CN105821150A - 基因cidec检测猪肌肉中甘油三酯含量的方法 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了一种基因CIDEC检测猪肌肉中甘油三酯含量的方法，利用基因CIDEC在脂肪组织中的表达水平来检测猪肌肉中甘油三酯含量。该法具有快速准确、操作方便且不影响猪正常生长的特点，适用于在猪养殖过程中动态监控猪肌肉中甘油三酯含量情况以便于随时掌握猪生长状况，对猪肌肉中脂肪的含量有一个相对精确的了解，进而对猪的日粮进行调整。

Description

基因CIDEC检测猪肌肉中甘油三酯含量的方法
技术领域
本发明属于猪肌肉中甘油三酯含量检测领域，尤其是涉及一种基因CIDEC检测猪肌肉中甘油三酯含量的方法。
背景技术
猪是我国主要的肉用动物，猪肉产量已占肉类总产量的60％以上。多年来的育种工作使猪瘦肉率水平有很大提高、脂肪性状得以显著改良。然而，在瘦肉率上升的同时，猪肉品质却在急剧下降。
猪肌肉中脂肪通常称为肌内脂肪(IMF)，猪的肌内脂肪含量是其重要经济性状，也是影响肉质的一个极其重要的指标，对肌肉的风味、嫩度和多汁性等食用品质有重要影响。脂肪组织能大量储存甘油三酯，猪的肌内脂肪主要成分为甘油三酯，通过对甘油三酯的测定可以了解猪肌肉中脂肪的积累情况。因此，可以通过动态监控肌肉中甘油三酯的含量来动态调节猪肉品质，进而对日粮进行调整，得到品质更好的猪肉。多年来，国内外学者对猪肌内脂肪含量做了相当多的研究，其研究结果对猪品种的选育、肉品的加工利用等均有重要的参考价值。
Cide家族是上世纪末发现的一组新蛋白。人类中，Cide家族蛋白有三个成员，分别是Cidea、Cideb和Cidec，对Cide家族蛋白结构分析显示，其N端结构与DFF45N端结构高度同源，由此得名。此外，Cide家族蛋白N端结构也是分子间相互作用的结构，而其C端均含有独特的同源序列，是该家族蛋白特有的功能结构域，发挥重要作用。Cidec是调控脂肪滴发育和脂肪沉积的关键因子，其可能与脂质代谢有密切关系。Cidec在脂肪组织中高表达，可以通过调节能量消耗来参与肥胖的发生。Cidec基因的定位于脂滴表面，在诱导大脂滴形成的同时也增加体内甘油三酯的存储。
发明内容
本发明要解决的技术问题是提供一种快速准确、操作方便且不影响猪正常生长的基因CIDEC检测猪肌肉中甘油三酯含量的方法。
为解决上述技术问题，本发明采用以下技术方案：基因CIDEC检测猪肌肉中甘油三酯含量的方法，利用基因CIDEC在脂肪组织中的表达水平来检测猪肌肉中甘油三酯含量。
上述基因CIDEC检测猪肌肉中甘油三酯含量的方法，通过定量PCR来检测基因CIDEC在脂肪组织里mRNA的表达量，用于定量PCR基因CIDEC特异片段的引物对分别具有以下碱基序列：
Forwardprimer：AGAAACATGGAGCCCAACGC，
Reverseprimer：GTCTGCCAGCATCAGACTGT。
上述基因CIDEC检测猪肌肉中甘油三酯含量的方法，包括以下步骤：
(1)从被检测的猪组织中抽提总RNA，反转录得到相应的cDNA样品；
(2)用引物对Forwardprimer和Reverseprimer对步骤(1)中的cDNA样品进行定量PCR。
步骤(1)中的反转录反应体系和条件为：在20μl反转录体系中，加入4μl总RNA，2μlOlig(dT)，4μlDEPC水，先置于70℃温育10min，再置于冰上急速冷却2min；然后加入：1μldNTPMix，0.5μlM-MLV，4μlBuffer，0.5μlRRI，4μlDEPC水，依次置于42℃1h，90℃10min，20℃2min；最后-20℃保存。
步骤(2)中定量PCR扩增步骤的反应体系和反应条件为：
反应体系：在20μl定量PCR反应体系中，含有1μlcDNA模板，10μSYBRPremixExTa定量II2×，0.4μlROXReferenceDyeII50×，1μM的1μl引物Forwardprimer，1μM的1μl引物Reverseprimer，6.6μl无菌去离子水；
反应条件：95℃30s；95℃5s，60℃30s，40个循环；95℃15s，60℃1min，95℃30s，60℃15s。
针对目前猪养殖和生产中缺乏有效监测其肌内脂肪含量状况的措施，发明人研究发现，CIDEC基因的表达量与猪肌肉中甘油三酯含量成正相关，而肌内脂肪含量的高低可由猪肌肉中甘油三酯含量的情况体现出来，猪肌肉中甘油三酯含量又可以通过CIDEC基因的表达量确定，因此，CIDEC在脂肪组织中的相对表达量可以用来反应猪肌内脂肪含量状况。据此，发明人建立了一种基因CIDEC检测猪肌肉中甘油三酯含量的方法，利用基因CIDEC在脂肪组织中的表达水平来检测猪肌肉中甘油三酯含量。该法具有快速准确、操作方便且不影响猪正常生长的特点，适用于在猪养殖过程中动态监控猪肌肉中甘油三酯含量情况以便于随时掌握猪生长状况，对猪肌肉中脂肪的含量有一个相对精确的了解，进而调整猪的日粮。
附图说明
图1是5月龄、8月龄、11月龄猪肌肉甘油三酯的相对含量图。
图2是5月龄、8月龄、11月龄猪脂肪组织中的Cidec相对表达量及肌肉甘油三酯的相对含量对照图，图中：左为Cidec相对表达量图，右为Cidec相对表达量与肌肉甘油三酯相对含量的相关性图。
图3是5月龄、8月龄、11月龄猪脂肪组织中的LPL相对表达量及肌肉甘油三酯的相对含量对照图，图中：左为LPL相对表达量图，右为LPL相对表达量与肌肉甘油三酯相对含量的相关性图。
图4是5月龄、8月龄、11月龄猪脂肪组织中的plin1相对表达量及肌肉甘油三酯的相对含量对照图，图中：左为plin1相对表达量图，右为plin1相对表达量与肌肉甘油三酯相对含量的相关性图。
具体实施方式
一、研究设计
以巴马香猪为研究对象，正常喂食处理，在5月龄、8月龄、11月龄检测Cidec、LPL和Plin1的表达水平，考察相关基因的表达量与猪肌肉甘油三酯含量的关系。
利用NCBI数据库中公开发表的猪(susscrofa)的Cidec序列(序列登录号：GI：162951808；参见网址：NCBI数据http：//www.ncbi.nlm.nih.gov/)，LPL序列(序列登录号：55741568)，Plin1序列(序列登录号：84490422)，设计特异性定量引物，以便检测猪的基因组中该基因的相对表达量。其中，猪(susscrofa)的Cidec特异片段，序列全长为803bp，猪(susscrofa)的LPL特异片段，序列全长为2946bp，猪(susscrofa)的Plin1特异片段，序列全长为1579bp。猪的看家基因甘油醛-3-脱氢酶基因GAPDH特异片段，序列全长为1341bp。
用于定量PCR上述Cidec特异片段的引物对，其碱基序列为：
Forwardprimer(P1)：AGAAACATGGAGCCCAACGC；
Reverseprimer(P2)：GTCTGCCAGCATCAGACTGT。
用于定量PCR上述LPL特异片段的引物对，其碱基序列为：
Forwardprimer(P3)：TGCTGGGAATCCAAACTGAA；
Reverseprimer(P4)：TCTGGCACCACTGGAACAAT。
用于定量PCR上述Plin1特异片段的引物对，其碱基序列为：
Forwardprimer(P5)：GCACTACGTGCCGCTCC；
Reverseprimer(P6)：CCTCTGGCGGCGGGTT。
用于定量PCR猪的看家基因甘油醛-3-脱氢酶GAPDH特异片段的引物，其碱基序列为：
Forwardprimer(P7)：CGTGTCGGTTGTGGATCTGA；
Reverseprimer(P8)：TGACGAAGTGGTCGTTGAGG。
二、研究方法
(1)动物和样品的获得
实验用猪在广西大学动物科学技术学院巴马香猪饲养基地喂养，不同月龄的猪分栏饲养，每栏最多不超过4头，按体重的3％进行饲喂。在相应的时间点(5月龄、8月龄、11月龄)，空腹16小时后，称体重、手术采集猪背部皮下脂肪，将采集的猪背部皮下脂肪样品立即用液氮冷冻，然后放置于-80℃超低温冰箱冻存以待分析。采集猪背最长肌，生理盐水清洗后用组织细胞甘油三酯酶法测定试剂盒(北京普利莱基因技术有限公司)测定背最长肌甘油三酯含量。
(2)总RNA提取和反转录
从-80℃冰箱中取出0.1g的猪皮下脂肪组织样放入2ml离心管中，加入1mlTrizol试剂(ambion)，用高通量研磨仪(大连爱科仪器开发有限公司)研磨2min，后静置5min，让组织充分裂解；向离心管中加入0.2ml的氯仿，用力摇晃30s，静置5min，后4℃12000rpm离心10min；取上清至另一1.5ml离心管中，加入等体积的异丙醇，颠倒混匀，室温静置10min，后4℃12000rpm离心10min，弃上清；在离心管中加入70％的用DEPC水配制的乙醇，4℃12000rpm离心3min，洗涤两次；沉淀自然挥发干，加入20μlDEPC水，-80℃保存。
通过酶标仪(TECANinfiniteM200PRO)测定总RNA浓度。
在经过无RNA酶处理的PCR管(AXYGEN)中配制20μl反转录体系，进行反转录得到cDNA样品。在20μl反转录体系中，加入4μl总RNA，2μlOlig(dT)，4μlDEPC水，先置于70℃温育10min，再置于冰上急速冷却2min；然后加入：1μldNTPMix(SolarbiodNTPMix)，0.5μlM-MLV(TaKaRaReverseTranscriptaseM-MLV)，4μlBuffer(TaKaRa5×ReverseTranscriptaseM-MLVBuffer)，0.5μlRRI(TaKaRa)，4μlDEPC水，依次置于42℃1h，90℃10min，20℃2min；最后-20℃保存。
(3)定量PCR
分别用基因Cidec、LPL和Plin1的特异性引物对(P1和P2、P3和P4、P5和P6)对步骤(2)所述的cDNA样品进行定量PCR。用引物对P7和P8，对看家基因GAPDH进行定量PCR。对定量PCR的结果进行分析计算，得到其相对表达量。
在8连管(AXYGEN)中配制20μl定量PCR体系，进行定量PCR。
在20μl定量PCR反应体系中，含有1μlcDNA模板，10μSYBRPremixExTa定量II2×(TaKaRaPremixExTa定量TMII(TliRNaseHPlus)试剂盒)，0.4μlROXReferenceDyeII50×(TaKaRaPremixExTa定量TMII(TliRNaseHPlus)试剂盒)，1μM的1μl引物Forwardprimer，1μM的1μl引物Reverseprimer，6.6μl无菌去离子水；
在定量PCR仪(AppliedBiosystems7500RealTimePCRSystem)中进行表达量检测，反应条件：95℃30s；95℃5s，60℃30s，40个循环；95℃15s，60℃1min，95℃30s，60℃15s。
(4)统计分析
结果用平均值±标准误差产方式表示。通过SPSS19.0软件(德国)用One-WayANOVA进行统计分析。P＜0.05可确定为具有统计差异。
表15月龄、8月龄、11月龄猪的体重表格和背膘厚度
三、研究结论
表1和图1-4结果表明，基因Cidec的表达量与肌肉甘油三酯正相关，而LPL和Plin1的表达量与肌肉甘油三酯相关性较差。因此，以基因Cidec在猪脂肪组织中的mRNA相对表达量可以用来反应猪的肌肉甘油三酯含量状况。

Claims (5)

1.一种基因CIDEC检测猪肌肉中甘油三酯含量的方法，其特征在于利用基因CIDEC在脂肪组织中的表达水平来检测猪肌肉中甘油三酯含量。
2.根据权利要求1所述的基因CIDEC检测猪肌肉中甘油三酯含量的方法，其特征在于通过定量PCR来检测基因CIDEC在脂肪组织里mRNA的表达量，用于定量PCR基因CIDEC特异片段的引物对分别具有以下碱基序列：
Forwardprimer：AGAAACATGGAGCCCAACGC，
Reverseprimer：GTCTGCCAGCATCAGACTGT。
3.根据权利要求1所述的基因CIDEC检测猪肌肉中甘油三酯含量的方法，其特征在于包括以下步骤：
(1)从被检测的猪组织中抽提总RNA，反转录得到相应的cDNA样品；
(2)用引物对Forwardprimer和Reverseprimer对步骤(1)中的cDNA样品进行定量PCR。
4.根据权利要求1所述的基因CIDEC检测猪肌肉中甘油三酯含量的方法，其特征在于步骤(1)中的反转录反应体系和条件为：在20μl反转录体系中，加入4μl总RNA，2μlOlig(dT)，4μlDEPC水，先置于70℃温育10min，再置于冰上急速冷却2min；然后加入：1μldNTPMix，0.5μlM-MLV，4μlBuffer，0.5μlRRI，4μlDEPC水，依次置于42℃1h，90℃10min，20℃2min；最后-20℃保存。
5.根据权利要求1所述的基因CIDEC检测猪肌肉中甘油三酯含量的方法，其特征在于步骤(2)中定量PCR扩增步骤的反应体系和反应条件为：
反应体系：在20μl定量PCR反应体系中，含有1μlcDNA模板，10μSYBRPremixExTa定量II2×，0.4μlROXReferenceDyeII50×，1μM的1μl引物Forwardprimer，1μM的1μl引物Reverseprimer，6.6μl无菌去离子水；
反应条件：95℃30s；95℃5s，60℃30s，40个循环；95℃15s，60℃1min，95℃30s，60℃15s。
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