CN111667922A - 一种临床诊疗数据录入系统和方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开一种临床诊疗数据录入系统和方法。所述临床诊疗数据录入系统包括:数据获取单元,接收原始临床诊疗数据,利用标准数据模版对原始临床诊疗数据进行筛选,得到匹配标准数据模版的多个诊疗数据项;处理单元,针对多个诊疗数据项中的任一个,接收由至少两个录入客户端基于同一诊疗数据项的两个录入结果,判断两个录入结果是否存在差异;执行单元,响应于处理单元判断出两个录入结果存在差异,则向专家系统推送录入结果的差异性信息,以请求由专家系统对存在差异的录入结果所对应的诊疗数据项进行重新录入。利用本发明的方案,可提高诊疗数据项录入的准确性。
Description
技术领域
本发明涉及临床研究领域,更具体而言涉及一种临床诊疗数据录入系统和方法。
背景技术
近年来随着医院科研任务及要求的增加,对科研数据获取的准确性要求越来越高,由于目前医院的临床诊疗数据采集中,不同的信息系统中的数据存在噪音或者伪数据,直接存储数据出错率高,导致数据准确性和有效性降低,不利于基于数据的医学研究。
因此,需要提出一种技术方案解决上述技术问题。
发明内容
为了解决上述技术问题,本发明提供了一种临床诊疗数据录入系统和方法。
作为本发明的第一方面,提供一种临床诊疗数据录入系统,其中,所述系统包括:
数据获取单元,被配置为:接收原始临床诊疗数据,利用标准数据模版对所述原始临床诊疗数据进行筛选,得到匹配所述标准数据模版的多个诊疗数据项,其中,所述标准数据模版包括符合CDISC标准的基线信息、诊疗经过信息和治疗结果信息;
处理单元,被配置为:针对所述多个诊疗数据项中的任一个,接收由至少两个录入客户端基于同一所述诊疗数据项的两个录入结果,判断两个所述录入结果是否存在差异;
执行单元,被配置为:响应于所述处理单元判断出两个所述录入结果存在差异,则向专家系统推送所述录入结果的差异性信息,以请求由所述专家系统对存在差异的录入结果所对应的诊疗数据项进行重新录入。
在一个实施例中,所述原始临床诊疗数据来自以下至少一个数据源:批量导入的表格数据、从医院信息系统HIS获取的数据、电子病历EMR数据、影像归档和通信系统PACS数据、医院实验室信息管理系统LIS数据。
在一个实施例中,所述处理单元被进一步配置为:分别提取两个所述录入结果的特征值A1和特征值A2,判断所述特征值A1与所述特征值A2的差值是否介于预设阈值范围,若是,则确定两个所述录入结果相同,若否,则确定两个所述录入结果存在差异。
在一个实施例中,所述执行单元还被配置为:响应于所述处理单元判断出两个所述录入结果相同,则将所述录入结果存储至数据库。
作为本发明的第二方面,提供一种服务器,其中,所述服务器包括本发明所述的临床诊疗数据录入系统。
作为本发明的第三方面,提供一种临床诊疗数据录入方法,其中,所述方法包括:
接收原始临床诊疗数据,利用标准数据模版对所述原始临床诊疗数据进行筛选,得到匹配所述标准数据模版的多个诊疗数据项,其中,所述标准数据模版包括符合CDISC标准的基线信息、诊疗经过信息和治疗结果信息;
针对所述多个诊疗数据项中的任一个,接收由至少两个录入客户端基于同一所述诊疗数据项的两个录入结果,判断两个所述录入结果是否存在差异;
响应于判断出两个所述录入结果存在差异,则向专家系统推送所述录入结果的差异性信息,以请求由所述专家系统对存在差异的录入结果所对应的诊疗数据项进行重新录入。
在一个实施例中,所述原始临床诊疗数据来自以下至少一个数据源:批量导入的表格数据、从医院信息系统HIS获取的数据、电子病历EMR数据、影像归档和通信系统PACS数据、医院实验室信息管理系统LIS数据。
在一个实施例中,所述判断两个所述录入结果是否存在差异,包括:分别提取两个所述录入结果的特征值A1和特征值A2,判断所述特征值A1与所述特征值A2的差值是否介于预设阈值范围,若是,则确定两个所述录入结果相同,若否,则确定两个所述录入结果存在差异。
在一个实施例中,所述方法还包括:响应于判断出两个所述录入结果相同,则将所述录入结果存储至数据库。
为本发明的第四方面,提供一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,所述计算机程序在被处理器执行时实现本发明所述临床诊疗数据录入方法。
本发明的技术方案,可以利用标准数据模版对不同的信息系统中的数据进行降噪和滤波,去除原始临床诊疗数据中的噪声和伪数据,在一定程度上提高了数据的有效性;并且在数据录入的过程中对诊疗数据项采用双录入,并对录入结果进行校验,然后可通过专家系统对问题数据进行修正,以进一步提高录入的诊疗数据项的准确性,有利于基于数据的医学研究。
附图说明
现在将仅通过参考附图的非限制性示例来描述本发明,其中:
图1是示出根据本发明一个实施例的临床诊疗数据录入系统的示意图;
图2是示出根据本发明一个实施例的临床诊疗数据录入方法的流程图。
具体实施方式
为了使本发明的上述以及其他特征和优点更加清楚,下面结合附图进一步描述本发明。应当理解,本文给出的具体实施例是出于向本领域技术人员解释的目的,仅是示例性的,而非限制性的。
作为本发明的第一方面,提供一种临床诊疗数据录入系统。图1示意性示出根据本发明一个实施例的临床诊疗数据录入系统100。所述临床诊疗数据录入系统100包括数据获取单元110、处理单元120以及执行单元130,并且各个单元之间通信地耦合。所述临床诊疗数据录入系统100可以部分地或者整体地设置于服务器端,例如服务器上。
数据获取单元110可以被配置为:接收原始临床诊疗数据,利用标准数据模版对所述原始临床诊疗数据进行筛选,得到匹配所述标准数据模版的多个诊疗数据项,其中,所述标准数据模版包括符合临床数据交换标准协会(CDISC)标准的基线信息、诊疗经过信息和治疗结果信息。
如能理解的,由于所述原始临床诊疗数据多来自于不同的系统,数据中难免存在噪声或伪数据等干扰,而利用标准数据模版对所述原始临床诊疗数据进行筛选,可以去除所述原始临床诊疗数据中的噪音和/或伪数据,在一定程度上提高了数据的准确性,从而可便于实现临床诊疗数据的智能化或自动化录入,进而可提高临床诊疗数据录入效率。
根据情况,所述原始诊疗数据的来源或数据源可以包括多种。例如,可以是诊疗过程中原始记录的数据,例如医生问诊时患者对病情的描述、医生所开的处方、护士对住院病人的情况记录以及患者微信端录入随访数据等,其中,上述噪声或伪数据例如可以是由于病患对病症描述不准、医护人员记录风格不同等原因造成的。或者,所述原始诊疗数据可以是从医院各个数据系统获取的原始临床诊疗数据,在一个实施例中,所述原始临床诊疗数据来自以下至少一个数据源:批量导入的表格数据、从医院信息系统HIS获取的数据、电子病历EMR数据、影像归档和通信系统PACS数据、医院实验室信息管理系统LIS数据。在该实施例中,当数据来源包括上述HIS系统、LIS系统以及PACS系统时,所述原始临床诊疗数据可以包括HIS系统中的患者的基线数据、LIS系统的中血液生化检验数据以及PACS系统中的图像数据。
数据获取单元110可以通过多种可能的方式获取所述原始临床诊疗数据。例如,可以通过扫描仪、医生、护士工作使用的计算机、病人使用的智能终端设备(例如,智能手机)等进行数据采集,采集到的数据可以发送给所述数据获取单元110。或者,在一个实施例中,可以为临床诊疗数据录入系统100独立配置一前置终端,用于从医院的各种数据系统中获取所述原始临床诊疗数据,然后发送给数据获取单元110。
如能理解的,所述标准数据模版可以为多种可能的形式,例如,可以是表格、语句等形式,用于对所需数据进行描述、限定。例如,所述标准数据模版的描述语句为“患者的血红蛋白指标是[]”,此时,所述数据获取单元110可以利用标准数据模版对原始临床诊疗数据进行筛选,从描述语句中抽取关键词“血红蛋白”,然后所述原始临床诊疗数据中匹配得到“血红蛋白(HGB或Hb):14.5g/dl”,从而提取“14.5g/dl”补充到上述描述语句中作为一条匹配到的诊疗数据项。
根据情况,所述基线信息可以包括但不限于,人口学、疾病史、诊断、患者ID以及入院时间5个CDISC标准子域。其中,人口学例如可以包括但不限于:性别、出生日期、血型等信息;疾病史可以包括但不限于病人和/或其直系亲属之前所患疾病、治疗方案等;诊断可以采用国际诊断字典库ICD10统一进行标准化处理。诊疗经过可以包括治疗方式(例如,所用药物、所用设备等)、治疗周期(如,3周、2个月等)、检查结果3个CDISC标准子域。治疗结果可以包括,住院时长、诊疗相关总费用、并发症以及治疗结果4个CDISC标准子域。
处理单元120可以被配置为:针对所述多个诊疗数据项中的任一个,接收由至少两个录入客户端基于同一所述诊疗数据项的两个录入结果,判断两个所述录入结果是否存在差异。
如能理解的,虽然利用标准数据模版对所述诊疗数据项进行筛选,在一定程度上提高了数据的有效性,但考虑到为进一步提高诊疗数据的录入准确性,还需要处理单元120对所述录入结果执行进一步地校验。
根据情况,处理单元120可通过任何可用的方式判断两个所述录入结果是否存在差异。例如,在一个实施例中,处理单元120可以分别提取两个所述录入结果的特征值A1和特征值A2,判断所述特征值A1与所述特征值A2的差值是否介于预设阈值范围,若是,则确定两个所述录入结果相同,若否,则确定两个所述录入结果存在差异。
这里,特征值为录入结果中可作为识别依据的参数,所述参数的类型至少可包括属性值类型或数值类型。
其中,针对属性值类型,所述参数可以为诊疗数据项中的医学指标或者患者基本信息,所述医学指标具体可包括医学指标的名称、医学指标的特殊识别符号和/或其他可用的数据;例如,医学指标的名称可以为“血小板数量”,对应的结果可以为“正常”或“异常”,患者的个人信息例如为性别,对应的结果为“男”或“女”。
针对数值类型,所述参数可以为患者的诊疗数据项中医学指标的检测结果数据或者患者的基本信息。例如,检测结果数据可以为血红蛋白的(HGB或Hb)的检测结果数据;所述患者的基本信息可以为患者的年龄、身份证号、医保账号或者手机号码等。
根据情况,所述特征值的提取可通过多种可用的方式实现。例如,处理单元120可基于预设算法分别对两个所述录入结果进行特征值提取,其中,所述预设算法可以为自然语言处理算法与预先训练的神经网络模型(该神经网络模型可利用海量的诊疗数据项进行预先训练而得到),利用自然语言处理算法将所述录入的结果进行语义分析以及关键词提取,整理关键词,然后利用上述预先训练的神经网络模型对所述关键词进行分类,根据分类结果确定特征值A1和特征值A2,从而实现特征值的提取。
进一步地,处理单元120可通过合适的方式计算所述特征值A1与所述特征值A2的差值。例如,对于属性值类型的特征值,中文字符可利用GB2312-80国标码将特征A1和特征值A2分别转换为二进制数据(例如,性别“男”先转换十六进制为“C4D0”,然后“C4D0”转换二进制为“1100010011010000”),类似地,对于英文字符可利用ASCII转换为二进制数据;然后计算两个二进制数据的差值,如果差值为0(此时预设阈值范围可理解为仅包括0),则确定特征值A1与特征值A2相同,否则,确定特征值A1与特征值A2存在差异。
对于数值类型特征值,处理单元120可以将特征值A1和特征值A2中的大值减去小值除以大值,从而计算出差值,如果差值介于预设阈值范围,则确定特征值A1与特征值A2无差异,反之,确定特征值A1与特征值A2存在差异。
所述预设阈值可以根据情况设定,例如,预设阈值范围可以为-0.0001~0.0001;如果一组待录入的诊疗数据项为血红蛋白(HGB或Hb):14.5g/dl,由两个不同的录入客户端录入的录入结果分别为血红蛋白(HGB或Hb):14g/dl和血红蛋白(HGB或Hb):14.5g/dl,则处理单元120可以提取的特征值分别为特征值A1和特征值A2,其中,特征值A1为数值14,特征值A2为数值14.5;则通过上述针对数值类型特征值的计算方法,可确定所述特征值A1与所述特征值A2的差值为0.03,(计算公式:(14.5-14)/14.5≈0.03),超过预设阈值范围-0.0001~0.0001,因此,可确定两个所述录入结果存在差异。处理单元120通过上述判断,可以从众多的录入结果中确定出存在差异性问题录入结果,然后将相关判断信息推送给执行单元130。
需要说明的是,造成两个所述录入结果存在差异的原因有多种。例如,操作所述录入客户端进行数据录入的工作人员失误,或者,由于网络延时、阻塞等原因导致录入客户端录入的数据出现数据丢失,从而造成所述录入结果中的数据不完整。其中,所述录入客户端可以为智能终端,例如智能手机、平板电脑或者其他合适的智能设备。
所述数据库可为适用的任意类型的数据库,所述存储结果可以匹配所述数据库存储形式的数据项,例如,所述数据库为关系型数据库,则所述存储结果可以键值对的形式存储于其中。
执行单元130可以被配置为:响应于所述处理单元判断出两个所述录入结果存在差异,则向专家系统推送所述录入结果的差异性信息,以请求由所述专家系统对存在差异的录入结果所对应的诊疗数据项进行重新录入。
如能理解的,所述专家系统是基于现有技术进行专业判断的系统,可以是智能系统,例如通过人工智能构建,也可以是人工客户端,由临床医生或研究人员进行判断。所述录入结果的差异性信息可以包括录入结果本身以及该录入结果所对应的诊疗数据项的标识信息,以便于所述专家系统确定需要重新输入的诊疗数据项。例如,专家系统可以分别对录入结果和所述诊疗数据项进行匹配,所述匹配可以为关键字的语意匹配,专家系统可基于预设算法(例如,自然语言处理算法)进行关键字提取,然后基于关键字匹配。具体地,如果录入结果为血红蛋白(HGB或Hb):14.5g/dl;则可以提取“血红蛋白”作为关键字,然后据此在全部诊疗数据项中匹配,在匹配到几组候选的诊疗数据项后,可进一步以录入结果的标识信息与几组候选的诊疗数据项的标识信息进行比对,标识信息一致,则确定该候选的诊疗数据项即为与录入结果对应。所述标识信息例如可以为数据录入时间、录入人员签名信息等。
进而,所述专家系统可基于确定的诊疗数据项进行重新录入,并可将录入结果反馈给执行单元130进行存储,例如存储至数据库。此外,执行单元130还可以响应于所述处理单元120判断出两个所述录入结果相同,直接将所述录入结果存储至数据库。
可选地,由专家系统录入诊疗数据项时,除了修正后的诊疗数据项,还包括补充数据,所述补充数据包括记录录入数据的录入端、录入时间和/或比对确认痕迹。
综上所述,本发明的技术方案,可以利用标准数据模版对不同的信息系统中的数据进行降噪和滤波,去除原始临床诊疗数据中的噪声和伪数据,在一定程度上提高了数据的有效性,并且在数据录入的过程中对诊疗数据项采用双录入,并对录入结果进行校验,然后可通过专家系统对问题数据进行修正,以进一步提高录入的诊疗数据项的准确性,有利于基于数据的医学研究。
作为本发明的第二方面,提供一种服务器,其中,所述服务器包括本发明所述的临床诊疗数据录入系统。
作为本发明的第三个方面,提供一种临床诊疗数据录入方法。图2示意性示出根据本发明一个实施例的临床诊疗数据录入方法200。
如图2所示,所述临床诊疗数据录入方法200,包括:S210、原始临床诊疗数据,利用标准数据模版对所述原始临床诊疗数据进行筛选,得到匹配所述标准数据模版的多个诊疗数据项,其中,所述标准数据模版包括符合CDISC标准的基线信息、诊疗经过信息和治疗结果信息;S220、针对所述多个诊疗数据项中的任一个,接收由至少两个录入客户端基于同一所述诊疗数据项的两个录入结果,判断两个所述录入结果是否存在差异;S230、响应于判断出两个所述录入结果存在差异,则向专家系统推送所述录入结果的差异性信息,以请求由所述专家系统对存在差异的录入结果所对应的诊疗数据项进行重新录入。
在一个实施例中,所述原始临床诊疗数据来自以下至少一个数据源:批量导入的表格数据、从医院信息系统HIS获取的数据、电子病历EMR数据、影像归档和通信系统PACS数据、医院实验室信息管理系统LIS数据。
在一个实施例中,所述判断两个所述录入结果是否存在差异,包括:分别提取两个所述录入结果的特征值A1和特征值A2,判断所述特征值A1与所述特征值A2的差值是否介于预设阈值范围,若是,则确定两个所述录入结果相同,若否,则确定两个所述录入结果存在差异。
在一个实施例中,所述方法还包括:响应于判断出两个所述录入结果相同,则将所述录入结果存储至数据库。
应理解,本文中前述第一方面关于临床诊疗数据录入系统所描述的具体特征也可类似地应用于第三方面的临床诊疗数据录入方法中进行类似扩展。为简化起见,未对其进行详细描述。
应理解,本发明的临床诊疗数据录入系统100的各个单元可全部或部分地通过软件、硬件、固件或其组合来实现。所述各单元各自可以硬件或固件形式内嵌于计算机设备的处理器中或独立于所述处理器,也可以软件形式存储于计算机设备的存储器中以供处理器调用来执行所述各单元的操作。所述各单元各自可以实现为独立的部件或模块,或者两个或更多个单元可实现为单个部件或模块。
本领域普通技术人员应理解,图1中示出的临床诊疗数据录入系统100的示意图仅仅是与本发明的方案相关的部分结构的示例性说明框图,并不构成对体现本发明的方案的计算机设备、处理器或计算机程序的限定。具体的计算机设备、处理器或计算机程序可以包括比图中所示更多或更少的部件或模块,或者组合或拆分某些部件或模块,或者可具有不同的部件或模块布置。
作为本发明第四方面,提供一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,所述计算机程序在被处理器执行时实现本发明第三方面的方法的步骤。在一个实施例中,所述计算机程序被分布在网络耦合的多个计算机设备或处理器上,以使得所述计算机程序由一个或多个计算机设备或处理器以分布式方式存储、访问和执行。单个方法步骤/操作,或者两个或更多个方法步骤/操作,可以由单个计算机设备或处理器或由两个或更多个计算机设备或处理器执行。一个或多个方法步骤/操作可以由一个或多个计算机设备或处理器执行,并且一个或多个其他方法步骤/操作可以由一个或多个其他计算机设备或处理器执行。一个或多个计算机设备或处理器可以执行单个方法步骤/操作,或执行两个或更多个方法步骤/操作。
本领域普通技术人员可以理解,本发明的临床诊疗数据录入方法的全部或部分步骤可以通过计算机程序来指示相关的硬件如计算机设备或处理器完成,所述的计算机程序可存储于非暂时性计算机可读存储介质中,该计算机程序被执行时实现本发明的辅助方法的步骤。根据情况,本文中对存储器、存储、数据库或其它介质的任何引用可包括非易失性和/或易失性存储器。非易失性存储器的示例包括只读存储器(ROM)、可编程ROM(PROM)、电可编程ROM(EPROM)、电可擦除可编程ROM(EEPROM)、闪存、磁带、软盘、磁光数据存储装置、光学数据存储装置、硬盘、固态盘等。易失性存储器的示例包括随机存取存储器(RAM)、外部高速缓冲存储器等。
以上描述的各技术特征可以任意地组合。尽管未对这些技术特征的所有可能组合进行描述,但这些技术特征的任何组合都应当被认为由本说明书涵盖,只要这样的组合不存在矛盾。
尽管结合实施例对本发明进行了描述,但本领域技术人员应理解,上文的描述和附图仅是示例性而非限制性的,本发明不限于所公开的实施例。在不偏离本发明的精神的情况下,各种改型和变体是可能的。
Claims (10)
1.一种临床诊疗数据录入系统,其特征在于,所述系统包括:
数据获取单元,被配置为:接收原始临床诊疗数据,利用标准数据模版对所述原始临床诊疗数据进行筛选,得到匹配所述标准数据模版的多个诊疗数据项,其中,所述标准数据模版包括符合CDISC标准的基线信息、诊疗经过信息和治疗结果信息;
处理单元,被配置为:针对所述多个诊疗数据项中的任一个,接收由至少两个录入客户端基于同一所述诊疗数据项的两个录入结果,判断两个所述录入结果是否存在差异;
执行单元,被配置为:响应于所述处理单元判断出两个所述录入结果存在差异,则向专家系统推送所述录入结果的差异性信息,以请求由所述专家系统对存在差异的录入结果所对应的诊疗数据项进行重新录入。
2.根据权利要求1所述的系统,其特征在于,所述原始临床诊疗数据来自以下至少一个数据源:
批量导入的表格数据、从医院信息系统HIS获取的数据、电子病历EMR数据、影像归档和通信系统PACS数据、医院实验室信息管理系统LIS数据。
3.根据权利要求1或2所述的系统,其特征在于,所述处理单元被进一步配置为:
分别提取两个所述录入结果的特征值A1和特征值A2,判断所述特征值A1与所述特征值A2的差值是否介于预设阈值范围,若是,则确定两个所述录入结果相同,若否,则确定两个所述录入结果存在差异。
4.根据权利要求1或2所述的系统,其特征在于,所述执行单元还被配置为:
响应于所述处理单元判断出两个所述录入结果相同,则将所述录入结果存储至数据库。
5.一种服务器,其特征在于,所述服务器包括权利要求1-4中任一项所述的临床诊疗数据录入系统。
6.一种临床诊疗数据录入方法,其特征在于,所述方法包括:
接收原始临床诊疗数据,利用标准数据模版对所述原始临床诊疗数据进行筛选,得到匹配所述标准数据模版的多个诊疗数据项,其中,所述标准数据模版包括符合CDISC标准的基线信息、诊疗经过信息和治疗结果信息;
针对所述多个诊疗数据项中的任一个,接收由至少两个录入客户端基于同一所述诊疗数据项的两个录入结果,判断两个所述录入结果是否存在差异;
响应于判断出两个所述录入结果存在差异,则向专家系统推送所述录入结果的差异性信息,以请求由所述专家系统对存在差异的录入结果所对应的诊疗数据项进行重新录入。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述原始临床诊疗数据来自以下至少一个数据源:
批量导入的表格数据、从医院信息系统HIS获取的数据、电子病历EMR数据、影像归档和通信系统PACS数据、医院实验室信息管理系统LIS数据。
8.根据权利要求6或7所述的方法,其特征在于,所述判断两个所述录入结果是否存在差异,包括:
分别提取两个所述录入结果的特征值A1和特征值A2,判断所述特征值A1与所述特征值A2的差值是否介于预设阈值范围,若是,则确定两个所述录入结果相同,若否,则确定两个所述录入结果存在差异。
9.根据权利要求6或7所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:
响应于判断出两个所述录入结果相同,则将所述录入结果存储至数据库。
10.一种计算机可读存储介质,其特征在于,其上存储有计算机程序,所述计算机程序在被处理器执行时实现权利要求6-9任一项所述的临床诊疗数据录入方法。
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