CN116194596A - 用于检测和预测3级宫颈上皮瘤变(cin3)和/或癌症的方法 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及用于预测个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展的测定方法,其通过确定取自个体的样本中的DNA分子群体中某些CpG的甲基化状态;基于所述某些CpG的甲基化状态推导指数值;和基于所述癌症指数值预测所述个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展。本发明进一步涉及一种治疗和/或预防个体中的癌症,特别是宫颈癌和子宫内膜癌的方法,所述方法包括通过实施本发明的测定方法来评估个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展,随后基于所述评估向所述个体施用一种或多种疗效性治疗或措施。本发明进一步提供了一种根据个体的癌症指数值随时间的改变监测所述个体的CIN3和/或癌症状态的方法。本发明进一步涉及适合用于实施本发明的测定方法的芯片。
Description
序列表
本申请包含已以ASCII格式以电子方式提交的序列表,并由此通过引用整体并入本文。所述ASCII副本创建于2021年6月9日,名为‘Sequence listing as filed 17 June2021 N417235WO MGW JAS.txt’,大小为3,022,158字节。
技术领域
本发明涉及测定方法,所述测定方法用于预测个体中3级宫颈上皮内瘤变(grade3 cervical intra-epithelial neoplasia,CIN3)和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展,其通过确定取自个体的样本中的DNA分子群体中某些CpG的甲基化状态;基于所述某些CpG的甲基化状态推导指数值;和基于所述癌症指数值预测所述个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展。本发明进一步涉及一种治疗和/或预防个体中的CIN3和/或宫颈癌的方法,所述方法包括通过实施本发明的测定方法来评估个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展,随后基于所述评估向所述个体施用一种或多种疗效性或预防性治疗或措施。本发明进一步提供了一种根据个体的癌症指数值随时间的改变监测所述个体的CIN3和/或癌症状态的方法。本发明进一步涉及适合用于实施本发明的测定方法的芯片(array)。
促成本申请的项目由欧盟委员会的地平线2020研究与创新行动、根据第634570号资助协议的H2020 FORECEE、欧盟委员会的地平线2020欧洲研究理事会执行机构、根据第742432号资助协议资助的H2020 BRCA-ERC以及慈善机构The Eve Appeal资助。
背景技术
宫颈癌筛查是迄今为止最成功的个性化癌症预防策略;筛查的目的是鉴定出有浸润前病变的女性,然后通过手术将病变切除。
目前,大多数国家正在将筛查从细胞学检查改变为HPV测试作为主要筛查,并利用细胞学检查对HPV+ve女性实施分诊以实施阴道镜评估。然而,基于HPV的筛查仍然存在一些挑战:
(1)HPV的低特异性:HPV在细胞学检查-ve女性中非常普遍,取决于年龄和国家的不同,至多为24%,甚至在接种HPV疫苗的女性中,HPV感染的患病率为约5%。
(2)HPV+ve女性的低细胞学检查灵敏度:HPV+ve女性中约31%的CIN3+(CIN3或浸润性癌症)主要为细胞学检查-ve,在12个月后因HPV持续性引发的阴道镜检查或变为细胞学检查+ve才被诊断为CIN3+。
(3)欧洲国家的参与率在40.5%和81.4%之间不等,并且提高参与度的努力至关重要。最近的一项荟萃分析(meta-analysis)提供了表明自行采样比临床医生采样具有更高的接受度的强有力的证据。HPV测试表明自行采集样本和临床医生采集样本的结果相当,但提供自行采集样本的女性中只有不到60%的人遵守后续建议,这一事实表明,需要基于测试HPV+ve的相同的自行采集样本对女性实施分诊的除细胞学检查外的其它测试,以提高可接受性和最终的参与率。
迄今为止,在诊断CIN3+方面,针对HPV+ve女性的最佳分诊算法是p16/Ki-67双重免疫染色;细胞学检查和双重染色的特异性均为75%,但与常规细胞学检查(51.9%)相比,双重染色更灵敏(74.9%)。
本发明人连同其它研究人员先前已经表明了利用DNA甲基化标志物来鉴定患有浸润前或浸润性癌症的女性的可行性。临床使用DNA甲基化标志物来鉴定CIN3+高风险的女性受到以下几个因素的阻碍:
(i)检测CIN3或CIN 3+的灵敏度低得令人无法接受,尤其是在HPV患病率显著较高的年轻女性中。因此,这些女性对高性能分诊测试的需求增加,例如,GynTect测试(利用六个基因的DNA甲基化)对CIN3的灵敏度在<30岁女性的35%和≥30岁女性的76%之间不等,并且QIAsure(使用两个基因的甲基化)检测CIN3+的灵敏度在<30岁细胞学检查异常女性的37.5%和≥30岁细胞学检查异常女性的89.3%之间不等。
(ii)低特异性,其也与年龄相关并且与细胞学检查相当,范围为≥30岁女性的76.6%至<30岁女性的87.8%。
(iii)缺乏数据,因此无法判断DNA甲基化标志物或标志物组是否能够鉴定出在评估时为细胞学检查-ve但在随后的几年中继续发展为CIN3+的HPV+ve女性。
使用基于队列的嵌套病例/对照设置,发明人开发并验证了宫颈涂片样本中的DNA甲基化特征(被称为女性癌症风险鉴定CIN3指数,WID-CIN3-指数),它能够诊断和预测个体中的CIN3+以及癌症,特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌的风险。
发明内容
本发明人阐述以理解是否可以使用DNAme(DNA甲基化)特征来检测是否存在3级宫颈上皮内瘤变(CIN3)和/或宫颈癌。发明人还阐述以理解是否可以将所述DNAme特征与CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的发展相关联,以及因此这些特征是否能够用作替代标志物用于与CIN3和/或宫颈癌相关的个体分层目的。
在这方面,发明人已经成功地开发了涉及“癌症指数值”的测定方法,所述癌症指数值源自从包括上皮细胞的样本建立的DNAme特征并与其相关联。所述样本可以特别地源自宫颈、阴道、颊区域、血液和/或尿液。所述样本优选地是宫颈液基细胞学检查样本,并且更优选地是宫颈涂片样本,其值可以用于对与癌症相关地对个体实施分层。用于本文描述和定义的任何测定方法的优选样本是宫颈组织样本。用于本文描述和定义的任何测定方法的特别优选的样本是宫颈涂片样本。
癌症指数值从与如本文进一步定义和描述的含有CpG的组中的一个或多个CpG的甲基化状态有关的数据确定。所述组的CpG是来自细胞的DNA中的甲基化位点,所述细胞源自/获自其中保留了天然组织结构的组织样本,例如活检或包括来自组织表面的脱落细胞的样本。所述样本可以包括上皮细胞。所述样本可以特别地源自宫颈、阴道、颊区域、血液和/或尿液。所述样本优选地是宫颈涂片样本,并且更优选地是宫颈液基细胞学检查样本,其可以由医疗保健专业人员或女性自己采集(自行采集)。
为了本发明的目的,所述癌症指数值在本文中可以与“WID-CIN-指数”、“WID-指数”、“癌症指数”、“指数”或“指数值”互换使用(WID=女性风险鉴定(WID=women’s riskidentification))。此外,在本发明的上下文中对癌症指数值的任何引用可以同样用于评估个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展。
基于对已知为CIN3阴性和/或无宫颈癌的患者的研究,发明人已经使用含有CpG的特异性组建立了癌症指数值,其已被确定为与CIN3阴性和/或宫颈癌阴性的宫颈组织相关联/具有其特征。基于对已知患有CIN3和/或宫颈癌的患者的研究,发明人建立了癌症指数值,其已被确定为与CIN3和/或宫颈癌阳性的宫颈组织相关联/具有其特征。基于对已知为CIN3阴性和/或无宫颈癌的患者的研究,其中相同患者在一至四年后的测定方法中随后被示出确定为CIN3阳性和/或宫颈癌阳性,发明人建立了癌症指数值,其已被确定为与CIN3和/或宫颈癌阳性的宫颈组织相关联/具有其特征。
因此,发明人已经能够使用含有CpG的特异性组建立癌症指数值,其可以将个体表征为患有CIN3和/或癌症或未患有CIN3和/或癌症,或具有CIN3和/或癌症发展的高风险。所述癌症优选地是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选地是宫颈癌。
通过从源自个体的样本确定基于甲基化特征的癌症指数值,可以将个体看成是具有某一癌症指数值,所述癌症指数值与经由本文所述的发明人的研究已知为CIN3阳性或阴性和/或宫颈癌阳性或阴性,或成为CIN3阳性或阴性和/或宫颈癌阳性或阴性的个体所具有的那些癌症指数值相关。这种相关性已以高度的统计准确性,特别是关于与生物测定方法相关的参数,例如接受者操作特征(ROC)灵敏度和特异性以及曲线下面积(AUC)确定。因此,通过从来自给定个体的样本确定癌症指数值,可以确定所述个体具有CIN3和/或癌症阳性的宫颈组织,即所述个体被诊断为患有CIN3和/或宫颈癌。相反,通过从来自给定个体的样本确定癌症指数值,可以确定所述个体具有CIN3和/或癌症阴性的宫颈组织,即所述个体被诊断为未患有CIN3和/或宫颈癌。
根据本发明的测定方法对CIN3的评估可以鉴定未来可能发展CIN3的个体,特别是从使用本文所述的一种或多种测定方法对个体实施首次评估之日起约四年内。
根据本发明的测定方法对癌症发展的评估可以指评估个体中的预先存在的癌症病变的进展或恶化。根据本发明的测定方法对癌症发展的评估可以指预测癌症复发的可能性。
本文描述的观察结果证实,如本文进一步描述和定义的癌症指数值是动态的并且可以随时间改变。因此,癌症指数值可以用于监测个体的癌症状态和癌症发展的风险。此外,癌症指数值可以用于监测施用于个体的癌症治疗的功效,包含疗效性治疗和预防性治疗。
因此,在本发明的上下文中,通过从来自给定个体的样本确定癌症指数值,可以评估个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展,或者换句话说,针对癌症对个体实施分层。在本发明的上下文中,针对癌症的分层是将个体分类为具有与癌症(包含个体中是否存在癌症或癌症发展)有关的表型的个体群组中的一员的过程,即通过具有上皮细胞,其特别地源自宫颈、阴道、颊区域、血液和/或尿液,更优选地是宫颈涂片样本,甚至更优选地是宫颈液基细胞学检查样本。
如本文所解释,本发明的测定方法方法基于源自来源于细胞的DNA的甲基化特征的癌症指数值,所述细胞特别地源自宫颈、阴道、颊区域、血液和/或尿液,更优选地是宫颈液基细胞学检查样本,甚至更优选地是宫颈涂片样本。因此,所述测定方法提供了用于以高统计准确性将上皮细胞或最优选宫颈涂片样本源性DNA甲基化特征与与宫颈癌或子宫内膜癌相关的状态相关联的手段,其范围为从癌症阴性个体到癌症阳性个体。因为本发明的测定方法提供了甲基化特征和疾病状态之间的相关性,所以技术人员将理解,作为分层过程和结果的一部分,疾病状态基于可能性来指定。因此,本发明的方法提供了可预测个体的关于癌症的状态的测定方法。因此,本发明的测定方法提供了用于预测个体中是否存在癌症的手段。因此,本发明的测定方法还提供了用于预测个体中的癌症发展的手段。本发明的测定方法可以提供用于预测个体中的癌症发展的手段,因为发明人已经证明特定癌症指数值可以定义癌症阴性的宫颈和子宫内膜组织,而其它可以定义癌症阳性的宫颈和子宫内膜组织,并且由于特定癌症指数值可能是动态的并且由此随着肿瘤分期和进一步增加的癌症风险因素(例如,女性绝经后)而增加,所述值可能会随着癌症风险的改变而改变。
尽管可以基于可能性来指定疾病状态,但发明人在本文中已经证明,可以使用与生物测定方法相关的参数以非常高的统计准确性实现DNA甲基化特征和使用癌症指数值的癌症状态之间的相关性,如本文进一步描述。因此,本发明的测定方法提供了用于预测个体中癌症的存在、不存在或发展以及针对癌症对个体实施分层的手段,并且其中所述预测/分层可以被定义为在统计上高度可靠和稳健。这反过来意味着可以以高置信水平实施所述预测/分层。如本文进一步描述和定义,可以通过本领域已知的手段将本发明的测定方法定义为统计学上准确的。可以根据与其统计特异性和灵敏度相关的参数来定义本发明的测定方法。这些参数定义了假阳性和假阴性测试结果的可能性。假阳性和假阴性测试结果的比例越低,测定方法在统计学上就越准确。在这方面,发明人已经建立了CpG组,如本文进一步描述和定义,其中组中的CpG的甲基化状态可以用于建立癌症指数值,使得所述测定方法产生癌症状态的统计学上准确的预测。因此,发明人已经确定,本文描述的测定方法可以根据统计参数(例如,特异性和灵敏度百分比)以及通过接受者操作特征(ROC)曲线下面积(AUC)来定义。所有这些手段在本领域中是已知的并且已知是生物学测定方法的统计准确性的限定量度,例如本文描述和定义的那些。
因此,本发明的方法提供了可以用于以高度统计准确性预测CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展的测定方法。本发明的方法提供了可以用于以高度统计准确性针对癌症状态对个体实施分层的测定方法。因此,本发明的方法为个体和他们的医生提供了关于患者癌症状态的有用信息。如果鉴定出个体中的癌症的存在,则本信息可能有助于告知实际疗效性治疗措施。通过在一段时间内监测癌症指数值的改变,所述信息可能有助于监测个体中的疗效性治疗措施的进展。通过在一段时间内监测癌症指数值的改变,所述信息可能有助于监测个体中的预防疾病性或预防性治疗措施的进展。因此,本发明的方法在个体中的个性化预防和早期检测以及癌症治疗和管理方面提供了显著优势。
因此,本发明提供了一种用于评估个体中3级宫颈上皮内瘤变(CIN3)和/或癌症的存在、不存在或发展的测定方法,所述测定方法包括:
1.提供取自所述个体的样本,所述样本包括DNA分子群体;
2.在所述样本中的所述DNA分子群体中确定以下组的甲基化状态:
i.一个或多个CpG,其选自SEQ ID NO:1至5000中鉴定的CpG的组,其中所述CpG在核苷酸位置61至62处鉴定;和/或
ii.一个或多个CpG,其选自由SEQ ID NO:5001至5418定义的一个或多个差异甲基化区域(DMR)的组,其中所述CpG由CG表示;
3.基于所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态推导癌症指数值;和
4.基于所述癌症指数值评估所述个体中CIN3和/或癌症的存在、不存在或发展,优选地,其中所述癌症是宫颈癌;
其中所述测定方法的特征在于具有0.60或更大的曲线下面积(AUC),如通过接受者操作特征(ROC)所确定的。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中所述一个或多个CpG的组包括至少500个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.80的AUC。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至500中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的AUC。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中所述一个或多个CpG的组包括至少1000个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.80的AUC。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至1000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的AUC。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中所述一个或多个CpG的组包括至少1500个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.82的AUC。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至1500中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的AUC。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中所述一个或多个CpG的组包括至少2000个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.81的AUC。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至2000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的AUC。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述5000个CpG,并且另外地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的AUC。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中在所述样本中的所述DNA分子群体中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定每个CpG的β值。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中基于所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态推导所述癌症指数值的所述步骤包括:
1.提供包括所述组中的每个CpG的所述甲基化β值的甲基化β值数据集;
2.提供能够从所述甲基化β值数据集生成所述癌症指数的数学模型;和
3.将所述数学模型应用于所述甲基化β值数据集,从而生成所述癌症指数。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中所述癌症指数值是WID-CIN-指数癌症指数值,并且其中应用于所述甲基化β值数据集以生成所述癌症指数的所述数学模型是根据以下公式的算法:
其中:
1.β1,...,βn是甲基化β值(介于0和1之间);
2.w1,...,w5000是实值系数;
3.μ和σ是用于缩放所述指数的实值参数;并且
4.n指所述一个或多个CpG的组中的CpG的数量;
优选地,其中所述癌症是宫颈癌。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中当所述个体的所述癌症指数值为约-0.331或更大时,所述个体被评估为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,或其中当所述个体的所述癌症指数值小于约-0.331时,所述个体被评估为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,优选地,其中:
a.所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少500个,并且其中灵敏度为至少87%,且特异性为至少49%;
b.所述一个或多个CpG的组包括由SEQ ID NO:1至500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少86%,且特异性为至少77%;
c.所述一个或多个CpG的组包括由SEQ ID NO:1至1000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少87%,且特异性为至少77%;或
d.所述一个或多个CpG的组包括由SEQ ID NO:1至1500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少89%,且特异性为至少76%;
优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化β值,更优选地,其中所述癌症是宫颈癌。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中当所述个体的所述癌症指数值为约-0.167或更大时,所述个体被评估为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,或其中当所述个体的所述癌症指数值小于约-0.167时,所述个体被评估为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,优选地,其中:
a.所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少500个,并且其中灵敏度为至少80%,且特异性为至少61%;
b.所述一个或多个CpG的组包括由SEQ ID NO:1至500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少77%,且特异性为至少90%;
c.所述一个或多个CpG的组包括由SEQ ID NO:1至1000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少72%,且特异性为至少89%;或
d.所述一个或多个CpG的组包括由SEQ ID NO:1至1500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少78%,且特异性为至少91%;
优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化β值,更优选地,其中所述癌症是宫颈癌。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中确定一个或多个CpG的组的甲基化状态的所述步骤包括确定由SEQ ID NO:5001至5418定义的一个或多个DMR的组中鉴定的由CG表示的一个或多个CpG的甲基化状态,任选地,其中所述一个或多个CpG的组包括所述DMR的组中鉴定的由CG表示的两个或更多个CpG、所述DMR的组中鉴定的由CG表示的三个或更多个CpG、所述DMR的组中鉴定的由CG表示的四个或更多个CpG、或由SEQ ID NO:5001至5418定义的所述DMR中鉴定的由CG表示的所有CpG。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中确定所述一个或多个CpG的组的甲基化状态的所述步骤包括确定在由SEQ ID NO:5001至5418定义的所述DMR中的任一个或多个内的由CG表示的所述CpG中的五个或更多个、六个或更多个、七个或更多个、八个或更多个、或九个或更多个、或所有的甲基化状态。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中确定一个或多个CpG的组的甲基化状态的所述步骤包括确定在以下范围内的由CG表示的所述CpG中的两个或更多个、三个或更多个、四个或更多个、五个或更多个、六个或更多个、七个或更多个、八个或更多个、或九个或更多个、或所有的甲基化状态:
1.DMR 1至418中的两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个或九个或更多个的任意组合;
2.DMR 1至418中的十个、二十个、三十个、四十个、五十个、六十个、七十个、八十个或九十个或更多个的任意组合;
3.DMR 1至418中的所有418个;
4.由SEQ ID NO:5001定义的一个DMR、由SEQ ID NO:5001至5002定义的两个DMR、由SEQ ID NO:5001至5003定义的三个DMR、由SEQ ID NO:5001至5004定义的四个DMR、由SEQID NO:5001至5005定义的五个DMR、由SEQ ID NO:5001至5006定义的六个DMR、由SEQ IDNO:5001至5007定义的七个DMR、由SEQ ID NO:5001至5008定义的八个DMR、或由SEQ ID NO:5001至5009定义的九个DMR;
5.由SEQ ID NO:5391、SEQ ID NO:5392、SEQ ID NO:5393、SEQ ID NO:5407和SEQID NO:5414定义的一个或多个DMR的任意组合,优选地,在所有SEQ ID NO:5391、SEQ IDNO:5392、SEQ ID NO:5393、SEQ ID NO:5407和SEQ ID NO:5414内;
6.由SEQ ID NO:5392、SEQ ID NO:5393和SEQ ID NO:5407定义的一个或多个DMR的任意组合,优选地,在所有SEQ ID NO:5392、SEQ ID NO:5393和SEQ ID NO:5407内;
7.由SEQ ID NO:5001至5010定义的十个DMR、由SEQ ID NO:5001至5020定义的二十个DMR、由SEQ ID NO:5001至5030定义的三十个DMR、由SEQ ID NO:5001至5040定义的四十个DMR、由SEQ ID NO:5001至5050定义的五十个DMR、由SEQ ID NO:5001至5060定义的六十个DMR、由SEQ ID NO:5001至5070定义的七十个DMR、由SEQ ID NO:5001至5080定义的八十个DMR、或由SEQ ID NO:5001至5090定义的九十个DMR;
8.由SEQ ID NO:5001至5050、SEQ ID NO:5051至5100、SEQ ID NO:5101至5150、SEQ ID NO:5151至5200、SEQ ID NO:5201至5250、SEQ ID NO:5301至5350、或SEQ ID NO:5341至5418定义的五十个DMR;或
9.由SEQ ID NO:5015、5016、5017、5025、5026、5027、5028、5029、5032、5033、5048、5049、5050、5053、5054、5057、5068、5069、5071、5072、5073、5074、5075、5076、5077、5083、5090、5091、5092、5093、5094、5095、5096、5099、5102、5137、5138、5140、5143、5146、5147、5148、5149、5150、5151、5164、5165、5167、5175、5176、5177、5179、5180、5185、5204、5224、5226、5228、5232、5246、5248、5285、5287、5293、5307、5309、5315、5317、5324、5328、5337、5339、5340、5348、5349、5354、5361、5362、5366、5368和5377定义的八十一个DMR。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中确定一个或多个CpG的组的甲基化状态的所述步骤包括确定选自由如由SEQ ID NO:5001至5418定义的DMR 1至418组成的DMR群组的任一个或多个DMR内的一个或多个CpG的甲基化状态,包含:
1.在如由SEQ ID NO:5001定义的DMR 1内的并由CG表示的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.894的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
2.在如由SEQ ID NO:5002定义的DMR 2内的并由CG表示的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.894的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
3.在如由SEQ ID NO:5003定义的DMR 3内的并由CG表示的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.894的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
4.在如由SEQ ID NO:5004定义的DMR 4内的并由CG表示的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.894的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
5.在如由SEQ ID NO:5005定义的DMR 5内的并由CG表示的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.894的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
6.在如由SEQ ID NO:5006定义的DMR 6内的并由CG表示的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.876的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
7.在如由SEQ ID NO:5007定义的DMR 7内的并由CG表示的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.874的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
8.在如由SEQ ID NO:5008定义的DMR 8内的并由CG表示的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.874的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
9.在如由SEQ ID NO:5009定义的DMR 9内的并由CG表示的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.874的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;和/或
10.在如由SEQ ID NO:5010定义的DMR 10内的并由CG表示的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.874的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中:
1.当所述个体的所述癌症指数为约0.016或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险;或
2.当所述个体的所述癌症指数小于约0.016时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症;
优选地,其中所述测定方法具有75%或更高的特异性,更优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的平均β值。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中:
1.其癌症指数值被确定的由CG表示的CpG位于由SEQ ID NO:5001定义的至少DMR1内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.023或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 1的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5001中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
2.其癌症指数值被确定的由CG表示的CpG位于由SEQ ID NO:5001定义的至少DMR1内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.023时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 1的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5001中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
3.其癌症指数值被确定的由CG表示的CpG位于由SEQ ID NO:5002定义的至少DMR2内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.023或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 2的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5002中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
4.其癌症指数值被确定的由CG表示的CpG位于由SEQ ID NO:5002定义的至少DMR2内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.023时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 2的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5002中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
5.其癌症指数值被确定的由CG表示的CpG位于由SEQ ID NO:5003定义的至少DMR3内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.023或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 3的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5003中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
6.其癌症指数值被确定的由CG表示的CpG位于由SEQ ID NO:5003定义的至少DMR3内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.023时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 3的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5003中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
7.其癌症指数值被确定的由CG表示的CpG位于由SEQ ID NO:5004定义的至少DMR4内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.023或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 4的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5004中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
8.其癌症指数值被确定的由CG表示的CpG位于由SEQ ID NO:5004定义的至少DMR4内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.023时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 4的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5004中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
9.其癌症指数值被确定的由CG表示的CpG位于由SEQ ID NO:5005定义的至少DMR5内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.023或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 5的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5005中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;和/或
10.其癌症指数值被确定的由CG表示的CpG位于由SEQ ID NO:5005定义的至少DMR5内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.023时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 5的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5005中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤进一步包括或另外包括确定由SEQ ID NO:5703至5786鉴定的所述序列中的一个或多个内的每个CpG的甲基化状态。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定在以下范围内的每个CpG:
1.SEQ ID NO:5759和/或SEQ ID NO:5703和/或SEQ ID NO:5731,并且其中当所述癌症指数值为约1.146或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少95.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.96,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5759和/或SEQ ID NO:5703和/或SEQ ID NO:5731定义的序列的甲基化参考百分比;
2.SEQ ID NO:5759和/或SEQ ID NO:5703和/或SEQ ID NO:5731,并且其中当所述癌症指数值小于约1.146时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少95.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.96,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5759和/或SEQ ID NO:5703和/或SEQ ID NO:5731定义的序列的甲基化参考百分比;
3.SEQ ID NO:5760和/或SEQ ID NO:5704和/或SEQ ID NO:5732,并且其中当所述癌症指数值为约0.473或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,所述测定方法的特异性为至少85.00%,并且AUC为0.96,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5760和/或SEQ ID NO:5704和/或SEQ ID NO:5732定义的序列的甲基化参考百分比;
4.SEQ ID NO:5760和/或SEQ ID NO:5704和/或SEQ ID NO:5732,并且其中当所述癌症指数值小于约0.473时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,所述测定方法的特异性为至少85.00%,并且AUC为0.96,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5760和/或SEQ ID NO:5704和/或SEQ ID NO:5732定义的序列的甲基化参考百分比;
5.SEQ ID NO:5761和/或SEQ ID NO:5705和/或SEQ ID NO:5733,并且其中当所述癌症指数值为约1.546或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少95.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.95,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5761定义的序列的甲基化参考百分比;
6.SEQ ID NO:5761和/或SEQ ID NO:5705和/或SEQ ID NO:5733,并且其中当所述癌症指数值小于约1.546时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少95.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.95,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5761和/或SEQ ID NO:5705和/或SEQ ID NO:5733定义的序列的甲基化参考百分比;
7.SEQ ID NO:5762和/或SEQ ID NO:5706和/或SEQ ID NO:5734,并且其中当所述癌症指数值为约1.645或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.94,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5762和/或SEQ ID NO:5706和/或SEQ ID NO:5734定义的序列的甲基化参考百分比;
8.SEQ ID NO:5762和/或SEQ ID NO:5706和/或SEQ ID NO:5734,并且其中当所述癌症指数值小于约1.645时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.94,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5762和/或SEQ ID NO:5706和/或SEQ ID NO:5734定义的序列的甲基化参考百分比;
9.SEQ ID NO:5763和/或SEQ ID NO:5707和/或SEQ ID NO:5735,并且其中当所述癌症指数值为约2.824或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少90.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.94,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5763和/或SEQ ID NO:5707和/或SEQ ID NO:5735定义的序列的甲基化参考百分比;和/或
10.SEQ ID NO:5763和/或SEQ ID NO:5707和/或SEQ ID NO:5735,并且其中当所述癌症指数值小于约2.824时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少90.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.94,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5763和/或SEQ ID NO:5707和/或SEQ ID NO:5735定义的序列的甲基化参考百分比。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤进一步包括或另外包括确定由SEQ ID NO:5703、5731、5759、5723、5751、5779、5713、5741、5769、5706、5734、5762、5705、5733和5761鉴定的所述序列中的一个或多个内的每个CpG的甲基化状态,或甚至更优选地,其中所述一个或多个CpG的组进一步包括或另外包括确定由SEQ ID NO:5703、5731、5759、5713、5741、5769、5706、5734和5762鉴定的所述序列中的一个或多个内的每个CpG的甲基化状态。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中在所述样本中的所述DNA分子群体中确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化状态的所述步骤包括:
1.实施测序步骤以确定每个CpG的序列;
2.将DNA与包括能够区分所述CpG的甲基化和非甲基化形式的探针的芯片杂交,并将检测系统应用于所述芯片以确定每个CpG的甲基化状态;和/或
3.使用甲基化特异性引物实施PCR步骤,其中所述CpG的甲基化状态通过PCR产物是否存在来确定。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化状态的所述步骤包括:
1.亚硫酸氢盐转化所述DNA;或
2.实施以下步骤:将5-甲基胞嘧啶碱基(5mC)氧化为5-羧基胞嘧啶碱基(5caC),优选地通过10-11易位(TET),和/或将5-羟甲基胞嘧啶碱基(5hmC)氧化为5-羧基胞嘧啶碱基(5caC),优选地通过10-11易位(TET);然后将5-羧基胞嘧啶碱基(5caC)还原为二氢尿嘧啶碱基(DHU),任选地使用吡啶硼烷。
本发明还提供了一种治疗或预防个体中的CIN3和/或宫颈癌的方法,所述方法包括:
1.通过实施本发明的测定方法中的任何一种测定方法评估所述个体中癌症的存在、不存在或发展来评估所述个体的CIN3和/或宫颈癌状态;
2.基于所述评估向所述个体施用一种或多种疗效性或预防性治疗。
本发明的方法可以如上实施,并且另外地,其中所述个体被评估为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述癌症指数值为约-0.530或更大并且小于约-0.330,并且优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化β值,所述个体根据其癌症指数值接受一种或多种治疗,所述一种或多种治疗包括根据本发明的任一测定方法的重复测定方法,优选地,其中所述重复测定方法在所述先前测定方法后约一年实施。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中所述个体被评估为具有患CIN3和/或癌症的中等风险或具有CIN3和/或癌症发展的中等风险,并且其中所述癌症指数值为约-0.330或更大并且小于约-0.170,并且优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化β值,所述个体根据其癌症指数值接受一种或多种治疗,所述一种或多种治疗包括人类乳头瘤病毒(HPV)状态的测试,并且其中:
1.当所述个体为HPV阳性时,所述一种或多种治疗包括阴道镜检查和任选的经阴道超声和/或子宫内膜活检以评估子宫内膜;或
2.当所述个体为HPV阴性时,所述一种或多种治疗包括根据本发明的测定方法的重复测定方法,优选地,其中所述重复测定方法在所述先前测定方法后约一年实施。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中所述个体被评估为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述癌症指数值为约-0.170或更大,并且优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化β值,所述个体根据其癌症指数值接受一种或多种治疗,所述一种或多种治疗包括阴道镜检查,并且其中所述阴道镜检查为阴性,所述一种或多种治疗包括子宫内膜活检和宫腔镜检查。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中所述个体被评估为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述癌症指数值为约:
1. 5.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5768内的每个CpG;
2. 1.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5765内的每个CpG;
3. 2.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5759内的每个CpG;
4. 5.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5785内的每个CpG;
5. 4.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5763内的每个CpG;
6. 4.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5781内的每个CpG;
7. 1.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5769内的每个CpG;
8. 1.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5766内的每个CpG;
9. 4.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5761内的每个CpG;
10. 4.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5779内的每个CpG;
11. 4.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5764内的每个CpG;
12. 5.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5772内的每个CpG;
13. 2.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5773内的每个CpG;
14. 1.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5778内的每个CpG;
15. 5.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5767内的每个CpG;
16. 5.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5774内的每个CpG;
17.大于0.000,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5760内的每个CpG;
18. 4.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5771内的每个CpG;
19. 2.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5762内的每个CpG;
20. 7.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5780内的每个CpG;
21. 6.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5776内的每个CpG;
22. 5.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5783内的每个CpG;
23. 6.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5782内的每个CpG;
24. 6.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5784内的每个CpG;
25. 5.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5777内的每个CpG;
26. 2.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5786内的每个CpG;
27. 7.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5775内的每个CpG;或
28. 3.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5770内的每个CpG,
并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比,所述个体根据其癌症指数值接受一种或多种治疗,所述一种或多种治疗包括阴道镜检查,并且其中所述阴道镜检查为阴性,所述一种或多种治疗包括子宫内膜活检,并且其中所述子宫内膜活检也为阴性,所述一种或多种治疗包括根据本发明的测定方法的重复测定方法,优选地,其中所述重复测定方法在所述先前测定方法后约一年实施。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中所述个体所接受的所述一种或多种治疗在初始施用后每月、每三个月、每六个月、每年或每两年重复一次。
本发明还提供了一种根据个体的癌症指数值监测所述个体的CIN3和/或癌症状态的方法,所述方法包括:(a)通过在第一时间点实施根据本发明的任一测定方法的测定方法来评估个体中CIN3和/或癌症的存在、不存在或发展;(b)通过在一个或多个其它时间点实施根据本发明的任一测定方法的测定方法来评估所述个体中CIN3和/或癌症的存在、不存在或发展;和(c)监测所述个体在时间点之间的癌症指数值和/或CIN3和/或癌症状态的任何改变。
本发明的方法可以如上实施,并且另外地,其中所述其它时间点是初始评估后的每月、每三个月、每六个月、每年或每两年。
本发明的方法可以如上实施,并且另外地,其中取决于所述个体的癌症状态,根据本发明的方法中的任何一种向所述个体施用一种或多种治疗,或者当所述个体的所述癌症指数值:
1.小于约-0.530,并且优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化β值时,不向所述个体施用治疗;
2.小于约5.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5768内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
3.小于约1.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5765内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
4.小于约2.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5759内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
5.小于约5.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5785内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
6.小于约4.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5763内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
7.小于约4.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5781内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
8.小于约1.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5769内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
9.小于约1.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5766内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
10.小于约4.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5761内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
11.小于约4.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5779内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
12.小于约4.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5764内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
13.小于约5.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5772内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
14.小于约2.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5773内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
15.小于约1.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5778内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
16.小于约5.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5767内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
17.小于约5.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5774内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
18.为0.000,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5760内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
19.小于约4.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5771内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
20.小于约2.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5762内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
21.小于约7.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5780内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
22.小于约6.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5776内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
23.小于约5.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5783内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
24.小于约6.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5782内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
25.小于约6.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5784内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
26.小于约5.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5777内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
27.小于约2.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5786内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
28.小于约7.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5775内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;或
29.小于约3.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定5770内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗。
本发明的方法可以如上实施,并且另外地,其中所述癌症指数值的增加指示对所述一种或多种治疗的负面反应。
本发明的方法可以如上实施,并且另外地,其中如果鉴定出负面反应,则对所述一种或多种治疗实施改变。
本发明的方法可以如上实施,并且另外地,其中所述癌症指数值的降低指示对所述一种或多种治疗的正面反应。
本发明的方法可以如上实施,并且另外地,其中如果鉴定出正面反应,则对所述一种或多种治疗实施改变。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中所述样本获自包括上皮细胞的组织,优选地,其中所述样本不获自卵巢或子宫内膜组织。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中所述样本获自:
1.宫颈组织;
2.阴道组织;
3.宫颈阴道组织;
4.颊组织;
优选地,其中所述样本获自宫颈组织,最优选地,其中所述样本获自来自宫颈涂片的组织。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中所述测定方法用于评估以下的存在、不存在或发展:
1. 3级宫颈上皮瘤变(CIN3)和/或宫颈癌,特别地,其中所述宫颈癌是鳞状细胞癌、腺癌或腺鳞癌;
2.子宫内膜癌,优选地,其中所述子宫内膜癌是子宫内膜样癌、子宫癌肉瘤、鳞状细胞癌、小细胞癌、移行细胞癌、浆液性癌、透明细胞癌、粘液性腺癌、未分化癌、去分化癌或浆液性腺癌。
本发明还提供了一种能够区分CpG的甲基化和非甲基化形式的芯片;所述芯片包括对于CpG组中的每个CpG的甲基化形式具有特异性的寡核苷酸探针和对于所述组中的每个CpG的非甲基化形式具有特异性的寡核苷酸探针;其中所述组由至少500个CpG组成,其选自在SEQ ID NO:1至5000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的以及在SEQ ID NO:5001至5418中鉴定并由CG表示的CpG。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,条件是所述芯片不是InfiniumMethylationEPIC BeadChip芯片或Infinium HumanMethylation450,和/或条件是所述芯片的CpG特异性寡核苷酸探针的数量是482,000或更少、480,000或更少,450,000或更少、440,000或更少、430,000或更少、420,000或更少、410,000或更少或400,000或更少。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外地,其中所述组包括本发明的测定方法中的任何一种测定方法中定义的CpG的任何组。
本发明的测定方法可以如上实施,并且另外进一步包括一个或多个寡核苷酸,所述寡核苷酸包括本发明的测定方法中的任何一种测定方法中定义的CpG的任何组,其中所述一个或多个寡核苷酸与所述芯片的相对应寡核苷酸探针杂交。
本发明还提供了一种杂交芯片,其中所述芯片能通过将一组寡核苷酸与根据本发明的芯片中的任何一种的芯片杂交获得,所述一组寡核苷酸包括本发明的测定方法中的任何一种测定方法中定义的CpG的任何组。
本发明还提供了一种用于制备根据本发明的杂交芯片的杂交芯片的方法,其包括使根据本发明的芯片中的任何一种的芯片与一组寡核苷酸接触,所述一组寡核苷酸包括本发明的测定方法中的任何一种中定义的CpG的任何组。
附图说明
图1示出了支持WID-CIN-指数的发现和验证的实验设计。
图2示出了(A)诊断验证集中的WID-CIN-指数的分布,其截止值对应于90%(短划虚线)和75%特异性(点虚线)。(B)对应于诊断验证集的接受者操作特征(ROC)曲线,其中>30岁和≤30岁女性有单独的曲线。(C)WID-CIN-指数在CIN1和CIN2病例中的分布,其作为诊断验证集的一部分,其特异性截止值为90%(短划虚线)和75%(点虚线)。
图3示出了(A)HPV+对照样本中的WID-CIN-指数对生物样本库存储时间的依赖性。(B)预测验证集中的WID-CIN-指数,所述预测验证集由CIN3+诊断(红点)或审查(蓝点)前1-4年采集的HPV阳性和细胞学检查阴性样本组成。(C)对应于预测验证集的ROC曲线。
图4示出了(A)WID-CIN-指数在子宫内膜诊断验证集中的分布,所述子宫内膜诊断验证集由来自健康对照和患有子宫内膜癌的女性的样本组成。(B)对应于子宫内膜诊断验证集的ROC曲线。
图5示出了CIN3+真阳性率(TPR)和CIN1/2真阴性率(TNR),其对应于a)检测所有细胞学检查阳性样本中的CIN3+病例的100%灵敏度,和b)检测所有HPV+样本中的CIN3+病例的75%灵敏度。基于诊断验证数据集。包含<30岁和≥30岁女性的单独截止值。
图6示出了(A)组合发现和诊断验证集中的细胞-类型组成,如由hEpiDISH算法确定。(B)将发现集中的HPV+对照与CIN3+病例实施比较后的p值的分布(基于对年龄和免疫细胞比例实施调整的线性回归模型)。(C)估算上皮和免疫δ-β的分布。(D)基于对发现集实施的10折交叉验证的袋外估算值的岭和套索分类器的性能。(E)将包括WID-CIN-指数的5,000个CpG的基因组注释与分析中使用的777,005个CpG实施比较时的优势比。
图7示出了(A)WID-CIN-指数对来自发现集的HPV+对照和CIN3+病例中的免疫细胞比例的依赖性。(B)WID-CIN-指数对来自发现集的HPV+对照和CIN3+病例中的年龄的依赖性。(C)对应于来自发现集的HPV-对照和CIN3+病例中的WID-CIN-指数的表现的ROC曲线。
图8示出了(A)基于hEpiDISH算法的来自预测验证集的样本的细胞-类型组成。(B)WID-CIN-指数对来自预测验证集的HPV+对照和CIN3+病例中的年龄的依赖性。
图9示出了(A)WID-CIN-指数的岛子组分作为诊断验证集中的免疫细胞比例的函数。(B)对应于诊断验证集中的WID-CIN-指数的岛子组分的ROC曲线。(C)WID-CIN-指数的岛子组分作为预测验证集中的免疫细胞比例的函数。(D)对应于预测验证集中的WID-CIN-指数的岛子组分的ROC曲线。(E)WID-CIN-指数的开放海域子组分作为诊断验证集中的免疫细胞比例的函数。(F)对应于诊断验证集中的WID-CIN-指数的开放海域子组分的ROC曲线。(G)WID-CIN-指数的开放海域子组分作为预测验证集中的免疫细胞比例的函数。(H)对应于预测验证集中的WID-CIN-指数的开放海域子组分的ROC曲线。
图10示出了(A)基于hEpiDISH算法的来自子宫内膜诊断验证集的样本的细胞-类型组成。(B)WID-CIN-指数对来自子宫内膜诊断验证集的HPV+对照和CIN3+病例中的年龄的依赖性。
图11示出了应用于患者数据的截点(cutpoint)以及在应用这些截点时实现的CIN3状态区分的特异性和灵敏度。
具体实施方式
CpG的鉴定
本发明人寻求鉴定基于CpG甲基化的测定方法,其能够评估个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展。本文描述的用于评估个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展的任何测定方法能够用于评估宫颈癌和/或子宫内膜癌(特别是宫颈癌)的存在、不存在或发展。本发明人通过已知宫颈癌和子宫内膜癌均为阴性、或已知宫颈癌和/或子宫内膜癌阳性的女性群组比较了非癌性上皮细胞中的CpG甲基化水平,所述上皮细胞特别地源自宫颈、阴道、颊区域、血液和/或尿液,优选地源自宫颈液基细胞学检查样本,更优选地是宫颈涂片样本。这令人惊讶地建立了“癌症指数”,其在本文中可与“指数”、“指数值”、“WID-CIN-指数”或“WID-指数”(WID=女性风险鉴定)互换使用。
如本文定义的CpG是指相对于每个SEQ ID NO.鉴定的CG二核苷酸基序,其中关注的CG二核苷酸由CG和[[CG]]表示。因此,通过确定由给定SEQ ID NO定义或鉴定的一个或多个CpG的任何组的甲基化状态,也就意味着在以下示出的每个序列中的一个或多个CpG的组中确定方括号中鉴定的CG二核苷酸基序的胞嘧啶的甲基化状态,从而接受了由于测序错误或个体之间的变异而存在任何给定CpG上游和下游的序列的不同。
如在实施例中更详细地阐述,可以确定如SEQ ID NO:1至5000中鉴定的5000个CpG的子选择的甲基化状态,以以高灵敏度和特异性评估个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展。根据本文描述的本发明,可以使用SEQ ID NO:1至5000中鉴定的一个或多个CpG的组来推导个体的癌症指数。
含有根据SEQ ID NO:1至5000定义的5000个CpG中的一个或多个CpG的组的甲基化状态可以通过任何合适的技术评估。如在下面的实施例中更详细地解释,发明人使用的一种特定示例性技术是与β值分析相结合的基于芯片的分析技术。SEQ ID NO:1至5000对应于所述芯片中使用的商业探针的序列。
发明人进一步鉴定了与CIN3和癌症,特别是宫颈癌或子宫内膜癌相关的418个差异甲基化区域(DMR)。418个DMR的核苷酸序列分别由以下表1中列出的SEQ ID NO:5001至5418的核苷酸序列定义,从而接受了由于测序错误和/或个体之间的变异而存在任何给定DMR的核苷酸序列的不同。在对应于SEQ ID NO:5001至5418的每个序列中,方括号或双方括号中鉴定的CG二核苷酸基序的胞嘧啶是CpG的胞嘧啶,当实施本发明的测定方法时,其可以包含在含有CpG的组中。
发明人进一步在选择数量的418个DMR中定义了28个区域,其与CIN3和癌症,特别是宫颈癌或子宫内膜癌特别相关。所述28个区域的核苷酸序列分别由以下表2中列出的SEQID NO:5703至5786的核苷酸序列定义,从而接受了由于测序错误和/或个体之间的变异而存在任何给定DMR的核苷酸序列的不同。在实施本发明的测定方法时,当所述28个区域中的任一个或多个包含在含有CpG的组中时,确定所述区域中的CG二核苷酸内每个胞嘧啶的甲基化状态。由表2中列出的28个引物和探针反应生成的扩增子序列由SEQ ID NO:5787至5814并在表12中描述和定义。在本文所述的任何测定方法中,确定一个或多个CpG的组的甲基化状态的步骤可以包括确定由SEQ ID NO:5787至5814定义并由CG表示的任一个或多个扩增子内的一个或多个CpG的甲基化状态。更优选地,在本文所述的任何测定方法中,确定一个或多个CpG的组的甲基化状态的步骤可以包括确定由SEQ ID NO:5787、5790、5797、5807和5789但更优选5787、5790、5797定义并由CG表示的任一个或多个扩增子内的一个或多个CpG的甲基化状态。还更优选地,在本文所述的任何测定方法中,确定一个或多个CpG的组的甲基化状态的步骤可以包括确定由SEQ ID NO:5787、5790、5797、5807和5789但更优选5787、5790、5797定义的扩增子中的由CG表示的所有CpG的甲基化状态。
表1. 418个DMR的核苷酸序列分别由SEQ ID NO:5001至5418的核苷酸序列定义。
表2.选择数量的418个DMR内的28个区域的核苷酸序列,其与CIN3和癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌)相关。所述28个区域由甲基化荧光检测探针SEQ ID NO:5703至5786定义。正向(SEQ ID NO:5703至5730)和反向(SEQ ID NO:5731至5758)甲基化荧光检测引物也在本表2中提供。
表12
用于分析的癌症相关CpG
在本文所述的任何测定方法中,在取自个体的样本中,所述样本包括DNA分子群体。本发明的测定方法进一步包括在所述样本中的所述DNA分子群体中确定以下组的甲基化状态:
(i)一个或多个CpG,其选自SEQ ID NO:1至5000中鉴定的CpG的组,其中所述CpG在核苷酸位置61至62处鉴定;和/或
(ii)一个或多个CpG,其选自由SEQ ID NO:5001至5418定义的一个或多个差异甲基化区域(DMR)的组,其中所述CpG由CG表示。
然后,基于所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态推导癌症指数值,其用于基于所述癌症指数值评估个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展。
在本文所述的任何测定方法中,在源自所述样本中的细胞的DNA中确定组中的每个CpG的甲基化状态:
(i)一个或多个CpG,其选自SEQ ID NO:1至5000中鉴定的CpG的组,其中所述CpG在核苷酸位置61至62处鉴定;和/或
(ii)一个或多个CpG,其选自由SEQ ID NO:5001至5418定义的一个或多个差异甲基化区域(DMR)的组,其中所述CpG由CG表示。
在本文所述的任何测定方法中,在源自所述样本中的细胞的DNA中,从含有在SEQID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的CpG的组确定一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化状态。
在本文所述的任何测定方法中,所述一个或多个CpG的组可以包括至少500个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.80的接受者操作特征(ROC)曲线下面积(AUC)。所述一个或多个CpG的组可以包括在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的ROC AUC。
在本文所述的任何测定方法中,所述一个或多个CpG的组可以包括至少1000个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.80的ROC AUC。所述一个或多个CpG的组可以包括在SEQ ID NO:1至1000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的ROC AUC。
在本文所述的任何测定方法中,所述一个或多个CpG的组可以包括至少1500个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.82的ROC AUC。所述一个或多个CpG的组可以包括在SEQ ID NO:1至1500中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的ROC AUC。
在本文所述的任何测定方法中,所述一个或多个CpG的组可以包括至少2000个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.81的AUC。所述一个或多个CpG的组可以包括在SEQ IDNO:1至200中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的ROC AUC。
在本文所述的任何测定方法中,所述一个或多个CpG的组可以包括在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述5000个CpG,并且另外地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的ROC AUC。
在任何上述测定方法中,所述测定方法的特征可以在于具有0.60或更大、0.61或更大、0.62或更大、0.63或更大、0.64或更大、0.65或更大、0.66或更大、0.67或更大、0.68或更大、0.69或更大、0.70或更大、0.71或更大、0.72或更大、0.73或更大、0.74或更大、0.75或更大、0.76或更大、0.77或更大、0.78或更大、0.79或更大、0.80或更大、0.81或更大、0.82或更大、0.83或更大、0.84或更大、0.85或更大、0.86或更大、0.87或更大、0.88或更大、0.89或更大、或0.90或更大的ROC AUC。
在任何所述测定方法中,所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态优选地通过β值分析确定,并且所述测定方法用于评估CIN3和/或癌症的存在、不存在或发展,优选地,所述癌症是宫颈癌或子宫内膜癌。最优选地,所述癌症是宫颈癌。
在本文所述的任何测定方法中,所述一个或多个CpG的组可以包括至少500个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,任选地,其中:
1.所述测定方法的特征在于具有至少0.92的ROC AUC(AUC),并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至500中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
2.所述测定方法的特征在于具有至少0.90的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:501至1000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
3.所述测定方法的特征在于具有至少0.88的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1001至1500中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
4.所述测定方法的特征在于具有至少0.86的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1501至2000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
5.所述测定方法的特征在于具有至少0.86的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:2001至2500中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
6.所述测定方法的特征在于具有至少0.83的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:2501至3000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
7.所述测定方法的特征在于具有至少0.82的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:3001至3500中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
8.所述测定方法的特征在于具有至少0.82的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:3501至4000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;或
9.所述测定方法的特征在于具有至少0.80的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:4001至4500中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
10.所述测定方法的特征在于具有至少0.81的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:4501至5000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG。
在任何所述测定方法中,所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态优选地通过β值分析确定,并且所述测定方法用于评估CIN3和/或癌症的存在、不存在或发展,优选地,所述癌症是宫颈癌或子宫内膜癌。最优选地,所述癌症是宫颈癌。
在任何上述测定方法中,所述测定方法的特征可以在于具有0.60或更大、0.61或更大、0.62或更大、0.63或更大、0.64或更大、0.65或更大、0.66或更大、0.67或更大、0.68或更大、0.69或更大、0.70或更大、0.71或更大、0.72或更大、0.73或更大、0.74或更大、0.75或更大、0.76或更大、0.77或更大、0.78或更大、0.79或更大、0.80或更大、0.81或更大、0.82或更大、0.83或更大、0.84或更大、0.85或更大、0.86或更大、0.87或更大、0.88或更大、0.89或更大、或0.90或更大的ROC AUC。
在本文所述的任何测定方法中,所述一个或多个CpG的组可以包括:
1.至少100个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.90的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至100中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
2.至少500个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至500中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至500中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
3.至少1000个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至500中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至1000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
4.至少1500个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至500中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至1500中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
5.至少2000个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至500中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至2000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
6.至少2500个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至500中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至2500中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
7.至少3000个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至500中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至3000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
8.至少3500个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至500中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至3500中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
9.至少4000个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至500中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至4000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
10.至少4500个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至500中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至4500中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;或
11.至少5000个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至500中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG。
在任何所述测定方法中,所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态优选地通过β值分析确定,并且所述测定方法用于评估CIN3和/或癌症的存在、不存在或发展,优选地,所述癌症是宫颈癌或子宫内膜癌。最优选地,所述癌症是宫颈癌。
在任何上述测定方法中,所述测定方法的特征可以在于具有0.60或更大、0.61或更大、0.62或更大、0.63或更大、0.64或更大、0.65或更大、0.66或更大、0.67或更大、0.68或更大、0.69或更大、0.70或更大、0.71或更大、0.72或更大、0.73或更大、0.74或更大、0.75或更大、0.76或更大、0.77或更大、0.78或更大、0.79或更大、0.80或更大、0.81或更大、0.82或更大、0.83或更大、0.84或更大、0.85或更大、0.86或更大、0.87或更大、0.88或更大、0.89或更大、或0.90或更大的ROC AUC。
在本文所述的任何测定方法中,所述一个或多个CpG的组可以包括:
1.至少500个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.81的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:4501至5000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
2.至少1000个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.80的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:4001至5000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
3.至少1500个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.82的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:3501至5000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
4.至少2000个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.81的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:3001至5000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
5.至少2500个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.82的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:2501至5000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
6.至少3000个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.82的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:2001至5000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
7.至少3500个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.82的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1501至5000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
8.至少4000个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.84的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1001至5000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
9.至少4500个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.88的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:501至5000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;
10.至少4900个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.91的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:101至5000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG;或
11.至少5000个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG。
在任何所述测定方法中,所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态优选地通过β值分析确定,并且所述测定方法用于评估CIN3和/或癌症的存在、不存在或发展,优选地,所述癌症是宫颈癌或子宫内膜癌。最优选地,所述癌症是宫颈癌。
在任何上述测定方法中,所述测定方法的特征可以在于具有0.60或更大、0.61或更大、0.62或更大、0.63或更大、0.64或更大、0.65或更大、0.66或更大、0.67或更大、0.68或更大、0.69或更大、0.70或更大、0.71或更大、0.72或更大、0.73或更大、0.74或更大、0.75或更大、0.76或更大、0.77或更大、0.78或更大、0.79或更大、0.80或更大、0.81或更大、0.82或更大、0.83或更大、0.84或更大、0.85或更大、0.86或更大、0.87或更大、0.88或更大、0.89或更大、或0.90或更大的ROC AUC。
在本文所述的任何测定方法中,确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定选自由SEQ ID NO:5001至5418定义的一个或多个差异甲基化区域(DMR)的组的一个或多个CpG的甲基化状态,其中每个DMR中选择的CpG由CG表示。418个DMR的核苷酸序列分别由表1中列出的SEQ ID NO:5001至5418的核苷酸序列定义,从而接受了由于测序错误和/或个体之间的变异而存在任何给定DMR的核苷酸序列的变异。在以下示出的每个序列中,方括号和双方括号中鉴定的CG二核苷酸基序的胞嘧啶是CpG的胞嘧啶,当实施本发明的测定方法时,该CpG可以包含在CpG的组中。
在本文所述的任何测定方法中,确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定由SEQ ID NO:5001至5418定义的任一个或多个DMR内或两个或更多个DMR的任意组合内的由CG表示的一个或多个CpG的甲基化状态,其中每个DMR中的选择CpG由CG表示。所述DMR选自由DMR 1至418(SEQ ID NO:5001至5418;如表1中所示)组成的群组。
确定一个或多个CpG的组的甲基化状态的所述步骤可以包括确定所述DMR 1至418中的任一个内或1至418中的两个或更多个DMR的任意组合内的由CG表示的所述CpG中的一个或多个的癌症指数值。
确定一个或多个CpG的组的甲基化状态的所述步骤可以包括确定所述DMR 1至418(由SEQ ID NO:5001至5418定义)中的任一个内,任选地1至418中的两个或更多个DMR的任意组合内的由CG表示的所述CpG中的两个或更多个、三个或更多个、四个或更多个、五个或更多个、六个或更多个、七个或更多个、八个或更多个、或九个或更多个的癌症指数值。
所述一个或多个CpG的组可以包括所述DMR的两个或更多个CpG、所述DMR的三个或更多个CpG、所述DMR的四个或更多个CpG或所述DMR的所有CpG。
确定一个或多个CpG的组的甲基化状态的所述步骤包括确定在所述DMR 1至418中的任一个内或在以下范围内的由CG表示的所述CpG中的至少两个或更多个、三个或更多个、四个或更多个、五个或更多个、六个或更多个、七个或更多个、八个或更多个、或九个或更多个的癌症指数值:
a.DMR 1至418中的两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个或九个或更多个的任意组合;
b.DMR 1至418中的十个、二十个、三十个、四十个、五十个、六十个、七十个、八十个或九十个或更多个的任意组合;
c.DMR 1至418中的所有418个;
d.由SEQ ID NO:5001定义的一个DMR、由SEQ ID NO:5001至5002定义的两个DMR、由SEQ ID NO:5001至5003定义的三个DMR、由SEQ ID NO:5001至5004定义的四个DMR、由SEQID NO:5001至5005定义的五个DMR、由SEQ ID NO:5001至5006定义的六个DMR、由SEQ IDNO:5001至5007定义的七个DMR、由SEQ ID NO:5001至5008定义的八个DMR、或由SEQ ID NO:5001至5009定义的九个DMR;
e.由SEQ ID NO:5391、SEQ ID NO:5392、SEQ ID NO:5393、SEQ ID NO:5407和SEQID NO:5414定义的一个或多个DMR的任意组合,优选地,在所有SEQ ID NO:5391、SEQ IDNO:5392、SEQ ID NO:5393、SEQ ID NO:5407和SEQ ID NO:5414内;
f.由SEQ ID NO:5392、SEQ ID NO:5393和SEQ ID NO:5407定义的一个或多个DMR的任意组合,优选地,在所有SEQ ID NO:5392、SEQ ID NO:5393和SEQ ID NO:5407内;或
g.由SEQ ID NO:5001至5010定义的十个DMR、由SEQ ID NO:5001至5020定义的二十个DMR、由SEQ ID NO:5001至5030定义的三十个DMR、由SEQ ID NO:5001至5040定义的四十个DMR、由SEQ ID NO:5001至5050定义的五十个DMR、由SEQ ID NO:5001至5060定义的六十个DMR、由SEQ ID NO:5001至5070定义的七十个DMR、由SEQ ID NO:5001至5080定义的八十个DMR、或由SEQ ID NO:5001至5090定义的九十个DMR;
h.由SEQ ID NO:5001至5050、SEQ ID NO:5051至5100、SEQ ID NO:5101至5150、SEQ ID NO:5151至5200、SEQ ID NO:5201至5250、SEQ ID NO:5301至5350、或SEQ ID NO:5341至5418定义的五十个DMR;或
i.由SEQ ID NO:5015、5016、5017、5025、5026、5027、5028、5029、5032、5033、5048、5049、5050、5053、5054、5057、5068、5069、5071、5072、5073、5074、5075、5076、5077、5083、5090、5091、5092、5093、5094、5095、5096、5099、5102、5137、5138、5140、5143、5146、5147、5148、5149、5150、5151、5164、5165、5167、5175、5176、5177、5179、5180、5185、5204、5224、5226、5228、5232、5246、5248、5285、5287、5293、5307、5309、5315、5317、5324、5328、5337、5339、5340、5348、5349、5354、5361、5362、5366、5368和5377定义的八十一个DMR。
在本文所述的任何测定方法中,确定一个或多个CpG的组的甲基化状态的所述步骤可以包括确定选自由如由SEQ ID NO:5001至5418定义的DMR 1至418组成的DMR群组的任一个或多个DMR内的一个或多个CpG的甲基化状态,包括:
1.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5001定义的DMR 1内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.894的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
2.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5002定义的DMR 2内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.894的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
3.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5003定义的DMR 3内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.894的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
4.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5004定义的DMR 4内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.894的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
5.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5005定义的DMR 5内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.894的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
6.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5006定义的DMR 6内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.876的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
7.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5007定义的DMR 7内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.874的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
8.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5008定义的DMR 8内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.874的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
9.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5009定义的DMR 9内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.874的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
10.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5010定义的DMR 10内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.874的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
11.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5011定义的DMR 11内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.874的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
12.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5012定义的DMR 12内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.874的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
13.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5013定义的DMR 13内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.874的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
14.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5014定义的DMR 14内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.87的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
15.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5015定义的DMR 15内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.869的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
16.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5016定义的DMR 16内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.869的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
17.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5017定义的DMR 17内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.869的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
18.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5018定义的DMR 18内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.868的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
19.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5019定义的DMR 19内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.868的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
20.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5020定义的DMR 20内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.866的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
21.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5021定义的DMR 21内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.863的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
22.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5022定义的DMR 22内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.863的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
23.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5023定义的DMR 23内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.862的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
24.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5024定义的DMR 24内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.861的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
25.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5025定义的DMR 25内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.86的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
26.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5026定义的DMR 26内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.86的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
27.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5027定义的DMR 27内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.86的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
28.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5028定义的DMR 28内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.86的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
29.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5029定义的DMR 29内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.86的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
30.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5030定义的DMR 30内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.859的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
31.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5031定义的DMR 31内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.859的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
32.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5032定义的DMR 32内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.858的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
33.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5033定义的DMR 33内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.858的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
34.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5034定义的DMR 34内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.858的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
35.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5035定义的DMR 35内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.858的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
36.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5036定义的DMR 36内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.858的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
37.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5037定义的DMR 37内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.858的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
38.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5038定义的DMR 38内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.858的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
39.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5039定义的DMR 39内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.858的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
40.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5040定义的DMR 40内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.858的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
41.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5041定义的DMR 41内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.858的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
42.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5042定义的DMR 42内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.858的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
43.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5043定义的DMR 43内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.858的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
44.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5044定义的DMR 44内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.858的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
45.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5045定义的DMR 45内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.858的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
46.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5046定义的DMR 46内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.858的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
47.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5047定义的DMR 47内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.856的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
48.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5048定义的DMR 48内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.855的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
49.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5049定义的DMR 49内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.855的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
50.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5050定义的DMR 50内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.855的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
51.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5051定义的DMR 51内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.852的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
52.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5052定义的DMR 52内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.852的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
53.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5053定义的DMR 53内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.851的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
54.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5054定义的DMR 54内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.851的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
55.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5055定义的DMR 55内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.851的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
56.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5056定义的DMR 56内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.851的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
57.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5057定义的DMR 57内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.851的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
58.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5058定义的DMR 58内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.848的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
59.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5059定义的DMR 59内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.847的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
60.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5060定义的DMR 60内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.847的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
61.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5061定义的DMR 61内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.846的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
62.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5062定义的DMR 62内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.846的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
63.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5063定义的DMR 63内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.845的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
64.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5064定义的DMR 64内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.845的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
65.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5065定义的DMR 65内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.845的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
66.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5066定义的DMR 66内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.845的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
67.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5067定义的DMR 67内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.843的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
68.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5068定义的DMR 68内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.843的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
69.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5069定义的DMR 69内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.84的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
70.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5070定义的DMR 70内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.84的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
71.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5071定义的DMR 71内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.84的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
72.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5072定义的DMR 72内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.839的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
73.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5073定义的DMR 73内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.839的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
74.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5074定义的DMR 74内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.839的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
75.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5075定义的DMR 75内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.839的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
76.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5076定义的DMR 76内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.839的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
77.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5077定义的DMR 77内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.839的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
78.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5078定义的DMR 78内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.838的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
79.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5079定义的DMR 79内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.838的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
80.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5080定义的DMR 80内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.838的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
81.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5081定义的DMR 81内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.838的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
82.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5082定义的DMR 82内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.837的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
83.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5083定义的DMR 83内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.837的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
84.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5084定义的DMR 84内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.837的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
85.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5085定义的DMR 85内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.837的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
86.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5086定义的DMR 86内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.837的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
87.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5087定义的DMR 87内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.837的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
88.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5088定义的DMR 88内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.837的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
89.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5089定义的DMR 89内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.836的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
90.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5090定义的DMR 90内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.836的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
91.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5091定义的DMR 91内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.836的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
92.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5092定义的DMR 92内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.836的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
93.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5093定义的DMR 93内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.835的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
94.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5094定义的DMR 94内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.835的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
95.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5095定义的DMR 95内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.834的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
96.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5096定义的DMR 96内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.834的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
97.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5097定义的DMR 97内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.834的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
98.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5098定义的DMR 98内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.834的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
99.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5099定义的DMR 99内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.834的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
100.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5100定义的DMR 100内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.834的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
101.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5101定义的DMR 101内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.834的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
102.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5102定义的DMR 102内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.834的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
103.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5103定义的DMR 103内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.834的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
104.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5104定义的DMR 104内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.834的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
105.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5105定义的DMR 105内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.834的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
106.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5106定义的DMR 106内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.834的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
107.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5107定义的DMR 107内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.834的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
108.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5108定义的DMR 108内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.833的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
109.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5109定义的DMR 109内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.833的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
110.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5110定义的DMR 110内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.833的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
111.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5111定义的DMR 111内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.833的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
112.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5112定义的DMR 112内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.833的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
113.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5113定义的DMR 113内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.833的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
114.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5114定义的DMR 114内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.833的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
115.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5115定义的DMR 115内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.833的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
116.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5116定义的DMR 116内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.831的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
117.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5117定义的DMR 117内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.831的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
118.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5118定义的DMR 118内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.83的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
119.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5119定义的DMR 119内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.83的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
120.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5120定义的DMR 120内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.83的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
121.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5121定义的DMR 121内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.83的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
122.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5122定义的DMR 122内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.83的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
123.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5123定义的DMR 123内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.83的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
124.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5124定义的DMR 124内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.83的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
125.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5125定义的DMR 125内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.83的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
126.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5126定义的DMR 126内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.83的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
127.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5127定义的DMR 127内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.83的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
128.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5128定义的DMR 128内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.829的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
129.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5129定义的DMR 129内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.829的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
130.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5130定义的DMR 130内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.829的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
131.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5131定义的DMR 131内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.829的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
132.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5132定义的DMR 132内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.828的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
133.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5133定义的DMR 133内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.828的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
134.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5134定义的DMR 134内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.828的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
135.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5135定义的DMR 135内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.828的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
136.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5136定义的DMR 136内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.828的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
137.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5137定义的DMR 137内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.827的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
138.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5138定义的DMR 138内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.827的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
139.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5139定义的DMR 139内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.827的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
140.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5140定义的DMR 140内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.826的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
141.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5141定义的DMR 141内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.826的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
142.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5142定义的DMR 142内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.826的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
143.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5143定义的DMR 143内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.826的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
144.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5144定义的DMR 144内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.826的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
145.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5145定义的DMR 145内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.826的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
146.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5146定义的DMR 146内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.826的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
147.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5147定义的DMR 147内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.825的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
148.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5148定义的DMR 148内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.825的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
149.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5149定义的DMR 149内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.825的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
150.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5150定义的DMR 150内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.825的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
151.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5151定义的DMR 151内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.825的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
152.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5152定义的DMR 152内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.825的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
153.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5153定义的DMR 153内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.825的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
154.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5154定义的DMR 154内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.825的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
155.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5155定义的DMR 155内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.825的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
156.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5156定义的DMR 156内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.825的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
157.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5157定义的DMR 157内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.825的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
158.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5158定义的DMR 158内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.825的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
159.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5159定义的DMR 159内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.825的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
160.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5160定义的DMR 160内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.825的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
161.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5161定义的DMR 161内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.825的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
162.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5162定义的DMR 162内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.825的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
163.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5163定义的DMR 163内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.825的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
164.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5164定义的DMR 164内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.824的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
165.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5165定义的DMR 165内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.823的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
166.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5166定义的DMR 166内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.823的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
167.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5167定义的DMR 167内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.823的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
168.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5168定义的DMR 168内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.823的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
169.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5169定义的DMR 169内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.823的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
170.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5170定义的DMR 170内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.823的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
171.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5171定义的DMR 171内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.823的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
172.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5172定义的DMR 172内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.823的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
173.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5173定义的DMR 173内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.823的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
174.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5174定义的DMR 174内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.822的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
175.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5175定义的DMR 175内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.822的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
176.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5176定义的DMR 176内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.822的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
177.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5177定义的DMR 177内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.822的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
178.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5178定义的DMR 178内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.822的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
179.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5179定义的DMR 179内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.822的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
180.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5180定义的DMR 180内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.821的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
181.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5181定义的DMR 181内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.821的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
182.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5182定义的DMR 182内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.821的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
183.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5183定义的DMR 183内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.821的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
184.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5184定义的DMR 184内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.821的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
185.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5185定义的DMR 185内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.821的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
186.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5186定义的DMR 186内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.821的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
187.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5187定义的DMR 187内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.821的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
188.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5188定义的DMR 188内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.821的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
189.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5189定义的DMR 189内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.821的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
190.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5190定义的DMR 190内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.82的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
191.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5191定义的DMR 191内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.82的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
192.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5192定义的DMR 192内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.82的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
193.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5193定义的DMR 193内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.82的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
194.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5194定义的DMR 194内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.819的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
195.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5195定义的DMR 195内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.819的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
196.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5196定义的DMR 196内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.819的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
197.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5197定义的DMR 197内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.819的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
198.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5198定义的DMR 198内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.819的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
199.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5199定义的DMR 199内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.819的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
200.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5200定义的DMR 200内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.819的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
201.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5201定义的DMR 201内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.819的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
202.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5202定义的DMR 202内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.819的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
203.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5203定义的DMR 203内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.819的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
204.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5204定义的DMR 204内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.818的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
205.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5205定义的DMR 205内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.818的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
206.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5206定义的DMR 206内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.818的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
207.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5207定义的DMR 207内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.818的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
208.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5208定义的DMR 208内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.818的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
209.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5209定义的DMR 209内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.818的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
210.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5210定义的DMR 210内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.818的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
211.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5211定义的DMR 211内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.817的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
212.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5212定义的DMR 212内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.817的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
213.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5213定义的DMR 213内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.817的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
214.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5214定义的DMR 214内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.817的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
215.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5215定义的DMR 215内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.817的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
216.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5216定义的DMR 216内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.817的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
217.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5217定义的DMR 217内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.817的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
218.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5218定义的DMR 218内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.817的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
219.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5219定义的DMR 219内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.817的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
220.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5220定义的DMR 220内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.817的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
221.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5221定义的DMR 221内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.816的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
222.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5222定义的DMR 222内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.816的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
223.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5223定义的DMR 223内的一个或多个CpG,优选地,其中.所述测定方法的特征在于具有至少0.816的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
224.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5224定义的DMR 224内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.815的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
225.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5225定义的DMR 225内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.815的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
226.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5226定义的DMR 226内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.815的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
227.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5227定义的DMR 227内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.814的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
228.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5228定义的DMR 228内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.814的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
229.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5229定义的DMR 229内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.814的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
230.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5230定义的DMR 230内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.814的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
231.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5231定义的DMR 231内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.814的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
232.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5232定义的DMR 232内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.814的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
233.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5233定义的DMR 233内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.814的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
234.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5234定义的DMR 234内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.814的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
235.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5235定义的DMR 235内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.814的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
236.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5236定义的DMR 236内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.814的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
237.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5237定义的DMR 237内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.814的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
238.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5238定义的DMR 238内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.813的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
239.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5239定义的DMR 239内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.813的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
240.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5240定义的DMR 240内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.813的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
241.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5241定义的DMR 241内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.813的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
242.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5242定义的DMR 242内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.812的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
243.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5243定义的DMR 243内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.812的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
244.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5244定义的DMR 244内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.812的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
245.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5245定义的DMR 245内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.812的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
246.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5246定义的DMR 246内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.812的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
247.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5247定义的DMR 247内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.812的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
248.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5248定义的DMR 248内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.811的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
249.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5249定义的DMR 249内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.811的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
250.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5250定义的DMR 250内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.811的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
251.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5251定义的DMR 251内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.811的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
252.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5252定义的DMR 252内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.81的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
253.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5253定义的DMR 253内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.81的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
254.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5254定义的DMR 254内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.81的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
255.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5255定义的DMR 255内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.81的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
256.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5256定义的DMR 256内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.81的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
257.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5257定义的DMR 257内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.81的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
258.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5258定义的DMR 258内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.809的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
259.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5259定义的DMR 259内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.809的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
260.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5260定义的DMR 260内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.809的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
261.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5261定义的DMR 261内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.809的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
262.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5262定义的DMR 262内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.809的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
263.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5263定义的DMR 263内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.809的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
264.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5264定义的DMR 264内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.808的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
265.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5265定义的DMR 265内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.808的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
266.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5266定义的DMR 266内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.808的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
267.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5267定义的DMR 267内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.808的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
268.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5268定义的DMR 268内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.808的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
269.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5269定义的DMR 269内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.808的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
270.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5270定义的DMR 270内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.808的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
271.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5271定义的DMR 271内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.808的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;2
272.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5272定义的DMR 272内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.808的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
273.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5273定义的DMR 273内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.808的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
274.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5274定义的DMR 274内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.807的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
275.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5275定义的DMR 275内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.807的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
276.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5276定义的DMR 276内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.807的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
277.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5277定义的DMR 277内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.807的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
278.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5278定义的DMR 278内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.807的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
279.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5279定义的DMR 279内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.807的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
280.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5280定义的DMR 280内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.807的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
281.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5281定义的DMR 281内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.807的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
282.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5282定义的DMR 282内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.807的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
283.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5283定义的DMR 283内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.807的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
284.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5284定义的DMR 284内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.807的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
285.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5285定义的DMR 285内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.806的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
286.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5286定义的DMR 286内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.806的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
287.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5287定义的DMR 287内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.806的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
288.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5288定义的DMR 288内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.806的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
289.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5289定义的DMR 289内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.806的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
290.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5290定义的DMR 290内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.806的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
291.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5291定义的DMR 291内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.806的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
292.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5292定义的DMR 292内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.805的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
293.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5293定义的DMR 293内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.805的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
294.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5294定义的DMR 294内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.805的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
295.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5295定义的DMR 295内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.805的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
296.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5296定义的DMR 296内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.805的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
297.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5297定义的DMR 297内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.805的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
298.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5298定义的DMR 298内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.805的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
299.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5299定义的DMR 299内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.805的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
300.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5300定义的DMR 300内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.805的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
301.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5301定义的DMR 301内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.805的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
302.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5302定义的DMR 302内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.805的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
303.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5303定义的DMR 303内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.805的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
304.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5304定义的DMR 304内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.805的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
305.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5305定义的DMR 305内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.804的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
306.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5306定义的DMR 306内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.804的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
307.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5307定义的DMR 307内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.804的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
308.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5308定义的DMR 308内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.804的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
309.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5309定义的DMR 309内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.804的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
310.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5310定义的DMR 310内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.804的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
311.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5311定义的DMR 311内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.804的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
312.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5312定义的DMR 312内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.804的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
313.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5313定义的DMR 313内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.803的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
314.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5314定义的DMR 314内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.803的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
315.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5315定义的DMR 315内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.803的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
316.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5316定义的DMR 316内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.803的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
317.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5317定义的DMR 317内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.803的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
318.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5318定义的DMR 318内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.803的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
319.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5319定义的DMR 319内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.803的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
320.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5320定义的DMR 320内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.803的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
321.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5321定义的DMR 321内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.803的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
322.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5322定义的DMR 322内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.803的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
323.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5323定义的DMR 323内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.803的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
324.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5324定义的DMR 324内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.803的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
325.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5325定义的DMR 325内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.802的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
326.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5326定义的DMR 326内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.802的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
327.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5327定义的DMR 327内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.802的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
328.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5328定义的DMR 328内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.802的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
329.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5329定义的DMR 329内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.802的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
330.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5330定义的DMR 330内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.802的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
331.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5331定义的DMR 331内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.802的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
332.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5332定义的DMR 332内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.802的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
333.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5333定义的DMR 333内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.802的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
334.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5334定义的DMR 334内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.802的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
335.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5335定义的DMR 335内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.802的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
336.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5336定义的DMR 336内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.802的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
337.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5337定义的DMR 337内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.802的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
338.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5338定义的DMR 338内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.802的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
339.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5339定义的DMR 339内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.802的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
340.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5340定义的DMR 340内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.802的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
341.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5341定义的DMR 341内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.802的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
342.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5342定义的DMR 342内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.802的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
343.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5343定义的DMR 343内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.802的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
344.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5344定义的DMR 344内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
345.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5345定义的DMR 345内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
346.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5346定义的DMR 346内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
347.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5347定义的DMR 347内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
348.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5348定义的DMR 348内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
349.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5349定义的DMR 349内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
350.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5350定义的DMR 350内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
351.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5351定义的DMR 351内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
352.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5352定义的DMR 352内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
353.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5353定义的DMR 353内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
354.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5354定义的DMR 354内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
355.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5355定义的DMR 355内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
356.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5356定义的DMR 356内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
357.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5357定义的DMR 357内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
358.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5358定义的DMR 358内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
359.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5359定义的DMR 359内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
360.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5360定义的DMR 360内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
361.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5361定义的DMR 361内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
362.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5362定义的DMR 362内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
363.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5363定义的DMR 363内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
364.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5364定义的DMR 364内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
365.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5365定义的DMR 365内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
366.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5366定义的DMR 366内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
367.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5367定义的DMR 367内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
368.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5368定义的DMR 368内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
369.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5369定义的DMR 369内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
370.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5370定义的DMR 370内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
371.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5371定义的DMR 371内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
372.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5372定义的DMR 372内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
373.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5373定义的DMR 373内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
374.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5374定义的DMR 374内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
375.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5375定义的DMR 375内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.800的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
376.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5376定义的DMR 376内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.800的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
377.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5377定义的DMR 377内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.800的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
378.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5378定义的DMR 378内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.800的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
379.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5379定义的DMR 379内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.800的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
380.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5380定义的DMR 380内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.800的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
381.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5381定义的DMR 381内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.800的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
382.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5382定义的DMR 382内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.800的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
383.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5383定义的DMR 383内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.800的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
384.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5384定义的DMR 384内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.800的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
385.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5385定义的DMR 385内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.800的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
386.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5386定义的DMR 386内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.800的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
387.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5387定义的DMR 387内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.800的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
388.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5388定义的DMR 388内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.800的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
389.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5389定义的DMR 389内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.800的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
390.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5390定义的DMR 390内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.800的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
391.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5391定义的DMR 391内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.860的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
392.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5392定义的DMR 392内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.858的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
393.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5393定义的DMR 393内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.855的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
394.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5394定义的DMR 394内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.851的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
395.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5395定义的DMR 395内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.845的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
396.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5396定义的DMR 396内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.839的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
397.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5397定义的DMR 397内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.839的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
398.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5398定义的DMR 398内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.837的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
399.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5399定义的DMR 399内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.835的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
400.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5400定义的DMR 400内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.834的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
401.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5401定义的DMR 401内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.827的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
402.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5402定义的DMR 402内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.825的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
403.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5403定义的DMR 403内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.825的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
404.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5404定义的DMR 404内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.814的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
405.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5405定义的DMR 405内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.811的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
406.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5406定义的DMR 406内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.806的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
407.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5407定义的DMR 407内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.804的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
408.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5408定义的DMR 408内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.801的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
409.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5409定义的DMR 409内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.799的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
410.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5410定义的DMR 410内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.798的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
411.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5411定义的DMR 411内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.784的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
412.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5412定义的DMR 412内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.78的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
413.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5413定义的DMR 413内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.771的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
414.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5414定义的DMR 414内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.768的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
415.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5415定义的DMR 415内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.766的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
416.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5416定义的DMR 416内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.761的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
417.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5417定义的DMR 417内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.747的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;或
418.由CG表示的在如由SEQ ID NO:5418定义的DMR 418内的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.739的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG,
优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化β值,更优选地,其中所述癌症是宫颈癌。
在本文所述的任一测定方法中,确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤可以包括或可以另外包括确定由SEQ ID NO:5703至5786鉴定的所述序列中的一个或多个内的每个CpG的甲基化状态。
在本文所述的任一测定方法中,确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤可以优选地包括或可以优选地另外包括确定由SEQ ID NO:5703、5731、5759、5723、5751、5779、5713、5741、5769、5706、5734、5762、5705、5733和5761鉴定的所述序列中的一个或多个内的每个CpG的甲基化状态。更优选地,在本文所述的任一测定方法中,确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤可以包括或可以另外包括确定由SEQ ID NO:5703、5731、5759、5723、5751、5779、5713、5741、5769、5706、5734、5762、5705、5733和5761鉴定的所有所述序列内的每个CpG的甲基化状态。
在本文所述的任一测定方法中,确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤可以优选地包括或可以优选地另外包括确定由SEQ ID NO:5703、5731、5759、5713、5741、5769、5706、5734和5762鉴定的所述序列中的一个或多个内的每个CpG的甲基化状态。更优选地,在本文所述的任一测定方法中,确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤可以包括或可以另外包括确定由SEQ ID NO:5703、5731、5759、5713、5741、5769、5706、5734和5762鉴定的所有所述序列内的每个CpG的甲基化状态。
本发明还提供了多种测定方法,每种测定方法包括多个步骤中的任何1个、2个、3个、4个、5个、6个、7个、8个、9个、10个或更多个(或其中可推导的任何范围)并且无特定顺序,其包括以下方法:在样本中测量;分析样本;评估样本;评价样本;测量样本中的核酸;评估样本中的核酸;检测样本中的核酸;测量样本中的核酸的甲基化;分析样本中的核酸;评估样本中的核酸;测量样本中的一个或多个CpG二核苷酸处的甲基化;检测样本中的一个或多个CpG二核苷酸处的甲基化;测定样本中的一个或多个CpG二核苷酸处的甲基化;评估样本中的一个或多个CpG二核苷酸处的甲基化;测量样本中的甲基化状态;测定方法样本中的甲基化状态;检测样本中的甲基化状态;确定样本中的甲基化状态;鉴定样本中的甲基化状态;测量样本中的一个或多个DNA甲基化标志物;评估样本中的一个或多个DNA甲基化标志物;检测样本中的一个或多个DNA甲基化标志物;测量样本中的一个或多个标志物处的甲基化的存在;检测样本中的一个或多个标志物处的甲基化的存在;评估样本中的一个或多个标志物处的甲基化的存在;测定方法样本中的一个或多个标志物的存在;测量样本中的一个或多个DNA甲基化标志物,但不包含测量所述样本中的一个或多个其它DNA甲基化标志物;评估样本中的一个或多个DNA甲基化标志物,但不包含评估所述样本中的一个或多个其它DNA甲基化标志物;分析样本中的一个或多个DNA甲基化标志物,但不包含分析所述样本中的一个或多个其它DNA甲基化标志物;检测样本中的一个或多个DNA甲基化标志物,但不包含检测所述样本中的一个或多个其它DNA甲基化标志物;测量来自患癌个体的组织而非疑似患癌或有患癌风险的个体的组织的核酸中的甲基化状态;检测来自患癌个体的组织而非疑似患癌或有患癌风险的个体的组织的核酸中的甲基化状态;分析来自患癌个体的组织而非疑似患癌或有患癌风险的个体的组织的核酸中的甲基化状态;评估来自患癌个体的组织而非疑似患癌或有患癌风险的个体的组织的核酸中的甲基化状态;测量样本中的一个或多个CpG二核苷酸处的甲基化,但不包含测量所述样本中的一个或多个CpG二核苷酸处的甲基化;评估样本中的一个或多个CpG二核苷酸处的甲基化,但不包含评估所述样本中的一个或多个CpG二核苷酸处的甲基化;分析样本中的一个或多个CpG二核苷酸处的甲基化,但不包含分析所述样本中的一个或多个CpG二核苷酸处的甲基化;检测样本中的一个或多个CpG二核苷酸处的甲基化,但不包含检测所述样本中的一个或多个CpG二核苷酸处的甲基化;测量来自患癌个体的组织而非疑似患癌或有患癌风险的个体的组织的核酸中的一个或多个CpG二核苷酸处的甲基化;检测来自患癌个体的组织而非疑似患癌或有患癌风险的个体的组织的核酸中的一个或多个CpG二核苷酸处的甲基化;分析来自患癌个体的组织而非疑似患癌或有患癌风险的个体的组织的核酸中的一个或多个CpG二核苷酸处的甲基化;评估来自患癌个体的组织而非疑似患癌或有患癌风险的个体的组织的核酸中的一个或多个CpG二核苷酸处的甲基化;当个体已被确定在一个或多个甲基化标志物处具有甲基化状态时,为所述个体实施癌症治疗;当个体已被确定在一个或多个CpG二核苷酸处具有甲基化时,为所述个体实施癌症治疗;
其中任何前述方法或本公开涵盖的任何其它方法可以包括以下方法步骤中的任一个或多个:
测量甲基化状态,其中所述测量鉴定来自样本中的核酸的一个或多个标志物的甲基化状态;
测量甲基化状态,其中所述测量鉴定来自样本中的核酸的一个或多个标志物的存在;
测量来自样本的一个或多个甲基化标志物的存在;
提供来自样本的DNA;
提供来自样本的核酸;
确定来自样本的核酸的一个或多个甲基化标志物是否被甲基化;
测量来自样本的核酸的一个或多个甲基化标志物是否被甲基化;
对来自样本的核酸实施测序步骤;
确定来自样本的核酸的序列;
对一个或多个标志物实施亚硫酸氢盐转化;
对一个或多个CpG二核苷酸实施亚硫酸氢盐转化;
将DNA与包括能够确定甲基化和非甲基化标志物的探针的芯片杂交;
将DNA与包括能够确定甲基化和非甲基化CpG二核苷酸的探针的芯片杂交;
将DNA与包括能够区分甲基化和非甲基化标志物的探针的芯片杂交;
将DNA与包括能够区分甲基化和非甲基化CpG二核苷酸的探针的芯片杂交;
对来自样本的核酸的序列实施扩增步骤;
使用甲基化特异性引物对来自核酸的序列实施扩增步骤;
对包括疑似具有甲基化或需要确定甲基化状态的一个或多个区域的序列实施扩增;
对包括疑似具有甲基化或需要确定甲基化状态的一个或多个区域的序列实施PCR;
实施捕获步骤;
实施结合步骤;
实施纯化步骤;
实施捕获步骤,包括将包括一个或多个甲基化标志物的多核苷酸与对所述一个或多个甲基化标志物具有特异性的结合分子结合,并采集其复合物;
对癌症的级别进行分层;
确定癌症的风险;
确定癌症复发的风险;
从个体获得样本;
从个体的样本获得DNA;
向个体施用治疗;
提供来自样本的DNA;
确定来自含有甲基化标志物的组的一个或多个甲基化标志物是否包括特定序列;和/或
获得鉴定来自组的一组甲基化标志物中的每一个是否包括特定序列的数据。
此外,在本发明的一些方面中,被施用疗法或治疗的个体已接受了本文所述的任何方法和步骤。
本文描述了利用一个或多个CpG的统计上稳健组的测定方法,所述CpG的甲基化状态可以被确定以提供对个体中的CIN3和/或癌症的存在或发展的可靠预测。通过确定所述一个或多个CpG的组内的每个CpG的甲基化状态,可以推导癌症指数值,从而能够根据个体发展CIN3和/或癌症或患有癌症,特别是宫颈癌和/或子宫内膜癌的风险,以统计上稳健的灵敏度和特异性对个体实施分层。本领域技术人员将会理解,一个或多个CpG的组内的每个CpG的甲基化状态可以通过任何合适的手段确定,从而推导癌症指数值。可以使用任何一种方法或方法的组合来确定一个或多个CpG的组内的每个CpG的甲基化状态。
本文描述了用于确定一个或多个CpG的组内的每个CpG的甲基化状态的各种示例性方法。例如,在一种方法中,可以确定CpG的甲基化参考百分比(PMR)值。在另一种方法中,可以确定CpG的甲基化β值。可以取决于情况采用不同的机制来确定特定值,例如基于PCR的机制或基于芯片的机制。
作为诊断和风险评估工具的癌症指数值
在本文所述的任何测定方法中,对个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展的评估基于所述个体在测试时的所述癌症指数值。
如本文所解释,使用本文公开的含有所述特定CpG的组,可以建立对应于CIN3和/或癌症阴性样本的癌症指数值,因为它们基于源自已知为CIN3和/或癌症阴性的个体的值。类似地,使用本文公开的含有所述特定CpG的组,可以建立对应于来自已知为CIN3和/或癌症阳性的个体的CIN3和/或癌症阳性样本的癌症指数值。然后,用户可以应用这些癌症指数值来评估其CIN3和/或癌症状态需要测试的任何测试个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展。同样如本文所解释,本发明的测定方法能够以高度统计准确性实施。
如本文所解释,所描述的测定方法特别地涉及对宫颈癌和/或子宫内膜癌(特别是宫颈癌)的存在、不存在或发展的评估。
本领域技术人员将容易理解,癌症指数值提供了指示本发明的任何测定方法的“可能性”或“风险”或“预测”的值,其正确地评估个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展。这是因为评估基于组织样本的DNA甲基化特征与个体疾病状态之间的相关性。然而,如实施例和本文其它地方列出的数据所证明,本发明的测定方法提供了这种具有高统计准确性的相关性,从而为技术人员提供了高度的置信度,即为其癌症状态需要测试的任何测试个体确定的所述癌症指数值将提供与所述个体的实际疾病状态的准确相关性。
在本发明的上下文中,“可能性”、“风险”和“预测”可以彼此同义地使用。
本文对序列、基因组序列和/或基因组坐标的任何引用均基于智人(人类)基因组组装GRCh37(hg19)推导。技术人员将会理解,由于测序错误和/或个体之间的变异,可能存在任何给定序列,特别是DMR 1至418的核苷酸序列的变异。
本发明的测定方法表示‘预测’,因为根据本发明推导的任何癌症指数值(WID-CIN-指数)不太可能能够以100%特异性和100%灵敏度将每个个体诊断为患有或未患有癌症。相反,取决于用户为正向预测个体中的癌症的存在而应用的癌症指数截点阈值,假阳性率和假阴性率将会有所不同。换言之,发明人已经发现,本发明的测定方法可以实现预测CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展的不同水平的灵敏度和特异性,如由接受者操作特征所定义的,这取决于用户选择和应用的癌症指数截点阈值。从本文公开的数据可以看出,这种灵敏度和特异性可在高比例下实现,从而证明了准确和统计显著的区分能力。
类似地,已被预先确定为与特定癌症表型相关的癌症指数值,例如是否存在癌症,已被定义为具有高水平的统计准确性,如本文进一步解释的。
在本发明的上下文中,评估癌症的‘发展’可以指评估个体是否可能或不可能发展癌症。来自所取样的这些组织/解剖部位的细胞可以作为可能转化为癌症的宫颈和/或子宫内膜细胞的替代物。根据本发明的测定方法评估癌症的发展可以指评估CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌和子宫内膜癌,优选宫颈癌)发展的可能性增加或减少。根据本发明的测定方法评估癌症的发展可以指评估个体中的预先存在的癌症病变的进展或恶化。根据本发明的测定方法评估癌症的发展可以指预测癌症复发的可能性。
在本文所述的任何测定方法中,基于癌症指数值评估个体中CIN3和/或癌症的存在、不存在或发展的所述步骤可以涉及阈值的应用。阈值可以提供个体的CIN3和/或癌症状态的基于风险的指示,无论是CIN3和/或癌症阳性,还是CIN3和/或癌症阴性。阈值还可以提供一种用于鉴定癌症指数值是否介于CIN3和/或癌症阳性值和CIN3和/或癌症阴性值之间的手段。如本文所解释,所述癌症指数值可以是动态的并且取决于遗传和/或环境因素而发生改变。因此,所述癌症指数值可以提供一种用于评估和监测癌症发展的手段。因此,癌症指数值可以至少指示所述个体具有CIN3和/或癌症阳性状态或具有指示CIN3和/或癌症发展的状态的低风险或高风险。如果个体的癌症指数值通过本发明的测定方法在两个或更多个时间点确定,则所述个体的癌症指数值的增加或减小可以指示所述个体患有或发展CIN3和/或癌症,特别是宫颈癌和/或子宫内膜癌,最优选宫颈癌的风险增加或减小。
在本文的整个公开内容中,术语“阈值”、“截点”和“截点阈值”被认为是同义的且可互换的。
如本文进一步解释,本发明的任何测定方法是一种用于评估个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展的测定方法。癌症的类型在本文中进一步阐述。如本文进一步解释,本发明的测定方法提供了一种用于基于特定截点阈值评估个体是否有患有或发展CIN3和/或癌症的风险的手段。此类风险评估可以基于表征所述测定方法的统计参数而具有高度的置信度。因此,在本文所述的涉及癌症指数截点阈值的任何测定方法中,所述截点阈值可以用于风险评估目的。同样,在本文所述的涉及癌症指数截点阈值的任何测定方法中,所述截点阈值可以用于指定个体是否患有CIN3和/或癌症作为纯诊断测试。同样,此类诊断测试可以基于表征所述测定方法的统计参数而具有高度的置信度。因此,在本文所述的指定个体的癌症指数值是特定值或更大,或为“约”特定值或更大的任何测定方法中,所述个体可以被评估为患有癌症。在本文所述的指定个体的癌症指数值小于特定值或小于“约”特定值的任何测定方法中,所述个体可以被评估为未患有癌症。术语“约”应被理解为提供所述值的+/-5%的范围。
因此,本发明的任何测定方法是一种用于评估个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展的测定方法,所述测定方法包括:
a.提供取自所述个体的样本,所述样本包括DNA分子群体;
b.在所述样本中的所述DNA分子群体中确定以下组的甲基化状态:
(i)一个或多个CpG,其选自SEQ ID NO:1至5000中鉴定的CpG的组,其中所述CpG在核苷酸位置61至62处鉴定;和/或
(ii)一个或多个CpG,其选自由SEQ ID NO:5001至5418定义的一个或多个差异甲基化区域(DMR)的组,其中所述CpG由CG表示;
c.基于所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态推导癌症指数值;和
d.基于所述癌症指数值评估所述个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展;
其中所述测定方法的特征在于具有0.60或更大的曲线下面积(AUC),如通过接受者操作特征(ROC)所确定的。
本发明的任何测定方法特别地用于评估个体中是否存在CIN3和/或癌症。
可以根据本文公开和定义的任何方法实施此测定方法。
如本文进一步解释,本发明的用于评估个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展的任何测定方法可以可替代地被称为用于根据他们的CIN3和/或癌症状态对个体实施分层的测定方法。
因此,本发明的任何测定方法是一种用于针对个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展对个体实施分层的测定方法,所述测定方法包括:
a.提供取自所述个体的样本,所述样本包括DNA分子群体;
b.在所述样本中的所述DNA分子群体中确定以下组的甲基化状态:
(i)一个或多个CpG,其选自SEQ ID NO:1至5000中鉴定的CpG的组,其中所述CpG在核苷酸位置61至62处鉴定;和/或
(ii)一个或多个CpG,其选自由SEQ ID NO:5001至5418定义的一个或多个差异甲基化区域(DMR)的组,其中所述CpG由CG表示;
c.基于所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态推导癌症指数值;和
d.基于所述癌症指数值针对CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展对所述个体实施分层;
其中所述测定方法的特征在于具有0.60或更大的曲线下面积(AUC),如通过接受者操作特征(ROC)所确定的。
可以根据本文公开和定义的任何方法实施此测定方法。
因此,本发明的任何测定方法是一种用于针对CIN3和/或癌症对个体实施分层的测定方法,所述测定方法包括:
a.提供取自所述个体的样本,所述样本包括DNA分子群体;
b.在所述样本中的所述DNA分子群体中确定以下组的甲基化状态:
(i)一个或多个CpG,其选自SEQ ID NO:1至5000中鉴定的CpG的组,其中所述CpG在核苷酸位置61至62处鉴定;和/或
(ii)一个或多个CpG,其选自由SEQ ID NO:5001至5418定义的一个或多个差异甲基化区域(DMR)的组,其中所述CpG由CG表示;
c.基于所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态推导癌症指数值;和
d.基于所述癌症指数值针对癌症对所述个体实施分层;
其中所述测定方法的特征在于具有0.60或更大的曲线下面积(AUC),如通过接受者操作特征(ROC)所确定的。
可以根据本文公开和定义的任何方法实施此测定方法。
可以通过任何合适的手段推导所述癌症指数值。优选地,所述癌症指数值可以通过在从个体提供的样本中评估所述组的甲基化状态来推导:
(i)一个或多个CpG,其选自SEQ ID NO:1至5000中鉴定的CpG的组,其中所述CpG在核苷酸位置61至62处鉴定;和/或
(ii)一个或多个CpG,其选自由SEQ ID NO:5001至5418定义的一个或多个差异甲基化区域(DMR)的组,其中所述CpG由CG表示。
所述CpG的甲基化状态可以通过任何合适的手段推导。例如,在本文所述的任何测定方法中,确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化状态的所述步骤可以包括:
a.实施测序步骤以确定每个CpG的序列;
b.将DNA与包括能够区分所述CpG的甲基化和非甲基化形式的探针的芯片杂交,并将检测系统应用于所述芯片以确定每个CpG的甲基化状态;和/或
c.使用甲基化特异性引物实施PCR步骤,其中所述CpG的甲基化状态通过PCR产物是否存在来确定。
在本文所述的任何测定方法中,确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化状态的所述步骤可以包括亚硫酸氢盐转化所述DNA。
在所述样本中的所述DNA分子群体中确定一个或多个CpG的组的甲基化状态的所述步骤可以包括确定每个CpG的β值。推导所述癌症指数值可以涉及提供甲基化β值数据集,其包括所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化β值。另外地或可替代地,在所述样本中的所述DNA分子群体中确定一个或多个CpG的组的甲基化状态的所述步骤可以包括确定所述一个或多个CpG的组中的每一个的甲基化参考百分比值。任选地,推导所述癌症指数值还可以涉及估算从样本提供的所述DNA内的污染DNA的分数。
DNA可以是来源于特定来源的生物体、组织或细胞类型的DNA。优选地,所述污染DNA来源于与一种或多种关注的细胞类型不同的一种或多种细胞类型。关注的细胞类型可以特别地是上皮细胞。在本发明的一些方面中,可能优选的是,在提供取自个体的样本的步骤之后估算污染DNA的分数。本文所述的测定方法可以任选地涉及通过任何合适的手段估算所述样本中的DNA内的污染DNA分数。优选地,经由任何合适的生物信息学分析工具估算所述样本的所述污染DNA分数。可以用于估算污染DNA分数的生物信息学分析工具可以是EpIDISH。如本文所述,可能需要估算来自与所述一种或多种关注的细胞类型不同的所述一种或多种细胞类型的污染DNA的分数,这是因为在一些情况下,用于预测个体中的癌症的存在或发展的所述癌症指数值可能只能通过从特定的关注的细胞类型的DNA确定一组CpG的甲基化状态而可靠地得出。特别地,相对于来自样本内的不同细胞类型的污染DNA中的甲基化状态β值,同一样本内的所述一种或多种关注的细胞类型的甲基化状态β值可以不同。因此,在一些情况下,在无需估算和控制从所述样本提供的所述DNA中的污染DNA分数的情况下,所导出的癌症指数值可能具有降低的预测能力。在本发明的涉及估算污染DNA的分数并相应地控制所述污染DNA的测定方法中,优选的是,估算从所述样本提供的所述DNA内的免疫细胞DNA分数。在本发明的特定测定方法中,其中所述个体具有超过50%的免疫细胞污染(即,其中所述样本中超过50%的所述DNA被认为源自免疫细胞),所述测定方法可以优选地涉及通过根据本发明仅从源自上皮细胞的所述DNA分子推导所述癌症指数来控制所述免疫细胞污染。
本文所述的包括基于所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态推导癌症指数值的步骤的任何测定方法可以进一步包括:将算法应用于所述甲基化β值数据集以获得所述癌症指数值。优选地,在本文所述的任何测定方法中,基于CpG的组的甲基化状态推导所述癌症指数值的所述步骤包括:提供甲基化β值数据集,其包括所述组中的每个CpG的所述甲基化β值;并且将算法应用于所述甲基化β值数据集以获得所述癌症指数值。
在本文所述的任何测定方法中,基于所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态推导所述癌症指数值的所述步骤可以包括:
a.提供包括所述组中的每个CpG的所述甲基化β值的甲基化β值数据集;
b.提供能够从所述甲基化β值数据集生成所述癌症指数的数学模型;和
c.将所述数学模型应用于所述甲基化β值数据集,从而生成所述癌症指数。
在本文所述的任何测定方法中,所述癌症指数值可以通过任何合适的数学模型,例如算法或公式来计算。优选地,所述癌症指数值被称为女性宫颈癌风险鉴定指数(WID-CIN-指数),并且其中应用于所述甲基化β值数据集以生成所述癌症指数的所述数学模型通过根据以下公式的算法计算:
其中:
1.β1,...,βn是甲基化β值(介于0和1之间);
2.w1,...,w5000是实值系数;
3.μ和σ是用于缩放所述指数的实值参数;并且
4.n指所述测试CpG集中的CpG的数量;
优选地,其中所述癌症是子宫内膜癌。
在本文所述的任何测定方法中,所述WID-CIN-指数算法应用通过最初在数据集(在实施例中描述的本发明的示例性实施例中,本数据集由165个CIN3+病例和202个人类乳头瘤病毒阳性病例组成(HPV+)对照组成)上训练推断的实值系数,以使用具有混合参数值α=0(岭罚)和二项式响应类型的R包glmnet拟合岭分类器。通过cv.glmnet函数在内部使用十折交叉验证以确定正则化参数λ的最佳值。使用来自个体υ的n个CpG的β值作为所述岭分类器的输入。从拟合模型获得系数w1,...,wn。为所述训练集中的每个个体υ计算以下量:
任何合适的实数值系数可以应用于本文所述的任何测定方法中的所述WID-CIN-指数。
参数μ和σ的值分别由所述训练数据集中的xυ的均值和标准偏差给出。
因此,任何合适的μ和σ实值参数可以应用于本文所述的任何测定方法中的所述WID-CIN-指数。任何合适的训练数据集可以应用于本文所述的测定方法,以推断随后可以应用于根据本发明的所述WID-CIN-指数公式的实值参数和系数。根据本发明利用训练数据集的示例性方式在实施例的材料和方法部分的‘分类器开发的统计分析’部分中进一步描述。
对于SEQ ID NO:1至5000中鉴定的CpG子集,示例性的μ和σ实值参数在表2中提供。这些实值参数可以应用于本文所述的任何测定方法,其中所述实值参数对应于在SEQ IDNO:1至5000中鉴定并在表3的左栏中列出的所述CpG集中的任一个。
SEQ ID NO: | μ | σ |
1-100 | 2.740972 | 5.738187 |
1-500 | 7.58544 | 7.762485 |
1-1000 | 5.731128 | 8.397056 |
1-1500 | 5.609192 | 9.469183 |
1-2000 | 5.498524 | 10.06744 |
1-2500 | 4.994593 | 9.862255 |
1-3000 | 5.11682 | 9.974974 |
1-3500 | 3.809614 | 8.180184 |
1-4000 | 4.352256 | 10.55814 |
1-4500 | 4.416423 | 9.848581 |
1-5000 | 4.268773 | 10.38904 |
表3.对于SEQ ID NO:1至5000中鉴定的CpG子集,示例性的μ和σ实值参数在表3中提供
对于在SEQ ID NO:1至5000中的位置61至62处鉴定的CpG,示例性的w1,...,wn实值系数在下面提供。这些实值系数可以应用于本文所述的任何测定方法,其中实值参数对应于SEQ ID NO:1至5000中鉴定的所述CpG集中的任一个,其中下面的所述5000个实数值系数依次对应于在SEQ ID NO:1至5000中的核苷酸位置61至62处依次鉴定的CpG。因此,所列出的系数在下面以分别对应于SEQ ID NO:1至5000中鉴定的CpG的数字顺序呈现。因此,下面的第一个数字对应于SEQ ID NO:1,第二个数字对应于SEQ ID NO:2,以此类推。示例性实数值系数如下:
-1.4775、-1.12307、-1.06088、1.02708、-0.96865、-0.87277、0.85797、0.85533、0.84542、-0.84206、-0.8321、-0.81011、-0.79471、0.77851、-0.77179、-0.75927、0.75082、-0.73863、-0.7318、0.72738、0.72644、-0.7134、0.71318、0.70257、-0.6891、-0.6883、0.67779、-0.67584、0.66994、-0.667、-0.6634、-0.6558、0.65126、-0.64549、0.64461、-0.64282、0.63756、-0.63593、-0.63406、-0.63239、-0.62702、-0.62655、0.62338、0.61844、-0.61788、-0.61317、0.60845、-0.60205、-0.59891、0.59795、0.5958、0.59007、0.58909、-0.58345、0.58343、-0.58072、-0.57796、-0.56978、0.56904、-0.56875、0.56635、-0.56237、-0.55676、0.55659、-0.55655、-0.55407、-0.55107、-0.55091、-0.55045、0.55042、0.54961、0.54723、0.54665、-0.54636、-0.54566、0.54097、-0.53854、-0.53758、-0.53165、-0.52949、-0.52598、0.52439、-0.52218、-0.52083、-0.51658、0.51647、-0.51358、0.51072、0.51028、0.50981、-0.50841、0.50286、-0.50242、-0.49984、-0.49701、-0.49605、-0.49543、-0.49485、-0.49472、-0.49469、-0.49309、-0.48824、-0.48715、0.48711、-0.48433、0.48313、0.48294、-0.48258、-0.48251、-0.48197、-0.48011、0.47981、-0.47821、0.476、-0.47481、-0.47374、0.4733、-0.4716、0.47091、0.47028、0.46854、0.46782、-0.4677、-0.46738、0.46548、-0.46218、-0.46142、0.46072、0.46064、-0.45973、0.45913、-0.45882、-0.45805、0.45732、0.45726、0.45588、0.45555、-0.45529、0.45168、0.45058、0.45051、0.44934、-0.44906、0.44896、-0.44841、0.44837、-0.44764、0.44714、-0.44601、0.44583、0.44535、0.44155、-0.44058、0.44035、0.43869、0.43775、-0.43757、-0.43745、0.43701、0.43676、0.43551、0.43259、0.43171、0.43165、-0.43081、-0.42966、0.42941、-0.42855、-0.4283、-0.42811、-0.42726、-0.42653、0.42533、-0.42497、-0.42227、0.42197、0.42112、0.42065、-0.42017、0.41908、-0.41877、-0.41752、0.41744、-0.41699、-0.41692、-0.41629、-0.41507、0.41444、-0.41419、0.41388、0.41252、-0.41247、-0.41095、0.40819、0.40749、0.40686、0.4068、0.40677、-0.40377、-0.40374、-0.40252、-0.40054、0.39925、-0.39864、-0.39699、0.39649、-0.39624、-0.39583、-0.3953、-0.39496、-0.39482、0.39471、-0.39437、-0.39338、-0.39292、0.39274、0.39259、0.3915、-0.39145、0.39104、-0.39039、-0.39002、-0.3891、0.38898、-0.38861、-0.38804、0.38715、-0.38646、0.38602、-0.38594、0.38586、-0.3853、-0.38497、0.38362、-0.38354、-0.383、-0.38281、-0.38096、-0.38045、-0.38024、0.38002、-0.37994、-0.37937、-0.37767、0.37711、-0.3768、-0.37629、0.37623、0.37534、-0.37525、0.3749、-0.37383、0.37336、0.37282、0.37192、0.37191、-0.37097、0.37079、-0.37068、0.37047、0.37041、0.37028、-0.37016、0.36947、-0.36861、-0.36807、0.36779、-0.36706、-0.36682、-0.36616、0.36615、-0.36479、-0.36473、0.36451、0.36409、-0.3629、0.36281、0.36178、-0.36176、0.36069、0.36024、0.35967、-0.35955、-0.35946、-0.35936、0.35719、-0.35713、0.35628、-0.35409、0.35395、0.35376、-0.35299、-0.35255、0.3502、0.34911、0.34869、0.34786、-0.34731、-0.3471、-0.34694、0.34675、0.34558、0.34527、0.34508、0.34378、0.34336、-0.34305、0.34299、0.34214、-0.34168、0.34143、0.34138、0.34034、0.34026、-0.34019、0.33913、0.33878、0.33822、-0.33782、-0.33778、-0.33715、-0.33713、-0.33665、-0.33625、-0.33623、0.33616、-0.33561、0.33559、0.33525、-0.33489、0.33477、-0.33312、0.33209、-0.33134、-0.3305、-0.33018、0.32949、-0.32908、0.32858、0.32858、0.32795、0.3279、0.32741、-0.32719、-0.32718、0.32703、0.32691、-0.32668、-0.32659、0.32609、-0.32464、-0.3245、0.32405、0.32346、-0.32291、-0.32267、-0.32219、-0.32198、-0.32197、-0.32185、-0.32129、0.32038、-0.31978、-0.31957、0.31914、0.31908、-0.31904、-0.31885、-0.31876、-0.31864、0.31804、-0.31803、0.31776、-0.31706、-0.31689、-0.31626、-0.31614、-0.31607、0.31574、-0.31553、-0.31525、0.31518、-0.31511、-0.31467、0.31413、-0.31391、-0.31389、-0.3138、-0.3134、0.31327、-0.31314、0.313、0.31292、-0.31269、-0.3126、0.3125、0.31178、-0.31143、0.31132、0.31075、-0.3105、-0.30969、0.30928、0.30863、-0.30829、0.30777、0.30744、-0.30664、-0.30618、-0.30603、-0.30603、-0.30568、-0.30566、0.30496、0.30485、0.30471、-0.30431、-0.30418、-0.30363、-0.30298、-0.30289、-0.30286、0.30273、-0.30251、0.30162、-0.30149、0.30131、0.30105、-0.30075、-0.30067、0.30019、0.29954、0.29932、-0.29929、-0.29923、0.29811、-0.298、0.29791、-0.29759、0.29747、0.29739、0.2973、-0.29718、0.29686、-0.29589、0.29583、-0.29553、-0.29544、0.29505、-0.29498、-0.29483、-0.29472、-0.29457、-0.29421、0.29396、-0.29395、0.29355、0.29323、0.29296、-0.29269、-0.29268、-0.29173、-0.29138、0.29128、0.29032、0.29016、0.28977、-0.28877、-0.28853、0.28826、0.28777、0.28759、-0.28734、0.28707、-0.28678、0.28627、0.28603、0.28595、-0.28568、0.2855、0.28543、-0.28538、-0.28476、-0.28467、-0.28462、-0.28439、-0.28433、0.28392、-0.28383、-0.28378、0.28364、0.28321、-0.283、0.28291、0.28291、-0.2828、-0.28264、0.28248、-0.28148、-0.28142、0.28123、0.28046、-0.27976、-0.27975、0.27962、0.27924、0.27877、0.27816、0.27801、0.27732、-0.27667、-0.27651、0.27644、-0.27633、0.27626、-0.27616、0.27613、0.27601、-0.27591、-0.27582、-0.27574、0.2757、-0.27471、-0.27457、0.27455、0.2742、-0.27409、0.2739、-0.27333、-0.2733、-0.2727、-0.27248、-0.27213、0.27197、-0.27158、-0.27131、0.27111、-0.27047、-0.27002、-0.26996、0.26988、-0.26977、0.26976、-0.26969、-0.26927、-0.26918、0.26906、-0.26896、0.26894、0.26893、-0.26874、0.26838、-0.26817、0.26792、-0.26742、-0.26739、-0.26736、0.26734、-0.26717、-0.26691、-0.2669、-0.26685、-0.26616、-0.26615、0.2657、0.26568、-0.26561、0.26525、0.26501、0.2649、-0.26476、-0.26474、-0.2644、-0.26409、0.26401、-0.26401、-0.26387、0.26305、-0.26301、0.26295、-0.26295、-0.26106、0.26057、-0.26037、0.26031、-0.26019、0.26018、0.26007、0.26005、-0.25972、-0.2595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、0.00487、0.00485、0.00485、0.00484、0.00482、-0.00482、-0.00481、-0.00479、-0.00476、-0.00474、0.00471、0.00469、-0.00466、0.00465、0.00464、0.00463、-0.00461、-0.0046、-0.00459、-0.00458、0.00457、-0.00457、0.00456、0.00446、-0.00445、0.00443、-0.00443、0.00443、-0.00442、0.00439、-0.00432、-0.00432、-0.0043、-0.00427、0.00427、0.00424、-0.00423、0.00421、0.00418、-0.00415、0.00414、-0.00412、0.00409、0.00407、0.00407、-0.00406、0.00405、-0.00403、0.00403、-0.00403、-0.00399、0.00397、0.00395、-0.00392、-0.00391、0.0039、0.0039、0.00389、0.00388、0.00383、-0.0038、-0.0038、-0.00378、-0.00375、0.00374、-0.00373、0.00373、0.00371、-0.00368、0.00361、0.0036、0.00358、0.00357、-0.00357、-0.00352、0.00352、-0.00351、0.00347、-0.00347、-0.00347、-0.0034、-0.00338、-0.00338、0.00331、0.00325、0.00323、0.00322、0.00321、-0.00316、0.00316、-0.00315、-0.00315、-0.00314、-0.0031、0.00309、0.00307、-0.00305、-0.00301、-0.003、-0.00299、0.00299、0.00296、-0.00295、-0.00294、0.00293、-0.00291、-0.00291、0.00289、-0.00289、-0.00287、0.00287、0.00287、-0.00285、-0.00284、-0.00282、-0.00266、-0.00265、0.00263、-0.00262、0.00261、-0.0026、-0.0026、-0.00258、0.00255、-0.00255、-0.00251、-0.0025、0.00249、-0.00248、0.00247、0.00237、0.00236、0.00236、-0.00233、0.00231、-0.0023、-0.00229、-0.00228、0.00223、0.00222、0.0022、0.00219、0.00217、0.00214、0.0021、-0.00208、-0.00208、-0.00207、0.00206、-0.00203、-0.00202、-0.00201、-0.002、0.002、0.0019、0.00188、-0.00186、0.00184、0.0018、-0.00178、-0.00175、0.00172、-0.00172、0.0017、-0.00168、-0.00164、-0.00162、0.00162、0.00155、-0.00155、-0.00151、0.00148、0.00148、-0.00148、-0.00148、-0.00147、-0.00144、0.00144、0.00144、-0.00142、-0.00141、0.0014、0.00139、-0.00136、0.00134、0.00134、0.00133、-0.00132、-0.00128、-0.00126、-0.00123、0.00123、-0.00121、-0.0012、0.00118、0.00116、-0.00113、0.00113、0.00112、0.00111、-0.00109、0.00108、0.00107、-0.00107、0.00106、-0.00105、0.00104、0.00101、0.00097、0.00096、-0.00083、0.00081、0.00077、-0.00073、-0.00069、0.00068、0.00068、0.00065、-0.00065、-0.00063、0.00062、0.00059、-0.00059、0.00058、0.00057、0.00057、-0.00054、0.00053、0.00051、0.00051、5.00E-04、-0.00048、0.00045、-0.00045、0.00041、4.00E-04、-0.00039、0.00038、-0.00038、-0.00038、-0.00036、-0.00036、-0.00033、-0.00031、-0.00029、0.00025、0.00019、-0.00019、-0.00018、-0.00014、0.00011、5.00E-05、-3.00E-05、-3.00E-05、-3.00E-05和-1.00E-05。
预测个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展可以特别地涉及应用阈值癌症指数值以评估个体患有或未患有癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险或低风险或对所述个体实施分层。
本发明的测定方法可以涉及应用阈值指数以评估个体中是否存在CIN3和/或癌症。所述评估的特征可以是接受者操作特征,特别是曲线下面积(AUC)、灵敏度和特异性,其指示被应用于评估个体中是否存在CIN3和/或癌症的所述阈值的可靠性。
在本文所述的任何测定方法中,其中当所述个体的所述癌症指数值为约-0.331或更大时,所述个体基于所述WID-CIN-指数被评估为患有癌症和/或CIN3,或在个体中具有癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)和/或CIN3发展的风险。用于推导所述癌症指数值的所述一个或多个CpG的组可以包括:
a.在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少500个,并且其中灵敏度为至少87%,且特异性为至少49%;
b.由SEQ ID NO:1至500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少86%,且特异性为至少77%;
c.由SEQ ID NO:1至1000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少87%,且特异性为至少77%;
d.由SEQ ID NO:1至1500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少89%,且特异性为至少76%。
在本文所述的任何测定方法中,其中当所述个体的所述癌症指数值为约-0.331或更大时,所述个体被评估为患有癌症和/或CIN3或具有癌症和/或CIN3发展的高风险,或其中当所述个体的所述癌症指数值小于约-0.331时,所述个体基于所述WID-CIN-指数被评估为未患有癌症和/或CIN3或在个体中具有癌症发展和/或CIN3,特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌的低风险。用于推导所述癌症指数值的所述一个或多个CpG的组可以包括:
1.在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少500个,并且其中灵敏度为至少87%,且特异性为至少49%;
2.在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少1000个,并且其中灵敏度为至少86%,且特异性为至少49%;
3.在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少1500个,并且其中灵敏度为至少90%,且特异性为至少51%;
4.在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少2000个,并且其中灵敏度为至少89%,且特异性为至少51%;
5.在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少2500个,并且其中灵敏度为至少89%,且特异性为至少53%;
6.在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少3000个,并且其中灵敏度为至少87%,且特异性为至少52%;
7.在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少3500个,并且其中灵敏度为至少87%,且特异性为至少52%;
8.在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少4000个,并且其中灵敏度为至少86%,且特异性为至少57%;
9.在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少4500个,并且其中灵敏度为至少86%,且特异性为至少66%;
10.在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少4900个,并且其中灵敏度为至少90%,且特异性为至少75%;或
11.在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少5000个,并且其中灵敏度为至少90%,且特异性为至少75%。
在本文所述的任何测定方法中,其中当所述个体的所述癌症指数值为约-0.311或更大时,所述个体被评估为患有癌症和/或CIN3或具有癌症和/或CIN3发展的高风险,或其中当所述个体的所述癌症指数值小于约-0.311时,所述个体基于所述WID-CIN-指数被评估为未患有癌症和/或CIN3或在个体中具有癌症发展和/或CIN3,特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌的低风险。用于推导所述癌症指数值的所述一个或多个CpG的组可以包括:
1.由SEQ ID NO:1至500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少86%,且特异性为至少77%;
2.由SEQ ID NO:501至1000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少84%,且特异性为至少77%;
3.由SEQ ID NO:1001至1500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少86%,且特异性为至少68%;
4.由SEQ ID NO:1501至2000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少86%,且特异性为至少60%;
5.由SEQ ID NO:2001至2500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少90%,且特异性为至少61%;
6.由SEQ ID NO:2501至3000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少86%,且特异性为至少55%;
7.由SEQ ID NO:3001至3500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少86%,且特异性为至少52%;
8.由SEQ ID NO:3501至4000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少86%,且特异性为至少53%;
9.由SEQ ID NO:4001至4500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少87%,且特异性为至少51%;
10.由SEQ ID NO:4501至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少87%,且特异性为至少49%;
11.由SEQ ID NO:1至100定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少86%,且特异性为至少77%;
12.由SEQ ID NO:1至500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少86%,且特异性为至少77%;
13.由SEQ ID NO:1至1000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少87%,且特异性为至少77%;
14.由SEQ ID NO:1至1500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少89%,且特异性为至少76%;
15.由SEQ ID NO:1至2000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少89%,且特异性为至少76%;
16.由SEQ ID NO:1至2500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少90%,且特异性为至少75%;
17.由SEQ ID NO:1至3000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少90%,且特异性为至少73%;
18.由SEQ ID NO:1至3500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少90%,且特异性为至少73%;
19.由SEQ ID NO:1至4000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少90%,且特异性为至少76%;
20.由SEQ ID NO:1至4500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少90%,且特异性为至少74%;
21.由SEQ ID NO:1至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少90%,且特异性为至少75%;
22.由SEQ ID NO:4501至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少87%,且特异性为至少49%;
23.由SEQ ID NO:4001至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少86%,且特异性为至少49%;
24.由SEQ ID NO:3501至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少90%,且特异性为至少51%;
25.由SEQ ID NO:3001至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少89%,且特异性为至少51%;
26.由SEQ ID NO:2501至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少89%,且特异性为至少53%;
27.由SEQ ID NO:2001至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少87%,且特异性为至少52%;
28.由SEQ ID NO:1501至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少87%,且特异性为至少52%;
29.由SEQ ID NO:1001至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少86%,且特异性为至少57%;
30.由SEQ ID NO:501至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少86%,且特异性为至少66%;
31.由SEQ ID NO:101至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少90%,且特异性为至少75%;或
32.由SEQ ID NO:1至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少90%,且特异性为至少75%。
在任何所述测定方法中,所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态优选地通过β值分析确定,并且所述测定方法用于评估CIN3和/或癌症的存在、不存在或发展,优选地,所述癌症是宫颈癌或子宫内膜癌。最优选地,所述癌症是宫颈癌。
在本文所述的任何测定方法中,其中当所述个体的所述癌症指数值为约-0.167或更大时,所述个体被评估为患有癌症和/或CIN3或具有癌症和/或CIN3发展的风险,或其中当所述个体的所述癌症指数值小于约-0.167时,所述个体基于所述WID-CIN-指数被评估为未患有癌症和/或CIN3或在个体中具有癌症发展和/或CIN3,特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌的低风险。用于推导所述癌症指数值的所述一个或多个CpG的组可以包括:
a.在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少500个,并且其中灵敏度为至少80%,且特异性为至少61%;
b.由SEQ ID NO:1至500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少77%,且特异性为至少90%;
c.由SEQ ID NO:1至1000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少72%,且特异性为至少89%;
d.由SEQ ID NO:1至1500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少78%,且特异性为至少91%。
在本文所述的任何测定方法中,其中当所述个体的所述癌症指数值为约-0.167或更大时,所述个体被评估为患有癌症和/或CIN3或具有癌症和/或CIN3发展的高风险,或其中当所述个体的所述癌症指数值小于约-0.167时,所述个体基于所述WID-CIN-指数被评估为未患有癌症和/或CIN3或在个体中具有癌症发展和/或CIN3,特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌的低风险。用于推导所述癌症指数值的所述一个或多个CpG的组可以包括:
1.在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少500个,并且其中灵敏度为至少80%,且特异性为至少61%;
2.在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少1000个,并且其中灵敏度为至少79%,且特异性为至少59%;
3.在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少1500个,并且其中灵敏度为至少79%,且特异性为至少60%;
4.在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少2000个,并且其中灵敏度为至少80%,且特异性为至少60%;
5.在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少2500个,并且其中灵敏度为至少79%,且特异性为至少63%;
6.在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少3000个,并且其中灵敏度为至少79%,且特异性为至少65%;
7.在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少3500个,并且其中灵敏度为至少76%,且特异性为至少81%;
8.在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少4000个,并且其中灵敏度为至少80%,且特异性为至少70%;
9.在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少4500个,并且其中灵敏度为至少76%,且特异性为至少81%;
10.在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少4900个,并且其中灵敏度为至少74%,且特异性为至少90%;或
11.在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少5000个,并且其中灵敏度为至少78%,且特异性为至少89%。
在本文所述的任何测定方法中,其中当所述个体的所述癌症指数值为约-0.167或更大时,所述个体被评估为患有癌症和/或CIN3或具有癌症和/或CIN3发展的风险,或其中当所述个体的所述癌症指数值小于约-0.167时,所述个体基于所述WID-CIN-指数被评估为未患有癌症和/或CIN3或在个体中具有癌症发展和/或CIN3,特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌的低风险。用于推导所述癌症指数值的所述一个或多个CpG的组可以包括:
1.由SEQ ID NO:1至500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少77%,且特异性为至少90%;
2.由SEQ ID NO:501至1000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少64%,且特异性为至少92%;
3.由SEQ ID NO:1001至1500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少76%,且特异性为至少85%;
4.由SEQ ID NO:1501至2000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少82%,且特异性为至少76%;
5.由SEQ ID NO:2001至2500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少79%,且特异性为至少77%;
6.由SEQ ID NO:2501至3000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少80%,且特异性为至少70%;
7.由SEQ ID NO:3001至3500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少82%,且特异性为至少67%;
8.由SEQ ID NO:3501至4000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少84%,且特异性为至少62%;
9.由SEQ ID NO:4001至4500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少77%,且特异性为至少61%;
10.由SEQ ID NO:4501至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少80%,且特异性为至少61%;
11.由SEQ ID NO:1至100定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少75%,且特异性为至少86%;
12.由SEQ ID NO:1至500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少77%,且特异性为至少90%;
13.由SEQ ID NO:1至1000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少72%,且特异性为至少89%;
14.由SEQ ID NO:1至1500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少78%,且特异性为至少91%;
15.由SEQ ID NO:1至2000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少79%,且特异性为至少90%;
16.由SEQ ID NO:1至2500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少80%,且特异性为至少89%;
17.由SEQ ID NO:1至3000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少80%,且特异性为至少89%;
18.由SEQ ID NO:1至3500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少80%,且特异性为至少89%;
19.由SEQ ID NO:1至4000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少78%,且特异性为至少90%;
20.由SEQ ID NO:1至4500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少80%,且特异性为至少89%;
21.由SEQ ID NO:1至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少78%,且特异性为至少89%;
22.由SEQ ID NO:4501至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少80%,且特异性为至少61%;
23.由SEQ ID NO:4001至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少79%,且特异性为至少59%;
24.由SEQ ID NO:3501至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少79%,且特异性为至少60%;
25.由SEQ ID NO:3001至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少80%,且特异性为至少60%;
26.由SEQ ID NO:2501至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少79%,且特异性为至少63%;
27.由SEQ ID NO:2001至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少79%,且特异性为至少65%;
28.由SEQ ID NO:1501至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少80%,且特异性为至少66%;
29.由SEQ ID NO:1001至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少80%,且特异性为至少70%;
30.由SEQ ID NO:501至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少76%,且特异性为至少81%;
31.由SEQ ID NO:101至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少74%,且特异性为至少90%;或
32.由SEQ ID NO:1至5000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少78%,且特异性为至少89%。
在任何所述测定方法中,所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态优选地通过β值分析确定,并且所述测定方法用于评估CIN3和/或癌症的存在、不存在或发展,优选地,所述癌症是宫颈癌或子宫内膜癌。最优选地,所述癌症是宫颈癌。
在任何所述测定方法中,所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态优选地通过β值分析确定,并且所述测定方法用于评估CIN3和/或癌症的存在、不存在或发展,优选地,所述癌症是宫颈癌或子宫内膜癌。最优选地,所述癌症是宫颈癌。
表4、5和6中列出的对应于SEQ ID NO:1至5000的每个指定组的ROC数据是通过从所述组确定癌症指数值而推导出的。
表4
表5
表6
预测个体中癌症的存在、不存在或发展可以特别地涉及通过本文定义的任何一个或多个CpG的组确定平均β值。可以应用阈值平均β值以将个体分层为患有或未患有癌症,或具有CIN3和/或癌症发展的高风险或低风险,优选地,其中所述癌症是宫颈癌或子宫内膜癌,更优选地,其中所述癌症是宫颈癌。
在本文所述的任何测定方法中,其中:
4.当所述个体的所述癌症指数为约0.016或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险;或
5.当所述个体的所述癌症指数小于约0.016时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症;
优选地,其中所述测定方法具有75%或更高的特异性,更优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的平均β值。
在本文所述的任何测定方法中,其中:
a.当所述个体的所述癌症指数为约0.025或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险;或
b.当所述个体的所述癌症指数小于约0.025时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症;
优选地,其中所述测定方法具有75%或更高的特异性,更优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的平均β值。
在本文所述的任何测定方法中,其中:
a.当所述个体的所述癌症指数为约0.050或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险;或
b.当所述个体的所述癌症指数小于约0.050时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症;
优选地,其中所述测定方法具有75%或更高的特异性,更优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的平均β值。
在本文所述的任何测定方法中,其中:
a.当所述个体的所述癌症指数为约0.075或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险;或
b.当所述个体的所述癌症指数小于约0.075时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症;
优选地,其中所述测定方法具有75%或更高的特异性,更优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的平均β值。
在本文所述的任何测定方法中,其中:
a.当所述个体的所述癌症指数为约0.100或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险;或
b.当所述个体的所述癌症指数小于约0.100时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症;
优选地,其中所述测定方法具有75%或更高的特异性,更优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的平均β值。
在本文所述的任何测定方法中,其中:
a.当所述个体的所述癌症指数为约0.125或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险;或
b.当所述个体的所述癌症指数小于约0.125时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症;
优选地,其中所述测定方法具有75%或更高的特异性,更优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的平均β值。
在本文所述的任何测定方法中,其中:
a.当所述个体的所述癌症指数为约0.150或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险;或
b.当所述个体的所述癌症指数小于约0.150时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症;
优选地,其中所述测定方法具有75%或更高的特异性,更优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的平均β值。
在本文所述的任何测定方法中,其中:
a.当所述个体的所述癌症指数为约0.175或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险;或
b.当所述个体的所述癌症指数小于约0.175时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症:
优选地,其中所述测定方法具有75%或更高的特异性,更优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的平均β值。
在本文所述的任何测定方法中,其中:
a.当所述个体的所述癌症指数为约0.200或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险;或
b.当所述个体的所述癌症指数小于约0.200时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症;
优选地,其中所述测定方法具有75%或更高的特异性,更优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的平均β值。
在本文所述的任何测定方法中,其中:
a.当所述个体的所述癌症指数为约0.225或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险;或
b.当所述个体的所述癌症指数小于约0.225时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症;
优选地,其中所述测定方法具有75%或更高的特异性,更优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的平均β值。
在本文所述的任何测定方法中,其中:
a.当所述个体的所述癌症指数为约0.250或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险;或
b.当所述个体的所述癌症指数小于约0.250时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症;
优选地,其中所述测定方法具有75%或更高的特异性,更优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的平均β值。
在本文所述的任何测定方法中:
1.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5001定义的至少DMR 1内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.023或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR1的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5001中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
2.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5001定义的至少DMR 1内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.023时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 1的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5001中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
3.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5002定义的至少DMR 2内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.023或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR2的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5002中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
4.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5002定义的至少DMR 2内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.023时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 2的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5002中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
5.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5003定义的至少DMR 3内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.023或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR3的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5003中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
6.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5003定义的至少DMR 3内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.023时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 3的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5003中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
7.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5004定义的至少DMR 4内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.023或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR4的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5004中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
8.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5004定义的至少DMR 4内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.023时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 4的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5004中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
9.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5005定义的至少DMR 5内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.023或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR5的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5005中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
10.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5005定义的至少DMR 5内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.023时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR5的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5005中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
11.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5006定义的至少DMR 6内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.027或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少83.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 6的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5006中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
12.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5006定义的至少DMR 6内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.027时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少83.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR6的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5006中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
13.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5007定义的至少DMR 7内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.027或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 7的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5007中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
14.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5007定义的至少DMR 7内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.027时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR7的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5007中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
15.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5008定义的至少DMR 8内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.027或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 8的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5008中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
16.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5008定义的至少DMR 8内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.027时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR8的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5008中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
17.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5009定义的至少DMR 9内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.027或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 9的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5009中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
18.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5009定义的至少DMR 9内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.027时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR9的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5009中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
19.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5010定义的至少DMR 10内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.027或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 10的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5010中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
20.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5010定义的至少DMR 10内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.027时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR10的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5010中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
21.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5011定义的至少DMR 11内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.027或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 11的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5011中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
22.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5011定义的至少DMR 11内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.027时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR11的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5011中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
23.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5012定义的至少DMR 12内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.027或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 12的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5012中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
24.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5012定义的至少DMR 12内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.027时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR12的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5012中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
25.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5013定义的至少DMR 13内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.027或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 13的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5013中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
26.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5013定义的至少DMR 13内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.027时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR13的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5013中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
27.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5014定义的至少DMR 14内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.02或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 14的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5014中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
28.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5014定义的至少DMR 14内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.02时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR14的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5014中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
29.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5015定义的至少DMR 15内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.026或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少83.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR15的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5015中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
30.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5015定义的至少DMR 15内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.026时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少83.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR15的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5015中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
31.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5016定义的至少DMR 16内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.026或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少83.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 16的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5016中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
32.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5016定义的至少DMR 16内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.026时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少83.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR16的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5016中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
33.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5017定义的至少DMR 17内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.026或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少83.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 17的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5017中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
34.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5017定义的至少DMR 17内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.026时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少83.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR17的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5017中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
35.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5018定义的至少DMR 18内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.025或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少78.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 18的至少十五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5018中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
36.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5018定义的至少DMR 18内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.025时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少78.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR18的至少十五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5018中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
37.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5019定义的至少DMR 19内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.025或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少78.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 19的至少十五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5019中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
38.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5019定义的至少DMR 19内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.025时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少78.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR19的至少十五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5019中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
39.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5020定义的至少DMR 20内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.028或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 20的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5020中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
40.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5020定义的至少DMR 20内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.028时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR20的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5020中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
41.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5021定义的至少DMR 21内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.03或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 21的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5021中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
42.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5021定义的至少DMR 21内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.03时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR21的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5021中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
43.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5022定义的至少DMR22内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.019或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少82.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 22的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5022中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
44.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5022定义的至少DMR 22内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.019时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少82.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR22的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5022中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
45.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5023定义的至少DMR 23内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.029或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少82.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 23的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5023中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
46.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5023定义的至少DMR 23内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.029时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少82.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR23的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5023中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
47.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5024定义的至少DMR 24内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.039或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少78.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 24的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5024中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
48.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5024定义的至少DMR 24内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.039时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少78.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR24的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5024中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
49.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5025定义的至少DMR 25内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.048或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 25的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5025中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
50.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5025定义的至少DMR 25内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.048时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR25的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5025中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
51.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5026定义的至少DMR 26内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.048或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 26的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5026中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
52.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5026定义的至少DMR 26内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.048时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR26的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5026中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
53.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5027定义的至少DMR 27内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.022或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少79.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 27的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5027中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
54.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5027定义的至少DMR 27内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.022时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少79.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR27的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5027中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
55.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5028定义的至少DMR 28内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.048或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 28的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5028中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
56.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5028定义的至少DMR 28内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.048时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR28的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5028中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
57.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5029定义的至少DMR 29内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.022或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少79.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 29的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5029中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
58.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5029定义的至少DMR 29内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.022时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少79.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR29的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5029中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
59.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5030定义的至少DMR 30内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.034或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 30的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5030中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
60.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5030定义的至少DMR 30内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.034时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR30的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5030中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
61.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5031定义的至少DMR 31内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.03或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少79.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 31的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5031中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
62.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5031定义的至少DMR 31内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.03时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少79.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR31的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5031中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
63.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5032定义的至少DMR 32内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.027或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少83.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 32的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5032中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
64.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5032定义的至少DMR 32内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.027或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少83.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 32的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5032中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
65.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5033定义的至少DMR 33内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.027或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少83.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 33的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5033中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
66.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5033定义的至少DMR 33内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.027时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少83.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR33的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5033中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
67.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5034定义的至少DMR 34内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.041或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 34的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5034中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
68.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5034定义的至少DMR 34内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.041时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR34的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5034中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
69.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5035定义的至少DMR 35内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.041或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 35的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5035中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
70.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5035定义的至少DMR 35内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.041时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR35的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5035中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
71.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5036定义的至少DMR 36内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.026或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 36的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5036中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
72.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5036定义的至少DMR 36内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.026时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR36的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5036中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
73.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5037定义的至少DMR 37内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.026或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 37的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5037中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
74.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5037定义的至少DMR 37内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.026时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR37的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5037中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
75.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5038定义的至少DMR 38内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.026或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 38的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5038中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
76.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5038定义的至少DMR 38内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.026时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR38的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5038中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
77.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5039定义的至少DMR 39内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.041或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 39的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5039中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
78.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5039定义的至少DMR 39内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.041时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR39的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5039中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
79.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5040定义的至少DMR 40内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.041或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 40的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5040中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
80.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5040定义的至少DMR 40内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.041时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR40的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5040中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
81.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5041定义的至少DMR 41内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.026或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 41的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5041中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
82.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5041定义的至少DMR 41内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.026时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR41的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5041中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
83.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5042定义的至少DMR 42内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.041或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 42的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5042中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
84.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5042定义的至少DMR 42内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.041时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR42的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5042中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
85.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5043定义的至少DMR43内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.041或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 43的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5043中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
86.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5043定义的至少DMR 43内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.041时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR43的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5043中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
87.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5044定义的至少DMR 44内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.041或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 44的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5044中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
88.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5044定义的至少DMR 44内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.041时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR44的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5044中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
89.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5045定义的至少DMR 45内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.041或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 45的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5045中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
90.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5045定义的至少DMR 45内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.041时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR45的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5045中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
91.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5046定义的至少DMR 46内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.038或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 46的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5046中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
92.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5046定义的至少DMR 46内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.038时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR46的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5046中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
93.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5047定义的至少DMR 47内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.029或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 47的至少十一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5047中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
94.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5047定义的至少DMR47内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.029时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR47的至少十一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5047中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
95.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5048定义的至少DMR 48内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.028或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少83.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 48的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5048中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
96.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5048定义的至少DMR 48内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.028时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少83.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR48的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5048中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
97.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5049定义的至少DMR 49内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.028或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少83.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 49的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5049中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
98.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5049定义的至少DMR 49内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.028时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少83.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR49的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5049中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
99.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5050定义的至少DMR 50内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.028或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少83.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 50的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5050中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
100.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5050定义的至少DMR 50内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.028时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少83.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 50的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5050中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
101.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5051定义的至少DMR 51内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.034或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 51的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5051中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
102.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5051定义的至少DMR 51内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.034时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 51的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5051中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
103.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5052定义的至少DMR 52内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.034或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 52的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5052中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
104.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5052定义的至少DMR 52内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.034时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 52的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5052中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
105.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5053定义的至少DMR 53内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.036或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少82.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 53的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5053中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
106.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5053定义的至少DMR 53内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.036时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少82.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 53的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5053中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
107.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5054定义的至少DMR 54内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.036或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少82.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 54的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5054中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
108.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5054定义的至少DMR 54内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.036时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少82.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 54的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5054中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
109.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5055定义的至少DMR 55内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.05或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 55的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5055中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
110.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5055定义的至少DMR 55内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.05时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 55的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5055中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
111.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5056定义的至少DMR 56内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.016或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 56的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5056中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
112.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5056定义的至少DMR 56内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.016时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 56的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5056中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
113.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5057定义的至少DMR 57内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.036或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少82.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 57的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5057中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
114.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5057定义的至少DMR 57内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.036时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少82.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 57的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5057中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
115.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5058定义的至少DMR 58内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.085或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 58的至少一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5058中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
116.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5058定义的至少DMR 58内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.085或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 58的至少一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5058中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
117.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5059定义的至少DMR 59内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.028或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 59的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5059中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
118.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5059定义的至少DMR 59内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.028时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 59的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5059中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
119.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5060定义的至少DMR 60内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.042或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 60的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5060中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
120.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5060定义的至少DMR 60内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.042时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 60的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5060中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
121.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5061定义的至少DMR 61内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.037或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 61的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5061中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
122.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5061定义的至少DMR 61内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.037时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 61的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5061中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
123.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5062定义的至少DMR 62内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.057或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 62的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5062中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
124.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5062定义的至少DMR 62内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.057时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 62的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5062中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
125.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5063定义的至少DMR 63内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.031或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 63的至少十一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5063中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
126.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5063定义的至少DMR 63内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.031时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 63的至少十一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5063中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
127.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5064定义的至少DMR 64内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.031或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 64的至少十一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5064中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
128.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5064定义的至少DMR 64内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.031时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 64的至少十一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5064中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
129.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5065定义的至少DMR 65内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.031或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 65的至少十一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5065中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
130.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5065定义的至少DMR 65内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.031时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 65的至少十一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5065中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
131.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5066定义的至少DMR 66内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.031或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 66的至少十一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5066中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
132.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5066定义的至少DMR 66内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.031时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 66的至少十一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5066中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
133.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5067定义的至少DMR 67内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.041或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 67的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5067中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
134.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5067定义的至少DMR 67内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.041时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 67的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5067中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
135.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5068定义的至少DMR 68内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.037或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少79.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 68的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5068中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
136.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5068定义的至少DMR 68内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.037时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少79.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 68的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5068中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
137.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5069定义的至少DMR 69内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.05或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少82.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 69的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5069中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
138.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5069定义的至少DMR 69内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.05时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少82.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 69的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5069中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
139.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5070定义的至少DMR 70内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.049或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 70的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5070中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
140.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5070定义的至少DMR 70内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.049时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 70的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5070中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
141.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5071定义的至少DMR 71内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.041或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 71的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5071中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
142.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5071定义的至少DMR 71内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.041时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 71的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5071中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
143.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5072定义的至少DMR 72内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.06或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 72的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5072中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
144.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5072定义的至少DMR 72内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.06时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 72的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5072中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
145.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5073定义的至少DMR 73内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.042或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少79.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 73的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5073中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
146.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5073定义的至少DMR 73内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.042时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少79.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 73的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5073中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
147.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5074定义的至少DMR 74内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.042或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少79.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 74的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5074中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
148.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5074定义的至少DMR 74内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.042时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少79.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 74的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5074中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
149.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5075定义的至少DMR 75内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.042或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少79.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 75的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5075中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
150.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5075定义的至少DMR 75内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.042时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少79.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 75的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5075中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
151.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5076定义的至少DMR 76内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.042或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少79.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 76的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5076中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
152.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5076定义的至少DMR 76内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.042时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少79.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 76的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5076中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
153.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5077定义的至少DMR 77内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.038或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 77的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5077中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
154.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5077定义的至少DMR 77内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.038时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 77的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5077中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
155.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5078定义的至少DMR 78内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.016或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 78的至少一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5078中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
156.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5078定义的至少DMR 78内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.016时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 78的至少一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5078中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
157.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5079定义的至少DMR 79内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.033或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 79的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5079中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
158.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5079定义的至少DMR 79内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.033时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 79的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5079中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
159.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5080定义的至少DMR 80内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.032或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 80的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5080中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
160.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5080定义的至少DMR 80内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.032时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 80的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5080中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
161.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5081定义的至少DMR 81内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.037或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 81的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5081中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
162.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5081定义的至少DMR 81内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.037时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 81的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5081中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
163.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5082定义的至少DMR 82内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.033或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 82的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5082中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
164.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5082定义的至少DMR 82内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.033时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 82的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5082中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
165.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5083定义的至少DMR 83内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.042或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 83的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5083中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
166.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5083定义的至少DMR 83内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.042时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 83的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5083中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
167.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5084定义的至少DMR 84内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.033或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 84的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5084中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
168.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5084定义的至少DMR 84内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.033时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 84的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5084中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
169.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5085定义的至少DMR 85内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.033或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 85的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5085中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
170.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5085定义的至少DMR 85内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.033时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 85的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5085中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
171.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5086定义的至少DMR 86内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.033或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 86的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5086中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
172.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5086定义的至少DMR 86内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.033时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 86的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5086中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
173.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5087定义的至少DMR 87内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.058或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少78.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 87的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5087中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
174.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5087定义的至少DMR 87内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.058时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少78.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 87的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5087中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
175.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5088定义的至少DMR 88内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.042或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 88的至少十二个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5088中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
176.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5088定义的至少DMR 88内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.042时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 88的至少十二个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5088中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
177.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5089定义的至少DMR 89内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.036或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 89的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5089中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
178.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5089定义的至少DMR 89内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.036时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 89的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5089中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
179.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5090定义的至少DMR 90内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.04或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 90的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5090中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
180.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5090定义的至少DMR 90内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.04时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 90的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5090中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
181.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5091定义的至少DMR 91内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.04或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 91的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5091中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
182.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5091定义的至少DMR 91内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.04时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 91的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5091中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
183.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5092定义的至少DMR 92内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.042或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 92的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5092中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
184.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5092定义的至少DMR 92内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.042时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 92的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5092中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
185.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5093定义的至少DMR 93内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.05或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少79.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 93的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5093中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
186.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5093定义的至少DMR 93内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.05时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少79.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 93的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5093中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
187.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5094定义的至少DMR 94内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.05或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少79.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 94的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5094中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
188.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5094定义的至少DMR 94内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.05时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少79.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 94的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5094中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
189.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5095定义的至少DMR 95内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.032或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 95的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5095中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
190.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5095定义的至少DMR 95内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.032时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 95的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5095中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
191.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5096定义的至少DMR 96内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.032或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 96的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5096中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
192.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5096定义的至少DMR 96内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.032时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 96的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5096中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
193.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5097定义的至少DMR 97内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.053或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 97的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5097中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
194.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5097定义的至少DMR 97内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.053时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 97的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5097中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
195.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5098定义的至少DMR 98内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.024或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 98的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5098中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
196.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5098定义的至少DMR 98内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.024时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 98的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5098中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
197.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5099定义的至少DMR 99内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.032或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 99的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5099中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
198.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5099定义的至少DMR 99内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.032时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 99的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5099中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
199.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5100定义的至少DMR 100内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.036或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 100的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5100中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
200.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5100定义的至少DMR 100内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.036时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 100的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5100中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
201.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5101定义的至少DMR 101内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.034或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 101的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5101中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
202.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5101定义的至少DMR 101内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.034时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 101的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5101中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
203.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5102定义的至少DMR 102内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.032或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 102的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5102中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
204.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5102定义的至少DMR 102内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.032时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 102的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5102中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
205.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5103定义的至少DMR 103内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.034或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 103的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5103中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
206.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5103定义的至少DMR 103内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.034时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 103的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5103中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
207.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5104定义的至少DMR 104内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.024或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 104的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5104中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
208.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5104定义的至少DMR 104内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.024时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 104的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5104中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
209.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5105定义的至少DMR 105内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.024或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 105的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5105中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
210.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5105定义的至少DMR 105内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.024时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 105的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5105中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
211.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5106定义的至少DMR 106内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.036或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 106的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5106中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
212.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5106定义的至少DMR 106内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.036时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 106的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5106中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
213.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5107定义的至少DMR 107内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.036或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 107的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5107中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
214.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5107定义的至少DMR 107内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.036时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 107的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5107中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
215.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5108定义的至少DMR 108内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.051或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 108的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5108中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
216.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5108定义的至少DMR 108内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.051时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 108的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5108中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
217.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5109定义的至少DMR 109内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.04或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 109的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5109中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
218.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5109定义的至少DMR 109内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.04时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 109的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5109中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
219.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5110定义的至少DMR 110内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.04或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 110的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5110中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
220.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5110定义的至少DMR 110内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.04时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 110的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5110中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
221.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5111定义的至少DMR 111内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.057或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 111的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5111中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
222.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5111定义的至少DMR 111内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.057时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 111的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5111中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
223.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5112定义的至少DMR 112内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.04或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 112的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5112中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
224.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5112定义的至少DMR 112内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.04时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 112的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5112中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
225.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5113定义的至少DMR 113内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.057或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 113的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5113中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
226.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5113定义的至少DMR 113内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.057时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR113的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5113中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
227.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5114定义的至少DMR 114内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.04或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 114的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5114中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
228.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5114定义的至少DMR 114内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.04或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 114的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5114中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
229.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5115定义的至少DMR 115内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.037或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 115的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5115中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
230.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5115定义的至少DMR 115内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.037时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 115的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5115中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
231.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5116定义的至少DMR 116内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.047或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 116的至少一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5116中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
232.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5116定义的至少DMR 116内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.047时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 116的至少一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5116中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
233.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5117定义的至少DMR 117内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.035或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少78.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 117的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5117中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
234.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5117定义的至少DMR 117内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.035时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少78.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 117的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5117中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
235.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5118定义的至少DMR 118内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.043或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 118的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5118中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
236.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5118定义的至少DMR 118内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.043时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 118的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5118中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
237.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5119定义的至少DMR 119内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.043或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 119的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5119中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
238.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5119定义的至少DMR 119内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.043时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 119的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5119中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
239.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5120定义的至少DMR 120内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.043或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 120的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5120中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
240.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5120定义的至少DMR 120内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.043时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 120的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5120中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
241.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5121定义的至少DMR 121内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.043或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 121的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5121中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
242.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5121定义的至少DMR 121内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.043时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 121的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5121中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
243.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5122定义的至少DMR 122内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.022或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 122的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5122中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
244.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5122定义的至少DMR 122内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.022时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 122的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5122中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
245.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5123定义的至少DMR 123内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.043或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 123的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5123中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
246.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5123定义的至少DMR 123内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.043时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 123的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5123中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
247.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5124定义的至少DMR 124内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.043或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 124的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5124中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
248.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5124定义的至少DMR 124内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.043时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 124的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5124中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
249.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5125定义的至少DMR 125内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.043或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 125的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5125中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
250.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5125定义的至少DMR 125内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.043时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 125的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5125中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
251.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5126定义的至少DMR 126内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.022或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 126的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5126中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
252.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5126定义的至少DMR 126内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.022时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 126的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5126中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
253.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5127定义的至少DMR 127内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.043或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 127的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5127中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
254.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5127定义的至少DMR 127内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.043或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR127的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5127中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
255.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5128定义的至少DMR 128内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.038或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 128的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5128中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
256.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5128定义的至少DMR 128内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.038时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 128的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5128中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
257.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5129定义的至少DMR 129内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.038或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 129的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5129中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
258.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5129定义的至少DMR 129内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.038时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 129的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5129中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
259.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5130定义的至少DMR 130内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.029或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 130的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5130中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
260.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5130定义的至少DMR 130内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.029时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 130的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5130中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
261.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5131定义的至少DMR 131内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.038或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 131的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5131中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
262.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5131定义的至少DMR 131内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.038时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 131的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5131中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
263.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5132定义的至少DMR 132内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.03或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 132的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5132中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
264.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5132定义的至少DMR 132内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.03时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 132的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5132中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
265.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5133定义的至少DMR 133内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.036或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 133的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5133中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
266.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5133定义的至少DMR 133内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.036时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 133的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5133中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
267.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5134定义的至少DMR 134内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.051或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少78.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 134的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5134中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
268.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5134定义的至少DMR 134内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.051时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少78.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 134的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5134中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
269.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5135定义的至少DMR 135内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.025或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 135的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5135中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
270.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5135定义的至少DMR 135内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.025时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 135的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5135中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
271.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5136定义的至少DMR 136内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.036或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 136的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5136中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
272.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5136定义的至少DMR 136内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.036时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 136的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5136中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
273.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5137定义的至少DMR 137内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.088或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 137的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5137中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
274.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5137定义的至少DMR 137内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.088时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 137的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5137中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
275.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5138定义的至少DMR 138内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.088或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 138的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5138中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
276.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5138定义的至少DMR 138内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.088时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 138的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5138中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
277.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5139定义的至少DMR 139内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.04或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 139的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5139中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
278.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5139定义的至少DMR 139内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.04时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 139的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5139中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
279.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5140定义的至少DMR 140内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.099或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 140的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5140中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
280.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5140定义的至少DMR 140内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.099时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 140的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5140中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
281.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5141定义的至少DMR 141内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.044或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 141的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5141中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
282.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5141定义的至少DMR 141内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.044时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 141的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5141中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
283.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5142定义的至少DMR 142内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.029或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 142的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5142中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
284.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5142定义的至少DMR 142内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.029时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 142的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5142中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
285.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5143定义的至少DMR 143内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.07或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 143的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5143中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
286.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5143定义的至少DMR 143内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.07时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 143的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5143中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
287.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5144定义的至少DMR 144内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.02或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 144的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5144中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
288.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5144定义的至少DMR 144内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.02时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 144的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5144中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
289.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5145定义的至少DMR 145内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.029或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 145的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5145中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
290.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5145定义的至少DMR 145内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.029时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 145的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5145中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
291.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5146定义的至少DMR 146内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.065或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 146的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5146中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
292.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5146定义的至少DMR 146内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.065时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 146的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5146中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
293.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5147定义的至少DMR 147内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.084或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 147的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5147中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
294.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5147定义的至少DMR 147内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.084时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 147的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5147中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
295.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5148定义的至少DMR 148内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.084或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 148的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5148中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
296.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5148定义的至少DMR 148内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.084时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 148的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5148中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
297.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5149定义的至少DMR 149内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.084或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 149的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5149中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
298.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5149定义的至少DMR 149内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.084时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 149的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5149中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
299.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5150定义的至少DMR 150内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.058或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 150的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5150中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
300.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5150定义的至少DMR 150内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.058时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 150的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5150中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
301.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5151定义的至少DMR 151内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.058或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 151的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5151中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
302.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5151定义的至少DMR 151内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.058时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 151的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5151中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
303.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5152定义的至少DMR 152内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.027或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 152的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5152中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
304.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5152定义的至少DMR 152内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.027时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 152的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5152中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
305.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5153定义的至少DMR 153内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.027或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 153的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5153中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
306.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5153定义的至少DMR 153内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.027时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 153的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5153中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
307.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5154定义的至少DMR 154内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.042或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 154的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5154中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
308.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5154定义的至少DMR 154内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.042时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 154的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5154中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
309.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5155定义的至少DMR 155内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.042或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 155的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5155中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
310.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5155定义的至少DMR 155内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.042时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 155的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5155中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
311.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5156定义的至少DMR 156内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.034或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 156的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5156中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
312.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5156定义的至少DMR 156内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.034时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 156的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5156中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
313.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5157定义的至少DMR 157内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.042或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 157的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5157中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
314.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5157定义的至少DMR 157内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.042时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 157的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5157中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
315.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5158定义的至少DMR158内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.042或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 158的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5158中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
316.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5158定义的至少DMR 158内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.042时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 158的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5158中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
317.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5159定义的至少DMR 159内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.027或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 159的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5159中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
318.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5159定义的至少DMR 159内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.027时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 159的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5159中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
319.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5160定义的至少DMR 160内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.034或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 160的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5160中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
320.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5160定义的至少DMR 160内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.034时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 160的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5160中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
321.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5161定义的至少DMR 161内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.027或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 161的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5161中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
322.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5161定义的至少DMR 161内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.027时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 161的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5161中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
323.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5162定义的至少DMR 162内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.027或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 162的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5162中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
324.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5162定义的至少DMR 162内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.027时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 162的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5162中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
325.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5163定义的至少DMR 163内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.027或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 163的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5163中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
326.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5163定义的至少DMR 163内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.027时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 163的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5163中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
327.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5164定义的至少DMR 164内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.095或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 164的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5164中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
328.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5164定义的至少DMR 164内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.095时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 164的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5164中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
329.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5165定义的至少DMR 165内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.054或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 165的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5165中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
330.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5165定义的至少DMR 165内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.054时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 165的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5165中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
331.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5166定义的至少DMR 166内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.042或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 166的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5166中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
332.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5166定义的至少DMR 166内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.042或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR166的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5166中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
333.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5167定义的至少DMR 167内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.054或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 167的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5167中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
334.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5167定义的至少DMR 167内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.054时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 167的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5167中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
335.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5168定义的至少DMR 168内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.051或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 168的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5168中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
336.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5168定义的至少DMR 168内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.051时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 168的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5168中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
337.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5169定义的至少DMR 169内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.051或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 169的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5169中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
338.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5169定义的至少DMR 169内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.051时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 169的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5169中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
339.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5170定义的至少DMR 170内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.035或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 170的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5170中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
340.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5170定义的至少DMR 170内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.035时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 170的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5170中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
341.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5171定义的至少DMR 171内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.035或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 171的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5171中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
342.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5171定义的至少DMR 171内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.035时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 171的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5171中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
343.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5172定义的至少DMR 172内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.051或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 172的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5172中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
344.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5172定义的至少DMR 172内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.051时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 172的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5172中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
345.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5173定义的至少DMR 173内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.042或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 173的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5173中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
346.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5173定义的至少DMR 173内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.042时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 173的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5173中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
347.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5174定义的至少DMR 174内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.056或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 174的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5174中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
348.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5174定义的至少DMR 174内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.056时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 174的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5174中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
349.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5175定义的至少DMR 175内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.059或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 175的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5175中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
350.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5175定义的至少DMR 175内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.059时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 175的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5175中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
351.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5176定义的至少DMR 176内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.059或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 176的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5176中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
352.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5176定义的至少DMR 176内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.059时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 176的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5176中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
353.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5177定义的至少DMR 177内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.059或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 177的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5177中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
354.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5177定义的至少DMR 177内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.059时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 177的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5177中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
355.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5178定义的至少DMR 178内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.021或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 178的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5178中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
356.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5178定义的至少DMR 178内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.021时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 178的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5178中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
357.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5179定义的至少DMR 179内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.059或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 179的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5179中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
358.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5179定义的至少DMR 179内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.059时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 179的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5179中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
359.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5180定义的至少DMR 180内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.07或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 180的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5180中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
360.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5180定义的至少DMR 180内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.07时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 180的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5180中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
361.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5181定义的至少DMR 181内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.04或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 181的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5181中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
362.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5181定义的至少DMR 181内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.04时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 181的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5181中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
363.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5182定义的至少DMR 182内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.042或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 182的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5182中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
364.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5182定义的至少DMR 182内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.042时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 182的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5182中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
365.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5183定义的至少DMR 183内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.038或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 183的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5183中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
366.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5183定义的至少DMR 183内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.038时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 183的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5183中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
367.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5184定义的至少DMR 184内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.042或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 184的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5184中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
368.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5184定义的至少DMR 184内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.042时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 184的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5184中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
369.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5185定义的至少DMR 185内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.07或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 185的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5185中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
370.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5185定义的至少DMR 185内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.07时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 185的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5185中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
371.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5186定义的至少DMR 186内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.04或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 186的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5186中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
372.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5186定义的至少DMR 186内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.04时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 186的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5186中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
373.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5187定义的至少DMR 187内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.04或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 187的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5187中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
374.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5187定义的至少DMR 187内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.04时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 187的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5187中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
375.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5188定义的至少DMR 188内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.078或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 188的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5188中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
376.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5188定义的至少DMR 188内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.078时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 188的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5188中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
377.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5189定义的至少DMR 189内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.038或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 189的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5189中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
378.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5189定义的至少DMR 189内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.038时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 189的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5189中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
379.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5190定义的至少DMR 190内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.019或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 190的至少一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5190中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
380.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5190定义的至少DMR 190内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.019时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 190的至少一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5190中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
381.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5191定义的至少DMR 191内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.037或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 191的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5191中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
382.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5191定义的至少DMR 191内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.037时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 191的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5191中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
383.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5192定义的至少DMR 192内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.037或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 192的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5192中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
384.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5192定义的至少DMR 192内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.037时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 192的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5192中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
385.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5193定义的至少DMR 193内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.029或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 193的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5193中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
386.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5193定义的至少DMR 193内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.029时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 193的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5193中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
387.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5194定义的至少DMR 194内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.054或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 194的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5194中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
388.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5194定义的至少DMR 194内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.054时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 194的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5194中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
389.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5195定义的至少DMR 195内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.031或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 195的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5195中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
390.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5195定义的至少DMR 195内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.031时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 195的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5195中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
391.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5196定义的至少DMR 196内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.024或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 196的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5196中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
392.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5196定义的至少DMR 196内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.024时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 196的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5196中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
393.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5197定义的至少DMR 197内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.03或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 197的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5197中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
394.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5197定义的至少DMR 197内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.03时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 197的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5197中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
395.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5198定义的至少DMR 198内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.024或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 198的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5198中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
396.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5198定义的至少DMR 198内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.024时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 198的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5198中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
397.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5199定义的至少DMR 199内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.03或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 199的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5199中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
398.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5199定义的至少DMR 199内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.03时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 199的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5199中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
399.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5200定义的至少DMR 200内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.031或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 200的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5200中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
400.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5200定义的至少DMR 200内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.031时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 200的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5200中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
401.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5201定义的至少DMR 201内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.031或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 201的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5201中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
402.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5201定义的至少DMR 201内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.031时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 201的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5201中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
403.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5202定义的至少DMR 202内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.054或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 202的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5202中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
404.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5202定义的至少DMR 202内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.054时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 202的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5202中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
405.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5203定义的至少DMR 203内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.03或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 203的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5203中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
406.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5203定义的至少DMR 203内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.03时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 203的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5203中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
407.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5204定义的至少DMR 204内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.026或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 204的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5204中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
408.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5204定义的至少DMR 204内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.026时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 204的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5204中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
409.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5205定义的至少DMR 205内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.022或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 205的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5205中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
410.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5205定义的至少DMR 205内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.022时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 205的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5205中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
411.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5206定义的至少DMR 206内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.032或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 206的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5206中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
412.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5206定义的至少DMR 206内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.032时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 206的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5206中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
413.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5207定义的至少DMR 207内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.022或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 207的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5207中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
414.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5207定义的至少DMR 207内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.022时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR207的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5207中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
415.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5208定义的至少DMR 208内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.032或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 208的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5208中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
416.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5208定义的至少DMR 208内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.032时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 208的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5208中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
417.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5209定义的至少DMR 209内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.039或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 209的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5209中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
418.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5209定义的至少DMR 209内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.039时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 209的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5209中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
419.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5210定义的至少DMR 210内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.036或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 210的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5210中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
420.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5210定义的至少DMR 210内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.036时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 210的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5210中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
421.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5211定义的至少DMR 211内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.066或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 211的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5211中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
422.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5211定义的至少DMR 211内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.066时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 211的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5211中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
423.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5212定义的至少DMR 212内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.044或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 212的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5212中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
424.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5212定义的至少DMR 212内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.044时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 212的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5212中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
425.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5213定义的至少DMR 213内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.044或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 213的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5213中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
426.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5213定义的至少DMR 213内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.044时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 213的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5213中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
427.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5214定义的至少DMR 214内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.044或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 214的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5214中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
428.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5214定义的至少DMR 214内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.044时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 214的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5214中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
429.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5215定义的至少DMR 215内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.042或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 215的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5215中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
430.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5215定义的至少DMR 215内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.042时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 215的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5215中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
431.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5216定义的至少DMR 216内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.066或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 216的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5216中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
432.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5216定义的至少DMR 216内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.066时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 216的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5216中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
433.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5217定义的至少DMR 217内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.027或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR217的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5217中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
434.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5217定义的至少DMR 217内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.027时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 217的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5217中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
435.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5218定义的至少DMR 218内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.022或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 218的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5218中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
436.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5218定义的至少DMR 218内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.022时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 218的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5218中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
437.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5219定义的至少DMR 219内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.027或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 219的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5219中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
438.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5219定义的至少DMR 219内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.027时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 219的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5219中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
439.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5220定义的至少DMR 220内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.027或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 220的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5220中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
440.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5220定义的至少DMR 220内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.027或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 220的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5220中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
441.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5221定义的至少DMR 221内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.051或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 221的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5221中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
442.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5221定义的至少DMR 221内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.051时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 221的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5221中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
443.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5222定义的至少DMR 222内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.044或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 222的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5222中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
444.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5222定义的至少DMR 222内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.044时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 222的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5222中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
445.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5223定义的至少DMR 223内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.044或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 223的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5223中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
446.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5223定义的至少DMR 223内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.044时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 223的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5223中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
447.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5224定义的至少DMR 224内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.049或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 224的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5224中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
448.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5224定义的至少DMR 224内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.049时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 224的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5224中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
449.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5225定义的至少DMR 225内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.044或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 225的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5225中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
450.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5225定义的至少DMR 225内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.044时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 225的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5225中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
451.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5226定义的至少DMR 226内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.049或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 226的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5226中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
452.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5226定义的至少DMR 226内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.049时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 226的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5226中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
453.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5227定义的至少DMR 227内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.033或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 227的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5227中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
454.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5227定义的至少DMR 227内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.033时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 227的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5227中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
455.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5228定义的至少DMR 228内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.023或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 228的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5228中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
456.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5228定义的至少DMR 228内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.023时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 228的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5228中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
457.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5229定义的至少DMR 229内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.033或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 229的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5229中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
458.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5229定义的至少DMR 229内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.033时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 229的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5229中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
459.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5230定义的至少DMR 230内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.033或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 230的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5230中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
460.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5230定义的至少DMR 230内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.033时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 230的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5230中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
461.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5231定义的至少DMR 231内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.023或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 231的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5231中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
462.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5231定义的至少DMR 231内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.023时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 231的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5231中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
463.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5232定义的至少DMR 232内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.079或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 232的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5232中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
464.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5232定义的至少DMR 232内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.079时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 232的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5232中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
465.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5233定义的至少DMR 233内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.023或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 233的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5233中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
466.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5233定义的至少DMR 233内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.023时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 233的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5233中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
467.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5234定义的至少DMR 234内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.04或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 234的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5234中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
468.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5234定义的至少DMR 234内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.04时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 234的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5234中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
469.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5235定义的至少DMR 235内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.051或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 235的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5235中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
470.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5235定义的至少DMR 235内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.051时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 235的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5235中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
471.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5236定义的至少DMR 236内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.023或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 236的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5236中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
472.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5236定义的至少DMR 236内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.023时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 236的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5236中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
473.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5237定义的至少DMR 237内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.033或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 237的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5237中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
474.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5237定义的至少DMR 237内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.033时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 237的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5237中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
475.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5238定义的至少DMR 238内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.048或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 238的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5238中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
476.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5238定义的至少DMR 238内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.048时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 238的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5238中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
477.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5239定义的至少DMR 239内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.063或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 239的至少一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5239中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
478.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5239定义的至少DMR 239内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.063时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 239的至少一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5239中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
479.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5240定义的至少DMR 240内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.05或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 240的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5240中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
480.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5240定义的至少DMR 240内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.05时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 240的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5240中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
481.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5241定义的至少DMR 241内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.035或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR241的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5241中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
482.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5241定义的至少DMR 241内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.035时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 241的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5241中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
483.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5242定义的至少DMR 242内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.058或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 242的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5242中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
484.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5242定义的至少DMR 242内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.058时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 242的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5242中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
485.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5243定义的至少DMR 243内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.039或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 243的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5243中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
486.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5243定义的至少DMR 243内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.039时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 243的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5243中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
487.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5244定义的至少DMR 244内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.028或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 244的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5244中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
488.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5244定义的至少DMR 244内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.028时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 244的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5244中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
489.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5245定义的至少DMR 245内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.034或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 245的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5245中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
490.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5245定义的至少DMR 245内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.034时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 245的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5245中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
491.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5246定义的至少DMR 246内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.022或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 246的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5246中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
492.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5246定义的至少DMR 246内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.022时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 246的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5246中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
493.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5247定义的至少DMR 247内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.039或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 247的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5247中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
494.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5247定义的至少DMR 247内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.039时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 247的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5247中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
495.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5248定义的至少DMR 248内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.187或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 248的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5248中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
496.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5248定义的至少DMR 248内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.187时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 248的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5248中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
497.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5249定义的至少DMR 249内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.042或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 249的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5249中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
498.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5249定义的至少DMR 249内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.042时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 249的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5249中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
499.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5250定义的至少DMR 250内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.042或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 250的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5250中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
500.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5250定义的至少DMR 250内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.042时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 250的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5250中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
501.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5251定义的至少DMR 251内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.06或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 251的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5251中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
502.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5251定义的至少DMR 251内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.06时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 251的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5251中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
503.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5252定义的至少DMR 252内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.04或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 252的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5252中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
504.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5252定义的至少DMR 252内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.04时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 252的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5252中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
505.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5253定义的至少DMR 253内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.018或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少66.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 253的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5253中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
506.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5253定义的至少DMR 253内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.018时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少66.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 253的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5253中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
507.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5254定义的至少DMR 254内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.026或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 254的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5254中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
508.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5254定义的至少DMR 254内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.026时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 254的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5254中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
509.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5255定义的至少DMR 255内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.026或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 255的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5255中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
510.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5255定义的至少DMR 255内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.026时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 255的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5255中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
511.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5256定义的至少DMR 256内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.051或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 256的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5256中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
512.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5256定义的至少DMR 256内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.051时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 256的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5256中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
513.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5257定义的至少DMR 257内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.051或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 257的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5257中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
514.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5257定义的至少DMR 257内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.051时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 257的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5257中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
515.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5258定义的至少DMR 258内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.051或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR258的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5258中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
516.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5258定义的至少DMR 258内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.051时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 258的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5258中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
517.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5259定义的至少DMR 259内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.091或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 259的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5259中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
518.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5259定义的至少DMR 259内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.091时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 259的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5259中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
519.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5260定义的至少DMR 260内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.044或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 260的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5260中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
520.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5260定义的至少DMR 260内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.044时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 260的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5260中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
521.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5261定义的至少DMR 261内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.051或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 261的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5261中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
522.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5261定义的至少DMR 261内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.051时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 261的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5261中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
523.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5262定义的至少DMR 262内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.029或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 262的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5262中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
524.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5262定义的至少DMR 262内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.029时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 262的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5262中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
525.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5263定义的至少DMR 263内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.039或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 263的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5263中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
526.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5263定义的至少DMR 263内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.039时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 263的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5263中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
527.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5264定义的至少DMR 264内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.047或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR264的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5264中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
528.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5264定义的至少DMR 264内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.047时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 264的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5264中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
529.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5265定义的至少DMR 265内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.046或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 265的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5265中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
530.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5265定义的至少DMR 265内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.046时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 265的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5265中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
531.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5266定义的至少DMR 266内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.023或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 266的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5266中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
532.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5266定义的至少DMR 266内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.023时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 266的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5266中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
533.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5267定义的至少DMR 267内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.047或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 267的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5267中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
534.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5267定义的至少DMR 267内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.047时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 267的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5267中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
535.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5268定义的至少DMR 268内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.078或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 268的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5268中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
536.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5268定义的至少DMR 268内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.078时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 268的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5268中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
537.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5269定义的至少DMR 269内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.065或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 269的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5269中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
538.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5269定义的至少DMR 269内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.065时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 269的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5269中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
539.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5270定义的至少DMR 270内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.023或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 270的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5270中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
540.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5270定义的至少DMR 270内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.023或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR270的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5270中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
541.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5271定义的至少DMR 271内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.023或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 271的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5271中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
542.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5271定义的至少DMR 271内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.023时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 271的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5271中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
543.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5272定义的至少DMR 272内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.051或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 272的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5272中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
544.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5272定义的至少DMR 272内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.051时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 272的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5272中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
545.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5273定义的至少DMR 273内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.051或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 273的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5273中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
546.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5273定义的至少DMR 273内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.051时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 273的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5273中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
547.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5274定义的至少DMR 274内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.068或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 274的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5274中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
548.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5274定义的至少DMR 274内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.068时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 274的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5274中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
549.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5275定义的至少DMR 275内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.057或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 275的至少一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5275中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
550.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5275定义的至少DMR 275内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.057时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 275的至少一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5275中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
551.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5276定义的至少DMR 276内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.068或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 276的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5276中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
552.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5276定义的至少DMR 276内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.068时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 276的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5276中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
553.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5277定义的至少DMR 277内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.068或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 277的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5277中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
554.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5277定义的至少DMR 277内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.068时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 277的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5277中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
555.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5278定义的至少DMR 278内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.035或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 278的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5278中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
556.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5278定义的至少DMR 278内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.035时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 278的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5278中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
557.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5279定义的至少DMR 279内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.039或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 279的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5279中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
558.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5279定义的至少DMR 279内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.039时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 279的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5279中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
559.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5280定义的至少DMR 280内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.068或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 280的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5280中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
560.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5280定义的至少DMR 280内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.068时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 280的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5280中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
561.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5281定义的至少DMR 281内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.039或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 281的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5281中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
562.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5281定义的至少DMR 281内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.039时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 281的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5281中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
563.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5282定义的至少DMR 282内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.028或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR282的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5282中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
564.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5282定义的至少DMR 282内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.028时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 282的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5282中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
565.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5283定义的至少DMR 283内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.042或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 283的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5283中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
566.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5283定义的至少DMR 283内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.042时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR283的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5283中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
567.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5284定义的至少DMR 284内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.032或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 284的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5284中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
568.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5284定义的至少DMR 284内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.032时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 284的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5284中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
569.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5285定义的至少DMR 285内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.091或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 285的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5285中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
570.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5285定义的至少DMR 285内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.091时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 285的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5285中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
571.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5286定义的至少DMR 286内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.069或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 286的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5286中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
572.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5286定义的至少DMR 286内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.069时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 286的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5286中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
573.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5287定义的至少DMR 287内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.091或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 287的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5287中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
574.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5287定义的至少DMR 287内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.091时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 287的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5287中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
575.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5288定义的至少DMR 288内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.061或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 288的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5288中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
576.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5288定义的至少DMR 288内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.061时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 288的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5288中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
577.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5289定义的至少DMR 289内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.033或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 289的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5289中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
578.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5289定义的至少DMR 289内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.033时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 289的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5289中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
579.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5290定义的至少DMR 290内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.045或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 290的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5290中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
580.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5290定义的至少DMR 290内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.045时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 290的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5290中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
581.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5291定义的至少DMR 291内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.056或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 291的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5291中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
582.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5291定义的至少DMR 291内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.056时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 291的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5291中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
583.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5292定义的至少DMR 292内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.041或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 292的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5292中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
584.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5292定义的至少DMR 292内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.041时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 292的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5292中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
585.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5293定义的至少DMR 293内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.033或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 293的至少二十一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5293中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
586.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5293定义的至少DMR 293内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.033时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 293的至少二十一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5293中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
587.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5294定义的至少DMR 294内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.056或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 294的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5294中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
588.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5294定义的至少DMR 294内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.056时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 294的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5294中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
589.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5295定义的至少DMR 295内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.072或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 295的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5295中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
590.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5295定义的至少DMR 295内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.072时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 295的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5295中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
591.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5296定义的至少DMR 296内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.028或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 296的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5296中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
592.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5296定义的至少DMR 296内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.028时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 296的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5296中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
593.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5297定义的至少DMR 297内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.041或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 297的至少十一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5297中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
594.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5297定义的至少DMR 297内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.041时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 297的至少十一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5297中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
595.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5298定义的至少DMR 298内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.041或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 298的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5298中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
596.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5298定义的至少DMR 298内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.041时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 298的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5298中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
597.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5299定义的至少DMR 299内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.087或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 299的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5299中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
598.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5299定义的至少DMR 299内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.087时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 299的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5299中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
599.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5300定义的至少DMR 300内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.041或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 300的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5300中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
600.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5300定义的至少DMR 300内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.041时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 300的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5300中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
601.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5301定义的至少DMR 301内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.041或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 301的至少十一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5301中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
602.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5301定义的至少DMR 301内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.041时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 301的至少十一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5301中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
603.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5302定义的至少DMR 302内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.052或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 302的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5302中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
604.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5302定义的至少DMR 302内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.052时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 302的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5302中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
605.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5303定义的至少DMR 303内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.041或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 303的至少十一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5303中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
606.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5303定义的至少DMR 303内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.041时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 303的至少十一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5303中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
607.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5304定义的至少DMR 304内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.056或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 304的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5304中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
608.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5304定义的至少DMR 304内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.056时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 304的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5304中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
609.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5305定义的至少DMR 305内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.113或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 305的至少一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5305中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
610.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5305定义的至少DMR 305内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.113时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 305的至少一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5305中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
611.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5306定义的至少DMR 306内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.061或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 306的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5306中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
612.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5306定义的至少DMR 306内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.061时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 306的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5306中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
613.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5307定义的至少DMR 307内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.045或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少66.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 307的至少二十三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5307中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
614.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5307定义的至少DMR 307内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.045时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少66.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 307的至少二十三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5307中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
615.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5308定义的至少DMR 308内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.037或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 308的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5308中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
616.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5308定义的至少DMR 308内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.037时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 308的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5308中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
617.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5309定义的至少DMR 309内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.032或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 309的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5309中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
618.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5309定义的至少DMR 309内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.032时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 309的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5309中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
619.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5310定义的至少DMR 310内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.037或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 310的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5310中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
620.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5310定义的至少DMR 310内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.037时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 310的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5310中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
621.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5311定义的至少DMR 311内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.043或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 311的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5311中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
622.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5311定义的至少DMR 311内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.043时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 311的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5311中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
623.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5312定义的至少DMR 312内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.043或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 312的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5312中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
624.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5312定义的至少DMR 312内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.043时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 312的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5312中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
625.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5313定义的至少DMR 313内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.037或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 313的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5313中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
626.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5313定义的至少DMR 313内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.037时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 313的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5313中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
627.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5314定义的至少DMR 314内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.041或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 314的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5314中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
628.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5314定义的至少DMR 314内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.041时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 314的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5314中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
629.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5315定义的至少DMR 315内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.035或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 315的至少二十二个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5315中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
630.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5315定义的至少DMR 315内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.035时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 315的至少二十二个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5315中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
631.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5316定义的至少DMR 316内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.037或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 316的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5316中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
632.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5316定义的至少DMR 316内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.037时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 316的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5316中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
633.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5317定义的至少DMR 317内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.035或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 317的至少二十二个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5317中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
634.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5317定义的至少DMR 317内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.035时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 317的至少二十二个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5317中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
635.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5318定义的至少DMR 318内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.027或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 318的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5318中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
636.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5318定义的至少DMR 318内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.027时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 318的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5318中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
637.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5319定义的至少DMR 319内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.029或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 319的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5319中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
638.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5319定义的至少DMR 319内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.029时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 319的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5319中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
639.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5320定义的至少DMR 320内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.029或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 320的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5320中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
640.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5320定义的至少DMR 320内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.029时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 320的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5320中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
641.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5321定义的至少DMR 321内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.055或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少63.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 321的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5321中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
642.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5321定义的至少DMR 321内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.055时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少63.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 321的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5321中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
643.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5322定义的至少DMR 322内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.055或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少63.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 322的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5322中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
644.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5322定义的至少DMR 322内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.055时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少63.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 322的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5322中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
645.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5323定义的至少DMR 323内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.029或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 323的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5323中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
646.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5323定义的至少DMR 323内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.029时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 323的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5323中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
647.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5324定义的至少DMR 324内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.022或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 324的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5324中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
648.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5324定义的至少DMR 324内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.022时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 324的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5324中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
649.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5325定义的至少DMR 325内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.122或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 325的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5325中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
650.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5325定义的至少DMR 325内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.122时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 325的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5325中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
651.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5326定义的至少DMR 326内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.071或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 326的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5326中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
652.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5326定义的至少DMR 326内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.071时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 326的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5326中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
653.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5327定义的至少DMR 327内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.071或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 327的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5327中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
654.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5327定义的至少DMR 327内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.071时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 327的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5327中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
655.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5328定义的至少DMR 328内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.034或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 328的至少二十一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5328中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
656.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5328定义的至少DMR 328内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.034时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 328的至少二十一个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5328中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
657.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5329定义的至少DMR 329内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.066或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 329的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5329中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
658.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5329定义的至少DMR 329内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.066时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 329的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5329中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
659.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5330定义的至少DMR 330内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.122或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 330的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5330中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
660.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5330定义的至少DMR 330内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.122时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 330的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5330中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
661.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5331定义的至少DMR 331内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.056或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 331的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5331中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
662.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5331定义的至少DMR 331内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.056时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 331的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5331中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
663.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5332定义的至少DMR 332内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.071或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 332的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5332中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
664.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5332定义的至少DMR 332内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.071时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 332的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5332中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
665.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5333定义的至少DMR 333内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.056或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 333的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5333中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
666.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5333定义的至少DMR 333内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.056时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 333的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5333中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
667.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5334定义的至少DMR 334内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.04或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 334的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5334中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
668.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5334定义的至少DMR 334内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.04时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 334的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5334中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
669.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5335定义的至少DMR 335内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.04或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 335的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5335中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
670.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5335定义的至少DMR 335内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.04时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 335的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5335中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
671.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5336定义的至少DMR 336内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.056或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 336的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5336中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
672.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5336定义的至少DMR 336内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.056时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 336的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5336中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
673.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5337定义的至少DMR 337内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.234或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 337的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5337中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
674.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5337定义的至少DMR 337内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.234时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 337的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5337中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
675.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5338定义的至少DMR 338内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.056或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 338的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5338中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
676.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5338定义的至少DMR 338内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.056时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 338的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5338中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
677.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5339定义的至少DMR 339内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.234或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 339的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5339中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
678.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5339定义的至少DMR 339内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.234时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 339的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5339中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
679.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5340定义的至少DMR 340内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.234或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 340的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5340中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
680.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5340定义的至少DMR 340内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.234时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 340的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5340中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
681.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5341定义的至少DMR 341内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.056或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 341的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5341中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
682.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5341定义的至少DMR 341内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.056时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 341的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5341中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
683.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5342定义的至少DMR 342内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.054或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 342的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5342中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
684.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5342定义的至少DMR 342内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.054时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 342的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5342中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
685.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5343定义的至少DMR 343内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.033或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 343的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5343中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
686.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5343定义的至少DMR 343内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.033时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 343的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5343中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
687.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5344定义的至少DMR 344内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.059或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 344的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5344中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
688.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5344定义的至少DMR 344内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.059时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 344的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5344中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
689.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5345定义的至少DMR 345内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.049或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 345的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5345中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
690.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5345定义的至少DMR 345内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.049时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 345的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5345中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
691.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5346定义的至少DMR 346内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.06或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 346的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5346中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
692.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5346定义的至少DMR 346内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.06时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 346的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5346中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
693.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5347定义的至少DMR 347内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.043或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 347的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5347中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
694.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5347定义的至少DMR 347内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.043时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 347的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5347中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
695.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5348定义的至少DMR 348内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.054或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 348的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5348中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
696.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5348定义的至少DMR 348内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.054时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 348的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5348中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
697.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5349定义的至少DMR 349内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.054或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 349的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5349中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
698.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5349定义的至少DMR 349内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.054时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 349的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5349中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
699.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5350定义的至少DMR 350内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.056或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 350的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5350中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
700.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5350定义的至少DMR 350内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.056时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 350的至少七个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5350中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
701.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5351定义的至少DMR 351内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.031或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 351的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5351中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
702.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5351定义的至少DMR 351内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.031时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 351的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5351中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
703.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5352定义的至少DMR 352内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.065或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 352的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5352中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
704.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5352定义的至少DMR 352内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.065时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 352的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5352中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
705.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5353定义的至少DMR 353内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.049或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 353的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5353中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
706.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5353定义的至少DMR 353内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.049时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 353的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5353中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
707.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5354定义的至少DMR 354内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.052或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 354的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5354中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
708.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5354定义的至少DMR 354内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.052时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 354的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5354中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
709.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5355定义的至少DMR 355内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.056或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少66.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 355的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5355中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
710.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5355定义的至少DMR 355内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.056时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少66.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 355的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5355中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
711.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5356定义的至少DMR 356内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.059或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 356的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5356中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
712.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5356定义的至少DMR 356内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.059时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 356的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5356中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
713.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5357定义的至少DMR 357内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.043或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 357的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5357中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
714.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5357定义的至少DMR 357内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.043时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 357的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5357中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
715.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5358定义的至少DMR 358内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.05或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 358的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5358中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
716.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5358定义的至少DMR 358内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.05时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 358的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5358中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
717.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5359定义的至少DMR 359内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.043或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 359的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5359中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
718.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5359定义的至少DMR 359内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.043时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 359的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5359中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
719.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5360定义的至少DMR 360内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.059或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 360的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5360中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
720.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5360定义的至少DMR 360内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.059时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 360的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5360中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
721.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5361定义的至少DMR 361内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.052或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 361的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5361中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
722.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5361定义的至少DMR 361内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.052时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 361的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5361中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
723.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5362定义的至少DMR 362内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.052或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 362的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5362中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
724.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5362定义的至少DMR 362内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.052时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 362的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5362中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
725.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5363定义的至少DMR 363内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.043或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 363的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5363中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
726.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5363定义的至少DMR 363内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.043时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 363的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5363中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
727.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5364定义的至少DMR 364内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.02或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 364的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5364中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
728.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5364定义的至少DMR 364内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.02时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 364的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5364中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
729.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5365定义的至少DMR 365内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.029或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 365的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5365中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
730.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5365定义的至少DMR 365内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.029时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少68.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 365的至少六个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5365中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
731.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5366定义的至少DMR 366内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.052或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 366的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5366中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
732.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5366定义的至少DMR 366内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.052时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 366的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5366中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
733.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5367定义的至少DMR 367内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.043或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 367的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5367中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
734.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5367定义的至少DMR 367内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.043时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 367的至少八个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5367中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
735.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5368定义的至少DMR 368内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.052或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 368的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5368中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
736.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5368定义的至少DMR 368内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.052时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 368的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5368中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
737.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5369定义的至少DMR 369内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.034或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 369的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5369中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
738.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5369定义的至少DMR 369内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.034时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 369的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5369中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
739.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5370定义的至少DMR 370内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.034或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 370的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5370中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
740.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5370定义的至少DMR 370内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.034时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 370的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5370中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
741.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5371定义的至少DMR 371内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.031或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 371的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5371中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
742.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5371定义的至少DMR 371内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.031时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 371的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5371中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
743.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5372定义的至少DMR 372内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.031或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 372的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5372中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
744.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5372定义的至少DMR 372内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.031时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 372的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5372中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
745.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5373定义的至少DMR 373内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.072或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 373的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5373中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
746.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5373定义的至少DMR 373内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.072时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 373的至少三个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5373中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
747.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5374定义的至少DMR 374内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.058或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 374的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5374中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
748.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5374定义的至少DMR 374内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.058时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 374的至少两个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5374中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
749.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5375定义的至少DMR 375内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.061或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 375的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5375中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
750.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5375定义的至少DMR 375内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.061时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 375的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5375中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
751.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5376定义的至少DMR 376内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.048或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 376的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5376中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
752.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5376定义的至少DMR 376内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.048时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 376的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5376中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
753.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5377定义的至少DMR 377内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.051或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 377的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5377中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
754.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5377定义的至少DMR 377内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.051时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 377的至少五个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5377中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
755.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5378定义的至少DMR 378内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.048或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 378的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5378中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
756.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5378定义的至少DMR 378内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.048时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 378的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5378中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
757.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5379定义的至少DMR 379内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.048或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 379的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5379中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
758.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5379定义的至少DMR 379内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.048时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 379的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5379中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
759.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5380定义的至少DMR 380内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.028或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 380的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5380中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
760.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5380定义的至少DMR 380内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.028时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 380的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5380中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
761.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5381定义的至少DMR 381内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.028或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 381的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5381中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
762.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5381定义的至少DMR 381内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.028时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 381的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5381中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
763.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5382定义的至少DMR 382内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.028或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 382的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5382中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
764.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5382定义的至少DMR 382内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.028时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 382的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5382中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
765.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5383定义的至少DMR 383内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.048或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 383的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5383中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
766.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5383定义的至少DMR 383内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.048时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 383的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5383中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
767.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5384定义的至少DMR 384内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.048或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 384的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5384中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
768.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5384定义的至少DMR 384内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.048时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 384的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5384中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
769.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5385定义的至少DMR 385内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.021或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 385的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5385中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
770.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5385定义的至少DMR 385内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.021时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 385的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5385中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
771.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5386定义的至少DMR 386内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.021或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 386的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5388中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
772.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5386定义的至少DMR 386内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.021时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 386的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5388中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
773.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5387定义的至少DMR 387内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.047或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 387的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5387中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
774.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5387定义的至少DMR 387内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.047或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR387的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5387中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
775.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5388定义的至少DMR 388内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.047或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 388的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5388中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
776.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5388定义的至少DMR 388内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.047时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 388的至少四个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5388中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
777.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5389定义的至少DMR 389内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.042或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少66.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 389的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5389中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
778.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5389定义的至少DMR 389内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.042时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少66.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 389的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5389中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
779.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5390定义的至少DMR 390内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.048或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 390的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5390中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
780.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5390定义的至少DMR 390内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.048或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR390的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5390中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
781.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5391定义的至少DMR 391内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.048或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 391的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5391中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
782.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5391定义的至少DMR 391内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.048或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR391的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5391中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
783.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5392定义的至少DMR 392内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.027或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少83.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 392的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5392中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
784.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5392定义的至少DMR 392内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.027或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少83.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR392的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5392中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
785.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5393定义的至少DMR 393内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.038或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 393的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5393中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
786.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5393定义的至少DMR 393内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.038或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR393的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5393中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
787.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5394定义的至少DMR 394内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.036或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少82.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 394的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5394中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
788.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5394定义的至少DMR 394内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.036或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少82.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR394的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5394中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
789.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5395定义的至少DMR 395内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.030或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 395的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5395中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
790.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5395定义的至少DMR 395内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.030或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR395的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5395中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
791.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5396定义的至少DMR 396内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.042或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少79.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 396的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5396中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
792.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5396定义的至少DMR 396内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.042或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少79.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR396的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5396中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
793.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5397定义的至少DMR 397内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.060或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 397的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5397中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
794.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5397定义的至少DMR 397内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.060或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR397的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5397中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
795.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5398定义的至少DMR 398内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.042或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 398的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5398中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
796.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5398定义的至少DMR 398内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.042或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR398的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5398中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
797.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5399定义的至少DMR 399内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.050或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少79.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 399的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5399中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
798.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5399定义的至少DMR 399内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.042或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少79.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR399的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5399中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
799.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5400定义的至少DMR 400内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.032或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 400的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5400中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
800.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5400定义的至少DMR 400内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.032或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR400的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5400中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
801.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5401定义的至少DMR 401内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.088或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 401的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5401中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
802.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5401定义的至少DMR 401内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.088或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少77.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR401的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5401中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
803.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5402定义的至少DMR 402内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.084或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 402的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5402中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
804.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5402定义的至少DMR 402内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.084或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少76.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR402的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5402中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
805.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5403定义的至少DMR 403内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.058或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 403的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5403中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
806.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5403定义的至少DMR 403内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.058或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR403的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5403中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
807.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5404定义的至少DMR 404内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.023或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 404的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5404中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
808.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5404定义的至少DMR 404内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.023或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少74.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR404的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5404中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
809.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5405定义的至少DMR 405内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.187或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 405的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5405中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
810.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5405定义的至少DMR 405内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.187或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR405的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5405中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
811.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5406定义的至少DMR 406内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.091或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 406的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5406中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
812.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5406定义的至少DMR 406内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.091或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少69.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR406的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5406中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
813.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5407定义的至少DMR 407内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.032或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 407的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5407中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
814.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5407定义的至少DMR 407内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.032或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR407的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5407中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
815.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5408定义的至少DMR 408内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.054或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 408的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5408中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
816.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5408定义的至少DMR 408内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.054或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR408的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5408中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
817.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5409定义的至少DMR 409内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.034或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR409的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5409中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
818.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5409定义的至少DMR 409内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.034或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR409的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5409中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
819.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5410定义的至少DMR 410内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.062或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 410的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5410中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
820.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5410定义的至少DMR 410内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.062或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR410的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5410中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
821.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5411定义的至少DMR 411内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.082或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR411的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5411中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
822.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5408定义的至少DMR 411内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.082或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少67.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 411的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5411中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
823.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5412定义的至少DMR 412内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.062或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 412的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5412中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
824.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5412定义的至少DMR 412内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.062或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少71.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR412的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5412中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
825.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5413定义的至少DMR 413内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.072或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少63.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 413的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5413中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
826.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5413定义的至少DMR 413内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.072或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少63.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR413的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5413中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
827.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5414定义的至少DMR 414内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.043或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少66.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 414的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5414中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
828.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5414定义的至少DMR 414内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.043或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少66.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR414的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5414中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
829.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5415定义的至少DMR 415内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.203或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少66.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 415的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5415中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
830.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5415定义的至少DMR 415内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.203或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少66.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR415的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5415中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
831.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5416定义的至少DMR 416内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.098或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 416的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5416中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
832.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5416定义的至少DMR 416内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.098或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR416的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5416中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
833.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5417定义的至少DMR 417内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.057或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 417的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5417中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
834.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5417定义的至少DMR 417内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.057或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少64.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR417的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5417中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
835.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5418定义的至少DMR 418内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.111或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少62.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 418的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5418中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
836.其癌症指数值被确定的CpG位于由SEQ ID NO:5418定义的至少DMR 418内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.111或更大时,所述个体被归类为未患有癌症或具有癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少62.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR418的至少九个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5418中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值。
在任何所述测定方法中,所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态优选地通过β值分析确定,并且所述测定方法用于评估CIN3和/或癌症的存在、不存在或发展,优选地,所述癌症是宫颈癌或子宫内膜癌。最优选地,所述癌症是宫颈癌。
表7中列出的对应于SEQ ID NO:5001至5418中的每一个的ROC数据是通过在每种情况下从CpG的组确定癌症指数值而推导出的,由此所述组包括由[[CG]]表示的所述CpG。
表7.
预测个体中癌症的存在、不存在或发展可以特别地涉及确定所述一个或多个CpG的组的甲基化参考百分比。可以应用阈值甲基化参考百分比值以将个体分层为患有或未患有癌症,或具有CIN3和/或癌症发展的高风险或低风险,优选地,其中所述癌症是宫颈癌或子宫内膜癌,更优选地,其中所述癌症是宫颈癌。
在本文所述的任何测定方法中,确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤可以包括确定在以下范围内的每个CpG:
1.SEQ ID NO:5759和/或SEQ ID NO:5703和/或SEQ ID NO:5731,并且其中当所述癌症指数值为约1.146或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少95.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.96,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5759和/或SEQ ID NO:5703和/或SEQ ID NO:5731定义的序列的甲基化参考百分比;
2.SEQ ID NO:5759和/或SEQ ID NO:5703和/或SEQ ID NO:5731,并且其中当所述癌症指数值小于约1.146时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少95.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.96,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5759和/或SEQ ID NO:5703和/或SEQ ID NO:5731定义的序列的甲基化参考百分比;
3.SEQ ID NO:5760和/或SEQ ID NO:5704和/或SEQ ID NO:5732,并且其中当所述癌症指数值为约0.473或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,所述测定方法的特异性为至少85.00%,并且AUC为0.96,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5760和/或SEQ ID NO:5704和/或SEQ ID NO:5732定义的序列的甲基化参考百分比;
4.SEQ ID NO:5760和/或SEQ ID NO:5704和/或SEQ ID NO:5732,并且其中当所述癌症指数值小于约0.473时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,所述测定方法的特异性为至少85.00%,并且AUC为0.96,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5760和/或SEQ ID NO:5704和/或SEQ ID NO:5732定义的序列的甲基化参考百分比;
5.SEQ ID NO:5761和/或SEQ ID NO:5705和/或SEQ ID NO:5733,并且其中当所述癌症指数值为约1.546或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少95.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.95,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5761和/或SEQ ID NO:5705和/或SEQ ID NO:5733定义的序列的甲基化参考百分比;
6.SEQ ID NO:5761和/或SEQ ID NO:5705和/或SEQ ID NO:5733,并且其中当所述癌症指数值小于约1.546时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少95.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.95,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5761和/或SEQ ID NO:5705和/或SEQ ID NO:5733定义的序列的甲基化参考百分比;
7.SEQ ID NO:5762和/或SEQ ID NO:5706和/或SEQ ID NO:5734,并且其中当所述癌症指数值为约1.645或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.94,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5762和/或SEQ ID NO:5706和/或SEQ ID NO:5734定义的序列的甲基化参考百分比;
8.SEQ ID NO:5762和/或SEQ ID NO:5706和/或SEQ ID NO:5734,并且其中当所述癌症指数值小于约1.645时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.94,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5762和/或SEQ ID NO:5706和/或SEQ ID NO:5734定义的序列的甲基化参考百分比;
9.SEQ ID NO:5763和/或SEQ ID NO:5707和/或SEQ ID NO:5735,并且其中当所述癌症指数值为约2.824或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少90.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.94,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5763和/或SEQ ID NO:5707和/或SEQ ID NO:5735定义的序列的甲基化参考百分比;
10.SEQ ID NO:5763和/或SEQ ID NO:5707和/或SEQ ID NO:5735,并且其中当所述癌症指数值小于约2.824时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少90.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.94,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5763和/或SEQ ID NO:5707和/或SEQ ID NO:5735定义的序列的甲基化参考百分比;
11.SEQ ID NO:5764和/或SEQ ID NO:5708和/或SEQ ID NO:5736,并且其中当所述癌症指数值为约2.968或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.94,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5764和/或SEQ ID NO:5708和/或SEQ ID NO:5736定义的序列的甲基化参考百分比;
12.SEQ ID NO:5764和/或SEQ ID NO:5708和/或SEQ ID NO:5736,并且其中当所述癌症指数值小于约2.968时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.94,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5764和/或SEQ ID NO:5708和/或SEQ ID NO:5736定义的序列的甲基化参考百分比;
13.SEQ ID NO:5765和/或SEQ ID NO:5709和/或SEQ ID NO:5737,并且其中当所述癌症指数值为约0.184或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,所述测定方法的特异性为至少80.00%,并且AUC为0.93,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5765和/或SEQ ID NO:5709和/或SEQ ID NO:5737定义的序列的甲基化参考百分比;
14.SEQ ID NO:5765和/或SEQ ID NO:5709和/或SEQ ID NO:5737,并且其中当所述癌症指数值小于约0.184时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少93.00%,所述测定方法的特异性为至少80.00%,并且AUC为0.75,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5765和/或SEQ ID NO:5709和/或SEQ ID NO:5737定义的序列的甲基化参考百分比;
15.SEQ ID NO:5766和/或SEQ ID NO:5710和/或SEQ ID NO:5738,并且其中当所述癌症指数值为约0.716或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少90.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.93,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5766和/或SEQ ID NO:5710和/或SEQ ID NO:5738定义的序列的甲基化参考百分比;
16.SEQ ID NO:5766和/或SEQ ID NO:5710和/或SEQ ID NO:5738,并且其中当所述癌症指数值小于约0.716时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少90.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.93,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5766和/或SEQ ID NO:5710和/或SEQ ID NO:5738定义的序列的甲基化参考百分比;
17.SEQ ID NO:5767和/或SEQ ID NO:5711和/或SEQ ID NO:5739,并且其中当所述癌症指数值为约3.482或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.93,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5767和/或SEQ ID NO:5711和/或SEQ ID NO:5739定义的序列的甲基化参考百分比;
18.SEQ ID NO:5767和/或SEQ ID NO:5711和/或SEQ ID NO:5739,并且其中当所述癌症指数值小于约3.482时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.93,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5767和/或SEQ ID NO:5711和/或SEQ ID NO:5739定义的序列的甲基化参考百分比;
19.SEQ ID NO:5768和/或SEQ ID NO:5712和/或SEQ ID NO:5740,并且其中当所述癌症指数值为约3.818或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少90.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.92,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5768和/或SEQ ID NO:5712和/或SEQ ID NO:5740定义的序列的甲基化参考百分比;
20.SEQ ID NO:5768和/或SEQ ID NO:5712和/或SEQ ID NO:5740,并且其中当所述癌症指数值小于约3.818时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少90.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.92,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5768和/或SEQ ID NO:5712和/或SEQ ID NO:5740定义的序列的甲基化参考百分比;
21.SEQ ID NO:5769和/或SEQ ID NO:5713和/或SEQ ID NO:5741,并且其中当所述癌症指数值为约0.295或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.92,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5769和/或SEQ ID NO:5713和/或SEQ ID NO:5741定义的序列的甲基化参考百分比;
22.SEQ ID NO:5769和/或SEQ ID NO:5713和/或SEQ ID NO:5741,并且其中当所述癌症指数值小于约0.295时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.92,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5769和/或SEQ ID NO:5713和/或SEQ ID NO:5741定义的序列的甲基化参考百分比;
23.SEQ ID NO:5770和/或SEQ ID NO:5714和/或SEQ ID NO:5742,并且其中当所述癌症指数值为约1.725或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.92,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5770和/或SEQ ID NO:5714和/或SEQ ID NO:5742定义的序列的甲基化参考百分比;
24.SEQ ID NO:5770和/或SEQ ID NO:5714和/或SEQ ID NO:5742,并且其中当所述癌症指数值小于约1.725时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.92,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5770和/或SEQ ID NO:5714和/或SEQ ID NO:5742定义的序列的甲基化参考百分比;
25.SEQ ID NO:5771和/或SEQ ID NO:5715和/或SEQ ID NO:5743,并且其中当所述癌症指数值为约3.258或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少90.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.92,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5771和/或SEQ ID NO:5715和/或SEQ ID NO:5743定义的序列的甲基化参考百分比;
26.SEQ ID NO:5771和/或SEQ ID NO:5715和/或SEQ ID NO:5743,并且其中当所述癌症指数值小于约3.258时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少90.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.92,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5771和/或SEQ ID NO:5715和/或SEQ ID NO:5743定义的序列的甲基化参考百分比;
27.SEQ ID NO:5772和/或SEQ ID NO:5716和/或SEQ ID NO:5744,并且其中当所述癌症指数值为约4.731或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.92,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5772和/或SEQ ID NO:5716和/或SEQ ID NO:5744定义的序列的甲基化参考百分比;
28.SEQ ID NO:5772和/或SEQ ID NO:5716和/或SEQ ID NO:5744,并且其中当所述癌症指数值小于约4.731时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.92,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5772和/或SEQ ID NO:5716和/或SEQ ID NO:5744定义的序列的甲基化参考百分比;
29.SEQ ID NO:5773和/或SEQ ID NO:5717和/或SEQ ID NO:5745,并且其中当所述癌症指数值为约1.427或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.92,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5773和/或SEQ ID NO:5717和/或SEQ ID NO:5745定义的序列的甲基化参考百分比;
30.SEQ ID NO:5773和/或SEQ ID NO:5717和/或SEQ ID NO:5745,并且其中当所述癌症指数值小于约1.427时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.92,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5773和/或SEQ ID NO:5717和/或SEQ ID NO:5745定义的序列的甲基化参考百分比;
31.SEQ ID NO:5774和/或SEQ ID NO:5718和/或SEQ ID NO:5746,并且其中当所述癌症指数值为约4.511或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.92,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5774和/或SEQ ID NO:5718和/或SEQ ID NO:5746定义的序列的甲基化参考百分比;
32.SEQ ID NO:5774和/或SEQ ID NO:5718和/或SEQ ID NO:5746,并且其中当所述癌症指数值小于约4.511时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.92,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5774和/或SEQ ID NO:5718和/或SEQ ID NO:5746定义的序列的甲基化参考百分比;
33.SEQ ID NO:5775和/或SEQ ID NO:5719和/或SEQ ID NO:5747,并且其中当所述癌症指数值为约6.894或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少90.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.92,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5775和/或SEQ ID NO:5719和/或SEQ ID NO:5747定义的序列的甲基化参考百分比;
34.SEQ ID NO:5775和/或SEQ ID NO:5719和/或SEQ ID NO:5747,并且其中当所述癌症指数值小于约6.894时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少90.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.92,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5775和/或SEQ ID NO:5719和/或SEQ ID NO:5747定义的序列的甲基化参考百分比;
35.SEQ ID NO:5776和/或SEQ ID NO:5720和/或SEQ ID NO:5748,并且其中当所述癌症指数值为约3.934或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.92,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5776和/或SEQ ID NO:5720和/或SEQ ID NO:5748定义的序列的甲基化参考百分比;
36.SEQ ID NO:5776和/或SEQ ID NO:5720和/或SEQ ID NO:5748,并且其中当所述癌症指数值小于约3.934时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.92,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5776和/或SEQ ID NO:5720和/或SEQ ID NO:5748定义的序列的甲基化参考百分比;
37.SEQ ID NO:5777和/或SEQ ID NO:5721和/或SEQ ID NO:5749,并且其中当所述癌症指数值为约4.153或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.92,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5777和/或SEQ ID NO:5721和/或SEQ ID NO:5749定义的序列的甲基化参考百分比;
38.SEQ ID NO:5777和/或SEQ ID NO:5721和/或SEQ ID NO:5749,并且其中当所述癌症指数值小于约4.153时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.92,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5777和/或SEQ ID NO:5721和/或SEQ ID NO:5749定义的序列的甲基化参考百分比;
39.SEQ ID NO:5778和/或SEQ ID NO:5722和/或SEQ ID NO:5750,并且其中当所述癌症指数值为约0.468或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.91,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5778和/或SEQ ID NO:5722和/或SEQ ID NO:5750定义的序列的甲基化参考百分比;
40.SEQ ID NO:5778和/或SEQ ID NO:5722和/或SEQ ID NO:5750,并且其中当所述癌症指数值小于约0.468时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.91,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5778和/或SEQ ID NO:5722和/或SEQ ID NO:5750定义的序列的甲基化参考百分比;
41.SEQ ID NO:5779和/或SEQ ID NO:5723和/或SEQ ID NO:5751,并且其中当所述癌症指数值为约2.226或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少90.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.90,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5779和/或SEQ ID NO:5723和/或SEQ ID NO:5751定义的序列的甲基化参考百分比;
42.SEQ ID NO:5779和/或SEQ ID NO:5723和/或SEQ ID NO:5751,并且其中当所述癌症指数值小于约2.226时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少90.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.90,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5779和/或SEQ ID NO:5723和/或SEQ ID NO:5751定义的序列的甲基化参考百分比;
43.SEQ ID NO:5780和/或SEQ ID NO:5724和/或SEQ ID NO:5752,并且其中当所述癌症指数值为约6.942或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.90,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5780和/或SEQ ID NO:5724和/或SEQ ID NO:5752定义的序列的甲基化参考百分比;
44.SEQ ID NO:5780和/或SEQ ID NO:5724和/或SEQ ID NO:5752,并且其中当所述癌症指数值小于约6.942时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.90,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5780和/或SEQ ID NO:5724和/或SEQ ID NO:5752定义的序列的甲基化参考百分比;
45.SEQ ID NO:5781和/或SEQ ID NO:5725和/或SEQ ID NO:5753,并且其中当所述癌症指数值为约1.955或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.90,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5781和/或SEQ ID NO:5725和/或SEQ ID NO:5753定义的序列的甲基化参考百分比;
46.SEQ ID NO:5781和/或SEQ ID NO:5725和/或SEQ ID NO:5753,并且其中当所述癌症指数值小于约1.955时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.90,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5781和/或SEQ ID NO:5725和/或SEQ ID NO:5753定义的序列的甲基化参考百分比;
47.SEQ ID NO:5782和/或SEQ ID NO:5726和/或SEQ ID NO:5754,并且其中当所述癌症指数值为约5.005或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.88,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5782和/或SEQ ID NO:5726和/或SEQ ID NO:5754定义的序列的甲基化参考百分比;
48.SEQ ID NO:5782和/或SEQ ID NO:5726和/或SEQ ID NO:5754,并且其中当所述癌症指数值小于约5.005时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.88,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5782和/或SEQ ID NO:5726和/或SEQ ID NO:5754定义的序列的甲基化参考百分比;
49.SEQ ID NO:5783和/或SEQ ID NO:5727和/或SEQ ID NO:5755,并且其中当所述癌症指数值为约5.315或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.86,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5783和/或SEQ ID NO:5727和/或SEQ ID NO:5755定义的序列的甲基化参考百分比;
50.SEQ ID NO:5783和/或SEQ ID NO:5727和/或SEQ ID NO:5755,并且其中当所述癌症指数值小于约5.315时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.86,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5783和/或SEQ ID NO:5727和/或SEQ ID NO:5755定义的序列的甲基化参考百分比;
51.SEQ ID NO:5784和/或SEQ ID NO:5728和/或SEQ ID NO:5756,并且其中当所述癌症指数值为约5.381或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.85,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5784和/或SEQ ID NO:5728和/或SEQ ID NO:5756定义的序列的甲基化参考百分比;
52.SEQ ID NO:5784和/或SEQ ID NO:5728和/或SEQ ID NO:5756,并且其中当所述癌症指数值小于约5.381时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.85,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5784和/或SEQ ID NO:5728和/或SEQ ID NO:5756定义的序列的甲基化参考百分比;
53.SEQ ID NO:5785和/或SEQ ID NO:5729和/或SEQ ID NO:5757,并且其中当所述癌症指数值为约3.671或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.84,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5785和/或SEQ ID NO:5729和/或SEQ ID NO:5757定义的序列的甲基化参考百分比;
54.SEQ ID NO:5785和/或SEQ ID NO:5729和/或SEQ ID NO:5757,并且其中当所述癌症指数值小于约3.671时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.84,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5785和/或SEQ ID NO:5729和/或SEQ ID NO:5757定义的序列的甲基化参考百分比;
55.SEQ ID NO:5786和/或SEQ ID NO:5730和/或SEQ ID NO:5758,并且其中当所述癌症指数值为约0.652或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少55.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.82,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5786和/或SEQ ID NO:5730和/或SEQ ID NO:5758定义的序列的甲基化参考百分比;
56.SEQ ID NO:5786和/或SEQ ID NO:5730和/或SEQ ID NO:5758,并且其中当所述癌症指数值小于约0.652时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少55.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.82,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5786和/或SEQ ID NO:5730和/或SEQ ID NO:5758定义的序列的甲基化参考百分比
57.SEQ ID NO:5759和/或SEQ ID NO:5703和/或SEQ ID NO:5731,并且其中当所述癌症指数值为约0.003或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少86.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.95,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5759和/或SEQ ID NO:5703和/或SEQ ID NO:5731定义的序列的甲基化参考百分比;
58.SEQ ID NO:5759和/或SEQ ID NO:5703和/或SEQ ID NO:5731,并且其中当所述癌症指数值小于约0.003时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少86.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.95,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5759和/或SEQ ID NO:5703和/或SEQ ID NO:5731定义的序列的甲基化参考百分比;
59.SEQ ID NO:5779和/或SEQ ID NO:5723和/或SEQ ID NO:5751,并且其中当所述癌症指数值为约0.111或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少86.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.90,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5779和/或SEQ ID NO:5723和/或SEQ ID NO:5751定义的序列的甲基化参考百分比;
60.SEQ ID NO:5779和/或SEQ ID NO:5723和/或SEQ ID NO:5751,并且其中当所述癌症指数值小于约0.111时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少86.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.90,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5779和/或SEQ ID NO:5723和/或SEQ ID NO:5751定义的序列的甲基化参考百分比;
61.SEQ ID NO:5769和/或SEQ ID NO:5713和/或SEQ ID NO:5741,并且其中当所述癌症指数值为约0.022或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,所述测定方法的特异性为至少78.00%,并且AUC为0.93,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5769和/或SEQ ID NO:5713和/或SEQ ID NO:5741定义的序列的甲基化参考百分比;
62.SEQ ID NO:5769和/或SEQ ID NO:5713和/或SEQ ID NO:5741,并且其中当所述癌症指数值小于约0.022时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,所述测定方法的特异性为至少78.00%,并且AUC为0.93,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5769和/或SEQ ID NO:5713和/或SEQ ID NO:5741定义的序列的甲基化参考百分比;
63.SEQ ID NO:5762和/或SEQ ID NO:5706和/或SEQ ID NO:5734,并且其中当所述癌症指数值为约0.033或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少88.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.93,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5762和/或SEQ ID NO:5706和/或SEQ ID NO:5734定义的序列的甲基化参考百分比;
64.SEQ ID NO:5762和/或SEQ ID NO:5706和/或SEQ ID NO:5734,并且其中当所述癌症指数值小于约0.033时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少88.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.93,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5762和/或SEQ ID NO:5706和/或SEQ ID NO:5734定义的序列的甲基化参考百分比;
65.SEQ ID NO:5761和/或SEQ ID NO:5705和/或SEQ ID NO:5733,并且其中当所述癌症指数值为约0.001或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少84.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.94,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5761和/或SEQ ID NO:5705和/或SEQ ID NO:5733定义的序列的甲基化参考百分比;
66.SEQ ID NO:5761和/或SEQ ID NO:5705和/或SEQ ID NO:5733,并且其中当所述癌症指数值小于约0.001时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少84.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.94,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5761和/或SEQ ID NO:5705和/或SEQ ID NO:5733定义的序列的甲基化参考百分比;
67.SEQ ID NO:5759和/或SEQ ID NO:5703和/或SEQ ID NO:5731,并且其中当所述癌症指数值为约0.003或更大时,所述个体被归类为患有子宫内膜癌或具有子宫内膜癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少88.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,且所述AUC为0.95,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5759和/或SEQ ID NO:5703和/或SEQ ID NO:5731定义的序列的甲基化参考百分比;
68.SEQ ID NO:5759和/或SEQ ID NO:5703和/或SEQ ID NO:5731,并且其中当所述癌症指数值小于约0.003时,所述个体被归类为未患有子宫内膜癌或具有子宫内膜癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少88.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.95,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5759和/或SEQID NO:5703和/或SEQ ID NO:5731定义的序列的甲基化参考百分比;
69.SEQ ID NO:5779和/或SEQ ID NO:5723和/或SEQ ID NO:5751,并且其中当所述癌症指数值为约0.111或更大时,所述个体被归类为患有子宫内膜癌或具有子宫内膜癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,且所述AUC为0.92,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5779和/或SEQ ID NO:5723和/或SEQ ID NO:5751定义的序列的甲基化参考百分比;
70.SEQ ID NO:5779和/或SEQ ID NO:5723和/或SEQ ID NO:5751,并且其中当所述癌症指数值小于约0.111时,所述个体被归类为未患有子宫内膜癌或具有子宫内膜癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.92,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5779和/或SEQID NO:5723和/或SEQ ID NO:5751定义的序列的甲基化参考百分比;
71.SEQ ID NO:5769和/或SEQ ID NO:5713和/或SEQ ID NO:5741,并且其中当所述癌症指数值为约0.022或更大时,所述个体被归类为患有子宫内膜癌或具有子宫内膜癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,所述测定方法的特异性为至少78.00%,且所述AUC为0.91,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5769和/或SEQ ID NO:5713和/或SEQ ID NO:5741定义的序列的甲基化参考百分比;
72.SEQ ID NO:5769和/或SEQ ID NO:5713和/或SEQ ID NO:5741,并且其中当所述癌症指数值小于约0.022时,所述个体被归类为未患有子宫内膜癌或具有子宫内膜癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,所述测定方法的特异性为至少78.00%,并且AUC为0.91,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5769和/或SEQID NO:5713和/或SEQ ID NO:5741定义的序列的甲基化参考百分比;
73.SEQ ID NO:5762和/或SEQ ID NO:5706和/或SEQ ID NO:5734,并且其中当所述癌症指数值为约0.033或更大时,所述个体被归类为患有子宫内膜癌或具有子宫内膜癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,且所述AUC为0.85,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5762和/或SEQ ID NO:5706和/或SEQ ID NO:5734定义的序列的甲基化参考百分比;
74.SEQ ID NO:5762和/或SEQ ID NO:5706和/或SEQ ID NO:5734,并且其中当所述癌症指数值小于约0.033时,所述个体被归类为未患有子宫内膜癌或具有子宫内膜癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少72.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.85,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5762和/或SEQID NO:5706和/或SEQ ID NO:5734定义的序列的甲基化参考百分比;
75.SEQ ID NO:5761和/或SEQ ID NO:5705和/或SEQ ID NO:5733,并且其中当所述癌症指数值为约0.001或更大时,所述个体被归类为患有子宫内膜癌或具有子宫内膜癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,且所述AUC为0.89,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5761和/或SEQ ID NO:5705和/或SEQ ID NO:5733定义的序列的甲基化参考百分比;和/或
76.SEQ ID NO:5761和/或SEQ ID NO:5705和/或SEQ ID NO:5733,并且其中当所述癌症指数值小于约0.001时,所述个体被归类为未患有子宫内膜癌或具有子宫内膜癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少80.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.89,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5761和/或SEQID NO:5705和/或SEQ ID NO:5733定义的序列的甲基化参考百分比。
在任何所述测定方法中,所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态优选地通过甲基化参考百分比分析确定,并且所述测定方法用于评估CIN3和/或癌症的存在、不存在或发展,优选地,所述癌症是宫颈癌或子宫内膜癌。最优选地,所述癌症是宫颈癌。
表8、10、11和13中列出的对应于SEQ ID NO:5703至5786中的每一个的ROC数据是通过从CpG的组确定癌症指数值而推导出的,其中在每种情况下,所述组包括由SEQ ID NO定义的所述序列中的所有所述CpG。表8和13中列出的ROC数据涉及本发明的测定方法在将个体分层为患有或未患有CIN3,或具有发展CIN3的高风险或低风险方面的表现。表11中列出的ROC数据涉及本发明的测定方法在将个体分层为患有或未患有子宫内膜癌,或具有发展子宫内膜癌的高风险或低风险方面的表现。
表8.
表11
癌症指数值和确定CpG的甲基化状态的关系
鉴于本文所述的观察结果(参见实施例),发明人基于甲基化状态(DNAme;如上所述)的分析推导癌症指数,用于评估个体中的癌症的存在或发展的测定方法。
如本文所解释,所描述的测定方法特别地涉及评估宫颈癌和/或子宫内膜癌(特别是宫颈癌)的存在、不存在或发展的评估。
如本文描述和定义,本文所述的任何测定方法涉及基于在从个体提供的样本中测定的一个或多个CpG的组的甲基化状态来推导癌症指数值。
可以通过任何合适的手段推导所述癌症指数值。
发明人已经鉴定了如本文描述和定义的特定CpG,其可以用于形成含有CpG的组,其甲基化状态被确定以根据本文描述和定义的测定方法建立癌症指数值。使用这些组,发明人已经证明,有可能推导与正常组织相关并指示正常组织的癌症指数值,所述正常组织即CIN3和/或癌症阴性的组织,特别是癌症阴性的宫颈和/或子宫内膜组织。因此,可以评估个体中不存在癌症。使用这些组,发明人已经证明,有可能推导与CIN3和/或癌症组织相关并指示其的癌症指数值,所述CIN3和/或癌症组织即CIN3和/或癌症阳性的组织,特别是癌症阴性的宫颈和/或子宫内膜组织。因此,可以评估个体中存在CIN3和/或癌症。如本文所解释,发明人已经表明,使用含有已经鉴定的所述CpG的组,因此可以评估个体中存在CIN3和/或癌症。如本文所解释,发明人已经表明,使用含有已经鉴定的所述CpG的组,可以表明正常细胞(特别地来自上皮细胞,特别地源自宫颈、阴道、颊区域、血液或尿液,或来自宫颈液基细胞学检查样本,更优选地来自宫颈涂片样本)的DNA甲基化特征,如所述癌症指数值所指示,是动态的并且会从指示CIN3和/或癌症阴性到CIN3和/或癌症阳性组织连续地改变。特别地,本文所述的癌症指数值用作以高度统计准确性指示个体的宫颈和/或子宫内膜组织是癌症阴性还是癌症阳性的替代物。因此,使用含有已经鉴定的所述CpG的组,可以建立癌症指数值量表,其可以用于评估个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展。
如本文所述,发明人已使用某些方法来确定样本中的DNA分子群体中的特定CpG的甲基化状态。例如,在一种方法中,可以确定CpG的甲基化参考百分比(PMR)值。在另一种方法中,可以确定CpG的甲基化β值。可以取决于情况采用不同的机制来确定特定值,如基于PCR的机制或基于芯片的机制。
对于本领域技术人员而言显而易见的是,在本发明的测定方法中,在样本中的DNA分子群体中确定特定CpG的甲基化状态的步骤不限于任何一种特定方法。如本领域技术人员所理解的,因为癌症指数值基于CpG的甲基化状态,并且由于CpG的甲基化状态可以由特定方法学特有的值(例如,甲基化参考百分比(PMR)值或甲基化β值)来表示,那么定义癌症阴性和癌症阳性样本的癌症指数值的范围可以取决于用于确定CpG的甲基化状态的方法。然而,用户可以使用用于确定CpG的甲基化状态的任何合适方法来容易地再现和实施本发明的测定方法,条件是始终使用相同的方法。此外,用户可以通过从已知癌症阴性和癌症阳性的患者样本确定构成本文公开的特定CpG的组中的CpG的甲基化状态而容易地重新建立定义癌症阴性和癌症阳性样本的癌症指数值。一旦使用本文鉴定的CpG建立了这种癌症指数值,用户就可以使用这些值作为评估其癌症状态待确定的任何测试个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展的基础。因此,根据本发明的癌症指数值不限于确定CpG的甲基化状态的特定方法。相反,本领域技术人员将理解,可以建立反映本文鉴定的CpG将甲基化状态与CIN3和/或癌症疾病状态相关的内在能力的癌症指数值。
因此,癌症指数值可以通过以任何合适的手段在从个体提供的样本中评估所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态来推导。
确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化状态的所述步骤可以通过确定所述一个或多个CpG中的每一个的甲基化参考百分比(PMR)值来实现。确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化状态的所述步骤可以通过确定所述一个或多个CpG中每一个的甲基化β值来实现。
在本文所述的任何测定方法中,所述CpG的甲基化状态可以通过任何合适的手段推导。例如,在本文所述的任何测定方法中,确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化状态的所述步骤可以包括:
a.实施测序步骤以确定每个CpG的序列;
b.将DNA与包括能够区分所述CpG的甲基化和非甲基化形式的探针的芯片杂交,并将检测系统应用于所述芯片以确定每个CpG的甲基化状态;和/或
c.使用甲基化特异性引物实施PCR步骤,其中所述CpG的甲基化状态通过PCR产物是否存在来确定。
确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化状态的所述步骤可以包括转化步骤,以将甲基化CpG二核苷酸相对于非甲基化CpG二核苷酸区分。所述转化步骤可以包括例如样本中的DNA的亚硫酸氢盐转化或TAPS(TET辅助吡啶硼烷测序)转化,其将应用于上述a.至c.中的任何一项或多项。TAPS可以特别地涉及以下步骤:将5-甲基胞嘧啶碱基(5mC)氧化为5-羧基胞嘧啶碱基(5caC),优选地通过10-11易位(TET),和/或将5-羟甲基胞嘧啶碱基(5hmC)氧化为5-羧基胞嘧啶碱基(5caC),优选地通过10-11易位(TET);然后任选地使用吡啶硼烷将5-羧基胞嘧啶碱基(5caC)还原为二氢尿嘧啶碱基(DHU)。
确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化状态的所述步骤可以另外地或可替代地包括使用TempO-seq(模板化寡核苷酸测序)。TempO-seq的上下文中的寡核苷酸可以被设计成或不被设计成使得它们在如本文所述的预先转化后与甲基化CpG二核苷酸杂交。
确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化状态的所述步骤可以包括使所述样本中的所述DNA与切割其限制性位点的甲基化和/或非甲基化形式的一种或多种甲基化敏感的限制性核酸内切酶接触,并且优选地,在实施上述a.至c.中的任何一项之前实施所述DNA的所述接触。在使用甲基化敏感的限制性酶的本发明的测定方法中,实施一个或多个对照反应。优选地,所述一个或多个对照反应涉及对已知基因座的询问,所述已知基因座(i)不含有限制性核酸内切酶位点;(ii)含有甲基化的限制性位点;(iii)含有未甲基化的限制性位点。
使用用于确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化状态的任何方法,可以确定任何给定基因座处的甲基化和未甲基化CpG的比例,从而能够生成癌症指数值。
优选地,在所述样本中的所述DNA分子群体中确定一个或多个CpG的组的甲基化状态的所述步骤进一步包括确定每个CpG的β值。推导所述癌症指数值可以涉及提供甲基化β值数据集,其包括所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化β值。
CpG的甲基化状态的评估
DNA的甲基化是一种公认的表观遗传修饰形式,其具有改变基因和其它元件(例如,微RNA)的表达的能力。在癌症发展和进展中,甲基化可能具有例如沉默肿瘤抑制基因和/或增加致癌基因的表达的作用。甲基化可能导致其它形式的失调。DNA的甲基化发生在主要是由CpG基序组成的二核苷酸的离散基因座处,但也可能发生在CHH基序(其中H是A、C或T)处。在甲基化期间,甲基被添加到胞嘧啶碱基的第五个碳上以产生甲基胞嘧啶。
甲基化可以发生在整个基因组中,并且不限于关于表达序列(如基因)的区域。甲基化通常但不总是发生在启动子或表达序列的其它调控区(例如,增强子元件)。最典型地,CpG的甲基化状态簇集在CpG岛中,例如CpG岛存在于基因的调控区,特别是它们的启动子区域中。
通常,DNA甲基化状态的评估涉及分析DNA中是否存在甲基,例如一个或多个胞嘧啶核苷酸的5位上的甲基。优选地,评估作为CpG二核苷酸存在的一个或多个胞嘧啶核苷酸的甲基化状态(其中C表示胞嘧啶,G表示鸟嘌呤,而p表示连接两者的磷酸基团)。
有多种技术可用于鉴定和评估CpG甲基化状态,如下面将简要概述的。本文所述的测定方法涵盖用于确定CpG甲基化状态的任何合适的技术。
在常规的体外处理步骤(例如,PCR)期间,甲基从起始DNA分子丢失。为避免这种情况,检测甲基的技术通常涉及在后续处理之前以保留原始DNA分子的甲基化状态信息的方式对DNA实施初步处理。这些初步技术涉及三个主要类别的处理,即亚硫酸氢盐修饰、限制性酶消化和基于亲和力的分析。然后,这些技术的产品可以与用于随后对CpG甲基化状态实施鉴定或定性评估的基于测序或芯片的平台相结合。
涉及DNA的亚硫酸氢盐修饰的技术已成为检测和评估CpG二核苷酸的甲基化状态的最常用测定方法。用亚硫酸氢盐(例如,亚硫酸氢钠)对DNA实施的处理将胞嘧啶碱基转化为尿嘧啶碱基,但对5-甲基胞嘧啶没有影响。因此,经亚硫酸氢盐处理的DNA中的胞嘧啶的存在指示了起始DNA分子中的先前甲基化的胞嘧啶碱基的存在。这种胞嘧啶碱基可以通过多种技术检测。例如,可以生成对未甲基化及甲基化DNA具有特异性的引物,并将其用于甲基化CpG二核苷酸的基于PCR的鉴定。可以在亚硫酸氢盐转化之前或之后扩增DNA。可以例如使用结合分子(例如,互补寡核苷酸序列)实施分离/捕获步骤。也可以使用标准和下一代DNA测序方案。
在其它方法中,可以使用甲基化敏感的酶,其仅在甲基化DNA存在的情况下实施消化或切割。所得片段的分析通常使用微芯片实施。
基于亲和力的技术利用结合相互作用来捕获甲基化DNA的片段以实施富集。通常在后续处理步骤(例如,PCR和测序)之前使用结合分子(例如,抗5-甲基胞嘧啶抗体)。
Olkhov-Mitsel和Bapat(2012)提供了对可用于鉴定和评估涉及甲基胞嘧啶的生物标志物的技术的全面综述。
为了评估本文表征和描述的基于CpG的生物标志物的甲基化状态,可以采用任何合适的测定方法。
本文所述的测定方法可以包括通过亚硫酸氢盐转化DNA来确定CpG的甲基化状态。优选的测定方法涉及DNA的亚硫酸氢盐处理,包含用于甲基化特异性PCR的鉴定CpG基因座的扩增和/或使用甲基化区分微芯片对靶基因座的甲基化状态的测序和/或评估。
可以通过多种方法实现CpG基因座的扩增。优选地,使用PCR扩增CpG基因座。可以使用各种基于PCR的方法。例如,可以将甲基化特异性引物与包含关注的CpG序列的DNA杂交。此类引物可以被设计成退火至源于甲基化或非甲基化CpG基因座的序列。退火后,实施PCR反应,并且后续PCR产物的存在指示了可鉴定序列的退火CpG的存在。在此类测定方法中,DNA在扩增前被亚硫酸氢盐转化。此类技术通常被称为甲基化特异性PCR(MSP)。
在其它技术中,PCR引物可以独立于甲基化状态而与退火至关注的CpG序列,并且可以使用进一步的处理步骤来确定CpG的状态。测定方法被设计成使得CpG位点位于引物退火位点之间。这种测定方法方案用于如亚硫酸氢盐基因组测序、COBRA、Ms-SNuPE等技术。在此类测定方法中,DNA可以在扩增之前或之后实施亚硫酸氢盐转化。
可以使用小规模PCR方法。此类方法通常涉及样本的质量划分(例如,数字PCR)。这些技术在高度微型化系统(皮升大小的液滴)的背景下提供稳健的准确性和灵敏度,非常适合于可从生物样本(特别是尿液样本)中可能存在的小容量细胞材料获得的少量DNA的随后处理。各种此类小规模PCR技术已广泛应用。例如,基于微液滴的PCR仪器可购自各种供应商,包括RainDance Technologies,Inc.(比勒利卡,马萨诸塞州;http:// raindancetech.com/)和Bio-Rad,Inc.(http://www.bio-rad.com/)。也可以使用微芯片平台来实施小规模PCR。此类平台可以包括例如可获自Fluidigm Corp.(www.fluidigm.com)的基于微流控网络的芯片。
在CpG基因座扩增后,扩增PCR产物可以与后续分析平台偶联,以确定关注的CpG的甲基化状态。例如,PCR产物可以直接测序以确定靶CpG处是否存在甲基胞嘧啶或通过基于芯片的技术实施分析。
可以采用任何合适的测序技术来确定靶DNA的序列。在本发明的测定方法中,可以使用高通量的、所谓的“第二代”、“第三代”和“下一代”技术对经亚硫酸氢盐处理的DNA实施测序。
在第二代技术中,大量DNA分子被并行测序。通常,数以万计的分子以高密度锚定到给定位置,并且在依赖于DNA合成的过程中确定序列。反应通常由例如用以允许掺入可逆的标记终止子碱基的连续的试剂输送和洗涤步骤,以及用以确定碱基掺入的顺序的扫描步骤组成。这种类型的基于芯片的系统可商购自例如Illumina,Inc.(圣地亚哥,加利福尼亚州;http://www.illumina.com/)。
第三代技术通常被定义为不需要在检测步骤之间停止测序过程,并且因此可以被视为实时系统。例如,可以在微孔系统(例如,参见获自Life Technologies;http://www.1ifetechnologies.com/的Ion Torrent系统)的背景下检测到在掺入过程期间发生的氢离子的碱基特异性释放。类似地,在焦磷酸测序中,检测和分析了焦磷酸盐(PPi)的碱基特异性释放。在纳米孔技术中,DNA分子通过纳米孔或定位在纳米孔附近,并且在DNA分子相对于纳米孔运动后,确定各个碱基的鉴定。这种类型的系统可商购自例如Oxford Nanopore(https://www.nanoporetech.com/)。在一种替代测定方法中,将DNA聚合酶限于“零模式波导(zero-mode waveguide)”中,并通过γ标记物的磷酸核苷酸(参见例如PacifcBiosciences;http://www.pacificbiosciences.com/)的荧光检测来确定掺入碱基的鉴定。
在其它测定方法中,可以省略测序步骤。例如,基于两条互补核酸链退火形成双链分子的原理,可以将扩增PCR产物直接应用于杂交芯片。杂交芯片可以被设计成包含能够与CpG的扩增产物杂交并允许区分甲基化和非甲基化基因座的探针。例如,可以设计能够与含有胸腺嘧啶的CpG基因座选择性地杂交的探针,指示在起始模板DNA中的未甲基化的胞嘧啶的亚硫酸氢盐转化后生成尿嘧啶。相反,可以设计能够与含有胞嘧啶的CpG基因座选择性地杂交的探针,指示在亚硫酸氢盐处理后不存在尿嘧啶转化。这对应于起始模板DNA中的甲基化CpG基因座。
在将合适的检测系统应用于所述芯片后,可以使用基于计算机的分析技术来确定CpG的甲基化状态。检测系统可以包含例如在甲基化状态特异性探针延伸反应后添加荧光分子。这种技术允许在对CpG扩增产物的测序没有特定需求的情况下的CpG状态确定。此类基于芯片的鉴别探针可以被称为甲基化特异性探针。
可以使用任何合适的甲基化区分微芯片来评估本文所述的CpG的甲基化状态。Illumina,Inc.(圣地亚哥,加利福尼亚州;http://www.illumina.com/)提供了一种特定的甲基化区分微芯片系统。特别地,可以使用Infinium MethylationEPIC BeadChip芯片和Infinium HumanMethylation450 BeadChip芯片系统来评估CpG的甲基化状态以预测癌症发展,如本文所述。此系统利用了在起始DNA分子的亚硫酸氢盐处理后的对DNA实施的化学修饰。简而言之,所述芯片包括对对应于CpG的未甲基化形式的DNA序列具有特异性的寡核苷酸探针所偶联的微珠,以及对对应于CpG的甲基化形式的DNA序列具有特异性的寡核苷酸探针所偶联的不同微珠。将候选DNA分子应用于所述芯片,并在适当条件下与对应于相关表观遗传形式的寡核苷酸探针选择性地杂交。因此,源自在相对应基因组DNA中甲基化的CpG的DNA分子将选择性地附接到包括甲基化特异性寡核苷酸探针的微珠,但将无法附接到包括非甲基化特异性寡核苷酸探针的微珠。只有杂交探针的单碱基延伸掺入了标记ddNTP,随后对其用荧光试剂实施染色并成像。CpG的甲基化状态通过计算来自甲基化和未甲基化位点的荧光信号的比率来确定。
Infinium HumanMethylation450 BeadChip芯片系统可以用于询问本文所述的测定方法中的CpG。然而,可以采用替代或定制芯片来询问本文定义的癌症特定CpG生物标志物,条件是它们包括用于询问如本文定义的给定测定方法的所有CpG的手段。
也可以使用涉及上述测定方法的组合的技术。例如,可以将含有关注的CpG序列的DNA与微芯片杂交,然后实施DNA测序以如上所述确定CpG的状态。
在上述测定方法中,如果期望,对应于CpG基因座的序列也可以实施富集过程。含有关注的CpG序列的DNA可以通过结合如与关注的CpG靶序列互补的寡核苷酸探针等分子来捕获。可以在亚硫酸氢盐转化之前或之后或扩增之前或之后捕获对应于CpG基因座的序列。探针可以被设计成与经亚硫酸氢盐转化的DNA互补。然后,可以对捕获的DNA实施进一步的处理步骤以确定CpG的状态,例如DNA测序步骤。
捕获/分离步骤可以实施定制设计。可替代地,多种此类技术可商购,例如获自Agilent Technologies(http://www.agilent.com/home)的SureSelect靶标富集系统。在本系统中,与含有关注的CpG序列的DNA互补的生物素化“诱饵”或“探针”序列(例如,RNA)与样本核酸杂交。然后,使用链霉亲和素包被的磁性微珠捕获与诱饵序列杂交的关注的序列。未结合的部分被丢弃。然后,去除诱饵序列(例如,通过RNA的消化),从而提供与非CpG序列分离的CpG靶序列的富集池。模板DNA可以实施亚硫酸氢盐转化,并通过小规模PCR(例如,使用与CpG的甲基化状态无关的引物的微液滴PCR)实施靶基因座扩增。扩增后,样本可以实施捕获步骤以富集含有靶CpG的PCR产物,例如如上所述使用磁性微珠捕获和纯化。捕获后,实施标准PCR反应以将DNA测序条形码掺入到含CpG的扩增子中。将PCR产物再次纯化,然后实施DNA测序和分析,以确定靶基因组CpG处是否存在甲基胞嘧啶。
在本文中由SEQ ID NO:1至5000定义的CpG生物标志物基因座对应于本领域已知的标识符(IlmnID)。这些CpG基因座标识符是指市售/>InfiniumMethylation EPIC BeadChip试剂盒和/>Infinium Human Methylation450BeadChip试剂盒中使用的各个CpG位点。每个CpG基因座标识符所表示的每个CpG位点的鉴定可参考Infinium Methylation EPIC BeadChip试剂盒和Infinium HumanMethylation450 BeadChip试剂盒中使用的CpG位点,从Illumina,Inc.网站公开获得。
为了补充不断发展的公共数据库以提供准确的CpG基因座标识符和链取向,已开发了一种基于每个单独CpG基因座的实际或前后文序列一致地指定CpG基因座的方法。为了明确地提及任何物种中的CpG基因座,/>已开发了一种一致性且确定性的CpG基因座数据库,以确保甲基化数据报告的一致性。所述/>方法利用CpG基因座侧翼序列来生成唯一的CpG基因座簇ID。此数字仅基于序列信息,并且不受基因组版本的影响。Illumina的标准化命名法也与通常用于单核苷酸多态性(SNP)命名的TOP/BOT链命名法(其指示链取向)并行使用。
Infinium MethylationEPIC BeadChip和Infinium Human Methylation450BeadChip系统的标识符也可获自如Gene Expression Omnibus(GEO)(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)等公共存储库。
评估CpG的甲基化状态是指确定给定CpG是甲基化的还是未甲基化的。此外,这还指确定给定CpG位点在样本中通过CpG基因座群的甲基化程度。
CpG甲基化状态可以使用荧光等检测系统间接测量。可以使用甲基化区分微芯片。在计算给定CpG的甲基化程度时,可以使用的β值定义。特定CpG位点的/>甲基化β值是根据甲基化(M)和未甲基化(U)等位基因的强度计算的,即荧光信号的比率β=Max(M,0)/[Max(M,0)+Max(U,0)+100]。在此范围内,0<β<1,β值为1或接近1指示100%甲基化,而值为0或接近0指示0%甲基化。
由SEQ ID NO:1至5000定义或在SEQ ID NO:5001至5418中鉴定的CpG中的任一个或多个CpG的甲基化状态可以通过任何合适的技术评估。如在下面的实施例中更详细地解释,发明人使用的一种特定示例性技术是甲基化鉴别芯片,例如IlluminaInfiniumMethylation EPIC BeadChip。这些测定方法利用了针对给定基因座处的甲基化和未甲基化CpG的探针。
发明人用来确定任一个或多个CpG的甲基化状态的另一种示例性技术是被称为甲基化荧光检测的基于荧光的PCR技术。这些测定方法利用了对序列具有特异性的正向和反向PCR引物,所述序列涵盖根据SEQ ID NO:1至5000定义或在SEQ ID NO:5001至5418和5703至5786中鉴定的所述5000个CpG中的任一个或多个。因此,可以通过甲基化荧光检测分析确定由SEQ ID NO:1至5000定义或在SEQ ID NO:5001至5418和5703至5786中鉴定的一个或多个CpG的甲基化状态。鉴于典型的甲基化荧光检测方案内的亚硫酸氢盐转化步骤,可检测探针通常被设计成使得它们仅与待测定方法的所述一个或多个CpG的甲基化形式杂交。
基于CpG的测定方法的生物信息学工具和统计指标
通常可用有助于经亚硫酸氢盐转化的DNA序列的计算机分析和用于甲基化特异性分析目的的引物设计的软件程序,并且先前已对其实施了描述。
在预测癌症的风险模型中,经常使用接受者操作特征(ROC)曲线分析,其中会评估曲线下面积(AUC)。ROC曲线上的每个点都表现出将风险/可能性估算值转化为对个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展的预测的规则的影响。AUC衡量了模型区分病例受试者和对照受试者的能力。对应于病例受试者和对照受试者的随机分类的ROC曲线是AUC为50%的直线。对应于完美分类的ROC曲线的AUC为100%。
在本文所述的任何方法中,ROC AUC的95%置信区间可以在0.60和1之间。
在本文所述的任何方法中,所述区间可以被定义为具有0.60和1之间的任何数字作为上限的范围。所述上限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77、0.78、0.79、0.80、0.81、0.82、0.83、0.84、0.85、0.86、0.87、0.88、0.89、0.90、0.91、0.92、0.93、0.94、0.95、0.96、0.97、0.98、0.99或1.00。
在本文所述的任何方法中,所述区间可以被定义为具有0.60和1之间的任何数字作为下限的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77、0.78、0.79、0.80、0.81、0.82、0.83、0.84、0.85、0.86、0.87、0.88、0.89、0.90、0.91、0.92、0.93、0.94、0.95、0.96、0.97、0.98、0.99或1.00。
在本文所述的任何方法中,所述区间范围可以包括任何上述下限数字与任何上述上限数字的适当组合。
优选地,所述上限数字为1。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为1且下限为0.60和1之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77、0.78、0.79、0.80、0.81、0.82、0.83、0.84、0.85、0.86、0.87、0.88、0.89、0.90、0.91、0.92、0.93、0.94、0.95、0.96、0.97、0.98、0.99或1.00。
所述上限数字可以为0.99。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.99且下限为0.60和0.99之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77、0.78、0.79、0.80、0.81、0.82、0.83、0.84、0.85、0.86、0.87、0.88、0.89、0.90、0.91、0.92、0.93、0.94、0.95、0.96、0.97、0.98或0.99。
所述上限数字可以为0.98。因此,95%置信ROCAUC区间可以被定义为上限为0.98且下限为0.60和0.98之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77、0.78、0.79、0.80、0.81、0.82、0.83、0.84、0.85、0.86、0.87、0.88、0.89、0.90、0.91、0.92、0.93、0.94、0.95、0.96、0.97或0.98。
所述上限数字可以为0.97。因此,95%置信ROCAUC区间可以被定义为上限为0.97且下限为0.60和0.97之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77、0.78、0.79、0.80、0.81、0.82、0.83、0.84、0.85、0.86、0.87、0.88、0.89、0.90、0.91、0.92、0.93、0.94、0.95、0.96或0.97。
所述上限数字可以为0.96。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.96且下限为0.60和0.96之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77、0.78、0.79、0.80、0.81、0.82、0.83、0.84、0.85、0.86、0.87、0.88、0.89、0.90、0.91、0.92、0.93、0.94、0.95或0.96。
所述上限数字可以为0.95。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.95且下限为0.60和0.95之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77、0.78、0.79、0.80、0.81、0.82、0.83、0.84、0.85、0.86、0.87、0.88、0.89、0.90、0.91、0.92、0.93、0.94或0.95。
所述上限数字可以为0.94。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.94且下限为0.60和0.94之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77、0.78、0.79、0.80、0.81、0.82、0.83、0.84、0.85、0.86、0.87、0.88、0.89、0.90、0.91、0.92、0.93或0.94。
所述上限数字可以为0.93。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.93且下限为0.60和0.93之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77、0.78、0.79、0.80、0.81、0.82、0.83、0.84、0.85、0.86、0.87、0.88、0.89、0.90、0.91、0.92或0.93。
所述上限数字可以为0.92。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.92且下限为0.60和0.92之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77、0.78、0.79、0.80、0.81、0.82、0.83、0.84、0.85、0.86、0.87、0.88、0.89、0.90、0.91或0.92。
所述上限数字可以为0.91。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.91且下限为0.60和0.91之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77、0.78、0.79、0.80、0.81、0.82、0.83、0.84、0.85、0.86、0.87、0.88、0.89、0.90或0.91。
所述上限数字可以为0.90。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.90且下限为0.60和0.90之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77、0.78、0.79、0.80、0.81、0.82、0.83、0.84、0.85、0.86、0.87、0.88、0.89或0.90。
所述上限数字可以为0.89。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.89且下限为0.60和0.89之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77、0.78、0.79、0.80、0.81、0.82、0.83、0.84、0.85、0.86、0.87、0.88或0.89。
所述上限数字可以为0.88。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.88且下限为0.60和0.88之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77、0.78、0.79、0.80、0.81、0.82、0.83、0.84、0.85、0.86、0.87或0.88。
所述上限数字可以为0.87。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.87且下限为0.60和0.87之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77、0.78、0.79、0.80、0.81、0.82、0.83、0.84、0.85、0.86或0.87。
所述上限数字可以为0.86。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.86且下限为0.60和0.86之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77、0.78、0.79、0.80、0.81、0.82、0.83、0.84、0.85或0.86。
所述上限数字可以为0.85。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.85且下限为0.60和0.85之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77、0.78、0.79、0.80、0.81、0.82、0.83、0.84或0.85。
所述上限数字可以为0.84。因此,95%置信ROCAUC区间可以被定义为上限为0.84且下限为0.60和0.84之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77、0.78、0.79、0.80、0.81、0.82、0.83或0.84。
所述上限数字可以为0.83。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.83且下限为0.60和0.83之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77、0.78、0.79、0.80、0.81、0.82或0.83。
所述上限数字可以为0.82。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.82且下限为0.60和0.82之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77、0.78、0.79、0.80、0.81或0.82。
所述上限数字可以为0.81。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.81且下限为0.60和0.81之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77、0.78、0.79、0.80或0.81。
所述上限数字可以为0.80。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.80且下限为0.60和0.80之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77、0.78、0.79或0.80。
所述上限数字可以为0.79。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.79且下限为0.60和0.79之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77、0.78或0.79。
所述上限数字可以为0.78。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.78且下限为0.60和0.78之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76、0.77或0.78。
所述上限数字可以为0.77。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.77且下限为0.60和0.77之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75、0.76或0.77。
所述上限数字可以为0.76。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.76且下限为0.60和0.76之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74、0.75或0.76。
所述上限数字可以为0.75。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.75且下限为0.60和0.75之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73、0.74或0.75。
所述上限数字可以为0.74。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.74且下限为0.60和0.74之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72、0.73或0.74。
所述上限数字可以为0.73。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.73且下限为0.60和0.73之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71、0.72或0.73。
所述上限数字可以为0.72。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.72且下限为0.60和0.72之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70、0.71或0.72。
所述上限数字可以为0.71。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.71且下限为0.60和0.71之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69、0.70或0.71。
所述上限数字可以为0.70。因此,95%置信ROC AUC区间可以被定义为上限为0.70且下限为0.60和0.70之间的任何数字的范围。所述下限数字可以为0.60、0.61、0.62、0.63、0.64、0.65、0.66、0.67、0.68、0.69或0.70。
治疗和诊断方法
如本文使用,“治疗(treatment)”旨在指对个体实施的任何干预或程序,包括手术干预或药理学干预,例如化合物或药物的施用。可以出于疗效性(therapeutic)目的或为了预防性(preventative)或预防疾病性(prophylactic)目的实施任何此类治疗。
本发明还涵盖在基于本文所述的任何方法的CIN3和/或癌症,特别是宫颈癌和/或子宫内膜癌的阳性分类之后实施一个或多个治疗步骤。所述治疗可以被认为是“疗效性”治疗。
本发明还涵盖在基于本文所述的任何方法的CIN3和/或癌症的阴性分类或预测个体有癌症发展,特别是宫颈癌和/或子宫内膜癌的风险之后实施一个或多个治疗步骤。所述治疗可以被认为是“风险预防”、“预防性”或“预防疾病性”治疗。
本发明还涵盖在基于本文描述的任何方法的CIN3和/或癌症的阴性分类或预测个体有CIN3和/或癌症发展的风险之后,在个体中实施一个或多个治疗步骤,所述个体携带使其发展CIN3和/或癌症的风险增加的一种或多种突变。
因此,本发明涵盖了一种治疗癌症和/或CIN3患者的方法,其包括向所述患者施用化学疗法、放射、免疫疗法或本文所述的任何疗法;基于本文所述的任何测定方法,所述患者被确定为具有指示所述患者为癌症和/或CIN3阳性的癌症指数值,优选地,其中所述癌症是宫颈癌。
因此,本发明涵盖了一种治疗和/或预防个体中的CIN3和/或癌症的方法,所述方法包括:
a.通过实施本文所述的任一测定方法,通过评估所述个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展来评估所述个体的癌症状态;
b.基于所述评估向所述个体施用一种或多种疗效性或预防性治疗,
优选地,其中所述癌症是宫颈癌和/或子宫内膜癌,最优选宫颈癌。
因此,本发明涵盖了一种治疗和/或预防个体中的癌症的方法,所述方法包括:
a.通过评估所述个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展来评估所述个体的癌症状态包括:
i.提供取自所述个体的样本,所述样本包括DNA分子群体;
ii.在所述样本中的所述DNA分子群体中确定以下组的甲基化状态:
1.一个或多个CpG,其选自SEQ ID NO:1至5000中鉴定的CpG的组,其中所述CpG在核苷酸位置61至62处鉴定;和/或
2.一个或多个CpG,其选自由SEQ ID NO:5001至5418定义的一个或多个差异甲基化区域(DMR)的组,其中所述CpG由CG表示;
iii.基于所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态推导癌症指数值;和
iv.基于所述癌症指数值评估所述个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展,其中所述测定方法的特征在于具有0.60或更大的曲线下面积(AUC),如通过接受者操作特征(ROC)所确定的;
b.基于所述评估向所述个体施用一种或多种疗效性治疗,
优选地,其中所述癌症是宫颈癌和/或子宫内膜癌,最优选宫颈癌。
在本发明涵盖的任何治疗方法中,预测个体中的CIN3和/或癌症(优选地,其中所述癌症是宫颈癌和/或子宫内膜癌)的存在或发展的所述步骤可以涉及推导癌症指数值。
在本发明涵盖的任何治疗方法中,预测个体中的CIN3和/或癌症的存在或发展的所述步骤可以涉及使用本文所述的任一芯片。
在本发明涵盖的任何治疗方法中,对所述个体实施分层的所述步骤可以涉及根据本文所述的本发明的任一测定方法应用所述阈值中的任一个。
施用一种或多种治疗的所述步骤可以包括不同的治疗步骤,这取决于基于个体的CIN3和/或癌症状态或者他们患有CIN3和/或癌症的风险或基于CIN3和/或癌症发展,特别是宫颈癌和/或子宫内膜癌,最优选宫颈癌的风险对个体实施的分层。特别地,所施用治疗的侵入性程度可能会有所不同,这取决于基于个体的CIN3和/或癌症状态或者他们患有CIN3和/或癌症的风险或基于他们的CIN3和/或癌症发展风险对个体实施的分层。向所述个体施用的治疗可以包括本领域技术人员认为合适的任何治疗。
例如,当所述个体被评估为未患有CIN3和/或癌症、具有患CIN3和/或癌症的低风险或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述癌症指数值为约-0.530或更大并且小于-0.330,并且优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化β值时,所述个体根据癌症指数值实施一种或多种治疗,所述一种或多种治疗可以包括根据本文所述的本发明的测定方法的重复测定方法,优选地,其中所述重复测定方法在所述先前测定方法后约一年实施,优选地,其中所述癌症是宫颈癌和/或子宫内膜癌,最优选地,其中所述癌症是宫颈癌。
例如,当所述个体被评估为具有患CIN3和/或癌症的中等风险或具有CIN3和/或癌症发展的中等风险,并且其中所述癌症指数值为约-0.330或更大并且小于-0.170,并且优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化β值时,所述个体根据癌症指数值实施一种或多种治疗,所述一种或多种治疗可以包括人类乳头瘤病毒(HPV)状态的测试,并且其中:
1.当所述个体为HPV阳性时,所述一种或多种治疗可以包括阴道镜检查和任选的经阴道超声和/或子宫内膜活检以评估子宫内膜;或
2.当所述个体为HPV阴性时,所述一种或多种治疗可以包括根据本文所述的本发明的任一测定方法的重复测定方法,优选地,其中所述重复测定方法在所述先前测定方法后约一年实施,
优选地,其中所述癌症是宫颈癌和/或子宫内膜癌,最优选地,其中所述癌症是宫颈癌。
例如,当所述个体被评估为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述癌症指数值为约-0.170或更大,并且优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化β值时,所述个体根据癌症指数值实施一种或多种治疗,所述一种或多种治疗可以包括阴道镜检查,并且其中所述阴道镜检查为阴性,所述一种或多种治疗包括子宫内膜活检和宫腔镜检查。
例如,当所述个体被评估为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述癌症指数值为约:
a.5.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5768和/或SEQ ID NO:5712和/或SEQ ID NO:5740内的每个CpG;
b.1.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5765和/或SEQ ID NO:5709和/或SEQ ID NO:5737内的每个CpG;
c.2.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5759和/或SEQ ID NO:5703和/或SEQ ID NO:5731内的每个CpG;
d.5.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5785和/或SEQ ID NO:5729和/或SEQ ID NO:5757内的每个CpG;
e.4.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5763和/或SEQ ID NO:5707和/或SEQ ID NO:5735内的每个CpG;
f.4.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5781和/或SEQ ID NO:5725和/或SEQ ID NO:5753内的每个CpG;
g.1.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5769和/或SEQ ID NO:5713和/或SEQ ID NO:5741内的每个CpG;
h.1.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5766和/或SEQ ID NO:5710和/或SEQ ID NO:5738内的每个CpG;
i.4.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5761和/或SEQ ID NO:5705和/或SEQ ID NO:5733内的每个CpG;
j.4.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5779和/或SEQ ID NO:5723和/或SEQ ID NO:5751内的每个CpG;
k.4.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5764和/或SEQ ID NO:5708和/或SEQ ID NO:5736内的每个CpG;
l.5.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5772和/或SEQ ID NO:5716和/或SEQ ID NO:5744内的每个CpG;
m.2.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5773和/或SEQ ID NO:5717和/或SEQ ID NO:5745内的每个CpG;
n.1.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5778和/或SEQ ID NO:5722和/或SEQ ID NO:5750内的每个CpG;
o.5.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5767和/或SEQ ID NO:5711和/或SEQ ID NO:5739内的每个CpG;
p.5.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5774和/或SEQ ID NO:5718和/或SEQ ID NO:5746内的每个CpG;
q.大于0.000,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5760和/或SEQ ID NO:5704和/或SEQ ID NO:5732内的每个CpG;
r.4.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5771和/或SEQ ID NO:5715和/或SEQ ID NO:5743内的每个CpG;
s.2.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5762和/或SEQ ID NO:5706和/或SEQ ID NO:5734内的每个CpG;
t.7.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5780和/或SEQ ID NO:5724和/或SEQ ID NO:5752内的每个CpG;
u.6.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5776和/或SEQ ID NO:5720和/或SEQ ID NO:5748内的每个CpG;
v.5.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5783和/或SEQ ID NO:5727和/或SEQ ID NO:5755内的每个CpG;
w.6.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5782和/或SEQ ID NO:5726和/或SEQ ID NO:5754内的每个CpG;
x.6.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5784和/或SEQ ID NO:5728和/或SEQ ID NO:5756内的每个CpG;
y.5.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5777和/或SEQ ID NO:5721和/或SEQ ID NO:5749内的每个CpG;
z.2.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5786和/或SEQ ID NO:5730和/或SEQ ID NO:5758内的每个CpG;
aa.7.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5775和/或SEQ ID NO:5719和/或SEQ ID NO:5747内的每个CpG;或
bb.3.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5770和/或SEQ ID NO:5714和/或SEQ ID NO:5742内的每个CpG,
并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,所述个体根据其癌症指数值接受一种或多种治疗,所述一种或多种治疗包括阴道镜检查,并且其中所述阴道镜检查为阴性,所述一种或多种治疗包括子宫内膜活检,并且其中所述子宫内膜活检也为阴性,所述一种或多种治疗包括根据本文所述的本发明的任一测定方法的重复测定方法,优选地,其中所述重复测定方法在所述先前测定方法后约一年实施,或当所述个体的根据1至28的癌症指数值小于所述指定癌症指数值时,不向所述个体施用治疗。
在本文所述的任何测定方法中,可以以本领域技术人员理解的任何合适的间隔重复所述个体所接受的所述一种或多种治疗。例如,所述个体所接受的所述一种或多种治疗中的任何一种在初始施用后每月、每三个月、每六个月、每年或每两年重复一次。
其它示例性治疗包括癌症阳性诊断后的一种或多种外科手术、一种或多种化学治疗剂、一种或多种细胞毒性化学治疗剂、一种或多种放射治疗剂、一种或多种免疫治疗剂、一种或多种生物治疗剂、一种或多种抗激素治疗或上述的任意组合。
在本文描述的任何治疗方法中,可以向所述个体特别地施用表9中列举的治疗。由癌症指数值范围定义的四个亚组在表9中被指定为对应于优选的临床行动,包括强化筛查、治疗剂的施用和手术。
可以以足以预防、治疗、治愈、减轻或部分抑制癌症或其一种或多种症状的量向携带癌症或有癌症发展风险的个体施用癌症治疗。此类治疗可以实现癌症症状的严重程度降低和/或癌症指数值降低,或无症状期的频率或持续时间增加。足以实现这一点的治疗量被定义为“治疗有效量”。特定目的的有效量将取决于癌症的严重程度和/或个体的癌症指数值以及个体的体重和总体状况。如本文使用,术语“个体”包含任何人,优选地,其中所述人是女性。如本文使用,“治疗”被认为与“治疗剂”同义。
以下治疗剂可以仅基于个体的癌症风险或基于癌症风险和本文所述的任何其它治疗的组合而施用于个体。治疗剂可以例如通过化学缀合而直接附接到抗体。将试剂或标记与抗体缀合的方法是本领域已知的。例如,可以使用碳二亚胺缀合(Bauminger和Wilchek(1980)《酶学方法(Methods Enzymol.)》70,151-159)来将多种试剂(包含多柔比星)缀合到抗体或肽。水溶性碳二亚胺,1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺(EDC)特别适用于将功能部分缀合到结合部分。也可以使用将某一部分缀合到抗体的其它方法。例如,可以使用高碘酸钠氧化并随后实施适当反应物的还原烷基化,戊二醛交联也可以。然而,公认的是,无论选择哪种方法来生产本发明的缀合物,都必须确定抗体保持其靶向能力并且功能部分保持其相关功能。
细胞毒性部分可以为直接和/或间接细胞毒性。“直接细胞毒性”是指所述部分本身具有细胞毒性。“间接细胞毒性”是指所述部分尽管本身不具有细胞毒性,但可以诱导细胞毒性,例如通过其对其它分子的作用或通过对其的进一步作用。细胞毒性部分可以仅在胞内时具有细胞毒性,并且优选地在胞外时不具有细胞毒性。
细胞毒性化学治疗剂是本领域熟知的。细胞毒性化学治疗剂,例如抗癌剂,包含:烷化剂,包含氮芥类,例如二氯甲基二乙胺(HN2)、环磷酰胺、异环磷酰胺、美法仑(melphalan)(L-苯丙氨酸氮芥)和苯丁酸氮芥;乙烯亚胺和甲基三聚氰胺,如六甲基三聚氰胺、噻替哌(thiotepa);烷基磺酸酯类,如白消安(busulfan);亚硝基脲类,如卡莫司汀(carmustine,BCNU)、洛莫司汀(lomustine,CCNU)、司莫司汀(semustine,甲基-CCNU)和链脲菌素(链脲佐菌素);以及三氮烯类,如达卡巴嗪(decarbazine,DTIC;二甲基三氮杂咪唑-羧酰胺);抗代谢物(Antimetabolites),包括:叶酸类似物,如甲氨蝶呤(氨甲蝶呤);嘧啶类似物,如氟脲嘧啶(5-氟脲嘧啶;5-FU)、氟脲苷(氟脱氧脲苷;FUdR)和阿糖胞苷(胞嘧啶阿糖胞苷);以及嘌呤类似物和相关抑制剂,如巯嘌呤(6-巯嘌呤;6-MP)、硫鸟嘌呤(6-硫鸟嘌呤;TG)和喷司他汀(pentostatin)(2’-脱氧助间型霉素)。天然产物包括:长春花生物碱类,如长春碱(VLB)和长春新碱;表鬼臼毒素类,如依托泊苷(etoposide)和替尼泊苷(teniposide);抗生素类,如放线菌素(放线菌素D)、柔红霉素(daunorubicin)(道诺霉素(daunomycin);红比霉素(rubidomycin))、多柔比星(doxorubicin)、博莱霉素(bleomycin)、普卡霉素(plicamycin)(光辉霉素(mithramycin))和丝裂霉素(mitomycin)(丝裂霉素C);酶,如L-天冬酰胺酶;以及生物反应调节剂,如干扰素表型组(alphenome)。其它试剂包括:铂配位络合物,如顺铂(cis-DDP)和卡铂;蒽醌,如米托蒽醌(mitoxantrone)和蒽环霉素(anthracycline);取代脲,如羟基脲;甲基肼衍生物,如甲基苄肼(N-甲基肼,MIH);以及肾上腺皮质抑制剂,如米托坦(mitotane)(o,p’-DDD)和氨鲁米特(aminoglutethimide);紫杉醇及其类似物/衍生物;以及激素激动剂/拮抗剂,如氟他胺和他莫昔芬(tamoxifen)。
细胞毒性化学治疗剂可以是导致细胞死亡的细胞毒性肽或多肽部分。细胞毒性肽和多肽部分是本领域熟知的并且包含例如蓖麻毒素、相思豆毒素(abrin)、假单胞菌外毒素、组织因子等。将它们连接到如抗体等靶向部分的方法也是本领域已知的。其它核糖体失活蛋白在WO 96/06641中被描述为细胞毒性剂。假单胞菌外毒素也可以用作细胞毒性多肽。某些细胞因子,例如TNFα和IL-2,也可以用作细胞毒性剂。
如果以足够的剂量递送,某些放射性原子也可能具有细胞毒性。放射治疗剂可以包括放射性原子,其在使用中将足够量的放射性递送到靶部位从而具有细胞毒性。合适的放射性原子包含磷-32、碘-125、碘-131、铟-111、铼-186、铼-188或钇-90,或发射足够能量以破坏邻近细胞、细胞器或核酸的任何其它同位素。优选地,本发明的试剂中的同位素和放射性原子的密度使得大于4000cGy(优选至少6000、8000或10000cGy)的剂量被递送到靶部位,并且优选递送到靶部位处的细胞及其细胞器,特别是细胞核。
放射性原子可以以已知方式附接到抗体、其抗原结合片段、变体、融合物或衍生物。例如,EDTA或另一种螯合剂可以附接到结合部分并用于附接111In或90Y。酪氨酸残基可以直接用125I或131I标志物。
细胞毒性化学治疗剂可以是合适的间接细胞毒性多肽。在一个特别优选的实施例中,间接细胞毒多肽是具有酶活性并且可以将无毒和/或相对无毒的前药转化为细胞毒性药物的多肽。对于抗体,这种类型的系统通常被称为ADEPT(抗体导向酶前药疗法(Antibody-Directed Enzyme Prodrug Therapy))。所述系统要求抗体将酶部分定位到患者体内的期望部位,并在允许酶在所述部位定位一段时间后施用作为酶底物的前药,催化的最终产物即为细胞毒性化合物。所述方法的目的是使期望部位的药物浓度最大化,并使正常组织中的药物浓度最小化。在一个优选实施例中,细胞毒性部分能够将非细胞毒性前药转化为细胞毒性药物。
在本文所述的任何治疗方法中,所述个体所接受的所述一种或多种治疗可以重复一次或多次。可以以规律间隔重复所述一种或多种治疗。所述治疗施用的重复性可以取决于所施用的特定治疗。一些治疗可能需要比其它治疗更频繁地重复施用。技术人员会知道本领域已知的疗法所需的施用频率。所述一种或多种治疗可以每周、每两周、每三周、每四周、每月、每三个月、每六个月、每年、每两年、每三年、每四年或每五年重复一次。
在本文所述的任何方法中,当所述个体被评估为具有小于约-0.530的癌症指数值,并且优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化β值时,不向所述个体施用治疗。
在本文所述的任何方法中,当所述个体被评估为其具有的癌症指数值:
1.小于约5.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5768和/或SEQ ID NO:5712和/或SEQ ID NO:5740内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
2.小于约1.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5765和/或SEQ ID NO:5709和/或SEQ ID NO:5737内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
3.小于约2.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5759和/或SEQ ID NO:5703和/或SEQ ID NO:5731内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
4.小于约5.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5785和/或SEQ ID NO:5729和/或SEQ ID NO:5757内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
5.小于约4.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5763和/或SEQ ID NO:5707和/或SEQ ID NO:5735内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
6.小于约4.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5781和/或SEQ ID NO:5725和/或SEQ ID NO:5753内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
7.小于约1.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5769和/或SEQ ID NO:5713和/或SEQ ID NO:5741内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
8.小于约1.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5766和/或SEQ ID NO:5710和/或SEQ ID NO:5738内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
9.小于约4.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5761和/或SEQ ID NO:5705和/或SEQ ID NO:5733内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
10.小于约4.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5779和/或SEQ ID NO:5723和/或SEQ ID NO:5751内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
11.小于约4.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5764和/或SEQ ID NO:5708和/或SEQ ID NO:5736内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
12.小于约5.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5772和/或SEQ ID NO:5716和/或SEQ ID NO:5744内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
13.小于约2.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5773和/或SEQ ID NO:5717和/或SEQ ID NO:5745内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
14.小于约1.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5778和/或SEQ ID NO:5772和/或SEQ ID NO:5750内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
15.小于约5.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5767和/或SEQ ID NO:5711和/或SEQ ID NO:5739内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
16.小于约5.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5774和/或SEQ ID NO:5718和/或SEQ ID NO:5746内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
17.为0.000,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5760和/或SEQ ID NO:5704和/或SEQ ID NO:5732内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
18.小于约4.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5771和/或SEQ ID NO:5715和/或SEQ ID NO:5743内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
19.小于约2.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5762和/或SEQ ID NO:5706和/或SEQ ID NO:5734内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
20.小于约7.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5780和/或SEQ ID NO:5724和/或SEQ ID NO:5752内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
21.小于约6.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5776和/或SEQ ID NO:5720和/或SEQ ID NO:5748内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
22.小于约5.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5783和/或SEQ ID NO:5727和/或SEQ ID NO:5755内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
23.小于约6.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5782和/或SEQ ID NO:5726和/或SEQ ID NO:5754内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
24.小于约6.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5784和/或SEQ ID NO:5728和/或SEQ ID NO:5756内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
25.小于约5.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5777和/或SEQ ID NO:5721和/或SEQ ID NO:5749内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
26.小于约2.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5786和/或SEQ ID NO:5730和/或SEQ ID NO:5758内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
27.小于约7.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5775和/或SEQ ID NO:5719和/或SEQ ID NO:5747内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;或
28.小于约3.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5770和/或SEQ ID NO:5714和/或SEQ ID NO:5742内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗。
监测方法
本发明还提供了监测个体中的CIN3和/或癌症的存在或其存在或发展的风险的方法。
本发明上下文中的“监测”可以指对个体的CIN3和/或癌症状态、携带CIN3和/或癌症的风险或CIN3和/或癌症发展的风险的纵向评估。所述纵向评估可以根据本文所述的本发明的任何测定方法实施。这种纵向评估可以涉及实施本文所述的本发明的任何测定方法,以在未确定的时间窗过程中在超过一个时间点预测个体中的CIN3和/或癌症的存在或发展。所述时间窗可以是所述个体还活着的任何时间段。所述时间窗可能会持续到所述个体的一生。所述时间窗可能会持续到所述个体的CIN3和/或癌症状态、携带CIN3和/或癌症的风险或CIN3和/或癌症发展的风险低于某一水平。所述水平可以是特定癌症指数值。
因此,本发明涵盖了一种监测个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌,特别是宫颈癌和/或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展的方法,所述方法包括:
a.通过在第一时间点实施本文所述的本发明的任一测定方法来评估个体中是否存在CIN3和/或癌症或评估个体中的癌症发展以建立所述个体的CIN3和/或癌症状态;
b.通过在一个或多个其它时间点实施本文所述的本发明的任一测定方法来评估所述个体中是否存在CIN3和/或癌症或评估所述个体中的CIN3和/或癌症发展以建立所述个体的CIN3和/或癌症状态,优选地,其中步骤a和b中的所述个体的CIN3和/或癌症状态使用相同的测定方法实施评估;和
c.监测所述个体在时间点之间的CIN3和/或癌症状态的任何改变。
本发明还涵盖了一种监测个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌,特别是宫颈癌和/或子宫内膜癌)的存在、不存在或发展的方法,所述方法包括:
a.通过在第一时间点实施测定方法来评估个体中是否存在CIN3和/或癌症或评估个体中的癌症发展以建立所述个体的CIN3和/或癌症状态,其包括:
1.提供取自所述个体的样本,所述样本包括DNA分子群体;
2.在所述样本中的所述DNA分子群体中确定以下组的甲基化状态:
a.一个或多个CpG,其选自SEQ ID NO:1至5000中鉴定的CpG的组,其中所述CpG在核苷酸位置61至62处鉴定;和/或
b.一个或多个CpG,其选自由SEQ ID NO:5001至5418定义的一个或多个差异甲基化区域(DMR)的组,其中所述CpG由CG表示;
3.基于所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态推导癌症指数值;和
4.基于所述癌症指数值评估所述个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展,其中所述测定方法的特征在于具有0.60或更大的曲线下面积(AUC),如通过接受者操作特征(ROC)所确定的;
b.通过实施步骤a(1)至a(4)的测定方法或通过在一个或多个其它时间点实施本文所述的本发明的任一测定方法来评估所述个体中是否存在CIN3和/或癌症或评估所述个体中的癌症发展以建立所述个体的CIN3和/或癌症状态;和
c.监测所述个体在时间点之间的CIN3和/或癌症状态的任何改变。
在本文所述的任何监测方法中,基于癌症指数值评估个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展的所述步骤可以涉及阈值的应用。阈值可以提供个体的CIN3和/或癌症状态、患有CIN3和/或癌症的风险或个体的CIN3和/或癌症发展的风险的指示。例如,癌症指数值可以指示是否存在CIN3和/或癌症,或患有或发展CIN3和/或癌症的高风险或低风险。在本发明涵盖的任何监测方法中,预测个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展的所述步骤涉及推导癌症指数值。
本发明进一步涵盖了一种在多个时间点测量患者中的甲基化的方法,其包括:(a)通过在第一时间点实施本文所述的本发明的任一测定方法来评估个体中CIN3和/或癌症的存在、不存在或发展;(b)通过在一个或多个其它时间点实施本文所述的本发明的任一测定方法来评估所述个体中CIN3和/或癌症的存在、不存在或发展,和(c)检测(a)和(b)之间的差异甲基化状态。
在本文所述的任何监测方法中,取决于个体中的CIN3和/或癌症的存在或发展的风险,根据本发明涵盖和本文描述的任一治疗方法向所述个体施用一种或多种治疗,或其中所述个体的所述癌症指数值小于约-0.530,并且优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化β值,不向所述个体施用治疗。可以取决于基于个体的CIN3和/或癌症状态、携带CIN3和/或癌症的风险或基于他们的CIN3和/或癌症发展的风险对个体实施的分层来施用不同的治疗。所述方法可以进一步包括根据本文所述的治疗方法施用一种或多种治疗。
所述癌症指数值可以在任何两个或更多个时间点之间发生改变。出于这个原因,对个体的癌症指数值的纵向监测可能对例如癌症进展、癌症复发预防、癌症治疗功效或癌症功效的评估特别有益。
在本文所述的任何监测方法中,所述一个或多个其它时间点可以是任何合适的时间点。优选地,所述一个或多个其它时间点可以相隔合适的距离以实施足够频繁的筛查,以便预测个体中的癌症存在或发展的任何特别早发的病例。优选地,所述一个或多个其它时间点可以相隔合适的距离以评估一种或多种治疗的功效。优选地,所述一个或多个其它时间点可以相隔合适的距离以预测个体在成功的治疗过程之后是否仍然没有癌症。所述一个或多个其它时间点可以是约每月、约每两个月、约每三个月、约每四个月、约每五个月、约每六个月、约每七个月、约每八个月、约每九个月、约每十个月、约每十一个月、约每年、约每两年或每两年以上。
在本文所述的任何监测方法中,可以对所述一种或多种治疗实施改变,其中观察到对所述一种或多种治疗的正面反应或负面反应。可以根据本文所述的治疗方法改变治疗。如果所述个体的基于其癌症指数值的癌症状态或分层风险发生改变,则治疗可能会特别地发生改变。
在本发明涵盖的任何监测方法中,预测个体中的CIN3和/或癌症的存在或发展的所述步骤可以涉及使用本文所述的任一芯片。
生物样本
优选地对来自细胞的DNA实施本文所述的测定方法,所述细胞源自/获自其中保留了天然组织结构的组织样本,例如活检或包括来自组织表面的脱落细胞的样本。所述样本可以包括上皮细胞。所述样本可以特别地源自宫颈、阴道、颊区域、血液和/或尿液。所述样本优选地是宫颈液基细胞学检查样本,并且更优选地是宫颈涂片样本。
优选地,本文所述的用于评估个体中CIN3和/或癌症(特别是宫颈癌或子宫内膜癌,最优选宫颈癌)的存在、不存在或发展的任一测定方法包括提供取自所述个体的样本。优选地,所述个体是女性。
在本文所述的任何测定方法中,所述测定方法可以涵盖或不涵盖从所述个体获得所述样本的所述步骤。在不涵盖从所述个体获得所述样本的所述步骤的测定方法中,提供先前已获自所述个体的样本。
所述样本可以直接从所述个体提供用于分析,或可以源于储存的材料,例如冷冻、保存的、固定的或冷冻保存的材料。
在本文所述的任何测定方法中,所述样本可以自行采集或由任何合适的医疗专业人员采集。
在本文所述的任何测定方法中,所述样本可以包括细胞。所述样本可以包括遗传材料,例如DNA和/或RNA。
本文所述的任何测定方法可以涉及提供来自所述患者的生物样本作为用于甲基化分析的患者DNA源。
本文所述的任何测定方法可以涉及从先前已获自所述患者的生物样本获得患者DNA。
本文所述的任何测定方法可以涉及从所述患者获得生物样本作为用于甲基化分析的患者DNA源。所述样本可以自行采集或由任何合适的医疗专业人员采集。获得生物样本的程序包含活检。
用于样本分离和随后从此类细胞或组织样本提取和分离DNA以准备评估DNA甲基化的方法是本领域技术人员熟知的。在本文所述的测定方法或方法的上下文中,可以使用整个样本,或者可替代地,可以浓缩细胞或可以对细胞类型实施分级,以便仅将一种或多种细胞类型的子集应用于本测定方法或方法。可以使用任何合适的浓缩或分级方法。
癌症的类型
本文所述的方法可以应用于任何癌症。优选地,本文所述的方法可以应用于宫颈癌和/或子宫内膜癌,特别是宫颈癌。本文所述的方法最优选地应用于宫颈癌。
所述癌症可以是原发性癌症病变。所述癌症可以是继发性癌症病变。所述癌症可以是转移性病变。
在本文所述的测定方法中,其中所述测定方法用于评估3级宫颈上皮瘤变(CIN3)和/或宫颈癌的存在、不存在或发展,所述宫颈癌可以优选地是鳞状细胞癌、腺癌或腺鳞癌。本文所述的任何测定方法可以另外地或可替代地用于评估是否存在子宫内膜癌或评估其发展。
在本文所述的测定方法中,其中所述测定方法用于评估是否存在子宫内膜癌或评估其发展,所述子宫内膜癌可以优选地是子宫内膜样癌、子宫癌肉瘤、鳞状细胞癌、小细胞癌、移行细胞癌、浆液性癌、透明细胞癌、粘液性腺癌、未分化癌、去分化癌或浆液性腺癌。
芯片和试剂盒
本发明还涵盖能够区分如本文定义的CpG的甲基化和非甲基化形式的芯片;所述芯片可以包括对如本文定义的CpG的甲基化形式具有特异性的寡核苷酸探针和对如本文定义的CpG的非甲基化形式具有特异性的寡核苷酸探针。
在本文所述的任何芯片中,所述芯片可以包括对CpG组中的每个CpG的甲基化形式具有特异性的寡核苷酸探针和对所述组中的每个CpG的非甲基化形式具有特异性的寡核苷酸探针;其中所述组由选自SEQ ID NO:1至5418中鉴定的所述CpG的至少500个CpG组成。
所述组可以由选自SEQ ID NO:1至5418中鉴定的所述CpG的至少500个CpG组成,优选地,其中所述CpG包括SEQ ID NO:1至500中鉴定的所述CpG。
所述组可以由选自SEQ ID NO:1至5418中鉴定的所述CpG的至少1000个CpG组成,优选地,其中所述CpG包括SEQ ID NO:1至1000中鉴定的所述CpG。
所述组可以由选自SEQ ID NO:1至5418中鉴定的所述CpG的至少1500个CpG组成,优选地,其中所述CpG包括SEQ ID NO:1至1500中鉴定的所述CpG。
所述组可以由选自SEQ ID NO:1至5418中鉴定的所述CpG的至少2000个CpG组成,优选地,其中所述CpG包括SEQ ID NO:1至2000中鉴定的所述CpG。
所述组可以由选自SEQ ID NO:1至5418中鉴定的所述CpG的至少2500个CpG组成,优选地,其中所述CpG包括SEQ ID NO:1至2500中鉴定的所述CpG。
所述组可以由选自SEQ ID NO:1至5418中鉴定的所述CpG的至少3000个CpG组成,优选地,其中所述CpG包括SEQ ID NO:1至3000中鉴定的所述CpG。
所述组可以由选自SEQ ID NO:1至5418中鉴定的所述CpG的至少3500个CpG组成,优选地,其中所述CpG包括SEQ ID NO:1至3500中鉴定的所述CpG。
所述组可以由选自SEQ ID NO:1至5418中鉴定的所述CpG的至少4000个CpG组成,优选地,其中所述CpG包括SEQ ID NO:1至4000中鉴定的所述CpG。
所述组可以由选自SEQ ID NO:1至5418中鉴定的所述CpG的至少4500个CpG组成,优选地,其中所述CpG包括SEQ ID NO:1至4500中鉴定的所述CpG。
所述组可以由选自SEQ ID NO:1至5418中鉴定的所述CpG的至少5000个CpG组成,优选地,其中所述CpG是SEQ ID NO:1至5000中鉴定的所述CpG。
所述组可以由在SEQ ID NO:1至5000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的以及在SEQ ID NO:5001至5418中鉴定并由CG表示的所有CpG组成。
在一些实施例中,所述芯片不是Infinium MethylationEPIC BeadChip芯片或Illumina Infinium HumanMethylation450BeadChip芯片。
单独地或另外地,在一些实施例中,所述芯片的CpG特异性寡核苷酸探针的数量是482,000或更少、480,000或更少、450,000或更少、440,000或更少、430,000或更少、420,000或更少、410,000或更少、或400,000或更少、375,000或更少、350,000或更少、325,000或更少、300,000或更少、275,000或更少、250,000或更少、225,000或更少、200,000或更少、175,000或更少、150,000或更少、125,000或更少、100,000或更少、75,000或更少、50,000或更少、45,000或更少、40,000或更少、35,000或更少、30,000或更少、25,000或更少、20,000或更少、15,000或更少、10,000或更少、5,000或更少、4,000或更少、3,000或更少或2,000或更少。
所述CpG组可以包括本文描述的本发明的测定方法中定义的CpG的任何组。
本发明的芯片可以包括一个或多个寡核苷酸,所述寡核苷酸包括本发明的测定方法中定义的CpG的任何组,其中所述一个或多个寡核苷酸与所述芯片的相对应寡核苷酸探针杂交。
本发明还涵盖了一种用于制备本文所述的杂交芯片的方法,其包括使根据本发明的芯片与一组寡核苷酸接触,所述一组寡核苷酸包括本发明的测定方法中定义的CpG的任何组。
如本文定义的任何芯片可以包括在试剂盒中。所述试剂盒可以包括如本文定义的任何芯片以及使用说明。
本发明进一步涵盖了如本文定义的任何芯片在用于确定CpG的甲基化状态以预测个体中的癌症的存在或发展的任何测定方法中的用途。
以下实施例用于说明而非限制本发明。
实施例
在本文所述的实施例中,WID-CIN-指数是癌症指数值,其中所述指数值已通过在源自个体的给定样本的DNA分子群体中测定方法含有CpG的组的甲基化状态来确定,所述CpG选自在SEQ ID NO:1至5000中和/或在由SEQ ID NO:5001至5418定义的差异甲基化区域内鉴定的所述CpG。
在实施例内的一些情况下,由SEQ ID NO:1至5000定义的所有CpG已被包含在已被测定方法以获得癌症指数值的所述组中。此外,由SEQ ID NO:1至500定义的所述500个CpG中的特定CpG子选择已被包含在已被测定方法以获得癌症指数值的所述组中。在这些情况下,描述了所述癌症指数值区分CIN3和/或癌症阳性和CIN3和/或癌症阴性女性的能力,其中所述指数的区分能力由AUC和接受操作特征表征。
宫颈筛查目前正在从细胞学检查转向HPV测试。这将导致大规模筛查的灵敏度增加但特异性降低。迫切需要一种客观、自动化的测试,其能够不依赖于样本异质性和年龄而对HPV+ve女性实施准确分诊,同时还能够检测其它上皮性子宫癌。本发明人连同其它科学家已经表明了利用DNA甲基化标志物来鉴定患有浸润前或浸润性癌症的女性的可行性。临床使用DNA甲基化标志物来鉴定CIN3+高风险的女性受到以下几个因素的阻碍:
(i)检测CIN3或CIN 3+的灵敏度不佳,尤其是在HPV患病率显著较高的30岁以下的年轻女性中,并且因此,这些女性对高性能分诊测试的需求增加。例如,GynTect测试(利用六个基因的DNA甲基化)对CIN3的灵敏度为<30岁女性的35%以及≥30岁女性的76%,并且QIAsure(使用两个基因的甲基化)检测CIN3+的灵敏度为<30岁细胞学检查异常女性的37.5%以及≥30岁细胞学检查异常女性的89.3%。
(ii)低特异性,其也与年龄相关并且与细胞学检查相当,范围为≥30岁女性的76.6%至<30岁女性的87.8%。
(iii)缺乏数据,因此无法判断DNA甲基化标志物或标志物组是否能够鉴定出在评估时为细胞学检查-ve但在随后的几年中继续发展为CIN3+的HPV+ve女性。
使用基于队列的嵌套病例-对照设置,发明人旨在开发并验证宫颈液基细胞学检查样本中的DNA甲基化特征(被称为女性癌症风险鉴定CIN3指数,WID-CIN3-指数)。所述癌症指数值应能够诊断和预测CIN3+的未来风险。
材料和方法
宫颈液基细胞学检查样本采集
在瑞典首都斯德哥尔摩处理的所有宫颈液基细胞学检查样本都通过卡罗林斯卡大学医院的卡罗林斯卡大学实验室的最先进平台实施生物样本库保藏,如先前所述(Perskvist等人,2013)。自2013年以来,每年约150000个LBC几乎100%被压缩并在-27°下以600微升、96孔板格式储存。这允许完整细胞的保存以及DNA、RNA和蛋白质含量等的分析。生物样本库通过个体唯一的个人鉴定号(PIN)与瑞典健康登记基础设施相关联(Ludvigsson等人,2016)。
发明人定义了2013-2015年间参与宫颈筛查或临床指征测试的所有女性的队列,并将其与瑞典国家卫生和福利委员会的国家癌症登记局相关联,以鉴定这些年期间的在样本采集中发生的所有CIN3或侵入性宫颈癌(CIN3+)病例(n=来自n名女性的样本)。发明人利用此队列来鉴定:a)患有普遍CIN3+的所有女性,b)样本正常但在此后1-4年内诊断为CIN3+的所有女性,c)患有低级宫颈病变(所谓的CIN1-2)的所有女性,和d)年龄及日历年采样频率匹配的健康女性对照组,她们在国家癌症登记局中从未有过宫颈病变的记录。在2013-2015年期间,一些人群组被随机分配到HPV筛查,而一些人群组被随机分配到初级细胞学检查。发明人仔细平衡了每个样本集以反映这一事实。未记录HPV结果的所有样本在cobas48000测定方法(ref)(其在整个期间一直是公开招标的HPV测试平台)上实施了高性能HPV测试。发明人进一步将所有样本与国家宫颈筛查登记局(NKCx.se)中保存的全面、统一的细胞学检查诊断记录相关联。这使得能够分别通过高风险HPV阳性和细胞学检查状态对所有样本实施分层。
为了最大化DNA含量,我们在对病例-对照状态不知情的情况下对符合条件的所有生物样本库保藏样本小瓶实施了目视筛选,以确保存在可见的细胞沉淀。约1/3的样本有这种沉淀,这与病例-对照或CIN3/ICC状态无关。然后,发明人从每个样本中等分100微升用于UCL以实施甲基化分析。
样本处理和DNA提取
将650ul PBS添加到从卡罗林斯卡大学实验室生物样本库接收的每个100ul宫颈液基细胞学检查样本中,并以4,600rpm离心15分钟。小心地去除上清液,并用另外的750ulPBS洗涤沉淀。然后,将样本涡旋并再次以4,600rpm离心15分钟。在小心地去除第二次PBS洗液后,发明人将样本重悬于来自Nucleo-Mag Blood 200ul试剂盒(Macherey Nagel,目录号744501.4)的裂解缓冲液中,所述试剂盒与Hamilton Star液体处理平台结合使用以实施高通量DNA提取。使用Nanodrop-8000(Thermoscientific Inc.)测量DNA浓度和质量吸光度比。将提取的DNA在-80℃下储存直至进一步分析。
DNA甲基化芯片分析
将宫颈归一化为10-25ng/ul,并且将200-500ng总DNA在Hamilton Star液体处理平台上使用EZ-96DNA Methylation-Lightning试剂盒(Zymo Research Corp,目录号D5047)实施亚硫酸氢盐修饰。根据制造商的标准方案,在UCL Genomics的IlluminaInfiniumMethylation EPIC BeadChip(Illumina,加利福尼亚州,美国)上对8ul经修饰的DNA实施甲基化分析。
甲基化分析
所有甲基化微芯片数据通过相同的标准化管线实施处理。使用R包minfi加载原始数据。去除中值甲基化和未甲基化强度<9.5的任何样本。检测p值>0.01的任何探针被视为失效。从数据集去除失效探针>10%的任何样本以及失效率>10%的任何探针。使用作为impute R包的一部分的impute.knn函数,对来自失效探针的β值(数据集的约0.001%)实施估算。
从数据集去除非CpG探针(2,932),由Zhou等人鉴定的SNP相关探针(82,108)和chrY探针。去除另外6,102个遵循基础SNP的三峰甲基化特征的先前鉴定的探针。使用minfi单样本preprocessNoob函数实施背景强度校正和染料偏差校正。使用β混合分位数归一化(BMIQ)算法来实施探针偏差校正。
使用上皮细胞、成纤维细胞和免疫细胞参考数据集,使用EpiDISH算法估算每个样本中的免疫细胞污染的分数以及不同免疫细胞亚型的相对比例。将前1,000个最具可变性的探针(按标准偏差排名)用于主成分分析。实施了统计测试以鉴定板、sentrix位置、芯片处理日期、DNA创建日期、研究中心、免疫污染分数、年龄、类型(病例及对照)和前十个主要成分之间的任何异常关联。没有发现异常关联。
甲基化荧光检测反应设计
生成了两个CpG排名列表。第一个根据上皮δ-β估算值(病例和对照之间的宫颈上皮细胞中的甲基化的估算差值)实施排名。第二个根据p值(在针对免疫细胞比例和年龄调整后,从将病例与对照实施比较的线性模型推导出)实施排名。对于每个CpG,我们在鉴定出+/-500bp内的任何连续的CpG。发明人计算并绘制了通过此1000bp区域内的所有CpG的病例和对照中的平均甲基化。在目视检查前50个CpG(在两个排名列表中)后,我们根据以下标准鉴定了多个候选区域:
1.健康对照中的甲基化水平接近于零的区域。
2.对照内的变异性相对较低的区域。
3.病例中的甲基化水平升高的区域。
4.包含两个或更多个CpG位点的区域
分类器开发的统计分析
由免疫细胞带来的污染对差异甲基化位置(DMP)的鉴定提出了挑战,因为仅发生在上皮细胞中的差异甲基化在具有高IC的样本中有所减少,并且反之亦然。为了克服这一点,发明人对每个CpG位点的IC上的β值实施了线性回归,将线性模型分别适用于病例和对照。IC=0处的截取点被用作纯上皮细胞群中的病例和对照的平均β值的估算值。这些截取点之间的差异提供了上皮细胞中的δ-β估算值。IC=I处的截取点之间的差异提供了免疫细胞δ-β估算值。
使用R包glmnet以混合参数值α=0(岭(ridge)罚)和α=1(套索(lasso)罚)以及二项式响应类型来训练分类器。使用来自发现集数据集的数据来拟合分类器。通过获取具有最大上皮δ-β的CpG,然后获取具有最大免疫δ-β的CpG,然后获取第二大的上皮δ-β,依次类推(去除任何重复),生成了CpG的排名列表。使用来自排名CpG列表的前n个CpG作为分类器的输入。通过cv.glmnet函数在训练集内使用十折交叉验证以确定正则化参数λ的最佳值。使用AUC作为分类器性能的度量。袋外(out-of-bag)AUC估算值(基于非用于训练分类器的交叉验证折数)随训练期间用作输入的CpG的数量n而改变。n的最大值为10,000。
基于在发现集上获得的最高袋外AUC选择最佳分类器。一旦分类器最终确定,则将其应用于验证数据集。
将前n个CpG表示为β1,...,βn并将来自训练分类器的回归系数表示为w1,...,wn,则其中μ和σ被定义为发现集中的量/>的均值和标准偏差(即,指数在发现集中被缩放为具有零均值和单位标准偏差)。岛(开放海域)子组分通过将上述总和限制为位于如Illumina清单版本B4中定义的CpG岛(开放海域)中的CpG而获得。
实施例:
样本异质性和差异甲基化
对于发现集(图1),发明人从当时诊断出3级宫颈上皮内瘤变(CIN)(n=154)或浸润性癌症(n=6)(CIN3+)的169名细胞学检查+ve女性(164名HPV+ve和5名HPV-ve)以及来自卡罗林斯卡学院基于人群的宫颈细胞学检查生物样本库的年龄和日历年匹配的HPV+ve细胞学检查-ve女性(n=202)鉴定出宫颈液基细胞学检查样本
此前,发明人已发现,与对照相比,甲基化差异可能会因病例中的免疫细胞类型组成而不同。因此,发明人使用EpiDISH评估了每个宫颈细胞学检查样本中的细胞类型异质性的水平,EpiDISH是一种推断每个样本中的上皮细胞、成纤维细胞和七种免疫细胞亚型的相对比例的算法。CIN3+病例和对照之间的细胞类型分布大致相似,其中CIN2和CIN3+病例中的免疫细胞有所增加(图6a)。
在错误发现率调整后评估850,000个CpG位点,发明人发现在CIN3+病例和对照之间有158,434个CpG被显著差异甲基化(图6b),其中主要差异基于上皮细胞,并且在CIN3+病例中偏向高甲基化(图6c)。
区分指数的发展
为了推导被称为WID-CIN-指数的用以检测CIN3或侵入性宫颈癌的诊断性甲基化特征,发明人使用发现集中的岭和套索分类器将个体分类为CIN3+病例或对照。使用接受者操作特征曲线下的面积(AUC)作为预测性能的量度。根据CIN3+病例和对照之间的δ-β对CpG实施排名。
预测性能基于发现集中的10折交叉验证实施估算,并随用于训练分类器的CpG的数量的改变而实施评估。使用5,000个具有岭回归的CpG实现了0.98的最佳发现集AUC(图6d)。完全使用发现集来开发分类器,然后再将其应用于验证数据集。
发明人发现,所述指数在开放海域区域富集而在CpG岛大量减少(图6e)。岭回归组合了来自所有输入CpG的信息,而套索回归通常选择输入的较小子集。岭回归提供了始终如一的卓越性能,表明通过组合来自多个CpG位点的大量信号,可以最稳健地提取鉴别信号。
WID-测试的诊断能力的验证
为了评估WID-测试的诊断能力,发明人分析了一个独立的宫颈细胞学检查样本数据集,其由被诊断患有CIN3+的87名女性和111名HPV+对照组成(参见图1)。计算每位女性的WID-CIN3-指数(图2a),得到的AUC为0.92(95%CI:0.88-0.96)(图2b)。在75%和90%的特异性下,灵敏度分别为90%和78%。鉴别表现与免疫细胞比例无关(图7a)。由于WID-CIN3+-指数表现出年龄相关性(图7b),发明人分别评估了≤30岁和>30岁女性。与≤30岁女性(AUC 0.87;95%CI 0.78-0.95)相比,WID-CIN测试在>30岁女性(AUC 0.95;95%CI 0.91-0.99)中的表现更好(图2b)。发明人在HPV-ve/细胞学检查-ve对照的背景下进一步验证了WID-CIN测试的诊断有效性,并且获得了类似的表现(图7c)。
事实上,几乎所有CIN3+病例都可以在50%的特异性下被正确分类(无论年龄)(图2b),这表明WID-CIN测试明显优于细胞学检查。为了评估仅在细胞学检查+ve女性中评估时WID-CIN测试是否也更优越,以及它是否对CIN3+具有特异性,或者它是否也可以检测处HPV+ve/细胞学检查+ve女性(其在阴道镜评估和宫颈活检中表现出CIN1或CIN2),发明人分析了256个细胞学检查+ve样本,其中166个和90个在活检中分别显示为CIN1和CIN2(图2c)。发明人应用了导致CIN3+的100%灵敏度的截止值(即,针对<30岁和≥30岁女性,分别为-0.60和-0.56),这分别导致了39.5%和32.8%的真阴性率(图5a),指示高达40%的细胞学检查+ve女性不需要阴道镜评估或活检。HPV+ve女性的常规细胞学检查导致52%/75%的灵敏度/特异性,而p16/Ki-67双染细胞学检查导致显著改善的表现(75%/74%)。将检测CIN3+病例的灵敏度设置为75%并将所有HPV+ve女性纳入我们的诊断集中,这导致总体特异性为93.7%,并且<30岁和≥30岁女性的特异性分别为80%和97.5%(图5b)。
WID-测试的预测能力的验证
为了优化筛查的功效,不仅要鉴定当前患有CIN3+的女性,而且还要鉴定未来发展CIN3+的风险最高的那些女性。为了解决这一点,发明人分析了428名HPV+ve/细胞学检查-ve女性,其中210名在提供其样本后1至4年被诊断为CIN3+,218名在同一时期内保持无疾病(图1)。样本细胞类型组成与发现集大致相当(图8a)。为了使观察期达到令人满意的持续时间,发明人从早期提供样本并已随访四年的女性选择了样本,因此这些样本相较于用于发现和诊断验证的那些样本在生物样本库中的保存时间更长。有趣的是,较长的存储时间显著降低了WID-CIN-指数(图3a;p=0.044),使得无法应用与先前集合中所选择相同的WID-CIN-指数截止值。然而,在CIN3+诊断之前长达四年的这些细胞学检查-ve样本中,WID-CIN-指数升高(图3b),其中总体AUC为0.70(95%CI:0.65-0.75)(图3c)。与诊断集一样,相较于≤30岁女性(AUC 0.63;95%CI 0.55-0.7),>30岁女性(AUC 0.78;95%CI 0.72-0.84)的表现更好(图3c、8b)。
岛和开放海域CpG的表现的比较
尽管岛CpG的数量代表性不足(即,5,000个CpG中只有702个是岛CpG),但这些CpG在WID-CIN-指数中的权重最高。因此,发明人将WID-CIN-指数分解为仅基于702个CpG岛的子组分和基于3,411个开放海域CpG的子组分。岛子组分提供了极其强的信号,其对应于诊断验证集中的AUC 0.87(图9a、b)。它还在AUC为0.67的预测验证集中得到了稳健的验证(图9c、d)。相比之下,开放海域子组分由相对较弱的信号组成(诊断验证集中的AUC 0.76;图9e、f),所述信号在预测验证集中几乎完全丢失,这可能是由于与存储相关的退化(图9g、h)。
检测子宫内膜癌的能力
宫颈和子宫内膜上皮构成了苗勒氏管系统的一部分。因此,为了评估具有WID-CIN-指数阳性结果(其宫颈经阴道镜评估无异常)的女性是否患有潜在的子宫内膜癌,发明人在来自217名患有子宫内膜癌的女性和869名健康对照的宫颈细胞学检查样本中评估了WID-CIN-指数。子宫内膜癌的细胞类型组成与发现集大致相似(图10a)。发明人发现,WID-CIN-测试还可以以非常高的准确性鉴定患有子宫内膜癌的女性(AUC 0.88;95%CI:0.85-0.91)。所述测试在很大程度上与年龄无关(图10b),并且≤60岁女性的AUC为0.85(95%CI0.81-0.89),且老年女性的AUC为0.85(95%CI 0.79-0.91)(图4b)。
癌症指数值和临床行动
由癌症指数值范围定义的四个亚组在表9中被指定为对应于优选的临床行动,包括强化筛查、治疗剂的施用和手术。所述亚组基于来自内部验证集的对照样本。换言之,这些指数值将对照样本分成四个大小相等的组。通过将给定四分位数中的病例和对照的数量与第一四分位数(作为参考)实施比较来计算优势比。确定CIN3风险和子宫内膜癌风险的优势比。例如,第四个四分位数中的女性患CIN3的可能性是第一个四分位数中的女性的约104倍,患子宫内膜癌的可能性是第一个四分位数中的女性的约40多倍。
讨论
一般而言,宫颈癌筛查是医学,特别是肿瘤学领域最成功的案例之一。在此,发明人提供广泛的证据表明,客观的DNA甲基化特征,即WID-CIN-测试,作为对HPV+ve女性实施分诊的工具优于细胞学检查。发明人已经证明,WID-CIN-测试(i)将假阳性HPV+女性的数量减少了50%,(ii)没有鉴定出患有CIN1的女性,并且仅鉴定出一半患有CIN2的女性(即可能是如果之前未实施治疗则可能进展为CIN3+的那些),(iii)能够鉴定出长达四年后表现出CIN3+的HPV+ve女性(尽管细胞学检查呈阴性),并且(iv)还能够鉴定出大多数患有子宫内膜癌的女性。
尽管大量DNA甲基化标志物已经在宫颈液基细胞学检查样本中实施了鉴定和评估并且被认为是有前途的,但只有少数研究评估了这些标志物在筛查环境中的临床有效性。使用两个基因(即MAL和miR-124-2)的组合的DNA甲基化水平,Verhoef等人在一项前瞻性临床试验中证明,与细胞学检查分诊(74.8%)相比,通过DNA甲基化对HPV+ve女性实施分诊以某种方式降低了灵敏度(67.5%),并且需要几乎两倍的阴道镜检查转诊。由于这项研究是针对33岁或以上的女性实施的,因此这些甲基化标志物在更年轻女性中的表现会更差。尽管发明人也在WID-测试中观察到这种年龄依赖性的表现,但在年轻女性中,在75%的特异性下,灵敏度为80%。
迄今为止,宫颈液基细胞学检查样本的巨大异质性已被完全低估(特别是在DNA水平,包含在评估细胞学检查时在显微镜水平上不可见的来自细胞碎片的DNA),它们的上皮细胞和免疫细胞的高度可变性比例的范围从几乎没有免疫细胞到样本几乎完全由免疫细胞组成。发明人已经充分地实施评估并得出结论,WID-测试表现与样本异质性无关,因此在自行采集样本中可能同样表现良好。
我们观察到,WID-测试能够鉴定在宫颈液基细胞学检查样本中未表现出异常细胞但在长达四年后发展CIN3+的HPV+ve女性,这可能表明WID-测试不仅反映了表观遗传癌症计划,但实际上可能反映了感染HPV后进展为宫颈癌(前期)的个体倾向。为了检验这一假设,需要分析来自女性的HPV感染前的样本,以便评估WID-测试是否能在致癌物出现之前就预测疾病发展。
在此,发明人证明了DNA甲基化分类器(WID-CIN-测试)在鉴定患有CIN3+或具有患CIN3+的风险的HPV+ve女性方面的前所未有的表现。事实上,所述测试不仅鉴定了患有CIN3+的女性(在与HPV+ve或HPV-ve女性实施比较时同样如此),而且还鉴定了患有子宫内膜癌的女性,这强烈表明WID-CIN-测试应迅速引入并实施于临床领域中。
表9
表10
Claims (47)
1.一种用于评估个体中3级宫颈上皮内瘤变(CIN3)和/或癌症的存在、不存在或发展的测定方法,所述测定方法包括:
a.提供取自所述个体的样本,所述样本包括DNA分子群体;
b.在所述样本中的所述DNA分子群体中确定以下组的甲基化状态:
i.一个或多个CpG,其选自SEQ ID NO:1至5000中鉴定的CpG的组,其中所述CpG在核苷酸位置61至62处鉴定;和/或
ii.一个或多个CpG,其选自由SEQ ID NO:5001至5418定义的一个或多个差异甲基化区域(DMR)的组,其中所述CpG由CG表示;
c.基于所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态推导癌症指数值;和
d.基于所述癌症指数值评估所述个体中CIN3和/或癌症的存在、不存在或发展,优选地,其中所述癌症是宫颈癌;
其中所述测定方法的特征在于具有0.60或更大的曲线下面积(AUC),如通过接受者操作特征(ROC)所确定的。
2.根据权利要求1所述的测定方法,其中所述一个或多个CpG的组包括至少500个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.80的AUC。
3.根据权利要求2所述的测定方法,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至500中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的AUC。
4.根据权利要求1所述的测定方法,其中所述一个或多个CpG的组包括至少1000个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.80的AUC。
5.根据权利要求4所述的测定方法,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至1000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的AUC。
6.根据权利要求1所述的测定方法,其中所述一个或多个CpG的组包括至少1500个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.82的AUC。
7.根据权利要求6所述的测定方法,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至1500中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的AUC。
8.根据权利要求1所述的测定方法,其中所述一个或多个CpG的组包括至少2000个CpG,其选自在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.81的AUC。
9.根据权利要求8所述的测定方法,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至2000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的AUC。
10.根据权利要求1所述的测定方法,其中所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述5000个CpG,并且另外地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.92的AUC。
11.根据权利要求1至10中任一项所述的测定方法,其中在所述样本中的所述DNA分子群体中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定每个CpG的β值。
12.根据权利要求11所述的测定方法,其中基于所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态推导所述癌症指数值的所述步骤包括:
a.提供包括所述组中的每个CpG的所述甲基化β值的甲基化β值数据集;
b.提供能够从所述甲基化β值数据集生成所述癌症指数的数学模型;和
c.将所述数学模型应用于所述甲基化β值数据集,从而生成所述癌症指数。
14.根据权利要求1至13中任一项所述的测定方法,其中当所述个体的所述癌症指数值为约-0.331或更大时,所述个体被评估为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,或其中当所述个体的所述癌症指数值小于约-0.331时,所述个体被评估为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,优选地,其中:
a.所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少500个,并且其中灵敏度为至少87%,且特异性为至少49%;
b.所述一个或多个CpG的组包括由SEQ ID NO:1至500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少86%,且特异性为至少77%;
c.所述一个或多个CpG的组包括由SEQ ID NO:1至1000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少87%,且特异性为至少77%;或
d.所述一个或多个CpG的组包括由SEQ ID NO:1至1500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少89%,且特异性为至少76%;
优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化β值,更优选地,其中所述癌症是宫颈癌。
15.根据权利要求1至13中任一项所述的测定方法,其中当所述个体的所述癌症指数值为约-0.167或更大时,所述个体被评估为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,或其中当所述个体的所述癌症指数值小于约-0.167时,所述个体被评估为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,优选地,其中:
a.所述一个或多个CpG的组包括在SEQ ID NO:1至5000中在核苷酸位置61至62处鉴定的所述CpG中的至少500个,并且其中灵敏度为至少80%,且特异性为至少61%;
b.所述一个或多个CpG的组包括由SEQ ID NO:1至500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少77%,且特异性为至少90%;
c.所述一个或多个CpG的组包括由SEQ ID NO:1至1000定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少72%,且特异性为至少89%;或
d.所述一个或多个CpG的组包括由SEQ ID NO:1至1500定义并在核苷酸位置61至62处鉴定的至少所述CpG,并且其中灵敏度为至少78%,且特异性为至少91%;
优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化β值,更优选地,其中所述癌症是宫颈癌。
16.根据权利要求1或根据前述权利要求中任一项所述的测定方法,其中确定一个或多个CpG的组的甲基化状态的所述步骤包括确定由SEQ ID NO:5001至5418定义的一个或多个DMR的组中鉴定的由CG表示的一个或多个CpG的甲基化状态,任选地,其中所述一个或多个CpG的组包括所述DMR的组中鉴定的由CG表示的两个或更多个CpG、所述DMR的组中鉴定的由CG表示的三个或更多个CpG、所述DMR的组中鉴定的由CG表示的四个或更多个CpG、或由SEQID NO:5001至5418定义的所述DMR中鉴定的由CG表示的所有CpG。
17.根据权利要求16所述的测定方法,其中确定所述一个或多个CpG的组的甲基化状态的所述步骤包括确定在由SEQ ID NO:5001至5418定义的所述DMR中的任一个或多个内的由CG表示的所述CpG中的五个或更多个、六个或更多个、七个或更多个、八个或更多个、或九个或更多个、或所有的甲基化状态。
18.根据权利要求16或17所述的测定方法,其中确定一个或多个CpG的组的甲基化状态的所述步骤包括确定在以下范围内的由CG表示的所述CpG中的两个或更多个、三个或更多个、四个或更多个、五个或更多个、六个或更多个、七个或更多个、八个或更多个、或九个或更多个、或所有的甲基化状态:
a.DMR 1至418中的两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个或九个或更多个的任意组合;
b.DMR 1至418中的十个、二十个、三十个、四十个、五十个、六十个、七十个、八十个或九十个或更多个的任意组合;
c.DMR 1至418中的所有418个;
d.由SEQ ID NO:5001定义的一个DMR、由SEQ ID NO:5001至5002定义的两个DMR、由SEQID NO:5001至5003定义的三个DMR、由SEQ ID NO:5001至5004定义的四个DMR、由SEQ IDNO:5001至5005定义的五个DMR、由SEQ ID NO:5001至5006定义的六个DMR、由SEQ ID NO:5001至5007定义的七个DMR、由SEQ ID NO:5001至5008定义的八个DMR、或由SEQ ID NO:5001至5009定义的九个DMR;
e.由SEQ ID NO:5391、SEQ ID NO:5392、SEQ ID NO:5393、SEQ ID NO:5407和SEQ IDNO:5414定义的一个或多个DMR的任意组合,优选地,在所有SEQ ID NO:5391、SEQ ID NO:5392、SEQ ID NO:5393、SEQ ID NO:5407和SEQ ID NO:5414内;
f.由SEQ ID NO:5392、SEQ ID NO:5393和SEQ ID NO:5407定义的一个或多个DMR的任意组合,优选地,在所有SEQ ID NO:5392、SEQ ID NO:5393和SEQ ID NO:5407内;或
g.由SEQ ID NO:5001至5010定义的十个DMR、由SEQ ID NO:5001至5020定义的二十个DMR、由SEQ ID NO:5001至5030定义的三十个DMR、由SEQ ID NO:5001至5040定义的四十个DMR、由SEQ ID NO:5001至5050定义的五十个DMR、由SEQ ID NO:5001至5060定义的六十个DMR、由SEQ ID NO:5001至5070定义的七十个DMR、由SEQ ID NO:5001至5080定义的八十个DMR、或由SEQ ID NO:5001至5090定义的九十个DMR;
h.由SEQ ID NO:5001至5050、SEQ ID NO:5051至5100、SEQ ID NO:5101至5150、SEQ IDNO:5151至5200、SEQ ID NO:5201至5250、SEQ ID NO:5301至5350、或SEQ ID NO:5341至5418定义的五十个DMR;或
i.由SEQ ID NO:5015、5016、5017、5025、5026、5027、5028、5029、5032、5033、5048、5049、5050、5053、5054、5057、5068、5069、5071、5072、5073、5074、5075、5076、5077、5083、5090、5091、5092、5093、5094、5095、5096、5099、5102、5137、5138、5140、5143、5146、5147、5148、5149、5150、5151、5164、5165、5167、5175、5176、5177、5179、5180、5185、5204、5224、5226、5228、5232、5246、5248、5285、5287、5293、5307、5309、5315、5317、5324、5328、5337、5339、5340、5348、5349、5354、5361、5362、5366、5368和5377定义的八十一个DMR。
19.根据权利要求16至18中任一项所述的测定方法,其中确定一个或多个CpG的组的甲基化状态的所述步骤包括确定选自由如由SEQ ID NO:5001至5418定义的DMR 1至418组成的DMR群组的任一个或多个DMR内的一个或多个CpG的甲基化状态,包括:
1.在如由SEQ ID NO:5001定义的DMR 1内的并由CG表示的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.894的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
2.在如由SEQ ID NO:5002定义的DMR 2内的并由CG表示的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.894的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
3.在如由SEQ ID NO:5003定义的DMR 3内的并由CG表示的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.894的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
4.在如由SEQ ID NO:5004定义的DMR 4内的并由CG表示的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.894的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
5.在如由SEQ ID NO:5005定义的DMR 5内的并由CG表示的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.894的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
6.在如由SEQ ID NO:5006定义的DMR 6内的并由CG表示的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.876的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
7.在如由SEQ ID NO:5007定义的DMR 7内的并由CG表示的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.874的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
8.在如由SEQ ID NO:5008定义的DMR 8内的并由CG表示的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.874的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;
9.在如由SEQ ID NO:5009定义的DMR 9内的并由CG表示的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.874的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG;和/或
10.在如由SEQ ID NO:5010定义的DMR 10内的并由CG表示的一个或多个CpG,优选地,其中所述测定方法的特征在于具有至少0.874的ROC AUC,并且更优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括由[[CG]]表示的至少所述CpG。
20.根据权利要求16至19中任一项所述的测定方法,其中:
a.当所述个体的所述癌症指数为约0.016或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险;或
b.当所述个体的所述癌症指数小于约0.016时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症;
优选地,其中所述测定方法具有75%或更高的特异性,更优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的平均β值。
21.根据权利要求16至19中任一项所述的测定方法,其中:
a.其癌症指数值被确定的由CG表示的CpG位于由SEQ ID NO:5001定义的至少DMR 1内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.023或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 1的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5001中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
b.其癌症指数值被确定的由CG表示的CpG位于由SEQ ID NO:5001定义的至少DMR 1内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.023时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少70.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 1的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5001中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
c.其癌症指数值被确定的由CG表示的CpG位于由SEQ ID NO:5002定义的至少DMR 2内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.023或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 2的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5002中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
d.其癌症指数值被确定的由CG表示的CpG位于由SEQ ID NO:5002定义的至少DMR 2内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.023时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 2的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5002中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
e.其癌症指数值被确定的由CG表示的CpG位于由SEQ ID NO:5003定义的至少DMR 3内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.023或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 3的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5003中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
f.其癌症指数值被确定的由CG表示的CpG位于由SEQ ID NO:5003定义的至少DMR 3内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.023时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 3的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5003中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
g.其癌症指数值被确定的由CG表示的CpG位于由SEQ ID NO:5004定义的至少DMR 4内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.023或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 4的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5004中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
h.其癌症指数值被确定的由CG表示的CpG位于由SEQ ID NO:5004定义的至少DMR 4内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.023时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 4的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5004中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;
i.其癌症指数值被确定的由CG表示的CpG位于由SEQ ID NO:5005定义的至少DMR 5内,并且其中当所述个体的所述癌症指数为约0.023或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 5的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5005中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值;和/或
j.其癌症指数值被确定的由CG表示的CpG位于由SEQ ID NO:5005定义的至少DMR 5内,并且其中当所述个体的所述癌症指数小于约0.023时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,且所述测定方法的特异性为至少75.00%,优选地,其中所述一个或多个CpG的组包括来自DMR 5的至少十个CpG,并且更优选地,其中所述癌症指数值是SEQ ID NO:5005中的由[[CG]]表示的所述CpG的平均β值。
22.根据权利要求1或前述权利要求中任一项所述的测定方法,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤进一步包括或另外包括确定由SEQ ID NO:5703至5786鉴定的所述序列中的一个或多个内的每个CpG的甲基化状态。
23.根据权利要求22所述的测定方法,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定在以下范围内的每个CpG:
a.SEQ ID NO:5759和/或SEQ ID NO:5703和/或SEQ ID NO:5731,并且其中当所述癌症指数值为约1.146或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少95.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.96,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5759和/或SEQ IDNO:5703和/或SEQ IDNO:5731定义的序列的甲基化参考百分比;
b.SEQ ID NO:5759和/或SEQ ID NO:5703和/或SEQ ID NO:5731,并且其中当所述癌症指数值小于约1.146时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少95.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.96,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5759和/或SEQ ID NO:5703和/或SEQ IDNO:5731定义的序列的甲基化参考百分比;
c.SEQ ID NO:5760和/或SEQ ID NO:5704和/或SEQ ID NO:5732,并且其中当所述癌症指数值为约0.473或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,所述测定方法的特异性为至少85.00%,并且AUC为0.96,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5760和/或SEQ ID NO:5704和/或SEQ ID NO:5732定义的序列的甲基化参考百分比;
d.SEQ ID NO:5760和/或SEQ ID NO:5704和/或SEQ ID NO:5732,并且其中当所述癌症指数值小于约0.473时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少75.00%,所述测定方法的特异性为至少85.00%,并且AUC为0.96,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5760和/或SEQ ID NO:5704和/或SEQ ID NO:5732定义的序列的甲基化参考百分比;
e.SEQ ID NO:5761和/或SEQ ID NO:5705和/或SEQ ID NO:5733,并且其中当所述癌症指数值为约1.546或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少95.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.95,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5761定义的序列的甲基化参考百分比;
f.SEQ ID NO:5761和/或SEQ ID NO:5705和/或SEQ ID NO:5733,并且其中当所述癌症指数值小于约1.546时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少95.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.95,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5761和/或SEQ ID NO:5705和/或SEQ ID NO:5733定义的序列的甲基化参考百分比;
g.SEQ ID NO:5762和/或SEQ ID NO:5706和/或SEQ ID NO:5734,并且其中当所述癌症指数值为约1.645或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.94,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5762和/或SEQ ID NO:5706和/或SEQ ID NO:5734定义的序列的甲基化参考百分比;
h.SEQ ID NO:5762和/或SEQ ID NO:5706和/或SEQ ID NO:5734,并且其中当所述癌症指数值小于约1.645时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少85.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.94,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5762和/或SEQ ID NO:5706和/或SEQ ID NO:5734定义的序列的甲基化参考百分比;
i.SEQ ID NO:5763和/或SEQ ID NO:5707和/或SEQ ID NO:5735,并且其中当所述癌症指数值为约2.824或更大时,所述个体被归类为患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的高风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少90.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.94,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5763和/或SEQ ID NO:5707和/或SEQ ID NO:5735定义的序列的甲基化参考百分比;和/或
j.SEQ ID NO:5763和/或SEQ ID NO:5707和/或SEQ ID NO:5735,并且其中当所述癌症指数值小于约2.824时,所述个体被归类为未患有CIN3和/或宫颈癌或具有CIN3和/或宫颈癌发展的低风险,并且其中所述测定方法的灵敏度为至少90.00%,所述测定方法的特异性为至少75.00%,并且AUC为0.94,优选地,其中所述癌症指数值是由SEQ ID NO:5763和/或SEQ ID NO:5707和/或SEQ ID NO:5735定义的序列的甲基化参考百分比。
24.根据权利要求1至23中任一项所述的测定方法,其中在所述样本中的所述DNA分子群体中确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化状态的所述步骤包括:
a.实施测序步骤以确定每个CpG的序列;
b.将DNA与包括能够区分所述CpG的甲基化和非甲基化形式的探针的芯片杂交,并将检测系统应用于所述芯片以确定每个CpG的甲基化状态;和/或
c.使用甲基化特异性引物实施PCR步骤,其中所述CpG的甲基化状态通过PCR产物是否存在来确定。
25.根据权利要求1至24中任一项所述的测定方法,其中确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化状态的所述步骤包括:
a.亚硫酸氢盐转化所述DNA;或
b.实施以下步骤:将5-甲基胞嘧啶碱基(5mC)氧化为5-羧基胞嘧啶碱基(5caC),优选地通过10-11易位(TET),和/或将5-羟甲基胞嘧啶碱基(5hmC)氧化为5-羧基胞嘧啶碱基(5caC),优选地通过10-11易位(TET);然后将5-羧基胞嘧啶碱基(5caC)还原为二氢尿嘧啶碱基(DHU),任选地使用吡啶硼烷。
26.一种治疗或预防个体中的CIN3和/或宫颈癌的方法,所述方法包括:
a.通过实施根据权利要求1至25中任一项所述的测定方法评估所述个体中癌症的存在、不存在或发展来评估所述个体的CIN3和/或宫颈癌状态;
b.基于所述评估向所述个体施用一种或多种疗效性或预防性治疗。
27.根据权利要求26所述的方法,其中所述个体被评估为未患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的低风险,并且其中所述癌症指数值为约-0.530或更大并且小于约-0.330,并且优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化β值,所述个体根据其癌症指数值接受一种或多种治疗,所述一种或多种治疗包括根据权利要求1至25中任一项的重复测定方法,优选地,其中所述重复测定方法在先前测定方法后约一年实施。
28.根据权利要求26所述的方法,其中所述个体被评估为具有患CIN3和/或癌症的中等风险或具有CIN3和/或癌症发展的中等风险,并且其中所述癌症指数值为约-0.330或更大并且小于约-0.170,并且优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化β值,所述个体根据其癌症指数值接受一种或多种治疗,所述一种或多种治疗包括人类乳头瘤病毒(HPV)状态的测试,并且其中:
a.当所述个体为HPV阳性时,所述一种或多种治疗包括阴道镜检查和任选的经阴道超声和/或子宫内膜活检以评估子宫内膜;或
b.当所述个体为HPV阴性时,所述一种或多种治疗包括根据权利要求1至25中任一项的重复测定方法,优选地,其中所述重复测定方法在先前测定方法后约一年实施。
29.根据权利要求26所述的方法,其中所述个体被评估为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述癌症指数值为约-0.170或更大,并且优选地,其中所述测定方法包括确定所述一个或多个CpG的组中的每个CpG的甲基化β值,所述个体根据其癌症指数值接受一种或多种治疗,所述一种或多种治疗包括阴道镜检查,并且其中所述阴道镜检查为阴性,所述一种或多种治疗包括子宫内膜活检和宫腔镜检查。
30.根据权利要求26所述的方法,其中所述个体被评估为患有CIN3和/或癌症或具有CIN3和/或癌症发展的高风险,并且其中所述癌症指数值为约:
a.5.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5768和/或SEQ ID NO:5712和/或SEQ ID NO:5740内的每个CpG;
b.1.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5765和/或SEQ ID NO:5709和/或SEQ ID NO:5737内的每个CpG;
c.2.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5759和/或SEQ ID NO:5703和/或SEQ ID NO:5731内的每个CpG;
d.5.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5785和/或SEQ ID NO:5729和/或SEQ ID NO:5757内的每个CpG;
e.4.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5763和/或SEQ ID NO:5707和/或SEQ ID NO:5735内的每个CpG;
f.4.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5781和/或SEQ ID NO:5725和/或SEQ ID NO:5753内的每个CpG;
g.1.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5769和/或SEQ ID NO:5713和/或SEQ ID NO:5741内的每个CpG;
h.1.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5766和/或SEQ ID NO:5710和/或SEQ ID NO:5738内的每个CpG;
i.4.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5761和/或SEQ ID NO:5705和/或SEQ ID NO:5733内的每个CpG;
j.4.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5779和/或SEQ ID NO:5723和/或SEQ ID NO:5751内的每个CpG;
k.4.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5764和/或SEQ ID NO:5708和/或SEQ ID NO:5736内的每个CpG;
l.5.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5772和/或SEQ ID NO:5716和/或SEQ ID NO:5744内的每个CpG;
m.2.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5773和/或SEQ ID NO:5717和/或SEQ ID NO:5745内的每个CpG;
n.1.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5778和/或SEQ ID NO:5722和/或SEQ ID NO:5750内的每个CpG;
o.5.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5767和/或SEQ ID NO:5711和/或SEQ ID NO:5739内的每个CpG;
p.5.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5774和/或SEQ ID NO:5718和/或SEQ ID NO:5746内的每个CpG;
q.大于0.000,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5760和/或SEQ ID NO:5704和/或SEQ ID NO:5732内的每个CpG;
r.4.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5771和/或SEQ ID NO:5715和/或SEQ ID NO:5743内的每个CpG;
s.2.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5762和/或SEQ ID NO:5706和/或SEQ ID NO:5734内的每个CpG;
t.7.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5780和/或SEQ ID NO:5724和/或SEQ ID NO:5752内的每个CpG;
u.6.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5776和/或SEQ ID NO:5720和/或SEQ ID NO:5748内的每个CpG;
v.5.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5783和/或SEQ ID NO:5727和/或SEQ ID NO:5755内的每个CpG;
w.6.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5782和/或SEQ ID NO:5726和/或SEQ ID NO:5754内的每个CpG;
x.6.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5784和/或SEQ ID NO:5728和/或SEQ ID NO:5756内的每个CpG;
y.5.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5777和/或SEQ ID NO:5721和/或SEQ ID NO:5749内的每个CpG;
z.2.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5786和/或SEQ ID NO:5730和/或SEQ ID NO:5758内的每个CpG;
aa.7.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5775和/或SEQ ID NO:5719和/或SEQ ID NO:5747内的每个CpG;或
bb.3.000或更大,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5770和/或SEQ ID NO:5714和/或SEQ ID NO:5742内的每个CpG,
并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比,所述个体根据其癌症指数值接受一种或多种治疗,所述一种或多种治疗包括阴道镜检查,并且其中所述阴道镜检查为阴性,所述一种或多种治疗包括子宫内膜活检,并且其中所述子宫内膜活检也为阴性,所述一种或多种治疗包括根据权利要求1至25中任一项的重复测定方法,优选地,其中所述重复测定方法在所述先前测定方法后约一年实施。
31.根据权利要求26至30中任一项所述的方法,其中所述个体所接受的所述一种或多种治疗在初始施用后每月、每三个月、每六个月、每年或每两年重复一次。
32.一种根据个体的癌症指数值监测个体的CIN3和/或癌症状态的方法,所述方法包括:(a)通过在第一时间点实施根据权利要求1至25中任一项所述的测定方法来评估个体中CIN3和/或癌症的存在、不存在或发展;(b)通过在一个或多个其它时间点实施根据权利要求1至25中任一项所述的测定方法来评估所述个体中CIN3和/或癌症的存在、不存在或发展;和(c)监测所述个体在时间点之间的癌症指数值和/或CIN3和/或癌症状态的任何改变。
33.根据权利要求32所述的方法,其中所述其它时间点是初始评估后的每月、每三个月、每六个月、每年或每两年。
34.根据权利要求32或33所述的方法,其中取决于所述个体的癌症状态,根据权利要求26至30中任一项向所述个体施用一种或多种治疗,或者当所述个体的所述癌症指数值:
a.小于约5.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5768和/或SEQ ID NO:5712和/或SEQ ID NO:5740内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
b.小于约1.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5765和/或SEQ ID NO:5709和/或SEQ ID NO:5737内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
c.小于约2.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5759和/或SEQ ID NO:5703和/或SEQ ID NO:5731内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
d.小于约5.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5785和/或SEQ ID NO:5729和/或SEQ ID NO:5757内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
e.小于约4.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5763和/或SEQ ID NO:5707和/或SEQ ID NO:5735内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
f.小于约4.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5781和/或SEQ ID NO:5725和/或SEQ ID NO:5753内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
g.小于约1.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5769和/或SEQ ID NO:5713和/或SEQ ID NO:5741内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
h.小于约1.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5766和/或SEQ ID NO:5710和/或SEQ ID NO:5738内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
i.小于约4.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5761和/或SEQ ID NO:5705和/或SEQ ID NO:5733内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
j.小于约4.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5779和/或SEQ ID NO:5723和/或SEQ ID NO:5751内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
k.小于约4.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5764和/或SEQ ID NO:5708和/或SEQ ID NO:5736内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
l.小于约5.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5772和/或SEQ ID NO:5716和/或SEQ ID NO:5744内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
m.小于约2.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5773和/或SEQ ID NO:5717和/或SEQID NO:5745内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
n.小于约1.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5778和/或SEQ ID NO:5772和/或SEQ ID NO:5750内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
o.小于约5.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5767和/或SEQ ID NO:5711和/或SEQ ID NO:5739内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
p.小于约5.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5774和/或SEQ ID NO:5718和/或SEQ ID NO:5746内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
q.为0.000,优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5760和/或SEQ ID NO:5704和/或SEQ ID NO:5732内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
r.小于约4.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5771和/或SEQ ID NO:5715和/或SEQ ID NO:5743内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
s.小于约2.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5762和/或SEQ ID NO:5706和/或SEQ ID NO:5734内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
t.小于约7.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5780和/或SEQ ID NO:5724和/或SEQ ID NO:5752内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
u.小于约6.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5776和/或SEQ ID NO:5720和/或SEQ ID NO:5748内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
v.小于约5.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5783和/或SEQ ID NO:5727和/或SEQ ID NO:5755内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
w.小于约6.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5782和/或SEQ ID NO:5726和/或SEQ ID NO:5754内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
x.小于约6.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5784和/或SEQ ID NO:5728和/或SEQ ID NO:5756内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
y.小于约5.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5777和/或SEQ ID NO:5721和/或SEQ ID NO:5749内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
z.小于约2.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5786和/或SEQ ID NO:5730和/或SEQ ID NO:5758内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;
aa.小于约7.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5775和/或SEQ ID NO:5719和/或SEQ ID NO:5747内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗;或
bb.小于约3.000,并且优选地,其中确定所述组中的所述一个或多个CpG的甲基化状态的所述步骤包括确定SEQ ID NO:5770和/或SEQ ID NO:5714和/或SEQ ID NO:5742内的每个CpG,并且更优选地,其中所述测定方法包括确定由所述指定SEQ ID NO定义的所述序列的甲基化参考百分比时,不向所述个体施用治疗。
35.根据权利要求32至34中任一项所述的方法,其中所述癌症指数值的增加指示对所述一种或多种治疗的负面反应。
36.根据权利要求35所述的方法,其中如果鉴定出负面反应,则对所述一种或多种治疗实施改变。
37.根据权利要求32至34中任一项所述的方法,其中所述癌症指数值的降低指示对所述一种或多种治疗的正面反应。
38.根据权利要求38所述的方法,其中如果鉴定出正面反应,则对所述一种或多种治疗实施改变。
39.根据前述权利要求中任一项所述的测定方法,其中所述样本获自包括上皮细胞的组织,优选地,其中所述样本不获自卵巢或子宫内膜组织。
40.根据权利要求42所述的测定方法,其中所述样本获自:
a.宫颈组织;
b.阴道组织;
c.宫颈阴道组织;
d.颊组织;
优选地,其中所述样本获自宫颈组织,最优选地,其中所述样本获自来自宫颈涂片的组织。
41.根据前述权利要求中任一项所述的测定方法,其中所述测定方法用于评估以下的存在、不存在或发展:
a.3级宫颈上皮瘤变(CIN3)和/或宫颈癌,特别地,其中所述宫颈癌是鳞状细胞癌、腺癌或腺鳞癌;
b.子宫内膜癌,优选地,其中所述子宫内膜癌是子宫内膜样癌、子宫癌肉瘤、鳞状细胞癌、小细胞癌、移行细胞癌、浆液性癌、透明细胞癌、粘液性腺癌、未分化癌、去分化癌或浆液性腺癌。
42.一种能够区分CpG的甲基化和非甲基化形式的芯片;所述芯片包括对于CpG组中的每个CpG的甲基化形式具有特异性的寡核苷酸探针和对于所述组中的每个CpG的非甲基化形式具有特异性的寡核苷酸探针;其中所述组由至少500个CpG组成,其选自在SEQ ID NO:1至5000中鉴定并在核苷酸位置61至62处鉴定的以及在SEQ ID NO:5001至5418中鉴定并由CG表示的CpG。
43.根据权利要求42所述的芯片,条件是所述芯片不是Infinium MethylationEPICBeadChip芯片或Infinium HumanMethylation450,和/或条件是所述芯片的CpG特异性寡核苷酸探针的数量是482,000或更少、480,000或更少,450,000或更少、440,000或更少、430,000或更少、420,000或更少、410,000或更少或400,000或更少。
44.根据权利要求42或43所述的芯片,其中所述组包括根据权利要求1至25中任一项所述的测定方法中定义的CpG的任何组。
45.根据权利要求42至44中任一项所述的芯片,其进一步包括一个或多个寡核苷酸,所述寡核苷酸包括根据权利要求1至25中任一项所述的测定方法中定义的CpG的任何组,其中所述一个或多个寡核苷酸与所述芯片的相对应寡核苷酸探针杂交。
46.一种杂交芯片,其中所述芯片能通过将一组寡核苷酸与根据权利要求42至45中任一项所述的芯片杂交获得,所述一组寡核苷酸包括根据权利要求1至24中任一项所述的测定方法中定义的CpG的任何组。
47.一种用于制备根据权利要求46所述的杂交芯片的方法,其包括使根据权利要求42至45所述的芯片与一组寡核苷酸接触,所述一组寡核苷酸包括根据权利要求1至25中任一项所述的测定方法中定义的CpG的任何组。
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