具体实施方式
下面结合附图和实施例对本发明作进一步的详细说明。可以理解的是,此处所描述的具体实施例仅仅用于解释本发明,而非对本发明的限定。另外还需要说明的是,为了便于描述,附图中仅示出了与本发明相关的部分而非全部结构。
实施例一
图1为本发明实施例一提供的一种核酸提取方法的流程示意图,本实施例可适用于自动控制核酸提取设备提取核酸的情况,该方法可以由核酸提取装置来执行,其中该装置可由软件和/或硬件实现,并一般集成在控制设备中。具体参见图1所示,该方法可以包括如下步骤:
S110,获取当前检测任务的检测参数。
其中,所述当前检测任务可以为核酸提取项目,当前检测任务的检测参数可以包括检测名称、备注信息、样品数量、提取方式、荧光检测确定参数、生成电泳表确定参数、模板归一化确定参数、表格名称、操作人员以及实验时间等。
本实施例中,控制设备配置核酸提取软件,通过该核酸提取软件接收操作,并控制核酸提取设备提取核酸。具体地,获取核酸提取软件的图2所示的主界面中新建检测按钮对应的点击操作,确定该点击操作对应的创建检测任务指令,并根据创建检测任务操作确定当前检测任务。进一步地,控制设备根据确定的当前检测任务弹出图2所示的检测参数获取界面,控制设备通过检测参数获取界面接收外部输入的检测参数,并保存检测参数,并将检测参数发送给核酸提取设备,以便核酸提取设备依据该检测参数提取核酸。可选地,如图2所示的检测参数获取界面可以包括一个或多个检测参数提供可选项,例如,提取方式可以选择磁珠提取或者硅珠提取,样品数量可以选择“24”、“48”、“72”或者“96”。
S120,接收样品放置操作,基于样品放置操作控制核酸提取设备将所需样品放置在对应的样品区域。
其中,样品放置操作可以为控制设备接收的外部确定的样品放置控制指令。可选地,控制设备将样品放置操作发送给核酸提取设备,核酸提取设备根据样品放置操作确定样品区域,自动将所需样品放置在对应的样品区域。
可选地,控制设备将样品放置操作可以以协议包的形式发送给核酸提取设备,核酸提取设备的主控制模块对该协议包进行解析,根据解析结果确定样品区域,核酸提取设备的主控模块控制子模块(例如机械夹手)将所需样品放置在对应的样品区域。待样品区域放置完样品后,核酸提取设备还可以获取样品放置结果,并将样品放置结果反馈给控制设备,可以达到根据样品放置操作自动化放置样品的目的。
S130,接收板材位置确定操作,基于板材位置确定操作确定各操作区域中板材的位置。
其中,板材位置确定操作可以为控制设备接收的外部确定的板材位置确定指令,用于控制核酸提取设备确定各板材的位置信息。其中,所述板材预先根据板材放置操作对应放置,各所述板材可以包括NFC(Near Field Communication,近场通信)标签。
可选地,可以根据所述板材位置确定操作控制所述核酸提取设备扫描所述核酸提取设备各所述板材的标签信息,并接收所述核酸提取设备发送的所述标签信息,基于所述标签信息对所述板材的位置进行校验,根据校验结果确定各操作区域中板材的位置。
具体地,控制设备获取主界面上的NFC扫码按钮对应的点击操作,确定该点击操作对应的板材位置确定操作,并将所述板材位置确定操作发送给核酸提取设备,核酸提取设备的主控制模块控制NFC扫码机械臂扫描各操作区域内的各板材的标签信息,将得到的标签信息反馈给控制设备,控制设备对各板材的标签信息进行校验,根据校验结果确定各操作区域的板材的位置。
可选地,控制设备确定各操作区域内板材的位置之后,还可以根据各板材的标签信息判断对应的板材与操作区域是否匹配,如果不匹配,发出提示信息,以提示用户重新放置板材,避免因板材位置错误对核酸提取过程造成影响。
S140,接收运行启动操作,根据运行启动操作和检测参数控制核酸提取设备在样品中提取核酸,得到核酸提取结果。
本实施例中,控制设备获取到检测参数后,可以确定各检测参数对应的操作区域,并确定各操作区域的运行顺序,根据操作区域的运行顺序控制核酸提取设备在样品中提取核酸,得到核酸提取结果。
本发明实施例提供的技术方案,通过获取当前检测任务的检测参数,接收样品放置操作,基于所述样品放置操作控制核酸提取设备将所需样品放置在对应的样品区域,可以达到根据样品放置操作自动化放置样品的目的,接收板材位置确定操作,基于所述板材位置确定操作确定各操作区域中板材的位置,其中,所述板材预先根据板材放置操作对应放置,以准确确定板材的位置,避免因板材位置出现错误对核酸提取过程产生影响,接收运行启动操作,根据所述运行启动操作和所述检测参数控制所述核酸提取设备在所述样品中提取核酸,得到核酸提取结果。解决了现有技术中通过人工实验的方式提取核酸步骤繁琐,耗时较长,以及人为操作失误可能性较高的问题,达到自动化控制核酸提取设备提取核酸的目的,实现提高核酸提取效率的效果。
实施例二
图4为本发明实施例二提供的一种核酸提取方法的流程示意图。本实施例的技术方案在上述实施例的进行了细化。可选地,所述根据所述运行启动操作和所述检测参数控制所述核酸在所述样品中提取设备提取核酸,包括:确定所述检测参数对应的运行脚本,其中,所述运行脚本至少包括核酸提取步骤;基于所述运行启动操作,控制所述核酸提取设备执行所述核酸提取步骤,以提取所述样品中的核酸。在该方法实施例中未详尽描述的部分请参考上述实施例。具体参见图4所示,该方法可以包括如下步骤:
S210,获取当前检测任务的检测参数。
S220,接收样品放置操作,基于样品放置操作控制核酸提取设备将所需样品放置在对应的样品区域。
S230,接收板材位置确定操作,基于板材位置确定操作确定各操作区域中板材的位置。
可选地,在接收板材位置确定操作之前,控制设备可以通过界面引导的方式引导用户放置板材,并获取板材放置结果。本实施例中,可以通过如下步骤获取板材放置结果:根据预先确定的板材引导信息生成引导提示信息,并获取与所述引导提示信息对应的所述板材放置操作,将所述板材放置操作发送至所述核酸提取设备,并接收所述核酸提取设备发送的板材放置结果,其中,所述引导提示信息包括显示引导以及语音引导中的至少一种,所述板材放置结果包括所述板材和所述板材对应的各操作区域。
其中,板材引导信息可以理解为主控设备预先存储的板材引导逻辑,用于生成引导提示信息。可选地,可以通过如下方式生成引导提示信息:根据板材放置顺序和所述板材引导信息,确定所述核酸提取设备中板材放置位置,基于引导界面中与所述板材放置位置对应的图标,生成所述板材引导信息,其中,所述引导界面中包括与所述核酸提取设备中各板材位置对应的图标。需要说明的是,板材引导信息可以预先存储在控制设备中,板材放置顺序可以理解为核酸提取设备确定的板材放置逻辑,核酸提取设备可以将板材放置顺序发送给控制设备,以使控制设备根据板材放置顺序和所述板材引导信息,对核酸提取设备中的板材放置位置进行确定。
具体地解释,如图3所示的主界面上包括多个操作区域的图标,可以将各板材所属区域称为上述引导界面。控制设备预先将引导界面上各图标的位置与核酸提取设备中各板材位置均对应,并对板材放置顺序和预先存储的板材引导信息进行解析,根据解析结果确定核酸提取设备中板材的放置位置,然后在引导界面上确定与板材的放置位置对应的图标,并生成各图标的引导提示信息,通过闪烁或者发出语音的方式引导用户放置板材。进一步地,控制设备接收外部确定的与引导提示信息对应的图标点击操作,将图标点击操作作为板材放置操作,并将板材放置操作发送给核酸提取设备,控制核酸提取设备自动放置板材,或者,核酸提取设备发出提示,引导用户将板材放置在对应的操作区域,并接收核酸提取设备发送的板材放置结果,直至所有板材放置完成,然后接收板材位置确定操作,基于板材位置确定操作进一步确定各操作区域中板材的位置。
可以理解的是,本实施例通过引导提示信息引导用户将板材放置在对应区域,达到自动化引导用户放置板材的目的,提高板材放置效率和准确率。
S240,接收运行启动操作,确定检测参数对应的运行脚本,基于运行启动操作,控制核酸提取设备执行核酸提取步骤,以提取样品中的核酸,得到核酸提取结果。
可选地,运行脚本可以包括核酸提取步骤,控制设备可以根据运行脚本的核酸提取步骤控制核酸提取设备提取核酸。具体地,控制设备获取到检测参数后,可以确定各检测参数对应的操作流程,并确定各操作流程的运行顺序,并将所述运行顺序确定为核酸提取步骤,然后将各核酸提取步骤与各操作区域对应组合,得到所述运行脚本。其中,每一个操作流程的运行对应一个预先设置的子脚本,根据核酸提取步骤将各子脚本进行组合,得到当前核酸提取项目的运行脚本。
可选地,在接收运行启动操作之前,控制设备还可以接收核酸提取设备发送的试剂添加信息,以确定当前检测任务的试剂添加完毕,可选地,试剂添加信息至少包括试剂种类、试剂添加位置以及试剂添加量。
可选地,如果检测参数还包括荧光检测的确定参数,控制设备可以根据荧光检测的确定参数控制核酸提取设备在提取核酸过程中进行荧光检测,并获取经过荧光检测的核酸提取结果,根据荧光检测的确定参数生成经过荧光检测的核酸提取结果对应的核酸定量报告,并展示核酸定量报告。可选地,如果检测参数不包括荧光检测的确定参数,核酸提取设备在提取核酸过程中不进行荧光检测,控制设备获取到核酸提取结果后,也不生成核酸定量报告。
可选地,控制设备还可以显示核酸提取的运行信息,所述运行信息包括运行状态、运行时间、剩余时间中的至少一种。如图5所示为运行界面图的示意图,通过图5可以对样本号以及运行信息等进行显示。
本发明实施例提供的技术方案,在接收板材位置确定操作之前,控制设备可以根据预先确定的板材引导信息生成引导提示信息,并获取与所述引导提示信息对应的所述板材放置操作,将所述板材放置操作发送至所述核酸提取设备,并接收所述核酸提取设备发送的板材放置结果,可以达到自动引导用户放置板材的目的,提高板材放置效率和准确率;并且,通过确定检测参数对应的运行脚本,基于运行启动操作,控制核酸提取设备执行核酸提取步骤,以提取样品中的核酸,可以实现通过自动执行运行脚本的核酸提取步骤,将核酸提取的复杂流程脚本化,提高核酸提取效率的效果。
实施例三
图6为本发明实施例三提供的一种核酸提取装置的结构示意图。参见图6所示,该装置包括:检测参数确定模块31、样品放置结果接收模块32、板材位置确定模块33以及核酸提取模块34。
其中,检测参数确定模块31,用于获取当前检测任务的检测参数;样品放置结果接收模块32,用于接收样品放置操作,基于所述样品放置操作控制核酸提取设备将所需样品放置在对应的样品区域;板材位置确定模块33,用于接收板材位置确定操作,基于所述板材位置确定操作确定各操作区域中板材的位置,其中,所述板材预先根据板材放置操作对应放置;核酸提取模块34,用于接收运行启动操作,根据所述运行启动操作和所述检测参数控制所述核酸提取设备在所述样品中提取核酸,得到核酸提取结果。
在上述各技术方案的基础上,核酸提取模块34还用于,确定所述检测参数对应的运行脚本,其中,所述运行脚本至少包括核酸提取步骤;
基于所述运行启动操作,控制所述核酸提取设备执行所述核酸提取步骤,以提取所述样品中的核酸。
在上述各技术方案的基础上,该装置还包括:板材放置结果接收模块;其中,板材放置结果接收模块,用于根据预先确定的板材引导信息生成引导提示信息,并获取与所述引导提示信息对应的所述板材放置操作,其中,所述引导提示信息包括显示引导以及语音引导中的至少一种;
将所述板材放置操作发送至所述核酸提取设备,并接收所述核酸提取设备发送的板材放置结果,其中,所述板材放置结果包括所述板材和所述板材对应的各操作区域。
在上述各技术方案的基础上,板材放置结果接收模块还用于,根据板材放置顺序和所述板材引导信息,确定所述核酸提取设备中板材放置位置;
基于引导界面中与所述板材放置位置对应的图标,生成所述引导提示信息,其中,所述引导界面中包括与所述核酸提取设备中各板材位置对应的图标。
在上述各技术方案的基础上,板材位置确定模块33还用于,根据所述板材位置确定操作控制所述核酸提取设备扫描所述核酸提取设备各所述板材的标签信息,并接收所述核酸提取设备发送的所述标签信息;
基于所述标签信息对所述板材的位置进行校验,根据校验结果确定所述各操作区域中板材的位置。
在上述各技术方案的基础上,该装置还包括:核酸定量报告生成模块;其中,核酸定量报告生成模块,用于如果所述检测参数包括荧光检测的确定参数,根据所述荧光检测的确定参数生成核酸定量报告。
在上述各技术方案的基础上,该装置还包括:显示模块;其中,显示模块,用于显示核酸提取的运行信息,所述运行信息包括运行状态、运行时间、剩余时间中的至少一种。
本发明实施例提供的技术方案,通过获取当前检测任务的检测参数,接收样品放置操作,基于所述样品放置操作控制核酸提取设备将所需样品放置在对应的样品区域,可以达到根据样品放置操作自动化放置样品的目的,接收板材位置确定操作,基于所述板材位置确定操作确定各操作区域中板材的位置,其中,所述板材预先根据板材放置操作对应放置,以准确确定板材的位置,避免因板材位置出现错误对核酸提取过程产生影响,接收运行启动操作,根据所述运行启动操作和所述检测参数控制所述核酸提取设备在所述样品中提取核酸,得到核酸提取结果。解决了现有技术中通过人工实验的方式提取核酸步骤繁琐,耗时较长的问题,达到自动化控制核酸提取设备提取核酸的目的,实现提高核酸提取效率的效果。
实施例四
图7为本发明实施例四提供的一种核酸提取系统的结构示意图。参见图7所示,该系统包括:控制设备1和核酸提取设备2;
其中,控制设备1,用于获取当前检测任务的检测参数,接收样品放置操作,基于所述样品放置操作控制核酸提取设备将所需样品放置在对应的样品区域,接收板材位置确定操作,基于所述板材位置确定操作确定各操作区域中板材的位置,其中,所述板材预先根据板材放置操作对应放置,接收运行启动操作,根据所述运行启动操作和所述检测参数控制所述核酸提取设备在所述样品中提取核酸,得到核酸提取结果;
核酸提取设备2,用于在所述控制设备的控制下,将所需样品放置在对应的样品区域、确定各操作区域中板材的位置以及在所述样品中提取核酸,并将核酸提取结果发送至所述控制设备;
在上述各技术方案的基础上,控制设备1还用于,确定所述检测参数对应的运行脚本,其中,所述运行脚本至少包括核酸提取步骤;
基于所述运行启动操作,控制所述核酸提取设备执行所述核酸提取步骤,以提取所述样品中的核酸。
在上述各技术方案的基础上,控制设备1还用于,根据预先确定的板材引导信息生成引导提示信息,并获取与所述引导提示信息对应的所述板材放置操作,其中,所述引导提示信息包括显示引导以及语音引导中的至少一种;
将所述板材放置操作发送至所述核酸提取设备,并接收所述核酸提取设备发送的板材放置结果,其中,所述板材放置结果包括所述板材和所述板材对应的各操作区域。
在上述各技术方案的基础上,控制设备1还用于,根据板材放置顺序和所述板材引导信息,确定所述核酸提取设备中板材放置位置;
基于引导界面中与所述板材放置位置对应的图标,生成所述引导提示信息,其中,所述引导界面中包括与所述核酸提取设备中各板材位置对应的图标。
在上述各技术方案的基础上,控制设备1还用于,根据所述板材位置确定操作控制所述核酸提取设备扫描所述核酸提取设备各所述板材的标签信息,并接收所述核酸提取设备发送的所述标签信息;
基于所述标签信息对所述板材的位置进行校验,根据校验结果确定所述各操作区域中板材的位置。
在上述各技术方案的基础上,控制设备1还用于,如果所述检测参数包括荧光检测的确定参数,根据所述荧光检测的确定参数生成核酸定量报告。
在上述各技术方案的基础上,控制设备1还用于,显示核酸提取的运行信息,所述运行信息包括运行状态、运行时间、剩余时间中的至少一种。
实施例五
图8为本发明实施例五提供的一种控制设备的结构示意图。参见图8所示,图8示出了适于用来实现本发明实施方式的示例性控制设备12的框图。图8显示的控制设备12仅仅是一个示例,不应对本发明实施例的功能和使用范围带来任何限制。
如图8所示,控制设备12以通用计算设备的形式表现。控制设备12的组件可以包括但不限于:一个或者多个处理器或者处理单元16,系统存储器28,连接不同系统组件(包括系统存储器28和处理单元16)的总线18。
总线18表示几类总线结构中的一种或多种,包括存储器总线或者存储器控制器,外围总线,图形加速端口,处理器或者使用多种总线结构中的任意总线结构的局域总线。举例来说,这些体系结构包括但不限于工业标准体系结构(ISA)总线,微通道体系结构(MAC)总线,增强型ISA总线、视频电子标准协会(VESA)局域总线以及外围组件互连(PCI)总线。
控制设备12典型地包括多种计算机系统可读介质。这些介质可以是任何能够被控制设备12访问的可用介质,包括易失性和非易失性介质,可移动的和不可移动的介质。
系统存储器28可以包括易失性存储器形式的计算机系统可读介质,例如随机存取存储器(RAM)30和/或高速缓存存储器32。控制设备12可以进一步包括其它可移动/不可移动的、易失性/非易失性计算机系统存储介质。仅作为举例,存储系统34可以用于读写不可移动的、非易失性磁介质(图8未显示,通常称为“硬盘驱动器”)。尽管图8中未示出,可以提供用于对可移动非易失性磁盘(例如“软盘”)读写的磁盘驱动器,以及对可移动非易失性光盘(例如CD-ROM,DVD-ROM或者其它光介质)读写的光盘驱动器。在这些情况下,每个驱动器可以通过一个或者多个数据介质接口与总线18相连。存储器28可以包括至少一个程序产品,该程序产品具有一组(例如核酸提取装置的检测参数确定模块31、样品放置结果接收模块32、板材位置确定模块以及核酸提取模块34)程序模块,这些程序模块被配置以执行本发明各实施例的功能。
具有一组(例如核酸提取装置的检测参数确定模块31、样品放置结果接收模块32、板材位置确定模块以及核酸提取模块34)程序模块46的程序/实用工具44,可以存储在例如存储器28中,这样的程序模块46包括但不限于操作系统、一个或者多个应用程序、其它程序模块以及程序数据,这些示例中的每一个或某种组合中可能包括网络环境的实现。程序模块46通常执行本发明所描述的实施例中的功能和/或方法。
控制设备12也可以与一个或多个外部设备14(例如键盘、指向设备、显示器24等)通信,还可与一个或者多个使得用户能与该控制设备12交互的设备通信,和/或与使得该控制设备12能与一个或多个其它计算设备进行通信的任何设备(例如网卡,调制解调器等等)通信。这种通信可以通过输入/输出(I/O)接口22进行。并且,控制设备12还可以通过网络适配器20与一个或者多个网络(例如局域网(LAN),广域网(WAN)和/或公共网络,例如因特网)通信。如图所示,网络适配器20通过总线18与控制设备12的其它模块通信。应当明白,尽管图中未示出,可以结合控制设备12使用其它硬件和/或软件模块,包括但不限于:微代码、设备驱动器、冗余处理单元、外部磁盘驱动阵列、RAID系统、磁带驱动器以及数据备份存储系统等。
处理单元16通过运行存储在系统存储器28中的程序,从而执行各种功能应用以及数据处理,例如实现本发明实施例所提供的一种核酸提取方法,该方法包括:
获取当前检测任务的检测参数;
接收样品放置操作,基于所述样品放置操作控制核酸提取设备将所需样品放置在对应的样品区域;
接收板材位置确定操作,基于所述板材位置确定操作确定各操作区域中板材的位置,其中,所述板材预先根据板材放置操作对应放置;
接收运行启动操作,根据所述运行启动操作和所述检测参数控制所述核酸提取设备在所述样品中提取核酸,得到核酸提取结果。
处理单元16通过运行存储在系统存储器28中的程序,从而执行各种功能应用以及数据处理,例如实现本发明实施例所提供的一种核酸提取方法。
当然,本领域技术人员可以理解,处理器还可以实现本发明任意实施例所提供的一种核酸提取方法的技术方案。
实施例六
本发明实施例五还提供了一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,该程序被处理器执行时实现如本发明实施例所提供的一种核酸提取方法,该方法包括:
获取当前检测任务的检测参数;
接收样品放置操作,基于所述样品放置操作控制核酸提取设备将所需样品放置在对应的样品区域;
接收板材位置确定操作,基于所述板材位置确定操作确定各操作区域中板材的位置,其中,所述板材预先根据板材放置操作对应放置;
接收运行启动操作,根据所述运行启动操作和所述检测参数控制所述核酸提取设备在所述样品中提取核酸,得到核酸提取结果。
当然,本发明实施例所提供的一种计算机可读存储介质,其上存储的计算机程序不限于如上的方法操作,还可以执行本发明任意实施例所提供的一种核酸提取方法中的相关操作。
本发明实施例的计算机存储介质,可以采用一个或多个计算机可读的介质的任意组合。计算机可读介质可以是计算机可读信号介质或者计算机可读存储介质。计算机可读存储介质例如可以是——但不限于——电、磁、光、电磁、红外线、或半导体的系统、系统或器件,或者任意以上的组合。计算机可读存储介质的更具体的例子(非穷举的列表)包括:具有一个或多个导线的电连接、便携式计算机磁盘、硬盘、随机存取存储器(RAM)、只读存储器(ROM)、可擦式可编程只读存储器(EPROM或闪存)、光纤、便携式紧凑磁盘只读存储器(CD-ROM)、光存储器件、磁存储器件、或者上述的任意合适的组合。在本文件中,计算机可读存储介质可以是任何包含或存储程序的有形介质,该程序可以被指令执行系统、系统或者器件使用或者与其结合使用。
计算机可读的信号介质可以包括在检测参数以及核酸提取结果等,其中承载了计算机可读的程序代码。这种传播的检测参数以及核酸提取结果等形式。计算机可读的信号介质还可以是计算机可读存储介质以外的任何计算机可读介质,该计算机可读介质可以发送、传播或者传输用于由指令执行系统、系统或者器件使用或者与其结合使用的程序。
计算机可读介质上包含的程序代码可以用任何适当的介质传输,包括——但不限于无线、电线、光缆、RF等等,或者上述的任意合适的组合。
可以以一种或多种程序设计语言或其组合来编写用于执行本发明操作的计算机程序代码,程序设计语言包括面向对象的程序设计语言—诸如Java、Smalltalk、C++,还包括常规的过程式程序设计语言—诸如”C”语言或类似的程序设计语言。程序代码可以完全地在用户计算机上执行、部分地在用户计算机上执行、作为一个独立的软件包执行、部分在用户计算机上部分在远程计算机上执行、或者完全在远程计算机或服务器上执行。在涉及远程计算机的情形中,远程计算机可以通过任意种类的网络——包括局域网(LAN)或广域网(WAN)—连接到用户计算机,或者,可以连接到外部计算机(例如利用因特网服务提供商来通过因特网连接)。
值得注意的是,上述核酸提取装置的实施例中,所包括的各个模块只是按照功能逻辑进行划分的,但并不局限于上述的划分,只要能够实现相应的功能即可;另外,各功能单元的具体名称也只是为了便于相互区分,并不用于限制本发明的保护范围。
注意,上述仅为本发明的较佳实施例及所运用技术原理。本领域技术人员会理解,本发明不限于这里所述的特定实施例,对本领域技术人员来说能够进行各种明显的变化、重新调整和替代而不会脱离本发明的保护范围。因此,虽然通过以上实施例对本发明进行了较为详细的说明,但是本发明不仅仅限于以上实施例,在不脱离本发明构思的情况下,还可以包括更多其他等效实施例,而本发明的范围由所附的权利要求范围决定。