CN113724876A - 基于多模态融合和dfs-lle算法的脑卒中院内并发症预测模型 - Google Patents

基于多模态融合和dfs-lle算法的脑卒中院内并发症预测模型 Download PDF

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Abstract

本发明公开了基于多模态融合和DFS‑LLE算法的脑卒中院内并发症预测模型,该模型构建方法包括如下步骤:S1、采集脑卒中患者住院期间的截止并发症发生时的就诊数据,就诊数据包括临床结构化和医学图像2种模态的数据;S2、分别对2种模态的数据进行预处理;S3、提取医学图像中影像组学特征,与临床结构化数据进行多模态融合;S4、利用DFS技术对经步骤S3融合后的特征进行合成;S5、利用LLE对经步骤S4合成的特征进行降维;S6、根据上述数据构建基于深度神经网络的脑卒中并发症预测模型。本发明能有效的提升模型的预测性能,提高脑卒中并发症的预测能力,为临床提供强有力的辅助决策作用。

Description

基于多模态融合和DFS-LLE算法的脑卒中院内并发症预测 模型
技术领域
本发明属于医疗大数据挖掘及疾病智能预测技术领域,具体涉及基于多模态融合和DFS-LLE算法的脑卒中院内并发症预测模型。
背景技术
脑卒中是全球第二大致死疾病和第三大致残疾病,根据《中国脑卒中防治报告2018》,我国每12秒就有一人发生脑卒中,每21秒就有一人死于脑卒中。其中脑卒中的死亡病例中,有很多不是死于疾病本身,而是死于各种并发症,如感染、循环衰竭及肾脏病、电解质紊乱、消化道出血等,目前对于脑卒中并发症以临床症状显露后的治疗为主要手段,缺乏预防及控制的决策信息支持。
目前有国内外学者针对脑卒中的各种并发症提出了一些评估预测模型,2018年,Hoffmann等制定了A2DS2评分表评估急性缺血性脑卒中并发肺部感染的风险;2019年JiaFu使用多因素logistic回归分析了急性缺血性脑卒中并发消化道出血的风险因素,2020年,SangHeeHa利用单因素分析得到急性缺血性脑卒中合并深静脉血栓形成的相关变量。上述模型对线性关系拟合较强,对于复杂的非线性医疗数据,难以挖掘其中的潜在信息。
目前脑卒中并发症的预测大多根据临床结构化数据进行预测,而临床结构化数据大多比较主观,预测的效果不够精准。临床上,医学影像一般用于疾病的初步筛查和诊断,为临床疗效评价提供客观依据。除此之外,医学影像包含着大量的信息,包括人眼难以识别或量化的复杂模式。因此本研究采用患者住院期间的就诊数据,通过灰度共生矩阵(GreyLevel Co-occurrence Matrix,GLCM)挖掘更深层次医学影像纹理特征,再与临床结构化数据相结合,同时采用深度特征合成(Deep Feature Synthesis,DFS)技术和局部线性嵌入(Locally linear embedding,LLE)对特征进行处理,建立脑卒中并发症预测模型,为脑卒中并发症精准预防和控制提供参考。
发明内容
针对现有技术中的不足与难题,本发明旨在提供一种基于多模态融合和DFS-LLE算法的脑卒中院内并发症预测模型。
本发明通过以下技术方案予以实现:
基于多模态融合和DFS-LLE算法的脑卒中院内并发症预测模型,该模型构建方法包括如下步骤:
S1、采集脑卒中患者住院期间的截止并发症发生时的就诊数据,就诊数据包括临床结构化和医学图像2种模态的数据,其中临床结构化数据包括人口统计学信息、医学检验、临床用药、护理记录;医学影像数据包括患者的头部CT、MRI检查图像;
S2、分别对2种模态的数据进行预处理;
S3、提取医学图像中影像组学特征,与临床结构化数据进行多模态融合;
S4、利用DFS技术对经步骤S3融合后的特征进行合成;
S5、利用LLE对经步骤S4合成的特征进行降维;
S6、构建基于深度神经网络、XGboost、logistics回归的脑卒中并发症预测模型。
进一步地,步骤S1中的脑卒中患者需要符合《中国急性缺血性脑卒中诊疗指南诊断标准2010》中的诊断标准:(1)年龄≥18岁;(2)通过颅脑CT或MRI检查确诊。排除标准:(1)院内死亡及转院患者;(2)既往有卒中史患者;(3)入院24h内发生并发症的患者;(4)共患肿瘤、血液病及自身免疫性疾病患者。
进一步地,所述步骤S2中的临床结构化数据的预处理为:剔除数据中的异常值,将数据中含有缺失值将缺失率超过20%的特征直接删除,缺失率小于20%的特征采用多重插补法进行填充完整;所述步骤S2中的医学图像数据的预处理步骤为:将所有图像归一化和标准化,并对梗死部位进行ROI标注。
进一步地,所述步骤S3中,采用灰度共生矩阵对医学图像的纹理特征进行提取,得到主要特征值,将这些特征值与临床结构化数据的特征进行融合。
进一步地,所述步骤S4通过以下公式对述步骤S3融合后的特征进行合成:
Figure BDA0003256130080000021
式中,i为递归的次数,n与m是前向关系和后向关系的个数,r是rfeat函数的个数,e是efeat函数的个数。
进一步地,所述步骤S5对特征进行降维的步骤如下:
S5-1、寻找每个样本点的k个近邻点;
S5-2、由每个样本点的近邻点计算出该样本点的局部重建权值矩阵;
S5-3、由该样本点的局部重建权值矩阵和其近邻点计算出该样本点的输出值。
进一步地,所述步骤S6中分别构建基于深度神经网络、XGboost、logistics回归的脑卒中并发症预测模型,其中模型训练运用十折交叉验证网格搜索最优参数,以AUC值作为评价指标,对比不同预测模型在训练集和测试集上效果。
与现有技术相比,本发明基于多模态数据,采用GLCM对图像进行纹理特征提取,挖掘其中的复杂隐藏信息,再采用DFS-LLE算法对所有特征数据进行处理,从高维空间中映射出可用与分类的特征,结合各种机器学习算法,相比于其他所有对照组,能有效的提升模型的预测性能,提高脑卒中并发症的预测能力,为临床提供强有力的辅助决策作用
附图说明
图1为本发明结构示意图。
具体实施方式
下面结合附图,对本发明作进一步地说明。
基于多模态融合和DFS-LLE算法的脑卒中院内并发症预测模型,该模型构建方法流程图如图1所示,包括如下步骤:
S1、数据采集
采集脑卒中患者住院期间的就诊数据(截止并发症发生时),主要包括临床结构化数据和医学图像数据;
其中临床结构化数据主要包括人口统计学信息、医学检验、临床用药、护理记录等,医学影像数据主要包括患者的头部CT、MRI等检查图像;
脑卒中患者需要符合《中国急性缺血性脑卒中诊疗指南诊断标准2010》中的诊断标准:(1)年龄≥18岁,(2)通过颅脑CT或MRI检查确诊;排除标准:(1)院内死亡及转院患者,(2)既往有卒中史患者,(3)入院24h内发生并发症的患者,(4)共患肿瘤、血液病及自身免疫性疾病患者。
S2、分别对2种模态的数据进行预处理。
临床结构化数据的预处理为:剔除数据中的异常值,将数据中含有缺失值将缺失率超过20%的特征直接删除,缺失率小于20%的特征采用多重插补法进行填充完整;
医学图像数据的预处理为:将所有图像归一化和标准化,并对梗死部位进行ROI标注。
S3、提取图像中影像组学特征,与临床结构化数据进行多模态融合
采用GLCM对图像的纹理特征进行提取,得到主要特征值,将这些特征值与临床结构化数据的特征进行融合。其纹理特征进行提取的主要步骤为:
从数字图像中任意取一点,令其坐标为(x,y),偏离该点的坐标为(x+a,x+b),设定该偏离点的灰度值为(i,j);令(x,y)在整幅图像中移动,那就会得到各种不同的(i,j)的值,用k来表示灰度级数,则共有k2种组合;在整幅图像中,统计出所有(i,j)值出现的次数排成一个矩阵,用概率Pij表示(i,j)出现的总次数的归一化值,我们把这样的矩阵称作为灰度联合概率矩阵;灰度联合概率矩阵的另外一个名称是二像点的联合直方图。如果矩阵主要倾向于对角分布,那么这幅图像纹理粗而有规则;因为距离差(a,b)可以进行不同的取值,主要是根据纹理的周期分布特性来选择,用下面数学表达式表示:
Figure BDA0003256130080000041
上式中的i为点(x,y)移动的方向,Dx,Dy分布代表偏移量,可以再4个方向上取值,一般取45°、90°、135°、0°,各点的频度值为:
Figure BDA0003256130080000042
上式中R是归一化常数。
S4、利用DFS技术对数据特征进行合成
假设E1,2,...,k表示所有就诊的实体,每次就诊有1...J个特征,
Figure BDA0003256130080000043
表示第k次就诊的第i个实例特征j的值;其中生成的特征有三种类型,分别是efeat、dfeat、rfeat,在生成的dfeat和rfeat类型的特征时通过联合分析两次不同就诊实体El和Ek得出来的,这个两次就诊存在前向关系或者后向关系。
三种类型特征的计算方法分别为:
(1)efeat:通过计算每个属性值来获取特征,这些特征可以通过对xi,j'逐元应用计算函数。这种计算可表示为:
xi,j'=dfeat(x:,j,i)
(2)dfeat:应用于关系表中的前向关系,相关实体i∈Ek中的特征被直接转移为m∈Ek的特征。
(3)rfeat:应用于后向关系,通过将数学函数应用于
Figure BDA0003256130080000051
来导出实体Ek的实例i,它通过提取实体中特征j的所有值来组合Ek,提取条件是,这种转换可以表示为:
Figure BDA0003256130080000052
算法为给定实体合成的特征数量z由下式给出:
Figure BDA0003256130080000053
i为递归的次数,n与m是前向关系和后向关系的个数,r是rfeat函数的个数,e是efeat函数的个数。
S5、利用LLE对特征进行降维
具体步骤为:
步骤5-1:计算出每个样本点的k个近邻点。
步骤5-2:计算出样本点的局部重建权值矩阵W,首先定义重构误差:
Figure BDA0003256130080000054
以及局部协方差矩阵C:
Figure BDA0003256130080000055
其中,x表示一个特定的点,它的k个近邻点用η表示。
则其目标函数为:最小化:
Figure BDA0003256130080000061
其中∑jWj=1得到
Figure BDA0003256130080000062
步骤5-3:将所有样本点映射到低维空间,映射条件满足下式:
Figure BDA0003256130080000063
上式可以转化成:
Figure BDA0003256130080000064
其中:M=(I-W)T(I-W),再加上限制条件:
Figure BDA0003256130080000065
(中心化),
Figure BDA0003256130080000066
(单位协方差)可以得到最终解:MY=λY;
标准的特征分解问题,取Y为M的最小m个非零特征值所对应的特征向量;
针对数据处理方面,分别设置2个对照组:1仅采用临床结构化数据建模;2仅采用影像学特征建模;
针对特征处理方面,分别设置2个对照组:1仅使用DFS算法进行处理;2仅使用LLE算法进行处理;
将上述数据处理方面和特征处理方面进行两两组合,可以得到4个对照组。
S6、根据上述数据构建基于深度神经网络、XGboost、logistics回归的脑卒中并发症预测模型,输出效果最优的模型。
模型训练运用十折交叉验证网格搜索最优参数,以AUC值作为评价指标,对比不同预测模型在训练集和测试集上效果。
以上所述仅表达了本发明的优选实施方式,其描述较为具体和详细,但并不能因此而理解为对本发明专利范围的限制。应当指出的是,对于本领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明构思的前提下,还可以做出若干变形、改进及替代,这些都属于本发明的保护范围。因此,本发明专利的保护范围应以所附权利要求为准。

Claims (7)

1.基于多模态融合和DFS-LLE算法的脑卒中院内并发症预测模型,其特征在于,所述模型构建方法包括如下步骤:
S1、采集脑卒中患者住院期间的截止并发症发生时的就诊数据,就诊数据包括临床结构化和医学图像2种模态的数据;
S2、分别对2种模态的数据进行预处理;
S3、提取医学图像中影像组学特征,与临床结构化数据进行多模态融合;
S4、利用DFS技术对经步骤S3融合后的特征进行合成;
S5、利用LLE对经步骤S4合成的特征进行降维;
S6、构建基于深度神经网络、XGboost、logistics回归的脑卒中并发症预测模型。
2.根据权利要求1所述的基于多模态融合和DFS-LLE算法的脑卒中院内并发症预测模型,其特征在于,所述步骤S1中的临床结构化数据包括人口统计学信息、医学检验、临床用药、护理记录;医学影像数据包括患者的头部CT、MRI检查图像;
所述步骤S1中的脑卒中患者需要符合《中国急性缺血性脑卒中诊疗指南诊断标准2010》中的诊断标准:(1)年龄≥18岁,(2)通过颅脑CT或MRI检查确诊;排除标准:(1)院内死亡及转院患者,(2)既往有卒中史患者,(3)入院24h内发生并发症的患者,(4)共患肿瘤、血液病及自身免疫性疾病患者。
3.根据权利要求1或2所述的基于多模态融合和DFS-LLE算法的脑卒中院内并发症预测模型,其特征在于,所述步骤S2中的临床结构化数据的预处理为:剔除数据中的异常值,将数据中含有缺失值将缺失率超过20%的特征直接删除,缺失率小于20%的特征采用多重插补法进行填充完整;
所述步骤S2中的医学图像数据的预处理步骤为:将所有图像归一化和标准化,并对梗死部位进行ROI标注。
4.根据权利要求3所述的基于多模态融合和DFS-LLE算法的脑卒中院内并发症预测模型,其特征在于:所述步骤S3中,采用灰度共生矩阵对医学图像的纹理特征进行提取,得到主要特征值,将这些特征值与临床结构化数据的特征进行融合。
5.根据权利要求4所述的基于多模态融合和DFS-LLE算法的脑卒中院内并发症预测模型,其特征在于,所述步骤S4通过以下公式对述步骤S3融合后的特征进行合成:
Figure FDA0003256130070000021
式中,i为递归的次数,n与m是前向关系和后向关系的个数,r是rfeat函数的个数,e是efeat函数的个数。
6.根据权利要求5所述的基于多模态融合和DFS-LLE算法的脑卒中院内并发症预测模型,其特征在于,所述步骤S5对特征进行降维的步骤如下:
S5-1、寻找每个样本点的k个近邻点;
S5-2、由每个样本点的近邻点计算出该样本点的局部重建权值矩阵;
S5-3、由该样本点的局部重建权值矩阵和其近邻点计算出该样本点的输出值。
7.根据权利要求1所述的基于多模态融合和DFS-LLE算法的脑卒中院内并发症预测模型,其特征在于:所述步骤S6中分别构建基于深度神经网络、XGboost、logistics回归的脑卒中并发症预测模型,其中模型训练运用十折交叉验证网格搜索最优参数,以AUC值作为评价指标,对比不同预测模型在训练集和测试集上效果。
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