CN116507915A

CN116507915A - 可溶性trem-1作为患有冠状病毒感染的受试者的严重程度或并发症的标志物

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Publication number: CN116507915A
Application number: CN202180057319.6A
Authority: CN
Inventors: J-J·加罗; 马尔克·德里夫; M·萨尔塞多-马吉利; L·若利; S·吉博; D·穆林; M·内泰亚; A·德努奥耶尔
Original assignee: Centre Hospitalier Regional Universitaire De Nancy; Radford University Foundation Medical Center; Centre National de la Recherche Scientifique CNRS; Universite Henri Poincare Nancy I; Inotrem SA
Current assignee: Centre Hospitalier Regional Universitaire De Nancy; Radford University Foundation Medical Center; Centre National de la Recherche Scientifique CNRS; Universite Henri Poincare Nancy I; Inotrem SA
Priority date: 2020-06-05
Filing date: 2021-06-07
Publication date: 2023-07-28

Abstract

本发明涉及髓样细胞上表达的可溶性触发受体‑1(sTREM‑1)作为标志物用于鉴定患有由冠状病毒导致的疾病如COVID‑19的受试者为处于具有严重形式和/或并发症的风险中或处于发展严重形式和/或并发症的风险中或处于死亡的风险中的方法中、用于评估由冠状病毒导致的疾病如COVID‑19的严重程度的方法中以及用于监测患有由冠状病毒导致的疾病如COVID‑19的受试者的方法中的用途。

Description

可溶性TREM-1作为患有冠状病毒感染的受试者的严重程度或并发症的标志物

发明领域

本发明涉及鉴定和监测患有由冠状病毒导致的疾病的受试者，尤其是处于所述疾病的严重形式的风险中或处于并发症的风险中的受试者。本发明特别涉及在髓样细胞上表达的可溶性触发受体-1(sTREM-1)作为由冠状病毒导致的疾病的标志物，尤其是作为严重程度和/或并发症的标志物，用于鉴定、评估、监测患有由冠状病毒导致的疾病的受试者的方法中。

发明背景

冠状病毒(CoV)是冠状病毒(Coronaviridae)科的核糖核酸(RNA)病毒，其显著特征在于电子显微镜下可见的独特形态，即从其包膜表面突出的棒状刺突形成的冠状外观。冠状病毒感染哺乳动物和鸟类，并导致广泛的呼吸道、胃肠道、神经系统和全身疾病。

人类冠状病毒最初被认为在大多数情况下仅导致轻微的呼吸道感染，例如普通感冒。因此，预估四种地方性人类CoV占成人上呼吸道感染的10％至30％。然而，近年来，动物宿主出现两种导致严重呼吸道疾病的高致病性冠状病毒，即2003年首次鉴定的严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)和2012年首次鉴定的中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)。

2019年12月，鉴定出一种新的不明原因的传染性呼吸道疾病。在其中的一些患者中很快鉴定出冠状病毒RNA，并且在2020年1月，中国上海复旦大学上海公共卫生临床中心和公共卫生学院发布了新鉴定的人类冠状病毒SARS-CoV-2(先前称为2019-nCoV)的全基因组序列。SARS-COV-2的基因组序列与人类SARS-CoV的基因组序列具有82％核苷酸同一性(Chan等人,Emerg Microbes Infect.2020；9(1):221–236)。此外，如先前针对SARS-CoV所证明的，SARS-CoV-2利用ACE2(血管紧张素转换酶2)作为病毒进入细胞的受体(Hoffmann等人,Cell.2020；181(2):271–280.e8)。

在表现出症状的被感染受试者中，SARS-COV-2导致的疾病被称为“冠状病毒病2019”(COVID-19)。COVID-19是一种临床广谱型呼吸道疾病。大多数被感染的受试者出现轻度或中度症状。COVID-19通常首先表现为包括头痛、肌肉疼痛、疲劳、发热和呼吸系统症状(如干咳、气短和/或胸闷)的症状。其他报告的症状包括失去嗅觉和/或味觉。一些受试者发展为可导致肺炎和急性呼吸衰竭的严重形式的COVID-19。COVID-19的并发症包括血栓性或血栓栓塞性并发症、肺栓塞、心血管衰竭、肾衰竭、肝衰竭和继发感染。据估计，约5％患有COVID-19的受试者需要住院，约15-25％的住院受试者需要入住重症监护室(ICU)。SARS-CoV-2感染被认为在30-60％的被感染受试者中是无症状的，或导致轻微临床表现或无临床表现。

全球正在努力确定有效的诊断、预后和监测标志物。这将特别有助于鉴定可能发展为疾病严重形式和/或并发症的患有COVID-19的受试者，评估受试者中COVID-19的严重程度，以及监测患有COVID-19的受试者。

因此，仍然需要可用于鉴定、评估和监测患有由冠状病毒导致的疾病如由SARS-CoV-2导致的COVID-19的受试者，尤其是可能发展为疾病严重形式和/或疾病并发症的受试者的标志物。

本发明涉及在髓样细胞上表达的可溶性触发受体-1(sTREM-1)作为由冠状病毒导致的疾病如由SARS-CoV-2导致的COVID-19的标志物，尤其是作为用于鉴定患有由冠状病毒导致的疾病的受试者为处于严重形式和/或并发症的风险中的方法中、用于评估由冠状病毒导致的疾病的严重程度的方法中以及用于监测患有由冠状病毒导致的疾病的受试者的方法中的标志物。

发明内容

本发明的第一目的是一种鉴定患有由冠状病毒感染导致的疾病的受试者为具有以下风险的体外方法，所述风险为具有由冠状病毒感染导致的疾病的严重形式和/或并发症，或发展由冠状病毒感染导致的疾病的严重形式和/或并发症，或在冠状病毒感染后发生死亡，所述方法包括：

-测量来自受试者的生物样品中的在髓样细胞上表达的可溶性触发受体-1(sTREM-1)的水平；和

-将在来自受试者的生物样品中测量的sTREM-1水平与参考值进行比较。

在一个实施方案中，由冠状病毒感染导致的疾病的并发症选自以下：呼吸衰竭，包括急性呼吸衰竭或急性呼吸窘迫综合征(ARDS)；需要氧气治疗(包括非侵入性通气)的呼吸衰竭；需要机械通气的呼吸衰竭；持续呼吸衰竭，包括需要长期机械通气，尤其是持续超过15天的长期机械通气，以及拔管失败；继发感染或超感染(superinfection)；血栓并发症(也称为血栓栓塞并发症)，包括静脉和/或动脉血栓栓塞、深静脉血栓形成、肺栓塞和脑血管意外；心脏循环系统衰竭(其也被称为心血管衰竭)；肾衰竭，例如急性肾损伤(AKI)；肝衰竭；及其任意组合。

本发明的另一目的是一种用于确定受试者中由冠状病毒感染导致的疾病的严重程度的体外方法，所述方法包括：

在一个实施方案中，确定受试者中由冠状病毒感染导致的疾病的严重程度的方法允许随时间监测所述受试者，并且所述方法包括测量在至少两个时间获得(优选间隔至少24小时)的来自受试者的生物样品中的sTREM-1水平。

在一个实施方案中，冠状病毒是严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)，并且由冠状病毒感染导致的疾病是冠状病毒病2019(COVID-19)。

在一个实施方案中，sTREM-1水平是sTREM-1的转录水平或sTREM-1的翻译水平。在一个实施方案中，生物样品是血液样品，优选是血清样品。

在一个实施方案中，受试者需要住院。在一个实施方案中，受试者需要呼吸支持。在一个实施方案中，在住院后第3天测量sTREM-1的水平。

定义

在本发明中，以下术语具有以下含义：

“TREM-1”是指“在髓样细胞上表达的触发受体-1”并且有时也称为CD354。TREM-1是属于免疫球蛋白(Ig)超家族的膜结合糖蛋白受体，尤其在髓样细胞上表达。TREM-1在称为DAP12(12kDa的DNAX激活蛋白)的衔接蛋白的帮助下激活下游信号传导通路。TREM-1包含三个不同的结构域：Ig样结构(主要负责配体结合)、跨膜部分和与DAP12结合的胞质尾。除非另有说明，否则TREM-1蛋白具有SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列，对应于UniProtKB/Swiss-Prot登录号Q9NP99-1(2000年10月1日最后修改)以及UniProtKB登录号Q38L15-1(2005年11月22日最后修改)。已知TREM-1的几个转录物。通常称为TREM1-201的转录物(转录物ID ensembl ENST00000244709.8)编码SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列。通常称为TREM1-202的转录物，也称为TREM-1同工型2(ensembl转录物ID ENST00000334475.10)编码如SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列(对应于UniProtKB/Swiss-Prot登录号Q9NP99-2)。通常称为TREM1-207的转录物，也称为TREM-1同工型3(ensembl转录物ID ENST00000591620.1)编码SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列(对应于UniProtKB/Swiss-Prot登录号Q9NP99-3)。通常称为TREM1-204的转录物(ensembl转录物ID ENST00000589614.5)编码SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列(对应于UniProtKB/Swiss-Prot登录号K7EKM5-1，2013年1月9日最后修改)。

“sTREM-1”，即“在髓样细胞上表达的可溶性触发受体-1”，是指缺少TREM-1的跨膜结构域和胞内结构域的TREM-1可溶性形式。因此，在一个实施方案中，sTREM-1对应于TREM-1的可溶形式的细胞外结构域。可溶性TREM-1可以由基质金属蛋白酶自膜锚定的TREM-1蛋白水解切割下TREM-1Ig样胞外结构域而产生(Gomez-Pina等人,J Immunol.2007Sep15；179(6):4065-73)。因此，在一个实施方案中，sTREM-1对应于从髓样细胞的细胞膜，尤其是从活化的髓样细胞的细胞膜脱落的截短的TREM-1。还有人提出，sTREM-1是TREM-1mRNA的选择性剪接产生的。TREM-1剪接变体由Baruah等人描述于2015年(J Immunol.2015Dec 15；195(12):5725-31)，并且发现由初级和次级人嗜中性粒细胞颗粒分泌。因此，在一个实施方案中，sTREM-1对应于TREM-1剪接变体，尤其对应于通常被称为TREM1-202(也称为TREM-1同工型2，编码如SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列)的TREM-1转录物。

数字前面的“约”涵盖所述数字的值的正或负10％或更小。因此，例如，“约10”涵盖范围从9到11的值，“约100”涵盖范围从90到110的值。应当理解，术语“约”所指的值本身也被具体地公开，并且被优选地公开。

“生物标志物”(biomarker或biological marker)是指可以在来自受试者的生物样品中测量的变量。

“电化学发光免疫测定(ECLIA)”是指信号的检测基于电化学发光的免疫测定，所述电化学发光即为一种化学发光形式，在该形式中发光的化学发光反应先于电化学反应。

当在本发明中用于两个或更多个多肽的序列之间的关系时，术语“同一性”或“同一”是指多肽之间的序列相关性的程度，由两个或更多个氨基酸残基的链之间的匹配数决定。“同一性”测定两个或更多个序列中较小者之间相同匹配的百分比，其中空位比对(如果有的话)由特定数学模型或计算机程序(即“算法”)解决。相关多肽的同一性可以通过已知方法容易地计算。此类方法包括但不限于以下描述的那些方法：Computational MolecularBiology,Lesk,A.M.,ed.,Oxford University Press,New York,1988；Biocomputing:Informatics and Genome Projects,Smith,D.W.,ed.,Academic Press,New York,1993；Computer Analysis of Sequence Data,Part 1,Griffin,A.M.,and Griffin,H.G.,eds.,Humana Press,New Jersey,1994；Sequence Analysis in Molecular Biology,vonHeinje,G.,Academic Press,1987；Sequence Analysis Primer,Gribskov,M.andDevereux,J.,eds.,M.Stockton Press,New York,1991；和Carillo等人,SIAM J.AppliedMath.48,1073(1988)。确定同一性的优选方法经设计使所测试序列之间的匹配最大。确定同一性的方法描述在公众可得的计算机程序中。用于确定两个序列之间的同一性的优选的计算机程序方法包括，包括含GAP的GCG程序包(Devereux等人,Nucl.Acid.Res.\2,387(1984)；Genetics Computer Group,University of Wisconsin,Madison,Wis.)、BLASTP、BLASTN和FASTA(Altschul等人,J.MoI.Biol.215,403-410(1990))。BLASTX程序可从国家生物技术信息中心(NCBI)和其他来源公开获取(BLAST Manual,Altschul等人NCB/NLM/NIHBethesda,Md.20894；Altschul等人,J.MoI.Biol.215,403-410(1990))。熟知的SmithWaterman算法也可用于确定同一性。

“测量”或者“检测”意指评估来自受试者的生物样品中特定物质(即sTREM-1)的存在、不存在、数量或量(可以是有效量)。如本文所用，“测量”或者“检测”包括推导生物样品中和受试者体内所述物质(即sTREM-1)的定性或定量浓度(例如，血液浓度或血浆浓度)。

“呼吸支持”是指为补偿受试者经受的呼吸窘迫或衰竭而向受试者施用的任何措施。此类措施的实例包括氧气治疗(也称为标准氧气治疗或补充氧气)，例如通过面罩、鼻插管(nasal cannula)或鼻叉(nasal prongs)补充氧气、正压、高流量鼻氧、非侵入性通气(NIV)(例如，闭塞面罩(occlusive mask))；需要气管插管和/或气管切开术的侵入性机械通气(IMV)；和体外膜肺氧合(ECMO)。如本文所用，“呼吸支持”因此涵盖氧气治疗和侵入性机械通气(IMV)两者。

“机械通气”是指侵入性呼吸支持，包括需要气管插管和/或气管切开术的呼吸支持，和体外膜肺氧合(ECMO)。如本文所用，术语“机械通气”和“侵入性机械通气”可互换。

“护理标准”是指通常为患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是由SARS-CoV-2导致的COVID-19的住院受试者提供的护理。护理标准可包括例如以下中的至少一项：如上文定义的呼吸支持、血管加压药治疗(例如，苯肾上腺素、去甲肾上腺素、肾上腺素、血管加压素和/或多巴胺)、液体治疗、抗微生物治疗、抗病毒治疗、心血管支持、肾替代治疗和镇静作用。

“受试者”指哺乳动物，优选人。根据本发明，受试者是患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是由SARS-CoV-2导致的COVID-19的哺乳动物，优选人。

如本文所用，“确认的COVID-19实验室诊断”是指经过实验室测试确认的由SARS-CoV-2导致的COVID-19，例如可检测来自受试者的样品(例如来自鼻拭子的样品、来自口咽拭子的样品、痰液样品、下呼吸道吸出物、支气管肺泡灌洗液、鼻咽冲洗液/吸出物或鼻吸出物)中SARS-CoV-2的存在的rRT-PCR(实时逆转录聚合酶链式反应)测试，或可检测来自受试者的样品(例如血液样本)中针对SARS-CoV-2的抗体的存在的抗体测试(例如酶联免疫吸附测定(ELISA))。

“由冠状病毒导致的疾病”和“由冠状病毒感染导致的疾病”是可互换的，并且是指受试者中由所述受试者器官中冠状病毒的存在而引起的任何症状或任何一组症状。

“治疗”是指治疗性治疗、预防性(或防止性)治疗，或治疗性治疗和预防性(或防止性)治疗两者，其中目的是防止、减轻、缓解和/或减慢(减少)有此需要的受试者中由冠状病毒导致的疾病，尤其是由SARS-CoV-2导致的COVID-19的一种或多种症状或表现。由冠状病毒导致的疾病，尤其是由SARS-CoV-2导致的COVID-19的症状包括但不限于发热和呼吸道症状，例如干咳和/或可能需要呼吸支持(例如补充氧气、非侵入性通气、侵入性机械通气、体外膜肺氧合(ECMO))的呼吸困难。由冠状病毒导致的疾病，尤其是由SARS-CoV-2导致的COVID-19的表现还包括但不限于来自受试者的生物样品中检测到病毒载量(也称为病毒负荷或病毒滴度)。在一个实施方案中，“治疗”是指治疗性治疗。在另一个实施方案中，“治疗”是指预防性或防止性治疗。在又一个实施方案中，“治疗”是指预防性(或防止性)治疗和治疗性治疗两者。

发明详述

本发明涉及在髓样细胞上表达的触发受体-1(TREM-1)，尤其是在髓样细胞上表达的可溶性触发受体-1(sTREM-1)，作为由冠状病毒导致的疾病(也称为由冠状病毒感染导致的疾病)的标志物，尤其是作为所述疾病的严重程度和/或并发症的标志物。本发明还涉及TREM-1的水平，尤其是sTREM-1的水平，作为标志物，尤其是作为所述疾病的严重程度和/或并发症的标志物，用于鉴定、评估和监测患有如本文所述的由冠状病毒导致的疾病的受试者的方法。

因此，本发明涉及用于鉴定、评估和监测患有如本文所述的由冠状病毒导致的疾病的受试者的方法，所述方法包括以下或由以下组成：

-测量如本文所述受试者的生物样品中的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平；和

-将在来自受试者的生物样品中测量的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平与如本文所述的参考值进行比较。

TREM-1(在髓样细胞上表达的触发受体-1)是属于Ig超家族的糖蛋白受体，尤其在髓样细胞中表达。sTREM-1是缺乏TREM-1的跨膜结构域和胞内结构域的TREM-1的可溶性形式。不希望受到理论的束缚，申请人提出，包括Nod样受体(NLR)和Toll样受体(TLR)在内的PRR(病原体识别受体)的参与诱导了TREM-1表达的上调和/或其在细胞膜的动员和聚集，这导致其二聚化和多聚化。所述NLR和TLR激活可以通过连接DAMP(危险相关分子模式)或PAMP(病原体相关分子模式)而发生。特别地，所述NLR和TLR激活可以在无菌炎性条件下通过连接DAMP和/或警报素(alarmin)来发生，或在感染条件下通过连接PAMP而发生。这种NLR和TLR的激活诱导了蛋白酶，尤其是金属蛋白酶的上调，而后者在许多靶点中转而通过膜锚定TREM-1的蛋白水解裂解诱导释放可溶性TREM 1(Gomez-Pina等人,J Immunol.2007Sep 15；179(6):4065-73)。所述蛋白水解裂解取决于TREM-1受体的二聚化。因此，sTREM-1从髓样细胞膜脱落，尤其是从活化的髓样细胞脱落，并且sTREM-1的释放是TREM-1激活的标志。在一个实施方案中，sTREM-1对应于TREM-1胞外结构域的可溶性形式。在一个实施方案中，sTREM-1对应于从髓样细胞膜，尤其是从活化的髓样细胞膜脱落的截短的TREM-1。

根据一个实施方案，TREM-1的水平是TREM-1转录物的水平。

已知的TREM-1转录物的实例包括但不限于通常称为TREM1-201的转录物(转录物ID ensembl ENST00000244709.8)，其编码对应于SEQ ID NO:1的氨基酸序列；通常称为TREM1-202的转录物，也称为TREM-1同工型2(ensembl转录物ID ENST00000334475.10)，其编码对应于SEQ ID NO:2的氨基酸序列；通常称为TREM1-207的转录物，也称为TREM-1同工型3(ensembl转录物ID ENST00000591620.1)，其编码对应于SEQ ID NO:3的氨基酸序列；通常称为TREM1-204的转录物(ensembl转录物ID ENST00000589614.5)，其编码对应于SEQ IDNO:4的氨基酸序列。

在一个实施方案中，TREM-1转录物编码如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列。在一个实施方案中，TREM-1转录物编码如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列。在一个实施方案中，sTREM-1是SEQ IDNO:1的变体、SEQ ID NO:3的变体或SEQ ID NO:4的变体。

在一个实施方案中，SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4的变体分别是包含以下或由以下组成的氨基酸序列：SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4的氨基酸序列的至少25个连续氨基酸，优选至少50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、165、170、175、180或185个连续氨基酸。在一个实施方案中，SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3或SEQ IDNO:4的变体分别是包含以下或由以下组成的氨基酸序列：SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3或SEQID NO:4的氨基酸序列，以及分别位于SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4的C末端和/或N末端的额外氨基酸，其中额外氨基酸的数量范围为1至50个，优选1至20个，更优选1至10个氨基酸，例如，C末端的1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸和/或N末端的1个、2个、3个、4个、5个、6个、7个、8个、9个或10个氨基酸。在一个实施方案中，SEQ ID NO:1、SEQ IDNO:3或SEQ ID NO:4的变体是典型地分别通过一个或多个氨基酸取代、缺失、添加和/或插入而不同于SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4的氨基酸序列的氨基酸序列。在一个实施方案中，所述取代、缺失、添加和/或插入可影响1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸。在一个实施方案中，SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4的变体是至少25个氨基酸，优选至少50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、165、170、175、180或185个氨基酸的氨基酸序列，其分别与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少60％、65％、70％、75％、80％、90％、95％或至少96％、97％、98％、99％或更高的同一性。在一个实施方案中，SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4的变体分别是与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少60％、65％、70％、75％、80％、90％、95％或至少96％、97％、98％、99％或更高同一性的氨基酸序列。

根据一个实施方案，TREM-1的水平是sTREM-1的水平。

在一个实施方案中，sTREM-1对应于通过蛋白酶，优选基质金属肽酶，更优选基质金属蛋白酶9(MMP9)裂解具有如SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列的膜结合TREM-1而产生的细胞外片段。

在一个实施方案中，sTREM-1具有如SEQ ID NO:5(ATKLTEEKYELKEGQTLDVKCDYTLEKFASSQKAWQIIRDGEMPKTLAC TERPSKNSHPVQVGRIILEDYHDHGLLRVRMVNLQVEDSGLYQCVIYQPP KEPHMLFDRIRLVVTKGFSGTPGSNENSTQNVYKIPPTTTKALCPLYTSPRT VTQAPPKSTADVSTPDSEINLTNVTDIIRVPVFN)所示的氨基酸序列，对应于SEQ ID NO:1的氨基酸21至205。

在一个实施方案中，sTREM-1具有如SEQ ID NO:6(LKEGQTLDVKCDYTLEKFASSQKAWQIIRDGEMPKTLACTERPSKNSHP VQVGRIILEDYHDHGLLRVRMVNLQVEDSGLYQCVIYQPPKEPHMLFDRI RLVVTKGFSGTPGSNENSTQNVYKIPPTTTKALCPLYTSPRTVTQAPPKSTA DVSTPDSEINLTNVTDIIRVPVFN)所示的氨基酸序列，对应于SEQ ID NO:1的氨基酸31至205。

sTREM-1也可以由TREM-1mRNA的选择性剪接产生。Baruah等人在2015年描述了TREM-1剪接变体(J Immunol.2015Dec 15；195(12):5725-31)，并且发现其是从初级和次级人嗜中性粒细胞颗粒分泌的。在一个实施方案中，sTREM-1对应于TREM-1剪接变体。在一个实施方案中，sTREM-1对应于TREM-1转录物，通常称为TREM1-202，也称为TREM-1同工型2，其编码如SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列。在一个实施方案中，sTREM-1因此具有如SEQ IDNO:2(MRKTRLWGLLWMLFVSELRAATKLTEEKYELKEGQTLDVKCDYTLEKF ASSQKAWQIIRDGEMPKTLACTERPSKNSHPVQVGRIILEDYHDHGLLRV RMVNLQVEDSGLYQCVIYQPPKEPHMLFDRIRLVVTKGFRCSTLSFSWLV DS)所示的氨基酸序列。

在一个实施方案中，sTREM-1包含如SEQ ID NO:7(LKEGQTLDVKCDYTLEKFASSQKAWQIIRDGEMPKTLACTERPSKNSHP VQVGRIILEDYHDHGLLRVRMVNLQVEDSGLYQCVIYQPPKEPHMLFDRIRLVVTKGF)所示的氨基酸序列，对应于SEQ ID NO:1的氨基酸31至137，并且长度为200个氨基酸或更短，优选为185个氨基酸或更短。

在一个实施方案中，sTREM-1具有如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列。在一个实施方案中，sTREM-1具有如SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列。

在一个实施方案中，sTREM-1是SEQ ID NO:2的变体、SEQ ID NO:5的变体或SEQ IDNO:6的变体。在一个实施方案中，sTREM-1是SEQ ID NO:5的变体或SEQ ID NO:6的变体。

在一个实施方案中，SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:6的变体是分别包含以下或由以下组成的氨基酸序列：SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:6的氨基酸序列的至少25个连续氨基酸，优选至少50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、165、170、175、180或185个连续氨基酸。在一个实施方案中，SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5或SEQ IDNO:6的变体分别是包含以下或由以下组成的氨基酸序列：SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5或SEQID NO:6的氨基酸序列，以及分别位于SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:6的C末端和/或N末端的额外氨基酸，其中额外氨基酸的数量范围为1至50个，优选1至20个，更优选1至10个氨基酸，例如，C末端的1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸和/或N末端的1个、2个、3个、4个、5个、6个、7个、8个、9个或10个氨基酸。在一个实施方案中，SEQ ID NO:2、SEQ IDNO:5或SEQ ID NO:6的变体是典型地分别通过一个或多个氨基酸取代、缺失、添加和/或插入而不同于SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:6的氨基酸序列的氨基酸序列。在一个实施方案中，所述取代、缺失、添加和/或插入可影响1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸。在一个实施方案中，SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:6的变体是至少25个氨基酸，优选至少50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、165、170、175、180或185个氨基酸的氨基酸序列，其分别与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:6的氨基酸序列具有至少60％、65％、70％、75％、80％、90％、95％或至少96％、97％、98％、99％或更高的同一性。在一个实施方案中，SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:6的变体分别是与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:6的氨基酸序列具有至少60％、65％、70％、75％、80％、90％、95％或至少96％、97％、98％、99％或更高同一性的氨基酸序列。在一个实施方案中，SEQ IDNO:2、SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:6的变体不是SEQ ID NO:1。

在一个实施方案中，sTREM-1是SEQ ID NO:2的片段、SEQ ID NO:5的片段或SEQ IDNO:6的片段。在一个实施方案中，sTREM-1是SEQ ID NO:5的片段或SEQ ID NO:6的片段。

在一个实施方案中，SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:6的片段是分别包含以下或由以下组成的氨基酸序列：SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:6的氨基酸序列的至少25个连续氨基酸，优选至少50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、165、170、175、180或185个连续氨基酸。在一个实施方案中，SEQ ID NO:2的片段是包含以下或由以下组成的氨基酸序列：SEQ ID NO:2的氨基酸序列的至少25个连续氨基酸，优选至少50、60、70、80、90、100、110、120、130、135、140或145个连续氨基酸。在一个实施方案中，SEQ IDNO:5的片段是包含以下或由以下组成的氨基酸序列：SEQ ID NO:5的氨基酸序列的至少25个连续氨基酸，优选至少50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、165、170、175或180个连续氨基酸。在一个实施方案中，SEQ ID NO:6的片段是包含以下或由以下组成的氨基酸序列：SEQ ID NO:6的氨基酸序列的至少25个连续氨基酸，优选至少50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、155、160、165或170个连续氨基酸。

发明人惊讶地发现，在来自受试者的生物样品中测量的sTREM-1水平可以用作所述受试者患有的由冠状病毒导致的疾病的标志物，尤其是作为所述疾病的严重程度和/或并发症的标志物，如本文所述方法中所详述。

在一个实施方案中，冠状病毒是人冠状病毒。在一个实施方案中，冠状病毒是α冠状病毒或β冠状病毒，优选β冠状病毒。

α冠状病毒的实例包括但不限于人冠状病毒229E(HCoV-229E)和人冠状病毒NL63(HCoV-NL63)，有时也称为HCoV-NH或纽黑文(New Haven)人冠状病毒。β冠状病毒的实例包括但不限于人冠状病毒OC43(HCoV-OC43)、人冠状病毒HKU1(HCoV-HKU1)、中东呼吸综合征相关冠状病毒(MERS-CoV)(先前称为新型冠状病毒2012或HCoV-EMC)、严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)(也称为SARS-CoV-1或SARS-经典)和严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV-2)，也称为2019-nCoV或新型冠状病毒2019。

在一个实施方案中，冠状病毒选自包含以下或由以下组成的组：HCoV-229E、HCoV-NL63、HCoV-OC43、HCoV-HKU1、MERS-CoV、SARS-CoV-1和SARS-CoV-2。在一个实施方案中，冠状病毒选自包含以下或由以下组成的组：MERS-CoV、SARS-CoV-1和SARS-CoV-2。

在一个实施方案中，冠状病毒是MERS冠状病毒，尤其是导致中东呼吸综合征(MERS)的MERS-CoV。因此，在一个实施方案中，受试者患有由MERS-CoV导致的MERS。

在一个实施方案中，冠状病毒是SARS冠状病毒。在一个实施方案中，冠状病毒是导致严重急性呼吸综合征(SARS)的SARS-CoV(也称为SARS-CoV-1)或导致COVID-19的SARS-CoV-2。因此，在一个实施方案中，受试者患有由SARS-CoV(也称为SARS-CoV-1)导致的SARS或由SARS-CoV-2导致的COVID-19。在一个实施方案中，冠状病毒是导致COVID-19的SARS-CoV-2。因此，在一个实施方案中，受试者患有由SARS-CoV-2导致的COVID-19。

如本文所用，“SARS-CoV-2”涵盖最初发现的SARS-CoV-2及其任意变种。SARS-CoV-2的变种可能因其任意蛋白中存在一个或多个突变而彼此不同，所述蛋白包括其非结构性复制酶多蛋白及其四种结构蛋白，称为S(刺突)蛋白或糖蛋白、E(包膜)蛋白、M(膜)蛋白和N(核衣壳)蛋白。特别地，SARS-CoV-2的变种可因其S蛋白中存在一个或多个突变而彼此不同。S蛋白的参考序列由1273个氨基酸组成，如SEQ ID NO:14所示，对应于UniProtKB登录号P0DTC2，最后一次修改于2020年4月22日。

如美国疾病控制与预防中心(CDC)所述，SARS-CoV-2变种的实例包括但不限于：

-变种B.1.1.7，也称为Alpha(WHO标签)、VUI–202012/01、VOC-202012/01、20I/501Y.V1，或俗称“UK变种或英国变种或英变种”，包含以下突变(基于序列SEQ ID NO:21):69del、70del、144del、N501Y、A570D、D614G、P681H、T716I、S982A、D1118H和任选的E484K、S494P和/或K1191N；

-变种B.1.351，也称为Beta(WHO标签)、20H/501Y.V2(以前为20C/501Y.V2)，或俗称“南非”变种，包含以下突变(基于序列SEQ ID NO:21)：D80A、D215G、241del、242del、243del、K417N、E484K、N501Y、D614G、A701V；

-变种P.1，也称为Gamma(WHO标签)、20J/501Y.V3，或俗称“巴西变种”，包含以下突变(基于序列SEQ ID NO:21)：L18F、T20N、P26S、D138Y、R190S、K417T、E484K、N501Y、D614G、H655Y、T1027I；

-变种P.2，也称为Zeta(WHO标签)或20J，一种首次在巴西发现的变种，包含以下突变(基于序列SEQ ID NO:21)：E484K、D614G、V1176F和任选的F565L；

-变种B.1.617，也称为20A/484Q，或俗称“印度变种”，包含以下突变(基于序列SEQID NO:21)：L452R、E484Q、D614G；

-变种B.1.617.1，也称为Kappa(WHO标签)或20A/S:154K，一种首次在印度发现的变种，包含以下突变(基于序列SEQ ID NO:21)：G142D、E154K、L452R、E484Q、D614G、P681R、Q1071H和任选的T95I；

-变种B.1.617.2，也称为Delta(WHO标签)或20A/S:478K，一种首次在印度发现的变种，包含以下突变(基于序列SEQ ID NO:21)：T19R、156del、157del、R158G、L452R、T478K、D614G、P681R、D950N和任选的G142D；

-变种B.1.617.3，一种首次在印度发现的变种，包含以下突变(基于序列SEQ IDNO:21)：T19R、G142D、L452R、E484Q、D614G、P681R、D950N；

-变种B.1.427，也称为Epsilon(WHO标签)或20C/S:452R，包含以下突变(基于序列SEQ ID NO:21)：L452R、D614G；

-变种B.1.429，也称为20C/S:452R，包含以下突变(基于序列SEQ ID NO:21)：S13I、W152C、L452R、D614G；

-变种B.1.525，也称为Eta(WHO标签)或20A/S:484K，包含以下突变(基于序列SEQID NO:21)：A67V、69del、70del、144del、E484K、D614G、Q677H、F888L；

-变种B.1.526，也称为Iota(WHO标签)或20C/S:484K，包含以下突变(基于序列SEQID NO:21)：T95I、D253G、D614G和任选的L5F、S477N、E484K和/或A701V；和

-变种B.1.526.1，也称为20C，包含以下突变(基于序列SEQ ID NO:21)：D80G、144del、F157S、L452R、D614G、D950H和任选的T791I和/或T859N。

因此，在一个实施方案中，受试者患有由SARS-CoV-2或SARS-CoV-2的任意变种导致的COVID-19。在一个实施方案中，受试者患有由SARS-CoV-2变种导致的COVID-19，所述SARS-CoV-2变种选自包含以下或由以下组成的组：变种B.1.1.7(Alpha)、变种B.1.351(Beta)、变种P.1(Gamma)、变种P.2(Zeta)、变种B.1.617、变种B.1.617.1(Kappa)、变种B.1.617.2(Delta)和/或变种B.1.617.3。在一个实施方案中，受试者患有由SARS-CoV-2变种B.1.1.7(Alpha)导致的COVID-19。在一个实施方案中，受试者患有由SARS-CoV-2变种B.1.617或任意相关变种B.1.617.1(Kappa)、B.1.617.2(Delta)和/或B.1.617.3导致的COVID-19。

在一个实施方案中，患有上述冠状病毒导致的疾病的受试者不住院。在一个实施方案中，患有上述冠状病毒导致的疾病的受试者住院。

在一个实施方案中，患有上述冠状病毒导致的疾病的受试者住院，但不需要入住重症监护室(ICU)。在一个实施方案中，患有上述冠状病毒导致的疾病的受试者住院，并需要入住ICU。在一个实施方案中，患有上述冠状病毒导致的疾病的受试者住院到ICU。

在一个实施方案中，患有上述冠状病毒导致的疾病的受试者住院，并且不需要呼吸支持。在一个实施方案中，患有上述冠状病毒导致的疾病的受试者住院，并且需要呼吸支持。

在一个实施方案中，患有上述冠状病毒导致的疾病的受试者住院，并且需要非侵入性通气(NIV)。在一个实施方案中，患有上述冠状病毒导致的疾病的受试者住院，并且需要侵入性机械通气(IMV)。在一个实施方案中，患有上述冠状病毒导致的疾病的受试者住院到ICU，并且需要呼吸支持。在一个实施方案中，患有上述冠状病毒导致的疾病的受试者住院到ICU，并且需要IMV。在一个实施方案中，患有上述冠状病毒导致的疾病的受试者住院到ICU，并且接受IMV。在一个实施方案中，患有上述冠状病毒导致的疾病的受试者住院到ICU，并且已经接受IMV少于6小时、少于12小时、少于18小时、少于24小时、少于30小时、少于36小时、少于42小时或少于48小时，优选少于48小时。

在一个实施方案中，受试者患有与上述冠状病毒导致的疾病相关的急性呼吸衰竭或急性呼吸窘迫综合征(ARDS)。

在一个实施方案中，受试者是男性。在一个实施方案中，受试者是女性。

在一个实施方案中，受试者是成年人。因此，在一个实施方案中，受试者年龄大于18、19、20或21岁。在一个实施方案中，受试者是儿童。因此，在一个实施方案中，受试者年龄小于18、17、16或15岁。

在一个实施方案中，受试者年龄小于85、80、75、70、65或60岁。在一个实施方案中，受试者为85岁或更小。在一个实施方案中，受试者年龄大于60、65或70岁。在一个实施方案中，受试者年龄大于60、65或70岁且小于85岁。在一个实施方案中，受试者为60岁或更大。在一个实施方案中，受试者为60岁或更大且小于85岁。

在一个实施方案中，受试者患有至少一种共病。

如本文所用，“共病”是指在患有由冠状病毒导致的疾病的受试者中共存的疾病或病况。

可在患有由冠状病毒导致的疾病的受试者中共存的共病的实例包括但不限于哮喘、自身免疫或自身炎性疾病或病况、心血管疾病或病况、慢性支气管炎、慢性肾病、慢性肝病、慢性阻塞性肺病(COPD)、囊性纤维化、糖尿病、肺气肿、高血压、免疫缺陷、恶性肿瘤(即癌症)、肥胖、肺动脉高压和严重呼吸系统疾病。

在一个实施方案中，受试者表现出至少一种选自包含以下或由以下组成的组的共病：哮喘、自身免疫或自身炎性疾病或病况、心血管疾病或病况、慢性支气管炎、慢性肾病、慢性肝病、慢性阻塞性肺病(COPD)、囊性纤维化、糖尿病、肺气肿、高血压、免疫缺陷、恶性肿瘤(即癌症)、肥胖、肺动脉高压和严重呼吸系统疾病。

根据本文所述的方法，在如上所述的受试者的生物样品中测量TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。

如本文所用，“生物样品”是指从受试者分离、收集或收获的生物样品，可示例性地包括但不限于体液、细胞样品和/或组织提取物，例如从受试者获得的匀浆或溶解的组织。

在一个实施方案中，本发明不包括从受试者获得生物样品。因此，在一个实施方案中，来自受试者的生物样品是先前从受试者获得的生物样品。所述生物样品在如本文所述使用之前可以在适当的条件下保存。

在一个实施方案中，来自受试者的生物样品是体液样品。体液的实例包括但不限于血液、血浆、血清、淋巴、尿液、支气管肺泡灌洗液、脑脊液、汗液或任何其他身体分泌物或其衍生物。

根据本发明，“血液”包括全血、血浆、血清、循环上皮细胞、血液的成分或任何其他血液衍生物。

在一个实施方案中，来自受试者的生物样品是血液样品。在一个实施方案中，来自受试者的生物样品是全血样品或血浆样品。用于获得血浆样品的方法常规用在临床实验室中。在一个实施方案中，处理来自受试者的全血样品或血浆样品以获得血清样品。用于从全血样品或血浆样品获得血清样品的方法常规用在临床实验室中。

在一个实施方案中，生物样品是血液样品、血浆样品或血清样品。因此，在一个实施方案中，TREM-1，尤其是sTREM-1的水平是血液水平、血浆水平或血清水平。

在一个实施方案中，来自受试者的生物样品是组织提取物。组织提取物通常从组织活检和尸检材料中获得。

如本文所用，“TREM-1水平”，尤其是“sTREM-1水平”中的术语“水平”是指TREM-1，尤其是sTREM-1的表达水平。它也可以指TREM-1，尤其是sTREM-1的转录水平(即mRNA或cDNA的水平)；或指TREM-1，尤其是sTREM-1的翻译水平(即蛋白水平)。表达水平可以在细胞内或细胞外检测。

根据本发明，TREM-1，尤其是sTREM-1的水平可以通过本领域中任何已知方法来测量。用于测量表达水平如转录水平或翻译水平的方法是本领域技术人员公知的。

在一个实施方案中，“TREM-1水平”，尤其是“sTREM-1水平”中的术语“水平”是指TREM-1，尤其是sTREM-1的数量、量或浓度。因此，在来自受试者的生物样品中测量的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平是指所述生物样品中TREM-1，尤其是sTREM-1的数量、量或浓度。

根据一个实施方案，TREM-1，尤其是sTREM-1的水平是指蛋白水平、蛋白数量、蛋白量或蛋白浓度。

在一个实施方案中，TREM-1的水平是指上文所述的SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3和/或SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列和/或其变体的水平。

在一个实施方案中，TREM-1的水平是sTREM-1的水平。

在一个实施方案中，sTREM-1的水平是指上文所述的SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:5和/或SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列和/或其片段和/或其变体的水平。在一个实施方案中，sTREM-1的水平是指上文所述的SEQ ID NO:5和/或SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列和/或其片段和/或其变体的水平。

测量TREM-1，尤其是sTREM-1的翻译水平(即TREM-1蛋白或sTREM-1蛋白的水平)的方法是本领域技术人员熟知的，包括但不限于免疫组织化学、多重方法(如)、免疫测定、蛋白质印迹、酶联免疫吸附测定(ELISA)、夹心ELISA、多重ELISA、基于毛细管的ELISA(如平台)、电化学发光(ECL)(也称为电产生的化学发光或电化学发光免疫测定(ECLIA))、酶联荧光测定(ELFA)、荧光联免疫吸附测定(FLISA)、酶免疫测定(EIA)、放射免疫测定(RIA)、流式细胞术(FACS)、表面等离子共振(SPR)、生物层干涉法(BLI)、免疫色谱测定(ICA)(如NEXUS IB10，Sphinotech)和基于质谱的方法。

通常，如上文所述的测量生物样品中TREM-1蛋白，尤其是sTREM-1蛋白的水平可包括使生物样品与能够选择性与生物样品中的TREM-1或sTREM-1相互作用的结合配偶体接触。

在一个实施方案中，如上文所述的测量生物样品中TREM-1蛋白，尤其是sTREM-1蛋白的水平包括使用抗体，例如多克隆或单克隆抗体。

允许检测TREM-1，尤其是sTREM-1的抗体的实例包括但不限于针对人TREM-1的Met1-Arg200氨基酸产生的多克隆抗体(来自R&D Systems，编号AF1278)、针对人TREM-1的Ala21-Asn205产生的单克隆抗体(来自R&DSystems，编号MAB1278)、纯化的抗人CD354(TREM-1)抗体(克隆TREM-26，来自BioLegend，编号314902)、纯化的抗人CD354(TREM-1)抗体(克隆TREM-37，来自BioLegend，编号316102)、单克隆小鼠抗人sTREM1(克隆15G7，来自USBio，编号298099)、小鼠抗人TREM1(克隆2E2，来自USBio，编号134704)。允许检测sTREM-1的抗体的其他非限制性实例包括以下专利或专利申请中描述的sTREM-1和/或TREM-1抗体：US2013/150559、US 2013/211050、US 2013/309239、WO2013/120553和US8,106,165。

在一个实施方案中，如上所述的测量生物样品中TREM-1，尤其是sTREM-1的水平，尤其是sTREM-1蛋白的水平包括使用ELISA、ECLIA或ELFA。

因此，ELISA可用于测量生物样品中TREM-1，尤其是sTREM-1的水平，其中例如，测定板的孔被至少一种识别TREM-1或sTREM-1的抗体所包被。然后将含有或怀疑含有TREM-1或sTREM-1的生物样品添加到包被的孔中。在孵育一段足以允许形成抗体-TREM-1复合物或抗体-sTREM-1复合物的时间后，可以洗涤板以去除未结合的部分，并添加具有可检测标记的二级结合分子，例如与辣根过氧化物酶(HRP)偶联的识别TREM-1或sTREM-1的第二抗体。二级结合分子可以与任何捕获的抗体-TREM-1复合物或抗体-sTREM-1复合物反应，洗涤平板并使用本领域公知的方法检测二级结合分子的存在。可以理解，可以使用商业测定酶联免疫吸附测定(ELISA)试剂盒。因此，ELISA的实例包括但不限于TREM-1Quantikine ELISA试剂盒(来自R&D Systems，编号DTRM10C)；人TREM-1DuoSet(来自R&D Systems，编号DY1278B和DY1278BE)、sTREM-1ELISA(来自iQProducts，编号sTREM-1ELISA)。

ECLIA也可用于测量生物样品中TREM-1，尤其是sTREM-1的水平，其中例如含有或怀疑含有TREM-1或sTREM-1的生物样品与至少两种在不同表位上识别TREM-1或sTREM-1的抗体孵育，以形成夹心抗体-TREM-1或抗体-sTREM-1复合物，其中一种抗体被生物素化(即捕获抗体)，另一种抗体用钌复合物标记(即检测抗体)。在孵育一段足以允许形成夹心复合物的时间之后，添加链霉亲和素包被的微粒(例如，链霉亲和素包被的磁珠)，使得夹心复合物通过生物素和链霉亲和素的相互作用而与颗粒结合。一旦在分析仪的测量池中，微粒就通过磁性被捕获到电极表面上。去除未结合的部分并向电极施加电压，从而激发钌复合物，后者在620nm处发射光。发射的光由分析仪测量池中的光电倍增管测量。此类ECLIA的实例包括(Roche Diagnostics)。

ELFA也可用于测量生物样品中TREM-1，尤其是sTREM-1的水平，其中例如容器被至少一种识别TREM-1或sTREM-1的抗体所包被。然后将含有或怀疑含有TREM-1或sTREM-1的生物样品添加到容器中。在孵育一段足以允许形成抗体-TREM-1复合物或抗体-sTREM-1复合物的时间后，可以洗涤容器以去除未结合的部分，并添加用酶(例如碱性磷酸酶)标记的二级结合分子。二级结合分子可以与任何捕获的抗体-TREM-1复合物或抗体-sTREM-1复合物反应，洗涤容器，并通过测量在添加酶底物(例如4-甲基-伞形酮磷酸酯)后发射的荧光来检测二级结合分子的存在，所述酶底物在被酶水解后发荧光。ELFA的实例包括(Biomérieux)。

根据一个实施方案，TREM-1，尤其是sTREM-1的水平，是指核酸水平、核酸数量、核酸量或核酸浓度。在一个实施方案中，核酸是RNA，优选mRNA或cDNA。

在一个实施方案中，TREM-1的水平是TREM-1转录物的水平。

在一个实施方案中，TREM-1核酸的水平是指编码如上所述的SEQ ID NO:1、SEQ IDNO:3和/或SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列和/或其变体的mRNA或cDNA水平。

在一个实施方案中，TREM-1的水平是sTREM-1的水平。

在一个实施方案中，sTREM-1核酸的水平是指编码如上所述的SEQ ID NO:2、SEQID NO:5和/或SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列和/或其片段和/或其变体的mRNA或cDNA水平。在一个实施方案中，sTREM-1核酸的水平是指编码如上所述的SEQ ID NO:5和/或SEQ IDNO:6所示的氨基酸序列和/或其片段和/或其变体的mRNA或cDNA水平。

测量如上所述生物样品中的TREM-1，尤其是sTREM-1的转录水平(即TREM-1mRNA或cDNA，尤其是sTREM-1mRNA或cDNA的水平)的方法是本领域技术人员公知的，包括但不限于PCR、qPCR、RT-PCR、RT-qPCR、northern印迹、杂交技术如使用微阵列，及其组合，包括但不限于通过RT-PCR获得的扩增子的杂交，测序例如下一代DNA测序(NGS)或RNA-seq(也称为“全转录组鸟枪测序”)。

在一个实施方案中，使用分别具有如SEQ ID NO:8和SEQ ID NO:9所示的核苷酸序列的正向引物和反向引物来测量TREM-1，尤其是sTREM-1的核酸水平。在一个实施方案中，使用分别具有如SEQ ID NO:10和SEQ ID NO:11所示的核苷酸序列的正向引物和反向引物来测量TREM-1，尤其是sTREM-1的核酸水平。在一个实施方案中，使用分别具有如SEQ IDNO:12和SEQ ID NO:13所示的核苷酸序列的正向引物和反向引物来测量TREM-1，尤其是sTREM-1的核酸水平。

在一个实施方案中，测量如上所述生物样品中的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平是基线水平，即基线TREM-1，尤其是基线sTREM-1的水平。在一个实施方案中，基线水平是在开始医疗护理之前、治疗施用开始之前或开始时、住院时、入住重症监护室(ICU)时或开始机械通气时从受试者获得的生物样品中测得的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。在一个实施方案中，基线水平是在如上所述冠状病毒导致的疾病的诊断之后，尤其是在如上所述冠状病毒导致的疾病在医院诊断之后测得的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。在一个实施方案中，基线水平是在住院第一天测量的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。在一个实施方案中，基线水平是住院到ICU第一天测量的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。在一个实施方案中，基线水平是在机械通气第一天测量的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。

在一个实施方案中，如上所述生物样品中测量的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平是在住院后的(或在住院后小于12小时、24小时、36小时、48小时、60小时或72小时从受试者获得的如上所述的生物样品中测量的)，尤其是在入住重症监护室(ICU)后的，或在开始机械通气后的小于12小时、24小时、36小时、48小时、60小时或72小时测量的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。在一个实施方案中，在如上所述的生物样品中测量的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平是在住院后的(或在住院后12小时、24小时、36小时、48小时、60小时或72小时从受试者获得的如上所述的生物样品中测量的)，尤其是在入住重症监护室(ICU)后的，或在开始机械通气后的12小时、24小时、36小时、48小时、60小时或72小时测量的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。

在一个实施方案中，如上所述生物样品中测量的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平是在住院后的(或在住院后第1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20或21天从受试者获得的如上所述的生物样品中测量的)，尤其是在入住重症监护室(ICU)后的，或在开始机械通气后的第1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20或21天测量的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。换言之，在一个实施方案中，如上所述生物样品中测量的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平是在住院后的(或在住院后第一、二、三、四、五、六或七天从受试者获得的如上所述的生物样品中测量的)，尤其是在入住重症监护室(ICU)后的，或在开始机械通气后的第一、二、三、四、五、六或七天测量的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。

在一个实施方案中，如上所述生物样品中测量的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平是在住院后的(或在住院后第3天从受试者获得的如上所述的生物样品中测量的)，尤其是在入住重症监护室(ICU)后的，或在开始机械通气后的第3天测量的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。换言之，在一个实施方案中，如上所述生物样品中测量的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平是在住院后的(或在住院后第三天从受试者获得的如上所述的生物样品中测量的)，尤其是在入住重症监护室(ICU)后的，或在开始机械通气后的第三天测量的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。

根据本文所述的方法，将上文所述受试者的生物样品中测得的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平与参考值进行比较。

根据一个实施方案，参考值是参考TREM-1水平，尤其是参考sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

根据一个实施方案，使用酶联免疫吸附测定(ELISA)来确定参考TREM-1水平，尤其是参考sTREM-1水平。

根据一个实施方案，使用给定方法或测定确定的参考TREM-1水平，尤其是参考sTREM-1水平涵盖了使用另一种方法或测定确定的相应参考TREM-1水平，尤其是相应参考sTREM-1水平。根据用给定方法或测定获得的水平，本领域技术人员将知晓如何确定用另一种方法或测定获得的相应水平。这样做的方法包括例如(i)用两种不同的方法或测定测量从给定参考群体(例如本文所述的参考群体)的受试者获得的样品中的水平，从而获得所述给定参考群体的两组测量；和(ii)确定获得的给定参考群体的两组测量之间的相关性。

在一个实施方案中，使用ELISA确定的参考TREM-1水平，尤其是参考sTREM-1水平涵盖了使用另一种免疫测定(如电化学发光免疫测定(ECLIA)或酶联荧光测定(ELFA))确定的相应的参考TREM-1水平，尤其是相应的参考sTREM-1水平。在一个实施方案中，使用ELISA确定的参考TREM-1水平，尤其是参考sTREM-1水平涵盖了使用ECLIA确定的相应的参考TREM-1水平，尤其是相应的参考sTREM-1水平。

在一个实施方案中，参考值源自参考群体。在一个实施方案中，参考值源自群体研究，包括例如具有相似年龄范围的受试者，或相同或相似种族群体的受试者。

根据一个实施方案，参考值源自从一个或多个基本健康的受试者获得的生物样品中TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平的测量。在一个实施方案中，“基本健康的受试者”是指未被诊断或鉴定为具有或患有由冠状病毒导致的疾病的受试者。在一个实施方案中，“基本健康的受试者”是指未被诊断或鉴定为具有或患有由冠状病毒或任何其他感染导致的疾病的受试者。在一个实施方案中，“基本健康的受试者”是指未被诊断或鉴定为具有或患有由冠状病毒导致的疾病或诱导免疫系统应答的任何其他疾病或诱导TREM-1通路激活的任何其他疾病的受试者。因此，在一个实施方案中，参考值是源自基本健康的受试者的参考群体的参考TREM-1水平，尤其是参考sTREM-1水平。

在一个实施方案中，源自基本健康的受试者的参考群体的参考值是范围为约20pg/mL至约500pg/mL，优选约50pg/mL至约250pg/mL，更优选约100pg/mL至约200pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，源自基本健康的受试者的参考群体的参考值是使用ELISA确定的范围为约20pg/mL至约500pg/mL，优选约50pg/mL至约250pg/mL，更优选约100pg/mL至约200pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应TREM-1水平，尤其是相应sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

在一个实施方案中，源自基本健康的受试者的参考群体的参考值是使用ECLIA确定的范围为约50pg/mL至约500pg/mL，优选约200pg/mL至约450pg/mL，更优选约250pg/mL至约400pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ELISA确定的相应TREM-1水平，尤其是相应sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

在一个实施方案中，源自基本健康的受试者的参考群体的参考值是约50、75、100、125、150、175、200、225或250pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，源自基本健康的受试者的参考群体的参考值是使用ELISA确定的约50、75、100、125、150、175、200、225或250pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，源自基本健康的受试者的参考群体的参考值是约50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、105、110、115、120、125、130、135、140、145或150pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，源自基本健康的受试者的参考群体的参考值是使用ELISA确定的约50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、105、110、115、120、125、130、135、140、145或150pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，源自基本健康的受试者的参考群体的参考值是约80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119或120pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，源自基本健康的受试者的参考群体的参考值是使用ELISA确定的约80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119或120pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

在一个实施方案中，源自基本健康的受试者的参考群体的参考值是使用ECLIA确定的约200、205、210、215、220、225、230、235、240、245、250、255、260、265、270、275、280、285、290、295、300、305、310、315、320、325、330、335、340、345、350、355、360、365、370、375、380、385、390、395、400、405、410或415pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ELISA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

根据一个实施方案，参考值源自来自被诊断或鉴定为患有或已患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是由SARS-CoV-2导致的COVID-19的一个或多个受试者的生物样品中的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平的测量。因此，在一个实施方案中，参考值是参考TREM-1水平，尤其是参考sTREM-1水平，其源自被诊断或鉴定为患有或已患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是由SARS-CoV-2导致的COVID-19的受试者的参考群体。

在一个实施方案中，参考值可以源自通过由冠状病毒导致的疾病，尤其是由SARS-CoV-2导致的COVID-19的数学算法和计算指数(computed indice)获得的，上文所述的参考群体的统计学分析和/或风险预测数据。

在一个实施方案中，上文所述的源自参考群体的参考值是所述参考群体的平均TREM-1水平，尤其是平均sTREM-1水平。在一个实施方案中，上文所述的源自参考群体的参考值是所述参考群体的中值TREM-1水平，尤其是中值sTREM-1水平。

在一个实施方案中，上文所述的源自参考群体的参考值是所述参考群体的TREM-1三分位数(tercile或tertile)，尤其是sTREM-1三分位数，即所述参考群体的第一TREM-1三分位数，尤其是第一sTREM-1三分位数，或第二TREM-1三分位数，尤其是第二sTREM-1三分位数。

根据本发明的这个实施方案：

-第一三分位数对应的TREM-1值或sTREM-1值为：在参考群体中测量的TREM-1或sTREM-1水平有三分之一低于该值，并且在参考群体中测量的TREM-1或sTREM-1水平有三分之二高于该值；和

-第二三分位数对应的TREM-1值或sTREM-1值为：在参考群体中测量的TREM-1或sTREM-1水平有三分之二低于该值，并且在参考群体中测量的TREM-1或sTREM-1水平有三分之一高于该值。

在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是范围为约20pg/mL至约6000pg/mL，优选约30pg/mL至约2000pg/mL、更优选约50pg/mL至约1000pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是使用ELISA确定的范围为约20pg/mL至约6000pg/mL，优选约30pg/mL至约2000pg/mL、更优选约50pg/mL至约1000pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是范围为约50pg/mL至约800pg/mL，优选约75pg/mL至约600pg/mL，更优选约100pg/mL至约400pg/mL，甚至更优选约130pg/mL至约400pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是使用ELISA确定的范围为约50pg/mL至约800pg/mL，优选约75pg/mL至约600pg/mL，更优选约100pg/mL至约400pg/mL，甚至更优选约130pg/mL至约400pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是范围为约130pg/mL至约600pg/mL，优选约200pg/mL至约500pg/mL、更优选约250pg/mL至约400pg/mL，甚至更优选约300pg/mL至约375pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是使用ELISA确定的范围为约130pg/mL至约600pg/mL，优选约200pg/mL至约500pg/mL、更优选约250pg/mL至约400pg/mL，甚至更优选约300pg/mL至约375pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是使用ECLIA确定的范围为约350pg/mL至约1200pg/mL，优选约600pg/mL至约1100pg/mL、更优选约700pg/mL至约1000pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ELISA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是约75、100、125、150、175、200、225、250、275、300、325、350、375或400pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是使用ELISA确定的约75、100、125、150、175、200、225、250、275、300、325、350、375或400pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是约130、135、140、145、150、155、160、165、170、175、180、185、190、195、200、205、210、215、220、225、230、235、240、245、250、255、260、265、270、275、280、285、290、295、300、305、310、315、320、325、330、335、340、345、350、355、360、365、370、375、380、385、390、395、400、405、410、415、420、425或430pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是约300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332，333、334、335、336、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351、352、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、367、368、369、370、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、381、382、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397、398、399或400pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是如使用ECLIA确定的约700、705、710、715、720、725、730、735、740、745、750、755、760、765、770、775、780、785、790、795、800、805、810、815、820、825、830、835、840、845、850，855、860、865、870、875、885、890、895、900、905、910、915、920、925、930、935、940、945、950、955、960、965、970、975、980、985、990、995或1000pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ELISA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

根据一个实施方案，参考值是个体化参考值，即参考值是从所述受试者获得的生物样品中测量的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平。

在一个实施方案中，个体化参考值是在基线从所述受试者获得的生物样品中测量的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，即基线TREM-1水平，尤其是基线sTREM-1水平。在一个实施方案中，基线水平是在开始医疗护理之前从受试者获得的生物样品中测量的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平。在一个实施方案中，基线水平是在住院时或入住ICU时从受试者获得的生物样品中测量的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平。在一个实施方案中，基线水平是在如上所述由冠状病毒导致的疾病的诊断之后，尤其是在如上所述由冠状病毒导致的疾病的医院诊断之后测量的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平。在一个实施方案中，基线水平是在治疗施用之前或开始时，尤其是在施用本文所述的TREM-1抑制剂之前或开始时从受试者获得的生物样品中测量的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平。

根据一个实施方案，本文所述的方法进一步包括测量如上所述受试者的生物样品中的至少另一种生物标志物的水平，并将在来自受试者的生物样品中测量的所述至少另一种生物标志物的水平与本文所述的参考值进行比较。

在一个实施方案中，本文所述的方法进一步包括本文所述的测量来自受试者的生物样品中的白介素-6(IL-6)的水平，并将在来自受试者的生物样品中测量的IL-6水平与IL-6参考值进行比较。

IL-6是一种细胞因子，其对炎症、免疫应答和造血有显著影响。用于测量IL-6水平的方法是本领域技术人员公知的，并且包括但不限于免疫组织化学、多重方法、免疫测定、蛋白质印迹、酶联免疫吸附测定(ELISA)、夹心ELISA、多重ELISA、基于毛细管的ELISA、电化学发光免疫测定(ECLIA)、酶联荧光测定(ELFA)、荧光联免疫吸附测定(FLISA)、酶免疫测定(EIA)、放射免疫测定(RIA)、流式细胞术(FACS)、表面等离子共振(SPR)、生物层干涉法(BLI)、免疫色谱测定(ICA)和基于质谱的方法。

根据一个实施方案，IL-6参考值是参考IL-6水平，优选血液、血浆或血清水平。

根据一个实施方案，使用酶联免疫吸附测定(ELISA)来确定参考IL-6水平。

如上所述，本领域技术人员众所周知，蛋白水平的测量可能会根据用于确定所述测量的方法或测定而变化。因此，根据一个实施方案，使用给定方法或测定确定的参考IL-6水平涵盖了使用另一种方法或测定确定的相应参考IL-6水平。在一个实施方案中，使用ELISA确定的参考IL-6水平涵盖了使用另一种免疫测定如电化学发光免疫测定(ECLIA)或酶联荧光测定(ELFA)确定的相应参考IL-6水平。在一个实施方案中，使用ELISA确定的参考IL-6水平涵盖了使用ECLIA确定的相应参考IL-6水平。

在一个实施方案中，IL-6参考值源自如上所述从一个或多个基本健康的受试者获得的生物样品中的IL-6水平的测量。在一个实施方案中，IL-6参考值源自如上所述基本健康的受试者的参考群体。

在一个实施方案中，IL-6参考值源自从一个或多个被诊断或鉴定为患有或已患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是由SARS-CoV-2导致的COVID-19的受试者获得的生物样品中的IL-6水平的测量。在一个实施方案中，IL-6参考值源自被诊断或鉴定为患有或已患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是由SARS-CoV-2导致的COVID-19的受试者的参考群体。

在一个实施方案中，IL-6参考值是约20pg/mL至约800pg/mL，优选约50pg/mL至约500pg/mL、更优选约100pg/mL至约400pg/mL，甚至更优选约200pg/mL至约300pg/mL范围内的IL-6水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，IL-6参考值是约100、105、110、115、120、125、130、135、140、145、150、155、160、165、170、175、180、185、190、195、200、205、210、215、220、225、230、235、240、245、250、255、260、265、270、275、280、285、290、295、300、305、310、315、320、325、330、335、340、345、350、355、360、370、375、380、385、390、395或400pg/mL的IL-6水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，IL-6参考值是约200、201、202、203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299或300pg/mL的IL-6水平，优选血液、血浆或血清水平。

在一个实施方案中，如上所述的IL-6水平，优选血液、血浆或血清水平是使用ELISA确定的，或者是使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应IL-6水平，优选血液、血浆和血清水平。

本发明的一个目的是一种用于鉴定如上所述患有由冠状病毒导致的疾病的受试者为具有以下风险的体外方法，所述风险为具有由冠状病毒导致的疾病的严重形式和/或并发症，或发展由冠状病毒导致的疾病的严重形式和/或并发症，和/或死亡，所述方法包括以下或由以下组成：

-测量如上所述受试者的生物样品中的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平；和

-将来自受试者的生物样品中测量的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平与如上所述的参考值进行比较。

在一个实施方案中，本发明涉及一种用于鉴定患有COVID-19的受试者为具有以下风险的体外方法，所述风险为具有COVID-19的严重形式和/或并发症，或发展COVID-19的严重形式和/或并发症，和/或死亡，所述方法包括以下或由以下组成：

-测量如上所述受试者的生物样品中的sTREM-1水平；和

-将来自受试者的生物样品中测量的sTREM-1水平与如上所述的参考值进行比较。

在一个实施方案中，将由冠状病毒导致的疾病的严重形式，尤其是COVID-19的严重形式定义为需要住院。在一个实施方案中，将由冠状病毒导致的疾病的严重形式，尤其是COVID-19的严重形式定义为需要入住ICU。

在一个实施方案中，将由冠状病毒导致的疾病的严重形式，尤其是COVID-19的严重形式定义为需要如上所述的呼吸支持。在一个实施方案中，呼吸支持选自包括以下或由以下组成的组：通过面罩或鼻叉补充氧气、正压、高流量鼻氧(也称为氧气治疗)；非侵入性通气(NIV)；需要气管插管和/或气管切开术的侵入性机械通气(IMV)；和体外膜肺氧合(ECMO)。在一个实施方案中，将由冠状病毒导致的疾病的严重形式，尤其是COVID-19的严重形式定义为需要如上所述的侵入性机械通气。在一个实施方案中，将由冠状病毒导致的疾病的严重形式，尤其是COVID-19的严重形式定义为需要延长的呼吸支持，尤其是延长的侵入性机械通气。

在一个实施例中，延长的呼吸支持，尤其是延长的侵入性机械通气是持续至少5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20天，优选至少15天的呼吸支持，尤其是侵入性机械通气。在一个实施方案中，延长的呼吸支持，尤其是延长的侵入性机械通气是持续至少1、2、3、4或5周，优选至少2周的呼吸支持，尤其是侵入性机械通气。在一个实施方案中，延长的呼吸支持，尤其是延长的侵入性机械通气是持续超过5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20天，优选超过15天的呼吸支持，尤其是侵入性机械通气。在一个实施方案中，延长的呼吸支持，尤其是延长的侵入性机械通气是持续超过1、2、3、4或5周，优选超过2周的呼吸支持，尤其是侵入性机械通气。

由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的并发症的实例包括但不限于呼吸衰竭，包括急性呼吸衰竭或急性呼吸窘迫综合征(ARDS)；需要氧气治疗(包括非侵入性通气)的呼吸衰竭；需要机械通气的呼吸衰竭；持续的呼吸衰竭，包括需要延长的机械通气，尤其是持续超过15天的延长的机械通气，以及拔管失败；继发感染或超感染；血栓并发症(也称为血栓栓塞并发症或血栓栓塞事件)，包括静脉和/或动脉血栓栓塞、深静脉血栓形成、肺栓塞和脑血管意外；心脏循环系统衰竭(也可称为心血管衰竭)；肾衰竭，包括急性肾损伤(AKI)；肝衰竭；以及它们的任何组合。

在一个实施方案中，由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的一种或多种并发症选自包括以下或由以下组成的组：呼吸衰竭、持续的呼吸衰竭、继发感染或超感染、血栓并发症(也称为血栓栓塞并发症)、心脏循环系统衰竭(也可称为心血管衰竭)、肾衰竭、肝衰竭。在一个实施方案中，由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的并发症选自包括以下或由以下组成的组：呼吸衰竭，包括急性呼吸衰竭或急性呼吸窘迫综合征(ARDS)；需要氧气治疗(包括非侵入性通气)的呼吸衰竭；需要机械通气的呼吸衰竭；持续的呼吸衰竭，包括需要延长的机械通气，尤其是持续超过15天的延长的机械通气，以及拔管失败；继发感染或超感染；血栓并发症也称为血栓栓塞并发症或血栓栓塞事件，包括静脉和/或动脉血栓栓塞、深静脉血栓形成、肺栓塞和脑血管意外；心脏循环系统衰竭(也可称为心血管衰竭)；肾衰竭，例如急性肾损伤(AKI)；肝衰竭；以及它们的任何组合。

在一个实施方案中，由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的并发症是呼吸衰竭。在一个实施方案中，由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的并发症是需要氧气治疗的呼吸衰竭、需要机械通气的呼吸衰竭、急性呼吸衰竭和/或急性呼吸窘迫综合征(ARDS)。在一个实施方案中，由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的并发症是持续的呼吸衰竭，包括需要如上文定义的延长的机械通气，以及拔管失败。

在一个实施方案中，当受试者表现出肺炎或菌血症的临床、实验室或放射学体征或症状时，诊断为继发感染，任选地通过阳性培养来验证。

在一个实施方案中，血栓并发症(也称为血栓栓塞并发症或血栓栓塞事件)包括以下或由以下组成：静脉和/或动脉血栓栓塞、深静脉血栓形成、肺栓塞和/或脑血管意外。

在一个实施方案中，急性呼吸窘迫综合征(ARDS)根据柏林定义(ARDS DefinitionTask Force,Ranieri等人,JAMA.2012；307(23):2526-2533.)进行诊断。

在一个实施方案中，急性肾损伤根据改善全球肾病结局(KDIGO)临床实践指南(Khwaja,Nephron Clin Pract.2012；120(4):c179-c184)进行诊断。

在一个实施方案中，心力衰竭被定义为存在以下一项或多项：肌钙蛋白的血清水平升高、脑型钠尿肽(brain type natriuretic peptide，BNP)的血清水平升高、心力衰竭的临床或放射学特征和/或需要心脏功能的药理学或机械支持。

在一个实施方案中，血管功能障碍被定义为以下一项或多项：临床或实验室的血管舒张特征、全身血管阻力或血压低、和/或维持足够血压需要血管加压药。

在一个实施方案中，当肌钙蛋白的血清水平大于12pg/mL或需要血管加压药时，诊断为心脏循环系统衰竭(cardiocirculatory failure)。

在一个实施方案中，患有由冠状病毒导致的疾病，尤其COVID-19的受试者的死亡风险是全因死亡风险。在一个实施方案中，患有由冠状病毒导致的疾病，尤其COVID-19的受试者的死亡风险是来自由冠状病毒导致的疾病，尤其COVID-19的症状或并发症的死亡风险。在一个实施方案中，患由冠状病毒导致的疾病，尤其COVID-19的受试者的死亡风险是冠状病毒感染后，尤其是SARS-CoV-2感染后发生的死亡风险。

在一个实施方案中，在来自受试者的生物样品中测得的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平高于上文所述的参考值则表明具有以下风险，所述风险为具有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式和/或并发症，或发展由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式和/或并发症，和/或死亡。

在一个实施方案中，参考值源自如上所述自一个或多个基本健康的受试者获得的生物样品中的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平的测量。在一个实施方案中，参考值是源自基本健康的受试者的参考群体的参考sTREM-1水平。

在一个实施方案中，所述参考值是约20pg/mL至约500pg/mL，优选约50pg/mL至约250pg/mL，更优选约100pg/mL至约200pg/mL范围内的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，所述参考值是使用ELISA确定的约20pg/mL至约500pg/mL，优选约50pg/mL至约250pg/mL，更优选约100pg/mL至约200pg/mL范围内的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，所述参考值是约50、75、100、125、150、175、200、225或250pg/mL的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，所述参考值是使用ELISA确定的约50、75、100、125、150、175、200、225或250pg/mL的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

在一个实施方案中，源自基本健康的受试者的参考群体的参考值是使用ECLIA确定的约50pg/mL至约500pg/mL，优选约200pg/mL至约450pg/mL,更优选约250pg/mL至约400pg/mL范围内的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ELISA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

在一个实施方案中，源自基本健康的受试者的参考群体的参考值是约50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、105、110、115、120、125、130、135、140、145或150pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，源自基本健康的受试者的参考群体的参考值是使用ELISA确定的约50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、105、110、115、120、125、130、135、140、145或150pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，源自基本健康的受试者的参考群体的参考值是约80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119或120pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，源自基本健康的受试者的参考群体的参考值是使用ELISA确定的约80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119或120pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

在一个实施方案中，参考值源自从一个或多个被诊断或鉴定为患有或已患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是由SARS-CoV-2导致的COVID-19的受试者获得的生物样品中的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平的测量。在一个实施方案中，参考值是源自被诊断或鉴定为患有或已患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是由SARS-CoV-2导致的COVID-19的受试者的参考群体的参考sTREM-1水平。

在一个实施方案中，所述参考值是约50pg/mL至约800pg/mL，优选约75pg/mL至约600pg/mL，更优选约100pg/mL至约400pg/mL，甚至更优选约130pg/mL至约400pg/mL范围内的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，所述参考值是使用ELISA确定的约50pg/mL至约800pg/mL，优选约75pg/mL至约600pg/mL，更优选约100pg/mL至约400pg/mL，甚至更优选约130pg/mL至约400pg/mL范围内的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是约130pg/mL至约600pg/mL，优选约200pg/mL至约500pg/mL，更优选约250pg/mL至约400pg/mL，甚至更优选约300pg/mL至约375pg/mL范围内的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是使用ELISA确定的约130pg/mL至约600pg/mL，优选约200pg/mL至约500pg/mL，更优选约250pg/mL至约400pg/mL，甚至更优选约300pg/mL至约375pg/mL范围内的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是使用ECLIA确定的约350pg/mL至约1200pg/mL，优选约600pg/mL至约1100pg/mL，更优选约700pg/mL至约1000pg/mL范围内的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ELISA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是约75、100、125、150、175、200、225、250、275、300、325、350、375或400pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是使用ELISA确定的约75、100、125、150、175、200、225、250、275、300、325、350、375或400pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是约130、135、140、145、150、155、160、165、170、175、180、185、190、195、200、205、210、215、220、225、230、235、240、245、250、255、260、265、270、275、280、285、290、295、300、305、310、315、320、325、330、335、340、345、350、355、360、365、370、375、380、385、390、395、400、405、410、415、420、425或430pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是使用ELISA确定的约130、135、140、145、150、155、160、165、170、175、180、185、190、195、200、205、210、215、220、225、230、235、240、245、250、255、260、265、270、275、280、285、290、295、300、305、310、315、320、325、330、335、340、345、350、355、360、365、370、375、380、385、390、395、400、405、410、415、420、425或430pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是约300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351、352、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、367、368、369、370、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、381、382、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397、398、399或400pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是使用ELISA确定的约300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351、352、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、367、368、369、370、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、381、382、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397、398、399或400pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是使用ECLIA确定的约700、705、710、715、720、725、730、735、740、745、750、755、760、765、770、775、780、785、790、795、800、805、810、815、820、825、830、835、840、845、850、855、860、865、870、875、885、890、895、900、905、910、915、920、925、930、935、940、945、950、955、960、965、970、975、980、985、990、995或1000pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ELISA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

根据一个实施方案，来自受试者的生物样品中测得的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平高于参考值则表明具有以下风险，所述风险为具有由冠状病毒导致的疾病，尤其COVID-19的严重形式和/或并发症，或发展由冠状病毒导致的疾病，尤其COVID-19的严重形式和/或并发症。在一个实施方案中，所述参考值是约100pg/mL至约400pg/mL，优选约130pg/mL至约300pg/mL，更优选约130pg/mL至约200pg/mL甚至更优选约135pg/mL至约190pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，优选是使用ELISA确定的，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，所述参考值是使用ELISA确定的约130、135、140、145、150、155、160、165、170、175、180、185、190、195、200、205、210、215、220、225、230、235、240、245或250pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，所述参考值是约130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199或200pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，优选是使用ELISA确定的，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

根据一个实施方案，来自受试者的生物样品中测得的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平高于参考值则表明存在死亡风险。在一个实施方案中，所述参考值是约200pg/mL至约500pg/mL，优选约250pg/mL至约400pg/mL，更优选约300pg/mL至约375pg/mL范围内的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，优选是使用ELISA确定的，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，所述参考值是约250、255、260、265、270、275、280、285、290、295、300、305、310、315、320、325、330、335、340、345、350、355、360、365、370、375、380、385、390、395、400、405、410、415、420、425或430pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，优选是使用ELISA确定的，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，所述参考值是约300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351、352、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、367、368、369、370、371、372、373、374、375pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，优选是使用ELISA确定的，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

根据一个实施方案，所述方法进一步包括测量来自如上所述的受试者的生物样品中的白介素-6(IL-6)水平，和将来自受试者的生物样品中测得的IL-6水平与如上所述的IL-6参考值进行比较。

在一个实施方案中，来自受试者的生物样品中测得的IL-6水平高于上文所述的IL-6参考值则表明具有以下风险，所述风险是具有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式和/或并发症，或发展由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式和/或并发症，和/或死亡。

在一个实施方案中，本发明涉及一种用于鉴定患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的受试者为具有以下风险的体外方法，所述风险是具有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式和/或并发症，或发展由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式和/或并发症，和/或死亡，所述方法包括以下或由以下组成：

-测量如上所述的受试者的生物样品中的sTREM-1水平；和

-比较如上文所述受试者的生物样品中测得的sTREM-1水平与如上所述的参考值，优选源自基本健康的受试者的参考群体的参考sTREM-1水平，或源自被诊断或鉴定为患有或已患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是由SARS-CoV-2导致的COVID-19的受试者的参考群体的参考sTREM-1水平，

其中，来自受试者的生物样品中测得的sTREM-1水平高于参考值则表明具有以下风险，所述风险为具有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式和/或并发症，或发展由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式和/或并发症，或死亡。

在一个实施方案中，本发明涉及一种用于鉴定患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的受试者为具有以下风险的体外方法，所述风险为具有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式和/或并发症，或发展由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式和/或并发症，和/或死亡，所述方法包括以下或由以下组成：

-测量如上所述的受试者的生物样品中的sTREM-1水平，和测量如上所述的受试者的生物样品中的IL-6水平；和

-将来自受试者的生物样品中测得的sTREM-1水平与如上所述的sTREM-1参考水平进行比较，和将来自受试者的生物样品中测得的IL-6水平与如上所述的IL-6参考水平进行比较，

其中，来自受试者的生物样品中测得的sTREM-1水平高于sTREM-1参考水平以及来自受试者的生物样品中测得的IL-6水平高于IL-6参考水平则表明具有以下风险，所述风险是具有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式和/或并发症，或发展由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式和/或并发症，和/或死亡。

本发明的另一个目的是一种用于确定如上所述患有由冠状病毒导致的疾病的受试者的预后的体外方法，所述方法包括以下或由以下组成：

-测量上文所述受试者的生物样品中的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平；和

-将在来自受试者的生物样品中测得的TREM-1，尤其是sTREM-1水平与上文所述的参考值进行比较。

在一个实施方案中，本发明涉及一种用于确定患有COVID-19的患者的预后的体外方法，所述方法包括以下或由以下组成：

-测量上文所述受试者的生物样品中的sTREM-1水平；和

-将在来自受试者的生物样品中测得的sTREM-1水平与上文所述的参考值进行比较。

在一个实施方案中，来自受试者的生物样品中测得的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平高于上文所述的参考值则表明，具有患有上文所述由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的受试者预后不良。

在一个实施方案中，预后不良定义为发展并发症的风险升高和/或死亡风险升高。

在一个实施方案中，参考值源自从一个或多个如上所述基本健康的受试者获得的生物样品中的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平的测量。在一个实施方案中，参考值是源自基本健康的受试者的参考群体的参考sTREM-1水平。

在一个实施方案中，源自基本健康的受试者的参考群体的参考值是使用ECLIA确定的约50pg/mL至约500pg/mL，优选约200pg/mL至约450pg/mL，更优选约250pg/mL至约400pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ELISA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

在一个实施方案中，源自基本健康的受试者的参考群体的参考值是约为50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、105、110、115、120、125、130、135、140、145或150pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，源自基本健康的受试者的参考群体的参考值是使用ELISA确定的约50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、105、110、115、120、125、130、135、140、145或150pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，源自基本健康的受试者的参考群体的参考值是约80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119或120pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，源自基本健康的受试者的参考群体的参考值是使用ELISA确定的约80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119或120pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

在一个实施方案中，参考值源自来自一个或多个被诊断或鉴定为患有或已患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的受试者的生物样品中的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平的测量。在一个实施方案中，参考值是源自被诊断或鉴定为患有或已患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的受试者的参考群体的参考sTREM-1水平。

在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是使用ECLIA测定的约350pg/mL至约1200pg/mL，优选约600pg/mL至约1100pg/mL，更优选约700pg/mL至约1000pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ELISA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

在一个实施方案中，所述参考值是约75、100、125、150、175、200、225、250、275、300、325、350、375或400pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，所述参考值是约75、100、125、150、175、200、225、250、275、300、325、350、375或400pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是约130、135、140、145、150、155、160、165、170、175、180、185、190、195、200、205、210、215、220、225、230、235、240、245、250、255、260、265、270、275、280、285、290、295、300、305、310、315、320、325、330、335、340、345、350、355、360、365、370、375、380、385、390、395、400、405、410、415、420、425或430pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是约130、135、140、145、150、155、160、165、170、175、180、185、190、195、200、205、210、215、220、225、230、235、240、245、250、255、260、265、270、275、280、285、290，295、300、305、310、315、320、325、330、335、340、345、350、355、360、365、370、375、380、385、390、395、400、405、410、415、420、425或430pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是约300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351、352、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、367、368、369、370、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、381、382、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397、398、399或400pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是使用ELISA确定的约130、135、140、145、150、155、160、165、170、175、180、185、190、195、200、205、210、215、220、225、230、235、240、245、250、255、260、265、270、275、280、285、290、295、300、305、310、315、320、325、330、335、340、345、350、355、360、365、370、375、380、385、390、395、400、405、410、415、420、425或430pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

根据一个实施方案，来自受试者的生物样品中测得的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平高于参考值则表明预后不良，所述预后不良定义为发展并发症的风险升高。在一个实施方案中，所述参考值是约100pg/mL至约400pg/mL，优选约130pg/mL至约300pg/mL，更优选约130pg/mL至约200pg/mL，甚至更优选约135pg/mL至约190pg/mL范围内的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，优选是使用ELISA确定的，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，所述参考值是约130、135、140、145、150、155、160、165、170、175、180、185、190、195、200、205、210、215、220、225、230、235、240、245或250pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，优选是使用ELISA确定的，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，所述参考值是约130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199或200pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，优选是使用ELISA确定的，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

根据一个实施方案，来自受试者的生物样品中测得的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平高于参考值则表明预后不良，所述预后不良定义为死亡风险升高。在一个实施方案中，所述参考值是约200pg/mL至约500pg/mL，优选约250pg/mL至约400pg/mL，更优选约300pg/mL至约375pg/mL范围内的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，优选是使用ELISA确定的，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，所述参考值是约250、255、260、265、270、275、280、285、290、295、300、305、310、315、320、325、330、335、340、345、350、355、360、365、370、375、380、385、390、395、400、405、410、415、420、425或430pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，优选是使用ELISA确定的，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，所述参考值是约300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350，351、352、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、367、368、369、370、371、372、373、374、375pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，优选是使用ELISA确定的，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

根据一个实施方案，本发明的方法包括在至少两个时间测量如上所述受试者的生物样品中的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。换言之，在一个实施方案中，本发明的方法包括随时间多次测量如上所述受试者的生物样品中的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。因此，应当理解，在一个实施方案中，本发明的方法包括随时间测量如上所述从受试者获得的多个生物样品中的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。

在一个实施方案中，来自受试者的生物样品中的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平的所述至少两个测量间隔至少24小时、36小时、48小时、60小时或72小时。在一个实施方案中，来自受试者的生物样品中的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平的所述至少两个测量值间隔至少1、2或3天。

在一个实施方案中，本发明的方法包括每24小时、每36小时、每48小时、每60小时或每72小时测量如上所述受试者的生物样品中的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。在一个实施方案中，本发明的方法包括每天、每2天或每3天测量如上所述受试者的生物样品中的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。

在一个实施方案中，如上所述受试者的生物样品中测得的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平高于参考值并且随时间保持稳定或增加则表明，上文所述患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的受试者预后不良。

在一个实施方案中，在来自受试者的生物样品中测量的随时间保持稳定的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平是，在来自受试者的生物样品中测量的在至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20或21天保持稳定的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。在一个实施方案中，在来自受试者的生物样品中测量的随时间增加的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平是，在在来自受试者的生物样品中测量的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12天内增加的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。

在一个实施方案中，本发明涉及一种用于确定患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的患者的预后的体外方法，所述方法包括以下或由以下组成：

-测量上文所述受试者的生物样品中的sTREM-1水平；和

-比较来自受试者的生物样品中测量的sTREM-1水平与如上文所述的参考值，优选源自如上所述基本健康的受试者的参考群体的参考sTREM-1水平，或源自被诊断或鉴定为患有或已患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是由SARS-CoV-2导致的COVID-19的受试者的参考群体的参考sTREM-1水平，

其中在来自受试者的生物样品中测量的sTREM-1水平高于参考值，优选在来自受试者的生物样品中测量的sTREM-1水平高于上文所述的参考值并且随时间保持稳定或增加则表明，上文所述患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的患者预后不良。

本发明的另一个目的是一种用于确定受试者中上文所述由冠状病毒导致的疾病的严重程度的体外方法，所述方法包括以下或由以下组成：

-测量如上文所述受试者的生物样品中的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平；和

-将在来自受试者的生物样品中测量的TREM-1，尤其是sTREM-1水平与参考值进行比较。

在一个实施方案中，本发明涉及一种用于确定受试者中COVID-19的严重程度的体外方法，所述方法包括以下或由以下组成：

-测量如上所述受试者的生物样品中的sTREM-1水平；和

-将在来自受试者的生物样品中测量的sTREM-1水平与如上所述的参考值进行比较。

在一个实施方案中，在来自受试者的生物样品中测量的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平与所述受试者中由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重程度相关。

在一个实施方案中，如上文所述与参考值相比在来自受试者的生物样品中测得的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平越高，则所述受试者中由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19越严重。

在一个实施方案中，参考值源自从一个或多个基本健康的受试者获得的生物样品中的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平的测量，如上文所定义。在一个实施方案中，参考值是源自基本健康的受试者的参考群体的参考sTREM-1水平。

在一个实施方案中，源自基本健康的受试者的参考群体的参考值是使用ECLIA确定的约50pg/mL至约500pg/mL，优选约200pg/mL至约450pg/mL，更优选约250pg/mL至约400pg/mL范围内的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ELISA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

在一个实施方案中，所述参考值是约75、100、125、150、175、200、225、250、275、300、325、350、375或400pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，所述参考值是使用ELISA确定的约75、100、125、150、175、200、225、250、275、300、325、350、375或400pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是约130、135、140、145、150、155、160、165、170、175、180、185、190、195、200、205、210、215、220、225、230、235、240、245、250、255、260、265、270、275、280、285、290、295、300、305、310、315、320、325、330、335、340、345、350、355、360、365、370、375、380、385、390、395、400、405、410、415、420、425或430pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是使用ELISA确定的约130、135、140、145、150、155、160、165、170、175、180、185、190、195、200、205、210、215、220、225、230、235、240、245、250、255、260、265、270、275、280、285、290、295、300、305、310、315、320、325、330、335、340、345、350、355、360、365、370、375、380、385、390、395、400、405、410、415、420、425或430pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是约300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351、352、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、367、368、369、370、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、381、382、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397、398、399或400pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是使用ELISA确定的约300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351、352、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、367、368、369、370、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、381、382、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397、398、399或400pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ECLIA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

如上文所述，在一个实施方案中，由冠状病毒导致的疾病的严重形式，尤其是COVID-19的严重形式，被定义为需要住院和/或需要入住ICU。在一个实施方案中，由冠状病毒导致的疾病的严重形式，尤其是COVID-19的严重形式，被定义为需要上文所述的呼吸支持。在一个实施方案中，由冠状病毒导致的疾病的严重形式，尤其是COVID-19的严重形式，被定义为需要上文所述的侵入性机械通气。

在一个实施方案中，本发明涉及一种用于确定受试者中由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重程度的体外方法，所述方法包括以下或由以下组成：

-测量上文所述受试者的生物样品中的sTREM-1水平；和

-比较来自受试者的生物样品中测得的sTREM-1水平与上文所述的参考值，优选源自基本健康的受试者的参考群体的参考sTREM-1水平，或源自被诊断或鉴定为患有或已患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是由SARS-CoV-2导致的COVID-19的受试者的参考群体的参考sTREM-1水平，

其中，如上文所述与参考值相比在来自受试者的生物样品中测得的sTREM-1水平越高，则所述受试者中由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19越严重。

根据一个实施方案，本发明的方法包括在至少两个时间，优选间隔至少24小时的至少两个时间测量来自上文所述受试者的生物样品中的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。换言之，在一个实施方案中，本发明的方法包括如上所述随时间多次测量来自上文所述受试者的生物样品中的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。如上所述，应当理解，在一个实施方案中，本发明的方法包括随时间测量从上文所述受试者获得的多个生物样品中的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。

因此，在一个实施方案中，本发明的方法可以随时间监测受试者中由冠状病毒感染导致的疾病。

因此，本发明的另一个目的是一种用于监测受试者中如上文所述由冠状病毒导致的疾病的体外方法，所述方法包括以下或由以下组成：

-在至少两个时间，优选间隔至少24小时的至少两个时间，测量来自上文所述受试者的生物样品中的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平；和

-将来自受试者的生物样品中测得的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平与参考值进行比较。

在一个实施方案中，本发明涉及一种用于监测受试者中COVID-19的体外方法，所述方法包括以下或由以下组成：

-在至少两个时间，优选间隔至少24小时的至少两个时间，测量来自上文所述受试者的生物样品中的sTREM-1水平；和

-将来自受试者的生物样品中测得的sTREM-1水平与参考值进行比较。

在一个实施方案中，本发明的方法包括在间隔至少24小时、36小时、48小时、60小时或72小时的至少两个时间，测量来自上文所述受试者的生物样品中的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。在一个实施方案中，本发明的方法包括在间隔至少1、2或3天的至少两个时间，测量来自上文所述受试者的生物样品中的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。

如上所述，应当理解，在至少两个时间测量来自上文所述受试者的生物样品中的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平表示，测量在至少两个时间获得的来自上文所述受试者的生物样品中的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。

在一个实施方案中，本发明的方法包括每24小时、每36小时、每48小时、每60小时或每72小时测量来自上文所述受试者的生物样品中的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。在一个实施方案中，本发明的方法包括每天、每2天或每3天测量来自上文所述受试者的生物样品中的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平。

根据一个实施方案，在来自受试者的生物样品中测得的随时间保持稳定或增加的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平则表明，受试者中如上文所述由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的恶化。

因此，在一个实施方案中，在来自受试者的生物样品中测得的随时间降低的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平则表明，受试者中如上文所述由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19减轻。

在一个实施方案中，参考值是个体化参考值，即参考值是在从受试者获得的生物样品中测量的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平。在一个实施方案中，个体化参考值是在基线从受试者获得的生物样品中测量的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，即基线TREM-1或sTREM-1水平。在一个实施方案中，基线TREM-1或sTREM-1水平是在医疗护理开始之前从受试者获得的生物样品中测量的TREM-1或sTREM-1水平。在一个实施方案中，基线TREM-1或sTREM-1水平是在住院时或入住ICU时从受试者获得的生物样品中测量的TREM-1或sTREM-1水平。

根据一个实施方案，在来自受试者的生物样品中测得的TREM-1，尤其是sTREM-1的水平高于上文所述的参考值并且随时间保持稳定或增加则表明，受试者中如上文所述由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19恶化。

在一个实施方案中，参考值源自从一个或多个如上文所述基本健康的受试者获得的生物样品中的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平的测量。在一个实施方案中，参考值是源自基本健康的受试者的参考群体的参考sTREM-1水平。

在一个实施方案中，参考值是源自来自一个或多个被诊断或鉴定为患有或已患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的受试者的生物样品中的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平的测量。在一个实施方案中，参考值是源自被诊断或鉴定为患有或已患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的受试者的参考群体的参考sTREM-1水平。

在一个实施方案中，上文所述的参考值，优选源自参考群体的参考值是使用ECLIA确定的约350pg/mL至约1200pg/mL，优选约600pg/mL至约1100pg/mL，更优选约700pg/mL至约1000pg/mL的TREM-1水平，尤其是sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平，或使用另一种免疫测定，尤其是ELISA确定的相应的TREM-1水平，尤其是相应的sTREM-1水平，优选血液、血浆或血清水平。

在一个实施方案中，本发明涉及一种用于监测受试者中由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的体外方法，所述方法包括以下或由以下组成：

-比较来自受试者的生物样品中测得的sTREM-1水平与参考值，优选个体化参考值，例如在基线从受试者获得的生物样品中测得的sTREM-1水平，

其中在来自受试者的生物样品中测得的sTREM-1水平随时间保持稳定或增加则表明，受试者中如上文所述由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19恶化。

在一个实施例中，本发明涉及一种用于监测受试者中由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的体外方法，所述方法包括以下或由以下组成：

-在至少两个时间，优选间隔至少24小时的至少两个时间，测量上文所述受试者的生物样品中的sTREM-1水平；和

-比较来自受试者的生物样品中测得的sTREM-1水平与如上所述的参考值，优选源自基本健康的受试者的参考群体的参考sTREM-1水平，或源自被诊断或鉴定为患有或已患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是由SARS-CoV-2导致的COVID-19的受试者的参考群体的参考sTREM-1水平，

其中在来自受试者的生物样品中测得的sTREM-1水平高于上文所述的参考值并且随时间保持稳定或增加则表明，受试者中如上文所述由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19恶化。

本发明还涉及一种为被鉴定为具有以下风险的患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的受试者提供适应性护理(adapted care)的方法，所述风险是具有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式/并发症，或发展由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式和/或并发症，或死亡风险，所述方法包括以下或由以下组成：

-鉴定患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的受试者为具有以下风险，所述风险为具有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式和/或并发症，或发展由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式和/或并发症，或死亡，如上所述；和

-为鉴定为具有以下风险的患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的受试者提供适应性护理，所述风险为具有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式和/或并发症，或发展由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式和/或并发症，或死亡。

本发明的另一个目的是一种为鉴定为预后不良的患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的受试者提供适应性护理的方法，所述方法包括以下或由以下组成：

-将患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的受试者鉴定为预后不良，如上文所述；和

-为鉴定为预后不良的患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的受试者提供适应性护理。

本发明的另一个目的是为被鉴定为具有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式的患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的受试者提供适应性护理的方法，所述方法包括以下或由以下组成：

-鉴定患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的受试者为具有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式，如上文所述；和

-为鉴定为具有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式的患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的受试者提供适应性护理。

在一个实施方案中，为患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的如上文所鉴定的受试者提供适应性护理包括以下至少一项或由以下至少一项组成：

-监测受试者，尤其是监测如上文所述的受试者；

-向受试者提供呼吸支持，尤其是向受试者提供补充氧气、非侵入性通气(NIV)或侵入性机械通气(IMV)；

-接收受试者入住重症监护室(ICU)。

在一个实施方案中，监测受试者包括以下或由以下组成：监测受试者的呼吸功能，例如通过监测他/她的氧饱和度、他/她的动脉血气和/或静脉血气，或他/她的动脉氧分压/吸入氧分数或PaO₂/FiO₂(mmHg)。

在一个实施方案中，监测受试者包括以下或由以下组成：监测受试者的器官功能，例如通过确定他/她的SOFA评分(序贯器官衰竭评估(Sequential Organ FailureAssessment，SOFA)评分，最初被称为败血症相关器官衰竭评估)。SOFA评分系统(Vincent等人,Crit Care Med.1998Nov；26(11):1793-800)依赖于对呼吸系统的评估(即PaO2/FiO2(mmHg))；对神经系统的评估(即格拉斯哥昏迷量表)；对心血管系统的评估(即平均动脉压或施用所需的血管加压药)；对肝功能的评估(即胆红素(mg/dL或μmol/L))；对血凝的评估(即血小板计数)；以及对肾功能的评估(即肌酐(mg/dL或μmol/L)或尿排出(mL/d))。

本发明还涉及一种治疗被鉴定为具有以下风险的患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的受试者的方法，所述风险为具有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式和/或并发症，或发展由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式和/或并发症，或死亡，所述方法包括以下或由以下组成：

-鉴定患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的受试者为具有以下风险，所述风险为具有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式和/或并发症，或发展由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式和/或并发症，或死亡，如上文所述；和

-治疗鉴定为具有以下风险的患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的受试者，所述风险为具有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式和/或并发症，或发展由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式和/或并发症，或死亡。

本发明的另一个目的是一种治疗鉴定为预后不良的患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的受试者的方法，所述方法包括以下或由以下组成：

-鉴定患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的受试者为预后不良，如上文所述；和

-治疗鉴定为预后不良的患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的受试者。

本发明的另一个目的是一种治疗鉴定为具有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式的患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的受试者的方法，所述方法包括以下或由以下组成：

-治疗鉴定为具有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的严重形式的患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的受试者。

在一个实施方案中，治疗患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的如上文鉴定的受试者包括向所述受试者施用以下至少一项或由向所述受试者施用以下至少一项组成：上文所定义的呼吸支持、血管加压药治疗(例如，苯肾上腺素、去甲肾上腺素、肾上腺素、血管加压素和/或多巴胺)、液体治疗、抗微生物治疗、抗病毒治疗、心血管支持、肾替代治疗、镇静作用，或其任何混合物。

在一个实施方案中，治疗患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的如上文鉴定的受试者包括以下或由以下组成：向所述受试者施用抗病毒药物、抗白介素6(抗IL-6)药物、类固醇、另一种药物如氯喹或羟基氯喹，或其任何混合物。在一个实施方案中，治疗患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的如上文鉴定的受试者包括以下或由以下组成：向所述受试者施用抗病毒药物、抗白介素6(抗IL-6)药物、另一种药物如氯喹或羟基氯喹，或其任何混合物。

在一个实施方案中，治疗患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的如上文鉴定的受试者包括向所述受试者施用以下至少一项或由向所述受试者施用以下至少一项组成：上文所定义的呼吸支持、血管加压药治疗(例如，苯肾上腺素、去甲肾上腺素、肾上腺素、血管加压素和/或多巴胺)、液体治疗、抗微生物治疗、抗病毒治疗、心血管支持、肾替代治疗、镇静作用、抗病毒药物、抗白介素6(抗IL-6)药物或另一种药物如氯喹或羟基氯喹，或其任何混合物。

抗病毒药物的实例包括但不限于瑞德西韦(remdesivir)，以及洛匹那韦(lopinavir)和利托那韦(ritonavir)的组合(洛匹那韦/利托那韦)。在一个实施方案中，治疗患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的如上文鉴定的受试者包括以下或由以下组成：向所述受试者施用瑞德西韦，或洛匹那韦和利托那韦的组合(洛匹那韦/利托那韦)。

如本文所用，抗IL-6药物靶向IL-6(白介素6或白介素-6)或其受体(IL-6R)。抗IL-6药物的实例包括但不限于托珠单抗(tocilizumab)和沙利鲁单抗(sarilumab)。在一个实施方案中，治疗患有由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的如上文鉴定的受试者包括以下或由以下组成：向所述受试者施用托珠单抗或沙利鲁单抗。

在一个实施方案中，所述至少一种其他药物活性剂是类固醇，如地塞米松。

在一个实施方案中，治疗由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的如上文所述定义的受试者包括向所述受试者施用以下至少一项或由向所述受试者施用以下至少一项组成：瑞德西韦、洛匹那韦和利托那韦的组合、托珠单抗、沙利鲁单抗、类固醇如地塞米松、氯喹、羟基氯喹，或其任何混合物。在一个实施方案中，治疗由冠状病毒导致的疾病，尤其是COVID-19的如上文所述鉴定的受试者包括向所述受试者施用以下至少一项或由向所述受试者施用以下至少一项组成：瑞德西韦、洛匹那韦和利托那韦的组合、托珠单抗、沙利鲁单抗、氯喹、羟基氯喹或其任何混合物。

附图简要说明

图1A-1B是比较健康志愿者(HV)和患有COVID-19的患者中的sTREM-1水平的组合图。图1A显示了在基线(第1天)的sTREM-1水平。图1B显示了入住重症监护室(ICU)后第3天的sTREM-1水平。***：p<0.001；****：p<0.0001。

图2A-2B是比较存活的患有COVID-19的患者(存活者-S)和未存活的患有COVID-19的患者(非存活者-NS)的sTREM-1水平的组合图。图2A显示了第1天(即入住ICU当天)的sTREM-1水平。图2B显示了入住重症监护室(ICU)后第3天的sTREM-1水平。*：p<0.05；**：p<0.01。

图3A-3B是比较健康志愿者(HV)和患有COVID-19的不同组患者中的sTREM-1水平的组合图：所有：所有患有COVID-19的患者；MV<10：接受机械通气少于10天的患有COVID-19的患者；MV≥10和NS：接受机械通气10天或以上的患有COVID-19的患者，以及无论机械通气时间长短都无法存活的患者(非存活者-NS)；MV<15：接受机械通气少于15天的患有COVID-19的患者；MV≥15和NS：接受机械通气15天或以上的患有COVID-19的患者，以及无论机械通气时间长短都无法存活的患者(非存活者-NS)。图3A显示了第1天(即入住ICU当天)的sTREM-1水平。图3B显示了入住ICU后第3天的sTREM-1水平。ns：不显著；*：p<0.05；***：p<0.001；****：p<0.0001。

图4A-4B是显示患有COVID-19的患者中随时间的sTREM-1水平的组合图(入住ICU后第1天至第21天)。图4A比较了接受机械通气少于15天的患有COVID-19的患者(MV<15)和接受机械通气15天或以上的患有COVID-19的患者(MV≥15)中随时间的sTREM-1水平。图4B比较了基线的肌钙蛋白水平低于12pg/mL(TROPO<12)的患有COVID-19的患者和基线的肌钙蛋白水平高于12pg/mL(TROPO>12)的患有COVID-19的患者中随时间的sTREM-1水平。缺失数据采用LOCF方法(最后一次观察结转值，Last Observed Carry Forward value)处理。

图5A是显示ROC曲线的图，该曲线评估了入住ICU后第3天的sTREM-1水平对持续少于15天的机械通气(MV)和持续15天或更长时间的机械通气(MV)的区分能力。图5B是显示ROC曲线相关参数的表格。

图6A-6D是发生率曲线的组合(用于个体分类的考克斯比例-哈扎德(PH)模型和用于整个队列的Kaplan-Meier)，显示了随时间患有COVID-19的患者摆脱侵入性机械通气(即开始拔管)的比例，或随时间患有COVID-19的患者离开重症监护室的比例。图6A的发生率曲线显示了根据第1天(基线)的截断sTREM-1水平186pg/mL，随时间患有COVID-19的患者摆脱侵入性机械通气(即开始拔管)的比例。图6B的发生率曲线显示了根据第3天的截断sTREM-1水平186pg/mL，随时间患有COVID-19的患者摆脱侵入性机械通气(即开始拔管)的比例。图6C的发生率曲线显示了根据第1天(基线)的截断sTREM-1水平186pg/mL，随时间患有COVID-19的患者离开重症监护室的比例。图6D的发生率曲线显示了根据第3天的截断sTREM-1水平186pg/mL，随时间患有COVID-19的患者离开重症监护室的比例。KM总体：患者总体队列的随时间比例；sTREM-1>186：在所示时间(第1天或第3天)sTREM-1水平>186pg/mL的患者的随时间比例；sTREM-1<186：在所示时间(第1天或第3天)sTREM-1水平<186pg/mL的患者的随时间比例。

图7是描述验证队列的流程图。重度疾病定义为在住院期间需要入住ICU。数据以四分位距的中值表示。

图8A-C是显示患有COVID-19的不同患者组的血浆sTREM-1水平的组合图。图8A比较了中度疾病患者(中度疾病)和重度疾病患者(重度疾病)的血浆sTREM-1水平。重度疾病定义为在住院期间需要入住ICU。图8B比较了存活者和非存活者的血浆sTREM-1水平。图8C比较了具有血栓栓塞事件(TEE)的患者和没有血栓栓塞事件(无TEE)的患者的血浆sTREM-1水平。数据以四分位距的中值表示。通过Mann-Whitney U检验计算P值。*：p<0.05；***：p<0.001。

图9A-D是显示患有COVID-19的不同患者组的血浆sTREM-1水平的组合图。图9A显示了根据结果的COVID-19中度疾病患者的血浆sTREM-1水平(存活者相对于非存活者，p值＝0.019)。图9B根据结果比较了COVID-19重度患者的血浆sTREM-1水平(存活者相对于非存活者，p值＝0.007)。图9C根据疾病严重程度比较了COVID-19存活患者的血浆sTLEM-1水平(中度疾病相对于重度疾病，p值＝0.068)。图9D根据疾病严重程度比较了COVID-19非存活患者的血浆sTREM-1水平(中度疾病相对于重度疾病，p值＝0.737)。重度疾病定义为在住院期间需要入住ICU。数据以四分位数距的中值表示。通过Mann-Whitney U检验计算P值。ns：不显著；*：p<0.05；**：p<0.01。

图10A-C是显示患有COVID-19的患者中的sTREM-1水平与其他临床结果之间相关性的组合图。图10A显示了sTREM-1水平与住院总时间之间的相关性。图10B显示了sTREM-1水平与ICU入住总时间之间的相关性。图10C显示了采样时sTREM-1水平与疾病持续时间之间的相关性。如图所示，相关系数和p值使用Spearman秩相关检验计算。

图11A-F是显示患有COVID-19的患者中的sTREM-1水平和炎性标志物之间相关性的组合图。图11A显示了sTREM-1水平与白细胞(WBC)计数之间的相关性。图11B显示了sTREM-1水平与淋巴细胞计数之间的相关性。图11C显示了sTREM-1水平与C-反应性蛋白(CRP)水平之间的相关性。图11D显示了sTREM-1水平与铁蛋白水平之间的相关性。图11E显示了sTREM-1水平和D-二聚体水平之间的相关性。图11F显示了sTREM-1水平与白介素-6(IL-6)循环浓度之间的相关性。如图所示，相关系数和p值使用Spearman秩相关检验计算。

图12A-D是接收者操作特征(ROC)曲线的组合，评估了所述生物标志物(在医院诊断COVID-19后获得的第一个样本品中测量)对存活者和非存活者的区分能力。图12A是评估sTREM-1水平对存活者和非存活者的区分能力的ROC曲线。图12B是评估C-反应性蛋白(CRP)水平对存活者和非存活者的区分能力的ROC曲线。图12C是评估铁蛋白水平对存活者和非存活者的区分能力的ROC曲线。图12D是评估白介素-6(IL-6)循环浓度对存活者和非存活者的区分能力的ROC曲线。AUC：曲线下面积。

图13A-E是Kaplan-Meier曲线的组合，其显示了根据所示生物标志物截断值，患有COVID-19的患者随时间的存活百分比。图13A显示了根据所示sTREM-1截断值，患有COVID-19的患者随时间的存活百分比。图13B显示了根据所示C-反应性蛋白(CRP)截断值，患有COVID-19的患者随时间的存活百分比。图13C显示了根据所示铁蛋白截断值，患有COVID-19的患者随时间的存活百分比。图13D显示了根据所示白介素-6(IL-6)截断值，患有COVID-19的患者随时间的存活百分比。图13E，根据所示sTREM-1和白介素-6(IL-6)截断值的组合，患有COVID-19的患者随时间的存活百分比。截断值基于源自图12A-D显示的接收者操作特征曲线的最大Youden指数。通过对数秩(Mantel-Cox)检验计算危险比(hazard ratio)。

图14是用sTREM-1Elecsys ECLIA和sTREM-1Quantikine ELISA测量的sTREM-1血浆浓度的散点图。

实施例

本发明通过以下实施例进一步说明。

实施例1：

材料与方法

研究设计和参与者

根据WHO(世界卫生组织)临时指南被诊断为患有COVID-19并入住重症监护室(ICU)的27名成人患者于2020年3月15日至2020年3月31日期间被纳入法国南锡区域大学中心医院(Centre Hospitalier Régional Universitaire，CHRU)。所有患者经聚合酶链反应(鼻/咽拭子或肺部样品)被确认为SARS-CoV-2阳性，并因急性呼吸窘迫综合征而入住ICU。这项研究获得了CHRU南锡伦理委员会的批准(saisine n°196)。

定义

在显示经阳性培养证实的肺炎或菌血症的临床体征或症状的患者中，诊断继发感染。急性呼吸窘迫综合征(ARDS)根据柏林定义(ARDS Definition Task Force,Ranieri等人,JAMA.2012；307(23):2526-2533.)进行诊断。急性肾损伤根据改善全球肾病结局(KDIGO)临床实践指南(Khwaja,Nephron Clin Pract.2012；120(4):c179 c184)进行诊断。如果血清肌钙蛋白水平高于12pg/mL，或者需要使用血管加压药，则诊断为心脏循环系统衰竭。

数据收集和实验室程序

收集医疗记录并进行回顾性分析。从入住ICU到出院(discharge)，在第1、3、6、14和21天收集血浆样品。通过常规血液检测获得血液计数、血液学、血清生化检测、肌钙蛋白和白介素-6(IL-6)。通过酶联免疫吸附测定(ELISA)和多重测定定量血浆中的炎性标志物。

sTREM-1测量

使用市售的仅用于研究的ELISA测定(人TREM-1ELISA试剂盒，R&DSystems，标号DTRM10C)，使用经分析验证的基于ELISA的方法(EMA生物分析方法验证指南，EMEA/CHMP/EWP/192217/2009(2011))测量sTREM-1水平。下表1总结了该方法的分析性能和接受标准。

表1：sTREM-1ELISA验证方法的分析性能和接受标准的总结

LCS：最低校准标准；HCS：最高校准标准；CS：校准标准；QC：质量控制；RE：相对误差；CV：变异系数；LLOQ：定量下限；ULOQ：定量上限。

细胞因子测定

使用流式微球阵列(CBA)Human Soluble Protein Flex Set System(BDBiosciences，San Jose，CA，USA)同时检测血浆中的12种细胞因子/趋化因子和内皮标志物(IL-1β(白介素-1β)、IL-6(白介素-6)、IL-8(白介素-8)、IL-10(白介素-10)、MCP-1(单核细胞趋化蛋白-1)、INFγ(干扰素γ)、RANTES(调节激活正常T细胞表达和分泌因子)、VEGF(血管内皮生长因子)、ICAM-1(细胞间粘附分子1)、E-选择素、P-选择素和VCAM-1(血管细胞粘附分子1))。CBA技术按照制造商的说明进行。对ICAM-1、E-选择素、P-选择素、VCAM-1的检测灵敏度为36.06pg/mL，对IL-1β、IL-6、IL-8、IL-10、MCP-1、INFγ、RANTES和VEGF的检测灵敏度为9.77pg/mL。使用FCAP Array Infinite软件(SoftFlow Group，匈牙利)分析数据。或者，根据制造商的说明，通过市售的特异性酶联免疫吸附测定(人血管生成素-1/血管生成素-2ELISA试剂盒，R&D Systems)测量Ang1(血管生成素-1)和Ang2(血管生成因子-2)的血浆浓度。检测限为10.3pg/mL(Ang1)和21.3pg/mL(Ang2)。

统计学分析

分类变量表示为数字(％)，并通过χ2检验在各组之间进行比较。连续变量表示为中位数(四分位距)，并用Mann-Whitney U检验进行比较。构建了接收者操作特征(ROC)曲线，以说明sTREM-1的截断值。

通过Kaplan-Meier生存分析进行事件时间分析(time-to-event analysis)，其中对死亡进行罚分。当显示时，使用最后一次观察结转(LOCF)方法替换缺失值。

分别进行至ICU离开(从重症监护室离开)时间和至无IVM时间(从侵入性机械通气拔管，即拔管时间)分析。由于死亡而被审查的受试者考虑在第35天进行审查用于事件时间分析。首先估算乘积极限估算(Kaplan-Meier曲线)，不考虑sTREM-1类。随后，针对这些分类预测器(categorical predictor)中的每个分别拟合Cox比例危险(PH)模型：第1天(基线)sTREM-1分类器和第3天sTREM-1分类器。根据每个Cox PH模型，产生终点的危险比以及它们的95％置信区间和p值(对数秩检验)。根据每个Cox PH模型，绘制每个分类器水平的累积发生率函数，并将其叠加在Kaplan-Meier曲线上。

ROC(接收者操作特征)曲线用于研究sTREM-1，作为(i)用于MV(机械通气)持续时间<15天或(ii)MV持续时间≥15天和非存活者的分类器，作为支持性分析。使用这些曲线探究了灵敏度(真阳性率)和特异性(真阴性率)。该分析分别使用第1天和第3天的sTREM-1值。ROC曲线的曲线下面积(AUC)用于评估sTREM-1的性能。

结果

健康志愿者特征

健康志愿者的特征如下表2所示。

表2：健康志愿者的特征

数据以中位数(IQR)或n(％)表示。BMI：体重指数。MV：机械通气。IL-6：白介素-6。

患者特征

基线特征示于下表3中。

表3：队列中包括的患者的基线特征

除非另有说明，否则值以中位数(四分位距)表示。p值是机械通气(MV)<15天亚组和MV≥15天和非存活(NS)亚组之间的比较。BMI：体重指数。VAP：呼吸机相关性肺炎。MV：机械通气。NS：非存活者。CV病：心血管疾病。Creat：肌酸。RRT：肾脏替代治疗。ARDS：急性呼吸窘迫综合征。TROPO：肌钙蛋白水平(pg/mL)。AKI：急性肾损伤。KDIGO：改善全球肾病结局。PaO₂/FiO₂比：动脉氧分压/吸入氧分数的比值。

在该队列的27名患者中，22名患者需要使用血管加压药，17名患者的心脏肌钙蛋白水平高于12pg/mL，2名患者的KDIGO为3，10名患者出现严重ARDS，13名患者出现中度ARDS，4名患者出现轻度ARDS。9名患者发展继发感染，其中8名患者患有呼吸机相关性肺炎(VAP)。3名患者死亡，并且机械通气(MV)的持续时间中值为15天。当对非存活者的MV持续时间给予33天的罚分时，该值不变，33天相当于该队列中观察到的MV的最大持续时间。

11名患者的MV持续时间低于15天，16名患者具有至少15天的MV或死亡。较高比例的男性和较高比例的重度ARDS患者具有至少15天的MV持续时间或死亡。这些患者的继发感染频率较高。

除了第3天的白细胞计数(WBC)和嗜中性粒细胞外(但值在正常范围内)，这两组在基线和第3天的血液学和生化参数方面没有观察到显著差异。

在基线和第3天，COVID-19患者中的sTREM-1水平提高大于健康志愿者(HV)

健康志愿者(HV)的sTREM-1血浆浓度中值为103.5pg/mL(IQR(四分位距)75.22-124.4)，COVID-19患者的sTREM-1血浆浓度中值在基线时为161.1pg/mL(IQR 129.4-195.7)，在第3天为142pg/mL(IQR 108.7-187.3)(见图1)。如图1A-B所示，HV和COVID-19患者的sTREM-1血浆浓度之间的差异是统计学显著的。有趣的是，即使只有3名患者死亡，在基线(见图2A)和第3天(见图2B)，在非存活者中仍观察到与存活的COVID-19患者的sTREM-1水平相比显著更高的sTREM-1水平(见图2)。非存活者(NS)的sTREM-1血浆浓度中值在基线时为422.6pg/mL，在第3天为300pg/mL。

在基线(第1天)和第3天，在需要更长的机械通气(MV)时间的患者中观察到较高的sTREM-1水平。

事实上，在基线和第3天，与需要少于10天的MV的患者亚组相比，在包括未存活者和需要10天或更长时间的MV的患者的亚组中观察到sTREM-1血浆浓度的显著不同。与需要少于15天的MV的患者亚组相比，在包括未存活者和需要15天或更长时间的MV的患者的亚组中仍然存在这种差异(参见图3A-B和下表4)。这在观察这两个亚组中的sTREM-1动力学时得到了进一步证实(见图4A)。事实上，与需要少于15天的MV的患者相比，非存活者和需要15天或更长时间的MV的患者从基线(第1天)到出院(第21天)表现出提高更大的sTREM-1水平。

表4：所有COVID-19患者以及通过少于15天的MV定义的或者通过死亡或至少15天的MV定义的两个亚组中的血液学数据、生物化学数据和炎性标志物

p值是MV<15天亚组与MV≥15天和非存活者(NS)亚组之间的比较。MV：机械通气。NS：非存活者。D1：第1天。D3：第3天。WBC：白细胞。Ly：淋巴细胞。PMN：多形核嗜中性粒细胞。PLT：血小板。Hg：血凝素。AST：天冬氨酸转氨酶TP：总蛋白。ICAM-1：细胞间粘附分子1。VCAM-1：血管细胞粘附分子1。IL-6：白介素6。IL-8：白介素-8。IL-10：白介素-10。MCP-1：单核细胞趋化蛋白-1。RANTES：调节激活正常T细胞表达和分泌因子。Ang1：血管生成素-1。Ang2：血管生成素-2。D3-D1是第3天和第1天的sTREM-1浓度之间的差异。％D3-D1是该差异与D1的值相比的百分比。

研究队列中机械通气(MV)的中位持续时间为15天(见上表3)。如上所述，11名患者的MV持续时间低于15天，16名患者具有至少15天的MV或死亡。如图3A-3B所示，与健康志愿者(103.5pg/mL(IQR：75.22-124.4))相比，需要少于15天的MV的患者在基线和第3天的sTREM-1水平相似(分别为150pg/mL(IQR:94,48-194.9)和117.4pg/mL(IQR:106.8-129.9))。令人惊讶的是，与健康志愿者相比，需要15天或更长时间的MV和非存活者的患者在基线时(176.8pg/mL(IQR：147-195.9)，p<0.0001)和第3天(163.4pg/mL，IQR：142-263.7)，p＝0.0003)的sTREM-1水平显著更高(见图3A-3B)，并且与需要少于15天的MV的患者相比在第3天的sTREM-1水平显著更高(见图3B)。

如图5A-5B所示，第3天的sTREM-1浓度形成了分辨值用以识别需要低于15天的MV的患者和需要多于15天的MV的患者，曲线下面积为0.733(95％置信区间0.4633-1.000)，p值为0.0431。186pg/mL的sTREM-1截断值产生了约80％的特异性和90％的灵敏度。基于186pg/mL的sTREM-1截断值，对离开ICU的时间和摆脱IMV的时间(即从IMV拔管的时间)进行了分析。对于摆脱IMV的时间(即从侵入性机械通气拔管的时间)，危险比(HR)及其相应95％CI在基线(第1天)时为0.411(0.155，1.087)(见图6A)，在第3天为0.153(0.034，0.685)(见图6B)。对于离开ICU(即离开重症监护室)的时间，HR及其相应95％CI在基线(第1天)时为0.374(0.141，0.992)(见图6C)，在第3天时为0.151(0.033，0.681)(见图6D)。

因此，数据显示，在基线和第3天显示出高于186pg/Ml的sTREM-1水平的COVID-19患者在15天之前拔管或存活的可能性较低(基线HR：0.374(95％CI 0.141-0.992)，第3天HR：0.151(95％CI 0.033-0.681))。

sTREM-1与其他临床参数的相关性

为了进一步确定TREM-1通路激活是否与COVID-19并发症相关，在第1天和第3天评估了sTREM-1与COVID-19的临床参数和特征之间的相关性(见下表5-7)。

淋巴细胞水平已被发现是COVID-19患者预后的预测器，死于COVID-19的个体被证明其淋巴细胞水平明显低于存活者。有趣的是，在第3天，显示所有COVID-19患者中的sTREM-1与淋巴细胞计数呈显著负相关(spearman r-0.6593(-0.8530至-0.3058)，p值＝0.0012，见表5)。对于需要少于15天的MV的病情较不严重的患者，则没有这种负相关(见表6)，但在病情较重的患者中仍然存在(spearman r-0.5699(0.8425至-0.06476)，p值0.0291，见表7)。

还发现sTREM-1水平在第3天与胆红素水平(spearman r 0.5196(0.07123至0.7933)p值0.0226，见表5)以及尿素和肌酸水平(见下表5、表6和表7)相关，这些是肝脏和肾脏患病或功能障碍的不同标志物。在所有患者中，发现sTREM-1与肌钙蛋白水平之间也存在正相关(r＝0.6559，p＝0.0096，见表5)，而在病情较重的患者中，这种相关性甚至更显著(r＝-0.8333，p＝0.0154，见表7)。通过观察肌钙蛋白水平高于12pg/mL的患者的sTREM-1动力学，证实了TREM-1通路激活与心脏衰竭之间的关联：与肌钙蛋白水平低于12pg/mL的患者相比，他们从被纳入(第1天)到出院(第21天)显示更高水平的sTREM1(见图4B)。

器官功能障碍，尤其是肾脏、肝脏和/或心脏功能障碍是COVID-19患者的主要并发症，并且与复杂且不良的结局相关。数据证实，TREM-1通路的参与可能会驱动COVID-19患者中的炎症和并发症。

所述队列的患者中未观察到INF-γ、IL-1β和VEGF的可检测水平，ICAM-1、E-选择素、P-选择素、VCAM-1、IL-6、IL-8、IL-10、MCP-1、RANTES、Ang1和Ang2的水平升高(见上表4)。出乎意料的是，sTREM-1是显示以少于15天的MV或以死亡或至少15天的MV来定义的两组患者之间差异的唯一标志物。在第3天，所述差异更为显著，并且在统计学上显著。

表5：所有COVID-19患者中sTREM-1与临床和炎性标志物之间的相关性表格

WBC：白细胞。ALAT：丙氨酸转氨酶。ASAT：天冬氨酸转氨酶。ICAM-1：细胞间粘附分子1。VCAM-1：血管细胞粘附分子1。IL-6：白介素6。IL-8：白介素-8。IL-10：白介素-10。MCP-1：单核细胞趋化蛋白-1。RANTES：调节激活正常T细胞表达和分泌因子。Ang1：血管生成素-1。Ang2：血管生成素-2。*表示统计学显著性，其中*：p<0.05，**：p<0.01，***：p<0.001，****：p<0.0005。

表6：MV持续时间低于15天的COVID-19患者中的sTREM-1与临床和炎性标志物之间的相关性表格

WBC：白细胞。ALAT：丙氨酸转氨酶。ASAT：天冬氨酸转氨酶。ICAM-1：细胞间粘附分子1。VCAM-1：血管细胞粘附分子1。IL-6：白介素6。IL-8：白介素-8。IL-10：白介素-10。MCP-1：单核细胞趋化蛋白-1。RANTES：调节激活正常T细胞表达和分泌因子。Ang1：血管生成素-1。Ang2：血管生成素-2。*：p<0.05。

表7：最严重的COVID-19患者、非存活者和MV持续时间超过15天的患者的sTREM-1与临床和炎性标志物之间的相关性表格

WBC：白细胞。ALAT：丙氨酸转氨酶。ASAT：天冬氨酸转氨酶。ICAM-1：细胞间粘附分子1。VCAM-1：血管细胞粘附分子1。IL-6：白介素6。IL-8：白介素-8。IL-10：白介素-10。MCP-1：单核细胞趋化蛋白-1。RANTES：调节激活正常T细胞表达和分泌因子。Ang1：血管生成素-1。Ang2：血管生成素-2。*表示统计学显著性，其中*：p<0.05，**：p<0.01。

实施例2：

材料和方法

研究设计和参与者

以下回顾性研究是对荷兰奈梅亨拉德堡德大学医学中心(Radboudumc)收治的192名COVID-19患者(ICU和非ICU)的验证队列进行的研究。所述验证队列由在2020年3月6日至2020年4月15日期间由Radboudumc收治的经PCR证实或临床诊断为SARS-CoV-2感染的患者组成。临床诊断COVID-19感染是基于体征和症状、根据荷兰COVID-19报告和数据系统(CO-RADS)分类法的特定计算机断层扫描(CT)结果以及临床专家的最终共识而确定的。95％(183/192)的COVID-19确诊患者在诊断时的PCR结果为阳性。研究方案获得了当地伦理委员会的批准(CMO 2020 6344和CMO 2016 2963)。所有患者或法定代表均被告知研究细节，并且可拒绝参与。

在医院诊断为COVID-19后，在首次常规采血时采集乙二胺四乙酸(EDTA)血浆进行实验室检测(即基线)。为了进行分析，根据疾病严重程度和死亡率将患者分为多组。疾病严重程度是根据住院期间入住ICU的需要来定义的：重度疾病定义为患者需要入住ICU，而中度疾病定义为住院期间患者不需要入住ICU。采样时，有10名患者入住非ICU病房，但在住院期间他们需要入住ICU。这些患者被分为重度疾病组。

数据收集

从电子患者档案(EPIC，EPIC Systems Corporation，Verona，WI，USA)收集临床数据和实验室结果，并记录在电子病例报告表(Castor EDC，阿姆斯特丹，荷兰)。血浆采样当天收集白细胞(WBC)计数、淋巴细胞计数、C-反应性蛋白(CRP)、铁蛋白和D-二聚体的值。记录临床结局(ICU入住、住院时长、ICU入住时长、血栓栓塞事件(TEE)发生率和死亡率)直至出院。

测量和测定

在EDTA管中收集静脉血，然后在室温下以2954g(3800rpm)离心10分钟。收集血浆并在进行等分，在-80℃下储存用于进一步分析。根据制造商的说明，使用酶联免疫吸附测定(ELISA，Quantikine，R&D systems)测量IL-6浓度，检测下限为16pg/mL。根据监管要求(EMA2011)，使用经分析验证的ELISA测定，使用市售的仅用于研究的ELISA测定(人TREM-1ELISA试剂盒，R&D systems，编号DTRM10C)，测量血浆sTREM-1水平。该方法经验证分别为34.2和2070pg/mL的定量下限和上限。对于常规分析，每轮分析含有3个水平的质量控制(QC)样品(低、中、高，QC.低＝93pg/mL，QC.中＝728pg/mL，QC.高＝1610pg/mL)，如果标准曲线和QC样品在接受标准内，则每个运行均被接受。该方法的分析性能和接受标准总结在上表1中(参见实施例1)。

统计学分析

使用SPSS版本25.0(IBM Corp.,Armonk,NY,USA)、GraphPad Prism版本8.0(GraphPad Software,Inc.,San Diego,CA,USA)和MedCalc版本19.6.4(MedCalc SoftwareLtd,Ostend,比利时)，对获得的数据进行分析。通过对连续变量的Mann-Whitney U检验和对离散变量的Fisher精确检验，评估各组之间的差异。通过Spearman秩相关检验，评估sTREM-1浓度与炎性参数之间的相关性，以及sTREM-1浓度与住院时间之间的相关性。进行接收者操作特征(ROC)分析，以通过计算曲线下面积(AUC)来评估数种生物标志物的预后表现。生物标志物的最佳截断值基于最大Youden’J指数确定，并用于通过Kaplan-Meier生存分析评估高和低生物标志物浓度在住院期间的生存差异。危险比基于对数秩检验。p值<0.05(双尾)被认为是统计学显著的。

结果

患有严重COVID-19的患者的sTREM-1浓度升高

对218名确诊为COVID-19并入住Radboudumc的患者进行了纳入研究的评估(图7)。其中，11名患者拒绝参与。此外，另外14名患者被排除在外，因为没有COVID-19诊断后首次常规采血时的血浆样品(基线)，还有一名患者因测量错误而被排除。最终研究人群(n＝192)根据疾病严重程度(中度疾病(n＝119)和重度疾病(n＝73))和结局(存活者(n＝166)和非存活者(n＝26))进行分组。在ICU收治的73名患者(即重症患者)中，72名患者需要有创机械通气。119名中度疾病患者(即未入住ICU)中，109名患者接受了氧气治疗：8名患者接受非侵入性通气，101名患者通过鼻插管或面罩补充氧气。下表8显示了COVID-19患者的特征，根据疾病严重程度(即中度疾病/重度疾病)分组。下表9显示了COVID 19患者的特征，根据结局分组(即存活者/非存活者)。

表8：验证队列中包括的患者的特征(所有患者和根据疾病严重程度分组的患者)

数据以中位数(IQR)或n(％)表示。BMI：体重指数。CRP：C-反应性蛋白。IL-6：白介素-6。

^a中度疾病相对于重度疾病(Mann-Whitney U检验)，^b总住院期间的ICU，^c在192名患者中的151名中测量。

表9：验证队列中包括的患者的特征(所有患者和根据结果分组的患者)

^a存活者相对于非存活者(Mann-Whitney U检验)，^b总住院期间的ICU，^c在192名患者中的151名中测量。

与中度疾病患者(即仅入住临床病房的患者)相比，重度疾病患者的炎性参数(CRP、D-二聚体和IL-6)浓度更高，住院时间更长(31天相对于7天，p<0.001)，死亡率更高(22％相对于8％，p＝0.010)。与存活的患者相比，非存活者年龄更大(73岁相对于64岁，p<0.001)，入住ICU的频率更高(62％相对于34％，p＝0.010)。组之间在性别、BMI、共病方面没有观察到其他差异。

如图8A所示，重症患者的sTREM-1血浆浓度与中度疾病患者相比较高(分别为235pg/mL(IQR 176-319)相对于195pg/mL(IQR 139-283)，p＝0.017)。类似地，如图8B所示，非存活者的sTREM-1血浆浓度与存活者相比较高(分别为326pg/mL(IQR 207-445)相对于199pg/mL(IQR 142-278)，p＜0.001)。

在这些亚组中分别评估了sTREM-1与疾病严重程度或死亡率之间的关系，显示存活者与非存活者之间的sTREM-1浓度差异最大(图9A-D)。

此外，发展血栓栓塞事件的患者(n＝28，14％)与无该并发症的患者相比显示出增加的sTREM-1浓度(图8C，p＝0.044)。血栓栓塞事件包括肺栓塞(n＝26)、脑血管意外(n＝2)和深静脉血栓形成(n＝1)。

此外，sTREM-1水平与总住院时间和ICU入住时间呈弱正相关(分别为r＝0.22，p＝0.002和r＝0.26，p＝0.030，图10A-B)，但未发现与基线样品采集时症状的持续时间的相关性(r＝0.09，p＝0.211；图10C)。这些后续发现表明，在重度疾病患者的病程中，sTREM-1可持续增加。

观察到sTREM-1浓度与白细胞(WBC)计数、淋巴细胞计数、C-反应性蛋白(CRP)、铁蛋白、D-二聚体和IL-6的正相关性(分别见图11A-11F)。这些发现表明sTREM-1浓度与全身炎性应答直接相关，尽管它们可能独立于标准的实验室炎性标志物，如CRP或铁蛋白。

sTREM-1对死亡率的分辨力

图12显示了基于sTREM-1浓度区分存活者和非存活者的ROC曲线(图12A)；CRP(图12B)、铁蛋白(图12C)和IL-6(图12D)的ROC曲线用于比较。下表10中提供了针对每种生物标志物进行的测试的特征。

表10：测试特性

AUC：曲线下面积。CRP：C-反应性蛋白。IL-6：白介素-6。PPV：正预测值。NPV：负预测值。

sTREM-1的AUC为0.73(95％CI 0.62-0.83)，表明存活者和非存活者之间存在中度区分性。sTREM-1的区分力与IL-6相似(AUC＝0.77，95％CI 0.65-0.88；p＝0.887)，但表现优于CRP(AUC＝0.059，95％CI 0.47-0.72；p＝0.132)和铁蛋白(AUC＝0.58，95％CI 0.66-0.70；p＝0.078)，尽管没有显著不同。

接下来，sTREM-1的生存分析表明，sTREM-1血浆浓度大于315pg/mL的患者具有增加的住院死亡风险(危险比＝3.3，95％CI 1.4-7.8)(图13A)。CRP(图13B)、铁蛋白(图13C)和IL-6(图13D)高循环浓度的死亡危险比分别为1.2(95％CI 0.4-3.7)、1.9(95％CI 0.7-5.1)和2.5(95％CI 0.9-6.9)。

sTREM-1和IL-6的组合使用并没有改善对存活者和非存活者的区分性。sTREM-1和IL-6组合的AUC为0.79，与单独IL-6的AUC无统计学差异(p＝0.562)。类似地，在生存分析中组合使用sTREM-1与IL-6(见图13E)与单独使用两种生物标志物中的任一种相比未显示出显著差异。然而，sTREM-1＞315pg/mL且IL-6＞237pg/mL的患者与sTREM-1＜315pg/mL且IL-6＜237pg/mL的患者相比观察到显著差异(HR：4.5，p＝0.005)。

上文实施例1和实施例2中展示的数据表明，COVID-19患者中的sTREM-1浓度显著升高，并显示其与疾病严重程度和死亡率相关(见图1-2和8)。因此，根据sTREM-1血浆浓度(见图12A和13A)，可能区分需要<15天的机械通气的患者和需要≥15天的机械通气的患者(见图5)，以及存活者和非存活者。因此，在进入医院或进入ICU时显示高sTREM-1的患者在15天内拔管或存活的可能性较低(见图6)。所述数据还表明，sTREM-1浓度升高与并发症的存在显著相关，所述并发症例如心血管衰竭(见图4B)和血栓栓塞事件，即血栓并发症(见图8C)。

实施例3：

材料和方法

通过ELISA(人TREM 1ELISA试剂盒，R&D Systems，编号DTRM10C)和ECLIA(来自Roche Diagnostics的Elecsys)，在从NCT03158948研究中招募的患者获得的109份血浆样品中进行sTREM-1定量。

ECLIA方法包括用生物素化的第一sTREM-1特异性抗体和用钌复合物标记的第二sTREM-1特异性抗体孵育样品，以形成夹心复合物。添加链霉亲和素包被的微粒后，第二孵育允许夹心复合物与微粒结合，从而形成固相。然后将反应混合物吸入分析仪(来自RocheDiagnostics的Cobas分析仪)的测量池中，在那里微粒被磁性捕获至电极表面上。去除未结合的物质。向电极施加电压会激发钌复合物，并引发由光电倍增管测量的化学发光。通过校准曲线确定结果。

ELISA方法包括在平板(96孔板)中对样品进行第一孵育，其中平板的孔预包被有sTREM-1特异性捕获抗体。在数次洗涤孔后，用与辣根过氧化物酶(HRP)偶联的sTREM-1特异性检测抗体孵育样品。数次洗涤后，添加比色试剂，30分钟后添加停止溶液。使用设置为450nm的微板读数器和OD 540nm的波长校正，在30分钟内测量每个孔的光密度(OD)。通过校准曲线确定结果。

结果

研究了用Elecsys sTREM-1ECLIA测定测量的sTREM-1血浆浓度和用QuantikinesTREM-1ELISA测定测量的sTREM-1血浆浓度之间的相关性。结果表明，使用两种方法获得的sTREM-1血浆浓度之间存在线性关系。如图14所示，这些测量高度相关(Pearson’s r0.962，Spearman’s rho 0.962，Kendall’stau 0.858)。使用加权戴明回归(Demingregression)的回归分析得出截距为50.0(-6.41；106)pg/ml且斜率为2.89(2.74；3.04)。

序列表

<110> 伊诺特伦公司（INOTREM）

南锡大学地区医疗中心（CENTRE HOSPITALIER REGIONAL UNIVERSITAIRE DENANCY）

洛林大学（UNIVERSITE DE LORRAINE）

国家科学研究中心（CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE）

拉德堡德大学基金会医疗中心（STICHTING RADBOUD UNIVERSITAIR MEDISCHCENTRUM）

J-J·加罗（GARAUD Jean-Jacques）

马尔克·德里夫（DERIVE Marc）

M·萨尔塞多-马吉利（SALCEDO-MAGGUILLI Margarita）

L·若利（JOLLY Lucie）

S·吉博（GIBOT Sébastien）

D·穆林（MOULIN David）

M·内泰亚（NETEA Mihai）

A·德努奥耶尔（DE NOOIJER Aline）

<120> 可溶性TREM-1作为患有冠状病毒感染的受试者的严重程度或并发症的标志物

<130> IBIO-1529/PCT

<160> 14

<170> BiSSAP 1.3.6

<210> 1

<211> 234

<212> PRT

<213> 人（Homo sapiens）

<400> 1

Met Arg Lys Thr Arg Leu Trp Gly Leu Leu Trp Met Leu Phe Val Ser

1 5 10 15

Glu Leu Arg Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys

20 25 30

Glu Gly Gln Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe

35 40 45

Ala Ser Ser Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro

50 55 60

Lys Thr Leu Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val

65 70 75 80

Gln Val Gly Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu

85 90 95

Arg Val Arg Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln

100 105 110

Cys Val Ile Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg

115 120 125

Ile Arg Leu Val Val Thr Lys Gly Phe Ser Gly Thr Pro Gly Ser Asn

130 135 140

Glu Asn Ser Thr Gln Asn Val Tyr Lys Ile Pro Pro Thr Thr Thr Lys

145 150 155 160

Ala Leu Cys Pro Leu Tyr Thr Ser Pro Arg Thr Val Thr Gln Ala Pro

165 170 175

Pro Lys Ser Thr Ala Asp Val Ser Thr Pro Asp Ser Glu Ile Asn Leu

180 185 190

Thr Asn Val Thr Asp Ile Ile Arg Val Pro Val Phe Asn Ile Val Ile

195 200 205

Leu Leu Ala Gly Gly Phe Leu Ser Lys Ser Leu Val Phe Ser Val Leu

210 215 220

Phe Ala Val Thr Leu Arg Ser Phe Val Pro

225 230

<210> 2

<211> 150

<212> PRT

<213> 人（Homo sapiens）

<400> 2

Met Arg Lys Thr Arg Leu Trp Gly Leu Leu Trp Met Leu Phe Val Ser

1 5 10 15

Glu Leu Arg Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys

20 25 30

Glu Gly Gln Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe

35 40 45

Ala Ser Ser Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro

50 55 60

Lys Thr Leu Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val

65 70 75 80

Gln Val Gly Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu

85 90 95

Arg Val Arg Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln

100 105 110

Cys Val Ile Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg

115 120 125

Ile Arg Leu Val Val Thr Lys Gly Phe Arg Cys Ser Thr Leu Ser Phe

130 135 140

Ser Trp Leu Val Asp Ser

145 150

<210> 3

<211> 225

<212> PRT

<213> 人（Homo sapiens）

<400> 3

Met Arg Lys Thr Arg Leu Trp Gly Leu Leu Trp Met Leu Phe Val Ser

1 5 10 15

Glu Leu Arg Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys

20 25 30

Glu Gly Gln Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe

35 40 45

Ala Ser Ser Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro

50 55 60

Lys Thr Leu Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val

65 70 75 80

Gln Val Gly Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu

85 90 95

Arg Val Arg Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln

100 105 110

Cys Val Ile Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg

115 120 125

Ile Arg Leu Val Val Thr Lys Gly Phe Ser Gly Thr Pro Gly Ser Asn

130 135 140

Glu Asn Ser Thr Gln Asn Val Tyr Lys Ile Pro Pro Thr Thr Thr Lys

145 150 155 160

Ala Leu Cys Pro Leu Tyr Thr Ser Pro Arg Thr Val Thr Gln Ala Pro

165 170 175

Pro Lys Ser Thr Ala Asp Val Ser Thr Pro Asp Ser Glu Ile Asn Leu

180 185 190

Thr Asn Val Thr Asp Ile Ile Arg Tyr Ser Phe Gln Val Pro Gly Pro

195 200 205

Leu Val Trp Thr Leu Ser Pro Leu Phe Pro Ser Leu Cys Ala Glu Arg

210 215 220

Met

225

<210> 4

<211> 250

<212> PRT

<213> 人（Homo sapiens）

<400> 4

Met Arg Lys Thr Arg Leu Trp Gly Leu Leu Trp Met Leu Phe Val Ser

1 5 10 15

Glu Leu Arg Ala Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys

20 25 30

Glu Gly Gln Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe

35 40 45

Ala Ser Ser Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro

50 55 60

Lys Thr Leu Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val

65 70 75 80

Gln Val Gly Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu

85 90 95

Arg Val Arg Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln

100 105 110

Cys Val Ile Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg

115 120 125

Ile Arg Leu Val Val Thr Lys Gly Phe Ser Gly Thr Pro Gly Ser Asn

130 135 140

Glu Asn Ser Thr Gln Asn Val Tyr Lys Ile Pro Pro Thr Thr Thr Lys

145 150 155 160

Ala Leu Cys Pro Leu Tyr Thr Ser Pro Arg Thr Val Thr Gln Ala Pro

165 170 175

Pro Lys Ser Thr Ala Asp Val Ser Thr Pro Asp Ser Glu Ile Asn Leu

180 185 190

Thr Asn Val Thr Asp Ile Ile Arg Glu Lys Ser Met Thr Phe Gly Ile

195 200 205

Arg Arg Leu Asp Val Glu Ser His Pro Leu Pro Pro Leu His Thr Gly

210 215 220

His Phe Arg Ile Ser Gln Phe Phe Ser Gln Ala Gly Thr Gln Ser Leu

225 230 235 240

His Ser Cys Tyr Lys Gly Lys Pro Thr Pro

245 250

<210> 5

<211> 185

<212> PRT

<213> 人（Homo sapiens）

<400> 5

Ala Thr Lys Leu Thr Glu Glu Lys Tyr Glu Leu Lys Glu Gly Gln Thr

1 5 10 15

Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu Lys Phe Ala Ser Ser Gln

20 25 30

Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu Met Pro Lys Thr Leu Ala

35 40 45

Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His Pro Val Gln Val Gly Arg

50 55 60

Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly Leu Leu Arg Val Arg Met

65 70 75 80

Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu Tyr Gln Cys Val Ile Tyr

85 90 95

Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe Asp Arg Ile Arg Leu Val

100 105 110

Val Thr Lys Gly Phe Ser Gly Thr Pro Gly Ser Asn Glu Asn Ser Thr

115 120 125

Gln Asn Val Tyr Lys Ile Pro Pro Thr Thr Thr Lys Ala Leu Cys Pro

130 135 140

Leu Tyr Thr Ser Pro Arg Thr Val Thr Gln Ala Pro Pro Lys Ser Thr

145 150 155 160

Ala Asp Val Ser Thr Pro Asp Ser Glu Ile Asn Leu Thr Asn Val Thr

165 170 175

Asp Ile Ile Arg Val Pro Val Phe Asn

180 185

<210> 6

<211> 175

<212> PRT

<213> 人（Homo sapiens）

<400> 6

Leu Lys Glu Gly Gln Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu

1 5 10 15

Lys Phe Ala Ser Ser Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu

20 25 30

Met Pro Lys Thr Leu Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His

35 40 45

Pro Val Gln Val Gly Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly

50 55 60

Leu Leu Arg Val Arg Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu

65 70 75 80

Tyr Gln Cys Val Ile Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe

85 90 95

Asp Arg Ile Arg Leu Val Val Thr Lys Gly Phe Ser Gly Thr Pro Gly

100 105 110

Ser Asn Glu Asn Ser Thr Gln Asn Val Tyr Lys Ile Pro Pro Thr Thr

115 120 125

Thr Lys Ala Leu Cys Pro Leu Tyr Thr Ser Pro Arg Thr Val Thr Gln

130 135 140

Ala Pro Pro Lys Ser Thr Ala Asp Val Ser Thr Pro Asp Ser Glu Ile

145 150 155 160

Asn Leu Thr Asn Val Thr Asp Ile Ile Arg Val Pro Val Phe Asn

165 170 175

<210> 7

<211> 107

<212> PRT

<213> 人（Homo sapiens）

<400> 7

Leu Lys Glu Gly Gln Thr Leu Asp Val Lys Cys Asp Tyr Thr Leu Glu

1 5 10 15

Lys Phe Ala Ser Ser Gln Lys Ala Trp Gln Ile Ile Arg Asp Gly Glu

20 25 30

Met Pro Lys Thr Leu Ala Cys Thr Glu Arg Pro Ser Lys Asn Ser His

35 40 45

Pro Val Gln Val Gly Arg Ile Ile Leu Glu Asp Tyr His Asp His Gly

50 55 60

Leu Leu Arg Val Arg Met Val Asn Leu Gln Val Glu Asp Ser Gly Leu

65 70 75 80

Tyr Gln Cys Val Ile Tyr Gln Pro Pro Lys Glu Pro His Met Leu Phe

85 90 95

Asp Arg Ile Arg Leu Val Val Thr Lys Gly Phe

100 105

<210> 8

<211> 18

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 引物

<400> 8

gtggtgacca aggggttc 18

<210> 9

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 引物

<400> 9

agatggatgt ggctggaagt 20

<210> 10

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 引物

<400> 10

gtgaccaagg gtttttcagg 20

<210> 11

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 引物

<400> 11

acaccggaac cctgatgata 20

<210> 12

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 引物

<400> 12

aaaggcaaga acgcctgac 19

<210> 13

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223> 引物

<400> 13

gggactttac caagagggac 20

<210> 14

<211> 1273

<212> PRT

<213> SARS冠状病毒

<220>

<223> S蛋白

<400> 14

Met Phe Val Phe Leu Val Leu Leu Pro Leu Val Ser Ser Gln Cys Val

1 5 10 15

Asn Leu Thr Thr Arg Thr Gln Leu Pro Pro Ala Tyr Thr Asn Ser Phe

20 25 30

Thr Arg Gly Val Tyr Tyr Pro Asp Lys Val Phe Arg Ser Ser Val Leu

35 40 45

His Ser Thr Gln Asp Leu Phe Leu Pro Phe Phe Ser Asn Val Thr Trp

50 55 60

Phe His Ala Ile His Val Ser Gly Thr Asn Gly Thr Lys Arg Phe Asp

65 70 75 80

Asn Pro Val Leu Pro Phe Asn Asp Gly Val Tyr Phe Ala Ser Thr Glu

85 90 95

Lys Ser Asn Ile Ile Arg Gly Trp Ile Phe Gly Thr Thr Leu Asp Ser

100 105 110

Lys Thr Gln Ser Leu Leu Ile Val Asn Asn Ala Thr Asn Val Val Ile

115 120 125

Lys Val Cys Glu Phe Gln Phe Cys Asn Asp Pro Phe Leu Gly Val Tyr

130 135 140

Tyr His Lys Asn Asn Lys Ser Trp Met Glu Ser Glu Phe Arg Val Tyr

145 150 155 160

Ser Ser Ala Asn Asn Cys Thr Phe Glu Tyr Val Ser Gln Pro Phe Leu

165 170 175

Met Asp Leu Glu Gly Lys Gln Gly Asn Phe Lys Asn Leu Arg Glu Phe

180 185 190

Val Phe Lys Asn Ile Asp Gly Tyr Phe Lys Ile Tyr Ser Lys His Thr

195 200 205

Pro Ile Asn Leu Val Arg Asp Leu Pro Gln Gly Phe Ser Ala Leu Glu

210 215 220

Pro Leu Val Asp Leu Pro Ile Gly Ile Asn Ile Thr Arg Phe Gln Thr

225 230 235 240

Leu Leu Ala Leu His Arg Ser Tyr Leu Thr Pro Gly Asp Ser Ser Ser

245 250 255

Gly Trp Thr Ala Gly Ala Ala Ala Tyr Tyr Val Gly Tyr Leu Gln Pro

260 265 270

Arg Thr Phe Leu Leu Lys Tyr Asn Glu Asn Gly Thr Ile Thr Asp Ala

275 280 285

Val Asp Cys Ala Leu Asp Pro Leu Ser Glu Thr Lys Cys Thr Leu Lys

290 295 300

Ser Phe Thr Val Glu Lys Gly Ile Tyr Gln Thr Ser Asn Phe Arg Val

305 310 315 320

Gln Pro Thr Glu Ser Ile Val Arg Phe Pro Asn Ile Thr Asn Leu Cys

325 330 335

Pro Phe Gly Glu Val Phe Asn Ala Thr Arg Phe Ala Ser Val Tyr Ala

340 345 350

Trp Asn Arg Lys Arg Ile Ser Asn Cys Val Ala Asp Tyr Ser Val Leu

355 360 365

Tyr Asn Ser Ala Ser Phe Ser Thr Phe Lys Cys Tyr Gly Val Ser Pro

370 375 380

Thr Lys Leu Asn Asp Leu Cys Phe Thr Asn Val Tyr Ala Asp Ser Phe

385 390 395 400

Val Ile Arg Gly Asp Glu Val Arg Gln Ile Ala Pro Gly Gln Thr Gly

405 410 415

Lys Ile Ala Asp Tyr Asn Tyr Lys Leu Pro Asp Asp Phe Thr Gly Cys

420 425 430

Val Ile Ala Trp Asn Ser Asn Asn Leu Asp Ser Lys Val Gly Gly Asn

435 440 445

Tyr Asn Tyr Leu Tyr Arg Leu Phe Arg Lys Ser Asn Leu Lys Pro Phe

450 455 460

Glu Arg Asp Ile Ser Thr Glu Ile Tyr Gln Ala Gly Ser Thr Pro Cys

465 470 475 480

Asn Gly Val Glu Gly Phe Asn Cys Tyr Phe Pro Leu Gln Ser Tyr Gly

485 490 495

Phe Gln Pro Thr Asn Gly Val Gly Tyr Gln Pro Tyr Arg Val Val Val

500 505 510

Leu Ser Phe Glu Leu Leu His Ala Pro Ala Thr Val Cys Gly Pro Lys

515 520 525

Lys Ser Thr Asn Leu Val Lys Asn Lys Cys Val Asn Phe Asn Phe Asn

530 535 540

Gly Leu Thr Gly Thr Gly Val Leu Thr Glu Ser Asn Lys Lys Phe Leu

545 550 555 560

Pro Phe Gln Gln Phe Gly Arg Asp Ile Ala Asp Thr Thr Asp Ala Val

565 570 575

Arg Asp Pro Gln Thr Leu Glu Ile Leu Asp Ile Thr Pro Cys Ser Phe

580 585 590

Gly Gly Val Ser Val Ile Thr Pro Gly Thr Asn Thr Ser Asn Gln Val

595 600 605

Ala Val Leu Tyr Gln Asp Val Asn Cys Thr Glu Val Pro Val Ala Ile

610 615 620

His Ala Asp Gln Leu Thr Pro Thr Trp Arg Val Tyr Ser Thr Gly Ser

625 630 635 640

Asn Val Phe Gln Thr Arg Ala Gly Cys Leu Ile Gly Ala Glu His Val

645 650 655

Asn Asn Ser Tyr Glu Cys Asp Ile Pro Ile Gly Ala Gly Ile Cys Ala

660 665 670

Ser Tyr Gln Thr Gln Thr Asn Ser Pro Arg Arg Ala Arg Ser Val Ala

675 680 685

Ser Gln Ser Ile Ile Ala Tyr Thr Met Ser Leu Gly Ala Glu Asn Ser

690 695 700

Val Ala Tyr Ser Asn Asn Ser Ile Ala Ile Pro Thr Asn Phe Thr Ile

705 710 715 720

Ser Val Thr Thr Glu Ile Leu Pro Val Ser Met Thr Lys Thr Ser Val

725 730 735

Asp Cys Thr Met Tyr Ile Cys Gly Asp Ser Thr Glu Cys Ser Asn Leu

740 745 750

Leu Leu Gln Tyr Gly Ser Phe Cys Thr Gln Leu Asn Arg Ala Leu Thr

755 760 765

Gly Ile Ala Val Glu Gln Asp Lys Asn Thr Gln Glu Val Phe Ala Gln

770 775 780

Val Lys Gln Ile Tyr Lys Thr Pro Pro Ile Lys Asp Phe Gly Gly Phe

785 790 795 800

Asn Phe Ser Gln Ile Leu Pro Asp Pro Ser Lys Pro Ser Lys Arg Ser

805 810 815

Phe Ile Glu Asp Leu Leu Phe Asn Lys Val Thr Leu Ala Asp Ala Gly

820 825 830

Phe Ile Lys Gln Tyr Gly Asp Cys Leu Gly Asp Ile Ala Ala Arg Asp

835 840 845

Leu Ile Cys Ala Gln Lys Phe Asn Gly Leu Thr Val Leu Pro Pro Leu

850 855 860

Leu Thr Asp Glu Met Ile Ala Gln Tyr Thr Ser Ala Leu Leu Ala Gly

865 870 875 880

Thr Ile Thr Ser Gly Trp Thr Phe Gly Ala Gly Ala Ala Leu Gln Ile

885 890 895

Pro Phe Ala Met Gln Met Ala Tyr Arg Phe Asn Gly Ile Gly Val Thr

900 905 910

Gln Asn Val Leu Tyr Glu Asn Gln Lys Leu Ile Ala Asn Gln Phe Asn

915 920 925

Ser Ala Ile Gly Lys Ile Gln Asp Ser Leu Ser Ser Thr Ala Ser Ala

930 935 940

Leu Gly Lys Leu Gln Asp Val Val Asn Gln Asn Ala Gln Ala Leu Asn

945 950 955 960

Thr Leu Val Lys Gln Leu Ser Ser Asn Phe Gly Ala Ile Ser Ser Val

965 970 975

Leu Asn Asp Ile Leu Ser Arg Leu Asp Lys Val Glu Ala Glu Val Gln

980 985 990

Ile Asp Arg Leu Ile Thr Gly Arg Leu Gln Ser Leu Gln Thr Tyr Val

995 1000 1005

Thr Gln Gln Leu Ile Arg Ala Ala Glu Ile Arg Ala Ser Ala Asn Leu

1010 1015 1020

Ala Ala Thr Lys Met Ser Glu Cys Val Leu Gly Gln Ser Lys Arg Val

1025 1030 1035 1040

Asp Phe Cys Gly Lys Gly Tyr His Leu Met Ser Phe Pro Gln Ser Ala

1045 1050 1055

Pro His Gly Val Val Phe Leu His Val Thr Tyr Val Pro Ala Gln Glu

1060 1065 1070

Lys Asn Phe Thr Thr Ala Pro Ala Ile Cys His Asp Gly Lys Ala His

1075 1080 1085

Phe Pro Arg Glu Gly Val Phe Val Ser Asn Gly Thr His Trp Phe Val

1090 1095 1100

Thr Gln Arg Asn Phe Tyr Glu Pro Gln Ile Ile Thr Thr Asp Asn Thr

1105 1110 1115 1120

Phe Val Ser Gly Asn Cys Asp Val Val Ile Gly Ile Val Asn Asn Thr

1125 1130 1135

Val Tyr Asp Pro Leu Gln Pro Glu Leu Asp Ser Phe Lys Glu Glu Leu

1140 1145 1150

Asp Lys Tyr Phe Lys Asn His Thr Ser Pro Asp Val Asp Leu Gly Asp

1155 1160 1165

Ile Ser Gly Ile Asn Ala Ser Val Val Asn Ile Gln Lys Glu Ile Asp

1170 1175 1180

Arg Leu Asn Glu Val Ala Lys Asn Leu Asn Glu Ser Leu Ile Asp Leu

1185 1190 1195 1200

Gln Glu Leu Gly Lys Tyr Glu Gln Tyr Ile Lys Trp Pro Trp Tyr Ile

1205 1210 1215

Trp Leu Gly Phe Ile Ala Gly Leu Ile Ala Ile Val Met Val Thr Ile

1220 1225 1230

Met Leu Cys Cys Met Thr Ser Cys Cys Ser Cys Leu Lys Gly Cys Cys

1235 1240 1245

Ser Cys Gly Ser Cys Cys Lys Phe Asp Glu Asp Asp Ser Glu Pro Val

1250 1255 1260

Leu Lys Gly Val Lys Leu His Tyr Thr

1265 1270

Claims

1.一种用于鉴定患有由冠状病毒感染导致的疾病的受试者为具有以下风险的体外方法，所述风险为具有由冠状病毒感染导致的疾病的严重形式和/或并发症，或发展由冠状病毒感染导致的疾病的严重形式和/或并发症，或冠状病毒感染后发生死亡，所述方法包括：

-测量来自所述受试者的生物样品中的在髓样细胞上表达的可溶性触发受体-1(sTREM-1)的水平；和

-将来自所述受试者的生物样品中测量的sTREM-1水平与参考值进行比较。

2.根据权利要求1所述的体外方法，其中所述由冠状病毒感染导致的疾病的并发症选自以下：呼吸衰竭，包括急性呼吸衰竭或急性呼吸窘迫综合征(ARDS)；持续呼吸衰竭，包括需要长期机械通气，尤其是持续15天以上的长期机械通气，以及拔管失败；继发感染或超感染；血栓并发症，包括静脉和/或动脉血栓栓塞；肺栓塞；心脏循环系统衰竭(也称为心血管衰竭)；肾衰竭，例如急性肾损伤(AKI)；肝衰竭；及其任意组合。

3.一种用于确定受试者中由冠状病毒感染导致的疾病的严重程度的体外方法，所述方法包括：

-将在来自所述受试者的生物样品中测量的sTREM-1水平与参考值进行比较。

4.根据权利要求3所述的体外方法，其中所述方法允许随时间监测所述受试者中由冠状病毒感染导致的疾病，并且其中所述方法包括测量在至少两个时间获得的所述受试者的生物样品中sTREM-1的水平，优选地所述至少两个时间间隔至少24小时。

5.根据权利要求1至4中任一项所述的体外方法，其中所述冠状病毒是严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)，并且由冠状病毒感染导致的疾病是冠状病毒病2019(COVID-19)。

6.根据权利要求1至5中任一项所述的体外方法，其中所述sTREM-1水平是sTREM-1的转录水平或sTREM-1的翻译水平。

7.根据权利要求1至6中任一项所述的体外方法，其中所述生物样品是血液样品，优选是血清样品。

8.根据权利要求1至7中任一项所述的体外方法，其中所述受试者需要住院。

9.根据权利要求8所述的体外方法，其中所述受试者需要呼吸支持。

10.根据权利要求8或9所述的体外方法，其中在住院后第3天测量sTREM-1的水平。