CN113361254A - 一种自动化电子病历解析方法与装置 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及医疗设备技术领域，具体涉及一种自动化电子病历解析方法与装置；包病例样本数据获取单元、数据解析单元、解析模板库、解析验证单元、报告对比单元、人工优化单元和人工优化单元；本发明集成解析模板库，按照顺序遍历，对不同医院不同厂家的电子病历模板进行解析模板适配，适配度的评价标准通过病历解析校验评分实现，同时，通过异常处理，对关键字缺失的情况进行处理，结合人工优化，可以实现极大提高电子病历解析的效率，解决了不同医院规则反复更新、无关键字无法解析的问题，降低了解析成本，更具有通用性。
Description
技术领域
本发明涉及医疗设备技术领域，具体涉及一种自动化电子病历解析方法与装置。
背景技术
电子病历是一个人在医疗机构历次就诊过程中产生和被记录的完整、详细的临床信息资源，是目前医疗数据主要的组成部分。但是目前电子病历多以文本形式为主，并不能直接用于分析研究。因此，如何将电子病历准确有效解析，并提取出数据组内容用于分析研究是医疗数据治理中亟待解决的问题。
电子病历解析是将从医疗机构采集的非结构化病历文本，参照卫生部电子病历书写标准以及其他国际指南或标准，解析为可以被广泛应用的结构化数据。医院HIS系统数据接到专科大数据平台的数据库以后，其原有数据的储存格式、节点名称等可能处于未规范化状态。通过病历自动解析，可针对异源异构数据进行规范化节点名称解析与归一，按照标准格式储存。
目前，常用的数据组解析的方法是关键字提取、正则表达式匹配的方法，该方法具体如下：
首先，根据电子病历中的关键字，确定提取数据组的位置；
然后，使用正则表达式等规则匹配方式，将数据组内容提取出来。
例如，从入院记录文本中提取主诉信息：首先，根据“主诉”二字，确定入院记录文本中这组数据组的位置；然后，根据回车符、句号等分隔符将主诉内容提取出来。
虽然，通过这种方法可以快速的进行电子病历数据组解析，但由于电子病历为半结构化内容，大量段落为自由填写。且不同医院不同厂家的电子病历模板也不尽相同。因此，存在如下问题：
①、在确定关键字、制定提取规则时，需要根据不同厂家、不同类型的病历逐一制定，通用性较差；
②、在提取过程中，需要根据实际内容，反复打磨规则，准确率较低；
③、一旦系统出现升级或更换厂家，需重新确定关键字及提取规则，故通用性较差；
④、通过该方法无法解析文本中关键字缺失的情况，对关键字依赖性太强。
综上所述，研发一种自动化电子病历解析方法与装置，仍是医疗设备技术领域中急需解决的关键问题。
发明内容
针对现有技术所存在的上述缺点，本发明在于提供一种自动化电子病历解析方法与装置，本发明集成解析模板库，按照顺序遍历，对不同医院不同厂家的电子病历模板进行解析模板适配，适配度的评价标准通过病历解析校验评分实现，同时，通过异常处理，对关键字缺失的情况进行处理，结合人工优化，可以实现极大提高电子病历解析的效率，解决了不同医院规则反复更新、无关键字无法解析的问题，降低了解析成本，更具有通用性。
为实现上述目的，本发明提供了如下技术方案：
一种自动化电子病历解析装置，包括：
病例样本数据获取单元，所述病例样本数据获取单元用于获取电子病例样本数据。
数据解析单元，所述数据解析单元根据获取的电子病例样本数据，按照模板顺序依次进行样本数数据的解析，所述数据解析单元与病例样本数据获取单元电性连接。
解析模板库，所述解析模板库用于存储解析模板，所述解析模板库与数据解析单元电性连接。
解析验证单元，所述解析验证单元对解析的样本数据分别统计解析节点的数量与原始病历数量，对比解析前后病历数量有无丢失，统计是否存在异常，所述解析验证单元与数据解析单元电性连接；
报告对比单元，所述报告对比单元用于比较所有解析模板的病历解析验证报告，并选出报告分值最高的模板，所述报告对比单元与解析验证单元电性连接。
人工优化单元，所述人工优化单元用于人工优化输出的得分最高的模板，所述人工优化单元与数据解析单元、解析模板库和解析验证单元均电性连接。
本发明进一步设置为：还包括病例解析输出单元，所述病例解析输出单元用于输出解析后的病例模板，所述病例解析输出单元与人工优化单元电性连接。
本发明进一步设置为：所述解析验证单元还用于对所述解析模板进行评分。
本发明进一步设置为：所述数据解析单元包括模板获取模块、样本解析模块和异常处理模块，其中，
所述模板获取模块用于从解析模板库内按照模板顺序依次调取解析模板。
所述样本解析模块根据解析规则对电子病例样本数据进行解析，所述样本解析模块与模板获取模块电性连接。
所述异常处理模块根据无法解析的电子病例样本数据，发起人工解析指令，所述异常处理模块与样本解析模块电性连接。
本发明进一步设置为：所述解析验证单元包括数据统计模块和数据对比模块，其中，
所述数据统计模块用于统计解析节点的数量与原始病历数量。
所述数据对比模块用于对比解析前后病历数量有无丢失，统计是否异常，并对解析结果进行评分。
本发明进一步设置为：所述人工优化单元包括解析模板设置模块、节点设置模块和执行解析模块，其中，
所述解析模板设置模块通过定义解析模板以及与标准病历模板对应的节点，进行解析模板设置。
所述节点设置模块用于进行节点配置，包括增添、删除和修改节点名称，所述节点设置模块与解析模板设置模块电性连接。
所述执行解析模块用于对样本数据进行解析，并返回解析结果验证，所述执行解析模块与节点设置模块电性连接。
本发明进一步设置为：所述节点设置模块还用于将节点设置后的解析模板存储到解析模板库。
一种自动化电子病历解析方法，包括以下步骤：
S1、病例样本数据获取单元获取病例样本数据，将病例样本数据传输至数据解析单元。
S2、数据解析单元从解析模板库中取出第1个模板，对样本数据进行解析。
S3、解析验证单元分别统计解析节点的数量与原始病历数量，对比解析前后病历数量有无丢失，统计是否异常，形成输出报告，并对解析结果进行评分。
S4、重复步骤S2-S3，直到所有模板均取出。
S5、由报告对比单元比较所有解析模板的病历解析验证报告，并选出报告分值最高的模板。
S6、通过人工优化单元由人工对解析模板进行优化。
S7、由病例解析输出单元输出病例解析结果。
本发明进一步设置为：在所述步骤S2中，在发送解析异常时，转至步骤S6，进行人工解析，并将人工解析结果传输给解析验证单元进行解析验证。
本发明进一步设置为：在所述步骤S6中，在人工进行解析优化后，将解析优化模板记录到解析模板库中。
有益效果
采用本发明提供的技术方案，与已知的公有技术相比，具有如下有益效果：
在使用时，病例样本数据获取单元获取电子病例样本数据，将获取的病例样本数据传输至数据解析单元，数据解析单元从解析模板库中获取第1个模板，对样本数据进行解析，并将使用第1个模板的解析结果传输至解析验证单元，然后再从解析模板库中取出第2个模板，再次进行解析，直到所有的模板均取出，解析验证单元对解析的样本数据分别统计解析节点的数量与原始病历数量，对比解析前后病历数量有无丢失，统计是否存在异常，并对所有的解析模板报告进行评分，将解析验证结果传输至报告对比单元，报告对比单元比较所有解析模板的病历解析验证报告，并选出报告分值最高的模板，将选出的最高得分模板传输至人工优化单元，由人工优化单元确定是否进行优化，若优化，则将优化后的解析结果重新传输给解析验证单元，进行验证，并将优化的模板传输到解析模板库，进行模板存储，再通过病例解析输出单元输出解析后的病例，同时，在数据解析单元解析发生异常时，会将病例样本数据直接传输给人工优化单元，进行人工处理，通过解析模板库和异常处理，克服了电子病历解析过程中对关键字及规则的依赖，解决了不同医院规则反复更新、无关键字无法解析的问题，降低了解析成本，极大的提高了电子病历解析的效率，更具有通用性。
附图说明
图1为一种自动化电子病历解析装置的系统图；
图2为一种自动化电子病历解析装置中数据解析单元内部的系统图；
图3为一种自动化电子病历解析装置中解析验证单元内部的系统图；
图4为一种自动化电子病历解析装置中人工优化单元内部的系统图；
图5为一种自动化电子病历解析方法的流程图。
图中标号说明：
1、病例样本数据获取单元；2、数据解析单元；201、模板获取模块；202、样本解析模块；203、异常处理模块；3、解析模板库；4、解析验证单元；401、数据统计模块；402、数据对比模块；5、报告对比单元；6、人工优化单元；601、解析模板设置模块；602、节点设置模块；603、执行解析模块；7、病例解析输出单元。
具体实施方式
下面将结合本发明实施例中的附图，对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述；显然，所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例，而不是全部的实施例，基于本发明中的实施例，本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都属于本发明保护的范围。
在本发明的描述中，需要说明的是，术语“上”、“下”、“内”、“外”、“顶/底端”等指示的方位或位置关系为基于附图所示的方位或位置关系，仅是为了便于描述本发明和简化描述，而不是指示或暗示所指的装置或元件必须具有特定的方位、以特定的方位构造和操作，因此不能理解为对本发明的限制。此外，术语“第一”、“第二”仅用于描述目的，而不能理解为指示或暗示相对重要性。
在本发明的描述中，需要说明的是，除非另有明确的规定和限定，术语“安装”、“设置有”、“套设/接”、“连接”等，应做广义理解，例如“连接”，可以是固定连接，也可以是可拆卸连接，或一体地连接；可以是机械连接，也可以是电连接；可以是直接相连，也可以通过中间媒介间接相连，可以是两个元件内部的连通；对于本领域的普通技术人员而言，可以具体情况理解上述术语在本发明中的具体含义。
实施例1：
请参照图1-4所示，一种自动化电子病历解析装置，包括：
病例样本数据获取单元1，病例样本数据获取单元1用于获取电子病例样本数据。
数据解析单元2，数据解析单元2根据获取的电子病例样本数据，按照模板顺序依次进行样本数数据的解析，数据解析单元2与病例样本数据获取单元1电性连接。
解析模板库3，解析模板库3用于存储解析模板，解析模板库3与数据解析单元2电性连接。
解析验证单元4，解析验证单元4对解析的样本数据分别统计解析节点的数量与原始病历数量，对比解析前后病历数量有无丢失，统计是否存在异常，解析验证单元4与数据解析单元2电性连接；
报告对比单元5，报告对比单元5用于比较所有解析模板的病历解析验证报告，并选出报告分值最高的模板，报告对比单元5与解析验证单元4电性连接。
人工优化单元6，人工优化单元6用于人工优化输出的得分最高的模板，人工优化单元6与数据解析单元2、解析模板库3和解析验证单元4均电性连接。
还包括病例解析输出单元7，病例解析输出单元7用于输出解析后的病例模板，病例解析输出单元7与人工优化单元6电性连接。
解析验证单元4还用于对解析模板进行评分。
本发明在使用时，病例样本数据获取单元1获取电子病例样本数据，将获取的病例样本数据传输至数据解析单元2，数据解析单元2从解析模板库3中获取第1个模板，对样本数据进行解析，并将使用第1个模板的解析结果传输至解析验证单元4，然后再从解析模板库3中取出第2个模板，再次进行解析，直到所有的模板均取出，解析验证单元4对解析的样本数据分别统计解析节点的数量与原始病历数量，对比解析前后病历数量有无丢失，统计是否存在异常，并对所有的解析模板报告进行评分，将解析验证结果传输至报告对比单元5，报告对比单元5比较所有解析模板的病历解析验证报告，并选出报告分值最高的模板，将选出的最高得分模板传输至人工优化单元6，由人工优化单元6确定是否进行优化，若优化，则将优化后的解析结果重新传输给解析验证单元4，进行验证，并将优化的模板传输到解析模板库3，进行模板存储，再通过病例解析输出单元7输出解析后的病例，同时，在数据解析单元2解析发生异常时，会将病例样本数据直接传输给人工优化单元6，进行人工处理，通过解析模板库3和异常处理，克服了电子病历解析过程中对关键字及规则的依赖，解决了不同医院规则反复更新、无关键字无法解析的问题，降低了解析成本，极大的提高了电子病历解析的效率，更具有通用性。
数据解析单元2包括模板获取模块201、样本解析模块202和异常处理模块203，其中，
模板获取模块201用于从解析模板库3内按照模板顺序依次调取解析模板。
样本解析模块202根据解析规则对电子病例样本数据进行解析，样本解析模块202与模板获取模块201电性连接。
异常处理模块203根据无法解析的电子病例样本数据，发起人工解析指令，异常处理模块203与样本解析模块202电性连接。
本发明模板获取模块201从解析模板库3中按照顺序依次获取解析模板，将解析模块传输给样本解析模块202，样本解析模块202通过解析模板和病例样本数据进行解析，并通过异常处理模块203调用异常处理规则，对异常情况进行处理，转入人工优化单元6进行人工解析。
解析验证单元4包括数据统计模块401和数据对比模块402，其中，
数据统计模块401用于统计解析节点的数量与原始病历数量。
数据对比模块402用于对比解析前后病历数量有无丢失，统计是否异常，并对解析结果进行评分。
本发明数据统计模块401统计解析节点的数量与原始病历数量，将统计结果传输给数据对比模块402，由数据对比模块402对比解析前后病历数量有无丢失，统计是否存在无解析成功、通过规则判断是否有逻辑错误等情况，并对解析结果进行评分，集成解析模板库3，按照顺序遍历，对不同医院不同厂家的电子病历模板进行解析模板适配，适配度的评价标准通过病历解析校验评分实现。
人工优化单元6包括解析模板设置模块601、节点设置模块602和执行解析模块603，其中，
解析模板设置模块601通过定义解析模板以及与标准病历模板对应的节点，进行解析模板设置。
节点设置模块602用于进行节点配置，包括增添、删除和修改节点名称，节点设置模块602与解析模板设置模块601电性连接。
执行解析模块603用于对样本数据进行解析，并返回解析结果验证，执行解析模块603与节点设置模块602电性连接。
节点设置模块602还用于将节点设置后的解析模板存储到解析模板库3。
本发明由解析模板设置模块601通过定义解析模板以及与标准病历模板对应的节点，进行解析模板设置，如入院记录的主诉、现病史、既往史等，增添、删除或修改解析模板，再由节点设置模块602按照实际医院情况，进行节点配置，可以进行增添、删除、修改节点名称，其顺序为该医院的解析顺序，最后由执行解析模块603针对样本数据进行解析，将解析结果传输至传输给解析验证单元4进行解析验证，同时，将解析优化模板记录到解析模板库3中。
实施例2：
在实施例1的基础上，请参照图5所示，本发明还提供了一种自动化电子病历解析方法，包括以下步骤：
步骤一、病例样本数据获取单元1获取病例样本数据，将病例样本数据传输至数据解析单元2。
步骤二、数据解析单元2从解析模板库3中取出第1个模板，对样本数据进行解析。
步骤三、解析验证单元4分别统计解析节点的数量与原始病历数量，对比解析前后病历数量有无丢失，统计是否异常，形成输出报告，并对解析结果进行评分。
步骤四、重复步骤S2-S3，直到所有模板均取出。
步骤五、由报告对比单元5比较所有解析模板的病历解析验证报告，并选出报告分值最高的模板。
步骤六、通过人工优化单元6由人工对解析模板进行优化。
步骤七、由病例解析输出单元7输出病例解析结果。
在步骤二中，在发送解析异常时，转至步骤S6，进行人工解析，并将人工解析结果传输给解析验证单元4进行解析验证。
在步骤六中，在人工进行解析优化后，将解析优化模板记录到解析模板库3中。
本发明集成解析模板库3，按照顺序遍历，对不同医院不同厂家的电子病历模板进行解析模板适配，适配度的评价标准通过病历解析校验评分实现，同时，通过异常处理，对关键字缺失的情况进行处理，结合人工优化，可以实现极大提高电子病历解析的效率，解决了不同医院规则反复更新、无关键字无法解析的问题，降低了解析成本，更具有通用性。
本发明的各部分可以用硬件、软件、固件或他们的组合来实现，在上述实施方式中，多个步骤或方法可以用存储在存储器中且由合适的指令执行系统执行的软件或固件来实现，例如，如果用硬件来实现，和在另一实施方式中一样，可用本领域公知的下列技术中的任一项或他们的组合来实现：具有用于对数据信号实现逻辑功能的逻辑门电路的离散逻辑电路，具有合适的组合逻辑门电路的专用集成电路，可编程门阵列（PGA），现场可编程门阵列（FPGA）等。
以上实施例仅用以说明本发明的技术方案，而非对其限制；尽管参照前述实施例对本发明进行了详细的说明，本领域的普通技术人员应当理解：其依然可以对前述各实施例所记载的技术方案进行修改，或者对其中部分技术特征进行等同替换；而这些修改或者替换，并不会使相应技术方案的本质脱离本发明各实施例技术方案的精神和范围。
Claims (10)
1.一种自动化电子病历解析装置，其特征在于，包括：
病例样本数据获取单元（1），所述病例样本数据获取单元（1）用于获取电子病例样本数据；
数据解析单元（2），所述数据解析单元（2）根据获取的电子病例样本数据，按照模板顺序依次进行样本数数据的解析，所述数据解析单元（2）与病例样本数据获取单元（1）电性连接；
解析模板库（3），所述解析模板库（3）用于存储解析模板，所述解析模板库（3）与数据解析单元（2）电性连接；
解析验证单元（4），所述解析验证单元（4）对解析的样本数据分别统计解析节点的数量与原始病历数量，对比解析前后病历数量有无丢失，统计是否存在异常，所述解析验证单元（4）与数据解析单元（2）电性连接；
报告对比单元（5），所述报告对比单元（5）用于比较所有解析模板的病历解析验证报告，并选出报告分值最高的模板，所述报告对比单元（5）与解析验证单元（4）电性连接；
人工优化单元（6），所述人工优化单元（6）用于人工优化输出的得分最高的模板，所述人工优化单元（6）与数据解析单元（2）、解析模板库（3）和解析验证单元（4）均电性连接。
2.根据权利要求1所述的一种自动化电子病历解析装置，其特征在于，还包括病例解析输出单元（7），所述病例解析输出单元（7）用于输出解析后的病例模板，所述病例解析输出单元（7）与人工优化单元（6）电性连接。
3.根据权利要求1所述的一种自动化电子病历解析装置，其特征在于，所述解析验证单元（4）还用于对所述解析模板进行评分。
4.根据权利要求1所述的一种自动化电子病历解析装置，其特征在于，所述数据解析单元（2）包括模板获取模块（201）、样本解析模块（202）和异常处理模块（203），其中，
所述模板获取模块（201）用于从解析模板库（3）内按照模板顺序依次调取解析模板；
所述样本解析模块（202）根据解析规则对电子病例样本数据进行解析，所述样本解析模块（202）与模板获取模块（201）电性连接；
所述异常处理模块（203）根据无法解析的电子病例样本数据，发起人工解析指令，所述异常处理模块（203）与样本解析模块（202）电性连接。
5.根据权利要求1所述的一种自动化电子病历解析装置，其特征在于，所述解析验证单元（4）包括数据统计模块（401）和数据对比模块（402），其中，
所述数据统计模块（401）用于统计解析节点的数量与原始病历数量；
所述数据对比模块（402）用于对比解析前后病历数量有无丢失，统计是否异常，并对解析结果进行评分。
6.根据权利要求1所述的一种自动化电子病历解析装置，其特征在于，所述人工优化单元（6）包括解析模板设置模块（601）、节点设置模块（602）和执行解析模块（603），其中，
所述解析模板设置模块（601）通过定义解析模板以及与标准病历模板对应的节点，进行解析模板设置；
所述节点设置模块（602）用于进行节点配置，包括增添、删除和修改节点名称，所述节点设置模块（602）与解析模板设置模块（601）电性连接；
所述执行解析模块（603）用于对样本数据进行解析，并返回解析结果验证，所述执行解析模块（603）与节点设置模块（602）电性连接。
7.根据权利要求6所述的一种自动化电子病历解析装置，其特征在于，所述节点设置模块（602）还用于将节点设置后的解析模板存储到解析模板库（3）。
8.一种自动化电子病历解析方法，其特征在于，使用了根据权利要求1-7任一项所述的一种自动化电子病历解析装置，包括以下步骤：
S1、病例样本数据获取单元（1）获取病例样本数据，将病例样本数据传输至数据解析单元（2）；
S2、数据解析单元（2）从解析模板库（3）中取出第1个模板，对样本数据进行解析；
S3、解析验证单元（4）分别统计解析节点的数量与原始病历数量，对比解析前后病历数量有无丢失，统计是否异常，形成输出报告，并对解析结果进行评分；
S4、重复步骤S2-S3，直到所有模板均取出；
S5、由报告对比单元（5）比较所有解析模板的病历解析验证报告，并选出报告分值最高的模板；
S6、通过人工优化单元（6）由人工对解析模板进行优化；
S7、由病例解析输出单元（7）输出病例解析结果。
9.根据权利要求8所述的一种自动化电子病历解析方法与装置，其特征在于，在所述步骤S2中，在发送解析异常时，转至步骤S6，进行人工解析，并将人工解析结果传输给解析验证单元（4）进行解析验证。
10.根据权利要求8所述的一种自动化电子病历解析方法与装置，其特征在于，在所述步骤S6中，在人工进行解析优化后，将解析优化模板记录到解析模板库（3）中。
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