CN100400652C - 高效降解芘基因工程菌及其构建 - Google Patents
高效降解芘基因工程菌及其构建 Download PDFInfo
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- CN100400652C CN100400652C CNB2005100145815A CN200510014581A CN100400652C CN 100400652 C CN100400652 C CN 100400652C CN B2005100145815 A CNB2005100145815 A CN B2005100145815A CN 200510014581 A CN200510014581 A CN 200510014581A CN 100400652 C CN100400652 C CN 100400652C
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Abstract
本发明涉及生物修复或生态恢复领域,具体地说是一种降解芘基因工程菌及其构建。本发明的高效降解芘基因工程菌是将白腐真菌(Phanerochaete chrysosporium)的细胞色素P450单加氧酶pc-1基因,经逆转录-DNA扩增反应得到pc-1的cDNA,再将cDNA转化进大肠杆菌JM109中,构建成功能高效降解多环芳烃的基因工程菌,命名为JM413。构建的基因工程菌JM413,因具有氨苄青霉素抗性基因和单加氧酶基因,所以,适应性强,容易扩大培养,而且安全性高,不会对环境造成任何不良影响,因此,可以广泛应用于生物修复和生态恢复工程,降解难降解有机物,促进生态恢复,保持生态平衡。
Description
技术领域
本发明涉及生物修复或生态恢复领域,具体地说是一种降解芘基因工程菌及其构建。
背景技术
在多环芳烃降解中限速步骤是开始的苯环加氧,一旦完成苯环加氧,随后再氧化降解就相对容易进行。但是常见微生物往往缺少单加氧酶基因,或者单加氧酶不能表达。
发明内容
本发明的目的是提供一种高效降解芘基因工程菌及其构建方法。
本发明的高效降解芘基因工程菌是将白腐真菌(Phanerochaete chrysosporium)的细胞色素P450单加氧酶pc-1基因,经逆转录-DNA扩增反应(RT-PCR)得到pc-1的cDNA(互补DNA),再将cDNA转化进大肠杆菌JM109中,构建成功能高效降解多环芳烃的基因工程菌,命名为JM413。本发明人保证从申请日起20年内向公众提供该工程菌。白腐真菌(Phanerochaetechrysosporium)购于中国科学院微生物所菌种保存中心。
高效降解芘基因工程菌的构建方法,
1)引物设计根据白腐真菌(Phanerochaete chrysosporium)的细胞色素P450单加氧酶pc-1的基因序列,选取其上下游保守序列设计上下游引物A和B,并在各引物的一端分别加上EcoR I和BamH I两个限制性内切酶的酶切位点序列。引物A和B的核苷酸序列如下,下划线部分为EcoRI和BamH I两个限制性内切酶的酶切位点序列。
引物A:5’-ATG GAA TTC ATG GTG ACT ACT TTT ACG AG-3’
引物B:5’-ATG GGA TCC GGA TTG CTT CTG C-3’
2)提取总RNA自白腐真菌(Phanerochaete chrysosporium)的细胞提取总RNA
3)逆转录-DNA扩增反应(RT-PCR)采用一步RT-PCR的方法,由总RNA开始逆转录-扩增出单加氧酶基因pc-1的cDNA
4)重组质粒将载体pUC18与单加氧酶pc-1的cDNA在连接酶的作用下杂交为一个新的质粒。
5)转化将杂交的新质粒转化进大肠杆菌JM109中。(大肠杆菌JM109购于华美生物工程公司)
6)筛选和鉴别经进一步的筛选和鉴别确认单加氧酶pc-1的cDNA基因转化进了大肠杆菌JM109中,命名为JM413。
7)性能测定用邻苯三酚分光光度法测定基因工程菌JM413的氧化酶活性,实验证明JM413氧化酶活性比JM109提高135%;以典型的多环芳烃化合物-芘为降解目标物,检验基因工程菌JM413的降解特性,结果表明,在完全相同的条件下,在菌与芘作用48h后JM413的芘降解率是JM109的近20倍。
本发明将真核生物白腐真菌(Phanerochaete chrysosporium)的细胞色素P450单加氧酶pc-1的基因,经RT-PCR技术得到cDNA,再将cDNA转化进原核生物大肠杆菌JM109中,构建成功具有单加氧酶活性的基因工程菌JM413。构建的基因工程菌JM413,除具有JM109的特性外,还具有单加氧酶基因,能高效表达产生氧化酶的特性。该菌具有高效降解多环芳烃的特性,在生物修复或生态恢复工程中具有重要应用价值和广阔的市场前景。
本发明的有益效果:
构建的基因工程菌JM413,因具有氨苄青霉素抗性基因和单加氧酶基因,所以,适应性强,容易扩大培养,而且安全性高,不会对环境造成任何不良影响,因此,可以广泛应用于生物修复和生态恢复工程,降解难降解有机物,促进生态恢复,保持生态平衡。
测试、检验结果:
(一).基因工程菌的氧化酶活性测定
1.实验原理
邻苯三酚比色法,基于用邻苯三酚(又称焦性没食子酸)为基质,在有空气氧的情况下,由于微生物的氧化酶的催化生成有色的没食子素。产生没食素在610nm波长下有最大吸光值,其含量与颜色深度(A610nm)呈正相关。以7.5mg.mL-1重铬酸钾水溶液的颜色对应于1mg.mL-1的没食子素的乙酸乙酯溶液。以单位时间内生成没食子素的量表示氧化酶活性。
2.测定结果(表1-1),柱状图(图1-1)
表1-1 JM413与JM109氧化酶活性
测定结果说明,基因工程菌JM413的氧化酶活性是JM109氧化酶活性135%。这是由于重组菌中转化进了白腐真菌细胞色素P450单加氧酶pc-1基因,并得到了高效表达,提高了JM413的氧化能力的结果。
(二).基因工程菌JM413与JM109对芘降解特性的比较
1、菌悬液的制备:
从JM109和JM413的保存斜面上各挑取一环菌体分别加入到10ml LB培养液中,在37℃下200r·min-1振荡培养过夜,分别将其全部转接入90ml新鲜的LB培养液中,37℃下200r·min-1恒温振荡培养约24h,至对数生长期A600约为2.0时(每mL菌液菌落数约8.0×108),4000rpm离心10min,4℃,冰箱保存备用。
2.降解实验
移取200μL的芘-丙酮溶液(1g·L-1)至100ml锥形瓶中,向其中加入36mL灭菌无机盐培养液,在无菌条件下分别加入JM109和JM413菌悬液4mL,最终芘浓度为5mg·L-1,37℃200r·min-1振荡培养。定时取样测定溶液中芘的浓度。
3.芘含量的测定
(1)取培养到一定时间的菌降解液,在超净工作台上将其全部转移到50mL离心管中,4800rpm离心10min,上清液加入20mL乙酸乙酯,沉淀加入10mL乙酸乙酯,室温振荡提取0.5h。
(2)将乙酸乙酯和上清液全部转移至分液漏斗中,剧烈混合,静置10min,待分层后,收集乙酸乙酯层(上层),向水相中再加入10mL乙酸乙酯,重复上述提取步骤3次,收集乙酸乙酯层,定容至100mL。
(3)将沉淀用乙酸乙酯提取,4800rpm离心10min。将乙酸乙酯转移至50mL容量瓶中,反复提取三次。最后合并提取液乙酸乙酯定容至50mL。
(4)将乙酸乙酯提取液用旋转蒸发器蒸干,用色谱级甲醇定容至10mL,用液相色谱专用膜过滤(0.45μm),高压液相色谱法(HPLC)测定芘的浓度。
(5)高压液相色谱法:Waters1525型高压液相色谱仪,Waters 2475 MultiλFluorescence Detector(荧光检测器),Waters Symmetry ShieldTM RP18色谱柱(5μm,3.9×150mm),流动相为乙腈/H2O(v∶v=80∶20),流速为1mL·min-1;荧光检测器激发波长为333nm,荧光发射波长为390nm,灵敏度为2.0,进样量为20μ1,室温下测定,外标法定量。检出限为0.5μg·L-1。
4.测定结果(表1-2,图1-2,图1-3)
表1-2芘降解试验结果
附图说明
图1-1是氧化酶活性对比图
图1-2是JM413降解芘的曲线图
图1-3是JM109与JM413降解量对比图
具体实施方式
实施例1
(一)总RNA的提取
1)将白腐真菌用马铃薯培养基培养至对数生长期,取菌体50mg加入500μL变性溶液和3.6μL β-巯基乙醇,混匀,用匀浆棒冰浴匀浆。
2).立即加入100μL醋酸钠(2mol/L,pH4.0),200μL水饱和酚和200μL氯仿/异戊醇(24∶1)。加入每种组分后,盖上离心管盖,轻轻振摇充分混匀,冰浴15min。
3).在4℃下10000rpm离心10min,将含RNA的水相移入一新的离心管中。
4).加入与提取液等体积的异丙醇,充分混合,在-20℃沉淀RNA 1h或更长时间。在4℃下15000rpm离心15min
5).轻轻倒出异丙醇,加入100μl溶解RNA颗粒,并加入等体积异丙醇,在-20℃沉淀RNA 1h或更长时间。
6).于4℃下15000rpm离心15min,收集RNA沉淀。用75%的乙醇重复洗涤沉离心2次。吸出残存的乙醇,并打开盖子倒置几分钟,控干乙醇。
7).加100μLDEPC处理过的水溶解沉淀,将总RNA溶液贮存于-70℃。(实验中所有离心管取样器都要用DEPC处理)。
(二)逆转录-DNA扩增(RT-PCR)
为防止RNA被污染,反应皆在无菌条件下操作
1).取5支PCR专用0.5mL薄壁离心管(2支样品,3支对照)置于冰上,加入2*RT-PCR缓冲溶液 25μL
模板RNA(总RNA) 终浓度10pg-1ug
引物A 1μL
引物B 1μL
RT/TaqMix 1μL
无菌双蒸水 补足至50μL
阴性对照:
对照1:不加模板RNA
对照2:不加反转录酶用2U Taq替代RT/Taq Mix
对照3:不加引物
2).轻轻混匀,(瞬间离心,确保所有组分在管底),上覆液体石蜡约50μl。
3).RT-PCR步骤与条件
第1个循环 | 37℃cDNA合成15-30min,94℃预变性2min |
第35-40个循环PCR扩增 | 94℃变性15s,55-60℃退火30s,68-72℃延伸40s |
最后1个循环 | 72℃延伸5-10min,获得cDNA |
(三)载体puc18DNA与cDNA的酶切与连接
1).酶切
(1)cDNA酶切:
BamH I 0.8μL
EcoR I 0.8μL
Buffer K 2.0μL
cDNA 大约1.0μL(终浓度为0.1μg·μL-1)
无菌双蒸水H2O 补足至20μL
37℃恒温水浴1h,加入50μL无水乙醇,-20℃放置30min以上,4℃,15000rpm离心10min,弃去上清液,倒置20min,加入无菌双蒸水10μL。
(2)载体puc18DNA的酶切:
BamH I 0.8μL
EcoR I 0.8μL
Buffer K 2.0μL
pUC18DNA 大约1.0μL(终浓度为0.1μg·μL-1)
ddH2O 补足至20μL
37℃恒温水浴1h,加入50μl无水乙醇,-20℃放置30min以上,4℃,15000rpm离心10min,弃去上清液,倒置20min,加入无菌双蒸水10μL,-20℃保存。
2)cDNA与pUC18DNA的连接
目的DNA 3.0μL
载体DNA 1.0μL
T4连接酶 1.0μL
10*Buffer 1.0μL
无菌双蒸水 补足至10.0μL
恒温16℃,过夜,-20℃保存。
(四)感受态细胞的制备与转化
1)取100μL菌株E.coli JM109甘油保存菌液,接入3mL LB液体培养液中,37℃振摇过夜,将培养液转入25mL新鲜LB培养液中,37℃继续培养至A600约为0.3~0.4,取1.5mL培养液于4℃下5000rpm离心10min,弃去上清,倒置控干。
2)加入0.5mL0.1mol·L-1CaCl2-MgCl2,冰浴10min,于4℃下10000rpm离心10min,弃去上清。
3).再向菌体中加入1ml 0.1mol·L-1CaCl2-MgCl2,混合均匀,分装成100μL/管,-20℃保存。
4).取cDNA与pUC18DNA的连接液5μL加入到100μL感受态细胞中,冰浴30min后,42℃热激90s,取出后立即冰浴1~2min。
5).向其中加入800μL含氨苄青霉素(0.1%)的LB培养液,37℃70r·min-1恒温培养45min,4℃,10000rpm离心10min,弃去部分上清液,-20℃保存备用。
(五)用X-gal和IPTG筛选阳性重组子菌落——蓝白斑筛选
1).在含有氨苄青霉素的预制LB平板中央滴加40μL 2%X-gal和8μL 20%IPTG。
2).用一个灭菌的涂布器将X-gal和IPTG溶液涂布均匀,使之均匀分散于培养基表面。37℃放置0.5h至培养基表面无液体。
3).接种100μL(四)制备的转化菌悬液,用无菌涂布器涂布均匀,待接种液完全吸收后,倒置培养板于37℃培养过夜。
4).取出培养板于4℃放置0.5~1h,使菌落显色充分。
5).筛选出白色的菌落,即为基因工程菌,命名为JM413。
实施例二
(一)总RNA的提取
1)将白腐真菌用马铃薯培养基培养至对数生长期,取菌体100mg
500μL变性溶液和3.6μLβ-巯基乙醇,混匀,用匀浆棒冰浴匀浆。
2).立即加入100μL醋酸钠(2mol/L,pH4.0),200μL水饱和酚和200μL氯仿/异戊醇(24∶1)。加入每种组分后,盖上离心管盖,轻轻振摇充分混匀,冰浴15min。
3).在4℃下10000rpm离心10min,将含RNA的水相移入一新的离心管中。
4).加入与提取液等体积的异丙醇,充分混合,在-20℃沉淀RNA 1h或更长时间。在4℃下15000rpm离心15min
5).轻轻倒出异丙醇,加入100μl溶解RNA颗粒,并加入等体积异丙醇,在-20℃沉淀RNA 1h或更长时间。
6).于4℃下15000rpm离心15min,收集RNA沉淀。用75%的乙醇重复洗涤沉离心2次。吸出残存的乙醇,并打开盖子倒置几分钟,控干乙醇。
7).加100μLDEPC处理过的水溶解沉淀,将总RNA溶液贮存于-70℃。(实验中所有离心管取样器都要用DEPC处理)。
(二)逆转录-DNA扩增(RT-PCR)
为防止RNA被污染,反应皆在无菌条件下操作
1).取5支PCR专用0.5mL薄壁离心管(2支样品,3支对照)置于冰上,加入2*RT-PCR缓冲溶液 25μL
模板RNA(总RNA) 终浓度10pg~1ug
引物A 2μL
引物B 2μL
RT/Taq Mix 2μL
无菌双蒸水 补足至50μL
阴性对照:
对照1:不加模板RNA
对照2:不加反转录酶用2U Taq替代RT/Taq Mix
对照3:不加引物
2).轻轻混匀,(瞬间离心,确保所有组分在管底),上覆液体石蜡约50μl。
3).RT-PCR步骤与条件
第1个循环 | 37℃cDNA合成15~30min95℃预变性2min |
第35~40循环PCR扩增 | 95℃变性15s,55℃退火30s,72℃延伸40s |
最后1个循环 | 72℃延伸5-10min,获得cDNA |
(三)载体puc18DNA与cDNA的酶切与连接
1).酶切
(1)cDNA酶切:
BamH I 0.8μL
EcoR I 0.8μL
Buffer K 2.0μL
cDNA 大约1.0μL(终浓度为0.1μg·μL-1)
无菌双蒸水H2O 补足至20μL
37℃恒温水浴1h,加入50μL无水乙醇,-20℃放置30min以上,4℃,15000rpm离心10min,弃去上清液,倒置20min,加入无菌双蒸水10μL。
(2)载体puc18DNA的酶切:
BamH I 0.8μL
EcoR I 0.8μL
Buffer K 2.0μL
pUC18DNA 大约1.0μL(终浓度为0.1μg·μL-1)
ddH2O 补足至20μL
37℃恒温水浴1h,加入50μl无水乙醇,-20℃放置30min以上,4℃,15000rpm离心10min,弃去上清液,倒置20min,加入无菌双蒸水10μL,-20℃保存。
2)cDNA与pUC18DNA的连接
目的DNA 3.0μL
载体DNA 1.0μL
T4连接酶 1.0μL
10*Buffer 1.0μL
无菌双蒸水 补足至10.0μL
恒温16℃,过夜,-20℃保存。
(四)感受态细胞的制备与转化
1)取100μL菌株E.coli JM109甘油保存菌液,接入3mL LB液体培养液中,37℃振摇过夜,将培养液转入25mL新鲜LB培养液中,37℃继续培养至A600约为0.3~0.4,取1.5mL培养液于4℃下5000rpm离心10min,弃去上清,倒置控干。
2)加入0.5mL0.1mol·L-1CaCl2-MgCl2,冰浴10min,于4℃下10000rpm离心10min,弃去上清。
3).再向菌体中加入1ml 0.1mol·L-1CaCl2-MgCl2,混合均匀,分装成100μL/管,-20℃保存。
4)cDNA与pUC18DNA的连接液5μL加入到100μL感受态细胞中,冰浴30min后,42℃热激90s,取出后立即冰浴1~2min。
5)其中加入800μL含氨苄青霉素(0.1%)的LB培养液,37℃70r·min-1恒温培养45min,4℃,10000rpm离心10min,弃去部分上清液,-20℃保存备用。
(五)用X-gal和IPTG筛选阳性重组子菌落——蓝白斑筛选
1).在含有氨苄青霉素的预制LB平板中央滴加40μL 2%X-gal和8μL 20%IPTG。
2).用一个灭菌的涂布器将X-gal和IPTG溶液涂布均匀,使之均匀分散于培养基表面。37℃放置0.5h至培养基表面无液体。
3).接种100μL(四)制备的转化菌悬液,用无菌涂布器涂布均匀,待接种液完全吸收后,倒置培养板于37℃培养过夜。
4)将培养板于4℃放置0.5~1h,使菌落显色充分。
5).筛选出白色的菌落,即为基因工程菌,命名为JM413。
实施例三
(一)总RNA的提取
1)将白腐真菌用马铃薯培养基培养至对数生长期,取菌体80mg
500μL变性溶液和3.6μL β-巯基乙醇,混匀,用匀浆棒冰浴匀浆。
2).立即加入100μL醋酸钠(2mol/L,pH4.0),200μL水饱和酚和200μL氯仿/异戊醇(24∶1)。加入每种组分后,盖上离心管盖,轻轻振摇充分混匀,冰浴15min。
3).在4℃下10000rpm离心10min,将含RNA的水相移入一新的离心管中。
4).加入与提取液等体积的异丙醇,充分混合,在-20℃沉淀RNA 1h或更长时间。在4℃下15000rpm离心15min
5).轻轻倒出异丙醇,加入100μl溶解RNA颗粒,并加入等体积异丙醇,在-20℃沉淀RNA 1h或更长时间。
6).于4℃下15000rpm离心15min,收集RNA沉淀。用75%的乙醇重复洗涤沉离心2次。吸出残存的乙醇,并打开盖子倒置几分钟,控干乙醇。
7).加100μLDEPC处理过的水溶解沉淀,将总RNA溶液贮存于-70℃。(实验中所有离心管取样器都要用DEPC处理)。
(二)逆转录-DNA扩增(RT-PCR)
为防止RNA被污染,反应皆在无菌条件下操作
1).取5支PCR专用0.5mL薄壁离心管(2支样品,3支对照)置于冰上,加入2*RT-PCR缓冲溶液 25μL
模板RNA(总RNA) 终浓度10pg~1ug
引物A 2μL
引物B 2μL
RT/Taq Mix 2μL
无菌双蒸水 补足至50μL
阴性对照:
对照1:不加模板RNA
对照2:不加反转录酶用2U Taq替代RT/Taq Mix
对照3:不加引物
2).轻轻混匀,(瞬间离心,确保所有组分在管底),上覆液体石蜡约50μl。
3).RT-PCR步骤与条件
第1个循环 | 37℃cDNA合成15~30min95℃预变性3min |
第35~40循环PCR扩增 | 95℃变性15s,55℃退火30s,72℃延伸40s |
最后1个循环 | 72℃延伸5~8min获得cDNA |
(三)载体puc18DNA与cDNA的酶切与连接
1).酶切
(1)cDNA酶切:
BamH I 0.8μL
EcoR I 0.8μL
Buffer K 2.0μL
cDNA 大约1.0μL(终浓度为0.1μg·μL-1)
无菌双蒸水H2O 补足至20μL
37℃恒温水浴1h,加入50μL无水乙醇,-20℃放置30min以上,4℃,15000rpm离心10min,弃去上清液,倒置20min,加入无菌双蒸水10μL。
(2)载体puc18DNA的酶切:
BamH I 0.8μL
EcoR I 0.8μL
Buffer K 2.0μL
pUC18DNA 大约1.0μL(终浓度为0.1μg·μL-1)
ddH2O 补足至20μL
37℃恒温水浴1h,加入50μl无水乙醇,-20℃放置30min以上,4℃,15000rpm离心10min,弃去上清液,倒置20min,加入无菌双蒸水10μL,-20℃保存。
2)cDNA与pUC18DNA的连接
目的DNA 3.0μL
载体DNA 1.0μL
T4连接酶 1.0μL
10*Buffer 1.0μL
无菌双蒸水 补足至10.0μL
恒温16℃,过夜,-20℃保存。
(四)感受态细胞的制备与转化
1)取100μL菌株E.coli JM109甘油保存菌液,接入3mL LB液体培养液中,37℃振摇过夜,将培养液转入25mL新鲜LB培养液中,37℃继续培养至A600约为0.3~0.4,取1.5mL培养液于4℃下5000rpm离心10min,弃去上清,倒置控干。
2)加入0.5mL0.1mol·L-1CaCl2-MgCl2,冰浴10min,于4℃下10000rpm离心10min,弃去上清。
3).再向菌体中加入1ml 0.1mol·L-1CaCl2-MgCl2,混合均匀,分装成100μL/管,-20℃保存。
4)cDNA与pUC18DNA的连接液5μL加入到100μL感受态细胞中,冰浴30min后,42℃热激90s,取出后立即冰浴1~2min。
5)向其中加入800μL含氨苄青霉素(0.1%)的LB培养液,37℃70r·min-1恒温培养45min,4℃,10000rpm离心10min,弃去部分上清液,-20℃保存备用。
(五)用X-gal和IPTG筛选阳性重组子菌落——蓝白斑筛选
1).在含有氨苄青霉素的预制LB平板中央滴加40μL 2%X-gal和8μL 20%IPTG。
2).用一个灭菌的涂布器将X-gal和IPTG溶液涂布均匀,使之均匀分散于培养基表面。37℃放置0.5h至培养基表面无液体。
3).接种100μL(四)制备的转化菌悬液,用无菌涂布器涂布均匀,待接种液完全吸收后,倒置培养板于37℃培养过夜。
4)将培养板于4℃放置0.5~1h,使菌落显色充分。
5)筛选出白色的菌落,即为基因工程菌,命名为JM413。
序列列表
SEQUENCE LISTING
<110>南开大学
<120>高效降解芘基因工程菌及其构建
<130>20050720
<160>2
<170>PatentIn version 3.1
<210>1
<211>29
<212>DNA
<213>JM413
<220>
<221>primer_bind
<222>(1)..(29)
<223>
<400>1
atggaattca tggtgactac ttttacgag 29
<210>2
<211>22
<212>DNA
<213>JM413
<220>
<221>primer_bind
<222>(1)..(22)
<223>
<400>2
atgggatccg gattgcttct gc 22
Claims (2)
1.一种降解芘基因工程菌,其特征在于,它是将白腐真菌(Phanerochaetechrysosporium)的细胞色素P450单加氧酶pc-1基因,经逆转录-DNA扩增反应得到pc-1的cDNA,再将cDNA转化进大肠杆菌JM109中,构建成能降解多环芳烃的基因工程菌,命名为JM413。
2.一种降解芘基因工程菌的构建方法,其特征在于,包括下述步骤:
1)引物设计根据白腐真菌(Phanerochaete chrysosporium)的细胞色素P450单加氧酶pc-1的基因序列,选取其上下游保守序列设计上下游引物A和B,并在各引物的一端分别加上EcoR I和BamH I两个限制性内切酶的酶切位点序列,引物A和B的核苷酸序列如下,下划线部分为EcoR I和BamH I两个限制性内切酶的酶切位点序列;
引物A:5’-ATG GAATTC ATG GTGACTACTTTTACGAG-3’
引物B:5’-ATG GGATCCGGATTG CTT CTG C-3’
2)提取总RNA自白腐真菌(Phanerochaete chrysosporium)的细胞提取总RNA;
3)逆转录-DNA扩增反应采用一步RT-PCR的方法,由总RNA开始逆转录-扩增出单加氧酶基因pc-1的cDNA;
4)重组质粒将载体pUC18与单加氧酶pc-1的cDNA在连接酶的作用下杂交为一个新的质粒;
5)转化将杂交的新质粒转化进大肠杆菌JM109中;
6)筛选和鉴别经进一步的筛选和鉴别确认单加氧酶pc-1的cDNA基因转化进了大肠杆菌JM109中,命名为JM413。
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Citations (3)
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---|---|---|---|---|
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---|---|---|---|---|
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WO2001036684A2 (en) * | 1999-11-19 | 2001-05-25 | Incyte Genomics, Inc. | Mammalian toxicological response markers |
CN1608755A (zh) * | 2004-11-15 | 2005-04-27 | 清华大学 | 应用白腐真菌降解难降解环境污染物的两阶段方法 |
Non-Patent Citations (6)
Title |
---|
原毛平格菌堆肥处理有害废弃物的可行性. 马瑛等.环境科学,第20卷第6期. 1999 |
原毛平格菌堆肥处理有害废弃物的可行性. 马瑛等.环境科学,第20卷第6期. 1999 * |
白腐真菌和细菌对芘的协同生物降解研究. 侯树宇等.农业环境科学学报,第24卷第2期. 2005 |
白腐真菌和细菌对芘的协同生物降解研究. 侯树宇等.农业环境科学学报,第24卷第2期. 2005 * |
白腐真菌对土壤中多环芳烃(PAHs)降解的研究. 陈静等.环境科学,第24卷第3期. 2005 |
白腐真菌对土壤中多环芳烃(PAHs)降解的研究. 陈静等.环境科学,第24卷第3期. 2005 * |
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