CN115703843A - 融合蛋白、其相关核酸分子以及其在高通量测序中的应用 - Google Patents

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CN115703843A CN202110944263.8A CN202110944263A CN115703843A CN 115703843 A CN115703843 A CN 115703843A CN 202110944263 A CN202110944263 A CN 202110944263A CN 115703843 A CN115703843 A CN 115703843A
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章文蔚
张维
董宇亮
郑越
马旭妍
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Abstract

本发明提供了一种融合蛋白、其相关核酸分子以及其在高通量测序中的应用。其中,该融合蛋白包括脱氧核糖核苷酸抗体以及与脱氧核糖核苷酸抗体融合表达的荧光素酶,融合蛋白能够与脱氧核糖核苷酸抗体对应的脱氧核糖核苷酸结合,且在催化荧光素酶底物后发光。该融合蛋白兼具两种活性,一方面能够识别阻断的脱氧核糖核苷酸上的碱基,直接靶向测序碱基,另一方面能够催化荧光素酶底物自发光。因而应用于测序时,不需要化学修饰制备试剂原料,同时拥有自发光测序平台仪器结构简单、无需荧光光源等优势。

Description

融合蛋白、其相关核酸分子以及其在高通量测序中的应用
技术领域
本发明涉及高通量测序技术领域,具体而言,涉及一种融合蛋白、其相关核酸分子以及其在高通量测序中的应用。
背景技术
荧光素酶(Luciferase)是生物体内能够产生生物发光的酶的总称。由于其自发光效应而被广泛应用作为报告基因。在检测等方面的应用也越来越广泛。荧光素酶的种类包括:细菌荧光素酶(Bacterial Luciferase,BLuc)、萤火虫荧光素酶(Firefly Luciferase,FLuc)、海肾荧光素酶(Renilla Luciferase,RLuc)和高斯荧光素酶(Gaussia Luciferase,GLuc)。
“边合成边测序技术”(SBS)是目前世界范围内广泛使用的新一代测序技术,它是通过在dNTP上引入可逆阻断基团以及可切割的荧光标记,来实现dNTP掺入时的荧光信号的采集的。最常见的SBS测序方法是:将模板和测序引物固定在固体支撑物上,并将该支撑物暴露于四种含有可逆阻断基团和可切割荧光标记的dNTP类似物中。退火时,在DNA聚合酶的作用下,只有正确的互补碱基可以掺入3’末端,洗掉未掺入的核苷酸并将固体支撑物成像即完成了一个碱基的测序。接着在体系中加入切除试剂以裂解接头释放荧光团,并去除3’端阻断基团,从而使3’-O H再生。而后可以重复该循环。每一种碱基使用不同的荧光颜色进行标记,使得在每个测序循环中,可以通过其颜色鉴定掺入的dNTP类似物,判断被测序的碱基。然而,目前的SBS方法需要昂贵的可逆终止的dNTP,且这种将荧光标记修饰在dNTP上的测序方法,相比未带荧光标记的dNTP而言,在一定程度上对DNA聚合酶的聚合效率影响更大。另外,由于这种荧光标记在前一轮PCR信号采集完成后需要切掉,以便引入下一个dNTP,由于切割荧光标记后的DNA链上会留有“疤痕”(即残留的修饰),一方面影响后续DNA聚合酶的识别和结合效率,另一方面还可能对后一个dNTP所携带的荧光产生干扰,甚至导致荧光淬灭。
为此,华大智造开发出一种新的基于抗体识别碱基的抗体测序技术。抗体测序技术是利用抗体识别未进行染料标记的脱氧核糖核苷酸进而完成测序的技术。其具体原理如图1所示,通过脱氧核糖核苷酸抗体识别待测序碱基,抗体上标有不同荧光染料进而可以识别不同碱基。在测序过程中,可逆阻断的dNTP(简称cold-dNTP)首先被聚合到与待测DNA分子反向互补的分子锚上,带有不同荧光标记的抗体分别与cold-dNTP特异结合。通过信号采集和脱氧核糖核苷酸识别算法获得待测DNA分子的脱氧核糖核苷酸序列信息。
但是,抗体测序技术需要开发4种荧光染料,且4种荧光染料需要修饰到抗体上。同时由于使用荧光染料,后续测序仪必需用到贵重的光学仪器,因而在一定程度上限制了其在测序方面的广泛应用。因此,仍需要对现有技术中的高通量测序技术进行改进。
发明内容
本发明的主要目的在于提供一种融合蛋白、其相关核酸分子以及其在高通量测序中的应用,为研究和开发新的测序技术提供基础。
为了实现上述目的,根据本发明的一个方面,提供了一种融合蛋白,该融合蛋白包括脱氧核糖核苷酸抗体以及与脱氧核糖核苷酸抗体融合表达的荧光素酶,融合蛋白能够与脱氧核糖核苷酸抗体对应的脱氧核糖核苷酸结合,且在催化荧光素酶底物后发光。
进一步地,脱氧核糖核苷酸抗体选自dATP、dTTP、dCTP及dGTP中任意一种脱氧核糖核苷酸的抗体;优选地,荧光素酶选自细菌荧光素酶、萤火虫荧光素酶、海萤荧光素酶、海肾荧光素酶、高斯荧光素酶、Nanoluc萤光素酶和刺虾荧光素酶中的任意一种;优选地,脱氧核糖核苷酸抗体采用IgG、Fab、scFV、及VHH中的任意一种抗体的结构。
进一步地,脱氧核糖核苷酸抗体包括轻链和重链,并且重链与荧光素酶融合表达;优选地,重链与荧光素酶之间通过柔性肽连接;优选地,柔性肽为(GGGGS)n或A(EAAAK)nA,n选自1、2、3或4;优选地,重链与荧光素酶之间通过柔性肽连接形成H-Luc重组重链,其中,H-Luc重组重链选自SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:7;优选地,融合蛋白为anti-A-Luc融合蛋白、anti-T-Luc融合蛋白、anti-C-Luc融合蛋白或anti-G-Luc融合蛋白,其中,anti-A-Luc融合蛋白的H-Luc重组重链的氨基酸序列为SEQ ID NO:1,轻链的氨基酸序列为SEQ ID NO:2;anti-T-Luc融合蛋白的H-Luc重组重链的氨基酸序列为SEQ IDNO:3,轻链的氨基酸序列为SEQ ID NO:4;anti-C-Luc融合蛋白的H-Luc重组重链的氨基酸序列为SEQ ID NO:5,轻链的氨基酸序列为SEQ ID NO:6;anti-G-Luc融合蛋白的H-Luc重组重链的氨基酸序列为SEQ ID NO:7,轻链的氨基酸序列为SEQ ID NO:8。
为了实现上述目的,根据本发明的第二个方面,提供了编码上述任一种融合蛋白的融合片段的核酸分子,融合片段为脱氧核糖核苷酸抗体与荧光素酶融合表达的片段。
进一步地,融合片段为脱氧核糖核苷酸抗体的重链与荧光素酶融合而成的H-Luc重组重链,其中,编码H-Luc重组重链的核酸分子的核酸序列选自SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13或SEQ ID NO:15;优选地,编码融合蛋白的核酸分子还包括编码脱氧核糖核苷酸抗体的轻链的核酸分子,其中,当编码H-Luc重组重链的核酸分子的核酸序列为SEQID NO:9时,编码轻链的核酸分子的核酸序列为SEQ ID NO:10;当编码H-Luc重组重链的核酸分子的核酸序列为SEQ ID NO:11时,编码轻链的核酸分子的核酸序列为SEQ ID NO:12;当编码H-Luc重组重链的核酸分子的核酸序列为SEQ ID NO:13时,编码轻链的核酸分子的核酸序列为SEQ ID NO:14;当编码H-Luc重组重链的核酸分子的核酸序列为SEQ ID NO:15时,编码轻链的核酸分子的核酸序列为SEQ ID NO:16。
根据本申请的第三个方面,提供了一种重组载体,重组载体上连接有上述任一种核酸分子。
根据本申请的第四个方面,提供了一种宿主细胞,该宿主细胞中转染有上述任一种重组载体。
根据本申请的第五个方面,提供了一种高通量测序方法,该高通量测序方法包括:将带有可逆阻断基团的脱氧核糖核苷酸加入到待测序的核酸分子上,再加入上述任一种融合蛋白,通过检测融合蛋白自发光所产生的信号来确定掺入的脱氧核糖核苷酸的类型,从而确定待测序的核酸分子的序列。
进一步地,通过检测在每一轮反应中掺入带有可逆阻断基团的脱氧核糖核苷酸时,融合蛋白自发光所产生的信号,来获得待测序的核酸分子的碱基序列;其中,每一轮反应的反应体系包括带有可逆阻断基团的脱氧核糖核苷酸、待测序的核酸分子、DNA聚合酶、融合蛋白以及融合蛋白的荧光素酶活性相对应的底物荧光素,且每一轮反应掺入的带有可逆阻断基团的脱氧核糖核苷酸为可逆阻断dATP、可逆阻断dTTP、可逆阻断dCTP及可逆阻断dGTP中的一种;优选地,荧光素选自萤火虫荧光素、海萤荧光素、腔肠素、氟代腔肠素和腔肠素类似物中的任意一种;优选地,通过自发光测序平台检测融合蛋白自发光所产生的信号,更优选自发光测序平台包括DNBSeq-E5测序仪。
根据本申请的第六个方面,提供了上述任一种融合蛋白在高通量测序中的应用。
应用本发明的技术方案,提供了一种脱氧核糖核苷酸抗体与荧光素酶的融合蛋白,该融合蛋白兼具两种活性,一方面能够识别阻断的脱氧核氧核苷酸上的碱基,直接靶向测序碱基,另一方面能够催化荧光素酶底物自发光。因而应用于测序时,不需要化学修饰制备试剂原料,同时拥有自发光测序平台仪器简单、无需荧光光源等优势,为开发新型测序技术提供了新的思路和基础。
附图说明
构成本申请的一部分的说明书附图用来提供对本发明的进一步理解,本发明的示意性实施例及其说明用于解释本发明,并不构成对本发明的不当限定。在附图中:
图1示出了现有技术中基于脱氧核糖核苷酸抗体测序的原理示意图;
图2示出了本申请优选实施例中融合蛋白的结构示意图;
图3A至图3C示出了本申请优选实施例中融合蛋白的表达载体构建过程示意图;
图4示出了本申请优选实施例中表达的融合蛋白的SDS-PAGE检测图;
图5示出了本申请优选实施例中所构建表达的融合蛋白的抗体部分ELISA检测图;
图6示出了本申请优选实施例中所构建表达的融合蛋白生物发光检测实验结果;
图7示出了本申请优选实施例中所构建表达的融合蛋白双功能活性检测图;
图8示出了本申请优选实施例中所构建表达的融合蛋白在自发光测序仪上活性检测图;
图9示出了本申请另一种优选实施例中融合蛋白的结构示意图。
具体实施方式
需要说明的是,在不冲突的情况下,本申请中的实施例及实施例中的特征可以相互组合。下面将结合实施例来详细说明本发明。
术语解释:
柔性肽:也可以叫做接头序列(linker),本申请中指通过适当的核苷酸序列将不同的目的基因连接起来,使其在适当的生物体内表达为一条单一的肽链,其中,起到连接作用的氨基酸序列即被称为柔性肽。
VHH:Variable domain of heavy chain of heavy chain antibody,只有重链可变区组成的单域抗体,也称为纳米抗体(nanobody,a single domain antibody),是最小的功能性抗原结合片段,具有分子量小、结构简单、易于进行基因改造、稳定性好、可溶性强、抗原结合性能好以及体积小、免疫原性低、组织穿透力强等特点。
如背景技术所提到的,现有的大多高通量测序技术都基于识别碱基,使得特定的荧光基团或荧光染料在特定波长的激光激发下产生特定的荧光信号来确定碱基顺序,这不仅需要测序仪器配备贵重的光学仪器来实现荧光信号的产生和采集,而且需要复杂的化学修饰工艺来制备相应的试剂。为改善这一现状,本申请开发出一种融合蛋白,并且基于该融合蛋白改进了测序方案。该融合蛋白是一种脱氧核糖核苷酸抗体与荧光素酶融合蛋白,该融合蛋白使得抗体测序技术的优势得以在自发光测序平台上使用。本申请开发出的融合蛋白一方面能够识别阻断的脱氧核氧核苷酸上的碱基,直接靶向测序碱基,另一方面能够催化荧光素酶底物自发光。因而应用于测序时,不需要化学修饰制备试剂原料,同时拥有自发光测序平台仪器简单,无需荧光光源等优势,为开发新型测序技术提供了新的思路和基础。
基于上述研究结果,申请人提出了本申请的技术方案。在一种典型的实施方式中,提供了一种融合蛋白,该融合蛋白包括脱氧核糖核苷酸抗体以及与脱氧核糖核苷酸抗体融合表达的荧光素酶,融合蛋白能够与脱氧核糖核苷酸抗体对应的脱氧核糖核苷酸结合,且在催化荧光素酶底物后发光。
本发明提供的融合蛋白同时保留了两部分蛋白的活性,一方面能够特异性地与dNTP结合,另一方面能够发挥荧光素酶催化底物后发光的优势,有助于降低测序平台对荧光光源及昂贵光学采集设备的依赖,可应用于临床检测或相关科学研究。
上述脱氧核糖核苷酸抗体选自dATP、dTTP、dCTP及dGTP中任意一种脱氧核糖核苷酸的抗体。优选地,荧光素酶选自细菌荧光素酶、萤火虫荧光素酶、海萤荧光素酶、海肾荧光素酶、高斯荧光素酶(Gaussia luciferase,一种20KD的蛋白,来源于海洋桡足类生物长腹水蚤,可通过催化腔肠素氧化发光)、Nanoluc荧光素酶和刺虾荧光素酶(即刺虾来源的荧光素酶)中的任意一种。
上述脱氧核糖核苷酸抗体的结构可以采用现有抗体结构中的任意一种,优选采用IgG、Fab、scFv、VHH中的任意一种抗体的结构,本申请中优选实施例中,采用图2所示的抗体结构。为进一步提高荧光素酶的自发光性能,也可以在图2所示基础上增加所融合的荧光素酶的数量,比如如图9所示的抗体结构。
通常,融合蛋白的构建需要满足融合分子间以富含疏水性氨基酸的接头序列连接。相应地,上述融合蛋白中脱氧核糖核苷酸抗体与荧光素酶之间也通过接头序列连接,使两部分活性分子之间保持足够的空间距离以使得融合的两部分活性分子的生物学活性能够正常发挥。能够起到此类作用的接头序列可以是螺旋状的连接肽[A(EAAAK)nA](能够增加蛋白结构域之间的距离)和低疏水性、低电荷的氨基酸组成的柔性肽。
采用低疏水性、低电荷小的氨基酸组成的多肽接头具有较大的柔性,能够充分伸展以分开两种融合的组合分子,使之能在互不干扰的情况下充分折叠成各自的天然构象。最常用的是(GGGGS)n,n≥2。
柔性肽的长度若过长,容易使融合蛋白对蛋白酶比较敏感,导致活性融合蛋白在生产过程中的产量下降。若过短,能避免融合蛋白被分解,但两个融合分子相距太近,不利于蛋白功能的发挥。通常连接肽至少应包含10个氨基酸。目前最为常用的是Huston设计合成的(GGGGS)3序列。
在本申请一些优选的实施例中,融合蛋白中脱氧核糖核苷酸抗体与荧光素酶之间通过柔性肽连接,优选地,柔性肽为(GGGGS)n或A(EAAAK)nA,n选自1、2、3或4;具体柔性链的类型和长度可以根据实际效果进行合理选择确定。更优选地,柔性肽为(GGGGS)2。n选自2时柔性肽序列为GGGGSGGGGS(SEQ ID NO:17)或AEAAAKEAAAKA(SEQ ID NO:20);n选自3时柔性肽序列为GGGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:18)或AEAAAKEAAAKEAAAKA(SEQ ID NO:21);n选自4时柔性肽序列为GGGGSGGGGSGGGGSGGGGS(SEQ ID NO:19)或AEAAAKEAAAKEAAAKEAAAKA(SEQID NO:22)。
脱氧核糖核苷酸抗体的结构包括重链和轻链,荧光素酶融合时,根据需要可以与轻链融合,也可以与重链融合,具体与轻链或重链融合的位置,可以根据需要合理选择。本申请优选的实施例中,荧光素酶通过与重链融合形成的上述融合蛋白。优选地,荧光素酶在重链的C端融合。即通过上述柔性链与重链的C末端连接。
在本申请中,将重链与荧光素酶之间通过柔性肽连接形成的片段记作H-Luc重组重链,根据脱氧核糖核苷酸抗体种类的不同,该H-Luc重组重链的序列也不同。优选地,H-Luc重组重链选自SEQ ID NO:1(即为dATP抗体的重组重链序列)、SEQ ID NO:3(即为dTTP抗体的重组重链序列)、SEQ ID NO:5(即为dCTP抗体的重组重链序列)或SEQ ID NO:7(即为dGTP抗体的重组重链序列)。
将四种脱氧核糖核苷酸抗体的融合蛋白分别记作anti-A-Luc融合蛋白、anti-T-Luc融合蛋白、anti-C-Luc融合蛋白或anti-G-Luc融合蛋白,在一优选的实施例中,anti-A-Luc融合蛋白的H-Luc重组重链的氨基酸序列为SEQ ID NO:1,轻链的氨基酸序列为SEQ IDNO:2;anti-T-Luc融合蛋白的H-Luc重组重链的氨基酸序列为SEQ ID NO:3,轻链的氨基酸序列为SEQ ID NO:4;anti-C-Luc融合蛋白的H-Luc重组重链的氨基酸序列为SEQ ID NO:5,轻链的氨基酸序列为SEQ ID NO:6;anti-G-Luc融合蛋白的H-Luc重组重链的氨基酸序列为SEQ ID NO:7,轻链的氨基酸序列为SEQ ID NO:8。
在本申请第二种典型的实施方式中,还提供了一种核酸分子,该核酸分子编码上述任一种融合蛋白的融合片段,融合片段为脱氧核糖核苷酸抗体与荧光素酶融合表达的片段。
核酸分子的序列结构根据脱氧核糖核苷酸抗体与荧光素酶融合的具体方式的不同而有所不同。在本申请一种优选的实施例中,融合片段为脱氧核糖核苷酸抗体的重链与荧光素酶融合而成的上述H-Luc重组重链,其中,编码H-Luc重组重链的核酸分子的核酸序列选自SEQ ID NO:9(即为dATP抗体的重组重链的重组DNA序列)、SEQ ID NO:11(即为dTTP抗体的重组重链的重组DNA序列)、SEQ ID NO:13(即为dCTP抗体的重组重链的重组DNA序列)或SEQ ID NO:15(即为dGTP抗体的重组重链的重组DNA序列)。
上述融合蛋白是通过将编码抗体轻链和重组重链的基因置于同一细胞中表达后结合而成。即编码融合蛋白的核酸分子还包括编码轻链的核酸分子,分别选自SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14或SEQ ID NO:16,其中SEQ ID NO:9编码的H-Luc重组重链与SEQ ID NO:10编码的轻链结合形成上述anti-A-Luc融合蛋白;SEQ ID NO:11编码的H-Luc重组重链与SEQ ID NO:12编码的轻链结合形成上述anti-T-Luc融合蛋白;SEQ ID NO:13编码的H-Luc重组重链与SEQ ID NO:14编码的轻链结合形成上述anti-C-Luc融合蛋白;SEQ ID NO:15编码的H-Luc重组重链与SEQ ID NO:16编码的轻链结合形成上述anti-G-Luc融合蛋白。
在本申请第三种典型的实施方式中,提供了一种重组载体,该重组载体上连接有编码上述融合蛋白的融合片段的核酸分子。
在本申请第四种典型的实施方式中,提供了一种宿主细胞,该宿主细胞中转染有上述重组载体。
在上述基础上,本申请还提供了一种融合蛋白的纯化方法,该纯化方法包括但不局限于:离子交换层析(Q柱、SP柱)、疏水层析、肝素柱层析或硫酸铵沉淀法。
在本申请第五种典型的实施方式中,提供了一种高通量测序方法,该高通量测序方法包括:将带有可逆阻断基团的脱氧核糖核苷酸加入到待测序的核酸分子上,再加入上述任一种的融合蛋白,通过检测该融合蛋白自发光产生的信号来确定掺入的脱氧核糖核苷酸的类型,从而确定该待测序核酸分子的序列。
在一种优选的实施例中,上述高通量测序的方法包括:通过检测在每一轮反应中掺入带有可逆阻断基团的脱氧核糖核苷酸时融合蛋白自发光所产生的信号,来获得待测序核酸分子的碱基序列;其中,每一轮反应的反应体系包括带有可逆阻断基团的脱氧核糖核苷酸、待测核酸分子、DNA聚合酶、融合蛋白以及融合蛋白的荧光素酶活性相对应的底物荧光素,且每一轮反应掺入的带有可逆阻断基团的脱氧核糖核苷酸为可逆阻断dATP、可逆阻断dTTP、可逆阻断dCTP及可逆阻断dGTP中的一种。
本申请提供的上述融合蛋白是一种脱氧核糖核苷酸抗体与荧光素酶融合蛋白,该融合蛋白兼具两个分子的生物学活性,一方面能够通过脱氧核糖核苷酸抗体特异性识别阻断的脱氧核糖核苷酸,直接靶向测序碱基,另一方面能够催化荧光素酶底物自发光。因而应用于测序时,可以简化底物制备流程,无需荧光标记,同时拥有自发光测序平台仪器简单,无需荧光光源等优势。
现有技术中基于抗体的测序原理是:每一种抗体特异性识别一种具有可逆阻断基团的脱氧核糖核苷酸,然后通过识别每一种抗体所携带的荧光标记的颜色来判断相应的碱基。
在本申请改进的融合蛋白方案中,将常规抗体上的荧光标记改为荧光素酶,则上述改进的测序反应的原理为:若添加的一个dNTP(如dCTP),通过碱基互补配对原则,能够与待测核酸分子配对,则在聚合酶的作用下被添加到引物的3’末端,通过向反应体系中加入融合蛋白,融合蛋白中的抗体部分可以特异性的识别添加的脱氧核糖核苷酸(如dCTP),向体系中通入对应底物时,融合蛋白中的荧光素酶可以催化底物发光,发光信号可被检测系统识别而完成测序的技术。
在本申请中,荧光素可以根据对应的荧光素酶进行选择,在一种优选的实施例中,上述荧光素选自萤火虫荧光素、海萤荧光素、腔肠素、氟代腔肠素和腔肠素类似物中的任意一种。其中,萤火虫荧光素是萤火虫荧光素酶的底物,海萤荧光素是海萤荧光素酶的底物,腔肠素、氟代腔肠素和腔肠素类似物是海肾荧光素酶、高斯荧光素酶等的底物。
在本申请中,融合蛋白中的荧光素酶催化底物发光的颜色理论上可以相同也可以不同。在一种实施方式中,每一轮反应仅加入一种融合蛋白及其对应的底物荧光素,因而,只需通过检测是否发光即可判断该轮反应加入的脱氧核糖核苷酸中碱基的类型是否与待测序核酸分子的模板序列匹配,进而可以判断相应位置的脱氧核糖核苷酸中碱基的类型,此种情形下,荧光素酶催化底物后发光的颜色无特殊要求,可以相同或不同。
在另一种实施方式中,每一轮反应同时加入四种融合蛋白及其对应的四种底物荧光素,需要检测四种颜色不同的荧光来实现四种不同的脱氧核糖核苷酸类型的区分,此时荧光素酶催化底物后发光的颜色互不相同。
在又一种实施方式中,每一轮反应同时加入三种融合蛋白和一种未与荧光素酶融合的脱氧核糖核苷酸抗体,三种融合蛋白中的第一种融合蛋白含有第一种荧光素酶,第二种融合蛋白含有第二种荧光素酶,第三种融合蛋白同时含有第一种和第二种荧光素酶(结构如图9所示),因此,在通入第一种荧光素酶对应的底物时,检测到发光信号则是对应第一融合蛋白和第三融合蛋白结合的脱氧核糖核苷酸,在通入第二种荧光素酶对应的底物时,检测到发光信号则是对应第二融合蛋白和第三融合蛋白结合的脱氧核糖核苷酸,而两次检测后都不发光则是对应未与荧光素酶融合的脱氧核糖核苷酸抗体所对应的脱氧核糖核苷酸,此种情形下,荧光素酶催化底物后发光的颜色是相同的,不需要进行特殊区分。具体地,例如使用anti-A-Gluc、anti-T-Nluc、anti-C-Nluc-Gluc三种融合蛋白和未与荧光素酶融合的anti-G抗体,在通入Gluc的底物腔肠素时,第一次检测到发光信号则对应脱氧核糖核苷酸A和C,在通入Nluc的底物氟代腔肠素时,第二次检测到发光信号则对应脱氧核糖核苷酸T和C,即两次检测都发光则对应脱氧核糖核苷酸C,只有第一次检测发光则对应脱氧核糖核苷酸A,只有第二次检测发光则对应脱氧核糖核苷酸T,两次检测后都没有发光则对应脱氧核糖核苷酸G,从而实现四种脱氧核糖核苷酸的区分。
由于本申请的融合蛋白能够在催化底物荧光素后自发光产生信号,因而本申请的高通量测序步骤中,对测序平台的设备要求较低,在发光步骤不需要高昂的激发光光源设备,在信号采集步骤中也不需要采用高昂的光学设备,只需采用普通的自发光测序平台进行发光信号的采集即可。优选可采用的自发光测序平台包括DNBseq-E5测序仪。
此外,在其他实施方式中,本申请的上述融合蛋白还可以在高通量测序中有其他的应用形式,比如作为对照,用于开发其他新的测序用试剂等。
下面将结合具体的实施例来进一步说明本申请的有益效果。需要说明的是,以下实施例主要包括如下内容:
1)将基因合成获得的融合蛋白重组表达质粒pcDNA3.1-H-Luc和pcDNA3.1-L电转入CHO细胞中,两种质粒的表达产物——抗体重链荧光素酶融合蛋白和抗体轻链,在细胞内组装成本发明的融合蛋白,利用遗传霉素G418进行筛选高表达融合抗体的稳定细胞株;
2)对稳定细胞株扩大培养,低温离心取上清,将上清过Protein A柱进行分离纯化;
3)SDS-PAGE鉴定分离纯化得到的融合蛋白;
4)ELISA实验鉴定融合蛋白抗体部分的亲和活性;
5)酶活实验鉴定荧光素酶部分的自发光活性。
6)在4)和5)证明融合蛋白均良好地保留了两部分蛋白的活性基础上,将融合蛋白在自发光测序仪上进行信号测试,能很好地接收信号,表明本发明的融合蛋白可用于新型测序技术。
实施例1融合蛋白重组表达载体pcDNA3.1-H-Luc和pcDNA3.1-L的构建
设计含有碱基抗体重链与荧光素酶的融合基因的质粒pcDNA3.1-H-Luc(SEQ IDNO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:15),设计含有碱基抗体轻链基因的质粒pcDNA3.1-L(SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:16),委托华大吉比爱合成以上质粒。
SEQ ID NO:9中第1位至第1341位为dATP抗体重链基因序列,第1342位至第1386位为linker基因序列,第1387位至第1905位为荧光素酶基因序列;
SEQ ID NO:11中第1位至第1347位为dTTP抗体重链基因序列,第1348位至第1392位为linker基因序列,第1393位至第1911位为荧光素酶基因序列;
SEQ ID NO:13中第1位至第1338位为dCTP抗体重链基因序列,第1339位至第1383位为linker基因序列,第1384位至第1905位为荧光素酶基因序列;
SEQ ID NO:15中第1位至第1326位为dGTP抗体重链基因序列,第1327位至第1371位为linker基因序列,第1372位至第1890位为荧光素酶基因序列;
各序列中加粗及加下划线部分为柔性肽(或者叫linker,连接序列),linker前的序列为抗体重链序列,linker后的序列为荧光素酶序列。以pcDNA3.1-A-H-Luc和pcDNA3.1-A-L为例,质粒图谱设计思路及构建过程如图3A、3B及3C所示。
实施例2融合表达载体的转染、表达和纯化
准备1mL浓度为1×107个/mL的CHO细胞,取100μL,加入10μg构建好的pcDNA3.1-H-Luc和pcDNA3.1-L融合蛋白表达质粒,混合均匀。将混好的融合蛋白表达质粒细胞混合物加入电击杯中,通过电转仪(125V 50ms)电转细胞。将细胞取出放入37℃预热的新鲜培养基中。37℃,8%CO2条件下培养。
待细胞扩大培养收集细胞培养液8000rpm/min离心10min,收集上清。将上清过滤后进行Protein A柱上样,PBS洗涤10mL。用pH3.0 100mM甘氨酸20mM精氨酸洗脱。10%SDS-PAGE检测洗脱得到的蛋白。将最终纯化后的样品透析或超滤至PBS中,液氮速冻,-70℃保存。
SDS-PAGE检测结果见图4。其中泳道1:anti-A-Luc融合蛋白;泳道2:anti-T-Luc融合蛋白;泳道3:anti-C-Luc融合;泳道4:anti-G-Luc融合蛋白;泳道M:分子marker。上述结果显示,各融合蛋白符合预期大小。
实施例3融合蛋白抗体部分Elisa测试亲和实验
BSA-A/T/C/G蛋白的制备:用水稀释dNTP mix至终浓度为1mM。加0.4mg EDC(1-乙基-3-[3-二甲氨基丙基]碳化二亚胺盐酸盐)和0.6mg NHS(N-羟基琥珀酰亚胺)到0.5ml活化缓冲液(0.1M MES,0.5M NaCl,pH 6.0)中,再加入等体积的1mM Cold dNTP溶液,混合均匀,在室温下反应20min。用1ml PBS溶解BSA至终浓度为1mM,加入到上述体系中,在室温下反应2小时。(上述所涉及试剂均为市售商品,且不限品牌。)
将制备好的抗原100μL BSA-A/T/C/G蛋白(浓度1μg/mL)过夜包被于酶条上。加200μLPBST震荡洗涤10min 3次,PBS震荡洗涤3次。
加入1%BSA-PBS 200μL,37℃封闭2h。PBST 200μL,10min,洗涤3次,PBS200μL,10min,洗涤3次。
加入浓度梯度稀释的蛋白溶液100μL,37℃孵育2h。PBST 200μL,10min,洗涤3次,PBS200μL,10min,洗涤3次。
加入稀释的商品辣根过氧化物酶标记的羊抗兔抗体100μL,37℃孵育1h。PBST 200μL,10min,洗涤3次,PBS200μL,10min,洗涤3次。
使用四甲基联苯胺微孔过氧化物酶底物(TMB)作为底物进行显色10min;
加入50μL浓度为0.1mol/L的硫酸终止反应后,测量450nm的吸光度。
分析吸光度与浓度,做出效果分析图。结果如图5所示。其中,A:Anti-A-Luc融合蛋白实验结果分析;B:Anti-T-Luc融合蛋白实验结果分析;C:Anti-C-Luc融合蛋白实验结果分析;D:Anti-G-Luc融合蛋白实验结果分析。从图5可以看出,各融合蛋白对相应碱基的结合力与作为阳性对照的针对各碱基的抗体的结合力相当。即该结果显示各融合蛋白保留了抗体对碱基的亲和活性。
实施例4融合蛋白荧光素酶部分活性检测
将各融合蛋白用底物稀释液(50mM Tris,pH 8.0,100mM NaCl)稀释至3nM,取10μL加入96孔酶标板。再加入用相同溶液稀释至10μM的底物腔肠素90μL,用酶标仪自发光模块读取发光强度,具体结果见图6。
图6中,A:Anti-A-Luc融合蛋白实验结果分析;B:Anti-T-Luc融合蛋白实验结果分析;C:Anti-C-Luc融合蛋白实验结果分析;D:Anti-G-Luc融合蛋白实验结果分析。从图6所示结果可以看出,融合蛋白荧光素酶部分催化底物腔肠素自发光活性与各自对应的非融合的荧光素酶的发光强度相当,即结果显示融合蛋白保留了荧光素酶催化底物发光的活性。
实施例5融合蛋白双功能活性检测
通过ELISA检测结合力与生物发光实验。
(1)将抗原100μL抗原蛋白浓度1μg/mL过夜包被于酶条上。加200μL PBST震荡洗涤10min3次,PBS震荡洗涤3次。
(2)加入1%BSA-PBS 200μL,37℃封闭2h。PBST 200μL,10min,洗涤3次,PBS200μL,10min,洗涤3次。
(3)加入1μg/mL融合蛋白溶液100μL,37℃孵育2h。PBST 200μL,10min,洗涤3次,PBS200μL,10min,洗涤3次。
(4)加入用溶液稀释至10μM的底物腔肠素100μL,用酶标仪自发光模块读取发光强度。
(5)分析发光值,做出效果分析图,结果见图7(其中,阳性对照为高斯荧光素酶,阴性对照为PBS buffer)。
从图7可以看出,各融合蛋白双功能活性与阳性对照相当。该结果表明,各融合蛋白均能够结合各靶点碱基后催化底物发光,因而同时具有抗体及荧光素酶双功能活性。
实施例6融合蛋白在测序仪上检测信号
在自发光测序仪DNBSeqE5上使用融合蛋白进行发光信号验证,检测融合蛋白测序信号值,具体步骤为:
(1)提供连接于支持物上的待测序的核酸分子,或者将待测序的核酸分子连接于支持物上;
(2)添加用于起始核苷酸聚合反应的引物,使引物退火至待测序的核酸分子上,引物作为起始的生长的核酸链,与待测序的核酸分子一起形成连接于支持物上的双链体;
(3)添加用于进行核苷酸聚合反应的聚合酶,以及四种dNTP,从而形成含有溶液相和固相的反应体系;
(4)在允许聚合酶进行核苷酸聚合反应的条件下,使用聚合酶进行核苷酸聚合反应,从而将所述四种dNTP中的一种聚合在生长的核酸链的3'端;
(5)移除前一步骤的反应体系的溶液相,保留连接于支持物上的双链体,并加入5μg/ml抗体荧光素酶融合蛋白;
(6)用洗脱缓冲液充分去除未结合的融合蛋白;
(7)加入荧光素酶底物,通入底物的同时检测荧光信号;
(8)通入洗脱反应液,移除上一步反应的溶液;
(9)酶失活,通入使荧光素酶变性的反应试剂
(10)移除上一步反应的溶液;
(11)重复步骤(3)-(11)分析对照与融合蛋白信号值,做出效果分析图,结果见图8(其中对照为E5系列测序使用的用于检测A碱基的Gluc luciferase通道蛋白)。
从图8中可以看出,各融合蛋白在测序时能够检测掺入dNTP上的相应碱基产生的荧光信号,可以应用于新型测序技术。
以上所述仅为本发明的优选实施例而已,并不用于限制本发明,对于本领域的技术人员来说,本发明可以有各种更改和变化。凡在本发明的精神和原则之内,所作的任何修改、等同替换、改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。
序列表
<110> 深圳华大生命科学研究院
<120> 融合蛋白、其相关核酸分子以及其在高通量测序中的应用
<130> PN142912HDSM
<160> 22
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 635
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)..(447)
<223> anti-T-Luc融合蛋白中的重链序列
<220>
<221> PEPTIDE
<222> (448)..(462)
<223> 柔性肽
<220>
<221> DOMAIN
<222> (463)..(635)
<223> 荧光素酶
<400> 1
Gly Val Gln Cys Gln Glu Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val
1 5 10 15
Lys Pro Glu Gly Ser Leu Thr Leu Thr Cys Thr Ala Ser Gly Phe Ser
20 25 30
Phe Ser Ser Tyr Tyr Tyr Met Cys Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys
35 40 45
Gly Leu Glu Leu Ser Ala Cys Ile Asp Thr Gly Ser Gly Ser Thr Trp
50 55 60
Tyr Pro Ser Trp Val Asn Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Ser Thr Ser
65 70 75 80
Leu Asn Thr Val Asp Leu Lys Met Thr Ser Leu Thr Ala Ala Asp Thr
85 90 95
Ala Thr Tyr Phe Cys Ala Arg Glu Tyr Ser Thr Ala Trp Tyr Phe Asn
100 105 110
Leu Trp Gly Pro Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gln Pro Lys
115 120 125
Ala Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Cys Cys Gly Asp Thr Pro Ser
130 135 140
Ser Thr Val Thr Leu Gly Cys Leu Val Lys Gly Tyr Leu Pro Glu Pro
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Val Thr Val Thr Trp Asn Ser Gly Thr Leu Thr Asn Gly Val Arg Thr
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Phe Pro Ser Val Arg Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val
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Val Ser Val Thr Ser Ser Ser Gln Pro Val Thr Cys Asn Val Ala His
195 200 205
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210 215 220
Ser Lys Pro Met Cys Pro Pro Pro Glu Leu Pro Gly Gly Pro Ser Val
225 230 235 240
Phe Ile Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr
245 250 255
Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser Gln Asp Asp Pro Glu
260 265 270
Val Gln Phe Thr Trp Tyr Ile Asn Asn Glu Gln Val Arg Thr Ala Arg
275 280 285
Pro Pro Leu Arg Glu Gln Gln Phe Asn Ser Thr Ile Arg Val Val Ser
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Thr Leu Pro Ile Ala His Gln Asp Trp Leu Arg Gly Lys Glu Phe Lys
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Ser Lys Ala Arg Gly Gln Pro Leu Glu Pro Lys Val Tyr Thr Met Gly
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Pro Pro Arg Glu Glu Leu Ser Ser Arg Ser Val Ser Leu Thr Cys Met
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Ile Asn Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ser Val Glu Trp Glu Lys Asn
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Gly Lys Ala Glu Asp Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Thr Val Leu Asp Ser
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Asp Lys Gly Lys Pro Thr Glu Asn Asn Glu Asp Phe Asn Ile Val Ala
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Val Ala Ser Asn Phe Ala Thr Thr Asp Leu Asp Ala Asp Arg Gly Lys
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Leu Pro Gly Lys Lys Leu Pro Leu Glu Val Leu Lys Glu Leu Glu Ala
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His Ile Lys Cys Thr Pro Lys Met Lys Lys Phe Ile Pro Gly Arg Cys
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His Thr Tyr Glu Gly Asp Lys Glu Ser Ala Gln Gly Gly Ile Gly Glu
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Ala Ile Val Asp Ile Pro Glu Ile Pro Gly Phe Lys Asp Leu Glu Pro
565 570 575
Leu Glu Gln Phe Ile Ala Gln Val Asp Leu Cys Val Asp Cys Thr Thr
580 585 590
Gly Cys Leu Lys Gly Leu Ala Asn Val Gln Cys Ser Asp Leu Leu Lys
595 600 605
Lys Trp Leu Pro Gln Arg Cys Ala Thr Phe Ala Ser Lys Ile Gln Gly
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Gln Val Asp Lys Ile Lys Gly Ala Gly Gly Asp
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<210> 2
<211> 217
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)..(217)
<223> anti-A-Luc融合蛋白的轻链
<400> 2
Ala Thr Phe Ala Ile Lys Met Thr Gln Thr Pro Gly Ser Val Glu Val
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Ala Val Gly Gly Thr Val Thr Ile Asn Cys Gln Ala Ser Gln Ser Ile
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Ser Thr Ala Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Arg Pro Lys
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Leu Leu Ile Tyr Asp Ala Ser Arg Leu Ala Ser Gly Val Pro Ser Arg
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Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Gly
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Val Glu Cys Ala Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys His Gln Gly Phe Gly
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Ala Ser Asn Val Asp Asn Pro Phe Gly Gly Gly Thr Glu Val Val Val
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Glu Gly Asp Pro Val Ala Pro Thr Val Leu Ile Phe Pro Pro Ala Ala
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Tyr Phe Pro Asp Val Thr Val Thr Trp Glu Val Asp Gly Thr Thr Gln
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Thr Thr Gly Ile Glu Asn Ser Lys Thr Pro Gln Asn Ser Ala Asp Cys
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Thr Tyr Asn Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Thr Ser Thr Gln Tyr Asn
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Ser His Lys Glu Tyr Thr Cys Lys Val Thr Gln Gly Thr Thr Ser Val
195 200 205
Val Gln Ser Phe Asn Arg Gly Asp Cys
210 215
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<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)..(449)
<223> anti-T-Luc融合蛋白中的重链序列
<220>
<221> PEPTIDE
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<223> 柔性肽
<220>
<221> DOMAIN
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<223> anti-T-Luc融合蛋白中的荧光素酶序列
<400> 3
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1 5 10 15
Pro Gly Ala Ser Leu Thr Leu Thr Cys Lys Ala Ser Gly Phe Asp Leu
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Ser Ser Ser Tyr Phe Met Cys Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Arg Gly
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Leu Glu Trp Ile Ala Cys Ile Asp Thr Arg Asn Ile Asp Thr Ala Tyr
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Ala Ser Trp Ala Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Lys Thr Ser Ser Thr
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Tyr Phe Cys Gly Arg Gly Gly Asn Ile Asn Gly Leu Ala Thr Gly Phe
100 105 110
Asn Leu Trp Gly Pro Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gln Pro
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130 135 140
Ser Ser Thr Val Thr Leu Gly Cys Leu Val Lys Gly Tyr Leu Pro Glu
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Pro Val Thr Val Thr Trp Asn Ser Gly Thr Leu Thr Asn Gly Val Arg
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195 200 205
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Gly Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
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Val Ala Val Ala Ser Asn Phe Ala Thr Thr Asp Leu Asp Ala Asp Arg
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Gln Gly Gln Val Asp Lys Ile Lys Gly Ala Gly Gly Asp
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<210> 4
<211> 219
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)..(219)
<223> anti-T-Luc融合蛋白的轻链
<400> 4
Ala Thr Phe Ala Val Val Leu Thr Gln Thr Pro Ser Pro Val Ser Ala
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Ala Val Gly Gly Thr Val Thr Ile Ser Cys Gln Ala Ser Gln Ser Val
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<220>
<221> DOMAIN
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<220>
<221> PEPTIDE
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<223> 柔性肽
<220>
<221> DOMAIN
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<223> anti-C-Luc融合蛋白的荧光素酶
<400> 5
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Leu Pro Gly Lys Lys Leu Pro Leu Glu Val Leu Lys Glu Leu Glu Ala
500 505 510
Asn Ala Arg Lys Ala Gly Cys Thr Arg Gly Cys Leu Ile Cys Leu Ser
515 520 525
His Ile Lys Cys Thr Pro Lys Met Lys Lys Phe Ile Pro Gly Arg Cys
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565 570 575
Leu Glu Gln Phe Ile Ala Gln Val Asp Leu Cys Val Asp Cys Thr Thr
580 585 590
Gly Cys Leu Lys Gly Leu Ala Asn Val Gln Cys Ser Asp Leu Leu Lys
595 600 605
Lys Trp Leu Pro Gln Arg Cys Ala Thr Phe Ala Ser Lys Ile Gln Gly
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Gln Val Asp Lys Ile Lys Gly Ala Gly Gly Asp
625 630 635
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<212> PRT
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Tyr Tyr Thr Thr Leu Val Phe Gly Gly Gly Thr Glu Val Val Val Arg
100 105 110
Gly Asp Pro Val Ala Pro Thr Val Leu Ile Phe Pro Pro Ala Ala Asp
115 120 125
Gln Val Ala Thr Gly Thr Val Thr Ile Val Cys Val Ala Asn Lys Tyr
130 135 140
Phe Pro Asp Val Thr Val Thr Trp Glu Val Asp Gly Thr Thr Gln Thr
145 150 155 160
Thr Gly Ile Glu Asn Ser Lys Thr Pro Gln Asn Ser Ala Asp Cys Thr
165 170 175
Tyr Asn Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Thr Ser Thr Gln Tyr Asn Ser
180 185 190
His Lys Glu Tyr Thr Cys Lys Val Thr Gln Gly Thr Thr Ser Val Val
195 200 205
Gln Ser Phe Asn Arg Gly Asp Cys
210 215
<210> 7
<211> 630
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)..(442)
<223> anti-G-Luc融合蛋白的重链
<220>
<221> PEPTIDE
<222> (443)..(457)
<223> 柔性肽
<220>
<221> DOMAIN
<222> (458)..(630)
<223> anti-G-Luc融合蛋白的荧光素酶
<400> 7
Gly Val Gln Cys Gln Glu Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val
1 5 10 15
Gln Pro Glu Gly Ser Leu Thr Leu Thr Cys Lys Ala Ser Gly Leu Asp
20 25 30
Phe Leu Ser Asn Tyr Trp Ile Cys Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys
35 40 45
Gly Leu Glu Trp Ile Ala Cys Ile Tyr Ile Asp Asp Gly Thr Thr Tyr
50 55 60
Tyr Ala Asn Trp Ala Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Thr Ser Ser
65 70 75 80
Thr Thr Val Thr Leu Gln Met Ala Ser Leu Thr Ala Ala Asp Thr Ala
85 90 95
Thr Tyr Phe Cys Ala Arg Gly Asn Pro Phe Thr Leu Trp Gly Pro Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gln Pro Lys Ala Pro Ser Val Phe
115 120 125
Pro Leu Ala Pro Cys Cys Gly Asp Thr Pro Ser Ser Thr Val Thr Leu
130 135 140
Gly Cys Leu Val Lys Gly Tyr Leu Pro Glu Pro Val Thr Val Thr Trp
145 150 155 160
Asn Ser Gly Thr Leu Thr Asn Gly Val Arg Thr Phe Pro Ser Val Arg
165 170 175
Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Ser Val Thr Ser
180 185 190
Ser Ser Gln Pro Val Thr Cys Asn Val Ala His Pro Ala Thr Asn Thr
195 200 205
Lys Val Asp Lys Thr Val Ala Pro Ser Thr Cys Ser Lys Pro Met Cys
210 215 220
Pro Pro Pro Glu Leu Pro Gly Gly Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro
225 230 235 240
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
245 250 255
Val Val Val Asp Val Ser Gln Asp Asp Pro Glu Val Gln Phe Thr Trp
260 265 270
Tyr Ile Asn Asn Glu Gln Val Arg Thr Ala Arg Pro Pro Leu Arg Glu
275 280 285
Gln Gln Phe Asn Ser Thr Ile Arg Val Val Ser Thr Leu Pro Ile Ala
290 295 300
His Gln Asp Trp Leu Arg Gly Lys Glu Phe Lys Cys Lys Val His Asn
305 310 315 320
Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Arg Gly
325 330 335
Gln Pro Leu Glu Pro Lys Val Tyr Thr Met Gly Pro Pro Arg Glu Glu
340 345 350
Leu Ser Ser Arg Ser Val Ser Leu Thr Cys Met Ile Asn Gly Phe Tyr
355 360 365
Pro Ser Asp Ile Ser Val Glu Trp Glu Lys Asn Gly Lys Ala Glu Asp
370 375 380
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Thr Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Tyr Phe
385 390 395 400
Leu Tyr Ser Lys Leu Ser Val Pro Thr Ser Glu Trp Gln Arg Gly Asp
405 410 415
Val Phe Thr Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
420 425 430
Gln Lys Ser Ile Ser Arg Ser Pro Gly Lys Gly Gly Gly Gly Ser Gly
435 440 445
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Asp Asp Asp Lys Gly Lys Pro
450 455 460
Thr Glu Asn Asn Glu Asp Phe Asn Ile Val Ala Val Ala Ser Asn Phe
465 470 475 480
Ala Thr Thr Asp Leu Asp Ala Asp Arg Gly Lys Leu Pro Gly Lys Lys
485 490 495
Leu Pro Leu Glu Val Leu Lys Glu Leu Glu Ala Asn Ala Arg Lys Ala
500 505 510
Gly Cys Thr Arg Gly Cys Leu Ile Cys Leu Ser His Ile Lys Cys Thr
515 520 525
Pro Lys Met Lys Lys Phe Ile Pro Gly Arg Cys His Thr Tyr Glu Gly
530 535 540
Asp Lys Glu Ser Ala Gln Gly Gly Ile Gly Glu Ala Ile Val Asp Ile
545 550 555 560
Pro Glu Ile Pro Gly Phe Lys Asp Leu Glu Pro Leu Glu Gln Phe Ile
565 570 575
Ala Gln Val Asp Leu Cys Val Asp Cys Thr Thr Gly Cys Leu Lys Gly
580 585 590
Leu Ala Asn Val Gln Cys Ser Asp Leu Leu Lys Lys Trp Leu Pro Gln
595 600 605
Arg Cys Ala Thr Phe Ala Ser Lys Ile Gln Gly Gln Val Asp Lys Ile
610 615 620
Lys Gly Ala Gly Gly Asp
625 630
<210> 8
<211> 218
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)..(218)
<223> anti-G-Luc融合蛋白的轻链
<400> 8
Ala Thr Phe Ala Gln Val Leu Thr Gln Thr Pro Ser Ser Val Ser Ala
1 5 10 15
Ala Val Gly Gly Thr Val Thr Ile Asn Cys Gln Ser Ser Pro Ser Val
20 25 30
Tyr Arg Asn Tyr Leu Ser Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Arg Pro
35 40 45
Lys Leu Leu Ile Tyr His Ala Ser Thr Leu Ala Ser Gly Val Pro Ser
50 55 60
Arg Phe Ser Ala Ser Gly Ser Gly Thr Gln Phe Ser Leu Thr Ile Ser
65 70 75 80
Asp Ala His Cys Asp Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys Ala Gly Gly Tyr
85 90 95
Ile Gly Ser Ser Asp Ala Trp Ala Phe Gly Gly Gly Thr Glu Val Val
100 105 110
Val Arg Gly Asp Pro Val Ala Pro Thr Val Leu Ile Phe Pro Pro Ala
115 120 125
Ala Asp Gln Val Ala Thr Gly Thr Val Thr Ile Val Cys Val Ala Asn
130 135 140
Lys Tyr Phe Pro Asp Val Thr Val Thr Trp Glu Val Asp Gly Thr Thr
145 150 155 160
Gln Thr Thr Gly Ile Glu Asn Ser Lys Thr Pro Gln Asn Ser Ala Asp
165 170 175
Cys Thr Tyr Asn Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Thr Ser Thr Gln Tyr
180 185 190
Asn Ser His Lys Glu Tyr Thr Cys Lys Val Thr Gln Gly Thr Thr Ser
195 200 205
Val Val Gln Ser Phe Asn Arg Gly Asp Cys
210 215
<210> 9
<211> 1905
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(1341)
<223> dATP抗体重链基因序列
<220>
<221> misc_feature
<222> (1342)..(1386)
<223> linker基因序列
<220>
<221> misc_feature
<222> (1387)..(1905)
<223> 荧光素酶基因序列
<400> 9
ggcgtgcaat gccaggaaca gctggtggag agcggaggag gactggtgaa acctgaaggc 60
agcctgaccc tgacatgcac cgctagcgga tttagcttta gcagctatta ctacatgtgc 120
tgggtgaggc aggcccctgg caaaggactg gaacttagcg cttgtattga caccggcagc 180
ggcagcacat ggtatcctag ctgggtgaac ggcaggttca ccatcagcag gagcaccagc 240
ctgaacaccg tggacttaaa aatgaccagc ctgaccgccg ctgataccgc cacatatttt 300
tgtgctaggg aatacagcac cgcctggtac ttcaacctgt ggggccctgg aacactcgtg 360
accgttagca gcggacagcc taaggctcct agcgtgtttc ctctggcccc ttgttgtggc 420
gacaccccta gcagcacagt gaccctggga tgtctggtga aaggctatct gcctgagcct 480
gtgaccgtga catggaacag cggaaccctg accaacggcg tgagaacatt ccctagcgtg 540
agacagagca gcggcctgta ctctctgagc agcgtggtta gcgtgacaag cagctctcaa 600
cctgtgacct gtaacgtggc ccaccctgcc acaaatacca aggtggataa aaccgtggcc 660
cctagcacct gcagcaagcc tatgtgtcct cctcctgagc tgcctggcgg ccctagcgtt 720
tttattttcc ctcctaaacc taaggacacc ctgatgatca gcaggacccc tgaagtgacc 780
tgcgtggtgg tggatgtgtc tcaagacgat cctgaagtgc agtttacctg gtacatcaac 840
aacgagcagg tgaggaccgc caggcctcct ctgagagaac aacagtttaa tagcaccatc 900
agggtggtga gcaccctgcc tattgcccat caggactggc tgaggggaaa ggagtttaaa 960
tgcaaggtgc acaacaaggc cctgcctgcc cctattgaga agaccattag caaggccagg 1020
ggccagcctc tggaacctaa agtgtatacc atgggccctc ctagggagga gctgagcagc 1080
agatctgtga gcctgacatg tatgatcaac ggcttctacc ctagcgacat cagcgtggag 1140
tgggagaaga acggcaaggc cgaagataac tacaagacca cccctaccgt gctggacagc 1200
gacggaagct attttctgta cagcaagctg agcgtgccta ccagcgagtg gcaaagggga 1260
gatgtgttta cctgcagcgt gatgcatgag gccctgcaca atcactacac ccagaagagc 1320
atcagcagga gccctggcaa aggcggcgga ggatctggcg gtggaggaag cggaggagga 1380
ggaagcgatg atgacaaagg aaaacctaca gagaacaacg aggacttcaa catcgtggcc 1440
gtggccagca atttcgccac aacagatctg gacgccgaca gaggcaaact gcctgggaaa 1500
aagctgcctc tggaagtgct gaaggagctg gaggccaatg ccaggaaagc tggatgtacc 1560
aggggctgcc tgatctgtct gagccacata aagtgcaccc ctaagatgaa gaagttcatc 1620
cctggcaggt gccacaccta cgagggcgat aaagaaagcg cccaaggagg cattggcgag 1680
gctattgtgg atatccctga gatccctggc tttaaggacc tggagcctct ggagcagttc 1740
atcgcccaag tggacctgtg tgtggactgc accacaggct gtctgaaagg actggccaac 1800
gtgcaatgca gcgatctgct gaagaaatgg ctgcctcaga ggtgcgccac attcgcctct 1860
aaaatccagg gccaagtgga caaaattaag ggcgccggcg gagac 1905
<210> 10
<211> 651
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(651)
<223> dATP抗体轻链基因序列
<400> 10
cctaccttcg ccatcaagat gacccaaacc cctggaagcg tggaagtggc tgttggaggc 60
accgtgacca ttaattgcca ggccagccag tctattagca cagccctggc ttggtatcaa 120
cagaagcctg gccaaaggcc taagctgctg atctacgacg ctagcaggct ggcttctgga 180
gtgcctagca gatttagcgg cagcggaagc ggaacagagt tcaccctgac aatcagcgga 240
gtggagtgtg ctgatgctgc cacctactac tgtcaccaag gcttcggcgc tagcaatgtg 300
gacaaccctt tcggcggagg aacagaggtt gtggtggaag gcgatcctgt ggctcctaca 360
gtgctgattt tccctcctgc tgccgaccaa gttgccacag gcaccgtgac aattgtgtgc 420
gtggccaaca agtacttccc tgacgtgacc gtgacctggg aagtggatgg caccacacag 480
acaacaggca tcgagaacag caagacccct cagaacagcg ctgactgcac ctacaacctg 540
agcagcaccc tgacacttac cagcacccag tacaacagcc acaaggagta cacctgcaag 600
gtgacccagg gcacaacatc tgtggtgcag agcttcaaca gaggcgactg c 651
<210> 11
<211> 1911
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(1347)
<223> dTTP抗体重链基因序列
<220>
<221> misc_feature
<222> (1348)..(1392)
<223> linker基因序列
<220>
<221> misc_feature
<222> (1393)..(1911)
<223> 荧光素酶基因序列
<400> 11
ggagtgcaat gccaaagcct ggaagaaagc ggaggcgatc tggtgaaacc tggagctagc 60
ctgaccctga catgtaaagc cagcggattc gaccttagca gcagctactt catgtgctgg 120
gtgagacagg ctcctggcag aggactggaa tggattgcct gcatcgacac caggaacatc 180
gacaccgctt atgcctcttg ggccaaaggc agattcacca tcagcaagac cagcagcacc 240
accgtgactc tgcagatgac aagcctgacc gctgctgata ccgccagata tttttgtggc 300
aggggcggca acattaatgg actggccacc ggctttaatc tttggggccc tggaacactg 360
gtgacagtgt ctagcggcca gcctaaagct cctagcgtgt tccctctggc tccttgttgc 420
ggagataccc ctagcagcac agtgacactg ggatgcctgg tgaagggata cctgcctgag 480
cctgtgaccg tgacatggaa tagcggcacc ctgacaaatg gagtgaggac cttccctagc 540
gtgagacaaa gcagcggcct gtattctctg agcagcgtgg tgtctgtgac aagcagcagc 600
cagcctgtga catgtaacgt tgcccaccct gccacaaata ccaaggtgga caagacagtg 660
gcccctagca cctgtagcaa gcctatgtgc cctcctcctg aacttcctgg aggacctagc 720
gtgttcatct tccctcctaa gcctaaggac accctgatga tcagcaggac ccctgaggtg 780
acctgtgtgg tggtggatgt gagccaggat gaccctgagg tgcagttcac ctggtacatc 840
aacaacgagc aggtgaggac cgctagacct cctcttaggg agcagcagtt caacagcacc 900
atcagggtgg tgagcaccct tcctatcgct caccaagatt ggctgagggg caaggagttc 960
aagtgcaagg tgcacaacaa ggctctgcct gcccctattg agaagaccat cagcaaggct 1020
aggggccaac ctcttgagcc taaggtgtac accatgggcc ctcctagaga ggaactgagc 1080
agcagaagcg ttagcctgac ctgcatgatc aacggcttct accctagcga catcagcgtg 1140
gagtgggaga agaatggcaa ggccgaggac aactacaaga ccacccctac cgtgcttgat 1200
agcgacggaa gctacttcct gtacagcaag ctgagcgtgc ctacaagcga atggcagagg 1260
ggcgatgtgt tcacatgcag cgtgatgcat gaggccctgc acaaccacta cacccagaag 1320
agcatcagca ggagccctgg caaaggcggc ggcggaggaa gcggaggagg aggaagcggc 1380
ggaggaggaa gcgatgatga taaaggcaaa cctaccgaga acaacgagga cttcaacatc 1440
gtggccgtgg ccagcaactt cgccaccaca gatctggatg ctgacagggg aaagctgcct 1500
ggcaagaaac tgcctctgga ggtgctgaag gagctggagg ccaatgccag gaaggccggc 1560
tgtacaagag gctgtctgat ctgcctgagc catatcaagt gcacccctaa gatgaagaag 1620
ttcatccctg gcaggtgcca cacctacgag ggcgataaag agagcgccca gggcggaatt 1680
ggagaggcca ttgtggatat ccctgagatc cctggcttca aggacctgga gcctctggag 1740
cagttcatcg cccaggtgga cctgtgcgtg gactgcacaa caggctgtct gaaaggcctg 1800
gctaatgtgc agtgcagcga cctgctgaag aagtggctgc ctcagaggtg cgccaccttc 1860
gccagcaaaa ttcagggcca ggtggacaag atcaagggcg ccggaggaga t 1911
<210> 12
<211> 657
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(657)
<223> dTTP抗体轻链基因序列
<400> 12
gctacatttg ccgtggtgct gacacaaacc cctagccctg tgtctgctgc tgttggcgga 60
acagtgacca ttagctgcca ggctagccaa agcgtgtaca acaacgactg gctggcctgg 120
taccaacaaa agcctggcca gcctcctaag ctgctgatct actgggctag cacactggct 180
tctggagtgc ctagcagatt caagggaagc ggaagcggca cacaatttac cctgaccatc 240
agcgacctgg aatgtgatga cgccgctacc tattattgtc agggcggcta cttcagaagg 300
gtggacagct tccctttcgg aggaggcaca gaggttgtgg tgaaaggcga tcctgtggct 360
cctaccgtgc tgatctttcc tcctgccgcc gatcaagttg ctacaggcac agtgaccatt 420
gtgtgcgtgg ccaacaagta cttccctgac gtgaccgtga catgggaggt ggatggcaca 480
acacagacca caggcatcga gaacagcaag acccctcaga atagcgccga ctgcacctat 540
aacctgagca gcaccctgac acttaccagc acccagtaca acagccacaa ggagtacacc 600
tgcaaggtga cccaaggcac aacaagcgtg gtgcagagct tcaatagggg cgactgc 657
<210> 13
<211> 1905
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(1338)
<223> dCTP抗体重链基因序列
<220>
<221> misc_feature
<222> (1339)..(1383)
<223> linker基因序列
<220>
<221> misc_feature
<222> (1384)..(1905)
<223> 荧光素酶基因序列
<400> 13
gacatccagt gccaggagca gctggtggag agcggcggcg gactggtgca gcctgaggga 60
tccctgacac tgacatgtac cgcctccggc ttcagcttca gcagcagcca ctggatctgt 120
tgggtgagac aggcccctgg caagggcctg gagtggatcg gctgtatcta catcggcaac 180
ggcaggacct actacgccag ctgggccaag ggcagattca ccatcagcaa gacctccagc 240
accaccatga ccctgcagat ctccagcctg acagacgccg acaccgccac ctacttctcc 300
gtgagagacc ctaccgccgg ctggggcgga ggactgtggg gacctggaac cctggtgacc 360
gtgagctccg gccagcctaa ggccccctcc gtgttccccc tggccccttg ttgtggcgac 420
acaccctcct ccaccgtgac actgggctgt ctggtgaagg gctacctgcc tgagcctgtg 480
acagtgacct ggaactccgg cacactgaca aacggcgtga gaaccttccc ttccgtgaga 540
cagtcctccg gcctgtactc cctgagctcc gtggtgagcg tgacctcctc ctcccagcct 600
gtgacctgca acgtggccca ccctgccacc aacacaaagg tggacaagac agtggcccct 660
tccacatgta gcaagcctat gtgtcccccc cccgagctgc ccggaggacc tagcgttttc 720
atcttccccc ccaagcccaa ggatacactg atgatctcca ggacccccga ggtgacatgt 780
gtggtggtgg atgtgagcca ggatgaccct gaggtgcagt tcacctggta catcaacaac 840
gagcaggtga ggaccgccag gcctcctctg agagagcagc agttcaacag caccatcaga 900
gtggtgtcca ccctgcccat cgcccaccag gactggctga gaggcaagga gttcaagtgt 960
aaggtgcaca acaaggccct gcccgcccct atcgagaaga caatctccaa ggccagaggc 1020
cagcccctgg agcccaaggt gtacaccatg ggccccccta gggaggagct gagctccaga 1080
agcgtgagcc tgacatgtat gatcaacggc ttctacccct ccgacatctc cgtggagtgg 1140
gagaagaacg gcaaggccga ggataactac aagacaacac ccacagtgct ggatagcgat 1200
ggcagctact tcctgtactc caagctgagc gtgcccacct ccgagtggca gaggggcgat 1260
gtgttcacct gctccgtgat gcacgaggcc ctgcacaacc actacacaca gaagtccatc 1320
tccaggtccc ctggcaaggg cggcggagga tctggcggtg gaggaagcgg aggaggagga 1380
agcgatgatg acaaaggaaa acctacagag aacaacgagg acttcaacat cgtggccgtg 1440
gccagcaatt tcgccacaac agatctggac gccgacagag gcaaactgcc tgggaaaaag 1500
ctgcctctgg aagtgctgaa ggagctggag gccaatgcca ggaaagctgg atgtaccagg 1560
ggctgcctga tctgtctgag ccacataaag tgcaccccta agatgaagaa gttcatccct 1620
ggcaggtgcc acacctacga gggcgataaa gaaagcgccc aaggaggcat tggcgaggct 1680
attgtggata tccctgagat ccctggcttt aaggacctgg agcctctgga gcagttcatc 1740
gcccaagtgg acctgtgtgt ggactgcacc acaggctgtc tgaaaggact ggccaacgtg 1800
caatgcagcg atctgctgaa gaaatggctg cctcagaggt gcgccacatt cgcctctaaa 1860
atccagggcc aagtggacaa aattaagggc gccggcggag actga 1905
<210> 14
<211> 648
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(648)
<223> dCTP抗体轻链基因序列
<400> 14
gctatctgtg accccgtgat gacccagacc ccttccagca catccgccgc cgtgggcgga 60
acagtgacca tctcctgcca gtcctcccag agcgtgtaca acaacaacta cctggcctgg 120
taccagcaga agcctggcca gcctcccaag agactgatct acgaggccag ctccctggcc 180
agcggcgtgc cttctaggtt caagggctcc ggctccggcg cccagttcgc tctgaccatc 240
tccggcgtgc agtgcgatga tgccgccacc tactactgtc tgggcgccta ctacaccacc 300
ctggtgttcg gcggcggcac agaggtggtg gtgagaggcg atcctgtggc ccccaccgtg 360
ctgatcttcc cccctgccgc cgatcaggtg gccacaggaa cagtgacaat cgtgtgtgtg 420
gccaacaagt acttccccga cgtgacagtg acatgggagg tggacggcac cacacagacc 480
accggcatcg agaacagcaa gacacctcag aacagcgccg attgcaccta caacctgtcc 540
agcacactga ccctgaccag cacccagtac aacagccaca aggagtacac atgtaaggtg 600
acccagggca caacctccgt ggtgcagagc ttcaacagag gcgactgc 648
<210> 15
<211> 1890
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(1326)
<223> dGTP抗体重链基因序列
<220>
<221> misc_feature
<222> (1327)..(1371)
<223> linker基因序列
<220>
<221> misc_feature
<222> (1372)..(1890)
<223> 荧光素酶基因序列
<400> 15
ggcgtgcaat gccaagaaca actggtggag agcggcggcg gattagtgca acctgaagga 60
agcctgaccc tgacctgcaa agccagcggc ctggattttc tgagcaatta ctggatctgc 120
tgggtgaggc aggcccctgg caaaggcctg gaatggattg cctgtattta catcgacgac 180
ggcaccacct actacgccaa ctgggccaaa ggcaggttca ccatcagcag gaccagcagc 240
accaccgtga ccctgcaaat ggccagcctg acagcagccg acacagccac ctatttctgc 300
gccagaggaa accctttcac cctgtggggc cctggcacac tggtgacagt gtctagcgga 360
cagcctaaag cccctagcgt gttccctctg gccccttgtt gtggcgatac acctagcagc 420
accgtgaccc tgggatgcct ggtgaaagga tacctgcctg aacctgtgac cgtgacctgg 480
aacagcggca ccctgacaaa cggcgtgagg acctttccta gcgtgaggca gagcagcggc 540
ctgtatagcc tgagcagcgt ggtgagcgtg accagcagca gccaacctgt gacctgcaac 600
gtggcccacc ctgccacaaa taccaaagtg gacaagaccg tggcccctag cacctgcagc 660
aaacctatgt gccctcctcc tgagctgcct ggcggaccta gcgtgtttat tttccctcct 720
aagcctaagg acaccctgat gatcagcagg acccctgagg tgacatgcgt ggtggtggat 780
gtgagccaag atgaccctga agtgcaattc acctggtaca tcaacaacga gcaggtgagg 840
accgccaggc ctcctcttag agaacagcaa ttcaacagca ccatcagggt ggtgagcacc 900
ctgcctatcg cccaccaaga ctggctgagg ggcaaagagt ttaagtgcaa ggtgcacaac 960
aaggccctgc ctgcccctat cgagaagacc atcagcaagg ccaggggcca gcctctggaa 1020
cctaaagtgt ataccatggg ccctcctagg gaggagctga gcagcagaag cgtgagcctg 1080
acctgtatga tcaacggctt ctaccctagc gacatcagcg tggagtggga gaagaacggc 1140
aaggccgagg acaactacaa gaccacccct accgtgctgg acagcgacgg cagctatttt 1200
ctgtacagca agctgagcgt gcctaccagc gagtggcaga ggggagatgt gttcacctgc 1260
agcgtgatgc acgaggccct gcacaaccac tacacccaga agagcatcag caggagccct 1320
ggcaagggcg gcggaggaag cggaggagga ggaagcggcg gaggaggaag cgatgatgat 1380
aaaggcaaac ctaccgagaa caacgaggac ttcaacatcg tggccgtggc cagcaacttc 1440
gccaccacag atctggatgc tgacagggga aagctgcctg gcaagaaact gcctctggag 1500
gtgctgaagg agctggaggc caatgccagg aaggccggct gtacaagagg ctgtctgatc 1560
tgcctgagcc atatcaagtg cacccctaag atgaagaagt tcatccctgg caggtgccac 1620
acctacgagg gcgataaaga gagcgcccag ggcggaattg gagaggccat tgtggatatc 1680
cctgagatcc ctggcttcaa ggacctggag cctctggagc agttcatcgc ccaggtggac 1740
ctgtgcgtgg actgcacaac aggctgtctg aaaggcctgg ctaatgtgca gtgcagcgac 1800
ctgctgaaga agtggctgcc tcagaggtgc gccaccttcg ccagcaaaat tcagggccag 1860
gtggacaaga tcaagggcgc cggaggagat 1890
<210> 16
<211> 654
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(654)
<223> dGTP抗体轻链基因序列
<400> 16
gctacatttg ctcaggtgct gacccaaaca cctagcagcg tgtctgctgc tgtgggagga 60
accgtgacca ttaactgcca gagcagccct agcgtgtaca ggaactacct gagctggtac 120
cagcaaaagc ctggccaaag acctaagctg ctgatctacc acgctagcac ccttgcttct 180
ggagtgccta gcagatttag cgctagcggc agcggaacac aattcagcct gaccattagc 240
gacgcccatt gtgatgacgc cgccacctat tattgtgccg gaggctatat tggaagcagc 300
gacgcttggg cttttggcgg aggaacagaa gtggtggtga gaggcgatcc tgtggctcct 360
acagtgctga tcttccctcc tgccgctgat caagttgcta ccggcacagt gacaatcgtg 420
tgcgtggcca acaagtactt ccctgacgtg accgtgacat gggaagtgga cggaaccacc 480
cagacaacag gcatcgagaa cagcaagacc cctcagaata gcgccgactg cacctataac 540
ctgagcagca ccctgacact gacaagcacc cagtacaaca gccacaagga gtacacctgc 600
aaggtgaccc aaggcacaac aagcgtggtg cagagcttca ataggggcga ctgc 654
<210> 17
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<222> (1)..(10)
<223> (GGGGS)2柔性肽
<400> 17
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
1 5 10
<210> 18
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<222> (1)..(15)
<223> (GGGGS)3柔性肽
<400> 18
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
1 5 10 15
<210> 19
<211> 20
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<222> (1)..(20)
<223> (GGGGS)4柔性肽
<400> 19
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
1 5 10 15
Gly Gly Gly Ser
20
<210> 20
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<222> (1)..(12)
<223> A(EAAAK)2A连接序列
<400> 20
Ala Glu Ala Ala Ala Lys Glu Ala Ala Ala Lys Ala
1 5 10
<210> 21
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<222> (1)..(17)
<223> A(EAAAK)3A连接序列
<400> 21
Ala Glu Ala Ala Ala Lys Glu Ala Ala Ala Lys Glu Ala Ala Ala Lys
1 5 10 15
Ala
<210> 22
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<221> PEPTIDE
<222> (1)..(22)
<223> A(EAAAK)4A连接序列
<400> 22
Ala Glu Ala Ala Ala Lys Glu Ala Ala Ala Lys Glu Ala Ala Ala Lys
1 5 10 15
Glu Ala Ala Ala Lys Ala
20

Claims (10)

1.一种融合蛋白,其特征在于,所述融合蛋白包括脱氧核糖核苷酸抗体以及与所述脱氧核糖核苷酸抗体融合表达的荧光素酶,所述融合蛋白能够与所述脱氧核糖核苷酸抗体对应的脱氧核糖核苷酸结合,且在催化荧光素酶底物后发光。
2.根据权利要求1所述的融合蛋白,其特征在于,所述脱氧核糖核苷酸抗体选自dATP、dTTP、dCTP及dGTP中任意一种脱氧核糖核苷酸的抗体;
优选地,所述荧光素酶选自细菌荧光素酶、萤火虫荧光素酶、海萤荧光素酶、海肾荧光素酶、高斯荧光素酶、Nanoluc萤光素酶和刺虾荧光素酶中的任意一种;
优选地,所述脱氧核糖核苷酸抗体采用IgG、Fab、scFV、及VHH中的任意一种抗体的结构。
3.根据权利要求1或2所述的融合蛋白,其特征在于,所述脱氧核糖核苷酸抗体包括轻链和重链,并且所述重链与所述荧光素酶融合表达;
优选地,所述重链与所述荧光素酶之间通过柔性肽连接;
优选地,所述柔性肽为(GGGGS)n或A(EAAAK)nA,n选自1、2、3或4;
优选地,所述重链与所述荧光素酶之间通过柔性肽连接形成H-Luc重组重链,其中,所述H-Luc重组重链选自SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:5或SEQID NO:7;
优选地,所述融合蛋白为anti-A-Luc融合蛋白、anti-T-Luc融合蛋白、anti-C-Luc融合蛋白或anti-G-Luc融合蛋白,其中,
所述anti-A-Luc融合蛋白的所述H-Luc重组重链的氨基酸序列为SEQ ID NO:1,所述轻链的氨基酸序列为SEQ ID NO:2;
所述anti-T-Luc融合蛋白的所述H-Luc重组重链的氨基酸序列为SEQ ID NO:3,所述轻链的氨基酸序列为SEQ ID NO:4;
所述anti-C-Luc融合蛋白的所述H-Luc重组重链的氨基酸序列为SEQ ID NO:5,所述轻链的氨基酸序列为SEQ ID NO:6;
所述anti-G-Luc融合蛋白的所述H-Luc重组重链的氨基酸序列为SEQ ID NO:7,所述轻链的氨基酸序列为SEQ ID NO:8。
4.编码权利要求1-3中任一项所述的融合蛋白的融合片段的核酸分子,其特征在于,所述融合片段为所述脱氧核糖核苷酸抗体与所述荧光素酶融合表达的片段。
5.根据权利要求4所述的核酸分子,其特征在于,所述融合片段为所述脱氧核糖核苷酸抗体的重链与所述荧光素酶融合而成的所述H-Luc重组重链,其中,编码所述H-Luc重组重链的核酸分子的核酸序列选自SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:13或SEQID NO:15;
优选地,编码所述融合蛋白的核酸分子还包括编码脱氧核糖核苷酸抗体的轻链的核酸分子,其中,当编码所述H-Luc重组重链的核酸分子的核酸序列为SEQ ID NO:9时,编码所述轻链的核酸分子的核酸序列为SEQ ID NO:10;
当编码所述H-Luc重组重链的核酸分子的核酸序列为SEQ ID NO:11时,编码所述轻链的核酸分子的核酸序列为SEQ ID NO:12;
当编码所述H-Luc重组重链的核酸分子的核酸序列为SEQ ID NO:13时,编码所述轻链的核酸分子的核酸序列为SEQ ID NO:14;
当编码所述H-Luc重组重链的核酸分子的核酸序列为SEQ ID NO:15时,编码所述轻链的核酸分子的核酸序列为SEQ ID NO:16。
6.一种重组载体,其特征在于,所述重组载体上连接有权利要求4或5所述的核酸分子。
7.一种宿主细胞,其特征在于,所述宿主细胞中转染有权利要求6所述的重组载体。
8.一种高通量测序方法,其特征在于,所述高通量测序方法包括:
将带有可逆阻断基团的脱氧核糖核苷酸加入到待测序的核酸分子上,再加入权利要求1-3中任一项所述的融合蛋白,通过检测所述融合蛋白自发光所产生的信号来确定掺入的脱氧核糖核苷酸的类型,从而确定所述待测序的核酸分子的序列。
9.根据权利要求8所述的高通量测序方法,其特征在于,
通过检测在每一轮反应中掺入带有所述可逆阻断基团的脱氧核糖核苷酸时,所述融合蛋白自发光所产生的信号,来获得所述待测序的核酸分子的碱基序列;
其中,每一轮反应的反应体系包括所述带有可逆阻断基团的脱氧核糖核苷酸、所述待测序的核酸分子、DNA聚合酶、所述融合蛋白以及所述融合蛋白的荧光素酶活性相对应的底物荧光素,且每一轮反应掺入的所述带有可逆阻断基团的脱氧核糖核苷酸为可逆阻断dATP、可逆阻断dTTP、可逆阻断dCTP及可逆阻断dGTP中的一种;
优选地,所述荧光素选自萤火虫荧光素、海萤荧光素、腔肠素、氟代腔肠素和腔肠素类似物中的任意一种;
优选地,通过自发光测序平台检测所述融合蛋白自发光所产生的信号,更优选所述自发光测序平台包括DNBSeq-E5测序仪。
10.权利要求1至3中任一项所述的融合蛋白在高通量测序中的应用。
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