CN104711338A - miR-24作为血浆/血清miRNA检测的内参基因的应用 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了miR-24作为血浆/血清miRNA检测的内参基因的应用。本发明还保护一种检测血浆或血清中miRNA的相对表达量的方法,包括如下步骤:(1)提取待测血浆或血清的总RNA并反转录为cDNA;(2)以步骤(1)获得的cDNA为模板,分别检测其中目的miRNA的编码序列的含量和miR-24的编码序列的含量;(3)根据步骤(2)的结果,以所述miR-24为内参基因,计算目的miRNA的相对表达量。采用miR-24为内参基因可以实现不同实验室间研究结果的比较,促进各实验结果的归一化处理,进而促进血清/血浆miRNA研究结果向临床成果转化,为临床医生提供更加精确的诊断、分型、预后判断以及个体化治疗的有力工具。
Description
技术领域
本发明涉及miR-24作为血浆/血清miRNA检测的内参基因的应用。
背景技术
MicroRNAs(即miRNAs)是近年来发现的一类长约18-24个核苷酸的非编码小RNA,在基因组中占1-3%,但预计其可以调控30%的基因表达。miRNA首先在细胞核内由RNA聚合酶II转录生成pri-miRNA,pri-miRNA经Drosha核酸酶处理生成70个核苷酸左右的pre-miRNA,并通过Exportin-5依赖的转运机制运送至胞浆。在胞浆中pre-miRNA经Dicer核酸酶进一步剪切成为成熟的miRNA。成熟miRNA以互补配对的方式与靶mRNA的3’-UTR区、5’-UTR区甚至开放读码框结合,造成靶mRNA的降解或转录抑制。MiRNA的互补配对并非绝对互补,因此同一个miRNA可以调控多个mRNA,同时同一个位点也可能同时受多个miRNA调控。
目前大量文献证实miRNA涉及生理、病理,包括增殖、分化、迁移、凋亡等几乎所有过程,与许多疾病的发生发展密切关联,同时在这些疾病中都检测到其与正常组织的差异表达情况,因此miRNA已经成为包括肿瘤在内的多种疾病的诊断、分型以及预后的候选标志物。
血液游离核酸作为疾病标志物始于1948年。由于核酸检测手段多样,定量简便,DNA和RNA相继成为研究热点。但DNA特异性较差且不能实时反应变化情况,而RNA在血液中非常容易降解,不够稳定。MiRNA作为新兴研究热点,具有在血清/血浆中稳定性好,对酸碱、反复冻融(10次)、常温放置(24小时)以及RNA酶等均不敏感的特性,表达稳定。血液游离miRNA来源非常复杂,包括血细胞miRNA释放,组织细胞中直接渗出miRNA等,在癌症患者中还包括肿瘤组织胞外体和超微小泡的外泌作用释放miRNA等,无论其来源如何,血液游离miRNA以其表达稳定、易检测、具有疾病特异性等特点成为优质血液来源生物标志物。
目前研究人员常用于血清/血浆控制miRNA表达差异的方法有三种:一是利用所有可检测到的miRNA的平均值作为参照;二是利用血清/血浆总体积作为参照;三是利用外源添加的非人类定量miRNA作为参照。以上方法都解决了部分差异控制的问题,但都存在一定的缺陷:第一种方法仅限于高通量的检测平台,如高通量测序、miRNA芯片等技术,在低通量检测平台检测少量特定的miRNA时无法使用;第二、三种方法可以有效控制实验技术带来的差异,但无法控制个体本身的生物学差异。
发明内容
本发明的目的是提供miR-24作为血浆/血清miRNA检测的内参基因的应用。
本发明要求保护miR-24作为内参基因的应用。
所述应用中,所述miR-24具体作为血浆或血清中miRNA检测的内参基因。
所述应用中,所述miR-24具体作为单独的内参基因(即无需与其他内参基因组合使用)。
本发明还保护一种检测血浆或血清中miRNA的相对表达量的方法,包括如下步骤:
(1)提取待测血浆或血清的总RNA并反转录为cDNA;
(2)以步骤(1)获得的cDNA为模板,分别检测其中目的miRNA的编码序列的含量和miR-24的编码序列的含量;
(3)根据步骤(2)的结果,以所述miR-24为内参基因,计算目的miRNA的相对表达量。‘
所述方法应用于非治疗目的和非诊断目的。
本发明还要求保护用于检测血浆或血清中miR-24的物质的应用;所述应用为:以miR-24为内参基因,检测其它miRNA相对于所述内参基因在血浆或血清中的相对表达量。
本发明还要求保护用于检测血浆或血清中miR-24的物质在制备试剂盒中的应用;所试剂盒的用途为:以miR-24为内参基因,检测其它miRNA相对于所述内参基因在血浆或血清中的相对表达量。
本发明还保护一种试剂盒,含有用于检测血浆或血清中miR-24的物质;所试剂盒的用途为:以miR-24为内参基因,检测其它miRNA相对于所述内参基因在血浆或血清中的相对表达量。所述试剂盒可为基于real-time PCR的试剂盒,如基于Taqman探针法的real-time PCR试剂盒或基于荧光染料法的real-time PCR试剂盒。
以上任一所述miR-24如序列表的序列1所示。
以上任一所述血浆或血清可来源于结直肠癌患者、肺癌患者或健康人。
采用miR-24为内参基因可以实现不同实验室间研究结果的比较,促进各实验结果的归一化处理,进而促进血清/血浆miRNA研究结果向临床成果转化,为临床医生提供更加精确的诊断、分型、预后判断以及个体化治疗的有力工具。
miRNA作为新型生物标志物,在血清/血浆中受内外因素干扰较小、表达稳定、检测手段多样、定量检测精确。因此以miRNA作为血清/血浆中的内参基因有助于外周血标志物在诊断、分型以及预后等方面的价值转化以及不同实验室间检测结果的对比。以单个miRNA作为血清或血浆中的内参基因,适用于高、低通量的检测平台,对于大规模临床检测应用,降低了操作难度,简化了操作流程。
具体实施方式
以下的实施例便于更好地理解本发明,但并不限定本发明。下述实施例中的实验方法,如无特殊说明,均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料,如无特殊说明,均为自常规生化试剂商店购买得到的。以下实施例中的定量试验,均设置三次重复实验,结果取平均值。miR为单链RNA,实施例中提供的各个miR的序列均为5’→3’方向。
实施例1、通过TLDA芯片筛选候选内参基因
利用TLDA芯片分别检测已经医院确诊但未经任何治疗的结直肠癌患者、肺癌患者和健康人的血浆miRNA的表达谱及含量,分析不同病例和对照间miRNA表达的稳定性和表达量,筛选得到稳定高表达的miRNA作为候选内参miRNA。
1、血浆样本的制备
分别采集已经医院确诊但未经任何治疗的结直肠癌患者(49人)、肺癌患者(6人)和健康人(58人)的血浆。
将结直肠癌患者分为5组,相关信息见表1。
表1结直肠癌患者的信息
肺癌患者为一组,相关信息见表2。
表2肺癌患者的信息
年龄 | 性别 | |
患者1 | 62 | 男 |
患者2 | 55 | 女 |
患者3 | 58 | 女 |
患者4 | 61 | 男 |
患者5 | 47 | 男 |
患者6 | 70 | 男 |
健康人分为6组,相关信息见表3。
表3健康人的信息
采集血浆的方法如下:
(1)用EDTA抗凝采血管收集外周血4-5mL,轻轻倒转采血管4-5次以利抗凝。
(2)将完成步骤(1)的采血管放入水平式离心机中,室温、2500g离心10分钟(该步骤在采血4小时内进行),吸取上层血浆至1.5ml离心管(或2ml离心管,注意轻柔操作避免扰动和吸取到含白细胞的中间层)。
(3)取步骤(2)得到的血浆,室温、10000g离心10min,吸取上清(血浆样本),冻存于-80℃冰箱中或直接进行下一步实验。
2、混合血浆样本的制备
结直肠癌患者第一组至第四组,将每组的10个血浆样本混合,依次得到结直肠癌混合血浆样本一、结直肠癌混合血浆样本二、结直肠癌混合血浆样本三和结直肠癌混合血浆样本四。结直肠患者第五组,将9个血浆样本混合,得到结直肠癌混合血浆样本五。
健康人第一组至第四组,将每组的10个血浆样本混合,依次得到健康混合血浆样本一、健康混合血浆样本二、健康混合血浆样本三和健康混合血浆样本四。健康人第五组,将9个血浆样本混合,得到健康混合血浆样本五。
3、利用miRNeasy Mini Kit(QIAGEN公司,产品目录号:217004)并按试剂盒说明书分别提取步骤2得到的各个混合血浆样本或步骤1制备的各个血浆样本的总RNA,总RNA得率约为100ng/100μL血浆。
4、分别取步骤3得到的各个总RNA,采用MicroRNA Reverse TranscriptionKit(Life Technologies公司,产品目录号4366596)将100ng总RNA反转录为cDNA。
5、采用预扩增试剂盒(Life Technologies公司,MegaplexTMPrimer Pools,HumanPools Set v3.0和PreAmp Master Mix,产品目录号分别为4444750和4391128)并按试剂盒说明书,将步骤4得到的cDNA进行预扩增,然后利用TaqMan humanMicroRNA Array Set v3.0芯片(Life Technologies公司,产品目录号:4444913)进行检测(所有cDNA中各个miRNA的表达量的检测均是在完全平行的体系和完全相同的条件下进行的),获得miRNA表达谱(TLDA芯片可用于检测768种miRNA,设置荧光阈值为自动,原始输出结果为每种miRNA的Ct值)。
比较5个结直肠癌混合血浆样本(结直肠癌混合血浆样本一至结直肠癌混合血浆样本五)与5个健康混合血浆样本(健康混合血浆样本一至健康混合血浆样本五),并将所有CV值(CV=标准偏差/平均值×100%)小于5%的miRNA按照Ct值从小到大进行排序,前五名依次为hsa-miR-19b-3p(序列:UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA;结直肠癌混合血浆样本一的Ct值为17.02,结直肠癌混合血浆样本二的Ct值为15.95,结直肠癌混合血浆样本三的Ct值为15.97,结直肠癌混合血浆样本四的Ct值为15.99,结直肠癌混合血浆样本五的Ct值为15.94,健康混合血浆样本一的Ct值为16.97,健康混合血浆样本二的Ct值为15.99,健康混合血浆样本三的Ct值为15.98,健康混合血浆样本四的Ct值为14.96,健康混合血浆样本五的Ct值为15.96)、hsa-miR-16-5p(序列:UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG;结直肠癌混合血浆样本一的Ct值为16.99,结直肠癌混合血浆样本二的Ct值为15.95,结直肠癌混合血浆样本三的Ct值为15.98,结直肠癌混合血浆样本四的Ct值为15.97,结直肠癌混合血浆样本五的Ct值为16.01,健康混合血浆样本一的Ct值为16.97,健康混合血浆样本二的Ct值为16.97,健康混合血浆样本三的Ct值为15.97,健康混合血浆样本四的Ct值为14.97,健康混合血浆样本五的Ct值为15.95)、hsa-miR-126-5p(序列:CAUUAUUACUUUUGGUACGCG;结直肠癌混合血浆样本一的Ct值为16.97,结直肠癌混合血浆样本二的Ct值为15.95,结直肠癌混合血浆样本三的Ct值为15.97,结直肠癌混合血浆样本四的Ct值为15.96,结直肠癌混合血浆样本五的Ct值为16.96,健康混合血浆样本一的Ct值为16.97,健康混合血浆样本二的Ct值为15.97,健康混合血浆样本三的Ct值为16.60,健康混合血浆样本四的Ct值为15.98,健康混合血浆样本五的Ct值为15.97)、hsa-miR-24(序列:UGGCUCAGUUCAGCAGGAACAG;结直肠癌混合血浆样本一的Ct值为17.97,结直肠癌混合血浆样本二的Ct值为16.96,结直肠癌混合血浆样本三的Ct值为15.99,结直肠癌混合血浆样本四的Ct值为16.97,结直肠癌混合血浆样本五的Ct值为18.02,健康混合血浆样本一的Ct值为17.98,健康混合血浆样本二的Ct值为16.96,健康混合血浆样本三的Ct值为17.03,健康混合血浆样本四的Ct值为16.00,健康混合血浆样本五的Ct值为16.97)、hsa-miR-20a(序列:UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG;结直肠癌混合血浆样本一的Ct值为17.95,结直肠癌混合血浆样本二的Ct值为17.98,结直肠癌混合血浆样本三的Ct值为16.96,结直肠癌混合血浆样本四的Ct值为16.95,结直肠癌混合血浆样本五的Ct值为17.97,健康混合血浆样本一的Ct值为17.98,健康混合血浆样本二的Ct值为16.97,健康混合血浆样本三的Ct值为16.94,健康混合血浆样本四的Ct值为15.95,健康混合血浆样本五的Ct值为16.97)。
比较6个肺癌血浆样本(肺癌患者1的血浆样本、肺癌患者2的血浆样本、肺癌患者3的血浆样本、肺癌患者4的血浆样本、肺癌患者5的血浆样本和肺癌患者6的血浆样本)和9个健康血浆样本(健康人50的血浆样本、健康人51的血浆样本、健康人52的血浆样本、健康人53的血浆样本、健康人54的血浆样本、健康人55的血浆样本、健康人56的血浆样本、健康人57的血浆样本和健康人58的血浆样本),并将所有CV值小于5%的miRNA按照Ct值从小到大进行排序,前五名依次为hsa-miR-146a-5p(序列:UGAGAACUGAAUUCCAUGGGUU;肺癌患者1的血浆样本的Ct值为24.98,肺癌患者2的血浆样本的Ct值为25.98,肺癌患者3的血浆样本的Ct值为23.95,肺癌患者4的血浆样本的Ct值为23.95,肺癌患者5的血浆样本的Ct值为22.97,肺癌患者6的血浆样本的Ct值为22.95,健康人50的血浆样本的Ct值为23.98,健康人51的血浆样本的Ct值为23.96,健康人52的血浆样本的Ct值为21.98,健康人53的血浆样本的Ct值为22.93,健康人54的血浆样本的Ct值为25.98,健康人55的血浆样本的Ct值为22.97,健康人56的血浆样本的Ct值为22.95,健康人57的血浆样本的Ct值为22.97,健康人58的血浆样本的Ct值为23.99)、hsa-miR-222-3p(序列:AGCUACAUCUGGCUACUGGGU;肺癌患者1的血浆样本的Ct值为23.94,肺癌患者2的血浆样本的Ct值为24.91,肺癌患者3的血浆样本的Ct值为22.94,肺癌患者4的血浆样本的Ct值为23.95,肺癌患者5的血浆样本的Ct值为22.95,肺癌患者6的血浆样本的Ct值为22.93,健康人50的血浆样本的Ct值为23.94,健康人51的血浆样本的Ct值为23.95,健康人52的血浆样本的Ct值为22.94,健康人53的血浆样本的Ct值为24.94,健康人54的血浆样本的Ct值为25.94,健康人55的血浆样本的Ct值为23.94,健康人56的血浆样本的Ct值为23.94,健康人57的血浆样本的Ct值为23.94,健康人58的血浆样本的Ct值为23.96)、hsa-miR-24(序列:UGGCUCAGUUCAGCAGGAACAG;肺癌患者1的血浆样本的Ct值为22.93,肺癌患者2的血浆样本的Ct值为23.98,肺癌患者3的血浆样本的Ct值为21.98,肺癌患者4的血浆样本的Ct值为21.97,肺癌患者5的血浆样本的Ct值为21.98,肺癌患者6的血浆样本的Ct值为21.98,健康人50的血浆样本的Ct值为22.97,健康人51的血浆样本的Ct值为23.01,健康人52的血浆样本52的Ct值为20.97,健康人53的血浆样本的Ct值为22.97,健康人54的血浆样本的Ct值为24.98,健康人55的血浆样本的Ct值为22.99,健康人56的血浆样本的Ct值为23.98,健康人57的血浆样本的Ct值为22.97,健康人58的血浆样本的Ct值为22.99)、hsa-miR-320a(序列:AAAAGCUGGGUUGAGAGGGCGA;肺癌患者1的血浆样本的Ct值为22.98,肺癌患者2的血浆样本的Ct值为22.97,肺癌患者3的血浆样本的Ct值为21.99,肺癌患者4的血浆样本的Ct值为22.97,肺癌患者5的血浆样本的Ct值为21.95,肺癌患者6的血浆样本的Ct值为22.99,健康人50的血浆样本的Ct值为22.97,健康人51的血浆样本的Ct值为22.99,健康人52的血浆样本的Ct值为21.99,健康人53的血浆样本的Ct值为22.96,健康人54的血浆样本的Ct值为22.96,健康人55的血浆样本的Ct值为22.98,健康人56的血浆样本的Ct值为22.97,健康人57的血浆样本的Ct值为21.97,健康人58的血浆样本的Ct值为22.97)、hsa-miR-484(序列:UCAGGCUCAGUCCCCUCCCGAU;肺癌患者1的血浆样本的Ct值为23.97,肺癌患者2的血浆样本的Ct值为24.97,肺癌患者3的血浆样本的Ct值为22.97,肺癌患者4的血浆样本的Ct值为23.99,肺癌患者5的血浆样本的Ct值为23.97,肺癌患者6的Ct值为23.96,健康人50的血浆样本的Ct值为25.99,健康人51的血浆样本的Ct值为25.98,健康人52的血浆样本的Ct值为23.98,健康人53的血浆样本的Ct值为25.99,健康人54的血浆样本的Ct值为25.98,健康人55的血浆样本的Ct值为24.99,健康人56的血浆样本的Ct值为26.98,健康人57的血浆样本的Ct值为24.97,健康人58的血浆样本的Ct值为23.98)。
结直肠癌/健康对照组和肺癌/健康对照组两组前五名重叠的只有miR-24(序列表的序列1:UGGCUCAGUUCAGCAGGAACAG)。
实施例2、内参基因在不同个体中稳定表达
1、分别取实施例1的步骤1中得到的结直肠癌患者(49人)和健康人(49人)的血浆样本。
2、利用miRNeasy Mini Kit并按试剂盒说明书分别提取步骤1得到的各个血浆样本的总RNA。
3、分别取步骤2得到的各个总RNA,采用MicroRNA Reverse TranscriptionKit将100ng总RNA反转录为cDNA。
4、以步骤3得到的cDNA为模板,利用real-time PCR(Taqman探针法)检测各个血浆样本中miR-24的表达量、miR-16(miR-16:UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG)的表达量和miR-484(miR-484:UCAGGCUCAGUCCCCUCCCGAU)的表达量(所有cDNA中各个miRNA的表达量的检测均是在完全平行的体系和完全相同的条件下进行的)。
原始输出的结果是Ct值,阈值为0.1,原始输出结果经Normfinder软件处理后得到的结果见表4。
表449位结直肠癌患者的血浆样本和58位健康人的血浆样本的检测结果
hsa-miR-16 | hsa-miR-24 | hsa-miR-484 | 阈值 | |
结直肠癌患者1的血浆样本 | 23.01 | 27.95 | 26.61 | 0.10 |
结直肠癌患者2的血浆样本 | 20.43 | 25.44 | 28.47 | 0.10 |
结直肠癌患者3的血浆样本 | 22.25 | 26.95 | 28.05 | 0.10 |
结直肠癌患者4的血浆样本 | 21.65 | 26.36 | 25.57 | 0.10 |
结直肠癌患者5的血浆样本 | 23.37 | 27.22 | 27.55 | 0.10 |
结直肠癌患者6的血浆样本 | 23.29 | 29.04 | 27.20 | 0.10 |
结直肠癌患者7的血浆样本 | 23.87 | 30.54 | 28.92 | 0.10 |
结直肠癌患者8的血浆样本 | 23.17 | 27.55 | 31.85 | 0.10 |
结直肠癌患者9的血浆样本 | 23.28 | 31.14 | 28.36 | 0.10 |
结直肠癌患者10的血浆样本 | 24.19 | 30.18 | 27.71 | 0.10 |
结直肠癌患者11的血浆样本 | 25.52 | 32.60 | 29.98 | 0.10 |
结直肠癌患者12的血浆样本 | 22.17 | 26.37 | 27.07 | 0.10 |
结直肠癌患者13的血浆样本 | 23.02 | 26.97 | 26.98 | 0.10 |
结直肠癌患者14的血浆样本 | 28.98 | 35.04 | 33.08 | 0.10 |
结直肠癌患者15的血浆样本 | 25.40 | 30.51 | 28.78 | 0.10 |
结直肠癌患者16的血浆样本 | 24.40 | 29.11 | 30.99 | 0.10 |
结直肠癌患者17的血浆样本 | 26.08 | 31.93 | 28.66 | 0.10 |
结直肠癌患者18的血浆样本 | 22.05 | 26.92 | 26.21 | 0.10 |
结直肠癌患者19的血浆样本 | 22.36 | 27.89 | 27.53 | 0.10 |
结直肠癌患者20的血浆样本 | 28.18 | 33.71 | 31.95 | 0.10 |
结直肠癌患者21的血浆样本 | 26.40 | 31.26 | 29.04 | 0.10 |
结直肠癌患者22的血浆样本 | 24.81 | 30.71 | 28.39 | 0.10 |
结直肠癌患者23的血浆样本 | 23.57 | 27.39 | 29.00 | 0.10 |
结直肠癌患者24的血浆样本 | 25.64 | 31.25 | 28.60 | 0.10 |
结直肠癌患者25的血浆样本 | 22.12 | 26.27 | 26.76 | 0.10 |
结直肠癌患者26的血浆样本 | 24.97 | 29.34 | 27.82 | 0.10 |
结直肠癌患者27的血浆样本 | 22.67 | 30.66 | 27.44 | 0.10 |
结直肠癌患者28的血浆样本 | 24.78 | 29.78 | 27.69 | 0.10 |
结直肠癌患者29的血浆样本 | 21.72 | 25.89 | 26.36 | 0.10 |
结直肠癌患者30的血浆样本 | 24.09 | 29.54 | 27.44 | 0.10 |
结直肠癌患者31的血浆样本 | 23.78 | 28.57 | 28.50 | 0.10 |
结直肠癌患者32的血浆样本 | 21.63 | 26.25 | 25.30 | 0.10 |
结直肠癌患者33的血浆样本 | 22.07 | 26.33 | 25.29 | 0.10 |
结直肠癌患者34的血浆样本 | 24.31 | 28.69 | 27.06 | 0.10 |
结直肠癌患者35的血浆样本 | 23.04 | 28.09 | 26.84 | 0.10 |
结直肠癌患者36的血浆样本 | 24.01 | 29.39 | 36.19 | 0.10 |
结直肠癌患者37的血浆样本 | 24.01 | 30.68 | 35.22 | 0.10 |
结直肠癌患者38的血浆样本 | 23.26 | 28.07 | 34.66 | 0.10 |
结直肠癌患者39的血浆样本 | 24.85 | 29.27 | 36.98 | 0.10 |
结直肠癌患者40的血浆样本 | 25.61 | 30.17 | 35.37 | 0.10 |
结直肠癌患者41的血浆样本 | 24.84 | 29.53 | 38.13 | 0.10 |
结直肠癌患者42的血浆样本 | 22.13 | 27.22 | 34.32 | 0.10 |
结直肠癌患者43的血浆样本 | 23.21 | 27.66 | 27.29 | 0.10 |
结直肠癌患者44的血浆样本 | 24.83 | 32.01 | 31.58 | 0.10 |
结直肠癌患者45的血浆样本 | 31.18 | 39.08 | Undetermined | 0.10 |
结直肠癌患者46的血浆样本 | 22.46 | 26.70 | 34.47 | 0.10 |
结直肠癌患者47的血浆样本 | 26.01 | 30.77 | Undetermined | 0.10 |
结直肠癌患者48的血浆样本 | 24.65 | 29.92 | 34.35 | 0.10 |
结直肠癌患者49的血浆样本 | 24.74 | 31.22 | 34.60 | 0.10 |
健康人1的血浆样本 | 26.50 | 30.27 | 30.13 | 0.10 |
健康人2的血浆样本 | 24.62 | 30.26 | 28.09 | 0.10 |
健康人3的血浆样本 | 25.08 | 29.55 | 29.21 | 0.10 |
健康人4的血浆样本 | 25.97 | 30.26 | 28.49 | 0.10 |
健康人5的血浆样本 | 25.16 | 29.61 | 27.89 | 0.10 |
健康人6的血浆样本 | 27.02 | 31.58 | 29.17 | 0.10 |
健康人7的血浆样本 | 25.16 | 28.89 | 29.90 | 0.10 |
健康人8的血浆样本 | 24.68 | 28.43 | 26.98 | 0.10 |
健康人9的血浆样本 | 24.05 | 28.12 | 26.54 | 0.10 |
健康人10的血浆样本 | 25.30 | 29.09 | 27.75 | 0.10 |
健康人11的血浆样本 | 25.43 | 29.64 | 27.23 | 0.10 |
健康人12的血浆样本 | 26.31 | 29.92 | 27.92 | 0.10 |
健康人13的血浆样本 | 25.29 | 29.17 | 27.89 | 0.10 |
健康人14的血浆样本 | 27.90 | 31.15 | 27.51 | 0.10 |
健康人15的血浆样本 | 23.89 | 27.96 | 26.52 | 0.10 |
健康人16的血浆样本 | 25.95 | 29.97 | 27.94 | 0.10 |
健康人17的血浆样本 | 22.82 | 26.33 | 25.38 | 0.10 |
健康人18的血浆样本 | 25.23 | 29.87 | 27.50 | 0.10 |
健康人19的血浆样本 | 24.30 | 28.71 | 27.95 | 0.10 |
健康人20的血浆样本 | 23.82 | 27.33 | 27.04 | 0.10 |
健康人21的血浆样本 | 25.57 | 29.26 | 27.32 | 0.10 |
健康人22的血浆样本 | 24.85 | 29.93 | 27.18 | 0.10 |
健康人23的血浆样本 | 26.02 | 29.79 | 27.50 | 0.10 |
健康人24的血浆样本 | 24.84 | 29.16 | 26.94 | 0.10 |
健康人25的血浆样本 | 25.99 | 29.84 | 27.59 | 0.10 |
健康人26的血浆样本 | 24.66 | 28.16 | 26.67 | 0.10 |
健康人27的血浆样本 | 25.32 | 28.36 | 30.22 | 0.10 |
健康人28的血浆样本 | 25.17 | 31.02 | 28.66 | 0.10 |
健康人29的血浆样本 | 24.89 | 28.86 | 28.68 | 0.10 |
健康人30的血浆样本 | 24.26 | 29.21 | 29.44 | 0.10 |
健康人31的血浆样本 | 23.27 | 27.18 | 28.20 | 0.10 |
健康人32的血浆样本 | 25.76 | 29.90 | 29.26 | 0.10 |
健康人33的血浆样本 | 23.81 | 27.21 | 28.25 | 0.10 |
健康人34的血浆样本 | 22.61 | 26.57 | 29.35 | 0.10 |
健康人35的血浆样本 | 25.20 | 29.52 | 29.03 | 0.10 |
健康人36的血浆样本 | 24.32 | 28.31 | 28.18 | 0.10 |
健康人37的血浆样本 | 23.41 | 27.20 | 27.94 | 0.10 |
健康人38的血浆样本 | 23.16 | 27.53 | 26.52 | 0.10 |
健康人39的血浆样本 | 22.96 | 26.81 | 29.06 | 0.10 |
健康人40的血浆样本 | 24.79 | 28.92 | 27.04 | 0.10 |
健康人41的血浆样本 | 25.40 | 30.76 | 28.43 | 0.10 |
健康人42的血浆样本 | 24.07 | 28.56 | 30.26 | 0.10 |
健康人43的血浆样本 | 31.32 | 33.75 | 31.13 | 0.10 |
健康人44的血浆样本 | 24.61 | 29.42 | 27.50 | 0.10 |
健康人45的血浆样本 | 26.25 | 29.93 | 30.64 | 0.10 |
健康人46的血浆样本 | 23.71 | 27.85 | 27.64 | 0.10 |
健康人47的血浆样本 | 26.94 | 31.69 | 30.66 | 0.10 |
健康人48的血浆样本 | 24.72 | 28.75 | 27.78 | 0.10 |
健康人49的血浆样本 | 30.27 | 35.55 | 32.80 | 0.10 |
利用Normfinder分析real-time PCR检测的各个miRNA在不同血浆中的稳定性,稳定值(stability)越低稳定性越高。miR-24的稳定值最低,稳定性最高。miR-24可以作为单独的内参基因。
Claims (8)
1.miR-24作为内参基因的应用;所述miR-24如序列表的序列1所示。
2.如权利要求1所述的应用,其特征在于:所述应用中,所述miR-24作为血浆或血清中miRNA检测的内参基因。
3.如权利要求1或2所述的应用,其特征在于:所述应用中,所述miR-24作为单独的内参基因。
4.一种检测血浆或血清中miRNA的相对表达量的方法,包括如下步骤:
(1)提取待测血浆或血清的总RNA并反转录为cDNA;
(2)以步骤(1)获得的cDNA为模板,分别检测其中目的miRNA的编码序列的含量和miR-24的编码序列的含量;所述miR-24如序列表的序列1所示;
(3)根据步骤(2)的结果,以所述miR-24为内参基因,计算目的miRNA的相对表达量。
5.如权利要求4所述的方法,其特征在于:所述方法应用于非治疗目的和非诊断目的。
6.用于检测血浆或血清中miR-24的物质的应用;所述应用为:以miR-24为内参基因,检测其它miRNA相对于所述内参基因在血浆或血清中的相对表达量;所述miR-24如序列表的序列1所示。
7.用于检测血浆或血清中miR-24的物质在制备试剂盒中的应用;所试剂盒的用途为:以miR-24为内参基因,检测其它miRNA相对于所述内参基因在血浆或血清中的相对表达量;所述miR-24如序列表的序列1所示。
8.一种试剂盒,含有用于检测血浆或血清中miR-24的物质;所试剂盒的用途为:以miR-24为内参基因,检测其它miRNA相对于所述内参基因在血浆/血清中的相对表达量;所述miR-24如序列表的序列1所示。
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