CN116162745A - 一种核酸分子杂交仪程序组件的控制方法及系统 - Google Patents

一种核酸分子杂交仪程序组件的控制方法及系统 Download PDF

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Abstract

本发明提出一种核酸分子杂交仪程序组件的控制方法及系统，涉及网络应用的技术领域，首先，运行核酸分子杂交仪本地程序组件，确认程序组件合法性，程序组件由自定义的多个段组成，含有命令域和参数域，采用明文语言描述，便于调整；然后对程序组件进行解析，将核酸分子杂交自动化过程封装于程序组件中，将程序组件的各个段的命令域与核酸分子杂交仪的逻辑框架表进行匹配，编译产生核酸分子杂交仪的指令集，最后执行指令集中的指令，并根据需求，适时进行交互，逻辑框架表通俗易懂，整个实现核酸分子杂交仪程序组件的控制过程易读、易调整，无需程序员调整代码的自动化控制，适合非从事专业程序工作的现场生物技术人员和实验员使用。

Description

一种核酸分子杂交仪程序组件的控制方法及系统
技术领域
本发明涉及网络应用的技术领域，更具体地，涉及一种核酸分子杂交仪程序组件的控制方法及系统。
背景技术
核酸分子杂交技术是指互补的核苷酸序列(DNA与DNA、DNA与RNA、RNA与RNA等)通过Watson-Crick碱基配对形成非共价键，从而形成稳定的同源或异源双链分子的过程。
随着现代工业发展对机器人和自动化处理日益增长的需求，各行各业特别是化学、生物行业对试验自动化要求越来越高。伴随着生物医药领域的发展，应用核酸分子杂交技术的核酸分子杂交仪成为药物筛选、基因表达分析以及临床诊断的一种十分有效的工具。一般核酸分子杂交仪包括：机壳、机械臂、水泵、移液模块、杂交反应室、界面UI模块、解析器模块、电磁阀、加热器等，能实现自动化，按照设定的程序进行实验试剂、水、酶、显色液，开泵，关泵等自动化操作。如现有技术中提出了一种核酸杂交反应平台及杂交分析方法，以程序控制的正压和负压作为驱动力促使待检测样品在杂交通道中自动地往复穿梭流动，杂交过程通过程序控制，无须人工操作，但核酸分子杂交实验需由取得PCR职业资格的实验员进行，而核酸分子杂交仪是由软件程序进行控制的，对全自动仪器软件的设计、参数设置、运行程序是由程序员负责的，因此，整个杂交实验过程由专业实验员和专业的仪器程序员共同完成，但是程序员是不可以进入实验室的，也是不能操作仪器进行实验的，因此，核酸分子杂交仪只能专机专用，程序不能编辑，实验员无法因试剂的要求，自由编辑程序。
此外，核酸分子杂交仪的人机交互涉及专业程序语言，而仪器升级需由厂家技术人员完成。整体上程序组件不易读、调整困难，不太适合非从事专业程序工作的现场生物技术人员的使用。
发明内容
为解决当前核酸分子杂交仪程序组件可编辑性差，编辑调整专业性要求高的问题，本申请提出了一种核酸分子杂交仪程序组件的控制方法及系统，控制过程程序组件易读、易调整，无需程序员调整代码，适合非从事专业程序工作的现场生物技术人员和实验员使用。
为了达到上述技术效果，本发明的技术方案如下：
一种核酸分子杂交仪程序组件的控制方法，所述方法包括以下步骤：
S1.运行核酸分子杂交仪本地程序组件，确认程序组件合法性，程序组件由自定义的多个段组成，含有命令域和参数域；
S2.对程序组件进行解析，将核酸分子杂交自动化过程封装于程序组件中；
S3.将程序组件的各个段的命令域与核酸分子杂交仪的逻辑框架表进行匹配，编译产生核酸分子杂交仪的指令集；
S4.执行指令集中的指令，并根据需求，适时进行指令之前的交互、指令间的信息交互及不同指令集之间的核酸分子杂交仪机械运动逻辑的配合。
优选地，所述程序组件采用中文描述性明文语言，方便进行调整。
优选地，所述程序组件由一个命令域和多个参数域构成，一个命令域和多个参数域构成构成一项命令模块，以段的形式表达，域与域之间利用“┃”符号进行切割，每个程序组件的第一个域必须是命令域，后续的域根据命令域的不同，参数域数据格式、意义、参数域的个数有所不同。
在此，程序组件各段的顺序的调整、增加或者减少，只需要移动、增加或删除段，能根据要求用户便捷的进行修改。
优选地，命令域运行逻辑内容包括核酸分子杂交仪机械臂的XYZ轴坐标、水泵、电磁阀打开关闭的时长、加热器温度设置、原点偏移、试剂加热、等候试剂到达温度、压扣、反应室控温、正向加试剂、开泵、提示框、等待、反向加试剂。
优选地，在步骤S1中，确认程序合法性的过程为：
S11.对本地程序组件进行过滤，逐行读取，一行为一个段，一行以“/n/r”转义字符结束；
S12.以“//”开头的段和空白段跳过不需要进行解析，对非程序组件命令域即系统程序无法识别的命令域进行提示。
S13.解析器模块将程序组件以流的形式进行处理，将流以”|”符号进行分割，并统计参数域的个数，如果参数域的个数与核酸分子杂交仪的逻辑框架表中规定的个数不同则报错；
逻辑框架表内依次定义了“命令域”内容、运行序号及运行序号对应的运行子逻辑，一个命令域对应多行运行序号及运行子逻辑，逻辑框架表为硬编码，无法修改，核酸分子杂交仪的逻辑框架表内保存着所有合法的自定义的段，逻辑框架表内还定义了命令域正常运行所需的参数个数，如果段的参数个数与逻辑框架表不一致，则程序组件为不合法的段；
若在本地程序组件的命令域查找且逻辑框架表内没有匹配时，则本地程序组件的命令域为无法识别的命令域。
在此，通过逻辑框架表通俗易懂的限定了运行序号与运行子逻辑，并且无复杂的程序语言，通俗易懂。
优选地，逻辑框架表的命令域包括“正向加试剂”、“开泵”，其中，“正向加试剂”对应运行序号为“1”、“2”、“3”、“4”、“5”、“6”、“7”；“开泵”对应运行序号为“1”、“2”；在“正向加试剂”命令域中，运行序号“1”对应的运行子逻辑为“读取域2，将预计运行时间发送给界面UI模块”，运行序号“2”对应的运行子逻辑为“读取域3，将提示信息发送给界面UI模块”，运行序号“3”对应的运行子逻辑为“读取域8，如果模式为1或3时，读取域4，移动到指定X,Y,Z轴坐标，移液模块取枪头；如果模式为0或2时，移液模块不取枪头”，运行序号“4”对应的运行子逻辑为“读取域5，移动到指定X,Y,Z轴坐标，移液模块取枪头；读取域9，吸取需要注入反应室的液体体积”，运行序号“5”对应的运行子逻辑为“读取域6，移动到指定X,Y,Z轴坐标；读取域9，移液模块注入液体到反应室”，运行序号“6”对应的运行子逻辑为“读取域7，一吸多吐进用”，运行序号“7”对应的运行子逻辑为“读取域8，如果模式为1或0时，移液模不退出枪头，如果模式为2或3时，移液模退出枪头”；在“开泵”命令域中，运行序号“1”对应的运行子逻辑为“读取域4和6，形成开泵时间为28秒，开泵速度为默认速度”，运行序号“2”对应的运行子逻辑为“读取域5，开阀时间长为5秒”。
优选地，在步骤S3中，将程序组件的各个段的命令域与核酸分子杂交仪的逻辑框架表进行匹配时，按顺序通过命令域搜索逻辑框架表，对应找到命令域所在行的指令集，实现将参数域的参数同步匹配到逻辑框架表中的运行子逻辑，形成指令集，指令集需要的参数从段中获取。
优选地，同步匹配到逻辑框架表中的运行子逻辑，形成指令集的操作过程为：
S31.判断命令域是否为“正向加试剂”，若是，则执行步骤S32；否则，执行步骤S35；
S32.参数域2表示当前段运行时长，将此参数匹配到运行的倒计时指令，提示用户；参数域3表示当前段的实验步骤说明，解析器将提示信息指令和参数域3指定信息整合成指令，发送在界面UI模块，显示参数域3指定的信息，提示用户；参数域9表示吸头模式，可设定为“1”，“0”，“2”，“3”中的一种，表示整移液体过程运行不同有取吸头方式；参数域4表示耗材吸头的XYZ轴坐标位置，将这些参数匹配到各轴电机运动控制指令，将移液体模块运动到耗材吸头架位置，进行移耗材洗头的获取；参数域5表示试剂槽的XYZ轴坐标位置，将这些参数匹配到各轴电机运动控制指令，将移液体模块运动到试剂槽位置，吸取试剂液体；
S33.读取已经运行的“开泵”段在参数域5设置好的信号量，如果已经设置了信号量则机器等待30秒，清除信号量,然后往下运行；
S34.参数域6、7、8分别表示杂交反应室的XYZ轴坐标位置、反应室孔间距、加入反应室的液体的量，将这些参数匹配到一组各轴电机连续运动控制指令，将吸取的液体按参数域8的设定均匀的加到杂交反应室内；
S35.判断命令域是否为“开泵”，若是，则执行步骤S36；否则，等待；
S36.参数域2表示当前段运行时长，将此参数匹配到运行的倒计时指令，提示用户；参数域3表示当前段的实验步骤说明，将此参数匹配到发送UI信息指令，将信息显示在界面UI模块上，提示用户；参数域4表示打开泵的时长，将参数匹配到泵的开关指令，将反应室的液体通过管道排出，找开泵时间达到指定时长后关闭泵；参数域5表示打开泄压阀的时长，将参数匹配到泄压阀的开关指令，反应室内为密闭空间会因泵的抽吸而产生负压，打开泄压阀使空气进入，达到指定时间后关闭阀；参数域6表示信号量，在运行当前段后，系统是否记录此信号量；根据信号量，决定是否延迟进行。
优选地，在步骤S4中，指令之前的交互包括：命令域为“正向加试剂”和“开泵”之间的交互；命令域为“开泵”设置信号量,保存在系统全局变量上以供命令域为“正向加试剂”的段做识别；“正向加试剂”的段读取设置的信号量，执行并清除。
本申请还提出一种核酸分子杂交仪程序组件的控制系统，所述控制系统包括：
程序组件合法性确认单元，运行核酸分子杂交仪本地程序组件，确认程序组件合法性，程序组件由自定义的多个段组成，含有命令域和参数域；
程序组件解析单元，对程序组件进行解析，将核酸分子杂交自动化过程封装于程序组件中；
指令集生成单元，将程序组件的各个段的命令域与核酸分子杂交仪的逻辑框架表进行匹配，编译产生核酸分子杂交仪的指令集；
交互单元，执行指令集中的指令，并根据需求，适时进行指令之前的交互、指令间的信息交互及不同指令集之间的核酸分子杂交仪机械运动逻辑的配合。
与现有技术相比，本发明技术方案的有益效果是：
本发明提出一种核酸分子杂交仪程序组件的控制方法及系统，运行核酸分子杂交仪本地程序组件，确认程序组件合法性，程序组件由自定义的多个段组成，含有命令域和参数域，采用明文语言描述，便于调整；然后对程序组件进行解析，将核酸分子杂交自动化过程封装于程序组件中，将程序组件的各个段的命令域与核酸分子杂交仪的逻辑框架表进行匹配，编译产生核酸分子杂交仪的指令集，最后执行指令集中的指令，并根据需求，适时进行指令之前的交互、指令间的信息交互及不同指令集之间的核酸分子杂交仪机械运动逻辑的配合，逻辑框架表通俗易懂，整个实现核酸分子杂交仪程序组件的控制过程易读、易调整，无需程序员调整代码的自动化控制，适合非从事专业程序工作的现场生物技术人员和实验员使用。
附图说明
图1表示本发明实施例1中提出的核酸分子杂交仪程序组件的控制方法的流程示意图；
图2表示本发明实施例2中提出的命令域为“正向加试剂”时，同步匹配到逻辑框架表中的运行子逻辑，形成指令集的操作过程的示意图；
图3表示本发明实施例2中提出的命令域为“开泵”时，同步匹配到逻辑框架表中的运行子逻辑，形成指令集的操作过程的示意图；
图4表示本发明实施例3中提出的核酸分子杂交仪程序组件的控制系统的结构示意图。
具体实施方式
附图仅用于示例性说明，不能理解为对本专利的限制；
为了更好地说明本实施例，附图某些部位会有省略、放大或缩小，并不代表实际尺寸；
对于本领域技术人员来说，附图中某些公知内容说明可能省略是可以理解的。
下面结合附图和实施例对本发明的技术方案做进一步的说明。
附图中描述位置关系的仅用于示例性说明，不能理解为对本专利的限制；
实施例1
如图1所示的流程图内容，本实施例提出了一种核酸分子杂交仪程序组件的控制方法，参见图1，所述方法包括以下步骤：
S1.运行核酸分子杂交仪本地程序组件，确认程序组件合法性，程序组件由自定义的多个段组成，含有命令域和参数域；
S2.对程序组件进行解析，将核酸分子杂交自动化过程封装于程序组件中；
S3.将程序组件的各个段的命令域与核酸分子杂交仪的逻辑框架表进行匹配，编译产生核酸分子杂交仪的指令集；
S4.执行指令集中的指令，并根据需求，适时进行指令之前的交互、指令间的信息交互及不同指令集之间的核酸分子杂交仪机械运动逻辑的配合。
以上整个实现核酸分子杂交仪程序组件的控制过程易读、易调整，无需程序员调整代码的自动化控制，适合非从事专业程序工作的现场生物技术人员和实验员使用。
实施例2
在本实施例中，程序组件采用中文描述性明文语言，方便进行调整。
在本实施例中，程序组件由一个命令域和多个参数域构成，一个命令域和多个参数域构成构成一项命令模块，以段的形式表达，段含有“命令”域、UI交互信息、相关运行参数，域与域之间利用“┃”符号进行切割，每个程序组件的第一个域必须是命令域，后续的域根据命令域的不同，参数域数据格式(可能是数字也可能是字符)、意义、参数域的个数有所不同。
在此，程序组件各段的顺序的调整、增加或者减少，只需要移动、增加或删除段，能根据要求用户便捷的进行修改。
“命令”域具体运行逻辑必须说明，命令域运行逻辑内容包括核酸分子杂交仪机械臂的XYZ轴坐标、水泵、电磁阀打开关闭的时长、加热器温度设置、原点偏移、试剂加热、等候试剂到达温度、压扣、反应室控温、正向加试剂、开泵、提示框、等待、反向加试剂。
在步骤S1中，确认程序合法性的过程为：
S11.对本地程序组件进行过滤，逐行读取，一行为一个段，一行以“/n/r”转义字符结束；
S12.以“//”开头的段和空白段跳过不需要进行解析，对非程序组件命令域即系统程序无法识别的命令域进行提示。
S13.解析器模块将程序组件以流的形式进行处理，将流以”|”符号进行分割，并统计参数域的个数，如果参数域的个数与核酸分子杂交仪的逻辑框架表中规定的个数不同则报错；
逻辑框架表内依次定义了“命令域”内容、运行序号及运行序号对应的运行子逻辑，一个命令域对应多行运行序号及运行子逻辑，逻辑框架表为硬编码，无法修改，核酸分子杂交仪的逻辑框架表内保存着所有合法的自定义的段，逻辑框架表内还定义了命令域正常运行所需的参数个数，如果段的参数个数与逻辑框架表不一致，则程序组件为不合法的段；
若在本地程序组件的命令域查找且逻辑框架表内没有匹配时，则本地程序组件的命令域为无法识别的命令域。
表1表示本发明实施例提出的逻辑框架表。
表1
Figure BDA0004050832870000071
Figure BDA0004050832870000081
逻辑框架表的命令域包括“正向加试剂”、“开泵”，其中，“正向加试剂”对应运行序号为“1”、“2”、“3”、“4”、“5”、“6”、“7”；“开泵”对应运行序号为“1”、“2”；在“正向加试剂”命令域中，运行序号“1”对应的运行子逻辑为“读取域2，将预计运行时间发送给界面UI模块”，运行序号“2”对应的运行子逻辑为“读取域3，将提示信息发送给界面UI模块”，运行序号“3”对应的运行子逻辑为“读取域8，如果模式为1或3时，读取域4，移动到指定X,Y,Z轴坐标，移液模块取枪头；如果模式为0或2时，移液模块不取枪头”，运行序号“4”对应的运行子逻辑为“读取域5，移动到指定X,Y,Z轴坐标，移液模块取枪头；读取域9，吸取需要注入反应室的液体体积”，运行序号“5”对应的运行子逻辑为“读取域6，移动到指定X,Y,Z轴坐标；读取域9，移液模块注入液体到反应室”，运行序号“6”对应的运行子逻辑为“读取域7，一吸多吐进用”，运行序号“7”对应的运行子逻辑为“读取域8，如果模式为1或0时，移液模不退出枪头，如果模式为2或3时，移液模退出枪头”；在“开泵”命令域中，运行序号“1”对应的运行子逻辑为“读取域4和6，形成开泵时间为28秒，开泵速度为默认速度”，运行序号“2”对应的运行子逻辑为“读取域5，开阀时间长为5秒”。
在步骤S3中，将程序组件的各个段的命令域与核酸分子杂交仪的逻辑框架表进行匹配时，按顺序通过命令域搜索逻辑框架表，对应找到命令域所在行的指令集，实现将参数域的参数同步匹配到逻辑框架表中的运行子逻辑，形成指令集，指令集需要的参数从段中获取。
同步匹配到逻辑框架表中的运行子逻辑，形成指令集的操作过程为：
S31.判断命令域是否为“正向加试剂”，若是，则执行步骤S32；否则，执行步骤S35；
S32.如图2所示，参数域2表示当前段运行时长，将此参数匹配到运行的倒计时指令，提示用户；参数域3表示当前段的实验步骤说明，解析器将提示信息指令和参数域3指定信息整合成指令，发送在界面UI模块，显示参数域3指定的信息，提示用户；参数域9表示吸头模式，可设定为“1”，“0”，“2”，“3”中的一种，表示整移液体过程运行不同有取吸头方式；参数域4表示耗材吸头的XYZ轴坐标位置，将这些参数匹配到各轴电机运动控制指令，将移液体模块运动到耗材吸头架位置，进行移耗材洗头的获取；参数域5表示试剂槽的XYZ轴坐标位置，将这些参数匹配到各轴电机运动控制指令，将移液体模块运动到试剂槽位置，吸取试剂液体；
S33.读取已经运行的“开泵”段在参数域5设置好的信号量，如果已经设置了信号量则机器等待30秒，清除信号量,然后往下运行；
S34.参数域6、7、8分别表示杂交反应室的XYZ轴坐标位置、反应室孔间距、加入反应室的液体的量，将这些参数匹配到一组各轴电机连续运动控制指令，将吸取的液体按参数域8的设定均匀的加到杂交反应室内；
S35.判断命令域是否为“开泵”，若是，则执行步骤S36；否则，等待；
S36.如图3所示，参数域2表示当前段运行时长，将此参数匹配到运行的倒计时指令，提示用户；参数域3表示当前段的实验步骤说明，将此参数匹配到发送UI信息指令，将信息显示在界面UI模块上，提示用户；参数域4表示打开泵的时长，将参数匹配到泵的开关指令，将反应室的液体通过管道排出，找开泵时间达到指定时长后关闭泵；参数域5表示打开泄压阀的时长，将参数匹配到泄压阀的开关指令，反应室内为密闭空间会因泵的抽吸而产生负压，打开泄压阀使空气进入，达到指定时间后关闭阀；参数域6表示信号量，在运行当前段后，系统是否记录此信号量；根据信号量，决定是否延迟进行。
在步骤S4中，指令之前的交互包括：命令域为“正向加试剂”和“开泵”之间的交互；命令域为“开泵”设置信号量,保存在系统全局变量上以供命令域为“正向加试剂”的段做识别；“正向加试剂”的段读取设置的信号量，执行并清除。
实施例3
如图4所示，本申请还提出一种核酸分子杂交仪程序组件的控制系统，参见图4，该控制系统包括：
程序组件合法性确认单元，运行核酸分子杂交仪本地程序组件，确认程序组件合法性，程序组件由自定义的多个段组成，含有命令域和参数域；
程序组件解析单元，对程序组件进行解析，将核酸分子杂交自动化过程封装于程序组件中；
指令集生成单元，将程序组件的各个段的命令域与核酸分子杂交仪的逻辑框架表进行匹配，编译产生核酸分子杂交仪的指令集；
交互单元，执行指令集中的指令，并根据需求，适时进行指令之前的交互、指令间的信息交互及不同指令集之间的核酸分子杂交仪机械运动逻辑的配合。
显然，本发明的上述实施例仅是为清楚地说明本发明所作的举例，而并非是对本发明的实施方式的限定。对于所属领域的普通技术人员来说，在上述说明的基础上还可以做出其它不同形式的变化或变动。这里无需也无法对所有的实施方式予以穷举。凡在本发明的精神和原则之内所作的任何修改、等同替换和改进等，均应包含在本发明权利要求的保护范围之内。

Claims (10)

1.一种核酸分子杂交仪程序组件的控制方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：
S1.运行核酸分子杂交仪本地程序组件，确认程序组件合法性，程序组件由自定义的多个段组成，含有命令域和参数域；
S2.对程序组件进行解析，将核酸分子杂交自动化过程封装于程序组件中；
S3.将程序组件的各个段的命令域与核酸分子杂交仪的逻辑框架表进行匹配，编译产生核酸分子杂交仪的指令集；
S4.执行指令集中的指令，并根据需求，适时进行指令之前的交互、指令间的信息交互及不同指令集之间的核酸分子杂交仪机械运动逻辑的配合。
2.根据权利要求1所述的核酸分子杂交仪程序组件的控制方法，其特征在于，所述程序组件采用中文描述性明文语言。
3.根据权利要求2所述的核酸分子杂交仪程序组件的控制方法，其特征在于，所述程序组件由一个命令域和多个参数域构成，一个命令域和多个参数域构成构成一项命令模块，以段的形式表达，域与域之间利用“┃”符号进行切割，每个程序组件的第一个域必须是命令域，后续的域根据命令域的不同，参数域数据格式、意义、参数域的个数有所不同。
4.根据权利要求3所述的核酸分子杂交仪程序组件的控制方法，其特征在于，命令域运行逻辑内容包括核酸分子杂交仪机械臂的XYZ轴坐标、水泵、电磁阀打开关闭的时长、加热器温度设置、原点偏移、试剂加热、等候试剂到达温度、压扣、反应室控温、正向加试剂、开泵、提示框、等待、反向加试剂。
5.根据权利要求4所述的核酸分子杂交仪程序组件的控制方法，其特征在于，在步骤S1中，确认程序合法性的过程为：
S11.对本地程序组件进行过滤，逐行读取，一行为一个段，一行以“/n/r”转义字符结束；
S12.以“//”开头的段和空白段跳过不需要进行解析，对非程序组件命令域即系统程序无法识别的命令域进行提示。
S13.解析器模块将程序组件以流的形式进行处理，将流以”|”符号进行分割，并统计参数域的个数，如果参数域的个数与核酸分子杂交仪的逻辑框架表中规定的个数不同则报错；
逻辑框架表内依次定义了“命令域”内容、运行序号及运行序号对应的运行子逻辑，一个命令域对应多行运行序号及运行子逻辑，逻辑框架表为硬编码，无法修改，核酸分子杂交仪的逻辑框架表内保存着所有合法的自定义的段，逻辑框架表内还定义了命令域正常运行所需的参数个数，如果段的参数个数与逻辑框架表不一致，则程序组件为不合法的段；
若在本地程序组件的命令域查找且逻辑框架表内没有匹配时，则本地程序组件的命令域为无法识别的命令域。
6.根据权利要求5所述的核酸分子杂交仪程序组件的控制方法，其特征在于，逻辑框架表的命令域包括“正向加试剂”、“开泵”，其中，“正向加试剂”对应运行序号为“1”、“2”、“3”、“4”、“5”、“6”、“7”；“开泵”对应运行序号为“1”、“2”；在“正向加试剂”命令域中，运行序号“1”对应的运行子逻辑为“读取域2，将预计运行时间发送给界面UI模块”，运行序号“2”对应的运行子逻辑为“读取域3，将提示信息发送给界面UI模块”，运行序号“3”对应的运行子逻辑为“读取域8，如果模式为1或3时，读取域4，移动到指定X,Y,Z轴坐标，移液模块取枪头；如果模式为0或2时，移液模块不取枪头”，运行序号“4”对应的运行子逻辑为“读取域5，移动到指定X,Y,Z轴坐标，移液模块取枪头；读取域9，吸取需要注入反应室的液体体积”，运行序号“5”对应的运行子逻辑为“读取域6，移动到指定X,Y,Z轴坐标；读取域9，移液模块注入液体到反应室”，运行序号“6”对应的运行子逻辑为“读取域7，一吸多吐进用”，运行序号“7”对应的运行子逻辑为“读取域8，如果模式为1或0时，移液模不退出枪头，如果模式为2或3时，移液模退出枪头”；在“开泵”命令域中，运行序号“1”对应的运行子逻辑为“读取域4和6，形成开泵时间为28秒，开泵速度为默认速度”，运行序号“2”对应的运行子逻辑为“读取域5，开阀时间长为5秒”。
7.根据权利要求6所述的核酸分子杂交仪程序组件的控制方法，其特征在于，在步骤S3中，将程序组件的各个段的命令域与核酸分子杂交仪的逻辑框架表进行匹配时，按顺序通过命令域搜索逻辑框架表，对应找到命令域所在行的指令集，实现将参数域的参数同步匹配到逻辑框架表中的运行子逻辑，形成指令集，指令集需要的参数从段中获取。
8.根据权利要求7所述的核酸分子杂交仪程序组件的控制方法，其特征在于，同步匹配到逻辑框架表中的运行子逻辑，形成指令集的操作过程为：
S31.判断命令域是否为“正向加试剂”，若是，则执行步骤S32；否则，执行步骤S35；
S32.参数域2表示当前段运行时长，将此参数匹配到运行的倒计时指令，提示用户；参数域3表示当前段的实验步骤说明，解析器将提示信息指令和参数域3指定信息整合成指令，发送在界面UI模块，显示参数域3指定的信息，提示用户；参数域9表示吸头模式，可设定为“1”，“0”，“2”，“3”中的一种，表示整移液体过程运行不同有取吸头方式；参数域4表示耗材吸头的XYZ轴坐标位置，将这些参数匹配到各轴电机运动控制指令，将移液体模块运动到耗材吸头架位置，进行移耗材洗头的获取；参数域5表示试剂槽的XYZ轴坐标位置，将这些参数匹配到各轴电机运动控制指令，将移液体模块运动到试剂槽位置，吸取试剂液体；
S33.读取已经运行的“开泵”段在参数域5设置好的信号量，如果已经设置了信号量则机器等待30秒，清除信号量,然后往下运行；
S34.参数域6、7、8分别表示杂交反应室的XYZ轴坐标位置、反应室孔间距、加入反应室的液体的量，将这些参数匹配到一组各轴电机连续运动控制指令，将吸取的液体按参数域8的设定均匀的加到杂交反应室内；
S35.判断命令域是否为“开泵”，若是，则执行步骤S36；否则，等待；
S36.参数域2表示当前段运行时长，将此参数匹配到运行的倒计时指令，提示用户；参数域3表示当前段的实验步骤说明，将此参数匹配到发送UI信息指令，将信息显示在界面UI模块上，提示用户；参数域4表示打开泵的时长，将参数匹配到泵的开关指令，将反应室的液体通过管道排出，找开泵时间达到指定时长后关闭泵；参数域5表示打开泄压阀的时长，将参数匹配到泄压阀的开关指令，反应室内为密闭空间会因泵的抽吸而产生负压，打开泄压阀使空气进入，达到指定时间后关闭阀；参数域6表示信号量，在运行当前段后，系统是否记录此信号量；根据信号量，决定是否延迟进行。
9.根据权利要求8所述的核酸分子杂交仪程序组件的控制方法，其特征在于，在步骤S4中，指令之前的交互包括：命令域为“正向加试剂”和“开泵”之间的交互；命令域为“开泵”设置信号量,保存在系统全局变量上以供命令域为“正向加试剂”的段做识别；“正向加试剂”的段读取设置的信号量，执行并清除。
10.一种核酸分子杂交仪程序组件的控制系统，其特征在于，所述控制系统包括：
程序组件合法性确认单元，运行核酸分子杂交仪本地程序组件，确认程序组件合法性，程序组件由自定义的多个段组成，含有命令域和参数域；
程序组件解析单元，对程序组件进行解析，将核酸分子杂交自动化过程封装于程序组件中；
指令集生成单元，将程序组件的各个段的命令域与核酸分子杂交仪的逻辑框架表进行匹配，编译产生核酸分子杂交仪的指令集；
交互单元，执行指令集中的指令，并根据需求，适时进行指令之前的交互、指令间的信息交互及不同指令集之间的核酸分子杂交仪机械运动逻辑的配合。
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Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20020133002A1 (en) * 1999-02-22 2002-09-19 Ellen M. Heath Computer implemented nucleic acid isolation method and apparatus
CN104962454A (zh) * 2015-06-19 2015-10-07 广东凯普生物科技股份有限公司 全自动核酸分子杂交仪
CN204824844U (zh) * 2015-06-19 2015-12-02 广东凯普生物科技股份有限公司 全自动核酸分子杂交仪
CN107831682A (zh) * 2017-11-17 2018-03-23 广州瑞能医学科技有限公司 一种核酸提取仪智能控制方法
CN111240658A (zh) * 2018-11-29 2020-06-05 福建省天奕网络科技有限公司 一种基于Unity引擎的控制台实现方法及终端
CN216451296U (zh) * 2021-12-10 2022-05-06 亚能生物技术（深圳）有限公司 一种多模块化的自动设备控制电路及核酸分子杂交仪

Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20020133002A1 (en) * 1999-02-22 2002-09-19 Ellen M. Heath Computer implemented nucleic acid isolation method and apparatus
CN104962454A (zh) * 2015-06-19 2015-10-07 广东凯普生物科技股份有限公司 全自动核酸分子杂交仪
CN204824844U (zh) * 2015-06-19 2015-12-02 广东凯普生物科技股份有限公司 全自动核酸分子杂交仪
CN107831682A (zh) * 2017-11-17 2018-03-23 广州瑞能医学科技有限公司 一种核酸提取仪智能控制方法
CN111240658A (zh) * 2018-11-29 2020-06-05 福建省天奕网络科技有限公司 一种基于Unity引擎的控制台实现方法及终端
CN216451296U (zh) * 2021-12-10 2022-05-06 亚能生物技术（深圳）有限公司 一种多模块化的自动设备控制电路及核酸分子杂交仪

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
ZHENG LIU ET AL.: "Research of the Incubation and Hybridization Instrument wiVibration for Nanoparticles", JOURNAL OF NANOSCIENCE AND NANOTECHNOLOGY, vol. 12, pages 8448 *
杨鸿: "全自动核酸分子杂交仪设计与实现", 中国优秀硕士学位论文全文数据库 工程科技II辑, no. 6, pages 10 *

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