants are obtained. per ng of cDNA.

V druhém podobném pokusu se získá přibližně 1000 transformantů E. coli K-12 kmene 294/ rezistentních vůči tetracyklinu a citlivých na ampicilin/ na Jeden ng cDNA, V tomto případě se frakcionaci cDNA podle velikosti molekul a elektroeluci získá materiál o velikosti v rozmezí od 600 do 1300 b.p·, který ee použije k navázáni koncových dC.In a second similar experiment, approximately 1000 E. coli K-12 strain 294 (tetracycline resistant and ampicillin sensitive) / per ng ng cDNA were obtained, in which case cDNA fractionation by molecular size and electroelution yielded a material ranging from 600 up to 1300 bp · which ee will use to bind the terminal dC.

O. Příprava synthetických oligonukleotidů a jejich použitiO. Preparation of synthetic oligonucleotides and their use

Znalost aminokyeelinových sekvenci různých tryptických fragmentů lidského leukocyw tárniho interferonu dovoluje navrhnout synthetické deeoxyoligonukleotidy komplementární k různým oblastem LelF mRNA. Byly zvoleny dva tryptickó peptidy T 1 a T 13; poněvadž máji aminokyselinovou sekvenci vyžadující eynthesu pouze 12,' popřípadě 4 undekamerů/ aby se vysvětlily všechny možné kódující sekvence (viz obrázek 1). Synthetlaují 3Θ čtyři soubory zkušebních vzorků deoxyoligonukleotidů pro každou sekvenci,' z nichž každý obsahuje bu3 tři (T-lA, B, C,‘ O) nebo Jeden (T-13A/ B/ C, O) oligonukleotid. Uvedené komplementární deoxyoligonukleotidy o délce 11 basí se synthetisuji chemicky za použití fosfortriesterovó metody /viz Grea a spolupracovnici/ Proč. Nati. Acad. Sci. USA 75/ 5765-5769 (1978)/. V T-13 sérii se připraví čtyři Jednotlivé vzorky, v eerii T-1 dvanáct vzorků ve čtyřech skupinách po třech vzorcích, jak je uvedeno na obrázku 1.Knowledge of the aminokyeeline sequences of various tryptic fragments of human leukocyte tare interferon allows to design synthetic deeoxyoligonucleotides complementary to different regions of LelF mRNA. Two tryptic peptides T1 and T13 were selected; since they have an amino acid sequence requiring only 12 or 4 undecamer eynthesis (to explain all possible coding sequences (see Figure 1)). They synthesize 3Θ4 sets of test deoxyoligonucleotides for each sequence, each containing either three (T-1A, B, C, 10) or One (T-13A / B / C, O) oligonucleotide. Said 11 base complementary deoxyoligonucleotides are synthesized chemically using the phosphfortriester method (see Grea et al., Proc.). Nati. Acad. Sci. USA 75 / 5765-5769 (1978)]. In the T-13 series four individual samples are prepared, in the T-1 series twelve samples in four groups of three samples as shown in Figure 1.

čtyři individuální zkušební vzorky v T-13 sérií a dvanáct T-1 zkušebních vzorků při7four individual test samples in the T-13 series and twelve T-1 test samples at 7

CS 273 181 B2 pravených vs čtyřech skupinách po třech primérech v každá ee použijí k informační synthe8Θ radioaktivně značené jednovláknové cDNA za účelem použití k hybridizačním zkouškám.CS 273 181 B2 prepared in four groups of three primers in each ee will use radiolabeled single stranded cDNA for information synthesis for use in hybridization assays.

□ako vzorové mRNA se použije buď 12S RNA z KG-1 buněk indukovaných Sendaiským virem (8000 jednotek IF aktivity na jeden /Ug) nebo celkové poly(A) mRNA z naindukovaných leukocytů (aktivita menši než 10 jednotek na ,ug). Z uvedených primérů aa připravi cDNA značenáBuď either 12S RNA from KG-1 cells induced by Sendai virus (8000 units of IF activity per µg) or total poly (A) mRNA from induced leukocytes (activity less than 10 units per µg) was used as exemplary mRNA. From the aa primers, prepare labeled cDNA

P za použiti známých reakčnich podmínek /víz Noyea a spolupracovnici. Proč. Nati, Acad. Sci. USA 76,1 1770-1774 (1979)/. Reakce aa provedou v 60 mikrolitrových pufrach o složeni 20 mM Tris-HCl (hydrochlorid tris-hydroxymethylmethanu) o pH 8,3, 20 mM chloridu draselného, 8 mM bezvodého chloridu hořečnatého a 30 mM jj-merkaptoethanolu. Pro reakce sa použije vždy jednoho /Ug každého primářů (tj. celkem 12 /ug pro primary T-l série a celkem 4- /Ug pro T-13 série), 2 /ug indukované 12S frakce mRNA (nebo 10 /u9 neindukované póly (A) mRNA); 0,5 mM dATP;' dCTP,* dTTP, 200 /UCi (c<32 P)dCTP (dodavatel Amersham, 2000-3000 Ci/mmol) a 60 jednotek reversní transkriptásy (dodavatel Bethesda Research Laboratories). Žádaný produkt se oddělijod nainkorporovanóho značkovacího materiálu gelovou filtraci na sloupci 10 ml SaphadexuG-50 a produkt ee zahřívá 30 minut na 70 °C s 0,3 N roztokám hydroxidu-sodného,' aby sa rozložila RNA; a pak ss směs zneutralizujs kyselinou chlorovodíkovou. Hybridisaca aa provedou způsobem popsaným Kafatosem a spolupracovníky v časopisu Nucleic Acids Ras. 7; 1541-1552 (1979)/.P using known Noyea reaction conditions / visas and co-workers. Why. Natl, Acad. Sci. USA 76, 1770-1774 1 (1979) /. Reactions aa are performed in 60 microliter buffers of 20 mM Tris-HCl (pH 8.3), 20 mM potassium chloride, 8 mM anhydrous magnesium chloride, and 30 mM β-mercaptoethanol. For each reaction, one µg of each primary is used (i.e., a total of 12 µg for the primary T1 series and a total of 4- / µg for the T-13 series), 2 µg induced 12S fraction of mRNA (or 10 / u9 non-induced poles). mRNA); 0.5 mM dATP; dCTP, * dTTP, 200 / UCi (c < 32 P) dCTP (Amersham supplier, 2000-3000 Ci / mmol) and 60 reverse transcriptase units (Bethesda Research Laboratories supplier). The desired product is separated from the incorporated marker material by gel filtration on a 10 ml column of Saphadex G-50 and the product ee is heated at 70 ° C for 30 minutes with 0.3 N sodium hydroxide solutions to decompose the RNA; and then neutralized with hydrochloric acid. Hybridisations aa were performed as described by Kafatos and co-workers in Nucleic Acids Ras. 7; 1541-1552 (1979)].

E. Identifikace klonů pLl až pL30E. Identification of clones pL1 to pL30

K přípravě 1 /Ug plasmidické ONA z každého z 500 individuálních transformantů E. coli K-I2,1 kmene 294 (viz oddíl C) se použije rychlého způsobu isolace plasmidu popsaného Birnboimam a spolupracovníky v časopisu Niclaic Acids Res. 7j 1513-1523 (1979). Každý získaný vzorek DNA se denaturuje a pak aplikuje trojmo na nitrocalulosový filtr podle postupu popsaného Kafatosem a spolupracovníky (viz výše).The rapid plasmid isolation method described by Birnboimam and co-workers in Niclaic Acids Res is used to prepare 1 / Ug plasmid ONA from each of the 500 individual E. coli K-I2 transformants, 1 strain 294 (see section C). 7j 1513-1523 (1979). Each DNA sample obtained was denatured and then applied in triplicate to a nitrocalulose filter according to the procedure described by Kafatos and coworkers (see above).

Tři shora uvedené soubory nitrocelulosových filtrů obsahující 500 plasmidických vzorků ss hybridizujiThe above three sets of nitrocellulose filters containing 500 plasmid DC samples hybridize

a) a indukovanou cONA obsahující T-l soubor primářů;a) and induced cONA containing a T-1 set of primaries;

b) a indukovanou cONA obsahující T-13 priméry, ab) and induced cONA containing T-13 primers, and

c) s neindukovanou cDNA připravenou za použiti obou souborů příměrů.(c) uninduced cDNA prepared using both primer sets.

Klony se považují za positivní,' když hybridizuji silněji na jednom nebo obou vzorcích indukované cDNA než na celkovém neindukovaném vzorku. Z výchozích 500 vzorků plasmidů bylo vybráno třicet positivních klonů (pLl až pL30) k další analyse.Clones are considered positive when hybridizing more strongly on one or both samples induced by cDNA than on the total non-induced sample. Thirty positive clones (pL1 to pL30) were selected from the initial 500 plasmid samples for further analysis.

F. Identifikace klonů pL3l až pL39. Isolace plasmidu Číslo 104 obsahujícího LelF genový fragmentF. Identification of clones pL31 to pL39. Isolation of plasmid Number 104 containing the LelF gene fragment

Transformanty mikroorganismů E. coli x 1776 ae podrobí užšímu výběru metodou koloniové hybridizacs podle Grunsteina a Hognesse /viz Proč. Nati. Acad. Sci. USA 72; 3961-3965 (1975)/ za použiti 32P značené indukované mRNA jako zkušebního vzorku /viz Lillsnhaug a spolupracovnici; Biochemistry 15; 1858-1965 (1976)/. Neznačná mRNA z naindukovaných buněk se smísí se zkušebním vzorkem v poměru 200:1,' aby došlo ke kompetici 3 naindukovanou mRNA přítomnou v preparátu značeném P. Hybridizace značené mRNA nastává přednostně 8 koloniemi obsahujícími indukované sekvence. Získají se tři druhy transformantů:The transformants of E. coli x 1776 ae will be short-listed by the method of colony hybridization according to Grunstein and Hogness / see Proc. Nati. Acad. Sci. USA 72; 3961-3965 (1975) (using 32 P labeled induced mRNA as a test sample), see Lillsnhaug et al. Biochemistry 15; 1858-1965 (1976)]. Unlabeled mRNA from induced cells is mixed with the test sample at a ratio of 200: 1 to compete with the 3 induced mRNA present in the P-labeled preparation. Hybridization of the labeled mRNA occurs preferably with 8 colonies containing induced sequences. Three types of transformants are obtained:

1) 2 až 3 % kolonií hybridizovaných na 32P-mRNA velmi silně;1) 2 to 3% colonies hybridized to 32 P-mRNA very strongly;

2) 10 % kolonii hybridizovaných signifikantně méně nsž va skupině 1); a2) 10% colonies hybridized significantly less than in group 1); and

3) zbytek; který nadává dategovatalný hybridizačni signál,3) a residue; that swears a dategatable hybridization signal,

Positivní kolonie (skupiny 1 a 2) sa testuji na přítomnost sekvencí specifických pro interferon pomoci zkoušky; která spočívá v hybridizaci intarferonovó mRNA specificky na plaemidickou DNA. Nejprve se 60 ailně positivních kolonii (ze skupiny 1) kultivuje individuálně va 100 ml živného prostředí M9; doplněného tatracyklinera (20 /ug/ml), kyselinou diaminopimslovou (100 /Ug/ml),' thymidinsm (20 /.ug/ml) a d-biotinam (1/Ug/ml). Živná půda M9 obsahuje v 1 litru hydroganfosforsčnan sodný (6 g), dihydrogsnfosforečnanPositive colonies (Groups 1 and 2) are tested for the presence of interferon-specific sequences by assay; which consists in hybridizing intarferon mRNA specifically to plaemid DNA. First, 60 affinity-positive colonies (from group 1) are cultured individually in 100 ml of M9 broth; supplemented with tatracycline (20 µg / ml), diaminopimylic acid (100 µg / ml), thymidine (20 µg / ml) and d-biotinam (1 µg / ml). M9 broth contains sodium hydrogen phosphate (6 g) in 1 liter, dihydrogen phosphate

CS 273 181 B2 draselný (3 g), chlorid sodný (0,5 g) a chlorid amonný (1 g); po vystsrilizování v autoklávu ss přidá 1 ml sterilního 1M roztoku síranu hořečnatého (bszvodóho) a 10 ml sterilního 0,01 M roztoku bszvodého chloridu vápenatého. Kultury es spoji po deseti a ze šesti uvedených spojených skupin ss izoluje plasmidická DNA způsobem popsaným Clawsllam a spolupracovníky v časopisu Biochemistry 9, 4428-4440 (1970). Deset ^ug plasmidické DNA z každé skupiny se rozštěpí enzymem HindlII, směs se danaturuje a kovalentně naváže na OBM-papir (diazobsnzyloxymethylovaný filtrační papír). Oeden ^ug přečištěné mRNA z indukovaných buněk se hybridizujs s rozštěpenou DNA vázanou na DBM-papíru. Nazhybridizovaná mRNA sa odstraní promytim, specificky hybridizovaná mRNA sa eluuje a testuje pomoci oocytŮ Xenopus laevie. V tomto testu bylo všech šsst skupin negativních. Z 59 slabě positivních kolonii (skupina 2) bylo vytvořeno pět skupin po 10 koloniích a jedna skupina z 9 kolonii, a z těchto skupin byly shora uvedeným způsobem připraveny plasmidy, které byly zhodnoceny jak bylo uvedeno výše. Z šesti testovaných skupin hybridizovala jedna (K 10) na interferonovou mRNA a vykazovala v každé době testováni hladiny signifikantně vyšší než byly základní hladiny. Za účelem identifikováni specifického interferonového cDNA klonu se z 9 kolonii skupiny K 10 připrav! plasmidické DNA a testuji se individuálně. Dva ze zmíněných plasmidů (číslo 101 a číslo 104) vázaly Interfsronovou mRNA signifikantně nad základní hladiny. Z plasmidů číslo 104 byl izolován unikátní Bgl II rss32 trikční fragment obsahující 260 b.p., označen radioaktivním P způsobem popsaným Tayloram a spolupracovníky v časopisu Biochim. Biophys. Acta 442, 324-330 (1976) a použit jako zkušební vzorek k nezávislému výběrovému hodnoceni na 400 transformantech.E. coli 294 za použiti skriningové metody na koloniích in šitu /viz Grunstsin a Hogness, Proč. Nati. Sci. USA 72, 3961-3965 (1975)/. Bylo identifikováno devět kolonii (pL31 až pL39), které hybridizovaly v tomto testu do rozdílného stupně.CS 273 181 B2 potassium (3 g), sodium chloride (0.5 g) and ammonium chloride (1 g); After sterilization in an autoclave, 1 ml of sterile 1M magnesium sulphate solution (bszvodó) and 10 ml of sterile 0.01 M calcium chloride chloride solution are added. Plasma DNA cultures are isolated by ten joints from ten of the six cohesive groups, as described by Clawsllam et al., Biochemistry 9, 4428-4440 (1970). Ten µg of plasmid DNA from each group was digested with HindIII, the mixture danatured and covalently bound to OBM-paper (diazobsnzyloxymethyl filter paper). One µg of purified mRNA from the induced cells hybridized to the digested DNA bound to DBM-paper. The hybridized mRNA is removed by washing, specifically the hybridized mRNA is eluted and assayed with Xenopus laevie oocytes. In this test, all six groups were negative. Of the 59 weakly positive colonies (Group 2), five groups of 10 colonies and one group of 9 colonies were formed, and from these groups plasmids were prepared as described above and evaluated as above. Of the six test groups, one (K 10) hybridized to interferon mRNA and showed levels significantly higher than baseline at each time of testing. To identify a specific interferon cDNA clone, prepare from 9 colonies of the K10 group. plasmid DNA and tested individually. Two of these plasmids (number 101 and number 104) bound Interfsron mRNA significantly above baseline levels. A unique Bgl II rss32 trick fragment containing 260 b.p. was isolated from plasmids number 104, labeled with a radioactive P as described by Taylor and co-workers in Biochim. Biophys. Acta 442, 324-330 (1976) and used as a test sample for independent selection on 400 transformants. coli 294 using the in situ screening method / see Grunstsin and Hogness, Proc. Nati. Sci. USA 72, 3961-3965 (1975)]. Nine colonies (pL31 to pL39) were identified that hybridized to a different degree in this assay.

Shora uvsdaný značený fragment o 260 b.p. byl dále použit v nezávislém skríningu na 4000 transformantsch E. coli 294 stejným způsobem. Bylo identifikováno 50 kolonii, které v tomto testu hybridizovaly ss zkušebním vzorkem do rozdílných stupňů. Bedna z nich obsahovala LalF G fragment, jedna LsIF H fragment a jedna obsahovala fragment označený Jako LelF Hl, zřejmou alalickou variantu interferonu LelF H. Hybridní plasmidy, která byly uvedeným způsobem získány, byly označeny jako pLsIF H“, atd.The above tagged 260 bp fragment. was further used in independent screening for 4000 transformants of E. coli 294 in the same manner. 50 colonies were identified that hybridized with the test sample to different degrees in this assay. The box contained a LalF G fragment, one LsIF H fragment, and one contained a fragment designated as LelF H1, an apparent alanic variant of interferon LelF H. The hybrid plasmids obtained were designated as pLsIF H ', and so on.

G. Izolace a stanoveni sekvence prvého LsIF genu a plné délce řetězceG. Isolation and sequence determination of the first LsIF gene and full-length chain

Zs všech 39 potenciálních LsIF cONA klonů ss připraví plasmidické ONA, které se znovu podrobí dalšímu výběru ss stejným zkušebním vzorkem DNA obsahujícím 260 b.p., za použiti hybridizačniho postupu popsaného Kafatosem a spolupracovníky (viz výšs). Tři plasmidy (pL 4, pL 31, pL 34) dávaly při tomto skríningu velmi silné hybridizačni signály, čtyři (pL 13, pL 30, pL 32, pL 36) hybridizovaly mírně a tři (pL 6, pL 8, pL 14) hybridizovaly ss zkušebním vzorkem slabě.Of all 39 potential LsIF cONA clones, ss prepare plasmid ONAs, which are again subjected to another selection with the same 260 b.p. DNA sample, using the hybridization procedure described by Kafatos and coworkers (see above). Three plasmids (pL 4, pL 31, pL 34) gave very strong hybridization signals in this screening, four (pL 13, pL 30, pL 32, pL 36) hybridized slightly and three (pL 6, pL 8, pL 14) hybridized with the test sample weakly.

Shora uvedených 39 potenciálních LelF cDNA rekombinovaných plasmidů bylo rovněž podrobeno výběrovému testováni za použiti syntetických undekamerů značených radioaktivnim P (skupiny individuálních T-l primsrů nsbo individuální 7-13 primery) přímo jako hybridizačnich zkušebních vzorků. Hybridizačni podmínky byly zvoleny tak, aby mohlo dojit k dokonalému párováni basi pro dstsgovatslnó hybridizačni signály /viz Wallacs a spolupracovnici, Nuclsic Acids Rss. 6, 3543-3557 (1979)/. Tak byly z 39 klonů připraveny standardním lysátovým postupem (viz Clevsll a spol., shora uvedená citace) plasmidické DNA, která byly čištěny sloupcovou chromatografií na agarosa značky Biorad Agarose A-50. Vzorky (3 ^ug) každého preparátu byly linsarizovány působením restrikčniho enzymu Eco RI, denaturovány alkálii a naneseny na 3 separátní nitrocelulo3ovó filtry v dávceThe above 39 potential LelF cDNA recombinant plasmids were also subjected to selective testing using synthetic radiolabeled P-labeled (groups of individual T-1 primers or individual 7-13 primers) directly as hybridization assay samples. The hybridization conditions were chosen so that perfect pairing of the base could be achieved for dsgging of the hybridization signals (see Wallacs et al., Nuclsic Acids Rss). 6, 3543-3557 (1979)]. Thus, plasmid DNA was prepared from 39 clones by standard lysate procedure (see Clevs11 et al., Supra), which were purified by Biorad Agarose A-50 agarose column chromatography. Samples (3 µg) of each preparation were linsarized with Eco RI, denatured with alkaline and applied to 3 separate nitrocellulose filters in a batch

1,5 /ug na Jsdnu nanášku (dle Kafatoss a spolupracovníků, citaci viz výšs). Individuální synthstické dsoxyolígonuklsotidické priméry a skupiny spojených primsrů byly fosforylovány pomoci (^ P) ATP následujícím způsobem: 50 pmol oligonuklsotidu a 100 pmol znače1.5 µg per Jdd application (according to Kafatoss and co-workers, see above). Individual synthetic dsoxyoligonucleotide primers and pools of fused primers were phosphorylated with (P) ATP as follows: 50 pmol oligonucleotide and 100 pmol labeled

CS 273 181 82 ného (/ P)-ATP (dodavatel Nsw England Nuclear, aktivita 2500 Ci/mmol) bylo vneseno do 30 mikrolltrO pufru složeného z 50 mM Tris-HCl, 10 mM bezvodého chloridu hořsčnatého a 15 mM /i -merkaptoethanolu. Ka směsi byly přidány 2 jednotky polynukleotidické kinasy T 4 a po 30 minutách zahříváni na 37 °C byly vzniklé P značené primery Čištěny chromatografii na sloupcích z 10 ml Ssphadexu®G-50. Poté byly provedeny hybridizace za použiti 106 cpm primaru T-130 nebo 3 x 106 cpm spojených primerů T-10. Hybridizace byly prováděny při 15 °C po dobu 14 hodin v prostředí 6 x SSC (1 x‘SSC β 0,15 M chlorid sodný a 0,015 M citrát sodný, pH 7,2) a 10 x Danhardtova roztoku (0,2 % hovězí serumalbumin, 0,2 % polyvinylpyrolidon, 0,2 % Ficoll), způsobem popsaným Wallacem a spolupracovníky (citaci viz výše). Filtry byly promývány po dobu 5 minut (3krét) při O °C v 6 x SSC, vysušeny a exponovány na film citlivý na X-paprsky. Výsledky získané s P značenými spojenými primery T-13C a s primerem T-1C jsou uvedeny na obrázku 2.CS 273 181 82 (β) -ATP (supplied by Nsw England Nuclear, activity 2500 Ci / mmol) was added to 30 microliter buffer consisting of 50 mM Tris-HCl, 10 mM anhydrous magnesium chloride, and 15 mM / mercaptoethanol. Two units of polynucleotide kinase T 4 were added to the mixture and after 30 minutes heating at 37 ° C the resulting P-labeled primers were purified by chromatography on 10 ml Ssphadex®G-50 columns. Hybridizations were then performed using 10 6 cpm primed T-130 or 3 x 10 6 cpm fused primers T-10. Hybridizations were performed at 15 ° C for 14 hours in 6 x SSC (1 x SSC β 0.15 M sodium chloride and 0.015 M sodium citrate, pH 7.2) and 10 x Danhardt's solution (0.2% bovine). serumalbumin, 0.2% polyvinylpyrrolidone, 0.2% Ficoll), as described by Wallace and coworkers (cited above). The filters were washed for 5 minutes (3 Cr) at 0 ° C in 6 x SSC, dried and exposed to X-ray sensitive film. The results obtained with P-labeled T-13C fused primers and T-1C primer are shown in Figure 2.

Bylo nalezeno, že dochází k signifikantní hybridizaci plasmidické DNA z klonu 104 ee skupinou spojených primerů T-1C a s primerem T-13C, ale nedochází k detegovatelné hybridizaci s jinými undekamery. 3ak je znázorněno na obrázku 2, četné z uvedených 39 potenciálních LalF plasmidů (pL 2, 4; 13, 17, 20,' 30,' 31, 34) rovněž hybridizují β oběma těmito zkušebními vzorky. Avšak restrikční endonukleázovou analýzou bylo zjištěno, že pouze jeden z těchto plasmidů,' plasmid pL 31, obsahuje rovněž interní BglII fragment o 250 b.p. Oigssci pL 31 rastrikčnim enzymem Pstl bylo zjištěno, že velikost této cDNA vložky je přibližně 1000 b.p.Significant hybridization of plasmid DNA from clone 104 ee was found to be by a group of linked primers T-1C and primer T-13C, but no detectable hybridization with other undecamers occurred. As shown in Figure 2, numerous of the 39 potential LalF plasmids (pL 2, 4; 13, 17, 20, 30, 31, 34) also hybridize to β by both of these test samples. However, restriction endonuclease analysis revealed that only one of these plasmids, plasmid pL31, also contains an internal BglII fragment of 250 b.p. By the PstI scanning enzyme pL31, the size of this cDNA insert was found to be approximately 1000 b.p.

U posléze uvedené úplné Pstl vložky plasmidu pL 31 byla analyzována nuklaotidická sekvence jednak Maxamovou-Gilbsrtovou chemickou metodou /viz časopis Mathods Enzymol. 55, 499-550 (1980)/ a jednak postupem stanovujícím zakončení dideoxydového řetězce /viz Smith, Methods Enzymol. 55, 560-580 (1980)/ po subklonováni Sau 3a fragmentů do M13 vektoru. Sekvence DNA jest znázorněna na obrázku 3 pod označením A“. Příslušná translační proČitací konstrukce zmíněné DNA se dá předpovědět z informaci, které jsou k dispozici o sekvenci aminokyselin interferonové bílkoviny, ze známého rozmezí molekulárních hmotnosti LsIF a z relativního výskytu stop-tripletů va třech možných pročitacich konstrukcích, a poznaná nukleotidická sekvence dovoluje naopak předpovídat aminokyselinovou sekvenci celého LalF, včetně prosekvance neboli signálního peptidu. První ATG iniciační kodon translace byl nalezen va vzdálenosti 60. nukleotidů od 5* konca sekvence, a je následován o 188 kodonů později TGA terminačním tripletem; pak je 342 nepřekládaných nukleotidů na 3' konci, následovaných póly (A) sekvenci. Domnělý signální psptid (pravděpodobně zahrnutý do sekrece zralého LalF z leukocytů) má délku 23 aminokyselin. Zralý LalF tvořený 165 aminokyselinami má vypočítanou molekulovou hmotnost 19390. Autoři vynálezu označili LeXF zakódovaný do plasmidu pL 31 jako LalF A. Z údajů o sekvenci (viz A na obrázku 4) Ja zřejmé,' že tryptické paptidy TI a T13 interferonu LsIF B odpovídají aminokyselinám 145-149,’ popřípadě 57 až 61, interferonu LalF A. Skutečné ONA kódující sekvence nalezené v těchto dvou oblastech odpovídají sekvencím reprezentovaným spojenými primery T 1-C a primerem T 13-C (viz obrázek 8).In the latter Pst1 insert of plasmid pL31, the nucleotide sequence was analyzed by the Maxam-Gilbsrt chemical method (see Mathods Enzymol). 55, 499-550 (1980)] and by the dideoxy chain termination procedure (see Smith, Methods Enzymol. 55, 560-580 (1980) / after subcloning the Sau 3a fragments into the M13 vector. The DNA sequence is shown in Figure 3 under the designation A '. The respective translational reading of said DNA can be predicted from the information available about the amino acid sequence of the interferon protein, the known molecular weight range of LsIF and the relative occurrence of stop-triplets in the three possible reading constructs, and the nucleotide sequence identified LalF, including the presequency or signal peptide. The first ATG translation initiation codon was found at a distance of 60 nucleotides from the 5 'end of the sequence, and is followed by 188 codons later by a TGA termination triplet; then there are 342 untranslated nucleotides at the 3 'end, followed by the poles (A) of the sequence. The putative signal psptid (probably involved in the secretion of mature LalF from leukocytes) is 23 amino acids in length. The mature 165 amino acid LalF has a calculated molecular weight of 19390. The inventors have designated LeXF encoded by plasmid pL31 as LalF A. Sequence data (see A in Figure 4) indicate that the tryptic peptides T1 and T13 of interferon LsIF B correspond to amino acids The actual ONA coding sequences found in these two regions correspond to the sequences represented by the linked T1-C primers and the T 13-C primer (see Figure 8).

H. Přímá exprese zralého leukocytárniho interferonu A (LsIF A)H. Direct expression of mature leukocyte interferon A (LsIF A)

I. ObecněI. General

Náaledujici způsob express interferonu LsIF A přimo vs formě zralého interferonového polypeptidu ja variantou postupu použitého dříve pro přípravu lidského růstového hormonu (Goeddel a spolupracovnici, Nátuře 281, 544-548 (1979)/ do té míry, že zahrnuje kombinování syntetické (N-tarmlnálni a komplementární ONA).The following method of expressing interferon LsIF A directly in the form of a mature interferon polypeptide is a variant of the method used previously for the preparation of human growth hormone (Goeddel et al., Nature 281, 544-548 (1979)) to the extent that it involves combining synthetic (N-tarminal and complementary ONA).

Oak ja znázorněno na obrázku 6, misto štěpení restrikční endonukleázou Sau3a je výhodně umístěno mszi kodony 1 a 3 interferonu LalF A. Byly určeny dva syntetické deoxyoligonukleotidy, které inkorporují ATG iniciační kodon pro translaci, obnovuji kodon pro aminokyselinu 1 (cystein) a vytváří záchytný (lepivý) EcoRI konec. Tyto oligomeryOak is shown in Figure 6, the restriction endonuclease cleavage site of Sau3a is preferably located between the mRNA codons 1 and 3 of interferon LalF A. Two synthetic deoxyoligonucleotides have been identified that incorporate the ATG translation initiation codon, restore the codon for amino acid 1 (cysteine) and sticky) EcoRI end. These oligomers

CS 273 181 B2 byly navázány na fragment o 34 b.p. mezi Sau3a - Avall místy plasmidu pL31. Získaný produkt o 45 b.p. byl navázán na dalši ONA fragmenty a tak byl zkonstruován syntheticko-přirozený gan o 865 b.p,, který kóduje interferon LelF A a který je navázán EcoRI a Pstl restrlkčnimi místy. Tento gen byl včleněn do plasmidu pBR 322 mezi jeho EcoRI a Pstl restrikčni mista za vzniku plasmidu pLalF Al.CS 273 181 B2 were ligated to a 34 b.p. fragment. between Sau3a-Avall sites of plasmid pL31. The product obtained by 45 b.p. was ligated to other ONA fragments, and a synthetic-natural gan of 865 bp, which encodes LelF A and which is bound by EcoRI and PstI restriction sites, was constructed. This gene was inserted into plasmid pBR 322 between its EcoRI and PstI restriction sites to give plasmid pLalF A1.

2. Zkonstruováni tryptofanovóho kontrolního prvku (obsahujícího E. coli trp promotor a operátor,' a trp hlavni rlbosomová vazebné místo, ale kterému schází ATG sekvence pro iniciaci translace)2. Construction of a tryptophan control element (containing the E. coli trp promoter and operator, and a trp rlbosome binding site, but lacking the ATG translation initiation sequence)

Plasmid pGMI nese tryptofénový (trp) oparon bakterii E. coli, mající deleci ALE14l3 /viz Miozzari a spolupracovnici, 0. Bactariology 133, 1457-1465 (1978)/ a proto exprimuje fúzovanou bílkovinu obsahující prvních 6 aminokyselin vedoucí trp sekvence a přibližně poeledni třetinu trp E polypeptidu (v dalším označovaný jako Le'), a rovněž exprimuje trp D polypeptid jako celek, věe pod kontrolou tryptofánového promotorového-operátorového systému. Plasmid (20 ^ug) se digeruje restrikčním enzymem PvuII, který rozštěpí plasmid na pěti mlatech. Genové fragmenty se pak zkombinuji 8 EcoRI spojovacími články (sestávajícími z vlastního komplementárního oligonuklsotidu o sekvenci pCATGAATTCATG), které obsahují EcoRI re trikční miato potřebné pro pozdější klonováni do plasmidu obsahujícího EcoRI místo. Na fragmenty DNA (20 yUg) získané z pGMI se působí 10 jednotkami ONA ligásy T4 v přítomnosti 200 pmol 5*-fosforylovaného syntetického oligonukleotidu pCATGAATTCATG a v prostředí 20 mikrolitrů T4 DNA ligásováho pufru (20mM Tria, pH 7,6, 0,5 mM ATP, 10 mM bezvodého chloridu hořečnatóho, 5 mM dithiothreitolu) při 4 °C přes noc. Roztok se pak zahřívá 10 minut na 70 °C, aby sa spojováni zastavilo. Spojovací články se rozětěpi digesci endonukleázou EcoRI, vzniklé fragmenty, nyni 8 EcoRI konci, se odděli za použiti PAGE elektroforssy (5%ni gel) a tři největší fragmenty se izoluji, po předchozím obarvení ethidiumbromidem a detekci v ultrafialovém světle, vyříznutím příslušné části gelové vrstvy obsahující žádaný fragment. Každý z uvedených gelových fragmentů se umístí spolu s 300 mikrolitry 0;l χ TBE pufru (TBE pufr obsahuje 10,8 Tris-base, 5,5 g kyseliny borité a 0,09 g dvojsodné soli kyseliny ethylendiamintetraoctové (NagEDTA) v 1 litru vody) do dlalysačniho vaku a podrobí alektroforesa při 100 V po dobu jedné hodiny v 0,1 x TBE pufru. Vodný roztok z dialysačniho vaku sa vyjme, extrahuje fenolem, extrahuje chloroformem, upraví ne 0,2 M roztok chloridem 9odným a ONA sa ziská, po vysráženi athanolem, va vodném prostředí. Získaný gen 8 EcoRI záchytnými konci, obsahující trp promotor-oparátor, sa identifikuje dále popsaným způsobem,* který spočivá ve vpraveni fragmentů do plasmidu citlivého na tatracyklin; který se po zmíněném začleněni fragmentu stane resistentnim vůči tetracyklinu.The plasmid pGMI carries a tryptophenic (trp) haze of E. coli having an ALE1413 deletion (see Miozzari et al., 0. Bactariology 133, 1457-1465 (1978)) and therefore expresses a fusion protein containing the first 6 amino acids of the trp sequence leader and approximately mid-third. the trp E polypeptide (hereinafter referred to as Le '), and also expresses the trp D polypeptide as a whole, under the control of the tryptophan promoter-operator system. The plasmid (20 [mu] g) was digested with the restriction enzyme PvuII, which cleaved the plasmid on five fresh grains. The gene fragments are then combined with 8 EcoRI linkers (consisting of the own complementary oligonucleotide having the sequence pCATGAATTCATG), which contain the EcoRI restriction pattern needed for later cloning into a plasmid containing the EcoRI site. DNA fragments (20 µg) obtained from pGMI were treated with 10 units of ONA ligase T 4 in the presence of 200 pmol of 5'-phosphorylated synthetic oligonucleotide pCATGAATTCATG and in a 20 microliter T 4 DNA ligase buffer (20 mM Tria, pH 7.6, 0, 5 mM ATP, 10 mM anhydrous magnesium chloride, 5 mM dithiothreitol) at 4 ° C overnight. The solution was then heated at 70 ° C for 10 minutes to stop the coupling. The linkers were digested by digestion with EcoRI endonuclease, the resulting fragments, now the 8 EcoRI ends, were separated using PAGE electrophoresis (5% ni gel) and the three largest fragments were isolated after pretreating with ethidium bromide and detection in ultraviolet light by cutting the appropriate portion of the gel layer. containing the desired fragment. Each of said gel fragments is placed together with 300 microliters of 0.1 l TBE buffer (TBE buffer contains 10.8 Tris-base, 5.5 g boric acid and 0.09 g ethylenediaminetetraacetic acid disodium salt (NagEDTA) in 1 liter of water ) into a slaking bag and subjected to an electrophoresis at 100 V for one hour in 0.1 x TBE buffer. The aqueous solution was removed from the dialysis bag, extracted with phenol, extracted with chloroform, treated with 0.2 M sodium chloride solution, and ONA was obtained, after precipitation with ethanol, in an aqueous medium. The obtained EcoRI capture gene 8, containing the trp promoter-oparator, is identified by the following method, which consists in inserting the fragments into a tatracycline-sensitive plasmid; which becomes tetracycline resistant upon said incorporation of the fragment.

Plasmid pBRHI /viz Rodrigusz a spolupracovnici, Nuclaic Acids Res. 6, 3267-3287 (1979)/ exprimuje ampicilinovou rezistenci a obsahuje gen pro tatracyklinovou rezistenci, ale poněvadž neni spojen 3 promotorem) posléze uvedenou rezistenci neexprimuje. Plasmid je proto citlivý vůči tetrackylinu. Vpravením promotorového-operátorového systému do EcoRI místa štěpeni plasmidu se plasmid stane rezistentním vůči tetracyklinu.Plasmid pBRHI / see Rodrigusz et al., Nuclaic Acids Res. 6, 3267-3287 (1979) / expresses ampicillin resistance and contains a gene for tatracycline resistance, but since it is not linked by the 3 promoter) it does not subsequently express said resistance. The plasmid is therefore sensitive to tetrackylin. By introducing a promoter-operator system into an EcoRI plasmid cleavage site, the plasmid becomes resistant to tetracycline.

Za tim účelem se plasmid pBRHI digeruje restrikční endonukleázou EcoRI) enzym sa odstraní fenolovou extrakci a následující chloroformovou extrakci a po vysráženi ethanolem ee DNA ziská vs vodném prostředí. Získaná molekula DNA sa pomoci T4 DNA ligásy, v oddělených reakčnich směsích,' váže shora popsaným způsobem a každým ze tři DNA fragmentů získaných shora uvedeným postupem. Vzniklá DNA, obsažená v reakční směsi, ss použije k transformaci přislušných bakterii E. coli K-12, kmene 294, za použiti standardních pracovních technik /viz Harshfleld a spolupracovnici; Proč. Nati. Acad. Sci. USA 71, 3455-3459 (1974)/. Bakterie as pak umísti na LB (Luria-Bertani) agarové desky obsahující 20 yug/mol ampicilinu a 5 ^ug/ml tetracyklinu. Kolonie bakterii rezistentních na tetracyklin se vyberou, izoluje se plasmidická DNA a přítomnost žádaného fragmentu se potvrdí restrikční enzymatickou analysou. Získaný plasmid byl označen jako pBRHtrp.To this end, the plasmid pBRHI was digested with restriction endonuclease EcoRI. The enzyme was removed by phenol extraction followed by chloroform extraction and, after ethanol precipitation, ee DNA was recovered in aqueous medium. The DNA molecule obtained was ligated with T 4 DNA ligase, in separate reaction mixtures, as described above, and with each of the three DNA fragments obtained as described above. The resulting DNA contained in the reaction mixture was used to transform appropriate E. coli K-12, strain 294, using standard techniques (see Harshfleld et al.); Why. Nati. Acad. Sci. USA 71, 3455-3459 (1974)]. The bacteria as are then plated on LB (Luria-Bertani) agar plates containing 20 µg / mol ampicillin and 5 µg / ml tetracycline. Colonies of tetracycline-resistant bacteria are selected, plasmid DNA is isolated, and the presence of the desired fragment is confirmed by restriction enzyme analysis. The plasmid obtained was designated as pBRHtrp.

CS 273 181 82CS 273 181 82

Digescí virového genomu hepatitidy B enzymy EcoRI a BamHI se obvyklým způsobem ziské produkt/ který se začlení do EcoRI a BamHI restrikčních míst plasmidu pGH6 /viz Goeddel a spolupracovnici; Natura 281; 544 (1979)/ za vzniku plasmidu pHS32. Získaný plasmid pHS32 ae rozštěpí enzymem Xbal/ směs se extrahuje fenolem, pak ee extrahuje chloroformem a vysráží ethanolem. Na získaný rozštěpený plasmid ae pak působí 1 mikrolitrem E. coli DNA polymerázy I,' Klenowovým fragmentem (Boehringer-Mannheim) v prostředí 30 mikrolitrů polymerázového pufru (tj. 50 mM fosforečnanu draselného, pH 7,4, 7 mM bezvodého chloridu hořečnatého a 1 mM /!-merkaptoethanolu), obsahujícího 0,1 mM dTTP a 0,1 mM dCTP, po dobu 30 minut při O °C a pak 2 hodiny při 37 °C. Při této reakci se doplní dva ze 4 nukleotidů komplementárních k 5 vyčnívajícímu konci Xbal štěpícího místa:By digesting the hepatitis B viral genome with the EcoRI and BamHI enzymes, the product obtained is incorporated into the EcoRI and BamHI restriction sites of plasmid pGH6 in a conventional manner (see Goeddel et al.; Natura 281; 544 (1979)] to give plasmid pHS32. The resulting plasmid pHS32 was digested with XbaI / the mixture was extracted with phenol, then extracted with chloroform and ethanol precipitated. The digested plasmid ae is then treated with 1 .mu.l of E. coli DNA polymerase I, Klenow fragment (Boehringer-Mannheim) in an environment of 30 .mu.l of polymerase buffer (i.e., 50 mM potassium phosphate, pH 7.4, 7 mM anhydrous magnesium chloride and 1. mM (1-mercaptoethanol), containing 0.1 mM dTTP and 0.1 mM dCTP, for 30 minutes at 0 ° C and then 2 hours at 37 ° C. In this reaction, two of the 4 nucleotides complementary to the 5 projecting ends of the XbaI cleavage site are added:

5' CTAGA— 5' CTAGA — , -z5 'CTAGA— 5' CTAGA -, -z

T- 3 TCT —T- 3 TCT -

Inkorporují se dva nukleotidy, dC a dTj a vznikne konec se dvěma 5' vyčnívajícími nukleotidy. Tento lineární zbytek plasmidu pHS32 (izolovaný po extrakci fenolem, extrakci chloroformem a vysrážení ethanolem ve vodném prostředí) se rozštěpí reetrikčním enzymem EcoRI. Velký plasmidický fragment ee oddělí od menšího EcoRI - Xbal fragmentu PAGE eloktroforésou a izoluje ae elektroelucí. Tento DNA-fragment plasmidu pHS32 (0,2 /Ug) se naváže, za podmínek podobných těm, která byly popsány výše, na EcoRI - Taql fragment tryptofánového operonu (0/01 y.ug) získaného z pBRHtrp.Two nucleotides, dC and dTj, are incorporated to form an end with two 5 'protruding nucleotides. This linear residue of the plasmid pHS32 (isolated after phenol extraction, chloroform extraction and ethanol precipitation in an aqueous medium) was digested with the EcoRI reetric enzyme. The large plasmid fragment ee is separated from the smaller EcoRI-XbaI fragment by PAGE by electrophoresis and isolated by electroelution. This DNA fragment of plasmid pHS32 (0.2 / µg) was ligated, under conditions similar to those described above, to an EcoRI-Taq1 fragment of the tryptophan operon (0/01 y.ug) obtained from pBRHtrp.

Při tomto shora popsaném postupu navazováni fragmentu z plasmidu pHS32 na EcoRI Taql fragment aa Taql vyčnívající konec naváže na Xbal zbývající vyčnívající konac, i když jeho base nejsou kompletně spárovány podle Watsonova a Crickova principu:In the above procedure, the binding of the fragment from plasmid pHS32 to the EcoRI Taq1 fragment and the Taq1 protruding tail binds to the XbaI remaining protruding tail, although its bases are not completely paired according to the Watson and Crick principles:

— T CTAGA- -TOTAGA—AGC TCT- — AGCTCTČást takto získané reakční směsi ligantů se transformuje do buněk bakterii E. coli 294, pak se na buňky působí teplem a přeočkují sa na LB agarové daeky obsahující ampicilin. Salekcí se získá 24 kolonii rezistentních vůči ampicilinu, které se kultivují dále na 3 ml LB půdy (Luria-Bertani) a plasmid se izoluje, šest z těchto plasmidů má Xbal štěpné mleto regenerované pomoci bakteriemi E. coli katalysovaného přepárováni a replikace DNA:A portion of the thus obtained reaction mixture of ligands is transformed into E. coli 294 cells, then the cells are heat treated and inoculated onto LB agar plates containing ampicillin. Salting yields 24 ampicillin resistant colonies which are cultured further on 3 ml of LB broth (Luria-Bertani) and the plasmid isolated, six of these plasmids having Xbal digestion regenerated with E. coli catalysed mismatching and DNA replication:

-TCTAGA -TCTAGA-»-AGCTCT- -AGATCTRovněž bylo nalezeno/ že se tyto plasmldy ětěpi jak restrikčnlm enzymem EcoRI/ tak enzymem Hpal; a že. poskytuji očekávané štěpné fragmenty. Oedan z těchto plasmidů/ označený pTrpl4/ byl použit pro expresi heterolognlch polypeptidů, jak je popsáno dále.-TCTAGA -TCTAGA - »- AGCTCT- -AGATCT It has also been found that these plasmids are cleaved by both the restriction enzyme EcoRI and the enzyme HpaI; and that. provide the expected cleavage fragments. Oedan from these plasmids (designated pTrp14) was used to express heterologous polypeptides as described below.

Plasmid pHGH 107 /víz Goeddel a spolupracovnici, Nátuře 281/ 544 (1979)/ obsahuje gen pro lidský růstový hormon, složený z 23 aminokyselinových kodonů produkovaných ze syntetických DNA fragmentů,1 a ze 163 aminokyselinových kodonů získaných z komplementární DNA vytvořené cestou reverzní transkripce informační RNA pro lidský růstový hormon. Tento gen; i když mu schází kodony pre-sekvence lidského růstového hormonu; obsahuje ATG kodon pro iniciaci translace. Gen se izoluje z 10 ^ug plasmidu pHGH 107 postupem zahrnujícím nejprve působeni restrikčniho enzymu EcoRI a poté připojení dTTP a dATP na získaný fragment působením Klenovova fragmentu Ě. coli DNA polymerázy I; jak bylo pospáno výše. Vzniklý plasmid se izoluje extrakci fenolem, extrakci chloroformem a vysráženira ethanolem,* a poté ee rozštěpí enzymem BamHI.Plasmid pHGH 107 (Goeddel et al., Nature 281/544 (1979)) contains a human growth hormone gene consisting of 23 amino acid codons produced from synthetic DNA fragments, 1 and 163 amino acid codons derived from complementary DNA generated by reverse transcription information. RNA for human growth hormone. This gene; although he lacks the codons of the human growth hormone pre-sequence; it comprises an ATG codon for translation initiation. The gene was isolated from 10 µg of plasmid pHGH 107 by a procedure comprising first treating with the restriction enzyme EcoRI and then attaching dTTP and dATP to the obtained fragment by treatment with Klenov fragment 6. coli DNA polymerase I; as described above. The resulting plasmid was isolated by phenol extraction, chloroform extraction and ethanol precipitation, and then digested with BamHI.

CS 273 181 B2CS 273 181 B2

Vzniklý fragment obsahující gen pro lidský růstový hormon (HGH:) se izoluje PAGE elsktroforesou a následující elektroeluci. Výsledný fragment DNA obsahuje rovněž prvních 350 nukleotidů strukturálního genu pro rezistenci vůči tetracyklinu, ale chybi mu tetracyklinový promotorový-operátorový systém; takže; když ss v následujícím postupu tento fragment začlení do plasmidu, který je schopný exprese, lze plasmidy obsahující tuto vložku určit podle obnoveni tetracyklinovó rezistence. Protože EcoRl zakončeni fragmentu je doplněno postupem za použiti Klenowovy polymerazy X, má zmíněný fragment jeden tupý a Jeden lepivý konec, což mu zajištuje .správnou orientaci, když Je později včleněn do plasmidu schopného exprese.The resulting fragment containing the human growth hormone (HGH :) gene was isolated by PAGE electrophoresis and subsequent electroelution. The resulting DNA fragment also contains the first 350 nucleotides of the structural gene for tetracycline resistance, but lacks the tetracycline promoter-operator system; so; when it incorporates this fragment into a plasmid capable of expression in the following procedure, plasmids containing the insert can be determined by restoring tetracycline resistance. Since the EcoR1 termination of the fragment is complemented by the procedure using Klenow polymerase X, said fragment has one blunt and one sticky end, providing it with the correct orientation when it is later incorporated into a plasmid capable of expression.

V dalším sa připraví exprese schopný plasmid pTrp 14 tak, aby mohl přijmout shora uvedeným způsobem získaný fragment obsahující HGH gen. Plasmid pTrp 14 se za tim účelem digeruje reatrikčnim enzymem Xbal a a vzniklé lepivá konce fragmentu se doplní postupem s Klenowovou polymerazou X za použiti trifosfátů dATP; dTTP; dGTT5 a dCTP. Po extrakci získaná směsi fenolem, extrakci chloroformem a vysráženi athanolem se na získanou DNA působí enzymem BamHI a vzniklý velký fragment plasmidu se izoluje PAGE elektroforesou a elektroeluci. Uvedený fragment odvozený od pTrp 14 má jeden tupý a jeden lepivý konec, které mu zajišťuji správnou orientaci při rakombinaci s výše popsaným fragmentem obsahujícím HGH gen.Next, an expression capable plasmid pTrp 14 is prepared so that it can receive the HGH gene-containing fragment obtained as described above. For this purpose, plasmid pTrp14 was digested with the XbaI enzyme and the resulting sticky ends of the fragment were complemented with the Klenow polymerase X procedure using dATP triphosphates; dTTP; dGTT 5 and dCTP. After extraction of the resulting mixture with phenol, extraction with chloroform and precipitation with ethanol, the obtained DNA is treated with BamHI and the resulting large plasmid fragment is isolated by PAGE electrophoresis and electroelution. Said fragment derived from pTrp 14 has one blunt and one sticky end which provides it with the correct orientation when it is combined with the above-described fragment containing the HGH gene.

Fragment obsahující HGH gen a posléze uvedený fragment pTrp 14AXba - BamHI se zkombinuji a navzájem naváži za podmínek podobných těm/ která byly popsány výše. Doplněná bal a EcoRl konce se naváži spolu s tupými vazebnými konci za obnoveni obou Xbal a EcoRl štěpných mlet:The fragment containing the HGH gene and the said fragment pTrp 14AXba-BamHI are combined and ligated together under conditions similar to those described above. The complemented bal and EcoRl ends are weighed together with blunt binding ends to restore both Xbal and EcoRl cleavage mills:

doplněný Xbal konec doplněni EcoRl konec iniciace HGH genuthe added XbaI end of the EcoRl end of the HGH gene initiation

-TCTAG AATTCTATG—. —TCTAGAATTCTATG— + ->—AGATC TTAAGATAC —AGATCTTAAGATACXbal EcoRl-TCTAG AATTCTATG—. —TCTAGAATTCTATG— + -> - AGATC TTAAGATAC —AGATCTTAAGATACX EcoRl

Touto konstrukci se rovněž obnoví rezistence genu vůči tstracyklinu. Oellkož plasmid pHGH 107 exprimuje tetracyklinovou rezistenci z promotoru ležícího proti proudu od HGH genu (lac promotor), umožňuje tato výsledná konstrukce plasmidu, označeného Jako pHGH 207, expresu genu pro tetracyklinovou rezistenci za kontroly tryptofanového promotoru-operátoru. Směs produktů ligace se transformuje do bakterií E. coli 294 a po kultivaci na LB agarových deskách s půdou obsahující 5 ^ug/ml tetracyklinu sa vyberou rezistentní kolonie.This construction also restores the resistance of the gene to tstracycline. The Oellk plasmid pHGH 107 expresses tetracycline resistance from the upstream promoter of the HGH gene (lac promoter), this resulting construction of a plasmid, designated pHGH 207, allows expression of the tetracycline resistance gene under the control of the tryptophan promoter-operator. The ligation product mixture is transformed into E. coli 294 and resistant colonies are selected after cultivation on LB agar plates with soil containing 5 µg / ml tetracycline.

Plasmid pHGH 207 ss digeruje restrikČnim enzymem EcoRl a PAGE alaktroforesou a následujíc! elektroeluci se izoluje fragment o 300 b.p. obsahující trp promotor, operátor a vazebné mláto pro tryptofánový hlavni ribosom/ kterému však schází ATG sekvence pro iniciaci translace. Tento DNA fragment se zaklonuje do EcoRl štěpného mleta plasmidu pLelF A. Exprese schopné plasmidy obsahující shora uvedený modifikovaný trp regulon (trp operon bakterie E. coli, zs kterého Js vynechána útlumová sekvence, aby sa kontrolovatelně zvýšily, hladiny exprese) lze kultivovat do stadia předem stanovených hladin na živné půdě obsahující přldatný tryptofan v množství dostatečném k potlačení promotorového-operátorového systému, pak se tryptofan odstraní; dojde k derepresi systému a nastane exprese žádaného produktu.Plasmid pHGH 207 ss was digested with restriction enzyme EcoR1 and PAGE by alactophoresis and as follows. A 300 bp fragment was isolated by electroelution. containing the trp promoter, operator, and tryptophan barrel ribosome binding glutamine / but lacking the ATG translation initiation sequence. This DNA fragment is cloned into the EcoR1 digestion plasmid of plasmid pLelF A. Expression capable plasmids containing the aforementioned modified trp regulon (the E. coli trp operon from which the attenuation sequence is omitted to increase controllable expression levels) can be cultured to a pre-stage determined levels on a broth containing additional tryptophan in an amount sufficient to suppress the promoter-operator system, then tryptophan is removed; the system is derepressed and the desired product is expressed.

Uvedený postup je podrobněji popaán nlža a znázorněn na obrázku č. 6. Plasmid pL 31 (250 óig) es digeruje rastrikčnim enzymem Pstl a galovou alaktroforesou na 6%níra polyakrylamidovém gelu se izoluje vložený fragment o 1000 b.p. Elektroeluci se z gelu získá asi 40 yug žádaného vloženého fragmentu;' který ee za účelem dalšího zpracováni enzymatickou digesci rozdělí na 3 alikvotní podíly:This procedure is described in more detail below and shown in Figure 6. Plasmid pL 31 (250 µg) is digested with PstI and a 1000 b.p. insert fragment is isolated by glacial alactrophoresis on a 6% polyacrylamide gel. About 40 µg of the desired inserted fragment is obtained from the gel by electroelution. which is divided into 3 aliquots for further processing by enzymatic digestion:

CS 273 181 B2 a} Asi 16 ytig vzorek tohoto fragmentu se Částečně dlgeruje 40 jednotkami endonukleázy Bglll po dobu 45 minut při 37 °C a reakční-směs 8e čisti PAGE elektroforeaou na 6% 6%nim gelu; získají se asi 2 yug žádaného fragmentu o 670 b.p.A approximately 16 µg sample of this fragment was partially digested with 40 units of BglII endonuclease for 45 minutes at 37 ° C and the reaction mixture 8e purified by PAGE electrophoresis on a 6% 6% gel; obtained about 2 .mu.g of the desired fragment Y 670 bp

b) Druhý vzorek (8 yug) Pst fragmentu o 1000 b.p. se štěpi endonukleázami Avall a Bglll; gelovou chromatografií (PAGE) se získá jeden yug uvedeného fragmentu o 150 b.p..b) the second sample (8 ug s) Pst I fragment of 1000 bp was digested with AvaII and BglII endonucleases; gel chromatography (PAGE) gave a y .mu.g of the fragment of 150 bp.

c) Na 16 /Ug vloženého fragmentu o 1000 b.p. se-působí enzymy Sau3a a Avall; po izolaci elektroforeaou na lO^iim polyakrylamidovém gelu se ziská aei 0,25 yug (10 pmol)) fragmentu o 34 b.p. Foafortrieeterovou metodou se eynthetisují dva dále uvedené deoxyoligonukleotidy, 5'-dAATTCATGTGT (fragment 1) a 5'-dGATCACACATG (fragment 2). Fragment 2 se fosforyluje následujícím způsobem; 200 mikrolitrů (asi 40 pmol) P)-ATP (dodavatel Amereham; aktivita 5000 Ci/mol) se vysuší a znovu nasuspenduje ve 30 mikrolitrech pufru složeného z 60 mM Trie-HCl (pH 8), 10 mM bezvodého chloridu hořečnatého a 15 mMj3-merkaptoethanolu, a obsahujícího 100 pmol zmíněného DNA fragmentu a 2 jednotky T4 polynukleotidkinézy. Směe se zahřívá 15 minut na 37 °C; pak ee přidá 1 mikrolitr 10 mM roztoku ATP,' reakce se nechá probíhat dalších 15 minut při uvedené teplotě a pak se zavede inaktivace zahříváním směsi po dobu 15 minut na 70 °C. K reakčni směsi ee přidá 100 pmol 5z-0H fragmentu 1 a 10 pmol Sau3a - Avall fragmentu o 34 b.p. a provede se vzájemné navázáni fragmentů v 50 mikrolitrech prostředí složeného z 20 mM Trie-HCl (pH 7,5); 10 mM bezvodého chloridu hořečnatého,' 10 mM dithiothreitolu,r 0,5 mM ATP, v přítomnosti 10 jednotek T4 DNA ligázy,' při 4 °C po dobu 5 hodin. Směe se rozdělí PAGE elektroforeeou na 6%ním gelu a elektroelucí se získá produkt o 45 b.p. Asi 30 ng (1 pmol) posléze zmíněného produktu o 45 b.p. ee zkombinuje s 0,5 yug (5 pmol) Avall - Bglll fragmentu o 150 b.p. a 1 yug (2 pmol) Bglll - Petl fragmentu o 670 b.p.c) 16 µg of the 1000 bp insert fragment was treated with Sau3a and Avall; after isolation elektroforeaou Lo ^ IIM polyacrylamide gel is obtained AEI Y 0.25 ug (10 pmole)) a fragment of 34 bp Foafortrieeterovou method is further eynthetisují two indicated deoxyoligonucleotides, 5'-dAATTCATGTGT (fragment 1) and 5'-dGATCACACATG (Fragment 2). Fragment 2 is phosphorylated as follows; 200 microliters (about 40 pmol) of P) -ATP (Amereham supplier; 5000 Ci / mol activity) is dried and resuspended in 30 microliters of a buffer consisting of 60 mM Trie-HCl (pH 8), 10 mM anhydrous magnesium chloride, and 15 mM J3. mercaptoethanol, and containing 100 pmol of said DNA fragment and 2 units of T4 polynucleotide kinase. The mixture was heated at 37 ° C for 15 minutes; 1 µl of a 10 mM ATP solution is then added, the reaction is allowed to proceed for a further 15 minutes at this temperature and then inactivated by heating the mixture at 70 ° C for 15 minutes. To the reaction mixture ee was added 100 pmol 5 of -0H fragment 1 and 10 pmol Sau3a -Avall fragment of 34 bp, and the fragments were ligated together in 50 microliters of medium composed of 20 mM Trie-HCl (pH 7.5); 10 mM anhydrous magnesium chloride, 10 mM dithiothreitol, r 0.5 mM ATP, in the presence of 10 units of T4 DNA ligase, at 4 ° C for 5 hours. The mixture was resolved by PAGE electrophoresis on a 6% gel and eluted with a 45 bp product by electroelution. About 30 ng (1 pmol) of the latter product by 45 bp was combined with a 0.5 µg (5 pmol) Avall-BglII fragment of 150 bp and y 1 ug (2 pmoles) of BglII - Pętla fragment 670 bp

Vzájemné navázání se provede působením 20 jednotek T4 ONA ligasy při 20 °C po dobu 16 hodin. Ligasa se inaktivuje zahříváním na 65 °C po dobu 10 minut a směs se za účelem odstraněni polymerů genu dlgeruje enzymy EcoRI a Petl. Po přečištěni směsi elektroforeaou na 6% PAGE se ziská asi 20 ng (0,04 pmol) produktu o 865 b.p. Polovina (10 ng) tohoto produktu se naváže do plasmidu pBR 322 (0,c3 ^ug) mezi jeho EcoRI a Petl ětěpná mleta. Po transformaci tohoto plasmidu do bakterii E. coli 294 se ziská 70 transformantů rezistentních vůči tetracyklinu a citlivých na ampicilin. Plasmidická DNA isolovaná z 18 z těchto transformantů se dlgeruje enzymy EcoRI a Pstl. 2 těchto 18 plaemidů obsahovalo 16 EcoRI - Petl fragment o délce 865 b.p. Oeden ^ug jednoho z těchto fragmentů, pLelF Al; ee dlgeruje enzymem EcoRI a naváže na^shora popsaným způsobem připravený EcoRI fragment o 300 b.p. (0;l yug), obsahující trp promotor a trp vazebné mleto hlavního ribosomu E. coli. Transformanty obsahující trp promotor se 32 identifikuji za použiti P-trp zkušebního vzorku ve spojeni se skriningovou metodou pro kolonie bakterii podle Gruneteina-Hognesse. Asymetricky umístěné Xbel štěpné místo v trp fragmentu dovoluje stanovení rekombinantů, ve kterých trp promotor je orientovaný ve směru na LelF A gen.The binding was performed by treatment with 20 units of T4 ONA ligase at 20 ° C for 16 hours. The ligase is inactivated by heating at 65 ° C for 10 minutes and digested with EcoRI and PetI to remove gene polymers. After purification by electrophoresis on 6% PAGE, about 20 ng (0.04 pmol) of the 865 bp product was obtained. Half (10 ng) of this product was ligated into plasmid pBR 322 (0, c 3 µg) between its EcoRI and Petl cleavage. ground. Upon transformation of this plasmid into E. coli 294, 70 tetracycline-resistant and ampicillin-sensitive transformants were obtained. Plasmid DNA isolated from 18 of these transformants was digested with EcoRI and PstI. 2 of these 18 plasmids contained a 16 EcoRI-PetI fragment of 865 bp length, one µg of one of these fragments, pLelF A1; ee was digested with EcoRI and ligated to the 300 bp (0.1 µg) EcoRI fragment prepared as described above, containing the trp promoter and the E. coli major ribosome binding rib. Transformants containing the trp promoter were identified using a P-trp assay in conjunction with the Grunetein-Hogness screening method for bacterial colonies. The asymmetrically located XbaI cleavage site in the trp fragment allows the determination of recombinants in which the trp promoter is oriented in the direction of the LelF A gene.

I. In vitro a in vivo účinnost interferonu LelF AI. In vitro and in vivo efficacy of interferon LelF A

Pro stanoveni interferonové účinnosti se připraví extrakty následujícím způsobem:To determine interferon activity, extracts are prepared as follows:

Kultury o objemu X ml se pěstuji na živné půdě L obsahující 5 yug/ml tetracyklinu do hodnoty absorbance při 550 nm (Agg0) asi 1,0; pak se kultura zředí do 25 ml M9 živné půdy obsahující 5 yug/ml tetracyklinu. Když Aggg dosáhne 1,0; odeberou se 10 ml vzorky, které se odstředí,’ a získané buňky se suspenduji v 1 ml roztoku obsahujícím 15 % aacharoβγ, 50 mM Trie-HCl (pH 8,0) a 50 mM EDTA (kyseliny ethylendiamintetraoctové). K suspenzi se přidá jeden mg lysozymu a po 5 minutách stáni při O °C se buňky rozruší ultrazvukem. Vzorky se centrifuguji 10 minut (15 000 otáček za monutu) a v supernatantu ea stanoví intarfaronová účinnost srovnáním ee standardy interferonu LelF pomoci testu inhibice cytopatická účinnosti (CPE). Ke stanovení počtu molekul interferonu (IF) na jednu buňku se po šCultures of X ml volume are grown on L medium containing 5 µg / ml tetracycline to an absorbance value at 550 nm (λ g0 ) of about 1.0; Then, the culture was diluted into 25 ml of M9 culture medium containing 5 y / ml tetracycline. When A ggg reaches 1.0; 10 ml samples are taken and centrifuged, and the resulting cells are suspended in 1 ml of a solution containing 15% aacharoβγ, 50 mM Trie-HCl (pH 8.0) and 50 mM EDTA (ethylenediaminetetraacetic acid). One mg of lysozyme is added to the suspension, and after standing for 5 minutes at 0 ° C, the cells are disrupted by ultrasound. The samples are centrifuged for 10 minutes (15,000 rpm) and the supernatant ea is determined for intarfarone activity by comparing the ee standards with interferon LelF using a cytopathic activity inhibition (CPE) assay. In order to determine the number of interferon (IF) molecules per cell, p

CS 273 181 B2CS 273 181 B2

O užívá LalF o specifická aktivitě 4 χ 10 Jsdnotek/mg.O takes LalF with a specific activity of 4 10 10 Units / mg.

□ak Je zřejmé z tabulky 1, klon pLelF A trp 25; ve kterém je trp promotor začleněnIf shown in Table 1, clone pLelF A trp 25; in which the trp promoter is incorporated

Q v žádaná orientaci, dává v tomto testu vysoké hladiny aktivity (ve výěl 2,5 x 10 jednotek v litru). 3ak vyplývá z tabulky 2; interferon produkovaný bakteriemi E. coli K-12 kmene 294/pLeXF A trp 25 se chová jako autentický lidský.interferon LeXFj je stálý vůči kyselému prostředí o pH a a jeho účinnost je neutralizována králičími protilátkami lidských leukocytérnich interferonů. Uvedený interferon má zdánlivou molekulovou hmotnost asi 20 OOO.Q in the desired orientation, yields high levels of activity in this assay (in a yield of 2.5 x 10 units per liter). 3a follows from Table 2; interferon produced by E. coli K-12 strain 294 / pLeXF A trp 25 behaves as an authentic human. Interferon LeXF 1 is stable to an acidic pH environment and is neutralized by rabbit antibodies of human leukocyte interferons. The interferon has an apparent molecular weight of about 20,000.

Účinnost interferonu in vivo vyžaduje přítomnost makrofégů a přirozených Umrtvujících (NK) buněk,' přičemž se zdá,1 že způsob jeho účinnosti in vivo spočívá ve stimulaci těchto buněk. Oe proto možná,1 že interferon produkovaný bakteriemi E. coli 294/pLeXF A 25, i když má antivirovou účinnost v testech na buněčných kulturách, by nemusel být účinný u infikovaných živočichů. Kromě toho, in vivo antivirové účinnost bakteriálně produkovaného, neglykosylovaného interferonu LelF A by mohla být rozdílná od glykosylovaného LalF pocházejícího z lidských leukocytú. Proto biologická účinnost bakteriálně syntetisovaného interferonu LelF A (o čistotě 2 %) byla srovnávána s účinností interferonu z lidských kůží pokrytých leukocytú (LelF; Čistota 8 %) u virová infekce letálni encefalomyokarditidy (EMC) hranostajů (viz tabulka 3).The efficacy of interferon requires the presence of in vivo makrofégů deadening and natural (NK) cells, "and it seems that one way of its effectiveness in vivo involves the stimulation of these cells. Oe therefore possible that one interferon produced by E. coli 294 / pLeXF A 25, while having antiviral activity in cell culture assays, may not be effective in infected animals. In addition, the in vivo antiviral activity of bacterially produced, non-glycosylated interferon LelF A could be different from glycosylated LalF derived from human leukocytes. Therefore, the biological efficacy of bacterially synthesized interferon LelF A (2% purity) was compared with that of human leukocyte-coated human skin (LelF; purity 8%) in lethal encephalomyocarditis (EMC) viral infection of stoat (see Table 3).

Tabulka 1. Interferonové účinnost extraktů z E. coliTable 1. Interferon activity of E. coli extracts

E, coli K-12 kmen 294 transformovaný plasmidem E, coli K-12 strain 294 transformed with plasmid buněčná hustota (počet buněk na ml) cell density (number of cells per ml) XF účinnost Jednotky/ml kultury XF efficiency Units / ml culture počat' LalF molekul na buňku number of LalF molecules per cell pLelF A trp 25 pLelF A trp 25 3,5 χ 108 3.5 χ 10 8 36 OOO 36 OOO 9 OOO 9 OOO pLeXF A trp 25 pLeXF A trp 25 1,8 χ 109 1.8 χ 10 9 250 OOO 250 OOO 12 OOO 12 OOO

Tabulka 2. Srovnání účinnosti extraktů z bakterii Ε» coli 294/pLeIF A 25 se standardním intsrfaronem LelF x Table 2. Comparison of the efficacy of Ε »coli 294 / pLeIF A 25 extracts with the standard LelF x

Extrakt Extract Interferonové účinnost (Jednotky/ml) Interferon efficiency (Units / ml) bez úpravy without modification při pH 2 at pH 2 v přítomnosti králičích anti-lidských lsukocytárnich protilátek in the presence of rabbit anti-human lysucocyte antibodies extrakt z E. coli E. coli extract 294/pLeXF A trp 25 294 / pLeXF A trp 25 500 500 500 500 <10 <10 LelF standard LelF standard 500 500 500 500 <10 <10

Extrakt z bakterii E. coli 294/pLeXF A trp 25 o interferonové aktivitě 250 OOO jednotek na ml; popsaný v tabulce 1; byl zředěn 500krát minimální základní živnou půdou na specifickou aktivitu 500 jednotek/ml.E. coli 294 / pLeXF A trp 25 extract with an interferon activity of 250,000 units per ml; described in Table 1; was diluted 500-fold with minimum baseline to a specific activity of 500 units / ml.

Standard leukocytárniho interferonu (z Wadleyova ústavu), předám otitrovaný vůči NIH leukocytárnimu interferonovému standardu,’ byl rovněž zředěn na konečnou koncentraci 500 U/ml. Alikvotni podíly o objemu 1 ml byly upraveny kyselinou chlorovodíkovou o koncentraci IN na pH 2,* vzorky inkubovány 52 hodin při 4 °C,ř zneutralizovány přidáním roztoku hydroxidu draselného a stanovena IF aktivita pomoci standardního testu CPE inhibice. □iná alikvotni podíly o objemu 25 mikrolitrů ze vzorků o koncentraci 500 Jednotek/ml (ni15The leukocyte interferon standard (from the Wadley Institute), forwarded titered to the NIH leukocyte interferon standard, was also diluted to a final concentration of 500 U / ml. Aliquots of 1 ml were adjusted with hydrochloric acid of pH 2 IN * samples were incubated for 52 hours at 4 ° C, neutralized by addition of potassium hydroxide solution and fixed IF activity using the standard CPE inhibition assay. □ 25 microliter aliquots of 500 Units / ml (ni15)

CS 273 181 B2 jak neošetřené) byly inkubovány e 25 míkrolitry králičí protilátky lidského leukocytárnlho interferonu při 37 DC po dobu 60 minut; vzorky byly 5 minut centrifugovány při 12 000 násobku g a eupernatant testován.CS 273 181 B2 as untreated) were incubated with 25 microliters e rabbit anti-human interferon leukocytárnlho at 37 D C for 60 minutes; samples were centrifuged at 12,000-fold for 5 minutes and the eupernatant tested.

Tabulka 3. Antivirová účinnost různých LsIF preparátů vůči EMC virové infekci hranostajůTable 3. Antiviral activity of various LsIF preparations against EMC viral infection of stoat

Ošetřeni interferonem Treatment interferon Přežití Survival □ednotky tvoření sérových destiček/ml Dest serum platelet forming units / ml den 2 den 2 den 3 den 3 de de n 4 n 4 Kontrola (bakteriální bílkoviny Control (bacterial proteins 0/3 0/3 10 ) : r 10 ): r 3xl03 4 * 0 0 ,3x10 3 4 * 0 0 10 104 1200 o10 10 4 1200 5 >3,4xl04 5> 3.4x10 4 Bakteriální Bacterial 3/3 3/3 0 0 0 0 0 0 LelF A LelF A 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 Standardní LelF Standard LelF 3/3 3/3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0

K testování byli použiti samci hranostajů o průměrné hmotnosti 713 g, kteří neměli před infikováním protilátky vůči EMC viru. Zvířata byla infikována intramuskulárně dávkou 100 x LDg0 EMC viru (zjištěno u myši). V kontrolní skupině uhynuli hranostajové za 134;Male ostriches with an average weight of 713 g and who had no antibody to the EMC virus prior to infection were used for testing. The animals were infected intramuscularly with a dose of 100 x LDg 0 of EMC virus (found in mice). In the control group, stoats died in 134;

158 a 164 hodin po infikováni. Ošetřeni zvířat intsrfsronom v dávce 106 jednotek bylo prováděno intravenosni cestou v intervalech -4, +2; 23 , 29 , 48 ; 72,' 168 a 240 hodin, vztaženo na dobu, kdy bylo provedeno infikováni. Použitý bakteriální leukocytárni interferon byla frakce ze sloupcové chromatografie lysátu bakterii E. coli 294/pLeZF A 25 o spécig fické aktivitě 7;4 x 10 jednotek/mg bílkoviny. Oako kontrolních bakteriálních bílkovin bylo použito bílkovin z ekvivalentní frakce sloupcové chromatografie lysátu bakterii E. coli 294 pBR 322 o dvojnásobné koncentraci celkových bílkovin. Oako standardního leukocytárniho interferonu bylo použito interferonu Indukovaného Sendaiským virem z normálnich lidských buněk, přečištěný chromatograficky do specifické aktivity 32 x 10 jednotek na mg bílkoviny.158 and 164 hours after infection. Treatment of animals with 10 6 units at 10 6 units was performed by intravenous route at intervals of -4, +2; 23, 29, 48; 72, 168 and 240 hours, based on the time at which the infection was performed. The bacterial leukocyte interferon used was a fraction from the column chromatography of lysate of E. coli 294 / pLeZF A 25 with a specific activity of 7; 4 x 10 units / mg protein. Oako control bacterial proteins were used from the equivalent fraction of column chromatography of E. coli 294 pBR 322 lysate at twice the total protein concentration. Oako standard leukocyte interferon was used by Senda virus-induced interferon from normal human cells, purified chromatographically to a specific activity of 32 x 10 units per mg protein.

Hranostajové v kontrolní skupině vykazovali postupující lethargii,' ztrátu rovnováhy, ochablost' a ochrnuti zadních končetin a zaléváni oči začínající asi 8 hodin před smrti. Interferonem ošetřeni hranostajové nevykazovali žádnou z těchto abnormalit; zůstávali po celý čas aktivní a nevyvinula se u nich virémie. Oeden hranostaj z kontrolní skupiny, u kterého se nevyvinula virémie během 4 dnů; uhynul nejpozději z neléčených zvířat (za 164 hodin po infikování); ale vykázal vysoké titry viru v srdci a v mozku post mortem.Stoats in the control group showed progressive lethargy, 'loss of balance, flaccidity' and paralysis of hind limbs and watering of eyes beginning about 8 hours before death. Interferon-treated stoats did not show any of these abnormalities; they remained active at all times and did not develop viremia. One stoat from the control group that did not develop viremia within 4 days; died at the latest from untreated animals (164 hours after infection); but showed high virus titers in the heart and brain post mortem.

U hranostajů ošetřených interferonem se nevytvořily protilátky proti EMC viru, jak bylo stanoveno za 14 a za 21 dnů po infikováni. Tyto výsledky ukazuji, že antivirálni účinnost LelF preparátů u infikovaných zvířat lze přisoudit pouze interferonu, poněvadž kontaminující bílkoviny v bakteriálních preparátech a v preparátech z lidských leukocytů jeou zcela rozličné. Tyto výsledky dále naznačuji, že glykosylace neni pro in vivo antivirovou účinnost interferonu LelF A potřebná.Interstates treated with interferon did not develop antibodies to the EMC virus as determined at 14 and 21 days after infection. These results show that the antiviral efficacy of LelF preparations in infected animals can only be attributed to interferon, since the contaminating proteins in bacterial preparations and in human leukocyte preparations are quite different. These results further suggest that glycosylation is not required for the in vivo antiviral activity of interferon LelF A.

3. Izolace dalších cONA pro ostatní leukocytárni interferony plně charakterizovaného plasmidů obsahujícího interferonovou LelF A cONA se vyřízne DNA enzymem Pstl; izoluje pomoci elektroforézy a označ! radioaktivním 32P. ZískáCS 273 1Θ1 B2 ná radioaktivně značená DNA ee použije jako zkušební vzorek k výběrovému třídění dalších transformantů bakterii E. coli 294, získaných stejným postupem jak bylo popsáno v části C; pomoci metody skriningu kolonií in sítu podle Grunsteina a Hogneese (viz výše); Izoluji se kolonie, které hybridizují v rozličných množstvích se zkušebním vzorkem. Štěpením těchto kolonii a deseti hybridizujících kolonii popsaných v části G pomoci enzymu Pstl bylo izolována plasmidická DNA, která byla charakterizována třemi rozdílnými metodami. Zmíněné Pstl fragmenty byly nejprve charakterizovány na základě vzorků získaných digesci restrikčnimi endonukleázami, enzymy Bgl II, Pvu II a Eco Rl. Tato analysa umožnila charakterizovat nejméně osm rozličných typů (LelF A, LelF B, LelF C, LelF D, LelF E LelF F,‘ LelF G a LeiF H), znázorněných na obrázku 5, na kterém je přibližně uvedeno umis těni různých restrikčních míst ve vztahu k současné znalosti o presekvenci a kódující sekvenci LsIF A. Deden z těchto fragmentů, LelF D, je pravděpodobně identický s DNA frag mentem popsaným Nagatou a spolupracovníky v časopisu Nátuře 284, 316-320(1980).3. Isolation of additional cONAs for other leukocyte interferons of a fully characterized plasmid containing interferon LelF A cONA is excised by DNA enzyme PstI; insulates by electrophoresis and label! Radioactive 32 P 273 ZískáCS 1Θ1 B2 radiolabeled DNA ee is used as a test sample for the selective sorting of other transformants, E. coli 294 obtained by the same procedure as described in Part C; using the in situ screening method of colonies according to Grunstein and Hognees (see above); Colonies are isolated which hybridize in varying amounts with the test sample. By digesting these colonies and the ten hybridizing colonies described in Part G with PstI, plasmid DNA was isolated and characterized by three different methods. Said Pst1 fragments were first characterized on the basis of samples obtained by digestion with restriction endonucleases, enzymes Bgl II, Pvu II and Eco R1. This analysis made it possible to characterize at least eight different types (LelF A, LelF B, LelF C, LelF D, LelF E LelF F, LelF G and LeiF H) shown in Figure 5, which approximately shows the location of the various restriction sites in the The deden of these fragments, LelF D, is probably identical to the DNA fragment described by Nagata and collaborators in Nature 284, 316-320 (1980).

Za druhé byly některé za zmíněných DNA testovány pomoci hybridizačnich selekčních testů popsaných Glevelandem a spolupracovníky v časopisu Cell 20, 95-105 (1980), na základě schopnosti selektivně odstraňovat LeiF mRNA z KG-1 buněčné RNA obsahující poly-A řetězce. V tomto testu byly LeiF A, B; C,a F positivní. Za třetí, posledně zmíněné Pst fragmenty byly včleněny do exprese schopného plasmidu, zmíněným plasmidem byly transformovány bakterie E. coli 294 a fragmenty byly exprimovány. Všechny produkty zmíněné expre se, o kterých se předpokládalo,' že to Jeou pra-interferony, byly positivní v CPE testu na interferonovou aktivitu, ačkoliv v případě LelF F fragmentu byla nalezena jen okrajová účinnost. Kromě shora uvedeného charakterisování byla u všech popsaných LelF typů stanovena sekvence.Second, some of these DNAs were tested using the hybridization selection assays described by Gleveland and co-workers in Cell 20, 95-105 (1980), based on the ability to selectively remove LeiF mRNA from KG-1 cell RNA containing poly-A strands. In this assay, LeiF were A, B; C, and F positive. Third, the latter Pst fragments were inserted into an expression plasmid, said plasmid transformed with E. coli 294, and the fragments were expressed. All of the products of the above-mentioned expector were thought to be pra-interferons were positive in the CPE assay for interferon activity, although only the marginal activity was found in the case of the LelF F fragment. In addition to the above characterization, a sequence was determined for all LelF types described.

K. Přímá exprese druhého zralého leukocytárního interferonu (LelF B)K. Direct expression of second mature leukocyte interferon (LelF B)

Bylo zjištěno, že sekvence prvních čtrnácti nukleotidů izolovaného fragmentu obsahujícího gen pro zralý interferon LelF B je stejná u typů A i B. Z plasmidu pLelF A 25 (byl proto izolován fragment nesoucí trp promotor-operátor, ribosomové vazebné místo a iniciační signál pro LelP A (·Β) gen, a tento fragment byl zkombinován se zbývající části B-sekvence za vzniku exprese schopného plasmidu. Mapy vyčnívajících restrikčních míst Pst fragmentu plasmidu pL4 (plasmid obsahující interferonový LelF B gen zakončený Pst zbytky, znázorněný na obrázku 5); a plasmidu pLelF A 25 j3ou uvedeny na obrázcích 7a a 7b.The sequence of the first fourteen nucleotides of the isolated fragment containing the mature interferon LelF B gene was found to be the same for both types A and B. From the plasmid pLelF A 25 (a fragment bearing the trp promoter-operator, ribosome binding site and LelP A initiation signal) (· Β) gene, and this fragment was combined with the remainder of the B-sequence to form an expressionable plasmid Maps of protruding restriction sites of the Pst fragment of plasmid pL4 (a plasmid containing the interferon LelF B gene terminated by Pst residues shown in Figure 5); pLelF A 25 is shown in Figures 7a and 7b.

Aby se ze sekvence znázorněná na obrázku 7a získal Sau3a až Pstl fragment obsahující přibližně 950 b.p·; je třeba provést několik operaci vzhledem k tomu, že je přítomno jedno nebo více intervenujících Sau 3a restrikčních míst; to je:In order to obtain a Sau3a to Pst1 fragment containing approximately 950 b.p · from the sequence shown in Figure 7a; several operations need to be performed since one or more of the intervening Sau 3a restriction sites are present; It is:

1. Po provedeném štěpení se izoluji následující fragmenty:1. After digestion, the following fragments are isolated:

a) fragment od Sau3a štěpícího místa po EcoRI místo obsahující 110 b.p.;a) fragment from Sau3a cleavage site to EcoRI site containing 110 b.p .;

b) fragment od EcoRI místa k Iba místu obsahující 132 b.p.;b) a fragment from the EcoRI site to the Iba site containing 132 b.p .;

c) fragment od Xba místa k Pst místu obsahující více než 700 b.p.c) a fragment from the Xba site to the Pst site containing more than 700 b.p.

2. Fragmenty la) a lb) se vzájemně naváži a koncové skupiny Sau 3a a Xba se odříznou působením enzymů XBa a BglII, aby se zabránilo samopolymeraci způsobené těmito terminály (relevantní Sau 3a místo Je uvnitř BglII místa; enzymem BglII se štěpí, aby se odříznul Sau 3a záchytný konec). Izoluje se fragment obsahující 242 b.p.2. Fragments 1a) and 1b) are ligated together and the Sau 3a and Xba end groups are cut off with XBa and BglII to prevent self-polymerization caused by these terminals (relevant Sau 3a site is within the BglII site; BglII is cleaved to Sau 3a cut off the end). The 242 b.p. fragment was isolated.

3. Produkty získané postupy 2) a lc) se navzájem naváži a za účelem zabráněni samovolné polymerizace se koncové skupiny odříznou působením enzymů Pstl a BglII. Izoluje se fragment od Sau3a až k Pstl místu obsahující asi 950 b.p., znázorněný na obrázku 7a. Tento fragment obsahuje tu část LelF B genu, která neni společná s LelF A.3. The products obtained by processes 2) and 1c) are weighed together and, in order to prevent spontaneous polymerization, the end groups are cut off with PstI and BglII. The fragment from Sau3a to the PstI site containing about 950 b.p., shown in Figure 7a, is isolated. This fragment contains that portion of the LelF B gene that is not common to LelF A.

4. 2 plasmidu pLelF A 25 se izoluje fragment obsahující přibližně 300 b.p. (od HindlII k Sau3a), obsahující trp promotor-operátor, ribosomové vazebné místo, STG startovací signál a cysteinový kodon pro LeiF A.4. A fragment containing approximately 300 b.p. was isolated from plasmid pLelF A25. (from HindIII to Sau3a), containing the trp promoter-operator, ribosome binding site, STG start signal, and cysteine codon for LeiF A.

CS 273 181 B2CS 273 181 B2

5. Z plasmidu pBR 322 se izoluje fragment od Pstl k HindlII obsahující přibližně 3600 b.p.; tento fragment obsahuje replikon a zakódovanou tatracyklinovou, ale nikoliv ampicilinovou rezistenci.5. A fragment from PstI to HindIII containing approximately 3600 bp is isolated from plasmid pBR 322; this fragment contains a replicon and encoded tatracycline but not ampicillin resistance.

6. Fragmenty získané vs stupních 3, 4 a 5 ss navzájem trojitě naváži a získaný plasmid se transformuje do bakterii E. coli K-12 kmene 294.6. The fragments obtained in steps 3, 4 and 5 ss bind three times to each other and the plasmid obtained is transformed into E. coli K-12 strain 294.

Provede se minimální vyhledávací tříděni transformantů /postupem podle Birnboima a spolupracovníků, Nucleic Acids Rss. 7, 1513-1523 (1979)/ a vzorky plasmidů se digeruji endonukleásou EcoRI. Digescí ss získají tři fragmenty, které byly identifikovány jako 1) fragment obsahující EcoRI-EcoRI trp promotoři 2) vnitřní EcoRI až EcoRI fragment plasmidu pL4, a 3) fragment plasmidu pL4 obsahující iniciační signál pro translaci bílkoviny až EcoRI.Minimal screening of transformants / Birnboim et al., Nucleic Acids Rss. 7, 1513-1523 (1979)] and plasmid samples were digested with EcoRI endonuclease. By digesting with ss, three fragments were identified which were identified as 1) a fragment containing EcoRI-EcoRI trp promoters 2) an internal EcoRI to EcoRI fragment of plasmid pL4, and 3) a fragment of plasmid pL4 containing an initiation signal for translation of the protein to EcoRI.

Bakteriální extrakty z klonů připravených shora uvedeným způsobem vykázaly v CPE * β testu typickoou hodnotu asi 10 x 10 Jednotek inteřferonové aktivity na litr při Α550 “Bacterial extracts from the clones prepared as described above showed a typical value of about 10 x 10 Units of interferon activity per liter at Α 550 in the CPE * β test.

1. Oaden reprezentační klon připravený tímto postupem byl označen jako E. coli 294/ pLelF B trp 7.1. The Oaden representative clone prepared by this procedure was designated E. coli 294 / pLelF B trp 7.

L. Přímá exprese dalěich zralých leukocytárních interferonů (LelF C,' D, ρ; Η,' I a O)L. Direct expression of other mature leukocyte interferons (LelF C, 'D, ρ; Η,' I and O)

Stejně jako v případě LelF A lze sestrojit i další genové fragmenty o plné délce, obsahující jiné typy interferonů LelF, a lze je umístit do exprimačních nosičů určených pro jejich expresi. Pomoci úplného stanovení sekvence obvyklými způsoby se zjisti, které restrikční místo leží dostatečně blízko prvého aminokyselinového kodonu zralého intarfaronového typu, aby umožnilo aplikovat postup popsaný va shora uvedené části H pro expresi zralého interferonu LelF A, to je eliminaci prasakvanca restrikčním odříznutím a nahražani kodonů pro N-tarminálni aminokyseliny ztracených eliminací prasakvenca navázáním synthetického DNA fragmentu. Selže-li tento způsob, lze použit následujícího postupu, který, ve stručnosti, spočívá vs štěpeni fragmentu obsahujícího prasekvanci přesně před bodem, ve kterém začíná kodon pro první aminokyselinu zralého polypeptidú. Postupuje ee tak, ža seAs with LelF A, other full-length gene fragments containing other types of LelF interferons can be engineered and placed in expression carriers designed for their expression. By means of complete sequence determination by conventional methods, it is determined which restriction site lies sufficiently close to the first amino acid codon of the mature intarfaronic type to allow the procedure described in the above part H to be applied to express mature interferon LelF A, i.e. - amino acids lost by elimination of the anthracite by binding of a synthetic DNA fragment. If this method fails, the following procedure can be used which, in brief, consists of cleavage of the fragment containing the short-term sequence just before the start point of the codon for the first amino acid of the mature polypeptide. It proceeds ee the way it does

1. Ovouvláknová ONA převede v oblasti obklopující tento bod na jsdnovláknovou ONA:1. A Fiber ONA converts to a Fiber ONA in the area surrounding this point:

2. Na jadnovléknovou oblast vytvořenou podle bodu 1) se hybridizuje komplementární dálka příměru Jednovléknové ONA, přičemž 5* konec primeru leží na opačné straně nukleotidu sousedícího se zamýšleným štěpícím místemt2. The complementary distance of the primer of the single-stranded ONA is hybridized to the nucleotide region generated according to (1), with the 5 * end of the primer lying on the opposite side of the nucleotide adjacent to the intended cleavage site

3. Ta část druhého vlákna odstraněná va stupni 1), která leží v 3f směru od primeru, sa obnoví reakci s ONA polymerásou v přítomnosti trifosfátů dsoxynuklsotidů obsahujících adenin, thymin, guanin a cytoain;3. The portion of the second strand removed in step 1), which lies 3f away from the primer, is reacted with an ONA polymerase in the presence of adenine, thymine, guanine, and cytoain triphosphates of dsoxynucleotides;

4. Zbývající délka jednovléknové DNA; která vyčnívá nad zamýšlené místo štěpení, se odstraní digescí.4. Remaining length of single stranded DNA; which protrudes above the intended cleavage site is removed by digestion.

Poté lze navázat na 3* konec kódujícího vlákna jako jeho zakončení krátký řetězec eynthetické DNA s iniciačním signálem ATG pro«translaci, například tak, že se pomoci lepivých konců naváže na sestrojený gan pro zralý interferon, a takto získaný gen ss včlení do plasmidu schopného exprese a uvede pod kontrolu promotoru a Jeho přidruženého ribosomového vazebného místa.A short strand of eynthetic DNA with an ATG translation initiation signal can then be ligated to the 3 * end of the coding strand as it terminates, for example by binding to the engineered mature interferon gan with the sticky ends, and incorporating the ss gene into an expression plasmid. and control the promoter and its associated ribosome binding site.

Podobným způsobem, jaký byl popsán výše v části K, se příslušně pro přímou bakteriální expresi uspořádají genové fragmenty kokující interferony LelF C a LelF D, Strategie exprese pro tyto dalěi leukocytární interferony zahrnuje v každém případě použití fragmentu přibližně o 300 b.p. (HindlII až Sau3a); obsahujícího trp promotor-operátor, ribosomové vazebné místo, ATG iniciační signál a cysteinový kodon interferonu LelF A z plasmidu pLelF A 25. S tímto fragmentem se zkombinuji genové fragmenty z dalšich intarfaronových genů kódující jejich příslušné aminokyselinové sekvence mimo počátečního cysteiCS 273 181 B2 nu,' který je společný všem. Každý takto vzniklý plasmid se použije k transformaci bakterii E. coli K-12,’ kmene 294. K sestrojení příslušných genů ss použije následujících ligaci.In a similar manner to that described in Section K above, gene fragments cocucing LelF C and LelF D coctors are arranged for direct bacterial expression. The expression strategy for these additional leukocyte interferons in each case involves the use of a fragment of approximately 300 b.p. (HindIII to Sau3a); containing the trp promoter-operator, the ribosome binding site, the ATG initiation signal, and the cysteine codon of interferon LelF A from plasmid pLelF A 25. This fragment combines gene fragments from other intarfaron genes encoding their respective amino acid sequences outside the initial cysteiCS 273 181 B2 nu '. which is common to all. Each plasmid thus generated was used to transform E. coli K-12 strain 294. The following ligation was used to construct the appropriate ss genes.

Intsrferon LelF CIntsrferon LelF C

Z plasmidů pLelF C se izoluji následující fragmenty:The following fragments were isolated from the plasmids pLelF C:

a) fragment od Sau 3a k Sau 96 o 35 b.p.;a) a fragment from Sau 3a to Sau 96 of 35 b.p .;

b) fragment od Sau 96 k Pstl o vice než 900 b.p.b) a fragment from Sau 96 to PstI of more than 900 b.p.

Z plasmidů pLelF A-25 se izoluje postupem popsaným výše v části K 4)It was isolated from the plasmids pLelF A-25 as described above in section K4).

c) fragment HindlII až Sau 3a o 300 b.p.;c) 300 bp HindIII to Sau 3a fragment;

Z plasmidů pBR 322 se izoluje způsobem popsaným výše v části K 5)It was isolated from the plasmids pBR 322 as described above in section K5).

d) fragment Pstl až HindlII o přibližné 3600 b.p.d) a fragment of PstI to HindIII of approximately 3600 b.p.

Sestrojeni genuConstruction of the gene

1. Naváži se fragmenty a) a c), produkt sa štěpí enzymy Bgl II a Hind III a izoluje se fragment asi o 335 b.p.1. We bind fragments a) and c), digest the product with Bgl II and Hind III and isolate the fragment by about 335 b.p.

2. Provede se trojitá ligace fragmentů 1) + b) + d) a resultujicim plasmidem se transformuji bakterie E. coli.2. Fragment 1) + b) + d) was ligated in triplicate and the resulting plasmid transformed with E. coli.

Typický klon ziakaný tímto způsobem byl označen jako E. coli K-12 kmen 294/pLeIF C trp 35.A typical clone obtained in this manner was designated E. coli K-12 strain 294 / pLeIF C trp 35.

Interferon LelF DInterferon LelF D

Z plasmidů pLelF O ss izoluji následujíc! fragmenty:I isolate the following plasmids from pLelF 0 ss. fragments:

a) fragment Sau3a až Ava II o 35 b.p.;a) 35 bp Sau3a to Ava II fragment;

b) fragment od Ava II k BglII o 150 b.p.;b) a fragment from Ava II to BglII of 150 b.p .;

c) fragment od BglII k Pstl o přibližně 700 b.p.c) a fragment from BglII to PstI of approximately 700 b.p.

Z plasmidů pLelF A25 se izolujeIt was isolated from the plasmids pLelF A25

d) fragment od HindlII až po Sau3a o 300 b.p.d) a fragment from HindIII to Sau3a of 300 b.p.

Z plasmidů se izolujeIt is isolated from the plasmids

e) fragment od HindlII k Pstl o přibližně 3600 b.p.e) a fragment from HindIII to PstI of approximately 3600 b.p.

Sestrojeni genuConstruction of the gene

1. Naváži se fragmenty a) + b),‘ produkt se vyřízne enzymem BglII a po přečištěni se získá produkt o 185 b.p. (1).1. Weigh the fragments a) + b), ‘the product was excised with BglII and after purification the product was 185 b.p. (1).

2. Provede se navázáni fragmentů 1) + d) vyřízne se enzymy HindlII a BglII a vyčisti se produkt o přibližně 500 b.p. (2).2. Bind fragments 1) + d), cut out with HindIII and BglII and purify the product by approximately 500 b.p. (2).

3. Provede 3Θ navázáni fragmentů 2) + c) + e) a získaným plasmidem se transformuji bakterie E. coli.3. Binding of 2) + c) + e) fragments is performed 3 a and the obtained plasmid is transformed with E. coli.

Typický klon připravený tímto způsobem byl označen jako E. coli K-12 kmen 294/pLeIF D trp 11.A typical clone prepared in this way was designated E. coli K-12 strain 294 / pLeIF D trp 11.

Interferon LelF FInterferon LelF F

Fragment obsahující LelF F lze pro přímou expresi sestrojit tak, že se k rekonstrukci s výhodou použije aminokyselinové sekvence 1 až 13 interferonů LelF 8, která je úplně shodná s obdobnou sekvenci interferonů LelF F. Z plasmidů pHGH 207, popsaného výše, se postupem za použiti restrikčnlch enzymů Pst I a Xba I digesci a následující izolaci připraví fragment asi o 1050 b.p. (a), obsahující trp promotor a majici žádanou konfiguraci na svých koncích. Druhý fragment (b) se izoluje jako větší fragment ze směsi získané digesci plasmidů pHKY 10 endonukleásami Pstl a BglII. Fragment a) obsahuje přibližně polovinu genu kódujícího ampicilinovou rezistenci; fragment b) obsahuje zbytek tohoto genu a celý gen pro tetracyklinovou rezistenci, kromě připojeného promotoru. Fragmenty a) aThe LelF F-containing fragment can be constructed for direct expression by preferably using the amino acid sequence of 1 to 13 LelF 8 interferons, which is exactly the same as that of LelF F interferons, from the pHGH 207 plasmids described above. restriction enzymes Pst I and Xba I digestion and subsequent isolation prepare a fragment of about 1050 bp (a) containing the trp promoter and having the desired configuration at its ends. The second fragment (b) is isolated as a larger fragment from a mixture obtained by digesting the plasmids pHKY 10 with PstI and BglII endonucleases. Fragment a) comprises approximately half of the gene encoding ampicillin resistance; fragment b) contains the remainder of this gene and the entire tetracycline resistance gene except the linked promoter. Fragments a) a

CS 273 181 B2CS 273 181 B2

b) se naváži pomoci T4 ligasy a produkt ss štěpí enzymy Xbal a BglIIř aby ss odstranily produkty dimarisaca. Vznikne fragment c), obsahující trp promotor-operátor a geny pro tetracyklinovoua ampicilinovou rezistenci.b) is ligated with T4 ligase and the product is digested with enzymes XbaI and BglII to remove dimarisac products. This results in fragment c) containing the trp promoter-operator and genes for tetracycline and ampicillin resistance.

Digescí plasmidů pLelF F enzymy Avall a BglII ss ziská fragment d) mající přibližněBy digesting the plasmids pLelF F with the enzymes Avall and BglII, a fragment of d) having approximately

580 b.p. a obsahující kodony pro aminokyseliny 14 až 166 interferonu LelF F.580 b.p. and containing codons for amino acids 14 to 166 of interferon LelF F.

Digescí plasmidů pLsIF B enzymy Xbal a Avall se získá fragment e) o 49 b.p., který kóduje aminokyseliny 1 až 13 interferonu LelF F.Digestion of plasmids pLsIF B by XbaI and Avall enzymes yielded a 49 bp fragment which encodes amino acids 1-13 of interferon LelF F.

Provede ss trojitá ligacs fragmentů c), d) a e) v přítomnosti T4 ligasy. Kohesivní konce příslušných fragmentů jsou takové; že ss fragmenty správně uzavřou do kruhu za vzniku kompositního plasmidů, který nese gen pro tetracyklinovou rezistenci pod kontrolou trp promotoru-operátoru, spolu s gsnsm pro zralý interferon LelF F. Bakterie transformovaná tímto plasmidem lze proto vybrat na základě zmíněné rezistence při jejich kultivaci na agarových deskách obsahujících tatracyklin. Typický klon připravený tímto způsobem byl označen jako E. coli K-12 kmen 294/pLaIF F trp 1.Performs ss triple ligations of fragments c), d) and e) in the presence of T4 ligase. The cohesive ends of the respective fragments are such; that the ss fragments correctly encircle to form a composite plasmid that carries the tetracycline resistance gene under the control of the trp promoter-operator, together with the gsns for the mature interferon LelF F. The bacteria transformed with this plasmid can therefore be selected based on said resistance in their agar culture. plates containing tatracycline. A typical clone prepared in this way was designated E. coli K-12 strain 294 / pLaIF F trp 1.

Interferon LsIF HInterferon LsIF H

Úplný LelF H gen pro expresi zralého leukoeytárního interferonu LelF H lze zkonstruovat následujícím způsobem:The full length LelF H gene for the expression of mature leukoeytar interferon LelF H can be constructed as follows:

1) Plasmid pLsIF H se podrobí digescí enzymy Hasil a Rsal a izoluje se fragment o 816 b.p. rozkládající se od signálu pro peptidickou aminokyselinu 10 až do 37 nekódující oblasti.1) Plasmid pLsIF H was subjected to digestion with the enzymes RsaI and Hasil and isolating a 816 bp fragment extending from the signal peptide amino acid 10 to 3 7 non-coding region.

2. Fragment se dsnaturuje a podrobí se rsparační synthsse pomocí Klenowova fragmentu DNA polymarasy I /viz Klenow a spolupracovnici, Proč. Nati. Acad. Sci. USA 65, 168 (1970)/, za použiti 8ynthstického dsoxyrlbooligonuklsotidu 57-dATG TGT AAT CTG TCT jako příměru.2. The fragment is dsnaturated and subjected to synthesis synthesis using Klenow DNA Polymarase I fragment (see Klenow et al., Proc.). Nati. Acad. Sci. USA 65, 168 (1970)], using the 8-synthetic dsoxyrbobo-oligonucleotide 5 7 -dATG TGT AAT CTG TCT as primer.

3. Vzniklý produkt ss štěpí enzymem Sau3a a izoluje se fragment o 452 b.p. rsprsssntujíci aminokyseliny interferonu 1 až 150.3. The resulting product was digested with Sau3a and the 452 bp fragment was isolated. amino acids interferon 1 to 150.

4. Plasmid pLelF H ss digsruje enzymy Sau3a a Pstl a izoluje se vzniklý fragment o 500 b.p.; ziská es gen kódující aminokyseliny od ISO až do konce kódující sekvence.4. Plasmid pLelF H ss digests Sau3a and PstI and isolates the resulting fragment of 500 b.p .; obtaining a gene encoding amino acids from ISO to the end of the coding sequence.

5. Fragmenty izolované ve etupnich 3) a 4) se navzájem naváži za vzniku fragmentu5. The fragments isolated in steps 3) and 4) are ligated together to form a fragment

166 met cya asp stopl166 met cya asp stopl

ATG TGT ... _j- .... GAT TGA_..._Pst IATG TGT ... _J- .... GAT TGA _..._ Pst I

Sau 3a zakódovajicifio. 166 aminokyselin interferonu LelF H.Sau 3a encoded. 166 amino acids of interferon LelF H.

6. Plasmid pLsIF A trp 2S se digsruje rsstrikčním enzymem Xbal, zakončí záchytnými konci a DNA polymsrásou I a produkt se digeruje endanukleásou Pstl. Vzniklý velký fragment se izoluje a provede se ligace s produktem získaným ve stupni 5). Získá se exprese schopný plasmid, který může po transformaci do E. coli K-12 kmens 294 nsbo do jiné hostující bakterie exprimovat zralý interferon LelF H.6. Plasmid pLsIF A trp 2S was digested with the restriction enzyme XbaI, terminated with the digestion ends and DNA polymorph I and digested with PstI endonuclease. The resulting large fragment is isolated and ligated with the product obtained in step 5). An expression-capable plasmid is obtained which, upon transformation into E. coli K-12 strain 294 nsbo into another host bacterium, can express mature interferon LelF H.

Interferon LelF IInterferon LelF I

Rekombinant lidského genomu fáze Λ Charonu 4A, sestrojený Lawnem a spolupracovníky /viz časopis Cell 15, 1157 (1978)/ byl podroben skríningu na leukocytární interferonové geny pomoci postupů popsaných Lawnsm a spolupracovníky (viz výšs) a Maniatissm a spolupracovníky /viz časopis Cell 15,' 687 (1978)/. R dioaktivni LsIF zkušební vzorek, získaný z cONA klonu interferonu LelF A byl použit k tříděni přibližně 500 000 plaků, z nichž bylo ' vybráno šest LsIF genomových klonů. Po opakovaném tříděni a přečištěni plaků byl vybránThe recombinant gen Charon 4A human genome, constructed by Lawn and coworkers (see Cell 15, 1157 (1978)), was screened for leukocyte interferon genes using procedures described by Lawns and coworkers (see above) and Maniatissm and coworkers (see Cell 15, 687 (1978)]. A rioactive LsIF assay, obtained from the interferon LelF A cONA clone, was used to screen approximately 500,000 plaques from which six LsIF genomic clones were selected. After repeated screening and plaque cleaning, it was selected

CS 273 181 B2 jeden z uvedených klanů, HLalF 2, pro dalši analysováni.CS 273 181 B2 one of the listed clans, HLalF 2, for further analysis.

Za použiti shora popsaná metody lze a výhodou použit jiných zkušebních vzorků k izolováni dalších laukocytárnich intarfaronových bílkovin podle tohoto vynálezu.Using the method described above, other test samples can and preferably be used to isolate the other laukocyte intarfarone proteins of the invention.

Sestrojeni genu pro interferon LelF I:Construction of the LelF I interferon gene:

1. EcoRI fragment klonu AhLsXF 2 o 2000 b.p. ee eubklonuje do plasmidu pBR 325 v jeho restrikčnim místě. Získaný plasmid obsahující LalF I sa ětěpi enzymem EcoRI a izoluje ss fragment o 2000 b.p. Na tsnto EcoRI fragment o 2000 b.p. se naváže daoxyoligonuklaotid dAATTCTGCAG (konvertor EcoRI - Pstl), vzniklý produkt se rozštěpí enzymem Pstl a získá ss fragment o 2000 b.p. obsahující Pstl konce. Tsnto fragment se rozštěpí enzymem Sau96 a izoluje sa fragment o 1100 b.p., který má jedon Pstl a jeden Sau96 konac.1. EcoRI fragment of clone AhLsXF 2 at 2000 b.p. ee clones into plasmid pBR 325 at its restriction site. The resulting plasmid containing LalF I was digested with EcoRI and the ss fragment of 2000 b.p. was isolated. This ts EcoRI fragment of 2000 b.p. The dAATTCTGCAG (EcoRI-PstI converter) was ligated, the resulting product was digested with PstI and the ss fragment of 2000 b.p. containing PstI ends. This fragment was digested with Sau96 and a 1100 bp fragment having one PstI and one Sau96 konac was isolated.

2. Plasmid pLelF C trp 35 sa digaruja enzymy Pstl a Xbal a izoluje sa větší fragment.2. Plasmid pLelF C trp 35 was digested with PstI and XbaI and the larger fragment isolated.

3. Malý Xbal - Pstl fragment z plasmidu pLalF C trp 35 sa digaruja enzymy Xbal a Sau96 a izoluje ss Xbal - Sau96 fragment o 40 b.p.3. A small XbaI - PstI fragment from plasmid pLalF C trp 35 was digested with XbaI and Sau96 and the ss XbaI - Sau96 fragment was isolated by 40 b.p.

4. Provede se ligace fragmentů izolovaných va stupních 1), 2) a 3) a tak se vytvoří exprese schopný plasmid pLelF I trp 1.4. Ligate the fragments isolated in steps 1), 2) and 3) to ligate to generate an expression plasmid pLelF I trp 1.

Interferon LelF 3Interferon LelF 3

Postup k sestrojeni plasmidu schopného exprese LelF 3:To construct a plasmid capable of expressing LelF 3:

1. Plasmid pLelF 3 obsahuje HindlII fragment o 3,-8 kilobasich lidské ganomové DNA, který zahrnuje LelF 3 genovou sekvenci. Z tohoto plasmidu ss izoluje DdsI - Rsal fragment □ 760 b.p.Plasmid pLelF 3 comprises a HindIII fragment of 3.8-kilobase human ganoma DNA that comprises the LelF 3 gene sequence. The DdsI-Rsal fragment □ 760 b.p.

2. Plasmid pLalF B trp 7 se rozštěpí enzymy HindlII a DdsI a izoluje se HindlII - Oděl fragment o 340 b.p.2. The plasmid pLalF B trp 7 was digested with HindIII and DdsI and the HindIII -IdeI fragment of 340 b.p. was isolated.

3. Plasmid pBR 322 sa rozštěpí enzymem Pstl,' fragmenty ss zakonči lepivými konci inkubaci 8 DNA polymerasou I (Klenowúv fragment) a provede sa digasca enzymem HindlII. Izoluje se velký fragment přibližně o 3600 b.p.3. Plasmid pBR 322 was digested with PstI, fragments with sticky ends incubated with 8 DNA polymerase I (Klenow fragment) and digested with HindIII. A large fragment of approximately 3600 b.p. is isolated.

4. Provede se ligace fragmentů izolovaných va stupních 1), 2) a 3) a tak sa sestrojí exprese schopný plasmid pLelF 3 trp 1.4. Ligate the fragments isolated in steps 1), 2) and 3) to ligate to construct an expression plasmid pLelF 3 trp 1.

M. ČištěniM. Čištěni

Obsah leukocytárnlho lnterfsronu v bakteriálních extraktech lze zvýšit postupným čištěním:The content of leukocyte interferon in bacterial extracts can be increased by sequential purification:

1. Polyethylsniminovým srážením; při kterém většina buněčných bílkovin, včetně interferonu, zůstává v supernatantu.1. Polyethylsimine precipitation; in which most cellular proteins, including interferon, remain in the supernatant.

2. Amoniumsulfétovou frakcionaci, při které interferon vypadává z 55%niho nasyceného roztoku síranu amonného.2. Ammonium sulphate fractionation in which the interferon falls out of a 55% saturated ammonium sulphate solution.

3. Suspendováním amoniumsulfátových palat v pufru složeném z 0,06 M fosforečnanu draselného a 10 mM Tris-HCl, pH 7,2, a dialysou proti 25 mM Tris-HCl,1 pH 7,'9 (intarferonová aktivita zůstává v roztoku).3. Suspending the ammonium sulfate palates in a buffer composed of 0.06 M potassium phosphate and 10 mM Tris-HCl, pH 7.2, and dialysis against 25 mM Tris-HCl, 1 pH7.9 (intarferon activity remains in solution).

4. Chromatografii shora uvedeným způsobem získaného supernatantu, pří pH upraveném na 8,5, na sloupci DEAE celulosy (lineární grádiantová eluca s O až 0,2 M roztokám chloridu sod něho ve 25 mM Tris-HCl, pH 8;5).4. Chromatography of the supernatant obtained above, at pH adjusted to 8.5, on a DEAE cellulose column (linear gradient elution with 0 to 0.2 M sodium chloride solutions in 25 mM Tris-HCl, pH 8; 5).

5. Adsorpci na agarose (značky Cibachrome Blua Agarose) nebo na hydroxyapatítu a eluci5. Adsorption on agarose (Cibachrome Blua Agarose) or on hydroxyapatite and elution

1,5 M roztokem chloridu draselného, popřípadě 0,2 M roztokem fosforečnanu.1.5 M potassium chloride solution or 0.2 M phosphate solution.

DD

6. Molekulárním tříděním na koloně Sephadaxu G-75.6. Molecular screening on Sephadax G-75 column.

CS 273 181 B2CS 273 181 B2

7. Katexovou chromatografii na CM-celuloaa va 25 mM roztoku octanu amonného při pH 5,0, eluca amoniumacetátovým gradientem (až na 0,2 M roztok octanu amonného).7. Cation exchange chromatography on CM-cellulose in a 25 mM ammonium acetate solution at pH 5.0 eluting with an ammonium acetate gradient (up to 0.2 M ammonium acetate solution).

Shora uváděnými čisticími postupy ss ziská materiál s čistotě vyěěi než 95 %.The above-mentioned purification procedures result in a material having a purity of greater than 95%.

fF

Surový materiál lze rovněž čistit chromatografickým třiděnim podle velikosti molekuly, vysokotlakou kapalinovou chromatografii s reversní fázi (RP-8) nebo afinitní chromatografií na imobilisováných antiintarferonových protilátkách.The crude material can also be purified by molecular size chromatography, reverse phase high-pressure liquid chromatography (RP-8) or affinity chromatography on immobilized anti-interferon antibodies.

Alternativně lze materiál získaný ve shora uvedeném stupni 4 nanést na sloupec obsahující monoklonálni protilátku, připravený způsobem popsaným Milsteinem v časopisu Scientific American 243/ 66 (1980), a interferon eluovat směsi 0,2 M kyseliny octové,Alternatively, the material obtained in step 4 above can be applied to a monoclonal antibody-containing column prepared as described by Milstein in Scientific American 243/66 (1980) and the interferon eluted with 0.2 M acetic acid,

0,1% roztoku Tritonu a 0,15 M roztoku chloridu sodného.0.1% Triton solution and 0.15 M sodium chloride solution.

Při alternativním výhodném provedeni'lze leukocytárni interferon vyprodukovaný shora popsaným způsobem čistit pomoci následujících čisticích operací:In an alternative preferred embodiment, the leukocyte interferon produced as described above can be purified by the following purification operations:

1. Zmražené buněčné pelety obsahující exprimovaný leukocytárni interferon se rozbiji bu3 manuálně nebo ve vhodném drticím zařízeni. Částečně rozmražené buňky se suspendují ve 4 objemech pufru A/ obsahujícího 0,1 M roztok Tris-base upravsný na pH 7/5 až 8,0 10% (m/V) roztok sacharosy, 0,2 M roztok chloridu sodného, 5 mM roztok EDTA, 0,1 mM roztok PMSF a 10 až 100 mM roztok bezvodého chloridu hořsčnatého. Suspenze se udržuje na teplotě asi 4 °C.1. Frozen cell pellets containing expressed leukocyte interferon are broken either manually or in a suitable grinding apparatus. The partially thawed cells are suspended in 4 volumes of Buffer A / containing 0.1 M Tris-base solution adjusted to pH 7/5 to 8.0 10% (w / v) sucrose solution, 0.2 M sodium chloride solution, 5 mM EDTA solution, 0.1 mM PMSF solution, and 10 to 100 mM anhydrous magnesium chloride solution. The suspension is maintained at about 4 ° C.

Suspenze se pak nechá projit homogenizátorem při asi 41,4 MPa a pak znovu při tlaku menším než 6/9 MPa. Efl ent z homogenizétoru z obou pasáží se jímá za chlazeni ledovou lázní.The slurry is then passed through a homogenizer at about 41.4 MPa and then again at a pressure of less than 6/9 MPa. The effluent from the homogenizer from both passages is collected while cooling with an ice bath.

2. K homogenátu se pomalu přidává polyethylenimin až do koncentrace asi 0,35 % a směs se ponechá stát asi 30 minut. Pevné podíly se oddělí odstředěním nebo filtraci. Tento stupeň se provádí za stálého kontrolováni teploty nebo dostatečně rychle, tak aby teplota supernatantu (nebo filtrátu) byla stále nižěi než 10 °C. Supernatant (filtrát) ss zkoncentruje ultrafiltraci přibližně na 1/10 původního objemu. Drobné částečky nebo zákal v zadrženém zahuštěném roztoku lze odstranit filtraci přes vhodný filtr, jako například přes mikroporesní membránu.2. Polyethyleneimine is slowly added to the homogenate to a concentration of about 0.35% and the mixture is allowed to stand for about 30 minutes. The solids were collected by centrifugation or filtration. This step is carried out under constant temperature control or sufficiently fast so that the temperature of the supernatant (or filtrate) is still below 10 ° C. The supernatant (filtrate) ss concentrates the ultrafiltration to approximately 1/10 of the original volume. Small particles or haze in the retained thickened solution can be removed by filtration through a suitable filter, such as a microporous membrane.

3. Vyčeřsný roztok se nanese přimo na sloupec obsahující monoklonálni protilátku, při rychlosti toku 5 až 8 cm/hod. (Například 25 až 40 ml/hod. na sloupci o průměru 2,6 cm). Po naneseni roztoku se sloupec promyje přibližně desetinásobkem objemu sloupce roztoku 25 mM Tris-HCl o pH 7,5 až 8/5/ obsahujícího 0/5 M roztok chloridu sodného a roztok povrchově aktivní látky, jako 0,2% roztok Tritonu X-100 nebo ekvivalentní látky. Po promyti se sloupec vypláchne desetinásobkem objemu sloupca roztoku obsahujícího 0,15 M chlorid sodný a povrchově aktivní činidlo jako Triton X-100 (0,1% roztok) nebo jeho ekvivalent. Pak se sloupec eluuje 0,2 M roztokem kyseliny octové obsahujícím povrchově aktivní látku jako Triton X-100 (0,1% roztok) nebo jeho ekvivalent. Bilkovinová frakce ze sloupce s monoklonálni protilátkou (stanovené pomoci UV absorbance nebo jinou vhodnou analytickou metodou) se shromáždi a pH se upraví LN roztokem hydroxidu sodného nebo 1/0 M roztokem Tris-base na hodnotu přibližně 4,5.3. Apply the clarification solution directly to the monoclonal antibody column at a flow rate of 5 to 8 cm / hr. (For example, 25 to 40 ml / hr on a 2.6 cm diameter column). After application of the solution, the column is washed approximately ten times the column volume of a 25 mM Tris-HCl solution of pH 7.5 to 8/5 / containing 0/5 M sodium chloride solution and a surfactant solution such as 0.2% Triton X-100 solution. or equivalent substances. After washing, the column is rinsed ten times the column volume of a solution containing 0.15 M sodium chloride and a surfactant such as Triton X-100 (0.1% solution) or equivalent. The column was then eluted with a 0.2 M acetic acid solution containing a surfactant such as Triton X-100 (0.1% solution) or equivalent. The protein fraction from the monoclonal antibody column (determined by UV absorbance or other suitable analytical method) was collected and the pH adjusted to about 4.5 with LN sodium hydroxide solution or 1/0 M Tris-base solution.

4. Spojené interferonové frakce se nanesou na sloupec katexu,’ jako na sloupec celulosy CM 52 (značky Whatman) nebo jeji ekvivalent/ která byla předtím ekvilibrována vhodným pufrem, jako 50 mM roztokem octanu amonného o pH 4,5. Po nanesení interferonu se sloupec promývá pufrem použitým k ekvilibraci tak dlouho, až UV absorbance efluentu dosáhne takové hladiny, že se ze sloupce eluuje trochu žádané bílkoviny. Sloupec se pak eluuje roztokem 25 mM octanu sodného obsahujícího 0,12 M chloridu sodného nebo jinou kombinaci, která optimalizuje získání interferonu a poskytne po lyofilisaci produkt mající vyhovující vlastnosti jako vzhled a rozpustnost.4. Combine interferon fractions onto a cation exchanger column, as a CM 52 cellulose column (Whatman brand) or equivalent previously equilibrated with a suitable buffer, such as a 50 mM ammonium acetate solution at pH 4.5. After interferon loading, the column is washed with the buffer used to equilibrate until the UV absorbance of the effluent has reached such a level that some of the desired protein is eluted from the column. The column is then eluted with a solution of 25 mM sodium acetate containing 0.12 M sodium chloride or another combination that optimizes the recovery of interferon and provides, after lyophilization, a product having satisfactory properties such as appearance and solubility.

Monoklonálni protilátky používané při výhodném provádění čištěni podle vynálezu po~ psaném výše lze připravit postupy popsanými Staehelinsm a spolupracovníky v časopisu Proč.The monoclonal antibodies used in the preferred purification of the invention described above can be prepared by the procedures described by Staehelins et al. In Proc.

CS 273 181 B2CS 273 181 B2

Nati. Acad. Sci. USA 78,' 1848-1852 (1981). Monoklonálni protilátky připravená z ascitické tekutiny se vyčisti a kovalentnš naváži na Affigel-10 způsobem popsaným niže:Nati. Acad. Sci. USA 78, 1848-1852 (1981). Monoclonal antibodies prepared from the ascites fluid are purified and covalently bound to Affigel-10 as described below:

Každá z pěti myších samic druhu Balb/c 9Θ naočkuje 5 až 10 x 10S hybridomnich buněk ze střední růstová fáze kmene. Aei 5 x 10S životaschopných buněk získaných z myši produkční kapaliny se inokuluja intraperitoneálně další skupině deseti nebo' vlče myši.Each of the five Balb / c 9Θ female mice inoculates 5-10 x 10 S hybridoma cells from the medium growth phase of the strain. The 5 x 10 5 viable cells obtained from the mouse production fluid were inoculated intraperitoneally with another group of ten or wolf mice.

Od každé myši z posléze uvedené skupiny se opakovaně (2x až 4x) odebírá ascitická kapalina. Mohou být provedeny až tři přenosy buněk a následující odebráni ascitické kapaliny z jedné skupiny myši na druhou. Ascitická kapalina odebraná myším při každém přenosu buněk se shromaž3uje.Ascites fluid was collected (2x to 4x) from each mouse of the latter group. Up to three cell transfers can be performed followed by removal of ascites fluid from one group of mice to another. The ascites fluid collected from the mice at each cell transfer is collected.

Z ascitické kapaliny se odstraní buňky a jejich zbytky odstředěním při nízkých otáčkách (500 až lOOOnásobek g) po dobu 15 minut. Pak se pokračuje v odstřeáováni při 18 OOO otáčkách za minutu po dobu 90 minut. Supernatant se zmrazí a uloží při teplotě -20 °C.Cells and their debris are removed from the ascites fluid by centrifugation at low speed (500-10000 times g) for 15 minutes. Centrifugation is then continued at 18,000 rpm for 90 minutes. The supernatant is frozen and stored at -20 ° C.

Po rozmraženi se odstraní další fibrin a jemný vyloučený materiál odstřeSovánim při 35 OOO otáčkách za minutu po dobu 90 minut. Všechny šarže ascitické kapaliny z každého transforu se testují na specifickou protilátkovou aktivitu stanovením protilátkové vazby v pevné fázi /viz Staehelin a spolupracovnici, citace uvedená výše/ a výhovujici podíly ee spojuji.After thawing, additional fibrin and fine precipitated material are removed by centrifugation at 35,000 rpm for 90 minutes. All lots of ascites fluid from each transform are tested for specific antibody activity by determining the solid phase antibody binding (see Staehelin et al., Supra, cited above) and matching ee fractions.

Koncentrace bílkoviny ve spojených roztocích se stanov! aproximačně na základě toho, že 1 mg bílkoviny vykazuje při 280 nm absorbanci 1,2 v kyvetě o tlouštce 1,0 cm. Ascitickó kapaliny s vysokými hladinami protilátky obsahuji 30 až 35 mg bílkoviny v jednom ml. Toto množství je ekvivalentní 4 až 7 mg specifické protilátky/ml. Ascitická kapalina o této koncentraci se ředi PBS roztokem (roztok 0,01 M fosforečnanu sodného o pH 7,3 a 0,15 M chloridu sodného) na koncentraci 10 až 12 mg bílkoviny v ml.The protein concentration in the combined solutions is determined. on an approximation basis, 1 mg of protein at 280 nm exhibits an absorbance of 1.2 in a 1.0 cm cuvette. Ascitic fluids with high antibody levels contain 30 to 35 mg protein per ml. This amount is equivalent to 4-7 mg specific antibody / ml. The ascites fluid at this concentration is diluted with PBS solution (0.01 M sodium phosphate solution at pH 7.3 and 0.15 M sodium chloride) to a concentration of 10-12 mg protein per ml.

Ke každým 100 ml takto zředěného roztoku se při O °G, za intenzivního mícháni, pomalu přidá 90 ml při teplotě místnosti nasyceného roztoku síranu amonného. Suspense se chladí ledem po dobu 40 až 60 minut a pak se odstře3uje 15 minut při teplotě 4 °C při 10 OOO otáčkách za minutu. Supernatant se oddekantuje a odcentrifugovaná látka se dobře vysuší. Pelety bílkoviny se rozpustí v roztoku obsahujícím 0,Ό2 M Tris-HCl (pH 7,9) a 0,04 M chlorid sodný (pufr I). Roztok bílkoviny se dialysuje 16 až 18 hodin při teplotě místnosti proti 100 objemům zmíněného pufru I s minimálně jednou výměnou pufru. Dialysovaný roztok se za účelem odstraněni nerozpustného materiálu odstře3uje 10 minut při 15 OOO otáčkách za minutu. Podle stanoveni absorpce při 280 nm se ziská 30 až 35 % původního množství celkové bílkoviny přítomné v ascitické kapalině.To each 100 ml of the diluted solution at 90 ° C, 90 ml of saturated ammonium sulfate solution was slowly added at room temperature with vigorous stirring. The suspension is ice-cooled for 40 to 60 minutes and then centrifuged for 15 minutes at 4 ° C at 10,000 rpm. The supernatant is decanted off and the centrifuged substance is dried well. Dissolve the protein pellets in a solution containing 0.1 M Tris-HCl (pH 7.9) and 0.04 M sodium chloride (buffer I). The protein solution is dialysed for 16-18 hours at room temperature against 100 volumes of said buffer I with at least one buffer change. The dialysed solution is centrifuged at 15,000 rpm for 10 minutes to remove insoluble material. By determining the absorption at 280 nm, 30-35% of the original amount of total protein present in the ascites fluid is recovered.

Roztok obsahující 30 až 40 mg bílkoviny na ml se poté nanese na sloupec DEAE-celulosy, ekvilibrované předem pufrem X. Na každý gram nanesené bílkoviny se použije vrstva sloupce o objemu alespoň 100 ml. Protilátka se ze sloupce vymývá gradientovou elucí roztokem chloridu sodného obsahujícím 0/02 M Tris-HCl o pH 7,9, s lineárním gradientem od 0,04 M do 0/5 M chloridu sodného. Spojené frakce bílkoviny eluované roztokem o koncentraci maži 0,06 až 0,1 M chloridu sodného ss zkoncentruji tím způsobem, že se bílkovina vysráži stejným objemem roztoku síranu amonného nasyceného při teplotě místnosti a produkt se odcentrifuguje. Získané pelety bílkoviny se rozpustí v roztoku obsahujícím 0,2 M hydroganuhličitan sodný (pH asi 8,0) a 0,'3 M chlorid sodný (pufr XI) a roztok se dialyeuJe při teplotě místnosti proti stejnému pufru, který ee třikrát vymění. Dialysovaný roztok ee za účelem odstranění malého množství nerozpustného materiálu odstřeSuje 15 minut při 20 OOO násobku g, a koncentrace bílkoviny se upraví pufrem II na hodnotu 20 až 25 mg/ml. Uvedeného roztoku protilátky se použije k přípravě imunoadsorbantu následujícím způsobem.The solution containing 30 to 40 mg protein per ml is then applied to a DEAE-cellulose column equilibrated beforehand with buffer X. A column layer of at least 100 ml is used for each gram of protein loaded. The antibody is eluted from the column by gradient elution with sodium chloride solution containing 0/02 M Tris-HCl, pH 7.9, with a linear gradient from 0.04 M to 0/5 M sodium chloride. The pooled protein fractions eluted with a 0.06-0.1 M sodium chloride solution were concentrated by precipitating the protein with an equal volume of an ammonium sulfate solution saturated at room temperature and centrifuging the product. The obtained protein pellets were dissolved in a solution containing 0.2 M sodium bicarbonate (pH about 8.0) and 0.3 M sodium chloride (buffer XI) and the solution was dialyzed at room temperature against the same buffer, which was changed three times. The dialysed solution is centrifuged at 20,000 times g for 15 minutes to remove a small amount of insoluble material, and the protein concentration is adjusted to 20-25 mg / ml with buffer II. Said antibody solution is used to prepare an immunoadsorbant as follows.

Affigel-10 (dodavatel BioRad Laboratories/ Richmond, Kalifornie) se promyje na eintrovaném skleněném filtru třikrát ledem ochlazeným isopropanolem a pak třikrát ledovou destilovanou vodou. Kaše gelu (asi 50%ni v ledové vodě) ss přenese do trubic z plastické hmoty a provede se sedimentace adsorbentu krátkým odstředěním; supernatant se odsaje. DoAffigel-10 (available from BioRad Laboratories / Richmond, Calif.) Is washed on an eintral glass filter three times with ice-cooled isopropanol and then three times with ice-cold distilled water. The gel slurry (about 50% ni in ice water) was transferred to the plastic tubes and the adsorbent was sedimented by brief centrifugation; the supernatant is aspirated. To

CS 273 181 B2 trubice naplněná gelem se přidá stejný objem (vzhledem ke gelu) přečištěného roztoku protilátky a trubice se nechá za účelem promíchání obsahu otáčet kolem kolmé osy 5 hodin při 4 °C. Po skončení reakce se gel odstředí a promyje dvakrát pufrem IXI (roztok 0,1 M hydroganuhličitanu sodného a 0,15 M chloridu sodného), aby se odstranila nezkopulovaná protilátka. Stanoveni bílkovin ve spojených promývacich roztocích ukázalo, že vice než 90 % protilátky se navázalo na gel.An equal volume (relative to gel) of the purified antibody solution was added to the gel-filled tube, and the tube was rotated about 4 hours at 4 ° C for about 5 hours to mix the contents. After completion of the reaction, the gel is centrifuged and washed twice with buffer IXI (0.1 M sodium bicarbonate solution and 0.15 M sodium chloride solution) to remove uncoupled antibody. Protein determination in the combined wash solutions showed that more than 90% of the antibody bound to the gel.

Aby se zablokovala nezreagovaná místa, smísi ss takto upravený gel ss stejným objemem 0,1 M roztoku hydrochloridu ethanolaminu (pH 8) a trubice se nechá znovu za účelem promícháni obsahu rotovat 60 minut při teplotě místnosti. Kase gelu se promyje až do odstraněni raaktantů roztokem PBS a přechovává se v roztoku PBS v přítomnosti 0,02 % (ra/V) azidu sodného při teplotě 4 °C.To block unreacted sites, the so treated gel is mixed with an equal volume of 0.1 M ethanolamine hydrochloride solution (pH 8) and the tube is again rotated at room temperature for 60 minutes to mix the contents. The gel slurry was washed until the ractants were removed with PBS and stored in PBS in the presence of 0.02% (ra / V) sodium azide at 4 ° C.

N. Parsnterální podáváni interferonůN. Parenteral administration of interferons

Interferonový LelF lze podávat parenterálně osobám potřebujícím antitumorové nebo antivirové léčeni a těm, u kterých se projevuji imunosupresivni stavy. Oávkováni a počet dávek jsou paralelní s těmi, které ss běžně používají při klinickém zkoušení interferonů θ získaných z lidských zdrojů, například asi (JL až 10) x 10 jednotek denně, a v případě materiálů o vyšši čistotě než 1 %, účelně až do této čistoty, například 5 x 10 jednotek denně.Interferon LelF can be administered parenterally to persons in need of anti-tumor or antiviral therapy and those who develop immunosuppressive conditions. Vaccination and dose numbers are parallel to those commonly used in clinical trials of human-derived interferons θ, for example about (JL to 10) x 10 units per day, and in the case of materials with a purity greater than 1%, expediently up to this of purity, for example 5 x 10 units per day.

□ako jeden přiklad vhodné aplikační formy pro v podstatě homogenní bakteriální inter feron LelF lze uvést přípravu parenterálni formy: 3 mg LelF o specifické aktivitě napřiklad 2 x 10 jednotek/mg se rozpustí vs 25 ml 5N roztoku lidského serumalbuminu; roztok ss zfiltruje přes bakteriologický filtr a zfiltrovaný roztok ss asepticky rozdělí do θJeden as one example of a suitable dosage form for a substantially homogeneous bacterial interferon LelF, parenteral formulations can be mentioned: 3 mg of LelF having a specific activity, for example 2 x 10 units / mg, are dissolved in 25 ml of a 5N human serum albumin solution; the ss solution is filtered through a bacteriological filter and the filtered ss solution is aseptically divided into θ

100 kusů injekčních ampulek, které pak obsahuji po 6 x 10 jednotek čistého interferonů vhodného pro parenterálni podávání. Ampulky se před použitím výhodně přechovávají v chladu (při -20 °C).100 ampoules of ampoules each containing 6 x 10 units of pure interferon suitable for parenteral administration. The vials are preferably stored refrigerated (-20 ° C) prior to use.

Sloučeniny podle předloženého vynálezu lze formulovat známými metodami do formy farmaceuticky vhodných přípravků, přičemž účinný polypeptid se používá ve smě3i s farmaceuticky přijatelným nosným vshikulsm. Vhodná vshikula a jejich formulováni jsou popsány například v příručce “Remingtonů Pharmaceutical Sciences E.V. Martinem, na kterou zde odkazujeme. Farmaceutické přípravky podlá vynálezu obsahuji účinné množství intsrferonové bílkoviny spolu s vhodným množstvím vehikula umožňujícího účinné podáváni preparátu hostiteli. Beden z přednostních způsobů podávání je parenterálni podávání.The compounds of the present invention can be formulated by known methods into pharmaceutically acceptable compositions wherein the active polypeptide is used in admixture with a pharmaceutically acceptable carrier. Suitable formulas and their formulation are described, for example, in Remington's Pharmaceutical Sciences E.V. Martin, to which we refer. The pharmaceutical compositions of the invention comprise an effective amount of the interferon protein together with an appropriate amount of a vehicle to allow the preparation to be effectively administered to the host. The container of the preferred modes of administration is parenteral.

Claims (6)

1. Způsob výroby E.coli buněk schopných produkovat zralý lidský leukocytárni intsrferon LelF A, B,' C, D, F, Η, X nsbo □ s aminokyselinovou sekvenci od polohy 1 až 166 jak je uvedeno na obr. 4 a 9, vyznačující sa tím, žaA method for producing E.coli cells capable of producing mature human leukocyte intsrferon LelF A, B, C, D, F, Η, X or β with an amino acid sequence from positions 1 to 166 as shown in Figures 4 and 9, characterized by with that a) inkubuji se E.coli buňky ošetřené chloridem vápenatým DNA expresním vektorem vybraným ze skupiny zahrnující plasmid pLalF A trp 25 DNA, plasmid pLeXF B trp 7 DNA, plasmid pLsIF C trp 35 DNA, plasmid pLeXF D trp 11 DNA, plasmid pLalF F trp 1 DNA, plasmid pLeXF H DNA, plasmid pLalF I trp 1 DNA a plasmid pLelF □ trp 1 DNA v ligačnim ústojném roztoku po dobu 30 minut aa) incubating E. coli cells treated with calcium chloride DNA with an expression vector selected from the group consisting of plasmid pLalF A trp 25 DNA, plasmid pLeXF B trp 7 DNA, plasmid pLsIF C trp 35 DNA, plasmid pLeXF D trp 11 DNA, plasmid pLalF F trp 1 DNA, plasmid pLeXF H DNA, plasmid pLalF-trp 1 DNA and plasmid pLelF-trp 1 DNA in ligation buffer for 30 minutes and b) provede se selekce transformovaných E.coli buněk na tuhé vrstvě agaru obsahující tetra cyklin.b) transforming E. coli cells on a solid layer of tetra cyclin-containing agar is selected. 2. Způsob podle bodu 1 pro výrobu E.coli buněk schopných produkovat zralý lidský leu kocytárni interferon LelF A s aminokyselinovou sekvenci od polohy 1 až 166 jak je uvedeno na obr. 4, vyznačující sa tím, že se inkubuji E.coli buňky plasmidsm pLelF A trp 25 DNA.2. The method of item 1 for the production of E. coli cells capable of producing mature human leu cocytic interferon LelF A having an amino acid sequence from position 1 to 166 as shown in Figure 4, characterized in that E. coli cells are incubated with plasmids pLelF. And suffer 25 DNA. CS 273 181 B2CS 273 181 B2 3. Způsob podle bodu 1 pro výrobu1 E.coli buněk schopných produkovat zralý lidský leukocytárni interferon LelF B, C, D nebo F s aminokyselinovou sekvenci od polohy 1 až 166 jak js uvedeno na obr. 4, vyznačující se tim, že se inkubuji E.coli buňky DNA expresním vektorem vybraným ze skupiny zahrnující plasmid pLelF B trp 7 DNA, plasmid pLelF C trp 35 DNA, plasmid pLelF D trp 11 DNA a plasmid pLelF trp 1 DNA.3. The method of item 1 for producing 1 E. coli cells capable of producing mature human leukocyte interferon LelF B, C, D or F having an amino acid sequence from position 1 to 166 as shown in FIG. 4, characterized by incubating E. coli DNA cells with an expression vector selected from the group consisting of plasmid pLelF B trp 7 DNA, plasmid pLelF C trp 35 DNA, plasmid pLelF D trp 11 DNA, and plasmid pLelF trp 1 DNA. 4. Způsob podle bodu 1 pro výrobu E.coli buněk schopných produkovat zralý lidský leukocytárni interferon LelF H a aminokyselinovou sekvencí od polohy 1 až 166 jak Je uvedeno na obr. 4, vyznačujici sa tim, žs se inkubuji E.coli buňky plasmidem pLelF H DNA.4. The method of item 1 for producing E. coli cells capable of producing mature human leukocyte interferon LelF H and an amino acid sequence from position 1 to 166 as shown in Figure 4, characterized in that E. coli cells are incubated with plasmid pLelF H. DNA. 5. Způsob podle bodu 1 pro výrobu E.coli buněk schopných produkovat zralý lidský leukocytárni interferon LelF I nebo 3 s aminokyselinovou sekvenci jak je uvedeno na obr. 9, vyznačujici ee tim, že se inkubuji E.coli buňky plasmidem pLelF I trp 1 DNA nebo plasraidem pLelF 3 trp 1 DNA.5. The method of item 1 for producing E. coli cells capable of producing mature human leukocyte interferon LelF I or 3 with the amino acid sequence as shown in Figure 9, characterized in that E. coli cells are incubated with plasmid pLelF I trp 1 DNA. or plasmid pLelF 3 trp 1 DNA. 6. Způsob podle bodu 1, vyznačujici se tim, že se jako E.coli kmen používá E.coli K-12 kmen 294 (ATCC 31446).6. The method of item 1, wherein the E. coli strain is E. coli K-12 strain 294 (ATCC 31446).
CS362687A 1980-07-01 1987-05-19 Method of escherichia coli cells production that are capable to produce mature human leucocytic interferon CS273181B2 (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CS362687A CS273181B2 (en) 1980-07-01 1987-05-19 Method of escherichia coli cells production that are capable to produce mature human leucocytic interferon

Applications Claiming Priority (6)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US16498680A 1980-07-01 1980-07-01
US18490980A 1980-09-08 1980-09-08
US20557880A 1980-11-10 1980-11-10
US06/256,204 US6610830B1 (en) 1980-07-01 1981-04-21 Microbial production of mature human leukocyte interferons
CS503781A CS273152B2 (en) 1980-07-01 1981-06-30 Method of mature human leucocytic interferon production
CS362687A CS273181B2 (en) 1980-07-01 1987-05-19 Method of escherichia coli cells production that are capable to produce mature human leucocytic interferon

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CS362687A2 CS362687A2 (en) 1990-07-12
CS273181B2 true CS273181B2 (en) 1991-03-12

Family

ID=27509695

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CS362687A CS273181B2 (en) 1980-07-01 1987-05-19 Method of escherichia coli cells production that are capable to produce mature human leucocytic interferon
CS362787A CS273182B2 (en) 1980-07-01 1987-05-19 Method of expressive vector production capable to give mature human leucocytic interferon in transformed strain of escherichia coli by means of expression

Family Applications After (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CS362787A CS273182B2 (en) 1980-07-01 1987-05-19 Method of expressive vector production capable to give mature human leucocytic interferon in transformed strain of escherichia coli by means of expression

Country Status (1)

Country Link
CS (2) CS273181B2 (en)

Also Published As

Publication number Publication date
CS273182B2 (en) 1991-03-12
CS362787A2 (en) 1990-07-12
CS362687A2 (en) 1990-07-12

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CS273152B2 (en) Method of mature human leucocytic interferon production
CA1341583C (en) Interferons and process for their preparation
KR920007439B1 (en) Hybrid human leukocyte interferons
HU193512B (en) Process for preparing hybride interferones from human erythrocytes
SK279535B6 (en) Human immune interferon and derivative thereof, dna isolate, replicable expression vector, recombinant microorganism or cell culture, pharmaceutical composition and use thereof
HU193507B (en) Process for producing interferen-like pelypeptides
IE57053B1 (en) Human immune interferon protein and production thereof
EP0165654B1 (en) Purified interleukin 1
JPS6363199B2 (en)
CS273181B2 (en) Method of escherichia coli cells production that are capable to produce mature human leucocytic interferon
FI82714C (en) Process for producing a transformed strain of E. coli capable of expressing a human mature leukocyte interferon
JPH064673B2 (en) Hybrid type human leukocyte interferon
KR870000510B1 (en) The manufacturing method of transformation microorganisms
KR870000511B1 (en) Preparing method of expression vehicles
KR910009901B1 (en) Hybrid human leukocyte interferons
Goeddel Microbial production of mature human leukocyte interferons
IL63197A (en) Mature human leukocyte interferons their production and compositions containing them
NZ214261A (en) Human immune interferon: production by recombinant dna technology