CN1965080A - 核酸提取用容器、固体基件的洗净方法及洗净机构、和核酸精制方法 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及核酸提取用容器(2),该核酸提取用容器包括:用于从试样提取目的核酸且附着所提取的核酸的核酸提取元件(20);和与核酸提取元件(20)分开另外形成且具有收容核酸提取元件(20)的收容槽(27)的容器主体。核酸提取元件(20)包括:附载目的核酸的固体基件(23);和保持该固体基件(23)的保持部件(20)。优选为,固体基件(23)以相对于保持部件(20)的垂直轴为倾斜的状态被保持。
Description
技术领域
本发明涉及用于从试样中精制目的核酸的技术。
背景技术
在医疗领域中,核酸分析由于以基因水平诊断感染症或基因疾病所以起到重要的作用,现在,不限于医疗的领域,在农业或食品领域等各领域中也应用。通常,核酸的分析要经过源自试样的核酸的精制、所精制的核酸的扩增和所扩增的核酸的检测这样的过程。在考虑人的成本、再现性、分析效率的情况下,最好各过程由机械自动地进行,理想的是,最好全部过程用机械自动地进行(参照专利文献1、2)。
作为以核酸精制的自动机械化为目标,有使用核酸结合性载体的方法。作为一个例子,有使用核酸结合性二氧化硅粒子和高离液(chaotropic)离子的方法(参照专利文献3)。该方法是,让具有使核酸结合性二氧化硅粒子和试样中的核酸游离的能力的高离液离子与试样混合,使试样中的核酸与核酸结合性二氧化硅粒子结合,然后,分离固相和液相后,洗脱与核酸结合性二氧化硅粒子结合的核酸。然而,为了分离固相和液相,需要进行离心分离或使用过滤器等的过滤等操作,实现机械化时的操作和装置结构复杂化。
作为使用核酸结合性载体的另一方法,有使用具有磁性的载体的方法(参照专利文献4、5)。该方法是,在具有磁性的二氧化硅粒子上吸附核酸后,利用磁铁分离二氧化硅粒子,在从分离的二氧化硅粒子中洗脱核酸后,回收洗脱液。该方法由于不进行离心分离操作等而可以分离固相和液相,因此在用机械实现自动化方面有优点。
然而,存在着核酸的回收率比较低,其回收率容易受到试样种类的影响的问题。而且,在采用PCR(聚合酶链反应,Polymerase ChainReaction)法作为核酸的扩增方法时,磁性二氧化硅粒子成为扩增反应的阻碍剂。另外,作为检测核酸的代表性方法,要对核酸进行标识,利用光学方法测定该标识。在采用这个方法的情况下,磁性二氧化硅的影响会生测定误差,精制时的磁性二氧化硅粒子的含有量的偏差会使再现性恶化。
另外,作为核酸的精制方法,有利用在固体基件中含浸提取核酸所必要的试剂类的方法(参照专利文献6~8)。利用这种方法,通过在固体基件上点附试样,提取目的核酸。然后,当扩增核酸时,将可成为阻碍剂的剩余成分洗净除去。更具体地说,剩余成分的洗净是通过利用冲头将固体基件的一部分冲切成圆盘状后,将冲切的圆盘状的固体基件收容在微型管中,在微型管内,从圆盘状的固体基件洗脱剩余成分来进行的。
在采用这个方法的情况下,不但需要冲切固体基件一部分的工序,而且为了冲切固体基件,需要使固体基件干燥。由于这样,在洗净圆盘状固体基件前,需要相当的时间。另外,圆盘状的固体基件的洗净,由于是使剩余成分从固体基件扩散在洗净液中的方法,所以洗净需相当的时间。特别是,为了得到很好的洗净效果,需要反复更换保持在微型管中的洗净液,因此在这点上,洗净需要的时间长。为了尽可能缩短洗净需要的时间,不得不将圆盘状的固体基件缩小。在这种情况下,可从试样回收的目的核酸量少。其结果是,核酸的检测灵敏度降低,另外,为了得到目的量核酸,需要将扩增时间设定得长。
另外,在利用圆盘状固体基件的方法中,核酸的扩增在用于进行核酸洗净的微型管中进行,同时,核酸的分析也在微型管中,利用光学的方法进行。由于这样,在圆盘状的固体基件不适当大的情况下,圆盘状的固体基件塞住测光路,只会阻碍核酸的分析。为了不产生这种问题,不得不将圆盘状的固体基件冲切成一定程度以下的大小例如2mm以下的大小,这样产生上述的问题,使得从试样可回收的目的核酸的量减少。另外,作为使用者,将固体基件冲切为2mm以下大小的操作的负担大,称不上是操作效率好的方法。
然而,利用PCR法的核酸扩增正在进行机械的自动化,市场上已有PCR装置出售。作为PCR装置,通常与核酸扩增的同时,可以进行所扩增的核酸的检测。
但是,在使用市场上出售的PCR装置的情况下,需要使用专用的扩增成套工具。通常的扩增成套工具是,预先将引物和聚合酶等试剂装入带盖的容器中。由于这样,使用者要加强打开容器的盖后,将核酸溶液分别注入容器内,在搅拌容器内的反应液、关闭盖后,将该容器安装在PCR装置中的操作。即,通常的扩增成套工具是,由于依赖使用者手操作的部分大,使用者的负担大,又由于大量存在使用者的手操作,分析效率低,基于使用者技术水平的差异的再现性恶化。另外,在扩增成套工具中所采用的容器,通常为通过树脂成形,与盖作成一体的通用品,在PCR装置中,自动地开闭盖困难。由于这样,在利用通常的专用成套工具的方法中,在PCR装置中自动地进行依赖使用者的手操作的操作困难。
作为核酸的扩增方法,除了PCR法以外,还有例如ICAN(Isothermal and Chimeric Primer-initiated Amplification of Nucleic acid)法或LAMP(Loop-Mediated Isothermal Amplification)法。这些方法,与PCR法相比,核酸的精制度不很高,是不能很好地扩增目的核酸的方法。因此,在利用机械使核酸的精制和扩增自动化的情况下,除了PCR法以外,为了能够采用其它的扩增方法,需要确立提高核酸的精制度的方法。
专利文献1:特开2001-149097号公报
专利文献2:特开2003-304899号公报
专利文献3:专利第2680462号公报
专利文献4:特开昭60-1564号公报
专利文献5:特开平9-19292号公报
专利文献6:美国专利第5496562号说明书
专利文献7:美国专利第5939259号说明书
专利文献8:美国专利第6168922号说明书
发明内容
本发明的目的在于利用机械自动地进行核酸的精制、核酸的扩增和核酸的测定这样的核酸分析中的一系列工序,减轻使用者的负担,同时改善分析效率和再现性。
本发明的另一个目的在于提供一种在利用机械使核酸的精制和扩增自动化的情况下,可采用各种扩增方法的核酸的精制技术。
在本发明的第一方面,提供一种核酸提取用容器,它包括:用于从试样中提取目的核酸且附载所提取的核酸的核酸提取元件;和与所述核酸提取元件分开另外形成且具有收容所述核酸提取元件的收容槽的容器主体。
优选为,核酸提取元件包括:用于附载目的核酸的固体基件;和用于保持该固体基件的保持部件。
固体基件相对于保持部件的垂直轴为倾斜的状态下被保持在保持部件上。优选为,相对于垂直轴为水平或大致水平的状态来保持。在种情况下,将固体基件作成圆盘形。
固体基件相对于上述垂直轴为倾斜的状态,例如可通过相对于固体基件刺向保持部件来达到。在这种情况下,保持部件包括:越向端部直径越缩小的锥部;从锥部延伸并且贯通固体基件的销状部;和抑制固体基件从销状部脱离的卡止片。
另外,固体基件在相对于保持部件的垂直轴为平行或大致平行的状态下,保持在保持部件上也可以。在这种情况下,优选固体基件作成片状。
固体基件相对于上述垂直轴为平行或大致平行的状态,可通过将固体基件吊持在保持部件上达到。在这种情况下,保持部件具有夹持固体基件的端部并且吊持固体基件的夹持部。
优选为,容器主体具有1个以上的用于保持洗净液的洗净槽,该洗净液用于除去附着在固体基件上的剩余成分。在这种情况下,优选为,在容器主体上设置有剩余洗净液除去装置,该剩余洗净液除去装置用于除去附着在固体基件或其周围上的剩余洗净液。
剩余洗净液除去装置包括例如吸水性部件。作为吸水性部件,可使用例如发泡树脂或布等多孔质粒。
本发明的核酸提取用容器可作为安装在核酸分析装置上使用的支架构成。
在核酸分析装置具有从收容槽取出附载目的核酸的核酸提取元件、将该核酸提取元件移送至其它部位的移送部件的情况下,核酸提取元件具有例如与所述移送部件卡合的卡合部。在这种情况下,卡合部作成用于嵌合例如移送部件的前端部的筒状。优选为,卡合部具有1个以上的凹陷部,该凹陷部是,当嵌合移送部件的前端部时,使弹性力作用在移送部件上。1个以上的凹陷部包括槽、切口和贯通孔中的至少一个。
与此相对,保持部件具有例如用于解除移送部件和卡合部的嵌合状态的突出部。优选为,突出部是向外侧突出的凸缘。在这种情况下,收容槽具有例如当将核酸提取元件收容在该收容槽中时、与突出部卡止的台阶部。
在本发明的第二方面中,提供一种固体基件的洗净方法,它是使用洗净液从附载目的核酸的固体基件上除去目的核酸以外的剩余成分的方法,通过使固体基件相对于洗净液沿上下方向进行相对移动,使上述固体基件浸渍上述洗净液中的状态和上述固体基件不浸渍在上述洗净液中的状态反复。
固体基件浸渍在洗净液中的状态和不浸渍的状态的反复,在使固体基件相对于上下方向为倾斜的状态下进行。优选为,使固体基件相对于上下方向为垂直或大致垂直的姿势进行。
在本发明的第三方面中,提供一种核酸精制方法,它是使用具有附载目的核酸的固体基件和保持该固体基件的保持部件的核酸提取元件,精制目的核酸的方法,它包括:将试样含浸在上述在固体基件中、在所述固体基件中附载试样中的目的核酸的核酸附载步骤;和使用洗净液除去附着在所述固体基件上的目的核酸以外的剩余成分的洗净步骤;并且所述洗净步骤,通过使所述核酸提取元件相对于洗净液沿上下方向相对地移动,使所述核酸提取元件浸渍在所述洗净液中的状态和所述核酸提取元件不浸渍在所述洗净液中的状态反复来进行。
在本发明的核酸精制方法中,作为核酸提取元件,使用以相对于保持部件的垂直轴为倾斜的状态将固体基件保持在保持部件上的元件。在这种情况下,洗净步骤,在使固体基件相对于上下方向为倾斜的状态下,通过使提取元件沿上下方向移动来进行。优选为,洗净步骤,通过以使固体基件相对于上下方向为垂直或大致垂直的姿势,使核酸提取元件沿上下方向移动来进行。
洗净步骤包括:在固体基件相对于洗净液的反复浸渍结束后,利用吸水性部件除去附着在固体基件中的剩余洗净液的作业。
在本发明的第四方面,提供一种固体基件的洗净机构,使用洗净液从附载目的核酸的固体基件中除去目的核酸以外的剩余成分,使固体基件相对于洗净液沿上下方向相对地移动,使得所述固体基件浸渍在所述洗净液中的状态和所述固体基件不浸渍在所述洗净液中的状态反复。
本发明的洗净机构,例如在使固体基件相对于上下方向为倾斜的状态下,使固体基件沿上下方向进行移动。优选为,以使固体基件相对于上下方向为垂直或大致垂直的姿势,使固体基件沿上下方向进行移动。
在本发明中,所谓“试样”是包含源自动物的生物试样(例如全血、血清、血浆、尿、唾液或体液)和动物以外的生物试样的概念,所谓“核酸”是指DNA或RNA,是包含双链DNA、单链DNA、质粒DNA、基因组DNA、cDNA、源自外源性寄生生物(病毒、细菌、真菌等)的RNA、内源性RNA的概念。
附图说明
图1是说明核酸分析装置的一个例子的全体立体图。
图2是表示图1所示的核酸分析装置的内部结构的平面图。
图3是沿着图2的III-III线的剖面图。
图4是沿着图1的IV-IV线的剖面图。
图5是表示核酸精制用支架的一个例子的全体立体图。
图6是沿着图5的VI-VI线的剖面图。
图7A是核酸精制用支架的核酸提取元件的全体立体图。
图7B是核酸提取元件的剖面图。
图8是核酸扩增用支架的全体立体图。
图9是沿着图8的IX-IX线的剖面图。
图10是说明固体基件的洗净动作的主要部分的剖面图。
图11是表示从核酸扩增用支架取出盖的动作的主要部分的剖面图。
图12是说明利用盖的扩散核酸提取元件的取出动作的主要部分的剖面图。
图13A是说明将核酸提取元件收容在核酸扩增用支架的反应槽中的动作的主要部分的剖面图;图13B是说明从反应槽取出盖的动作的主要部分的剖面图。
图14是沿着图13B的XIV-XIV线的剖面图。
图15是说明温度调节机构和测定机构的与沿着图2的XV-XV线的剖面相当的剖面图。
图16是表示用于说明核酸分析装置的一个例子的内部结构的平面图。
图17是沿着图16的XVII-XVII线的剖面图。
图18是沿着图16的XVIII-XVIII线的剖面图。
图19是表示核酸精制用支架的一个例子的全体立体图。
图20A是表示核酸精制用支架的核酸提取元件的立体图;图20B是其平面图;图20C是沿着图20A的XXc-XXc线的剖面图。
图21是核酸精制用支架的容器中的与沿着图19的XXI-XXI线的剖面相当的剖面图。
图22是表示从容器的收容槽取出核酸提取元件的操作的主要部分的剖面图。
图23是核酸扩增用支架的全体立体图。
图24A是沿着图23的XXIVa-XXIVa线的剖面图;图24B是表示在图24A中分离盖的状态的剖面图。
图25是说明尖端件在喷嘴上的安装动作的主要部分的正面图。
图26是说明核酸提取元件在喷嘴上的安装动作的主要部分的正面图。
图27是说明从喷嘴取出尖端件的动作的主要部分的正面图。
图28是说明从喷嘴取出核酸提取元件的动作的主要部分的正面图。
图29是表示旋转部件插入核酸扩增用支架的盖中的动作的主要部分的剖面图。
图30是说明取出核酸扩增用支架的盖的动作的主要部分的剖面图。
图31是表示将核酸提取元件收容在核酸扩增用支架的反应槽中的操作的主要部分的剖面图。
图32是说明再安装核酸扩增用支架的盖的动作的主要部分的剖面图。
图33是用于说明测定机构的与沿着图16的XXXIII-XXXIII线的剖面相当的剖面图。
图34是表示实施例1(PCR法)中的荧光强度测定结果的图形,它以横轴为温度,以纵轴为荧光强度的微分值来表示。
图35是表示实施例2(ICAN法)中的荧光强度测定结果的图形,它以横轴为循环数,以纵轴为荧光强度来表示。
图36是表示实施例3(LAMP法)中的荧光强度测定结果的图形,它以横轴为循环数,以纵轴为荧光强度来表示。
具体实施方式
以下参照附图,说明本发明的第一和第二实施方式。
首先,参照图1~图15说明本发明的第一实施方式。
图1~图4所示的核酸分析装置1可自动地进行试样中的核酸的精制、所提取的核酸的扩增和所扩增的核酸的分析。如图1和图2所示,在框体10的内部安装并使用同一数目的多个核酸精制用支架2和核酸扩增用支架3。
如图5和图6所示,核酸精制用支架2可适用于核酸分析装置1中的核酸的自动精制,具有核酸提取元件20和支架主体21。
核酸提取元件20是在从试样中提取核酸时所利用的元件,收容在后述的支架主体21的收容槽27中。如图7A和图7B清楚地所示,该核酸提取元件20具有保持部件22和固体基件23。
保持部件22具有筒状部24、凸缘部25和保持部26,例如全体由树脂成形形成。
筒状部24是在移动核酸提取元件20时利用的部分(参照图4和图12),具有凹部24A和卡止头24B。凹部24A用于嵌合后述的核酸精制用机构5的插入销50或核酸扩增用支架3的盖31的销36B(参照图4和图12)。卡止头24B用于嵌合后述的核酸扩增用支架3的盖31的卡止爪36A,在半径方向突出。
凸缘部25用于在将核酸提取元件20收容在后述的核酸精制用支架2的收容槽27中时,与收容槽27的台阶部27A卡合,作成向半径方向的外侧突出的环状(参照图12)。
保持部26为保持固体基件23的部分,具有锥部26A、销状部26B和卡止片26C。锥部26A起着容易使附着在保持部26上的洗净液向下方移动的作用。销状部26B为贯通固体基件23的部分。卡止片26C用于在使销状部26B贯通固体基件23时,防止固体基件23从销状部26B(保持部26)脱离。
O形圈22A固定在保持部件22上,于保持部26的稍上方。如图13B清楚地所示,该O形圈22A用于在将核酸提取元件20收容在核酸扩增用的支架3的反应槽34中时,与反应槽34的内面紧贴。即,在将核酸提取元件20收容在反应槽34中的情况下,在O形圈22A与反应槽34的内面贴紧的位置的下方形成密闭空间。因为O形圈22A配置在保持部26的上方,因此,固体基件23收容在密闭空间中。
固体基件23用于附载试样中的核酸,例如可作为将核酸提取用的试剂类附载在滤纸上构成。将该固体基件23作成圆盘状。即,固体基件23刺入销状部26B的状态下,水平或大致水平地支承,使得与保持部件22的垂直轴垂直。
在此,作为核酸提取用的试剂类,可举出例如弱碱、螯合试剂、阴离子界面活性剂或阴离子洗剂和尿酸或尿酸盐的组合,或者核酸吸附用载体和吸附促进剂的组合。作为核酸吸附用载体,可以使用众所周知的各种载体,典型地可使用二氧化硅珠。作为吸附促进剂,如果是使细胞膜破坏或使试样中的蛋白质变性、对核酸与核酸吸附用载体的结合有帮助的物质即可,例如可以使用高离液物质(例如胍硫氰酸盐、胍酸盐)。如果固体基件23是可以高效率地吸附试样中的核酸的结构即可,其结构不是仅限于上述的例子。
在上述的核酸提取元件20中,当将核酸提取元件20收容在后述的核酸扩增用支架3的反应槽34中时,可以成为使固体基件23与反应槽34的底离开的状态。这样,由于固体基件23不位于后述的测光机构8的测光路径上,可以提高测光精度。由于固体基件23不位于测光路径上,故可以使用尺寸大的固体基件23。这样,固体基件23上可附载更多的核酸,可以进行更高效率的核酸扩增,还可提高分析精度。
如图5和图6所示,支架主体21具有收容槽27、三个洗净槽281~283、试样保持槽29和剩余液除去槽21A,由树脂成形作成一体。
收容槽27用于收容核酸提取元件20,具有与核酸提取元件20的凸缘部25卡止的台阶部27A,在使用核酸精制用支架2前,优选利用铝薄膜等密封材料塞住该收容槽27的上部开口27B,使得核酸提取元件20不从上部开口27B脱离。密封材料在使用核酸精制用支架2时,可以由使用者剥离,也可以在核酸分析装置1中自动地剥离。
各洗净槽281~283用于在将核酸附载在固体基件23中后,保持从固体基件23除去夹杂物用的洗净液。优选洗净液预先装入作为核酸精制用支架2的洗净槽281~283中,但在分析时,将装入核酸分析装置1中的洗净液分别注入洗净槽281~283中也可以。作为洗净液,可以使用核酸从固体基件23洗脱作用少、妨碍夹杂物结合的洗净液(例如胍盐酸盐或乙醇)。在三个洗净槽281~283中保持相同的洗净液也可以,保持不同的洗净液也可以。
在预先将洗净液装入各洗净槽281~283中的情况下,需要利用铝薄膜等的密封材料塞住各洗净槽281~283的上部开口28A1~28A3。在这种情况下,个别地塞住各洗净槽281~283的上部开口28A1~28A3也可以,总括地塞住三个洗净槽281~283的上部开口28A1~28A3或总括地塞住三个洗净槽281~283的上部开口28A1~28A3和收容槽27的上部开口27B也可以。
试样保持槽29用于保持作为分析对象(提取核酸的对象)的试样。试样保持槽29对试样的保持,在将核酸精制用支架2安装在核酸分析装置1上之前进行也可以,在将核酸精制用支架2安装在核酸分析装置1上之后进行也可以。在后者的情况下,优选在核酸分析装置1中自动地将试样分别注入试样保持槽29中。作为试样,可以使用全血、血清、血浆、尿、唾液或体液。
剩余液除去槽21A用于在洗净核酸提取元件20中的固体基件23之后、除去附着在核酸提取元件20、固体基件23和保持部件22的保持部26上的剩余的洗净液。在剩余液除去槽21A中,吸水性部件21Ad、21Ae与底壁21Aa和前后壁21Ab、21Ac紧贴固定。吸水性部件21Ad、21Ae由发泡树脂或布等多孔质材料构成,通过接触核酸提取元件20,从核酸提取元件20吸收除去剩余的洗净液。
如图8和图9所示,核酸扩增用支架3可适应核酸分析装置1中的核酸自动扩增和测定,具有支架主体30和盖31。
支架主体30具有四个试剂类保持槽321~324、混合槽33和反应槽34,由树脂成形作成一体。
各试剂类保持槽321~324用于在水溶液或悬浊液状态下保持核酸扩增和测定所需要的试剂类。在此,保持在各试剂类保持槽321~324中的试剂类的种类,根据采用的扩增方法和测定方法来选择。作为扩增方法,可以采用PCR(聚合酶链反应,Polymerase Chain Reaction)法、ICAN(Isothermal and Chimeric Primer-initiated Amplification ofNucleic acid)法、LAMP(Loop-Mediated Isothermal Amplification)法或NASBA(核糖核酸序列扩增,Nucleic acid Sequence BaseaAmplification)法。在采用PCR法的情况下,作为试剂类,使用至少二种的引物、dNTP和DNA聚合酶。在采用ICAN法的情况下,作为试剂类,使用嵌合体引物、DNA聚合酶和RNaseH。在采用LAMP法的情况下,作为试剂类,使用1种以上的LAMP用引物、dNTP、链置换型DNA合成酶和逆转录酶。在采用NASBA法的情况下,作为试剂类,使用至少二种的引物、dNTP、rNTP、逆转录酶、DNA聚合酶、RNaseH和RNA聚合酶。另一方面,作为测定方法,可采用荧光测定、发色测定、放射性活性测定或电泳。在核酸分析装置1中采用荧光测定。在这种情况下,作为引物,优选使用荧光引物。
混合槽33是在将保持在试剂类保持槽321~324中的二种以上的试剂类供给反应槽34之前混合时所利用的部件。
优选预先将试剂类装入试剂类保持槽321~324中,在分析时,将装入核酸分析装置1中的试剂类分别注入试剂类保持槽321~324中也可以。在这种情况下,需要用铝薄膜等密封材料塞住试剂类保持槽321~324的上部开口32A1~32A4,但个别地塞住各试剂类保持槽321~324的上部开口32A1~32A4也可以,总括地塞住4个试剂类保持槽321~324的上部开口32A1~32A4或者总括地塞住4个试剂类保持槽321~324和混合槽33的上部开口32A1~32A4、33A也可以。
反应槽34用于收容混合试剂和核酸提取元件20,同时,提供使在核酸提取元件20中附载的核酸与在混合槽33中调整的混合试剂反应的场所(参照图13和图14)。反应槽34具有筒状部35和反应检测部37。
筒状部35是安装盖31的部分,在其内周面上作出螺纹槽35A。
反应检测部37提供引起核酸扩增反应的场所,同时,起到作为进行荧光测定的检测容器的作用。即,反应检测部37是从后述的测光机构8的发光部80射出的光照射的部分(参照图15)。
盖31用于选择使反应检测部37的内部是否为密闭状态,可自由地在反应槽34(筒状部35)上安装和拆卸。更具体地说,通过作用旋转力,盖31可以选择安装在筒状部35上的状态和完全与筒状部35(反应槽34)分离的状态。盖31具有圆筒状的主体部38、凸缘部39和保持部36。
主体部38具有与反应槽34的筒状部35的螺纹槽35A螺合的螺纹高出部38A和插入后述的盖安装拆卸机构6的旋转部件60(参照图11B)的凹部38B。在凹部38B的内周面上作出多个肋38C。多个肋38C在周方向上隔开一定间隔,在上下方向延伸。各个肋38C的上端部作成越向上方宽度尺寸越小的锥形状。
凸缘部39用于当移动从反应槽34取出的盖31时、与后述的盖安装拆卸机构6的外套部件61的爪64卡止(参照图11B)。该凸缘部39作成从主体部38的上端向半径方向的外侧突出的圆环状。
如图7B所示,保持部36用于保持核酸精制用支架2的核酸提取元件20,具有一对卡止爪36A和销36B。
一对卡止爪36A用于与核酸提取元件20的卡止头24B卡止,作成从主体部38的底面38D向下方突出。各卡止爪36A,在其前端设有钩子部36Aa,该钩子部36Aa可以摇动。即,一对卡止爪36A的钩子部36Aa可以互相接近和离开。
销36B用于插入核酸提取元件20的筒状部24的凹部24A中,作成从主体部38的底面38D向下方突出。销36B起到当将核酸提取元件20保持在盖31中时的导向装置的作用,同时在将核酸提取元件20保持在盖31中之后,可抑制核酸提取元件20相对于盖31的松动。
如图1所示,在核酸分析装置1的框体10中设有盖11、显示部12和操作部13。盖11用于选择框体10的内部为露出状态和不露出状态,当使支架2、3在框体10的内部出入时,盖11打开,另一方面,在核酸分析时和装置不使用时,盖11为关闭状态。显示部12用于显示分析结果等,例如由LCD构成。操作部13用于进行各种设定或者分析开始时的操作部分。
如图2和图3所示,在框体10的内部设有后述的吸液管装置4、核酸精制用动作机构5、盖安装拆卸机构6、温度调节机构7和测光机构8。
吸液管装置4主要用于进行核酸扩增用支架3的混合液的调整,具有喷嘴40。根据需要,该吸液管装置4可以用于将试样或洗净液供给核酸精制用支架2。
喷嘴40与图外的泵连接,可吸引和排出液体。可以选择将吸引力作用在喷嘴40的内部的状态和使排出力作用的状态。该喷嘴40利用机构手臂等驱动机构(图中省略)可在上下方向和水平移动,其动作由CPU等构成的控制部10控制。喷嘴40可在核酸扩增用支架3的试剂类保持槽321~324、混合槽33、反应槽34和核酸精制用支架2的收容槽27中移动。在混合试样的调整和将混合试样分别注入反应槽34(反应检测部37)的情况下,如图3所示,在喷嘴40的前端部42上安装尖端件43。如图2所示,尖端件43在与喷嘴40(吸液管装置4)的待机位置邻接的部位上,保持在机架44中。在与该机架44邻接的部位上配置废弃使用完的尖端件43的废弃盒45。
如图2~图4和图10所示,核酸精制用动作机构5,在利用核酸精制用支架2的核酸提取元件20,提取试样中的核酸时,用于控制核酸提取元件20的动作。该核酸精制用动作机构5具有多个插入销50、筒状体51和支承框架52。
多个插入销50用于嵌合于核酸提取元件20的筒状部24,可以一体运动地支承在支承框架52上。
筒状体51用于取出安装在插入销50上的核酸提取元件20,它从外面套着插入销50,与插入销50相互独立,可以在上下方向移动。即,筒状体51在进行从插入销50上取出核酸提取元件20的动作时以外,位于核酸提取元件20的上方(待机位置),另一方面,当进行从插入销50取出核酸提取元件20的动作时,可相对于插入销50向下方移动。
支承框体52在多个核酸精制用支架2的并列方向上隔开一定间隔支承多个插入销50,同时,起移动插入销50的媒体的作用。该支承框架52利用图外的驱动机构可在上下方向和前后方向移动,其动作由图2所示的控制部10控制。由于这样,多个插入销50和安装在其上的核酸提取元件20,可与支承框体52一起,在上下和前后方向移动。这样,多个核酸提取元件20可以总括地同时进行试样对固体基件23的含浸和固体基件23的洗净和剩余液的除去(参照图10)。
如图11和图13所示,盖安装拆卸机构6用于从核酸扩增用支架3的反应槽34取出盖31或将盖31安装在反应槽34上,具有旋转部件60和外套部件61。旋转部件60和外套部件61利用图外的驱动机构可以在上下方向和水平方向移动,由控制部10(参照图2)控制其动作。
旋转部件60用于将旋转力作用在核酸扩增用支架3的盖31上,同时,保持盖31,移动盖31,具有大致圆柱形的前端部62。在旋转部件60的前端部62形成多个助63。多个肋63在前端部62的周方向上,隔开一定间隔,在上下方向延伸,各个肋63的下端部作成越向下方,其宽度尺寸越小的锥形状。如图14所示,这些肋63用于与盖31的多个肋38C卡合,当将前端部62插入盖31的凹部38B中时,位于与凹部38B互相邻接的肋38C之间。
利用该结构,当使旋转部件60的前端部62旋转时,前端部61的肋63和凹部38的肋38C互相干涉,因此,前端部62可以抑制在盖31的凹部38B中的空旋转,可以适当地将旋转部件60的旋转力给与盖31。另外,凹部38B的多个肋38C的上端部作成越向上方向宽度越细的锥形状,另一方面,旋转部件60的前端部61的多个肋63作成越向下方向其宽度越细的锥形状。由于这样,可容易而可靠地将旋转部件60的前端部61插入盖31的凹部38B中。
外套部件61从外面套着旋转部件60,作成圆筒状,这种外套部件61具有用于与凸缘部39卡止的爪64。爪64的前端部64上设有钩子部65,钩子部65可以摇动。当将旋转部件60的前端部62插入盖31的凹部38B中时,爪64与盖31的凸缘部39卡止。这样,盖31与旋转部件60作成一体,通过移动旋转部件60和外套部件61,可以移动盖31。另外,当利用旋转部件60将盖31再安装在反应槽34上时,爪62自动解除与盖31的凸缘部39的卡止状态。
如图15所示,温度调节机构7通过控制热块70的温度,控制保持在核酸扩增用支架3的反应检测部37中的液体的温度。利用图外的温度传感器监视热块70的温度,根据温度传感器的监视结果,对热块70的温度进行反馈控制。在热块70上形成与核酸扩增用支架3的反应检测部37的外观形状对应的凹部71。这样,在热块7中,可以有选择而且有效地调节反应槽34的温度。在热块70中还作出与凹部71连接的直线形贯通孔72、73。贯通孔72将在后述的测光机构8的发光部80射出的光引导至反应槽34的反应检测部37上,贯通孔73将透过反应检测部37的光引导至受光部81。
测光机构8具有发光部80和受光部81。发光部80通过贯通孔72将激发光照射在反应检测部37上。受光部81,通过贯通孔73接收将激发光照射在反应检测部37上时的荧光。在测光机构8中,从发光部80连续地照射激发光,另一方面,在受光部81中,通过连续地监视荧光的量,可以实时地把握核酸的扩增程度。
其次,说明核酸分析装置1的动作。
在核酸分析装置1中进行核酸分析的情况下,首先如图1~图4所示,将核酸精制用支架2和核酸扩增用支架3安装在核酸分析装置1中。安装的支架2、3的个数,如果核酸精制用支架2的个数和核酸扩增用支架3的个数相同,则任何个数也可以。在以下的说明中,作为核酸精制用支架2,使用预先将洗净液保持在洗净槽281~283中的支架,在将核酸精制用支架2安装在核酸分析装置1中之前,将试样保持在试样保持槽29中。
其次,确认设在核酸分析装置1中的显示部12,并通过对操作部13进行操作,进行安装在核酸分析装置1中的支架2、3的个数和与支架2、3的种类(精制方法、扩增方法、测定方法)相应的设定。在上述设定结束的情况下,在核酸分析装置1中自动地进行核酸的精制、扩增和测定。
如图4所示,核酸的精制是在核酸精制用支架2中,通过利用核酸精制用动作机构5移动核酸提取元件20进行的。
更具体地说,首先在使核酸精制用动作机构5的插入销50位于核酸精制用支架2的容器21的收容槽27上方的状态下,驱动支承框架52,使插入销50向下运动后向上运动。通过使插入销50向下运动,插入销50嵌合在核酸提取元件20的筒状部24中,多个核酸提取元件20与核酸精制用动作机构5成为一体,通过使插入销50向上运动,核酸精制用动作机构5将核酸提取元件20升高。
其次,如图10所示,与支承框架52一起,移动插入销50,将核酸提取元件20的固体基件23浸渍在保持在核酸精制用支架2的试样保持槽29中的试样29L中,这样,在固体基件23中附载试样29L的核酸。
其次,依次将固体基件23浸渍在保持在三个洗净槽281~283中的洗净液28L1~28L3中。更具体地说,固体基件23的洗净通过利用核酸精制用动作机构5,在各洗净槽28中,使固体基件23反复上下运动来进行。这时,在核酸精制用动作机构5中进行控制,使得固体基件23完全浸渍在洗净液28L1~28L3的状态和固体基件23位于洗净液28L1~28L3的液面上方的状态反复。
利用这种洗净方法,当从固体基件23位于液面上方的状态向下方移动,浸渍在洗净液28L1~28L3中时,固体基件23敲击液面。这时,由于固体基件23水平或大致水平地被支承,故大的负荷作用在固体基件23上。另一方面,当固体基件23在洗净液28L1~28L3的内部移动时,由于固体基件23水平或大致水平地被支承,故大的移动阻力作用在固体基件23上,这作为产生对流的负荷作用在洗净液上。利用这些作用,可以高效率地从固体基件23除去夹杂物。这样,在以后进行的核酸扩增工序中,可有效地抑制夹杂物阻碍核酸扩增的情形,可以高精度地进行核酸的分析。这种效果不限于以水平状态移动固体基件23的情况,在以固体基件23相对于垂直轴为倾斜的状态进行移动的情况下,也可得到。
最后,使核酸提取元件20的前端部分与保持于剩余液除去槽21A中的吸水性部件21Ad、21Ae接触。由于吸水性部件21Ad与剩余液除去槽21A的底壁21Aa和前后壁21Ab、21Ac接触地来配置,故在使核酸提取元件20的前端部与这些全部吸水部件21Ad接触的情况下,从核酸提取元件20的前端部,主要是从固体基件23和保持部件22的保持部26高效率地除去剩余洗净液。结果,在以后利用核酸提取元件20进行扩增时,可以抑制洗净液中含有的杂质对核酸扩增的阻碍。
洗净结束后的固体基件23,在保持在核酸精制用动作机构5中的状态下,送风干燥也可以。在固体基件23的洗净结束(根据情况送风干燥结束)的情况下,从插入销50上取出核酸提取元件20,将核酸提取元件20再收容在核酸精制用支架2的收容槽27中。核酸提取元件20从插入销50的取出,如上所述,可通过使核酸精制用动作机构5的筒状体51向下运动,使筒状体51与卡止头24B干涉来进行。
这样,在核酸精制用支架2中,通过将核酸附载在固体(核酸提取元件20)上,可以容易地在核酸分析装置1中移动固体基件23。在这点上,核酸精制用支架2对自动进行核酸分析有帮助。
核酸的扩增是通过在核酸扩增用支架3中,调整混合试剂,将该试剂分注于核酸扩增用支架3的反应槽34中之后,与保持部件22一起,将附载核酸的固体基件23收容在反应槽34中来进行。在反应槽34中,混合试剂和固体基件23共存的情况下,根据所采用的扩增方法的种类,控制热块70(参照图15)的温度,调节反应槽34的温度。
混合试剂的调整是通过在将尖端件43安装在吸液管装置4的喷嘴40的前端部42上之后,依次按规定量将保持在核酸扩增用支架3的试剂类保持槽321~324中的试剂类注入每一个混合槽33中之后,利用吸液管装置4的吸液操作,将注入液混合来进行(参照图3)。
混合液向反应槽34的注入,是在利用盖安装拆卸机构6从反应槽34取出盖31之后,利用吸液管装置4进行的。如图11A和图11B所示,利用盖安装拆卸机构6取出盖31是在将盖安装拆卸机构6的旋转部件60的前端部62插入盖31的凹部38B中之后,使旋转部件60旋转,并向上运动来进行的。在将旋转部件60插入凹部38B的情况下,外套部件61的爪64的钩子部65与盖31的凸缘部39卡止。由于这样,从反应槽34取出的盖31可以与旋转部件60和外套部件61一起移动。这样,在核酸分析装置1和核酸扩增用支架3中,为了达到核酸的扩增进而核酸分析的全自动化,要下功夫,使得容易且可靠地从核酸扩增用支架3取出盖31。
另一方面,利用盖安装拆卸机构6和核酸扩增用支架3的盖31进行固体基件23在反应槽34中的收容。更具体地说,如图12和图13所示,固体基件23的收容可通过核酸提取元件20在盖31中的保持和盖31的再安装在反应槽34中的一系列操作来进行。
如图7B和图12所示,核酸提取元件20在盖31中的保持是通过利用盖安装拆卸机构6使盖31位于核酸精制用支架2的收容槽27的上方后,使盖31向下运动来进行的。在使盖31向下运动的过程中,盖31的销36B插入核酸提取元件20的筒状部24的凹部24A中。这样,可限制盖31和核酸提取元件20的筒状部24的位置关系,可适当地将盖31的一对卡止爪36A引导至与筒状部24的卡止头24B对应的位置。这样,一对卡止爪36A从上方压在卡止头24B上。结果,一对卡止爪36A移动,使它们的钩子部36Aa互相离开。进而,在使一对卡止爪36A向下方移动的情况下,盖31的销36B更深地插入筒状部24的凹部24A中,同时,当钩子部36Aa位于卡止头24B下方时,钩子部36Aa互相接近。结果,一对卡止爪36A与卡止头24B卡止,将核酸提取元件20保持在盖31上。这个状态,通过盖31的销36B插入筒状部24的凹部24A中而牢固地维持,可以抑制核酸提取元件20相对于盖31的松动。
如图13所示,盖31的再安装是在使盖31与反应槽34的位置一致的状态下,通过转动保持盖31的旋转部件60进行的。即,在位置一致的状态下,通过将旋转力加在盖31上,盖31与反应槽34的筒状部35螺合。在盖31与筒状部35螺合的情况下,外套部件61的爪64与盖31的凸缘部39卡止的状态被解除。这样,旋转部件60和外套部件61,可以与盖31相独立地移动。另一方面,由于核酸提取元件20保持在盖31中,故核酸提取元件20收容在反应槽34中。如上所述,由于在核酸提取元件20中,O形圈22A配置在保持部26稍为上方的位置,故在密闭空间中,核酸提取元件20的固体基件23固定在距反应槽34中的底部一定距离的位置上。由于先将混合试剂收容在反应检测部37中,因此,在反应检测部37中,固体基件23的全体被浸渍。这样,从固体基件23溶出核酸,另一方面,溶出的核酸与试剂类反应而扩增。
这样,在核酸分析装置1中,利用盖31的安装拆卸所需要的盖安装拆卸机构6,可以将收容槽27的核酸提取元件20移送至反应槽34中收容。即,在核酸分析装置1中不需要设置个别的机构用于移送核酸提取元件20。由于这样,当在一个装置中进行核酸的精制和核酸的扩增时,可以避免装置的复杂化,抑制装置的大型化,并且还可以抑制控制动作机构的数目的增加,因此在这点上也是有利的。
如图15所示,核酸的测定,在成为利用遮光构件9覆盖反应槽34的上方的状态后,利用测光机构8进行。
在测光机构8中,利用发光部80将激发光照射在反应槽34的反应检测部37上,另一方面,在受光部81中接收这时在反应检测部37上产生的荧光。如上所述,由于固体基件23安装在不阻碍测光机构8的测光的位置。因此,在核酸分析装置1中,可以高精度地进行核酸的测定。
如上所述,在核酸分析装置1中,只通过安装上述结构的核酸精制用支架2和核酸扩增用支架3的组,即可以自动进行核酸的分析。在核酸精制用支架2和核酸精制扩增用支架3中,也作了各种努力,使得可以自动地进行核酸的分析。由于这样,在利用核酸分析装置1、核酸精制用支架2和核酸扩增用支架3的情况下,在核酸的提取操作和核酸的扩增操作中,除了将支架2、3安装在核酸分析装置1中以外,没有依赖使用者手工操作的部分。由于这样,可以显著减轻核酸分析中使用者的负担。同时,不会因为使用者技术水平差异,核酸的回收率产生偏差等,测定再现性不会恶化。
本发明不限于上述实施方式中说明的例子。例如,核酸提取元件的固体基件,不必一定要保持成与保持部件的垂直轴水平或大致水平的状态,固体基件也不必一定要作成圆盘状形式,另外,将固体基件保持在保持部件上的结构也不限于使固体基件刺入的结构。而且,核酸扩增用支架的盖不必一定要作成完全与支架主体分离的结构,将附属于支架主体的反应槽的上部开口进行开闭的也可以。
其次,参照图16~图33说明本发明的第二实施方式。在以下参照的附图中,与先前所述的本发明的第一实施方式同样的部件用相同的符号表示,省略其重复说明。
图16~图18所示的核酸分析装置1’,与先前所述的核酸分析装置1(参照图1等)同样,安装并使用相同数目的多个核酸精制用支架2’和核酸扩增用支架3’。如图17所示,它具吸液管装置4’和核酸精制用动作机构5’。
如图19所示,核酸精制用支架2’用于进行核酸分析装置1’的核酸的自动精制,具有核酸提取元件20’和支架主体21’。
核酸提取元件20’用于附载试样中的核酸,如图20A~图20C清楚地所示,具有保持部件22’和固体基件23’。保持部件22’具有筒状部24’、凸缘部25’和夹持部26’,全体由树脂成形制成。
筒状部24’是移动核酸提取元件20’时所利用的部件(参照图18和图22),具有凹部24A’、凹陷部24B’、24C’和多个肋24D’。凹部24A’是用于嵌合后述的吸液管装置4’的喷嘴40’的前端部42’(参照图26A和图26B)或者核酸精制用机构5’的插入销50(参照图18)的部件,作成圆柱形。凹陷部24B’、24C’是用于将弹性给与筒状部24’,包含一对V字形的切口24B’和矩形贯通孔24C’。即,凹陷部24B’、24C’,当将喷嘴40’的前端部42’或插入销50’嵌合在凹部24A’中时(参照图18和图22),将弹性力作用在其上,有使嵌合可靠的作用。多个肋24D’是当将喷嘴40’的前端部42’或插入销50’嵌合在凹部24A’中时、将摩擦力作用在其上、可使嵌合可靠的部件,在筒状部24’的内面上,在上下方向延伸。
凸缘部25’作成向着半径方向的外侧突出的环状。该凸缘部25’是当将核酸提取元件20’保持在目的部位(核酸精制用支架2’的收容槽27和核酸扩增用支架3’的反应槽34’)上时、与设在目的部位的台阶部27A、36’卡止用的部件(参照图21和图33)。
夹持部26’是用于夹持固体基件23’的端部、使固体基件23’与保持部件22’成为一体的部件,它由一对爪26a’构成。为了提高核酸的回收效率,优选一对爪26a’与固体基件23’的接触面积作成极小。这是因为,如后所述,在核酸附着在固体基件23’上后,核酸被洗脱和回收,在一对爪26a’与固体基件23’接触的部分上存在的核酸洗脱不容易。
固体基件23’用于附载试样中的核酸,例如以在滤低上附载核酸提取用的试剂类的形式构成。固体基件23’作成长方形,通过将端部夹持在夹持部26’中,吊持在保持部件22’上。
如图19和图21所示,支架主体21’与先前所述的核酸精制用支架2的支架主体21(参照图5和图6)相同,具有收容槽27、三个洗净槽281~283和试样保持槽29,但剩余液除去槽21A(参照图5和图6)省略。当然,在支架主体21’上设置剩余液除去槽也可以。
如图23、图24A和图24B所示,核酸扩增用支架3’可进行核酸分析装置1’的核酸自动扩增和测定,具有支架主体30’和盖31’。
支架主体30’具有5个试剂类保持槽32’、混合槽33’和反应槽34’,这些槽32’、33’、34’由树脂成形作成一体。
各试剂类保持槽32’用于在水溶液或悬浊液状态下保持核酸扩增和测定所必要的试剂类。各试剂类保持槽32’的横剖面为大致矩形,但正确地说,为4个侧面32A’的中央部向内突出的形态。即,试剂类保持槽32’的四个角为90°以下的锐角。这样,可抑制试剂类附着在试剂类保持槽32’的侧面32A’上的状态,可将试剂类保持在试剂类保持槽32’的底部。结果,可以有效地利用保持在试剂类保持槽32’中的试剂类,即使在使用高价的试剂的情况下,也使保持于试剂类保持槽32’中的试剂的量少,可以降低制造成本。这个结果也可通过在试剂类保持槽32’的侧面32A’上作出槽或肋得到。
保持在各试剂类保持槽32’中的试剂类的种类,根据所采用的扩增方法和测定方法来选择。作为扩增方法,可以采用PCR法、ICAN法、LAMP法或NASBA法。
混合槽33’是,在供给反应槽34’之前,混合保持在试剂类保持槽32’中的二种以上的试剂类,调整混合试剂类时所利用的部件。该混合槽33’也与先前所述的试剂类保持槽32’同样,四个角的角度作成90°以下的锐角。当然,在混合槽33’的侧面33A’作出槽或肋也可以。
反应槽34’用于收容混合试剂和核酸提取元件20’,同时,可提供使在核酸提取元件20’中附载的核酸与在混合槽33’中调整的混合试剂进行反应的场所(参照图33)。该反应槽34’具有筒状部35和反应检测部37,在它们之间设有台阶部36’。该台阶部36’是用于与核酸提取元件20’的凸缘部25’卡止的部分(参照图33),通过将反应检测部37的直径设定得比筒状部35的直径小而设置。
盖31’用于选择是否密闭反应检测部37的内部,可在反应槽34’(筒状部35)上自由安装和拆卸。更具体地说,通过使旋转力作用,盖31’可以选择安装在筒状部35上的状态和与筒状部35(反应槽34)完全分离的状态。盖31’与先前所述的核酸扩增用支架3的盖31(参照图9)同样,具有圆筒状的主体部38和凸缘部39。但在核酸分析装置1’中,由于利用吸液管装置4’的喷嘴40’移动核酸提取元件20’,故在盖31’中省略了设在先前所述的核酸扩增用支架3的盖31上的保持部36(参照图7B和图9)。
图16和图17所示的吸液管装置4’,用于进行在核酸扩增用支架3’中的混合液调整和向混合液的反应槽34’的移动。如图25~图28所示,吸液管装置4’具有喷嘴40’和取出部件41’。
喷嘴40’可吸引和排出液体,同时,可在上下方向和水平方向移动,可以在核酸扩增用支架3’的试剂类保持槽32’、混合槽33’、反应槽34’和核酸精制用支架2’的收容槽27中移动(参照图16和图17)。在混合试样的调整和向反应槽34’(反应检测部37)注入混合试样的情况下,如图25A和图25B所示,在喷嘴40’的前端部42’上安装尖端件43。在喷嘴40’的前端部42’的安装尖端件43的部分上嵌入O形圈42a’。当将尖端件43安装在前端部42’上时,可以提高前端部42’和尖端件43的接触部分的紧贴性。
而且,吸液管装置4’具有如图示22所示从核酸精制用支架2’的收容槽27取出核酸提取元件20’、以及如图31所示将该核酸提取元件20’移动至核酸扩增用支架3’的反应槽34’中的作用。如图26A和图26B所示,在进行这种动作的情况下,在喷嘴40’的前端部42’上安装核酸提取元件20’。
如图27和图28所示,取出部件41’用于取出安装在喷嘴40’的前端部42’上的尖端件43或核酸提取元件20’。该取出部件41’从外面套着喷嘴40’,使得可以与喷嘴40’独立地在上下方向移动。即,当进行从喷嘴40’的前端部42’取出尖端件43或核酸提取元件20’的动作时以外,取出部件41’位于尖端件43的端面43a或核酸提取元件20’的凸缘25’的上方(待机位置),另一方面,当进行将它们取出的动作时,可相对于喷嘴40’向下方移动。在从待机位置向下方移动取出部件41’一定距离以上的情况下,取出部件41’的端面41A’与尖端件43的端面43a或核酸提取元件20’的凸缘部25’干涉,将向下方的力作用在尖端件43或核酸提取元件20’上。这样,从喷嘴40’的前端部42’取出尖端件43或核酸提取元件20’。
如图16~图18所示,核酸精制用动作机构5’用于在利用核酸提取元件20’提取试样中的核酸时控制核酸提取元件20’的动作。该核酸精制用动作机构5’与先前所述的核酸分析装置1的核酸精制用动作机构5(参照图2~图4)同样,具有多个插入销50’、筒状体51和支承框架52。各插入销50’作成与喷嘴40’的前端部42’类似的形状,使得可以适当地与核酸提取元件20’的筒状部24’嵌合。
其次,说明核酸分析装置1’的动作。
如图16~图18所示,在核酸分析装置1’中,在将核酸精制用支架2’和核酸扩增用支架3’安装在核酸分析装置1’上之后,通过进行与支架2’、3’的个数和种类(精制方法、扩增方法、测定方法)相对应的设定,自动地进行核酸的精制、扩增和测定。
如图18所示,核酸的精制,通过在核酸精制用支架2’中,由核酸精制用动作机构5’移动核酸提取元件20’来进行。更具体地说,首先,将核酸精制用动作机构5’的多个插入销50’与所对应的核酸提取元件20’的筒状部24’嵌合,成为可以一体化地移动多个核酸提取元件20’的状态。在这个状态下,利用核酸精制用动作机构5’将多个核酸提取元件20’的固体基件23’浸渍在试样中,使试样中的核酸附着在各固体基件23’上。
最后,依次将固体基件23’浸渍在三个洗净槽281~283(参照图19)的洗净液中。更具体地说,固体基件23’的洗净是通过利用核酸精制用动作机构5’,在各洗净槽281~283(参照图19)中,使固体基件23’反复上下运动来进行的。这时,控制核酸精制用动作机构5’,使固体基件23’完全浸渍在洗净液中的状态和固体基件23’位于洗净液的液面上方的状态反复。利用这种洗净方法,由于可从固体基件23’高效率地除去夹杂物,所以在以后进行的核酸扩增工序中,可以有效地抑制夹杂物对核酸扩增的阻碍,可以高精度地进行核酸的分析。
洗净结束后的固体基件23’在保持核酸精制用动作机构5’中的状态下送风干燥也可以。在固体基件23’的洗净结束(根据情况,送风干燥结束)的情况下,从插入销50’取出核酸提取元件20’,将核酸提取元件20’再收容在核酸精制用支架2’的收容槽27中(参照图19和图21)。
在核酸精制用支架2’中,通过将目的核酸附载在固体(核酸提取元件20’)上,可以容易地在核酸分析装置1’中移动目的核酸。在这点上,核酸精制用支架2’对自动地进行核酸分析有帮助。
核酸的扩增,通过在核酸扩增用支架3’中调制混合试剂,将该试剂注入核酸扩增用支架3’的反应槽34’中之后,与保持部件22’一起,将附载核酸的固体基件23’移送至反应槽34’中来进行。又如图33所示,在反应槽34’中,在混合试剂和固体基件23’共存的情况下,根据所采用的扩增方法的种类,控制热块70的温度,可以调节反应槽34’的温度。
混合试剂的调制和混合试剂在反应槽34’中的注入,与先前所述的核酸分析装置1(参照图1等)同样,通过控制吸液管装置4’的动作来进行。在将混合试剂注入反应槽34’中的情况下,如图31所示,需要利用盖安装拆卸机构6,从反应槽34’取出盖31’,但盖31’的取出,如图29和图30所示,在将盖安装拆卸机构6的旋转部件60插入盖31’的凹部38B’中之后,通过转动旋转部件60,并使它向上运动来进行。在将旋转部件60插入凹部38B’中的情况下,旋转部件60的爪62与盖31’的凸缘部39’卡止,因此,从反应槽34’取出的盖31’可以与旋转部件60一起移动。这样,在核酸分析装置1’和核酸扩增用支架3’中,为了达到核酸的扩增进而核酸分析的全自动化,要下功夫,使得容易且可靠地从核酸扩增用支架3’上取出盖31’。
另一方面,固体基件23’向反应槽34’的移送,可通过核酸提取元件20’从核酸精制用支架2’的收容槽27中的取出(参照图22)、核酸提取元件20’向核酸扩增用支架3’的反应槽34’中的移动和核酸提取元件20’从喷嘴40’中的取出(参照图28和图31)的一系列操作来进行。
如图22所示,核酸提取元件20’的取出,可通过在使喷嘴40’位于核酸精制用支架2’的收容槽27的上方后,使喷嘴40’向下运动,使喷嘴40’的前端部42’与核酸提取元件20’的筒状部24’嵌合后,使喷嘴40’向上运动来进行。在筒状部24’中作出V字形切口24B’和矩形贯通孔24C’这样的凹陷部24B’、24C’(参照图20A~图20C)。由于这样,在使喷嘴40’的前端部42’与筒状部24’嵌合的情况下,可将适当的弹性力施加在前端部42’上。这样,在筒状部24’中,核酸提取元件20’适当地保持在喷嘴40’的前端部42’上。
核酸提取元件20’的移动是在将核酸提取元件20’保持在喷嘴40’的前端部42’上的状态下,通过移动喷嘴40’来进行的。
如图28和图31所示,核酸提取元件20’的取出是通过使喷嘴40’的前端部42’,与核酸提取元件20’一起,位于反应槽34’的内部,使取出部件41’相对于喷嘴40’向下方移动来进行。即,在使取出部件41’向下方移动的情况下,取出部件41’与核酸提取元件20’的凸缘部25’干涉,将向下方的力作用在凸缘部25’进而核酸提取元件20’上,可从喷嘴40’的前端部42’取出核酸提取元件20’。
这样,在核酸分析装置1’中,可利用试样调整所需要的喷嘴40’和取出部件41’进行核酸提取元件20’的移动。由于这样,当在1个装置中进行核酸的精制和核酸的扩增时,由于利用本来必要的结构(吸液管装置4)可抑制装置的复杂化。另外,由于可以抑制应控制的动作机构数目的增加,故在这点上,对抑制装置结构复杂化和大型化有利。
如图31所示,在保持部件22’的凸缘部25’,从喷嘴40’的前端部42’取出的核酸提取元件20’与反应槽34’的台阶部36’卡止。这时,固体基件23’在其下端与反应检测部37的底部离开一定距离的状态下,收容在反应检测部37中。由于混合试剂先收容在反应检测部37中,故在反应检测部37中,固体基件23’的全体被浸渍,这样,从固体基件23’溶出核酸,另一方面,所溶出的核酸与试剂类反应而扩增。
如上所述,固体基件23’的下端成为与反应检测部37的底部离开的状态。更具体地说,固体基件23’的下端位置是不阻碍测光机构8对反应检测部37的激发光照射和荧光测定的位置(参照图33)。这样,在附着核酸方面使用固体载体的情况下,在核酸的测定中,该固体载体不会阻碍测定。
核酸的测定,如图32和图33所示,成为再安装反应槽34’的盖31’的状态,另一方面,在用遮光部件9覆盖反应槽34’上方的状态之后利用测光机构8进行。利用测光机构8进行的核酸测定,与先前所述的核酸分析装置1(参照图1等)同样地进行。
如上所述,在核酸分析装置1’中,与先前所述的核酸分析装置1(参照图1等)同样,只通过安装上述结构的核酸精制用支架2’和核酸扩增用支架3’,就可以自动地进行核酸的分析,在核酸的提取操作和核酸的扩增操作中,除了将支架2’、3’安装在核酸分析装置1中以外,没有依赖使用者手工操作的部分。由于这样,可以显著地减轻核酸分析中的使用者的负担,同时,不会产生因使用者技术水平差异造成的核酸回收率偏差等,不会使测量定再现性恶化。
[实施例]
以下,利用上述的本发明第一实施方式的核酸精制用支架、核酸扩增用支架和核酸分析装置,通过SNP(单核苷酸多态性,SingleNucleotide Polymorphism)分类,研究是否可以适当地精制和扩增作为目的核酸的人基因组DNA。
实施例1
(核酸精制用支架的形成)
核酸精制用支架的形成如下这样进行,在利用下面说明的方法形成支架主体(参照图中的符号21)和核酸提取元件(参照图中的符号20)之后,将核酸提取元件收容在支架主体的收容槽(参照图中的符号27)中,而且通过将作为吸水性部件(参照图中的符号21Ad、21Ae)的发泡树脂(INOAC CORPORATION公司制,发泡聚氨脂SAQ)固定在剩余液除去槽(参照图中的符号21A)中。吸水性部件21Ad的尺寸为5mm×8mm×17mm,吸水性部件21Ae的尺寸为5mm×11mm×14mm。
支架主体通过使用PET的树脂成形形成图5和图6所示的形态。
另一方面,核酸提取元件通过将固体基件(参照图中的符号23)保持在保持部件(参照图中的符号22)上形成。固体基件通过利用冲头将FTA Classic Card(Whatman社,Cat.No WB120205)冲切成Φ2.5mm的圆盘状来形成。FTA Classic Card是以纤维素为主成分的核酸收集用滤纸。另一方面,通过使用PET的树脂成形,将保持部件作成图7A和图7B所示的形态。在树脂成形后的保持部件中,不形成卡止片(参照图中的符号26C),在固体基件的中心开孔,插入保持部件的销状部(参照图中的符号26B)中之后,通过热处理销状部的前端部,形成卡止片。如上所述,卡止片用于防止固体基件从销状部中脱落。
(核酸扩增用支架的形成)
核酸精制用支架如下这样来形成,即,通过使用PET的树脂成形,将支架主体(参照图中的符号30)和盖(参照图中的符号31)作成图8和图9所示的形态后,通过使盖与支架主体的反应槽(参照图中的符号34)螺合而形成。
(核酸的精制)
核酸的精制是在将试样(参照图中的符号29L)注入核酸精制用支架主体的试样保持槽(参照图中符号29)中,将洗净液(参照图中的符号28L1~28L3)分别注入三个洗净槽(参照图中的符号281~283)中之后,将核酸精制用支架安装在核酸分析装置(参照图中的符号1)中,在核酸分析装置中自动地进行。
作为试样,使用全血(抗凝固剂:含有肝素Na),其注入量为120μL。作为洗净液28L1,使用下述表1所示的洗净液I(800μL),作为洗净液28L2,使用下述表1所示的洗净液I(600μL),作为洗净液28L3,使用下述表1所示的洗净液II(600μL)。
表1
组成 | PH | ||
洗净液I | 10mM Tris-HCl | 1mM EDTA | 8.0 |
洗净液II | 10mM Tris-HCl | 0.1mM EDTA | 8.0 |
另一方面,在核酸分析装置中,驱动核酸精制用动作机构(参照图中的符号5),使核酸提取元件(固体基件)进行以下所述的动作。
首先,成为将核酸动作机构的插入销(参照图中的符号50)嵌合在保持部件的筒状部(参照图中的符号24)中的状态,将固体基件浸渍在试样保持槽中的全血中。其次,利用三个洗净槽281~283洗净固体基件。固体基件的洗净按洗净槽281→洗净槽282→洗净槽283的顺序依次改变所使用的洗净槽28L1~28L3。利用洗净槽281的固体基件的洗净,通过以固体基件23的全体位于洗净液28L1的液面上方的状态和完全浸渍在28L1中的位置之间的20Hz,上下运动1分钟来进行。另一方面,在利用洗净槽282、283的固体基件的洗净中,除了上下运动的时间为2分钟以外,与利用洗净槽281的情况相同。
接着,除去有可能阻碍以后所进行的核酸扩增反应的剩余成分。剩余成分的除去,通过将固体基件和保持部件的前端部分(卡止片、销状部、锥部(参照图中的符号26)压在吸水性部件(参照图中的符号21Ad、26Ae)上来进行。
(核酸扩增的确认)
核酸的扩增,通过使用下述表2的试剂混合液A、B的PCR法进行,核酸扩增的程度,利用作为将药剂代谢酶进行编码的碱基序列的CYP2C19*2*3的SNP(单核苷酸多态性,Single NucleotidePolymorphism)分类来确认。
表2
试剂混合液A | 40μL |
灭菌蒸馏水 | 35.6μL |
10×Gene Taq通用缓冲剂(没有Mg)(NIPPON GENE CO.,LTD制) | 4μL |
5单位/μL Gene Taq FP | 0.4μL |
试剂混合液B | 40μL |
灭菌蒸馏水 | 5.6μL |
10×Gene Taq通用缓冲剂(没有Mg)(NIPPON GENE CO.,LTD制) | 4μL |
40%甘油液 | 20μL |
100mM MgCl2液(NIPPON GENE CO.,LTD制) | 1.2μL |
2.5mM dNTP混合物(NIPPON GENE CO.,LTD制) | 6.4μL |
100μM CYP2C19*2 F-引物(序列号1) | 0.4μL |
100μM CYP2C19*2 R-引物(序列号2) | 0.2μL |
100μM CYP2C19*3 F-引物(序列号3) | 0.2μL |
100μM CYP2C19*3 R-引物(序列号4) | 0.4μL |
5μM CYP2C19*2探针(序列号5) | 0.8μL |
5μM CYP2C19*3探针(序列号6) | 0.8μL |
序列号1:gttttctcttagatatgcaataattttccca
序列号2:cgagggttgttgatgtccatc
序列号3:gaaaaattgaatgaaaacatcaggattgta
序列号4:gtacttcagggcttggtcaata
序列号5:ttatgggttcccgggaaataatc-(BODIPY-FL)
序列号6:gcaccccctggatcc-(TAMRA)
更具体地说,核酸扩增的确认是在个别地将试剂混合液A或试剂混合液B注入核酸扩增用支架主体的试剂类保持槽(参照图中的符号321、322)后,将核酸扩增用支架安装在核酸分析装置(参照图中的符号1)中,在核酸分析装置中自动地进行。
在核酸分析装置中,驱动吸液管装置(参照图中的符号4)、盖安装拆卸机构(参照图中的符号6)和温度调节机构(图中的符号7),使核酸提取元件(固体基件)进行下述的动作。
首先,在将尖端件(图中的符号43)安装在吸液管装置的喷嘴(图中的符号40)上之后,从试剂类保持槽33A采取30μL的试剂混合液A,从试剂类保持槽33B采取30μm的试剂混合液B,分别注入混合槽(参照图中的符号33)中。其次,利用喷嘴的吸排活动,进行试剂混合液A、B的搅拌和混合,调制反应液之后,利用喷嘴采取50μL的反应液,将它注入反应槽(参照图中的符号34)中。
另一方面,在利用盖安装拆卸机构的旋转部件(参照图中的符号60),从核酸扩增用支架上取出盖(参照图中的31)之后,移动盖,使盖的卡止爪(参照图的符号36A)与核酸提取元件的卡止头(参照图中的符号24B)卡合,使它们成为一体。
接着,利用盖安装拆卸机构,与盖一起将核酸提取元件20收容在核酸扩增支架的反应槽(参照图中的符号34)中,并利用旋转部件的旋转,用盖关闭反应槽。这样,固体基件在完全浸渍在反应液中的状态下,密闭保持在反应槽(图中34)中。
接着,驱动温度调节机构的热块(参照图中的符号70),改变反应槽中的反应液温度,进行目的核酸的扩增。温度变化为在95℃下120秒→将(95℃下4秒+54℃下60秒)进行50次循环→95℃下60秒→45℃下90秒。
在SNP分类中,采用Tm解析。当进行Tm解析时,以1℃/3秒的比例,使核酸扩增的反应液温度从45℃上升至95℃,实时地测定这时的荧光强度。测定波长为515~555nm(*2)、585~750nm(*3)二种,分别在测定波长((*2)、(*3))中进行SNP分类。在各自波长下测定荧光强度的结果表示在以横轴为温度、以纵轴为荧光强度的微分值(变化率)的图34中。
从图34可看出,在测定波长*2和*3任何一种情况下,在所测定的荧光强度的微分值(变化率)的变化曲线中,出现二个峰。这些峰与SNP类型的野生型和突变型对应,在可区别它们程度上,可以确认很好地扩增目的核酸。
实施例2
在本实施例中,与实施例1同样,在进行核酸的精制后,采用ICAN法作为扩增法,进行SNP分类。作为扩增试剂,使用TaKaRa公司制Cycleave ICAN human ALDH2分类试剂盒(目录号CY101)。应保持在支架主体的试剂类保持槽(参照图中的符号321、322)中的试剂混合液A、B的组成如表3所示。这些试剂混合液A、B的注入量、混合条件和反应液的注入量与实施例1的情况相同。
表3
试剂混合液A | 40μL |
灭菌蒸馏水 | 15.2μL |
2×ICAN反应缓冲剂 | 20μL |
RNaSe H | 1.6μL |
BcaBEST DNA聚合酶 | 3.2μL |
试剂混合液B | 40μL |
灭菌蒸馏水 | 13.6μL |
2×ICNA反应缓冲剂 | 20μL |
ALDH2 ICAN引物混合物 | 3.2μL |
ALDH2探针混合物 | 3.2μL |
(反应条件)
反应是在将固体基件浸渍在反应液中状态下,在70℃下培育300秒后,在60℃下进行1小时。这1小时的反应是由不进行荧光强度测定的第一阶段的30秒和进行荧光强度测定的第二阶段的30秒作为1个循环的60次循环构成,在各循环的第二阶段实时地测定荧光强度。测定波长取515~555nm(mt)、585~750nm(wt)二种,分别在SNP类型的突变型和野生型中进行SNP分类。在各自波长下测定荧光强度的结果表示在以横轴为循环数、以纵轴为荧光强度的图35中。
从图35可看出,在经过一定的循环数后,与SNP类型突变型对应的荧光强度增加,而与SNP类型野生型对应的荧光强度,即使增加循环数,荧光强度也几乎不增加。因此,从图35所示结果可知,在可区别SNP类型野生型和突变型的程度上可确认有选择且充分地扩增目的核酸(SNP类型野生型)。
实施例3
在本实施例中,与实施例1同样,进行核酸的精制后,采用LAMP法作为扩增法,进行SNP分类。作为扩增试剂,使用荣研化学公司制Loopamp P450分类试剂盒(CYP2C9*3),保持在支架主体的试剂类保持槽(参照图中的符号33A、33B)中的试剂混合液A、B的组成如表3所示。试剂混合液A、B的注入量、混合条件和反应液的注入量与实施例1的情况相同。
表4
试剂混合液A | 40μL |
灭菌蒸馏水 | 9.6μL |
反应混合物SNP | 16μL |
基因组荧光测定试剂 | 3.2μL |
10mM Tris溶液PH8.0 | 8μL |
Bst DNA聚合酶 | 3.2μL |
试剂混合液B | 40μL |
灭菌蒸馏水 | 11.2μL |
反应混合物SNP | 16μL |
2C9*3(C)的引物混合物或2C9*3(A)的引物混合物 | 12.8μL |
(反应条件)
反应是在将固体基件浸渍在反应液中的状态下,在95℃下处理5分钟后,在60℃下进行1小时的反应。这一小时的反应是以不进行荧光强度测定的第一阶段30秒和进行荧光强度测定的第二阶段30秒为1个循环的60个循环构成,在各循环的第二阶段、在测定波长为515~555nm下实时地测定荧光强度。在各循环的第二阶段中测定荧光强度的结果表示在以横轴为循环数、纵轴为荧光强度的图36中。
从图36可看出,在经过一定的循环数后,与SNP类型突变型对应的荧光强度(图中的A等位基因)增加,而与SNP类型野生型对应的荧光强度(图中的G等位基因),即使增加循环数,荧光强度也几乎不增加。因此,从图36所示结果可知,在可区别SNP类型野生型和突变型的程度上可确认有选择且很好地扩增目的核酸(SNP类型野生型)。
从实施例1~3的结果可看出,在利用本发明第一实例方式中所述的核酸提取元件进行核酸精制的情况下,不限于PCR法,即使在采用ICAN法或LAMP法作为扩增方法的情况下,也可以适当地扩增目的的核酸。如上所述,在目的核酸的精制度不高的情况下,ICAN法和LAMP法不能引起充分的扩增反应。因此,本发明第一实施方式中所述的精制方法,可以适当地精制目的核酸。因此,上述的精制方法不仅是PCR法,作为其以外的扩增方法的前处理,也可适当地使用,并且对缩短扩增时间有帮助。
另外,在实施例1~3中已经证实,通过使用本发明的第一实施方式中所述的核酸精制用支架、核酸提取用支架和核酸分析装置,可自动地进行核酸分析。在这种情况下,作为核酸扩增方法,不限于PCR法,可以采用以PCR法为代表的众所周知的各种扩增方法,这也已被证实。
在实施例1~3中,研究了基于本发明第一实施方式中所述的例子而适当地扩增核酸的情况,在采用本发明第二实施方式中所述的结构的情况下,也可以适当地扩增核酸,能够得到上述的效果。
Claims (31)
1.一种核酸提取用容器,其特征在于,它包括:
用于从试样中提取目的核酸且附载所提取的核酸的核酸提取元件;和
与所述核酸提取元件分开另外形成且具有用于收容所述核酸提取元件的收容槽的容器主体。
2.如权利要求1所述的核酸提取用容器,其特征在于:
所述核酸提取元件包括:用于附载目的核酸的固体基件;和用于保持该固体基件的保持部件。
3.如权利要求2所述的核酸提取用容器,其特征在于:所述固体基件以相对于所述保持部件的垂直轴为倾斜的状态被保持。
4.如权利要求3所述的核酸提取用容器,其特征在于:所述固体基件相对于所述垂直轴为水平或大致水平地被支承。
5.如权利要求3所述的核酸提取用容器,其特征在于:
所述固体基件以刺入所述保持部件的状态被支承在所述保持部件上。
6.如权利要求5所述的核酸提取用容器,其特征在于:
所述保持部件包括:越向端部直径越缩小的锥部;从所述锥部延伸并且用于贯通所述固体基件的销状部;和用于抑制所述固体基件从所述销状部脱离的卡止片。
7.如权利要求3所述的核酸提取用容器,其特征在于:所述固体基件作成圆盘状。
8.如权利要求2所述的核酸提取用容器,其特征在于:所述固体基件作成片状,并且在所述保持部件上以吊持的状态被保持。
9.如权利要求8所述的核酸提取用容器,其特征在于:
所述保持部件具有用于夹持所述固体基件的端部并且吊持所述固体基件的夹持部。
10.如权利要求2所述的核酸提取用容器,其特征在于:
所述容器主体具有1个以上的用于保持洗净液的洗净槽,该洗净液用于除去附着在所述固体基件上的剩余成分。
11.如权利要求10所述的核酸提取用容器,其特征在于:
在所述容器主体上设置有剩余洗净液除去装置,该剩余洗净液除去装置用于除去附着在所述固体基件或其周围的剩余洗净液。
12.如权利要求11所述的核酸提取用容器,其特征在于:所述剩余洗净液除去装置包括吸水性部件。
13.如权利要求1所述的核酸提取用容器,其特征在于:它作为安装在核酸分析装置中使用的支架构成。
14.如权利要求13所述的核酸提取用容器,其特征在于:
在所述核酸分析装置具有用于从所述收容槽取出附载目的核酸的核酸提取元件、将该核酸提取元件移送至其它部位的移送部件的情况下,所述核酸提取元件具有用于与所述移送部件卡合的卡合部。
15.如权利要求14所述的核酸提取用容器,其特征在于:所述卡合部作成用于嵌合所述移送部件的前端部的筒状。
16.如权利要求15所述的核酸提取用容器,其特征在于:
所述卡合部具有1个以上的凹陷部,该凹陷部用于当嵌合所述移送部件的前端部时,使弹性力能够作用在所述移送部件上。
17.如权利要求16所述的核酸提取用容器,其特征在于:所述1个以上的凹陷部包括槽、切口和贯通孔中的至少一个。
18.如权利要求14所述的核酸提取用容器,其特征在于:
所述保持部件具有用于解除所述移送部件和所述卡合部的嵌合状态的突出部。
19.如权利要求18所述的核酸提取用容器,其特征在于:所述突出部是向外侧突出的凸缘。
20.如权利要求18所述的核酸提取用容器,其特征在于:
所述收容槽具有当将所述核酸提取元件收容在该收容槽中时、与所述突出部卡止的台阶部。
21.一种固体基件的洗净方法,它是使用洗净液从附载有目的核酸的固体基件上除去目的核酸以外的剩余成分的方法,
通过使所述固体基件相对于洗净液沿上下方向进行相对移动,使所述固体基件浸渍在所述洗净液中的状态和所述固体基件不浸渍在所述洗净液中的状态反复。
22.如权利要求21所述的固体基件的洗净方法,其特征在于:
所述固体基件浸渍在洗净液中的状态和不浸渍的状态的反复,在使所述固体基件相对于上下方向为倾斜的状态下进行。
23.如权利要求22所述的固体基件的洗净方法,其特征在于:
所述固体基件浸渍在洗净液中的状态和不浸渍的状态的反复,在使所述固体基件相对于上下方向为水平或大致水平的状态下进行。
24.如权利要求21所述的固体基件的洗净方法,其特征在于:
在所述洗净液中的浸渍结束后,利用吸水性部件除去附着在所述固体基件上的剩余洗净液。
25.一种核酸精制方法,它是使用具有用于附载目的核酸的固体基件和用于保持该固体基件的保持部件的核酸提取元件,精制目的核酸的方法,
它包括:将试样含浸在所述在固体基件中、在所述固体基件中附载试样中的目的核酸的核酸附载步骤;和
使用洗净液除去附着在所述固体基件上的目的核酸以外的剩余成分的洗净步骤;并且
所述洗净步骤,通过使所述核酸提取元件相对于洗净液沿上下方向相对地移动,使所述核酸提取元件浸渍在所述洗净液中的状态和所述核酸提取元件不浸渍在所述洗净液中的状态反复来进行。
26.如权利要求25所述的核酸精制方法,其特征在于:
作为所述核酸提取元件,使用以相对于所述保持部件的垂直轴为倾斜的状态将所述固体基件保持在所述保持部件上的元件,并且
所述洗净步骤,在使所述固体基件相对于上下方向为倾斜的状态下,通过使所述提取元件沿上下方向移动来进行。
27.如权利要求26所述的核酸精制方法,其特征在于:
所述洗净步骤,以使所述固体基件相对于上下方向为垂直或大致垂直的姿势,通过使所述核酸提取元件沿上下方向移动来进行。
28.如权利要求25所述核酸精制方法,其特征在于:
所述洗净步骤包括:在所述固体基件相对于所述洗净液的反复浸渍结束后,利用吸水性部件除去附着在所述固体基件上的剩余洗净液的作业。
29.一种固体基件的洗净机构,用于使用洗净液从附载有目的核酸的固体基件中除去目的核酸以外的剩余成分,
使固体基件相对于洗净液沿上下方向相对地移动,使得所述固体基件浸渍在所述洗净液中的状态和所述固体基件不浸渍在所述洗净液中的状态反复。
30.如权利要求29所述的固体基件的洗净机构,其特征在于:
在使所述固体基件相对于上下方向为倾斜的状态下,使所述固体基件沿上下方向进行移动。
31.如权利要求30所述的固体基件的洗净机构,其特征在于:
以使所述固体基件相对于上下方向为垂直或大致垂直的姿势,使所述固体基件沿上下方向进行移动。
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