CN115932272B - 血清学生物标志物在克罗恩病临床诊断中的应用 - Google Patents
血清学生物标志物在克罗恩病临床诊断中的应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN115932272B CN115932272B CN202211168032.3A CN202211168032A CN115932272B CN 115932272 B CN115932272 B CN 115932272B CN 202211168032 A CN202211168032 A CN 202211168032A CN 115932272 B CN115932272 B CN 115932272B
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- crohn
- disease
- subject
- protein
- expression level
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 208000011231 Crohn disease Diseases 0.000 title claims abstract description 152
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 title claims abstract description 52
- 238000003759 clinical diagnosis Methods 0.000 title claims abstract description 19
- 230000000405 serological effect Effects 0.000 title abstract description 27
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 63
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims abstract description 60
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 claims abstract description 54
- 102100025012 Dipeptidyl peptidase 4 Human genes 0.000 claims abstract description 27
- 101000908391 Homo sapiens Dipeptidyl peptidase 4 Proteins 0.000 claims abstract description 26
- 102100032007 Serum amyloid A-2 protein Human genes 0.000 claims abstract description 26
- 101710083332 Serum amyloid A-2 protein Proteins 0.000 claims abstract description 26
- 229940090124 dipeptidyl peptidase 4 (dpp-4) inhibitors for blood glucose lowering Drugs 0.000 claims abstract description 26
- 102100021184 Golgi membrane protein 1 Human genes 0.000 claims abstract description 25
- 101001040742 Homo sapiens Golgi membrane protein 1 Proteins 0.000 claims abstract description 25
- 101001044940 Homo sapiens Insulin-like growth factor-binding protein 2 Proteins 0.000 claims abstract description 25
- 102100022710 Insulin-like growth factor-binding protein 2 Human genes 0.000 claims abstract description 25
- 102100035688 Guanylate-binding protein 1 Human genes 0.000 claims abstract description 24
- 101001001336 Homo sapiens Guanylate-binding protein 1 Proteins 0.000 claims abstract description 23
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 23
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 claims abstract description 20
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 claims abstract description 20
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 claims abstract description 15
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims abstract description 14
- 229940079593 drug Drugs 0.000 claims abstract description 12
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims abstract description 8
- 238000012216 screening Methods 0.000 claims abstract description 4
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims description 13
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims description 11
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 claims description 4
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 claims description 4
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 claims 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 abstract description 18
- 230000008569 process Effects 0.000 abstract description 9
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 abstract description 5
- 238000013399 early diagnosis Methods 0.000 abstract description 4
- 230000008506 pathogenesis Effects 0.000 abstract description 2
- 230000007310 pathophysiology Effects 0.000 abstract description 2
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 48
- 108010074051 C-Reactive Protein Proteins 0.000 description 40
- 102100032752 C-reactive protein Human genes 0.000 description 40
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 21
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 20
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 20
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 17
- 230000000968 intestinal effect Effects 0.000 description 17
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 16
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 16
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 11
- 208000022559 Inflammatory bowel disease Diseases 0.000 description 9
- 230000008859 change Effects 0.000 description 9
- 230000002757 inflammatory effect Effects 0.000 description 9
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 9
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 9
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 8
- 210000004400 mucous membrane Anatomy 0.000 description 8
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 8
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 7
- 210000001165 lymph node Anatomy 0.000 description 7
- 210000000577 adipose tissue Anatomy 0.000 description 5
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 5
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 5
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 5
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 5
- 230000003902 lesion Effects 0.000 description 5
- 210000000754 myometrium Anatomy 0.000 description 5
- 108020004465 16S ribosomal RNA Proteins 0.000 description 4
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 4
- 208000025865 Ulcer Diseases 0.000 description 4
- 230000000875 corresponding effect Effects 0.000 description 4
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 4
- 208000002551 irritable bowel syndrome Diseases 0.000 description 4
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 description 4
- 231100000397 ulcer Toxicity 0.000 description 4
- 241001408449 Asca Species 0.000 description 3
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 3
- 208000004232 Enteritis Diseases 0.000 description 3
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 3
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 3
- 101100067996 Mus musculus Gbp1 gene Proteins 0.000 description 3
- 230000009266 disease activity Effects 0.000 description 3
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 3
- 238000007619 statistical method Methods 0.000 description 3
- 206010061692 Benign muscle neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 206010009900 Colitis ulcerative Diseases 0.000 description 2
- 102000004372 Insulin-like growth factor binding protein 2 Human genes 0.000 description 2
- 201000004458 Myoma Diseases 0.000 description 2
- 238000011529 RT qPCR Methods 0.000 description 2
- 201000006704 Ulcerative Colitis Diseases 0.000 description 2
- 230000000845 anti-microbial effect Effects 0.000 description 2
- 210000001815 ascending colon Anatomy 0.000 description 2
- 230000000721 bacterilogical effect Effects 0.000 description 2
- 230000006399 behavior Effects 0.000 description 2
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 2
- 210000002421 cell wall Anatomy 0.000 description 2
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 2
- 238000001839 endoscopy Methods 0.000 description 2
- 238000010201 enrichment analysis Methods 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 210000003608 fece Anatomy 0.000 description 2
- 238000012165 high-throughput sequencing Methods 0.000 description 2
- 238000007901 in situ hybridization Methods 0.000 description 2
- 210000004347 intestinal mucosa Anatomy 0.000 description 2
- 230000009191 jumping Effects 0.000 description 2
- 210000000713 mesentery Anatomy 0.000 description 2
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 2
- 210000002381 plasma Anatomy 0.000 description 2
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 2
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 2
- 238000004393 prognosis Methods 0.000 description 2
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 2
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 2
- 241000894007 species Species 0.000 description 2
- 230000007480 spreading Effects 0.000 description 2
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 2
- 210000004876 tela submucosa Anatomy 0.000 description 2
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 1
- HVCOBJNICQPDBP-UHFFFAOYSA-N 3-[3-[3,5-dihydroxy-6-methyl-4-(3,4,5-trihydroxy-6-methyloxan-2-yl)oxyoxan-2-yl]oxydecanoyloxy]decanoic acid;hydrate Chemical compound O.OC1C(OC(CC(=O)OC(CCCCCCC)CC(O)=O)CCCCCCC)OC(C)C(O)C1OC1C(O)C(O)C(O)C(C)O1 HVCOBJNICQPDBP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000004998 Abdominal Pain Diseases 0.000 description 1
- 206010000077 Abdominal mass Diseases 0.000 description 1
- 239000004382 Amylase Substances 0.000 description 1
- 102000013142 Amylases Human genes 0.000 description 1
- 108010065511 Amylases Proteins 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 108700003860 Bacterial Genes Proteins 0.000 description 1
- 206010007134 Candida infections Diseases 0.000 description 1
- 238000001353 Chip-sequencing Methods 0.000 description 1
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 1
- 101100508040 Danio rerio igfbp2a gene Proteins 0.000 description 1
- 206010012735 Diarrhoea Diseases 0.000 description 1
- 108010067722 Dipeptidyl Peptidase 4 Proteins 0.000 description 1
- 108090000194 Dipeptidyl-peptidases and tripeptidyl-peptidases Proteins 0.000 description 1
- 102000003779 Dipeptidyl-peptidases and tripeptidyl-peptidases Human genes 0.000 description 1
- 208000018522 Gastrointestinal disease Diseases 0.000 description 1
- 208000034826 Genetic Predisposition to Disease Diseases 0.000 description 1
- 101000597577 Gluconacetobacter diazotrophicus (strain ATCC 49037 / DSM 5601 / CCUG 37298 / CIP 103539 / LMG 7603 / PAl5) Outer membrane protein Proteins 0.000 description 1
- 229930186217 Glycolipid Natural products 0.000 description 1
- 102000017319 Golgi membrane protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 108050005430 Golgi membrane protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 206010018691 Granuloma Diseases 0.000 description 1
- 101710110781 Guanylate-binding protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 description 1
- 206010020772 Hypertension Diseases 0.000 description 1
- 108090000964 Insulin-like growth factor binding protein 2 Proteins 0.000 description 1
- 206010022699 Intestinal stenosis Diseases 0.000 description 1
- 229920000057 Mannan Polymers 0.000 description 1
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 1
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 208000007027 Oral Candidiasis Diseases 0.000 description 1
- 208000002193 Pain Diseases 0.000 description 1
- 102000003992 Peroxidases Human genes 0.000 description 1
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 1
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 1
- 208000027418 Wounds and injury Diseases 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 239000012072 active phase Substances 0.000 description 1
- 230000001154 acute effect Effects 0.000 description 1
- 208000038016 acute inflammation Diseases 0.000 description 1
- 230000006022 acute inflammation Effects 0.000 description 1
- 230000002776 aggregation Effects 0.000 description 1
- 238000004220 aggregation Methods 0.000 description 1
- 235000019418 amylase Nutrition 0.000 description 1
- 238000012443 analytical study Methods 0.000 description 1
- 239000004599 antimicrobial Substances 0.000 description 1
- 210000000436 anus Anatomy 0.000 description 1
- 230000004888 barrier function Effects 0.000 description 1
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 1
- 238000003766 bioinformatics method Methods 0.000 description 1
- 230000008827 biological function Effects 0.000 description 1
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 1
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 1
- 201000003984 candidiasis Diseases 0.000 description 1
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 1
- 238000006555 catalytic reaction Methods 0.000 description 1
- 125000002091 cationic group Chemical group 0.000 description 1
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 230000001684 chronic effect Effects 0.000 description 1
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 1
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 1
- 208000029742 colonic neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 230000002596 correlated effect Effects 0.000 description 1
- 238000010219 correlation analysis Methods 0.000 description 1
- 238000007405 data analysis Methods 0.000 description 1
- 206010012601 diabetes mellitus Diseases 0.000 description 1
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 1
- 230000037213 diet Effects 0.000 description 1
- 235000005911 diet Nutrition 0.000 description 1
- 238000001647 drug administration Methods 0.000 description 1
- 210000003237 epithelioid cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000002550 fecal effect Effects 0.000 description 1
- 230000006870 function Effects 0.000 description 1
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 description 1
- 239000003862 glucocorticoid Substances 0.000 description 1
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 1
- RQFCJASXJCIDSX-UUOKFMHZSA-N guanosine 5'-monophosphate Chemical compound C1=2NC(N)=NC(=O)C=2N=CN1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]1O RQFCJASXJCIDSX-UUOKFMHZSA-N 0.000 description 1
- 238000012333 histopathological diagnosis Methods 0.000 description 1
- 230000013632 homeostatic process Effects 0.000 description 1
- 101150071737 igfbp2 gene Proteins 0.000 description 1
- 210000003405 ileum Anatomy 0.000 description 1
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 1
- 230000003100 immobilizing effect Effects 0.000 description 1
- 230000003832 immune regulation Effects 0.000 description 1
- 230000002134 immunopathologic effect Effects 0.000 description 1
- 229960003444 immunosuppressant agent Drugs 0.000 description 1
- 230000001861 immunosuppressant effect Effects 0.000 description 1
- 239000003018 immunosuppressive agent Substances 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 230000004968 inflammatory condition Effects 0.000 description 1
- 208000014674 injury Diseases 0.000 description 1
- 102000028416 insulin-like growth factor binding Human genes 0.000 description 1
- 108091022911 insulin-like growth factor binding Proteins 0.000 description 1
- 208000003243 intestinal obstruction Diseases 0.000 description 1
- 206010022694 intestinal perforation Diseases 0.000 description 1
- 210000000936 intestine Anatomy 0.000 description 1
- 230000009545 invasion Effects 0.000 description 1
- 230000002045 lasting effect Effects 0.000 description 1
- 210000005229 liver cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000001365 lymphatic vessel Anatomy 0.000 description 1
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- LUEWUZLMQUOBSB-GFVSVBBRSA-N mannan Chemical class O[C@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@@H](O[C@@H]2[C@H](O[C@@H](O[C@H]3[C@H](O[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H]3O)CO)[C@@H](O)[C@H]2O)CO)[C@H](O)[C@H]1O LUEWUZLMQUOBSB-GFVSVBBRSA-N 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 230000004001 molecular interaction Effects 0.000 description 1
- 210000004877 mucosa Anatomy 0.000 description 1
- 239000000101 novel biomarker Substances 0.000 description 1
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 1
- 230000001991 pathophysiological effect Effects 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 108040007629 peroxidase activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 1
- 230000006916 protein interaction Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 230000004044 response Effects 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 1
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 1
- 230000036262 stenosis Effects 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 230000002459 sustained effect Effects 0.000 description 1
- 230000008718 systemic inflammatory response Effects 0.000 description 1
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 1
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 1
- 238000010200 validation analysis Methods 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
- G01N33/6893—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids related to diseases not provided for elsewhere
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/543—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/58—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances
- G01N33/581—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances with enzyme label (including co-enzymes, co-factors, enzyme inhibitors or substrates)
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
- G01N2333/46—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans from vertebrates
- G01N2333/47—Assays involving proteins of known structure or function as defined in the subgroups
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/06—Gastro-intestinal diseases
- G01N2800/065—Bowel diseases, e.g. Crohn, ulcerative colitis, IBS
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/52—Predicting or monitoring the response to treatment, e.g. for selection of therapy based on assay results in personalised medicine; Prognosis
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
- Y02A90/00—Technologies having an indirect contribution to adaptation to climate change
- Y02A90/10—Information and communication technologies [ICT] supporting adaptation to climate change, e.g. for weather forecasting or climate simulation
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Immunology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明属于临床医学技术领域,公开一组血清学生物标志物在克罗恩病临床诊断中的应用,所述血清学生物标志物包括SAA2、DPP4、GOLM1、IGFBP2或GBP1蛋白质分子中的至少一种,通过检测所述血清学生物标志物在受试者外周血血清中的蛋白表达水平,可判断受试者是否患有克罗恩病。此外,本发明还提供一种用于克罗恩病临床诊断的试剂盒、一种用于克罗恩病临床诊断的模块,以及一种用于筛选治疗克罗恩病的药物的方法。本发明提供的具有高度灵敏度和特异度的CD血清诊断标志物集合,可用于临床对于CD的早期诊断,以指导临床对于CD的治疗过程,并为进一步解释CD的病理生理学发病机制提供新的理论依据。
Description
技术领域
本发明属于临床医学技术领域,具体涉及一组血清学生物标志物在克罗恩病临床诊断中的应用。
背景技术
炎症性肠病(inflammatory bowel disease,IBD)是一种病因尚不完全明确的慢性非特异性肠道炎症性疾病,目前主流观点认为其主要是在具有遗传易感性的个体中,由于环境、饮食、药物、肠道菌群等多种因素的影响导致个体肠道免疫稳态失衡所导致的肠道炎症损伤,包括克罗恩病(Crohn’s disease,CD)和溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)。近年来,CD在我国的发病率呈逐年增高的趋势,发病率为0.848/10万人,患病率为2.29/10万人,比10年前增长2.5倍。CD临床症状主要表现为腹痛、腹泻、腹部包块、肛周瘘管等,病变呈多节段、跳跃式分布,常导致肠梗阻、狭窄、穿孔等,造成严重的肠道致残。由于其病情反复、迁延不愈,中青年发病率逐年增加,临床缺乏灵敏的早期诊断方法以及有效的治疗手段等特点,给个人、家庭及社会带来了沉重的负担。目前,临床对于CD 的诊断方法主要为内镜检查及活检组织病理学诊断,创伤性较大,给病人带来较大的痛苦,且费用相对较高,在临床的应用中不甚方便;而影像学检查对于CD的诊断价值较低,且血清及粪便的生物学标志物特异度或灵敏度较低。而早诊断、早治疗,对于CD患者的预后具有较大的益处,因此寻找便捷、有效的血清学生物标志物,在CD临床诊断、治疗及预后管理的过程中具有重要的意义。
现有技术中通过检测CD患者外周血CRP水平来评估CD患者疾病活动程度。CRP是一种非特异性急性炎症的血清学标志物,主要由由肝细胞合成,是机体受到感染和组织损伤时,血浆中能检测出的急性实相反应蛋白,与炎症因子存在着密切的相关性,且与CD的临床活动度有较强的正相关性,可以用于区分IBD与其他非炎症性胃肠道疾病。CRP是一种非特异性的炎症标志物,在多种炎症情况下,包括感染以及其他导致组织炎症损伤的疾病中都会升高,特异度较低,仅可用于评估CD发生时患者系统性炎症反应水平,在一定程度上评估患者疾病的活动程度,而无法为精准诊断CD提供帮助。且尽管有些CD患者处于临床活动期,但是仍可表现出持续性低水平的CRP,包括低BMI或单纯空回肠型CD患者。
此外,现有技术中还通过检测CD患者外周血中抗微生物相关抗体(如 ASCA,Cbir1,OMPC)来诊断克罗恩病。抗多糖抗体是一类针对微生物(细菌、真菌)细胞壁多糖类抗原决定簇的抗体,作为CD相关的特异性血清学标志物已经被大部分临床医生认可,其中针对酿酒酵母菌细胞壁甘露聚糖的血清反应性抗体ASCA是第一个被发现对CD具有高度特异性的血清学标志物。目前临床上检测IBD患者外周血中ASCA的水平,来评估IBD患者的疾病行为和疾病活动程度。但是,有研究表明这些抗微生物相关抗体对于CD 诊断普遍存在灵敏度低、阳性检出率低或特异性低等不足。
术语:
1、炎症性肠病,英文名为inflammatory bowel disease,缩写为IBD。
2、克罗恩病,英文名为Crohn’s disease,缩写为CD。
3、血浆淀粉样蛋白-2,英文名为Serum Amyloid A2,缩写为SAA2。
4、胰岛素样生长因子结合蛋白-2,英文名为Insulin Like Growth FactorBinding Protein 2,缩写为IGFBP2。
5、高尔基膜蛋白-1,英文名为Golgi Membrane Protein 1,缩写为GOLM1。
6、二肽基肽酶-4,英文名为Dipeptidyl Peptidase 4,缩写为DPP4。
7、鸟苷酸结合蛋白-1,英文名为Guanylate Binding Protein 1,缩写为 GBP1。
8、“生物标志物”,在本文中或可写作“标志物”或“血清学标志物”,包括基于DNA、RNA、蛋白质、碳水化合物或糖脂的分子学标志物,在本文中指血清中的可溶性蛋白质分子标志物,它们的存在可以在受试者的或患者的外周血清样本中通过标准方法(本文中所涉及到的方法)进行检测。
9、“样品”是指来源于CD患者或健康受试者的外周血清样本,可以用过公知的技术获得。
发明内容
本发明的目的在于提供一组具有高度灵敏度和特异度的CD血清诊断标志物集合,用于临床对于CD的早期诊断,以指导临床对于CD的治疗过程,并为进一步解释CD的病理生理学发病机制提供新的理论依据。
在前期工作中,我们收集了30例CD患者手术切除回肠肠段样本的炎症部位和相对正常部位组织,包括肠道黏膜层(MUC),黏膜下层-肌层-浆膜层(SMS),肠旁脂肪组织(MAT),肠系膜(MES)和肠系膜淋巴结(MLN),以及5例非CD患者(non-CD control,NC)对应的相对正常部位组织(此5 位对照组入组患者为早期升结肠肿瘤患者,手术切除升结肠及回肠末端肠段,所取样本备份并进行免疫病理学检查,由两位以上专业病理科医生复核为非肿瘤侵袭的相对正常部位组织)。我们首先对上述样本进行蛋白质组学测序和16S rRNA测序分析研究,描绘了CD肠道炎症发生过程中不同组织部位的蛋白质分子谱和细菌谱。随后我们根据差异蛋白质分子在CD患者不同组织部位的相对表达量的变化情况及差异菌种相关基因在CD患者不同组织部位相对表达量的变化情况绘制c-Fuzzy图谱,统计学分析方法表明P.C1 (protein cluster 1)和M.C1(microbial cluster 1)之间具有较强的相关性。随后我们对P.C1中的蛋白质分子和M.C1中的细菌基因进行相关性分析和功能注释后,鉴定出一系列关键的差异蛋白质分子和关键菌种,在CD肠道炎症发生过程中肠道炎症向肠外组织播散和菌群向肠外组织移位的过程中起到了重要的作用。
根据我们在前期工作中的研究结果,我们认为在CD肠道炎症发生的过程中,肠道及其附属器官不同组织内免疫调节的紊乱及物理屏障功能的破坏,可能参与了CD发生时肠道炎症向肠外组织的播散及菌群移位的过程,因此我们推测上述关键蛋白质分子和关键菌种是否能够在CD患者体液样本中具有诊断效能。于是我们收集了30例CD患者及30例健康对照者配对的外周血清及粪便样本,分别进行了血清非靶向蛋白质组学测序以及粪便16SrRNA 测序分析,并与组织蛋白组学和细菌组学的结果进行比较,发现5种上述关键蛋白质分子在CD患者外周血清中存在差异表达的情况,包括SAA2、 DPP4、GOLM1、IGFBP2和GBP1,且上述关键蛋白质分子和粪便中的关键菌种具有良好的相关性。
基于此,本发明的第一方面提出了一组血清学生物标志物在克罗恩病临床诊断中的应用,所述血清学生物标志物包括SAA2、DPP4、GOLM1、IGFBP2 或GBP1蛋白质分子中的至少一种。
根据本发明所提供的应用,通过检测所述血清学生物标志物在受试者外周血血清中的表达水平,判断受试者是否患有克罗恩病。
具体来说,当受试者外周血血清中SAA2、GOLM1、IGFBP2或GBP1 中至少一种的表达水平升高,指示所述受试者患有克罗恩病;当受试者外周血血清中DPP4的表达水平降低,指示所述受试者患有克罗恩病。
本发明的第二方面提供用于克罗恩病临床诊断的试剂盒,该试剂盒包括检测血清学生物标志物表达水平的试剂,所述血清学生物标志物包括SAA2、 DPP4、GOLM1、IGFBP2或GBP1蛋白质分子中的至少一种。
优选地,在本发明所提供的用于克罗恩病临床诊断的试剂盒中,所述检测血清学生物标志物表达水平的试剂包括:基于RT-PCR、实时定量PCR、免疫检测、原位杂交、芯片或高通量测序检测所述血清学生物标志物表达水平的试剂。
进一步优选地,所述基于RT-PCR检测所述血清学生物标志物表达水平的试剂至少包括一对特异扩增所述血清学生物标志物的的核酸序列的引物;所述基于实时定量PCR检测所述血清学生物标志物表达水平的试剂至少包括一对特异扩增所述血清学生物标志物的的核酸序列的引物;所述基于免疫检测技术检测所述血清学生物标志物表达水平的试剂至少包括与所述血清学生物标志物特异性结合的抗体;所述基于原位杂交检测所述血清学生物标志物表达水平的试剂至少包括与所述血清学生物标志物的核酸序列杂交的探针;所述基于芯片检测所述血清学生物标志物表达水平的试剂至少包括:蛋白芯片和基因芯片;所述蛋白芯片包括与所述血清学生物标志物特异性结合的抗体,所述基因芯片包括与所述血清学生物标志物的核酸序列杂交的探针;所述基于高通量测序检测所述血清学生物标志物表达水平的试剂至少包括:用于检测所述血清学生物标志物转录水平的引物和/或探针。
本发明的第三方面提供一种用于克罗恩病临床诊断的模块,该模块包括诊断指标输入模块和克罗恩病状态评估模块;所述诊断指标输入模块至少包括获取血清学生物标志物在受试者外周血血清中的表达水平,所述血清学生物标志物包括SAA2、DPP4、GOLM1、IGFBP2或GBP1蛋白质分子中的至少一种;所述克罗恩病状态评估模块至少包括将所述诊断指标输入模块获取的所述血清学生物标志物在受试者外周血血清中的表达水平输入诊断模型得出得分值;将所获得的得分值与预先设定的诊断模型的截断值比较,输出受试者克罗恩病状态的评估结果;所述克罗恩病状态包括诊断模型预先设定的克罗恩病相关状态。
本发明的第四方面提供一种用于筛选治疗克罗恩病的药物的方法,包括:在测试组中,向待测对象使用待测试药物,检测测试组中来源于所述对象的样品中血清学生物标志物的表达水平V1;在对照组中,向待测对象使用空白对照药物,检测对照组中来源于所述对象的样品中血清学生物标志物的表达水平V2;比较检测所得到的血清学生物标志物V1和V2,从而确定所述测试药物是否具有治疗克罗恩病的效能;所述血清学生物标志物包括SAA2、 DPP4、GOLM1、IGFBP2或GBP1蛋白质分子中的至少一种。
附图说明
图1是克罗恩病患者和健康对照者外周血清中IGFBP2、DPP4、GBP1、 SAA2和GOLM1表达水平的比较,其中HC指健康对照者,A-CD指活动期 CD患者;
图2是SAA2作为标志物诊断克罗恩病的ROC曲线图,并与CRP比较;
图3是GBP1作为标志物诊断克罗恩病的ROC曲线图,并与CRP比较;
图4是IGFBP2作为标志物诊断克罗恩病的ROC曲线图,并与CRP比较;
图5是GOLM1作为标志物诊断克罗恩病的ROC曲线图,并与CRP比较;
图6是DPP4作为标志物诊断克罗恩病的ROC曲线图,并与CRP比较;
图7是SAA2、DPP4、IGFBP2、GOLM1和GBP1作为标志物诊断克罗恩病的平均ROC曲线图,并与CRP比较;
图8是SAA2在克罗恩病患者外周血清中与CRP表达量的相关程度分析;
图9是GBP1在克罗恩病患者外周血清中与CRP表达量的相关程度分析;
图10是IGFBP2在克罗恩病患者外周血清中与CRP表达量的相关程度分析;
图11是GOLM1在克罗恩病患者外周血清中与CRP表达量的相关程度分析;
图12是DPP4在克罗恩病患者外周血清中与CRP表达量的相关程度分析。
具体实施方式
为使本发明的目的、技术方案和优点更加清楚,下面将对本发明的各实施方式进行详细的阐述。然而,本领域的普通技术人员可以理解,在本发明各实施方式中,为了使读者更好地理解本申请而提出了许多技术细节。但是,即使没有这些技术细节和基于以下各实施方式的种种变化和修改,也可以实现本申请各权利要求所要求保护的技术方案。
1、生物标志物的发现:克罗恩病患者及非克罗恩病患者肠道及其附属器官蛋白质组学及细菌组学测序分析研究
1.1样本收集:
筛选年龄>18岁,未使用免疫抑制剂、小分子靶向药物、糖皮质激素、抗生素及其他特殊药物等,无合并影响肠道病理生理学状态的其他疾病,无合并高血压、糖尿病等疾病的患者,提前获取患者知情同意,于患者手术过程中,由专业手术医生于无菌条件下收集30例克罗恩病患者炎症及相对正常部位的肠道粘膜层、黏膜下层-肌层-浆膜层、肠旁脂肪、肠系膜和肠系膜淋巴结,以及5例非克罗恩病患者未被疾病侵袭部位的相对正常黏膜层、黏膜下层-肌层-浆膜层、肠旁脂肪、肠系膜和肠系膜淋巴结,液氮运送,-80℃保存备用。非CD患者相对正常部位组织均进行病理组织学检查,由两名以上专业病理科医生复核为非疾病侵袭组织。
1.2组织蛋白质组学测序分析:
①使用CD患者手术切除肠道及其附属器官组织样本(包括配对的炎症及相对正常部位肠黏膜组织,肌层和浆膜层组织,肠旁脂肪组织,肠系膜组织及肠系膜淋巴结组织)以及非CD患者手术切除肠道及其附属器官相对正常部位组织样本(包括肠黏膜组织,肌层和浆膜层组织,肠旁脂肪组织,肠系膜组织和肠系膜淋巴结组织)进行4-D蛋白组学测序分析。
②比较CD患者炎症及非CD患者相对正常部位相同类型组织样本中蛋白质表达谱的差异,并计算差异蛋白质在组织样本中的表达量,并对差异蛋白质进行通路富集分析,并根据数据库(Nano string以及Import等)对差异蛋白质进行功能注释,探索CD肠道炎症发生时不同组织中蛋白质表达谱的变化情况,探究不同组织生物学功能的变化。
③比较CD患者炎症部位及相对正常部位相同类型组织样本中细菌谱的差异,并计算差异蛋白质在组织样本中的表达量,探索CD发生时肠道局部炎症对于蛋白质表达谱的影响。
④绘制CD患者炎症部位不同类型组织样本中蛋白质相互作用网络图,分析在CD肠道炎症发生时不同部位中的关键蛋白质分子及相互作用关系。
1.3组织细菌组学测序分析研究:
描绘CD患者肠炎发生时肠道及其附属器官不同部位组织的细菌谱。
①使用CD患者手术切除肠道及其附属器官组织样本(包括配对的炎症及相对正常部位肠黏膜组织,肌层和浆膜层组织,肠旁脂肪组织,肠系膜组织及肠系膜淋巴结组织)以及非CD患者手术切除肠道及其附属器官相对正常部位组织样本(包括肠黏膜组织,肌层和浆膜层组织,肠旁脂肪组织,肠系膜组织和肠系膜淋巴结组织)进行16S rDNA细菌组学测序分析。
②比较CD患者炎症及非CD患者相对正常部位相同类型组织样本中细菌谱的差异,并计算差异菌种在组织样本中的丰度,探索CD肠炎发生时肠道及其附属器官细菌谱的变化情况。
③比较CD患者炎症部位及相对正常部位相同类型组织样本中细菌谱的差异,并计算差异菌种在组织样本中的丰度,探索CD发生时肠道局部炎症对于菌群谱的影响。
④纵向比较上述差异菌种在CD患者炎症部位不同类型组织样本中的丰度,并利用生物信息学方法计算模拟不同部位特定菌群谱形成的可能来源,探索CD发生时肠道及其附属器官组织内的菌群移位和空间分布情况。
⑤绘制CD患者炎症部位不同类型组织样本中菌群相互作用网络图,分析在CD肠道炎症发生时不同部位中的关键菌种空间分布。
1.4组织细菌-宿主蛋白质分子互作关系研究:
①根据CD患者肠道及其附属器官炎症部位不同组织中菌群丰度及蛋白质表达量的绘制丰度/表达量变化曲线图并进行比较,寻找丰度/表达量变化趋势相似的菌群簇及蛋白质分子簇。
②对上述菌群簇以及蛋白质簇进行通路富集分析,探究其代表的不同组织部位中宿主功能变化状态以及对细菌种群的影响。
③根据CD患者肠道及其附属器官不同组织样本中菌群丰度及蛋白质表达量的情况以及已有数据库,绘制细菌-蛋白质分子相互作用关系网络图,探究在肠道炎症发生时不同组织部位发挥关键作用的菌种及蛋白质分子。
④纵向比较CD患者肠道及其附属器官炎症部位不同组织中关键的相互作用的蛋白质分子及菌种,探究该种相互作用方式在CD肠炎发生过程中菌群移位中的作用。
1.5验证上述关键蛋白质分子和菌种在CD患者外周血清和粪便中的富集情况:
收集30例活动期CD患者及30例健康对照者的配对的外周血血清样本及粪便样本,利用非靶向蛋白组学技术检测上述研究中找出的关键蛋白质分子,利用16S rRNA检测技术分析样本中的菌群组成,检测上述研究中找出的关键菌种的丰度,评估其作为CD疾病诊断标志物的灵敏度和特异度;收集CD患者的临床信息,如年龄、性别、疾病行为、用药情况、合并症等信息,利用统计学方法研究上述关键蛋白质分子和关键菌种的变化与患者临床症状或治疗方法的相关性。最终找到5个在CD患者外周血中存在差异表达(如图1~7所示),且与粪便相应菌种有较好相关性的关键蛋白质分子,如下表1所示:
表1
2.新型生物标志物诊断效能验证:
2.1样本收集:
对克罗恩病患者和非克罗恩病患者(或健康受试者)进行内镜检查,克罗恩病患者病变呈节段性或跳跃性,早期患者为鹅口疮样溃疡,随后溃疡范围可扩大、融合,形成沿肠道长轴的纵行裂隙状溃疡,将黏膜分割为鹅卵石样外观;采集患者肠道内病变部位黏膜组织,并由两位以上专业病理科医生进行复核,克罗恩病病变黏膜组织的特点为由类上皮细胞和多核巨细胞构成的非干酪样肉芽肿,深达黏膜下层甚至肌层的裂隙状溃疡,伴有固有层和黏膜下层大量淋巴细胞聚集、淋巴管扩张、神经节炎等。根据内镜检查结果及组织病理学检查结果可将受试者区分为克罗恩病患者和非克罗恩病患者。
2.2受试者外周血清样本收集和分析:
实验目的:获取30例克罗恩病患者和30例健康对照者的外周血清样品, ELISA方法检测CD患者外周血清其中上述五种可溶性蛋白质分子的表达量(包括SAA2、IGFBP2、GOLM1、DPP4和GBP1),并与对照组受试者外周血清样品中相应的蛋白质分子的表达量进行比较。对照为非克罗恩病的健康受试者。
实验方法:酶联免疫吸附法:用事先制备好的目标可溶性蛋白质分子所对应的抗体包被酶标板,制成固相载体;向包被抗体的微孔中加入预先稀释好的标准品和受试者血清,使目的可溶性蛋白质分子(包括SAA2、IGFBP2、GOLM1、 DPP4和GBP1)与固定的抗体结合,洗去未结合的样品,加入辣根过氧化物酶标记的检测抗体,经过孵育使酶标记的检测抗体与受试者血清中的目标蛋白质分子结合,从而固定在微孔板上。未结合的酶标记物被彻底洗涤后,用底物TMB 显色。TMB在过氧化物酶的催化下形成蓝色的阳离子产物,加酸终止反应后蓝色转变为黄色。颜色的深浅和样品中目标可溶性蛋白质分子浓度呈正相关。用酶标仪在450nm波长下测定OD值,计算样品中可溶性蛋白质分子的浓度。
数据分析:对上述30例克罗恩病患者和30例健康对照者(两组受试者年龄和性别匹配)外周血血清中的目标可溶性蛋白质分子的表达水平进行检测比较,经过ROC曲线分析,并于临床中用于评估克罗恩病患者疾病活动性的标志物C-反应蛋白(CRP)进行比较,其中CRP的AUC值为0.890,而SAA2的 AUC值为0.890,GBP1的AUC值为0.902,IGFBP2的AUC值为0.913,GOLM1 的AUC值为0.917,DPP4的AUC值为0.920。
图2是SAA2作为标志物诊断克罗恩病的ROC曲线图,并与CRP进行比较,表2为曲线下的面积的计算。
表2图2曲线下的面积
(注:检验结果变量:CRP在正的和负的实际状态组之间至少有一个结。统计量可能会出现偏差。 a.在非参数假设下;b.零假设:实面积=0.5。)
图3是GBP1作为标志物诊断克罗恩病的ROC曲线图,并与CRP进行比较,表3为曲线下的面积的计算。
表3图3曲线下的面积
(注:检验结果变量:CRP在正的和负的实际状态组之间至少有一个结。统计量可能会出现偏差。 a.在非参数假设下;b.零假设:实面积=0.5。)
图4是IGFBP2作为标志物诊断克罗恩病的ROC曲线图,并与CRP进行比较,表4为曲线下的面积的计算。
表4图4曲线下的面积
(注:检验结果变量:CRP在正的和负的实际状态组之间至少有一个结。统计量可能会出现偏差。 a.在非参数假设下;b.零假设:实面积=0.5。)
图5是GOLM1作为标志物诊断克罗恩病的ROC曲线图,并与CRP进行比较,表5为曲线下的面积的计算。
表5图5曲线下的面积
(注:检验结果变量:CRP在正的和负的实际状态组之间至少有一个结。统计量可能会出现偏差。 a.在非参数假设下;b.零假设:实面积=0.5。)
图6是DPP4作为标志物诊断克罗恩病的ROC曲线图,并与CRP进行比较,曲线下的面积的计算。
表6图6曲线下的面积
(注:检验结果变量:CRP在正的和负的实际状态组之间至少有一个结。统计量可能会出现偏差。 a.在非参数假设下;b.零假设:实面积=0.5。)
图7是SAA2、DPP4、IGFBP2、GOLM1和GBP1作为标志物诊断克罗恩病的平均ROC曲线图,并与CRP进行比较。
随后比较克罗恩病患者外周血清中目标可溶性蛋白质分子与CRP之间的相关性。图8是SAA2在克罗恩病患者外周血清中与CRP表达量的相关程度分析;图9是GBP1在克罗恩病患者外周血清中与CRP表达量的相关程度分析;图10 是IGFBP2在克罗恩病患者外周血清中与CRP表达量的相关程度分析;图11是 GOLM1在克罗恩病患者外周血清中与CRP表达量的相关程度分析;图12是 DPP4在克罗恩病患者外周血清中与CRP表达量的相关程度分析。根据统计学分析均具有显著性(p值均小于0.01),其中SAA2与CRP的相关性系数值为 0.906,GOLM1与CRP的相关性系数值为0.556,IGFBP2与CRP的相关性系数值为0.137,GBP1与CRP的相关性系数值为0.411,均为显著正相关;DPP4 与CRP的相关性系数值为-0.527,为显著负相关。
基于上述研究成果,本发明提出SAA2、DPP4、GOLM1、IGFBP2或GBP1 蛋白质分子中的一种或几种可作为血清学生物标志物应用于克罗恩病的临床诊断中。
本领域的普通技术人员可以理解,上述各实施方式是实现本发明的具体实施例,而在实际应用中,可以在形式上和细节上对其作各种改变,而不偏离本发明的精神和范围。
Claims (8)
1.检测蛋白生物标志物表达水平的试剂在制备克罗恩病临床诊断试剂盒中的应用,所述蛋白生物标志物为SAA2、DPP4、GOLM1、IGFBP2和GBP1蛋白质分子;所述试剂盒通过检测所述蛋白生物标志物在受试者外周血血清中的表达水平,判断受试者是否患有克罗恩病。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,当受试者外周血血清中SAA2、GOLM1、IGFBP2和GBP1表达水平升高,且DPP4表达水平降低,指示所述受试者患有克罗恩病。
3.一种用于克罗恩病临床诊断的试剂盒,其特征在于,包括检测蛋白生物标志物表达水平的试剂,所述蛋白生物标志物为SAA2、DPP4、GOLM1、IGFBP2和GBP1蛋白质分子;
所述试剂盒通过检测所述蛋白生物标志物在受试者外周血血清中的表达水平,判断受试者是否患有克罗恩病。
4.根据权利要求3所述的用于克罗恩病临床诊断的试剂盒,其特征在于,当受试者外周血血清中SAA2、GOLM1、IGFBP2和GBP1表达水平升高,且DPP4表达水平降低,指示所述受试者患有克罗恩病。
5.根据权利要求3所述的用于克罗恩病临床诊断的试剂盒,其特征在于,所述检测蛋白生物标志物表达水平的试剂包括:基于免疫检测技术检测所述蛋白生物标志物表达水平的试剂。
6.根据权利要求5所述的用于克罗恩病临床诊断的试剂盒,其特征在于,所述基于免疫检测技术检测所述蛋白生物标志物表达水平的试剂至少包括与所述蛋白生物标志物特异性结合的抗体。
7.一种用于克罗恩病临床诊断的模块,其特征在于,包括诊断指标输入模块和克罗恩病状态评估模块;
所述诊断指标输入模块至少包括获取蛋白生物标志物在受试者外周血血清中的表达水平,所述蛋白生物标志物为SAA2、DPP4、GOLM1、IGFBP2和GBP1蛋白质分子;
所述克罗恩病状态评估模块至少包括将所述诊断指标输入模块获取的所述蛋白生物标志物在受试者外周血血清中的表达水平输入诊断模型得出得分值;将所获得的得分值与预先设定的诊断模型的截断值比较,输出受试者克罗恩病状态的评估结果;所述克罗恩病状态包括诊断模型预先设定的克罗恩病相关状态。
8.一种用于筛选治疗克罗恩病的药物的方法,其特征在于,包括:
在测试组中,向待测对象使用待测试药物,检测测试组中来源于所述对象的外周血血清样品中蛋白生物标志物的表达水平V1;在对照组中,向待测对象使用空白对照药物,检测对照组中来源于所述对象的外周血血清样品中蛋白生物标志物的表达水平V2;比较检测所得到的蛋白生物标志物V1和V2,从而确定所述测试药物是否具有治疗克罗恩病的效能;
所述蛋白生物标志物为SAA2、DPP4、GOLM1、IGFBP2和GBP1蛋白质分子。
Priority Applications (6)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202311516863.XA CN117517676A (zh) | 2022-09-23 | 2022-09-23 | 蛋白生物标志物golm1在克罗恩病临床诊断中的应用 |
CN202311516851.7A CN117517675A (zh) | 2022-09-23 | 2022-09-23 | 蛋白生物标志物saa2在克罗恩病临床诊断中的应用 |
CN202311520855.2A CN117538542A (zh) | 2022-09-23 | 2022-09-23 | 蛋白生物标志物igfbp2在克罗恩病临床诊断中的应用 |
CN202211168032.3A CN115932272B (zh) | 2022-09-23 | 2022-09-23 | 血清学生物标志物在克罗恩病临床诊断中的应用 |
CN202311518116.XA CN117607452A (zh) | 2022-09-23 | 2022-09-23 | 蛋白生物标志物gbp1在克罗恩病临床诊断中的应用 |
CN202311518053.8A CN117554614A (zh) | 2022-09-23 | 2022-09-23 | 蛋白生物标志物dpp4在克罗恩病临床诊断中的应用 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202211168032.3A CN115932272B (zh) | 2022-09-23 | 2022-09-23 | 血清学生物标志物在克罗恩病临床诊断中的应用 |
Related Child Applications (5)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN202311518053.8A Division CN117554614A (zh) | 2022-09-23 | 2022-09-23 | 蛋白生物标志物dpp4在克罗恩病临床诊断中的应用 |
CN202311518116.XA Division CN117607452A (zh) | 2022-09-23 | 2022-09-23 | 蛋白生物标志物gbp1在克罗恩病临床诊断中的应用 |
CN202311516851.7A Division CN117517675A (zh) | 2022-09-23 | 2022-09-23 | 蛋白生物标志物saa2在克罗恩病临床诊断中的应用 |
CN202311516863.XA Division CN117517676A (zh) | 2022-09-23 | 2022-09-23 | 蛋白生物标志物golm1在克罗恩病临床诊断中的应用 |
CN202311520855.2A Division CN117538542A (zh) | 2022-09-23 | 2022-09-23 | 蛋白生物标志物igfbp2在克罗恩病临床诊断中的应用 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN115932272A CN115932272A (zh) | 2023-04-07 |
CN115932272B true CN115932272B (zh) | 2023-12-12 |
Family
ID=86649614
Family Applications (6)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN202311518053.8A Pending CN117554614A (zh) | 2022-09-23 | 2022-09-23 | 蛋白生物标志物dpp4在克罗恩病临床诊断中的应用 |
CN202311516851.7A Pending CN117517675A (zh) | 2022-09-23 | 2022-09-23 | 蛋白生物标志物saa2在克罗恩病临床诊断中的应用 |
CN202311520855.2A Pending CN117538542A (zh) | 2022-09-23 | 2022-09-23 | 蛋白生物标志物igfbp2在克罗恩病临床诊断中的应用 |
CN202211168032.3A Active CN115932272B (zh) | 2022-09-23 | 2022-09-23 | 血清学生物标志物在克罗恩病临床诊断中的应用 |
CN202311518116.XA Pending CN117607452A (zh) | 2022-09-23 | 2022-09-23 | 蛋白生物标志物gbp1在克罗恩病临床诊断中的应用 |
CN202311516863.XA Pending CN117517676A (zh) | 2022-09-23 | 2022-09-23 | 蛋白生物标志物golm1在克罗恩病临床诊断中的应用 |
Family Applications Before (3)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN202311518053.8A Pending CN117554614A (zh) | 2022-09-23 | 2022-09-23 | 蛋白生物标志物dpp4在克罗恩病临床诊断中的应用 |
CN202311516851.7A Pending CN117517675A (zh) | 2022-09-23 | 2022-09-23 | 蛋白生物标志物saa2在克罗恩病临床诊断中的应用 |
CN202311520855.2A Pending CN117538542A (zh) | 2022-09-23 | 2022-09-23 | 蛋白生物标志物igfbp2在克罗恩病临床诊断中的应用 |
Family Applications After (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN202311518116.XA Pending CN117607452A (zh) | 2022-09-23 | 2022-09-23 | 蛋白生物标志物gbp1在克罗恩病临床诊断中的应用 |
CN202311516863.XA Pending CN117517676A (zh) | 2022-09-23 | 2022-09-23 | 蛋白生物标志物golm1在克罗恩病临床诊断中的应用 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (6) | CN117554614A (zh) |
Citations (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN110174513A (zh) * | 2019-04-15 | 2019-08-27 | 中山大学附属第一医院 | Tgm2在制备监测克罗恩病疾病活动的生物标志物中的应用 |
US20200149087A1 (en) * | 2017-03-23 | 2020-05-14 | Meharry Medical College | Methods for diagnosing and treating inflammatory bowel disease |
CN111733226A (zh) * | 2020-03-09 | 2020-10-02 | 苏州市立医院 | 一种检测克罗恩病的环状rna标志物及应用 |
CN113189335A (zh) * | 2021-06-17 | 2021-07-30 | 上海中乔新舟生物科技有限公司 | 血清淀粉样蛋白a2在制备检测肺癌试剂盒中的应用 |
CN114317725A (zh) * | 2022-02-15 | 2022-04-12 | 同济大学 | 克罗恩病生物标志物、试剂盒及生物标志物的筛选方法 |
US20220291238A1 (en) * | 2021-03-12 | 2022-09-15 | Janssen Biotech, Inc. | Methods for Predicting Treatment Response in Ulcerative Colitis |
-
2022
- 2022-09-23 CN CN202311518053.8A patent/CN117554614A/zh active Pending
- 2022-09-23 CN CN202311516851.7A patent/CN117517675A/zh active Pending
- 2022-09-23 CN CN202311520855.2A patent/CN117538542A/zh active Pending
- 2022-09-23 CN CN202211168032.3A patent/CN115932272B/zh active Active
- 2022-09-23 CN CN202311518116.XA patent/CN117607452A/zh active Pending
- 2022-09-23 CN CN202311516863.XA patent/CN117517676A/zh active Pending
Patent Citations (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20200149087A1 (en) * | 2017-03-23 | 2020-05-14 | Meharry Medical College | Methods for diagnosing and treating inflammatory bowel disease |
CN110174513A (zh) * | 2019-04-15 | 2019-08-27 | 中山大学附属第一医院 | Tgm2在制备监测克罗恩病疾病活动的生物标志物中的应用 |
CN111733226A (zh) * | 2020-03-09 | 2020-10-02 | 苏州市立医院 | 一种检测克罗恩病的环状rna标志物及应用 |
US20220291238A1 (en) * | 2021-03-12 | 2022-09-15 | Janssen Biotech, Inc. | Methods for Predicting Treatment Response in Ulcerative Colitis |
CN113189335A (zh) * | 2021-06-17 | 2021-07-30 | 上海中乔新舟生物科技有限公司 | 血清淀粉样蛋白a2在制备检测肺癌试剂盒中的应用 |
CN114317725A (zh) * | 2022-02-15 | 2022-04-12 | 同济大学 | 克罗恩病生物标志物、试剂盒及生物标志物的筛选方法 |
Non-Patent Citations (3)
Title |
---|
肠内营养支持对克罗恩病营养障碍患者IGF-I、IGF-IR及IGFBP-5水平的影响;赵威;鲁英杰;黄爱洁;王新;杨梅;;现代生物医学进展(第31期);第6091-6094页 * |
血清淀粉样蛋白A(SAA)水平检测在临床实验诊断及健康监测中的应用;李福刚;雷蕾;石晓强;杨晶;王鼎;王东旭;尚勇;顾敏晔;蒋瑾瑾;薛汉阳;;现代检验医学杂志(第03期);第7-11页 * |
血清淀粉样蛋白A在炎症性肠病中的价值;胡玲珍;陈志芬;;胃肠病学和肝病学杂志(第09期);第78-81页 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN117517676A (zh) | 2024-02-06 |
CN117554614A (zh) | 2024-02-13 |
CN117538542A (zh) | 2024-02-09 |
CN115932272A (zh) | 2023-04-07 |
CN117517675A (zh) | 2024-02-06 |
CN117607452A (zh) | 2024-02-27 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Do et al. | Dual transcriptomic and epigenomic study of reaction severity in peanut-allergic children | |
WO2010045180A1 (en) | Biomarkers for inflammatory bowel disease and methods using the same | |
BR122019026188B1 (pt) | Métodos para determinar se um indivíduo com esteatose não alcoólica tem esteato-hepatite não alcoólica e para monitorar um indivíduo com esteatose não alcoólica para o desenvolvimento de nash | |
CN113151483B (zh) | 结直肠癌代谢基因预后预测模型 | |
Liu et al. | Metagenome-wide association study of gut microbiome revealed potential microbial marker set for diagnosis of pediatric myasthenia gravis | |
US20170059581A1 (en) | Methods for diagnosis and prognosis of inflammatory bowel disease using cytokine profiles | |
WO2015164616A1 (en) | Biomarkers for detection of tuberculosis | |
CN115932272B (zh) | 血清学生物标志物在克罗恩病临床诊断中的应用 | |
CN116287220B (zh) | 用于快速诊断川崎病的分子生物标志物和分析方法 | |
Barnes et al. | Use of blood based biomarkers in the evaluation of Crohn’s disease and ulcerative colitis | |
CN114758719B (zh) | 一种结直肠癌预测系统及其应用 | |
Kang et al. | Diagnosis of Crohn’s disease and ulcerative colitis using the microbiome | |
CN112481380B (zh) | 一种评估晚期膀胱癌抗肿瘤免疫治疗反应性和预后生存的标志物及其应用 | |
CN115436633A (zh) | 一种结直肠癌检测的生物标志物及其应用 | |
Su et al. | A comparison of the microbiome composition in lower respiratory tract at different sites in early lung cancer patients | |
Bukauskas et al. | Values of circulating molecular biomarkers (microRNAs) for the evaluation of renal failure during urgent abdominal sepsis anaesthesia | |
Stefanovic et al. | Tubular marker excretion in children from families with Balkan nephropathy | |
Chen et al. | Advances in clinical detection methods and nanomaterials for autoimmune liver diseases | |
Chouik et al. | Circulating microRNAs improve bacterial infection diagnosis and overall survival prediction in acute decompensation of liver cirrhosis | |
CN116042806B (zh) | 生物标志物在Cronkhite-Canada综合征诊断中的应用 | |
US20230402131A1 (en) | Biomarker and diagnosis system for colorectal cancer detection | |
US11767562B2 (en) | Circulating serum cell-free DNA biomarkers and methods | |
Schwenger et al. | Links between gut microbiome, metabolome, clinical variables and non‐alcoholic fatty liver disease severity in bariatric patients | |
WO2016205740A1 (en) | Methods and compositions for diagnosis and prognosis of appendicitis and differentiation of causes of abdominal pain | |
Muñoz-Villafranca et al. | P035 Potential biomarkers for diagnosis through proteomics, in patients with Inflammatory Bowel Disease |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
GR01 | Patent grant | ||
GR01 | Patent grant |