CN106928336B - 囊性纤维化患者的cftr基因突变形式及其应用 - Google Patents

Abstract

本发明公开了一种提供囊性纤维化患者的CFTR基因突变形式及其应用。本发明保护蛋白质：(a1)将囊性纤维化跨膜传导调节因子第314位氨基酸残基由甘氨酸突变为色氨酸的蛋白质；(a2)将囊性纤维化跨膜传导调节因子第604位氨基酸残基由苏氨酸突变为脯氨酸的蛋白质。本发明还保护检测突变甲的和/或突变乙的物质在制备试剂盒中的应用；突变甲：人基因组中序列3第71位由G突变为T；突变乙：人基因组中序列4第44位由A突变为C；试剂盒功能：(c1)评价待测者患囊性纤维化的风险性；(c2)评价待测者或待测夫妻的后代患囊性纤维化的风险性；(c3)诊断或辅助诊断待测者是否为囊性纤维化患者。本发明对于囊性纤维化患者的诊断具有重大应用价值。

Description

囊性纤维化患者的CFTR基因突变形式及其应用

技术领域

本发明涉及囊性纤维化患者的CFTR基因突变形式及其应用。

背景技术

囊性纤维化(cystic fibrosis，CF)是一种常染色体隐性遗传病，是由于囊性纤维化跨膜传导调节因子(cystic fibrosis transmem brane conductance regulator，CFTR)的基因突变导致大量黏液阻塞全身外分泌腺，可累及呼吸、消化、生殖等多系统，临床表现为慢性咳嗽、咯大量黏痰、反复发作的肺部感染、脂肪泻、生长发育迟缓及男性不育等。

囊性纤维化首要累及的器官是肺，而肺部病变也是囊性纤维化患者的最主要的致死因素(85％)。囊性纤维化造成气道粘膜分泌物稠化，通过慢性阻塞、感染、炎症，最终导致支气管扩张和肺实质破坏。胰腺也是囊性纤维化的重要受累器官，患者主要表现为胰腺外分泌功能障碍：营养障碍(脂肪、蛋白质吸收障碍、脂肪泻、生长迟滞)，胰腺功能不全所致低体重和肺功能及生存率呈负相关，是预后不良的重要因素。患者亦可有其他消化系统表现，如肝脏肿大、肝硬化、黄疸等。因此当同时出现呼吸系统和消化系统表现时，更应警惕囊性纤维化。

囊性纤维化在发达国家高加索人群中的流行病学研究较为完善，是高加索人群中最常见的遗传性疾病之一，发病率约为1/1800至1/25000。亚洲囊性纤维化发病率的数据主要来自回顾性研究或病例研究，并不能十分准确、客观地描述囊性纤维化在亚洲人群准确的发病率，其发病率很可能被低估。1975年-2015年报道的文献中，共记载了36例囊性纤维化患者。近10年，中国大陆报道的囊性纤维化患者为13例。由于病例数较少，我国目前尚无该病发病情况的流行病学统计数据。

基因检测作为一种安全、快速、易行的手段在囊性纤维化诊断中也有着重要作用。对于临床表现不典型和/或汗液试验阴性(或临界值)的患者可通过基因检测进行确诊。囊性纤维化在我国的可能并非罕见，患者临床表现不典型，但如提高对疾病的认识，仍可通过临床表现和相关辅助检查发现高度怀疑的病例，进而通过基因检测快速地做出正确的判断。我国CFTR基因与欧美国家报道大为不同且具有很高的异质性，因此关于CFTR基因突变谱及与临床表型关系还需要进一步完善。

发明内容

本发明的目的是提供囊性纤维化患者的CFTR基因突变形式及其应用。

本发明保护一种蛋白质，为如下(a1)或(a2)：

(a1)将囊性纤维化跨膜传导调节因子第314位氨基酸残基由甘氨酸(Gly)突变为色氨酸(Trp)得到的蛋白质；

(a2)将囊性纤维化跨膜传导调节因子第604位氨基酸残基由苏氨酸(Thr)突变为脯氨酸(Pro)得到的蛋白质。

囊性纤维化跨膜传导调节因子具体如序列表的序列1所示。

编码所述蛋白质的基因也属于本发明的保护范围。

所述基因为如下(b1)或(b2)：

(b1)编码区为将序列表的序列2所示的DNA分子第940位核苷酸由G突变为T得到的DNA分子；

(b2)编码区为将序列表的序列2所示的DNA分子第1810位核苷酸由A突变为C得到的DNA分子。

本发明还保护用于检测特异突变甲的物质和/或用于检测特异突变乙的物质在制备试剂盒中的应用；所述特异突变甲为：人基因组中序列表的序列3所示DNA分子中的第71位核苷酸由G突变为T；所述特异突变乙为：人基因组中序列表的序列4所示DNA分子中的第44位核苷酸由A突变为C；

所述试剂盒的功能为如下(c1)、(c2)或(c3)：

(c1)评价待测者患囊性纤维化的风险性；

(c2)评价待测者或待测夫妻的后代患囊性纤维化的风险性；

(c3)诊断或辅助诊断待测者是否为囊性纤维化患者。

本发明还保护一种试剂盒，包括用于检测所述特异突变甲的物质和/或用于检测所述特异突变乙的物质；所述试剂盒的功能为评价待测者患囊性纤维化的风险性。所述试剂盒还包括记载如下判断标准(d1)和/或(d2)和/或(d3)的载体：(d1)如果待测者一条染色体携带所述特异突变甲，待测者相对正常人患囊性纤维化的风险性增高；(d2)如果待测者一条染色体携带所述特异突变乙，待测者相对正常人患囊性纤维化的风险性增高；(d3)如果待测者一条染色体携带所述特异突变甲，另一条染色体携带所述特异突变乙，待测者相对正常人患囊性纤维化的风险性增高。

本发明还保护一种试剂盒，包括用于检测所述特异突变甲的物质和/或用于检测所述特异突变乙的物质；所述试剂盒的功能为评价待测者的后代或待测夫妻的后代患囊性纤维化的风险性。所述试剂盒还包括记载如下判断标准(e1)和/或(e2)和/或(e3)和/或(e4)的载体：(e1)如果待测者一条染色体携带所述特异突变甲，待测者的后代相对正常人患囊性纤维化的风险性增高；(e2)如果待测者一条染色体携带所述特异突变乙，待测者的后代相对正常人患囊性纤维化的风险性增高；(e3)如果待测者一条染色体携带所述特异突变甲，另一条染色体携带所述特异突变乙，待测者的后代相对正常人患囊性纤维化的风险性增高；(e4)如果所述待测夫妻中的一位携带所述特异突变甲、另一位携带所述特异突变乙，待测夫妻的后代相对正常人患囊性纤维化的风险性增高。

本发明还保护一种试剂盒，包括用于检测所述特异突变甲的物质和/或用于检测所述特异突变乙的物质；所述试剂盒的功能为诊断或辅助诊断待测者是否为囊性纤维化患者。所述试剂盒还包括记载如下判断标准(f1)和/或(f2)和/或(f3)的载体：(f1)如果待测者一条染色体携带所述特异突变甲，待测者为或候选为囊性纤维化患者；(f2)如果待测者一条染色体携带所述特异突变乙，待测者为或候选为囊性纤维化患者；(f3)如果待测者一条染色体携带所述特异突变甲，另一条染色体携带所述特异突变乙，待测者为或候选为囊性纤维化患者。

所述正常人为两条染色体均携带序列表的序列1所示的囊性纤维化跨膜传导调节因子的编码基因的人。

所述序列表的序列1所示的囊性纤维化跨膜传导调节因子的编码基因具体如序列表的序列2所示。

所述序列表的序列1所示的囊性纤维化跨膜传导调节因子的编码基因具体如GENBANKACCESSION NO.NG_016465.4所示(linear PRI 28-AUG-2016)。

以上任一所述用于检测所述特异突变甲的物质具体可为引物对甲。引物对甲由两条引物组成，一条引物为序列表的序列7所示的单链DNA分子，另一条引物为序列表的序列8所示的单链DNA分子。

以上用于检测所述特异突变乙的物质具体可为引物对乙。引物对乙由两条引物组成，一条引物为序列表的序列9所示的单链DNA分子，另一条引物为序列表的序列10所示的单链DNA分子。

本发明对于囊性纤维化患者的诊断具有重大应用价值。

附图说明

图1为胸部CT的照片。

图2为患儿父亲的相关测序结果。

图3为患儿母亲的相关测序结果。

具体实施方式

以下的实施例便于更好地理解本发明，但并不限定本发明。下述实施例中的实验方法，如无特殊说明，均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料，如无特殊说明，均为自常规生化试剂商店购买得到的。以下实施例中的定量试验，均设置三次重复实验，结果取平均值。

基因组中，CFTR基因的核苷酸序列见GENBANKACCESSION NO.NG_016465.4所示(linear PRI 28-AUG-2016)。

CFTR基因编码的蛋白质，如序列表的序列1所示。

CFTR基因的cDNA中的读码框如序列表的序列2所示。

基因组中，CFTR基因包括27个外显子，其中第8外显子的核苷酸序列如序列表的序列3所示，第14外显子的核苷酸序列如序列表的序列4所示。基因组中，CFTR基因的第8外显子及其周边序列如序列表的序列5所示，CFTR基因的第14外显子及其周边序列如序列表的序列6所示。

实施例、

一、患儿的相关信息

患儿基本情况：女，13岁，于2014年5月因“反复咳嗽、咯痰7年余”入院。

患儿病程：入院前7年患儿无明显诱因出现不剧烈咳嗽，伴咯痰、发热，无喘憋、发绀、呼吸困难，当地医院诊断“右下肺炎”，予静脉药物治疗，咳嗽、咯痰好转；此后每间隔1-2月患儿即出现上述症状，夜间及晨起为著，痰液多为黄色粘痰，不易咯出，伴喘息，无青紫，反复于当地医院静脉输注抗生素治疗，症状可缓解；入院前2年，患儿咳嗽较前明显加重，痰量较前增多，为黄绿色粘痰，并出现活动后气促，当地医院胸片、胸部CT提示双肺支气管扩张伴感染，予中药口服治疗症状稍有好转；入院前10月，患儿咯少量新鲜血丝痰，抗感染治疗后好转；发病以来，患儿食欲可，大小便正常，既往体健，生长发育正常。

患儿父母及家族情况：父母非近亲结婚,家族中无类似病人。

2014年5月入院查体结果：体温37℃，体重29kg，身高147cm，呼吸27次/min，脉搏106次/min，血压90/60mmHg，体格发育稍落后，营养差，卡疤(+)，双肺呼吸音粗，双下肺可闻及中量湿罗音，未闻及喘鸣银，杵状指(趾)阳性，余查体无明显异常。

2014年5月辅助检查结果：血气分析、血常规、血电解质、肝肾功能、大便常规、体液、细胞免疫功能正常；多次痰培养及支气管灌洗液培养均为铜绿假单胞菌；胸部CT(图1)提示双肺广泛支气管柱状及囊柱状扩张、支气管增厚；鼻窦CT提示双侧副鼻窦炎；腹部B超可见胰腺回声不均匀，考虑慢性胰腺炎；支气管镜检查显示气管、支气管内膜炎症，广泛粘稠分泌物阻塞，部分亚支扩张；肺功能提示混合性通气功能障碍。

2014年5月治疗过程：入院后先后予拉氧头孢、头孢哌酮舒巴坦静点抗感染治疗，行2次电子支气管镜灌洗治疗，咳嗽、咯痰症状好转，治疗13天好转出院。

二、患儿的CFTR基因测序

1、提取患儿的基因组DNA。

2、取步骤1得到的基因组DNA，进行二代测序，患儿的CFTR基因发生了复杂杂合突变，一条染色体中的CFTR基因发生了940G>T突变(相应氨基酸突变为Gly314Trp)、其它位置均未发生突变，另一条染色体中的CFTR基因发生了1810A>C突变(相应氨基酸突变位点为Thr604Pro)、其它位置均未发生突变。

940G>T突变即基因组中CFTR基因的第8外显子的第71位核苷酸由G突变为了T。

1810A>C突变即基因组中CFTR基因的第14外显子的第44位核苷酸由A突变为了C。

综合步骤一的病症和步骤二的测序结果，该患儿确诊为囊性纤维化患者。

三、患儿父母的CFTR基因测序

1、分别提取患儿的父亲和母亲的基因组DNA。

2、以步骤1得到的基因组DNA为模板，分别采用引物对甲(F1和R1组成)和引物对乙(F2和R2组成)进行PCR扩增，将后分别将PCR扩增产物进行测序。

F1(序列表的序列7)：5’-CCATgCTCAgATCTTCCATTCC-3’；

R1(序列表的序列8)：5’-CgCACATTTTTgCAAAgTTCA-3’。

F2(序列表的序列9)：5’-TgCTATCAgAATTCACAAggTACCAA-3’；

R2(序列表的序列10)：5’-ACgCTgATgCgAggCAgTAT-3’。

患儿父亲的相关测序结果见图2。图2中，A和B分别为不同染色体上的相关突变区域的测序结果。

患儿母亲的相关测序结果见图3。图3中，A和B分别为不同染色体上的相关突变区域的测序结果。

结果表明：患儿父亲的一条染色体上的CFTR基因发生了940G>T突变，另一条染色体上的CFTR基因未发生突变；患儿母亲的一条染色体上的CFTR基因发生了1810A>C突变，另一条染色体上的CFTR基因未发生突变；患儿获得了父亲CFTR基因发生了940G>T突变的染色体和母亲CFTR基因发生了1810A>C突变的染色体，因此发生了囊性纤维化。

SEQUENCE LISTING

<110> 首都医科大学附属北京儿童医院

<120> 囊性纤维化患者的CFTR基因突变形式及其应用

<130> GNCYX170282

<160> 10

<170> PatentIn version 3.5

<210> 1

<211> 1480

<212> PRT

<213> 人

<400> 1

Met Gln Arg Ser Pro Leu Glu Lys Ala Ser Val Val Ser Lys Leu Phe

1 5 10 15

Phe Ser Trp Thr Arg Pro Ile Leu Arg Lys Gly Tyr Arg Gln Arg Leu

20 25 30

Glu Leu Ser Asp Ile Tyr Gln Ile Pro Ser Val Asp Ser Ala Asp Asn

35 40 45

Leu Ser Glu Lys Leu Glu Arg Glu Trp Asp Arg Glu Leu Ala Ser Lys

50 55 60

Lys Asn Pro Lys Leu Ile Asn Ala Leu Arg Arg Cys Phe Phe Trp Arg

65 70 75 80

Phe Met Phe Tyr Gly Ile Phe Leu Tyr Leu Gly Glu Val Thr Lys Ala

85 90 95

Val Gln Pro Leu Leu Leu Gly Arg Ile Ile Ala Ser Tyr Asp Pro Asp

100 105 110

Asn Lys Glu Glu Arg Ser Ile Ala Ile Tyr Leu Gly Ile Gly Leu Cys

115 120 125

Leu Leu Phe Ile Val Arg Thr Leu Leu Leu His Pro Ala Ile Phe Gly

130 135 140

Leu His His Ile Gly Met Gln Met Arg Ile Ala Met Phe Ser Leu Ile

145 150 155 160

Tyr Lys Lys Thr Leu Lys Leu Ser Ser Arg Val Leu Asp Lys Ile Ser

165 170 175

Ile Gly Gln Leu Val Ser Leu Leu Ser Asn Asn Leu Asn Lys Phe Asp

180 185 190

Glu Gly Leu Ala Leu Ala His Phe Val Trp Ile Ala Pro Leu Gln Val

195 200 205

Ala Leu Leu Met Gly Leu Ile Trp Glu Leu Leu Gln Ala Ser Ala Phe

210 215 220

Cys Gly Leu Gly Phe Leu Ile Val Leu Ala Leu Phe Gln Ala Gly Leu

225 230 235 240

Gly Arg Met Met Met Lys Tyr Arg Asp Gln Arg Ala Gly Lys Ile Ser

245 250 255

Glu Arg Leu Val Ile Thr Ser Glu Met Ile Glu Asn Ile Gln Ser Val

260 265 270

Lys Ala Tyr Cys Trp Glu Glu Ala Met Glu Lys Met Ile Glu Asn Leu

275 280 285

Arg Gln Thr Glu Leu Lys Leu Thr Arg Lys Ala Ala Tyr Val Arg Tyr

290 295 300

Phe Asn Ser Ser Ala Phe Phe Phe Ser Gly Phe Phe Val Val Phe Leu

305 310 315 320

Ser Val Leu Pro Tyr Ala Leu Ile Lys Gly Ile Ile Leu Arg Lys Ile

325 330 335

Phe Thr Thr Ile Ser Phe Cys Ile Val Leu Arg Met Ala Val Thr Arg

340 345 350

Gln Phe Pro Trp Ala Val Gln Thr Trp Tyr Asp Ser Leu Gly Ala Ile

355 360 365

Asn Lys Ile Gln Asp Phe Leu Gln Lys Gln Glu Tyr Lys Thr Leu Glu

370 375 380

Tyr Asn Leu Thr Thr Thr Glu Val Val Met Glu Asn Val Thr Ala Phe

385 390 395 400

Trp Glu Glu Gly Phe Gly Glu Leu Phe Glu Lys Ala Lys Gln Asn Asn

405 410 415

Asn Asn Arg Lys Thr Ser Asn Gly Asp Asp Ser Leu Phe Phe Ser Asn

420 425 430

Phe Ser Leu Leu Gly Thr Pro Val Leu Lys Asp Ile Asn Phe Lys Ile

435 440 445

Glu Arg Gly Gln Leu Leu Ala Val Ala Gly Ser Thr Gly Ala Gly Lys

450 455 460

Thr Ser Leu Leu Met Val Ile Met Gly Glu Leu Glu Pro Ser Glu Gly

465 470 475 480

Lys Ile Lys His Ser Gly Arg Ile Ser Phe Cys Ser Gln Phe Ser Trp

485 490 495

Ile Met Pro Gly Thr Ile Lys Glu Asn Ile Ile Phe Gly Val Ser Tyr

500 505 510

Asp Glu Tyr Arg Tyr Arg Ser Val Ile Lys Ala Cys Gln Leu Glu Glu

515 520 525

Asp Ile Ser Lys Phe Ala Glu Lys Asp Asn Ile Val Leu Gly Glu Gly

530 535 540

Gly Ile Thr Leu Ser Gly Gly Gln Arg Ala Arg Ile Ser Leu Ala Arg

545 550 555 560

Ala Val Tyr Lys Asp Ala Asp Leu Tyr Leu Leu Asp Ser Pro Phe Gly

565 570 575

Tyr Leu Asp Val Leu Thr Glu Lys Glu Ile Phe Glu Ser Cys Val Cys

580 585 590

Lys Leu Met Ala Asn Lys Thr Arg Ile Leu Val Thr Ser Lys Met Glu

595 600 605

His Leu Lys Lys Ala Asp Lys Ile Leu Ile Leu His Glu Gly Ser Ser

610 615 620

Tyr Phe Tyr Gly Thr Phe Ser Glu Leu Gln Asn Leu Gln Pro Asp Phe

625 630 635 640

Ser Ser Lys Leu Met Gly Cys Asp Ser Phe Asp Gln Phe Ser Ala Glu

645 650 655

Arg Arg Asn Ser Ile Leu Thr Glu Thr Leu His Arg Phe Ser Leu Glu

660 665 670

Gly Asp Ala Pro Val Ser Trp Thr Glu Thr Lys Lys Gln Ser Phe Lys

675 680 685

Gln Thr Gly Glu Phe Gly Glu Lys Arg Lys Asn Ser Ile Leu Asn Pro

690 695 700

Ile Asn Ser Ile Arg Lys Phe Ser Ile Val Gln Lys Thr Pro Leu Gln

705 710 715 720

Met Asn Gly Ile Glu Glu Asp Ser Asp Glu Pro Leu Glu Arg Arg Leu

725 730 735

Ser Leu Val Pro Asp Ser Glu Gln Gly Glu Ala Ile Leu Pro Arg Ile

740 745 750

Ser Val Ile Ser Thr Gly Pro Thr Leu Gln Ala Arg Arg Arg Gln Ser

755 760 765

Val Leu Asn Leu Met Thr His Ser Val Asn Gln Gly Gln Asn Ile His

770 775 780

Arg Lys Thr Thr Ala Ser Thr Arg Lys Val Ser Leu Ala Pro Gln Ala

785 790 795 800

Asn Leu Thr Glu Leu Asp Ile Tyr Ser Arg Arg Leu Ser Gln Glu Thr

805 810 815

Gly Leu Glu Ile Ser Glu Glu Ile Asn Glu Glu Asp Leu Lys Glu Cys

820 825 830

Phe Phe Asp Asp Met Glu Ser Ile Pro Ala Val Thr Thr Trp Asn Thr

835 840 845

Tyr Leu Arg Tyr Ile Thr Val His Lys Ser Leu Ile Phe Val Leu Ile

850 855 860

Trp Cys Leu Val Ile Phe Leu Ala Glu Val Ala Ala Ser Leu Val Val

865 870 875 880

Leu Trp Leu Leu Gly Asn Thr Pro Leu Gln Asp Lys Gly Asn Ser Thr

885 890 895

His Ser Arg Asn Asn Ser Tyr Ala Val Ile Ile Thr Ser Thr Ser Ser

900 905 910

Tyr Tyr Val Phe Tyr Ile Tyr Val Gly Val Ala Asp Thr Leu Leu Ala

915 920 925

Met Gly Phe Phe Arg Gly Leu Pro Leu Val His Thr Leu Ile Thr Val

930 935 940

Ser Lys Ile Leu His His Lys Met Leu His Ser Val Leu Gln Ala Pro

945 950 955 960

Met Ser Thr Leu Asn Thr Leu Lys Ala Gly Gly Ile Leu Asn Arg Phe

965 970 975

Ser Lys Asp Ile Ala Ile Leu Asp Asp Leu Leu Pro Leu Thr Ile Phe

980 985 990

Asp Phe Ile Gln Leu Leu Leu Ile Val Ile Gly Ala Ile Ala Val Val

995 1000 1005

Ala Val Leu Gln Pro Tyr Ile Phe Val Ala Thr Val Pro Val Ile

1010 1015 1020

Val Ala Phe Ile Met Leu Arg Ala Tyr Phe Leu Gln Thr Ser Gln

1025 1030 1035

Gln Leu Lys Gln Leu Glu Ser Glu Gly Arg Ser Pro Ile Phe Thr

1040 1045 1050

His Leu Val Thr Ser Leu Lys Gly Leu Trp Thr Leu Arg Ala Phe

1055 1060 1065

Gly Arg Gln Pro Tyr Phe Glu Thr Leu Phe His Lys Ala Leu Asn

1070 1075 1080

Leu His Thr Ala Asn Trp Phe Leu Tyr Leu Ser Thr Leu Arg Trp

1085 1090 1095

Phe Gln Met Arg Ile Glu Met Ile Phe Val Ile Phe Phe Ile Ala

1100 1105 1110

Val Thr Phe Ile Ser Ile Leu Thr Thr Gly Glu Gly Glu Gly Arg

1115 1120 1125

Val Gly Ile Ile Leu Thr Leu Ala Met Asn Ile Met Ser Thr Leu

1130 1135 1140

Gln Trp Ala Val Asn Ser Ser Ile Asp Val Asp Ser Leu Met Arg

1145 1150 1155

Ser Val Ser Arg Val Phe Lys Phe Ile Asp Met Pro Thr Glu Gly

1160 1165 1170

Lys Pro Thr Lys Ser Thr Lys Pro Tyr Lys Asn Gly Gln Leu Ser

1175 1180 1185

Lys Val Met Ile Ile Glu Asn Ser His Val Lys Lys Asp Asp Ile

1190 1195 1200

Trp Pro Ser Gly Gly Gln Met Thr Val Lys Asp Leu Thr Ala Lys

1205 1210 1215

Tyr Thr Glu Gly Gly Asn Ala Ile Leu Glu Asn Ile Ser Phe Ser

1220 1225 1230

Ile Ser Pro Gly Gln Arg Val Gly Leu Leu Gly Arg Thr Gly Ser

1235 1240 1245

Gly Lys Ser Thr Leu Leu Ser Ala Phe Leu Arg Leu Leu Asn Thr

1250 1255 1260

Glu Gly Glu Ile Gln Ile Asp Gly Val Ser Trp Asp Ser Ile Thr

1265 1270 1275

Leu Gln Gln Trp Arg Lys Ala Phe Gly Val Ile Pro Gln Lys Val

1280 1285 1290

Phe Ile Phe Ser Gly Thr Phe Arg Lys Asn Leu Asp Pro Tyr Glu

1295 1300 1305

Gln Trp Ser Asp Gln Glu Ile Trp Lys Val Ala Asp Glu Val Gly

1310 1315 1320

Leu Arg Ser Val Ile Glu Gln Phe Pro Gly Lys Leu Asp Phe Val

1325 1330 1335

Leu Val Asp Gly Gly Cys Val Leu Ser His Gly His Lys Gln Leu

1340 1345 1350

Met Cys Leu Ala Arg Ser Val Leu Ser Lys Ala Lys Ile Leu Leu

1355 1360 1365

Leu Asp Glu Pro Ser Ala His Leu Asp Pro Val Thr Tyr Gln Ile

1370 1375 1380

Ile Arg Arg Thr Leu Lys Gln Ala Phe Ala Asp Cys Thr Val Ile

1385 1390 1395

Leu Cys Glu His Arg Ile Glu Ala Met Leu Glu Cys Gln Gln Phe

1400 1405 1410

Leu Val Ile Glu Glu Asn Lys Val Arg Gln Tyr Asp Ser Ile Gln

1415 1420 1425

Lys Leu Leu Asn Glu Arg Ser Leu Phe Arg Gln Ala Ile Ser Pro

1430 1435 1440

Ser Asp Arg Val Lys Leu Phe Pro His Arg Asn Ser Ser Lys Cys

1445 1450 1455

Lys Ser Lys Pro Gln Ile Ala Ala Leu Lys Glu Glu Thr Glu Glu

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Glu Val Gln Asp Thr Arg Leu

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<210> 2

<211> 4443

<212> DNA

<213> 人

<400> 2

atgcagaggt cgcctctgga aaaggccagc gttgtctcca aacttttttt cagctggacc 60

agaccaattt tgaggaaagg atacagacag cgcctggaat tgtcagacat ataccaaatc 120

ccttctgttg attctgctga caatctatct gaaaaattgg aaagagaatg ggatagagag 180

ctggcttcaa agaaaaatcc taaactcatt aatgcccttc ggcgatgttt tttctggaga 240

tttatgttct atggaatctt tttatattta ggggaagtca ccaaagcagt acagcctctc 300

ttactgggaa gaatcatagc ttcctatgac ccggataaca aggaggaacg ctctatcgcg 360

atttatctag gcataggctt atgccttctc tttattgtga ggacactgct cctacaccca 420

gccatttttg gccttcatca cattggaatg cagatgagaa tagctatgtt tagtttgatt 480

tataagaaga ctttaaagct gtcaagccgt gttctagata aaataagtat tggacaactt 540

gttagtctcc tttccaacaa cctgaacaaa tttgatgaag gacttgcatt ggcacatttc 600

gtgtggatcg ctcctttgca agtggcactc ctcatggggc taatctggga gttgttacag 660

gcgtctgcct tctgtggact tggtttcctg atagtccttg ccctttttca ggctgggcta 720

gggagaatga tgatgaagta cagagatcag agagctggga agatcagtga aagacttgtg 780

attacctcag aaatgattga aaatatccaa tctgttaagg catactgctg ggaagaagca 840

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tatgtgagat acttcaatag ctcagccttc ttcttctcag ggttctttgt ggtgttttta 960

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tcattctgca ttgttctgcg catggcggtc actcggcaat ttccctgggc tgtacaaaca 1080

tggtatgact ctcttggagc aataaacaaa atacaggatt tcttacaaaa gcaagaatat 1140

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tgggaggagg gatttgggga attatttgag aaagcaaaac aaaacaataa caatagaaaa 1260

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ggagcaggca agacttcact tctaatggtg attatgggag aactggagcc ttcagagggt 1440

aaaattaagc acagtggaag aatttcattc tgttctcagt tttcctggat tatgcctggc 1500

accattaaag aaaatatcat ctttggtgtt tcctatgatg aatatagata cagaagcgtc 1560

atcaaagcat gccaactaga agaggacatc tccaagtttg cagagaaaga caatatagtt 1620

cttggagaag gtggaatcac actgagtgga ggtcaacgag caagaatttc tttagcaaga 1680

gcagtataca aagatgctga tttgtattta ttagactctc cttttggata cctagatgtt 1740

ttaacagaaa aagaaatatt tgaaagctgt gtctgtaaac tgatggctaa caaaactagg 1800

attttggtca cttctaaaat ggaacattta aagaaagctg acaaaatatt aattttgcat 1860

gaaggtagca gctattttta tgggacattt tcagaactcc aaaatctaca gccagacttt 1920

agctcaaaac tcatgggatg tgattctttc gaccaattta gtgcagaaag aagaaattca 1980

atcctaactg agaccttaca ccgtttctca ttagaaggag atgctcctgt ctcctggaca 2040

gaaacaaaaa aacaatcttt taaacagact ggagagtttg gggaaaaaag gaagaattct 2100

attctcaatc caatcaactc tatacgaaaa ttttccattg tgcaaaagac tcccttacaa 2160

atgaatggca tcgaagagga ttctgatgag cctttagaga gaaggctgtc cttagtacca 2220

gattctgagc agggagaggc gatactgcct cgcatcagcg tgatcagcac tggccccacg 2280

cttcaggcac gaaggaggca gtctgtcctg aacctgatga cacactcagt taaccaaggt 2340

cagaacattc accgaaagac aacagcatcc acacgaaaag tgtcactggc ccctcaggca 2400

aacttgactg aactggatat atattcaaga aggttatctc aagaaactgg cttggaaata 2460

agtgaagaaa ttaacgaaga agacttaaag gagtgctttt ttgatgatat ggagagcata 2520

ccagcagtga ctacatggaa cacatacctt cgatatatta ctgtccacaa gagcttaatt 2580

tttgtgctaa tttggtgctt agtaattttt ctggcagagg tggctgcttc tttggttgtg 2640

ctgtggctcc ttggaaacac tcctcttcaa gacaaaggga atagtactca tagtagaaat 2700

aacagctatg cagtgattat caccagcacc agttcgtatt atgtgtttta catttacgtg 2760

ggagtagccg acactttgct tgctatggga ttcttcagag gtctaccact ggtgcatact 2820

ctaatcacag tgtcgaaaat tttacaccac aaaatgttac attctgttct tcaagcacct 2880

atgtcaaccc tcaacacgtt gaaagcaggt gggattctta atagattctc caaagatata 2940

gcaattttgg atgaccttct gcctcttacc atatttgact tcatccagtt gttattaatt 3000

gtgattggag ctatagcagt tgtcgcagtt ttacaaccct acatctttgt tgcaacagtg 3060

ccagtgatag tggcttttat tatgttgaga gcatatttcc tccaaacctc acagcaactc 3120

aaacaactgg aatctgaagg caggagtcca attttcactc atcttgttac aagcttaaaa 3180

ggactatgga cacttcgtgc cttcggacgg cagccttact ttgaaactct gttccacaaa 3240

gctctgaatt tacatactgc caactggttc ttgtacctgt caacactgcg ctggttccaa 3300

atgagaatag aaatgatttt tgtcatcttc ttcattgctg ttaccttcat ttccatttta 3360

acaacaggag aaggagaagg aagagttggt attatcctga ctttagccat gaatatcatg 3420

agtacattgc agtgggctgt aaactccagc atagatgtgg atagcttgat gcgatctgtg 3480

agccgagtct ttaagttcat tgacatgcca acagaaggta aacctaccaa gtcaaccaaa 3540

ccatacaaga atggccaact ctcgaaagtt atgattattg agaattcaca cgtgaagaaa 3600

gatgacatct ggccctcagg gggccaaatg actgtcaaag atctcacagc aaaatacaca 3660

gaaggtggaa atgccatatt agagaacatt tccttctcaa taagtcctgg ccagagggtg 3720

ggcctcttgg gaagaactgg atcagggaag agtactttgt tatcagcttt tttgagacta 3780

ctgaacactg aaggagaaat ccagatcgat ggtgtgtctt gggattcaat aactttgcaa 3840

cagtggagga aagcctttgg agtgatacca cagaaagtat ttattttttc tggaacattt 3900

agaaaaaact tggatcccta tgaacagtgg agtgatcaag aaatatggaa agttgcagat 3960

gaggttgggc tcagatctgt gatagaacag tttcctggga agcttgactt tgtccttgtg 4020

gatgggggct gtgtcctaag ccatggccac aagcagttga tgtgcttggc tagatctgtt 4080

ctcagtaagg cgaagatctt gctgcttgat gaacccagtg ctcatttgga tccagtaaca 4140

taccaaataa ttagaagaac tctaaaacaa gcatttgctg attgcacagt aattctctgt 4200

gaacacagga tagaagcaat gctggaatgc caacaatttt tggtcataga agagaacaaa 4260

gtgcggcagt acgattccat ccagaaactg ctgaacgaga ggagcctctt ccggcaagcc 4320

atcagcccct ccgacagggt gaagctcttt ccccaccgga actcaagcaa gtgcaagtct 4380

aagccccaga ttgctgctct gaaagaggag acagaagaag aggtgcaaga tacaaggctt 4440

tag 4443

<210> 3

<211> 247

<212> DNA

<213> 人

<220>

<221> misc_feature

<222> (71)..(71)

<223> n is g, or t

<400> 3

aacagaactg aaactgactc ggaaggcagc ctatgtgaga tacttcaata gctcagcctt 60

cttcttctca nggttctttg tggtgttttt atctgtgctt ccctatgcac taatcaaagg 120

aatcatcctc cggaaaatat tcaccaccat ctcattctgc attgttctgc gcatggcggt 180

cactcggcaa tttccctggg ctgtacaaac atggtatgac tctcttggag caataaacaa 240

aatacag 247

<210> 4

<211> 724

<212> DNA

<213> 人

<220>

<221> misc_feature

<222> (44)..(44)

<223> n is a, or c

<400> 4

ctgtgtctgt aaactgatgg ctaacaaaac taggattttg gtcncttcta aaatggaaca 60

tttaaagaaa gctgacaaaa tattaatttt gcatgaaggt agcagctatt tttatgggac 120

attttcagaa ctccaaaatc tacagccaga ctttagctca aaactcatgg gatgtgattc 180

tttcgaccaa tttagtgcag aaagaagaaa ttcaatccta actgagacct tacaccgttt 240

ctcattagaa ggagatgctc ctgtctcctg gacagaaaca aaaaaacaat cttttaaaca 300

gactggagag tttggggaaa aaaggaagaa ttctattctc aatccaatca actctatacg 360

aaaattttcc attgtgcaaa agactccctt acaaatgaat ggcatcgaag aggattctga 420

tgagccttta gagagaaggc tgtccttagt accagattct gagcagggag aggcgatact 480

gcctcgcatc agcgtgatca gcactggccc cacgcttcag gcacgaagga ggcagtctgt 540

cctgaacctg atgacacact cagttaacca aggtcagaac attcaccgaa agacaacagc 600

atccacacga aaagtgtcac tggcccctca ggcaaacttg actgaactgg atatatattc 660

aagaaggtta tctcaagaaa ctggcttgga aataagtgaa gaaattaacg aagaagactt 720

aaag 724

<210> 5

<211> 552

<212> DNA

<213> 人

<220>

<221> misc_feature

<222> (264)..(264)

<223> n is g, or t

<400> 5

ttcatataag gtaactgagg cccagagaga ttaaataaca tgcccaaggt cacacaggtc 60

atatgatgtg gagccaggtt aaaaatatag gcagaaagac tctagagacc atgctcagat 120

cttccattcc aagatccctg atatttgaaa aataaaataa catcctgaat tttattgtta 180

ttgtttttta tagaacagaa ctgaaactga ctcggaaggc agcctatgtg agatacttca 240

atagctcagc cttcttcttc tcanggttct ttgtggtgtt tttatctgtg cttccctatg 300

cactaatcaa aggaatcatc ctccggaaaa tattcaccac catctcattc tgcattgttc 360

tgcgcatggc ggtcactcgg caatttccct gggctgtaca aacatggtat gactctcttg 420

gagcaataaa caaaatacag gtaatgtacc ataatgctgc attatatact atgatttaaa 480

taatcagtca atagatcagt tctaatgaac tttgcaaaaa tgtgcgaaaa gatagaaaaa 540

gaaatttcct tc 552

<210> 6

<211> 1242

<212> DNA

<213> 人

<220>

<221> misc_feature

<222> (390)..(390)

<223> n is a, or c

<400> 6

ccttaaagat catctaataa tttcctcatt ttctagataa ataaactgag agaccccgag 60

gataaatgat ttgctcaaag tcaaatatct acttaatata ggaaatttaa tttcattctc 120

agtctgttaa catgcaactt ttcaatatag catgttattt catgctatca gaattcacaa 180

ggtaccaatt taattactac agagtactta tagaatcatt taaaatataa taaaattgta 240

tgatagagat tatatgcaat aaaacattaa caaaatgcta aaatacgaga catattgcaa 300

taaagtattt ataaaattga tatttatatg tttttatatc ttaaagctgt gtctgtaaac 360

tgatggctaa caaaactagg attttggtcn cttctaaaat ggaacattta aagaaagctg 420

acaaaatatt aattttgcat gaaggtagca gctattttta tgggacattt tcagaactcc 480

aaaatctaca gccagacttt agctcaaaac tcatgggatg tgattctttc gaccaattta 540

gtgcagaaag aagaaattca atcctaactg agaccttaca ccgtttctca ttagaaggag 600

atgctcctgt ctcctggaca gaaacaaaaa aacaatcttt taaacagact ggagagtttg 660

gggaaaaaag gaagaattct attctcaatc caatcaactc tatacgaaaa ttttccattg 720

tgcaaaagac tcccttacaa atgaatggca tcgaagagga ttctgatgag cctttagaga 780

gaaggctgtc cttagtacca gattctgagc agggagaggc gatactgcct cgcatcagcg 840

tgatcagcac tggccccacg cttcaggcac gaaggaggca gtctgtcctg aacctgatga 900

cacactcagt taaccaaggt cagaacattc accgaaagac aacagcatcc acacgaaaag 960

tgtcactggc ccctcaggca aacttgactg aactggatat atattcaaga aggttatctc 1020

aagaaactgg cttggaaata agtgaagaaa ttaacgaaga agacttaaag gtaggtatac 1080

atcgcttggg ggtatttcac cccacagaat gcaattgagt agaatgcaat atgtagcatg 1140

taacaaaatt tactaaaatc ataggattag gataaggtgt atcttaaaac tcagaaagta 1200

tgaagttcat taattataca agcaacgtta aaatgtaaaa ta 1242

<210> 7

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 7

ccatgctcag atcttccatt cc 22

<210> 8

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 8

cgcacatttt tgcaaagttc a 21

<210> 9

<211> 26

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 9

tgctatcaga attcacaagg taccaa 26

<210> 10

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 10

acgctgatgc gaggcagtat 20

Claims (5)

1.用于检测特异突变甲的物质和/或用于检测特异突变乙的物质在制备试剂盒中的应用；所述特异突变甲为：人基因组中序列表的序列3所示DNA分子中的第71位核苷酸由G突变为T；所述特异突变乙为：人基因组中序列表的序列4所示DNA分子中的第44位核苷酸由A突变为C；

所述试剂盒的功能为如下(c1)、(c2)或(c3)：

(c1)评价待测者患囊性纤维化的风险性；

(c2)评价待测者或待测夫妻的后代患囊性纤维化的风险性；

(c3)诊断或辅助诊断待测者是否为囊性纤维化患者。

2.一种试剂盒，包括用于检测特异突变甲的物质和/或用于检测特异突变乙的物质；所述特异突变甲为：人基因组中序列表的序列3所示DNA分子中的第71位核苷酸由G突变为T；所述特异突变乙为：人基因组中序列表的序列4所示DNA分子中的第44位核苷酸由A突变为C；

所述试剂盒的功能为如下(c1)、(c2)或(c3)：

(c1)评价待测者患囊性纤维化的风险性；

(c2)评价待测者或待测夫妻的后代患囊性纤维化的风险性；

(c3)诊断或辅助诊断待测者是否为囊性纤维化患者。

3.如权利要求2所述的试剂盒，其特征在于：

所述试剂盒的功能为(c1)，所述试剂盒还包括记载如下判断标准(d1)和/或(d2)和/或(d3)的载体：

(d1)如果待测者一条染色体携带所述特异突变甲，待测者相对正常人患囊性纤维化的风险性增高；

(d2)如果待测者一条染色体携带所述特异突变乙，待测者相对正常人患囊性纤维化的风险性增高；

(d3)如果待测者一条染色体携带所述特异突变甲，另一条染色体携带所述特异突变乙，待测者相对正常人患囊性纤维化的风险性增高。

4.如权利要求2所述的试剂盒，其特征在于：

所述试剂盒的功能为(c2)，所述试剂盒还包括记载如下判断标准(e1)和/或(e2)和/或(e3)和/或(e4)的载体：

(e1)如果待测者一条染色体携带所述特异突变甲，待测者的后代相对正常人患囊性纤维化的风险性增高；

(e2)如果待测者一条染色体携带所述特异突变乙，待测者的后代相对正常人患囊性纤维化的风险性增高；

(e3)如果待测者一条染色体携带所述特异突变甲，另一条染色体携带所述特异突变乙，待测者的后代相对正常人患囊性纤维化的风险性增高；

(e4)如果所述待测夫妻中的一位携带所述特异突变甲、另一位携带所述特异突变乙，待测夫妻的后代相对正常人患囊性纤维化的风险性增高。

5.如权利要求2所述的试剂盒，其特征在于：

所述试剂盒的功能为(c3)，所述试剂盒还包括记载如下判断标准(f1)和/或(f2)和/或(f3)的载体：

(f1)如果待测者一条染色体携带所述特异突变甲，待测者为或候选为囊性纤维化患者；

(f2)如果待测者一条染色体携带所述特异突变乙，待测者为或候选为囊性纤维化患者；

(f3)如果待测者一条染色体携带所述特异突变甲，另一条染色体携带所述特异突变乙，待测者为或候选为囊性纤维化患者。