CN114496233B - 一种心肌梗死并发症的辅助诊断系统 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及智慧医疗技术领域,提供了一种心肌梗死并发症的辅助诊断系统,包括:数据获取模块,用于获取患者的医疗数据,所述医疗数据包括生理指标数据、影像数据和心电图数据;影像解析模块,用于根据影像数据,基于预先训练的心脏影像异常检测模型,判断所述患者的心脏异常情况;心电图解析模块,用于根据心电图数据,基于预先训练的心电图异常检测模型,判断所述患者的心脏异常情况;并发症诊断模块,用于根据患者的生理指标数据、影像解析结果和心电图解析结果,基于预先训练的心肌梗死并发症诊断模型,判断出现各类并发症的概率。本发明综合考虑了生理、影像和心电图跨模态数据,提高了并发症诊断准确率。
Description
技术领域
本发明属于智慧医疗技术领域,尤其涉及一种心肌梗死并发症的辅助诊断系统。
背景技术
目前诊断心肌梗死并发症主要通过诊断医师对多种临床检查以及医学影像资料对患者进行综合评估,但是心肌梗死并发症存在影像图像复杂、种类繁多等特点,并且目前对这类病症还缺乏标准化格式,导致对诊断医师有较高的要求,使诊断需要消耗的时间较长、诊断效率低、诊断的重复性较高。
当前的辅助诊断模型主要以根据生理性指标进行线性拟合得到,但是,心肌梗死并发症通常还需要辅以影像数据和心电图数据,线性拟合模型的结果仅能够作为一项参考指标,当前尚未有综合多模态检查数据进行心肌梗死并发症诊断的相关技术。
发明内容
为克服上述现有技术的不足,本发明提供了一种心肌梗死并发症的辅助诊断系统。综合考虑了生理、影像和心电图跨模态数据,提高了诊断准确率,能够为医生诊断提供参考。
为实现上述目的,本发明的一个或多个实施例提供了如下技术方案:
一种心肌梗死并发症的辅助诊断系统,包括:
数据获取模块,用于获取患者的医疗数据,所述医疗数据包括生理指标数据、影像数据和心电图数据;
影像解析模块,用于根据影像数据,基于预先训练的心脏影像异常检测模型,判断所述患者的心脏异常情况;
心电图解析模块,用于根据心电图数据,基于预先训练的心电图异常检测模型,判断所述患者的心脏异常情况;
并发症诊断模块,用于根据患者的生理指标数据、影像解析结果和心电图解析结果,基于预先训练的心肌梗死并发症诊断模型,判断出现各类并发症的概率。
进一步地,所述数据获取模块获取数据后,还进行数据预处理,包括数据清洗、数据补全和数据变换。
进一步地,所述心脏影像异常检测模型包括心脏破裂检测模块、室壁瘤检测模块、附壁血栓检测模块和心包液检测模块,分别基于训练数据,采用生成对抗网络训练得到。
进一步地,所述系统还包括模型训练模块,用于针对每一类并发症,均根据生理指标数据基于logistic回归分析建立初级诊断模型;以及,基于生理指标数据、影像解析结果和心电图解析结果,基于神经网络建立二级诊断模型。
进一步地,对于一种并发症,二级诊断模型训练方法包括:
获取所述并发症相关的患者生理指标数据、影像解析结果和心电图解析结果进行结构化处理,得到多个特征向量;
基于深度神经网络,训练得到二级诊断模型。
进一步地,所述结构化处理包括:对于生理指标,若存在异常,根据超出正常阈值最大值还是最小值赋值为1或-1,否则赋值为0;对于心脏异常指标,若影像解析或心电图解析结果为异常,则赋值为1,反之赋值为0。
进一步地,对于初级诊断模型和二级诊断模型,均针对每类并发症,根据辅助诊断结果和医生诊断结果,基于欧氏距离计算数据差异,得到初级诊断模型和二级诊断模型对于每类并发症的准确率。
进一步地,所述并发症诊断模块,被配置为:
根据生理指标数据,对于每一类并发症,基于初级诊断模型,获取各类并发症的概率;
根据生理指标数据、影像解析结果和心电图解析结果,基于预先训练的二级诊断模型,得到各类并发症的概率;
以每类并发症初级诊断模型和二级诊断模型的准确率为权重,计算该类并发症的联合概率,联合概率最高的并发症类型即为诊断结果。
进一步地,所述系统还包括治疗方案推荐模块,用于根据并发症诊断结果,获取相关治疗方案。
进一步地,所述系统还包括数据库系统,采用分布式消息系统,根据疾病编码和诊断结果,将心肌梗死并发症相关患者信息、历史检查数据、诊断结果和治疗方案进行分类存储。
以上一个或多个技术方案存在以下有益效果:
本发明利用大数据分析,综合考虑了生理、影像和心电图跨模态数据,在保证诊断准确率的前提下,不仅可以极大地减轻诊断医师工作负担,还可以显著提高诊断的工作效率。
本发明基于logistics回归分析和深度学习两类模型,分别基于生理指标和生理、影像、心电图联合指标进行并发症的预测,然后将两类模型的准确度作为权重,计算各类并发症的联合概率,相较于采用单一模型进行诊断,准确率有所提高。
通过对诊断结果进行评价,能够得知模型针对各类并发症的适用性,有助于进一步有针对性地对模型进行优化。
附图说明
构成本发明的一部分的说明书附图用来提供对本发明的进一步理解,本发明的示意性实施例及其说明用于解释本发明,并不构成对本发明的不当限定。
图1为本发明实施例中心肌梗死并发症的辅助诊断系统框架图。
具体实施方式
应该指出,以下详细说明都是示例性的,旨在对本发明提供进一步的说明。除非另有指明,本文使用的所有技术和科学术语具有与本发明所属技术领域的普通技术人员通常理解的相同含义。
需要注意的是,这里所使用的术语仅是为了描述具体实施方式,而非意图限制根据本发明的示例性实施方式。如在这里所使用的,除非上下文另外明确指出,否则单数形式也意图包括复数形式,此外,还应当理解的是,当在本说明书中使用术语“包含”和/或“包括”时,其指明存在特征、步骤、操作、器件、组件和/或它们的组合。
在不冲突的情况下,本发明中的实施例及实施例中的特征可以相互组合。
实施例一
本实施例公开了一种心肌梗死并发症的辅助诊断系统,包括:数据库系统和辅助诊断系统。
所述数据库系统,用于存储各类心肌梗死并发症的患者医疗数据,所述医疗数据包括患者的历史检查数据和相应治疗方案。
所述数据库系统采用分布式消息系统Kafka,将来自医院、诊所的医疗数据进行整合,根据疾病编码和诊断结果,将相应患者信息、历史检查数据、诊断结果和治疗方案分类存储。分布式消息系统Kafka的核心组件主要包括:主题,即发布在Kafka的消息所属类别,Kafka系统按照不同的主题将消息进行分类。按照心肌梗死并发症分类标准,划分六个主题分别为心脏破裂、室壁瘤、形成附壁血栓、心律失常、心力衰竭和心源性休克、心肌梗死后综合征;生产者,即发布消息到Kafka系统相应主题的信息源或数据源,以心肌梗死并发症治疗方案数据作为生产者,并根据数据所对应的治疗类型分别向心脏破裂、室壁瘤、形成附壁血栓、心律失常、心力衰竭和心源性休克、心肌梗死后综合征六个主题发送消息,所述信息包括患者病历(包括生理数据、影像数据和心电图数据),以及医生出具的相应治疗方案;消费者,即从Kafka系统中提取消息或消费消息的终端或服务,要求消费者具有从Kafka系统获取消息并及时处理的能力,即要求选用的消费者有流畅框架来应对实时场景。
Spark Streaming是Spark核心API的一个扩展,可以实现高吞吐量的、具有容错机制的实时数据流处理,选用Spark Streaming作为消费者,以Spark Streaming为基础获取Kafka系统中的主题数据。
所述数据库系统获取各类心肌梗死并发症的患者医疗数据后,执行以下处理:
(1)对数据进行数据清洗,包括:补全残缺数据;找出并去除或更正错误数据;确认并整理重复数据;
(2)对数据进行数据变换,通过对比最新心肌梗死的诊断标准,剔除检查所得数据中的无关变量,同时也通过平滑处理、合计处理等方式将数据转换成适用的形式;
(3)对数据进行集成存储,通过将清理后的临床检查数据在逻辑上或物理上有效集成,首先,采用SQL语句查询所得数据中不完整的数据项,确保所得数据均可参与运算分析;接着,采用Sqoop技术建立数据与HDFS文件系统之间的数据连接,将数据存入Hadoop的HDFS文件系统中;当数据存入后,采用MapReduce编程方法对数据进行运算分析,并将运算分析后的数据同步上传到HDFS文件系统中,完成数据的预处理。
所述辅助诊断系统,包括:
知识图谱构建模块,用于从所构建好的数据库中获取心肌梗死并发症相关的医学知识、心肌梗死并发症的病发机制,以及心肌梗死并发症患者的心脏影像数据、心电图数据、生理指标数据,并进行知识抽取,对患者数据进行结构化处理,整合为知识图谱。具体地,所述知识图谱构建方法为:构建领域知识图谱,主要包括命名实体识别和关系抽取两个任务。构建的心肌梗死并发症知识图谱主要以<实体,关系,实体>三元组的形式存储,本实施例中,所述实体包括并发症、症状、与各并发症相关的生理检验指标、影像检查指标和心电图检查指标、治疗方法和药品等,所述关系用于表示上述实体之间的语义关系,如分支关系、治疗关系、成因关系等。
知识图谱节点语义分布向量获取。图嵌入是一种知识图谱节点语义分布向量表示技术,可以采用随机游走等算法获得。本实施例采用基于GCN图神经网络来进行图谱节点嵌入表示学习。具体地,通过图卷积神经网络对领域知识图谱中的节点拓扑进行学习,即通过神经网络将图节点的属性和连接关系语义映射到低维空间,从而获得节点的语义分布向量。
上述知识图谱包含了所有心肌梗死并发症的特征数据,形成了心肌梗死并发症语义网络,当需要进行知识推理时,例如根据确诊并发症查找相应治疗方案,则将该并发症转换为语义网络中的节点,使用层级知识图谱嵌入的关键方法实现推理。
模型训练模块,用于从数据库系统获取生理指标数据,建立初级诊断模型;获取心脏异常的影像数据,和异常的心电图数据,分别训练心脏影像异常检测模型和心电图异常检测模型;以及获取确诊各类并发症的患者生理指标数据、影像解析结果和心电图解析结果,训练心肌梗死并发症二级诊断模型。
其中,所述心脏影像异常检测模型中,心脏破裂检测模块、室壁瘤检测模块、附壁血栓检测模块和心包液检测模块等,通过分别获取心脏破裂影像、室壁瘤影像、附壁血栓影像等作为训练数据,采用深度学习模型训练得到。本实施例中,采用生成对抗网络GAN,使用对抗性训练方法联合正向分割网络和反向映射网络来训练该模型,从而获得所需的数据。
所述初级诊断模型基于logistics回归分析构建得到。
所述二级诊断模型基于深度神经网络训练得到,具体包括:
(1)获取训练数据集,所述训练数据集包括各类并发症相应的生理指标、心脏异常指标,并标注相应的并发症类型标签;
(2)对训练数据集进行结构化处理,将每一条数据生成一个特征向量;具体地,对于生理指标,若存在异常,根据超出正常阈值最大值还是最小值赋值为1或-1,否则赋值为0。对于心脏异常指标,若影像解析或心电图解析结果为异常,则赋值为1,反之赋值为0。假设结构化特征数据的结构包括白细胞含量、血红蛋白含量、免疫球蛋白G(IgG)、免疫球蛋白A(IgA)、心脏破裂、室壁瘤、附壁血栓、心包积液、心率异常、心房颤动,若某患者血清检测结果为白细胞明显增多,影像解析结果为心包积液,其他无异常,则该患者的结构化特征数据为[1,0,0,0,0,0,0,0,1,0]。
(3)根据训练数据集特征向量及相应并发症标签,基于深度学习网络,构建二级诊断模型。
所述深度学习网络包括依次连接的三个卷积层和两个全连接层,其中,每两个卷积层之间均连接一个最大池化层。
建立初步诊断模型,还对各类并发症模型的准确率进行计算,并将所述准确率作为后续综合评价的权重。
数据获取模块,用于获取患者的医疗数据,所述医疗数据包括生理指标数据、影像数据和心电图数据;其中,所述影像数据为X线影像或CT影像。
影像解析模块,用于根据影像数据,基于预先训练的心脏影像异常检测模型,判断所述患者的心脏异常情况;所述心脏影像异常检测模型包括心脏破裂检测模块、室壁瘤检测模块、附壁血栓检测模块和心包液检测模块等。
心电图解析模块,用于根据心电图数据,基于预先训练的心电图异常检测模型,判断所述患者的心脏异常情况;所述心电图异常检测模型包括心率异常检测模块、心房颤动检测模块等。
并发症诊断模块,用于根据患者的生理指标数据、影像解析结果和心电图解析结果,基于预先训练的心肌梗死并发症诊断模型,判断出现各类并发症的概率。具体地,可针对各类并发症的概率进行排序,供医生参考。
具体地,包括以下步骤:
(1)根据生理指标数据,基于各类并发症的初步诊断模型,判断可能并发症及概率。
所述各类并发症的初步诊断模型通过logistic线性回归拟合得到。具体地,对每一类并发症,分别根据生理指标数据和是否确诊的关系,确定自变量和对应的因变量值,线性组合可以用logistic回归方程来实现,形式如下
上式中,xi(i=1,2,…,n)为受试者进行某一项临床检查得到的n项生理指标数据,例如白细胞含量、血红蛋白含量、免疫球蛋白G(IgG),免疫球蛋白A(IgA)等,θ=(θ1,θ2,...θi,...,θn),表示参数向量,其中,θi(i=1,2,…,n)为样本训练拟合出的参数值。
接着,将所得的各项因变量值θTx转换为概率值,可利用Sigmoid函数来实现,形式如下
在完成了由因变量值转换为概率值之后,可利用似然函数,完成对受试者的辅助诊断。
(2)对于每一类并发症,分别根据生理指标数据、影像解析结果和心电图解析结果,基于预先训练的二级诊断模型,判断相应并发症及概率。
首先对生理指标数据进行结构化处理得到所有与心肌梗死并发症相关的生理指标和心脏异常指标。具体地,对于生理指标,若存在异常,根据超出正常阈值最大值还是最小值赋值为1或-1,否则赋值为0,与上文对训练数据进行结构化处理的方法相同。
(3)对于每一类并发症,以初级诊断模型和二级诊断模型的准确率为权重,将经由两个模型得到的概率进行加权求和,计算结果最大的即为诊断结果。
治疗方案推荐模块,用于根据并发症诊断结果,从数据库系统查询相关治疗方案,或者,基于知识图谱获取相关治疗方案,具体地,将得到的心肌梗死并发症诊断结果,结合心脏影像指标、心电图指标、和生理指标数据,建立特征向量。具体地,基于知识图谱对诊断结果及相关指标构建实体表示向量,然后将所述实体表示向量与所述知识图谱进行实体对齐,基于图谱节点路径和图节点语义分布特征进行特征扩展并进行任务关联知识召回,得到相应治疗方案和用药方案。
模型管理模块,用于存储心脏影像异常检测模型和心电图异常检测模型,并在获取新的训练数据时进行更新。
诊断结果评估模块,用于获取辅助诊断结果与诊断医师诊断结果,利用两种结果分别拟合KNN模型,计算出两类数据之间的差距,可以用欧式距离公式来实现,形式如下:
上式中,xi(i=1,2,…,n)为辅助诊断结果中的各项指标数据,yi(i=1,2,…,n)为诊断医师诊断结果中的各项指标数据,d为欧氏距离。
将多次辅助诊断结果与诊断医师诊断结果计算后的d进行大小排序,并选取最小的K个点,K的取值需小于样本总数的平方根,并为奇数。判断K个点分别属于诊断正确与诊断错误当中的哪一类别。
根据分类结果,计算出辅助诊断的准确率。
根据针对并发症的诊断结果,可归纳出当预测诊断结果为哪种类型的心肌梗死并发症时准确率最高,哪种准确率最低,从而有针对性的对模型或输入特征进行优化。
本领域技术人员应该明白,上述本发明的各模块或各步骤可以用通用的计算机装置来实现,可选地,它们可以用计算装置可执行的程序代码来实现,从而,可以将它们存储在存储装置中由计算装置来执行,或者将它们分别制作成各个集成电路模块,或者将它们中的多个模块或步骤制作成单个集成电路模块来实现。本发明不限制于任何特定的硬件和软件的结合。
上述虽然结合附图对本发明的具体实施方式进行了描述,但并非对本发明保护范围的限制,所属领域技术人员应该明白,在本发明的技术方案的基础上,本领域技术人员不需要付出创造性劳动即可做出的各种修改或变形仍在本发明的保护范围以内。
Claims (8)
1.一种心肌梗死并发症的辅助诊断系统,其特征在于,包括:
数据获取模块,用于获取患者的医疗数据,所述医疗数据包括生理指标数据、影像数据和心电图数据;
影像解析模块,用于根据影像数据,基于预先训练的心脏影像异常检测模型,判断所述患者的心脏异常情况;
心电图解析模块,用于根据心电图数据,基于预先训练的心电图异常检测模型,判断所述患者的心脏异常情况;
模型训练模块,用于针对每一类并发症,均根据生理指标数据基于logistic回归分析建立初级诊断模型;以及,基于生理指标数据、影像解析结果和心电图解析结果,基于神经网络建立二级诊断模型;
并发症诊断模块,被配置为:
根据生理指标数据,基于各类并发症的初步诊断模型,判断可能并发症及概率;
对于每一类并发症,分别根据生理指标数据、影像解析结果和心电图解析结果,基于预先训练的二级诊断模型,判断相应并发症及概率;
以每类并发症初级诊断模型和二级诊断模型的准确率为权重,计算该类并发症的联合概率,联合概率最高的并发症类型即为诊断结果。
2.如权利要求1所述的一种心肌梗死并发症的辅助诊断系统,其特征在于,所述数据获取模块获取数据后,还进行数据预处理,包括数据清洗、数据补全和数据变换。
3.如权利要求1所述的一种心肌梗死并发症的辅助诊断系统,其特征在于,所述心脏影像异常检测模型包括心脏破裂检测模块、室壁瘤检测模块、附壁血栓检测模块和心包液检测模块,分别基于训练数据,采用生成对抗网络训练得到。
4.如权利要求1所述的一种心肌梗死并发症的辅助诊断系统,其特征在于,对于一种并发症,二级诊断模型训练方法包括:
获取所述并发症相关的患者生理指标数据、影像解析结果和心电图解析结果进行结构化处理,得到多个特征向量;
基于深度神经网络,训练得到二级诊断模型。
5.如权利要求1所述的一种心肌梗死并发症的辅助诊断系统,其特征在于,所述模型训练模块中,针对二级诊断模型的训练数据,还进行结构化处理:对于生理指标,若存在异常,根据超出正常阈值最大值还是最小值赋值为1或-1,否则赋值为0;对于心脏异常指标,若影像解析或心电图解析结果为异常,则赋值为1,反之赋值为0。
6.如权利要求1所述的一种心肌梗死并发症的辅助诊断系统,其特征在于,对于初级诊断模型和二级诊断模型,均针对每类并发症,根据辅助诊断结果和医生诊断结果,基于欧氏距离计算数据差异,得到初级诊断模型和二级诊断模型对于每类并发症的准确率。
7.如权利要求1所述的一种心肌梗死并发症的辅助诊断系统,其特征在于,所述系统还包括治疗方案推荐模块,用于根据并发症诊断结果,获取相关治疗方案。
8.如权利要求1所述的一种心肌梗死并发症的辅助诊断系统,其特征在于,所述系统还包括数据库系统,采用分布式消息系统,根据疾病编码和诊断结果,将心肌梗死并发症相关患者信息、历史检查数据、诊断结果和治疗方案进行分类存储。
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