CN108315240A - 一种可以用于基因测序的流程质控标准技术 - Google Patents

一种可以用于基因测序的流程质控标准技术 Download PDF

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Abstract

本发明公开了一种可以用于基因测序的流程质控标准技术,包括样本模块、QC模块、游离DNA提取模块、QUBIT测定DNA浓度模块、管式快速文库构建模块、QPCR定量模块、文库等摩尔数pooling模块、上机测序模块、数据分析模块、质检模块和发送报告模块,所述样本模块、QUBIT测定DNA浓度模块和上机测序模块的输出端均与QC模块的输入端连接,QC模块的输出端分别于游离DNA提取模块、管式快速文库构建模块和数据分析模块的输入端连接,所述样本模块包括样本接收单元、血浆转运单元和血浆分离单元,且样本接收单元的输出端与血浆转运单元的输入端连接。本发明布局合理,极大的提高了检测结果的准确性和及时性,满足了人们的使用需求。

Description

一种可以用于基因测序的流程质控标准技术
技术领域
本发明涉及基因测序技术领域,尤其涉及一种可以用于基因测序的流程质控标准技术。
背景技术
基因测序是一种新型基因检测技术,能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。
但是现有的用于基因测序的流程质控标准技术在实际应用时,人工的手动操作较多,存在较大的潜在失误,导致检测结果产生误差,且人工输入数据的速度较慢,使得检测结果丧失了一定的及时性,因此满足不了人们的使用需求。
发明内容
本发明的目的是为了解决现有技术中存在的缺点,而提出的一种可以用于基因测序的流程质控标准技术。
为了实现上述目的,本发明采用了如下技术方案:
一种可以用于基因测序的流程质控标准技术,包括样本模块、QC模块、游离DNA提取模块、QUBIT测定DNA浓度模块、管式快速文库构建模块、QPCR定量模块、文库等摩尔数pooling模块、上机测序模块、数据分析模块、质检模块和发送报告模块,所述样本模块、QUBIT测定DNA浓度模块和上机测序模块的输出端均与QC模块的输入端连接,QC模块的输出端分别于游离DNA提取模块、管式快速文库构建模块和数据分析模块的输入端连接,所述样本模块包括样本接收单元、血浆转运单元和血浆分离单元,且样本接收单元的输出端与血浆转运单元的输入端连接,血浆转运单元的输出端与血浆分离单元的输入端连接,血浆分离单元的输出端与QC模块的输入端连接,发送报告模块包括打印终端单元,打印终端单元的输入端与质检模块的输出端连接。
优选的,所述文库等摩尔数pooling模块与QPCR定量模块双向连接。
优选的,所述样本模块和游离DNA提取模块之间设置有QC模块。
优选的,所述数据分析模块在对数据分析后将数据传输给质检模块后经发送报告模块的打印终端单元进行打印。
本发明中,建立了严格的全程质量控制体系,从最初的样本采集,到文库制备,上机测试,生物信息分析,到最终的报告生成,做到了全程式、多方位的质量控制体系,尽量的减少了人工手动的操作,降低了潜在的失误的风险,本发明布局合理,极大的提高了检测结果的准确性和及时性,满足了人们的使用需求。
附图说明
图1为本发明提出的一种可以用于基因测序的流程质控标准技术的原理结构示意图。
具体实施方式
下面结合具体实施例对本发明作进一步解说。
实施例
参照图1,一种可以用于基因测序的流程质控标准技术,包括样本模块、QC模块、游离DNA提取模块、QUBIT测定DNA浓度模块、管式快速文库构建模块、QPCR定量模块、文库等摩尔数pooling模块、上机测序模块、数据分析模块、质检模块和发送报告模块,样本模块、QUBIT测定DNA浓度模块和上机测序模块的输出端均与QC模块的输入端连接,QC模块的输出端分别于游离DNA提取模块、管式快速文库构建模块和数据分析模块的输入端连接,样本模块包括样本接收单元、血浆转运单元和血浆分离单元,且样本接收单元的输出端与血浆转运单元的输入端连接,血浆转运单元的输出端与血浆分离单元的输入端连接,血浆分离单元的输出端与QC模块的输入端连接,发送报告模块包括打印终端单元,打印终端单元的输入端与质检模块的输出端连接,文库等摩尔数pooling模块与QPCR定量模块双向连接,样本模块和游离DNA提取模块之间设置有QC模块,数据分析模块在对数据分析后将数据传输给质检模块后经发送报告模块的打印终端单元进行打印。
本实施例中,检测人员可对样品信息录入,样品质量监控、样本分析、生成报告等一整套检测流程进行Web端在线操作,并同时对数据进行记录、展示与跟踪,实现全面、自动、高效的数据管理,样本在接收到血浆转运、血浆分离到文库制备中的游离DNA提取、QUBIT测定DNA浓度、管式快速文库构建、文库等摩尔数pooling,再到上机测序,到最终的报告生成,全程且多方位的质量控制体系确保了检测结果的准确性。
以上所述,仅为本发明较佳的具体实施方式,但本发明的保护范围并不局限于此,任何熟悉本技术领域的技术人员在本发明揭露的技术范围内,根据本发明的技术方案及其发明构思加以等同替换或改变,都应涵盖在本发明的保护范围之内。

Claims (4)

1.一种可以用于基因测序的流程质控标准技术,包括样本模块、QC模块、游离DNA提取模块、QUBIT测定DNA浓度模块、管式快速文库构建模块、QPCR定量模块、文库等摩尔数pooling模块、上机测序模块、数据分析模块、质检模块和发送报告模块,其特征在于,所述样本模块、QUBIT测定DNA浓度模块和上机测序模块的输出端均与QC模块的输入端连接,QC模块的输出端分别于游离DNA提取模块、管式快速文库构建模块和数据分析模块的输入端连接,所述样本模块包括样本接收单元、血浆转运单元和血浆分离单元,且样本接收单元的输出端与血浆转运单元的输入端连接,血浆转运单元的输出端与血浆分离单元的输入端连接,血浆分离单元的输出端与QC模块的输入端连接,发送报告模块包括打印终端单元,打印终端单元的输入端与质检模块的输出端连接。
2.根据权利要求1所述的一种可以用于基因测序的流程质控标准技术,其特征在于,所述文库等摩尔数pooling模块与QPCR定量模块双向连接。
3.根据权利要求1所述的一种可以用于基因测序的流程质控标准技术,其特征在于,所述样本模块和游离DNA提取模块之间设置有QC模块。
4.根据权利要求1所述的一种可以用于基因测序的流程质控标准技术,其特征在于,所述数据分析模块在对数据分析后将数据传输给质检模块后经发送报告模块的打印终端单元进行打印。
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Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN113528631A (zh) * 2021-07-05 2021-10-22 南京世和基因生物技术股份有限公司 一种ngs测序中样本质量预测方法及系统
CN115565609A (zh) * 2022-09-28 2023-01-03 北京博安智联科技有限公司 一种针对dna测序数据的自动分析方法
CN117050867A (zh) * 2023-08-20 2023-11-14 浙江深华生物科技有限公司 一种评估肿瘤dna高通量定量检测系统

Citations (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101921841A (zh) * 2010-06-30 2010-12-22 深圳华大基因科技有限公司 基于Illumina GA测序技术的HLA基因高分辨率分型方法
CN104357918A (zh) * 2014-11-25 2015-02-18 北京阅微基因技术有限公司 血浆游离dna文库的构建方法
CN104561294A (zh) * 2014-12-26 2015-04-29 北京诺禾致源生物信息科技有限公司 基因分型测序文库的构建方法和测序方法
CN104598773A (zh) * 2015-01-08 2015-05-06 江西师范大学 基于RAD-seq开发濒危羊踯躅SSR引物的方法
CN105117817A (zh) * 2015-07-27 2015-12-02 上海原能细胞医学技术有限公司 生物样本库应用管理系统
CN105354443A (zh) * 2015-12-14 2016-02-24 孔祥军 无创产前基因检测分析软件
CN106367504A (zh) * 2016-09-05 2017-02-01 东北农业大学 一种利用高通量测序技术研究原料乳及其环境中的细菌多样性及致病菌的方法
CN106676182A (zh) * 2017-02-07 2017-05-17 北京诺禾致源科技股份有限公司 一种低频率基因融合的检测方法及装置
CN106709267A (zh) * 2017-01-25 2017-05-24 武汉贝纳科技服务有限公司 数据获取方法及装置
CN107066836A (zh) * 2017-06-15 2017-08-18 上海思路迪生物医学科技有限公司 基因检测管理方法及系统

Patent Citations (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101921841A (zh) * 2010-06-30 2010-12-22 深圳华大基因科技有限公司 基于Illumina GA测序技术的HLA基因高分辨率分型方法
CN104357918A (zh) * 2014-11-25 2015-02-18 北京阅微基因技术有限公司 血浆游离dna文库的构建方法
CN104561294A (zh) * 2014-12-26 2015-04-29 北京诺禾致源生物信息科技有限公司 基因分型测序文库的构建方法和测序方法
CN104598773A (zh) * 2015-01-08 2015-05-06 江西师范大学 基于RAD-seq开发濒危羊踯躅SSR引物的方法
CN105117817A (zh) * 2015-07-27 2015-12-02 上海原能细胞医学技术有限公司 生物样本库应用管理系统
CN105354443A (zh) * 2015-12-14 2016-02-24 孔祥军 无创产前基因检测分析软件
CN106367504A (zh) * 2016-09-05 2017-02-01 东北农业大学 一种利用高通量测序技术研究原料乳及其环境中的细菌多样性及致病菌的方法
CN106709267A (zh) * 2017-01-25 2017-05-24 武汉贝纳科技服务有限公司 数据获取方法及装置
CN106676182A (zh) * 2017-02-07 2017-05-17 北京诺禾致源科技股份有限公司 一种低频率基因融合的检测方法及装置
CN107066836A (zh) * 2017-06-15 2017-08-18 上海思路迪生物医学科技有限公司 基因检测管理方法及系统

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
严小庆: "浅析高通量测序过程质量监督管理", 《科技创业月刊》 *

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN113528631A (zh) * 2021-07-05 2021-10-22 南京世和基因生物技术股份有限公司 一种ngs测序中样本质量预测方法及系统
CN115565609A (zh) * 2022-09-28 2023-01-03 北京博安智联科技有限公司 一种针对dna测序数据的自动分析方法
CN117050867A (zh) * 2023-08-20 2023-11-14 浙江深华生物科技有限公司 一种评估肿瘤dna高通量定量检测系统

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