CN104726559A - 一种检测生物分子的方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种检测生物分子的方法,首先使目的生物分子与磁珠探针结合,实现目的生物分子的初步富集,然后选择DNA/RNA变性溶液或免疫分离溶液,使目的生物分子与磁珠探针分离,再将目的生物分子溶液滴于疏水表面上,通过微浓缩作用,使目的生物分子液滴自然蒸发形成直径为45?400um的斑点,使目标分子的最终浓度较初始浓度提高103?105倍,用荧光显微镜或芯片扫描仪对斑点进行灵敏度检测,显著提高检测灵敏度。该方法不仅适用于DNA、RNA等核酸分子的检测,而且适用于抗原-抗体免疫检测及酶-底物反应等相关检测,操作简便,易于广泛推广应用。
Description
技术领域
本发明涉及一种方法,该方法可以检测在生物材料中的生物分子,属于生物分子检测技术领域。
背景技术
生物分子,更具体地来自少量的生物材料的蛋白和/或肽的特异性检测,是用于研究和医疗诊断的重要要求。
作为生命活动的基本分子和遗传信息的载体,生物分子的检测一直是人们关注的重要课题之一,如何实现生物分子简单、快速、高灵敏度和特异性检测,对于疾病的诊断与治疗、环境监测、公共安全甚至防恐等都具有非常重要的意义。
就核酸分子而言,按其检测原理一般可以分为两类:一类是基于聚合酶链式反应(PCR)的各种指数扩增技术;另一类则是基于核酸分子杂交互补原理,通过杂交反应固定靶分子进行检测。PCR技术能对靶序列进行扩增,提高检测灵敏度,但由于酶的储存运输要求严格,并且通常需要专业人员操作,操作繁琐,耗时较长,价格相对昂贵,自动化存在困难;如果采用杂交的方法,由于对靶序列没有前期的扩增,相对的检测灵敏度远不如PCR的检测方法,但操作比较简单,易于满足复杂场地的检测需要。而蛋白质分子与核酸分子不同,它不能通过扩增技术使目的蛋白分子数目增加,只能采用酶联免疫吸附法(ELISA)等方法直接测定,因此,检测灵敏度受到极大限制,且检测过程繁琐,检测时间较长。
微浓缩技术是使液滴在一疏水表面自然蒸发,通过液滴收缩作用,提高液滴中溶质分子检测灵敏度的方法。Nordhoff等(Ana
Chem,2000,72,3436-3442)通过微加工技术在疏水性聚四氟乙烯表面制备直径200pm、间隔2.25mm的纳米金亲水阵列,然后将待测样品溶液滴在表面上,随着溶剂的蒸发,溶质生物分子将自动浓缩于亲水性纳米金位点,形成直径为200um的液斑,用免疫沉淀及基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱进行检测,可显著提高检测灵敏度,对于MALDI-MS而言,一般情况下,对80bp的DNA分子,其检测灵敏度约为50fM,而经过微浓缩后其检测灵敏度可提尚到5fM左右。
但是目前使用的方法在检测的时候存在灵敏度不高的缺陷,因此急需提供一种新的检测生物分子的方法。
发明内容
本发明的目的是克服现有技术存在的不足,提供一种检测生物分子的方法,可以有效提高检测的灵敏度。
为了实现上述目的,本发明的技术方案为:
一种检测生物分子的方法,首先使目的生物分子与磁珠探针结合,实现目的生物分子的初步富集,然后选择DNA/RNA变性溶液或免疫分离溶液,使目的生物分子与磁珠探针分离,再将目的生物分子溶液滴于疏水表面上,通过微浓缩作用,使目的生物分子液滴自然蒸发形成直径为45〜400um的斑点,用荧光显微镜或芯片扫描仪对斑点进行检测,具体包括以下步骤:
A.先使磁珠与探针生物分子结合,形成磁珠探针;将一端共价结合有荧光分子的生物分子溶液与磁珠探针混合,使目的生物分子与磁珠探针结合;
B.分离磁珠,梯度洗涤,磁分离,加DNA/RNA变性溶液或免疫分离溶液使目的生物分子与磁珠探针分离;
C.用磁分离器处理步骤2)得到的目的生物分子溶液,取上清液1〜8uL滴于疏水表面上进行浓缩,使液滴自然蒸发,蒸干后浓缩斑点直径在45〜400um之间;
D.采用荧光显微镜或芯片扫描仪对浓缩斑点进行检测。
优选的,所述磁珠探针是指通过1-乙基-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺盐酸盐、戊二醛、二硫键或链霉亲和素-生物素将探针生物分子与磁珠共价结合,形成可与目的生物分子结合的磁珠探针;所述磁珠颗粒直径在0.4〜8um,磁珠表面有羧基、氨基、羟基、巯基、甲苯磺酰基、链霉亲和素或生物素包被。
更优选的,所述疏水表面是指经十七氟癸基三甲氧基硅烷、十八烷基三甲氧基硅烷、碳氟聚合物或聚四氟乙烯修饰的玻片、硅片、石英。
进一步的,所述生物分子是经过修饰的。
更进一步的,所述生物分子为DNA、RNA、酶、抗原或抗体。
与现有技术相比,本发明的有益效果至少在于:
⑴本发明通过磁珠富集和微浓缩效应使检测灵敏度提高到1.6〜160aM(而通常情况下荧光分析的检测灵敏度为1〜10fM),大大提高了检测灵敏度;
⑵适用范围广,不仅适用于DNA、RNA等核酸分子的检测,而且还适用于抗原-抗体免疫检测及酶-底物反应等相关检测;
⑶磁珠探针和疏水表面制备简单,易于存储,且可批量制备,使检测成本显著降低;检测迅速,整个检测过程可在1小时内完成;
⑷该检测方法简单易行,操作简便,特异性和灵敏度高,且易于自动化,应用前景好。
具体实施方式
本发明提供一种用于检测生物分子(DNA、RNA、酶、抗原及抗体等)的方法,首先使磁珠与探针生物分子(单链DNA、酶、抗原或抗体等)结合,形成磁珠探针,再与溶液中标记有荧光基团的目的生物分子进行杂交,利用磁珠实现目的分子的初步富集;然后通过DNA/RNA变性溶液或免疫分离溶液使磁珠探针与目的分子分离,再将目的分子溶液滴于疏水表面上,通过微浓缩作用,目的生物分子溶液蒸发形成直径45〜400pm的斑点,使目标分子的最终浓度较初始浓度提高103〜105倍,用荧光显微镜或芯片扫描仪对斑点进行检测,显著提高检测灵敏度。
具体的工艺过程是:①先通过1-乙基-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺盐酸盐(EDC)、戊二醛、二硫键或链霉亲和素-生物素等将探针生物分子与磁珠共价结合,形成可与目的生物分子特异结合的磁珠探针;磁珠颗粒直径在0.5〜1.5um,磁珠表面有竣基、氣基、轻基、疏基、链霉未和素或生物素等包被;将一端共价结合有荧光分子的生物分子溶液与磁珠探针混合,使目的生物分子与磁珠探针结合;②分离磁珠,梯度洗涤,应尽可能除去与磁珠探针不能结合的生物分子,并减少磁珠探针与目的生物分子发生分离,以提高检测的特异性;为保证随后的微浓缩过程浓缩斑点足够小,选择适宜浓度的DNA、RNA变性溶液或免疫分离溶液使目的生物分子与磁珠探针分离;③用磁分离器处理上述得到的目的生物分子溶液,取经磁分离器处理的含目的生物分子上清液1〜8pL滴于疏水表面上进行浓缩,疏水表面是指经十七氟癸基三甲氧基硅烷(FAS)、十八烷基三甲氧基硅烷、碳氟聚合物(FCP)或聚四氟乙烯(PTFE)等修饰的玻片、硅片、石英或聚合物膜等;继而使液滴自然蒸发,蒸干后浓缩斑点直径在45〜400pm之间;④采用荧光显微镜或芯片扫描仪对浓缩斑点进行检测。
实施例1
微浓缩技术用于人类巨细胞病毒PP150蛋白分子高灵敏度检测:
磁珠探针的制备,将待测溶液与磁珠探针混合,使目的蛋白分子与磁珠探针结合;
取30uL的甲苯磺酰基修饰的磁珠(直径10pm,4X108个/mL)置于微量离心管中,用磁分离器处理8分钟,弃去上清液,再用100pL包被缓冲液(0.1mol/L磷酸,pH为9.5)清洗3次,加入10pL
1mg/mL的PP150-8MAPs抗原肽混合均匀,37℃振荡孵育24h,用磁分离器处理5分钟,弃去反应液。4℃用缓冲液A(2g/LBSA的PBS,pH7.4)洗涤磁珠3次,并用1mL缓冲液A悬浮磁珠。
将用PP150-8MAPS免疫的Balb/c小鼠抗血清用考马斯亮蓝染色后,用缓冲液A稀释105倍,取lmL与8uL的磁珠溶液混合,室温轻轻振 荡60min,用磁分离器处理5分钟,弃去反应液,用缓冲液A洗涤3次。
分离磁珠,加免疫分离溶液使目的蛋白分子与磁珠探针分离;
用磁体富集上述结合有目的DNA的磁珠,弃去上清液,用15uLMilli-Q水悬浮磁珠,37℃静置10min使目的分子与磁珠探针分离。
疏水表面的制备;
将玻片置于表面皿中,用丙酮浸泡清洗30分钟,用乙醇清洗2次,用Milli-Q水冲洗干净;玻片浸入浓度比为1:1的HC1:C2H50H溶液中,清洗30分钟,用Milli-Q水冲洗干净;玻片浸入浓度比为3:1的H2S04:30%H202溶液约30分钟,用Milli-Q水冲洗干净,用氮气吹干;
将玻片浸入2%十八烷基三甲氧基硅烷的甲苯溶液中反应2小时,用Milli-Q水清洗干净,用氮气吹干。
用磁分离器处理步骤2)中的含目的蛋白的溶液,取上清液10pL滴于步骤3)制得的疏水表面上,使液滴自然蒸发实现微浓缩过程。
采用荧光显微镜对浓缩斑点进行检测,浓缩斑点直径约为400|am,检测灵敏度约为160aM。
综上所述,本发明通过磁珠富集和微浓缩效应使检测灵敏度提高到1.6〜160aM(103〜105个分子/mL),显著提高了检测灵敏度;适用范围广,不仅适用于DNA、RNA等核酸分子的检测,而且适用于抗原-抗体免疫检测及酶-底物反应等相关检测;磁珠探针和疏水表面制备简单,易于存储,且可批量制备,使检测成本显著降低;检测迅速,整个检测过程可在1小时内完成;与现有技术相比,该检测方法简单易行,操作简便,特异性和
灵敏度高,且易于自动化,有广泛的应用前景。
以上所述仅为本发明的较佳实施例,并不用以限制本发明,凡在本发明的精神和原则之内,所作的任何修改、等同替换、改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。
Claims (5)
1.一种检测生物分子的方法,其特征在于,首先使目的生物分子与磁珠探针结合,实现目的生物分子的初步富集,然后选择DNA/RNA变性溶液或免疫分离溶液,使目的生物分子与磁珠探针分离,再将目的生物分子溶液滴于疏水表面上,通过微浓缩作用,使目的生物分子液滴自然蒸发形成直径为45〜400um的斑点,用荧光显微镜或芯片扫描仪对斑点进行检测,具体包括以下步骤:
A.先使磁珠与探针生物分子结合,形成磁珠探针;将一端共价结合有荧光分子的生物分子溶液与磁珠探针混合,使目的生物分子与磁珠探针结合;
B.分离磁珠,梯度洗涤,磁分离,加DNA/RNA变性溶液或免疫分离溶液使目的生物分子与磁珠探针分离;
C.用磁分离器处理步骤2)得到的目的生物分子溶液,取上清液1〜8uL滴于疏水表面上进行浓缩,使液滴自然蒸发,蒸干后浓缩斑点直径在45〜400um之间;
D.采用荧光显微镜或芯片扫描仪对浓缩斑点进行检测。
2.根据权利要求1所述的一种检测生物分子的方法,其特征在于,所述磁珠探针是指通过1-乙基-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺盐酸盐、戊二醛、二硫键或链霉亲和素-生物素将探针生物分子与磁珠共价结合,形成可与目的生物分子结合的磁珠探针;所述磁珠颗粒直径在0.4〜8um,磁珠表面有羧基、氨基、羟基、巯基、甲苯磺酰基、链霉亲和素或生物素包被。
3.根据权利要求1所述的一种检测生物分子的方法,其特征在于,所述疏水表面是指经十七氟癸基三甲氧基硅烷、十八烷基三甲氧基硅烷、碳氟聚合物或聚四氟乙烯修饰的玻片、硅片、石英。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的一种检测生物分子的方法,其特征在于,所述生物分子是经过修饰的。
5.根据权利要求1-3中任一项所述的一种检测生物分子的方法,其特征在于,所述生物分子为DNA、RNA、酶、抗原或抗体。
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