CN111768873A - 一种covid-19实时风险预测方法 - Google Patents

一种covid-19实时风险预测方法 Download PDF

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Abstract

本发明公开了一种COVID‑19实时风险预测方法,包括以下步骤:获取疫情危险评估数据和社会脆弱性评估数据;建立传染数衰减方程和疫情传播动力学模型;根据传染数衰减方程和疫情传播动力学模型对疫情危险性评估数据进行预测;建立熵值‑层次分析法组合模型;根据熵值‑层次分析组合模型、疫情危险评估数据和社会脆弱性评估数据进行疫情风险预测;绘制疫情风险预测等级地图;本方法为后期疫情防控决策提供了支持,同时也可用于今后新的疫情发生时期或其他突发性公共安全事件下风险的应急预测。

Description

一种COVID-19实时风险预测方法
技术领域
本发明涉及数据分析技术领域,尤其涉及一种COVID-19实时风 险预测方法。
背景技术
学术上关于COVID-19风险预测主要是风险概率分析,通过分析 病原体及传染源、潜在传染源的输入、传播途径、传播潜力等得出特 定地点和环境下出现疫情爆发的风险。这些方法主要考虑疫情传播感 染病例数等特征,风险评估指标集不够完备,没有耦合经济、人口、 政策和医疗措施等指标,风险预测的准确性有待提高;风险预测方法 没有结合疫情传播动力学机制,在长时间预测方面存在一定缺陷,限 制了地区风险预测的准确性和合理性;同时在研究传染病传播和发展 规律方面,传统疫情动力学模型也存在一定缺陷:忽视了政策和病毒 自身随时间变化的特征,不能够对真实疫情发展规律进行拟合仿真。
发明内容
有鉴于此,本发明提出了一种COVID-19实时风险预测方法,以 解决如何提高风险预测的准确性,实现不同区域风险分级预测的问题。 为实现上述目的,本发明提出的COVID-19实时风险预测方法包括步 骤:
S1、获取疫情基础病例数据;
S2、根据S1获取的疫情基础病例数据建立传染数衰减方程得到基 本传染数,再根据基本传染数和S1获取的疫情基础病例数据建立疫 情传播动力学模型;
S3、将本区域实时易感者、感染者、潜伏者、治愈者以及死亡者 数据作为疫情传播动力学模型的输入数据,对本区域实时疫情基础病 例数据进行预测;
S4、根据本区域实时疫情基础病例数据,计算疫情危险性数据;
S5、确定社会脆弱性数据;
S6、对疫情危险性数据和社会脆弱性数据进行归一化处理,分别 建立熵值-层次分析法组合模型,得到疫情危险性数据权重矩阵和社 会脆弱性数据权重矩阵;
S7、根据疫情危险性数据权重矩阵、社会脆弱性数据权重矩阵、 疫情危险性数据以及社会脆弱性数据进行区域疫情风险预测,根据预 测风险值将区域疫情风险划分为三个等级,三级风险是风险值<0.3, 二级风险是0.3≤风险值≤0.5,一级风险是风险值>0.5;
S8、根据S7风险等级,利用ArcMap10.2软件绘制疫情风险预测 等级地图。
进一步地,疫情病例基础数据包括区域人口、区域面积、累计确 诊病例、累计死亡病例以及累计治愈病例。
进一步地,所述S2中传染数衰减方程如下:
Figure BDA0002522743790000031
其中,C为基本传染数,C0为疫情初期基本传染数,k为衰 减系数,t0为预计传染病消失的时间,t为时间。
进一步地,所述S2中疫情传播动力学模型如下:
Figure BDA0002522743790000032
其中,C为基本传染数,当C<1时,传染病将会逐渐消失;β 为发病率;θ是潜伏者相对于传染者的传染能力;S为易感者,σ为 潜伏者转化感染者的速率,为1/潜伏期;α为致死率;γ为感染者治愈 的速率,本文中时间单位为d,每个时间步长为1d,I为感染者,E 为潜伏者,R为治愈者,D为死亡者,t为时间。
进一步地,所述易感者=区域人口-累计确诊病例;感染者=累计 确诊病例-累计死亡病例-累计治愈病例;潜伏者(t)=累计确诊病例 (t+a)-累计确诊病例(t),t为时间,a为潜伏期;治愈者=累计治愈病例; 死亡者=累计死亡病例。
进一步地,疫情危险性数据包括每日新增确诊病例密度、现存确 诊病例密度、累计死亡人数密度、死亡率、连续3天有无新增以及14天有无聚集性疫情。
进一步地,每日新增确诊病例密度=(当日累计确诊人数-前一日 累计确诊人数)/区域面积;现存确诊病例密度=(累计确诊病例-累 计治愈病例-累计死亡病例)/区域面积;累计死亡人数密度=累计死 亡病例/区域面积;死亡率=累计死亡病例/累计确诊人数。
进一步地,社会脆弱性数据包括人口密度、年龄大于一定值以上 人口占比、人均GDP和每万人病床数。
进一步地,疫情危险性数据权重矩阵和社会脆弱性数据权重矩阵 步骤如下:
S61、用归一化处理后的疫情危险性数据构建熵值法模型和层次 分析法模型;
S62、将熵值法模型中各数据权重系数v=(v1,v2,v3,......vn) 和层次分析法模型中各数据权重系数w=(w1,w2,w3,......wn)进 行加权平均,计算得到疫情危险性数据权重矩阵σi
Figure BDA0002522743790000041
S63、用归一化处理后的社会脆弱性数据构建熵值法模型和层次 分析法模型;
S64、将熵值法模型中各数据权重系数v=(v1,v2,v3,......vn) 和层次分析法模型中各数据权重系数w=(w1,w2,w3,......wn)进 行加权平均,计算得到社会脆弱性数据权重矩阵σj
Figure BDA0002522743790000042
其中,σi指第i疫情危险性数据对应权重,i=1.....n,σj指第j个 社会脆弱性数据对应权重,j=1.....n,n为权重总个数。
进一步地,步骤S7预测风险值计算如下:
疫情危险性值=疫情危险性数据×疫情危险性数据权重;
社会脆弱性值=社会脆弱性数据×社会脆弱性数据权重;
预测风险值=疫情危险性值×社会脆弱性值。
本发明提供的技术方案带来的有益效果是:
(1)建立了更加完备的指标集,能够更加准确地预测区域疫情 风险;同时建立了传染数衰减方程,考虑了政策和病毒随时间变化的 特征,使疫情传播动力学模型能够更好地拟合疫情发展的整个过程;
(2)将疫情动力学模型和疫情风险预测相结合,实现区域风险 的动态预测,进而进行风险等级划分,绘制风险地图,为风险控制措 施提供辅助决策。
附图说明
图1是本发明一种COVID-19实时风险预测方法流程图;
图2是一种COVID-19实时风险预测方法欧洲8国疫情动态传播 预测图;
图3是一种COVID-19实时风险预测方法欧洲8国疫情风险演变 趋势预测图;
图4是一种COVID-19实时风险预测方法欧洲8国疫情风险预测 等级地图。
具体实施方式
为了对本发明的技术特征、目的和效果有更加清楚的理解,现对 照附图详细说明本发明的具体实施方式。
参阅图1所示,是本发明一种COVID-19实时风险预测方法的流 程图,本实施例对欧洲8个国家进行了疫情风险预测,具体步骤如下:
S1、获取疫情基础病例数据;
在本实施例中,疫情基础病例数据包括区域基本概况(区域人口、 区域面积)和欧洲8国疫情发生时间至2020年4月16日病例统计数 据(累计确诊病例、累计死亡病例、累计治愈病例),本方法疫情基 础病例数据来自腾讯、丁香园和WHO等。
S2、根据S1获取的疫情基础病例数据建立传染数衰减方程得到基 本传染数,传染数衰减方程如下:
Figure BDA0002522743790000061
其中,C为基本传染数,C0为疫情初期基本传染数,k为衰减系 数,本实施例中,0.1≤k≤0.3,t0为预计传染病消失的时间,t为时间, 根据基本传染数和S1获取的疫情基础病例数据建立疫情传播动力学 模型,疫情传播动力学模型如下:
Figure BDA0002522743790000062
其中,C为基本传染数,当C<1时,传染病将会逐渐消失;β 为发病率;θ是潜伏者相对于传染者的传染能力,本实例认为潜伏期 患者与确诊患者传染能力相同,取值为1;S为易感者,σ为潜伏者转 化感染者的速率,为1/潜伏期,本实施例中取1/7;α为致死率;γ为感染者治愈的速率,本文中时间单位为d,每个时间步长为1d,I为 感染者,E为潜伏者,R为治愈者,D为死亡者,t为时间;
S3、将本区域实时易感者、感染者、潜伏者、治愈者以及死亡者 数据作为疫情传播动力学模型的输入数据,对本区域实时疫情基础病 例数据进行预测;
所述易感者=区域人口-累计确诊病例;感染者=累计确诊病例-累 计死亡病例-累计治愈病例;本方法认为潜伏者在经历a潜伏期后将 会转化成感染者,潜伏者(t)=累计确诊病例(t+a)-累计确诊病例(t),a 为潜伏期,t为时间;治愈者=累计治愈病例;死亡者=累计死亡病例, 疫情传播动力学模型参数β发病率、α致死率和γ感染者治愈的速率皆采用马尔可夫链方法或欧拉数值方法或非线性最小二乘拟合方法求 解。
在本实施例中,利用欧洲8国疫情发生时间至2020年4月16日 病例统计数据,计算易感者、感染者、潜伏者、治愈者以及死亡者五 项输入数据,采用非线性最小二乘拟合方法求解参数,得到疫情传播 动力学模型。输入2020年4月17日真实疫情基础病例数据,即可对欧洲8国累计确诊病例、累计死亡病例、现存确诊病例、累计死亡病 例进行预测,欧洲8国现存确诊病例预测结果如图2所示。
S4、根据本区域实时疫情基础病例数据,计算疫情危险性数据; 疫情危险性数据包括每日新增确诊病例密度、现存确诊病例密度、累 计死亡人数密度、死亡率、连续3天有无新增以及14天有无聚集性 疫情,在本实施例中,考虑到相较于感染病例数指标,感染病例密度, 即感染人数除以地区面积能够更准确地反映疫情传播的严重程度,聚 集性疫情容易导致疫情大规模传播,死亡率更是表明区域疫情的危险 性,因此采用新增确诊密度、现存确诊密度、累计死亡病例密度、死 亡率、连续3天有无新增和聚集性疫情作为预测危险性数据;
新增确诊病例密度=(当日累计确诊人数-前一日累计确诊人数) /区域面积;
现存确诊病例密度=(累计确诊病例-累计治愈病例-累计死亡病 例)/区域面积;
累计死亡人数密度=累计死亡病例/区域面积;
死亡率=累计死亡病例/累计确诊人数。
S5、确定社会脆弱性数据;
在本实施例中,社会脆弱性数据包括人口密度、年龄大于一定值 (例如65岁)的以上人口占比、人均GDP和每万人病床数。人口密 度大、经济发展水平低且医疗条件差的国家和地区更倾向于大规模传 播。其中,考虑到本次疫情对老年人更具攻击性,因此将人口结构, 即65岁以上人口占比纳入社会脆弱性评价数据;人均GDP反映了社 会活跃度,人均GDP越高,国民活跃度越高,人群接触机会也会相 应增加;医疗水平则采用每万人病床数、每平方公里医院数以及每万 人口医院数来衡量,本发明社会脆弱性数据来自世界银行与经济合作 与发展组织。
S6、对疫情危险性数据和社会脆弱性数据进行归一化处理,分别 建立熵值-层次分析法组合模型,得到疫情危险性数据权重矩阵和社 会脆弱性数据权重矩阵;具体步骤如下:
S61、用归一化处理后的疫情危险性数据构建熵值法模型和层次 分析法模型;
S62、将熵值法模型中各数据权重系数v=(v1,v2,v3,......vn) 和层次分析法模型中各数据权重系数w=(w1,w2,w3,......wn)进 行加权平均,计算得到疫情危险性数据权重矩阵σi
Figure BDA0002522743790000091
在本实施例中,i=1......6;n=6,v1、v2、v3、v4、v5、v6分别代表 每日新增确诊病例密度、现存确诊病例密度、累计死亡人数密度、死 亡率、连续3天有无新增以及14天有无聚集性疫情的熵值法权重系 数;w1、w2、w3、w4、w5、w6分别代表每日新增确诊病例密度、 现存确诊病例密度、累计死亡人数密度、死亡率、连续3天有无新增 以及14天有无聚集性疫情的层次分析法权重系数;
S63、用归一化处理后的社会脆弱性数据构建熵值法模型和层次 分析法模型;
S64、将熵值法模型中各数据权重系数v=(v1,v2,v3,......vn) 和层次分析法模型中各数据权重系数w=(w1,w2,w3,......wn)进 行加权平均,计算得到社会脆弱性数据权重矩阵σj
Figure BDA0002522743790000101
其中,σi指第i疫情危险性数据对应权重,i=1.....n,σj指第j个 社会脆弱性数据对应权重,j=1.....n,n为权重总个数。
在本实施例中,i=1......4,n=4;v1、v2、v3、v4分别代表人口密度、 年龄大于65岁以上人口占比、人均GDP和每万人病床数的熵值法权 重系数;w1、w2、w3、w4分别代表人口密度、年龄大于65岁以上 人口占比、人均GDP和每万人病床数的层次分析法权重系数;
S7、根据疫情危险性数据权重矩阵、社会脆弱性数据权重矩阵、 疫情危险性数据以及社会脆弱性数据进行区域疫情风险预测,预测风 险值计算如下:
疫情危险性值=疫情危险性数据×疫情危险性数据权重;
社会脆弱性值=社会脆弱性数据×社会脆弱性数据权重;
预测风险值=疫情危险性值×社会脆弱性值;
根据预测风险值将区域疫情风险划分为三个等级,三级风险是风 险值<0.3,二级风险是0.3≤风险值≤0.5,一级风险是风险值>0.5,在 本实施例中,对欧洲8国进行了风险预测,风险变化趋势如图3所示。
S8、根据S7风险等级,选取4个时间节点利用ArcMap10.2软件 绘制了欧洲疫情风险预测图4。
上面结合附图对本发明的实施例进行了描述,但是本发明并不局 限于上述的具体实施方式,上述的具体实施方式仅仅是示意性的,而 不是限制性的,本领域的普通技术人员在本发明的启示下,在不脱离 本发明宗旨和权利要求所保护的范围情况下,还可做出很多形式,这 些均属于本发明的保护之内。

Claims (10)

1.一种COVID-19实时风险预测方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1、获取疫情基础病例数据;
S2、根据S1获取的疫情基础病例数据建立传染数衰减方程得到基本传染数,再根据基本传染数和S1获取的疫情基础病例数据建立疫情传播动力学模型;
S3、将本区域实时易感者、感染者、潜伏者、治愈者以及死亡者数据作为疫情传播动力学模型的输入数据,对本区域实时疫情基础病例数据进行预测;
S4、根据本区域实时疫情基础病例数据,计算疫情危险性数据;
S5、确定社会脆弱性数据;
S6、对疫情危险性数据和社会脆弱性数据进行归一化处理,分别建立熵值-层次分析法组合模型,得到疫情危险性数据权重矩阵和社会脆弱性数据权重矩阵;
S7、根据疫情危险性数据权重矩阵、社会脆弱性数据权重矩阵、疫情危险性数据以及社会脆弱性数据进行本区域疫情风险预测,根据预测风险值将区域疫情风险划分为三个等级,三级风险是风险值<0.3,二级风险是0.3≤风险值≤0.5,一级风险是风险值>0.5;
S8、根据S7划分的风险等级,利用ArcMap10.2软件绘制疫情风险预测等级地图。
2.根据权利要求1所述的一种COVID-19实时风险预测方法,其特征在于,疫情病例基础数据包括区域人口、区域面积、累计确诊病例、累计死亡病例以及累计治愈病例。
3.根据权利要求1所述的一种COVID-19实时风险预测方法,其特征在于,所述S2中传染数衰减方程如下:
Figure FDA0002522743780000021
其中,C为基本传染数,C0为疫情初期基本传染数,k为衰减系数,t0为预计传染病消失的时间,t为时间。
4.根据权利要求1所述的一种COVID-19实时风险预测方法,其特征在于,所述S2中疫情传播动力学模型如下:
Figure FDA0002522743780000022
其中,C为基本传染数,当C<1时,传染病将会逐渐消失;β为发病率;θ是潜伏者相对于传染者的传染能力;S为易感者,σ为潜伏者转化感染者的速率,为1/潜伏期;α为致死率;γ为感染者治愈的速率,本文中时间单位为d,每个时间步长为1d,I为感染者,E为潜伏者,R为治愈者,D为死亡者,t为时间。
5.根据权利要求4所述的一种COVID-19实时风险预测方法,其特征在于,所述易感者=区域人口-累计确诊病例;感染者=累计确诊病例-累计死亡病例-累计治愈病例;潜伏者(t)=累计确诊病例(t+a)-累计确诊病例(t),t为时间,a为潜伏期;治愈者=累计治愈病例;死亡者=累计死亡病例。
6.根据权利要求1所述的一种COVID-19实时风险预测方法,其特征在于,疫情危险性数据包括每日新增确诊病例密度、现存确诊病例密度、累计死亡人数密度、死亡率、连续3天有无新增以及14天有无聚集性疫情。
7.根据权利要求6所述的一种COVID-19实时风险预测方法,其特征在于,每日新增确诊病例密度=(当日累计确诊人数-前一日累计确诊人数)/区域面积;现存确诊病例密度=(累计确诊病例-累计治愈病例-累计死亡病例)/区域面积;累计死亡人数密度=累计死亡病例/区域面积;死亡率=累计死亡病例/累计确诊人数。
8.根据权利要求1所述的一种COVID-19实时风险预测方法,其特征在于,社会脆弱性数据包括人口密度、年龄大于一定值以上人口占比、人均GDP和每万人病床数。
9.根据权利要求1所述的一种COVID-19实时风险预测方法,其特征在于,疫情危险性数据权重矩阵和社会脆弱性数据权重矩阵计算步骤如下:
S61、用归一化处理后的疫情危险性数据构建熵值法模型和层次分析法模型;
S62、将熵值法模型中各数据权重系数v=(v1,v2,v3,......vn)和层次分析法模型中各数据权重系数w=(w1,w2,w3,......wn)进行加权平均,计算得到疫情危险性数据权重矩阵σi
Figure FDA0002522743780000041
S63、用归一化处理后的社会脆弱性数据构建熵值法模型和层次分析法模型;
S64、将熵值法模型中各数据权重系数v=(v1,v2,v3,......vn)和层次分析法模型中各数据权重系数w=(w1,w2,w3,......wn)进行加权平均,计算得到社会脆弱性数据权重矩阵σj
Figure FDA0002522743780000042
其中,σi指第i个疫情危险性数据对应的权重,i=1.....n,σj指第j个社会脆弱性数据对应的权重,j=1.....n,n为权重总个数。
10.根据权利要求1所述的一种COVID-19实时风险预测方法,其特征在于,所述步骤S7预测风险值计算如下:
疫情危险性值=疫情危险性数据×疫情危险性数据权重;
社会脆弱性值=社会脆弱性数据×社会脆弱性数据权重;
预测风险值=疫情危险性值×社会脆弱性值。
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