CN114207151A - 治疗泌尿系统癌症的方法 - Google Patents

Abstract

本文提供了通过向患者给药英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐来治疗患者的上尿路上皮癌的方法。本文还提供了通过向患者给药英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐来治疗非肌层浸润性膀胱癌的方法。

Description

治疗泌尿系统癌症的方法

相关申请的交叉引用

本申请要求于2019年5月31日提交的美国专利申请62/855,277，以及2019年9月26日提交的美国专利申请62/906,194的权益和优先权，其全文以引用方式并入本文。

背景技术

在2018年，据估计150,350名新患者被诊断患有泌尿系统癌症：81,190例膀胱；65,340例肾和肾盂；以及3,820例输尿管及其他泌尿器官。非尿路上皮肾癌排除在外，所有尿路上皮癌中大约有5至10％是上尿路上皮癌(UTUC)。男性中UTUC的发病率比女性高2至3倍(Siegel等人,2018；Roupret等人,2015)。

与侵入性膀胱癌(UCB)相反，UTUC具有更具侵袭性的临床病程。在诊断时，与UCB患者的15％至25％相比，60％的UTUC患者患有侵入性癌症(Roupret等人,2015；Margulis等人,2009)。36％患有区域性疾病且9％患有远端转移疾病(Raman等人,2010)。对在12个中心经历根治性肾输尿管切除术(RNU)的1363名UTUC患者进行的大量回顾性调查展示，总群体的28％在RNU后复发(Margulis等人,2009)。

为了降低UTUC患者的发病率和死亡率，需要新辅助或辅助治疗。POUT研究(即UTUC的大规模随机试验)支持使用基于顺铂的标准护理辅助化疗(Birtle等人,2020)。因为许多UTUC患者在RNU后将具有一个剩余的肾，并且经常具有其他显著的共病病症，基于顺铂的疗法不是很能耐受(NCCN指南第3版，2018)。RNU前后的肾功能大大地限制了符合基于铂的新辅助或辅助疗法的条件的UTUC患者的数量。因此，需要靶向疗法来治疗UTUC(Lane等人,2010)。

尽管展示了侵入性UCB的新辅助治疗的存活有益效果，但许多患有侵入性UCB的患者不大可能接受基于顺铂的(新)辅助化疗，部分是由于顺铂不符合条件(Porter等人,2011)。此外，新辅助疗法后的残留疾病与不良预后相关联(Grossman等人,2003)。因此，对于相当大比例的如下患有侵入性UCB的患者仍然存在着尚未满足的需求：不符合或拒绝接受基于顺铂的辅助化疗，或者在新辅助疗法后具有残留疾病。

发明内容

在一个方面，本文提供了在有此需要的患者中治疗上尿路上皮癌的方法，该方法包括向患者给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。在某些实施方案中，上尿路上皮癌是侵入性上尿路上皮癌。在某些实施方案中，上尿路上皮癌是非侵入性上尿路上皮癌。

在某些实施方案中，患者不符合用基于顺铂的化疗疗法治疗的条件。在某些实施方案中，患者先前给药过基于顺铂的化疗，但具有残留癌。

在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐发生在肾输尿管切除术或输尿管下段切除术之后。

在某些实施方案中，与通过将有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐给药于有此需要的患者来治疗膀胱尿路上皮癌相比，将有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐给药于患者在治疗上尿路上皮癌中具有更大的功效。

在另一方面，本文提供了在有此需要的患者中治疗尿路上皮癌的方法，该方法包括向患者给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，其中患者先前已经进行肾输尿管切除术、输尿管下段切除术、或膀胱切除术。在某些实施方案中，尿路上皮癌是侵入性上尿路上皮癌或膀胱尿路上皮癌。在某些实施方案中，尿路上皮癌是非侵入性上尿路上皮癌或膀胱尿路上皮癌。

在某些实施方案中，患者不符合用基于顺铂的化疗疗法治疗的条件。在某些实施方案中，患者先前给药过基于顺铂的化疗，但具有残留癌。

在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括每天一次口服给药约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。

在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括28天周期，其中连续3周内每天一次向患者口服给药约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，并且在1周内不给药英菲格拉替尼。在一些实施方案中，将约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以100mg单位剂量和25mg单位剂量提供。在一些实施方案中，将约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以单位剂量提供。

在某些实施方案中，尿路上皮癌经组织学或细胞学证实。

在某些实施方案中，尿路上皮癌具有FGFR3突变、基因重排或融合。在某些实施方案中，尿路上皮癌具有FGFR3突变。在一些实施方案中，FGFR3突变选自FGFR3 R248C、FGFR3S249C、FGFR3 G372C、FGFR3 A393E、FGFR3 Y375C、FGFR3 K652M/T、FGFR3 K652E/Q，以及它们的组合。

在另一方面，本文提供了在有此需要的患者中治疗非肌层浸润性膀胱癌的方法，该方法包括给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，其中患者在先前给药另一种疗法后非肌层浸润性膀胱癌复发。

在某些实施方案中，先前给药的另一种疗法是用于非肌层浸润性膀胱癌的疗法。在某些实施方案中，先前给药另一种疗法是给药免疫治疗剂。在一些实施方案中，先前给药的免疫治疗剂是含卡介苗的方案。

在某些实施方案中，非肌层浸润性膀胱癌具有FGFR3突变、基因重排或基因融合。在某些实施方案中，非肌层浸润性膀胱癌具有FGFR3突变。在一些实施方案中，FGFR3突变选自FGFR3 K650E、FGFR3 S249C、FGFR3 R248C、FGFR3 Y375C、FGFR3 G372C、FGFR3 S373C、FGFR3 A393E、FGFR3 A371A、FGFR3 I378C、FGFR3 L379L、FGFR3 G382R，以及它们的组合。在某些实施方案中，非肌层浸润性膀胱癌具有FGFR3基因融合。在一些实施方案中，FGFR3基因融合包含FGFR3基因融合配偶体TACC3。

在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括每天一次给药约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。

在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括28天周期，其中连续3周内每天一次向患者口服给药约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，并且在1周内不给药英菲格拉替尼。

在某些实施方案中，将约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以100mg单位剂量和25mg单位剂量提供。在某些实施方案中，将约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以单位剂量提供。

在某些实施方案中，将约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐口服给药于患者。

在某些实施方案中，将有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐经由局部给药而给药于患者。在一些实施方案中，将有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐经瘤内给药于患者。在一些实施方案中，将有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐经膀胱内给药于患者。在某些实施方案中，经由将控释可植入装置插入患者的膀胱中来递送有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。在某些实施方案中，经由将控释可植入装置插入患者的输尿管中来递送有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。在某些实施方案中，经由将控释可植入装置插入患者的肾盂中来递送有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。

在某些实施方案中，控释可植入装置是包含超弹性圆形截面耐纶丝的双腔硅胶管。在某些实施方案中，控释可植入装置是凝胶。

在某些实施方案中，该方法还包括将有效量的第二治疗剂给药于患者。在一些实施方案中，将有效量的第二治疗剂经由局部给药而给药于患者。在某些实施方案中，将有效量的第二治疗剂经膀胱内给药于患者。在一些实施方案中，第二治疗剂是吉西他滨或其药学上可接受的盐。

在另一方面，本文提供了在有此需要的患者中治疗上尿路上皮癌的方法，该方法包括向患者给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，其中有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐作为新辅助疗法给药。

在某些实施方案中，上尿路上皮癌具有FGFR3突变、基因重排或基因融合。

在另一方面，本文提供了治疗有此需要的患者的方法，该患者患有具有至少一种FGFR3突变、基因重排或基因融合的上尿路上皮癌，该方法包括：(i)从患者获得样本；(ii)分析样本中至少一种FGFR3突变、基因重排或基因融合的存在；并且(iii)向患者给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，其中有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐作为新辅助疗法给药。

在某些实施方案中，尿路上皮癌具有FGFR3突变。在一些实施方案中，FGFR3突变选自FGFR3 R248C、FGFR3 S249C、FGFR3 G372C、FGFR3 A393E、FGFR3 Y375C、FGFR3 K652M/T、FGFR3 K652E/Q，以及它们的组合。

在某些实施方案中，上尿路上皮癌是低级别上尿路上皮癌。在某些实施方案中，上尿路上皮癌是高级别上尿路上皮癌。

在某些实施方案中，患者不符合用基于顺铂的新辅助化疗疗法治疗的条件。

在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括每天一次口服给药约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。

在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括28天周期，其中连续3周内每天一次向患者口服给药约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，并且在1周内不给药英菲格拉替尼。在某些实施方案中，将有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐给药于患者两个连续的28天周期。

在某些实施方案中，将约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以100mg单位剂量和25mg单位剂量提供。在某些实施方案中，将约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以单位剂量提供。

在某些实施方案中，该方法还包括在开始新辅助疗法的8周内，患者经历肾输尿管切除术或输尿管切除术。

在另一方面，本文提供了鉴定用有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐治疗上尿路上皮癌的患者的方法，该方法包括：测试在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之后从患者获得的样本，以测量至少一种FGFR3生物标记的基因表达，其中与基线基因表达测量相比，至少一种FGFR3生物标记的表达水平的改变的检测指示患者接受治疗的候选资格，并且其中基线基因表达测量是在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之前患者中测量的基因表达。

在另一方面，本文提供了监测患者对通过有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐治疗上尿路上皮癌的反应的方法，该方法包括：测试在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之后从患者获得的样本，以测量至少一种FGFR3生物标记的基因表达，其中与基线基因表达测量相比，至少一种FGFR3生物标记的表达水平的改变的检测指示患者对治疗的反应，并且其中基线基因表达测量是在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之前患者中测量的基因表达。

在另一方面，本文提供了鉴定用有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐治疗上尿路上皮癌的患者的方法，该方法包括：测试在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之后从患者获得的样本，以测量患者细胞游离DNA(cfDNA)中至少一种FGFR3生物标记的等位基因频率，其中与至少一种FGFR3生物标记的基线等位基因频率相比，患者的cfDNA中至少一种FGFR3生物标记的较低变异等位基因频率的检测指示患者接受治疗的候选资格，并且其中基线等位基因频率测量是在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之前患者的cfDNA中测量的等位基因频率。

在另一方面，本文提供了监测患者对通过有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐治疗上尿路上皮癌的反应的方法，该方法包括：测试在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之后从患者获得的样本，以测量患者的细胞游离DNA(cfDNA)中至少一种FGFR3生物标记的等位基因频率，其中与至少一种FGFR3生物标记的基线等位基因频率相比，患者的cfDNA中至少一种FGFR3生物标记的较低变异等位基因频率的检测指示患者对治疗的反应，并且其中基线等位基因频率测量是在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之前患者的cfDNA中测量的等位基因频率。

附图说明

图1A示出在上尿路上皮癌患者的肿瘤组织中观察到的FGFR3的突变的频率。

图1B示出在膀胱尿路上皮癌患者的肿瘤组织中观察到的FGFR3的突变的频率。

图2是英菲格拉替尼治疗的上尿路上皮癌患者和膀胱尿路上皮癌患者的无进展生存率的叠加。

图3是英菲格拉替尼治疗的上尿路上皮癌患者和膀胱尿路上皮癌患者的总生存率的叠加。

图4示出上尿路上皮癌患者和膀胱尿路上皮癌患者的cfDNA中变异频率的比较。

图5示出上尿路上皮癌患者和膀胱尿路上皮癌患者的肿瘤组织和cfDNA中FGFR3基因组改变的中值变异等位基因频率。

图6示出上尿路上皮癌患者和膀胱尿路上皮癌患者中cfDNA基因组图谱的瀑布图(oncoplots)。

具体实施方式

如本文一般描述，本公开提供了在有此需要的患者中治疗上尿路上皮癌的方法，例如，当患者患有侵入性上尿路上皮癌时。本公开还提供了在有此需要的患者中治疗尿路上皮癌(例如侵入性上尿路上皮癌或膀胱尿路上皮癌)的方法，例如，当患者先前已经进行肾输尿管切除术、输尿管下段切除术、或膀胱切除术时。

定义

为了有利于理解本发明，以下定义了许多术语和短语。

除非另有定义，否则本文使用的所有技术术语和科学术语都具有与本发明所属领域的普通技术人员通常理解的相同的含义。本文使用的缩写具有其在化学和生物领域内的常规含义。本文所阐述的化学结构和式根据化学领域中已知的化学价的标准规则来构建。

在整个说明书中，在组合物和试剂盒被描述为具有、包括、或包含特定组分的情况下，或者在过程和方法被描述为具有、包括、或包含特定步骤的情况下，还预期本发明的组合物和试剂盒基本上由或由所叙述的组分组成，并且根据本发明的过程和方法基本上由或由所叙述的处理步骤组成。

在本申请中，在要素或组分被称为包括在并且/或者选自所叙述的要素或组分的列表的情况下，应当理解，要素或组分可为所叙述的要素或组分中的任一种，或者要素或组分可选自所叙述的要素或组分中的两种或更多种。

另外，应当理解，本文所述的组合物或方法的要素和/或特征能够以多种方式组合而不脱离本发明的精神和范围，无论在本文中是明确的还是隐含的。例如，在提及到具体化合物的情况下，该化合物可用于本发明的组合物的各种实施方案中和/或本发明的方法中，除非从上下文中另外理解。换言之，在本申请内，已经以使得能够书写和绘制清楚而简明的应用的方式描述和描绘实施方案，但是意图并且将理解的是，在不脱离本发明教导和本发明的情况下，实施方案可以不同地组合或分开。例如，应当理解，本文描述和描绘的所有特征可应用于本文描述和描绘的本发明的所有方面。

除非上下文不适当，否则冠词“一个”和“一种”在本公开中用于指冠词的语法对象中的一个或多于一个(即，指至少一个)。以举例的方式，“一个要素”意指一个要素或多于一个要素。

术语“和/或”在本公开中用于意指“和”或者“或”，除非另外指明。

应当理解的是，表述“至少一个”包括在该表述之后所叙述对象中的单独每者以及所叙述对象中的两者或更多者的各种组合，除非从上下文和使用中另外理解。与三个或更多个所叙述对象相关的表述“和/或”应理解为具有相同的含义，除非从上下文中另外理解。

使用的术语“包括(include)”、“包括(includes)”、“包括(including)”、“具有(have)”、“具有(has)”、“具有(having)”、“含有(contain)”、“含有(contains)”、或“含有(containing)”，包括其语法等同物，应通常理解为开放式和非限制性的，例如，不排除额外的未叙述的要素或步骤，除非从上下文中另外具体叙述或理解。

在术语“约”在定量值之前使用的情况下，本发明还包括特定的定量值本身，除非另外特别叙述。如本文所用，术语“约”是指偏离标称值±10％的变化，除非另外指明或从上下文中推断。

在本说明书中的各种地方，变量或参数以组或范围公开。特别地，本说明书旨在包括这样的组和范围的成员的每个和每一个单独的子组合。例如，0至40范围内的整数特别地旨在单独公开0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39和40，并且1至20范围内的整数特别地旨在单独公开1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19和20。

本文中任何和所有实例或示例性语言(例如，“如”或“包括”)的使用仅旨在更好地说明本发明，并且不对本发明的范围构成限制，除非要求保护。说明书中的语言不应解释为指示任何未要求保护的要素是实践本发明所必需的。

一般情况下，指定百分比的组合物按重量计，除非另外指明。此外，如果变量不伴有定义，则以变量的先前定义为准。

如本文所用，“药物组合物”或“药物制剂”是指活性剂与惰性或活性载体的组合，使得组合物尤其适用于体内或离体诊断或治疗用途。

“药学上可接受的”意指经联邦或州政府的管理机构或者在除美国以外的国家的相应机构批准或可批准的，或者在美国药典(U.S.Pharmacopoeia)或其他公认药典中列出用于动物，更特别地用于人类。

如本文所用，“药学上可接受的盐”是指可存在于本发明的化合物(例如英菲格拉替尼)中的酸性或碱性基团的任何盐，该盐与药物给药相容。

如本领域的技术人员所知，化合物的“盐”可衍生自无机或有机酸和碱。酸的实例包括但不限于盐酸、氢溴酸、硫酸、硝酸、高氯酸、富马酸、马来酸、磷酸、乙醇酸、乳酸、水杨酸、琥珀酸、对甲苯磺酸、酒石酸、乙酸、柠檬酸、甲磺酸、乙磺酸、甲酸、苯甲酸、丙二酸、萘-2-磺酸和苯磺酸。其他酸，如草酸，虽然本身不是药学上可接受的，但可用于制备可用作获得本文所述的化合物及其药学上可接受的酸加成盐的中间体的盐。

碱的实例包括但不限于碱金属(例如钠和钾)氢氧化物、碱土金属(例如镁和钙)氢氧化物、氨，以及式NW₄ ⁺(其中W为C_1-4烷基)的化合物等。

盐的实例包括但不限于乙酸盐、己二酸盐、藻酸盐、天冬氨酸盐、苯甲酸盐、苯磺酸盐、硫酸氢盐、丁酸盐、柠檬酸盐、樟脑酸盐、樟脑磺酸盐、环戊烷丙酸盐、二葡萄糖酸盐、十二烷基硫酸盐、乙磺酸盐、富马酸盐、氟庚酸盐、甘油磷酸盐、半硫酸盐、庚酸盐、己酸盐、盐酸盐、氢溴酸盐、氢碘酸盐、2-羟基乙磺酸盐、乳酸盐、马来酸盐、甲磺酸盐、2-萘磺酸盐、烟酸盐、草酸盐、棕榈酸盐、果胶酸盐、过硫酸盐、苯丙酸盐、苦味酸盐、新戊酸盐、丙酸盐、琥珀酸盐、酒石酸盐、硫氰酸盐、甲苯磺酸盐、十一烷酸盐等。盐的其他实例包括与合适的阳离子如Na⁺、K⁺、Ca²⁺、NH₄ ⁺和NW₄ ⁺(其中W可为C_1-4烷基)等复合的本发明的化合物的阴离子。

对于治疗用途，预期本发明的化合物的盐是药学上可接受的。然而，非药学上可接受的酸和碱的盐也可用于例如制备或纯化药学上可接受的化合物。

如本文所用，“药学上可接受的赋形剂”是指有助于将活性剂给药于受试者并且/或者被受试者吸收并且可包括在本发明的组合物中而不对患者造成显著不利毒理效应的物质。药学上可接受的赋形剂的非限制性实例包括水、NaCl、生理盐溶液如磷酸盐缓冲盐水溶液、乳剂(例如，如油/水或水/油乳剂)、乳酸林格氏液、生理蔗糖、生理葡萄糖、粘结剂、填充剂、崩解剂、润滑剂、包衣、甜味剂、调味剂、盐溶液(如林格氏液)、醇、油、明胶、碳水化合物如乳糖、直链淀粉或淀粉、脂肪酸酯、羟甲基纤维素、聚乙烯吡咯烷和着色剂等。可将这样的制剂灭菌，并且根据需要与辅剂混合，所述辅剂如润滑剂、防腐剂、稳定剂、润湿剂、乳化剂、用于影响渗透压的盐、缓冲剂、着色剂和/或芳族物质等，其不与本发明的化合物有毒地反应。对于赋形剂的实例，参见Martin,Remington’s Pharmaceutical Sciences,第15版,Mack Publ.Co.,Easton,PA(1975)。

术语“AUC”是指在给药药物组合物后时间/血浆浓度曲线下的面积。AUC_0-无穷大代表从时间0到无穷大的血浆浓度与时间曲线下的面积；AUC_0-t代表从时间0到时间t的血浆浓度与时间曲线下的面积。应当理解，AUC值可以通过本领域已知的方法测定。

考虑给药的“受试者”包括但不限于人类(即，任何年龄段的男性或女性，例如儿童受试者(例如，婴儿、儿童、青少年)或成年受试者(例如，年轻人、中年人或老年人))和/或非人动物，例如哺乳动物诸如灵长类(例如，食蟹猴、恒河猴)、牛、猪、马、绵羊、山羊、啮齿动物、猫和/或狗。在某些实施方案中，受试者是人类。在某些实施方案中，受试者是非人动物。

术语“C_最大”是指在给药药物组合物后治疗剂(例如英菲格拉替尼)在血液(例如血浆)中的最大浓度。

术语“t_最大”是指在给药包含治疗剂(例如英菲格拉替尼)的药物组合物后实现C_最大时的时间(以小时计)。

如本文所用，“固体剂型”意指固体形式的一个或多个药物剂量，例如片剂、胶囊、颗粒剂、散剂、小药囊、可重构粉末、干粉吸入剂和可咀嚼剂。

如本文所用，“给药”意指向受试者口服给药、作为栓剂给药、局部接触、静脉内给药、肠胃外给药、腹膜内给药、肌内给药、病灶内给药、鞘内给药、颅内给药、鼻内给药或皮下给药、或植入缓释装置，例如微量渗透泵。给药是通过任何途径，包括肠胃外和经粘膜(例如颊面、舌下、腭、齿龈、鼻、阴道、直肠或透皮)。肠胃外给药包括例如静脉内、肌内、动脉内、皮内、皮下、腹膜内、心室内和颅内。其他递送模式包括但不限于使用脂质体制剂、静脉内输注、透皮贴剂等。所谓的“共同给药”意指本文所述的组合物在给药一种或多种额外疗法(例如，抗癌剂、化疗剂、或神经变性疾病的治疗)的同时、临在之前、或临在之后给药。英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐可单独给药或者可共同给药于患者。共同给药意在包括单独或组合的化合物(多于一种化合物或药剂)同时或依序给药。因此，制备物也可根据需要与其他活性物质组合(例如，以减少代谢降解)。

术语“疾病”、“障碍”和“病症”在本文中可互换使用。

如本文所用，并且除非另外指明，否则术语“治疗(treat)”、“治疗(treating)”和“治疗(treatment)”预期了在受试者患有指定的疾病、障碍或病症时发生的作用，其降低疾病、障碍或病症的严重程度，或者延迟或减缓疾病、障碍或病症的进展(例如“治疗性治疗”)。

一般来讲，化合物的“有效量”是指足以引起期望的生物反应(例如治疗上尿路上皮癌或非肌层浸润性膀胱癌)的量。如本领域的普通技术人员将理解，本公开的化合物的有效量可以根据如下因素变化：期望的生物学终点、化合物的药代动力学、所治疗的疾病、给药模式，以及受试者的年龄、体重、健康状态和病症。

英菲格拉替尼

如式(I)所示的英菲格拉替尼是选择性和ATP竞争性泛成纤维细胞生长因子受体(FGFR)激酶抑制剂，也称为3-(2,6-二氯-3,5-二甲氧基苯基)-1-{6-[4-(4-乙基-1-哌嗪-1-基)苯氨基]-嘧啶基-4-基}-1-甲基脲。英菲格拉替尼选择性地抑制FGFR1、FGFR2、FGFR3和FGFR4的激酶活性。

化学合成英菲格拉替尼(包括本文所提供的实施例1)、英菲格拉替尼的几种结晶和无定形形式(包括本文所述的无水结晶单磷酸盐)以及制备所述形式的方法(包括本文所提供的实施例2)描述于美国专利9,067,896中，其全文以引用方式并入本文。

在一个方面，本文提供了给药英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以用于在有此需要的患者中治疗上尿路上皮癌的方法。在某些实施方案中，患者先前已经进行肾输尿管切除术、输尿管下段切除术、或膀胱切除术。在某些实施方案中，在患者经历肾输尿管切除术、输尿管下段切除术、或膀胱切除术之前给药英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。

在另一方面，本文提供了给药英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以用于在有此需要的患者中治疗尿路上皮癌(例如侵入性上尿路上皮癌或膀胱尿路上皮癌)的方法，其中患者先前已经进行肾输尿管切除术、输尿管下段切除术、或膀胱切除术。

在另一方面，本文提供了给药英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以用于治疗非肌层浸润性膀胱癌的方法。

在另一方面，本文提供了给药英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以用于治疗非肌层浸润性膀胱癌的方法，其中患者在先前给药另一种疗法后非肌层浸润性膀胱癌复发。

在某些实施方案中，本文提供了给药英菲格拉替尼的药学上可接受的盐以用于在有此需要的患者中治疗上尿路上皮癌的方法。在某些实施方案中，本文提供了给药英菲格拉替尼的药学上可接受的盐以用于在有此需要的患者中治疗尿路上皮癌(例如侵入性上尿路上皮癌或膀胱尿路上皮癌)的方法，其中患者先前已经进行肾输尿管切除术、输尿管下段切除术、或膀胱切除术。

在某些实施方案中，本文提供了给药英菲格拉替尼的药学上可接受的盐以用于治疗非肌层浸润性膀胱癌的方法。在某些实施方案中，本文提供了给药英菲格拉替尼的药学上可接受的盐以用于治疗非肌层浸润性膀胱癌的方法，其中患者在先前给药另一种疗法后非肌层浸润性膀胱癌复发。

在某些实施方案中，英菲格拉替尼的药学上可接受的盐是单磷酸盐。英菲格拉替尼的单磷酸盐也可称为BGJ398。

在一些实施方案中，英菲格拉替尼的单磷酸盐是无水结晶单磷酸盐。在一些实施方案中，无水结晶单磷酸盐具有X射线粉末衍射(XRPD)图谱，该图谱包含约15.0°或15.0°±0.2°处以2θ计的特征峰。在一些实施方案中，无水结晶单磷酸盐的X射线粉末衍射图谱还包含一个或多个以2θ计的特征峰，所述特征峰选自约13.7°±0.2°、约16.8°±0.2°、约21.3°±0.2°和约22.4°±0.2°处的峰。在一些实施方案中，无水结晶单磷酸盐的X射线粉末衍射图谱还包含一个或多个以2θ计的特征峰，所述特征峰选自约9.2°、约9.6°、约18.7°、约20.0°、约22.9°和约27.2°处的峰。在一些实施方案中，无水结晶单磷酸盐具有包括至少三个以2θ计的特征峰的XRPD图谱，所述特征峰选自约13.7°、约15°、约16.8°、约21.3°和约22.4°处的峰。在一些实施方案中，无水结晶单磷酸盐的X射线粉末衍射图谱可包含一个、两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个、十个或十一个以2θ计的特征峰，所述特征峰选自约9.2°、约9.6°、约13.7°、约15°、约16.8°、约18.7°、约20.0°、约21.3°以及约22.4°、约22.9°和约27.2°处的峰。

药物组合物

英菲格拉替尼的药物组合物以及制备所述药物组合物的方法(例如，包括本文所述的实施例3)描述于美国专利公开2017/0007602中，其全文以引用方式并入本文。

在一个方面，本文提供了给药药物组合物以用于在有此需要的患者中治疗上尿路上皮癌的方法，该药物组合物包含英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以及药学上可接受的赋形剂。在某些实施方案中，患者先前已经进行肾输尿管切除术、输尿管下段切除术、或膀胱切除术。在某些实施方案中，在患者经历肾输尿管切除术、输尿管下段切除术、或膀胱切除术之前给药英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。

在另一方面，本文提供了给药药物组合物以用于在有此需要的患者中治疗尿路上皮癌(例如侵入性上尿路上皮癌或膀胱尿路上皮癌)的方法，该药物组合物包含英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以及药学上可接受的赋形剂，其中患者先前已经进行肾输尿管切除术、输尿管下段切除术、或膀胱切除术。

在另一方面，本文提供了给药药物组合物以用于在有此需要的患者中治疗非肌层浸润性膀胱癌的方法，该药物组合物包含英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以及药学上可接受的赋形剂。

在另一方面，本文提供了给药药物组合物以用于在有此需要的患者中治疗非肌层浸润性膀胱癌的方法，该药物组合物包含英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以及药学上可接受的赋形剂，其中患者在先前给药另一种疗法后非肌层浸润性膀胱癌复发。

在某些实施方案中，本发明教导的药物组合物包含：

(a)约20重量％至约60重量％的呈其游离碱形式的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐；

(b)约0.5重量％至约5重量％的羟丙基甲基纤维素；

(c)约1重量％至约4重量％的交联聚乙烯吡咯烷酮；以及

(d)选自纤维素、乳糖、甘露糖醇、以及它们的组合的填充剂；

其中重量百分比基于药物组合物的总重量计。

在某些实施方案中，药物组合物包含约30重量％至45重量％的呈其游离碱形式的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。

在某些实施方案中，药物组合物包含约2％至约4％的羟丙基甲基纤维素。在某些实施方案中，药物组合物包含约2％至约4％的交联聚乙烯吡咯烷酮。

在某些实施方案中，药物组合物还包含以下中的一种或多种：

(e)基于药物组合物的总重量计约10重量％至约95重量％的一种或多种填充剂；

(f)基于药物组合物的总重量计约0.1重量％至约3重量％的一种或多种润滑剂；以及

(g)基于药物组合物的总重量计约0.1重量％至约2重量％的一种或多种助流剂。

在某些实施方案中，一种或多种填充剂选自微晶纤维素、乳糖和/或甘露糖醇。

在某些实施方案中，药物组合物中的一种或多种润滑剂以基于药物组合物的总重量计约0.2重量％至约2重量％的量存在。在一些实施方案中，一种或多种润滑剂是硬脂酸镁。

在某些实施方案中，一种或多种助流剂以基于药物组合物的总重量计约0.1重量％至约0.5重量％的量存在于药物制剂中。在一些实施方案中，一种或多种助流剂是胶态二氧化硅(胶态氧化硅)。

在某些实施方案中，药物组合物中的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐的量为约25mg至约150mg、约50mg至约150mg、约75mg至约150mg、约100mg至约150mg、约125mg至约150mg、约25mg至约125mg、约25mg至约100mg、约25mg至约75mg、约25mg至约50mg、约50mg至约125mg、约50mg至约100mg、约50mg至约75mg、约75mg至约125mg、约75mg至约100mg、或约100mg至约125mg。在一些实施方案中，药物组合物中的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐的量为约100mg至约150mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。

在某些实施方案中，药物组合物中的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐的量为约25mg、约50mg、约75mg、约100mg、约125mg、约150mg、约175mg、或约200mg。在一些实施方案中，药物组合物中的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐的量为约125mg。在一些实施方案中，药物组合物中的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐的量为约100mg。在一些实施方案中，药物组合物中的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐的量为约25mg。

在另一方面，本文提供了用于在有此需要的患者中治疗上尿路上皮癌的药物组合物，该药物组合物包含约125mg英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐；以及药学上可接受的赋形剂。

在另一方面，本文提供了用于在有此需要的患者中治疗尿路上皮癌的药物组合物，该药物组合物包含约125mg英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐；以及药学上可接受的赋形剂，其中患者先前已经进行肾输尿管切除术、输尿管下段切除术、或膀胱切除术。

在另一方面，本文提供了用于在有此需要的患者中治疗非肌层浸润性膀胱癌的药物组合物，该药物组合物包含约125mg英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐；以及药学上可接受的赋形剂。

在另一方面，本文提供了用于在有此需要的患者中治疗非肌层浸润性膀胱癌的药物组合物，该药物组合物包含约125mg英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐；以及药学上可接受的赋形剂，其中患者在先前给药另一种疗法后非肌层浸润性膀胱癌复发。

在某些实施方案中，药物组合物包含有效量的英菲格拉替尼的药学上可接受的盐。在一些实施方案中，英菲格拉替尼的药学上可接受的盐是单磷酸盐。在一些实施方案中，英菲格拉替尼的药学上可接受的盐是无水单磷酸盐。在一些实施方案中，英菲格拉替尼的药学上可接受的盐是多晶型的无水单磷酸盐，其特征在于15.0°±0.2°处的X射线粉末衍射(XRPD)峰(2θ)(并且可包括如本文所述的该形式的其他XRPD峰)。

本文所提供的药物组合物可以通过多种途径给药，包括但不限于口服(肠内)给药、肠胃外(通过注射)给药、直肠给药、透皮给药、皮内给药、鞘内给药、皮下(SC)给药、静脉内(IV)给药、肌内(IM)给药和鼻内给药。在一些实施方案中，将本文所公开的药物组合物口服给药。

本文所提供的药物组合物也可以长期地给药(“长期给药”)。长期给药是指化合物或其药物组合物在延长的时间段内，例如，在3个月、6个月、1年、2年、3年、5年等内给药，或者可以无限期地持续例如受试者的余生。在某些实施方案中，长期给药旨在提供化合物在血液中的恒定水平，例如，在延长时间段内的治疗窗之内。

本文所提供的药物组合物能够以单位剂型呈现以利于精确给予。术语“单位剂型”是指适合作为用于人类受试者和其他哺乳动物的单位剂量的物理离散单位，每个单位含有预定量的活性材料，其被计算成与合适的药物赋形剂结合起来产生期望的治疗效果。典型的单位剂型包括液体组合物的预填充的预测量安瓿或注射器，或者在固体组合物的情况下包括丸剂、片剂、胶囊等。

在某些实施方案中，将本文所提供的药物组合物以固体剂型给药于患者。在一些实施方案中，固体剂型是胶囊。

在某些实施方案中，本文所提供的化合物可以作为单独的活性剂给药，或者它们可以与其他活性剂组合给药。

虽然本文所提供的药物组合物的描述主要涉及适于向人类给药的药物组合物，但是技术人员将理解，此类组合物通常适于给药于所有种类的动物。对适于给药于人类的药物组合物改良以使得组合物适于给药于各种动物是公知的，并且普通的熟练兽医药理学家可以用普通的实验来设计和/或执行此类改良。药物组合物的配制和/或制造中的一般考虑可例如见于Remington:The Science and Practice of Pharmacy第21版,LippincottWilliams&Wilkins,2005。

使用和治疗方法

上尿路上皮癌的治疗

尿路上皮癌(也可称为移行细胞癌)是一类通常发生在泌尿系统中的癌症。这些癌症可发生在例如膀胱、肾盂、输尿管和/或尿道中。

在一个方面，本文提供了在有此需要的患者中治疗上尿路上皮癌的方法。

在某些实施方案中，本文提供了在有此需要的患者中治疗上尿路上皮癌的方法，该方法包括向患者给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。

在某些实施方案中，上尿路上皮癌是侵入性上尿路上皮癌。在一些实施方案中，侵入性上尿路上皮癌位于肾盏(renal calcyces)、肾盂和/或输尿管中。在某些实施方案中，上尿路上皮癌是非侵入性上尿路上皮癌。

在某些实施方案中，患者不符合用基于顺铂的化疗疗法治疗的条件。在某些实施方案中，患者先前已经进行基于顺铂的化疗，但具有残留癌。

在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐发生在患者经历肾输尿管切除术或输尿管下段切除术之前。在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐发生在肾输尿管切除术或输尿管下段切除术之后。在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐发生在肾输尿管切除术或输尿管下段切除术后120天内。

在某些实施方案中，与通过将有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐给药于有此需要的患者来治疗膀胱尿路上皮癌相比，将有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐给药于患者在治疗上尿路上皮癌中具有更大的功效。

在某些实施方案中，上尿路上皮癌经组织学或细胞学证实。

在某些实施方案中，上尿路上皮癌具有FGFR1突变、基因重排或基因融合。在某些实施方案中，上尿路上皮癌具有FGFR1基因融合。在一些实施方案中，FGFR1基因融合包含选自以下的FGFR1基因融合配偶体：BAG4、ERLIN2、NTM、FGFR1OP2、TACC3和TRP。

在某些实施方案中，上尿路上皮癌具有FGFR2突变、基因重排或基因融合。在某些实施方案中，上尿路上皮癌具有FGFR2基因融合。在一些实施方案中，FGFR2基因融合包含选自以下的FGFR2基因融合配偶体：10Q26.13、AFF1、AFF3、AFF4、AHCYL1、ALDH1L2、ARFIP1、BAG4、BAIAP2L1、BICC1、C10orf118、C10orf68、C7、CASC15、CASP7、CCDC147、CCDC6、CELF2、CIT、COL14A1、CREB5、CREM、DNAJC12、ERLIN2、HOOK1、INA、KCTD1、KIAA1217、KIAA1598、KIAA1967、KIFC3、MGEA5、NCALD、NOL4、NPM1、NRAP、OFD1、OPTN、PARK2、PAWR、PCMI、PDHX、PHLDB2、PPAPDC1A、PPHLN1、RASAL2、SFMBT2、SLC45A3、SLMAP、SLMAP2、SORBS1、STK26、STK3、TACC1、TACC2、TACC3、TBC1D1、TEL、TFEC、TRA2B、UBQLN1、VCL、WAC、ZMYM4和FGFROP2。

在某些实施方案中，上尿路上皮癌具有FGFR3突变、基因重排或基因融合。在某些实施方案中，上尿路上皮癌具有FGFR3基因融合。在一些实施方案中，FGFR3基因融合包含选自以下的FGFR3基因融合配偶体：BAIAP2L1、JAKMIP1、TACC3、TNIP2和WHSC1。

在某些实施方案中，患者经历分子预筛，例如使用第二代测序、循环肿瘤DNA分析或荧光原位杂交测定，以确定上尿路上皮癌是否具有FGFR1、FGFR2、或FGFR3突变、基因重排或基因融合。在一些实施方案中，分子预筛发生在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之前。在一些实施方案中，分子预筛发生在先前给药基于顺铂的化疗疗法之前。

在某些实施方案中，上尿路上皮癌具有FGFR1、FGFR2和/或FGFR3突变。在某些实施方案中，上尿路上皮癌具有FGFR1突变。在某些实施方案中，上尿路上皮癌具有FGFR2突变。在某些实施方案中，上尿路上皮癌具有FGFR3突变。

在某些实施方案中，FGFR1突变选自FGFR1 G818R、FGFR1 K656E、FGFR1 N546K、FGFR1 R445W、FGFR1 T141R，以及它们的组合。

在某些实施方案中，FGFR2突变选自FGFR2 D471N、FGFR2 A315T、FGFR2 D336N、FGFR2 P253R、FGFR2 S252W、FGFR2 Y375C、FGFR2 I547V、FGFR2 K659E、FGFR2 N549K、FGFR2N549S、FGFR2 N549Y、FGFR2 V395D、FGFR2 C382R、FGFR2 E565A、FGFR2 K641R、FGFR2K659M、FGFR2 L617V、FGFR2 N549H、FGFR2 N550K、FGFR2 V564F，以及它们的组合。

在某些实施方案中，FGFR3突变选自FGFR3 A391E、FGFR3 A393E、FGFR3 D785Y、FGFR3 E627K、FGFR3 G370C、FGFR3 G372C、FGFR3 G380R、FGFR3 K650E、FGFR3 K652E/Q、FGFR3 K650M、FGFR3 K652M/T、FGFR3 K650N、FGFR3 K650T、FGFR3 K652E、FGFR3 N540S、FGFR3 R248C、FGFR3 R399C、FGFR3 S131L、FGFR3 S249C、FGFR3 S249C、FGFR3 S371C、FGFR3V555M、FGFR3 V677I、FGFR3 Y373C、FGFR3 Y375C，以及它们的组合。在一些实施方案中，FGFR3突变选自FGFR3 R248C、FGFR3 S249C、FGFR3 G372C、FGFR3 A393E、FGFR3 Y375C、FGFR3 K652M/T、FGFR3 K652E/Q，以及它们的组合。

在另一方面，本文提供了用于在有此需要的患者中治疗上尿路上皮癌的方法，该方法包括向患者给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，其中有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐作为新辅助疗法给药。

在某些实施方案中，上尿路上皮癌具有FGFR3突变、基因重排或基因融合。

在另一方面，本文提供了用于治疗有此需要的患者的方法，该患者患有具有至少一种FGFR3突变、基因重排或基因融合的上尿路上皮癌，该方法包括：

(i)从患者获得样本；

(ii)分析样本中至少一种FGFR3突变、基因重排或基因融合的存在；并且

(iii)向患者给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，

其中有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐作为新辅助疗法给药。

在某些实施方案中，从患者获得的样本是使用选自以下的方法从患者获得的样本：选择性上尿路冲洗、细针穿刺、空芯针活检、刷拭活检、尿细胞游离DNA、血液细胞游离DNA以及其他细胞学样本(对于转移性部位如胸腔积液等的细胞学取样)。

在另一方面，本文提供了用于治疗有此需要的患者的方法，该患者患有具有至少一种FGFR3突变、基因重排或基因融合的上尿路上皮癌，该方法包括：

(i)从患者获得样本；其中样本使用选择性上尿路冲洗从患者获得；

(ii)分析样本中至少一种FGFR3突变、基因重排或基因融合的存在；并且

(iii)向患者给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，

其中有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐作为新辅助疗法给药。

在某些实施方案中，上尿路上皮癌是低级别上尿路上皮癌。在某些实施方案中，上尿路上皮癌是高级别上尿路上皮癌。

在某些实施方案中，患者不符合用基于顺铂的新辅助化疗疗法治疗的条件。

在某些实施方案中，该方法还包括在开始新辅助疗法的5周、6周、7周、8周、9周、或10周内，患者经历肾输尿管切除术或输尿管切除术。在一些实施方案中，该方法还包括在开始新辅助疗法的8周内，患者经历肾输尿管切除术或输尿管切除术。

在另一方面，本文提供了鉴定用有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐治疗上尿路上皮癌的患者的方法，该方法包括：

测试在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之后从患者获得的样本，以测量至少一种FGFR3生物标记的基因表达，

其中与基线基因表达测量相比，至少一种FGFR3生物标记的表达水平的改变的检测指示患者接受治疗的候选资格，并且

其中基线基因表达测量是在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之前患者中测量的基因表达。

在另一方面，本文提供了监测患者对通过有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐治疗上尿路上皮癌的反应的方法，该方法包括：

测试在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之后从患者获得的样本，以测量至少一种FGFR3生物标记的基因表达，

其中与基线基因表达测量相比，至少一种FGFR3生物标记的表达水平的改变的检测指示患者对治疗的反应，并且

其中基线基因表达测量是在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之前患者中测量的基因表达。

在某些实施方案中，从患者获得的样本是排泄的尿样。在某些实施方案中，从患者获得的样本是血样。在某些实施方案中，从患者获得样本是使用选择性上尿路冲洗从患者获得的样本。

在另一方面，本文提供了鉴定用有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐治疗上尿路上皮癌的患者的方法，该方法包括：

测试在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之后从患者获得的样本，以测量至少一种FGFR3生物标记的基因表达，

其中与基线基因表达测量相比，至少一种FGFR3生物标记的表达水平的改变的检测指示患者接受治疗的候选资格，并且

其中基线基因表达测量是在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之前患者中测量的基因表达。

在某些实施方案中，从患者获得的样本是使用选自以下的方法从患者获得的样本：选择性上尿路冲洗、细针穿刺、空芯针活检、刷拭活检、尿细胞游离DNA、血液细胞游离DNA以及其他细胞学样本(对于转移性部位如胸腔积液等的细胞学取样)。

在另一方面，本文提供了鉴定用有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐治疗上尿路上皮癌的患者的方法，该方法包括：

测试在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之后从患者获得的样本，以测量至少一种FGFR3生物标记的基因表达，其中样本使用选择性上尿路冲洗从患者获得，

其中与基线基因表达测量相比，至少一种FGFR3生物标记的表达水平的改变的检测指示患者接受治疗的候选资格，并且

其中基线基因表达测量是在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之前患者中测量的基因表达。

在另一方面，本文提供了监测患者对通过有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐治疗上尿路上皮癌的反应的方法，该方法包括：

测试在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之后从患者获得的样本，以测量至少一种FGFR3生物标记的基因表达，

其中与基线基因表达测量相比，至少一种FGFR3生物标记的表达水平的改变的检测指示患者对治疗的反应，并且

其中基线基因表达测量是在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之前患者中测量的基因表达。

在某些实施方案中，从患者获得的样本是使用选自以下的方法从患者获得的样本：选择性上尿路冲洗、细针穿刺、空芯针活检、刷拭活检、尿细胞游离DNA、血液细胞游离DNA以及其他细胞学样本(对于转移性部位如胸腔积液等的细胞学取样)。

在另一方面，本文提供了监测患者对通过有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐治疗上尿路上皮癌的反应的方法，该方法包括：

测试在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之后从患者获得的样本，以测量至少一种FGFR3生物标记的基因表达，其中样本使用选择性上尿路冲洗从患者获得，

其中与基线基因表达测量相比，至少一种FGFR3生物标记的表达水平的改变的检测指示患者对治疗的反应，并且

其中基线基因表达测量是在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之前患者中测量的基因表达。

在另一方面，本文提供了鉴定用有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐治疗上尿路上皮癌的患者的方法，该方法包括：

测试在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之后从患者获得的样本，以测量患者的细胞游离DNA(cfDNA)中至少一种FGFR3生物标记的等位基因频率，

其中与至少一种FGFR3生物标记的基线等位基因频率相比，患者的cfDNA中至少一种FGFR3生物标记的较低变异等位基因频率的检测指示患者对治疗的反应，并且

其中基线等位基因频率测量是在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之前患者的cfDNA中测量的等位基因频率。

在另一方面，本文提供了鉴定用有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐治疗上尿路上皮癌的患者的方法，该方法包括：

测试在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之后从患者获得的样本，以测量患者的细胞游离DNA(cfDNA)中至少一种FGFR3生物标记的基因表达，

其中与基线基因表达测量相比，患者的cfDNA中至少一种FGFR3生物标记的表达水平的改变的检测指示患者接受治疗的候选资格，并且

其中基线基因表达测量是在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之前患者的cfDNA中测量的基因表达。

一种监测患者对通过有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐治疗上尿路上皮癌的反应的方法，该方法包括：

测试在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之后从患者获得的样本，以测量患者的细胞游离DNA(cfDNA)中至少一种FGFR3生物标记的等位基因频率，

其中与至少一种FGFR3生物标记的基线等位基因频率相比，患者的cfDNA中至少一种FGFR3生物标记的较低变异等位基因频率的检测指示患者对治疗的反应，并且

其中基线等位基因频率测量是在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之前患者的cfDNA中测量的等位基因频率。

一种监测患者对通过有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐治疗上尿路上皮癌的反应的方法，该方法包括：

测试在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之后从患者获得的样本，以测量患者的细胞游离DNA(cfDNA)中至少一种FGFR3生物标记的基因表达，

其中与基线基因表达测量相比，患者的cfDNA中至少一种FGFR3生物标记的表达水平的改变的检测指示患者对治疗的反应，并且

其中基线基因表达测量是在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之前患者的cfDNA中测量的基因表达。

在某些实施方案中，从患者获得的样本是血样。

在某些实施方案中，至少一种FGFR3生物标记选自ERK、pERK、STAT、pSTAT、RAF、pRAF，或它们的组合。

在另一方面，本文提供了用于在有此需要的患者中治疗尿路上皮癌的方法。在某些实施方案中，患者先前已经进行肾输尿管切除术、输尿管下段切除术、或膀胱切除术。

在某些实施方案中，本文提供了在有此需要的患者中治疗尿路上皮癌的方法，该方法包括向患者给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，其中患者先前已经进行肾输尿管切除术、输尿管下段切除术、或膀胱切除术。

在某些实施方案中，本文提供了在有此需要的患者中治疗尿路上皮癌的方法，该方法包括向患者给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，其中在给药的120天内，患者先前已经进行肾输尿管切除术、输尿管下段切除术、或膀胱切除术。

在某些实施方案中，尿路上皮癌是侵入性上尿路上皮癌或膀胱尿路上皮癌。在某些实施方案中，尿路上皮癌是非侵入性上尿路上皮癌或膀胱尿路上皮癌。

在某些实施方案中，患者先前给药过基于顺铂的化疗，但具有残留癌。

在某些实施方案中，尿路上皮癌经组织学或细胞学证实。

在某些实施方案中，尿路上皮癌具有FGFR1突变、基因重排或融合。在某些实施方案中，尿路上皮癌具有FGFR1基因融合。在一些实施方案中，FGFR1基因融合包含选自以下的FGFR1基因融合配偶体：BAG4、ERLIN2、NTM、FGFR1OP2、TACC3和TRP。在一些实施方案中，FGFR1基因融合包含FGFR1基因融合配偶体，其中FGFR1基因融合配偶体是NTM。

在某些实施方案中，尿路上皮癌具有FGFR2突变、基因重排或融合。在某些实施方案中，尿路上皮癌具有FGFR2基因融合。在一些实施方案中，FGFR2基因融合包含选自以下的FGFR2基因融合配偶体：10Q26.13、AFF1、AFF3、AFF4、AHCYL1、ALDH1L2、ARFIP1、BAG4、BAIAP2L1、BICC1、C10orf118、C10orf68、C7、CASC15、CASP7、CCDC147、CCDC6、CELF2、CIT、COL14A1、CREB5、CREM、DNAJC12、ERLIN2、HOOK1、INA、KCTD1、KIAA1217、KIAA1598、KIAA1967、KIFC3、MGEA5、NCALD、NOL4、NPM1、NRAP、OFD1、OPTN、PARK2、PAWR、PCMI、PDHX、PHLDB2、PPAPDC1A、PPHLN1、RASAL2、SFMBT2、SLC45A3、SLMAP、SLMAP2、SORBS1、STK26、STK3、TACC1、TACC2、TACC3、TBC1D1、TEL、TFEC、TRA2B、UBQLN1、VCL、WAC、ZMYM4和FGFROP2。

在某些实施方案中，尿路上皮癌具有FGFR3突变、基因重排或融合。在某些实施方案中，尿路上皮癌具有FGFR3基因融合。在一些实施方案中，FGFR3基因融合包含选自以下的FGFR3基因融合配偶体：BAIAP2L1、JAKMIP1、TACC3、TNIP2和WHSC1。在一些实施方案中，FGFR3基因融合包含选自以下的FGFR3基因融合配偶体：BAIAP2L1、JAKMIP1、TACC3和TNIP2。

在某些实施方案中，患者经历分子预筛，例如使用第二代测序、循环肿瘤DNA分析或荧光原位杂交测定，以确定上尿路上皮癌是否具有FGFR1、FGFR2、或FGFR3突变、基因重排或基因融合。在一些实施方案中，分子预筛发生在给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之前。在一些实施方案中，分子预筛发生在先前给药基于顺铂的化疗疗法之前。

在某些实施方案中，尿路上皮癌具有FGFR1、FGFR2和/或FGFR3突变。在某些实施方案中，尿路上皮癌具有FGFR1突变。在某些实施方案中，尿路上皮癌具有FGFR2突变。在某些实施方案中，尿路上皮癌具有FGFR3突变。

在某些实施方案中，FGFR1突变选自FGFR1 G818R、FGFR1 K656E、FGFR1 N546K、FGFR1 R445W、FGFR1 T141R，以及它们的组合。

在某些实施方案中，FGFR2突变选自FGFR2 D471N、FGFR2 A315T、FGFR2 D336N、FGFR2 P253R、FGFR2 S252W、FGFR2 Y375C、FGFR2 I547V、FGFR2 K659E、FGFR2 N549K、FGFR2N549S、FGFR2 N549Y、FGFR2 V395D、FGFR2 C382R、FGFR2 E565A、FGFR2 K641R、FGFR2K659M、FGFR2 L617V、FGFR2 N549H、FGFR2 N550K、FGFR2 V564F，以及它们的组合。

在某些实施方案中，FGFR3突变选自FGFR3 A391E、FGFR3 A393E、FGFR3 D785Y、FGFR3 E627K、FGFR3 G370C、FGFR3 G372C、FGFR3 G380R、FGFR3 K650E、FGFR3 K652E/Q、FGFR3 K650M、FGFR3 K652M/T、FGFR3 K650N、FGFR3 K650T、FGFR3 K652E、FGFR3 N540S、FGFR3 R248C、FGFR3 R399C、FGFR3 S131L、FGFR3 S249C、FGFR3 S249C、FGFR3 S371C、FGFR3V555M、FGFR3 V677I、FGFR3 Y373C、FGFR3 Y375C，以及它们的组合。在一些实施方案中，FGFR3突变选自FGFR3 R248C、FGFR3 S249C、FGFR3G372C、FGFR3 A393E、FGFR3 Y375C、FGFR3K652M/T、FGFR3 K652E/Q，以及它们的组合。在某些实施方案中，本文所述的FGFR3突变对应于FGFR3 mRNA同种型NM_001163213.1的氨基酸编号。在某些实施方案中，对应于各种FGFR3同种型中的类似位置的氨基酸编号可以不同(例如，在同种型NM_00142.5中A393E变为A391E)，如本领域的技术人员已知的。

在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括每天一次口服给药约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括每天一次口服给药约100mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括每天一次口服给药约75mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括每天一次口服给药约50mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括每天一次口服给药约25mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。

在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括28天周期，其中连续3周内每天一次向患者口服给药约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，并且在1周内不给药英菲格拉替尼。在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括28天周期，其中连续3周内每天一次向患者口服给药约100mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，并且在1周内不给药英菲格拉替尼。在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括28天周期，其中连续3周内每天一次向患者口服给药约75mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，并且在1周内不给药英菲格拉替尼。在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括28天周期，其中连续3周内每天一次向患者口服给药约50mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，并且在1周内不给药英菲格拉替尼。在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括28天周期，其中连续3周内每天一次向患者口服给药约25mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，并且在1周内不给药英菲格拉替尼。

在某些实施方案中，将有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐给药于患者两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个、十个、十一个或十二个连续的28天周期。在一些实施方案中，将有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐给药于患者两个连续的28天周期。

在某些实施方案中，将约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以单位剂量提供。在某些实施方案中，将约100mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以单位剂量提供。在某些实施方案中，将约75mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以单位剂量提供。在某些实施方案中，将约50mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以单位剂量提供。在某些实施方案中，将约25mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以单位剂量提供。

在某些实施方案中，将约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以100mg单位剂量和25mg单位剂量提供。在一些实施方案中，将约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以75mg单位剂量和50mg单位剂量提供。

在某些实施方案中，将约100mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以75mg单位剂量和25mg单位剂量提供。在一些实施方案中，将约100mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以两个50mg单位剂量提供。

在某些实施方案中，将约75mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以50mg单位剂量和25mg单位剂量提供。

在某些实施方案中，将约50mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以两个25mg单位剂量提供。

在某些实施方案中，该方法包括将有效量的英菲格拉替尼的药学上可接受的盐给药于有此需要的患者。在一些实施方案中，英菲格拉替尼的药学上可接受的盐是单磷酸盐。在一些实施方案中，英菲格拉替尼的药学上可接受的盐是无水单磷酸盐。在一些实施方案中，英菲格拉替尼的药学上可接受的盐是多晶型的无水单磷酸盐，其特征在于15.0°±0.2°处的X射线粉末衍射(XRPD)峰(2θ)。在一些实施方案中，本文描述了英菲格拉替尼的无水结晶单磷酸盐的多晶型。

在另一方面，本文提供了在有此需要的患者中治疗上尿路上皮癌的方法，该方法包括将本文所公开的任一种药物组合物给药于患者。

在另一方面，本文提供了在有此需要的患者中治疗尿路上皮癌的方法，该方法包括将本文所公开的任一种药物组合物给药于患者，其中患者先前已经进行肾输尿管切除术、输尿管下段切除术、或膀胱切除术。

在另一方面，本文提供了在有此需要的患者中治疗尿路上皮癌的方法，该方法包括将本文所公开的任一种药物组合物给药于患者，其中患者先前已经进行肾输尿管切除术、输尿管下段切除术、或膀胱切除术。在一些实施方案中，在给药的120天内，患者先前已经进行肾输尿管切除术、输尿管下段切除术、或膀胱切除术。

在另一方面，本文提供了在有此需要的患者中治疗上尿路上皮癌的方法，该方法包括将本文所公开的任一种药物组合物给药于患者，其中药物组合物作为新辅助疗法给药。

在另一方面，本文提供了治疗有此需要的患者的方法，该患者患有具有至少一种FGFR3突变、基因重排或基因融合的上尿路上皮癌，该方法包括：

(i)从患者获得样本；

(ii)分析样本中至少一种FGFR3突变、基因重排或基因融合的存在；并且

(iii)将本文所公开的任一种药物组合物给药于患者，

其中有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐作为新辅助疗法给药。

在某些实施方案中，使用选自以下的方法从患者获得样本：选择性上尿路冲洗、细针穿刺、空芯针活检、刷拭活检、尿细胞游离DNA、血液细胞游离DNA以及其他细胞学样本(对于转移性部位如胸腔积液等的细胞学取样)。

在另一方面，本文提供了治疗有此需要的患者的方法，该患者患有具有至少一种FGFR3突变、基因重排或基因融合的上尿路上皮癌，该方法包括：

(i)从患者获得样本；其中样本使用选择性上尿路冲洗从患者获得；

(ii)分析样本中至少一种FGFR3突变、基因重排或基因融合的存在；并且

(iii)将本文所公开的任一种药物组合物给药于患者，

其中有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐作为新辅助疗法给药。

非肌层浸润性膀胱癌的治疗

在一个方面，本文提供了在有此需要的患者中治疗非肌层浸润性膀胱癌的方法。非肌层浸润性膀胱癌也可称为中度风险非肌层浸润性膀胱癌或高级别非侵入性乳头状尿路上皮癌。

在某些实施方案中，本文提供了在有此需要的患者中治疗非肌层浸润性膀胱癌的方法，该方法包括向患者给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。

在某些实施方案中，患者在先前给药另一种疗法后非肌层浸润性膀胱癌复发。

在某些实施方案中，本文提供了在有此需要的患者中治疗非肌层浸润性膀胱癌的方法，该方法包括给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，其中患者在先前给药另一种疗法后非肌层浸润性膀胱癌复发。

在某些实施方案中，先前给药的另一种疗法是用于非肌层浸润性膀胱癌的疗法。在一些实施方案中，先前给药另一种疗法是给药免疫治疗剂。在一些实施方案中，先前给药的免疫治疗剂是含卡介苗的方案。

在某些实施方案中，非肌层浸润性膀胱癌具有FGFR3突变、基因重排或基因融合。

在某些实施方案中，非肌层浸润性膀胱癌具有FGFR3突变。在一些实施方案中，FGFR3突变选自FGFR3 K650E、FGFR3 S249C、FGFR3 R248C、FGFR3 Y375C、FGFR3 G372C、FGFR3 S373C、FGFR3 A393E、FGFR3 A371A、FGFR3 I378C、FGFR3 L379L、FGFR3 G382R，以及它们的组合。

在某些实施方案中，非肌层浸润性膀胱癌具有FGFR3基因融合。在一些实施方案中，FGFR3基因融合包含FGFR3基因融合配偶体TACC3。

在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括每天一次给药约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括每天一次给药约100mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括每天一次给药约75mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括每天一次给药约50mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括每天一次给药约25mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。

在某些实施方案中，给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括28天周期，其中连续3周内每天一次向患者给药约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，并且在1周内不给药英菲格拉替尼。给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括28天周期，其中连续3周内每天一次向患者给药约100mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，并且在1周内不给药英菲格拉替尼。给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括28天周期，其中连续3周内每天一次向患者给药约75mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，并且在1周内不给药英菲格拉替尼。给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括28天周期，其中连续3周内每天一次向患者给药约50mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，并且在1周内不给药英菲格拉替尼。给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括28天周期，其中连续3周内每天一次向患者给药约25mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，并且在1周内不给药英菲格拉替尼。

在某些实施方案中，将约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以单位剂量提供。在某些实施方案中，将约100mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以单位剂量提供。在某些实施方案中，将约75mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以单位剂量提供。在某些实施方案中，将约50mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以单位剂量提供。在某些实施方案中，将约25mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以单位剂量提供。

在某些实施方案中，将约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以100mg单位剂量和25mg单位剂量提供。在一些实施方案中，将约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以75mg单位剂量和50mg单位剂量提供。

在某些实施方案中，将约100mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以75mg单位剂量和25mg单位剂量提供。在一些实施方案中，将约100mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以两个50mg单位剂量提供。

在某些实施方案中，将约75mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以50mg单位剂量和25mg单位剂量提供。

在某些实施方案中，将约50mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以两个25mg单位剂量提供。

在某些实施方案中，将约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐口服给药于患者。在某些实施方案中，将约100mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐口服给药于患者。在某些实施方案中，将约75mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐口服给药于患者。在某些实施方案中，将约50mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐口服给药于患者。在某些实施方案中，将约25mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐口服给药于患者。

在某些实施方案中，将有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐经由局部给药而给药于患者。在某些实施方案中，将有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐经膀胱内给药于患者。在某些实施方案中，将有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐经瘤内给药于患者。

在某些实施方案中，经由将控释可植入装置插入患者的膀胱中来递送有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。在某些实施方案中，经由将控释可植入装置插入患者的输尿管中来递送有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。在某些实施方案中，经由将控释可植入装置插入患者的肾盂中来递送有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。

在某些实施方案中，控释可植入装置是包含超弹性圆形截面耐纶丝的双腔硅胶管。包含超弹性圆形截面耐纶丝的双腔硅胶管的实例是Taris装置。

在某些实施方案中，控释可植入装置是凝胶。在一些实施方案中，凝胶是可生物降解凝胶。可生物降解凝胶的实例是水凝胶。

在某些实施方案中，该方法包括将有效量的英菲格拉替尼的药学上可接受的盐给药于有此需要的患者。在一些实施方案中，英菲格拉替尼的药学上可接受的盐是单磷酸盐。在一些实施方案中，英菲格拉替尼的药学上可接受的盐是无水单磷酸盐。在一些实施方案中，英菲格拉替尼的药学上可接受的盐是多晶型的无水单磷酸盐，其特征在于15.0°±0.2°处的X射线粉末衍射(XRPD)峰(2θ)。在一些实施方案中，本文描述了英菲格拉替尼的无水结晶单磷酸盐的多晶型。

在某些实施方案中，本文所提供的方法还包括将有效量的第二治疗剂给药于患者。在某些实施方案中，将有效量的第二治疗剂经由局部给药而给药于患者。在某些实施方案中，将有效量的第二治疗剂经膀胱内给药于患者。

在某些实施方案中，经由将控释可植入装置插入患者的膀胱中来递送有效量的第二治疗剂。在某些实施方案中，经由将控释可植入装置插入患者的输尿管中来递送有效量的第二治疗剂。在某些实施方案中，经由将控释可植入装置插入患者的肾盂中来递送有效量的第二治疗剂。

在某些实施方案中，控释可植入装置是包含超弹性圆形截面耐纶丝的双腔硅胶管。包含超弹性圆形截面耐纶丝的双腔硅胶管的实例是Taris装置。

在某些实施方案中，控释可植入装置是凝胶。在一些实施方案中，凝胶是可生物降解凝胶。可生物降解凝胶的实例是水凝胶。

在某些实施方案中，第二治疗剂是吉西他滨或其药学上可接受的盐。

在另一方面，本文提供了在有此需要的患者中治疗非肌层浸润性膀胱癌的方法，该方法包括将本文所公开的任一种药物组合物给药于患者。

在另一方面，本文提供了在有此需要的患者中治疗非肌层浸润性膀胱癌的方法，该方法包括将本文所公开的任一种药物组合物给药于患者，其中患者在先前给药另一种疗法后非肌层浸润性膀胱癌复发。

实施例

为了可以更充分地理解本文所述的本公开，阐述了以下实施例。本申请中描述的合成和生物实施例被提供成用于说明本文所提供的化合物、药物组合物和方法，并且不以任何方式解释为限制其范围。

实施例1：3-(2,6-二氯-3,5-二甲氧基-苯基)-1-{6-4-(4-乙基-哌嗪-1-基)-苯氨基-嘧啶-4-基}-1-甲基-脲(英菲格拉替尼)的合成

步骤A：N-4-(4-乙基-哌嗪-1-基)-苯基)-N'-甲基-嘧啶-4,6-二胺的合成

将4-(4-乙基哌嗪-1-基)-苯胺(1g，4.88mmol)、(6-氯-嘧啶-4-基)-甲基-胺(1.81g，12.68mmol，1.3当量)和4N HCl在二氧杂环己烷(15mL)中的混合物在密封管中加热至150℃达5小时。将反应混合物浓缩，用二氯甲烷(DCM)和饱和碳酸氢钠水溶液稀释。将水层分离并用DCM萃取。将有机相用盐水洗涤、干燥(硫酸钠)，过滤并浓缩。通过硅胶柱色谱法(DCM/MeOH，93:7)纯化残余物，然后在二乙醚中研磨，得到呈白色固体的标题化合物：ESI-MS:313.2[MH]⁺；t_R＝1.10分钟(梯度J)；TLC：R_f＝0.21(DCM/MeOH，93:7)。

步骤B：4-(4-乙基哌嗪-1-基)-苯胺的合成

在氢气气氛下，将1-乙基-4-(4-硝基-苯基)-哌嗪(6.2g，26.35mmol)和雷尼镍(2g)在MeOH(120mL)中的悬浮液在室温下搅拌7小时。将反应混合物过滤通过硅藻土垫并浓缩，得到5.3g呈紫色固体的标题化合物：ESI-MS:206.1[MH]⁺；TLC：R_f＝0.15(DCM/MeOH+1％NH₃ ^aq，9:1)。

步骤C：1-乙基-4-(4-硝基-苯基)-哌嗪的合成

将1-溴-4-硝基苯(6g，29.7mmol)和1-乙基哌嗪(7.6mL，59.4mmol，2当量)的混合物加热至80℃达15小时。在冷却至室温之后，将反应混合物用水和DCM/MeOH(9:1)稀释。将水层分离并用DCM/MeOH(9:1)萃取。将有机相用盐水洗涤、干燥(硫酸钠)，过滤并浓缩。通过硅胶柱色谱法(DCM/MeOH+1％NH₃ ^aq，9:1)纯化残余物，得到6.2g呈黄色固体的标题化合物：ESI-MS:236.0[MH]+；t_R＝2.35分钟(纯度：100％，梯度J)；TLC：R_f＝0.50(DCM/MeOH+1％NH₃ ^aq，9:1)。

步骤D：(6-氯-嘧啶-4-基)-甲基-胺的合成

该材料通过文献中公开的改良程序制备(J.Appl.Chem.1955,5,358)：向市售的4,6-二氯嘧啶(20g，131.6mmol，1.0当量)在异丙醇(60mL)中的悬浮液添加含33％甲胺的乙醇(40.1mL，328.9mmol，2.5当量)，添加速率使得内部温度不升高超过50℃。在添加完成之后，将反应混合物在室温下搅拌1小时。然后，添加水(50mL)并使所形成的悬浮液在冰浴中冷却至5℃。将沉淀的产物滤出，用冷异丙醇/水2:1(45mL)和水洗涤。将收集的材料在45℃下真空干燥过夜，得到呈无色粉末的标题化合物：t_R＝3.57分钟(纯度：>99％，梯度A)，ESI-MS:144.3/146.2[MH]⁺。

步骤E：3-(2,6-二氯-3,5-二甲氧基-苯基)-1-{6-4-(4-乙基-哌嗪-1-基)-苯氨 基-嘧啶-4-基}-1-甲基-脲的合成

通过将2,6-二氯-3,5-二甲氧基苯基-异氰酸酯(1.25当量)添加到N-4-(4-乙基-哌嗪-1-基)-苯基)-N'-甲基-嘧啶-4,6-二胺(2.39g，7.7mmol，1当量)的甲苯溶液中，并将反应混合物回流搅拌1.5小时来制备标题化合物。通过硅胶柱色谱法(DCM/MeOH+1％NH₃ ^aq，95:5)纯化粗产物，得到呈白色固体的标题化合物：ESI-MS:560.0/561.9[MH]⁺；t_R＝3.54分钟(纯度：100％，梯度J)；TLC：R_f＝0.28(DCM/MeOH+1％NH₃ ^aq，95:5)。分析：C₂₆H₃₁N₇O₃Cl₂，计算值C，55.72％；H，5.57％；N，17.49％；O，8.56％；C1，12.65％。实测值C，55.96％；H，5.84％；N，17.17％；O，8.46％；C1，12.57％。

实施例2：3-(2,6-二氯-3,5-二甲氧基-苯基)-1-{6-4-(4-乙基-哌嗪-1-基)-苯氨基-嘧啶-4-基}-1-甲基-脲的单磷酸盐形式A(BGJ398)的合成

向圆底烧瓶中添加3-(2,6-二氯-3,5-二甲氧基苯基)-1-(6-4-(4-乙基哌嗪-1-基)苯氨基-嘧啶-4-基)-1-甲基-脲(134g，240mmol)和异丙醇(IPA)(2000mL)。将悬浮液搅拌并加热至50℃，并向其中分批添加磷酸(73.5g，750mmol)的水(2000mL)溶液。将混合物在60℃下搅拌30分钟并通过聚丙烯垫过滤。将垫用温热的IPA/水(1:1，200mL)洗涤，并且合并滤液。向该澄清溶液中添加IPA(6000mL)，并将混合物回流搅拌20分钟，缓慢冷却至室温(25℃)，并搅拌24小时。将白色盐产物通过过滤收集，用IPA(2×500mL)洗涤并在60℃的烘箱中减压干燥两天，以提供无水结晶单磷酸盐(110g)。收率70％。纯度>98％，通过HPLC确定。分析：C₂₆H₃₄N₇O₇Cl₂P，计算值C，47.42％；H，5.20％；N，14.89％；O，17.01％；C1，10.77％；P，4.70％。实测值C，47.40％；H，5.11％；N，14.71％；O，17.18％；Cl，10.73％；P，4.87％。

实施例3：25mg、100mg和125mg剂量英菲格拉替尼药物制剂的制造过程

在以下实施例中，概述了所有示例性剂量强度的制造过程。

在以下实施例3.1、3.2和3.3的配方中提供了各成分的相应量。

药物共混物的制造

将纤维素MK-GR、乳糖(研磨的)、英菲格拉替尼、纤维素HPM 603和交联聚乙烯吡咯烷酮(PVP-XL)依序添加到立式湿法高剪切制粒机(例如TK Fiedler(底部驱动，65L)中，其中制粒机填充体积为约45-50％，然后，将五种组分在60-270rpm，优选地150rpm的叶轮设定；以及600-3000rpm，优选地1500rpm的切碎机设定下混合约5分钟，以获得干燥共混物。

在1.5巴的喷雾设定压力下(叶轮设定为60-270rpm，优选地150rpm；并且切碎机设定为600-3000rpm，优选地1500rpm)，将纯化水作为制粒液体以约385g/分钟的速率在7分钟内添加(添加多至约2.7kg的水)。将所得的制粒混合物捏合约3分钟(叶轮设定为60-270rpm，优选地150rpm；并且切碎机设定为600-3000rpm，优选地1500rpm)。使用Comil以90-600rpm将捏合的制粒团块通过3.0mm筛过筛。该工序是可选的并且可省略，但优选地执行该工序。

将颗粒在流化床干燥器(例如Glatt GPCG 15/30或等同物)中干燥，其中入口空气温度为55-65℃，优选地60℃，产物温度为约30-40℃，并且入口空气体积为300-1200m³/h，以达到≤2.2％的干燥终点。

在Comil中，将干燥的颗粒通过800-1000μm过筛。所得的干燥和过筛的颗粒也在本文中称为内相。

在Comil中约50-150rpm下，将外相赋形剂PVP XL和Aerosil 200通过900-1000μm过筛，然后在合适的容器(例如，箱式混合器turbula或等同物)中通过以4-25rpm，优选地17rpm混合约5分钟(33-66％粉末填充)与内相合并。

通过在扩散混合器(转鼓)或箱式混合器(例如，Bohle PM400，Turbula，或等同物)中以约17rpm共混约3分钟，通过添加500rpm过筛的硬脂酸镁作为额外的外相赋形剂来润滑固体，以获得准备用于胶囊填充的最终共混物。

胶囊的制造

然后，通过具有给予板原理或给予管的包囊机(例如，

&Karg GKF 330、Bosch GKF 1500、Zanasi 12E、Zanasi 40E)，将最终共混物填充到0、1或3规格的硬明胶胶囊(HGC)中，其中包囊速度为10,000多至100,000个胶囊/小时且无预压缩。控制胶囊的重量并对胶囊除尘。

实施例3.1

表1：25mg剂量强度的配方

^a盐因子为1.175。如果含量≤99.5％，则必须调整药物物质的量。通过调整乳糖含量进行相应的补偿。

^b在干燥过程中除去制粒期间使用的水。

实施例3.2

表2：100mg剂量强度的配方

^a盐因子为1.175。如果含量≤99.5％，则必须调整药物物质的量。通过调整乳糖含量进行相应的补偿。

^b在干燥过程中除去制粒期间使用的水。

实施例3.3

表3：125mg剂量强度的配方

^a盐因子为1.175。如果含量≤99.5％，则必须调整药物物质的量。通过调整乳糖含量进行相应的补偿。

^b在干燥过程中除去制粒期间使用的水。

实施例4：口服英菲格拉替尼(BGJ398)用于治疗患有FGFR3基因组改变的侵入性尿路上皮癌的患者的研究

研究目标

主要目标：比较在肾输尿管切除术、输尿管下段切除术、或膀胱切除术后，用英菲格拉替尼与安慰剂治疗的患有FGFR3基因组改变的侵入性尿路上皮癌的受试者的中央审查的无病生存期(DFS)。

次要目标：比较用英菲格拉替尼与安慰剂治疗的受试者中的DFS，包括管腔内低风险复发。

比较用英菲格拉替尼与安慰剂治疗的受试者的无转移生存期(MFS)。

比较用英菲格拉替尼与安慰剂治疗的受试者中的总生存期(OS)。

为了比较用英菲格拉替尼与安慰剂治疗的受试者中的研究者审查的DFS。

表征英菲格拉替尼在作为术后辅助单一疗法给药时的安全性和耐受性。

比较用英菲格拉替尼与安慰剂治疗的受试者中的生活质量(QOL)。

评价英菲格拉替尼的PK。

评价细胞游离DNA(cfDNA)和/或RNA的抗性机制。

研究终点

中央审查的DFS，从随机化日期起到局部/区域或对侧侵入性或转移性复发、或任何原因所致的死亡(以较早发生者为准)。

研究者审查的DFS，包括管腔内低风险复发，从随机化日期起到任何复发或任何原因所致的死亡(以较早发生者为准)。

研究者审查的MFS，定义为从随机化起到任何转移性复发或任何原因所致的死亡(以较早发生者为准)的时间。

OS，定义为从随机化起到死亡的时间。

不良事件(AE)和严重不良事件(SAE)的类型、频率和严重程度，实验室异常以及其他安全性发现。

研究者审查的DFS，从随机化日期起到局部/区域或对侧侵入性或转移性复发、或任何原因所致的死亡(以较早发生者为准)。

QOL，如由欧洲五维健康量表问卷(EuroQOL five dimensions questionnaire，EQ-5D)和欧洲肿瘤研究与治疗组织(European Organization for Research andTreatment of Cancer，EORTC)和生活质量问卷(QLQ)C30所测量。

药代动力学(PK)参数(谷和最大血浆浓度)。

通过cfDNA和/或RNA测序检测的FGFR3改变作为疾病复发的生物标记。

研究设计

这是一项3期多中心双盲随机安慰剂对照研究，以评价英菲格拉替尼在大约218名成人受试者中的功效，所述成人受试者在肾输尿管切除术、输尿管下段切除术、或膀胱切除术后120天内患有FGFR3基因组改变的侵入性尿路上皮癌并且不符合基于顺铂的(新)辅助化疗的条件，或者在新辅助疗法后具有残留疾病。使用适应性设计希望区域方法，基于中期分析结果，样本量可以进一步增加到多至共328名受试者。患有侵入性尿路上皮癌的受试者包括患有侵入性上尿路上皮癌(UTUC)和膀胱尿路上皮癌(UCB)的受试者。

受试者以1:1随机化，以接受在每28天周期的前3周(21天)每天一次给药的口服英菲格拉替尼或安慰剂，最多52周，或者直到局部/区域或对侧侵入性或转移性复发、不可接受的毒性、撤回知情同意、或死亡。通过放射成像以及通过尿细胞学检查来评价受试者的肿瘤复发。对于患有UTUC的受试者(即，有膀胱的受试者)，执行膀胱镜检查。放射线照相术、尿细胞学检查和膀胱镜检查持续，直到通过设盲独立中央审查(BICR)的转移性复发，或者通过研究者评估的转移性复发(如果通过BICR的局部/区域或对侧侵入性复发已经发生)。此后，随访受试者的生存状态，并且在达到最终DFS事件目标(即研究结束)后使用抗癌疗法1年。

在大约35例中央审查的DFS事件发生后进行中期分析。基于对DFS的中期分析结果，如果使用希望区域方法认为有必要增加样本量，则样本量/DFS事件目标最大增加50％(328/105)。如果增加样本量并调整事件目标，则在达到经调整的事件目标时，相应地按时间调整后续分析。样本量适应方法的细节在适应计划中预先指定。

根据淋巴结转移(是与否)、既往新辅助化疗(是与否)、阶段(pT2与>pT2)以及疾病(UTUC与UCB)，对受试者进行分层。

受试者数量：最初计划大约218名受试者参与研究。使用适应性设计希望区域方法，基于中期分析结果，样本量可以增加到多至共328名受试者。不超过15％的群体入组UCB，并且不超过25％的UTUC受试者具有pT2UTUC(限制将基于分层)。

诊断和入选标准

符合条件的受试者满足所有以下标准：

1.任一性别的年龄≥18岁。

2.已经签署知情同意。

3.具有在肾输尿管切除术、输尿管下段切除术、或膀胱切除术后120天内经组织学或细胞学证实的具有敏感FGFR3改变的侵入性尿路上皮癌。

关于FGFR3改变的样本和文件：如果FGFR3基因在外显子7(R248C、S249C)、外显子10(G370C、A391E、Y373C)、或外显子15(K650M/T、K650E/Q)中突变，则证实FGFR3突变；如果鉴定基因融合或易位，则证实FGFR3基因融合或易位；FGFR3突变的氨基酸编号是指功能性FGFR3同种型1(NP_000133.1)，即用于通过FoundationOne CDx测试来报告FGFR3中的遗传改变的NCBI Refseq ID；在中国以外的研究中心，研究资格需要由FoundationOne CDx测试(通过Foundation Medicine USA)FGFR3改变的中心实验室测定的书面文件。对于中国的研究中心，需要通过与中心测试等同的测试进行证实；对于需要分子预筛以证实FGFR3改变的存在以满足入选标准的患者，必须将具有病理学报告的存档肿瘤样本送至FoundationMedicine USA进行FoundationOne CDx测试；对于中国的研究地点，研究资格要求签约中心实验室的FGFR3改变的书面文件。

如果是新辅助化疗后的状态，则手术切除时的病理分期必须是AJCC分期≥ypT2和/或yN+。既往的新辅助疗法定义为至少3个周期的基于顺铂的新辅助化疗，计划的顺铂剂量为70mg/m²/周期。接受低于这一水平或基于非顺铂的新辅助治疗的患者将被认为没有接受新辅助化疗。

如果不是新辅助化疗后的状态，则基于Galsky等人(2011)不符合接受基于顺铂的辅助化疗的条件：肌酐清除率≤60mL/分钟，和/或不良事件通用术语标准(commonTerminology Criteria for Adverse Events，CTCAE 5.0版本或更高版本)≥2级听力损失或CTCAE≥2级神经病变。

如果基于Galsky等人(2011)不符合顺铂的条件，则还必须满足以下标准：上尿路疾病应当为AJCC分期≥pT2 pN0-2 M0(淋巴结切除术后或无淋巴结切除术[pNx])；UBC应为AJCC分期≥pT3或pN+。

在随机化前28天内，必须具有中央审查的阴性术后CT(根据实体瘤反应评价标准(Response Evaluation Criteria in Solid Tumors)[RECIST]v1.1，定义为短轴<1.0cm且无生长和无远端转移的淋巴结)或阴性活检，以证实基线不存在疾病。

4.如果具有与既往手术或新辅助化疗相关联的不良事件(AE)，则在随机化前，它们已稳定或者消退至≤2级。

5.具有≤2的东部肿瘤协作组(Eastern Cooperative Oncology Group，ECOG)行为状态。

6.如果女性具有生育潜能(WOCBP)，则必须在研究药物的第一剂量的7天内具有阴性妊娠测试。WOCBP和性伴侣为WOCBP的男性必须同意在接受研究药物时及其研究药物最后剂量后3个月内使用工具避孕和第二种形式的避孕(Clinical Trials FacilitationGroup 2014)。性活跃的男性在服用研究药物时以及在研究药物最后剂量后3个月内必须在性交期间使用避孕套，并且在该时段期间不应育有后代。研究受试者必须同意在研究期间及其研究药物最后剂量后3个月内避免捐献精子和卵子。

7.愿意并能够遵守研究访视和研究程序。

排除标准

为了符合研究条件，受试者不得满足以下任何标准：

1.肾输尿管切除术、输尿管下段切除术、或膀胱切除术后存在切缘阳性。

2.先前30天内接受过卡介苗(BCG)或其他NMIBC膀胱内疗法。

3.目前正在接受或计划在参与本研究期间接受药剂即已知CYP3A4的强诱导剂或抑制剂以及增加血清磷和/或钙浓度的药物的治疗。不允许受试者接受酶诱导抗癫痫药，包括卡马西平、苯妥英、苯巴比妥和扑米酮。如果满足入选标准#3，则允许既往新辅助化疗或免疫疗法。在研究药物的第一剂量之前，既往化疗必须已经完成一段时间，该时间大于用于该治疗的周期长度。在研究药物的第一剂量之前，接受生物疗法的受试者应当已经完成疗法≥5个半衰期的时段。

4.在该研究的同时，计划接受旨在治疗侵入性尿路上皮癌的其他全身疗法。

5.先前或当前正在接受促分裂原活化蛋白激酶(MEK)或选择性FGFR抑制剂的治疗。

6.在过去3年内具有原发性恶性肿瘤史，除了(1)侵入性UBC或UTUC(即，研究中的疾病)，(2)非侵入性尿路上皮癌，(3)任何适当治疗的原位癌或非黑色素瘤皮肤癌，(4)预期在参与研究期间不需要对复发治疗的任何其他治愈性治疗的恶性肿瘤，或者(5)监测中的未治疗的癌症，基于临床医生评估/声明，所述癌症可能不会影响受试者的存活状态≥3年。对于不满足以上标准的任何其他癌症，医学监查员需要书面批准。

7.具有通过眼科检查证实的角膜或视网膜障碍/角膜病的当前证据，包括但不限于大泡性/带状角膜病变、炎症或溃疡、角膜结膜炎。研究者评估的无症状眼科病症对参与研究构成最小风险的受试者可入组本研究。

8.具有广泛组织钙化的病史和/或当前证据，包括但不限于软组织、肾、肠、脉管系统、心肌和肺，除了钙化淋巴结、轻微肺实质钙化、小肾囊肿或结石钙化，以及无症状冠状动脉钙化以外。

9.具有可能显著改变口服英菲格拉替尼吸收的受损胃肠(GI)功能或GI疾病(例如，活动性溃疡性疾病、不受控制的恶心、呕吐、腹泻、吸收不良综合征、小肠切除术)。

10.具有钙/磷酸盐体内平衡的内分泌改变的当前证据(例如，甲状旁腺疾病、甲状旁腺切除术史、肿瘤消除、肿瘤样钙质沉着症)，除非得到良好控制。

11.在研究药物的第一剂量前7天内已经进食葡萄柚、葡萄柚汁、葡萄柚杂交体、石榴、杨桃、柚子、或酸橙、或含有这些果实的果汁的产品。

12.在研究药物的第一剂量前7天内已经使用已知延长QT间期和/或与尖端扭转型室速(Torsades de Pointes，TdP)的风险相关联的药物。

13.在研究药物的第一剂量前90天内已经使用胺碘酮。

14.骨髓功能不足：嗜中性粒细胞绝对计数(ANC)<1,000/mm³(1.0×10⁹/L)；血小板<75,000/mm³(<75×10⁹/L)；血红蛋白<9.0g/dL。

15.肝肾功能不足：总胆红素>1.5×测试实验室的正常值上限(ULN)(对于有记录的吉尔伯特综合征患者，排除直接胆红素>1.5×ULN，并且入组需要医学监查员批准)；天冬氨酸转氨酶/血清谷草转氨酶(AST/SGOT)和丙氨酸转氨酶/血清谷丙转氨酶(ALT/SGPT)>2.5×测试实验室的ULN；计算的(使用Cockcroft-Gault[C-G]式(Cockcroft和Gault,1976)或测量的肌酐清除率<30mL/分钟。

16.具有淀粉酶或脂肪酶>2.0×ULN。

17.具有异常的钙-磷酸盐体内平衡：高于测试实验室ULN的无机磷；高于测试实验室ULN的总血清钙(可校正)。

18.具有临床上显著的心脏病，包括以下中的任一种：需要治疗的充血性心力衰竭(纽约心脏协会(New York Heart Association)[NYHA]≥2级)，左心室射血分数(LVEF)<50％或局部正常值下限，如由多门控采集(MUGA)扫描或超声心动图(ECHO)所测定，或不受控的高血压(参见欧洲心脏病学会和欧洲高血压学会(European Society of Cardiologyand European Society of Hypertension)指南[Williams等人,2018])；不良事件通用术语标准(Common Terminology Criteria for Adverse Events，5.0版本或更高版本)≥2级室性心律失常、心房纤颤、心动过缓、或传导异常；不稳定型心绞痛或急性心肌梗死≤研究药物的第一剂量前3个月；QTcF>470毫秒(男性和女性)。注释：如果第一心电图(ECG)中的QTcF>470毫秒，则应执行总共3次ECG，间隔至少5分钟。如果QTcF的这些3个连续结果的平均值≤470毫秒，则受试者就这一点而言满足资格；先天性长QT综合征病史。

19.最近(研究药物的第一剂量前≤3个月)具有短暂性脑缺血发作或中风。

20.如果女性怀孕或哺乳(授乳)，其中怀孕定义为受孕后直至妊娠终止的女性状态，由阳性人绒毛膜促性腺激素尿或血液实验室测试证实。

21.对研究药物的任何组分具有已知的过敏/超敏反应。

22.按照研究者的观点会干扰研究参与的任何其他并发疾病或病症。

随机化到英菲格拉替尼组的受试者接受硬明胶胶囊，以使用给药3周(1-21天)/停药1周(22-28天)给予方案来口服给药英菲格拉替尼125mg QD(以一粒100mg胶囊和一粒25mg胶囊给药)。

随机化到安慰剂的受试者接受外观上与活性研究药物(英菲格拉替尼)匹配的安慰剂，其以硬明胶胶囊提供用于口服使用并按给药3周(1-21天)/停药1周(22-28天)的给予方案每天给药一次。

治疗持续时间

受试者接受多至52周的治疗。

评价标准

功效：评估由在以下执行的计算机断层扫描(CT)/磁共振成像(MRI)扫描组成：治疗开始前28天内基线处，每3个月多至24个月，在C13D28或治疗结束(EOT)时，此后每年或直到研究者评估的转移性复发(如果通过BICR的局部/区域或对侧侵入性复发已经发生)。在以下执行膀胱镜检查和细胞学检查(对于有膀胱的UTUC受试者)：在筛选时；3、6、9和12个月时；在C13D28或EOT时；然后每6个月多至24个月，然后每年或直到通过BICR的转移性复发或者研究者评估的转移性复发(如果通过BICR的局部/区域或对侧侵入性复发已经发生)。因复发以外的原因在治疗当年结束前停止治疗的受试者应当按照评估计划表继续完成功效评估(表3：评估计划表：PK采样)。

QOL：使用EORTC QLQ-C30和EQ-5D，在筛选时以及通过停止研究药物后的前6个月随访的每次访视时评价受试者QOL。

PK：在第1周期第1天给予前和给予后4小时(±30分钟)；第1周期第21天给予前和给予后4小时(±30分钟)；以及第2周期和所有后续周期第21天给予前和给予后4小时(±30分钟)收集血样。测量英菲格拉替尼及其活性代谢物的血浆浓度。另外计算C_谷和C_最大的药代动力学(PK)参数。

安全性：在筛选时和整个治疗时段的每次访视时(参见表2)以及多至治疗后30天收集评估：不良事件(AE和严重AE[SAE])、临床实验室测试(血液和尿液)、身体检查、生命体征和心电图(ECG)、LVEF(ECHO或MUGA)、ECOG、眼科评估。为BICR发送视网膜光学相干断层(OCT)扫描图像。在治疗后30天评估AE和SAE。

统计方法

样本量：在本研究中，最初以双盲方式随机分配大约218名受试者进行治疗。使用适应性设计希望区域方法，基于中期分析结果，样本量可以增加到多至共328名受试者。本研究将以成组序贯设计开始，在大约35例中央审查的DFS事件(初始事件目标的50％)中进行1次中期分析。Haybittle-Peto边界将用于功效边界，其中固定单侧α为0.00005，用于中央审查的DFS的中期分析，其余α(单侧α＝0.025)用于主要中央审查的DFS分析。虽然为中期中央审查的DFS分析规定了功效边界，但如果跨越功效边界，试验将不会在中期分析时停止。近似O’Brien-Fleming边界的Lan DeMets消耗函数将用于非约束无效边界。假设安慰剂组的前2年内46％的受试者疾病复发并且第三年及以后的年复发率为5％，则初始成组序贯设计所需的样本量为大约218名受试者，以达到70例中央审查的DFS事件。这是假设3年统一入组、1年随访、10％年退出率和0.5的风险比(HR)。基于控制单侧0.025的第一类误差的对数秩检验，假设HR为0.5，样本量将提供大约80％的能力来检测DFS差异。

在中期分析中，研究采用了适应性设计希望区域方法，以根据需要调整样本量和事件目标。样本量适应方法的细节将在适应计划中预先指定。如果在中期分析中不需要样本量适应，则研究预计从第一名受试者随机化起4年达到计划的中央审查DFS事件数量(70)。如果基于中期结果和希望区域方法认为有必要增加样本量，则样本量/事件目标将最大增加50％(328/105)。如果增加样本量并调整事件目标，则将在达到经调整的事件目标时相应地按时间调整后续分析，并且在达到经调整的事件目标时测试中央审查的DFS的边界将基于来自初始成组序贯设计的原始边界。

功效分析：主要功效分析在意向治疗(ITT)群体中进行，其包括随机化的所有受试者。受试者根据他们被随机化的治疗组来分析。

对于主要功效终点，在中期分析中的样本量增加的情况下，将使用基于分层对数秩检验的CHW统计(使用除疾病类型[UTUC或UBC]之外的随机化分层因素)来控制第一类误差。如果未在中期调整样本量，则将使用常规分层对数秩检验来推断中央审查的DFS。基于分层Cox比例风险模型，将为估计的HR提供重复置信区间。

对于次要功效终点DFS(包括管腔内低风险复发)、MFS和OS，将遵循固定序列测试程序，以将族群第一类误差控制在单侧0.025的水平。

如果中央审查的DFS的测试是显著的，则将测试包括管腔内低风险复发的DFS；如果DFS和包括管腔内低风险复发的DFS均是显著的，则随后进行MFS测试。如果DFS、包括管腔内低风险复发的DFS以及MFS都是显著的，则将最终测试OS。

中期分析：当总共发生35例DFS事件时，执行DFS的一个形式化中期分析。

在中期分析时，如果跨越中心审查的DFS的功效边界，则不停止功效的研究。

如果跨越用于测试中央审查的DFS的无效边界，则可由于中期DFS分析无效而停止研究。无效停止边界是非约束性的，以允许额外的考虑。

如果使用希望区域方法基于DFS的中期结果认为有必要增加样本量，则样本量/事件目标最大增加50％(328/105)。样本量适应方法的细节在单独的适应计划中预先指定。

实施例5：口服英菲格拉替尼(BGJ398)在FGFR3基因组改变的非肌层浸润性膀胱癌患者中的标记病变研究

研究设计

在膀胱内卡介苗(BCG)的既往治疗后临床高级别非侵入性乳头状尿路上皮癌复发的患者符合研究条件。

经由测试治疗前或存档肿瘤组织来确定患者的FGFR3改变状态。

使用给药3周、停药1周的给予方案(1个周期)，将BGJ398以125mg PO的剂量口服给药于符合条件的患者。在治疗2个周期之后(在7周)，经由膀胱镜检查和尿细胞学检查确定反应。对具有完全反应的患者给予继续疗法额外11个月的选项。

结果

四名患者入组试验。确定两名患者具有FGFR3 S249C突变，一名患者具有FGFR3K650E突变，并且一名患者具有FGFR3-TACC3融合。

三名患者在7周评价时间点显示出完全反应。另一名患者在4周停止治疗后表现出较小的出现坏死的病变。

临床上显著的毒性包括眼障碍、皮肤和指甲障碍以及肝功能测试(LFT)升高。两名患者因毒性而需要降低剂量。两名患者在7周评价之前停止治疗，一名由于皮肤毒性，另一名由于肝毒性。另外两名患者在7周完全反应后继续治疗，但在3和4个治疗周期后(11和16周后)分别因视力/皮肤毒性和指甲感染/粘膜炎而最终停止治疗。

表4：研究结果

实施例6：新辅助英菲格拉替尼(BGJ398)在上尿路上皮癌中的耐受性和活性的研究

研究目标

主要目标：评价英菲格拉替尼在铂不符合的低级别和高级别上尿路上皮癌(UTUC)患者中的耐受性。

次要目标包括：评估英菲格拉替尼在肾小球滤过率(GFR)为30-44的那些中的耐受性；评价在不具和不具有FGFR3改变的UTUC中2个周期后英菲格拉替尼的客观反应率(完全反应(CR)和部分反应(PR))；肿瘤组织FGFR3改变(存在/不存在、改变类型和克隆状态)与不良事件(AE)如高磷血症的反应和发生/严重程度的相关性；12个月内的上尿路、膀胱以及局部/远处复发；在治疗前和两次治疗后评价肾功能。

目标包括：使用以下项来评价瘤内异质性、基因表达谱和肿瘤微环境变化：治疗前后的单细胞RNA测序(scRNA-seq)和大量细胞计数法(CyTOF)以鉴定反应和/或抗性的潜在机制，以及与AE的发生/严重程度的相关性；尿/上尿路冲洗液FGFR3改变作为用于检测和反应的潜在生物标记；细胞游离DNA(cfDNA)，以用于检测FGFR3改变并作为反应的预测因子。

主要终点：由于过度毒性，不能完成2个周期治疗的患者比例。

次要终点包括基于病理学评价，在2个周期的英菲格拉替尼后实现目标反应(CR或PR)的患者百分比。由内窥镜评价执行肿瘤标测，并用于与病理结果进行比较，从而确定反应。

其他可能的终点包括：

(1)肿瘤研究：使用10x Genomics平台在新鲜冷冻肿瘤上执行scRNA-seq。对肿瘤细胞异质性、FGFR3基因表达和肿瘤微环境进行分析。所有生物信息学数据分析在基因组医学系计算生物学实验室(Computational Biology Laboratory,Department of GenomicMedicine)执行；组织微阵列(TMA)由FFPE组织(活检和最终病理标本)构建，并使用CyTOF进行免疫研究的探询。对于不具有残留肿瘤的完全反应患者，使用最大治疗前肿瘤床(基于肿瘤图谱)进行免疫研究；组织优先化：活检和病理肿瘤组织的使用按以下顺序和来源优先化：1.突变分析(FFPE)，2.RNAseq(新鲜/冷冻)，3.TMA(FFPE)。

(2)尿生物标记：优选收集排泄的尿液，但当排泄的尿液不可用或不足时，用选择性上尿路冲洗液取代。在3个时间点(治疗前、英菲格拉替尼治疗完成后/术前，以及术后5周+/-2周)收集尿液和血液。尿液处理遵循建立的标准操作程序。将样品储存于-80℃，然后送至Fox Chase Cancer Center供进一步分析(Dr.Phil Abbosh laboratory，我们与其具有现有的合作和MTA)。从尿样中分离DNA，然后检查质量(通常得到几微克高分子量DNA)。在开始疗法之前还从外周血单核细胞(PBMC)中分离DNA以用作种系参考样本。使用HaloPlexHS平台，使来自种系和治疗前/后/术后时间点的DNA经受第二代测序，其中目标深度为1000X，覆盖54个良好表征的癌基因。这些基因在尿路上皮癌患者中富集(包括FGFR3)。HaloPlexHS使用预扩增单分子标签来过滤PCR期间出现的taq误差，因此大大增强了检测罕见等位基因的能力。在初步实验中，该方法被验证是高度灵敏和准确的，从而检测尿液中肿瘤组织突变的>60％并且在尿液中鉴定组织中未见的其他突变。针对FGFR3热点或其他错义变体表征尿液，并且在纵向样本中跟踪它们的变异等位基因频率。治疗前尿液中点突变的存在与作为先验预测生物标记的病理反应相关。单独地，治疗之后所有治疗前突变的清除与英菲格拉替尼相关，并且在手术后与作为事后生物标记的病理反应相关。针对两种分析使用Fishers精确检验来确定相关性。

(3)细胞游离DNA(cfDNA)：分析cfDNA与反应的关联，在入组时和治疗后/术前收集血液(每个时间点30mL)。处理并储存这些样本直到肿瘤研究完成且结果可用。在鉴定为具有肿瘤FGFR3改变的所有患者中，随机选择5名以测定其基线cfDNA；如果发现3名或更多名具有可检测的FGFR3改变，则将运行多至5名患者基线样本。对发现在其cfDNA中具有可检测基线FGFR3改变的那些在其第二时间点进行测定。然后使这些结果与疾病负担、病理结果、疾病等级、阶段、客观反应和免疫相关因素相关联。对于cfDNA，利用70-基因液体活检小组(70-Gene Liquid Biopsy Panel，LBP-70)的可用性。经验证的基于第二代测序(NGS)的小组在病理学和实验室医学的MD Anderson部门(MD Anderson Department of Pathologyand Laboratory Medicine)运行。将外周血收集到Streck管中，该Streck管被设计成减少运输期间循环cfDNA与来自血细胞的细胞DNA的混合。基于NGS的小组被设计成检测包括在该小组中的所有70个基因中的单核苷酸变异分析(SNV)和小插入缺失(Indels)。此外，还可以检测涉及所选基因的扩增(拷贝数变异；CNV)和融合(易位)。特别地关于该研究，小组能够检测FGFR3的突变/插入缺失、扩增和融合。全面的液体活检测试利用分子条码技术和复杂的误差检测算法，以允许灵敏和准确地检测低水平突变。

研究设计

使如下患者服用英菲格拉替尼2个周期(1个周期＝给药3周、停药1周)，然后经历肾输尿管切除术或输尿管切除术：经历计划的肾输尿管切除术或输尿管切除术的手术切除，具有足够的活检组织用于生物标记研究，并且不是新辅助化疗的(低度疾病、或高度铂不符合的)候选者。持续监测患者的安全性和耐受性。由专门的研究GU病理学家在手术切除时收获冗余肿瘤和正常组织以供生物标记研究。评价治疗前活检的FGFR3改变，并且评价手术标本组织对治疗的客观反应(完全反应和部分反应，与使用肿瘤标测的治疗前内窥镜评估比较)；然后使FGFR3改变的存在与客观反应相关联。

剂量：所有患者口服接受125mg英菲格拉替尼，每天一次(QD)，每28天治疗周期使用给药3周、停药1周的方案，其将被重复总共2个周期。在8-9周期间执行手术。

受试者数量：最初计划20名受试者参与研究。

入选标准

符合条件的受试者满足所有以下标准：

1.受试者患有经历肾输尿管切除术或输尿管切除术的低级别UTUC、或高级别UTUC，并且由于以下任一项而不符合顺铂新辅助化疗的条件：医学共病(例如，心功能不全、听力损失、GFR<50)，或者基于临床列线图的非器官局限性疾病的风险预测<49％(PetrosF.等人,Urol.Oncol.,2018)。

2.在入组前，如由研究病理学家所确定，受试者具有足够的活检组织可用于突变分析。

3.受试者具有0-2的东部肿瘤协作组(Eastern Cooperative Oncology Group，ECOG)行为状态。

4.受试者已从先前全身抗癌疗法的AE恢复至基线或1级，脱发除外。

排除标准

符合条件的受试者不满足以下任何标准：

1.受试者在3年内具有另一种原发性恶性肿瘤史，但以下情况除外：a.适当治疗的子宫颈原位癌、或非黑素瘤皮肤癌，b.由治疗医师认为在研究时段期间进展风险较低的任何其他未经治疗的癌症(例如，低或中度风险的前列腺癌)，c.预期在研究过程期间不复发或不需要治疗的经治愈性治疗的恶性肿瘤。

2.受试者患有不受控制的膀胱癌。膀胱癌患者在开始治疗前必须通过经尿道切除术清除膀胱疾病，并且不必需要全身疗法或膀胱切除术。

3.受试者具有通过眼科学检查证实的角膜或视网膜障碍/角膜病的当前证据，包括但不限于大泡性/带状角膜病变、角膜擦伤、炎症/溃疡和角膜结膜炎。研究者评估的无症状眼科学病症对参与研究构成最小风险的受试者可入组本研究。

4.受试者具有广泛组织钙化的病史和/或当前证据，包括但不限于软组织、肾、肠、心肌和肺，除了钙化淋巴结、轻微肺实质钙化和无症状冠状动脉钙化以外。

5.受试者具有可能显著改变口服英菲格拉替尼吸收的胃肠(GI)功能损害或GI疾病(例如，溃疡性疾病、不受控制的恶心、呕吐、腹泻、吸收不良综合征、小肠切除术)。

6.受试者具有钙/磷酸盐体内平衡的内分泌改变的当前证据，例如，甲状旁腺疾病、甲状旁腺切除术史、肿瘤消除、肿瘤样钙质沉着症等。

7.受试者目前正在接受药剂即已知CYP3A4的强诱导剂或抑制剂以及增加血清磷和/或钙浓度的药物的治疗。不允许受试者接受酶诱导抗癫痫药，包括卡马西平、苯妥英、苯巴比妥和扑米酮。

8.受试者在研究药物的第一剂量前7天内已经进食葡萄柚、葡萄柚汁、葡萄柚杂交体、石榴、杨桃、柚子、酸橙、或含有这些果实的果汁的产品。

9.受试者在研究药物的第一剂量前7天内已经使用已知延长QT间期和/或与尖端扭转型室速(Torsades de Pointes，TdP)的风险相关联的药物。

10.受试者在研究药物的第一剂量前90天内已经使用胺碘酮。

11.受试者目前正在使用治疗剂量的华法林钠或任何其他香豆素衍生物抗凝剂，或者使用主要由CYP3A4代谢的直接凝血酶抑制剂(例如阿加曲班)或因子Xa抑制剂(例如利伐沙班)。不被CYP3A4代谢的肝素和/或低分子量肝素或直接凝血酶抑制剂和/或因子Xa抑制剂(例如达比加群、依度沙班)是允许的。

12.受试者骨髓功能不足：

(a)嗜中性粒细胞绝对计数(ANC)<1,000/mm³(1.0×10⁹/L)

(b)血小板<100,000/mm³(75×10⁹/L)

(c)血红蛋白<9.0g/dL

13.受试者肝肾功能不足：

(a)总胆红素>1.5×正常值上限(ULN)(除非有记录的吉尔伯特综合征，然后仅得到研究医学监查员批准)

(b)天冬氨酸转氨酶/血清谷草转氨酶(AST/SGOT)和丙氨酸转氨酶/血清谷丙转氨酶(ALT/SGPT)>2.5×ULN(在胆管癌肝转移存在下AST和ALT>5×ULN)

(c)计算或测量的肌酐清除率<30mL/分钟

14.受试者的淀粉酶或脂肪酶>2.0×ULN。

15.受试者具有异常的钙-磷酸盐体内平衡：

(a)无机磷超出局部正常限值

(b)总校正血清钙超出局部正常限值

16.受试者患有临床上显著的心脏病，包括以下中的任一种：

(a)需要治疗的充血性心力衰竭(纽约心脏协会(New York Heart Association)≥2级)，左心室射血分数(LVEF)<50％或局部正常值下限，如由超声心动图(ECHO)所测定，或不受控的高血压(参见欧洲心脏病学会和欧洲高血压学会(European Society ofCardiology and European Society of Hypertension)指南)

(b)不良事件通用术语标准(Common Terminology Criteria for AdverseEvents，CTCAE)v5.0≥2级室性心律失常、心房纤颤、心动过缓、或传导异常

(c)不稳定型心绞痛或急性心肌梗死≤研究药物的第一剂量前3个月

(d)QTcF>470毫秒(男性和女性)。注释：如果第一心电图(ECG)中的QTcF>470毫秒，则应执行总共3次ECG，间隔至少5分钟。如果QTcF的这些3个连续结果的平均值≤470毫秒，则受试者就这一点而言满足资格。

(e)已知的先天性长QT综合征病史。

17.受试者最近(≤3个月)具有短暂性脑缺血发作或中风。

18.CTCAE(v5.0)≥2级听力损失

19.CTCAE(v5.0)≥2级神经病变

20.如果女性怀孕或哺乳(授乳)，其中怀孕定义为受孕后直至妊娠终止的女性状态，由阳性人绒毛膜促性腺激素尿或血液实验室测试证实。

对于每28天的治疗周期，使用“给药3周、停药1周”计划表，向受试者给药口服英菲格拉替尼125mg QD(以一粒100mg胶囊和一粒25mg胶囊给药)。两个28天周期，每个周期使用“给药3周、停药1周”。

安全性：安全性评价基于AE报告、实验室参数、生命体征、身体检查、12导联ECG和眼科评估。耐受性通过导致研究药物停止的AE的发生率来评估。

功效：将通过比较治疗前内窥镜评价时的肿瘤标测与手术标本中的病理结果来评价肿瘤反应。

主要目标：主要目标是评价英菲格拉替尼作为新辅助疗法的安全性和耐受性。多至20名患者入组本研究。本研究估计了由于过度毒性而不能完成治疗(在完成2个治疗周期前停止)的患者比例连同90％的精确置信区间。使用等级的频率和百分比及其与治疗的关系，将毒性制成表。假设30％停止是由于过度毒性，90％置信区间将为(13.1％，46.9％)，样本量为20。

分别汇总了全组患者和eGFR≥50和eGFR[即30-49]的患者的毒性数据。安全性分析包括接受至少一个剂量的英菲格拉替尼的所有患者。

安全性监测：本研究使用该监测规则来监测由于过度毒性而未完成治疗的发病率。如果Prob(Ptox>0.3|数据)>0.85，即提前停止试验。其中Ptox代表不能完成治疗的患者比例。相应的停止界限是如果在任何时间观察到(由于过度毒性而未完成治疗的n名患者/被治疗的N名患者)>＝3/5、4/(6-8)、5/(9-10)、6/(11-13)、7/(14-16)和8/(17-19)，则提前停止试验。该停止规则分别应用于eGFR≥45和eGFR 30-44的每个群组，使得仅对受影响的GFR群组停止入组。

次要目标(功效)：次要功效终点是2个周期的英菲格拉替尼治疗后的客观反应。对于整个患者群组以及具有和不具有FGFR3改变的患者，估计客观反应率连同90％置信区间。使用Fisher精确检验来探索两个患者群组之间的反应差异。

次要目标(其他次要分析和探索性分析)：描述性统计用于汇总作为连续变量的量化，并且频率和百分比连同95％CI用于汇总分类变量。Wilcoxon秩和检验法以及Fisher精确检验用于探索客观反应与次要结果(例如cfDNA、标记的表达、FGFR3改变类型)之间的关联。相同的方法也用于探索AE如高磷血症与反应的关联。使用比例和90％置信区间作为二元结果汇总12个月时的复发率，并且使用卡普兰-梅尔(Kaplan-Meier)方法作为事件时间变量进行估计。对所有患者以及分层为具有或不具有FGFR3改变的患者执行所有分析。

样本量：20名参与者。

安全性分析：计划的统计分析的全部细节包括在统计分析计划中。

实施例7：与膀胱尿路上皮癌相比英菲格拉替尼(BGJ398)在上尿路上皮癌中的研究以及与全面基因组分析/细胞游离DNA数据的关联

目标

鉴于UTUC和UCB的不同生物学特征，确定英菲格拉替尼活性在上尿路上皮癌(UTUC)和膀胱尿路上皮癌(UCB)中是否存在差异。

通过表征肿瘤组织和细胞游离DNA(cfDNA)，确定UTUC和UCB在晚期或转移性尿路上皮癌患者中的基因组图谱是否不同。

研究设计

符合条件的患者具有活化FGFR3突变/融合的转移性尿路上皮癌以及既往的基于铂的化疗，除非禁忌。

患者通过口服给药接受125mg的英菲格拉替尼，每天一次，使用3周给药/1周停药的给予方案。

将总反应率(ORR：CR+PR)和疾病控制率(DCR；CR+PR+SD)在UCB和UTUC患者中进行表征。

采用从治疗前获得的FFPE肿瘤组织和血浆(cfDNA)分离的DNA来执行UCB和UTUC患者的基因组分析：

·肿瘤组织的全面基因组分析(Foundation Medicine；Cambridge,Ma)使用患者，以入组FGFR3基因改变的患者。

·通过第二代测序使用600-基因小组(Novartis Labs)来评价从治疗前的血液获得的细胞游离DNA(cfDNA)。

参与研究的患者的基线特征显示于表5中。

表5：患者的基线特征

与UCB相比，在UTUC中观察到FGFR3胞外Ig样结构域中突变R248C和S249C的不同频率(分别为图1A和1B)。在UCB而非UTUC中观察到Ig样结构域之外的突变。

比较既往抗癌疗法在UTUC或UCB的患者中的功效的汇总显示于表6中。

表6：既往抗癌疗法的功效汇总

表7中显示了比较英菲格拉替尼在UTUC或UCB患者中的功效的研究汇总。图2和图3分别是用英菲格拉替尼治疗的患者的无进展生存率和总生存率的叠加。

表7：英菲格拉替尼的功效汇总

^a在未评估疾病进展/死亡的情况下具有证实的客观反应的患者作为“删失”包括在内

患者0507_00103(具有完全反应的UTUC患者参见表7)：患有III期UTUC的62岁女性(基线时肺和纵隔靶病变和非靶肺结节)。在2013年5月29日，她开始125mg英菲格拉替尼，3周给药/1周停药，并保持治疗(50mg，3周给药/1周停药)。CR在2016年8月19日开始并继续。

研究期间观察到的治疗突发不良事件(TEAE)的汇总显示于表8中。

表8：TEAE的汇总

n(％)	UTUC(n＝8)	UCB(n＝59)	总计(n＝67)
				任何TEAE	8(100.0)	58(98.3)	66(98.5)
等级3/4	5(62.5)	41(69.5)	46(68.7)
				严重	1(12.5)	23(39.0)	24(35.8)
治疗相关的	8(100.0)	56(94.9)	64(95.5)
				严重治疗相关的	1(12.5)	3(5.1)	4(6.0)
导致治疗停止	2(25.0)	8(13.6)	10(14.9)
				导致剂量中断/剂量调整	8(100.0)	45(76.3)	53(79.1)

观察到在大多数基因中，cfDNA中的变异等位基因频率(VAF)在UCB中比在UTUC中更高(图4)。在UCB中观察到的cfDNA中更高的VAF表明，与UTUC相比，UCB患者可能具有更高的疾病负担或不同的转移机制。

与UTUC患者相比，UCB患者的肿瘤组织和cfDNA中FGFR3基因组改变的中值VAF更高(图5)。

在筛选时，30/38(79％)名患者的肿瘤组织和cfDNA的FGFR3改变是一致的。与UTUC患者相比，在UCB患者的cfDNA中观察到具有增加的突变负荷的更复杂的基因组图谱(图6)。具有高突变负荷(▲)的UTUC患者可能由于MSH2中的移码突变而缺乏错配修复。

引用参照

本申请涉及各种授权的专利、公开的专利申请、期刊文章和其他出版物，所有这些以引用方式并入本文。如果任何引入的参考文献与本说明书之间存在冲突，则以本说明书为准。此外，落入现有技术内的本公开的任何特定实施方案可以从任何一个或多个权利要求中明确地排除。因为这样的实施方案被认为是本领域的普通技术人员已知的，它们可以被排除，即使本文没有明确地阐述该排除。无论是否涉及到现有技术的存在，出于任何原因，本公开的任何特定实施方案可从任何权利要求中排除。

等同物

本发明能够以其他具体形式实施，而不脱离其精神或基本特征。因此，前述实施方案在所有方面都应被认为是例示性的而不是对本文所述的本发明的限制。因此，本发明的范围由所附权利要求而非前述具体实施方式来指示，并且落入权利要求书的等同物的含义和范围内的所有改变都旨在涵盖于其中。

Claims (65)

1.一种在有此需要的患者中治疗上尿路上皮癌的方法，其包括向所述患者给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述上尿路上皮癌是侵入性上尿路上皮癌。

3.根据权利要求1所述的方法，其中所述上尿路上皮癌是非侵入性上尿路上皮癌。

4.根据权利要求1-3中任一项所述的方法，其中所述患者不符合用基于顺铂的化疗疗法治疗的条件。

5.根据权利要求1-3中任一项所述的方法，其中所述患者先前给药过基于顺铂的化疗，但具有残留癌。

6.根据权利要求1-5中任一项所述的方法，其中给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐发生在肾输尿管切除术或输尿管下段切除术之后。

7.根据权利要求1-6中任一项所述的方法，其中与通过将有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐给药于有此需要的患者来治疗膀胱尿路上皮癌相比，将有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐给药于所述患者在治疗上尿路上皮癌中具有更大的功效。

8.一种在有此需要的患者中治疗尿路上皮癌的方法，其包括向所述患者给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，其中所述患者先前已经进行肾输尿管切除术、输尿管下段切除术、或膀胱切除术。

9.根据权利要求8所述的方法，其中所述尿路上皮癌是侵入性上尿路上皮癌或膀胱尿路上皮癌。

10.根据权利要求8所述的方法，其中所述尿路上皮癌是非侵入性上尿路上皮癌或膀胱尿路上皮癌。

11.根据权利要求8或9所述的方法，其中所述患者不符合用基于顺铂的化疗疗法治疗的条件。

12.根据权利要求8或9所述的方法，其中所述患者先前给药过基于顺铂的化疗，但具有残留癌。

13.根据权利要求1-12中任一项所述的方法，其中给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括每天一次口服给药约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。

14.根据权利要求1-13中任一项所述的方法，其中给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括28天周期，其中连续3周内每天一次向所述患者口服给药约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，并且在1周内不给药英菲格拉替尼。

15.根据权利要求13或14所述的方法，其中所述约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以100mg单位剂量和25mg单位剂量提供。

16.根据权利要求13或14所述的方法，其中所述约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以单位剂量提供。

17.根据权利要求1-12中任一项所述的方法，其中所述有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐经由局部给药而给药于所述患者。

18.根据权利要求1-16中任一项所述的方法，其中所述尿路上皮癌经组织学或细胞学证实。

19.根据权利要求1-18中任一项所述的方法，其中所述尿路上皮癌具有FGFR3突变、基因重排或基因融合。

20.根据权利要求1-15中任一项所述的方法，其中所述尿路上皮癌具有FGFR3突变。

21.根据权利要求20所述的方法，其中所述FGFR3突变选自FGFR3 R248C、FGFR3 S249C、FGFR3 G372C、FGFR3 A393E、FGFR3 Y375C、FGFR3 K652M/T、FGFR3 K652E/Q，以及它们的组合。

22.一种用于在有此需要的患者中治疗非肌层浸润性膀胱癌的方法，其包括：

给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，其中所述患者在先前给药另一种疗法后非肌层浸润性膀胱癌复发。

23.根据权利要求22所述的方法，其中所述先前给药的另一种疗法是用于非肌层浸润性膀胱癌的疗法。

24.根据权利要求22或23所述的方法，其中所述先前给药另一种疗法是给药免疫治疗剂。

25.根据权利要求24所述的方法，其中所述先前给药的免疫治疗剂是含卡介苗的方案。

26.根据权利要求22-25中任一项所述的方法，其中所述非肌层浸润性膀胱癌具有FGFR3突变、基因重排或基因融合。

27.根据权利要求22-26中任一项所述的方法，其中所述非肌层浸润性膀胱癌具有FGFR3突变。

28.根据权利要求27所述的方法，其中所述FGFR3突变选自FGFR3 K650E、FGFR3 S249C、FGFR3 R248C、FGFR3 Y375C、FGFR3 G372C、FGFR3 S373C、FGFR3 A393E、FGFR3 A371A、FGFR3I378C、FGFR3 L379L、FGFR3 G382R，以及它们的组合。

29.根据权利要求22-26中任一项所述的方法，其中所述非肌层浸润性膀胱癌具有FGFR3基因融合。

30.根据权利要求29所述的方法，其中所述FGFR3基因融合包含FGFR3基因融合配偶体TACC3。

31.根据权利要求22-30中任一项所述的方法，其中给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括每天一次给药约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。

32.根据权利要求22-31中任一项所述的方法，其中给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括28天周期，其中连续3周内每天一次向所述患者给药约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，并且在1周内不给药英菲格拉替尼。

33.根据权利要求31或32所述的方法，其中所述约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以100mg单位剂量和25mg单位剂量提供。

34.根据权利要求31或32所述的方法，其中所述约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以单位剂量提供。

35.根据权利要求31-34中任一项所述的方法，其中所述约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐口服给药于所述患者。

36.根据权利要求22-30中任一项所述的方法，其中所述有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐经由局部给药而给药于所述患者。

37.根据权利要求36所述的方法，其中所述有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐经膀胱内给药于所述患者。

38.根据权利要求36或37所述的方法，其中经由将控释可植入装置插入患者的膀胱中来递送所述有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。

39.根据权利要求36或37所述的方法，其中经由将控释可植入装置插入患者的输尿管中来递送所述有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。

40.根据权利要求36或37所述的方法，其中经由将控释可植入装置插入患者的肾盂中来递送所述有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。

41.根据权利要求38-40中任一项所述的方法，其中所述控释可植入装置是包含超弹性圆形截面耐纶丝的双腔硅胶管。

42.根据权利要求38-40中任一项所述的方法，其中所述控释可植入装置是凝胶。

43.根据权利要求22-42中任一项所述的方法，所述方法还包括将有效量的第二治疗剂给药于所述患者。

44.根据权利要求43所述的方法，其中所述有效量的第二治疗剂经由局部给药而给药于所述患者。

45.根据权利要求43或44所述的方法，其中所述有效量的第二治疗剂经膀胱内给药于所述患者。

46.根据权利要求43-45中任一项所述的方法，其中所述第二治疗剂是吉西他滨或其药学上可接受的盐。

47.一种在有此需要的患者中治疗上尿路上皮癌的方法，其包括向所述患者给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，其中所述有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐作为新辅助疗法给药。

48.根据权利要求47所述的方法，其中所述上尿路上皮癌具有FGFR3突变、基因重排或基因融合。

49.一种治疗有此需要的患者的方法，所述患者患有具有至少一种FGFR3突变、基因重排或基因融合的上尿路上皮癌，所述方法包括：

(i)从所述患者获得样本；

(ii)分析所述样本中所述至少一种FGFR3突变、基因重排或基因融合的存在；并且

(iii)向所述患者给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，

其中所述有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐作为新辅助疗法给药。

50.根据权利要求48或49所述的方法，其中所述尿路上皮癌具有FGFR3突变。

51.根据权利要求50所述的方法，其中所述FGFR3突变选自FGFR3 R248C、FGFR3 S249C、FGFR3 G372C、FGFR3 A393E、FGFR3 Y375C、FGFR3 K652M/T、FGFR3 K652E/Q，以及它们的组合。

52.根据权利要求47-51中任一项所述的方法，其中所述上尿路上皮癌是低级别上尿路上皮癌。

53.根据权利要求47-51所述的方法，其中所述上尿路上皮癌是高级别上尿路上皮癌。

54.根据权利要求47-53中任一项所述的方法，其中所述患者不符合用基于顺铂的新辅助化疗疗法治疗的条件。

55.根据权利要求47-54中任一项所述的方法，其中给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括每天一次口服给药约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐。

56.根据权利要求47-55中任一项所述的方法，其中给药有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐包括28天周期，其中连续3周内每天一次向所述患者口服给药约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐，并且在1周内不给药英菲格拉替尼。

57.根据权利要求56所述的方法，其中将所述有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐给药于所述患者两个连续的28天周期。

58.根据权利要求55-57中任一项所述的方法，其中所述约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以100mg单位剂量和25mg单位剂量提供。

59.根据权利要求55-57中任一项所述的方法，其中所述约125mg的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐以单位剂量提供。

60.根据权利要求49-54中任一项所述的方法，其中所述有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐经由局部给药而给药于所述患者。

61.根据权利要求47-59中任一项所述的方法，其还包括在开始所述新辅助疗法的8周内，所述患者经历肾输尿管切除术或输尿管切除术。

62.一种鉴定用有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐治疗上尿路上皮癌的患者的方法，其包括：

测试在给药所述有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之后从所述患者获得的样本，以测量至少一种FGFR3生物标记的基因表达，

其中与基线基因表达测量相比，所述至少一种FGFR3生物标记的表达水平的改变的检测指示所述患者接受治疗的候选资格，并且

其中所述基线基因表达测量是在给药所述有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之前所述患者中测量的基因表达。

63.一种监测患者对通过有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐治疗上尿路上皮癌的反应的方法，其包括：

测试在给药所述有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之后从所述患者获得的样本，以测量至少一种FGFR3生物标记的基因表达，

其中与基线基因表达测量相比，所述至少一种FGFR3生物标记的表达水平的改变的检测指示所述患者对所述治疗的反应，并且

其中所述基线基因表达测量是在给药所述有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之前所述患者中测量的基因表达。

64.一种鉴定用有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐治疗上尿路上皮癌的患者的方法，其包括：

测试在给药所述有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之后从所述患者获得的样本，以测量所述患者的细胞游离DNA(cfDNA)中至少一种FGFR3生物标记的等位基因频率，

其中与所述至少一种FGFR3生物标记的基线等位基因频率相比，所述患者的cfDNA中所述至少一种FGFR3生物标记的较低变异等位基因频率的检测指示所述患者接受治疗的候选资格，并且

其中所述基线等位基因频率测量是在给药所述有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之前所述患者的cfDNA中测量的等位基因频率。

65.一种监测患者对通过有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐治疗上尿路上皮癌的反应的方法，其包括：

测试在给药所述有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之后从所述患者获得的样本，以测量所述患者的细胞游离DNA(cfDNA)中至少一种FGFR3生物标记的等位基因频率，

其中与所述至少一种FGFR3生物标记的基线等位基因频率相比，所述患者的cfDNA中所述至少一种FGFR3生物标记的较低变异等位基因频率的检测指示所述患者对所述治疗的反应，并且

其中所述基线等位基因频率测量是在给药所述有效量的英菲格拉替尼或其药学上可接受的盐之前所述患者的cfDNA中测量的等位基因频率。

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