CN1304448A - 人树突状细胞表达基因群 - Google Patents

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CN1304448A
CN1304448A CN00800747A CN00800747A CN1304448A CN 1304448 A CN1304448 A CN 1304448A CN 00800747 A CN00800747 A CN 00800747A CN 00800747 A CN00800747 A CN 00800747A CN 1304448 A CN1304448 A CN 1304448A
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桥本真一
松岛纲治
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Abstract

本申请发明是有关来自人单核细胞的树突状细胞表达基因群的发明。更详细地讲,本申请发明涉及到由人树突状细胞中表达频率高的100个基因组成的基因集合体,与人单核细胞相比在人树突状细胞中表达频率高和低的各100个基因组成的基因集合体,这些基因群的相应的cDNA群,这些cDNA连接在最靠近聚A的碱基序列5’一CATG－3’上,分别具有1—100碱基序列,这些基因群中包含的新的基因(群),以及特定这些基因和cDNA的寡核苷酸的集合体。

Description

人树突状细胞表达基因群
技术领域
本申请的发明是有关在来自人单核细胞的树突状细胞中表达的基因群的发明。更详细地讲，本申请发明涉及到由在人树突状细胞中高度表达的100个基因组成的基因集合体，与人单核细胞相比在人树突状细胞中表达频率高和低的各100个基因组成的基因集合体，这些基因群的相应的cDNA群、这些基因群中包含的新基因(群)，以及用于特别确定这些基因和cDNA的寡核苷酸的集合体。
背景技术
树突状细胞群(dendritic cells:DCs)在诸如为CD4+原初的T细胞呈递抗原等免疫系统中起着及其重要的作用。也有报道说DCs与B细胞产生免疫球蛋白以及T细胞耐受性有直接的关系。淋巴细胞以及非淋巴组织的DCs由于它们表面的标记和功能各不相同，因此有不同的称呼(例如，来自皮肤的称为朗氏细胞；来自淋巴节的称为交错树突细胞(interdigitating DC)；来自心脏、肺、肾和睾丸的称为间质DC；来自胸腺的称为胸腺DC等)。
人们一直认为DCs是属于与单核细胞或巨噬细胞不同的另外系统，但据报道巨噬细胞和DCs是来自共同的干细胞。而据报道人DCs是在粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF)或肿瘤坏死因子(TNF)-α的存在下由脐带血和骨髓分离出的CD34+前体细胞生成的。另外也有报道说，与GM-CSF和白介素(IL)-4共同培养的血液单核细胞转变和分化为具有DCs形态、功能特征的非附着性的CD1a+CD14low/o。另外也已经了解到DCs由于TNF-α、CD40配体、LPS或单核细胞条件培养基的刺激向表达CD38的成熟DCs转变。
然而，虽然知道DCs是从单核细胞分化的细胞，但现状是其分化的过程还没有完全阐明。
阐明由单核细胞向DCs分化的过程不仅是为了理解免疫系统的功能，而且对于与树突状细胞有关的各种疾病的诊断和治疗的新的手段的开发也非常重要。为了阐明由单核细胞向DCs的分化过程，指认在各个细胞中表达频率高或低的基因群是一种有效的手段。
本申请发明是借鉴以上那样的报道而形成的发明，以提供由在人树突状细胞表达的基因中表达最多的前100个基因组成的基因群作为课题。
另外提供由该基因群的各个cDNA组成的cDNA群、基因群中包含的新的基因(群)以及用于特定基因群和cDNA群的寡核苷酸群也是本申请的课题。
另外提供与单核细胞相比，由在来自单核细胞的人树突状细胞中表达频率更高的前100个基因和表达频率较低的前100个基因分别组成的基因群也是本申请的课题，而提供有关这些基因群的各个cDNA群、新的基因群和寡核苷酸群也是本申请的课题。
发明的公开
本申请作为解决上述课题的发明，提供在人树突状细胞中表达的基因群，其特征是该基因群由在来自人单核细胞的树突状细胞的基因中表达最多的前100个基因组成的，各个基因的cDNA连接在最靠近聚A区的碱基序列5’-CATG-3’上、分别具有序列1-100的碱基序列；提供由该基因群的各个cDNA组成的cDNA群；该基因群中包含的新基因，以及各该新的基因编码的新的蛋白质、抗体和拮抗剂，以及提供连接在碱基序列5’-CATG-3’上，由序列1-100的各个碱基序列组成的寡核苷酸群。而优选的状态是在该人树突状细胞中表达最多的基因群中，编码具有序列1碱基序列的cDNA编码的基因的表达频率最高，其余99个基因的表达频率依次为序列2-100号。
本申请还提供人树突状细胞表达基因群，其特征是该基因群是与人单核细胞相比，由在来自人单核细胞的树突状细胞中更多表达的基因中表达最多的前100个基因组成的，各个基因的cDNA连接在最靠近聚A区的碱基序列5’-CATG-3’上、分别具有序列101-200的碱基序列；提供由该基因群的各个cDNA组成的cDNA群， 包含在该基因群中的新的基因，以及各该新的基因编码的新的蛋白质、抗体和拮抗剂，以及提供连接在碱基序列5’-CATG-3’上，由序列101-200的各个碱基序列组成的寡核苷酸群。而作为优选的状态是在该人树突状细胞中表达增加的基因群中，编码具有序列101碱基序列的cDNA的基因的表达频率与人单核细胞中该基因表达频率之间的差最大，而其余99个基因的表达频率与在人单核细胞中该基因表达频率之间的差依次为102-200。
另外，本申请提供人树突状细胞中表达基因群，其特征是该基因群是与人单核细胞相比，由在来自人单核细胞的树突状细胞中表达较低的基因中表达最低的前100个基因组成的，各个基因的cDNA连接着最靠近聚A区的碱基序列5’-CATG-3’上、分别具有序列201-300的碱基序列；提供由该基因群的各个cDNA组成的cDNA群；在该基因群中包含的新基因，以及属于该新基因群的各个基因编码的新的蛋白质、相应的抗体和拮抗剂，以及提供连接在碱基序列5’-CATG-3’上、由序列201-300的各个碱基序列组成的寡核苷酸群。而作为优选状态是在该人树突状细胞表达低的基因群中，编码含有序列201碱基序列的cDNA的基因的表达频率与该基因在人单核细胞中的表达频率之间的差最大，其余99个基因的表达频率与该基因在人单核细胞中表达频率之间的差依次为202-300。
由本申请的上述发明提供的各个基因群是由连接在碱基序列5’-CATG-3’上的序列1-300的Tag序列而特定的基因的各个集合体，这些由14bp组成的基因信息对鉴定各个基因的全长是十分有用的信息，通过克隆、蛋白质表达和它们的功能的解析，例如对人感染症或炎症疾病的诊断、监控和预后的判定非常有用。另外cDNA群和寡核苷酸群作为对上述那样疾病诊断用的微阵列或DNA芯片等的材料是很有用的。另外由于新的基因群参与人感染症或炎症疾病的成因的可能性很高，所以这些基因编码的蛋白质、其抗体、拮抗剂作为药物开发的材料是很有用的。
附图的简要说明
图1是对来自人血液单核细胞的DCs的表型进行分析的荧光分析的结果。
图2是在单核细胞和DCs中基因表达的比较结果。
图3是4个人的血液供体(A、B、C、D)的单核细胞、GM-巨噬细胞以及DCs中的9个基因的RT-PCR分析的结果。
实施发明的最佳方案
本发明的各个人树突状细胞表达基因群是在来自人单核细胞的树突状细胞中表达的100种不同种类的基因的集合体，这些基因群是通过众所周知的SAGE：基因表达顺次分析法，Serial Analysis of GeneExpression法(Science 276:1268,1997；Cell 88:243,1997；Science270:484,1995；Nature 389:300,1997；美国专利第5,695,937号)特别确定的。该SAGE法是确定赋予各个cDNA特征的10个碱基对DNA序列(Tag，标记)的方法，这些cDNA是由在任意细胞表达的基因制备的。而通过由所得到的所有的Tag算出各个Tag的比例，也可确定各个基因的表达频率(拷贝数)。到目前为止，使用SAGE法分析了以下的基因表达。Cololectal癌辐照下的G2抑制(G2 arrest incololectal cancer irradiation)(Molecular Cell 1:3-1 1,1997)；油酸盐培养基与Pip2q调节(Oleate medium and Pip2q regulation)(18届国际酵母遗传学与分子生物学大会，18th IntemationalConference on Yeast Genetics and Molecular Biologys107:58,1997)；大鼠胚胎成纤维细胞(Rat embryo fibroblast cells)(Oncogene 15:1079-1085,1997);p53表达(p53 expression)(Nature389:300,1997)；酵母基因组(Yeast genome)(Cell 88:243,1997)；胃肠道肿瘤(Gastrointestinal tumors)(Science 276:1268,1997)。另外本申请的发明人等利用SAGE法对在人单核细胞以及人巨噬细胞中表达最多的基因群以及单核细胞和人巨噬细胞之间的表达频率存在差别的基因群进行了特定，已经申请了专利(特愿平10-304550号)。
本发明的在人树突状细胞表达的基因群分别为根据上述各个文献以及美国专利记载的方法而特定的基因集合体，各个cDNA连接在最靠近聚A区的碱基序列5’-CATG-3’上，分别具有序列1-100、101-200、201-300碱基序列的基因集合体。这些基因例如可以通过以本发明的由14bp构成的各个寡核苷酸作为探针对人基因组文库进行筛选来分离。
另外本发明的cDNA群是构成上述各个基因群的基因的cDNA连接在最靠近聚A区的碱基序列5’-CATG-3’上，分别具有序列1-100、101-200、201-300的碱基序列的cDNA或其一部分序列的集合体。这些cDNA例如可以通过以本发明的各个寡核苷酸作为探针对人cDNA文库进行筛选来分离。
由构成本发明的寡核苷酸的14bp组成的基因信息对于鉴定各个基因和cDNA的全长是充分的信息。
另外在本发明的cDNA群中也包括含有各cDNA的任一部分碱基序列的DNA片段(10bp以上)。另外由有意义链和反意义链构成的DNA片段也包括在该cDNA群中。
另外经常会看到人基因由于个体差异而产生的多型性。因此在本发明的基因群和cDNA群中由于一个或多个核苷酸的添加、缺失和/或通过其它的核苷酸和修饰核苷酸置换形成的基因以及cDNA也包含在本发明的范围内。
本发明的新基因群是通过数据库检索没有对应基因的基因，以及只是通过EST(表达序列标记Expression Sequence Tag)特定的基因的集合体。这些新基因群例如可以以本发明的各个寡核苷酸作为标记物的定位克隆、以该寡核苷酸为探针的cDNA文库的筛选或基因库的检索等具体地特定。另外由新的基因可以得到该基因编码的新的蛋白质和针对该蛋白质的抗体。蛋白质例如可以利用对新的基因cDNA或其一部分序列进行体外转录的方法或通过在适当的宿主-载体中大量表达等方法得到。另外抗体可以按照众所周知的方法制备出多克隆抗体或单克隆抗体。
本发明拮抗剂是针对属于本发明的各个基因群的各个基因表达的拮抗剂，例如针对各个基因的转录因子的拮抗剂等。另外本发明的拮抗剂是针对属于本发明的各个基因群的各个基因表达的蛋白质活性的拮抗剂，例如针对各个蛋白质受体、或各个蛋白质结合的靶蛋白的受体的拮抗剂等。即，属于本发明的各个基因群的基因是在人DCs中表达多的基因、或与人单核细胞相比较表达较多或较少的基因的集合体，由于它们参与人感染症或炎症的发病的可能性高，所以针对这些基因或蛋白质的拮抗剂作为感染症或炎症的预防药物或治疗药物的成分是有用的。
而拮抗剂可以通过上述各个基因的体外表达体系或以各个蛋白质为对象的常规的筛选等特定。或者通过蛋白质以及其受体的结构解析等，通过化学合成等来制备。
以下就有关本发明的各个基因群的具体的特定方法和被特定的基因群进行说明。
(A)细胞的制备
按照常规方法从健康人(8名)的静脉血抽取末梢血单核细胞(peripheral blood mononuclear cells:PBMC)，使该PBMC通过磁性细胞分离系统分离单核细胞，对该细胞的悬浮液进行培养得到高度纯化的单核细胞。
另外将该单核细胞按照常规方法与GM-CSF一起培养，制备巨噬细胞(GM-巨噬细胞)。
另外将对末梢血CD14显阳性的单核细胞与GM-CSF、IL-4和TNF-α一起培养5天，制备DCs。即利用该培养条件使单核细胞分化为非附着性的CD14-、CD1a+、CD80low/-、CD86low/-、HLA-DR+、CD33-和CD83-(图1)。这些细胞具有未成熟DCs的树突状形态。
(B)SAGE分析
由上述(1)制备的各个细胞分别生成相应的mRNA，使用生物素化寡(dT)合成cDNA。这些cDNA(DC文库)用限制酶NlaⅢ消化，利用抗生物素蛋白-磁珠纯化各个cDNA的3’端片段。由于NlaⅢ切断部位变成了5’-CATG-3’，纯化的cDNA 3’端片段的5’末端的序列一律变成了“CATG”。然后再将cDNA分成2部分，在各个5’末端附加上不同的接头，用限制酶BsmF1在接头3’末端开始的14个碱基对下游处切断cDNA。这14个碱基对的DNA片段无论那一个5’端的CATG序列都是共同的，其余的10个碱基对因各个cDNA的不同而不同，所以这10个碱基对变成了赋予cDNA特征的Tag了。而为了对这些Tag的集合进行克隆，首先对BsmF1切断部位进行平端化，然后将分开的两段cDNA片段连接起来，以对应于各个接头的寡核苷酸作为引物通过PCR扩增DNA。由此，得到两端含有接头序列(5’-GGATG-3’)和与5’-CATG-3’及各自互补的各个序列，在各自的3’末端连接了不同的Tag序列的DNA片段(Ditag)。扩增的DNA片段用NlaⅢ切断后，连接各个Ditag，作成concatemer，克隆到载体pZerol中。
(C)在人DCs表达的基因群
通过以上操作，由在人DCs表达的cDNA得到58540个Tag，通过这些Tag可以特定17000以上的基因，其中也包含同一个Tag存在两次以上的5000个以上的基因。而从这些全部Tag按照重复多少(即该Tag指定的cDNA的表达频率高)的顺序选择100个，如序列1-100所示。
序列1-100的Tag就象上述说明所表明的那样，是连接存在于最靠近在人DCs中表达的基因cDNA的聚A区域位置的碱基序列CATG的10个碱基对。因此对已有的DNA数据库等进行检索，对于序列已知的cDNA情况，找出最靠近该DNA序列的聚A区域的碱基序列CATG，通过对照与该序列相连接的10个碱基序列，可以特定该Tg指定的cDNA(以及对该cDNA进行编码的基因)。表1和表2是序列1-100的Tag(B栏)、Tag数(A栏)、根据各个Tag检索数据库(GenBank)的结果特定的基因(C栏)和数据库的登录号(D栏、E栏、F栏)。
表1
                           表1
    A     B     C     D     E     F
  1     952  GTTCACATTA p33(HLADR不变链) X00497
  2     826  CCCTGGGTTC 铁蛋白L-链 M10119
  3     667  GGGCATCTCT HLADRα -链 J00196
  4     485  TTGGTGAAGG 胸腺素β-4 M17733
  5     453  CCTGTAATCC 多重匹配
  6     435  TGCCTGCACC 半胱氨酸蛋白酶抑制剂C X05607
  7     430  CAAGCATCCC EST AA653836  AA226653 AA230314
  8     427  TTGGTCCTCT 核糖体蛋白L41 AF026844
  9     393  TTGGGGTTTC 铁蛋白H链 L20941
  10     325  GTGAAACCCC 多重匹配
  11     318  CTAAGACTTC 线粒体DNA AA467764
  12     310  GTGACCACGG EST H50114  H84279
  13     297  CCACTGCACT 多重匹配
  14     273  GGGGAAATCG 胸腺素β10 M92381
  15     256  GTTGTGGTTA β-2-微球蛋白 AB021288
  16     254  TGTGTTGAGA 延伸因子α1亚基 X16869
  17     242  CCCATCGTCC EST A1357743  A1281418 A1281569
  18     237  TTCATACACC EST A1300940  AA902681 AA070967
  19     201  GTGAAACCCT 多重匹配
  20     187  TCCAAATCGA 波形蛋白 X56134
  21     185  TGGGTGAGCC 组织蛋白酶B M14221
  22     182  TTGGCCAGGC 多重匹配
  23     180  CACAAACGGT 核糖体蛋白S27 U57847
  24     171  AGCCCTACAA EST A1280609  A1287963 A1374100
  25     167  GGCTGGGGGC 抑制蛋白 J03191
  26     163  CACCTAATTG 线粒体DNA AA226180
  27     150  CTGACCTGTG Ⅰ类MHC M28205
  28     148  ACTTTTTCAA 无匹配
  29     146  TGGTGTTGAG 核糖体蛋白S18 X69150
  30     141  GGAGGTGGGG 颗粒体蛋白 M75161
  31     140  TGTACCTGTA α微管蛋白 K00558
  32     136  TGATTTCACT 肌球蛋白-结合蛋白C Al114736
  33     125  TGCACGTTTT 核糖体蛋白L32 X03342
  34     125  TCACCGGTCA 凝溶胶蛋白 X04412
  35     124  CCTCAGGATA EST AA935174  AA224784 AA906133
  36     123  ATGGCTGGTA 40S核糖体蛋白S2 X17206
  37     122  GGCACAAAGG TRAC D43767
  38     121  GCCTGCTGGG 磷脂氩过氧化物酶谷胱甘肽过氧化物酶GPx-4mRNA X71973
  39     121  TTCCCTTCTT Ⅱ类MHC淋巴细胞抗原B链 M28202
  40     121  AGAAGTGTCC 溶酶体酸性脂酶LAL mRNA M74775
  41     120  CCAGAACAGA 胸苷酸激酶或核糖体蛋白L30 L05095 L16991
  42     119  CCTAGCTGGA 肽基脯氨酰基顺-反异构酶A Y00052
  43     113  TAGGTTGTCT 翻译受控肿瘤蛋白 X16064
  44     111  AGGCTACGGA 核糖体蛋白L138a AA052955
  45     111  GTGCTGAATG 肌球蛋白碱性轻链 M22918
  46     111  ACGCAGGGAC 热休克90kD蛋白1,α AB897500
  47     108  GCTTTATTTG β肌动蛋白 V00478
  48     108  AAAACATTCT EST A1098657  AA069402  AA099906
  49     105  CCCCCTGGAT 细胞分裂循环2样1 AA081048
  50     105  TGAAAACTAC SBⅡ类组织相容性抗原α链 X00457
                                表2
    A     B     C     D       E     F
 51  104  ATGAGCTGAC 半胱氨酸蛋白酶抑制剂B L03558
 52  102  TTGTAATCGT 鸟氨酸脱羧酶 D78361
 53  101  CCCGTCCGGA EST AA213823 AA216620 AA251755
 54  101  CTGGGTTAAT 核糖体蛋白S19 M81757
 55  101  GCAGTTCTGA Ⅱ类MHC X00699
 56  100  GGGGCAACAC CDW52 X67699
 57  96  CCGTCCAAGG 核糖蛋白S16 M60854
 58  95  AAGACAGTGG 核糖体蛋白L37a L06499  X66699
 59  95  TGTGATCAGA ATP酶 AF092124
 60  94  AGCCACCGCA 葡萄糖-6-磷酸酶 U01120
 61  93  TGGCCCCAGG 载脂蛋白C-1 X00570
 62  91  AGGTGGCAAC EST AA131091 AA151439 AA194429
 63  87  GACGACACGA 核糖体蛋白S28 U58682
 64  87  ACCCTTGGCC EST AW237867 AA482078  AA496571
 65  86  CCTGTAGTCC 多重匹配
 66  85  GCGACCGTCA 醛缩酶A M11560
 67  84  GAAGCAGGAC non-muscle type cofilin X95404
 68  84  ACACAGCAAC 多重匹配
 69  82  AGGGCTTCCA 细胞色素C还原酶 M64241
 70  82  CGCTGGTTCC 核糖体蛋白L11 X79234
 71  81  AGCACATTTG EST AA130191
 72  80  GGGCTGGGGT 核糖体蛋白L29 U10248
 73  80  ACCGCCGTGC 细胞色素b245 M21185
 74  77  GCCGAGGAAC 核糖体蛋白S12 X53505
 75  77  CTCATAAGGA EST AA833550 A1086871  A1366586
 76  76  GTGCGCTGAC  HLA-CW3 X58536
 77  76  GCCCCCAATA 14kD  beta glycotoside-binding lectin J04456
 78  75  CGCCGCCGGC ribosomal protein L35 U12465
 79  75  AAGTTGCTAT prosaposin D00422
 80  74  TGGCTCCTCC 淋巴细胞胞质蛋白1 AA044266
 81  14  TCGAAGCCCC 无匹配
 82  73  AGCACCTCCA 真核翻译延伸因子2 Z11692
 83  73  CGCCGGAACA 核糖体蛋白L4 X73974
 84  71  AGGTCAGCAC 多重匹配
 85  71  GTGTGTTTGT TGF-B介导的基因生产 M77349
 86  71  GTAATCCTGC 无匹配
 87  71  CACCACGGTC EST AA019224 AA019897 AA021231
 88  70  CCATTGCACT atacim relangiectasia磷脂酰肌醇3-激酶同系物 U26455
 89  70  TAATAAAGGT 多重匹配
 90  69  CACTACTCAC 无匹配
 91  69  CCTGGGGTAA Ⅱ类组织相容性复合物DQα1 M17847
 92  68  ATTCTCCAGT 核糖体蛋白L23 X52839
 93  68  ATAATTCTTT 核糖体蛋白S29 L31610
 94  67  GGATTTGGCC 酸性核糖体磷蛋白 AB002533 M17887
 95  67  TTCACTGTGA 巨噬细胞半孔糖特异性凝集素 AB006780
 95  55  GAGGGAGTTT 核糖体蛋白L27a U14968
 97  66  AGCTCTCCCT 核糖体蛋白L23 X53777
 98  65  ACTAACACCC  PACAP型-3Nip2型受体 U18810
 99  65  GCCTTCCAAT 核p68蛋白 X15729
100  54  GTGAAGGCAG 核糖体蛋白S3A L13802
就象表1和表2所表示的那样，在人DCs中表达最多的基因是HLADR不变链(invariant chain)(表达频率为1.17％)。已经确认在DC文库中所有表达的基因都是与MHC Class Ⅰ、Class Ⅱ、蛋白质合成和细胞骨架相关的基因。
(D)与人单核细胞相比在人DCs中表达更多的基因群
与上述(B)一样，特定在人单核细胞和人GM-巨噬细胞中表达的各个基因的Tag，比较在人单核细胞和人DCs中表达的基因。在这些细胞中，几乎所有的基因(20000以上)表现出类似的表达模式(图2)。然而在单核细胞中表达的313个基因与在DCs中表达模式存在着显著性差异(p＜0.01)。即，313个基因中，181个基因的表达水平在DCs中降低，而相反有132个基因在DCs中表达频率比单核细胞高。表3和4给出了在人DCs中表达比在人单核细胞多的前100个基因。另外在表3、4中，也给出了在GM-巨噬细胞和DCs中表达基因的比较结果。即在表3和4中，A栏：Tag在单核细胞和DCs中表达频率的倍数，B栏：在单核细胞中的Tag拷贝数，C栏：在巨噬细胞中的Tag拷贝数，D栏：DCs中的Tag拷贝数，E栏：Tag序列(序列101-200)，F栏：与基因库数据一致的蛋白质，G、H、和I栏：基因库(Genbank)登录号。
在表4中，行编号63的F栏的完整蛋白质的全称是“酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶活化蛋白，β-多肽”“tyrosine3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activationprotein,beta polypeptide”，而行编号95的F栏是“人克隆24860Ena-VASP样蛋白mRNA序列，部分cds”“Homo sapiens clone24860 Ena-VASP like protein mRNA sequence,partial cds”。
                               表3
   A    B     C     D     E     F     G     H     I
 1  125     0     72    125  TCACCGGTCA 凝溶胶蛋白  X04412
 2  122     0     1    122  GGCACAAAGG TRAC  D43767
 3  61     2     79    121  AGAAGTGTCC 核糖体酸性脂酶LAL mRNA  M74775
 4  47     2     2    94  AGCCACCGCA 萄萄糖-6-磷酸酶  U01120
 5  41     0     10    41  CGTGAGCCAC 雌激素效应B箱型蛋白 AF096870
 6  40     0     4    40  CCCTGCAGTC 丝氨酸蛋白酶抑制剂Kuuitz 2型 AB006534
 7  36     0     3    36  GCCCTGAAAG 无匹配
 8  35     1     0    35  TTGGAACAAT EST AA586687 A1130926
 9  34     0     0    34  CCTCTGGGCA P450氧化还原醇 R42191
 10  33     0     3    33  CCAAGACTTC 无匹配
 11  33     0     117    33  AACGGGGCCC MDC U83171
 12  32     0     15    32  CAGCTATTTC 脂肪酸结合蛋白类似物 M94856
 13  31     0     0    31  CTTTCAGATG platelet-rype phosphotroctokinese O25328
 14  31     0     5    31  TTACTTCCCC △-6脂肪酸去饱和酶 AF126799
 15  30     1     0    30  TTGAGACCTC ⅩⅢ因子亚单位 N14539
 16  28     2     20    55  CTGTTAGTGT 马来酸脱氢酶 U20352
 17  25     0     31    25  TCTTCATTTA α-2巨球蛋白 M11313
 18  25     0     64    25  TGTCCCAGCC 酸式磷酸醇5型 X14618
 19  23     0     3    23  CCCCCGTAAT Meisl  homolog AI203963
 20  22     0     6    22  ATGGAAGTCT 磷酸肌醇5-磷酸酶 X98429
 21  21     0     9    21  CTAAAAAAAA CD81抗原 M33680
 22  20    21     166    430  CAAGCATCCC EST AW275645 AA226653
 23  20     0     1    20  TGTGAACAAC EST AA470682
 24  20    0     0    20  ACTCACCTTA EST AA742376
 25  20    0     0    20  GATACAGCCA Fc-epson受体CD23抗原 M14766
 26  19    0     5    19  CTGATCTCCA EST AI088488
 27  19    0     19    19  AGCCAGGGTA EST AA115735
 28  19    2     3    37  TTTGCTCTCC 粘着斑蛋白 M33308
 29  18    0     1    18  CTATATTTTT 组织蛋白酶C X8212
 30  18    0     0    18  AAGGGATGCT MCP-4 U46767
 31  18    0     2    18  AACGAGGAAT 无匹配
 32  18    0     3    18  CCCTCGGTCC 无匹配
 33  18    0     15    18  GCCTACCCGA 胰腺癌标记物GA733-1  X13425
 34  18    0     34    18  GATGACCCCC EST  AA075089 AA074875 AA075567
 35  17    0     1    17  GGTGTGCTTG 克隆24736  AF055021
 36  17    0     0    17  AGTGCAGGGC 无匹配
 37  17    0     0    11  CCTCACTACC EST  AA454170
 38  17    0     0    17  TGCAGAAGAA 甘露糖受体 J05550
 39  17    0     5    11  CCGGGCGTGG EST  R49492
 40  17    1     9    17  CCCAAGCTAG 热休克27kD蛋白1  S74571
 41  17    0     32    17  AAGATTGGTG CD9 M38690
 42  16    3     7    48  TGGCGTACGG EST AI242886  AI279985 AI301916
 43  16    1     4    16  GCCAGCCCAG KRAB伴随蛋白1 U78773
 44  16    0     4    16  GGTCCCCTAC K1AA01D0基因产物 AA551245
 45  16    9     61    140  TGTACCTGTA α微管蛋白 K00558
 46  16    6     1515    93  TGGCCCCAGG 载脂蛋白C-1 X00570
 47  15    0     0    15  CTCTGTAAGT 金属蛋白酶(HME) L23808
 48  15    0     0    15  GGAGGCAGGA 无匹配
 49  15    0     6    15  TTTTCTGAAA 硫氧还蛋白(TXIV) J04026
 50  15    7     105    104  ATGAGCTGAC 半胱氨酸蛋白酶抑制剂B L03558
                               表4
 A B G  D     E     F     G     H     I
 51  14     1     1     14  CACAAAAAAA 多重匹配
 52  14     1     0     14  GTGGCGTGTG 克隆23933  U79273
 53  14     1     0     14  TCCGCCTCGG DEK基因  A1929197
 54  14     0     2     14  CTCTACAGTG 液泡质子ATP酶  Y15286
 55  14     0     3     14  AATGCTTTTA 二噁英介导的细胞色素p450  U03688
 56  14     1     4     14  TTGGACTGAG 神经节苷脂表达因子2  AA099173
 57  14     0     8     14  CTTTGATGTT NOR1-1  AB010427
 58  14     1     21     14  ACCACTTATC EST  AA865837  A1080299 A1123033
 59  14     0     40     14  CACCTCCTAT 无匹配
 60  13     1     0     13  AGCCACCACG KIAA0149  D63483 D86864
 61  13     0     2     13  TCATTGTAAT 谷胱甘肽过氧化物酶3(胞浆)  AA027858
 62  13     0     3     13  ATGGCAGGAG EST  AA514878 AA828070 AA578984
 63  13     1     3     13  CTTTTTGTGC 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶活化  AA400245
 64  13     0     4     13  TGGAAACAAA DORA蛋白  AJ223183
 65  13     1     8     13  TACTAGTCCT HSP90  D87666
 66  13     1     13     13  TCCTTCTCCA α-辅肌动蛋白  X15804
 67  13     5     4     63  CCCAGCTAAT 花生四烯酸15-脂氧化酶  M23892
 68  13     2     4     25  GAGGGTGCCA 补体组件1,q亚组件，β多肽  AA910242
 69  12     0     0     12  CTGAGAGCTG 生长抑制特异性蛋白  L13720
 70  12     0     0     12  GTGGCTTCCC 肿瘤坏死因子受体超家族，5员  AA147592
 71  12     0     0     12  TTCTCAATAA HTA1胸腺细胞抗原arment cD1 mRNA  X04450
 72  12     1     0     12  TTTGTGCACT EST  AW085447
 73  12     0     2     12  CTGTGCGCCC 丝氨酸蛋白酶抑制剂，Kunitz型  AW189576
 74  12     0     2     12  TGTGTGAGCT EST  AA056972 AA158746
 75  12     1     3     12  AGATAATGTT 弗林蛋白醇fur-mRNA  X17094
 76  12     0     3     12  TCCTGCTGGC KIAA0496  AA948411
 77  12     0     7     12  TATATTTTCT 转谷氨酰胺酶  M98479
 78  12     1     10     12  GACTGTGCCA 胞浆动力蛋白轻链  U32944
 79  12     1     31     12  TTACAGAACT 磷脂酶A2,Ⅶ类  NM005084 U24577
 80  11     0     1     11  AAGTACTTCA 普通转录因子ⅡB  AA136737
 81  11     0     1     11  TCACTCCTGG 无匹配
 82  11     0     0     11  AATTGGATTG 胸腺细胞抗原CD1c  M28827
 83  11     0     0     11  ATTAAGAAAA AHNAK核蛋白  AA027210
 84  11     0     0     11  CAAAATGCAA EST  AA489062 AA011305 AA242818
 85  11     1     0     11  GCTTTGCAGC src-样适配蛋白  U44403
 86  11     0     0     11  TCACAAAAGA β-1,4-半乳糖基转移酶  AF038663
 87  11     2     3     22  CAGGATGACG EST  AA461521  AA565978  AA6097147
 88  11     0     2     11  TTCCTGGTAG KIAA0788  AB018331
 89  11     0     3     11  GGAAGGGGGA cofilon 1  T34499
 90  11     0     5     11  CTGGGTTGTG EST  AA256831 AA600012 AA699963
 91  11     0     5     11  GGGGACTGGT 蛋白激酶C,Δ  AA505643
 92  11     0     9     11  TCAGGGCTGA EST  AA488396  AA582282 AA834210
 93  11     1    16     11  TGTTTATCCT 地西泮结合抑制剂或内氮革  M14200
 94  11     0    39     11  ACATTCTTTT NMB  X76534
 95  10     7    15     71  CACCACGGTG Homo saoiens克隆24860 Ena-VASP样蛋白mRNA序列  AF131766
 96  10     2     2     20  GAAGTCGGAA EST  AI382431  AA575974 AI073720
 97  10     0     1     10  CACAAAAAGA 整联蛋白αX  AA989341
 98  10     0     0     10  AAGTTGACTT 无匹配
 99  10     1     0     10  AGCAAACTGA  Homo sapiens 亮氨酸氨基肽酶mRNA  AF061738
100  10     0     0     10  ATTAAGAGGG 无匹配
就象表3、4所表示的那样，GM-巨噬细胞和DCs表现出类似的基因表达模式。另外与单核细胞相比，在DCs中表达频率高的基因是编码象凝胶溶素和纽带蛋白那样的与细胞结构有关的蛋白质、象溶酶体酸脂肪酶和载脂蛋白C-1那样的与脂质代谢有关的蛋白质、象TARC、MDCMCR-4那样的ケモカイン的基因。而编码凝胶溶素、溶酶体酸脂肪酶、MDC、脂肪酸结合蛋白类似物、酸性磷酸酶5型、GA733-1、CD9、HPS27等的基因无论在巨噬细胞还是在DCs中都增加。另外编码TARC、肝细胞生长促进抑制因子2型(HAI-2)、血小板型磷酸果糖激酶、因子ⅩⅢ、CD23、组织蛋白酶C、MCP-4、金属蛋白酶在DCs中表达频率特别高(图3)。
(E)与单核细胞相比在DCs中表达少的基因群
与上述(D)一样，比较在人单核细胞和人DCs中表达的基因，表5和6给出了与单核细胞相比在DCs中表达少的100基因。表示形式与表3和4一样。另外表6的行编号58F栏是“B细胞抑制剂κ轻多肽基因增强子核因子，α”“nuclear factor of kappa lightpolypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor,alpha”，行编号59F栏是“单核细胞活化抗原或尿激酶样纤维蛋白溶酶原活化受体”“monocyte activation antigen or urokinase-type plasminogenactivator receptor”。
在DCs中表达最少的基因是编码补体蛋白(ficolin和备解素(properdin))、DNA结合蛋白(GOS3、GOS2和c-fos)、表面蛋白质(CDl4)。在DCs中表达减少的基因在GM-巨噬细胞中也表现出同样的倾向。另外与GM-巨噬细胞相比，表达降低了10倍以上的基因是MRP-14、MRP-1α、CDl4、alpha 1 antitypsin、HLA-B和tranleolase。另外CD14在DCs中的减少利用图1给出的荧光分析结果也可确认。
                            表5
   A  B  C  D     E     F     G      H  I
 1  532  1064  47  2  GTCCCCACGG MRP-14 X06233
 2  287  287  0  0  TACCTCCAGA MRP-8 X06234
 3  244  244  3  0  CCCACAACCT ficolin-1 D83920
 4  105  105  19  0  GCACCAAACC MIP-1a D00044
 5  97  97  0  O  TGGAAGCACT IL-8 M17017
 6  84  84 10  0  TGGTCCAGCG CD14 M86511
 1  77  77  0  1  CTTGACATAC 蛋白质酪氨酸磷酸酶 X68277
 8  66  66  10  1  GGAAAAGTGG α1～抗胰蛋白酶 M26123
 9  65  65  22  1  GCTGTTGCGC 核糖体蛋白S20 AAG76625
10  65  65  2  0  GGCCACGTAC 补体D组件 AA302667
11  63  63  0  0  TCTACACGTG 补体组件备解素 M83652
12  63  63  0  0  CTGATGGCGA S100钙结合蛋白A9 AA587283
13  55  55  0  0  CTGTACTTGT GOS 3 L49469
14  51  51  0  0  TGGAAAGTGA v-fos FBJ鼠骨肉瘤病毒癌基因同源物 NM005252
15  48  48 10  1  CTGACTTGTG MHC类      I HLA-B M15470
16  46  46  0  0  ACATTTCCAA 人GOS2蛋白基因 AA594415
17  44  88  5  2  TCACAGCTGT 抗增殖的B细胞易位基因1 AA024842
18  44  44  0  1  ATGGTGGCGG 锌指蛋白 M63625
19  44  44  19  1  TTGGCAGCCC 核糖体蛋白L27a H73560
20  34  34  2  0  TGGGCAGCTG 多重匹配
21  33  33  20  0  TTGCGTGTGT 蛋白质磷酸酶 PAC-1 L11329
22  31  31  1  0  CTCCATCCAG G-CSF受体 M59819
23  31  31  0  0  AGTGCACGTG 核糖体蛋白L29 AA157635
24  31  31  0  0  GGCCACGACT 甲酰基肽受体1 M60627
25  27  27  2  1  GTCCCCCCAA EST AI217285
26  27  27  0  0  CCCTGAGGCC cDNA DKFZp566F164 AI148871
27  25  25  0  0  GTGGGCCACG  Homo sapiens SNC73蛋白质(SNc73)mRNA AI735130
28  23  70  20  3  GCCGCCATCT 转酮醇酶 LI2711 U55017
29  22 112  16  5  CTGTTGGCAT 核糖体蛋白L21 T41133
30  21  21  1  0  ACCATTCTGC IFN-诱导mRNA X57351
31  21  21  3  0  ACTTTAATGA Csa过敏毒受体 M62505
32  21  21 11  0  AATTAAATTT 真核翻译起始因子4,γ1 AA622573 AA082100
33  20  20  7  1  GGTAGCCCAC 含5的三核苷酸重复 AA468594
34  20  20  0  0  GCCGCCGTGC 无匹配
35  19  19  0  1  CTTTTTTCCC CD48 M59904
36  19  19  4  0  CTTGGGATGT endoplasmic reticulum lumenal orotein AA075076
37  19  37  11  2  ATGCAGCGCA 肿瘤坏死因子超家族，成员IB M32315
38  18  18  2  1  ACGCTCTCGA CD37 X14046
39  18  18  0  0  TACCCCCCTG TNF M10988
40  18  18  0  0  TTGGACCACT EST AA724726
41  18  18  0  0  TTTCTGTATG H3组蛋白，3B族(H3,3B) AA400294
42  18  18  5  0  ATGGCTTGGT 核糖体蛋白S2 AA064604
43  17  17  0  0  TAATGCTAAA 螺旋-环-螺旋碱性磷蛋白 L13463
44  16  48  0  3  TCAAGTAACA putativa翻译起始因子 AJ012375
45  15  48  2  3  GGGAAACACG EST AA970435
46  15  16  0  1  TGAGTCTGGC 核心增强子成分结合蛋白 AL117595
47  16  15  8  1  GCGACAGCTC 核糖体蛋白L24 A1375511
48  15  79 18  5  GCTCAACGCG CCAAT  增强子结合蛋白  (C.EBP),β AA135498
49  15  15  1  0  TGTTTTCATA 小诱导细胞活素A4 AA777287
50  15  15  0  0  CTCACTTTTT       NF-IL6 bevta M83667
                                 表6
A B  C  D     E     F     G     H       I
 51  15     15     0     0  GCGGCGGCTC 核糖体蛋白L28 A1340623
 52  15     15     2     0  ACTACAAATA 核糖体蛋白L9 AW169101
 53  14     14     0     1  TCAACTTCTG 溶质载体家族2(促进葡萄糖输送)成员3 AA101267
 54  14     14     0     0  ATCCGCACCC 成长抑制和诱导DNA破坏34 U83981
 55  14     14     0     0  CAATTTGTGT 1L1b AF043335
 56  14     14     0     0  TTGAAGGGCC δ睡眠诱导肽，免疫反应剂 AL110191
 57  14     14     0     0  TTGCTGCCAG EST A12758034
 58  14     14     2     0  GACTTGTATA B细胞κ轻多肽基因增强子核因子 A1285391
 59  14     14     6     0  AACCACATTG 单核细胞活化抗原或尿激酶型纤溶酶原活化剂 M83246 U08839
 60  13     13     4     1  GCGTGCTCTC 核糖体蛋白L18a A1815745
 61  13     13     7     0  ATGGCGATCT 核糖体蛋白S24 A1333064
 62  13     51     7     4  GGCCTTTTTT 组蛋白HIX D64142
 63  12     12     3     1  TAGAAAGGCA 丁酸反应因子2 AA039882
 64  12     12     7     1  TTGACCTGTG 主要组织相容性复合体，Ⅰ类B AW072760
 65  12     12     1     0  GCGAGACCCC 无匹配
 66  12     12     1     0  TAAACTGTTT 核糖体蛋白S14 N22003
 67  12     12     1     0  TTGGGTCCTC 核糖体蛋白L41 AA484882
 68  12     12     1     0  TTTCAATAGA EST A1243522 A1696759
 69  12     12     1     0  GACTGGACCG 无匹配
 70  12     12     1     0  TACGTTGTCT 翻译控制的肿瘤蛋白1 A1719912
 71  12     12     0     O  CTGGGCCAGC 囊相关膜蛋白(myobrevin) A1066491
 72  12     12     0     0  TACCTGCAAA P47-phox(NcF1)儿童基因 M25665 M55067
 73  12     12     0     0  AACTCCCAGT 负生长调节蛋白 AF090950
 74  12     12     0     0  TGTTGTAACT EST AA947175
 75  12     12     2     0  GGGCCAAAAC EST AA047668
 76  12     12     4     0  GGCCTGGCAC EST A1223741
 77  12     12     9     0  GCGCGGCCGA 核糖体蛋白，大P1 AA190821     90827 AA304860
 78  12     35     3     3  GCGGCTTTCC 酵母Scol同源cDNA AL021683
 79  11     22     3     2  CCCCCACCTA 分化依赖性AU蛋白 L09604
 80  11     11     0     1  CTTAATCTTG BTG2 U72649
 81  11     11     0     0  ACTCGAATAT K12蛋白前体 U77643
 82  11     11     0     0  ACTGCCTACA A3样小诱导细胞活素1 AW059858
 83  11     11     0     0  TCTATCCCCC 多重匹配
 84  11     11     2     0  TTGAAGGCAG 无匹配
 85  11     11     8     0  TACCCCACCT H2A组蛋白家族成员Y C75515
 86  11     11    39     0  CTGGGGTTTC 无匹配
 87  11     42     0     0  TACATTCTGT 髓细胞白血病序列1 L08246
 88  11     21     5     2  GAGATCCGCA IFN-r或前催乳激素原释放肽 AB0154
 89  10     30     2     3  GCAGAGAAAA 肌动蛋白结合蛋白P57 D44497
 90  10     10     0     1  CTGAGGTGTG OEBP2ac1 acute myeloid leukoemia Z35278
 91  10     10     0     1  GGAGGTGGAG 多重匹配
 92  10     10     0     1  TCCGTCCGGA 无匹配
 93  10     10    12     1  ATCGTGCGCT 无匹配
 94  10     10    18     1  CATCCCGTGA 白三烯A-4水解醇 J02959
 95  10     10    26     1  CTCTGGGTTC 无匹配
 96  10     10     0     0  TTTGGGACCC 血小板-白细胞C激醇底物类似物，片段7 A151287
 97  10     10     0     0  AGGAGATGCT 白细胞免疫球蛋白样受体B亚家族成员2 AF011566 AF025528
 98  10     10     0     0  ATAGCTGGAT TYRO蛋白酪氨酸激酶结合蛋白 A1299346
 99  10     10     0     0  GGGTTCCAGT 骨髓基质细胞抗原1 D21878
100  10     10     0     0  TATATTGATT 抗增殖的B细胞易位基因1 X61123
另外象上述那样的各个基因表达的SAGE分析用从8人的血液中制备的细胞进行。这里为了研究各个基因表达的差别是否与血液供体的基因的差别有关，以9个基因为对象，对4个人的血液样品实施RT-PCR。结果就象图3所示那样，SAGE分析的结果可以确认，各个基因表达频率的差异并不是由血液供体的基因引起的，而是依赖于在GM-巨噬细胞和DCs细胞中基因表达频率的差异。
另外本申请的cDNA群是构成上述各个基因群的基因的cDNA，连接在最靠近聚A区域的碱基序列5’-CATG-3’上，是分别具有序列1-100、101-200、201-300的碱基序列的cDNA或其一部分序列的集合体。在本发明的cDNA群中也包括含有各个cDNA的任何一部分碱基序列的DNA片段(10bp以上)。而由有意义链和反意义链构成的DNA片段也包括在该cDNA群中。
另外经常会看到人基因由于个体差异而产生的多型性。因此在本发明的基因群和cDNA群中由于一个或多个核苷酸的添加、缺失和/或通过其它的核苷酸置换形成的基因以及cDNA也包含在本发明的范围内。
如上所述，本发明提供的基因群也含有新的基因，是全部在人DCs中表达的基因，而且是表达量最多的前100个基因。本发明提供的基因群与人单核细胞相比，在DCs(以及GM-巨噬细胞)中是表达量相对高的基因群和表达量相对低的基因群。因此这些基因群和cDNA，或者指定它们的Tag的集合体例如可以应用于以下那样的领域内。
(1)新基因的特定
例如，就本发明提供的基因群，可以以该Tag序列的5’端附加了5’-CATG-3’的寡核苷酸作为标记物的定位克隆、以该寡核苷酸为探针的cDNA文库的筛选或基因库的检索等特定这些新的基因。另外由新的基因可以得到该基因编码的新的蛋白质和对应该蛋白质的抗体和拮抗剂。蛋白质例如可以利用对新的基因cDNA或其一部分序列进行体外转录的方法或通过在适当的宿主-载体中大量表达等方法得到。另外抗体可以按照众所周知的方法制备出多克隆抗体或单克隆抗体。而拮抗剂可以通过蛋白质以及其受体的结构解析等，通过化学合成等来制备。
(2)疾病基因的特定
与人DCs有关的疾病(例如萎缩性皮炎、哮喘等)的发病基因是在DCs中高频率表达的基因的可能性高。例如在本发明提供的DCs表达基因群中包含的特定基因的过量表达或表达量降低、缺损、或基因变异等。另外如上所述，在单核细胞和DCs中存在着表达量明显不同的基因。因此这些表达量不同的基因也有可能是与各个细胞功能有关的疾病的原因基因的潜在的候补。因此本发明提供的各个基因群对阐明这些疾病基因和该疾病发病机制是有用的。
(3)药物的开发
上述(2)中的原因基因和发病机制的阐明对开发上述疾病的治疗药物是有用的。例如使过量表达的基因的表达量降低的药物等。
(4)诊断手段的开发
Tag的集合体在与人DCs有关的疾病的诊断手段的开发中很有用。例如用于利用了针对原因基因表达的蛋白质的抗体的EIA和RIA的试剂盒、或重组了基因的一部分或全长DNA的DNA芯片等。特别是DNA芯片在与多个基因有关的疾病的诊断中是有用的，由于能够重组入基盘上的DNA片段数被限制，所以必须选择对诊断必需的基因。本发明提供表达量高的基因和cDNA，由于它们是对细胞功能起着重要作用的基因和它们的cDNA的集合，所以作为构成DNA芯片的DNA的候补是非常有用的。另外含有Tag序列的本发明的寡核苷酸群由于是正确特定各个基因的序列，所以也可以用作重组到DNA芯片中的最低限度的DNA序列。
另外，由本发明提供的新的基因的14bp构成的基因信息对鉴定各个基因的全长是非常有用的信息，通过克隆、蛋白质表达和它们功能的解析，与药物和拮抗剂等开发联系在一起。
工业实用性
通过本申请的发明提供由在人DCs中高度表达的100个基因组成的基因群，与人单核细胞相比在人DCs中高频率表达和低频率表达的各100个基因群。这些基因群不仅在理解由单核细胞向DCs的分化过程非常有用，而且对于单核细胞和DCs起着重要作用的各种人疾病的诊断和治疗的新的手段的开发也非常有用。
序列表<110>  科学技术振兴事业团<120>  人树突状细胞表达基因群<150>JP 11-095481<151>1999-4-1<160>300<210>1<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>1GTTCACATTA                               10<210>2<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>2CCCTGGGTTC                               10<210>3<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>3GGGCATCTCT                               10<210>4<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>4TTGGTGAAGG                               10<210>5<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>5CCTGTAATCC                               10<210>6<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>6TGCCTGCACC                               10<210>7<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>7CAAGCATCCC                               10<210>8<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>8TTGGTCCTCT                               10<210>9<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>9TTGGGGTTTC                               10<210>10<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>10GTGAAACCCC                               10<210>11<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>11CTAAGACTTC                               10<210>12<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>12GTGACCACGG                               10<210>13<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>13CCACTGCACT                               10<210>14<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>14GGGGAAATCG                               10<210>15<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>15GTTGTGGTTA                               10<210>16<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>16TGTGTTGAGA                               10<210>17<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>17CCCATCGTCC                               10<210>18<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>18TTCATACACC                               10<210>19<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>19GTGAAACCCT                               10<210>20<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>20TCCAAATCGA                               10<210>21<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>21TGGGTGAGCC                               10<210>22<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>22TTGGCCAGGC                               10<210>23<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>23CACAAACGGT                               10<210>24<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>24AGCCCTACAA                               10<210>25<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>25GGCTGGGGGC                               10<210>26<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>26CACCTAATTG                               10<210>27<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>27CTGACCTGTG                               10<210>28<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>28ACTTTTTCAA                               10<210>29<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>29TGGTGTTGAG                               10<210>30<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>30GGAGGTGGGG                               10<210>31<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>31TGTACCTGTA                               10<210>32<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>32TGATTTCACT                               10<210>33<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>33TGCACGTTTT                               10<210>34<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>34TCACCGGTCA                               10<210>35<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>35CCTCAGGATA                               10<210>36<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>36ATGGCTGGTA                               10<210>37<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>37GGCACAAAGG                               10<210>38<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>38GCCTGCTGGG                             1 0<210>39<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens·<400>39TTCCCTTCTT                               10<210>40<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>40                                10AGAAGTGTCC<210>41<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>41CCAGAACAGA                               10<210>42<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>42CCTAGCTGGA                               10<210>43<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>43TAGGTTGTCT                               10<210>44<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>44AGGCTACGGA                               10<210>45<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>45GTGCTGAATG                               10<210>46<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>46ACGCAGGGAG                               10<210>47<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>47GCTTTATTTG                               10<210>48<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>48AAAACATTCT                               10<210>49<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>49CCCCCTGGAT                               10<210>50<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>50TGAAAACTAC                               10<210>51<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>51ATGAGCTGAC                               10<210>52<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>52TTGTAATCGT                               10<210>53<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>53CCCGTCCGGA                               10<210>54<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>54CTGGGTTAAT                               10<210>55<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>55GCAGTTCTGA                               10<210>56<211>10<212>DNA<213>Homo sapiens<400>56G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Claims (27)

1．人树突状细胞表达基因群，其特征是：该基因群由在来自人单核细胞的树突状细胞中表达的基因中表达最多的前100个基因组成的，各个基因的cDNA连接在最靠近聚A的碱基序列5’-CATG-3’上，分别具有1-100的碱基序列。
2．权利要求1的人树突状细胞表达基因群，其中编码具有序列1碱基序列的cDNA的基因的表达频率最高，其余99个基因的表达频率依次顺序为序列2-100。
3．人树突状细胞表达基因的cDNA群，其特征是：由构成权利要求1的人树突状细胞表达基因群的各个基因的cDNA构成，它们连接在最靠近聚A的碱基序列5’-CATG-3’上，由分别具有1-100的碱基序列的cDNA或其一部分序列构成的。
4．人树突状细胞表达新基因，其特征是：该基因是包含在权利要求1基因群中的新的基因，该基因的cDNA连接在最靠近聚A的碱基序列5’-CATG-3’上，分别具有序列7、12、17、18、24、28、35、48、53、62、64、71、75、81、86、87或90的碱基序列。
5．权利要求4的人树突状细胞表达的新基因编码的新的蛋白质。
6．抗权利要求5的新蛋白质的抗体。
7．针对属于权利要求1的基因群的各个基因表达的拮抗剂。
8．针对属于权利要求1的基因群的各个基因表达的蛋白质的活性的拮抗剂。
9．连接在碱基序列5’-CATG-3’上，由序列1-100的各个碱基序列组成的寡核苷酸群。
10．人树突状细胞表达基因群，其特征是：由与单核细胞相比，在来自人单核细胞的树突状细胞中表达比较多的基因中表达最多的前100个基因组成，各个基因的cDNA连接在最靠近聚A的碱基序列5’-CATG-3’上，分别具有序列101-200的碱基序列。
11．权利要求10的人树突状细胞表达基因群，其中编码含有序列101碱基序列的cDNA的基因的表达频率与该基因在人单核细胞中的表达频率之间的差最大，其余99个基因的表达频率的差依次为102-200。
12．人树突状细胞表达基因的cDNA群，其特征是：该cDNA群由构成权利要求10的人树突状细胞表达基因的各个基因的cDNA构成，它们连接在最靠近聚A的碱基序列5’-CATG-3’上，由分别具有序列101-200的碱基序列的cDNA或是由其一部分序列构成的。
13．人树突状细胞表达新基因，其特征是：该基因是包含在权利要求10的基因群中的新的基因，各个基因的cDNA连接在最靠近聚A的碱基序列5’-CATG-3’上，分别具有序列107、108、110、122-124、126、127、131、132、134、136、137、139、142、148、158、159、162、172、174、181、184、187、190、192、196、198或200的碱基序列。
14．权利要求13的人树突状细胞表达新基因编码的新蛋白质。
15．抗权利要求14新蛋白质的抗体。
16．针对属于权利要求10的基因群的各个基因表达的拮抗剂。
17．针对属于权利要求10的基因群的各个基因表达的蛋白质的活性的拮抗剂。
18．连接在碱基序列5’-CATG-3’上，由序列101-200的各个碱基序列组成的寡核苷酸群。
19．人树突状细胞表达基因群，其特征是：该基因群由与人单核细胞相比，在来自人单核细胞的树突状细胞中表达比较低的基因中的表达最低的前100个基因组成的，各个基因的cDNA连接在最靠近聚A的碱基序列5’-CATG-3’上，分别具有序列201-300的碱基序列。
20．权利要求19的人树突状细胞表达基因群，其中编码含有序列201碱基序列的cDNA的基因的表达频率与该基因在人单核细胞中表达频率之间的差最大，其余99个基因的表达频率的差依次为202-300。
21．人树突状细胞表达基因的cDNA群，其特征是：该cDNA群由构成权利要求19的人树突状细胞表达基因的各个基因的cDNA构成，它们连接在最靠近聚A的碱基序列5’-CATG-3’上，由分别具有序列201-300的碱基序列的cDNA或由其一部分序列构成的。
22．人树突状细胞表达新基因，其特征是：该基因是包含在权利要求19的基因群中的新的基因，各个基因的cDNA连接在最靠近聚A的碱基序列5’-CATG-3’上，分别具有序列225、234、240、245、257、265、268、269、274-276、284、286、292、293或295的碱基序列。
23．权利要求22的人树突状细胞表达新基因编码的新蛋白质。
24．抗权利要求23新蛋白质的抗体。
25．针对属于权利要求19的基因群的各个基因表达的拮抗剂。
26．针对属于权利要求19的基因群的各个基因表达的蛋白质的活性的拮抗剂。
27．连接在碱基序列5’-CATG-3’上，由序列201-300各个碱基序列组成的寡核苷酸群。
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