CN109191380A - 显微图像的拼接方法、装置、计算机设备和存储介质 - Google Patents
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Abstract
本申请涉及一种显微图像拼接方法、装置、计算机设备和存储介质。所述方法包括:获取显微局部图像;检测所述显微局部图像之间的重叠区域;在所述重叠区域中,确定非空重叠区域;对包含所述非空重叠区域的显微局部图像进行拼接,得到显微全景图像。采用本方法能够减少了拼接时间,提升了拼接显微图像的效率。
Description
技术领域
本申请涉及显微镜技术领域,特别是涉及一种显微图像拼接方法、装置、计算机设备和存储介质。
背景技术
传统显微镜在病理诊断和病理研究中,存在着操作步骤多、工作量大、资源共享难、不能长期保存等诸多问题,针对于上述问题,病理玻璃切片被数字化技术应运而生。数字化切片技术,针对于显微镜头的视野限制,利用显微镜采集切片各个局部的图像,通过图像无缝拼接技术,将多个图像组合而成的一张全景图像。
目前,较为常见的图像拼接方法中,是首先检测图像之间的重叠区域,然后根据重叠区域中的图像特征对图像进行拼接。
然而,数字切片是由几百乃至上万的图像拼接而成,上述的拼接方法需要对大量的重叠区域进行检测,导致整个拼接过程非常耗时。
因此,目前的显微图像拼接方法存在着拼接效率较低的问题。
发明内容
基于此,有必要针对上述技术问题,提供一种能够提升拼接效率的显微图像拼接方法、装置、计算机设备和存储介质。
一种显微图像拼接方法,包括:
获取显微局部图像;
检测所述显微局部图像之间的重叠区域;
在所述重叠区域中,确定非空重叠区域;
对包含所述非空重叠区域的显微局部图像进行拼接,得到显微全景图像。
在其中一个实施例,所述对包含所述非空重叠区域的显微局部图像进行拼接,得到显微全景图像,包括:
在所述显微局部图像中,选取单行图像;
在所述单行图像中,选取第一图像和第二图像;所述第二图像和所述第一图像在所述单行图像中相邻;
当所述第一图像与所述第二图像之间存在有所述非空重叠区域,拼接所述第一图像和所述第二图像,得到拼接图像;
根据所述拼接图像,生成所述显微全景图像。
在其中一个实施例,当所述第一图像与所述第二图像之间不存在有所述非空重叠区域,所述对包含所述非空重叠区域的显微局部图像进行拼接,得到显微全景图像,还包括:
确定所述单行图像的相邻行图像;
在所述相邻行图像中,选取第三图像;所述第三图像为所述第一图像在所述相邻行图像中相邻的显微局部图像;
当所述第一图像与所述第三图像之间存在有所述非空重叠区域,拼接所述第一图像和所述第三图像,得到所述拼接图像;
根据所述拼接图像,生成所述显微全景图像。
在其中一个实施例,所述根据所述拼接图像,生成显微全景图像,包括:
在所述拼接图像中,选取原点拼接图像;
计算所述拼接图像与所述原点拼接图像的拼接偏移量;
确定所述原点拼接图像的原点坐标,并根据所述原点坐标和所述拼接偏移量,计算所述拼接图像的图像坐标;
根据所述拼接图像的图像坐标,组合所述拼接图像,得到所述显微全景图像。
在其中一个实施例,所述根据所述拼接图像的图像坐标,组合所述拼接图像,得到所述显微全景图像,包括:
对所述拼接图像的图像坐标进行种子填充处理,得到所述拼接图像的连通域;
根据所述拼接图像的连通域,连通所述拼接图像,得到所述显微全景图像。
在其中一个实施例,所述在所述重叠区域中,确定非空重叠区域,包括:
对所述重叠区域进行下采样,得到缩小区域图像;
判断所述缩小区域图像中是否包含有预设的图像特征;
若是,则判定所述重叠区域为所述非空重叠区域。
在其中一个实施例,所述获取显微局部图像,包括:
采集原始显微图像;
根据所述原始显微图像的采集顺序,对所述原始显微图像进行排序,得到所述显微局部图像。
一种显微图像拼接装置,包括:
图像获取模块,用于获取显微局部图像;
区域检测模块,用于检测所述显微局部图像之间的重叠区域;
非空区域确定模块,用于在所述重叠区域中,确定非空重叠区域;
拼接模块,用于对包含所述非空重叠区域的显微局部图像进行拼接,得到显微全景图像。
一种计算机设备,包括存储器和处理器,所述存储器存储有计算机程序,所述处理器执行所述计算机程序时实现以下步骤:
获取显微局部图像;
检测所述显微局部图像之间的重叠区域;
在所述重叠区域中,确定非空重叠区域;
对包含所述非空重叠区域的显微局部图像进行拼接,得到显微全景图像。
一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,所述计算机程序被处理器执行时实现以下步骤:
获取显微局部图像;
检测所述显微局部图像之间的重叠区域;
在所述重叠区域中,确定非空重叠区域;
对包含所述非空重叠区域的显微局部图像进行拼接,得到显微全景图像。
上述显微图像拼接方法、装置、计算机设备和存储介质,通过检测显微局部图像之间的重叠区域,并确定非空重叠区域,对包含非空重叠区域的显微局部图像进行拼接,得到显微全景图像。从而,在保证拼接显微图像的准确性的同时,避免了对包含有空白重叠区域的显微局部图像进行拼接,减少了拼接时间,提升了拼接显微图像的效率。
而且,由于避免了对包含有空白重叠区域的显微局部图像进行拼接,避免了因为空白重叠区域导致图像拼接失败的问题。
附图说明
图1是一个实施例的一种显微图像拼接方法的流程示意图;
图2是本申请实施例的一种显微局部图像的示意图;
图3是本申请实施例的一种显微全景图像的示意图;
图4是本申请实施例的一种显微图像拼接具体流程的示意图;
图5是一个实施例的一种显微图像拼接装置的结构框图;
图6是一个实施例的一种计算机设备的内部结构图。
具体实施方式
为了使本申请的目的、技术方案及优点更加清楚明白,以下结合附图及实施例,对本申请进行进一步详细说明。应当理解,此处描述的具体实施例仅仅用以解释本申请,并不用于限定本申请。
在一个实施例中,如图1所示,提供了一种显微图像拼接方法,可以由一种拼接处理器执行,该拼接处理器可以设置在显微镜上,也可以外置于显微镜。显微镜可以用于采集显微局部图像,由拼接处理器针对显微局部图像进行拼接处理。具体地,上述的显微图像拼接方法,可以包括以下步骤:
步骤S110,获取显微局部图像。
其中,显微局部图像可以为显微镜针对切片局部所采集的、按序排列的多个图像。
具体实现中,显微镜可以针对用于病例诊断和病例研究的切片进行图像采集。在每次采集中,可以采集到切片局部的图像。拼接处理器可以获取显微镜采集的图像,按照一定顺序对采集的图像进行排序,即可得到显微局部图像。
图2是本申请实施例的一种显微局部图像的示意图。如图所示,针对切片的各个局部进行图像采集,将采集的图像进行排序,得到一系列按序排列的图像1至图像20。其中,图像1至图像10处于第一行,图像11至图像20处于第二行。
步骤S120,检测所述显微局部图像之间的重叠区域。
其中,重叠区域为两张显微局部图像中具有相同图像内容的区域。显微镜在采集图像时,是通过移动部件控制镜头的移动,在移动至一定位置下采集一张图像,然后,移动至下一个位置采集另一张图像。然后,由于移动部件在控制镜头移动时可能存在误差,导致采集的图像之间具有重叠区域。
具体实现中,拼接处理器可以针对相邻的两张显微局部图像预估重叠区域。
步骤S130,在所述重叠区域中,确定非空重叠区域。
其中,非空重叠区域可以为具有图像特征的重叠区域。
具体实现中,拼接处理器可以判断重叠区域中是否包含有细胞对象等的图像特征。若重叠区域中包含有特定的图像特征,则标记非空重叠区域;若重叠区域中不包含有特定的图像特征,则标记空白重叠区域。
本领域技术人员可以根据实际的病例诊断、研究需求确定具体的图像特征,本申请实施例对此不作限制。
步骤S140,对包含所述非空重叠区域的显微局部图像进行拼接,得到显微全景图像。
具体实现中,可以针对包含有非空重叠区域的显微局部图像进行拼接,将拼接的显微局部图像,作为初始的拼接图像。
例如,可以对在同一行中左右相邻的、且包含有非空重叠区域的两张显微局部图像进行拼接,当同一行中的所有包含非空重叠区域的显微局部图像拼接完毕,则开始对下一行中左右相邻、且包含有非空重叠区域的两张显微局部图像进行拼接。当每一行左右相邻、且包含有非空重叠区域的显微局部图像拼接完毕,则可以对上下相邻、且包含有非空重叠区域的两张显微局部图像进行拼接。
参考图2,针对图像1,判断图像1和图像2之间的重叠区域是否为非空重叠区域,若是,则拼接图像1和图像2;若否,则继续判断图像2和图像3之间的重叠区域是否为非空重叠区域。如此类推,直至将第一行和第二行中的左右相邻、且包含有非空重叠区域的图像进行拼接。然后,进行上下相邻图像的拼接,具体地,假设针对图11,当图11与图12之间因为没有非空重叠区域而没有拼接,则判断图11与相邻的图1是否具有非空重叠区域,若是,则拼接图11和图1。如此类推,直至将所有的上下相邻、且包含有非空重叠区域的图像进行拼接。
在实际应用中,本领域技术人员也可以通过其他方式,对包含非空重叠区域的显微局部图像进行拼接。例如,先针对上下相邻、且包含有非空重叠区域的两张显微局部图像进行拼接,再对左右相邻、且包含有非空重叠区域的显微局部图像进行拼接。
具体实现中,在得到拼接图像之后,可以选取其中一个拼接图像作为原点,确定与作为原点的拼接图像进行了拼接的其他拼接图像,计算两者在拼接时的拼接偏移量,并基于该拼接偏移量,确定其他拼接图像相对于原点的图像坐标,由此得到各个拼接图像的图像坐标。最后,根据各个拼接图像的图像坐标,组合拼接图像,得到上述的显微全景图像。
图3是本申请实施例的一种显微全景图像的示意图。如图所示,将各个显微局部图像进行拼接之后,得到反映整个切片的显微全景图像。
需要说明的是,数字切片是由几百乃至上万的图片拼接而成,因此要求非常高的拼接速度。以14mm*14mm的切片样本为例,假设,分辨率为0.20μm/像素(使用20倍物镜)数字切片的尺寸为70000*70000像素。又假设,采集的显微局部图像的尺寸为2048*2048像素,相邻的显微局部图像之间的重叠区域为30%。由于需要采集2401张显微局部图像,因此,最少需要进行2400次的图像拼接,按0.6秒/次的拼接速度,整个拼接过程则需要1440秒。因此,相邻的显微局部图像拼接速度很关键。当显微局部图像之间存在有空白重叠区域时,由于缺乏作为拼接依据的图像特征,因此会耗费大量的时间进行图像拼接,甚至可能会导致图像拼接失败。
根据本申请实施例的技术方案,通过检测显微局部图像之间的重叠区域,并确定非空重叠区域,对包含非空重叠区域的显微局部图像进行拼接,得到显微全景图像。从而,在保证拼接显微图像的准确性的同时,避免了对包含有空白重叠区域的显微局部图像进行拼接,减少了拼接时间,提升了拼接显微图像的效率。
而且,由于避免了对包含有空白重叠区域的显微局部图像进行拼接,避免了因为空白重叠区域导致图像拼接失败的问题。
在另一个实施例中,所述步骤S110,包括:
采集原始显微图像;根据所述原始显微图像的采集顺序,对所述原始显微图像进行排序,得到所述显微局部图像。
其中,原始显微图像可以为显微镜所采集的、未经排序的图像。
具体实现中,显微镜可以根据设定的一个移动轨迹进行移动并拍摄图像,将拍摄的多张图像发送至拼接处理器,拼接处理器可以接收到显微镜采集的图像,按照对应于移动轨迹的采集顺序,对采集的图像进行排序,即可得到显微局部图像。
在实际应用中,在采集到原始显微图像之后,拼接处理器还可以对原始显微图像进行去噪等的图像预处理,从而得到更为清晰的显微局部图像,基于清晰的显微局部图像判断重叠区域是否为空,可以提升图像拼接的准确性。
在另一个实施例中,所述步骤S130,包括:
对所述重叠区域进行下采样,得到缩小区域图像;判断所述缩小区域图像中是否包含有预设的图像特征;若是,则判定所述重叠区域为所述非空重叠区域;若否,则判定所述重叠区域为所述空白重叠区域。
具体实现中,在确定重叠区域之后,可以对重叠区域中的图像进行下采样,得到缩小区域图像。例如,将重叠区域内的图像进行1/4采样,得到1/4像素的缩小区域图像。
然后,判断该缩小区域图像中是否包含有预先设定的图像特征。若是,表明重叠区域中包含有可用作拼接依据的图像内容,因此判定为非空重叠区域。
根据本申请实施例的技术方案,通过对图像进行下采样,减少进行图像处理的区域,提高了确定非空重叠区域的判断速度,提升了图像拼接效率。
在另一个实施例中,所述步骤S140,包括:
在所述显微局部图像中,选取单行图像;在所述单行图像中,选取第一图像和第二图像;所述第二图像和所述第一图像在所述单行图像中相邻;当所述第一图像与所述第二图像之间存在有所述非空重叠区域,拼接所述第一图像和所述第二图像,得到拼接图像;根据所述拼接图像,生成所述显微全景图像。
其中,单行图像可以为成序列的显微局部图像中的一行图像。参考图2,图像11至图像20处于同一行,即,图像11至图像20为上述的单行图像。
具体实现中,针对形成多行多列的多张显微局部图像,选取其中一行显微局部图像,作为上述的单行图像。
可以按照从左往右的顺序,在单行图像中,选取相邻的两张显微局部图像,作为第一图像和第二图像。参考图2,假设当前选取图像11和图像12,作为第一图像和第二图像。
判断第一图像与第二图像之间是否存在有非空重叠区域,若是,则根据第一图像和第二图像之间的重叠区域中的图像特征,进行图像拼接,形成拼接图像。
参考图2,例如,图像11和图像12之间存在有非空重叠区域,可以根据该非空重叠区域中的图像特征,对图像11和图像12进行拼接。
得到拼接图像之后,可以针对拼接图像生成显微全景图像。
在另一个实施例中,当所述第一图像与所述第二图像之间不存在有所述非空重叠区域,所述步骤S140,还包括:
确定所述单行图像的相邻行图像;在所述相邻行图像中,选取第三图像;所述第三图像为所述第一图像在所述相邻行图像中相邻的显微局部图像;当所述第一图像与所述第三图像之间存在有所述非空重叠区域,拼接所述第一图像和所述第三图像,得到所述拼接图像;根据所述拼接图像,生成所述显微全景图像。
其中,相邻行图像可以为与单行图像相邻的另一行显微局部图像。假设,单行图像为图像11至图像20,相邻行图像即为图像1至图像10。
具体实现中,如果第一图像与第二图像之间不存在有非空重叠区域,可以在相邻行图像中,选取与第一图像相邻的显微局部图像,作为第三图像。判断第一图像与第三图像之间是否存在有非空重叠区域,若是,则对第一图像和第三图像进行拼接,得到拼接图像。
参考图2,例如,图像11与图像12不存在有非空重叠区域,不进行拼接,图像11与相邻行图像中的图像1相邻,选取图像1作为第三图像,判断图像11与图像1之间是否存在有非空重叠区域,若是,则对图像11和图像1进行拼接。
得到拼接图像之后,可以针对拼接图像生成显微全景图像。
在另一个实施例中,所述根据所述拼接图像,生成所述显微全景图像,包括:
在所述拼接图像中,选取原点拼接图像;计算所述拼接图像与所述原点拼接图像的拼接偏移量;确定所述原点拼接图像的原点坐标,并根据所述原点坐标和所述拼接偏移量,计算所述拼接图像的图像坐标;根据所述拼接图像的图像坐标,组合所述拼接图像,得到所述显微全景图像。
具体实现中,可以在多个拼接图像中,选取一个拼接图像,作为原点拼接图像。由于在将显微局部图像拼接成拼接图像的过程中,图像的位置发生偏移,因此,可以计算该拼接偏移量。例如,图像12的初始位置为(x1,y1),在拼接至图像11时,位置移动至(x2,y2),因此,可以根据(x1,y1)和(x2,y2)计算图像12的拼接偏移量。
可以确定原点拼接图像的原点坐标,假设将图像11选取为原点拼接图像,其原点坐标为(0,0)。
根据拼接图像的拼接偏移量和原点坐标,既可以确定各个拼接图像的图像坐标。例如,图像11的原点坐标为(0,0),相应地,根据图像12相对于图像11的拼接偏移量,即可得到图像12的图像坐标(x3,y3)。由此,基于图像11作为一个坐标轴的原点,确定其他多张图像在该坐标轴上的坐标。
根据各个拼接图像的图像坐标,组合各个拼接图像,即可得到显微全景图像。
实际应用中,可以针对各个显微局部图像在图像序列中的行列信息,生成对应的二维数组。在生成显微全景图像时,可以根据二维数组将对应的图像复制至一个图像框架,形成显微全景图像。
在另一个实施例中,所述根据所述拼接图像的图像坐标,组合所述拼接图像,得到所述显微全景图像,包括:
对所述拼接图像的图像坐标进行种子填充处理,得到所述拼接图像的连通域;根据所述拼接图像的连通域,连通所述拼接图像,得到所述显微全景图像。
其中,种子填充处理是基于种子填充算法的一种处理方式。种子填充算法又称为边界填充算法。其基本思想是从多边形区域的一个内点开始,由内向外用给定的颜色画点直到边界为止。如果边界是以一种颜色指定的,则种子填充算法可逐个像素地处理直到遇到边界颜色为止。
具体实现中,可以根据拼接图像的图像坐标进行种子填充处理,得到拼接图像之间的连通域。根据拼接图像之间的连通域,连通各个拼接图像,形成显微全景图像。
根据本申请实施例的技术方案,通过种子填充处理的方式确定图像之间的连通域,根据连通域连通拼接图像以得到显微全景图像,从而可以准确地拼接成显微全景图像,提升了显微全景图像的准确性。
为了便于本领域技术人员理解本申请实施例,以下将结合图4的具体示例进行说明。
图4是本申请实施例的一种显微图像拼接具体流程的示意图。如图所示,首先,显微镜采集图像,得到多个图像,形成图像的序列,确定每个图像在序列中的位置为第n行第m列。然后,可以对采集的图像进行图像去噪等的预处理。预处理之后,判断相邻的图像之间的重叠区域是否为空。按照从左往右的顺序,针对每一行图像,对重叠区域非空的相邻图像进行拼接。左右拼接完毕之后,针对没有进行左右拼接的图像,判断其与上下相邻的图像之间是否存在有非空重叠区域,若是,则进行拼接。最后,执行种子填充处理,连通各个拼接的图像,并确定图像的坐标。根据图像的坐标,生成全景图像。
应该理解的是,虽然图1的流程图中的各个步骤按照箭头的指示依次显示,但是这些步骤并不是必然按照箭头指示的顺序依次执行。除非本文中有明确的说明,这些步骤的执行并没有严格的顺序限制,这些步骤可以以其它的顺序执行。而且,图1中的至少一部分步骤可以包括多个子步骤或者多个阶段,这些子步骤或者阶段并不必然是在同一时刻执行完成,而是可以在不同的时刻执行,这些子步骤或者阶段的执行顺序也不必然是依次进行,而是可以与其它步骤或者其它步骤的子步骤或者阶段的至少一部分轮流或者交替地执行。
在一个实施例中,如图5所示,提供了一种显微图像拼接装置,包括:图像获取模块510、区域检测模块520、非空区域确定模块530和拼接模块540,其中:
图像获取模块510,用于获取显微局部图像;
区域检测模块520,用于检测所述显微局部图像之间的重叠区域;
非空区域确定模块530,用于在所述重叠区域中,确定非空重叠区域;
拼接模块540,用于对包含所述非空重叠区域的显微局部图像进行拼接,得到显微全景图像。
根据本申请实施例的技术方案,通过检测显微局部图像之间的重叠区域,并确定非空重叠区域,对包含非空重叠区域的显微局部图像进行拼接,得到显微全景图像。从而,在保证拼接显微图像的准确性的同时,避免了对包含有空白重叠区域的显微局部图像进行拼接,减少了拼接时间,提升了拼接显微图像的效率。
而且,由于避免了对包含有空白重叠区域的显微局部图像进行拼接,避免了因为空白重叠区域导致图像拼接失败的问题。
在另一个实施例中,所述拼接模块540,包括:
单行图像子模块,用于在所述显微局部图像中,选取单行图像;
第一图像选取子模块,用于在所述单行图像中,选取第一图像和第二图像;所述第二图像和所述第一图像在所述单行图像中相邻;
第一拼接子模块,用于当所述第一图像与所述第二图像之间存在有所述非空重叠区域,拼接所述第一图像和所述第二图像,得到拼接图像;
全景图像生成子模块,用于根据所述拼接图像,生成所述显微全景图像。
在另一个实施例中,所述拼接模块540,还包括:
相邻行图像子模块,用于确定所述单行图像的相邻行图像;
第二图像选取子模块,用于在所述相邻行图像中,选取第三图像;所述第三图像为所述第一图像在所述相邻行图像中相邻的显微局部图像;
第二拼接子模块,用于当所述第一图像与所述第三图像之间存在有所述非空重叠区域,拼接所述第一图像和所述第三图像,得到所述拼接图像。
在另一个实施例中,所述全景图像生成子模块,包括:
原点选取单元,用于在所述拼接图像中,选取原点拼接图像;
偏移量计算单元,用于计算所述拼接图像与所述原点拼接图像的拼接偏移量;
坐标计算单元,用于确定所述原点拼接图像的原点坐标,并根据所述原点坐标和所述拼接偏移量,计算所述拼接图像的图像坐标;
图像组合单元,用于根据所述拼接图像的图像坐标,组合所述拼接图像,得到所述显微全景图像。
在另一个实施例中,所述图像组合单元,包括:
种子填充子单元,用于对所述拼接图像的图像坐标进行种子填充处理,得到所述拼接图像的连通域;
连通子单元,用于根据所述拼接图像的连通域,连通所述拼接图像,得到所述显微全景图像。
在另一个实施例中,所述非空区域确定模块530,包括:
下采样子模块,用于对所述重叠区域进行下采样,得到缩小区域图像;
特征判断子模块,用于判断所述缩小区域图像中是否包含有预设的图像特征;
判定子模块,用于判定所述重叠区域为所述非空重叠区域。
在另一个实施例中,所述图像获取模块510,包括:
图像采集子模块,用于采集原始显微图像;
排序子模块,用于根据所述原始显微图像的采集顺序,对所述原始显微图像进行排序,得到所述显微局部图像。
根据本申请实施例的技术方案,通过对图像进行下采样,减少进行图像处理的区域,提高了确定非空重叠区域的判断速度,提升了图像拼接效率。
根据本申请实施例的技术方案,通过种子填充处理的方式确定图像之间的连通域,根据连通域连通拼接图像以得到显微全景图像,从而可以准确地拼接成显微全景图像,提升了显微全景图像的准确性。
关于显微图像拼接装置的具体限定可以参见上文中对于显微图像拼接方法的限定,在此不再赘述。上述显微图像拼接装置中的各个模块可全部或部分通过软件、硬件及其组合来实现。上述各模块可以硬件形式内嵌于或独立于计算机设备中的处理器中,也可以以软件形式存储于计算机设备中的存储器中,以便于处理器调用执行以上各个模块对应的操作。
在一个实施例中,提供了一种计算机设备,该计算机设备可以是服务器,其内部结构图可以如图6所示。该计算机设备包括通过系统总线连接的处理器、存储器、网络接口和数据库。其中,该计算机设备的处理器用于提供计算和控制能力。该计算机设备的存储器包括非易失性存储介质、内存储器。该非易失性存储介质存储有操作系统、计算机程序和数据库。该内存储器为非易失性存储介质中的操作系统和计算机程序的运行提供环境。该计算机设备的网络接口用于与外部的终端通过网络连接通信。该计算机程序被处理器执行时以实现一种显微图像拼接方法。
本领域技术人员可以理解,图6中示出的结构,仅仅是与本申请方案相关的部分结构的框图,并不构成对本申请方案所应用于其上的计算机设备的限定,具体的计算机设备可以包括比图中所示更多或更少的部件,或者组合某些部件,或者具有不同的部件布置。
在一个实施例中,提供了一种计算机设备,包括存储器和处理器,存储器中存储有计算机程序,该处理器执行计算机程序时实现以下步骤:
获取显微局部图像;
检测所述显微局部图像之间的重叠区域;
在所述重叠区域中,确定非空重叠区域;
对包含所述非空重叠区域的显微局部图像进行拼接,得到显微全景图像。
在一个实施例中,处理器执行计算机程序时还实现以下步骤:
在所述显微局部图像中,选取单行图像;
在所述单行图像中,选取第一图像和第二图像;所述第二图像和所述第一图像在所述单行图像中相邻;
当所述第一图像与所述第二图像之间存在有所述非空重叠区域,拼接所述第一图像和所述第二图像,得到拼接图像;
根据所述拼接图像,生成所述显微全景图像。
在一个实施例中,处理器执行计算机程序时还实现以下步骤:
确定所述单行图像的相邻行图像;
在所述相邻行图像中,选取第三图像;所述第三图像为所述第一图像在所述相邻行图像中相邻的显微局部图像;
当所述第一图像与所述第三图像之间存在有所述非空重叠区域,拼接所述第一图像和所述第三图像,得到所述拼接图像;
根据所述拼接图像,生成所述显微全景图像。
在一个实施例中,处理器执行计算机程序时还实现以下步骤:
在所述拼接图像中,选取原点拼接图像;
计算所述拼接图像与所述原点拼接图像的拼接偏移量;
确定所述原点拼接图像的原点坐标,并根据所述原点坐标和所述拼接偏移量,计算所述拼接图像的图像坐标;
根据所述拼接图像的图像坐标,组合所述拼接图像,得到所述显微全景图像。
在一个实施例中,处理器执行计算机程序时还实现以下步骤:
对所述拼接图像的图像坐标进行种子填充处理,得到所述拼接图像的连通域;
根据所述拼接图像的连通域,连通所述拼接图像,得到所述显微全景图像。
在一个实施例中,处理器执行计算机程序时还实现以下步骤:
对所述重叠区域进行下采样,得到缩小区域图像;
判断所述缩小区域图像中是否包含有预设的图像特征;
若是,则判定所述重叠区域为所述非空重叠区域。
在一个实施例中,处理器执行计算机程序时还实现以下步骤:
采集原始显微图像;
根据所述原始显微图像的采集顺序,对所述原始显微图像进行排序,得到所述显微局部图像。
在一个实施例中,提供了一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,计算机程序被处理器执行时实现以下步骤:
获取显微局部图像;
检测所述显微局部图像之间的重叠区域;
在所述重叠区域中,确定非空重叠区域;
对包含所述非空重叠区域的显微局部图像进行拼接,得到显微全景图像。
在一个实施例中,计算机程序被处理器执行时还实现以下步骤:
在所述显微局部图像中,选取单行图像;
在所述单行图像中,选取第一图像和第二图像;所述第二图像和所述第一图像在所述单行图像中相邻;
当所述第一图像与所述第二图像之间存在有所述非空重叠区域,拼接所述第一图像和所述第二图像,得到拼接图像;
根据所述拼接图像,生成所述显微全景图像。
在一个实施例中,计算机程序被处理器执行时还实现以下步骤:
确定所述单行图像的相邻行图像;
在所述相邻行图像中,选取第三图像;所述第三图像为所述第一图像在所述相邻行图像中相邻的显微局部图像;
当所述第一图像与所述第三图像之间存在有所述非空重叠区域,拼接所述第一图像和所述第三图像,得到所述拼接图像;
根据所述拼接图像,生成所述显微全景图像。
在一个实施例中,计算机程序被处理器执行时还实现以下步骤:
在所述拼接图像中,选取原点拼接图像;
计算所述拼接图像与所述原点拼接图像的拼接偏移量;
确定所述原点拼接图像的原点坐标,并根据所述原点坐标和所述拼接偏移量,计算所述拼接图像的图像坐标;
根据所述拼接图像的图像坐标,组合所述拼接图像,得到所述显微全景图像。
在一个实施例中,计算机程序被处理器执行时还实现以下步骤:
对所述拼接图像的图像坐标进行种子填充处理,得到所述拼接图像的连通域;
根据所述拼接图像的连通域,连通所述拼接图像,得到所述显微全景图像。
在一个实施例中,计算机程序被处理器执行时还实现以下步骤:
对所述重叠区域进行下采样,得到缩小区域图像;
判断所述缩小区域图像中是否包含有预设的图像特征;
若是,则判定所述重叠区域为所述非空重叠区域。
在一个实施例中,计算机程序被处理器执行时还实现以下步骤:
采集原始显微图像;
根据所述原始显微图像的采集顺序,对所述原始显微图像进行排序,得到所述显微局部图像。
本领域普通技术人员可以理解实现上述实施例方法中的全部或部分流程,是可以通过计算机程序来指令相关的硬件来完成,所述的计算机程序可存储于一非易失性计算机可读取存储介质中,该计算机程序在执行时,可包括如上述各方法的实施例的流程。其中,本申请所提供的各实施例中所使用的对存储器、存储、数据库或其它介质的任何引用,均可包括非易失性和/或易失性存储器。非易失性存储器可包括只读存储器(ROM)、可编程ROM(PROM)、电可编程ROM(EPROM)、电可擦除可编程ROM(EEPROM)或闪存。易失性存储器可包括随机存取存储器(RAM)或者外部高速缓冲存储器。作为说明而非局限,RAM以多种形式可得,诸如静态RAM(SRAM)、动态RAM(DRAM)、同步DRAM(SDRAM)、双数据率SDRAM(DDRSDRAM)、增强型SDRAM(ESDRAM)、同步链路(Synchlink)DRAM(SLDRAM)、存储器总线(Rambus)直接RAM(RDRAM)、直接存储器总线动态RAM(DRDRAM)、以及存储器总线动态RAM(RDRAM)等。
以上实施例的各技术特征可以进行任意的组合,为使描述简洁,未对上述实施例中的各个技术特征所有可能的组合都进行描述,然而,只要这些技术特征的组合不存在矛盾,都应当认为是本说明书记载的范围。
以上所述实施例仅表达了本申请的几种实施方式,其描述较为具体和详细,但并不能因此而理解为对发明专利范围的限制。应当指出的是,对于本领域的普通技术人员来说,在不脱离本申请构思的前提下,还可以做出若干变形和改进,这些都属于本申请的保护范围。因此,本申请专利的保护范围应以所附权利要求为准。
Claims (10)
1.一种显微图像拼接方法,其特征在于,包括:
获取显微局部图像;
检测所述显微局部图像之间的重叠区域;
在所述重叠区域中,确定非空重叠区域;
对包含所述非空重叠区域的显微局部图像进行拼接,得到显微全景图像。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述对包含所述非空重叠区域的显微局部图像进行拼接,得到显微全景图像,包括:
在所述显微局部图像中,选取单行图像;
在所述单行图像中,选取第一图像和第二图像;所述第二图像和所述第一图像在所述单行图像中相邻;
当所述第一图像与所述第二图像之间存在有所述非空重叠区域,拼接所述第一图像和所述第二图像,得到拼接图像;
根据所述拼接图像,生成所述显微全景图像。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,当所述第一图像与所述第二图像之间不存在有所述非空重叠区域,所述对包含所述非空重叠区域的显微局部图像进行拼接,得到显微全景图像,还包括:
确定所述单行图像的相邻行图像;
在所述相邻行图像中,选取第三图像;所述第三图像为所述第一图像在所述相邻行图像中相邻的显微局部图像;
当所述第一图像与所述第三图像之间存在有所述非空重叠区域,拼接所述第一图像和所述第三图像,得到所述拼接图像;
根据所述拼接图像,生成所述显微全景图像。
4.根据权利要求2或3所述的方法,其特征在于,所述根据所述拼接图像,生成显微全景图像,包括:
在所述拼接图像中,选取原点拼接图像;
计算所述拼接图像与所述原点拼接图像的拼接偏移量;
确定所述原点拼接图像的原点坐标,并根据所述原点坐标和所述拼接偏移量,计算所述拼接图像的图像坐标;
根据所述拼接图像的图像坐标,组合所述拼接图像,得到所述显微全景图像。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述根据所述拼接图像的图像坐标,组合所述拼接图像,得到所述显微全景图像,包括:
对所述拼接图像的图像坐标进行种子填充处理,得到所述拼接图像的连通域;
根据所述拼接图像的连通域,连通所述拼接图像,得到所述显微全景图像。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述在所述重叠区域中,确定非空重叠区域,包括:
对所述重叠区域进行下采样,得到缩小区域图像;
判断所述缩小区域图像中是否包含有预设的图像特征;
若是,则判定所述重叠区域为所述非空重叠区域。
7.根据权利要求1至6任一所述的方法,其特征在于,所述获取显微局部图像,包括:
采集原始显微图像;
根据所述原始显微图像的采集顺序,对所述原始显微图像进行排序,得到所述显微局部图像。
8.一种显微图像拼接装置,其特征在于,包括:
图像获取模块,用于获取显微局部图像;
区域检测模块,用于检测所述显微局部图像之间的重叠区域;
非空区域确定模块,用于在所述重叠区域中,确定非空重叠区域;
拼接模块,用于对包含所述非空重叠区域的显微局部图像进行拼接,得到显微全景图像。
9.一种计算机设备,包括存储器和处理器,所述存储器存储有计算机程序,其特征在于,所述处理器执行所述计算机程序时实现权利要求1至7中任一项所述方法的步骤。
10.一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,其特征在于,所述计算机程序被处理器执行时实现权利要求1至7中任一项所述的方法的步骤。
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