CN104694554A - 一种分离的禽流感病毒h7基因核酸序列 - Google Patents

Abstract

本发明属于基因工程领域，尤其涉及一种分离的禽流感病毒H7基因的核酸序列。本发明所述一种分离的禽流感病毒H7基因的核酸序列具有如SEQ I D NO：1所示的核酸序列，所述H7基因具有如SEQ I D NO：2所示的氨基酸序列。本发明提供了一种分离的禽流感病毒H7基因的核酸以及氨基酸序列，为H7N9禽流感病毒的检测和预防提供了重要参考，有利于简单、方便、快速检测方法的建立。

Description

一种分离的禽流感病毒H7基因核酸序列

技术领域

本发明涉及基因工程技术领域，尤其涉及一种分离的禽流感病毒H7基因核酸序列。

背景技术

禽流感，全称禽类流行性感冒病毒感染，是由正粘病毒科、流感病毒属的A型流感病毒引起禽类的一种从呼吸系统感染到败血症等多种症状的传染病。

H7N9是禽流感的一种亚型。流感病毒颗粒外膜由两型表面糖蛋白覆盖，一型为血细胞凝集素(即H)，一型为神经氨酸酶(即N)，H又分15个亚型，N分9个亚型。所有人类的流感病毒都可以引起禽类流感，但不是所有的禽流感病毒都可以引起人类流感，禽流感病毒中，H3、H5、H7、H9可以传染给人，其中H5为高致病性。H3为人犬共患，依据流感病毒特征可分为HxNx共135种亚型，H7N9亚型禽流感病毒是其中的一种，既往仅在禽间发现，未发现过人的感染情况。这个病毒的生物学特点、致病力、传播力，还没有依据进行分析判断。

H7N9型禽流感是一种新型禽流感，于2013年3月底在上海和安徽两地率先发现。H7N9型禽流感是全球首次发现的新亚型流感病毒，尚未纳入我国法定报告传染病监测报告系统，并且至2013年4月初尚未有疫苗推出。被该病毒感染均在早期出现发热等症状，至2013年4月尚未证实此类病毒是否具有人传染人的特性。2013年4月经调查，H7N9禽流感病毒基因来自于东亚地区野鸟和中国上海、浙江、江苏鸡群的基因重配。截至2015年01月25日，全国已确诊133人，37人死亡，76人痊愈。病例分布于北京、上海、江苏、浙江、安徽、山东、河南、台湾、福建、东莞、汕尾等地。

目前，由于对于禽流感尤其是H7N9型禽流感一直存在着检测方法不够灵敏、预防效果不够理想等问题，所以提供一种新型的禽流感病毒核酸序列来增加人们对于H7N9型禽流感的进一步认识具有重要意义。

发明内容

鉴于现有技术所存在的问题，本发明提供一种分离的禽流感病毒核酸序列，对于人们对于H7N9型禽流感的进一步认识具有重要意义。

本发明解决上述技术问题的技术方案如下：

一种分离的禽流感病毒H7基因的核酸序列，具有如SEQ ID NO：1所示的核酸序列。

SEQ ID NO：1所示的核酸序列如下：

ATGAACACTCAAATCCTCGTTTTCGCCCTCATCGCCATCATCCCCACTAACGCTGATAAGATCTGCCTCGGTCACCACGCTGTCTCCAACGGCACCAAGGTTAACACCCTCACTGAGAGAGGAGTGGAAGTGGTCAACGCTACAGAGACCGTGGAACGCACAAACATCCCCAGGATCTGCTCCAAGGGCAAGCGTACCGTCGACTTGGGCCAGTGTGGCCTGCTCGGAACTATCACAGGCCCCCCTCAGTGCGATCAATTCTTGGAGTTCTCTGCCGACCTGATCATCGAGCGTCGCGAAGGAAGCGATGTGTGTTACCCTGGCAAGTTCGTCAACGAGGAAGCTCTGAGACAGATCCTCCGTGAGAGCGGTGGCATCGACAAGGAAGCCATGGGATTCACCTACTCAGGTATCCGCACAAACGGAGCTACCTCGGCTTGCAGGAGATCCGGCTCCTCTTTCTACGCTGAGATGAAGTGGTTGCTGTCTAACACTGACAACGCTGCCTTCCCACAGATGACAAAGAGCTACAAGAACACCAGGAAGTCACCGGCTCTGATCGTTTGGGGTATCCACCACTCTGTGAGCACTGCCGAGCAAACAAAGCTCTACGGCTCCGGAAACAAGTTGGTTACCGTGGGAAGCTCAAACTACCAGCAATCCTTCGTCCCATCTCCGGGTGCTCGCCCACAGGTTAACGGTCTGTCTGGCAGGATCGATTTCCACTGGTTGATGCTGAACCCAAACGACACCGTGACTTTCTCATTCAACGGCGCTTTCATCGCCCCGGACAGAGCTTCGTTCCTGCGTGGCAAGTCTATGGGCATCCAGAGCGGAGTCCAAGTTGATGCCAACTGCGAGGGTGACTGTTACCACTCAGGAGGTACCATCATCTCGAACCTCCCCTTCCAGAACATCGACAGCCGTGCTGTCGGCAAGTGCCCTCGCTACGTTAAGCAAAGGTCTCTCTTGCTGGCCACTGGAATGAAGAACGTCCCCGAGATCCCTAAGGGTCGCGGCTTGTTCGGTGCTATCGCCGGCTTCATCGAGAACGGATGGGAAGGTCTGATCGACGGCTGGTACGGATTCAGGCACCAGAACGCTCAAGGAGAGGGTACTGCTGCCGATTACAAGTCAACACAGTCGGCCATCGACCAAATCACCGGAAAGCTCAACAGATTGATCGAAAAGACTAACCAGCAATTCGAGCTGATCGATAACGAATTCAACGAGGTGGAAAAGCAGATCGGTAACGTCATCAACTGGACCCGTGACTCCATCACTGAAGTGTGGTCTTACAACGCTGAGCTCTTGGTCGCCATGGAAAACCAGCACACCATCGATCTGGCTGACTCCGAGATGGATAAGCTCTACGAACGTGTGAAGCGCCAATTGAGGGAGAACGCCGAGGAAGACGGCACTGGATGTTTCGAAATCTTCCACAAGTGCGACGATGACTGTATGGCTTCGATCCGCAACAACACATACGACCACTCCAAGTACAGAGAGGAAGCCATGCAGAACCGTATCCAAATCGATCCTGTTAAGCTGTCGTCCGGTTACAAGGACGTCATCCTCTGGTTCAGCTTCGGCGCTTCATGCTTCATCCTGCTCGCCATCGTTATGGGACTGGTTTTCATCTGCGTCAAGAACGGCAACATGCGCTGCACAATCTGTATCTAA

一种编码H7基因的氨基酸序列，具有如SEQ ID NO：2所示的氨基酸序列：

本发明SEQ ID NO：1所示的核酸序列和SEQ ID NO：2所示的氨基酸序列可用于H7N9禽流感病毒的检测和预防。

本发明的有益效果是：由于H7N9禽流感病毒存在着传播快、危害大、致病率高等特点，为针对H7N9禽流感的预防和检测带来了很大困难，本发明提供了一种分离的禽流感病毒H7基因的核酸以及氨基酸序列，为H7N9禽流感病毒的检测和预防提供了重要参考，有利于简单、方便、快速检测方法的建立。

附图说明

图1为本发明H7N9禽流感病毒的电镜检测图。

具体实施方式

以下结合附图对本发明的原理和特征进行描述，所举实例只用于解释本发明，并非用于限定本发明的范围。

实施例利用高通量测序H7N9禽流感病毒的基因组

采集样品：选择A/Anhui/1/2013(H7N9)病毒株为种子株，将种子株在无特殊病原体的鸡胚中连续传代培养，使其自发突变，得到的H7N9禽流感病毒的电镜检测图如图1所示，收集样品，

提取RNA：按照MagMAX Viral RNA Isolation Kit说明书操作：取200微升样品，加入600微升裂解液，50微升磁珠混合液，震荡10min，使其充分裂解并吸附核酸，放在磁力架上，溶液变澄清后弃掉上清加入300微升洗液洗涤I两次，加入洗液II洗涤两次，晾干，最后加入100微升去RNA酶水溶解提取到的RNA。

设计并合成通用引物(引物在深圳华大基因科技有限公司合成)：

U1：ACGCGTGATCAGCAGAAGCAGC，如SEQ ID NO：3所示；

U2：ACGCGTGATCAGTAGAACAAGG，如SEQ ID NO：4所示；

逆转录cDNA扩增，以提取的RNA为模板，以U1U2为模板进一步扩增。逆转录试剂盒购自Invirrogen公司。反应体系及反应条件参见说明书。

将得到cDNA送去深圳华大基因科技有限公司，进行高通量测序，利用NCBI分析比对试验结果。经测序发现，与原始序列相比，测得的序列在H7基因序列部分有多个位点发生突变。测得的核酸序列如SEQ ID NO：1所示，测得的氨基酸序列如：SEQ ID NO：2所示。

以上所述仅为本发明的较佳实施例，并不用以限制本发明，凡在本发明的精神和原则之内，所作的任何修改、等同替换、改进等，均应包含在本发明的保护范围之内。

Claims (3)

1.一种分离的禽流感病毒H7基因的核酸序列，其特征在于，具有如SEQID NO：1所示的核酸序列。

2.根据权利要求1所述一种分离的禽流感病毒H7基因的核酸序列，其特征在于，所述H7基因具有如SEQ I D NO：2所示的氨基酸序列。

3.一种如权利要求1所述的分离的禽流感病毒H7基因的核酸序列在禽流感病毒检测和预防中的应用。