CN115348872A - 用于蛋白质募集和/或降解的双功能剂 - Google Patents
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Abstract
本公开涉及新的化合物,包括双功能化合物,其用作靶向蛋白质降解的泛素化调节剂。
Description
技术领域
本发明提供用于通过泛素蛋白酶体途径降解靶蛋白的新化合物,包括双功能化合物,其用于如本文进一步描述的治疗应用。
相关申请的交叉引用
本申请要求2019年12月17日提交的62/949,028号美国临时申请的权益,该临时申请的全部内容并入本文。
背景技术
蛋白质降解是维持细胞内稳态的高度调控和必要的过程。受损、错误折叠或过量的蛋白质的选择性识别和移除是经由泛素-蛋白酶体途径(UPP)实现的。UPP对于几乎所有的细胞过程的调控都是必要的。
通过E3泛素连接酶将多个泛素分子与末端赖氨酸残基共价附接标记了用于蛋白酶体降解的蛋白质,其中蛋白质被消化成小肽,并最终消化成其组成氨基酸,其作为新蛋白质的构建模块。
已经发现沙利度胺及其类似物与泛素连接酶塞勒布隆(cereblon)结合,并使其泛素化活性改变(Ito,T.等人,Science,2010,327:1345)。塞勒布隆形成E3泛素连接酶复合物的一部分,该部分与受损的DNA结合蛋白相互作用,从而与Cullin 4和E2-结合蛋白ROC1(称为RBX1)形成E3泛素连接酶复合物,其中其充当底物受体以选择用于泛素化的蛋白质。来那度胺与塞勒布隆的结合促进塞勒布隆与Ikaros和Aiolos的后续结合,导致它们的泛素化和被蛋白酶体降解(Lu,G.等人,Science,2014,343:305-309;Kronke,J.等人,Science,2014,343:301-305)。
本发明的目的是提供与塞勒布隆结合的新化合物及其用于例如通过调节蛋白质降解来治疗各种疾病和病症的用途。
发明内容
本发明涉及新化合物和它们的用途及其制备。所述化合物具有通式(A)k-L1或(A)k-L-Q。所述化合物的部分A与塞勒布隆结合。L或L1是接头。部分Q是与靶蛋白结合的部分,所述靶蛋白与所述E3泛素连接酶螯合和/或在与所述E3泛素连接酶相互作用后降解。
一方面,本发明涉及具有通式(A)k-L1的化合物或其盐、对映异构体、立体异构体、多晶型物或N-氧化物,其中:
A是与E3泛素连接酶结合的部分,并且具有选自由式I、式II、式III、式IV、式V、式VI、式VII、式VIII、式IX和式X组成的组的结构;
L1是接头;
每个A在化合价允许的情况下与所述L1共价连接;
R1是芳基、-N(R5)-X-R6、-SO2R5或-O(CH2)mR5,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R2是芳基、-NH-(C3-C10)杂芳基或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R3是氰基、芳基、-NH-(C3-C10)杂芳基、(C3-C10)杂环或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R4是卤代基、氰基、芳基、OR5或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R5在每次出现时独立地为H、(C1-C3)烷基、(C3-C10)杂环、(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)杂环、-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基、芳基或杂芳基,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R6在每次出现时独立地为OH、(C1-C3)烷基、-(C1-C3)烷氧基、(C3-C10)杂环、(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)杂环、-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基、芳基、杂芳基,或者R5和R6与它们所连接的原子合起来形成含氮的(C3-C10)杂环,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R7是H、(C1-C3)烷基,或者R7和R26与它们所连接的碳合起来形成碳碳双键;
R8、R9、R10、R11各自独立地为H、卤代基、OH、氰基、(C1-C3)烷基、(C1-C3)烷氧基、芳基或杂芳基,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R12、R13、R14、R15各自独立地为H、NH2、(C1-C3)烷基、-N(R5)-(CH2)m-N(R5)-X-R6,附带条件为R12、R13、R14和R15中不超过三个取代基是H,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R16是NH2或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R17是氰基、杂芳基、-(CH2)m-C(O)O-R6或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R18、R19、R20、R21各自独立地为H、卤代基、(C1-C3)烷基、(C1-C3)烷氧基或-N(R5)-X-R6,附带条件为R18、R19、R20、R21中不超过两个取代基是H;或者
R18、R19与它们所连接的碳合起来形成(C3-C10)环烷基或(C3-C10)杂环,或者R19、R20与它们所连接的碳合起来形成(C3-C10)环烷基或(C3-C10)杂环,或者R20、R21与它们所连接的碳合起来形成(C3-C10)环烷基或(C3-C10)杂环,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R25是芳基、杂芳基或(C3-C10)杂环,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
Rw在每次出现时独立地为H、卤代基、氰基、硝基、氧代、烷基、卤代烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、杂环(heterocyclo)、芳基、杂芳基、芳基烷基、杂芳基烷基、环烷基烷基、杂环烷基,其中所述烷基、卤代烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、杂环、芳基、杂芳基、芳基烷基、杂芳基烷基、环烷基烷基和杂环烷基可进一步独立地被一个或多个选自卤代基、氰基、氧代(C3-C10)杂环、(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)杂环、-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基、芳基和杂芳基的基团取代;
X是键、-SO2-、-(CH2)nC(O)(CH2)m-、-C(O)NH-、-C(O)N(Rw)-、-NHC(O)NH-或-(CH2)n-;
Y1是-NHR25、-NHC(O)R25或-CHR25R26;
m是0、1、2、3或4;
k是1、2、3、4、5、6、7、8、9或10;
n是0、1、2、3或4。
在一实施方案中,L1是-Lb-(La)t-H;其中La在每次出现时独立地选自键、CR5R6、C(R5R6)O、C(R5R6)C(R5R6)O、SO2、NR5、C(R5R6)NR5、SO2NR5、SONR5、CONR5、NR5CONR6、NR5SO2NR6、CO、CR5=CR6、C≡C、SiR5R6、P(O)R5、P(O)OR5、NR5C(=NCN)NR6、NR5C(=NCN)和NR5C(=CNO2)NR6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
H是氢。
Lb选自:
t是0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20。
一方面,本发明涉及通式(A)k-L-Q的化合物或其盐、对映异构体、立体异构体、多晶型物或N-氧化物,其中:
A是与E3泛素连接酶结合的化合物,并且具有选自式I、式II、式III、式IV、式V、式VI、式VII、式VIII、式IX和式X的结构;
Q是与靶蛋白结合的部分,所述靶蛋白与所述E3泛素连接酶螯合和/或在与所述E3泛素连接酶相互作用后降解;
L是接头;
每个A在化合价允许的情况下与所述L共价连接;
R1是芳基、-N(R5)-X-R6、-SO2R5或-O(CH2)mR5,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R2是芳基、-NH-(C3-C10)杂芳基或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R3是氰基、芳基、-NH-(C3-C10)杂芳基、(C3-C10)杂环或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R4是卤代基、氰基、芳基、OR5或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R5在每次出现时独立地为H、(C1-C3)烷基、(C3-C10)杂环、(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)杂环、-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基、芳基或杂芳基,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R6在每次出现时独立地为OH、(C1-C3)烷基、-(C1-C3)烷氧基、(C3-C10)杂环、(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)杂环、-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基、芳基、杂芳基,或者R5和R6与它们所连接的原子合起来形成含氮的(C3-C10)杂环,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R7是H、(C1-C3)烷基,或者R7和R26与它们所连接的碳合起来形成碳碳双键;
R8、R9、R10、R11各自独立地为H、卤代基、OH、氰基、(C1-C3)烷基、(C1-C3)烷氧基、芳基或杂芳基,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R12、R13、R14、R15各自独立地为H、NH2、(C1-C3)烷基、-N(R5)-(CH2)m-N(R5)-X-R6,附带条件为R12、R13、R14和R15中不超过三个取代基是H,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R16是NH2或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R17是氰基、杂芳基、-(CH2)m-C(O)O-R6或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R18、R19、R20、R21各自独立地为H、卤代基、(C1-C3)烷基、(C1-C3)烷氧基或-N(R5)-X-R6,附带条件为R18、R19、R20、R29中不超过两个取代基是H;或者
R18、R19与它们所连接的碳合起来形成(C3-C10)环烷基或(C3-C10)杂环,或者R19、R20与它们所连接的碳合起来形成(C3-C10)环烷基或(C3-C10)杂环,或者R20、R21与它们所连接的碳合起来形成(C3-C10)环烷基或(C3-C10)杂环,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R25是芳基、杂芳基或(C3-C10)杂环,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
Rw在每次出现时独立地为H、卤代基、氰基、硝基、氧代、烷基、卤代烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、杂环、芳基、杂芳基、芳基烷基、杂芳基烷基、环烷基烷基、杂环烷基,其中所述烷基、卤代烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、杂环、芳基、杂芳基、芳基烷基、杂芳基烷基、环烷基烷基和杂环烷基可进一步独立地被一个或多个选自卤代基、氰基、氧代(C3-C10)杂环、(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)杂环、-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基、芳基和杂芳基的基团取代;
X是键、-SO2-、-(CH2)nC(O)(CH2)m-、-C(O)NH-、-C(O)N(Rw)-、-NHC(O)NH-或-(CH2)n-;
Y1是-NHR25、-NHC(O)R25或-CHR25R26;
m是0、1、2、3或4;
k是1、2、3、4、5、6、7、8、9或10;
n是0、1、2、3或4。
在一实施方案中,L是-Lb-(La)t-;其中La在每次出现时独立地选自键、CR5R6、C(R5R6)O、C(R5R6)C(R5R6)O、SO2、NR5、C(R5R6)NR5、SO2NR5、SONR5、CONR5、NR5CONR6、NR5SO2NR6、CO、CR5=CR6、C≡C、SiR5R6、P(O)R5、P(O)OR5、NR5C(=NCN)NR6、NR5C(=NCN)和NR5C(=CNO2)NR6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
Lb选自:
t是0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20。
在一实施方案中,L是-(CH2CH2)t-、-(CH2O)t-或-(CH2CH2O)t-。
一方面,部分A选自:
3-[1-氧代-5-(喹唑啉-4-基氨基)异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
3-[5-[(4-氨基噻吩并[2,3-d]嘧啶-2-基)氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
N-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-1-氧代-异吲哚啉-5-基]乙酰胺;
3-[5-[(2-氨基嘧啶-4-基)氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
6-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-1-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]哒嗪-3-甲腈;
3-[[2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-1-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]乙酰基]氨基]苯甲酰胺;
2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-1-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]乙酸;
N-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]喹啉-2-甲酰胺;
3-[6-[[2-(2-甲基-1-哌啶基)-2-氧代-乙基]氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
3-[6-[(2-异吲哚啉-2-基-2-氧代-乙基)氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
N-(环丙基甲基)-2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]-N-甲基-乙酰胺;
乙酸;3-[1-氧代-6-(喹唑啉-4-基氨基)异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
3-[6-[[2-(3-甲基-1-哌啶基)-2-氧代-乙基]氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
3-[6-[(4-甲基-3-氧代-吡嗪-2-基)氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
3-[1-氧代-6-(喹喔啉-2-基氨基)异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
3-[6-[(1-甲基吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-基)氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
3-[6-(5,7-二氢呋喃并[3,4-d]嘧啶-2-基氨基)-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
3-[6-[(6-甲基嘧啶-4-基)氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]-N-苯基-乙酰胺;
3-[6-[[2-(2,4-二甲基哌嗪-1-基)-2-氧代-乙基]氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
3-[6-(二甲基氨基)-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
3-(1-氧代-6-苯基-异吲哚啉-2-基)哌啶-2,6-二酮;
2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]-N,N-二甲基-乙酰胺;
3-[6-[[2-(2-甲基吗啉-4-基)-2-氧代-乙基]氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]-N-甲基-N-[(1-甲基吡唑-4-基)甲基]乙酰胺;
N-苄基-2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]乙酰胺;
6-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]哒嗪-3-甲腈;
3-[6-[(6-甲基吡咯并[3,2-d]嘧啶-4-基)氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
2-(二甲基氨基)-N-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]乙酰胺;
N-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-甲酰胺;
N-环丙基-2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]乙酰胺;
3-[1-氧代-6-(2-氧代咪唑烷-1-基)异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-甲腈;
2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]丙酸;
2-乙酰氨基-N-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]乙酰胺;
2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]乙酰胺;
3-[6-[[2-(3-甲基-5-氧代-哌嗪-1-基)-2-氧代-乙基]氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
N-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]乙酰胺;
3-[6-[[2-(4-甲基-3-氧代-哌嗪-1-基)-2-氧代-乙基]氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
N-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]-3H-咪唑并[4,5-b]吡啶-6-甲酰胺;
2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]-N-四氢吡喃-4-基-乙酰胺;
2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]乙酸;
3-[1-氧代-6-[[2-氧代-2-(1-哌啶基)乙基]氨基]异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
3-(1-氧代-7-苯基-异吲哚啉-2-基)哌啶-2,6-二酮;
2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-4-甲腈;
2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-4-基]氨基]乙酸;
3-(7-氟-1-氧代-异吲哚啉-2-基)哌啶-2,6-二酮;
3-(5-氨基-1-氧代-3,4-二氢异喹啉-2-基)哌啶-2,6-二酮;
2-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-1-基]乙酸叔丁酯;
3-[1-(2H-吲哚-3-基)-3-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-1-甲腈;
3-[1-(二甲基氨基)-3-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
3-(2-氧代吡咯烷-1-基)哌啶-2,6-二酮;
3-(喹唑啉-2-基氨基)哌啶-2,6-二酮;
(3Z)-3-亚苄基哌啶-2,6-二酮;
3-(喹喔啉-2-基氨基)哌啶-2,6-二酮;
3-(嘧啶-2-基氨基)哌啶-2,6-二酮;
N-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-2-氧代-3H-吡啶-6-甲酰胺;
3-(4-甲基-1,1,3-三氧代-1,2-苯并噻唑-2-基)哌啶-2,6-二酮;
3-(8-氨基-4-氧代-1,2,3-苯并三嗪-3-基)哌啶-2,6-二酮;
3-(5-氨基-4-氧代-1,2,3-苯并三嗪-3-基)哌啶-2,6-二酮;
3-(4-氧代-1,2,3-苯并三嗪-3-基)哌啶-2,6-二酮;
3-(5-甲基-4-氧代-1,2,3-苯并三嗪-3-基)哌啶-2,6-二酮;
3-(6-甲基-4-氧代-1,2,3-苯并三嗪-3-基)哌啶-2,6-二酮;和
3-(8-甲基-4-氧代-1,2,3-苯并三嗪-3-基)哌啶-2,6-二酮。
在一实施方案中,Q是与靶蛋白结合的部分,其中所述靶蛋白选自B7.1和B7、TINFR1m、TNFR2、NADPH氧化酶、Bc1、C5a受体、HMG-CoA还原酶、PDE V磷酸二酯酶类型、PDEIV磷酸二酯酶类型4、PDE I、PDEII、PDEIII、角鲨烯-藿烯环化酶、CXCR1、CXCR2、一氧化氮(N0)合酶、环加氧酶1、环加氧酶2、5HT受体、多巴胺受体、G蛋白、Gq、组胺受体、5-脂加氧酶、胰蛋白酶丝氨酸蛋白酶、胸苷酸合酶、嘌呤核苷磷酸化酶、锥虫GAPDH、糖原磷酸化酶、碳酸酐酶、趋化因子受体、JAW/STAT、类视黄醇X受体、HIV 1蛋白酶、HIV 1整合酶、流感、神经氨酸酶、乙型肝炎逆转录酶、钠通道、蛋白P-糖蛋白(和MRP)、酪氨酸激酶、CD23、CD124、酪氨酸激酶p56lck、CD4、CD5、IL-2受体、IL-1受体、TNF-α、ICAM1、Cat+通道、VCAM、VLA-4整联蛋白、选择素、CD40/CD40L、newokinin及受体、肌苷一磷酸脱氢酶、p38 MAP激酶、Ras/Raf/ME/ERK途径、白介素-1转化酶、半胱天冬酶、HCV、NS3蛋白酶、HCV NS 3RNA解旋酶、甘氨酰胺核糖核苷酸甲酰基转移酶、鼻病毒3C蛋白酶、单纯疱疹病毒-1(HSV-I)蛋白酶、巨细胞病毒(CMV)蛋白酶、聚(ADP-核糖)聚合酶、细胞周期蛋白依赖性激酶、血管内皮生长因子、c-Kit、TGF β激活激酶1、雷帕霉素的哺乳动物靶标、SHP2、雄激素受体、催产素受体、微粒体转移蛋白抑制剂、5α还原酶、血管紧张素II、甘氨酸受体、去甲肾上腺素再摄取受体、雌激素受体、雌激素相关受体、粘着斑激酶、Src、内皮素受体、神经肽Y及受体、腺苷受体、腺苷激酶和AMP脱氨酶、嘌呤能受体(P2Y1、P2Y2、P2Y4、P2Y6、P2X1-7)、法尼基转移酶、香叶基香叶基转移酶、NGF的TrkA a受体、β-淀粉样蛋白、酪氨酸激酶Flk-1、玻连蛋白受体、整联蛋白受体、Her-2/neu、端粒酶、胞质磷脂酶A2和EGF受体酪氨酸激酶、蜕皮素20-单加氧酶、GABA门控氯离子通道的离子通道、乙酰胆碱酯酶、电压敏感性钠通道蛋白、钙通道蛋白和氯离子通道蛋白、乙酰基-CoA羧化酶、腺苷酸琥珀酸合成酶、原卟啉原氧化酶和烯醇式丙酮酰莽草酸-磷酸合酶。
在一实施方案中,Q是为Hsp90抑制剂、激酶抑制剂、磷酸酶抑制剂、HDM2/MDM2抑制剂、人BET布罗莫结构域抑制剂、HDAC抑制剂、人赖氨酸甲基转移酶抑制剂、RAF受体抑制剂、FKBP抑制剂、血管生成抑制剂、芳烃受体抑制剂、雄激素受体抑制剂、雌激素受体抑制剂、甲状腺激素受体抑制剂、HIV蛋白酶抑制剂、HIV整合酶抑制剂、酰基蛋白硫酯酶1抑制剂或酰基蛋白硫酯酶2抑制剂的部分。
在一实施方案中,Q是为TANK-结合激酶1(TBK1)抑制剂、雌激素受体α(ERα)抑制剂、含布罗莫结构域的蛋白4(BRD4)抑制剂、雄激素受体(AR)抑制剂、血小板源性生长因子受体抑制剂、p38 MAPK抑制剂、Bcr-Ab1酪氨酸-激酶抑制剂、Her2抑制剂、EGFR抑制剂、MDM2抑制剂、含布罗莫结构域的蛋白2(BRD2)抑制剂、HDAC抑制剂、DHFR抑制剂或c-Myc抑制剂的部分。
在一实施方案中,Q是选自甲氧苄啶、伏立诺他、他莫昔芬、JQ1、Nutlin 3、阿法替尼、氯烷烃、达沙替尼、BIRB796、FK-506、辛伐他汀、雷帕霉素和索拉非尼的部分。
一方面,本发明涉及包含式(A)k-L-Q或(A)k-L1的化合物和药学上可接受的载体、添加剂和/或赋形剂的药物组合物。
在实施方案中,所述组合物是蛋白质降解的二价诱导剂(也称为蛋白水解靶向嵌合体(PROTAC))。在实施方案中,所述组合物是可点击蛋白水解靶向嵌合体(CLIPTAC)。在实施方案中,这种CLIPTAC包括(a)包含靶蛋白的配体的第一部分;(b)包含E3泛素连接酶的配体的第二部分;和(c)共价偶联所述第一和第二部分的接头部分;其中所述接头包含由相容的反应性部分对之间的生物正交点击反应产生的共价键。在实施方案中,所述组合物是细胞内点击形成的蛋白水解靶向嵌合体(CLIPTAC)。
一方面,本发明涉及治疗受试者的疾病的方法,所述方法包括施用有效量的具有式(A)k-L-Q或(A)k-L1的化合物。
一方面,本发明涉及治疗受试者的疾病的方法,其中失调的蛋白质活性是造成所述疾病的原因,所述方法包括施用有效量的具有式(A)k-L-Q或(A)k-L1的化合物。
在一实施方案中,所述癌症选自鳞状细胞癌、基底细胞癌、腺癌、肝细胞癌、肾细胞癌、膀胱癌、肠癌、乳腺癌、宫颈癌、结肠癌、食道癌、头癌、肾癌、肝癌、肺癌、颈癌、卵巢癌、胰腺癌、前列腺癌、胃癌、子宫癌、白血病、淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、黑素瘤、骨髓增生性疾病、多发性骨髓瘤、肉瘤包括尤因氏肉瘤、血管肉瘤、卡波西氏肉瘤、脂肪肉瘤、肌肉瘤、周围神经上皮瘤、滑膜肉瘤)、神经胶质瘤、星形细胞瘤、少突神经胶质瘤、室管膜瘤、胶质母细胞瘤、成神经细胞瘤、神经节瘤、神经节神经胶质瘤、成神经管细胞瘤、松果体细胞肿瘤、脑膜瘤、脑膜肉瘤、神经纤维瘤、神经鞘瘤、睾丸癌、甲状腺癌、星形细胞瘤、霍奇金病、维尔姆斯瘤和畸胎癌。
另一方面,本发明涉及治疗或预防一种或多种自身免疫性疾病或病症的方法,包括对有需要的受试者施用包含药学有效量的本文所述的化合物和药学上可接受的载体的组合物。在一实施方案中,所述自身免疫性疾病或病症选自如多发性硬化症、糖尿病、狼疮、乳糜泻、克罗恩病、溃疡性结肠炎、格林-巴利综合征、硬皮病、古德帕斯丘综合征、韦格纳肉芽肿病、自身免疫性癫痫、拉斯穆森脑炎、原发性胆汁性硬化、硬化性胆管炎、自身免疫性肝炎、阿狄森病、桥本甲状腺炎、纤维肌痛、美尼尔综合征;移植排斥(例如,预防同种异体移植排斥)恶性贫血、类风湿性关节炎、全身性红斑狼疮、皮肌炎、舍格伦综合征、红斑狼疮、多发性硬化症、重症肌无力、赖特综合征、格雷夫斯病及其他自身免疫性疾病或病症。
在一实施方案中,所述受试者是人。
附图说明
当结合附图阅读时,将会更好地理解本发明的前述发明内容以及以下具体实施方式。
图1示出实施例5中的中间体化合物53的HNMR。
图2示出甲氧苄啶-来那度胺(TMP-LEN)的LCMS数据。
图3示出用MAPPIT样测定法检测到的TMP-LEN杂合配体诱导的CRBN与DHFR之间的结合。由DHFR配体甲氧苄啶(TMP)通过PEG接头与CRBN配体来那度胺融合组成的杂合分子用于在MAPPIT测定中诱导DHFR募集至CRBN诱饵。如图所示,在CRBN表达为gp130融合体且DHFR与MAPPIT嵌合膜受体连接的情况下,可以观察到TMP-LEN剂量依赖性信号。
具体实施方式
以下是本发明的具体实施方式。本领域的普通技术人员可以在不脱离本公开的实质或范围的情况下对本文描述的实施方案进行修改和变动。本文提到的所有出版物、专利申请、专利及其它参考文献明确地以全文引用的方式并入本文。
本发明描述新的化合物(包括双功能化合物)、组合物和方法,其涉及意外且出乎意料的发现,即一旦通过结合E3泛素连接酶蛋白和靶蛋白的双功能或嵌合构建体将E3泛素连接酶蛋白(例如,塞勒布隆)和靶蛋白靠近放置,E3泛素连接酶蛋白便使靶蛋白泛素化。因此本发明提供了这类具有通式(A)k-L1或(A)k-L-Q的化合物,其中A是与E3泛素连接酶蛋白结合的部分;L或L1是接头;Q是与靶蛋白结合的部分。
在一实施方案中,本文公开的化合物、其药学上可接受的盐或其药学上可接受的组合物可用于治疗由塞勒布隆、IKZF1、SALL4和ASS1中的一者或多者介导的病症,例如各种癌症和自身免疫性疾病或病症。
除另有定义外,本文使用的所有技术和科学术语具有与本发明所属领域的普通技术人员通常所理解的相同的含义。说明书中使用的术语仅用于描述特定的实施方案,并不旨在限制本发明。
在提供数值范围的情况下,要理解的是,在该范围的上限与下限之间除上下文明确另有规定外精确到下限单位的十分之一的每个中间值(如在含有一定数目的碳原子的基团的情况下,在所述情况下提供了落在所述范围内的每个碳原子数目)以及在该范围内的任何其它规定或中间值都涵盖在本发明内。这些较小范围的上限和下限可独立地包括在所述较小的范围内,也涵盖在本发明内,但要遵守规定范围内的任何具体排除限制。在规定范围包括一个或两个界限的情况下,排除那些包括的界限中的任一者或两者的范围也包括在本发明中。
以下术语用于描述本发明。在本文中没有具体定义术语的情况下,该术语由将该术语在上下文中应用于描述本发明的用途的本领域普通技术人员赋予本领域中公认的含义。
定义
除上下文明确另指出外,如本文和所附权利要求中所用的冠词“一个(种)”在本文中用于指一个或多于一个(即,至少一个)所述冠词的语法对象。举例来说,“一种元素”意指一种元素或多于一种元素。
术语“H”表示单个氢原子。该基团可与例如氧原子连接以形成羟基基团。
在单独使用或在其他术语如“卤代烷基”或“烷基氨基”内使用术语“烷基”的情况下,其包括具有一至约十二个碳原子的直链或支链基团。更优选的烷基是具有一至约六个碳原子的“低级烷基”。这类基团的实例包括甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、戊基、异戊基、己基等。甚至更优选的是具有一个或两个碳原子的低级烷基。术语“亚烷基(alkylenyl/alkylene)”包括桥连的二价烷基,如亚甲基或亚乙基。术语“被R2取代的低级烷基”不包括缩醛部分。术语“烷基”进一步包括其中链中的一个或多个碳原子被选自氧、氮或硫的杂原子取代的烷基。
术语“烯基”包括具有至少一个碳-碳双键的二至约十二个碳原子的直链或支链基团。更优选的烯基是具有二至约六个碳原子的“低级烯基”。最优选的低级烯基是具有二至约四个碳原子的基团。烯基的实例包括乙烯基、丙烯基、烯丙基、丙烯基、丁烯基和4-甲基丁烯基。术语“烯基”和“低级烯基”包括具有“顺式”和“反式”取向或者“E”和“Z”取向的基团。
术语“炔基”表示具有至少一个碳-碳三键并具有二至约十二个碳原子的直链或支链基团。更优选的炔基是具有二至约六个碳原子的“低级炔基”。最优选的是具有二至约四个碳原子的低级炔基。这类基团的实例包括炔丙基和丁炔基等。
烷基、亚烷基、烯基和炔基可任选被一个或多个诸如卤代基、羟基、硝基、氨基、氰基、卤代烷基、芳基、杂芳基和杂环等的官能团取代。
术语“卤代基”意指卤素,如氟、氯、溴或碘原子。
术语“卤代烷基”包括其中任何一个或多个烷基碳原子被如上所定义的卤代基取代的基团。具体包括单卤代烷基、二卤代烷基和多卤代烷基,包括全卤代烷基。单卤代烷基例如可在基团内具有碘代、溴代、氯代或氟代原子。二卤代和多卤代烷基可具有两个或更多个相同的卤代原子或不同的卤代基团的组合。“低级卤代烷基”包括具有1至6个碳原子的基团。甚至更优选的是具有一至三个碳原子的低级卤代烷基。卤代烷基的实例包括氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、氯甲基、二氯甲基、三氯甲基、五氟乙基、七氟丙基、二氟氯甲基、二氯氟甲基、二氟乙基、二氟丙基、二氯乙基和二氯丙基。
术语“全氟烷基”意指所有氢原子都被氟代原子置换的烷基。实例包括三氟甲基和五氟乙基。
术语“羟烷基”包括具有一至约十个碳原子的直链或支链烷基,其中的任何一个碳原子可以被一个或多个羟基取代。更优选的羟烷基是具有一至六个碳原子和一个或多个羟基的“低级羟烷基”。这类基团的实例包括羟甲基、羟乙基、羟丙基、羟丁基和羟己基。甚至更优选的是具有一至三个碳原子的低级羟烷基。
术语“烷氧基”包括各自具有一至约十个碳原子的烷基部分的直链或支链含氧基团。更优选的烷氧基是具有一至六个碳原子的“低级烷氧基”。这类基团的实例包括甲氧基、乙氧基、丙氧基、丁氧基和叔丁氧基。甚至更优选的是具有一至三个碳原子的低级烷氧基。烷氧基可以被一个或多个诸如氟代、氯代或溴代的卤代原子进一步取代,得到“卤代烷氧基”。甚至更优选的是具有一至三个碳原子的低级卤代烷氧基。这类基团的实例包括氟甲氧基、氯甲氧基、三氟甲氧基、三氟乙氧基、氟乙氧基和氟丙氧基。
单独或组合的术语“芳基”意指含有一个或两个环的碳环芳族体系,其中这类环可以按稠合的方式连接在一起。术语“芳基”包括芳族基团,如苯基、萘基、茚基、四氢萘基和茚满基。更优选的芳基是苯基。“芳基”可具有1个或多个取代基,如低级烷基、羟基、卤代基、卤代烷基、硝基、氰基、烷氧基和低级烷基氨基等。被-O-CH2-O-取代的苯基形成芳基苯并间二氧杂环戊烯基(benzodioxolyl)取代基。
术语“杂环基”(或“杂环”)包括饱和的、部分饱和的和不饱和的含杂原子的环基团,其中杂原子可选自氮、硫和氧。其不包括含有-O-O-、-O-S-或-S-S-部分的环。“杂环基”可具有1至4个取代基,如羟基、Boc、卤代基、卤代烷基、氰基、低级烷基、低级芳烷基、氧代、低级烷氧基、氨基和低级烷基氨基。
饱和杂环基团的实例包括含有1至4个氮原子的饱和3至6元杂单环基团[例如,吡咯烷基、咪唑烷基、哌啶基、吡咯啉基、哌嗪基];含有1至2个氧原子和1至3个氮原子的饱和3至6元杂单环基团[例如,吗啉基];含有1至2个硫原子和1至3个氮原子的饱和3至6元杂单环基团[例如,噻唑烷基]。部分饱和的杂环基的实例包括二氢噻吩基、二氢吡喃基、二氢呋喃基和二氢噻唑基。
不饱和杂环基团(也称为“杂芳基”)的实例包括含有1至4个氮原子的不饱和5至6元杂单环基,例如吡咯基、咪唑基、吡唑基、2-吡啶基、3-吡啶基、4-吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、三唑基[例如,4H-1,2,4-三唑基、1H-1,2,3-三唑基、2H-1,2,3-三唑基];含有氧原子的不饱和5至6元杂单环基团,例如吡喃基、2-呋喃基、3-呋喃基等;含有硫原子的不饱和5至6元杂单环基团,例如2-噻吩基、3-噻吩基等;含有1至2个氧原子和1至3个氮原子的不饱和5至6元杂单环基团,例如噁唑基、异噁唑基、噁二唑基[例如,1,2,4-噁二唑基、1,3,4-噁二唑基、1,2,5-噁二唑基];含有1至2个硫原子和1至3个氮原子的不饱和5至6元杂单环基团,例如噻唑基、噻二唑基[例如,1,2,4-噻二唑基、1,3,4-噻二唑基、1,2,5-噻二唑基]。
术语杂环基(或杂环)还包括其中杂环基团与芳基稠合(fused/condensed)的基团:含有1至5个氮原子的不饱和稠合杂环基团,例如吲哚基、异吲哚基、吲哚嗪基、苯并咪唑基、喹啉基、异喹啉基、吲唑基、苯并三唑基、四唑并哒嗪基[例如,四唑并[1,5-b]哒嗪基];含有1至2个氧原子和1至3个氮原子的不饱和稠合杂环基团[例如苯并噁唑基、苯并噁二唑基];含有1至2个硫原子和1至3个氮原子的不饱和稠合杂环基团[例如,苯并噻唑基、苯并噻二唑基];以及含有1至2个氧或硫原子的饱和的、部分不饱和的和不饱和的稠合杂环基团[例如苯并呋喃基、苯并噻吩基、2,3-二氢-苯并[1,4]二噁英基和二氢苯并呋喃基]。优选的杂环基团包括五至十元稠合或非稠合基团。杂芳基更优选的实例包括喹啉基、异喹啉基、咪唑基、吡啶基、噻吩基、噻唑基、噁唑基、呋喃基和吡嗪基。其他优选的杂芳基有含有一或两个选自硫、氮和氧的杂原子的5或6元杂芳基,其选自噻吩基、呋喃基、吡咯基、吲唑基、吡唑基、噁唑基、三唑基、咪唑基、吡唑基、异噁唑基、异噻唑基、吡啶基、哌啶基和吡嗪基。
非含氮杂芳基的特定实例包括吡喃基、2-呋喃基、3-呋喃基、2-噻吩基、3-噻吩基、苯并呋喃基和苯并噻吩基等。
部分饱和的和饱和的杂环基的特定实例包括吡咯烷基、咪唑烷基、哌啶基、吡咯啉基、吡唑烷基、哌嗪基、吗啉基、四氢吡喃基、噻唑烷基、二氢噻吩基、2,3-二氢-苯并[1,4]二噁烷基、吲哚啉基、异吲哚啉基、二氢苯并噻吩基、二氢苯并呋喃基、异色满基、色满基、1,2-二氢喹啉基、1,2,3,4-四氢-异喹啉基、1,2,3,4-四氢-喹啉基、2,3,4,4a,9,9a-六氢-1H-3-氮杂-芴基、5,6,7-三氢-1,2,4-三唑并[3,4-a]异喹啉基、3,4-二氢-2H-苯并[1,4]噁嗪基、苯并[1,4]二噁烷基、2,3-二氢-1H-1λ′-苯并[d]异噻唑-6-基、二氢吡喃基、二氢呋喃基和二氢噻唑基等。
术语“杂环”因此涵盖以下环体系:
等。
术语“磺酰基”无论单独使用还是与其他术语连接(如烷基磺酰基)分别表示二价基团-SO2-。
术语“氨磺酰基”、“氨基磺酰基”和“磺酰胺基”表示被胺基团取代的磺酰基,形成磺酰胺(-SO2NH2)。
术语“烷基氨基磺酰基”包括“N-烷基氨基磺酰基”,其中氨磺酰基独立地被一个或两个烷基取代。更优选的烷基氨基磺酰基是具有一至六个碳原子的“低级烷基氨基磺酰基”。甚至更优选的是具有一至三个碳原子的低级烷基氨基磺酰基。这类低级烷基氨基磺酰基的实例包括N-甲基氨基磺酰基和N-乙基氨基磺酰基。
术语“羧基(carboxy/carboxyl)”无论单独使用还是与其他术语一起使用(如“羧烷基”)均表示-CO2H。
术语“羰基”无论单独使用还是与其他术语一起使用(如“氨基羰基”)均表示-(C=O)-。
术语“氨基羰基”表示式C(=O)NH2的酰胺基团。
术语“N-烷基氨基羰基”和“N,N-二烷基氨基羰基”表示分别独立地被一个或两个烷基取代的氨基羰基。更优选的是具有与氨基羰基连接的如上所述的低级烷基的“低级烷基氨基羰基”。
术语“N-芳基氨基羰基”和“N-烷基-N-芳基氨基羰基”表示分别被一个芳基或一个烷基和一个芳基取代的氨基羰基。
术语“杂环基亚烷基”和“杂环基烷基”包括杂环取代的烷基。更优选的杂环基烷基是具有一至六个碳原子的烷基部分和5或6元杂芳基的“5或6元杂芳基烷基”。甚至更优选的是具有一至三个碳原子的烷基部分的低级杂芳基亚烷基。实例包括诸如吡啶基甲基和噻吩基甲基的基团。
术语“芳烷基”包括芳基取代的烷基。优选的芳烷基是具有与具有一至六个碳原子的烷基连接的芳基的“低级芳烷基”。甚至更优选的是与具有一至三个碳原子的烷基部分连接的“苯基亚烷基”。这类基团的实例包括苄基、二苯基甲基和苯基乙基。所述芳烷基中的芳基可另外被卤代基、烷基、烷氧基、卤代烷基和卤代烷氧基取代。
术语“烷硫基”包括含有与二价硫原子连接的一至十个碳原子的直链或支链烷基的基团。甚至更优选的是具有一至三个碳原子的低级烷硫基。“烷硫基”的实例有甲硫基(CH3S-)。
术语“卤代烷硫基”包括含有与二价硫原子连接的一至十个碳原子的卤代烷基的基团。甚至更优选的是具有一至三个碳原子的低级卤代烷硫基。“卤代烷硫基”的实例有三氟甲硫基。
术语“烷基氨基”包括“N-烷基氨基”和“N,N-二烷基氨基”,其中氨基分别独立地被一个烷基和被两个烷基取代。更优选的烷基氨基是具有一个或两个与氮原子连接的一至六个碳原子的烷基的“低级烷基氨基”。甚至更优选的是具有一至三个碳原子的低级烷基氨基。合适的烷基氨基可以是单烷基氨基或二烷基氨基,如N-甲基氨基、N-乙基氨基、N,N-二甲基氨基和N,N-二乙基氨基等。
术语“芳基氨基”表示已被一个或两个芳基取代的氨基,如N-苯基氨基。芳基氨基可在该基团的芳基环部分上被进一步取代。
术语“杂芳基氨基”表示已被一个或两个杂芳基取代的氨基,如N-噻吩基氨基。“杂芳基氨基”可在该基团的杂芳基环部分上被进一步取代。
术语“芳烷基氨基”表示已被一个或两个芳烷基取代的氨基。更优选的是苯基-C1-C3-烷基氨基,如N-苄基氨基。芳烷基氨基可在芳基环部分上被进一步取代。
术语“N-烷基-N-芳基氨基”和“N-芳烷基-N-烷基氨基”表示对于氨基已分别独立地被一个芳烷基和一个烷基或一个芳基和一个烷基取代的氨基。
术语“氨基烷基”包括具有一至约十个碳原子的直链或支链烷基,其中的任何一个碳原子可以被一个或多个氨基取代。更优选的氨基烷基是具有一至六个碳原子和一个或多个氨基的“低级氨基烷基”。这类基团的实例包括氨基甲基、氨基乙基、氨基丙基、氨基丁基和氨基己基。甚至更优选的是具有一至三个碳原子的低级氨基烷基。
术语“烷基氨基烷基”包括被烷基氨基取代的烷基。更优选的烷基氨基烷基是具有一至六个碳原子的烷基的“低级烷基氨基烷基”。甚至更优选的是具有一至三个碳原子的烷基的低级烷基氨基烷基。合适的烷基氨基烷基可以是单烷基或二烷基取代的,如N-甲基氨基甲基、N,N-二甲基-氨基乙基和N,N-二乙基氨基甲基等。
术语“烷基氨基烷氧基”包括被烷基氨基取代的烷氧基。更优选的烷基氨基烷氧基是具有一至六个碳原子的烷氧基的“低级烷基氨基烷氧基”。甚至更优选的是具有一至三个碳原子的烷基的低级烷基氨基烷氧基。合适的烷基氨基烷氧基可以是单烷基或二烷基取代的,如N-甲基氨基乙氧基、N,N-二甲基氨基乙氧基和N,N-二乙基氨基乙氧基等。
术语“烷基氨基烷氧基烷氧基”包括被烷基氨基烷氧基取代的烷氧基。更优选的烷基氨基烷氧基烷氧基是具有一至六个碳原子的烷氧基的“低级烷基氨基烷氧基烷氧基”。甚至更优选的是具有一至三个碳原子的烷基的低级烷基氨基烷氧基烷氧基。合适的烷基氨基烷氧基烷氧基可以是单烷基或二烷基取代的,如N-甲基氨基甲氧基乙氧基、N-甲基氨基乙氧基乙氧基、N,N-二甲基氨基乙氧基乙氧基和N,N-二乙基氨基甲氧基甲氧基等。
术语“羧烷基”包括具有一至约十个碳原子的直链或支链烷基,其中的任何一个碳原子可以被一个或多个羧基取代。更优选的羧烷基是具有一至六个碳原子和一个羧基的“低级羧烷基”。这类基团的实例包括羧甲基和羧丙基等。甚至更优选的是具有一至三个CH2基团的低级羧烷基。
术语“卤代磺酰基”包括被卤素基团取代的磺酰基。这类卤代磺酰基的实例包括氯磺酰基和氟磺酰基。
术语“芳硫基”包括与二价硫原子连接的六至十个碳原子的芳基。“芳硫基”的实例有苯硫基。
术语“芳烷硫基”包括与二价硫原子连接的如上所述的芳烷基。更优选的是苯基-C1-C3-烷硫基。“芳烷硫基”的实例有苄硫基。
术语“芳氧基”包括与氧原子连接的如上所定义的任选取代的芳基。这类基团的实例包括苯氧基。
术语“芳烷氧基”包括通过氧原子与其它基团连接的含氧芳烷基。更优选的芳烷氧基是具有与如上所述的低级烷氧基连接的任选取代的苯基的“低级芳烷氧基”。
术语“杂芳氧基”包括与氧原子连接的如上所定义的任选取代的杂芳基。
术语“杂芳基烷氧基”包括通过氧原子与其它基团连接的含氧杂芳基烷基。更优选的杂芳基烷氧基是具有与如上所述的低级烷氧基连接的任选取代的杂芳基的“低级杂芳基烷氧基”。
术语“环烷基”包括饱和碳环基团。优选的环烷基包括C3-C6环。更优选的化合物包括环戊基、环丙基和环己基。
术语“环烷基烷基”包括环烷基取代的烷基。优选的环烷基烷基是环烷基与具有一至六个碳原子的烷基连接的“低级环烷基烷基”。甚至更优选的是与具有一至三个碳原子的烷基部分连接的“5至6元环烷基烷基”。这类基团的实例包括环己基甲基。所述基团中的环烷基可另外被卤代基、烷基、烷氧基和羟基取代。
术语“环烯基”包括具有一个或多个碳-碳双键的碳环基团,包括“环烷基二烯基”化合物。优选的环烯基包括C3-C6环。更优选的化合物包括例如环戊烯基、环戊二烯基、环己烯基和环庚二烯基。
术语“包含”意指开放式的,包括所指示的组分,但不排除其它元素。
置换氢原子的基团或原子也被称为取代基。
任何特定的分子或基团可具有一个或多个取代基,这取决于可以被置换的氢原子的数目。
符号“-”代表共价键,并且也可用在基团中表示与另一基团的连接点。在化学结构中,该符号通常用于代表分子中的甲基。
术语“治疗有效量”意指改善、减轻或消除特定疾病或病状的一种或多种症状或者预防或延迟特定疾病或病状的一种或多种症状发作的化合物的量。
术语“患者”和“受试者”可以互换使用,表示动物,如狗、猫、母牛、马、绵羊和人。特定的患者是哺乳动物。术语患者包括雄性和雌性。
术语“药学上可接受的”意指所提到的物质如式I的化合物或式I的化合物的盐或含有式I的化合物的制剂或特定的赋形剂适合于对患者施用。
术语“治疗(treating/treat/treatment)”包括预防性(例如,预防的)和姑息性治疗。
术语“赋形剂”意指除活性药物成分(API)之外的任何药学上可接受的添加剂、载体、稀释剂、佐剂或其他成分,其通常被包括用于配制和/或对患者施用。
术语“癌症”意指哺乳动物中以不受控制的细胞生长为特征的生理病状。癌症的一般类别包括癌、淋巴瘤、肉瘤和胚细胞瘤。
组合物
以治疗有效量对患者施用本发明的化合物。所述化合物可单独施用或作为药学上可接受的组合物或制剂的一部分施用。此外,所述化合物或组合物可一次全部施用,例如通过推注,多次施用,如通过一系列片剂,或经一段时间基本上均匀地递送,例如采用透皮递送。还要注意的是,化合物的剂量可随时间变化。
如果需要的话,可以口服、经直肠、肠胃外(例如,静脉内、肌内或皮下)、脑池内、阴道内、腹膜内、膀胱内、局部(例如,粉剂、软膏或滴剂)或作为口腔或鼻喷雾剂对患者施用。本领域技术人员用于施用药物活性剂的所有方法都是预期的。
适用于肠胃外注射的组合物可包含生理上可接受的无菌水溶液或非水溶液、分散体、悬浮液或乳液和用于重构成无菌可注射溶液或分散体的无菌粉末。合适的水性和非水性载体、稀释剂、溶剂或媒介物的实例包括水、乙醇、多元醇(丙二醇、聚乙二醇、甘油等)、其合适的混合物、植物油(如橄榄油)和可注射的有机酯如油酸乙酯。可例如通过使用包衣如卵磷脂、在分散体的情况下通过维持所需的粒度和通过使用表面活性剂来维持适当的流动性。
这些组合物还可以含有佐剂,如防腐剂、润湿剂、乳化剂和分散剂。可通过添加各种抗细菌剂和抗真菌剂来防止微生物污染,例如添加对羟基苯甲酸酯、氯丁醇、苯酚、山梨酸等。还可取的是包括等渗剂,例如糖、氯化钠等。可通过使用延迟吸收的试剂例如单硬脂酸铝和明胶来实现可注射药物组合物的延长吸收。
用于口服施用的固体剂型包括胶囊、片剂、粉剂和颗粒剂。在这类固体剂型中,将活性化合物与至少一种惰性常规赋形剂(或载体)混合,如柠檬酸钠或磷酸二钙或(a)填充剂或增量剂,例如淀粉、乳糖、蔗糖、甘露糖醇和硅酸;(b)粘结剂,例如羧甲基纤维素、海藻酸盐、明胶、聚乙烯吡咯烷酮、蔗糖和阿拉伯胶;(c)保湿剂,例如甘油;(d)崩解剂,例如琼脂、碳酸钙、马铃薯或木薯淀粉、海藻酸、某些复合硅酸盐和碳酸钠;(a)溶液缓凝剂,例如石蜡;(f)吸收促进剂,例如季铵化合物;(g)润湿剂,例如鲸蜡醇和单硬脂酸甘油酯;(h)吸附剂,例如高岭土和膨润土;和(i)润滑剂,例如滑石、硬脂酸钙、硬脂酸镁、固体聚乙二醇、月桂基硫酸钠或其混合物。在胶囊和片剂的情况下,剂型还可包含缓冲剂。
类似类型的固体组合物也可用作软和硬填充明胶胶囊中的填充剂,所述胶囊使用诸如乳糖(lactose)或奶糖(milk sugar)以及高分子量聚乙二醇等的赋形剂。
固体剂型如片剂、糖衣丸、胶囊、丸剂和颗粒剂可制备有包衣和壳,如本领域中熟知的肠溶包衣等。它们还可以含有遮光剂,并且还可以有这样的组成,使得它们在肠道的某一部分中以延迟的方式释放一种或多种活性化合物。可以使用的包埋组合物的实例是聚合物质和蜡。如果适当的话,活性化合物也可与一种或多种上述赋形剂呈微囊化形式。
用于口服施用的液体剂型包括药学上可接受的乳液、溶液、混悬液、糖浆和酏剂。除了活性化合物之外,液体剂型还可含有本领域中常用的惰性稀释剂,如水或其他溶剂、增溶剂和乳化剂,例如乙醇、异丙醇、碳酸乙酯、乙酸乙酯、苄醇、苯甲酸苄酯、丙二醇、1,3-丁二醇、二甲基甲酰胺、油,特别是棉籽油、花生油、玉米胚芽油、橄榄油、蓖麻油和芝麻油;甘油、四氢糠醇、聚乙二醇和脱水山梨糖醇的脂肪酸酯或这些物质的混合物等。
除了这类惰性稀释剂之外,组合物还可以包括佐剂,如润湿剂、乳化剂和悬浮剂、甜味剂、调味剂和芳香剂。除了活性化合物之外,混悬液可含有悬浮剂,如乙氧基化异硬脂醇、聚氧乙烯山梨糖醇和脱水山梨糖醇酯、微晶纤维素、偏氢氧化铝、膨润土、琼脂和黄蓍胶或这些物质的混合物等。
用于经直肠施用的组合物优选为栓剂,其可通过将本发明的化合物与合适的非刺激性赋形剂或载体如可可脂、聚乙二醇或栓剂蜡混合来制备,这些物质在通常的室温下为固体,但在体温下为液体,因此在直肠或阴道腔中融化并释放活性组分。
用于局部施用本发明的化合物的剂型包括软膏、粉剂、喷雾剂和吸入剂。将活性化合物或适合的化合物在无菌条件下与生理上可接受的载体和可能需要的任何防腐剂、缓冲剂或推进剂混合。眼用制剂、眼用软膏、粉剂和溶液也涵盖在本发明的范围内。
可以将本发明的化合物以每天约0.1至约3,000mg范围内的剂量水平对患者施用。对于体重约70kg的正常成年人,每千克体重约0.01至约100mg范围内的剂量通常是足够的。可以使用的具体剂量和剂量范围取决于许多因素,包括患者的要求、所治疗的病状或疾病的严重程度和所施用的化合物的药理学活性。对于特定患者确定剂量范围和最佳剂量在本领域普通技术人员的技能范围内。
本发明的化合物可作为药学上可接受的盐、酯、酰胺或前药施用。术语“盐”是指本发明的化合物的无机盐和有机盐。盐可以在化合物的最终分离和纯化期间原位制备,或者通过将纯化的化合物以其游离碱或酸形式与合适的有机或无机碱或酸单独反应并分离由此形成的盐来制备。代表性的盐包括氢溴酸盐、盐酸盐、硫酸盐、硫酸氢盐、硝酸盐、乙酸盐、草酸盐、棕榈酸盐、硬脂酸盐、月桂酸盐、硼酸盐、苯甲酸盐、乳酸盐、磷酸盐、甲苯磺酸盐、柠檬酸盐、马来酸盐、富马酸盐、琥珀酸盐、酒石酸盐、萘酸盐、甲磺酸盐、葡庚糖酸盐、乳糖醛酸盐和月桂基磺酸盐等。盐可包括基于碱金属和碱土金属的阳离子,如钠、锂、钾、钙、镁等,以及无毒铵、季铵和胺阳离子,包括但不限于铵、四甲铵、四乙铵、甲胺、二甲胺、三甲胺、三乙胺、乙胺等。参见例如S.M.Berge等人,″Pharmaceutical Salts,″J Pharm Sci,66:1-19(1977)。
本发明的化合物的药学上可接受的酯的实例包括C1-C8烷基酯。可接受的酯还包括C5-C7环烷基酯以及芳基烷基酯如苄基。通常使用C1-C4烷基酯。可根据本领域中熟知的方法制备本发明的化合物的酯。
本发明的化合物的药学上可接受的酰胺的实例包括衍生自氨、伯C1-C8烷基胺和仲C1-C8二烷基胺的酰胺。在仲胺的情况下,胺也可以呈含有至少一个氮原子的5或6元杂环烷基的形式。通常使用衍生自氨、C1-C3伯烷基胺和C1-C2二烷基仲胺的酰胺。可根据本领域技术人员熟知的方法制备本发明的化合物的酰胺。
术语“前药”意指在体内转化以产生本发明的化合物的化合物。可通过各种机制发生转化,如通过在血液中水解。在T.Higuchi和W.Stella的“Prodrugs as Novel DeliverySystems”,A.C.S.Symposium Series的第14卷以及Bioreversible Carriers in DrugDesign,Edward B.Roche编,American Pharmaceutical Association and PergamonPress,1987中提供了关于前药用途的讨论。
举例而言,如果本发明的化合物含有羧酸官能团,则前药可包含通过用诸如以下的基团置换酸基团的氢原子形成的酯:(C1-C8烷基、(C2-C12)烷酰氧基甲基、具有4至9个碳原子的1-(烷酰氧基)乙基、具有5至10个碳原子的1-甲基-1-(烷酰氧基)乙基、具有3至6个碳原子的烷氧基羰基氧基甲基、具有4至7个碳原子的1-(烷氧基羰基氧基)乙基、具有5至8个碳原子的1-甲基-1-(烷氧基羰基氧基)乙基、具有3至9个碳原子的N-(烷氧基羰基)氨基甲基、具有4至10个碳原子的1-(N-(烷氧基羰基)氨基甲基、3-邻苯二甲酰基、4-巴豆内酯基、γ-丁内酯-4-基、二-N,N-(C1-C2)烷基氨基(C2-C3)烷基(如β-二甲基氨基乙基)、氨基甲酰基-(C1-C2)烷基、N,N-二(C1-C2)烷基氨基甲酰基-(C1-C2)烷基和哌啶子基-、吡咯烷子基-或吗啉代(C2-C3)烷基。
类似地,如果本发明的化合物包含醇官能团,则前药可通过用诸如以下的基团置换醇基团的氢原子而形成:(C1-C6)烷酰氧基甲基、1-((C1-C6)烷酰氧基)乙基、1-甲基-1-((C1-C6)烷酰氧基)乙基、(C1-C6)烷氧羰基氧基甲基、N-(C1-C6)烷氧羰基氨基甲基、琥珀酰基、(C1-C6)烷酰基、α-氨基(C1-C4)烷酰基、芳基酰基和α-氨基酰基或α-氨基酰基-α-氨基酰基,其中每个α-氨基酰基独立地选自天然存在的L-氨基酸、-P(O)(OH)2、-P(O)(O(C1-C6)烷基)2或糖基(由移除碳水化合物的半缩醛形式的羟基而产生的基团)。
本发明的化合物可含有不对称或手性中心,因此以不同的立体异构形式存在。预期化合物的所有立体异构形式以及其混合物(包括外消旋混合物)形成本发明的一部分。此外,本发明涵盖所有的几何异构体和位置异构体。例如,如果化合物含有双键,则涵盖顺式和反式形式(分别指定为S和E)以及混合物。
立体异构体的混合物(如非对映异构体混合物)可基于它们的物理化学差异而通过已知的方法(如色谱法和/或分级结晶法)分离成它们单独的立体化学组分。对映异构体也可通过如下方式分离:通过与适当的光学活性化合物(例如,醇)反应将对映异构体混合物转化成非对映异构体混合物,分离非对映异构体,并将单独的非对映异构体转化(例如,水解)为相应的纯对映异构体。另外,一些化合物可以是阻转异构体(例如,取代的联芳基)。
本发明的化合物可以以非溶剂化形式以及与药学上可接受的溶剂如水(水合物)、乙醇等的溶剂化形式存在。本发明考虑并涵盖溶剂化和非溶剂化形式两者。
还可能的是,本发明的化合物可以以不同的互变异构形式存在。本发明的化合物的所有互变异构体均被考虑在内。例如,本发明包括四唑部分的所有互变异构形式。另外,例如本发明包括化合物的所有酮-烯醇或亚胺-烯胺形式。
本领域技术人员将认识到,本文包含的化合物名称和结构可基于化合物的特定互变异构体。虽然可以使用仅特定互变异构体的名称或结构,但除另有说明外,本发明旨在涵盖所有互变异构体。
本发明还旨在涵盖采用实验室技术(如合成化学家熟知的技术)在体外合成的化合物;或采用体内技术(如通过代谢、发酵、消化等)合成的化合物。还预期可采用体外技术和体内技术的组合来合成本发明的化合物。
本发明还包括同位素标记的化合物,它们与本文列举的化合物相同,但一个或多个原子被原子质量或质量数不同于自然界中通常存在的原子质量或质量数的原子置换。可结合到本发明的化合物中的同位素的实例包括氢、碳、氮、氧、磷、氟和氯的同位素,如2H、3H、13C、14C、15N、16O、17O、18O、31P、32P、35S、18F和36Cl。一方面,本发明涉及其中一个或多个氢原子被氘(2H)原子置换的化合物。
含有上述同位素和/或其他原子的其他同位素的本发明的化合物在本发明的范围内。本发明的某些同位素标记的化合物可用于药物和/或底物组织分布测定,例如结合了放射性同位素如3H和14C的那些。氚化(即,3H)和碳-14(即,14C)同位素是特别优选的,因为它们易于制备和检测。进一步地,用较重的同位素如氘(即,2H)取代可由于代谢稳定性更大而提供某些治疗优势,例如增加的体内半衰期或降低的剂量需求,因此在一些情况下可能是优选的。通常可以通过用容易获得的同位素标记的试剂代替非同位素标记的试剂来制备本发明的同位素标记的化合物。
本发明的化合物可以各种固体状态存在,包括结晶状态和非晶状态。预期本发明化合物的不同结晶状态(也称为多晶型物)和非晶状态为本发明的一部分。
本文列举的所有专利、公布的专利申请及其他出版物特此以引用的方式并入本文。
化合物
一方面,本发明涉及具有通式(A)k-L1的化合物或其盐、对映异构体、立体异构体、多晶型物或N-氧化物,其中:
A是与E3泛素连接酶结合的部分,并且具有选自式I、式II、式III、式IV、式V、式VI、式VII、式VIII、式IX和式X的结构;
L1是接头;
每个A在化合价允许的情况下与所述L1共价连接;
R1是芳基、-N(R5)-X-R6、-SO2R5或-O(CH2)mR5,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R2是芳基、-NH-(C3-C10)杂芳基或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R3是氰基、芳基、-NH-(C3-C10)杂芳基、(C3-C10)杂环或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R4是卤代基、氰基、芳基、OR5或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R5在每次出现时独立地为H、(C1-C3)烷基、(C3-C10)杂环、(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)杂环、-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基、芳基或杂芳基,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R6在每次出现时独立地为OH、(C1-C3)烷基、-(C1-C3)烷氧基、(C3-C10)杂环、(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)杂环、-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基、芳基、杂芳基,或者R5和R6与它们所连接的原子合起来形成含氮的(C3-C10)杂环,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R7是H、(C1-C3)烷基,或者R7和R26与它们所连接的碳合起来形成碳碳双键;
R8、R9、R10、R11各自独立地为H、卤代基、OH、氰基、(C1-C3)烷基、(C1-C3)烷氧基、芳基或杂芳基,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R12、R13、R14、R15各自独立地为H、NH2、(C1-C3)烷基、-N(R5)-(CH2)m-N(R5)-X-R6,附带条件为R12、R13、R14和R15中不超过三个取代基是H,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R16是NH2或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R17是氰基、杂芳基、-(CH2)m-C(O)O-R6或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R18、R19、R20、R21各自独立地为H、卤代基、(C1-C3)烷基、(C1-C3)烷氧基或-N(R5)-X-R6,附带条件为R18、R19、R20、R29中不超过两个取代基是H;或者
R18、R19与它们所连接的碳合起来形成(C3-C10)环烷基或(C3-C10)杂环,或者R19、R20与它们所连接的碳合起来形成(C3-C10)环烷基或(C3-C10)杂环,或者R20、R21与它们所连接的碳合起来形成(C3-C10)环烷基或(C3-C10)杂环,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R25是芳基、杂芳基或(C3-C10)杂环,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
Rw在每次出现时独立地为H、卤代基、氰基、硝基、氧代、烷基、卤代烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、杂环、芳基、杂芳基、芳基烷基、杂芳基烷基、环烷基烷基、杂环烷基,其中所述烷基、卤代烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、杂环、芳基、杂芳基、芳基烷基、杂芳基烷基、环烷基烷基和杂环烷基可进一步独立地被一个或多个选自卤代基、氰基、氧代(C3-C10)杂环、(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)杂环、-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基、芳基和杂芳基的基团取代;
X是键、-SO2-、-(CH2)nC(O)(CH2)m-、-C(O)NH-、-C(O)N(Rw)-、-NHC(O)NH-或-(CH2)n-;
Y1是-NHR25、-NHC(O)R25或-CHR25R26;
m是0、1、2、3或4;
k是1、2、3、4、5、6、7、8、9或10;
n是0、1、2、3或4。
在一实施方案中,L1是-Lb-(La)t-H;其中La在每次出现时独立地选自键、CR5R6、C(R5R6)O、C(R5R6)C(R5R6)O、SO2、NR5、C(R5R6)NR5、SO2NR5、SONR5、CONR5、NR5CONR6、NR5SO2NR6、CO、CR5=CR6、C≡C、SiR5R6、P(O)R5、P(O)OR5、NR5C(=NCN)NR6、NR5C(=NCN)和NR5C(=CNO2)NR6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
H是氢。
Lb选自:
t是0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20。
在一实施方案中,部分A选自实施例6的表6中所列的化合物。
一方面,本发明涉及通式(A)k-L-Q的化合物或其盐、对映异构体、立体异构体、多晶型物或N-氧化物,其中:
A是与E3泛素连接酶结合的化合物,并且具有选自式I、式II、式III、式IV、式V、式VI、式VII、式VIII、式IX和式X的结构;
Q是与靶蛋白结合的部分,所述靶蛋白与所述E3泛素连接酶螯合和/或在与所述E3泛素连接酶相互作用后降解;
L是接头;
每个A在化合价允许的情况下与所述L共价连接;
R1是芳基、-N(R5)-X-R6、-SO2R5或-O(CH2)mR5,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R2是芳基、-NH-(C3-C10)杂芳基或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R3是氰基、芳基、-NH-(C3-C10)杂芳基、(C3-C10)杂环或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R4是卤代基、氰基、芳基、OR5或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R5在每次出现时独立地为H、(C1-C3)烷基、(C3-C10)杂环、(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)杂环、-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基、芳基或杂芳基,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R6在每次出现时独立地为OH、(C1-C3)烷基、-(C1-C3)烷氧基、(C3-C10)杂环、(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)杂环、-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基、芳基、杂芳基,或者R5和R6与它们所连接的原子合起来形成含氮的(C3-C10)杂环,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R7是H、(C1-C3)烷基,或者R7和R26与它们所连接的碳合起来形成碳碳双键;
R8、R9、R10、R11各自独立地为H、卤代基、OH、氰基、(C1-C3)烷基、(C1-C3)烷氧基、芳基或杂芳基,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R12、R13、R14、R15各自独立地为H、NH2、(C1-C3)烷基、-N(R5)-(CH2)m-N(R5)-X-R6,附带条件为R12、R13、R14和R15中不超过三个取代基是H,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R16是NH2或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R17是氰基、杂芳基、-(CH2)m-C(O)O-R6或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R18、R19、R20、R21各自独立地为H、卤代基、(C1-C3)烷基、(C1-C3)烷氧基或-N(R5)-X-R6,附带条件为R18、R19、R20、R21中不超过两个取代基是H;或者
R18、R19与它们所连接的碳合起来形成(C3-C10)环烷基或(C3-C10)杂环,或者R19、R20与它们所连接的碳合起来形成(C3-C10)环烷基或(C3-C10)杂环,或者R20、R21与它们所连接的碳合起来形成(C3-C10)环烷基或(C3-C10)杂环,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R25是芳基、杂芳基或(C3-C10)杂环,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
Rw在每次出现时独立地为H、卤代基、氰基、硝基、氧代、烷基、卤代烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、杂环、芳基、杂芳基、芳基烷基、杂芳基烷基、环烷基烷基、杂环烷基,其中所述烷基、卤代烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、杂环、芳基、杂芳基、芳基烷基、杂芳基烷基、环烷基烷基和杂环烷基可进一步独立地被一个或多个选自卤代基、氰基、氧代(C3-C10)杂环、(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)杂环、-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基、芳基和杂芳基的基团取代;
X是键、-SO2-、-(CH2)nC(O)(CH2)m-、-C(O)NH-、-C(O)N(Rw)-、-NHC(O)NH-或-(CH2)n-;
Y1是-NHR25、-NHC(O)R25或-CHR25R26;
m是0、1、2、3或4;
k是1、2、3、4、5、6、7、8、9或10;
n是0、1、2、3或4。
在一实施方案中,L是-Lb-(La)t-;其中La在每次出现时独立地选自键、CR5R6、C(R5R6)O、C(R5R6)C(R5R6)O、SO2、NR5、C(R5R6)NR5、SO2NR5、SONR5、CONR5、NR5CONR6、NR5SO2NR6、CO、CR5=CR6、C≡C、SiR5R6、P(O)R5、P(O)OR5、NR5C(=NCN)NR6、NR5C(=NCN)和NR5C(=CNO2)NR6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
Lb选自:
t是0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20。
在一实施方案中,L是-(CH2CH2)t-、-(CH2O)t-或-(CH2CH2O)t-。
在一实施方案中,A是式XI的部分
或其药学上可接受的盐,其中:
R22是H、卤代基、OH、-NR5R5、(C1-C3)烷基、(C1-C3)烷氧基、(羟基)(C1-C3)烷基、氰基、-N(R5)-X-R6、-N(R5)-(CH2)m-N(R5)-X-R6、芳基或杂芳基,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R23是H、卤代基、OH、-NR5R5、-(CH2)n-NR5R5、(C1-C3)烷基、(C1-C3)烷氧基、-C(O)NR5R6、(羟基)(C1-C3)烷基、氰基、-N(R5)-X-R6、-N(R5)-(CHR5)m-X-R6、-N(R5)-(CH2)m-N(R5)-X-R6、芳基、杂芳基,或者R22和R23与它们所连接的碳合起来形成(C3-C10)环烷基环或(C3-C10)杂环,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R24是H、卤代基、OH、-NR5R5、-(CH2)n-NR5R5、(C1-C3)烷基、(C1-C3)烷氧基、(卤代基)(C1-C3)烷基、(羟基)(C1-C3)烷基、氰基、-NO2、-N(R5)-X-R6、-N(R5)-(CH2)m-N(R5)-X-R6、芳基、杂芳基,或者R23和R24与它们所连接的碳合起来形成(C3-C10)环烷基环或(C3-C10)杂环,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R5在每次出现时独立地为H、(C1-C3)烷基、(C3-C10)杂环、(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)杂环、-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基、芳基或杂芳基,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R6在每次出现时独立地为OH、(C1-C3)烷基、-(C1-C3)烷氧基、(C3-C10)杂环、(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)杂环、-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基、芳基、杂芳基,或者R5和R6与它们所连接的原子合起来形成含氮的(C3-C10)杂环,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
Rw在每次出现时独立地为H、卤代基、氰基、硝基、氧代、烷基、卤代烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、杂环、芳基、杂芳基、芳基烷基、杂芳基烷基、环烷基烷基、杂环烷基,其中所述烷基、卤代烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、杂环、芳基、杂芳基、芳基烷基、杂芳基烷基、环烷基烷基和杂环烷基可进一步独立地被一个或多个选自卤代基、氰基、氧代(C3-C10)杂环、(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)杂环、-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基、芳基和杂芳基的基团取代;
X是键、-SO2-、-(CH2)nC(O)(CH2)m-、-C(O)NH-、-C(O)N(Rw)-、-NHC(O)NH-或-(CH2)n-;
m是0、1、2、3或4;
n是0、1、2、3或4。
在一实施方案中,R22是H;R23是H;R24是卤代基。
在一实施方案中,A是式XII、XIII、XIV、XV、XVI、XVII或XVIII的部分,
或其药学上可接受的盐,其中:
R28、R29、R30、R31独立地为H、卤代基、OH、-NR5R5、-(CH2)n-NR5R5、(C1-C3)烷基、(C1-C3)烷氧基、(卤代基)(C1-C3)烷基、(羟基)(C1-C3)烷基、氰基、-NO2、-N(R5)-X-R6、-N(R5)-(CH2)m-N(R5)-X-R6、芳基、杂芳基,或者R28、R29与它们所连接的碳合起来形成(C3-C10)环烷基或(C3-C10)杂环,或者R30、R31与它们所连接的碳合起来形成(C3-C10)环烷基或(C3-C10)杂环,或者R29、R30合起来形成键,或者R29、R30与它们所连接的碳合起来形成(C3-C10)环烷基或(C3-C10)杂环或芳基或杂芳基,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R5在每次出现时独立地为H、(C1-C3)烷基、(C3-C10)杂环、(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)杂环、-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基、芳基或杂芳基,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R6在每次出现时独立地为OH、(C1-C3)烷基、-(C1-C3)烷氧基、(C3-C10)杂环、(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)杂环、-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基、芳基、杂芳基,或者R5和R6与它们所连接的原子合起来形成含氮的(C3-C10)杂环,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
Rw在每次出现时独立地为H、卤代基、氰基、硝基、氧代、烷基、卤代烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、杂环、芳基、杂芳基、芳基烷基、杂芳基烷基、环烷基烷基、杂环烷基,其中所述烷基、卤代烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、杂环、芳基、杂芳基、芳基烷基、杂芳基烷基、环烷基烷基和杂环烷基可进一步独立地被一个或多个选自卤代基、氰基、氧代(C3-C10)杂环、(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)杂环、-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基、芳基和杂芳基的基团取代;
X是键、-SO2-、-(CH2)nC(O)(CH2)m-、-C(O)NH-、-C(O)N(Rw)-、-NHC(O)NH-或-(CH2)n-;
m是0、1、2、3或4;
n是0、1、2、3或4。
接头L1和L
接头L1和L各自独立地与E3泛素连接酶结合部分A共价结合。接头L也独立地与靶蛋白结合部分Q共价结合。连接的共价键优选是通过酰胺、酯、硫酯、酮基团、氨基甲酸酯(尿烷)、碳或醚,这些基团中的每一者在化合价允许的情况下可插在A部分或Q部分上的任何位置,包括A部分或Q部分中的任何取代基或官能团。在某些优选方面,接头可任选被(C1-C6)烷基、(C1-C6)亚烷基、(C1-C6)炔烃、芳基、杂芳基、(C3-C8)环烷基或(C3-C8)杂环取代。在一实施方案中,接头L1或L经由如上所定义的R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R9、R10、R11、R12、R13、R14、R15、R16、R17、R18、R19、R20、R21、R22、R23、R24、R25、R26、R27、R28、R29、R30或R31与A部分连接。
在一实施方案中,L1是-Lb-(La)t-H,其中H是氢。
在一实施方案中,L是-Lb-(La)t-。
在一实施方案中,t是0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20。
在一实施方案中,La选自
Lb选自:
t是0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20。
A-L1的实施方案
在一实施方案中,具有通式A-L1的化合物选自表1中所列的化合物。
表1:通式A-L1的实施方案
(A)k-L-Q的实施方案
在一实施方案中,具有通式(A)k-L-Q的化合物选自表2、表3或表4中所列的化合物。
表2:具有L-Q部分的通式(A)k-L-Q的实施方案。
表3:具有Q部分的通式(A)k-L-Q的实施方案。
表4:通式A-Lb-La-Q的实施方案
在一些实施方案中,本发明的化合物具有通式A-Lb-La-Q,其中部分A、Lb和La-Q独立地选自表4。表4中所列的A、Lb和La-Q的任意组合预期为本发明的化合物。Lb在化合价允许的情况下与部分A经由共价键在A的任何位置处连接。为清楚起见,La1.0-6包括七个La1部分,其中T分别为0、1、2、3、4、5或6。同样地,La2.0-5包括六个La2部分,其中T分别为0、1、2、3、4或5;Lb6.1-3包括三个Lb6部分,分别具有1、2或3个亚甲基链;Lb7.0-5包括六个Lb7部分,分别具有0、1、2、3、4或5个亚甲基链;Lb8.1-4包括四个Lb8部分,分别具有1、2、3或4个亚甲基链。R32、R33、R34、R35、R36、R37、R38、R39、R40、R41、R42、R43、R44、R45、R46、R47、R48、R49、R50、R51、R52、R53、R54、R55、R56、R57、R58、R59、R60、R61、R62、R63、R64、R65、R66、R67、R68、R69、R70、R71、R72、R73、R74、R75、R76、R77、R78、R79、R80、R81、R82、R83、R84、R85、R86、R87、R88、R89、R90、R91、R92、R93、R94、R95、R96、R97、R98、R99、R100、R101、R102、R103、R104和R105各自独立地选自H、卤代、氰基、硝基、氧代、烷基、卤代烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、杂环、芳基、杂芳基、芳基烷基、杂芳基烷基、环烷基烷基和杂环烷基,其中所述烷基、卤代烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、杂环、芳基、杂芳基、芳基烷基、杂芳基烷基、环烷基烷基和杂环烷基可进一步独立地被一个或多个选自卤代、氰基、氧代(C3-C10)杂环、(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)杂环、-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基、芳基和杂芳基的基团取代。在一实施方案中,Lb与A部分经由R32、R33、R34、R35、R36、R37、R38、R39、R40、R41、R42、R43、R44、R45、R46、R47、R48、R49、R50、R51、R52、R53、R54、R55、R56、R57、R58、R59、R60、R61、R62、R63、R64、R65、R66、R67、R68、R69、R70、R71、R72、R73、R74、R75、R76、R77、R78、R79、R80、R81、R82、R83、R84、R85、R86、R87、R88、R89、R90、R91、R92、R93、R94、R95、R96、R97、R98、R99、R100、R101、R102、R103、R104或R105共价连接。
在一实施方案中,所述化合物具有4.001-Lb1-La1.0-6、4.001-Lb1-La2.0-5、4.002-Lb1-La1.0-6、4.002-Lb1-La2.0-5、4.003-Lb1-La1.0-6、4.003-Lb1-La2.0-5、4.004-Lb1-La1.0-6、4.004-Lb1-La2.0-5、4.005-Lb1-La1.0-6、4.005-Lb1-La2.0-5、4.006-Lb1-La1.0-6、4.006-Lb1-La2.0-5、4.007-Lb1-La1.0-6、4.007-Lb1-La2.0-5、4.008-Lb1-La1.0-6、4.008-Lb1-La2.0-5、4.009-Lb1-La1.0-6、4.009-Lb1-La2.0-5、4.010-Lb1-La1.0-6、4.010-Lb1-La2.0-5、4.011-Lb1-La1.0-6、4.011-Lb1-La2.0-5或4.012-Lb1-La2.0-5的结构。
在一实施方案中,所述化合物具有4.001-Lb2-La1.0-6、4.001-Lb2-La2.0-5、4.002-Lb2-La1.0-6、4.002-Lb2-La2.0-5、4.003-Lb2-La1.0-6、4.003-Lb2-La2.0-5、4.004-Lb2-La1.0-6、4.004-Lb2-La2.0-5、4.005-Lb2-La1.0-6、4.005-Lb2-La2.0-5、4.006-Lb2-La1.0-6、4.006-Lb2-La2.0-5、4.007-Lb2-La1.0-6、4.007-Lb2-La2.0-5、4.008-Lb2-La1.0-6、4.008-Lb2-La2.0-5、4.009-Lb2-La1.0-6、4.009-Lb2-La2.0-5、4.010-Lb2-La1.0-6、4.010-Lb2-La2.0-5、4.011-Lb2-La1.0-6、4.011-Lb2-La2.0-5或4.012-Lb2-La2.0-5的结构。
在一实施方案中,所述化合物具有4.001-Lb3-La1.0-6、4.001-Lb3-La2.0-5、4.002-Lb3-La1.0-6、4.002-Lb3-La2.0-5、4.003-Lb3-La1.0-6、4.003-Lb3-La2.0-5、4.004-Lb3-La1.0-6、4.004-Lb3-La2.0-5、4.005-Lb3-La1.0-6、4.005-Lb3-La2.0-5、4.006-Lb3-La1.0-6、4.006-Lb3-La2.0-5、4.007-Lb3-La1.0-6、4.007-Lb3-La2.0-5、4.008-Lb3-La1.0-6、4.008-Lb3-La2.0-5、4.009-Lb3-La1.0-6、4.009-Lb3-La2.0-5、4.010-Lb3-La1.0-6、4.010-Lb3-La2.0-5、4.011-Lb3-La1.0-6、4.011-Lb3-La2.0-5或4.012-Lb3-La2.0-5的结构。
在一实施方案中,所述化合物具有4.001-Lb4-La1.0-6、4.001-Lb4-La2.0-5、4.002-Lb4-La1.0-6、4.002-Lb4-La2.0-5、4.003-Lb4-La1.0-6、4.003-Lb4-La2.0-5、4.004-Lb4-La1.0-6、4.004-Lb4-La2.0-5、4.005-Lb4-La1.0-6、4.005-Lb4-La2.0-5、4.006-Lb4-La1.0-6、4.006-Lb4-La2.0-5、4.007-Lb4-La1.0-6、4.007-Lb4-La2.0-5、4.008-Lb4-La1.0-6、4.008-Lb4-La2.0-5、4.009-Lb4-La1.0-6、4.009-Lb4-La2.0-5、4.010-Lb4-La1.0-6、4.010-Lb4-La2.0-5、4.011-Lb4-La1.0-6、4.011-Lb4-La2.0-5或4.012-Lb4-La2.0-5的结构。
在一实施方案中,所述化合物具有4.001-Lb5-La1.0-6、4.001-Lb5-La2.0-5、4.002-Lb5-La1.0-6、4.002-Lb5-La2.0-5、4.003-Lb5-La1.0-6、4.003-Lb5-La2.0-5、4.004-Lb5-La1.0-6、4.004-Lb5-La2.0-5、4.005-Lb5-La1.0-6、4.005-Lb5-La2.0-5、4.006-Lb5-La1.0-6、4.006-Lb5-La2.0-5、4.007-Lb5-La1.0-6、4.007-Lb5-La2.0-5、4.008-Lb5-La1.0-6、4.008-Lb5-La2.0-5、4.009-Lb5-La1.0-6、4.009-Lb5-La2.0-5、4.010-Lb5-La1.0-6、4.010-Lb5-La2.0-5、4.011-Lb5-La1.0-6、4.011-Lb5-La2.0-5或4.012-Lb5-La2.0-5的结构。
在一实施方案中,所述化合物具有4.001-Lb6-La1.0-6、4.001-Lb6-La2.0-5、4.002-Lb6-La1.0-6、4.002-Lb6-La2.0-5、4.003-Lb6-La1.0-6、4.003-Lb6-La2.0-5、4.004-Lb6-La1.0-6、4.004-Lb6-La2.0-5、4.005-Lb6-La1.0-6、4.005-Lb6-La2.0-5、4.006-Lb6-La1.0-6、4.006-Lb6-La2.0-5、4.007-Lb6-La1.0-6、4.007-Lb6-La2.0-5、4.008-Lb6-La1.0-6、4.008-Lb6-La2.0-5、4.009-Lb6-La1.0-6、4.009-Lb6-La2.0-5、4.010-Lb6-La1.0-6、4.010-Lb6-La2.0-5、4.011-Lb6-La1.0-6、4.011-Lb6-La2.0-5或4.012-Lb6-La2.0-5的结构。
在一实施方案中,所述化合物具有4.001-Lb7-La1.0-6、4.001-Lb7-La2.0-5、4.002-Lb7-La1.0-6、4.002-Lb7-La2.0-5、4.003-Lb7-La1.0-6、4.003-Lb7-La2.0-5、4.004-Lb7-La1.0-6、4.004-Lb7-La2.0-5、4.005-Lb7-La1.0-6、4.005-Lb7-La2.0-5、4.006-Lb7-La1.0-6、4.006-Lb7-La2.0-5、4.007-Lb7-La1.0-6、4.007-Lb7-La2.0-5、4.008-Lb7-La1.0-6、4.008-Lb7-La2.0-5、4.009-Lb7-La1.0-6、4.009-Lb7-La2.0-5、4.010-Lb7-La1.0-6、4.010-Lb7-La2.0-5、4.011-Lb7-La1.0-6、4.011-Lb7-La2.0-5或4.012-Lb7-La2.0-5的结构。
在一实施方案中,所述化合物具有4.001-Lb8-La1.0-6、4.001-Lb8-La2.0-5、4.002-Lb8-La1.0-6、4.002-Lb8-La2.0-5、4.003-Lb8-La1.0-6、4.003-Lb8-La2.0-5、4.004-Lb8-La1.0-6、4.004-Lb8-La2.0-5、4.005-Lb8-La1.0-6、4.005-Lb8-La2.0-5、4.006-Lb8-La1.0-6、4.006-Lb8-La2.0-5、4.007-Lb8-La1.0-6、4.007-Lb8-La2.0-5、4.008-Lb8-La1.0-6、4.008-Lb8-La2.0-5、4.009-Lb8-La1.0-6、4.009-Lb8-La2.0-5、4.010-Lb8-La1.0-6、4.010-Lb8-La2.0-5、4.011-Lb8-La1.0-6、4.011-Lb8-La2.0-5或4.012-Lb8-La2.0-5的结构。
在一实施方案中,所述化合物具有4.001-Lb9-La1.0-6、4.001-Lb9-La2.0-5、4.002-Lb9-La1.0-6、4.002-Lb9-La2.0-5、4.003-Lb9-La1.0-6、4.003-Lb9-La2.0-5、4.004-Lb9-La1.0-6、4.004-Lb9-La2.0-5、4.005-Lb9-La1.0-6、4.005-Lb9-La2.0-5、4.006-Lb9-La1.0-6、4.006-Lb9-La2.0-5、4.007-Lb9-La1.0-6、4.007-Lb9-La2.0-5、4.008-Lb9-La1.0-6、4.008-Lb9-La2.0-5、4.009-Lb9-La1.0-6、4.009-Lb9-La2.0-5、4.010-Lb9-La1.0-6、4.010-Lb9-La2.0-5、4.011-Lb9-La1.0-6、4.011-Lb9-La2.0-5或4.012-Lb9-La2.0-5的结构。
在一实施方案中,所述化合物具有4.001-Lb10-La1.0-6、4.001-Lb10-La2.0-5、4.002-Lb10-La1.0-6、4.002-Lb10-La2.0-5、4.003-Lb10-La1.0-6、4.003-Lb10-La2.0-5、4.004-Lb10-La1.0-6、4.004-Lb10-La2.0-5、4.005-Lb10-La1.0-6、4.005-Lb10-La2.0-5、4.006-Lb10-La1.0-6、4.006-Lb10-La2.0-5、4.007-Lb10-La1.0-6、4.007-Lb10-La2.0-5、4.008-Lb10-La1.0-6、4.008-Lb10-La2.0-5、4.009-Lb10-La1.0-6、4.009-Lb10-La2.0-5、4.010-Lb10-La1.0-6、4.010-Lb10-La2.0-5、4.011-Lb10-La1.0-6、4.011-Lb10-La2.0-5或4.012-Lb10-La2.0-5的结构。
在一实施方案中,所述化合物具有4.001-Lb11-La1.0-6、4.001-Lb11-La2.0-5、4.002-Lb11-La1.0-6、4.002-Lb11-La2.0-5、4.003-Lb11-La1.0-6、4.003-Lb11-La2.0-5、4.004-Lb11-La1.0-6、4.004-Lb11-La2.0-5、4.005-Lb11-La1.0-6、4.005-Lb11-La2.0-5、4.006-Lb11-La1.0-6、4.006-Lb11-La2.0-5、4.007-Lb11-La1.0-6、4.007-Lb11-La2.0-5、4.008-Lb11-La1.0-6、4.008-Lb11-La2.0-5、4.009-Lb11-La1.0-6、4.009-Lb11-La2.0-5、4.010-Lb11-La1.0-6、4.010-Lb11-La2.0-5、4.011-Lb11-La1.0-6、4.011-Lb11-La2.0-5或4.012-Lb11-La2.0-5的结构。
在一实施方案中,所述化合物具有4.001-Lb12-La1.0-6、4.001-Lb12-La2.0-5、4.002-Lb12-La1.0-6、4.002-Lb12-La2.0-5、4.003-Lb12-La1.0-6、4.003-Lb12-La2.0-5、4.004-Lb12-La1.0-6、4.004-Lb12-La2.0-5、4.005-Lb12-La1.0-6、4.005-Lb12-La2.0-5、4.006-Lb12-La1.0-6、4.006-Lb12-La2.0-5、4.007-Lb12-La1.0-6、4.007-Lb12-La2.0-5、4.008-Lb12-La1.0-6、4.008-Lb12-La2.0-5、4.009-Lb12-La1.0-6、4.009-Lb12-La2.0-5、4.010-Lb12-La1.0-6、4.010-Lb12-La2.0-5、4.011-Lb12-La1.0-6、4.011-Lb12-La2.0-5或4.012-Lb12-La2.0-5的结构。
在一实施方案中,所述化合物具有4.001-Lb13-La1.0-6、4.001-Lb13-La2.0-5、4.002-Lb13-La1.0-6、4.002-Lb13-La2.0-5、4.003-Lb13-La1.0-6、4.003-Lb13-La2.0-5、4.004-Lb13-La1.0-6、4.004-Lb13-La2.0-5、4.005-Lb13-La1.0-6、4.005-Lb13-La2.0-5、4.006-Lb13-La1.0-6、4.006-Lb13-La2.0-5、4.007-Lb13-La1.0-6、4.007-Lb13-La2.0-5、4.008-Lb13-La1.0-6、4.008-Lb13-La2.0-5、4.009-Lb13-La1.0-6、4.009-Lb13-La2.0-5、4.010-Lb13-La1.0-6、4.010-Lb13-La2.0-5、4.011-Lb13-La1.0-6、4.011-Lb13-La2.0-5或4.012-Lb13-La2.0-5的结构。
在一实施方案中,所述化合物具有4.001-Lb14-La1.0-6、4.001-Lb14-La2.0-5、4.002-Lb14-La1.0-6、4.002-Lb14-La2.0-5、4.003-Lb14-La1.0-6、4.003-Lb14-La2.0-5、4.004-Lb14-La1.0-6、4.004-Lb14-La2.0-5、4.005-Lb14-La1.0-6、4.005-Lb14-La2.0-5、4.006-Lb14-La1.0-6、4.006-Lb14-La2.0-5、4.007-Lb14-La1.0-6、4.007-Lb14-La2.0-5、4.008-Lb14-La1.0-6、4.008-Lb14-La2.0-5、4.009-Lb14-La1.0-6、4.009-Lb14-La2.0-5、4.010-Lb14-La1.0-6、4.010-Lb14-La2.0-5、4.011-Lb14-La1.0-6、4.011-Lb14-La2.0-5或4.012-Lb14-La2.0-5的结构。
在一实施方案中,部分A选自实施例6的表6中所列的化合物。
一方面,部分A选自:
3-[1-氧代-5-(喹唑啉-4-基氨基)异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
3-[5-[(4-氨基噻吩并[2,3-d]嘧啶-2-基)氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
N-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-1-氧代-异吲哚啉-5-基]乙酰胺;
3-[5-[(2-氨基嘧啶-4-基)氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
6-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-1-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]哒嗪-3-甲腈;
3-[[2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-1-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]乙酰基]氨基]苯甲酰胺;
2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-1-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]乙酸;
N-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]喹啉-2-甲酰胺;
3-[6-[[2-(2-甲基-1-哌啶基)-2-氧代-乙基]氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
3-[6-[(2-异吲哚啉-2-基-2-氧代-乙基)氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
N-(环丙基甲基)-2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]-N-甲基-乙酰胺;
乙酸;3-[1-氧代-6-(喹唑啉-4-基氨基)异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
3-[6-[[2-(3-甲基-1-哌啶基)-2-氧代-乙基]氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
3-[6-[(4-甲基-3-氧代-吡嗪-2-基)氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
3-[1-氧代-6-(喹喔啉-2-基氨基)异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
3-[6-[(1-甲基吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-基)氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
3-[6-(5,7-二氢呋喃并[3,4-d]嘧啶-2-基氨基)-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
3-[6-[(6-甲基嘧啶-4-基)氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]-N-苯基-乙酰胺;
3-[6-[[2-(2,4-二甲基哌嗪-1-基)-2-氧代-乙基]氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
3-[6-(二甲基氨基)-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
3-(1-氧代-6-苯基-异吲哚啉-2-基)哌啶-2,6-二酮;
2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]-N,N-二甲基-乙酰胺;
3-[6-[[2-(2-甲基吗啉-4-基)-2-氧代-乙基]氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]-N-甲基-N-[(1-甲基吡唑-4-基)甲基]乙酰胺;
N-苄基-2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]乙酰胺;
6-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]哒嗪-3-甲腈;
3-[6-[(6-甲基吡咯并[3,2-d]嘧啶-4-基)氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
2-(二甲基氨基)-N-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]乙酰胺;
N-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-甲酰胺;
N-环丙基-2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]乙酰胺;
3-[1-氧代-6-(2-氧代咪唑烷-1-基)异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-甲腈;
2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]丙酸;
2-乙酰氨基-N-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]乙酰胺;
2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]乙酰胺;
3-[6-[[2-(3-甲基-5-氧代-哌嗪-1-基)-2-氧代-乙基]氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
N-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]乙酰胺;
3-[6-[[2-(4-甲基-3-氧代-哌嗪-1-基)-2-氧代-乙基]氨基]-1-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
N-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]-3H-咪唑并[4,5-b]吡啶-6-甲酰胺;
2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]-N-四氢吡喃-4-基-乙酰胺;
2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-5-基]氨基]乙酸;
3-[1-氧代-6-[[2-氧代-2-(1-哌啶基)乙基]氨基]异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
3-(1-氧代-7-苯基-异吲哚啉-2-基)哌啶-2,6-二酮;
2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-4-甲腈;
2-[[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-4-基]氨基]乙酸;
3-(7-氟-1-氧代-异吲哚啉-2-基)哌啶-2,6-二酮;
3-(5-氨基-1-氧代-3,4-二氢异喹啉-2-基)哌啶-2,6-二酮;
2-[2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-1-基]乙酸叔丁酯;
3-[1-(2H-吲哚-3-基)-3-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
2-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-3-氧代-异吲哚啉-1-甲腈;
3-[1-(二甲基氨基)-3-氧代-异吲哚啉-2-基]哌啶-2,6-二酮;
3-(2-氧代吡咯烷-1-基)哌啶-2,6-二酮;
3-(喹唑啉-2-基氨基)哌啶-2,6-二酮;
(3Z)-3-亚苄基哌啶-2,6-二酮;
3-(喹喔啉-2-基氨基)哌啶-2,6-二酮;
3-(嘧啶-2-基氨基)哌啶-2,6-二酮;
N-(2,6-二氧代-3-哌啶基)-2-氧代-3H-吡啶-6-甲酰胺;
3-(4-甲基-1,1,3-三氧代-1,2-苯并噻唑-2-基)哌啶-2,6-二酮;
3-(8-氨基-4-氧代-1,2,3-苯并三嗪-3-基)哌啶-2,6-二酮;
3-(5-氨基-4-氧代-1,2,3-苯并三嗪-3-基)哌啶-2,6-二酮;
3-(4-氧代-1,2,3-苯并三嗪-3-基)哌啶-2,6-二酮;
3-(5-甲基-4-氧代-1,2,3-苯并三嗪-3-基)哌啶-2,6-二酮;
3-(6-甲基-4-氧代-1,2,3-苯并三嗪-3-基)哌啶-2,6-二酮;和
3-(8-甲基-4-氧代-1,2,3-苯并三嗪-3-基)哌啶-2,6-二酮。
靶蛋白结合部分Q
要被部分Q结合的靶蛋白种类众多,并且选自在细胞中表达的蛋白质,使得至少一部分序列见于所述细胞中。术语“蛋白质”包括长度足以与根据本发明的Q部分结合的寡肽和多肽序列。如本文另外描述的那样,真核系统或微生物系统(包括病毒、细菌或真菌)中的任何蛋白质均为由根据本发明的化合物介导的泛素化的靶标。优选地,靶蛋白是真核蛋白。
根据本发明的Q部分包括例如,包括与蛋白质特异性结合(与靶蛋白结合)的任何部分,并且包括小分子靶蛋白部分的以下非限制性实例:Hsp90抑制剂、激酶抑制剂、HDM2和MDM2抑制剂、靶向人BET含布罗莫结构域蛋白的化合物、HDAC抑制剂、人赖氨酸甲基转移酶抑制剂、血管生成抑制剂、核激素受体化合物、免疫抑制化合物和靶向芳烃受体(AHR)的化合物等等。下面举例说明这些类型的小分子靶蛋白结合部分的一些成员。这类小分子靶蛋白结合部分还包括其药学上可接受的盐、对映异构体、溶剂合物和多晶型物。这些结合部分通过接头与泛素连接酶结合部分连接,以便在泛素连接酶附近呈递靶蛋白(蛋白质靶标部分与之结合)用于泛素化和降解。在一实施方案中,所述泛素连接酶是塞勒布隆。
能与部分Q结合并作用于泛素连接酶或被泛素连接酶降解的任何蛋白质均为根据本发明的靶蛋白。一般来说,靶蛋白可包括例如结构蛋白、受体、酶、细胞表面蛋白;与细胞的整合功能相关的蛋白,包括参与催化活性、芳香酶活性、运动活性、解旋酶活性、代谢过程(合成代谢和分解代谢)、抗氧化活性、蛋白水解、生物合成的蛋白质;具有激酶活性、氧化还原酶活性、转移酶活性、水解酶活性、裂解酶活性、异构酶活性、连接酶活性、酶调节剂活性、信号转导活性、结构分子活性、结合活性(蛋白质、脂质碳水化合物)、受体活性、细胞运动性、膜融合、细胞通讯、生物过程的调节、发育、细胞分化、对刺激的反应的蛋白质;行为蛋白、细胞粘附蛋白、参与细胞死亡的蛋白质、参与转运的蛋白质(包括蛋白质转运蛋白活性、核转运、离子转运蛋白活性、通道转运蛋白活性、载体活性、通透酶活性、分泌活性、电子转运蛋白活性、发病机制、伴侣蛋白调节活性、核酸结合活性、转录调节活性、细胞外组织和生物发生活性、翻译调节活性。所关注的蛋白质可包括来自真核生物和原核生物的蛋白质,这些生物包括作为药物治疗的靶标的人、其它动物(包括驯养动物)、用于测定抗生素及其它抗微生物剂的靶标的微生物,以及植物和甚至病毒等许多。
在一实施方案中,所述靶蛋白选自B7.1和B7、TINFR1m、TNFR2、NADPH氧化酶、Bc1、C5a受体、HMG-CoA还原酶、PDE V磷酸二酯酶类型、PDE IV磷酸二酯酶类型4、PDE I、PDEII、PDEIII、角鲨烯-藿烯环化酶、CXCR1、CXCR2、一氧化氮(NO)合酶、环加氧酶1、环加氧酶2、5HT受体、多巴胺受体、G蛋白、Gq、组胺受体、5-脂加氧酶、胰蛋白酶丝氨酸蛋白酶、胸苷酸合酶、嘌呤核苷磷酸化酶、锥虫GAPDH、糖原磷酸化酶、碳酸酐酶、趋化因子受体、JAW/STAT、类视黄醇X受体、HIV 1蛋白酶、HIV 1整合酶、流感、神经氨酸酶、乙型肝炎逆转录酶、钠通道、蛋白P-糖蛋白(和MRP)、酪氨酸激酶、CD23、CD124、酪氨酸激酶p56 lck、CD4、CD5、IL-2受体、IL-1受体、TNF-α、ICAM1、Cat+通道、VCAM、VLA-4整联蛋白、选择素、CD40/CD40L、newokinin及受体、肌苷一磷酸脱氢酶、p38MAP激酶、Ras/Raf/ME/ERK途径、白介素-1转化酶、半胱天冬酶、HCV、NS3蛋白酶、HCV NS3 RNA解旋酶、甘氨酰胺核糖核苷酸甲酰基转移酶、鼻病毒3C蛋白酶、单纯疱疹病毒-1(HSV-I)蛋白酶、巨细胞病毒(CMV)蛋白酶、聚(ADP-核糖)聚合酶、细胞周期蛋白依赖性激酶、血管内皮生长因子、c-Kit、TGFβ激活激酶1、雷帕霉素的哺乳动物靶标、SHP2、雄激素受体、催产素受体、微粒体转移蛋白抑制剂、5α还原酶、血管紧张素II、甘氨酸受体、去甲肾上腺素再摄取受体、雌激素受体、雌激素相关受体、粘着斑激酶、Src、内皮素受体、神经肽Y及受体、腺苷受体、腺苷激酶和AMP脱氨酶、嘌呤能受体(P2Y1、P2Y2、P2Y4、P2Y6、P2X1-7)、法尼基转移酶、香叶基香叶基转移酶、NGF的TrkA a受体、β-淀粉样蛋白、酪氨酸激酶F1k-1、玻连蛋白受体、整联蛋白受体、Her-2/neu、端粒酶、胞质磷脂酶A2和EGF受体酪氨酸激酶、蜕皮素20-单加氧酶、GABA门控氯离子通道的离子通道、乙酰胆碱酯酶、电压敏感性钠通道蛋白、钙通道蛋白和氯离子通道蛋白、乙酰基-CoA羧化酶、腺苷酸琥珀酸合成酶、原卟啉原氧化酶和烯醇式丙酮酰莽草酸-磷酸合酶。
在一实施方案中,Q是为Hsp90抑制剂、激酶抑制剂、磷酸酶抑制剂、HDM2/MDM2抑制剂、人BET布罗莫结构域抑制剂、HDAC抑制剂、人赖氨酸甲基转移酶抑制剂、RAF受体抑制剂、FKBP抑制剂、血管生成抑制剂、芳烃受体抑制剂、雄激素受体抑制剂、雌激素受体抑制剂、甲状腺激素受体抑制剂、HIV蛋白酶抑制剂、HIV整合酶抑制剂、酰基蛋白硫酯酶1抑制剂或酰基蛋白硫酯酶2抑制剂的部分。
在一实施方案中,Q是为TANK-结合激酶1(TBK1)抑制剂、雌激素受体α(ERα)抑制剂、含布罗莫结构域的蛋白4(BRD4)抑制剂、雄激素受体(AR)抑制剂、血小板源性生长因子受体抑制剂、p38MAPK抑制剂、Bcr-Ab1酪氨酸-激酶抑制剂、Her2抑制剂、EGFR抑制剂、MDM2抑制剂、含布罗莫结构域的蛋白2(BRD2)抑制剂、HDAC抑制剂、DHFR抑制剂或c-Myc抑制剂的部分。
在一实施方案中,Q是选自甲氧苄啶、伏立诺他、他莫昔芬、JQ1、Nutlin 3、阿法替尼、氯烷烃、达沙替尼、BIRB796、FK-506、辛伐他汀、雷帕霉素和索拉非尼的部分。
在一实施方案中,Q是与靶蛋白结合的部分。这类靶蛋白可以被E3泛素连接酶降解或螯合,其中所述E3泛素连接酶选自塞勒布隆(CRBN)、受损DNA结合蛋白1(DDB1)、Cullin-4A(CUL4A)、cullins 1的调节剂(ROCl)和Von Hippel Lindau(VHL)。
在一实施方案中,所述E3泛素连接酶是CRBN。
在一实施方案中,本文所述的具有通式(A)k-L1或(A)k-L-Q的化合物能够同时与靶蛋白和E3泛素连接酶结合。在一实施方案中,所述结合导致靶蛋白被E3泛素连接酶泛素化。在一实施方案中,所述结合导致靶蛋白被蛋白酶体降解。
一方面,本发明涉及包含式(A)k-L-Q或(A)k-L1的化合物和药学上可接受的载体、添加剂和/或赋形剂的药物组合物。
一方面,本发明涉及治疗受试者的疾病的方法,所述方法包括施用有效量的具有式(A)k-L-Q或(A)k-L1的化合物。
一方面,本发明涉及治疗受试者的疾病的方法,其中失调的蛋白质活性是造成所述疾病的原因,所述方法包括施用有效量的具有式(A)k-L-Q或(A)k-L1的化合物。
在一实施方案中,所述癌症选自鳞状细胞癌、基底细胞癌、腺癌、肝细胞癌、肾细胞癌、膀胱癌、肠癌、乳腺癌、宫颈癌、结肠癌、食道癌、头癌、肾癌、肝癌、肺癌、颈癌、卵巢癌、胰腺癌、前列腺癌、胃癌、子宫癌、白血病、淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、黑素瘤、骨髓增生性疾病、多发性骨髓瘤、肉瘤(包括尤因氏肉瘤、血管肉瘤、卡波西氏肉瘤、脂肪肉瘤、肌肉瘤、周围神经上皮瘤、滑膜肉瘤)、神经胶质瘤、星形细胞瘤、少突神经胶质瘤、室管膜瘤、胶质母细胞瘤、成神经细胞瘤、神经节瘤、神经节神经胶质瘤、成神经管细胞瘤、松果体细胞肿瘤、脑膜瘤、脑膜肉瘤、神经纤维瘤、神经鞘瘤、睾丸癌、甲状腺癌、星形细胞瘤、霍奇金病、维尔姆斯瘤和畸胎癌。
另一方面,本发明涉及治疗或预防一种或多种自身免疫性疾病或病症的方法,包括对有需要的受试者施用包含药学有效量的本文所述的化合物和药学上可接受的载体的组合物。在一实施方案中,所述自身免疫性疾病或病症选自如多发性硬化症、糖尿病、狼疮、乳糜泻,克罗恩病、溃疡性结肠炎、格林-巴利综合征、硬皮病、古德帕斯丘综合征、韦格纳肉芽肿病、自身免疫性癫痫、拉斯穆森脑炎、原发性胆汁性硬化、硬化性胆管炎、自身免疫性肝炎、阿狄森病、桥本甲状腺炎、纤维肌痛、美尼尔综合征;移植排斥(例如,预防同种异体移植排斥)恶性贫血、类风湿性关节炎、全身性红斑狼疮、皮肌炎、舍格伦综合征、红斑狼疮、多发性硬化症,重症肌无力、赖特综合征、格雷夫斯病及其他自身免疫性疾病或病症
在一实施方案中,所述受试者是人。
另一方面,本发明涉及调节塞勒布隆的方法,包括对有需要的受试者施用包含本文所述的具有通式(A)k-L1或(A)k-L-Q的化合物或其盐、对映异构体、立体异构体、多晶型物或N-氧化物的组合物。
另一方面,本发明涉及调节蛋白质的蛋白酶体降解的方法,包括对有需要的受试者施用包含本文所述的具有通式(A)k-L1或(A)k-L-Q的化合物或其盐、对映异构体、立体异构体、多晶型物或N-氧化物的组合物。
另一方面,本发明涉及调节蛋白质与蛋白酶体的螯合的方法,包括对有需要的受试者施用包含本文所述的具有通式(A)k-L1或(A)k-L-Q的化合物或其盐、对映异构体、立体异构体、多晶型物或N-氧化物的组合物。
实施例
一般合成方案
通常可以从市售的起始物开始,并采用本领域技术人员已知的合成技术来制备本发明的化合物。下面概述了一些适合于制备本发明的化合物的反应方案。进一步的示例见于所提供的具体实施例中。
实施例1:竞争测定
通过测定测试化合物与甲氧苄啶-来那度胺杂合配体竞争与细胞中的CRBN结合的能力,用MAPPIT样测定法评估CRBN结合。例如在Lemmens等人“MAPPIT,a mammalian two-hybrid method for in-cell detection of protein-protein interactions,”MethodsMol Biol.2015;1278:447-55中描述的传统MAPPIT测定法已用于监测蛋白质-蛋白质相互作用。诱饵蛋白(蛋白A)被表达为融合蛋白,其中其与瘦素受体的工程化细胞内受体结构域遗传融合,瘦素受体本身又与促红细胞生成素(Epo)受体的细胞外结构域融合。Epo配体与EpoR组分的结合导致受体相关细胞内JAK2的激活。然而,激活的JAK2不能激活瘦素受体以触发STAT3结合及其磷酸化,因为它的酪氨酸残基通常被激活的JAK2磷酸化而已发生突变。JAK2可磷酸化的STAT3对接位点的重构反而是通过蛋白B与蛋白A的相互作用产生的,由此蛋白B与gp130受体(其现在拥有由激活的JAK2激酶识别的适当酪氨酸残基)的胞质结构域融合。因此,蛋白A与蛋白B的物理相互作用重构,并且Epo触发JAK2-STAT3信号传导途径激活。可通过引入STAT3响应性报告基因来监测STAT3的激活,包括荧光素酶编码基因或编码荧光标记如GFP或一些其他类型的荧光蛋白(EGF等)的基因。以这种方式,MAPPIT测定法提供了评估完整细胞中的这类重组蛋白质-蛋白质相互作用或化合物或杂合配体诱导的蛋白质-蛋白质相互作用的通用测定法。
在此,我们采用类似的MAPPIT样测定法来测定测试化合物与甲氧苄啶-来那度胺诱导的DHFR与CRBN之间的结合竞争的能力。因此,用编码转基因(编码DHFR和CRBN融合蛋白)的适当cDNA转染的HEK293细胞用于产生阳性测定信号,这是由于三元蛋白质/化合物复合物形成,包括DHFR-融合蛋白、甲氧苄啶(TMP)-来那度胺杂合配体(TMP是DHFR的配体)和CRBN-gp130融合蛋白(CRBN结合配体来那度胺)-因此,形成DHFR-TMP-LEN-CRBN复合物。复合物的形成导致STAT响应性荧光素酶报告基因的激活。该信号被设定为100%荧光素酶活性。在单独的样品设置中,以相同的方式准备细胞,但另外与测试化合物共温育,该测试化合物与CRBN的相互作用经过了研究。与CRBN融合蛋白的结合同杂合配体与相同CRBN蛋白的结合竞争,因此由于阻止产生测定信号所需的三元复合物形成而抑制测定信号。评估浓度增加的测试化合物以测定CRBN结合效率,如在活细胞中的这种类型的配体竞争实验中所测定。通过平行实验设置评估信号抑制的特异性,其中评估测试化合物抑制由对照gp130融合蛋白(CTRL)产生的信号的效果,所述对照gp130融合蛋白在不存在杂合配体的情况下与DHFR-融合蛋白直接结合(即蛋白质的直接相互作用)。
更详细地,将HEK293T细胞在补充有10%胎牛血清的杜尔贝科氏改良伊格尔培养基中培养,在37℃、8%CO2下温育。采用标准的转染方法,将细胞用编码与突变瘦素受体(pCLG-eDHFR)的胞质结构域尾部融合的大肠杆菌二氢叶酸还原酶(DHFR)的质粒、编码与gp130胞质结构域(pMG1-CRBN)融合的CRBN捕获物的质粒或编码可与DHFR融合蛋白(pMG1-REM2)的瘦素受体直接相互作用的REM2对照捕获物的质粒和STAT3响应性pXP2d2-rPAPI-荧光素酶报告质粒转染,如所描述的那样(Lievens等人,″Array MAPPIT:high-throughputinteractome analysis in mamma lian cells.″Journal of Proteome Research 8.2(2009):877-886)。将细胞用瘦素处理以激活瘦素受体融合蛋白,并在转染后24小时补充300nM甲氧苄啶-来那度胺融合化合物(杂合配体,其中甲氧苄啶与DHFR相互作用,且来那度胺与CRBN相互作用),不含或含有指示剂量的测试化合物。使用带有Ensight读板器(PERKINELMER LIFE SCIENCES,Waltham,MA)的萤光素酶测定系统试剂盒(PROMEGA,Madison,WI),在化合物处理后24小时测量由包括DHFR-甲氧苄啶-来那度胺-CRBN的三元复合物的形成以及随之而来的STAT3信号传导的激活诱导的萤光素酶活性。数据点代表一式三份样品的平均荧光素酶活性,这些样品来源于用瘦素+测试化合物处理的用于REM2对照(CTRL)的细胞或用瘦素+杂合配体+测试化合物(CRBN)处理的细胞相对于仅用瘦素(CTRL)或瘦素+杂合配体(CRBN)处理的样品(对于两种情况,在不存在添加的测试化合物的情况下获得的信号在y轴上设定为100%的荧光素酶活性)。误差条代表标准偏差。在GRAPHPAD PRISM软件中采用4参数非线性回归进行曲线拟合
实施例2:募集测定:
在此实施例2中,如实施例1中所述应用类似的MAPPIT样测定法以测定测试化合物诱导的所关注的特定底物蛋白与CRBN的结合。在此实验装置中,将细胞用编码CRBN-融合蛋白的构建体和另一种编码底物-融合蛋白的构建体转染。用浓度增加的测试化合物评估测试化合物活性(剂量响应研究)以监测促进CRBN-配体诱导的蛋白质相互作用的能力。
具体地,将HEK293T细胞用编码MAPPIT受体融合物的质粒(其中所关注的蛋白质(CRBN或底物蛋白)与瘦素受体的胞质结构域遗传连接,而瘦素受体本身与促红细胞生成素(Epo)受体(pSEL-X,其中X代表CRBN或所关注的任何测试的底物蛋白)的胞外结构域或与瘦素受体(pCLG-X,其中X代表CRBN或所关注的任何测试的底物蛋白)的胞外结构域融合)、编码MAPPIT gp130融合物(pMG1-Y,Y是任何测试的底物蛋白或CRBN)的质粒和STAT3响应性荧光素酶编码报告质粒(pXP2d2-rPAPI-荧光素酶报告质粒)转染,如所描述的那样(Lievens等人,″Array MAPPIT:high-throughput interactome analysis in mammalian cells.″Journal of Proteome Research 8.2(2009):877-886)。除了在使用同种型7的IKZF1和应用同种型3的BRD4的情况下,对测试的靶蛋白中的每一者融合全尺寸蛋白。对于所述研究,使用以下构建体组合:IKZF1募集:pSEL-CRBN+pMG1-IKZF1(同种型7);ASS1募集:pSEL-CRBN+pMG1-ASS1;SALL4募集:pSEL-SALL4+pMG1-CRBN;DHFR募集:pCLG-DHFR+pMG1-CRBN;ESR1募集:pSEL-CRBN+pMG1-ESR1;BRD4募集:pSEL-CRBN+pMG1-BRD4(同种型3)。在转染后24小时将细胞用促红细胞生成素(Epo;其中使用pSEL型受体融合物构建体)或瘦素(在应用pCLG型受体融合物构建体的情况下)处理,不含或含有指示剂量的测试化合物。使用带有Ensight读板器(PERKIN ELMER LIFE SCIENCES,Waltham,MA)的萤光素酶测定系统试剂盒(PROMEGA,Madison,WI),在测试化合物处理后24小时测量荧光素酶活性。数据点描绘了来自Epo或瘦素+测试化合物处理的细胞对比仅Epo或瘦素处理的细胞的一式三份样品的平均萤光素酶活性的倍数诱导。误差条代表标准偏差。在GRAPHPAD PRISM软件中采用4参数非线性回归进行曲线拟合。
实施例3:蛋白质降解生物测定
使用本文公开的代表性化合物进行以下生物测定以评价在各种细胞类型中观察到的蛋白质降解的水平。
在每一项生物测定中,用不同量的本公开所涵盖的化合物处理细胞。在本研究中评价了以下蛋白质的降解:TANK结合激酶1(TBK1)、雌激素受体α(ERα)、含布罗莫结构域的蛋白4(BRD4)、雄激素受体(AR)和c-Myc。
1.TBK1 Western方案
Panc02.13细胞购自ATCC,并在补充有15%FBS(ATCC)和10单位/mL人重组胰岛素(Gibco)的RPMI-1640(Gibco)中培养。DMSO对照和化合物处理(0.1μM、0.3μM和1μM)在12孔板中进行16h。最后3h添加TLR3激动剂Poly I:C(Invivogen;tlr1-pic)。收获细胞,并在补充有蛋白酶和磷酸酶抑制剂的RIPA缓冲液(50mM Tris pH8、150mM NaCl、1%Tx-100、0.1%SDS、0.5%脱氧胆酸钠)中裂解。将裂解物以16,000g澄清10分钟,并通过SDS-PAGE分离上清液。采用标准方案进行免疫印迹法。使用的抗体是TBK1(Cell Signaling#3504)、pIRF3(abcam#ab76493)和GAPDH(Cell Signaling#5174)。使用BioradChemiDoc MP成像系统对条带进行定量。
2.ERR αWestern方案
在补充有15%FBS(Life Technologies)的RPMI-1640(Life Technologies)中培养NAMALWA细胞(ATCC)。DMSO对照和化合物温育(0.1μM、0.3μM和1μM)在24孔板中进行16h。收获细胞,并用含有蛋白酶抑制剂(Thermo Scientific)的细胞裂解缓冲液(CellSignaling Technologies)进行裂解。将裂解物以16,000g澄清10分钟,并通过SDS-PAGE分离上清液。采用标准方案进行免疫印迹法。使用的抗体是ERRα(Cell Signaling#8644)和GAPDH(Cell Signaling#5174)。使用Bio-Rad ChemiDoc MP成像系统对条带进行定量。
3.BRD4 Western方案
VCaP细胞购自ATCC,并在补充有10%FBS(ATCC)和青霉素/链霉素(LifeTechnologies)的杜尔贝科氏改良伊格尔培养基(ATCC)中培养。DMS0对照和化合物处理(0.003μM、0.01μM、0.03μM和0.1μM)在12孔板中进行16h。收获细胞,并在补充有蛋白酶和磷酸酶抑制剂的RIPA缓冲液(50mM Tris pH8、150mM NaCl、1%Tx-100、0.1%SDS、0.5%脱氧胆酸钠)中裂解。将裂解物以16,000g澄清10分钟,并测定蛋白质浓度。对等量的蛋白质(20μg)进行SDS-PAGE分析,接着根据标准方案进行免疫印迹法。使用的抗体是BRD4(CellSignaling#13440)和肌动蛋白(Sigma#5441)。检测试剂是Clarity Western ECL底物(Bio-rad#170-5060)。
4.AR ELISA方案
VCaP细胞购自ATCC,并在补充有10%FBS(ATCC)和青霉素/链霉素(LifeTechnologies)的杜尔贝科氏改良伊格尔培养基(ATCC)中培养。DMSO对照和化合物处理(0.0001μM-1μM)在96孔板中进行16h。收获细胞,并用细胞裂解缓冲液(目录号#9803)(20mMTris-HCL(pH 7.5)、150mM NaCl、1mM Na2EDTA、1mM EGTA、1%Triton、2.5mM焦磷酸钠、1mMB-甘油磷酸酯、1mM Na3VO4、1ug/ml亮抑酶肽)裂解。将裂解物以16,000g澄清10分钟,并加载到PathScan AR ELISA(Cell Signaling Catalog#12850)中。总雄激素受体夹心ELISA试剂盒是检测总雄激素受体蛋白的内源性水平的固相夹心酶联免疫吸附测定(ELISA)。已经将雄激素受体兔mAb包被到微孔上。在与细胞裂解物一起温育后,雄激素受体蛋白被包被抗体捕获。在充分洗涤后,添加雄激素受体小鼠检测mAb以检测捕获的雄激素受体蛋白。然后使用HRP连接抗体抗小鼠IgG来识别结合的检测抗体。添加HRP底物TMB以显色。显色的吸光度的大小与总雄激素受体蛋白的量成比例。
5.c-Myc ELISA测定方案
22RV-1细胞购自ATCC,并在RPMI+10%FBS培养基中培养。使用胰蛋白酶(Gibco#25200-114)收获细胞,计数并按30,000个细胞/孔以75μL/孔的体积接种在96孔板中的RPMI+10%FBS培养基中。将细胞用在0.1%DMSO中稀释的化合物给药,温育18h,然后洗涤,并在补充有蛋白酶和磷酸酶抑制剂的50uL RIPA缓冲液(50mM Tris pH8、150mM Nacl、1%Tx-100、0.1%SDS、0.5%脱氧胆酸钠)中裂解。将裂解物在4℃下以4000rpm澄清10分钟,然后将等分试样添加到来自Life Technologies目录号#KH02041的Novex Human c-Myc ELISA试剂盒的96孔ELISA板中。将50ul的c-Myc检测抗体添加到每个孔中,将板在室温下温育3小时,然后用ELISA洗涤缓冲液洗涤。将100uL抗兔IgG-HRP二级抗体添加到每个孔中,并在室温下温育30分钟。将板用ELISA洗涤缓冲液洗涤,将100μL TMB添加到每个孔中,然后每5分钟监测颜色变化。添加100μL终止溶液,并在450nm下读板。
实施例4:化合物的制备
可通过有机化学领域中熟知的方法制备本发明的化合物。参见例如J.March,‘Advanced 0rganic Chemistry’第4版,John Wiley and Sons。在合成顺序期间,可能有必要和/或希望保护任何相关分子上的敏感性或反应性基团。这是借助于常规的保护基团实现的,诸如T.W.Greene和P.G.M.Wutts‘Protective Groups in Organic Synthesis’第3版,John Wiley and Sons,1999中描述的那些。任选在方便的后续阶段采用本领域中熟知的方法移除保护性基团。如果需要的话,任选采用常规的技术分离和纯化反应的产物,所述常规技术不限于过滤、蒸馏、结晶、色谱法等。这类物质任选采用常规手段表征,包括物理常数和光谱数据。
在本发明的化合物的合成中,可取的是使用某些离去基团。术语“离去基团”(“LG”)通常是指可被亲核试剂置换的基团。这类离去基团是本领域中已知的。离去基团的实例包括但不限于卤离子(例如,I、Br、F、Cl)、磺酸根(例如,甲磺酸根、甲苯磺酸根)、硫化物(例如,SCH3)、N-羟基琥珀酰亚胺、N-羟基苯并三唑等。亲核试剂的实例包括但不限于胺、硫醇、醇、格氏试剂(Grignard reagents)、阴离子物质(例如,醇盐、酰胺、碳负离子)等。
HPLC纯化
采用HPLC进行纯化(H2O-MeOH;配备DAD和质量检测器的Agilent 1260Infinity系统。Waters Sunfire C18 OBD制备柱,5μm,19mm X100mm,带有SunFire C18制备保护柱,10μm,19mm X10mm)。将物质溶解在0.7mL DMSO中。流量:30mL/min。经由分析型LCMS检查获得的级分的纯度。记录每一级分以溶液形式直接在色谱后获得时的光谱。在80℃的N2流中蒸发溶剂。基于色谱后的LCMS分析将级分合并。将固体级分溶解在0.5mLMeOH中,并转移到预先称重的标记小瓶中。将获得的溶液在80℃的N2流中再次蒸发。干燥后,最终通过LCMS和1H NMR表征产物。
分析方法
NMR
仪器规格:
Bruker AVANCE DRX 500
Varian UNITYplus 400
LC/MS
仪器规格:
具有DAD\ELSD和Agilent LC\MSD VL(G1956A)、SL(G1956B)质谱仪的Agilent1100系列LC/MSD系统。
具有DAD\ELSD和Agilent LC\MSD SL(G6130A)、SL(G6140A)质谱仪的Agilent1200系列LC/MSD系统。
所有LC/MS数据均使用正/负模式切换获得。
柱Zorbax SB-C18 1.8μm 4.6x15mm快速拆分柱(PN 821975-932)
流动相A-乙腈,0.1%甲酸
B-水(0.1%甲酸)
流速3ml/min
梯度0min-100%B
0.01min-100%B
1.5min-0%B
1.8min-0%B
1.81min-100%B
注入体积1μl
电离模式大气压化学电离(APCI)
扫描范围m/z 80-1000
实施例5:说明性双功能化合物的活性
a.TMP-LEN的合成
根据如下反应方案制备TMP-LEN。
向4-戊炔酸(51)(3.4g,34.5mmol)在100mL苯中的溶液中添加2滴DMF,接着添加草酰氯(17.5g,138mmol)。将混合物在80℃下搅拌2h并蒸发至干,得到氯代酸酐(52)(3.1g,76%),其不经另外的纯化用于下一步。
向(50)(345mg,1.33mmol)在30mL THF中的溶液中添加在5mLTHF中的氯代酸酐(52)(315mg,2.70mmol),并将混合物在75℃下搅拌7h。将反应混合物用0.5mL MeOH猝灭,搅拌1h并蒸发至干。将固体残留物用Et2O洗涤并干燥,得到化合物(53)(541mg,100%)。
向化合物(53)(33mg,0.112mmol)和TMP-叠氮化物(63mg,0.109mmol)在DMF-H2O,2∶1(10mL)中的溶液中添加抗坏血酸钠(24mg,0.120mmol),接着添加CuS04·5H2O(27mg,0.109mmol),并将混合物在环境温度下搅拌15h。将混合物用H2O稀释,用CHCl3萃取,并弃去有机层。将水层蒸发至干,并将目标产物在C18反相HPLC柱上纯化,用梯度MeCN-H2O-0.1%TFA洗脱。将含有目标产物的级分蒸发至干,得到化合物TMP-LEN(23mg,23%),为固体。
b.杂合配体诱导的CRBN与DHFR之间的结合的评价
应用如实施例1中所述的类似的MAPPIT样测定法以评价由杂合分子诱导的CRBN与DHFR(二氢叶酸还原酶)之间的结合,所述杂合分子由DHFR配体甲氧苄啶(TMP)通过PEG接头与CRBN配体来那度胺(LEN)融合组成。如实施例1中描述的方案中那样,将HEK293T细胞用编码(大肠杆菌)DHFR锚蛋白与嵌合MAPPIT受体融合的融合构建体的质粒和gpl30-CRBN诱饵融合构建体连同STAT3响应性荧光素酶编码报告质粒(pXP2d2-rPAPI-荧光素酶报告质粒)一起共转染,所述嵌合MAPPIT受体含有与瘦素受体的工程化胞内结构域连接的瘦素受体胞外结构域(pCLG-DHFR),如所描述的那样(Lievens等人,″Array MAPPIT:high-throughputinteractome analysis in mammalian cells.″Journal of Proteome Research 8.2(2009):877-886)。在转染后24h,将细胞用不含和含有指示浓度的TMP-LEN杂合配体的瘦素处理,并再在24h后使用带有Ensight读板器(PERKIN ELMER LIFE SCIENCES,Waltham,MA)的荧光素酶测定系统试剂盒(PROMEGA,Madi son,WI)测定荧光素酶活性。图3中所示的剂量-响应曲线代表来自瘦素+测试化合物处理的细胞对比仅瘦素处理的细胞的一式三份样品的平均萤光素酶活性的诱导倍数。误差条代表标准偏差,并使用GRAPHPAD PRISM软件中的4-参数非线性回归拟合曲线。此实施例表明可应用在此提供的MAPPIT测定来评估由杂合配体诱导的两种蛋白质之间的结合。
实施例6:测试结果
在本文所述的竞争测定和/或募集测定中测试以下化合物,并且结果在下面列出。
表6:采用实施例1中所述的方案和试剂测定IC50竞争值。采用实施例2中所述的方案和试剂测定募集IKZF1、ASS1和SALL4的EC50值。对每种化合物进行募集评估,其中真=在IKZF1、ASS1和SALL4当中在任何测试化合物浓度下观察到任何测试底物的募集,且伪=在IKF1、ASS1和SALL4当中在任何测试化合物浓度下未观察到任何测试底物的募集。NA代表在任何测试浓度下均未观察到底物募集的情况,>>代表无法计算EC50曲线的情况,因为值没有达到超过测量的浓度范围内的平稳值,且<<代表无法计算EC50的情况,因为在化合物测试的第一浓度(13.7nM)下读取值高于对照的50%。
表7:采用实施例1中所述的方案和试剂测定IC50竞争值。采用实施例2中所述的方案和试剂测定募集指示的靶蛋白的EC50值。NA代表在任何测试浓度下均未观察到底物募集的情况,>>代表无法计算EC50曲线的情况,因为值没有达到超过测量的浓度范围内的平稳值,且<<代表无法计算EC50的情况,因为在化合物测试的第一浓度(13.7nM)下读取值高于对照的50%。
实施例7:双功能化合物的CRBN结合和/或底物募集的评价
对于选定的双功能化合物,将分别在实施例1和实施例2中描述的竞争测定和/或募集测定应用于评价CRBN结合和/或底物募集。所得到的剂量响应曲线示于图3中。
实施例8:合成中间体和最终化合物
中间体合成
中间体1的合成:
在0℃和N2气氛下向SM1(5.0g,13.5mmol)在DCM(50mL)中的溶液中添加SM2(3.8g,27.0mmol),然后将混合物在60℃下加热过夜。
将反应物冷却到RT,浓缩,并将残留物溶解在MeOH(50mL)中。将混合物加热回流3小时,然后浓缩,得到目标物1.1(4.5g,收率94%),为白色固体。TLC:Rf=0.15(DMC/MeOH=10∶1,v/v,254nm)。LCMS:(方法P0-POS):m/z 358.2[M+H]+,2.109min。
向化合物1.1(4.5g,12.6mmol)在DCM(50mL)中的溶液中添加SM3(2.9g,15.1mmol)和DIPEA(4.9g,37.8mmol),并将所得混合物在RT下搅拌过夜。
将混合物用水(100mL)稀释,用DCM(50mL×3)萃取,并将合并的有机萃取物用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并浓缩。将残留物通过柱(洗脱液石油DCM∶MeOH=40∶1,v∶v)纯化,得到产物1.2(4.9g,收率83%),为白色固体。
向化合物1.2(4.9g,10.4mmol)在1-4二噁烷(20mL)中的溶液中添加4N HCl/二噁烷(30mL),并将混合物在RT下搅拌4h。
将混合物浓缩,并将残留物与醚一起研磨,得到中间体1(4g,93%),为白色固体。TLC:Rf 0.1(DCM/MeOH=10∶1,v/v,254nm)LCMS:(P0(-1)-POS):m/z 416.2[M+H]+,3.457min。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)(FID号:CJP-0147-084-HNMR)δ7.40-7.37(m,2H),7.31-7.27(m,1H),7.22-7.19(m,4H),7.14-7.11(m,3H),6.79-6.77(m,2H),6.66-6.64(m,2H),4.25(t,J=4.4Hz,2H),4.13(s,2H),3.54-3.53(m,2H),2.89(s,3H),2.40-2.34(m,2H),0.85(t,J=7.2Hz,3H)。
中间体2的合成
在0℃下向酸(21g,111.57mmol)和胺(20.53g,111.57mmol)在吡啶(300mL)中的溶液中添加POCl3(13.07g,133.89mmol),并将混合物在室温下搅拌30分钟。
将混合物用水(600mL)稀释,并用EtOAc(200mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(200mL)洗涤,经Na2SO4干燥,并在减压下浓缩。将残留物通过柱色谱法(石油醚∶EtOAc,1∶1,v/v)纯化,得到2.1(10g,31%),为黄色固体。TLC:Rf=0.49(石油醚∶EtOAc=1∶1,v/v,254nm)。LCMS:(LCMS方法P2-POS):m/z 288.20[M+H]+,3.598min。
在0℃下向NH2OH·HCl(11.49g,348mmol)在MeOH(100mL)中的溶液中添加KOH(29.29g,522mmol),并将混合物搅拌1h。将所得沉淀物滤出,并将游离NH2OH的溶液置于圆底烧瓶中,并在冰浴中冷却。将化合物2.1(10g,34.8mmol)添加到溶液中,并将混合物在RT下搅拌过夜。
将混合物用水(200mL)稀释,并用AcOH酸化至pH~5,然后在+4℃冰箱中保存3h。通过过滤收集沉淀物,用水洗涤,并从丙酮/THF(1∶1,v/v)中结晶,得到中间体2(7g,70%),为白色固体。TLC:Rf=0(EtOAc/石油醚=1/1,v/v)。LCMS:(方法P2-POS):m/z289.20[M+H]+,2.820min。1H NMR:1H NMR(400MHz,DMSO-d6)(FID号:YJ-0489-075-HNMR)10.32(s,1H),10.03(s,1H),8.65(s,1H),7.61-7.59(m,2H),7.40-7.38(m,2H),4.06(s,1H),2.32-2.28(m,2H),1.95-1.91(m,2H),1.58-1.47(m,4H),1.28-1.27(m,4H)。
中间体3的合成
向SM(2.4g,5.25mmol)在DCM(15mL)中的溶液中添加TFA(10mL),并将混合物在RT下搅拌过夜。TLC显示SM被消耗。在真空下移除溶剂。将残留物与水(25mL*2)一起研磨,得到中间体3(2.00g,95%),为浅黄色固体。LCMS:(方法P2-POS):m/z 401.10[M+H]+,3.209min。1H NMR:(400MHz,DMSO-d6,FID号:WFL-0259-100-1-20190227-HNMR)δ12.43(s,1H),7.50(d,J=8.8Hz,2H),7.47-7.41(m,2H),4.45(t,J=7.2Hz,1H),3.43(dd,J=16.8,6.8Hz,1H),3.32(dd,J=16.8,7.4Hz,1H),2.60(s,3H),2.41(s,3H),1.63(s,3H)。
中间体9的合成
在0℃下向SM1(46g,0.3mol)在MeOH(300mL)中的溶液中添加SOCl2(59g,0.5mol),并将混合物在70℃下加热2h。然后将混合物浓缩,得到产物9.1(42g,84%),为棕色固体。TLC:Rf=0.65(DCM∶MeOH=20∶1,v/v,254nm)。1H NMR:1H NMR(400MHz,DMS0-d6)(FID号:CJP-0147-055-HNMR)δ9.69(m,1H),7.18-7.16(m,1H),7.07(t,J=8Hz,1H),7.00-6.98(m,1H),3.79(s,3H),2.27(s,3H)。
向9.1(65g,0.39mol)在DCM(500mL)中的溶液中添加咪唑(91.4g,1.17mol)和TBSCl(70.5g,0.47mol),并将混合物在RT下搅拌2h。
将混合物用水(800mL)稀释,并用DCM(300mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(400mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并浓缩,得到产物9.2(100g,91%),为棕色油状物。TLC:Rf=0.8(DCM∶MeOH=20∶1,v/v,254nm)。1H NMR:1H NMR(400MHz,DMSO-d6)(FID No:FGX41-013-HNMR)δ7.35-7.33(m,1H),7.18(t,J=8.4Hz,1H),7.04-7.01(m,1H),3.80(s,3H),2.31(s,3H),0.98(s,9H),0.21(s,6H)。
向化合物9.2(100g,0.36mol)在CCl4(500mL)中的溶液中添加NBS(71.2g,0.40mol)和AIBN(5.9g,0.036mol),并将混合物加热回流3h。
将混合物浓缩,并将残留物用水(500mL)稀释,并用DCM(200mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(300mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并浓缩,得到产物9.3(120g,94%),为棕色油状物。TLC:Rf=0.3(DCM∶MeOH=40∶1,v/v,254nm)1H NMR:1H NMR(400MHz,DMSO-d6)(FID号:FGX41-025-HNMR)δ7.47-7.45(m,1H),7.37(t,J=8Hz,1H),7.16-7.14(m,1H),4.95(s,2H),3.86(s,3H),1.03(s,9H),0.29(s,6H)。
向化合物9.3(90g,0.25mol)在ACN(600mL)中的溶液中添加SM2(45.1g,0.28mol)和DIPEA(96.9g,0.75mol),并将混合物在40℃下加热过夜。
将混合物浓缩,并将残留物与EtOAc(150mL x2)一起研磨,得到化合物9.4(60g,63%),为白色固体。TLC:Rf=0.28(DCM∶MeOH=10∶1,v/v,254nm)。LCMS:(LCMS方法P1-POS):m/z 375.1[M+H]+,2.117min。
向化合物9.4(50g,0.13mol)在THF(400mL)中的溶液中添加TBAF(在THF中的1M溶液,160mL,0.16mol),并将混合物在RT下搅拌3h。
将混合物在减压下浓缩,并将残留物与EtOAc(150mL x2)一起研磨,得到产物9.5(28g,80%),为白色固体。TLC:Rf=0.5(DCM∶MeOH=10∶1,v/v,254nm)。LCMS:(LCMS方法P2-POS):m/z261.0[M+H]+,1.611min。
向化合物9.5(16.0g,61.5mmol)在DMF(100mL)中的溶液中添加SM3(8.4g,43.1mmol)、Na2CO3(13.0g,123mmol)和KI(2.0g,12.3mmol),并将混合物在60℃下加热6小时。
将混合物用水(800mL)稀释,用EtOAc(200mL×3)萃取,并将合并的有机层用盐水(300mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并浓缩。将残留物通过硅胶柱(DCM/MeOH=200∶1至40∶1,v/v)纯化,得到产物9.6(6.0g,26%),为白色固体。TLC:Rf=0.6(DCM∶MeOH=10∶1,v/v,254nm)。LCMS:(LCMS方法S12):m/z 373.1[M-H]-,3.779min。
在0℃下向化合物9.6(14g,37.4mmol)在DCM(100mL)中的溶液中添加TFA(40mL),并将混合物在RT下搅拌6h。
将混合物浓缩,并将残留物用醚(100mL)冲洗,得到中间体9(11g,92%),为白色固体。TLC:Rf=0.2(DCM∶MeOH=10∶1,v/v,254nm)。LCMS:(LCMS方法P1-POS):m/z 319.1[M+H]+,1.774min。1H NMR:1H NMR(400MHz,DMSO-d6)(FID号:CJP-0147-102)δ10.97(s,1H),7.46(t,J=8Hz,1H),7.34-7.32(m,1H),7.17-7.15(m,1H),5.13-5.08(m,1H),4.84(s,2H),4.42-4.24(m,2H),2.91-2.86(m,1H),2.61-2.56(m,1H),2.49-2.40(m,1H),2.02-1.98(m,2H)。
中间体10-13的合成
向中间体9在DMF中的溶液(0.25M)中添加HATU(2.0当量)和DIPEA(3.0当量),并将混合物在RT下搅拌30分钟。然后添加氨基-叠氮化物(1.2当量),并在RT下继续搅拌16h。将混合物用水稀释,通过DCM/MeOH(15/1)萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,浓缩。将残留物通过Biotage C18柱或p-TLC纯化,得到中间体10-13。
将中间体10通过Biotage C18柱(在水中40%ACN)纯化,得到中间体10(收率:43%),为无色油状物。LCMS:(方法S12):m/z 563.3[M+H]+,1.233min。1H NMR:(400MHz,DMSO-d6,FID号:CJP-0147-104-HNMR)δ11.00(s,1H),8.11(t,J=5.6Hz,1H),7.47(t,J=8.0Hz,1H),7.34(d,J=6.4Hz 1H),7.13(d,J=8.0Hz 1H),5.16-5.11(m,1H),4.64(s,2H),4.48-4.32(m,2H),3.60-3.58(m,2H),3.50-3.48(m,4H),3.43-3.38(m,8H),3.39-3.28(m,6H),2.97-2.90(m,1H),2.63-2.61(m,1H),2.44-2.37(m,1H),2.04-2.00(m,1H)
将中间体11通过Biotage C18柱(在水中40%ACN)纯化,得到中间体11(收率:25%),为半固体。LCMS:(LCMS方法S12):m/z 519.3[M+H]+,2.333min。1H NMR:(400MHz,DMSO-d6,FID号:CJP-0147-099-HNMR)δ11.00(s,1H),8.11(t,J=5.6Hz,1H),7.47(t,J=8.0Hz,1H),7.34(d,J=6.4Hz 1H),7.13(d,J=8.0Hz 1H),5.16-5.11(m,1H),4.64(s,2H),4.48-4.32(m,2H),3.59-3.57(m,2H),3.50-3.44(m,8H),3.38-3.31(m,6H),2.96-2.90(m,1H),2.62-2.59(m,1H),2.43-2.36(m,1H),2.03-1.99(m,1H)。
将中间体12通过制备型TLC(DCM∶MeOH=10∶1,v/v)纯化,得到中间体12(收率:63%),为黄色油状物。TLC:Rf=0.18(DCM∶MeOH=20∶1,v/v,254nm)。LCMS:(LCMS方法P2):m/z=475.30[M+H]+,2.516min。1H NMR:1H NMR(400MHz,氯仿-d)(FID号:ZJ-0523-016-HNMR)δ8.14(s,1H),7.57(d,J=7.6Hz,1H),7.47(t,J=7.8Hz,1H),7.02(d,J=8.2Hz,1H),6.85(s,1H),5.23(dd,J=13.4,5.2Hz,1H),4.61(s,2H),4.52(d,J=16.4Hz,1H),4.38(d,J=16.6Hz,1H),3.64-3.61(m,2H),3.60-3.55(m,6H),3.33(dd,J=5.6,4.4Hz,2H),3.03-2.89(m,1H),2.84(ddd,J=17.8,13.0,5.2Hz,1H),2.40(qd,J=13.0,5.0Hz,1H),2.24(ddd,J=10.2,5.2,2.8Hz,1H),1.58-1.36(m,2H)。
将中间体13通过Biotage C18柱(在水中40%ACN)纯化,得到中间体13(收率:27%),为白色固体。LCMS:(LCMS方法P0-POS):m/z 387.1[M+H]+,2.165min。1H NMR:1H NMR(400MHz,DMSO-d6,FID号:LL-0450-112-HNMR)δ11.00(s,1H),8.30(t,J=5.4Hz,1H),7.47(t,J=7.8Hz,1H),7.35(d,J=7.2Hz,1H),7.15(d,J=7.8Hz,1H),5.14(dd,J=13.4,5.1Hz,1H),4.66(d,J=2.2Hz,2H),4.46(d,J=17.4Hz,1H),4.35(d,J=17.4Hz,1H),3.43-3.37(m,2H),3.37-3.33(m,2H),2.99-2.86(m,1H),2.61(d,J=16.8Hz,1H),2.41(m,1H),2.02(m,1H)。
表5中所列化合物5.49-5.52的合成
一般程序
向叠氮化物(1.0当量)在叔丁醇/H2O(1/1,v/v)中的溶液(0.03M)中添加中间体2(1.0当量),接着添加CuSO4·5H2O(0.2当量)和抗坏血酸钠(1.0当量),并将混合物在80℃和N2气氛下加热5h。将混合物用水稀释,用DCM/MeOH(15/1)萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,浓缩,并通过制备型TLC或制备型HPLC纯化,得到化合物5.49-5.52。
将化合物5.49通过制备型HPLC(在含有0.1%TFA的水中5-60%ACN)纯化,得到化合物5.49(收率5%),为白色固体。LCMS:(LCMS方法S12-5MIN):m/z 851.5[M+H]+,1.047min。1H NMR:(400MHz,DMSO-d6)(FID号:CJP-0147-115-HNMR)δ11.00(s,1H),10.32(s,1H),9.94(s,1H),8.42(s,1H),8.11(t,J=6.0Hz,1H),7.76-7.50(m,4H),7.46(t,J=8.0Hz,1H),7.35-7.33(m,1H),7.14-1.12(m,1H),5.16-5.11(m,1H),4.64(s,2H),4.54(t,J=5.2Hz,2H),4.47-4.31(m,2H),3.84(t,J=5.2Hz,2H),3.53-3.47(m,3H),3.46-3.44(m,3H),3.44-3.41(m,8H),3.40-3.26(m,3H),2.95-2.89(m,1H),2.63-2.58(m,1H),2.443-2.40(m,1H),2.33-2.28(m,2H),2.02-1.94(m,3H),1.59-1.51(m,4H),1.49-1.21(m,4H)
将化合物5.50通过制备型HPLC(在含有0.1%TFA的水中5-60%ACN)纯化,得到化合物5.50(收率8%),为无色油状物。LCMS:(LCMS方法S12-5MIN):m/z 807.4[M+H]+,2.165min。1H NMR:(400MHz,DMSO-d6)(FID号:CJP-0147-116-HNMR)δ11.00(s,1H),10.33(s,1H),9.95(s,1H),8.64(s,1H),8.42(s,1H),8.10(t,J=5.6Hz,1H),7.75-7.65(m,4H),7.46(t,J=4.8Hz,1H),7.35-7.33(m,1H),7.14-1.11(m,1H),5.15-5.10(m,1H),4.63(s,2H),4.54(t,J=5.2Hz,2H),4.46-4.30(m,2H),3.84(t,J=5.2Hz,2H),3.84-3.44(m,2H),3.42-3.40(m,2H),3.40(s,4H),3.33-3.28(m,2H),3.25-3.16(m,2H),2.95-2.92(m,1H),2.86-2.58(m,1H),2.50-2.42(m,1H),2.39-2.30(m,2H),2.00-1.94(m,3H),1.59-1.49(m,5H),1.39-1.21(m,2H)
将化合物5.51通过制备型TLC(DCM/MeOH=10/1,v/v)纯化,得到化合物5.51(收率:12%),为黄色固体。TLC:Rf=0.29(石油醚∶EtOAc=5∶1,v/v,254nm)。LCMS:(LCMS方法P2):m/z 763.45[M+H]+,2.421min。1H NMR:1H NMR(400MHz,DMSO-d6)(FID号:ZJ-0523-018-HNMR)δ11.00(s,1H),10.33(s,1H),9.95(s,1H),8.65(s,1H),8.42(s,1H),8.09(s,1H),7.73(s,2H),7.66(s,2H),7.44(d,J=7.9Hz,1H),7.34(d,J=7.6Hz,1H),7.12(d,J=8.2Hz,1H),4.58(d,J=37.0Hz,4H),4.41(s,1H),4.34(s,1H),3.84(d,J=6.6Hz,2H),3.55-3.45(m,4H),3.40(d,J=6.0Hz,2H),3.25(d,J=5.6Hz,2H),3.17(d,J=5.0Hz,2H),2.60(d,J=17.2Hz,1H),2.40(d,J=12.6Hz,1H),2.30(t,J=7.6Hz,2H),1.94(t,J=7.4Hz,3H),1.53(d,J=35.6Hz,4H),1.28(s,4H),1.09(t,J=7.0Hz,1H)。
将化合物5.52通过制备型HPLC(在含有0.1%TFA的水中5-60%ACN)纯化,得到化合物5.52(收率:34%),为棕色固体。LCMS:(LCMS方法S12):m/z 675.3[M+H]+,2.170min。1HNMR:(400MHz,DMSO-d6,FID号:LL-0450-115-HNMR)δ10.99(s,1H),10.32(s,1H),9.94(s,1H),8.42(s,1H),8.30(s,1H),7.72(s,2H),7.67(s,2H),7.43(t,J=7.8Hz,1H),7.33(s,1H),7.10(d,J=7.8Hz,1H),5.11(dd,J=13.2,5.2Hz,1H),4.64(d,J=2.2Hz,2H),4.51(s,2H),4.39(s,1H),4.34(s,1H),3.66-3.58(m,2H),2.91(ddd,J=17.4,13.6,5.2Hz,1H),2.58(d,J=17.2Hz,1H),2.40(td,J=13.0,4.4Hz,1H),2.31(s,2H),2.07(s,4H),1.94(s,3H),1.58(d,J=7.2Hz,2H),1.54-1.45(m,2H),1.35-1.23(m,4H)。
表5中所列化合物5.53和5.56的合成
向叠氮化物(1.0当量)在THF(0.08M)中的溶液中添加PPh3(2.0当量)和2M HCl(4.0当量),并将混合物在RT下搅拌过夜。添加更多的PPh3(1.0当量),并继续再搅拌8h。在真空下移除溶剂,并将残留物与二乙醚一起研磨,得到标题胺中间体,其不经任何进一步纯化直接用于下一步。
向中间体1在DMF中的溶液(0.045M)中添加胺中间体(1.2当量),接着添加TBTU(1.5当量)和DIPEA(3.0当量),并将混合物在RT和N2气氛下搅拌16h。将混合物用水稀释,用DCM/MeOH(15/1)萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,浓缩。通过制备型TLC或制备型HPLC纯化残留物,得到化合物5.53和5.56。
将化合物5.53通过制备型HPLC(在含有0.1%TFA的水中5-80%ACN)纯化,得到化合物5.53(收率6%),为白色固体。LCMS:(LCMS方法S12-5MIN):m/z 934.4[M+H]+,2.356min。1H NMR:(400MHz,DMSO-d6)(FID号:CJP-0147-132-HNMR)δ8(t,J=5.2Hz,1H).12,7.73-7.62(m,2H),7.46(t,J=8.0Hz,1H),7.39-7.33(m,3H),7.29-7.26(m,1H),7.21-7.11(m,8H),6.74-6.59(m,4H),5.15-5.12(m,1H),4.64(s,2H),4.48-4.34(m,4H),4.22(t,J=5.6Hz,1H),3,91(t,J=5.2Hz,1H),3.43-3.32(m,14H),3.19-3.18(m,2H),2.97-2.90(m,3H),2.68-2.58(m,3H),2.39-2.37(m,3H),2.25(s,3H),2.02-1.99(m,1H),1.66-1.62(m,1H),1.40-1.32(m,1H),0.91(t,J=7.6Hz,1H),0.86-080(m,3H)。
将化合物5.56通过制备型HPLC(在含有0.1%TFA的水中5-80%ACN)纯化,得到化合物5.56(收率:10%),为白色固体。LCMS:(LCMS方法S12):m/z 758.3[M+H]+,3.088min。1HNMR:(400MHz,DMSO-d6,FID号:LL-0450-120-HNMR)δ9.80(s,1H),8.59(s,1H),8.15(d,J=5.8Hz,1H),7.63(s,1H),7.44(t,J=7.8Hz,1H),7.38(dd,J=8.0,6.8Hz,2H),7.34-7.26(m,2H),7.22-7.17(m,4H),7.15-7.09(m,4H),6.77(d,J=8.8Hz,2H),6.64(d,J=8.8Hz,2H),4.77(dd,J=10.2,4.7Hz,1H),4.62(d,J=17.6Hz,3H),4.43(d,J=18.0Hz,2H),4.18(s,2H),3.92(d,J=33.0Hz,3H),3.21(d,J=19.4Hz,4H),2.85(s,3H),2.37(d,J=7.4Hz,2H),2.26(s,2H),2.23-2.18(m,1H),2.10-2.00(m,1H),0.84(t,J=7.4Hz,3H)。
表5中所列化合物5.54和5.55的合成
向双胺(1.0当量)在DCM中的溶液(0.47M)中添加(Boc)2O(1.0当量)和TEA(2.5当量),并将混合物在RT下搅拌2h。在真空下移除溶剂,并将残留物用水稀释,并用EtOAc萃取。将有机层用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并浓缩,得到单-boc-胺,其不经任何进一步纯化直接用于下一步。
向酸中间体1、4或9(1.0当量)在DMF中的溶液(0.15M)中添加单-boc-胺(1.2当量),接着添加TBTU(1.5当量)和DIPEA(3.0当量),并将混合物在RT和N2气氛下搅拌16h。将混合物用水稀释,并通过DCM/MeOH(30/1)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,浓缩,并通过硅胶柱色谱法纯化残留物,得到boc-保护的中间体。
向boc-保护的中间体在二噁烷中的溶液中添加在二噁烷(8当量)中的4M HCl,并将混合物在RT下搅拌2-4h。在真空下移除溶剂,得到标题HCl盐,其直接用于下一步。
向中间体1(1.0当量)在DMF中的溶液(0.045M)中添加胺HCl盐(1.2当量),接着添加TBTU(1.5当量)和DIPEA(3.0当量),并将混合物在RT和N2气氛下搅拌16h。将混合物用水稀释,并通过DCM/MeOH(15/1)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,浓缩,并通过制备型TLC或制备型HPLC纯化残留物,得到最终化合物。
将化合物5.54通过制备型TLC(DCM/MeOH=10/1,v/v)纯化,得到化合物5.54(收率:13%),为灰白色固体。TLC:Rf=0.15(DCM:MeOH=10∶1,v/v,254nm)。LCMS:(LCMS方法P2):m/z 846.50[M+H]+,0.490min。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)(FID号:ZJ-0523-039-HNMR)δ11.00(s,1H),8.11(t,J=5.8Hz,1H),7.69(s,1H),7.46(t,J=7.8Hz,1H),7.35(t,J=8.0Hz,3H),7.30-7.25(m,1H),7.22-7.17(m,4H),7.14-7.10(m,4H),5.13(dd,J=13.2,5.2Hz,1H),4.63(d,J=1.6Hz,2H),4.44(d,J=17.6Hz,1H),4.33(d,J=17.6Hz,1H),3.93(t,J=5.6Hz,2H),3.43(s,3H),3.41-3.34(m,4H),3.27(q,J=6.2Hz,3H),3.18(d,J=5.8Hz,2H),3.02(s,2H),2.72(s,2H),2.44-2.32(m,4H),2.29(s,1H),2.03-1.97(m,1H),1.24(d,J=2.8Hz,3H),0.86-0.84(m,3H)。
将化合物5.55通过制备型TLC(DCM/MeOH=10/1,v/v)纯化,得到化合物5.55(收率:11%),为灰白色固体。LCMS:(LCMS方法P2):m/z890.4[M+H]+,3.172min。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)(FID号:CJP-0147-137-HNMR)δ11.00(s,1H),8.12(t,J=5.6Hz,1H),7.68(s,1H),7.46(t,J=7.6Hz,1H),7.39-7.28(m,4H),7.21-7.11(m,8H),6.74-6.59(m,4H),5.16-5.11(m,1H),4.64(s,2H),4.72-4.31(m,2H),3.92(t,J=5.6Hz,2H),3.46-3.41(m,10H),3.36-3.32(m,2H),3.29-3.26(m,2H),3.19-3.16(m,2H),2.99-2.88(m,3H),2.70-2.58(m,3H),2.39-2.34(m,2H),2.27(s,3H),2.02-1.98(m,1H),1.26-1.24(m,1H),0.84(t,J=7.2Hz,3H)。
表5中所列化合物5.57-5.60的合成
向中间体3(1.0当量)在DMF中的溶液(0.05M)中添加胺HCl盐(1.2当量),接着添加TBTU(1.5当量)和DIPEA(3.0当量),并将混合物在RT和N2气氛下搅拌16h。将混合物用水稀释,并通过DCM/MeOH(15/1)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,浓缩,并通过制备型TLC或制备型HPLC纯化残留物,得到化合物5.57-5.60。
将化合物5.57通过制备型TLC(DCM/MeOH=8/1,v/v)纯化,得到化合物5.57(收率4%),为黄色固体。LCMS:(LCMS方法S12-5MIN):m/z 919.5[M+H]+,3.033min。1H NMR:(400MHz,DMSO-d6)(FID号:CJP-0147-135-HNMR)δ11.00(s,1H),8.27(t,J=5.6Hz,1H),8.12(t,J=5.6Hz,1H),7.49-7.47(m,3H),7.43-7.35(m,2H),7.35-7.33(m,1H),7.13(d,J=8Hz,1H),5.14-5.11(m,1H),4.64(s,2H),4.52-4.48(m,1H),4.43-4.30(m,2H),3.52-3.43(m,13H),3.33-3.25(m,4H),3.22-3.21(m,5H),2.92-2.82(m,1H),2.62-2.59(m,4H),2.50-2.40(m,4H),2.03-1.99(m,1H),1.62(s,3H)。
将化合物5.58通过制备型TLC(DCM/MeOH=10/1,v/v)纯化,得到化合物5.58(收率4%),为白色固体。LCMS:(LCMS方法S12-5MIN):m/z 875.2[M+H]+,2.898min。1H NMR:(400MHz,DMSO-d6)(FID号:CJP-0147-138-HNMR)δ11.00(s,1H),8.27(t,J=5.6Hz,1H),8.13(t,J=5.6Hz,1H),7.49-7.43(m,5H),7.40(d,J=7.6Hz,1H),7.13(d,J=8.0Hz,1H),5.14-5.11(m,1H),4.64(s,2H),4.52-4.47(m,2H),4.43-4.31(m,1H),3.51(d,J=9.2Hz,8H),3.46-3.43(m,4H),3.32-3.21(m,6H),2.96-2.88(m,1H),2.62-2.59(m,4H),2.50-2.40(m,4H),2.02-1.99(m,1H),1.62(s,3H)
将化合物5.59通过制备型HPLC(在含有0.1%TFA的水中5-50%ACN)纯化,得到化合物5.59(收率:7%),为灰白色固体。LCMS:(LCMS方法P2):m/z 831.30[M+H]+,1.678min。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)(FID号:ZJ-0523-038-HNMR)δ11.00(s,1H),8.27(t,J=5.8Hz,1H),8.13(t,J=5.8Hz,1H),7.49-7.42(m,5H),7.34(d,J=7.6Hz,1H),7.12(d,J=8.2Hz,1H),5.13(d,J=8.4Hz,1H),4.64(s,2H),4.52-4.42(m,3H),4.33(d,J=17.6Hz,2H),3.52(s,3H),3.45(q,J=3.2Hz,4H),3.27(d,J=10.8Hz,4H),2.97-2.85(m,2H),2.59(s,3H),2.40(s,3H),1.99(d,J=7.0Hz,1H),1.61(s,2H),1.47(s,1H),1.28-1.23(m,3H)。
将化合物5.60通过制备型HPLC(在含有0.1%TFA的水中5-50%ACN)纯化,得到化合物5.60(收率:30%),为白色固体。LCMS:(LCMS方法S12):m/z 743.2[M+H]+,2.842min。1HNMR:(400MHz,DMS0-d6,FID号:LL-0450-145-HNMR)δ10.96(d,J=2.8Hz,1H),8.34(d,J=5.6Hz,1H),7.66-7.54(m,1H),7.52-7.43(m,3H),7.41(s,2H),7.34(dd,J=7.6,3.2Hz,1H),7.15(s,1H),5.10(s,1H),4.61(d,J=3.0Hz,2H),4.49(tt,J=9.6,4.8Hz,1H),4.45-4.38(m,1H),4.32(dd,J=17.6,14.8Hz,1H),3.44(d,J=6.8Hz,1H),3.23(q,J=5.6Hz,5H),2.95-2.81(m,1H),2.59(d,J=11.8Hz,2H),2.44-2.35(m,3H),2.34-2.26(m,1H),1.95-1.87(m,1H),1.85-1.77(m,1H),1.57(d,J=15.2Hz,3H),1.06(t,J=6.8Hz,1H)。
实施例9:竞争和募集活性
根据实施例1和实施例2中所示的测定法测量本文所述的化合物的竞争和募集活性。IC50或EC50的强度从最强至最弱(即+++至+)报告,而“NA”为不适用。
Claims (24)
1.一种具有通式(A)k-L1的化合物或其盐、对映异构体、立体异构体、多晶型物或N-氧化物,其中:
A是与E3泛素连接酶结合的部分,并且具有选自由式I、式II、式III、式IV、式V、式VI、式VII、式VIII、式IX和式X组成的组的结构;
L1是接头;
每个A在化合价允许的情况下与所述L1共价连接;
R1是芳基、-N(R5)-X-R6、-SO2R5或-O(CH2)mR5,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R2是芳基、-NH-(C3-C10)杂芳基或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R3是氰基、芳基、-NH-(C3-C10)杂芳基、(C3-C10)杂环或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R4是卤代基、氰基、芳基、OR5或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R5在每次出现时独立地为H、(C1-C3)烷基、(C3-C10)杂环、(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)杂环、-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基、芳基或杂芳基,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R6在每次出现时独立地为OH、(C1-C3)烷基、-(C1-C3)烷氧基、(C3-C10)杂环、(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)杂环、-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基、芳基、杂芳基,或者R5和R6与它们所连接的原子合起来形成含氮的(C3-C10)杂环,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R7是H、(C1-C3)烷基,或者R7和R26与它们所连接的碳合起来形成碳碳双键;
R8、R9、R10、R11各自独立地为H、卤代基、OH、氰基、(C1-C3)烷基、(C1-C3)烷氧基、芳基或杂芳基,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R12、R13、R14、R15各自独立地为H、NH2、(C1-C3)烷基、-N(R5)-(CH2)m-N(R5)-X-R6,附带条件为R12、R13、R14和R15中不超过三个取代基是H,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R16是NH2或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R17是氰基、杂芳基、-(CH2)m-C(O)O-R6或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R18、R19、R20、R21各自独立地为H、卤代基、(C1-C3)烷基、(C1-C3)烷氧基或-N(R5)-X-R6,附带条件为R18、R19、R20、R21中不超过两个取代基是H;或者
R18、R19与它们所连接的碳合起来形成(C3-C10)环烷基或(C3-C10)杂环,或者R19、R20与它们所连接的碳合起来形成(C3-C10)环烷基或(C3-C10)杂环,或者R20、R21与它们所连接的碳合起来形成(C3-C10)环烷基或(C3-C10)杂环,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R25是芳基、杂芳基或(C3-C10)杂环,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
Rw在每次出现时独立地为H、卤代基、氰基、硝基、氧代、烷基、卤代烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、杂环、芳基、杂芳基、芳基烷基、杂芳基烷基、环烷基烷基、杂环烷基,其中所述烷基、卤代烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、杂环、芳基、杂芳基、芳基烷基、杂芳基烷基、环烷基烷基和杂环烷基基团可进一步独立地被一个或多个选自由卤代基、氰基、氧代(C3-C10)杂环、(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)杂环、-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基、芳基和杂芳基组成的组的基团取代;
X是键、-SO2-、-(CH2)nC(O)(CH2)m-、-C(O)NH-、-C(O)N(Rw)-、-NHC(O)NH-或-(CH2)n-;
Y1是–NHR25、-NHC(O)R25或–CHR25R26;
m是0、1、2、3或4;
k是1、2、3、4、5、6、7、8、9或10;
n是0、1、2、3或4。
2.如权利要求1所述的化合物,其中L1是-Lb-(La)t-H;其中La在每次出现时独立地选自由以下组成的组:键、CR5R6、C(R5R6)O、C(R5R6)C(R5R6)O、SO2、NR5、C(R5R6)NR5、SO2NR5、SONR5、CONR5、NR5CONR6、NR5SO2NR6、CO、CR5═CR6、C≡C、SiR5R6、P(O)R5、P(O)OR5、NR5C(═NCN)NR6、NR5C(═NCN)和NR5C(═CNO2)NR6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
H是氢。
Lb选自由以下组成的组:
t是0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20。
3.一种通式(A)k-L-Q的化合物或其盐、对映异构体、立体异构体、多晶型物或N-氧化物,其中:
A是与E3泛素连接酶结合的化合物,并且具有选自由式I、式II、式III、式IV、式V、式VI、式VII、式VIII、式IX和式X以下组成的组的结构;
Q是与靶蛋白结合的部分,所述靶蛋白与所述E3泛素连接酶螯合和/或在与所述E3泛素连接酶相互作用后降解;
L是接头;
每个A在化合价允许的情况下与所述L共价连接;
R1是芳基、-N(R5)-X-R6、-SO2R5或-O(CH2)mR5,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R2是芳基、-NH-(C3-C10)杂芳基或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R3是氰基、芳基、-NH-(C3-C10)杂芳基、(C3-C10)杂环或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R4是卤代基、氰基、芳基、OR5或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R5在每次出现时独立地为H、(C1-C3)烷基、(C3-C10)杂环、(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)杂环、-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基、芳基或杂芳基,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R6在每次出现时独立地为OH、(C1-C3)烷基、-(C1-C3)烷氧基、(C3-C10)杂环、(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)杂环、-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基、芳基、杂芳基,或者R5和R6与它们所连接的原子合起来形成含氮的(C3-C10)杂环,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R7是H、(C1-C3)烷基,或者R7和R26与它们所连接的碳合起来形成碳碳双键;
R8、R9、R10、R11各自独立地为H、卤代基、OH、氰基、(C1-C3)烷基、(C1-C3)烷氧基、芳基或杂芳基,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R12、R13、R14、R15各自独立地为H、NH2、(C1-C3)烷基、-N(R5)-(CH2)m-N(R5)-X-R6,附带条件为R12、R13、R14和R15中不超过三个取代基是H,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R16是NH2或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R17是氰基、杂芳基、-(CH2)m-C(O)O-R6或-N(R5)-(CH2)m-X-(CH2)n-R6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R18、R19、R20、R21各自独立地为H、卤代基、(C1-C3)烷基、(C1-C3)烷氧基或-N(R5)-X-R6,附带条件为R18、R19、R20、R21中不超过两个取代基是H;或者
R18、R19与它们所连接的碳合起来形成(C3-C10)环烷基或(C3-C10)杂环,或者R19、R20与它们所连接的碳合起来形成(C3-C10)环烷基或(C3-C10)杂环,或者R20、R21与它们所连接的碳合起来形成(C3-C10)环烷基或(C3-C10)杂环,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
R25是芳基、杂芳基或(C3-C10)杂环,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
Rw在每次出现时独立地为H、卤代基、氰基、硝基、氧代、烷基、卤代烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、杂环、芳基、杂芳基、芳基烷基、杂芳基烷基、环烷基烷基、杂环烷基,其中所述烷基、卤代烷基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、杂环、芳基、杂芳基、芳基烷基、杂芳基烷基、环烷基烷基和杂环烷基基团可进一步独立地被一个或多个选自由卤代基、氰基、氧代(C3-C10)杂环、(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)环烷基、-(CH2)n-(C3-C10)杂环、-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基、芳基和杂芳基以下组成的组的基团取代;
X是键、-SO2-、-(CH2)nC(O)(CH2)m-、-C(O)NH-、-C(O)N(Rw)-、-NHC(O)NH-或-(CH2)n-;
Y1是–NHR25、-NHC(O)R25或–CHR25R26;
m是0、1、2、3或4;
k是1、2、3、4、5、6、7、8、9或10;
n是0、1、2、3或4。
4.如权利要求3所述的化合物,其中L是-Lb-(La)t-;其中La在每次出现时独立地选自由以下组成的组:键、CR5R6、C(R5R6)O、C(R5R6)C(R5R6)O、SO2、NR5、C(R5R6)NR5、SO2NR5、SONR5、CONR5、NR5CONR6、NR5SO2NR6、CO、CR5═CR6、C≡C、SiR5R6、P(O)R5、P(O)OR5、NR5C(═NCN)NR6、NR5C(═NCN)和NR5C(═CNO2)NR6,它们中的任一者在化合价允许的情况下可任选被1个或多个Rw基团取代;
Lb选自由以下组成的组:
t是0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20。
5.如权利要求3所述的化合物,其中L是-(CH2CH2)t-、-(CH2O)t-或-(CH2CH2O)t-。
6.如权利要求3-5中任一项所述的化合物,其中Q是与靶蛋白结合的部分,其中所述靶蛋白选自由以下组成的组:B7.1和B7、TINFR1m、TNFR2、NADPH氧化酶、Bcl、C5a受体、HMG-CoA还原酶、PDE V磷酸二酯酶类型、PDE IV磷酸二酯酶类型4、PDE I、PDEII、PDEIII、角鲨烯-藿烯环化酶、CXCR1、CXCR2、一氧化氮(NO)合酶、环加氧酶1、环加氧酶2、5HT受体、多巴胺受体、G蛋白、Gq、组胺受体、5-脂加氧酶、胰蛋白酶丝氨酸蛋白酶、胸苷酸合酶、嘌呤核苷磷酸化酶、锥虫GAPDH、糖原磷酸化酶、碳酸酐酶、趋化因子受体、JAW/STAT、类视黄醇X受体、HIV 1蛋白酶、HIV 1整合酶、流感、神经氨酸酶、乙型肝炎逆转录酶、钠通道、蛋白P-糖蛋白(和MRP)、酪氨酸激酶、CD23、CD124、酪氨酸激酶p56 lck、CD4、CD5、IL-2受体、IL-1受体、TNF-α、ICAM1、Cat+通道、VCAM、VLA-4整联蛋白、选择素、CD40/CD40L、newokinin及受体、肌苷一磷酸脱氢酶、p38 MAP激酶、Ras/Raf/ME/ERK途径、白介素-1转化酶、半胱天冬酶、HCV、NS3蛋白酶、HCV NS3 RNA解旋酶、甘氨酰胺核糖核苷酸甲酰基转移酶、鼻病毒3C蛋白酶、单纯疱疹病毒-1(HSV-I)蛋白酶、巨细胞病毒(CMV)蛋白酶、聚(ADP-核糖)聚合酶、细胞周期蛋白依赖性激酶、血管内皮生长因子、c-Kit、TGFβ激活激酶1、雷帕霉素的哺乳动物靶标、SHP2、雄激素受体、催产素受体、微粒体转移蛋白抑制剂、5α还原酶、血管紧张素II、甘氨酸受体、去甲肾上腺素再摄取受体、雌激素受体、雌激素相关受体、粘着斑激酶、Src、内皮素受体、神经肽Y及受体、腺苷受体、腺苷激酶和AMP脱氨酶、嘌呤能受体(P2Y1、P2Y2、P2Y4、P2Y6、P2X1-7)、法尼基转移酶、香叶基香叶基转移酶、NGF的TrkA a受体、β-淀粉样蛋白、酪氨酸激酶Flk-1、玻连蛋白受体、整联蛋白受体、Her-2/neu、端粒酶、胞质磷脂酶A2和EGF受体酪氨酸激酶、蜕皮素20-单加氧酶、GABA门控氯离子通道的离子通道、乙酰胆碱酯酶、电压敏感性钠通道蛋白、钙通道蛋白和氯离子通道蛋白、乙酰基-CoA羧化酶、腺苷酸琥珀酸合成酶、原卟啉原氧化酶和烯醇式丙酮酰莽草酸-磷酸合酶。
7.如权利要求3-5中任一项所述的化合物,其中Q是为Hsp90抑制剂、激酶抑制剂、磷酸酶抑制剂、HDM2/MDM2抑制剂、人BET布罗莫结构域抑制剂、HDAC抑制剂、人赖氨酸甲基转移酶抑制剂、RAF受体抑制剂、FKBP抑制剂、血管生成抑制剂、芳烃受体抑制剂、雄激素受体抑制剂、雌激素受体抑制剂、甲状腺激素受体抑制剂、HIV蛋白酶抑制剂、HIV整合酶抑制剂、酰基蛋白硫酯酶1抑制剂或酰基蛋白硫酯酶2抑制剂的部分。
8.如权利要求3-5中任一项所述的化合物,其中Q是为TANK-结合激酶1(TBK1)抑制剂、雌激素受体α(ERα)抑制剂、含布罗莫结构域的蛋白4(BRD4)抑制剂、雄激素受体(AR)抑制剂、血小板源性生长因子受体抑制剂、p38 MAPK抑制剂、Bcr-Abl酪氨酸-激酶抑制剂、Her2抑制剂、EGFR抑制剂、MDM2抑制剂、含布罗莫结构域的蛋白2(BRD2)抑制剂、HDAC抑制剂、DHFR抑制剂或c-Myc抑制剂的部分。
9.如权利要求3-5中任一项所述的化合物,其中Q是选自由甲氧苄啶、伏立诺他、他莫昔芬、JQ1、Nutlin 3、阿法替尼、氯烷烃、达沙替尼、BIRB796、FK-506、辛伐他汀、雷帕霉素和索拉非尼组成的组的部分。
10.如权利要求1-9中任一项所述的化合物,其中所述E3泛素连接酶选自塞勒布隆(CRBN)、受损DNA结合蛋白1(DDB1)、Cullin-4A(CUL4A)、cullins 1的调节剂(ROC1)和VonHippel Lindau(VHL)。
11.如权利要求10所述的化合物,其中所述E3泛素连接酶是CRBN。
12.如权利要求3-11中任一项所述的化合物,其中所述化合物能够同时与所述靶蛋白和所述E3泛素连接酶结合。
13.如权利要求12所述的化合物,其中所述结合导致所述靶蛋白被所述E3泛素连接酶泛素化。
14.如权利要求12所述的化合物,其中所述结合导致所述靶蛋白被所述蛋白酶体降解。
15.一种药物组合物,其包含如权利要求1或3所述的化合物和药学上可接受的载体、添加剂和/或赋形剂。
16.一种治疗受试者的疾病的方法,其中失调的蛋白质活性是造成所述疾病的原因,所述方法包括施用有效量的根据权利要求3的化合物。
17.如权利要求16所述的方法,其中所述疾病是癌症。
18.如权利要求17所述的方法,其中所述癌症选自由以下组成的组:鳞状细胞癌、基底细胞癌、腺癌、肝细胞癌、肾细胞癌、膀胱癌、肠癌、乳腺癌、宫颈癌、结肠癌、食道癌、头癌、肾癌、肝癌、肺癌、颈癌、卵巢癌、胰腺癌、前列腺癌、胃癌、子宫癌、白血病、淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、黑素瘤、骨髓增生性疾病、多发性骨髓瘤、肉瘤,包括尤因氏肉瘤、血管肉瘤、卡波西氏肉瘤、脂肪肉瘤、肌肉瘤、周围神经上皮瘤、滑膜肉瘤;神经胶质瘤、星形细胞瘤、少突神经胶质瘤、室管膜瘤、胶质母细胞瘤、成神经细胞瘤、神经节瘤、神经节神经胶质瘤、成神经管细胞瘤、松果体细胞肿瘤、脑膜瘤、脑膜肉瘤、神经纤维瘤、神经鞘瘤、睾丸癌、甲状腺癌、星形细胞瘤、霍奇金病、维尔姆斯瘤和畸胎癌。
19.如权利要求17所述的方法,其中所述癌症是多发性骨髓瘤。
20.如权利要求16所述的方法,其中所述疾病是自身免疫性疾病或病症。
21.如权利要求20所述的方法,其中所述自身免疫性疾病或病症选自如多发性硬化症、糖尿病、狼疮、乳糜泻、克罗恩病、溃疡性结肠炎、格林-巴利综合征、硬皮病、古德帕斯丘综合征、韦格纳肉芽肿病、自身免疫性癫痫、拉斯穆森脑炎、原发性胆汁性硬化、硬化性胆管炎、自身免疫性肝炎、阿狄森病、桥本甲状腺炎、纤维肌痛、美尼尔综合征;移植排斥(例如,预防同种异体移植排斥)恶性贫血、类风湿性关节炎、全身性红斑狼疮、皮肌炎、舍格伦综合征、红斑狼疮、多发性硬化症、重症肌无力、赖特综合征、格雷夫斯病及其他自身免疫性疾病或病症。
22.一种调节塞勒布隆的方法,其包括对有需要的受试者施用如权利要求15所述的组合物。
23.一种调节蛋白质的蛋白酶体降解的方法,其包括对有需要的受试者施用如权利要求15所述的组合物。
24.一种调节蛋白质与蛋白酶体的螯合的方法,其包括对有需要的受试者施用如权利要求15所述的组合物。
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