CN115768458A - CEBP-β拮抗剂的施用和使用方法 - Google Patents

CEBP-β拮抗剂的施用和使用方法 Download PDF

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Abstract

提供了施用CCAAT/增强子结合蛋白β(C/EBPβ)肽拮抗剂的方法和通过施用C/EBPβ肽拮抗剂来治疗实体瘤的方法。

Description

CEBP-β拮抗剂的施用和使用方法
相关申请的交叉引用
本申请要求2020年6月21日提交的美国临时申请号63/041,986、63/041,988、63/041,989、63/041,990和63/041,991,以及2021年4月8日提交的美国临时申请号63/172,560的权益,所有这些临时申请都以引用的方式整体并入本文。
背景技术
CCAAT-增强子结合蛋白β(C/EBPβ)是一种在诸如分化、炎症、细胞存活和新陈代谢的细胞过程中发挥作用的转录因子。C/EBPβ被上调或过度激活以促进肿瘤存活和增殖并抑制许多不同癌症,包括乳腺癌、胶质母细胞瘤、前列腺癌和多发性骨髓瘤的分化(Homma2006,Kim 2008,Pal 2009,Zahnow 2009,Aguilar-Morante 2011)。另外,已经证明C/EBPβ与疾病预后和生存呈负相关。由于C/EBPβ在细胞增殖和分化调节中的作用(Lekstrom-Himes 1998;Lamb 2003),以及C/EBPβ在许多类型的癌症中的表达或激活增加(Oya 2003;Homma 2006;Zahnow 2009),C/EBPβ被认为是治疗干预的潜在靶标。然而,部分由于靶向转录因子的困难,在本发明之前没有有效的C/EBPβ抑制剂进入临床开发阶段。
序列表
本申请含有序列表,所述序列表以ASCII格式以电子方式提交并特此以引用的方式整体并入。ASCII副本创建于2021年6月18日,名为Sapience_013_WO1_SL.txt并且大小为2,047字节。
发明内容
本发明的一些主要方面总结如下。在本公开的具体实施方式、实施例、附图和权利要求部分中描述了另外的方面。本公开的每个部分中的描述意图结合其他部分来阅读。此外,本公开的每个部分中所描述的各种实施方案可以各种不同的方式进行组合,并且所有此类组合都意图落入本发明的范围内。
本公开提供了一种治疗患者的实体瘤的方法,所述方法包括向患者胃肠外施用包含有效量的CCAAT-增强子结合蛋白β(C/EBPβ)肽拮抗剂的药物组合物。还提供了一种用于胃肠外施用的药物组合物,所述药物组合物包含有效量的C/EBPβ肽拮抗剂以用于治疗患者的实体瘤。肽拮抗剂优选以约0.5-16mg/kg的剂量施用于患者。
在一个实施方案中,实体瘤是黑色素瘤、癌或肉瘤。在某些实施方案中,患者已被诊断患有局部晚期或转移性乳腺癌(LA/MBC)、黑色素瘤、胶质母细胞瘤(GBM)或去势抵抗性前列腺癌(CRPC)。
在一些情况下,患者已接受选自由以下组成的组的先前治疗:化学疗法、基于激素的疗法、免疫疗法、靶向疗法及其组合。在一个实施方案中,先前治疗是用于患者诊断的标准治疗(标准护理治疗)。
在一个实施方案中,C/EBPβ肽拮抗剂包含D-氨基酸序列VAEAREELERLEARLGQARGEL(SEQ ID NO:4)。在一个实施方案中,肽拮抗剂包含氨基酸序列LEGRAQGLRAELRELEERAEAV(SEQ ID NO:3)。肽拮抗剂可为细胞穿透肽。在一个特定的实施方案中,肽拮抗剂是ST101。
本发明的特定方法包括治疗患者的黑色素瘤、HRposLA/MBC、原发GBM或CRPC的方法,所述方法包括通过静脉内输注向患者施用包含有效量的ST101的药物组合物。还提供了一种用于静脉内输注的药物组合物,所述药物组合物包含有效量的ST101以用于治疗患者的黑色素瘤、HRposLA/MBC、原发GBM或CRPC。
在优选的实施方案中,患者是人患者。
在某些实施方案中,患者在施用ST101之前已接受至少一线疗法。
在一个实施方案中,患者患有在用免疫检查点抑制剂治疗之后或治疗时进展的晚期/转移性黑色素瘤。在一个实施方案中,患者患有包含BRAF突变的黑色素瘤,并且其中患者已接受至少一线靶向疗法。
在一个实施方案中,GBM在先前通过最大限度的手术切除、放射疗法以及替莫唑胺(temozolomide)联合放射疗法或辅助化学疗法联合替莫唑胺治疗后复发或进展。
在一个实施方案中,患者患有在先前用紫杉烷、阿比特龙(abiraterone)、达洛鲁胺(daralutamide)和/或恩杂鲁胺(enzalutamide)/阿帕鲁胺(apalutamide)治疗后进展的CRPC。
在某些实施方案中,向患者静脉内,例如通过输注施用药物组合物。在一些实施方案中,总输注持续时间为约30分钟至约360分钟,或约60分钟至约360分钟或约60分钟至约180分钟。
在一个方面,药物组合物每周施用一次。在另一方面,药物组合物每两周施用一次。可施用药物组合物至少约三周或至少约四周。
本发明的一些实施方案包括施用一种或多种二级剂。例如,二级剂选自由以下组成的组:抗组胺剂、白三烯抑制剂、非类固醇抗炎药、对乙酰氨基酚、皮质类固醇、抗恶心药、静脉内盐水、电解质及其组合。可在施用药物组合物的同时、之前或之后向受试者施用一种或多种二级剂。在一个特定的实施方案中,在施用药物组合物之前约48小时内向受试者施用抗组胺剂和/或白三烯抑制剂。
在某些实施方案中,药物组合物包含缓冲液和填充剂。在一个特定的实施方案中,药物组合物包含乳酸和海藻糖。药物组合物的pH可为例如约3.0-8.0。
在本发明的一些实施方案中,ST101的清除率为每小时0.75-3.5升。在一些实施方案中,ST101的半衰期(t1/2)为10-70小时。
附图说明
图1示出了ST101的作用机制。C/EBPβ驱动肿瘤细胞增殖和存活,并抑制多种细胞类型的分化。ST101扰乱C/EBPβ与辅因子诸如ATF5的相互作用,从而剥夺细胞的致癌信号并导致选择性肿瘤细胞死亡。
图2示出了与C/EBPβ(底部)结合的ST101(顶部)的模型化结构。在分子操作环境(MOE)中,使用与C/EBPβ结合的ATF4晶体结构作为模型(PDB ID 1ci6)来生成所述结构。
图3示出了圆二色性(CD)光谱,表明ST101与C/EBPβ相互作用(图A)但不与ATF5相互作用(图B)。示出了ST101(顶部灰线,图A和图B)、C/EBPβ(浅灰色线,图A)和ATF5(浅灰色线,图B)的个别光谱。黑线表示实际ST101+C/EBPβ(图A)或ST101+ATF5(图B)观察结果,而虚线表示两个各自个别光谱的均值。
图4示出了细胞热转移测定,表明ST101与U251人胶质母细胞瘤细胞中的C/EBPβ缔合。示出了C/EBPβ/β-微管蛋白表达的蛋白质印迹(图A)和密度量化(图B)。
图5示出了C/EBPβ优先与ST101而非ATF5相互作用,如在一定波长范围内的摩尔残基椭圆率(MRE)所示。图A中220nm处的最低线示出了ST101+C/EBPβ的光谱;图B中的最高线示出了ST101+ATF5的光谱。浅灰色线示出了ATF5(图A中220nm处的顶部线)或C/EBPβ(图B中220nm处的底部线)的个别光谱。黑线示出了与ATF5一起孵育的ST101+C/EBPβ的实际光谱,而虚线表示ST101+C/EBPβ和ATF5光谱的均值(图A)或ST101+ATF5和C/EBPβ光谱的均值(图B)。
图6示出了ST101扰乱C/EBPβ与ATF5的相互作用。图A中示出了ATF5与C/EBPβ结合。图B中示出了ST101对ATF5与C/EBPβ结合的抑制。
图7示出了ST101穿过小鼠的血脑屏障。代表性图像显示出在微血管和神经胶质细胞中的ST101(通过DAB(3,3-二氨基联苯胺)染色鉴别)(箭头,图B),并且在媒介物处理的对照中不存在染色(图A)。
图8示出了实施例6中所描述的研究的状态。PR=部分反应(至少减少30%);SD=稳定疾病(减少少于30%,并且增加少于20%)。
图9示出了如实施例6中所描述的,第1天输注后队列1-4患者的第1周期和第2周期的ST101血浆浓度。ST101以0.5mg/kg(队列1)、1mg/kg(队列2)、2mg/kg(队列3)或4mg/kg(队列4)的剂量施用。
图10示出了如实施例6中所描述的,第1天输注后队列1-4的个别患者的ST101的Cmax(图A)和AUC0-t(图B)。ST101以0.5mg/kg(队列1)、1mg/kg(队列2)、2mg/kg(队列3)或4mg/kg(队列4)的剂量施用。
图11示出了如实施例6中所描述的,输注后队列1-4患者的四小时处的ST101血浆浓度。ST101以0.5mg/kg(队列1)、1mg/kg(队列2)、2mg/kg(队列3)或4mg/kg(队列4)的剂量施用。
图12示出了随着ST101剂量的增加,肿瘤活检中的ST101摄取增加(组A-C)。对在治疗的第2周期期间从患者收集的活检样品进行处理,并使用兔多克隆抗ST101抗体对ST101进行免疫测定。显示出ST101染色的细胞百分比是由委员会认证的病理学家确定(组D)。基于ST101染色阳性的样品中的细胞数量来分配得分:0=阴性;1=1-10%;2=11-25%;3=26-50%;4=51-75%;5=76-100%。
图13示出了在用ST101治疗后患者活检中的肿瘤细胞增殖减少。对在治疗前(筛检)和治疗第2周期之后从患者收集的活检样品进行处理并对Ki67进行免疫测定。图A中的图像示出了来自治疗之前(上图)和治疗第2周期之后(下图)队列3中患者的活检样品的染色。Ki67的更高表达表明肿瘤细胞的更大增殖。队列1-3中每个队列的患者的显示出Ki67染色的细胞百分比是由委员会认证的病理学家确定(组B)。基于Ki67信号的强度以0-3的尺度分配得分:0=阴性;1=轻度;2=中度;3=强度。
具体实施方式
除非另外说明,否则本发明的实践可采用药剂学、配方科学、蛋白质化学、细胞生物学、细胞培养、分子生物学、微生物学、重组DNA、免疫学、临床药理学和临床实践的常规技术,这些技术在本领域的技术范围内。
为了能够更容易地理解本发明,首先定义某些术语。额外定义在整个本公开中阐述。除非另外定义,否则本文中所用的所有技术和科学术语具有与本发明相关领域的普通技术人员通常理解的含义相同的含义。
本文提供的任何标题不限制本发明的各种方面或实施方案,这些方面或实施方案可通过整体参考本说明书而得。因此,下文直接定义的术语通过整体参考本说明书被更详细地定义。
本公开中所引用的所有参考文献特此以引用的方式整体并入。另外,本文所引用或提及的任何产品的任何制造商的说明或目录都以引用的方式并入。以引用的方式并入此文本的文件或其中的任何教导可用于实践本发明。以引用的方式并入此文本的文件不被承认为现有技术。
I.定义
本公开中的措词或术语目的在于说明而非限制,因此技术人员将会根据教导和指导来对本说明书的术语或措词进行解释。
除非上下文另外明确规定,否则如本说明书和所附权利要求书中所用的单数形式“一个(种)(a/an)”和“所述(the)”包括复数指示物。术语“一个(种)(a)”(或“一个(种)(an)”)以及术语“一个(种)或多个(种)”和“至少一个(种)”在本文中可互换使用。
此外,“和/或”应视为具体公开两种特定特征或组分的每一者,并且公开或未公开另一者。因此,在诸如“A和/或B”的短语中所用的术语“和/或”意图包括A和B、A或B、A(单独)和B(单独)。同样,在诸如“A、B和/或C”的短语中所用的术语“和/或”意图包括A、B和C;A、B或C;A或B;A或C;B或C;A和B;A和C;B和C;A(单独);B(单独);和C(单独)。
每当在用语言“包含”来描述实施方案时,包括以“由......组成”和/或“主要由......组成”描述的其他类似实施方案。
单位、前缀和符号以其Système International d’Unités(SI)可接受的形式表示。数值范围包括定义所述范围的数字,并且本文所提供的任何个别值可充当包括本文所提供的其他个别值的范围的端点。例如,诸如1、2、3、8、9和10的一组值也公开了1-10、1-8、3-9等数字范围。同样,所公开的范围公开了由所述范围涵盖的每个个别值(即,中间值),包括整数和分数。例如,5-10的规定范围也分别公开了5、6、7、8、9和10,以及5.2、7.5、8.7等。
除非另外说明,否则在一系列要素之前的术语“至少”或“约”应理解为指所述系列中的每个要素。数值前的术语“约”包括所述值的±10%。例如,约1mg/mL的浓度包括0.9mg/mL至1.1mg/mL。同样,约1%至10%(重量/体积)的浓度范围包括0.9%(重量/体积)至11%(重量/体积)。
术语“多肽”、“肽”和“蛋白质”可互换地用于指任何长度的氨基酸聚合物及其盐。聚合物可为直链或支链的,可包含修饰的氨基酸,并且可间杂有非氨基酸。除非另外说明,例如,对于本文所示的不常见或非天然氨基酸的缩写,如本领域中所用的三字母和单字母缩写在本文中用于表示氨基酸残基。除非前面有“D”或小写字母,否则氨基酸是L-氨基酸。氨基酸缩写组或串用于表示肽。除非特别指明,否则肽用左边的N末端表示,并且序列从N末端到C末端进行书写。
“逆反”肽具有相对于参考L-氨基酸序列的反向氨基酸序列,并且由所有D-氨基酸(反转氨基酸亚基的α-中心手性)构成,以帮助保持与原始L-氨基酸肽相似的侧链拓扑。
“分离的”分子是呈自然界中不存在的形式的分子,包括已经纯化的那些分子。
“结合亲和力”通常指分子的单个结合位点与其结合配偶体(例如受体及其配体、抗体及其抗原、形成二聚体的两个单体等)之间的非共价相互作用总和的强度。除非另外说明,否则如本文所用的“结合亲和力”是指反映结合对的成员之间1:1相互作用的内在结合亲和力。分子X对其配偶体Y的亲和力通常可用解离常数(KD)来表示。亲和力可通过本领域已知的常用方法(包括本文中描述的那些方法)进行测量。低亲和力的结合配偶体通常结合缓慢并且倾向于容易解离,而高亲和力的结合配偶体通常结合更快并且倾向于保持更长时间的结合。
分子对其结合配偶体的亲和力或亲合力可使用本领域已知的任何合适的方法,例如流式细胞术、酶联免疫吸附测定(ELISA)或放射免疫测定(RIA)或动力学(例如
Figure BDA0004005490120000081
或BIACORETM
Figure BDA0004005490120000082
分析)通过实验确定。可容易地使用直接结合测定以及竞争性结合测定形式。(参见例如Berzofsky等人,“Antibody-Antigen Interactions,”于Fundamental Immunology,Paul,W.E.,编,Raven Press:New York,N.Y.(1984);Kuby,Immunology,W.H.Freeman and Company:New York,N.Y.(1992))。如果在不同条件(例如盐浓度、pH、温度)下测量,则特定结合对相互作用的测量亲和力可变化。因此,亲和力和其他结合参数(例如KD或Kd、Kon、Koff)的测量是用如本领域已知的结合配偶体的标准化溶液和标准化缓冲液进行的。
“活性剂”是意图提供生物活性的成分。活性剂可与一种或多种其他成分缔合。作为肽的活性剂还可称为“活性肽”。
活性剂的“有效量”是足以实现特别规定目的的量。
术语“药物组合物”是指呈允许活性成分的生物活性有效的形式的制剂,并且所述制剂不含对将施用组合物的受试者具有不可接受的毒性的额外组分。此类组合物可为无菌的并且可包含药学上可接受的载剂,诸如生理盐水。合适的药物组合物可包含以下中的一种或多种:缓冲液(例如乙酸盐、磷酸盐或柠檬酸盐缓冲液)、表面活性剂(例如聚山梨醇酯)、稳定剂(例如多元醇或氨基酸)、防腐剂(例如苯甲酸钠)和/或其他常规增溶剂或分散剂。
“受试者”或“个体”或“动物”或“患者”或“哺乳动物”是需要诊断、预后或治疗的任何受试者,特别是哺乳动物受试者。哺乳动物受试者包括人、家畜、农场动物、运动动物和实验室动物,包括例如人、非人灵长类动物、犬科动物、猫科动物、猪、牛、马、啮齿动物,包括大鼠和小鼠、兔等。
诸如“治疗(treating/treatment/to treat)”或“缓解(alleviating/toalleviate)”的术语是指治愈、减缓、减轻诊断的病理学病状或病症的症状,和/或停止诊断的病理学病状或病症的进展的治疗措施。在某些实施方案中,如果患者表现出与疾病或病症相关的至少一种症状或可测量的身体参数的全部、部分或瞬时的缓解或消除,则成功地“治疗”了受试者的疾病或病症。
“对照患者”是未接受本发明的治疗的受试者。“对照群体”或“对照患者群体”是一组未接受本发明的治疗的受试者。对照患者或对照群体中的受试者患有和与对照患者或对照群体进行比较的受试者相同的疾病或病症。例如,将接受本发明的药物组合物或方法的癌症患者的临床结果与未接受本发明的药物组合物或方法的患有相同类型癌症的受试者的平均(中值)结果进行比较。在一些实施方案中,对照患者或对照群体中的患者已接受除本发明的治疗之外的治疗,例如标准护理治疗。
“拮抗剂”是防止、阻断、抑制、中和或降低另一种分子(诸如受体或配体)的生物活性或作用的物质。
术语“抑制”、“阻断”和“阻遏”可互换使用并且是指发生或活动的任何统计学上显著减少,包括发生或活动的完全阻断。例如,“抑制”可指活动或发生减少约10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或100%。“抑制剂”是使过程、路径或分子的发生或活动产生统计学上显著减少的分子、因子或物质。
“赘生性细胞”或“赘生物”通常经历了某种形式的突变/转化,从而导致与相同类型的正常细胞或组织相比异常的生长。赘生物包括形态学上的不规则性以及病理性增殖。赘生性细胞可为良性的或恶性的。恶性赘生物,即癌症,与良性赘生物的区别在于它们表现出细胞分化和定向的丧失,并且具有侵袭和转移的特性。
“肿瘤”或“实体瘤”是赘生性细胞(诸如癌细胞)团。术语“晚期”、“转移性”和“晚期/转移性”可互换用于描述恶性细胞已经从原始肿瘤迁移到患者体内的另一个位置(例如另一个器官)的癌症。
“药代动力学”或“PK”是指对受试者身体如何处理所施用物质的研究。PK测定包括物质如何进入血液循环(吸收)、如何分散或传播到全身的流体和组织(分布)、如何被身体识别和转化(新陈代谢)以及如何从体内去除(排泄)。所述物质可为药物,例如ST101。药代动力学可使用各种度量进行评价,其中许多度量是基于在施用物质后不同时间点的体内(例如血浆中)的物质量计算得出的。
施用后的时间从T0开始测量,T0是开始施用单剂量物质的时间。在药物组合物的施用在总输注期期间暂停并恢复一次或多次的情况下,T0是总输注期的开始。
“总输注持续时间”或“总输注期”是从单剂量药物组合物开始到施用结束的时间,并且包括输注期和中断期。
“Cmax”是指代施用后物质的峰值血浆浓度的药代动力学度量。
“Tmax”是指代物质开始施用(T0)后到达到Cmax的时间的药代动力学度量。
“Tlast”是指代物质最后可量化浓度的时间的药代动力学度量。
“AUC”或“曲线下面积”是描述血浆中物质浓度随时间的变化的药代动力学度量。可针对不同的时间段,例如从时间零到指定时间t(AUCt或AUC0-t)、从时间零到无穷大(AUC或AUC0-∞)等计算AUC。
“消除半衰期”或“半衰期”或
Figure BDA0004005490120000111
是指代物质浓度达到其原始值一半所需的时间的药代动力学度量。
“清除率”是指代每单位时间清除物质的血浆体积的药代动力学度量。
“Vz”是指代终末阶段期间的分布体积的药代动力学度量。
II.肽和组合物
C/EBPβ
转录因子(TF)占所有已知致癌基因的大约20%,并且与许多人类癌症有关(Lambert 2018)。然而,由于小分子无法影响TF活性且大分子无法在细胞内到达TF,因此TF历来被视为“无成药性”的靶标(Yan 2013;Bushweller 2019)。TF通常通过α螺旋碱性亮氨酸拉链(bZIP)结构域来二聚化,将它们的DNA结合结构域聚集在一起,以便与DNA内的关键共有序列进行有效的相互作用(Asada 2011;Potapov 2015)。扰乱这些TF蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)代表了对这类难以捉摸的靶标进行药物治疗的潜在的强大方法。最近,肽已成为一类能够以高亲和力和特异性靶向和扰乱TF相互作用的治疗剂,并证明了对多个先前“无成药性”的靶标的概念验证拮抗作用(Takada 2012;Walensky 2014;Bruzzoni-Giovanelli 2018;Lathbridge 2018;Demma 2019;Lathbridge 2019)。
C/EBPβ代表开发肽拮抗剂的首要靶标,因为它依赖于碱性亮氨酸拉链与辅因子的相互作用。为了与DNA缔合并反式激活基因表达,C/EBPβ通过它们的bZIP结构域之间的相互作用而与结合配偶体二聚。。除了同二聚化,C/EBPβ与含有bZIP的转录因子(诸如Jun/Fos、C/EBPγ(Huggins 2013)、δ-相互作用蛋白A(Bezy 2005)和CREB/ATF家族(Zhao 2014))形成异二聚体。
激活转录因子5(ATF5)是一种CREB/ATF因子,已确定其与HEK293和HCT116癌细胞中的C/EBPβ相关并激活C/EBPβ,导致促生存表型的反式激活(Zhang 2015)。ATF5在许多癌症,包括胶质瘤中高度表达,在所述癌症中,ATF5通过驱动Bcl-2家族蛋白和存活蛋白的过表达而促成致癌表型,但基本上不存在于分化的细胞类型中(Sheng 2010)。在胶质瘤和其他肿瘤细胞中缺乏DNA结合结构域的ATF5的截短的bZIP结构域的过表达导致癌细胞的细胞毒性(Angelastro 2006);施用含有截短的bZIP结构域的肽产生了类似的结果(Cates2016;Karpel-Massler 2016)。
C/EBPβ拮抗剂肽
在一些实施方案中,本发明的方法包括用有效量的C/EBPβ肽拮抗剂治疗患有实体瘤的患者。在一个实施方案中,C/EBPβ肽拮抗剂包含D-氨基酸序列VAEAREELERLEARLGQARGEL(SEQ ID NO:1),其是野生型ATF5 bZIP结构域的逆反变体。可例如,如实施例1中所描述的设计C/EBPβ肽拮抗剂。
C/EBPβ肽拮抗剂可为细胞穿透肽。在一个实施方案中,肽包含细胞穿透结构域。文献中描述并表征了许多细胞穿透肽序列(参见WO 2019/136125)。在一个实施方案中,肽是环状肽。例如,使用烃装订(Bernal 2007;Bird 2016)或本领域中已知的其他环化方法的环化肽可通过被动扩散、胞吞作用/内体逃逸或其他机制进入细胞(Dougherty 2019)。肽也可通过利用细胞受体(例如整合素靶向的RGD样序列)的机制递送到细胞。替代地,可将肽封装在囊泡(诸如外体或脂质体)或胶束中并递送至细胞。
基于天然ATF5 bZIP结构域的肽拮抗C/EBPβ活性的能力可通过本文,例如在实施例2中所描述的方法测量。C/EBPβ肽拮抗剂的细胞毒性活性可通过已知的测定法体外测量和/或使用已知的肿瘤模型体内测量;例如,WO 2019/136125描述了此类测定法和模型。
ST101是一种体外和体内均显示出有效的抗肿瘤活性以及对蛋白水解降解的抗性的全D-氨基酸肽。特别是,我们先前已经证明了ST101在HL60(早幼粒细胞性白血病)、AML14(急性骨髓性白血病)、SET2(巨核细胞白血病)、A375(黑色素瘤)、MCF7(乳腺癌)、U87(胶质母细胞瘤)、U251(胶质母细胞瘤)、DU145(前列腺癌)、A549(肺癌)、外周血单核细胞(PBMC)和骨髓单核细胞(BMMC)中的细胞毒性(参见WO 2019/136125)。另外,在使用A375、HL60、MCF7和U251细胞的异种移植小鼠模型中皮下施用ST101导致肿瘤体积显著减小(参见WO2019/136125)。
ST101由基于ATF5 bZIP结构域和触角足穿膜肽结构域(Antennapediapenetratin domain)的修饰结构域构成,以允许细胞穿透。ST101的D-氨基酸序列是VAEAREELERLEARLGQARGELKKWKMRRNQFWLKLQR(SEQ ID NO:2),其中细胞穿透区用斜体表示。如本文所示,ST101通过扰乱C/EBPβ与抗凋亡转录因子的缔合来促进肿瘤细胞中的细胞毒性活性(图1;实施例2)。
组合物和施用
在某些方面,本发明提供了一种包含C/EBPβ肽拮抗剂诸如ST101的组合物,例如药物组合物。在一个实施方案中,ST101可呈盐形式,诸如乙酸盐。优选地,组合物包含一种或多种载剂、稀释剂、赋形剂或其他添加剂。例如,组合物可包含一种或多种填充剂(例如葡聚糖40、甘氨酸、乳糖、甘露醇、海藻糖)、一种或多种缓冲液(例如乙酸盐、柠檬酸盐、组氨酸、乳酸盐、磷酸盐、Tris)、一种或多种pH调节剂(例如盐酸、乙酸、硝酸、氢氧化钾、氢氧化钠)和/或一种或多种稀释剂(例如水、生理盐水)。组合物的pH值优选在约3.0与8.0之间。在一个实施方案中,pH值在约3.5与6.5之间或约5.0与7.5之间。
在一些实施方案中,药物组合物包含填充剂,诸如海藻糖,其中按重量计,填充剂的量与ST101的量成特定比,诸如填充剂:ST101的比为约6:1至约2:1。
本发明的方面涉及向受试者施用C/EBPβ肽拮抗剂的方法。C/EBPβ肽拮抗剂是胃肠外施用的。胃肠外施用途径包括静脉内(IV)、肌肉内、腹腔内、鞘内和皮下。在一个优选实施方案中,包含ST101的药物组合物是通过IV输注施用。药物组合物可例如在包含生理盐水(0.9%)、半生理盐水(0.45%)、5%葡萄糖水溶液(D5W)的IV流体中提供。
C/EBPβ肽拮抗剂是基于患者的体重给药。C/EBPβ肽拮抗剂,诸如ST101,可以约0.5mg/kg至约16mg/kg的剂量施用于患者。在某些实施方案中,ST101以约0.5mg/kg、约0.75mg/kg、约1mg/kg、约1.5mg/kg、约2mg/kg、约2.5mg/kg、约3mg/kg、约4mg/kg、约5mg/kg、约6mg/kg、约7mg/kg、约8mg/kg、约10mg/kg、约12mg/kg、约14mg/kg或约16mg/kg的剂量施用。这些量也可充当待施用的剂量范围,例如约0.5mg/kg至约8mg/kg、约2mg/kg至约4mg/kg等的端点。
在本发明的实施方案中,药物组合物通过静脉内输注施用于受试者,其中总输注持续时间不超过约360分钟。在一些实施方案中,总输注持续时间为约30分钟至约240分钟。例如,总输注持续时间可为30分钟、60分钟、90分钟、120分钟、150分钟或180分钟,或中间持续时间,诸如45分钟、100分钟等。在某些实施方案中,总输注持续时间为约60分钟至约90分钟、或约60分钟至约120分钟、或约90分钟至约120分钟、或约60分钟至约180分钟。
在一些实施方案中,药物组合物的输注可中断,即,可暂时停止然后恢复。中断的持续时间可变化,例如所述持续时间可为约15分钟或更短时间、或约30分钟或更短时间、或约一小时或更短时间、或约两小时或更短时间、或约三小时或更短时间、或约四小时或更短时间。
在一些实施方案中,药物组合物可与一种或多种意图阻断组胺释放、预防或改善输注相关反应(IRR)、减少发热或炎症和/或缓解瘙痒和/或荨麻疹的二级剂一起施用。可在施用药物组合物的同时、之前和/或之后施用一种或多种二级剂。一种或多种二级剂可以与药物组合物分开的组合物施用,或可与药物组合物组合。另外,一种或多种二级剂可通过与药物组合物相同的途径施用,或可通过不同的途径(例如口服)施用。
与药物组合物一起施用的一种或多种二级剂的实例包括但不限于抗组胺剂,包括H1拮抗剂、H2拮抗剂和肥大细胞脱颗粒抑制剂(例如阿伐斯汀(acrivastine)、阿司咪唑(astemizole)、阿扎他定(azatadine)、氮卓斯汀(azelastine)、贝他斯汀(bepotastine)、溴苯那敏(bromopheniramine)、丁夫罗林(burfroline)、西替利嗪(cetirizine)、氯唑沙宗(chlorzoxazone)、氯苯那敏(chlorpheniramine)、色甘酸(cromolyn)、赛庚啶(cyproheptadine)、地氯雷他定(desloratadine)、右溴苯那敏(dexbromphenir amine)、苯海拉明(diphenhydramine)、多沙唑嗪(doxantrozole)、依匹斯汀(epinastine)、依托羟嗪(etodroxizine)、法莫替丁(famotidine)、非索非那定(fexofenadine)、毛喉素(forskolin)、羟嗪、异丙肾上腺素(isoproterenol)、酮替芬(ketotifen)、左西替利嗪(levocetirizine)、氯雷他定(loratadine)、洛度沙胺、美喹他嗪(mequitazine)、甲地嗪(methdilazine)、咪唑斯汀(mizolastine)、奈多罗米(nedocromil)、奥洛他定(olopatadine)、奥沙米特(oxatomide)、吡嘧司特(pemirolast)、吡美莫司(pimecrolimus)、吡布特罗(pirbuterol)、苯噻啶(pizotifen)、普昔罗米(proxicromil)、雷尼替丁(ranitidine)、特非那定(terfenadine)、特布他林(terbutaline));白三烯抑制剂(例如孟鲁司特(montelukast)、扎鲁司特(zafirlukast)、齐留通(zileuton);非类固醇抗炎药(NSAID)(例如布洛芬、萘普生、阿司匹林);对乙酰氨基酚/醋氨酚;皮质类固醇(例如氢化可的松、地塞米松、泼尼松、泼尼松龙);抗恶心药物(例如丙氯拉嗪(prochlorperazine)、昂丹司琼(ondansetron));和生理盐水和/或电解质。在一个优选实施方案中,二级剂是抗组胺剂,诸如氯苯那敏或苯海拉明。在特定的实施方案中,二级剂选自由以下组成的组:对乙酰氨基酚/醋氨酚、H1拮抗剂和H2拮抗剂、孟鲁司特、止吐剂及其组合。
在某些实施方案中,二级剂在药物组合物的施用期间,诸如在输注期期间施用。在某些实施方案中,在施用药物组合物之前,诸如在施用前约7天内、或在施用前约6天内、或在施用前约5天内、或在施用前约4天内、或在施用前约72小时内、或在施用前约48小时内、或在施用前约24小时内、或在施用前约8-12小时内、或在施用前约6-8小时内、或在施用前约4-6小时内、或在施用前约2-4小时内、或在施用前约1-2小时内、或在施用前约1小时内或在施用前立即将二级剂诸如抗组胺剂施用于受试者。在一些实施方案中,在施用药物组合物后24小时内施用二级剂。例如,可在完成药物组合物施用之后立即、完成之后约0.5-1小时、完成之后约1-2小时、完成之后约2-4小时、完成之后约4-6小时、完成之后约6-8小时、完成之后约8-12小时或完成之后约24小时施用二级剂。
可在施用药物组合物之前、期间和/或之后施用多次二级剂。二级剂的组合可同时或在不同时间施用。例如,可在施用药物组合物之前施用抗组胺剂,并且可在施用药物组合物之后施用皮质类固醇。
在一个实施方案中,C/EBPβ肽拮抗剂的施用可每周进行一次,持续至少三周(即施用三次)、六周(即施用六次)、九周、十二周、三个月、六个月、九个月或十二个月的持续时间。在另一个实施方案中,施用可每两周进行一次,持续至少四周(即施用两次)、八周(即施用四次)、十二周、三个月、六个月、九个月或十二个月的持续时间。在一些实施方案中,可每周一次向患者施用C/EBPβ肽拮抗剂,持续至少三周、六周、九周、十二周、三个月、六个月、九个月或十二个月的持续时间,接着每两周施用一次,持续至少四周、八周、十二周、三个月、六个月、九个月或十二个月。
C/EBPβ拮抗剂的药代动力学(PK)可通过标准方法并如实施例中所描述的进行评估。在一些实施方案中,C/EBPβ拮抗剂是ST101。ST101的清除率可为约0.75L/h至约3.5L/h、或约1L/h至约3L/h、或约1L/h至约2.5L/h。ST101的半衰期(t1/2)可为约10小时至约70小时、或约20小时至约60小时、或约25小时至约45小时。
在一些实施方案中,PK是剂量成比例的。例如,在施用0.5mg/kg ST101的患者中,Cmax可为约1,000ng/mL至约2,000ng/mL、或约1,300ng/mL至约1,800ng/mL、或约1,370ng/mL至约1,770ng/mL。在施用1.0mg/kg ST101的患者中,Cmax可为约2,500ng/mL至约5,500ng/mL、或约2,670ng/mL至约5,300ng/mL、或约2,840ng/mL至约5,110ng/mL。在施用2.0mg/kgST101的患者中,Cmax可为约8,000ng/mL至约13,000ng/mL、或约8,500ng/mL至约12,500ng/mL、或约9,000ng/mL至约11,900ng/mL。在施用4.0mg/kg ST101的患者中,Cmax可为约7,000ng/mL至约35,000ng/mL、或约7,650ng/mL至约32,900ng/mL、或约9,150ng/mL至约30,000ng/mL、或约15,000ng/mL至约28,000ng/mL。
III.治疗方法
需要通过本发明的方法治疗的受试者是诊断患有实体瘤的患者。例如,受试者可能患有局部晚期实体瘤或无法手术的转移性肿瘤。在一些实施方案中,受试者患有黑色素瘤、癌或肉瘤。在一个实施方案中,黑色素瘤是皮肤黑色素瘤或粘膜黑色素瘤。在一个实施方案中,癌是腺癌,诸如膀胱腺癌、结直肠腺癌、胰腺腺癌、胃/印戒腺癌或小肠腺癌。在一个实施方案中,肉瘤是腹部肉瘤或肌纤维母细胞肉瘤。在本发明的特定实施方案中,施用ST101可抑制肿瘤生长、减小肿瘤体积或其组合。
在一个实施方案中,患者患有局部晚期或转移性乳腺癌(LA/MBC)。在一个实施方案中,LA/MBC是激素受体阳性的(HRpos)。在一个实施方案中,患者患有在接受一次或两次先前基于激素的疗法后进展的LA/MBC。在一个实施方案中,患者先前已接受用靶向疗法(诸如周期蛋白依赖性激酶4/6(CDK4/6)抑制剂或哺乳动物雷帕霉素靶标(mTOR)抑制剂)或用化学疗法,或其组合的治疗。
在一个实施方案中,患者已被诊断患有黑色素瘤。在一个实施方案中,患者患有在接受一线或二线先前针对黑色素瘤(特别是晚期/转移性黑色素瘤)的疗法后进展的黑色素瘤。
在一个实施方案中,患者患有在用免疫检查点抑制剂(CPI)或CPI的组合治疗后或治疗时进展的黑色素瘤。免疫CPI包括例如CTLA-4抑制剂,诸如伊匹单抗(ipilimumab)和替西木单抗(tremelimumab);PD-1抑制剂,诸如西米普利单抗(cemiplimab)、尼沃鲁单抗(nivolumab)、帕博利珠单抗(pembrolizumab)、匹地利珠单抗(pidilizumab)和斯巴达珠单抗(spartalizumab);PD-L1抑制剂,诸如阿替利珠单抗(atezolizumab)、阿维单抗(avelumab)和度伐利尤单抗(durvalumab);LAG-3抑制剂,诸如瑞拉利单抗(relatilimab);TIGIT抑制剂,诸如替瑞利尤单抗(tiragolumab);以及靶向toll样受体9(TLR9)的剂,诸如TLR9激动剂。
在一个实施方案中,患者患有BRAF突变疾病并接受了至少一线靶向疗法,诸如BRAF抑制剂和/或MEK抑制剂,例如维罗非尼(vemurafenib)、达拉菲尼(dabrafenib)、康奈非尼(encorafenib)、曲美替尼(trametinib)、考比替尼(cobimetinib)、比美替尼(binimetinib)或其组合。
在一个实施方案中,患者已被诊断患有胶质母细胞瘤(GBM)。在一个实施方案中,GBM在接受先前疗法线后已复发或进展。先前疗法线包括例如手术、放射、化学疗法、靶向疗法、电场疗法及其组合。化学治疗化合物包括例如替莫唑胺、卡莫司汀和洛莫司汀。靶向疗法包括例如贝伐珠单抗(bevacizumab)。
在一个实施方案中,GBM是在一种标准治疗方案后复发或进展(根据修改的RANO标准)的原发(从头)GBM。“标准治疗方案”定义为最大限度的手术切除、放射疗法以及替莫唑胺联合放射疗法或辅助化学疗法联合替莫唑胺。在一个实施方案中,患者已接受肿瘤治疗领域作为一线疗法的辅助治疗。
在一个实施方案中,患者已被诊断患有前列腺癌。在一个实施方案中,前列腺癌是去势抵抗性前列腺癌(CRPC)。“去势抵抗性前列腺癌”(CRPC)是由尽管进行了雄激素耗竭疗法,但仍存在例如根据前列腺癌临床试验工作组3(PCWG3)标准(Scher 2016)的疾病进展定义的。在一些实施方案中,患者患有在选自由以下组成的组的治疗之后进展的CRPC:化学疗法,诸如紫杉烷,包括多西他赛(docetaxel)和卡巴他赛(cabazitaxel),任选地与诸如泼尼松或泼尼松龙的皮质类固醇组合;免疫疗法,包括西普鲁塞-T(sipuleucel-T);基于激素的疗法,包括阿比特龙、恩杂鲁胺、达洛鲁胺和阿帕鲁胺;及其组合。在一个实施方案中,患者患有在先前用紫杉烷、阿比特龙、达洛鲁胺和/或恩杂鲁胺/阿帕鲁胺治疗后进展的CRPC。
可通过一种或多种已知的措施来评价治疗的功效。例如,与未经受本发明方法的患者,即对照患者的相同结果相比,经受本发明方法的患者可经历包括延长的生存期、改进的无进展生存期、改进的反应持续时间、更长的缓解期、降低的复发风险和/或改进的肿瘤对C/EBPβ肽拮抗剂治疗的反应的结果。可将通过本发明的方法治疗的患者的结果与例如对照患者群体的中值结果进行比较。可向对照患者群体施用例如选自由以下组成的组的方案:安慰剂、手术、放射、化学疗法、免疫疗法、基于激素的疗法、靶向疗法及其组合。可使用例如威尔科克森符号秩检验(Wilcoxon signed rank test)或Kaplan-Meier法对比较进行统计分析。
在一个实施方案中,将接受任选地与标准护理治疗组合的C/EBPβ肽拮抗剂诸如ST101的患者的结果与接受安慰剂的对照患者的中值结果进行比较。在一个实施方案中,将接受C/EBPβ肽拮抗剂诸如ST101的患者的结果与接受标准护理治疗的对照患者的中值结果进行比较。
在一个实施方案中,将接受任选地与化学疗法组合的ST101的LA/MBC患者的结果与接受化学疗法的LA/MBC患者的中值结果进行比较。在一个实施方案中,将接受任选地与基于激素的疗法组合的ST101的LA/MBC患者的结果与接受基于激素的疗法的LA/MBC患者的中值结果进行比较。在一个实施方案中,将接受ST101的LA/MBC患者的结果与接受靶向疗法的LA/MBC患者的中值结果进行比较。
在一个实施方案中,将接受任选地与化学疗法组合的ST101的黑色素瘤患者的结果与接受化学疗法的黑色素瘤患者的中值结果进行比较。在一个实施方案中,将接受任选地与免疫疗法组合的ST101的黑色素瘤患者的结果与接受免疫疗法的黑色素瘤患者的中值结果进行比较。在一个实施方案中,将接受任选地与靶向疗法组合的ST101的黑色素瘤患者的结果与接受靶向疗法的黑色素瘤患者的中值结果进行比较。
在一个实施方案中,将接受任选地与手术、放射、化学疗法和靶向疗法中的一种或多种组合的ST101的GBM患者的结果与接受手术、放射、化学疗法、靶向疗法或其组合的GBM患者的中值结果进行比较。在一个实施方案中,将接受任选地与标准治疗方案组合的ST101的GBM患者的结果与接受标准治疗方案的GBM患者的中值结果进行比较。
在一个实施方案中,将接受任选地与化学疗法组合的ST101的前列腺癌患者的结果与接受化学疗法的前列腺癌患者的中值结果进行比较。在一个实施方案中,将接受任选地与免疫疗法组合的ST101的前列腺癌患者的结果与接受免疫疗法的前列腺癌患者的中值结果进行比较。在一个实施方案中,将接受任选地与基于激素的疗法组合的ST101的前列腺癌患者的结果与接受基于激素的疗法的前列腺癌患者的中值结果进行比较。在一个实施方案中,将接受任选地与紫杉烷、阿比特龙、达洛鲁胺和/或恩杂鲁胺/阿帕鲁胺组合的ST101的前列腺癌患者的结果与接受紫杉烷、阿比特龙、达洛鲁胺和/或恩杂鲁胺/阿帕鲁胺的前列腺癌患者的中值结果进行比较。
与基线(例如在用ST101治疗之前)相比,对治疗的反应比较治疗方案之后的一个或多个功效量度。优选在用C/EBPβ肽拮抗剂首次治疗前24、48或72小时内,或1、2、3或4周内进行基线评估。在一个优选实施方案中,在第一次ST101治疗之前24小时内进行基线评估。
在受试者是前列腺癌患者的实施方案中,基线和对治疗的反应可通过包括例如以下的因素来测量:评价基于血液的生物标志物,诸如睾酮、前列腺特异性抗原(PSA)和血清细胞因子的成像(诸如通过计算机体层成像(CT),包括对比增强CT或磁共振成像(MRI),包括横断面MRI);活检/组织学分析;和患者报告的因素,诸如疼痛、镇痛药使用、身体功能、生活质量等。这些参数可例如根据PCWG3指南(Scher 2016)确定。
PCWG3范式定义了治疗反应的两大类:(1)治疗控制、缓解或消除基线时存在的疾病表现的程度;和(2)治疗可预防或延迟疾病的未来表现的程度(Scher 2016;Scher2011)。因此,在一个方面,本发明提供了一种控制、缓解或消除患者(包括CRPC患者)的前列腺癌的至少一种表现的方法,所述方法包括向患者施用C/EBPβ肽拮抗剂,诸如ST101。在另一方面,本发明提供了一种预防或延迟患者(包括CRPC患者)的前列腺癌的至少一种表现的方法,所述方法包括向患者施用C/EBPβ肽拮抗剂,诸如ST101。在一个实施方案中,前列腺癌的表现被预防或延迟至少4、6、8、10或12周,至少4、6、8、10、12、16、18或24个月,或至少3、4或5年。预防或延迟的持续时间是相对于对照群体中预防或延迟的中值持续时间来测量的。前列腺癌的表现包括例如肿瘤负荷、新的转移性病变、升高的PSA水平、骨病理学(包括骨折发生率)、疼痛、止痛药使用(包括阿片剂)和生活质量下降(Scher 2016;Scher 2011)。
“肿瘤负荷”是患者体内癌组织的总质量或总大小。可通过包括客观反应率、疾病控制率和反应持续时间的度量来评价肿瘤反应。根据肿瘤的类型,可例如通过修改的实体瘤反应评价标准(RECIST 1.1)(Eisenhauer 2009)、修改的神经肿瘤学反应评估(mRANO)(Ellingson 2017)或PCWG3指南(Scher 2016)来确定这些参数。
客观反应率评估肿瘤大小(例如肿瘤直径)的减少,这可通过临床检查和/或成像来确定。当患者患有多种肿瘤时,肿瘤大小可任选地表示为所有肿瘤的平均直径或由所有肿瘤直径的总和表示。浅表肿瘤可在临床上测量,例如使用卡尺或通过照相成像和尺子测量来测量。成像方法包括计算机体层成像(CT),通常使用造影剂;X光;磁共振成像(MRI);和正电子发射体层成像(PET),诸如(18)F-氟代脱氧葡萄糖PET。在一个优选实施方案中,CT用于评估例如LA/MBC患者或黑色素瘤患者中的肿瘤反应。在另一个优选实施方案中,MRI,诸如钆增强的MRI,用于评估例如GBM患者中的肿瘤反应。因此,在一个方面,本发明提供了一种减少患者的肿瘤负荷,即肿瘤质量和/或肿瘤大小的方法,所述方法包括向患者施用C/EBPβ肽拮抗剂,诸如ST101。相对于基线测量肿瘤负荷的减少。
在某些实施方案中,特别是通过RECIST 1.1进行评估的那些实施方案,疾病控制率将肿瘤反应水平定义为完全反应(CR),即肿瘤消失;部分反应(PR),即肿瘤大小减少至少30%,;稳定的疾病,其中肿瘤大小没有变化;或疾病进展,即肿瘤大小和/或新病变增加至少20%。
在一些实施方案中,疾病控制率将肿瘤反应水平定义为完全反应(CR)、部分反应(PR)、进行性疾病(PD)或稳定的疾病(SD)。表I阐述了针对这些疾病状态的修改的RANO指南,所述指南基于肿瘤测量值相对于基线的变化,并且持续至少四周。Ellingson 2017中提供了其他参数和详细信息。
表I
Figure BDA0004005490120000231
反应持续时间是从实现反应到疾病进展的时间长度,即肿瘤不生长或扩散或死亡的时段。接受ST101治疗的患者的反应持续时间可为例如至少4、6、8、10或12周,至少4、6、8、10、12、16、18或24个月,或至少3、4或5年。因此,在一个方面,本发明提供了一种增加患者反应持续时间的方法,所述方法包括向患者施用C/EBPβ肽拮抗剂,诸如ST101。反应持续时间的增加是相对于对照群体的中值反应持续时间来测量的。
生存期可评估为总生存期,即患者存活的时间长度,或评估为无进展生存期,即患者接受治疗而疾病没有进展或恶化的时间长度。生存期可从诊断日或治疗开始日开始测量。总生存期、中值总生存期、无进展生存期和中值无进展生存期可基于对治疗的反应,例如通过Kaplan-Meier分析来计算。因此,在一个方面,本发明提供了一种增加患者总生存期的方法,所述方法包括向患者施用C/EBPβ肽拮抗剂,诸如ST101。总生存期的增加是相对于对照群体的中值总生存期来测量的。在另一方面,本发明提供了一种增加患者无进展生存期的方法,所述方法包括向患者施用C/EBPβ肽拮抗剂,诸如ST101。无进展生存期的增加是相对于对照群体的中值无进展生存期来测量的。
如果患者在施用C/EBPβ肽拮抗剂诸如ST101后经历或显示至少一种以下结果,则患者是根据本发明的方法成功治疗的:
-无法检测到肿瘤(或在基线时存在多种肿瘤的情况下,无法检测到至少一种肿瘤);
-与基线相比,肿瘤大小减少至少约10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%或90%;
-与基线相比,肿瘤大小未显著增加(例如增加少于20%);
-任选地与对照患者群体的中值反应持续时间相比,反应持续时间显著增加;
-任选地与对照患者群体的中值无进展生存期相比,无进展生存期显著增加;
-任选地与对照患者群体的中值总生存期相比,总生存期显著增加。
IV.制备方法
C/EBPβ肽拮抗剂可例如使用固相肽合成或溶液相肽合成,或两者的组合来化学合成。合成可任选地作为后续以化学或酶促方式组合的肽片段进行。
替代地,C/EBPβ肽拮抗剂可使用重组方法表达。例如,编码ST101的核酸分子可使用寡核苷酸合成仪通过化学合成来构建。可基于ST101的氨基酸序列和在产生重组ST101的宿主细胞中有利的那些密码子的选择来设计核酸分子。可应用标准方法来合成编码C/EBPβ肽拮抗剂诸如ST101的核酸分子。
一旦制备好,编码肽的核酸就可插入表达载体中并可操作地连接到适合于在所需宿主中表达肽的表达控制序列。为了获得肽的高表达水平,核酸可与在所选表达宿主中起作用的转录和翻译表达控制序列可操作地连接或关联。
丰富多样的表达宿主/载体组合可用于本领域已知的任何人。真核宿主的有用表达载体包括例如包含来自SV40、牛乳头瘤病毒、腺病毒和巨细胞病毒的表达控制序列的载体。细菌宿主的有用表达载体包括已知的细菌质粒,诸如来自大肠杆菌的质粒,包括pCR1、pBR322、pMB9及其衍生物;更广泛的宿主范围质粒,诸如M13;以及丝状单链DNA噬菌体。
合适的宿主细胞包括在适当的启动子控制下的原核生物、酵母、昆虫或高等真核细胞。原核生物包括革兰氏阴性或革兰氏阳性生物体,例如大肠杆菌或杆菌。可建立高等真核细胞或哺乳动物来源的细胞系,所述细胞系的实例包括毕赤酵母(Pichia pastoris)、293细胞、COS-7细胞、L细胞、C127细胞、3T3细胞、中国仓鼠卵巢(CHO)细胞、HeLa细胞和BHK细胞。也可使用无细胞翻译系统。
可使用包括例如反相高效液相色谱法(RP-HPLC)、多柱逆流溶剂梯度纯化法(MCSGP)和离子交换色谱法的方法来纯化肽。
实施例
可参考以下非限制性实施例进一步定义本公开的实施方案。对本领域技术人员将显而易见的是在不脱离本公开的范围的情况下,可对材料和方法作出许多修改。
实施例1.C/EBPβ肽拮抗剂的设计
含有天然ATF5 bZIP结构域的22个氨基酸区段LEGECQGLEARNRELKERAESV(SEQ IDNO:3)和16个氨基酸的穿膜肽结构域的前体肽的初始设计导致HL-60早幼粒细胞性白血病细胞的剂量依赖性细胞毒性,其中EC50值为17.4±0.5μM。我们假设被设计来增强肽与C/EBPβ之间静电相互作用的修饰将提高效力。合成了探测肽拮抗剂的非亮氨酸氨基酸与C/EBPβbZIP结构域的非亮氨酸氨基酸的分子堆积的一组46种合理设计的肽,并对其细胞毒性活性进行了筛检。“获胜者”肽显示出最大的细胞毒性,导致EC50值为5.5±0.5μM,或与母肽相比效力增加3.2倍,表明引入的合理变化提高了体外肽抗-肿瘤活性。“获胜者”肽包含具有氨基酸序列LEGRAQGLRAELRELEERAEAV(SEQ ID NO:4)的bZIP结构域序列和穿膜肽结构域。
由于L-氨基酸肽在生物基质中通常缺乏稳定性,从而限制了它们的药代动力学并因此限制了治疗潜力,我们生成了优化的ATF5 bZIP结构域VAEAREELERLEARLGQARGEL(SEQID NO:1)的全D氨基酸肽版本,所述肽另外包含穿膜肽结构域。当在胃蛋白酶和胰蛋白酶存在下在37℃下孵育17小时时,这种肽ST101显示出蛋白水解抗性,而L-对映体肽在5分钟内100%降解。在未治疗的对照中观察到的最小ST101损失归因于在这些条件下发生的常见肽化学降解。
ST101的细胞毒性测试揭露在HL-60早幼粒细胞性白血病细胞中的EC50为4.9±0.2μM,与具有相同氨基酸序列的L-对映体肽具有相当的活性,表明虽然D-氨基酸变体显示出显著增强的稳定性,但它没有丧失抗肿瘤活性。
ST101与C/EBPβbZIP结构域之间的相互作用是基于C/EBPβ和CREB/ATF家族辅因子ATF440的晶体结构建模的。假设ST101在溶液中呈螺旋状。使用分子操作环境(MOE)软件,通过将ST101结合序列约束为与ATF4的部分(所述部分与ATF4具有最高的序列相似性)重叠的α螺旋结构,并最小化以支持侧链相互作用,从而生成ST101与C/EBPβ结合的模型。所述模型表明,ST101可能主要通过疏水接触与一些电荷-电荷相互作用(ST101 E12与C/EBPβ R279和ST101 E21与C/EBPβ K267)和阳离子-π相互作用(ST101 R5与C/EBPβ F282)来进行相互作用(图2)。
实施例2.ST101与C/EBPβ相互作用,但不与ATF5相互作用
在计算机中使用圆二色性(CD)光谱证明ST101与C/EBPβ相互作用。在CD光谱中,当肽/蛋白质相互作用时,观察到的组合样品的光谱不同于每个组分的个别光谱的均值。使用Applied Photophysics Chirascan CD装置(Leatherhead,UK)在1mm路径长度下,使用200μl CD细胞样品进行CD。样品含有异二聚体溶液等摩尔浓度的150μM总肽浓度(即每种肽75μM),并在分析之前悬浮于pH 7.0的10mM磷酸钾和100mM氟化钾中。样品的CD光谱在260nm与200nm之间以1nm步长扫描,每个波长平均扫描0.5s。三次扫描在20℃下取平均值。
ST101与源自C/EBPβ的bZIP结构域的肽组合产生的光谱与个别光谱的均值显著不同,表明两种组分之间的结构相互作用(图3,图A)。相比之下,观察到的ST101与源自ATF5的bZIP结构域的肽组合的光谱与两种肽的个别光谱的均值相比没有变化(图3,图B),表明这些肽在这些条件下不进行相互作用。这些数据表明ST101与C/EBPβ特异性相互作用。
使用细胞热转移测定(CETSA)在U251人胶质母细胞瘤细胞的生物环境中进一步证明了ST101与C/EBPβ的相互作用。将细胞暴露于媒介物或10μM ST1011小时。由细胞制备裂解物,并且随后暴露于跨越52-60℃的热梯度以使蛋白质变性。然后将裂解物离心以去除变性的蛋白质聚集体,并通过SDS-PAGE分离。进行蛋白质印迹分析以检测加热后保留在细胞裂解物中的C/EBPβ和β-微管蛋白。
在来自未处理的U251细胞的热变性细胞裂解物的蛋白质印迹分析中,变性C/EBPβ在58℃时从溶液中脱落,如蛋白质印迹上C/EBPβ蛋白带的丢失所指示的(图4,图A)。用10μMST101处理的细胞在58℃时显示出增加的C/EBPβ稳定性,如C/EBPβ的检测增加所示,表明ST101与C/EBPβ之间的相互作用(图4,图A和图B)。对照实验表明,在CETSA测定中,ST101并未赋予ATF5增加的稳定性,证明了与C/EBPβ相互作用的特异性,并与CD数据一致。
使用CD光谱评价二聚体交换的额外实验证明C/EBPβ对ST101的亲和力高于对ATF5的亲和力。在这些实验中,当ST101与含有C/EBPβ的bZIP结构域的肽预混合时,添加含有ATF5的bZIP结构域的肽不能置换ST101,如无信号增益所证明的(图5,图A)。相比之下,当ST101与ATF5 bZIP肽预混合时,添加C/EBPβ bZIP肽导致信号增益,生成与ST101与C/EBPβbZIP肽相互作用相同的峰值(图5,图B)。这些数据表明C/EBPβ与ST101的相互作用优于ATF5,如添加ST101时C/EBPβ+ATF5的光谱位移所示。
为了定量ST101对C/EBPβ与ATF5相互作用的抑制作用,使用了竞争性酶联免疫吸附测定(ELISA)格式。C/EBPβ(3.6ng/孔)通过在4℃下孵育过夜而固定到384孔板(NuncMaxiSorp,ThermoSci)。用tris缓冲盐水(TBS)+0.1%Tween(TBST)洗涤三次来去除未结合的蛋白质,并且然后将孔在4℃下用TBS中的5%牛血清白蛋白阻断1小时。去除阻断缓冲液后,将ST101在TBS中稀释,并在4℃下添加到适当的孔中1小时,并且用TBST洗涤孔三次。
接下来,在4℃下孵育18小时之前,将1ng重组ATF5添加到每个孔中,并在用TBST洗涤三次后去除未结合的蛋白质。通过以下步骤检测板结合的ATF5:在4℃下孵育1∶1000稀释度的兔抗ATF5抗体(ab60126,Abcam),接着孵育1:1000的山羊抗兔IgG-HRP抗体(ab6721,Abcam)1小时,其中在每次抗体孵育后用TBST洗涤三次,并且使用50μL TMB底物。通过添加25μL 2.5M硫酸来终止反应,并使用SpectraMax M3读板器(Molecular Devices)在450nm处检测吸光度。使用GraphPad Prism 8.3.0软件通过具有四个参数和可变斜率的非线性回归计算ST101 IC50
初步实验确定,在3.6ng C/EBPβ是板结合的条件下,ATF5缔合导致1.0nM的Kd(图6,图A)。在后续实验中,将增加浓度的ST101添加到恒定浓度的1nM ATF5中,导致ATF5检测的剂量依赖性降低(图6,图B)。非线性四参数分析确定ST101抑制ATF5与C/EBPβ缔合的IC50为24.6±0.9nM。这些数据支持CD二聚体交换实验。
实施例3.ST101穿透未处理C57BL/6小鼠中的血脑屏障
为了确定ST101的全身施用是否可进入具有完整血脑屏障的动物的大脑,在单次全身施用后对未处理的C57BL/6大脑切片进行了ST101的免疫组织化学(IHC)分析。ST101(25mg/kg)或媒介物是通过静脉内注射至尾侧静脉中施用(n=3只/组)。注射后两小时,将小鼠安乐死。收集大脑并储存在4%多聚甲醛中。使用用DAB偶联的抗兔二级试剂检测的兔多克隆抗ST101抗体,处理组织以在2μM切片上进行IHC染色。
来自施用ST101的小鼠的大脑切片显示出ST101的细胞和微血管染色的证据(图7,图B),而来自施用媒介物的小鼠的大脑切片中没有ST101染色的证据(图7,图A)。这些数据表明,ST101在全身肽施用后穿过未处理的C57BL/6中的血脑屏障。
实施例4.ST101是安全的
安全药理学
ST101对中枢神经系统、心血管系统和呼吸系统的潜在药理作用在食蟹猴中在良好实验室规范(GLP)下的28天毒性、毒代动力学(TK)和安全药理学研究中进行了研究。如下文更详细的描述,未观察到ST101对这些系统中的任一个的影响。
在给药前和接近最后一次施用时进行心电图(ECG)检查。通过以大约10mg/kg的剂量肌肉内注射100mg/mL盐酸氯胺酮来使猴子镇静,以尽量减少与处理相关的压力。由委员会认证的兽医心脏病专家对ECG进行了定性和定量评价(例如QT&HR;QTc)。使用导联I、II、III、aVR、aVL和aVF记录ECG。心电图评价未揭露与ST101相关的变化。
对于辅助ECG和呼吸评价,使用ECG波形和通气期间胸部和腹部扩张的波形来比较通过IV推注施用对照(0mg/kg)或30mg/kg的ST101的动物引发的定性心电图和通气变化。总体而言,对总共16只(8只雄性和8只雌性;n=4只/组/性别)猴子的ECG描记进行了评价。对于定性评价,对每只动物的描记进行目视检查,以检查ECG以及胸腹呼吸导联的节律和/或形态异常。除其他因素外,定性分析还评价了描记的解释质量、是否存在肌肉震颤或60Hz伪影、电压随时间的一般变化、ST-T的构型和节律。比较对照动物与高剂量动物之间的数据,以及对照和高剂量组的施用后与基线之间的数据。
所有猴子都具有(通常)短暂的记录期,在所述记录期可主观地分析ECG和呼吸描记图。似乎没有归因于ST101的心电图或呼吸描记图的主观变化。
在分配研究之前和接近治疗期结束时,由委员会认证的兽医眼科医生对镇静的猴子进行间接眼底镜检查。组平均眼科评价未揭露ST101相关的变化。
在适应期(治疗前的基线)期间以及接近治疗和恢复期结束时,由兽医或受过训练的指定人员记录猴子的呼吸。以30秒间隔记录呼吸次数,并且然后乘以2以得出呼吸数/分钟。组平均呼吸评价未揭露ST101相关的变化。
在分配研究之前以及接近治疗和恢复期结束时收集猴子的血压(收缩压、舒张压和平均动脉压)。在进行呼吸检查的同时收集血压。使猴子镇静,以尽量减少处理相关的压力。组平均血压评价未揭露ST101相关的变化。
假过敏反应的评估
假过敏反应的临床体征可包括体温下降、活动减少和立毛。静脉内(IV)推注施用10mg/kg ST101 2-3分钟后,在食蟹猴中未观察到假过敏反应的临床体征,而施用30mg/kg导致动物在24H内恢复的中度活动减退。将输注速率从2-3分钟延长到1-2H导致30mg/kgST101的剂量是良好耐受的。
1H内IV输注50mg/kg或30分钟内IV输注30mg/kg导致动物在数小时内恢复的活动减退和潮红。后续研究表明,猴子在11天期内4次通过1H输注施用7.5mg/kg、15mg/kg和30mg/kg的剂量水平时,没有出现假过敏的体征(n=2只/性别/组)。
在对猴子进行的28天GLP毒性研究中(参见实施例5),在30mg/kg组中,6只雌性中有1只并且无雄性在首次暴露于ST101后表现出假过敏反应的体征。所述动物似乎正在恢复,因为几个小时后它开始进食和翻动,并且没有进行干预。ST101暴露后大约48H,所述动物的病状恶化,其特征为不活动和心跳缓慢,并且此后不久动物死亡。在这项研究中没有假过敏反应的其他体征(n=4只核心+2只恢复猴/性别/组,总计36只ST101治疗动物)。这些研究中耐受的ST101暴露水平显著高于临床中测试的那些暴露水平。因此,假过敏预计不会发生在人受试者身上。
实施例5.ST101是良好耐受的
研究1
在一项12天研究中,评价了食蟹猴重复一小时IV输注7.5mg/kg、15mg/kg和30mg/kg的剂量后ST101的耐受性。表1中提供的研究设计表明,四组中的每组(每种剂量的ST101以及媒介物对照的组)由四只猴子(每种性别两只猴子)组成,并在11天内四次施用ST101或媒介物对照。
表1.食蟹猴的12天研究设计(每周两次,通过1小时IV输注给药)
Figure BDA0004005490120000321
在第1天和第11天在剂量施用之前和之后的多个时间点采集血样。从包括大脑、膀胱、心脏、肠、肾、肝和肺的各种器官收集组织,并对其进行评估和处理以进行评价。
结果表明临床观察、体重、临床化学或血液学没有显著变化。在接受7.5mg/kg剂量的两只雄性、接受15mg/kg剂量的一只雄性、接受30mg/kg剂量的一只雄性和所有治疗的雌性的一次或多次注射部位处观察到澄清流体。没有观察到与ST101施用相关的其他宏观发现。
在接受7.5mg/kg剂量ST101的一只雄性、接受15mg/kg剂量ST101的一只雄性和接受30mg/kg剂量ST101的两只雄性以及所有治疗的雌性的最后一次注射部位处观察到轻度至明显的血栓形成。没有观察到与ST101相关的其他微观发现。
在食蟹猴中施用7.5mg/kg、15mg/kg和30mg/kg剂量会导致注射部位处的血栓形成、急性炎症、红细胞积聚、纤维化和水肿。这些发现与施用ST101引起的局部刺激一致。没有与ST101相关的其他宏观或微观发现。
基于这项研究的结果,30mg/kg的剂量被视为ST101的最高非严重毒性剂量(HNSTD)和未观察到有害作用水平(NOAEL)。
研究2
在这项研究中,向雄性和雌性食蟹猴分别施用7.5mg/kg、15mg/kg和30mg/kg剂量(对应于组2、3和4)的测试制品ST101或媒介物对照(组1),作为每周两次的一小时静脉内(IV)输注,总计8剂。雌性在第24天并且雄性在第25天施用最后一剂。表2中提供的研究设计表明,四组中的每组(每种剂量的ST101以及媒介物对照的组)由核心研究中的八只猴子(每种性别四只)加上恢复组中的四只猴子(每种性别两只)组成。恢复组在最后一次暴露于ST101后经历了两周的无治疗期。
表2.食蟹猴的28天GLP研究
接着14天恢复的设计
Figure BDA0004005490120000341
在第1天和第24/25天采集血样,使用经验证的LC-MS/MS分析方法,以量化范围为20.0ng/mL至2000ng/mL来分析ST101的血浆浓度。在第1天和第24/25天确定组2(7.5mg/kg)、3(15mg/kg)和4(30mg/kg)的ST101的毒代动力学(TK)参数。对所有动物进行大体观察和器官重量的尸检,并对所有30mg/kg剂量和对照核心研究动物进行组织病理学检查。
治疗相关的观察结果包括注射部位的肿胀/水肿、结痂、鳞状皮肤和酸痛/溃疡。这些观察结果的严重程度和发生率与剂量水平成正比。对组平均体重和体重增加的评价未揭露ST101相关的变化。
与ST101相关的临床化学变化仅发生在30mg/kg剂量组,并且在7.5mg/kg剂量或15mg/kg剂量组中未观察到。类似地,诸如血小板增加和纤维蛋白原增加的血液学变化仅限于30mg/kg剂量组。增加的血小板和纤维蛋白原水平以及增加的肌酐磷酸激酶与注射部位的血管刺激相关。
对使用带胸带的DSI护套(非侵入式)外部遥测系统收集的常规ECG和呼吸数据的评价未揭露治疗相关的变化。
ST101相关的器官重量参数变化包括:30mg/kg剂量的雄性在终末尸检时肝脏和肾脏(绝对和相对于大脑和体重)重量的增加,以及30mg/kg剂量的雌性在终末尸检时肝脏和肾脏(绝对和相对于体重)重量的增加。对于15mg/kg剂量的雌性,绝对肾上腺和肾脏重量增加。恢复期尸检时,30mg/kg剂量的动物的肝脏和肾脏(绝对和相对于大脑和体重)重量的增加以及胸腺(绝对和相对于大脑和体重)重量的减少仍然明显。
经显微镜检查,观察到给予30mg/kg ST101的两只雄性和三只雌性出现轻微至中度肾小管坏死,并且观察到给予30mg/kg ST101的一只雌性出现轻度肾小管的蛋白样铸型。观察到给予15mg/kg的两只雄性和一只雌性出现轻微至明显的肾小管坏死。对于恢复动物,在一只7.5mg/kg剂量的雄性、两只15mg/kg剂量的雄性、一只30mg/kg剂量的雄性和一只15mg/kg剂量的雌性的肾脏中观察到轻微至轻度肾小管坏死。在分配给这项研究的时间段内,肾小管的变化是部分可逆的。肾脏病变的频率和严重程度与施用剂量没有明确的关系,在核心和恢复动物中偶尔出现严重程度较低的情况。
在终末尸检时,肉眼病变包括在给予30mg/kg的四只雄性中的两只和四只雌性中的两只的一次或多次注射部位处观察到澄清流体。在给予7.5mg/kg的四只雄性中的一只和四只雌性中的一只、给予15mg/kg的四只雄性中的三只和四只雌性中的一只以及给予30mg/kg的四只雄性中的三只和所有雌性的一次或多次注射部位处观察到硬皮/病变/红色素沉着。对于每个剂量组的一些动物,还观察到最后一次注射部位处的轻度至明显的血栓形成,在30mg/kg剂量组中以更高频率出现。在恢复尸检时,在给予15mg/kg的两只雌性中的一只和给予30mg/kg的两只雄性的一次或多次注射部位处观察到观察到硬皮/病变/红色素沉着。
鉴于这些结果,HNSTD被视为15mg/kg剂量,并且NOAEL被视为7.5mg/kg剂量。
实施例6:向患有实体瘤的患者施用ST101
进行了一项开放标签的1-2阶段剂量发现研究,以确定在患有晚期不可切除的转移性实体瘤的患者中静脉内施用ST101的安全性、耐受性、PK、药效学(PD)和概念验证功效。研究包括两个阶段:(1)剂量递增阶段,和(2)扩增阶段。
剂量递增阶段
研究设计
剂量递增阶段涉及向被诊断患有局部晚期或转移性黑色素瘤、癌或任何肿瘤类型的肉瘤的患者静脉内施用ST101,所述患者对可能影响生存的所有可用疗法都不起反应或不耐受。剂量队列为0.5mg/kg、1mg/kg、2mg/kg、4mg/kg、6mg/kg、8mg/kg和16mg/kg,在所有队列中每周一次(QW)给药;最高剂量水平可每隔一周(Q2W)给药。施用是通过IV输注,总输注持续时间为至少90分钟。ST101以在0.9%盐水中稀释的包含海藻糖和乳酸的药物组合物形式提供。
输液相关反应(IRR)可能在施用ST101期间和/或之后发生。此类反应可包括发热、寒战/僵直、心动过速、呼吸急促、低血压、支气管痉挛和其他公认的症状。除非相关症状持续超过两天,否则IRR不被视为DLT。DRC将使用IRR来评估施用途径和持续时间的可行性。
可进行支持性护理措施以通过标准医疗管理维持患者的舒适度。此类措施包括停止或减慢输注、苯海拉明、对乙酰氨基酚和NSAID、晶体液、氧气、支气管扩张剂和其他临床必需的药剂,例如,如下:
a.对乙酰氨基酚/醋氨酚,650-1000mg,通过IV或口服(PO)施用;
b.25-50mg苯海拉明,通过IV或PO施用;
c.氯苯那敏,5-10mg,通过IV或PO施用;
d.雷尼替丁,50mg,通过IV或PO施用;
e.布洛芬,200-400mg,通过PO施用;
f.萘普生,500mg,通过PO施用;
g.0.9%生理盐水,1L或PRN,通过IV(温热的)施用;
h.丙氯拉嗪,5-10mg,通过IV或PO施用;
i.昂丹司琼,4-16mg,通过IV或PO施用;
j.地塞米松,5-10mg,通过IV施用;
k.氢化可的松,100mg一次,通过IV施用;
l.氢化可的松,50mg q6h,通过IV施用;
在第一次输注时出现相关IRR的患者在后续所有输注中接受防治,其中至少使用苯海拉明和对乙酰氨基酚,所述药物应在施用ST101前施用,以预测输注期间出现IRR。
.结果
剂量递增阶段正在进行。队列1-4中的所有患者(剂量水平分别为0.5mg/kg、1mg/kg、2mg/kg和4mg/kg;对于队列1-3中的每个队列,n=3;对于队列4,n=6)都已完成21天DLT期,但队列4中的一名患者因疾病进展未接受所有剂量。在队列5(6mg/kg)中,一名患者已完成DLT期并且两名患者处于DLT期中。队列5中的患者在给药前2天和给药当天施用10mg孟鲁司特、在给药当天PO或IV施用20mg法莫替丁,并且在给药当天PO施用10mg氯苯那敏或IV施用50mg苯海拉明。患有其他病状诸如过敏的患者可每天施用二级剂,诸如孟鲁司特。
队列1中的一名患者和队列3中的两名患者在至少18周内表现出稳定的疾病,如通过对肿瘤的放射评估(大小减少30%至增加20%)确定的。值得注意的是,队列1中的患者在46周内表现出稳定的疾病。图8中示出了患者的疾病状态。
一名患有转移性皮肤黑色素瘤的62岁女性对所有可用疗法都不起反应,在用4mg/kg ST101治疗9周后达成部分缓解。患者先前经历了四次局部复发,所述局部复发均切除并用美法仑隔离肢体灌注治疗。肺转移采用伊匹单抗-尼沃单抗组合疗法,然后尼沃鲁单抗单一疗法治疗,所述单一疗法因垂体炎而停止。随后的额叶脑转移用完全切除、放射疗法和尼沃鲁单抗治疗,直到进行性疾病PD。随后的粟粒性肺转移在切除腹部大肿块后用替莫唑胺治疗大约16个月,直到PD。在本研究开始前不久,患者被诊断出患有梨状肌转移。表3中示出了通过使用造影剂的CT测量的患者对ST101疗法的反应的评估。
表3.黑色素瘤患者的肿瘤反应
Figure BDA0004005490120000381
*最长直径(mm);+与基线相比,而不是第9周;PR=部分反应
除了患者的一个病变外,所有病变都缩小了,其中最大的病变显示出明显的缩小。另外,非靶标多发性肺病变的大小减小,并且未检测到新病变。
患者经历的大多数AE是前六小时内发生的IRR,并且用抗组胺剂/抗炎剂控制。为了管控IRR,对患者采用了以下措施:抗组胺剂(58%,12名患者)、NSAID(17%,队列1、3或4中的患者均无)、对乙酰氨基酚/醋氨酚(50%)、皮质类固醇(42%,队列1或2中的患者均无)、法莫替丁(8%,队列1、2或4中的患者均无)、中断输注(42%,队列1或2中的患者均无)以及减慢输注(42%,队列1或2中的患者均无)。
在给药前和第一个周期期间的总输注期之后的不同时间点抽取血样,并且此后以较低频率抽取血样。对于处于QW给药队列并因此遵循21天治疗周期的患者,在表4中所示的以下时间点抽取血样。
表4.QW队列中的抽血时间点
Figure BDA0004005490120000391
对于处于Q2W给药队列并因此遵循28天治疗周期的患者,在表5中所示的以下时间点抽取血样。
表5.Q2W队列中的抽血时间点
Figure BDA0004005490120000401
ST101在血浆中的药代动力学(PK)通过液相色谱联合串联质谱(LC-MS)来评估。队列1-4的PK结果表明Cmax和AUCt与剂量成比例(图9;图10,图A和图B),并且每个队列在输注后四小时表现出最小的ST101积聚(图11)。另外,每个队列的Tmax在输注结束时或接近输注结束,尽管队列之间的平均消除半衰期不同。PK结果总结在表6中。
表6.第1周期药代动力学参数的汇总
Figure BDA0004005490120000402
*基于n=2计算的
ST101的肿瘤摄取是通过免疫组织化学分析确定的。对在筛检期间(即用ST101治疗之前)和治疗的第2周期期间从患者收集的活检样品进行处理,并使用兔多克隆抗ST101抗体对ST101进行免疫测定。切片由委员会认证的病理学家分析,并基于显示ST101摄取的细胞的流行率进行评分。数据表明,随着ST101剂量的增加,肿瘤对ST101的摄取增加(图12)。在ST101暴露之前,在筛检期间从患者收集的所有活检均对ST101免疫染色呈阴性。
通过免疫组织化学分析确定ST101对肿瘤细胞增殖的影响。对在筛检和治疗第2周期期间从患者收集的活检样品进行处理并对Ki67的存在进行免疫测定。切片由委员会认证的病理学家进行分析,并基于Ki67信号的强度进行评分。数据表明Ki67信号在ST101暴露之后降低,如通过Ki67染色降低所证明的(图13)。
药效学评估包括针对机制相关的基因异常和随时间变化的循环无细胞脱氧核糖核酸(DNA)分析,以及使用定量逆转录酶(qRT)-聚合酶链反应(PCR)、Nanostring和免疫组织化学(IHC)在基线和治疗时进行的肿瘤分析。
扩增阶段
一旦达到最高递增队列或在给定剂量水平下观察到显著功效,并选择推荐的第2阶段剂量(RP2D),研究就进入扩增阶段。RP2D的选择是基于安全性、PK、PD和功效数据。RP2D可为最大耐受剂量(MTD)、“活性剂量”(被视为具有抗肿瘤活性的ST101的剂量,基于临床前、安全性、PK、PD和功效数据选择)或MTD与活性剂量之间的替代剂量。扩增阶段由下文所描述的四个特定肿瘤类型队列组成。
扩增阶段队列中至少10名患者在入组前28天内的筛检时进行了强制性核心或切除活检。如果可行,并且如果肿瘤在接受筛检活检的患者中持续存在,则对同一病变进行治疗后活检。可对任何其他病变进行额外任选的活检。
向乳腺癌患者施用ST101
向被诊断患有在先前的一到两种基于激素的疗法后进展的激素受体阳性(HRpos)的局部晚期或转移性乳腺癌(LA/MBC)的患者以0.5mg/kg、1mg/kg、2mg/kg、4mg/kg、6mg/kg、8mg/kg、12mg/kg或16mg/kg的剂量每周一次施用ST101,或以16mg/kg的剂量每隔一周施用ST101。先前用周期蛋白依赖性激酶4/6(CDK4/6)抑制剂、哺乳动物雷帕霉素靶标(mTOR)抑制剂或化学疗法的治疗允许作为单一疗法或组合疗法。
RECIST 1.1(Eisenhauer 2009)用于评估肿瘤反应、疾病控制率(DCR)、反应持续时间(DOR)和/或无进展生存期(PFS)。计算机CT或MRI用于评估肿瘤反应,其中CT是优选的成像技术。CR或PR的放射学评估需要在观察到初始反应评估后至少4周进行确认性成像。SD的放射学评估需要在观察到初始反应评估后至少6周进行确认性成像。PFS是从第一次治疗施用到第一次记录的疾病进展或死亡的时间确定的。DOR是从第一次观察到反应到第一次记录的疾病进展或死亡的时间确定的。
向黑色素瘤患者施用ST101
向被诊断患有在用免疫检查点抑制剂(CPI)治疗之后或治疗时进展的晚期/转移性黑色素瘤的患者以0.5mg/kg、1mg/kg、2mg/kg、4mg/kg、6mg/kg、8mg/kg、12mg/kg或16mg/kg的剂量每周一次施用ST101,或以16mg/kg的剂量每隔一周施用ST101。患有BRAF突变疾病的患者也应该接受一线适当的靶向疗法。
RECIST 1.1(Eisenhauer 2009)用于评估肿瘤反应、疾病控制率(DCR)、反应持续时间(DOR)和/或无进展生存期(PFS)。计算机CT或MRI用于评估肿瘤反应,其中CT是优选的成像技术。CR或PR的放射学评估需要在观察到初始反应评估后至少4周进行确认性成像。SD的放射学评估需要在观察到初始反应评估后至少6周进行确认性成像。PFS是从第一次治疗施用到第一次记录的疾病进展或死亡的时间确定的。DOR是从第一次观察到反应到第一次记录的疾病进展或死亡的时间确定的。
向胶质母细胞瘤患者施用ST101
向被诊断患有在一种标准的治疗方案之后复发或进展的原发(从头)GBM的患者以0.5mg/kg、1mg/kg、2mg/kg、4mg/kg、6mg/kg、8mg/kg、12mg/kg或16mg/kg的剂量每周一次施用ST101,或以16mg/kg的剂量每隔一周施用ST101。标准疗法定义为最大限度的手术切除、放射疗法以及替莫唑胺联合放射疗法或辅助化学疗法联合替莫唑胺。接受肿瘤治疗领域作为一线疗法的辅助治疗的患者是合格的。
修改的RANO(Ellingson 2017)用于评估肿瘤反应、疾病控制率(DCR)、反应持续时间(DOR)和/或无进展生存期(PFS)。钆增强的MRI用于评估肿瘤反应。CR或PR的放射学评估需要在观察到初始反应评估后至少4周进行确认性成像。SD的放射学评估需要在观察到初始反应评估后至少6周进行确认性成像。PFS是从第一次治疗施用到第一次记录的疾病进展或死亡的时间确定的。DOR是从第一次观察到反应到第一次记录的疾病进展或死亡的时间确定的。
向前列腺癌患者施用ST101
向被诊断患有在先前用紫杉烷、阿比特龙和恩杂鲁胺/阿帕鲁胺(除非禁用或患者对这些剂不耐受)治疗后进展的去势抵抗性前列腺癌(CRPC)的患者以0.5mg/kg、1mg/kg、2mg/kg、4mg/kg、6mg/kg、8mg/kg、12mg/kg或16mg/kg的剂量每周一次施用ST101,或以16mg/kg的剂量每隔一周施用ST101。
使用PCWG3指南(Scher 2016)对反应进行评级。CT或MRI用于评估肿瘤反应。进行成像评估直到进行性疾病(PD)。CR或PR的放射学评估需要在观察到初始反应评估后至少4周进行确认性成像。稳定疾病(SD)的放射评估需要在观察到初始反应评估后至少6周进行确认性成像。DCR、DOR和PFS的评估基于PCWG3测量值。第一次治疗施用到第一次记录的疾病进展或死亡的时间将决定PFS。第一次观察到反应到第一次记录的疾病进展或死亡的时间将决定DOR。
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***
本发明由以下权利要求进一步描述。
序列表
<110> 智慧疗法有限公司(SAPIENCE THERAPEUTICS, INC.)
<120> CEBP-β拮抗剂的施用和使用方法
<130> SAPIENCE.013.WO1
<140>
<141>
<150> 63/172,560
<151> 2021-04-08
<150> 63/041,991
<151> 2020-06-21
<150> 63/041,990
<151> 2020-06-21
<150> 63/041,989
<151> 2020-06-21
<150> 63/041,988
<151> 2020-06-21
<150> 63/041,986
<151> 2020-06-21
<160> 4
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
<220>
<221> MOD_RES
<222> (1)..(22)
<223> D-氨基酸
<400> 1
Val Ala Glu Ala Arg Glu Glu Leu Glu Arg Leu Glu Ala Arg Leu Gly
1 5 10 15
Gln Ala Arg Gly Glu Leu
20
<210> 2
<211> 38
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 人工序列的描述:合成
多肽
<220>
<221> MOD_RES
<222> (1)..(38)
<223> D-氨基酸
<400> 2
Val Ala Glu Ala Arg Glu Glu Leu Glu Arg Leu Glu Ala Arg Leu Gly
1 5 10 15
Gln Ala Arg Gly Glu Leu Lys Lys Trp Lys Met Arg Arg Asn Gln Phe
20 25 30
Trp Leu Lys Leu Gln Arg
35
<210> 3
<211> 22
<212> PRT
<213> 未知(Unknown)
<220>
<223> 未知的描述:
ATF5 bZIP域肽
<400> 3
Leu Glu Gly Glu Cys Gln Gly Leu Glu Ala Arg Asn Arg Glu Leu Lys
1 5 10 15
Glu Arg Ala Glu Ser Val
20
<210> 4
<211> 22
<212> PRT
<213> 未知(Unknown)
<220>
<223> 未知的描述:
bZIP域肽
<400> 4
Leu Glu Gly Arg Ala Gln Gly Leu Arg Ala Glu Leu Arg Glu Leu Glu
1 5 10 15
Glu Arg Ala Glu Ala Val
20

Claims (38)

1.一种治疗人患者的实体瘤的方法,所述方法包括向所述患者胃肠外施用包含有效量的CCAAT-增强子结合蛋白β(C/EBPβ)肽拮抗剂的药物组合物。
2.如权利要求1所述的方法,其中所述实体瘤是黑色素瘤、癌或肉瘤。
3.如权利要求1所述的方法,其中所述患者已被诊断患有局部晚期或转移性乳腺癌(LA/MBC)、黑色素瘤、胶质母细胞瘤(GBM)或去势抵抗性前列腺癌(CRPC)。
4.如权利要求1所述的方法,其中所述患者已接受选自由以下组成的组的先前治疗:化学疗法、基于激素的疗法、免疫疗法、靶向疗法及其组合。
5.如权利要求1所述的方法,其中所述肽拮抗剂包含D-氨基酸序列VAEAREELERLEARLGQARGEL(SEQ ID NO:4)。
6.如权利要求1所述的方法,其中所述肽拮抗剂包含氨基酸序列LEGRAQGLRAELRELEERAEAV(SEQ ID NO:3)。
7.如权利要求1所述的方法,其中所述肽拮抗剂是细胞穿透肽。
8.如权利要求1所述的方法,其中所述肽拮抗剂是ST101。
9.如权利要求8所述的方法,其中所述肽拮抗剂以约0.5-16mg/kg的剂量施用于所述患者。
10.如权利要求1所述的方法,其中所述药物组合物是静脉内施用。
11.如权利要求10所述的方法,其中所述药物组合物通过输注施用。
12.如权利要求11所述的方法,其中所述药物组合物通过静脉内输注施用,总输注持续时间为约30分钟至约360分钟。
13.如权利要求12所述的方法或组合物,其中所述总输注持续时间为约60分钟至约180分钟。
14.如权利要求1所述的方法,其中所述药物组合物每周施用一次。
15.如权利要求1所述的方法,其中所述药物组合物每两周施用一次。
16.如权利要求1所述的方法,其中所述药物组合物施用至少四周。
17.如权利要求1所述的方法,其中在施用所述药物组合物的同时、之前或之后施用一种或多种选自由以下组成的组的二级剂:抗组胺剂、白三烯抑制剂、非类固醇抗炎药、对乙酰氨基酚、皮质类固醇、抗恶心药、静脉内盐水和电解质。
18.如权利要求17所述的方法,其中在施用所述药物组合物之前约48小时内向所述受试者施用抗组胺剂和/或白三烯抑制剂。
19.如权利要求1所述的方法,其中所述药物组合物包含缓冲液和填充剂。
20.如权利要求1所述的方法,其中所述药物组合物包含乳酸和海藻糖。
21.如权利要求1所述的方法,其中所述药物组合物的pH为约3.0-8.0。
22.一种治疗人患者的HRpos LA/MBC的方法,所述方法包括通过静脉内输注向所述患者施用包含有效量的ST101的药物组合物。
23.一种治疗人患者的黑色素瘤的方法,所述方法包括通过静脉内输注向所述患者施用包含有效量的ST101的药物组合物,其中所述患者在施用ST101之前已接受至少一线疗法。
24.如权利要求23所述的方法,其中所述患者患有在用免疫检查点抑制剂治疗之后或治疗时进展的黑色素瘤,并且其中所述患者患有晚期/转移性黑色素瘤。
25.如权利要求23所述的方法,其中所述患者患有包含BRAF突变的黑色素瘤,并且其中所述患者已接受至少一线靶向疗法。
26.一种治疗人患者的原发GBM的方法,所述方法包括通过静脉内输注向所述患者施用包含有效量的ST101的药物组合物。
27.如权利要求26所述的方法,其中所述GBM在先前通过最大限度的手术切除、放射疗法以及替莫唑胺联合放射疗法或辅助化学疗法联合替莫唑胺治疗后复发或进展。
28.一种治疗人患者的CRPC的方法,所述方法包括通过静脉内输注向所述患者施用包含有效量的ST101的药物组合物。
29.如权利要求28所述的方法,其中所述患者患有在先前用紫杉烷、阿比特龙、达洛鲁胺和/或恩杂鲁胺/阿帕鲁胺治疗后进展的CRPC。
30.如权利要求22至29中任一项所述的方法,其中ST101以约0.5-16mg/kg的剂量施用于所述患者。
31.如权利要求30所述的方法,其中所述药物组合物每周施用一次,持续至少三周。
32.如权利要求30所述的方法,其中所述药物组合物每两周施用一次,持续至少四周。
33.如权利要求22至32中任一项所述的方法,其中所述药物组合物包含海藻糖和乳酸。
34.如权利要求22至33中任一项所述的方法,其中所述药物组合物通过静脉内输注施用,总输注持续时间为约60分钟至约360分钟。
35.如权利要求22至34中任一项所述的方法,其中ST101的清除率为每小时0.75-3.5升。
36.如权利要求22至35中任一项所述的方法,其中ST101的半衰期(t1/2)为10-70小时。
37.一种用于胃肠外施用的药物组合物,所述药物组合物包含有效量的C/EBPβ肽拮抗剂以用于治疗人患者的实体瘤。
38.一种用于静脉内输注的药物组合物,所述药物组合物包含有效量的ST101以用于治疗人患者的黑色素瘤、HRpos LA/MBC、原发GBM或CRPC。
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