CN111816314A - 一种用于人工智能筛查尘肺病胸片遴选、标注及验证方法 - Google Patents

一种用于人工智能筛查尘肺病胸片遴选、标注及验证方法 Download PDF

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Abstract

一种用于人工智能筛查尘肺病胸片遴选、标注及验证方法;包括计算机硬件系统及控制软件系统,计算机硬件系统包括中央处理器、存储器、输入输出控制系统;其方法包括以下步骤:基础数据库的建立、计算与建模、对人工智能模型验证。本发明可准确和高效的对尘肺病胸片进行标注,并用于人工智能筛查尘肺模型的建立,使人工智能在接触粉尘工人职业健康检查筛查和尘肺病辅助诊断中,提高筛查和诊断准确率、提高工作效率。

Description

一种用于人工智能筛查尘肺病胸片遴选、标注及验证方法
技术领域
本发明涉及职业健康检查筛查或辅助诊断尘肺病方法,特别涉及统计功效估计遴选样本数、并联与串联相结合的尘肺病胸片读片标注、人工智能模型验证等技术。
背景技术
尘肺病是在职业活动中长期吸入生产性矿物性粉尘并在肺内潴留而引起的以肺组织弥漫性纤维化为主的肺部疾病,是目前世界上危害最严重和最常见的职业病。
目前尘肺病主要以X射线高千伏或数字化摄影(DR)后前位胸片作为筛查或诊断依据。长期的实践和研究证明,在尘肺病体检或诊断中,读片差异是客观存在的。在遵循相同的诊断原则及读片条件下,不同读片者或同一读片者前后判断的结果均不尽相同,这种差异严重影响尘肺病筛查或诊断的准确性,极易产生误诊或漏诊。通过检索1990年1月1日至2018年8月10日中国关于尘肺病诊断差异的文献资料并进行系统分析,结果显示,对尘肺病诊断的总体符合率在15.0%至64.0%之间。
近年来,人工智能在医疗卫生领域的研究与应用发展迅速。人工智能以强大的学习能力、计算能力、识别能力作为诊疗辅助手段发挥了重要作用,尤其是利用影像学数据对肺部疾病进行诊断发展迅速。使用决策树、支持向量机、卷积神经网络算法构建的模型,在对肺部疾病包括尘肺病诊断方面都取得了比较理想的结果。人工智能筛查或辅助诊断尘肺病,对减少读片差异和提高诊断准确性将发挥积极的作用。但建立人工智能模型需要使用胸片样本,而且要对胸片进行准确标记。
如采用传统方法,使用大量胸片样本,个人或集体对尘肺病胸片读片标注,由于受主观因素的影响,仍存在30~40%的较大差异,严重影响人工智能筛查或诊断尘肺病准确性,且成本效率不合理。
技术内容
本发明的目的是,提供一种采用统计功效估计方法遴选样本和并联与串联相结合读片标注方法,建立人工智能筛查尘肺病系统,通过验证获得理想效果。使人工智能在接触粉尘工人职业健康检查筛查和尘肺病辅助诊断中,提高筛查和诊断准确率,以及提高工作效率。
本发明的目的可以通过以下技术方案实现,一种用于人工智能筛查尘肺病胸片遴选、标注及验证方法;人工智能系统包括计算机硬件系统及控制软件系统,计算机硬件系统包括中央处理器、存储器、输入输出控制系统;其所述方法包括以下步骤:
1)、基础数据库的建立:
(1)采用统计功效估计方法遴选DR(数字化X线摄影)胸片:
选取DR正常胸片、壹期尘肺病胸片、贰期尘肺病胸片、叁期尘肺病胸片若干份;
(2)依据《职业性尘肺病诊断》(GBZ70-2015),对选取的上述胸片进行分区,按两侧肺野6个肺区范围,将左肺野及右肺野,分别由肺尖至膈顶的垂直距离,用等分点的水平线把每侧肺野各分为上、中、下三个肺区,即将胸片左右肺野共分为6个区域;
(3)依据《职业性尘肺病诊断》(GBZ70-2015),并对采用统计功效估计方法遴选的胸片,由人工进行每一区域的特征标注,具体特征标注为:
A、小阴影形态和大小:记录小阴影的形态和大小,分别用p、q、r、s、t、u标记或组合标注,如p/p、p/q、q/q、q/p、p/s、s/s、s/t、t/t、t/s等;
B、密集度:按三大级及十二小级分级标注,表示如下:0/-、0/0、0/1为0级;1/0、1/1、1/2为1级;2/1、2/2、2/3为2级;3/2、3/3、3/+为3级;
C、总体密集度:以4大级分级标注,表示如下:0、1、2、3级;
D、大阴影:用4表示,并标注所处肺区,同时在胸片上用红色线条画图标注;
E、小阴影聚集:用9表示,并标注所处肺区,同时在胸片上用绿色线条画图标注;
F、分布范围:将胸片中具有的上述特征,分别在两肺野相应肺区标注,以表示分布范围;
(4)人工标注:
采用并联与串联相结合方法,即双盲与集体读片方法读片标注,以提高标准片的精准性;
A、将人工分为A、B两组,每组2人以上,各组分别独立读片,并用上述特征对每个肺区进行标注,诊断为尘肺及分期结果一致的胸片作为标准片;诊断结果不一致的胸片,随机再次分配给各组读片,诊断为尘肺及分期结果一致的胸片作为标准片;
B、对于两组读片结果不一致胸片,A组与B组共同读片,或另选同等条件的人工,即C组读片,诊断为尘肺及分期结果一致的作为标准片,认定未超过2/3一致的胸片剔除,每次读片间隔2周以上;
C、将标准片按分期结果分别存入计算机正常胸片标准数据库、壹期胸片标准数据库、贰期胸片标准数据库、叁期胸片标准数据库;
2)、计算与建模
采用深度学习方法之一的卷积神经网络法,对DR胸片DICOM图像进行学习训练,包括正常胸片标准数据库、壹期胸片标准数据库、贰期胸片标准数据库、叁期胸片标准数据库中的特征标注,建立人工智能筛查尘肺病初级模型;
由于原规格胸片分辨率较低,首先使胸片规格调整变小,对胸片两肺野进行抠影,并分为6个区域,以提高胸片分辨率,胸片重新调整至原规格,便于计算机对图像的识别;
模型共包含3个组件:输入层、隐藏层和输出层;其中,输入层用于接受DR胸片DICOM图像的输入,并传递给隐藏层,最终将信号传递给输出层;最后得出尘肺病及分期的预测结果;
3)、对人工智能模型验证:
(1)计算机录入用于验证的胸片,计算识别该胸片的特征,小阴影形态和大小、密集度、总体密集度、分布范围、大阴影、小阴影聚集,并分别存入待查胸片数据库;
(2)计算机将待查胸片数据库中该胸片的特征,输入筛查尘肺病初级模型,经过计算得出结果,生成尘肺病及分期的诊断报告;
(3)筛查尘肺病初级模型计算运行结束后,将该待查胸片、诊断结果存入诊断数据库;
(4)由两人以上的人工对诊断数据库中的疑似尘肺病的胸片读片,将读片最终诊断与计算机输出诊断结果对比进行验证,分别统计分析:阴阳准确率(ACCscr)、灵感度(SEN)、特异度(SPE)、分期准确率(ACCsta);具体的计算为:
A、指标为:真阴性(TN)、伪阴性(FN)、伪阳性(FP)、真阳性(TP);
B、计算公式为:
Figure BDA0002564927730000051
Figure BDA0002564927730000052
Figure BDA0002564927730000053
Figure BDA0002564927730000054
Figure BDA0002564927730000061
Figure BDA0002564927730000062
Figure BDA0002564927730000063
(5)经上述统计分析,筛选尘肺病准确率达到97%或以上,分期准确率达到80%或以上,灵敏度0.98,特异度0.97,验证结果显示所建筛查尘肺病模型效果良好。
本发明可准确和高效的对尘肺病胸片进行标注,并用于人工智能筛查尘肺模型的建立,使人工智能在接触粉尘工人职业健康检查筛查和尘肺病辅助诊断中,提高筛查和诊断准确率、提高工作效率。
具体实施方式
一种用于人工智能筛查尘肺病胸片遴选、标注及验证方法;人工智能系统包括计算机硬件系统及控制软件系统,计算机硬件系统包括中央处理器、存储器、输入输出控制系统;其特征在于所述方法包括以下步骤:
1、基础数据库的建立
(1)胸片遴选数量:本发明中胸片的遴选,是基于统计功效估计方式来确定遴选胸片张数的,遴选胸片以下统计功效是基于最小ROC曲线(接收者操作特征曲线)下面积(AUC)0.85来计算的。ROC曲线,即接收者操作特征曲线,是一种坐标图式的分析工具,用于选择最佳分类模型、舍弃次佳分类模型。AUC(Area under the Curve of ROC),即ROC曲线下方的面积。
对于N1例正常胸片对比样本和N2例尘肺壹期胸片样本,计算的统计功效为0.89。如果真实的AUC是0.90,那么模型更够准确的区分正常胸片样本和尘肺壹期胸片样本的AUC显著高于0.85(显著水平为0.05)。
对于N2例尘肺壹期胸片样本和N3例尘肺贰期胸片样本,计算的统计功效为0.90。如果真实的AUC是0.88,那么模型更够准确的区分正常胸片样本和尘肺壹期胸片样本的AUC显著高于0.85(显著水平为0.05)。
对于N3例尘肺贰期胸片样本和N4例尘肺叁期胸片样本,计算的统计功效为0.77。如果真实的AUC是0.88,那么模型更够准确的区分正常胸片样本和尘肺壹期胸片样本的AUC显著高于0.85(显著水平为0.05)。
根据计算结果,收集数字化X射线(Digital Radiography,DR)胸片DICOM原图数据共N例,胸片质量3级以上(不含3级),其中壹期胸片、贰期胸片各N2、N3例,叁期胸片N4例,健康人DR胸片N1例,完全可以满足人工智能筛查尘肺病系统的需要。
(2)标注特征
1)依据《职业性尘肺病诊断》(GBZ70-2015),对人工选取的上述胸片进行尘肺病胸片的分区,即将胸片左右肺野分为6个区域;
2)依据《职业性尘肺病诊断》(GBZ70-2015),对人工选取的上述胸片由人工进行每一区域的特征标注,具体特征标注为;
a.小阴影形态和大小:记录小阴影的形态和大小,分别用p、q、r、s、t、u标记或组合标注,如p/p、p/q、q/q、q/p、p/s、s/s、s/t、t/t、t/s等;
b.密集度:按三大级及十二小级分级标注,表示如下:0/-、0/0、0/1为0级;1/0、1/1、1/2为1级;2/1、2/2、2/3为2级;3/2、3/3、3/+为3级;
c.总体密集度:以4大级分级标注,表示如下:0、1、2、3级;
d.大阴影:用4表示,并标注所处肺区,同时在胸片上用红色线条画图标注;
e.小阴影聚集:用9表示,并标注所处肺区,同时在胸片上用绿色线条画图标注。
f.分布范围:将胸片中具有的上述特征分别在两肺野相应肺区标注,以表示分布范围。
(3)标注方法
1)将具有尘肺病诊断资格、高级职称、从事专业技术工作10年以上专家分为A、B两组,每组2人以上,各组分别独立读片,并用上述方法对每个肺区进行标注,诊断为尘肺及分期结果一致的胸片作为标准片;诊断结果不一致的胸片,随机再次分配给各组读片,诊断为尘肺及分期结果一致的胸片作为标准片;
2)对于两组读片结果不一致胸片,A组与B组共同读片,或另选同等条件的人工,即C组读片,诊断为尘肺及分期结果一致的作为标准片,认定未超过2/3一致的胸片剔除,每次读片间隔2周以上;
3)将标准片按分期结果分别存入计算机正常胸片标准数据库、壹期胸片标准数据库、贰期胸片标准数据库、叁期胸片标准数据库。
2、计算与建模:
采用深度学习方法之一的卷积神经网络,分别对正常胸片标准数据库、壹期胸片标准数据库、贰期胸片标准数据库、叁期胸片标准数据库中的胸片的特征标注,包括小阴影形态和大小、密集度、总体密集度、分布范围、大阴影、小阴影聚集等,进行学习训练,并建立人工智能筛查尘肺病模型。所述模型共包含3个组件:输入层、隐藏层和输出层;其中,输入层用于接受原始DICOM图像的输入,并传递给隐藏层。隐藏层可设置不同层数的神经元,或采用不同的排布结构,并最终将信号传递给输出层。输出层汇总隐藏层最后一层的信号,得出尘肺胸片分期的预测结果。
3、对尘肺病模型验证
(1)计算机录入用于验证的胸片,存入待查胸片数据库,计算机识别该胸片的特征,小阴影形态和大小、密集度、总体密集度、分布范围、大阴影、小阴影聚集,并分别存入待查胸片影像特征数据库;
(2)计算机将待查胸片影像特征数据库中该胸片的特征,输入筛查尘肺病初期模型,经计算,并给出诊断结果,生成具有上述数据的诊断报告;
(3)计算机将该待查胸片、诊断结果存入诊疗数据库。
(4)由具有尘肺病诊断资格、高级职称、从事专业技术工作10年以上专家,集体对计算得出的疑似尘肺病结果的胸片读片,将读片最终诊断与计算机输出诊断结果对比,进行验证,并统计分析:阴阳准确率(ACCscr)、灵感度(SEN)、特异度(SPE)、分期准确率(ACCsta);具体的计算为:
1)指标为:真阴性(TN)、伪阴性(FN)、伪阳性(FP)、真阳性(TP);
2)计算公式为:
Figure BDA0002564927730000101
Figure BDA0002564927730000102
Figure BDA0002564927730000103
Figure BDA0002564927730000104
Figure BDA0002564927730000105
Figure BDA0002564927730000106
Figure BDA0002564927730000107
(5)经上述统计分析,筛选准确率达到97%或以上,分期准确率达到80%或以上,灵敏度0.98,特异度0.97,验证结果:所建筛查尘肺病模型效果良好。

Claims (1)

1.一种用于人工智能筛查尘肺病胸片遴选、标注及验证方法;人工智能系统包括计算机硬件系统及控制软件系统,计算机硬件系统包括中央处理器、存储器、输入输出控制系统;其特征在于所述方法包括以下步骤:
1)、基础数据库的建立:
(1)采用统计功效估计方法遴选DR(数字化X线摄影)胸片:选取DR正常胸片、壹期尘肺病胸片、贰期尘肺病胸片、叁期尘肺病胸片若干份;
(2)依据《职业性尘肺病诊断》(GBZ70-2015),对选取的上述胸片进行分区,按两侧肺野6个肺区范围,将左肺野及右肺野,分别由肺尖至膈顶的垂直距离,用等分点的水平线把每侧肺野各分为上、中、下三个肺区,即将胸片左右肺野共分为6个区域;
(3)依据《职业性尘肺病诊断》(GBZ70-2015),并对采用统计功效估计方法遴选的胸片,由人工进行每一区域的特征标注,具体特征标注为:
A、小阴影形态和大小:记录小阴影的形态和大小,分别用p、q、r、s、t、u标记或组合标注,如p/p、p/q、q/q、q/p、p/s、s/s、s/t、t/t、t/s等;
B、密集度:按三大级及十二小级分级标注,表示如下:0/-、0/0、0/1为0级;1/0、1/1、1/2为1级;2/1、2/2、2/3为2级;3/2、3/3、3/+为3级;
C、总体密集度:以4大级分级标注,表示如下:0、1、2、3级;
D、大阴影:用4表示,并标注所处肺区,同时在胸片上用红色线条画图标注;
E、小阴影聚集:用9表示,并标注所处肺区,同时在胸片上用绿色线条画图标注;
F、分布范围:将胸片中具有的上述特征,分别在两肺野相应肺区标注,以表示分布范围;
(4)人工标注:
采用并联与串联相结合方法,即双盲与集体读片方法读片标注,以提高标准片的精准性;
A、将人工分为A、B两组,每组2人以上,各组分别独立读片,并用上述特征对每个肺区进行标注,诊断为尘肺及分期结果一致的胸片作为标准片;诊断结果不一致的胸片,随机再次分配给各组读片,诊断为尘肺及分期结果一致的胸片作为标准片;
B、对于两组读片结果不一致胸片,A组与B组共同读片,或另选同等条件的人工,即C组读片,诊断为尘肺及分期结果一致的作为标准片,认定未超过2/3一致的胸片剔除,每次读片间隔2周以上;
C、将标准片按分期结果分别存入计算机正常胸片标准数据库、壹期胸片标准数据库、贰期胸片标准数据库、叁期胸片标准数据库;
2)、计算与建模
采用深度学习方法之一的卷积神经网络法,对DR胸片DICOM图像进行学习训练,包括正常胸片标准数据库、壹期胸片标准数据库、贰期胸片标准数据库、叁期胸片标准数据库中的特征标注,建立人工智能筛查尘肺病初级模型;
由于原规格胸片分辨率较低,首先使胸片规格调整变小,对胸片两肺野进行抠影,并分为6个区域,以提高胸片分辨率,胸片重新调整至原规格,便于计算机对图像的识别;
模型共包含3个组件:输入层、隐藏层和输出层;其中,输入层用于接受DR胸片DICOM图像的输入,并传递给隐藏层,最终将信号传递给输出层;最后得出尘肺病及分期的预测结果;
3)、对人工智能模型验证:
(1)计算机录入用于验证的胸片,计算识别该胸片的特征,小阴影形态和大小、密集度、总体密集度、分布范围、大阴影、小阴影聚集,并分别存入待查胸片数据库;
(2)计算机将待查胸片数据库中该胸片的特征,输入筛查尘肺病初级模型,经过计算得出结果,生成尘肺病及分期的诊断报告;
(3)筛查尘肺病初级模型计算运行结束后,将该待查胸片、诊断结果存入诊断数据库;
(4)由两人以上的人工对诊断数据库中的疑似尘肺病的胸片读片,将读片最终诊断与计算机输出诊断结果对比进行验证,分别统计分析:阴阳准确率(ACCscr)、灵感度(SEN)、特异度(SPE)、分期准确率(ACCsta);具体的计算为:
A、指标为:真阴性(TN)、伪阴性(FN)、伪阳性(FP)、真阳性(TP);
B、计算公式为:
Figure FDA0002564927720000041
Figure FDA0002564927720000042
Figure FDA0002564927720000043
Figure FDA0002564927720000044
Figure FDA0002564927720000045
Figure FDA0002564927720000046
Figure FDA0002564927720000047
(5)经上述统计分析,筛选尘肺病准确率达到97%或以上,分期准确率达到80%或以上,灵敏度0.98,特异度0.97,验证结果显示所建筛查尘肺病模型效果良好。
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