CN113913527A - 预测黑色素瘤患者对mage-a3免疫疗法敏感性的产品 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了预测黑色素瘤患者对MAGE‑A3免疫疗法敏感性的产品,所述产品包括试剂盒,所述试剂盒中包含检测标志物IL2RG、TMEM56、和/或ELFN1表达水平的试剂,利用本发明提供的方法和产品预测黑色素瘤患者对MAGE‑A3免疫疗法的敏感性,具有方法简单、时间短、效率高等优点,可为个体化用药和治疗方案的选择提供指导。
Description
技术领域
本发明属于生物医学技术领域,具体地,本发明涉及预测黑色素瘤患者对MAGE-A3免疫疗法敏感性的产品。
背景技术
黑色素瘤(Melanoma)是一种来源于表皮基底层黑色素细胞的高度恶性肿瘤,起源于神经脊的黑素细胞,黑色素瘤好发于皮肤或邻近皮肤的粘膜,是最具侵袭性和致死性的皮肤癌。近年来,黑色素瘤在世界范围内的发病率与死亡率呈明显增加趋势,占所有恶性肿瘤的1%-3%,但以6%-7%的增长速度逐年递增,且发病年龄呈年轻化趋势,为发病率增长最快的恶性肿瘤之一。黑色素瘤发病率有较明显种族差异,在白种人中的发病率最高,黄种人和黑种人中的发病率较低。导致黑色素瘤患者死亡的主要原因是肿瘤易发生快速转移。黑色素瘤具有恶性程度高、进展迅速,转移早等特征,而且,近年来,免疫疗法和靶向治疗方法的快速发展使得黑色素瘤的临床病史发生了革命性的变化,其治疗具有一定的效果,能够显著性地延长黑色素瘤患者的生存期,但是,这受限于临床的实际运用,并且对于已经出现了肿瘤转移的晚期黑色素瘤患者而言,目前仍然还没有令人满意的治疗方法。
因此,关于黑色素瘤发病机制的研究还亟需进一步进行深入地研究。目前,越来越多的证据表明,黑色素瘤的病理形成涉及到多个基因、多个信号通路和基因调控的复杂变化。因此,鉴定黑色素瘤进展中的一些潜在的靶标分子,进一步探索黑色素瘤发生和发展的相关机制,寻找新的肿瘤标志物以及治疗靶点延长患者生存期成为亟待解决的问题。目前,免疫药物MAGE-A3治疗方案被广泛应用于临床黑色素瘤的辅助治疗中,但是目前仍然难以预测哪些黑色素瘤患者会对免疫药物MAGE-A3治疗方案敏感和/或有反应性,预测黑色素瘤患者对免疫药物MAGE-A3的敏感性或反应性仍然是一个巨大的挑战,因此,发现能够用于黑色素瘤患者对免疫药物MAGE-A3治疗方案的敏感性和/或反应性进行准确预测的生物标志物,并将其应用于治疗前黑色素瘤患者的筛查中对于本领域而言至关重要,可有助于实现个体化的治疗。
发明内容
鉴于此,为了解决目前本领域存在的上述技术缺陷,本发明的目的在于提供预测黑色素瘤患者对MAGE-A3免疫疗法敏感性的产品。
本发明所述的上述目的,通过以下技术方案得以实现:
本发明的第一方面提供了检测生物标志物表达水平的试剂在制备用于预测黑色素瘤对免疫药物MAGE-A3敏感性和/或反应性的产品中的应用。
进一步,所述生物标志物为IL2RG、TMEM56、和/或ELFN1。
进一步,本发明所述的生物标志物IL2RG、TMEM56、ELFN1的详细信息如下:
基因IL2RG(Interleukin 2receptor subunit gamma):Gene ID为3561,具体位置为Xq13.1;
基因TMEM56(Transmembrane Protein 56):Gene ID为3675,又称TLCD4(TLCdomain containing 4),具体位置为1p21.3;
基因ELFN1(Extracellular leucine rich repeat and fibronectin type IIIdomain containing 1):Gene ID为392617,具体位置为7p22.3。
进一步,所述试剂选自:
特异性识别所述生物标志物的探针;或
特异性扩增所述生物标志物的引物;或
特异性结合所述生物标志物的抗体、抗体片段、亲和性蛋白。
进一步,所述产品包括通过核酸杂交技术、核酸扩增技术、蛋白免疫技术、测序技术、色谱技术、质谱技术检测所述生物标志物表达水平的试剂。
进一步,所述核酸杂交技术是指互补的核苷酸序列(DNA与DNA、DNA与RNA、RNA与RNA等)通过Watson-Crick碱基配对形成非共价键,从而形成稳定的同源或异源双链分子的过程,又称为核酸杂交。
进一步,所述核酸扩增技术是指一大类技术方法的总称,目前核酸扩增技术包括常规PCR、实时荧光PCR、等温核酸扩增技术等,可将极微量的靶DNA特异地扩增上百万倍,从而大大提高对DNA分子的分析和检测能力,能检测单分子DNA或对每10万个细胞中仅含1个靶DNA分子的样品,具有敏感性高、特异性强、快速、简便等优点。
进一步,所述蛋白免疫技术是指包括放射免疫测定、直接、间接或对比酶联免疫吸附测定、酶免疫测定、荧光免疫测定、蛋白质印迹法、免疫沉淀法、基于任何颗粒的免疫测定(例如:使用金颗粒、银颗粒或乳胶颗粒、磁性颗粒或量子点)对目标物进行检测的一类方法的统称,可在微量滴定板或条的形式中实施蛋白免疫法。
进一步,所述测序技术包括(但不限于)一代测序、二代测序、三代测序,其中,一代测序也称Sanger测序,是利用DNA聚合酶合成反应的测序技术,一代测序是基于Sanger方法的测序技术;二代测序基于大规模平行测序技术(Massive parallel analysis,MPS),它能同时完成测序模板互补链的合成和序列数据的获取;三代测序则基于单分子测序和大规模平行测序技术。
进一步,所述色谱技术是指分离和分析复杂混合物中各个组分的方法,利用不同物质在由固定相和流动相构成的体系中具有不同的分配系数,当两相作相对运动时,这些物质随流动相一起运动,并在两相间进行反复多次的分配,从而使各物质达到分离。
进一步,所述质谱技术是指利用电场和磁场将运动的离子(带电荷的原子、分子或分子碎片、有分子离子、同位素离子、碎片离子、重排离子、多电荷离子、亚稳离子、负离子和离子-分子相互作用产生的离子)按它们的质荷比分离后进行检测的方法。测出离子准确质量即可确定离子的化合物组成。
进一步,所述产品包括试剂盒、芯片、试纸、高通量测序平台。
进一步,在本发明的具体实施例中,所述黑色素瘤为转移性黑色素瘤。
本发明的第二方面提供了一种用于预测黑色素瘤患者对免疫药物MAGE-A3敏感性和/或反应性的产品。
进一步,所述产品包含检测样本中生物标志物IL2RG、TMEM56、和/或ELFN1表达水平的试剂。
进一步,所述试剂包括检测所述生物标志物的mRNA表达水平的试剂、检测所述生物标志物的蛋白表达水平的试剂。
进一步,所述试剂包括特异性识别所述生物标志物的探针、特异性扩增所述生物标志物的引物、或特异性结合所述生物标志物的抗体、抗体片段、亲和性蛋白。
进一步,所述产品包括试剂盒、芯片、试纸、高通量测序平台。
在本发明的具体实施例中,所述样本选自血液或组织。
本发明的第三方面提供了一种预测黑色素瘤患者对免疫药物MAGE-A3敏感性和/或反应性的系统/装置。
进一步,所述系统/装置包括:
(1)分析单元:所述分析单元用于检测受试者样本中生物标志物IL2RG、TMEM56、和/或ELFN1的表达水平;
(2)评估单元:所述评估单元包含存储的参考和数据处理器,所述数据处理器已经实现了用于比较分析单元检测得到的生物标志物IL2RG、TMEM56、和/或ELFN1的表达水平与存储的参考的算法,由此预测黑色素瘤患者对免疫药物MAGE-A3敏感性和/或反应性;
(3)评估结果输出单元:所述评估结果输出单元将评估单元得到的黑色素瘤患者对免疫药物MAGE-A3敏感性和/或反应性的预测结果输出。
本发明的第四方面提供了生物标志物IL2RG、TMEM56、和/或ELFN1在构建用于预测黑色素瘤患者对免疫药物MAGE-A3敏感性和/或反应性的系统/装置中的应用。
进一步,在本发明的具体实施例中,本发明通过受试者工作特征曲线下面积(AUC)对生物标志物对黑色素瘤患者对免疫药物MAGE-A3治疗的敏感性和/或反应性的诊断效能或精确性进行评估。诊断方法的精确性由它的受试者工作特征(ROC)描述得最好。ROC图是源自在观察的整个数据范围上连续改变决策阈的所有灵敏度/特异性对的线图。在本发明的具体实施方式中,可根据受试者工作特征曲线下面积(AUC)来评估本发明所述的生物标志物对预测黑色素瘤患者对免疫药物MAGE-A3治疗的敏感性或反应性的诊断效能,其中,若AUC>0.6,则表明所述生物标志物具有一定的诊断效能,可作为预测黑色素瘤患者对免疫药物MAGE-A3治疗的敏感性或反应性的标志物;若AUC>0.7,则表明所述生物标志物具有相对较好的诊断效能,可作为预测黑色素瘤患者对免疫药物MAGE-A3治疗的敏感性或反应性的标志物;若AUC>0.8,则表明所述生物标志物具有较好的诊断效能,可作为预测黑色素瘤患者对免疫药物MAGE-A3治疗的敏感性或反应性的标志物。
本发明中所述的生物标志物包括所述生物标志物,以及其编码的蛋白及其同源物,突变,和同等型,所述生物标志物涵盖全长未加工的生物标志物,以及源自细胞中加工的任何形式的生物标志物,同时涵盖生物标志物的天然发生变体(例如剪接变体或等位变体)。gene ID可在https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/获得。
为了进一步阐明本发明的内容,此处对本发明中涉及到的部分专业科学术语进行如下解释。
本发明中所述的“反应性”,同“反应”,是指患有、怀疑患有或倾向于患黑色素瘤的患者/受试者显示对免疫药物MAGE-A3治疗的反应。本领域的技术人员根据本发明所述的方法会容易地确定采用免疫药物MAGE-A3治疗方案的患者/受试者是否显示反应。
本发明中所述的“敏感性”,同“敏感”,是指患有、怀疑患有或倾向于患黑色素瘤的患者/受试者以某种方式对免疫药物MAGE-A3治疗显示阳性反应。本领域的技术人员根据本发明所述的方法会容易地确定采用免疫药物MAGE-A3治疗方案的患者/受试者是否显示阳性反应。
本发明中所述的“生物标志物”,同“标志物”、“标志分子”,是指患者表型的指示物,在本发明的具体实施方式中,是指对免疫药物MAGE-A3治疗方案敏感或有反应的黑色素瘤患者(有反应者)与对免疫药物MAGE-A3治疗方案无敏感性或反应性的黑色素瘤患者(无反应者)之间差异表达的标志物,所述标志物包括但不限于:基因、蛋白质、小分子代谢物质、糖类、基于糖脂的分子等。生物标志物可以是包含编码该生物标志物的全部或部分核酸序列或这类序列的互补体的DNA。可用于本发明的生物标志物核酸被认为包括包含任何目的核酸序列的全部或部分序列的DNA和RNA。
本发明中所述的“样本”,同“样品”、“受试者样本”、“黑色素瘤患者的样本”,可以是细胞或组织样本(例如活检物)、生物流体、提取物(例如从研究对象获得的蛋白质或DNA提取物)。特别地,样本可以是肿瘤样本,例如实体瘤,例如黑色素瘤组织样本。样本可以是从研究对象新鲜获得的样本,或者可以是在进行确定之前已经加工和/或储存的样本(例如,冷冻、固定或经历一个或更多个纯化、富集或提取步骤),如经试剂处理、稳定化、或针对某些成分(如蛋白质或多核苷酸)富集、或包埋在用于切片目的的半固体或固体基质中。本发明中所述的样本包括但不限于:组织、全血、血液来源的细胞、血清、血浆、淋巴液、滑膜液、细胞提取物及其组合。
本发明中所述的“表达水平”,同“基因的表达水平”,是指受试者样本中本发明所述的生物标志物的表达水平。基因表达水平的确定可以涉及在获自个体的包含癌细胞的样本中确定所述基因表达的蛋白质水平。蛋白质表达水平可以通过任何可用的手段,包括使用免疫测定来确定。例如,表达水平可以通过免疫组织化学(IHC)、蛋白质印迹、ELISA、免疫电泳、免疫沉淀、流式细胞术、大量细胞计数法(Mass cytometry)和免疫染色来确定。使用这些方法中的任何一种,都可以确定本文公开的生物标志物的蛋白质的相对表达水平。
作为一种可选择的实施方案,也可以使用高级测序方法检测基因的表达水平。例如,可以使用Illumina检测生物标志物。下一代测序(例如,Sequencing-By-Synthesis或TruSeq方法,其使用例如HiSeq、HiScan、GenomeAnalyzer或MiSeq系统)。生物标志物也可以使用离子流测序或其他合适的半导体测序方法来进行检测。
作为一种可选择的实施方案,可以使用质谱法使用RNase图谱(Mapping)对生物标志物进行定量。在通过MS或串联MS(MS/MS)方法对分离的RNA进行分析之前,可以用具有高特异性的RNA内切核酸酶(RNase)(例如,RNase T1,其在所有未修饰的鸟苷残基的3’侧切割)对分离的RNA进行酶促消化。开发的第一种方法使用直接与ESI-MS偶联的反相HPLC对核酸内切酶消化物进行在线色谱分离。转录后修饰的存在可以通过与基于RNA序列预期的那些的质量偏移来揭示。然后可以分离质量/电荷值异常的离子用于串联MS测序,从而定位转录后修饰的核苷的序列位置。
基质辅助激光解吸/电离质谱法(MALDI-MS)也已被用作获得关于转录后修饰的核苷的信息的分析方法。基于MALDI的方法可以通过分离步骤与基于ESI的方法区分。在MALDI-MS中,质谱仪用于分离生物标志物。
本发明中所述的“引物”,是指具有短游离3’-羟基的核酸序列,是可以与互补模板形成碱基对并充当模板链复制的起点的短核酸。在适当的缓冲溶液和温度下,在存在用于聚合的试剂(即DNA聚合酶或逆转录酶)和四种不同的核苷三磷酸的情况下,引物可以引发DNA合成。可以根据本领域已知的技术适当地选择PCR条件以及正义和反义引物的长度。
本发明中所述的“探针”,是指对应于可以特异性结合mRNA的几个碱基至数百个碱基的核酸片段(例如RNA或DNA),并且可以通过标签来确认特定mRNA的存在与否以及表达水平。探针可以以寡核苷酸探针、单链DNA探针、双链DNA探针或RNA探针的形式制备。可以根据本领域已知的技术适当地选择合适的探针和杂交条件。
本发明中所述的“抗体”,是本领域众所周知的,是指针对抗原位点的特异性免疫球蛋白。本发明中的抗体是指与本发明的生物标志物蛋白特异性结合的抗体,可以根据本领域中的常规方法来制造抗体。抗体的形式包括多克隆抗体或单克隆抗体、抗体片段(诸如Fab、Fab’、F(ab’)2和Fv片段)、单链Fv(scFv)抗体、多特异性抗体(诸如双特异性抗体)、单特异性抗体、单价抗体、嵌合抗体、人源化抗体、人抗体、包含抗体的抗原结合位点的融合蛋白,以及包含抗原结合位点的任何其他修饰的免疫球蛋白分子,只要该抗体表现出所需的生物结合活性即可。
本发明中所述的“肽”,同“多肽”,是指具有与靶物质高度结合的能力,并且在热处理/化学处理期间不会发生变性。而且,由于其尺寸小,可以通过将其附接到其它蛋白上而用作融合蛋白。具体而言,因为可以特异性地附接到高分子蛋白链上,它可以用作诊断试剂盒和药物递送物质。
本发明中所述的“免疫药物MAGE-A3”,同“免疫治疗药物MAGE-A3”、“药物MAGE-A3”、“MAGE-A3”,是指用于转移性黑色素瘤免疫治疗的药物,该药物具体是指重组MAGE-A3蛋白溶于免疫刺激剂(AS02B或AS15)得到的物质。本发明中所述的“MAGE-A3免疫疗法”,同“MAGE-A3免疫治疗”,是指将重组MAGE-A3蛋白溶于免疫刺激剂(AS02B或AS15)得到的物质施用于转移性黑色素瘤患者的一种免疫治疗方法。
相对于现有技术,本发明具有的优点和有益效果:
本发明首次发现IL2RG、TMEM56、和/或ELFN1联合可用于预测黑色素瘤患者对免疫药物MAGE-A3治疗的敏感性或反应性,且具有较高的准确性,AUC值均较高,可辅助临床医生判断黑色素瘤受试者对免疫药物MAGE-A3治疗的敏感性或反应性,进而实现个体化治疗,具有非常好的临床应用前景。
附图说明
以下,结合附图来详细说明本发明的实施方案,其中:
图1显示IL2RG在对免疫药物MAGE-A3治疗有反应组和对免疫药物MAGE-A3治疗无反应组的黑色素瘤患者之间差异表达的结果图;
图2显示TMEM56在对免疫药物MAGE-A3治疗有反应组和对免疫药物MAGE-A3治疗无反应组的黑色素瘤患者之间差异表达的结果图;
图3显示ELFN1在对免疫药物MAGE-A3治疗有反应组和对免疫药物MAGE-A3治疗无反应组的黑色素瘤患者之间差异表达的结果图;
图4显示IL2RG对预测黑色素瘤对免疫药物MAGE-A3敏感性的诊断效能的结果图;
图5显示TMEM56对预测黑色素瘤对免疫药物MAGE-A3敏感性的诊断效能的结果图;
图6显示ELFN1对预测黑色素瘤对免疫药物MAGE-A3敏感性的诊断效能的结果图;
图7显示IL2RG+TMEM56联合对预测黑色素瘤对免疫药物MAGE-A3敏感性的诊断效能的结果图;
图8显示IL2RG+ELFN1联合对预测黑色素瘤对免疫药物MAGE-A3敏感性的诊断效能的结果图;
图9显示TMEM56+ELFN1联合对预测黑色素瘤对免疫药物MAGE-A3敏感性的诊断效能的结果图;
图10显示IL2RG+TMEM56+ELFN1联合对预测黑色素瘤对免疫药物MAGE-A3敏感性的诊断效能的结果图。
具体实施方式
下面结合具体实施例,进一步阐述本发明,有必要指出的是以下实施例只用于对本发明进行进一步的说明,而不能理解为对本发明保护范围的限制。本领域的普通技术人员可以理解为:在不脱离本发明的原理和宗旨的情况下可以对这些实施例进行多种变化、修改、替换和变型。下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件或按照厂商所建议的条件实施检测。除非另行定义,文中所使用的所有专业与科学用语与本领域熟练技术人员所熟悉的意义相同,此外,任何与所记载内容相似或均等的方法及材料皆可应用于本发明中。
实施例1与转移性黑色素瘤对免疫药物MAGE-A3敏感性相关的基因的筛选
1、数据来源和筛选方法
收集临床诊断为转移性黑色素瘤的患者,这些患者在接受免疫药物MAGE-A3免疫治疗之前均未接受过免疫药物MAGE-A3的治疗。在上述收集的转移性黑色素瘤的患者接受免疫药物MAGE-A3免疫治疗之前,收集所述患者的肿瘤活检组织,检测经MAGE-A3免疫治疗后有反应组(R,responder)或无反应组(NR,non-responder)患者的肿瘤组织中差异表达的基因。所述MAGE-A3免疫治疗是指将免疫药物MAGE-A3施用于转移性黑色素瘤患者,所述免疫药物MAGE-A3是指重组MAGE-A3蛋白溶于免疫刺激剂(AS02B或AS15)得到的物质。其中,根据转移性黑色素瘤是否对免疫药物MAGE-A3有反应/敏感,结合RECIST 1.0(实体瘤的疗效评价标准)指南将上述黑色素瘤患者分为有反应组(R,responder)和无反应组(NR,non-responder);所述有反应组包括完全反应(CR,complete response)的黑色素瘤患者和部分反应(PR,partial response)的黑色素瘤患者,所述无反应组包括稳定性疾病(SD,stabledisease)(>4个月)和进行性疾病(PD,progressive disease);本研究的数据来源于GSE35640,对免疫药物MAGE-A3无反应性和有反应性的转移性黑色素瘤患者的比例如下:non-responder:responder=34:22;
对比有反应组的转移性黑色素瘤患者和无反应组的转移性黑色素瘤患者之间差异表达的基因;使用R软件中的“limma”包(版本为3.36.5)进行差异表达基因的分析,其中,差异表达基因的筛选标准为P.Value<0.01,|log2FC|>1。
2、实验结果
结果显示,筛选得到的在有反应组和无反应组之间差异表达基因中,IL2RG、TMEM56、ELFN1在对免疫药物MAGE-A3治疗有反应组和对免疫药物MAGE-A3治疗无反应组的转移性黑色素瘤患者之间呈现显著性的差异表达,IL2RG、TMEM56、ELFN1在有反应组中的表达趋势分别为上调、下调和下调(见图1-图3),上述结果提示IL2RG、TMEM56、ELFN1是预测黑色素瘤对免疫药物MAGE-A3治疗敏感性的潜在生物标志物。
实施例2筛选得到的差异表达基因在预测黑色素瘤对免疫药物MAGE-A3治疗敏感性中的应用
1、实验方法
对实施例1中筛选得到的在有反应组和无反应组之间差异表达的基因,使用R包“pROC”(版本1.15.0)执行接收器工作特性(ROC)分析,计算受试者工作特征曲线下面积(AUC)以评估单个差异表达基因、任意两个差异表达基因联合、三个差异表达基因联合分别对预测黑色素瘤对免疫药物MAGE-A3治疗敏感性的准确性,其中,所述AUC值的范围是0-1;
其中,在判断单个差异表达基因对预测黑色素瘤对免疫药物MAGE-A3治疗敏感性的诊断效能时,直接采用单个差异表达基因的表达量进行分析,选择Youden指数最大的一点对应的水平作为其cutoff值,AUC在0.5<AUC<0.8的差异表达的基因被用于联合分析;
其中,在判断任意两个差异表达基因联合、三个差异表达基因联合对预测黑色素瘤对免疫药物MAGE-A3治疗敏感性的诊断效能时,对各个差异表达基因的表达水平进行Logistics回归分析,通过拟合出的回归曲线计算出每个黑色素瘤患者对免疫药物MAGE-A3治疗敏感的概率,确定不同的概率划分阈值,根据确定的概率划分阈值,计算得出任意两个差异表达基因联合、三个差异表达基因联合对预测黑色素瘤对免疫药物MAGE-A3治疗敏感性的准确性、特异性以及灵敏度等。
2、实验结果
结果显示,基因联合IL2RG+TMEM56、IL2RG+ELFN1、TMEM56+ELFN1、IL2RG+TMEM56+ELFN1对预测黑色素瘤对免疫药物MAGE-A3治疗敏感性的诊断效能显著优于单个基因的诊断效能,利用上述基因联合预测黑色素瘤对免疫药物MAGE-A3治疗敏感性的AUC值均较高(见表1、图4-图10),表明了上述基因IL2RG、TMEM56、和/或ELFN1可用于临床上辅助医生判断黑色素瘤对免疫药物MAGE-A3治疗的敏感性和/反应性,以指导临床医生选择有效的治疗方法,实现精准的个体化治疗,具有非常好的临床应用前景。
表1基因对预测黑色素瘤对免疫药物MAGE-A3治疗敏感性的诊断效能
基因 | AUC值 |
IL2RG | 0.758 |
TMEM56 | 0.737 |
ELFN1 | 0.698 |
IL2RG+TMEM56 | 0.842 |
IL2RG+ELFN1 | 0.853 |
TMEM56+ELFN1 | 0.779 |
IL2RG+TMEM56+ELFN1 | 0.901 |
上述实施例的说明只是用于理解本发明的方法及其核心思想。应当指出,对于本领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明原理的前提下,还可以对本发明进行若干改进和修饰,这些改进和修饰也将落入本发明权利要求的保护范围内。
Claims (10)
1.检测生物标志物表达水平的试剂在制备用于预测黑色素瘤对免疫药物MAGE-A3敏感性和/或反应性的产品中的应用,其特征在于,所述生物标志物为IL2RG、TMEM56、和/或ELFN1。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述试剂选自:
特异性识别所述生物标志物的探针;或
特异性扩增所述生物标志物的引物;或
特异性结合所述生物标志物的抗体、抗体片段、亲和性蛋白。
3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述产品包括通过核酸杂交技术、核酸扩增技术、蛋白免疫技术、测序技术、色谱技术、质谱技术检测所述生物标志物表达水平的试剂。
4.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述产品包括试剂盒、芯片、试纸、高通量测序平台。
5.一种用于预测黑色素瘤患者对免疫药物MAGE-A3敏感性和/或反应性的产品,其特征在于,所述产品包含检测样本中生物标志物IL2RG、TMEM56、和/或ELFN1表达水平的试剂。
6.根据权利要求5所述的产品,其特征在于,所述试剂包括检测所述生物标志物的mRNA表达水平的试剂、检测所述生物标志物的蛋白表达水平的试剂。
7.根据权利要求6所述的产品,其特征在于,所述试剂包括特异性识别所述生物标志物的探针、特异性扩增所述生物标志物的引物、或特异性结合所述生物标志物的抗体、抗体片段、亲和性蛋白。
8.根据权利要求5所述的产品,其特征在于,所述产品包括试剂盒、芯片、试纸、高通量测序平台。
9.一种预测黑色素瘤患者对免疫药物MAGE-A3敏感性和/或反应性的系统/装置,其特征在于,所述系统/装置包括:
(1)分析单元:所述分析单元用于检测受试者样本中生物标志物IL2RG、TMEM56、和/或ELFN1的表达水平;
(2)评估单元:所述评估单元包含存储的参考和数据处理器,所述数据处理器已经实现了用于比较分析单元检测得到的生物标志物IL2RG、TMEM56、和/或ELFN1的表达水平与存储的参考的算法,由此预测黑色素瘤患者对免疫药物MAGE-A3敏感性和/或反应性;
(3)评估结果输出单元:所述评估结果输出单元将评估单元得到的黑色素瘤患者对免疫药物MAGE-A3敏感性和/或反应性的预测结果输出。
10.生物标志物IL2RG、TMEM56、和/或ELFN1在构建用于预测黑色素瘤患者对免疫药物MAGE-A3敏感性和/或反应性的系统/装置中的应用。
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CN114694745A (zh) * | 2022-03-24 | 2022-07-01 | 至本医疗科技(上海)有限公司 | 预测免疫疗效的方法、装置、计算机设备和存储介质 |
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