CN1264740A - 人尿苷酸-胞苷酸激酶及其编码序列,以及制法和用途 - Google Patents

人尿苷酸-胞苷酸激酶及其编码序列,以及制法和用途 Download PDF

Info

Publication number
CN1264740A
CN1264740A CN99102449A CN99102449A CN1264740A CN 1264740 A CN1264740 A CN 1264740A CN 99102449 A CN99102449 A CN 99102449A CN 99102449 A CN99102449 A CN 99102449A CN 1264740 A CN1264740 A CN 1264740A
Authority
CN
China
Prior art keywords
sequence
uck
polypeptide
people
seq
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN99102449A
Other languages
English (en)
Other versions
CN1151259C (zh
Inventor
余龙
赵勇
傅强
张宏来
赵寿元
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Fudan University
Original Assignee
Fudan University
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Fudan University filed Critical Fudan University
Priority to CNB991024494A priority Critical patent/CN1151259C/zh
Publication of CN1264740A publication Critical patent/CN1264740A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN1151259C publication Critical patent/CN1151259C/zh
Anticipated expiration legal-status Critical
Expired - Fee Related legal-status Critical Current

Links

Images

Classifications

    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02PCLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
    • Y02P20/00Technologies relating to chemical industry
    • Y02P20/50Improvements relating to the production of bulk chemicals
    • Y02P20/52Improvements relating to the production of bulk chemicals using catalysts, e.g. selective catalysts

Landscapes

  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Abstract

本发明提供了人尿苷酸-胞苷酸激酶(UMP-CMP激酶,UCK)及其编码cDNA序列,该激酶是猪UMP-CMP激酶的同系物。本发明还涉及这些多肽和核酸编码序列的应用,以及所述核酸序列和所述多肽的生产方法。

Description

人尿苷酸-胞苷酸激酶及其编码序列,以及制法和用途
本发明涉及基因工程领域,具体地,本发明涉及一种新的人基因核苷酸序列。更具体地说,本发明涉及人尿苷酸-胞苷酸激酶(UMP-CMP激酶,UCK)的cDNA序列,其编码的蛋白是猪UMP-CMP激酶的同系物。本发明还涉及由该核苷酸序列编码的多肽,这些多核苷酸和多肽的应用,以及所述多核苷酸和所述多肽的生产方法。
单磷酸核苷酸激酶(EC 2.7.4.-)是一个分布十分广泛的酶,它普遍存在于各种原核生物和真核生物中。单磷酸核苷酸激酶能够催化三磷酸核苷酸与单磷酸核苷酸间可逆的磷酸基团的转移,它在生物核苷酸合成的补救途径中发挥关键作用,从而有着重要的生物学意义。其反应一般可以表示为
                 ATP+NMP←→ADP+NDP
根据对底物的选择性的差异,可以把单磷酸核苷酸激酶进一步分为腺苷酸激酶(AMP kinase,AK)、尿苷酸/胞苷酸激酶(UMP/CMP kinase,UCK)、鸟苷酸激酶(GMP kinase)和胸苷酸激酶(TMP kinase)。其中,AK是研究最为深入的一个酶。根据AK结构及其它生物学特性的差异,又可以的AK类激酶划分为AK1、AK2和AK3亚类。其中AK1位于脊椎动物的胞质区,AK2位于线粒体膜间区和胞质中,而AK3位于线粒体基质中。并且AK3更倾向于高效地利用GTP作为磷酸基团的供体(Nakazawa,A.et al. Progr.Clin.Biol.Res.334:495-514,1990)。通常,虽然单磷酸核苷酸激酶对磷酸基团供体的选择性并不是很高,但却更倾向使用ATP为供体。另外,AK2和AK3较之其它成员的蛋白质序列长了近30个残基,这一差别源于在一个所谓“LID区”的长度不同。
UCK(EC 2.7.4.14)是一种在进化上与AK相关的激酶。
生物体内的核苷酸的合成除能以简单前体物质进行所谓的“从头合成”以外,尚能由预先形成的碱基和核苷合成核苷酸,即通过所谓“补救途径”。这其中,嘧啶核苷酸的通过核苷酸激酶的补救途径对于生物来说尤为重要,这其中UCK起着关键的作用。
迄今为止,已有15个来源不同的UCK蛋白的全长或部分的氨基酸/核苷酸序列被公布。早在1989年,Liljielund,P.等人就从酿酒酵母中分离到了UCK的cDNA顺序(Liljielund,P.et al.Biochem.Biophys.Res.Commun.165:464-473,1989)。1990年,Wiesmuller,L.等又从粘菌(Dictyostelium discoideum)的lambdagt11 cDNA文库中得到了一个编码UCK的cDNA克隆(Wiesmuller,L.et al.J.Biol.Chem.265(11):6339-6345,1990)。哺乳动物中第一个UCK来自猪,它是Okajima,T.等从猪脑的lambda gt11 cDNA文库中分离到的(Okajima,T.et al.J.Biochem.117(5):980-986)。猪的UCK蛋白序列与来自酵母和粘菌的UCK蛋白序列有约50%的一致性。人的UCK蛋白部分序列(N端1-19aa)也已公布(SP|P30085),然而,其全长蛋白及核酸序列尚未见报导。
本发明的一个目的是提供一种新的多核苷酸,该多核苷酸编码UMP-CMP激酶家族的一个新成员,本发明的UMP-CMP激酶家族成员被命名为人UCK。
本发明的另一个目的是提供一种新的UMP-CMP激酶家族成员即人UCK,该蛋白被命名为人UCK蛋白。
本发明的再一个目的是提供一种利用重组技术生产所述的新的人UCK激酶的方法。
本发明还提供了这种人的UMP-CMP激酶核酸序列和多肽的应用。
在本发明的一个方面,提供了一种分离出的DNA分子,它包括:编码具有人UCK蛋白活性的多肽的核苷酸序列,所述的核苷酸序列与SEQ ID NO.3中从核苷酸57-647位的核苷酸序列有至少70%的同源性;或者所述的核苷酸序列能在中度严紧条件下与SEQ ID NO.3中从核苷酸57-647位的核苷酸序列杂交。较佳地,所述的序列编码一多肽,该多肽具有SEQ ID NO.4所示的序列。更佳地,该序列具有SEQ ID NO.3中从核苷酸57-647位的核苷酸序列。
在本发明的另一方面,提供了一种分离的人UCK蛋白多肽,它包括:具有SEQ ID NO.4氨基酸序列的多肽、或其保守性变异多肽、或其活性片段,或其活性衍生物。较佳地,该多肽是具有SEQ ID NO.4序列的多肽。
在本发明的另一方面,提供了一种载体,它含有上述分离出的DNA。
在本发明的另一方面,提供了一种所述载体转化的宿主细胞。
在本发明的另一方面,提供了一种产生具有人UCK蛋白活性的多肽的方法,该方法包括:
(a)将编码具有人UCK蛋白活性的多肽的核苷酸序列可操作地连于表达调控序列,形成人UCK蛋白表达载体,所述的核苷酸序列与SEQ ID NO.3中从核苷酸57-647位的核苷酸序列有至少70%的同源性;
(b)将步骤(a)中的表达载体转入宿主细胞,形成人UCK蛋白的重组细胞;
(c)在适合表达人UCK蛋白多肽的条件下,培养步骤(b)中的重组细胞;
(d)分离出具有人UCK蛋白活性的多肽。
在本发明的一个具体实施方案中,本发明的分离的多核苷酸全长为781个核苷酸,其详细序列见SEQ ID NO.3,其中开放读框位于57-647位核苷酸。
在本发明中,“分离的”、“纯化的”或“基本纯的”DNA是指,该DNA或片段已从天然状态下位于其两侧的序列中分离出来,还指该DNA或片段已经与天然状态下伴随核酸的组份分开,而且已经与在细胞中伴随其的蛋白质分开。
在本发明中,术语“人UCK蛋白(或多肽)编码序列”指编码具有人UCK蛋白活性的多肽的核苷酸序列,如SEQ ID NO.3中57-647位核苷酸序列及其简并序列。该简并序列是指,位于SEQ ID NO.3序列的编码框57-647位核苷酸中,有一个或多个密码子被编码相同氨基酸的简并密码子所取代后而产生的序列。由于密码子的简并性,所以与SEQ ID NO.3中57-647位核苷酸序列同源性低至约70%的简并序列也能编码出SEQ ID NO.4所述的序列。该术语还包括能在中度严紧条件下,更佳地在高度严紧条件下,与SEQ ID NO.3中从核苷酸57-647位的核苷酸序列杂交的核苷酸序列。还术语还包括与SEQ ID NO.3中从核苷酸57-647位的核苷酸序列的同源性至少70%,较佳地至少85%,更佳地至少95%,最佳至少98%的核苷酸序列。
该术语还包括能编码具有与人UCK相同功能的蛋白的、SEQ ID NO.4序列的变异形式。这些变异形式包括(但并不限于):若干个(通常为1-90个,较佳地1-60个,更佳地1-20个,最佳地1-10个)核苷酸的缺失、插入和/或取代,以及在5’和/或3’端添加数个(通常为60个以内,较佳地为30个以内,更佳地为10个以内,最佳地为5个以内)核苷酸。
在本发明中,“基本纯的”蛋白质或多肽是指其至少占样品总物质的至少20%,较佳地至少50%,更佳地至少80%,最佳地至少90%(按干重或湿重计)。纯度可以用任何合适的方法进行测量,如用柱层析、PAGE或HPLC法测量多肽的纯度。基本纯的多肽基本上不含天然状态下的伴随其的组分。
在本发明中,术语“人UCK蛋白多肽”指具有人UCK蛋白活性的SEQ ID NO.4序列的多肽。该术语还包括具有与人UCK相同功能的、SEQ ID NO.4序列的变异形式。这些变异形式包括(但并不限于):若干个(通常为1-50个,较佳地1-30个,更佳地1-20个,最佳地1-10个)氨基酸的缺失、插入和/或取代,以及在C末端和/或N末端添加一个或数个(通常为20个以内,较佳地为10个以内,更佳地为5个以内)氨基酸。例如,在本领域中,用性能相近或相似的氨基酸进行取代时,通常不会改变蛋白质的功能。又比如,在C末端和/或N末端添加一个或数个氨基酸通常也不会改变蛋白质的功能。该术语还包括人UCK蛋白的活性片段和活性衍生物。
该多肽的变异形式包括:同源序列、保守性变异体、等位变异体、天然突变体、诱导突变体、在高或低的严紧度条件下能与人UCK DNA杂交的DNA所编码的蛋白、以及利用抗人UCK多肽的抗血清获得的多肽或蛋白。本发明还提供了其他多肽,如包含人UCK多肽或其片段的融合蛋白。除了几乎全长的多肽外,本发明还包括了人UCK多肽的可溶性片段。通常,该片段具有人UCK多肽序列的至少约10个连续氨基酸,通常至少约30个连续氨基酸,较佳地至少约50个连续氨基酸,更佳地至少约80个连续氨基酸,最佳地至少约100个连续氨基酸。
发明还提供人UCK蛋白或多肽的类似物。这些类似物与天然人UCK多肽的差别可以是氨基酸序列上的差异,也可以是不影响序列的修饰形式上的差异,或者兼而有之。这些多肽包括天然或诱导的遗传变异体。诱导变异体可以通过各种技术得到,如通过辐射或暴露于诱变剂而产生随机诱变,还可通过定点诱变法或其他已知分子生物学的技术。类似物还包括具有不同于天然L-氨基酸的残基(如D-氨基酸)的类似物,以及具有非天然存在的或合成的氨基酸(如β、γ-氨基酸)的类似物。应理解,本发明的多肽并不限于上述例举的代表性的多肽。
修饰(通常不改变一级结构)形式包括:体内或体外的多肽的化学衍生形式如乙酰化或羧基化。修饰还包括糖基化,如那些在多肽的合成和加工中或进一步加工步骤中进行糖基化修饰而产生的多肽。这种修饰可以通过将多肽暴露于进行糖基化的酶(如哺乳动物的糖基化酶或去糖基化酶)而完成。修饰形式还包括具有磷酸化氨基酸残基(如磷酸酪氨酸,磷酸丝氨酸,磷酸苏氨酸)的序列。还包括被修饰从而提高了其抗蛋白水解性能或优化了溶解性能的多肽。
在本发明中,“人UCK保守性变异多肽”指与SEQ ID No.4的氨基酸序列相比,有至多10个,较佳地至多8个,更佳地至多5个,最佳地至多3个氨基酸被性质相似或相近的氨基酸所替换而形成多肽。这些保守性变异多肽最好根据表1
                    进行氨基酸替换而产生。
                       表1
  最初的残基   代表性的取代   优选的取代
   Ala(A)   Val;Leu;Ile     Val
   Arg(R)   Lys;Gln;Asn     Lys
   Asn(N)   Gln;His;Lys;Arg     Gln
   Asp(D)   Glu     Glu
   Cys(C)   Ser     Ser
   Gln(Q)   Asn     Asn
   Glu(E)   Asp     Asp
   Gly(G)   Pro;Ala     Ala
   His(H)   Asn;Gln;Lys;Arg     Arg
   Ile(I)   Leu;Val;Met;Ala;Phe     Leu
   Leu(L)   Ile;Val;Met;Ala;Phe     Ile
   Lys(K)   Arg;Gln;Asn     Arg
   Met(M)   Leu;Phe;Ile     Leu
   Phe(F)   Leu;Val;Ile;Ala;Tyr     Leu
   Pro(P)   Ala     Ala
   Ser(S)   Thr     Thr
   Thr(T)   Ser     Ser
   Trp(W)   Tyr;Phe     Tyr
   Tyr(Y)   Trp;Phe;Thr;Ser     Phe
   Val(V)   Ile;Leu;Met;Phe;Ala     Leu
本发明还包括人UCK多肽编码序列及其片段的反义序列。这种反义序列可用于抑制细胞内人UCK的表达。
本发明还包括一种可用作探针的核酸分子,该分子通常具有人UCK多肽编码序列的8-100个,较佳地15-50个连续核苷酸。该探针可用于检测样品中是否存在编码人UCK的核酸分子。
本发明还包括检测人UCK核苷酸序列的方法,它包括用上述的探针与样品进行杂交,然后检测探针是否发生了结合。较佳地,该样品是PCR扩增后的产物,其中PCR扩增引物对应于人UCK多肽的编码序列,并可位于该编码序列的两侧或中间。引物长度一般为20-50个核苷酸。
在本发明中,可选用本领域已知的各种载体,如市售的载体。比如,选用市售的载体,然后将编码本发明多肽的核苷酸序列可操作地连于表达调控序列,可以形成蛋白表达载体。
如本文所用,“可操作地连于”指这样一种状况,即线性DNA序列的某些部分能够影响同一线性DNA序列其他部分的活性。例如,如果信号肽DNA作为前体表达并参与多肽的分泌,那么信号肽(分泌前导序列)DNA就是可操作地连于多肽DNA;如果启动子控制序列的转录,那么它是可操作地连于编码序列;如果核糖体结合位点被置于能使其翻译的位置时,那么它是可操作地连于编码序列。一般,“可操作地连于”意味着相邻近,而对于分泌前导序列则意味着在阅读框中相邻。
在本发明中,术语“宿主细胞”包括原核细胞和真核细胞。常用的原核宿主细胞的例子包括大肠杆菌、枯草杆菌等。常用的真核宿主细胞包括酵母细胞,昆虫细胞、和哺乳动物细胞。较佳地,该宿主细胞是真核细胞,如CHO细胞、COS细胞等。
另一方面,本发明还包括对人UCK DNA或是其片段编码的多肽具有特异性的多克隆抗体和单克隆抗体,尤其是单克隆抗体。这里,“特异性”是指抗体能结合于人UCK基因产物或片段。较佳地,指那些能与人UCK基因产物或片段结合但不识别和结合于其它非相关抗原分子的抗体。本发明中抗体包括那些能够结合并抑制人UCK蛋白的分子,也包括那些并不影响人UCK蛋白功能的抗体。本发明还包括那些能与修饰或未经修饰形式的人UCK基因产物结合的抗体。
本发明不仅包括完整的单克隆或多克隆抗体,而且还包括具有免疫活性的抗体片段,如Fab′或(Fab)2片段;抗体重链;抗体轻链;遗传工程改造的单链Fv分子(Ladner等人,美国专利No.4,946,778);或嵌合抗体,如具有鼠抗体结合特异性但仍保留来自人的抗体部分的抗体。
本发明的抗体可以通过本领域内技术人员已知的各种技术进行制备。例如,纯化的人UCK基因产物或者其具有抗原性的片段,可被施用于动物以诱导多克隆抗体的产生。与之相似的,表达人UCK或其具有抗原性的片段的细胞可用来免疫动物来生产抗体。本发明的抗体也可以是单克隆抗体。此类单克隆抗体可以利用杂交瘤技术来制备(见Kohler等人,Nature 256;495,1975;Kohler等人,Eur.J.Immunol.6:511,1976;Kohler等人,Eur.J.Immunol.6:292,1976;Hammerling等人,In Monoclonal Antibodies and T Cell Hybridomas,Elsevier,N.Y.,1981)。本发明的抗体包括能阻断人UCK功能的抗体以及不影响人UCK功能的抗体。本发明的各类抗体可以利用人UCK基因产物的片段或功能区,通过常规免疫技术获得。这些片段或功能区可以利用重组方法制备或利用多肽合成仪合成。与人UCK基因产物的未修饰形式结合的抗体可以用原核细胞(例如E.Coli)中生产的基因产物来免疫动物而产生;与翻译后修饰形式结合的抗体(如糖基化或磷酸化的蛋白或多肽),可以用真核细胞(例如酵母或昆虫细胞)中产生的基因产物来免疫动物而获得。
本发明的人UCK核苷酸全长序列或其片段通常可以用PCR扩增法、重组法或人工合成的方法获得。对于PCR扩增法,可根据本发明所公开的有关核苷酸序列,尤其是开放阅读框序列来设计引物,并用市售的cDNA库或按本领域技术人员已知的常规方法所制备的cDNA库作为模板,扩增而得有关序列。当序列较长时,常常需要进行两次或多次PCR扩增,然后再将各次扩增出的片段按正确次序拼接在一起。
一旦获得了有关的序列,就可以用重组法来大批量地获得有关序列。这通常是将其克隆入载体,再转入细胞,然后通过常规方法从增殖后的宿主细胞中分离得到有关序列。
此外,还可用人工合成的方法来合成有关序列,尤其是片段长度较短时。通常,通过先合成多个小片段,然后再进行连接可获得序列很长的片段。
在本发明的一个实施例中,人UCK的cDNA核苷酸序列是如此获得的,以人肾λgt11cDNA文库(购自Clontech公司)为模板,用一对寡核苷酸为引物——A:5’-GCCTTAGCTTCCTGCTGCAGACC-3′为正向引物,寡核苷酸B:5′-GTTTTACCATGTACTTTCCAGCCAC-3’为反向引物,进行PCR。测序后得到SEQ ID NO.3的全长cDNA序列。
UCK能够催化ATP与UMP或CMP之间的磷酸基团转换反应,其结果是生成UDP或CDP。这一反应是生物体内的嘧啶类物质再循环利用(即所谓嘧啶核苷合成的补救途径)的重要环节,对于胞嘧啶来说更是如此。因此,UCK对于生物体来说具有重要的生物学意义
图1为本发明的人UCK(humUCK)与猪UCK(pigUCK)的氨基酸序列的同源比较图。
下面结合具体实施例,进一步阐述本发明。应理解,这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件如Sambrook等人,分子克隆:实验室手册(New York:Cold Spring HarborLaboratory Press,1989)中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件。
实施例1
人UCK的cDNA序列的克隆和测定
1.引物扩增
以人肾λgt11cDNA文库(购自Clontech公司)为模板,用一对寡核苷酸为引物——A:5’-GCCTTAGCTTCCTGCTGCAGACC-3’(SEQ ID NO:1)为正向引物,寡核苷酸B:5’-GTTTTACCATGTACTTTCCAGCCAC-3’(SEQ ID NO:2)为反向引物,进行PCR。A/B的PCR条件为93℃4分钟,随之以93℃1分钟、66℃1分钟和72℃1分钟进行35个循环,最后72℃延伸5分钟。电泳检测得到约800bp的目的片段。
2.PCR产物的测序
将上述PCR扩增产物AB与pGEM-T载体(Promega)连接,转化大肠杆菌JM103,用QIAprep Plasmid试剂盒(QIAGEN)提取质粒,用双链嵌套式缺失试剂盒(Pharmacia)对插入片段进行定向系列缺失,然后用PCR对缺失子进行快速鉴定及排序。用SequiTherm EXCELTMDNA测序试剂盒(Epicentre Technologies)对依次截短的缺失子进行测序,最后用电脑软件拼接顺序,获得全长cDNA序列,共781bp,详细序列见SEQ ID NO:3,其中开放读框位于57-647位核苷酸。
根据得到的全长基因组序列推导出人UCK的氨基酸序列,共196个氨基酸残基,其氨基酸序列详见SEQ ID NO:4。
实施例2
同源比较
用本发明的人UCK的全长cDNA序列及其编码蛋白,在Non-redundantGenBank+EMBL+DDBJ+PDB数据库及Non-redundant GenBank CDStranslations+PDB+SwissProt+Spupdate+PIR数据库中,用BLAST程序进行核酸和蛋白同源检索。结果发现,它们与UCK和AK基因及其编码蛋白具有广泛的同源性,特别是与猪的UCK的氨基酸一致性达到了97%(图1)。
生物体内的核苷酸的合成除能以简单前体物质进行所谓的“从头合成”以外,尚能由预先形成的碱基和核苷合成核苷酸,即通过所谓“补救途径”。但是在生物体内,除腺苷酸激酶外缺乏其它嘌呤核苷酸激酶。显然在嘌呤类物质的再利用过程中,核苷酸激酶途径即使不能排除,也是不重要的。然而嘧啶核苷酸激酶在嘧啶的补救途径中却起着重要作用。尿嘧啶核苷酸可以以两种形式的补救途径合成:1)与5-磷酸核糖焦磷酸反应;2)尿嘧啶与1-磷酸核糖反应产生尿嘧啶核苷,后者在UCK作用下被磷酸化而形成尿嘧啶核苷酸。而胞嘧啶不能直接与5-磷酸核糖焦磷酸反应生成胞嘧啶核苷酸,但它能被UTK催化而生成胞嘧啶核苷酸。
本发明的人UCK除了可作为该家族一员用于进一步的功能研究,还可用于与其他蛋白一起产生融合蛋白,比如与免疫球蛋白一起产生融合蛋白。此外,本发明人UCK还可以与该家族的其他成员进行融合或交换片段,以产生新的蛋白。例如将本发明的人UCK的N端与猪UCK的N端进行交换,以产生新的活性更高或具有新特性的蛋白。
针对本发明人UCK的抗体,用于筛选该家族的其他成员,或者用于亲和纯化相关蛋白(如该家族的其他成员)。
此外,本发明人UCK核酸(编码序列或反义序列)可以被引入细胞,以提高人UCK的表达水平或者抑制人UCK的过度表达。本发明的人UCK蛋白或其活性多肽片段可以施用于病人,以治疗或减轻因人UCK缺失、无功能或异常而导致的有关病症。此外,还可以用基于本发明的核酸序列或抗体进行有关的诊断或预后判断。
实施例3
人UCK在大肠杆菌中的表达
在该实施例中,以实施例1中PCR扩增产物A/B为模板,将编码人UCK的cDNA序列用对应于该DNA序列的5′和3′端的PCR寡核苷酸引物进行扩增,获得人UCK cDNA作为插入片段。
PCR反应中使用的5′寡核苷酸引物序列为:
5′-TCAGGGATCCATGAAGCCGCTGGTCGTGT-3′(SEQ ID NO.5),该引物含有BamHI限制性内切酶的酶切位点,在该酶切位点之后是由起始密码子开始的人UCK编码序列的19个核苷酸;
3′端引物序列为:
5’-TTGGAAGCTT TTAGCCTTCCTTGTCAAAAAT-3’(SEQ ID NO.6),该引物含有HindIII限制性内切酶的酶切位点、翻译终止子和人UCK的部分编码序列。
引物上的限制性内切酶的酶切位点对应于细菌表达载体pQE-9(Qiagen Inc..Chatsworth,CA)上的限制性内切酶酶切位点,该质粒载体编码抗生素抗性(Ampr)、一个细菌复制起点(ori)、一个IPTG-可调启动子/操纵子(P/O)、一个核糖体结合位点(RBS)、一个6-组氨酸标记物(6-His)以及限制性内切酶克隆位点。
用BamHI和HindIII消化pQE-9载体及插入片段,随后将插入片段连接到pQE-9载体并保持开放读框在细菌RBS起始。随后用连接混合物转化购自Qiagen,商品名为M15/rep4的E.coli菌株,M15/rep4含有多拷贝的质粒pREP4,其表达lacI阻遏物并携带卡那霉素抗性(Kanr)。在含有Amp和Kan的LB培养皿上筛选转化子,抽提质粒,测序验证人UCK的cDNA片段已正确插入了载体。
在补加Amp(100μg/ml)和Kan(25μg/ml)的LB液体培养基中过夜培养(O/N)含所需构建物的阳性转化子克隆。过夜(O/N)培养物以1∶100-1∶250的稀释率稀释,然后接种到大体积培养基中,培养细胞生长至600光密度(OD600)为0.4-0.6时,加入IPTG(“异丙基硫代-β-D-半乳糖苷”)至终浓度为1mM。通过使lacI阻遏物失活,IPTG诱导启动P/O导致基因表达水平提高。继续培养细胞3-4小时,随后离心(6000×g,20分钟)。超声裂解包涵体,收集细胞并将细胞沉淀溶于6M的盐酸胍中。澄清后,通过在能使含6-His标记物蛋白紧密结合的条件下,用镍-螯合柱层析从溶液中纯化溶解的人UCK。用6M盐酸胍(pH5.0)从柱中洗脱人UCK。可用几种方法从盐酸胍中变性沉淀蛋白。或者,使用透析步骤除去盐酸胍,或者从镍-螯合柱中分离出的纯化蛋白。纯化后的蛋白质被结合到第二个柱中,该柱中具有递减的线性盐酸胍梯度。在结合到该柱时蛋白质变性,随后用盐酸胍(pH5.0)洗脱。最后,将可溶的蛋白质用PBS进行透析,然后将蛋白质保存在终浓度为10%(w/v)甘油的贮存液中。
用12%的SDS-PAGE胶进行电泳,鉴定表达蛋白的分子量大小为约22KDa。
此外,用常规方法对达蛋白的N端和C端各10个氨基酸长度的氨基酸进行测序,发现与SEQ ID NO.4的序列一致。
实施例4
人UCK在真核细胞(CHO细胞株)中的表达
在该实施例中,以实施例1中PCR扩增产物A/B为模板,将编码人UCK的cDNA序列用对应于该DNA序列的5′和3′端的PCR寡核苷酸引物进行扩增,获得人UCK cDNA作为插入片段。
PCR反应中使用的5′寡核苷酸引物序列为:
5′-TCAGAAGCTTATGAAGCCGCTGGTCGTGT-3′(SEQ ID NO.7)
该引物含有HindIII限制性内切酶的酶切位点,在该酶切位点之后是由起始密码子开始的人UCK编码序列的19个核苷酸;
3′端引物序列为:
5’-TTGGGGATCCTTAGCCTTCCTTGTCAAAAAT-3’(SEQ ID NO.8)
该引物含有BamHI限制性内切酶的酶切位点、一个翻译终止子和人UCK的部分编码序列。
引物上的限制性内切酶的酶切位点对应于CHO细胞表达载体pcDNA3上的限制性内切酶酶切位点,该质粒载体编码抗生素抗性(Ampr和Neor)、一个噬菌体复制起点(fl ori)、一个病毒复制起点(SV40 ori)、一个T7启动子、一个病毒启动子(P-CMV)、一个Sp6启动子、一个SV40启动子、一个SV40加尾信号和相应的polyA顺序、一个BGH加尾信号和相应的polyA顺序。
用HindIII和BamHI消化pcDNA3载体及插入片段,随后将插入片段连接到pcDNA3载体。随后用连接混合物转化E.coli DH5α菌株。在含有Amp的LB培养皿上筛选转化子,在补加Amp(100μg/ml)的LB液体培养基中过夜培养(O/N)含所需构建物的克隆。抽提质粒,测序验证人UCK的cDNA片段已正确插入了载体。
质粒转染CHO细胞是采用脂转染法,用Lipofectin(GiBco Life)进行的。转染48小时后,经2-3周的持续G418加压筛选,收集细胞及细胞上清测定表达蛋白酶活力。去G418,连续传代培养;对混合克隆细胞极限稀释,选择具有较高蛋白活性的细胞亚克隆。按常规方法大量培养上述阳性亚克隆。48小时后,开始收集细胞及上清,用超声裂解方法破碎细胞。以含0.05%Triton的50mMTris HCl(pH7.6)溶液为平衡液及洗脱液,用经预平衡的Superdex G-75柱收集上述蛋白的活性峰。再用50mMTris HCl(pH8.0)平衡的DEAE-Sepharose柱,以含0-1M NaCl的50mMTrisáHCl(pH8.0)溶液为洗脱液进行梯度洗脱,收集上述蛋白的活性峰。然后以PBS(pH7.4)为透析液对表达蛋白溶液进行透析。最后冻干保存。
用12%的SDS-PAGE胶进行电泳,鉴定表达蛋白的分子量大小为22Da。
此外,用常规方法对达蛋白的N端和C端各10个氨基酸长度的氨基酸进行测序,发现与SEQ ID NO.4的序列一致。
实施例5
制备抗体
将实施例3和4中获得的重组蛋白用来免疫动物以产生抗体,具体方法如下。重组分子用层析法进行分离后备用。也可用SDS-PAGE凝胶电泳法进行分离,将电泳条带从凝胶中切下,并用等体积的完全Freund’s佐剂乳化。用50-100μg/0.2ml乳化过的蛋白,对小鼠进行腹膜内注射。14天后,用非完全Freund’s佐剂乳化的同样抗原,对小鼠以50-100μg/0.2ml的剂量进行腹膜内注射以加强免疫。每隔14天进行一次加强免疫,至少进行三次。获得的抗血清的特异反应活性用它在体外沉淀人UCK基因翻译产物的能力加以评估。结果发现,抗体可特异性地与本发明蛋白特异性地发生沉淀。
实施例6
酶活性测定
按Toshihide,O.等人报导的方法(J.Biochem.117,980-986,1995;FEBS lett.334,86-88,1993),在标准测试混合液(87mM三乙醇胺-HCl(pH 7.5),10mMMgCl2,100mM KCl,1mM磷酸烯醇丙酮酸,0.16mM NADH,1mM ATP,1mM UMP,20单位的丙酮酸激酶和20单位乳酸脱氢酶)中,对实施例3中分离到的人UCK蛋白进行酶活性测定。通过吸光度测量发现,在加有人UCK蛋白的反应体系中,ATP被消耗,从而证实人UCK可以催化如下反应:
                   ATP+UMP←→ADP+UDP
在本发明提及的所有文献都在本申请中引用作为参考,就如同每一篇文献被单独引用作为参考那样。此外应理解,在阅读了本发明的上述讲授内容之后,本领域技术人员可以对本发明作各种改动或修改,这些等价形式同样落于本申请所附权利要求书所限定的范围。
                    序列表(1)一般信息:(i)申请人:复旦大学(ii)发明名称:人尿苷酸-胞苷酸激酶及其编码序列,以及制法和用途(iii)序列数目:8(2)SEQ ID NO.1的信息(i)序列特征
 (A)长度:23碱基
 (B)类型:核酸
 (C)链性:单链
 (D)拓扑结构:线性(ii)分子类型:寡核苷酸(xi)序列描述:SEQ ID NO.1:GCCTTAGCTTCCTGCTGCAG ACC                                  23(2)SEQ ID NO.2的信息(i)序列特征
 (A)长度:25碱基
 (B)类型:核酸
 (C)链性:单链
 (D)拓扑结构:线性(ii)分子类型:寡核苷酸(xi)序列描述:SEQ ID NO:2:GTTTTACCAT GTACTTTCCA GCCAC                               25(2)SEQ ID NO.3的信息:  (i)序列特征:
 (A)长度:781bp
 (B)类型:核酸
 (C)链性:单链
 (D)拓扑结构:线性(ii)分子类型:cDNA(iii)序列描述:SEQ ID NO.3GCCTTAGCTT  CCTGCTGCAG  ACCCGCCGGC  CGATTCTCCT  CTGCTCTCCA  CGTCTCATGA   60AGCCGCTGGT  CGTGTTCGTC  CTCGGCGGCC  CCGGCGCCGG  CAAGGGGACC  CAGTGCGCCC  120GCATCGTCGA  GAAATATGGC  TACACACACC  TTTCTGCAGG  AGAGCTGCTT  CGTGATGAAA  180GGAAGAACCC  AGATTCACAG  TATGGTGAAC  TTATTGAAAA  GTACATTAAA  GAAGGAAAGA  240TTGTACCAGT  TGAGATAACC  ATCAGTTTAT  TAAAGAGGGA  AATGGATCAG  ACAATGGCTG  300CCAATGCTCA  GAAGAATAAA  TTCTTGATTG  ATGGGTTTCC  AAGAAATCAA  GACAACCTTC  360AAGGATGGAA  CAAGACCATG  GATGGGAAGG  CAGATGTATC  TTTCGTTCTC  TTTTTTGACT  420GTAATAATGA  GATTTGTATT  GAACGATGTC  TTGAGAGGGG  AAAGAGTAGT  GGTAGGAGTG  480ATGACAACAG  AGAGAGCTTG  GAAAAGAGAA  TTCAGACCTA  CCTTCAGTCA  ACAAAGCCAA  540TTATTGACTT  ATATGAAGAA  ATGGGGAAAG  TCAAGAAAAT  AGATGCTTCT  AAATCTGTTG  600ATGAAGTTTT  TGATGAAGTT  GTGCAGATTT  TTGACAAGGA  AGGCTAATTC  TAAACCTGAA  660AGCATCCTTG  AAATCATGCT  TGAATATTGC  TTTGATAGCT  GCTATCATGA  CCCCTTTTTA  720AGGCAATTCT  AATCTTTCAT  AACTACATCT  CAATTAGTGG  CTGGAAAGTA  CATGGTAAAA  780C                                                                      781(2)SEQ ID NO.4的信息:(i)序列特征:
 (A)长度:196个氨基酸
 (B)类型:氨基酸
 (D)拓扑结构:线性(ii)分子类型:多肽(xi)序列描述:SEQ ID NO.4Met Lys Pro Leu Val Val Phe Val Leu Gly Gly Pro Gly Ala Gly 15Lys Gly Thr Gln Cys Ala Arg Ile Val Glu Lys Tyr Gly Tyr Thr 30His Leu Ser Ala Gly Glu Leu Leu Arg Asp Glu Arg Lys Asn Pro 45Asp Ser Gln Tyr Gly Glu Leu Ile Glu Lys Tyr Ile Lys Glu Gly 60Lys Ile Val Pro Val Glu Ile Thr Ile Ser Leu Leu Lys Arg Glu 75Met Asp Gln Thr Met Ala Ala Asn Ala Gln Lys Asn Lys Phe Leu 90Ile Asp Gly Phe Pro Arg Asn Gln Asp Asn Leu Gln Gly Trp Asn 105Lys Thr Met Asp Gly Lys Ala Asp Val Ser Phe Val Leu Phe Phe 120Asp Cys Asn Asn Glu Ile Cys Ile Glu Arg Cys Leu Glu Arg Gly 135Lys Ser Ser Gly Arg Ser Asp Asp Asn Arg Glu Ser Leu Glu Lys 150Arg Ile Gln Thr Tyr Leu Gln Ser Thr Lys Pro Ile Ile Asp Leu 165Tyr Glu Glu Met Gly Lys Val Lys Lys Tle Asp Ala Ser Lys Ser 180Val Asp Glu Val Phe Asp Glu Val Val Gln Ile Phe Asp Lys Glu 195Gly                                                         196(2)SEQ ID NO.5的信息(i)序列特征
 (A)长度:29碱基
 (B)类型:核酸
 (C)链性:单链
 (D)拓扑结构:线性(ii)分子类型:寡核苷酸(xi)序列描述:SEQ ID NO.5:TCAGGGATCC ATGAAGCCGC TGGTCGTGT                           29(2)SEQ ID NO.6的信息(i)序列特征
 (A)长度:31碱基
 (B)类型:核酸
 (C)链性:单链
 (D)拓扑结构:线性(ii)分子类型:寡核苷酸(xi)序列描述:SEQ ID NO.6:TTGGAAGCTT TTAGCCTTCC TTGTCAAAAAT                         31(2)SEQ ID NO.7的信息(i)序列特征
 (A)长度:29碱基
 (B)类型:核酸
 (C)链性:单链
 (D)拓扑结构:线性(ii)分子类型:寡核苷酸(xi)序列描述:SEQ ID NO.7TCAGAAGCTT ATGAAGCCGC TGGTCGTGT                           29(2)SEQ ID NO.8的信息(i)序列特征
 (A)长度:31碱基
 (B)类型:核酸
 (C)链性:单链
 (D)拓扑结构:线性(ii)分子类型:寡核苷酸(xi)序列描述:SEQ ID NO.8:TTGGGGATCC TTAGCCTTCC TTGTCAAAAA T                        31

Claims (10)

1.一种分离出的DNA分子,其特征在于,它包括:编码具有人UCK蛋白活性的多肽的核苷酸序列,
所述的核苷酸序列与SEQ ID NO.3中从核苷酸57-647位的核苷酸序列有至少70%的同源性;或者
所述的核苷酸序列能在中度严紧条件下与SEQ ID NO.3中从核苷酸57-647位的核苷酸序列杂交。
2.如权利要求1所述的DNA分子,其特征在于,所述的序列编码一多肽,该多肽具有SEQ ID NO.4所示的序列。
3.如权利要求1所述的DNA分子,其特征在于,该序列具有SEQ ID NO.3中从核苷酸57-647位的核苷酸序列。
4.一种分离的人UCK蛋白多肽,其特征在于,它包括:具有SEQ ID NO.4氨基酸序列的多肽、或其保守性变异多肽、或其活性片段,或其活性衍生物。
5.如权利要求4所述的多肽,其特征在于,该多肽是具有SEQ ID NO.4序列的多肽。
6.一种载体,其特征在于,它含有权利要求1所述的DNA。
7.一种用权利要求6所述载体转化的宿主细胞。
8.一种产生具有人UCK蛋白活性的多肽的方法,其特征在于,该方法包括:
(a)将编码具有人UCK蛋白活性的多肽的核苷酸序列可操作地连于表达调控序列,形成人UCK蛋白表达载体,所述的核苷酸序列与SEQ ID NO.3中从核苷酸57-647位的核苷酸序列有至少70%的同源性;
(b)将步骤(a)中的表达载体转入宿主细胞,形成人UCK蛋白的重组细胞;
(c)在适合表达人UCK蛋白多肽的条件下,培养步骤(b)中的重组细胞;
(d)分离出具有人UCK蛋白活性的多肽。
9.一种核苷酸分子,其特征在于,它是权利要求1所述DNA分子的反义序列。
10.一种探针分子,其特征在于,它含有权利要求1所述的DNA分子中8-100个连续核苷酸。
CNB991024494A 1999-02-26 1999-02-26 人尿苷酸-胞苷酸激酶及其编码序列,以及制法 Expired - Fee Related CN1151259C (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CNB991024494A CN1151259C (zh) 1999-02-26 1999-02-26 人尿苷酸-胞苷酸激酶及其编码序列,以及制法

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CNB991024494A CN1151259C (zh) 1999-02-26 1999-02-26 人尿苷酸-胞苷酸激酶及其编码序列,以及制法

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN1264740A true CN1264740A (zh) 2000-08-30
CN1151259C CN1151259C (zh) 2004-05-26

Family

ID=5270831

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CNB991024494A Expired - Fee Related CN1151259C (zh) 1999-02-26 1999-02-26 人尿苷酸-胞苷酸激酶及其编码序列,以及制法

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN1151259C (zh)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN103031286A (zh) * 2012-12-10 2013-04-10 浙江工业大学 冬虫夏草中国被毛孢尿苷酸-胞苷酸激酶、编码基因及应用

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN103031286A (zh) * 2012-12-10 2013-04-10 浙江工业大学 冬虫夏草中国被毛孢尿苷酸-胞苷酸激酶、编码基因及应用
CN103031286B (zh) * 2012-12-10 2015-03-18 浙江工业大学 冬虫夏草中国被毛孢尿苷酸-胞苷酸激酶、编码基因及应用

Also Published As

Publication number Publication date
CN1151259C (zh) 2004-05-26

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN1128878C (zh) 人甲硫氨酸亚砜还原酶编码序列、其编码的多肽及制备方法
CN1264740A (zh) 人尿苷酸-胞苷酸激酶及其编码序列,以及制法和用途
CN1132939C (zh) 一种新的焦磷酸合成酶编码序列、其编码的多肽及制备方法
CN1125177C (zh) 人短链醇脱氢酶编码序列、其编码的多肽及制备方法
CN1249340A (zh) 新的人线粒体基质gtp:amp磷酸转移酶、其编码序列及制备方法
CN1249347A (zh) 新的人钙调磷酸化酶调节亚基、其编码序列及制备方法
CN1125178C (zh) 人丝氨酸/苏氨酸激酶ⅱ编码序列、其编码的多肽及制备方法
CN1250096A (zh) 新的人蛋白质磷酸酯酶亚基、其编码序列及制备方法
CN1277259A (zh) 晚期胚胎丰富蛋白的同源蛋白及其编码序列
CN1259574A (zh) 新的人磷脂翻转酶、其编码序列及制法和用途
CN1261102A (zh) 新的人纺锤素蛋白及其编码序列,及制法和用途
CN1253180A (zh) 新的人神经内分泌特异性蛋白和编码序列、及制法和用途
CN1274728A (zh) 一种新的人蛋白及其编码序列,以及制法和用途
CN1277260A (zh) 一种人肌动蛋白相关蛋白亚基及其编码序列
CN1287172A (zh) 人尿苷激酶及其编码序列、以及制法和用途
CN1259572A (zh) 新的人蛋白质及其编码序列,及制法和用途
CN1251860A (zh) 一种新的人基因序列、其编码的多肽及制法和用途
CN1246529A (zh) 人翻译起始因子亚基的编码序列、其编码的多肽及制备方法
CN1257920A (zh) 新的人黑素瘤生长相关因子、其编码序列及制法和用途
CN1257927A (zh) 一种新的人蛋白质及其编码序列,及制法和用途
CN1252448A (zh) 人肌动蛋白相关蛋白基因、其编码的多肽及制法和用途
CN1250097A (zh) 一种新的人基因编码序列、其编码的多肽及制法
CN1275621A (zh) 人λ晶状体蛋白及其编码序列,以及制法和用途
CN1249341A (zh) 新的人蛋白激酶c抑制蛋白编码序列、其编码的多肽及制备方法
CN1257921A (zh) 新的人黑素瘤生长相关因子及其编码序列,及制法和用途

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
C14 Grant of patent or utility model
GR01 Patent grant
CF01 Termination of patent right due to non-payment of annual fee

Granted publication date: 20040526

Termination date: 20150226

EXPY Termination of patent right or utility model