CN116829940A - 用于构建和执行色谱工作流的方法、介质和系统 - Google Patents

Abstract

示例性实施方案提供了用于构建和执行色谱工作流的方法、介质和系统。根据本文所述的技术，该工作流的步骤可以按顺序布置并由门和/或转变分开。转变可以表示工作流中的位置，在该位置处，工作流中数据的责任或管理从一个用户传递到不同用户。步骤可以被表示为页面，其中由多个不同页面表示的步骤中的至少一些步骤表示用于可视化、步骤的配置等的不同定制选项。通过选择用于各个步骤的页面并将步骤中的至少一些步骤与转变相连接，用户可以非常快速且高效地构建工作流。所得工作流支持改进的审计，强行实施访问权限，以及改进工作流可视化等优点。

Description

用于构建和执行色谱工作流的方法、介质和系统

相关申请的交叉引用

本申请要求于2020年12月18日提交的美国临时专利申请63/127,609号的权益。该申请的全部公开内容据此以引用方式并入本文。

背景技术

色谱法是指通过使混合物以溶液、悬浮液形式或作为蒸气通过其中混合物的组分以不同速率移动的介质来分离混合物。然后可分析组分以鉴定组分的存在、量、浓度或其他特性。色谱法包括许多不同的技术，诸如质谱(MS)、液相色谱质谱(LCMS)和许多其他技术。

发明内容

示例性实施方案涉及构建和控制用于分析来自色谱实验的数据的工作流的技术。示例性实施方案可以采取计算机实现的方法、存储在非暂态计算机可读介质上的指令、计算设备等的形式。除非另有说明，否则预期所描述的实施方案可单独使用以便实现下文所述的个别优点，或者可以任何组合一起应用以实现协同结果。

根据第一实施方案，一种系统可以接收生成用于分析色谱实验结果的工作流的指令。该工作流可以包括多个有序步骤，其中一个步骤包括对来自实验的原始数据(或轻度处理的数据，诸如已经被处理以满足工作流的初始要求的数据)或由前一步骤产生的处理数据进行操作的计算。每个步骤可以基于此步骤的设置来执行与共同色谱分析任务相关联的一组计算，并且生成输出。各步骤可以基于正在执行的色谱任务来分离，并且可以仅生成足够的数据以执行该任务。执行不同任务的后续步骤可以依赖于来自先前步骤的输出。

该步骤可以提供该步骤的输出的可视化；例如，从色谱实验获取原始质谱读数并识别数据中的峰值的“积分”步骤可以输出峰值列表，该峰值列表可以叠加到质谱读数的图上。积分步骤可以生成具有识别的峰值和/或叠加的峰值数据的原始质谱数据的可视化。“积分”步骤仅是在色谱数据分析中通常执行的步骤的一个示例。步骤的其他示例包括检查采集步骤、检查输入步骤、识别组分步骤、校准步骤、系统适应性步骤以及审阅结果步骤等等。本领域普通技术人员将理解在色谱分析中通常执行的每个步骤通常需要什么，以及上面未列举的其他步骤可以基于具体情况而包括什么。

在一些实施方案中，几个色谱步骤可以一起组合成工作流中的单个“步骤”数据结构，特别是当两个色谱步骤由同一分析者或审阅者执行时。

每个步骤可以与一个或多个页面相关联，其中每个页面可以表示该步骤的变化。页面可以提供步骤的配置，这些不同页面提供执行步骤和/或可视化来自步骤的输出数据的不同方式。例如，与“积分”步骤相关联的第一页面可能在数据可视化上显示峰值表，而第二页面可能隐藏该峰值表。用户可以从可用页面中进行选择以配置执行或呈现该步骤的方式。

该系统可以呈现用户界面，该用户界面显示可被包括在(或已经被包括在)工作流中的步骤。该系统可以经由用户界面接收对要编辑的步骤的选择。响应于接收到该选择，该系统可以呈现显示所选步骤的可用页面以及该页面可用的任何配置选项的用户界面。该系统可以经由用户界面接收对该页面的选择和/或该页面的配置选项，并且可以将配置的页面与工作流中的步骤相关联。

该系统可以自动地或响应于用户选择而将转变插入到工作流中。该转变可以表示从当前步骤到下一步骤的数据保管权的改变。例如，当前步骤可以被配置为由第一用户执行，并且下一步骤可以被配置为由不同于第一用户的第二用户执行。

在每个级之间可以存在阶跃边界。一些阶跃边界可以是非门控的，因为它们不需要用户确认它们希望从一个级移动到下一级。其他阶跃边界可以是门控的，因为它们需要此类确认，或者诸如凭证或在级之间移动的原因之类的更多事物。可以仅在一些阶跃边界处或者在每个阶跃边界处存在转变。

在该实施方案中，转变标记了工作流的一部分中的一个或多个步骤与工作流的另一部分中的一个或多个步骤之间的分离。转变允许消费应用程序(例如，实现工作流的分析程序)跟踪用户当前正在查看/实现哪个(些)步骤。它还允许程序向前/向后查看后续/先前转变，使得应用程序可以高效地选择要在工作流的导航面板中显示的步骤。在一些实施方案中，实现工作流的应用程序可以基于工作流中的转变而从工作流构建器仅请求有限数目的步骤(例如，仅前一转变与下一转变之间的步骤，或有限数目的在前一转变之前/在下一转变之后的步骤)。如果应用程序请求工作流中的所有步骤(不考虑转变以及用户当前在工作流中的位置)，则应用程序必须跟踪分析在工作流中发生的位置，这可使应用程序的解析逻辑复杂化。

转变允许应用程序跟踪负责每个步骤的用户，并且当在由不同用户控制的步骤之间移动以进行审计跟踪时简化签名的收集。它还分离了属于不同用户的步骤，从而允许简化的访问控制，使得用户不能访问他们未被授权执行的步骤。

根据第二实施方案，该步骤可以由数据结构定义，并且该转变由相同的数据结构定义为特定种类的步骤。换句话说，转变可以仅仅是步骤的特殊情况。这种改进用于使数据模型变平(例如，需要更少的数据结构，因为工作流可以简单地表示为一系列步骤，而不是步骤和单独的转变)。因此，工作流构建器不需要做出关于工作流将如何在特定系统上可视化的假设；这使得工作流更通用并且允许容易地扩展到不同的应用程序。这还允许使转变(被正在构建工作流的最终用户以及负责工作流构建器程序的工程师两者)更容易理解的更清洁的实现。因此，更容易维护工作流构建器代码。

根据第三实施方案，步骤可以被组织成一个或多个序列，并且每个序列可以被配置为具有到工作流中的下一序列、到工作流的前一序列、或到工作流的末尾的转变。这表示第二实施方案的替代组织，因为转变不是工作流中的单独元素(步骤)，而是被定义为序列的一部分。如在第二实施方案中那样，转变保持可定制和可扩展。该实施方案还允许灵活地查询工作流：例如，用户可以请求完整的工作流或工作流内的特定序列。它还允许将逻辑构建到工作流本身中，这可以简化构建到可视化或执行工作流的应用程序中的逻辑；例如，序列可以被编码为“审阅”序列，这可以简化构建到应用程序中的跟踪逻辑，该跟踪逻辑确定是否允许从一个序列到另一个序列的转变。然而，与第二实施方案相比，与转变相关联的任何动作(例如，从一个序列到另一个序列的签字)可能需要保持相对简单，因为转变的设计需要适应步骤的整个序列。

根据第四实施方案，工作流构建器可以识别多个步骤的子集的预定义排序，并且可以在生成工作流时强行实施预定义排序。某些步骤可能需要以指定顺序执行，因为可能需要一个步骤的结果以便准确地执行后续步骤。色谱数据分析的一个示例是包括“积分”、“识别”、“校准”和“审阅”步骤的一系列步骤。尽管可以在这些步骤之间插入其他步骤，但是需要对质谱进行积分以便在系统可以识别与那些峰相关联的混合物组分之前确定这些峰在数据中的位置。在识别混合物组分之后，可以识别混合物组分内的校准组分。在基于校准组分校准数据之后，可以审阅实验的最终结果。以不同的顺序执行这些步骤将是不合适的，因此当用户设计工作流时，工作流构建器可以强行实施该排序。预定义步骤排序的其他示例对于本领域普通技术人员将是显而易见的。特别地，当工作流复杂时，在其他步骤和/或在有序步骤之间插入的转变的情况下，或者在需要应用于步骤的不同子集的多个不同排序的情况下，用户可能难以识别哪些步骤需要在其他步骤之前执行。因此，用户可能无意地构建具有不正确的步骤排序的工作流。通过强行实施预定义排序，可以避免这个问题。

根据第五实施方案，可以执行工作流。作为执行的一部分，可以识别执行当前步骤的第一用户。可以将第一用户记录在审计日志中。在到达转变处时，该系统可以识别负责执行第二步骤的第二用户。该系统可以将工作流的控制从第一用户移交给第二用户，并且可以将第二用户记录在审计日志中。该实施方案允许将转变用于访问控制。尤其在以合规为导向的工作流中，可能重要的是确保每个步骤由适当授权的用户执行，并且确保将符合该要求的情况记录在可用于生成审计跟踪的日志中。示例性实施方案的转变提供了有效点，在该有效点处，强行实施这些限制并记录信息以用于审计目的。

根据基于第五实施方案的第六实施方案，第一用户和第二用户可以各自与用户简档相关联。在这种情况下，可以通过在与第二用户相关联的简档中识别第二用户具有针对第二步骤的访问权限来执行识别第二用户。该实施方案使得执行从第一用户到第二用户的转变更高效，因为执行工作流的应用程序可以查阅用户简档以确定是否允许尝试访问后转变步骤的用户这样做。此外，可以通过向简档中的用户分配某些步骤来实现负责不同步骤。

根据第七实施方案，该多个步骤的第一子集可以与处理模板相关联，并且该多个步骤的第二子集可以与审阅模板相关联。色谱实验通常包括处理步骤(其中数据被生成并可视化)以及一组审阅步骤(其允许通过审阅来评估所生成/可视化的数据)。由于处理和审阅步骤通常由不同用户执行，因此将这些不同类型的步骤分成不同模板是更高效的。审阅模板可以提供允许分析者更好地执行分析处理步骤的可定制的可视化页面，并且审阅模板可以提供审阅者要采取的动作。当工作流从数据分析团队转到审阅团队时，模板之间的划分还为转变提供了方便的位置。

根据第八实施方案，该页面中的至少一个页面可以与可视化元素相关联，该可视化元素被配置为在用户界面上显示与对应于该页面的步骤相关联的数据。该系统可以接收可视化元素的配置，该配置控制可视化元素如何显示数据。可视化元素的配置的示例包括在何处放置图形/图表、使用哪些颜色、是否显示校准数据、如果数据超过特定阈值则何时应用标记等。通过提供表示由给定页面定义的数据的高效方式(经由可配置的可视化元素)，与每个可视化元素必须针对每个页面进行编码的情况相比，可以更高效地构建工作流。每个页面可提供可视化元素的不同布置和配置。这提供了一种快速且高效的方式来以允许向数据分析者提供其偏好的信息以便以高效方式执行其分析的方式建立工作流。

根据基于第八实施方案的第九实施方案，接收配置可以涉及识别与该页面相关联的多个预定义显示格式，以及接收对预定义显示格式中的一个预定义显示格式的选择。预定义的显示格式使得以分析者要求或偏好的精确方式定义可视化更加高效。

根据第十实施方案，可以执行工作流。执行工作流可以包括在多个步骤中的第一步骤处接收在色谱实验期间采集的原始数据流，该原始数据流被存储在原始数据存储库中。可以在第一步骤处基于处理原始数据来生成元数据。元数据可以被存储在与原始数据流不同的元数据目录中，元数据目录被存储在与原始数据存储库不同的文档存储库中。将原始数据流与元数据目录分离允许将原始数据目录锁定(例如，设置为“只读”)以用于审计目的。类似地，在每个步骤处生成的数据可以被单独审计。如果重新运行步骤并且生成后续数据，则有可能确定在步骤的第一运行和后续运行之间改变了什么。以这种方式，审阅者可以确定改变的目的是否是使数据的某些部分符合用户的预想概念，而不是实现最佳实验实践。

此外，保持原始数据流和元数据目录分开允许它们被存储在分开的位置中，该分开的位置被优化用于读取和查询这两种不同类型的数据。例如，因为原始数据被存储在流中，所以它可以由被优化以高效地读取静态可流对象的系统最佳地读取，诸如得自亚马逊网络服务(AWS)的简单存储服务(S3)。另一方面，元数据目录通常不是数据流，因此可以更好地存储在数据库系统中以及从数据库系统读取。

根据第十一实施方案，可以执行工作流。执行工作流可以涉及接收工作流中从多个步骤中的一个步骤移动到多个步骤中的另一个步骤的指令并且将该移动记录在审计日志中。通常，工作流被配置为以连续的顺序执行，并且有意地向用户提供执行当前步骤所需的有限量的数据。因此，一些类型的移动(诸如当用户向前移动到某一步骤、从该步骤获得信息、然后向后移动以执行前一步骤时)可能是有问题的并且应当被包括在审计日志中。

在第十二和第十三实施方案中捕获了一个此类示例。在这两个实施方案中，在工作流中，多个步骤中的另一个步骤在多个步骤中的一个步骤之前。在第十二实施方案中，该系统可以提示发起移动的用户输入返回到多个步骤中的另一个步骤的原因，并且将该原因记录在审计日志中。在第十三实施方案中，用户在多个步骤中的另一个步骤处对设置做出改变。该系统可以提示发起移动的用户输入改变设置的原因并且将该原因记录在审计日志中。这两个实施方案捕获审计日志中的动作，这些动作对于用户与工作流交互而言可能是特别有问题的方式。通过捕获在步骤之间移动的原因和/或用户改变的设置，审阅者可以更好地判断用户与工作流的交互的适合性。

在捕获审计日志中的信息的任何实施方案中，审计日志可以在审阅用户的请求下显示在用户界面上。审计日志可以是可交互的；例如，用户可以选择在审计日志中捕获的动作，以被带到其中发生该动作的工作流的步骤。可以在用户界面中向审阅者呈现在该步骤处可用的可视化以及可用的任何配置选项(原始配置选项和用户在该步骤的执行期间改变的任何选项两者)。

下面将参考附图详细描述这些实施方案。

附图说明

为了容易识别对任何特定元件或动作的论述，参考标号中的一个或多个最有效数字是指首先引入该元件的附图标号。

图1示出了根据示例性实施方案的质谱系统的示例。

图2示出了根据一个实施方案的工作流的示例。

图3描绘了根据示例性实施方案的用于工作流构建器的示例性界面，包括工作流步骤、转变以及与每个步骤相关联的可视化。

图4示出了根据一个实施方案的示例性工作流模板。

图5A描绘了根据一个实施方案的工作流的组织结构的示例。

图5B描绘了根据一个实施方案的工作流的组织结构的另一示例。

图5C描绘了根据一个实施方案的工作流的组织结构的另一示例。

图6描绘了根据一个实施方案的示例性工作流管理环境。

图7A是描绘用于创建工作流的示例性逻辑的流程图，该示例性逻辑适于与示例性实施方案一起使用。

图7B是描绘根据一个实施方案的用于执行工作流的示例性逻辑的流程图。

图8描绘了可用于实践本文所述的示例性实施方案的例示性计算机系统架构。

具体实施方式

分析色谱结果的过程可以分几个步骤进行。根据本文所述的技术，可以将给定色谱分析的所有步骤组织成由门和/或转变分开的工作流。转变可以表示工作流中的位置，在该位置处，工作流中数据的责任或管理从一个用户传递到不同用户。步骤可以被表示为页面，其中由多个不同页面表示的步骤中的至少一些步骤表示用于可视化、步骤的配置等的不同定制选项。

通过选择用于各个步骤的页面并将该步骤中的至少一些步骤与转变相连接，用户可以非常快速且高效地构建工作流。所得工作流通过在各个级处记录信息来支持审计。此外，工作流在转变处强行实施访问权限，从而确保仅授权的用户执行必要步骤。它还改进了负责执行工作流的应用程序将工作流可视化的能力-因为应用程序知道给定用户负责两个转变之间的步骤，所以当负责这些步骤的用户与转变交互时，应用程序只需要请求工作流步骤以及两个转变之间的数据。不需要检索后续工作流步骤，直到下一用户接收到工作流的移交。在一些情况下，可以检索转变之外的有限数目的步骤，使得可以在导航元素中呈现这些步骤。以这种方式，可以通知当前用户接下来是什么处理步骤，以及谁可能负责执行这些处理步骤。

下面将参考附图更详细地描述这些和其他特征。

为了例示的目的，图1是可以结合本文的技术使用的系统的示意图。尽管图1描绘了特定LCMS配置中的特定类型的装置，但本领域的普通技术人员将理解，不同类型的色谱装置(例如，MS、串联MS等)也可以结合本公开使用。

样本102通过进样器106进样到液相色谱104中。泵108可以将样本泵送通过色谱柱110，以根据通过色谱柱的保留时间将混合物分离成组分部分。

来自色谱柱的输出被输入到质谱仪112中用于分析。最初，样本由去溶剂化/离子化装置114去溶剂化并且离子化。去溶剂化可以是任何去溶剂化技术，包括例如加热器、气体、与气体组合的加热器或其他去溶剂化技术。离子化可以采用任何离子化技术来实现，包括例如电喷雾离子化(ESI)、大气压化学离子化(APCI)、基质辅助激光解吸(MALDI)或其他离子化技术。由离子化产生的离子通过施加到离子导向器116的电压梯度被送入碰撞室118。碰撞室118可用于传递离子(低能量)或将离子碎片化(高能量)。

可以使用不同的技术(包括在授予Bateman等人的美国专利6,717，130号中描述的技术，该专利以引用方式并入本文)，其中可以在碰撞室118上施加交变电压来引起碎片化。收集低能量下的前体(无碰撞)以及高能量下的碎片(碰撞的产物)的光谱。

碰撞室118的输出被输入到质量分析仪120。质量分析仪120可以是任何质量分析仪，包括四极杆、飞行时间(TOF)、离子阱、扇形磁场质量分析仪以及它们的组合。检测器122检测从质量分析仪122发出的离子。检测器122可以与质量分析仪120成一体。例如，在TOF质量分析仪的情况下，检测器122可以是对离子强度进行计数(即，对射入的离子进行计数)的微通道板检测器。

原始数据存储库124可为存储用于分析的离子计数提供永久性存储。例如，原始数据存储库124可以是内部或外部计算机数据存储装置，诸如磁盘、基于闪存的存储装置等。分析计算机126分析存储的数据。还可以实时分析数据，而不需要存储在存储介质124中。在实时分析中，检测器122将要分析的数据直接传递到计算机126，而不是首先将其存储到永久性存储装置中。

碰撞室118执行前体离子的碎片化。可以使用碎片化来确定肽的一级序列，随后识别起源蛋白质。碰撞室118包含气体，诸如氦气、氩气、氮气、空气或甲烷。当带电前体与气体原子相互作用时，所产生的碰撞可以通过将前体分解成所得的碎片离子而使前体碎片化。这种碎片化可以使用Bateman中描述的技术，通过将碰撞室中的电压在低电压状态(例如，低能量，<5V)和高电压状态(例如，高能量或升高能量，＞15V)之间切换来实现，其中低电压状态用于获得肽前体的MS光谱，高电压状态用于获得前体的碰撞诱导碎片的MS光谱。高电压和低电压可以被称为高能量和低能量，因为分别使用高电压或低电压来将动能赋予离子。

可以使用各种规程来确定何时以及如何切换用于这种MS/MS采集的电压。例如，常规方法以目标或数据相关模式(数据相关分析，即DDA)触发电压。这些方法还包括目标前体的耦联的气相隔离(或预选)。低能量光谱由软件实时获取并检查。当所需的质量达到低能量光谱中的规定强度值时，碰撞室中的电压切换到高能量状态。然后获得针对预选的前体离子的高能量光谱。这些光谱包含在低能量下看到的前体肽的碎片。在收集到足够的高能量光谱之后，数据采集回到低能量状态，继续寻找具有合适强度的前体质量来用于高能量碰撞分析。

不同的合适方法可以与如本文所述的系统一起使用来获得离子信息，诸如结合对用于分析样本的质谱法的前体和产物离子的信息。尽管可以采用常规的切换技术，但实施方案可以使用Bateman中描述的技术，其可以被表征为以简单的交替循环来切换电压的碎片化规程。这种切换在足够高的频率下完成，以便在单一色谱峰内包含多个高能量光谱和多个低能量光谱。与常规的切换规程不同，该循环与数据的内容无关。在Bateman中描述的这种切换技术提供对前体离子和产物离子两者的有效的同时质量分析。在Bateman中，使用高能量和低能量切换规程可作为肽混合物单次进样的LC/MS分析的一部分来应用。在从单次进样或实验运行中采集的数据中，低能量光谱包含主要来自未碎片化前体的离子，而高能量光谱包含主要来自碎片化前体的离子。例如，可将前体离子的一部分碎片化以形成产物离子，并且基本上同时分析前体离子和产物离子，或者同时地，或者例如采用快速演替，通过向MS模块的碰撞室应用快速切换或交变电压，在低电压(例如，主要生成前体)和高电压或升高电压(例如，主要生成碎片)之间切换来调整碎片化。根据上述Bateman的技术，采用在高(或升高)能量和低能量之间交替的快速演替的MS操作在本文中也可以被称为Bateman技术和高-低规程。

由高-低规程采集的数据允许准确确定在低能量模式和高能量模式两者下收集的所有离子的保留时间、质荷比和强度。一般来讲，在两种不同的模式中看到不同的离子，并且在每种模式下采集的光谱可以单独或组合地被进一步分析。如在一种或两种模式中看到的来自公共前体的离子将共享相同的保留时间(并因此具有基本上相同的扫描时间)和峰形。高-低规程允许在单个模式内和在模式之间对离子的不同特征进行有意义的比较。该比较然后可以用来将在低能量光谱和高能量光谱中看到的离子分组。

总之，诸如当使用Bateman技术来操作系统时，样本102被进样到LC/MS系统中。LC/MS系统产生两组光谱，即一组低能量光谱和一组高能量光谱。该组低能量光谱主要包含与前体相关的离子。该组高能量光谱主要包含与碎片相关的离子。这些光谱被存储在原始数据存储库124中。在数据采集之后，这些光谱可以从原始数据存储库124中提取出来，并且通过分析计算机126中的后采集算法来显示和处理。

分析计算机126可根据工作流进行操作，在每个工作流步骤向分析者提供数据的可视化，并且允许分析者通过执行特定于工作流步骤的处理来生成输出数据。可以经由客户端浏览器132生成和检索工作流(在图6中描绘了用于构建和存储工作流的合适环境)。当分析计算机126执行工作流的步骤时，它可从位于原始数据存储库124中的数据流读取原始数据。当分析计算机126执行工作流的步骤时，它可生成存储在文档存储库128中的元数据目录130中的处理数据。它还可生成可被存储在审计日志134中的审计记录。

本文所述的示例性实施方案可在客户端浏览器132和分析计算机126等位置处执行。图8中描绘了适合用作分析计算机126和/或客户端浏览器132的装置的示例。

图2描绘了可由图1的分析计算机126应用的工作流202的简化示例。工作流202被设计成获取一组输入204，将多个工作流步骤或级应用于输入以在每个级生成输出，并且在后续级继续处理输出以便生成实验结果。注意，工作流202是工作流的特定示例，并且包括以特定顺序执行的特定级。然而，本发明不限于图2中描绘的特定工作流。其他合适的工作流可具有以不同顺序执行的更多、更少或不同的级。

输入的初始集204可包括样本集206，其包括从色谱实验设备接收的原始(未处理)数据。这可包括测量结果或读数，诸如质荷比。最初存在于样本集206中的测量结果可以是尚未被处理(例如以执行峰值检测或其他分析技术)的测量结果。样本集206可包括流形式的数据(例如，从实验设备以稳定、连续的流接收的数据值的顺序列表)。

输入的初始集204还可包括处理方法208，其可以是应用于(并且因此嵌入)工作流202的模板方法(如上所讨论)。处理方法208可包括要在工作流202的各个级应用的设置。

输入的初始集204还可包括结果集210。当被创建时，结果集210可包括来自样本集206的信息。在一些情况下，样本集206在被复制到结果集210中时可以某种初始方式被处理-例如，MS数据在被提供给工作流202之前可能需要提取、平滑等。应用于初始结果集210的处理可基于正在使用的工作流202在逐个情况的基础上确定。一旦原始数据从样本集206被复制以创建结果集210，则该结果集210对于其生命周期的剩余部分可完全独立于样本集206。

工作流202可被分成一组级。每个级可与执行与该级相关的计算的一个或多个级处理器相关联。每个级处理器可与影响处理器如何从给定输入生成输出的级设置相关联。

级可通过阶跃边界238彼此分开。阶跃边界238可表示输出已由级生成并存储在结果集中的点，在该点处，处理可前进至下一级。一些级边界可能需要某些类型的输入以便被跨越(例如，在给定级处生成的数据可能需要由一个或多个审阅者审阅，这些审阅者需要提供其授权以便跨越阶跃边界238到下一级)。阶跃边界238可在用户从一个级移动到不同级的任何时候在任何方向上应用。例如，当用户从初始化级212移动到通道处理级214时，存在阶跃边界238，但当用户试图从定量级222向后移动回到积分级216时，也存在阶跃边界。阶跃边界238可以是非门控的，这意味着一旦用户确定移动到下一级，就不需要进一步的输入(或者仅粗略的输入)，或者是门控的，这意味着用户必须提供某种类型的确认来指示他们希望前进至所选择的级(可能响应于由分析计算机126发出的警告)，或者移动到某一级的原因，或者授权工作流202前进至所选择的级的凭证。

在初始化级212中，级处理器中的每一者可通过清除其生成的结果来作出响应。例如，通道处理级214的级处理器可以清除所有其导出的通道和峰值表(见下文)。在任何时间点，清除级设置可清除来自当前级和任何后续级的级跟踪。在该示例中，初始化级212不生成任何输出。

在跨越阶跃边界238之后，处理可前进至通道处理级214。如上所述，色谱检测器可与可在其上收集数据的一个或多个通道相关联。在通道处理级214处，分析计算机126可导出存在于结果集210中的数据中的一组处理通道，并且可输出经处理的通道列表226。经处理的通道列表226可被存储在与通道处理级214相关联的版本化子文档中，该版本化子文档可被包括在结果集210中。

在跨越阶跃边界238之后，处理可前进至积分级216，其基于经处理的通道列表226识别结果集210中的数据中的峰值。积分级216可使用在积分级216的设置中指定的技术来识别峰值，该设置可在处理方法208中定义。积分级216可输出峰值表228并将峰值表228存储在与积分级216相关联的版本化子文档中。该子文档可被包括在结果集210中。

在跨越阶跃边界238之后，处理可前进至识别级218。在该级，分析计算机126可基于峰值表228中的信息来识别由色谱设备分析的混合物中的组分。识别级218可输出组分表230，其包括混合物中存在的组分的列表。组分表230可被存储在与识别级218相关联的版本化子文档中。该子文档可被包括在结果集210中。

在跨越阶跃边界238之后，处理可前进至校准级220。在色谱实验期间，可将校准化合物进样到色谱设备中。该过程允许分析者在整个实验中考虑电子器件、表面清洁度、实验室中的环境条件等的细微变化。在校准级220中，对关于这些校准化合物获得的数据进行分析并用于生成校准表232，其允许分析计算机126对数据进行校正以确保其是可靠且可再现的。校准表232可被存储在与校准级220相关联的版本化子文档中。该子文档可被包括在结果集210中。

在跨越阶跃边界238之后，处理可前进至定量级222。定量是指确定样本中分析物的量的数值的过程。分析计算机126可使用来自先前级的结果以便对包括在组分表230中的组分进行定量。定量级222可用定量结果更新234存储在结果集210中的组分表230。更新的组分表230可被存储在与定量级222相关联的版本化子文档中。该子文档可被包括在结果集210中。

在跨越阶跃边界238之后，处理可前进至汇总级224。在汇总级224中，可分析每个先前级的结果并将其并入汇总结果报告236中。汇总结果236可被存储在与汇总级224相关联的版本化子文档中。该子文档可被包括在结果集210中。

如本文所用，步骤可对应于上述级。另选地，单个级可包括多个步骤，或者多个级可被组织成单个步骤。在任何情况下，在给定步骤中执行的所有活动应当可由同一用户或用户组执行，并且每个步骤与描述该步骤的一组配置选项(例如，可视化选项、审阅选项、步骤配置设置等)的一个或多个页面相关联。

在一些或所有阶跃边界238处可存在转变，但并非每个阶跃边界238都需要转变。转变可表示对数据集的责任从第一用户或用户组到第二不同用户或用户组的改变。

图3描绘了可以在工作流构建器的用户界面中显示工作流的方式的示例(例如，如可以在先前描述的客户端浏览器132上显示)。

在用户界面中，一组步骤302a-302g按顺序布置。可以向用户提供一组步骤，这些步骤可以被布置在界面上或者可以从多个预先生成的模板中选择。可以允许用户按顺序移动步骤，尽管工作流构建器可以强行实施某些步骤的相对排序(例如，要求在校准步骤302e之前执行积分峰值步骤302c)。

该步骤中的一些步骤或全部步骤可以由转变304a-304c分开。转变可以与方向相关联(例如，允许按顺序沿向前方向、相反方向、或向前方向和相反方向移动)。实现工作流的应用程序可以通过仅允许如转变所指示的工作流中的移动来强行实施转变。在每个转变处，应用程序可以强行实施数据管理的改变；对数据的责任可以从与转变之前的步骤相关联的用户组改变到与转变之后的步骤相关联的用户组。该应用程序可以要求放弃和/或获取数据访问权限的用户组提供签名。

步骤302a-302g中的每个步骤可以与定义用于步骤的不同配置(例如，可视化元素的配置和布置、用于步骤和/或可视化元素的设置等)的一个或多个页面相关联。工作流构建器可以经由用户界面接收对步骤302a-302g中的一个步骤的选择，并且作为响应，可以显示可与所选步骤一起使用的页面的图像。这些图像可以示出用于该步骤的可视化元素的不同配置和布置。在接收到对与页面中的一个页面相关联的图像的选择时，该系统可以将该页面与所选步骤相关联。该页面可以定义关于如何布置和配置可视化元素/步骤的指令。实现工作流的应用程序可以检索页面定义并应用这些页面定义来配置由应用程序实现的可视化元素/步骤。图3提供了已被选择用于步骤302a-302g中的每个步骤并与其相关联的页面306a-306g的示例。

图4描绘了根据示例性实施方案的工作流402的组织结构的示例。工作流402包括多个步骤406、408、410、418、420、422，每个步骤对应于与特定色谱分析任务相关的一组处理动作和/或计算。如上所述，每个步骤与定义该步骤的各种配置选项的唯一页面或页面集相关联。

这些步骤可以被组织成序列404、416。每个序列可以由负责在序列中的每个步骤处生成的数据的用户组来定义。用户是否有权运行该步骤和/或生成数据可以由与实验分析相关联的数据系统中与用户相关联的用户简档中的标记来定义。例如，数据分析者或分析者团队可以负责在处理序列404的第一步骤406处、第二步骤408处和第三步骤410处生成数据。审阅者或审阅者团队可以负责在审阅序列416的第一步骤418处、第二步骤420处和第三步骤422处审阅数据。

序列404、416内的步骤的识别和/或排序可以由模板来定义。例如，处理序列404中所包括的步骤可以由处理序列模板412来定义，该处理序列模板还可以定义这些步骤的相对排序以及任何步骤是否是任选的。类似地，审阅序列416中所包括的步骤可以由审阅序列模板426来定义。

图5A、图5B和图5C描绘了用于组织工作流的各种结构。特别地，这些图示出了如何将转变结合到工作流中的各种不同选项。

图5A描绘了其中上述序列各自由不同的工作流维护的实施方案。在该实施方案中，给定工作流内的每个步骤被分配给公共用户或用户组。例如，第一工作流可以包括由数据分析团队执行的数据处理步骤，而第二工作流可以包括由审阅团队执行的审阅步骤。工作流的最后步骤定义转变，并用于转变到下一工作流的第一步骤。

尽管有效，但是该组织结构可能难以为用户理解，因为它有效地表示“多个工作流中的某一工作流”。用户通常期望用于执行给定色谱实验的数据分析的所有步骤将被组织成单个工作流。它还可以使工作流之间的导航混淆，因为引导工作流执行的应用程序可能难以解释如何呈现两个不同工作流之间的转变。此外，该概念设想了用于工作流构建器的用户界面UI，因为用户通常必须独立地对每个工作流进行工作，然后将各个工作流组合成工作流链，以便生成实验数据的完整分析。

图5B提供了更好地匹配用户对于工作流应当是什么的直觉的替代方案。在该示例中，单个工作流由一组序列构建，其中不同的用户或用户组负责不同序列中的数据。每个序列与转变相关联，该转变是该序列的一部分(例如，该序列定义其所包括的步骤以及从当前序列到下一序列的转变)。

在概念上，该实施方案对于用户来说更容易掌握，因为它对应于工作流应该是什么的预想概念。该实施方案还允许灵活地查询工作流：例如，用户可以请求完整的工作流或工作流内的特定序列。它还允许将逻辑构建到工作流本身中，这可以简化构建到可视化或执行工作流的应用程序中的逻辑；例如，序列可以被编码为“审阅”序列，这可以简化构建到应用程序中的跟踪逻辑，该跟踪逻辑确定是否允许从一个序列到另一个序列的转变。

然而，与第二实施方案相比，与转变相关联的任何动作(例如，从一个序列到另一个序列的签字)可能需要保持相对简单，因为转变的设计需要适应步骤的整个序列。

图5C描绘了解决图5A和图5B的一些缺点的又一替代方案。在该示例中，工作流由一系列步骤组成。转变发生在一些步骤之间，并且转变表示步骤类型或类别的特殊情况。换句话说，存在表示“步骤”的数据结构，并且使用该相同数据结构来实现转变。在概念上，转变之间的步骤仍然表示序列，尽管因为转变被呈现为单独的步骤而不需要明确的序列数据结构。

该示例具有匹配用户对工作流性质的理解的益处，但是与图5B的实施方案相比，简化了应用程序使用和消费工作流的过程。这种改进用于使数据模型变平(例如，需要更少的数据结构，因为工作流可以简单地表示为一系列步骤，而不是步骤和单独的转变)。因此，工作流构建器不需要做出关于工作流将如何在特定系统上可视化的假设；这使得工作流更通用并且允许容易地扩展到不同的应用程序。这还允许使转变(被正在构建工作流的最终用户以及负责工作流构建器程序的工程师两者)更容易理解的更清洁的实现。因此，更容易维护工作流构建器代码。

图6描绘了用于构建、管理和实现工作流的示例性环境。该环境可以与结合图7A和图7B描述的逻辑结合使用。

该环境包括客户端浏览器132，其允许最终用户与系统交互。客户端浏览器132可以提供用于创建和编辑工作流的用户界面。

客户端浏览器132可以通过工作流构建器602来管理工作流。工作流构建器602可以与色谱数据系统606交互以构建工作流。工作流构建器602和色谱数据系统606可以在数据存储库604中存储和检索与工作流相关的数据。

色谱数据系统606可以负责定义和实现可以绑定到工作流中的每个步骤的页面。这些页面可以通过色谱数据系统606存储在数据存储库604中的页面定义来描述。工作流构建器602可以经由RESTful端点608发现哪些页面可与给定步骤一起使用。例如，当用户在工作流中选择步骤以用于编辑时，工作流构建器602可以向RESTful端点608发出GET请求以检索匹配与该步骤相关联的页面分类的任何页面(工作流中的每个步骤可以由页面定义的硬编码命名分类来表示；当向工作流添加步骤时，可以要求用户从相关联的页面定义分类中选择一个变体以将该步骤分配给工作流)。

从RESTful端点608检索到的页面变化可以在用户界面中呈现给用户，并且用户可以选择一个页面变化以包括在工作流中。因为这些变化可以定义与该步骤相关联的可视化元素的不同配置，所以可以在用户界面中显示示出该配置的汇总/缩略图图像。可以通过调用HTTP端点610从色谱数据系统606检索图像。

工作流构建器602可以使用在用户界面中做出的选择来构建工作流并将该工作流存储在数据存储库604中。当用户希望消费(例如，执行)工作流时，该过程可以通过色谱数据系统606来执行，该色谱数据系统充当用于现有色谱环境中的色谱分析的若干不同级的接触点。为此，工作流构建器602可以展示RESTful端点612，其允许当前用户基于(例如)用户的团队文件夹上下文来发现对当前用户可用的工作流。色谱数据系统606可以对RESTful端点612进行GET调用以检索每个团队文件夹上下文每个用户的工作流。

图7A描绘了根据示例性实施方案的用于构建和/或编辑工作流的示例性工作流构建逻辑700。工作流构建逻辑700可体现为计算机实现的方法或存储在非暂态计算机可读存储介质上的指令，并且可被配置以使得处理器执行图7A中包括的逻辑块。在一些实施方案中，工作流构建逻辑700可由被配置为执行图7A中包括的逻辑块的计算系统来执行。

在框702处，系统可以接收生成或编辑工作流的指令。可以经由呈现在客户端浏览器132上的用户界面来接收指令。

响应于接收到指令，在框704处，系统可以检索一个或多个工作流模板。工作流模板可以定义步骤的初始集和步骤的排序。工作流模板可以是多个预定义工作流模板中的一个预定义工作流模板，每个模板对应于在不同类型的色谱分析中通常执行的一组步骤。要检索的模板可以经由用户界面来选择和/或被指定为在框702处接收到的指令的一部分。另选地，系统可以以空白工作流开始，从而允许用户在特设的基础上添加工作流步骤。

在框706处，系统可以接收对工作流步骤的选择。这可以是用户希望配置或编辑的工作流中的现有步骤，或者可以是用于包括在工作流中的新步骤的选择。用户可以例如通过定义任何现有工作流步骤中的位置或者通过将现有工作流步骤移动到新位置来定义他们希望该步骤在工作流中的位置。

在框708处，系统可以检索所选步骤的页面列表。例如，响应于在框706处接收到对工作流步骤的选择，工作流构建器602可以查询RESTful端点608以识别任何可用页面，并且查询色谱数据系统606的HTTP端点610以检索与可用页面相关联的图像，如上所述。这可以允许工作流构建器602在框710处呈现可用页面的缩略图图像并且在框712处接收对这些图像中的一个图像的选择。响应于接收到对图像的选择，工作流构建器602在框714处可以将工作流配置为包括对应于所选图像的页面。

每个页面可以包括一个或多个可视化，并且有可能通过调整与可视化相关联的设置来配置可视化。用户可以手动调整设置和/或可以从用于可视化的多个预定义设置选项中选择。该配置信息可以被存储为该步骤的页面配置的一部分。

在决策框716处，系统可以确定是否仍有更多步骤要配置。例如，工作流构建器602可以呈现允许用户继续添加或编辑步骤或者选择用于移动到工作流定义的下一部分的选项的界面。

如果仍有更多步骤要配置，则处理可以回到框706，并且系统可以接收对要处理的下一步骤的选择。否则，处理可以前进至框718。

在框718处，系统可以定义现有步骤之间的序列。例如，在框720处，系统可以允许用户选择界面中的阶跃边界(两个现有步骤之间的位置)并将转变与阶跃边界相关联。在框722处，用户可以使用用户界面来定义转变。这可以涉及定义例如用户可以经过转变的方向(例如，向前、向后或两者)、是否要向转变提供警告或者当经过转变时是否需要签名、和/或当在每个允许的方向上经过数据时什么用户对数据负责。每个转变之间的步骤可以形成序列。

在框724处，系统可以存储转变。转变可以各自被创建为步骤的实例(例如，使用与用于定义框704或框706中的步骤相同的数据结构)。可以以与在工作流中表示步骤相同的方式将转变存储为工作流的一部分。在一些实施方案中，可以在工作流开始处添加隐式转变，并且系统可以提示用户识别哪些用户应当负责第一序列(另选地，这可以被指定为用于选择要被包括在工作流中的模板的选择过程的一部分)。也可以向工作流的末尾添加隐式转变，从而指示工作流被完成并且结果应当被标记为最终的且被锁定以防止进一步编辑。

在决策框726处，系统可以确定是否仍有任何更多转变要定义。例如，用户界面可以向用户呈现继续定义序列或指示这些序列已完成该过程的选项。如果仍有更多转变要定义，则处理可以返回到框720。否则，处理可以前进至框728，并且系统可以将工作流存储在数据存储库604中。工作流可以被表示为围绕表示步骤和门的其他数据结构的封装数据结构。为了简洁的目的，门没有被包括在图7A的流程图中，但是可以以类似于转变的方式来定义。转变不需要单独的数据结构，因为它们被简单地表示为门。类似地，可能不需要将序列明确地存储在单独的序列结构中，因为可以从转变推断序列的存在。

处理然后可以前进至框730并结束。

图7B描绘了根据一个示例性实施方案的示例性工作流执行逻辑762。工作流执行逻辑762可体现为计算机实现的方法或存储在非暂态计算机可读存储介质上的指令，并且可被配置以使得处理器执行图7B中包括的逻辑块。在一些实施方案中，工作流执行逻辑762可由被配置为执行图7B中包括的逻辑块的计算系统来执行。

处理在框732处开始，此时用户经由客户端浏览器132打开用户界面。该界面可以向用户呈现选择用于执行的工作流的选项，并且在框734处，用户可以通过该界面识别要开始的工作流。系统可以识别数据存储库604中存储工作流的结构的位置。同时，可以检索来自要由工作流分析的实验的原始数据。原始数据可以是存储在原始数据存储库124中的数据流的形式。

在框736处，系统可以检索工作流中的下一序列以用于执行。当第一次启动时，可以选择第一步骤或序列。在一些实施方案中，系统禁止检索工作流中的所有步骤，并且仅检索在下一转变处结束的步骤序列。在其他实施方案中，系统检索超出转变的那些步骤和预定义数目(例如，一个)的步骤。类似地，如果在当前序列之前存在步骤，则可以检索那些步骤的预定义数目(例如，一个)。可以用导航窗格来更新用户界面，该导航窗格指示当前序列中的步骤、正在实现的当前步骤、和/或在当前序列之前或之后的任何检索到的步骤。

在框738处，系统可以认证一个或多个当前用户以验证他们被允许访问当前序列。例如，转变到当前序列可以定义被允许访问当前序列的特定用户或用户类别(例如，“审阅者”或“数据分析者”)。系统可以查阅可访问系统的当前用户的简档以确保当前用户与授权的用户列表或类别相匹配。如果不匹配，则系统可以显示指示当前用户未被授权的错误消息，并且终止处理。

在框783处被认证的用户可被记录在审计日志中，该审计日志是在工作流被执行时存储关于该工作流的信息和事件的数据结构。当控制通过转变被移交给不同用户时，在框738的后续迭代中被认证的新用户也可被记录在审计日志中。

如果用户被授权，则在框740处，系统可以检索在框736处识别的序列中的下一步骤。在该框中，系统可以(例如)检索当前步骤的页面配置，如图7A中的框714中所定义的。

在框742处，系统可以检索执行与该步骤相关联的任何计算以便生成输出结果。当系统执行计算时，可以生成与工作流相关的元数据。元数据可被存储在文档存储库128中的元数据目录130中，与存储在原始数据存储库124中的数据流分开。

系统可以依赖于用于工作流的一个或多个设置以便执行框742处的计算。在执行计算之前，用户可以改变一个或多个设置。在这种情况下，系统可以将改变记录在审计日志中。系统还可以任选地提示用户关于为什么设置被改变的原因，并且可以将该原因记录在审计日志中。

在框744处，系统可以识别在与该步骤相关联的页面中定义的任何可视化参数，并且可以基于这些参数来构造用于在用户界面中显示的一个或多个可视化元素。系统可以根据由页面指定的配置来配置或格式化可视化元素，并且在框746处，在用户界面上显示所配置的可视化元素。

在框748处，系统可以接收从当前步骤移开的移动指令。这可以是移动到下一步骤、向后移动到前一步骤、或退出工作流的指令。在一些实施方案中，通过工作流的任何移动可被记录在审计日志中。在其他实施方案中，仅某些类型的移动可以触发审计，例如当用户向后移动到前一步骤时。

如果移动指令将导致用户在到不同序列的转变上向前或向后移动(决策框750处为“是”)，则可以记录该移动并且可以向用户询问签名或确认。在这一点上，工作流将转变到一组新的授权用户，因此处理返回到其中检索下一序列的框736。可以用框736处检索到的新步骤来更新导航面板。系统可以在审计日志中记录从一组用户到另一组用户的移交。

如果移动前进到同一序列内的另一个步骤(框752处为“是”)，则不需要进一步认证；处理可以返回到框740，并且可以检索要执行的下一步骤。

如果移动倒退到同一序列内的前一步骤(框754处为“是”)，则不需要新的认证。然而，可以向用户提示向后移动到框756处的前一步骤的原因，并且该原因可以被记录在审计日志中。在提供它们的原因之后，处理可以前进至框758并且系统可以移动到所请求的步骤。

如果该请求是退出工作流的请求(在决策框750、决策框752和决策框754处为“否”)，则处理可以前进至完成框760并结束。

图8示出了可用于在独立和/或联网环境中实现本文所述的一个或多个例示性方面的系统架构和数据处理装置的一个示例。诸如数据服务器810、web服务器806、计算机804和膝上型计算机802的各种网络节点可经由诸如互联网的广域网808(WAN)互连。也可以或可另选地使用其他网络，包括专用内联网、公司网络、LAN、城域网(MAN)、无线网络、个人网络(PAN)等。网络808是为了例示目的，并且可以用更少或更多的计算机网络来代替。局域网(LAN)可以具有任何已知LAN拓扑结构中的一个或多个拓扑结构，并且可以使用各种不同协议中的一个或多个协议，诸如以太网。装置数据服务器810、web服务器806、计算机804、膝上型计算机802和其他装置(未示出)可以经由双绞线、同轴电缆、光纤、无线电波或其他通信介质连接到一个或多个网络。

计算机软件、硬件和网络可用于各种不同的系统环境中，包括独立的、联网的、远程访问(也称为远程桌面)、虚拟化的和/或基于云的环境等等。

本文使用并在附图中所描绘的术语“网络”不仅指其中远程存储装置经由一个或多个通信路径耦接在一起的系统，而且还指可以不时地耦接到具有存储能力的此类系统的独立装置。因此，术语“网络”不仅包括“物理网络”，还包括“内容网络”，该内容网络由驻留在所有物理网络上的、能够归属于单个实体的数据构成。

部件可包括数据服务器810、web服务器806、客户端计算机804和膝上型计算机802。数据服务器810提供数据库和控制软件的整体访问、控制和管理，以用于执行本文所述的一个或多个例示性方面。数据服务器810可以连接到web服务器806，用户通过该web服务器与所请求的数据交互并获得该数据。另选地，数据服务器810本身可以充当web服务器并且直接连接到互联网。数据服务器810可通过网络808(例如，互联网)、经由直接或间接连接或经由某一其他网络连接到web服务器806。用户可使用远程计算机804、膝上型计算机802与数据服务器810交互，例如使用web浏览器经由由web服务器806托管的一个或多个外部公开web站点连接到数据服务器810。客户端计算机804、膝上型计算机802可以与数据服务器810一起使用以访问存储在其中的数据，或者可以用于其他目的。例如，从客户端计算机804，用户可使用互联网浏览器(如本领域已知的)或通过执行经由计算机网络(诸如互联网)与web服务器806和/或数据服务器810通信的软件应用程序来访问web服务器806。

服务器和应用程序可以组合在相同的物理机器上，并且保留单独的虚拟或逻辑地址，或者可以驻留在单独的物理机器上。图8仅示出了可以使用的网络架构的一个示例，并且本领域技术人员将理解，所使用的特定网络架构和数据处理装置可能有所不同，并且对于它们所提供的功能是次要的，如本文进一步描述的。例如，由web服务器806和数据服务器810提供的服务可被组合在单个服务器上。

每个部件数据服务器810、web服务器806、计算机804、膝上型计算机802可以是任何类型的已知计算机、服务器或数据处理装置。数据服务器810例如可包括控制数据服务器810的总体操作的处理器812。数据服务器810还可以包括RAM 816、ROM 818、网络接口814、输入/输出接口820(例如，键盘、鼠标、显示器、打印机等)以及存储器822。输入/输出接口820可以包括用于读取、写入、显示和/或打印数据或文件的各种接口单元和驱动器。存储器822还可以存储用于控制数据服务器810的总体操作的操作系统软件824、用于指示数据服务器810执行本文所述的各方面的控制逻辑部件826，以及用于提供可结合或不结合本文所述的各方面使用的辅助、支持和/或其他功能的其他应用软件828。控制逻辑部件在本文中也可被称为数据服务器软件控制逻辑部件826。数据服务器软件的功能可以指基于被编码到控制逻辑部件中的规则自动做出的、由向系统提供输入的用户手动做出的操作或决策，和/或基于用户输入(例如，查询、数据更新等)的自动处理的组合。

存储器1122还可以存储用于执行本文所述的一个或多个方面的数据，包括第一数据库832和第二数据库830。在一些实施方案中，第一数据库可包括第二数据库(例如，作为单独的表、报告等)。即，信息可根据系统设计存储在单个数据库中，或被分成不同的逻辑、虚拟或物理数据库。web服务器806、计算机804、膝上型计算机802可具有与相对于数据服务器810所描述的类似或不同的架构。本领域的技术人员将理解，如本文所述的数据服务器810(或web服务器806、计算机804、膝上型计算机802)的功能可分布在多个数据处理装置上，例如，以跨多个计算机分配处理负载，以基于地理位置、用户访问级别、服务质量(QoS)等来分离事务。

一个或多个方面可体现在计算机可用或可读数据和/或计算机可执行指令中，诸如体现在由如本文所述的一个或多个计算机或其他装置执行的一个或多个程序模块中。通常，程序模块包括例程、程序、对象、部件、数据结构等，其在由计算机或其他装置中的处理器执行时执行特定任务或实现特定抽象数据类型。这些模块可以用源代码编程语言来编写，这些源代码编程语言随后被编译以供执行，或者这些模块可以用诸如(但不限于)HTML或XML的脚本语言来编写。计算机可执行指令可以存储在诸如非易失性存储装置的计算机可读介质上。可以利用任何合适的计算机可读存储介质，包括硬盘、CD-ROM、光学存储装置、磁性存储装置和/或它们的任何组合。此外，如本文所述的表示数据或事件的各种传输(非存储)介质可以以通过信号传导介质(诸如金属线、光纤和/或无线传输介质)传播的电磁波的形式在来源与目的地之间传送。本文所述的各个方面可以体现为方法、数据处理系统或计算机程序产品。因此，各种功能可全部或部分地体现在软件、固件和/或硬件或硬件等效物(诸如集成电路、现场可编程门阵列(FPGA)等)中。特定数据结构可用于更有效地实现本文所述的一个或多个方面，并且设想此类数据结构在本文所述的计算机可执行指令和计算机可用数据的范围内。

可使用离散电路系统、专用集成电路(ASIC)、逻辑门和/或单芯片架构的任何组合来实现上文所述的装置的部件和特征。此外，在适当的情况下，可以使用微控制器、可编程逻辑阵列和/或微处理器或前述的任何组合来实现这些装置的特征。需注意，硬件、固件和/或软件元件在本文中可被统称为或单独地称为“逻辑部件”或“电路”。

应当理解，上述框图中示出的示例性装置可以表示许多可能具体实施的一个功能描述性示例。因此，附图中描绘的块功能的划分、省略或包含并不意味着用于实现这些功能的硬件部件、电路、软件和/或元件将必然在实施方案中被划分、省略或包含。

至少一个计算机可读存储介质可以包括指令，这些指令在被执行时使得系统执行本文所述的计算机实现的方法中的任一种。

可使用表述“一个实施方案”或“实施方案”以及其派生词来描述一些实施方案。这些术语意味着结合实施方案描述的特定特征、结构或特性包括在至少一个实施方案中。短语“在一个实施方案中”在说明书中不同位置处出现不一定都指同一实施方案。此外，除非另有说明，否则上述特征被认为可以以任何组合一起使用。因此，单独讨论的任何特征可以彼此组合地使用，除非指出这些特征彼此不相容。

一般参考本文使用的标记和命名，本文的详细描述可以按照在计算机或计算机网络上执行的程序过程来呈现。本领域的技术人员使用这些程序描述和表示来最有效地向本领域的其他技术人员传达他们工作的实质。

这里的过程通常被认为是带来期望结果的自洽操作序列。这些操作是需要对物理量进行物理操纵的那些操作。尽管不是必须的，但这些量通常采用能够被存储、传送、组合、比较和以其他方式操纵的电、磁或光信号的形式。实践证明，将这些信号称为位、值、元素、符号、字符、术语、数字等有时是很方便的，主要是出于通用的原因。然而，应当注意，所有这些和类似的术语都与适当的物理量相关联，并且仅仅是应用于这些量的方便标记。

此外，所执行的操纵通常被称为诸如添加或比较等术语，其通常与由人类操作者执行的脑力操作相关联。在形成一个或多个实施方案的一部分的本文所述的任何操作中，在大多数情况下，人类操作者的这种能力不是必需的或期望的。相反，这些操作是机器操作。用于执行各种实施方案的操作的有用机器包括通用数字计算机或类似装置。

可使用表述“耦接”和“连接”以及其派生词来描述一些实施方案。这些术语并不一定旨在互为同义词。例如，可使用术语“连接”和/或“耦接”来描述一些实施方案，以指示两个或更多个元件彼此直接物理或电接触。然而，术语“耦接”还可表示两个或更多个元件不彼此直接接触，但是仍然彼此协作或相互作用。

各种实施方案还涉及用于执行这些操作的设备或系统。该设备可以为所需目的而专门构造，或者其可以包括由存储在计算机中的计算机程序选择性地激活或重新配置的通用计算机。本文所呈现的过程本质上与特定计算机或其他设备不相关。各种通用机器可以与根据本文的教导内容编写的程序一起使用，或者可以证明构造更专用的设备来执行所需的方法步骤是方便的。各种这些机器的所需结构将出现在所给出的描述中。

需强调，提供本公开的摘要，从而允许读者快速地确定技术公开的实质。应当理解，所提交的摘要将不会被用于解释或限制权利要求的范围或含义。另外，在前述具体实施方式中，可以看出，可以出于简化本公开目的，各种特征在单一实施方案中被分组在一起。本公开的该方法不应被解释为反映要求保护的实施方案要求比每项权利要求中明确地表述的特征更多的特征的意图。相反，如以下权利要求所反映，本发明的主题比单个公开的实施方案的所有特征少。因此，以下权利要求在此结合到具体实施方式中，其中每项权利要求作为一个单独的实施方案独立存在。在所附权利要求中，术语“包括(including)”和“其中(in which)”分别用作相应术语“包括(comprising)”和“其中(wherein)”的通俗英文等效用语。此外，术语“第一”、“第二”、“第三”等仅用作标签，而不旨在对它们的对象强加数字要求。

上文已描述的内容包括所公开的架构的示例。当然，不可能描述部件和/或方法的每一种可想到的组合，但本领域的普通技术人员可以认识到，许多进一步的组合和置换是可能的。因此，该新型架构旨在涵盖落入所附权利要求书的实质和范围内的所有此类变更、修改和变型。

Claims (39)

1.一种方法，包括：

接收生成用于分析色谱实验结果的工作流的指令，其中：

所述工作流包括多个步骤，

每个步骤与一个或多个页面相关联，并且

每个页面表示所述步骤的变化；

经由用户界面接收对要编辑的步骤的选择；

经由所述用户界面接收对所选步骤的页面的选择；以及

向所述工作流添加转变，所述转变表示从所述多个步骤中的当前步骤到所述多个步骤中的下一步骤的数据保管权的改变，其中所述当前步骤被配置为由第一用户执行，并且所述下一步骤被配置为由不同于所述第一用户的第二用户执行。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述步骤由数据结构定义，并且所述转变由相同数据结构定义为特定种类的步骤。

3.根据权利要求1所述的方法，其中所述步骤被组织成一个或多个序列，并且每个序列被配置为具有到所述工作流中的下一序列、到所述工作流的前一序列、或到所述工作流的末尾的转变。

4.根据权利要求1所述的方法，还包括：

识别所述多个步骤的子集的预定义排序；以及

当生成所述工作流时强行实施所述预定义排序。

5.根据权利要求1所述的方法，还包括执行所述工作流，所述执行包括：

识别执行所述当前步骤的所述第一用户；

将所述第一用户记录在审计日志中；

到达所述转变处；

识别负责执行所述第二步骤的所述第二用户；

将所述工作流的控制从所述第一用户移交给所述第二用户；以及

将所述第二用户记录在所述审计日志中。

6.根据权利要求5所述的方法，其中所述第一用户和所述第二用户各自与用户简档相关联，并且识别所述第二用户包括在与所述第二用户相关联的简档中识别所述第二用户具有针对所述第二步骤的访问权限。

7.根据权利要求1所述的方法，其中：

所述多个步骤的第一子集与处理模板相关联，所述处理模板针对每个步骤定义一个或多个可定制的可视化页面；并且

所述多个步骤的第二子集与审阅模板相关联，所述审阅模板指定由所述多个步骤的所述第一子集生成的数据的审阅者要采取的一个或多个动作。

8.根据权利要求1所述的方法，其中所述页面中的至少一个页面与可视化元素相关联，所述可视化元素被配置为在用户界面上显示与对应于所述页面的步骤相关联的数据，并且所述方法还包括接收用于所述可视化元素的配置，所述配置控制所述可视化元素如何显示所述数据。

9.根据权利要求8所述的方法，其中接收所述配置包括：

识别与所述页面相关联的多个预定义显示格式；以及

接收对所述预定义显示格式中的一个预定义显示格式的选择。

10.根据权利要求1所述的方法，还包括执行所述工作流，所述执行包括：

在所述多个步骤中的第一步骤处接收在所述色谱实验期间采集的原始数据流，所述原始数据流被存储在原始数据存储库中；

在所述第一步骤处生成从处理所述原始数据导出的元数据；以及

将所述元数据存储在与所述原始数据流不同的元数据目录中，所述元数据目录被存储在与所述原始数据存储库不同的文档存储库中。

11.根据权利要求1所述的方法，还包括执行所述工作流，所述执行包括：

接收所述工作流中从所述多个步骤中的一个步骤移动到所述多个步骤中的另一个步骤的指令；

将所述移动记录在审计日志中。

12.根据权利要求11所述的方法，其中在所述工作流中，所述多个步骤中的所述另一个步骤在所述多个步骤中的所述一个步骤之前，并且所述方法还包括：

提示发起所述移动的用户输入返回到所述多个步骤中的所述另一个步骤的原因；以及

将所述原因记录在所述审计日志中。

13.根据权利要求11所述的方法，其中所述用户在所述多个步骤中的所述另一个步骤处对设置做出改变，并且所述方法还包括：

提示发起所述移动的所述用户输入改变所述设置的原因；以及

将所述原因记录在所述审计日志中。

14.一种非暂态计算机可读存储介质，所述计算机可读存储介质包括指令，所述指令在被计算机执行时使得所述计算机执行以下操作：

接收生成用于分析色谱实验结果的工作流的指令，其中：

所述工作流包括多个步骤，

每个步骤与一个或多个页面相关联，并且

每个页面表示所述步骤的变化；

经由用户界面接收对要编辑的步骤的选择；

经由所述用户界面接收对所选步骤的页面的选择；以及

向所述工作流添加转变，所述转变表示从所述多个步骤中的当前步骤到所述多个步骤中的下一步骤的数据保管权的改变，其中所述当前步骤被配置为由第一用户执行，并且所述下一步骤被配置为由不同于所述第一用户的第二用户执行。

15.根据权利要求14所述的计算机可读存储介质，其中所述步骤由数据结构定义，并且所述转变由相同数据结构定义为特定种类的步骤。

16.根据权利要求14所述的计算机可读存储介质，其中所述步骤被组织成一个或多个序列，并且每个序列被配置为具有到所述工作流中的下一序列、到所述工作流的前一序列、或到所述工作流的末尾的转变。

17.根据权利要求14所述的计算机可读存储介质，其中所述指令还将所述计算机配置为：

识别所述多个步骤的子集的预定义排序；以及

当生成所述工作流时强行实施所述预定义排序。

18.根据权利要求14所述的计算机可读存储介质，其中所述指令还将所述计算机配置为执行所述工作流，所述执行包括：

识别执行所述当前步骤的所述第一用户；

将所述第一用户记录在审计日志中；

到达所述转变处；

识别负责执行所述第二步骤的所述第二用户；

将所述工作流的控制从所述第一用户移交给所述第二用户；以及

将所述第二用户记录在所述审计日志中。

19.根据权利要求18所述的计算机可读存储介质，其中所述第一用户和所述第二用户各自与用户简档相关联，并且识别所述第二用户包括在与所述第二用户相关联的简档中识别所述第二用户具有针对所述第二步骤的访问权限。

20.根据权利要求14所述的计算机可读存储介质，其中：

所述多个步骤的第一子集与处理模板相关联，所述处理模板针对每个步骤定义一个或多个可定制的可视化页面；并且

所述多个步骤的第二子集与审阅模板相关联，所述审阅模板指定由所述多个步骤的所述第一子集生成的数据的审阅者要采取的一个或多个动作。

21.根据权利要求14所述的计算机可读存储介质，其中所述页面中的至少一个页面与可视化元素相关联，所述可视化元素被配置为在用户界面上显示与对应于所述页面的步骤相关联的数据，并且其中所述指令还将所述计算机配置为接收用于所述可视化元素的配置，所述配置控制所述可视化元素如何显示所述数据。

22.根据权利要求21所述的计算机可读存储介质，其中接收所述配置包括：

识别与所述页面相关联的多个预定义显示格式；以及

接收对所述预定义显示格式中的一个预定义显示格式的选择。

23.根据权利要求14所述的计算机可读存储介质，其中所述指令还将所述计算机配置为执行所述工作流，所述执行包括：

在所述多个步骤中的第一步骤处接收在所述色谱实验期间采集的原始数据流，所述原始数据流被存储在原始数据存储库中；

在所述第一步骤处生成从处理所述原始数据导出的元数据；以及

将所述元数据存储在与所述原始数据流不同的元数据目录中，所述元数据目录被存储在与所述原始数据存储库不同的文档存储库中。

24.根据权利要求14所述的计算机可读存储介质，其中所述指令还将所述计算机配置为执行所述工作流，所述执行包括：

接收所述工作流中从所述多个步骤中的一个步骤移动到所述多个步骤中的另一个步骤的指令；

将所述移动记录在审计日志中。

25.根据权利要求24所述的计算机可读存储介质，其中在所述工作流中，所述多个步骤中的所述另一个步骤在所述多个步骤中的所述一个步骤之前，并且其中所述指令还将所述计算机配置为：

提示发起所述移动的用户输入返回到所述多个步骤中的所述另一个步骤的原因；以及

将所述原因记录在所述审计日志中。

26.根据权利要求24所述的计算机可读存储介质，其中所述用户在所述多个步骤中的所述另一个步骤处对设置做出改变，并且其中所述指令还将所述计算机配置为：

提示发起所述移动的所述用户输入改变所述设置的原因；以及

将所述原因记录在所述审计日志中。

27.一种计算设备，包括：

处理器；和

存储器，所述存储器存储指令，所述指令在由所述处理器执行时将所述设备配置为：

接收生成用于分析色谱实验结果的工作流的指令，其中：

所述工作流包括多个步骤，

每个步骤与一个或多个页面相关联，并且

每个页面表示所述步骤的变化；

经由用户界面接收对要编辑的步骤的选择；

经由所述用户界面接收对所选步骤的页面的选择；以及

向所述工作流添加转变，所述转变表示从所述多个步骤中的当前步骤到所述多个步骤中的下一步骤的数据保管权的改变，其中所述当前步骤被配置为由第一用户执行，并且所述下一步骤被配置为由不同于所述第一用户的第二用户执行。

28.根据权利要求27所述的计算设备，其中所述步骤由数据结构定义，并且所述转变由相同数据结构定义为特定种类的步骤。

29.根据权利要求27所述的计算设备，其中所述步骤被组织成一个或多个序列，并且每个序列被配置为具有到所述工作流中的下一序列、到所述工作流的前一序列、或到所述工作流的末尾的转变。

30.根据权利要求27所述的计算设备，其中所述指令还将所述设备配置为：

识别所述多个步骤的子集的预定义排序；以及

当生成所述工作流时强行实施所述预定义排序。

31.根据权利要求27所述的计算设备，其中所述指令还将所述设备配置为执行所述工作流，所述执行包括：

识别执行所述当前步骤的所述第一用户；

将所述第一用户记录在审计日志中；

到达所述转变处；

识别负责执行所述第二步骤的所述第二用户；

将所述工作流的控制从所述第一用户移交给所述第二用户；以及

将所述第二用户记录在所述审计日志中。

32.根据权利要求31所述的计算设备，其中所述第一用户和所述第二用户各自与用户简档相关联，并且识别所述第二用户包括在与所述第二用户相关联的简档中识别所述第二用户具有针对所述第二步骤的访问权限。

33.根据权利要求27所述的计算设备，其中：

所述多个步骤的第一子集与处理模板相关联，所述处理模板针对每个步骤定义一个或多个可定制的可视化页面；并且

所述多个步骤的第二子集与审阅模板相关联，所述审阅模板指定由所述多个步骤的所述第一子集生成的数据的审阅者要采取的一个或多个动作。

34.根据权利要求27所述的计算设备，其中所述页面中的至少一个页面与可视化元素相关联，所述可视化元素被配置为在用户界面上显示与对应于所述页面的步骤相关联的数据，并且其中所述指令还将所述设备配置为接收用于所述可视化元素的配置，所述配置控制所述可视化元素如何显示所述数据。

35.根据权利要求34所述的计算设备，其中接收所述配置包括：

识别与所述页面相关联的多个预定义显示格式；以及

接收对所述预定义显示格式中的一个预定义显示格式的选择。

36.根据权利要求27所述的计算设备，其中所述指令还将所述设备配置为执行所述工作流，所述执行包括：

在所述多个步骤中的第一步骤处接收在所述色谱实验期间采集的原始数据流，所述原始数据流被存储在原始数据存储库中；

在所述第一步骤处生成从处理所述原始数据导出的元数据；以及

将所述元数据存储在与所述原始数据流不同的元数据目录中，所述元数据目录被存储在与所述原始数据存储库不同的文档存储库中。

37.根据权利要求27所述的计算设备，其中所述指令还将所述设备配置为执行所述工作流，所述执行包括：

接收所述工作流中从所述多个步骤中的一个步骤移动到所述多个步骤中的另一个步骤的指令；

将所述移动记录在审计日志中。

38.根据权利要求37所述的计算设备，其中在所述工作流中，所述多个步骤中的所述另一个步骤在所述多个步骤中的所述一个步骤之前，并且其中所述指令还将所述设备配置为：

提示发起所述移动的用户输入返回到所述多个步骤中的所述另一个步骤的原因；以及

将所述原因记录在所述审计日志中。

39.根据权利要求37所述的计算设备，其中所述用户在所述多个步骤中的所述另一个步骤处对设置做出改变，并且其中所述指令还将所述设备配置为：

提示发起所述移动的所述用户输入改变所述设置的原因；以及

将所述原因记录在所述审计日志中。