CN113088537B - Tlr9基因人源化的动物模型的构建方法及应用 - Google Patents

Tlr9基因人源化的动物模型的构建方法及应用 Download PDF

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Abstract

本发明涉及一种TLR9基因人源化的动物模型、其构建方法及应用,具体涉及表达人或人源化TLR9蛋白的人源化TLR9基因动物模型的构建方法及其在生物医药领域的应用。本发明还涉及一种人源化TLR9蛋白、人源化TLR9基因以及构建TLR9基因人源化的动物模型的靶向载体。

Description

TLR9基因人源化的动物模型的构建方法及应用
技术领域
本申请涉及基因人源化改造动物模型的建立方法及应用技术领域,具体而言,涉及基于一种编码人源化TLR9蛋白的基因改造动物模型的构建方法及其在生物医药的应用。
背景技术
天然免疫在微生物感染早期具有重要作用,参与天然免疫应答的细胞通过识别病原微生物中具有保守序列的结构后,迅速启动天然免疫应答。作为识别病原体并快速启动反应的蛋白,Toll样受体家族在对抗外来病原微生物的天然免疫中发挥了重要作用。其中Toll样受体9(TLR9)为I型跨膜蛋白,分为信号肽、胞外区、跨膜区和胞内区四部分,胞外区由25个富含亮氨酸的重复序列(LRR)组成,是哺乳动物细胞识别病毒和细菌基因组中的非甲基化胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤二核苷酸序列(CpG)的主要受体。已有研究发现TLR9不仅表达在固有免疫系统中(包括树突细胞、B细胞和巨噬细胞等免疫细胞),还表达在人的气管黏膜上皮、消化道、胰腺等组织,以及多种实体瘤和血液瘤细胞上。
实验动物疾病模型对于研究人类疾病发生的病因、发病机制、开发防治技术和开发药物是不可缺少的研究工具。随着基因工程技术的不断发展和成熟,用人类基因替代或置换动物的同源性基因已经实现,通过这种方式开发人源化实验动物模型(humanizedanimal model)是动物模型未来的发展方向。其中基因人源化动物模型,即,利用基因编辑技术,用人源正常或突变基因替换动物基因组的同源基因,可建立更接近人类生理或疾病特征的正常或突变基因动物模型。基因人源化动物不但本身具有重要应用价值,如通过基因人源化可改进和提升细胞或组织移植人源化动物模型,更重要的是,由于人类基因片段的插入,动物体内可表达或部分表达人源蛋白,可作为仅能识别人蛋白氨基酸序列的药物的靶点,为在动物水平进行抗人抗体及其它药物的筛选提供了可能。然而,由于动物与人类在生理学及病理学方面存在差异,加上基因(即遗传因子)的复杂性,如何能构建出“有效”的人源化动物模型用于新药研发仍是最大的挑战(Scheer N,Snaith M,Wolf Ct,SeiblerJ.Generation and utility of genetically humanized mouse models,Drug DiscovToday;18(23-24):1200-11,2013)。
已有研究表明TLR9信号通路在感染性疾病、变应性疾病、自身免疫性疾病以及肿瘤防控应用等方面发挥重要作用。但不同种属中TLR9识别的配体不同,因此不能用普通小鼠进行抗人TLR9靶向药物的筛选。考虑TLR9在免疫治疗领域具有巨大应用价值,为了使临床前期的试验更有效,本发明在提供一种建立人源化TLR9基因改造动物模型的新方法,得到的TLR9基因人源化动物可作为新药研发和临床前研究的工具,用于药物筛选等用途。
发明内容
本发明的第一方面,提供了一种TLR9基因人源化的动物模型的构建方法,所述的动物模型体内表达人或人源化TLR9蛋白,所述的动物模型内源TLR9蛋白表达降低或缺失。
优选的,所述的人源化TLR9蛋白包含人TLR9蛋白的胞外区,进一步优选包含下列组中的一种:
A)SEQ ID NO:4第26-818位所示氨基酸序列;
B)与SEQ ID NO:4第26-818位所示氨基酸的序列同一性至少为90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或至少99%;
C)与SEQ ID NO:4第26-818位所示的氨基酸的序列差异不超过10、9、8、7、6、5、4、3、2或不超过1个氨基酸;或,
D)与SEQ ID NO:4第26-818位所示的,包括取代、缺失和/或插入一个或多个氨基酸残基的氨基酸序列。
优选的,所述的人源化TLR9蛋白还包含动物模型内源TLR9蛋白的信号肽、跨膜区和/或胞内区。进一步优选的,所述的人源化TLR9蛋白的氨基酸序列包含下列组中的一种:
a)SEQ ID No:12所示氨基酸序列;
b)与SEQ ID NO:12所示氨基酸的序列同一性至少为90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或至少99%;
c)与SEQ ID NO:12所示的氨基酸的序列差异不超过10、9、8、7、6、5、4、3、2或不超过1个氨基酸;或,
d)与SEQ ID NO:12所示的,包括取代、缺失和/或插入一个或多个氨基酸残基的氨基酸序列。
优选的,所述的动物模型的基因组中包含人TLR9基因的2号外显子的部分序列。进一步优选包含编码人TLR9胞外区的2号外显子核苷酸序列。更进一步优选包含下列组中的一种:
(A)SEQ ID NO:7所示核苷酸序列;
(B)与SEQ ID NO:7所示的核苷酸序列的同一性至少为90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或至少99%;
(C)与SEQ ID NO:7所示的核苷酸序列差异不超过10、9、8、7、6、5、4、3、2或不超过1个核苷酸;或,
(D)具有SEQ ID NO:7所示的核苷酸序列所示的,包括取代、缺失和/或插入一个或多个核苷酸的核苷酸序列。
优选的,所述的动物模型的基因组中包含人源化TLR9基因,所述的人源化TLR9基因的核苷酸序列包含下列组中的任一种:
(a)SEQ ID NO:11所示核苷酸序列;
(b)与SEQ ID NO:11所示的核苷酸序列的同一性至少为90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或至少99%;
(c)与SEQ ID NO:11所示的核苷酸序列差异不超过10、9、8、7、6、5、4、3、2或不超过1个核苷酸;
(d)具有SEQ ID NO:11所示的核苷酸序列所示的,包括取代、缺失和/或插入一个或多个核苷酸的核苷酸序列;
(e)包含SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9和/或SEQ ID NO:10所示核苷酸序列;
(f)与包含SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9和/或SEQ ID NO:10所示的核苷酸序列的同一性至少为90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或至少99%;
(g)与包含SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9和/或SEQ ID NO:10所示的核苷酸序列差异不超过10、9、8、7、6、5、4、3、2或不超过1个核苷酸;或,
(h)具有包含SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9和/或SEQ ID NO:10所示的核苷酸序列所示的,包括取代、缺失和/或插入一个或多个核苷酸的核苷酸序列。
优选的,所述的构建方法包括将人TLR9基因的2号外显子部分核苷酸序列可操作的连接在非人动物TLR9基因座上。进一步优选包括将编码人TLR9蛋白胞外区的核苷酸序列可操作的连接在非人动物TLR9基因座上。
在本发明的一个具体实施方式中,包括将人TLR9基因的2号外显子部分核苷酸序列替换非人动物TLR9基因2号外显子部分核苷酸序列。
在本发明的一个具体实施方式中,包括将编码人TLR9蛋白胞外区的核苷酸序列替换编码非人动物TLR9蛋白胞外区的核苷酸序列。
在本发明的一个具体实施方式中,包括将编码人TLR9蛋白胞外区的核苷酸序列替换编码非人动物TLR9蛋白胞外区和跨膜区N端1-5个氨基酸的核苷酸序列。
优选的,使用靶向载体进行动物模型的构建,所述的靶向载体包含人TLR9的2号外显子部分核苷酸序列。优选包含编码胞外区的核苷酸序列。进一步优选包含SEQ ID NO:7。
优选的,所述的靶向载体还包含5’臂和/或3’臂,所述的5’臂或3’臂与NCBI登录号为NC_000075.6至少具有90%同源性的核苷酸。优选自TLR9基因基因组D NA的100-10000个长度的核苷酸。进一步优选的,所述的5’臂如SEQ ID NO:5所示,所述的3’臂序列如SEQ IDNO:6所示。
本发明的第二方面,提供了一种人源化TLR9蛋白,所述的人源化TLR9蛋白包含人TLR9蛋白的全部或部分。优选包含人TLR9蛋白的胞外区。进一步优选包含SEQ ID NO:4第26-818位所示氨基酸序列。
优选的,所述的人源化TLR9蛋白的氨基酸序列中至少5至793个连续序列与人TLR9蛋白的氨基酸序列一致,且所述的人源化TLR9蛋白可以结合靶向人特定抗原的抗体。进一步优选的,所述的人源化TLR9蛋白的氨基酸序列中至少10至100个连续序列与人TLR9蛋白的氨基酸序列一致。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的人源化TLR9蛋白的氨基酸序列中至少7、10、20、50、80、100、120、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750个或期间的任一数字个连续或不连续序列与人TLR9蛋白的氨基酸序列一致。
优选的,所述的人源化TLR9蛋白还包含非人动物TLR9蛋白的部分。进一步优选包含非人动物TLR9蛋白的信号肽、跨膜区和/或胞内区。更优选包含SEQ ID NO:2第1-25位和/或第820-1032位。
优选的,所述的人源化TLR9蛋白包含信号肽、胞外区、跨膜区和胞内区。
优选的,所述的人源化TLR9蛋白中胞外区部分的氨基酸序列为至少5至793个连续序列与人TLR9蛋白胞外区的氨基酸序列一致,且所述的人源化TLR9蛋白可以结合靶向人特定抗原的抗体。进一步优选的,所述的人源化TLR9蛋白中胞外区部分的氨基酸序列为至少10至100个连续序列与人TLR9蛋白胞外区的氨基酸序列一致。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的人源化TLR9蛋白中胞外区部分的氨基酸序列为至少7、10、20、50、80、100、120、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750个或期间的任一数字个连续或不连续序列与人TLR9蛋白胞外区的氨基酸序列一致。
进一步优选的,所述的非人动物TLR9蛋白的部分包含信号肽和/或胞内区。
优选的,所述的非人动物TLR9蛋白的部分包含人TLR9外显子1编码的氨基酸序列。进一步优选的,所述的非人动物TLR9蛋白的部分还包含人TLR9外显子2编码信号肽的氨基酸序列。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的人源化TLR9蛋白包含信号肽、胞外区、跨膜区和/或胞内区;其中,所述的胞外区包含来源于人TLR9蛋白胞外区的全部或部分,所述的信号肽和/或胞内区来源于非人动物TLR9蛋白,优选的,所述的跨膜区来源于人和/或非人动物TLR9蛋白。
优选的,所述的人TLR9蛋白的部分,其氨基酸序列包含由人TLR9外显子1-2的全部或部分核苷酸序列编码的氨基酸序列。进一步优选的,所述的人TLR9蛋白的部分,其氨基酸序列包含由人TLR9外显子1和/或外显子2的全部或部分核苷酸序列编码。最为优选的,所述的人TLR9蛋白的部分,其氨基酸序列包含人TLR9外显子2的全部或部分核苷酸序列编码的氨基酸序列。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的人TLR9外显子2的部分核苷酸序列为编码不含信号肽的胞外区的全部或部分核苷酸序列。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的人TLR9蛋白的部分,其氨基酸序列包含下列组中的一种:
A)SEQ ID NO:4或SEQ ID NO:4第26-818位所示氨基酸序列的全部或部分;
B)与SEQ ID NO:4或SEQ ID NO:4第26-818位所示氨基酸的序列同一性至少为90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或至少99%;
C)与SEQ ID NO:4或SEQ ID NO:4第26-818位所示的氨基酸的序列差异不超过10、9、8、7、6、5、4、3、2或不超过1个氨基酸;或,
D)与SEQ ID NO:4或SEQ ID NO:4第26-818位所示的,包括取代、缺失和/或插入一个或多个氨基酸残基的氨基酸序列。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的人源化TLR9蛋白的氨基酸序列包含下列组中的一种:
a)SEQ ID NO:12所示氨基酸序列的全部或部分;
b)与SEQ ID NO:12所示氨基酸的序列同一性至少为90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或至少99%;
c)与SEQ ID NO:12所示的氨基酸的序列差异不超过10、9、8、7、6、5、4、3、2或不超过1个氨基酸;
d)与SEQ ID NO:12所示的,包括取代、缺失和/或插入一个或多个氨基酸残基的氨基酸序列;
e)人源化TLR9蛋白中来源于人TLR9蛋白的全部或部分氨基酸序列为SEQ ID NO:4所示氨基酸序列的全部或部分;
f)人源化TLR9蛋白中来源于人TLR9蛋白的全部或部分氨基酸序列与SEQ ID NO:4所示氨基酸的序列同一性至少为90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或至少99%;
g)人源化TLR9蛋白中来源于人TLR9蛋白的全部或部分氨基酸序列与SEQ ID NO:4所示的氨基酸的序列差异不超过10、9、8、7、6、5、4、3、2或不超过1个氨基酸;
h)人源化TLR9蛋白中来源于人TLR9蛋白的全部或部分氨基酸序列与SEQ ID NO:4所示的,包括取代、缺失和/或插入一个或多个氨基酸残基的氨基酸序列;
i)人源化TLR9蛋白中来源于非人动物TLR9蛋白的全部或部分氨基酸序列为SEQID NO:2所示氨基酸序列的全部或部分;
j)人源化TLR9蛋白中来源于非人动物TLR9蛋白的全部或部分氨基酸序列与SEQID NO:2所示氨基酸的序列同一性至少为90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或至少99%;
k)人源化TLR9蛋白中来源于非人动物TLR9蛋白的全部或部分氨基酸序列与SEQID NO:2所示的氨基酸的序列差异不超过10、9、8、7、6、5、4、3、2或不超过1个氨基酸;或,1)人源化TLR9蛋白中来源于非人动物TLR9蛋白的全部或部分氨基酸序列与SEQ ID NO:2所示的,包括取代、缺失和/或插入一个或多个氨基酸残基的氨基酸序列。
本发明的第三方面,提供了一种人源化TLR9基因,所述的人源化TLR9基因包含人TLR9基因的全部或部分。优选包含人TLR9基因2号外显子的部分核苷酸序列。更优选包含编码人TLR9胞外区的核苷酸序列。更进一步优选包含SEQ ID NO:7。
优选还包含编码非人动物TLR9信号肽、跨膜区和/或胞内区的核苷酸序列。
优选的,所述的人源化TLR9基因的核苷酸序列连续30-2379个与人TLR9基因序列一致,且其编码的TLR9蛋白可以结合靶向人特定抗原的抗体。进一步优选的,所述的人源化TLR9基因的核苷酸序列连续50-1000个与人TLR9基因序列一致。在本发明的一个具体实施方式中,所述的人源化TLR9基因的核苷酸序列连续或不连续30、50、80、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1100、1200、1300、1400、1500、1600、1700、1800、1900、2000、2200、2300个或期间的任一数字个核苷酸序列与人TLR9基因核苷酸序列一致。
优选的,所述的人源化TLR9基因还包含非人动物TLR9基因的部分。
优选的,所述的人TLR9基因的部分,其核苷酸序列包含人TLR9外显子1-2的全部或部分核苷酸序列。进一步优选的,所述的人TLR9基因的部分,其核苷酸序列包含由人TLR9外显子1和/或外显子2的全部或部分核苷酸序列。
最为优选的,所述的人TLR9基因的部分,其核苷酸序列包含人TLR9外显子2的全部或部分核苷酸序列。
其中,所述的人TLR9外显子2的部分核苷酸序列中连续30-2379个与人TLR9基因序列一致,且其编码的TLR9蛋白可以结合靶向人特定抗原的抗体。进一步优选的,所述的人TLR9外显子2的部分核苷酸序列中连续50-1000个与人TLR9基因序列一致。在本发明的一个具体实施方式中,所述的人TLR9外显子2的部分核苷酸序列连续或不连续30、50、80、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1100、1200、1300、1400、1500、1600、1700、1800、1900、2000、2200、2300个或期间的任一数字个核苷酸序列与人TLR9基因核苷酸序列一致。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的人TLR9外显子2的部分核苷酸序列为编码除信号肽外的人TLR9胞外区的全部或部分核苷酸序列。即所述的人TLR9基因的部分包含编码人TLR9胞外区的全部或部分核苷酸序列。
优选的,所述的人源化TLR9基因编码的蛋白包含信号肽、胞外区、跨膜区和胞内区。进一步优选的,所述的人TLR9基因的部分,其核苷酸序列包含编码人TLR9胞外区的全部或部分核苷酸序列。更进一步优选的,所述的人TLR9基因的部分,其核苷酸序列不包含编码人TLR9信号肽的核苷酸序列。
进一步优选的,所述的非人动物TLR9基因的部分,其核苷酸序列包含编码信号肽、跨膜区和/或胞内区的核苷酸序列。
再进一步优选的,所述的非人动物TLR9基因的部分,其核苷酸序列包含编码信号肽和/或胞内区的核苷酸序列。
优选的,所述的非人动物TLR9基因的部分,其核苷酸序列包含TLR9基因的外显子1全部核苷酸序列。
进一步优选的,所述的非人动物TLR9基因的部分,其核苷酸序列还包含TLR9基因的外显子2中编码信号肽的核苷酸序列。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的人源化TLR9基因编码的蛋白包含信号肽、胞外区、跨膜区和/或胞内区;其中,所述的胞外区包含编码人TLR9基因胞外区的全部或部分核苷酸序列,所述的信号肽和/或胞内区来源于编码非人动物TLR9蛋白的核苷酸序列,优选的,所述的跨膜区来源于编码人和/或非人动物TLR9蛋白的核苷酸序列。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的人TLR9基因的部分,其核苷酸序列包含下列组中的一种:
(A)SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:7所示核苷酸序列的全部或部分;
(B)与SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:7所示的核苷酸序列的同一性至少为90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或至少99%;
(C)与SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:7所示的核苷酸序列差异不超过10、9、8、7、6、5、4、3、2或不超过1个核苷酸;或
(D)具有SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:7所示的核苷酸序列所示的,包括取代、缺失和/或插入一个或多个核苷酸的核苷酸序列。
优选的,所述的人源化TLR9基因编码上述的人源化TLR9蛋白。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的人源化TLR9基因的核苷酸序列包含下列组中的一种:
(a)SEQ ID NO:11所示核苷酸序列的全部或部分;
(b)与SEQ ID NO:11所示的核苷酸序列的同一性至少为90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或至少99%;
(c)与SEQ ID No:11所示的核苷酸序列差异不超过10、9、8、7、6、5、4、3、2或不超过1个核苷酸;
(d)具有SEQ ID No:11所示的核苷酸序列所示的,包括取代、缺失和/或插入一个或多个核苷酸的核苷酸序列;
(e)为包含SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9和/或SEQ ID NO:10所示核苷酸序列的全部或部分;
(f)与包含SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9和/或SEQ ID NO:10所示的核苷酸序列的同一性至少为90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或至少99%;
(g)与包含SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9和/或SEQ ID NO:10所示的核苷酸序列差异不超过10、9、8、7、6、5、4、3、2或不超过1个核苷酸;
(h)具有包含SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9和/或SEQ ID NO:10所示的核苷酸序列所示的,包括取代、缺失和/或插入一个或多个核苷酸的核苷酸序列;
(i)人源化TLR9基因中来源于人TLR9基因的全部或部分核苷酸序列为SEQ ID NO:3所示核苷酸序列的全部或部分;
(j)人源化TLR9基因中来源于人TLR9基因的全部或部分核苷酸序列与SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列的同一性至少为90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或至少99%;
(k)人源化TLR9基因中来源于人TLR9基因的全部或部分核苷酸序列与SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列差异不超过10、9、8、7、6、5、4、3、2或不超过1个核苷酸;
(1)人源化TLR9基因中来源于人TLR9基因的全部或部分核苷酸序列具有sEQ IDNO:3所示的核苷酸序列所示的,包括取代、缺失和/或插入一个或多个核苷酸的核苷酸序列;
(m)人源化TLR9基因中来源于非人动物TLR9基因的全部或部分核苷酸序列为SEQID NO:1所示核苷酸序列的全部或部分;
(n)人源化TLR9基因中来源于非人动物TLR9基因的全部或部分核苷酸序列与SEQID NO:1所示的核苷酸序列的同一性至少为90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或至少99%;
(o)人源化TLR9基因中来源于非人动物TLR9基因的全部或部分核苷酸序列与SEQID NO:1所示的核苷酸序列差异不超过10、9、8、7、6、5、4、3、2或不超过1个核苷酸;或(p)人源化TLR9基因中来源于非人动物TLP9基因的全部或部分核苷酸序列具有SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列所示的,包括取代、缺失和/或插入一个或多个核苷酸的核苷酸序列。
优选的,所述的人源化TLR9基因还包括特异性诱导物或阻遏物。进一步优选的,所述的特异性诱导物或阻遏物可以为常规可以诱导或阻遏的物质。在本发明的一个具体实施方式中,所述的特异性诱导物选自四环素系统(Tet-OffSystem/Tet-On System)或他莫昔芬系统(Tamoxifen System)。
优选的,所述人源化TLR9基因小鼠TLR9 D NA的非模板链、编码链或有义链包含序列SEQ ID NO:7。
本发明的第四方面,提供了一种TLR9基因的靶向载体,所述的靶向载体包含人TLR9的2号外显子部分核苷酸序列。优选包含编码胞外区的核苷酸序列。进一步优选包含SEQ ID NO:7。优选的,所述的靶向载体还包含5’臂和/或3’臂,所述的5’臂或3’臂与NCBI登录号为NC_000075.6至少具有90%同源性的核苷酸,优选自TLR9基因基因组DNA的100-10000个长度的核苷酸;进一步优选的,所述的5’臂如SEQ ID NO:5所示,所述的3’臂序列如SEQ ID NO:6所示。
优选的,所述的靶向载体包含供体DNA序列,所述的供体DNA序列包含人TLR9基因的全部或部分。
优选的,所述的供体DNA序列包含人TLR9外显子1-2的全部或部分核苷酸序列;进一步优选的,所述的供体DNA序列包含人TLR9外显子2的全部或部分核苷酸序列。更进一步优选的,所述的供体DNA序列包含编码人TLR9胞外区的全部或部分核苷酸序列。再进一步优选的,所述的供体DNA序列不包含编码人TLR9信号肽的核苷酸序列。最为优选的,所述的供体DNA序列包含SEQ ID NO:7。
优选的,所述的靶向载体还包含与待改变的转换区5’端同源的DNA片段,即5’臂,其选自TLR9基因基因组DNA的100-10000个长度的核苷酸。进一步优选的,所述的5’臂与NCBI登录号为NC_000075.6至少具有90%同源性的核苷酸。更进一步优选的,所述5’臂序列如SEQ ID NO:5所示。
优选的,所述的靶向载体还包含与待改变的转换区3’端同源的第二个DNA片段,即3’臂,其选自TLR9基因基因组DNA的100-10000个长度的核苷酸。进一步优选的,所述的3’臂与NCBI登录号为NC_000075.6至少具有90%同源性的核苷酸。更进一步优选的,所述3’臂序列如SEQ ID NO:6所示。
优选的,所述的待改变的转换区位于TLR9基因的外显子2上。
优选的,所述的靶向载体还包含标记基因。进一步优选的,所述标记基因为负筛选标记的编码基因。更进一步优选的,所述负筛选标记的编码基因为白喉毒素A亚基的编码基因(DTA)。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的靶向载体中还包括阳性克隆筛选的抗性基因。进一步优选的,所述阳性克隆筛选的抗性基因为新霉素磷酸转移酶编码序列Neo。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的靶向载体中还包括特异性重组系统。进一步优选的,所述特异性重组系统为Frt重组位点(也可选择常规的LoxP重组系统)。所述的特异性重组系统为2个,分别装在抗性基因的两侧。
本发明的第五方面,提供了一种包含上述的靶向载体的细胞。
本发明的第六方面,提供了一种上述的靶向载体、上述的细胞在TLR9基因编辑中的应用。
优选的,所述的应用包括但不限于敲除、插入或替换TLR9基因的外显子1至外显子2的全部或部分核苷酸序列。
进一步优选的,所述的应用包括但不限于敲除、插入或替换TLR9基因的外显子2的全部或部分核苷酸序列。
本发明的第七方面,提供了一种TLR9基因人源化的动物模型,所述的动物模型体内表达人或人源化TLR9蛋白。
本发明的第八方面,提供了一种TLR9基因人源化的动物模型的构建方法,所述的动物模型体内表达人或人源化TLR9蛋白。
优选的,所述的动物模型内源TLR9蛋白表达降低或缺失。
优选的,所述的人源化TLR9蛋白包含人TLR9蛋白的全部或部分。
优选的,所述的人源化TLR9蛋白的氨基酸序列中至少5至793个连续序列与人TLR9蛋白的氨基酸序列一致,且所述的人源化TLR9蛋白可以结合靶向人特定抗原的抗体。进一步优选的,所述的人源化TLR9蛋白的氨基酸序列中至少10至100个连续序列与人TLR9蛋白的氨基酸序列一致。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的人源化TLR9蛋白的氨基酸序列中至少7、10、20、50、80、100、120、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750个或期间的任一数字个连续序列与人TLR9蛋白的氨基酸序列一致。
优选的,所述的人TLR9蛋白的部分包含人TLR9蛋白的胞外区全部或部分。
优选的,所述的人TLR9蛋白的部分,其氨基酸序列包含由人TLR9外显子1至外显子2的全部或部分核苷酸序列编码。进一步优选的,所述的人TLR9蛋白的部分,其氨基酸序列包含由人TLR9外显子1和/或外显子2的全部或部分核苷酸序列编码。最为优选的,所述的人TLR9蛋白的部分,其氨基酸序列包含由人TLR9外显子2的全部或部分核苷酸序列编码的氨基酸序列。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的人TLR9外显子2的部分核苷酸序列为编码不含信号肽的胞外区的全部或部分核苷酸序列。
优选的,所述的人源化TLR9蛋白还包含非人动物TLR9蛋白的部分。进一步优选的,所述的非人动物TLR9蛋白的部分包含信号肽、跨膜区和/或胞内区。
最为优选的,所述的人源化TLR9蛋白选自上述的任一的人源化TLR9蛋白。
优选的,所述的TLR9基因人源化的动物模型的基因组中包含人TLR9基因的全部或部分。进一步优选的,所述的人TLR9基因的部分,其核苷酸序列包含人TLR9外显子1-2的全部或部分核苷酸序列。更进一步优选的,所述的人TLR9基因的部分,其核苷酸序列包含人TLR9外显子2的全部或部分核苷酸序列;再进一步优选的,所述的人TLR9基因的部分,其核苷酸序列包含编码人TLR9胞外区的全部或部分核苷酸序列。最为优选的,所述的人TLR9基因的部分,其核苷酸序列不包含编码人TLR9信号肽的核苷酸序列。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的TLR9基因人源化的动物模型的基因组中包含上述的人源化TLR9基因。
优选的,将人源化TLR9基因或者人TLR9基因的全部或部分核苷酸序列可操作的连接在非人动物TLR9基因座上,获得TLR9基因人源化的动物模型。
优选的,所述的人源化TLR9基因在动物模型中通过调控元件进行调控。进一步优选的,所述的调控元件可以是内源性或者外源性。
优选的,所述的调控元件包括但不限于启动子。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的内源性调控元件来自非人动物TLR9基因,所述的外源性调控元件来自人TLR9基因。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的人源化TLR9基因在动物模型中通过内源调控元件进行调控。
优选的,所述的TLR9基因人源化的动物模型是纯合或杂合的。
优选的,使用基因编辑技术进行TLR9基因人源化的动物模型的构建,所述的基因编辑技术包括利用胚胎干细胞的基因打靶技术、CRISPR/Cas9技术、锌指核酸酶技术、转录激活子样效应因子核酸酶技术、归巢核酸内切酶或其他分子生物学技术。
在本发明的一个具体实施方式中,破坏非人动物TLR9基因的编码框,将编码人TLR9蛋白的全部或部分核苷酸序列或者本发明所述的人源化TLR9基因核苷酸序列插入非人动物TLR9基因内源调控元件之后,获得TLR9基因人源化的动物模型。优选的,所述的破坏非人动物TLR9基因的编码框可以采用敲除非人动物TLR9基因的功能区或者采用插入一段序列,使得非人动物TLR9蛋白不表达或表达的蛋白无功能。进一步优选的,所述的破坏非人动物TLR9基因的编码框可以为敲除非人动物TLR9基因的外显子1至外显子2的全部或部分核苷酸序列。
在本发明的一个具体实施方式中,将编码人TLR9蛋白的全部或部分核苷酸序列或者本发明所述的人源化TLR9基因核苷酸序列,和辅助序列插入非人动物TLR9基因内源调控元件之后,获得TLR9基因人源化的动物模型。优选的,所述的辅助序列可以为终止密码子,使得TLR9基因人源化的动物模型体内表达人TLR9蛋白,不表达非人动物TLR9蛋白。进一步优选的,所述的辅助序列为WPRE和/或polyA。
在本发明的一个具体实施方式中,将编码人TLR9蛋白的全部或部分核苷酸序列或者本发明所述的人源化TLR9基因核苷酸序列替换非人动物TLR9基因的外显子1至外显子2的全部或部分核苷酸序列,获得TLR9基因人源化的动物模型。
在本发明的一个具体实施方式中,将人TLR9基因的全部或部分替换非人动物TLR9基因的全部或部分,获得TLR9基因人源化的动物模型。
在本发明的一个具体实施方式中,将人TLR9基因的外显子1至外显子2的全部或部分核苷酸序列替换非人动物TLR9基因的外显子1至外显子2的全部或部分核苷酸序列,获得TLR9基因人源化的动物模型。
在本发明的一个具体实施方式中,将人TLR9基因的外显子2的全部或部分核苷酸序列替换非人动物TLR9基因外显子2的全部或部分核苷酸序列,获得TLR9基因人源化的动物模型。
优选的,用人TLR9基因的外显子2的全部或部分核苷酸序列替换非人动物TLR9基因外显子2的全部或部分核苷酸序列。
进一步优选的,用编码人TLR9蛋白胞外区的全部或部分核苷酸序列替换非人动物TLR9基因编码胞外区和/或跨膜区的全部或部分核苷酸序列。
最为优选的,用编码人TLR9蛋白胞外区的全部或部分核苷酸序列替换非人动物TLR9基因编码胞外区的全部或部分核苷酸序列。
在本发明的一个具体实施方式中,使用上述的任一靶向载体实现上述任一所述的替换。
优选的,也可以使用靶位点位于TLR9基因外显子2上的sgRNA序列靶向,实现上述任一替换或插入。
本发明的第九方面,提供了一种多基因修饰的非人动物的构建方法,所述的构建方法包括如下步骤:
i)提供上述的TLR9基因人源化的动物模型,或者采用上述的构建方法获得的TLR9基因人源化的动物模型;
ii)将步骤i)获得的TLR9基因人源化的动物模型与其他基因修饰的非人动物交配、体外授精或直接进行基因编辑,并进行筛选,得到多基因修饰的非人动物。
优选的,所述的其他基因修饰的非人动物包括基因CD137、LAG-3、CTLA-4、TIM-3、BTLA、4-1BB、CD27、CD28、CD47、TIGIT、GITR、OX40、PD-1或PD-L1修饰的非人动物。
优选的,所述的多基因修饰的非人动物为双基因人源化非人动物、三基因人源化非人动物、四基因人源化非人动物、五基因人源化非人动物、六基因人源化非人动物、七基因人源化非人动物、八基因人源化非人动物或九基因人源化非人动物。
优选的,所述的多基因修饰的非人动物的基因组中人源化的多个基因中的每一个基因均可以是纯合或杂合的。
本发明的第十方面,提供了一种TLR9基因人源化的细胞、组织、器官或荷瘤后的瘤组织,所述的细胞、组织、器官或荷瘤后的瘤组织表达权利要求9-10任一所述的人源化TLR9蛋白,优选的,所述的细胞、组织、器官或荷瘤后的瘤组织的基因组中包含权利要求11-12任一所述的人源化TLR9基因
本发明的第十一方面,提供了一种上述的构建方法获得的TLR9基因人源化的动物模型或其子代及多基因修饰的非人动物或其子代。
本发明的第十二方面,提供了一种荷瘤或炎症的动物模型,所述的动物模型来源于上述的构建方法获得的TLR9基因人源化的动物模型、上述的TLR9基因人源化的动物模型、上述的构建方法获得的多基因修饰的非人动物或者上述的多基因修饰的非人动物或其子代。
本发明的第十三方面,提供了一种荷瘤或炎症的动物模型的制备方法,所述的制备方法包括提供上述的构建方法获得的TLR9基因人源化的动物模型、上述的TLR9基因人源化的动物模型、上述的构建方法获得的多基因修饰的非人动物或者上述的多基因修饰的非人动物或其子代。优选的,所述的制备方法还包括植入肿瘤细胞的步骤。
本发明的第十四方面,提供了上述的构建方法获得的TLR9基因人源化的动物模型、上述的TLR9基因人源化的动物模型、上述的构建方法获得的多基因修饰的非人动物或者上述的多基因修饰的非人动物或其子代在构建荷瘤或炎症的动物模型中的应用。
本发明的第十五方面,提供了一种细胞或细胞系或原代细胞培养物,所述细胞或细胞系或原代细胞培养物来源于上述的构建方法获得的TLR9基因人源化的动物模型、上述的TLR9基因人源化的动物模型、上述的构建方法获得的多基因修饰的非人动物、上述的多基因修饰的非人动物或其子代或者上述的荷瘤或炎症的动物模型。
本发明的第十六方面,提供了一种组织或器官或其培养物,所述组织或器官或其培养物来源于上述的构建方法获得的TLR9基因人源化的动物模型、上述的TLR9基因人源化的动物模型、上述的构建方法获得的多基因修饰的非人动物、上述的多基因修饰的非人动物或其子代或者上述的荷瘤或炎症的动物模型。优选的,所述组织或器官为脾脏、肿瘤或其培养物。
本发明的第十七方面,提供了一种荷瘤后的瘤组织,所述的瘤组织来源于上述的构建方法获得的TLR9基因人源化的动物模型、上述的TLR9基因人源化的动物模型、上述的构建方法获得的多基因修饰的非人动物、上述的多基因修饰的非人动物或其子代或者上述的荷瘤或炎症的动物模型。
本发明的第十八方面,提供了一种TLR9基因人源化的细胞株,所述的细胞株表达人或人源化TLR9蛋白。
优选的,所述的细胞株中内源TLR9蛋白表达降低或缺失。
优选的,所述的人源化TLR9蛋白包含人TLR9蛋白的全部或部分。
优选的,所述的人源化TLR9蛋白的氨基酸序列中至少5至793个连续序列与人TLR9蛋白的氨基酸序列一致,且所述的人源化TLR9蛋白可以结合靶向人特定抗原的抗体。进一步优选的,所述的人源化TLR9蛋白的氨基酸序列中至少10至100个连续序列与人TLR9蛋白的氨基酸序列一致。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的人源化TLR9蛋白的氨基酸序列中至少7、10、20、50、80、100、120、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750个或期间的任一数字个连续序列与人TLR9蛋白的氨基酸序列一致。
优选的,所述的人TLR9蛋白的部分包含人TLR9蛋白的胞外区全部或部分。
优选的,所述的人TLR9蛋白的部分,其氨基酸序列包含由人TLR9外显子1至外显子2的全部或部分核苷酸序列编码。进一步优选的,所述的人TLR9蛋白的部分,其氨基酸序列包含由人TLR9外显子1和/或外显子2的全部或部分核苷酸序列编码。最为优选的,所述的人TLR9蛋白的部分,其氨基酸序列包含由人TLR9外显子2的全部或部分核苷酸序列编码的氨基酸序列。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的人TLR9外显子2的部分核苷酸序列为编码不含信号肽的胞外区的全部或部分核苷酸序列。
优选的,所述的人源化TLR9蛋白还包含非人动物TLR9蛋白的部分。进一步优选的,所述的非人动物TLR9蛋白的部分包含信号肽、跨膜区和/或胞内区。
最为优选的,所述的人源化TLR9蛋白选自上述任一的人源化TLR9蛋白。
优选的,所述的细胞株的基因组核苷酸序列中包含人TLR9基因的全部或部分核苷酸序列。进一步优选的,所述的人TLR9基因的部分核苷酸序列包含人TLR9外显子1-2的全部或部分核苷酸序列。更进一步优选的,所述的人TLR9基因的部分核苷酸序列包含人TLR9外显子2的全部或部分核苷酸序列。再进一步优选的,所述的人TLR9基因的部分核苷酸序列包含编码人TLR9胞外区的全部或部分核苷酸序列。最为优选的,所述的人TLR9基因的部分核苷酸序列不包含编码人TLR9信号肽的核苷酸序列。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的细胞株的基因组中包含上述任一的人源化TLR9基因。
本发明的第十九方面,提供了一种TLR9基因人源化的细胞株的构建方法,使用基因编辑技术进行细胞株的构建,所述的基因编辑技术包括利用胚胎干细胞的基因打靶技术、CRISPR/Cas9技术、锌指核酸酶技术、转录激活子样效应因子核酸酶技术、归巢核酸内切酶或其他分子生物学技术。
优选的,所述的构建方法包括将人源化TLR9基因或者人TLR9基因的全部或部分核苷酸序列可操作的连接在非人动物细胞TLR9基因座上。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的构建方法包括破坏非人动物细胞TLR9基因的编码框,将编码人TLR9蛋白的全部或部分核苷酸序列或者本发明所述的人源化TLR9基因核苷酸序列插入非人动物细胞TLR9基因内源调控元件之后。优选的,所述的破坏非人动物细胞TLR9基因的编码框可以采用敲除非人动物细胞TLR9基因的功能区或者采用插入一段序列,使得非人动物细胞TLR9蛋白不表达或表达的蛋白无功能。进一步优选的,所述的破坏非人动物细胞TLR9基因的编码框可以为敲除非人动物细胞TLR9基因的外显子1至外显子2的全部或部分核苷酸序列。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的构建方法包括将编码人TLR9蛋白的全部或部分核苷酸序列或者本发明所述的人源化TLR9基因核苷酸序列,和辅助序列插入非人动物细胞TLR9基因内源调控元件之后。优选的,所述的辅助序列可以为终止密码子,使得细胞表达人TLR9蛋白,不表达非人动物细胞内源TLR9蛋白。进一步优选的,所述的辅助序列为WPRE和/或polyA。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的构建方法包括将编码人TLR9蛋白的全部或部分核苷酸序列或者本发明所述的人源化TLR9基因核苷酸序列替换非人动物细胞TLR9基因的外显子1至外显子2的全部或部分核苷酸序列。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的构建方法包括将人TLR9基因的全部或部分替换非人动物细胞TLR9基因的全部或部分。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的构建方法包括将人TLR9基因的外显子1至外显子2的全部或部分核苷酸序列替换非人动物细胞TLR9基因的外显子1至外显子2的全部或部分核苷酸序列。
在本发明的一个具体实施方式中,所述的构建方法包括将人TLR9基因的外显子2的全部或部分核苷酸序列替换非人动物细胞TLR9基因外显子2的全部或部分核苷酸序列。
优选的,使用上述的任一靶向载体将人TLR9基因的外显子2的全部或部分核苷酸序列替换非人动物TLR9基因外显子2的全部或部分核苷酸序列。进一步优选的,也可以使用靶位点位于TLR9基因外显子2上的sgRNA序列靶向,实现该替换或插入。
本发明所述的非人动物为非人哺乳动物。优选的,所述的非人哺乳动物为啮齿类动物、猪、兔子、猴子等任何可以进行基因编辑制备TLR9基因人源化的动物模型的非人哺乳动物。进一步优选的,所述的啮齿类动物为小鼠或大鼠。
本发明的第二十方面,提供了一种包含上述人源化TLR9基因的构建体。优选的,所述的构建体表达人或人源化TLR9蛋白。
本发明的第二十一方面,提供了一种包含上述构建体的细胞。
本发明的第二十二方面,提供了一种包含上述细胞的组织。
本发明的第二十三方面,提供了来源于上述的人源化TLR9蛋白、上述的人源化TLR9基因、上述的构建方法获得的TLR9基因人源化的动物模型、上述的TLR9基因人源化的动物模型、上述的构建方法获得的多基因修饰的非人动物、上述的非人动物或其子代、上述的荷瘤或炎症的动物模型、上述的细胞或细胞系或原代细胞培养物、上述的组织或器官或其培养物、上述的荷瘤后的瘤组织、上述的细胞株、上述的构建体、上述的细胞或者上述的组织在需要涉及人类细胞的免疫过程的产品开发,制造抗体,或者作为药理学、免疫学、微生物学、医学研究的模型系统中的应用;或者在生产和利用动物实验疾病模型,用于开发新的诊断策略和/或治疗策略中的应用;或者在筛选、验证、评价或研究TLR9功能、人TLR9信号机理、靶向人的抗体、靶向人的药物、药效,免疫相关疾病药物以及抗肿瘤或抗炎症药物,筛选和评估人用药及药效研究方面的应用;以及制备筛选、验证、评价或研究TLR9功能、人TLR9信号机理、靶向人的抗体、靶向人的药物、药效,免疫相关疾病药物以及抗肿瘤或抗炎症药物,筛选和评估人用药及药效的产品中的应用。
本发明的第二十四方面,提供了来源于上述的TLR9基因人源化的动物模型、上述的构建方法获得的TLR9基因人源化的动物模型、上述的构建方法获得的多基因修饰的非人动物、上述的多基因修饰的非人动物或其子代或者上述的荷瘤或炎症的动物模型用作人TLR9特异性调节剂的筛选。
本发明的第二十五方面,提供了一种人TLR9特异性调节剂的筛选方法,所述的筛选方法包括向植入肿瘤细胞的个体施加调节剂,检测肿瘤抑制性;其中,所述的个体选自上述的构建方法获得的TLR9基因人源化的动物模型、上述的TLR9基因人源化的动物模型、上述的构建方法获得的多基因修饰的非人动物、上述的多基因修饰的非人动物或其子代或者上述的荷瘤或炎症的动物模型。
优选的,所述的调节剂选自CAR-T、药物。进一步优选的,所述的药物为抗体。
优选的,所述筛选方法不是治疗方法。该筛选方法对调节剂的效果进行检测和评价,以确定该调节剂是否有治疗效果,即治疗效果不是必然的,只是一种可能性。
本发明的第二十六方面,提供了一种人用药物筛选或评价的方法,所述的方法包括向个体体内移植人肿瘤细胞,向移入人肿瘤细胞的动物给予候选药物,对给予候选药物的个体进行药效检测和/或比较。其中,所述的个体选自上述的构建方法获得的TLR9基因人源化的动物模型、上述的TLR9基因人源化的动物模型、上述的构建方法获得的多基因修饰的非人动物、上述的多基因修饰的非人动物或其子代或者上述的荷瘤或炎症的动物模型。
优选的,所述药物筛选或评价的方法不是治疗方法。该方法用来筛选或评价药物,对候选药物的药效进行检测和比较,以确定哪些候选药物可以作为药物,哪些不能作为药物,或者,比较不同药物的药效敏感程度,即治疗效果不是必然的,只是一种可能性。
优选的,所述候选药物包括靶向药物。进一步优选的,所述的靶向药物为抗原结合蛋白。在本发明的一个具体实施方式中,所述的抗原结合蛋白为抗体。
优选的,所述候选药物为单抗或双特异性抗体或两种及两种以上药物的联合使用。
优选的,所述检测包括测定肿瘤细胞的大小和/或增殖速率;优选的,所述检测的方法包括游标卡尺测量、流式细胞检测和/或动物活体成像检测。
优选的,所述的检测包括评估个体体重、脂肪量、活化途径、神经保护活性或代谢变化,所述的代谢变化包括食物消耗或水消耗的变化。
通过上述的技术方案,本发明取得了良好的技术效果,包括:在TLR9基因人源化的动物模型体内正常表达人或人源化TLR9蛋白,以及表达的人源化TLR9蛋白可以结合靶向人特定抗原的抗体。
本发明所述的“人源化TLR9蛋白”,包含来源于人TLR9蛋白的部分和非人TLR9蛋白的部分,其中,所述“人TLR9蛋白”为人TLR9蛋白的全长氨基酸序列。所述的人TLR9蛋白的部分与非人TLR9蛋白的部分之间可以直接连接或者接头连接,所述的“接头”为柔性接头,优选为肽接头,其氨基酸数目和种类没有限定,只要可以连接人TLR9蛋白的部分与非人TLR9蛋白部分,且不影响人源化TLR9蛋白的功能即可。
本发明所述的“人源化TLR9基因”,包含来源于人TLR9基因的部分和非人TLR9基因的部分,所述的“人TLR9基因”为人TLR9基因的全长核苷酸序列。
本发明所述的“全部或部分”,“全部”为整体;“部分”为整体中的局部,或者整体中的个体。例如“外显子1至外显子2的全部或部分”,“外显子1至外显子2的全部”为整体,即外显子1至外显子2的全部核苷酸序列;“外显子1至外显子2的部分”为整体的局部或整体的个体,即外显子1至外显子2连续或间隔的核苷酸序列。其中,所述的“外显子1至外显子2”包括外显子1至外显子2之间的内含子。
本发明所述的“TLR9蛋白”,例如“人TLR9蛋白”、“非人动物TLR9蛋白”或“人源化TLR9蛋白”,均包含信号肽、胞外区、胞内区和/或跨膜区,且本发明所述的“胞外区”均不包含信号肽。
本发明所述的“包含”或“包括”是开放式的描述,含有所描述的指定成分或步骤,以及不会实质上影响的其他指定成分或步骤。然而在用于描述蛋白质或核酸的序列时,所述蛋白质或核酸可以是由所述序列组成,或者在所述蛋白质或核酸的一端或两端可以具有额外的氨基酸或核苷酸,但仍然具有本发明所述的活性。
本发明所述“同源性”,是指在使用蛋白序列或核苷酸序列的方面,本领域技术人员可以根据实际工作需要对序列进行调整,使使用序列与现有技术获得的序列相比,具有(包括但不限于)1%,2%,3%,4%,5%,6%,7%,8%,9%,10%,11%,12%,13%,14%,15%,16%,17%,18%,19%,20%,21%,22%,23%,24%,25%,26%,27%,28%,29%,30%,31%,32%,33%,34%,35%,36%,37%,38%,39%,40%,41%,42%,43%,44%,45%,46%,47%,48%,49%,50%,51%,52%,53%,54%,55%,56%,57%,58%,59%,60%,70%,80%,81%,82%,83%,84%,85%,86%,87%,88%,89%,90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%,99.1%,99.2%,99.3%,99.4%,99.5%,99.6%,99.7%,99.8%,99.9%的同一性。
本领域的技术人员能够确定并比较序列元件或同一性程度,以区分另外的小鼠和人序列。
除非特别说明,本发明的实践将采取细胞生物学、细胞培养、分子生物学、转基因生物学、微生物学、重组DNA和免疫学的传统技术。这些技术在以下文献中进行了详细的解释。例如:Molecular Cloning A Laboratory Manual,2ndEd.,ed.By Sambrook,Fritschand Maniatis(Cold Spring Harbor Laboratory Press:1989);DNA Cloning,Volumes I and II(D.N.Glovered.,1985);Oligonucleotide Synthesis(M.J.Gaited.,1984);Mullisetal.U.S.Pat.No.4,683,195;Nucleic Acid Hybridization(B.D.Hames&S.J.Higginseds.1984);Transcription And Translation(B.D.Hames&S.J.Higginseds.1984);Culture OfAnimal Cells(R.I.Freshney,AlanR.Liss,Inc.,1987);Immobilized Cells And Enzymes(IRL Press,1986);B.Perbal,A PracticalGuide To MolecularCloning(1984);the series,Methods In ENZYMOLOGY(J.Abelsonand M.Simon,eds.in chief,Academic Press,Inc.,New York),specifically,Vols.154and 155(Wuetal.eds.)and Vol.185,″Gene Expression Technology″(D.Goeddel,ed.);Gene Transfer Vectors For Mammalian Cells(J.H.Miller and M.P.Caloseds.,1987,Cold Spring Harbor Laboratory);Immunochemical Methods In Cell And MolecularBiology(Mayer and Walker,eds.,Academic Press,London,1987);Handbook OfExperimental Immunology,Volumes V(D.M.Weir and C.C.Blackwell,eds.,1986);andManipulating the Mouse Embryo,(Cold Spring Harbor Laboratory Press,ColdSpring Harbor,N.Y.,1986)。
在一个方面,所述非人动物是哺乳动物。优选的,所述非人动物是小型哺乳动物。在一个实施方式中,所述TLR9基因人源化的动物模型是啮齿动物。在一个实施方式中,所述啮齿动物选自小鼠、大鼠和仓鼠。在一个实施方式中,所述啮齿动物选自鼠家族。在一个实施方式中,所述基因修饰的动物来自选自丽仓鼠科(例如小鼠样仓鼠)、仓鼠科(例如仓鼠、新世界大鼠和小鼠、田鼠)、鼠总科(真小鼠和大鼠、沙鼠、刺毛鼠、冠毛大鼠)、马岛鼠科(登山小鼠、岩小鼠、有尾大鼠、马达加斯加大鼠和小鼠)、刺睡鼠科(例如多刺睡鼠)和鼹形鼠科(例如摩尔大鼠、竹大鼠和鼢鼠)家族。在一个特定实施方式中,所述基因修饰的啮齿动物选自真小鼠或大鼠(鼠总科)、沙鼠、刺毛鼠和冠毛大鼠。在一个实施方式中,所述基因修饰的小鼠来自鼠科家族成员。在一个实施方式中,所述动物是啮齿动物。在一个特定实施方式中,所述啮齿动物选自小鼠和大鼠。在一个实施方式中,所述非人动物是小鼠。
在一个特定实施方式中,所述非人动物是啮齿动物,其为选自BALB/c、A、A/He、A/J、A/WySN、AKR、AKR/A、AKR/J、AKR/N、TA1、TA2、RF、SWR、C3H、C57BR、SJL、C57L、DBA/2、KM、NIH、ICR、CFW、FACA、C57BL/A、C57BL/An、C57BL/GrFa、C57BL/KaLwN、C57BL/6、C57BL/6J、C57BL/6ByJ、C57BL/6NJ、C57BL/10、C57BL/10ScSn、C57BL/10Cr和C57BL/Ola的C57BL、C58、CBA/Br、CBA/Ca、CBA/J、CBA/st、CBA/H品系的小鼠及NOD、NOD/SCID、NOD-PrkdcscidIL-2rgnull背景的小鼠。
以上只是概括了本发明的一些方面,不是也不应该认为是在任何方面限制本发明。
本说明书提到的所有专利和出版物都是通过参考文献作为整体而引入本发明的。本领域的技术人员应认识到,对本发明可作某些改变并不偏离本发明的构思或范围。下面的实施例进一步详细说明本发明,不能认为是限制本发明或本发明所说明的具体方法的范围。
附图说明
以下,结合附图来详细说明本发明的实施例,其中:
图1:小鼠和人TLR9基因对比示意图(非按比例);
图2:人源化小鼠TLR9基因座示意图(非按比例);
图3:打靶策略示意图(非按比例);
图4:细胞Southern blot结果,分别用BamHI、AseI、SacI或EcoNI消化细胞DNA并使用3个探针分别进行杂交,其中WT为野生型;
图5:FRT重组过程示意图(非按比例);
图6:F1代鼠尾PCR鉴定结果,其中,图(A)使用引物对WT-F1和WT-R用于扩增野生型小鼠TLR9基因2号外显子部分片段;图(B)使用引物对Mut-F和WT-R用于扩增改造后的小鼠TLR9基因2号外显子部分片段,用以验证靶向载体是否存在并正确插入基因组位点;图(C)使用引物对Frt-F和Frt-R用以扩增neo片段以验证抗性片段是否去除;图(D)使用引物对Flp-F和Flp-R用以确认F中片段的存在;其中,WT为野生型,PC为阳性对照,H2O为水对照,M为Marker;
图7:脾脏B细胞流式分析结果,其中,图A、C为野生型C57BL/6鼠,图B、D为TLR9基因人源化杂合子小鼠;
图8:脾脏NK细胞流式分析结果,其中,图A、C为野生型C57BL/6鼠,图B、D为TLR9基因人源化杂合子小鼠;
图9:脾脏DC细胞流式分析结果,其中,图A、C为野生型C57BL/6鼠,图B、D为TLR9基因人源化杂合子小鼠。
具体实施方式
下面结合具体实施例来进一步描述本发明,本发明的优点和特点将会随着描述而更为清楚。但这些实施例仅是范例性的,并不对本发明的范围构成任何限制。本领域技术人员应该理解的是,在不偏离本发明的精神和范围下可以对本发明技术方案的细节和形式进行修改或替换,但这些修改和替换均落入本发明的保护范围内。
在下述每一实施例中,设备和材料是从以下所指出的几家公司获得:
C57BL/6小鼠和Flp工具鼠均购自中国食品药品检定研究院国家啮齿类实验动物种子中心;
PD-1人源化小鼠来源北京百奥赛图基因生物技术有限公司,产品编号为B-CM-001;
Brilliant Violet 510TM anti-mouse CD45 Anhbody来源Biolegend,货号103138;
PerCP/Cyanine5.5anti-mouse TCRβchainAntibody来源Biolegend,货号109228;
PE anti-mouse CD19Antibody(CD19-PE)来源Biolegend,货号115508;
Brilliant Violet 605TM anti-mouse CD11c Antibody来源Biolegend,货号117334;
APC anti-human CD289(TLR9)Antibody(hTLR9-APC)来源Biolegend,货号394807;
PerCP-CyTM5.5MouseAnti-MouseNK-1.1来源BDPharmingen,货号552878;
Anti-TLR9 antibody[ABM4D70](FITC)(mTLR9-FITC)来源Abcam,货号ab210925;
Foxp3/转录因子染色试剂盒(eBioscienceTM Foxp3/Transcription FactorStaining Buffer Set)来源ebioscience,货号00-5523-00;
BamHI、AseI、EcoNI或SacI酶购自NEB,货号分别为:R3136M、R0526M、R3101M和R3156M。
本发明计划对非人动物(如小鼠)进行改造,使该动物体内包含编码人TLR9蛋白的核苷酸序列的全部或部分,以使其体内表达人或人源化TLR9蛋白。可通过各种基因编辑系统和制备方法得到表达人或人源化TLR9蛋白的非人哺乳动物,包括但不限于利用胚胎干细胞(embryonic stem cell,ES)的基因打靶技术、锌指核酸酶(ZFN)技术、转录激活子样效应因子核酸酶(TALEN)技术、归巢核酸内切酶(兆碱基大范围核酶)、规律成簇间隔短回文重复(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats,CRISPR)技术或其他分子生物学技术。本发明实施例主要以ES细胞的基因同源重组技术为例,阐述如何通过构建特异靶向小鼠TLR9基因靶向载体实现序列替换得到所述人源化小鼠。
实施例1 TLR9基因人源化小鼠
小鼠TLR9基因(NCBI Gene ID:81897,Primary source:MGI:1932389,UniProtIID:Q9EQU3,基于转录本NM_031178.2(SEQ ID NO:1)及其编码蛋白NP_112455.2(SEQ IDNO:2))和人TLR9基因(NCBIGeneIID:54106,Primary source:HGNC:15633,UniProtIID:Q9NR96,基于转录本NM_017442.3(SEQ ID NO:3)及其编码蛋白NP_059138.1(SEQ ID NO:4))对比示意图如图1所示。
为了达到本发明的目的,可在小鼠内源TLR9基因座的胞外区引入编码人TLR9蛋白胞外区的核苷酸序列,使得该小鼠表达人或人源化的TLR9蛋白。具体而言,用基因编辑技术对小鼠细胞进行修饰,在小鼠内源TLR9基因座上用人TLR9基因的序列替换特定小鼠TLR9基因序列。在小鼠TLR9基因调节元件的控制下,如将至少包含小鼠TLR9基因的2号外显子约2.4kb的序列用对应的人基因序列替换,得到小鼠人源化TLR9基因座,示意图如图2所示。
进一步的,设计如图3所示的打靶策略,实现人的TLR9蛋白(NP_059138.1)的第26-818位氨基酸替换小鼠的TLR9蛋白(NP_112455.2)的第26-819位氨基酸,对应的转录本替换策略,实现人的TLR9转录本(NM_017442.3)的第710-3088位碱基替换小鼠的TLR9转录本(NM_031178.2)的第182-2563位碱基,其中图3所示的靶向载体上含有5’同源臂(SEQ ID NO:5)、3’同源臂(SEQ ID NO:6)以及包含人TLR基因片段的DNA片段(以下简称A片段),其中5’同源臂与NCBI登录号与NC_000075.6的第106218978-106223586位核苷酸序列相同;3’同源臂与NCBI登录号与NC_000075.6的第106227223-106231701位核苷酸序列相同;A片段中人TLR基因片段(SEQ ID NO:7)与NCBI登录号与NC_000003.12的第52224240-52221862位核苷酸序列相同,其中,人TLR基因片段和5’同源臂直接连接,人TLR基因的序列下游与鼠基因座的下游连接设计为5’-
Figure BDA0002890300510000161
Figure BDA0002890300510000162
(SEQ ID NO:8),其中序列“ACTGT”的最后一个“T”是人序列的最后一个核苷酸,序列
Figure BDA0002890300510000163
的第一个“T”是小鼠序列的第一个核苷酸。A片段上还包括用于阳性克隆筛选的抗性基因,即新霉素磷酸转移酶编码序列Neo,并在抗性基因的两侧装上两个同向排列的位点特异性重组系统Frt重组位点,组成Neo盒(Neo cassette);Neo盒和鼠基因座的上游连接设计为在5’-
Figure BDA0002890300510000164
Figure BDA0002890300510000165
(SEQ ID NO:9)内,其中序列“AACAG”的“G”是鼠序列的最后一个核苷酸,序列
Figure BDA0002890300510000166
的“G”是Neo盒的第一个核苷酸。Neo盒和鼠基因座的下游连接设计为在5’-
Figure BDA0002890300510000167
Figure BDA0002890300510000168
(SEQ ID NO:10)内,其中序列
Figure BDA0002890300510000169
的最后一个“C”是Neo盒的最后一个核苷酸,序列“CAAGG”的“C”是鼠序列的第一个核苷酸。改造后的人源化小鼠TLR的mRNA序列及其编码的蛋白序列分别如SEQ ID NO:11和SEQ ID NO:12所示。
此外,还在靶向载体3’同源臂下游构建了具有负筛选标记的编码基因(白喉毒素A亚基的编码基因(DTA))。
靶向载体构建可采用常规方法进行,如酶切连接等。构建好的靶向载体可通过酶切进行初步验证,再送测序公司进行测序验证。将测序验证正确的靶向载体电穿孔转染入C57BL/6小鼠的胚胎干细胞中,利用阳性克隆筛选标记基因对得到的细胞进行筛选,并利用PCR和Southern Blot技术进行检测确认外源基因的整合情况,筛选出正确的阳性克隆细胞,经PCR鉴定为阳性的克隆再进行Southern Blot(分别用BamHI、AseI、SacI或EcoNI消化细胞DNA并使用3个探针进行杂交,见表1)检测,5’探针、3’探针和Neo探针分别位于5’同源臂外侧、3’同源臂外侧和Neo盒上。结果见如图4所示,检测结果表明8个经PCR验证为阳性的克隆中,有4个克隆(分别为1-A12、1-H09、2-G08、3-F04)确认无随机插入。
PCR测定包括下述引物:
F1:5’-GCTCGACTAGAGCTTGCGGA-3’(SEQ ID NO:13),
R1:5’-CCCTGTTGTAACATGGCTTTGACG-3’(SEQ ID NO:14);
F2:5’-GTTGACAGACTAGGATAGGCCCAAC-3’(SEQ ID NO:15),
R2:5’-CAGGCACAGTCATGATGTTG-3’(SEQ ID NO:16);
Southern Blot检测包括如下探针引物:
5’探针(5'Probe):
F:5’-GACGAGGTACATCCCAAGCAACAC-3’(SEQ ID NO:17),
R:5’-CACCCACTGTAGCCAAAGGCTTTTG-3’(SEQ ID NO:18);
3’探针(3'Probe):
F:5’-CTTCTGGGTCTGAGGCAGAAGTG-3’(SEQ ID NO:19),
R:5’-GAGAAGCTGCTGGTCACGTGGAAG-3’(SEQ ID NO:20);
Neo探针(NeoProbe):
F:5’-GGATCGGCCATTGAACAAGATGG-3’(SEQ ID NO:21),
R:5’-CAGAAGAACTCGTCAAGAAGGCG-3’(SEQ ID NO:22)。
表1具体探针及目的片段的长度
Figure BDA00028903005100001610
Figure BDA0002890300510000171
将筛选出的正确阳性克隆按照本领域已知的技术将阳性克隆细胞(黑色鼠)导入已分离好的囊胚中(白色鼠),得到的嵌合囊胚转移至培养液中短暂培养后移植至受体母鼠(白色鼠)的输卵管,可生产F0代嵌合体鼠(黑白相间)。将F0代嵌合鼠与野生型鼠回交获得F1代鼠,再将F1代杂合小鼠互相交配即可获得F2代纯合子鼠。可将F1代阳性鼠与Flp工具鼠交配去除阳性克隆筛选标记基因(该过程示意图见图5)后,再通过互相交配即可得到表达人源化TLR9蛋白的人源化纯合子小鼠。可通过PCR鉴定子代小鼠体细胞的基因型,示例性的F1代小鼠(已去Neo)的鉴定结果见图6,综合图6的四组结果可见,编号为F1-1的小鼠为阳性杂合小鼠。
PCR测定包括下述引物:
WT-F:5’-TGAACCTGACAGTTCTAGACGTGAGAAG-3’(SEQ ID NO:23),
WT-R:5’-CCATGCCAGGCACAGATGAAAAC-3’(SEQ ID NO:24);
Mut-F:5’-CGGCTTCTTTTCCAAGGCCAAG-3’(SEQ ID NO:25);
WT-R:5’-CCATGCCAGGCACAGATGAAAAC-3’(SEQ ID NO:24);
Frt-F:5’-GATGAAAGGCTAGTTTGTCTTTGACC-3’(SEQ ID NO:26);
Frt-R:5’-CACACCTTTGACTCTCCTCTGGC-3’(SEQ ID NO:27);
Flp-F:5’-GACAAGCGTTAGTAGGCACATATAC-3’(SEQ ID NO:28);
Flp-R:5’-GCTCCAATTTCCCACAACATTAGT-3’(SEQ ID NO:29)。
通过常规检测方法可确认小鼠体内人源化TLR9蛋白的表达情况,例如取野生型C57BL/6小鼠和TLR9基因人源化杂合子小鼠(5-7周龄)各1只,分离脾脏细胞,加入Brilliaut Violet 510TM anti-mouse CD45 Antibody、PerCP/Cyanine5.5anti-mouse TCRβchain Antibody、PE anti-mouse CD19 Antibody(CD19-PE)、Brilliant Violet 605TManti-mouse CD11c Antibody和PerCP-CyTM5.5MouseAnti-MouseNK-1.1抗体标记后,使用Foxp3/转录因子染色试剂盒(eBioscienceTMFoxp3/Transcription Factor StainingBuffer Set)进行固定和破膜,具体实验过程按照说明书进行,然后再加入APC anti-humanCD289(TLR9)Antibody(hTLR9-APC)和Anti-TLR9 antibody[ABM4D70](FITC)(mTLR9-FITC)抗体染色后进行流式检测TLR9蛋白的表达。检测结果表明,可在野生型C57BL/6小鼠和TLR9基因人源化杂合子小鼠的脾脏来源的B细胞(图7A、图7B)、NK细胞(图8A、图8B)、树突细胞(DC)(图9A、图9B)内检测到表达鼠TLR9蛋白的细胞,但只能在TLR9基因人源化杂合子小鼠体内中检测到表达人源化TLR9蛋白的细胞(图7D、图8D、图9D),不能在野生型C57BL/6小鼠体内检测到表达人或人源化TLR9蛋白的细胞(图7C、图8C、图9C)。
其中,流式检测门控策略为,B细胞被定为完整的、单一的、活的,mCD45+,mCD19+;NK细胞被定为完整的、单一的、活的,mCD45+,NK1.1+;DC细胞被定为完整的、单一的、活的,mCD45+,TCRB-,CD11c+。
实施例2双重人源化或多基因人源化TLR9小鼠
利用实施例1制得的TLR9人源化小鼠制备包含TLR9基因人源化的多基因人源化小鼠模型。如,显微注射及胚胎移植过程使用的受精卵细胞选择来源于其它基因修饰小鼠的受精卵细胞,如,对PD-1人源化小鼠的受精卵细胞进行基因编辑,可以得到PD-1和TLR9双基因人源化小鼠模型。也可将TLR9人源化小鼠纯合或杂合子与其它基因修饰纯合或杂合小鼠交配,对其后代进行筛选,根据孟德尔遗传规律,可有一定几率得到TLR9人源化小鼠与其它基因修饰的双基因或多基因修饰的杂合小鼠,再将杂合子相互交配可以得到双基因或多基因修饰的纯合子。
实施例3评估药效
利用本方法制得的TLR9基因人源化小鼠可以用于评估靶向人TLR9的调节剂药效。例如可以皮下接种小鼠结肠癌细胞MC38,待肿瘤体积生长到约100mm3后根据肿瘤体积分为对照组或治疗组,治疗组随机选择靶向人TLR9的化合物,对照组注射等体积的生理盐水。定期测量肿瘤体积并称量小鼠的体重,可通过结果比较小鼠体重变化和肿瘤大小即可有效评估化合物的体内安全性和体内药效。
以上详细描述了本发明的优选实施方式,但是,本发明并不限于上述实施方式中的具体细节,在本发明的技术构思范围内,可以对本发明的技术方案进行多种简单变型,这些简单变型均属于本发明的保护范围。
另外需要说明的是,在上述具体实施方式中所描述的各个具体技术特征,在不矛盾的情况下,可以通过任何合适的方式进行组合,为了避免不必要的重复,本发明对各种可能的组合方式不再另行说明。
此外,本发明的各种不同的实施方式之间也可以进行任意组合,只要其不违背本发明的思想,其同样应当视为本发明所公开的内容。
序列表
<110> 北京百奥赛图基因生物技术有限公司
<120> TLR9基因人源化的动物模型的构建方法及应用
<130> 1
<160> 29
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 3471
<212> DNA/RNA
<213> 小鼠(Mouse)
<400> 1
tgaaagtgtc acttcctcaa ttctctgaga gaccctggtg tggaacatca ttctctgccg 60
cccagtttgt cagagggagc ctcgggagaa tcctccatct cccaacatgg ttctccgtcg 120
aaggactctg caccccttgt ccctcctggt acaggctgca gtgctggctg agactctggc 180
cctgggtacc ctgcctgcct tcctaccctg tgagctgaag cctcatggcc tggtggactg 240
caattggctg ttcctgaagt ctgtaccccg tttctctgcg gcagcatcct gctccaacat 300
cacccgcctc tccttgatct ccaaccgtat ccaccacctg cacaactctg acttcgtcca 360
cctgtccaac ctgcggcagc tgaacctcaa gtggaactgt ccacccactg gccttagccc 420
cctgcacttc tcttgccaca tgaccattga gcccagaacc ttcctggcta tgcgtacact 480
ggaggagctg aacttgagct ataatggtat caccactgtg ccccgactgc ccagctccct 540
ggtgaatctg agcctgagcc acaccaacat cctggttcta gatgctaaca gcctcgccgg 600
cctatacagc ctgcgcgttc tcttcatgga cgggaactgc tactacaaga acccctgcac 660
aggagcggtg aaggtgaccc caggcgccct cctgggcctg agcaatctca cccatctgtc 720
tctgaagtat aacaacctca caaaggtgcc ccgccaactg ccccccagcc tggagtacct 780
cctggtgtcc tataacctca ttgtcaagct ggggcctgaa gacctggcca atctgacctc 840
ccttcgagta cttgatgtgg gtgggaattg ccgtcgctgt gaccatgccc ccaatccctg 900
tatagaatgt ggccaaaagt ccctccacct gcaccctgag accttccatc acctgagcca 960
tctggaaggc ctggtgctga aggacagctc tctccataca ctgaactctt cctggttcca 1020
aggtctggtc aacctctcgg tgctggacct aagcgagaac tttctctatg aaagcatcac 1080
ccacaccaat gcctttcaga acctaacccg cctgcgcaag ctcaacctgt ccttcaatta 1140
ccgcaagaag gtatcctttg cccgcctcca cctggcaagt tcctttaaga acctggtgtc 1200
actgcaggag ctgaacatga acggcatctt cttccgcttg ctcaacaagt acacgctcag 1260
atggctggcc gatctgccca aactccacac tctgcatctt caaatgaact tcatcaacca 1320
ggcacagctc agcatctttg gtaccttccg agcccttcgc tttgtggact tgtcagacaa 1380
tcgcatcagt gggccttcaa cgctgtcaga agccacccct gaagaggcag atgatgcaga 1440
gcaggaggag ctgttgtctg cggatcctca cccagctccg ctgagcaccc ctgcttctaa 1500
gaacttcatg gacaggtgta agaacttcaa gttcaccatg gacctgtctc ggaacaacct 1560
ggtgactatc aagccagaga tgtttgtcaa tctctcacgc ctccagtgtc ttagcctgag 1620
ccacaactcc attgcacagg ctgtcaatgg ctctcagttc ctgccgctga ctaatctgca 1680
ggtgctggac ctgtcccata acaaactgga cttgtaccac tggaaatcgt tcagtgagct 1740
accacagttg caggccctgg acctgagcta caacagccag ccctttagca tgaagggtat 1800
aggccacaat ttcagttttg tgacccatct gtccatgcta cagagcctta gcctggcaca 1860
caatgacatt catacccgtg tgtcctcaca tctcaacagc aactcagtga ggtttcttga 1920
cttcagcggc aacggtatgg gccgcatgtg ggatgagggg ggcctttatc tccatttctt 1980
ccaaggcctg agtggcctgc tgaagctgga cctgtctcaa aataacctgc atatcctccg 2040
gccccagaac cttgacaacc tccccaagag cctgaagctg ctgagcctcc gagacaacta 2100
cctatctttc tttaactgga ccagtctgtc cttcctaccc aacctggaag tcctagacct 2160
ggcaggcaac cagctaaagg ccctgaccaa tggcaccctg cctaatggca ccctcctcca 2220
gaaactcgat gtcagtagca acagtatcgt ctctgtggtc ccagccttct tcgctctggc 2280
ggtcgagctg aaagaggtca acctcagcca caacattctc aagacggtgg atcgctcctg 2340
gtttgggccc attgtgatga acctgacagt tctagacgtg agaagcaacc ctctgcactg 2400
tgcctgtggg gcagccttcg tagacttact gttggaggtg cagaccaagg tgcctggcct 2460
ggctaatggt gtgaagtgtg gcagccccgg ccagctgcag ggccgtagca tcttcgcgca 2520
ggacctgcgg ctgtgcctgg atgaggtcct ctcttgggac tgctttggcc tttcactctt 2580
ggctgtggcc gtgggcatgg tggtgcctat actgcaccat ctctgcggct gggacgtctg 2640
gtactgtttt catctgtgcc tggcatggct acctttgcta gcccgcagcc gacgcagcgc 2700
ccaaactctc ccttatgatg ccttcgtggt gttcgataag gcacagagcg cagttgccga 2760
ctgggtgtat aacgagctgc gggtgcggct ggaggagcgg cgcggccgcc gagccctacg 2820
cttgtgtctg gaggaccgag attggctgcc tggccagacg ctcttcgaga acctctgggc 2880
ttccatctat gggagccgca agactctatt tgtgctggcc cacacggacc gcgtcagtgg 2940
cctcctgcgc accagcttcc tgctggctca gcagcgcctg ttggaagacc gcaaggacgt 3000
ggtggtgttg gtgatcctgc gtccggatgc ccaccgctcc cgctatgtgc gactgcgcca 3060
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gtgcgcaata tatgctacca agccaccagg cccacggagc aaaggttggc tgtaaagggt 3360
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ggactggagt tcattctctg cccctccacc cccctttgtc tgtctctgta t 3471
<210> 2
<211> 1032
<212> PRT
<213> 小鼠(Mouse)
<400> 2
Met Val Leu Arg Arg Arg Thr Leu His Pro Leu Ser Leu Leu Val Gln
1 5 10 15
Ala Ala Val Leu Ala Glu Thr Leu Ala Leu Gly Thr Leu Pro Ala Phe
20 25 30
Leu Pro Cys Glu Leu Lys Pro His Gly Leu Val Asp Cys Asn Trp Leu
35 40 45
Phe Leu Lys Ser Val Pro Arg Phe Ser Ala Ala Ala Ser Cys Ser Asn
50 55 60
Ile Thr Arg Leu Ser Leu Ile Ser Asn Arg Ile His His Leu His Asn
65 70 75 80
Ser Asp Phe Val His Leu Ser Asn Leu Arg Gln Leu Asn Leu Lys Trp
85 90 95
Asn Cys Pro Pro Thr Gly Leu Ser Pro Leu His Phe Ser Cys His Met
100 105 110
Thr Ile Glu Pro Arg Thr Phe Leu Ala Met Arg Thr Leu Glu Glu Leu
115 120 125
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130 135 140
Leu Val Asn Leu Ser Leu Ser His Thr Asn Ile Leu Val Leu Asp Ala
145 150 155 160
Asn Ser Leu Ala Gly Leu Tyr Ser Leu Arg Val Leu Phe Met Asp Gly
165 170 175
Asn Cys Tyr Tyr Lys Asn Pro Cys Thr Gly Ala Val Lys Val Thr Pro
180 185 190
Gly Ala Leu Leu Gly Leu Ser Asn Leu Thr His Leu Ser Leu Lys Tyr
195 200 205
Asn Asn Leu Thr Lys Val Pro Arg Gln Leu Pro Pro Ser Leu Glu Tyr
210 215 220
Leu Leu Val Ser Tyr Asn Leu Ile Val Lys Leu Gly Pro Glu Asp Leu
225 230 235 240
Ala Asn Leu Thr Ser Leu Arg Val Leu Asp Val Gly Gly Asn Cys Arg
245 250 255
Arg Cys Asp His Ala Pro Asn Pro Cys Ile Glu Cys Gly Gln Lys Ser
260 265 270
Leu His Leu His Pro Glu Thr Phe His His Leu Ser His Leu Glu Gly
275 280 285
Leu Val Leu Lys Asp Ser Ser Leu His Thr Leu Asn Ser Ser Trp Phe
290 295 300
Gln Gly Leu Val Asn Leu Ser Val Leu Asp Leu Ser Glu Asn Phe Leu
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Tyr Glu Ser Ile Thr His Thr Asn Ala Phe Gln Asn Leu Thr Arg Leu
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Arg Lys Leu Asn Leu Ser Phe Asn Tyr Arg Lys Lys Val Ser Phe Ala
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Arg Leu His Leu Ala Ser Ser Phe Lys Asn Leu Val Ser Leu Gln Glu
355 360 365
Leu Asn Met Asn Gly Ile Phe Phe Arg Leu Leu Asn Lys Tyr Thr Leu
370 375 380
Arg Trp Leu Ala Asp Leu Pro Lys Leu His Thr Leu His Leu Gln Met
385 390 395 400
Asn Phe Ile Asn Gln Ala Gln Leu Ser Ile Phe Gly Thr Phe Arg Ala
405 410 415
Leu Arg Phe Val Asp Leu Ser Asp Asn Arg Ile Ser Gly Pro Ser Thr
420 425 430
Leu Ser Glu Ala Thr Pro Glu Glu Ala Asp Asp Ala Glu Gln Glu Glu
435 440 445
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450 455 460
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465 470 475 480
Ser Arg Asn Asn Leu Val Thr Ile Lys Pro Glu Met Phe Val Asn Leu
485 490 495
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500 505 510
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Leu Pro Gln Leu Gln Ala Leu Asp Leu Ser Tyr Asn Ser Gln Pro Phe
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Ser Met Lys Gly Ile Gly His Asn Phe Ser Phe Val Thr His Leu Ser
565 570 575
Met Leu Gln Ser Leu Ser Leu Ala His Asn Asp Ile His Thr Arg Val
580 585 590
Ser Ser His Leu Asn Ser Asn Ser Val Arg Phe Leu Asp Phe Ser Gly
595 600 605
Asn Gly Met Gly Arg Met Trp Asp Glu Gly Gly Leu Tyr Leu His Phe
610 615 620
Phe Gln Gly Leu Ser Gly Leu Leu Lys Leu Asp Leu Ser Gln Asn Asn
625 630 635 640
Leu His Ile Leu Arg Pro Gln Asn Leu Asp Asn Leu Pro Lys Ser Leu
645 650 655
Lys Leu Leu Ser Leu Arg Asp Asn Tyr Leu Ser Phe Phe Asn Trp Thr
660 665 670
Ser Leu Ser Phe Leu Pro Asn Leu Glu Val Leu Asp Leu Ala Gly Asn
675 680 685
Gln Leu Lys Ala Leu Thr Asn Gly Thr Leu Pro Asn Gly Thr Leu Leu
690 695 700
Gln Lys Leu Asp Val Ser Ser Asn Ser Ile Val Ser Val Val Pro Ala
705 710 715 720
Phe Phe Ala Leu Ala Val Glu Leu Lys Glu Val Asn Leu Ser His Asn
725 730 735
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Leu Thr Val Leu Asp Val Arg Ser Asn Pro Leu His Cys Ala Cys Gly
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770 775 780
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Trp Asp Cys Phe Gly Leu Ser Leu Leu Ala Val Ala Val Gly Met Val
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Val Pro Ile Leu His His Leu Cys Gly Trp Asp Val Trp Tyr Cys Phe
835 840 845
His Leu Cys Leu Ala Trp Leu Pro Leu Leu Ala Arg Ser Arg Arg Ser
850 855 860
Ala Gln Thr Leu Pro Tyr Asp Ala Phe Val Val Phe Asp Lys Ala Gln
865 870 875 880
Ser Ala Val Ala Asp Trp Val Tyr Asn Glu Leu Arg Val Arg Leu Glu
885 890 895
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Gly Ser Arg Lys Thr Leu Phe Val Leu Ala His Thr Asp Arg Val Ser
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Gly Leu Leu Arg Thr Ser Phe Leu Leu Ala Gln Gln Arg Leu Leu Glu
945 950 955 960
Asp Arg Lys Asp Val Val Val Leu Val Ile Leu Arg Pro Asp Ala His
965 970 975
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Leu Phe Trp Pro Gln Gln Pro Asn Gly Gln Gly Gly Phe Trp Ala Gln
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<210> 3
<211> 3922
<212> DNA/RNA
<213> 人(human)
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ggaggtcttg tttccggaag atgttgcaag gctgtggtga aggcaggtgc agcctagcct 60
cctgctcaag ctacaccctg gccctccacg catgaggccc tgcagaactc tggagatggt 120
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gcaggagcca agacctgagg gtggaagtgt cctcttagaa tggggagtgc ccagcaaggt 240
gtacccgcta ctggtgctat ccagaattcc catctctccc tgctctctgc ctgagctctg 300
ggccttagct cctccctggg cttggtagag gacaggtgtg aggccctcat gggatgtagg 360
ctgtctgaga ggggagtgga aagaggaagg ggtgaaggag ctgtctgcca tttgactatg 420
caaatggcct ttgactcatg ggaccctgtc ctcctcactg ggggcagggt ggagtggagg 480
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ctgtgggaag ggacctcgag tgtgaagcat ccttccctgt agctgctgtc cagtctgccc 600
gccagaccct ctggagaagc ccctgccccc cagcatgggt ttctgccgca gcgccctgca 660
cccgctgtct ctcctggtgc aggccatcat gctggccatg accctggccc tgggtacctt 720
gcctgccttc ctaccctgtg agctccagcc ccacggcctg gtgaactgca actggctgtt 780
cctgaagtct gtgccccact tctccatggc agcaccccgt ggcaatgtca ccagcctttc 840
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ctgccacatg accatcgagc ccagcacctt cttggctgtg cccaccctgg aagagctaaa 1020
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cctcagccat accaacatcc tgatgctaga ctctgccagc ctcgccggcc tgcatgccct 1140
gcgcttccta ttcatggacg gcaactgtta ttacaagaac ccctgcaggc aggcactgga 1200
ggtggccccg ggtgccctcc ttggcctggg caacctcacc cacctgtcac tcaagtacaa 1260
caacctcact gtggtgcccc gcaacctgcc ttccagcctg gagtatctgc tgttgtccta 1320
caaccgcatc gtcaaactgg cgcctgagga cctggccaat ctgaccgccc tgcgtgtgct 1380
cgatgtgggc ggaaattgcc gccgctgcga ccacgctccc aacccctgca tggagtgccc 1440
tcgtcacttc ccccagctac atcccgatac cttcagccac ctgagccgtc ttgaaggcct 1500
ggtgttgaag gacagttctc tctcctggct gaatgccagt tggttccgtg ggctgggaaa 1560
cctccgagtg ctggacctga gtgagaactt cctctacaaa tgcatcacta aaaccaaggc 1620
cttccagggc ctaacacagc tgcgcaagct taacctgtcc ttcaattacc aaaagagggt 1680
gtcctttgcc cacctgtctc tggccccttc cttcgggagc ctggtcgccc tgaaggagct 1740
ggacatgcac ggcatcttct tccgctcact cgatgagacc acgctccggc cactggcccg 1800
cctgcccatg ctccagactc tgcgtctgca gatgaacttc atcaaccagg cccagctcgg 1860
catcttcagg gccttccctg gcctgcgcta cgtggacctg tcggacaacc gcatcagcgg 1920
agcttcggag ctgacagcca ccatggggga ggcagatgga ggggagaagg tctggctgca 1980
gcctggggac cttgctccgg ccccagtgga cactcccagc tctgaagact tcaggcccaa 2040
ctgcagcacc ctcaacttca ccttggatct gtcacggaac aacctggtga ccgtgcagcc 2100
ggagatgttt gcccagctct cgcacctgca gtgcctgcgc ctgagccaca actgcatctc 2160
gcaggcagtc aatggctccc agttcctgcc gctgaccggt ctgcaggtgc tagacctgtc 2220
ccacaataag ctggacctct accacgagca ctcattcacg gagctaccgc gactggaggc 2280
cctggacctc agctacaaca gccagccctt tggcatgcag ggcgtgggcc acaacttcag 2340
cttcgtggct cacctgcgca ccctgcgcca cctcagcctg gcccacaaca acatccacag 2400
ccaagtgtcc cagcagctct gcagtacgtc gctgcgggcc ctggacttca gcggcaatgc 2460
actgggccat atgtgggccg agggagacct ctatctgcac ttcttccaag gcctgagcgg 2520
tttgatctgg ctggacttgt cccagaaccg cctgcacacc ctcctgcccc aaaccctgcg 2580
caacctcccc aagagcctac aggtgctgcg tctccgtgac aattacctgg ccttctttaa 2640
gtggtggagc ctccacttcc tgcccaaact ggaagtcctc gacctggcag gaaaccagct 2700
gaaggccctg accaatggca gcctgcctgc tggcacccgg ctccggaggc tggatgtcag 2760
ctgcaacagc atcagcttcg tggcccccgg cttcttttcc aaggccaagg agctgcgaga 2820
gctcaacctt agcgccaacg ccctcaagac agtggaccac tcctggtttg ggcccctggc 2880
gagtgccctg caaatactag atgtaagcgc caaccctctg cactgcgcct gtggggcggc 2940
ctttatggac ttcctgctgg aggtgcaggc tgccgtgccc ggtctgccca gccgggtgaa 3000
gtgtggcagt ccgggccagc tccagggcct cagcatcttt gcacaggacc tgcgcctctg 3060
cctggatgag gccctctcct gggactgttt cgccctctcg ctgctggctg tggctctggg 3120
cctgggtgtg cccatgctgc atcacctctg tggctgggac ctctggtact gcttccacct 3180
gtgcctggcc tggcttccct ggcgggggcg gcaaagtggg cgagatgagg atgccctgcc 3240
ctacgatgcc ttcgtggtct tcgacaaaac gcagagcgca gtggcagact gggtgtacaa 3300
cgagcttcgg gggcagctgg aggagtgccg tgggcgctgg gcactccgcc tgtgcctgga 3360
ggaacgcgac tggctgcctg gcaaaaccct ctttgagaac ctgtgggcct cggtctatgg 3420
cagccgcaag acgctgtttg tgctggccca cacggaccgg gtcagtggtc tcttgcgcgc 3480
cagcttcctg ctggcccagc agcgcctgct ggaggaccgc aaggacgtcg tggtgctggt 3540
gatcctgagc cctgacggcc gccgctcccg ctacgtgcgg ctgcgccagc gcctctgccg 3600
ccagagtgtc ctcctctggc cccaccagcc cagtggtcag cgcagcttct gggcccagct 3660
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cacggccgaa tagccgtgag ccggaatcct gcacggtgcc acctccacac tcacctcacc 3780
tctgcctgcc tggtctgacc ctcccctgct cgcctccctc accccacacc tgacacagag 3840
caggcactca ataaatgcta ccgaaggcta aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 3900
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aa 3922
<210> 4
<211> 1032
<212> PRT
<213> 人(human)
<400> 4
Met Gly Phe Cys Arg Ser Ala Leu His Pro Leu Ser Leu Leu Val Gln
1 5 10 15
Ala Ile Met Leu Ala Met Thr Leu Ala Leu Gly Thr Leu Pro Ala Phe
20 25 30
Leu Pro Cys Glu Leu Gln Pro His Gly Leu Val Asn Cys Asn Trp Leu
35 40 45
Phe Leu Lys Ser Val Pro His Phe Ser Met Ala Ala Pro Arg Gly Asn
50 55 60
Val Thr Ser Leu Ser Leu Ser Ser Asn Arg Ile His His Leu His Asp
65 70 75 80
Ser Asp Phe Ala His Leu Pro Ser Leu Arg His Leu Asn Leu Lys Trp
85 90 95
Asn Cys Pro Pro Val Gly Leu Ser Pro Met His Phe Pro Cys His Met
100 105 110
Thr Ile Glu Pro Ser Thr Phe Leu Ala Val Pro Thr Leu Glu Glu Leu
115 120 125
Asn Leu Ser Tyr Asn Asn Ile Met Thr Val Pro Ala Leu Pro Lys Ser
130 135 140
Leu Ile Ser Leu Ser Leu Ser His Thr Asn Ile Leu Met Leu Asp Ser
145 150 155 160
Ala Ser Leu Ala Gly Leu His Ala Leu Arg Phe Leu Phe Met Asp Gly
165 170 175
Asn Cys Tyr Tyr Lys Asn Pro Cys Arg Gln Ala Leu Glu Val Ala Pro
180 185 190
Gly Ala Leu Leu Gly Leu Gly Asn Leu Thr His Leu Ser Leu Lys Tyr
195 200 205
Asn Asn Leu Thr Val Val Pro Arg Asn Leu Pro Ser Ser Leu Glu Tyr
210 215 220
Leu Leu Leu Ser Tyr Asn Arg Ile Val Lys Leu Ala Pro Glu Asp Leu
225 230 235 240
Ala Asn Leu Thr Ala Leu Arg Val Leu Asp Val Gly Gly Asn Cys Arg
245 250 255
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260 265 270
Pro Gln Leu His Pro Asp Thr Phe Ser His Leu Ser Arg Leu Glu Gly
275 280 285
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290 295 300
Arg Gly Leu Gly Asn Leu Arg Val Leu Asp Leu Ser Glu Asn Phe Leu
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Tyr Lys Cys Ile Thr Lys Thr Lys Ala Phe Gln Gly Leu Thr Gln Leu
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355 360 365
Leu Asp Met His Gly Ile Phe Phe Arg Ser Leu Asp Glu Thr Thr Leu
370 375 380
Arg Pro Leu Ala Arg Leu Pro Met Leu Gln Thr Leu Arg Leu Gln Met
385 390 395 400
Asn Phe Ile Asn Gln Ala Gln Leu Gly Ile Phe Arg Ala Phe Pro Gly
405 410 415
Leu Arg Tyr Val Asp Leu Ser Asp Asn Arg Ile Ser Gly Ala Ser Glu
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Leu Thr Ala Thr Met Gly Glu Ala Asp Gly Gly Glu Lys Val Trp Leu
435 440 445
Gln Pro Gly Asp Leu Ala Pro Ala Pro Val Asp Thr Pro Ser Ser Glu
450 455 460
Asp Phe Arg Pro Asn Cys Ser Thr Leu Asn Phe Thr Leu Asp Leu Ser
465 470 475 480
Arg Asn Asn Leu Val Thr Val Gln Pro Glu Met Phe Ala Gln Leu Ser
485 490 495
His Leu Gln Cys Leu Arg Leu Ser His Asn Cys Ile Ser Gln Ala Val
500 505 510
Asn Gly Ser Gln Phe Leu Pro Leu Thr Gly Leu Gln Val Leu Asp Leu
515 520 525
Ser His Asn Lys Leu Asp Leu Tyr His Glu His Ser Phe Thr Glu Leu
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Leu Arg His Leu Ser Leu Ala His Asn Asn Ile His Ser Gln Val Ser
580 585 590
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595 600 605
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675 680 685
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705 710 715 720
Phe Ser Lys Ala Lys Glu Leu Arg Glu Leu Asn Leu Ser Ala Asn Ala
725 730 735
Leu Lys Thr Val Asp His Ser Trp Phe Gly Pro Leu Ala Ser Ala Leu
740 745 750
Gln Ile Leu Asp Val Ser Ala Asn Pro Leu His Cys Ala Cys Gly Ala
755 760 765
Ala Phe Met Asp Phe Leu Leu Glu Val Gln Ala Ala Val Pro Gly Leu
770 775 780
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785 790 795 800
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850 855 860
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885 890 895
Glu Cys Arg Gly Arg Trp Ala Leu Arg Leu Cys Leu Glu Glu Arg Asp
900 905 910
Trp Leu Pro Gly Lys Thr Leu Phe Glu Asn Leu Trp Ala Ser Val Tyr
915 920 925
Gly Ser Arg Lys Thr Leu Phe Val Leu Ala His Thr Asp Arg Val Ser
930 935 940
Gly Leu Leu Arg Ala Ser Phe Leu Leu Ala Gln Gln Arg Leu Leu Glu
945 950 955 960
Asp Arg Lys Asp Val Val Val Leu Val Ile Leu Ser Pro Asp Gly Arg
965 970 975
Arg Ser Arg Tyr Val Arg Leu Arg Gln Arg Leu Cys Arg Gln Ser Val
980 985 990
Leu Leu Trp Pro His Gln Pro Ser Gly Gln Arg Ser Phe Trp Ala Gln
995 1000 1005
Leu Gly Met Ala Leu Thr Arg Asp Asn His His Phe Tyr Asn Arg Asn
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Phe Cys Gln Gly Pro Thr Ala Glu
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<210> 5
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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ttcagcagca agtctcagag gctgaaaaca ttttagacct agacaagaag attgtaaaga 240
ggctagaagc ttccgggact aggcctaggt tagcagatgg gcaggcagta aatcctctaa 300
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agaatgaaag tatttgaaca gaggctactg gagagatgac tcagcagtta agagcactgg 420
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gaggtactta gacatacatg caggcaacac acacgtatgc acacacacat atgtatttcc 600
atatatttgt gcacctatat ggagagagtg tgtcttagtt agggttttac tgctgtgaac 660
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ttcagaggtt cagtccataa tcatcaagac aggagcatgg catcatctag gcaggcatgg 780
tgcagaggag ctgagagttc tacatctgaa ggctgctagt ggaagactga cttccagaca 840
actaggatga aagtcttaaa gcccatgccc acagggccat agcttctaat agtgccactc 900
cctgggccaa gcatatacaa accatcacag agagagagaa aggtttgaac aagcctttcc 960
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gggagtctag attagagatg atgtcagctc aggcagcagg tggataggca ggttgtgagc 1080
agtgggcagt ttctaaaggg acagaatcag ggcttaatgt ctctccaggg tctctggggc 1140
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<210> 6
<211> 4479
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 6
caaggagctg agagccagag gagagtcaaa ggtgtgttca accttgtgtg tgtgtgtgtg 60
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gcgcaccaca cccacccttt tcccgtgggt tttcggaatc agattcagct tgtcacgcct 420
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catgacaaat attgtcacct acatgacata gttcatattt gacatctgtg taatgggtta 540
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ttccatgcac ttatctctta gacctgcttt aaactcagcc tgaggcccac ttgcttcttt 840
ctgcctgctg ggattaaaga tatgggacta ccactccaga ttttgttttt aaatttttaa 900
gttgcattta ttttgtaagt atgtatggag agggcgtgtc caagtgccag gactggattg 960
tggcagtcac aggacaaagg aatcagctct ttcaacattc caggcgcaga gattgaactc 1020
gctggagagg aagataagtt ccaggaaagg agtttccctg ttccccgaac ctcaaccatt 1080
gtgcagaagt tggaatgctg caggtccgga acctaattaa aatttatctt aggctgcggt 1140
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aaggtgcctg gacttgtagt gttttgtttt gttttttgct tttcaagaca gggtttcaca 1380
atatagctct ggctgccctg gatctcactg tgtagaccag gctgacctcc aactcacaga 1440
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actgcctggc ctccactatt ctacttgtga tttttgttgt tgttgttgtt ctattactac 1680
ccaaaaaaaa aaaaattcat caaattgtta ccacattgga acacggagtt tgaagtaatc 1740
taatctgtgt tcctggaaca tggtcacttg gatttggctg cagaataaac taccttttat 1800
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agaagaagaa gaagaagaag aagaagaagc ccatagcatt ggggtcagga ggcctgaacc 2820
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ggtcctcatg cttgcaagac atttatttta ctgagctatg ccccctgctg gtctactaag 3720
gttttttaac aactcagcct ttctcttggc actttgtgtc ctgaacatct aaacattctt 3780
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ctttcctcag tgcacctatt ctgcctaagg gatttggatg cccttgggac ccccttccat 4440
tcaatcagta catgttttat cagcatccac tgaatcctg 4479
<210> 7
<211> 2379
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 7
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<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 9
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attctctaga aagtatagga ac 82
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<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 10
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<210> 11
<211> 3468
<212> DNA/RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 11
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cccagtttgt cagagggagc ctcgggagaa tcctccatct cccaacatgg ttctccgtcg 120
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cctgggtacc ttgcctgcct tcctaccctg tgagctccag ccccacggcc tggtgaactg 240
caactggctg ttcctgaagt ctgtgcccca cttctccatg gcagcacccc gtggcaatgt 300
caccagcctt tccttgtcct ccaaccgcat ccaccacctc catgattctg actttgccca 360
cctgcccagc ctgcggcatc tcaacctcaa gtggaactgc ccgccggttg gcctcagccc 420
catgcacttc ccctgccaca tgaccatcga gcccagcacc ttcttggctg tgcccaccct 480
ggaagagcta aacctgagct acaacaacat catgactgtg cctgcgctgc ccaaatccct 540
catatccctg tccctcagcc ataccaacat cctgatgcta gactctgcca gcctcgccgg 600
cctgcatgcc ctgcgcttcc tattcatgga cggcaactgt tattacaaga acccctgcag 660
gcaggcactg gaggtggccc cgggtgccct ccttggcctg ggcaacctca cccacctgtc 720
actcaagtac aacaacctca ctgtggtgcc ccgcaacctg ccttccagcc tggagtatct 780
gctgttgtcc tacaaccgca tcgtcaaact ggcgcctgag gacctggcca atctgaccgc 840
cctgcgtgtg ctcgatgtgg gcggaaattg ccgccgctgc gaccacgctc ccaacccctg 900
catggagtgc cctcgtcact tcccccagct acatcccgat accttcagcc acctgagccg 960
tcttgaaggc ctggtgttga aggacagttc tctctcctgg ctgaatgcca gttggttccg 1020
tgggctggga aacctccgag tgctggacct gagtgagaac ttcctctaca aatgcatcac 1080
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ccaaaagagg gtgtcctttg cccacctgtc tctggcccct tccttcggga gcctggtcgc 1200
cctgaaggag ctggacatgc acggcatctt cttccgctca ctcgatgaga ccacgctccg 1260
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caactgcatc tcgcaggcag tcaatggctc ccagttcctg ccgctgaccg gtctgcaggt 1680
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cagcggcaat gcactgggcc atatgtgggc cgagggagac ctctatctgc acttcttcca 1980
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ccaaaccctg cgcaacctcc ccaagagcct acaggtgctg cgtctccgtg acaattacct 2100
ggccttcttt aagtggtgga gcctccactt cctgcccaaa ctggaagtcc tcgacctggc 2160
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gctggatgtc agctgcaaca gcatcagctt cgtggccccc ggcttctttt ccaaggccaa 2280
ggagctgcga gagctcaacc ttagcgccaa cgccctcaag acagtggacc actcctggtt 2340
tgggcccctg gcgagtgccc tgcaaatact agatgtaagc gccaaccctc tgcactgcgc 2400
ctgtggggcg gcctttatgg acttcctgct ggaggtgcag gctgccgtgc ccggtctgcc 2460
cagccgggtg aagtgtggca gtccgggcca gctccagggc ctcagcatct ttgcacagga 2520
cctgcgcctc tgcctggatg aggccctctc ctgggactgt tttggccttt cactcttggc 2580
tgtggccgtg ggcatggtgg tgcctatact gcaccatctc tgcggctggg acgtctggta 2640
ctgttttcat ctgtgcctgg catggctacc tttgctagcc cgcagccgac gcagcgccca 2700
aactctccct tatgatgcct tcgtggtgtt cgataaggca cagagcgcag ttgccgactg 2760
ggtgtataac gagctgcggg tgcggctgga ggagcggcgc ggccgccgag ccctacgctt 2820
gtgtctggag gaccgagatt ggctgcctgg ccagacgctc ttcgagaacc tctgggcttc 2880
catctatggg agccgcaaga ctctatttgt gctggcccac acggaccgcg tcagtggcct 2940
cctgcgcacc agcttcctgc tggctcagca gcgcctgttg gaagaccgca aggacgtggt 3000
ggtgttggtg atcctgcgtc cggatgccca ccgctcccgc tatgtgcgac tgcgccagcg 3060
tctctgccgc cagagtgtgc tcttctggcc ccagcagccc aacgggcagg ggggcttctg 3120
ggcccagctg agtacagccc tgactaggga caaccgccac ttctataacc agaacttctg 3180
ccggggacct acagcagaat agctcagagc aacagctgga aacagctgca tcttcatgtc 3240
tggttcccga gttgctctgc ctgccttgct ctgtcttact acaccgctat ttggcaagtg 3300
cgcaatatat gctaccaagc caccaggccc acggagcaaa ggttggctgt aaagggtagt 3360
tttcttccca tgcatctttc aggagagtga agatagacac caaacccaca cagaacagga 3420
ctggagttca ttctctgccc ctccaccccc ctttgtctgt ctctgtat 3468
<210> 12
<211> 1031
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 12
Met Val Leu Arg Arg Arg Thr Leu His Pro Leu Ser Leu Leu Val Gln
1 5 10 15
Ala Ala Val Leu Ala Glu Thr Leu Ala Leu Gly Thr Leu Pro Ala Phe
20 25 30
Leu Pro Cys Glu Leu Gln Pro His Gly Leu Val Asn Cys Asn Trp Leu
35 40 45
Phe Leu Lys Ser Val Pro His Phe Ser Met Ala Ala Pro Arg Gly Asn
50 55 60
Val Thr Ser Leu Ser Leu Ser Ser Asn Arg Ile His His Leu His Asp
65 70 75 80
Ser Asp Phe Ala His Leu Pro Ser Leu Arg His Leu Asn Leu Lys Trp
85 90 95
Asn Cys Pro Pro Val Gly Leu Ser Pro Met His Phe Pro Cys His Met
100 105 110
Thr Ile Glu Pro Ser Thr Phe Leu Ala Val Pro Thr Leu Glu Glu Leu
115 120 125
Asn Leu Ser Tyr Asn Asn Ile Met Thr Val Pro Ala Leu Pro Lys Ser
130 135 140
Leu Ile Ser Leu Ser Leu Ser His Thr Asn Ile Leu Met Leu Asp Ser
145 150 155 160
Ala Ser Leu Ala Gly Leu His Ala Leu Arg Phe Leu Phe Met Asp Gly
165 170 175
Asn Cys Tyr Tyr Lys Asn Pro Cys Arg Gln Ala Leu Glu Val Ala Pro
180 185 190
Gly Ala Leu Leu Gly Leu Gly Asn Leu Thr His Leu Ser Leu Lys Tyr
195 200 205
Asn Asn Leu Thr Val Val Pro Arg Asn Leu Pro Ser Ser Leu Glu Tyr
210 215 220
Leu Leu Leu Ser Tyr Asn Arg Ile Val Lys Leu Ala Pro Glu Asp Leu
225 230 235 240
Ala Asn Leu Thr Ala Leu Arg Val Leu Asp Val Gly Gly Asn Cys Arg
245 250 255
Arg Cys Asp His Ala Pro Asn Pro Cys Met Glu Cys Pro Arg His Phe
260 265 270
Pro Gln Leu His Pro Asp Thr Phe Ser His Leu Ser Arg Leu Glu Gly
275 280 285
Leu Val Leu Lys Asp Ser Ser Leu Ser Trp Leu Asn Ala Ser Trp Phe
290 295 300
Arg Gly Leu Gly Asn Leu Arg Val Leu Asp Leu Ser Glu Asn Phe Leu
305 310 315 320
Tyr Lys Cys Ile Thr Lys Thr Lys Ala Phe Gln Gly Leu Thr Gln Leu
325 330 335
Arg Lys Leu Asn Leu Ser Phe Asn Tyr Gln Lys Arg Val Ser Phe Ala
340 345 350
His Leu Ser Leu Ala Pro Ser Phe Gly Ser Leu Val Ala Leu Lys Glu
355 360 365
Leu Asp Met His Gly Ile Phe Phe Arg Ser Leu Asp Glu Thr Thr Leu
370 375 380
Arg Pro Leu Ala Arg Leu Pro Met Leu Gln Thr Leu Arg Leu Gln Met
385 390 395 400
Asn Phe Ile Asn Gln Ala Gln Leu Gly Ile Phe Arg Ala Phe Pro Gly
405 410 415
Leu Arg Tyr Val Asp Leu Ser Asp Asn Arg Ile Ser Gly Ala Ser Glu
420 425 430
Leu Thr Ala Thr Met Gly Glu Ala Asp Gly Gly Glu Lys Val Trp Leu
435 440 445
Gln Pro Gly Asp Leu Ala Pro Ala Pro Val Asp Thr Pro Ser Ser Glu
450 455 460
Asp Phe Arg Pro Asn Cys Ser Thr Leu Asn Phe Thr Leu Asp Leu Ser
465 470 475 480
Arg Asn Asn Leu Val Thr Val Gln Pro Glu Met Phe Ala Gln Leu Ser
485 490 495
His Leu Gln Cys Leu Arg Leu Ser His Asn Cys Ile Ser Gln Ala Val
500 505 510
Asn Gly Ser Gln Phe Leu Pro Leu Thr Gly Leu Gln Val Leu Asp Leu
515 520 525
Ser His Asn Lys Leu Asp Leu Tyr His Glu His Ser Phe Thr Glu Leu
530 535 540
Pro Arg Leu Glu Ala Leu Asp Leu Ser Tyr Asn Ser Gln Pro Phe Gly
545 550 555 560
Met Gln Gly Val Gly His Asn Phe Ser Phe Val Ala His Leu Arg Thr
565 570 575
Leu Arg His Leu Ser Leu Ala His Asn Asn Ile His Ser Gln Val Ser
580 585 590
Gln Gln Leu Cys Ser Thr Ser Leu Arg Ala Leu Asp Phe Ser Gly Asn
595 600 605
Ala Leu Gly His Met Trp Ala Glu Gly Asp Leu Tyr Leu His Phe Phe
610 615 620
Gln Gly Leu Ser Gly Leu Ile Trp Leu Asp Leu Ser Gln Asn Arg Leu
625 630 635 640
His Thr Leu Leu Pro Gln Thr Leu Arg Asn Leu Pro Lys Ser Leu Gln
645 650 655
Val Leu Arg Leu Arg Asp Asn Tyr Leu Ala Phe Phe Lys Trp Trp Ser
660 665 670
Leu His Phe Leu Pro Lys Leu Glu Val Leu Asp Leu Ala Gly Asn Gln
675 680 685
Leu Lys Ala Leu Thr Asn Gly Ser Leu Pro Ala Gly Thr Arg Leu Arg
690 695 700
Arg Leu Asp Val Ser Cys Asn Ser Ile Ser Phe Val Ala Pro Gly Phe
705 710 715 720
Phe Ser Lys Ala Lys Glu Leu Arg Glu Leu Asn Leu Ser Ala Asn Ala
725 730 735
Leu Lys Thr Val Asp His Ser Trp Phe Gly Pro Leu Ala Ser Ala Leu
740 745 750
Gln Ile Leu Asp Val Ser Ala Asn Pro Leu His Cys Ala Cys Gly Ala
755 760 765
Ala Phe Met Asp Phe Leu Leu Glu Val Gln Ala Ala Val Pro Gly Leu
770 775 780
Pro Ser Arg Val Lys Cys Gly Ser Pro Gly Gln Leu Gln Gly Leu Ser
785 790 795 800
Ile Phe Ala Gln Asp Leu Arg Leu Cys Leu Asp Glu Ala Leu Ser Trp
805 810 815
Asp Cys Phe Gly Leu Ser Leu Leu Ala Val Ala Val Gly Met Val Val
820 825 830
Pro Ile Leu His His Leu Cys Gly Trp Asp Val Trp Tyr Cys Phe His
835 840 845
Leu Cys Leu Ala Trp Leu Pro Leu Leu Ala Arg Ser Arg Arg Ser Ala
850 855 860
Gln Thr Leu Pro Tyr Asp Ala Phe Val Val Phe Asp Lys Ala Gln Ser
865 870 875 880
Ala Val Ala Asp Trp Val Tyr Asn Glu Leu Arg Val Arg Leu Glu Glu
885 890 895
Arg Arg Gly Arg Arg Ala Leu Arg Leu Cys Leu Glu Asp Arg Asp Trp
900 905 910
Leu Pro Gly Gln Thr Leu Phe Glu Asn Leu Trp Ala Ser Ile Tyr Gly
915 920 925
Ser Arg Lys Thr Leu Phe Val Leu Ala His Thr Asp Arg Val Ser Gly
930 935 940
Leu Leu Arg Thr Ser Phe Leu Leu Ala Gln Gln Arg Leu Leu Glu Asp
945 950 955 960
Arg Lys Asp Val Val Val Leu Val Ile Leu Arg Pro Asp Ala His Arg
965 970 975
Ser Arg Tyr Val Arg Leu Arg Gln Arg Leu Cys Arg Gln Ser Val Leu
980 985 990
Phe Trp Pro Gln Gln Pro Asn Gly Gln Gly Gly Phe Trp Ala Gln Leu
995 1000 1005
Ser Thr Ala Leu Thr Arg Asp Asn Arg His Phe Tyr Asn Gln Asn Phe
1010 1015 1020
Cys Arg Gly Pro Thr Ala Glu
1025 1030
<210> 13
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 13
gctcgactag agcttgcgga 20
<210> 14
<211> 24
<212> DNA/RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 14
ccctgttgta acatggcttt gacg 24
<210> 15
<211> 25
<212> DNA/RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 15
gttgacagac taggataggc ccaac 25
<210> 16
<211> 20
<212> DNA/RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 16
caggcacagt catgatgttg 20
<210> 17
<211> 24
<212> DNA/RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 17
gacgaggtac atcccaagca acac 24
<210> 18
<211> 25
<212> DNA/RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 18
cacccactgt agccaaaggc ttttg 25
<210> 19
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 19
cttctgggtc tgaggcagaa gtg 23
<210> 20
<211> 24
<212> DNA/RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 20
gagaagctgc tggtcacgtg gaag 24
<210> 21
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 21
ggatcggcca ttgaacaaga tgg 23
<210> 22
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 22
cagaagaact cgtcaagaag gcg 23
<210> 23
<211> 28
<212> DNA/RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 23
tgaacctgac agttctagac gtgagaag 28
<210> 24
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 24
ccatgccagg cacagatgaa aac 23
<210> 25
<211> 22
<212> DNA/RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 25
cggcttcttt tccaaggcca ag 22
<210> 26
<211> 26
<212> DNA/RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 26
gatgaaaggc tagtttgtct ttgacc 26
<210> 27
<211> 23
<212> DNA/RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 27
cacacctttg actctcctct ggc 23
<210> 28
<211> 25
<212> DNA/RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 28
gacaagcgtt agtaggcaca tatac 25
<210> 29
<211> 24
<212> DNA/RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 29
gctccaattt cccacaacat tagt 24

Claims (13)

1.一种TLR9基因人源化的动物模型的构建方法,其特征在于,所述的动物模型体内表达人源化TLR9蛋白,且所述的动物模型内源TLR9蛋白表达降低或缺失,所述的构建方法包括在小鼠内源TLR9基因座上用人TLR9基因的序列替换小鼠TLR9基因序列,所述的构建方法包括将编码SEQ ID NO:2的26-819位所示氨基酸序列的核苷酸序列替换为编码SEQ ID NO:4的26-818位所示氨基酸序列的核苷酸序列,所述的非人动物为小鼠。
2.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述的人源化TLR9蛋白的氨基酸序列包含SEQ ID NO:12所示氨基酸序列。
3.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述的动物模型的基因组中包含SEQID NO:7所示核苷酸序列。
4.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述的动物模型的基因组中包含人源化TLR9基因,所述的人源化TLR9基因的核苷酸序列包含下列组中的任一种:
(a)SEQ ID NO:11所示核苷酸序列;或,
(b)SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9和/或SEQ ID NO:10所示核苷酸序列。
5.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述的构建方法包括将编码人TLR9蛋白胞外区的核苷酸序列可操作的连接在非人动物TLR9基因座上。
6.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述的构建方法包括使用靶向载体,所述的靶向载体包含SEQ ID NO:7的核苷酸序列;所述的靶向载体还包含5’臂和/或3’臂,所述的5’臂如SEQ ID NO:5所示,所述的3’臂序列如SEQ ID NO:6所示。
7.一种TLR9基因的靶向载体,其特征在于,所述的靶向载体包含SEQ ID NO:7,所述的靶向载体还包含5’臂和/或3’臂,所述的5’臂如SEQ ID NO:5所示,所述的3’臂序列如SEQID NO:6所示。
8.一种多基因修饰的非人动物的构建方法,其特征在于,所述的构建方法包括如下步骤:
i)采用权利要求1-6任一所述的构建方法获得的TLR9基因人源化的动物模型;
ii)将步骤i)获得的TLR9基因人源化的动物模型与其他基因修饰的非人动物交配、体外授精或直接进行基因编辑,并进行筛选,得到多基因修饰的非人动物;
所述的非人动物为小鼠。
9.根据权利要求8所述的构建方法,其特征在于,所述的其他基因修饰的非人动物包括基因CD137、LAG-3、CTLA-4、TIM-3、BTLA、4-1BB、CD27、CD28、CD47、TIGIT、GITR、OX40、PD-1或PD-L1修饰的非人动物。
10.来源于权利要求1-6任一所述的构建方法获得的TLR9基因人源化的动物模型、权利要求8-9任一所述的构建方法获得的多基因修饰的非人动物的应用,其特征在于,所述的应用为非疾病的诊断或治疗目的,所述的应用包括:
A)在需要涉及人类细胞的免疫过程的产品开发中的应用;
B)作为药理学、免疫学、微生物学、医学研究的模型系统中的应用;
C)在生产和利用动物实验疾病模型中的应用;
D)在筛选、验证、评价或研究TLR9功能、人TLR9信号机理中的应用;
E)在筛选、验证、评价或研究靶向人的药物、药效中的应用;或,
F)在筛选和评估人用药及药效研究方面的应用。
11.根据权利要求10所述的应用,其特征在于,A)中所述的涉及人类细胞的免疫过程的产品开发包括制造抗体。
12.根据权利要求10所述的应用,其特征在于,E)中所述的靶向人的药物包括靶向人的抗体。
13.根据权利要求10所述的应用,其特征在于,E)中所述的靶向人的药物包括免疫相关疾病药物、抗肿瘤或抗炎症药物。
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