CN104798174A - 使用多个光谱以不同碰撞能量进行化合物识别 - Google Patents

使用多个光谱以不同碰撞能量进行化合物识别 Download PDF

Info

Publication number
CN104798174A
CN104798174A CN201380060412.8A CN201380060412A CN104798174A CN 104798174 A CN104798174 A CN 104798174A CN 201380060412 A CN201380060412 A CN 201380060412A CN 104798174 A CN104798174 A CN 104798174A
Authority
CN
China
Prior art keywords
ion
mass
spectrum
fragment ion
instrument parameter
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN201380060412.8A
Other languages
English (en)
Other versions
CN104798174B (zh
Inventor
大卫·M·考克斯
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
DH Technologies Development Pte Ltd
Original Assignee
DH Technologies Development Pte Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by DH Technologies Development Pte Ltd filed Critical DH Technologies Development Pte Ltd
Publication of CN104798174A publication Critical patent/CN104798174A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN104798174B publication Critical patent/CN104798174B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • H—ELECTRICITY
    • H01—ELECTRIC ELEMENTS
    • H01J—ELECTRIC DISCHARGE TUBES OR DISCHARGE LAMPS
    • H01J49/00—Particle spectrometers or separator tubes
    • H01J49/0027—Methods for using particle spectrometers
    • H01J49/0031—Step by step routines describing the use of the apparatus
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16C—COMPUTATIONAL CHEMISTRY; CHEMOINFORMATICS; COMPUTATIONAL MATERIALS SCIENCE
    • G16C20/00—Chemoinformatics, i.e. ICT specially adapted for the handling of physicochemical or structural data of chemical particles, elements, compounds or mixtures
    • G16C20/20—Identification of molecular entities, parts thereof or of chemical compositions
    • H—ELECTRICITY
    • H01—ELECTRIC ELEMENTS
    • H01J—ELECTRIC DISCHARGE TUBES OR DISCHARGE LAMPS
    • H01J49/00—Particle spectrometers or separator tubes
    • H01J49/004—Combinations of spectrometers, tandem spectrometers, e.g. MS/MS, MSn
    • H01J49/0045—Combinations of spectrometers, tandem spectrometers, e.g. MS/MS, MSn characterised by the fragmentation or other specific reaction

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
  • Computing Systems (AREA)
  • Theoretical Computer Science (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • Other Investigation Or Analysis Of Materials By Electrical Means (AREA)

Abstract

本发明提供用于使用多个光谱进行化合物识别的系统及方法，所述多个光谱随影响碎片离子的强度的可变仪器参数而变化。使用处理器从质谱仪接收至少一个离子的随可变仪器参数而变化的多个所获取碎片离子光谱。通过使用所述处理器将所获取碎片离子与已知碎片离子的质量强度相对于所述可变仪器参数的改变速率进行比较来识别所述至少一个离子。具体来说，将针对所获取碎片离子依据所述多个所获取碎片离子光谱计算的一或多个所获取改变速率与针对已知化合物的数据库中的一或多个已知化合物的一或多个所存储碎片离子计算的一或多个已知改变速率进行比较。

Description

使用多个光谱以不同碰撞能量进行化合物识别
相关申请案的交叉参考
本申请案主张2012年12月20日提出申请的序列号为61/740,369的美国临时专利申请案的权益，所述临时专利申请案的内容以全文引用的方式并入本文中。
背景技术
介绍
依据串联质谱法或质谱/质谱法(MS/MS)识别化合物，光谱通常为模糊的。现有算法(点积算法、基于概率的算法等)给出表示所获取光谱与库光谱之间的相似度的分数。然而，要知晓何为良好的分数是困难的。换句话说，要知晓何种分数将可信地识别化合物是困难的。
一些化合物具有极少或不具有区分碎片，此导致不表示识别的可信度的分数。举例来说，不具有碎片的化合物将得到极高的符合率与纯度分数，但具有不良碎裂的许多其它化合物也将如此。这使得难以将误肯定与真命中区分开。
在其它情形中，中等丰富的碎裂图案具有来自共洗脱化合物的干扰，此不利地影响分数。这使得难以知晓何种分数适于可信地识别化合物。
历史上，最常对气相色谱-质谱联用(GC-MS)系统电子撞击(EI)源使用库搜索。这些系统及源具有极良好定义的能量，从而导致不同实验室当中且甚至跨越仪器模型的极可再现的光谱。针对液相色谱-串联质谱联用(LC-MS/MS)光谱，碎裂图案在很大程度上取决于所使用的碰撞能量(CE)且可在仪器之间稍微变化。这使得难以设置适当分数以跨越不同实验室识别化合物。
发明内容
揭示一种用于使用多个光谱进行化合物识别的系统，所述多个光谱随影响碎片离子的强度的可变仪器参数而变化。质谱仪分析样本。在每一分析循环内，所述质谱仪选择至少一个离子，且使用影响碎片离子的所述强度的可变仪器参数的两个或两个以上值将所述离子碎裂。产生随所述可变仪器参数而变化的多个碎片离子光谱。
处理器从所述质谱仪接收所述至少一个离子的所述多个所获取碎片离子光谱。所述处理器通过将所获取碎片离子与已知碎片离子的质量强度相对于所述可变仪器参数的改变速率进行比较来识别所述至少一个离子。具体来说，将针对所获取碎片离子依据所述多个所获取碎片离子光谱计算的一或多个所获取改变速率与针对已知化合物的数据库中的一或多个已知化合物的一或多个所存储碎片离子计算的一或多个已知改变速率进行比较。已知化合物的所述数据库针对每一已知化合物的每一碎片离子包含也随所述可变仪器参数而变化的多个已知碎片离子光谱。
揭示一种用于使用多个光谱进行化合物识别的方法，所述光谱随影响碎片离子的强度的可变仪器参数而变化。使用处理器从质谱仪接收至少一个离子的随可变仪器参数而变化的多个所获取碎片离子光谱。
通过使用所述处理器将所获取碎片离子与已知碎片离子的质量强度相对于所述可变仪器参数的改变速率进行比较来识别所述至少一个离子。具体来说，将针对所获取碎片离子依据所述多个所获取碎片离子光谱计算的一或多个所获取改变速率与针对已知化合物的数据库中的一或多个已知化合物的一或多个所存储碎片离子计算的一或多个已知改变速率进行比较。
揭示一种包含非暂时性及有形计算机可读存储媒体的计算机程序产品，所述计算机可读存储媒体的内容包含具有在处理器上执行以便执行用于使用多个光谱进行化合物识别的方法的指令的程序，所述多个光谱随影响碎片离子的强度的可变仪器参数而变化。在各种实施例中，所述方法包含提供一系统，其中所述系统包括一或多个相异软件模块，且其中所述相异软件模块包括测量模块及分析模块。
所述测量模块使用所述测量模块从质谱仪接收至少一个离子的随可变仪器参数而变化的多个所获取碎片离子光谱。所述分析模块通过将所获取碎片离子与已知碎片离子的质量强度相对于所述可变仪器参数的改变速率进行比较来识别所述至少一个离子。具体来说，将针对所获取碎片离子依据所述多个所获取碎片离子光谱计算的一或多个所获取改变速率与针对已知化合物的数据库中的一或多个已知化合物的一或多个所存储碎片离子计算的一或多个已知改变速率进行比较。
本文中陈述申请人的教示的这些特征及其它特征。
附图说明
所属领域的技术人员将理解，下文所描述的图式仅用于图解说明目的。所述图式并不打算以任何方式限制本发明教示的范围。
图1是图解说明可在其上实施本发明教示的实施例的计算机系统的框图。
图2是展示根据各种实施例的用于使用多个光谱进行化合物识别的系统的示意图，所述多个光谱随影响碎片离子的强度的可变仪器参数而变化。
图3是展示根据各种实施例的用于使用多个光谱进行化合物识别的方法的示范性流程图，所述多个光谱随影响碎片离子的强度的可变仪器参数而变化。
图4是根据各种实施例的包含一或多个相异软件模块，执行用于使用多个光谱进行化合物识别的方法的系统的示意图，所述多个光谱随影响碎片离子的强度的可变仪器参数而变化。
在详细描述本发明教示的一或多项实施例之前，所属领域的技术人员将了解，本发明教示在其应用方面并不限于以下详细描述中所陈述或图式中所图解说明的构造细节、组件布置及步骤安排。此外，应理解，本文中所使用的措辞及术语是用于描述的目的且不应视为具限制性。
具体实施方式
计算机实施的系统
图1是图解说明可在其上实施本发明教示的实施例的计算机系统100的框图。计算机系统100包含总线102或用于传递信息的其它通信机构，及与总线102耦合以用于处理信息的处理器104。计算机系统100还包含耦合到总线102以用于存储待由处理器104执行的指令的存储器106，所述存储器可为随机存取存储器(RAM)或其它动态存储装置。存储器106还可用于在待由处理器104执行的指令的执行期间存储临时变量或其它中间信息。计算机系统100进一步包含只读存储器(ROM)108或耦合到总线102以用于存储用于处理器104的静态信息及指令的其它静态存储装置。存储装置110(例如磁盘或光盘)经提供且耦合到总线102以用于存储信息及指令。
计算机系统100可经由总线102耦合到显示器112(例如阴极射线管(CRT)或液晶显示器(LCD))以向计算机用户显示信息。包含字母数字键及其它键的输入装置114耦合到总线102以用于将信息及命令选择传递到处理器104。另一类型的用户输入装置为用于将方向信息及命令选择传递到处理器104且用于控制显示器112上的光标移动的光标控制件116，例如鼠标、轨迹球或光标方向键。此输入装置通常具有在两个轴(第一轴(即，x)及第二轴(即，y))上的两个自由度，此允许所述装置规定在平面中的位置。
计算机系统100可执行本发明教示。依照本发明教示的特定实施方案，由计算机系统100响应于处理器104执行存储器106中所含有的一或多个指令的一或多个序列而提供结果。可将此类指令从另一计算机可读媒体(例如存储装置110)读取到存储器106中。存储器106中所含有的指令序列的执行致使处理器104执行本文中所描述的过程。或者，可代替或组合软件指令而使用硬连线电路来实施本发明教示。因此，本发明教示的实施方案并不限于硬件电路与软件的任何特定组合。
如本文中所使用的术语“计算机可读媒体”是指参与将指令提供到处理器104以供执行的任何媒体。此媒体可呈许多形式，包含但不限于非易失性媒体、易失性媒体及传输媒体。举例来说，非易失性媒体包含光盘或磁盘，例如存储装置110。易失性媒体包含动态存储器，例如存储器106。传输媒体包含同轴电缆、铜线及光纤，包含包括总线102的导线。
举例来说，常见形式的计算机可读媒体包含软盘、柔性磁盘、硬盘、磁带或任何其它磁性媒体、CD-ROM、数字视频光盘(DVD)、蓝光光盘、任何其它光学媒体、拇指驱动器、存储器卡、RAM、PROM及EPROM、快闪EPROM、任何其它存储器芯片或盒式磁盘，或者计算机可从其读取的任何其它有形媒体。
在将一或多个指令的一或多个序列载运到处理器104以供执行时，可涉及各种形式的计算机可读媒体。举例来说，最初可在远程计算机的磁盘上载运指令。所述远程计算机可将指令加载到其动态存储器中并使用调制解调器经由电话线发送指令。在计算机系统100本地的调制解调器可在电话线上接收数据并使用红外发射器将数据转换为红外信号。耦合到总线102的红外检测器可接收在红外信号中载运的数据并将数据放置于总线102上。总线102将数据载运到存储器106，处理器104从存储器106检索并执行指令。由存储器106接收的指令在由处理器104执行之前或之后可任选地存储于存储装置110上。
根据各种实施例，经配置以由处理器执行以执行一方法的指令存储于计算机可读媒体上。所述计算机可读媒体可为存储数字信息的装置。举例来说，计算机可读媒体包含如在存储软件的领域中已知的光盘只读存储器(CD-ROM)。计算机可读媒体由适合于执行经配置而被执行的指令的处理器存取。
已出于图解说明及描述的目的而呈现本发明教示的各种实施方案的以下描述。其并非穷尽性的且不会将本发明教示限制于所揭示的精确形式。鉴于以上教示，可能存在若干修改形式及变化形式或可从本发明教示的实践获取所述修改形式及变化形式。另外，所描述实施方案包含软件，但本发明教示可实施为硬件与软件的组合或单独以硬件来实施。可用面向对象的编程系统及非面向对象的编程系统两者来实施本发明教示。
用于化合物识别的系统及方法
如上文所描述，尝试依据串联质谱光谱来识别化合物通常可产生模糊结果。这可能是由于在对所获取光谱与已知化合物的所存储光谱库或数据库的比较进行评分方面的困难所致。另外，例如液相色谱-串联质谱联用(LC-MS/MS)等的一些串联质谱方法产生在很大程度上取决于例如碰撞能量(CE)等的可变仪器参数的光谱。因此，难以跨越不同仪器或实验室将来自一个仪器的结果进行比较。
在各种实施例中，通过将一或多个所获取质量强度相对于一可变仪器参数的改变速率与一或多个数据库所存储质量强度相对于同一可变仪器参数的改变速率进行比较来识别化合物。所属领域的技术人员可了解，质量强度还可包含质荷比(m/z)强度。可变仪器参数为影响碎片离子的强度的参数。
将质量强度相对于可变仪器参数的改变速率进行比较使识别化合物的过程较不模糊。由于改变速率含有更多信息，因此模糊性减小。改变速率含有来自质量强度的至少两个测量值的信息。按惯例，对质量强度的比较或对质量是否在彼处的确定仅基于质量强度的一个测量值。
此外，使用质量强度的改变速率来识别化合物改进跨越不同仪器或实验室的结果的一致性。如果不同仪器或实验室使用不同可变仪器参数值，那么其可测量所关注化合物的不同质量强度绝对值。所关注化合物的这些质量强度绝对值也可不同于已知化合物的存储于光谱的数据库中的质量强度绝对值。
然而，只要不同仪器或实验室产生与所搜索的已知化合物的光谱的数据库共享共同的可变仪器参数值范围的质量强度值，结果便将为一致的。这是因为化合物的质量强度值相对于共同的可变仪器参数值范围的改变速率将跨越所有仪器、实验室及在所述共同范围内已知化合物的光谱的数据库为类似的。这种情形即便在以下情况下也是真实的：跨越那些仪器、实验室的质量强度绝对值与已知化合物化合物的光谱的数据库在所述共同范围内的特定值处可能不同。
在各种实施例中，碰撞能量(CE)为用于依据串联质谱光谱识别化合物的可变仪器参数。CE为影响碎片离子的强度的参数。快速串联质谱仪可在仪器的单个循环时间内执行多个碎裂离子扫描或产物离子扫描。因此，可每循环使用数个不同CE来将所关注化合物或前驱物离子碎裂，从而每循环产生多个产物离子光谱。一组经组合产物离子光谱提供关于每一碎片或产物离子的质量强度如何相对于CE而改变的信息。
可计算每一产物离子的质量强度相对于CE的改变速率。可使用一或多个产物离子的质量强度相对于CE的改变速率来识别前驱物离子。可将针对一或多个产物离子计算的一或若干改变速率与已知化合物的产物离子的一或若干改变速率进行比较。
已知化合物的一些常规库或数据库包含使用不同碰撞能量收集的产物离子的光谱。此类常规库用于将可能已经以不同CE收集的来自不同仪器的数据进行比较。因此，其经设计以用于一次比较一个光谱。换句话说，其并不易于提供产物离子相对于CE的改变速率。然而，所有所述数据在此数据库中均是固有的。因此，如果也计算一或多个产物离子库的改变速率，那么甚至可使用一些常规库来依据改变速率识别化合物。
可以多种不同方式将所获取产物离子的质量强度相对于CE或质量强度随CE而变化的改变速率与已知化合物的光谱库的所存储产物离子的随CE而变化的质量强度进行比较。举例来说，可针对每一产物离子绘制质量强度对CE的图，且可对照库数据比较或测量这些击穿曲线的形状。
在另一实施例中，可将所获取数据转换成图像。接着，使用图像比较工具来将匹配评分。举例来说，图像的元素为质量、质量强度与CE的组合。CE的额外维度使得显著较容易提取多个化合物识别。举例来说，使用共同图像匹配算法(互相关匹配)，可能可信地识别一种化合物，从图像移除这些特征且接着识别其它化合物。
虽然本文中的实例描述通过使用质量强度随CE而变化的改变速率而依据串联质谱仪数据识别化合物的系统及方法，但各种实施例并不限于串联质谱法或随CE而变化的改变速率。
用于化合物识别的系统
图2是展示根据各种实施例的用于使用多个光谱进行化合物识别的系统200的示意图，所述多个光谱随影响碎片离子的强度的可变仪器参数而变化。系统200包含质谱仪210、处理器220及数据库230。
质谱仪210可包含执行一或多个质量分析的一或多个物理质量分析器。串联质谱仪的质量分析器可包含但不限于飞行时间(time-of-flight，TOF)质量分析器、四极质量分析器、离子陷阱质量分析器、线性离子陷阱质量分析器、轨道陷阱质量分析器或傅里叶变换质量分析器。质谱仪210还可包含一或多个分离装置(未展示)。所述分离装置可执行包含但不限于液相色谱法、气相色谱法、毛细管电泳或离子迁移的分离技术。质谱仪210可包含分别在空间或时间上的分离质谱阶段或步骤。
处理器220可为但不限于计算机、微处理器或能够将控制信号及数据发送到质谱仪210以及从质谱仪210接收控制信号及数据并处理数据的任何装置。处理器220与质谱仪210通信。
数据库230可包含磁性存储装置或电子存储装置。数据库230可为处理器220的存储器的部分或其可为单独存储器。除硬件组件之外，数据库230还可包含软件组件。
质谱仪210分析样本。在每一分析循环内，质谱仪210选择至少一个离子，且使用影响碎片离子的强度的可变仪器参数的两个或两个以上值将所述离子碎裂。产生随可变仪器参数而变化的多个碎片离子光谱。
举例来说，质谱仪210使用质谱/质谱法(MS/MS)来分析样本。在各种替代实施例中，举例来说，光谱仪210使用质谱/质谱/质谱法(MS3)来分析样本。举例来说，可变仪器参数为碰撞能量(CE)。
数据库230存储已知化合物的随可变仪器参数的变量而变化的碎片离子光谱。数据库230针对每一已知化合物的每一碎片离子包含随可变仪器参数而变化的多个碎片离子光谱。
处理器220从质谱仪210接收至少一个离子的多个所获取碎片离子光谱。举例来说，处理器220在获取后步骤中接收多个所获取碎片离子光谱。处理器220通过将所获取碎片离子与已知碎片离子的质量强度相对于可变仪器参数的改变速率进行比较来识别至少一个离子。更具体来说，处理器220将针对一或多个所获取碎片离子依据多个所获取碎片离子光谱计算的质量强度相对于可变仪器参数的一或多个所获取改变速率与针对数据库230中的一或多个已知化合物的一或多个所存储碎片离子计算的质量强度相对于可变仪器参数的一或多个已知改变速率进行比较。
在各种实施例中，处理器220通过将所获取碎片离子与已知碎片离子的改变速率的比较评分、基于比较的分数计算已知化合物的列表的分数及从所述列表选择已知化合物来识别至少一个离子。
在各种实施例中，将改变速率进行比较涉及将所获取击穿曲线与已知击穿曲线进行比较。更具体来说，将针对一或多个所获取碎片离子依据多个所获取碎片离子光谱计算的质量强度对可变仪器参数的一或多个所获取击穿曲线与针对数据库230中的一或多个已知化合物的一或多个所存储碎片离子计算的质量强度对可变仪器参数的一或多个已知击穿曲线进行比较。
在各种实施例中，将改变速率进行比较涉及将碎片离子数据的所获取图像与已知图像进行比较。举例来说，每一图像的每一元素为质量、质量强度与碰撞能量(CE)的组合。更具体来说，将针对一或多个所获取碎片离子依据多个所获取碎片离子光谱计算的一或多个所获取图像与针对数据库230中的一或多个已知化合物的一或多个所存储碎片离子计算的一或多个已知图像进行比较。
用于化合物识别的方法
图3是展示根据各种实施例的用于使用多个光谱进行化合物识别的方法300的示范性流程图，所述多个光谱随影响碎片离子的强度的可变仪器参数而变化。
在方法300的步骤310中，使用处理器从质谱仪接收至少一个离子的随可变仪器参数而变化的多个所获取碎片离子光谱。依据由质谱仪进行的对样本的分析产生多个所获取碎片离子光谱。在每一分析循环内，质谱仪选择至少一个离子，且使用影响碎片离子的强度的可变仪器参数的两个或两个以上值将所述至少一个离子碎裂，从而产生多个所获取碎片离子光谱。
在步骤320中，通过使用处理器将所获取碎片离子与已知碎片离子的质量强度相对于可变仪器参数的改变速率来识别至少一个离子。将针对所获取碎片离子依据多个所获取碎片离子光谱计算的一或多个所获取改变速率与针对已知化合物的数据库中的一或多个已知化合物的一或多个所存储碎片离子计算的一或多个已知改变速率进行比较。已知化合物的数据库针对每一已知化合物的每一碎片离子包含也随可变仪器参数而变化的多个已知碎片离子光谱。
用于化合物识别的计算机程序产品
在各种实施例中，计算机程序产品包含有形计算机可读存储媒体，所述计算机可读存储媒体的内容包含具有在处理器上执行以便执行用于使用多个光谱进行化合物识别的方法的指令的程序，所述多个光谱随影响碎片离子的强度的可变仪器参数而变化。此方法由包含一或多个相异软件模块的系统执行。
图4是根据各种实施例的包含一或多个相异软件模块，执行用于使用多个光谱进行化合物识别的方法的系统400的示意图，所述多个光谱随影响碎片离子的强度的可变仪器参数而变化。系统400包含测量模块410及分析模块420。
测量模块410使用测量模块从质谱仪接收至少一个离子的随可变仪器参数而变化的多个所获取碎片离子光谱。依据由质谱仪进行的对样本的分析产生多个所获取碎片离子光谱。在每一分析循环内，质谱仪选择至少一个离子，且使用影响碎片离子的强度的可变仪器参数的两个或两个以上值将所述至少一个离子碎裂，从而产生多个所获取碎片离子光谱。
分析模块420通过将所获取碎片离子与已知碎片离子的质量强度相对于可变仪器参数的改变速率进行比较来识别至少一个离子。将针对所获取碎片离子依据多个所获取碎片离子光谱计算的一或多个所获取改变速率与针对已知化合物的数据库中的一或多个已知化合物的一或多个所存储碎片离子计算的一或多个已知改变速率进行比较。已知化合物的数据库针对每一已知化合物的每一碎片离子包含也随可变仪器参数而变化的多个已知碎片离子光谱。
尽管连同各种实施例一起描述了本发明教示，但并不打算将本发明教示限制于此类实施例。相反，本发明教示涵盖各种替代方案、修改形式及等效形式，如所属领域的技术人员将了解。
此外，在描述各种实施例时，说明书可能已将方法及/或过程呈现为特定步骤序列。然而，在所述方法或过程不依赖于本文中所陈述的特定步骤次序的方面来说，所述方法或过程不应限制于所描述的特定步骤序列。如所属领域的技术人员将了解，其它步骤序列可为可能的。因此，说明书中所陈述的特定步骤次序不应理解为对权利要求书的限制。另外，针对于所述方法及/或过程的技术方案不应限制于以所书写的次序执行其步骤，且所属领域的技术人员可容易了解，所述序列可变化且仍保持在各种实施例的精神及范围内。

Claims (15)

1.一种用于使用多个光谱进行化合物识别的系统，所述多个光谱随影响碎片离子的强度的可变仪器参数而变化，所述系统包括：
质谱仪，其分析样本且在所述质谱仪的每一循环内选择至少一个离子，且使用影响碎片离子的所述强度的可变仪器参数的两个或两个以上值将所述至少一个离子碎裂，从而产生随所述可变仪器参数而变化的多个所获取碎片离子光谱；
已知化合物的数据库，其针对每一已知化合物的每一碎片离子包含随所述可变仪器参数而变化的多个碎片离子光谱；及
处理器，其与所述质谱仪及所述数据库通信，所述处理器
从所述质谱仪接收所述至少一个离子的所述多个所获取碎片离子光谱，及
通过将针对一或多个所获取碎片离子依据所述多个所获取碎片离子光谱计算的质量强度相对于所述可变仪器参数的一或多个所获取改变速率与针对所述数据库中的一或多个已知化合物的一或多个所存储碎片离子计算的质量强度相对于所述可变仪器参数的一或多个已知改变速率进行比较来识别所述至少一个离子。
2.根据前述系统权利要求的任一组合所述的系统，其中所述质谱仪使用串联质谱法或质谱/质谱法MS/MS来分析所述样本。
3.根据前述系统权利要求的任一组合所述的系统，其中所述质谱仪使用质谱/质谱/质谱法MS3来分析所述样本。
4.根据前述系统权利要求的任一组合所述的系统，其中所述可变仪器参数包括碰撞能量CE。
5.根据前述系统权利要求的任一组合所述的系统，其中将所述一或多个所获取改变速率与所述一或多个已知改变速率进行比较包括
将针对一或多个所获取碎片离子依据所述多个所获取碎片离子光谱计算的质量强度对所述可变仪器参数的一或多个所获取击穿曲线与针对所述数据库中的一或多个已知化合物的一或多个所存储碎片离子计算的质量强度对所述可变仪器参数的一或多个已知击穿曲线进行比较。
6.根据前述系统权利要求的任一组合所述的系统，其中将所述一或多个所获取改变速率与所述一或多个已知改变速率进行比较包括
将针对一或多个所获取碎片离子依据所述多个所获取碎片离子光谱计算的一或多个所获取图像与针对所述数据库中的一或多个已知化合物的一或多个所存储碎片离子计算的一或多个已知图像进行比较。
7.根据前述系统权利要求的任一组合所述的系统，其中所述一或多个所获取图像中的每一图像的每一元素为质量、质量强度与碰撞能量CE的组合，且所述一或多个已知图像中的每一图像的每一元素为质量、质量强度与碰撞能量CE的组合。
8.一种用于使用多个光谱进行化合物识别的方法，所述多个光谱随影响碎片离子的强度的可变仪器参数而变化，所述方法包括：
使用处理器从质谱仪接收至少一个离子的随可变仪器参数而变化的多个所获取碎片离子光谱，其中所述质谱仪分析样本且在所述质谱仪的每一循环内选择所述至少一个离子，且使用影响碎片离子的所述强度的所述可变仪器参数的两个或两个以上值将所述至少一个离子碎裂，从而产生所述多个所获取碎片离子光谱；及
通过使用所述处理器将针对一或多个所获取碎片离子依据所述多个所获取碎片离子光谱计算的质量强度相对于所述可变仪器参数的一或多个所获取改变速率与针对已知化合物的数据库中的一或多个已知化合物的一或多个所存储碎片离子计算的质量强度相对于所述可变仪器参数的一或多个已知改变速率进行比较来识别所述至少一个离子，其中已知化合物的所述数据库针对每一已知化合物的每一碎片离子包含随所述可变仪器参数而变化的多个碎片离子光谱。
9.根据前述方法权利要求的任一组合所述的方法，其中所述质谱仪使用串联质谱法或质谱/质谱法MS/MS来分析所述样本。
10.根据前述方法权利要求的任一组合所述的方法，其中所述质谱仪使用质谱/质谱/质谱法MS3来分析所述样本。
11.根据前述方法权利要求的任一组合所述的方法，其中所述可变仪器参数包括碰撞能量CE。
12.根据前述方法权利要求的任一组合所述的方法，其中将所述一或多个所获取改变速率与所述一或多个已知改变速率进行比较包括
将针对一或多个所获取碎片离子依据所述多个所获取碎片离子光谱计算的质量强度对所述可变仪器参数的一或多个所获取击穿曲线与针对所述数据库中的一或多个已知化合物的一或多个所存储碎片离子计算的质量强度对所述可变仪器参数的一或多个已知击穿曲线进行比较。
13.根据前述方法权利要求的任一组合所述的方法，其中将所述一或多个所获取改变速率与所述一或多个已知改变速率进行比较包括
将针对一或多个所获取碎片离子依据所述多个所获取碎片离子光谱计算的一或多个所获取图像与针对所述数据库中的一或多个已知化合物的一或多个所存储碎片离子计算的一或多个已知图像进行比较。
14.根据前述方法权利要求的任一组合所述的方法，其中所述一或多个所获取图像中的每一图像的每一元素为质量、质量强度与碰撞能量CE的组合，且所述一或多个已知图像中的每一图像的每一元素为质量、质量强度与碰撞能量CE的组合。
15.一种计算机程序产品，其包括非暂时性及有形计算机可读存储媒体，所述计算机可读存储媒体的内容包含具有在处理器上执行以便执行用于使用多个光谱进行化合物识别的方法的指令的程序，所述多个光谱随影响碎片离子的强度的可变仪器参数而变化，所述方法包括：
提供一系统，其中所述系统包括一或多个相异软件模块，且其中所述相异软件模块包括测量模块及分析模块；
使用所述测量模块从质谱仪接收至少一个离子的随可变仪器参数而变化的多个所获取碎片离子光谱，其中所述质谱仪分析样本且在所述质谱仪的每一循环内选择所述至少一个离子，且使用影响碎片离子的所述强度的所述可变仪器参数的两个或两个以上值将所述至少一个离子碎裂，从而产生所述多个所获取碎片离子光谱；及
通过使用所述分析模块将针对一或多个所获取碎片离子依据所述多个所获取碎片离子光谱计算的质量强度相对于所述可变仪器参数的一或多个所获取改变速率与针对已知化合物的数据库中的一或多个已知化合物的一或多个所存储碎片离子计算的质量强度相对于所述可变仪器参数的一或多个已知改变速率进行比较来识别所述至少一个离子，其中已知化合物的所述数据库针对每一已知化合物的每一碎片离子包含随所述可变仪器参数而变化的多个碎片离子光谱。
CN201380060412.8A 2012-12-20 2013-11-21 用于使用多个光谱以不同碰撞能量进行化合物识别的系统、方法及设备 Active CN104798174B (zh)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201261740369P 2012-12-20 2012-12-20
US61/740,369 2012-12-20
PCT/IB2013/002607 WO2014096915A1 (en) 2012-12-20 2013-11-21 Compound identification using multiple spectra at different collision energies

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN104798174A true CN104798174A (zh) 2015-07-22
CN104798174B CN104798174B (zh) 2017-09-08

Family

ID=50977693

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201380060412.8A Active CN104798174B (zh) 2012-12-20 2013-11-21 用于使用多个光谱以不同碰撞能量进行化合物识别的系统、方法及设备

Country Status (3)

Country Link
EP (1) EP2936544B1 (zh)
CN (1) CN104798174B (zh)
WO (1) WO2014096915A1 (zh)

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP3254298B1 (en) * 2015-02-05 2023-10-18 DH Technologies Development PTE. Ltd. Rapid scanning of wide quadrupole rf windows while toggling fragmentation energy
CA2989523A1 (en) * 2015-06-18 2016-12-22 Dh Technologies Development Pte. Ltd. Probability-based library search algorithm (prols)

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6534764B1 (en) * 1999-06-11 2003-03-18 Perseptive Biosystems Tandem time-of-flight mass spectrometer with damping in collision cell and method for use
US20100179766A1 (en) * 2007-05-31 2010-07-15 The Regents Of The University Of California Method for Identifying Peptides Using Tandem Mass Spectra by Dynamically Determining the Number of Peptide Reconstructions Required
CN102017058A (zh) * 2008-05-15 2011-04-13 塞莫费雪科学（不来梅）有限公司 Ms/ms数据处理

Family Cites Families (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CA2466837A1 (en) * 2001-11-13 2003-05-22 Caprion Pharmaceuticals Inc. Mass intensity profiling system and uses thereof
US8507285B2 (en) * 2003-03-13 2013-08-13 Agilent Technologies, Inc. Methods and devices for identifying biopolymers using mass spectroscopy
US9354236B2 (en) * 2009-07-01 2016-05-31 Consejo Superior De Investigaciones Cientificas Method for identifying peptides and proteins from mass spectrometry data
US8847152B2 (en) * 2009-11-30 2014-09-30 Physikron Sa Multiplexed tandem mass spectrometry method
WO2012111249A1 (ja) * 2011-02-14 2012-08-23 学校法人麻布獣医学園 質量分析法における質量変化を検出する方法及び安定同位体標識タンパク質の絶対量の定量方法

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6534764B1 (en) * 1999-06-11 2003-03-18 Perseptive Biosystems Tandem time-of-flight mass spectrometer with damping in collision cell and method for use
JP2010232193A (ja) * 1999-06-11 2010-10-14 Applied Biosystems Llc 衝突室中での減衰を伴うタンデム飛行時間型質量分析計およびその使用のための方法
US20100179766A1 (en) * 2007-05-31 2010-07-15 The Regents Of The University Of California Method for Identifying Peptides Using Tandem Mass Spectra by Dynamically Determining the Number of Peptide Reconstructions Required
CN102017058A (zh) * 2008-05-15 2011-04-13 塞莫费雪科学（不来梅）有限公司 Ms/ms数据处理

Also Published As

Publication number Publication date
WO2014096915A1 (en) 2014-06-26
EP2936544B1 (en) 2024-02-28
EP2936544A4 (en) 2016-08-03
EP2936544A1 (en) 2015-10-28
CN104798174B (zh) 2017-09-08

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US8180581B2 (en) Systems and methods for identifying correlated variables in large amounts of data
CN104025249A (zh) 针对滞留时间确定或确认的视窗化质谱分析数据的使用
CN104285276A (zh) 用于在串联质谱分析中使用交错窗宽度的系统及方法
US9768000B2 (en) Systems and methods for acquiring data for mass spectrometry images
US9442887B2 (en) Systems and methods for processing fragment ion spectra to determine mechanism of fragmentation and structure of molecule
CN109643633B (zh) 自动化质谱库保留时间校正
JP2018504600A (ja) 干渉検出および着目ピークのデコンボルーション
US7587285B2 (en) Method for identifying correlated variables
CN104798174A (zh) 使用多个光谱以不同碰撞能量进行化合物识别
US10147590B2 (en) Mass spectrometry data processing apparatus and mass spectrometry data processing method
EP3335236B1 (en) Library search tolerant to isotopes
US8073639B2 (en) Method for identifying a convolved peak
US10446376B2 (en) Compound identification using multiple spectra at different collision energies
CA2989523A1 (en) Probability-based library search algorithm (prols)
CN108375643A (zh) 通过色谱重建检测低含量lcms组分

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant