CN114126619B - 用于合成肽模拟物的化合物 - Google Patents
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- ORQXBVXKBGUSBA-QMMMGPOBSA-N β-cyclohexyl-alanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1CCCCC1 ORQXBVXKBGUSBA-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
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Abstract
描述了邻苯并三唑和邻咪唑合成子的合成。还描述了合成子在氮杂肽和其他肽模拟物的合成中的用途、由所述合成子合成的氮杂肽和其他肽模拟物以及氮杂肽和其他肽模拟物的用途。
Description
本申请要求2019年5月9日提交的美国临时申请号62/845,617的权益,所述临时申请通过引用并入本文。
技术领域
本发明涉及用于合成氮杂肽和其他氮杂氨基酸缀合物的化合物;氮杂肽和其他氮杂氨基酸缀合物的合成;和氮杂肽和其他氮杂氨基酸缀合物在药物开发、疾病诊断、预防、抑制和治疗中的用途。
背景技术
肽的体外和体内稳定性以及体外和体内半衰期受限于例如其水解和酶促降解速率。
氮杂肽为肽的类似物。氮杂肽含有取代的氨基脲,而非亲本肽的一个或多个氨基酸残基。换言之,亲本肽的一个或多个α-碳原子被氮杂肽中的氮原子置换。与亲本肽相比,氮杂肽被酶水解和降解之速率更低。
氮杂氨基酸并非用于合成氮杂肽和其他氮杂氨基酸缀合物的理想合成子。与亲本肽相比,氮杂肽含有氮原子,而非一个或多个α-碳原子。由于氮杂氨基酸残基中羰基部分之反应性相对于天然氨基酸对应物有所减小,氮杂肽键在肽酶作用下更稳定。因此,与亲本肽相比,氮杂肽被肽酶水解和降解的速率更低并表现出例如改进的代谢稳定性。
然而,氮杂肽键的形成速率慢于典型肽键的形成速率。因此,与使用常规氨基酸相比,在使用氮杂氨基酸进行氮杂肽合成期间形成不想要的副产物的可能性更大。利用氮杂氨基酸合成氮杂肽的另一个阻碍为肼体系中两个可用氮原子的正交官能化。出于这些和其他原因,使用氮杂氨基酸和其他常规偶联剂合成氮杂肽在本发明之前是具有挑战性的。
需要克服常规氮杂氨基酸的局限性且/或允许例如更快和/或更便宜和/或更有效合成氮杂肽和其他氮杂氨基酸缀合物的化合物。
发明内容
本发明的目的是提供用于合成氮杂肽和其他氮杂氨基酸缀合物的化合物。
本发明的另一个目的是提供比亲本肽更稳定且/或更有效的氮杂肽和其他氮杂氨基酸缀合物。
本发明的又一个目的是提供氮杂肽诊断和治疗剂。
结合以上目的和其他目的,本发明涉及式(IA)的化合物:
其中A为N-邻苯二甲酰亚胺基(NPhth)或NR1R2,
R1为H,
R2为叔丁氧基羰基(Boc)、9-芴基甲氧基羰基(Fmoc)、2-(3,5-二甲氧基苯基)丙-2-基氧基羰基(Ddz),或者
R和R1或R2连接并一起形成脯氨酸的侧链基团;
X为杂芳基;并且
R选自:天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、苏氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺、丝氨酸和谷氨酰胺的侧链基团。杂芳基可以为未取代的或被以下中的一者或多者取代:卤素(Cl、F或Br)、C1-C6烷基(例如,甲基)、羟基、-COOH、-COH、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基(例如,-CF3、-CHF2、-CH2F、-CBr3、-CHBr2、-CH2Br、-CCl3、-CHCl2、-CH2Cl)、-NH2或-NH3。在某些实施例中,杂芳基被-CF3取代。所述侧链基团可以为未取代的或被以下中的一者或多者取代:卤素(Cl、F或Br)、C1-C6烷基(例如,甲基)、羟基、-COOH、-COH、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基(例如,氯甲基、氟甲基等)或保护基团(例如,Phth、Boc、Fmoc、Ddz等)。在某些实施例中,R选自:H、甲基、异丙基、异丁基、苄基以及天冬氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、天冬酰胺和谷氨酰胺的侧链基团。在某些实施例中,杂芳基为咪唑基或苯并三唑基。咪唑基或苯并三唑基可以为未取代的或被以下中的一者或多者取代:卤素(Cl、F或Br)、C1-C6烷基(例如,甲基)、羟基、-COOH、-COH、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基(例如,-CF3、-CHF2、-CH2F、-CBr3、-CHBr2、-CH2Br、-CCl3、-CHCl2、-CH2Cl)、-NH2或-NH3。在某些实施例中,咪唑基或苯并三唑基被-CF3取代。式(IA)的化合物可用作用于合成氮杂肽和其他肽模拟物的结构单元或合成子。
在某些实施例中,式(IA)的化合物为如下化合物,其中
A为N-邻苯二甲酰亚胺基或NR1R2,
R1为H,
R2为叔丁氧基羰基、9-芴基甲氧基羰基、2-(3,5-二甲氧基苯基)丙-2-基氧基羰基;
X为咪唑基或苯并三唑基;并且
R选自:天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、苏氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺和谷氨酰胺的侧链基团。咪唑基和苯并三唑基可以为未取代的或被以下中的一者或多者取代:卤素(Cl、F或Br)、C1-C6烷基(例如,甲基)、羟基、-COOH、-COH、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基(例如,-CF3、-CHF2、-CH2F、-CBr3、-CHBr2、-CH2Br、-CCl3、-CHCl2、-CH2Cl)、-NH2或-NH3。在某些实施例中,咪唑基和苯并三唑基被-CF3取代。所述侧链基团可以为未取代的或被以下中的一者或多者取代:卤素(Cl、F或Br)、C1-C6烷基(例如,甲基)、羟基、-COOH、-COH、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基(例如,氯甲基、氟甲基等)或保护基团(例如,Phth、Boc、Fmoc、Ddz等)。在某些实施例中,R选自:H、甲基、异丙基、异丁基、苄基以及天冬氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、天冬酰胺和谷氨酰胺的侧链基团。
在某些实施例中,式(IA)的化合物为如下化合物,其中
A为N-邻苯二甲酰亚胺基或NR1R2,
R1为H,
R2为叔丁氧基羰基、9-芴基甲氧基羰基、2-(3,5-二甲氧基苯基)丙-2-基氧基羰基;
X为被-CF3、-CHF2、-CH2F、-CBr3、-CHBr2、-CH2Br、-CCl3、-CHCl2、-CH2Cl取代的咪唑基;并且
R选自:天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、苏氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺和谷氨酰胺的侧链基团。所述侧链基团可以为未取代的或被以下中的一者或多者取代:卤素(Cl、F或Br)、C1-C6烷基(例如,甲基)、羟基、-COOH、-COH、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基(例如,氯甲基、氟甲基等)或保护基团(例如,Phth、Boc、Fmoc、Ddz等)。在某些实施例中,R选自:H、甲基、异丙基、异丁基、苄基以及天冬氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、天冬酰胺和谷氨酰胺的侧链基团。
在某些实施例中,式(IA)的化合物为如下化合物,其中
A为N-邻苯二甲酰亚胺基或NR1R2,
R1为H,
R2为叔丁氧基羰基、9-芴基甲氧基羰基、2-(3,5-二甲氧基苯基)丙-2-基氧基羰基;
X为被-CF3、-CHF2、-CH2F、-CBr3、-CHBr2、-CH2Br、-CCl3、-CHCl2或-CH2Cl取代的苯并三唑基;并且
R选自:天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、苏氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺和谷氨酰胺的侧链基团。所述侧链基团可以为未取代的或被以下中的一者或多者取代:卤素(Cl、F或Br)、C1-C6烷基(例如,甲基)、羟基、-COOH、-COH、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基(例如,氯甲基、氟甲基等)或保护基团(例如,Phth、Boc、Fmoc、Ddz等)。在某些实施例中,R选自:H、甲基、异丙基、异丁基、苄基以及天冬氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、天冬酰胺和谷氨酰胺的侧链基团。
在某些实施例中,式(IA)的化合物为如下化合物,其中X为咪唑基或苯并三唑基,并且
(i)A和R连接并形成脯氨酸的侧链,或者
(ii)A为氢或包含邻苯二甲酰亚胺基、叔丁氧基羰基、9-芴基甲氧基羰基、2-(3,5-二甲氧基苯基)丙-2-基氧基羰基的保护基团,并且R选自:天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺、半胱氨酸、丝氨酸、苏氨酸和谷氨酰胺的侧链基团。所述侧链基团可以为未取代的或被以下中的一者或多者取代:卤素(Cl、F或Br)、C1-C6烷基(例如,甲基)、羟基、-COOH、-COH、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基(例如,氯甲基、氟甲基等)或保护基团(例如,Phth、Boc、Fmoc、Ddz等)。
在某些实施例中,式(IA)的化合物为如下化合物,其中X为被-CF3、-CHF2、-CH2F、-CBr3、-CHBr2、-CH2Br、-CCl3、-CHCl2或-CH2Cl取代的咪唑基,并且
(i)A和R连接并形成脯氨酸的侧链,或者
(ii)A为氢或包含邻苯二甲酰亚胺基、叔丁氧基羰基、9-芴基甲氧基羰基、2-(3,5-二甲氧基苯基)丙-2-基氧基羰基的保护基团,并且R选自:天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺、半胱氨酸、丝氨酸、苏氨酸和谷氨酰胺的侧链基团。所述侧链基团可以为未取代的或被以下中的一者或多者取代:卤素(Cl、F或Br)、C1-C6烷基(例如,甲基)、羟基、-COOH、-COH、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基(例如,氯甲基、氟甲基等)或保护基团(例如,Phth、Boc、Fmoc、Ddz等)。
在某些实施例中,式(IA)的化合物为如下化合物,其中X为被-CF3、-CHF2、-CH2F、-CBr3、-CHBr2、-CH2Br、-CCl3、-CHCl2或-CH2Cl取代的苯并三唑基,并且
(i)A和R连接并形成脯氨酸的侧链,或者
(ii)A为氢或包含邻苯二甲酰亚胺基、叔丁氧基羰基、9-芴基甲氧基羰基、2-(3,5-二甲氧基苯基)丙-2-基氧基羰基的保护基团,并且R选自:天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺、半胱氨酸、丝氨酸、苏氨酸和谷氨酰胺的侧链基团。所述侧链基团可以为未取代的或被以下中的一者或多者取代:卤素(Cl、F或Br)、C1-C6烷基(例如,甲基)、羟基、-COOH、-COH、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基(例如,氯甲基、氟甲基等)或保护基团(例如,Phth、Boc、Fmoc、Ddz等)。
在某些实施例中,式(IA)的化合物为如下化合物,其中R1和R为CH2CH2CH2,并且R2为叔丁氧基羰基、9-芴基甲氧基羰基、2-(3,5-二甲氧基苯基)丙-2-基氧基羰基,并且X为咪唑基或苯并三唑基。
在某些实施例中,式(IA)的化合物为如下化合物,其中R1和R为CH2CH2CH2,并且R2为叔丁氧基羰基、9-芴基甲氧基羰基、2-(3,5-二甲氧基苯基)丙-2-基氧基羰基,并且X为咪唑基或苯并三唑基。
本发明还部分涉及式(IA)的化合物:
其中
X为咪唑基或苯并三唑基,并且其中
(i)A和R连接并形成脯氨酸的侧链,或者
(ii)A为氢或包含邻苯二甲酰亚胺基、叔丁氧基羰基、9-芴基甲氧基羰基、2-(3,5-二甲氧基苯基)丙-2-基氧基羰基的保护基团;且R选自:天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺、半胱氨酸、丝氨酸、苏氨酸和谷氨酰胺的侧链基团。
式(IA)的化合物可用于药物开发和/或用作用于合成氮杂肽和其他肽模拟物的结构单元或合成子。
本发明还部分涉及式(IB)的化合物:
其中R2为保护基团(例如,叔丁氧基羰基、9-芴基甲氧基羰基、2-(3,5-二甲氧基苯基)丙-2-基氧基羰基),并且X为咪唑基或苯并三唑基。式(IB)的化合物可用于药物开发和/或用作用于合成氮杂肽和其他肽模拟物的结构单元或合成子。
在某些实施例中,本发明涉及非天然氨基酸的邻苯二甲酰基保护的氨基甲酰基氮杂咪唑衍生物和邻苯二甲酰基保护的氨基甲酰基氮杂苯并三唑衍生物,包括例如β-氨基酸(例如,L-β-高酪氨酸、β-丙氨酸、L-β-高天冬酰胺、L-β-高丙氨酸、L-β-高苯丙氨酸、L-β-高脯氨酸、L-β-高赖氨酸、L-β-高精氨酸、L-β-脯氨酸等)、脂族氨基酸(例如,6-氨基己酸、2-氨基-3-甲氧基丁酸、1-氨基环戊烷-1-羧酸、2-(氨基氧基)乙酸、6-氨基己酸、2-[2-(氨基)-乙氧基]-乙氧基}乙酸)、β-环己基-L-丙氨酸、6-氨基己酸、L-α,β-二氨基丙酸、L-炔丙基甘氨酸、L-α,β-二氨基丙酸、α-氨基异丁酸、β-(2-吡啶基)-L-丙氨酸、β-(3-吡啶基)-L-丙氨酸、β-环丙基-L-丙氨酸、β-叔丁基-L-丙氨酸、(2,4-二硝基苯基))-L-α,β-二氨基丙酸、(烯丙基氧基羰基)-L-α,β-二氨基丙酸、D-α,β-二氨基丙酸、L-α,β-二氨基丙酸、(N-γ-l-(4,4-二甲基-2,6-二氧代环己-l-亚基)乙基)-L-α,γ-二氨基丁酸、(N-γ-4-甲基三苯甲基)-L-α,γ-二氨基丁酸、L-α,γ-二氨基丁酸、4-氟-L-苯基甘氨酸、5,5,5-三氟-DL-亮氨酸、ε-氨基己酸-OH、L-α-叔丁基甘氨酸、L-2-氨基-3-(二甲基氨基)丙酸、L-2-氨基己酸、L-烯丙基甘氨酸、赖氨酸叠氮化物、(Nδ-4-甲基三苯甲基)-L-鸟氨酸、Arg(Me)(Pbf)-OH、二甲基-L-精氨酸(对称和不对称)、L-2-氨基-3-胍基丙酸、L-瓜氨酸、ε-乙酰基-L-赖氨酸、Lys(ivDde)-OH、Lys(Me)2-OH·HCl、Lys(Me3)-OH氯化物、α-甲基-DL-谷氨酸、γ-羧基-L-谷氨酸γ,γ-二叔丁酯、(N-γ-乙基)-L-谷氨酰胺、2,6-二氨基庚二酸、Glu(OAll)-OH、L-磺丙氨酸、α-甲基-DL-甲硫氨酸、DL-丁硫氨酸、L-磺丙氨酸、L-硒代甲硫氨酸、S-[2-(4-吡啶基)乙基]-L-半胱氨酸、S-[2-(4-吡啶基)乙基]-L-半胱氨酸、S-二苯基甲基-L-半胱氨酸、S-三苯甲基-L-高半胱氨酸、S-三苯甲基-L-青霉胺、(Se-p-甲氧基苄基)-L-硒代半胱氨酸、β-羟基苯丙氨酸、2-氰基-L-苯丙氨酸、L-甲状腺氨酸、O-甲基-L-酪氨酸、β-甲基-DL-苯丙氨酸、2-氰基-L-苯丙氨酸、L-甲状腺氨酸、O-甲基-L-酪氨酸、β-甲基-DL-苯丙氨酸、2-氰基-L-苯丙氨酸、3,4-二氯-L-苯丙氨酸、3,4-二氟-L-苯丙氨酸、3,4-二羟基-L-苯丙氨酸、3,4-二羟基-苯丙氨酸、3-氨基-L-酪氨酸、3-氯-L-酪氨酸、3-氟-DL-酪氨酸、3-硝基-L-酪氨酸、4-氨基-L-苯丙氨酸、4-氨基甲基-L-苯丙氨酸、4-(膦酰基甲基)-苯丙氨酸、4-苯甲酰基-D-苯丙氨酸、4-双(2-氯乙基)氨基-L-苯丙氨酸、4-氰基-L-苯丙氨酸、4-氟-L-苯丙氨酸、4-碘-L-苯丙氨酸、DL-m-酪氨酸、2,6-二甲基-酪氨酸、L-高苯丙氨酸、O-甲基-L-酪氨酸、Phe(4-胍基)-OH、O-苄基-L-磷酸酪氨酸、(2S,3R)-3-苯基吡咯烷-2-羧酸、(2S,4S)-4-苯基-吡咯烷-2-羧酸、(2S,3aS,7aS)-八氢-1H-吲哚-2-羧酸、(2S,3R)-3-苯基吡咯烷-2-羧酸、(2S,4R)-(-)-4-叔丁氧基吡咯烷-2-羧酸、反式-4-氟-L-脯氨酸、(3S,4S)-4-氨基-3-羟基-6-甲基庚酸、4-氨基-3-羟基丁酸、L-α-甲基丝氨酸、(2S,3S)-2-氨基-3-甲氧基丁酸、Thr(β-D-GlcNAc(Ac)3)-OH、O-苄基-L-磷酸丝氨酸、O-苄基-D-磷酸苏氨酸、O-苄基-L-磷酸苏氨酸、4-甲基-DL-色氨酸、6-氟-DL-色氨酸、6-甲基-DL-色氨酸、DL-7-氮杂色氨酸、(R)-7-氮杂色氨酸、5-苄基氧基-DL-色氨酸、5-溴-DL-色氨酸、5-氯-DL-色氨酸、5-氟-DL-色氨酸、5-羟基-L-色氨酸、5-甲氧基-L-色氨酸、6-氯-L-色氨酸、6-甲基-DL-色氨酸、7-甲基-DL-色氨酸、DL-7-氮杂色氨酸、5-叠氮基-戊酸、2-氨基-N-(3-叠氮基丙基)-3-巯基丙酰胺、2-氨基-N-(3-叠氮基丙基)-3-巯基丙酰胺、叠氮基高丙氨酸、L-炔丙基甘氨酸·DCHA、叠氮基赖氨酸、p-叠氮基苯丙氨酸、叠氮基高丙氨酸、D-炔丙基甘氨酸、L-炔丙基甘氨酸、叠氮基赖氨酸、三[(l-苄基-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基]胺、2-(7'-辛烯基)丙氨酸、2-(4'-戊烯基)丙氨酸、2-(4'-戊烯基)甘氨酸、2-(7'-辛烯基)丙氨酸、[5-((2-氨基乙基)氨基)萘-1-磺酸]、L-谷氨酸-γ-[2-(1-磺酰基-5-萘基)-氨基乙基酰胺]、N-ε-(5-羧基荧光素)-L-赖氨酸、N-ε-(5/6-羧基荧光素)-L-赖氨酸、N-ε-(4,4-二甲基偶氮苯-4'羰基)-L-赖氨酸、Nε-2,4-二硝基苯基-L-赖氨酸、N-ε-[(7-甲氧基香豆素-4-基)-乙酰基-L-赖氨酸、糖基化氨基酸(例如,Ser(β-D-GlcNAc(Ac)3)-OH、Thr(β-D-GlcNAc(Ac)3)-OH)、3-氮杂双环[3.1.0]己烷-2-羧酸、4-氨基-(1-羧基甲基)哌啶、4-苯基哌啶-4-羧酸、Nα-甲基-N-im-三苯甲基-L-组氨酸、Nα-甲基-O-苄基-L-丝氨酸二环己基铵盐、Nα-甲基-Nω-(4-甲氧基-2,3,6-三甲基苯磺酰基)-L-精氨酸、Nα-甲基-L-亮氨酸、Nα-甲基-L-正缬氨酸、Nα-甲基-L-苯丙氨酸、Nα-甲基-N-im-三苯甲基-L-组氨酸、Nα-甲基-O-叔丁基-L-丝氨酸、Nα-甲基甘氨酸、21-氨基-4,7,10,13,16,19-六氧杂二十一烷酸、{2-[2-(氨基)-乙氧基]-乙氧基}乙酸、6-氨基-4-氧杂己酸、5-氨基-3-氧杂戊酸、NH-(PEG)10-CH2CH2COOH、NH-(PEG)12-CH2CH2COOH、9-氨基-4,7-二氧杂壬酸、9-氨基-4,7-二氧杂壬酸、12-氨基-4,7,10-三氧杂十二酸、15-氨基-4,7,10,13-四氧杂十五酸、18-氨基-4,7,10,13,16-五氧杂十八酸、21-氨基-4,7,10,13,16,19-六氧杂二十一烷酸、NH-(PEG)8-CH2CH2COOH、11-氨基-3,6,9-三氧杂十一酸、N-(Fmoc-8-氨基-3,6-二氧杂-辛基)琥珀酰胺酸、N-ε-乙酰基-L-赖氨酸、L-瓜氨酸、Arg(Me)(Pbf)-OH、Nω,ω-二甲基-L-精氨酸(不对称和对称)、Lys(Me)2-OH氯化物、N-ε,ε-t-甲基-L-赖氨酸、Lys(Me3)-OH氯化物、O-苄基-L-磷酸丝氨酸、O-苄基-D-磷酸苏氨酸、O-苄基-L-磷酸苏氨酸、O-苄基-L-磷酸酪氨酸的氮杂咪唑衍生物和邻苯二甲酰基保护的氨基甲酰基氮杂苯并三唑衍生物。
本发明还涉及式(II)的化合物:
其中R选自:天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、苏氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺、丝氨酸和谷氨酰胺的侧链基团;并且M为任选取代基,选自:卤素(Cl、F或Br)、C1-C6烷基(例如,甲基)、羟基、-COOH、-COH、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基(例如,-CF3、-CHF2、-CH2F、-CBr3、-CHBr2、-CH2Br、-CCl3、-CHCl2、-CH2Cl)、-NH2或-NH3。在某些实施例中,M为-CF3。所述侧链基团可以为未取代的或被以下中的一者或多者取代:卤素(Cl、F或Br)、C1-C6烷基(例如,甲基)、羟基、-COOH、-COH、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基(例如,氯甲基、氟甲基等)或保护基团(例如,Phth、Boc、Fmoc、Ddz等)。在某些实施例中,R选自:H、甲基、异丙基、异丁基、苄基以及天冬氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、天冬酰胺和谷氨酰胺的侧链基团。式(II)的化合物可用于药物开发和/或用作用于合成氮杂肽和其他肽模拟物的结构单元或合成子。
本发明还涉及式(III)的化合物:
其中R选自:天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、苏氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺、丝氨酸和谷氨酰胺的侧链基团。所述侧链基团可以为未取代的或被以下中的一者或多者取代:卤素(Cl、F或Br)、C1-C6烷基(例如,甲基)、羟基、-COOH、-COH、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基(例如,氯甲基、氟甲基等)或保护基团(例如,N-Phth、N-Boc、N-Fmoc、N-Ddz等)。在某些实施例中,R选自:H、甲基、异丙基、异丁基、苄基以及天冬氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、天冬酰胺和谷氨酰胺的侧链基团。式(III)的化合物可用于药物开发、疾病诊断、预防和治疗,或用作用于合成氮杂肽和其他肽模拟物的结构单元或合成子。
本发明还涉及式(IV)的化合物:
其中R选自:天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、苏氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺、丝氨酸和谷氨酰胺的侧链基团。所述侧链基团可以为未取代的或被以下中的一者或多者取代:卤素(Cl、F或Br)、C1-C6烷基(例如,甲基)、羟基、-COOH、-COH、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基(例如,氯甲基、氟甲基等)或保护基团(例如,N-Phth、N-Boc、N-Fmoc、N-Ddz等)。在某些实施例中,R选自:H、甲基、异丙基、异丁基、苄基以及天冬氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、天冬酰胺和谷氨酰胺的侧链基团。式(IV)的化合物可用于药物开发、疾病诊断、预防和治疗,或用作用于合成氮杂肽和其他肽模拟物的结构单元或合成子,例如用于药物开发、疾病诊断、预防和治疗。
本发明还涉及式(IA)、(IB)、(II)、(III)和(IV)化合物在制备式(V)的化合物中的用途:
其中在式(V)的化合物的N末端和/或C末端处和/或在式(V)的化合物的裂解或水解位点处或与式(V)的化合物的裂解或水解位点相邻;
其中B选自:氢、-NH2、-NNH2、-CONH2、-COOR3、-COOH、-COH、-COC1-C4烷基、-COC1-C4卤代烷基、-OH、氨基酸、氮杂氨基酸、2至60聚体肽、2至60聚体氮杂肽、2至60聚体α-碳全氮取代肽;
D选自:-OR4、-OH、-NH2、-NNH2、-NHCOCH3、-NHCH3、-N(CH3)2、-CONH2、-COOH、-COH、-COC1-C4烷基、-COC1-C4卤代烷基、氨基酸、氮杂氨基酸、2至60聚体肽、2至60聚体氮杂肽、2至60聚体α-碳全氮取代肽;
R3和R4各自独立地选自:C1-C6烷基(例如,甲基)、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基(例如,氯甲基、氟甲基等)或保护基团(例如,Phth、Boc、Fmoc、Ddz等);
R选自:天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺、丝氨酸、苏氨酸、半胱氨酸和谷氨酰胺的侧链基团。天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺、丝氨酸、苏氨酸、半胱氨酸和谷氨酰胺的所述侧链基团可以为未取代的或被以下中的一者或多者取代:卤素(Cl、F或Br)、C1-C6烷基(例如,甲基)、羟基、-COOH、-COH、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基(例如,氯甲基、氟甲基等)或保护基团(例如,Phth、Boc、Fmoc、Ddz等)。式(V)的化合物为式(VI)的化合物的氮杂肽类似物:
其中B选自:氢、-NH2、-NNH2、-CONH2、-COOR3、-COOH、-COH、-COC1-C4烷基、-COC1-C4卤代烷基、-OH、氨基酸、氮杂氨基酸、2至60聚体肽、2至60聚体氮杂肽、2至60聚体α-碳全氮取代肽;
D选自:-OR4、-OH、-NH2、-NNH2、-NHCOCH3、-NHCH3、-N(CH3)2、-CONH2、-COOH、-COH、-COC1-C4烷基、-COC1-C4卤代烷基、氨基酸、氮杂氨基酸、2至60聚体肽、2至60聚体氮杂肽、2至60聚体α-碳全氮取代肽;
R3和R4各自独立地选自:C1-C6烷基(例如,甲基)、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基(例如,氯甲基、氟甲基等)或保护基团(例如,Phth、Boc、Fmoc、Ddz等);
R选自:天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺、丝氨酸、苏氨酸、半胱氨酸和谷氨酰胺的侧链基团。天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺、丝氨酸、苏氨酸、半胱氨酸和谷氨酰胺的所述侧链基团可以为未取代的或被以下中的一者或多者取代:卤素(Cl、F或Br)、C1-C6烷基(例如,甲基)、羟基、-COOH、-COH、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基(例如,氯甲基、氟甲基等)或保护基团(例如,Phth、Boc、Fmoc、Ddz等)。在优选的实施例中,式(V)的化合物比式(VI)的化合物更耐水解和/或酶促降解。在这些优选的实施例中的一些实施例中,例如由于更适合生物受体,式(V)的化合物比式(VI)的化合物更有效。式(V)的化合物可以例如用于药物开发、疾病诊断、预防和治疗。
本发明还涉及式(IA)、(IB)、(II)、(III)和(IV)化合物在制备式(V)的化合物中的用途:
其中与式(V)的化合物的N末端和/或C末端相邻;
其中B选自:氢、-NH2、-NNH2、-CONH2、-COOR3、-COOH、-COH、-COC1-C4烷基、-COC1-C4卤代烷基、-OH、氨基酸、氮杂氨基酸、2至60聚体肽、2至60聚体氮杂肽、2至60聚体α-碳全氮取代肽;
D选自:-OR4、-OH、-NH2、-NNH2、-NHCOCH3、-NHCH3、-N(CH3)2、-CONH2、-COOH、-COH、-COC1-C4烷基、-COC1-C4卤代烷基、氨基酸、氮杂氨基酸、2至60聚体肽、2至60聚体氮杂肽、2至60聚体α-碳全氮取代肽;
R3和R4各自独立地选自:C1-C6烷基(例如,甲基)、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基(例如,氯甲基、氟甲基等)或保护基团(例如,Phth、Boc、Fmoc、Ddz等);
R选自:天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺、丝氨酸、苏氨酸、半胱氨酸和谷氨酰胺的侧链基团。天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺、丝氨酸、苏氨酸、半胱氨酸和谷氨酰胺的所述侧链基团可以为未取代的或被以下中的一者或多者取代:卤素(Cl、F或Br)、C1-C6烷基(例如,甲基)、羟基、-COOH、-COH、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基(例如,氯甲基、氟甲基等)或保护基团(例如,Phth、Boc、Fmoc、Ddz等)。式(V)的化合物为式(VI)的化合物的氮杂肽类似物:
其中B选自:氢、-NH2、-NNH2、-CONH2、-COOR3、-COOH、-COH、-COC1-C4烷基、-COC1-C4卤代烷基、-OH、氨基酸、氮杂氨基酸、2至60聚体肽、2至60聚体氮杂肽、2至60聚体α-碳全氮取代肽;
D选自:-OR4、-OH、-NH2、-NNH2、-NHCOCH3、-NHCH3、-N(CH3)2、-CONH2、-COOH、-COH、-COC1-C4烷基、-COC1-C4卤代烷基、氨基酸、氮杂氨基酸、2至60聚体肽、2至60聚体氮杂肽、2至60聚体α-碳全氮取代肽;
R3和R4各自独立地选自:C1-C6烷基(例如,甲基)、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基(例如,氯甲基、氟甲基等)或保护基团(例如,Phth、Boc、Fmoc、Ddz等);
R选自:天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺、丝氨酸、苏氨酸、半胱氨酸和谷氨酰胺的侧链基团。天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺、丝氨酸、苏氨酸、半胱氨酸和谷氨酰胺的所述侧链基团可以为未取代的或被以下中的一者或多者取代:卤素(Cl、F或Br)、C1-C6烷基(例如,甲基)、羟基、-COOH、-COH、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基(例如,氯甲基、氟甲基等)或保护基团(例如,Phth、Boc、Fmoc、Ddz等)。在优选的实施例中,式(V)的化合物比式(VI)的化合物更耐水解和/或酶促降解。在这些优选的实施例中的一些实施例中,例如由于更适合生物受体,式(V)的化合物比式(VI)的化合物更有效。式(V)的化合物可以例如用于药物开发、疾病诊断、预防、抑制和治疗。
在某些实施例中,在式(V)的化合物和式(VI)的化合物中,每种化合物的B独立地选自:氢、-NH2、-NNH2、-CONH2、-COOR3、-COC1-C4烷基、-COC1-C4卤代烷基、-OH、氨基酸、氮杂氨基酸、2至60聚体肽、2至60聚体氮杂肽、2至60聚体α-碳全氮取代肽;
每种化合物的D独立地选自:-OR4、-NH2、-NNH2、-NHCOCH3、-NHCH3、-N(CH3)2、-CONH2、-COOH、-COH、-COC1-C4烷基、-COC1-C4卤代烷基、氨基酸、氮杂氨基酸、2至60聚体肽、2至60聚体氮杂肽、2至60聚体α-碳全氮取代肽;
R3和R4各自独立地选自:C1-C6烷基(例如,甲基)、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基(例如,氯甲基、氟甲基等)或保护基团(例如,Phth、Boc、Fmoc、Ddz等);并且
每种化合物的R独立地选自:天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、丝氨酸、苏氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺和谷氨酰胺的侧链基团。天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺的所述侧链基团可以为未取代的或被以下中的一者或多者取代:卤素(Cl、F或Br)、C1-C6烷基(例如,甲基)、羟基、-COOH、-COH、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基(例如,氯甲基、氟甲基等)或保护基团(例如,Phth、Boc、Fmoc、Ddz等)。
本发明还涉及式(IA)、(IB)、(II)、(III)和(IV)的化合物在制备氮杂缓激肽(包括例如氮杂-7缓激肽、氮杂-2,8缓激肽、氮杂-2缓激肽和氮杂-8缓激肽)中的用途:
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本发明还部分涉及一种制备式(V)的化合物的方法,所述方法包括活化式(IA)、式(IB)、式(II)、式(III)或式(IV)的化合物以形成活化的式(IA)、式(IB)、式(II)、式(III)或式(IV)的化合物的步骤;将活化的式(IA)、式(IB)、式(II)、式(III)或式(IV)的化合物与氨基酸的N末端、氮杂氨基酸的N末端偶联以形成受保护的式(V)的化合物的步骤,条件在于如果氨基酸或氮杂氨基酸的侧链含有选自氨基、酰胺、胍基N、羧基、巯基、羧基、羟基、吲哚、咪唑、苯酚的基团,则用保护基团保护所述基团,所述保护基团选自:叔丁氧基羰基(Boc)、9-芴基甲氧基羰基(Fmoc)或2-(3,5-二甲氧基苯基)丙-2-基氧基羰基(Ddz)、邻苯二甲酰亚胺(Phth)、羧基苄基(Cbz)、2,2,4,6,7-五甲基-二氢苯并呋喃-5-磺酰基(Pbf)、三苯甲基或三苯基甲基(Trt)、叔丁基酯(OtBu)、叔丁基醚(tBu)、S-叔丁基醚(StBu)、烯丙基氧基羰基(Aloc)、甲氧基三甲基苯磺酰基(Mtr)、4,4-二甲基氧基二苯甲基(Mbh)、2,2,5,7,8-五甲基苯并二氢吡喃-6-磺酰氯(Pmc)、2,4,6-三甲氧基苄基(Tmob)、烯丙基酯(OAI)、乙酰胺基甲基(Acm)等;以及例如用肼、哌啶、TFA、乙酸、硫代苯甲醚、EDT、苯甲醚等将受保护的式(V)的化合物去保护以形成式(V)的化合物的步骤。
在某些实施例中,式(IA)、式(IB)和式(IV)的化合物被碘甲烷(MeI)活化。
在某些实施例中,式(IA)、式(IB)和式(III)的化合物被乙腈中的DIPEA活化。
本发明还涉及一种制备氮杂肽的方法,其包括活化如式(I)的化合物的步骤;以及将活化的化合物与氨基酸的N末端、氮杂氨基酸的N末端偶联的步骤;其中所述氮杂肽为式(V)的化合物。式(I)的化合物可以为未取代的或被以下中的一者或多者取代:卤素、C1-C6烷基、羟基、-COOH、-COH、甲氧基、乙氧基、丙氧基或C1-C6卤代烷基。式(V)的化合物中的可以在式(V)的化合物的N末端和/或C末端处,与式(V)的化合物的N末端和/或C末端相邻,或为式(V)的化合物的水解位点。在一些实施例中,式(I)的化合物被碘甲烷活化,所述偶联是在乙腈中进行并且包括添加DIPEA,且是在固相氮杂肽合成期间进行。在另外的实施例中,式(I)化合物被碘甲烷活化,所述偶联是在乙腈中进行并且包括添加DIPEA,并且是在液相氮杂肽合成期间进行。
在本发明的方法中,优选以至少约40%(按重量计)(例如,约45%至约65%、约50%至约65%或约55%至约65%等)的产率制备所述氮杂肽。在某些实施例中,产率大于约45%、约50%、约55%或约60%。因此,产率可以例如是约50%、约55%、约60%或约65%。在某些实施例中,所述氮杂肽为二氮杂肽并且以约80%至约98%的产率合成。
本发明还部分涉及一种制备式(V)的化合物的方法,所述方法包括将式(IA)、(IB)、(II)、(III)或(IV)的化合物与氮杂氨基酸偶联以形成受保护的二-α-碳全氮取代肽的步骤以及例如用肼、TFA、乙酸、硫代苯甲醚、EDT、苯甲醚、任何前述物质的混合物或另一种去保护化合物将受保护的二-α-碳全氮取代肽去保护以形成式(V)的化合物的步骤。
本发明还部分涉及一种制备式(V)的化合物的方法,所述方法包括在15℃至35℃的温度下在乙腈中将式(IA)、(IB)、(II)、(III)或(IV)的第一化合物与氨基酸、式(IA)、(IB)、(II)、(III)或(IV)的第二化合物、肽或α-碳全氮取代肽偶联,其中所述偶联持续约20分钟至约6小时、约30分钟至约5小时、约40分钟至约4小时、约50分钟至约3小时、约50分钟至约2小时。在这些实施例中的一些实施例中,所述偶联在约18℃至25℃的温度下持续约30分钟至约90分钟。可以将约1至约3当量的DIPEA和约1当量至约1.4当量(优选地约1.1当量)的氨基酸、式(IA)、(IB)、(II)、(III)或(IV)的第二化合物、肽或α-碳全氮取代肽添加到乙腈中以进行偶联反应。在一些实施例中,在偶联步骤期间未添加另外的试剂。在某些实施例中,正在偶联的化合物为具有活化的氨基甲酰基咪唑部分的氮杂肽并且使用约1.5当量的氨基酸和约1.0当量的DIPEA,并且在室温下在氮气下偶联约20小时。在某些实施例中,正在偶联的化合物为具有活化的氨基甲酰基咪唑部分的α-碳全氮取代肽并且使用约1.5当量的肼和约1.0当量的DIPEA,并且在约40℃下在氮气下偶联约20小时。在某些实施例中,正在偶联的化合物为具有氨基甲酰基苯并三唑(HBt)部分的氮杂肽并且使用约1.5当量的氨基酸和约2.0当量的DIPEA,并且在约40℃下在氮气下偶联约20小时。在某些实施例中,正在偶联的化合物为具有氨基甲酰基1-O-苯并三唑(HOBt)部分的氮杂肽并且使用约1.1当量的氨基酸和约2.0当量的DIPEA,并且在约25℃下在氮气下偶联1小时。
本发明还部分涉及式(V)的化合物的溶液相合成,所述溶液相合成包括将式(IA)、(IB)、(II)、(III)或(IV)的化合物转化成式(IA)、(IB)、(II)、(III)或(IV)的化合物的酰胺的步骤;将式(IA)、(IB)、(II)、(III)或(IV)的化合物的酰胺去保护的步骤;将去保护的式(IA)、(IB)、(II)、(III)或(IV)的酰胺与另外的式(IA)、(IB)、(II)、(III)或(IV)的化合物、或受保护的氨基酸、或受保护的氮杂氨基酸偶联以形成受保护的氮杂肽的步骤;以及将受保护的氮杂肽去保护以提供式(V)的化合物的步骤。
本发明还部分涉及式(V)化合物的固相合成,所述固相合成包括将受保护的式(IA)、(IB)、(II)、(III)或(IV)化合物与支持物偶联的步骤;将受保护的式(IA)、(IB)、(II)、(III)或(IV)的化合物去保护的步骤;将去保护的式(IA)、(IB)、(II)、(III)或(IV)的化合物与另外受保护的式(IA)、(IB)、(II)、(III)或(IV)的化合物、另外受保护的氨基酸或另外受保护的氮杂氨基酸偶联以形成受保护的肽的步骤;以及将受保护的肽去保护并裂解以提供式(V)的化合物的步骤。
本发明还部分涉及一种制备式(V)的化合物的方法,其包括在肽的N末端和/或C末端裂解肽的步骤以及将裂解的肽与式(IA)、(IB)、(II)、(III)或(IV)的化合物偶联以形成式(V)的化合物的步骤。在某些实施例中,式(IA)、(IB)、(II)、(III)或(IV)的化合物在与裂解的肽偶联之前被活化。
本发明还部分涉及一种制备式(V)的化合物的方法,其包括在肽的裂解位点裂解肽以形成两个较小肽的步骤;用氮杂氨基酸置换至少一个所述较小肽的最后一个氨基酸的步骤;以及将氮杂肽与其余较小肽缀合以提供式(V)的化合物的步骤。
本发明还涉及一种制备式(V)的化合物的方法,其包括使肽在其裂解位点处水解以及使所述裂解的肽与式(IA)、(IB)、(II)、(III)或(IV)的化合物反应以提供式(V)的化合物。
本发明还部分涉及一种氮杂肽合成的方法,其包括使式(IA)、(IB)、(II)、(III)或(IV)的化合物与氮杂氨基酸、氨基酸或肽反应以形成氮杂肽,其中所述氮杂肽为式(V)的化合物。
本发明的式(IA)、(IB)、(II)、(III)或(IV)的化合物和方法允许例如以至少约40%(例如,约45%至约65%、约50%至约65%或约55%至约65%等)的产率(按重量计%)制备式(V)的化合物。在某些实施例中,产率大于约45%、约50%、约55%或约60%。因此,产率可以例如是约50%、约55%、约60%或约65%。在某些实施例中,式(V)的化合物为二氮杂肽并且以约80%至约98%的产率合成。
定义
在本说明书中术语“约”意指紧接在术语“约”之后所述的值的15%(±15%)内的值,包括等于此范围的上限(即,+15%)的值和等于此范围的下限(即,-15%)的值。例如,短语“约100”涵盖85与115之间的任何数值,包括85和115。
“氮杂肽”意指其中一个或多个α-碳被三价氮原子置换的肽。
“α-碳全氮取代肽”意指其中所有α-碳都被三价氮原子置换的肽。
“α-氮”意指在氮杂肽或α-碳全氮取代肽中键合至羰基基团的氮原子。与α-氮相邻的碳原子称为β-碳。
“氮杂氨基酸”被定义为其中手性α-碳原子被氮原子置换的氨基酸。
“氮杂肽类似物”意指与肽不同但为其类似物的化合物,该不同之处在于肽的一个或多个α-碳原子已被氮原子置换,其中肽的氨基酸残基的侧链具有或不具有另外的结构修饰。被置换的一个或多个α-碳原子可例如在肽的N-末端处(即,肽的第一残基)、肽的第二残基处、肽的C末端处(即,肽的最后一个残基)、共价结合至肽的C末端的残基和/或肽的另一个残基处(例如,在肽的水解位点处)。尽管具有与肽不同的主链,但氮杂肽类似物保留、延伸和/或改进所述肽的功能活性。氮杂肽类似物比肽更耐受降解,和/或与肽相比具有改进的治疗活性,和/或与肽相比具有改进的对生物受体的选择性,和/或具有改进的对生物受体的亲和力,和/或在生物受体处具有可逆的活性(激动活性代替拮抗活性,或拮抗活性代替激动活性)。
术语“杂芳基”包括具有除C和H以外的原子的所有芳基化合物。
如本文所用,术语“受保护”意指氨基酸、氮杂氨基酸、肽、氮杂肽或化合物中的一个或多个基团(例如,-OH)用保护基团(例如,Phth、Ddz等)保护。除非另有说明,否则术语“保护基团”或“保护的基团”当用于指经历化学反应的分子的一部分时意指在该化学反应条件下不反应并且可以被去除以提供在那些条件下反应的部分的化学部分。保护基团包括例如氮保护基团和羟基保护基团。保护基团的实例包括例如苄基、二苯基甲基、三苯甲基、Cbz、Boc、Fmoc、甲氧基羰基、乙氧基羰基、Phth、Ddz以及本领域技术人员已知的其他保护基团。
天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺和谷氨酰胺的“侧链基团”具有以下结构:
“脯氨酸的侧链基团”为仲胺,其中α-氨基基团直接附接至主链,使得α碳成为侧链的直接取代基:
可用于本发明中的氨基酸为L-氨基酸和D-氨基酸。
除非另有说明,否则术语“预防(prevent、preventing和prevention)”考虑了在患者开始罹患特定疾病或病症的症状之前发生的作用,其抑制或降低所述疾病或病症或其一种或多种症状的严重性。所述术语涵盖了预防法。
本发明的化合物可以来源于无机酸或有机酸的药学上可接受的盐的形式使用。为了清楚起见,如本文所用的术语“药学上可接受的盐”通常是指由药学上可接受的酸或碱(包括无机酸和碱以及有机酸和碱)制备的盐。合适的药学上可接受的碱加成盐包括例如由铝、钙、锂、镁、钾、钠和锌制成的金属盐或由赖氨酸、N,N'-二苄基乙二胺、氯普鲁卡因、胆碱、二乙醇胺、乙二胺、葡甲胺(N-甲基葡糖胺)和普鲁卡因制成的有机盐。合适的无毒酸包括诸如乙酸、海藻酸、邻氨基苯甲酸、苯磺酸、苯甲酸、樟脑磺酸、柠檬酸、乙烯磺酸、甲酸、富马酸、糠酸、半乳糖醛酸、葡萄糖酸、葡萄糖醛酸、谷氨酸、乙醇酸、氢溴酸、盐酸、羟乙磺酸、乳酸、马来酸、苹果酸、扁桃酸、甲烷磺酸、粘酸、硝酸、扑酸、泛酸、苯乙酸、磷酸、丙酸、水杨酸、硬脂酸、琥珀酸、磺胺酸、硫酸、酒石酸和对甲苯磺酸的无机酸和有机酸。特定酸包括例如盐酸、氢溴酸、磷酸、硫酸和甲烷磺酸。具体盐的实例包括例如盐酸盐和甲磺酸盐。其他盐为本领域熟知的。参见例如雷明顿制药科学,第18版(麦克出版社,宾夕法尼亚州伊斯顿:1990)和雷明顿:药学科学与实践,第19版(麦克出版社,宾夕法尼亚州伊斯顿:1995)。如果在合理医学判断的范围内本发明的化合物的酸加成盐、羧酸盐、氨基酸加成盐和两性离子盐适用于与人类和低等动物的组织接触而无过度毒性、刺激性、过敏反应等,与合理益处/风险比率一致并有效用于其预期用途,则其制备和使用也被认为是药学上可接受的。此类盐也可包括本发明的化合物的各种溶剂合物和水合物。
本发明的某些化合物可例如用碳、氟或碘的各种同位素进行同位素标记,当讨论的化合物含有至少一个此类原子时适用。在优选实施例中,本发明的诊断方法包括施用此种同位素标记的化合物。
本发明的某些化合物可作为立体异构体存在,其中存在不对称或手性中心。这些立体异构体根据围绕手性碳原子的取代基的构型为“R”或“S”。本文所用的术语“R”和“S”为如IUPAC 1974基础立体化学E部分的建议,纯粹与应用化学,1976,45:13-30中所定义的构型。本发明考虑了其各种立体异构体和混合物,并且这些特别包括在本发明的范围内。立体异构体包括对映体和非对映体以及对映体或非对映体的混合物。本发明的化合物的个别立体异构体可由可商购获得的含有不对称或手性中心的起始材料合成制备或通过制备外消旋混合物随后进行本领域普通技术人员熟知的拆分来制备。这些拆分方法的实例为(1)将对映体的混合物附接至手性助剂、通过重结晶或色谱法分离所得非对映体的混合物以及任选地从助剂释放光学纯的产物,如弗尼斯、汉纳福德、史密斯和塔切尔,"沃格尔的实用有机化学教科书",第5版(1989),朗曼科技,艾塞克斯CM20 2JE,英国中所述;或者(2)在手性色谱柱上直接分离光学对映体的混合物;或者(3)分级重结晶方法。
本发明的某些化合物可作为顺式或反式异构体存在,其中环上的取代基可以一种方式附接,使得它们相对于彼此在环的同一侧上(顺式)或相对于彼此在环的相反侧上(反式)。此类方法为本领域普通技术人员熟知的,并且可包括通过重结晶或色谱分离异构体。应理解本发明的化合物可具有互变异构形式以及几何异构体,并且这些化合物也构成本发明的方面。
除非另有说明,否则化合物的“诊断有效量”为足以诊断疾病或病症的量。一般而言,出于诊断目的施用化合物不会与化合物的治疗性使用一样长,并且如果此化合物足以产生诊断,就可仅施用一次。
如本文所用的术语“非天然氨基酸的邻苯二甲酰基保护的氨基甲酰基氮杂咪唑衍生物”意指在其N末端共价结合(缀合)至邻苯二甲酰亚胺基并在其C末端共价结合(缀合)至咪唑的非天然氮杂氨基酸。非天然氨基酸可为取代的和未取代的。
如本文所用的术语“非天然氨基酸的邻苯二甲酰基保护的氨基甲酰基氮杂苯并三唑衍生物”意指在其N末端共价结合(缀合)至邻苯二甲酰亚胺基并在其C末端共价结合(缀合)至苯并三唑的非天然氮杂氨基酸。非天然氨基酸可为取代的和未取代的。
术语“固相合成”意指一种方法,其中分子(例如,氨基酸,氮杂氨基酸等)共价结合在固体载体材料上并且在单个反应容器中利用选择性保护基团化学逐步合成。在此方法中,通常在所有反应性官能团处保护结构单元。官能团反应次序可通过去保护的次序来控制。例如,在氮杂肽合成中,氨基保护的氨基酸或氨基保护的氮杂氨基酸结合至固相材料(例如,低交联聚苯乙烯珠粒),在羰基基团与树脂之间形成共价键,例如酰胺基或酯键。然后,将氨基基团去保护并使其与下一个氨基保护的氨基酸或氨基保护的氮杂氨基酸的羰基基团反应。重复此循环以形成所需肽或氮杂肽链。在所有反应完成后,从珠粒中裂解合成的肽或氮杂肽。
术语“溶液相合成”和“液相合成”意指一种方法,其中分子(例如,氨基酸、氮杂氨基酸等)在溶液中合成而未共价结合在固体载体材料上。
术语“合成子”意指结构单元。
术语“室温”意指20℃。
术语“环境温度”意指18-28℃。
术语“亲本肽”和“相应肽”意指天然肽(即,天然或常见肽),其与氮杂肽的不同之处在于天然肽的一个或多个氨基残基被氮杂肽中的氨基脲或取代的氨基脲置换(即,天然肽的一个或多个α-碳被三价氮原子置换)。置换可例如在肽的N末端处(即,肽的第一残基)、肽的第二残基处、肽的C末端处(即,肽的最后一个残基)、共价结合至肽的C末端的残基和/或肽的另一个残基处(例如,在肽的水解位点处)。
术语“邻苯二甲酰亚胺基”意指:
术语“邻苯二甲酰基”意指:
缩写“N-Phth”意指“N-邻苯二甲酰亚胺基”。
缩写“Boc”意指“叔丁氧基羰基”。
缩写“Fmoc”意指“9-芴基甲氧基羰基”。
缩写“Ddz”意指“2-(3,5-二甲氧基苯基)丙-2-基氧基羰基”。
缩写“HOBt”意指“1-OH-苯并三唑”。
缩写“SPPS”意指“固相肽合成”。
缩写“TCCA”意指“三氯异氰尿酸”。
缩写“TBACl”意指“四丁基氯化铵”。
缩写“Phth”意指“邻苯二甲酰基”。
缩写“Cbz”意指“羧基苄基”。
缩写“Pbf”意指“2,2,4,6,7-五甲基二氢苯并呋喃-5-磺酰基”。
缩写“Trt”意指“三苯甲基或三苯基甲基”。
缩写“OtBu”意指“邻叔丁基”。
缩写“tBu”意指“叔丁基”。
缩写“StBu”意指S-叔丁基醚。
缩写“Aloc”意指“烯丙基氧基羰基”。
缩写“Mtr”意指“甲氧基三甲基苯磺酰基”。
缩写“Mbh”意指“4,4-二甲基氧基二苯甲基”。
缩写“Pmc”意指“2,2,5,7,8-五甲基苯并二氢吡喃-6-磺酰氯”。
缩写“Tmob”意指2,4,6-三甲氧基苄基。
缩写“OAI”意指“烯丙基酯”。
缩写“Acm”意指“乙酰胺基甲基”。
缩写“DEAD”意指“偶氮二羧酸二乙酯”(IUPAC名称N-乙基-N-丙-2-基丙-2-胺)。
在肽化学中,“去保护”是指通过化学剂去除保护基团(例如,邻苯二甲酰基、Boc、Cbz、Fmoc等)的过程。例如,可以在酸性条件下(例如,4M HCl或净三氟乙酸TFA)去除Boc保护基团;可以在碱性条件下在pH高于12(20%哌啶/DMF或DCM)时去除Fmoc保护基团;并且可以例如在碱性条件下或通过使用肼来裂解邻苯二甲酰基基团。
附图说明
图1为来自实施例15的SPPS的具有副产物(M=493)的中间物(M=641)的HPLC。
图2为来自实施例15的SPPS的粗制物8AzaBK(26)的HPLC。
图3为实施例15的分离的8氮杂-8AzaBK(26)的HPLC。
具体实施方式
用氮置换肽中的一个或多个α-碳将肽转化成“氮杂肽”;并且用氮置换肽中的所有α-碳将肽转化成“α-碳全氮取代肽”。
氮杂肽和α-碳全氮取代肽为肽模拟物并且通常比相应肽更耐酶促水解。抗酶促降解的增加可导致化合物的代谢稳定性增加和/或受体结合得到改进(例如,对受体的亲和力得到改进)。因此,氮杂肽和α-碳全氮取代肽为用于药物设计、医药化学应用以及疾病诊断、预防和治疗的有用工具,并且可以例如代替肽用作氮杂肽类似物(“肽模拟物”)。
本发明的式(IA)、(IB)、(II)、(III)和(IV)的化合物可用作用于在溶液相合成、固相合成或包括溶液相合成和固相合成的合成中合成氮杂肽和其他肽模拟物和氮杂氨基酸缀合物(包括式(V)的化合物)的“结构单元”或合成子。
式(IA)、(IB)、(II)和(III)的化合物
式(IA)、(IB)、(II)和(III)的化合物在37℃下在pH约为7(例如,蒸馏水)的水性介质(例如,水溶液)中稳定至少30分钟、60分钟、90分钟、1小时、2小时、3小时、4小时或5小时。
式(IA)、(IB)、(II)和(III)的化合物可用作用于合成氮杂肽和其他肽模拟物和氮杂氨基酸缀合物的结构单元或合成子。所得氮杂肽和肽模拟物可用于药物开发、疾病诊断、预防、抑制和治疗。
在某些实施例中,式(IA)、(IB)、(II)和(III)的化合物选自:
以及其药学上可接受的盐,其中“PG”为H或保护基团(例如,Phth、Boc、Fmoc、Ddz等)。
在某些实施例中,式(IA)、(IB)、(II)和(III)的化合物选自:N-(((1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基)氧基)羰基)-N-(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)甘氨酸(邻苯二甲酰基-氮杂-天冬氨酸-氨基甲酰基-O-苯并三唑)、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基苄基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-苯丙氨酸-氨基甲酰基-O-苯并三唑)、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)(甲基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-丙氨酸-氨基甲酰基-O-苯并三唑)、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基((1H-吡咯-2-基)甲基)(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-组氨酸-氨基甲酰基-O-苯并三唑)、3-((((1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基)氧基)羰基)(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基)丙酸(邻苯二甲酰基-氮杂-谷氨酸-氨基甲酰基-O-苯并三唑)、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基((1H-吲哚-3-基)甲基)(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-色氨酸-氨基甲酰基-O-苯并三唑)、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)(异丙基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-缬氨酸-氨基甲酰基-O-苯并三唑)、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)(异丁基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-亮氨酸-氨基甲酰基-O-苯并三唑)、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基(4-氨基丁基)(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-赖氨酸-氨基甲酰基-O-苯并三唑)、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)(2-(甲硫基)乙基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-半胱氨酸-氨基甲酰基-O-苯并三唑)、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)(4-羟基苄基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-酪氨酸-氨基甲酰基-O-苯并三唑)、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基仲丁基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-亮氨酸-氨基甲酰基-O-苯并三唑)、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)(3-胍基丙基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-精氨酸-氨基甲酰基-O-苯并三唑)、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-甘氨酸-氨基甲酰基-O-苯并三唑)、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基(2-氨基-2-氧代乙基)(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-天冬酰胺-氨基甲酰基-O-苯并三唑)、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基(3-氨基-3-氧代丙基)(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-谷氨酰胺-氨基甲酰基-O-苯并三唑)以及其药学上可接受的盐。
式(IV)的化合物
式(IV)的化合物在37℃下在pH约为7(例如,蒸馏水)的水性介质(例如,水溶液)中稳定至少30分钟、60分钟、90分钟、1小时、2小时、3小时、4小时或5小时。
式(IV)的化合物可用作用于合成氮杂肽和其他肽模拟物的结构单元或合成子。所得氮杂肽和肽模拟物可用于药物开发、疾病诊断、预防、抑制和治疗。
在某些实施例中,式(IV)的化合物选自:
以及其药学上可接受的盐,其中“PG”为H或保护基团(例如,Phth、Boc、Fmoc、Ddz等)。
在某些实施例中,式(IV)的化合物选自:N-(((1H-咪唑-1-基)氧基)羰基)-N-(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)甘氨酸(邻苯二甲酰基-氮杂-天冬氨酸-氨基甲酰基-O-咪唑)、1H-咪唑-1-基苄基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-苯丙氨酸-氨基甲酰基-O-咪唑)、1H-咪唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)(甲基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-丙氨酸-氨基甲酰基-O-咪唑)、1H-咪唑-1-基((1H-吡咯-2-基)甲基)(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-组氨酸-氨基甲酰基-O-咪唑)、3-((((1H-咪唑-1-基)氧基)羰基)(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基)丙酸(邻苯二甲酰基-氮杂-谷氨酸-氨基甲酰基-O-咪唑)、1H-咪唑-1-基((1H-吲哚-3-基)甲基)(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-色氨酸-氨基甲酰基-O-咪唑)、1H-咪唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)(异丙基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-缬氨酸-氨基甲酰基-O-咪唑)、1H-咪唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)(异丁基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-亮氨酸-氨基甲酰基-O-咪唑)、1H-咪唑-1-基(4-氨基丁基)(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-赖氨酸-氨基甲酰基-O-咪唑)、1H-咪唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)(2-(甲硫基)乙基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-半胱氨酸-氨基甲酰基-O-咪唑)、1H-咪唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)(4-羟基苄基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-酪氨酸-氨基甲酰基-O-咪唑)、1H-咪唑-1-基仲丁基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-异亮氨酸-氨基甲酰基-O-咪唑)、1H-咪唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)(3-胍基丙基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-精氨酸-氨基甲酰基-O-咪唑)、1H-咪唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-甘氨酸-氨基甲酰基-O-咪唑)、1H-咪唑-1-基(2-氨基-2-氧代乙基)(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-天冬酰胺-氨基甲酰基-O-咪唑)、1H-咪唑-1-基(3-氨基-3-氧代丙基)(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-谷氨酰胺-氨基甲酰基-O-咪唑),以及其药学上可接受的盐。
氮杂肽和α-碳全氮取代肽的合成
式(IA)、(IB)、(II)、(III)和(IV)的化合物可通过溶液相或液相、固相和混合溶液相/固相合成方法以线性、分步、链延长方式彼此偶联、与氨基酸、氮杂氨基酸、肽、氮杂肽和α-碳全氮取代肽偶联,以构建式(V)的化合物。
式(IA)、(IB)、(II)、(III)和(IV)的化合物也可以用作例如亚单体以延伸和/或封端肽和氮杂肽。
例如,在某些实施例中,式(IA)、(IB)、(II)和(IV)的化合物可被碘甲烷活化,并且所活化的化合物可以通过溶液相或液相合成方法偶联,例如受保护或未受保护的氮杂氨基酸;受保护或未受保护的肽;受保护或未受保护的氮杂肽;受保护或未受保护的α-碳全氮取代肽;或受保护或未受保护的式(IA)、式(IB)、式(II)、式(III)或式(IV)的化合物;或受保护或未受保护的肼,例如以形成式(V)的化合物。氨基酸、氮杂氨基酸、肽、氮杂肽、式(IA)、(IB)、(II)、(III)和(IV)的化合物各自可为未取代的或被以下中的一者或多者取代:卤素(Cl、F或Br)、C1-C6烷基(例如,甲基)、羟基、-COOH、-COH、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基(例如,氯甲基、氟甲基等)。所述偶联可以例如长达约20小时。在某些实施例中,可以在约30分钟、约40分钟、约50分钟、约60分钟、约70分钟、约80分钟、约90分钟、约100分钟、约110分钟或约120分钟内完成所述偶联。
本发明的方法可以用于合成长度为2至200聚体的氮杂肽和α-碳全氮取代肽,例如二-α-碳全氮取代肽、三-α-碳全氮取代肽、四氮杂肽、五氮杂肽等。在某些实施例中,肽的长度为9聚体。
在某些实施例中,制备氮杂肽或α-碳全氮取代肽的方法包括使肽(例如,式(VI)的化合物)水解成片段以及使一个或多个片段与式(IA)、(IB)、(II)、(III)或(VI)的化合物反应。
在某些实施例中,制备氮杂肽或α-碳全氮取代肽的方法包括使肽(例如,式(VI)的化合物)裂解成片段以及使一个或多个片段与式(IA)、(IB)、(II)、(III)或(VI)的化合物反应。
在某些实施例中,制备氮杂肽或α-碳全氮取代肽的方法包括裂解肽(例如,式(VI)的化合物)的末端以及使裂解的肽与式(IA)、(IB)、(II)、(III)或(VI)的化合物反应。
在某些实施例中,制备氮杂肽或α-碳全氮取代肽的方法包括使式(IA)、(IB)、(II)、(III)或(VI)的化合物与截短肽反应。
在某些实施例中,制备氮杂肽或α-碳全氮取代肽的方法包括将式(IA)、(IB)、(II)、(III)或(VI)的化合物与截短肽(例如,式(VI)的化合物)缀合。
在某些实施例中,氮杂肽或α-碳全氮取代肽合成的方法包括使(i)氮杂氨基酸的苯并三唑衍生物,其包括在其N末端共价结合(缀合)至保护基团并在其C末端共价结合(缀合)至苯并三唑的氮杂氨基酸;与(ii)肽反应,以形成氮杂肽或α-碳全氮取代肽,其中氮杂氨基酸、氮杂肽或α-碳全氮取代肽的苯并三唑衍生物为式(IA)、(IB)、(II)或(III)的化合物。
在某些实施例中,氮杂肽或α-碳全氮取代肽合成的方法包括使(i)氮杂氨基酸的咪唑衍生物,其包括在其N末端共价结合(缀合)至保护基团并在其C末端共价结合(缀合)至咪唑的氮杂氨基酸,其中氮杂氨基酸选自:氮杂甘氨酸、氮杂丙氨酸、氮杂缬氨酸、氮杂亮氨酸、氮杂异亮氨酸、氮杂脯氨酸、氮杂苯丙氨酸、氮杂酪氨酸、氮杂色氨酸、氮杂天冬氨酸、氮杂谷氨酸、氮杂天冬酰胺、氮杂谷氨酰胺、氮杂组氨酸、氮杂赖氨酸和氮杂精氨酸;与(ii)酰肼反应,以形成氮杂肽。在某些实施例中,咪唑衍生物为式(IV)的化合物。
式(V)的化合物的用途
式(V)的化合物为式(VI)的化合物的氮杂肽类似物。在优选的实施例中,式(V)的化合物比式(VI)的化合物更耐水解和/或酶促降解。
式(V)的化合物可用于在体外和体内抑制肽酶。肽酶可以是例如内肽酶、外肽酶、天冬氨酸蛋白酶、谷氨酸蛋白酶、天冬酰胺肽裂解酶或逆转录病毒蛋白酶。
在这些优选的实施例中的一些实施例中,例如由于更适合生物受体,式(V)的化合物比式(VI)的化合物更有效。式(V)的化合物可以例如用于药物开发、疾病诊断、预防、抑制和治疗。
式(V)的化合物可各自包括2至200个羰基基团。例如,式(V)的化合物可各自包括2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、36、37、38、39、40、41、43、44、56或166个羰基基团。在某些实施例中,式(V)的化合物包括2至60个羰基基团、2至50个羰基基团、2至40个羰基基团、2至30个羰基基团、2至25个羰基基团、2至20个羰基基团、2至15个羰基基团、2至12个羰基基团、2至10个羰基基团、2至9个羰基基团、3至40个羰基基团、3至30个羰基基团、3至25个羰基基团、3至20个羰基基团、3至15个羰基基团、3至12个羰基基团、3至10个羰基基团或3至9个羰基基团。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括2至200个羰基基团和共价结合至至少一个所述羰基基团的至少一个α-氮,并且具有比肽大的生物利用度(例如,口服、经皮和/或鼻内),所述肽与式(V)的化合物在结构上不同之处仅在于肽包括α-碳而非所述α-氮。在某些实施例中,α-氮在式(V)的化合物的N末端或C末端处。在某些实施例中,α-氮在式(V)的化合物的N末端和C末端处。在某些实施例中,α-氮不在式(V)的化合物的N末端处也不在C末端处,而在肽的裂解或水解位点处。
在某些实施例中,式(V)的化合物为治疗肽的氮杂肽类似物。
在某些实施例中,式(V)的化合物为诊断肽的氮杂肽类似物。
式(V)的化合物可以用于药物开发、疾病诊断、预防、抑制和治疗。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括含有2至200个羰基基团和共价结合至至少一个所述羰基基团的主链,并且对治疗受试者的病症在治疗上有效,同时与式(V)的化合物在结构上不同之处仅在于肽包括α-碳而非所述α-氮对治疗所述病症在治疗上无效。例如可在肽的N末端处(即,肽的第一残基)、肽的第二残基处、肽的C末端处(即,肽的最后一个残基)、共价结合至肽的C末端的残基和/或肽的另一个残基处(例如,在肽的水解位点处)进行置换。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括2至200个羰基基团和共价结合至至少一个所述羰基基团的α-氮,并且具有比肽大的治疗功效,所述肽与式(V)的化合物在结构上不同之处仅在于肽包括α-碳而非所述α-氮。例如可在肽的N末端处(即,肽的第一残基)、肽的第二残基处、肽的C末端处(即,肽的最后一个残基)、共价结合至肽的C末端的残基和/或肽的另一个残基处(例如,在肽的水解位点处)进行置换。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括2至200个羰基基团和共价结合至至少一个所述羰基基团的α-氮,并且具有比肽长的治疗活性持续时间,所述肽与式(V)的化合物在结构上不同之处仅在于肽包括α-碳而非所述α-氮。例如可在肽的N末端处(即,肽的第一残基)、肽的第二残基处、肽的C末端处(即,肽的最后一个残基)、共价结合至肽的C末端的残基和/或肽的另一个残基处(例如,在肽的水解位点处)进行置换。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括2至75个羰基基团和共价结合至至少一个所述羰基基团的至少一个α-氮,并且具有比肽大的体内半衰期,所述肽与式(V)的化合物在结构上不同之处仅在于所述至少一个α-氮被α-碳置换。例如可在肽的N末端处(即,肽的第一残基)、肽的第二残基处、肽的C末端处(即,肽的最后一个残基)、共价结合至肽的C末端的残基和/或肽的另一个残基处(例如,在肽的水解位点处)进行置换。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括含有2至75个羰基基团的主链,其中至少两个羰基基团共价结合至三价氮,并且式(V)的化合物具有比肽大的体内半衰期,所述肽与式(V)的化合物在结构上不同之处仅在于所述式(V)的化合物的一个或多个α氮被α碳置换。例如可在肽的N末端处(即,肽的第一残基)、肽的第二残基处、肽的C末端处(即,肽的最后一个残基)、共价结合至肽的C末端的残基和/或肽的另一个残基处(例如,在肽的水解位点处)进行置换。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括至少一个氮杂氨基酸,并且具有比肽大的体内半衰期,所述肽与式(V)的化合物在结构上不同之处仅在于氮杂氨基酸被相应氨基酸置换。例如可在肽的N末端处(即,肽的第一残基)、肽的第二残基处、肽的C末端处(即,肽的最后一个残基)、共价结合至肽的C末端的残基和/或肽的另一个残基处(例如,在肽的水解位点处)进行置换。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括2至200个羰基基团和共价结合至至少一个所述羰基基团的α-氮,并且比肽更耐蛋白酶降解,所述肽与式(V)的化合物在结构上不同之处仅在于肽包括α-碳而非所述α-氮。例如可在肽的N末端处(即,肽的第一残基)、肽的第二残基处、肽的C末端处(即,肽的最后一个残基)、共价结合至肽的C末端的残基和/或肽的另一个残基处(例如,在肽的水解位点处)进行置换。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括2至200个羰基基团和共价结合至至少一个所述羰基基团的α-氮,并且具有比肽大的对生物受体的亲和力,所述肽与式(V)的化合物在结构上不同之处仅在于肽包括α-碳而非所述α-氮。例如可在肽的N末端处(即,肽的第一残基)、肽的第二残基处、肽的C末端处(即,肽的最后一个残基)、共价结合至肽的C末端的残基和/或肽的另一个残基处(例如,在肽的水解位点处)进行置换。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括2至60个羰基基团。
在某些实施例中,式(V)的化合物为线性的。
在某些实施例中,式(V)的化合物为环状的。
在某些实施例中,式(V)的化合物为聚乙二醇化的。
在某些实施例中,式(V)的化合物与免疫球蛋白缀合。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括其主链的N末端的α-氮。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括其主链的C末端的α-氮。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括两个羰基基团和两个α-氮。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括三个羰基基团和一个α-氮。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括三个羰基基团和两个α-氮。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括三个羰基基团和三个α-氮。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括四个羰基基团和一个α-氮。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括四个羰基基团和两个α-氮。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括四个羰基基团和三个α-氮。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括四个羰基基团和四个α-氮。
在某些实施例中,式(V)的化合物为包括氨基酸的2至200个氨基酸肽的氮杂肽类似物,所述氨基酸选自:甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸、天冬氨酸、谷氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、组氨酸、赖氨酸和精氨酸;氮杂类似物与氨基酸肽的不同之处在于肽的氨基酸被相应氮杂氨基酸置换。
在某些实施例中,式(V)的化合物为包括氨基酸的2至200个氨基酸肽的氮杂肽类似物,所述氨基酸选自:甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸、天冬氨酸、谷氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、组氨酸、赖氨酸和精氨酸,其中类似物包括氨基酸的至少一个相应氮杂氨基酸。
在某些实施例中,式(V)的化合物为2至200个氨基酸肽的氮杂肽类似物,所述2至200个氨基酸肽包括氨基酸,其选自:甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸、天冬氨酸、谷氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、组氨酸、赖氨酸、精氨酸,类似物与氨基酸肽的不同之处在于氮杂类似物包括氮杂氨基酸而非至少一个氨基酸,其中氮杂类似物包括氮杂甘氨酸而非甘氨酸,和/或氮杂类似物包括氮杂丙氨酸而非丙氨酸,和/或氮杂类似物包括氮杂缬氨酸而非缬氨酸,和/或氮杂类似物包括氮杂亮氨酸而非亮氨酸,或/和氮杂类似物包括氮杂异亮氨酸而非异亮氨酸,和/或氮杂类似物包括氮杂脯氨酸而非脯氨酸,和/或氮杂类似物包括氮杂苯丙氨酸而非苯丙氨酸,或/和氮杂类似物包括氮杂酪氨酸而非酪氨酸,和/或氮杂类似物包括氮杂色氨酸而非色氨酸,或/和氮杂类似物包括氮杂天冬氨酸而非天冬氨酸,和/或氮杂类似物包括氮杂谷氨酸而非谷氨酸,和/或氮杂类似物包括氮杂天冬酰胺而非天冬酰胺,和/或氮杂类似物包括氮杂谷氨酰胺而非谷氨酰胺,和/或氮杂类似物包括氮杂组氨酸而非组氨酸,和/或氮杂类似物包括氮杂赖氨酸而非赖氨酸,和/或氮杂类似物包括氮杂精氨酸而非精氨酸。
某些实施例中,式(V)的化合物为包含2至50个氨基酸的肽的氮杂肽类似物,所述氨基酸选自:甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸、天冬氨酸、谷氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、组氨酸、赖氨酸、精氨酸,并且至少2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸被相应氮杂氨基酸置换。在这些实施例中的一些实施例中,所置换的氨基酸为肽的第一个氨基酸。在这些实施例中的一些实施例中,所置换的氨基酸为肽的最后一个氨基酸。在这些实施例中的一些实施例中,肽的第一个氨基酸和最后一个氨基酸二者均被相应氮杂氨基酸置换。
在某些实施例中,式(V)的化合物为包括氨基酸的10聚体肽的氮杂肽类似物,所述氨基酸选自:甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸、天冬氨酸、谷氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、组氨酸、赖氨酸和精氨酸;氮杂类似物与氨基酸肽的不同之处在于肽的氨基酸被相应氮杂氨基酸置换。
在某些实施例中,式(V)的化合物为包括氨基酸的9聚体肽的氮杂肽类似物,所述氨基酸选自:甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸、天冬氨酸、谷氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、组氨酸、赖氨酸和精氨酸;氮杂类似物与氨基酸肽的不同之处在于肽的氨基酸被相应氮杂氨基酸置换。
在某些实施例中,式(V)的化合物为包括氨基酸的8聚体肽的氮杂肽类似物,所述氨基酸选自:甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸、天冬氨酸、谷氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、组氨酸、赖氨酸和精氨酸;氮杂类似物与氨基酸肽的不同之处在于肽的氨基酸被相应氮杂氨基酸置换。
在某些实施例中,式(V)的化合物为包括氨基酸的7聚体肽的氮杂肽类似物,所述氨基酸选自:甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸、天冬氨酸、谷氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、组氨酸、赖氨酸和精氨酸;氮杂类似物与氨基酸肽的不同之处在于肽的氨基酸被相应氮杂氨基酸置换。
在某些实施例中,式(V)的化合物为包括氨基酸的6聚体肽的氮杂肽类似物,所述氨基酸选自:甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸、天冬氨酸、谷氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、组氨酸、赖氨酸和精氨酸;氮杂类似物与氨基酸肽的不同之处在于肽的氨基酸被相应氮杂氨基酸置换。
在某些实施例中,式(V)的化合物为包括氨基酸的5聚体肽的氮杂肽类似物,所述氨基酸选自:甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸、天冬氨酸、谷氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、组氨酸、赖氨酸和精氨酸;氮杂类似物与氨基酸肽的不同之处在于肽的氨基酸被相应氮杂氨基酸置换。
在某些实施例中,式(V)的化合物为包括氨基酸的5聚体肽的氮杂肽类似物,所述氨基酸选自:甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸、天冬氨酸、谷氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、组氨酸、赖氨酸和精氨酸;氮杂类似物与氨基酸肽的不同之处在于肽的氨基酸被相应氮杂氨基酸置换。
在某些实施例中,式(V)的化合物为包括氨基酸的4聚体肽的氮杂肽类似物,所述氨基酸选自:甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸、天冬氨酸、谷氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、组氨酸、赖氨酸和精氨酸;氮杂类似物与氨基酸肽的不同之处在于肽的氨基酸被相应氮杂氨基酸置换。
在某些实施例中,式(V)的化合物为包括氨基酸的3聚体肽的氮杂肽类似物,所述氨基酸选自:甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸、天冬氨酸、谷氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、组氨酸、赖氨酸和精氨酸;氮杂类似物与氨基酸肽的不同之处在于肽的氨基酸被相应氮杂氨基酸置换。
在某些实施例中,肽的最后一个氨基酸选自:天冬氨酸、苯丙氨酸和精氨酸。
在某些实施例中,肽的第一个氨基酸选自:酪氨酸、苯丙氨酸和精氨酸。
在某些实施例中,肽的第一个氨基酸和最后一个氨基酸是相同的。
在某些实施例中,肽的第一个氨基酸和最后一个氨基酸是不同的。
在某些实施例中,式(V)的化合物不是α-碳全氮取代肽。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括氨基酸,其选自:半胱氨酸、甲硫氨酸、丝氨酸和苏氨酸。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括至少一个、至少两个或至少三个氮杂甘氨酸。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括至少一个、至少两个或至少三个氮杂丙氨酸。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括至少一个、至少两个或至少三个氮杂缬氨酸。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括至少一个、至少两个或至少三个氮杂亮氨酸。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括至少一个、至少两个或至少三个氮杂异亮氨酸。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括至少一个、至少两个或至少三个氮杂脯氨酸。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括至少一个、至少两个或至少三个氮杂苯丙氨酸。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括至少一个、至少两个或至少三个氮杂酪氨酸。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括至少一个、至少两个或至少三个氮杂色氨酸。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括至少一个、至少两个或至少三个氮杂天冬氨酸。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括至少一个、至少两个或至少三个氮杂谷氨酸。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括至少一个、至少两个或至少三个氮杂天冬酰胺。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括至少一个、至少两个或至少三个氮杂谷氨酰胺。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括至少一个、至少两个或至少三个氮杂组氨酸。
在某些实施括中,式(V)的化合物包括至少一个、至少两个或至少三个氮杂赖氨酸。
在某些实施例中,式(V)的化合物包括至少一个、至少两个或至少三个氮杂精氨酸。
某些实施例中,式(V)化合物在其N末端和/或C末端包括氮杂甘氨酸、氮杂丙氨酸、氮杂缬氨酸、氮杂亮氨酸、氮杂异亮氨酸、氮杂脯氨酸、氮杂苯丙氨酸、氮杂酪氨酸、氮杂色氨酸、氮杂天冬氨酸、氮杂谷氨酸、氮杂天冬酰胺、氮杂谷氨酰胺、氮杂组氨酸、氮杂赖氨酸或氮杂精氨酸。
在某些实施例中,式(V)的化合物在其N末端和/或C末端包括氮杂甘氨酸、氮杂丙氨酸、氮杂缬氨酸、氮杂亮氨酸、氮杂异亮氨酸、氮杂脯氨酸、氮杂苯丙氨酸、氮杂酪氨酸、氮杂色氨酸、氮杂天冬氨酸、氮杂谷氨酸、氮杂天冬酰胺、氮杂谷氨酰胺、氮杂组氨酸、氮杂赖氨酸或氮杂精氨酸,并且为治疗性肽的氮杂类似物,并且具有比治疗性肽(在其未改变状态下)大的生物利用度(例如,口服、经皮和/或鼻内)。
在某些实施例中,式(V)的化合物在其N末端和/或C末端包括氮杂甘氨酸、氮杂丙氨酸、氮杂缬氨酸、氮杂亮氨酸、氮杂异亮氨酸、氮杂脯氨酸、氮杂苯丙氨酸、氮杂酪氨酸、氮杂色氨酸、氮杂天冬氨酸、氮杂谷氨酸、氮杂天冬酰胺、氮杂谷氨酰胺、氮杂组氨酸、氮杂赖氨酸或氮杂精氨酸,并且为治疗性肽的氮杂类似物,保持治疗性肽的治疗功效并且具有比治疗性肽的体内半衰期大的体内半衰期。
在某些实施例中,式(V)的化合物在其N末端和/或C末端包括氮杂甘氨酸、氮杂丙氨酸、氮杂缬氨酸、氮杂亮氨酸、氮杂异亮氨酸、氮杂脯氨酸、氮杂苯丙氨酸、氮杂酪氨酸、氮杂色氨酸、氮杂天冬氨酸、氮杂谷氨酸、氮杂天冬酰胺、氮杂谷氨酰胺、氮杂组氨酸、氮杂赖氨酸或氮杂精氨酸,并且为治疗性肽的氮杂类似物,并且具有比治疗性肽长的治疗活性持续时间。
在某些实施例中,式(V)的化合物在其N末端和/或C末端包括氮杂甘氨酸、氮杂丙氨酸、氮杂缬氨酸、氮杂亮氨酸、氮杂异亮氨酸、氮杂脯氨酸、氮杂苯丙氨酸、氮杂酪氨酸、氮杂色氨酸、氮杂天冬氨酸、氮杂谷氨酸、氮杂天冬酰胺、氮杂谷氨酰胺、氮杂组氨酸、氮杂赖氨酸或氮杂精氨酸,为治疗性肽的氮杂类似物,并且比治疗性肽更耐蛋白酶降解。
在某些实施例中,式(V)的化合物在其N末端和/或C末端包括氮杂甘氨酸、氮杂丙氨酸、氮杂缬氨酸、氮杂亮氨酸、氮杂异亮氨酸、氮杂脯氨酸、氮杂苯丙氨酸、氮杂酪氨酸、氮杂色氨酸、氮杂天冬氨酸、氮杂谷氨酸、氮杂天冬酰胺、氮杂谷氨酰胺、氮杂组氨酸、氮杂赖氨酸或氮杂精氨酸,为治疗性肽的氮杂类似物,并且具有比治疗性肽大的对生物受体的亲和力。
二-α-碳全氮取代肽
在某些实施例中,式(V)的化合物为式(IX)的化合物的二-α-碳全氮取代肽
或其药学上可接受的盐,其中R选自:天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺和谷氨酰胺的未取代的和取代的侧链基团。
例如可通过溶液相或固相合成来制备二-α-碳全氮取代肽。在某些实施例中,产率(以重量计%)为约80%至约98%。
二-α-碳全氮取代肽可制备为具有C-至-N末端构造和N-至-C末端构造。
三-α-碳全氮取代肽
在某些实施例中,式(V)的化合物或为式(X)的三-α-碳全氮取代肽:
或其药学上可接受的盐,其中R选自:天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸(包括R-异亮氨酸、S-异亮氨酸和RS-异亮氨酸)、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺、脯氨酸和谷氨酰胺的未取代的和取代的侧链基团。
例如可通过溶液相或固相合成来制备三-α-碳全氮取代肽。
三-α-碳全氮取代肽可制备为具有C-至-N末端结构和N-至-C末端结构。
四-氮杂肽
在某些实施例中,式(V)的化合物为以下式的化合物:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施例中,式(V)的化合物为以下式的化合物:
或其药学上可接受的盐。
例如可通过溶液相或固相合成来制备四-α-碳全氮取代肽。
四-α-碳全氮取代肽可制备为具有C-至-N末端结构和N-至-C末端结构。
九聚体氮杂肽
在某些实施例中,式(V)的化合物为以下式的化合物:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施例中,式(V)的化合物为以下式的化合物:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施例中,式(V)的化合物为以下式的化合物:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施例中,式(V)的化合物为以下式的化合物:
或其药学上可接受的盐。
在某些实施例中,式(V)的化合物为以下式的化合物:
或其药学上可接受的盐。
例如可以通过溶液相、固相合成以及溶液相和固相合成的组合来制备九聚体氮杂肽。
九聚体氮杂肽可制备为具有C-至-N末端结构和N-至-C末端结构。
另外的氮杂肽
在某些实施例中,式(V)的化合物选自:A-6、A-623(AMG-623)、A-71378、A-75998、阿巴瑞克(PPI-149)、ABT-510、AC-100、AC-162352(PYY 3-36)、AC-253、AC-2592、AC-625、ACV-1、ADH-1、AEZS-108(AN-152)(ZEN-008)、AF-37702、阿法诺肽(EP-1647)(CUV-1647)(美拉诺坦I)、AG2/102、AG-284、AI-502、AKL-0707(LAB GHRH)、阿必鲁泰(GSK-716155)、艾博卫泰、ALG-889、丽蝇抗病毒肽、Allotrap 2702(B-2702)、ALTY-0601、ALX-40-4C、氨莫司汀(PTT-119)、阿那立肽、拮抗剂G(PTL-68001)、AOD-9604、APL-180、ATN-161、阿托西班(ORF-22164)、心房肽、阿肽地尔(PSD-510)、阿伏瑞林(EP-23904)、AZD-2315、氮替瑞林(YM-14673)、AZX-100、B27PD、BA-058、巴芦西班(FE-200400)、BAY-73-7977、BDM-E、BGC-728、BIM-23190、BIM-44002、BIO-1211、比伐卢定(BG-8865)、BMS-686117、布雷默浪丹(PT-141)、BRX-0585、布舍瑞林、降钙素(人类)、降钙素(鲑鱼)、卡贝缩宫素、卡非佐米(PR-171)、卡古缩宫素(Y-5350)、卡培立肽(SUN-4936)、卡索胺、CB-182804、CB-183315、CBP-501、CBT-101、CCK(25-33)、CD-NP、西马多丁(LU-103793)、西曲瑞克(NS-75)、CG-77X56、CGRP(LAB-CGRP)、氯毒素(TM-601)、西仑吉肽(EMD-121974)(EMD-85189)、CJC-1008(DAC:强啡肽A)、CJC-1131(DAC:GLP-1)、CJC-1134(PC-DAC)(毒晰外泌肽-4)、CJC-1295(DAC:GRF)、Cnsnqic-Cyclic(802-2)、坎普他汀(POT-4)、芋螺睡眠肽G、芋螺迟缓肽G(CGX-1007)、可的瑞林(NEU-3002)、CP-95253、C-肽(SPM-933)、CR-665、CR-845、CTCE-0214、CTCE-9908、CTS-21166(ASP-1702)(ATG-Z1)(OM-00-3)(OM-99-2)、CVX-045、CVX-060、CVX-096(PF-4856883)、CZEN-002、D-4F(APP-018)、达奈加肽(ZP-1609)(WAY-261134)(GAP-134)、达瓦林肽(AC-2307)、达夫奈肽(AL-108)(AL-208)、地加瑞克(FE 200486)、地米肽(RDP-58)、泊拉得可(CP-0127)、德舍瑞林、去氨加压素、地肽瑞里(RS-68439)、DG-3173(PTR-3173)、膜海鞘素B(NSC-325319)、地瑞考肽(MBP-8298)、地司特泰(NAFB-001)(P-144)、DMP-728(DU-728)、dnaJP1(AT-001)、多巴他汀(BIM-23A760)、DPK-060、DRF-7295、DSC-127、强啡肽A、E-2078、EA-230、依比拉肽(Hoe-427)、依多曲肽(SMT-487)、依屈肽(TV-4710)、依非加群(LY-294468)、依降钙素、章鱼唾腺精(ELD-950)、依利地新(PM-02734)、EMD-73495、恩夫韦地(T-20)、EP-100、EP-51216(EP-51389)、依替巴肽(C68-22)、ET-642(RLT-肽)、ETRX 101、艾沙瑞林(EP-23905)(MF-6003)、艾塞那肽(AC-2993)(LY-2148568)、Exsulin(INGAP肽)、F-991、FAR-404、FE 202158、苯赖升压素、FGLL、氟雷法胺(LEF-576)(SPD-759)(BCH-3963)、FX-06、加尼瑞克(Org-37462)(RS-26306)、格拉莫德(SKF-107647)、格拉替雷(COP-1)、胰高血糖素、葡萄糖戊基胞壁酰三肽、氧化型谷胱甘肽二钠盐(NOV-002)、甘氨酰-脯氨酰-谷氨酸、GMDP、戈洛莫德(SCV-07)、戈雷拉肽(BIM-32001)、戈舍瑞林(ICI-118630)、GPG-NH2、GTP-200、GTP-300、H-142、Hemoparatide(PTH(1-37))、六肽铜II(PC-1358)、组氨瑞林、hLF(1-11)、HP-228、I-040302(KUR-112)、艾替班特(JE-049)(HOE-140)、艾罗卡肽(ITF-1697)、IMX-942、伊帕瑞林(NNC-26-0161)、IPP-201101、艾塞加南(IB-367)、ISF402、伊妥瑞克(ORF-23541)、JTP-2942、KAI-1455、KAI-1678、KM-9803、KP-101(GHRP-1)、L-346670、L-364343、拉贝地米(RMP-7)、拉加肽(BN-52080)、兰瑞肽(ITM-014)、拉瑞唑来(AT-1001)(SPD-550)、来考诺肽(AM-336)、亮丙瑞林(SOT-375)、利那洛肽(MD-1100)(MM-41775)、利拉鲁肽(NN-2211)、利西拉来(AVE-0010)(ZP-10)、LSI-518P、芦西纳坦、卢舒普肽(BY-2001)、LY-2189265、LY-2510924、LY-548806、LYN-001、赖氨酸加压素、MER-104、甲硫脑啡肽(INNO-105)、美克法胺(LY-127623)、米伐木肽(CGP-19835)(MLV-19835)、孟替瑞林(CG-3703)、MPL-TLB100、MS肽、MT-II(PT-14)、莫拉丁酯(VA-101)(CY-220)、胞壁酰三肽、那法瑞林(RS-94991)、NBI-6024、奈米非肽(INN-00835)、Neogen、奈帕坦特(MEN-11420)、奈西立肽、尼法那塔(BW942C)、NNZ-2566、NP-213、NFC-567、NPY(24-36)(PTL-041120)、NT-13、奥尼匹肽(TM-30338)、奥曲肽(SMS-201-995)、奥谷法奈(IM-862)、OGP 10-14L、奥米加南(CPI-226)、OP-145、ORG-2766Org-42982(AG-4263)、鸟氨酸加压素、催产素、奥扎瑞克(D-63153)(SPI-153)、p-1025、P-113(PAC-113)、帕瑞肽(SOM-230)、peg-TPOmp(RWJ-800088)、喷替吉肽(TA-521)、Pep-F(5K)、肽肾素抑制剂、肽T(AIDS000530)、肽YY3-36、培西加南(MSI-78)、PF-4603629、PI-0824、PI-2301、PL-3994、PLD-116、PMX-53、POL-6326、泊替瑞林、PPI-1019、普拉莫瑞林、普兰林肽、普罗瑞林、PTH(7-34)、PTHrP-(1-36)、PTL-0901、PXL-01、R-1516、R-15-K、R-7089、RA肽、雷莫瑞克(Hoe-013)、RC-3095、Re-188-P-2045(P2045)、rGRF、咯咪珀咯(AMG-531)、罗莫肽(DJ-7041)、ROSE-010(GTP-010)(LY-307161)、罗替加肽(ZP-123)(GAP-486)、芦沙拉肽(TP-508)、SAN-134、沙拉新(P-113)、分泌素(人类)(PGN-52)(R-52)、分泌素(人类)(RG-1068)、司美格鲁肽(NN-9535)、SGS-111、西夫韦肽、SKF-101926、SKF-105494、SKF-110679(U-75799E)、索博列多汀(YHI-501)(TZT-1027)、生长抑素、生长抑素(D-Trp、D-Cys类似物)、SP-304(Guanilib)、SPC-3、SPI-1620、SST类似物、SUN-11031、SUN-E7001(CS-872)、SYN-1002、他比劳肽(RP-56142)、TAK-448、TAK-683、他替瑞林(TA-0910)、他西多丁(ILX-651)(BSF-223651)、他司鲁泰(BIM-51077)、TCMP-80、替度鲁肽(ALX-0600)、特立帕肽(LY-333334)、特拉吉仑(CP-80794)、特利加压素、替莫瑞林(TH-9507)、替维瑞克(EP-24332)、TH-0318、TH-9506、胸腺法新、胸腺抑素、Thymonoctan(FCE-25388)、胸腺五肽(TP-5)、胸腺素β-4、替夫韦肽(R-724)(T-1249)、替加泊肽(PCK-3145)、替利莫肽(NBI-5788)、TKS-1225(胃泌酸调节素)、TLN-232(CAP-232)(TT-232)、TM-30339、TP-9201、TRI-1144、曲卡克肽(AP-214)、曲来肽(Z-420)(ZAMI-420)、曲普瑞林(WY-42462)、TT-223(E1-INT)、TT-235、TX14(A)、酪丝亮肽(CMS-024)、酪丝缬肽(CMS-024-02)、乌拉立肽(CDD-95-126)(ESP-305)、未酰化胃饥饿素(AZP-01)(TH-0332)、尿皮素II、伐普肽(RC-160)、后叶加压素、VIR-576、Xen-2174、XG-102、XOMA-629、齐考诺肽(SNX-111)、ZP-120或ZP-1846的氮杂类似物。
在某些实施例中,式(V)的化合物选自:AC-2592、AC-625、阿那立肽、APL-180、心房肽、BGC-728、卡培立肽(SUN-4936)、CD-NP、CG-77X56、D-4F(APP-018)、达奈加肽(ZP-1609)(WAY-261134)(GAP-134)、DMP-728(DU-728)、依非加群(LY-294468)、EMD-73495、依替巴肽(C68-22)、ET-642(RLT-肽)、FE 202158、FX-06、艾替班特(JE-049)(HOE-140)、艾罗卡肽(ITF-1697)、KAI-1455、KM-9803、L-346670、L-364343、LSI-518P、奈西立肽、肽肾素抑制剂、PL-3994、罗替加肽(ZP-123)(GAP-486)、沙拉新(P-113)、SKF-105494、特拉吉仑(CP-80794)、曲卡克肽(AP-214)、乌拉立肽(CDD-95-126)(ESP-305)、尿皮素II、齐考诺肽(SNX-111)或ZP-120的氮杂类似物;并且在治疗心血管疾病(例如,减轻心血管疾病的一种或多种症状)中具有效用。
在某些实施例中,式(V)的化合物选自:氮替瑞林(YM-14673)、芋螺睡眠肽G、可的瑞林(NEU-3002)、CTS-21166(ASP-1702)(ATG-Z1)(OM-00-3)(OM-99-2)、达夫奈肽(AL-108)(AL-208)、泊拉得可(CP-0127)、依比拉肽(Hoe-427)、FGLL、甘氨酰-脯氨酰-谷氨酸、JTP-2942、孟替瑞林(CG-3703)、奈米非肽(INN-00835)、NNZ-2566、NT-13、ORG-2766、肽T(AIDS000530)、泊替瑞林、PPI-1019、普罗瑞林、分泌素(人类)(RG-1068)、SGS-111、他替瑞林(TA-0910)、XG-102或齐考诺肽(SNX-111)的氮杂类似物,并且在治疗CNS病症(例如,减轻CNS病症的一种或多种症状)中具有效用。
在某些实施例中,式(V)的化合物选自:A-6、阿巴瑞克(PPI-149)、ABT-510、ADH-1、AEZS-108(AN-152)(ZEN-008)、氨莫司汀(PTT-119)、拮抗剂G(PTL-68001)、ATN-161、阿伏瑞林(EP-23904)、布舍瑞林、卡非佐米(PR-171)、CBP-501、西马多丁(LU-103793)、氯毒素(TM-601)、西仑吉肽(EMD-121974)(EMD-85189)、CTCE-9908、CVX-045、CVX-060、地加瑞克(FE200486)、膜海鞘素B(NSC-325319)、DRF-7295、依多曲肽(SMT-487)、依利地新(PM-02734)、EP-100、氧化型谷胱甘肽二钠盐(NOV-002)、戈雷拉肽(BIM-32001)、戈舍瑞林(ICI-118630)、组氨瑞林、拉贝地米(RMP-7)、亮丙瑞林(SOT-375)、LY-2510924、甲硫脑啡肽(INNO-105)、米伐木肽(CGP-19835)(MLV-19835)、胞壁酰三肽、奥扎瑞克(D-63153)(SPI-153)、POL-6326、雷莫瑞克(Hoe-013)、RC-3095、Re-188-P-2045(P2045)、罗莫肽(DJ-7041)、索博列多汀(YHI-501)(TZT-1027)、SPI-1620、他比劳肽(RP-56142)、TAK-448、TAK-683、他西多丁(ILX-651)(BSF-223651)、替维瑞克(EP-24332)、替加泊肽(PCK-3145)、TLN-232(CAP-232)(TT-232)、曲普瑞林(WY-42462)、酪丝亮肽(CMS-024)、酪丝缬肽(CMS-024-02)、ZP-1848、ZT0131的氮杂类似物;并且在治疗肿瘤病状(例如,减轻肿瘤病状的一种或多种症状)中具有效用。
在某些实施例中,式(V)的化合物选自:A-623(AMG-623)、AG-284、AI-502、Allotrap 2702(B-2702)、AZD-2315、Cnsnqic-Cyclic(802-2)、地米肽(RDP-58)、地瑞考肽(MBP-8298)、地司特泰(NAFB-001)(P-144)、dnaJP1(AT-001)、依屈肽(TV-4710)、F-991、FAR-404、格拉莫德(SKF-107647)、格拉替雷(COP-1)、GMDP、IPP-201101、艾替班特(JE 049)(HOE-140)、MS肽、Org-42982(AG-4263)、喷替吉肽(TA-521)、PI-0824、PI-2301、PLD-116、PMX-53、PTL-0901、RA肽、TCMP-80、胸腺抑素、胸腺五肽(TP-5)、替利莫肽(NBI-5788)或ZP-1848的氮杂类似物;并且在治疗过敏症和免疫学病症中具有效用。
在某些实施例中,式(V)的化合物选自:A-71378、AC-162352(PYY 3-36)、AC-253、AG2/102、AKL-0707(LAB GHRH)、阿必鲁泰(GSK-716155)、AOD-9604、BAY-73-7977、BIM-44002、BMS-686117、BRX-0585、CJC-1131(DAC:GLP-1)、CJC-1134(PC-DAC)(毒晰外泌肽-4)、CJC-1295(DAC:GRF)、CP-95253、CVX-096(PF-4856883)、达瓦林肽(AC-2307)、艾塞那肽(AC-2993)(LY-2148568)、Exsulin(INGAP肽、胰高血糖素、ISF402、利拉鲁肽(NN-2211)、利西拉来(AVE-0010)(ZP-10)、LY-2189265、LY-548806、那法瑞林(RS 94991)、NBI-6024、奥尼匹肽(TM-30338)、肽YY 3-36、PF-4603629、普兰林肽、R-7089、司美格鲁肽(NN-9535)、SST类似物、SUN-E7001(CS-872)、他司鲁泰(BIM-51077)、替莫瑞林(TH-9507)、TH-0318、TKS-1225(胃泌酸调节素)、TM-30339、TT-223(E1-INT)、未酰化胃饥饿素(AZP-01)(TH-0332)或ZT0131的氮杂类似物,并且在治疗代谢病症(例如,减轻代谢病症的一种或多种症状)中具有效用。
在某些实施例中,式(V)的化合物选自:A-75998、布舍瑞林、西曲瑞克(NS-75)、地肽瑞里(RS-68439)、加尼瑞克(Org-37462)(RS-26306)、伊妥瑞克、那法瑞林(RS-94991)或曲普瑞林(WY-42462)的氮杂类似物;并且在治疗生育力中具有效用。
在某些实施例中,式(V)的化合物选自:AC-100和p-1025的氮杂类似物,并且在治疗牙科病症中具有效用。
在某些实施例中,式(V)的化合物选自:ACV-1、芋螺睡眠肽G、CJC-1008(DAC:强啡肽A)、芋螺迟缓肽G(CGX-1007)、CR-665、CR-845、强啡肽A、E-2078、苯赖加压素、氟雷法胺(LEF-576)(SPD-759)(BCH-3963)、HP-228、艾替班特(JE-049)(HOE-140)、KAI-1678、来考诺肽(AM-336)、美克法胺(LY-127623)、MPL-TLB100、NT-13、SYN-1002、TX14(A)、Xen-2174和齐考诺肽(SNX-111)的氮杂类似物;并且在治疗疼痛中具有效用。
在某些实施例中,式(V)的化合物选自:阿法诺肽(EP-1647)(CUV-1647)(美拉诺坦I)、AZX-100、DPK-060、DSC-127、Hemoparatide(PTH(1-37))、六肽铜II(PC-1358)、培西加南(MSI-78)、PTH(7-34)、PXL-01、SKF-110679(U-75799E)或胸腺素β-4的氮杂类似物;并且在治疗皮肤病状(例如,减轻皮肤病状的一种或多种症状)中具有效用。
在某些实施例中,式(V)的化合物选自:AF-37702、比伐卢定(BG-8865)、卡非佐米(PR-171)、CTCE-0214、ETRX 101、H-142、OGP 10-14L、鸟氨酸加压素、peg-TPOmp(RWJ-800088)、R-1516、咯咪珀咯(AMG-531)和TP-9201的氮杂类似物;并且在治疗血液学病症(例如,减轻血液学病症的一种或多种症状)中具有效用。
在某些实施例中,式(V)的化合物选自:艾博卫泰、ALG-889、丽蝇抗病毒肽、ALX-40-4C、CB-182804、CB-183315、CZEN-002、恩夫韦地(T-20)、葡萄糖戊基胞壁酰三肽、戈洛莫德(SCV-07)、GPG-NH2、hLF(1-11)、IMX-942、艾塞加南(IB-367)、莫拉丁酯(VA-101)(CY-220)、Neogen、NP-213、奥谷法奈(IM-862)、奥米加南(CPI-226)、OP-145、p-1025、P-113(PAC-113)、Pep-F(5K)、R-15-K、西夫韦肽、SPC-3、胸腺法新、Thymonoctan(FCE-25388)、替夫韦肽(R-724)(T-1249)、TRI-1144、VIR-576或XOMA-629的氮杂类似物;并且作为抗微生物剂或抗病毒剂具有效用。
在某些实施例中,式(V)的化合物选自:ALTY-0601、B27PD、BDM-E、BIM-23190、CBT-101、坎普他汀(POT-4)、章鱼唾腺精(ELD-950)和LYN-001的氮杂类似物,并且在治疗眼科病症中具有效用。
在某些实施例中,式(V)的化合物选自:阿托西班(ORF-22164)、巴芦西班(FE-200400)、卡贝缩宫素、卡古缩宫素(Y-5350)、德舍瑞林、催产素或TT-235的氮杂类似物,且在治疗OB-GYN病症中具有效用。
在某些实施例中,式(V)的化合物选自:阿肽地尔(PSD-510)、布雷默浪丹(PT-141)、C-肽(SPM-933)、去氨加压素、EA-230、赖氨酸加压素、MER-104、MT-II(PT-14)、SKF-101926或后叶加压素的氮杂类似物,并且在治疗泌尿道病状(例如,减轻泌尿道病状的一种或多种症状)中具有效用。
在某些实施例中,式(V)的化合物选自:AC-100、BA-058、降钙素(人类)、降钙素(鲑鱼)、依降钙素、I-040302(KUR-112)、PTHrP-(1-36)、芦沙拉肽(TP-508)、SAN-134、特立帕肽(LY-333334)或ZT031的氮杂类似物;并且在治疗骨骼和结缔组织病症中具有效用。
在某些实施例中,式(V)的化合物选自:BIO-1211、CGRP(LAB-CGRP)、葡萄糖戊基胞壁酰三肽、GMDP、艾罗卡肽(ITF-1697)、芦西纳坦、卢舒普肽(BY-2001)、NPC-567、NPY(24-36)(PTL-041120)或分泌素(人类)(PGN-52)(R-52)的氮杂类似物;并且在治疗呼吸道病状(例如,减轻呼吸道病状的一种或多种症状)中具有效用。
在某些实施例中,式(V)的化合物选自:卡索胺、CCK(25-33)、拉加肽(BN-52080)、拉瑞唑来(AT-1001)(SPD-550)、利那洛肽(MD-1100)(MM-41775)、奈帕坦特(MEN-11420)、尼法那塔(BW942C)、ROSE-010(GTP-010)(LY-307161)、生长抑素、生长抑素(D-Trp、D-Cys类似物)、SP-304(Guanilib)、替度鲁肽(ALX-0600)、特利加压素、曲来肽(Z-420)(ZAMI-420)、伐普肽(RC-160)、ZP-1846或ZP-1846的氮杂类似物;并且在治疗胃肠道病症(例如,减轻胃肠道病症的一种或多种症状)中具有效用。
在某些实施例中,式(V)的化合物选自:CJC-1295(DAC:GRF)、DG-3173(PTR-3173)、多巴他汀(BIM-23A760)、EP-51216(EP-51389)、艾沙瑞林(EP-23905)(MF-6003)、GTP-200(GTP-300)、伊帕瑞林(NNC-26-0161)、伊妥瑞克(ORF-23541)、KP-101(GHRP-1)、兰瑞肽(ITM-014)、奥曲肽(SMS-201-995)、帕瑞肽(SOM-230)、普拉莫瑞林、rGRF、SUN-11031、TH-9506、ZT0131或伐普肽(RC-160)的氮杂类似物;并且在治疗内分泌失调(例如,减轻胃肠病症的一种或多种症状)中具有效用。
实施例1
基于苯并三唑的氮杂氨基酸衍生物的合成;用于偶联的容易反应的结构单元
与HBt和基于5-CF3-HBt的衍生物相比,基于HOBt的衍生物为反应性的并且在一小时内和室温下产生高产率偶联。此类条件对于固相和溶液相偶联均为相容的。
实施例2
N-Phth-1-OH-苯并三唑(HOBt)结构单元的合成
尝试Boc和Fmoc保护策略并且总之,产率低,并且观察到多个副产物。因此,决定集中于Phth保护。与传统肽保护基团诸如Fmoc和Boc相比,出于以下原因Phth表示有吸引力的保护基团:
与Fmoc-NH-或Boc-NH-相比,Phth-N的NH缺乏在氮杂化学中提供了作为保护基团的优越性。Fmoc-NH-和Boc-NH-中的NH使稳定性、反应性和用于偶联效率的反应条件复杂化。
Phth去保护需要不会损害任何氨基酸侧链保护剂的独特条件。在某些实施例中,在室温下使用DMF中的约60%水合肼持续1个小时以达成此目的。
实施例3
评估HOBt氮杂结构单元在传统α氨基保护基团(例如Phth、Fmoc和Boc)存在下与其
他保护性合成和稳定性的相容性
当用R=Boc或Fmoc和R'=H保护N-1时,观察到稳定性的问题。这是由于存在导致不期望的分子内环化和噁唑形成的NH的存在(未来医药化学(2011)3(9),1139-1164)有机和生物分子化学,2015,13,59-63。Boc和Fmoc在肽合成中使用酸卤化试剂(化学研究述评1996,29,268-274;美国化学学会杂志1996,118,9796-9797)并在氮杂肽合成中使用肼组分形成不想要的羧基酸酐的副反应,将形成噁二唑酮(肽科学杂志2013,19,725-729)。
实施例4
1-OH-苯并三唑(HOBt)结构单元偶联活性1
/>
在测试偶联反应后,在用Fmoc和Boc保护N-α时,产率低、副产物多和反应条件长达6个小时。相比之下,Phth保护提供更高产率和更短的时间反应。
实施例5
1-OH-苯并三唑(HOBt)结构单元偶联活性2
实施例6
合成的N-Phth-二氮杂肽的实例
/>
实施例7
除非另有说明,否则所有起始材料均获自商业供应商并且不经进一步纯化即直接使用。在500或600MHz仪器上收集NMR谱。化学位移以相对于氘化溶剂峰或内部标准四甲基硅烷(TMS)峰的百万分率(ppm)表示。偶联常数的单位为赫兹(Hz)。分裂模式描述了明显的多重性并且表示为s(单峰)、d(双峰)、t(三重峰)、q(四重峰)、m(多重峰)、br(宽峰)。在赛默科技LTQ XLTM线性离子阱质谱仪上进行低分辨率质谱,在具有短波长和长波长的UV光下观察TLC板,或在碘染色后观察所述板,或通过在暴露于钼酸铵(VI)四水合物和硫酸铈(IV)四水合物的溶液之后加热板来查看所述板。使用硅胶60(230-400目)实施快速柱色谱(FCC)并采用分步溶剂极性梯度,与TLC迁移率相关。使用组合1525二元泵的Waters系统进行HPLC。分析柱为菲罗门Kinetex 2.6μmEVO C18分析柱,150*4.6mm。在环境温度下使用1mL/min流速使用水(0.05%TFA):CAN(0.05%TFA)[95:5]至水(0.05%TFA):CAN(0.05%TFA)[5:95]的线性梯度在15分钟内进行色谱分析,在254nm和/或215nm下通过2998光电二极管阵列(PDA)检测器UV监测/检测。对于制备型[“制备型”],使用组合2545二元梯度模块的Waters制备型150LC系统进行HPLC。制备型柱为waters Xselect Peptide CSH C18 OBD制备型柱,/>5μm,19mm*150mm。在环境温度下使用18mL/min流速使用水(0.1%FA):CAN(0.1%FA)[95:5]至水(0.1%FA):CAN(0.1%FA)[5:95]的线性梯度在12分钟(其中保持2min)内进行色谱分析。在254nm和/或215nm处通过2998光电二极管阵列(PDA)检测器UV监测/检测。在王氏树脂(0.3mmol/g,0.33g,0.1mmol)上使用标准Fmoc/叔丁基化学在Tribute肽合成仪(蛋白质技术公司)上使用DMF中的HCTU/NNM活化进行肽链延长。
制备烷基-(1,3-二氧代-1,3-二氢-异吲哚-2-基)-氨基甲酸苯并三唑-l-基酯的
一般程序:
在0℃下向N-烷基-氨基邻苯二甲酰亚胺(1mmol)于无水DCM(10mL)中的溶液中添加光气(1.5mmol,甲苯中的1M溶液)。将搅拌的混合物升温至室温并在此温度下搅拌0.5小时。通过蒸发过量挥发物来停止反应并且在真空泵下干燥粗制混合物1小时,以得到相应酰基氯,将其再溶解于无水DCM(10mL)中。向上述溶液中添加HOBt(400μL DMF中的1.5mmol)和DIPEA(1.5mmol)。将反应混合物在室温下搅拌半小时。将反应混合物与水(25mL)混合并用EtOAc(25mL*4)萃取。将合并的有机层用盐水(25mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并在真空下蒸发,并且通过FCC纯化残余物,以得到相应烷基-(1,3-二氧代-1,3-二氢-异吲哚-2-基)-氨基甲酸苯并三唑-l-基酯。
制备以下四个结构单元:
苄基-(1,3-二氧代-1,3-二氢-异吲哚-2-基)-氨基甲酸苯并三唑-1-基酯
在FCC纯化后,分离呈白色泡沫的Phth-Azphe-Obt(371mg,90%)。
在丙酮-d6 NMR中观察到具有1:4的比率的两个构象;ESI质谱(MH+=414)。
[(苯并三唑-1-基氧基羰基)-(1,3-二氧代-1,3-二氢-异吲哚-2-基)-氨基]-乙酸叔丁基酯
在FCC纯化后,分离呈白色泡沫的Phth-Azasp-Obt(328mg,75%)。
在丙酮-d6 NMR中观察到具有1:2的比率的两个构象;ESI质谱(MH+=438)。
3-{[(苯并三唑-1-基氧基羰基)-(1,3-二氧代-1,3-二氢-异吲哚-2-基)-氨基]-甲基}-吲哚-1-羧酸叔丁基酯
在FCC纯化后,分离呈白色泡沫的Phth-Aztrp-Obt(425mg,77%)。
在丙酮-d6 NMR中观察到具有1:6的比率的两个构象;ESI质谱(MH+=553)。
(1,3-二氧代-1,3-二氢-异吲哚-2-基)-[3-(N,N',N”-三-Boc)-胍基-丙基]-氨基甲酸苯并三唑-1-基酯
在FCC纯化后,分离呈白色泡沫的Phth-Azarg-Obt(339mg,47%)。
ESI质谱(MH+=723)。
实施例8
制备N-Boc-azphe-phe-Ome酯的程序
(S)-2-苄基-2-((1-甲氧基-1-氧代-3-苯基丙-2-基)氨基甲酰基)肼-1-羧酸叔丁酯
向Boc-Azphe-Obt(0.065mmol)于CAN(0.5mL)中的溶液中添加L-苯丙氨酸甲基酯HCl盐(0.072mmol)和DIPEA(0.13mmol)。将反应混合物在室温下搅拌6小时。然后,将反应混合物与水(5mL)混合并用EtOAc(5mL*4)萃取。将合并的有机层用盐水(5mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并在真空下蒸发,并且通过FCC纯化残余物,以得到相应化合物(24mg,86%)。1HNMR(500MHz,丙酮d6)δ8.09(br,1H),7.25(m,10H),6.25(br,1H),4.70(m,3H),3.67(s,3H),3.11(m,2H),1.23(s,9H);13C NMR(125MHz,丙酮d6)δ173.1,158.0,155.2,138.4,137.9,130.3,129.5,129.4,129.2,129.1,128.1,127.5,81.2,55.5,52.3,51.2,38.8,28.3。ESI质谱(MH+=428)。
实施例9
制备N-Boc-azphe-val-OtBu酯的程序
(S)-2-苄基-2-((1-(叔丁氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)氨基甲酰基)肼-l-羧酸叔丁酯
向Boc-Azphe-Obt(0.065mmol)于CAN(0.5mL)中的溶液中添加L-缬氨酸叔丁基酯HCl盐(0.072mmol)和DIPEA(0.13mmol)。将反应混合物在室温下搅拌5小时,然后将反应混合物与水(5mL)混合并且用EtOAc(5mL*4)萃取。将合并的有机层用盐水(5mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并在真空下蒸发,并且通过FCC纯化残余物,以得到相应化合物(24mg,86%)。1HNMR(500MHz,丙酮d6)δ8.03(br,1H),7.31(m,5H),6.02(br,1H),4.86-4.40(br,2H),4.26(m,1H),2.18(m,1H),1.54(s,9H),1.41(s,9H),0.90(d,J=10Hz,3H),0.84(d,J=10Hz,3H);13C NMR(125MHz,丙酮d6)δ172.2,158.3,155.1,138.6,129.5,129.4,128.1,81.9,81.2,59.5,51.6,32.4,28.3,28.0,19.3,17.9。ESI质谱(MH+=422)。
实施例10
制备N-Fmoc-azphe-phe-Ome酯的程序:
(S)-2-苄基-2-((1-甲氧基-1-氧代-3-苯基丙-2-基)氨基甲酰基)肼-1-羧酸(9H-芴-9-基)甲酯
向Fmoc-Azphe-Obt(0.05mmol)于CAN(0.5mL)中的溶液中添加L-苯丙氨酸甲基酯HCl盐(0.055mmol)和DIPEA(0.1mmol)。将反应混合物在室温下搅拌2小时,然后将反应混合物与水(5mL)混合并且用EtOAc(5mL*4)萃取。将合并的有机层用盐水(5mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并在真空下蒸发,并且通过FCC纯化残余物,以得到相应化合物(18mg,67%)。1HNMR(500MHz,丙酮d6)δ8.81(br,1H),7.88(d,J=10Hz,2H),7.67(d,J=10Hz,2H),7.46(m,2H),7.36-7.21(m,12H),6.32(br,1H),4.86-4.60(br,2H),4.65(m,1H),4.42(br,2H),4.20(m,1H),3.65(s,3H),3.08(m,2H);13C NMR(125MHz,丙酮d6)δ173.0,157.7,156.0,144.7,142.1,138.2,137.8,130.2,129.5,129.2,129.1,128.6,128.1,128.0,127.4,126.2,120.8,67.7,60.5,55.5,52.2,51.2,47.8,38.6。ESI质谱(MH+=550)。
实施例11
制备N-Phth-azphe-Aa-Ome或OtBu酯的一般程序
向Phth-Azphe-Obt于CAN中的溶液中添加L-氨基酸甲基或叔丁基酯和DIPEA。将反应混合物在室温下搅拌1小时。然后,将反应混合物与水混合并用EtOAc萃取(x4)。将合并的有机层用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并在真空下蒸发,并且通过FCC纯化残余物,以得到相应化合物。
制备以下化合物。
(苄基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酰基)-L-苯丙氨酸甲酯
向CAN(0.5mL)中的Phth-Azphe-Obt(0.065mmol)中添加L-苯丙氨酸甲酯HCl盐(0.072mmol)和DIPEA(0.13mmol)。产率(25mg,91%)。1HNMR(500MHz,丙酮d6)δ7.93-7.80(m,4H),7.39-7.30(m,2H),7.25-7.15(m,8H),6.75(br,1H),4.85(Abq,J=20Hz,2H),4.58(m,1H),3.62(s,3H),3.02(dd,J=15,6Hz,1H),2.90(dd,J=15,8Hz,1H);13C NMR(125MHz,丙酮d6)δ172.9,165.9,165.8,156.9,138.1,137.0,135.6,131.1,130.2,129.9,129.1,128.9,128.4,127.4,124.2,124.1,56.3,53.1,52.1,38.2。ESI质谱(MH+=458)。
(苄基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酰基)-L-别异亮氨酸甲酯
向CAN(0.5mL)中的Phth-Azphe-Obt(0.048mmol)中添加L-异亮氨酸甲酯HCl盐(0.053mmol)和DIPEA(0.096mmol)。产率(19.2mg,95%)。1HNMR(500MHz,丙酮d6)δ7.85(m,4H),7.40(m,2H),7.25(m,3H),6.65(br,1H),4.85(Abq,2H),4.35(m,1H),3.65(s,3H),1.75(m,1H),1.43(m,1H),1.12(m,1H),0.80(m,6H);13C NMR(125MHz,丙酮d6)δ173.2,166.1,166.0,157.2,138.1,137.1,135.6,131.3,131.2,130.0,129.0,128.5,124.2,124.1,59.2,53.4,51.9,37.7,25.8,15.8,11.3。ESI质谱(MH+=424)。
(苄基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酰基)-L-脯氨酸甲酯
向CAN(0.5mL)中的Phth-Azphe-Obt(0.048mmol)中添加L-脯氨酸甲酯HCl盐(0.053mmol)和DIPEA(0.096mmol)。产率(19.0mg,97%)。1HNMR(500MHz,丙酮d6)δ7.90(m,4H),7.42(m,2H),7.22(m,3H),4.80(Abq,2H),4.35(m,1H),3.45(s,3H),3.35(m,2H),2.12(m,1H),1.90-1.78(m,3H);13C NMR(125MHz,丙酮d6)δ173.3,166.0,165.8,158.5,137.1,136.0,130.5,130.3,128.9,128.4,124.3,61.6,50.5,55.2,51.9,48.8,25.0。ESI质谱(MH+=408)。
(苄基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酰基)-L-甲硫氨酸甲酯
向CAN(0.5mL)中的Phth-Azphe-Obt(0.048mmol)中添加L-甲硫氨酸甲酯HCl盐(0.053mmol)和DIPEA(0.096mmol)。产率(19.0mg,90%)。1HNMR(500MHz,丙酮d6)δ7.85(m,4H),7.38(m,2H),7.22(m,3H),6.98(br,1H),4.90(Abq,2H),4.55(m,1H),3.65(s,3H),2.50(m,2H),2.02(s,3H),1.98(m,1H),1.80(m,1H);13C NMR(125MHz,丙酮d6)δ173.3,166.0,165.8,157.3,137.1,135.7,131.2,131.1,130.1,128.9,128.4,124.2,124.1,53.6,53.0,52.3,32.0,30.8,15.2。ESI质谱(MH+=442)。
(苄基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酰基)-L-色氨酸甲酯
向CAN(0.5mL)中的Phth-Azphe-Obt(0.048mmol)中添加L-色氨酸甲酯HCl盐(0.053mmol)和DIPEA(0.096mmol)。产率(23mg,96%)。1HNMR(500MHz,丙酮d6)δ10.0(bs,1H),7.90-7.80(m,4H),7.51(d,J=7.9Hz,1H),7.35(m,3H),7.21(m,3H),7.12(m,1H),7.04(t,J=7.15Hz,1H),6.96(t,J=7.3,1H),6.74(m,1H),4.86(Abq,J=14.8Hz,2H),4.65(m,1H),3.59(s,3H),3.19(m,1H),3.05(m,1H);13C NMR(125MHz,丙酮d6)δ173.3,165.9,157.0,137.4,137.0,135.6,131.0,129.9,128.9,128.4,124.5,124.4,124.3,122.1,119.6,118.9,112.1,110.7,55.7,53.2,52.2,28.2。ESI质谱(MH+=497)。
N2-(苄基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酰基)-N6-(叔丁氧基羰基)-L-赖氨酸甲酯
向CAN(0.5mL)中的Phth-Azphe-Obt(0.048mmol)中添加L-N-Boc-赖氨酸甲酯HCl盐(0.053mmol)和DIPEA(0.096mmol)。产率(21.0mg,81%)。1HNMR(500MHz,丙酮d6)δ7.85(m,4H),7.40(m,2H),7.22(m,3H),6.89(d,J=8.0Hz,1H),6.86(br,1H),5.85(br,1H),4.90(Abq,2H),4.39(m,1H),3.60(s,3H),3.05(m,2H),1.70(m,1H),1.50-1.40(m,14H);13C NMR(125MHz,丙酮d6)δ173.7,166.0,165.9,157.3,156.6,137.1,135.6,131.2,131.1,130.1,128.9,128.4,124.2,124.1,78.3,54.6,53.1,52.1,40.8,32.0,29.4,28.7,23.8。ESI质谱(MH+=539)。
N2-(苄基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酰基)-Nw-((2,2,4,6,7-五甲基-2,3-二氢苯并呋喃-5-基)磺酰基)-L-精氨酸甲酯
向CAN(0.5mL)中的Phth-Azphe-Obt(0.048mmol)中添加L-N-Pbf-精氨酸甲酯HCl盐(0.053mmol)和DIPEA(0.096mmol)。产率(33.0mg,94%)。1HNMR(500MHz,丙酮d6)δ7.85(m,4H),7.38(m,2H),7.20(m,3H),6.95(br,1H),6.49(br,2H),4.90(Abq,J=15Hz,2H),4.35(m,1H),3.64(s,3H),3.18(m,2H),3.00(s,2H),2.55(s,3H),2.48(s,3H),2.05(s,3H),1.75(m,1H),1.60-1.50(m,3H),1.45(s,6H);13C NMR(125MHz,丙酮d6)δ173.4,166.0,165.8,158.9,157.4,157.2,138.7,137.0,135.6,135.5,132.8,131.1,130.1,128.9,128.4,125.3,124.2,124.1,117.5,87.0,54.3,53.1,52.2,43.6,41.1,28.7,26.6,19.5,18.2,12.6。ESI质谱(MH+=719)。
(苄基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酰基)-L-缬氨酸叔丁酯
向CAN(0.5mL)中的Phth-Azphe-Obt(0.06mmol)中添加L-缬氨酸叔丁基酯HCl盐(0.066mmol)和DIPEA(0.12mmol)。产率(26.0mg,96%)。1HNMR(500MHz,丙酮d6)δ7.85(m,4H),7.45(m,2H),7.25(m,3H),6.35(br,1H),4.90(s,2H),4.29(q,J1=10Hz,J2=5Hz,1H),1.95(m,1H),1.42(s,9H),0.89(d,J=5.0Hz,3H),0.80(d,J=5.0Hz,3H);13C NMR(125MHz,丙酮d6)δ171.7,166.1,157.2,137.2,135.6,131.3,131.2,129.9,129.0,128.4,124.2,81.5,60.8,53.4,31.6,28.2,19.5,18.6。ESI质谱(MH+=452)。
(苄基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酰基)-L-亮氨酸叔丁酯
向CAN(0.5mL)中的Phth-Azphe-Obt(0.048mmol)中添加L-亮氨酸叔丁基酯HCl盐(0.053mmol)和DIPEA(0.96mmol)。产率(21.0mg,94%)。1HNMR(500MHz,丙酮d6)δ7.85(m,4H),7.40(m,2H),7.22(m,3H),6.72(br,1H),4.90(s,2H),4.35(m,1H),1.70(m,1H),1.45(m,11H),0.92(d,J=5Hz,3H),0.85(d,J=5Hz,3H);13C NMR(125MHz,丙酮d6)δ172.9,166.0,165.9,157.3,137.2,135.5,131.2,130.0,128.9,128.3,124.2,124.1,81.1,53.8,53.0,41.3,28.1,25.2,23.3,21.8。ESI质谱(MH+=466)。
(苄基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酰基)-L-天冬酰胺叔丁酯
向CAN(0.3mL)和DMF(0.2mL)中的Phth-Azphe-Obt(0.048mmol)添加L-天冬酰胺叔丁基酯HCl盐(0.053mmol)和DIPEA(0.96mmol)。产率(20.0mg,90%)。1HNMR(500MHz,CD3OD)δ7.78(m,4H),7.30(m,2H),7.18(m,3H),4.84(q,J1=14Hz,J2=5Hz,2H),4.48(t,J=5.5Hz,1H),2.70(m,2H),1.42(s,9H);13C NMR(125MHz,CD3OD)δ175.3,171.7,166.6,158.1,136.1,135.8,131.0,130.9,130.6,129.6,129.4,125.0,124.9,83.5,53.7,52.6,37.9,28.5。ESI质谱(MH+=467)。
(苄基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酰基)-L-天冬氨酸1-烯丙基4-(叔丁基)酯
向CAN(0.5mL)中的Phth-Azphe-Obt(0.048mmol)中添加L-天冬氨酸(O-tBu)-烯丙基酯HCl盐(0.053mmol)和DIPEA(0.96mmol)。产率(22.0mg,92%)。1HNMR(500MHz,丙酮d6)δ7.89(m,4H),7.43(m,2H),7.23(m,3H),6.95(br,1H),5.35(m,1H),5.23(m,1H),4.90(Abq,J=15Hz,2H),4.77(q,J1=15Hz,J2=5Hz,2H),4.61(d,J=15Hz,2H),2.80(m,1H),2.60(m,11H),1.40(s,9H);13C NMR(125MHz,丙酮d6)δ171.4,170.0,165.7,156.9,137.0,135.7,133.2,131.0,129.9,128.9,128.4,124.2,118.0,81.3,66.1,53.1,51.4,38.3,28.1。ESI质谱(MH+=508)。
((2-(叔丁氧基)-2-氧代乙基)(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酰基)-L-缬氨酸叔丁酯
向CAN(0.2mL)中的Phth-Azasp-Obt(0.023mmol)中添加L-缬氨酸叔丁基酯HCl盐(0.025mmol)和DIPEA(0.046mmol)。产率(9.5mg,87%)。1HNMR(500MHz,丙酮d6)δ7.94(s,4H),6.59(br,1H),4.90(s,2H),4.37(Abq,J=20Hz,2H),4.16(dd,J=10Hz,1H),1.95(m,1H),1.42(s,9H),1.39(s,9H),0.92(d,J=10Hz,3H),0.85(d,J=10Hz,3H);13C NMR(125MHz,丙酮d6)δ171.7,168.0,165.8,156.7,135.6,131.6,124.3,124.2,81.7,81.5,60.8,51.9,31.7,28.1,28.0,19.5,18.7。ESI质谱(MH+=476)。
(S)-3-((3-(1-(叔丁氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-1-(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)脲基)甲基)-1H-吲哚
-1-羧酸叔丁酯
向CAN(0.15mL)和DMF(0.15mL)中的Phth-Azphe-Obt(0.018mmol)添加L-缬氨酸叔丁基酯HCl盐(0.02mmol)和DIPEA(0.036mmol)。产率(10.0mg,94%)。1HNMR(500MHz,丙酮d6)δ8.08(d,J=10Hz,1H),7.97-7.81(m,4H),7.78(d,J=10Hz,1H),7.65(s,1H),7.31(t,J=10Hz,1H),7.21(t,J=10Hz,1H),6.50(br,1H),5.10(Abq,J=20Hz,2H),4.23(dd,J=10Hz,1H),1.95(m,1H),1.59(s,9H),1.41(s,9H),0.98(d,J=10Hz,3H),0.85(d,J=10Hz,3H);13CNMR(125MHz,丙酮d6)δ171.7,166.1,166.0,157.1,150.1,135.6,131.4,131.3,130.8,126.6,125.2,124.3,124.2,123.3,120.9,117.0,115.7,84.2,81.5,60.8,43.6,31.6,28.0,19.5,18.7。ESI质谱(MH+=591)。
(Z)-((1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)(3-(1,2,3-三(叔丁氧基羰基)胍基)丙基)氨基甲酰基)-L-缬氨酸叔
丁酯
向CAN(0.1mL)中的Phth-Azlys-Obt(0.01mmol)中添加L-缬氨酸叔丁基酯HCl盐(0.011mmol)和DIPEA(0.02mmol)。产率(7.0mg,92%)。1HNMR(500MHz,丙酮d6)δ10.19(br,1H),7.83(s,4H),6.25(br,1H),4.25(m,1H),4.15(m,1H),3.80(m,2H),1.95(m,1H),1.45(s,37H),1.25(m,2H),0.92(d,J=10Hz,3H),0.82(d,J=10Hz,3H);13C NMR(125MHz,丙酮d6)δ171.8,166.5,156.9,153.9,135.6,131.5,124.3,83.4,81.5,64.1,62.3,60.7,48.4,46.0,31.7,28.7,28.3,28.1,28.0,19.6,18.8。ESI质谱(MH+=761)。
实施例12
合成以下化合物。
表1
实施例13
合成以下化合物。
表2
/>
实施例14
8氮杂-缓激肽的固相肽合成(SPPS)
检查Obt合成子与使用标准Fmoc/叔丁基化学进行的SPPS的相容性和反应性。
选择8氮杂-缓激肽作为示例,因为在本发明之前,通过溶液相合成以极低产率合成8氮杂-缓激肽并且其纯化存在问题。使用以下标准SPPS程序:
树脂装载:DMF中的约100mg/mL
溶胀:DMF 10min持续3个周期
Fmoc去保护:20%哌啶/DMF 2.5min持续2个周期
偶联周期:树脂取代:氨基酸:偶联试剂:碱(1:5:5:10)10min持续1个周期
洗涤:DMF 0.5min持续5个周期;DCM 0.5min持续6个周期
封端:DMF中的50当量乙酸酐和50当量吡啶持续30分钟(需要时重复循环)
裂解:TFA:水:三异丙基硅烷(95:2.5:2.5)持续2小时
在Fmoc-Arg(pbf)-王氏树脂(0.3mmol/g,0.33g,0.1mmol)溶胀之后,使用DMF中的20%哌啶去除Fmoc保护基团。将试剂Fmoc-azphe-Obt(4当量)于DMF中的溶液自动递送至肽基树脂并且将珠粒悬浮液振摇1小时(图式1)。
图式1
在所述过程中,研究Fmoc-azphe-Obt与肽基树脂的偶联活性以获得树脂结合的Fmoc-氮杂-Phe-Arg(pbf)-OH。由于氮杂肽键的形成远慢于天然肽的形成,使用典型偶联剂和氨基酸活性剂的常规SPPS方案不可直接应用于氮杂肽合成。为了实现在氮杂肽键形成中氨基脲部分的有效酰化,应用新鲜生成的氨基酸氯化物作为偶联活性剂。在Fmoc去除后,将树脂结合的NH2-氮杂-Phe-Arg(pbf)-OH与二氧六环中的Na2CO3(30当量)和Fmoc-脯氨酸氯化物(5当量)混合。将珠粒悬浮液振摇1小时以获得树脂结合的Fmoc-pro-氮杂-Phe-Arg(pbf)-OH(图式2)。裂解小部分珠粒(10mg)并且通过使用0.2mL按体积计95/2.5/2.5的TFA/H2O/TIS从固体载体去保护1小时。在冷乙醚(2mL)中沉淀出粗制氮杂肽并且用乙醚(x3)洗涤。RP-HPLC分析表明形成所需产物24(70%)连同缺失的氮杂-Phe副产物25(30%),这表明Fmoc-azphe-Obt不完全转化成树脂结合的Fmoc-氮杂-Phe-Arg(pbf)-OH(图1)。Gibson在RGD-模拟物的此合成中报告了类似观察(有机化学期刊1999,64,7388-7394)。
图式2
使用DMF中的20%哌啶去除Fmoc保护基团并且使肽基树脂经历常规SPPS方案以完成缓激肽序列(图式3)。
图式3
通过使用2mL按体积计95/2.5/2.5的TFA/H2O/TIS来进行最终裂解和从固体载体去保护2小时。在冷乙醚(40mL)中沉淀出粗制氮杂肽并且用乙醚(x3)洗涤以获得粗产物(127mg)。RP-HPLC分析表明形成主要所需产物8氮杂-缓激肽(26)(图2)。
通过RP-HPLC使用组合2545二元梯度模块的Waters制备型150LC体系纯化粗制物26。制备型柱为waters Xselect Peptide CSH C18 OBD制备型柱,5μm,19mm*150mm。在环境温度下使用18mL/min流速使用水(0.1%FA):CAN(0.1%FA)[95:5]至水(0.1%FA):CAN(0.1%FA)[50:50]的线性梯度在12分钟(其中保持2min)内进行色谱分析。在254nm和/或215nm处通过2998光电二极管阵列(PDA)检测器UV监测/检测。收集含有26的级分并将其冻干,以获得8氮杂-缓激肽(26)(30mg,96%纯的)。在8小时工作时间内通过SPPS合成的总产率为28%。
Fmoc-azphe-Obt不完全转化为树脂结合的Fmoc-氮杂-Phe-Arg(pbf)-OH的原因为Fmoc-azphe-Obt的偶联活性较小并且其可通过增加试剂内容物的浓度来改进并且增强偶联时间或重复偶联过程。
与Fmoc-azphe-Obt相比,Phth-azphe-Obt更稳定并且为活性氮杂结构单元,如溶液相二氮杂肽合成中所示(表1)。与Fmoc-NH-或Boc-NH-相比,Phth-N的NH缺乏在氮杂化学中提供了作为保护基团的优越性。Fmoc-NH-和Boc-NH-中的NH使稳定性、反应性和用于偶联效率的反应条件复杂化。NH的存在导致不期望的分子内环化和噁唑形成(未来医药化学(2011)3(9),1139-1164);(有机和生物分子化学,2015,13,59-63)。另外,Boc和Fmoc在肽合成中使用酸卤化试剂(化学研究述评1996,29,268-274;美国化学学会杂志1996,118,9796-9797)并在氮杂肽合成中使用肼组分形成不想要的羧基酸酐的副反应,将形成噁二唑酮(肽科学杂志2013,19,725-729)。
研究Phth-azphe-Obt与肽基树脂的偶联活性以获得树脂结合的Phth-氮杂-Phe-Arg(pbf)-OH。在Fmoc-Arg(pbf)-王氏树脂(0.3mmol/g,0.33g,0.1mmol)溶胀之后,使用DMF中的20%哌啶去除Fmoc保护基团。将试剂Phth-azphe-Obt(5当量)于DMF中的溶液自动递送至肽基树脂并且将珠粒悬浮液振摇1h(图式4)。
图式4
裂解小部分珠粒(10mg)并且通过使用0.2mL按体积计95/2.5/2.5的TFA/H2O/TIS来从固体载体去保护1小时。在冷乙醚(2mL)中沉淀出粗制氮杂肽并且用乙醚(x3)洗涤。RP-HPLC分析表明仅形成所需产物27(>95%)(图3)。
邻苯二甲酰基去保护需要不会损害任何氨基酸侧链保护剂的条件。另外,据报告DMF中的60%肼持续1-3h从树脂中完全去除邻苯二甲酰基(美国化学学会杂志1997,119,1556-1564)。然而,当在裂解并从固体载体去保护后将同一种方法应用于树脂结合的Phth-氮杂-Phe-Arg(pbf)-OH时,RP-HPLC分析表明形成仅半开放副产物28(90%):
检查不同试剂、反应时间和溶剂以实现完全去保护的产物(29)。在测试中,无水THF中的50%MeNHNH2在室温下持续1小时,产生80%所需产物(29)。
实施例15
氮杂缓激肽的合成
通过SPPS使用标准氨基酸(Aa)偶联使用自动模式由Fmoc-azPhe-Obt结构单元合成8氮杂-缓激肽(8-氮杂-BK),通过SPPS合成的总产率为28%(97%纯的)。合成图式如下:
图式1
图式2
图式3
HPLC分析呈现于图1-3中。
在先前的说明书中,已经参考其具体实施例以及实例描述了本发明。然而,将显而易见的是,在不脱离如所附权利要求中阐述的本发明的更广泛精神和范围的情况下,可以对其做出各种修改和改变。因此,应以说明性方式而不是限制性意义来理解本说明书和附图。本文引用的所有文献以及出现在附图中的文本出于所有目的以引用方式整体并入本文,其程度与各自如此单独表示相同。
Claims (16)
1.一种用于合成氮杂肽和其他氮杂氨基酸缀合物的化合物,其中所述化合物选自式(IA)的化合物或式(IB)的化合物:
其中A为N-邻苯二甲酰亚胺基或NR1R2,
R1为H,
R2为叔丁氧基羰基、9-芴基甲氧基羰基、2-(3,5-二甲氧基苯基)丙-2-基氧基羰基;
X为未取代的或被取代的咪唑基或苯并三唑基,其中取代基选自卤素、C1-C6烷基、羟基、-COOH、-COH、甲氧基、乙氧基、丙氧基和C1-C6卤代烷基;并且
R选自:H、甲基、异丙基、异丁基、苄基以及任选取代的天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、苏氨酸、R-异亮氨酸、S-异亮氨酸、RS-异亮氨酸、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺、丝氨酸和谷氨酰胺的侧链基团,其中所述任选取代的取代基选自卤素、C1-C6烷基、羟基、-COOH、-COH、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基或-NH2;
其中R2为叔丁氧基羰基、9-芴基甲氧基羰基或2-(3,5-二甲氧基苯基)丙-2-基氧基羰基,并且X为咪唑基或苯并三唑基。
2.根据权利要求1所述的化合物,其为式(III)的化合物:
其中R选自:H、甲基、异丙基、异丁基、苄基以及天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、苏氨酸、R-异亮氨酸、S-异亮氨酸、RS-异亮氨酸、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺、丝氨酸和谷氨酰胺的侧链基团。
3.根据权利要求1所述的化合物,其为式(II)的化合物:
其中R选自:H、甲基、异丙基、异丁基、苄基以及任选取代的天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、R-异亮氨酸、S-异亮氨酸、RS-异亮氨酸、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺、丝氨酸、苏氨酸和谷氨酰胺的侧链基团;并且M为取代基,选自:卤素、C1-C6烷基、羟基、-COOH、-COH、甲氧基、乙氧基、丙氧基和C1-C6卤代烷基。
4.根据权利要求1所述的化合物,其中所述化合物选自:
以及其药学上可接受的盐,其中PG选自:H、N-邻苯二甲酰亚胺基、叔丁氧基羰基、9-芴基甲氧基羰基、2-(3,5-二甲氧基苯基)丙-2-基氧基羰基。
5.根据权利要求4所述的化合物,其中所述PG为N-邻苯二甲酰亚胺基。
6.根据权利要求1所述的化合物,其中所述化合物选自:N-(((1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基)氧基)羰基)-N-(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)甘氨酸、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基苄基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)(甲基)氨基甲酸酯、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基((1H-吡咯-2-基)甲基)(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯、3-((((1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基)氧基)羰基)(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基)丙酸、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基((1H-吲哚-3-基)甲基)(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)(异丙基)氨基甲酸酯(邻苯二甲酰基-氮杂-缬氨酸-氨基甲酰基-O-苯并三唑)、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)(异丁基)氨基甲酸酯、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基(4-氨基丁基)(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)(2-(甲硫基)乙基)氨基甲酸酯、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)(4-羟基苄基)氨基甲酸酯、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基仲丁基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)(3-胍基丙基)氨基甲酸酯、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基(2-氨基-2-氧代乙基)(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基(3-氨基-3-氧代丙基)(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯以及其药学上可接受的盐。
7.根据权利要求1所述的化合物,其中所述化合物选自:
以及其药学上可接受的盐,其中PG选自:H、N-邻苯二甲酰亚胺基、叔丁氧基羰基、9-芴基甲氧基羰基、2-(3,5-二甲氧基苯基)丙-2-基氧基羰基。
8.根据权利要求7所述的化合物,其中所述PG为N-邻苯二甲酰亚胺基。
9.根据权利要求1所述的化合物,其选自:N-(((1H-咪唑-1-基)氧基)羰基)-N-(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)甘氨酸、1H-咪唑-1-基苄基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯、1H-咪唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)(甲基)氨基甲酸酯、1H-咪唑-1-基((1H-吡咯-2-基)甲基)(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯、3-((((1H-咪唑-1-基)氧基)羰基)(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基)丙酸、1H-咪唑-1-基((1H-吲哚-3-基)甲基)(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯、1H-咪唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)(异丙基)氨基甲酸酯、1H-咪唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)(异丁基)氨基甲酸酯、1H-咪唑-1-基(4-氨基丁基)(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯、1H-咪唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)(2-(甲硫基)乙基)氨基甲酸酯、1H-咪唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)(4-羟基苄基)氨基甲酸酯、1H-咪唑-1-基仲丁基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯、1H-咪唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)(3-胍基丙基)氨基甲酸酯、1H-咪唑-1-基(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯、1H-咪唑-1-基(2-氨基-2-氧代乙基)(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯、1H-咪唑-1-基(3-氨基-3-氧代丙基)(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)氨基甲酸酯,以及其药学上可接受的盐。
10.一种制备氮杂肽的方法,其包括
活化如权利要求1所述的化合物的步骤;以及
将所述活化的化合物与氨基酸的N末端、氮杂氨基酸的N末端偶联的步骤;
其中所述氮杂肽为式(V)的化合物:
其中在所述式(V)的化合物的N末端和/或C末端处,与所述式(V)的化合物的N末端和/或C末端相邻或为所述式(V)的化合物的水解位点,
B选自:氢、-NH2、-NNH2、-CONH2、-COOR3、-COOH、-COH、-COC1-C4烷基、-COC1-C4卤代烷基、-OH、氨基酸、氮杂氨基酸、2至60聚体肽、2至60聚体氮杂肽、2-60聚体α-碳全氮取代肽,
D选自:-OR4、-OH、-NH2、-NNH2、-NHCOCH3、-NHCH3、-N(CH3)2、-CONH2、-COOH、-COH、-COC1-C4烷基、-COC1-C4卤代烷基、氨基酸、氮杂氨基酸、2至60聚体肽、2至60聚体氮杂肽、2-60聚体α-碳全氮取代肽,
R3和R4各自独立地选自:C1-C6烷基、甲氧基、乙氧基、丙氧基、C1-C6卤代烷基和保护基团,
R选自:任选取代的天冬氨酸、苯丙氨酸、丙氨酸、组氨酸、谷氨酸、色氨酸、缬氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、酪氨酸、异亮氨酸、精氨酸、甘氨酸、天冬酰胺、丝氨酸、苏氨酸、半胱氨酸和谷氨酰胺的侧链基团,其中所述任选取代的取代基选自卤素、C1-C6烷基、羟基、-COOH、-COH、甲氧基、乙氧基、丙氧基和C1-C6卤代烷基。
11.根据权利要求10所述的方法,其中根据权利要求1所述的化合物被MeI活化。
12.根据权利要求10或权利要求11所述的方法,其中所述偶联是在乙腈中进行。
13.根据权利要求12所述的方法,其中将DIPEA添加到所述乙腈中。
14.根据权利要求13所述的方法,其中所述偶联是在固相氮杂肽合成期间进行。
15.根据权利要求13所述的方法,其中所述偶联是在液相氮杂肽合成期间进行。
16.根据权利要求10所述的方法,其中以至少50%的产率产生所述氮杂肽。
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