CN113260619A - 雷帕霉素衍生物 - Google Patents

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CN113260619A CN201980087363.4A CN201980087363A CN113260619A CN 113260619 A CN113260619 A CN 113260619A CN 201980087363 A CN201980087363 A CN 201980087363A CN 113260619 A CN113260619 A CN 113260619A
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D·J·格拉斯
M·米哈里克
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P·齐格
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Abstract

本披露提供了具有式(I)的32‑脱氧‑雷帕霉素衍生物或其药学上可接受的盐、包含具有式(I)的化合物的药物组合物和药物组合,及其制备方法。本文还提供了使用具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐治疗本文所述的疾病和障碍的方法。

Description

雷帕霉素衍生物
优先权
本申请要求于2018年12月18日提交的U.S.S.N.62/781,242的优先权,将该文献通过引用以其全文并入本文。
技术领域
本披露提供了32-脱氧-雷帕霉素衍生物,涉及其制备以及其使用方法。
背景技术
在哺乳动物细胞中,雷帕霉素靶标(mTOR)激酶存在于两种不同的多蛋白复合物中(称为mTORC1复合物和mTORC2复合物),这两种复合物均可感知营养素和能量的利用,并整合来自生长因子和应激信号的输入。mTORC1整合来自生长因子和营养物质的信号并控制细胞生长和代谢(Laplante M.等人,Cell.[细胞](2012)149(2):274-93),并且是蛋白质翻译和自噬的关键调节剂。该mTORC1复合物对变构mTOR抑制剂,如雷帕霉素和雷帕霉素类似物(rapamycin analog)(所谓的“雷帕霉素类似物(rapalog)”)敏感。雷帕霉素和先前生产的雷帕霉素类似物的作用方式涉及与FK506结合蛋白(例如FKBP12、FKBP12.6、FKBP13、FKBP25、FKBP51或FKBP52(这些FKBP将在此处称为“FKBP”或“FKBPs”))形成细胞内复合物以及该结合蛋白的细胞内复合物的形成,然后使FKBP-雷帕霉素类似物复合物与mTOR的FRB(FK506-雷帕霉素结合)结构域结合。
Figure BDA0003140978730000011
A.M.等人,Mol Cell Biol.[分子细胞生物学](2013)33(7):1357-1367。FKBP-雷帕霉素类似物复合物与mTORC1的这种相互作用导致复合物的变构抑制。雷帕霉素和雷帕霉素类似物(如RAD001(依维莫司;
Figure BDA0003140978730000022
))通过抑制与良性和恶性增殖性障碍相关的mTORC1的活性获得了临床相关性。Royce M.E.等人BreastCancer[乳腺癌](Auckl).(2015)9:73-79;Pleniceanu O.等人Kidney Int Rep.[国际肾脏报告](2018)3(1):155-159。
雷帕霉素是一种已知的由吸水链霉菌(Streptomyces hygoscopius)产生的大环内酯类抗生素,参见例如McAlpine,J.B.等人,J.Antibiotics[抗生素杂志](1991)44:688;Schreiber,S.L.等人,J.Am.Chem.Soc.[美国化学会志](1991)113:7433;美国专利号3,929,992。本文件中使用的雷帕霉素及其衍生物的下列编号规定如下所示:
Figure BDA0003140978730000021
雷帕霉素是有效的免疫抑制剂,也已显示具有抗肿瘤和抗真菌活性。它已显示可用于预防或治疗系统性红斑狼疮、肺部炎症、胰岛素依赖型糖尿病、皮肤障碍如银屑病、血管损伤后平滑肌细胞增殖和内膜增厚、成人T细胞白血病/淋巴瘤、恶性癌、心脏炎性疾病、贫血和神经突增生。然而,它作为药物的实用性受到其极低且可变的生物利用度的限制。此外,雷帕霉素的配制具挑战性,因此难以获得稳定的盖仑(galenic)组合物。
在动物模型中,雷帕霉素类似物延长寿命并延缓与年龄有关的疾病的发作。与其他生物过程一样,衰老是由信号传导途径,如TOR途径(在这种情况下,命名为“TOR”,以包括酵母和秀丽隐杆线虫(C elegans)系统)调节,并且在哺乳动物中则由mTORC1途径调节。TOR和mTORC1信号传导的调节可延长寿命,并延缓从蝇到哺乳动物的各种生物体中与年龄有关的疾病发作。例如,通过基因突变对TOR途径的抑制延长了酵母、秀丽隐杆线虫和果蝇的寿命,并且对mTORC1途径的抑制延长了小鼠的寿命(Kaeberlein等人,Science[科学](2005)310:1193-1196;Kapahi等人,Curr Biol[当代生物学](2004)14:885-890;Selman等人,Science[科学](2009)326:140-144;Vellai等人,Nature[自然](2003)426:620)。此外,mTORC1抑制剂雷帕霉素延长小鼠的寿命,即使在晚年(Harrison等人,Nature[自然](2009)460(7253):392-395)。这些数据增加了靶向哺乳动物TOR(mTOR)途径的药物将对人类衰老和与年龄有关的疾病具有治疗作用的可能性。M.Leslie在Science[科学],2013,342中描述了在老年男性中使用雷帕霉素的临床试验报告。J.Mannick等人在Sci Transl Med.[科学转化医学](2014)6(268):268ra179中描述了mTOR抑制可改善老年人的免疫功能。然而,由于其副作用(包括免疫抑制、血细胞减少、口腔炎、胃肠道不适和间质性肺炎),研究人员一直警惕在人类衰老试验中使用当前可用的mTOR抑制剂。
在神经损伤之前或紧随之后,mTOR途径的药理抑制作用可预防动物脑部的病理变化和获得性癫痫模型中的自发性复发性癫痫发作的进展(Zeng等人,The mammaliantarget of rapamycin signaling pathway mediates epileptogenesis in a model oftemporal lobe epilepsy[雷帕霉素信号传导途径的哺乳动物靶标介导颞叶癫痫模型中的癫痫发生];J.Neurosci.[神经科学杂志],(2009)第6964-6972页)。因此,认为雷帕霉素和雷帕霉素类似物在此类适应证中也具有潜在价值。
已证明雷帕霉素类似物对人类的肝纤维化症状有效。参见,例如,Liver Int.[肝脏国际](2014)34(10):1513-21。
线粒体肌病(MM)是成人发病型线粒体疾病的最常见表现,并表现出多方面的组织特异性应激反应:(1)转录反应,包括代谢性细胞因子FGF21和GDF15;(2)一碳代谢的重构;和(3)线粒体未折叠蛋白反应。Khan等人于2017年8月1日在Cell Metabolism[细胞代谢]26,419-428中描述到,这些过程是一个整合的线粒体应激反应(ISRmt)的一部分,该反应由骨骼肌中的mTORC1控制。mtDNA复制缺陷激活了mTORC1,mTORC1通过ATF4激活来驱动整合的线粒体应激反应,从而诱导核苷酸和丝氨酸从头合成、1C循环、以及FGF21和GDF15的产生。雷帕霉素对mTORC1的抑制下调了ISRmt(整合的线粒体应激反应)的所有组分,改善了所有MM标志,甚至逆转了晚期MM的进程,而不引起线粒体生物发生。因此,认为雷帕霉素和雷帕霉素类似物在此类适应证中也具有潜在价值。
因此,仍然需要提供新的mTOR抑制剂,它们是良好候选药物,在良好效力、稳定性和生物利用度方面表现出了平衡。
发明内容
具有式(I)的化合物是mTORC1抑制剂,并且可用于治疗障碍,特别是与年龄有关的障碍,或目前批准使用雷帕霉素类似物治疗的疾病和障碍。如本文所述,C32处的酮的完全还原和C16甲氧基的取代提供了在良好效力、稳定性和生物利用度方面表现出平衡的化合物。
不希望受理论束缚,在FKBP12水平足以抑制mTORC1的情况下,具有式(I)的化合物通过与FKBP12结合而有效抑制mTORC1。在FKBP12水平不足以抑制mTORC1但其中FKBP25、FKBP51和/或FKBP52足以抑制mTORC1的情况下,具有式(I)的化合物还可以通过与FKBP25、FKBP51和/或FKBP52结合而有效抑制mTORC1。因此,在某些细胞类型中(例如,并且因此在不同的潜在适应证中,例如,如本文所述的疾病和障碍),FKBP水平可能不同。因此,RAD001可能对具有足够FKBP12水平的此类细胞类型有效。然而,具有式(I)的化合物可能在FKBP12水平足够或不足的某些细胞类型中有效。
一方面,本披露提供了具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中:
Figure BDA0003140978730000051
R1选自由-ORa和5至6元杂芳基组成的组;
R2和R3各自独立地选自由以下组成的组:H、C1-6烷基、
-ORb、-C0-6亚烷基-SO2R4和-C(O)OR5
R4是-OR5、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、杂C1-6烷基、C1-6羟基烷基、C3-8环烷基C0-6烷基;
R5是H或C1-6烷基;
Ra选自由以下组成的组:H、-P(O)(Rb)2、-C(O)Rc、-C(O)ORc、C1-6烷基和C1-6羟基烷基;
每个Rb独立地选自由H和C1-6烷基组成的组;并且
每个Rc独立地选自由H、C1-6烷基和C1-6羟基烷基组成的组。
在一个实施例中,本披露提供了药物组合物,所述药物组合物包含治疗有效量的具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐、以及一种或多种药学上可接受的载体。
在一个实施例中,本披露提供了药物组合,所述药物组合包含治疗有效量的具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐、以及一种或多种治疗活性剂。
在另一方面,本披露提供了在有需要的受试者中用于治疗由mTOR途径介导的障碍或疾病的方法,所述方法包括向受试者施用治疗有效量的具有式(I)的化合物、或药物组合物、或其药物组合。
在另一方面,本披露提供了一种用于治疗受试者的疾病或障碍的方法,其中与疾病或障碍的病理学相关的靶组织、器官或细胞具有不足以抑制mTORC1的FKBP12水平,所述方法包括向有需要的受试者施用治疗有效量的具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐、或本文所述的药物组合物、或本文所述的药物组合。
在一个实施例中,例如与雷帕霉素或RAD001相比,具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐与FKBP12、FKBP51和/或FKBP52结合具有较高的亲和力,足以抑制mTORC1。
在一个实施例中,与雷帕霉素或RAD001相比,具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐可与FKBP12、FKBP25、FKBP51和/或FKBP52复合,以更有效地结合和抑制mTORC1。
在一个实施例中,例如与雷帕霉素或RAD001相比,与FKBP12、FKBP25、FKBP51和/或FKBP52具有较高的亲和力,从而产生更大的功效。
在一个实施例中,治疗功效是根据经验确定的,例如,与雷帕霉素或RAD001相比。
在另一方面,本披露提供了一种用于治疗具有或被确定具有不足以抑制mTORC1的FKBP12水平的受试者的疾病或障碍的方法,所述方法包括向有需要的受试者施用治疗有效量的具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,或本文所述的药物组合物,或本文所述的药物组合。
在一个实施例中,受试者在与疾病或障碍的病理学相关的靶组织、器官或细胞中具有或被确定具有不足以抑制mTORC1的FKBP12水平。
在一个实施例中,例如与雷帕霉素或RAD001相比,具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐与FKBP12、FKBP25、FKBP51和/或FKBP52结合具有较高的亲和力,足以抑制mTORC1。
在一个实施例中,治疗功效是根据经验确定的,例如,与雷帕霉素或RAD001相比。
在另一方面,本披露提供了一种治疗具有或先前被确定具有足以抑制mTORC1的FKBP12水平的受试者的疾病或障碍的方法,所述方法包括向有需要的受试者施用治疗有效量的具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,或本文所述的药物组合物,或本文所述的药物组合。
在另一方面,本披露提供了在有需要的受试者中治疗年龄有关的疾病或障碍的方法,所述方法包括向受试者施用治疗有效量的具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,或本文所述的药物组合物,或本文所述的药物组合。
在一个实施例中,所述疾病或障碍选自肌肉减少症、皮肤萎缩、樱桃状血管瘤、脂溢性角化病、脑萎缩(也称作痴呆)、动脉粥样硬化、动脉硬化、肺气肿、骨质疏松症、骨关节炎、高血压(high blood pressure)、勃起功能障碍、白内障、黄斑变性、青光眼、中风、脑血管疾病(中风)、慢性肾脏疾病、糖尿病相关性肾脏疾病、肝功能受损、肝纤维化、自身免疫性肝炎、子宫内膜增生、代谢功能障碍、肾血管疾病、听觉损失、行动不便(例如,虚弱)、认知减退、肌腱僵硬、心脏功能障碍(如心脏肥大和/或收缩和/或舒张功能障碍和/或高血压(hypertension))、导致射血分数降低的心脏功能障碍、免疫衰老、帕金森氏病、阿尔茨海默氏病、癌症、由于免疫监视降低导致的致癌免疫衰老、由于免疫功能下降导致的感染、慢性阻塞性肺病(COPD)、肥胖、味觉消失、嗅觉消失、关节炎和II型糖尿病(包括糖尿病引起的并发症,如肾功能衰竭、失明和神经病)。
在另一方面,本披露提供了在有需要的受试者中治疗疾病或障碍的方法,所述方法包括向受试者施用治疗有效量的具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐、或药物组合物、或其药物组合,其中所述障碍或疾病选自:
-急性或慢性器官或组织移植排斥;
-移植血管病变;
-导致血管内膜增厚、血管阻塞、阻塞性冠状动脉粥样硬化、再狭窄的平滑肌细胞增殖和迁移;
-自身免疫性疾病和炎性病症;
-哮喘;
-多药耐药性(MDR);
-真菌感染;
-炎症;
-感染;
-与年龄有关的疾病;
-神经退行性疾病;
-增殖性障碍,例如癌症;
-癫痫发作和与癫痫发作有关的障碍;和
-线粒体肌病和线粒体应激。
在另一方面,本披露提供了在有需要的受试者中治疗癌症的方法,所述方法包括向受试者施用治疗有效量的具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,或本文所述的药物组合物,或本文所述的药物组合。
在一个实施例中,所述方法进一步包括PD-1/PDL-1抑制剂。
在一个实施例中,所述癌症选自肾癌、肾细胞癌、结肠直肠癌、子宫肉瘤、子宫内膜子宫癌、子宫内膜癌、乳腺癌、卵巢癌、宫颈癌、胃癌、纤维肉瘤、胰腺癌、肝癌、黑素瘤、白血病、多发性骨髓瘤、鼻咽癌、前列腺癌、肺癌、胶质母细胞瘤、膀胱癌、间皮瘤、头癌、横纹肌肉瘤、肉瘤、淋巴瘤和颈癌。
在一个实施例中,所述障碍是包括纤维化和/或炎症过程的肝障碍,例如,发生在终末期肝脏疾病中的肝纤维化;肝硬化;毒性引起的肝衰竭;非酒精相关性肝脂肪变性或NASH;和酒精相关性脂肪变性。
在一个实施例中,所述障碍是在肾脏中包括纤维化或炎症过程的肾障碍,例如,肾纤维化,其发生是急性肾损伤的结果,导致慢性肾脏疾病和糖尿病性肾病。
在一个实施例中,所述障碍是心脏功能障碍,例如,心肌梗塞或心脏肥大。在一个实施例中,所述心脏功能障碍是收缩和/或舒张功能障碍。在一个实施例中,所述心脏功能障碍是高血压。在一个实施例中,所述心脏功能障碍导致射血分数降低。
在一个实施例中,所述障碍是由于免疫监视降低导致的致癌免疫衰老。
在一个实施例中,所述障碍是癌症,包括通过免疫疗法治疗的肿瘤,以及先前已通过雷帕霉素、RAD001或另一雷帕霉素类似物治疗的那些肿瘤。在一个实施例中,所述癌症包括显示mTOR途径被激活的肿瘤,包括其中Tsc1基因中存在突变的情况,或其中通过雷帕霉素类似物适当治疗的肿瘤微环境的情况。
本文陈述了本披露的一个或多个实施例的细节。通过附图、具体实施方式、实例和权利要求书,本披露的其他特征、目标和优点将是显而易见的。
附图说明
图1描绘了化合物2与FKBP12的X射线共晶结构。C16取代基是(S)-构型。
图2描绘了化合物29与FKBP12的X射线共晶结构。C16取代基是(R)-构型。
图3A描绘了显示静脉注射(i.v.)和口服(p.o.)给药后大鼠中RAD001血药浓度的线图。Y轴-RAD001的血药浓度(nM)。X轴-施用RAD001后采血的时间(小时)。数据为来自3只大鼠的平均值±标准偏差。
图3B描绘了显示静脉注射(i.v.)和口服(p.o.)给药后在大鼠中化合物2血药浓度的线图。Y轴-化合物2的血药浓度(nM)。X轴-施用化合物2后采血的时间(小时)。数据为来自3只大鼠的平均值±标准偏差。
图4A和4B显示化合物2抑制大鼠肝脏中的mTORC1途径。给予大鼠1、3或10mg/kg单次口服剂量的化合物2,并在给药后3小时采集肝脏样本。用媒介物处理的大鼠用作对照。图4A显示了用媒介物或1、3或10mg/kg的化合物2处理,并在处理后3小时进行了分析的大鼠肝脏中磷酸化(p-)和总(t-)S6蛋白的免疫印迹图像。GAPDH(3-磷酸甘油醛脱氢酶)用作蛋白质载样对照。图4B中的直方图显示了p-S6到t-S6的光密度定量。在图4B中描绘的直方图中,每个条上方显示了表示p-S6/t-S6比的平均任意值。X轴代表口服给予剂量(1、3或10mg/kg)。Y轴代表任意单位。在每个实验组中使用六只大鼠。数据为平均值±标准偏差。用单因素ANOVA然后用邓尼特多重比较检验进行数据分析,其中将所有组的平均值与媒介物处理组进行比较。****P<0.001。
图5A-5D描绘了用化合物2(实线)或RAD001(虚线)处理后在野生型(图5A)、FKBP12敲除(图5B)、FKBP12/12.6/13/52/51敲除(图5C)和FKBP12/12.6/25/52/51敲除(图5D)293T细胞中显示出S6K1(Thr389)抑制的线图。将细胞以一式三份进行处理。Y轴代表相对于用培养基加DMSO处理的细胞中的S6K1(Thr389)水平的抑制百分比。X轴代表化合物2或RAD001的浓度。
具体实施方式
本文披露的化合物是mTORC1抑制剂,可用于治疗障碍,特别是与年龄有关的障碍,或目前批准使用雷帕霉素类似物(例如RAD001)治疗的障碍。
定义
除非另有指明,术语“本披露的化合物(compounds of the disclosure或compound of the disclosure)”、“具有式(I)的化合物(a compound of Formula(I)和compounds of Formula(I))”是指具有式(I)的化合物,子式(I)-A、(I)-B、(I)-C、(I)-D、(I)-E、(I)-F,示例化合物及其盐,以及所有的立体异构体(包括非对映异构体和对映异构体)、旋转异构体、互变异构体和同位素标记的化合物(包括氘取代物)以及固有形成的部分。
本披露化合物的术语“治疗有效量”是指将引起受试者的生物学或医学应答(例如,酶或蛋白活性的降低或抑制,或改善症状、缓解病症、减慢或延迟疾病进展或预防疾病等)的本披露的化合物的量。在一个实施例中,术语“治疗有效量”是指本披露的化合物的如下量,当施用于受试者时,所述量有效地(1)至少部分缓解或改善病症或障碍或疾病(i)由mTOR途径介导,或(ii)与mTOR活性相关,或(iii)表征为mTOR的活性(正常或异常);或(2)降低或抑制mTOR的活性;或(3)减少或抑制mTOR的表达。在一个实施例中,术语“治疗有效量”是指本披露的化合物的如下量,当施用至细胞、或组织、或非细胞生物材料、或介质时有效地至少部分降低或抑制mTOR的活性;或至少部分地减少或抑制mTOR的表达。
如本文所用,术语“受试者”是指灵长类动物(例如,人(男性或女性))、狗、猫、兔、豚鼠、猪、大鼠和小鼠。在某些实施例中,受试者为灵长类。在又其他的实施例中,受试者是人。
如本文所用,术语“施用(administer、administering或administration)”是指植入、吸收、摄取、注射、吸入、或以其他方式引入本发明化合物或其药物组合物。
如本文所用,术语“抑制(inhibit、inhibition或inhibiting)”是指减少或抑制给定的病症、症状或障碍、或疾病,或在生物活性或过程的基线活性方面的显著降低。
如本文所用,术语任何疾病或障碍的“治疗(treat、treating或treatment)”是指缓解、延迟发作或改善疾病或障碍(即,减慢或阻止疾病或其至少一种临床症状的发展);或缓解或改善与所述疾病或障碍相关的至少一种物理参数或生物标记,包括患者可能无法辨别的那些物理参数或生物标记。在一个实施例中,“治疗”需要已经发展或已经观察到疾病、障碍或病症的体征或症状。在其他实施例中,可以在没有疾病或病症的体征或症状的情况下施用治疗。例如,可以在症状发作之前对易感个体施用治疗(例如,根据症状史和/或根据遗传或其他易感因素)。症状已经消退后也可以继续治疗,例如,以延迟或防止复发。
如本文所用,术语任何疾病或障碍的“预防(prevent、preventing或prevention)”是指疾病或障碍的预防性治疗;或延迟疾病或障碍的发作或进展。
如本文所用,“与年龄有关的疾病或障碍”是指在人群中的发病率或在个体中的严重程度与年龄进展相关的任何疾病或障碍。更具体地,与年龄有关的疾病或障碍是相对于25-35岁之间的人类个体而言,在65岁以上的人类个体中发病率至少高1.5倍的疾病或障碍。与年龄有关的障碍的实例包括但不限于:肌肉减少症、皮肤萎缩、樱桃状血管瘤、脂溢性角化病、脑萎缩(也称作痴呆)、动脉粥样硬化、动脉硬化、肺气肿、骨质疏松症、骨关节炎、高血压、勃起功能障碍、白内障、黄斑变性、青光眼、中风、脑血管疾病(中风)、慢性肾脏疾病、糖尿病相关性肾脏疾病、肝功能受损、肝纤维化、自身免疫性肝炎、子宫内膜增生、代谢功能障碍、肾血管疾病、听觉损失、行动不便(例如,虚弱)、认知减退、肌腱僵硬、心脏功能障碍(如心脏肥大和/或收缩和/或舒张功能障碍和/或高血压)、导致射血分数降低的心脏功能障碍、免疫衰老、帕金森氏病、阿尔茨海默氏病、癌症、由于免疫监视降低导致的致癌免疫衰老、由于免疫功能下降导致的感染、慢性阻塞性肺疾病(COPD)、肥胖、味觉消失、嗅觉消失、关节炎和II型糖尿病(包括糖尿病引起的并发症,如肾功能衰竭、失明和神经病)。
如本文所用,如果受试者将在生物学上、在医学上或在生活质量上从治疗中获益,则这名受试者是“需要”这种治疗的。
如本文所用,术语“一个/种(a,an)”,“所述(the)”以及在本披露的上下文中使用的类似术语(特别是在权利要求的上下文中)应被解释为涵盖单数和复数两者,本文中除非另外指示或与上下文明显相矛盾。
术语“烷基”是指具有从1至6个碳原子的直链或支链饱和烃基的基团(“C1-6烷基”)。在一些实施例中,烷基基团具有1至5个碳原子(“C1-5烷基”)。在一些实施例中,烷基基团具有1至4个碳原子(“C1-4烷基”)。在一些实施例中,烷基基团具有1至3个碳原子(“C1-3烷基”)。在一些实施例中,烷基基团具有1至2个碳原子(“C1-2烷基”)。在一些实施例中,烷基基团具有1个碳原子(“C1烷基”)。在一些实施例中,烷基基团具有2至6个碳原子(“C2-6烷基”)。C1-6烷基基团的实例包括甲基(C1)、乙基(C2)、丙基(C3)(例如,正丙基,异丙基)、丁基(C4)(例如,正丁基、叔丁基、仲丁基、异丁基)、戊基(C5)(例如,正戊基、3-戊基、戊烷基、新戊基、3-甲基-2-丁烷基、叔戊基)、和己基(C6)(例如,正己基)。
“亚烷基”是指烷基基团的二价基团,例如-CH2-、-CH2CH2-、和-CH2CH2CH2-。
“杂烷基”是指烷基基团,其进一步包括在母链的一个或多个末端位置内(即插入在相邻碳原子之间)和/或位于母链的一个或多个末端位置的至少一个选自氧、氮或硫的杂原子(例如,1、2、3或4个杂原子)。在一些实施例中,杂烷基基团是在母链内具有1至6个碳原子和1个或多个杂原子的饱和基团(“杂C1-6烷基”)。在一些实施例中,杂烷基基团是在母链内具有1至5个碳原子和1或2个杂原子的饱和基团(“杂C1-5烷基”)。在一些实施例中,杂烷基基团是在母链内具有1至4个碳原子和1或2个杂原子的饱和基团(“杂C1-4烷基”)。在一些实施例中,杂烷基基团是在母链内具有1至3个碳原子和1个杂原子的饱和基团(“杂C1-3烷基”)。在一些实施例中,杂烷基基团是在母链内具有1至2个碳原子和1个杂原子的饱和基团(“杂C1-2烷基”)。在一些实施例中,杂烷基基团是具有1个碳原子和1个杂原子的饱和基团(“杂C1烷基”)。在一些实施例中,杂烷基基团是在母链内具有2至6个碳原子和1或2个杂原子的饱和基团(“杂C2-6烷基”)。
“卤代烷基”是指取代的烷基,其中一个或多个氢原子独立地被卤素(例如氟、溴、氯或碘)替换,并且包括其中所有氢已被卤基(例如,全氟烷基)替换的烷基部分。在一些实施例中,卤代烷基部分具有1至6个碳原子(“C1-6卤代烷基”)。在一些实施例中,卤代烷基部分具有1至4个碳原子(“C1-4卤代烷基”)。在一些实施例中,卤代烷基部分具有1至3个碳原子(“C1-3卤代烷基”)。在一些实施例中,卤代烷基部分具有1至2个碳原子(“C1-2卤代烷基”)。卤代烷基的实例包括-CF3、-CF2CF3、-CF2CF2CF3、-CCl3、-CH2CH2Cl、-CH2CH2CH2Cl、-CFCl2、-CF2Cl等。
“羟基C1-6烷基”是指被一个或多个-OH基团取代的烷基基团。羟基C1-6烷基基团的实例包括HO-CH2-、HO-CH2CH2-和-CH2-CH(OH)CH3
“环烷基”是指具有3至12个碳的环状、双环、三环或多环非芳香烃基团。在一个实施例中,环烷基是具有3-6个碳的单环。环烷基基团可含有稠环或螺环。稠环是共用一个碳原子的环。环烷基部分的实例包括但不限于环丙基、环丁基、环戊基、环己基、金刚烷基和降莰基。
“环烷基烷基”是指(环烷基)-烷基基团,其中环烷基和烷基如本文所披露的。“环烷基烷基”通过烷基基团键合到母体分子结构上。在一个实施例中,环烷基烷基部分是C3环烷基C1-6烷基基团。在一个实施例中,环烷基烷基部分是C4环烷基C1-6烷基基团。在一个实施例中,环烷基烷基是C5环烷基C1-6烷基基团。在一个实施例中,环烷基烷基是C6环烷基C1-6烷基基团。在一个实施例中,环烷基烷基部分是C3环烷基C1-3烷基基团。在一个实施例中,环烷基烷基部分是C4环烷基C1-3烷基基团。在一个实施例中,环烷基烷基是C5环烷基C1-3烷基基团。在一个实施例中,环烷基烷基是C6环烷基C1-3烷基基团。
“杂芳基”是指具有指定的环原子数并且包含一个或多个单独地选自氮、氧和硫的杂原子的稳定的芳香单环基或双环基。杂芳基基团可以经由碳原子或杂原子键合。在一个实施例中,杂芳基是5或6元杂芳基。在一个实施例中,杂芳基是5元杂芳基。在一个实施例中,杂芳基是6元杂芳基。杂芳基基团的实例包括但不限于呋喃基、吡咯基、噻吩基、吡唑基、咪唑基、噻唑基、异噻唑基、噁唑基、异噁唑基、三唑基、四唑基、吡嗪基、哒嗪基、嘧啶基、吡啶基、喹啉基、异喹啉基、吲哚基、吲唑基、噁二唑基、苯并噻唑基、喹喔啉基等等。
如本文所用,“羟基”(hydroxy或hydroxyl)是指-OH。
如本文所用,当每个表达(例如烷基、m、n等)在任何结构中出现不止一次时,其的定义旨在独立于其在相同结构中其他位置的定义。
以下更详细地描述特定官能团和化学术语的定义。化学元素根据元素周期表,CAS版本,Handbook of Chemistry and Physics[物理化学手册],第75版,内封面进行鉴定,并且具体官能团通常如其中所述被定义。另外,有机化学的一般原理以及特定功能性部分和反应性描述在Thomas Sorrell,Organic Chemistry[有机化学],University ScienceBooks[大学科学书籍出版社],索萨利托,1999;Smith和March,March’s Advanced OrganicChemistry[马奇氏高级有机化学],第5版,John Wiley&Sons,Inc.[约翰·威利父子出版社],纽约,2001;Larock,Comprehensive Organic Transformations[有机官能团转换],VCH Publishers,Inc.[VCH出版社有限公司],纽约,1989;以及Carruthers,Some ModernMethods of Organic Synthesis[有机合成的一些现代方法],第3版,CambridgeUniversity Press[剑桥大学出版社],剑桥,1987中。
本披露的某些化合物可以以特定的几何或立体异构形式存在。例如,如果需要本披露化合物的特定对映异构体,则可以通过不对称合成或通过手性助剂衍生来制备,其中将所得非对映异构体混合物分离并且将辅助基团裂解以提供所希望的纯对映异构体。可替代地,在分子含有碱性官能团(例如氨基)、或酸性官能团(例如羧基)的情况下,通过与适当的光学活性酸或碱形成非对映异构体盐,然后通过分步结晶或本领域熟知的色谱方法拆分由此形成的非对映异构体,以及随后回收纯对映异构体。
除非另有说明,本文所描绘的结构还意味着包括该结构的几何(或构象))形式;例如,每个不对称中心的R和S构型、Z和E双键异构体以及Z和E构象异构体。因此,本披露化合物的单一立体化学异构体以及对映异构体、非对映异构体和几何(或构象)混合物都在本披露的范围内。除非另有说明,否则本披露化合物的所有互变异构形式都在本披露的范围内。另外,除非另有说明,否则本文描绘的结构还意在包括仅在一个或多个同位素富集的原子存在下不同的化合物。例如,具有本披露结构的化合物,包括用氘或氚替换氢,或用富含13C-或14C-的碳替换碳,都在本披露的范围内。此类化合物例如可用作分析工具,用作生物学测定中的探针或用作根据本披露的治疗剂。
组合物的“对映异构体过量”或“%对映异构体过量”可使用以下所示的方程式计算。在下面所示的实例中,组合物含有90%的一种对映异构体(例如S对映异构体),和10%的另一种对映异构体(即R对映异构体)。
ee=(90-10)/100*100%=80%。
因此,据信含有90%的一种对映异构体和10%的另一种对映异构体的组合物具有80%的对映异构体过量。本文所述的化合物或组合物可含有化合物的一种形式(S-对映异构体)的至少50%、75%、90%、95%、或99%的对映异构体过量。换句话说,此类化合物或组合物含有S对映异构体超过R对映异构体的对映异构体过量。
在特定对映体是优选的情况下,在一些实施例中,它可以基本上不含相应的对映体,并且也可以称为“光学富集的”提供。如本文所用,“光学富集的”意指化合物由显著更大比例的一种对映异构体组成。在某些实施例中,化合物由按重量计至少约90%的优选的对映异构体组成。在其他实施例中,化合物由按重量计至少约95%、98%或99%的优选的对映异构体组成。优选的对映异构体可以通过本领域技术人员已知的任何方法(包括手性高压液相色谱(HPLC)和手性盐的形成和结晶)从外消旋混合物中分离,或通过不对称合成制备。参见,例如Jacques等人,Enantiomers,Racemates and Resolutions[对映异构体、外消旋体和分辨率](Wiley Interscience[威利国际科学出版社],纽约,1981);Wilen,等人,Tetrahedron[四面体]33:2725(1977);Eliel,E.L.Stereochemistry of CarbonCompounds[碳化合物的立体化学](McGraw-Hill[麦格劳希尔出版社],NY,1962);Wilen,S.H.Tables of Resolving Agents and Optical Resolutions[分辨剂和光学分辨率的表]第268页(E.L.Eliel,编辑,Univ.of Notre Dame Press[圣母大学出版社],巴黎圣母院(Notre Dame),IN 1972)。
在本文描述的所有方法能够以任何适合顺序进行,除非本文另外指示或另外与上下文明显矛盾。本文提供的任何和所有实例或示例性语言(如“例如”)的应用仅旨在更好地说明本披露,而不对另外要求保护的本披露范围做出限制。
任何所得异构体混合物可以基于组分的物理化学差异分离成纯的或基本上纯的几何或光学异构体、非对映异构体、外消旋体,例如通过色谱法和/或分级结晶。
可以通过已知方法将任何所得的终产物或中间体的外消旋体拆分成光学对映体,例如通过分离用光学活性酸或碱获得的其非对映异构体盐,并释放出光学活性的酸性或碱性化合物来拆分。特别地,因此可以采用碱性部分将本披露的化合物拆分成它们的光学对映体,例如通过分级结晶用光学活性酸,例如酒石酸、二苯甲酰基酒石酸、二乙酰基酒石酸、二-O,O'-对甲苯酰基酒石酸、扁桃酸、苹果酸或樟脑-10-磺酸形成的盐来拆分。外消旋产物也可以通过手性色谱法拆分,例如使用手性吸附剂的高压液相色谱法(HPLC)。
本文披露的化合物还可在构成此类化合物的一个或多个原子处包含非自然比例的原子同位素。例如,化合物可以用放射性同位素进行放射性标记,例如氘(2H)、氚(3H)、碳-13(13C)或碳-14(14C)。本文披露的化合物的所有同位素变体,无论是否具有放射性,均旨在涵盖在本披露的范围内。此外,本文描述的化合物的所有互变异构形式均旨在落入本披露的范围内。
术语“互变异构体”是指具有可互换形式的特定化合物结构并且在氢原子和电子移位方面变化的化合物。因此,两种结构可以通过π电子和原子(通常是H)的运动处于平衡。例如,烯醇和酮是互变异构体,因为通过用酸或碱的处理它们快速地相互转化。互变异构的另一个实例是苯基硝基甲烷的酸-和硝基-形式,它们同样是通过用酸或碱处理而形成的。互变异构形式可以与获得目的化合物的最优化学反应性和生物活性相关。
化合物
一方面,本披露提供了具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中:
Figure BDA0003140978730000181
R1选自由-ORa和5至6元杂芳基组成的组;
R2和R3各自独立地选自由以下组成的组:H、C1-6烷基、-ORb、-C0-6亚烷基-SO2R4和-C(O)OR5
R4是-OR5、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、杂C1-6烷基、C1-6羟基烷基、C3-8环烷基C0-6烷基;
R5是H或C1-6烷基;
Ra选自由以下组成的组:H、-P(O)(Rb)2、-C(O)Rc、-C(O)ORc、C1-6烷基和C1-6羟基烷基;
每个Rb独立地选自由H和C1-6烷基组成的组;并且
每个Rc独立地选自由H、C1-6烷基和C1-6羟基烷基组成的组。
在一个实施例中,R1是-ORa。在一个实施例中,R1是5至6元杂芳基,例如5元杂芳基。在一个实施例中,R1选自由羟基、
Figure BDA0003140978730000182
组成的组。
在一个实施例中,R2和R3各自独立地选自由H和-ORb组成的组。在一个实施例中,R2和R3各自独立地选自由H、C1-6烷基和-C0-6亚烷基-SO2R4组成的组。在一个实施例中,R2和R3各自独立地选自由H、羟基、-C0-6亚烷基-SO2R4和-C(O)OR5组成的组。
在一个实施例中,所述化合物是具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中:
R1选自由以下组成的组:羟基、
Figure BDA0003140978730000191
Figure BDA0003140978730000192
R2和R3各自独立地选自由H、羟基、-C0-6亚烷基-SO2R4和-C(O)OR5组成的组;
R4是-OR5、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、C1-6羟基烷基、C3-8环烷基C0-6烷基;并且
R5是H或C1-6烷基。在一个实施例中,R2是H、羟基或C1-6烷基;并且R3是-C0-6亚烷基-SO2R4或-C(O)OR5
在一个实施例中,所述化合物是具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中:
R1是羟基;
R2和R3各自独立地选自H和-C0-6亚烷基-SO2R4组成的组;并且
R4是C1-6烷基。在一个实施例中,R2和R3中的一个是H并且另一个是-C0-6亚烷基-SO2R4
在一个实施例中,所述化合物是具有结构式(I)-A或(I)-B的化合物:
Figure BDA0003140978730000193
在一个实施例中,所述化合物是具有结构式(I)-C或(I)-D的化合物:
Figure BDA0003140978730000201
在一个实施例中,所述化合物是具有结构式(I)-E或(I)-F的化合物:
Figure BDA0003140978730000202
在一个实施例中,所述化合物或其药学上可接受的盐选自表1:
表1
Figure BDA0003140978730000203
Figure BDA0003140978730000211
Figure BDA0003140978730000221
Figure BDA0003140978730000231
Figure BDA0003140978730000241
Figure BDA0003140978730000251
Figure BDA0003140978730000261
Figure BDA0003140978730000271
Figure BDA0003140978730000281
Figure BDA0003140978730000291
Figure BDA0003140978730000301
Figure BDA0003140978730000311
药学上可接受的盐
也考虑这些化合物的药学上可接受的盐用于本文所述的用途。如本文所用,术语“盐(salt或salts)”是指本披露的化合物的酸加成盐或碱加成盐。“盐”特别包括“药学上可接受的盐。”术语“药学上可接受的盐”是指保留本文所披露的化合物的生物有效性和特性的盐,并且这些盐典型地不是生物学上或其他方面不期望的盐。在许多情况下,由于氨基和/或羧基基团或与其类似的基团的存在,本文披露的化合物能够形成酸和/或碱盐。
可以用无机酸和有机酸形成药学上可接受的酸加成盐。
可以衍生出盐的无机酸包括,例如盐酸、氢溴酸、硫酸、硝酸、磷酸等。
可以衍生出盐的有机酸包括,例如乙酸、丙酸、乙醇酸、草酸、马来酸、丙二酸、琥珀酸、富马酸、酒石酸、柠檬酸、苯甲酸、扁桃酸、甲磺酸、乙磺酸、甲苯磺酸、磺基水杨酸等。
可以用无机碱和有机碱形成药学上可接受的碱加成盐。
可以衍生出盐的无机碱包括例如铵盐和来自元素周期表第I至XII列的金属。在某些实施例中,盐衍生自钠、钾、铵、钙、镁、铁、银、锌和铜;特别合适的盐包括铵盐、钾盐、钠盐、钙盐和镁盐。
可以衍生出盐的有机碱包括例如伯胺、仲胺和叔胺;取代的胺(包括天然存在的取代的胺);环胺;碱性离子交换树脂等。某些有机胺包括异丙胺、苄星、胆碱盐、二乙醇胺、二乙胺、赖氨酸、葡甲胺、哌嗪和氨丁三醇。
在另一方面,本披露提供了呈以下形式的具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物:乙酸盐、抗坏血酸盐、己二酸盐、天冬氨酸盐、苯甲酸盐、苯磺酸盐、溴化物/氢溴酸盐、碳酸氢盐/碳酸盐、硫酸氢盐/硫酸盐、樟脑磺酸盐、癸酸盐、氯化物/盐酸盐、氯脲鎓酸盐(chlortheophyllonate)、柠檬酸盐、乙二磺酸盐、富马酸盐、葡庚糖酸盐、葡糖酸盐、葡萄糖醛酸盐、谷氨酸盐、戊二酸盐、乙醇酸、马尿酸盐、氢碘酸盐/碘化物、羟乙基磺酸盐、乳酸盐、乳糖醛酸盐、十二烷基硫酸盐、苹果酸盐、马来酸盐、丙二酸盐、扁桃酸盐、甲磺酸盐、甲基硫酸盐、黏酸盐、萘甲酸盐、萘磺酸盐、烟酸盐、硝酸盐、十八烷酸盐、油酸盐、草酸盐、棕榈酸盐、双羟萘酸盐、磷酸盐/磷酸氢盐/磷酸二氢盐、聚半乳糖醛酸盐、丙酸盐、癸二酸盐、硬脂酸盐、琥珀酸盐、磺基水杨酸盐、硫酸盐、酒石酸盐、甲苯磺酸盐三氟甲磺酸盐、三氟乙酸盐或昔萘酸盐形式。
药物组合物
在另一方面,本披露提供了一种药物组合物,其包含一种或多种具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐,以及一种或多种药学上可接受的载体。术语“药学上可接受的载体”是指涉及携带或运输任何本发明的组合物或其组分的药学上可接受的材料、组合物或媒介物,例如液体或固体填充剂、稀释剂、赋形剂、溶剂或包囊材料。每种载体在与主题组合物及其组分相容且对患者无害的意义上必须是“可接受的”。可用作药学上可接受的载体的材料的一些实例包括:(1)糖类,如乳糖、葡萄糖和蔗糖;(2)淀粉,如玉米淀粉和马铃薯淀粉;(3)纤维素及其衍生物,如羧甲基纤维素钠、乙基纤维素和乙酸纤维素;(4)粉状黄芪胶;(5)麦芽;(6)明胶;(7)滑石;(8)赋形剂,如可可脂和栓剂蜡;(9)油类,如花生油、棉籽油、红花油、芝麻油、橄榄油、玉米油、大豆油等;(10)二醇类,如丙二醇;(11)多元醇类,如甘油、山梨醇、甘露醇和聚乙二醇;(12)酯类,如油酸乙酯和月桂酸乙酯;(13)琼脂;(14)缓冲剂,如氢氧化镁和氢氧化铝;(15)海藻酸;(16)无热原水;(17)等渗盐水;(18)林格氏溶液;(19)乙醇;(20)磷酸盐缓冲液;以及(21)用于药物配制品的其他无毒相容物质。
本披露的组合物可以口服、肠胃外、通过吸入喷雾、局部、直肠、鼻、颊、阴道或经由植入的储库施用。如本文所用,术语“肠胃外”包括皮下、静脉内、肌内、关节内、滑膜内、骨内、鞘内、肝内、病变内和颅内注射或输注技术。在一些实施例中,本披露的组合物经口服、腹膜内或静脉内施用。本披露的组合物的无菌可注射形式可以是水性或油性悬浮液。可以根据本领域已知的技术,使用合适的分散剂或湿润剂和悬浮剂来配制这些悬浮液。无菌可注射制剂还可以是在无毒肠胃外可接受的稀释剂或溶剂中的无菌可注射溶液或悬浮液(例如在1,3-丁烷二醇中的溶液)。可接受的媒介物和溶剂中可使用的是水、林格氏液和等渗氯化钠溶液。此外,常规地可以使用无菌不挥发性油作为溶剂或悬浮介质。
为此目的,可以使用任何温和的不挥发性油,包括合成的单甘油酯或二甘油酯。脂肪酸(例如油酸及其甘油酯衍生物)因为是天然药学上可接受的油(例如橄榄油或蓖麻油)可用于制备可注射剂,尤其是其聚氧乙烯化形式也可用于制备注射剂。这些油溶液或悬浮液还可以含有长链醇稀释剂或分散剂(例如羧甲基纤维素或类似的分散剂),其通常用于配制药学上可接受的剂型(包括乳剂和悬浮液)。出于配制的目的,也可以使用其他常用的表面活性剂,例如
Figure BDA0003140978730000341
Spans和其他乳化剂或生物利用度增强剂,它们通常用于制备药学上可接受的固体、液体或其他剂型。
本披露的药学上可接受的组合物可以以任何口服可接受的剂型口服施用,这些剂型包括但不限于胶囊剂、片剂、水性悬浮液或溶液。对于口服使用的片剂,常用的载体包括乳糖和玉米淀粉。典型地还添加润滑剂,例如硬脂酸镁。对于胶囊形式的口服施用,有用的稀释剂包括乳糖和干燥的玉米淀粉。当需要口服水性悬浮液时,将活性成分与乳化剂和悬浮剂混合。如果需要,也可以添加某些甜味剂、调味剂或着色剂。
可替代地,本披露的药学上可接受的组合物可以栓剂的形式用于直肠施用。这些可以通过将药剂与合适的无刺激性赋形剂混合来制备,该赋形剂在室温下为固体,但在直肠温度下为液体,因此将在直肠中融化以释放药物。这些材料包括可可脂、蜂蜡和聚乙二醇。
本披露的药学上可接受的组合物也可以局部施用,尤其是当治疗的目标包括通过局部应用容易达到的区域或器官(包括眼、皮肤或下肠道疾病)时。针对这些区域或器官中的每一个容易制备合适的局部配制品。下肠道的局部应用可以直肠栓剂配制品(见上文)或以合适的灌肠配制品进行。也可以使用局部透皮贴剂。
对于局部应用,可将药学上可接受的组合物配制成含有悬浮或溶解于一种或多种载体中的活性组分的合适的软膏剂。用于本披露化合物的局部施用的载体包括但不限于矿物油、液体矿脂、白凡士林、丙二醇、聚氧乙烯、聚氧丙烯化合物、乳化蜡和水。可替代地,可将药学上可接受的组合物配制成含有悬浮或溶解于一种或多种药学上可接受的载体中的活性组分的合适的洗剂或乳膏。合适的载体包括但不限于矿物油、山梨聚糖单硬脂酸酯,聚山梨酯60、鲸蜡酯蜡、鲸蜡硬脂醇、2-辛基十二烷醇、苄醇和水。
本披露的药学上可接受的组合物也可以通过鼻喷雾或吸入施用。此类组合物是根据药物配制品领域中熟知的技术制备的,并且可以使用苄醇或其他合适的防腐剂、增强生物利用度的吸收促进剂、碳氟化合物和/或其他常规的增溶剂或分散剂,以盐溶液的形式制备。可以与载体材料组合以产生单个剂型的组合物的本披露化合物的量将取决于所治疗的宿主、具体的施用方式而变化。优选地,组合物应该被配制为使得可以将0.01-100mg/kg体重/天剂量的抑制剂施用接受这些组合物的患者。
同位素标记的化合物
具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐也旨在表示未标记的形式以及该化合物的同位素标记形式。同位素标记的化合物具有由本文给出的式表示的结构,除了一个或多个原子被具有所选原子质量或质量数的原子代替。可以掺入本披露化合物的同位素的实例包括氢、碳、氮、氧、磷、氟和氯的同位素,例如,分别是2H、3H、11C、13C、14C、15N、18F、31P、32P、35S、36Cl、123I、124I、125I。本披露包括如本文所定义的各种同位素标记的化合物,例如其中存在放射性同位素(例如3H和14C)的那些化合物,或其中存在非放射性同位素(例如2H和13C)的那些化合物。此类同位素标记的化合物可用于代谢研究(用14C)、反应动力学研究(例如用2H或3H)、检测或成像技术(如正电子发射断层扫描(PET)或单光子发射计算机断层扫描(SPECT),包括药物或底物组织分布测定),或用于患者的放射性治疗。特别地,18F或标记的化合物对于PET或SPECT研究可能是特别期望的。同位素标记的具有式(I)、(Ia)或(Ib)的化合物或其药学上可接受的盐通常可以通过本领域技术人员已知的常规技术或通过与所附实例和制备中所述的那些类似的方法,使用适当的同位素标记的试剂代替未标记的先前使用的试剂来制备。
此外,用较重的同位素,特别是氘(即,2H或D)取代可以提供来源于更大的代谢稳定性(例如,体内半衰期延长或剂量需求减少或治疗指数改进)的某些治疗优点。应理解,认为在本上下文中的氘是具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的取代基。这种较重的同位素(特别是氘)的浓度可以由同位素富集因子来定义。如本文所使用的,术语“同位素富集因子”是指同位素丰度与特定同位素的天然丰度之间的比率。如果本披露的化合物中的取代基指示氘,这样的化合物具有针对每个指定的氘原子的同位素富集因子为至少3500(在每个指定的氘原子上52.5%氘掺入)、至少4000(60%氘掺入)、至少4500(67.5%氘掺入)、至少5000(75%氘掺入)、至少5500(82.5%氘掺入)、至少6000(90%氘掺入)、至少6333.3(95%氘掺入)、至少6466.7(97%氘掺入)、至少6600(99%氘掺入)或至少6633.3(99.5%氘掺入)。
剂量
可以通过标准药学方法在细胞培养物或实验动物中确定本披露的化合物(包括药学上可接受的盐和氘化的变体)的毒性和治疗功效。LD50是50%群体的致死剂量。ED50是50%群体的治疗有效剂量。毒性和治疗效果之间的剂量比(LD50/ED50)是治疗指数。表现出大的治疗指数的化合物是优选的。尽管可以使用表现出有毒副作用的化合物,但是应该小心设计将此类化合物靶向至受影响组织部位的递送系统,从而将对未感染细胞的潜在损伤最小化,并且由此减少副作用。
从细胞培养测定和动物研究获得的数据可以用于配制一系列的用于在人体中使用的剂量。此类化合物的剂量处于包括ED50在内的有很小毒性或没有毒性的循环浓度范围内。该剂量可根据所应用的剂型和所使用的施用途径在该范围内变化。对于任何化合物,均可根据细胞培养测定初步估计治疗有效剂量。可以在动物模型中配制剂量,以达到在细胞培养中确定的循环血浆浓度范围,该范围包括IC50(即,供试化合物达到半数最大症状抑制的浓度)。此类信息可用于更精确地确定在人体中有用的剂量。可以例如通过高效液相色谱法来测量血浆中的水平。
还应理解,针对任何特定患者的特定剂量和治疗方案将取决于多种因素,包括所用特定化合物的活性、年龄、体重、总体健康状况、性别、饮食、施用时间、排泄率、药物组合以及治疗医师的判断、以及所治疗特定疾病的严重性。本披露的化合物在组合物中的量也将取决于组合物中的特定化合物。
在本文描述的所有方法能够以任何适合顺序进行,除非本文另外指示或另外与上下文明显矛盾。本文提供的任何和所有实例或示例性语言(如“例如”)的应用仅旨在更好地说明本披露,而不对另外要求保护的本披露范围做出限制。
本披露的一种或多种化合物的任何非对称原子(例如,碳等)可以以外消旋或对映异构体富集的形式存在,例如,(R)-、(S)-或(R,S)-构型。在某些实施例中,每个非对称原子具有至少50%对映异构体过量、至少60%对映异构体过量、至少70%对映异构体过量、至少80%对映异构体过量、至少90%对映异构体过量、至少95%对映异构体过量、或至少99%对映异构体过量的(R)-或(S)-构型。如果可能,在具有不饱和双键的原子上的取代基可以以顺式-(Z)-或反式-(E)-形式存在。
因此,如本文所用,本披露的化合物可以呈可能的立体异构体、旋转异构体、阻转异构体、互变异构体或其混合物之一的形式,例如,作为基本上纯的几何(顺式或反式)立体异构体、非对映异构体、光学异构体(对映体)、外消旋体、或其混合物。
可以基于组分的物理化学差异,例如通过色谱法和/或分级结晶法将任何所得的立体异构体混合物分离成纯的或基本上纯的几何或光学异构体、非对映异构体、外消旋体。
可以通过已知方法将任何所得的本披露的化合物或中间体的外消旋体拆分成旋光对映体,例如通过将用光学活性酸或碱得到的其非对映异构体盐进行分离,并释放出光学活性的酸性或碱性化合物。特别地,因此可以采用碱性部分将本披露的化合物拆分成它们的光学对映体,例如通过分级结晶用光学活性酸,例如酒石酸、二苯甲酰基酒石酸、二乙酰基酒石酸、二-O,O'-对甲苯酰基酒石酸、扁桃酸、苹果酸或樟脑-10-磺酸形成的盐来拆分。本披露的外消旋化合物或外消旋中间体还可以通过手性色谱法(例如,使用手性吸附剂的高压液相色谱法(HPLC))拆分。
疾病和障碍
具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物可用于治疗选自以下的与年龄有关的疾病或障碍:
急性或慢性器官或组织移植排斥;
移植血管病变;
导致血管内膜增厚、血管阻塞、阻塞性冠状动脉粥样硬化、再狭窄的平滑肌细胞增殖和迁移;
自身免疫性疾病和炎性病症;
哮喘;
多药耐药性(MDR);
真菌感染;
炎症;
感染;
与年龄有关的疾病;
神经退行性疾病;
增殖性障碍,例如癌症;
癫痫发作和与癫痫发作有关的障碍;和
线粒体肌病和线粒体应激。
在另一方面,本文披露的化合物可用于治疗已显示使与年龄有关疾病的可能性更高的病症,如衰老诱导性细胞因子(例如IL6)增加的情况。
在另一方面,本文披露的化合物可用于治疗包括纤维化和/或炎症过程的障碍,例如肝和肾障碍。实例包括,发生在终末期肝脏疾病中的肝纤维化;肝硬化;毒性引起的肝衰竭;非酒精相关性肝脂肪变性或NASH;和酒精相关性脂肪变性。另一个实例是肾纤维化,其发生是急性肾损伤的结果,导致慢性肾脏疾病。糖尿病肾病可诱发肾纤维化和炎症。通常肾脏疾病由于血压升高引起心力衰竭;这也可能与心脏纤维化相关。
在另一方面,本披露的化合物可用于治疗心力衰竭。(Buss,S.J.等人Beneficialeffects of Mammalian target of rapamycin inhibition on left ventricularremodeling after myocardial infarction.[哺乳动物中雷帕霉素靶标抑制对心肌梗死后左心室重构的有益作用].J Am Coll Cardiol.[美国心脏病学会杂志](2009)54(25):2435-46;Buss,S.J.等人Augmentation of autophagy by mTOR-inhibition inmyocardial infarction:When size matters.[在心肌梗死中通过mTOR抑制增强自噬:当大小很重要时].Autophagy.[自噬](2010)6(2):304-6)。
在另一方面,本披露的化合物可用于治疗接受肝移植的患者的肝纤维化。(Villamil,F.G.等人Fibrosis progression in maintenance liver transplantpatients with hepatitis C recurrence:a randomized study of RAD001vs.calcineurin inhibitors.[丙型肝炎复发维持性肝移植患者的纤维化进展:RAD001与钙调神经磷酸酶抑制剂的随机研究].Liver Int.[肝脏国际](2014)34(10):1513-21)。
急性或慢性器官或组织移植排斥的治疗包括治疗例如心脏、肺、心肺结合、肝脏、肾脏、胰腺、皮肤或角膜移植的受体。还指示出本披露的化合物用于预防移植物抗宿主疾病,如在骨髓移植后。
移植血管病变包括动脉粥样硬化。
自身免疫性疾病和炎性病症特别地包括具有以下病因的炎性病症,所述病因包括自体免疫组分,如关节炎(例如类风湿性关节炎、慢性进行性关节炎(arthritis chronicaprogrediente)和变形性关节炎)和风湿性疾病。可采用具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物的特定自身免疫性疾病包括自身免疫性血液学障碍(包括例如溶血性贫血、再生障碍性贫血、单纯红细胞性贫血和特发性血小板减少症)、全身性红斑狼疮、多软骨炎、硬皮病、韦格纳肉芽肿病(Wegener granulamatosis)、皮肌炎、慢性活动性肝炎、重症肌无力、银屑病、史蒂文-约翰逊综合征(Steven-Johnsonsyndrome)、特发性腹泻、自身免疫性炎性肠病(包括例如溃疡性结肠炎和克罗恩氏病(Crohn'sdisease)、内分泌性眼病、格雷夫斯病(Graves disease)、结节病、多发性硬化、原发性胆汁性肝硬化、幼年型糖尿病(I型糖尿病)、葡萄膜炎(前葡萄膜炎和后葡萄膜炎)、干燥性角膜结膜炎和春季角膜结膜炎、间质性肺纤维化、银屑病性关节炎、肾小球肾炎(伴有和不伴有肾病综合征,例如包括特发性肾病综合征或微小病变性肾病)和幼年型皮肌炎。
本披露的化合物还可用于治疗多药耐药性(MDR),包括增强其他化学治疗剂在治疗和控制多药耐药病症(例如多药耐药性癌症或多重耐药性AIDS)中的功效。MDR在对常规化疗没有反应的癌症患者和AIDS患者中尤其成问题,因为药物通过Pgp从细胞中泵出。
本披露的化合物还可用于治疗感染,包括由具有Mip或Mip样因子的病原体引起的感染。
与年龄有关的疾病还包括:肌肉减少症、皮肤萎缩、樱桃状血管瘤、脂溢性角化病、脑萎缩(也称作痴呆)、动脉粥样硬化、动脉硬化、肺气肿、骨质疏松症、骨关节炎、高血压、勃起功能障碍、白内障、黄斑变性、青光眼、中风、脑血管疾病(中风)、慢性肾脏疾病、糖尿病相关性肾脏疾病、肝功能受损、肝纤维化、自身免疫性肝炎、子宫内膜增生、代谢功能障碍、肾血管疾病、听觉损失、行动不便(例如,虚弱)、认知减退、肌腱僵硬、心脏功能障碍(如心脏肥大和/或收缩和/或舒张功能障碍和/或高血压)、导致射血分数降低的心脏功能障碍、免疫衰老、帕金森氏病、阿尔茨海默氏病、癌症、由于免疫监视降低导致的致癌免疫衰老、由于免疫功能下降导致的感染、慢性阻塞性肺疾病(COPD)、肥胖、味觉消失、嗅觉消失、关节炎和II型糖尿病(包括糖尿病引起的并发症,如肾功能衰竭、失明和神经病)。
神经退行性疾病包括亨廷顿氏病、帕金森氏病、3型脊髓小脑性共济失调、阿尔茨海默氏病、运动神经元疾病和周围神经病变。
增殖性障碍包括癌症。此类病症包括美国专利号9,669,032列出的那些,例如肾癌、肾细胞癌、结肠直肠癌、子宫肉瘤、子宫内膜子宫癌、子宫内膜癌、乳腺癌、卵巢癌、宫颈癌、胃癌、纤维肉瘤、胰腺癌、肝癌、黑素瘤、白血病、多发性骨髓瘤、鼻咽癌、前列腺癌、肺癌、胶质母细胞瘤、膀胱癌、间皮瘤、头癌、横纹肌肉瘤、肉瘤、淋巴瘤或颈癌。
癫痫发作和与癫痫发作有关的障碍包括韦斯特综合症、局灶性皮质发育不良(FCD)、结节性硬化症(TSC)、儿童失神性癫痫、儿童良性局灶性癫痫、青少年肌阵挛癫痫(JME)、颞叶癫痫、额叶癫痫、难治性癫痫、伦诺克斯-加斯多(Lennox-Gastaut)综合征、枕叶癫痫、普罗特斯综合征、半巨脑综合征(HMEG)、巨脑综合征(MEG)、巨脑-毛细血管畸形(MCAP)和巨脑-多小脑回-多趾-脑积水综合征(MPPH)。
线粒体肌病和线粒体应激是线粒体障碍,例如在以下文献中描述的:Chinnery,P.F.(2015);EMBO Mol.Med.[欧洲分子生物学学会杂志之分子医学]7,1503-1512;Koopman,W.J.等人,(2016);EMBO Mol.Med.[欧洲分子生物学学会杂志之分子医学]8,311-327;以及Young,M.J.,和Yound和Copeland,W.C.(2016);Curr.Opin.Genet.Dev.[遗传学与发展的最新观点]38,52-62。
已显示使与年龄有关的疾病的可能性更高的可治疗的病症包括衰老,例如,免疫衰老。这可以通过以下来诊断:(i)循环细胞因子(如IL-6)的增加;(ii)在肌肉、肾脏、肝脏、脑、神经元、肝脏、胰腺或心脏中发现的衰老细胞;或(iii)DNA修复效率的下降,这可以通过重复元件(包括转座子编码基因)转录的增加来证明。
治疗方法
本披露提供了具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐用于治疗本文所述的疾病和障碍,例如与年龄有关的障碍,或目前批准使用雷帕霉素类似物(例如RAD001)治疗的疾病和障碍。
一方面,本披露提供了在有需要的受试者中治疗由mTOR途径介导的障碍或疾病的方法,所述方法包括向受试者施用治疗有效量的具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物,或其药学上可接受的盐。
在另一方面,本披露提供了一种用于治疗受试者的疾病或障碍的方法,其中与疾病或障碍的病理学相关的靶组织、器官或细胞具有不足以抑制mTORC1的FKBP12水平,所述方法包括向有需要的受试者施用治疗有效量的具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物,或其药学上可接受的盐。
在一个实施例中,例如与雷帕霉素或RAD001相比,具有式(I)化合物或其药学上可接受的盐与FKBP12、FKBP25、FKBP51和/或FKBP52结合具有较高的亲和力。
在一个实施例中,具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐与FKBP12、FKBP25、FKBP51和/或FKBP52结合具有高的亲和力,足以抑制mTORC1。
在一个实施例中,治疗功效是根据经验确定的,例如,与雷帕霉素或RAD001相比。
在另一方面,本披露提供了一种用于治疗具有或被确定具有不足以抑制mTORC1的FKBP12水平的受试者的疾病或障碍的方法,所述方法包括向有需要的受试者施用治疗有效量的具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物,或其药学上可接受的盐。
在一个实施例中,例如与雷帕霉素或RAD001相比,具有式(I)化合物或其药学上可接受的盐与FKBP12、FKBP25、FKBP51和/或FKBP52结合具有较高的亲和力。
在一个实施例中,受试者在靶组织、器官或细胞中具有或被确定具有不足以抑制mTORC1的FKBP12水平。
在一个实施例中,治疗功效是根据经验确定的,例如,与雷帕霉素或RAD001相比。
在另一方面,本披露提供了一种治疗具有或先前被确定具有足以抑制mTORC1的FKBP12水平的受试者的疾病或障碍的方法,所述方法包括向有需要的受试者施用治疗有效量的具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,或本文所述的药物组合物,或本文所述的药物组合。
在一个实施例中,所述疾病或障碍选自肌肉减少症、皮肤萎缩、樱桃状血管瘤、脂溢性角化病、脑萎缩、动脉粥样硬化、动脉硬化、肺气肿、骨质疏松症、骨关节炎、高血压、勃起功能障碍、白内障、黄斑变性、青光眼、中风、脑血管疾病(中风)、慢性肾脏疾病、糖尿病相关性肾脏疾病、肝功能受损、肝纤维化、自身免疫性肝炎、子宫内膜增生、代谢功能障碍、肾血管疾病、听觉损失、行动不便、认知减退、肌腱僵硬、心脏功能障碍(如心脏肥大和/或收缩和/或舒张功能障碍和/或高血压)、导致射血分数降低的心脏功能障碍、免疫衰老、帕金森氏病、阿尔茨海默氏病、癌症、由于免疫监视降低导致的致癌免疫衰老、由于免疫功能下降导致的感染、慢性阻塞性肺病(COPD)、肥胖、味觉消失、嗅觉消失、关节炎、和II型糖尿病,包括糖尿病引起的并发症,如肾功能衰竭、失明和神经病。
在一个实施例中,所述障碍是肝纤维化。
在另一方面,本披露提供了一种在有需要的受试者中治疗疾病或障碍的方法,所述方法包括向受试者施用治疗有效量的具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐、包含具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物,或包含具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合,其中所述障碍或疾病选自:
-急性或慢性器官或组织移植排斥;
-移植血管病变;
-导致血管内膜增厚、血管阻塞、阻塞性冠状动脉粥样硬化、再狭窄的平滑肌细胞增殖和迁移;
-自身免疫性疾病和炎性病症;
-哮喘;
-多药耐药性(MDR);
-真菌感染;
-炎症;
-感染;
-与年龄有关的疾病;
-神经退行性疾病;
-增殖性障碍,特别是癌症;
-癫痫发作和与癫痫发作有关的障碍;和
-线粒体肌病和线粒体应激。
在一个实施例中,所述障碍是包括纤维化和/或炎症过程的障碍。
在一个实施例中,所述障碍选自肝和肾障碍。
在一个实施例中,所述肝障碍选自:发生在终末期肝脏疾病中的肝纤维化;肝硬化;毒性引起的肝衰竭;非酒精相关性肝脂肪变性或NASH;和酒精相关性脂肪变性。
在一个实施例中,所述肾障碍是肾纤维化。
在一个实施例中,所述肾纤维化发生是急性肾损伤的结果。
在一个实施例中,所述肾障碍是慢性肾障碍。
在一个实施例中,所述肾障碍是糖尿病性肾病。
在另一方面,本披露提供了一种在有需要的受试者中治疗与年龄有关的障碍或疾病的方法,所述方法包括向受试者施用治疗有效量的具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐、包含具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物,或包含具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合,其中所述障碍或疾病选自:肌肉减少症、皮肤萎缩、樱桃状血管瘤、脂溢性角化病、脑萎缩、动脉粥样硬化、动脉硬化、肺气肿、骨质疏松症、骨关节炎、高血压、勃起功能障碍、白内障、黄斑变性、青光眼、中风、脑血管疾病(中风)、慢性肾脏疾病、糖尿病相关性肾脏疾病、肝功能受损、肝纤维化、自身免疫性肝炎、子宫内膜增生、代谢功能障碍、肾血管疾病、听觉损失、行动不便、认知减退、肌腱僵硬、心脏功能障碍(如心脏肥大和/或收缩和/或舒张功能障碍和/或高血压)、导致射血分数降低的心脏功能障碍、免疫衰老、帕金森氏病、阿尔茨海默氏病、癌症、由于免疫监视降低导致的致癌免疫衰老、由于免疫功能下降导致的感染、慢性阻塞性肺病(COPD)、肥胖、味觉消失、嗅觉消失、关节炎、和II型糖尿病,包括糖尿病引起的并发症,如肾功能衰竭、失明和神经病。
在另一方面,本披露提供了一种治疗受试者癌症的方法,所述方法包括向受试者施用治疗有效量的具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐、包含具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物,或包含具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合。
在一个实施例中,所述方法进一步包括PD-1/PDL-1抑制剂。
在一个实施例中,所述癌症选自肾癌、肾细胞癌、结肠直肠癌、子宫肉瘤、子宫内膜子宫癌、子宫内膜癌、乳腺癌、卵巢癌、宫颈癌、胃癌、纤维肉瘤、胰腺癌、肝癌、黑素瘤、白血病、多发性骨髓瘤、鼻咽癌、前列腺癌、肺癌、胶质母细胞瘤、膀胱癌、间皮瘤、头癌、横纹肌肉瘤、肉瘤、淋巴瘤和颈癌。
在另一方面,本披露提供了具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐、包含具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物,或包含具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合,用作药物。
在另一方面,本披露提供了具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐,包含具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物,或包含具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合,用于预防或治疗由mTOR途径介导的障碍或疾病。
在另一方面,本披露提供了具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐,包含具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物,或包含具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合,用于预防或治疗选自以下的障碍或疾病:
-急性或慢性器官或组织移植排斥;
-移植血管病变;
-导致血管内膜增厚、血管阻塞、阻塞性冠状动脉粥样硬化、再狭窄的平滑肌细胞增殖和迁移;
-自身免疫性疾病和炎性病症;
-哮喘;
-多药耐药性(MDR);
-真菌感染;
-炎症;
-感染;
-与年龄有关的疾病;
-神经退行性疾病;
-增殖性障碍,特别是癌症;
-癫痫发作和与癫痫发作有关的障碍;和
-线粒体肌病和线粒体应激。
在另一方面,本披露提供了具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐,包含具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物,或包含具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合,用于预防或治疗包括纤维化和/或炎症过程的障碍或疾病。
在一个实施例中,所述障碍选自肝和肾障碍。
在一个实施例中,所述肝障碍选自:发生在终末期肝脏疾病中的肝纤维化;肝硬化;毒性引起的肝衰竭;非酒精相关性肝脂肪变性或NASH;和酒精相关性脂肪变性。
在一个实施例中,所述肾障碍是肾纤维化,其发生是急性肾损伤的结果。
在一个实施例中,所述肾障碍是慢性肾障碍。
在一个实施例中,所述肾障碍是糖尿病性肾病。
在另一方面,本披露提供了具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐,包含具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物,或包含具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合,用于预防或治疗与年龄有关的选自以下的障碍或疾病:肌肉减少症、皮肤萎缩、樱桃状血管瘤、脂溢性角化病、脑萎缩(也称作痴呆)、动脉粥样硬化、动脉硬化、肺气肿、骨质疏松症、骨关节炎、高血压、勃起功能障碍、白内障、黄斑变性、青光眼、中风、脑血管疾病(中风)、慢性肾脏疾病、糖尿病相关性肾脏疾病、肝功能受损、肝纤维化、自身免疫性肝炎、子宫内膜增生、代谢功能障碍、肾血管疾病、听觉损失、行动不便(例如,虚弱)、认知减退、肌腱僵硬、心脏功能障碍(如心脏肥大和/或收缩和/或舒张功能障碍和/或高血压)、导致射血分数降低的心脏功能障碍、免疫衰老、帕金森氏病、阿尔茨海默氏病、癌症、由于免疫监视降低导致的致癌免疫衰老、由于免疫功能下降导致的感染、慢性阻塞性肺病(COPD)、肥胖、味觉消失、嗅觉消失、关节炎和II型糖尿病(包括糖尿病引起的并发症,如肾功能衰竭、失明和神经病)。
在另一方面,本披露提供了具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐、包含具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物,或包含具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合,用于治疗癌症。
在另一方面,本披露提供了具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐、包含具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物,或包含具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合,用于治疗肾癌、肾细胞癌、结肠直肠癌、子宫肉瘤、子宫内膜子宫癌、子宫内膜癌、乳腺癌、卵巢癌、宫颈癌、胃癌、纤维肉瘤、胰腺癌、肝癌、黑素瘤、白血病、多发性骨髓瘤、鼻咽癌、前列腺癌、肺癌、胶质母细胞瘤、膀胱癌、间皮瘤、头癌、横纹肌肉瘤、肉瘤、淋巴瘤或颈癌。
在另一方面,本披露提供了具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的用途,用于制备药物。
在另一方面,本披露提供了具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的用途,用于制备治疗由mTOR途径介导的障碍或疾病的药物。
在另一方面,本披露提供了具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的用途,用于制备治疗选自以下的障碍或疾病的药物:
-急性或慢性器官或组织移植排斥;
-移植血管病变;
-导致血管内膜增厚、血管阻塞、阻塞性冠状动脉粥样硬化、再狭窄的平滑肌细胞增殖和迁移;
-自身免疫性疾病和炎性病症;
-哮喘;
-多药耐药性(MDR);
-真菌感染;
-炎症;
-感染;
-与年龄有关的疾病;
-神经退行性疾病;
-增殖性障碍,例如癌症;
-癫痫发作和与癫痫发作有关的障碍;和
-线粒体肌病和线粒体应激。
在另一方面,本披露提供了具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的用途,用于制备治疗包括纤维化或炎症过程的障碍或疾病的药物。
在一个实施例中,所述障碍选自肝和肾障碍。
在一个实施例中,所述肝障碍选自:发生在终末期肝脏疾病中的肝纤维化;肝硬化;毒性引起的肝衰竭;非酒精相关性肝脂肪变性或NASH;和酒精相关性脂肪变性。
在一个实施例中,所述肾障碍是肾纤维化,其发生是急性肾损伤的结果。
在一个实施例中,所述肾障碍是慢性肾障碍。
在一个实施例中,所述肾障碍是糖尿病性肾病。
在另一方面,本披露提供了具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的用途,用于制备预防或治疗与年龄有关的障碍或疾病的药物,所述障碍或疾病选自肌肉减少症、皮肤萎缩、樱桃状血管瘤、脂溢性角化病、脑萎缩(也称作痴呆)、动脉粥样硬化、动脉硬化、肺气肿、骨质疏松症、骨关节炎、高血压、勃起功能障碍、白内障、黄斑变性、青光眼、中风、脑血管疾病(中风)、慢性肾脏疾病、糖尿病相关性肾脏疾病、肝功能受损、肝纤维化、自身免疫性肝炎、子宫内膜增生、代谢功能障碍、肾血管疾病、听觉损失、行动不便、认知减退、肌腱僵硬、心脏功能障碍(如心脏肥大和/或收缩和/或舒张功能障碍和/或高血压)、导致射血分数降低的心脏功能障碍、免疫衰老、帕金森氏病、阿尔茨海默氏病、癌症、由于免疫监视降低导致的致癌免疫衰老、由于免疫功能下降导致的感染、慢性阻塞性肺疾病(COPD)、肥胖、味觉消失、嗅觉消失、关节炎和II型糖尿病(包括糖尿病引起的并发症,如肾功能衰竭、失明和神经病)。
在另一方面,本披露提供了具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的用途,用于制备预防或治疗癌症的药物。
在另一方面,本披露提供了具有式(I)、式(I)-A、式(I)-B、式(I)-C、式(I)-D、式(I)-E和式(I)-F的化合物或其药学上可接受的盐的用途,用于制备治疗以下癌症的药物:肾癌、肾细胞癌、结肠直肠癌、子宫肉瘤、子宫内膜子宫癌、子宫内膜癌、乳腺癌、卵巢癌、宫颈癌、胃癌、纤维肉瘤、胰腺癌、肝癌、黑素瘤、白血病、多发性骨髓瘤、鼻咽癌、前列腺癌、肺癌、胶质母细胞瘤、膀胱癌、间皮瘤、头癌、横纹肌肉瘤、肉瘤、淋巴瘤或颈癌。
制备具有式(I)的化合物的方法
在另一方面,本披露提供了根据方案1、2和3制备本披露化合物的方法。
方案1:
Figure BDA0003140978730000511
具有式(I)的化合物(其中R2和R3如式(I)所定义)可通过C32-脱氧雷帕霉素(中间体1)与(R2)(R3)NH(其中R2和R3如式(I)所定义)在适当溶剂存在下(例如二氯甲烷),在用于取代反应的合适试剂(例如氯化锌(II))存在下反应获得。合适的条件如下:
1)(R2)(R3)NH、对甲苯磺酸-H2O、二氯甲烷、室温
2)(R2)(R3)NH、三氟乙酸、-40℃、二氯甲烷(参见EP 1212331 B1)
3)(R2)(R3)NH、5M LiClO4、Et2O(0.1M)、室温(参见TL,1995,43,7823)
4)(R2)(R3)NH、Cp2HfCl2-AgClO4(Suzuki's催化剂)、4A MS、二氯甲烷、室温(参见TL,1995,43,7823)
5)(R2)(R3)NH、BF3-OEt2或Zn(OTf)2、THF、0℃(参见TL,1994,37,6835)
6)(R2)(R3)NH、ZnCl2、二氯甲烷、0℃(参见JOC,1994,59,6512)。
7)(R2)(R3)NH、甲磺酸、二氯甲烷、室温
8)(R2)(R3)NH、磷酸、二氯甲烷、室温
9)(R2)(R3)NH、多磷酸、二氯甲烷、室温
用作起始材料的C32-脱氧雷帕霉素可以通过本领域已知的方法制备,例如,如WO2007/085400中所述的。
方案2:
Figure BDA0003140978730000521
具有式(I)-A的化合物,其中R1是-ORa;Ra选自由以下组成的组:H、-P(O)(Rb)2、C1-6烷基和C1-6羟基烷基;并且R2和R3如式(I)所定义,可通过中间体1与R1-H或R1-X反应,然后与(R2)(R3)NH反应获得。在一个实施例中,中间体1在烷基化、膦酸化(phosphination)或酯化条件下与R1-H或R1-X反应,以提供中间体1-A。在一个实施例中,中间体1-A在取代反应条件下(例如,如本文提供的)与(R2)(R3)NH反应,以得到具有式(I)-A的化合物。具有式(I)-C和式(I)-D的化合物也可以按照类似于方案2中所示的合成路线的方式来制备。
方案3:
Figure BDA0003140978730000531
具有式(I)-B的化合物,其中R1
Figure BDA0003140978730000532
并且R2和R3如式(I)中所定义,可通过中间体1-B与R1-H反应,然后与(R2)(R3)NH反应而获得。在一个实施例中,中间体1-B在亲核条件下被激活和反应,以提供中间体1-B。在一个实施例中,中间体1-B在取代反应条件下(例如,如本文提供的)与(R2)(R3)NH反应,以提供具有式(I)-B的化合物。具有式(I)-E和式(I)-F的化合物也可以按照类似于方案3所示的合成路线的方式制备。
实例
本披露设置了以下实例。提供了本申请中描述的合成实例和生物学实例以说明本文所提供的化合物、药物组合物和方法,并且所述实例不应被解释为以任何方式限制其范围。
本文提供的化合物可以使用本领域技术人员熟知的对以下列出的特定合成方案的修饰,由容易获得的起始材料制备。应认识到,除非另有说明,否则在给出典型或优选的工艺条件(即反应温度、时间、反应物的摩尔比、溶剂、压力等)的情况下,也可以使用其他工艺条件。最佳反应条件可以随着使用的特定反应物或溶剂而变化,但是此类条件可以由本领域技术人员通过常规优化程序进行决定。
此外,正如本领域技术人员将清楚的,常规保护基团对于保护某些官能团免于经受不希望的反应是必需的。选择用于特定官能团的合适的保护基团以及用于保护和脱保护的合适条件是本领域熟知的。例如,众多保护基团及其引入和去除,描述于Greene等人,Protecting Groups in Organic Synthesis[有机合成中的保护基团],第二版,威利出版社,纽约,1991,及其中引用的参考文献中。
雷帕霉素及其衍生物,例如具有式(I)的化合物,以溶剂和pH依赖性平衡的六元和七元半缩酮形式存在,如下面E和F所示(方案4和5)。参见The Journal of Antibiotics[抗生素杂志](东京)(1991)44(6):688-90;和Tetrahedron Letters[四面体快报](1992)33(33):4139-4142。雷帕霉素及其衍生物也以以下显示的E、H、J和K(方案4和5)的顺式和反式酰胺的混合物形式存在。[参见Mierke,D.F.,Schmieder,P.,Karuso,P.和Kessler,H.(1991),Conformational Analysis of the cis-and trans-Isomers of FK506 by NMRand Molecular Dynamics[通过NMR和分子动力学对FK506的顺式和反式异构体进行构象分析].Helvetica Chimica Acta[瑞士化学学报],74:1027-1047]。实例中显示的NMR表征数据仅对应于在报道的氘代溶剂条件下观察到的主要平衡形式。
方案4:
Figure BDA0003140978730000551
其中:
R1是-ORa
Ra选自由以下组成的组:H、-P(O)(Rb)2、C1-6烷基和C1-6羟基烷基;
R2和R3各自独立地选自由以下组成的组:H、C1-6烷基、ORb、-C0-6亚烷基-SO2R4和-C(O)OR5
每个Rb独立地选自由H和C1-6烷基组成的组;
R4是-OR5、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、杂C1-6烷基、C1-6羟基烷基、C3-8环烷基C0-6烷基;并且
R5是H或C1-6烷基。
方案5:
Figure BDA0003140978730000561
其中:
R1是杂芳基,例如5元杂芳基,例如
Figure BDA0003140978730000562
R2和R3各自独立地选自由以下组成的组:H、C1-6烷基、ORb、-C0-6亚烷基-SO2R4和-C(O)OR5
每个Rb独立地选自由H和C1-6烷基组成的组;
R4是-OR5、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、杂C1-6烷基、C1-6羟基烷基、C3-8环烷基C0-6烷基;并且
R5是H或C1-6烷基。
在一个实施例中,具有式(I)、式(I)-A和式(I)-B的化合物以溶剂和pH依赖性平衡的六元和七元半缩酮形式存在,以下显示为E-1和F-1(方案6)。在一个实施例中,具有式(I)、式(I)-A和式(I)-B的化合物以顺式和反式酰胺E-1和H-1的混合物存在。
方案6:
Figure BDA0003140978730000571
R1是-ORa
Ra选自由以下组成的组:H、-P(O)(Rb)2、C1-6烷基和C1-6羟基烷基;
R2和R3各自独立地选自由以下组成的组:H、C1-6烷基、ORb、-C0-6亚烷基-SO2R4和-C(O)OR5
每个Rb独立地选自由H和C1-6烷基组成的组;
R4是-OR5、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、杂C1-6烷基、C1-6羟基烷基、C3-8环烷基C0-6烷基;并且
R5是H或C1-6烷基。
化合物的制备
本披露的化合物可如以下实例中所述进行制备。
缩写列表
下文使用的以下缩写具有对应的含义:
A 埃
d 双重峰
dd 双二重峰
DCM 二氯甲烷
DMSO 二甲亚砜
ESIMS 电喷雾离子化质谱法
EtOAc 乙酸乙酯
eq 当量
FA 甲酸
HSQC NMR 异核单量子相干核磁共振
HPLC 高效液相色谱法
Hz 赫兹
MeCN 乙腈
MeOH 甲醇
M 摩尔
m 多重峰
mg 毫克
MHz 兆赫
mL 毫升
mmol 毫摩尔
NMR 核磁共振
PEI 聚乙烯亚胺
PPU 丙基吡啶基脲
q 四重峰
μL 微升
μM 微摩尔
s 单峰
SFC 超临界流体色谱法
t 三重峰
实例的纯化中采用的方法
通过正相或反相色谱法进行中间体和终产物的纯化。
快速色谱法
正相色谱法使用预填充的SiO2小柱(例如来自特利丹蒂斯科公司(TeledyneIsco,Inc.)的
Figure BDA0003140978730000591
Rf柱),用适当的溶剂体系的梯度洗脱(例如己烷和乙酸乙酯;DCM和MeOH;或除非另外指示)来进行。
反相色谱法使用预填充的C18小柱(例如来自特利丹蒂斯科公司(Teledyne Isco,Inc.)的
Figure BDA0003140978730000592
Rf柱),用适当的溶剂体系的梯度洗脱(例如乙腈和水;或除非另外指示)来进行。
SFC使用以下描述的方法进行:
方法1:Reprospher PEI 5μm(100A)柱(30x250mm);CO2/MeOH
方法2:Princeton PPU 5μm(100A)柱(30x250mm);CO2/MeOH
方法3:Kinetex BiPhenyl 5μm(100A)柱(30x250mm);CO2/MeOH
基于分析性分离法选择梯度。
使用以下描述的方法进行反向制备型HPLC:
方法1:Phenomenex Luna C18;5μm柱(30x250mm);在乙腈中的0.1%甲酸和5%水;在水中的0.1%甲酸和5%乙腈。基于分析性分离法选择梯度。
方法2:YMC Actus Triart C18;5μm柱(20x150mm);乙腈/水。基于分析性分离法选择梯度。
方法3:YMC Actus Triart C18ExRS;5μm柱(20x150mm);在乙腈中的0.1%甲酸和5%水;在水中的0.1%甲酸和5%乙腈。基于分析性分离法选择梯度。
方法4:YMC Actus Triart C8;5μm柱(20x150mm);在乙腈中的0.1%甲酸和5%水;在水中的0.1%甲酸和5%乙腈。基于分析性分离法选择梯度。
中间体的制备
中间体1至9的制备
中间体1:C32-脱氧-雷帕霉素
Figure BDA0003140978730000601
中间体1是根据文献中已知的方法制备,所述文献包括在WO 2007/085400 A1中披露的那些,将这些文献各自通过引用以其全文并入本文。
中间体2:
Figure BDA0003140978730000602
将中间体1(4.37g,4.86mmol)溶于无水二氯甲烷(20mL)中。添加无水甲苯(20mL)。将反应混合物在旋转蒸发仪上蒸发至干。将此共沸干燥过程再重复两次。
将干燥的起始材料与在无水二氯甲烷(58mL)中的2,6-二甲基吡啶(1.39ml,11.9mmol)合并。将烧瓶加盖,并将混合物用氮气真空吹扫两次。将混合物在乙腈/干冰浴中冷却至-30℃。
经四分钟的时间段,经由注射器逐滴添加三氟甲磺酸酐(1.20ml,7.16mmol)。将反应混合物在-30℃搅拌30分钟。将反应混合物转移至0℃的冰水浴中,并在0℃下搅拌20分钟。
将反应混合物置于旋转蒸发仪上,并在不加热下浓缩。添加乙酸异丙酯(22mL)。一次性添加四唑(1.17g,16.7mmol)。快速将烧瓶加盖,并用氮气真空吹扫两次。经一分钟的时间段,经由注射器添加N,N-二异丙基乙胺(4.18ml,23.9mmol)。将反应混合物在室温下搅拌过夜。
将反应混合物在旋转蒸发仪上浓缩。将浓缩物通过正相硅胶快速柱色谱法(0至40%丙酮-庚烷梯度洗脱,80g二氧化硅柱,TLC 40%丙酮-庚烷,UV下可见)纯化。
合并第二洗脱峰级分(如通过在279nm下的UV吸光度确定)并浓缩,以给出呈白色固体状的中间体2(2.19g,2.30mmol,47.4%产率)。
中间体2:ESIMS[M+NH4]+969.8,ESIMS[M-H]-950.8。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.33(d,J=6.4Hz,1H),6.58-6.41(m,2H),6.35-6.14(m,2H),6.09-5.98(m,1H),5.55-5.43(m,1H),5.19(m,1H),5.05(m,1H),5.00-4.93(m,1H),4.87-4.79(m,1H),4.67-4.56(m,1H),3.98-3.87(m,1H),3.87(d,J=6.9Hz,1H),3.61(m,2H),3.55(dd,J=11.8,1.9Hz,1H),3.49-3.38(m,1H),3.31-3.17(m,4H),3.10(m,4H),3.04(s,3H),2.88-2.75(m,1H),2.29-2.09(m,3H),2.07-1.86(m,3H),1.88-1.60(m,9H),1.59-1.44(m,7H),1.43-1.01(m,11H),0.96(t,J=7.1Hz,5H),0.95-0.77(m,7H),0.72(m,4H)。
中间体3:
Figure BDA0003140978730000621
将中间体1(0.233g,0.259mmol)与在无水二氯甲烷(2.6mL)中的2,6-二叔丁基-4-甲基吡啶(0.424g,2.07mmol)合并。将反应混合物用氮气真空吹扫一次。将反应混合物在冰水浴中冷却至0℃。一次性添加固体二甲基膦酰氯(0.145g,1.29mmol)。将反应混合物在0℃搅拌80分钟。
将反应用饱和NaHCO3水溶液稀释,并用EtOAc萃取几次。合并有机萃取物,经Na2SO4干燥,倾析并浓缩,以给出无色焦油粗产物(0.77g)。
将粗产物通过硅胶快速柱色谱法(0-80%丙酮-庚烷梯度洗脱,24g二氧化硅柱,以80%EtOAc-庚烷进行TLC,UV下可见)纯化。合并含产物的级分并浓缩,以给出呈白色固体状的中间体3(0.09g,0.09mmol,34.4%产率)。
中间体3:ESIMS[M+NH4]+993.7,ESIMS[M-H]-974.7。
HRMS:计算值:999.5812(Na+加合物)。实测值:999.5807。
1H NMR(600MHz,氯仿-d)δ6.47-6.26(m,2H),6.22-6.08(m,1H),6.02-5.83(m,1H),5.54(m,1H),5.35-5.26(m,1H),5.21(m,1H),4.85-4.76(m,1H),4.12(m,2H),3.93-3.81(m,1H),3.67(t,J=7.7Hz,1H),3.62(d,J=6.7Hz,1H),3.60-3.53(m,1H),3.53-3.44(m,1H),3.42-3.36(m,3H),3.32(m,3H),3.28-3.18(m,1H),3.13(m,3H),3.05(m,1H),2.82(m,1H),2.42-2.21(m,3H),2.16-2.08(m,3H),1.99(m,1H),1.95-1.83(m,1H),1.83-1.72(m,4H),1.71-1.57(m,9H),1.57-1.43(m,12H),1.39(m,1H),1.34-1.20(m,4H),1.20-1.10(m,1H),1.05(m,4H),1.00(d,J=6.5Hz,3H),0.95(dd,J=6.6,2.1Hz,3H),0.92(d,J=6.6Hz,3H),0.91-0.84(m,4H),0.77(q,J=12.1Hz,1H)。
中间体4:
Figure BDA0003140978730000631
在反应小瓶中将2-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)乙醇(0.471g,2.67mmol)溶于无水甲苯(0.95mL)中。将小瓶加盖,然后用氮气真空吹扫。经由注射器添加N,N-二异丙基乙胺(DIPEA)(0.490ml,2.81mmol)。将混合物在冰水浴中冷却至0℃。在0℃下,经约两分钟的时间段逐滴添加三氟甲磺酸酐(Tf2O)(0.438ml,2.59mmol)。将反应混合物在0℃搅拌30分钟。
将小瓶从冷浴中取出。经由注射器添加DIPEA(0.490ml,2.81mmol)。打开小瓶,并快速一次性添加固体中间体1(0.600g,0.667mmol)。快速将小瓶重新加盖,并将混合物用氮气真空吹扫。添加甲苯(0.5mL)。
将反应在40℃在氮气下搅拌过夜。将反应用饱和水性NaHCO3稀释。将淬灭的混合物用EtOAc萃取五次。合并有机萃取物,经Na2SO4干燥,通过硅藻土真空过滤并浓缩,得到蜡状白色固体粗产物。
将粗产物通过硅胶快速柱色谱法(0-35%丙酮-庚烷,梯度洗脱,40g二氧化硅柱,以35%丙酮-庚烷进行TLC,UV下可见)纯化,以给出呈玻璃状的所需中间体4(0.245g,0.231mmol,34.7%产率),将其立即“按原样”用于下一步骤。
中间体4:ESIMS[M+NH4]+1076.1,ESIMS[M-H]-1056.0。
中间体5:C16-(1,1-二氧化-1,2-硫杂氮杂环丁烷-2-基)-C32-脱氧-雷帕霉素
(非对映异构体1)
中间体6:C16-(1,1-二氧化-1,2-硫杂氮杂环丁烷-2-基)-C32-脱氧-雷帕霉素
(非对映异构体2)
Figure BDA0003140978730000641
*未确定C16的绝对立体化学
在0℃下向中间体1(150mg,0.167mmol)和1,2-硫杂氮杂环丁烷1,1-二氧化物(891mg,0.833mmol)在DCM(3mL)中的溶液中添加氯化锌(II)(在二乙醚中的1M溶液,0.5mL,0.5mmol)。将反应混合物在室温下搅拌两小时。将混合物用H2O稀释并用乙酸乙酯萃取。减压蒸发有机萃取物。将非对映异构体混合物的粗产物通过快速色谱法(二氧化硅;MeCN/DCM0:100至100:0)分离。
通过制备型HPLC(方法2)最终纯化第一洗脱的非对映异构体,产生呈白色固体状的中间体5(18mg,10%产率)。
中间体5:ESIMS[M+NH4]+992.6,[M+FA-H]-1019.6。
1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ6.39(dd,J=14.8,9.8Hz,1H),6.34(dd,J=14.8,10.3Hz,1H),6.18-6.10(m,1H),6.02(d,J=10.3,1.5Hz,1H),5.66(dd,J=15.1,8.6Hz,1H),5.38(s,1H),5.32(dd,J=6.4,1.8Hz,1H),5.23(d,J=9.6Hz,1H),4.87-4.76(m,1H),4.12-4.06(m,1H),3.99(ddd,J=12.0,8.2,6.2Hz,1H),3.92-3.86(m,1H),3.84(dd,J=10.7,4.4Hz,1H),3.81-3.74(m,1H),3.63-3.59(m,2H),3.59(d,J=3.6Hz,1H),3.46(d,J=7.6Hz,1H),3.43(s,3H),3.40-3.37(m,1H),3.32(s,3H),3.04(ddd,J=8.2,5.8,3.8Hz,1H),3.00-2.94(m,1H),2.94-2.89(m,1H),2.88-2.84(m,1H),2.64(d,J=6.7Hz,1H),2.47-2.38(m,1H),2.36-2.27(m,2H),2.21-2.12(m,1H),2.03-1.97(m,1H),1.95-1.77(m,7H),1.76-1.67(m,5H),1.65(s,3H),1.60-1.50(m,6H),1.47-1.39(m,2H),1.38-1.27(m,4H),1.25-1.10(m,3H),1.08-1.04(m,1H),1.03-1.01(m,3H),1.00(d,J=1.4Hz,3H),0.99-0.97(m,3H),0.97(d,J=6.6Hz,3H),0.93(d,J=6.8Hz,3H),0.75-0.66(m,1H)。
使用SFC色谱法(方法2)最终纯化第二洗脱的非对映异构体,产生呈白色固体状的中间体6(16mg,9.2%产率)。
中间体6:ESIMS[M+NH4]+992.7,[M+FA-H]-1019.6。
1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ6.46(dd,J=14.2,10.9Hz,1H),6.22(dd,J=14.2,10.6Hz,1H),6.14(dd,J=14.5,10.6Hz,1H),6.00(d,J=10.9Hz,1H),5.38(dd,J=14.5,9.6Hz,1H),5.27-5.19(m,1H),5.12-5.05(m,1H),4.66-4.59(m,1H),4.59-4.53(m,1H),4.25(d,J=1.8Hz,1H),4.17-4.06(m,3H),4.02(ddd,J=11.8,8.0,3.5Hz,1H),3.66(d,J=7.0Hz,1H),3.60-3.52(m,2H),3.43-3.34(m,4H),3.28(s,3H),3.17-3.07(m,1H),3.03-2.95(m,1H),2.95-2.89(m,1H),2.84-2.73(m,1H),2.65-2.62(m,1H),2.35-2.26(m,1H),2.27-2.21(m,1H),2.21-2.12(m,3H),2.12-2.05(m,1H),2.02-1.98(m,1H),1.97-1.95(m,3H),1.91-1.83(m,1H),1.82-1.70(m,3H),1.70-1.51(m,10H),1.50-1.17(m,10H),1.11-1.06(m,1H),1.06-1.02(m,6H),1.01-0.96(m,1H),0.93(d,J=6.8Hz,4H),0.89(d,J=6.6Hz,3H),0.86(d,J=6.8Hz,3H),0.64(q,J=11.9Hz,1H)。
中间体7和8:
Figure BDA0003140978730000661
*未确定C16的绝对立体化学
向中间体1(500mg,0.555mmol)和氨基甲酸叔丁酯(976mg,8.33mmol)在DCM(4mL)中的混合物添加4-甲基苯磺酸水合物(5.3mg,0.028mmol)。将反应混合物在室温下搅拌18小时。通过快速色谱法(二氧化硅;MeCN/DCM 0:100至25:75)直接分离整个反应混合物。第一洗脱非对映异构体经分离后,得到了呈黄色固体状的中间体7(105mg,15.4%产率)。
中间体7:ESIMS[M+Na]+1008.0,ESIMS[M-H]-984.0。
第二洗脱非对映异构体经分离后,得到了呈黄色固体状的中间体8(220mg,36.2%产率)。
中间体8:ESIMS[M+Na]+1008.1,ESIMS[M-H]-984.7。
HRMS:C55H89N2O13的计算值-985.6365。实测值-985.6379。
中间体9和中间体10:
Figure BDA0003140978730000671
*未确定C16的绝对立体化学
向中间体4(120mg,0.113mmol)和1,2-硫杂氮杂环丁烷1,1-二氧化物(121mg,1.13mmol)在DCM(4mL)中的溶液中添加氯化锌(II)(在二乙醚中的1M溶液,0.57mL,0.57mmol)。将反应混合物在室温下搅拌三小时。将反应用饱和NaHCO3水溶液稀释,并用乙酸乙酯萃取。减压蒸发有机萃取物,以给出两种非对映异构体的产物混合物。通过快速色谱法(二氧化硅;MeCN/DCM 0:100至40:60)分离非对映异构体混合物。
使用SFC色谱法(方法2)纯化第一洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的中间体9(18.3mg,13.5%产率)。
中间体9:ESIMS[M+NH4]+1151.1,[M+FA-H]-1178.2
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:6.57-6.37(m,2H),6.32-6.12(m,2H),6.04(dd,J=22.7,10.9Hz,1H),5.60-5.48(m,1H),5.06(d,J=9.1Hz,1H),4.98-4.91(m,1H),4.90-4.83(m,1H),4.68-4.59(m,1H),4.17-3.99(m,3H),3.92-3.86(m,1H),3.69-3.61(m,3H),3.59-3.49(m,3H),3.49-3.41(m,1H),3.34(s,3H),3.28(d,J=8.9Hz,1H),3.17-3.09(m,4H),3.09-3.03(m,1H),3.01-2.93(m,2H),2.91-2.80(m,1H),2.29-2.12(m,2H),2.12-2.00(m,2H),1.99-1.88(m,3H),1.82(s,3H),1.78-1.62(m,6H),1.58-1.54(m,1H),1.53-1.32(m,10H),1.34-1.20(m,3H),1.18-1.09(m,3H),1.06-0.94(m,7H),0.92-0.83(m,13H),0.80(d,J=6.7Hz,3H),0.77-0.68(m,4H),0.68-0.59(m,1H),0.03(s,6H)。
使用SFC色谱法(方法2)纯化第二洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的中间体10(7.3mg,5.5%产率)。
中间体10:ESIMS[M+NH4]+1151.3,[M+FA-H]-1178.4
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:6.44(dd,J=13.9,11.0Hz,1H),6.26-6.12(m,2H),6.10-6.05(m,1H),5.98(s,1H),5.52(dd,J=14.1,9.4Hz,1H),5.15-5.04(m,1H),5.04-5.00(m,1H),4.96(d,J=9.7Hz,1H),4.67-4.57(m,1H),4.20-4.00(m,4H),3.98-3.89(m,1H),3.65(t,J=5.2Hz,2H),3.58-3.49(m,4H),3.42-3.35(m,1H),3.33(s,3H),3.22-3.16(m,1H),3.16-3.09(m,4H),3.09-3.03(m,1H),3.00-2.92(m,1H),2.75-2.65(m,1H),2.27-2.12(m,2H),2.12-2.01(m,2H),2.00-1.88(m,3H),1.83(s,3H),1.78-1.66(m,2H),1.64-1.57(m,3H),1.56-1.48(m,7H),1.48-1.34(m,3H),1.32-1.23(m,3H),1.22-1.03(m,5H),1.01-0.95(m,4H),0.93-0.88(m,4H),0.87-0.84(m,12H),0.83-0.77(m,4H),0.75(d,J=6.7Hz,3H),0.62(q,J=11.9Hz,1H),0.03(s,6H)。
实例1.化合物1和化合物2的合成
Figure BDA0003140978730000681
向中间体1(125mg,0.139mmol)和甲磺酰胺(264mg,2.78mmol)在DCM(8mL)中的溶液中添加氯化锌(II)(在二乙醚中的1M溶液,0.69mL,0.69mmol)。将反应混合物在室温下搅拌30分钟。将反应用H2O稀释,并用乙酸乙酯萃取。减压蒸发有机萃取物,以给出两种非对映异构体的产物混合物。通过反相制备型HPLC色谱法(方法1)分离非对映异构体混合物。
分离第一洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物1(6.5mg,4.6%产率)。
化合物1:ESIMS[M-H]-961.6
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.30(d,J=7.9Hz,1H),6.47(s,1H),6.39(dd,J=13.7,11.2Hz,1H),6.22-6.08(m,2H),6.05(d,J=11.0Hz,1H),5.54(dd,J=14.2,8.8Hz,1H),5.07-4.98(m,3H),4.69-4.62(m,1H),4.59(d,J=4.6Hz,1H),4.00-3.96(m,1H),3.96-3.87(m,1H),3.80-3.69(m,2H),3.62(d,J=14.5Hz,1H),3.31(d,J=1.7Hz,3H),3.23-3.10(m,5H),2.89(s,3H),2.86-2.76(m,1H),2.58-2.52(m,1H),2.28-2.19(m,1H),2.19-1.98(m,3H),1.94-1.86(m,1H),1.82-1.70(m,5H),1.70-1.34(m,17H),1.34-1.11(m,6H),1.10-0.88(m,6H),0.87-0.81(m,6H),0.79(d,J=6.7Hz,3H),0.75(d,J=6.6Hz,3H),0.54(q,J=11.8Hz,1H)。
使用SFC色谱法(方法1)纯化第二洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物2(7.5mg,5.3%产率)。
化合物2:ESIMS[M-H]-961.7
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.49(d,J=9.3Hz,1H),6.60(s,1H),6.44(dd,J=14.3,11.0Hz,1H),6.31-6.11(m,2H),5.98(d,J=11.0Hz,1H),5.51(dd,J=14.5,9.5Hz,1H),5.05(s,1H),4.99-4.92(m,1H),4.87-4.77(m,1H),4.66-4.53(m,2H),3.95-3.85(m,2H),3.77-3.68(m,1H),3.68-3.57(m,1H),3.49-3.39(m,1H),3.39-3.28(m,3H),3.26-3.14(m,2H),3.12(s,3H),2.91-2.78(m,2H),2.71(s,3H),2.22(s,1H),2.17-1.83(m,6H),1.81(s,3H),1.79-1.57(m,5H),1.56-1.08(m,17H),1.06-0.89(m,8H),0.86(d,J=6.6Hz,4H),0.79(d,J=6.7Hz,3H),0.74(d,J=6.7Hz,3H),0.65-0.54(m,2H)。
化合物2中C16取代基的绝对构型通过与FKBP12的X射线晶体学共结晶来确定。[参见Stuart L.Schrieber和Jon Clardy等人,Atomic Structure of the Rapamycin HumanoImmunophilin FKBP-12Complex[雷帕霉素人免疫亲和蛋白FKBP-12复合物的原子结构],J.Am.Chem.Soc.[美国化学学会会志],1991,113,7433-7434。]晶体结构描绘于图1中。
将纯的FKBP12(1-108)蛋白在50mM Tris pH 8.0、150mM NaCl、1mM EDTA、1mMTCEP中浓缩至9mg/mL。通过将该蛋白与3mM的化合物(来自在90%dDMSO和10%D2O中制备的50mM储备液)混合来制备用于共结晶的复合物。将复合物在4℃下孵育两小时,然后在结晶之前以10000rpm离心2分钟以除去任何潜在的沉淀。在20℃下并通过使用微晶种基质筛选进行的坐滴蒸汽扩散法获得共晶[Allan D’Arcy等人,An automated microseed matrix-screening method for protein crystallization[用于蛋白质结晶的自动化微晶种基质筛选方法],Acta Cryst[晶体学报],(2007)D63,550-554]。液滴由200nL的蛋白质溶液、160nL的孔溶液和40nL的种子储备液组成。在可商购自凯杰公司(Qiagen)的“硫酸铵”筛的A1条件下,几天之内出现了晶体。储液由2.2M硫酸铵组成。将晶体在补充有20%乙二醇的储液中进行冷冻保护,然后快速冷冻到液氮中。数据是通过光束线X10SA在瑞士光源设施(SLS,Villigen,瑞士)上采集的。
将数据用XDS处理(Kabsch,W.(2010),XDS.Acta Cryst.[晶体学报]D,66:125-132)。使用先前的FKBP12 X射线结构作为搜索模型,通过分子置换法确定结构(Collaborative Computational Project[协同计算项目],第4期,(1994)Acta Cryst.[晶体学报]D50,760-763)。程序REFMAC(Murshudov GN,Skubák P,Lebedev AA等人,REFMAC5for the refinement of macromolecular crystal structures[REFMAC5用于精制大分子晶体结构].Acta Crystallographica Section D:Biological Crystallography[晶体学报,部分D:生物晶体学].2011;67(Pt 4):355-367)和COOT(Emsley P,Lohkamp B,ScottWG,Cowtan K.Features and development of Coot[Coot的特征和发展],ActaCrystallographica Section D:Biological Crystallography[晶体学报,部分D:生物晶体学].2010;66(Pt 4):486-501)用于精制和模型(重新)构建。
根据X射线共晶结构,化合物2中的C16取代基为(S)-构型。晶体结构描绘于图1中。
实例2.化合物3和化合物4
Figure BDA0003140978730000711
向中间体1(120mg,0.133mmol)和乙磺酰胺(218mg,2.00mmol)在DCM(7mL)中的溶液中添加氯化锌(II)(在二乙醚中的1M溶液,0.67mL,0.67mmol)。将反应混合物在室温搅拌14分钟。将反应用H2O稀释,并用乙酸乙酯萃取。减压蒸发有机萃取物,以给出两种非对映异构体的产物混合物。通过快速色谱法(二氧化硅;MeCN/DCM 0:100至50:50)分离非对映异构体混合物。
使用SFC色谱法(方法1)纯化第一洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物3(13.4mg,10.1%产率)。
化合物3:ESIMS[M+NH4]+994.7,[M+FA-H]-1021.7
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.52(d,J=9.3Hz,1H),6.59(s,1H),6.43(dd,J=14.2,11.0Hz,1H),6.24(dd,J=14.2,10.6Hz,1H),6.17(dd,J=14.2,10.7Hz,1H),5.96(d,J=10.9,1.6Hz,1H),5.50(dd,J=14.4,9.6Hz,1H),5.04(d,J=4.7Hz,1H),4.96-4.89(m,1H),4.87-4.78(m,1H),4.69-4.54(m,2H),4.00-3.91(m,1H),3.88(dd,J=9.3,4.7Hz,1H),3.76-3.67(m,1H),3.67-3.58(m,1H),3.50-3.40(m,1H),3.31(s,3H),3.25-3.15(m,2H),3.12(s,3H),2.92-2.79(m,3H),2.77-2.65(m,1H),2.29-2.17(m,1H),2.17-2.10(m,1H),2.10-1.98(m,2H),1.97-1.86(m,3H),1.82(s,3H),1.80-1.76(m,1H),1.74-1.68(m,2H),1.67-1.60(m,2H),1.55-1.49(m,3H),1.48(s,3H),1.46-1.33(m,4H),1.32-1.24(m,1H),1.22-1.11(m,6H),1.09(t,J=7.3Hz,3H),1.07-1.01(m,1H),1.01-0.94(m,7H),0.89-0.82(m,4H),0.79(d,J=6.7Hz,3H),0.74(d,J=6.7Hz,3H),0.70-0.63(m,1H),0.63-0.54(m,1H)。
使用SFC色谱法(方法1)纯化第二洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物4(28.6mg,21.5%产率)。
化合物4:ESIMS[M+NH4]+994.8,[M-H]-976.0
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.30(d,J=7.9Hz,1H),6.42(s,1H),6.41-6.34(m,1H),6.19-6.10(m,2H),6.10-6.04(m,1H),5.54(dd,J=14.2,8.9Hz,1H),5.06-5.00(m,3H),4.66(ddd,J=9.4,6.0,2.5Hz,1H),4.59(d,J=4.5Hz,1H),4.03-3.96(m,1H),3.96-3.85(m,1H),3.75(d,J=5.3Hz,1H),3.74-3.68(m,1H),3.62(dd,J=9.9,6.3Hz,1H),3.31(s,3H),3.23-3.10(m,5H),3.03-2.90(m,2H),2.82(ddd,J=11.0,8.7,4.3Hz,1H),2.52-2.48(m,1H),2.29-2.19(m,1H),2.19-2.12(m,1H),2.12-2.07(m,1H),2.06-1.98(m,1H),1.97-1.86(m,1H),1.80-1.70(m,5H),1.69-1.64(m,1H),1.64-1.56(m,4H),1.56-1.50(m,6H),1.50-1.43(m,2H),1.43-1.33(m,3H),1.30-1.23(m,2H),1.21-1.12(m,7H),1.11-1.01(m,1H),0.98(d,J=6.4Hz,3H),0.96-0.87(m,2H),0.87-0.81(m,7H),0.79(d,J=6.7Hz,3H),0.75(d,J=6.6Hz,3H),0.54(q,J=11.8Hz,1H)。
实例3.化合物5和化合物6的合成
Figure BDA0003140978730000721
向中间体1(120mg,0.133mmol)和丙烷-1-磺酰胺(328mg,2.67mmol)在DCM(7mL)中的溶液中添加氯化锌(II)(在二乙醚中的1M溶液,0.67mL,0.67mmol)。将反应混合物在室温下搅拌10分钟。将反应用H2O稀释,并用乙酸乙酯萃取。减压蒸发有机萃取物,以给出两种非对映异构体的产物混合物。通过快速色谱法(二氧化硅;MeCN/DCM 100:0至50:50)分离非对映异构体混合物。
使用快速色谱法(二氧化硅;MeCN/DCM 0:100至40:60)然后用反相制备型HPLC(方法2)纯化第一洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物5(2.5mg,1.8%产率)。
化合物5:ESIMS[M+NH4]+1008.8,[M+FA-H]-1035.8
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.53(d,J=9.4Hz,1H),6.59(s,1H),6.43(dd,J=14.2,11.0Hz,1H),6.25(dd,J=14.2,10.5Hz,1H),6.18(dd,J=14.4,10.6Hz,1H),6.01-5.92(m,1H),5.50(dd,J=14.5,9.6Hz,1H),5.05(d,J=4.7Hz,1H),4.97-4.91(m,1H),4.86-4.78(m,1H),4.66-4.53(m,2H),3.99-3.90(m,1H),3.87(dd,J=9.3,4.6Hz,1H),3.75-3.67(m,1H),3.67-3.59(m,1H),3.49-3.40(m,1H),3.31(s,3H),3.22(d,J=9.2Hz,1H),3.20-3.14(m,1H),3.12(s,3H),2.89-2.78(m,3H),2.73-2.63(m,1H),2.28-2.17(m,1H),2.17-2.09(m,1H),2.09-2.01(m,2H),1.96-1.86(m,3H),1.81(s,3H),1.78-1.69(m,3H),1.69-1.60(m,2H),1.60-1.53(m,2H),1.53-1.49(m,3H),1.48(s,3H),1.45-1.35(m,3H),1.35-1.25(m,2H),1.23-1.09(m,6H),1.07-1.01(m,2H),0.98(d,J=3.3Hz,3H),0.97(d,J=3.4Hz,3H),0.89-0.84(m,7H),0.79(d,J=6.7Hz,3H),0.74(d,J=6.7Hz,3H),0.70-0.65(m,1H),0.64-0.54(m,1H)。
使用反相快速色谱法(C18;MeCN/水10:90至100:0)纯化第二洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物6(3mg,2.2%产率)。
化合物6:ESIMS[M+NH4]+1008.8,[M+FA-H]-1035.8
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.53-7.06(m,1H),6.51-6.30(m,2H),6.19-6.09(m,2H),6.06(d,J=11.4Hz,1H),5.53(dd,J=14.3,8.7Hz,1H),5.15-4.95(m,3H),4.66(td,J=7.5,6.0,2.4Hz,1H),4.62-4.52(m,1H),4.05-3.95(m,1H),3.95-3.84(m,1H),3.77(d,J=5.1Hz,1H),3.75-3.68(m,1H),3.68-3.58(m,1H),3.31(s,3H),3.24-3.09(m,5H),3.03-2.95(m,1H),2.95-2.87(m,1H),2.84-2.78(m,1H),2.57-2.43(m,1H),2.35-2.21(m,1H),2.20-2.11(m,1H),2.11-1.96(m,2H),1.96-1.85(m,1H),1.82-1.70(m,5H),1.70-1.56(m,8H),1.56-1.48(m,6H),1.48-1.32(m,4H),1.32-1.09(m,6H),1.08-1.00(m,1H),1.00-0.92(m,6H),0.92-0.86(m,3H),0.86-0.80(m,6H),0.78(d,J=6.7Hz,3H),0.75(d,J=6.6Hz,3H),0.53(q,J=11.8Hz,1H)。
实例4.化合物7和化合物8的合成
Figure BDA0003140978730000741
向中间体1(120mg,0.133mmol)和丙烷-2-磺酰胺(164mg,1.33mmol)在DCM(6mL)中的溶液中添加氯化锌(II)(在二乙醚中的1M溶液,0.67mL,0.67mmol)。将反应混合物在室温下搅拌18小时。将反应用H2O稀释,并用乙酸乙酯萃取。减压蒸发有机萃取物,以给出两种非对映异构体的产物混合物。通过快速色谱法(二氧化硅;MeCN/DCM 0:100至40:60)分离非对映异构体混合物。
使用SFC色谱法(方法1)纯化第一洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物7(9.1mg,6.7%产率)。
化合物7:ESIMS[M+NH4]+1008.8,[M+FA-H]+1035.9
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.47(d,J=9.3Hz,1H),6.59(s,1H),6.42(dd,J=14.0,11.0Hz,1H),6.29-6.19(m,1H),6.16(dd,J=13.7,10.1Hz,1H),5.97-5.89(m,1H),5.49(dd,J=14.2,9.6Hz,1H),5.04(d,J=4.7Hz,1H),4.98-4.88(m,1H),4.87-4.77(m,1H),4.66-4.55(m,2H),4.03-3.90(m,1H),3.87(dd,J=9.2,4.6Hz,1H),3.75-3.68(m,1H),3.68-3.58(m,1H),3.50-3.39(m,1H),3.32(s,3H),3.25-3.15(m,2H),3.12(s,3H),2.94-2.76(m,3H),2.29-2.17(m,1H),2.17-2.00(m,3H),2.00-1.87(m,3H),1.82(s,3H),1.81-1.70(m,2H),1.70-1.59(m,3H),1.59-1.45(m,6H),1.45-1.34(m,3H),1.34-1.22(m,2H),1.22-1.14(m,7H),1.15-1.12(m,2H),1.10(d,J=6.7Hz,3H),1.07-0.99(m,2H),1.00-0.93(m,6H),0.89-0.82(m,4H),0.79(d,J=6.7Hz,3H),0.74(d,J=6.7Hz,3H),0.72-0.64(m,1H),0.64-0.52(m,1H)。
使用SFC色谱法(方法1)纯化第二洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物8(19.8mg,14.5%产率)。
化合物8:ESIMS[M+NH4]+1008.7,[M-H]-989.7
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.26(d,J=8.1Hz,1H),6.43-6.37(m,1H),6.36(s,1H),6.18-6.04(m,3H),5.54(dd,J=14.0,8.9Hz,1H),5.08-4.98(m,3H),4.71-4.62(m,1H),4.59(d,J=4.4Hz,1H),4.08-3.97(m,1H),3.96-3.89(m,1H),3.77(d,J=5.0Hz,1H),3.74-3.67(m,1H),3.66-3.58(m,1H),3.31(s,3H),3.21-3.09(m,6H),2.86-2.77(m,1H),2.54-2.45(m,1H),2.28-2.20(m,1H),2.19-2.13(m,1H),2.12-2.06(m,1H),2.06-1.99(m,1H),1.95-1.86(m,1H),1.81-1.68(m,5H),1.68-1.56(m,4H),1.56-1.49(m,6H),1.49-1.32(m,6H),1.32-1.25(m,1H),1.25-1.10(m,11H),1.09-1.01(m,1H),0.98(d,J=6.6Hz,3H),0.94-0.88(m,2H),0.88-0.81(m,7H),0.79(d,J=6.7Hz,3H),0.75(d,J=6.7Hz,3H),0.53(q,J=11.8Hz,1H)。
实例5.化合物9和化合物10的合成
Figure BDA0003140978730000761
向中间体1(120mg,0.133mmol)和2-甲基丙烷-1-磺酰胺(274mg,2.00mmol)在DCM(7mL)中的溶液中添加氯化锌(II)(在二乙醚中的1M溶液,0.67mL,0.67mmol)。将反应混合物在室温下搅拌1小时。将混合物用H2O稀释,并用乙酸乙酯萃取。减压蒸发有机萃取物,以给出两种非对映异构体的产物混合物。通过快速色谱法(二氧化硅;MeCN/DCM 0:100至50:50)分离非对映异构体混合物。
使用SFC色谱法(方法1)纯化第一洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物9(13.9mg,10.2%产率)。
化合物9:ESIMS[M+NH4]+1022.8,[M-H]-1003.8
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.54(d,J=9.3Hz,1H),6.58(s,1H),6.43(dd,J=14.2,11.0Hz,1H),6.25(dd,J=14.3,10.6Hz,1H),6.18(dd,J=14.4,10.5Hz,1H),6.01-5.91(m,1H),5.50(dd,J=14.4,9.6Hz,1H),5.05(d,J=4.5Hz,1H),4.97-4.90(m,1H),4.86-4.78(m,1H),4.67-4.54(m,2H),3.98-3.89(m,1H),3.89-3.79(m,1H),3.76-3.68(m,1H),3.67-3.58(m,1H),3.50-3.41(m,1H),3.31(s,3H),3.25-3.15(m,2H),3.12(s,3H),2.89-2.77(m,2H),2.74-2.61(m,2H),2.28-2.17(m,1H),2.17-2.09(m,1H),2.09-2.00(m,2H),2.00-1.95(m,1H),1.95-1.86(m,3H),1.81(s,3H),1.78-1.59(m,5H),1.58-1.50(m,3H),1.48(s,3H),1.45-1.35(m,3H),1.35-1.24(m,2H),1.23-1.08(m,6H),1.05-1.00(m,2H),1.00-0.96(m,9H),0.91-0.87(m,4H),0.85(d,J=6.4Hz,3H),0.79(d,J=6.7Hz,3H),0.76(d,J=6.7Hz,3H),0.70-0.63(m,1H),0.63-0.54(m,1H)。
使用SFC色谱法(方法1)纯化第二洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物10(24.6mg,18.0%产率)。
化合物10:ESIMS[M+NH4]+1022.9,[M-H]-1004.0
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.32(d,J=8.2Hz,1H),6.47-6.33(m,2H),6.20-6.10(m,2H),6.09-6.03(m,1H),5.53(dd,J=14.2,8.8Hz,1H),5.10-4.97(m,3H),4.73-4.62(m,1H),4.59(d,J=4.5Hz,1H),4.04-3.96(m,1H),3.95-3.87(m,1H),3.78(d,J=4.8Hz,1H),3.76-3.69(m,1H),3.68-3.58(m,1H),3.31(s,3H),3.22-3.09(m,5H),2.94-2.84(m,2H),2.83-2.76(m,1H),2.56-2.42(m,1H),2.29-2.20(m,1H),2.20-2.13(m,1H),2.11-2.00(m,3H),1.95-1.87(m,1H),1.81-1.70(m,5H),1.68-1.56(m,5H),1.56-1.50(m,5H),1.50-1.43(m,3H),1.43-1.33(m,3H),1.31-1.11(m,6H),1.09-0.95(m,10H),0.95-0.87(m,2H),0.87-0.81(m,7H),0.79(d,J=6.7Hz,3H),0.75(d,J=6.6Hz,3H),0.53(q,J=11.8Hz,1H)。
实例6.化合物11和化合物12的合成
Figure BDA0003140978730000771
向中间体1(120mg,0.133mmol)和环丙磺酰胺(323mg,2.67mmol)在DCM(7mL)中的溶液中添加氯化锌(II)(在二乙醚中的1M溶液,0.67mL,0.67mmol)。将反应混合物在室温下搅拌10分钟。将反应混合物用H2O稀释,并用乙酸乙酯萃取。减压蒸发有机萃取物,以给出两种非对映异构体的产物混合物。通过快速色谱法(二氧化硅;MeCN/DCM 0:100至100:0)分离非对映异构体混合物。
使用SFC色谱法(方法1)纯化第一洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物11(4.4mg,3.2%产率)。
化合物11:ESIMS[M+NH4]+1006.7,[M+FA-H]--1033.7
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.51(d,J=8.5Hz,1H),6.59(s,1H),6.43(dd,J=14.1,11.0Hz,1H),6.22(dd,J=14.2,10.5Hz,1H),6.17(dd,J=14.4,10.8Hz,1H),6.00-5.91(m,1H),5.50(dd,J=14.3,9.6Hz,1H),5.05(d,J=4.5Hz,1H),4.99-4.90(m,1H),4.87-4.79(m,1H),4.69-4.54(m,2H),4.00-3.90(m,1H),3.90-3.80(m,1H),3.78-3.68(m,1H),3.68-3.56(m,1H),3.50-3.40(m,1H),3.31(s,3H),3.23(d,J=9.2Hz,1H),3.19-3.15(m,1H),3.12(s,3H),2.91-2.78(m,2H),2.29-2.17(m,2H),2.17-2.09(m,1H),2.06-1.98(m,2H),1.98-1.86(m,3H),1.83(s,3H),1.79-1.74(m,1H),1.73-1.67(m,2H),1.67-1.58(m,2H),1.58-1.49(m,3H),1.48(s,3H),1.46-1.27(m,5H),1.24-1.09(m,6H),1.09-1.00(m,2H),1.00-0.94(m,6H),0.89-0.85(m,4H),0.85-0.81(m,4H),0.79(d,J=6.8Hz,3H),0.74(d,J=6.7Hz,3H),0.73-0.66(m,1H),0.60(q,J=11.8Hz,1H)。
使用SFC色谱法(方法1)纯化第二洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物12(16.7mg,12.4%产率)。
化合物12:ESIMS[M+NH4]+1006.4,[M-H]-987.5
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.28(d,J=7.6Hz,1H),6.47-6.37(m,1H),6.36(s,1H),6.20-6.09(m,2H),6.05(d,J=11.1Hz,1H),5.54(dd,J=14.3,8.7Hz,1H),5.10-4.96(m,3H),4.70-4.63(m,1H),4.59(d,J=4.4Hz,1H),4.05-3.94(m,2H),3.84-3.76(m,1H),3.71(d,J=5.4Hz,1H),3.66-3.57(m,1H),3.31(s,3H),3.23-3.17(m,1H),3.17-3.10(m,4H),2.82(ddd,J=11.0,8.7,4.3Hz,1H),2.63-2.53(m,2H),2.31-2.19(m,1H),2.19-2.09(m,2H),2.06-1.99(m,1H),1.96-1.87(m,1H),1.80-1.72(m,5H),1.69-1.57(m,5H),1.57-1.50(m,7H),1.50-1.44(m,2H),1.44-1.33(m,2H),1.32-1.12(m,6H),1.12-1.01(m,1H),0.98(d,J=6.4Hz,3H),0.94-0.88(m,6H),0.88-0.82(m,7H),0.79(d,J=6.7Hz,3H),0.75(d,J=6.7Hz,3H),0.54(q,J=11.8Hz,1H)。
实例7.化合物13和化合物14的合成
Figure BDA0003140978730000791
向中间体1(120mg,0.133mmol)和环丁烷磺酰胺(270mg,2.00mmol)在DCM(7mL)中的溶液中添加氯化锌(II)(在二乙醚中的1M溶液,0.67mL,0.67mmol)。将反应混合物在室温下搅拌11分钟。将反应用H2O稀释,并用乙酸乙酯萃取。减压蒸发有机萃取物,以给出两种非对映异构体的产物混合物。通过快速色谱法(二氧化硅;MeCN/DCM 0:100至80:20)分离非对映异构体混合物。
使用SFC色谱法(方法1)纯化第一洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物13(12.3mg,9.19%产率)。
化合物13:ESIMS[M+NH4]+1020.8,[M+FA-H]-1047.9
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.46(d,J=9.3Hz,1H),6.59(s,1H),6.43(dd,J=13.9,11.0Hz,1H),6.29-6.21(m,1H),6.21-6.13(m,1H),5.92(dd,J=11.0,1.5Hz,1H),5.50(dd,J=14.2,9.6Hz,1H),5.05(d,J=4.7Hz,1H),4.97-4.90(m,1H),4.86-4.78(m,1H),4.65-4.56(m,2H),3.97-3.90(m,1H),3.89-3.84(m,1H),3.71-3.65(m,1H),3.65-3.58(m,1H),3.55-3.49(m,1H),3.47-3.40(m,1H),3.31(s,3H),3.22(d,J=9.2Hz,1H),3.20-3.14(m,1H),3.12(s,3H),2.91-2.79(m,2H),2.26-2.17(m,3H),2.17-2.09(m,2H),2.09-1.99(m,3H),1.96-1.87(m,3H),1.86-1.80(m,2H),1.80-1.71(m,5H),1.69-1.59(m,3H),1.57-1.50(m,3H),1.48(s,3H),1.45-1.35(m,3H),1.35-1.25(m,2H),1.22-1.08(m,6H),1.07-1.00(m,1H),1.00-0.93(m,7H),0.89-0.82(m,4H),0.78(d,J=6.7Hz,3H),0.74(d,J=6.7Hz,3H),0.71-0.63(m,1H),0.63-0.54(m,1H)。
使用SFC色谱法(方法1)纯化第二洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物14(26.6mg,19.5%产率)。
化合物14:ESIMS[M+NH4]+1020.9,[M-H]-1002.0
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.27(d,J=8.2Hz,1H),6.47(s,1H),6.44-6.34(m,1H),6.17-6.09(m,2H),6.04(dd,J=11.1,1.6Hz,1H),5.58-5.47(m,1H),5.07-4.98(m,3H),4.70-4.62(m,1H),4.59(s,1H),4.03-3.96(m,1H),3.93-3.86(m,1H),3.85-3.81(m,1H),3.77(d,J=4.9Hz,1H),3.68-3.63(m,2H),3.31(s,3H),3.20-3.09(m,5H),2.81(ddd,J=11.2,8.6,4.3Hz,1H),2.54-2.45(m,1H),2.27-2.14(m,6H),2.10-2.00(m,2H),1.95-1.82(m,3H),1.77-1.70(m,5H),1.64-1.58(m,5H),1.58-1.53(m,3H),1.53(s,3H),1.49-1.43(m,2H),1.43-1.33(m,3H),1.33-1.23(m,1H),1.23-1.11(m,5H),1.09-1.01(m,1H),0.98(d,J=6.5Hz,3H),0.94-0.88(m,2H),0.87-0.81(m,7H),0.80-0.74(m,6H),0.53(q,J=11.8Hz,1H)。
实例8.化合物15和化合物16的合成
Figure BDA0003140978730000811
向中间体1(120mg,0.133mmol)和环戊烷磺酰胺(298mg,2.00mmol)在DCM(7mL)中的溶液中添加氯化锌(II)(在二乙醚中的1M溶液,0.67mL,0.67mmol)。将反应混合物在室温下搅拌11分钟。将反应用H2O稀释,并用乙酸乙酯萃取。减压蒸发有机萃取物,以给出两种非对映异构体的产物混合物。通过快速色谱法(二氧化硅;MeCN/DCM 0:100至50:50)分离非对映异构体混合物。
使用SFC色谱法(方法1)随后使用制备型HPLC(方法2)纯化第一洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物15(4.8mg,3.4%产率)。
化合物15:ESIMS[M+NH4]+1034.9,[M-H]-1015.9
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.48(d,J=9.2Hz,1H),6.54(s,1H),6.43(dd,J=14.1,11.0Hz,1H),6.23(dd,J=14.3,10.7Hz,1H),6.20-6.11(m,1H),5.95(dd,J=10.9,1.6Hz,1H),5.49(dd,J=14.2,9.6Hz,1H),5.05(s,1H),4.97-4.89(m,1H),4.86-4.77(m,1H),4.71-4.51(m,2H),4.00-3.90(m,1H),3.90-3.83(m,1H),3.78-3.68(m,1H),3.68-3.59(m,1H),3.50-3.40(m,1H),3.32(s,3H),3.24-3.20(m,1H),3.20-3.14(m,2H),3.12(s,3H),2.92-2.80(m,2H),2.28-2.17(m,1H),2.16-2.08(m,1H),2.08-1.99(m,2H),1.96-1.87(m,3H),1.85-1.78(m,7H),1.76-1.72(m,1H),1.69-1.59(m,6H),1.53-1.46(m,8H),1.44-1.36(m,3H),1.34-1.26(m,2H),1.22-1.09(m,6H),1.02-0.93(m,8H),0.88-0.83(m,4H),0.79(d,J=6.7Hz,3H),0.74(d,J=6.7Hz,3H),0.70-0.63(m,1H),0.63-0.53(m,1H)。
使用SFC色谱法(方法1)纯化第二洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物16(22.8mg,16.3%产率)。
化合物16:ESIMS[M+NH4]+1034.5,[M-H]-1015.5
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.53-7.11(m,1H),6.47-6.30(m,2H),6.19-6.09(m,2H),6.09-6.02(m,1H),5.53(dd,J=14.1,8.9Hz,1H),5.18-4.90(m,3H),4.66(ddd,J=9.5,6.2,2.5Hz,1H),4.63-4.52(m,1H),4.04-3.96(m,1H),3.96-3.87(m,1H),3.79(d,J=4.8Hz,1H),3.72-3.65(m,1H),3.65-3.60(m,1H),3.60-3.51(m,1H),3.31(s,3H),3.20-3.10(m,5H),2.87-2.76(m,1H),2.57-2.45(m,1H),2.28-2.20(m,1H),2.20-2.14(m,1H),2.11-2.00(m,2H),1.92-1.80(m,5H),1.79-1.69(m,5H),1.69-1.61(m,5H),1.60-1.53(m,7H),1.51(s,3H),1.50-1.43(m,2H),1.43-1.33(m,3H),1.31-1.27(m,1H),1.24-1.13(m,5H),1.09-1.01(m,1H),0.98(d,J=6.5Hz,3H),0.94-0.87(m,3H),0.86-0.80(m,6H),0.78(d,J=6.7Hz,3H),0.75(d,J=6.6Hz,3H),0.53(q,J=11.9Hz,1H)。
实例9.化合物17和化合物18的合成
Figure BDA0003140978730000821
向中间体1(100mg,0.111mmol)和3-氯丙烷-1-磺酰胺(263mg,1.67mmol)在DCM(3mL)中的溶液中添加氯化锌(II)(在二乙醚中的1M溶液,0.56mL,0.56mmol)。将反应混合物在室温下搅拌10分钟。将反应用H2O稀释,并用乙酸乙酯萃取。减压蒸发有机萃取物,以给出两种非对映异构体的产物混合物。通过快速色谱法(二氧化硅;MeCN/DCM 0:100至40:60)分离非对映异构体混合物。
使用SFC色谱法(方法1)纯化第一洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物17(8.0mg,6.8%产率)。
化合物17:ESIMS[M+NH4]+1042.4,[M-H]-1023.3
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.69(d,J=9.0Hz,1H),6.60(s,1H),6.41(dd,J=14.1,11.0Hz,1H),6.23(dd,J=14.1,10.5Hz,1H),6.17(dd,J=14.4,10.5Hz,1H),6.03-5.91(m,1H),5.49(dd,J=14.4,9.6Hz,1H),5.05(d,J=4.6Hz,1H),4.98-4.90(m,1H),4.86-4.77(m,1H),4.68-4.55(m,2H),3.99-3.90(m,1H),3.88(dd,J=9.2,3.8Hz,1H),3.77-3.56(m,4H),3.51-3.40(m,1H),3.31(s,3H),3.25-3.16(m,2H),3.12(s,3H),3.05-2.94(m,1H),2.92-2.80(m,3H),2.29-2.17(m,1H),2.17-2.08(m,1H),2.08-1.98(m,4H),1.96-1.87(m,3H),1.82(s,3H),1.78-1.60(m,5H),1.55-1.45(m,6H),1.44-1.34(m,4H),1.32-1.25(m,1H),1.23-1.08(m,6H),1.04-0.94(m,8H),0.88-0.82(m,4H),0.79(d,J=6.7Hz,3H),0.74(d,J=6.7Hz,3H),0.65(d,J=9.5Hz,1H),0.63-0.51(m,1H)。
使用SFC色谱法(方法1)纯化第二洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物18(15.0mg,12.9%产率)。
化合物18:ESIMS[M+NH4]+1042.4,[M-H]-1023.4
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.48(d,J=7.9Hz,1H),6.45(s,1H),6.43-6.35(m,1H),6.20-6.10(m,2H),6.09-6.03(m,1H),5.53(dd,J=14.2,8.9Hz,1H),5.09-4.97(m,3H),4.71-4.62(m,1H),4.59(d,J=4.4Hz,1H),4.03-3.96(m,1H),3.93-3.83(m,1H),3.80-3.69(m,4H),3.68-3.58(m,1H),3.31(s,3H),3.20-3.11(m,6H),3.08-3.02(m,1H),2.81(ddd,J=11.1,8.6,4.3Hz,1H),2.55-2.50(m,1H),2.29-2.19(m,1H),2.16-2.02(m,5H),1.96-1.85(m,1H),1.80-1.70(m,5H),1.69-1.34(m,16H),1.33-1.10(m,6H),1.09-1.02(m,1H),1.00-0.97(m,3H),0.94-0.89(m,2H),0.88-0.81(m,7H),0.79(d,J=6.6Hz,3H),0.75(d,J=6.6Hz,3H),0.54(q,J=11.9Hz,1H)。
实例10.化合物19和化合物20的合成
Figure BDA0003140978730000841
向中间体1(100mg,0.111mmol)和2-羟基乙磺酰胺(139mg,1.11mmol)在DCM(7mL)中的溶液中添加氯化锌(II)(在二乙醚中的1M溶液,0.55mL,0.55mmol)。将反应混合物在室温下搅拌30分钟。将反应用H2O稀释,并用乙酸乙酯萃取。减压蒸发有机萃取物,以给出两种非对映异构体的产物混合物。通过快速色谱法(二氧化硅;MeCN/DCM 0:100至70:30)分离非对映异构体混合物。
使用SFC色谱法(方法1)纯化第一洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物19(2.2mg,1.8%产率)。
化合物19:ESIMS[M-H]-991.9
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:6.44(dd,J=14.0,10.9Hz,1H),6.29-6.13(m,2H),5.96(d,J=10.6Hz,1H),5.50(dd,J=14.2,9.6Hz,1H),4.96-4.90(m,1H),4.82(d,J=9.9Hz,1H),4.68-4.56(m,1H),3.97-3.84(m,2H),3.78-3.68(m,1H),3.68-3.58(m,3H),3.48-3.40(m,1H),3.39-3.26(m,3H),3.24-3.13(m,2H),3.12(s,3H),3.05-2.79(m,4H),2.28-2.18(m,1H),2.18-1.99(m,3H),1.99-1.83(m,3H),1.81(s,3H),1.79-1.58(m,5H),1.57-1.08(m,17H),1.06-0.89(m,8H),0.89-0.82(m,4H),0.79(d,J=6.7Hz,3H),0.74(d,J=6.7Hz,3H),0.70-0.53(m,2H)。
使用SFC色谱法(方法1)纯化第二洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物20(9.0mg,7.8%产率)。
化合物20:ESIMS[M-H]-991.9
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.32(d,J=7.8Hz,1H),6.50-6.32(m,2H),6.21-6.08(m,2H),6.08-6.03(m,1H),5.56(dd,J=14.1,8.7Hz,1H),5.06-4.99(m,3H),4.85(s,1H),4.71-4.62(m,1H),4.61-4.54(m,1H),4.02-3.88(m,2H),3.81-3.67(m,4H),3.65-3.58(m,1H),3.37-3.25(m,3H),3.20-3.09(m,7H),2.85-2.77(m,1H),2.60-2.53(m,1H),2.28-2.19(m,1H),2.19-1.96(m,3H),1.95-1.87(m,1H),1.82-1.70(m,5H),1.69-1.35(m,16H),1.33-1.11(m,6H),1.11-0.96(m,4H),0.95-0.81(m,9H),0.79(d,J=6.6Hz,3H),0.75(d,J=6.6Hz,3H),0.54(q,J=11.8Hz,1H)。
实例11.化合物21和化合物22的合成
Figure BDA0003140978730000851
向中间体2(100mg,0.105mmol)和甲磺酰胺(100mg,1.05mmol)在DCM(25mL)中的溶液中添加氯化锌(II)(在二乙醚中的1M溶液,0.53mL,0.53mmol)。将反应混合物在室温下搅拌1小时。将反应用H2O稀释,并用乙酸乙酯萃取。减压蒸发有机萃取物,以给出两种非对映异构体的产物混合物。通过反相制备型HPLC色谱法(方法1)分离非对映异构体混合物。
使用SFC色谱法(方法1)纯化第一洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物21(4.5mg,4.0%产率)。
化合物21:ESIMS[M-H]-1014.0
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:9.28(s,1H),7.27(s,1H),6.58-6.34(m,2H),6.26-6.08(m,2H),6.09-6.00(m,1H),5.53(dd,J=14.1,8.8Hz,1H),5.24-5.12(m,1H),5.09-4.97(m,3H),4.76-4.64(m,1H),3.99-3.96(m,1H),3.95-3.85(m,1H),3.84-3.75(m,1H),3.67(d,J=5.7Hz,1H),3.64-3.56(m,2H),3.45-3.17(m,4H),3.14(s,3H),2.88(s,3H),2.62-2.54(m,1H),2.30-2.08(m,4H),2.08-1.99(m,1H),1.98-1.87(m,1H),1.83-1.34(m,22H),1.33-1.14(m,5H),1.12-0.79(m,16H),0.69(d,J=6.7Hz,3H)。
使用SFC色谱法(方法1)纯化第二洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物22(5.5mg,4.8%产率)。
化合物22:ESIMS[M-H]-1014.1
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:9.32(s,1H),7.48(s,1H),6.72-6.38(m,2H),6.33-6.12(m,2H),5.98(d,J=10.9Hz,1H),5.50(dd,J=14.2,9.6Hz,1H),5.26-5.15(m,1H),5.05(s,1H),4.99-4.92(m,1H),4.83(d,J=9.8Hz,1H),4.64-4.54(m,1H),3.97-3.80(m,2H),3.79-3.70(m,1H),3.68-3.57(m,2H),3.48-3.41(m,1H),3.26(s,3H),3.21(d,J=9.2Hz,1H),3.09(s,3H),2.91-2.78(m,1H),2.71(s,3H),2.30-1.85(m,7H),1.80(s,3H),1.77-1.61(m,5H),1.61-1.35(m,13H),1.33-0.89(m,14H),0.86(d,J=6.5Hz,3H),0.81(d,J=6.7Hz,3H),0.77-0.55(m,4H)。
实例12.化合物23和化合物24的合成
Figure BDA0003140978730000871
向中间体3(100mg,0.102mmol)和甲磺酰胺(97mg,1.0mmol)在DCM(7mL)中的溶液中添加氯化锌(II)(在二乙醚中的1M溶液,0.51mL,0.51mmol)。将反应混合物在室温下搅拌30分钟。将反应用H2O稀释,并用乙酸乙酯萃取。减压蒸发有机萃取物,以给出两种非对映异构体的产物混合物。通过反相制备型HPLC色谱法(方法1)分离非对映异构体混合物。
分离第一洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物23(5.6mg,4.6%产率)。
化合物23:ESIMS[M-H]-1037.4
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.30(d,J=7.7Hz,1H),6.48(s,1H),6.46-6.33(m,1H),6.23-6.08(m,2H),6.05(d,J=11.0Hz,1H),5.54(dd,J=14.2,8.8Hz,1H),5.11-4.97(m,3H),4.73-4.62(m,1H),4.06-3.84(m,3H),3.81-3.70(m,2H),3.68-3.59(m,1H),3.37-3.26(m,3H),3.21-3.11(m,4H),3.11-2.99(m,1H),2.89(s,3H),2.59-2.51(m,1H),2.30-1.86(m,6H),1.80-1.68(m,4H),1.66-1.46(m,14H),1.46-1.11(m,14H),1.10-0.87(m,7H),0.88-0.82(m,6H),0.79(d,J=6.6Hz,3H),0.75(d,J=6.6Hz,3H),0.69-0.52(m,1H)。
使用SFC色谱法(方法1),随后使用反相制备型HPLC色谱法(方法3)纯化第二洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物24(5.3mg,4.7%产率)。
化合物24:ESIMS[M-H]-1037.9
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.49(d,J=9.3Hz,1H),6.60(s,1H),6.45(dd,J=14.1,11.1Hz,1H),6.31-6.11(m,2H),5.98(d,J=10.9Hz,1H),5.50(dd,J=14.3,9.6Hz,1H),5.06(d,J=4.6Hz,1H),5.01-4.91(m,1H),4.82(d,J=9.8Hz,1H),4.62-4.52(m,1H),4.06-3.80(m,3H),3.78-3.68(m,1H),3.68-3.56(m,1H),3.50-3.40(m,1H),3.29(s,3H),3.23(d,J=9.1Hz,1H),3.12(s,3H),3.08-2.98(m,1H),2.91-2.77(m,1H),2.71(s,3H),2.30-1.84(m,8H),1.81(s,3H),1.78-1.59(m,4H),1.58-1.27(m,19H),1.26-1.09(m,4H),1.08-0.90(m,10H),0.86(d,J=6.4Hz,3H),0.80(d,J=6.7Hz,3H),0.76-0.60(m,4H)。
实例13.中间体4-A、中间体4-B和化合物25的合成
Figure BDA0003140978730000881
向中间体4(100mg,0.094mmol)和甲磺酰胺(180mg,1.88mmol)在DCM(10mL)中的溶液中添加氯化锌(II)(在二乙醚中的1M溶液,0.47mL,0.47mmol)。将反应混合物在室温下搅拌30分钟。将反应用H2O稀释,并用二氯甲烷萃取。减压蒸发有机萃取物。通过快速色谱法(二氧化硅;环己烷/EtOAc 100:0至0:100)分离粗产物。
使用SFC色谱法(方法1)分离含有非对映异构体混合物的第一洗脱峰,得到呈白色固体状的中间体4-A(6.0mg,5.4%产率)。
中间体4-A:ESIMS[M-H]-1119.9
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.49(d,J=9.4Hz,1H),6.59(s,1H),6.43(dd,J=14.4,11.1Hz,1H),6.30-6.11(m,2H),5.98(d,J=11.2,1.5Hz,1H),5.51(dd,J=14.6,9.5Hz,1H),5.05(d,J=4.7Hz,1H),4.97-4.90(m,1H),4.86-4.77(m,1H),4.65-4.56(m,1H),3.99-3.80(m,2H),3.78-3.69(m,1H),3.68-3.58(m,3H),3.57-3.50(m,2H),3.48-3.40(m,1H),3.31(s,3H),3.22(d,J=9.2Hz,1H),3.16-3.05(m,4H),3.04-2.93(m,1H),2.90-2.76(m,1H),2.70(s,3H),2.27-2.18(m,1H),2.17-1.84(m,7H),1.81(s,3H),1.77-1.59(m,3H),1.59-1.45(m,6H),1.44-1.08(m,12H),1.07-0.91(m,8H),0.90-0.81(m,14H),0.79(d,J=6.7Hz,3H),0.74(d,J=6.7Hz,3H),0.70-0.57(m,1H),0.03(s,6H)。
将含有第二非对映异构体的SFC纯化部分通过反相制备型HPLC色谱法(方法4)进行纯化,得到呈白色固体状的中间体4-B(5.0mg,4.2%产率)。
中间体4-B:ESIMS[M-H]-1119.6
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.29(d,J=7.6Hz,1H),6.46(s,1H),6.44-6.33(m,1H),6.23-6.08(m,2H),6.05(d,J=11.1Hz,1H),5.54(dd,J=14.2,9.0Hz,1H),5.07-4.96(m,3H),4.74-4.62(m,1H),4.01-3.96(m,1H),3.95-3.87(m,1H),3.81-3.69(m,2H),3.68-3.58(m,3H),3.56-3.50(m,2H),3.38-3.25(m,3H),3.23-3.11(m,4H),3.10-3.00(m,1H),3.00-2.91(m,1H),2.89(s,3H),2.60-2.52(m,1H),2.28-2.18(m,1H),2.18-2.01(m,3H),2.00-1.84(m,2H),1.80-1.70(m,4H),1.70-1.46(m,17H),1.46-1.00(m,6H),1.00-0.91(m,4H),0.91-0.81(m,16H),0.80-0.69(m,7H),0.65-0.51(m,1H),0.03(s,6H)。
使用SFC色谱法(方法1)纯化第二洗脱峰,得到呈白色固体状的化合物25(5.5mg,5.5%产率)。
化合物25:ESIMS[M-H]-1005.4
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.30(d,J=7.8Hz,1H),6.47(s,1H),6.40(dd,J=13.7,11.2Hz,1H),6.20-6.08(m,2H),6.05(d,J=11.0Hz,1H),5.54(dd,J=14.3,8.8Hz,1H),5.08-4.97(m,3H),4.70-4.62(m,1H),4.49-4.38(m,1H),4.02-3.96(m,1H),3.95-3.87(m,1H),3.80-3.70(m,2H),3.67-3.58(m,1H),3.55-3.41(m,4H),3.37-3.24(m,3H),3.22-3.10(m,4H),3.04-2.92(m,2H),2.89(s,3H),2.60-2.49(m,1H),2.27-2.19(m,1H),2.18-1.99(m,3H),1.98-1.87(m,2H),1.83-1.71(m,4H),1.70-1.34(m,15H),1.32-1.00(m,7H),1.00-0.88(m,5H),0.88-0.81(m,8H),0.81-0.69(m,6H),0.59(q,J=11.7Hz,1H)。
实例14.化合物26的合成
Figure BDA0003140978730000901
向中间体4-B(30mg,0.027mmol)在己烷(1mL)、EtOAc(1mL)和H2O(1mL)中的混合物添加乙酸(0.1mL)。将反应混合物在室温下搅拌4小时。将反应用H2O稀释,并用乙酸乙酯萃取。减压蒸发有机萃取物。通过SFC色谱法(方法1)纯化粗产物,得到呈白色固体状的化合物26(4.5mg,16%产率)。
化合物26:ESIMS[M-H]-1005.9
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.49(d,J=9.3Hz,1H),6.59(s,1H),6.44(dd,J=14.3,11.0Hz,1H),6.30-6.11(m,2H),6.02-5.94(m,1H),5.50(dd,J=14.5,9.5Hz,1H),5.05(d,J=4.6Hz,1H),4.98-4.89(m,1H),4.82(d,J=9.8Hz,1H),4.64-4.54(m,1H),4.46(s,1H),3.99-3.78(m,2H),3.77-3.68(m,1H),3.68-3.58(m,1H),3.57-3.41(m,5H),3.40-3.26(m,3H),3.22(d,J=9.2Hz,1H),3.12(s,3H),3.10-2.93(m,2H),2.91-2.77(m,1H),2.70(s,3H),2.28-1.83(m,8H),1.81(s,3H),1.77-1.46(m,10H),1.45-1.07(m,12H),1.07-0.89(m,8H),0.89-0.82(m,4H),0.79(d,J=6.7Hz,3H),0.74(d,J=6.7Hz,3H),0.71-0.55(m,1H)。
实例15.化合物27的合成
Figure BDA0003140978730000911
向中间体3(100mg,0.102mmol)和N-甲基甲磺酰胺(112mg,1.02mmol)在DCM(7mL)中的溶液中添加氯化锌(II)(在二乙醚中的1M溶液,0.51mL,0.51mmol)。将反应混合物在室温下搅拌30分钟。将反应用H2O稀释,并用乙酸乙酯萃取。减压蒸发有机萃取物。使用SFC色谱法(方法1)纯化粗产物,得到呈白色固体状的化合物27(25mg,22%产率)。
化合物27:ESIMS[M-H]-1051.4
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:6.49(dd,J=14.1,10.9Hz,1H),6.35(s,1H),6.30-6.12(m,2H),5.99(d,J=10.9Hz,1H),5.46(dd,J=14.4,9.7Hz,1H),5.07(d,J=4.9Hz,1H),4.98-4.87(m,2H),4.75-4.63(m,1H),4.60-4.48(m,1H),4.02-3.90(m,2H),3.80-3.69(m,1H),3.68-3.55(m,1H),3.53-3.26(m,5H),3.22-2.97(m,7H),2.84-2.72(m,1H),2.51(s,3H),2.29-2.13(m,2H),2.13-1.89(m,4H),1.80(s,3H),1.76-1.06(m,30H),1.04-0.90(m,8H),0.88(d,J=6.3Hz,3H),0.83-0.59(m,8H)。
实例16.化合物28和化合物29的合成
Figure BDA0003140978730000921
非对映异构体1:将中间体7(68mg,0.069mmol)在HCl(在二噁烷中的4M溶液,1.35mL,5.52mmol)中的溶液在室温下搅拌1小时。将反应混合物直接冷冻干燥,以给出粗产物。通过制备型HPLC(方法1)纯化非对映异构体粗产物,得到呈白色固体状的化合物28(4.4mg,6.7%产率)。
化合物28:ESIMS[M+H]+885.6,[M+FA-H]-929.6
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:6.47-6.40(m,1H),6.21-6.12(m,2H),5.96-5.87(m,1H),5.46(dd,J=14.0,9.2Hz,1H),4.98-4.93(m,1H),4.89-4.81(m,1H),4.66-4.59(m,1H),4.02-3.94(m,1H),3.91-3.86(m,1H),3.64-3.55(m,1H),3.48-3.40(m,1H),3.31(s,3H),3.29-3.24(m,2H),3.21-3.16(m,1H),3.12(s,3H),2.88-2.80(m,2H),2.24-2.17(m,1H),2.17-2.10(m,1H),2.09-2.01(m,1H),1.97-1.90(m,2H),1.88-1.82(m,1H),1.81-1.74(m,5H),1.74-1.70(m,2H),1.68-1.61(m,2H),1.54-1.47(m,6H),1.44-1.37(m,3H),1.34-1.27(m,2H),1.25-1.09(m,6H),1.07-1.00(m,2H),0.98-0.95(m,6H),0.88-0.83(m,4H),0.79(d,J=6.7Hz,3H),0.75-0.69(m,4H),0.59(q,J=11.9Hz,1H)。
非对映异构体2:将中间体8(75mg,0.076mmol)在HCl(在二噁烷中的4M溶液,0.95mL,3.8mmol)中的溶液在室温下搅拌1小时。将反应混合物直接冷冻干燥,以给出粗产物。通过制备型HPLC(方法1)纯化非对映异构体粗产物,得到呈白色固体状的化合物29(10.9mg,15.8%产率)。
化合物29:ESIMS[M+H]+885.9,[M+FA-H]-930.2
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:6.50-6.40(m,1H),6.24-6.11(m,3H),5.60(dd,J=14.1,8.7Hz,1H),5.06-5.01(m,1H),4.95(d,J=9.7Hz,1H),4.70-4.63(m,1H),4.04-3.98(m,1H),3.98-3.92(m,1H),3.69-3.61(m,2H),3.57(d,J=6.8Hz,1H),3.31(s,3H),3.27-3.21(m,1H),3.20-3.16(m,1H),3.15(s,3H),2.82(ddd,J=11.2,8.7,4.4Hz,1H),2.76-2.67(m,1H),2.29-2.20(m,1H),2.19-2.13(m,1H),2.12-2.01(m,2H),1.95-1.89(m,1H),1.85-1.80(m,3H),1.78-1.71(m,3H),1.68-1.55(m,5H),1.55-1.49(m,6H),1.49-1.46(m,2H),1.45-1.38(m,2H),1.33-1.10(m,7H),1.02-0.97(m,4H),0.92-0.85(m,5H),0.84-0.79(m,6H),0.74(d,J=6.7Hz,3H),0.57(q,J=11.8Hz,1H)。
化合物29中C16取代基的绝对构型通过与FKBP12的X射线晶体学共结晶来确定。根据X射线共晶结构,化合物29中的C16取代基为(R)-构型。晶体结构描绘于图2中。
实例17.化合物30和化合物31的合成
Figure BDA0003140978730000941
向中间体1(350mg,0.389mmol)和甲基氨基甲酸叔丁酯(765mg,5.83mmol)在DCM(3mL)中的混合物添加4-甲基苯磺酸水合物(74mg,0.389mmol)。将反应混合物在室温下搅拌23小时。通过反相快速色谱法(C18;MeCN/H2O 40:60至90:10)分离包含两种非对映异构体的产物混合物的整个反应混合物。
使用SFC色谱法(方法3)随后使用制备型HPLC(方法2)纯化第一洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物30(22mg,5.4%产率)。
化合物30:ESIMS[M+NH4]+1017.2,[M+FA-H]-1044.2
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:6.61-6.51(m,1H),6.50-6.45(m,1H),6.24-6.15(m,2H),5.99(d,J=11.0Hz,1H),5.66(dd,J=14.2,8.4Hz,1H),5.07(d,J=4.7Hz,1H),5.04-5.00(m,1H),4.89(d,J=9.6Hz,1H),4.72-4.65(m,1H),4.59(d,J=4.4Hz,1H),4.48-4.29(m,1H),3.91(dd,J=8.6,4.6Hz,1H),3.73-3.61(m,1H),3.54-3.42(m,2H),3.34(d,J=8.1Hz,1H),3.30(s,3H),3.20-3.16(m,1H),3.14(s,3H),2.96-2.88(m,1H),2.86-2.79(m,1H),2.59(s,3H),2.28-2.19(m,2H),2.17-2.10(m,1H),2.08-2.00(m,2H),1.96-1.90(m,1H),1.86-1.80(m,1H),1.77-1.62(m,8H),1.56-1.46(m,6H),1.43-1.26(m,17H),1.23-1.09(m,4H),1.07-1.02(m,1H),1.01-0.94(m,6H),0.89-0.81(m,8H),0.73(d,J=6.7Hz,3H),0.58(q,J=11.9Hz,1H)。
使用SFC色谱法(方法3)随后使用制备型HPLC(方法2)纯化第二洗脱的非对映异构体,得到呈白色固体状的化合物31(45mg,11.2%产率)。
化合物31:ESIMS[M+NH4]+1017.2,[M+FA-H]-1044.3
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:6.49-6.40(m,1H),6.27-6.11(m,2H),5.98-5.84(m,1H),5.53-5.36(m,1H),5.10-5.05(m,1H),5.02-4.91(m,2H),4.64-4.54(m,2H),4.44-4.19(m,1H),4.06-3.92(m,1H),3.77-3.64(m,1H),3.65-3.50(m,2H),3.51-3.39(m,1H),3.33(s,3H),3.21-3.16(m,1H),3.13(s,3H),2.90-2.79(m,1H),2.69-2.61(m,1H),2.51(s,3H),2.26-2.13(m,2H),2.09-2.00(m,2H),1.94-1.88(m,1H),1.78-1.67(m,5H),1.67-1.65(m,1H),1.63-1.48(m,10H),1.47-1.44(m,1H),1.42-1.30(m,12H),1.29-1.22(m,3H),1.22-1.12(m,4H),1.12-1.01(m,1H),1.01-0.95(m,4H),0.92-0.81(m,8H),0.80-0.73(m,6H),0.60(q,J=11.9Hz,1H)。
实例18.化合物32和化合物33的合成
Figure BDA0003140978730000951
非对映异构体1:将化合物31(44mg,0.044mmol)在HCl(在二噁烷中的4M溶液,550μL,2.20mmol)中的溶液在室温下搅拌6分钟。将反应混合物直接冷冻干燥,以给出粗产物。通过制备型HPLC(方法2)纯化非对映异构体粗产物,得到呈白色固体状的化合物32(11.5mg,27.4%产率)。
化合物32:ESIMS[M+H]+899.9,[M+FA-H]-945.2
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:9.08-8.59(m,2H),6.86(s,1H),6.51-6.41(m,1H),6.34-6.17(m,3H),5.71-5.60(m,1H),5.12-5.07(m,2H),4.96(d,J=9.5Hz,1H),4.70-4.63(m,1H),4.60(d,J=4.4Hz,1H),4.14-4.03(m,1H),4.02-3.90(m,2H),3.76-3.65(m,1H),3.54(d,J=7.3Hz,1H),3.31(s,3H),3.25-3.17(m,1H),3.17-3.15(m,1H),3.14(s,3H),2.85-2.75(m,2H),2.43-2.37(m,3H),2.34-2.24(m,1H),2.21-2.12(m,2H),2.11-1.97(m,2H),1.93-1.87(m,1H),1.81(s,3H),1.78-1.68(m,4H),1.65-1.44(m,11H),1.41-1.36(m,1H),1.35-1.24(m,5H),1.18-1.09(m,3H),1.01-0.97(m,4H),0.96-0.92(m,1H),0.90(d,J=6.4Hz,3H),0.87-0.79(m,7H),0.73(d,J=6.7Hz,3H),0.56(q,J=11.8Hz,1H)。
非对映异构体2:将化合物30(60mg,0.060mmol)在HCl(甲醇中的1.25M溶液,2.9mL,3.60mmol)中的溶液在室温下搅拌8小时。将反应在减压下蒸发,得到粗产物。通过制备型HPLC(方法2)纯化非对映异构体粗产物,得到呈白色固体状的化合物33(3.6mg,6.3%产率)。
化合物33:ESIMS[M+H]+900.0,[M+FA-H]-944.0
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:9.19(d,J=150.7Hz,2H),6.72(s,1H),6.48(dd,J=14.3,11.1Hz,1H),6.31-6.16(m,3H),5.56(dd,J=14.6,9.5Hz,1H),5.04(d,J=5.0Hz,1H),4.94(dd,J=6.4,1.9Hz,1H),4.81(d,J=9.8Hz,1H),4.67-4.59(m,2H),4.17-4.05(m,1H),3.87(dd,J=9.2,4.9Hz,1H),3.65-3.52(m,2H),3.50-3.43(m,1H),3.32(s,3H),3.23(d,J=9.2Hz,1H),3.20-3.16(m,1H),3.12(s,3H),2.91-2.82(m,2H),2.29(s,3H),2.23-2.10(m,3H),2.09-2.03(m,1H),2.00-1.90(m,3H),1.86(s,3H),1.80-1.63(m,5H),1.56-1.50(m,3H),1.47(s,3H),1.44-1.35(m,4H),1.33-1.25(m,1H),1.24-1.09(m,6H),1.04-0.94(m,8H),0.90-0.87(m,1H),0.84(d,J=6.5Hz,3H),0.80(d,J=6.7Hz,3H),0.74(d,J=6.7Hz,3H),0.72-0.66(m,1H),0.65-0.54(m,1H)。
实例19.化合物34和化合物35的合成
Figure BDA0003140978730000971
向中间体1(150mg,0.167mmol)和羟基氨基甲酸叔丁酯(333mg,2.50mmol)在DCM(5mL)中的混合物中添加4-甲基苯磺酸水合物(9.51mg,0.0501mmol)。将反应混合物在室温下搅拌三小时。通过快速色谱法(二氧化硅;MeCN/DCM 0:100至100:0)直接纯化整个反应混合物。第二洗脱峰得到了两种非对映异构体的产物混合物。
通过SFC色谱法(方法1)分离非对映异构体混合物。
第一洗脱的非对映异构体得到了呈白色固体状的化合物34(32.4mg,19.0%产率)。
化合物34:ESIMS[M+NH4]+1019.1,[M+FA-H]-1046.1
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:8.78(s,1H),6.47-6.37(m,1H),6.22-6.10(m,2H),5.97(s,1H),5.97-5.90(m,1H),5.50-5.39(m,1H),5.06(d,J=4.7Hz,1H),5.02-4.94(m,2H),4.65-4.53(m,3H),4.05-3.94(m,1H),3.87-3.76(m,1H),3.60(d,J=6.5Hz,1H),3.58-3.51(m,1H),3.39-3.34(m,1H),3.32(s,3H),3.23-3.16(m,1H),3.14(s,3H),2.84(ddd,J=11.2,8.6,4.3Hz,1H),2.71-2.59(m,1H),2.24-2.11(m,2H),2.08-2.01(m,2H),1.95-1.88(m,1H),1.78-1.71(m,5H),1.64-1.46(m,10H),1.44-1.35(m,13H),1.30-1.13(m,8H),1.11-1.03(m,1H),1.00-0.95(m,4H),0.92-0.82(m,8H),0.79(d,J=6.8Hz,3H),0.76(d,J=6.7Hz,3H),0.58(q,J=11.9Hz,1H)。
第二洗脱的非对映异构体得到了呈白色固体状的化合物35(17.mg,10.3%产率)。
化合物35:ESIMS[M+NH4]+1019.1,[M+FA-H]-1046.1
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:9.02(s,1H),6.55(s,1H),6.51-6.41(m,1H),6.24-6.13(m,2H),5.96-5.90(m,1H),5.59-5.46(m,1H),5.02(d,J=4.7Hz,1H),4.99-4.93(m,1H),4.87-4.80(m,1H),4.69-4.61(m,1H),4.60(d,J=4.5Hz,1H),4.45-4.36(m,1H),3.87(dd,J=9.1,4.4Hz,1H),3.85-3.76(m,1H),3.71-3.60(m,1H),3.54-3.44(m,1H),3.31(s,3H),3.23(d,J=9.2Hz,1H),3.21-3.15(m,1H),3.12(s,3H),2.91-2.79(m,2H),2.46-2.35(m,1H),2.29-2.18(m,1H),2.17-2.10(m,1H),2.09-2.01(m,1H),1.98-1.89(m,2H),1.86(s,3H),1.79-1.62(m,6H),1.55-1.46(m,6H),1.44-1.27(m,14H),1.25-1.09(m,6H),1.06-0.95(m,8H),0.89-0.83(m,4H),0.80(d,J=6.8Hz,3H),0.72(d,J=6.7Hz,4H),0.59(q,J=11.8Hz,1H)。
实例20.化合物36和化合物37的合成
Figure BDA0003140978730000981
非对映异构体1:将化合物34(29.7mg,0.030mmol)在HCl(在二噁烷中的4M溶液,445μL,1.78mmol)中的溶液在室温下搅拌13分钟。将反应混合物直接冷冻干燥,以给出粗产物。通过制备型HPLC(方法2)纯化非对映异构体粗产物,得到呈白色固体状的化合物36(10.5mg,38.1%产率)。
化合物36:ESIMS[M+H]+902.0,[M+FA-H]-946.0
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:6.81-6.74(m,1H),6.54(s,1H),6.48-6.39(m,1H),6.17-6.08(m,2H),5.96(d,J=10.7Hz,1H),5.49(dd,J=14.1,8.9Hz,1H),5.05(d,J=4.6Hz,1H),5.03-4.98(m,2H),4.71-4.63(m,1H),4.60(d,J=4.4Hz,1H),4.02-3.93(m,2H),3.66(d,J=6.0Hz,1H),3.63-3.53(m,1H),3.40-3.35(m,1H),3.31(s,3H),3.25-3.19(m,1H),3.16-3.12(m,4H),2.86-2.80(m,1H),2.66-2.56(m,1H),2.27-2.15(m,2H),2.12-2.07(m,1H),2.06-1.98(m,1H),1.95-1.88(m,1H),1.84-1.78(m,4H),1.74-1.69(m,2H),1.64-1.60(m,2H),1.59-1.56(m,2H),1.55-1.51(m,5H),1.48-1.45(m,2H),1.41-1.37(m,1H),1.37-1.27(m,4H),1.25-1.22(m,1H),1.21-1.14(m,4H),1.07-1.02(m,1H),1.00-0.96(m,4H),0.89-0.85(m,5H),0.83(d,J=6.4Hz,3H),0.79(d,J=6.7Hz,3H),0.75(d,J=6.8Hz,3H),0.56(q,J=11.8Hz,1H)。
非对映异构体2:将化合物35(15.7mg,0.0157mmol)在HCl(在二噁烷中的4M溶液,392μL,1.57mmol)中的溶液在室温下搅拌13分钟。将反应混合物直接冷冻干燥,以给出粗产物。通过制备型HPLC(方法2)纯化非对映异构体粗产物,得到呈白色固体状的化合物37(4.0mg,27.5%产率)。
化合物37:ESIMS[M+H]+901.6,[M+FA-H]-945.6
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.05-6.89(m,1H),6.48(s,1H),6.46-6.39(m,1H),6.18-6.10(m,2H),5.89(dd,J=11.1,1.6Hz,1H),5.45(dd,J=14.0,9.4Hz,1H),5.04(d,J=4.7Hz,1H),4.97-4.90(m,1H),4.90-4.83(m,1H),4.66-4.58(m,2H),4.00-3.93(m,1H),3.91(dd,J=8.9,3.8Hz,1H),3.63-3.54(m,1H),3.48-3.39(m,1H),3.36-3.26(m,5H),3.20-3.16(m,1H),3.12(s,3H),2.88-2.80(m,2H),2.26-2.19(m,1H),2.17-2.10(m,1H),2.07-2.00(m,1H),1.97-1.85(m,3H),1.80-1.72(m,5H),1.70-1.61(m,4H),1.54-1.47(m,6H),1.43-1.27(m,5H),1.23-1.11(m,6H),1.03-0.94(m,8H),0.88-0.83(m,4H),0.79(d,J=6.7Hz,4H),0.72(d,J=6.8Hz,3H),0.60(q,J=11.9Hz,1H)。
实例21.化合物38和化合物39的合成
Figure BDA0003140978730001001
非对映异构体1:向中间体5(15.4mg,0.0160mmol)在DCM(1mL)中的溶液中添加4-甲基苯磺酸水合物(3.0mg,0.016mmol)。将反应混合物在室温下搅拌1小时。通过制备型HPLC(方法2)直接纯化整个反应混合物,得到呈白色固体状的化合物38(11.3mg,70.6%产率)。
化合物38:ESIMS[M+H]+994.0,[M-H]-992.1
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:8.88-8.30(m,2H),6.71(s,1H),6.49(dd,J=14.6,11.0Hz,1H),6.35-6.24(m,2H),6.20(dd,J=14.8,10.7Hz,1H),5.57(dd,J=14.8,9.6Hz,1H),5.04(d,J=4.8Hz,1H),4.96-4.91(m,1H),4.81(d,J=9.8Hz,1H),4.66-4.61(m,1H),4.60(d,J=4.7Hz,1H),4.08-3.98(m,1H),3.91-3.85(m,1H),3.85-3.75(m,1H),3.68-3.57(m,1H),3.50-3.42(m,1H),3.32(s,3H),3.23(d,J=9.2Hz,1H),3.21-3.15(m,1H),3.12(s,3H),3.06-2.91(m,2H),2.89-2.74(m,4H),2.25-2.08(m,3H),2.08-1.98(m,2H),1.98-1.89(m,2H),1.84(s,3H),1.78-1.62(m,5H),1.55-1.45(m,6H),1.44-1.28(m,5H),1.24-1.08(m,6H),1.04-0.93(m,8H),0.89-0.82(m,4H),0.80(d,J=6.8Hz,3H),0.75(d,J=6.7Hz,3H),0.69-0.54(m,2H)。
非对映异构体2:向中间体6(13.7mg,0.0141mmol)在DCM(1mL)中的溶液中添加4-甲基苯磺酸水合物(2.67mg,0.0141mmol)。将反应混合物在室温下搅拌1小时。通过制备型HPLC(方法2)直接纯化整个反应混合物,得到呈白色固体状的化合物39(9.1mg,63.9%产率)。
化合物39:ESIMS[M+H]+993.9,[M-H]-991.9
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:8.85-8.07(m,2H),6.53-6.45(m,1H),6.36(d,J=10.9Hz,1H),6.30-6.20(m,2H),6.17(s,1H),5.74(dd,J=14.3,8.1Hz,1H),5.12-5.08(m,1H),5.08-5.05(m,1H),4.93(d,J=9.5Hz,1H),4.76-4.67(m,1H),4.59(d,J=4.4Hz,1H),4.10-3.98(m,2H),3.94(dd,J=7.7,5.0Hz,1H),3.71-3.61(m,1H),3.50(d,J=7.7Hz,1H),3.31(s,3H),3.25-3.18(m,1H),3.17-3.09(m,5H),3.08-3.02(m,1H),2.89-2.78(m,4H),2.35-2.26(m,1H),2.24-2.18(m,1H),2.18-2.10(m,2H),2.10-1.99(m,1H),1.95-1.88(m,1H),1.81(s,3H),1.77-1.68(m,4H),1.65-1.59(m,2H),1.59-1.46(m,8H),1.46-1.38(m,1H),1.37-1.22(m,6H),1.21-1.12(m,3H),1.04-0.97(m,4H),0.94-0.88(m,4H),0.87-0.78(m,7H),0.74(d,J=6.7Hz,3H),0.56(q,J=11.9Hz,1H)。
实例22.化合物40和化合物41的合成
Figure BDA0003140978730001011
非对映异构体1:向中间体9(20mg,0.018mmol)在DCM(1mL)中的溶液中添加4-甲基苯磺酸水合物(5.0mg,0.026mmol)。将反应混合物在室温下搅拌1小时。通过制备型HPLC(方法2)直接纯化整个反应混合物,得到呈白色固体状的化合物40(9.6mg,50.9%产率)。
化合物40:ESIMS[M+H]+1038.1,[M-H]-1036.1
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:8.85-8.39(m,2H),6.71(s,1H),6.53-6.43(m,1H),6.37-6.24(m,2H),6.23-6.14(m,1H),5.57(dd,J=15.0,9.6Hz,1H),5.03(d,J=4.9Hz,1H),4.97-4.90(m,1H),4.81(d,J=9.8Hz,1H),4.67-4.54(m,1H),4.45(t,J=5.4Hz,1H),4.10-3.97(m,1H),3.92-3.78(m,2H),3.68-3.57(m,1H),3.54-3.42(m,5H),3.32(s,3H),3.23(d,J=9.1Hz,1H),3.12(s,3H),3.10-3.01(m,2H),3.01-2.93(m,2H),2.90-2.83(m,1H),2.83-2.71(m,2H),2.25-2.07(m,3H),2.06-2.01(m,1H),1.99-1.90(m,3H),1.83(s,3H),1.74-1.62(m,4H),1.58-1.50(m,3H),1.47(s,3H),1.45-1.26(m,6H),1.26-1.06(m,6H),1.07-0.95(m,8H),0.94-0.90(m,1H),0.84(d,J=6.5Hz,3H),0.80(d,J=6.7Hz,3H),0.75(d,J=6.7Hz,3H),0.70-0.56(m,2H)。
非对映异构体2:向中间体10(9mg,0.008mmol)在DCM(0.5mL)中的溶液中添加4-甲基苯磺酸水合物(2.3mg,0.012mmol)。将反应混合物在室温下搅拌1小时。通过制备型HPLC(方法2)直接纯化整个反应混合物,得到呈白色固体状的化合物41(3.0mg,35.3%产率)。
化合物41:ESIMS[M+H]+1037.9,[M-H]-1036.1
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:8.90-8.13(m,2H),6.52-6.44(m,1H),6.34(d,J=11.0Hz,1H),6.28-6.20(m,2H),6.19(s,1H),5.74(dd,J=14.2,7.9Hz,1H),5.11-5.06(m,2H),4.96-4.90(m,1H),4.76-4.68(m,1H),4.44(t,J=5.4Hz,1H),4.11-3.97(m,2H),3.94(dd,J=7.6,4.9Hz,1H),3.70-3.62(m,1H),3.52-3.45(m,5H),3.32(s,3H),3.28-3.19(m,1H),3.14(s,3H),3.08-2.92(m,4H),2.89-2.78(m,3H),2.35-2.26(m,1H),2.24-2.17(m,1H),2.16-2.08(m,2H),1.96-1.89(m,2H),1.80(s,3H),1.75-1.59(m,6H),1.56-1.50(m,7H),1.46-1.40(m,1H),1.38-1.23(m,7H),1.21-1.14(m,2H),1.09-1.05(m,1H),1.03-0.98(m,4H),0.93-0.89(m,4H),0.86-0.81(m,7H),0.74(d,J=6.7Hz,3H),0.62(q,J=11.7Hz,1H)。
实例23:化合物42的合成
Figure BDA0003140978730001031
*未确定C16的绝对立体化学
在反应小瓶中将中间体1(0.185g,0.206mmol)与N-甲基甲磺酰胺(0.188ml,2.06mmol)在无水二氯甲烷(1.0mL)中合并。将小瓶加盖,并将混合物用氮气真空吹扫两次。经20秒的时间段,逐滴添加三氟乙酸(0.047ml,0.62mmol)。将反应在室温下搅拌30分钟。
用饱和NaHCO3水溶液淬灭反应。将淬灭的混合物用EtOAc萃取3次。合并有机萃取物,经Na2SO4干燥,倾析并浓缩。
通过硅胶快速柱色谱法(0-50%丙酮-庚烷)纯化粗产物,以给出呈浅黄色固体状的化合物42(0.063g,0.061mmol,29.8%产率)。
化合物42:ESIMS[M+NH4]+995.8,[M-H]-976.0
HRMS:C52H84N2O13SNa(钠加合物)的计算值为999.5592。实测值为999.5591
1H NMR(600MHz,氯仿-d)δ6.43(dd,J=14.7,10.9Hz,1H),6.23(dd,J=14.7,10.6Hz,1H),6.12(dd,J=14.9,10.7Hz,1H),5.97(d,J=10.9Hz,1H),5.35(dd,J=14.9,9.8Hz,1H),5.19(d,J=5.9Hz,1H),5.14(d,J=9.9Hz,1H),4.83(d,J=12.2Hz,1H),4.70-4.65(m,1H),4.18(d,J=5.7Hz,1H),3.91(t,J=11.2Hz,1H),3.85(t,J=8.1Hz,1H),3.63(d,J=13.9Hz,1H),3.47-3.32(m,8H),3.30(s,3H),3.00(s,3H),2.95-2.89(m,2H),2.69-2.62(m,1H),2.55(s,3H),2.25(m,4H),2.18-2.04(m,4H),1.99(dd,J=12.9,4.3Hz,2H),1.88-1.83(m,4H),1.80-1.68(m,3H),1.68-1.60(m,4H),1.60-1.48(m,2H),1.44-1.40(m,2H),1.40-1.17(m,4H),1.09-1.03(m,4H),1.02-0.96(m,4H),0.96-0.88(m,4H),0.87-0.84(m,6H),0.65(q,J=12.0Hz,1H)。
绝对构型的确定
使用氢原子H25和H27的化学位移,以及来自相应的HSQC NMR波谱的氢原子H6的相对位移Δf2,指定了化合物在位置C16处的绝对构型。在Bruker Spectrospin(400MHz)上记录波谱。通常使用DMSO-d6作为溶剂。H25和H27的相对化学位移是立体异构体(R)-C16和(S)-C16的特征。
表2
(R)-C16差向异构体在H16处的化学位移: 2.5-2.9ppm
(S)-C16差向异构体在H16处的化学位移: 2.8-2.9ppm
(R)-C16差向异构体在H27处的化学位移: 3.5-3.8ppm
(S)-C16差向异构体在H27处的化学位移: 3.2-3.4ppm
两个C6氢的相对化学位移(Δf2)表示C16差向异构体的绝对构型。
表3
(R)-C16差向异构体的H6的相对化学位移Δf2: 150.6-202.3Hz
(S)-C16差向异构体的H6的相对化学位移Δf2: 54.5-80.9Hz
化合物2(绝对构型(S)-C16)和化合物29(绝对构型(R)-C16)的X射线结构作为立体化学分配的参考。
Figure BDA0003140978730001041
表4
Figure BDA0003140978730001042
Figure BDA0003140978730001051
Figure BDA0003140978730001061
实例24:生物学测定和数据
通过以下体外和体内方法评估根据本披露的化合物的活性。
药理学表征
材料与方法
用于确定雷帕霉素类似物效力的基于细胞的测定法。使用基于MEF TSC1-/-细胞的测定法来确定雷帕霉素类似物的效力。MEF TSC1-/-细胞是结节性硬化蛋白-TSC1缺陷的小鼠胚胎成纤维细胞,该结节性硬化蛋白负调控mTORC1信号传导,因此显示出组成型mTORC1激活,从而导致下游分子的磷酸化(激活)。这种基于细胞的测定法用于测量雷帕霉素类似物或其他mTOR抑制剂对S6和4EBP1的抑制作用(脱磷酸化作用)。
将MEF TSC1-/-细胞铺板在聚-D-赖氨酸涂覆的384孔Griener透明底板上,并在37℃、5%CO2下孵育过夜。在第二天,将细胞用“Hard starve”溶液(1L DPBS+1g D-(+)葡萄糖+10ml 7.5%碳酸氢钠+20ml 1M HEPES)洗涤8次,并在相同溶液中再孵育2小时。接下来用浓度降低的化合物(3.16倍稀释度时有8个点)处理细胞,并在37℃、5%CO2下孵育2小时。将细胞用4%多聚甲醛固定30min,并用TBS-EDTA洗涤5次,然后用针对pS6(Ser240/244)(细胞信号传导公司(Cell Signaling)#9468)和p4EBP1(Thr 37/46)(细胞信号传导公司#5123)的荧光标记所标记的抗体进行免疫染色。将细胞核通过Hoechst(赛默飞世尔科技公司(ThermoFisher Scientific)#H3570)染色进行可视化。使用各自的荧光通道对细胞进行成像(InCell 600),并通过pS6 IC50(nM)定义mTOR抑制剂的效力。
动物维持、化合物处理和组织收集。所有涉及动物的程序均经过美国马萨诸塞州坎布里奇市诺华生物医学研究所的机构动物护理和使用委员会(the InstitutionalAnimal Care and Use Committee of the Novartis Institutes for BiomedicalResearch,Cambridge,MA,USA)的批准。成年Sprague Dawley(SD)雄性大鼠购自Envigo公司(印第安纳波利斯(Indianapolis),美国)。一旦输入,将大鼠维持在无特定病原体的设施中,温度和光照受控(22℃,12-h光照/12-h黑暗循环:在0600h时开灯/在1800h时关灯),并且可以随意获取食物和水。在实验开始之前,使大鼠适应至少3天。
配制化合物2和RAD001,用于口服(oral、per os,p.o.)给药。将空白配制品(不含化合物2或RAD001)用作媒介物对照。大鼠口服接受单一剂量的化合物2、RAD001或相应的媒介物。在治疗后的预定时间,将大鼠用3.5%异氟烷麻醉并实施安乐死。采集各种器官并在液氮中冷冻。通过尾静脉或心脏穿刺(末端)采集血液,并冷冻以进行进一步的药代动力学分析。将所有组织储存在-80℃直至分析。
测定血液中化合物2和RAD001的浓度。使用HPLC/质谱测定浓度。
蛋白质提取和免疫印迹。为了提取蛋白质,将速冻的组织在补充有完全的EDTA游离蛋白酶抑制剂和PhosSTOP磷酸酶抑制剂片剂(罗氏公司(Roche),曼海姆(Manheim),德国)的MSD裂解缓冲液(MSD公司,罗克维尔,马里兰州)中裂解,并在4℃下以13,000g离心20min。所得的上清液用于免疫印迹。用BCA蛋白测定法(赛默科技公司(ThermoScientific),马萨诸塞州)定量蛋白质。将样品在4%-20%的CriterionTMTGXTM预制的Midi蛋白凝胶(伯乐公司(Bio-Rad),加利福尼亚州)上分离,并使用Trans Turbo印迹系统(伯乐公司,加利福尼亚州)转移到硝酸纤维素膜(伯乐公司,加利福尼亚州)上。使用来自细胞信号传导科技公司(Cell Signaling Technologies)的针对p-S6和t-S6的抗体(在5%BSA的TBS-T溶液中均为1:1000)进行免疫印迹。“p”和“t”前缀分别表示“磷酸化”形式和“总”形式。用抗GAPDH抗体(#5174,细胞信号传导科技公司,马萨诸塞州)检测的3-磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH)用作蛋白质载样对照。针对兔的HRP缀合的二抗(#7074)来自马萨诸塞州的细胞信号传导科技公司。化学发光信号是使用SuperSignalTMWest Femto增强型化学发光底物(#34095,赛默科技公司,马萨诸塞州)或Western
Figure BDA0003140978730001081
Plus-ECL增强型化学发光底物(NEL103001EA,珀金埃尔默公司(Perkin Elmer),马萨诸塞州)生成的,并使用ChemiDoc MP成像系统(伯乐公司)捕获。将得到的数字图像转换为TIFF格式,并使用ImageJ软件进行量化。
FKBP敲除细胞的产生。使用
Figure BDA0003140978730001082
4D-NucleofectorTMX试剂盒(龙沙公司(Lonza),V4XC-2032),用CRISPR/Cas9系统将含有靶向FKBP12(GCCACTACTCACCGTCTCCT,位置1392950)、FKBP12.6(TGCCCCAAGCTCATCTAGCA,位置24063057)、FKBP13(GCAGATCGGGGTCAAGAAGC,位置64242479)、FKBP25(GGTTATAGGCTGTAACCAAG,位置45130715)、FKBP52(AAGACTCGGTCCCCAATCAT,位置2797173)和FKBP51(TCATCAAGGCATGGGACATT,位置35620248)的指导RNA(gRNA)序列的核糖核蛋白复合物递送到293T细胞。使用抗FKBP特异性抗体通过免疫印迹法筛选细胞克隆:FKBP12(诺维斯公司(Novus),NB300-508)、FKBP12.6(Abnova公司(Abnova),H00002281-M01)、FKBP13(R&D系统公司(R&D Systems),MAB4356)、FKBP25(R&D系统公司,MAB3955)、FKBP52(细胞信号传导科技公司,#11826)和FKBP51(细胞信号传导科技公司,#12210)。选择每种FKBP缺陷的单细胞克隆。通过依次敲除五个FKBP基因,产生五重FKBP12/12.6/13/52/51敲除细胞和FKBP12/12.6/25/52/51敲除细胞。
用RAD001和化合物2处理野生型(WT)和FKBP敲除的293T细胞。将WT、FKBP12敲除、FKBP12/12.6/13/52/51敲除或FKBP12/12.6/25/52/51敲除的293T细胞以每孔30,000个细胞的密度铺板在聚D-赖氨酸涂覆的96孔板(康宁公司(Corning),#354461)中的补充有10%胎牛血清(赛默飞世尔公司,#16140-071)的杜氏改良的伊格尔氏培养基(赛默飞世尔公司,#11995-065)中。将细胞在37℃、5%CO2下孵育48小时,直到它们达到约80%汇合。一式三份,用RAD001或化合物2以1000nM至0.0033nM的12点或10点剂量范围在37℃下处理细胞2小时。将补充有空白二甲亚砜(DMSO)的培养基用作这两种化合物的对照。根据制备商的方案,通过夹心ELISA试剂盒(细胞信号传导公司,#7063C)检测磷酸化的S6K1(Thr389)量。
测定对FK506结合蛋白(FKBP)的结合亲和力的SPR测定法。
使用标准程序,将N-末端avi-his6-标记的FKBP融合蛋白在大肠杆菌中表达,并用镍层析进行纯化。使用Biacore 8K(通用健康医疗集团(GE Healthcare))将生物素化的his-avi-FKBP固定在链霉亲和素芯片上。为了测定雷帕霉素类似物对FKBP的动力学亲和力,将雷帕霉素类似物用DMSO稀释至50倍工作浓度。接下来,将3.1uL的每种雷帕霉素类似物溶液添加到384深孔板(greiner bio-one公司/78127)中的150uL缓冲液(50mM Tris pH7.5/150mM NaCl/0.01%Tween 20/1mM DTT)中,并使用Biomek FX混合。然后以45uL/min注射雷帕霉素类似物梯度溶液(6个浓度/2倍稀释,3.1-100nM或31-1000nM或310-10000nM),持续120秒:在运行缓冲液(50mM Tris pH 7.5/150mM NaCl/0.01%Tween 20/1mM DTT/2%DMSO)中的接触时间和解离时间为1800秒。将单循环动力学数据拟合到1:1结合模型,以测量缔合速率ka(1/Ms)、解离速率kd(1/s)和亲和力KD(M)。为了测定与具有mTOR的FKBP结合的雷帕霉素类似物的三元复合物形成的表观动力学-亲和力,将雷帕霉素类似物在DMSO中稀释,使得DMSO中的最终浓度为500μM。将his6-mTOR(氨基酸2019-2112)在缓冲液(50mMTris pH 7.5/150mM NaCL/0.01%Tween 20/1mM DTT)中稀释,以制备浓度梯度(6个浓度/2倍稀释,15.6-500nM)。将3.1uL的500μM雷帕霉素类似物溶液添加到384深孔板(greinerbio-one公司/78127)中的150uL mTOR样品中,并使用Biomek FX混合。然后以45uL/min注射mTOR梯度溶液,持续120秒:在运行缓冲液(50mM Tris pH 7.5/150mM NaCl/0.01%Tween20/1mM DTT/2%DMSO)中的接触时间和解离时间为1800秒。将单循环动力学数据拟合到1:1结合模型,以测量三元复合物形成的缔合速率ka(1/Ms)、解离速率kd(1/s)和表观亲和力KD(M)。见下表6和7。
可以在不同的细胞或组织类型中实现雷帕霉素类似物的不同药理学,这取决于1)这些细胞/组织中FKBP同源物的相对丰度,和2)与这些不同的FKBP同源物结合的特异性(Mol.Cell Biol.[分子与细胞生物学](2013)33:1357-1367)。
结果
mTOR抑制剂的体外效力由MEF TSC1-/-细胞中的pS6 IC50(nM)定义。
表5
Figure BDA0003140978730001101
Figure BDA0003140978730001111
Figure BDA0003140978730001121
IC50值计算为多次测定的平均值。
FKBP12、FKBP51和FKBP52的平衡解离常数(KD)如下表6所示。
表6
化合物 FKBP12 K<sub>D</sub> nM FKBP51 K<sub>D</sub> nM FKBP52 K<sub>D</sub> nM
RAD001 500 811 1766
1 0.061 11 9.8
2 4.8 144 374
3 0.20 40 61
4 0.55 315 256
11 0.29 45 63
12 0.39 117 135
18 0.73 573 436
24 0.54 25 90
26 0.83 47 80
42 6.5 1231 1383
对于三元复合物形成的表观亲和力KD(M)显示在下表7中。
表7
Figure BDA0003140978730001131
化合物2在大鼠中的药代动力学曲线。为了比较化合物2与RAD001在大鼠中的生物利用度,将化合物配制成溶液配制品:化合物2在MilliQ水中的15%PEG300、7.5%Solutol、7.5%Cremophore EL中配制,RAD001在PBS中的10%PEG300、10%Solutol HS15、10%Cremophore EL中配制。对7-9周龄的大鼠(每组N=3)口服施用3mg/kg的化合物,并静脉内(i.v)施用1mg/kg的化合物(图3A和3B)。分别地对于化合物2和RAD001,生物利用度为16%和19%,i.v.终末半衰期为19h和9.5h,清除率为13mL/min/kg和32mL/min/kg。
化合物2抑制大鼠肝脏中的mTORC1途径。在4-6个月龄大鼠中确定了化合物2在体内抑制mTORC1途径的能力(图4A和4B)。1、3和10mg/kg的单一剂量化合物2(配制成定制的微乳液预浓缩物,参见例如,Shavlakadze等人J Gerontol A Biol Sci Med Sci.[老年病学杂志,A辑:生物科学和医学]73(7):845-852,2018)使得大鼠肝脏中S6的显著去磷酸化(失活)(与媒介物对照相比)(图4A和4B)。
与RAD001相比,化合物2的抑制作用对FKBP12的依赖性较小。最初,在用化合物2或RAD001处理的WT和FKBP12敲除的293T细胞中测量S6K1(Thr389)的磷酸化量(图5A和5B)。S6K1是mTORC1的下游靶标,并且其雷帕霉素类似物敏感的Thr389位点的磷酸化被用作mTORC1活性的功能性读数(Lee,C.H.,Inoki,K.和Guan,K.L.(2007).mTOR pathway as atarget in tissue hypertrophy.[作为组织肥大的靶标的mTOR途径]Annu.Rev.Pharmacol.Toxicol.[药理学与毒理学年度评论]47,443-467)。在WT 293T细胞中,RAD001和化合物2对S6K1(Thr389)磷酸化的抑制率均达到约80%(图5A)。在没有FKBP12的情况下,化合物2仍然达到了约70%的S6K1(Thr389)去磷酸化,而RAD001仅达到了约40%的S6K1(Thr389)去磷酸化(图5B)。这些结果表明,在没有FKBP12的情况下,其他一种或多种FKBP同源物可能与化合物2的功效有关。
接下来,通过测量S6K1(Thr389)的磷酸化量来评估化合物2和RAD001在缺少五种FKBP:FKBP12/12.6/13/52/51的293T细胞中的抑制作用(效力)(图5C)。在这些细胞中,RAD001几乎失去了所有效力,而化合物2可有效抑制S6K1(Thr389)(图5C):在最高测试浓度下,化合物2抑制S6K1(Thr389)约90%(图5C)。该结果表明,在没有FKBP12/12.6/13/52/51的情况下,化合物2的药理作用可能由另一种FKBP同源物介导。
为了鉴定在没有FKBP12/12.6/13/51/52的情况下与化合物2的抑制作用相关的FKBP同源物,通过测量S6K1(Thr389)磷酸化量,在缺乏FKBP12/12.6/25/52/51的293T细胞中评估了化合物2和RAD001的效力(图5D)。在这些细胞中,RAD001和化合物2都不能有效抑制S6K1(Thr389)(图5D)。该结果表明,在没有其他FKBP(FKBP12/12.6/13/51/52)同源物的情况下,FKBP25足以介导化合物2的抑制作用。
不希望受到理论的束缚,在没有FKBP12的情况下,其他FKBP可能会增强化合物2的抑制作用。因此,与RAD001相比,化合物2可以靶向更广泛的细胞类型,包括具有低水平FKBP12表达和足够水平的其他FKBP的细胞类型。
已经如此描述了若干实施例的若干方面,应理解,本领域技术人员将容易想到各种改变、修改和改进。这些改变、修改和改进旨在成为本披露的一部分,并且旨在落入本披露的精神和范围内。因此,前述的说明书和附图仅是举例来说。

Claims (61)

1.一种具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐,其中:
Figure FDA0003140978720000011
R1选自由-ORa和5至6元杂芳基组成的组;
R2和R3各自独立地选自由以下组成的组:H、C1-6烷基、-ORb、-C0-6亚烷基-SO2R4和-C(O)OR5
R4是-OR5、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、杂C1-6烷基、C1-6羟基烷基、C3-8环烷基C0-6烷基;
R5是H或C1-6烷基;
Ra选自由以下组成的组:H、-P(O)(Rb)2、-C(O)Rc、-C(O)ORc、C1-6烷基和C1-6羟基烷基;
每个Rb独立地选自由H和C1-6烷基组成的组;并且
每个Rc独立地选自由H、C1-6烷基和C1-6羟基烷基组成的组。
2.根据权利要求1所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R1是-ORa
3.根据权利要求1所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R1是5至6元杂芳基。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R1选自由羟基、
Figure FDA0003140978720000012
和5-元杂芳基组成的组。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R2和R3各自独立地选自由H和-ORb组成的组。
6.根据权利要求1至4中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R2和R3各自独立地选自由H、C1-6烷基和-C0-6亚烷基-SO2R4组成的组。
7.根据权利要求1至4中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R2和R3各自独立地选自由H、羟基、-C0-6亚烷基-SO2R4和-C(O)OR5组成的组。
8.根据权利要求1所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中:
R1选自由以下组成的组:羟基、
Figure FDA0003140978720000021
Figure FDA0003140978720000022
R2和R3各自独立地选自由以下组成的组:H、C1-6烷基、-ORb、-C0-6亚烷基-SO2R4和-C(O)OR5
R4是-OR5、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、杂C1-6烷基、C1-6羟基烷基和C3-8环烷基C0-6烷基;并且
R5是H或C1-6烷基。
9.根据权利要求1至8中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,所述化合物具有结构式(I)-A或(I)-B:
Figure FDA0003140978720000023
10.根据权利要求1至9中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,所述化合物具有结构式(I)-C或(I)-D:
Figure FDA0003140978720000031
11.根据权利要求1至9中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,所述化合物具有结构式(I)-E或(I)-F:
Figure FDA0003140978720000032
12.根据权利要求1所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物选自:
Figure FDA0003140978720000033
Figure FDA0003140978720000041
Figure FDA0003140978720000051
Figure FDA0003140978720000061
Figure FDA0003140978720000071
Figure FDA0003140978720000081
Figure FDA0003140978720000091
Figure FDA0003140978720000101
Figure FDA0003140978720000111
Figure FDA0003140978720000121
Figure FDA0003140978720000131
Figure FDA0003140978720000141
13.一种药物组合物,所述药物组合物包含治疗有效量的根据权利要求1至12中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐、和一种或多种药学上可接受的载体。
14.一种药物组合,所述药物组合包含治疗有效量的根据权利要求1至12中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐、以及一种或多种治疗活性剂。
15.一种在有需要的受试者中治疗由mTOR途径介导的障碍或疾病的方法,所述方法包括向所述受试者施用治疗有效量的根据权利要求1至12中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐、或根据权利要求13所述的药物组合物、或根据权利要求14所述的药物组合。
16.一种在受试者中治疗疾病或障碍的方法,其中与所述疾病或障碍的病理学相关的靶组织、器官或细胞具有不足以抑制mTORC1的FKBP12水平,所述方法包括向所述有需要的受试者施用治疗有效量的根据权利要求1至12中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐、或根据权利要求13所述的药物组合物、或根据权利要求14所述的药物组合。
17.根据权利要求16所述的方法,其中与雷帕霉素或RAD001相比,具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐具有更高的与FKBP12、FKBP25、FKBP51和/或FKBP52的亲和力结合。
18.根据权利要求16或17所述的方法,其中具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐对FKBP12、FKBP25、FKBP51和/或FKBP52具有足以抑制mTORC1的高亲和力结合。
19.根据权利要求16至18中任一项所述的方法,其中与雷帕霉素或RAD001相比,根据经验确定治疗功效。
20.一种在受试者中治疗疾病或障碍的方法,所述受试者具有或被确定具有不足以抑制mTORC1的FKBP12水平,所述方法包括向所述有需要的受试者施用治疗有效量的根据权利要求1至12中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐、或根据权利要求13所述的药物组合物、或根据权利要求13所述的药物组合。
21.根据权利要求20所述的方法,其中与雷帕霉素或RAD001相比,具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐具有更高的与FKBP12、FKBP25、FKBP51和/或FKBP52的亲和力结合。
22.根据权利要求20或21所述的方法,其中所述受试者在靶组织、器官或细胞中具有或被确定具有不足以抑制mTORC1的FKBP12水平。
23.根据权利要求20至22中任一项所述的方法,其中与雷帕霉素或RAD001相比,根据经验确定治疗功效。
24.根据权利要求15至23中任一项所述的方法,其中所述疾病或障碍选自肌肉减少症、皮肤萎缩、樱桃血管瘤、脂溢性角化病、脑萎缩、动脉粥样硬化、动脉硬化、肺气肿、骨质疏松症、骨关节炎、高血压、勃起功能障碍、白内障、黄斑变性、青光眼、中风、脑血管疾病(中风)、慢性肾病、糖尿病相关性肾脏疾病、肝功能受损、肝纤维化、自身免疫性肝炎、子宫内膜增生、代谢功能障碍、肾血管疾病、听力损失、行动不便、认知减退、肌腱僵硬、心脏功能障碍,如心脏肥大和/或收缩和/或舒张功能障碍和/或高血压、导致射血分数下降的心脏功能障碍、免疫衰老、帕金森病、阿尔茨海默病、癌症、由于免疫监视降低导致的致癌免疫衰老、免疫功能下降引起的感染、慢性阻塞性肺疾病(COPD)、肥胖、味觉消失、嗅觉消失、关节炎和II型糖尿病(包括糖尿病引起的并发症,如肾功能衰竭、失明和神经病变)。
25.根据权利要求15至23中任一项所述的方法,其中所述障碍是肝纤维化。
26.一种在有需要的受试者中治疗疾病或障碍的方法,所述方法包括向所述受试者施用治疗有效量的根据权利要求1至12中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐、或根据权利要求13所述的药物组合物、或根据权利要求14所述的药物组合,其中所述障碍或疾病选自:
-急性或慢性器官或组织移植排斥;
-移植血管病变;
-导致血管内膜增厚、血管阻塞、阻塞性冠状动脉粥样硬化、再狭窄的平滑肌细胞增殖和迁移;
-自身免疫性疾病和炎性病症;
-哮喘;
-多药耐药性(MDR);
-真菌感染;
-炎症;
-感染;
-与年龄有关的疾病;
-神经退行性疾病;
-癌症;
-癫痫发作和与癫痫发作有关的障碍;和
-线粒体肌病和线粒体应激。
27.根据权利要求26所述的方法,其中所述障碍是包括纤维化和/或炎症过程的障碍。
28.根据权利要求26所述的方法,其中所述障碍选自肝和肾障碍。
29.根据权利要求28所述的方法,其中所述肝障碍选自:发生在终末期肝脏疾病中的肝纤维化;肝硬化;毒性引起的肝衰竭;非酒精相关性肝脂肪变性或NASH;和酒精相关性脂肪变性。
30.根据权利要求28所述的方法,其中所述肾障碍是肾纤维化。
31.根据权利要求30所述的方法,其中所述肾纤维化发生是急性肾损伤的结果。
32.根据权利要求28所述的方法,其中所述肾障碍是慢性肾障碍。
33.根据权利要求28所述的方法,其中所述肾障碍是糖尿病性肾病。
34.一种在有需要的受试者中治疗与年龄有关的障碍或疾病的方法,所述方法包括向所述受试者施用治疗有效量的根据权利要求1至12中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐、或根据权利要求13所述的药物组合物、或根据权利要求14所述的药物组合,其中所述障碍或疾病选自:肌肉减少症、皮肤萎缩、樱桃状血管瘤、脂溢性角化病、脑萎缩、动脉粥样硬化、动脉硬化、肺气肿、骨质疏松症、骨关节炎、高血压、勃起功能障碍、白内障、黄斑变性、青光眼、中风、脑血管疾病(中风)、慢性肾脏疾病、糖尿病相关性肾脏疾病、肝功能受损、肝纤维化、自身免疫性肝炎、子宫内膜增生、代谢功能障碍、肾血管疾病、听觉损失、行动不便、认知减退、肌腱僵硬、心脏功能障碍(如心脏肥大和/或收缩和/或舒张功能障碍和/或高血压)、导致射血分数降低的心脏功能障碍、免疫衰老、帕金森氏病、阿尔茨海默氏病、癌症、由于免疫监视降低导致的致癌免疫衰老、由于免疫功能下降导致的感染、慢性阻塞性肺病(COPD)、肥胖、味觉消失、嗅觉消失、关节炎和II型糖尿病。
35.一种在有需要的受试者中治疗癌症的方法,所述方法包括向所述受试者施用治疗有效量的根据权利要求1至12中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐、或根据权利要求13所述的药物组合物、或根据权利要求14所述的药物组合。
36.根据权利要求35所述的方法,所述方法进一步包括PD-1/PDL-1抑制剂。
37.根据权利要求35或36所述的方法,其中所述癌症选自肾癌、肾细胞癌、结肠直肠癌、子宫肉瘤、子宫内膜子宫癌、子宫内膜癌、乳腺癌、卵巢癌、宫颈癌、胃癌、纤维肉瘤、胰腺癌、肝癌、黑素瘤、白血病、多发性骨髓瘤、鼻咽癌、前列腺癌、肺癌、胶质母细胞瘤、膀胱癌、间皮瘤、头癌、横纹肌肉瘤、肉瘤、淋巴瘤和颈癌。
38.根据权利要求1至12中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐、或根据权利要求13所述的药物组合物、或根据权利要求14所述的药物组合,用作药物。
39.根据权利要求1至12中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐、或根据权利要求13所述的药物组合物、或根据权利要求14所述的药物组合,用于治疗由mTOR途径介导的障碍或疾病。
40.根据权利要求1至12中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐、或根据权利要求13所述的药物组合物、或根据权利要求14所述的药物组合,用于治疗选自以下的障碍或疾病:
-急性或慢性器官或组织移植排斥;
-移植血管病变;
-导致血管内膜增厚、血管阻塞、阻塞性冠状动脉粥样硬化、再狭窄的平滑肌细胞增殖和迁移;
-自身免疫性疾病和炎性病症;
-哮喘;
-多药耐药性(MDR);
-真菌感染;
-炎症;
-感染;
-与年龄有关的疾病;
-神经退行性疾病;
-癌症;
-癫痫发作和与癫痫发作有关的障碍;和
-线粒体肌病和线粒体应激。
41.根据权利要求1至12中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐、或根据权利要求13所述的药物组合物、或根据权利要求14所述的药物组合,用于治疗包括纤维化或炎症过程的障碍或疾病。
42.根据权利要求41所述使用的化合物,其中所述障碍选自肝和肾障碍。
43.根据权利要求42所述使用的化合物,其中所述肝障碍选自:发生在终末期肝脏疾病中的肝纤维化;肝硬化;毒性引起的肝衰竭;非酒精相关性肝脂肪变性或NASH;和酒精相关性脂肪变性。
44.根据权利要求42所述使用的化合物,其中所述肾障碍是肾纤维化,其发生是急性肾损伤的结果。
45.根据权利要求42所述使用的化合物,其中所述肾障碍是慢性肾障碍。
46.根据权利要求42所述使用的化合物,其中所述肾障碍是糖尿病性肾病。
47.根据权利要求1至12中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐、或根据权利要求13所述的药物组合物、或根据权利要求14所述的药物组合,用于治疗与年龄有关的选自以下的障碍或疾病:肌肉减少症、皮肤萎缩、樱桃状血管瘤、脂溢性角化病、脑萎缩、动脉粥样硬化、动脉硬化、肺气肿、骨质疏松症、骨关节炎、高血压、勃起功能障碍、白内障、黄斑变性、青光眼、中风、脑血管疾病(中风)、慢性肾脏疾病、糖尿病相关性肾脏疾病、肝功能受损、肝纤维化、自身免疫性肝炎、子宫内膜增生、代谢功能障碍、肾血管疾病、听觉损失、行动不便、认知减退、肌腱僵硬、心脏功能障碍(如心脏肥大和/或收缩和/或舒张功能障碍和/或高血压)、导致射血分数降低的心脏功能障碍、免疫衰老、帕金森氏病、阿尔茨海默氏病、癌症、由于免疫监视降低导致的致癌免疫衰老、由于免疫功能下降导致的感染、慢性阻塞性肺病(COPD)、肥胖、味觉消失、嗅觉消失、关节炎和II型糖尿病。
48.根据权利要求1至12中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐、或根据权利要求13所述的药物组合物、或根据权利要求14所述的药物组合,用于治疗癌症。
49.根据权利要求1至12中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐、或根据权利要求13所述的药物组合物、或根据权利要求14所述的药物组合,用于治疗肾癌、肾细胞癌、结肠直肠癌、子宫肉瘤、子宫内膜子宫癌、子宫内膜癌、乳腺癌、卵巢癌、宫颈癌、胃癌、纤维肉瘤、胰腺癌、肝癌、黑素瘤、白血病、多发性骨髓瘤、鼻咽癌、前列腺癌、肺癌、胶质母细胞瘤、膀胱癌、间皮瘤、头癌、横纹肌肉瘤、肉瘤、淋巴瘤或颈癌。
50.根据权利要求1至12中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐、或根据权利要求13所述的药物组合物、或根据权利要求14所述的药物组合用于制备药物的用途。
51.根据权利要求1至12中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐、或根据权利要求13所述的药物组合物、或根据权利要求14所述的药物组合用于制备治疗由mTOR途径介导的障碍或疾病的药物的用途。
52.根据权利要求1至12中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐、或根据权利要求13所述的药物组合物、或根据权利要求14所述的药物组合用于制备治疗选自以下的障碍或疾病的药物的用途:
-急性或慢性器官或组织移植排斥;
-移植血管病变;
-导致血管内膜增厚、血管阻塞、阻塞性冠状动脉粥样硬化、再狭窄的平滑肌细胞增殖和迁移;
-自身免疫性疾病和炎性病症;
-哮喘;
-多药耐药性(MDR);
-真菌感染;
-炎症;
-感染;
-与年龄有关的疾病;
-神经退行性疾病;
-癌症;
-癫痫发作和与癫痫发作有关的障碍;和
-线粒体肌病和线粒体应激。
53.根据权利要求1至12中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐、或根据权利要求13所述的药物组合物、或根据权利要求14所述的药物组合用于制备治疗包括纤维化或炎症过程的障碍或疾病的药物的用途。
54.根据权利要求53所述的用途,其中所述障碍选自肝和肾障碍。
55.根据权利要求54所述的用途,其中所述肝障碍选自:发生在终末期肝脏疾病中的肝纤维化;肝硬化;毒性引起的肝衰竭;非酒精相关性肝脂肪变性或NASH;和酒精相关性脂肪变性。
56.根据权利要求54所述的用途,其中所述肾障碍是肾纤维化,其发生是急性肾损伤的结果。
57.根据权利要求54所述的用途,其中所述肾障碍是慢性肾障碍。
58.根据权利要求54所述的用途,其中所述肾障碍是糖尿病性肾病。
59.根据权利要求1至12中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐、或根据权利要求13所述的药物组合物、或根据权利要求14所述的药物组合用于制备治疗与年龄有关的选自以下的障碍或疾病的药物的用途:肌肉减少症、皮肤萎缩、樱桃状血管瘤、脂溢性角化病、脑萎缩、动脉粥样硬化、动脉硬化、肺气肿、骨质疏松症、骨关节炎、高血压、勃起功能障碍、白内障、黄斑变性、青光眼、中风、脑血管疾病(中风)、慢性肾脏疾病、糖尿病相关性肾脏疾病、肝功能受损、肝纤维化、自身免疫性肝炎、子宫内膜增生、代谢功能障碍、肾血管疾病、听觉损失、行动不便、认知减退、肌腱僵硬、心脏功能障碍(如心脏肥大和/或收缩和/或舒张功能障碍和/或高血压)、导致射血分数降低的心脏功能障碍、免疫衰老、帕金森氏病、阿尔茨海默氏病、癌症、由于免疫监视降低导致的致癌免疫衰老、由于免疫功能下降导致的感染、慢性阻塞性肺病(COPD)、肥胖、味觉消失、嗅觉消失、关节炎和II型糖尿病。
60.根据权利要求1至12中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐、或根据权利要求13所述的药物组合物、或根据权利要求14所述的药物组合用于制备治疗癌症的药物的用途。
61.根据权利要求1至12中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐、或根据权利要求13所述的药物组合物、或根据权利要求14所述的药物组合用于制备治疗以下癌症的药物的用途:肾癌、肾细胞癌、结肠直肠癌、子宫肉瘤、子宫内膜子宫癌、子宫内膜癌、乳腺癌、卵巢癌、宫颈癌、胃癌、纤维肉瘤、胰腺癌、肝癌、黑素瘤、白血病、多发性骨髓瘤、鼻咽癌、前列腺癌、肺癌、胶质母细胞瘤、膀胱癌、间皮瘤、头癌、横纹肌肉瘤、肉瘤、淋巴瘤或颈癌。
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