CN114573714B - 用于靶分子修饰的缀合物及其制备方法 - Google Patents
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Abstract
本申请涉及一种用于靶分子修饰的缀合物及其制备方法。本申请还涉及一种缀合物,其包含靶分子靶向部分以及蛋白降解器靶向部分,其中,所述靶分子靶向部分能够特异性识别所述靶分子并与该靶分子共价结合,所述蛋白降解器靶向部分与所述靶分子靶向部分直接或间接连接。本申请的用于靶分子修饰的缀合物可以具有促进靶分子降解的效果。
Description
技术领域
本申请涉及生物医药领域,具体的涉及一种用于靶分子修饰的缀合物及其制备方法。
背景技术
特异性降解靶分子成为疾病治疗中十分有前景的一种治疗手段。蛋白降解靶向嵌合物(Proteolysis Targeting Chimera,PROTAC)的化合物进入细胞后可以同时靶向胞内肿瘤相关蛋白和E3连接酶实现胞内蛋白的降解。然而,此类化合物难以实现细胞表面膜蛋白的降解,而且筛选靶向膜蛋白的高亲和力的小分子物质较为困难。溶酶体靶向嵌合体(lysosome targeting chimera,LYTAC)技术将靶向细胞表面受体CI-M6PR的寡糖通过化学反应偶联到靶蛋白的抗体上,然而LYTAC化合物的制备中寡糖的合成路线非常复杂,而采用的偶联技术也无法得到均一的产物,LYTAC化合物与靶分子的结合能力和降解效率也有待提高。AbTAC则开发了双特异性抗体,其中一个结构域靶向内吞受体RNF43,另一结构域靶向靶蛋白,然而制备均一的双特异性抗体具有较大的挑战性,同时该技术受限于靶细胞的内吞受体RNF43的表达。因此,开发一种不依赖于特定受体的、高效的膜蛋白降解技术迫在眉睫。
发明内容
本申请提供一种用于靶分子修饰的缀合物及其制备方法。本申请的用于靶分子修饰的缀合物可以具有合成简单,产物单一,与靶分子结合能力高和/或对靶分子降解效率高的特点,可以用于体内和/或体外对于靶分子的特异性降解,可以用于疾病的预防和治疗。
一方面,本申请提供一种缀合物,其包含:靶分子靶向部分以及蛋白降解器靶向部分;其中,所述靶分子靶向部分能够特异性识别靶分子并与该靶分子共价结合,所述蛋白降解器靶向部分与所述靶分子靶向部分直接或间接连接。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含第一官能团,所述靶分子包含第二官能团,当所述靶分子靶向部分与所述靶分子接近时,所述第一官能团能够与所述第二官能团反应而形成共价键。
在一种实施方式中,在所述第一官能团与所述第二官能团之间的距离小于约5E-10米时,所述第一官能团能够与所述第二官能团反应而形成共价键。
在一种实施方式中,所述第二官能团包含亲电基团。
在一种实施方式中,所述第二官能团包含天然氨基酸的侧链基团。
在一种实施方式中,所述第二官能团选自以下组:氨基、咪唑基、巯基、羟基、羧基、甲硫基,以及前述的衍生物。
在一种实施方式中,所述靶分子包含细胞表面的分子、细胞内的分子和/或细胞外的分子。
在一种实施方式中,所述靶分子选自以下组:多肽、核酸、小分子、多糖、脂质、纳米颗粒,以及前述的任意组合。
在一种实施方式中,所述靶分子选自以下组:免疫检查点分子、肿瘤相关分子和信号通路蛋白。
在一种实施方式中,所述靶分子选自以下组:PD-L1(细胞程序死亡-配体1)、EGFR(表皮生长因子受体)、HER-2(人类表皮生长因子受体-2)、Ras蛋白、CD38(淋巴细胞分化抗原CD38),以及前述的功能性片段。
在一种实施方式中,所述第一官能团选自以下组:
在一种实施方式中,所述第一官能团选自以下组:
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含非天然氨基酸的残基,所述非天然氨基酸包含所述第一官能团,所述非天然氨基酸选自以下组:
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含非天然氨基酸的残基,所述非天然氨基酸包含所述第一官能团,所述非天然氨基酸选自以下组:氟代硫酸盐-L-酪氨酸、6-溴-己酰赖氨酸,以及前述的衍生物。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分选自以下组:多肽、核酸、小分子、多糖、脂质、纳米颗粒,以及前述的任意组合。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含抗体或其抗原结合片段。
在一种实施方式中,所述抗体选自以下组:鼠源抗体、骆驼源抗体、嵌合抗体、人源化抗体和全人源抗体。
在一种实施方式中,所述抗原结合片段选自以下组:VHH,Fab,Fab′,Fv片段,(Fab')2,(Fab)2,scFv,di-scFv,亲和抗体(affibody)和dAb。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含单域抗体或其抗原结合片段。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,在第108位氨基酸、第110位氨基酸和/或第113位氨基酸包含所述第一官能团。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分能够特异性识别所述PD-L1。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第108位氨基酸、第110位氨基酸和/或第113位氨基酸被所述非天然氨基酸替换。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第108位氨基酸被所述6-溴-己酰赖氨酸替换、第110位氨基酸被所述6-溴-己酰赖氨酸替换、第113位氨基酸被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换和/或第108位氨基酸被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含SEQ ID NO:9-11中任一项所示的氨基酸序列。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,在第116位氨基酸包含所述第一官能团。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分能够特异性识别所述EGFR。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第116位氨基酸被所述非天然氨基酸替换。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第116位氨基酸被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器包含溶酶体和/或蛋白酶体。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器靶向部分选自以下组:多肽、核酸、小分子、多糖、脂质、纳米颗粒,以及前述的任意组合。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器靶向部分包含能够靶向溶酶体或蛋白酶体的分子或其功能活性片段。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器靶向部分选自以下组:溶酶体靶向肽(LTP)、低聚糖肽、甘露糖6-磷酸酯(M6P)、N-乙酰半乳糖胺(GalNAc)、半乳糖,以及前述的任意组合。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器靶向部分包含所述溶酶体靶向肽,所述溶酶体靶向肽的氨基酸序列如SEQ ID NO:63-77中任一项所示。
在一种实施方式中,所述缀合物还包含穿膜部分,所述穿膜部分能够促进所述靶分子进入细胞内,其中,所述穿膜部分与所述靶分子靶向部分直接或间接连接,和/或所述穿膜部分与所述蛋白降解器靶向部分直接或间接连接。
在一种实施方式中,所述穿膜部分选自以下组:穿膜肽(CPP)、低聚糖肽、甘露糖6-磷酸酯(M6P)、N-乙酰半乳糖胺(GalNAc)、半乳糖,以及前述的任意组合。
在一种实施方式中,所述穿膜部分包含聚精氨酸,所述聚精氨酸的重复单元数量至少为2。
在一种实施方式中,所述聚精氨酸的聚合单体包含D构型的精氨酸和/或L构型的精氨酸。
在一种实施方式中,所述缀合物包含所述穿膜肽和所述溶酶体靶向肽,所述穿膜肽和所述溶酶体靶向肽直接或间接连接。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器靶向部分包含能够靶向溶酶体或蛋白酶体和/或能够结合细胞表面促进内吞的受体的分子或其功能活性片段。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器靶向部分包含能够结合6-磷酸甘露糖受体(M6PR)的分子。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器靶向部分包含一个或多个甘露糖6-磷酸酯(M6P)或其功能活性片段。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器靶向部分包含约1个至约500个所述甘露糖6-磷酸酯或其功能活性片段。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器靶向部分包含支架分子,所述支架分子直接或间接连接所述一个或多个甘露糖6-磷酸酯或其功能活性片段。
在一种实施方式中,所述支架分子包含聚糖结构。
在一种实施方式中,所述支架分子包含糖蛋白,所述糖蛋白包含被所述一个或多个甘露糖6-磷酸酯或其功能活性片段修饰的一个或多个氨基酸。
在一种实施方式中,所述糖蛋白包含N-羧基酸酐(NCA)或其衍生物的基团。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器靶向部分包含能够结合去唾液酸糖蛋白受体(ASGPR)的分子或其功能活性片段。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器靶向部分包含所述去唾液酸糖蛋白受体的一个或多个配体。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器靶向部分包含一个或多个N-乙酰半乳糖胺(GalNAc)。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器靶向部分包含一个或多个半乳糖。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器靶向部分包含一个或多个葡萄糖。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器靶向部分包含所述去唾液酸糖蛋白受体的约1个至约500个配体。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器靶向部分包含支架分子,所述支架分子直接或间接连接所述去唾液酸糖蛋白受体的所述一个或多个配体。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器靶向部分包含所述一个或多个N-乙酰半乳糖胺修饰的一个或多个丙氨酸。
在一种实施方式中,所述支架分子包含一个、两个或三个所述N-乙酰半乳糖胺。
在一种实施方式中,所述支架分子包含一个、两个或三个所述半乳糖。
在一种实施方式中,所述缀合物包含融合蛋白。
在一种实施方式中,所述缀合物包含所述靶分子靶向部分、所述蛋白降解器靶向部分和所述穿膜部分,所述靶分子靶向部分、所述蛋白降解器靶向部分与所述穿膜部分之间相互独立地直接或间接连接。
在一种实施方式中,所述间接连接包含通过连接子连接。
在一种实施方式中,所述连接子包含肽连接子。
在一种实施方式中,所述连接子包含可酶切或不可酶切的连接子。
在一种实施方式中,所述可酶切的连接子包含可通过蛋白酶酶切的连接子。
在一种实施方式中,所述缀合物包含所述靶分子靶向部分、所述穿膜肽和所述溶酶体靶向肽。
在另一方面,本申请提供一种多肽,其包含靶分子靶向部分,所述靶分子靶向部分能够特异性识别靶分子并与该靶分子共价结合。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含第一官能团,所述靶分子包含第二官能团,当所述靶分子靶向部分与所述靶分子接近时,所述第一官能团能够与所述第二官能团反应而形成共价键。
在一种实施方式中,在所述第一官能团与所述第二官能团之间的距离小于约5E-10米时,所述第一官能团能够与所述第二官能团反应而形成共价键。
在一种实施方式中,所述第二官能团包含亲电基团。
在一种实施方式中,所述第二官能团包含天然氨基酸的侧链基团。
在一种实施方式中,所述第二官能团选自以下组:氨基、咪唑基、巯基、羟基、羧基、甲硫基,以及前述的衍生物。
在一种实施方式中,所述靶分子包含细胞表面的分子、细胞内的分子和/或细胞外的分子。
在一种实施方式中,所述靶分子选自以下组:多肽、核酸、小分子、多糖、脂质、纳米颗粒,以及前述的任意组合。
在一种实施方式中,所述靶分子选自以下组:免疫检查点分子、肿瘤相关分子和信号通路蛋白。
在一种实施方式中,所述靶分子选自以下组:PD-L1(细胞程序死亡-配体1)、EGFR(表皮生长因子受体)、HER-2(人类表皮生长因子受体-2)、Ras蛋白、CD38(淋巴细胞分化抗原CD38),以及前述的功能性片段。
在一种实施方式中,所述第一官能团选自以下组:
在一种实施方式中,所述第一官能团选自以下组:
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含非天然氨基酸的残基,所述非天然氨基酸包含所述第一官能团,所述非天然氨基酸选自以下组:
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含非天然氨基酸的残基,所述非天然氨基酸包含所述第一官能团,所述非天然氨基酸选自以下组:氟代硫酸盐-L-酪氨酸、6-溴-己酰赖氨酸,以及前述的衍生物。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分选自以下组:多肽、核酸、小分子、多糖、脂质、纳米颗粒,以及前述的任意组合。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含抗体或其抗原结合片段。
在一种实施方式中,所述抗体选自以下组:鼠源抗体、骆驼源抗体、嵌合抗体、人源化抗体和全人源抗体。
在一种实施方式中,所述抗原结合片段选自以下组:VHH,Fab,Fab′,Fv片段,(Fab')2,(Fab)2,scFv,di-scFv,亲和抗体(affibody)和dAb。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含单域抗体或其抗原结合片段。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,在第108位氨基酸、第110位氨基酸和/或第113位氨基酸包含所述第一官能团。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分能够特异性识别所述PD-L1。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第108位氨基酸、第110位氨基酸和/或第113位氨基酸被所述非天然氨基酸替换。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第108位氨基酸被所述6-溴-己酰赖氨酸替换、第110位氨基酸被所述6-溴-己酰赖氨酸替换、第113位氨基酸被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换和/或第108位氨基酸被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含SEQ ID NO:9-11中任一项所示的氨基酸序列。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,在第116位氨基酸包含所述第一官能团。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分能够特异性识别所述EGFR。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第116位氨基酸被所述非天然氨基酸替换。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第116位氨基酸被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列。
在另一方面,本申请提供一种核酸分子,其编码本申请的缀合物和/或本申请的多肽。
在另一方面,本申请提供一种载体,其包含本申请的核酸分子。
在另一方面,本申请提供一种免疫缀合物,其包含本申请的缀合物和/或本申请的多肽。
在另一方面,本申请提供一种细胞,其包含本申请的缀合物、本申请的核酸分子、本申请的载体和/或本申请的免疫缀合物。
在另一方面,本申请提供一种组合物,其包含本申请的缀合物、本申请的多肽、本申请的核酸分子、本申请的载体、本申请的免疫缀合物和/或本申请的细胞,以及任选地药学上可接受的载剂。
在另一方面,本申请提供一种试剂盒,其包含本申请的缀合物、本申请的多肽、本申请的核酸分子、本申请的载体、本申请的免疫缀合物、本申请的细胞、和/或本申请的组合物。
在另一方面,本申请提供本申请的缀合物、本申请的多肽、本申请的核酸分子、本申请的载体、本申请的免疫缀合物、本申请的细胞、本申请的组合物、和/或本申请的试剂盒在制备药物中的用途,所述药物用于预防和/或治疗疾病和/或病症。
在一种实施方式中,其中所述疾病和/或病症包含肿瘤。
在一种实施方式中,其中所述疾病和/或病症选自以下组:PD-L1阳性肿瘤、EGFR阳性肿瘤、HER-2阳性肿瘤、CD38阳性肿瘤和Ras功能和/或活性异常的肿瘤。
在一种实施方式中,其中所述疾病和/或病症包含实体瘤。
在一种实施方式中,其中所述疾病和/或病症包含乳腺癌、肺癌、皮肤癌、骨髓瘤和/或宫颈癌。
在另一方面,本申请提供本申请的缀合物、本申请的多肽、本申请的核酸分子、本申请的载体、本申请的免疫缀合物、本申请的细胞、本申请的组合物、和/或本申请的试剂盒,其用于预防和/或治疗疾病和/或病症。
在一种实施方式中,其中所述疾病和/或病症包含肿瘤。
在一种实施方式中,其中所述疾病和/或病症选自以下组:PD-L1阳性肿瘤、EGFR阳性肿瘤、HER-2阳性肿瘤、CD38阳性肿瘤和Ras功能和/或活性异常的肿瘤。
在一种实施方式中,其中所述疾病和/或病症包含实体瘤。
在一种实施方式中,其中所述疾病和/或病症包含乳腺癌、肺癌、皮肤癌、骨髓瘤和/或宫颈癌。
在另一方面,本申请提供一种预防和/或治疗疾病和/或病症的方法,其包含向有需要的对象施用本申请的缀合物、本申请的多肽、本申请的核酸分子、本申请的载体、本申请的免疫缀合物、本申请的细胞、本申请的组合物、和/或本申请的试剂盒。
在一种实施方式中,其中所述疾病和/或病症包含肿瘤。
在一种实施方式中,其中所述疾病和/或病症选自以下组:PD-L1阳性肿瘤、EGFR阳性肿瘤、HER-2阳性肿瘤、CD38阳性肿瘤和Ras功能和/或活性异常的肿瘤。
在一种实施方式中,其中所述疾病和/或病症包含实体瘤和/或血液瘤。
在一种实施方式中,其中所述疾病和/或病症包含乳腺癌、肺癌、皮肤癌、骨髓瘤和/或宫颈癌。
在另一方面,本申请提供一种影响靶分子含量的方法,施用本申请的缀合物、本申请的多肽、本申请的核酸分子、本申请的载体、本申请的免疫缀合物、本申请的细胞、本申请的组合物和/或本申请的试剂盒。
在一种实施方式中,所述方法包含体外方法、离体方法和/或体内方法。
在一种实施方式中,所述靶分子为细胞表面的分子和/或细胞内的分子。
在一种实施方式中,所述靶分子为皮肤细胞、骨髓细胞、宫颈细胞、肺细胞和/或乳腺细胞表面的分子。
在一种实施方式中,所述靶分子为皮肤癌细胞、骨髓瘤细胞、宫颈癌细胞、肺癌细胞和/或乳腺癌细胞表面的分子。
在一种实施方式中,所述细胞选自以下组:PD-L1阳性细胞、EGFR阳性细胞、HER-2阳性细胞、CD38阳性细胞和Ras功能和/或活性异常的细胞。
在另一方面,本申请提供一种制备本申请缀合物和/或本申请多肽的方法,包含在使得所述缀合物和/或所述多肽表达的条件下,培养本申请的细胞。
在一种实施方式中,通过转肽酶A(Srt A)连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分的C末端包含如SEQ ID NO:93所示的氨基酸序列LPXTG和/或所述靶分子靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列,其中X为任意氨基酸。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分的C末端包含如SEQ ID NO:92所示的氨基酸序列LPETG和/或所述靶分子靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器靶向部分的C末端包含如SEQ ID NO:93所示的氨基酸序列LPXTG和/或所述蛋白降解器靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列,其中X为任意氨基酸。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器靶向部分的C末端包含如SEQ ID NO:92所示的氨基酸序列LPETG和/或所述蛋白降解器靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分的C末端包含如SEQ ID NO:93所示的氨基酸序列LPXTG,所述蛋白降解器靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列,通过所述转肽酶A(Srt A)连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分,其中X为任意氨基酸。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分的C末端包含如SEQ ID NO:92所示的氨基酸序列LPETG,所述蛋白降解器靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列,通过所述转肽酶A(Srt A)连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器靶向部分的C末端包含如SEQ ID NO:93所示的氨基酸序列LPXTG,所述靶分子靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列,通过所述转肽酶A(Srt A)连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分,其中X为任意氨基酸。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器靶向部分的C末端包含如SEQ ID NO:92所示的氨基酸序列LPETG,所述靶分子靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列,通过所述转肽酶A(Srt A)连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分。
在另一方面,本申请提供一种制备本申请缀合物的方法,包含将所述缀合物的所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分直接或间接连接。
在一种实施方式中,通过转肽酶A(Srt A)连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分的C末端包含如SEQ ID NO:93所示的氨基酸序列LPXTG和/或所述靶分子靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列,其中X为任意氨基酸。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分的C末端包含如SEQ ID NO:92所示的氨基酸序列LPETG和/或所述靶分子靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器靶向部分的C末端包含如SEQ ID NO:93所示的氨基酸序列LPXTG和/或所述蛋白降解器靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列,其中X为任意氨基酸。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器靶向部分的C末端包含如SEQ ID NO:92所示的氨基酸序列LPETG和/或所述蛋白降解器靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分的C末端包含如SEQ ID NO:93所示的氨基酸序列LPXTG,所述蛋白降解器靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列,通过所述转肽酶A(Srt A)连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分,其中X为任意氨基酸。
在一种实施方式中,所述靶分子靶向部分的C末端包含如SEQ ID NO:92所示的氨基酸序列LPETG,所述蛋白降解器靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列,通过所述转肽酶A(Srt A)连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器靶向部分的C末端包含如SEQ ID NO:93所示的氨基酸序列LPXTG,所述靶分子靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列,通过所述转肽酶A(Srt A)连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分,其中X为任意氨基酸。
在一种实施方式中,所述蛋白降解器靶向部分的C末端包含如SEQ ID NO:92所示的氨基酸序列LPETG,所述靶分子靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列,通过所述转肽酶A(Srt A)连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分。
本领域技术人员能够从下文的详细描述中容易地洞察到本申请的其它方面和优势。下文的详细描述中仅显示和描述了本申请的示例性实施方式。如本领域技术人员将认识到的,本申请的内容使得本领域技术人员能够对所公开的具体实施方式进行改动而不脱离本申请所涉及发明的精神和范围。相应地,本申请的附图和说明书中的描述仅仅是示例性的,而非为限制性的。
附图说明
本申请所涉及的发明的具体特征如所附权利要求书所显示。通过参考下文中详细描述的示例性实施方式和附图能够更好地理解本申请所涉及发明的特点和优势。对附图简要说明如下:
图1显示的是,本申请的缀合物降解靶分子可以实现的一种降解途径的示意图。
图2A和图2B显示的是,可以作为靶分子靶向部分前体的野生型单域抗体的一级质谱图。
图3A和图3B显示的是,PD-L1单域抗体的不同位点被BrC6K或FSY替换后的所得化合物库的质谱图。
图4A和图4B显示的是,SDS-PAGE分析PD-L1单域抗体的不同位点被BrC6K或FSY替换后的所得化合物库同靶分子交联结果。
图5A、图5B和图5C显示的是,具有高邻近交联反应活性的靶分子靶向部分与靶分子交联后的交联肽段的串联质谱。
图6A、图6B、图6C和图6D显示的是,PD-L1单域抗体或EGFR单域抗体中不同位点被BrC6K或FSY替换后的所得靶分子靶向部分的质谱图。
图7A、图7B、和图7C显示的是,PD-L1单域抗体或EGFR单域抗体中不同位点被BrC6K或FSY替换后的所得靶分子靶向部分与靶分子体外交联检测结果。
图8A、图8B、图8C和图8D显示的是,靶分子靶向部分结合细胞表面靶分子的检测结果。
图9A和图9B显示的是,转肽酶介导蛋白降解器靶向部分和靶分子靶向部分连接制备本申请缀合物的示意图。
图10显示的是,PD-L1靶分子靶向部分αPD-L1 L108FSY,以及PD-L1靶分子靶向部分连接蛋白降解器靶向部分所得的缀合物GlueTACFSY/PD-L1的一级质谱图。
图11显示的是,野生型EGFR单域抗体连接蛋白降解器靶向部分所得的偶联物NbTAC-EGFR,以及EGFR靶分子靶向部分连接蛋白降解器靶向部分所得的缀合物GlueTAC-EGFR的一级质谱图。
图12显示的是,对照组和GlueTAC试验组的活细胞共聚焦荧光成像。
图13A、图13B、图13C和图13D显示的是,免疫印迹试验表征本申请缀合物促进靶分子降解的结果。
图14显示的是,免疫印迹试验表征本申请缀合物促进靶分子降解的结果。
图15显示的是,氯化铵存在情况下,申请缀合物促进靶分子降解的结果。
图16显示的是,本申请缀合物在体内促进肿瘤组织的靶分子降解的结果。
具体实施方式
以下由特定的具体实施例说明本申请发明的实施方式,熟悉此技术的人士可由本说明书所公开的内容容易地了解本申请发明的其他优点及效果。
术语定义
在本申请中,术语“药学上可接受的载剂”通常是指药剂学可接受的载体、赋形剂或稳定剂,它们在所采用的剂量和浓度对暴露于其的细胞或哺乳动物可以是无毒的。生理学可接受的载体可以包括合适的物质。药学上可接受的载体(carrier)与基因工程中用于插入核酸的载体(vector)通常并不是同一物质。
在本申请中,术语“肿瘤”通常是指任何新的病理性的组织增生。肿瘤细胞可以局部地或通过血流和淋巴系统扩散到身体其他部分。在本申请中,所述肿瘤可以包括良性肿瘤和恶性肿瘤。在本申请中,所述肿瘤可以包括实体瘤。在本申请中,所述肿瘤可以包括癌症。在本申请中,所述肿瘤的实例包括但不限于乳腺癌。
在本申请中,术语“实体瘤”通常是指可以通过临床检查(例如X线照射、CT扫描、B超或触诊等)手段检测到的有形的肿瘤。所述肿瘤可以包括异常细胞生长形成的赘生物或实体病变。
在本申请中,术语“缀合物”通常是指由两个或更多独立的部分接合在一起形成的任何物质。例如,缀合物可以包含由一段多肽与另一段或多段多肽连接而成的物质。例如,缀合物可以由共价键连接而成。例如,缀合物可以是通过转肽酶将单域抗体与穿膜肽以及溶酶体靶向肽连接形成的物质。
在本申请中,术语“靶分子靶向部分”通常是指能够特异性识别和/或特异性结合靶分子的部分。例如,靶分子靶向部分可以是抗原结合蛋白、抗体或抗体的抗原结合片段。例如,靶分子靶向部分还可以具有与靶分子形成共价键的能力。
在本申请中,术语“特异性识别”通常是指识别特异性靶分子,但是基本不识别或结合样品中其它分子的物质或部分。在某些情形中,特异性结合至抗原的抗体还可以结合至靶分子的不同等位形式。
在本申请中,术语“蛋白降解器”通常是指蛋白质降解相关的细胞内特定结构。例如,蛋白降解器可以包含细胞内具有降解蛋白能力的特定形态结构和功能的微器官。例如,蛋白降解器可以包含胞内的溶酶体。
在本申请中,术语“蛋白降解器靶向部分”通常是指能够靶向蛋白降解器的部分。例如,具有蛋白降解器靶向部分的物质,相比于不具有蛋白降解器靶向部分的该物质,可以以更高的数量比例进入蛋白降解器。例如,当一种物质连接了蛋白降解器靶向部分,该物质进入蛋白降解器的比例可以提高。例如,蛋白降解器靶向部分可以为溶酶体靶向肽或者可以为能够结合6-磷酸甘露糖受体(M6PR)的分子。
在本申请中,术语“穿膜肽”通常是指是一类能够穿过细胞膜或组织屏障的短肽。例如,穿膜肽可以通过内吞和直接穿透等机制运载蛋白质、RNA、DNA等生物大分子进入细胞内发挥其效应功能。
在本申请中,术语“溶酶体靶向肽”通常是指一类能够靶向溶酶体的肽段。例如,溶酶体靶向肽可以运载蛋白质、RNA、DNA等靶分子进入溶酶体。
在本申请中,术语“官能团”通常是指物质中执行一些功能或活性并与其他分子反应的部分。例如,一种官能团可以与另一种官能团发生化学反应以形成共价键连接。
在本申请中,术语“亲电基团”通常是指电子不足或电子缺乏的分子或其部分。例如,亲电基团可以选自以下组:氨基、咪唑基、巯基、羟基、羧基、甲硫基,以及前述的衍生物。
在本申请中,术语“氨基”通常是指-NH2。例如,氨基可以被任意取代。
在本申请中,术语“咪唑基”通常是指1,3二氮唑基(Imidazolyl)。例如,咪唑基可以被任意取代。
在本申请中,术语“巯基”通常是指-SH。例如,巯基可以被任意取代。
在本申请中,术语“羟基”通常是指-OH。例如,羟基可以被任意取代。
在本申请中,术语“羧基”通常是指-COOH。例如,羧基可以被任意取代。
在本申请中,术语“甲硫基”通常是指-SCH3。例如,甲硫基可以被任意取代。
在本申请中,术语“卤素”通常是指氟、氯、溴和/或碘。
在本申请中,术语“烷基”、“烯基”、“环烷基”通常可以在名称前加一个标识表示在特定情况下基团中存在的原子数,例如,C1-C4烷基,C3-C7环烷氧基,C1-C4烷基羰基氨基等,“C”后所跟下标数字表示在基团中存在的碳原子数。例如,C3烷基是指具有三个碳原子的烷基(例如,正丙基,异丙基);C1-4中基团的成员可具有落入1-4范围内的任何数目的碳原子。在本申请中,语“烷基”、“烯基”、“环烷基”通常可以任意地被取代。
在本申请中,术语“包含”或“包括”通常是指包括明确指定的特征,但不排除其他要素。在某些情形中,“包含”或者“包括”也涵盖“为”或者“由…组成”的情况。
在本申请中,术语“约”通常是指在指定数值以上或以下0.5%-10%的范围内变动,例如在指定数值以上或以下0.5%、1%、1.5%、2%、2.5%、3%、3.5%、4%、4.5%、5%、5.5%、6%、6.5%、7%、7.5%、8%、8.5%、9%、9.5%、或10%的范围内变动。
在本申请中,术语“PD-L1”通常是指PD-1的两种细胞表面糖蛋白配体之一(另一种是PD-L2)。例如,PD-L1可以在结合PD-1后下调T细胞活化和细胞因子分泌。例如,术语“PD-L1”可以包括人PD-L1(hPD-L1),hPD-L1的变体、同种型和物种同系物,以及包含PD-L1功能活性片段的物质。完整hPD-L1序列可见于GenBank登录号Q9NZQ7下。
在本申请中,术语“EGFR”通常是指人表皮生长因子受体1(又称为HER-1)。例如,EGFR的GenBank登录号可以为AF125253。例如,术语“EGFR”可以包括人EGFR,EGFR的变体、同种型和物种同系物,以及包含EGFR功能活性片段的物质。
在本申请中,术语“HER-2”通常是指人表皮生长因子受体2。例如,HER-2的GenBank登录号可以为P04626。例如,术语“HER-2”可以包括人HER-2,HER-2的变体、同种型和物种同系物,以及包含HER-2功能活性片段的物质。
在本申请中,术语“Ras”通常是指一种GTP结合蛋白。例如,Ras的GenBank登录号可以为P01112。例如,术语“Ras”可以包括人Ras,Ras的变体、同种型和物种同系物、失去GTP水解能力的Ras,以及包含Ras功能活性片段的物质。
在本申请中,术语“CD38”通常是指淋巴细胞表面抗原CD38。例如,CD38的GenBank登录号可以为P28907。例如,术语“CD38”可以包括人CD38,CD38的变体、同种型和物种同系物,以及包含CD38功能活性片段的物质。
在本申请中,术语“免疫检查点分子”通常是指一种调节免疫系统的分子。例如,免疫检查点分子可以防止免疫系统攻击细胞。例如,免疫检查点分子可以是PD-L1。
在本申请中,术语“肿瘤相关分子”通常是指与肿瘤的发生和/或发展相关的分子。例如,肿瘤相关分子可以是与肿瘤的生长和/或转移相关的分子。例如,肿瘤相关分子可以是肿瘤细胞高表达的分子。
在本申请中,术语“信号通路蛋白”通常是指细胞信号通路相关的蛋白。例如,信号通路蛋白可以激活MAPK信号通路的蛋白。
在本申请中,术语“CDR”也称“互补决定区”通常是指抗体可变结构域中的区域,其序列是高度可变的和/或形成结构定义环。通常,抗体包括六个CDR;在VH中三个(HCDR1、HCDR2、HCDR3),和在VL中三个(LCDR1、LCDR2、LCDR3)。例如,仅由重链组成的天然存在的骆驼抗体在缺乏轻链的情况下,其功能也能够正常且稳定。抗体CDR可以通过多种编码系统来确定,如CCG、Kabat、Chothia、IMGT、综合考虑Kabat/Chothia等。这些编码系统为本领域内已知。例如,靶分子靶向部分的氨基酸序列编号可以按照IMGT编号方案。例如,靶分子靶向部分的CDR可以根据Kabat编号系统确定。
在本申请中,术语“抗体”通常是指免疫球蛋白或其片段或其衍生物,可以涵盖包括抗原结合位点的任何多肽,无论其是在体外还是体内产生的。该术语可以包括但不限于多克隆的、单克隆的、单特异性的、多特异性的、非特异性的、人源化的、单链的、嵌合的、合成的、重组的、杂化的、突变的和移植的抗体。除非另外被术语“完整的”修饰,如在“完整的抗体”中,为了本申请的目的,术语“抗体”也可以包括抗体片段,比如Fab、F(ab')2、Fv、scFv、Fd、亲和抗体(affibody)、dAb和/或保持抗原结合功能的其它抗体片段。通常,这样的片段可以包括抗原结合结构域。基本的4链抗体单元可以是由两个相同的轻(L)链和两个相同的重(H)链组成的异四聚体糖蛋白。IgM抗体可以由5个基本的异四聚体单元与另外一个称为J链的多肽组成,且含有10个抗原结合位点,而IgA抗体可以包括2-5个可以与J链相结合聚合形成多价组合的基本4链单元。就IgG而言,4链单元可以一般为约150,000道尔顿。每个L链可以通过一个共价二硫键与H链连接,而两个H链可以通过一个或多个取决于H链同种型的二硫键相互连接。每个H和L链还可以具有规则间隔的链内二硫化桥键。每个H链在N末端可以具有可变结构域(VH),对于α和γ链各自继之以三个恒定结构域(CH)、对于μ和ε同种型继之以四个CH结构域。每个L链在N末端可以具有可变结构域(VL),在其另一端具有恒定结构域。VL与VH对应,且CL与重链的第一恒定结构域(CH1)可以相对应。特定的氨基酸残基可以被认为在轻链和重链可变结构域之间形成界面。VH和VL配对可以一起形成单个抗原结合位点。对于不同类别抗体的结构和性质。来自任何脊椎动物物种的L链可以基于其恒定结构域的氨基酸序列可以被分为两种明显不同的类型中的一种,称为κ和λ。根据重链(CH)恒定结构域的氨基酸序列,可以将免疫球蛋白分为不同的类别或同种型。目前存在五类免疫球蛋白:IgA、IgD、IgE、IgG和IgM,可以具有分别被命名为α、δ、ε、γ和μ的重链。
在本申请中,术语“多肽”通常是指氨基酸的聚合物。例如,多肽可以不是指特定长度的产物;因此,多肽的定义中可以包括了肽、寡肽和蛋白质。这个术语也可以不是指或排除多肽的表达后修饰,例如,糖基化、乙酰化作用、磷酸化作用等等。例如,多肽可以包含一个或多个氨基酸(包括,例如,非天然氨基酸,等)类似物的多肽、有取代键的多肽、以及本领域已知的修饰,既可以包括自然发生的也可以包括非自然发生的修饰。
在本申请中,术语“抗原结合片段”通常是指具有特异结合抗原能力的一个或多个多肽片段。在本申请中,所述抗原结合片段可以包括Fab,Fab’,F(ab)2、Fv片段、F(ab’)2,scFv,di-scFv,亲和抗体(affibody)和/或dAb。
在本申请中,术语“可变区”通常是指在抗体之间可变结构域的某些区段在序列上可能存在较大差异的区域。轻链中的“可变区”可以包含轻链可变区VL;重链中的“可变区”可以包含重链可变区VH。可变结构域可以介导抗原结合并决定特定抗体对其特定抗原的特异性。然而,可变性可以并非在整个可变结构域范围内均匀分布。它可以通常集中在轻链和重链可变结构域中称为高变区(CDR或HVR)的三个区段中。可变结构域的更高度保守的部分可以称为框架区(FR)。天然重链和轻链的可变结构域各自可以包含四个FR区,大多数采用β-折叠构型,通过三个CDR连接,其形成环形连接,并且在一些情况下可以形成β-折叠结构的一部分。每条链中的CDR可以通过FR区紧密靠近地保持在一起,并且来自另一条链的CDR一同促进抗体的抗原结合位点的形成。
在本申请中,术语“Fab”通常是指抗体的抗原结合片段。如上所述,可以使用木瓜蛋白酶消化完整的抗体。抗体经木瓜蛋白酶消化后产生两个相同的抗原结合片段,即“Fab”片段,和残余的“Fc”片段(即Fc区,同上)。Fab片段可以由一条完整的L链与一条重链的可变区和该H链(VH)的第一恒定区(CH1)组成。
在本申请中,术语“Fab′”或“Fab′片段”通常是指人单克隆抗体的单价抗原结合片段,该片段比Fab片段稍大。例如,Fab′片段可以包括所有轻链,所有重链可变区以及重链的所有或部分第一和第二恒定区。例如,Fab′片段还可包括重链的部分或所有的220-330个氨基酸残基。
在本申请中,术语“(Fab’)2”通常是指通过胃蛋白酶消化完整抗体所产生的抗体片段。F(ab')2片段可以含有由二硫键维持在一起的两个Fab片段和部分铰链区。F(ab')2片段可以具有二价抗原结合活性并且能够交联抗原。
在本申请中,术语“Fv”或“Fv片段”通常是指人单克隆抗体的单价抗原结合片段,可以包括所有或部分重链可变区和轻链可变区,并且可以缺乏重链恒定区和轻链恒定区。重链可变区和轻链可变区可以包括例如CDR。例如,Fv片段可以包括重链和轻链的约110个氨基酸的所有或部分氨基端可变区。
在本申请中,术语“scFv”通常是指包含至少一个包括轻链的可变区抗体片段和至少一个包括重链的可变区的抗体片段的融合蛋白,其中所述轻链和重链可变区可以是邻接的(例如经由合成接头例如短的柔性多肽接头),并且能够以单链多肽形式表达,且其中所述scFv可以保留其所来源的完整抗体的特异性。除非特别说明,否则如本申请中使用的那样,scFv可以以任何顺序(例如相对于多肽的N末端和C末端)具有所述的VL和VH可变区,scFv可以包括VL-接头-VH或可以包括VH-接头-VL。
在本申请中,术语“di-scFv”通常是指两个scFv可以以任何顺序(例如相对于多肽的N末端和C末端)进行连接得到的物质。
在本申请中,术语“亲和抗体”通常是指一种亲和蛋白。例如,亲和抗体(Affibody)分子可以是基于58个氨基酸残基蛋白结构域的亲和蛋白,所述结构域可以源自葡萄球菌A蛋白的三螺旋束IgG结合结构域。例如使用噬菌体展示技术可以从文库中选择靶向期望分子的亲和抗体变体。亲和抗体分子可以以简单稳健的结构和低的分子量(6kDa)的特点从而用于多种应用,例如,可以用作受体相互作用的检测试剂和抑制剂。有关亲和抗体及其生产的进一步描述发现可以记载在US 5,831,012中。标记的亲和抗体也可以用于成像应用中,以测定同种型的丰度。
在本申请中,术语“dAb”通常是指具有VH域或VL域的抗原结合片段,可以参考例如WO2006030220A1、WO2006003388A2或其它公布的专利申请。
在本申请中,术语“VHH”通常是指包含重链抗体的可变抗原结合结构域的抗体。VHH也可以称为纳米抗体(Nanobody)(Nb)和/或单域抗体。
在本申请中,术语“单克隆抗体”通常是指单分子组成的抗体分子制备物。单克隆抗体可以通常针对单个抗原位点具有高度特异性。而且,与常规多克隆抗体制剂(通常具有针对不同决定簇的不同抗体)不同,各单克隆抗体可以是针对抗原上的单个决定簇。除了它们的特异性之外,单克隆抗体的优点在于它们可以通过杂交瘤培养合成,不受其他免疫球蛋白污染。修饰语“单克隆”可以表示从基本上同质的抗体群体获得的抗体的特征,并且不被解释为需要通过任何特定方法产生抗体。例如,本申请使用的单克隆抗体可以在杂交瘤细胞中制备,或者可以通过重组DNA方法制备。
在本申请中,术语“嵌合抗体”通常是指其中可变区源自一个物种,而恒定区源自另一个物种的抗体。通常,可变区可以源自实验动物诸如啮齿动物的抗体(“亲本抗体”),且恒定区源自人类抗体,使得所得嵌合抗体与亲本(例如小鼠来源)抗体相比,在人类个体中引发不良免疫反应的可能性可以降低。
在本申请中,术语“人源化抗体”通常是指非人抗体(例如小鼠抗体)的CDR区以外的部分或全部有的氨基酸被源自人免疫球蛋白的相应的氨基酸置换的抗体。在CDR区中,氨基酸的小的添加、缺失、插入、置换或修饰也可以是允许的,只要它们仍保留抗体结合特定抗原的能力。人源化抗体可任选地包含人类免疫球蛋白恒定区的至少一部分。“人源化抗体”可以保留类似于原始抗体的抗原特异性。非人(例如鼠)抗体的“人源化”形式可以最低限度地包含衍生自非人免疫球蛋白的序列的嵌合抗体。在某些情形中,可以将人免疫球蛋白(受体抗体)中的CDR区残基用具有所期望性质、亲和力和/或能力的非人物种(供体抗体)(诸如小鼠,大鼠,家兔或非人灵长类动物)的CDR区残基替换。在某些情形中,可以将人免疫球蛋白的FR区残基用相应的非人残基替换。此外,人源化抗体可以包含在受体抗体中或在供体抗体中没有的氨基酸修饰。进行这些修饰可以是为了进一步改进抗体的性能,诸如结合亲和力。
在本申请中,术语“全人源抗体”通常是指仅包含人类免疫球蛋白蛋白质序列的抗体。如果其是在小鼠中、在小鼠细胞中或在衍生自小鼠细胞的杂交瘤中生产,那么全人源抗体可能含有鼠糖链。类似地,“小鼠抗体”或“大鼠抗体”分别指仅包含小鼠或大鼠免疫球蛋白序列的抗体。可通过噬菌体展示或其它分子生物学方法,在人体内、在具有人类免疫球蛋白种系序列的转基因动物体内生成全人源抗体。可用于制造抗体的示例性技术和其它技术,如使用文库,是本领域已知的。
发明详述
一方面,本申请提供一种缀合物。
图1显示的是,本申请的缀合物降解靶分子可以实现的降解途径之一的示意图。例如,本申请的缀合物可以包含:靶分子靶向部分以及蛋白降解器靶向部分,所述靶分子靶向部分可以特异性识别所述靶分子并与可以该靶分子共价结合;其中,所述蛋白降解器靶向部分可以与所述靶分子靶向部分直接或间接连接。
例如,所述靶分子靶向部分可以包含第一官能团,所述靶分子可以包含第二官能团,当所述靶分子靶向部分与所述靶分子接近时,所述第一官能团可以与所述第二官能团反应而形成共价键。例如,第二官能团可以包含亲电基团,第一官能团可以和第二官能团发生交联反应,例如可以是取代反应和/或加成反应。例如,靶分子靶向部分和靶分子可以通过取代反应和/或加成反应,形成共价键连接。例如,当所述靶分子靶向部分与所述靶分子通过抗体-抗原非共价作用接近时,所述第一官能团可以与所述第二官能团反应而形成共价键。例如,当所述靶分子靶向部分与所述靶分子接近时,靶分子靶向部分的骨架到靶分子的骨架之间的距离可以约等于带有第一官能团的侧链长度加上带有第二官能团的侧链长度之和。例如,第一官能团和第二官能团的取向可以是头对头,也可以是带有第一官能团的侧链和带有第二官能团的侧链可以通过旋转以实现头对头的取向。例如,在某些状态下,第一官能团和第二官能团之间的距离小于约5埃(5E-10米)时,所述第一官能团可以与所述第二官能团反应而形成共价键。例如,第一官能团和第二官能团之间的距离可以通过调节所述靶分子靶向部分的带有第一官能团的侧链长度来实现。例如,可以通过检测50%以上的第一官能团和第二官能团之间发生交联的时间,判断交联效率或邻近反应活性。例如,50%以上的第一官能团和第二官能团之间发生交联的时间小于约72小时、小于约48小时、小于约24小时、小于约12小时、小于约8小时、或小于约4小时,可以认为第一官能团具有与第二官能团发生邻近反应的活性。例如,靶分子靶向部分与所述靶分子通过非共价作用,例如抗体-抗原作用接近时,可以给予第一官能团具有与第二官能团发生邻近反应的条件和/或时间。
例如,第二官能团包含天然氨基酸的侧链基团。例如,天然氨基酸可以包含甘氨酸(Glycine)、丙氨酸(Alanine)、缬氨酸(Valine)、亮氨酸(Leucine)、异亮氨酸(Isoleucine)、苯丙氨酸(Phenylalanine)、色氨酸(Tryptophan)、酪氨酸(Tyrosine)、天冬氨酸(Aspartate)、组氨酸(Histidine)、天冬酰胺(Asparagine)、谷氨酸(Glutamate)、赖氨酸(Lysine)、谷胺酰胺(Glutamine)、甲硫氨酸(Methionine)、精氨酸(Arginine)、丝氨酸(Serine)、苏氨酸(Threonine)、半胱氨酸(Cysteine)、和/或脯氨酸(Proline)。例如,第二官能团也可以包含非天然氨基酸的侧链基团,例如一些靶分子可以包含硒半胱氨酸、吡咯赖氨酸和/或非天然氨基酸。例如,第二官能团也可以是任意的侧链基团,例如靶分子可以具有任意结构。
例如,第二官能团可以是亲电基团。例如,可以是包含电负性较大的原子,例如卤素原子、氧原子、氮原子、硫原子的基团。例如,第二官能团可以包含氨基、咪唑基、巯基、羟基、羧基和/或甲硫基。例如,第二官能团可以包含和/或例如,包含第二官能团的侧链可以选自以下组:-CH2SH、-CH2CH2COOH、-CH2CH2CONH2、-CH2CH2SCH3、-(CH2)3NH-C(NH)NH2、-(CH2)4NH2、-CH2-C6H4OH、-CH2OH、-CH(OH)CH3、-CH2COOH、-CH2CONH2、和-CH2-C3H3N2。例如,包含第二官能团的氨基酸可以选自以下组:半胱氨酸、谷氨酸、谷胺酰胺、甲硫氨酸、精氨酸、赖氨酸、酪氨酸、丝氨酸、苏氨酸、天冬氨酸、天冬酰胺和组氨酸。例如,包含第二官能团的氨基酸可以选自以下组:组氨酸、赖氨酸、酪氨酸、半胱氨酸、丝氨酸、苏氨酸、谷氨酸和甲硫氨酸。
例如,靶分子可以包含细胞表面的分子、细胞内的分子和/或细胞外的分子。例如,靶分子可以是细胞表面的受体分子。例如,靶分子可以选自以下组:多肽、核酸、小分子、多糖、脂质、纳米颗粒,以及前述的任意组合。例如,靶分子可以包含多肽。例如,靶分子可以选自以下组:免疫检查点分子、肿瘤相关分子和信号通路蛋白。例如,靶分子可以包含表皮生长因子受体(HER)家族的成员。例如,靶分子可以包含丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路的成员。例如,所述靶分子可以选自以下组:PD-L1、EGFR、HER-2、Ras、CD38,以及前述的功能性片段。
例如,靶分子可以包含SEQ ID NO:98所示的氨基酸序列。例如,PD-L1可以在第69位氨基酸包含所述第二官能团,例如组氨酸。
例如,第一官能团可以选自以下组:硫酰氟、卤代烃、羰基卤代烃、α羰基不饱和烃及上述基团的衍生物。例如,第一官能团可以选自以下组:
其中,R1可以为O、N或不存在,R2可以为卤素、烯基或炔基,R3可以为卤素、烯基或炔基,R4可以为卤素,n1和n2可以各自独立地至少为0。
例如,所述第一官能团可以选自以下组:
以及前述的衍生物。在本申请中,衍生物可以是指所述官能团或化合物的可被一个或多个额外基团取代或未被取代,所述额外基团可以单独且独立选自烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环烷基、羟基、烷氧基、巯基、氰基、卤素、羰基、硫代羰基、异氰酸基、硫氰酸基、异硫氰酸基、硝基、全卤代烷基、全氟代烷基和包括单取代及双取代氨基基团的氨基,及其受保护的衍生物。任选取代基的非限制性示例可以包括卤素、-CN、=O、=N-OH、=N-OR、=N-R、OR、-C(O)R、-C(O)OR、-OC(O)R、-OC(O)OR、-C(O)NHR、-C(O)NR2、-OC(O)NHR、-OC(O)NR2、-SR-、-S(O)R、-S(O)2R、-NHR、-N(R)2、-NHC(O)R、-NRC(O)R、-NHC(O)OR、-NRC(O)OR、S(O)2NHR、-S(O)2N(R)2、-NHS(O)2NR2、-NRS(O)2NR2、-NHS(O)2R、-NRS(O)2R、C1-C8烷基、C1-C8烷氧基、芳基、杂芳基、环烷基、杂环烷基、卤素取代的C1-C8烷基、和卤素取代的C1-C8烷氧基,其中各R可以独立选自H、卤素、C1-C8烷基、C1-C8烷氧基、芳基、杂芳基、环烷基、杂环烷基、卤素取代的C1-C8烷基、和卤素取代的C1-C8烷氧基。此类取代基团的位置和数量可以按各基团熟知的价态限制确定。
例如,靶分子靶向部分可以包含非天然氨基酸的残基,所述非天然氨基酸可以包含所述第一官能团,所述非天然氨基酸可以选自以下组:
例如,所述靶分子靶向部分可以包含非天然氨基酸的残基,所述非天然氨基酸可以包含所述第一官能团,所述非天然氨基酸可以选自以下组:氟代硫酸盐-L-酪氨酸、6-溴-己酰赖氨酸,以及前述的衍生物。
例如,靶分子靶向部分可以选自以下组:多肽、核酸、小分子、多糖、脂质、纳米颗粒,以及前述的任意组合。例如,靶分子靶向部分可以包含多肽。例如,靶分子靶向部分可以包含抗体或其抗原结合片段。例如,抗体可以选自以下组:鼠源抗体、骆驼源抗体、嵌合抗体、人源化抗体和全人源抗体。例如,抗原结合片段可以选自以下组:VHH,Fab,Fab′,Fv片段,(Fab')2,(Fab)2,scFv,di-scFv,亲和抗体(affibody)和dAb。例如,所述靶分子靶向部分可以包含单域抗体或其抗原结合片段。
抗体的CDR又称互补决定区,是可变区的一部分。该区域的氨基酸残基可以与抗原或抗原表位接触。抗体CDR可以通过多种编码系统来确定,如CCG、Kabat、Chothia、IMGT、综合考虑Kabat/Chothia等。这些编码系统为本领域内已知。本领域技术人员可以根据抗体的序列和结构,用不同的编码系统确定出CDR区。使用不同的编码系统,CDR区可能存在差别。在本申请中,所述CDR涵盖可以根据任何CDR划分方式划分得到的CDR序列;也涵盖其变体,所述变体包括所述CDR的氨基酸序列经过取代、缺失和/或添加一个或多个氨基酸。例如1-30个、1-20个或1-10个,又例如1个、2个、3个、4个、5个、6个、7个、8个或9个氨基酸取代、缺失和/或插入;也涵盖其同源物,所述同源物可以为与所述CDR的氨基酸序列具有至少约85%(例如,具有至少约85%、约90%、约91%、约92%、约93%、约94%、约95%、约96%、约97%、约98%、约99%或更高的)序列同源性的氨基酸序列。在某些实施方式中,所述CDR可以由Kabat编号方案来确定。
此外,需要说明的是,本申请所述靶分子靶向部分可以包含与其存在一个或多个保守序列修饰的重链和/或轻链序列。所谓“保守序列修饰”是指不会显著影响或改变抗体结合特性的氨基酸修饰。这样的保守修饰包括氨基酸替换、添加和删除。可以通过领域内已知的标准技术,例如点突变和PCR介导的突变,将修饰引入本申请所述靶分子靶向部分中。保守氨基酸替换可以是氨基酸残基用具有相似侧链的氨基酸残基进行替换。具有相似侧链的氨基酸残基组在领域内已知。这些氨基酸残基组可以包括具有碱性侧链(例如,赖氨酸、精氨酸、组氨酸)、酸性侧链(例如,天冬氨酸、谷氨酸)、不带电极性侧链(例如,甘氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸、半胱氨酸、色氨酸)、非极性侧链(例如,丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、甲硫氨酸)、β-支链侧链(例如,苏氨酸、缬氨酸、异亮氨酸)和芳香族侧链(例如,酪氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、组氨酸)的氨基酸。在某些实施方式中,本申请靶分子靶向部分的CDR区中的一个或多个氨基酸残基可以用同侧链组的其他氨基酸残基替换。本领域内的技术人员知道,一些保守序列修改可以不会使抗原结合性消失,
例如,靶分子靶向部分可以为抗体。例如,靶分子靶向部分可以在抗体可变区包含所述第一官能团。例如,与野生型的靶分子靶向部分相比,本申请靶分子靶向部分可以在抗体可变区的氨基酸包含第一官能团。例如,靶分子靶向部分可以在CDR区包含所述第一官能团。例如,与野生型的靶分子靶向部分相比,本申请靶分子靶向部分可以在CDR区的氨基酸包含第一官能团。例如,靶分子靶向部分可以在CDR区的N端前5个氨基酸中的任意氨基酸和/或C端后5个氨基酸中的任意氨基酸包含所述第一官能团。例如,靶分子靶向部分可以在CDR3区的N端前5个氨基酸中的任意氨基酸和/或C端后5个氨基酸中的任意氨基酸包含所述第一官能团。例如,CDR区可以是根据任意一种CDR区划分方式划分的,例如Kabat划分方法。例如,本申请靶分子靶向部分的CDR1、CDR2和CDR3可以分别如SEQ ID NO:1、2和3所示。例如,本申请靶分子靶向部分可以特异性结合PD-L1。例如,本申请靶分子靶向部分的CDR1、CDR2和CDR3可以分别如SEQ ID NO:4、5和6所示。例如,本申请靶分子靶向部分可以特异性结合EGFR。
例如,靶分子靶向部分可以为抗体。例如,靶分子靶向部分可以在抗体可变区包含氟代硫酸盐-L-酪氨酸和/或6-溴-己酰赖氨酸。例如,与野生型的靶分子靶向部分相比,本申请靶分子靶向部分在抗体可变区的氨基酸可以被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换和/或被所述6-溴-己酰赖氨酸替换。例如,靶分子靶向部分可以在CDR区包含氟代硫酸盐-L-酪氨酸和/或6-溴-己酰赖氨酸。例如,与野生型的靶分子靶向部分相比,本申请靶分子靶向部分在CDR区的氨基酸可以被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换和/或被所述6-溴-己酰赖氨酸替换。例如,靶分子靶向部分在CDR区的N端前5个氨基酸中的任意氨基酸和/或C端后5个氨基酸中的任意氨基酸可以被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换和/或被所述6-溴-己酰赖氨酸替换。例如,靶分子靶向部分在CDR3区的N端前5个氨基酸中的任意氨基酸和/或C端后5个氨基酸中的任意氨基酸可以被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换和/或被所述6-溴-己酰赖氨酸替换。
例如,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,可以在第108位氨基酸、第110位氨基酸和/或第113位氨基酸包含所述第一官能团。例如,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,第108位氨基酸、第110位氨基酸和/或第113位氨基酸可以为包含本申请第一官能团的物质,例如包含本申请第一官能团的非天然氨基酸。例如,所述靶分子靶向部分在第108位氨基酸、第110位氨基酸和/或第113位氨基酸的侧链可以包含本申请第一官能团。例如,所述靶分子靶向部分在第108位氨基酸、第110位氨基酸和/或第113位氨基酸包含的第一官能团可以与靶分子上的第二官能团发生邻近反应形成共价键连接。例如,所述靶分子靶向部分可以特异性识别所述PD-L1。所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第108位氨基酸、第110位氨基酸和/或第113位氨基酸可以被所述非天然氨基酸替换。
例如,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第108位氨基酸、第110位氨基酸和/或第113位氨基酸可以各自独立地被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换和/或被所述6-溴-己酰赖氨酸替换。例如,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第108位氨基酸可以被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换。例如,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第108位氨基酸、第110位氨基酸和/或第113位可以被所述6-溴-己酰赖氨酸替换。例如,所述靶分子靶向部分可以包含SEQ ID NO:9-11中任一项所示的氨基酸序列。
例如,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,可以在第116位氨基酸包含所述第一官能团。例如,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,第116位氨基酸可以为包含本申请第一官能团的物质,例如包含本申请第一官能团的非天然氨基酸。例如,所述靶分子靶向部分在第116位氨基酸的侧链可以包含本申请第一官能团。例如,所述靶分子靶向部分在第116位氨基酸包含的第一官能团可以与靶分子上的第二官能团发生邻近反应形成共价键连接。例如,所述靶分子靶向部分可以特异性识别所述EGFR。所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第116位氨基酸可以被所述非天然氨基酸替换。
例如,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第116位氨基酸可以被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸和/或6-溴-己酰赖氨酸替换。例如,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第116位氨基酸可以被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换。例如,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第116位氨基酸可以被所述6-溴-己酰赖氨酸替换。例如,所述靶分子靶向部分可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列。
例如,蛋白降解器可以包含溶酶体。例如,蛋白降解器靶向部分可以选自以下组:多肽、核酸、小分子、多糖、脂质、纳米颗粒,以及前述的任意组合。例如,蛋白降解器靶向部分可以包含能够靶向溶酶体的分子或其功能活性片段。例如,蛋白降解器靶向部分还可以包含穿膜部分,所述穿膜部分能够促进所述靶分子进入细胞内,其中,所述穿膜部分与所述靶分子靶向部分直接或间接连接,和/或所述穿膜部分与所述蛋白降解器靶向部分直接或间接连接。
例如,蛋白降解器靶向部分可以包含以下组:溶酶体靶向肽(LTP)、低聚糖肽、甘露糖6-磷酸酯(M6P)、N-乙酰半乳糖胺(GalNAc)、半乳糖,以及前述的任意组合。例如,缀合物还可以包含穿膜部分,所述穿膜部分可以促进所述靶分子进入细胞内,其中,所述穿膜部分可以与所述靶分子靶向部分直接或间接连接,和/或所述穿膜部分可以与所述蛋白降解器靶向部分直接或间接连接。例如,穿膜部分可以选自以下组:穿膜肽(CPP)、低聚糖肽、甘露糖6-磷酸酯(M6P)、N-乙酰半乳糖胺(GalNAc)、半乳糖,以及前述的任意组合。例如,穿膜肽可以包含聚精氨酸,所述聚精氨酸的重复单元数量可以至少为2。
例如,蛋白降解器靶向部分可以包含前蛋白转化酶枯草溶菌素9(PCSK9)或其功能活性片段,前蛋白转化酶枯草溶菌素9(PCSK9)可以与细胞表面的受体结合,可以促进PCSK9以及包含PCSK9的复合物的降解。例如,蛋白降解器靶向部分可以包含酪氨酸内吞基序(Tyrosine containing cytoplasmic motif)或其功能活性片段,例如可以是NPX1Y(如SEQID NO:63所示)或FX2NPX3Y(SEQ ID NO:65所示),其中X1、X2或X3可以是任意氨基酸,例如,X1、X2或X3可以各自独立地为甘氨酸G和/或丙氨酸A。例如,蛋白降解器靶向部分可以包含聚乳酸-羟基乙酸共聚物和/或聚乳酸,聚乳酸-羟基乙酸共聚物的聚合单体可以包含乳酸和羟基乙酸,乳酸和羟基乙酸的比例可以是任意的。例如,蛋白降解器靶向部分可以包含表皮生长因子EGF或其功能活性片段,序列可以如SEQ ID NO:67所示。例如,蛋白降解器靶向部分可以包含RGD序列,可以是L-精氨酸、甘氨酸和L-天冬氨酸组成的三肽序列,序列可以如RGD所示。
例如,蛋白降解器靶向部分可以包含以下组:溶酶体靶向十八烷基罗丹明B(Lysosomotropic octadecyl-rhodamine-B)、联吡啶缩氨基硫脲(dipyridyl-thio-semi-carbazones)、铁螯合剂Dp44mT(di-2-pyridylketone 4,4,-di-methyl-3-thiosemicarbazone)、铁螯合剂Bp4eT(2-benzoylpyridine-4-ethyl-3thiosemicarbazone)、铁螯合剂PIH(Pyridoxal isonicotinoyl hydrazone),以及它们的衍生物。例如,蛋白降解器靶向部分可以包含聚精氨酸,例如可以是聚L-精氨酸、可以是聚D-精氨酸,也可以是聚L-精氨酸-D-精氨酸共聚物,例如聚合精氨酸的重复单元数可以至少为2。例如,蛋白降解器靶向部分可以选自以下组:八聚L-精氨酸、八聚D-精氨酸、九聚L-精氨酸、九聚D-精氨酸、十二聚L-精氨酸、和十二聚D-精氨酸。例如,蛋白降解器靶向部分可以选自以下组:物质-P(Substance P,SP,序列可以如SEQ ID NO:68所示)、神经肽Y(Neuropeptide Y,序列可以如SEQ ID NO:69所示)、TP穿膜肽(TP transportan,序列可以如SEQ ID NO:70所示)、穿膜肽TAT(序列可以如SEQ ID NO:71所示)、穿透肽(pAntp,Penetratin,序列可以如SEQ ID NO:72所示)、低pH插入肽(pH low-insertion peptide,pHLIP,序列可以如SEQ ID NO:73所示)、跨膜序列ATRAM(acidity-triggered rationalmembrane,序列可以如SEQ ID NO:74所示)、可激活细胞穿透肽(ACPP,序列可以如SEQ IDNO:75所示)、加速穿透序列(pHK-PAS,序列可以如SEQ ID NO:76所示),以及上述的功能活性片段。
例如,蛋白降解器靶向部分可以靶向选自以下组的物质:离子非依赖性甘露糖6磷酸受体(CI-M6PR,也称为M6PR,uniprot登录号可以是P20645)、小窝蛋白-1(Caveolin-1,uniprot登录号可以是Q03135),网格蛋白(Clathrin,uniprot登录号可以是Q00610),催乳素受体(Prolactin receptor,PRLR,uniprot登录号可以是P16471),淀粉样前体样蛋白2(Amyloid Precursor Like Protein 2,APLP2,uniprot登录号可以是Q06481),溶酶体相关膜糖蛋白3(Lysosome-associated membrane glycoprotein 3,LAMP3,CD63,uniprot登录号可以是Q9UQV4),甘丙肽受体-1(GALR-1receptor,uniprot登录号可以是P47211),网格蛋白相关蛋白(Clathrin-associated proteins,uniprot登录号可以是P63010),Disabled-2蛋白(Dab2,uniprot登录号可以是Q5VWQ8),ARH蛋白(Low density lipoprotein receptoradapter protein1,uniprot登录号可以是Q5SW96),潜伏膜蛋白(latent membraneprotein,LMP,uniprot登录号可以是P13285),MDM2蛋白(E3泛素蛋白连接酶,uniprot登录号可以是Q00987),指环蛋白43(RNF43,Ring Finger Protein 43,uniprot登录号可以是Q68DV7),指环蛋白126(RNF126,Ring Finger Protein 126,uniprot登录号可以是Q9BV68),锌指蛋白(zinc and ring finger 3,ZNRF3,uniprot登录号可以是Q9ULT6),以及上述的功能活性片段。
例如,蛋白降解器靶向部分可以包含能够靶向溶酶体或蛋白酶体和/或能够结合细胞表面促进内吞的受体的分子或其功能活性片段。例如,所述蛋白降解器靶向部分包含能够结合6-磷酸甘露糖受体(M6PR)的分子。例如,所述蛋白降解器靶向部分可以包含一个或多个甘露糖6-磷酸酯(M6P)或其功能活性片段。例如,所述蛋白降解器靶向部分可以包含约1个至约500个所述甘露糖6-磷酸酯或其功能活性片段。例如,所述蛋白降解器靶向部分可以包含支架分子,所述支架分子直接或间接连接所述一个或多个甘露糖6-磷酸酯或其功能活性片段。例如,所述支架分子可以包含聚糖结构。例如,所述支架分子可以包含糖蛋白,所述糖蛋白可以包含被所述一个或多个甘露糖6-磷酸酯或其功能活性片段修饰的一个或多个氨基酸。例如,所述糖蛋白可以包含N-羧基酸酐(NCA)或其衍生物的基团。例如,所述蛋白降解器靶向部分可以包含能够结合去唾液酸糖蛋白受体(ASGPR)的分子或其功能活性片段。例如,所述蛋白降解器靶向部分可以包含所述去唾液酸糖蛋白受体的一个或多个配体。例如,所述蛋白降解器靶向部分可以包含一个或多个N-乙酰半乳糖胺(GalNAc)。例如,所述蛋白降解器靶向部分可以包含一个或多个半乳糖。例如,所述蛋白降解器靶向部分可以包含一个或多个葡萄糖。例如,所述蛋白降解器靶向部分可以包含所述去唾液酸糖蛋白受体的约1个至约500个配体。例如,所述蛋白降解器靶向部分可以包含支架分子,所述支架分子可以直接或间接连接所述去唾液酸糖蛋白受体的所述一个或多个配体。例如,所述蛋白降解器靶向部分可以包含所述一个或多个N-乙酰半乳糖胺修饰的一个或多个丙氨酸。例如,所述支架分子可以包含一个、两个或三个所述N-乙酰半乳糖胺。例如,所述支架分子可以包含一个、两个或三个所述半乳糖。例如,所述缀合物可以包含融合蛋白。
例如,所述缀合物可以包含所述靶分子靶向部分、所述蛋白降解器靶向部分和所述穿膜部分,所述靶分子靶向部分、所述蛋白降解器靶向部分与所述穿膜部分之间可以相互独立地直接或间接连接。例如,所述间接连接可以包含通过连接子连接。例如,所述连接子可以包含肽连接子。例如,所述连接子可以包含可酶切或不可酶切的连接子。例如,所述可酶切的连接子可以包含可通过蛋白酶酶切的连接子。
例如,所述缀合物可以包含所述靶分子靶向部分、所述穿膜部分和所述溶酶体靶向肽。
例如,本申请的缀合物可以包含靶分子靶向部分、所述穿膜部分和所述溶酶体靶向肽,其中所述靶分子靶向部分可以包含第一官能团,所述靶分子可以包含第二官能团,当所述靶分子靶向部分与所述靶分子接近时,所述第一官能团可以与所述第二官能团反应而形成共价键,所述穿膜部分可以促进所述靶分子进入细胞内,其中,所述穿膜部分与所述靶分子靶向部分直接或间接连接,和/或所述穿膜部分与所述蛋白降解器靶向部分直接或间接连接。
例如,本申请的缀合物可以包含靶分子靶向部分、所述穿膜部分和所述溶酶体靶向肽,其中所述靶分子靶向部分可以包含第一官能团,第一官能团可以选自以下组:
其中,R1可以为O、N或不存在,R2可以为卤素、烯基或炔基,R3可以为卤素、烯基或炔基,R4可以为卤素,n1和n2可以各自独立地至少为0;
例如,第一官能团可以为其中,R4可以为卤素、烯基或炔基,n2可以至少为0。例如,R4可以为F、Cl、Br或I、C2-C6烯基或C2-C6炔基。其中,n2可以为0至6;所述穿膜部分可以促进所述靶分子进入细胞内,其中,所述穿膜部分与所述靶分子靶向部分直接或间接连接,和/或所述穿膜部分与所述蛋白降解器靶向部分直接或间接连接。
例如,本申请的缀合物可以包含靶分子靶向部分、所述穿膜部分和所述溶酶体靶向肽,其中所述靶分子靶向部分可以包含第一官能团,所述第一官能团可以选自以下组:
例如,本申请的缀合物可以包含靶分子靶向部分、所述穿膜部分和所述溶酶体靶向肽,靶分子靶向部分可以包含非天然氨基酸的残基,所述非天然氨基酸可以选自以下组:
例如,本申请的缀合物可以包含靶分子靶向部分、所述穿膜部分和所述溶酶体靶向肽,靶分子靶向部分可以为抗体,其中所述靶分子靶向部分可以在CDR区氨基酸中、CDR区的N端前5个氨基酸中和/或CDR区的C端后5个氨基酸中的包含第一官能团,第一官能团可以选自以下组:
其中,R1可以为O、N或不存在,R2可以为卤素、烯基或炔基,R3可以为卤素、烯基或炔基,R4可以为卤素,n1和n2可以各自独立地至少为0;
例如,第一官能团可以为其中,R4可以为卤素、烯基或炔基,n2可以至少为0。例如,R4可以为F、Cl、Br或I、C2-C6烯基或C2-C6炔基。其中,n2可以为0至6;所述穿膜部分可以促进所述靶分子进入细胞内,其中,所述穿膜部分与所述靶分子靶向部分直接或间接连接,和/或所述穿膜部分与所述蛋白降解器靶向部分直接或间接连接。
例如,本申请的缀合物可以包含靶分子靶向部分、所述穿膜部分和所述溶酶体靶向肽,靶分子靶向部分可以为抗体,其中所述靶分子靶向部分可以在CDR区氨基酸中、CDR区的N端前5个氨基酸中和/或CDR区的C端后5个氨基酸中的包含第一官能团,所述第一官能团可以选自以下组:
例如,本申请的缀合物可以包含靶分子靶向部分、所述穿膜部分和所述溶酶体靶向肽,靶分子靶向部分可以为抗体,其中所述靶分子靶向部分可以在CDR区、CDR区的N端前5个氨基酸和/或CDR区的C端后5个氨基酸包含非天然氨基酸的残基,所述非天然氨基酸可以选自以下组:
例如,本申请的缀合物可以包含靶分子靶向部分、所述穿膜部分和所述溶酶体靶向肽,靶分子靶向部分可以为抗体,其中所述靶分子靶向部分可以在CDR区、CDR区的N端前5个氨基酸和/或CDR区的C端后5个氨基酸包含非天然氨基酸的残基,所述非天然氨基酸可以包含氟代硫酸盐-L-酪氨酸和/或6-溴-己酰赖氨酸,所述穿膜部分可以促进所述靶分子进入细胞内,其中,所述穿膜部分与所述靶分子靶向部分直接或间接连接,和/或所述穿膜部分与所述蛋白降解器靶向部分直接或间接连接。
例如,本申请的缀合物可以包含靶分子靶向部分、所述穿膜部分和所述溶酶体靶向肽,靶分子靶向部分可以为抗体,其中所述靶分子靶向部分可以在CDR区氨基酸中、CDR3区的N端前5个氨基酸中和/或CDR3区的C端后5个氨基酸中包含非天然氨基酸的残基,所述非天然氨基酸可以包含氟代硫酸盐-L-酪氨酸和/或6-溴-己酰赖氨酸,所述穿膜部分可以促进所述靶分子进入细胞内,其中,所述穿膜部分与所述靶分子靶向部分直接或间接连接,和/或所述穿膜部分与所述蛋白降解器靶向部分直接或间接连接。
例如,本申请的缀合物可以包含靶分子靶向部分、所述穿膜部分和所述溶酶体靶向肽,靶分子靶向部分可以为抗体,其中所述靶分子靶向部分可以在CDR区包含非天然氨基酸的残基,所述非天然氨基酸可以包含氟代硫酸盐-L-酪氨酸和/或6-溴-己酰赖氨酸,所述穿膜部分可以促进所述靶分子进入细胞内,其中,所述穿膜部分与所述靶分子靶向部分直接或间接连接,和/或所述穿膜部分与所述蛋白降解器靶向部分直接或间接连接。
例如,本申请的缀合物可以包含靶分子靶向部分、所述穿膜部分和所述溶酶体靶向肽,靶分子靶向部分可以为PD-L1单域抗体,其中所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,第108位氨基酸、第110位氨基酸和/或第113位氨基酸可以被氟代硫酸盐-L-酪氨酸和/或6-溴-己酰赖氨酸替换,所述穿膜部分可以促进所述靶分子进入细胞内,其中,所述穿膜部分与所述靶分子靶向部分直接或间接连接,和/或所述穿膜部分与所述蛋白降解器靶向部分直接或间接连接。
例如,本申请的缀合物可以包含靶分子靶向部分、所述穿膜部分和所述溶酶体靶向肽,靶分子靶向部分可以为PD-L1单域抗体,其中所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,第108位氨基酸可以被氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换,所述穿膜部分可以促进所述靶分子进入细胞内,其中,所述穿膜部分与所述靶分子靶向部分直接或间接连接,和/或所述穿膜部分与所述蛋白降解器靶向部分直接或间接连接。
例如,本申请的缀合物可以包含靶分子靶向部分、所述穿膜部分和所述溶酶体靶向肽,靶分子靶向部分可以为EGFR单域抗体,其中所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,第116位氨基酸可以被氟代硫酸盐-L-酪氨酸和/或6-溴-己酰赖氨酸替换,所述穿膜部分可以促进所述靶分子进入细胞内,其中,所述穿膜部分与所述靶分子靶向部分直接或间接连接,和/或所述穿膜部分与所述蛋白降解器靶向部分直接或间接连接。
例如,本申请的缀合物可以包含靶分子靶向部分、所述穿膜部分和所述溶酶体靶向肽,靶分子靶向部分可以为EGFR单域抗体,其中所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,第116位氨基酸可以被氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换,所述穿膜部分可以促进所述靶分子进入细胞内,其中,所述穿膜部分与所述靶分子靶向部分直接或间接连接,和/或所述穿膜部分与所述蛋白降解器靶向部分直接或间接连接。
例如,本申请的缀合物可以包含靶分子靶向部分、所述穿膜部分和所述溶酶体靶向肽,蛋白降解器靶向部分的氨基酸序列可以如SEQ ID NO:63-91中任一项所示,所述穿膜部分的氨基酸序列可以如SEQ ID NO:78-79中任一项所示,所述溶酶体靶向肽的氨基酸序列可以如SEQ ID NO:63-77所示,其中,所述穿膜部分与所述靶分子靶向部分直接或间接连接,和/或所述穿膜部分与所述蛋白降解器靶向部分直接或间接连接。
多肽
在另一方面,本申请提供一种多肽。例如,多肽可以包含靶分子靶向部分,所述靶分子靶向部分可以特异性识别所述靶分子并与该靶分子共价结合。
例如,所述靶分子靶向部分可以包含第一官能团,所述靶分子可以包含第二官能团,当所述靶分子靶向部分与所述靶分子接近时,所述第一官能团可以与所述第二官能团反应而形成共价键。例如,第二官能团可以包含亲电基团,第一官能团可以和第二官能团发生交联反应,例如可以是取代反应和/或加成反应。例如,靶分子靶向部分和靶分子可以通过取代反应和/或加成反应,形成共价键连接。例如,当所述靶分子靶向部分与所述靶分子通过抗体-抗原非共价作用接近时,所述第一官能团可以与所述第二官能团反应而形成共价键。例如,当所述靶分子靶向部分与所述靶分子接近时,靶分子靶向部分的骨架到靶分子的骨架之间的距离可以约等于带有第一官能团的侧链长度加上带有第二官能团的侧链长度之和。例如,第一官能团和第二官能团的取向可以是头对头,也可以是带有第一官能团的侧链和带有第二官能团的侧链可以通过旋转以实现头对头的取向。例如,在某些状态下,第一官能团和第二官能团之间的距离小于约5埃(5E-10米)时,所述第一官能团可以与所述第二官能团反应而形成共价键。例如,第一官能团和第二官能团之间的距离可以通过调节所述靶分子靶向部分的带有第一官能团的侧链长度来实现。例如,可以通过检测50%以上的第一官能团和第二官能团之间发生交联的时间,判断交联效率或邻近反应活性。例如,50%以上的第一官能团和第二官能团之间发生交联的时间小于约72小时、小于约48小时、小于约24小时、小于约12小时、小于约8小时、或小于约4小时,可以认为第一官能团具有与第二官能团发生邻近反应的活性。例如,靶分子靶向部分与所述靶分子通过非共价作用,例如抗体-抗原作用接近时,可以给予第一官能团具有与第二官能团发生邻近反应的条件和/或时间。
例如,第二官能团包含天然氨基酸的侧链基团。例如,天然氨基酸可以包含甘氨酸(Glycine)、丙氨酸(Alanine)、缬氨酸(Valine)、亮氨酸(Leucine)、异亮氨酸(Isoleucine)、苯丙氨酸(Phenylalanine)、色氨酸(Tryptophan)、酪氨酸(Tyrosine)、天冬氨酸(Aspartate)、组氨酸(Histidine)、天冬酰胺(Asparagine)、谷氨酸(Glutamate)、赖氨酸(Lysine)、谷胺酰胺(Glutamine)、甲硫氨酸(Methionine)、精氨酸(Arginine)、丝氨酸(Serine)、苏氨酸(Threonine)、半胱氨酸(Cysteine)、和/或脯氨酸(Proline)。例如,第二官能团也可以包含非天然氨基酸的侧链基团,例如一些靶分子可以包含硒半胱氨酸、吡咯赖氨酸和/或非天然氨基酸。例如,第二官能团也可以是任意的侧链基团,例如靶分子可以具有任意结构。
例如,第二官能团可以是亲电基团。例如,可以是包含电负性较大的原子,例如卤素原子、氧原子、氮原子、硫原子的基团。例如,第二官能团可以包含氨基、咪唑基、巯基、羟基、羧基和/或甲硫基。例如,第二官能团可以包含和/或例如,包含第二官能团的侧链可以选自以下组:-CH2SH、-CH2CH2COOH、-CH2CH2CONH2、-CH2CH2SCH3、-(CH2)3NH-C(NH)NH2、-(CH2)4NH2、-CH2-C6H4OH、-CH2OH、-CH(OH)CH3、-CH2COOH、-CH2CONH2、和-CH2-C3H3N2。例如,包含第二官能团的氨基酸可以选自以下组:半胱氨酸、谷氨酸、谷胺酰胺、甲硫氨酸、精氨酸、赖氨酸、酪氨酸、丝氨酸、苏氨酸、天冬氨酸、天冬酰胺和组氨酸。例如,包含第二官能团的氨基酸可以选自以下组:组氨酸、赖氨酸、酪氨酸、半胱氨酸、丝氨酸、苏氨酸、谷氨酸和甲硫氨酸。
例如,靶分子可以包含细胞表面的分子、细胞内的分子和/或细胞外的分子。例如,靶分子可以是细胞表面的受体分子。例如,靶分子可以选自以下组:多肽、核酸、小分子、多糖、脂质、纳米颗粒,以及前述的任意组合。例如,靶分子可以包含多肽。例如,靶分子可以选自以下组:免疫检查点分子、肿瘤相关分子和信号通路蛋白。例如,靶分子可以包含表皮生长因子受体(HER)家族的成员。例如,靶分子可以包含丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路的成员。例如,所述靶分子可以选自以下组:PD-L1、EGFR、HER-2、Ras、CD38,以及前述的功能性片段。
例如,靶分子可以包含SEQ ID NO:98所示的氨基酸序列。例如,PD-L1可以在第69位氨基酸包含所述第二官能团,例如组氨酸。
例如,第一官能团可以选自以下组:硫酰氟、卤代烃、羰基卤代烃、α羰基不饱和烃及上述基团的衍生物。例如,第一官能团可以选自以下组:
其中,R1可以为O、N或不存在,R2可以为卤素、烯基或炔基,R3可以为卤素、烯基或炔基,R4可以为卤素,n1和n2可以各自独立地至少为0。
例如,所述第一官能团可以选自以下组:
以及前述的衍生物。在本申请中,衍生物可以是指所述官能团或化合物的可被一个或多个额外基团取代或未被取代,所述额外基团可以单独且独立选自烷基、烯基、炔基、环烷基、芳基、杂芳基、杂环烷基、羟基、烷氧基、巯基、氰基、卤素、羰基、硫代羰基、异氰酸基、硫氰酸基、异硫氰酸基、硝基、全卤代烷基、全氟代烷基和包括单取代及双取代氨基基团的氨基,及其受保护的衍生物。任选取代基的非限制性示例可以包括卤素、-CN、=O、=N-OH、=N-OR、=N-R、OR、-C(O)R、-C(O)OR、-OC(O)R、-OC(O)OR、-C(O)NHR、-C(O)NR2、-OC(O)NHR、-OC(O)NR2、-SR-、-S(O)R、-S(O)2R、-NHR、-N(R)2、-NHC(O)R、-NRC(O)R、-NHC(O)OR、-NRC(O)OR、S(O)2NHR、-S(O)2N(R)2、-NHS(O)2NR2、-NRS(O)2NR2、-NHS(O)2R、-NRS(O)2R、C1-C8烷基、C1-C8烷氧基、芳基、杂芳基、环烷基、杂环烷基、卤素取代的C1-C8烷基、和卤素取代的C1-C8烷氧基,其中各R可以独立选自H、卤素、C1-C8烷基、C1-C8烷氧基、芳基、杂芳基、环烷基、杂环烷基、卤素取代的C1-C8烷基、和卤素取代的C1-C8烷氧基。此类取代基团的位置和数量可以按各基团熟知的价态限制确定。
例如,靶分子靶向部分可以包含非天然氨基酸的残基,所述非天然氨基酸可以包含所述第一官能团,所述非天然氨基酸可以选自以下组:
例如,所述靶分子靶向部分可以包含非天然氨基酸的残基,所述非天然氨基酸可以包含所述第一官能团,所述非天然氨基酸可以选自以下组:氟代硫酸盐-L-酪氨酸、6-溴-己酰赖氨酸,以及前述的衍生物。
例如,靶分子靶向部分可以选自以下组:多肽、核酸、小分子、多糖、脂质、纳米颗粒,以及前述的任意组合。例如,靶分子靶向部分可以包含多肽。例如,靶分子靶向部分可以包含抗体或其抗原结合片段。例如,抗体可以选自以下组:鼠源抗体、骆驼源抗体、嵌合抗体、人源化抗体和全人源抗体。例如,抗原结合片段可以选自以下组:VHH,Fab,Fab′,Fv片段,(Fab')2,(Fab)2,scFv,di-scFv,亲和抗体(affibody)和dAb。例如,所述靶分子靶向部分可以包含单域抗体或其抗原结合片段。
抗体的CDR又称互补决定区,是可变区的一部分。该区域的氨基酸残基可以与抗原或抗原表位接触。抗体CDR可以通过多种编码系统来确定,如CCG、Kabat、Chothia、IMGT、综合考虑Kabat/Chothia等。这些编码系统为本领域内已知。本领域技术人员可以根据抗体的序列和结构,用不同的编码系统确定出CDR区。使用不同的编码系统,CDR区可能存在差别。在本申请中,所述CDR涵盖可以根据任何CDR划分方式划分得到的CDR序列;也涵盖其变体,所述变体包括所述CDR的氨基酸序列经过取代、缺失和/或添加一个或多个氨基酸。例如1-30个、1-20个或1-10个,又例如1个、2个、3个、4个、5个、6个、7个、8个或9个氨基酸取代、缺失和/或插入;也涵盖其同源物,所述同源物可以为与所述CDR的氨基酸序列具有至少约85%(例如,具有至少约85%、约90%、约91%、约92%、约93%、约94%、约95%、约96%、约97%、约98%、约99%或更高的)序列同源性的氨基酸序列。在某些实施方式中,所述CDR可以由Kabat编号方案来确定。
此外,需要说明的是,本申请所述靶分子靶向部分可以包含与其存在一个或多个保守序列修饰的重链和/或轻链序列。所谓“保守序列修饰”是指不会显著影响或改变抗体结合特性的氨基酸修饰。这样的保守修饰包括氨基酸替换、添加和删除。可以通过领域内已知的标准技术,例如点突变和PCR介导的突变,将修饰引入本申请所述靶分子靶向部分中。保守氨基酸替换可以是氨基酸残基用具有相似侧链的氨基酸残基进行替换。具有相似侧链的氨基酸残基组在领域内已知。这些氨基酸残基组可以包括具有碱性侧链(例如,赖氨酸、精氨酸、组氨酸)、酸性侧链(例如,天冬氨酸、谷氨酸)、不带电极性侧链(例如,甘氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸、半胱氨酸、色氨酸)、非极性侧链(例如,丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、甲硫氨酸)、β-支链侧链(例如,苏氨酸、缬氨酸、异亮氨酸)和芳香族侧链(例如,酪氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、组氨酸)的氨基酸。在某些实施方式中,本申请靶分子靶向部分的CDR区中的一个或多个氨基酸残基可以用同侧链组的其他氨基酸残基替换。本领域内的技术人员知道,一些保守序列修改可以不会使抗原结合性消失,
例如,靶分子靶向部分可以为抗体。例如,靶分子靶向部分可以在抗体可变区包含所述第一官能团。例如,与野生型的靶分子靶向部分相比,本申请靶分子靶向部分可以在抗体可变区的氨基酸包含第一官能团。例如,靶分子靶向部分可以在CDR区包含所述第一官能团。例如,与野生型的靶分子靶向部分相比,本申请靶分子靶向部分可以在CDR区的氨基酸包含第一官能团。例如,靶分子靶向部分可以在CDR区的N端前5个氨基酸中的任意氨基酸和/或C端后5个氨基酸中的任意氨基酸包含所述第一官能团。例如,靶分子靶向部分可以在CDR3区的N端前5个氨基酸中的任意氨基酸和/或C端后5个氨基酸中的任意氨基酸包含所述第一官能团。例如,CDR区可以是根据任意一种CDR区划分方式划分的,例如Kabat划分方法。例如,本申请靶分子靶向部分的CDR1、CDR2和CDR3可以分别如SEQ ID NO:1、2和3所示。例如,本申请靶分子靶向部分可以特异性结合PD-L1。例如,本申请靶分子靶向部分的CDR1、CDR2和CDR3可以分别如SEQ ID NO:4、5和6所示。例如,本申请靶分子靶向部分可以特异性结合EGFR。
例如,靶分子靶向部分可以为抗体。例如,靶分子靶向部分可以在抗体可变区包含氟代硫酸盐-L-酪氨酸和/或6-溴-己酰赖氨酸。例如,与野生型的靶分子靶向部分相比,本申请靶分子靶向部分在抗体可变区的氨基酸可以被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换和/或被所述6-溴-己酰赖氨酸替换。例如,靶分子靶向部分可以在CDR区包含氟代硫酸盐-L-酪氨酸和/或6-溴-己酰赖氨酸。例如,与野生型的靶分子靶向部分相比,本申请靶分子靶向部分在CDR区的氨基酸可以被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换和/或被所述6-溴-己酰赖氨酸替换。例如,靶分子靶向部分在CDR区的N端前5个氨基酸中的任意氨基酸和/或C端后5个氨基酸中的任意氨基酸可以被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换和/或被所述6-溴-己酰赖氨酸替换。例如,靶分子靶向部分在CDR3区的N端前5个氨基酸中的任意氨基酸和/或C端后5个氨基酸中的任意氨基酸可以被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换和/或被所述6-溴-己酰赖氨酸替换。
例如,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,可以在第108位氨基酸、第110位氨基酸和/或第113位氨基酸包含所述第一官能团。例如,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,第108位氨基酸、第110位氨基酸和/或第113位氨基酸可以为包含本申请第一官能团的物质,例如包含本申请第一官能团的非天然氨基酸。例如,所述靶分子靶向部分在第108位氨基酸、第110位氨基酸和/或第113位氨基酸的侧链可以包含本申请第一官能团。例如,所述靶分子靶向部分在第108位氨基酸、第110位氨基酸和/或第113位氨基酸包含的第一官能团可以与靶分子上的第二官能团发生邻近反应形成共价键连接。例如,所述靶分子靶向部分可以特异性识别所述PD-L1。所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第108位氨基酸、第110位氨基酸和/或第113位氨基酸可以被所述非天然氨基酸替换。
例如,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第108位氨基酸、第110位氨基酸和/或第113位氨基酸可以各自独立地被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换和/或被所述6-溴-己酰赖氨酸替换。例如,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第108位氨基酸可以被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换。例如,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第108位氨基酸、第110位氨基酸和/或第113位可以被所述6-溴-己酰赖氨酸替换。例如,所述靶分子靶向部分可以包含SEQ ID NO:9-11中任一项所示的氨基酸序列。
例如,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,可以在第116位氨基酸包含所述第一官能团。例如,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,第116位氨基酸可以为包含本申请第一官能团的物质,例如包含本申请第一官能团的非天然氨基酸。例如,所述靶分子靶向部分在第116位氨基酸的侧链可以包含本申请第一官能团。例如,所述靶分子靶向部分在第116位氨基酸包含的第一官能团可以与靶分子上的第二官能团发生邻近反应形成共价键连接。例如,所述靶分子靶向部分可以特异性识别所述EGFR。所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第116位氨基酸可以被所述非天然氨基酸替换。
例如,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第116位氨基酸可以被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸和/或6-溴-己酰赖氨酸替换。例如,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第116位氨基酸可以被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换。例如,所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第116位氨基酸可以被所述6-溴-己酰赖氨酸替换。例如,所述靶分子靶向部分可以包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列。
例如,本申请的多肽可以包含靶分子靶向部分,其中所述靶分子靶向部分可以包含第一官能团,所述靶分子可以包含第二官能团,当所述靶分子靶向部分与所述靶分子接近时,所述第一官能团可以与所述第二官能团反应而形成共价键。
例如,本申请的多肽可以包含靶分子靶向部分,其中所述靶分子靶向部分可以包含第一官能团,第一官能团可以选自以下组:
其中,R1可以为O、N或不存在,R2可以为卤素、烯基或炔基,R3可以为卤素、烯基或炔基,R4可以为卤素,n1和n2可以各自独立地至少为0;
例如,本申请的多肽可以包含靶分子靶向部分,其中所述靶分子靶向部分可以包含第一官能团,所述第一官能团可以选自以下组:
例如,本申请的多肽可以包含靶分子靶向部分,靶分子靶向部分可以包含非天然氨基酸的残基,所述非天然氨基酸可以选自以下组:
例如,本申请的多肽可以包含靶分子靶向部分,靶分子靶向部分可以为抗体,其中所述靶分子靶向部分可以在CDR区氨基酸中、CDR区的N端前5个氨基酸中和/或CDR区的C端后5个氨基酸中的包含第一官能团,第一官能团可以选自以下组:
其中,R1可以为O、N或不存在,R2可以为卤素、烯基或炔基,R3可以为卤素、烯基或炔基,R4可以为卤素,n1和n2可以各自独立地至少为0;
例如,本申请的多肽可以包含靶分子靶向部分,靶分子靶向部分可以为抗体,其中所述靶分子靶向部分可以在CDR区氨基酸中、CDR区的N端前5个氨基酸中和/或CDR区的C端后5个氨基酸中的包含第一官能团,所述第一官能团可以选自以下组:
例如,本申请的多肽可以包含靶分子靶向部分,靶分子靶向部分可以为抗体,其中所述靶分子靶向部分可以在CDR区、CDR区的N端前5个氨基酸和/或CDR区的C端后5个氨基酸包含非天然氨基酸的残基,所述非天然氨基酸可以选自以下组:
例如,本申请的多肽可以包含靶分子靶向部分,靶分子靶向部分可以为抗体,其中所述靶分子靶向部分可以在CDR区、CDR区的N端前5个氨基酸和/或CDR区的C端后5个氨基酸包含非天然氨基酸的残基,所述非天然氨基酸可以包含氟代硫酸盐-L-酪氨酸和/或6-溴-己酰赖氨酸。
例如,本申请的多肽可以包含靶分子靶向部分,靶分子靶向部分可以为抗体,其中所述靶分子靶向部分可以在CDR区氨基酸中、CDR3区的N端前5个氨基酸中和/或CDR3区的C端后5个氨基酸中包含非天然氨基酸的残基,所述非天然氨基酸可以包含氟代硫酸盐-L-酪氨酸和/或6-溴-己酰赖氨酸。
例如,本申请的多肽可以包含靶分子靶向部分,靶分子靶向部分可以为抗体,其中所述靶分子靶向部分可以在CDR区包含非天然氨基酸的残基,所述非天然氨基酸可以包含氟代硫酸盐-L-酪氨酸和/或6-溴-己酰赖氨酸。
例如,本申请的多肽可以包含靶分子靶向部分,靶分子靶向部分可以为PD-L1单域抗体,其中所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,第108位氨基酸、第110位氨基酸和/或第113位氨基酸可以被氟代硫酸盐-L-酪氨酸和/或6-溴-己酰赖氨酸替换。
例如,本申请的多肽可以包含靶分子靶向部分,靶分子靶向部分可以为PD-L1单域抗体,其中所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,第108位氨基酸可以被氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换。
例如,本申请的多肽可以包含靶分子靶向部分,靶分子靶向部分可以为EGFR单域抗体,其中所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,第116位氨基酸可以被氟代硫酸盐-L-酪氨酸和/或6-溴-己酰赖氨酸替换。
例如,本申请的多肽可以包含靶分子靶向部分,靶分子靶向部分可以为EGFR单域抗体,其中所述靶分子靶向部分包含的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,第116位氨基酸可以被氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换。
例如,本申请的多肽可以包含靶分子靶向部分,靶分子靶向部分的氨基酸序列可以如SEQ ID NO:9-12中任一项所示。
例如,多肽还可以包含小分子物质,所述小分子物质可以与所述靶分子靶向部分直接或间接连接。例如,所述小分子物质可以是荧光分子,例如荧光探针TAMRA(5-Carboxytetramethylrhodamine)。
核酸,免疫缀合物,细胞,组合物和试剂盒
另一方面,本申请提供了分离的核酸分子,其可以编码本申请所述的缀合物和/或多肽。例如,其可以是通过以下方法产生或合成的:(i)在体外扩增的,例如通过聚合酶链式反应(PCR)扩增产生的;(ii)通过克隆重组产生的;(iii)纯化的,例如通过酶切和凝胶电泳分级分离;或者(iv)合成的,例如通过化学合成。
另一方面,本申请提供了一种载体,其可以包含本申请所述的核酸分子。此外,所述载体中还可包含其他基因,例如允许在适当的宿主细胞中和在适当的条件下选择该载体的标记基因。此外,所述载体还可以包含允许编码区在适当宿主中正确表达的表达控制元件。这样的控制元件为本领域技术人员所熟知的,例如,可以包括启动子、核糖体结合位点、增强子和调节基因转录或mRNA翻译的其他控制元件等。所述载体可以通过转化、转导或转染宿主细胞,使其携带的遗传物质元件在宿主细胞内表达得以表达。所述载体可以包括,例如质粒、粘粒、病毒、噬菌体或者在例如遗传工程中通常使用的其他载体。例如,所述载体可以为表达载体。此外,所述载体还可以包括有协助其进入细胞的成分,如病毒颗粒、脂质体或蛋白外壳。
另一方面,本申请提供了一种细胞,其可以包含本申请所述的核酸分子或本申请所述的载体。在某些实施方式中,每种或每个宿主细胞可以包含一个或一种本申请所述的核酸分子或载体。在某些实施方式中,每种或每个宿主细胞可以包含多个(例如,2个或以上)或多种(例如,2种或以上)本申请所述的核酸分子或载体。例如,可以将本申请所述的载体引入所述宿主细胞中,例如真核细胞,如来自植物的细胞、真菌或酵母细胞等。在某些实施方式中,所述细胞可以是细菌细胞(例如,大肠杆菌)、酵母细胞或其它真核细胞,例如COS细胞、中国仓鼠卵巢(CHO)细胞、CHO-K1细胞、LNCAP细胞、HeLa细胞、293T细胞、COS-1细胞、SP2/0细胞、NS0细胞或骨髓瘤细胞。可以通过本领域已知的方法将本申请所述的载体引入所述宿主细胞中,例如热转化、电穿孔、病毒侵染、Ca离子转化、lipofectine转染、lipofectamin转染或其他转染试剂等。
另一方面,本申请还提供了免疫缀合物,其可以包含本申请所述的缀合物和/或多肽。
在某些实施方式中,可以将本申请所述的缀合物和/或多肽或其片段与另一试剂,如化学治疗剂、毒素、免疫治疗剂、成像探针、分光镜探针等的连接。该连接可以通过一个或多个共价键,或非共价相互作用,并且可以包括螯合作用。可以使用多种接头(所述接头可以为本领域所知)以形成免疫缀合物。此外,可以以融合蛋白质的形式提供免疫缀合物,其可以由编码免疫缀合物的多核苷酸表达。所述免疫缀合物还可以包含例如抗体-药物缀合物(ADC)。在ADC中,抗体和治疗剂可以通过接头交联,该接头可以是可切割的接头,例如可以是体内和/或体外可酶切的接头,例如可以是肽类接头、二硫类接头或腙类接头。
另一方面,本申请还提供了药物组合物,其可以包含本申请所述的缀合物和/或多肽、本申请所述的多肽分子、本申请所述的免疫缀合物、本申请所述的核酸分子、本申请所述的载体和/或本申请所述的细胞,以及任选地药学上可接受的载剂。
在某些实施方案中,所述药物组合物还可以包含一种或多种(药学上有效的)佐剂、稳定剂、赋形剂、稀释剂、增溶剂、表面活性剂、乳化剂和/或防腐剂的合适的制剂。组合物的可接受成分在所用剂量和浓度下可以对接受者无毒。本发明的药物组合物可以包括但不限于液体、冷冻和冻干组合物。
在某些实施方案中,所述药物组合物还可含有多于一种活性化合物,通常为不会不利地影响彼此的具有互补活性的那些活性化合物。此类药物的类型和有效量可以取决于例如制剂中存在的拮抗剂的量和类型,以及受试者的临床参数。
在某些实施方案中,所述药学上可接受的载剂可以包括与药物给药相容的任何和所有的溶剂、分散介质、包衣、等渗剂和吸收延迟剂,通常安全、无毒。
在某些实施方案中,所述药物组合物可以包含肠胃外、经皮、腔内、动脉内、鞘内和/或鼻内施用或直接注射到组织中。例如,所述药物组合物可以通过输注或注射施用于患者或者受试者。在某些实施方案中,所述药物组合物的施用可以通过不同的方式进行,例如静脉内、腹膜内、皮下、肌肉内、局部或真皮内施用。在某些实施方案中,所述药物组合物可以不间断施用。所述不间断(或连续)施用可以通过患者佩戴的小泵系统来实现,以测量流入患者体内的治疗剂。
另一方面,本申请还提供了一种试剂盒,可以包含本申请的缀合物、本申请的多肽、本申请的核酸分子、本申请的载体、本申请的免疫缀合物、本申请的细胞、和/或本申请的组合物。例如,本申请的试剂盒可以用于预防和/或治疗疾病和/或病症、影响靶分子含量、和/或制备本申请缀合物和/或本申请多肽。
治疗方法
另一方面,本申请还提供了本申请的缀合物、本申请的多肽、本申请的核酸分子、本申请的载体、本申请的免疫缀合物、本申请的细胞、本申请的组合物、和/或本申请的试剂盒在制备药物中的用途,所述药物可以用于预防和/或治疗疾病和/或病症。例如,其中所述疾病和/或病症可以包含肿瘤。例如,其中所述疾病和/或病症可以选自以下组:PD-L1阳性肿瘤、EGFR阳性肿瘤、HER-2阳性肿瘤、CD38阳性肿瘤和Ras功能和/或活性异常的肿瘤。例如,其中所述疾病和/或病症可以选自以下组:PD-L1高表达肿瘤、EGFR高表达肿瘤、HER-2高表达肿瘤、和Ras高表达的肿瘤。例如,其中所述疾病和/或病症可以包含实体瘤。例如,其中所述疾病和/或病症可以包含乳腺癌、肺癌、皮肤肿瘤和/或宫颈癌。例如,其中所述疾病和/或病症可以包含乳腺癌、肺癌、皮肤癌、骨髓瘤和/或宫颈癌。
另一方面,本申请还提供了本申请的缀合物、本申请的多肽、本申请的核酸分子、本申请的载体、本申请的免疫缀合物、本申请的细胞、本申请的组合物、和/或本申请的试剂盒,其可以用于预防和/或治疗疾病和/或病症。例如,其中所述疾病和/或病症可以包含肿瘤。例如,其中所述疾病和/或病症可以选自以下组:PD-L1阳性肿瘤、EGFR阳性肿瘤、HER-2阳性肿瘤、和Ras功能和/或活性异常的肿瘤。例如,其中所述疾病和/或病症可以选自以下组:PD-L1高表达肿瘤、EGFR高表达肿瘤、HER-2高表达肿瘤、CD38高表达肿瘤和Ras高表达的肿瘤。例如,其中所述疾病和/或病症可以包含实体瘤。例如,其中所述疾病和/或病症可以包含乳腺癌、肺癌、皮肤癌、骨髓瘤和/或宫颈癌。
另一方面,本申请还提供了一种预防和/或治疗疾病和/或病症的方法,其可以包含向有需要的对象施用本申请的缀合物、本申请的多肽、本申请的核酸分子、本申请的载体、本申请的免疫缀合物、本申请的细胞、本申请的组合物、和/或本申请的试剂盒。例如,其中所述疾病和/或病症可以包含肿瘤。例如,其中所述疾病和/或病症可以选自以下组:PD-L1阳性肿瘤、EGFR阳性肿瘤、HER-2阳性肿瘤、和Ras功能和/或活性异常的肿瘤。例如,其中所述疾病和/或病症可以选自以下组:PD-L1高表达肿瘤、EGFR高表达肿瘤、HER-2高表达肿瘤、CD38高表达肿瘤和Ras高表达的肿瘤。例如,其中所述疾病和/或病症可以包含实体瘤。例如,其中所述疾病和/或病症可以包含乳腺癌、肺癌、皮肤癌、骨髓瘤和/或宫颈癌。
另一方面,本申请还提供了一种影响靶分子含量的方法,可以包含施用本申请的缀合物、本申请的多肽、本申请的核酸分子、本申请的载体、本申请的免疫缀合物、本申请的细胞、本申请的组合物和/或本申请的试剂盒。例如,所述方法可以包含降低靶分子的含量。例如,所述方法可以包含体外方法、离体方法和/或体内方法。例如,所述靶分子可以为细胞表面的分子和/或细胞内的分子。例如,所述靶分子可以为皮肤细胞、骨髓细胞、宫颈细胞、肺细胞和/或乳腺细胞表面的分子。例如,所述靶分子可以为皮肤癌细胞、骨髓瘤细胞、宫颈癌细胞、肺癌细胞和/或乳腺癌细胞表面的分子。例如,所述细胞可以选自以下组:PD-L1阳性细胞、EGFR阳性细胞、HER-2阳性细胞、CD38阳性细胞和Ras功能和/或活性异常的肿瘤。例如,所述细胞可以选自以下组:PD-L1高表达细胞、EGFR高表达细胞、HER-2高表达细胞、CD38高表达细胞和Ras高表达的细胞。
制备方法
另一方面,本申请还提供了一种制备本申请缀合物和/或本申请多肽的方法,可以包含在使得所述缀合物和/或所述多肽表达的条件下,培养本申请的细胞。
例如,可以通过转肽酶A(Srt A)连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分。
例如,所述靶分子靶向部分的C末端可以包含如SEQ ID NO:92或93所示的氨基酸序列LPETG或LPXTG,其中X可以为任意氨基酸,和/或所述靶分子靶向部分的N末端可以包含寡聚甘氨酸序列。
例如,所述蛋白降解器靶向部分的C末端可以包含如SEQ ID NO:92或93所示的氨基酸序列LPETG或LPXTG,其中X可以为任意氨基酸,和/或所述蛋白降解器靶向部分的N末端可以包含寡聚甘氨酸序列。
例如,所述靶分子靶向部分的C末端可以包含如SEQ ID NO:92或93所示的氨基酸序列LPETG或LPXTG,其中X可以为任意氨基酸,所述蛋白降解器靶向部分的N末端可以包含寡聚甘氨酸序列,可以通过所述转肽酶A(Srt A)连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分。
例如,所述蛋白降解器靶向部分的C末端可以包含如SEQ ID NO:92或93所示的氨基酸序列LPETG或LPXTG,其中X可以为任意氨基酸,所述靶分子靶向部分的N末端可以包含寡聚甘氨酸序列,可以通过所述转肽酶A(Srt A)连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分。
另一方面,本申请还提供了一种筛选高邻近反应活性的靶分子靶向部分的方法。例如,为了解决单域抗体的亲和力不足和血清半衰期短的问题,可以通过向单域抗体中引入具有邻近反应活性的非天然氨基酸制备共价抗体。例如,引入具有邻近反应活性的非天然氨基酸的位点可以是单域抗体的CDR区、CDR区N端前5个氨基酸位点和/或CDR区C端前5个氨基酸位点。例如,为了筛选具有更高的邻近反应活性的靶分子靶向部分,可以采用以下筛选方法:可以向IgG、scFv、Fab或者单域抗体的CDR区、CDR区N端前5个氨基酸位点和/或CDR区C端前5个氨基酸位点插入具有邻近反应活性的非天然氨基酸,或可以根据抗体和抗原复合物的晶体结构,在抗原的界面氨基酸,的5埃周围搜寻抗体上可以用于插入具有邻近反应活性的非天然氨基酸的候选位点,例如抗原的界面氨基酸可以是抗原上距离抗体最接近的氨基酸,例如可以是具有亲核基团的界面氨基酸,抗体的候选位点可以是距离该界面氨基酸5埃的所有位点;将候选位点突变为非天然氨基酸后,可以获得具有邻近反应活性的共价抗体库用于筛选具有更高的邻近反应活性的靶分子靶向部分。例如,可以通过遗传密码子拓展技术将具有邻近反应活性的非天然氨基酸替换候选位点的氨基酸。例如,可以通过将共价抗体库与少量的抗原孵育后,通过变性凝胶电泳分离得到具有更高的邻近反应活性的靶分子靶向部分与抗原的交联条带,可以通过胶内酶解,串联质谱分析,以及可以通过交联肽段的分析得到具有更高的邻近反应活性的共价抗体中邻近反应性非天然氨基酸的插入位置和抗原上反应的亲核残基。
例如,验证本申请的靶分子靶向部分是否可以与靶分子共价结合的方法可以是,将靶分子靶向部分与靶分子共同孵育,用变性剂洗涤后,检测靶分子靶向部分与靶分子是否仍可以结合。例如,可以通过荧光标记的αPD-L1共价抗体与另一种荧光标记的靶分子孵育,可以通过共聚焦荧光成像表征靶分子靶向部分与靶分子是否仍可以结合。例如,可以通过western blot检验蛋白交联产生分子量更高的交联条带的情况。
例如,可以通过转肽酶在共价抗体的C末端或N末端连接功能性多肽得到缀合物。例如,可以通过荧光标记缀合物、靶分子白串联的绿色荧光蛋白和溶酶体追踪剂三者的共定位成像表征降解子的降解过程。例如,可以将不同结构形式的缀合物同肿瘤细胞共同孵育,并可选地在部分培养基中加入溶酶体抑制剂,随后,收集细胞,提取蛋白质,经高温裂解和变性,western blot半定量检验缀合物对靶分子的降解程度。
本申请所述的靶分子靶向部分可以通过共价键连接无限降低了抗体对抗原的解离值,可以解决片段抗体半衰期短和易脱靶的缺点。通过转肽酶偶联功能分子的方式制备得到的缀合物则可以在结合靶分子后快速内吞并最终进入溶酶体中降解。利用靶分子靶向部分与靶分子不可逆结合的特点,可以实现缀合物-靶分子复合物在转运的过程中不能发生解离,避免靶分子在到达溶酶体前发生解离,而无法降解。同PROTAC技术相比,本申请可以实现对膜蛋白的高效降解,同LYTAC和AbTAC相比,本申请对膜蛋白的降解可以不依赖特定的肿瘤表面受体而能达到相同的降解效率,本申请的缀合物可以在基础科学研究和抗肿瘤治疗等领域具有更为广阔的应用前景。
另一方面,本申请还提供了一种制备本申请缀合物的方法,可以包含将所述缀合物的所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分直接或间接连接。
例如,可以通过转肽酶A(Srt A)连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分。
例如,所述靶分子靶向部分的C末端可以包含如SEQ ID NO:92或93所示的氨基酸序列LPETG或LPXTG,其中X可以为任意氨基酸,和/或所述靶分子靶向部分的N末端可以包含寡聚甘氨酸序列。
例如,所述蛋白降解器靶向部分的C末端可以包含如SEQ ID NO:92或93所示的氨基酸序列LPETG或LPXTG,其中X可以为任意氨基酸,和/或所述蛋白降解器靶向部分的N末端可以包含寡聚甘氨酸序列。
例如,所述靶分子靶向部分的C末端可以包含如SEQ ID NO:92或93所示的氨基酸序列LPETG或LPXTG,其中X可以为任意氨基酸,所述蛋白降解器靶向部分的N末端可以包含寡聚甘氨酸序列,可以通过所述转肽酶A(Srt A)连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分。
例如,所述蛋白降解器靶向部分的C末端可以包含如SEQ ID NO:92或93所示的氨基酸序列LPETG或LPXTG,其中X可以为任意氨基酸,所述靶分子靶向部分的N末端可以包含寡聚甘氨酸序列,可以通过所述转肽酶A(Srt A)连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分。
不欲被任何理论所限,下文中的实施例仅仅是为了阐释本申请的缀合物、制备方法和用途等,而不用于限制本申请发明的范围。
实施例
实施例1靶分子靶向部分的制备与检测
1.1靶分子靶向部分前体的表达载体的构建
为了制备能够特异性识别靶分子并与该靶分子共价结合的靶分子靶向部分,首先可以制备能够结合靶分子的靶分子靶向部分前体。例如,野生型单域抗体可以作为靶分子靶向部分前体。
利用重组酶(诺唯赞,Cat.No.C112-01)通过同源重组的方式改造表达载体pET20b(+)(Novagen,Cat.No.69739-3),向其中引入酶切位点Not I,得到野生型单域抗体专用表达载体Nb vector,其中线性化pET 20b(+)所用引物对如下所示:
上游引物:GAAGCTGAGTGCGGCCGCAGGAAGCTGAGTTGGCTGC(如SEQ ID NO:7所示);
下游引物:CTGCGGCCGCACTCAGCTTCCTTTCGGGCTTTGTTAGC(如SEQ ID NO:8所示);
合成包含PD-L1单域抗体表达序列的双链核酸(PD-L1单域抗体氨基酸序列可以如SEQ ID NO:14或16所示,核酸序列可以如SEQ ID NO:15或17所示),和包含EGFR单域抗体表达序列的双链核酸(EGFR单域抗体氨基酸序列可以如SEQ ID NO:19所示,核酸序列可以如SEQ ID NO:20所示)。任选地,为了后续的荧光染料标记和酶催化偶联多肽,单域抗体的C末端可以添加了一段转肽酶识别序列,如SEQ ID NO:92所示的氨基酸序列LPETG,随后通过限制性内切酶Nco I和Not I将单域抗体的编码序列亚克隆至Nb载体(Nb vector)中。
靶分子靶向部分前体的表达和纯化
将包含有单域抗体的Nb vector质粒通过热激法转化到表达型宿主菌BL 21(DE3)(TIANGEN,Cat.No.CB105-02)中,其涂布在含有氨苄青霉素(100μg/mL)的固体培养基的平板上,37℃过夜。挑选单菌落接种、培养过夜,第二天将过夜菌种以1:100的比例转接至新鲜的自诱导培养基中(每升含6g Na2HPO4,3g KH2PO4,20g蛋白胨(typtone),5g酵母提取物(yeast extract),5g NaCl,200mg MgCl2,200mg CaCl2,0.5g葡萄糖,2.5g乳糖,6mL甘油),37℃摇床培养至OD值达到0.6-0.8时,转移到27℃摇床培养12-16小时。4000rpm转速离心,弃去上清的培养基,收集菌体。按照每1g菌泥加入15mL高渗溶液(20%Sucrose,25mM Tris,150mM NaCl,1mM EDTA,1mg/mL溶菌酶,pH 7.4)的比例重悬,室温孵育30min。4℃条件下,17000rpm高速离心40min,去除沉淀,收集上清。然后使用镍离子亲和层析柱(生工,Cat.No.C600792-0505)纯化单域抗体蛋白,并使用FPLC(GE Healthcare)对单域抗体进一步纯化,纯化好的蛋白质浓缩后保存在含有甘油的PBS(pH 7.4)缓冲溶液中,纯化效果通过UPLC/MS进行表征,结果表明单域抗体的分子量正确,纯度在95%以上。
图2A和图2B显示的是,可以作为靶分子靶向部分前体的野生型单域抗体的一级质谱图。图2A为野生型单域抗体αPD-L1的质谱图,理论值为16016Da,测定值为16015Da,图2B为野生型单域抗体αEGFR的质谱图,理论值为15603Da,测定值为15601Da。
1.2靶分子靶向部分的表达载体的构建
为了制备能够特异性识别靶分子并与该靶分子共价结合的靶分子靶向部分,之后可以在靶分子靶向部分前体的氨基酸位点引入可以靶分子形成共价键连接的第一官能团,例如,可以将单域抗体的界面氨基酸使用非天然氨基酸替换。例如,界面氨基酸位点的确定方法可以是先将单域抗体按照本领域常用的CDR划分方式划分CDR区,界面氨基酸可以是CDR区内的任意氨基酸,界面氨基酸也可以是CDR的N端前5个氨基酸中的任意氨基酸,界面氨基酸也可以是CDR的C端后5个氨基酸中的任意氨基酸。例如,可以通过琥珀密码子TAG突变的方式,将靶分子靶向部分前体的氨基酸位点替换为可以与靶分子形成共价连接的非天然氨基酸。
靶分子靶向部分的表达载体的构建
合成包含PD-L1单域抗体表达序列的双链核酸,和包含EGFR单域抗体表达序列的双链核酸,并利用重组酶(诺唯赞,Cat.No.C112-01)通过同源重组的方式克隆到pBAD/His(Thermo,Cat.No.V43001)中,其中线性化pBAD/His载体的PCR反应中所用引物对如下所示:
上游引物:AGTTGGCTGCTGCCACCAGAATTTGCCTGGCGGCA(如SEQ ID NO:21所示);
下游引物:GCAGGTATTTCATATGGTTAATTCCTCCTGTTAGCCC(如SEQ ID NO:22所示);
使用PCR聚合酶(诺唯赞,Cat.No.P505-d1)通过覆盖线性扩增PCR向单域抗体的表达序列中引入琥珀密码子TAG突变用于非天然氨基酸的插入。
表1显示的是,在不同位点引入TAG突变的覆盖线性扩增PCR所用引物。
表1在不同位点引入TAG突变的覆盖线性扩增PCR所用引物
吸取3μL扩增产物加入到DH5α大肠杆菌(TIANGEN,Cat.No.CB101-02)化学感受态中,42℃热激1min后,冰浴,复苏,最后涂布在含有氨苄青霉素(100μg/mL)的固体培养基的平板上,37℃过夜。随机挑取至少3个单克隆菌落,以线性化pBAD/His载体的上游引物作为测序引物测序,选择正确的载体用于非天然氨基酸插入单域抗体的表达和纯化。
靶分子靶向部分的表达和纯化
将带有琥珀密码子TAG突变的单域抗体表达载体质粒分别同tRNA合成酶(tRNASynthetase)/tRNA载体质粒通过热激法共转化到宿主菌DH10B(庄盟生物,Cat.No.ZC112-2)中,涂布在含有氨苄青霉素(100μg/mL)和氯霉素(34μg/mL)的固体培养基的平板上,37℃过夜。每个平板各挑取一个单菌落接种于含有抗生素的LB培养基中,37℃,220rpm培养12小时。随后,从处于平台期的菌液中吸取相同体积的液体,并在混合后,以1:100的比例转接至新鲜的培养基中(每升含6g Na2HPO4,3g KH2PO4,20g蛋白胨(typtone),5g酵母提取物(yeast extract),5g NaCl,200mg MgCl2,200mg CaCl2,0.5g葡萄糖,6mL甘油),37℃摇床培养至OD值达到0.6-0.8时,加入终浓度为1mM的非天然氨基酸,37℃继续培养30min,加入终浓度为0.2%的阿拉伯糖诱导蛋白表达,随后转移到27℃摇床培养12-16小时。4000rpm转速离心,弃去上清的培养基,收集菌体。加入裂解液(25mM Tris,150mM NaCl,1mg/mL溶菌酶,1x蛋白酶抑制剂混合物(Protease inhibitor cocktail),pH 7.4)重悬,湿冰上超声破碎,4℃条件下,17000rpm高速离心40min,去除沉淀,收集上清。然后使用镍离子亲和层析柱(生工,Cat.No.C600792-0505)纯化单域抗体蛋白,并使用FPLC(GE Healthcare)对单域抗体进一步纯化,纯化好的蛋白质保存在含有甘油的PBS(pH 7.4)缓冲溶液中,纯化效果通过UPLC/MS进行表征。例如,非天然氨基酸的合成可以是本领域已知的,例如,6-溴-己酰赖氨酸(BrC6K)的合成酶可以记载于Angew.Chem.Int.Ed.Engl.56,14521-14525(2017).之中,氟代硫酸盐-L-酪氨酸(FSY)的合成酶可以记载于J.Am.Chem.Soc.140,4995-4999(2018).之中。
例如,可以分别向单域抗体中引入了BrC6K和FSY两种邻近交联反应活性非天然氨基酸。结果表明,不同位点引入非天然氨基酸的分子量均有在质谱结果中体现,此法可以得到不同位点插入非天然氨基酸的靶分子靶向部分化合物库。
表2显示的是,PD-L1单域抗体中不同位点被BrC6K或FSY替换后分子量。
表2 PD-L1单域抗体中不同位点被BrC6K或FSY替换后分子量
不同位点 | 被BrC6K替换后分子量 | 被FSY替换代后分子量 |
R32 | 16165 | 16105 |
T54 | 16220 | 16160 |
D99 | 16206 | 16146 |
S100 | 16234 | 16174 |
F101 | 16174 | 16114 |
E102 | 16192 | 16132 |
D103 | 16206 | 16146 |
P104 | 16224 | 16164 |
T105 | 16220 | 16160 |
T107 | 16220 | 16160 |
L108 | 16208 | 16148 |
V109 | 16222 | 16162 |
T110 | 16220 | 16160 |
S111 | 16234 | 16174 |
S112 | 16234 | 16174 |
G113 | 16264 | 16204 |
A114 | 16250 | 16190 |
F115 | 16174 | 16114 |
Q116 | 16193 | 16133 |
Y117 | 16158 | 16098 |
图3A和图3B显示的是,PD-L1单域抗体的不同位点被BrC6K或FSY替换后的所得化合物库的质谱图。图3A显示的是PD-L1单域抗体的不同位点被BrC6K后的所得化合物库的质谱图,图3B显示的是PD-L1单域抗体的不同位点被FSY替换后的所得化合物库的质谱图。
1.3靶分子靶向部分与靶分子形成共价键连接的检测
取少量复溶的人PD-L1蛋白(义翘神州,Cat.No.10084-HNAH)2μg置于1.5mL EP管中,加入30μg本申请中纯化出的PD-L1单域抗体中不同位点被BrC6K或FSY替换后的所得化合物库(化合物库中包含不同位点被BrC6K或FSY替换后的多个单域抗体的复合物)和70μLPBS缓冲液(pH 8.0),37℃反应一定时间后,冻干除去溶剂。加入40μL 1x上样缓冲液(康为世纪,Cat.No.CW0027S),重悬,室温静置30min,SDS-PAGE(金斯瑞,Cat.No.M00659)凝胶电泳分离分析反应体系。电泳完成后,拆开胶板,取出凝胶,蒸馏水洗涤后,考马斯亮蓝染色,脱色液脱色以鉴定交联。
图4A和图4B显示的是,SDS-PAGE分析PD-L1单域抗体的不同位点被BrC6K或FSY替换后的所得化合物库同靶分子交联结果。图4A显示的是,PD-L1单域抗体的不同位点被BrC6K替换后的所得化合物库与靶分子孵育0小时以及孵育72小时后的交联结果;图4B显示的是,PD-L1单域抗体的不同位点被FSY替换后的所得化合物库与靶分子孵育后的交联结果。结果显示,插入非天然氨基酸的单域抗体在和抗原蛋白孵育后,体系中产生了新的大分子量条带,分子量之和等于单域抗体加上抗原,表明靶分子靶向部分化合物库中的靶分子靶向部分都可以与抗原蛋白形成了新的共价相互作用,这种共价结合不受变性剂SDS的影响。所得化合物库中的靶分子靶向部分都具有邻近交联反应活性。
1.4高邻近交联反应活性的靶分子靶向部分的筛选
在干净的保鲜膜上,采用新的刀片将上述凝胶上的化合物库同抗原交联条带切下,分割为边长约1mm的小块。50%乙腈(Fisher,Cat.No.955-4)水溶液处理三次脱去残留的考马斯亮蓝染色液,纯乙腈对胶粒脱水。随后DTT(二硫苏糖醇)还原打开蛋白中的二硫键到游离态,碘乙酰修饰还原出的半胱氨酸的巯基。再次用纯乙腈脱去胶粒中的水份。随后用胰蛋白酶(Trypsin K/R,Promega,Cat.No.V511B)和胰凝乳蛋白酶(Chymotrypsin,Promega,Cat.No.V1061)两种酶同时作用将胶粒中的蛋白酶解为肽段,0.1%甲酸(Fluka)提取肽段,脱盐处理后提交串联质谱分析。串联质谱为Thermo的QE PLUS或LUMOS三合一质谱,流动相为0.1%甲酸水溶液和0.1%甲酸乙腈,梯度时间为90min。与此同时从胶上分离出PD-L1单域抗体条带和PD-L1条带,类似的处理后使用多级质谱鉴定切出来的肽段,p-Find软件搜索肽段,得到的结果作为对照分析。对于凝胶上的化合物库同抗原交联条带,采用p-link软件搜索鉴定到的交联肽段,绘制相互作用界面,可以确定具有高邻近交联反应活性的靶分子靶向部分上的非天然氨基酸插入位点,以及可以确定靶分子上发生交联的位点。
图5A、图5B和图5C显示的是,具有高邻近交联反应活性的靶分子靶向部分与靶分子交联后的交联肽段的串联质谱。图5A显示的是,PD-L1单域抗体中110位被BrC6K替换时,可以与靶分子PD-L1的第69位组氨酸具有更高的邻近交联反应活性;图5B显示的是,PD-L1单域抗体中113位被BrC6K替换时,可以与靶分子PD-L1的第69位组氨酸具有更高的邻近交联反应活性;图5C显示的是,PD-L1单域抗体中108位被FSY替换时,可以与靶分子PD-L1的第69位组氨酸具有更高的邻近交联反应活性。结果表明,SDS-PAGE结合胶内酶解交联蛋白并用多级质谱分析交联肽段的方法可以用于从靶分子靶向部分化合物库中筛选出具有更高的邻近交联反应活性的靶分子靶向部分;PD-L1单域抗体中110位、113位和108位被具有邻近交联反应活性的非天然氨基酸替换后,所得靶分子靶向部分具有更高的邻近交联反应活性。
将靶分子靶向部分表达和纯化:第110位被BrC6K替换后的PD-L1单域抗体(αPD-L1T110BrC6K)、第113位被BrC6K替换后的PD-L1单域抗体(αPD-L1 G113BrC6K)、第108位被FSY替换后的PD-L1单域抗体(αPD-L1 L108FSY)和第116位被FSY替换后的EGFR单域抗体(αEGFR Q116FSY)。
图6A、图6B、图6C和图6D显示的是,PD-L1单域抗体或EGFR单域抗体中不同位点被BrC6K或FSY替换后的所得靶分子靶向部分的质谱图。图6A显示的是,第110位被BrC6K替换后的PD-L1单域抗体(αPD-L1 T110BrC6K),图6B显示的是,第113位被BrC6K替换后的PD-L1单域抗体(αPD-L1 G113BrC6K),图6C显示的是,第108位被FSY替换后的PD-L1单域抗体(αPD-L1 L108FSY),图6D显示的是,第116位被FSY替换后的EGFR单域抗体(αEGFR Q116FSY)。
取复溶的人PD-L1蛋白(义翘神州,Cat.No.10084-HNAH)2μg置于1.5mL EP管中,加入5μg不同位点被非天然氨基酸替换的所得靶分子靶向部分或野生型PD-L1单域抗体和70μL PBS缓冲液(pH 8.0),37℃反应一定时间后,SDS-PAGE分析可以再以两种方式测试:方式一,加入50μg的GGG-TAMRA羧基罗丹明荧光底物(北京中科亚光生物科技有限公司合成)和0.5μg的转肽酶Sortase A(表达纯化得到,序列如SEQ ID NO:99所示),37℃孵育1小时使荧光底物连接到靶分子靶向部分上,加入5x上样缓冲液(康为世纪,Cat.No.CW0027S),室温静置30min,SDS-PAGE(金斯瑞,Cat.No.M00659)凝胶电泳分离分析反应体系。电泳完成后,蒸馏水清洗胶三次后,TYPHOON多功能激光扫描成像系统(GE healthhcare)扫描胶内荧光;方式二,冻干除去溶剂。加入40μL稀释为1x的5x上样缓冲液(康为世纪,Cat.No.CW0027S),重悬,室温静置30min,SDS-PAGE(金斯瑞,Cat.No.M00659)凝胶电泳分离,考马斯亮蓝染色,分析交联反应。
图7A、图7B、和图7C显示的是,PD-L1单域抗体或EGFR单域抗体中不同位点被BrC6K或FSY替换后的所得靶分子靶向部分与靶分子体外交联检测结果。图7A显示的是SDS-PAGE分析野生型PD-L1单域抗体,靶分子靶向部分αPD-L1 T110BrC6K,靶分子靶向部分αPD-L1G113BrC6K分别同PD-L1蛋白共同孵育24小时的混合液,本申请的靶分子靶向部分都可以与靶分子形成交联条带;图7B显示的是,SDS-PAGE分析αPD-L1 L108FSY同PD-L1蛋白共同孵育24小时的混合液,本申请的靶分子靶向部分都可以与靶分子形成交联条带;图7C显示的是,SDS-PAGE分析野生型EGFR单域抗体,αEGFR Q116FSY分别同靶分子EGFR蛋白共同孵育12小时的混合液,下图为荧光扫描胶结果显示本申请的靶分子靶向部分都可以与靶分子形成交联条带。结果表明,本申请得到的靶分子靶向部分都能够具有与靶分子邻近交联反应活性,本申请得到的靶分子靶向部分αPD-L1 L108FSY能够具有更高的与PD-L1邻近交联反应活性,αEGFR Q116FSY能够具有更高的与EGFR邻近交联反应活性。
1.5靶分子靶向部分结合细胞表面靶分子的检测
为了验证靶分子靶向部分可以共价结合在细胞膜表面的靶分子,采用转肽酶Sortase A在靶分子靶向部分的C末端标记荧光染料,例如,羧基罗丹明荧光底物。将带有LPETG转肽酶连接序列的靶分子靶向部分用超滤的方法更换到反应液中(25mM Tris,150mMNaCl,pH7.4),调整抗体浓度为100μM,加入10倍质量当量的GGG-TAMRA底物和0.1倍质量当量的转肽酶Sortase A,37℃孵育1小时使荧光底物连接到靶分子靶向部分上,加入终浓度为5mM的MTSET试剂(Biorigin,Cat#BN15003),Bio-rad脱盐柱离心除去底物的同时更换到PBS(pH 7.4)溶液中,加入10%的甘油于-80℃保存或使用。
表达PD-L1的细胞的构建
构建表达PD-L1或表达PD-L1-GFP细胞的方法可以是本领域常用的构建方法。例如,可以将3种质粒pLV-PD-L1-C-GFP Spark(义翘神州,Cat.No.HG10084-ACGLN)、psPAX2(淼灵生物,Cat.No.P0261)和pMD2.G(淼灵生物,Cat.No.P0262)共同转染进入生长密度为80%的HEK 293T细胞中,使用含有10%胎牛血清的DMEM培养基,放于恒温为37℃并含有5%的CO2的培养箱中培养24小时后更换新鲜的DMEM培养基,转染48小时后开始收取第一次病毒并更换新鲜培养基,72小时和96小时后收取第二次和第三次病毒颗粒。在24孔板中种植MDA-MB-231Luc乳腺癌细胞(诺和生物,MDA-MB-231+Luciferase),待生长密度为70%的时候,向4个孔中分别加入100μL,200μL,400μL和500μL病毒原液并加入终浓度为8μg/mL的聚凝胺,培养24小时后传代,扩大培养至直径10厘米培养皿中后用0.25%的胰酶消化悬浮为单细胞状态,随后送至细胞分选仪完成分选工作,分选通道选择GFP。得到多克隆后采用有限稀释法进一步得到不同PD-L1表达量的单克隆稳转系PD-L1/MDA或PD-L1-GFP/MDA,扩大培养后用快速冻存液冻存于-80℃冰箱或继续培养,可以通过共聚焦荧光显微镜拍摄荧光抗体标记的细胞表征PD-L1的转入。
消化吹散培养皿中的表达PD-L1的人乳腺癌MDA细胞(PD-L1/MDA),以1:5的比例铺被到8孔板中,37℃培养12小时。加入终浓度为200nM荧光标记的靶分子靶向部分或野生型单域抗体,继续培养5小时。随后普通清洗组使用PBS溶液(pH 7.4)洗三次,每次15min;强变性清洗组则采用强变性溶液(Stringent溶液,500mM NaCl,3%吐温20,100mM甘氨酸,pH3.0),洗三次,每次15min,该溶液为强烈的变性条件,因此通过非共价相互作用结合在细胞表面的物质(例如野生型单域抗体)将从细胞上解离。使用蔡司共聚焦荧光显微镜对TAMRA通道进行荧光成像。
图8A、图8B、图8C和图8D显示的是,靶分子靶向部分结合细胞表面靶分子的检测结果。图8A显示,PD-L1单域抗体被BrC6K替换后的靶分子靶向部分αPD-L1BrC6K在强变性溶液洗涤后依然与靶分子结合,图8B显示,免疫印迹试验表征αPD-L1BrC6K与靶分子PD-L1发生交联反应;图8C显示,EGFR单域抗体被FSY替换后的靶分子靶向部分αEGFRFSY在强变性溶液洗涤后依然与靶分子结合,图8D显示,免疫印迹试验表征αEGFRFSY与靶分子PD-L1发生交联反应。结果显示,强变性溶液处理后,依然可以在细胞表面检测到靶分子靶向部分(αPD-L1BrC6K或αEGFRFSY),而野生型单域抗体(αPD-L1或αEGFR)基本消失。这表明靶分子靶向部分在结合细胞膜表面靶分子后,在邻近效应的促进下,靶分子靶向部分上的具有邻近交联反应活性的非天然氨基酸将同靶分子上的亲核残基发生反应,二者的结合方式由非共价结合转变为共价交联连接。
实施例2缀合物的制备与检测
本申请提供一种将蛋白降解器靶向部分连接在靶分子靶向部分制备具有降解能力的缀合物的方法。例如,可以通过酶催化偶联反应将穿膜肽(Cell penetratingpeptide)和溶酶体靶向肽(Lysosomal targeting peptide)连接于靶分子靶向部分的N端或C端,同时保持靶分子靶向部分对靶分子的靶向结合和邻近交联反应的能力。
2.1蛋白降解器靶向部分的合成
本申请中所述穿膜肽指可以帮助胞外物质穿过细胞膜的多肽,例如,多个带正电的精氨酸串联在一起得到的多肽具有良好的穿膜能力,穿膜肽可以是多聚精氨酸;又例如,NPXY(如SEQ ID NO:64所示,其中X可以为甘氨酸G、或丙氨酸A),ALAPYIP(如SEQ ID NO:77所示)可以很好的靶向溶酶体。靶向溶酶体或蛋白酶体的其它多肽同样可以在本申请中发挥类似的作用,由二者组成的用于偶联反应的转肽反应底物序列包括但不限于表3显示的蛋白降解器靶向部分。
表3本申请的蛋白降解器靶向部分序列信息
上述多肽底物交由多肽合成公司(北京中科亚光生物科技有限公司),可以采用标准的固相多肽合成法合成,经由HPLC纯化后,纯度>95%。其中,G或G’、L或L’表示转肽酶Sortase A识别并连接的序列,CPP可以表示多聚精氨酸,例如9个D构型的精氨酸连接而成的多肽,LTP可以表示NPXY靶向溶酶体序列(如SEQ ID NO:64所示,其中X可以为甘氨酸G、或丙氨酸A),LTS可以表示ALAPYIP靶向溶酶体序列(如SEQ ID NO:77所示),MMP-B或B-MMP可以表示屏蔽多聚精氨酸的负电序列,其中MMP序列可以被细胞表面的蛋白酶酶切,从而使B序列的带负电序列被剪切,使得多聚精氨酸发挥穿膜能力。
2.2缀合物的合成
图9A和图9B显示的是,转肽酶介导蛋白降解器靶向部分和靶分子靶向部分连接制备本申请缀合物的示意图。图9A显示的是靶分子靶向部分的C端连接蛋白降解器靶向部分制备本申请缀合物;图9B显示的是靶分子靶向部分的N端连接蛋白降解器靶向部分制备本申请缀合物。
靶分子靶向部分的C端连接蛋白降解器靶向部分
将带有LPETG转肽酶连接序列的靶分子靶向部分用超滤或脱盐的方法更换为反应液(25mM Tris,150mM NaCl,5mM CaCl2,pH 7.4),调整抗体终浓度为100μM,加入终浓度为1mM的蛋白降解器靶向部分(例如Gn-CPP+LTS,其中n可以为1到10)和终浓度为10μM的转肽酶Sortase A,30℃孵育1小时,LC-MS监测反应进程。随后,加入终浓度为5mM的MTSET试剂,混匀后室温孵育10min。使用脱盐柱(Bio-rad,Cat.No.7326221)或PD-10(GE,Cat.No.52-1308-00)除去底物的同时更换到PBS(pH 7.4)溶液中。His标签(His-Tag)可以由6-10个连续的组氨酸残基组成,His标签可被镍柱吸附;由于参与连接反应的靶分子靶向部分的C端的His标签在反应中被切除,而转肽酶中C末端带有His标签,因此可以采用镍磁珠或树脂除去体系中残留未反应的靶分子靶向部分和转肽酶。因为是位点特异性连接并经过纯化后得到的产品,每一个靶分子靶向部分上可以均连接一分子的蛋白降解器靶向部分。得到的缀合物用液质联用质谱(LC-MS表征)。
图10显示的是,PD-L1靶分子靶向部分αPD-L1 L108FSY,以及PD-L1靶分子靶向部分连接蛋白降解器靶向部分所得的缀合物GlueTACFSY/PD-L1的一级质谱图。
图11显示的是,野生型EGFR单域抗体连接蛋白降解器靶向部分所得的偶联物NbTAC-EGFR,以及EGFR靶分子靶向部分连接蛋白降解器靶向部分所得的缀合物GlueTAC-EGFR的一级质谱图。
靶分子靶向部分的N端连接蛋白降解器靶向部分
为了可以在靶分子靶向部分的N端偶联蛋白降解器靶向部分或其它功能肽,本申请在靶分子靶向部分的N末端添加了寡聚甘氨酸序列(例如采用三聚甘氨酸)。合成N末端添加了寡聚甘氨酸序列的PD-L1单域抗体表达序列的双链核酸(氨基酸序列可以如SEQ IDNO:16所示,核酸序列可以如SEQ ID NO:17所示),随后通过Nco I和Not I将单域抗体的编码序列亚克隆至Nb vector。
采用本申请的方法在L108位和G113位引入琥珀密码子突变,所用引物如下:
在L108引入TAG突变的覆盖线性扩增PCR所用引物:
上游引物:GATCCGACCTGTACCTAGGTTACCAGCAGCGGTG(如SEQ ID NO:94所示);
下游引物:ACCGCTGCTGGTAACCTAGGTACAGGTCGGATCTTC(如SEQ ID NO:95所示)。
在G113引入TAG突变的覆盖线性扩增PCR所用引物:
上游引物:CCTGGTTACCAGCAGCTAGGCATTTCAGTATTGGG(如SEQ ID NO:96所示);
下游引物:CCAATACTGAAATGCCTAGCTGCTGGTAACCAGGG(如SEQ ID NO:97所示)。
将测序正确的突变质粒后,分别采用采用本申请表达和纯化的方法纯化得到N端带有三聚甘氨酸的野生型单域抗体NG3-αPD-L1,靶分子靶向部分NG3-αPD-L1 L108FSY和靶分子靶向部分NG3-αPD-L1 G113BrC6K。
将N端为三聚甘氨酸的单域抗体蛋白用超滤或脱盐的方法更换为反应液(25mMTris,150mM NaCl,5mM CaCl2,pH 7.4),调整抗体终浓度为100μM,加入终浓度为200μM的蛋白降解器靶向部分(例如带有LPETG转肽酶连接序列的CPP+LTS序列)和终浓度为10μM的转肽酶Sortase A,30℃孵育1小时,LC-MS监测反应进程。随后,加入终浓度为5mM的MTSET试剂,混匀后室温孵育10min。使用阳离子交换树脂从反应体系中纯化出目标产物,浓缩后使用脱盐柱(Bio-rad,Cat.No.7326221)或PD-10(GE,Cat.No.52-1308-00)除去底物的同时更换到PBS(pH 7.4)溶液中,因为是位点特异性连接并经过纯化后得到的产品,每一个单域抗体上可以均连接一分子的蛋白降解器靶向部分。得到的蛋白用液质联用质谱(LC-MS表征)。
实施例3缀合物介导的靶分子降解
3.1采用荧光成像的方法检测缀合物对靶分子的结合和促进靶分子降解
为了观察到本申请的缀合物在靶向靶分子后发生邻近交联反应,产生共价连接的复合物,并进入细胞在蛋白降解器内一同降解,本申请在PD-L1蛋白的C末端融合了绿色荧光蛋白,通过监测靶分子、缀合物和溶酶体定位探针的荧光信号,可以观测缀合物促进靶分子降解的过程。
消化吹散培养皿中表达PD-L1和GFP融合蛋白的人乳腺癌MDA细胞(PD-L1-GFP/MDA,通过本申请的方法构建),以1:5的比例铺被到8孔板中,37℃培养12小时。分别加入终浓度为200nM的TAMRA荧光标记的野生型PD-L1单域抗体(对照组)、终浓度为200nM的TAMRA荧光标记的PD-L1靶分子靶向部分连接蛋白降解器靶向部分所得的缀合物GlueTAC-PD-L1(GlueTAC试验组),并加入溶酶体荧光探针(Lysotracker Deepred,Thermo,Cat.No.L12492),继续培养5小时。随后使用PBS缓冲液(pH 7.4)洗3次,使用蔡司共聚焦荧光显微镜对GFP、TAMRA和Deepred三个通道分别进行荧光成像。
图12显示的是,对照组和GlueTAC试验组的活细胞共聚焦荧光成像。结果显示,对照组中荧光标记的单域抗体和靶分子在空间分布上没有明显的一致性;荧光标记的缀合物和靶分子在空间分布上有一定程度的一致性,其荧光呈现出聚集的效果,可以认为缀合物和靶分子以结合成为复合物的形式存在。进一步地,荧光合并图显示红色荧光的溶酶体定位探针的空间分布和缀合物-靶分子复合物也有一定程度的一致性,可以认为靶分子在本申请缀合物的介导下被送入溶酶体中降解。
3.2采用免疫印迹定量分析缀合物促进靶分子降解的能力
为了量化不同结构形式的缀合物在降解靶分子上的能力,消化吹散培养皿中的表达PD-L1和GFP融合蛋白的人乳腺癌MDA-MB-231细胞(PD-L1-GFP/MDA,通过本申请的方法构建)或人非小细胞肺癌HCC827细胞(Procell,Cat.No.CL0094),以1:3的比例铺被到12孔板中,37℃培养12小时。空白对照组:加入缓冲液,例如Hank's平衡盐溶液(Hank'sBalancedSalt Solution,HBSS);试验组A:加入终浓度为200nM的野生型PD-L1单域抗体(αPD-L1);试验组B:加入终浓度为200nM的野生型PD-L1单域抗体的N端连接蛋白降解器靶向部分所得的偶联物(NbTAC-N/PD-L1);试验组C:加入终浓度为200nM的野生型PD-L1单域抗体的C端连接蛋白降解器靶向部分所得的偶联物(NbTAC-C/PD-L1);试验组D:加入终浓度为200nM的PD-L1单域抗体第108位被FSY替换后的靶分子靶向部分(αPD-L1L108FSY);试验组E:加入终浓度为200nM的PD-L1靶分子靶向部分αPD-L1 G113BrC6K连接蛋白降解器靶向部分所得的缀合物GlueTACBrC6K/PD-L1;试验组F:加入终浓度为200nM的PD-L1靶分子靶向部分αPD-L1L108FSY连接蛋白降解器靶向部分所得的缀合物GlueTACFSY/PD-L1。细胞继续培养一段时间后取出,弃去培养基,每孔中加入60μL RIPA裂解液(Thermo,Cat.No.89901),冰上孵育30min。吸取细胞裂解液于1.5mL EP管中,加入15μL 5x上样缓冲液,95℃加热30min。12000rpm高速离心后,SDS-PAGE电泳。依次经过转膜,封闭,一抗标记和二抗标记后在成像仪(Biorad)上显影,其中一抗分别为鼠抗人PD-L1(CST),鼠抗人Tubulin(Cell SignalingTechnologies,Cat#2125S)和鼠抗His(Cell Signaling Technologies,Cat#12698S),二抗为兔抗鼠IgG(Abcam,Cat.No.ab6728),最后显影得到的图使用Image Lab软件计算每各条带的灰度值,以定量计算PD-L1的相对含量。
图13A、图13B、图13C和图13D显示的是,免疫印迹试验表征本申请缀合物促进靶分子降解的结果。图13A、图13B和图13D显示的是,本申请缀合物与人非小细胞肺癌HCC827细胞孵育24小时后促进靶分子PD-L1降解结果,图13C显示的是,本申请缀合物与人乳腺癌MDA-MB-231细胞孵育24小时后促进靶分子PD-L1降解结果。结果显示,与野生型PD-L1单域抗体相比,野生型PD-L1单域抗体的N端或C端连接蛋白降解器靶向部分所得的偶联物,可以促进靶分子降解。进一步地,具有邻近交联反应活性的靶分子靶向部分连接蛋白降解器靶向部分所得的本申请缀合物,可以实现约80%的更高的靶分子降解效率。可以认为,本申请的缀合物可以具有促进靶分子降解的能力。
根据本申请中免疫印迹定量分析缀合物促进靶分子降解的方法,检测本申请缀合物降解宫颈癌HeLa细胞的靶分子EGFR的能力。空白对照组:加入缓冲液,例如Hank's平衡盐溶液(Hank's Balanced Salt Solution,HBSS);试验组A:加入野生型EGFR单域抗体(αEGFR,7D12);试验组B:加入野生型EGFR单域抗体连接蛋白降解器靶向部分所得的偶联物(NbTAC-EGFR);试验组C:加入EGFR单域抗体第116位被FSY替换后的靶分子靶向部分(αEGFRQ116FSY);试验组D:加入EGFR靶分子靶向部分αEGFR Q116FSY连接蛋白降解器靶向部分所得的缀合物GlueTAC-EGFR。
图14显示的是,免疫印迹试验表征本申请缀合物促进靶分子降解的结果。结果显示,本申请缀合物GlueTAC-EGFR与HeLa细胞共同孵育24小时后,可以显著降低靶分子EGFR的含量。
3.3缀合物促进靶分子降解的降解途径的验证
根据本申请中免疫印迹定量分析缀合物促进靶分子降解的方法,氯化铵可以抑制溶酶体和蛋白酶体的功能,试验组可以加入蛋白降解器抑制剂氯化铵(Sigma,Cat.No.V900222-500G)验证本申请缀合物的降解途径。
图15显示的是,氯化铵存在情况下,申请缀合物促进靶分子降解的结果。结果显示,在蛋白降解器抑制剂的存在下,本申请靶分子靶向部分连接蛋白降解器靶向部分所得的缀合物的降解效率显著降低。可以认为本申请的缀合可以通过蛋白降解器降解靶分子。
实施例4缀合物介导的体内靶分子降解
用含有50%高浓度基质胶的Hank's平衡盐溶液(Hank's Balanced SaltSolution,HBSS)悬浮PD-L1/MDA(5x105)细胞,总体积100μL,在6周龄的雌性BALB/c Nude鼠的右腿上方皮下注射(经过北京大学动物实验伦理委员会的批准)。约1周后可以明显观察到凸起,触摸有异物感,2周左右使用游标卡尺测量,体积约为50-70mm3。此时在肿瘤部位原位注射50μg样品,空白对照组:注射缓冲液,例如Hank's平衡盐溶液(Hank's BalancedSalt Solution,HBSS);试验组A:注射野生型PD-L1单域抗体(αPD-L1);试验组B:注射野生型PD-L1单域抗体连接蛋白降解器靶向部分所得的偶联物(NbTAC-PD-L1);试验组C:注射PD-L1靶分子靶向部分αPD-L1 L108FSY连接蛋白降解器靶向部分所得的缀合物(GlueTAC-PD-L1)。
每组3只,并在给药24小时后取出肿瘤组织,肿瘤体积=(长x宽x宽)/2,剪碎。取20mg剪碎后的肿瘤组织,加入200μL RIPA裂解液,冰浴,匀浆仪分散肿瘤,离心去除脂肪层,室温反应1小时,充分裂解癌细胞。取40μL加入5x上样缓冲液(loading buffer)处理样品,Western blotting分析,分别用PD-L1抗体(CST,Cat.No.13684)和GADPH抗体(Abcam,Cat.No.ab128915)标记后显影。
图16显示的是,本申请缀合物在体内促进肿瘤组织的靶分子降解的结果。结果显示,本申请缀合物在体内可以显著降低靶分子的含量。
前述详细说明是以解释和举例的方式提供的,并非要限制所附权利要求的范围。目前本申请所列举的实施方式的多种变化对本领域普通技术人员来说是显而易见的,且保留在所附的权利要求和其等同方案的范围内。
序列表
<110> 北京大学
<120> 用于靶分子修饰的缀合物及其制备方法
<130> 0198-PA-010
<160> 99
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> αPD-L1 (KN035) CDR1
<400> 1
Arg Arg Cys Met Ala
1 5
<210> 2
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> αPD-L1 (KN035) CDR2
<400> 2
Lys Leu Leu Thr Thr Ser Gly Ser Thr Tyr Leu Ala Asp Ser Val Lys
1 5 10 15
Gly
<210> 3
<211> 19
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> αPD-L1 (KN035) CDR3
<400> 3
Asp Ser Phe Glu Asp Pro Thr Cys Thr Leu Val Thr Ser Ser Gly Ala
1 5 10 15
Phe Gln Tyr
<210> 4
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> αEGFR (7D12) CDR1
<400> 4
Ser Tyr Gly Met Gly
1 5
<210> 5
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> αEGFR (7D12) CDR2
<400> 5
Gly Ile Ser Trp Arg Gly Asp Ser Thr Gly Tyr Ala Asp Ser Val Lys
1 5 10 15
Gly
<210> 6
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> αEGFR (7D12) CDR3
<400> 6
Ala Ala Gly Ser Ala Trp Tyr Gly Thr Leu Tyr Glu Tyr Asp Tyr
1 5 10 15
<210> 7
<211> 37
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> pET F
<400> 7
gaagctgagt gcggccgcag gaagctgagt tggctgc 37
<210> 8
<211> 38
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> pET R
<400> 8
ctgcggccgc actcagcttc ctttcgggct ttgttagc 38
<210> 9
<211> 150
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> αPD-L1 T110BrC6K
<220>
<221> misc_feature
<222> (110)..(110)
<223> Xaa = 6-溴-己酰赖氨酸
<400> 9
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Lys Met Ser Ser Arg Arg
20 25 30
Cys Met Ala Trp Phe Arg Gln Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Arg Val
35 40 45
Ala Lys Leu Leu Thr Thr Ser Gly Ser Thr Tyr Leu Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Gln Asn Asn Ala Lys Ser Thr Val Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Ala Asp Ser Phe Glu Asp Pro Thr Cys Thr Leu Val Xaa Ser Ser
100 105 110
Gly Ala Phe Gln Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Leu Pro Glu Thr Gly Gly
130 135 140
His His His His His His
145 150
<210> 10
<211> 150
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> αPD-L1 G113BrC6K
<220>
<221> misc_feature
<222> (113)..(113)
<223> Xaa = 6-溴-己酰赖氨酸
<400> 10
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Lys Met Ser Ser Arg Arg
20 25 30
Cys Met Ala Trp Phe Arg Gln Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Arg Val
35 40 45
Ala Lys Leu Leu Thr Thr Ser Gly Ser Thr Tyr Leu Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Gln Asn Asn Ala Lys Ser Thr Val Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Ala Asp Ser Phe Glu Asp Pro Thr Cys Thr Leu Val Thr Ser Ser
100 105 110
Xaa Ala Phe Gln Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Leu Pro Glu Thr Gly Gly
130 135 140
His His His His His His
145 150
<210> 11
<211> 150
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> αPD-L1 L108BrC6K
<220>
<221> misc_feature
<222> (108)..(108)
<223> Xaa = 6-溴-己酰赖氨酸 或 氟代硫酸盐-L-酪氨酸
<400> 11
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Lys Met Ser Ser Arg Arg
20 25 30
Cys Met Ala Trp Phe Arg Gln Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Arg Val
35 40 45
Ala Lys Leu Leu Thr Thr Ser Gly Ser Thr Tyr Leu Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Gln Asn Asn Ala Lys Ser Thr Val Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Ala Asp Ser Phe Glu Asp Pro Thr Cys Thr Xaa Val Thr Ser Ser
100 105 110
Gly Ala Phe Gln Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Leu Pro Glu Thr Gly Gly
130 135 140
His His His His His His
145 150
<210> 12
<211> 143
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> αEGFR Q116FSY
<220>
<221> misc_feature
<222> (116)..(116)
<223> Xaa = 氟代硫酸盐-L-酪氨酸
<400> 12
Gln Val Lys Leu Glu Glu Ser Gly Gly Gly Ser Val Gln Thr Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Thr Cys Ala Ala Ser Gly Arg Thr Ser Arg Ser Tyr
20 25 30
Gly Met Gly Trp Phe Arg Gln Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Val
35 40 45
Ser Gly Ile Ser Trp Arg Gly Asp Ser Thr Gly Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Val Asp
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Ala Ala Ala Gly Ser Ala Trp Tyr Gly Thr Leu Tyr Glu Tyr Asp
100 105 110
Tyr Trp Gly Xaa Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser Ala Gly Gln Gly
115 120 125
Thr Ser Gly Leu Pro Glu Thr Gly Gly His His His His His His
130 135 140
<210> 13
<211> 128
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> αPD-L1 aa
<400> 13
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Lys Met Ser Ser Arg Arg
20 25 30
Cys Met Ala Trp Phe Arg Gln Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Arg Val
35 40 45
Ala Lys Leu Leu Thr Thr Ser Gly Ser Thr Tyr Leu Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Gln Asn Asn Ala Lys Ser Thr Val Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Ala Asp Ser Phe Glu Asp Pro Thr Cys Thr Leu Val Thr Ser Ser
100 105 110
Gly Ala Phe Gln Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
<210> 14
<211> 150
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> αPD-L1 (KN035) C-LPETG aa
<400> 14
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Lys Met Ser Ser Arg Arg
20 25 30
Cys Met Ala Trp Phe Arg Gln Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Arg Val
35 40 45
Ala Lys Leu Leu Thr Thr Ser Gly Ser Thr Tyr Leu Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Gln Asn Asn Ala Lys Ser Thr Val Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Ala Asp Ser Phe Glu Asp Pro Thr Cys Thr Leu Val Thr Ser Ser
100 105 110
Gly Ala Phe Gln Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Leu Pro Glu Thr Gly Gly
130 135 140
His His His His His His
145 150
<210> 15
<211> 453
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> αPD-L1 (KN035) C-LPETG nt
<400> 15
caagttcagc tgcaagaaag cggtggtggt ctggtgcagc cgggtggtag tctgcgtctg 60
agctgcgcag ccagcggtaa aatgagcagc cgccgctgca tggcttggtt tcgtcaagct 120
ccgggtaaag agcgcgaacg tgtggccaaa ctgctgacca ccagcggtag cacctatctg 180
gccgatagcg tgaaaggccg ctttaccatc agccagaaca acgccaagag caccgtgtat 240
ctgcagatga actctttaaa gccggaagat accgccatgt attactgcgc cgccgatagc 300
tttgaagatc cgacttgtac tttagtgacc agcagtggtg cctttcagta ttggggtcaa 360
ggtacccaag ttaccgtgag cagcggcggt ggtggtagcg gtggtggcgg ttctttaccg 420
gaaaccggcg gccatcatca ccatcatcat taa 453
<210> 16
<211> 139
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> αPD-L1 (KN035) N-GGG aa
<400> 16
Gly Gly Gly Gly Gly Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Leu
1 5 10 15
Val Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Lys
20 25 30
Met Ser Ser Arg Arg Cys Met Ala Trp Phe Arg Gln Ala Pro Gly Lys
35 40 45
Glu Arg Glu Arg Val Ala Lys Leu Leu Thr Thr Ser Gly Ser Thr Tyr
50 55 60
Leu Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Gln Asn Asn Ala
65 70 75 80
Lys Ser Thr Val Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr
85 90 95
Ala Met Tyr Tyr Cys Ala Ala Asp Ser Phe Glu Asp Pro Thr Cys Thr
100 105 110
Leu Val Thr Ser Ser Gly Ala Phe Gln Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Gln
115 120 125
Val Thr Val Ser Ser His His His His His His
130 135
<210> 17
<211> 420
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> αPD-L1 (KN035) N-GGG nt
<400> 17
ggtggcggcg gtggccaagt tcagctgcaa gaaagcggtg gtggtctggt gcagccgggt 60
ggtagtctgc gtctgagctg cgcagccagc ggtaaaatga gcagccgccg ctgcatggct 120
tggtttcgtc aagctccggg taaagagcgc gaacgtgtgg ccaaactgct gaccaccagc 180
ggtagcacct atctggccga tagcgtgaaa ggccgcttta ccatcagcca gaacaacgcc 240
aagagcaccg tgtatctgca gatgaactct ttaaagccgg aagataccgc catgtattac 300
tgcgccgccg atagctttga agatccgact tgtactttag tgaccagcag tggtgccttt 360
cagtattggg gtcaaggtac ccaagttacc gtgagcagcc atcatcacca tcatcattaa 420
<210> 18
<211> 124
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> αEGFR aa
<400> 18
Gln Val Lys Leu Glu Glu Ser Gly Gly Gly Ser Val Gln Thr Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Thr Cys Ala Ala Ser Gly Arg Thr Ser Arg Ser Tyr
20 25 30
Gly Met Gly Trp Phe Arg Gln Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Val
35 40 45
Ser Gly Ile Ser Trp Arg Gly Asp Ser Thr Gly Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Val Asp
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Ala Ala Ala Gly Ser Ala Trp Tyr Gly Thr Leu Tyr Glu Tyr Asp
100 105 110
Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 19
<211> 143
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> αEGFR (7D12) C- LPETG aa
<400> 19
Gln Val Lys Leu Glu Glu Ser Gly Gly Gly Ser Val Gln Thr Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Thr Cys Ala Ala Ser Gly Arg Thr Ser Arg Ser Tyr
20 25 30
Gly Met Gly Trp Phe Arg Gln Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Val
35 40 45
Ser Gly Ile Ser Trp Arg Gly Asp Ser Thr Gly Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Val Asp
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Ala Ala Ala Gly Ser Ala Trp Tyr Gly Thr Leu Tyr Glu Tyr Asp
100 105 110
Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser Ala Gly Gln Gly
115 120 125
Thr Ser Gly Leu Pro Glu Thr Gly Gly His His His His His His
130 135 140
<210> 20
<211> 432
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> αEGFR (7D12) C- LPETG nt
<400> 20
caggtgaaat tagaggaaag cggtggtggc agcgtccaaa cgggtggttc gttgcgctta 60
acgtgtgcgg ccagtggtcg tacaagccgg agctatggga tggggtggtt tcgccaagcc 120
ccaggtaagg aacgcgaatt tgttagtggg atttcgtggc ggggggactc gaccgggtat 180
gccgattcgg ttaaaggccg gttcacgatt tcgcgtgata acgctaagaa taccgtggac 240
ttgcagatga acagtctcaa accggaagat accgctattt attactgcgc ggcggcggcg 300
ggttcggcct ggtatggcac cctgtacgaa tatgattact ggggtcaggg cactcaggtt 360
acggtcagca gtgccggtca gggtacctcc ggtcttccag agacgggcgg acaccaccac 420
caccaccact ga 432
<210> 21
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> pBAD F
<400> 21
agttggctgc tgccaccaga atttgcctgg cggca 35
<210> 22
<211> 37
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> pBAD R
<400> 22
gcaggtattt catatggtta attcctcctg ttagccc 37
<210> 23
<211> 37
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> R32F
<400> 23
gtaaaatgag cagccgctag tgcatggctt ggtttcg 37
<210> 24
<211> 37
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> R32R
<400> 24
cgaaaccaag ccatgcacta gcggctgctc attttac 37
<210> 25
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> T54F
<400> 25
ggccaaactg ctgacctaga gcggtagcac ctatc 35
<210> 26
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> T54R
<400> 26
gataggtgct accgctctag gtcagcagtt tggcc 35
<210> 27
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> D99F
<400> 27
gtattactgc gccgcctaga gctttgaaga tccgac 36
<210> 28
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> D99R
<400> 28
gtcggatctt caaagctcta ggcggcgcag taatac 36
<210> 29
<211> 37
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> S100F
<400> 29
attactgcgc cgccgattag tttgaagatc cgacttg 37
<210> 30
<211> 37
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> S100R
<400> 30
caagtcggat cttcaaacta atcggcggcg cagtaat 37
<210> 31
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> F101F
<400> 31
ctgcgccgcc gatagctagg aagatccgac ttgtac 36
<210> 32
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> F101R
<400> 32
gtacaagtcg gatcttccta gctatcggcg gcgcag 36
<210> 33
<211> 39
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> E102F
<400> 33
gcgccgccga tagcttttag gatccgactt gtactttag 39
<210> 34
<211> 39
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> E102R
<400> 34
ctaaagtaca agtcggatcc taaaagctat cggcggcgc 39
<210> 35
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> D103F
<400> 35
gccgatagct ttgaatagcc gacttgtact ttagtg 36
<210> 36
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> D103R
<400> 36
cactaaagta caagtcggct attcaaagct atcggc 36
<210> 37
<211> 34
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> P104F
<400> 37
gatagctttg aagattagac ttgtacttta gtga 34
<210> 38
<211> 34
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> P104R
<400> 38
tcactaaagt acaagtctaa tcttcaaagc tatc 34
<210> 39
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> T105F
<400> 39
tagctttgaa gatccgtagt gtactttagt gaccag 36
<210> 40
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> T105R
<400> 40
ctggtcacta aagtacacta cggatcttca aagcta 36
<210> 41
<211> 32
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> T107F
<400> 41
gaagatccga cttgttagtt agtgaccagc ag 32
<210> 42
<211> 32
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> T107R
<400> 42
ctgctggtca ctaactaaca agtcggatct tc 32
<210> 43
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> L108F
<400> 43
agatccgact tgtacttagg tgaccagcag tggtg 35
<210> 44
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> L108R
<400> 44
caccactgct ggtcacctaa gtacaagtcg gatct 35
<210> 45
<211> 33
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> V109F
<400> 45
ccgacttgta ctttatagac cagcagtggt gcc 33
<210> 46
<211> 33
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> V109R
<400> 46
ggcaccactg ctggtctata aagtacaagt cgg 33
<210> 47
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> T110F
<400> 47
gacttgtact ttagtgtaga gcagtggtgc ctttc 35
<210> 48
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> T110R
<400> 48
gaaaggcacc actgctctac actaaagtac aagtc 35
<210> 49
<211> 32
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> S111F
<400> 49
gtactttagt gacctagagt ggtgcctttc ag 32
<210> 50
<211> 32
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> S111R
<400> 50
ctgaaaggca ccactctagg tcactaaagt ac 32
<210> 51
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> S112F
<400> 51
actttagtga ccagctaggg tgcctttcag tattg 35
<210> 52
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> S112R
<400> 52
caatactgaa aggcacccta gctggtcact aaagt 35
<210> 53
<211> 38
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> G113F
<400> 53
ctttagtgac cagcagttag gcctttcagt attggggt 38
<210> 54
<211> 38
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> G113R
<400> 54
accccaatac tgaaaggcct aactgctggt cactaaag 38
<210> 55
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> A114F
<400> 55
agtgaccagc agtggttagt ttcagtattg gggtc 35
<210> 56
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> A114R
<400> 56
gaccccaata ctgaaactaa ccactgctgg tcact 35
<210> 57
<211> 33
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> F115F
<400> 57
cagcagtggt gcctagcagt attggggtca agg 33
<210> 58
<211> 33
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> F115R
<400> 58
ccttgacccc aatactgcta ggcaccactg ctg 33
<210> 59
<211> 34
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> Q116F
<400> 59
gcagtggtgc cttttagtat tggggtcaag gtac 34
<210> 60
<211> 34
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> Q116R
<400> 60
gtaccttgac cccaatacta aaaggcacca ctgc 34
<210> 61
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> Y117F
<400> 61
cagtggtgcc tttcagtagt ggggtcaagg taccc 35
<210> 62
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> Y117R
<400> 62
gggtaccttg accccactac tgaaaggcac cactg 35
<210> 63
<211> 4
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> LTP‘
<220>
<221> misc_feature
<222> (3)..(3)
<223> Xaa 可以为任意氨基酸
<400> 63
Asn Pro Xaa Tyr
1
<210> 64
<211> 4
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> LTP
<220>
<221> misc_feature
<222> (3)..(3)
<223> Xaa = Ala或Gly
<400> 64
Asn Pro Xaa Tyr
1
<210> 65
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> LTP 2’
<220>
<221> misc_feature
<222> (2)..(2)
<223> Xaa 可以为任意氨基酸
<220>
<221> misc_feature
<222> (5)..(5)
<223> Xaa 可以为任意氨基酸
<400> 65
Phe Xaa Asn Pro Xaa Tyr
1 5
<210> 66
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> LTP 2
<220>
<221> misc_feature
<222> (2)..(2)
<223> Xaa = Ala或Gly
<220>
<221> misc_feature
<222> (5)..(5)
<223> Xaa = Ala或Gly
<400> 66
Phe Xaa Asn Pro Xaa Tyr
1 5
<210> 67
<211> 53
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> EGF
<400> 67
Asn Ser Asp Ser Glu Cys Pro Leu Ser His Asp Gly Tyr Cys Leu His
1 5 10 15
Asp Gly Val Cys Met Tyr Ile Glu Ala Leu Asp Lys Tyr Ala Cys Asn
20 25 30
Cys Val Val Gly Tyr Ile Gly Glu Arg Cys Gln Tyr Arg Asp Leu Lys
35 40 45
Trp Trp Glu Leu Arg
50
<210> 68
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> SP
<220>
<221> MOD-RES
<222> (10)..(10)
<223> 氨基化(AMIDATION)
<400> 68
Arg Pro Lys Pro Gln Gln Phe Gly Leu Met
1 5 10
<210> 69
<211> 18
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> NY
<220>
<221> MOD-RES
<222> (1)..(1)
<223> 乙酰化(ACETYLATION)
<220>
<221> MOD-RES
<222> (18)..(18)
<223> 氨基化(AMIDATION)
<400> 69
Lys Leu Ala Leu Lys Leu Ala Leu Lys Ala Leu Lys Ala Ala Leu Lys
1 5 10 15
Leu Ala
<210> 70
<211> 27
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> TP
<400> 70
Gly Trp Thr Leu Asn Ser Ala Gly Tyr Leu Leu Gly Lys Ile Asn Leu
1 5 10 15
Lys Ala Leu Ala Ala Leu Ala Lys Lys Ile Leu
20 25
<210> 71
<211> 13
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> TAT
<400> 71
Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gln Arg Arg Arg Pro Pro Gln
1 5 10
<210> 72
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> pAntp
<400> 72
Arg Gln Ile Lys Ile Trp Phe Gln Asn Arg Arg Met Lys Trp Lys Lys
1 5 10 15
<210> 73
<211> 35
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> pHLIP
<400> 73
Ala Glu Gln Asn Pro Ile Tyr Trp Ala Arg Tyr Ala Asp Trp Leu Phe
1 5 10 15
Thr Thr Pro Leu Leu Leu Leu Asp Leu Ala Leu Leu Val Asp Ala Asp
20 25 30
Glu Gly Thr
35
<210> 74
<211> 34
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> ATRAM
<400> 74
Gly Leu Ala Gly Leu Ala Gly Leu Leu Gly Leu Glu Gly Leu Leu Gly
1 5 10 15
Leu Pro Leu Gly Leu Leu Glu Gly Leu Trp Leu Gly Leu Glu Leu Glu
20 25 30
Gly Asn
<210> 75
<211> 27
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> ACPP
<400> 75
Asp Gly Gly Asp Gly Gly Asp Gly Gly Asp Gly Pro Leu Gly Leu Ala
1 5 10 15
Gly Arg Arg Arg Arg Arg Arg Arg Arg Arg Cys
20 25
<210> 76
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> pHK-PAS
<400> 76
Met Ile Ala Ser His Leu Leu Ala Tyr Phe Phe Thr Glu Leu Asn Gly
1 5 10 15
Lys Pro Ile Leu Phe Phe
20
<210> 77
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> LTS
<400> 77
Ala Leu Ala Pro Tyr Ile Pro
1 5
<210> 78
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> G’-CPP
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(12)
<223> Xaa = D构型Arg
<220>
<221> MOD_RES
<222> (12)..(12)
<223> 氨基化(AMIDATION)
<400> 78
Gly Gly Cys Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
1 5 10
<210> 79
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> G-CPP
<220>
<221> misc_feature
<222> (3)..(11)
<223> Xaa = D构型Arg
<220>
<221> MOD_RES
<222> (12)..(12)
<223> 氨基化(AMIDATION)
<400> 79
Gly Gly Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
1 5 10
<210> 80
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> G’-CPP-LTP
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(12)
<223> Xaa = D构型Arg
<220>
<221> MOD_RES
<222> (12)..(12)
<223> 氨基化(AMIDATION)
<400> 80
Gly Gly Cys Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Asn Pro Gly Tyr
1 5 10 15
<210> 81
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> G-CPP-LTP
<220>
<221> misc_feature
<222> (3)..(11)
<223> Xaa = D构型Arg
<220>
<221> MOD_RES
<222> (15)..(15)
<223> 氨基化(AMIDATION)
<400> 81
Gly Gly Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Asn Pro Gly Tyr
1 5 10 15
<210> 82
<211> 19
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> G’-LTS-CPP
<220>
<221> misc_feature
<222> (11)..(19)
<223> Xaa = D构型Arg
<220>
<221> MOD_RES
<222> (19)..(19)
<223> 氨基化(AMIDATION)
<400> 82
Gly Gly Cys Ala Leu Ala Pro Tyr Ile Pro Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
1 5 10 15
Xaa Xaa Xaa
<210> 83
<211> 18
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> G-LTS-CPP
<220>
<221> misc_feature
<222> (10)..(18)
<223> Xaa = D构型Arg
<220>
<221> MOD_RES
<222> (18)..(18)
<223> 氨基化(AMIDATION)
<400> 83
Gly Gly Ala Leu Ala Pro Tyr Ile Pro Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
1 5 10 15
Xaa Xaa
<210> 84
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> CPP-L’
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(9)
<223> Xaa = D构型Arg
<220>
<221> MOD_RES
<222> (16)..(16)
<223> 氨基化(AMIDATION)
<400> 84
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Cys Leu Pro Glu Thr Gly Gly
1 5 10 15
<210> 85
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> CPP-L
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(9)
<223> Xaa = D构型Arg
<220>
<221> MOD_RES
<222> (15)..(15)
<223> 氨基化(AMIDATION)
<400> 85
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Leu Pro Glu Thr Gly Gly
1 5 10 15
<210> 86
<211> 23
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> CPP’-LTS-L
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(9)
<223> Xaa = D构型Arg
<220>
<221> MOD_RES
<222> (23)..(23)
<223> 氨基化(AMIDATION)
<400> 86
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Ala Leu Ala Pro Tyr Ile Pro
1 5 10 15
Cys Leu Pro Glu Thr Gly Gly
20
<210> 87
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> CPP-LTS-L
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(9)
<223> Xaa = D构型Arg
<220>
<221> MOD_RES
<222> (22)..(22)
<223> 氨基化(AMIDATION)
<400> 87
Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Ala Leu Ala Pro Tyr Ile Pro
1 5 10 15
Leu Pro Glu Thr Gly Gly
20
<210> 88
<211> 36
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> G’-LTS-CPP-MMP-B
<220>
<221> misc_feature
<222> (11)..(19)
<223> Xaa = D构型Arg
<220>
<221> MOD_RES
<222> (36)..(36)
<223> 氨基化(AMIDATION)
<400> 88
Gly Gly Cys Ala Leu Ala Pro Tyr Ile Pro Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
1 5 10 15
Xaa Xaa Xaa Pro Leu Gly Leu Ala Gly Gly Asp Gly Gly Asp Gly Gly
20 25 30
Asp Gly Gly Asp
35
<210> 89
<211> 35
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> G-LTS-CPP-MMP-B
<220>
<221> misc_feature
<222> (10)..(18)
<223> Xaa = D构型Arg
<220>
<221> MOD_RES
<222> (35)..(35)
<223> 氨基化(AMIDATION)
<400> 89
Gly Gly Ala Leu Ala Pro Tyr Ile Pro Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
1 5 10 15
Xaa Xaa Pro Leu Gly Leu Ala Gly Gly Asp Gly Gly Asp Gly Gly Asp
20 25 30
Gly Gly Asp
35
<210> 90
<211> 40
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> B-MMP-CPP-LTS-L’
<220>
<221> misc_feature
<222> (18)..(26)
<223> Xaa = D构型Arg
<220>
<221> MOD_RES
<222> (40)..(40)
<223> 氨基化(AMIDATION)
<400> 90
Asp Gly Gly Asp Gly Gly Asp Gly Gly Asp Gly Pro Leu Gly Leu Ala
1 5 10 15
Gly Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Ala Leu Ala Pro Tyr Ile
20 25 30
Pro Cys Leu Pro Glu Thr Gly Gly
35 40
<210> 91
<211> 39
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> B-MMP-CPP-LTS-L
<220>
<221> misc_feature
<222> (18)..(26)
<223> Xaa = D构型Arg
<220>
<221> MOD_RES
<222> (39)..(39)
<223> 氨基化(AMIDATION)
<400> 91
Asp Gly Gly Asp Gly Gly Asp Gly Gly Asp Gly Pro Leu Gly Leu Ala
1 5 10 15
Gly Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Ala Leu Ala Pro Tyr Ile
20 25 30
Pro Leu Pro Glu Thr Gly Gly
35
<210> 92
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> Srt A reSEQ
<400> 92
Leu Pro Glu Thr Gly
1 5
<210> 93
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> Srt A reSEQ 2
<220>
<221> misc_feature
<222> (3)..(3)
<223> Xaa 可以为任意氨基酸
<400> 93
Leu Pro Xaa Thr Gly
1 5
<210> 94
<211> 34
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> NG3-L108F
<400> 94
gatccgacct gtacctaggt taccagcagc ggtg 34
<210> 95
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> NG3-L108R
<400> 95
accgctgctg gtaacctagg tacaggtcgg atcttc 36
<210> 96
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> NG3-G113F
<400> 96
cctggttacc agcagctagg catttcagta ttggg 35
<210> 97
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> NG3-G113R
<400> 97
ccaatactga aatgcctagc tgctggtaac caggg 35
<210> 98
<211> 290
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> PD-L1
<400> 98
Met Arg Ile Phe Ala Val Phe Ile Phe Met Thr Tyr Trp His Leu Leu
1 5 10 15
Asn Ala Phe Thr Val Thr Val Pro Lys Asp Leu Tyr Val Val Glu Tyr
20 25 30
Gly Ser Asn Met Thr Ile Glu Cys Lys Phe Pro Val Glu Lys Gln Leu
35 40 45
Asp Leu Ala Ala Leu Ile Val Tyr Trp Glu Met Glu Asp Lys Asn Ile
50 55 60
Ile Gln Phe Val His Gly Glu Glu Asp Leu Lys Val Gln His Ser Ser
65 70 75 80
Tyr Arg Gln Arg Ala Arg Leu Leu Lys Asp Gln Leu Ser Leu Gly Asn
85 90 95
Ala Ala Leu Gln Ile Thr Asp Val Lys Leu Gln Asp Ala Gly Val Tyr
100 105 110
Arg Cys Met Ile Ser Tyr Gly Gly Ala Asp Tyr Lys Arg Ile Thr Val
115 120 125
Lys Val Asn Ala Pro Tyr Asn Lys Ile Asn Gln Arg Ile Leu Val Val
130 135 140
Asp Pro Val Thr Ser Glu His Glu Leu Thr Cys Gln Ala Glu Gly Tyr
145 150 155 160
Pro Lys Ala Glu Val Ile Trp Thr Ser Ser Asp His Gln Val Leu Ser
165 170 175
Gly Lys Thr Thr Thr Thr Asn Ser Lys Arg Glu Glu Lys Leu Phe Asn
180 185 190
Val Thr Ser Thr Leu Arg Ile Asn Thr Thr Thr Asn Glu Ile Phe Tyr
195 200 205
Cys Thr Phe Arg Arg Leu Asp Pro Glu Glu Asn His Thr Ala Glu Leu
210 215 220
Val Ile Pro Glu Leu Pro Leu Ala His Pro Pro Asn Glu Arg Thr His
225 230 235 240
Leu Val Ile Leu Gly Ala Ile Leu Leu Cys Leu Gly Val Ala Leu Thr
245 250 255
Phe Ile Phe Arg Leu Arg Lys Gly Arg Met Met Asp Val Lys Lys Cys
260 265 270
Gly Ile Gln Asp Thr Asn Ser Lys Lys Gln Ser Asp Thr His Leu Glu
275 280 285
Glu Thr
290
<210> 99
<211> 181
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> Srt A
<400> 99
Lys Pro His Ile Asp Asn Tyr Leu His Asp Lys Asp Lys Asp Glu Lys
1 5 10 15
Ile Glu Gln Tyr Asp Lys Asn Val Lys Glu Gln Ala Ser Lys Asp Lys
20 25 30
Lys Gln Gln Ala Lys Pro Gln Ile Pro Lys Asp Lys Ser Lys Val Ala
35 40 45
Gly Tyr Ile Glu Ile Pro Asp Ala Asp Ile Lys Glu Pro Val Tyr Pro
50 55 60
Gly Pro Ala Thr Arg Glu Gln Leu Asn Arg Gly Val Ser Phe Ala Glu
65 70 75 80
Glu Asn Glu Ser Leu Asp Asp Gln Asn Ile Ser Ile Ala Gly His Thr
85 90 95
Phe Ile Gly Arg Pro Asn Tyr Gln Phe Thr Asn Leu Lys Ala Ala Lys
100 105 110
Lys Gly Ser Met Val Tyr Phe Lys Val Gly Asn Glu Thr Arg Lys Tyr
115 120 125
Lys Met Thr Ser Ile Arg Asn Val Lys Pro Thr Ala Val Gly Val Leu
130 135 140
Asp Glu Gln Lys Gly Lys Asp Lys Gln Leu Thr Leu Ile Thr Cys Asp
145 150 155 160
Asp Leu Asn Arg Glu Thr Gly Val Trp Glu Thr Arg Lys Ile Phe Val
165 170 175
Ala Thr Glu Val Lys
180
Claims (136)
1.一种缀合物,其包含:靶分子靶向部分以及蛋白降解器靶向部分;其中,所述靶分子靶向部分能够特异性识别靶分子并与该靶分子共价结合,所述蛋白降解器靶向部分与所述靶分子靶向部分直接或间接连接;以及
所述靶分子靶向部分包含第一官能团,所述靶分子靶向部分的氨基酸序列与SEQ IDNO:13所示的相应氨基酸序列相比,在第108位氨基酸、第110位氨基酸和/或第113位氨基酸包含所述第一官能团,或者所述靶分子靶向部分的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,在第116位氨基酸包含所述第一官能团,其中,
所述第一官能团选自以下组:
所述靶分子包含细胞表面的分子、细胞内的分子和/或细胞外的分子;
所述蛋白降解器靶向部分包含能够靶向溶酶体和/或蛋白酶体,和/或能够结合细胞表面促进内吞的受体的分子。
2.根据权利要求1所述的缀合物,所述靶分子包含第二官能团,当所述靶分子靶向部分与所述靶分子接近时,所述第一官能团能够与所述第二官能团反应而形成共价键,其中,所述第二官能团包含天然氨基酸的侧链基团。
3.根据权利要求2所述的缀合物,在所述第一官能团与所述第二官能团之间的距离小于5E-10米时,所述第一官能团能够与所述第二官能团反应而形成共价键。
4.根据权利要求2所述的缀合物,所述第二官能团包含亲电基团。
5.根据权利要求2所述的缀合物,所述第二官能团选自以下组:氨基、咪唑基、巯基、羟基、羧基和甲硫基。
6.根据权利要求1所述的缀合物,所述靶分子为小分子。
7.根据权利要求1所述的缀合物,所述靶分子选自以下组:多肽、核酸、多糖和脂质。
8.根据权利要求1所述的缀合物,所述靶分子为纳米颗粒。
9.根据权利要求1所述的缀合物,所述靶分子为信号通路蛋白。
10.根据权利要求1所述的缀合物,所述靶分子为肿瘤相关分子。
11.根据权利要求1所述的缀合物,所述靶分子为免疫检查点分子。
12.根据权利要求1所述的缀合物,所述靶分子选自以下组:PD-L1、EGFR、HER-2、Ras蛋白和CD38。
15.根据权利要求1所述的缀合物,所述靶分子靶向部分包含非天然氨基酸的残基,所述非天然氨基酸包含所述第一官能团,所述非天然氨基酸选自以下组:氟代硫酸盐-L-酪氨酸和6-溴-己酰赖氨酸。
16.根据权利要求1所述的缀合物,所述靶分子靶向部分为小分子。
17.根据权利要求1所述的缀合物,所述靶分子靶向部分选自以下组:多肽、核酸、多糖和脂质。
18.根据权利要求1所述的缀合物,所述靶分子靶向部分为纳米颗粒。
19.根据权利要求1所述的缀合物,所述靶分子靶向部分包含抗体或其抗原结合片段。
20.根据权利要求19所述的缀合物,所述抗体选自以下组:鼠源抗体、骆驼源抗体、人源化抗体和全人源抗体。
21.根据权利要求19所述的缀合物,所述抗体为嵌合抗体。
22.根据权利要求19所述的缀合物,所述抗原结合片段为亲和抗体。
23.根据权利要求19所述的缀合物,所述抗原结合片段为dAb。
24.根据权利要求19所述的缀合物,所述抗原结合片段为Fv片段。
25. 根据权利要求19所述的缀合物,所述抗原结合片段选自以下组:VHH,Fab,Fab′,(Fab')2,(Fab)2,scFv和di-scFv。
26.根据权利要求1所述的缀合物,所述靶分子靶向部分包含单域抗体。
27.根据权利要求12所述的缀合物,所述靶分子靶向部分能够特异性识别所述PD-L1。
28. 根据权利要求14所述的缀合物,所述靶分子靶向部分的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第108位氨基酸、第110位氨基酸和/或第113位氨基酸被所述非天然氨基酸替换。
29. 根据权利要求15所述的缀合物,所述靶分子靶向部分的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第108位氨基酸被所述6-溴-己酰赖氨酸替换、第110位氨基酸被所述6-溴-己酰赖氨酸替换、第113位氨基酸被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换和/或第108位氨基酸被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换。
30. 根据权利要求1所述的缀合物,所述靶分子靶向部分的氨基酸序列如SEQ ID NO:9-11中任一项所示。
31.根据权利要求12所述的缀合物,所述靶分子靶向部分能够特异性识别所述EGFR。
32. 根据权利要求14所述的缀合物,所述靶分子靶向部分的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第116位氨基酸被所述非天然氨基酸替换。
33. 根据权利要求15所述的缀合物,所述靶分子靶向部分的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第116位氨基酸被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换。
34. 根据权利要求1所述的缀合物,所述靶分子靶向部分的氨基酸序列如SEQ ID NO:12所示。
35.根据权利要求1所述的缀合物,所述蛋白降解器靶向部分为小分子。
36.根据权利要求1所述的缀合物,所述蛋白降解器靶向部分选自以下组:多肽、核酸、多糖和脂质。
37.根据权利要求1所述的缀合物,所述蛋白降解器靶向部分为纳米颗粒。
38. 根据权利要求1所述的缀合物,所述蛋白降解器靶向部分选自以下组: 溶酶体靶向肽、低聚糖肽、甘露糖6-磷酸酯、N-乙酰半乳糖胺和半乳糖。
39. 根据权利要求38所述的缀合物,所述蛋白降解器靶向部分包含所述溶酶体靶向肽,所述溶酶体靶向肽的氨基酸序列如SEQ ID NO:63-77中任一项所示。
40.根据权利要求38所述的缀合物,所述缀合物还包含穿膜部分,所述穿膜部分能够促进所述靶分子进入细胞内,其中,所述穿膜部分与所述靶分子靶向部分直接或间接连接,和/或所述穿膜部分与所述蛋白降解器靶向部分直接或间接连接。
41.根据权利要求40所述的缀合物,所述穿膜部分选自以下组:穿膜肽、低聚糖肽、甘露糖6-磷酸酯、N-乙酰半乳糖胺和半乳糖。
42.根据权利要求40所述的缀合物,所述穿膜部分包含聚精氨酸,所述聚精氨酸的重复单元数量至少为2。
43.根据权利要求42所述的缀合物,所述聚精氨酸的聚合单体包含D构型的精氨酸和/或L构型的精氨酸。
44.根据权利要求41所述的缀合物,所述缀合物包含所述穿膜肽和所述溶酶体靶向肽,所述穿膜肽和所述溶酶体靶向肽直接或间接连接。
45.根据权利要求1所述的缀合物,所述蛋白降解器靶向部分包含能够结合6-磷酸甘露糖受体的分子。
46.根据权利要求1所述的缀合物,所述蛋白降解器靶向部分包含一个或多个甘露糖6-磷酸酯。
47.根据权利要求46所述的缀合物,所述蛋白降解器靶向部分包含1个至500个所述甘露糖6-磷酸酯。
48.根据权利要求46所述的缀合物,所述蛋白降解器靶向部分包含支架分子,所述支架分子直接或间接连接一个或多个所述甘露糖6-磷酸酯。
49.根据权利要求48所述的缀合物,所述支架分子包含聚糖结构。
50.根据权利要求48所述的缀合物,所述支架分子包含糖蛋白,所述糖蛋白包含被所述一个或多个所述甘露糖6-磷酸酯修饰的一个或多个氨基酸。
51.根据权利要求50所述的缀合物,所述糖蛋白包含N-羧基酸酐。
52.根据权利要求1所述的缀合物,所述蛋白降解器靶向部分包含能够结合去唾液酸糖蛋白受体的分子。
53.根据权利要求52所述的缀合物,所述蛋白降解器靶向部分包含所述去唾液酸糖蛋白受体的一个或多个配体。
54.根据权利要求1所述的缀合物,所述蛋白降解器靶向部分包含一个或多个N-乙酰半乳糖胺。
55.根据权利要求1所述的缀合物,所述蛋白降解器靶向部分包含一个或多个半乳糖。
56.根据权利要求1所述的缀合物,所述蛋白降解器靶向部分包含一个或多个葡萄糖。
57.根据权利要求52所述的缀合物,所述蛋白降解器靶向部分包含所述去唾液酸糖蛋白受体的1个至500个配体。
58.根据权利要求52所述的缀合物,所述蛋白降解器靶向部分包含支架分子,所述支架分子直接或间接连接所述去唾液酸糖蛋白受体的一个或多个配体。
59.根据权利要求54所述的缀合物,所述蛋白降解器靶向部分包含一个或多个所述N-乙酰半乳糖胺修饰的一个或多个丙氨酸。
60.根据权利要求1-59中任一项所述的缀合物,所述缀合物包含融合蛋白。
61.根据权利要求40-44中任一项所述的缀合物,所述缀合物包含所述靶分子靶向部分、所述蛋白降解器靶向部分和所述穿膜部分,所述靶分子靶向部分、所述蛋白降解器靶向部分与所述穿膜部分之间相互独立地直接或间接连接。
62.根据权利要求61所述的缀合物,所述间接连接包含通过连接子连接。
63.根据权利要求62所述的缀合物,所述连接子包含肽连接子。
64.根据权利要求62所述的缀合物,所述连接子包含可酶切和/或不可酶切的连接子。
65.根据权利要求64所述的缀合物,所述可酶切的连接子包含可通过蛋白酶酶切的连接子。
66.根据权利要求41所述的缀合物,所述缀合物包含所述靶分子靶向部分、所述穿膜肽和所述溶酶体靶向肽。
67. 一种多肽,其包含靶分子靶向部分,所述靶分子靶向部分能够特异性识别靶分子并与该靶分子共价结合;以及所述靶分子靶向部分包含第一官能团,所述靶分子靶向部分的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,在第108位氨基酸、第110位氨基酸和/或第113位氨基酸包含所述第一官能团,或者所述靶分子靶向部分的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,在第116位氨基酸包含所述第一官能团;其中,
所述第一官能团选自以下组:
所述靶分子包含细胞表面的分子、细胞内的分子和/或细胞外的分子。
68.根据权利要求67所述的多肽,所述靶分子包含第二官能团,当所述靶分子靶向部分与所述靶分子接近时,所述第一官能团能够与所述第二官能团反应而形成共价键;其中,所述第二官能团包含天然氨基酸的侧链基团。
69.根据权利要求68所述的多肽,在所述第一官能团与所述第二官能团之间的距离小于5E-10米时,所述第一官能团能够与所述第二官能团反应而形成共价键。
70.根据权利要求68所述的多肽,所述第二官能团包含亲电基团。
71.根据权利要求68所述的多肽,所述第二官能团选自以下组:氨基、咪唑基、巯基、羟基、羧基和甲硫基。
72.根据权利要求67所述的多肽,所述靶分子为小分子。
73.根据权利要求67所述的多肽,所述靶分子选自以下组:多肽、核酸、多糖和脂质。
74.根据权利要求67所述的多肽,所述靶分子为纳米颗粒。
75.根据权利要求67所述的多肽,所述靶分子为信号通路蛋白。
76.根据权利要求67所述的多肽,所述靶分子为肿瘤相关分子。
77.根据权利要求67所述的多肽,所述靶分子为免疫检查点分子。
78.根据权利要求67所述的多肽,所述靶分子选自以下组:PD-L1、EGFR、HER-2、Ras蛋白和CD38。
81.根据权利要求67所述的多肽,所述靶分子靶向部分包含非天然氨基酸的残基,所述非天然氨基酸包含所述第一官能团,所述非天然氨基酸选自以下组:氟代硫酸盐-L-酪氨酸和6-溴-己酰赖氨酸。
82.根据权利要求67所述的多肽,所述靶分子靶向部分为小分子。
83.根据权利要求67所述的多肽,所述靶分子靶向部分选自以下组:多肽、核酸、多糖和脂质。
84.根据权利要求62所述的多肽,所述靶分子靶向部分为纳米颗粒。
85.根据权利要求67所述的多肽,所述靶分子靶向部分包含抗体或其抗原结合片段。
86.根据权利要求85所述的多肽,所述抗体选自以下组:鼠源抗体、骆驼源抗体、人源化抗体和全人源抗体。
87.根据权利要求85所述的多肽,所述抗体为嵌合抗体。
88.根据权利要求85所述的多肽,所述抗原结合片段为亲和抗体。
89.根据权利要求85所述的多肽,所述抗原结合片段为dAb。
90.根据权利要求85所述的多肽,所述抗原结合片段为Fv片段。
91.根据权利要求85所述的多肽,所述抗原结合片段选自以下组:VHH,Fab,Fab′,(Fab')2,(Fab)2,scFv和di-scFv。
92.根据权利要求57所述的多肽,所述靶分子靶向部分包含单域抗体。
93.根据权利要求78所述的多肽,所述靶分子靶向部分能够特异性识别所述PD-L1。
94. 根据权利要求80所述的多肽,所述靶分子靶向部分的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第108位氨基酸、第110位氨基酸和/或第113位氨基酸被所述非天然氨基酸替换。
95. 根据权利要求81所述的多肽,所述靶分子靶向部分的氨基酸序列与SEQ ID NO:13所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第108位氨基酸被所述6-溴-己酰赖氨酸替换、第110位氨基酸被所述6-溴-己酰赖氨酸替换、第113位氨基酸被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换和/或第108位氨基酸被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换。
96. 根据权利要求67所述的多肽,所述靶分子靶向部分的氨基酸序列如SEQ ID NO:9-11中任一项所示。
97.根据权利要求78所述的多肽,所述靶分子靶向部分能够特异性识别所述EGFR。
98. 根据权利要求80所述的多肽,所述靶分子靶向部分的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第116位氨基酸被所述非天然氨基酸替换。
99. 根据权利要求81所述的多肽,所述靶分子靶向部分的氨基酸序列与SEQ ID NO:18所示的相应氨基酸序列相比,所述靶分子靶向部分的第116位氨基酸被所述氟代硫酸盐-L-酪氨酸替换。
100. 根据权利要求67所述的多肽,所述靶分子靶向部分的氨基酸序列如SEQ ID NO:12所示。
101.一种核酸分子,其编码权利要求1-66中任一项所述的缀合物和/或权利要求67-100中任一项所述的多肽。
102.一种载体,其包含权利要求101所述的核酸分子。
103.一种免疫缀合物,其包含权利要求1-66中任一项所述的缀合物和/或权利要求67-100中任一项所述的多肽。
104.一种细胞,其包含权利要求1-66中任一项所述的缀合物、权利要求101所述的核酸分子、权利要求102所述的载体和/或权利要求103所述的免疫缀合物。
105.一种组合物,其包含权利要求1-66中任一项所述的缀合物、权利要求67-100中任一项所述的多肽、权利要求101所述的核酸分子、权利要求102所述的载体、权利要求103所述的免疫缀合物和/或权利要求104所述的细胞,以及药学上可接受的载剂。
106.一种试剂盒,其包含权利要求1-66中任一项所述的缀合物、权利要求67-100中任一项所述的多肽、权利要求101所述的核酸分子、权利要求102所述的载体、权利要求103所述的免疫缀合物、权利要求104所述的细胞、和/或权利要求105所述的组合物。
107.权利要求1-66中任一项所述的缀合物、权利要求67-100中任一项所述的多肽、权利要求101所述的核酸分子、权利要求102所述的载体、权利要求103所述的免疫缀合物、权利要求104所述的细胞、权利要求105所述的组合物、和/或权利要求106所述的试剂盒在制备药物中的用途,所述药物用于预防和/或治疗肿瘤,所述肿瘤为PD-L1阳性肿瘤、EGFR阳性肿瘤、HER-2阳性肿瘤、CD38阳性肿瘤和Ras功能或活性异常的肿瘤。
108.根据权利要求107所述的用途,其中所述肿瘤为实体瘤。
109.根据权利要求107所述的用途,其中所述肿瘤为乳腺癌、肺癌、皮肤癌、骨髓瘤和/或宫颈癌。
110.一种影响靶分子含量的方法,施用权利要求1-66中任一项所述的缀合物、权利要求67-100中任一项所述的多肽、权利要求101所述的核酸分子、权利要求102所述的载体、权利要求103所述的免疫缀合物、权利要求104所述的细胞、权利要求105所述的组合物和/或权利要求106所述的试剂盒,所述方法是非预防且非治疗目的的方法。
111.根据权利要求110所述的方法,所述方法包含体外方法、和/或离体方法。
112.根据权利要求110所述的方法,所述靶分子为细胞表面的分子和/或细胞内的分子。
113.根据权利要求110所述的方法,所述靶分子为皮肤细胞、骨髓细胞、宫颈细胞、肺细胞和/或乳腺细胞表面的分子。
114.根据权利要求110所述的方法,所述靶分子为皮肤癌细胞、骨髓瘤细胞、宫颈癌细胞、肺癌细胞和/或乳腺癌细胞表面的分子。
115.根据权利要求110所述的方法,所述细胞选自以下组:PD-L1阳性细胞、EGFR阳性细胞、HER-2阳性细胞、CD38阳性细胞和Ras功能和/或活性异常的细胞。
116.一种制备权利要求1-66中任一项所述缀合物和/或权利要求67-100中任一项所述多肽的方法,包含在使得所述缀合物和/或所述多肽表达的条件下,培养权利要求104所述的细胞。
117.根据权利要求116所述的方法,所述缀合物和/或所述多肽包含靶分子靶向部分与蛋白降解器靶向部分。
118. 根据权利要求116所述的方法,通过转肽酶A连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分,且所述转肽酶A的氨基酸序列如SEQ ID NO:99所示。
119. 根据权利要求117所述的方法,所述靶分子靶向部分的C末端的氨基酸序列如SEQID NO:93所示,和/或所述靶分子靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列。
120. 根据权利要求117所述的方法,所述靶分子靶向部分的C末端的氨基酸序列如SEQID NO:92所示,和/或所述靶分子靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列。
121. 根据权利要求117所述的方法,所述蛋白降解器靶向部分的C末端的氨基酸序列如SEQ ID NO:93所示,和/或所述蛋白降解器靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列。
122. 根据权利要求117所述的方法,所述蛋白降解器靶向部分的C末端的氨基酸序列如SEQ ID NO:92所示,和/或所述蛋白降解器靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列。
123. 根据权利要求118所述的方法,所述靶分子靶向部分的C末端的氨基酸序列如SEQID NO:93所示,所述蛋白降解器靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列,通过所述转肽酶A连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分。
124. 根据权利要求118所述的方法,所述靶分子靶向部分的C末端的氨基酸序列如SEQID NO:92所示,所述蛋白降解器靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列,通过所述转肽酶A连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分。
125. 根据权利要求118所述的方法,所述蛋白降解器靶向部分的C末端的氨基酸序列如SEQ ID NO:93所示,所述靶分子靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列,通过所述转肽酶A连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分。
126. 根据权利要求118所述的方法,所述蛋白降解器靶向部分的C末端的氨基酸序列如SEQ ID NO:92所示,所述靶分子靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列,通过所述转肽酶A连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分。
127.一种制备权利要求1-66中任一项所述缀合物的方法,包含将所述缀合物的所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分直接或间接连接。
128. 根据权利要求127所述的方法,通过转肽酶A连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分,且所述转肽酶A的氨基酸序列如SEQ ID NO:99所示 。
129. 根据权利要求127所述的方法,所述靶分子靶向部分的C末端的氨基酸序列如SEQID NO:93所示,和/或所述靶分子靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列。
130. 根据权利要求127所述的方法,所述靶分子靶向部分的C末端的氨基酸序列如SEQID NO:92所示,和/或所述靶分子靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列。
131. 根据权利要求127所述的方法,所述蛋白降解器靶向部分的C末端的氨基酸序列如SEQ ID NO:93所示,和/或所述蛋白降解器靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列。
132. 根据权利要求127所述的方法,所述蛋白降解器靶向部分的C末端的氨基酸序列如SEQ ID NO:92所示,和/或所述蛋白降解器靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列。
133. 根据权利要求128所述的方法,所述靶分子靶向部分的C末端的氨基酸序列如SEQID NO:93所示,所述蛋白降解器靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列,通过所述转肽酶A连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分。
134. 根据权利要求128所述的方法,所述靶分子靶向部分的C末端的氨基酸序列如SEQID NO:92所示,所述蛋白降解器靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列,通过所述转肽酶A连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分。
135. 根据权利要求128所述的方法,所述蛋白降解器靶向部分的C末端的氨基酸序列如SEQ ID NO:93所示,所述靶分子靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列,通过所述转肽酶A连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分。
136. 根据权利要求128所述的方法,所述蛋白降解器靶向部分的C末端的氨基酸序列如SEQ ID NO:92所示,所述靶分子靶向部分的N末端包含寡聚甘氨酸序列,通过所述转肽酶A连接所述靶分子靶向部分与所述蛋白降解器靶向部分。
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