CN112150378B - 基于自逆卷积生成对抗网络的低剂量全身pet图像增强方法 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了一种基于自逆卷积生成对抗网络的低剂量全身PET图像增强方法,使用采集的低剂量PET图像和全剂量PET图像训练模型,将低剂量PET图像和训练结果来测试模型,将测试结果保存,得到低剂量PET图像增强结果。本发明通过使用自逆神经网络来实现低剂量和全剂量PET图像之间的相互转换,由于训练的网络具有自逆性,可以有效的降低图像中的噪声和保持图像对比度,有效的提高模型的鲁棒性。本发明网络模型结构简单,计算效率高,能有效的降低图像中的噪声,有效保留图像细节以及对比度,定量误差低于10%。

Description

基于自逆卷积生成对抗网络的低剂量全身PET图像增强方法
技术领域
本发明涉及医学影像设备技术领域,更具体涉及一种基于自逆卷积生成对抗网络的低剂量全身PET图像增强方法。
背景技术
正电子发射计算机断层成像(Positron Emission Tomography)是核医学领域比较先进的临床检查影像技术。通过向人体注射放射性示踪剂药物,药物中的放射性核素衰变产生的一对γ射线,从而得到放射性药物在人体内的分布图。一般放射性示踪剂选取的是生物生命代谢中必须的物质,如:葡萄糖、蛋白质、核酸、脂肪酸,标记上短寿命的放射性核素(如18F,11C等),注入人体后,通过对于该物质在代谢中的聚集,来反映生命代谢活动的情况,从而达到诊断的目的。
由于PET扫描中存在的潜在放射性可能对人体带来辐照损伤,因此临床上非常渴望降低PET的扫描剂量,常见的降低扫描剂量的方法就是降低注射的放射性示踪剂的剂量。然而降低注射剂量会导致图像噪声增加,对比度下降,并最终可能影响到医生的诊断。传统的图像后处理方法包括BM3D,NLM等通常会导致图像过平滑和图像对比度下降等问题。近年来深度学习得到了快速的发展,并广泛应用于医学图像分析当中。为了克服低剂量PET图像中增加的噪声,我们提出了一种使用深度学习模型的方法来增强由于降低PET注射剂量之后重建图像,并有效的保留图像对比度,为医生提供高质量的PET图像。
发明内容
针对现有技术的不足,本发明提供了一种基于自逆卷积生成对抗网络的低剂量全身PET图像增强方法,通过使用自逆神经网络来实现低剂量和全剂量PET图像之间的相互转换,有效的降低图像中的噪声和保持图像对比度。
为实现上述目的,本发明提供了如下技术方案:基于自逆卷积生成对抗网络的低剂量全身PET图像增强方法,使用采集的低剂量PET图像和全剂量PET图像训练模型,将低剂量PET图像和训练结果来测试模型,将测试结果保存,得到低剂量PET图像增强结果。
进一步,上述训练流程为:
(1)采集低剂量和全剂量PET图像;
(2)将低剂量和全剂量PET图像数据集分成训练集、验证集和测试集;
(3)在训练集和验证集中,将低剂量和全剂量PET图像归一化到0-1之间;
(4)在训练集和验证集中,对归一化之后的低剂量与全剂量PET图像分别在相同位置提取3D图像碎片,组成训练数据对;
(5)使用生成的3D图像碎片来训练自逆生成对抗网络;
(6)网络训练完成,保存网络和权重;
(7)使用测试数据来评估模型性能。
进一步,训练自逆生成对抗网络流程为:
(1)产生两个条件图像:低剂量到全剂量条件Z=0,全剂量到低剂量条件Z=1;
(2)将低剂量PET图像和对应的条件文件输入到自逆生成网络G中,生成虚拟的全剂量图像,并与相应的全剂量PET图像计算损失;
(3)将全剂量PET图像和对应的条件文件输入到自逆生成网络G中,生成虚拟的低剂量图像,并与相应的低剂量PET图像计算损失;
(4)将虚拟的全剂量PET图像和真实全剂量PET图像分别输入到全剂量PET图像判别网络D2中,并分别计算损失;
(5)将虚拟的低剂量PET图像和真实低剂量PET图像分别输入到低剂量PET图像判别网络
Figure DEST_PATH_IMAGE001
1中,并分别计算损失;
(6)将模型应用于验证集上,计算验证误差,并判断是否达到最小;
(7)如果验证误差没有达到最小,继续更新网络参数;
(8)如果验证误差达到最小,保存网络和权重。
进一步,损失计算中,网络目标函数包含以下3个损失:
Figure DEST_PATH_IMAGE003
Figure DEST_PATH_IMAGE005
Figure DEST_PATH_IMAGE007
最终的目标函数为:
Figure DEST_PATH_IMAGE009
其中x,y和z分别为低剂量PET图像,全剂量PET图像和条件图像,这里的条件图像用于控制模型从x转换到y或者从y转换到x
进一步,模型测试流程如下,
(1)将采集到的低剂量PET图像进行预处理;
(2)加载训练好的网络和权重;
(3)将预处理好的PET图像输入到网络中进行处理;
(4)将网络输出的结果保存到DICOM文件中。
综上所述,本发明通过使用自逆神经网络来实现低剂量和全剂量PET图像之间的相互转换,由于训练的网络具有自逆性,可以有效的降低图像中的噪声和保持图像对比度,有效的提高模型的鲁棒性。通过训练好的自逆神经网络来实现低剂量PET图像增强以及由全剂量图像来模拟生成低剂量图像。本发明网络模型结构简单,计算效率高,能有效的降低图像中的噪声,有效保留图像细节以及对比度,定量误差低于10%。
附图说明
图1为本发明实施例中自逆生成网络结构框架;
图2为本发明实施例中判别网络框架;
图3为本发明实施例模型框架;
图4为本发明实施例流程;
图5为本发明实施例中模型训练流程;
图6为本发明实施例自逆生成对抗网络训练流程;
图7为本发明实施例测试流程;
图8为本发明实施例头部模型验证和测试效果;
图9为本发明实施例身体模型验证和测试效果。
具体实施方式
参照图1至图9对本发明一种基于自逆卷积生成对抗网络的低剂量全身PET图像增强方法的具体实施方式作进一步的说明。
基于自逆卷积生成对抗网络的低剂量全身PET图像增强方法,使用采集的低剂量PET图像和全剂量PET图像训练模型,将低剂量PET图像和训练结果来测试模型,将测试结果保存,得到低剂量PET图像增强结果。
如图5所示,上述训练流程为:
(1)采集低剂量和全剂量PET图像;
(2)将低剂量和全剂量PET图像数据集分成训练集、验证集和测试集;
(3)在训练集和验证集中,将低剂量和全剂量PET图像归一化到0-1之间;
(4)在训练集和验证集中,对归一化之后的低剂量与全剂量PET图像分别在相同位置提取3D图像碎片,组成训练数据对;
(5)使用生成的3D图像碎片来训练自逆生成对抗网络;
(6)网络训练完成,保存网络和权重;
(7)使用测试数据来评估模型性能。
如图6所示,训练自逆生成对抗网络流程为:
(1)产生两个条件图像:低剂量到全剂量条件Z=0,全剂量到低剂量条件Z=1;
(2)将低剂量PET图像和对应的条件文件输入到自逆生成网络G中,生成虚拟的全剂量图像,并与相应的全剂量PET图像计算损失;
(3)将全剂量PET图像和对应的条件文件输入到自逆生成网络G中,生成虚拟的低剂量图像,并与相应的低剂量PET图像计算损失;
(4)将虚拟的全剂量PET图像和真实全剂量PET图像分别输入到全剂量PET图像判别网络D2中,并分别计算损失;
(5)将虚拟的低剂量PET图像和真实低剂量PET图像分别输入到低剂量PET图像判别网络D2中,并分别计算损失;
(6)将模型应用于验证集上,计算验证误差,并判断是否达到最小;
(7)如果验证误差没有达到最小,继续更新网络参数;
(8)如果验证误差达到最小,保存网络和权重。
进一步,损失计算中,网络目标函数包含以下3个损失:
Figure 344248DEST_PATH_IMAGE003
Figure 543149DEST_PATH_IMAGE005
Figure 212027DEST_PATH_IMAGE007
最终的目标函数为:
Figure 205391DEST_PATH_IMAGE009
其中x,y和z分别为低剂量PET图像,全剂量PET图像和条件图像,这里的条件图像用于控制模型从x转换到y或者从y转换到x
如图7所示,模型测试流程如下,
(1)将采集到的低剂量PET图像进行预处理;
(2)加载训练好的网络和权重;
(3)将预处理好的PET图像输入到网络中进行处理;
(4)将网络输出的结果保存到DICOM文件中。
实施例,头部和身体模型验证和测试效果如图8和图9所示。
以上所述仅是本发明的优选实施方式,本发明的保护范围并不仅局限于上述实施例,凡属于本发明思路下的技术方案均属于本发明的保护范围。应当指出,对于本技术领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明原理前提下的若干改进和润饰,这些改进和润饰也应视为本发明的保护范围。

Claims (3)

1.基于自逆卷积生成对抗网络的低剂量全身PET图像增强方法,其特征在于:使用采集的低剂量PET图像和全剂量PET图像训练模型,将低剂量PET图像和训练结果来测试模型,将测试结果保存,得到低剂量PET图像增强结果;
训练自逆生成对抗网络流程为,
(1)产生两个条件图像:低剂量到全剂量条件Z=0,全剂量到低剂量条件Z=1;
(2)将低剂量PET图像和对应的条件文件输入到自逆生成网络G中,生成虚拟的全剂量图像,并与相应的全剂量PET图像计算损失;
(3)将全剂量PET图像和对应的条件文件输入到自逆生成网络G中,生成虚拟的低剂量图像,并与相应的低剂量PET图像计算损失;
(4)将虚拟的全剂量PET图像和真实全剂量PET图像分别输入到全剂量PET图像判别网络
Figure 983583DEST_PATH_IMAGE001
中,并分别计算损失;
(5)将虚拟的低剂量PET图像和真实低剂量PET图像分别输入到低剂量PET图像判别网络
Figure 852181DEST_PATH_IMAGE002
中,并分别计算损失;
(6)将模型应用于验证集上,计算验证误差,并判断是否达到最小;
(7)如果验证误差没有达到最小,继续更新网络参数;
(8)如果验证误差达到最小,保存网络和权重;
损失计算中,网络目标函数包含以下3个损失,
Figure 230073DEST_PATH_IMAGE003
Figure 660180DEST_PATH_IMAGE004
Figure 123522DEST_PATH_IMAGE005
最终的目标函数为,
Figure 671178DEST_PATH_IMAGE006
其中x,y和z分别为低剂量PET图像,全剂量PET图像和条件图像,这里的条件图像用于控制模型从x转换到y或者从y转换到x。
2.根据权利要求1所述的基于自逆卷积生成对抗网络的低剂量全身PET图像增强方法,其特征在于:模型训练流程为,
(1)采集低剂量和全剂量PET图像;
(2)将低剂量和全剂量PET图像数据集分成训练集、验证集和测试集;
(3)在训练集和验证集中,将低剂量和全剂量PET图像归一化到0-1之间;
(4)在训练集和验证集中,对归一化之后的低剂量与全剂量PET图像分别在相同位置提取3D图像碎片,组成训练数据对;
(5)使用生成的3D图像碎片来训练自逆生成对抗网络;
(6)网络训练完成,保存网络和权重;
(7)使用测试数据来评估模型性能。
3.根据权利要求2所述的基于自逆卷积生成对抗网络的低剂量全身PET图像增强方法,其特征在于:模型测试流程如下,
(1)将采集到的低剂量PET图像进行预处理;
(2)加载训练好的网络和权重;
(3)将预处理好的PET图像输入到网络中进行处理;
(4)将网络输出的结果保存到DICOM文件中。
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