CN116908458A - 用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物及检测试剂盒 - Google Patents

用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物及检测试剂盒 Download PDF

Info

Publication number
CN116908458A
CN116908458A CN202311171643.8A CN202311171643A CN116908458A CN 116908458 A CN116908458 A CN 116908458A CN 202311171643 A CN202311171643 A CN 202311171643A CN 116908458 A CN116908458 A CN 116908458A
Authority
CN
China
Prior art keywords
nervous system
central nervous
primary central
differential diagnosis
carnitine
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN202311171643.8A
Other languages
English (en)
Other versions
CN116908458B (zh
Inventor
陈利民
李霄
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Tianjin Yunjian Medical Lab Co ltd
Binhai Industrial Technology Research Institute of Zhejiang University
Original Assignee
Tianjin Yunjian Medical Lab Co ltd
Binhai Industrial Technology Research Institute of Zhejiang University
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Tianjin Yunjian Medical Lab Co ltd, Binhai Industrial Technology Research Institute of Zhejiang University filed Critical Tianjin Yunjian Medical Lab Co ltd
Priority to CN202311171643.8A priority Critical patent/CN116908458B/zh
Publication of CN116908458A publication Critical patent/CN116908458A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN116908458B publication Critical patent/CN116908458B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57484Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer involving compounds serving as markers for tumor, cancer, neoplasia, e.g. cellular determinants, receptors, heat shock/stress proteins, A-protein, oligosaccharides, metabolites
    • G01N33/57488Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer involving compounds serving as markers for tumor, cancer, neoplasia, e.g. cellular determinants, receptors, heat shock/stress proteins, A-protein, oligosaccharides, metabolites involving compounds identifable in body fluids
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N30/00Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography or field flow fractionation
    • G01N30/02Column chromatography
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N30/00Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography or field flow fractionation
    • G01N30/02Column chromatography
    • G01N30/04Preparation or injection of sample to be analysed
    • G01N30/06Preparation
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N30/00Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography or field flow fractionation
    • G01N30/02Column chromatography
    • G01N30/62Detectors specially adapted therefor
    • G01N30/72Mass spectrometers
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57407Specifically defined cancers
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N30/00Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography or field flow fractionation
    • G01N30/02Column chromatography
    • G01N2030/022Column chromatography characterised by the kind of separation mechanism
    • G01N2030/027Liquid chromatography
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N30/00Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography or field flow fractionation
    • G01N30/02Column chromatography
    • G01N30/04Preparation or injection of sample to be analysed
    • G01N30/06Preparation
    • G01N2030/062Preparation extracting sample from raw material

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Other Investigation Or Analysis Of Materials By Electrical Means (AREA)

Abstract

本发明实施例公开了用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物及检测试剂盒;该生物标志物为天冬酰胺、组氨酸、甲硫氨酸、脯氨酸、苏氨酸、焦谷氨酸、C10‑肉碱、C18:1‑肉碱、C5DC‑肉碱/C6OH‑肉碱和C8‑肉碱中的一种,或多种的组合;一些实施例公开了用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂,该检测试剂用于提取差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物。一些实施例公开了用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂盒;生物标志物,具有高通量、取材简单、特异性高的优点,有效提高了差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的准确性,能够对原发性中枢神经系统淋巴瘤的进行特异性筛查。

Description

用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物及检 测试剂盒
技术领域
本发明属于生物检测技术领域,具体涉及用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物及检测试剂盒。
背景技术
原发性中枢神经系统淋巴瘤(PCNSL)是一种罕见且高度恶性的非霍奇金淋巴瘤,主要在大脑、颅神经、软脑膜、脑脊液(CSF)、眼内结构和脊髓中侵袭性传播。PCNSL约占所有脑肿瘤的2%至3%,发病率为0.47/100000,近年来呈上升趋势,主要影响老年人和免疫功能低下人群。因为临床表现因涉及中枢神经系统的区域而异,PCNSL的差异诊断具有挑战性。
目前,PCNSL的差异诊断通常包括磁共振成像(MRI)、计算机断层扫描(CT)以及活检或其他组织样本分析。但是,由于MRI表型不是特异性的,很难与神经胶质瘤、壁内感染和非感染性炎症区分开来。活检或其他组织样本的病理检查是差异诊断PCNSL的金标准,然而,活检有并发症的风险,如出血、感染或神经损伤,特别是在肿瘤位于大脑敏感区域的情况下,并且由于较少的组织或先前的激素使用,也可能导致假阴性结果。
申请人在专利申请CN2023105729657中公开了用于诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物及检测试剂盒,公开了作为诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物丙氨酸、C4-肉碱、C14-肉碱;基于该生物标志物的检测试剂、检测试剂盒能够用于对原发性中枢神经系统淋巴瘤的进行特异性筛查。若试验样本的筛查结果或称分值小于临界值,表明结果为阴性,即可判定为非原发性中枢神经系统淋巴瘤,或原发性中枢神经系统淋巴瘤病变低风险;若试验样本的结果或称分值等于或大于临界值,表明结果为阳性,即可判定为原发性中枢神经系统淋巴瘤,或原发性中枢神经系统淋巴瘤病变高风险。
但是,现有技术不能根据阴性检查结果进一步区分非原发性中枢神经系统淋巴瘤,或原发性中枢神经系统淋巴瘤病变低风险;也不能根据阳性检查结果进一步区分原发性中枢神经系统淋巴瘤,或原发性中枢神经系统淋巴瘤病变高风险。
发明内容
申请人进一步研究发现了能够用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物。利用该生物标志物,能够用于对原发性中枢神经系统淋巴瘤进行差异诊断,若试验样本的结果或称分值小于临界值,表明结果为阴性,即为非原发性中枢神经系统淋巴瘤或其他脑转移癌;若试验样本的结果或称分值等于或大于临界值,表明结果为阳性,即为原发性中枢神经系统淋巴瘤。
一方面,一些实施例公开了用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物,该生物标志物为下述物质的一种,或多种的组合:
天冬酰胺、组氨酸、甲硫氨酸、脯氨酸、苏氨酸、焦谷氨酸、C10-肉碱、C18:1-肉碱、C5DC-肉碱/C6OH-肉碱和C8-肉碱。
另一方面,一些实施例公开了用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂,该检测试剂用于提取差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物。
进一步,一些实施例公开的用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂,检测试剂包括:
萃取液,用于提取生物标志物;
分离液,用于分离提取的生物标志物。
通常,利用检测试剂提取检测样本中的代谢产物,以提取作为诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物,检测试剂通常包括萃取试剂,例如包含1‰盐酸、1%β-巯基乙醇的甲醇溶液可以作为萃取试剂,提取代谢物,还包括分离试剂,例如正己烷作为分离试剂,以便将提取的生物标志物分离,进行有效检测。
再一方面,一些实施例公开了用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂的应用,用于制备差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂盒,检测试剂盒包含用于提取差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物的检测试剂;生物标志物为天冬酰胺、组氨酸、甲硫氨酸、脯氨酸、苏氨酸、焦谷氨酸、C10-肉碱、C18:1-肉碱、C5DC-肉碱/C6OH-肉碱和C8-肉碱中的任一种,或多种的组合。
又一方面,一些实施例公开了用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂盒,包括用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂。
进一步,一些实施例公开的用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂盒,该检测试剂盒的检测样本为脑脊液。
一些实施例公开的用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂盒,检测试剂盒对脑脊液样本的检测包括:
将设定量的脑脊液样本与检测试剂混合;
混合后进行连续涡旋,使蛋白质沉淀;
将涡旋样品进行离心分离,收集下清液,用于检测。
一些实施例公开的用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂盒,检测试剂盒对脑脊液样本的检测还包括:
将收集的下清液作为样本,进行质谱分析;具体包括:
采用高效液相色谱系统采用Vanquish UHPLC系统,三重四级杆质谱仪采用Altis质谱仪;
流动相为:含有甲酸、甲酸铵的甲醇-水溶液;
质谱仪条件为:
电离方式:电喷雾电离,ESI+;
离子喷雾电压:3.5kV;
鞘气:20Arb;
辅助气:5Arb;
吹扫气:0Arb;
离子传输毛细管温度:300℃;
喷雾器温度:200℃;
检测方式:选择反应监测SRM;
循环时间:0.8sec;
Q1分辨率FWHM:0.7;
Q3分辨率FWHM:0.7;
碰撞气:1.5mTorr;
源内裂解电压:0v。
一些实施例公开的用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂盒,检测试剂盒对脑脊液样本的检测还包括:
利用检测得到的生物标志物数据,构建原发性中枢神经系统淋巴瘤差异诊断检测模型。
一些实施例公开的用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂盒,还包括质控品、内标液中的一种,或两种的组合。
本发明实施例公开了用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物及检测试剂盒;生物标志物为从生物基质中筛选得到的标志代谢物,作为原发性中枢神经系统淋巴瘤标志物,具有高通量、取材简单、特异性高的优点,有效提高了差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的准确性;提供的检测试剂能够对生物标志物进行有效提取,提高了生物标志物的检出率;提供的检测试剂盒包含具有高灵敏度和特异性的新型低创伤生物标志物,能实现对原发性中枢神经系统淋巴瘤的特异性筛查。
附图说明
图1实施例1生物标志物天冬酰胺的信号强度值;
图2 实施例1生物标志物组氨酸的信号强度值;
图3 实施例1生物标志物苏氨酸的信号强度值;
图4 实施例1生物标志物脯氨酸的信号强度值;
图5 实施例1生物标志物焦谷氨酸的信号强度值;
图6 实施例1生物标志物甲硫氨酸的信号强度值;
图7 实施例1生物标志物C18:1肉碱的信号强度值;
图8 实施例1生物标志物C10-肉碱的信号强度值;
图9 实施例1生物标志物C8肉碱的信号强度值;
图10 实施例1生物标志物C5DC-肉碱/C6OH-肉碱的信号强度值;
图11实施例1脑转移癌组与原发性中枢神经系统淋巴瘤组ROC曲线图。
具体实施方式
在这里专用的词“实施例”,作为“示例性”所说明的任何实施例不必解释为优于或好于其它实施例。本发明实施例中性能指标测试,除非特别说明,采用本领域常规试验方法。应理解,本发明实施例中所述的术语仅仅是为描述特别的实施方式,并非用于限制本发明实施例公开的内容。
除非另有说明,否则本文使用的技术和科学术语具有本发明实施例所属技术领域的普通技术人员通常理解的相同含义;作为本发明实施例中其它未特别注明的试验方法和技术手段均指本领域内普通技术人员通常采用的实验方法和技术手段。
本文所用的术语“基本”和“大约”用于描述小的波动。例如,它们可以是指小于或等于±5%,如小于或等于±2%,如小于或等于±1%,如小于或等于±0.5%,如小于或等于±0.2%,如小于或等于±0.1%,如小于或等于±0.05%。在本文中以范围格式表示或呈现的数值数据,仅为方便和简要起见使用,因此应灵活解释为不仅包括作为该范围的界限明确列举的数值,还包括该范围内包含的所有独立的数值或子范围。例如,“1~5%”的数值范围应被解释为不仅包括1%至5%的明确列举的值,还包括在所示范围内的独立值和子范围。因此,在这一数值范围中包括独立值,如2%、3.5%和4%,和子范围,如1%~3%、2%~4%和3%~5%等。这一原理同样适用于仅列举一个数值的范围。此外,无论该范围的宽度或所述特征如何,这样的解释都适用。
在本文中,包括权利要求书中,连接词,如“包含”、“包括”、“带有”、“具有”、“含有”、“涉及”、“容纳”等被理解为是开放性的,即是指“包括但不限于”。只有连接词“由……构成”和“由……组成”是封闭连接词。
为了更好的说明本发明内容,在下文的具体实施例中给出了众多的具体细节。本领域技术人员应当理解,没有某些具体细节,本发明同样可以实施。在实施例中,对于本领域技术人员熟知的一些方法、手段、仪器、设备等未作详细描述,以便凸显本发明的主旨。
在不冲突的前提下,本发明实施例公开的技术特征可以任意组合,得到的技术方案属于本发明实施例公开的内容。
在一些实施方式中,用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物为下述物质的一种,或多种的组合:
天冬酰胺、组氨酸、甲硫氨酸、脯氨酸、苏氨酸、焦谷氨酸、C10-肉碱、C18:1-肉碱、C5DC-肉碱/C6OH-肉碱和C8-肉碱。通常,生物标志物能够稳定存在于生物基质中。
通常多种物质的组合,是指两种以上物质的组合,如两种、三种、四种、五种等,以及十种物质同时作为生物标志物。通常情况下,生物标志物包含的种类越多,检测准确性越高。例如,两种物质组合的生物标志物,其检测结果比一种物质的生物标志物检测准确性高,三种物质组合的生物标志物,其检测结果准确性高于两种物质组合的生物标志物。
一些实施例中,用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂,能够用于提取差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物。
一些实施例中,用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂包括:
萃取液,用于提取生物标志物;
分离液,用于分离提取的生物标志物。
一些实施例中,用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂中,萃取液为包含1‰盐酸、1%β-巯基乙醇的甲醇溶液,分离液为正己烷。
一些实施例中,用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂,用于制备差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂盒,检测试剂盒包含有检测试剂,其中的检测试剂用于提取差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物,生物标志物为天冬酰胺、组氨酸、甲硫氨酸、脯氨酸、苏氨酸、焦谷氨酸、C10-肉碱、C18:1-肉碱、C5DC-肉碱/C6OH-肉碱和C8-肉碱中的任一种,或多种的组合。
一些实施例中,用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂盒,包括用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂。
一些实施例中,用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂盒的检测样本为脑脊液。
一些实施例中,用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂盒,对脑脊液样本的检测包括:
将设定量的脑脊液样本与检测试剂混合;
混合后进行连续涡旋,使蛋白质沉淀;
将涡旋样品进行离心分离,收集下清液,用于检测。
一些实施例公开的用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂盒,检测试剂盒对脑脊液样本的检测还包括:
将收集的下清液作为样本,进行质谱分析;具体包括:
采用高效液相色谱系统采用Vanquish UHPLC系统,三重四级杆质谱仪采用Altis质谱仪;
流动相为:含有甲酸、甲酸铵的甲醇-水溶液;
质谱仪条件为:
电离方式:电喷雾电离,ESI+;
离子喷雾电压:3.5kV;
鞘气:20Arb;
辅助气:5Arb;
吹扫气:0Arb;
离子传输毛细管温度:300℃;
喷雾器温度:200℃;
检测方式:选择反应监测SRM;
循环时间:0.8sec;
Q1分辨率FWHM:0.7;
Q3分辨率FWHM:0.7;
碰撞气:1.5mTorr;
源内裂解电压:0v。
一些实施例公开的用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂盒,检测试剂盒对脑脊液样本的检测进一步包括:利用检测得到的生物标志物数据,构建原发性中枢神经系统淋巴瘤差异诊断检测模型。
通常构建原发性神经系统淋巴瘤肿瘤差异诊断模型后,利用检测试剂盒处理待测样本,然后检测待测样本中的生物标志物信息,进一步将得到的生物标志物及其含量数据信息带入原发性中枢神经系统淋巴癌差异诊断模型进行打分,确定与临界值的关系;若试验样本的结果或称分值小于临界值,表明结果为阴性,即为非原发性中枢神经系统淋巴瘤或其他脑转移癌;若试验样本的结果或称分值等于或大于临界值,表明结果为阳性,即为原发性中枢神经系统淋巴瘤。
通常情况下,生物标志物包含的种类越多,原发性中枢神经系统淋巴癌诊断模型进行打分后,确定的临界值更为准确,检测准确性越高。例如,两种物质组合的生物标志物,其检测结果比一种物质的生物标志物检测准确性高,三种物质组合的生物标志物,其检测结果准确性高于两种物质组合的生物标志物。
一些实施例公开的用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂盒,还包括质控品、内标液中的一种,或两种。通常地,质控品为已知待测物浓度的样品,用于试剂盒检测过程中的质量控制,内标液采用标准品,用于进行定量分析。
以下结合实施例对技术细节做进一步示例性说明。
实施例1
生物标志物的筛选
方法设计:根据临床差异诊断确认结果,收集脑转移癌组与原发性中枢神经系统淋巴瘤患者组的脑脊液样品。经预处理后,通过质谱靶向分析脑脊液中的代谢提取物,并使用单变量分析比较脑转移癌组和原发性中枢神经系统淋巴瘤患者组脑脊液样本,旨在筛选出具有特异性的代谢物,作为生物标记物。
质谱分析:将5~15 µL脑脊液,添加5~15 µL内标液和50~200 µL萃取液及100~300 µL分离液进行提取,其中萃取液为含1‰盐酸和1% β-巯基乙醇的甲醇溶液,分离液为正己烷;将提取的样品连续涡旋20~120秒,使蛋白质沉淀;将涡旋样品以12,000g转速离心3~10分钟,进行分离;进行MS分析之前,收集75~85μL下清液,作为脑脊液提取物样品,在零下20°C下保存或直接检测。
实施例1中的内标液包括下表1所列的标准品;
表1 标准品列表
质谱分析使用高效液相色谱-质谱法(UHPLC–MS),使用Security GuardUltracartridge–UPLC C18 2.1 mm ID色谱柱注射(phenomenex,Torrance, CA, US)。在正离子模式以及30°C下运行。
使用高效液相色谱系统和三重四级杆质谱仪,高效液相色谱系统采用VanquishUHPLC系统,三重四级杆质谱仪采用Altis质谱仪(Thermo Scientific,San Jose,CA)。
流动相为:含有甲酸、甲酸铵的甲醇-水溶液。
Altis质谱仪参数设置如下:
电离方式:电喷雾电离,ESI(+);
离子喷雾电压:3.5kV;
鞘气(Arb):20;
辅助气(Arb):5;
吹扫气(Arb):0;
离子传输毛细管温度(℃):300;
喷雾器温度(℃):200;
检测方式:选择反应监测(SRM);
循环时间(sec):0.8;
Q1分辨率(FWHM):0.7;
Q3分辨率(FWHM):0.7;
碰撞气(mTorr):1.5;
源内裂解电压(v):0。
将2 µL脑脊液提取物注入UHPLC系统进行检测实验。通过检测获得扫描后的碎片离子丰度,根据相对定量计算方法,使用目标代谢物的定量检测结果作为预测指标,基于所选代谢物的重要权重,进行模型分析,将原发性中枢神经系统淋巴瘤患者与脑转移癌区分开。
验受试者队列共邀请66名,其中脑转移癌患者33名,原发性中枢神经系统淋巴瘤患者33名,每个受试者均采集了脑脊液样本。将上述样本随机分成发现队列和验证队列,其临床特征和人口学特见表2和表3。
表2 发现队列临床特征和人口学特征
表3验证队列临床特征和人口学特征
在45种代谢物的靶向定量质谱分析中,筛选出十种代谢物:天冬酰胺、组氨酸、甲硫氨酸、脯氨酸、苏氨酸、焦谷氨酸、C10-肉碱,C18:1-肉碱、C5DC-肉碱/C6OH-肉碱和C8-肉碱用于原发性中枢神经系统淋巴瘤差异诊断。其中,C5DC-肉碱为C6OH-肉碱的同分异构体。图1-图10为原发性中枢神经系统淋巴瘤差异诊断中各生物标志物分别在发现组、验证组的信号强度值。图1-图10中的标志物分别为天冬酰胺、组氨酸、苏氨酸、脯氨酸、焦谷氨酸、甲硫氨酸、C18:1-肉碱、C10-肉碱、C8-肉碱和C5DC-肉碱/C6OH-肉碱的信号强度值;
表4 列出了原发性中枢神经系统淋巴瘤受试者与脑转移癌患者的十种代谢标志物的单变量分析结果。
表4 原发性中枢神经系统淋巴瘤与脑转移癌患者单变量分析表
检测模型的构建
用包含至少一种代谢标志物的生物标志物,进行原发性中枢神经系统淋巴瘤差异诊断检测模型的构建。
本实施例1使用LR算法构建包含本发明所述的十种代谢标志物的原发性中枢神经系统淋巴瘤差异诊断算法,即原发性中枢神经系统淋巴瘤差异诊断模型,然后对该模型性能进行评估,通过特异性、敏感性及AUC值,确定原发性中枢神经系统淋巴瘤差异诊断临界值;AUC(AreaUnder Curve)值,用于评价检测方法或预测方法的优劣性,AUC最优值对应的点即为临界值。
LR算法是Logistic regression(逻辑回归)的简称,属于一种广义线性模型。逻辑回归通过最大似然估计来估计模型的参数,即寻找使得观测样本属于实际类别的概率尽可能大的参数。逻辑回归的优点包括:1)简单而高效:计算成本低,易于实现。2)可解释性强:模型的输出可以被解释为概率。3)容易处理离散特征:适用于连续和离散型特征。4)可以用于概率预测:可以输出概率值,对于不同阈值可以得到不同的分类结果。
具体地,LR算法将样本i中各个输入特征,例如代谢标志物的浓度数据,组合成为向量Xi,计算样本为实验组的概率yi(P(yi= 1|Xi)),LR算法的计算公式为:
其中,exp为以自然对数为底的指数函数;ω为各个输入特征的计算权重,ω0为待定常数。
将实施例1得到的十种代谢标志物代入LR算法中,得出原发性中枢神经系统淋巴瘤差异诊断模型。在该模型中的ω以及ω0如下表5所示:
表5 代谢标志物及模型参数值列表
进一步地,将模型预测概率值从0到1依次设定设置点作为阈值,并计算该设置点下模型分类的特异性和敏感性,以得到AUC值最优的点,将其作为临界值。
若试验样本的结果或称分值小于临界值,表明结果为阴性,即为非原发性中枢神经系统淋巴瘤或其他脑转移癌;
若试验样本的结果或称分值等于或大于临界值,表明结果为阳性,即为原发性中枢神经系统淋巴瘤。
使用验证队列测试原发性中枢神经系统淋巴瘤差异诊断模型的性能水平如表6所示。
表6原发性中枢神经系统淋巴瘤差异诊断模型的性能水平
如图11为脑转移癌患组与原发性中枢神经系统淋巴瘤组ROC曲线图。对于原发性中枢神经系统淋巴瘤差异诊断模型ROC(Receiver Operating Characteristic)的AUC(Area Under Curve)为0.86,表明实施例1的检测方法效果良好。并将区分值对应的阈值设为检测方法的临界值,本实施例1原发性中枢神经系统淋巴瘤差异诊断模型获得的临界值为0.519,低于0.519判断为阴性,为非原发性中枢神经系统淋巴瘤或其他脑转移癌;等于或大于0.519判断为阳性,为原发性中枢神经系统淋巴瘤。
实施例2
试剂盒及试剂盒对检测样本的检测方法
试剂盒包含有萃取液、内标液、分离液,以脑脊液为检测样本;萃取液为含1‰盐酸和1% β-巯基乙醇的甲醇溶液,分离液为正己烷;
取10 µL脑脊液,其中添加10 µL内标液和90 µL萃取液及200 µL分离液进行提取。将提取的样品连续涡旋60秒,使蛋白质沉淀;
将涡旋样品以12 ,000 g,离心5分钟,进行分离;
进行MS分析之前,收集80 μL下清液,作为脑脊液提取物样品用于检测;
使用高效液相色谱-质谱法(UHPLC-MS),使用Vanquish UHPLC系统和TSQ AltisTM三重四级杆质谱仪(Thermo Scientific,San Jose,CA)。流动相为:含有甲酸、甲酸铵的甲醇-水溶液。
将2 µL脑脊液提取物样品注入UHPLC系统,样品通过30℃ Security GuardUltracartridge–UPLC C18 2.1 mm ID色谱柱,在ESI正离子模式注入;
通过质谱法得到天冬酰胺、组氨酸、甲硫氨酸、脯氨酸、苏氨酸、焦谷氨酸、C10-肉碱、C14-肉碱,C18:1-肉碱、C5DC-肉碱/C6OH-肉碱和C8-肉碱十种代谢物的含量,代入原发性中枢神经系统淋巴瘤差异诊断模型进行打分,得分值小于临界值0.343,结果为阴性,为非原发性中枢神经系统淋巴瘤或其他脑转移癌。
本发明实施例公开了用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物及检测试剂盒;生物标志物为从生物基质中筛选得到的标志代谢物,作为原发性中枢神经系统淋巴瘤标志物,具有高通量、取材简单、特异性高的优点,有效提高了差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的准确性;提供的检测试剂能够对生物标志物进行有效提取,提高了生物标志物的检出率;提供的检测试剂盒包含具有高灵敏度和特异性的新型低创伤生物标志物,能够对原发性中枢神经系统淋巴瘤的进行特异性筛查。
本发明实施例公开的技术方案和实施例中公开的技术细节,仅是示例性说明本发明的发明构思,并不构成对本发明实施例的技术方案的限定,凡是对本发明实施例公开的技术细节所做的常规改变、替换或组合等,都与本发明具有相同的发明构思,都在本发明权利要求的保护范围之内。

Claims (10)

1.用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物,其特征在于,所述生物标志物为下述物质的一种,或多种的组合:
天冬酰胺、组氨酸、甲硫氨酸、脯氨酸、苏氨酸、焦谷氨酸、C10-肉碱、C18:1-肉碱、C5DC-肉碱/C6OH-肉碱和C8-肉碱。
2.用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂,其特征在于,所述检测试剂用于提取权利要求1所述的生物标志物。
3.根据权利要求2所述的用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂,其特征在于,所述检测试剂包括:
萃取液,用于提取生物标志物;
分离液,用于分离提取的生物标志物。
4.用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂的应用,其特征在于,用于制备差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂盒,所述检测试剂盒包括用于提取差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物,所述生物标志物为天冬酰胺、组氨酸、甲硫氨酸、脯氨酸、苏氨酸、焦谷氨酸、C10-肉碱、C18:1-肉碱、C5DC-肉碱/C6OH-肉碱和C8-肉碱中的任一种,或多种的组合。
5.用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂盒,其特征在于,包括权利要求2或3所述的检测试剂。
6.根据权利要求5所述的用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂盒,其特征在于,所述检测试剂盒的检测样本为脑脊液。
7.根据权利要求6所述的用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂盒,所述检测试剂盒对脑脊液样本的检测包括:
将设定量的脑脊液样本与检测试剂混合;
混合后进行连续涡旋,使蛋白质沉淀;
将涡旋样品进行离心分离,收集下清液,用于检测。
8.根据权利要求7所述的用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂盒,所述检测试剂盒对脑脊液样本的检测还包括:
将收集的下清液作为样本,进行质谱分析;具体包括:
采用高效液相色谱系统采用Vanquish UHPLC系统,三重四级杆质谱仪采用Altis质谱仪;
流动相为:含有甲酸、甲酸铵的甲醇-水溶液;
质谱仪条件为:
电离方式:电喷雾电离,ESI +;
离子喷雾电压:3.5kV;
鞘气:20 Arb;
辅助气:5 Arb;
吹扫气:0 Arb;
离子传输毛细管温度:300℃;
喷雾器温度:200℃;
检测方式:选择反应监测;
循环时间:0.8 sec;
Q1分辨率FWHM:0.7;
Q3分辨率FWHM:0.7;
碰撞气:1.5 mTorr;
源内裂解电压:0 v。
9.根据权利要求8所述的用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂盒,其特征在于,所述检测试剂盒对脑脊液样本的检测还包括:
利用检测得到的生物标志物数据,构建原发性中枢神经系统淋巴瘤差异诊断检测模型。
10.根据权利要求5~9任一项所述的用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的检测试剂盒,其特征在于,还包括质控品、内标液中的一种,或两种的组合。
CN202311171643.8A 2023-09-12 2023-09-12 用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物及检测试剂盒 Active CN116908458B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202311171643.8A CN116908458B (zh) 2023-09-12 2023-09-12 用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物及检测试剂盒

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202311171643.8A CN116908458B (zh) 2023-09-12 2023-09-12 用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物及检测试剂盒

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN116908458A true CN116908458A (zh) 2023-10-20
CN116908458B CN116908458B (zh) 2023-12-29

Family

ID=88356961

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN202311171643.8A Active CN116908458B (zh) 2023-09-12 2023-09-12 用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物及检测试剂盒

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN116908458B (zh)

Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2007080664A1 (ja) * 2006-01-12 2007-07-19 Niigata University 中枢神経系原発悪性リンパ腫マーカーおよびその用途
KR20120121941A (ko) * 2011-04-27 2012-11-07 사회복지법인 삼성생명공익재단 중추신경계 림프종 진단용 조성물 및 이를 이용한 중추신경계 림프종 진단 키트
US20220008513A1 (en) * 2018-11-30 2022-01-13 Fondazione Centro San Raffaele Combined treatment of primary central nervous system lymphoma
KR20220061737A (ko) * 2020-11-06 2022-05-13 사회복지법인 삼성생명공익재단 중추신경계 림프종을 진단하기 위한 마커, 이를 포함하는 중추신경계 림프종 진단 키트 및 중추신경계 림프종을 진단하는 방법
CN114774360A (zh) * 2022-04-19 2022-07-22 首都医科大学附属北京天坛医院 原发性中枢神经系统淋巴瘤原代细胞的培养方法及专用培养基
CN116338210A (zh) * 2023-05-22 2023-06-27 天津云检医学检验所有限公司 用于诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物及检测试剂盒

Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2007080664A1 (ja) * 2006-01-12 2007-07-19 Niigata University 中枢神経系原発悪性リンパ腫マーカーおよびその用途
KR20120121941A (ko) * 2011-04-27 2012-11-07 사회복지법인 삼성생명공익재단 중추신경계 림프종 진단용 조성물 및 이를 이용한 중추신경계 림프종 진단 키트
US20220008513A1 (en) * 2018-11-30 2022-01-13 Fondazione Centro San Raffaele Combined treatment of primary central nervous system lymphoma
KR20220061737A (ko) * 2020-11-06 2022-05-13 사회복지법인 삼성생명공익재단 중추신경계 림프종을 진단하기 위한 마커, 이를 포함하는 중추신경계 림프종 진단 키트 및 중추신경계 림프종을 진단하는 방법
CN114774360A (zh) * 2022-04-19 2022-07-22 首都医科大学附属北京天坛医院 原发性中枢神经系统淋巴瘤原代细胞的培养方法及专用培养基
CN116338210A (zh) * 2023-05-22 2023-06-27 天津云检医学检验所有限公司 用于诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物及检测试剂盒

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
FENG‑XIANG WANG等: "Cerebrospinal fluid‑based metabolomics to characterize different types of brain tumors", JOURNAL OF NEUROLOGY, pages 984 - 993 *
孙黎明, 支文靖, 武万水, 唐泓, 张蕾, 王起风, 李苗: "急性淋巴细胞白血病患儿大剂量门冬酰胺酶治疗后脑脊液门冬酰胺浓度测定", 白血病.淋巴瘤, no. 03 *
张春燕;程昱璇;赵振宇;朱永阑;蒋涛;吴珏;田亚平;: "基于代谢组学评价血液生物标志物对中枢神经系统肿瘤的诊断价值", 标记免疫分析与临床, no. 06 *
董智慧;关明;: "原发性中枢神经系统淋巴瘤相关分子标志物的研究进展", 检验医学与临床, no. 17 *

Also Published As

Publication number Publication date
CN116908458B (zh) 2023-12-29

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Kerian et al. Differentiation of prostate cancer from normal tissue in radical prostatectomy specimens by desorption electrospray ionization and touch spray ionization mass spectrometry
Theodorescu et al. Pilot study of capillary electrophoresis coupled to mass spectrometry as a tool to define potential prostate cancer biomarkers in urine
Campa et al. Protein expression profiling identifies macrophage migration inhibitory factor and cyclophilin a as potential molecular targets in non-small cell lung cancer
CN113960235B (zh) 生物标志物在制备肺癌检测试剂中的用途和方法
Ocak et al. Mass spectrometry–based proteomic profiling of lung cancer
US10983127B2 (en) Device for diagnosing colorectal cancer and method for providing colorectal cancer diagnosis information
CN116338210B (zh) 用于诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物及检测试剂盒
CN113960312A (zh) 用于肺部良恶性结节诊断的血清代谢标志物及其应用
CN109307764B (zh) 一组代谢标志物在制备胶质瘤诊断试剂盒方面的应用
CN113552247A (zh) 一种样品未知成分的液质联用非靶向分析方法
Cho et al. Fine needle aspiration combined with matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight/mass spectrometry to characterize lipid biomarkers for diagnosing accuracy of breast cancer
US20080046224A1 (en) Apparatus and method for predicting disease
CN101196526A (zh) 一种结核快速诊断的质谱分析试剂盒和方法
Wu et al. Identification of serum biomarkers for ovarian cancer using MALDI–TOF-MS combined with magnetic beads
CN117147672A (zh) 用于糖尿病肾病风险判别的生物标志物组合及其应用
CN109959700B (zh) 特定组织状态的质谱测定
Massion et al. Proteomic strategies for the characterization and the early detection of lung cancer
CN116879558A (zh) 卵巢癌诊断标志物、检测试剂及检测试剂盒
CN116908458B (zh) 用于差异诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤的生物标志物及检测试剂盒
CN113514530A (zh) 一种基于敞开式离子源的甲状腺恶性肿瘤诊断系统
WO2007062363A2 (en) Method for diagnosing a person having sjogren's syndrome
CN114280202B (zh) 一种用于诊断镉中毒的生物标志物及其应用
Qian et al. SELDI-TOF MS combined with magnetic beads for detecting serum protein biomarkers and establishment of a boosting decision tree model for diagnosis of pancreatic cancer
US20070249000A1 (en) Method for diagnosing a person having b-cell pathologies
CN112305118B (zh) L-辛酰基肉碱作为疾病诊断的生物标志物

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant