CN1287170A - 一种新的人神经递质运输蛋白及其编码序列 - Google Patents

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Abstract

本发明提供了一种新的人基因核苷酸序列。更具体地说,本发明提供了一种新的人神经递质运输蛋白NTrB21a的cDNA序列,该cDNA编码的蛋白是钠:神经递质共运输蛋白家族的成员。本发明还涉及由该核苷酸序列编码的多肽,这些多核苷酸和多肽的应用,以及所述多核苷酸和所述多肽的生产方法。

Description

一种新的人神经递质运输蛋白及其编码序列
本发明涉及基因工程领域,具体地,本发明涉及一种新的人基因核苷酸序列。更具体地说,本发明涉及人神经递质运输蛋白NTrB21a的cDNA序列,该cDNA编码的蛋白是钠:神经递质共运输蛋白家族的成员。本发明还涉及由该核苷酸序列编码的多肽,这些多核苷酸和多肽的应用,以及所述多核苷酸和所述多肽的生产方法。
神经递质运输蛋白(neurotransmitter transportor)是一类能够重积聚已释放的神经递质进入突触前末端的蛋白,可以帮助终止突触传输并实现神经递质的循环使用(Trends Neurosei 1992,15(7):265-268)。这类蛋白为钠依赖型蛋白,位于神经元和/或神经胶质细胞的质膜上,由两个不同的基因家族编码(Curr.Opin.Neurobiol.1993,3:337-344)。第一个基因家族编码四种不同的Na+/K+依赖型运输蛋白,吸收激发态氨基酸(excitatory amino acids,EAA),如天冬氨酸、谷氨酸。EAA运输蛋白一般长约500个氨基酸,成员间有60~40%的同源,含有6~10个跨膜区(Nature375,1995:599-603)。第二个基因家族编码的运输蛋白活性依赖于Na+和Cl-,它们的作用底物有甜菜碱、胆碱、肌酸、γ-氨基丁酸、多巴胺、甘氨酸、去甲肾上腺素、脯氨酸、5-羟色胺、牛磺酸等(Biochim.Biophys.Acta 1994,1197:133-166)。该家族也被称为钠:神经递质共运输蛋白家族(sodium:neurotransmitter symporterfamily,SNF)。迄今为止,大多数小分子神经递质的运输蛋白都已鉴定,只有一类大的神经递质——神经肽的运输蛋白尚未发现(Trends Neurosei 1992,15(7):265-268)
在已发现的SNF成员中,有些成员的底物尚未找到,这些运输蛋白被称为孤儿(orphan)运输蛋白,如大鼠中的NTT4或Rxtl、V-7-3-2、ROSIT等(Neuroscience 1997,77(2):319-333)。1995年,Smith小组用大鼠γ-氨基丁酸运输蛋白的编码eDNA为探针,在大鼠脑cDNA文库中发现了又一个孤儿运输蛋白rB21a(FEBS Lett.1995,357:86-92)。
研究已暗示,神经递质运输蛋白的异常与一些疾病相关,因此,为治疗目的研究和开发人神经递质运输蛋白有重要意义。
本发明的一个目的是提供一种新的多核苷酸,该多核苷酸编码钠:神经递质共运输蛋白家族(SNF家族)的一个新成员,本发明的SNF家族成员被命名为“人NTrB21a”。
本发明的另一个目的是提供一种新的人SNF家族成员,该蛋白被命名为人NTrB21a蛋白,人NTrB21是大鼠孤儿运输蛋白rB21a在人中的同源物
本发明的再一个目的是提供一种利用重组技术生产所述的新的人NTrB21a多肽的方法。
本发明还提供了这种人NTrB21a核酸序列和多肽的应用。
在本发明的一个方面,提供了一种分离出的DNA分子,它包括:编码具有人NTrB21a蛋白活性的多肽的核苷酸序列,所述的核苷酸序列与SEQ ID NO.5中从核苷酸47-1897位的核苷酸序列有至少70%的同源性;或者所述的核苷酸序列能在中度严紧条件下与SEQ ID NO.5中从核苷酸47-1897位的核苷酸序列杂交。较佳地,所述的序列编码一多肽,该多肽具有SEQ ID NO.6所示的序列。更佳地,该序列具有SEQ ID NO.5中从核苷酸47-1897位的核苷酸序列。
在本发明的另一方面,提供了一种分离的人NTrB21a蛋白多肽,它包括:具有SEQ ID NO.6氨基酸序列的多肽、或其保守性变异多肽、或其活性片段、或其活性衍生物。较佳地,该多肽是具有SEQ ID NO.6序列的多肽。
在本发明的另一方面,提供了一种载体,它含有上述分离出的DNA。
在本发明的另一方面,提供了一种所述载体转化的宿主细胞。
在本发明的另一方面,提供了一种产生具有人NTrB21a蛋白活性的多肽的方法,该方法包括:
(a)将编码具有人NTrB21a蛋白活性的多肽的核苷酸序列可操作地连于表达调控序列,形成人NTrB21a蛋白表达载体,所述的核苷酸序列与SEQ ID NO.5中从核苷酸47-1897位的核苷酸序列有至少70%的同源性;
(b)将步骤(a)中的表达载体转入宿主细胞,形成人NTrB21a蛋白的重组细胞;
(c)在适合表达人NTrB21a蛋白多肽的条件下,培养步骤(b)中的重组细胞;
(d)分离出具有人NTrB21a蛋白活性的多肽。
在本发明的一个具体实施方案中,本发明的分离的多核苷酸全长为1910个核苷酸,其详细序列见SEQ ID NO.5,其中开放读框位于47-1897位核苷酸。
在本发明中,“分离的”、“纯化的”或“基本纯的”DNA是指,该DNA或片段已从天然状态下位于其两侧的序列中分离出来,还指该DNA或片段已经与天然状态下伴随核酸的组份分开,而且已经与在细胞中伴随其的蛋白质分开。
在本发明中,术语“人NTrB21a蛋白(或多肽)编码序列”指编码具有人NTrB21a蛋白活性的多肽的核苷酸序列,如SEQ ID NO.5中47-1897位核苷酸序列及其简并序列。该简并序列是指,位于SEQ ID NO.5序列的编码框47-1897位核苷酸中,有一个或多个密码子被编码相同氨基酸的简并密码子所取代后而产生的序列。由于密码子的简并性,所以与SEQ ID NO.5中47-1897位核苷酸序列同源性低至约70%的简并序列也能编码出SEQ ID NO.6所述的序列。该术语还包括能在中度严紧条件下,更佳地在高度严紧条件下,与SEQ ID NO.5中从核苷酸47-1897位的核苷酸序列杂交的核苷酸序列。还术语还包括与SEQ ID NO.5中从核苷酸47-1897位的核苷酸序列的同源性至少70%,较佳地至少80%,更佳地至少90%,最佳地至少95%的核苷酸序列。
该术语还包括能编码具有与天然人NTrB21a相同功能的蛋白的、SEQ ID NO.6序列的变异形式。这些变异形式包括(但并不限于):若干个(通常为1-90个,较佳地1-60个,更佳地1-20个,最佳地1-10个)核苷酸的缺失、插入和/或取代,以及在5和/或3端添加数个核苷酸。本发明的编码序列可以是DNA或RNA,可以是单链或双链。
在本发明中,“基本纯的”蛋白质或多肽是指其至少占样品总物质的至少20%,较佳地至少50%,更佳地至少80%,最佳地至少90%(按干重或湿重计)。纯度可以用任何合适的方法进行测量,如用柱层析、PAGE或HPLC法测量多肽的纯度。基本纯的多肽基本上不含天然状态下的伴随其的组分。
在本发明中,术语“人NTrB21a蛋白多肽”指具有天然人NTrB21a蛋白活性的SEQ ID NO.6序列的多肽。该术语还包括具有与人NTrB21a蛋白相同功能的、SEQID NO.6序列的变异形式。这些变异形式包括(但并不限于):若干个(通常为1-50个,较佳地1-30个,更佳地1-20个,最佳地1-10个)氨基酸的缺失、插入和/或取代,以及在C末端和/或N末端添加一个或数个(通常为20个以内,较佳地为10个以内,更佳地为5个以内)氨基酸。例如,在本领域中,用性能相近或相似的氨基酸进行取代时,通常不会改变蛋白质的功能。又比如,在C末端和/或N末端添加一个或数个氨基酸通常也不会改变蛋白质的功能。该术语还包括人NTrB21a蛋白的活性片段和活性衍生物。
该多肽的变异形式包括:同源序列、保守性变异体、等位变异体、天然突变体、诱导突变体、在高或低的严紧度条件下能与人NTrB21aDNA杂交的DNA所编码的蛋白、以及利用抗人 ANTrB21a多肽的抗血清获得的多肽或蛋白。本发明还提供了其他多肽,如包含人NTrB21a多肽或其片段的融合蛋白。除了几乎全长的多肽外,本发明还包括了人NTrB21a多肽的可溶性片段。通常,该片段具有人NTrB21a多肽序列的至少约10个连续氨基酸,通常至少约30个连续氨基酸,较佳地至少约50个连续氨基酸,更佳地至少约80个连续氨基酸,最佳地至少约100个连续氨基酸。
发明还提供人NTrB21a蛋白或多肽的类似物。这些类似物与天然人NTrB21a多肽的差别可以是氨基酸序列上的差异,也可以是不影响序列的修饰形式上的差异,或者兼而有之。这些多肽包括天然或诱导的遗传变异体。诱导变异体可以通过各种技术得到,如通过辐射或暴露于诱变剂而产生随机诱变,还可通过定点诱变法或其他已知分子生物学的技术。类似物还包括具有不同于天然L-氨基酸的残基(女D-氨基酸)的类似物,以及具有非天然存在的或合成的氨基酸(如β、γ-氨基酸)的类似物。应理解,本发明的多肽并不限于上述例举的代表性的多肽。
修饰(通常不改变一级结构)形式包括:体内或体外的多肽的化学衍生形式如乙酰化或羧基化。修饰还包括糖基化,如那些在多肽的合成和加工中或进一步加工步骤中进行糖基化修饰而产生的多肽。这种修饰可以通过将多肽暴露于进行糖基化的酶(如哺乳动物的糖基化酶或去糖基化酶)而完成。修饰形式还包括具有磷酸化氨基酸残基(如磷酸酪氨酸,磷酸丝氨酸,磷酸苏氨酸)的序列。还包括被修饰从而提高了其抗蛋白水解性能或优化了溶解性能的多肽。
在本发明中,“人NTrB21a保守性变异多肽”指与SEQ ID No.6的氨基酸序列相比,有至多10个,较佳地至多8个,更佳地至多5个,最佳地至多3个氨基酸被性质相似或相近的氨基酸所替换而形成多肽。这些保守性变异多肽最好根据表1进行氨基酸替换而产生。
表1
最初的残基 代表性的取代 优选的取代
Ala(A) Val;Leu;Ile Val
Arg(R) Lys;Gln;Asn Lys
Asn(N) Gln;Mis;Lys;Arg Gln
Asp(D) Glu Glu
Cys(C) Ser Ser
Gln(Q) Asn Asn
Glu(E) Asp Asp
Gly(G) Pro;Ala Ala
His(H) Asn;Gln;Lys;Arg Arg
Ile(I) Leu;Val;Met;Ala;Phe Leu
Leu(L) Ile;Val;Met;Ala;Phe Ile
Lys(K) Arg;Gln;Asn Arg
Met(M) Leu;Phe;Ile Leu
Phe(F) Leu;Val;Ile;Ala;Tyr Leu
Pro(P) Ala Ala
Ser(S) Thr Thr
Thr(T) Ser Ser
Trp(W) Tyr;Ple Tyr
Tyr(Y) Trp;Phe;Thr;Ser Phe
Val(V) Ile;Leu;Met;Phe;Ala Leu
本发明还包括人NTrB21a多肽编码序列及其片段的反义序列。这种反义序列可用于抑制细胞内人NTrB21a的表达。
本发明还包括一种可用作探针的核酸分子,该分子通常具有人NTrB21a多肽编码序列的8-100个,较佳地15-50个连续核苷酸。该探针可用于检测样品中是否存在编码人NTrB21a的核酸分子。
本发明还包括检测人NTrB21a核苷酸序列的方法,它包括用上述的探针与样品进行杂交,然后检测探针是否发生了结合。较佳地,该样品是PCR扩增后的产物,其中PCR扩增引物对应于人NTrB21a多肽的编码序列,并可位于该编码序列的两侧或中间。引物长度一般为15-50个核苷酸。
在本发明中,可选用本领域已知的各种载体,如市售的载体。比如,选用市售的载体,然后将编码本发明多肽的核苷酸序列可操作地连于表达调控序列,可以形成蛋白表达载体。
如本文所用,“可操作地连于”指这样一种状况,即线性DNA序列的某些部分能够影响同一线性DNA序列其他部分的活性。例如,如果信号肽DNA作为前体表达并参与多肽的分泌,那么信号肽(分泌前导序列)DNA就是可操作地连于多肽DNA;如果启动子控制序列的转录,那么它是可操作地连于编码序列;如果核糖体结合位点被置于能使其翻译的位置时,那么它是可操作地连于编码序列。一般,“可操作地连于”意味着相邻近,而对于分泌前导序列则意味着在阅读框中相邻。
在本发明中,术语“宿主细胞”包括原核细胞和真核细胞。常用的原核宿主细胞的例子包括大肠杆菌、枯草杆菌等。常用的真核宿主细胞包括酵母细胞,昆虫细胞、和哺乳动物细胞。较佳地,该宿主细胞是真核细胞,如CHO细胞、COS细胞等。
另一方面,本发明还包括对人NTrB21a DNA或是其片段编码的多肽具有特异性的多克隆抗体和单克隆抗体,尤其是单克隆抗体。这里,“特异性”是指抗体能结合于人NTrB21a基因产物或片段。较佳地,指那些能与人NTrB21a基因产物或片段结合但不识别和结合于其它非相关抗原分子的抗体。本发明中抗体包括那些能够结合并抑制人NTrB21a蛋白的分子,也包括那些并不影响人NTrB21a蛋白功能的抗体。本发明还包括那些能与修饰或未经修饰形式的人NTrB21a基因产物结合的抗体。
本发明不仅包括完整的单克隆或多克隆抗体,而且还包括具有免疫活性的抗体片段,如Fab'或(Fab)2片段;抗体重链;抗体轻链;遗传工程改造的单链Fv分子(Ladner等人,美国专利No.4,946,778);或嵌合抗体,如具有鼠抗体结合特异性但仍保留来自人的抗体部分的抗体。
本发明的抗体可以通过本领域内技术人员已知的各种技术进行制备。例如,纯化的人NTrB21a基因产物或者其具有抗原性的片段,可被施用于动物以诱导多克隆抗体的产生。与之相似的,表达人NTrB21a或其具有抗原性的片段的细胞可用来免疫动物来生产抗体。本发明的抗体也可以是单克隆抗体。此类单克隆抗体可以利用杂交瘤技术来制备(见Kohler等人,Nature 256;495,1975;Kohler等人,Eur.J.Immunol.6:511,1976;Kohler等人,Eur.J.Immunol.6:292,1976;Hammerling等人,In Monoclonal Antibodies and T Cell Hybridomas,Elsevier,N.Y.,1981)。本发明的抗体包括能阻断人NTrB21a功能的抗体以及不影响人NTrB21a功能的抗体。本发明的各类抗体可以利用人NTrB21a基因产物的片段或功能区,通过常规免疫技术获得。这些片段或功能区可以利用重组方法制备或利用多肽合成仪合成。与人NTrB21a基因产物的未修饰形式结合的抗体可以用原核细胞(例如E.Coli)中生产的基因产物来免疫动物而产生;与翻译后修饰形式结合的抗体(如糖基化或磷酸化的蛋白或多肽),可以用真核细胞(例如酵母或昆虫细胞)中产生的基因产物来免疫动物而获得。
本发明的人NTrB21a核苷酸全长序列或其片段通常可以用PCR扩增法、重组法或人工合成的方法获得。对于PCR扩增法,可根据本发明所公开的有关核苷酸序列,尤其是开放阅读框序列来设计引物,并用市售的cDNA库或按本领域技术人员已知的常规方法所制备的cDNA库作为模板,扩增而得有关序列。当序列较长时,常常需要进行两次或多次PCR扩增,然后再将各次扩增出的片段按正确次序拼接在一起。
一旦获得了有关的序列,就可以用重组法来大批量地获得有关序列。这通常是将其克隆入载体,再转入细胞,然后通过常规方法从增殖后的宿主细胞中分离得到有关序列。
此外,还可用人工合成的方法来合成有关序列。通常,通过先合成多个小片段,然后再进行连接可获得序列很长的片段。目前,已经可以完全通过化学合成来编码本发明蛋白(或其片段,或其衍生物)的DNA序列。然后可将该DNA序列引入本领域中的各种DNA分子(如载体)和细胞中。此外,还可通过化学合成将突变引入本发明蛋白序列中。
本发明蛋白的片段,除了用重组法产生之外,还可用固相技术通过直接合成肽而加以生产(Stewart等人,(1969)Solid-Phase Peptide Synthesis,WH Freeman Co.,San Francisco;Merrifield J.(1963)J.Am Chem.Soc 85:2149-2154)。在体外合成蛋白质可以用手工或自动进行。例如,可以用Applied Biosystems的431A型肽合成仪(Foster City,CA)来自动合成肽。可以分别化学合成本发明蛋白的各片段,然后用化学方法加以连接以产生全长的分子。
本发明蛋白的编码序列还可用于基因定位。例如,通过荧光原位杂交技术(FISH),将cDNA克隆与分裂中期的染色体进行杂交,可以准确地进行染色体定位。该技术可以使用短至约500bp的cDNA;也可以使用长至约2000bp或者更长的cDNA。对于该技术,可参见Verma等人,Human Chromosomes:A Manual ofBasic Techniques,Pergamon Press,New York(1988)。
一旦序列被定位于染色体上的某个精确位置,将可以将序列在染色体上的物理位置与遗传图谱数据相关联。这些遗传图谱数据是可以获得的,例如通过孟德尔(Mendelian)人遗传数据库(可通过Johns Hopkins University Welch MedicalLibrary在网上获得)。然后,通过连锁分析来鉴定基因与已定位于同一染色体区域的疾病之间的相关性。
接着,有必要确定患病个体和健康个体之间的cDNA或基因组序列方面的差异。如果某一突变存在于部分或全部患病个体但不存在于正常个体,那么该突变可能就是该疾病的致病因素。
利用本发明蛋白,通过各种常规筛选方法,可筛选出与NTrB21a发生相互作用的物质,如受体、抑制剂或拮抗剂等。
本发明蛋白及其抗体、抑制剂、拮抗剂或受体等,当在治疗上进行施用(给药)时,可提供不同的效果。通常,可将这些物质配制于无毒的、惰性的和药学上可接受的水性载体介质中,其中pH通常约为5-8,较佳地pH约为6-8,尽管pH值可随被配制物质的性质以及待治疗的病症而有所变化。配制好的药物组合物可以通过常规途径进行给药,其中包括(但并不限于):肌内、腹膜内、皮下、皮内、或局部给药。
以本发明的人NTrB21a蛋白为例,可以将其与合适的药学上可接受的载体联用。这类药物组合物含有治疗有效量的蛋白质和药学上可接受的载体或赋形剂。这类载体包括(但并不限于):盐水、缓冲液、葡萄糖、水、甘油、乙醇、及其组合。药物制剂应与给药方式相匹配。本发明的人NTrB21a蛋白可以被制成针剂形式,例如用生理盐水或含有葡萄糖和其他辅剂的水溶液通过常规方法进行制备。诸如片剂和胶囊之类的药物组合物,可通过常规方法进行制备。药物组合物如针剂、溶液、片剂和胶囊宜在无菌条件下制造。活性成分的给药量是治疗有效量,例如每天约1微克/千克体重-约5毫克/千克体重。此外,本发明的多肽还可与其他治疗剂一起使用。
当本发明的人NTrB2la蛋白多肽被用作药物时,可将治疗有效剂量的该多肽施用于哺乳动物,其中该治疗有效剂量通常至少约10微克/千克体重,而且在大多数情况下不超过约8毫克/千克体重,较佳地该剂量是约10微克/千克体重-约1毫克/千克体重。当然,具体剂量还应考虑给药途径、病人健康状况等因素,这些都是熟练医师技能范围之内的。
由于本发明的人NTrB21a具有源自人的天然氨基酸序列,因此,与来源于其他物种的同族蛋白相比,预计在施用于人时将具有更高的活性和/或更低的副作用(例如在人体内的免疫原性更低或没有)。
在本发明的一个实施例中,人NTrB21a的cDNA核苷酸序列是如此获得的,以人脑λgtllcDNA文库(购自Clontech公司)为模板,用两对寡核苷酸为引物——A:5-CCGTCATCCATTTACCAGCCTCG-3′为正向引物,寡核苷酸B:5′-GTTGGATGGCTCATTGTAGCTGG-3为反向引物;C:5′-CCAAGGCCTGGATCAATGCAGC-3′为正向引物,D:5′-GGAAGCCCACATCTCAGGCCAC-3′为反向引物分别进行PCR。对扩增产物进行测序后拼接得到SEQ ID NO.5所示的NTrB21a的全长cDNA序列。
神经递质运输蛋白(neurotransmitter transportor)是一类能够重积聚已释放的神经递质进入突触前末端的蛋白,可以帮助终止突触传输并实现神经递质的循环使用(Trends Neurosci 1992,15(7):265-268),SNF家族是其中的一个类群,对许多药理及神经系统的研究具有重要作用。
在附图中,图1为本发明的人NTrB21a与大鼠神经递质运输蛋白rB21a(S76742)之间的氨基酸序列的同源比较图。其中,相同的氨基酸在两个序列之间用“|”标出,相似的氨基酸用“·”标出。相似的氨基酸是:A,S,T;D,E;N,Q;R,K;I,L,M,V;F,Y,W。
图2为本发明的人NTrB21a与小鼠孤儿运输蛋白msOrphan(AF075261)之间的氨基酸序列的同源比较图。其中,相同的氨基酸在两个序列之间用“|”标出,相似的氨基酸用“·”标出。相似的氨基酸是:A,S,T;D,E;N,Q;R,K;I,L,M,V;F,Y,W。
下面结合具体实施例,进一步阐述本发明。应理解,这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件如Sambrook等人,分子克隆:实验室手册(New York:Cold SpringHarbor Laboratory Press,1989)中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件。
实施例1
人NTrB21a的cDNA序列的克隆和测定
1.引物扩增
以人脑λgtllcDNA文库(购自Clontech公司)为模板,用两对寡核苷酸为引物一-A:5-CCGTCATCCATTTACCAGCCTCG-3(SEQ ID NO:1)为正向引物,寡核苷酸B:5-GTTGGATGGCTCATTGTAGCTGG-3(SEQ ID NO:2)为反向引物;C:5′-CCAAGGCCTGGATCAATGCAGC-3′(SEQ ID NO:3)为正向引物,D:5′-GGAAGCCCACATCTCAGGCCAC-3′(SEQ ID NO:4)为反向引物分别进行PCR。A/B的PCR条件为93℃4分钟,随之以93℃1分钟、63℃1分钟和72℃1分钟进行35个循环,最后72℃延伸5分钟。C/D的PCR条件为93℃4分钟,随之以93℃1分钟、65℃1分钟和72℃1分钟进行35个循环,最后72℃延伸5分钟。电泳检测得到A/B扩增产物为约930b的目的片段,C/D扩增产物为约1.1kb的目的片段。
2、PCR产物的测序
将上述PCR扩增产物A/B、C/D与pGEM-T_载体(Promega)连接,转化大肠杆菌JM103,用QIAprep Plasmid试剂盒(QIAGEN)提取质粒,用SequiThermEXCELTM DNA测序试剂盒(Epicentre Technologies)对依次截短的缺失子进行测序,最后用电脑软件拼接顺序,获得全长cDNA序列,共1910bp,详细序列见SEQ ID No.5,其中开放读框位于47-1897位核苷酸。
根据得到的全长cDNA序列推导出人NTrB21a的氨基酸序列,共616个氨基酸残基,其氨基酸序列详见SEQ ID No.6。
实施例2同源比较
用本发明的人NTrB21a的全长cDNA序列及其编码蛋白,在Non-redundantGenBank+EMBL+DDBJ+PDB数据库及Non-redundant GenBank CDStranslations+PDB+SwissProt+Spupdate+PIR数据库中,用BLAST程序进行核酸和蛋白同源检索。结果发现,它们与不同来源的SNF家族基因及其编码蛋白具有广泛的同源性,尤其是用PCGENE软件比较发现它与大鼠神经递质运输蛋白rB21a(S76742)在蛋白水平上的同一性达到89.1%,相似性达到93.2%(图1);与小鼠孤儿运输蛋白(AF075261)在蛋白水平上的同一性达到84.4%,相似性达到90.1%(图2)。
SNF家族成员的结构特点为:长约600~700个氨基酸(其中两个细菌蛋白稍小,约500个氨基酸);含有非常保守的常规拓扑特征,一般都有12个分界清楚的跨膜区,肽链两端都位于细胞质内(Trends Neurosci 1992,15(7):265-268);每个成员有两个高度保守特征区域,第一个区域包括第一跨膜区的C端、一段短的胞外环和第二个跨膜区的N端,其共同序列为WRF[G/P]YX4NGGGX[F/Y](方括号内表示任选其中一种氨基酸,Xn表示任意n个氨基酸);第二个区域位于第三个和第四个跨膜区之间的最大的胞外环,共同序列为Y[L/I/V/M/F/Y]X2[S/C][L/I/V/M/F/Y][S/T/Q]X2LPWX2CX4N[G/S/T](方括号内表示任选其中一种氨基酸,Xn表示任意n个氨基酸),该区域中含有两个保守的半胱氨酸,可形成二硫键。该胞外区还含有几个糖基化位点。本发明的人NTrB21a具有12个跨膜区,分别为33ANSLQFVFACISYAVGLGNVW5361MYGGGSFLVPYIIMLIVEGMP81106ELAVGQRMRQGSIGAWRTISP126192WEPALCLLLAWLVVYLCILRG212217GKVVYFTASLPYCVLIIYLIR317269ATQIFFSLGLGFGSLIAFASY289304SLINSFTSIFASIVTFSIYGF324413QLWSVLYFFMLLMLGIGSMLG433456AISGLVCLVNCAIGMVFTMEA476488AATLSLLLIVLVETIAVCYVY508530KVMWAGVSPLLIVSLFVFYLS550579ALAVIGLLVASSTMCIPLAAL599,而且它还含有两个高度保守特征区域,第一个为53WRFPYLCQMYGGGSF67,第二个为136YLFHSFQDPLPWSVCPLN GNH156。本发明的NTrB21a蛋白基本符合上述特点,因此,本发明的人NTrB21a蛋白可归入神经递质运输蛋白蛋白,并且具有神经递质运输蛋白蛋白的一般功能。
SNF成员在脑细胞中的表达分布是各不相同的,它们可以作为含各种特殊神经递质表型的神经元的相对特异的分子标记物。现有的SNF成员模型显示它们可以结合离子、药物、神经毒质、神经递质,运送离子、神经毒质和神经递质并将所运输的物质释放入神经元中。这些运输蛋白如何参与这些过程或如何受到调控的机制尚不清楚,但是成员间保守的氨基酸序列显示它们可能通过共同的机制完成运输过程(Trends Neurosci 1992,15(7):265-268)。
神经递质运输蛋白在药理学方面有着重要意义。许多滥用的药物,包括可卡因和苯异苯胺,主要通过这些运输蛋白实现它们的作用;而抗抑郁剂也和这些蛋白有着高亲和性。许多神经毒质专一地使含某种神经递质的神经元中毒,它们也通过神经递质运输蛋白实现其作用。运输蛋白可积聚集中有毒复合物,神经毒质的细胞类型特异性就决定于吸收毒素的特殊的运输蛋白(Trends Neurosci 1992,15(7):265-268)。
1995年,Smith小组在大鼠脑中发现了rB21a蛋白,该蛋白的mRNA在鼠脑的柔脑脊膜处高表达,这提示它可能调节底物在脑脊液中的水平。本发明的NTrB21是rB21a在人中的同源物,克隆工作为研究它的生理学功能提供了新途径,也为研究开发新的以运输蛋白为基础的治疗神经疾病和精神病的治疗试剂提供可能。
本发明的人NTrB21a除了可作为该家族一员用于进一步的功能研究,还可用于与其他蛋白一起产生融合蛋白,比如与免疫球蛋白一起产生融合蛋白。此外,本发明人NTrB21a还可以与该家族的其他成员进行融合或交换片段,以产生新的蛋白。例如将本发明人NTrB21a的N端与大鼠的rB21a的N端进行交换,以产生新的活性更高或具有新特性的蛋白。
本发明的人NTrB21a还可用于筛选抑制本发明蛋白活性的拮抗剂、或增强本发明蛋白活性的激动剂等。
针对本发明人NTrB21a的抗体,用于筛选该家族的其他成员,或者用于亲和纯化相关蛋白(如该家族的其他成员)。
此外,本发明人NTrB21a核酸(编码序列或反义序列)可以被引入细胞,以提高人NTrB21a的表达水平或者抑制人NTrB21a的过度表达。本发明的人NTrB21a蛋白或其活性多肽片段可以施用于病人,以治疗或减轻因人NTrB21a缺失、无功能或异常而导致的有关病症。此外,还可以用基于本发明的核酸序列或抗体进行有关的诊断或预后判断。
实施例3
人NTrB21a在大肠杆菌中的表达
在该实施例中,将实施例1中PCR扩增产物A/B、C/D乙醇沉淀后用BglⅡ酶切,用T4连接酶将酶切片段连接起来。将该连接片段为模板,将编码人NTrB2la的cDNA序列用对应于该DNA序列的5′和3′端的PCR寡核苷酸引物(SEQ ID NO.7和8)进行扩增,获得人NTrB21a cDNA作为插人片段。
PCR反应中使用的5′寡核苷酸引物序列为:
5′-TCAGGTCGACATGAGATTAGCAATTAAAAAAC-3′(SEQ ID NO.7),
该引物含有SalⅠ限制性内切酶的酶切位点,在该酶切位点之后是由起始密码子开始的人NTrB21a编码序列的22个核苷酸;
3′端引物序列为:
5-TTGGAAGCTTTCAGGCCACGGGGTCTGCG-3(SEQ ID NO.8),
该引物含有HindⅢ限制性内切酶的酶切位点、翻译终止子和人NTrB21a的部分编码序列。
引物上的限制性内切酶的酶切位点对应于细菌表达载体pQE-9(Qiagen Inc.,Chatsworth,CA)上的限制性内切酶酶切位点,该质粒载体编码抗生素抗性(Ampr)、一个细菌复制起点(ori)、一个IPTG-可调启动子/操纵子(P/O)、一个核糖体结合位点(RBS)、一个6-组氨酸标记物(6-His)以及限制性内切酶克隆位点。
用SalⅠ和HindⅢ消化pQE-9载体及插入片段,随后将插入片段连接到pQE-9载体并保持开放读框在细菌RBS起始。随后用连接混合物转化购自Qiagen,商品名为M15/rep4的E.coli菌株,M15/rep4含有多拷贝的质粒pREP4,其表达lacⅠ阻遏物并携带卡那霉素抗性(Kanr)。在含有Amp和Kan的LB培养皿上筛选转化子,抽提质粒,测序验证人NTrB21a的cDNA片段已正确插入了载体。
在补加Amp(100μg/ml)和Kan(25μg/ml)的LB液体培养基中过夜培养(O/N)含所需构建物的阳性转化子克隆。过夜(O/N)培养物以1∶100-1∶250的稀释率稀释,然后接种到大体积培养基中,培养细胞生长至600光密度(OD600)为0.4-0.6时,加入IPTG(“异丙基硫代-β-D-半乳糖苷”)至终浓度为1mM。通过使lacⅠ阻遏物失活,IPTG诱导启动P/O导致基因表达水平提高。继续培养细胞3-4小时,随后离心(6000×g,20分钟)。超声裂解培养物,收集细胞裂解液并将其稀释于6M盐酸胍中。澄清后,通过在能使含6-His标记物蛋白紧密结合的条件下,用镍-螯合柱层析从溶液中纯化溶解的人NTrB21a。用6M盐酸胍(PH5.0)从柱中洗脱人NTrB2la。可用几种方法从盐酸胍中变性沉淀蛋白。或者,使用透析步骤除去盐酸胍,或者从镍-螯合柱中分离出的纯化蛋白。纯化后的蛋白质被结合到第二个柱中,该柱中具有递减的线性盐酸胍梯度。在结合到该柱时蛋白质变性,随后用盐酸胍(PH5.0)洗脱。最后,将可溶的蛋白质用PBS进行透析,然后将蛋白质保存在终浓度为10%(w/v)甘油的贮存液中。
用12%的SDS-PAGE胶进行电泳,鉴定表达蛋白的分子量大小为约68KDa。
此外,用常规方法对达蛋白的N端和C端各10个氨基酸长度的氨基酸进行测序,发现与SEQ ID NO.6的序列一致。
实施例4
人NTrB21a在真核细胞(CHO细胞株)中的表达
在该实施例中,以实施例1中PCR扩增产物A/B、C/D乙醇沉淀后用BglⅡ酶切,用T4连接酶将酶切片段连接起来(与实施例3相同)。将该连接片段为模板,将编码人NTrB21a的cDNA序列用对应于该DNA序列的5′和3′端的PCR寡核苷酸引物(SEQID NO.9和10)进行扩增,获得人NTrB21a cDNA作为插入片段。
PCR反应中使用的5′寡核苷酸引物序列为:
5′-TCAGAAGCTTATGAGATTAGCAATTAAAAAAC-3′(SEQ ID NO.9)
该引物含有HindⅢ限制性内切酶的酶切位点,在该酶切位点之后是由起始密码子开始的人NTrB21a编码序列的22个核苷酸;
3′端引物序列为:
5-TTGGGAATTCTCAGGCCACGGGGTCTGCG-3(SEQ ID NO.10)
该引物含有EcoRⅠ限制性内切酶的酶切位点、一个翻译终止子和人NTrB21a的部分编码序列。
引物上的限制性内切酶的酶切位点对应于CHO细胞表达载体pcDNA3上的限制性内切酶酶切位点,该质粒载体编码抗生素抗性(Ampr和Neor)、一个噬菌体复制起点(f1ori)、一个病毒复制起点(SV40 ori)、一个T7启动子、一个病毒启动子(P-CMV)、一个Sp6启动子、一个SV40启动子、一个SV40加尾信号和相应的polyA顺序、一个BGH加尾信号和相应的polyA顺序。
用HindlⅡ和EcoRⅠ消化pcDNA3载体及插入片段,随后将插入片段连接到pcDNA3载体。随后用连接混合物转化E.coli DH5α菌株。在含有Amp的LB培养皿上筛选转化子,在补加Amp(100μg/ml)的LB液体培养基中过夜培养(O/N)含所需构建物的克隆。抽提质粒,用XbaⅠ酶切及测序验证人NTrB21a的cDNA片段已正确插入了载体。
质粒转染CHO细胞是采用脂转染法,用Lipofectin(GiBco Life)进行的。转染48小时后,经2-3周的持续G418加压筛选,收集细胞及细胞上清测定表达蛋白酶活力。去G418,连续传代培养;对混合克隆细胞极限稀释,选择具有较高蛋白活性的细胞亚克隆。按常规方法大量培养上述阳性亚克隆。48小时后,开始收集细胞及上清,用超声裂解方法破碎细胞。以含0.05%Triton的50mMTris·HCl(pH7.6)溶液为平衡液及洗脱液,用经预平衡的Superdex G-75柱收集上述蛋白的活性峰。再用50mMTris·HCl(pH8.0)平衡的DEAE-Sepharose柱,以含0-1M NaCl的50mMTris·HCl(pH8.0)溶液为洗脱液进行梯度洗脱,收集上述蛋白的活性峰。然后以PBS(pH7.4)为透析液对表达蛋白溶液进行透析。最后冻干保存。
用12%的SDS-PAGE胶进行电泳,鉴定表达蛋白的分子量大小约为68KDa。
此外,用常规方法对达蛋白的N端和C端各10个氨基酸长度的氨基酸进行测序,发现与SEQ ID NO.6的序列一致。
实施例5
制备抗体
将实施例3和4中获得的重组蛋白用来免疫动物以产生抗体,具体方法如下。重组分子用层析法进行分离后备用。也可用SDS-PAGE凝胶电泳法进行分离,将电泳条带从凝胶中切下,并用等体积的完全Freund s佐剂乳化。用50-100μg/0.2ml乳化过的蛋白,对小鼠进行腹膜内注射。14天后,用非完全Freund s佐剂乳化的同样抗原,对小鼠以50-100μg/0.2ml的剂量进行腹膜内注射以加强免疫。每隔14天进行一次加强免疫,至少进行三次。获得的抗血清的特异反应活性用它在体外沉淀人NTrB2la基因翻译产物的能力加以评估。结果发现,抗体可特异性地与本发明蛋白发生沉淀。
在本发明提及的所有文献都在本申请中引用作为参考,就如同每一篇文献被单独引用作为参考那样。此外应理解,在阅读了本发明的上述讲授内容之后,本领域技术人员可以对本发明作各种改动或修改,这些等价形式同样落于本申请所附权利要求书所限定的范围。
序列表(1)一般信息:
(ⅱ)发明名称:一种新的人神经递质运输蛋白及其编码序列
(ⅲ)序列数目:10(2)SEQ ID NO.1的信息
(ⅰ)序列特征
 (A)长度:23碱基
 (B)类型:核酸
 (C)链性:单链
 (D)拓扑结构:线性
(ⅱ)分子类型:寡核苷酸
(ⅹⅰ)序列描述:SEQ ID NO.1:CCGTCATCCA TTTACCAGCC TCG    23(2)SEQ ID NO.2的信息
(ⅰ)序列特征
 (A)长度:23碱基
 (B)类型:核酸
 (C)链性:单链
 (D)拓扑结构:线性
(ⅱ)分子类型:寡核苷酸
(ⅹⅰ)序列描述:SEQ ID NO:2GTTGGATGGC TCATTGTAGC TGG    23(2)SEQ ID NO.3的信息
(ⅰ)序列特征
 (A)长度:22碱基
 (B)类型:核酸
 (C)链性:单链
 (D)拓扑结构:线性
(ⅱ)分子类型:寡核苷酸
(ⅹⅰ)序列描述:SEQ ID NO.3:CCAAGGCCTG GATCAATGCA GC    22(2)SEQ ID NO.4的信息
(ⅰ)序列特征
 (A)长度:22碱基
 (B)类型:核酸
 (C)链性:单链
 (D)拓扑结构:线性
(ⅱ)分子类型:寡核苷酸
(ⅹⅰ)序列描述:SEQ ID NO:4GGAAGCCCAC ATCTCAGGCC AC    22(2)SEQ ID NO.5的信息:
(ⅰ)序列特征:
 (A)长度:1910bp
 (B)类型:核酸
 (C)链性:双链
 (D)拓扑结构:线性
(ⅱ)分子类型:cDNA
(ⅹⅰ)序列描述:SEQ ID NO.5:1  CCGTCATCCA  TTTACCAGCC  TCGCCTCTCG  GACGGGCGCG  CCGTTAATGA  GATTAGCAAT61  TAAAAAACCA  GCTAGCTGCG  ACCCCCGAGC  CGGAGCCGAG  CGCGCCGAGG  CCGGGGCCAT121  GGAGAAAGCG  CGGCCGCTGT  GGGCCAACTC  GCTACAGTTC  GTGTTCGCCT  GCATCTCGTA181  CGCCGTGGGC  CTGGGCAACG  TGTGGCGATT  CCCGTACCTG  TGCCAGATGT  ACGGCGGAGG241  TAGTTTCCTG  GTCCCCTACA  TCATCATGCT  TATCGTGGAG  GGAATGCCGC  TCTTGTACCT301  GGAACTGGCT  GTGGGGCAGC  GCATGCGGCA  GGGCAGCATC  GGCGCCTGGA  GGACCATCAG361  CCCGTACCTC  AGTGGTGTCG  GGGTCGCCAG  CGTGGTGGTC  TCTTTCTTCC  TCTCCATGTA421  CTACAACGTC  ATCAACGCCT  GGGCCTTCTG  GTACCTCTTC  CACTCCTTCC  AGGATCCCCT481  GCCGTGGTCT  GTCTGCCCAC  TGAATGGTAA  CCACACGGGC  TACGATGAGG  AGTGTGAGAA 541  GGCGTCCTCC  ACACAGTACT  TCTGGTACAG  GAAAACCCTC  AATATCTCGC  CGTCCCTCCA601  GGAGAACGGG  GGTGTGCAGT  GGGAGCCGGC  GCTGTGCCTC  CTCCTGGCCT  GGCTGGTGGT661  GTACCTGTGC  ATCCTGCGTG  GCACCGAGTC  CACTGGCAAG  GTGGTGTATT  TCACGGCGTC721  ACTGCCCTAT  TGCGTGCTCA  TCATCTACCT  CATCAGGGGC  CTCACGCTCC  ACGGAGCCAC781  CAATGGCCTC  ATGTACATGT  TCACTCCCAA  GATAGAGCAG  CTGGCCAACC  CCAAGGCCTG841  GATCAATGCA  GCCACCCAGA  TCTTCTTCTC  ACTTGGCCTG  GGCTTCGGCA  GCCTGATCGC901  CTTCGCCAGC  TACAATGAGC  CATCCAACAA  CTGCCAGAAG  CACGCCATCA  TCGTGTCCCT961  CATCAACAGC  TTCACCTCCA  TATTTGCCAG  CATTGTCACC  TTCTCCATCT  ATGGCTTCAA1021  GGCCACCTTC  AATTATGAAA  ACTGCTTGAA  GAAGGTGAGT  CTGCTGCTGA  CCAACACTTT1081  TGACCTTGAA  GATGGCTTTT  TGACAGCCAG  CAACCTGGAG  CAGGTGAAGG  GCTACCTCGC1141  ATCTGCCTAC  CCAAGCAAAT  ACAGCGAGAT  GTTCCCGCAA  ATCAAAAACT  GCAGCTTGGA1201  ATCGGAGCTA  GACACGGCCG  TCCAGGGCAC  TGGCCTGGCA  TTCATCGTCT  ACACAGAGGC1261  CATTAAAAAC  ATGGAGGTGT  CCCAGCTGTG  GTCGGTGCTC  TACTTCTTCA  TGCTGCTGAT1321  GCTGGGCATT  GGGAGCATGC  TGGGGAACAC  AGCGGCCATC  CTCACCCCTC  TGACAGACAG1381  CAAGATCATC  TCCAGCCACC  TGCCCAAGGA  GGCCATCTCA  GGTCTGGTGT  GCCTTGTCAA
1441  CTGTGCCATT  GGCATGGTGT  TCACGATGGA  GGCTGGGAAC  TACTGGTTTG  ACATATTCAA1501  CGACTACGCG  GCCACACTGT  CCCTGCTGCT  CATCGTGCTG  GTGGAGACGA  TTGCCGTGTG1561  CTACGTGTAC  GGGCTGAGGA  GATTTGAAAG  TGACCTTAAG  GCCATGACCG  GCCGAGCTGT1621  GAGCTGGTAC  TGGAAGGTGA  TGTGGGCTGG  CGTAAGCCCA  CTGCTGATTG  TCAGCCTCTT1681  TGTCTTCTAC  CTGAGCGACT  ACATCCTCAC  GGGGACCCTG  AAGTATCAAG  CCTGGGACGC1741  CTCCCAGGGC  CAGCTCGTGA  CCAAAGATTA  CCCGGCCTAT  GCACTGGCTG  TCATCGGGCT1801  GCTTGTGGCC  TCCTCCACCA  TGTGCATCCC  CCTGGCGGCC  CTGGGGACTT  TTGTTCAGCG1861  TCGCCTCAAG  AGGGGAGACG  CAGACCCCGT  GGCCTGAGAT  GTGGGCTTCC(2)SEQ ID NO.6的信息:
(ⅰ)序列特征:
 (A)长度:616个氨基酸
 (B)类型:氨基酸
 (D)拓扑结构:线性
(ⅱ)分子类型:多肽
(ⅹⅰ)序列描述:SEQ ID NO.6:1 Met Arg Leu Ala Ile Lys Lys Pro Ala Ser Cys Asp Pro Arg Ala 16 Gly Ala Glu Arg Ala Glu Ala Gly Ala Met Glu Lys Ala Arg Pro31 Leu Trp Ala Asn Ser Leu Gln Phe Val Phe Ala Cys Ile Ser Tyr46 Ala Val Gly Leu Gly Asn Val Trp Arg Phe Pro Tyr Leu Cys Gln61 Met Tyr Gly Gly Gly Ser Phe Leu Val Pro Tyr Ile Ile Met Leu76 Ile Val Glu Gly Met Pro Leu Leu Tyr Leu Glu Leu Ala Val Gly91 Gln Arg Met Arg Gln Gly Ser Ile Gly Ala Trp Arg Thr Ile Ser106 Pro Tyr Leu Ser Gly Val Gly Val Al a Ser Val Val Val Ser Phe121 Phe Leu Ser Met Tyr Tyr Asn Val Ile Asn Ala Trp Ala Phe Trp136 Tyr Leu Phe His Ser Phe Gln Asp Pro Leu Pro Trp Ser Val Cys151 Pro Leu Asn Gly Asn His Thr Gly Tyr Asp Glu Glu Cys Glu Lys166 Ala Ser Ser Thr Gln Tyr Phe Trp Tyr Arg Lys Thr Leu Asn Ile181 Ser Pro Ser Leu Gln Glu Asn Gly Gly Val Gln Trp Glu Pro Ala196 Leu Cys Leu Leu Leu Ala Trp Leu Val Val Tyr Leu Cys Ile Leu211 Arg Gly Thr Glu Ser Thr Gly Lys Val Val Tyr Phe Thr Ala Ser226 Leu Pro Tyr Cys Val Leu Ile Ile Tyr Leu Ile Arg Gly Leu Thr241 Leu His Gly Ala Thr Asn Gly Leu Met Tyr Met Phe Thr Pro Lys256 Ile Glu Gln Leu Ala Asn Pro Lys Ala Trp Ile Asn Ala Ala Thr271 Gln Ile Phe Phe Ser Leu Gly Leu Gly Phe Gly Ser Leu Ile Ala286 Phe Ala Ser Tyr Asn Glu Pro Ser Asn Asn Cys Gln Lys His Ala301 Ile Ile Val Ser Leu Ile Asn Ser Phe Thr Ser Ile Phe Ala Ser316 Ile Val Thr Phe Ser Ile Tyr Gly Phe Lys Ala Thr Phe Asn Tyr331 Glu Asn Cys Leu Lys Lys Val Ser Leu Leu Leu Thr Asn Thr Phe346 Asp Leu Glu Asp Gly Phe Leu Thr Ala Ser Asn Leu Glu Gln Val361 Lys Gly Tyr Leu Ala Ser Ala Tyr Pro Ser Lys Tyr Ser Glu Met376 Phe Pro Gln Ile Lys Asn Cys Ser Leu Glu Ser Glu Leu Asp Thr391 Ala Val Gln Gly Thr Gly Leu Ala Phe Ile Val Tyr Thr Glu Ala406 Ile Lys Asn Met Glu Val Ser Gln Leu Trp Ser Val Leu Tyr Phe421 Phe Met Leu Leu Met Leu Gly Ile Gly Ser Met Leu Gly Asn Thr436 Ala Ala Ile Leu Thr Pro Leu Thr Asp Ser Lys Ile Ile Ser Ser451 His Leu Pro Lys Glu Ala Ile Ser Gly Leu Val Cys Leu Val Asn466 Cys Ala Ile Gly Met Val Phe Thr Met Glu Ala Gly Asn Tyr Trp481 Phe Asp Ile Phe Asn Asp Tyr Ala Ala Thr Leu Ser Leu Leu Leu496 Ile Val Leu Val Glu Thr Ile Ala Val Cys Tyr Val Tyr Gly Leu511 Arg Arg Phe Glu Ser Asp Leu Lys Ala Met Thr Gly Arg Ala Val526 Ser Trp Tyr Trp Lys Val Met Trp Ala Gly Val Ser Pro Leu Leu541 Ile Val Ser Leu Phe Val Phe Tyr Leu Ser Asp Tyr Ile Leu Thr556 Gly Thr Leu Lys Tyr Gln Ala Trp Asp Ala Ser Gln Gly Gln Leu571 Val Thr Lys Asp Tyr Pro Ala Tyr Ala Leu Ala Val Ile Gly Leu586 Leu Val Ala Ser Ser Thr Met Cys Ile Pro Leu Ala Ala Leu Gly601 Thr Phe Val Gln Arg Arg Leu Lys Arg Gly Asp Ala Asp Pro Val616 Ala(2)SEQ ID NO.7的信息
(ⅰ)序列特征
 (A)长度:32碱基
 (B)类型:核酸
 (C)链性:单链
 (D)拓扑结构:线性
(ⅱ)分子类型:寡核苷酸
(ⅹⅰ)序列描述:SEQ ID NO.7:TCAGGTCGAC ATGAGATTAG CAATTAAAAA AC    32(2)SEQ ID NO.8的信息
(ⅰ)序列特征
 (A)长度:29碱基
 (B)类型:核酸
 (C)链性:单链
 (D)拓扑结构:线性
(ⅱ)分子类型:寡核苷酸
(ⅹⅰ)序列描述:SEQ ID NO.8:TTGGAAGCTT TCAGGCCACG GGGTCTGCG    29(2)SEQID NO.9的信息
(ⅰ)序列特征
 (A)长度:32碱基
 (B)类型:核酸
 (C)链性:单链
 (D)拓扑结构:线性
(ⅱ)分子类型:寡核苷酸
(ⅹⅰ)序列描述:SEQ ID NO.9:TCAGAAGCTT ATGAGATTAG CAATTAAAAA AC    32(2)SEQ ID NO.10的信息
(ⅰ)序列特征
 (A)长度:29碱基
 (B)类型:核酸
 (C)链性:单链
 (D)拓扑结构:线性
(ⅱ)分子类型:寡核苷酸
(ⅹⅰ)序列描述:SEQ ID NO.10:TTGGGAATTC TCAGGCCACG GGGTCTGCG    29

Claims (10)

1.一种分离出的DNA分子,其特征在于,它包括:编码具有人NTrB21a蛋白活性的多肽的核苷酸序列,
所述的核苷酸序列与SEQ ID NO.5中从核苷酸47-1897位的核苷酸序列有至少70%的同源性;或者
所述的核苷酸序列能在中度严紧条件下与SEQ ID NO.5中从核苷酸47-1897位的核苷酸序列杂交。
2.如权利要求1所述的DNA分子,其特征在于,所述的序列编码一多肽,该多肽具有SEQ ID NO.6所示的序列。
3.如权利要求1所述的DNA分子,其特征在于,该序列具有SEQ ID NO.5中从核苷酸47-1897位的核苷酸序列。
4.一种分离的人NTrB21a蛋白多肽,其特征在于,它包括:具有SEQID NO.6氨基酸序列的多肽、或其保守性变异多肽、或其活性片段、或其活性衍生物。
5.如权利要求4所述的多肽,其特征在于,该多肽是具有SEQ ID NO.6序列的多肽。
6.一种载体,其特征在于,它含有权利要求1所述的DNA。
7.一种用权利要求6所述载体转化的宿主细胞。
8.一种产生具有人NTrB21a蛋白活性的多肽的方法,其特征在于,该方法包括:
(a)将编码具有人NTrB21a蛋白活性的多肽的核苷酸序列可操作地连于表达调控序列,形成人NTrB21a蛋白表达载体,所述的核苷酸序列与SEQ ID NO.5中从核苷酸47-1897位的核苷酸序列有至少70%的同源性;
(b)将步骤(a)中的表达载体转入宿主细胞,形成人NTrB21a蛋白的重组细胞;
(c)在适合表达人NTrB21a蛋白多肽的条件下,培养步骤(b)中的重组细胞;
(d)分离出具有人NTrB21a蛋白活性的多肽。
9.一种能与权利要求4所述的人NTrB21a蛋白多肽特异性结合的抗体。
10.一种探针分子,其特征在于,它含有权利要求1所述的DNA分子中8-100个连续核苷酸。
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* Cited by examiner, † Cited by third party
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EP1627922A1 (en) * 2004-08-18 2006-02-22 Sanofi-Aventis Deutschland GmbH Method of screening for a carnitine transporter agonist or antagonist and its uses
US7033790B2 (en) 2001-04-03 2006-04-25 Curagen Corporation Proteins and nucleic acids encoding same

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