CN111982638B - 生物组织染色方法、装置、计算机设备和存储介质 - Google Patents
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Abstract
本发明提供了一种生物组织染色方法、装置、计算机设备和存储介质，属于组织生物学领域，具体包括：获取待染色的生物组织的组织类型和尺寸参数；根据所述组织类型获取对应的染色模型；将所述尺寸参数输入所述染色模型，输出对所述生物组织标记的标记参数，所述标记参数至少包括标记电流和标记时间，所述染色模型根据进入到所述生物组织的抗体总量计算标记电流和标记时间；根据所述标记参数控制标记装置对所述生物组织进行染色。通过本公开的处理方案，避免阻塞效应，提高厚组织免疫染色的均一性和质量。
Description
技术领域
本发明涉及组织生物学领域，具体涉及一种生物组织染色方法、装置、计算机设备和存储介质。
背景技术
为了实现对生物组织的快速免疫标记，一般基于外加电场驱动加速抗体分子进入组织。但是，由于抗体大分子在自由溶液和致密组织中的电迁移率大小有量级上的差别，抗体分子在电场驱动下，会大量的聚集到组织与溶液的交界面上，形成一种“阻塞效应”，即抗体大分子将组织中的空隙全部填充，使得溶液中的抗体分子无法进入组织，最终组织在边界部分被大量的标记，而内部几乎没有被标记。阻塞效应与电流密度的大小直接相关，而电流密度与电流大小、样本的尺寸和类型等密切相关。因此，为了避免阻塞效应，提高厚组织免疫染色的均一性和质量，迫切需要有一种能根据不同样本，不同抗体分子的选择最佳标记参数的快速免疫标记方法。
发明内容
因此，为了克服上述现有技术的缺点，本发明提供了一种避免阻塞效应，提高厚组织免疫染色的均一性和质量的生物组织染色方法、装置、计算机设备和存储介质。
为了实现上述目的，本发明提供一种生物组织染色方法，包括：获取待染色的生物组织的组织类型和尺寸参数；根据所述组织类型获取对应的染色模型；将所述尺寸参数输入所述染色模型，输出对所述生物组织标记的标记参数，所述标记参数至少包括标记电流和标记时间，所述染色模型根据进入到所述生物组织的抗体总量计算最佳的标记电流和标记时间；根据所述标记参数控制标记装置对所述生物组织进行染色。
在其中一个实施例中，所述染色模型的构建方法，包括：获取样本标记参数和采用所述样本标记参数标记的样本组织的样本组织类型、样本尺寸参数和样本标记结果，所述样本标记参数包括样本标记抗体、样本标记时间和样本标记电流；根据所述样本标记参数、所述样本尺寸参数和所述样本标记结果得到固定时间下，抗体分子进入所述样本组织的抗体总量与电流值的映射关系；根据所述映射关系计算得到与所述样本组织类型对应的抗体的等效迁移率，所述等效迁移率是抗体进入所述样本组织的深度与所述样本标记时间的比值；根据所述等效迁移率和所述映射关系构建染色模型。
在其中一个实施例中，所述等效迁移率根据公式v＝f(c,I,ρ,S,h)计算得到，其中，v为等效迁移率，c为样本标记抗体的浓度，I为样本标记电流值，ρ为组织密度，S为样本组织的截面积，h为抗体进入所述样本组织的深度。
在其中一个实施例中，将所述尺寸参数输入所述染色模型，输出对所述生物组织标记的标记参数之后，包括：获取用于对所述待染色的生物组织进行染色的抗体溶液的液体温度和当前环境温度，根据所述液体温度、当前环境温度和所述标记参数中的所述标记电流计算实际电流输出值。
在其中一个实施例中，所述样本标记电流携带有电流方向。
本发明还提供了一种生物组织染色装置，所述装置包括：参数获取模块，用于获取待染色的生物组织的组织类型和尺寸参数；模型获取模块，用于根据所述组织类型获取对应的染色模型；标记参数输出模块，用于将所述尺寸参数输入所述染色模型，输出对所述生物组织标记的标记参数，所述标记参数至少包括标记电流和标记时间，所述染色模型根据进入到所述生物组织的抗体总量计算标记电流和标记时间；组织染色模块，用于根据所述标记参数控制标记装置对所述生物组织进行染色。
本发明还提供了一种计算机设备，包括存储器和处理器，所述存储器存储有计算机程序，其特征在于，所述处理器执行所述计算机程序时实现上述方法的步骤。
本发明还提供了一种计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序，其特征在于，所述计算机程序被处理器执行时实现上述的方法的步骤。
与现有技术相比，本发明的优点在于：对每种样本针对性输出用于染色的最佳标记参数，从而避免阻塞效应，提高了厚组织免疫染色的均一性和质量。
附图说明
为了更清楚地说明本公开实施例的技术方案，下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图仅仅是本公开的一些实施例，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其它的附图。
图1是本发明的实施例中生物组织染色方法的流程示意图；
图2是本发明的实施例中染色装置的界面示意图；
图3是本发明的实施例中染色装置的结构示意图；
图4是本发明的实施例中染色模型的构建方法的流程示意图；
图5是本发明的实施例中生物组织染色装置的结构框图；
图6是本发明的实施例中染色装置的电路示意图；
图7是本发明的实施例中计算机设备的内部结构图。
具体实施方式
下面结合附图对本公开实施例进行详细描述。
以下通过特定的具体实例说明本公开的实施方式，本领域技术人员可由本说明书所揭露的内容轻易地了解本公开的其他优点与功效。显然，所描述的实施例仅仅是本公开一部分实施例，而不是全部的实施例。本公开还可以通过另外不同的具体实施方式加以实施或应用，本说明书中的各项细节也可以基于不同观点与应用，在没有背离本公开的精神下进行各种修饰或改变。需说明的是，在不冲突的情况下，以下实施例及实施例中的特征可以相互组合。基于本公开中的实施例，本领域普通技术人员在没有作出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都属于本公开保护的范围。
要说明的是，下文描述在所附权利要求书的范围内的实施例的各种方面。应显而易见，本文中所描述的方面可体现于广泛多种形式中，且本文中所描述的任何特定结构及/或功能仅为说明性的。基于本公开，所属领域的技术人员应了解，本文中所描述的一个方面可与任何其它方面独立地实施，且可以各种方式组合这些方面中的两者或两者以上。举例来说，可使用本文中所阐述的任何数个方面来实施设备及/或实践方法。另外，可使用除了本文中所阐述的方面中的一或多者之外的其它结构及/或功能性实施此设备及/或实践此方法。
还需要说明的是，以下实施例中所提供的图示仅以示意方式说明本公开的基本构想，图式中仅显示与本公开中有关的组件而非按照实际实施时的组件数目、形状及尺寸绘制，其实际实施时各组件的型态、数量及比例可为一种随意的改变，且其组件布局型态也可能更为复杂。
另外，在以下描述中，提供具体细节是为了便于透彻理解实例。然而，所属领域的技术人员将理解，可在没有这些特定细节的情况下实践所述方面。
如图1所示，本公开实施例提供一种生物组织染色方法，该方法应用于服务器为例进行说明，服务器可以但不限于是各种个人计算机、笔记本电脑、智能手机、平板电脑和便携式智能设备，包括以下步骤：
步骤S102，获取待染色的生物组织的组织类型和尺寸参数。
组织类型是与组织来源相关的数据，例如动物名称、动物组织器官、是否进行透明化处理等。尺寸参数是与样本尺寸相关的数据，例如，对应脑片等扁方形的组织，尺寸参数包括长、宽、厚度(L，W，H)等数值；对应心脏等圆球形的组织，尺寸参数可以包括直径+厚度(D，H)等数值。服务器获取待染色的生物组织的组织类型和尺寸参数。
步骤S104，根据所述组织类型获取对应的染色模型。
服务器根据动物名称、动物组织器官、是否进行透明化处理和尺寸参数等关键参数从事先构建的染色模型库中，获取相对应的染色模型。染色模型可以包含针对该生物组织适用的抗体类型、浓度以及处理方式。
步骤S106，将尺寸参数输入染色模型，输出对生物组织标记的标记参数，标记参数至少包括标记电流和标记时间，染色模型根据进入到生物组织的抗体总量计算标记电流和标记时间。
标记参数至少包括标记电流和标记时间。当抗体类型、抗体浓度为固定值时，标记参数仅包括标记电流和标记时间，染色模型根据进入到生物组织的抗体总量计算标记电流和标记时间；当抗体类型、抗体浓度需要根据染色环境发生变化时，染色模型不仅根据进入到生物组织的抗体总量计算标记电流和标记时间，还会根据测试环境输出抗体类型、抗体浓度。
服务器将尺寸参数输入染色模型，输出对生物组织标记的标记参数。标记参数可以包含标记电流值is、清洗电流值ic、标记时间ts、清洗时间tc和静置孵育时间ti等。
步骤S108，根据标记参数控制标记装置对生物组织进行染色。
服务器根据标记参数控制标记装置对生物组织进行染色。标记装置，通电对生物组织进行标记，可以包括：染色室主体，具有容纳腔；抗体槽，可拆卸设置在容纳腔内，两个侧面对称设置有与染色室主体连通的半透膜，用于容纳作为染色液的抗体；样本槽，可拆卸设置在抗体槽内，与半透膜对应的位置处设置有容纳生物组织的贯穿孔；以及两个电极板，平行且对称设置在抗体槽的两侧，下端与染色室主体的外部电源连接，用于对包围生物组织的抗体通电，并对生物组织进行标记染色。
如图2所示，标记装置可以同时对多个生物组织进行染色，在一个实施例中，标记装置可以对四个生物组织进行染色，每个生物组织设置在一个通道中，通过标记装置的实验运行界面，可以同时观察四个通道的运行状态，四通道独立控制。标记装置可以是图3所示的标记装置。
上述生物组织染色方法，根据待染色的效果对每种样本针对性输出用于染色的最佳标记参数，从而避免阻塞效应，提高了厚组织免疫染色的均一性和质量。
在其中一个实施例中，如图4所示，染色模型的构建方法，包括以下步骤：
步骤S202，获取样本标记参数和采用样本标记参数标记的样本组织的样本组织类型、样本尺寸参数和样本标记结果，样本标记参数包括样本标记抗体、样本标记时间和样本标记电流。
样本标记参数包括样本标记抗体、样本标记时间和样本标记电流。服务器获取样本标记参数和采用样本标记参数标记的样本组织的样本组织类型、样本尺寸参数和样本标记结果。
如下表所示，服务器可以将获取样本标记参数、样本组织类型、样本尺寸参数和样本标记结果以表格的形式进行存储。样本组织类型可以包含样本名称、组织名称、透明化方法等。样本标记参数是样本组织进行染色的工作参数，在其中一个实施例中，样本标记电流携带有电流方向。样本标记参数可以包含标记流程、流程循环次数、电流方向、标记清洗次数等。表中正向和反向表示的是电流的方向。
步骤S204，根据样本标记参数、样本尺寸参数和样本标记结果得到固定时间下，抗体分子进入样本组织的抗体总量与电流值的映射关系。
服务器根据样本标记参数、样本尺寸参数和样本标记结果得到固定时间下，抗体分子进入样本组织的抗体总量与电流值的映射关系。服务器可以根据上表中包含的样本标记参数、样本尺寸参数和样本标记结果，根据已完成的一系列不同抗体浓度、不同电流密度、不同组织样本、不同缓冲液等条件的免疫标记实验，绘制出在每一组实验条件下，抗体信号强度随组织深度d和标记时间t的变化关系图，每一组保证至少三个重复样本，将得到的图表数据进行积分处理，得到固定时间下，抗体分子进入样本组织的抗体总量与电流值的映射关系，映射关系可以是映射关系图。
步骤S206，根据映射关系计算得到与样本组织类型对应的抗体的等效迁移率，等效迁移率是抗体进入样本组织的深度与样本标记时间的比值。
服务器根据映射关系计算得到与样本组织类型对应的抗体的等效迁移率。服务器根据图表数据，拟合曲线后求导得到映射关系图中的图表曲线的斜率(组织深度/标记时间)，该斜率即为抗体分子的等效迁移率v，该数值的大小直接影响免疫标记的快慢。等效迁移率v与抗体浓度c呈负相关(即抗体浓度越高，抗体分子的迁移越慢)，与电场强度呈现低强度时的正相关、高强度时的负相关(表现为迁移率先随电场强度增加而增加，超过某一值之后随电场强度增加而减小)，与组织密度呈负相关(即越致密的组织，迁移率越小)，与截面积S呈正相关，与深度呈近似负相关的关系。多种因素作用中，尤以电场强度最为显著。在其他变量已知的情况下，必然存在一个E的值，使得v达到最大。在电泳免疫标记实验中，等效迁移率v同时受到抗体浓度、电场强度、组织密度、截面积等因素影响。
在其中一个实施例中，等效迁移率根据公式v＝f(c,I,ρ,S,h)计算得到，其中，v为等效迁移率，c为样本标记抗体的浓度，I为样本标记电流值，ρ为组织密度，S为样本组织的截面积，h为抗体进入样本组织的深度。h均为免疫标记的深度，可以直接用输入的组织厚度信息替换。
步骤S208，根据等效迁移率和映射关系构建染色模型。
服务器根据等效迁移率和映射关系构建与生物组织的组织类型对应的染色模型。针对不同组织样本和不同抗体，在已知抗体浓度，组织种类的基础上，电场强度和等效迁移率v满足相互关系为E＝v/(y(S,h))，并且，电场强度E又满足E＝U/D＝IR/D。
其中，U为对生物组织进行染色的两电极之间电压，D为电极距离，电压U由欧姆定律可知为IR，R值在已知组织种类的基础上基本固定，I为is(标记时候的电流值)或ic(清洗时候的电流值)，表现为电流值。电流值和样本尺寸的对应关系为is(ic)＝vD/(y(S,h)SR)。
根据公式Q＝g(I，t，ρ，S，h，q)构建模型，通过求导，并令其导数等于0的方式，即来求出最佳的电流值，并求出抗体总量Q的最大值，代入到等效迁移率公式计算出等效迁移率，再根据/>计算出时间。
在其中一个实施例中，将尺寸参数输入染色模型，输出对生物组织标记的标记参数之后，包括：获取用于对待染色的生物组织进行染色的抗体溶液的液体温度和当前环境温度，根据液体温度、当前环境温度和标记参数中的标记电流计算实际电流输出值。
标记装置还具有非接触式红外测温探头，通过I2C通信收集温度信息，可避免其他电路信号的干扰，保证测温的精确和方便(非接触更方便)，同时配了静音风扇开关，在温度较低时控制风扇间歇性运作，温度超过25℃时则一直运作。服务器获取用于对待染色的生物组织进行染色的抗体溶液的液体温度和当前环境温度，根据液体温度、当前环境温度和标记参数中的标记电流计算实际电流输出值。
实际电流输出值为It＝Is(Ic)×(1+ζ)，
其中，ζ为温度因子，用于修正仪器因抗体溶液实际运行温度造成的电流输出值与电流理论值的偏差。
服务器根据样本标记抗体、样本标记时间、样本实际电流输出值、样本尺寸参数和样本标记结果得到固定时间下，抗体分子进入样本组织的抗体总量与电流值的映射关系。
在其中一个实施例中，根据步骤S204得到抗体分子进入深度随电流值及时间的映射关系图，通过积分的方式处理原始图像数据，并对多次重复实验的结果拟合，可获得标记深度与标记时间的关系曲线，一系列不同的电流密度条件集合则构成了曲线簇，即h＝j(i,t)，
其中，i为is或ic，标记或清洗时的电流值。该式是实验结果统计的拟合曲线函数，is(ic)＝vD/(y(S,h)SR)。
在一个实施例中，如图5所示，本发明还提供了一种生物组织染色装置，装置包括参数获取模块302、密度计算模块304、标记参数输出模块306和组织染色模块308。
参数获取模块302，用于获取待染色的生物组织的组织类型和尺寸参数。
密度计算模块304，用于根据所述组织类型获取对应的染色模型。
标记参数输出模块306，用于将所述尺寸参数输入所述染色模型，输出对所述生物组织标记的标记参数，所述标记参数至少包括标记电流和标记时间，所述染色模型根据进入到所述生物组织的抗体总量计算标记电流和标记时间。
组织染色模块308，用于根据标记参数控制标记装置对生物组织进行染色。
如图6所示，生物组织染色装置可以通过电源线供电，通过前面板的触控显示屏获取输入参数信息，具体包括样本尺寸信息，样本类型，处理方法等，之后将收集到的信号传输至内部的微处理器(上位机)，通过算法来计算组织密度以及抗体总量和等效迁移率等，从而构建染色模型，之后根据染色模型，输出电流和时间参数给底层控制电路(下位机)，来实际控制抗体标记的进行。其他的回路控制、位置检测、温度传感、运行状态检测模块，都是来辅助仪器标记流程的顺利进行的。通常外部输入口还会连接一个加密的数据库，提供微处理器构建模型时候的数据支持。
在其中一个实施例中，标记参数输出模块306包括样本数据获取单元、映射关系生成单元、等效迁移率计算单元和模型生成单元。
样本数据获取单元，用于获取样本标记参数和采用样本标记参数标记的样本组织的样本组织类型、样本尺寸参数和样本标记结果，样本标记参数包括样本标记抗体、样本标记时间和样本标记电流。
映射关系生成单元，用于根据样本标记参数、样本尺寸参数和样本标记结果得到固定时间下，抗体分子进入样本组织的抗体总量与电流值的映射关系。
等效迁移率计算单元，用于根据映射关系计算得到与样本组织类型对应的抗体的等效迁移率，等效迁移率是抗体进入所述样本组织的深度与所述样本标记时间的比值；模型生成单元，用于根据等效迁移率和映射关系构建染色模型。
在其中一个实施例中，标记参数输出模块306包括温度获取单元和电流值调整。
温度获取单元，用于获取用于对所述待染色的生物组织进行染色的抗体溶液的液体温度和当前环境温度。
电流值调整单元，用于根据所述液体温度、当前环境温度和所述标记参数中的所述标记电流计算实际电流输出值。
在一个实施例中，提供了一种计算机设备，该计算机设备可以是终端，其内部结构图可以如图7所示。该计算机设备包括通过系统总线连接的处理器、存储器、通信接口、显示屏和输入装置。其中，该计算机设备的处理器用于提供计算和控制能力。该计算机设备的存储器包括非易失性存储介质、内存储器。该非易失性存储介质存储有操作系统和计算机程序。该内存储器为非易失性存储介质中的操作系统和计算机程序的运行提供环境。该计算机设备的通信接口用于与外部的终端进行有线或无线方式的通信，无线方式可通过WIFI、运营商网络、NFC(近场通信)或其他技术实现。该计算机程序被处理器执行时以实现一种生物组织染色方法。该计算机设备的显示屏可以是液晶显示屏或者电子墨水显示屏，该计算机设备的输入装置可以是显示屏上覆盖的触摸层，也可以是计算机设备外壳上设置的按键、轨迹球或触控板，还可以是外接的键盘、触控板或鼠标等。
本领域技术人员可以理解，图7中示出的结构，仅仅是与本申请方案相关的部分结构的框图，并不构成对本申请方案所应用于其上的计算机设备的限定，具体的计算机设备可以包括比图中所示更多或更少的部件，或者组合某些部件，或者具有不同的部件布置。
在一个实施例中，提供了一种计算机设备，包括存储器和处理器，存储器中存储有计算机程序，该处理器执行计算机程序时实现以下步骤：获取待染色的生物组织的组织类型和尺寸参数；根据组织类型和尺寸参数得到生物组织的组织密度；将组织类型、尺寸参数和组织密度输入染色模型，输出对生物组织标记的标记参数，标记参数至少包括标记电流和标记时间，染色模型根据进入到生物组织的抗体总量计算标记电流和标记时间；根据标记参数控制标记装置对生物组织进行染色。
在一个实施例中，处理器执行计算机程序时还实现以下步骤：获取样本标记参数和采用样本标记参数标记的样本组织的样本组织类型、样本尺寸参数和样本标记结果，样本标记参数包括样本标记抗体、样本标记时间和样本标记电流；根据样本标记参数、样本尺寸参数和样本标记结果得到固定时间下，抗体分子进入样本组织的抗体总量与电流值的映射关系；根据映射关系计算得到与样本组织类型对应的抗体的等效迁移率，等效迁移率是单位时间内抗体进入样本组织的深度；根据等效迁移率和映射关系构建染色模型。
在一个实施例中，处理器执行计算机程序时还实现以下步骤：等效迁移率根据公式v＝f(c,I,ρ,S,h)计算得到，其中，v为等效迁移率，c为样本标记抗体的浓度，I为样本标记电流值，ρ为组织密度，S为样本组织的截面积，h为抗体进入样本组织的深度。
在一个实施例中，处理器执行计算机程序时还实现以下步骤：样本标记参数还包括样本标记温度和样本标记环境温度，根据样本标记温度和样本标记环境温度和样本标记电流计算样本实际电流输出值；根据样本标记抗体、样本标记时间、样本实际电流输出值、样本尺寸参数和样本标记结果得到固定时间下，抗体分子进入样本组织的抗体总量与电流值的映射关系。
在一个实施例中，处理器执行计算机程序时还实现以下步骤：样本标记电流携带有电流方向。
在一个实施例中，提供了一种计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序，计算机程序被处理器执行时实现以下步骤：获取待染色的生物组织的组织类型和尺寸参数；根据组织类型和尺寸参数得到生物组织的组织密度；将组织类型、尺寸参数和组织密度输入染色模型，输出对生物组织标记的标记参数，标记参数至少包括标记电流和标记时间，染色模型根据进入到生物组织的抗体总量计算标记电流和标记时间；根据标记参数控制标记装置对生物组织进行染色。
在一个实施例中，计算机程序被处理器执行时还实现以下步骤：获取样本标记参数和采用样本标记参数标记的样本组织的样本组织类型、样本尺寸参数和样本标记结果，样本标记参数包括样本标记抗体、样本标记时间和样本标记电流；根据样本标记参数、样本尺寸参数和样本标记结果得到固定时间下，抗体分子进入样本组织的抗体总量与电流值的映射关系；根据映射关系计算得到与样本组织类型对应的抗体的等效迁移率，等效迁移率是抗体进入所述样本组织的深度与所述样本标记时间的比值；根据等效迁移率和映射关系构建染色模型。
在一个实施例中，计算机程序被处理器执行时还实现以下步骤：等效迁移率根据公式v＝f(c,I,ρ,S,h)计算得到，其中，v为等效迁移率，c为样本标记抗体的浓度，I为样本标记电流值，ρ为组织密度，S为样本组织的截面积，h为抗体进入样本组织的深度。
在一个实施例中，计算机程序被处理器执行时还实现以下步骤：样本标记参数还包括样本标记温度和样本标记环境温度，根据样本标记温度和样本标记环境温度和样本标记电流计算样本实际电流输出值；根据样本标记抗体、样本标记时间、样本实际电流输出值、样本尺寸参数和样本标记结果得到固定时间下，抗体分子进入样本组织的抗体总量与电流值的映射关系。
在一个实施例中，计算机程序被处理器执行时还实现以下步骤：样本标记电流携带有电流方向。
以上所述，仅为本公开的具体实施方式，但本公开的保护范围并不局限于此，任何熟悉本技术领域的技术人员在本公开揭露的技术范围内，可轻易想到的变化或替换，都应涵盖在本公开的保护范围之内。因此，本公开的保护范围应以权利要求的保护范围为准。
Claims (7)
1.一种生物组织染色方法，其特征在于，包括：
获取待染色的生物组织的组织类型和尺寸参数；
根据所述组织类型获取对应的染色模型；
将所述尺寸参数输入所述染色模型，输出对所述生物组织标记的标记参数，所述标记参数至少包括标记电流和标记时间，所述染色模型根据进入到所述生物组织的抗体总量计算标记电流和标记时间；
根据所述标记参数控制标记装置对所述生物组织进行染色。
2.根据权利要求1所述的生物组织染色方法，其特征在于，所述染色模型的构建方法，包括：
获取样本标记参数和采用所述样本标记参数标记的样本组织的样本组织类型、样本尺寸参数和样本标记结果，所述样本标记参数包括样本标记抗体、样本标记时间和样本标记电流；
根据所述样本标记参数、所述样本尺寸参数和所述样本标记结果得到固定时间下，抗体分子进入所述样本组织的抗体总量与电流值的映射关系；
根据所述映射关系计算得到与所述样本组织类型对应的抗体的等效迁移率，所述等效迁移率是抗体进入所述样本组织的深度与所述样本标记时间的比值；
根据所述等效迁移率和所述映射关系构建染色模型。
3.根据权利要求2所述的生物组织染色方法，其特征在于，所述样本标记电流携带有电流方向。
4.根据权利要求1所述的生物组织染色方法，其特征在于，将所述尺寸参数输入所述染色模型，输出对所述生物组织标记的标记参数之后，包括：
获取用于对所述待染色的生物组织进行染色的抗体溶液的液体温度和当前环境温度，
根据所述液体温度、当前环境温度和所述标记参数中的所述标记电流计算实际电流输出值。
5.一种生物组织染色装置，其特征在于，所述装置包括：
参数获取模块，用于获取待染色的生物组织的组织类型和尺寸参数；
模型获取模块，用于根据所述组织类型获取对应的染色模型；
标记参数输出模块，用于将所述尺寸参数输入所述染色模型，输出对所述生物组织标记的标记参数，所述标记参数至少包括标记电流和标记时间，所述染色模型根据进入到所述生物组织的抗体总量计算标记电流和标记时间；
组织染色模块，用于根据所述标记参数控制标记装置对所述生物组织进行染色。
6.一种计算机设备，包括存储器和处理器，所述存储器存储有计算机程序，其特征在于，所述处理器执行所述计算机程序时实现权利要求1至4中任一项所述方法的步骤。
7.一种计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序，其特征在于，所述计算机程序被处理器执行时实现权利要求1至4中任一项所述的方法的步骤。
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Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6409774B1 (en) * | 1999-06-11 | 2002-06-25 | Resolution Sciences Corporation | Electrophoresis-assisted staining of materials |
| CN102749369A (zh) * | 2012-07-17 | 2012-10-24 | 杨锦宇 | 一种高效高灵敏度的生物大分子转膜、染色系统和设备 |
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Family Cites Families (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20060275917A1 (en) * | 2005-06-02 | 2006-12-07 | The Lab. Of Bio-Informatics Technology | Method for staining and destaining gel, electrophoresis destaining device for gel, and kit for staining and destaining gel |
| JP5629850B2 (ja) * | 2010-07-02 | 2014-11-26 | 国立大学法人秋田大学 | 免疫組織染色方法および免疫組織染色装置 |
| JP6654634B2 (ja) * | 2014-12-03 | 2020-02-26 | ベンタナ メディカル システムズ， インコーポレイテッド | 不均一なバイオマーカー分布を定量的に分析するための方法、システム及び装置 |
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Patent Citations (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6409774B1 (en) * | 1999-06-11 | 2002-06-25 | Resolution Sciences Corporation | Electrophoresis-assisted staining of materials |
| CN1363006A (zh) * | 1999-06-11 | 2002-08-07 | 分析科学公司 | 物质的电泳辅助染色 |
| CN102749369A (zh) * | 2012-07-17 | 2012-10-24 | 杨锦宇 | 一种高效高灵敏度的生物大分子转膜、染色系统和设备 |
| CN108572099A (zh) * | 2018-04-23 | 2018-09-25 | 上海交通大学 | 一种实现生物组织快速染色的方法和装置 |
| CN111413184A (zh) * | 2020-05-02 | 2020-07-14 | 上海诒福科技有限公司 | 染色装置以及生物组织标记设备 |
Non-Patent Citations (1)
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| 吕春梅等.建立基于超薄切片的高分辨成像技术解析组织的精细空间结构.上海交通大学学报（医学版）.2012,(第11期),121-126. * |
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