一种CD105基因的原位杂交检测试剂盒及其检测方法和应用
【技术领域】
本发明涉及一种试剂盒,具体地说关于一种CD105基因的原位杂交检测试剂盒及其检测方法和应用
【背景技术】
2005年美国卫生研究院、癌症研究院、疾控中心等多家单位做了一个年度报告,“认为人类在抗癌大战中是失败”,也就是说癌症死亡率没有降低,其列举出造成抗癌大战失败的几个因素是:1、肿瘤细胞异质性;2、肿瘤细胞耐药性;3、抗癌药物设计思路不完善等。同时,该报告中亦提出应重新审视现有诊治癌症的措施。本发明人在研究中发现,导致癌症死亡率不降的另二个重要原因是:1、不能做到真正的早期诊断;2、转移的病理机制不清楚。依照传统的医学影像及和其它生化(如蛋白标记物)指标来诊断癌症,认为占位性癌块在2公分下是属于早期癌症的诊断(更小些有时无症状体征),这一临床概念值得认真讨论。影像医学的2公分以下癌块属早期这一界定科学性是不够严谨的,从细胞学角度,1公分的肿块约有一亿个肿瘤细胞,2公分的肿块其三维空间的细胞叠加数远不止2亿个肿瘤细胞,从癌变前期到单克隆癌细胞产生及形成2公分的癌块,其病理演变过程相当长,可能是一年或两年、甚至三年以上,很难证实的是在这个过程中,肿块是癌症唯一的发生地和单独的病灶。临床上已证实:一旦形成肿块的同时,其他癌细胞通过不同途径迁移到其他部位克隆生长;一旦切除原发灶后,其他器官复发灶或多发癌块灶先后形成或转移。因此,在临床上以2公分以下的肿块大小来界定早期与否,不够严谨(有些病例,在发现原发病灶时,同时发现转移病灶,不在我们表述的内容中),这时已经是晚期了,这是导致癌症死亡率不降的真正原因。
CD105能调节内皮间质间的信号传递,参与血管生成的过程,是新生血管的标志,与肿瘤组织的侵袭转移密切相关。研究证实,CD105标记的口腔鳞状细胞癌的MVD明显高于临近的正常黏膜,并且与肿瘤的分期及侵袭转移密切相关,CD105标记的MVD优于CD34和因子VIII相关抗原等标记的MVD,与患者生存期相关,可以作为独立的预后指标,而CD34和因子VIII相关抗原与患者的生存期无相关性。由此可见,CD105是判断血管生成状态及肿瘤侵袭转移特性的理想指标。Li等采用ELLSA法检测血浆CD105的水平,发现健康人与乳癌患血浆CD105含量不同,其中伴有肿瘤复发或转移患者的CD105水平显著升高。结直肠癌患者血浆CD105水平与对照组差异明显,而且CD105/TGFβ3术后血浆浓度比术前明显降低,血浆CD105及CD105/TGFβ3可能成为肿瘤侵袭转移的有用标记。Takahashi等也发现,发生转移的直肠癌、乳癌等实质性肿瘤患者的血浆sCD105水平显著高于未发生转移的患者,并发现化疗能降低血浆sCD105的含量,从而提出作为血管生成标记物的血浆sCD105可以用来预测恶性肿瘤患者疾病复发、转移的危险性。这种检测方法简便易行,适合于术前了解病情及术后的随访观察。
随着分子生物技术日益完善,功能基因组学,癌症基因组学等研究的深入展开,至今,我们已有可能在基因水平上做更精确的早期诊断,在癌变前期或癌细胞形成(单克隆时)就能做到早期预测诊断。采用核酸原位杂交技术检测CD105基因的表达量,对对临床各种类型的癌症的早期基因水平的诊断有非常重要的临床意义。CD105基因序列号:NM_000118,3196bp,mRNA.9q33-q34.1″,cds:414…2291bp。
原位杂交技术(in situ hybridization)是将分子生物学与细胞化学技术结合起来,以标记的核酸分子为探针,在组织细胞原位检测特异性核酸分子的技术。其原理是使含有特异序列、经过标记的核酸单链(即探针),在适宜条件下与组织细胞中的互补核酸单链即靶核酸发生杂交,再以放射自显影或免疫细胞化学方法对标记探针进行探测,从而在细胞原位显示特异的DNA或RNA分子。
【发明内容】
本发明的目的是针对现有技术中的不足,提供一种CD105基因的原位杂交检测试剂盒的用途。
本发明的再一的目的是,提供一种CD105基因的原位杂交检测试剂盒。
本发明的另一的目的是,提供一种CD105基因的原位杂交检测方法。
为实现上述目的,本发明采取的技术方案是:
一种CD105基因的原位杂交检测试剂盒在制备检测癌症早期转移、复发疾病药物中的应用,所述的试剂盒包括杂交探针、标记物,所述的杂交探针序列如SEQ ID NO.1所示。
所述的癌症是直肠癌或乳腺癌。
所述的杂交探针序列如SEQ ID NO.1所示的RNA序列。
所述的标记物选自放射性核素或非放射性标记物。
所述的放射性核素选自3H、35S、125I或32P中的一种。
所述的非放射性标记物选自生物素、地高辛、碱性磷酸酶、辣根过氧化酶或荧光素中的一种。
所述的非放射性标记物优选自地高辛。
所述的试剂盒还包括增效剂,所述的增效剂是碱性磷酸酶抗体。
为实现上述第二个目的,本发明采取的技术方案是:
一种CD105基因的原位杂交检测试剂盒,包括杂交探针、标记物,其中所述的杂交探针序列如SEQ ID NO.1所示,所述的标记物选自放射性核素或非放射性标记物。
为实现上述第三个目的,本发明采取的技术方案是:
一种CD105基因的原位杂交检测方法,该方法包括以下步骤:
a、将试剂盒中的杂交探针与底物中待测RNA接触,形成杂交复合体;
b、检测a步骤得到的杂交复合体。
本发明的诊断试剂盒的组份是由杂交探针,杂交液,显色剂,增效剂等组成。本试剂盒的核酸杂交原理是分子生物学业内人士均熟知,具体操作步骤是标本处理、预杂交、杂交、免疫组化染色、镜下进行定量分析、结果报告,其中杂交的具体步骤包括:
仪器操作:
1).将待测标本放入反应槽中;
2).仪器自动弃去液体,自动加消化液;
3).仪器自动弃去液体,自动后固定;
4).仪器自动弃去液体,自动预杂交(42℃);
5).仪器自动弃去液体,自动清洗;
6).仪器自动弃去液体,自动杂交(42℃);
7).仪器自动弃去液体,自动清洗;
8).仪器自动弃去液体,自动与DIG抗体培养(室温);
9).仪器自动弃去液体,自动清洗,显色;
10).取出封片镜检。
本发明优点在于:
1、本发明提供的试剂盒具有灵敏度高、特异性强的特点。
2、本发明的检测方法操作方便、简单,能在区级以上医院普遍使用和推广。
3、本发明的诊断试剂盒与临床上其它检测癌胚蛋白标志物,以及影像医学检查有显著不同。本发明可以在基因水平上检测CD105基因异常表达,在影像医学检查未发现占位性癌病灶复发之前,癌症生化指标未产生异常之前,亦未形成肿瘤之前,能及早做到以上基因表达异常的信息采集,给临床癌症病患一个真正的早期诊断以及治疗后转移复发及早预测。这样才有可能实施癌症的早期诊断、早期预防、早期治疗,有可能从源头上彻底根治癌症恶疾。
【附图说明】
图1是本发明实施例中直肠癌转移病人CD105基因表达图片。
图2是本发明实施例中乳腺癌转移病人CD105基因表达图片。
图3是本发明实施例中正常人CD105基因表达图片。
【具体实施方式】
下面结合附图对本发明具体实施方式作详细说明。
实施例1
一种CD105基因的原位杂交检测试剂盒,包括杂交探针、标记物、增效剂,其中,所述的杂交探针序列如SEQ ID NO.1所示。杂交探针用地高辛标记。试剂盒中的其它液体和标本组成如下:
消化液 100μl/管 1管/盒 无色透明液体
保护液 100μl/管 1管/盒 无色透明液体
预杂交液 1300μl/管 2管/盒 无色透明液体
正义杂交液 10μl/管 1管/盒 无色透明液体
反义杂交液 10μl/管 1管/盒 无色透明液体
封闭液 1000μl/管 1管/盒 无色透明液体
碱性磷酸酶抗体1μl/管 1管/盒 无色透明液体
显色剂A 175μl/管 1管/盒 黄色液体
显色剂B 320μl/管 1管/盒 无色透明液体
缓冲液I 10x 90ml/瓶 1瓶/盒 浅黄色或无色透明液体
缓冲液II 10x 80ml/瓶 1瓶/盒 浅黄色或无色透明液体
缓冲液III 10x 20m/瓶 3瓶/盒 浅黄色或无色透明液体
缓冲液IV 10x 90ml/瓶 1瓶/盒 浅黄色或无色透明液体
固定液 90ml/瓶 1瓶/盒 无色透明液体
阳性对照标本6片/盒
上述试剂成分说明:(所有试剂购自SIGMA)
1、消化液:20mg/ml蛋白酶K,100mg蛋白酶K,加DEPC-H2O 5ml;
2、保护液:0.2g的glycine加入1ml的1×缓冲液I;
3、预杂交液:1×缓冲液II 7.5ml
50×D 3ml
10mg/ml yest t-RNA 750ul
11mg/ml SALMON TESTES DNA 682ul
0.04M EDTA 3ml
50%formamide 15ml
4、封闭液:0.03g的bloking(购买自罗氏公司)加入1ml 1×缓冲液III;
5、10x缓冲液I:(PH7.1-7.4)
NaCl 80g
Na2HPO4.12H2O 360g
KCl 2g
KH2PO42g
加三蒸水至1l,并高压灭菌;
6、10x缓冲液II:(PH7.0)
NaCl 175.3g
柠檬酸钠88.2g
HCl 几滴
加三蒸水至1l,并高压灭菌;
7、缓冲液III:(PH7.9)
Tris 121.1g
NaCl 87.66g
HCl 60ml左右
加三蒸水至1l,并高压灭菌;
8、缓冲液IV:
1M Tris-HCl(PH9.5):Tirs 121.1g加HCl 3ml左右,加水900ml,调PH至9.5,加水至1l,并高压灭菌;
1M NaCl:NaCl 58.44加水至1l,并高压灭菌;
0.5M MgCl2:101.65g MgCl2.6H2O加水至1l,并高压灭菌;
9、固定液:多聚甲醛40g加1×缓冲液I至1l,稍加热(约50-60度)搅拌至溶解;
10、显色剂A:NBT 1g加70%DMF11.44ml;
11、显色剂B:BCIP 1g加100%DMF30ml。
本发明的试剂盒可以多人份使用或一人份使用。
实施例2
一种CD105基因原位杂交检测方法及其试剂盒应用
一、标本处理
1、用10ml的离心管,装4.5ml淋巴细胞分离液,再将3ml抗凝血缓慢加入含有淋巴细胞分离液(血∶淋巴细胞分离液=1∶1.5)的离心管中,2000r/min离心10min;
2、吸取中间层白细胞至另一离心管中,再在此管中加入约两倍的1×缓冲液I,混匀,1500g/min离心10min;
3、弃上清.沉淀加入约两倍的1×缓冲液I,混匀,1500g/min离心10min;
4、弃上清,并把试管口多余的液体用擦手纸吸去。再将沉淀制成悬液,滴在玻片上推片,自然干燥。(有条件的医院可以用制片机制片。)3ml血,可以做4张片子;
5、用40ml 4%固定液,在玻璃缸中,固定30min,再用1×缓冲液I洗5min。每缸可以放16片;
6、标本可保存在-20℃,或继续做实验。
二、将试剂盒中试剂配制成使用浓度
1、将10×缓冲液I用三蒸水按1∶10稀释成1×缓冲液I;
2、将20×缓冲液II用三蒸水按1∶10稀释成2×缓冲液II;
按1∶100稀释成0.2×缓冲液II;按1∶200稀释成0.1×缓冲液II;
3、将10×缓冲液III用三蒸水按1∶10稀释成1×缓冲液III;
4、10×缓冲液VI用三蒸水按1∶10稀释成×缓冲液IV(取1#,2#,3#各10ml,加水至100ml既可)。
三、实验步骤:
1、取每位待检者标本两张,(另外两张留作复查用)及阳性对照标本两张(每次实验做一对阳性对照);
2、在玻璃缸里加消化液(消化液100ul加1×缓冲液199.9ml,即为使用浓度)20ml。37℃水浴预热10分钟。放进16张玻片,37℃处理12min,再用1×缓冲液I洗5min;
3、用0.2%的保护液(保护液1ml加1×缓冲液I99ml即为使用浓度)洗10min,三蒸水洗5min,以上过程都在玻璃缸进行。玻片自然干燥;
4、将玻片放入保湿盒内,加预杂交液20ul/片.盖上盖玻片,盖紧保湿盒,放在42℃恒温水浴箱中3h以上;
5、取出玻片,弃去盖玻片,将玻片放入玻璃缸内,用70%,90%,95%的乙醇各洗2min,自然干燥;
6、将玻片放入保湿盒内,每位病人标本两张,一张加正义杂交液20ul/片,另一张加反义杂交液20ul/片,盖上盖玻片,盖紧保湿盒,放在42℃恒温水浴箱中16-24h;
7、取出玻片,弃去盖玻片,将玻片放入玻璃缸内
在42℃恒温水浴箱中用2×缓冲液II洗两次,每次15min
在42℃恒温水浴箱中用0.2×缓冲液II洗一次,每次15min
在42℃恒温水浴箱中用0.1×缓冲液II洗两次,每次15min;
8、用1×缓冲液III洗30s,取出玻片,自然干燥;
9、将玻片放入保湿盒内,加0.5%l封闭液(1ml封闭液加5ml1×缓冲液III)100ul/片,盖紧保湿盒,在室温下作用30min;
10、取出玻片,用1×缓冲液III洗30s,自然干燥;
11、将玻片放入保湿盒内,加碱性磷酸酶抗体(加入1.8ml 1×缓冲液III)100ul/片,盖紧保湿盒在室温下作用30min;
12、取出玻片,用1×缓冲液III洗3次,每次15min;
13、1×缓冲液IV洗2min,加显色剂(显色剂A73.3ul,显色剂B157.5ul加到30ml 1×缓冲液IV中,混匀),室温避光12h以上;
14、用三蒸水洗5min,自然干燥,(用甘油加10%的1×缓冲液I混匀)封片镜检。
四、结果判断
在光镜下计数100-300个细胞,计算染上紫色细胞的百分比。
阳性对照标本加反义杂交液的应该80%以上染上紫色。
所有加正义杂交液的阴性内对照应无色。
地高辛标记的cDNA、RNA和寡核苷酸探针,不但探针的具有生物素标记优点,还克服了生物素标记的探针在原位杂交过程中受组织内源性生物素干忧等缺点),将该杂交探针与人体血液白细胞的待测RNA核酸进行杂交,再用免疫组化的方法显色,在光镜下观察mRNA的存在和定位,根据染色的细胞数,判断目的基因的表达量。
本发明方法是目前常用的核酸原位杂交技术,该方法通过检测底物细胞中的CD105基因表达量,用来确定癌症是否发生和/或转移。
临床研究表明,CD105基因具有广谱性,因为CD105基因在正常人中表达低或零表达。如果CD105基因高表达,说明癌症已经复发、转移、扩散,从而获得癌症的诊断信息。当检测到CD105基因的表达高于正常对照时,则可预测受试者为癌症早期转移或癌症转移易感者,这些癌症包括直肠癌或乳腺癌。
本发明实施例采样为:直肠癌转移病人10名,乳腺癌转移病人10名,正常对照组10名。抽所有待检人的外周血3-5毫升(分离白细胞)做原位杂交。结果表示,所有癌症转移病人CD105基因有过度表达,细胞染色;正常对照组CD105基因不表达,细胞无染色。具体结果请见图1,图2和图3。
实施例3
用CD105基因试剂盒检测直肠癌转移疾病与用CA125基因试剂盒检测直肠癌转移疾病之间平行实验。
为了科学评价上述基因各自在直肠癌转移疾病的特异性、敏感性、准确性。我们用平行试验的方法,同时检测上述基因的mRNA,检测技术采用核酸原位杂交技术,用同一例直肠癌转移疾病患者的外周血,同时检测CD105基因和CA125(CA125(肿瘤标记物),NM-024690)基因的mRNA(进行核酸原位杂交、免疫组化染色、镜下记数、结果报告等均采用实施例1和实施例2的原位杂交技术的相同方法和步骤及试剂)。发现CD105基因在直肠癌转移疾病病人中表达量比CA125基因在同一疾病病人的表达量要高。结果表明,CD105基因对直肠癌转移疾病诊断的特异性、敏感性、准确性比CA125基因更好,原位杂交基因表达图显示,CD105基因的表达量是70%,CA125基因的表达量是50%。本发明的试剂盒作于直肠癌转移疾病诊断的指标有非常重要的临床意义。
SEQUENCE LISTING
<110>芮屈生物技术(上海)有限公司
<120>一种CD105基因的原位杂交检测试剂盒及其检测方法和应用
<130>/
<160>1
<170>PatentIn version 3.3
<210>1
<211>3196
<212>DNA
<213>智人(Homo sapiens)
<400>1
ctctacccgg ttggcaggcg gcctggccca gccccttctc taaggaagcg catttcctgc 60
ctccctgggc cggccgggct ggatgagccg ggagctccct gctgccggtc ataccacagc 120
cttcatctgc gccctggggc caggactgct gctgtcactg ccatccattg gagcccagca 180
ccccctcccc gcccatcctt cggacagcaa ctccagccca gccccgcgtc cctgtgtcca 240
cttctcctga cccctcggcc gccaccccag aaggctggag cagggacgcc gtcgctccgg 300
ccgcctgctc ccctcgggtc cccgtgcgag cccacgccgg ccccggtgcc cgcccgcagc 360
cctgccactg gacacaggat aaggcccagc gcacaggccc ccacgtggac agcatggacc 420
gcggcacgct ccctctggct gttgccctgc tgctggccag ctgcagcctc agccccacaa 480
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gcctggtcac cttccaagag cccccggggg tcaacaccac agagctgcca tccttcccca 840
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tggtccgggg ctgccacttg gaaggcgtgg ccggccacaa ggaggcgcac atcctgaggg 1080
tcctgccggg ccactcggcc gggccccgga cggtgacggt gaaggtggaa ctgagctgcg 1140
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tcgacgccaa ccacaacatg cagatctgga ccactggaga atactccttc aagatctttc 1260
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tctcacttca tgcctccagc tgcggtggta ggctgcagac ctcacccgca ccgatccaga 1440
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cctccaacac catcgagccg gggcagcaga gctttgtgca ggtcagagtg tccccatccg 1860
tctccgagtt cctgctccag ttagacagct gccacctgga cttggggcct gagggaggca 1920
ccgtggaact catccagggc cgggcggcca agggcaactg tgtgagcctg ctgtccccaa 1980
gccccgaggg tgacccgcgc ttcagcttcc tcctccactt ctacacagta cccataccca 2040
aaaccggcac cctcagctgc acggtagccc tgcgtcccaa gaccgggtct caagaccagg 2100
aagtccatag gactgtcttc atgcgcttga acatcatcag ccctgacctg tctggttgca 2160
caagcaaagg cctcgtcctg cccgccgtgc tgggcatcac ctttggtgcc ttcctcatcg 2220
gggccctgct cactgctgca ctctggtaca tctactcgca cacgcgtgag taccccaggc 2280
ccccacagtg agcatgccgg gcccctccat ccacccgggg gagcccagtg aagcctctga 2340
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gcatagcccc ggccccccgc gctcgcccag caggagagac tgagcagccg ccagctggga 2580
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tggaacacct tggggtccct ccaccccaca gaaccttcaa cccagtgggt ctgggatatg 2760
gctgcccagg agacagacca cttgccacgc tgttgtaaaa acccaagtcc ctgtcatttg 2820
aacctggatc cagcactggt gaactgagct gggcaggaag ggagaacttg aaacagattc 2880
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gagccacctg gatctatccc tgcggcctcc acacctgaac ttgcctaact aactggcagg 3000
ggagacagga gcctagcgga gcccagcctg ggagcccaga gggtggcaag aacagtgggc 3060
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accatgaaac cagtga 3196