CN112672827A - 两相冲洗系统和方法 - Google Patents

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Abstract

两相冲洗系统和方法。示例方法包括将阀移动到第一位置,以将包含第一试剂的第一试剂容器流体地连接到流动池,以及使来自第一试剂容器的第一试剂流到流动池,以执行生化反应。方法包括将阀移动到第二位置,以将气体流体地连接到流动池,以及使气体流入流动池中,以从流动池中排出来自生化反应的第一试剂的至少一部分。方法包括将阀移动到第三位置,以将包含缓冲试剂的缓冲试剂容器流体地连接到流动池,以及使缓冲试剂流入流动池中。

Description

两相冲洗系统和方法
背景技术
承载试剂的流体盒和流动池有时与流体系统结合使用。流体盒包括试剂流动通过的流体管线。试剂可以在冲洗操作期间使用。
发明内容
根据第一示例,方法包括(includes/comprises)将阀移动到第一位置,以将包含第一试剂的第一试剂容器流体地连接到流动池。方法包括使来自第一试剂容器的第一试剂流入流动池中,以执行生化反应。方法包括将阀移动到第二位置,以将气体流体地连接到流动池,以及使气体流到流动池,以从流动池中排出来自生化反应的第一试剂的至少一部分。方法包括将阀移动到第三位置,以将包含缓冲试剂的缓冲试剂容器流体地连接到流动池,以及使得缓冲试剂流入流动池中。方法包括将阀移动到第二位置来将气体流体地连接到流动池,以及使气体流动到流动池,以从流动池中排出缓冲试剂的至少一部分。方法包括将阀移动到第三位置,以将缓冲试剂容器流体地连接到流动池,以及使得缓冲试剂流入流动池中。方法包括将阀移动到第四位置,以将包含第二试剂的第二试剂容器流体地连接到流动池。
根据第二示例,装置包括(includes/comprises)流体盒,流体盒能够容纳在系统的盒接收器内并且被适配用于承载流动池。流体盒包括包含第一试剂的第一试剂容器和包含缓冲试剂的缓冲试剂容器、阀以及包括流体管线和入口端口的主体。入口端口被适配用于耦合到气体源。主体承载第一试剂容器、缓冲试剂容器和阀。流体管线将入口端口、第一试剂容器、缓冲试剂容器、阀和流动池流体地耦合。阀能够移动到:第一位置来将第一试剂容器流体地连接到流动池,以使来自第一试剂容器的第一试剂流入流动池中以执行生化反应;第二位置来将气体源流体地连接到流动池,以使气体流入流动池中来从流动池中排出来自生化反应的第一试剂的至少一部分;以及第三位置来将缓冲试剂容器流体地连接到流动池,以使缓冲试剂流入流动池中。
根据第三示例,装置包括系统,系统包括:阀驱动组件、盒接收器以及一个或多个处理器,一个或多个处理器被耦合到阀驱动组件。装置包括能够容纳在盒接收器内的试剂盒。试剂盒包括:试剂容器、流动池、阀以及流体管线。流体管线中的一个或多个流体管线将试剂容器、流动池和阀流体地连接。装置包括气体源。一个或多个处理器被适配用于使阀驱动组件在使试剂流到流动池的第一位置与使气体流到流动池的第二位置之间致动阀。
根据第四示例,方法包括将阀移动到第一位置,以将包含第一试剂的第一试剂容器流体地连接到流动池,以及使来自第一试剂容器的第一试剂流到流动池,以执行生化反应。方法包括将阀移动到第二位置,以将气体流体地连接到流动池,以及使气体流入流动池中,以从流动池中排出来自生化反应的第一试剂的至少一部分。方法包括将阀移动到第三位置,以将包含缓冲试剂的缓冲试剂容器流体地连接到流动池,以及使缓冲试剂流入流动池中。
根据第五示例,方法包括经由气体源来对试剂盒的一个或多个试剂容器加压。试剂盒承载流动池和流体管线。试剂容器中的一个或多个包含试剂。流体管线中的一个或多个将试剂容器和流动池流体地耦合。方法还包括使得气体和试剂迭代地且交替地流动通过试剂盒和流动池。
根据第六示例,装置包括流体盒,流体盒能够容纳在系统的盒接收器内并且被适配用于承载流动池。流体盒包括具有出口或包括出口的容器、阀以及包括流体管线和入口端口的主体。入口端口被适配用于耦合到气体源。主体承载容器和阀。流体管线将入口端口、容器、阀和流动池流体地耦合。阀能够致动来执行两相冲洗操作,以将在气体源处接收的气体中的一种气体选择性地流动到流动池,并且将流体从容器中的第一容器选择性地流动到流动池。
根据第七示例,装置包括系统,系统包括:阀驱动组件、盒接收器和一个或多个处理器。一个或多个处理器被耦合到阀驱动组件。装置还包括能够容纳在盒接收器内的试剂盒。试剂盒包括试剂容器、流动池、阀和流体管线。流体管线中的一个或多个将试剂容器、流动池和阀流体地耦合。装置包括气体源。气体源被流体地连接到阀和试剂容器,以对试剂容器加压。一个或多个处理器被适配用于使得阀驱动组件在将试剂流到流动池的第一位置和将气体流到流动池的第二位置之间将阀致动。
根据第八示例,方法包括对试剂盒的一个或多个试剂容器加压。试剂盒承载流动池并且包括试剂容器和流体管线。试剂容器包含试剂。流体管线中的一个或多个将试剂盒和流动池流体地连接。方法还包括执行试剂盒和流动池的两相冲洗操作,两相冲洗操作包括将试剂和气体之一选择性地流动通过流动池。
进一步根据前述的第一、第二、第三、第四、第五、第六、第七和/或第八示例,装置和/或方法还可以包括以下项中的任一项或多项:
根据一个示例,将阀移动到第一位置包括致动第一阀以流体地连接第一试剂容器,并且将阀移动到第二位置包括致动第二阀以将气体流体地连接到流动池。
根据另一示例,还包括对缓冲试剂容器加压。
根据另一示例,每次使气体流到流动池包括使气体流动通过基本为空的试剂容器。
根据另一示例,每次使气体流到流动池包括使得气体流动通过耦合在气体源与流动池之间的流体管线。
根据另一示例,每次使气体流到流动池包括使得气体流动通过试剂盒的歧管。试剂盒承载第一试剂容器、缓冲试剂容器以及第二试剂容器。
根据另一示例,还包括第二试剂容器,第二试剂容器包含第二试剂。流体管线将入口端口、第二试剂容器、阀和流动池流体地耦合。阀还能够移动到:第二位置以将气体源流体地连接到流动池,以使气体流入流动池中来从流动池中排出缓冲试剂的至少一部分;第三位置来将缓冲试剂容器流体地连接到流动池,以使缓冲试剂流到流动池中;以及第四位置来将第二试剂容器流体地连接到流动池。
根据另一示例,缓冲试剂容器经由气体源被加压。
根据另一示例,还包括第二试剂容器。在第二位置中并且当第二试剂容器基本不包含流体时,气体源通过第二试剂容器而被流体地连接到流动池。
根据另一示例,流体管线中的一个流体管线将入口端口与流动池直接流体地耦合。
根据另一示例,流体盒包括歧管。歧管包括入口端口,流体管线将歧管、阀和缓冲试剂容器耦合。
根据另一示例,气体源包括压缩气体盒。气体源还包括插塞和刺穿机构。歧管的接收器包括第一部分和第二部分。刺穿机构被设置在第一部分内并且被适配用于刺穿压缩气体盒以允许气体流入歧管中。插塞在第二部分附近被耦合到歧管。
根据另一示例,入口端口包括接口,接口被适配用于当流体盒被容纳在盒接收器内时,被系统密封地接合,以将入口端口和系统的气体源流体地耦合。
根据另一示例,入口端口包括从基部延伸的壁。壁具有或包括第一部分和第二部分。第一部分被耦合到基部。第二部分形成被适配用于与气体源耦合的接口。基部限定流体地耦合到容器的出口。
根据另一示例,气体源包括压缩气体盒。
根据另一示例,还包括插塞和刺穿机构。接收器包括第一部分和第二部分。刺穿机构被设置在第一部分内并且被适配用于刺穿压缩气体盒来允许气体流入歧管中。插塞在第二部分附近被耦合到歧管。
根据另一示例,主体包括容器。
根据另一示例,气体源被流体地连接到阀和试剂容器来对试剂容器加压。
根据另一示例,进一步包括第二试剂容器,并且使得气体流到流动池包括使得气体流动通过第二试剂容器,从而流到流动池。
根据另一示例,还包括调节器。调节器被耦合在气体源与试剂容器之间。
根据另一示例,试剂盒包括歧管。歧管被耦合到气体源。流体管线将歧管和试剂盒耦合。
根据另一示例,歧管包括入口端口,并且系统包括气体源。入口端口被适配用于与气体源流体地耦合。
根据另一示例,歧管包括被适配用于容纳气体源的接收器。
根据另一示例,试剂盒包含试剂。
根据另一示例,将阀移动到第一位置包括致动第一阀来流体地连接第一试剂容器,将阀移动到第二位置包括致动第二阀来将气体流体地连接到流动池,并且将阀移动至第三位置包括致动第三阀来将缓冲试剂容器流体地连接到流动池。
根据另一示例,还包括对缓冲试剂容器加压。
根据另一示例,使得气体流到流动池包括使得气体流动通过试剂盒的歧管。试剂盒承载第一试剂容器和缓冲试剂容器。
根据另一示例,使得气体流到流动池包括使得气体从压缩气体盒流动。
根据另一示例,压缩气体盒由试剂盒承载。
根据另一示例,使得气体流到流动池包括利用试剂盒的接收器内设置的刺穿机构来刺穿压缩气体盒。接收器容纳压缩气体盒。
应当理解,前述概念和以下更详细讨论的附加概念的所有组合(假设这样的概念不相互矛盾)被认为是本文所公开的发明主题的一部分。具体地,出现在本公开的结尾处的所要求保护的主题的所有组合被认为是本文所公开的发明主题的一部分。
附图说明
图1图示了根据本公开的教导的示例系统的示意图。
图2图示了根据本公开的教导的另一试剂盒的示意图。
图3图示了根据本公开的教导的另一试剂盒的示意图。
图4图示了根据本公开的教导的另一试剂盒的示意图。
图5图示了在图1的系统的盒接收器内能够容纳的示例试剂盒的示意图。
图6图示了图5的示例试剂盒的详细视图,示出了试剂盒的歧管与试剂盒的试剂容器之间的流体耦合。
图7图示了图5的示例试剂盒的试剂容器中的一个试剂容器的详细视图。
图8图示了可用于实现图5的试剂盒的备选示例歧管的示意图。
图9图示了使用图1的系统来执行冲洗操作的方法的流程图。
图10图示了使用图1的系统来执行冲洗操作的另一方法的流程图。
具体实施方式
尽管下文公开了示例方法、装置和/或制品的详细描述,但是应理解,产权的法律范围由本专利的所附的权利要求书来限定。因此,以下详细描述应仅被解释为示例,并且不描述每个可能的示例,因为即使不是不可能,但是描述每个可能的示例将是不切实际的。使用当前技术或在本专利申请日之后开发的技术,可以实现许多备选示例。可以预期这样的备选示例仍将落入权利要求的范围内。
本文所公开的示例涉及被适配用于执行两相冲洗操作的流体盒。例如,两相冲洗操作使用层流和剪切力而在合成测序(SBS)化学过程期间和/或其他流体操作期间冲洗掉污染物。所公开的示例还涉及被适配用于与流体盒对接来使得两相冲洗操作发生的流体仪器(例如,测序平台)。
在一个示例中,流体盒包括歧管,歧管被流体地耦合到一个或多个试剂容器和流动池。因此,试剂容器可以被加压。备选地,试剂容器不被加压。歧管可耦合到气体源。阀被设置在试剂容器与流动池之间,并且能够致动来使试剂流到流动池。阀也能够致动来使气体流到流动池。在一些示例中,歧管被直接耦合到阀,以允许气体选择性地流入与试剂容器分离的流动池中。在其他示例中,当(或如果)该试剂容器基本上不包含试剂时,气体被允许借助试剂容器中的一个试剂容器而选择性地流到阀。
在第一冲洗操作示例中,两相冲洗操作包括使得缓冲试剂和气体迭代地并且交替地流动通过流动池。这样的方法允许气体从流动池和/或流体管线中吹扫大量试剂,然后利用缓冲试剂(例如,洗涤缓冲液)来稀释和/或混合可能存在于试剂盒中的、未被气体吹扫或难以清洗的区域中的任何残留的先前试剂。气体和缓冲试剂的后续序列还可以吹扫和稀释任何残留的先前试剂。气体和缓冲试剂的迭代和交替流动减少了例如从流动池和/或流体管线中稀释和/或吹扫先前试剂所需的缓冲试剂体积。此外,这样的使用试剂跟随气体的方法允许试剂从系统中吹扫气泡。
在第二冲洗操作示例中,两相冲洗操作包括使得气体流动通过流动池,并且然后在无需重复以上公开的重复的情况下,使得缓冲试剂流到流动池。通过构造示例流体盒来执行两相冲洗操作,本文所公开的流体盒可以提高冲洗效率。如本文所使用的,“冲洗效率”指代在冲洗操作期间使用的缓冲试剂的量。例如,在一个示例中,冲洗效率是描述了需要多少体积的试剂来去除先前试剂的指标。因此,使用所公开的示例,在冲洗操作期间可以使用较少的试剂,同时实现例如低于约0.01%的残留浓度。在冲洗操作中使用较少的试剂可以允许流体盒承载较少的试剂,并且使其更小、重量更轻和/或生产成本更低。
图1图示了根据本公开的教导的示例系统100的示意图。系统100可以被用于对一个或多个感兴趣的样本执行分析。样本可以包括已被线性化来形成单链DNA(sstDNA)的一个或多个DNA簇。在所示的示例中,系统100被适配用于容纳试剂盒102,并且部分地包括气体源103、驱动组件104、控制器106、成像系统108和废物容器109。控制器106被电气地和/或通信地耦合到驱动组件104和成像系统108,并且被适配用于使得驱动组件104和/或成像系统108执行本文所公开的各种功能。
试剂盒102承载感兴趣的样本。在一些实现方式中,气体源103可以被用于对试剂盒102加压,并且驱动组件104与试剂盒102对接来使一个或多个试剂(例如,A、T、G、C核苷酸)流动,一个或多个试剂借助试剂盒102而与样本相互作用。气体源103可以由系统100提供和/或可以由试剂盒110承载(参见例如图8)。
在一个示例中,可逆终止子被附接至试剂,以允许单个核苷酸在每个循环中被sstDNA掺入。在一些这样的示例中,一个或多个核苷酸具有独特的荧光标签,荧光标签在被激发时发出颜色。颜色(或其不存在)被用于检测对应的核苷酸。在所示示例中,成像系统108被适配用于激发一个或多个可标识标签(例如,荧光标签),并且然后获得用于可标识标签的图像数据。标签可以被入射光和/或激光激发,并且图像数据可以包括响应于激发而由相应标签发出的一个或多个颜色。图像数据(例如,检测数据)可以由系统100进行分析。成像系统108可以是包括物镜和/或固态成像设备的荧光分光光度计。固态成像设备可以包括电荷耦合设备(CCD)和/或互补金属氧化物半导体(CMOS)。
在图像数据被获取之后,驱动组件104与试剂盒102对接,以使另一反应成分(例如,试剂)和/或气体流动通过试剂盒102,然后由废物容器109接收和/或以其他方式通过试剂盒102排出。试剂和气体可以交替地流动通过试剂盒102。反应成分和气体执行冲洗操作,冲洗操作将荧光标签和可逆终止子从sstDNA化学裂解。sstDNA然后准备好进行下一循环。
参考试剂盒102,在所示的示例中,试剂盒102能够容纳在系统100的盒接收器110内,并且包括歧管112、试剂容器114、主体116、一个或多个阀118以及流体管线120。在其他示例中,试剂盒102不包括歧管112。试剂容器111可以包含流体(例如,试剂和/或另一反应成分),并且阀118可以被选择性地致动来控制流动通过流体管线120的流体的流量。阀118中的一个或多个阀118可以通过旋转阀、夹管阀、平面阀、电磁阀、止回阀、压电阀等来实现。主体116可以使用注射成型技术和/或增材制造技术来由实心塑料制成。在一些示例中,试剂容器114与主体116一体地形成。在其他示例中,试剂容器114被独立地形成并耦合到主体116。
歧管112被流体地耦合到气体源103、试剂容器114和阀118。结果,气体(例如,空气)流动通过歧管112而流到试剂容器114,以对试剂盒102加压,并且流到阀118。对试剂盒102加压允许冲洗操作发生,在冲洗操作期间,空气和/或试剂在正压力下流动通过流动池122。使得试剂在正压力下流动通过流体管线120增加了通过试剂盒102的流速和/或减少使得试剂流入例如流动池122中的响应时间,并且更一般地,减少了系统100的循环时间。备选地,试剂容器114可以不被加压。
试剂盒102与流动池122流体连通。在所示的示例中,流动池122由试剂盒102承载并且经由流动池接收器123来容纳。备选地,流动池122可以被集成到试剂盒102中。在这样的示例中,流动池接收器123可以不被包括或者至少流动池122可以不被可移除地容纳在试剂盒102内。作为另一备选方案,流动池122可以与试剂盒102分离。
歧管112包括流体地耦合到气体源103的入口124和出口125。出口125中的一个出口125可以被流体地耦合到试剂容器114的入口126,并且出口125中的一个出口125可以被流体地耦合到阀118。作为备选,歧管112与阀118之间的流体管线120可以被去除,使得歧管112经由试剂容器114而被耦合到阀118(例如,参见图2-图8)。试剂容器114还包括流体地耦合到阀118的出口127。
调节器128可以位于气体源103与歧管112之间,并且被适配用于调节提供给歧管112的气体的压力。备选地,调节器128可以不被包括。调节器128可以由多通道调节器来实现。在一个示例中,施加到例如试剂容器114的压力通过将试剂盒102中的流速校准为气体源103的压力而被确定。然而,压力可以以不同的方式被选择。备选地,一个或多个调节器128可以位于歧管与试剂容器114之间和/或歧管112与阀118之间。
尽管以上公开内容描述了将试剂在正压力下推送通过流动池122,但是例如当试剂容器114不被加压时,试剂可以在负压力下被汲取通过流动池122。为此,试剂盒110可以包括位于流动池122与废物容器109之间的泵135。废物容器109可以选择性地容纳在系统100的废物接收器129内。泵135可以通过注射泵、蠕动泵、隔膜泵等来实现。虽然泵135可以位于流动池122与废物容器109之间,但是在其他示例中,泵135可以位于流动池122的上游或者被完全省略。
现在参考驱动组件104,在所示示例中,驱动组件104包括泵驱动组件130和阀驱动组件131。泵驱动组件130被适配用于与泵135对接以将流体泵送通过试剂盒110。阀驱动组件131被适配用于与阀118对接以控制阀118的位置。在一个示例中,阀118由具有第一位置、第二位置和第三位置的旋转阀来实现,第一位置阻止流向流动池122,第二位置允许从试剂容器114流到流动池122,并且第三位置允许气体从气体源103流到流动池122。但是,阀118可以被定位在任意数量的位置中,以使得第一试剂、缓冲试剂、气体、第二试剂等中的任一个或多个流到流动池122。在这样的示例中,阀驱动组件131可以包括致动阀118来执行冲洗操作的轴,其中阀118的位置在使得气体在阈值时间量内流动通过流动池122、使得试剂在阈值时间量内流动通过流动池122以及使得气体在阈值时间量内流动通过流动池122等之间交替。备选地,阀驱动组件131可以执行冲洗操作,其中阀118的位置在使得气体流动通过流动池122、使得试剂流动通过流动池122、使得气体不会再次流动通过流动池122之间交替。然而,冲洗操作可以以任何期望的序列来执行。
在一些示例中,通过执行其中除了试剂流动通过流动池122之外,气体还流动通过流动池122的冲洗操作,试剂(例如,洗涤缓冲液)的体积可以被减少约50%,并且与仅使用试剂(例如,洗涤缓冲液)时所需的体积相比,试剂盒110的体积可以减少约30%至约50%。然而,根据试剂盒110的流体架构,试剂盒110所承载的尺寸的减小和/或试剂体积的减小可以不同。通过减小试剂的体积,试剂的解冻时间(例如,解冻试剂所花费的时间)被对应地减少,并且试剂容器114的尺寸也被减小。换言之,使用所公开的示例生产的试剂盒可以包括更少的试剂、具有更小的占位面积、使用更少的材料、花费更少的成本和/或具有更轻的重量。
参考控制器106,在所示的示例中,控制器106包括用户接口132、通信接口133、一个或多个处理器134和存储器136,存储器136存储指令,指令能够由一个或多个处理器134执行,以执行包括所公开的示例的各种功能。用户接口132、通信接口133和存储器136被电和/或通信地耦合到一个或多个处理器134。
在一个示例中,用户接口132被适配用于接收来自用户的输入并且向用户提供与系统100的操作和/或发生的分析相关联的信息。用户接口132可以包括触摸屏、显示器、键盘、(多个)扬声器、鼠标、轨迹球和/或语音识别系统。触摸屏和/或显示器可以显示图形用户界面(GUI)。
在一个示例中,通信接口133被适配用于经由(多个)网络而在系统100和(多个)远程系统(例如,计算机)之间实现通信。(多个)网络可以包括内联网、局域网(LAN)、广域网(WAN)、内联网等。被提供给远程系统的一些通信可以与由系统100生成或以其他方式获得的分析结果、成像数据等相关联。被提供给系统100的一些通信可以与流体分析操作、患者记录和/或由系统100执行的(多个)协议相关联。
一个或多个处理器134和/或系统100可以包括(多个)基于处理器的系统或(多个)基于微处理器的系统中的一个或多个系统。在一些示例中,一个或多个处理器142和/或系统100包括(多个)精简指令集计算机(RISC)、专用集成电路(ASIC)、(多个)现场可编程门阵列(FPGA)、(多个)现场可编程逻辑设备(FPLD)、(多个)逻辑电路和/或执行各种功能(包括本文所述功能)的另一基于逻辑的设备。
存储器136可以包括硬盘驱动装置、闪存、只读存储器(ROM)、可擦除可编程只读存储器(EPROM)、电可擦除可编程只读存储器(EEPROM)、随机存取存储器(RAM)、非易失性RAM(NVRAM)存储器、光盘(CD)、数字多功能磁盘(DVD)、缓存中的一个或多个和/或其中在任何持续时间(例如,永久地、临时地、延长时段内、用于缓冲、用于缓存)内存储有信息的任何其他存储设备或存储盘。
图2图示了根据本公开的教导的另一试剂盒200的示意图。试剂盒200可以被容纳在图1的盒接收器110内。试剂盒200与图1的试剂盒102相同或相似的元素由相同的附图标记表示。为了简洁起见,省略或移除了对这些元素的描述。与图1的试剂盒102相比,图2的试剂盒200不包括歧管112、流动池接收器123和泵135,但是它确实包括与气体源103直接连通的入口端口138。在一些示例中,气体源103由试剂盒102承载。在其他示例中,气体源103由例如系统100提供。
尽管以上公开的示例图示了直接流体耦合到阀118的气体源103,但是当试剂容器114至少基本为空时,试剂容器114本身可以被用于使得气体流到流动池122。如本文所述,短语“基本为空”是指(多个)试剂容器114允许气体流动通过试剂容器114,流到流动池122,这与试剂容器114包含试剂并且气体被用于将试剂朝向流动池112推送时相反。试剂盒300的一个这样的详细示例在图3中图示,而试剂盒400的另一这样的详细示例在图4中图示。这些试剂盒300、400可以被容纳在图1的系统100的盒接收器110内并且被适配用于与系统100的驱动组件104对接来执行所公开的流体和/或分析操作。
参考图3,试剂盒300包括均经由流体管线120而流体地耦合的主体302、第一容器304、第二容器306、阀308和流动池接收器123。在所示的示例中,第一容器3040和第二容器306经由相关联的调节器128而独立地流体耦合到气体源103。在这样的示例中,调节器128可以将第一容器304加压到第一压力,以及可以将第二容器306加压到第二压力。第一压力和第二压力可以相同或不同。作为示例,第一容器304可以被加压至约30磅/平方英寸(psi),并且第二容器306可以被加压至约5psi。然而,任何其他压力可以被使用或者调节器128可以被省略。在其他示例中,试剂盒300包括流体地耦合到气体源103的入口端口,入口端口向第一容器304和第二容器306两者提供气体。
不论试剂容器304、306如何被流体地耦合到气体源103,气体源103均对容器304、306加压。当第一容器304包含流体(例如,试剂)时,对第一容器加压304允许流体在正压力下流动通过试剂盒300。当第一容器304不包含流体时(例如,流体已被排空),在例如示例冲洗操作期间,对第一容器304加压允许气体流动通过第一容器304,流到流动池接收器123。
阀308可以由旋转阀来实现。但是,可以使用其他类型的阀。在一个示例中,阀驱动组件131被适配用于与阀308对接,以在第一(闭合/阻挡)位置、将第一容器304和流动池接收器123流体地耦合的第二位置以及将第二容器304和流动池接收器123流体地耦合的第三位置之间移动阀308。虽然未示出,但是在一些示例中,流动池接收器123承载流动池(例如,流动池122)。
在示例冲洗操作中,当第一容器304包含流体而第二容器306基本不包含流体时,冲洗操作可以通过将阀118从第三位置移动到第二位置,然后移动到第一位置来执行。这样的方法可以被称为“空气冲洗方法”。在一些实现方式中,第二容器306可以被省略,使得流体管线120被直接连接到阀308和/或流动池接收器123。在所示的示例中,第一容器304和第二容器306使用公共管线310而被耦合到流动池122。备选地,每个容器304、306可以经由不同的流体管线而被耦合到流动池122。在这样的示例中,附加的阀可以被包括来控制从相应容器304、306流动到流动池122(例如,参见图5)。
为了执行空气冲洗方法,在一个示例中,第二容器306被加压至约30psi,并且在约10秒内,阀308被定位在第三位置中,第三位置使得气体流到流动池。虽然30psi被提及,但是也可以使用其他压力(例如,21psi、27psi、33psi、33.5psi等)。此外,尽管阀118被提及在约10秒内处于第三位置中,但是也可以使用其他时段(例如,7秒、8秒、12秒、13.3秒等)。
在另一示例冲洗操作中,当第一容器304包含流体并且第二容器306基本不包含流体时,冲洗操作可以通过将阀308在第二位置和第三位置之间来回移动阈值循环数来执行和/或将阀308在第一位置、第二位置和第三位置之间来回移动阈值循环数来执行,从而允许例如流动通过试剂盒300的气体后面跟随着将气体(例如,气泡)从试剂盒300推出的试剂。这样的方法可以被称为“空气喷射法”,在空气喷射法期间,在阀308的每个循环(例如,清扫)期间分配相对少量的试剂(例如,洗涤缓冲液),随后是气体。在一些示例中,阀308在第一位置、第二位置和第三位置之间移动24个循环。但是,可以使用任何其他数量的循环(例如,9个循环、10个循环、15个循环、25个循环等)。在阀308被实现为旋转阀的一个示例中,阀308可以在第一位置和第三位置之间旋转,其中阀308在第一位置处延迟大约250ms并且在第三位置处延迟大约250ms。但是,阀308可以在第一位置和/或第三位置处延迟不同的时间量(例如,150ms、200ms、300ms、310ms等),并且在第一位置和第三位置的延迟长度可以相同或彼此不同。在该示例中,当阀308在第一位置和第三位置之间跨第二位置移动时,由于气体被允许流到流动池122,因此阀308可以不被命令到第二位置。
使用所公开的示例,产生了两相流,两相流增加了冲洗效率和/或在提供增强的流体通道冲洗的空气-流体界面处产生了表面张力效应。作为示例,当空气流动通过流体管线120时,空气与流体相互作用并且将流体推送到流体管线120的侧面上和/或推送到流体管线120中可能没有空气冲洗的拐角或弯曲部中。结果,当例如以较高流速冲洗和/或使用较高冲洗体积时,所公开的示例具有增加的气泡清除效率。具体地,以较高的平均速度(较高的流速)泵送流体增加了气泡的流动性,并且因此增加了气泡的清除效率。附加地或备选地,试剂盒300可以包括用于改进气泡冲洗的几何形状。
在一些示例中,来自第一容器304的流体的流速为每分钟约1500微升(μL/min),第一容器304被加压至约30psi,第二容器306被加压至约5psi,并且阀118在第一位置和第二位置中的每一个中保持约250毫秒(ms)。尽管提及流速约为1500μL/min,但是也可以使用其他流速(例如,1400μL/min、1550μL/min、1725μL/min等)。尽管提及第一容器304被加压到30psi,但是也可以使用其他压力(例如,20psi、27psi、33psi、37psi等)。附加地,虽然提及第二容器306被加压至5psi以使得对应量的压力流动通过试剂盒300,但是可以替代地使用其他压力(例如,4psi、4.5psi、8.3psi、9psi等)。此外,虽然提及阀308处于第二位置和第三位置中和/或阀308处于第一位置、第二位置和第三位置中的阈值时间量为250ms,但是阀308可以在第一阈值时间量内处于第二位置中,并且阀308可以在第二阈值时间量内处于第三位置中。第一阈值和第二阈值可以相同或不同(例如,175ms、200ms、215ms、300ms等)。
参考图4,试剂盒400与试剂盒300相似。试剂盒400与图1的试剂盒300相同或相似的元素由相同的附图标记表示。为了简洁起见,省略或消除了对这些元素的描述。与图3的试剂盒300相比,图4的试剂盒400承载流动池122,但不包括第二容器304。因此,阀308可选择性地致动,以在容器304包含试剂时,使得试剂流动通过流动池122,并且在容器304基本上不包含试剂时,使得气体流动通过容器304并流动到流动池122。
尽管以上公开的示例图示了包括两个容器(图3)或一个容器(图4)的试剂盒300、400,但是试剂盒可以包括任何数量的容器,其中一些或全部容器可以被加压。试剂盒500的一个这样的详细示例在图5、图6和图7中图示,并且用于试剂盒的歧管800的另一个这样的详细示例在图8中图示。试剂盒500和承载歧管800的试剂盒可以被容纳在图1的系统100的盒接收器110内并且被适配用于与系统100的驱动组件104对接来执行所公开的流体和/或分析操作。
参考图5,试剂盒500承载流动池502,并且包括通过流体管芯528流体地耦合的主体504、歧管506、试剂容器508至522、阀523、524以及泵526。在一些示例中,试剂容器508至522与主体504一体地形成。在其他示例中,试剂容器508至522单独形成但被耦合到主体504。
在所示的示例中,第一至第四试剂容器508-514被流体地耦合到歧管506和流动池502。歧管506被适配用于流体地耦合到系统100的气体源103,以对第一至第四试剂容器508-514加压,并且在对应阀523被打开时,使得其中的任何流体在正压力下流向流动池502。当第一至第四试剂容器508-514中的一个或多个为空(例如,基本上不包含试剂或另一反应成分)时,气体可以借助流动池502流动通过一个或多个空试剂容器508-514,流到与废物容器109相关联的出口525。
第五至第八试剂容器516-522被流体地耦合到流动池502和泵526。对泵526进行操作,在负压力下,借助流动池502将试剂从第五至第八试剂容器516-522中的相应试剂容器朝向出口525汲取。
返回参考歧管506,在所示的示例中,歧管506包括从基部529延伸的壁527。基部529是矩形的,并且壁527包括第一部分530和第二部分532。壁527的第一部分530被耦合到基部529,并且壁527的第二部分532包括唇部或外围表面(界面)534。歧管506的基部529限定了出口538,出口538被流体地耦合到第一至第四试剂容器508-514。备选地,壁527中的一个或多个可以限定出口538。
在一个示例中,为了对试剂盒500加压,外围表面534与系统100的界面配合地接合,以将气体源103和流体盒500流体地耦合。外围表面534可以包括垫圈(例如,密封件)和/或可以是圆形的和/或可以具有其他轮廓。例如,外围表面534相对于试剂盒500的主体504的表面536可以是凹的、凸的、渐缩的和/或平坦的。
参考第一至第四试剂容器508-514,第一至第四试剂容器508-514还包括从相应基部542延伸的壁540。试剂容器508-514的基部542限定了入口端口544和出口端口546。歧管506的出口端口538经由流体管线528而被流体地耦合到试剂容器508-514的入口端口544(图6最清楚地示出了歧管506与试剂容器508-514之间的耦合)。
在所示的示例中,试剂容器508-514还包括位于入口端口544附近的屏蔽件548(图7最清楚地示出了第一试剂容器508的屏蔽件548)。在所示的示例中,每个屏蔽件548形成为弧形壁,弧形壁从基部542延伸并且在壁540中的两个之间延伸。第一至第四试剂容器508-514中的每一个的入口端口544被定位在屏蔽件548和壁540之间。在一些示例中,屏蔽件548用作阻止试剂从试剂容器508-514通过流体管线528流向歧管506的回流的坝。附加或备选地,基部529可以被定位(成角度)为促进试剂流向出口端口546而不是流向入口端口544。
为了使得试剂在正压力下从第一至第四试剂容器508-514中的一个或多个流到流动池502,阀驱动组件131将相关联的阀523致动并且试剂流向流动池502。当相关联的试剂容器508-514中的一个基本为空时,将相关联的阀523致动使得气体流动通过试剂容器508、510、512和/或514,流向流动池502。在备选示例中,附加的流体管线和相关联的阀可以被提供,从而将歧管506和流动池502直接耦合,或者将歧管506耦合到将试剂容器508至522连接到流动池502的流体管线528的上游。在这样的示例中,在第一至第四试剂容器508-514中的一个或多个包含流体时,气体可以流动通过流动池502和/或流体管线528。
虽然“空气喷射”方法和“空气冲洗”方法均在所示示例中公开了使得试剂在正压力下从第一至第四试剂容器508-514流动通过流动池502,但是试剂可以备选地使用泵526,在负压力下借助试剂盒200而从第一至第八试剂容器508-522中的一个或多个试剂容器汲取。具体地,通过对那些试剂容器508-514进行减压(或不加压),试剂可以在负压力下,从第一至第四试剂容器508-514汲取到流动池502。在试剂流动通过流动池502之后,试剂可以被推送朝向与系统100的废物容器109相关联的出口525。当对泵526进行操作时,为了避免逆流,由例如止回阀实现的阀524被设置在泵526的任一侧上。在其他示例中,可以不包括阀524。
图6图示了流体管线528的详细视图,流体管线528流体地耦合图5的歧管506的出口端口538以及图5的相应试剂容器508-514的入口端口544。
图7图示了形成空间550的屏蔽件548和壁540的详细视图,第一试剂容器508的入口端口544被定位在空间550中。
图8图示了根据本公开的教导的备选示例歧管800的示意图,备选示例歧管800可以被用于实现试剂盒500。歧管800与试剂盒500相同或相似的元素由相同的附图标记表示。为了简洁起见,省略或消除了对这些元素的描述。
与图5-图7的歧管506相反,图8的歧管800限定了被适配用于容纳气体源804的盲孔(blind bore)(接收器)802。因此,与被流体地耦合到系统100的气体源相反,图8的歧管800承载气体源804。气体源804被图示为位于孔802内的压缩气体盒(例如,CO2盒)。孔802包括允许气体源804被歧管800容纳的开口806。
在所示的示例中,插塞810的主体808被容纳在孔802的第一端部812内。插塞810还包括凸缘814。插塞810的主体808可以经由螺纹或过盈配合而被耦合到歧管800。在一些示例中,插塞810和歧管800之间的耦合提供了阻止气体从孔802逸出的密封件(例如,气密密封件)。凸缘814可以被适配用于与工具(例如,扳手)配合来促进将插塞810旋入歧管800中。
刺穿机构816被设置在孔802中与第一端部812和开口806相对的第二端部818内。刺穿机构816可以由被适配用于将气体源804的端部刺穿的刺突或另一尖锐物体来实现。为了允许气体从气体源404流出,插塞810的主体808被适配用于沿大致由箭头820指示的方向,在孔802内推送气体源804,并且将气体源804驱动到刺穿机构816来刺穿气体源804并允许气体流动通过流体管线528和相应的入口端口544,以对第一至第四试剂容器508-514加压。在一些实现方式中,刺穿机构816可以被省略,并且气体源804可以旋拧入流体连接插座中,以将气体源804流体地耦合到流体管线528。
图9图示了使用图1的系统100来执行冲洗操作的方法的流程图。在图9的流程图中,由实线包围的框可以被包括在示例过程900中,而由虚线包围的框在示例过程中是可选的。然而,无论图9中呈现框的边界的方式如何,框的执行顺序均可以被改变和/或一些框可以被改变、消除、组合和/或细分为多个框。
过程900开始于框902,在框902处,对试剂盒102的缓冲试剂容器加压。在一个示例中,执行存储器136中存储的指令的一个或多个处理器134使得气体源103对缓冲试剂容器加压。过程900将阀118移动到第一位置,以将包含第一试剂的第一试剂容器流体地连接到流动池122。(框904)。在一个示例中,执行存储器136中存储的指令的一个或多个处理器134使得阀驱动组件131将阀118移动到第一位置。在一些示例中,阀118包括多个阀,诸如结合图5图示的阀。在一些这样的示例中,将阀118致动到第一位置包括致动阀中的第一阀,将阀致动到第二位置包括致动阀中的第二阀,将阀致动到第三位置包括致动阀中的第三阀,将阀致动到第四位置包括致动阀中的第四阀等。但是,一个或多个阀可以被用于控制流动通过试剂盒102的流体。来自第一试剂容器的第一试剂流入流动池122中,以执行生化反应。(框906)。例如,预定量的第一试剂可以流入流动池122中。预定量可以与在阈值时间量内打开阀118相关联,使得一定体积的试剂流动通过试剂盒102等。
阀118被移动到第二位置,以将气体流体地连接到流动池。(框908)。在一个示例中,执行存储器136中存储的指令的一个或多个处理器134使得阀驱动组件131将阀118移动到第二位置,以将气体源103和流动池122流体地连接。气体流入流动池122中,以从流动池122中排出来自生化反应的第一试剂的至少一部分。(框910)。在一些示例中,使气体流到流动池122包括使气体流动通过基本上为空的试剂容器。在其他示例中,使得气体流到流动池122包括使得气体流动通过耦合在气体源103与流动池122之间的流体管线。附加地或备选地,使气体流到流动池122包括使气体流动通过试剂盒102的歧管112。无论如何,在一个示例中,预定量的气体流入流动池122中。预定量可以与以阈值时间量打开阀118相关联。
阀118被移动到第三位置来将包含缓冲试剂的缓冲试剂容器流体连接到流动池122。(框912)。在一个示例中,执行存储器136中存储的指令的一个或多个处理器134使得阀驱动组件131将阀118移动到第三位置。缓冲试剂流入流动池122中(框914)。在一个示例中,预定量的缓冲试剂流到流动池122。阀118被移动到第二位置来将气体流体地连接到流动池122。(框916)。气体流到流动池122,以从流动池122排出缓冲试剂的至少一部分。(框918)。在一个示例中,预定量的气体流到流动池122。
阀118被移动到第三位置来将缓冲试剂容器流体地连接到流动池122。(框920)。缓冲试剂流入流动池122中。(框922)。在一个示例中,预定量的缓冲试剂流到流动池122。阀118被移动到第四位置来将包含第二试剂的第二试剂容器流体地连接到流动池122。(框924)。在一个示例中,执行存储器136中存储的指令的一个或多个处理器134使得阀驱动组件131将阀118移动到第四位置。
图10图示了使用图1的系统100执行冲洗操作的方法的流程图。过程1000在框1002处开始,在框1002处,经由气体源103来将试剂盒102的一个或多个试剂容器114加压。一个或多个试剂容器包含试剂。试剂盒102承载流动池122并且包括流体管线120。流体管线120中的一个或多个将试剂容器114和流动池122流体地耦合。在一个示例中,执行存储器136中存储的指令的一个或多个处理器134使得气体源103对试剂容器114加压。在框1004处,过程包括当试剂容器144中的第一试剂容器包含试剂时,使得试剂从试剂容器114中的第一试剂容器流动到流动池122。在框1006处,过程1000包括当试剂容器114中的第一试剂容器基本不包含试剂时,使得气体从试剂容器114中的第一试剂容器流动到流动池122。
参考图9和图10所示的流程图,框的执行顺序可以被改变和/或所描述的一些框可以被改变、消除、组合和/或细分为多个框。
提供前述描述以使得本领域技术人员能够实践本文描述的各种配置。尽管已参考各种附图和配置具体描述了本主题技术,但是应当理解,这些仅是出于例示的目的,而不应被视为对本主题技术范围的限制。
如本文中所使用的,除非明确地指出,否则以单数形式叙述并且以单词“一(a)”或“一个(an)”开始的元件或步骤应被理解为不排除多个所述元件或步骤。此外,对“一个实现方式”的引用不旨在被解释为排除存在也并入所述特征的附加实现方式。此外,除非明确相反地指出,否则无论附加元素是否具有性质,“包括(comprising/including)”、或“具有”具有特定性质的一个或多个元素的实现方式可以包括附加元件。此外,术语“包括(comprising/including)”、“具有”等在本文中可互换使用。
贯穿本说明书使用的术语“基本上”、“大约”和“约”被用于描述和说明小的波动,诸如由于处理中的变化引起的波动。例如,它们可以指代小于或等于至±5%,诸如小于或等于±2%,诸如小于或等于±1%,诸如小于或等于±0.5%,诸如小于或等于±0.2%,诸如小于或等于±0.1%,诸如小于或等于±0.05%。
可以存在许多其他方式来实现本主题技术。在不脱离本主题技术的范围的情况下,本文所描述的各种功能和元件可以与所示出的功能和元素不同地划分。对这些实现方式的各种修改对于本领域技术人员而言是显而易见的,并且本文中定义的一般原理可以被应用于其他实现方式。因此,本领域普通技术人员可以在不脱离本主题技术的范围的情况下,对本主题技术进行许多改变和修改。例如,可以采用不同数量的给定模块或单元,可以采用不同类型的给定模块或单元,可以添加给定模块或单元,或者可以省略给定模块或单元。
具有下划线和/或斜体的标题和副标题仅是为了方便起见,不限制主题技术,并且不为与主题技术的描述有关而被提及。本领域普通技术人员已知或以后将知道的、贯穿本公开描述的各种实现方式的元素的所有结构和功能等同物均通过引用明确地并入本文,并且旨在被本主题技术涵盖。此外,无论在以上描述中是否明确叙述了这种公开,本文所公开的任何内容都不旨在奉献给公众。
应当理解,前述概念和下面更详细讨论的附加概念的所有组合(假设这样的概念不相互矛盾)被认为是本文公开的发明主题的一部分。特别地,出现在本公开的结尾处的要求保护的主题的所有组合被认为是本文公开的发明主题的一部分。

Claims (32)

1.一种方法,包括:
将阀移动到第一位置,以将包含第一试剂的第一试剂容器流体地连接到流动池;
使来自所述第一试剂容器的所述第一试剂流入所述流动池中,以执行生化反应;
将所述阀移动到第二位置,以将气体流体地连接到所述流动池;
使所述气体流到所述流动池,以从所述流动池中排出来自所述生化反应的所述第一试剂的至少一部分;
将所述阀移动到第三位置,以将包含缓冲试剂的缓冲试剂容器流体地连接到所述流动池;
使所述缓冲试剂流入所述流动池中;
将所述阀移动到所述第二位置,以将所述气体流体地连接到所述流动池;
使所述气体流到所述流动池,以从所述流动池中排出所述缓冲试剂的至少一部分;
将所述阀移动到所述第三位置,以将所述缓冲试剂容器流体地连接到所述流动池;
使所述缓冲试剂流入所述流动池中;以及
将所述阀移动到第四位置,以将包含第二试剂的第二试剂容器流体地连接到所述流动池。
2.根据权利要求1所述的方法,其中将所述阀移动到所述第一位置包括:致动第一阀以流体地连接所述第一试剂容器,并且将所述阀移动到所述第二位置包括:致动第二阀以将所述气体流体地连接到所述流动池。
3.根据前述权利要求中任一项所述的方法,还包括对所述缓冲试剂容器加压。
4.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中每次使所述气体流到所述流动池包括使所述气体流动通过基本为空的试剂容器。
5.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中每次使所述气体流到所述流动池包括:使所述气体流动通过耦合在气体源与所述流动池之间的流体管线。
6.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中每次使所述气体流到所述流动池包括:使所述气体流动通过试剂盒的歧管,所述试剂盒承载所述第一试剂容器、所述缓冲试剂容器以及所述第二试剂容器。
7.一种装置,包括:
流体盒,能够容纳在系统的盒接收器内并且被适配用于承载流动池,所述流体盒包括:
包含第一试剂的第一试剂容器和包含缓冲试剂的缓冲试剂容器;
阀;以及
主体,包括流体管线和入口端口,所述入口端口被适配用于耦合到气体源,所述主体承载所述第一试剂容器、所述缓冲试剂容器和所述阀,所述流体管线将所述入口端口、所述第一试剂容器、所述缓冲试剂容器、所述阀和所述流动池流体地耦合,
其中所述阀能够移动到:
第一位置,以将所述第一试剂容器流体地连接到所述流动池,以使来自所述第一试剂容器的所述第一试剂流入所述流动池中以执行生化反应;
第二位置,以将所述气体源流体地连接到所述流动池,以使气体流入所述流动池中来从所述流动池中排出来自所述生化反应的所述第一试剂的至少一部分;以及
第三位置,以将所述缓冲试剂容器流体地连接到所述流动池,以使所述缓冲试剂流入所述流动池中。
8.根据权利要求7所述的装置,还包括:包含第二试剂的第二试剂容器,其中所述流体管线将所述入口端口、所述第二试剂容器、所述阀和所述流动池流体地耦合,并且其中所述阀还能够移动到:
所述第二位置,以将所述气体源流体地连接到所述流动池,以使气体流入所述流动池中来从所述流动池中排出所述缓冲试剂的至少一部分;
所述第三位置,以将所述缓冲试剂容器流体地连接到所述流动池,以使所述缓冲试剂流入所述流动池中;以及
第四位置,以将所述第二试剂容器流体地连接到所述流动池。
9.根据权利要求7或8中任一项所述的装置,其中所述缓冲试剂容器经由所述气体源被加压。
10.根据权利要求7、8或9中任一项所述的装置,还包括第二试剂容器,其中在所述第二位置中并且当所述第二试剂容器基本不包含流体时,所述气体源通过所述第二试剂容器而被流体地连接到所述流动池。
11.根据权利要求7、8或9中任一项所述的装置,其中所述流体管线中的一个流体管线将所述入口端口与所述流动池直接流体地耦合。
12.根据权利要求7、8、9、10或11中任一项所述的装置,其中所述气体源包括压缩气体盒。
13.根据权利要求7、8、9、10或11中任一项所述的装置,其中所述流体盒包括歧管,所述歧管包括所述入口端口,所述流体管线将所述歧管、所述阀和所述缓冲试剂容器耦合。
14.根据权利要求13所述的装置,其中所述气体源包括压缩气体盒,所述气体源还包括插塞和刺穿机构,所述歧管的接收器包括第一部分和第二部分,所述刺穿机构被设置在所述第一部分内并且被适配用于刺穿所述压缩气体盒以允许气体流入所述歧管中,所述插塞在所述第二部分附近被耦合到所述歧管。
15.根据权利要求7、8、9、10、11、12、13或14中任一项所述的装置,其中所述入口端口包括接口,所述接口被适配用于在所述流体盒被容纳在所述盒接收器内时,由所述系统密封地接合,以将所述入口端口和所述系统的所述气体源流体地耦合。
16.根据权利要求7、8、9、10、11、12、13或14中任一项所述的装置,其中所述入口端口包括从基部延伸的壁,所述壁具有第一部分和第二部分,所述第一部分被耦合到所述基部,所述第二部分形成被适配用于与所述气体源耦合的接口,所述基部限定流体地耦合到所述容器的出口。
17.根据权利要求7至16中任一项所述的装置,其中所述主体包括所述容器。
18.一种装置,包括:
系统,包括:
阀驱动组件;
盒接收器;以及
一个或多个处理器,所述一个或多个处理器被耦合到所述阀驱动组件,
试剂盒,能够容纳在所述盒接收器内,所述试剂盒包括:
试剂容器;
流动池;
阀;以及
流体管线,所述流体管线中的一个或多个流体管线将所述试剂容器、所述流动池和所述阀流体地耦合;以及
气体源,其中所述一个或多个处理器被适配用于使所述阀驱动组件在使试剂流到所述流动池的第一位置与使气体流到所述流动池的第二位置之间致动所述阀。
19.根据权利要求18所述的装置,其中所述气体源被流体地耦合到所述阀和所述试剂容器,以对所述试剂容器加压。
20.根据权利要求18或19中任一项所述的装置,还包括第二试剂容器,并且其中使气体流到所述流动池包括使气体通过所述第二试剂容器流到所述流动池。
21.根据权利要求18、19或20中任一项所述的装置,还包括调节器,所述调节器被耦合在所述气体源与所述试剂容器之间。
22.根据权利要求18、19、20或21所述的装置,其中所述试剂盒包括歧管,所述歧管被耦合到所述气体源,所述流体管线将所述歧管和所述试剂盒耦合。
23.根据权利要求22所述的装置,其中所述歧管包括入口端口,并且所述系统包括所述气体源,所述入口端口被适配用于与所述气体源流体地耦合。
24.根据权利要求22所述的装置,其中所述歧管包括被适配用于容纳所述气体源的接收器。
25.根据权利要求18、19、20、21、22、23或24中任一项所述的装置,其中所述试剂盒包含所述试剂。
26.一种方法,包括:
将阀移动到第一位置,以将包含第一试剂的第一试剂容器流体地连接到流动池,
使来自所述第一试剂容器的所述第一试剂流到所述流动池,以执行生化反应;
将所述阀移动到第二位置,以将气体流体地连接到所述流动池;
使所述气体流入所述流动池中,以从所述流动池中排出来自所述生化反应的所述第一试剂的至少一部分;
将所述阀移动到第三位置,以将包含缓冲试剂的缓冲试剂容器流体地连接到所述流动池;以及
使所述缓冲试剂流入所述流动池内。
27.根据权利要求26所述的方法,其中将所述阀移动到所述第一位置包括:致动第一阀以流体地连接所述第一试剂容器,将所述阀移动到所述第二位置包括:致动第二阀以将所述气体流体地连接到所述流动池,并且将所述阀移动到所述第三位置包括致动第三阀以将所述缓冲试剂容器流体地连接到所述流动池。
28.根据权利要求26或27中任一项所述的方法,还包括对所述缓冲试剂容器加压。
29.根据权利要求26、27或28中任一项所述的方法,其中使所述气体流到所述流动池包括:使所述气体流动通过试剂盒的歧管,所述试剂盒承载所述第一试剂容器和所述缓冲试剂容器。
30.根据权利要求26、27、28或29中任一项所述的方法,其中使所述气体流到所述流动池包括使来自压缩气体盒的所述气体流动。
31.根据权利要求30所述的方法,其中所述压缩气体盒由试剂盒承载。
32.根据权利要求26、27、28、29、30或31中任一项所述的方法,其中使所述气体流到所述流动池包括:利用设置在试剂盒的接收器内的刺穿机构来刺穿压缩气体盒,所述接收器容纳所述压缩气体盒。
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Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20230167933A1 (en) * 2021-11-30 2023-06-01 Applied Materials, Inc. Integrated manifold and switches for fluidic movement

Citations (21)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4168294A (en) * 1977-02-14 1979-09-18 Claudio Calzi Instrument for photometric analyses
JPH02228562A (ja) * 1989-03-02 1990-09-11 Jeol Ltd 自動免疫測定装置
US5993740A (en) * 1995-01-20 1999-11-30 Hitachi, Ltd. Immunoassay method and analyzer using magnetic particles
US20020028926A1 (en) * 2000-09-07 2002-03-07 Yoshiyuki Shoji Nucleic acid purification method and purification apparatus
CN1517712A (zh) * 2003-01-20 2004-08-04 三星电子株式会社 用于检测生物试样中蛋白质的自动流体装置及其方法
CN1553969A (zh) * 2001-07-16 2004-12-08 Һ�����������·������ú��о��ľ� 整体块、化学输送系统及用于输送超纯化学制品的方法
CN1596369A (zh) * 2002-07-31 2005-03-16 株式会社东芝 碱基序列检测装置及碱基序列自动解析装置
CN1767899A (zh) * 2003-04-04 2006-05-03 皇家飞利浦电子股份有限公司 多微通道中的流体分隔
JP2008298755A (ja) * 2007-06-04 2008-12-11 Hitachi High-Technologies Corp 医用光度計
CN101482571A (zh) * 2008-01-07 2009-07-15 霍夫曼-拉罗奇有限公司 试剂盒
JP2010256050A (ja) * 2009-04-22 2010-11-11 Hitachi High-Technologies Corp 自動分析装置
CN101960315A (zh) * 2008-02-29 2011-01-26 贝克曼库尔特公司 清洗液体处理探针的装置和方法
JP2011247617A (ja) * 2010-05-24 2011-12-08 Hitachi High-Technologies Corp 自動分析装置
CN102735812A (zh) * 2012-06-15 2012-10-17 中国科学院长春应用化学研究所 一种生化需氧量的检测方法
JP2015040804A (ja) * 2013-08-23 2015-03-02 株式会社日立ハイテクノロジーズ 自動分析装置
US20160319350A1 (en) * 2013-08-08 2016-11-03 Illumina, Inc. Fluidic system for reagent delivery to a flow cell
CN106093256A (zh) * 2015-04-30 2016-11-09 塞莫费雪科学有限公司 用于减少耗气量的方法和设备
US20170144155A1 (en) * 2014-06-05 2017-05-25 Illumina, Inc. Systems and methods including a rotary valve for at least one of sample preparation or sample analysis
US20170333904A1 (en) * 2016-05-20 2017-11-23 Eli Lyons Sensor system and method for disease detection
US20180188279A1 (en) * 2017-01-05 2018-07-05 Illumina, Inc. Reagent mixing system and methods
US20180280975A1 (en) * 2017-04-04 2018-10-04 Omniome, Inc. Fluidic apparatus and methods useful for chemical and biological reactions

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2006121997A2 (en) * 2005-05-09 2006-11-16 Idaho Technology, Inc. Self-contained biological analysis
US9890424B2 (en) * 2014-06-17 2018-02-13 Life Technologies Corporation Sequencing device
WO2019018759A1 (en) * 2017-07-20 2019-01-24 Ginkgo Biowrks, Inc. SYSTEMS AND METHODS FOR HANDLING CONTROLLED LIQUID

Patent Citations (21)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4168294A (en) * 1977-02-14 1979-09-18 Claudio Calzi Instrument for photometric analyses
JPH02228562A (ja) * 1989-03-02 1990-09-11 Jeol Ltd 自動免疫測定装置
US5993740A (en) * 1995-01-20 1999-11-30 Hitachi, Ltd. Immunoassay method and analyzer using magnetic particles
US20020028926A1 (en) * 2000-09-07 2002-03-07 Yoshiyuki Shoji Nucleic acid purification method and purification apparatus
CN1553969A (zh) * 2001-07-16 2004-12-08 Һ�����������·������ú��о��ľ� 整体块、化学输送系统及用于输送超纯化学制品的方法
CN1596369A (zh) * 2002-07-31 2005-03-16 株式会社东芝 碱基序列检测装置及碱基序列自动解析装置
CN1517712A (zh) * 2003-01-20 2004-08-04 三星电子株式会社 用于检测生物试样中蛋白质的自动流体装置及其方法
CN1767899A (zh) * 2003-04-04 2006-05-03 皇家飞利浦电子股份有限公司 多微通道中的流体分隔
JP2008298755A (ja) * 2007-06-04 2008-12-11 Hitachi High-Technologies Corp 医用光度計
CN101482571A (zh) * 2008-01-07 2009-07-15 霍夫曼-拉罗奇有限公司 试剂盒
CN101960315A (zh) * 2008-02-29 2011-01-26 贝克曼库尔特公司 清洗液体处理探针的装置和方法
JP2010256050A (ja) * 2009-04-22 2010-11-11 Hitachi High-Technologies Corp 自動分析装置
JP2011247617A (ja) * 2010-05-24 2011-12-08 Hitachi High-Technologies Corp 自動分析装置
CN102735812A (zh) * 2012-06-15 2012-10-17 中国科学院长春应用化学研究所 一种生化需氧量的检测方法
US20160319350A1 (en) * 2013-08-08 2016-11-03 Illumina, Inc. Fluidic system for reagent delivery to a flow cell
JP2015040804A (ja) * 2013-08-23 2015-03-02 株式会社日立ハイテクノロジーズ 自動分析装置
US20170144155A1 (en) * 2014-06-05 2017-05-25 Illumina, Inc. Systems and methods including a rotary valve for at least one of sample preparation or sample analysis
CN106093256A (zh) * 2015-04-30 2016-11-09 塞莫费雪科学有限公司 用于减少耗气量的方法和设备
US20170333904A1 (en) * 2016-05-20 2017-11-23 Eli Lyons Sensor system and method for disease detection
US20180188279A1 (en) * 2017-01-05 2018-07-05 Illumina, Inc. Reagent mixing system and methods
US20180280975A1 (en) * 2017-04-04 2018-10-04 Omniome, Inc. Fluidic apparatus and methods useful for chemical and biological reactions

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