CN111004806B - 一种香鱼cd46基因、重组工程菌及其多克隆抗体的制备方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种香鱼CD46基因、重组工程菌及其多克隆抗体的制备方法,特点是包括香鱼CD46‑1、CD46‑2和CD46‑3基因,cDNA序列相应为SEQID NO.1、SEQID NO.3和SEQID NO.5所示;其重组香鱼CD46基因工程菌的制备方法包括构建重组香鱼CD46蛋白胞外区毕赤酵母表达质粒的步骤;筛选高表达重组工程菌株的步骤;高表达酵母菌株发酵罐培养的步骤;重组香鱼CD46胞外区蛋白纯化,得到重组香鱼CD46基因工程菌的步骤;以及通过兔免疫法制备得到兔抗香鱼CD46蛋白多克隆抗体,优点是能够特异性识别香鱼CD46蛋白异构体。
Description
技术领域
本发明涉及基因工程技术领域,尤其是涉及一种香鱼CD46基因、重组工程菌及其多克隆抗体的制备方法。
背景技术
膜辅蛋白(membrane cofactor protein, MCP或CD46)就是膜结合性补体调节蛋白(membrane complement regulatory protein, mRCPs)成员之一,作为补体因子Ⅰ的辅因子介导C3b和C4b的裂解,从而抑制补体级联反应,防止补体的过激活带来的自体细胞的损伤。此外,CD46是T细胞的共刺激蛋白,是调节T细胞免疫功能的关键分子。上述作用揭示了CD46在连接先天免疫和适应性免疫方面起着重要作用。新近,研究发现CD46参与染色质组装和基因表达调控;可降低脂多糖(Lipopolysaccharide, LPS)刺激的单核细胞来源的树突状细胞的促炎能力;此外,CD46也是多种病毒和细菌病原体的受体,可能参与病原感染过程。目前,鱼类CD46基因鲜有报道,尤其是香鱼CD46基因还未曾被注释。亦未有关于香鱼CD46毕赤酵母体外表达的任何报道,更无关于香鱼CD46多克隆抗体的研究。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是提供一种香鱼CD46基因、重组工程菌及其多克隆抗体的制备方法,该多克隆抗体能够特异性识别香鱼CD46蛋白异构体。
本发明解决上述技术问题所采用的技术方案为:
1、一种香鱼CD46基因,包括香鱼CD46-1基因,该基因为SEQID NO.1所示的cDNA序列。
所述的香鱼CD46-1基因的编码蛋白为SEQID NO.2所示的氨基酸序列。
2、一种香鱼CD46基因,包括香鱼CD46-2基因,该基因为SEQID NO.3所示的cDNA序列。
所述的香鱼CD46-2基因的编码蛋白为SEQID NO.4所示的氨基酸序列。
3、一种香鱼CD46基因,包括香鱼CD46-3基因,该基因为SEQID NO.5所示的cDNA序列。
所述的香鱼CD46-3基因的编码蛋白为SEQID NO.6所示的氨基酸序列。
4、一种重组香鱼CD46基因工程菌的制备方法,包括以下步骤:
(1)构建重组香鱼CD46蛋白胞外区毕赤酵母表达质粒
根据香鱼CD46-1基因核苷酸序列SEQID NO.1设计可扩增包含4个SCR和STP部分的胞外区的引物rPaCD46sex-F和rPaCD46sex-R,以香鱼外周血单核细胞的cDNA为模板,扩增获得PCR产物,切胶回收产物用限制性内切酶Eco RI 和Kpn I双酶切,再与相同酶切的质粒pPICZαA 用T4 DNA连接酶连接,转化大肠杆菌 DH5α中,得到重组质粒pPICZα-PaCD46ex;其中PCR引物序列如下:含Not I位点rPaCD46sex-F为 5'-GGCGGCCGCCAAGACTGCACCAGACCCGT-3',含XbaI位点rPaCD46sex-R为 5'-GTCTAGAAATCCTGTGTTGCTAGGAGCCT-3';
(2)筛选高表达重组工程菌株
重组表达质粒 pPICZα-PaCD46ex经Sac I酶线性化后,进行电击转化毕赤酵母感受态获得转化子,转化子经博莱霉高抗性筛选及 PCR 鉴定,阳性克隆为重组工程菌X33/pPICZα-PaCD46ex;将重组工程菌培养诱导表达,上清液用SDS-PAGE蛋白电泳检测,筛选得到表达水平为 60mg/L高表达重组工程菌株;
(3)高表达酵母菌株发酵罐培养
将发酵罐中装入发酵基底液后灭菌,之后调节发酵基底液pH至5.0.通过控制转速和溶氧情况监控整个发酵过程,全程保持温度为30℃,接种后先补充甘油,直到菌体湿重达到0.2-0.3g/mL再进行甲醇补料,发酵70小时以后,收集上清培养基;
(4)重组香鱼 CD46胞外区蛋白的纯化
收集步骤(3)发酵罐发酵后得到的上清培养基,经强阳离子交换柱层析,收集第二洗脱峰的洗脱液换液浓缩后,再经HisTrap™ FF标签蛋白层析柱分离纯化,收集最高洗脱峰,蛋白溶液脱盐后真空冷冻干燥,即得到纯度达95%以上的重组香鱼CD46胞外区蛋白,即为重组香鱼CD46基因工程菌。
步骤(3)具体为:将发酵罐中装入发酵基底液后灭菌,之后调节发酵基底液pH至5.0,同时将转速和通气量调至最大标定溶氧电极的100%,标定完成并设置温度为30℃后即可接种进行发酵,发酵过程中确保发酵液中溶氧大于20%;发酵18-24小时后,培养基中初始的甘油即将耗尽,取样测菌体湿重,之后开始添加甘油,通过补料补充甘油补料培养基,维持3-5小时;继续培养2-3小时后甘油消耗,直到菌体湿重达到0.2-0.3g/mL再进行甲醇补料,甲醇补料时初始流速应控制在1 mL/h/L,一旦适应甲醇作为营养源并以甲醇进行代谢后,溶氧趋于稳定,提高甲醇流加速度为原来两倍的流加速率,即2 mL/h/L,之后以此速度维持2小时后提高流加速率至3mL/h/L,直到发酵结束,发酵70小时以后,收集上清培养基,其中所述的发酵基底液配方为氢氧化钾4.13g/L、无水硫酸钙0.93g/L、无水硫酸钾18.2g/L、七水硫酸镁14.9g/L、甘油40 g/L、磷酸2.67vt%。
步骤(4)具体为:将上清培养基用低温高速离心机4℃,13,000 g离心,收集上清,在4 ℃条件下,使用5000NMWL旋转过滤器浓缩并透析在阳离子交换柱平衡缓冲液中,然后上样UNOsphere S阳离子交换柱;以 3.0 mL/min 的流速用含有1M NaCl的PB缓冲液通过线性梯度洗脱,收集得到的样品经电泳检测后合并,具有重组香鱼CD46-1蛋白胞外区的蛋白峰使用超滤离心管浓缩,接着使用HisTrap™ FF色谱柱纯化带His标签的重组香鱼CD46胞外区,将洗脱获得的蛋白通过5 mL Bio-Gel P-6脱盐柱脱盐,最终得到95% 以上的重组蛋白,分装后用冷冻干燥机冻干成粉末,放于-80℃保存待使用。
5、一种香鱼CD46蛋白多克隆抗体的制备方法,包括以下步骤:将纯化得到的权利要求7-9中任一项制备得到的重组香鱼CD46基因工程菌用弗氏佐剂乳化,然后免疫注射雄性新西兰兔;每隔10天免疫注射一次,共需注射四次,第四次免疫10天后,然后进行心脏采血,静置离心后获取上清,即为重组香鱼CD46蛋白多克隆抗血清,用Protein G柱纯化即得兔抗香鱼CD46蛋白多克隆抗体。
与现有技术相比,本发明的优点在于:本发明香鱼CD46基因、编码蛋白及其重组工程菌的构建方法和多克隆抗体的制备方法,首次克隆得到香鱼CD46基因,在克隆香鱼CD46基因异构体序列的基础上,首次构建香鱼CD46蛋白毕赤酵母表达载体,并最终制备了兔抗香鱼CD46蛋白多克隆抗体,该抗体能够特异性识别香鱼CD46蛋白异构体,为今后开展香鱼CD46蛋白异构体功能研究奠定了基础。
附图说明
图1为香鱼CD46基因异构体1氨基酸序列比对分析;
图2为香鱼CD46基因异构体和其它物种CD46氨基酸序列的系统发育进化树分析;
图3为香鱼CD46蛋白胞外区核苷酸片段PCR扩增结果;
图4为香鱼CD46蛋白胞外区毕赤酵母表达重组质粒的构建及鉴定;
图5为SDS-PAGE检测重组香鱼CD46蛋白胞外区毕赤酵母表达;M:蛋白marker;1:经甲醇诱导的pPICZαA/X33;2:经甲醇诱导的pPICZαA-rPaCD46ex/X33;3:纯化的重组香鱼CD46蛋白胞外区;
图6为Western blot检测香鱼CD46蛋白抗体特异性。1.阴性对照;2.纯化的重组CD46蛋白胞外区;3.PBMC总蛋白。
具体实施方式
以下结合附图实施例对本发明作进一步详细描述。
若未特别指明,实施例中所用的技术手段为本领域技术人员所熟知的常规手段。
具体实施例一
分析香鱼CD46基因克隆及序列分析
采用RNAiso Plus提取香鱼外周血单核细胞(peripheral blood mononuclearcell, PBMC)总RNA。经DNase I处理后,以Oligo(dT)-adaptor为引物,用AMV逆转录酶合成第一链cDNA。从香鱼头肾来源的单核巨噬细胞转录组中获得香鱼CD46两个异构体,采用开放阅读框序列设计扩增引物PaCD46t-F (5'-ATGCAGTCCCTTGATACATCTCGTT-3') 和PaCD46t-R (5'-CTATAGTGAATCAACAGGAGGACTGC-3'),以上述cDNA为模板,进行PCR扩增并测序验证。获得的香鱼CD46异构体序列采用BLAST search进行同源序列比对分析;分子量和等电点预测采用pI/Mw计算工具;信号肽预测采用SignalP 4.1软件;保守结构域分析采用SMART在线软件;O连接糖基化和N连接糖基化预测均采用在线软件。多序列比对采用ClustalW程序,进化树构建采用MEGA 7.0。从PBMC中克隆获得香鱼CD46基因3种异构体,分别命名为香鱼CD46-1、CD46-2和CD46-3。
香鱼CD46-1基因为SEQID NO.1所示的cDNA序列,其编码蛋白为SEQID NO.2所示的氨基酸序列,香鱼CD46-1编码长度为323个氨基酸的蛋白,分子量为33.8 kDa,等电点为7.21。
香鱼CD46-2基因为SEQID NO.3所示的cDNA序列,其编码蛋白为SEQID NO.4所示的氨基酸序列,香鱼CD46-2编码长度为310个氨基酸的蛋白,分子量为32.2 kDa,等电点为5.55。
香鱼CD46-3基因为SEQID NO.5所示的cDNA序列,其编码蛋白为SEQID NO.6所示的氨基酸序列,香鱼CD46-3编码长度为348个氨基酸的蛋白,分子量为36.3 kDa,等电点为5.55。
三个异构体均为跨膜蛋白,胞外区含有4个短同源重复序列(short consensusrepeats, SCR)和不同的富含丝氨酸、苏氨酸和脯氨酸区(Ser, Thr and Pro-richdomain, STP)。如图1所示3个异构体胞外区(extracellular domain)高度相似。如图2所示,香鱼CD46基因3个异构体与其他鱼类的序列形成一簇,再与哺乳动物CD46形成大簇。
上述香鱼PBMC细胞分离的步骤如下:用3.2 %的柠檬酸钠润洗1mL注射器,然后脊髓取健康香鱼血液,迅速混匀防止凝血,3,000rpm,5min离心后去上层血清,每管血液沉淀加入PBS缓冲液补足4 mL,混匀后用6wt%葡聚糖溶液沉淀4小时,取上清大约2mL,用PBS缓冲液清洗(1,500 rpm,5min)后,ficoll密度梯度离心2,000rpm,30min。取中间白膜层,PBS缓冲液再次清洗三次即得到香鱼PBMC细胞。
具体实施例二
重组香鱼CD46基因工程菌的构建方法
1、构建重组香鱼CD46蛋白胞外区毕赤酵母表达质粒
根据香鱼CD46-1基因核苷酸序列SEQID NO.1所示,设计可扩增包含4个SCR和STP部分的胞外区的引物rPaCD46sex-F和rPaCD46sex-R,PCR反应条件按照常规设置进行,以上述PBMC的cDNA为模板,扩增获得胞外区核苷酸序列。将含重组香鱼CD46蛋白胞外区的PCR产物用切胶回收试剂盒回收,回收产物用限制性内切酶Eco RI 和Kpn I双酶切,将酶切后的PCR产物与相同酶切的质粒 pPICZαA 用T4 DNA连接酶连接,转化大肠杆菌 DH5α中,得到重组质粒 pPICZα-PaCD46ex,重组子经酶切鉴定和测序验证。如图3所示PCR扩增获得重组香鱼胞外区核苷酸序列,为771bp。如图4所示上方条带为酶切后的载体,下方条带为重组香鱼胞外区核苷酸序列,说明结果正确。测序结果已经一步表明插入片段与原序列一致。因此,重组表达质粒的构建完全正确。其中PCR引物序列如下:
含Not I位点rPaCD46sex-F为 5'-GGCGGCCGCCAAGACTGCACCAGACCCGT-3',
含XbaI位点rPaCD46sex-R为 5'-GTCTAGAAATCCTGTGTTGCTAGGAGCCT-3'。
2、筛选高表达重组工程菌株
取经 SacI酶切线性化的重组表达质粒 pPICZα-PaCD46ex 20μg进行电击转化毕赤酵母感受态获得转化子,转化子经博莱霉 Zeocin 高抗性筛选及 PCR 鉴定,阳性克隆为重组工程菌 X33/pPICZα-PaCD46ex;将获得的博莱霉高抗性重组工程菌株 X33/pPICZα-PaCD46ex接种于BMGY培养基中,培养至OD600达2.0~6.0收集细胞,重悬于BMMY培养基中,0.5%甲醇诱导表达,上清液用SDS-PAGE蛋白电泳检测,筛选表达水平约为 60mg/L 的菌株,得到高表达重组工程菌株。如图5中SDS-PAGE电泳检测结果显示一条40kDa左右大小的清晰条带,与估算的重组蛋白分子量32.5 kDa(27.5kDa香鱼CD46胞外区+5kDa His标签)一致,表明重组香鱼CD46蛋白胞外区重组表达成功。
3、高表达酵母菌株发酵罐培养
配置发酵基底液(氢氧化钾4.13g/L、无水硫酸钙0.93g/L、无水硫酸钾18.2g/L、七水硫酸镁14.9g/L、甘油40 g/L、磷酸2.67%(体积百分比),连同罐体灭菌锅中121℃灭菌40min。发酵罐冷却后需用浓氨水调发酵液pH至5.0,同时将转速和通气量调至最大标定溶氧电极的100%,标定完成并设置温度为30℃后即可接种进行发酵。发酵过程中确保发酵液中溶氧大于20%。一般发酵18-24小时后,培养基中初始的甘油即将耗尽(此时DO上升到100%),取样测菌体湿重,之后开始添加甘油,通过补料补充甘油补料培养基(流量控制在18.15mL/h/L),维持大约4小时;继续培养2-3小时后甘油消耗,直到菌体湿重达到0.2-0.3g/mL再进行甲醇补料,甲醇补料时初始流速应控制在1 mL/h/L,一旦适应甲醇作为营养源并以甲醇进行代谢后,溶氧趋于稳定,此时可提高甲醇流加速度为原来两倍的流加速率,即2 mL/h/L,之后以此速度维持大约2小时后提高流加速率至3mL/h/L,直到发酵结束,发酵70小时以后,收集上清培养基。
4、重组香鱼 CD46胞外区蛋白的纯化
收集发酵罐发酵后得到的上清培养基,经强阳离子交换柱层析,收集第二洗脱峰的洗脱液浓缩后,再经HisTrap™ FF标签蛋白层析柱分离纯化,收集最高洗脱峰。蛋白溶液脱盐后真空冷冻干燥,即得到如图5纯度达95%以上的重组香鱼CD46胞外区蛋白。具体步骤如下:
将上清培养基用低温高速离心机4℃,13,000 g离心,收集上清,在4 ℃条件下,使用5000NMWL旋转过滤器浓缩并透析在阳离子交换柱平衡缓冲液中,然后上样UNOsphere S阳离子交换柱;以 3.0 mL/min 的流速用含有1M NaCl的PB缓冲液通过线性梯度洗脱,收集得到的样品经电泳检测后合并,具有重组香鱼CD46蛋白胞外区(rPaMCPex)的蛋白峰使用50mL超滤离心管浓缩,接着使用HisTrap™ FF色谱柱纯化带His标签的重组香鱼CD46胞外区,将洗脱获得的蛋白通过5 mL Bio-Gel P-6脱盐柱脱盐,最终得到95% 以上的重组蛋白,分装后用冷冻干燥机冻干成粉末,放于-80℃保存待使用。
具体实施例三
1、香鱼CD46蛋白多克隆抗体制备
将具体实施例二纯化得到的重组蛋白用弗氏佐剂乳化,然后免疫注射雄性新西兰兔。每隔10天免疫注射一次,共需注射四次。首次免疫时,用弗氏完全佐剂(1:1)乳化重组蛋白,每只兔子背部皮下多点注射纯化的重组蛋白1 mg。后三次免疫,用弗氏不完全佐剂(1:1)乳化重组蛋白于第10天、20天和30天用同样方法注射重组融合蛋白500μg。第四次免疫10天后,断粮1天,然后进行心脏采血。4℃冰箱静止过夜,用低温离心机4℃,15,000g离心10min,移液枪轻轻吸取上清,即为重组香鱼CD46蛋白多克隆抗血清。用Protein G柱纯化即得兔抗香鱼CD46蛋白多克隆抗体,分装后-20℃保存。
2、重组香鱼CD46蛋白多克隆抗体效价测定
用包被液稀释纯化的重组香鱼CD46蛋白胞外区(浓度为30μg/mL),在96孔酶标板中每孔加入100μL,温度4℃包被过夜;振荡洗涤3次后,酶标板孔中分别加入200μL封闭液,温度37℃封闭1小时;振荡洗涤3次后,将香鱼CD46蛋白多克隆抗体与PBS缓冲液按照体积1:10比例(μL)进行连续的梯度稀释,在酶标板孔中分别加入100μL,设置3个平行,以PBS作为阴性对照组,温度37℃孵育2小时;振荡洗涤3次后,在酶标板孔中分别加入100μL稀释的辣根过氧化物酶标记二抗(1:1000),温度37℃孵育2小时;振荡洗涤3次后,酶标板孔中分别加入100μL配制新鲜底物液,避光,温度37℃孵育20 min;酶标板孔中分别加入50μL终止液,用酶标仪检测450nm波长时各孔的吸光度值,标准为P/N≥2.1;最终经ELISA检测,重组香鱼CD46蛋白多克隆抗体的效价为1:512000,此效价可以满足后续免疫组化实验的需求。
3、重组香鱼CD46蛋白多克隆抗体特异性检测
香鱼PBMC用PBS缓冲液洗涤2次,再用裂解缓冲液裂解细胞提取细胞总蛋白,使用Bradford方法测量总蛋白浓度。然后使用Western blot方法检测目的蛋白。如图6用重组香鱼CD46蛋白多克隆抗体可与重组CD46蛋白特异性结合,同时可检测到PBMC细胞中存在3种异构体。
步骤中Western blot具体如下:
分离香鱼PBMC用PBS洗涤2次,再用裂解缓冲液(20mM HEPES、1.5mM MgCl2、 0.2mMEDTA、100mM NaCl、0.2mM DTT、0.5mM sodium orthovanadate、0.4mM PMSF、1% SDS)裂解细胞提取细胞总蛋白,使用Bradford方法测量总蛋白浓度。将样品(1.阴性对照;2.纯化重组CD46蛋白胞外区;3.PBMC总蛋白)各50μg上样至12% SDS-聚丙烯酰胺凝胶。100V恒压电泳至指示带完全进入分离胶后,调至电压至120V,继续电泳2小时。PVDF膜经100 %甲醇浸泡15秒活化,将电泳后的凝胶放置于PVDF膜上,然后夹在上下各三层的滤纸中,排除所有气泡。然后将其放置于电极之中,使膜一面朝向正极,接通电源,35-40V恒压转膜3-4小时。转膜结束后,在含10%脱脂牛奶的TBS-T溶液中,37℃封闭1小时。之后在5% BSA的TBS-T溶液稀释的自制香鱼CD46抗血清(1:500稀释)中孵育2小时。将PVDF膜用TBS-T每15 min洗3次。加入山羊抗鼠辣根过氧化物酶标记的IgG(用TBS-T 1:2000稀释,碧云天),37℃孵育1小时。PVDF膜用TBS-T 15 min洗4次,加上ECL,暗室显色。
上述说明并非对本发明的限制,本发明也并不限于上述举例。本技术领域的普通技术人员在本发明的实质范围内,做出的变化、改型、添加或替换,也应属于本发明的保护范围。
序 列 表
<110> 宁波大学
<120> 一种香鱼CD46基因、重组工程菌及其多克隆抗体的制备方法
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<211> 969
<212> DNA
<213> 香鱼CD46-1基因(ATGCAGTCCCTTGATACATCTCGTTGTTGGTTGCTGGCAAGCTGCCTCTGTCTTGCCTCTATGGTTGGCACAGTTCAAGCACAAGACTGCACCAGACCCGTTGGAGGCAACAACACGGTATTGTCACCTGAAGACATTGGAAAGACAGAATTTGTCGATGGATCTTCTGTCACGTTTAAATGTGACATTGGTTATGAACAAACTGGAGGGTCTCGGACCATGACATGCACAAAGGGAGAGTGGAGTACGCCGACAATGACTTGTGAAAGAAAGAATTGTGGCAGTCCTGGAGAAGTACTGAATGGGCAATTTGACCTCAGTGGTGGGACCAAATTTGGTGACACAGTTGTGGCTACATGCAACCTAGGATTCAAACTAATCGGAAGTAATCGACGCCAGTGTATGGATGGGGGGTGGTCTGGCAGAGTACCGATATGCGAAGTGTCAAAATGTGGTCGAGCACCTAACATTGTGAATGGGAGACCATCGTCGAATGCTGAGTCGCATGACTATGGTGCTCCTGTTAGTTACAGCTGTAATTCTGGATTCACATTGTCTGGAAGCAAAACCATAGTCTGCAAAGGGGATGAGGTATTTGAACCAGCTCCGCCTAAATGTATAAAGGTCGAGTGTCCTTATCCTGACGTTTCAAACGCCATAGTGATCGAGGGAGGCTCCGCTCCCTATGAATACCTATCCTTTCTTACATTTGAGTGCAAATCTGGATTTGTAATGACTGGATTACCAAGTATAACATGTGAAATAGAAAGTCAATGGAAACCTTCCCCTCCAGAATGCAAAGCTCCTGGTCCGAAGCCCACTGATAAACCAAAGGCTCCTAGCAACACAGGAGCCATTGTCGGGGGGGTTATTGGTGCACTTGCTCTTGTTGCAGTTGCCATTGGGTGCTTTCTTGCATTCAAAAAAAAGGGTGCAAAGCGCAGCAGTCCTCCTGTTGATTCACTATAG)
<400> 1
<210> 2
<211> 322
<212> PRT
<213> 香鱼CD46-1基因的编码蛋白(MQSLDTSRCWLLASCLCLASMVGTVQAQDCTRPVGGNNTVLSPEDIGKTEFVDGSSVTFKCDIGYEQTGGSRTMTCTKGEWSTPTMTCERKNCGSPGEVLNGQFDLSGGTKFGDTVVATCNLGFKLIGSNRRQCMDGGWSGRVPICEVSKCGRAPNIVNGRPSSNAESHDYGAPVSYSCNSGFTLSGSKTIVCKGDEVFEPAPPKCIKVECPYPDVSNAIVIEGGSAPYEYLSFLTFECKSGFVMTGLPSITCEIESQWKPSPPECKAPGPKPTDKPKAPSNTGAIVGGVIGALALVAVAIGCFLAFKKKGAKRSSPPVDSL)
<400> 2
<210> 3
<211> 920
<212> DNA
<213> 香鱼CD46-2基因(ATGCAGTCCCTTGATACATCTCGTTGTTGGTTGCTGGCAAGCTGCCTCTGTCTTGCCTCTATAGTTGGCACAGTTCAAGCACAAGACTGCACCAGACCCGTTGGAGGCAACAACACGGTATTGTCACCTGAAGACATTGGAAAGACAGAATTTGTCGATGGATCTTCTGTCACGTTTAAATGTGACATTGGTTATGAACAAACTGGAGGGTCTCGGACCATGACATGCACAAAGGGAGAGTGGAGTACGCCGACAATGACTTGTGAAAGAAAGAATTGTGGCAGTCCTGGAGAAGTACTGAATGGGCAATTTGACCTCAGTGGTGGGACCAAATTTGGTGACACAGTTGTGGCTACATGCAACCTAGGATTCAAACTAATCGGAAGTAATCGACGCCAGTGTATGGATGGGGGGTGGTCTGGCAGAGTACCGATATGCGAAGTGTCAAAATGTGGTCGAGCACCTAACATTGTGAATGGGAGACCATCGTCGAATGCTGAGTCGCATGACTATGGTGCTCCTGTTAGTTACAGCTGTAATTCTGGATTCACATTGTCTGGAAGCAAAACCATAGTCTGCAAAGGGGATGAGGTATTTGAACCAGCTCCGCCTAAATGTATAAAGGTCGAGTGTCCTTATCCTGACGTTTCAAACGCCATAGTGATCGAGGGAGGCTCCGCTCCCTATGAATACCTATCCTTTCTTACATTTGAGTGCAAATCTGGATTTGTAATGACTGGATTACCAAGTATAACATGTGAAATAGAAAGTCAATGGAAACCTTCCCCTCCAGAATGCAAAGCTCCTGGTCCGAAGCCCACTGATAAACCAAAGGCTCCTAGCAACACAGGAGCCATTGTCGGGGGGGTTATTGGTGCACTTGTGCAAAGCGCAGCAGTCCTCCTGTTGATTCACTATAG)
<400> 3
<210> 4
<211> 306
<212> PRT
<213> 香鱼CD46-2基因的编码蛋白(MQSLDTSRCWLLASCLCLASIVGTVQAQDCTRPVGGNNTVLSPEDIGKTEFVDGSSVTFKCDIGYEQTGGSRTMTCTKGEWSTPTMTCERKNCGSPGEVLNGQFDLSGGTKFGDTVVATCNLGFKLIGSNRRQCMDGGWSGRVPICEVSKCGRAPNIVNGRPSSNAESHDYGAPVSYSCNSGFTLSGSKTIVCKGDEVFEPAPPKCIKVECPYPDVSNAIVIEGGSAPYEYLSFLTFECKSGFVMTGLPSITCEIESQWKPSPPECKAPGPKPTDKPKAPSNTGAIVGGVIGALVQSAAVLLLIHY)
<400> 4
<210> 5
<211> 1044
<212> DNA
<213> 香鱼CD46-3基因(ATGCAGTCCCTTGATACATCTCGTTGTTGGTTGCTGGCAAGCTGCCTCTGTCTTGCCTCTATGGTTGGCACAGTTCAAGCACAAGACTGCACCAGACCCGTAGGAGGCAACAACACGGTATTGTCACCTGAAGACATTGGAAAGACAGAATTTGTCGATGGATCTTCTGTCACGTTTAAATGTGACATTGGTTATGAACAAACTGGAGGGTCTCGGACCATGACATGCACAAAGGGAGAGTGGAGTACGCCGACAATGACTTGTGAAAGAAAGAATTGTGGCAGTCCTGGAGAAGTACTGAATGGGCAATTTGACCTCAGTGGTGGGACCAAATTTGGTGACACAGTTGTGGCTACATGCAACCCAGGATTCAAACTAATCGGAAGTAATCGACGCCAGTGTATGGATGGGGGGTGGCCTGGCAGAGTGCCGATATGCGAAGTGTCAAAATGTGGTCGAGCACCTAACATTGTGAATGGGAGACCATCGTCGATTGCTGAGTCGCATGACTATGGTGCTCCTGTTAGTTACAGCTGTAATTCTGGATTCACATTGTCTGGAAGCAAAACCATAGTCTGCAAAGGGGATGAGGTATTTGAACCAGCTCCGCCTAAATGTATAAAGGTCGAGTGTCCTTATCCTGACGTTTCAAACGCCATAGTGATCGAGGGAGGCTCCGCTCCCTATGAATACCTATCCTTTCTTACATTTGAGTGCAAATCTGGATTTGTAATGACTGGATTACCAAGTATAACATGTGAAATAGAAAGTCAATGGAAACCTTCCCCTCCAGAATGCAAAGCCCCTTCAACCACAACCAAACCCACTACTACTACTGCTACTACTACTACTACTACAAAGAAACCTACAGACAAAGCTCCTGGTCCGAAGCCCACTGATAAACCAAAGGCTCCTGGCAACACAGGAGCCATTGTCGGGGGGGTTATTGGTGCACTTGCTCTTGTTGCAGTTGCCATTGGGTGCTTTCTTGCATTCAAAAAAAAGGGTGCAAAGCGCAGCAGTCCTCCTGTTGATTCACTATAG)
<400> 5
<210> 6
<211> 347
<212> PRT
<213> 香鱼CD46-3基因的编码蛋白(MQSLDTSRCWLLASCLCLASMVGTVQAQDCTRPVGGNNTVLSPEDIGKTEFVDGSSVTFKCDIGYEQTGGSRTMTCTKGEWSTPTMTCERKNCGSPGEVLNGQFDLSGGTKFGDTVVATCNPGFKLIGSNRRQCMDGGWPGRVPICEVSKCGRAPNIVNGRPSSIAESHDYGAPVSYSCNSGFTLSGSKTIVCKGDEVFEPAPPKCIKVECPYPDVSNAIVIEGGSAPYEYLSFLTFECKSGFVMTGLPSITCEIESQWKPSPPECKAPSTTTKPTTTTATTTTTTKKPTDKAPGPKPTDKPKAPGNTGAIVGGVIGALALVAVAIGCFLAFKKKGAKRSSPPVDSL)
<400> 6
<210> 7
<211> 29
<212> DNA
<213> 含Not I位点rPaCD46sex-F(5'-GGCGGCCGCCAAGACTGCACCAGACCCGT-3')
<400> 7
<210> 8
<211> 29
<212> DNA
<213> 含Xba I位点rPaCD46sex-R(5'-GTCTAGAAATCCTGTGTTGCTAGGAGCCT-3')
<400> 8
<210> 9
<211> 25
<212> DNA
<213> PaCD46t-F(5'-ATGCAGTCCCTTGATACATCTCGTT-3')
<400> 9
<210> 10
<211> 26
<212> DNA
<213> PaCD46t-R(5'-CTATAGTGAATCAACAGGAGGACTGC-3')
<400> 10
Claims (10)
1. 一种香鱼CD46基因,其特征在于所述基因的一种异构体为香鱼CD46-1基因,该基因为SEQ ID NO.1所示的cDNA序列。
2.根据权利要求1所述的一种香鱼CD46基因,其特征在于所述的香鱼CD46-1基因的编码蛋白为SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列。
3.一种香鱼CD46基因,其特征在于所述基因的一种异构体为香鱼CD46-2基因,该基因为SEQ ID NO.3所示的cDNA序列。
4.根据权利要求3所述的一种香鱼CD46基因,其特征在于所述的香鱼CD46-2基因的编码蛋白为SEQ ID NO.4所示的氨基酸序列。
5.一种香鱼CD46基因,其特征在于所述基因的一种异构体为香鱼CD46-3基因,该基因为SEQ ID NO.5所示的cDNA序列。
6.根据权利要求5所述的一种香鱼CD46基因,其特征在于所述的香鱼CD46-3基因的编码蛋白为SEQ ID NO.6所示的氨基酸序列。
7.一种重组香鱼CD46基因工程菌的制备方法,其特征在于包括以下步骤:
(1)构建重组香鱼CD46蛋白胞外区毕赤酵母表达质粒
根据香鱼CD46-1基因核苷酸序列SEQ ID NO.1设计可扩增包含4个SCR和STP部分的胞外区的引物rPaCD46sex-F和rPaCD46sex-R,以香鱼外周血单核细胞的cDNA为模板,扩增获得PCR产物,切胶回收产物用限制性内切酶Eco RI 和Kpn I双酶切,再与相同酶切的质粒pPICZαA 用T4 DNA连接酶连接,转化大肠杆菌 DH5α中,得到重组质粒pPICZα-PaCD46ex;其中PCR引物序列如下:含Not I位点rPaCD46sex-F为 5'-GGCGGCCGCCAAGACTGCACCAGACCCGT-3',含XbaI位点rPaCD46sex-R为 5'-GTCTAGAAATCCTGTGTTGCTAGGAGCCT-3';
(2)筛选高表达重组工程菌株
重组表达质粒 pPICZα-PaCD46ex经Sac I酶线性化后,进行电击转化毕赤酵母感受态获得转化子,转化子经博莱霉高抗性筛选及 PCR 鉴定,阳性克隆为重组工程菌X33/pPICZα-PaCD46ex;将重组工程菌培养诱导表达,上清液用SDS-PAGE蛋白电泳检测,筛选得到表达水平为 60mg/L高表达重组工程菌株;
(3)高表达酵母菌株发酵罐培养
将发酵罐中装入发酵基底液后灭菌,之后调节发酵基底液pH至5.0.通过控制转速和溶氧情况监控整个发酵过程,全程保持温度为30℃,接种后先补充甘油,直到菌体湿重达到0.2-0.3g/mL再进行甲醇补料,发酵70小时以后,收集上清培养基;
(4)重组香鱼 CD46胞外区蛋白的纯化
收集步骤(3)发酵罐发酵后得到的上清培养基,经强阳离子交换柱层析,收集第二洗脱峰的洗脱液换液浓缩后,再经HisTrap™ FF标签蛋白层析柱分离纯化,收集最高洗脱峰,蛋白溶液脱盐后真空冷冻干燥,即得到纯度达95%以上的重组香鱼CD46胞外区蛋白,即为重组香鱼CD46基因工程菌。
8.根据权利要求7所述的一种重组香鱼CD46基因工程菌的制备方法,其特征在于步骤(3)具体为:将发酵罐中装入发酵基底液后灭菌,之后调节发酵基底液pH至5.0,同时将转速和通气量调至最大标定溶氧电极的100%,标定完成并设置温度为30℃后即可接种进行发酵,发酵过程中确保发酵液中溶氧大于20%;发酵18-24小时后,培养基中初始的甘油即将耗尽,取样测菌体湿重,之后开始添加甘油,通过补料补充甘油补料培养基,维持3-5小时;继续培养2-3小时后甘油消耗,直到菌体湿重达到0.2-0.3g/mL再进行甲醇补料,甲醇补料时初始流速应控制在1 mL/h/L,一旦适应甲醇作为营养源并以甲醇进行代谢后,溶氧趋于稳定,提高甲醇流加速度为原来两倍的流加速率,即2 mL/h/L,之后以此速度维持2小时后提高流加速率至3mL/h/L,直到发酵结束,发酵70小时以后,收集上清培养基,其中所述的发酵基底液配方为氢氧化钾4.13g/L、无水硫酸钙0.93g/L、无水硫酸钾18.2g/L、七水硫酸镁14.9g/L、甘油40 g/L、磷酸2.67vt%。
9.根据权利要求7所述的一种重组香鱼CD46基因工程菌的制备方法,其特征在于步骤(4)具体为:将上清培养基用低温高速离心机4℃,13,000 g离心,收集上清,在4 ℃条件下,使用5000NMWL旋转过滤器浓缩并透析在阳离子交换柱平衡缓冲液中,然后上样UNOsphereS阳离子交换柱;以 3.0 mL/min 的流速用含有1M NaCl的PB缓冲液通过线性梯度洗脱,收集得到的样品经电泳检测后合并,具有重组香鱼CD46-1蛋白胞外区的蛋白峰使用超滤离心管浓缩,接着使用HisTrap™ FF色谱柱纯化带His标签的重组香鱼CD46胞外区,将洗脱获得的蛋白通过5 mL Bio-Gel P-6脱盐柱脱盐,最终得到95% 以上的重组蛋白,分装后用冷冻干燥机冻干成粉末,放于-80℃保存待使用。
10.一种香鱼CD46蛋白多克隆抗体的制备方法,其特征在于包括以下步骤:将权利要求7-9任一项所述的制备方法纯化得到的重组香鱼CD46蛋白用弗氏佐剂乳化,然后免疫注射雄性新西兰兔;每隔10天免疫注射一次,共需注射四次,第四次免疫10天后,然后进行心脏采血,静置离心后获取上清,即为重组香鱼CD46蛋白多克隆抗血清,用Protein G柱纯化即得兔抗香鱼CD46蛋白多克隆抗体。
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