CN113079138A - 一种生物信息数据在线过滤系统 - Google Patents

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颜颐欣
贾忠明
杜雪飞
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Abstract

本发明公开了一种生物信息数据在线过滤系统，可应用于网络边界，系统硬件由Xilinx公司生产的ZYNQ‑7000系列SoC配合以太网适配器、网络接口与存储器构成。ZYNQ的PL部分连接网络适配器接收链路层数据并对其进行解包，并根据PS端的输入的配置信息对网络数据包中的用户数据进行识别对比，将匹配结果发送回PS端。本系统使用外接网络接口控制器作为数据解包与对比识别的主要实现方案，具有灵活性好，处理速度快以及高度可定制的优点。ZYNQ的PS端的双核Cortex‑A9应用处理器部分嵌入Linux操作系统，使得本系统可作为一个计算机系统的从设备使用，也可以作为独立的终端工作与网络边界。

Description

一种生物信息数据在线过滤系统
技术领域
本发明涉及信息安全领域，特别是涉及网络数据在线过滤系统。
背景技术
由于人类基因组等计划顺利的实施，现有生物信息数据库中的数据量迅速膨胀，数据库的复杂程度也在不断增加。同时电子信息技术高速发展，世界各国相继建立了众多的生物信息学网络节点，提供大型数据库服务。生物科技研发的数字化是大势所趋，但新技术的便利也伴随新的风险隐患，网络生物信息安全问题随之兴起。特别是各类系统的生物信息资源集成、技术与物项的监测监管信息平台，在未来都有可能成为网络生物安全的风险点。使用高度可自定义的芯片作为主控制器在独立终端生物数据进行监控可在信息的源头扼制敏感数据的流出，提高系统的安全性。
发明内容
针对当前生物信息数据库的信息存储与明文的传输方式，本发明提供一种生物信息在线过滤系统，用于特定内网的网络边界，能够实现对特定生物信息数据的实时监测与过滤。
为了实现上述目的，本发明提供如下技术方案：
一种生物信息数据在线过滤系统，包括
数据接口，用于通过网络接收内网中传输的所有数据，供主控制器与数据过滤模块使用；
数据接口控制器，与所述数据接口直接相连，获取通过数据接口传入的数据，并与所述主控制单元相连接；
主控制单元，与数据接口控制器芯片连接，用于对实时传入的网络数据进行处理，生成网络数据检测日志并存储，并在内部的过滤功能模块中实现生物信息数据的过滤；所述的主控制单元为Xilinx公司生产的ZYNQ-7010芯片；
本地服务器，在所述的主控制单元内部的PS端搭载的Linux系统中运行，用于配置PL端网络数据过滤功能模块的行为以及将其运行状态作为日志保存；
终端，提供给用户与所述本地服务器进行交互通信，并用于实时查询所述数据过滤模块日志、查询数据过滤模块配置文件、配置工作模式或停止数据过滤模块工作。
可选地，所述的数据接口控制器与所述主控制单元连接后，所述数据接口控制器接收所述的主控制单元发送的校验码，并向所述的主控制单元发送回传码；所述主控制器分析所述回传码，并当网络数据正确传入所述数据接口控制器后，所述主控制器向所述数据接口控制器发送查询命令以获取网络数据。
可选地，所述的本地服务器包括第一查询单元、存储单元、更新单元、第二查询单元以及删除单元；
所述第一查询单元用于查询所述本地服务器中的原始配置文件是否存在变化，并当所述本地服务器中的原始文件存在变化时，跳至所述更新单元，当所述本地服务器中的原始文件未变化时，跳至所述存储单元；
所述更新单元用于停止数据过滤模块工作后覆盖本地服务器中的原始配置文件，并再次启动数据过滤模块；
所述第二查询单元用于查询所述本地服务器存储的数据过滤模块运行日志；
所述删除单元用于删除所述本地服务器中对数据过滤功能模块的配置文件并停止数据过滤模块的运行。
可选地，所述本地服务器的架构可为B/S架构或C/S架构，即提供以网页的形式操作所述数据过滤模块日志与配置文件，也可以通过串口或SSH连接至本地服务器通过命令行对所述数据过滤模块日志与配置文件进行操作。
所述数据过滤模块采用结合了PMT的BloomFilter对传入的网络数据进行过滤监测，并检出相应的敏感数据。
根据本发明提供的具体实例，本发明公开了以下技术效果：
本发明提供了一种基于ZYNQ的生物信息在线过滤系统，利用ZYNQ-7010处理器来处理数据采集模块采集的数据，在PL端实现数据过滤功能模块，在PS端提供本地服务器接受用户的交互操作，配置数据过滤模块的规则，并启用或停止数据过滤模块工作。本系统工作在网络边界，可以作为独立的终端，完全脱离计算机的控制使用，也可做为从设备配合计算机使用，具有处理速度快、性价比高、高度可配置、可定制等优点。
另外，上述敏感数据过滤规则与数据过滤日志文件也能够反馈给相关的工作人员，方便相关人士对数据流向的循证提供帮助。
附图说明
为了更清楚地说明本发明实例或现有技术中的技术方案，下面将对实例中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图仅仅是本发明的一些实例，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动性的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。
图1为本发明实例敏感数据过滤系统原理框图。
图2为本发明实例W5500嵌入式以太网控制器芯片内部框图。
图3为本发明实例W5500嵌入式以太网控制器芯片外部引脚图。
图4为本发明实例ZYNQ-7000系列芯片内部功能框图。
图5为本发明实例数据过滤模块初始化流程图。
图6为本发明实例数据过滤模块工作流程图。
图7为本发明实例网页设计流程图。
图8为本发明实例过滤日志显示界面设计流程图。
图9为本发明实例浏览器上的初始化界面图。
图10为本发明实例用户注册登录界面图。
图11为本发明实例过滤日志界面图。
图12为本发明实例系统框图。
具体实施方式
下面将结合本发明实例中的附图，对本发明实例中的技术方案进行清楚、完整地描述，需要说明的是，所描述的实例仅仅是本发明一部分实例，而不是全部的实例。基于本发明中的实例，本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实例，都属于本发明保护的范围。
为使本发明的上述目的、特征和优点能够更加明显易懂，下面结合附图和具体实施方式对本发明作进一步详细的说明。
名词解释
ZYNQ-7010，由Xilinx公司生产的ZYNQ-7000系列SoC，内部包含双核Cortex-A9应用处理器与FPGA组成的异构系统，作为主控制器，集成度高，拥有良好的的数据处理能力与网络通信能力，并可以适配完整的操作系统。
PMT，部分匹配表（Partial Match Table），过滤模块中的实现内容，部分匹配表由部分匹配值构成，部分匹配值为"前缀"和"后缀"的最长的共有元素的长度。再PL中使用片内RAM实现。
BloomFilter，布隆过滤器，过滤模块中的实现内容，使用HASH函数检索一个元素是否在一个集合中，具有良好的空间效率与时间效率。
BF，即 BloomFilter（布隆过滤器）。
主控制单元，与数据接口控制器芯片连接，用于对实时传入的网络数据进行处理，生成网络数据检测日志并存储，并在内部的过滤功能模块中实现敏感数据的过滤；所述的主控制单元为Xilinx公司生产的ZYNQ-7010芯片；
本地服务器，在所述的主控制单元内部的PS端搭载的Linux系统中运行，用于配置PL端网络数据过滤功能模块的行为以及将其运行状态作为日志保存；
终端，提供给用户与所述本地服务器进行交互通信，并用于实时查询所述数据过滤模块日志、查询数据过滤模块配置文件、配置工作模式或停止数据过滤模块工作。
数据传输过程为：数据又局域网中的特定设备通过网线传输至本系统，通过数据接口输入至数据接口控制器，主控制器通过读取数据接口控制器将网络数据传至数据过滤模块，符合规则的敏感数据经由数据过滤模块处理被丢弃并增加一条匹配记录，过滤后的不包含敏感数据的数据流被重新发往数据接口控制器经由数据接口发送到路由器。
数据过滤模块包括数据缓存FIFO、PMT、CBF系统。
数据接口控制器芯片选用WIZnet公司生产的W5500，该芯片是一款10M/100M以太网TCP/IP协议栈，工作在物理层、数据链路层、网络层、传输层，可以自动解析物理层数据并通过SPI读取。
本地服务器包括第一查询单元、存储单元、更新单元、第二查询单元以及删除单元。
第一查询单元用于查询所述本地服务器中的原始配置文件是否存在变化，并且当本地服务器中的原始文件存在变化时，跳至所述更新单元，当本地服务器中的原始文件未变化时，跳至所述存储单元。
更新单元用于停止数据过滤模块工作后覆盖本地服务器中的原始配置文件，并再次启动数据过滤模块。
第二查询单元用于查询所述本地服务器存储的数据过滤模块运行日志。
删除单元用于删除所述本地服务器中对数据过滤功能模块的配置文件并停止数据过滤模块的运行。
本地服务器的架构可为B/S架构或C/S架构，即提供以网页的形式操作所述数据过滤模块日志与配置文件，也可以通过串口或SSH连接至本地服务器通过命令行对所述数据过滤模块日志与配置文件进行操作。
配置文件设置过程：用户通过Web页面登陆至本地服务器，将在本地编辑好的配置文件通过网络传至本地服务器，服务器对比新旧配置文件是否不同，若不同则对旧配置文件进行覆盖，否则不进行操作；用户也可对配置文件进行删除，删除配置文件后，数据过滤模块自动停止工作。
终端内置包括服务器初始化部分、接受浏览器请求部分以及解析浏览器请求部分的Web服务器。
一般来说，Web服务器通常由以下几部分组成：
服务器初始化部分，这部分主要完成Web服务器的初始化工作，如建立守护进程、创建TCP套接字，绑定端口、将套接字转换成侦听套接字，进入循环结构，等待接受用户浏览器链接。
接受客户浏览器请求部分，由于客户浏览器请求以文本行的方式实现，所以Web服务器一般也以文本行为单位接受。
解析客户端请求部分，这部分工作比较复杂，需要解析出请求方法、URL目标、可选查询信息以及表单信息。如果请求方法为HEAD，则简单地响应首部即可；如果请求方法是GET，则先返回响应首部，然后将客户端请求的URL目标从Web服务器磁盘读出。发送响应信息之后，关闭与终端的链接。
终端以网页的形式显示人体健康监测数据，终端包括初始化界面、用户界面以及匹配信息以及配置界面，终端为web页面。
网页主要包含三个部分：初始化界面、用户界面以及健康数据显示界面。初始化界面为整个系统的初始界面，用户界面为用户注册登录界面，健康数据显示界面为实时显示健康数据界面。其网页设计流程如图7所示。
用户界面为一个html（超文本标记语言）表单，当用户提交用户名以及密码时，服务器会将用户名以及密码与数据库进行对比，若数据完全符合则进入下一页面，否则提醒输入错误（转到“error”页面）。其用户界面设计流程如图8所示。
健康数据显示界面：为了使数据能够实时显示，在数据显示部分单独设计一个框架，能都动态刷新服务器上的数据，一旦服务器上有新数据传输过来，网页就能够即时读取该数据并进行显示。其健康数据显示界面设计流程如图9所示。
初始界面与用户界面：打开浏览器，输入IP地址后进入本系统的初始界面。图10为PC端浏览器上显示的初始化界面，在本实例中使用的浏览器为Chrome。
在点击初始界面的进入键后，进入用户注册登录界面。图12为PC端用户注册登录界面，在该界面的左侧为用户登录模块，在该用户登录模块还提供复位按键，方面用户在输入错误信息后可以进行一键还原。在该界面的右侧为用户注册模块。
日志数据显示界面：用户在成功登陆后，进入日志数据显示界面，在该界面中显示了数据过滤模块的匹配记录。
从图11可知，匹配记录中规则字符串“abcd”匹配到了2次，规则字符串“qwer”匹配到了4次，规则字符串“fghj”匹配到了3次，规则字符串“vbnm”匹配到了0次，。从图11可知本系统基本可以做到实时过滤特定敏感数据的效果。
与现有技术相比，本发明具有以下优点：
1、本发明采用ZYNQ-7000系列SoC来搭建在线生物信息数据过滤系统，实现了对以太网控制器的控制以及数据过滤功能模块。
2、本发明搭建了本地服务器，终端可以利用SSH协议连接至服务器在字符界面查看配置文件以及数据过滤日志文件，也可以在浏览器中以网页的形式查看，真正做到机制与策略分离。
3、本发明采用外接以太网控制器（W5500芯片），在外接以太网控制器中对物理层数据进行解包与封包发送，不需要主控制器过多参与，方便高效。
4、主控制器与以太网控制器利用SPI接口进行通讯，方便、快捷。
5、本发明搭建的数据在线过滤系统操作方便、可扩展性强、价格低廉。
本说明书中各个实例采用递进的方式描述，每个实例重点说明的都是与其他实例的不同之处，各个实例之间相同相似部分互相参见即可。
本文中应用了具体个例对本发明的原理及实施方式进行了阐述，以上实例的说明只是用于帮助理解本发明的方法及其核心思想；同时，对于本领域的一般技术人员，依据本发明的思想，在具体实施方式及应用范围上均会有改变之处。综上所述，本说明书内容不应理解为对本发明的限制。

Claims (6)

1.一种生物信息数据在线过滤系统，其特征在于：包括数据接口机器控制器，用于实时接收网络数据，解包后供过滤模块使用；主控制器，与所述数据接口控制器连接，内部使用FPGA实现了数据过滤模块，用于根据配置信息对数据接口输入的数据进行过滤，对过滤结果生成记录的日志文件并存储；所述的主控制器为Xilinx公司生产的ZYNQ-7010芯片；本地服务器，运行在搭载了Linux操作系统的主控制器内部的APU中，用于接收用户提供给过滤模块的配置信息，也可对过滤模块的运行或停止进行操作；虚拟终端，用户与本地服务器使用虚拟终端进行交互，用于实时查看过滤模块记录日志。
2.根据权利要求1所述的一种生物信息数据在线过滤系统，其特征在于：使用了ZYNQ-7010、DDR、以太网适配器、网络数据接口与Linux操作系统。
3.DDR芯片容量为512MB连接在ZYNQ的PS端(APU)，以太网适配器与网络数据接口连接在ZYNQ的PL端(FPGA)，在PS端嵌入Linux操作系统对配置PL端的数据过滤模块提供配置信息。
4.根据权利要求1所述的一种生物信息数据在线过滤系统，其特征在于：所述的主处理器芯片采用Xilinx公司生产的XC7Z010CLG400-1；所述的DDR芯片选择了Micron公司生产的型号丝印为4QL77-09PZM的DDR；所述的以太网控制器选用了WIZnet公司生产的W5500芯片；所述的网络数据接口选用了型号为HR911105A的RJ45接口；所述的ZYNQ芯片中PS与PL通过芯片内部的AXI总线进行数据交换。
5.根据权利要求1所述的一种生物信息数据在线过滤系统，其特征在于：所述的本地服务器包括第一查询单元、存储单元、更新单元、第二查询单元以及删除单元；所述第一查询单元用于查询所述本地服务器中的原始配置文件是否存在变化，并当所述本地服务器中的原始文件存在变化时，跳至所述更新单元，当所述本地服务器中的原始文件未变化时，跳至所述存储单元；所述更新单元用于停止数据过滤模块工作后覆盖本地服务器中的原始配置文件，并再次启动数据过滤模块；所述第二查询单元用于查询所述本地服务器存储的数据过滤模块运行日志；所述删除单元用于删除所述本地服务器中对数据过滤功能模块的配置文件并停止数据过滤模块的运行。
6.根据权利要求1所述的一种生物信息数据在线过滤系统，其特征在于：所述的虚拟终端可使用B/S或C/S架构，供用户使用浏览器或字符终端登录使用，对过滤模块进行配置；其中，所述的过滤模块采用加入了PMT的Bloom Filter，可对数据进行高效的分组过滤。
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