CN102690801B - 冬虫夏草中国被毛孢合成代谢次黄嘌呤核苷酸的酶及应用 - Google Patents

冬虫夏草中国被毛孢合成代谢次黄嘌呤核苷酸的酶及应用 Download PDF

Info

Publication number
CN102690801B
CN102690801B CN201210175192.0A CN201210175192A CN102690801B CN 102690801 B CN102690801 B CN 102690801B CN 201210175192 A CN201210175192 A CN 201210175192A CN 102690801 B CN102690801 B CN 102690801B
Authority
CN
China
Prior art keywords
gene
seq
pund2
pund1
inosine monophosphate
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
CN201210175192.0A
Other languages
English (en)
Other versions
CN102690801A (zh
Inventor
郑裕国
李邦良
吴晖
柳志强
许静
陈丽芳
许峰
薛亚平
袁水金
王鸿艳
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Zhejiang University of Technology ZJUT
Hangzhou Zhongmei Huadong Pharmaceutical Co Ltd
Original Assignee
Zhejiang University of Technology ZJUT
Hangzhou Zhongmei Huadong Pharmaceutical Co Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Zhejiang University of Technology ZJUT, Hangzhou Zhongmei Huadong Pharmaceutical Co Ltd filed Critical Zhejiang University of Technology ZJUT
Priority to CN201210175192.0A priority Critical patent/CN102690801B/zh
Publication of CN102690801A publication Critical patent/CN102690801A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN102690801B publication Critical patent/CN102690801B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02PCLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
    • Y02P20/00Technologies relating to chemical industry
    • Y02P20/50Improvements relating to the production of bulk chemicals
    • Y02P20/52Improvements relating to the production of bulk chemicals using catalysts, e.g. selective catalysts

Landscapes

  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Abstract

本发明涉及一个来自“百令”生产菌冬虫夏草中国被毛孢参与腺嘌呤核苷酸出发合成代谢次黄嘌呤核苷酸的AMP脱氨基酶,编码这个酶的基因及其应用。所述AMP脱氨基酶,包括SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示的蛋白,其编码基因分别对应为SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示的核苷酸序列。本发明从原理上对腺嘌呤核苷酸合成次黄嘌呤核苷酸的代谢途径进行了详细研究,包含本发明所提供的核苷酸序列的克隆DNA可以用来通过转导、转化、结合转移的方法转入工程菌中,通过调节次黄嘌呤核苷酸生物合成基因的表达,赋予宿主次黄嘌呤核苷酸的高表达性,为扩大次黄嘌呤核苷酸的产量提供了有效途径,具有重大应用前景。

Description

冬虫夏草中国被毛孢合成代谢次黄嘌呤核苷酸的酶及应用
(一)技术领域
本发明涉及一组来自“百令”生产菌冬虫夏草中国被毛孢的参与腺嘌呤核苷酸出发合成代谢次黄嘌呤核苷酸的AMP脱氨基酶(adenosine deaminase),编码这个酶的基因及其应用。
(二)背景技术
冬虫夏草(Cordyceps sinensis(Berk.)Sacc.)是冬虫夏草菌寄生在鳞翅目(Lepidoptera)蝙蝠蛾科昆虫(Hepialus armoricanus Oberthur)幼虫上的子座及幼虫尸体上的复合体(包括子座和虫体)。冬虫夏草是一类珍惜的传统真菌药材资源,具有代谢产物和生物活性多样的特点,在生物医药领域展现出巨大的应用和发展前景。冬虫夏草以其多种药用功效广泛、明显而备受关注,在世界范围内备受推崇。中医认为,冬虫夏草入肺肾二经,既能补肺阴,又能补肾阳,主治肾虚,阳痿遗精,腰膝酸痛,病后虚弱,久咳虚弱,劳咳痰血,自汗盗汗等,是唯一的一种能同时平衡、调节阴阳的中药。现代药理学已证实,冬虫夏草具有免疫调节、抗菌、抗肿瘤、抗氧化、抗衰老、降血糖血脂、性激素样作用等广泛的生物活性。
冬虫夏草菌是一种子囊菌,在其生活史中具有分生孢子阶段(无性型)和子囊孢子阶段(有性型)。而在人工培养、液体发酵等实际生产中使用的是无性阶段的冬虫夏草菌,因而冬虫夏草无性型的鉴定非常重要。国内外学者在冬虫夏草资源调查、无性型确证、活性成分分离分析和作用机理、开发应用方面做了大量工作。冬虫夏草中国被毛孢已被证明是冬虫夏草的无性型存在形式,具有与天然冬虫夏草相同的活性成分和药效。
天然虫草具有严格的寄生性以及特殊的生态环境,故其产量很低,价格高昂。野生冬虫夏草由于受生长环境等因素制约,资源匮乏。由于近几年在人工栽培上进展不大,野生冬虫夏草代用品研究多集中在液体发酵上。利用液体深层发酵培养冬虫夏草菌丝体、提取物或发酵液,是解决冬虫夏草药源的一种有效途径。虫草发酵生产虫草替代品,既可有效保护虫草这一珍贵资源,又不受气候、地理环境和虫草寄生条件严格的限制,适合于工业化大规模生产。生产出的替代品如菌丝体其成分和药效也与天然虫草相似,因而国内外一直致力于虫草菌丝体的发酵培养。人工发酵培养冬虫夏草中国被毛孢得到的菌丝,经毒理、药理、植化研究,证明与天然虫草化学组成、药理作用基本一致,可代替天然虫草生产虫草制品,以弥补自然资源的短缺,通过对发酵条件的优化,菌丝体生物量和代谢产物的量均有明显提高。
近年来,随着天然产物化学和现代色谱技术的飞速发展,在对虫草产品研发中已逐步由虫草原料或粗提物的直接利用转向更深层次的功能性代谢产物研究。国内外已对虫草代谢产物做了大量的研究,代谢产物主要包括核苷、多糖、多肽、甾醇等几大类化合物,其中嘌呤类核苷、虫草多糖、甘露醇等具有代表性的功能性代谢产物在生物合成、药理作用等方面的研究初见成效。
核苷类是虫草最主要的活性物质之一,其中嘌呤类核苷包括腺苷和鸟苷及它们的前体类物质次黄嘌呤核苷(肌苷)和黄嘌呤核苷等。研究表明腺苷可作为心脏病治疗药物,还可用于诊断冠心病,其类似物具有抗病毒活性和抗肿瘤作用;肌苷可用于心脏病、肝病、白血球减少症、血小板减少症、视神经萎缩和中心性视网膜炎等疾病的治疗,能预防及解除由血防药物引起的对心脏或肝脏的副作用;鸟苷则可作为三氮唑核苷、无环鸟苷等许多抗病毒药物的合成原料。
由于嘌呤核苷及其类似物的重要生理作用,国内外有关微生物生产嘌呤类核苷已有很多研究。Matsui等(Matsui,Sato et al.Mutation of an inosine-producing strain ofBacillus subtilis to DL-methionine sulfoxide resistance for guanosine production[J].Applied and Environmental Microbiology,1997,34(4):337-341.)对肌苷生产菌B.subtilis1411进行诱变处理得到鸟苷高产菌AG169。为了进一步提高生产水平,国内有研究人员对生产菌中嘌呤核苷合成途径的遗传背景进行了研究(Qian,Cai et al.Analysis of three nucleotide sequences involved in purine nucleotides biosynthesis ininosine and guanosine-producing bacilus subtilis.Acta Microbiologica Sinica,2003,43(2):200-205.)。该研究从分子水平揭示了生产菌的部分遗传特性,有助于在基因水平理解产物在生产菌中的积累。
目前,所应用的嘌呤类核苷生产菌以枯草芽孢杆菌为主,而作为重要合成代谢嘌呤类核苷的冬虫夏草菌,还只停留在代谢产物成分分析和功效的研究上,对冬虫夏草菌嘌呤类核苷合成代谢途径中相关基因和蛋白的研究还很少见。
(三)发明内容
本发明目的在于针对以上存在的不足和需要解决的技术问题,对“百令”生产菌冬虫夏草中国被毛孢合成代谢次黄嘌呤核苷酸的酶及其编码基因进行深入研究,提供了“百令”生产菌冬虫夏草中国被毛孢参与腺嘌呤核苷酸出发合成代谢次黄嘌呤核苷酸的酶、编码基因及其应用。
本发明采用的技术方案是:
一组来自“百令”生产菌冬虫夏草中国被毛孢参与腺嘌呤核苷酸出发合成代谢次黄嘌呤核苷酸的AMP脱氨基酶:序列为SEQ ID No.1的punD1蛋白和序列为SEQ IDNo.2的punD2蛋白;该酶可催化腺嘌呤核苷酸制备次黄嘌呤核苷酸。
由腺嘌呤核苷酸合成代谢获得次黄嘌呤核苷酸的路径参见如下所示:
Figure BDA00001691948200031
本发明还涉及所述的AMP脱氨基酶在生物催化腺嘌呤核苷酸制备次黄嘌呤核苷酸中的应用。
本发明还涉及上述AMP脱氨基酶的编码基因,即AMP脱氨基酶基因:序列为SEQ ID No.3的punD1基因和序列为SEQ ID No.4的punD2基因。
所述的基因可用于构建能够生物催化腺嘌呤核苷酸制备次黄嘌呤核苷酸的基因工程菌,以扩大次黄嘌呤核苷酸或其衍生物的产量。
本发明的有益效果主要体现在:本发明从原理上对腺嘌呤核苷酸合成次黄嘌呤核苷酸代谢途径进行了详细研究,包含本发明所提供的核苷酸序列的克隆DNA可以用来通过转导、转化、结合转移的方法转入工程菌中,通过调节次黄嘌呤核苷酸生物合成基因的表达,赋予宿主次黄嘌呤核苷酸的高表达性,为扩大次黄嘌呤核苷酸或其衍生物的产量提供了有效途径,具有重大应用前景。
(四)附图说明
图1为“百令”生产菌冬虫夏草中国被毛孢总RNA的甲醛变性凝胶电泳图;
图2为嘌呤代谢途径注释图;
图3为AMP脱氨基酶基因PCR扩增产物凝胶电泳图;
图4为克隆载体pMD18-T Vector与表达载体pET-28b物理图谱;
图5为重组克隆质粒pMD18-T/punC物理图谱;
图6为重组表达质粒pET-28b/punC构建过程示意图;
图7为重组表达质粒pET-28b/punC物理图谱;
图8为AMP脱氨基酶蛋白SDS-PAGE图。
(五)具体实施方式
下面结合具体实施例对本发明进行进一步描述,但本发明的保护范围并不仅限于此:
实施例1:“百令”生产菌冬虫夏草中国被毛孢的培养
菌株来源:首先从青海采集天然冬虫夏草,并将其带回杭州进行分离筛选,得到了L0106菌株,并经菌种鉴定该菌株为中国被毛孢(Hirsutella Sinensis),该菌种保藏在中国典型培养物保藏中心,保藏编号为CCTCC No:M 2011278,已在在先专利申请CN102373190A中披露。
将该菌种接种于斜面,培养基配方(此为固化之前的液体配方,按下述比例配制好之后再制成斜面)为葡萄糖2.0%(w/v,1%表示100mL培养基中含有1g,下同)、玉米粉1.0%、土豆汁0.5%、糊精0.5%、酵母粉0.5%、麸皮1.0%、蚕蛹粉2.0%、蛋白胨1.0%、硫酸镁0.05%、磷酸二氢钾0.05%、琼脂粉1.0%,余量为水,在12~16℃培养25天;然后将菌种接种于发酵培养基,培养基配方为葡萄糖1.0%、糖蜜1.0%、蚕蛹粉0.5%、黄豆饼粉1.0%、酵母膏0.5%、硫酸镁0.01%、磷酸二氢钾0.02%,余量为水,置于摇床上,温度12~16℃培养25天,培养结束后在无菌条件下,进行固液分离,并将固体置于无菌器具,备用。
实施例2:“百令”生产菌冬虫夏草中国被毛孢总RNA的提取
用TRIzol试剂提取总RNA,步骤具体为:1)液氮研磨:取1g新鲜菌体放入研钵中,反复加入液氮充分研磨至粉末状,分装到预冷的1.5mL离心管中,加入1mLTRIzol试剂,混匀,冰上静置5min,使核酸蛋白复合物完全分离。2)RNA分离:加入0.2mL氯仿,用力震荡混匀15s,冰上静置2~3min,4℃、12000rpm离心15min,分层,取上层水相,约600μL。3)RNA沉淀:加入500μL异丙醇,在冰上静置10min,4℃、12000rpm离心10min,弃上清。4)RNA洗涤:加入1mL 75%(v/v)乙醇,将沉淀悬起,冰上静置10min,4℃、7500rpm离心15min;重复上面洗涤步骤,再洗一遍。5)溶解RNA:将离心管置于冰上敞开干燥5~10min,加适量DEPC水溶解。
实施例3:“百令”生产菌冬虫夏草中国被毛孢RNA样品测序
提取样品总RNA后,用带有Oligo(dT)的磁珠富集mRNA。加入fragmentationbuffer将mRNA打断成短片段(200~700bp),以mRNA为模板,用六碱基随机引物(random hexamers)合成第一条cDNA链,然后合成第二条cDNA链,再经过QiaQuickPCR试剂盒纯化并加EB缓冲液洗脱之后做末端修复、加polyA并连接测序接头,然后用琼脂糖凝胶电泳进行片段大小选择,最后进行PCR扩增,建好的测序文库用Illumina GAIIx进行测序。测序得到的原始图像数据经base calling转化为序列数据,即raw data或raw reads。除去原始测序reads中只含adaptor序列的reads,备以后续分析。
实施例4:“百令”生产菌冬虫夏草中国被毛孢RNA短读序列组装
使用短reads组装软件SOAPdenovo(Li,Zhu et al.De novo assembly of humangenomes with massively parallel short read sequencing[J].Genome Res,2010,20:265-272.)做转录组从头组装。SOAPdenovo首先将具有一定长度overlap的reads连成更长的不含N的Contig片段。然后将reads比对回Contig,通过paired-end reads确定来自同一转录本的不同Contig以及这些Contig之间的距离,SOAPdenovo将这些Contig连在一起,中间未知序列用N表示,这样就得到Scaffold。进一步利用paired-endreads对Scaffold做补洞处理,最后得到含N最少,两端不能再延长的Unigene序列。最后,将Unigene序列与蛋白数据库nr、Swiss-Prot、KEGG和COG做blastx比对(evalue<0.00001),取比对结果最好的蛋白确定Unigene的序列方向。如果不同库之间的比对结果有矛盾,则按nr、Swiss-Prot、KEGG和COG的优先级确定Unigene的序列方向,跟以上四个库皆对比不上的Unigene用软件ESTScan(Iseli,Jongeneel et al.ESTScan:a program for detecting,evaluating,and reconstructing potential coding regionsin EST sequences[J].In Proceedings of 9th InternationalConference on Intelligent Systemsfor Molecular Biology.AAAIPress,Menlo Park,CA,pp.1999,138-148.)预测其编码区并确定序列的方向。对于能确定序列方向的Unigene给出其从5'到3'方向的序列,对于无法确定序列方向的Unigene给出组装软件得到的序列。
实施例5:“百令”生产菌冬虫夏草中国被毛孢Unigene功能注释
功能注释信息给出Unigene的蛋白功能注释、Pathway注释、COG功能注释和GeneOntology(GO)功能注释。首先,通过blastx将Unigene序列比对到蛋白数据库nr、Swiss-Prot、KEGG和COG(evalue<0.00001),得到跟给定Unigene具有最高序列相似性的蛋白,从而得到该Unigene的蛋白功能注释信息。根据KEGG注释信息能进一步得到Unigene的Pathway注释。将Unigene和COG数据库进行比对,预测Unigene可能的功能并对其做功能分类统计。根据nr注释信息,使用Blast2GO软件(Conesa,Gotz et al.Blast2GO:a universal tool for annotation,visualization and analysis infunctional genomics research[J].Bioinformatics,2005,21(18):3674-3676.)得到Unigene的GO注释信息。得到每个Unigene的GO注释后,用WEGO软件(Ye,Fang et al.WEGO:a web tool for plotting GO annotations[J].Nucleic Acids Research,2006,34:293-297.)对所有Unigene做GO功能分类统计,从宏观上认识该物种的基因功能分布特征。
实施例6:“百令”生产菌冬虫夏草中国被毛孢次黄嘌呤核苷酸代谢途径分析
图2是KEGG代谢途径注释中的嘌呤代谢(map00230),已注释的酶是已检测到的“百令”生产菌冬虫夏草中国被毛孢嘌呤代谢途径相关酶类,从图中可以看出,检测到了从腺嘌呤核苷酸出发合成次黄嘌呤核苷酸的AMP脱氨基酶2个Unigene。通过NCBI中的ORF Finder软件在线检测,找出了这个基因的开放阅读框(SEQ ID No.3和SEQ ID No.4)并得到了相应的蛋白质序列(SEQ ID No.1和SEQ ID No.2)。
实施例7:“百令”生产菌冬虫夏草中国被毛孢AMP脱氨基酶基因引物设计
运用GENE RUNNER引物设计软件根据预测得到的基因开放阅读框DNA序列设计引物,用于克隆“百令”生产菌中国被毛孢合成代谢次黄嘌呤核苷酸的AMP脱氨基酶基因,引物由上海生工生物工程有限公司合成,引物序列如下所列:
punD1基因:正向引物5’ATTGAGCTCATGGTGAAGACGAACGTGC3’
反向引物5’ATTAAGCTTCTAGTTCCGTACCCTGCCAC3’
punD1基因长度为378bp
punD2基因:正向引物5’ATTGAATTCATGCTGCTGGCCAAGCTGG3’
反向引物5’ATTAAGCTTCTAGCCGGCCTCGAAGAG3’
punD2基因长度为1032bp
实施例8:“百令”生产菌冬虫夏草中国被毛孢cDNA第一链的制备
先按照实施例1提供的方法培养出中国被毛孢发酵菌丝体后,再按照实施例2所提供的方法对中国被毛孢进行总RNA的提取,得到总RNA后按下述进行“百令”生产菌冬虫夏草中国被毛孢cDNA第一链的合成,用于后续各基因克隆实验。
采用PrimeScript 1st Strand cDNA Synthesis Kit试剂盒(TaKaRa)从Total RNA中反转录合成cDNA第一链,实验步骤如下:
1)在Microtube管中配制下列混合液。
Figure BDA00001691948200061
2)变性、退火操作有利于模板RNA的变性以及反转录引物和模板的特异性退火,可提高反转录反应效率,所以在PCR仪上进行变性、退火反应,条件设置如下:
65℃,5min
4℃
3)退火结束后离心数秒钟使模板RNA/引物等的混合液聚集于Microtube管底部。
4)在上述Microtube管中配制下列反转录反应液。
Figure BDA00001691948200071
5)在PCR仪上按下列条件进行反转录反应。
42℃    15~30min
70℃    15min
4℃
一般情况,在真核生物mRNA3’末端都有一个PolyA结构,A碱基的数量在十至几百个不等,利用这一结构可以利用Oligo(dT)引物,在反转录酶的作用下,以mRNA为模板合成cDNA第一链,本发明采用由TaKaRa独自开发的dT区域的序列(PrimeScript 1st Strand cDNA Synthesis Kit中提供)为引物,如果获得的mRNA完整性较好,那么通过逆转录过程可以得到物种中所有酶蛋白编码基因的cDNA第一链。
实施例9:“百令”生产菌冬虫夏草中国被毛孢合成代谢嘌呤类核苷功能基因AMP脱氨基酶punD1、punD2基因的克隆、表达以及蛋白活力的检测
1、AMP脱氨基酶punD1和punD2基因的PCR扩增
以实施例8中得到的cDNA第一链为模板,用实施例7中合成的punD1基因引物:5’ATT GAG CTC ATG GTG AAG ACG AAC GTG C3’和5’ATT AAG CTT CTA GTTCCG TAC CCT GCC AC3’与punD2基因引物:5’ATT GAA TTC ATG ATT GGA ATCACC CAG CC3’和5’AGG AAG CTT CTA CGT CGA GTT CAT CGT CAA G3’进行PfuDNA聚合酶PCR扩增反应。
2、AMP脱氨基酶punD1和punD2基因PCR产物凝胶电泳检测
转录组测序预测AMP脱氨基酶punD1基因的大小为378bp,punD2基因的大小为1032bp,琼脂糖凝胶电泳结果表明已成功扩增出了AMP脱氨基酶punD1和punD2基因。
3、AMP脱氨基酶punD1和punD2基因PCR产物的加碱基A处理以及纯化
由于Pfu DNA聚合酶PCR产物末端为平端,所以在胶回收后还需进行加碱基A处理、纯化后才可用于T载体连接,最后用AxyPrep PCR清洁试剂盒纯化。
4、AMP脱氨基酶punD1和punD2基因与克隆载体的连接
克隆载体pMD18-TVector购自TaKaRa公司(TaKaRa code D101A),其物理图谱见图4,分别将AMP脱氨基酶punD1和punD2基因与克隆载体连接构建重组质粒pMD18-T/punD1和pMD18-T/punD2,物理图谱见图5。
5、AMP脱氨基酶重组质粒pMD18-T/punD1和pMD18-T/punD2的转化
分别将重组质粒pMD18-T/punD1和pMD18-T/punD2转入大肠杆菌E.coli JM109中构建携带AMP脱氨基酶punD1基因和punD2基因的重组菌E.coliJM109/pMD18-T/punD1和JM109/pMD18-T/punD2,具体步骤为:1)将10μL反应体系转至感受态细胞E.coli JM109中,冰浴30min;2)热击:42℃,90s;3)冰浴:2-3min;4)加入800μL液体LB,37℃,250rpm,1h;5)涂布平板(含Amp抗性);6)37℃培养箱培养过夜。
6、AMP脱氨基酶E.coli JM109/pMD18-T/punD1和E.coli JM109/pMD18-T/punD2阳性重组菌的筛选
菌落PCR可不必提取基因组DNA,而直接以菌体热解后暴露的DNA为模板进行PCR扩增,该方法操作简便、快捷、可以快速鉴定菌落是否为含有目的质粒的阳性菌落,将接种到液体培养基中对应的单菌落进行菌落PCR,以验证是否转入目的基因。首先,用牙签挑取单菌落加入含50μL无菌水的1.5mL离心管中,沸水浴30min,然后离心以上清作为模板,进行PCR扩增,具体的反应体系如下所示,PCR程序设定为Taq酶扩增一般程序。最后采用0.9%的琼脂糖凝胶电泳检测菌落PCR产物。
7、AMP脱氨基酶重组质粒pMD18-T/punD1和pMD18-T/punD2的测序
对菌落PCR检测出的阳性重组菌液体LB培养基培养过夜后,取4mL菌液提取质粒,方法按AxyPrep质粒DNA小量试剂盒提供的操作说明。测序由上海桑尼生物科技有限公司完成。
8、AMP脱氨基酶重组表达质粒pET-28b/punD 1和pET-28b/punD2的构建
实验根据外源基因在大肠杆菌中表达的原则,以及表达载体pET-28b和AMP脱氨基酶punD1和punD2基因酶切位点比对情况,确定了punD1基因Sac Ⅰ和HindIII、punD2基因EcoRⅠ和HindIII双酶切位点,并分别对重组大肠杆菌E.coliJM109/pMD18-T/punD1和E.coli JM109/pMD18-T/punD2进行液体LB试管摇床培养、重组质粒提取。
将AMP脱氨基酶punD1重组质粒pMD18-T/punD1和表达载体pET-28b用SacⅠ/HindIII限制性内切酶在37℃分别酶切,将AMP脱氨基酶punD2重组质粒pMD18-T/punD2和表达载体pET-28b用EcoRⅠ/HindIII限制性内切酶,分别37℃酶切处理6h。酶切结束后65℃灭活15min,然后分别用Axygen DNA凝胶回收试剂盒进行回收、纯化。
AMP脱氨基酶punD1和punD2基因及表达载体pET-28b经双酶切、纯化后再用T4连接酶16℃连接过夜,构建重组表达质粒pET-28b/punD1和pET-28b/punD2,其构建过程见图6,构建得到的重组表达质粒pET-28b/punD1和pET-28b/punD2图谱见图7。
9、AMP脱氨基酶重组表达质粒pET-28b/punD1和pET-28b/punD2的转化以及阳性单克隆的筛选
将构建好的表达质粒分别热激转化至E.coli BL21宿主菌中,然后涂布到含有卡那霉素(Kan)抗性的LB琼脂平板上,37℃培养过夜。从平板上随机挑选单菌落,以各功能基因的引物进行PCR扩增,挑选阳性克隆。
10、AMP脱氨基酶重组菌E.coli BL21/pET-28b/punD1和E.coliBL21/pET-28b/punD2的诱导表达
将鉴定为阳性的单克隆接种于5mL含有Kan抗性的LB液体培养基中,37℃、250r/min培养过夜。取1mL培养物,将其转接于50mL含有Kan抗性的LB液体培养基中37℃、250r/min培养至菌体浓度OD600约为0.6~0.8左右。向培养物中分别加入一定浓度的IPTG诱导培养8h。收集菌体供电泳分析以及酶活检测。
11、AMP脱氨基酶重组菌E.coli BL21/pET-28b/punD1和E.coliBL21/pET-28b/punD2表达产物SDS-PAGE分析
以转入空载体的E.coli BL21菌及未加入诱导剂IPTG的重组菌作为对照。鉴定为阳性的重组菌经IPTG诱导培养一定时间后,取0.5mL诱导培养物,离心收集菌体,重悬于50μL蒸馏水中,加入50μL上样缓冲液,混匀后煮沸10min,进行SDS-PAGE电泳分析,图8中的“D1”和“D2”泳道即为重组菌E.coli BL21/pET-28b/punD1和E.coli BL21/pET-28b/punD2表达的AMP脱氨基酶蛋白punD1和punD2的SDS-PAGE图。
12、AMP脱氨基酶重组菌E.coli BL21/pET-28b/punD1和E.coliBL21/pET-28b/punD2的蛋白活性检测
酶液制备:分别称取收集的重组菌E.coli BL21/pET-28b/punD1和E.coliBL21/pET-28b/punD20.5g用磷酸盐缓冲液(50mM、pH8.0)15mL悬浮,超声破碎(功率350W、破碎2s、间隔2s、共超声破碎5min)。
AMP脱氨基酶punD1和punD2转化体系:在50mL转化瓶中加入E.coliBL21/pET-28b/punD1和E.coli BL21/pET-28b/punD2超声破碎菌体混合液10mL、1%腺苷酸,30℃、150r/min转化,转化结束后,离心取上清备以后续检测。
检测方法:反相离子对色谱法定量检测次黄嘌呤核苷酸。条件:色谱柱,μBondapakC1810μm,125A,4.6×300mm;流动相:水、冰乙酸、四丁基氢氧化铵和甲醇以一定比例进行混合,使用前用0.45μm有机相膜进行抽滤,并超声波除气5min;检测波长254nm;进样体积10μL。分别配制次黄嘌呤核苷酸标准样品1-10000μg/mL的梯度质量浓度,绘制标准曲线。
转化结束后,将转化液于14000rpm离心25min,用0.45μm微孔滤膜过滤,滤液供反相离子对色谱分析。最后测得次黄嘌呤核苷酸得率为58.3%。
Figure IDA00001691948800011
Figure IDA00001691948800021
Figure IDA00001691948800031
Figure IDA00001691948800041

Claims (5)

1.一组来自冬虫夏草中国被毛孢的参与腺嘌呤核苷酸合成代谢次黄嘌呤核苷酸的AMP脱氨基酶:序列为SEQ ID No.1的punD1蛋白和序列为SEQ ID No.2的punD2蛋白。
2.如权利要求1所述的AMP脱氨基酶在生物催化腺嘌呤核苷酸制备次黄嘌呤核苷酸中的应用。
3.编码权利要求1所述AMP脱氨基酶的基因。
4.如权利要求3所述的基因,其特征在于所述基因为序列为SEQ ID No.3的punD1基因和序列为SEQ ID No.4的punD2基因。
5.如权利要求3或4所述的基因在构建能够生物催化腺嘌呤核苷酸制备次黄嘌呤核苷酸的基因工程菌中的应用。
CN201210175192.0A 2012-05-28 2012-05-28 冬虫夏草中国被毛孢合成代谢次黄嘌呤核苷酸的酶及应用 Active CN102690801B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201210175192.0A CN102690801B (zh) 2012-05-28 2012-05-28 冬虫夏草中国被毛孢合成代谢次黄嘌呤核苷酸的酶及应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201210175192.0A CN102690801B (zh) 2012-05-28 2012-05-28 冬虫夏草中国被毛孢合成代谢次黄嘌呤核苷酸的酶及应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN102690801A CN102690801A (zh) 2012-09-26
CN102690801B true CN102690801B (zh) 2014-07-02

Family

ID=46856537

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201210175192.0A Active CN102690801B (zh) 2012-05-28 2012-05-28 冬虫夏草中国被毛孢合成代谢次黄嘌呤核苷酸的酶及应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN102690801B (zh)

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN103013946B (zh) * 2012-11-09 2015-01-28 浙江工业大学 一种冬虫夏草十六烷辅酶a水解酶、基因及其应用
CN103031284B (zh) * 2012-12-10 2014-11-26 浙江工业大学 冬虫夏草胸苷酸合成酶、编码基因及其应用

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102373190A (zh) * 2011-09-09 2012-03-14 浙江工业大学 冬虫夏草中国被毛孢合成代谢甘露醇相关酶、基因及应用

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102373190A (zh) * 2011-09-09 2012-03-14 浙江工业大学 冬虫夏草中国被毛孢合成代谢甘露醇相关酶、基因及应用

Non-Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
AMP DEAMINASE ISOZYMES IN HUMAN TISSUES;NOBUAKI OGASAWARA等;《Biochimica et Biophysica Acta》;19821231;第714卷;298-306 *
Cloning of Human AMP Deaminase Isoform E cDNAs;Donna K. Mahnke-Zizelman等;《The Journal of Biological Chemistry》;19921015;第267卷(第29期);20866-20877 *
Donna K. Mahnke-Zizelman等.Cloning of Human AMP Deaminase Isoform E cDNAs.《The Journal of Biological Chemistry》.1992,第267卷(第29期),20866-20877.
NOBUAKI OGASAWARA等.AMP DEAMINASE ISOZYMES IN HUMAN TISSUES.《Biochimica et Biophysica Acta》.1982,第714卷298-306.
任斌 等.腺苷一磷酸脱氨酶(AMPD1)基因的研究进展.《中国畜禽种业》.2008,70-72.
腺苷一磷酸脱氨酶(AMPD1)基因的研究进展;任斌 等;《中国畜禽种业》;20080415;70-72 *

Also Published As

Publication number Publication date
CN102690801A (zh) 2012-09-26

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN102690796A (zh) 冬虫夏草中国被毛孢合成代谢鸟苷酸的酶、基因及其应用
CN103087998B (zh) 冬虫夏草合成十六烷基-辅酶a的酶、基因及其应用
CN102690801B (zh) 冬虫夏草中国被毛孢合成代谢次黄嘌呤核苷酸的酶及应用
CN103031295B (zh) 冬虫夏草胞苷脱氨酶、编码基因及其应用
CN103031285B (zh) 冬虫夏草中国被毛孢尿苷-胞苷激酶、编码基因及其应用
CN102747057B (zh) 冬虫夏草中国被毛孢合成代谢嘌呤的酶、基因及其应用
CN102690800B (zh) 冬虫夏草中国被毛孢合成代谢黄嘌呤的酶、基因及其应用
CN102690797A (zh) 冬虫夏草中国被毛孢合成代谢腺嘌呤的酶、基因及其应用
CN102776162B (zh) 冬虫夏草中国被毛孢合成代谢腺苷酸的酶、基因及其应用
CN103045574B (zh) 冬虫夏草中国被毛孢尿苷酸合成酶、编码基因及其应用
CN103031287B (zh) 冬虫夏草中国被毛孢二磷酸核苷激酶、编码基因及其应用
CN102703396A (zh) 冬虫夏草中国被毛孢合成代谢黄嘌呤核苷酸的酶及其应用
CN103031286B (zh) 冬虫夏草中国被毛孢尿苷酸-胞苷酸激酶、编码基因及应用
CN103031284B (zh) 冬虫夏草胸苷酸合成酶、编码基因及其应用
CN103031281B (zh) 冬虫夏草中国被毛孢氨甲酰磷酸合成酶、编码基因及应用
CN104651324B (zh) 冬虫夏草ctp合成酶、编码基因及其应用
CN103031280B (zh) 冬虫夏草ctp合成酶、编码基因及其应用
CN103031296B (zh) 冬虫夏草dCMP脱氨酶、编码基因及其应用
CN103031288A (zh) 冬虫夏草中国被毛孢5’-核苷酸酶、编码基因及其应用
CN102965350B (zh) 一种冬虫夏草十八烷酰辅酶a脱氢酶、基因及其应用
CN102965351B (zh) 一种冬虫夏草ω-6 脂肪酸-脱氢酶、基因及其应用
CN103074308B (zh) 冬虫夏草中国被毛孢合成3-羟基丁酸的酶、基因及应用
CN103045573B (zh) 冬虫夏草胞嘧啶脱氨酶、编码基因及其应用
CN103045557B (zh) 冬虫夏草中国被毛孢核苷三磷酸焦磷酸酶、编码基因及应用
CN104120112A (zh) 冬虫夏草3-异丙基苹果酸脱氢酶b、编码基因及其应用

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
C14 Grant of patent or utility model
GR01 Patent grant