CN117789859A - 分子力场展示方法及装置、介质 - Google Patents
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Abstract
本公开涉及一种分子力场展示方法及装置、介质,分子力场展示方法包括在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下,进行针对目标项目中与受体结合的各配体的力场计算,得到针对各配体的计算结果;基于针对第一配体的计算结果展示结果界面,结果界面包括第一区域、第二区域及第三区域,第一区域展示有第一配体的各碎片和各碎片中的二面角,第二区域展示有针对第一二面角的第一结果图,第三区域展示有针对第一碎片的第一三维结构图。根据本公开实施例的分子力场展示方法及装置、介质使得用户通过简单的操作就能够便捷、直观、迅速地获取到力场计算的结果。
Description
技术领域
本公开涉及药物研发技术领域,尤其涉及一种分子力场展示方法及装置、介质。
背景技术
相关技术中,湿实验室药物发现模式需要设计并合成大量分子,并进行临床前研究。这是一个不断试错的过程,也只是一种定性的研究。在这个过程中,会消耗大量的资源进行多次力场计算,以在分子势能水平上进一步分析各药物待选配体的情况。
因此,如何便捷、直观、迅速地实现展示力场计算的结果,是亟待解决的技术问题。
发明内容
有鉴于此,本公开提出了一种分子力场展示方法及装置、介质,使得用户通过简单的操作就能够便捷、直观、迅速地获取到力场计算的结果。
根据本公开的一方面,提供了一种分子力场展示方法,包括:
在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下,进行针对所述目标项目中与受体结合的各配体的力场计算,得到针对所述各配体的计算结果;
基于针对第一配体的计算结果展示结果界面,所述结果界面包括第一区域、第二区域及第三区域,所述第一区域展示有所述第一配体的各碎片和各碎片中的二面角,所述第二区域展示有针对第一二面角的第一结果图,所述第三区域展示有针对第一碎片的第一三维结构图;
其中,所述第一配体为所述目标项目的多个配体中的一个配体,所述第一碎片为所述第一配体的多个碎片中当前突出展示的碎片,所述第一二面角是所述第一碎片中所形成的二面角中当前突出展示的一个,所述第一结果图展示有在目标力场模型中不同第一二面角角度下第一碎片的分子势能。
这样,通过在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下进行针对目标项目中与受体结合的各配体的力场计算,得到针对各配体的计算结果,并基于针对第一配体的计算结果展示结果界面,从而通过结果界面的第一区域展示第一配体的各碎片和各碎片中的二面角、通过结果界面的第二区域展示针对第一二面角的第一结果图、通过结果界面的第三区域展示针对第一碎片的第一三维结构图,其中,第一配体为目标项目的多个配体中的一个配体,第一碎片为第一配体的多个碎片中当前突出展示的碎片,第一二面角是第一碎片中所形成的二面角中当前突出展示的一个,第一结果图展示有在目标力场模型中不同第一二面角角度下第一碎片的分子势能,这样,在整个力场计算的过程中,用户所需进行的操作少且简单,只需通过简单的操作就能够便捷、直观、迅速地获取到力场计算的结果,方便用户根据结果界面查看各碎片、各二面角以及分子势能结果,有助于用户根据这些结果快速筛选出更优选的药物待选配体,大大缩短新药开发流程,并降低新药失败风险。
在一种可能的实现方式中,所述方法还包括:在检测到针对力场计算控件的触发操作的情况下,展示用于力场计算的初始界面,所述初始界面中展示有至少一个可选项目;在根据第一选择操作从所述至少一个可选项目中确定出所述目标项目的情况下,展示针对所述目标项目的计算输入提示,所述计算输入提示中展示有多个第一输入框和所述启动控件,不同的第一输入框用于输入不同的计算输入,其中,所述计算输入包括记录描述所述配体的结构文件、计算所用的力场模型中的至少一种,所述力场模型包括目标力场模型;根据检测到的针对各所述计算输入框的输入操作,在所述计算输入提示中展示确定出的针对所述目标项目的计算输入,以在所述启动控件被触发的情况下基于所述计算输入进行所述力场计算。
这样,通过第一选择操作确定出目标项目,并根据计算输入提示确定出针对目标项目的计算输入,以实现在启动控件被触发的情况下能够基于计算输入进行力场计算,这个过程中,用户不仅可以从多个可选项目中选择目标项目,还可以在目标项目中选择任意数量的配体以进行后续的力场计算,并且可以自定义计算输入以确定力场计算所用的数据,从而能够得到符合用户需求的计算结果,大大提高了力场计算的灵活性,在最大程度上满足用户的计算需求。
在一种可能的实现方式中,所述方法还包括:在检测到针对展示于所述结果界面中的输入编辑控件的触发操作的情况下,展示用于针对所述目标项目的可选输入提示,所述可选输入提示中展示有多个第二输入框和所述启动控件,不同的第二输入框用于输入不同的可选输入,所述可选输入包括计算所用的参考力场模型、势能面的计算方式、计算所用的缓存结果、计算所用的随机构象数中的至少一种;根据检测到的针对各所述第二输入框的输入操作,在所述可选输入提示中展示确定出的针对所述目标项目的可选输入,以在所述启动控件被触发的情况下基于所述计算输入和所述可选输入进行所述力场计算。
这样,通过触发输入编辑控件来展示可选输入提示,并根据计算输入提示确定出针对目标项目的可选输入,以实现在启动控件被触发的情况下能够基于计算输入和可选输入进行进一步的力场计算,从而满足用户期望进行计算数据微小调整的需求,无需从头开始进行整个力场计算,在提高力场计算灵活性的同时有助于节约计算资源。
在一种可能的实现方式中,所述方法还包括:根据检测到的第二选择操作从所述多个配体中确定出对应于所述第二选择操作的第一配体;或者,在未检测到针对任一配体的第二选择操作的情况下,根据预设规则确定出所述第一配体;其中,在所述第一配体为一个或多个,所述第一区域中所展示的碎片的结构组成和/或二面角不同。
这样,通过对第二选择操作的检测来显示对应于第一配体的计算结果,方便用户选择所需数量的配体及对应计算结果。
在一种可能的实现方式中,所述第一区域包括多个第一子区域、一个第二子区域;各所述第一子区域展示有对应的碎片、该碎片的一个二面角和该碎片在该二面角下的第一分析结果,所述第二子区域展示有所述第一配体的碎片总数、二面角总数和第二分析结果;所述第一分析结果是根据在所述目标力场模型中对应的碎片在对应的二面角的不同角度下的分子势能所确定的,所述第二分析结果是根据所有碎片在分别对应的二面角下的第一分析结果所确定的;其中,所述方法还包括:在检测到针对第一排序控件的触发操作的情况下,在所述第一区域内按照第一顺序展示各所述第一子区域,其中,所述第一排序控件设置于所述第一区域,所述第一顺序是根据各所述第一子区域对应的碎片在对应二面角下的第一分析结果所确定的。
这样,通过第一区域中的第二子区域可以展示配体所包括的碎片总数、二面角总数及第二分析结果,通过第一区域中的各第一子区域可以展示各碎片、各二面角及对应的第一分析结果,方便用户直观地获取到针对配体的力场计算结果,并根据第一排序控件能够迅速实现基于第一分析结果对各第一子区域(实质上各二面角)进行排序并展示出来,有助于用户筛选二面角,操作简单。
在一种可能的实现方式中,各所述第一子区域还展示有所述第一分析结果对应的二面角下的第三分析结果,所述第二子区域中还展示有第四分析结果,所述第三分析结果是根据在参考力场模型中对应的碎片在对应的二面角的不同角度下的分子势能所确定的,所述第四分析结果是根据所有碎片在分别对应二面角下的第三分析结果所确定的;
其中,所述方法还包括:在检测到针对第二排序控件的触发操作的情况下,在所述第一区域内按照第二顺序展示各所述第一子区域,其中,所述第二排序控件设置于所述第一区域,所述第二顺序是根据各所述第一子区域对应的碎片在对应二面角下的第三分析结果所确定的。
这样,通过第一区域中的第二子区域可以进一步展示第四分析结果,通过第一区域中的各第一子区域可以进一步展示各二面角对应的第三分析结果,方便用户直观地获取到针对配体的力场计算结果,并根据第二排序控件能够迅速实现基于第三分析结果对各第一子区域(实质上各二面角)进行排序并展示出来,有助于用户筛选二面角,操作简单。
在一种可能的实现方式中,所述第一结果图展示有第一曲线,所述第一曲线表征在所述目标力场模型中第一二面角的不同角度下第一碎片的分子势能,所述第一曲线上有多个示意点,该多个示意点中的其中一个为第一示意点,所述第一示意点表征在所述目标力场模型中所述第一二面角为第一角度下第一碎片的分子势能为第一势能;所述方法还包括:在检测到针对所述第一曲线上的第一示意点的触发操作的情况下,在所述第一结果图中展示所述第一角度和所述第一势能,并在所述第一三维结构图中展示所述第一角度。
这样,通过第二区域中的第一结果图可以展示在目标力场模型中第一二面角在不同角度下的分子势能,并通过触发第一结果图中第一曲线上的第一示意点可以突出展示对应的第一二面角的具体角度和分子势能的具体数值,同时能够在第一三维结构图中展示对应的二面角,方便用户直观地获取到在目标力场模型下的二面角和分子势能的相关数据。
在一种可能的实现方式中,所述第一结果图还展示有第二曲线,所述第二曲线表征在第一参考力场模型中第一二面角的不同角度下第一碎片的分子势能,所述第二曲线上有多个示意点,该多个示意点中的其中一个为第二示意点,所述第二示意点表征在所述第一参考力场模型中所述第一二面角为第二角度下第一碎片的分子势能为第二势能;所述方法还包括:在检测到针对所述第二曲线上的第二示意点的触发操作的情况下,在所述第一结果图中展示所述第二角度和所述第二势能;并且/或者,所述第一结果图还展示有第三曲线,所述第三曲线表征在第二参考力场模型中第一二面角的不同角度下第一碎片的分子势能,所述第三曲线上有多个示意点,该多个示意点中的其中一个为第三示意点,所述第三示意点表征在所述第二参考力场模型中所述第一二面角为第三角度的下第一碎片的分子势能为第三势能;所述方法还包括:在检测到针对所述第三曲线上的第三示意点的触发操作的情况下,在所述第一结果图中展示所述第三角度和所述第三势能。
这样,方便用户直观地获取到在第一参考力场模型、第二参考力场模型下的二面角和分子势能的相关数据,还方便用户直观地比对在目标力场模型和在第一参考力场模型、第二参考力场模型下二面角和分子势能的数据,有助于用户筛选出更优选的药物待选配体,大大缩短新药开发流程,并降低新药失败风险。
在一种可能的实现方式中,所述第二区域中还展示有第一切换控件、第二切换控件、第三切换控件;所述方法还包括以下至少一种操作:在检测到针对所述第一切换控件的触发操作的情况下,在所述第一结果图中展示或隐藏所述第一曲线;在检测到针对所述第二切换控件的触发操作的情况下,在所述第一结果图中展示或隐藏所述第二曲线;在检测到针对所述第三切换控件的触发操作的情况下,在所述第一结果图中展示或隐藏所述第三曲线。
这样,通过触发任意切换控件,可以切换对应曲线的展示状态,方便用户根据自定义需求进行灵活查看且操作便捷。
在一种可能的实现方式中,所述第二区域中还展示有下载控件、局部放大控件、平移控件、矩形选择控件、自由图形选择控件、整体放大控件、整体缩小控件、自适应控件、重置控件;所述方法还包括以下至少一种操作:在检测到针对所述下载控件的触发操作的情况下,展示下载提示框,所述下载提示框中展示有对应于被触发的下载控件的第一结果图的名称、存储地址和下载确定控件;在检测到针对所述下载确定控件的触发操作的情况下,下载所述第一结果图的相关信息;在检测到针对所述局部放大控件的触发操作的情况下,对根据所述局部放大控件所确定出的区域进行局部放大;在检测到针对所述平移控件的触发操作的情况下,对所述第一结果图进行平移;在检测到针对所述矩形选择控件的触发操作的情况下,在所述第一结果图中突出展示根据所述矩形选择控件所选择出的矩形区域;在检测到针对所述自由图形选择控件的触发操作的情况下,在所述第一结果图中突出展示根据所述自由图形选择控件所选择出的自由图形区域;在检测到针对所述整体放大控件的触发操作的情况下,对所述第一结果图进行整体放大;在检测到针对所述整体缩小控件的触发操作的情况下,对所述第一结果图进行整体缩小;在检测到针对所述自适应控件的触发操作的情况下,在所述第二区域中展示所述第一结果图的所有内容;在检测到针对所述重置控件的触发操作的情况下,重置对所述第一结果图的所有操作,并在所述第二区域中展示原始的第一结果图。
这样,通过展示一系列的功能控件,方便用户下载、局部放大、平移、整体放大、整体缩小所关注的结果图,并可在结果中绘制矩形或自由图形以标记重点关注位置,还可以一键选择结果图自适应地展示在第二区域中以及重置所有操作以还原展示原始的结果图。
在一种可能的实现方式中,所述方法还包括:在检测到针对所述第一三维结构图的旋转操作的情况下,对所述第一三维结构图进行旋转;并且/或者,在检测到针对所述第一三维结构图的缩放操作的情况下,对所述第一三维结构图的展示尺寸进行放大或缩小。
这样,通过进行针对第一三维结构图的旋转操作和/或旋转操作的检测,能够及时响应用户的旋转三维结构图和/或缩放结构图的需求。
根据本公开的另一方面,提供了一种分子力场展示装置,包括:
计算模块,所述计算模块被配置为在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下,进行针对所述目标项目中与受体结合的各配体的力场计算,得到针对所述各配体的计算结果;
展示模块,所述展示模块被配置为基于针对第一配体的计算结果展示结果界面,所述结果界面包括第一区域、第二区域及第三区域,所述第一区域展示有所述第一配体的各碎片和各碎片中的二面角,所述第二区域展示有针对第一二面角的第一结果图,所述第三区域展示有针对第一碎片的第一三维结构图;
其中,所述第一配体为所述目标项目的多个配体中的一个配体,所述第一碎片为所述第一配体的多个碎片中当前突出展示的碎片,所述第一二面角是所述第一碎片中所形成的二面角中当前突出展示的一个,所述第一结果图展示有在目标力场模型中不同第一二面角角度下第一碎片的分子势能。
通过在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下进行针对目标项目中与受体结合的各配体的力场计算,得到针对各配体的计算结果,并基于针对第一配体的计算结果展示结果界面,从而通过结果界面的第一区域展示第一配体的各碎片和各碎片中的二面角、通过结果界面的第二区域展示针对第一二面角的第一结果图、通过结果界面的第三区域展示针对第一碎片的第一三维结构图,其中,第一配体为目标项目的多个配体中的一个配体,第一碎片为第一配体的多个碎片中当前突出展示的碎片,第一二面角是第一碎片中所形成的二面角中当前突出展示的一个,第一结果图展示有在目标力场模型中不同第一二面角角度下第一碎片的分子势能,这样,在整个力场计算的过程中,用户所需进行的操作少且简单,只需通过简单的操作就能够便捷、直观、迅速地获取到力场计算的结果,方便用户根据结果界面查看各碎片、各二面角以及分子势能结果,有助于用户根据这些结果快速筛选出更优选的药物待选配体,大大缩短新药开发流程,并降低新药失败风险。
在一种可能的实现方式中,所述装置还包括第一计算模块,所述第一计算模块被配置为:在检测到针对力场计算控件的触发操作的情况下,展示用于力场计算的初始界面,所述初始界面中展示有至少一个可选项目;在根据第一选择操作从所述至少一个可选项目中确定出所述目标项目的情况下,展示针对所述目标项目的计算输入提示,所述计算输入提示中展示有多个第一输入框和所述启动控件,不同的第一输入框用于输入不同的计算输入,其中,所述计算输入包括记录描述所述配体的结构文件、计算所用的力场模型中的至少一种,所述力场模型包括目标力场模型;根据检测到的针对各所述计算输入框的输入操作,在所述计算输入提示中展示确定出的针对所述目标项目的计算输入,以在所述启动控件被触发的情况下基于所述计算输入进行所述力场计算。
这样,通过第一选择操作确定出目标项目,并根据计算输入提示确定出针对目标项目的计算输入,以实现在启动控件被触发的情况下能够基于计算输入进行力场计算,这个过程中,用户不仅可以从多个可选项目中选择目标项目,还可以在目标项目中选择任意数量的配体以进行后续的力场计算,并且可以自定义计算输入以确定力场计算所用的数据,从而能够得到符合用户需求的计算结果,大大提高了力场计算的灵活性,在最大程度上满足用户的计算需求。
在一种可能的实现方式中,所述装置还包括第二计算模块,所述第一计算模块被配置为:在检测到针对展示于所述结果界面中的输入编辑控件的触发操作的情况下,展示用于针对所述目标项目的可选输入提示,所述可选输入提示中展示有多个第二输入框和所述启动控件,不同的第二输入框用于输入不同的可选输入,所述可选输入包括计算所用的参考力场模型、势能面的计算方式、计算所用的缓存结果、计算所用的随机构象数中的至少一种;根据检测到的针对各所述第二输入框的输入操作,在所述可选输入提示中展示确定出的针对所述目标项目的可选输入,以在所述启动控件被触发的情况下基于所述计算输入和所述可选输入进行所述力场计算。
这样,通过触发输入编辑控件来展示可选输入提示,并根据计算输入提示确定出针对目标项目的可选输入,以实现在启动控件被触发的情况下能够基于计算输入和可选输入进行进一步的力场计算,从而满足用户期望进行计算数据微小调整的需求,无需从头开始进行整个力场计算,在提高力场计算灵活性的同时有助于节约计算资源。
在一种可能的实现方式中,所述装置还包括确定模块,所述确定模块被配置为:根据检测到的第二选择操作从所述多个配体中确定出对应于所述第二选择操作的第一配体;或者,在未检测到针对任一配体的第二选择操作的情况下,根据预设规则确定出所述第一配体;其中,在所述第一配体为一个或多个,所述第一区域中所展示的碎片的结构组成和/或二面角不同。
这样,通过对第二选择操作的检测来显示对应于第一配体的计算结果,方便用户选择所需数量的配体及对应计算结果。
在一种可能的实现方式中,所述第一区域包括多个第一子区域、一个第二子区域;各所述第一子区域展示有对应的碎片、该碎片的一个二面角和该碎片在该二面角下的第一分析结果,所述第二子区域展示有所述第一配体的碎片总数、二面角总数和第二分析结果;所述第一分析结果是根据在所述目标力场模型中对应的碎片在对应的二面角的不同角度下的分子势能所确定的,所述第二分析结果是根据所有碎片在分别对应的二面角下的第一分析结果所确定的;其中,所述装置还包括第一排序模块,所述第一排序模块被配置为:在检测到针对第一排序控件的触发操作的情况下,在所述第一区域内按照第一顺序展示各所述第一子区域,其中,所述第一排序控件设置于所述第一区域,所述第一顺序是根据各所述第一子区域对应的碎片在对应二面角下的第一分析结果所确定的。
这样,通过第一区域中的第二子区域可以展示配体所包括的碎片总数、二面角总数及第二分析结果,通过第一区域中的各第一子区域可以展示各碎片、各二面角及对应的第一分析结果,方便用户直观地获取到针对配体的力场计算结果,并根据第一排序控件能够迅速实现基于第一分析结果对各第一子区域(实质上各二面角)进行排序并展示出来,有助于用户筛选二面角,操作简单。
在一种可能的实现方式中,各所述第一子区域还展示有所述第一分析结果对应的二面角下的第三分析结果,所述第二子区域中还展示有第四分析结果,所述第三分析结果是根据在参考力场模型中对应的碎片在对应的二面角的不同角度下的分子势能所确定的,所述第四分析结果是根据所有碎片在分别对应二面角下的第三分析结果所确定的;
其中,所述装置还包括第二排序模块,所述第二排序模块被配置为:在检测到针对第二排序控件的触发操作的情况下,在所述第一区域内按照第二顺序展示各所述第一子区域,其中,所述第二排序控件设置于所述第一区域,所述第二顺序是根据各所述第一子区域对应的碎片在对应二面角下的第三分析结果所确定的。
这样,通过第一区域中的第二子区域可以进一步展示第四分析结果,通过第一区域中的各第一子区域可以进一步展示各二面角对应的第三分析结果,方便用户直观地获取到针对配体的力场计算结果,并根据第二排序控件能够迅速实现基于第三分析结果对各第一子区域(实质上各二面角)进行排序并展示出来,有助于用户筛选二面角,操作简单。
在一种可能的实现方式中,所述第一结果图展示有第一曲线,所述第一曲线表征在所述目标力场模型中第一二面角的不同角度下第一碎片的分子势能,所述第一曲线上有多个示意点,该多个示意点中的其中一个为第一示意点,所述第一示意点表征在所述目标力场模型中所述第一二面角为第一角度下第一碎片的分子势能为第一势能;所述装置还包括第一展示模块,所述第一展示模块被配置为:在检测到针对所述第一曲线上的第一示意点的触发操作的情况下,在所述第一结果图中展示所述第一角度和所述第一势能,并在所述第一三维结构图中展示所述第一角度。
这样,通过第二区域中的第一结果图可以展示在目标力场模型中第一二面角在不同角度下的分子势能,并通过触发第一结果图中第一曲线上的第一示意点可以突出展示对应的第一二面角的具体角度和分子势能的具体数值,同时能够在第一三维结构图中展示对应的二面角,方便用户直观地获取到在目标力场模型下的二面角和分子势能的相关数据。
在一种可能的实现方式中,所述第一结果图还展示有第二曲线,所述第二曲线表征在第一参考力场模型中第一二面角的不同角度下第一碎片的分子势能,所述第二曲线上有多个示意点,该多个示意点中的其中一个为第二示意点,所述第二示意点表征在所述第一参考力场模型中所述第一二面角为第二角度下第一碎片的分子势能为第二势能;所述装置还包括第二展示模块,所述二展示模块被配置为:在检测到针对所述第二曲线上的第二示意点的触发操作的情况下,在所述第一结果图中展示所述第二角度和所述第二势能;并且/或者,所述第一结果图还展示有第三曲线,所述第三曲线表征在第二参考力场模型中第一二面角的不同角度下第一碎片的分子势能,所述第三曲线上有多个示意点,该多个示意点中的其中一个为第三示意点,所述第三示意点表征在所述第二参考力场模型中所述第一二面角为第三角度的下第一碎片的分子势能为第三势能;所述装置还包括第三展示模块,所述第三展示模块被配置为:在检测到针对所述第三曲线上的第三示意点的触发操作的情况下,在所述第一结果图中展示所述第三角度和所述第三势能。
这样,方便用户直观地获取到在第一参考力场模型、第二参考力场模型下的二面角和分子势能的相关数据,还方便用户直观地比对在目标力场模型和在第一参考力场模型、第二参考力场模型下二面角和分子势能的数据,有助于用户筛选出更优选的药物待选配体,大大缩短新药开发流程,并降低新药失败风险。
在一种可能的实现方式中,所述第二区域中还展示有第一切换控件、第二切换控件、第三切换控件;所述装置还包括切换模块,所述切换模块被配置为执行以下至少一种操作:在检测到针对所述第一切换控件的触发操作的情况下,在所述第一结果图中展示或隐藏所述第一曲线;在检测到针对所述第二切换控件的触发操作的情况下,在所述第一结果图中展示或隐藏所述第二曲线;在检测到针对所述第三切换控件的触发操作的情况下,在所述第一结果图中展示或隐藏所述第三曲线。
这样,通过触发任意切换控件,可以切换对应曲线的展示状态,方便用户根据自定义需求进行灵活查看且操作便捷。
在一种可能的实现方式中,所述第二区域中还展示有下载控件、局部放大控件、平移控件、矩形选择控件、自由图形选择控件、整体放大控件、整体缩小控件、自适应控件、重置控件;所述装置还包括多功能实现模块,所述多功能实现模块被配置为执行以下至少一种操作:在检测到针对所述下载控件的触发操作的情况下,展示下载提示框,所述下载提示框中展示有对应于被触发的下载控件的第一结果图的名称、存储地址和下载确定控件;在检测到针对所述下载确定控件的触发操作的情况下,下载所述第一结果图的相关信息;在检测到针对所述局部放大控件的触发操作的情况下,对根据所述局部放大控件所确定出的区域进行局部放大;在检测到针对所述平移控件的触发操作的情况下,对所述第一结果图进行平移;在检测到针对所述矩形选择控件的触发操作的情况下,在所述第一结果图中突出展示根据所述矩形选择控件所选择出的矩形区域;在检测到针对所述自由图形选择控件的触发操作的情况下,在所述第一结果图中突出展示根据所述自由图形选择控件所选择出的自由图形区域;在检测到针对所述整体放大控件的触发操作的情况下,对所述第一结果图进行整体放大;在检测到针对所述整体缩小控件的触发操作的情况下,对所述第一结果图进行整体缩小;在检测到针对所述自适应控件的触发操作的情况下,在所述第二区域中展示所述第一结果图的所有内容;在检测到针对所述重置控件的触发操作的情况下,重置对所述第一结果图的所有操作,并在所述第二区域中展示原始的第一结果图。
这样,通过展示一系列的功能控件,方便用户下载、局部放大、平移、整体放大、整体缩小所关注的结果图,并可在结果中绘制矩形或自由图形以标记重点关注位置,还可以一键选择结果图自适应地展示在第二区域中以及重置所有操作以还原展示原始的结果图。
在一种可能的实现方式中,所述装置还包括调整模块,所述调整模块被配置为:在检测到针对所述第一三维结构图的旋转操作的情况下,对所述第一三维结构图进行旋转;并且/或者,在检测到针对所述第一三维结构图的缩放操作的情况下,对所述第一三维结构图的展示尺寸进行放大或缩小。
这样,通过进行针对第一三维结构图的旋转操作和/或旋转操作的检测,能够及时响应用户的旋转三维结构图和/或缩放结构图的需求。
根据本公开的另一方面,提供了一种分子力场展示装置,包括:处理器;用于存储处理器可执行指令的存储器;其中,所述处理器被配置为在执行所述存储器存储的指令时,实现上述分子力场展示方法。
根据本公开的另一方面,提供了一种非易失性计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序指令,其中,所述计算机程序指令被处理器执行时实现上述分子力场展示方法。
根据下面参考附图对示例性实施例的详细说明,本公开的其它特征及方面将变得清楚。
附图说明
包含在说明书中并且构成说明书的一部分的附图与说明书一起示出了本公开的示例性实施例、特征和方面,并且用于解释本公开的原理。
图1示出根据本公开实施例提供的分子力场展示方法的流程图。
图2-图9示出根据本公开实施例提供的分子力场展示方法中界面的示意图。
图10示出根据本公开实施例提供的分子力场展示装置的框图。
图11示出根据本公开实施例提供的用于执行分子力场展示方法的装置的框图。
具体实施方式
以下将参考附图详细说明本公开的各种示例性实施例、特征和方面。附图中相同的附图标记表示功能相同或相似的元件。尽管在附图中示出了实施例的各种方面,但是除非特别指出,不必按比例绘制附图。
在这里专用的词“示例性”意为“用作例子、实施例或说明性”。这里作为“示例性”所说明的任何实施例不必解释为优于或好于其它实施例。
另外,为了更好的说明本公开,在下文的具体实施方式中给出了众多的具体细节。本领域技术人员应当理解,没有某些具体细节,本公开同样可以实施。在一些实例中,对于本领域技术人员熟知的方法、手段、元件和电路未作详细描述,以便于凸显本公开的主旨。
为解决上述技术问题,本公开实施例提供一种分子力场展示方法,通过在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下进行针对目标项目中与受体结合的各配体的力场计算,得到针对各配体的计算结果,并基于针对第一配体的计算结果展示结果界面,从而通过结果界面的第一区域展示第一配体的各碎片和各碎片中的二面角、通过结果界面的第二区域展示针对第一二面角的第一结果图、通过结果界面的第三区域展示针对第一碎片的第一三维结构图,其中,第一配体为目标项目的多个配体中的一个配体,第一碎片为第一配体的多个碎片中当前突出展示的碎片,第一二面角是第一碎片中所形成的二面角中当前突出展示的一个,第一结果图展示有在目标力场模型中不同第一二面角角度下第一碎片的分子势能,这样,在整个力场计算的过程中,用户所需进行的操作少且简单,只需通过简单的操作就能够便捷、直观、迅速地获取到力场计算的结果,方便用户根据结果界面查看各碎片、各二面角以及分子势能结果,有助于用户根据这些结果快速筛选出更优选的药物待选配体,大大缩短新药开发流程,并降低新药失败风险。
图1示出根据本公开实施例提供的分子力场展示方法的流程图。如图1所示,该分子力场展示方法可以包括下述步骤S101至步骤S102。
步骤S101、在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下,进行针对目标项目中与受体结合的各配体的力场计算,得到针对各配体的计算结果。
步骤S102、基于针对第一配体的计算结果展示结果界面。
结果界面可以包括第一区域、第二区域及第三区域。第一区域可展示有第一配体的各碎片和各碎片中的二面角。第二区域可展示有针对第一二面角的第一结果图,第三区域展示有针对第一碎片的第一三维结构图。其中,第一配体为目标项目的多个配体中的一个配体,第一碎片为第一配体的多个碎片中当前突出展示的碎片,第一二面角是第一碎片中所形成的二面角中当前突出展示的一个,第一结果图展示有在目标力场模型中不同第一二面角角度下第一碎片的分子势能。
这样,通过步骤S101能够在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下进行针对目标项目中与受体结合的各配体的力场计算,得到针对各配体的计算结果,通过步骤S102能够基于针对第一配体的计算结果展示结果界面,结果界面可包括第一区域、第二区域及第三区域,第一区域可展示有第一配体的各碎片和各碎片中的二面角,第二区域可展示有针对第一二面角的第一结果图,第三区域展示有针对第一碎片的第一三维结构图,其中,第一配体为目标项目的多个配体中的一个配体,第一碎片为第一配体的多个碎片中当前突出展示的碎片,第一二面角是第一碎片中所形成的二面角中当前突出展示的一个,第一结果图展示有在目标力场模型中不同第一二面角角度下第一碎片的分子势能,从而在整个力场计算的过程中,用户所需进行的操作少且简单,只需通过简单的操作就能够便捷、直观、迅速地获取到力场计算的结果,方便用户根据结果界面查看各碎片、各二面角以及分子势能结果,有助于用户根据这些结果快速筛选出更优选的药物待选配体,大大缩短新药开发流程,并降低新药失败风险。
图2-图9示出根据本公开实施例提供的分子力场展示方法中界面的示意图。以下结合图1-图9对本公开实施例提供的分子力场展示方法进行示意性说明。
在一种可能的实现方式中,在为进行力场计算的过程中,可展示用于力场计算的首页。首页中可设置有力场计算控件。在为用户展示首页的过程中,在检测到针对力场计算控件的触发操作的情况下,可以展示用于力场计算的初始界面。在初始界面中,可以展示有至少一个可选项目。在为用户展示初始界面的过程中,可以进行第一选择操作的检测。举例来说,第一选择操作可以是针对某一个可选项目的单击操作、双击操作等其他有针对性的选择操作。这样,在检测到针对某一个可选项目的第一选择操作的情况下,可以从至少一个可选项目中确定出目标项目。其中,用于力场计算的首页、初始界面可根据实际需求灵活设置,本公开实施例对此不做限制。
在一种可能的实现方式中,在根据第一选择操作从至少一个可选项目中确定出目标项目的情况下,可在初始界面中展示目标项目中与受体结合的各配体。举例来说,在初始界面的某一区域中,可展示目标项目中与受体结合的各配体的相关信息,相关信息可以是配体的结构式和名称。这样,方便用户通过选择其中一个或多个配体进行力场计算,从而避免计算资源的过度使用。
在一种可能的实现方式中,在根据第一选择操作从至少一个可选项目中确定出目标项目的情况下,可以展示针对目标项目的计算输入提示。计算输入提示可以展示在初始界面中的某一区域中,也可以弹出对话框的形式展示,本公开实施例对此不做限制,用户可根据实际需求和/或偏好设置展示计算输入提示的位置和形式。在计算输入提示中,可以展示有多个第一输入框和启动控件。不同的第一输入框可用于输入不同的计算输入,计算输入可包括描述配体的结构文件、计算所用的力场模型中的至少一种,力场模型可包括目标力场模型。启动控件可用于在被触发的情况下启动力场计算。根据检测到的针对各计算输入框的输入操作,可以在计算输入提示中展示确定出的针对目标项目的计算输入,以在启动控件被触发的情况下可以基于计算输入进行力场计算。一般,可通过基于计算输入进行的力场计算实现新建力场计算任务,在新建某个力场计算任务时,输入的力场模型可以仅包括目标力场模型(例如TandemForceField模型,下文简称TFF模型),从而能够得到在目标力场模型下的计算结果,减少计算资源的过度使用。
这样,通过第一选择操作确定出目标项目,并根据计算输入提示确定出针对目标项目的计算输入,以实现在启动控件被触发的情况下能够基于计算输入进行力场计算,这个过程中,用户不仅可以从多个可选项目中选择目标项目,还可以在目标项目中选择任意数量的配体以进行后续的力场计算,并且可以自定义计算输入以确定力场计算所用的数据,从而能够得到符合用户需求的计算结果,大大提高了力场计算的灵活性,在最大程度上满足用户的计算需求。
在基于计算输入进行新建的力场计算后,可以基于得到的计算结果展示结果界面。展示的结果界面中可设置有输入编辑控件,例如图2示出的结果界面I1中的输入编辑控件(Editing Parameters)Q1。在一种可能的实现方式中,在检测到针对展示于结果界面中的输入编辑控件的触发操作的情况下,可以展示用于针对目标项目的可选输入提示,例如图2示出的结果界面I1中的可选输入提示T0。如图2所示,可选输入提示T0可包括展示有多个第二输入框的提示区域T1和启动控件(Submit)Q2。不同的第二输入框可用于输入不同的可选输入,可选输入可包括计算所用的参考力场模型(Use GAFF2)、势能面的计算方式(qm_software)、计算所用的缓存结果(Use Cache)、计算所用的随机构象数(Sample RandomConformers)中的至少一种,参考力场模型可以是任意的参考力场模型例如GAFF2、QM等力场模型,势能面的计算方式可以根据与QM势能面相关的软件确定,缓存结果可以包括已经计算出来的参考力场模型下的结果,方便用户直接调用,无需占用额外资源进行计算。启动控件可用于在被触发的情况下启动力场计算。根据检测到的针对各第二输入框的输入操作,在可选输入提示中展示确定出的针对目标项目的可选输入,以在启动控件被触发的情况下基于计算输入和可选输入进行力场计算。一般,可通过基于计算输入和可选输入进行的力场计算实现进一步力场计算,在得到基于计算输入得到的计算结果后,进一步利用可选输入再次进行力场计算能够满足用户对需求的微小调整,而无需重新从头计算,大大节约了计算资源。
这样,通过触发输入编辑控件来展示可选输入提示,并根据计算输入提示确定出针对目标项目的可选输入,以实现在启动控件被触发的情况下能够基于计算输入和可选输入进行进一步的力场计算,从而满足用户期望进行计算数据微小调整的需求,无需从头开始进行整个力场计算,在提高力场计算灵活性的同时有助于节约计算资源。
在启动控件被触发的情况下,可以基于计算输入(或者基于计算输入和可选输入)进行针对目标项目中与受体结合的各配体的力场计算,从而得到针对各配体的计算结果。在得到计算结果的情况下,可以基于针对第一配体的计算结果展示结果界面。以图3、图4示出的界面为例,如图3所示,结果界面I1包括第一区域A1、第二区域A2及第三区域A3。在第一区域A1中,可展示有目标项目的多个配体中的某一配体(即第一配体)的各碎片(如图4示出的第一种碎片、第二种碎片、第三种碎片、第四种碎片)和各碎片中的二面角(如图4示出的第一种碎片中的二面角d1和二面角d2)。在第二区域A2中,可展示有针对第一配体的某一碎片(如图3中突出展示的第一碎片)中所形成的其中一个二面角(如图3中突出展示的第一二面角)的结果图(如图3中第二区域A2里示出的第一结果图),该结果图可展示有在力场模型中不同第一二面角角度(如图3示出的为Dihedral[°]的横轴)下的第一碎片的分子势能(如图3示出的为Energy[kcal/mol]的纵轴)。在第三区域A3中,可展示有针对第一碎片的三维结构图(如图3中第三区域A3里示出的第一三维结构图)。
在一种可能的实现方式中,在展示结果界面的过程中,还可以展示目标项目所包括的多个配体。结果界面还可以包括第四区域,第四区域可用于展示目标项目的多个配体。以图5示出的界面为例,在结果界面I1中的第四区域A4中,可展示有目标项目的多个配体,其中,可突出展示其中一个配体(即图5中的第一配体),同时在结果界面I1中的第一区域A1中,可展示有第一配体的各碎片和各二面角。
在一种可能的实现方式中,在展示结果界面的过程中,可以进行第二选择操作的检测。举例来说,第二选择操作可以是针对一个或多个配体的单击操作等其他有针对性的选择操作。这样,根据检测到的第二选择操作,可以从多个配体中确定出对应于第二选择操作的第一配体,其中,第一配体的数量可以是一个或多个。在检测到对应于第二选择操作的第一配体包括一个配体的情况下,如图5所示,可以在第四区域A4中突出展示这个配体(即第一配体),可以在第一区域A1中展示第一配体的各碎片和各二面角。在检测到对应于第二选择操作的第一配体包括多个配体的情况下,可以在第四区域A4中突出展示多个配体(即第一配体,例如图6中突出展示的两个配体),可以在第一区域A1中展示多个配体(即第一配体)的各碎片和各二面角,其中,展示出的碎片的结构组成和/或二面角不同。这样,通过对第二选择操作的检测来显示对应于第一配体的计算结果,方便用户选择所需数量的配体及对应计算结果。
在展示结果界面的过程中,在未检测到针对任一配体的第二选择操作的情况下,可以根据预设规则确定出第一配体。其中,预设规则可以是预先设置好的默认规则,例如按照各配体的名称进行排序,将最小序号的配体作为默认配体突出展示于结果界面中的第四区域中。预设规则也可以根据实际需求和/偏好设置的其他规则,根据预设规则确定出的第一配体可以是一个,也可以是多个,本公开实施例对此不做限制。类似的,针对结果界面中第一区域里突出展示的第一二面角也可以是根据预设规则确定出来的,或者根据用户的对二面角的选择操作所确定,一般在第一区域中仅突出展示一个二面角,这样方便用户在第二区域、第三区域中直观地查看突出展示的二面角的相关信息(即结果图和三维结构图)。
在一种可能的实现方式中,如图4所示,第一区域A1可包括多个第一子区域B1、一个第二子区域B2。第二子区域B2可展示有其中一个配体(即第一配体)的碎片总数(如图4中的4Fragments)、二面角总数(如图4中的12dihedrals)和第二分析结果(如图4中的AverageTFF RMSE:1.423kcal/mol)。第一子区域B1可展示对应于第二子区域B2中展示的第一配体的相关信息。第一子区域B1可展示有其中一个碎片(如图4中的第一种碎片)、该碎片的一个二面角(如图4中的二面角d1)和该碎片在该二面角(如图4中的二面角d1)下的第一分析结果(如图4中的RMSE(TFF)4.49),各第一子区域所展示的二面角不同。第一分析结果是根据在目标力场模型(例如TFF模型)中对应的碎片在对应的二面角的不同角度下的分子势能所确定的。以图4中第一种碎片的二面角d1为例,第一种碎片在二面角d1下的第一分析结果可根据在目标力场模型中不同二面角d1角度下的分子势能的数值确定出来。第二分析结果是根据所有碎片在分别对应的二面角下的第一分析结果所确定的。以图4展示的第一配体为例,针对第一配体的第二分析结果可以是第一配体的四种碎片的12个二面角的12个第一分析结果的平均值。
在一种可能的实现方式中,第一区域中还设置有第一排序控件,例如图7中的RMSE(TFF)。通过对第一排序控件进行触发可以实现按照第一分析结果的具体数值对各第一子区域(也即各二面角)的排布进行调整。第一区域中还设置有与第一排序控件配合设置第一控件和第二控件。通过对第一控件进行触发可以实现按照第一分析结果从小到大的顺序排布各第一子区域。通过对第二控件进行触发可以实现按照第一分析结果从大到小的顺序排布各第一子区域。
在一种可能的实现方式中,在展示第一区域的过程中,可以进行第一排序控件、第一控件、第二控件的触发操作的检测。在检测到针对第一排序控件的触发操作的情况下,可以在第一区域内按照第一顺序展示各第一子区域。其中,第一顺序是根据各第一子区域对应的碎片在对应二面角下的第一分析结果所确定的。第一顺序与第一控件、第二控件的触发情况相关,在检测到第一控件的情况下,可以在第一区域内按照第一分析结果从小到大的顺序排布各第一子区域。第二控件同理于第一控件,此处不再赘述。
这样,通过第一区域中的第二子区域可以展示配体所包括的碎片总数、二面角总数及第二分析结果,通过第一区域中的各第一子区域可以展示各碎片、各二面角及对应的第一分析结果,方便用户直观地获取到针对配体的力场计算结果,并根据第一排序控件能够迅速实现基于第一分析结果对各第一子区域(实质上各二面角)进行排序并展示出来,有助于用户筛选二面角,操作简单。
在一种可能的实现方式中,如图4所示,第二子区域B2还可展示第四分析结果(如图4中的Average GAFF2 RMSE:2.946kcal/mol)。第一子区域B1还可展示有第一分析结果对应的二面角(如图4中的二面角d1)下的第三分析结果(如图4中的RMSE(GAFF2)2.30),也就说,在同一个第一子区域中的第一分析结果和第三分析结果是在不同力场模型下针对同一种二面角得到的。第三分析结果是根据在参考力场模型(例如GAFF2模型)中对应的碎片在对应的二面角的不同角度下的分子势能所确定的。以图4中第一种碎片的二面角d1为例,第一种碎片在二面角d1下的第三分析结果RMSE(GAFF2)2.30可根据GAFF2模型中不同二面角d1角度下的分子势能的数值确定出来。第四分析结果是根据所有碎片在分别对应的二面角下的第三分析结果所确定的。以图4展示的第一配体为例,针对第一配体的第四分析结果可以是第一配体的四种碎片的12个二面角的12个第三分析结果的平均值。
在一种可能的实现方式中,第一区域中还设置有第二排序控件,例如图7中的RMSE(GAFF2)。通过对第二排序控件进行触发可以实现按照第三分析结果的具体数值对各第一子区域(也即各二面角)的排布进行调整。第一区域中还设置有与第二排序控件配合设置第一控件和第二控件。通过对第一控件进行触发可以实现按照第三分析结果从小到大的顺序排布各第一子区域。通过对第二控件进行触发可以实现按照第三分析结果从大到小的顺序排布各第一子区域。
在一种可能的实现方式中,在展示第一区域的过程中,可以进行第二排序控件、第一控件、第二控件的触发操作的检测。在检测到针对第二排序控件的触发操作的情况下,可以在第一区域内按照第二顺序展示各第一子区域。其中,第二顺序是根据各第一子区域对应的碎片在对应二面角下的第三分析结果所确定的。第二顺序与第一控件、第二控件的触发情况相关,在检测到第一控件的情况下,可以在第一区域内按照第三分析结果从小到大的顺序排布各第一子区域。第二控件同理于第一控件,此处不再赘述。
这样,通过第一区域中的第二子区域可以进一步展示第四分析结果,通过第一区域中的各第一子区域可以进一步展示各二面角对应的第三分析结果,方便用户直观地获取到针对配体的力场计算结果,并根据第二排序控件能够迅速实现基于第三分析结果对各第一子区域(实质上各二面角)进行排序并展示出来,有助于用户筛选二面角,操作简单。
在一种可能的实现方式中,如图8所示,在第一结果图中,可展示有第一曲线(例如图8中橙色曲线)。第一曲线可表征在目标力场模型(例如TFF模型)中第一二面角的不同角度下第一碎片的分子势能。第一曲线上有多个示意点,该多个示意点中的其中一个为第一示意点,第一示意点可表征在目标力场模型中第一二面角为第一角度下第一碎片的分子势能为第一势能。
在一种可能的实现方式中,在展示第二区域的过程中,可以进行对示意点的触发操作的检测。其中,该触发操作可以是光标移动至示意点所在(或附近)区域、单击操作、双击操作等。在检测到针对第一曲线上的第一示意点的触发操作的情况下,可以在第一结果图中展示第一角度和第一势能,并在第一三维结构图中展示第一角度。以图8为例,在检测到针对第一曲线上的第一示意点的触发操作的情况下,可以在第一结果图中展示第一角度的数值(例如图8中的41.282)和第一势能的数值(例如图8中的3.324)及在第一势能旁标记有TFF字样,并在第一三维结构图中展示近似的第一角度(例如图8中的41.3°)。
这样,通过第二区域中的第一结果图可以展示在目标力场模型中第一二面角在不同角度下的分子势能,并通过触发第一结果图中第一曲线上的第一示意点可以突出展示对应的第一二面角的具体角度和分子势能的具体数值,同时能够在第一三维结构图中展示对应的二面角,方便用户直观地获取到在目标力场模型下的二面角和分子势能的相关数据。
参考力场模型可包括第一参考力场模型和第二参考力场模型。其中,第一参考力场模型可以是标准力场模型(QM模型),第二参考力场模型可以是一般力场模型,在本示例中为GAFF2模型。
在一种可能的实现方式中,如图8所示,在第一结果图中,还可展示有第二曲线(例如图8中蓝色曲线)。第二曲线可表征在第一参考力场模型(QM模型)中第一二面角的不同角度下第一碎片的分子势能。第二曲线上有多个示意点,该多个示意点中的其中一个为第二示意点,第二示意点可表征在第一参考力场模型中第一二面角为第二角度下第一碎片的分子势能为第二势能。在第一结果图中同时展示有在第一参考力场模型和目标力场模型下计算出的曲线的情况下,可区分性地展示曲线,例如用不同的颜色显示不同的曲线。
在一种可能的实现方式中,在展示第二区域的过程中,可以进行对示意点的触发操作的检测。其中,该触发操作可以是光标移动至示意点所在(或附近)区域、单击操作、双击操作等。在检测到针对第二曲线上的第二示意点的触发操作的情况下,可以在第一结果图中展示第二角度和第二势能。以图8为例,在检测到针对第二曲线上的第二示意点的触发操作的情况下,可以在第一结果图中展示第二角度的数值(例如图8中的41.282,与第一示意点处于相同角度)和第二势能的数值(例如图8中的3.784),并在第二势能附近标记有QM的字样,以与第一势能作区分。
这样,通过第二区域中的第一结果图可进一步展示在第一参考力场模型(即标准力场模型)中第一二面角在不同角度下的分子势能,并通过触发第一结果图中第二曲线上的第二示意点可以突出展示对应的第一二面角的具体角度和分子势能的具体数值,不仅方便用户直观地获取到在第一参考力场模型下的二面角和分子势能的相关数据,还方便用户直观地比对在目标力场模型和在第一参考力场模型(即标准力场模型)下二面角和分子势能的数据,有助于用户筛选出更优选的药物待选配体,大大缩短新药开发流程,并降低新药失败风险。
在一种可能的实现方式中,如图8所示,在第一结果图中,还可展示有第三曲线(例如图8中蓝色曲线)。第三曲线可表征在第二参考力场模型(GAFF2模型)中第一二面角的不同角度下第一碎片的分子势能。第三曲线上有多个示意点,该多个示意点中的其中一个为第三示意点,第三示意点可表征在第二参考力场模型中第一二面角为第三角度下第一碎片的分子势能为第三势能。在第一结果图中同时展示有在第二参考力场模型和目标力场模型下计算出的曲线的情况下,可区分性地展示曲线,例如用不同的颜色显示不同的曲线。
在一种可能的实现方式中,在展示第二区域的过程中,可以进行对示意点的触发操作的检测。其中,该触发操作可以是光标移动至示意点所在(或附近)区域、单击操作、双击操作等。在检测到针对第三曲线上的第三示意点的触发操作的情况下,可以在第一结果图中展示第三角度和第三势能。以图8为例,在检测到针对第三曲线上的第三示意点的触发操作的情况下,可以在第一结果图中展示第三角度的数值(例如图8中的41.282,与第一示意点处于相同角度)和第三势能的数值(例如图8中的1.287),并在第三势能附近标记有GAFF2的字样,以与第一势能、第二势能作区分。
这样,通过第二区域中的第一结果图可进一步展示在第二参考力场模型中第一二面角在不同角度下的分子势能,并通过触发第一结果图中第三曲线上的第三示意点可以突出展示对应的第一二面角的具体角度和分子势能的具体数值,不仅方便用户直观地获取到在第二参考力场模型下的二面角和分子势能的相关数据,还方便用户直观地比对在目标力场模型和在第二参考力场模型下二面角和分子势能的数据,有助于用户筛选出更优选的药物待选配体,大大缩短新药开发流程,并降低新药失败风险。
在一种可能的实现方式中,如图9所示,第二区域A2中还展示有第一切换控件、第二切换控件、第三切换控件这多个切换控件。通过对第一切换控件进行触发可以切换第一子结果图中第一曲线的展示状态(也即展示第一曲线或者隐藏第一曲线)。通过对第二切换控件进行触发可以切换第一子结果图中第二曲线的展示状态(也即展示第二曲线或者隐藏第二曲线)。通过对第三切换控件进行触发可以切换第一子结果图中第三曲线的展示状态(也即展示第三曲线或者隐藏第三曲线)。
在一种可能的实现方式中,在展示第二区域的过程中,可以进行针对第一切换控件的触发操作的检测。在检测到针对第一切换控件的触发操作的情况下,可以在第一结果图中展示或隐藏第一曲线。
在一种可能的实现方式中,在展示第二区域的过程中,可以进行针对第二切换控件的触发操作的检测。在检测到针对第二切换控件的触发操作的情况下,在第一结果图中展示或隐藏第二曲线。以图9为例,在检测到针对第二切换控件的触发操作的情况下,在第一结果图中隐藏第二曲线,使得图9示出的第一结果图中仅展示有第一曲线和第三曲线。
在一种可能的实现方式中,在展示第二区域的过程中,可以进行针对第三切换控件的触发操作的检测。在检测到针对第三切换控件的触发操作的情况下,在第一结果图中展示或隐藏第三曲线。
这样,通过触发任意切换控件,可以切换对应曲线的展示状态,方便用户根据自定义需求进行灵活查看且操作便捷。
在一种可能的实现方式中,如图9所示,第二区域A2中还展示有下载控件W1、局部放大控件W2、平移控件W3、矩形选择控件W4、自由图形选择控件W5、整体放大控件W6、整体缩小控件W7、自适应控件W8、重置控件W9这些功能控件。在展示第二区域的过程中,可以进行针对功能控件的触发操作的检测。
在一种可能的实现方式中,在检测到针对下载控件的触发操作的情况下,可以展示下载提示框,下载提示框中可展示有对应于被触发的下载控件的第一结果图的名称、存储地址和下载确定控件。
在一种可能的实现方式中,在检测到针对下载确定控件的触发操作的情况下,可以下载第一结果图的相关信息。
在一种可能的实现方式中,在检测到针对局部放大控件的触发操作的情况下,可以对根据局部放大控件所确定出的区域进行局部放大。
在一种可能的实现方式中,在检测到针对平移控件的触发操作的情况下,可以对第一结果图进行平移。
在一种可能的实现方式中,在检测到针对矩形选择控件的触发操作的情况下,可以在第一结果图中突出展示根据矩形选择控件所选择出的矩形区域。
在一种可能的实现方式中,在检测到针对自由图形选择控件的触发操作的情况下,可以在第一结果图中突出展示根据自由图形选择控件所选择出的自由图形区域。
在一种可能的实现方式中,在检测到针对整体放大控件的触发操作的情况下,可以对第一结果图进行整体放大。
在一种可能的实现方式中,在检测到针对整体缩小控件的触发操作的情况下,可以对第一结果图进行整体缩小。
在一种可能的实现方式中,在检测到针对自适应控件的触发操作的情况下,可以在第二区域中展示第一结果图的所有内容。
在一种可能的实现方式中,在检测到针对重置控件的触发操作的情况下,可以重置对第一结果图的所有操作,并在第二区域中展示原始的第一结果图。
这样,通过展示一系列的功能控件,方便用户下载、局部放大、平移、整体放大、整体缩小所关注的结果图,并可在结果中绘制矩形或自由图形以标记重点关注位置,还可以一键选择结果图自适应地展示在第二区域中以及重置所有操作以还原展示原始的结果图。
在一种可能的实现方式中,在展示第三区域的过程中,可以进行针对第一三维结构图的旋转操作和/或旋转操作的检测。
在一种可能的实现方式中在检测到针对第一三维结构图的旋转操作的情况下,可以对第一三维结构图进行旋转。
在一种可能的实现方式中在检测到针对第一三维结构图的缩放操作的情况下,可以对第一三维结构图的展示尺寸进行放大或缩小。
缩放操作可以是对鼠标滚轮的滚动操作,旋转操作可以是点击第一三维结构图后滑动鼠标等等,本领域技术人员可以根据实际需要对缩放操作和旋转操作的实现方式进行设置,本公开实施例对此不作限制。
这样,通过进行针对第一三维结构图的旋转操作和/或旋转操作的检测,能够及时响应用户的旋转三维结构图和/或缩放结构图的需求。
本公开实施例还提出一种分子力场展示装置。图10示出根据本公开实施例提供的分子力场展示装置的框图。如图10所示,该分子力场展示装置100可以包括:
计算模块101,所述计算模块101被配置为在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下,进行针对所述目标项目中与受体结合的各配体的力场计算,得到针对所述各配体的计算结果;
展示模块102,所述展示模块102被配置为基于针对第一配体的计算结果展示结果界面,所述结果界面包括第一区域、第二区域及第三区域,所述第一区域展示有所述第一配体的各碎片和各碎片中的二面角,所述第二区域展示有针对第一二面角的第一结果图,所述第三区域展示有针对第一碎片的第一三维结构图;
其中,所述第一配体为所述目标项目的多个配体中的一个配体,所述第一碎片为所述第一配体的多个碎片中当前突出展示的碎片,所述第一二面角是所述第一碎片中所形成的二面角中当前突出展示的一个,所述第一结果图展示有在目标力场模型中不同第一二面角角度下第一碎片的分子势能。
通过在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下进行针对目标项目中与受体结合的各配体的力场计算,得到针对各配体的计算结果,并基于针对第一配体的计算结果展示结果界面,从而通过结果界面的第一区域展示第一配体的各碎片和各碎片中的二面角、通过结果界面的第二区域展示针对第一二面角的第一结果图、通过结果界面的第三区域展示针对第一碎片的第一三维结构图,其中,第一配体为目标项目的多个配体中的一个配体,第一碎片为第一配体的多个碎片中当前突出展示的碎片,第一二面角是第一碎片中所形成的二面角中当前突出展示的一个,第一结果图展示有在目标力场模型中不同第一二面角角度下第一碎片的分子势能,这样,在整个力场计算的过程中,用户所需进行的操作少且简单,只需通过简单的操作就能够便捷、直观、迅速地获取到力场计算的结果,方便用户根据结果界面查看各碎片、各二面角以及分子势能结果,有助于用户根据这些结果快速筛选出更优选的药物待选配体,大大缩短新药开发流程,并降低新药失败风险。
在一种可能的实现方式中,所述装置还包括第一计算模块,所述第一计算模块被配置为:在检测到针对力场计算控件的触发操作的情况下,展示用于力场计算的初始界面,所述初始界面中展示有至少一个可选项目;在根据第一选择操作从所述至少一个可选项目中确定出所述目标项目的情况下,展示针对所述目标项目的计算输入提示,所述计算输入提示中展示有多个第一输入框和所述启动控件,不同的第一输入框用于输入不同的计算输入,其中,所述计算输入包括记录描述所述配体的结构文件、计算所用的力场模型中的至少一种,所述力场模型包括目标力场模型;根据检测到的针对各所述计算输入框的输入操作,在所述计算输入提示中展示确定出的针对所述目标项目的计算输入,以在所述启动控件被触发的情况下基于所述计算输入进行所述力场计算。
这样,通过第一选择操作确定出目标项目,并根据计算输入提示确定出针对目标项目的计算输入,以实现在启动控件被触发的情况下能够基于计算输入进行力场计算,这个过程中,用户不仅可以从多个可选项目中选择目标项目,还可以在目标项目中选择任意数量的配体以进行后续的力场计算,并且可以自定义计算输入以确定力场计算所用的数据,从而能够得到符合用户需求的计算结果,大大提高了力场计算的灵活性,在最大程度上满足用户的计算需求。
在一种可能的实现方式中,所述装置还包括第二计算模块,所述第一计算模块被配置为:在检测到针对展示于所述结果界面中的输入编辑控件的触发操作的情况下,展示用于针对所述目标项目的可选输入提示,所述可选输入提示中展示有多个第二输入框和所述启动控件,不同的第二输入框用于输入不同的可选输入,所述可选输入包括计算所用的参考力场模型、势能面的计算方式、计算所用的缓存结果、计算所用的随机构象数中的至少一种;根据检测到的针对各所述第二输入框的输入操作,在所述可选输入提示中展示确定出的针对所述目标项目的可选输入,以在所述启动控件被触发的情况下基于所述计算输入和所述可选输入进行所述力场计算。
这样,通过触发输入编辑控件来展示可选输入提示,并根据计算输入提示确定出针对目标项目的可选输入,以实现在启动控件被触发的情况下能够基于计算输入和可选输入进行进一步的力场计算,从而满足用户期望进行计算数据微小调整的需求,无需从头开始进行整个力场计算,在提高力场计算灵活性的同时有助于节约计算资源。
在一种可能的实现方式中,所述装置还包括确定模块,所述确定模块被配置为:根据检测到的第二选择操作从所述多个配体中确定出对应于所述第二选择操作的第一配体;或者,在未检测到针对任一配体的第二选择操作的情况下,根据预设规则确定出所述第一配体;其中,在所述第一配体为一个或多个,所述第一区域中所展示的碎片的结构组成和/或二面角不同。
这样,通过对第二选择操作的检测来显示对应于第一配体的计算结果,方便用户选择所需数量的配体及对应计算结果。
在一种可能的实现方式中,所述第一区域包括多个第一子区域、一个第二子区域;各所述第一子区域展示有对应的碎片、该碎片的一个二面角和该碎片在该二面角下的第一分析结果,所述第二子区域展示有所述第一配体的碎片总数、二面角总数和第二分析结果;所述第一分析结果是根据在所述目标力场模型中对应的碎片在对应的二面角的不同角度下的分子势能所确定的,所述第二分析结果是根据所有碎片在分别对应的二面角下的第一分析结果所确定的;其中,所述装置还包括第一排序模块,所述第一排序模块被配置为:在检测到针对第一排序控件的触发操作的情况下,在所述第一区域内按照第一顺序展示各所述第一子区域,其中,所述第一排序控件设置于所述第一区域,所述第一顺序是根据各所述第一子区域对应的碎片在对应二面角下的第一分析结果所确定的。
这样,通过第一区域中的第二子区域可以展示配体所包括的碎片总数、二面角总数及第二分析结果,通过第一区域中的各第一子区域可以展示各碎片、各二面角及对应的第一分析结果,方便用户直观地获取到针对配体的力场计算结果,并根据第一排序控件能够迅速实现基于第一分析结果对各第一子区域(实质上各二面角)进行排序并展示出来,有助于用户筛选二面角,操作简单。
在一种可能的实现方式中,各所述第一子区域还展示有所述第一分析结果对应的二面角下的第三分析结果,所述第二子区域中还展示有第四分析结果,所述第三分析结果是根据在参考力场模型中对应的碎片在对应的二面角的不同角度下的分子势能所确定的,所述第四分析结果是根据所有碎片在分别对应二面角下的第三分析结果所确定的;
其中,所述装置还包括第二排序模块,所述第二排序模块被配置为:在检测到针对第二排序控件的触发操作的情况下,在所述第一区域内按照第二顺序展示各所述第一子区域,其中,所述第二排序控件设置于所述第一区域,所述第二顺序是根据各所述第一子区域对应的碎片在对应二面角下的第三分析结果所确定的。
这样,通过第一区域中的第二子区域可以进一步展示第四分析结果,通过第一区域中的各第一子区域可以进一步展示各二面角对应的第三分析结果,方便用户直观地获取到针对配体的力场计算结果,并根据第二排序控件能够迅速实现基于第三分析结果对各第一子区域(实质上各二面角)进行排序并展示出来,有助于用户筛选二面角,操作简单。
在一种可能的实现方式中,所述第一结果图展示有第一曲线,所述第一曲线表征在所述目标力场模型中第一二面角的不同角度下第一碎片的分子势能,所述第一曲线上有多个示意点,该多个示意点中的其中一个为第一示意点,所述第一示意点表征在所述目标力场模型中所述第一二面角为第一角度下第一碎片的分子势能为第一势能;所述装置还包括第一展示模块,所述第一展示模块被配置为:在检测到针对所述第一曲线上的第一示意点的触发操作的情况下,在所述第一结果图中展示所述第一角度和所述第一势能,并在所述第一三维结构图中展示所述第一角度。
这样,通过第二区域中的第一结果图可以展示在目标力场模型中第一二面角在不同角度下的分子势能,并通过触发第一结果图中第一曲线上的第一示意点可以突出展示对应的第一二面角的具体角度和分子势能的具体数值,同时能够在第一三维结构图中展示对应的二面角,方便用户直观地获取到在目标力场模型下的二面角和分子势能的相关数据。
在一种可能的实现方式中,所述第一结果图还展示有第二曲线,所述第二曲线表征在第一参考力场模型中第一二面角的不同角度下第一碎片的分子势能,所述第二曲线上有多个示意点,该多个示意点中的其中一个为第二示意点,所述第二示意点表征在所述第一参考力场模型中所述第一二面角为第二角度下第一碎片的分子势能为第二势能;所述装置还包括第二展示模块,所述二展示模块被配置为:在检测到针对所述第二曲线上的第二示意点的触发操作的情况下,在所述第一结果图中展示所述第二角度和所述第二势能;并且/或者,所述第一结果图还展示有第三曲线,所述第三曲线表征在第二参考力场模型中第一二面角的不同角度下第一碎片的分子势能,所述第三曲线上有多个示意点,该多个示意点中的其中一个为第三示意点,所述第三示意点表征在所述第二参考力场模型中所述第一二面角为第三角度的下第一碎片的分子势能为第三势能;所述装置还包括第三展示模块,所述第三展示模块被配置为:在检测到针对所述第三曲线上的第三示意点的触发操作的情况下,在所述第一结果图中展示所述第三角度和所述第三势能。
这样,方便用户直观地获取到在第一参考力场模型、第二参考力场模型下的二面角和分子势能的相关数据,还方便用户直观地比对在目标力场模型和在第一参考力场模型、第二参考力场模型下二面角和分子势能的数据,有助于用户筛选出更优选的药物待选配体,大大缩短新药开发流程,并降低新药失败风险。
在一种可能的实现方式中,所述第二区域中还展示有第一切换控件、第二切换控件、第三切换控件;所述装置还包括切换模块,所述切换模块被配置为执行以下至少一种操作:在检测到针对所述第一切换控件的触发操作的情况下,在所述第一结果图中展示或隐藏所述第一曲线;在检测到针对所述第二切换控件的触发操作的情况下,在所述第一结果图中展示或隐藏所述第二曲线;在检测到针对所述第三切换控件的触发操作的情况下,在所述第一结果图中展示或隐藏所述第三曲线。
这样,通过触发任意切换控件,可以切换对应曲线的展示状态,方便用户根据自定义需求进行灵活查看且操作便捷。
在一种可能的实现方式中,所述第二区域中还展示有下载控件、局部放大控件、平移控件、矩形选择控件、自由图形选择控件、整体放大控件、整体缩小控件、自适应控件、重置控件;所述装置还包括多功能实现模块,所述多功能实现模块被配置为执行以下至少一种操作:在检测到针对所述下载控件的触发操作的情况下,展示下载提示框,所述下载提示框中展示有对应于被触发的下载控件的第一结果图的名称、存储地址和下载确定控件;在检测到针对所述下载确定控件的触发操作的情况下,下载所述第一结果图的相关信息;在检测到针对所述局部放大控件的触发操作的情况下,对根据所述局部放大控件所确定出的区域进行局部放大;在检测到针对所述平移控件的触发操作的情况下,对所述第一结果图进行平移;在检测到针对所述矩形选择控件的触发操作的情况下,在所述第一结果图中突出展示根据所述矩形选择控件所选择出的矩形区域;在检测到针对所述自由图形选择控件的触发操作的情况下,在所述第一结果图中突出展示根据所述自由图形选择控件所选择出的自由图形区域;在检测到针对所述整体放大控件的触发操作的情况下,对所述第一结果图进行整体放大;在检测到针对所述整体缩小控件的触发操作的情况下,对所述第一结果图进行整体缩小;在检测到针对所述自适应控件的触发操作的情况下,在所述第二区域中展示所述第一结果图的所有内容;在检测到针对所述重置控件的触发操作的情况下,重置对所述第一结果图的所有操作,并在所述第二区域中展示原始的第一结果图。
这样,通过展示一系列的功能控件,方便用户下载、局部放大、平移、整体放大、整体缩小所关注的结果图,并可在结果中绘制矩形或自由图形以标记重点关注位置,还可以一键选择结果图自适应地展示在第二区域中以及重置所有操作以还原展示原始的结果图。
在一种可能的实现方式中,所述装置还包括调整模块,所述调整模块被配置为:在检测到针对所述第一三维结构图的旋转操作的情况下,对所述第一三维结构图进行旋转;并且/或者,在检测到针对所述第一三维结构图的缩放操作的情况下,对所述第一三维结构图的展示尺寸进行放大或缩小。
这样,通过进行针对第一三维结构图的旋转操作和/或旋转操作的检测,能够及时响应用户的旋转三维结构图和/或缩放结构图的需求。
在一些实施例中,本公开实施例提供的分子力场展示装置具有的功能或包含的模块可以用于执行上文方法实施例描述的方法,其具体实现可以参照上文分子力场展示方法实施例的描述,为了简洁,这里不再赘述。
本公开实施例还提出一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序指令,所述计算机程序指令被处理器执行时实现上述分子力场展示方法。计算机可读存储介质可以是易失性或非易失性计算机可读存储介质。
在一些实施例中,本公开实施例提供的计算机可读存储介质具有的功能或包含的模块可以用于执行上文方法实施例描述的方法,其具体实现可以参照上文分子力场展示方法实施例的描述,为了简洁,这里不再赘述。
本公开实施例还提出一种分子力场展示装置,包括:处理器;用于存储处理器可执行指令的存储器;其中,所述处理器被配置为在执行所述存储器存储的指令时,实现上述分子力场展示方法。
在一些实施例中,本公开实施例提供的分子力场展示装置具有的功能或包含的模块可以用于执行上文方法实施例描述的方法,其具体实现可以参照上文分子力场展示方法实施例的描述,为了简洁,这里不再赘述。
本公开实施例还提供了一种计算机程序产品,包括计算机可读代码,或者承载有计算机可读代码的非易失性计算机可读存储介质,当所述计算机可读代码在电子设备的处理器中运行时,所述电子设备中的处理器执行上述分子力场展示方法。
在一些实施例中,本公开实施例提供的计算机程序产品具有的功能或包含的模块可以用于执行上文方法实施例描述的方法,其具体实现可以参照上文分子力场展示方法实施例的描述,为了简洁,这里不再赘述。
图11示出根据本公开实施例提供的用于执行分子力场展示方法的装置的框图。例如,装置1900可以被提供为一服务器或终端设备。参照图11,装置1900包括处理组件1922,其进一步包括一个或多个处理器,以及由存储器1932所代表的存储器资源,用于存储可由处理组件1922的执行的指令,例如应用程序。存储器1932中存储的应用程序可以包括一个或一个以上的每一个对应于一组指令的模块。此外,处理组件1922被配置为执行指令,以执行上述方法。
装置1900还可以包括一个电源组件1926被配置为执行装置1900的电源管理,一个有线或无线网络接口1950被配置为将装置1900连接到网络,和一个输入输出接口1958(I/O接口)。装置1900可以操作基于存储在存储器1932的操作系统,例如Windows ServerTM,MacOS XTM,UnixTM,LinuxTM,FreeBSDTM或类似。
在示例性实施例中,还提供了一种非易失性计算机可读存储介质,例如包括计算机程序指令的存储器1932,上述计算机程序指令可由装置1900的处理组件1922执行以完成上述方法。
本公开可以是系统、方法和/或计算机程序产品。计算机程序产品可以包括计算机可读存储介质,其上载有用于使处理器实现本公开的各个方面的计算机可读程序指令。
计算机可读存储介质可以是可以保持和存储由指令执行设备使用的指令的有形设备。计算机可读存储介质例如可以是――但不限于――电存储设备、磁存储设备、光存储设备、电磁存储设备、半导体存储设备或者上述的任意合适的组合。计算机可读存储介质的更具体的例子(非穷举的列表)包括:便携式计算机盘、硬盘、随机存取存储器(RAM)、只读存储器(ROM)、可擦式可编程只读存储器(EPROM或闪存)、静态随机存取存储器(SRAM)、便携式压缩盘只读存储器(CD-ROM)、数字多功能盘(DVD)、记忆棒、软盘、机械编码设备、例如其上存储有指令的打孔卡或凹槽内凸起结构、以及上述的任意合适的组合。这里所使用的计算机可读存储介质不被解释为瞬时信号本身,诸如无线电波或者其他自由传播的电磁波、通过波导或其他传输媒介传播的电磁波(例如,通过光纤电缆的光脉冲)、或者通过电线传输的电信号。
这里所描述的计算机可读程序指令可以从计算机可读存储介质下载到各个计算/处理设备,或者通过网络、例如因特网、局域网、广域网和/或无线网下载到外部计算机或外部存储设备。网络可以包括铜传输电缆、光纤传输、无线传输、路由器、防火墙、交换机、网关计算机和/或边缘服务器。每个计算/处理设备中的网络适配卡或者网络接口从网络接收计算机可读程序指令,并转发该计算机可读程序指令,以供存储在各个计算/处理设备中的计算机可读存储介质中。
用于执行本公开操作的计算机程序指令可以是汇编指令、指令集架构(ISA)指令、机器指令、机器相关指令、微代码、固件指令、状态设置数据、或者以一种或多种编程语言的任意组合编写的源代码或目标代码,所述编程语言包括面向对象的编程语言—诸如Smalltalk、C++等,以及常规的过程式编程语言—诸如“C”语言或类似的编程语言。计算机可读程序指令可以完全地在用户计算机上执行、部分地在用户计算机上执行、作为一个独立的软件包执行、部分在用户计算机上部分在远程计算机上执行、或者完全在远程计算机或服务器上执行。在涉及远程计算机的情形中,远程计算机可以通过任意种类的网络—包括局域网(LAN)或广域网(WAN)—连接到用户计算机,或者,可以连接到外部计算机(例如利用因特网服务提供商来通过因特网连接)。在一些实施例中,通过利用计算机可读程序指令的状态信息来个性化定制电子电路,例如可编程逻辑电路、现场可编程门阵列(FPGA)或可编程逻辑阵列(PLA),该电子电路可以执行计算机可读程序指令,从而实现本公开的各个方面。
这里参照根据本公开实施例的方法、装置(系统)和计算机程序产品的流程图和/或框图描述了本公开的各个方面。应当理解,流程图和/或框图的每个方框以及流程图和/或框图中各方框的组合,都可以由计算机可读程序指令实现。
这些计算机可读程序指令可以提供给通用计算机、专用计算机或其它可编程数据处理装置的处理器,从而生产出一种机器,使得这些指令在通过计算机或其它可编程数据处理装置的处理器执行时,产生了实现流程图和/或框图中的一个或多个方框中规定的功能/动作的装置。也可以把这些计算机可读程序指令存储在计算机可读存储介质中,这些指令使得计算机、可编程数据处理装置和/或其他设备以特定方式工作,从而,存储有指令的计算机可读介质则包括一个制造品,其包括实现流程图和/或框图中的一个或多个方框中规定的功能/动作的各个方面的指令。
也可以把计算机可读程序指令加载到计算机、其它可编程数据处理装置、或其它设备上,使得在计算机、其它可编程数据处理装置或其它设备上执行一系列操作步骤,以产生计算机实现的过程,从而使得在计算机、其它可编程数据处理装置、或其它设备上执行的指令实现流程图和/或框图中的一个或多个方框中规定的功能/动作。
附图中的流程图和框图显示了根据本公开的多个实施例的系统、方法和计算机程序产品的可能实现的体系架构、功能和操作。在这点上,流程图或框图中的每个方框可以代表一个模块、程序段或指令的一部分,所述模块、程序段或指令的一部分包含一个或多个用于实现规定的逻辑功能的可执行指令。在有些作为替换的实现中,方框中所标注的功能也可以以不同于附图中所标注的顺序发生。例如,两个连续的方框实际上可以基本并行地执行,它们有时也可以按相反的顺序执行,这依所涉及的功能而定。也要注意的是,框图和/或流程图中的每个方框、以及框图和/或流程图中的方框的组合,可以用执行规定的功能或动作的专用的基于硬件的系统来实现,或者可以用专用硬件与计算机指令的组合来实现。
以上已经描述了本公开的各实施例,上述说明是示例性的,并非穷尽性的,并且也不限于所披露的各实施例。在不偏离所说明的各实施例的范围和精神的情况下,对于本技术领域的普通技术人员来说许多修改和变更都是显而易见的。本文中所用术语的选择,旨在最好地解释各实施例的原理、实际应用或对市场中的技术改进,或者使本技术领域的其它普通技术人员能理解本文披露的各实施例。
Claims (14)
1.一种分子力场展示方法,其特征在于,包括:
在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下,进行针对所述目标项目中与受体结合的各配体的力场计算,得到针对所述各配体的计算结果;
基于针对第一配体的计算结果展示结果界面,所述结果界面包括第一区域、第二区域及第三区域,所述第一区域展示有所述第一配体的各碎片和各碎片中的二面角,所述第二区域展示有针对第一二面角的第一结果图,所述第三区域展示有针对第一碎片的第一三维结构图;
其中,所述第一配体为所述目标项目的多个配体中的一个配体,所述第一碎片为所述第一配体的多个碎片中当前突出展示的碎片,所述第一二面角是所述第一碎片中所形成的二面角中当前突出展示的一个,所述第一结果图展示有在目标力场模型中不同第一二面角角度下第一碎片的分子势能。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:
在检测到针对力场计算控件的触发操作的情况下,展示用于力场计算的初始界面,所述初始界面中展示有至少一个可选项目;
在根据第一选择操作从所述至少一个可选项目中确定出所述目标项目的情况下,展示针对所述目标项目的计算输入提示,所述计算输入提示中展示有多个第一输入框和所述启动控件,不同的第一输入框用于输入不同的计算输入,其中,所述计算输入包括记录描述所述配体的结构文件、计算所用的力场模型中的至少一种,所述力场模型包括目标力场模型;
根据检测到的针对各所述计算输入框的输入操作,在所述计算输入提示中展示确定出的针对所述目标项目的计算输入,以在所述启动控件被触发的情况下基于所述计算输入进行所述力场计算。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:
在检测到针对展示于所述结果界面中的输入编辑控件的触发操作的情况下,展示用于针对所述目标项目的可选输入提示,所述可选输入提示中展示有多个第二输入框和所述启动控件,不同的第二输入框用于输入不同的可选输入,所述可选输入包括计算所用的参考力场模型、势能面的计算方式、计算所用的缓存结果、计算所用的随机构象数中的至少一种;
根据检测到的针对各所述第二输入框的输入操作,在所述可选输入提示中展示确定出的针对所述目标项目的可选输入,以在所述启动控件被触发的情况下基于所述计算输入和所述可选输入进行所述力场计算。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:
根据检测到的第二选择操作从所述多个配体中确定出对应于所述第二选择操作的第一配体;或者,
在未检测到针对任一配体的第二选择操作的情况下,根据预设规则确定出所述第一配体;
其中,在所述第一配体为一个或多个,所述第一区域中所展示的碎片的结构组成和/或二面角不同。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述第一区域包括多个第一子区域、一个第二子区域;各所述第一子区域展示有对应的碎片、该碎片的一个二面角和该碎片在该二面角下的第一分析结果,所述第二子区域展示有所述第一配体的碎片总数、二面角总数和第二分析结果;所述第一分析结果是根据在所述目标力场模型中对应的碎片在对应的二面角的不同角度下的分子势能所确定的,所述第二分析结果是根据所有碎片在分别对应的二面角下的第一分析结果所确定的;
其中,所述方法还包括:在检测到针对第一排序控件的触发操作的情况下,在所述第一区域内按照第一顺序展示各所述第一子区域,其中,所述第一排序控件设置于所述第一区域,所述第一顺序是根据各所述第一子区域对应的碎片在对应二面角下的第一分析结果所确定的。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,各所述第一子区域还展示有所述第一分析结果对应的二面角下的第三分析结果,所述第二子区域中还展示有第四分析结果,所述第三分析结果是根据在参考力场模型中对应的碎片在对应的二面角的不同角度下的分子势能所确定的,所述第四分析结果是根据所有碎片在分别对应二面角下的第三分析结果所确定的;
其中,所述方法还包括:在检测到针对第二排序控件的触发操作的情况下,在所述第一区域内按照第二顺序展示各所述第一子区域,其中,所述第二排序控件设置于所述第一区域,所述第二顺序是根据各所述第一子区域对应的碎片在对应二面角下的第三分析结果所确定的。
7.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述第一结果图展示有第一曲线,所述第一曲线表征在所述目标力场模型中第一二面角的不同角度下第一碎片的分子势能,所述第一曲线上有多个示意点,该多个示意点中的其中一个为第一示意点,所述第一示意点表征在所述目标力场模型中所述第一二面角为第一角度下第一碎片的分子势能为第一势能;所述方法还包括:
在检测到针对所述第一曲线上的第一示意点的触发操作的情况下,在所述第一结果图中展示所述第一角度和所述第一势能,并在所述第一三维结构图中展示所述第一角度。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述第一结果图还展示有第二曲线,所述第二曲线表征在第一参考力场模型中第一二面角的不同角度下第一碎片的分子势能,所述第二曲线上有多个示意点,该多个示意点中的其中一个为第二示意点,所述第二示意点表征在所述第一参考力场模型中所述第一二面角为第二角度下第一碎片的分子势能为第二势能;所述方法还包括:在检测到针对所述第二曲线上的第二示意点的触发操作的情况下,在所述第一结果图中展示所述第二角度和所述第二势能;
并且/或者,
所述第一结果图还展示有第三曲线,所述第三曲线表征在第二参考力场模型中第一二面角的不同角度下第一碎片的分子势能,所述第三曲线上有多个示意点,该多个示意点中的其中一个为第三示意点,所述第三示意点表征在所述第二参考力场模型中所述第一二面角为第三角度的下第一碎片的分子势能为第三势能;所述方法还包括:在检测到针对所述第三曲线上的第三示意点的触发操作的情况下,在所述第一结果图中展示所述第三角度和所述第三势能。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述第二区域中还展示有第一切换控件、第二切换控件、第三切换控件;所述方法还包括以下至少一种操作:
在检测到针对所述第一切换控件的触发操作的情况下,在所述第一结果图中展示或隐藏所述第一曲线;
在检测到针对所述第二切换控件的触发操作的情况下,在所述第一结果图中展示或隐藏所述第二曲线;
在检测到针对所述第三切换控件的触发操作的情况下,在所述第一结果图中展示或隐藏所述第三曲线。
10.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述第二区域中还展示有下载控件、局部放大控件、平移控件、矩形选择控件、自由图形选择控件、整体放大控件、整体缩小控件、自适应控件、重置控件;所述方法还包括以下至少一种操作:
在检测到针对所述下载控件的触发操作的情况下,展示下载提示框,所述下载提示框中展示有对应于被触发的下载控件的第一结果图的名称、存储地址和下载确定控件;在检测到针对所述下载确定控件的触发操作的情况下,下载所述第一结果图的相关信息;
在检测到针对所述局部放大控件的触发操作的情况下,对根据所述局部放大控件所确定出的区域进行局部放大;
在检测到针对所述平移控件的触发操作的情况下,对所述第一结果图进行平移;
在检测到针对所述矩形选择控件的触发操作的情况下,在所述第一结果图中突出展示根据所述矩形选择控件所选择出的矩形区域;
在检测到针对所述自由图形选择控件的触发操作的情况下,在所述第一结果图中突出展示根据所述自由图形选择控件所选择出的自由图形区域;
在检测到针对所述整体放大控件的触发操作的情况下,对所述第一结果图进行整体放大;
在检测到针对所述整体缩小控件的触发操作的情况下,对所述第一结果图进行整体缩小;
在检测到针对所述自适应控件的触发操作的情况下,在所述第二区域中展示所述第一结果图的所有内容;
在检测到针对所述重置控件的触发操作的情况下,重置对所述第一结果图的所有操作,并在所述第二区域中展示原始的第一结果图。
11.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:
在检测到针对所述第一三维结构图的旋转操作的情况下,对所述第一三维结构图进行旋转;
并且/或者,
在检测到针对所述第一三维结构图的缩放操作的情况下,对所述第一三维结构图的展示尺寸进行放大或缩小。
12.一种分子力场展示装置,其特征在于,包括:
计算模块,所述计算模块被配置为在检测到针对目标项目的启动控件的触发操作的情况下,进行针对所述目标项目中与受体结合的各配体的力场计算,得到针对所述各配体的计算结果;
展示模块,所述展示模块被配置为基于针对第一配体的计算结果展示结果界面,所述结果界面包括第一区域、第二区域及第三区域,所述第一区域展示有所述第一配体的各碎片和各碎片中的二面角,所述第二区域展示有针对第一二面角的第一结果图,所述第三区域展示有针对第一碎片的第一三维结构图;
其中,所述第一配体为所述目标项目的多个配体中的一个配体,所述第一碎片为所述第一配体的多个碎片中当前突出展示的碎片,所述第一二面角是所述第一碎片中所形成的二面角中当前突出展示的一个,所述第一结果图展示有在目标力场模型中不同第一二面角角度下第一碎片的分子势能。
13.一种分子力场展示装置,其特征在于,包括:
处理器;
用于存储处理器可执行指令的存储器;
其中,所述处理器被配置为在执行所述存储器存储的指令时,实现权利要求1至11中任意一项所述的方法。
14.一种非易失性计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序指令,其特征在于,所述计算机程序指令被处理器执行时实现权利要求1至11中任意一项所述的方法。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202311842237.XA CN117789859A (zh) | 2023-12-28 | 2023-12-28 | 分子力场展示方法及装置、介质 |
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