CN105357960B - 具有定制特征的转基因动物 - Google Patents

具有定制特征的转基因动物 Download PDF

Info

Publication number
CN105357960B
CN105357960B CN201480024934.7A CN201480024934A CN105357960B CN 105357960 B CN105357960 B CN 105357960B CN 201480024934 A CN201480024934 A CN 201480024934A CN 105357960 B CN105357960 B CN 105357960B
Authority
CN
China
Prior art keywords
promoter
animal
keratin
nucleic acid
protein
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Expired - Fee Related
Application number
CN201480024934.7A
Other languages
English (en)
Other versions
CN105357960A (zh
Inventor
詹姆士·韦斯特
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
AGGENETICS Inc
Original Assignee
AGGENETICS Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from US13/837,405 external-priority patent/US20130212723A1/en
Application filed by AGGENETICS Inc filed Critical AGGENETICS Inc
Publication of CN105357960A publication Critical patent/CN105357960A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN105357960B publication Critical patent/CN105357960B/zh
Expired - Fee Related legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K67/00Rearing or breeding animals, not otherwise provided for; New or modified breeds of animals
    • A01K67/027New or modified breeds of vertebrates
    • A01K67/0275Genetically modified vertebrates, e.g. transgenic
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C12N15/8509Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells for producing genetically modified animals, e.g. transgenic
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2227/00Animals characterised by species
    • A01K2227/10Mammal
    • A01K2227/101Bovine
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2267/00Animals characterised by purpose
    • A01K2267/02Animal zootechnically ameliorated

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Environmental Sciences (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biodiversity & Conservation Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Animal Husbandry (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Abstract

本发明公开了用于创建具有定制特征的动物的材料与方法。在本发明的原理证明中,使用角蛋白‑ 14 特异性启动子、loxp 盒中的红荧光蛋白、色素盒中的显性黑(△G23)β防御素 103及SV40(带有内含子)多聚腺苷酸化序列。当Cre 重组酶(或HTNCre)以载体形式(例如脂质双层)施用到动物皮肤上时,动物毛皮被永久地遗传修饰而在施加HTNCre的地方变为黑色形状。

Description

具有定制特征的转基因动物
相关申请的交叉引用
本申请是2013年3月15日提交的美国专利申请号为13/837,405的部分继续申请案,其中美国专利申请号为13/837,405的申请是2013年2月15日提交的美国专利申请号为13/768,760的申请的部分继续申请案,美国专利申请号为13/768,760的申请要求2012年2月15日提交的美国专利申请号为61/598,987的申请的优先权,其全部内容通过引用的方式并入本文。
本申请的序列表被标记为SeqList-14Marl3_ST25.txt,其创建于2013年3月14日且大小为85KB。序列表的全部内容通过引用的引证方式并入本文。
技术领域
本发明涉及动物的基因修饰以产生特定特征的可控变化,例如,皮肤和/或皮毛着色中的变化。
背景技术
大多数动物物种中合成的唯一色素及所有哺乳动物物种中合成的唯一色素是黑色素。黑色素分为两类:褐黑素,其产生金色或红色,及真黑素,其产生深棕色或黑色。两种黑色素都由酪氨酸合成,但其合成途径在多巴醌产生后不同。
控制特定的黑素细胞产生褐黑素或真黑素的主要开关是黑素皮质激素受体(MC1R)。MCIR多态性还可能是红色或金色褐黑素的主要决定因素。
黑素皮质激素受体可以通过任何的黑素细胞刺激激素(MSH)激活,最通常的是α-MSH,还可以是β-防御素103。相反地,MC1R的激活可能通过刺鼠信号蛋白(agoutisignaling protein,ASP)的表达被抑制。β-防御素103信号优于ASP信号且ASP信号优于MSH信号。此外,所有这些加强或降低其活性的基因中存在突变和多态性。毛色进一步地由黑色素产生及转运的多个调节剂调节,其包括酪氨酸酶(TYR)、酪氨酸酶转运体OCA2及泛素基因HERC2等。
植物产生多种其他色素,包括叶绿素、类胡萝卜素、花青素和甜菜红。在这些色素中,类胡萝卜素最容易转移到动物体内,因为植物中类胡萝卜素色素的产生依赖于动物中也能发现的前体。香叶基香叶基焦磷酸是HMG-CoA还原酶途径中的中间体,并用作合成类固醇和固醇的前体。随着4-5个植物蛋白的添加,香叶基香叶基焦磷酸可替换用作合成胡萝卜素的黄色和橙色或类胡萝卜素红色的前体。植物色素转移至动物已发生于自然界:豌豆蚜虫A具有几个从真菌转移的基因。类胡萝卜素已在转基因酵母中产生,所述酵母属于动物界。
在多细胞动物中通过基因干预曾尝试的表面色素的唯一修饰是动物由浅色到深色或由深色到浅色的不加选择的变化。还未创建更详细的模式。在动物中天然发现的胡萝卜素色素不比蚜虫更复杂,且未被设计进入任何多细胞动物中。在本发明之前,还未产生动物物种的皮肤或皮毛的定制颜色或图案。
发明简述
本发明提供了创建动物中定制特征的材料和方法。例如,本发明提供了创建动物的皮肤和/或皮毛中定制图案的材料和方法。在其他实施方案中,所述定制特征可以包括动物皮肤或皮毛的长度和/或纹理。可选地,本发明还可用于产生动物指甲、爪和/或角的纹理、结构强度和/或长度的可控变化。
在一个具体的实施方案中,本发明的方法包括将基因构建体导入动物的细胞中,所述基因构建体包括角蛋白-14特异性启动子、loxp盒中的红色荧光蛋白、色素盒中的显性黑(△G23)β防御素103,及SV40(带有内含子)多聚腺苷酸化序列。当将包括Cre重组酶(或HTNCre)的组合物施用于具有基因构建体的动物皮肤时,施用所述组合物的动物的皮毛将变黑。以这种方式,所述皮毛被永久地基因修饰而以所需形状转变颜色。
因此,在一个实施方案中,本发明提供了在动物的皮肤和/或皮毛中创建定制的永久图案的方法。
在另一实施方案中,本发明提供了在动物物种的皮肤和/或皮毛中产生多颜色图案的方法。
在进一步的实施方案中,本发明提供了在动物物种的皮肤和/或皮毛中创建定制图案的方法,以使所述动物能继续生长皮毛以在其整个生命期保持这些颜色。
本发明还提供了创建定制的预定义的条纹图案的方法,所述图案在该动物中是可遗传的。
在一个实施方案中,本发明提供了一个或多个活化因子的经皮施用以引起本发明的转基因动物中的重组和永久的转基因表达。在某些具体的实施方案中,根据本发明使用的活化因子包括,但不限于,重组酶蛋白质、能够诱导重组酶表达的小分子(如,强力霉素,cumate、蜕皮激素等),能够诱导重组酶表达的病毒,及驱使重组酶表达的核酸(如DNA)构建体。
在某些实施方案中,所述活化因子可单独地或在载体溶液中(例如,脂质体、溶剂、含有DMSO的混合物等)施用于动物皮肤的表面。在一个实施方案中,所述活化因子皮内(如使用纹身针)或皮下施用。
在一个实施方案中,所述转基因动物包含一个或多个外源核酸分子,其包括但不限于,着色-相关的基因,表皮/毛发特性基因(如控制动物毛发的长度和/或卷曲度的基因),与指甲/爪或角特性相关的基因(如编码交联角蛋白的核酸分子),及动物细胞中用于合成和/或表达植物色素的基因。
在某些实施方案中,根据本发明使用的启动子包括但不限于,皮肤-特异性启动子(例如,角蛋白特异性启动子),黑素细胞特异性启动子(例如,MCR启动子),组成型启动子(例如,β-球蛋白启动子、CMV启动子),及响应循环因子(如NF-kB、干扰素γ、雌激素和糖皮质激素类)的启动子。
在某些实施方案中,本发明提供了多种类型重组酶靶标的用途以允许通过施用不同重组酶选择性地特异性激活不同基因。在一个实施方案中,多元重组酶靶标用于允许动物出生后产生多种颜色。
在一个实施方案中,在具有天然金色皮毛的转基因狗中,Cre重组酶激活黑色狗皮毛的产生,且Flp重组酶激活红色狗皮毛的产生。
在一个实施方案中,本发明提供了自身启动子的用途以在不需要外源活化因子时引起表皮着色。在一个具体实施方案中,自身启动子涉及动物发育中限定体节边界。
在一个实施方案中,自身异源启动子用于创建不同物种的表皮图案,如,例如,使用猫中发现的Tabby或Ticked启动子以引起狗的表皮着色。
在某些实施方案中,本发明提供了具有在出生后永久可定制的表皮图案的转基因修饰的动物。
在某些实施方案中,本发明提供了具有不常发现于哺乳动物中的毛色的转基因修饰的动物。
在某些实施方案中,本发明提供了转基因修饰的牛、羊或其他动物,其表皮中长有永久的识别标志(如编号或条形码)。
在某些实施方案中,本发明提供了转基因修饰的牛、羊或其他动物,其表皮中具有“看不见”的标志,其响应健康或生理状况的变化可改变颜色。
在一个实施方案中,所述转基因牛或羊或其他动物可表达表皮或毛皮上的一个符号,其中如果动物具有NF-kB的慢性激活,所述符号可改变颜色,且如果动物具有干扰素-γ的慢性激活,另一符号可改变颜色。.
在某些实施方案中,本发明提供了转基因修饰的动物,其具有出生时本身物种中不常见的的毛色和图案。
在一个实施方案中,本发明提供了黑安格斯品种的转基因牛类动物,其具有白色或近白色的表皮或毛皮。
附图说明
图1是用于引起动物中颜色变化的基因构建体的实施方案示意图。
图2是用于创建动物皮肤或毛皮中定制的图案和颜色的基因构建体的实施方案示意图。
图3是用于创建动物皮肤或毛皮中定制的图案和颜色的基因构建体的实施方案示意图。
图4是用于创建小鼠皮肤或毛皮中定制的图案和颜色的基因构建体的实施方案示意图。所述构建体包含角蛋白l4启动子,其在所有皮肤成纤维细胞中都表达,以驱动显性黑色形式的信号分子β-防御素l03。β-防御素l03的表达被编码环指蛋白(RFP)的LoxP位点切割核酸阻断,环指蛋白用作标记物。编码RFP的核酸分子对于所述构建体是不需要的且可由STOP取代。
图5(A)示出了通过经皮施用重组酶激活的β-防御素l03表达,其创建了成年小鼠的表皮或毛皮中的可遗传永久改变。(B)可以实现标记改变的精准控制:通过注射重组酶产生具有单独狭窄黑线的小鼠。皮肤/毛皮的变化通过表皮再生长的多次循环维持,表示固有干细胞的成功改变。
图6示出了转基因小鼠的毛色可以通过施用于小鼠皮肤的重组酶数量滴定。增加施用于小鼠的重组酶数量增加转基因表达的水平和真黑素激活。
图7是用于基因敲入牛的基因构建体的实施方案示意图,所述牛具有增强型绿色荧光蛋白(EGFP)的精子-特异性表达,及重组酶-介导的显性阴性Rab7的黑素细胞-特异性表达。编码新霉素耐药性生物标记物蛋白的核酸序列位于构建体的中心且所述构建体两侧为短的同源臂,其中所述标记物蛋白可通过PIGGYBACTM转座子被切除。
图8示出了转基因的黑安格斯牛在皮肤中表达可定制的识别图案的描述。
序列简述
SEQ ID NO:l是双功能酶CarRP-类同种型1的氨基酸序列[豌豆蚜](GenBank登录号XP_001943170)。
SEQ ID NO:2是双功能酶CarRP-类的氨基酸序列[豌豆蚜(Acyrthosiphonpisum)](GenBank登录号XP_001950787)。
SEQ ID NO:3是番茄红素环化酶/八氢番茄红素合成酶-类的氨基酸序列[豌豆蚜](GenBank登录号XP_001950868)。
SEQ ID NO:4是八氢番茄红素脱氢酶-类的氨基酸序列[豌豆蚜](GenBank登录号XP_001943225)。
SEQ ID NO:5是八氢番茄红素脱氢酶-类的氨基酸序列[豌豆蚜](GenBank登录号XP_001950764)。
SEQ ID NO:6是八氢番茄红素脱氢酶-类的氨基酸序列[豌豆蚜](GenBank登录号XP_001946689)。
SEQ ID NO:7是八氢番茄红素脱氢酶-类的氨基酸序列[豌豆蚜](GenBank登录号XP_001943938)。
SEQ ID NO:8是黑素皮质激素1受体的氨基酸序列(GenBank登录号EDL 11741)。
SEQ ID NO:9是α-黑素细胞刺激素(MSH)的氨基酸序列。
SEQ ID NO:10是β-黑素细胞刺激素(MSH)的氨基酸序列。
SEQ ID NO:11是β-黑素细胞刺激素(MSH)的氨基酸序列。
SEQ ID NO:12是γ-黑素细胞刺激素(MSH)的氨基酸序列。
SEQ ID NO:13是β-防御素蛋白的氨基酸序列(GenBank登录号AAT67592)。
SEQ ID NO:14是刺鼠信号蛋白前体的氨基酸序列(GenBank登录号NP_056585)。
SEQ ID NO:15是酪氨酸酶(TYR)的氨基酸序列(GenBank登录号BAA00341)。
SEQ ID NO:16是黑素细胞特异性转运蛋白的氨基酸序列(GenBank登录号Q62052)。
SEQ ID NO:17是rab蛋白香叶基香叶基转移酶组分A2的氨基酸序列(GenBank登录号NP_067325)。
SEQ ID NO:18是ras-相关蛋白Rab-7a的氨基酸序列(GenBank登录号NP_033031)。
SEQ ID NO:19是可能的E3泛素蛋白连接酶(HERC2)的氨基酸序列(GenBank登录号NP 084390)。
SEQ ID NO:20是Pmel17蛋白的氨基酸序列[原鸡(Gallus gallus)](GenBank登录号AAT58250)。
SEQ ID NO:21是Pmel17蛋白的氨基酸序列[原鸡](GenBank登录号AAT58246)。
SEQ ID NO:22是Pmel17蛋白的氨基酸序列[原鸡](GenBank登录号AAT58249)。
发明详述
本发明提供了创建动物中定制特征的材料和方法。例如,本发明提供了创建动物的皮肤和/或毛皮中定制图案的材料和方法。在其他实施方案中,所述定制特征可以包括动物皮肤或毛皮的长度和/或纹理。可选地,本发明还可用于产生动物毛发、指甲、爪和/或角的纹理、结构强度和/或长度的可控变化。
在一个具体的实施方案中,本发明的方法包括将基因构建体导入动物的细胞中,所述基因构建体包括角蛋白-14特异性启动子、loxp盒中的红色荧光蛋白、色素盒中的显性黑(△G23)β防御素103,及SV40(带有内含子)多聚腺苷酸化序列。当将包括Cre重组酶(或HTNCre)的组合物施用于具有基因构建体的动物皮肤时,施用所述组合物的动物的毛皮将变黑。以这种方式,所述毛皮永久地基因修饰而以所需形状转变颜色。
因此,在一个实施方案中,本发明提供了在动物的皮肤和/或毛皮中创建定制永久图案的方法。
在另一实施方案中,本发明提供了在动物物种的皮肤和/或毛皮中产生多颜色图案的方法。
在进一步的实施方案中,本发明提供了在动物物种的皮肤和/或毛皮中创建定制图案的方法,以使所述动物能继续生长毛皮以在其整个生命期保持这些颜色。
本发明还提供了创建定制预定义的条纹图案的方法,所述图案在该动物中是可遗传的。
在一个实施方案中,所述转基因动物具有可遗传的软爪或柔软的毛发或毛皮。
在另一实施方案中,本发明提供了转基因动物的细胞、组织或部分(如皮肤、毛发、毛皮)及其用途。在一个实施方案中,所述转基因动物具有皮肤和/或毛皮中定制的颜色和/或图案,且其皮肤或毛皮可随后从用于生产兽皮、毛皮、皮革等的转基因动物移除,用于生产衣服、毯子、鞋子、马钉、马具、软垫以及其他皮革物品。
具有定制的特征的转基因动物
在一个实施方案中,本发明提供了具有定制特征的转基因动物,其中所述转基因动物(如在其基因组中)包括:
编码目的蛋白的外源核酸分子,其中所述核酸分子可操作地与启动子连接并受诱导型基因表达系统的调控,所述诱导型基因表达系统需要存在诱导剂以激活基因表达;
其中不存在诱导剂时外源核酸分子的表达被抑制。
在某些实施方案中,所述外源核酸分子编码的蛋白质是选自以下种类的蛋白质:色素蛋白;参与色素合成和/或转运的蛋白质;发光(如荧光)蛋白;参与动物皮肤或毛皮的长度和/或纹理的蛋白质;及参与动物指甲、爪和/或角的纹理、结构强度和/或长度的蛋白质。
在一个具体的实施方案中,本发明提供了具有定制的毛皮或皮肤着色的转基因动物,其中所述转基因动物的基因组包括:
外源核酸分子,其编码目的色素蛋白或参与目的色素合成和/或转运的蛋白质,其中所述核酸分子可操作地与启动子连接并受诱导型基因表达系统(即位点特异性重组系统)的调控,
其中不存在位点特异性重组时,位点特异性重组系统抑制第一核酸分子的表达。
在向转基因动物施用例如重组酶后可诱导外源核酸分子的表达。
在一个实施方案中,着色构建体含有外源核酸分子、启动子和/或位点特异性重组系统。
在一个实施方案中,所述转基因动物的基因组包含其表达受Cre/LoxP重组系统调控的外源核酸分子,其中Cre/LoxP重组系统阻止外源核酸分子的表达。在一个具体的实施方案中,所述Cre/LoxP重组系统包含lox-stop-lox(LSL)序列。
在一个实施方案中,所述着色构建体被转移至细胞中,如受精卵。可使用任何常规方法将所述着色构建体转移至受精卵,其包括但不限于,lentivirii,原核注射及胞浆内卵母细胞精子注射(ICSI)。
在某些实施方案中,将一个或多个着色构建体导入转基因动物的基因组中。所述着色构建体可以包含一个以上的外源核酸分子,每个核酸分子编码一种目的蛋白。
在某些实施方案中,所述转基因动物的基因组包括一个以上的诱导型基因表达系统以调控目的核酸分子的表达。
在一个具体的实施方案中,本发明提供了具有定制的特征(如毛皮或皮肤着色)的转基因动物,其中所述转基因动物的基因组包含:
第一外源核酸分子,其编码目的蛋白(如着色蛋白),可操作地与第一启动子连接并受loxP位点的调控,其中不存在Cre重组酶蛋白时loxP位点阻止第一外源核酸分子的表达;及
第二核酸分子,其编码Cre重组酶蛋白,可操作地与第二启动子连接。
在另一具体实施方案中,本发明提供了具有定制的特征(如毛皮或皮肤着色)的转基因动物,其中所述转基因动物的基因组包含:
第一外源核酸分子,其编码目的蛋白(如着色蛋白),可操作地与第一启动子连接并受loxP位点的调控,其中不存在Cre重组酶蛋白时loxP位点阻止第一外源核酸分子的表达;
第二核酸分子,其编码反向tRA(rtTA),可操作地与第二启动子连接;及
第三核酸分子,其编码Cre重组酶蛋白,在TetO操纵子的调控下可操作地与第三启动子连接。
图2和3示出了表达构建体的实施方案,其中目的外源核酸分子的表达(如色素蛋白和参与生物色素合成的蛋白质)受Cre-LoxP重组系统和四环素(Tet)-调控的转录激活系统的调控。
在一具体的实施方案中,将与DMSO载体混合的强力霉素(或蜕皮激素等)施用于具有金色毛皮的转基因动物,由此转基因动物的颜色变为红色;随后,将与DMSO混合的Cre或HTNCre施用于转基因动物以产生黑色。
在另一个具体的实施方案中,所述转基因动物的基因组包括外源核酸分子,其表达受四环素(Tet)-调控的转录激活系统调控。
在另一个实施方案中,本发明提供了具有定制特征(如毛皮或皮肤着色)的转基因动物,其中所述转基因动物的基因组包含:第一外源核酸分子,其编码目的蛋白(如着色蛋白),可操作地与第一启动子连接并受诱导型基因表达系统(例如,四环素(Tet)-调控的转录激活系统)的调控,其中诱导型基因表达系统在其未激活状态(未诱导时)阻止第一核酸分子的表达。
在一个实施方案中,本发明提供了具有定制的特征的转基因动物,其中所述转基因动物(如在其基因组中)包含:显性作用的,编码目的蛋白的外源核酸分子,其中所述核酸分子可操作地与启动子连接。
在一个实施方案中,本发明提供了表皮或毛皮颜色与其同种野生型动物不同的转基因动物,其中所述转基因动物(如在其基因组中)包含:显性作用的,编码以下蛋白质的外源核酸分子,所述蛋白质选自色素蛋白;参与色素合成和/或转运的蛋白质;及发光(如荧光)蛋白。
在一个实施方案中,本发明提供了表皮或毛皮具有目的颜色的转基因动物,其中所述转基因动物包含:
显性作用的外源核酸分子可操作地与启动子连接,其中所述外源核酸编码以下蛋白质,所述蛋白质选自参与黑素体组装的蛋白质,参与黑色素合成的蛋白质,参与黑色素转运的蛋白质,参与黑素细胞发育和/或转移的蛋白质,及参与生物色素合成和/或转运的蛋白质;和/或编码目的序列的外源抑制RNA,可操作地与启动子连接,其中所述编码目的序列的外源抑制RNA干扰显性作用的野生型动物核酸分子的表达,其中所述野生型核酸分子编码以下蛋白质,所述蛋白质选自参与黑素体组装的蛋白质,参与黑色素合成的蛋白质,参与黑色素转运的蛋白质,参与黑素细胞发育和/或转移的蛋白质,及参与生物色素合成和/或转运的蛋白质。
在一个实施方案中,所述外源核酸分子不存在于同种野生型动物的细胞中。在一个实施方案中,当所述外源核酸分子存在于相同物种的野生型动物细胞中时,其存在于野生型基因组的不同位置。在一个实施方案中,当所述外源核酸分子存在于相同物种的野生型动物细胞中时,其在野生型动物的不同细胞型中表达。在另一实施方案中,当所述外源核酸分子存在于相同物种的野生型动物细胞中时,转基因动物与相同物种的野生型动物相比具有额外拷贝的外源核酸。
转基因动物可以是任何物种,包括但不限于,哺乳动物,包括但不限于,驯养的和实验室动物如狗、猫、小鼠、大鼠、豚鼠和仓鼠;家畜如马、牛、猪、绵羊、山羊、鸭子、鹅和鸡;灵长类动物如猿、黑猩猩、猩猩、人类和猴子;鱼;两栖动物如青蛙和蝾螈;爬行动物如蛇和蜥蜴;及其他动物如狐狸、黄鼠狼、兔子、水貂、河狸、貂、水獭、黑貂、海豹、草原狼(coyotes)、灰鼠(chinchillas)、鹿、麝鼠(muskrats)和负鼠(possum)。在某些实施方案中,所述动物不是人类。
创建具有“非黑色”表皮或毛皮的转基因牛类动物
在一个实施方案中,本发明提供了具有白色或近白色的表皮或毛皮的转基因牛动物,其中所述转基因动物(如在其基因组中)包括:
显性作用的外源核酸分子,可操作地与启动子相连接,其中显性作用的外源核酸编码以下蛋白质,所述蛋白质选自抑制黑素体组装的蛋白质,抑制黑色素合成的蛋白质,抑制黑色素转运的蛋白质,抑制黑素细胞发育和/或转移的蛋白质,和/或
编码目的序列的外源抑制性RNA,可操作地与启动子相连接,其中外源抑制性RNA编码序列编码抑制性RNA,其干扰动物显性作用的野生型核酸分子的表达,其中野生型核酸分子编码以下蛋白质,所述蛋白质选自参与黑素体组装的蛋白质,参与黑色素合成的蛋白质,参与黑色素转运的蛋白质,参与黑素细胞发育和/或转移的蛋白质。
在一优选实施方案中,所述牛动物是黑安格斯品种。在某些实施方案中,本发明的转基因牛动物包括,但不限于,驯养的牛、欧洲野牛和水牛(例如水牛,非洲水牛)。
在一个实施方案中,显性作用的外源核酸分子是显性作用的白色等位基因。
本文中使用的术语“等位基因”,其一般含义是指基因的替代形式,通常由突变引起,其位于特定染色体的特定位置上。
显性白是一组遗传相关的表皮或颜色表现型,其存在于野生型动物的多个品种中,所述动物例如鸡、马、小鼠、狗和猫。
在一个实施方案中,所述显性白等位基因是编码Pmel17的核酸分子。Pmel17(也称为GP100和Silv)是黑素细胞/黑色素瘤-特异性糖蛋白,其在黑素体发育中起重要作用。在某些实施方案中,根据本发明使用的Pmel17蛋白可以来自,例如鸡、马、小鼠、狗和猫。在一具体的实施方案中,所述显性白等位基因编码白鸡的Pmel17蛋白。
在一个实施方案中,所述显性白等位基因是编码Rab7的核酸分子。
在某些实施方案中,所述外源抑制性RNA干扰黑素皮质激素受体(MC1R)、促黑素细胞激素(MSH)(例如,α-MSH、β-MSH、γ-MSH)、β-防御素103、刺鼠信号蛋白(ASP)、酪氨酸酶(TYR)、黑素细胞-特异性转运蛋白、Ras-相关蛋白Rab-7、rab蛋白香叶基香叶基转移酶组分A2,和可能的E3泛素蛋白连接酶(HERC2)的表达。
在一个实施方案中,所述转基因牛动物进一步包含诱导型基因表达系统。在一具体的实施方案中,外源核酸分子的表达或外源抑制性RNA编码序列的表达受诱导型系统的调控。在一个实施方案中,所述诱导型基因表达系统是位点特异性重组系统(例如,Lox/P系统)。
在一优选实施方案中,所述转基因牛动物具有白色或近白色的毛色。在某些实施方案中,所述转基因牛动物具有非黑色,如灰色、粉色、棕色和黄色。
色素蛋白
本文中使用的术语“色素蛋白”是指包含色素的蛋白质。本文中使用的术语“色素”,是指不发光但根据波长选择性吸收的结果变化反射或透射光的颜色的材料;这种物理学过程不同于材料可发光的荧光、磷光及其他形式的发光。色素蛋白包括,但不限于色蛋白如细胞色素和黄素蛋白。
发光蛋白
本发明使用的术语“发光蛋白”是指发光的蛋白质。根据本发明使用的发光蛋白包括但不限于,荧光蛋白,其包括但不限于,绿色荧光蛋白、黄色荧光蛋白、青色荧光蛋白和红色荧光蛋白;及磷光蛋白。荧光蛋白是一类蛋白质,其共有独特特性,由其自身多肽序列内的3个氨基酸序列自给自足地形成可见波长的发色团。各种发光蛋白,包括荧光蛋白,是众所周知的。根据本发明使用的荧光蛋白包括但不限于,美国专利号7,160,698、美国申请公开号2009/0221799、2009/0092960、2007/0204355、2007/0122851、2006/0183133、2005/0048609、2012/0238726、2012/0034643、2011/0269945、2011/0223636、2011/0152502、2011/0126305、2011/0099646、2010/0286370、2010/0233726、2010/0184116、2010/0087006、2010/0035287、2007/0021598、2005/0244921、2005/0221338、2004/0146972和2001/0003650中所公开的荧光蛋白,所有这些全部内容以引用方式并入本文。
参与生物色素合成的蛋白质
参与生物色素合成和/或转运的蛋白质包括但不限于黑素皮质激素受体(MC1R)、促黑素细胞激素(MSH)(例如,α-MSH、β-MSH、γ-MSH)、β-防御素103、刺鼠信号蛋白(ASP)、酪氨酸酶(TYR)、黑素细胞-特异性转运蛋白、Ras-相关蛋白Rab-7、rab蛋白香叶基香叶基转移酶组分A2、可能的E3泛素蛋白连接酶(HERC2)、Pmel17和黑素亲和素(MLPH)的野生型或突变型。
在某些实施方案中,所述转基因动物的基因组包含编码参与生物色素合成的蛋白质的外源核酸分子。
编码参与生物色素合成和/或转运的蛋白质的核酸分子可以源自以下基因,其包括但不限于显性MC1R E92K和刺鼠基因(agouti基因)。
在某些实施方案中,所述转基因动物的基因组包括编码参与生物色素合成和/或转运的蛋白质的核酸分子,所述色素包括但不限于黑色素(例如,褐黑素、真黑素);尿色素;叶绿素;胆红素;胆绿素;藻胆素;藻红素;粪胆素;尿胆素;血蓝蛋白;血红蛋白;肌红蛋白;荧光素;类胡萝卜素,包括血色素、胡萝卜素(例如,α和β胡萝卜素、番茄红素、视紫红质),叶黄素(例如,角黄素、玉米黄质、黄体素);植物光敏素;藻胆蛋白(例如,R-藻红蛋白(R-PE)、B-藻红蛋白(B-PE)、C-藻蓝蛋白(CPC),别藻蓝蛋白(APC));多烯烯醇盐和类黄酮。
黄色、红色或橙色类胡萝卜素可在表达八氢番茄红素合成酶、去饱和酶和环化酶的动物中合成,如Moran(2010)和Verdoes(2003)中所述。在一个实施方案中,所述类胡萝卜素色素使用香叶基香叶基焦磷酸作为底物合成。
参与生物色素合成和/或转运的蛋白质包括但不限于,双功能酶CarRP-类同种型1[豌豆蚜](如GenBank登录号XP_001943170(SEQ ID NO:l)),双功能酶CarRP-类[豌豆蚜](如GenBank登录号XP_001950787(SEQ ID NO:2)),番茄红素环化酶/八氢番茄红素合成酶-类[豌豆蚜](如GenBank登录号XP_001950868(SEQ ID NO:3)),八氢番茄红素脱氢酶-类[豌豆蚜](如GenBank登录号XP_001943225(SEQ ID NO:4)),八氢番茄红素脱氢酶-类[豌豆蚜](如GenBank登录号XP_001950764(SEQ ID NO:5)),八氢番茄红素脱氢酶-类[豌豆蚜](如GenBank登录号XP_001946689(SEQ ID NO:6))和八氢番茄红素脱氢酶-类[豌豆蚜](如GenBank登录号XP_001943938(SEQ ID NO:7))。
参与生物色素合成和/或转运的蛋白质可以来自于任何动物(如小鼠、猪、人类、马、狗、猫、小鼠、鸡),其包括但不限于黑素皮质激素1受体(如GenBank登录号EDL11741(SEQID NO:8))、α-黑素细胞刺激素(MSH)(如SEQ ID NO:9)、β-黑素细胞刺激素(MSH)(如SEQ IDNO:10、SEQ ID NO:11)、γ-黑素细胞刺激素(MSH)(如SEQ ID NO:12)、β-防御素(如GenBank登录号AAT67592(SEQ ID NO:13))、刺鼠信号蛋白前体(如GenBank登录号NP_056585(SEQID NO:14))、酪氨酸酶(TYR)(如GenBank登录号BAA00341(SEQ ID NO:15))、黑素细胞特异性转运蛋白(如GenBank登录号Q62052(SEQ ID NO:16))、rab蛋白香叶基香叶基转移酶组分A2(如GenBank登录号NP_067325(SEQ ID NO:17))、Ras-相关蛋白Rab-7a(如GenBank登录号NP_033031(SEQ ID NO:18)和可能的E3泛素蛋白连接酶(HERC2)(如GenBank登录号NP_084390(SEQ ID NO:19))和黑素亲和素(MLPH)(如GenBank登录号NP_44379848.2)。
在某些实施方案中,参与生物色素合成和/或转运的蛋白质与SEQ ID NO:1-22中任意一个具有至少80%的一致性,或高于80%的一致性(如至少85%、87%、90%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、或99%)。
各种Pmel17蛋白序列是公开的,如通过GenBank数据库。根据本发明使用的Pmel17蛋白包括但不限于,具有如SEQ ID NO:20-22氨基酸序列的原鸡Pmel17。
参与毛发、指甲、爪和/或角的纹理、结构强度和/或长度的蛋白质
在某些实施方案中,所述转基因动物表达编码改变毛发发质(如直或卷曲毛发)或长度的蛋白的核酸分子。在一个实施方案中,外根鞘的WNT3或DVL2的有条件的过表达导致动物中的短毛发。在某些实施方案中,所述转基因动物表达编码参与毛发、指甲、爪和/或角的纹理、结构强度和/或长度的蛋白质的核酸分子。
参与控制动物毛发、指甲、爪和/或角的纹理、结构强度和/或长度的蛋白质包括角蛋白,其包括但不限于角蛋白1、角蛋白2、角蛋白2A、角蛋白HB6、角蛋白3、角蛋白4、角蛋白5、角蛋白6、角蛋白7、角蛋白8、角蛋白9、角蛋白10、角蛋白11、角蛋白12、角蛋白13、角蛋白14、角蛋白15、角蛋白16、角蛋白17、角蛋白18、角蛋白19、角蛋白20、角蛋白23、角蛋白24、角蛋白25、角蛋白26、角蛋白27、角蛋白28、角蛋白31、角蛋白32、角蛋白33、角蛋白34、角蛋白35、角蛋白36、角蛋白37、角蛋白38、角蛋白39、角蛋白40、角蛋白71、角蛋白72、角蛋白73、角蛋白74、角蛋白75、角蛋白76、角蛋白77、角蛋白78、角蛋白79、角蛋白80、角蛋白81、角蛋白82、角蛋白83、角蛋白84、角蛋白85、和角蛋白86。
氨基酸和/或多核苷酸序列的修饰
各种色素蛋白的氨基酸序列;参与色素合成和/或转运的蛋白质;参与动物皮肤或毛皮的长度和/或纹理的蛋白质;参与动物指甲、爪和/或角的纹理、结构强度和/或长度的蛋白质是公开的,如通过GenBank数据库。本发明包括这些蛋白质的用途。
在本发明范围内的多核苷酸和多肽可以根据与本文中具体列举的那些序列的一致性定义。序列一致性通常大于60%,优选地大于75%,更优选地大于80%,甚至更优选地大于90%,且可大于95。与本文中所列举的序列相比,序列一致性可以是60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98或99%。
除非另有规定,本文中使用的两个序列的序列一致性百分比可以使用Karlin和Altschul(1990)算法、Karlin和Altschul(1993)所修改的算法测定。这些算法是纳入Altschul等的NBLAST和XBLAST程序的(1990)。BLAST搜索可通过NBLAST程序实施,评分=100、字长=12,以获得具有所需序列一致性百分比的序列。为了获得对比目的的间隔比对,可使用如Altschul等(1997)所述的间隔BLAST。当使用BLAST和间隔BLAST程序时,可以使用各自程序(NBLAST和XBLAST)的默认参数。参见NCBI/NIH网站。
启动子元件
在根据本发明的某些实施方案中,所述核酸分子可操作地与组成型、诱导型或组织-特异性启动子相连接。
本文中使用的术语“组成型启动子”,其一般含义是指未调控的启动子,其允许相关基因的连续转录。根据本发明使用的组成型启动子包括但不限于巨细胞病毒(CMV)启动子、CMV-鸡β肌动蛋白启动子、泛素启动子、JeT启动子、SV40启动子、β球蛋白启动子、延伸因子1α(EF1-α)启动子、RSV启动子和Mo-MLV-LTR启动子。
根据本发明使用的启动子包括但不限于,通用启动子(例如,Rosa26);组织-特异性启动子,如角质形成细胞特异性启动子(例如,角蛋白14);黑素细胞特异性启动子(例如,黑素皮质激素1受体(MCR1)基因的启动子);及毛乳头-特异性启动子。根据本发明使用的启动子包括黑素细胞特异性启动子和基质细胞特异性启动子。
角质形成细胞特异性启动子包括但不限于,角蛋白1、角蛋白2、角蛋白2A、角蛋白HB6、角蛋白3、角蛋白4、角蛋白5、角蛋白6、角蛋白7、角蛋白8、角蛋白9、角蛋白10、角蛋白11、角蛋白12、角蛋白13、角蛋白14、角蛋白15、角蛋白16、角蛋白17、角蛋白18、角蛋白19、角蛋白20、角蛋白23、角蛋白24、角蛋白25、角蛋白26、角蛋白27、角蛋白28、角蛋白31、角蛋白32、角蛋白33、角蛋白34、角蛋白35、角蛋白36、角蛋白37、角蛋白38、角蛋白39、角蛋白40、角蛋白71、角蛋白72、角蛋白73、角蛋白74、角蛋白75、角蛋白76、角蛋白77、角蛋白78、角蛋白79、角蛋白80、角蛋白81、角蛋白82、角蛋白83、角蛋白84、角蛋白85和角蛋白86基因的启动子。
在某些实施方案中,根据本发明使用的启动子包括但不限于,存在目的內源生物因子时诱导基因表达的启动子,所述因子如NF-KB、干扰素-γ、雌激素和/或糖皮质激素类。
根据本发明使用的启动子包括但不限于存在目的感染因子时诱导基因表达的启动子,所述因子如病毒、细菌和/或原生动物。
在一个实施方案中,毛乳头-特异性启动子用于创建源自体节的细胞中定制的着色、颜色或图案;使用的启动子包括但不限于,Ripply2启动子、Tabby启动子、Ticked启动子。启动子的选择可通过进行多物种比较和/或使用保守启动子元件的程度确定。在某些实施方案中,所述启动子元件进一步包括编码报告蛋白的核酸分子,其表达响应药物的施用和/或转基因动物中生物标记物的代谢状态或循环水平。在一个实施方案中,所述启动子诱导目的蛋白(如色素蛋白和/或参与生物色素合成的蛋白质)的表达响应转基因动物中目的生理状态的存在,如例如心脏负荷、循环细胞因子的水平增加和/或类固醇存在或活性增加。
诱导型表达系统
根据本发明使用的诱导型基因表达系统包括但不限于,位点特异性重组系统,其包括但不限于Cre-LoxP重组系统、FLP-FRT重组系统;四环素(Tet)-调控转录激活系统;蜕皮激素诱导型系统;热冲击开/关系统;lacO/IPTG系统;cumate阻遏蛋白CymR系统;硝基还原酶系统;香豆霉素/新生霉素调控系统;RheoSwitch配体RSL1系统;双向嵌合核受体表达系统;GAL4系统;固醇或类固醇或合成类固醇诱导/抑制系统;及其组合。
在一个实施方案中,根据本发明使用的诱导型系统是Cre-LoxP重组系统。所述转基因动物的基因组可包含受Cre/LoxP重组系统调控的外源核酸分子,其中Cre/LoxP重组系统阻止外源核酸分子的表达。在一具体的实施方案中,Cre/LoxP重组系统包含lox-stop-lox(LSL)序列。
所述Cre-LoxP重组系统是用于进行细胞或转基因动物的DNA中位点特异性删除、插入、易位及倒置的位点特异性重组技术。Cre重组酶蛋白(由最初称为“引起重组”的位点编码)由4个亚基和2个结构域组成:较大的羧基(C-末端)结构域和较小的氨基(N-末端)结构域。loxP(X-over PI位点)是噬菌体PI的位点且由34bp组成。Cre-重组酶-介导的重组结果取决于loxP位点的位置和方向,其可以顺式或反式定位。在顺式定位的情况下,loxP位点的方向可以是相同或相反的。在反式定位的情况下,所涉及的DNA链可以是线形的或环形的。Cre重组酶-介导的重组结果可以是在顺式loxP位点情况下切除(当loxP位点处于相同方向时)或倒置(当loxP位点处于相反方向时)间插序列,或在反式loxP位点情况下将两个分子(染色体)间的一个DNA插入另一个中或易位。所述Cre-LoxP重组系统在本领域是已知的,参见,例如Andras Nagy,Cre recombinase:the universal reagent for genometailoring,Genesis 26:99-109(2000)。
在没有Cre-介导重组的情况下Lox-Stop-Lox(LSL)盒阻碍转基因的表达。存在Cre重组酶、LoxP位点重组时,所述stop盒被去除。所述Lox-Stop-Lox(LSL)盒在本领域是已知的。参见,Allen Institute for Brain Science,Mouse Brain Connectivity Altas,Technical White Paper:Transgenic Characterization Overview(2012)。
在某些实施方案中,所述loxP位点进一步包含编码基因(例如,lacz、GFP)的报告基因和/或编码第二着色蛋白(例如,如果第一着色蛋白含有显性作用的MC1R,另一刺鼠基因(agouti gene)两侧可以是loxP位点)的核酸分子。
四环素(Tet)-调控转录激活是诱导型表达的方法,其中转录通过抗生素四环素或其衍生物(例如,强力霉素)之一的存在或缺失可逆地控制。基因表达因Tet-off或Tet-on蛋白与位于诱导型启动子内的四环素响应元件(TRE)结合而被激活。Tet-on和Tet-off蛋白都能激活基因。Tet-Off蛋白子在没有四环素衍生物-强力霉素(Dox)时激活基因表达,然而Tet-on蛋白在存在Dox时激活基因表达。
在Tet-off系统中,四环素反式激活(tTA)蛋白,其通过融合TetR(四环素阻遏)蛋白(由大肠杆菌细菌获得)和VP 16蛋白(由单纯疱疹病毒获得)而创建,在TetO操纵子处结合DNA。一旦结合TetO操纵子激活与TetO操纵子连接的启动子,从而激活附近基因的转录。四环素衍生物结合tTA并使其不能与TRE序列结合,从而阻止了靶基因的反式激活。
在Tet-On系统中,当tTA蛋白与强力霉素结合时,强力霉素-结合tTA能够与TetO操纵子结合。因此,将强力霉素导入系统中启动了基因产物的转录。Tet-on系统有时优选地用于更快的响应。
反向tTA(rtTA)是用于通过加入Dox(Tet-on)的快速基因激活的互补基因模件。参见Kistner等,Doxycycline-mediated quantitative and tissue-specific control ofgene expression in transgenic mice,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.Vol.93,pp.10933-10938(1996)。
Tet-on高等反式激活子(也称为rtTA2s-M2)是Tet-On的另一版本,其示出了比Tet-on降低的基础表达及功能,低10倍的Dox浓度。此外,认为其表达在真核细胞中更稳定,因为其为优化的人类密码子及利用3个最小转录激活域。Tet-on 3G(也称为rtTA-VIO)与高等Tet-on相似,且为优化的人类密码子并由3个最小VP 16激活域组成。Tet-on 3G与原始Tet-on相比低100倍的Dox敏感。
在四环素-响应调控表达元件的一实施方案中,四环素-调控的逆向反式激活子(rtTA)包括tetR(例如,来自大肠杆菌的Tnl0);哺乳动物转录因子VP 16,其可反式激活作为效应子的结构域;及组织-特异性启动子,其可控制rtTA效应子转录。存在强力霉素时,rtTA与位于CMV启动子上游的(TeTO)7操纵子(7个串联重复的TetO序列)结合,所述CMV启动子引起转基因的表达。因此,可通过施用及戒断强力霉素开启或关闭转基因表达。
表达构建体
本发明还提供了用于产生转基因动物的表达构建体、载体及宿主细胞。
本文中使用的术语“表达构建体”是指核酸序列的组合,其用于可操作连接的核酸序列的转录。本发明的表达构建体还通常包括调控元件,其在预计的宿主细胞中发挥作用,所述表达构建体在所述宿主细胞中表达。因此,本领域普通技术人员可选择宿主细胞中使用的调控元件,例如,细菌宿主细胞、酵母宿主细胞、植物宿主细胞、昆虫宿主细胞、哺乳动物宿主细胞和人类宿主细胞。调控元件包括启动子、转录终止序列、翻译终止序列、增强子和多聚腺苷酸元件。
在某些实施方案中,本发明提供了用于定制动物的颜色和/或图案的表达构建体,包括着色构建体和图案构建体。
图1示出了着色构建体的实施方案,其包括启动子、loxP盒、编码目的色素蛋白或参与目的色素合成和/或转运的蛋白质的核酸分子及多聚腺苷酸化序列。在着色构建体的一实施方案中,通过施用Cre重组酶激活目的色素蛋白或参与目的色素合成和/或转运的蛋白质的表达。
在另一实施方案中,本发明提供了图案构建体。图2示出了图案构建体的实施方案。在一个实施方案中,所述图案构建体的启动子源自特异于体节边界规格的基因。在一个实施方案中,所述启动子选自Ripply 2启动子、Tabby启动子和Ticked启动子。在一个实施方案中,所述转基因动物包含着色构建体和图案构建体。在一个实施方案中,所述转基因动物在背侧真皮具有定制的组成型垂直条纹。
在一个实施方案中,所述转基因动物的基因组包含:
1)如图1所示的着色构建体,其中启动子是黑素细胞-特异性启动子且核酸分子编码参与红色素(如ASIP或MC1R)合成的蛋白质;
2)如图1所示的着色构建体,其中启动子是毛乳头-特异性启动子且核酸分子编码防御素103;以及
3)一组如图3所示的构建体,其中启动子是黑素细胞-特异性启动子。
本发明的表达构建体可以包含与编码本发明中肽的多核苷酸序列可操作地连接的启动子序列。可以使用本领域已知的标准技术将启动子并入多核苷酸。在本发明的表达构建体中可使用启动子的多个拷贝或多个启动子。在一优选实施方案中,启动子可被定位在与其天然遗传环境中距离转录起点大约相同的位置。启动子活性没有大幅下降的情况下,可允许该距离的一些改变。转录起点通常包括在表达构建体中。
本文中使用的术语“可操作连接”是指所述组分的并列,其中所述组分的关系是允许其以预计的方式发挥作用。通常,可操作连接的组分是连续的关系。通常,与编码序列可操作连接的序列能够引起编码序列的复制、转录和/或翻译。例如,当启动子能够直接转录编码序列时,该编码序列可操作地连接启动子。
“编码序列”或“编码区域”是转录为mRNA和/或翻译成多肽的多核苷酸序列。例如,编码序列可以编码目的多肽。编码序列的边界由5'-端的翻译起始密码子和3'-端的翻译终止密码子确定。
本文中使用的术语“启动子”是指与被转录的核酸序列(如编码所需分子的核酸序列)可操作连接的DNA序列。启动子通常定位于被转录的核酸序列上游并提供RNA聚合酶及其他转录因子特异性结合的位点。在具体实施方案中,启动子通常位于被转录核酸序列的上游以创建所需分子,并提供RNA聚合酶及其他转录因子特异性结合的位点。
除了启动子,还可以包括一个或多个增强子序列,例如,但不限于巨细胞病毒(CMV)早期增强子元件及SV40增强子元件。另外包括的序列为内含子序列,如β球蛋白内含子或通用内含子、转录终止序列及mRNA多腺苷酸化(pA)序列,例如,但不限于SV40-pA、β-球蛋白-pA、人生长激素(hGH)pA和SCF-pA。
在一个实施方案中,所述表达构建体包括多腺苷酸化序列,如源自牛生长激素(BGH)和SV40的多腺苷酸化序列。
术语“polyA”或“p(A)”或“pA”是指转录终止及mRNA多腺苷酸化信号的核酸序列。polyA序列的特征是六核苷酸基序AAUAAA。常用的多腺苷酸化信号是SV40pA、人生长激素(hGH)pA、β-肌动蛋白pA和β-球蛋白pA。所述序列的长度范围为32至450bp。可以使用多个pA信号。
在一个实施方案中,所述基因构建体包含编码选择标记(如新霉素抗性标记蛋白)的核酸分子,所述选择标记可通过PIGGYBACTM转座子切除。在一个实施方案中,所述构建体两侧为短同源臂。
术语“载体”用来指向宿主细胞传递编码信息(例如,本发明的多核苷酸)的任何分子(例如,核酸、质粒或病毒)。
术语“表达载体”和“转录载体”互换使用地是指适合于宿主细胞(例如,受试者的细胞)中使用的载体并含有引导和/或控制外源核酸序列表达的核酸序列。表达包括但不限于,如转录、翻译及存在内含子时的RNA剪接过程。根据本发明使用的载体包括质粒、病毒、BAC、YAC等。具体的病毒载体举例包括源自腺病毒、腺伴随病毒和慢病毒的那些载体。
本文中使用的术语“分离的”分子(例如,分离的核酸分子)是指使用重组技术生产时基本游离于其他细胞材料或培养基,或化学合成时基本游离于化学前体或其他化学物的分子。
术语“重组子”用于表示核酸构建体,其中两个或多个核酸连接且在自然界未发现其连接。
本文中使用的术语“核酸”是指具有一个以上的任何形式核苷酸的RNA或DNA分子,所述形式包括单链、双链、寡核苷酸或多核苷酸。
术语“核苷酸序列”用来指核酸单链形式中寡核苷酸或多核苷酸的核苷酸排序。
术语“表达”是指核酸序列的转录以创建相应的mRNA和/或mRNA的翻译以创建相应的蛋白质。可以使用众所周知的方法重组或合成或通过DNA合成生成表达构建体。
本文中使用的术语“调控元件”是指控制可操作连接的核酸序列表达的一些方面的核苷酸序列。示例性调控元件包括增强子、内部核糖体进入位点(IRES)、内含子、复制起点、多腺苷酸化信号(pA)、启动子、转录终止序列、上游调控域,其有助于核酸序列的复制、转录、转录后处理。本领域普通技术人员只需要常规实验就能够选择并使用表达构建体中的这些或其他调控元件。
在一个实施方案中,本发明的构建体包含内部核糖体进入位点(IRES)。在一个实施方案中,所述表达构建体包含kozak共识序列。
可选地,转基因构建体中包括报告基因。本文中使用的术语“报告基因”是指表达时容易检测的基因,例如,通过化学发光、荧光、比色反应、抗体结合、诱导型标记物、配体结合试验等。示例性报告基因包括但不限于绿色荧光蛋白。通过基因工程创建重组核酸、载体、转化的宿主细胞、蛋白质及蛋白质片段是众所周知的。
如果需要,所述载体两侧可能含有指示位点特异性同源重组的核酸序列。使用两侧DNA序列以允许同源重组到所需的遗传位点在本领域是已知的。目前,优选地,载体的编码序列(或通过同源重组被插入到染色体位置的任何其他本发明的序列)两侧中存在对应于染色体插入位点的数千碱基或更多的两侧DNA以保证染色体序列与外源DNA的精确置换。参见,例如,Deng等,1993,Mol.Cell.Biol 13(4):2134-40;Deng等,1992,Mol Cell Biol12(8):3365-71;和Thomas等,1992,Mol Cell Biol 12(7):2919-23。还应注意的是本发明的细胞可能含有目的基因的多份拷贝。
转化的宿主细胞是被含有本发明核酸构建体的载体转化或转染的细胞,并可以或不可以转录或翻译可操作连接的目的核酸。
用于改变动物特征的RNA干扰盒
在另一实施方案中,本发明提供了具有定制的特征的转基因动物,其中所述转基因动物的基因组包含:
目的外源抑制性RNA编码序列,其可操作地与启动子连接并受诱导型基因表达系统的调控,所述表达系统需要诱导剂的存在以激活基因表达;
其中不存在诱导剂时目的外源抑制性RNA编码序列的表达被抑制。.
在某些实施方案中,所述目的外源抑制性RNA编码序列干扰编码蛋白质的核酸序列的表达,所述蛋白质为色素蛋白;参与色素合成和/或转运的蛋白质;参与动物皮肤或毛皮的长度和/或纹理的蛋白质;发光(如荧光)蛋白;及参与动物指甲、爪或角的纹理、结构强度和/或长度的蛋白质。
在一个实施方案中,外源抑制性RNA编码序列编码siRNA,其干扰指甲中交联肌动蛋白的表达,从而产生具有柔软指甲而不是锋利指甲的基因工程动物(如猫)。
在一个实施方案中,RNAi构建体包含干扰编码交联角蛋白的核酸序列表达的siRNA,其可操作地连接特异于交联角蛋白的启动子,并受两侧为loxP位点的报告基因的调控。
参与动物毛发、指甲、爪和/或角的纹理、结构强度和/或长度的角蛋白,包括但不限于角蛋白1、角蛋白2、角蛋白2A、角蛋白HB6、角蛋白3、角蛋白4、角蛋白5、角蛋白6、角蛋白7、角蛋白8、角蛋白9、角蛋白10、角蛋白11、角蛋白12、角蛋白13、角蛋白14、角蛋白15、角蛋白16、角蛋白17、角蛋白18、角蛋白19、角蛋白20、角蛋白23、角蛋白24、角蛋白25、角蛋白26、角蛋白27、角蛋白28、角蛋白31、角蛋白32、角蛋白33、角蛋白34、角蛋白35、角蛋白36、角蛋白37、角蛋白38、角蛋白39、角蛋白40、角蛋白71、角蛋白72、角蛋白73、角蛋白74、角蛋白75、角蛋白76、角蛋白77、角蛋白78、角蛋白79、角蛋白80、角蛋白81、角蛋白82、角蛋白83、角蛋白84、角蛋白85和角蛋白86。
在一个实施方案中,本发明提供了一种微RNA盒,其包括siRNA编码序列和3'UTR序列。
本文中使用的术语“RNA干扰”(“RNAi”)是指RNA选择性细胞内降解。RNAi天然地发生在细胞内,以去除外源RNA(例如病毒RNA)。天然的RNAi通过从游离dsRNA切割片段而进行,dsRNA指导其他相似RNA序列的降解。可替代地,RNAi可以被人为的启动,例如,使内源性靶基因(例如PKC-ι)的表达沉默。
本文中使用的术语“小干扰RNA”(“siRNA”)(现有技术中也称为“短干扰RNA”)是指这样的RNA(RNA类似物),其包括大约10至50个核苷酸(或核苷酸类似物),并能够指导或介导RNA干扰。
本文中使用的具有“与靶mRNA序列具有足够互补的序列以指导靶特异性RNA干扰(RNAi)”的siRNA是指siRNA具有通过RNAi机制或过程足以引发靶mRNA(例如,PKC-ιmRNA)破坏的序列。“mRNA”或“信使RNA”或“转录本”是单链RNA,其特异于一个或多个多核苷酸的氨基酸序列。该信息在核糖体与mRNA结合时发生蛋白质合成的期间被翻译。
术语“核苷酸”是指在与糖部分的酯键合中具有一个或多个磷酸酯基团的核苷酸。典型的核苷酸包括核苷单磷酸、核苷二磷酸和核苷三磷酸。在本文中术语“多聚核苷酸”和“核苷酸分子”互换使用,并且是指通过5'和3'碳原子之间的磷酸二酯键连接在一起的核苷酸聚合物。术语“核酸”或"核酸序列"包含寡核苷酸、核苷酸、聚核苷酸或上述核苷酸的片段、基因组来源或合成来源的DNA或RNA(它们可以是单链的或双链的,并且可以表示正义链或反义链)、肽核酸(PNA)、或任意DNA类或RNA类物质、天然或合成来源。本领域技术人员应当理解的是当核酸是RNA时,由核糖核苷酸A、G、C和U分别代替脱氧核苷酸A、G、C和T。
本文中使用的术语“RNA”或“RNA分子”或“核糖核酸分子”通常是指核糖核苷酸的聚合物。术语“DNA”或“DNA分子”或“脱氧核糖核酸分子”通常是指脱氧核糖核酸的聚合物。DNA和RNA分子可以是天然合成的(例如,分别通过DNA复制或DNA转录)。RNA分子可以是转录后修饰的。DNA和RNA分子也可以化学合成的。DNA和RNA分子可以是单链的(即,分别是ssRNA和ssDNA)或是多链的(例如双链,即,分别是dsRNA和dsDNA)。然而,基于本发明的性质,术语“RNA”或“RNA分子”或“核糖核酸分子”也可以指主要(即,高于80%或优选高于90%)包含核糖核苷酸但任选地至少包括一个非核糖核苷酸分子,例如,至少一个脱氧核苷酸和/或至少一个核苷酸类似物。
本文中使用的术语“核苷酸类似物”(也指“改性核苷酸”或“修饰的核苷酸”)是指非标准核苷酸,包括非天然发生的核糖核苷酸或脱氧核糖核苷酸。优选的核苷酸类似物是在任意位置进行修饰从而改变核苷酸的某些化学性质,而仍然保留核苷酸类似物发挥其目的功能的能力。
本文中使用的术语“RNA类似物”是指与相应的未改性或未修饰的RNA相比,具有至少一个改性或修饰的核苷酸,但保留与相应的未改性或未修饰的RNA相同或类似性质或功能的聚核苷酸(例如,化学合成的聚核苷酸)。如上所述,寡核苷酸可键合连接,这导致了与具有磷酸二酯键的RNA分子相比,RNA类似物的水解速率更低。示例性的RNA类似物包括糖-和/或骨架-修饰的核糖核苷酸和/或脱氧核糖核苷酸。这种改性或修饰可进一步包括非核苷酸物质的添加,例如添加到RNA的末端或(在RNA的一个或多个核苷酸的位置处)内部添加。RNA类似物仅需要与能够介导RNA干扰的天然的RNA具有足够的相似度,否则其会降低靶基因的表达。
非人转基因动物的制备方法
可以使用各种任意的方法将转基因引入到非人动物中以创建转基因动物。这种技术是本领域公知的,其包括但不限于原核显微注射、病毒注射和胚胎干细胞及iPs细胞的转化。可以用于创建转基因动物的方法包括但不限于在J.P.Sundberg和T.Ichiki,Eds.,Genetically Engineered Mice Handbook,CRC Press;2006;M.H.Hofker和I.vanDeursen,Eds.,Transgenic Mouse Methods and Protocols,Humana Press,2002;A.L.Joyner,Gene Targeting:A Practical Approach,Oxford University Press,2000;Manipulating the Mouse Embryo:A Laboratory Manual,第三版,Cold Spring HarborLaboratory Press;2002,ISBN-10:0879695919;K.Turksen(Ed.),Embryonic stem cells:methods and protocols in Methods Mol.Biol.2002;185,Humana Press;CurrentProtocols in Stem Cell Biology,ISBN:978047015180;Meyer等,PNAS USA,vol.107(34),15022-15026中描述的那些方法。
在某些实施方案中,可以利用精原干细胞(SSC)、利用转座元件的piggyBacTM流动DNA技术、黄单胞菌属(Xanthamonas)转录激活子类(TAL)核酸酶[aka TAL-效应子核酸酶(TALEN)]及其组合来产生具有位点特异性基因嵌入的转基因改造的动物。
动物特征的定制方法
在一个实施方案中,本发明提供了一种使用本发明的转基因动物定制动物特征的方法。在一个实施方案中,该方法包括:
a)提供转基因动物,其基因组包括:
编码目的蛋白的外源核酸分子,其中所述核酸分子可操作地与启动子连接并受诱导型基因表达系统的调控,所述诱导型基因表达表达系统需要存在诱导剂以激活基因表达;
其中不存在诱导剂时外源核酸分子的表达被抑制;
b)向转基因动物施用诱导剂从而诱导外源核酸分子的表达。
在某些实施方案中,所述外源核酸分子编码目的蛋白,其中所述目的蛋白选自色素蛋白;参与色素合成和/或转运的蛋白质;发光(如荧光)蛋白;参与动物皮肤或毛皮的长度和/或纹理的蛋白质;及参与动物指甲、爪和/或角的纹理、结构强度和/或长度的蛋白质。
在某些实施方案中,根据本发明使用的诱导型基因表达系统包括但不限于,位点特异性重组系统,其包括但不限于Cre-LoxP重组系统、FLP-FRT重组系统;四环素(Tet)-调控转录激活系统;蜕皮激素诱导型系统;热冲击开/关系统;lacO/IPTG系统;cumate阻遏蛋白CymR系统;硝基还原酶系统;香豆霉素/新生霉素调控系统;RheoSwitch配体RSL1系统;双向嵌合核受体表达系统;GAL4系统;固醇或类固醇或合成类固醇诱导/抑制系统;及其组合。
在某些实施方案中,根据本发明使用的基因表达诱导剂包括但不限于,cre重组酶、HTCre;FLP重组酶;四环素或其衍生物例如强力霉素;蜕皮激素;cumate;硝基还原酶类固醇;及其组合。
在一个实施方案中,转基因动物包括受位点特异性重组系统调控的外源核酸分子,并且在向转基因动物施用重组酶蛋白(例如通过局部施用)或施用编码重组酶蛋白的核酸分子(例如通过注射)后,外源核酸分子的表达被诱导。
在一个实施方案中,转基因动物的基因组包括表达受Cre/LoxP重组系统调控的外源核酸分子,其中所述Cre/LoxP重组系统阻止外源核酸分子的表达,其中向转基因动物施用Cre重组酶和/或HTCre(例如通过局部施用)或施用编码Cre重组酶和/或HTCre的核酸分子(例如通过注射)后,诱导外源核酸分子的表达,从而定制动物的目的特征。
在另一具体实施方案中,本发明提供了定制动物特征的方法,所述方法包括:
a)提供转基因动物,所述转基因动物的基因组包含:
第一外源核酸分子,其编码目的蛋白(如着色蛋白),可操作地与第一启动子连接并受loxP位点的调控,其中不存在Cre重组酶蛋白时loxP位点阻止第一外源核酸分子的表达;
第二核酸分子,其编码反向tTA(rtTA),可操作地与第二启动子连接;及
第三核酸分子,其编码Cre重组酶蛋白,在TetO操纵子的调控下可操作地与第三启动子连接。
b)向所述转基因动物施用强力霉素,由此诱导外源核酸分子的表达。
向转基因动物施用的诱导剂可以是与载体组合的形式。术语“载体”涉及与化合物一起施用的稀释剂、佐剂、辅料或赋形剂。这样的药物载体可以是无菌液,例如水和油,包括石油如矿物油、植物油(如花生油、大豆油、芝麻油)和动物油或合成源的油。无菌溶液和葡聚糖水溶液和甘油溶液还能以液体载体的形式施用,特别是可注射用的溶液形式。
可以利用标准途径向转基因动物施用诱导剂和组合物,包括口服、吸入或肠胃外施用,其包括静脉内、皮下、局部、经皮、皮内、透粘膜、腹膜内、肌肉内、囊内、眶内、心脏内、经气管、皮下、角质层下、关节内、囊下、蛛网膜下、脊柱内、硬脑膜外和胸骨内注射、注入和电穿孔,以及作为任意医用设备或医用物质的组分共同施用插入到(临时或永久地)转基因动物内。
具体实施方式
以下是用于解释实践本发明过程和实施方案的实施例。这些实施例不构成对本发明的限制。
实施例1-动物皮肤或毛皮着色的定制
该实施例提供了用于定制动物皮肤或毛皮着色的基因构建体的实施方案
具有定制的皮肤或毛皮着色或图案的动物
具有棕色(“Agouti”染色)肤色的C3H/HeJ鼠经转基因表达以下三个构建体:1)构建体,其包括角蛋白-14特异性启动子、loxp盒(其包括编码红色荧光蛋白的核酸)、色素盒(其包括编码显性黑色(ΔG23)β防御素103蛋白的核酸)和(具有内含子的)SV40多聚腺苷酸化序列;2)构建体,其包括编码反向四环素反式激活子(rtTA)的核酸分子和SV40多聚腺苷酸化序列,所述核酸分子可操作地与角蛋白-14特异性启动子连接,所述启动子启动编码rtTA的核酸的转录;和3)构建体,包括刺鼠信号蛋白(ASP)和牛生长激素(BGH)多聚腺苷酸化序列,ASP可操作地与四环素敏感型启动子(TetO)7连接,所述启动子启动编码ASP的核酸分子的转录。
当将强力霉素施用到基因修饰的小鼠时,小鼠毛皮变成金色(这是出生后毛发颜色的遗传修饰的第一例证)。
利用载体(例如,蛋白质载体,如脂质双层)向转基因的小鼠被刮开的皮肤施用Cre或HTNCre,诱导在Cre和/或HTNCre施用的区域毛皮出现遗传上永远的黑色颜色。根据本发明,出生时具有棕色毛皮的小鼠可以被改变为带任意形状黑色标记的具有金色毛皮的小鼠。例如,可以在金色背景的小鼠毛皮上创建黑色名字或黑色标志。
为了定制动物的皮肤着色,动物可以仅表达着色构建体,并不需要表达图案构建体(如图2所示)。着色和图案的定制可以直接由施用Cre和/或HTNCre来激活。
在一个实施方案中,利用基因修饰动物从而表达图案构建体来创建可遗传的图案。图2示出了图案构建体的一个实施方案。启动子可以是Ripply2启动子或来自特异于体节边界范围的基因的启动子。可替代的启动子可以是Tabby或Ticked启动子。
在一个实施方案中,基因修饰的动物(其基因组包括着色构建体和图案构建体)在背部真皮具有组成型垂直条纹。
复合图案/彩色图案
图3示出了用于在动物皮肤或毛皮中创建复合或彩色图案的基因构建体的某些实施方案。在一个实施方案中,利用包含诱导系统(如具有诱导性机制的启动子)的构建体创建复合图案。如图3所示,仅在组织特异性rtTA启动子中存在强力霉素时,Cre被激活。在动物中,组织特异性启动子的使用维持了体节边界,例如转基因能够仅在发育期被激活。可诱导系统还可以用于创建彩色图案。
根据本发明使用的可诱导系统包括但不限于四环素、蜕皮激素和三苯氧胺(tamoxifen)可诱导系统;FLP-FRT重组系统;和Cre-LOX重组系统。
实施例2-具有定制毛皮颜色和图案的小鼠
该实施例示出了基因修饰的小鼠的创建,其毛皮颜色可通过经皮施用易于跨过细胞膜的HTNCre重组酶而永久地被改变。
图4示出了用于创建小鼠皮肤或毛皮中定制的图案和颜色的基因构建体。所述构建体包含角蛋白l4启动子,其在所有皮肤成纤维细胞中都表达,以引起信号分子β-防御素l03的显性黑色的形式。β-防御素l03的表达被编码环指蛋白(RFP)的LoxP位点切割核酸阻断,RFP用作标记物。
刺鼠(Agouti)小鼠经转基因以表达编码“显性黑色”信号分子β-防御素l03的转基因,通过施用重组酶激活转基因表达。
图5A和B是示出了两种经转基因的小鼠,其中通过皮肤或皮肤内施用HTNCre的载体溶液激活显性黑色素蛋白的表达。在本发明之前,重组酶从未被施用到活的动物体内。
图6示出了向转基因小鼠施用重组酶可能导致毛皮颜色的剂量依赖性改变。刺鼠小鼠毛发的顶端通常的特征在于细胞包括黄褐黑素(A)。如图6所示,通过增加重组酶的剂量,转基因的活化增加,小鼠毛皮色素可能从褐黑素和黑真黑素(B)的混合物转变成纯的真黑素(C),其转化程度为打破黑色素划分的结构(D)。该实施例示出了重组酶的经皮使用更能够导致在转基因的小鼠内更精细地控制毛发颜色。
实施例3-定制肤色和图案用于牛的鉴定
在养牛业中,对于所有权证明、牧业管理、动物移动追踪以及可能是最重要的动物疾病可追溯性来说,用于个体识别的分娩处理的可靠方法变得越来越重要。
该实施例提供了用于牛识别的具有可以用作代码(例如,条形码)的定制肤色和图案的转基因牛。可以使用实施例2中描述的方法来创建转基因牛。如实施例2所示,向转基因小鼠(其基因组包括Cre-loxP重组系统)经皮或皮内施用重组酶,诱导出生后毛色出现定制的变化。
图7示出了用于在牛中创建定制的图案或颜色标志的构建体设计。所述构建体包括编码显性阴性Rab7的核酸分子,其可操作地与MCIR启动子连接并受loxP-STOP-loxP序列的调控。通过施用Cre重组酶可诱导Rab7的表达。TAL核酸酶的使用使得位点特异性基因可以敲入短的同源臂。构建体上的顶体蛋白启动子/EGFP臂允许流式分选基因修饰的精子,从而确保在F1代为100%基因修饰的子代。用于构建体的重要的元件是MC1R(黑素皮质激素受体)启动子,其仅在被重组酶激活时,驱动显性阴性Rab7基因的表达。构建体中各种元件的组合创建了用位点特异性基因敲入改性的牛,该位点特异性敲入允许在牛身上创建永久识别信息。
图8示出了转基因的黑安格斯牛在皮肤中表达定制的识别图案的描述。
分娩处理期间,通过将Cre重组酶施用到基因组包含图7所示的构建体的牛中,可以很容易地创建个体识别信息。同样地,转基因仅表达于动物的皮肤,这可在食品加工过程中除去;因此,在动物皮中创建的牛的识别不应成为政府机构(如美国农业部)的监管问题。
在某些实施方案中,可以使用常规的技术创建位点特异性基因敲入的动物,所述技术包括但不限于精原干细胞(SSC)、利用转座元件的piggyBacTM流动DNA技术、黄单胞菌属转录激活子类(TAL)核酸酶(XTN)[aka TAL-效应子核酸酶(TALENs)]和其组合。
在一个实施方案中,黑色安格斯毛色是用杂合敲入而进行后天修饰的,该杂合敲入使用黑素细胞特异性显性阴性Rab7,其需要关键的黑素生成基因Tyrpl的细胞内转运。
实施例4-用于牛疾病检测的定制肤色和图案
疾病是几乎所有的牛肉和奶制品生产商关注的问题,许多常见疾病可以显著地影响生产,而不必具有明显的临床症状。猝死往往是梭菌属疾病的第一个也是唯一的标志。亚临床乳腺炎是奶制品生产中常见的、花费颇高的问题。甚至有传言说有几乎没有明显的临床症状的疯牛病(BSE)可能会导致牛肉产业严重的经济损失。除了传染病,牛代谢性疾病也可能导致经济损失:1/3的肉牛由于在它们的饮食中存在螯合剂,而患有亚临床铜缺乏症。根据本发明的毛皮或皮肤颜色的变化(例如,使用重组酶激活表皮色特异性标记)可用于识别牛是否患病。
在一个实施方案中,用于检测牛疾病的构建体与图7所示的构建体相同,不同之处在于用可选的重组酶系统(例如,Flp-Frt重组系统)和/或疾病特异性启动子(例如响应NFkB,Ifnγ或铜缺乏靶标的启动子)替代了MC1R启动子。
在一个实施方案中,分娩处理期间,牛涂有重组酶以创建所需的符号。一旦牛出现炎症或代谢应力(由疾病特异性启动子调控的色素蛋白的表达),涂抹区域会改变颜色。牛的疾病检测应用可以通过使用不同的重组酶和重组目标与牛识别应用组合使用。
实施例5-具有定制表皮的狗
作为不同组合的色素基因突变的结果,不同品种的狗具有不同的毛色。哈巴狗具有完整的黑素皮质激素受体,而没有内源性表达“显性黑色”的信号分子β-防御素03。
具有定制毛色和图案的狗可以通过使用如实施例3和4所述用于牛的方法来创建,或者通过如实施例2所示用于小鼠的方法来创建。在一个实施方案中,经转基因的哈巴狗(其基因组包括如图7所示的构建体)具有定制颜色和图案的毛皮,包括虎纹、图形、文字和心形。
由于犬科动物的卵细胞发育系统的特异性,所以狗通常难以被转基因。目前,转基因的狗不能通过体外受精(IVF)而获得。可以利用精原干细胞(SSC)、利用转座元件的piggyBacTM流动DNA技术、黄单胞菌属转录激活子类(TAL)核酸酶(XTNs)[aka TAL-效应子核酸酶(TALENs)]和其组合来创建位点特异性基因敲入的转基因狗。
实施例6-具有“白色”毛色的转基因安格斯牛的创建
在牛中,热应力是引起发病率和死亡率的主要原因,并对养牛业具有不利的经济影响。黑色表皮色大幅度地削弱动物耐受热应力的能力,而黑色表皮的牛显示出其核心体温度的增加超过白色牛的五倍。
黑色安格斯牛是美国最流行的肉牛品种。部分原因是因为它的黑色表皮,黑色安格斯品种耐热应力很差,不适合生活在炎热的气候中。在黑安格斯牛耐热性差的问题一直是养牛业的一个长期存在的问题。
现有的通过育种计划创建白色或浅色毛色的安格斯品种的尝试都失败了,部分原因是因为黑安格斯品种的黑色表皮色的特征在于显性作用的MCIR的组成型活性等位基因,且在牛中不存在下游的显性白色等位基因。通过杂交繁殖创建“白色”表皮安格斯品种需要显性下游等位基因。酪氨酸酶和oca突变偶尔发生,并且创建白化病黑安格斯牛对于创建“白色”表皮安格斯品种是没有用的,因为这种战略需要同系繁殖。
本实施例提供了通过向牛中引入异源、非天然显性白色等位基因而创建具有“白色”表皮安格斯牛的方法。
在一个实施方案中,鸡中的Pmel17的显性白色等位基因(也称为GP100和Silv)被转移到牛中。Pmell7参与黑素体黑色素的组装。具有Pmel17隐性突变的夏洛莱牛有白色毛色,具有显性白色等位基因的牛是优选的。在小鼠、狗和马中发现了显性作用的Pmel17等位基因。可通过将显性突变敲入到隐性Pmel17等位基因,或通过在不同于天然Pmel17等位基因的位点引入非天然显性白色Pmel17来将这些显性白色等位基因转移到牛中。
用于创建具有白色表皮动物(如安格斯牛)的基因包括,但不限于,参与黑素体组装的显性等位基因(如Pmel17、MLPH、显性阴性Rab7等位基因);和编码抑制黑色素向黑素体转运的蛋白的等位基因。
同样地,可通过在编码蛋白的基因中引入显性突变来创建具有白色毛色的转基因动物(如牛),由此得到缺少黑素细胞的白色动物(如牛)。所述蛋白参与发育过程中来自神经嵴的黑素细胞的迁移,
此外,通过向动物中引入siRNA构建体(如miRNA构建体)能够来创建具有白色毛色的转基因动物(如牛),所述构建体抑制编码用于转运黑色素或对于黑素细胞迁移所必须的蛋白的核酸表达。
本发明还提供了具有白色毛色的转基因动物(如牛),其中可以通过真皮或经皮使用重组酶蛋白来创建遗传性黑色标记。
使用上述方式中的任何的组合,牛的非天然基因可用于创建显性超过在黑安格斯中发现的组成型活性MC1R“白色”等位基因,从而在转基因公牛和正常的黑安格斯母牛之间的远系繁殖产生的后代中出现白色或银色毛发。
本文所引用的所有参考文献,包括出版物、专利申请和专利全部以引证的方式并入本文,其程度如同每个参考文献被单独地和具体地指出通过引证的方式并入本文中一样。
除非本文另有说明或与上下文明显矛盾,本发明的上下文中使用的术语“a”和“an”和“the”和类似的指代被解释为包括单数和复数。
除非本文另外指出,本文数值范围的叙述仅旨在用作单独提及每一个单独的值落在该范围内,并且每个单独的值被并入说明书中,就好像它在本文中单独列举一样。除非另有说明,本文提供的所有精确值代表相应近似值(例如,关于特定因子或测量提供的所有精确的示例性值可以被认为也提供相应的近似测量值,在适当情况下,由“约”所修饰)。
除非另有说明,本文所使用的任何和所有实施例或示例性语言(例如,“如”)仅仅是为了更好地阐明本发明,并不构成对本发明范围的限制。除非尽可能明确陈述,说明书中的任何语言不应被解释为表示任何元素对于实践本发明而言是必不可少的。
此处的描述的本发明的任何方面或实施方案使用的术语,如“包含”,“具有”,“包括”或“含有”参照一个以上的元素意在支持本发明的类似的方面或实施方案的“包括,”基本上由,或“基本包含”特定的一个或多个元素,除非另有说明或上下文明显矛盾(例如,本文描述为包含特定元素的组合物应当理解为也描述了由所述元素组成的组合物,除非另有说明或通过上下文明显矛盾)。
但是应当理解的是,这里所描述的实施例和实施方案仅用于说明性的目的,并且其各种修改或变化都将被建议给本领域技术人员,它们都包括在本申请的精神和范围内。
参考文献
1.Candille SI,Kaelin CB,Cattanach BM,Yu B,Thompson DA,Nix MA,KernsJA,Schmutz SM,Millhauser GL,and Barsh GS.A-defensin mutation causes blackcoat color in domestic dogs.Science 318:1418-1423,2007.
2.Kistner et al.,Doxycycline-mediated quantitative and tissue-specific control of gene expression in transgenic mice,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.Vol.93,pp.10933-10938,1996.
3.Nolden L,Edenhofer F,Haupt S,Koch P,Wunderlich FT,Siemen H,andBrustle O.Site-specific recombination in human embryonic stem cells inducedby cell-permeant Cre recombinase.Nat Methods 3:461-467,2006.
4.Nagy,Cre recombinase:the universal reagent for genome tailoring,Genesis 26:99-109,2000.

Claims (10)

1.一种具有白色或近白色表皮或毛皮的非人转基因动物的细胞,其中所述转基因动物包含:
外源核酸分子,其可操作地与启动子连接,其中所述外源核酸分子编码显性白色Pmel17蛋白质;和/或
编码目的序列的外源抑制性RNA,其可操作地与启动子连接,其中所述编码目的序列的外源抑制性RNA干扰野生型动物核酸分子的表达,其中所述野生型动物核酸分子编码黑素皮质激素受体(MC1R)蛋白质。
2.根据权利要求1所述的细胞,其中所述动物是狗、猫、小鼠、大鼠、豚鼠、仓鼠、马、牛、猪、绵羊、山羊、鸭子、鹅、鸡、灵长类动物、鱼、蝾螈、蛇、蜥蜴、狐狸、黄鼠狼、兔子、河狸、貂、水獭、海豹、草原狼、灰鼠、鹿、麝鼠和负鼠。
3.根据权利要求2所述的细胞,其中所述貂是水貂或黑貂。
4.根据权利要求1所述的细胞,其中所述动物是牛科动物。
5.根据权利要求4所述的细胞,其中所述动物是黑安格斯品种的牛。
6.根据权利要求1所述的细胞,其中表达所述显性白色Pmel17蛋白质的等位基因来自原鸡。
7.根据权利要求1所述的细胞,其中所述启动子选自通用启动子、组成型启动子、组织特异性启动子和诱导型启动子。
8.根据权利要求1所述的细胞,其中所述启动子选自巨细胞病毒(CMV)启动子、CMV-鸡β肌动蛋白启动子、泛素启动子、JeT启动子、SV40 启动子、β球蛋白启动子、延伸因子1 α(EF1-α)启动子、RSV 启动子、Ripply 2启动子、Ticked启动子、Tabby启动子、Mo-MLV-LTR 启动子、Rosa26 启动子、角质形成细胞特异性启动子、黑素细胞特异性启动子、基质细胞特异性启动子和毛乳头特异性启动子。
9.根据权利要求1所述的细胞,其中所述外源核酸分子的表达或外源抑制性RNA编码序列的表达受以下诱导型系统的调控,所述诱导型系统选自Cre-LoxP重组系统、FLP-FRT 重组系统、四环素(Tet)-调控转录激活系统、蜕皮激素诱导型系统、热冲击开/关系统、lacO/IPTG系统、cumate阻遏蛋白CymR系统、硝基还原酶系统、香豆霉素/新生霉素调控系统、RheoSwitch配体RSL1系统、双向嵌合核受体表达系统、GAL4 系统、固醇诱导/抑制系统、类固醇诱导/抑制系统、合成类固醇诱导/抑制系统;及其组合。
10.根据权利要求9所述的细胞,其中所述诱导型系统包括Cre-LoxP重组系统。
CN201480024934.7A 2013-03-15 2014-03-15 具有定制特征的转基因动物 Expired - Fee Related CN105357960B (zh)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US13/837,405 US20130212723A1 (en) 2012-02-15 2013-03-15 Transgenic animals with customizable traits
US13/837,405 2013-03-15
PCT/US2014/029918 WO2014145196A2 (en) 2013-03-15 2014-03-15 Transgenic animals with customizable traits

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN105357960A CN105357960A (zh) 2016-02-24
CN105357960B true CN105357960B (zh) 2018-02-16

Family

ID=51538427

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201480024934.7A Expired - Fee Related CN105357960B (zh) 2013-03-15 2014-03-15 具有定制特征的转基因动物

Country Status (9)

Country Link
EP (1) EP2967017A4 (zh)
JP (1) JP2016512697A (zh)
CN (1) CN105357960B (zh)
AU (3) AU2014233317B2 (zh)
BR (1) BR112015023414A2 (zh)
CA (1) CA2906936A1 (zh)
HK (1) HK1214732A1 (zh)
MX (1) MX2015013253A (zh)
WO (1) WO2014145196A2 (zh)

Families Citing this family (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US10779518B2 (en) 2013-10-25 2020-09-22 Livestock Improvement Corporation Limited Genetic markers and uses therefor
CN107022549B (zh) * 2017-04-19 2021-06-01 华中农业大学 黄颡鱼β防御素基因及其β防御素抗菌肽及其应用
CN107177630A (zh) * 2017-05-09 2017-09-19 华南农业大学 一种无外源标记基因的抗pcv2转基因猪制备方法
CN111206042B (zh) * 2020-02-25 2021-08-31 中国科学院昆明植物研究所 一种表达酮式类胡萝卜素的融合基因、重组载体及其应用
CN113564186B (zh) * 2021-07-16 2023-07-25 山西大学 苹果黄蚜Tre基因及其核酸干扰剂制备方法与应用

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ATE312916T1 (de) * 1998-10-27 2005-12-15 Anticancer Inc Herstellung eines retrovirus, welches den mel- lokus von streptomyces enthält, sowie dessen expression in säugetierzellen
WO2002086098A2 (en) * 2001-03-05 2002-10-31 University Of Virginia Patent Foundation A lac operator-repressor system
EP2342343A2 (en) * 2008-09-05 2011-07-13 Aarhus Universitet Nuclear receptor sensor system in transgenic animal
JP6282600B2 (ja) * 2012-02-15 2018-02-21 エージージェネティクス インコーポレイテッド カスタマイズ可能な形質を有するトランスジェニック動物

Also Published As

Publication number Publication date
EP2967017A2 (en) 2016-01-20
AU2017213487B2 (en) 2019-07-04
CA2906936A1 (en) 2014-09-18
WO2014145196A3 (en) 2015-02-19
AU2019204084A1 (en) 2019-07-04
HK1214732A1 (zh) 2016-08-05
WO2014145196A2 (en) 2014-09-18
BR112015023414A2 (pt) 2017-11-28
JP2016512697A (ja) 2016-05-09
AU2017213487A1 (en) 2017-08-31
AU2014233317A1 (en) 2015-10-29
AU2014233317B2 (en) 2017-08-31
EP2967017A4 (en) 2016-11-09
MX2015013253A (es) 2016-04-07
CN105357960A (zh) 2016-02-24

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN104202970B (zh) 具有可定制性状的转基因动物
CN105357960B (zh) 具有定制特征的转基因动物
US8232450B1 (en) Purple transgenic fluorescent ornamental fish
Lievens et al. Genetically modified animals: Options and issues for traceability and enforcement
CN104619848A (zh) 细胞转染方法
US20150013025A1 (en) Transgenic animals with customizable traits
US20150320019A1 (en) Transgenic animals with cutomizable traits
CN108882696A (zh) 通过遗传互补对人源化肾脏的工程改造
CN106978416A (zh) 一种基因定位整合表达系统及其应用
US8546644B2 (en) Recombinant gene which enhances the ability of fish to tolerate low dissolved oxygen stress and the use thereof
Gannon et al. Transgenic farm animals
JP4811765B2 (ja) 外来遺伝子の誘導発現の制御が可能な発現ベクター
CN105063088B (zh) 一种生态安全型转基因荧光观赏鱼的研制方法
US20160044901A1 (en) Transgenic Animals With Customizable Traits
US20230200363A1 (en) Transgenic fluorescent ornamental amphibians
US20230105342A1 (en) Method for producing recombinant proteins in insects
US20210127650A1 (en) Method for producing recombinant proteins in insects
Nguyen et al. Red Fluorescent Protein Expression in Transgenic Founder of Angelfish (Pterophyllum sp) Driven by Zebrafish Myosin Light Chain 2 Promoter
Proudman et al. The quest for transgenic poultry: birds are not mice with feathers
CN1217384A (zh) 培育快速生长转基因动物的方法
JP2014233223A (ja) 転写制御ポリヌクレオチド

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant
CF01 Termination of patent right due to non-payment of annual fee

Granted publication date: 20180216

Termination date: 20200315

CF01 Termination of patent right due to non-payment of annual fee