CN111724897A - 一种运动功能数据处理方法及系统 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种运动功能数据处理方法及系统,包括:采集电子病历系统中运动功能和中风偏瘫的初次评估结果和末次评定结果,对所述初次评估结果和末次评定结果进行缺失数据删除和数据统一预处理操作,得到预处理结果数据集;将所述预处理结果数据集进行顺序拼接得到一维向量;将所述一维向量输入LSTM模型得到预测的末次评定结果,将所述预测的末次评定结果与采集的末次评定结果产生的误差进行反向传播训练所述LSTM模型的网络参数,得到预测模型;将新采集的初次评估结果通过S1进行预处理并通过S2生成一维向量后输入预测模型,得到预测的末次评定结果。采用改进的长短期记忆网络有效解决仅有初评结果数据集可能会出现的震荡。
Description
技术领域
本发明涉及运动功能领域,具体涉及一种运动功能数据处理方法及系统。
背景技术
脑卒中是一种急性脑血管疾病,具有较高的致死率,且脑卒中患者大都存在身体功能障碍,重者严重影响日常生活。脑卒中患者的身体状况与发病部位、时间长短、病情轻重以及造成身体功能障碍程度等多种因素有关。通过对人体的运动功能进行预测可以及时的判断人体的健康状况,如果存在患有脑卒中的情况,可以及时进行医治并可对当前的脑卒中患者最终的健康状况进行一个预测,目前临床上针对脑卒中患者的身体健康状况的预测主要依赖医师主观经验,通过评估患者身体状况来预测患者情况,主观性较强,不同医师之间可能存在较大差异。
论文“Accuracy of physical therapists'early predictions of upper-limbfunction in hospital stroke units”提出一种中风后功能预后的早期预测方法。该方法使用22名中分风患者进行计算预测模型构建,获取患者性别、年龄等基础数据,采集患者入院后72小时与6个月后的中风位置、中风类型等14个评价指标,使用逻辑回归构建预测模型,预测患者6个月后行动测试得分,需要患者的多种评价指标信息,采集信息时间较长,计算复杂,时间成本和经济成本较大。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是现有患者健康状况的预测需要大量医学影像或患者的多种评价指标信息,采集信息时间较长、计算复杂、时间成本和经济成本较大的问题,目的在于提供一种运动功能数据处理方法及系统,解决上述问题。
本发明通过下述技术方案实现:
一种运动功能数据处理方法,包括:
S1:采集电子病历系统中运动功能和中风偏瘫的初次评估结果和末次评定结果,对所述初次评估结果和末次评定结果进行缺失数据删除和数据统一预处理操作,得到预处理结果数据集;
S2:将所述预处理结果数据集进行顺序拼接得到一维向量;
S3:将所述一维向量输入LSTM模型得到预测的末次评定结果,将所述预测的末次评定结果与采集的末次评定结果产生的误差进行反向传播训练所述LSTM模型的网络参数,得到预测模型;
S4:将新采集的初次评估结果通过S1进行预处理并通过S2生成一维向量后输入预测模型,得到预测的末次评定结果。
本发明中采用的方法是从电子病历系统中采集脑卒中患者的运动功能以及中风偏瘫相关的初次评估结果和末次评定结果,用于训练LSTM模型,本发明改进了LSTM模型的参数更新过程,利用损失函数的二阶导数作为LSTM参数的更新方法,将新采集所述初次评估结果输入改进后的LSTM模型中进行预测。
具体的更新方法为多次输入电子病历中运动功能的初次评估结果得到预测的末次评估结果,将预测的末次评估结果与实际末次评定结果进行对比,得到两者之间的误差即为LSTM 模型的损失函数,将所述误差反向代入LSTM模型中实现LSTM模型参数的迭代更新,提高预测结果的准确性;
本发明LSTM模型的所有权重参数及偏置都可通过网络训练自动获得,在进行预测模型的训练时使用的训练数据必须包含初次评估结果和末次评定结果,因此需要将从电子病历系统中采集的缺少初次评估结果或末次评定结果的数据进行删除;由于运动功能障碍不同,导致不同运动功能评估项目存在差异,最常见的是运动功能障碍,本发明选取有关运动功能以及反应脑卒中严重程度的相关量表评估结果。筛选出同时有Fugl-Meyer下肢运动功能、 Fugl-Meyer上肢运动功能、Fugl-Meyer平衡功能、Barthel指数、中风和偏瘫评估得分共6项评定的患者评估结果,作为最终数据集。
进一步的,所述S1包括:
S11:采用正则表达式对所述初次评估结果和末次评定结果进行采集得到结果数据集,存储所述结果数据集且将同一个电子病历的初次评估结果和末次评定结果根据相同量表评定结果顺序存储;
S12:将所述结果数据集中缺失所述初次评估结果或末次评定结果的数据进行删除,得到完整结果数据集;
S13:对所述完整结果数据集进行数据统一操作,将包括Fugl-Meyer下肢运动功能、 Fugl-Meyer上肢运动功能、Fugl-Meyer平衡功能、Barthel指数、中风和偏瘫评估得分的患者评估结果,作为预处理结果数据集。
进一步的,所述S3包括:
S31:构建LSTM模型:
ht=ot⊙tanh(ct)
其中,ht表示隐藏层状态输出,ot表示LSTM模型第t时刻输出门,⊙表示同或运算符, tanh为双曲正切函数激活函数,ct表示当前时刻细胞状态;
S32:计算损失函数:
其中,θ表示损失函数的参数,k表示采用的评估量表数,oi表示LSTM模型中网络最终时间步输出的第i个值,即模型预测患者第i个量表的得分,yi表示患者出院前第i个量表的真实评估得分;
S33:利用梯度下降算法进行误差的反向传播,反向求得LSTM模型网络中所有权重、偏置参数大小后进行迭代训练,所述LSTM模型参数更新方法:
黑塞矩阵(Hessian Matrix)是一个由多元函数的二阶偏导数构成的矩阵,其特征值和特征向量可以描述某点的二阶导数的大小及方向,能够用于分析某一点的局部特性。因此,所述LSTM模型的损失函数可通过使用数学计算的方法表示为一个关于变量z1,z2,…zn的多元函数f(z1,z2,…zn),则函数的黑塞矩阵H[f(z)]可表示如下:
进一步的,所述S33中权重参数的更新:
其中,J(θ)表示损失函数,w表示权重参数。
进一步的,所述S31中LSTM模型的遗忘门计算公式:
ft=σ(Wxfxt+Whfht-1+Wcfct-1+bf)
其中,ft表示第t个时刻遗忘门,xt表示t时刻的当前输入,ht-1表示上一时刻的隐藏层输出,ct-1表示上一时刻的细胞状态,σ表示sigmod函数。Wxf、Whf、Wcf分别表示输入层、隐藏层和细胞状态与遗忘门之间的权重参数,bf表示遗忘门偏置。
进一步的,所述S31中LSTM模型的输入门计算公式:
it=σ(Wxixt+Whiht-1+Wcict-1+bi)
其中,it表示第t时刻输入门,σ表示sigmod函数,Wxi、Whi、Wci分别表示输入层、隐藏层和细胞状态与输入门之间的权重参数,bi表示输入门偏置。
进一步的,所述S31中LSTM模型的输出门计算公式:
ot=σ(Wxoxt+Whoht-1+Wcoct+bo)
其中,ot表示第t时刻输出门,σ表示sigmod函数,Wxo、Who、Wco表示输入层、隐藏层和细胞状态与输出层之间的权重参数,bo表示输出门偏置。
进一步的,所述S31中LSTM模型的当前时刻细胞状态计算公式:
ct=ft⊙ct-1+it⊙tanh(Wxcxt+Whcht-1+bc)
其中,ct表示当前时刻细胞状态,ft表示第t个时刻遗忘门,ct-1表示上一时刻的细胞状态,it表示第t时刻输入门,tanh为双曲正切函数激活函数,Wxc、Whc分别为输入层和隐藏层与细胞状态之间相连的权重参数,bc为细胞状态偏置。
一种运动功能数据处理系统,,包括:
采集模块,用于采集电子病历系统中运动功能和中风偏瘫的初次评估结果和末次评定结果;
预处理模块,用于对采集到的运动功能和中风偏瘫的初次评估结果和末次评定结果进行缺失数据删除和数据统一预处理操作,得到预处理结果数据集后,将所述预处理结果数据集进行顺序拼接得到一维向量;
训练模块,用于将所述一维向量输入LSTM模型进行训练,得到预测模型;
预测模块,用于将新采集的初次评估结果输入所述预测模型,得到预测的末次评定结果。
进一步的,所述LSTM模型:
ht=ot⊙tanh(ct)
其中,ht表示隐藏层状态输出,ot表示LSTM模型第t时刻输出门,⊙表示同或运算符, tanh为双曲正切函数激活函数,ct表示当前时刻细胞状态。
所述电子病历系统,包括运动功能、中风偏瘫及其他病历信息的具体数据;
所述运动功能数据处理系统采集所述电子病历系统中与运动功能和中风偏瘫相关的初次评估结果和末次评定结果数据。
本发明与现有技术相比,具有如下的优点和有益效果:
1、本发明一种运动功能数据处理方法及系统,采用改进的长短期记忆网络模型,使用损失函数的二阶导数作为参数的更新方式,可以有效解决预测问题中因仅有初评数值与末评数值可能会出现的震荡,损失函数收敛的更快,可以减少迭代次数、避免局部震荡而陷入局部极小值。
附图说明
此处所说明的附图用来提供对本发明实施例的进一步理解,构成本申请的一部分,并不构成对本发明实施例的限定。在附图中:
图1为本发明整体流程示意图;
图2为本发明系统结构示意图;
图3为本发明LSTM模型示意图。
具体实施方式
为使本发明的目的、技术方案和优点更加清楚明白,下面结合实施例和附图,对本发明作进一步的详细说明,本发明的示意性实施方式及其说明仅用于解释本发明,并不作为对本发明的限定。
实施例1
如图1和图2所示,一种运动功能数据处理方法,包括:
S1:采集电子病历系统中运动功能和中风偏瘫的初次评估结果和末次评定结果,对所述初次评估结果和末次评定结果进行缺失数据删除和数据统一预处理操作,得到预处理结果数据集;
S2:将所述预处理结果数据集进行顺序拼接得到一维向量;
S3:将所述一维向量输入LSTM模型得到预测的末次评定结果,将所述预测的末次评定结果与采集的末次评定结果产生的误差进行反向传播训练所述LSTM模型的网络参数,得到预测模型;
S4:将新采集的初次评估结果通过S1进行预处理并通过S2生成一维向量后输入预测模型,得到预测的末次评定结果。
本实施例中使用电子病历中499名真实脑卒中患者入院时初评结果作为模型输入,患者实际出院时末评结果作为输出。采用十折交叉验证法,将所述数据作为模型训练和测试集,训练预测模型。
进一步的,所述S1包括:
S11:采用正则表达式对所述初次评估结果和末次评定结果进行采集得到结果数据集,存储所述结果数据集且将同一个电子病历的初次评估结果和末次评定结果根据相同量表评定结果顺序存储;
S12:将所述结果数据集中缺失所述初次评估结果或末次评定结果的数据进行删除,得到完整结果数据集;
S13:对所述完整结果数据集进行数据统一操作,将包括Fugl-Meyer下肢运动功能、 Fugl-Meyer上肢运动功能、Fugl-Meyer平衡功能、Barthel指数、中风和偏瘫评估得分的患者评估结果,作为预处理结果数据集。
如图3所示,进一步的,所述S3包括:
S31:构建LSTM模型:
ht=ot⊙tanh(ct)
其中,ht表示隐藏层状态输出,ot表示LSTM模型第t时刻输出门,⊙表示同或运算符, tanh为双曲正切函数激活函数,ct表示当前时刻细胞状态;
S32:计算损失函数:
其中,θ表示损失函数的参数,k表示采用的评估量表数,oi表示LSTM模型中网络最终时间步输出的第i个值,即模型预测患者第i个量表的得分,yi表示患者出院前第i个量表的真实评估得分;
S33:利用梯度下降算法进行误差的反向传播,反向求得LSTM模型网络中所有权重、偏置参数大小后进行迭代训练,所述LSTM模型参数更新方法:
黑塞矩阵(Hessian Matrix)是一个由多元函数的二阶偏导数构成的矩阵,其特征值和特征向量可以描述某点的二阶导数的大小及方向,能够用于分析某一点的局部特性。因此,所述LSTM模型的损失函数可通过使用数学计算的方法表示为一个关于变量z1,z2,…zn的多元函数f(z1,z2,…zn),则函数的黑塞矩阵H[f(z)]可表示如下:
进一步的,所述S33中权重参数的更新:
其中,J(θ)表示损失函数,w表示权重参数。
进一步的,所述S31中LSTM模型的遗忘门计算公式:
ft=σ(Wxfxt+Whfht-1+Wcfct-1+bf)
其中,ft表示第t个时刻遗忘门,xt表示t时刻的当前输入,ht-1表示上一时刻的隐藏层输出,ct-1表示上一时刻的细胞状态,σ表示sigmod函数。Wxf、Whf、Wcf分别表示输入层、隐藏层和细胞状态与遗忘门之间的权重参数,bf表示遗忘门偏置。
进一步的,所述S31中LSTM模型的输入门计算公式:
it=σ(Wxixt+Whiht-1+Wcict-1+bi)
其中,it表示第t时刻输入门,σ表示sigmod函数,Wxi、Whi、Wci分别表示输入层、隐藏层和细胞状态与输入门之间的权重参数,bi表示输入门偏置。
进一步的,所述S31中LSTM模型的输出门计算公式:
ot=σ(Wxoxt+Whoht-1+Wcoct+bo)
其中,ot表示第t时刻输出门,σ表示sigmod函数,Wxo、Who、Wco表示输入层、隐藏层和细胞状态与输出层之间的权重参数,bo表示输出门偏置。
进一步的,所述S31中LSTM模型的当前时刻细胞状态计算公式:
ct=ft⊙ct-1+it⊙tanh(Wxcxt+Whcht-1+bc)
其中,ct表示当前时刻细胞状态,ft表示第t个时刻遗忘门,ct-1表示上一时刻的细胞状态,it表示第t时刻输入门,tanh为双曲正切函数激活函数,Wxc、Whc分别为输入层和隐藏层与细胞状态之间相连的权重参数,bc为细胞状态偏置。
一种运动功能数据处理系统,,包括:
采集模块,用于采集电子病历系统中运动功能和中风偏瘫的初次评估结果和末次评定结果;
预处理模块,用于对采集到的运动功能和中风偏瘫的初次评估结果和末次评定结果进行缺失数据删除和数据统一预处理操作,得到预处理结果数据集后,将所述预处理结果数据集进行顺序拼接得到一维向量;
训练模块,用于将所述一维向量输入LSTM模型进行训练,得到预测模型;
预测模块,用于将新采集的初次评估结果输入所述预测模型,得到预测的末次评定结果。
进一步的,所述LSTM模型:
ht=ot⊙tanh(ct)
其中,ht表示隐藏层状态输出,ot表示LSTM模型第t时刻输出门,⊙表示同或运算符, tanh为双曲正切函数激活函数,ct表示当前时刻细胞状态。
所述电子病历系统,包括运动功能、中风偏瘫及其他病历信息的具体数据;
所述运动功能数据处理系统采集所述电子病历系统中与运动功能和中风偏瘫相关的初次评估结果和末次评定结果数据。
以上所述的具体实施方式,对本发明的目的、技术方案和有益效果进行了进一步详细说明,所应理解的是,以上所述仅为本发明的具体实施方式而已,并不用于限定本发明的保护范围,凡在本发明的精神和原则之内,所做的任何修改、等同替换、改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。
Claims (10)
1.一种运动功能数据处理方法,其特征在于,包括:
S1:采集电子病历系统中运动功能和中风偏瘫的初次评估结果和末次评定结果,对所述初次评估结果和末次评定结果进行缺失数据删除和数据统一预处理操作,得到预处理结果数据集;
S2:将所述预处理结果数据集进行顺序拼接得到一维向量;
S3:将所述一维向量输入LSTM模型得到预测的末次评定结果,将所述预测的末次评定结果与采集的末次评定结果产生的误差进行反向传播训练所述LSTM模型的网络参数,得到预测模型;
S4:将新采集的初次评估结果通过S1进行预处理并通过S2生成一维向量后输入预测模型,得到预测的末次评定结果。
2.根据权利要求1所述的一种运动功能数据处理方法,其特征在于,所述S1包括:
S11:采用正则表达式对所述初次评估结果和末次评定结果进行采集得到结果数据集,存储所述结果数据集且将同一个电子病历的初次评估结果和末次评定结果根据相同量表评定结果顺序存储;
S12:将所述结果数据集中缺失所述初次评估结果或末次评定结果的数据进行删除,得到完整结果数据集;
S13:对所述完整结果数据集进行数据统一操作,将包括Fugl-Meyer下肢运动功能、Fugl-Meyer上肢运动功能、Fugl-Meyer平衡功能、Barthel指数、中风和偏瘫评估得分的患者评估结果,作为预处理结果数据集。
3.根据权利要求1所述的一种运动功能数据处理方法,其特征在于,所述S3包括:
S31:构建LSTM模型:
ht=ot⊙tanh(ct)
其中,ht表示隐藏层状态输出,ot表示LSTM模型第t时刻输出门,⊙表示同或运算符,tanh为双曲正切函数激活函数,ct表示当前时刻细胞状态;
S32:计算损失函数:
其中,θ表示损失函数的参数,k表示采用的评估量表数,oi表示LSTM模型中网络最终时间步输出的第i个值,即模型预测患者第i个量表的得分,yi表示患者出院前第i个量表的真实评估得分;
S33:利用梯度下降算法进行误差的反向传播,反向求得LSTM模型网络中所有权重、偏置参数大小后进行迭代训练,所述LSTM模型参数更新方法:
5.根据权利要求3所述的一种运动功能数据处理方法,其特征在于,所述S31中LSTM模型的遗忘门计算公式:
ft=σ(Wxfxt+Whfht-1+Wcfct-1+bf)
其中,ft表示第t个时刻遗忘门,xt表示t时刻的当前输入,ht-1表示上一时刻的隐藏层输出,ct-1表示上一时刻的细胞状态,σ表示sigmod函数。Wxf、Whf、Wcf分别表示输入层、隐藏层和细胞状态与遗忘门之间的权重参数,bf表示遗忘门偏置。
6.根据权利要求3所述的一种运动功能数据处理方法,其特征在于,所述S31中LSTM模型的输入门计算公式:
it=σ(Wxixt+Whiht-1+Wcict-1+bi)
其中,it表示第t时刻输入门,σ表示sigmod函数,Wxi、Whi、Wci分别表示输入层、隐藏层和细胞状态与输入门之间的权重参数,bi表示输入门偏置。
7.根据权利要求3所述的一种运动功能数据处理方法,其特征在于,所述S31中LSTM模型的输出门计算公式:
ot=σ(Wxoxt+Whoht-1+Wcoct+bo)
其中,ot表示第t时刻输出门,σ表示sigmod函数,Wxo、Who、Wco表示输入层、隐藏层和细胞状态与输出层之间的权重参数,bo表示输出门偏置。
8.根据权利要求3所述的一种运动功能数据处理方法,其特征在于,所述S31中LSTM模型的当前时刻细胞状态计算公式:
ct=ft⊙ct-1+it⊙tanh(Wxcxt+Whcht-1+bc)
其中,ct表示当前时刻细胞状态,ft表示第t个时刻遗忘门,ct-1表示上一时刻的细胞状态,it表示第t时刻输入门,tanh为双曲正切函数激活函数,Wxc、Whc分别为输入层和隐藏层与细胞状态之间相连的权重参数,bc为细胞状态偏置。
9.一种运动功能数据处理系统,其特征在于,包括:
采集模块,用于采集电子病历系统中运动功能和中风偏瘫的初次评估结果和末次评定结果;
预处理模块,用于对采集到的运动功能和中风偏瘫的初次评估结果和末次评定结果进行缺失数据删除和数据统一预处理操作,得到预处理结果数据集后,将所述预处理结果数据集进行顺序拼接得到一维向量;
训练模块,用于将所述一维向量输入LSTM模型进行训练,得到预测模型;
预测模块,用于将新采集的初次评估结果输入所述预测模型,得到预测的末次评定结果。
10.根据权利要求9所述的一种运动功能数据处理系统,其特征在于,所述预测模型:
ht=ot⊙tanh(ct)
其中,ht表示隐藏层状态输出,ot表示LSTM模型第t时刻输出门,⊙表示同或运算符,tanh为双曲正切函数激活函数,ct表示当前时刻细胞状态。
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CN202010537531.XA Active CN111724897B (zh) | 2020-06-12 | 2020-06-12 | 一种运动功能数据处理方法及系统 |
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